View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0664_low_14 (Length: 309)

Name: NF0664_low_14
Description: NF0664
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0664_low_14
NF0664_low_14
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (26-300)||(13505-13780)
scaffold0251 (26-300)||(21479-21754)
[»] chr6 (31 HSPs)
chr6 (26-300)||(23994784-23995059)
chr6 (26-300)||(18002615-18002888)
chr6 (26-300)||(26089598-26089871)
chr6 (38-300)||(15742339-15742604)
chr6 (26-294)||(18570142-18570409)
chr6 (26-293)||(18777019-18777275)
chr6 (130-300)||(35015276-35015446)
chr6 (130-294)||(32898756-32898920)
chr6 (144-291)||(31628248-31628395)
chr6 (126-293)||(25744331-25744498)
chr6 (169-294)||(22440940-22441064)
chr6 (26-249)||(25651097-25651322)
chr6 (224-300)||(18583377-18583453)
chr6 (176-294)||(13014826-13014943)
chr6 (130-291)||(18381803-18381964)
chr6 (130-294)||(19983416-19983580)
chr6 (177-291)||(18432656-18432770)
chr6 (126-291)||(18398901-18399065)
chr6 (136-272)||(25367376-25367512)
chr6 (169-291)||(16086022-16086144)
chr6 (137-291)||(22361885-22362039)
chr6 (224-291)||(16106576-16106643)
chr6 (136-270)||(28195234-28195368)
chr6 (124-234)||(18629788-18629898)
chr6 (142-247)||(33324671-33324776)
chr6 (142-247)||(35136176-35136281)
chr6 (144-203)||(18583314-18583372)
chr6 (147-242)||(18823565-18823659)
chr6 (147-242)||(18839420-18839514)
chr6 (126-236)||(29160478-29160588)
chr6 (126-236)||(34966829-34966939)
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (26-300)||(53770902-53771177)
chr3 (23-300)||(23492232-23492509)
chr3 (26-300)||(2844052-2844327)
chr3 (26-300)||(3992412-3992686)
chr3 (26-300)||(16261323-16261589)
chr3 (26-300)||(38167775-38168050)
chr3 (26-294)||(19260956-19261222)
chr3 (26-300)||(45581493-45581767)
chr3 (26-300)||(54038243-54038517)
chr3 (26-294)||(17100513-17100783)
chr3 (65-294)||(17101237-17101468)
chr3 (28-294)||(54423876-54424142)
chr3 (26-208)||(28558068-28558250)
chr3 (26-294)||(11061122-11061392)
chr3 (126-300)||(30152904-30153078)
chr3 (136-285)||(12560362-12560511)
chr3 (144-305)||(33341862-33342022)
chr3 (128-272)||(17139472-17139616)
chr3 (130-300)||(17956103-17956273)
chr3 (144-305)||(54685415-54685575)
chr3 (136-291)||(11329081-11329236)
chr3 (156-294)||(50112168-50112306)
chr3 (144-293)||(7853963-7854111)
chr3 (149-294)||(16996176-16996321)
chr3 (130-294)||(22144389-22144553)
chr3 (128-294)||(14295402-14295569)
chr3 (126-272)||(12488865-12489011)
chr3 (169-294)||(6154448-6154572)
chr3 (169-294)||(12349847-12349971)
chr3 (144-272)||(14528151-14528279)
chr3 (126-294)||(13817477-13817642)
chr3 (128-294)||(35123661-35123826)
chr3 (126-291)||(317628-317793)
chr3 (126-294)||(12349656-12349828)
chr3 (128-264)||(55440996-55441132)
chr3 (128-294)||(14298386-14298551)
chr3 (128-294)||(14304013-14304178)
chr3 (127-294)||(19570805-19570971)
chr3 (26-135)||(8604872-8604982)
chr3 (126-294)||(17523006-17523174)
chr3 (26-124)||(13326640-13326739)
chr3 (128-294)||(14301029-14301196)
chr3 (144-294)||(53898572-53898721)
chr3 (169-294)||(6146863-6146987)
chr3 (26-135)||(11882308-11882417)
chr3 (147-291)||(16182065-16182209)
chr3 (144-285)||(14059339-14059480)
chr3 (128-272)||(15876032-15876176)
chr3 (174-272)||(16880133-16880231)
chr3 (144-242)||(19946679-19946776)
chr3 (174-291)||(17938584-17938701)
chr3 (241-294)||(34439460-34439513)
chr3 (144-249)||(38811170-38811275)
chr3 (144-236)||(47784922-47785014)
chr3 (141-236)||(3576613-3576708)
chr3 (175-286)||(8631801-8631912)
chr3 (124-247)||(9590918-9591041)
chr3 (264-294)||(28558271-28558301)
[»] chr8 (35 HSPs)
chr8 (26-293)||(274305-274572)
chr8 (26-293)||(641277-641544)
chr8 (26-293)||(827083-827350)
chr8 (26-300)||(16039000-16039274)
chr8 (26-300)||(24385871-24386137)
chr8 (26-294)||(20481466-20481735)
chr8 (26-300)||(39115138-39115411)
chr8 (156-300)||(41506928-41507072)
chr8 (130-291)||(41246624-41246785)
chr8 (128-294)||(20573309-20573474)
chr8 (162-300)||(24716981-24717119)
chr8 (128-285)||(39446892-39447048)
chr8 (126-294)||(19993171-19993339)
chr8 (162-294)||(22234920-22235052)
chr8 (128-283)||(21680966-21681121)
chr8 (164-291)||(20647949-20648076)
chr8 (164-291)||(20654025-20654152)
chr8 (169-294)||(37611674-37611798)
chr8 (144-285)||(38533629-38533770)
chr8 (130-291)||(23837164-23837325)
chr8 (169-246)||(25122542-25122618)
chr8 (128-236)||(20567333-20567440)
chr8 (128-236)||(20573526-20573633)
chr8 (142-236)||(38635823-38635917)
chr8 (144-272)||(22735977-22736105)
chr8 (232-291)||(20561751-20561810)
chr8 (128-208)||(20567202-20567281)
chr8 (137-272)||(5854587-5854722)
chr8 (137-248)||(23149754-23149865)
chr8 (168-247)||(23226240-23226319)
chr8 (137-272)||(26011467-26011602)
chr8 (126-236)||(27233242-27233352)
chr8 (126-196)||(29759904-29759974)
chr8 (126-163)||(18041780-18041817)
chr8 (126-163)||(33172190-33172227)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (26-300)||(42056408-42056683)
chr7 (26-300)||(2028782-2029057)
chr7 (26-294)||(3894887-3895155)
chr7 (26-300)||(2190305-2190569)
chr7 (26-300)||(32494165-32494439)
chr7 (26-300)||(3049450-3049719)
chr7 (26-300)||(111388-111661)
chr7 (27-291)||(26070384-26070649)
chr7 (27-291)||(26094171-26094436)
chr7 (26-294)||(12369957-12370226)
chr7 (128-294)||(11287381-11287547)
chr7 (127-294)||(39046740-39046907)
chr7 (126-300)||(126377-126551)
chr7 (63-294)||(13863046-13863279)
chr7 (128-294)||(12248237-12248404)
chr7 (146-294)||(16570122-16570271)
chr7 (146-294)||(16595391-16595540)
chr7 (128-272)||(49047813-49047957)
chr7 (128-294)||(13274751-13274918)
chr7 (130-294)||(15822548-15822712)
chr7 (127-294)||(35094780-35094946)
chr7 (144-291)||(7284180-7284326)
chr7 (126-300)||(13377491-13377666)
chr7 (167-294)||(12758990-12759117)
chr7 (169-294)||(47289787-47289911)
chr7 (144-300)||(17224048-17224205)
chr7 (167-272)||(45452305-45452410)
chr7 (222-294)||(44865288-44865360)
chr7 (169-294)||(143651-143769)
chr7 (254-300)||(1937131-1937177)
chr7 (26-66)||(13866110-13866150)
chr7 (126-177)||(14940715-14940766)
chr7 (126-177)||(15368308-15368359)
chr7 (146-236)||(4484709-4484799)
chr7 (142-236)||(20583729-20583823)
chr7 (126-163)||(8267960-8267997)
chr7 (137-249)||(48356617-48356729)
[»] chr4 (33 HSPs)
chr4 (26-300)||(15272431-15272706)
chr4 (26-294)||(12837317-12837582)
chr4 (26-294)||(30232613-30232903)
chr4 (26-291)||(52265628-52265894)
chr4 (129-294)||(53704850-53705015)
chr4 (126-298)||(23270047-23270219)
chr4 (126-298)||(55376710-55376882)
chr4 (130-294)||(16732135-16732299)
chr4 (130-294)||(34395223-34395387)
chr4 (126-300)||(14951724-14951898)
chr4 (130-294)||(44055881-44056045)
chr4 (156-294)||(21959580-21959718)
chr4 (130-293)||(25119333-25119497)
chr4 (169-294)||(820033-820154)
chr4 (128-285)||(13809636-13809793)
chr4 (128-272)||(18494467-18494611)
chr4 (127-294)||(44346790-44346957)
chr4 (127-292)||(53907818-53907980)
chr4 (169-294)||(30457909-30458033)
chr4 (128-271)||(27960936-27961078)
chr4 (130-300)||(5682646-5682816)
chr4 (126-291)||(15044790-15044955)
chr4 (222-294)||(8872588-8872660)
chr4 (126-300)||(15109459-15109634)
chr4 (47-172)||(15851595-15851722)
chr4 (167-293)||(45458973-45459099)
chr4 (148-247)||(19821940-19822039)
chr4 (212-294)||(15675221-15675303)
chr4 (212-300)||(31115678-31115766)
chr4 (224-294)||(10104382-10104452)
chr4 (146-248)||(41166109-41166211)
chr4 (144-249)||(37957187-37957292)
chr4 (126-163)||(41916974-41917011)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (26-300)||(94837-95111)
scaffold0037 (29-294)||(24845-25106)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (26-300)||(55442-55717)
[»] chr2 (30 HSPs)
chr2 (26-300)||(21274168-21274441)
chr2 (26-300)||(9653015-9653279)
chr2 (26-291)||(36890805-36891071)
chr2 (26-294)||(25876036-25876305)
chr2 (26-160)||(16935457-16935591)
chr2 (26-160)||(17006117-17006251)
chr2 (130-294)||(32465824-32465988)
chr2 (26-249)||(23821767-23821992)
chr2 (26-249)||(23830846-23831071)
chr2 (126-294)||(23836822-23836990)
chr2 (144-294)||(28974029-28974179)
chr2 (128-294)||(271135-271300)
chr2 (26-135)||(19659927-19660037)
chr2 (130-300)||(22274689-22274858)
chr2 (144-271)||(22579999-22580126)
chr2 (167-293)||(4448251-4448377)
chr2 (130-300)||(22283922-22284091)
chr2 (130-294)||(25601990-25602154)
chr2 (128-294)||(24571408-24571574)
chr2 (130-250)||(27261772-27261892)
chr2 (187-298)||(6879460-6879571)
chr2 (126-291)||(67954-68119)
chr2 (134-249)||(24294685-24294800)
chr2 (137-248)||(25305418-25305529)
chr2 (212-294)||(24341521-24341603)
chr2 (144-249)||(3403-3507)
chr2 (174-247)||(19669273-19669346)
chr2 (144-248)||(19433495-19433599)
chr2 (126-236)||(6094678-6094788)
chr2 (144-236)||(24277741-24277833)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (29-300)||(14813-15085)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (26-300)||(1097-1372)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (30-300)||(193607-193877)
scaffold0004 (30-300)||(186645-186918)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (26-300)||(6662-6931)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (26-300)||(9626-9900)
[»] chr5 (30 HSPs)
chr5 (30-300)||(21650561-21650831)
chr5 (26-300)||(21204787-21205062)
chr5 (26-294)||(20711937-20712206)
chr5 (126-294)||(1168321-1168489)
chr5 (156-300)||(2031802-2031946)
chr5 (126-300)||(11342646-11342821)
chr5 (130-294)||(21397055-21397222)
chr5 (127-285)||(23493882-23494040)
chr5 (127-294)||(24475546-24475708)
chr5 (144-294)||(28261501-28261651)
chr5 (127-293)||(21646857-21647023)
chr5 (162-264)||(23466455-23466557)
chr5 (126-291)||(3673824-3673989)
chr5 (144-285)||(19405517-19405658)
chr5 (144-294)||(11337303-11337452)
chr5 (126-294)||(4865224-4865393)
chr5 (126-291)||(5450963-5451128)
chr5 (174-293)||(21906730-21906846)
chr5 (145-294)||(11584032-11584184)
chr5 (168-294)||(24183249-24183372)
chr5 (144-291)||(7728400-7728547)
chr5 (126-249)||(432425-432548)
chr5 (144-291)||(19862189-19862336)
chr5 (128-249)||(16595472-16595593)
chr5 (126-247)||(23981680-23981800)
chr5 (142-236)||(6456602-6456696)
chr5 (212-294)||(22053965-22054047)
chr5 (47-80)||(14342365-14342398)
chr5 (212-293)||(18531200-18531281)
chr5 (168-272)||(21617020-21617124)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (26-300)||(17523-17797)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (26-294)||(146462-146731)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (26-291)||(10094-10359)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (26-294)||(15588-15859)
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (29-294)||(35054621-35054886)
chr1 (26-294)||(27329872-27330138)
chr1 (26-300)||(21859873-21860147)
chr1 (126-300)||(22366981-22367154)
chr1 (128-294)||(35522436-35522601)
chr1 (126-300)||(15861545-15861717)
chr1 (174-294)||(49967660-49967780)
chr1 (128-270)||(51627805-51627947)
chr1 (126-294)||(22403227-22403395)
chr1 (156-300)||(44035090-44035233)
chr1 (128-294)||(41212033-41212202)
chr1 (174-294)||(21718238-21718358)
chr1 (130-291)||(20177141-20177302)
chr1 (168-272)||(9784239-9784343)
chr1 (144-248)||(13377003-13377107)
chr1 (134-248)||(41229102-41229216)
chr1 (224-291)||(9784184-9784248)
chr1 (144-249)||(27674777-27674881)
chr1 (144-203)||(22829632-22829691)
chr1 (147-249)||(36356455-36356557)
chr1 (126-163)||(40436517-40436554)
chr1 (136-236)||(8538085-8538185)
chr1 (136-236)||(8603324-8603424)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (26-222)||(22701-22897)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (27-300)||(79724-80000)
scaffold0034 (26-294)||(46025-46295)
scaffold0034 (58-294)||(40552-40788)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (26-300)||(147-405)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (26-271)||(19049-19294)
scaffold0039 (128-300)||(12639-12811)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (26-293)||(88158-88404)
scaffold0021 (130-294)||(132367-132531)
scaffold0021 (144-294)||(11667-11818)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (26-269)||(5802-6045)
scaffold0342 (156-300)||(570-714)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (57-294)||(4455-4694)
scaffold0447 (57-294)||(9069-9308)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (26-291)||(33525-33789)
[»] scaffold0480 (2 HSPs)
scaffold0480 (126-294)||(5363-5531)
scaffold0480 (146-294)||(8998-9147)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (57-294)||(7063-7303)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (128-291)||(109582-109745)
scaffold0035 (128-293)||(118081-118246)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (130-300)||(31399-31569)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (130-300)||(41275-41445)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (130-300)||(6202-6372)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (128-294)||(693-859)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (144-294)||(254931-255081)
scaffold0011 (144-294)||(261537-261687)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (26-201)||(147417-147590)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (130-291)||(85298-85459)
scaffold0014 (128-300)||(159266-159436)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (126-294)||(32165-32333)
scaffold0091 (126-294)||(41970-42138)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (126-294)||(164177-164345)
scaffold0016 (130-300)||(162297-162468)
scaffold0016 (225-300)||(166383-166458)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (130-294)||(22657-22821)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (130-294)||(70739-70903)
scaffold0001 (167-298)||(60809-60940)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (128-294)||(8951-9117)
[»] scaffold0195 (1 HSPs)
scaffold0195 (128-294)||(635-801)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (137-294)||(118-274)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (130-294)||(939-1103)
scaffold0673 (126-294)||(6962-7133)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (130-291)||(1285-1444)
scaffold0359 (187-294)||(11771-11875)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (176-294)||(7581-7699)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (144-294)||(9917-10067)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (144-294)||(21492-21642)
scaffold0120 (144-294)||(31191-31341)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (126-294)||(14839-15004)
scaffold0083 (126-234)||(14179-14287)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (130-275)||(30057-30202)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (128-285)||(33854-34010)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (136-264)||(3291-3419)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (130-294)||(38264-38428)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (128-272)||(109554-109698)
scaffold0022 (144-294)||(112662-112809)
scaffold0022 (144-285)||(103048-103189)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (136-243)||(7806-7913)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (128-294)||(11825-11990)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (144-272)||(3280-3407)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (40-247)||(10970-11177)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (126-268)||(1343-1485)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (130-294)||(253106-253270)
[»] scaffold0160 (2 HSPs)
scaffold0160 (156-294)||(13-151)
scaffold0160 (156-236)||(3511-3591)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (128-249)||(1880-2001)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (144-294)||(24940-25088)
scaffold0158 (174-294)||(25222-25341)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (130-291)||(4907-5068)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (126-291)||(2436-2601)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (144-269)||(31024-31149)
scaffold0031 (227-285)||(70676-70734)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (167-291)||(11688-11812)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (128-247)||(2419-2538)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (156-291)||(234-368)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (169-294)||(48153-48277)
scaffold0068 (169-294)||(61601-61725)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (130-291)||(76967-77128)
[»] scaffold0740 (1 HSPs)
scaffold0740 (238-293)||(4359-4414)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (142-247)||(79517-79622)
scaffold0028 (225-294)||(89586-89655)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (149-248)||(35463-35562)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (156-234)||(24374-24452)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (144-248)||(289-393)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (126-177)||(90078-90129)
[»] scaffold0670 (1 HSPs)
scaffold0670 (126-236)||(7850-7960)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (144-242)||(28516-28614)
[»] scaffold0153 (1 HSPs)
scaffold0153 (126-163)||(1797-1834)


Alignment Details
Target: scaffold0251 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13780 - 13505
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13780 caacatatctacttcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtat 13681  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaac-aaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaac 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13680 ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaac 13581  T
Q  225 aacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13580 aacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 13505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21754 - 21479
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  21754 caacatatctacttcaacaacatttcatgtagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcccaatccaacaattgagcaaaacatataattat 21655  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaa-ttatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaac 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21654 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaac 21555  T
Q  225 aacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21554 aacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 21479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 31)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Original strand, 23994784 - 23995059
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  23994784 caacatatctacttcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataattat 23994883  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaac-aaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23994884 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaac 23994983  T
Q  225 aacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23994984 aacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 23995059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18002888 - 18002615
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18002888 caacatatctacttcaacaacaattcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 18002789  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18002788 tcattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaac-aagtatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacgtcacttaaca 18002690  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  18002689 acaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcatcaattgagcataat 18002615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Original strand, 26089598 - 26089871
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26089598 caacatatctacttcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatctcaatccaacaattgagcaaaacacataagtat 26089697  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
     |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26089698 tcattttcacccaaccaacaacaacaacttatttcacaacaac-aattatgaatcatgcatacccaaaccatgaattagcatccataacatcacttaaca 26089796  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26089797 acaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 26089871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 38 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15742604 - 15742339
Alignment:
Q  38 ttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtatccattttcacca 137  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15742604 ttcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataattatccattttcacca 15742505  T
Q  138 aactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaac---aaca 234  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||    
T  15742504 aaccagcaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacaaca 15742405  T
Q  235 tctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15742404 tctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 15742339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 294
Target Start/End: Original strand, 18570142 - 18570409
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  18570142 caacatatctaattcaacaacacttcatttagacatgaattcaactataattcaacaacacaatatctcaatccaacaattgagcaaaactcataagtac 18570241  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
     |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18570242 tcattttcaccaaaccaacaacaaca-cttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaggccatgaattagcatccataacatcacttaaca 18570340  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  18570341 acaactacttctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgag 18570409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 293
Target Start/End: Original strand, 18777019 - 18777275
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||            |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  18777019 caacatatctacttcaacaacacttcatttagacttgaattcaac-----------aacacaatatcccaatccaacaattgaacaaaactcataagtat 18777107  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18777108 ctattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaaca 18777207  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattga 293  Q
    ||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  18777208 acaacaacattcattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattga 18777275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 130 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 35015446 - 35015276
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 229  Q
    |||||| |||| | |||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | || | |||| | || || ||| ||||||||    
T  35015446 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaacaa 35015347  T
Q  230 caacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35015346 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 35015276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 130 - 294
Target Start/End: Original strand, 32898756 - 32898920
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 229  Q
    ||||||||||  | ||||| || || ||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| | ||||| ||| ||||||||    
T  32898756 tttcaccaaaacaccaacatcatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccattaattatcatcaacaacatgactaaacaacaa 32898855  T
Q  230 caacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  32898856 caacttcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaattgag 32898920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 144 - 291
Target Start/End: Original strand, 31628248 - 31628395
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    |||||||| || ||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| || || ||||||||||||| ||||||    
T  31628248 caacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgat 31628347  T
Q  244 catgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  31628348 catgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaatt 31628395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 126 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 25744498 - 25744331
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||| ||||  | |||||||| || ||||| | ||||||||  | |||| ||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||| ||||    
T  25744498 ccattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctctacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca 25744399  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattga 293  Q
    ||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  25744398 acaacaacaacatttgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccacttga 25744331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 169 - 294
Target Start/End: Original strand, 22440940 - 22441064
Alignment:
Q  169 aaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaa 268  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||| |||| ||    
T  22440940 aaatcatgaatcatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaaatcatgaa 22441038  T
Q  269 caaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  22441039 caacaatgcataattcaccaattgag 22441064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 249
Target Start/End: Original strand, 25651097 - 25651322
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataa-ttgagcaaaacaca-taagt 123  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||| |||| ||  || ||||||||||| ||  ||||    
T  25651097 caacatatttaattcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacgacatcacaattcatcaatttgagcaaaactcacaaagt 25651196  T
Q  124 atccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaa 223  Q
    | |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| || || | ||| |||| | ||| | |||||||||| |||| | || | | || ||||||||     
T  25651197 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatccaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttag 25651296  T
Q  224 caacaacaacatctattgatcatgaa 249  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25651297 caacaacaacatcaattgaacatgaa 25651322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 224 - 300
Target Start/End: Original strand, 18583377 - 18583453
Alignment:
Q  224 caacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18583377 caacaacaacatcaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 18583453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 176 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13014943 - 13014826
Alignment:
Q  176 gaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccat 275  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||| || ||||| | ||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  13014943 gaatcatgca-acccaagccacgaattatcatcaacaacatgacttaacatcagcaacaacaattgatcttgaaacttatcacaattcatcaacaacaat 13014845  T
Q  276 gcataattcaccaattgag 294  Q
    |||||||||||||||||||    
T  13014844 gcataattcaccaattgag 13014826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 130 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 18381964 - 18381803
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 229  Q
    |||||| |||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||| | || | | ||||||||||| ||||||    
T  18381964 tttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaa 18381865  T
Q  230 caacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
    ||||||| ||||| |||||    |||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||    
T  18381864 caacatcaattgaacatgactcttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaacaatt 18381803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 130 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19983580 - 19983416
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 229  Q
    |||||| |||| | |||||||||   ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||| | || | |||| | || || ||| ||||||||    
T  19983580 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaacaa 19983481  T
Q  230 caacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||| | | | | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  19983480 caacaaccactaaccatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcactaattgag 19983416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 177 - 291
Target Start/End: Original strand, 18432656 - 18432770
Alignment:
Q  177 aatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatg 276  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| || || |||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||| | |    
T  18432656 aatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacataacatatcaacaacatcatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaag 18432755  T
Q  277 cataattcaccaatt 291  Q
    |||||||||||||||    
T  18432756 cataattcaccaatt 18432770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 291
Target Start/End: Original strand, 18398901 - 18399065
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||||| |||||  | || ||| | |||||| ||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||||||||| ||    
T  18398901 ccatttttacaaaaccaacaacaacaactcatttcttatca-caattcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagca 18398999  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||    ||||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  18399000 acaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 18399065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25367512 - 25367376
Alignment:
Q  136 caaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacat 235  Q
    |||||||  ||||||| || ||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||| |    | ||||||||||| ||||||||||||    
T  25367512 caaactactaacaacatctcatttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaagccatgaattatcgataacaacatcacttagcaacaacaacat 25367413  T
Q  236 ctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaac 272  Q
    | ||||| ||||||   |||||||||||| |||||||    
T  25367412 caattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaac 25367376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 291
Target Start/End: Original strand, 16086022 - 16086144
Alignment:
Q  169 aaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaa 268  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| || |||||| |||  | ||||| || || ||||||||||||| | |||||||||||  ||||| |||||| |||    
T  16086022 aaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcattaacaacatgacatatcaacaacaacatcaaatgatcatgaaacttatcataattcaacaa 16086121  T
Q  269 caaccatgcataattcaccaatt 291  Q
    |||| | | ||||||||||||||    
T  16086122 caacaaggtataattcaccaatt 16086144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22362039 - 22361885
Alignment:
Q  137 aaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatc 236  Q
    |||||||||||||||||| | ||| || || ||| | |||||| ||| | |||||||||| |||| | || | | || |||||||| |||||||||||||    
T  22362039 aaactaacaacaacaactcaattctcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatc 22361940  T
Q  237 tattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
     ||||| ||||||    ||||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  22361939 aattgaacatgaatttcatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatt 22361885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 291
Target Start/End: Original strand, 16106576 - 16106643
Alignment:
Q  224 caacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||    
T  16106576 caacaacaacatcaaatgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaggtataattcaccaatt 16106643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 28195368 - 28195234
Alignment:
Q  136 caaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacat 235  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| |||||| |||| || ||| ||||| || ||||||| |||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||     
T  28195368 caaactaccaacaacatctcatttctcaacaataaatcat-aattatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaaccacaa 28195270  T
Q  236 ctattgatcatgaaaaat-atcacaattcatcaaca 270  Q
    | ||||||||| |||  | ||||||||||| |||||    
T  28195269 caattgatcataaaatctcatcacaattcaacaaca 28195234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18629898 - 18629788
Alignment:
Q  124 atccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaa 223  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| || || ||||| |||| | ||| | |||||| ||| |||| | || | | || |||||||||    
T  18629898 atccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttaa 18629799  T
Q  224 caacaacaaca 234  Q
    |||||||||||    
T  18629798 caacaacaaca 18629788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 247
Target Start/End: Original strand, 33324671 - 33324776
Alignment:
Q  142 aacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattg 241  Q
    ||||||||||||| ||||| || || ||| | |||||| ||| |||||||||||| |||| | || | | ||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  33324671 aacaacaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattg 33324770  T
Q  242 atcatg 247  Q
    | ||||    
T  33324771 aacatg 33324776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 35136281 - 35136176
Alignment:
Q  142 aacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattg 241  Q
    ||||||||||||| ||||| || || ||| | |||||| ||| |||||||||||| |||| | || | | ||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  35136281 aacaacaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattg 35136182  T
Q  242 atcatg 247  Q
    | ||||    
T  35136181 aacatg 35136176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 203
Target Start/End: Original strand, 18583314 - 18583372
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaatta 203  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18583314 caacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaatta 18583372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18823659 - 18823565
Alignment:
Q  147 caacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattga 242  Q
    |||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||| |||| | ||||| || || ||||||||||||| |||||    
T  18823659 caacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 18823565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18839514 - 18839420
Alignment:
Q  147 caacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattga 242  Q
    |||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||| |||| | ||||| || || ||||||||||||| |||||    
T  18839514 caacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 18839420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29160588 - 29160478
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||  || | |||| | ||| |||||||||| | |||| | || | | || ||| |||||||    
T  29160588 ccattttcacaaaaccaataacaacaacttatttcacatcacaaactcatgatttatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaaca 29160489  T
Q  226 acaacaacatc 236  Q
    |||||||||||    
T  29160488 acaacaacatc 29160478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 236
Target Start/End: Original strand, 34966829 - 34966939
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||  || | |||| | ||| | |||||||| | |||| | || | | || ||| |||||||    
T  34966829 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcacgaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaaca 34966928  T
Q  226 acaacaacatc 236  Q
    |||||||||||    
T  34966929 acaacaacatc 34966939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Original strand, 53770902 - 53771177
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  53770902 caacatatctacttcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataattat 53771001  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaac-aaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  53771002 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaac 53771101  T
Q  225 aacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53771102 aacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 53771177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 23 - 300
Target Start/End: Original strand, 23492232 - 23492509
Alignment:
Q  23 catcaacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataag 122  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23492232 catcaacatatctactttaacaacacctcatttagacatgaattcaatcataattcaattacacaatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataag 23492331  T
Q  123 tatccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcactta 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23492332 tatccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaactatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcactta 23492431  T
Q  223 acaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  23492432 acaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatccataattcaccatttgagcataat 23492509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Original strand, 2844052 - 2844327
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2844052 caacatatctacttcaacaacacttcaattagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtat 2844151  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaac-aaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2844152 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttacttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaac 2844251  T
Q  225 aacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2844252 aacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaagaaccatgcataattcaccaattgagcataat 2844327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Original strand, 3992412 - 3992686
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3992412 caacatatctacttcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcccaatcca-taattgagcaaaacacataagtat 3992510  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaa-ttatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaac 224  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3992511 caattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaac 3992610  T
Q  225 aacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3992611 aacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 3992686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Original strand, 16261323 - 16261589
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16261323 caacatatctacttcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtat 16261422  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261423 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttt------aacaa--aattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaaca 16261514  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16261515 acaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 16261589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Original strand, 38167775 - 38168050
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataatt-gagcaaaacacataagta 124  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  38167775 caacatatctacttcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatattccaatccaacaatttgagcaaaactcataagta 38167874  T
Q  125 tccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaac 224  Q
     ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  38167875 cccattttcaccaaaacaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaac 38167974  T
Q  225 aacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||    
T  38167975 aacaacaacatctattgatcatgaaacttattacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcataat 38168050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19261222 - 19260956
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataatt-gagcaaaacacataagta 124  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  19261222 caacatatctatttcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatattccaatccaacaatttgagcaaaactcataagta 19261123  T
Q  125 tccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaac 224  Q
     |||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||    
T  19261122 cccattttcaccaaactaacaacaac---ttatttcataacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacattcataacatcatttaac 19261026  T
Q  225 aacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  19261025 aacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacttagtataattcaccaattgag 19260956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Original strand, 45581493 - 45581767
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||     
T  45581493 caacatatctaattcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacagcacaatatcccaatccaacaattgagcaaaattcataagtac 45581592  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |  | || ||| ||||    
T  45581593 ccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaaca 45581692  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  45581693 acaacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcataat 45581767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 54038517 - 54038243
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  54038517 caacatatctaattcaacaacacttcatttagacatgaatttaaccataattcaacaacacaatatcccaatccaacaattgagcaaaactcataagtat 54038418  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |  | || ||| ||||    
T  54038417 ccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttcttaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaactatatgactaaaca 54038318  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  54038317 acaacaacaaccattaatcatgaaacatatcacatttcatcaacaaccatgcataattcaccaatttagcataat 54038243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 294
Target Start/End: Original strand, 17100513 - 17100783
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataatt-gagcaaaacacataagta 124  Q
    ||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  17100513 caacatacctaattcaacaacatttcatttagacagaaattcaaccataattcaaccacacaatatcccaatccaacaatttgagcaaaactcataagta 17100612  T
Q  125 tccattttcaccaaactaacaa-caacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaa 223  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17100613 tccattttcaccaaaccaacattcaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaa 17100712  T
Q  224 caacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  17100713 caacaataacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgag 17100783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 65 - 294
Target Start/End: Original strand, 17101237 - 17101468
Alignment:
Q  65 ttcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataatt-gagcaaaacacataagtatccattttcaccaaactaacaa-caacaacttatttcac 162  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  17101237 ttcaaccataattcaaccacacaatatcccaatccaacaatttgagcaaaactcataagtatccattttcaccaaaccaacattcaacaacttatttcac 17101336  T
Q  163 aacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaatt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  17101337 aacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaataacatcaattgatcatgaaacttatcacaatt 17101436  T
Q  263 catcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  17101437 catcaacaacatagcataattcaccaattgag 17101468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 28 - 294
Target Start/End: Original strand, 54423876 - 54424142
Alignment:
Q  28 acatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataatt-gagcaaaacacataagtatc 126  Q
    ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||| |    
T  54423876 acatacctaattcaacaacatttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcacaatcgaacaatttgagcaaaactcataagtagc 54423975  T
Q  127 cattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaa 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||| ||||||| |||    
T  54423976 cattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcat-aacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacgtcacttagcaa 54424074  T
Q  227 caacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
     ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  54424075 taacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgag 54424142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 208
Target Start/End: Original strand, 28558068 - 28558250
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  28558068 caacatatctatttcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacataatatctcaatccaacaattgagcaaaactcataagtac 28558167  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatc 208  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28558168 tcattttcaccaaacaaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatc 28558250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 11061392 - 11061122
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataatt-gagcaaaacacataagta 124  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  11061392 caacatatctaattcaaaaacacttcatttagacataaattcaaccataattcaacaacacaatatttcaatccaacaatttgagcaaaactcataagta 11061293  T
Q  125 tccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaac 224  Q
     ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| | || | | || |||||||| |    
T  11061292 cccattttcaccaaatcaacaacaataacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagc 11061193  T
Q  225 aacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgag 294  Q
    | |||||||||| ||||| |||||  | |||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  11061192 accaacaacatcaattgaacatgactattatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgag 11061122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 126 - 300
Target Start/End: Original strand, 30152904 - 30153078
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||   || | |||| | || || ||| ||||    
T  30152904 ccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaatatgactaaaca 30153003  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30153004 acaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 30153078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 136 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 12560511 - 12560362
Alignment:
Q  136 caaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacat 235  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12560511 caaactaccaacaacatctcatttctcaacatcaaatcatgaatcatgcatacccaagccaggaattaacatccacaacatcacttagcaacaacaacat 12560412  T
Q  236 ctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 285  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  12560411 ccattgatcatgaatcatatcacaattcaacaacaacatagcataattca 12560362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 144 - 305
Target Start/End: Original strand, 33341862 - 33342022
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| | ||||||    
T  33341862 caacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 33341960  T
Q  244 catgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataatctacc 305  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  33341961 catgaaacatatcataattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacc 33342022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 128 - 272
Target Start/End: Original strand, 17139472 - 17139616
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||| ||||    
T  17139472 atttttaccaaactaccaacaacatctcatttcgcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaac 17139571  T
Q  228 aacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaac 272  Q
    ||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| |||||||    
T  17139572 aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaac 17139616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 130 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17956273 - 17956103
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 229  Q
    |||||| |||| | |||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| || | || | |||| | || || ||| ||||||||    
T  17956273 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaacaa 17956174  T
Q  230 caacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17956173 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataatacaccaattgagtataat 17956103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 144 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 54685575 - 54685415
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| | |||||||| |||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| | ||||||    
T  54685575 caacagcaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaatccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 54685477  T
Q  244 catgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataatctacc 305  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  54685476 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataatttacc 54685415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 136 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 11329236 - 11329081
Alignment:
Q  136 caaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacat 235  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  11329236 caaactaccaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacat 11329137  T
Q  236 ctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
    | ||||||||||||   |||||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  11329136 caattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 11329081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 156 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 50112306 - 50112168
Alignment:
Q  156 atttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatat 255  Q
    ||||| ||| ||||||  |||||||||||| || ||||||| |||||| |||| | ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  50112306 atttctcaaaaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacttat 50112207  T
Q  256 cacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50112206 cacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 50112168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 144 - 293
Target Start/End: Original strand, 7853963 - 7854111
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| | ||||||    
T  7853963 caacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgattcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 7854061  T
Q  244 catgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattga 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7854062 catgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattga 7854111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 149 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16996321 - 16996176
Alignment:
Q  149 acaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatga 248  Q
    |||||| ||||| ||||||||||  | |||| ||||| || ||||||| |||||| |||| | ||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  16996321 acaactcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatcatga 16996222  T
Q  249 aaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16996221 aacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 16996176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 130 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22144553 - 22144389
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 229  Q
    ||||||||||  | |||||||| || ||||| |||| |||||  |||||||||||| |||||||||| | |||| |||| | |||||  |||||||||||    
T  22144553 tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgtattatcatcaacaacatggcttaacaacaa 22144454  T
Q  230 caacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22144453 caacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcatacttcaccaattgag 22144389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Original strand, 14295402 - 14295569
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | |||||||||||  |||    
T  14295402 attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagaaac 14295501  T
Q  228 aacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgag 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  14295502 aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgag 14295569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 126 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12489011 - 12488865
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||  |||| |||||| ||| | |||||||||| |||||| |||| | ||||||||||| ||    
T  12489011 ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcccatcattaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagca 12488912  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaac 272  Q
    ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| |||||||    
T  12488911 acaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaac 12488865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 169 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 6154572 - 6154448
Alignment:
Q  169 aaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaa 268  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6154572 aaattatgaatcatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaataacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaa 6154474  T
Q  269 caaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
     ||| |||||||||||||||||||||    
T  6154473 taacaatgcataattcaccaattgag 6154448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 169 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12349971 - 12349847
Alignment:
Q  169 aaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaa 268  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12349971 aaatcatgaatcatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaa 12349873  T
Q  269 caaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    | || |||||||||||||||||||||    
T  12349872 ctacgatgcataattcaccaattgag 12349847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 144 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 14528279 - 14528151
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  14528279 caacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcattcatacccaagccatgaattaccatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgat 14528180  T
Q  244 catgaaaaatatcacaattcatcaacaac 272  Q
    ||||||   |||||||||||| |||||||    
T  14528179 catgaatcttatcacaattcaacaacaac 14528151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 126 - 294
Target Start/End: Original strand, 13817477 - 13817642
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||| ||||  | |||||||| || ||||| ||||||||||  | |||| ||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||| ||||    
T  13817477 ccattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca 13817576  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||||||||   |||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13817577 acaacaaca---attgatcatgaaacttatcacaattcaccaacaacaatgcataattcaccaattgag 13817642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Original strand, 35123661 - 35123826
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||| |||| | ||||| || || ||||    
T  35123661 attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaac 35123759  T
Q  228 aacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||    
T  35123760 aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgag 35123826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 126 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 317793 - 317628
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||| ||||  | |||||||| || ||||| | ||||||||  | |||| || || || ||||||| |||||| |||| | ||||| ||| ||||    
T  317793 ccattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctccacaacaaaccaagaattatacaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca 317694  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  317693 acaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatt 317628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 126 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12349828 - 12349656
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatac-----ccaagccacgaattagcatccataacatcact 220  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||     |||||||| || ||| |||| | ||||| ||     
T  12349828 ccattttcac-aaaccaaaaacaacaacttatttctcatcatcaaattatgaatcatgcaaaccatggccaagccatgatttatcatctacaacatgaca 12349730  T
Q  221 taacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  12349729 tatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgag 12349656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 128 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 55441132 - 55440996
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||||||||||| | |||||||| || ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||| || |||||| |||| | ||||||||||| || |    
T  55441132 attttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaaaaaatcatgaattatgcatacccaagtcatgaattatcatcaacaacatcacttagcatc 55441033  T
Q  228 aacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattca 264  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  55441032 aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattca 55440996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Original strand, 14298386 - 14298551
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| || ||  ||     
T  14298386 attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatattaat 14298484  T
Q  228 aacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14298485 aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcgacaacaacaaagcataattcaccaattgag 14298551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Original strand, 14304013 - 14304178
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| || ||  ||     
T  14304013 attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatattaat 14304111  T
Q  228 aacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14304112 aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcgacaacaacaaagcataattcaccaattgag 14304178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 127 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19570971 - 19570805
Alignment:
Q  127 cattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaa 226  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| || ||||| |||||||||   | |||| ||||| || ||||||| |||||| |||| | ||||| ||| |||||    
T  19570971 cattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaccaa-gaattatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaa 19570873  T
Q  227 caacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||||||| | |||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19570872 caacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcaccaacaacaatgcataattcaccaattgag 19570805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 135
Target Start/End: Original strand, 8604872 - 8604982
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataa-ttgagcaaaacacataagta 124  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||| || |||||    
T  8604872 caacatatctaattcaacaaaacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcacaatccatcaatttgagcaaaactcacaagta 8604971  T
Q  125 tccattttcac 135  Q
     ||||||||||    
T  8604972 cccattttcac 8604982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 126 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 17523174 - 17523006
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatc-acttaac 224  Q
    ||||||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||| |||| | || ||  ||||| |    
T  17523174 ccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcataaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaaaattgacttagc 17523076  T
Q  225 aacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||    
T  17523075 aacaacaacatcaattggtcatgaaacttatcacaattcatcaataacatagcataattcaccaattgag 17523006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 13326739 - 13326640
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataa-ttgagcaaaacacataagta 124  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||  || ||||||||||| ||||||||    
T  13326739 caacatatctaattcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcacaattcatcaatttgagcaaaactcataagta 13326640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Original strand, 14301029 - 14301196
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||| || |||| | |||| | |||||||||||  |||    
T  14301029 attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaacatgaatcatgcaaaccaaagacatgaataatcatcaacaacatcacttagaaac 14301128  T
Q  228 aacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgag 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  14301129 aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgag 14301196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 53898721 - 53898572
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    |||||||| || ||||| |||||  |||| ||||||| |||| |||||||||| |||||| || | | ||||| || || ||||||||||||  ||||||    
T  53898721 caacaacatctcatttctcaacat-aaatcatgaatcttgcaaacccaagccatgaattatcaccaacaacatgacatatcaacaacaacattaattgat 53898623  T
Q  244 catgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||||||  ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53898622 catgaaacttatcacaatgcaacaacaacaatgcataattcaccaattgag 53898572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 6146987 - 6146863
Alignment:
Q  169 aaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaa 268  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||| ||||||  ||| | ||||| |||||||||||||| || | ||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  6146987 aaatcatgaatcatgaa-acccaagccatgaattattatcaacaacatgacttaacaacaacagcaacaattgaccatgaaacttatcacaattcatcaa 6146889  T
Q  269 caaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||    
T  6146888 caacaatgcatgattcaccaattgag 6146863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 11882417 - 11882308
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||| ||  ||||  ||||||| | ||||||     
T  11882417 caacatatctaattcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacgcaatatctcaattcatcaatttggcaaaactcgtaagtac 11882318  T
Q  126 ccattttcac 135  Q
    ||||||||||    
T  11882317 ccattttcac 11882308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16182209 - 16182065
Alignment:
Q  147 caacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcat 246  Q
    ||||| || ||||| |||||||||   | |||| ||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||| || |||||||||| | |||||||||    
T  16182209 caacatctcatttctcaacaacaatccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaaaacaacaacaacaattgatcat 16182110  T
Q  247 gaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
     |||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  16182109 taaacttatcacaattcatcaacgacaatgcataattcaccaatt 16182065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 14059480 - 14059339
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    |||||||| || ||||| || ||||| || |||||| ||||| |||||||||| |||||| |||| | |||||||| || |||||| |||||| |||||     
T  14059480 caacaacatctcatttctcatcaacagatcatgaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacatagcaacaataacatcaattgaa 14059381  T
Q  244 catgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 285  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  14059380 catgaatattatcacaattcaacaacaacatagcataattca 14059339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 272
Target Start/End: Original strand, 15876032 - 15876176
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| || | |||||| |||||| ||| ||||| |||||| |||| | |||  | ||||||||||| ||||    
T  15876032 atttttaccaaactaccaacaccaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaatacctaagccatgaatcatcattaacaacatcacttaccaac 15876131  T
Q  228 aacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaac 272  Q
    ||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||| |||||||    
T  15876132 aacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaac 15876176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 272
Target Start/End: Original strand, 16880133 - 16880231
Alignment:
Q  174 atgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaac 272  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||   |||||||||||| |||||||    
T  16880133 atgaattatgcacacccaagccatgaattatcatccacaacatcacttagcaacaataacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaac 16880231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 242
Target Start/End: Original strand, 19946679 - 19946776
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattga 242  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||| |||| | ||||| || || ||||||||||||| |||||    
T  19946679 caacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 19946776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 291
Target Start/End: Original strand, 17938584 - 17938701
Alignment:
Q  174 atgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaacc 273  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||| |  ||| | ||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||| || |||||||     
T  17938584 atgaatcatgtaaacccaagccatgaatgattatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaaataaccacaatccaacaacaaca 17938683  T
Q  274 atgcataattcaccaatt 291  Q
    | |||||||||| |||||    
T  17938684 aagcataattcatcaatt 17938701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 34439513 - 34439460
Alignment:
Q  241 gatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34439513 gatcatgaaacttatcataattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 34439460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38811275 - 38811170
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    ||||||||||| |||||  | || ||||  |||||| ||||| |||||||||| |||| | |||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  38811275 caacaacaactcatttctgatcatcaaaacatgaattatgcacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 38811176  T
Q  244 catgaa 249  Q
    ||||||    
T  38811175 catgaa 38811170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 47785014 - 47784922
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatc 236  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| |  | | | |||||||||||||||||||||||||    
T  47785014 caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttaacaacaacaacatc 47784922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3576708 - 3576613
Alignment:
Q  141 taacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatc 236  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| | || ||| || || ||||| |||||||||||||    
T  3576708 taacaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaaccacaatattacttagcaacaacaacatc 3576613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 286
Target Start/End: Original strand, 8631801 - 8631912
Alignment:
Q  175 tgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaacca 274  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | |||| | ||||| || || ||||||||||||| |||  | ||||||  ||||||||| || ||||||| |    
T  8631801 tgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatttgttatgaaacttatcacaatccaacaacaacaa 8631900  T
Q  275 tgcataattcac 286  Q
     |||||||||||    
T  8631901 agcataattcac 8631912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9591041 - 9590918
Alignment:
Q  124 atccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaa 223  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||  ||| | ||||||| || |||| | || | | || |||||||||    
T  9591041 atccatttttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgaactatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatcacttaa 9590942  T
Q  224 caacaacaacatctattgatcatg 247  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||    
T  9590941 caacaacaacatcaattgaacatg 9590918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 294
Target Start/End: Original strand, 28558271 - 28558301
Alignment:
Q  264 atcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28558271 atcaacaaccatgcataattcaccaattgag 28558301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 35)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 26 - 293
Target Start/End: Original strand, 274305 - 274572
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  274305 caacatatctacttcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtat 274404  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  274405 ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgattcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaaca 274504  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattga 293  Q
    | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  274505 ataacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattga 274572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 26 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 641544 - 641277
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  641544 caacatatctacttcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtat 641445  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  641444 ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgattcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaaca 641345  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattga 293  Q
    | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  641344 ataacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattga 641277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 26 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 827350 - 827083
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  827350 caacatatctacttcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtat 827251  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  827250 ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgattcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaaca 827151  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattga 293  Q
    | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  827150 ataacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattga 827083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16039274 - 16039000
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  16039274 caacatatctaattcaacaatacttcatttagacatgaattcaaccatcattcaacaacacaatatcctaatccaacaattgagcaaaacacataagtac 16039175  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16039174 ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatatccaagccataaattagcatccataacatcacttaaca 16039075  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16039074 acaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcactaattgagcataat 16039000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24386137 - 24385871
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24386137 caacatatctacttcaaccgcacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatattccaatccaacaattgagcaaaacacataagtat 24386038  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaac-aaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaac 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24386037 ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttacttcataacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataaaatcacttaac 24385938  T
Q  225 aacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||         || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  24385937 aacaacaacatctattgatc---------attacaattcatcaacaacaatgcttaattcaccaattgagcataat 24385871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 294
Target Start/End: Original strand, 20481466 - 20481735
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataatt-gagcaaaacacataagta 124  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||  |||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  20481466 caacatatctacttcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattaaaaaacacaatataacaatccaacaatttgagcaaaactcataagta 20481565  T
Q  125 tccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaac 224  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||| |||||||    
T  20481566 cccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatcaacaacatgacttaac 20481665  T
Q  225 aacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  20481666 aacaacaacatcaattgatcatgcaacttatcacaattcatcaacaacaaagtataattcaccaattgag 20481735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Original strand, 39115138 - 39115411
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||     
T  39115138 caacatatctaattcaagaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatattccaatccaacaattgagcaaaactcataaatac 39115237  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
     |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||| |  | || ||| ||||    
T  39115238 tcattttcaccaacc-aacaataacaatttatttctcaacaataaattatgaatcatgcatacacaagtcatgaattatcatcaaccatatgactaaaca 39115336  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  39115337 acaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacgattcatcaacaactatgcataattcaccaattgagcataat 39115411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 156 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 41507072 - 41506928
Alignment:
Q  156 atttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatat 255  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | || || ||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  41507072 atttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatat 41506973  T
Q  256 cacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41506972 cacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 41506928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 130 - 291
Target Start/End: Original strand, 41246624 - 41246785
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 229  Q
    ||||||||||  | ||||||||  | ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||||||    
T  41246624 tttcaccaaaacaccaacaacatttcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaa 41246723  T
Q  230 caacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41246724 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatt 41246785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20573474 - 20573309
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| || || ||||    
T  20573474 attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaac 20573376  T
Q  228 aacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||    
T  20573375 aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaggataattcaccaattgag 20573309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 162 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24717119 - 24716981
Alignment:
Q  162 caacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaat 261  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || | |||| | || || ||| |||| |||||||| | ||||| ||||||| | ||||||||    
T  24717119 caacaacaaattatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacatcaacaacaaccattgaacatgaaacaaatcacaat 24717020  T
Q  262 tcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24717019 tcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 24716981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 128 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 39447048 - 39446892
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||  ||| | ||||||||||| ||||    
T  39447048 atttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcat-aatcatgcatacccaagccatgaattattatcaacaacatcacttagcaac 39446950  T
Q  228 aacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 285  Q
    ||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  39446949 aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattca 39446892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 126 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19993339 - 19993171
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||||||||  | |||||||| || ||||| |||||||||   | |||| ||||| |||| ||||| |||||| |||| | ||||| ||| ||||    
T  19993339 ccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaatccaagaattatgcaaaccctagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca 19993240  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19993239 acaacaacaacaattgatgatgaaatttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 19993171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 162 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22235052 - 22234920
Alignment:
Q  162 caacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaat 261  Q
    ||||||||||  | |||| ||||| |||||| ||| |||||| |||| | ||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  22235052 caacaacaaaccaagaattatgcaaacccaatccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaat 22234953  T
Q  262 tcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22234952 tcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 22234920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 128 - 283
Target Start/End: Original strand, 21680966 - 21681121
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||| |||||| || |||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| || ||      
T  21680966 atttttaccaaaataccaacaacatcttatttctccacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacataccagt 21681065  T
Q  228 aacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataatt 283  Q
    ||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  21681066 aacaacatcaattgatcatgaaactaatcacaattcaacaacaacaaagcataatt 21681121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 164 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 20648076 - 20647949
Alignment:
Q  164 acaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattc 263  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||| |||| | ||||| || || ||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  20648076 acaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattaacatcaacaacatgacctagcaacaacgacatcaattgatcatgaaacttatcacaattc 20647977  T
Q  264 atcaacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||    
T  20647976 atcaacaacatagcataattcaccaatt 20647949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 164 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 20654152 - 20654025
Alignment:
Q  164 acaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattc 263  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||| |||| | ||||| || || ||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  20654152 acaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagcaatgaattaacatcaacaacatgacctagcaacaacgacatcaattgatcatgaaacttatcacaattc 20654053  T
Q  264 atcaacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||    
T  20654052 atcaacaacttagcataattcaccaatt 20654025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 169 - 294
Target Start/End: Original strand, 37611674 - 37611798
Alignment:
Q  169 aaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaa 268  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||| |||||| |||| |  |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  37611674 aaatcatgaattatgca-acccaagccatgaattatcatcaaccacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaa 37611772  T
Q  269 caaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||| | |||||||||||||||||||    
T  37611773 caacaaagcataattcaccaattgag 37611798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 285
Target Start/End: Original strand, 38533629 - 38533770
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||| |||| | |||||||| || ||||||||||||| |||||     
T  38533629 caacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacctagcaacaacaacatcaattgaa 38533728  T
Q  244 catgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 285  Q
    ||||||    ||||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  38533729 catgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcataattca 38533770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 130 - 291
Target Start/End: Original strand, 23837164 - 23837325
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 229  Q
    |||||| |||| | || |||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||| | || | | ||||||||||| ||||||    
T  23837164 tttcacaaaaccaccaccaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaa 23837263  T
Q  230 caacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
    ||||||| ||||| |||||    || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  23837264 caacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 23837325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 246
Target Start/End: Original strand, 25122542 - 25122618
Alignment:
Q  169 aaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcat 246  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25122542 aaatcatgaatcatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatctattgatcat 25122618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20567440 - 20567333
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| || || ||||    
T  20567440 attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaac 20567342  T
Q  228 aacaacatc 236  Q
    |||||||||    
T  20567341 aacaacatc 20567333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20573633 - 20573526
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| || || ||||    
T  20573633 attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaac 20573535  T
Q  228 aacaacatc 236  Q
    |||||||||    
T  20573534 aacaacatc 20573526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 38635917 - 38635823
Alignment:
Q  142 aacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatc 236  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||| | || | | || ||| ||||||||||||||||||    
T  38635917 aacaacaacaacttgtttctcatcaacaaattatgattcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatc 38635823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22736105 - 22735977
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    ||||||||||| ||||  || |||||| | |||||| ||||| |||||||||| |||||| || | | ||||||| ||| ||| ||||||||| |||||     
T  22736105 caacaacaactcatttttcatcaacaattcatgaattatgcacacccaagccatgaattaacaacaacaacatcagttagcaagaacaacatcaattgaa 22736006  T
Q  244 catgaaaaatatcacaattcatcaacaac 272  Q
    ||||||   ||||||||| || |||||||    
T  22736005 catgaatcttatcacaatccaacaacaac 22735977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 20561810 - 20561751
Alignment:
Q  232 acatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  20561810 acatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaatt 20561751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20567281 - 20567202
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatc 208  Q
    ||||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  20567281 attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatc 20567202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 272
Target Start/End: Original strand, 5854587 - 5854722
Alignment:
Q  137 aaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatc 236  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| || || ||||| |||| | ||| | |||||||||| |||| | || | | || |||||||| |||||||||||||    
T  5854587 aaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatc 5854686  T
Q  237 tattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaac 272  Q
     ||||| ||||||    ||||||||||| |||||||    
T  5854687 aattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaac 5854722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 248
Target Start/End: Original strand, 23149754 - 23149865
Alignment:
Q  137 aaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatc 236  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  || || ||||| |||||| ||| |||| ||||||| |||| | || | | ||||||||||| |||||| |||| |    
T  23149754 aaaccaacaacaacaactcatttttcatcatcaaatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaaaaacaac 23149853  T
Q  237 tattgatcatga 248  Q
    |||||| |||||    
T  23149854 tattgaacatga 23149865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23226319 - 23226240
Alignment:
Q  168 caaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatg 247  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||| |||| | || | | || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23226319 caaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaacaacatcaattgaacatg 23226240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 272
Target Start/End: Original strand, 26011467 - 26011602
Alignment:
Q  137 aaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatc 236  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| || || ||||| |||| | ||| | |||||||||| |||| | || | | || |||||||| |||||||||||||    
T  26011467 aaaccaacaacaacaacttaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatc 26011566  T
Q  237 tattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaac 272  Q
     ||| | ||||||    ||||||||||| |||||||    
T  26011567 aattcaacatgaatctcatcacaattcaacaacaac 26011602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27233352 - 27233242
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||  | ||||| |||| | ||| | |||||||||| |||| | || | | || ||| |||||||    
T  27233352 ccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcattatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaaca 27233253  T
Q  226 acaacaacatc 236  Q
    |||||||||||    
T  27233252 acaacaacatc 27233242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 196
Target Start/End: Original strand, 29759904 - 29759974
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagcca 196  Q
    |||||| |||||||  | |||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  29759904 ccatttacaccaaaacaccaacaacaaaccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagcca 29759974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 18041817 - 18041780
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcaca 163  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18041817 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcaca 18041780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 163
Target Start/End: Original strand, 33172190 - 33172227
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcaca 163  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  33172190 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcaca 33172227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 42056683 - 42056408
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  42056683 caacatatctacttcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataattat 42056584  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaac-aaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  42056583 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataatatcacttaac 42056484  T
Q  225 aacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42056483 aacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 42056408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Original strand, 2028782 - 2029057
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2028782 caacatatctacttcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatccaaatccaacaattgagcaaaacacataagtat 2028881  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaac-aaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaac 224  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  2028882 ccattttcatcaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagtcatgaattagcatccataacatcacttaac 2028981  T
Q  225 aacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  2028982 aacgacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcataat 2029057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 26 - 294
Target Start/End: Original strand, 3894887 - 3895155
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  3894887 caacatatctaattcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatttcaatccaacaattgagcaaaactcataagtac 3894986  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3894987 tcattttcaccaaaccaacaacaacaacttattttacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaaca 3895086  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  3895087 acaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgag 3895155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 2190569 - 2190305
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||            |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2190569 caacatatctacttcaacaacacttcatgtagacatgaattcaac-----------aacacaatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtat 2190481  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaa-ttatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2190480 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttacttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaac 2190381  T
Q  225 aacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2190380 aacatcaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 2190305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 32494439 - 32494165
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  32494439 caacatatctaattcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcccaatccaacaattgagcaaaactcataagtac 32494340  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| || | || ||| ||||    
T  32494339 ccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacacaagccatgaattatcatcaatcatatgactaaaca 32494240  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32494239 acaacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 32494165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Original strand, 3049450 - 3049719
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataa-ttgagcaaaacacataagta 124  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  3049450 caacatatctacttcaacaacacttcatttaggcatgaattcaaccataattcaacaacacaatgttccaatccaacaatttgagcaaaactcataagta 3049549  T
Q  125 tccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaac 224  Q
     |||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3049550 cccattttcacgaa------aacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaac 3049643  T
Q  225 aacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||    
T  3049644 aacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcataat 3049719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 111661 - 111388
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  111661 caacatgtctatttcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacaccatatcccaatccaacaattgagcaaaactcataagtac 111562  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |  | || ||| ||||    
T  111561 tcattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaatt-tgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaaca 111463  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  111462 acaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 111388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 26070649 - 26070384
Alignment:
Q  27 aacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataatt-gagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||     
T  26070649 aacatatctaaatcaacaatacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatctcaatccaacaatttgagcaaaactcataagtac 26070550  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||| ||    
T  26070549 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagca 26070450  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  26070449 acaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaatt 26070384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 26094436 - 26094171
Alignment:
Q  27 aacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataatt-gagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||     
T  26094436 aacatatctaaatcaacaatacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatctcaatccaacaatttgagcaaaactcataagtac 26094337  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||| ||    
T  26094336 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagca 26094237  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  26094236 acaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaatt 26094171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12370226 - 12369957
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataatt-gagcaaaacacataagta 124  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||| |||||| | |||| ||||||||| ||||||||    
T  12370226 caacatatctaattcaacaacacttcatttagacatgaactcaaccataattcaaccacacaatatctcaatcccacaatttgagcaaaactcataagta 12370127  T
Q  125 tccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaac 224  Q
     ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |  || || ||||||||||| |    
T  12370126 cccattttcaccaaaccaacaactacaacttatttctcaataacaaatcatgaatcatgcatacctaagccatgaataattatgcacaacatcacttagc 12370027  T
Q  225 aacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  12370026 aacaacaacatcaattaatcatgaaagttatcacaattcaacaacaacaaggcataattcaccaattgag 12369957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Original strand, 11287381 - 11287547
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||| ||||    
T  11287381 attttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaac 11287480  T
Q  228 aacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  11287481 aacaacatcaactgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgag 11287547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 127 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 39046907 - 39046740
Alignment:
Q  127 cattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaa 226  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| || ||||| |||||||| || | |||| ||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||| |||||    
T  39046907 cattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacagatcaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaa 39046808  T
Q  227 caacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39046807 caacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 39046740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 126 - 300
Target Start/End: Original strand, 126377 - 126551
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    |||||||| |||||  | |||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | || | |||| | |  || ||| ||||    
T  126377 ccattttctccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacagtatgactaaaca 126476  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  126477 acaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 126551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 63 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13863279 - 13863046
Alignment:
Q  63 aattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataatt-gagcaaaacacataagtatccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttca 161  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13863279 aattcaaccataattcaacaacacaatatcccaatccaacaatttgagcaaaactcataagtacccattttcatcaaaccaacaacaacaacttatttca 13863180  T
Q  162 caacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaat 261  Q
    ||  | ||||| ||  || ||| | |||||||||| | || |  | | | || |||||||| ||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||||    
T  13863179 cattatcaaatcattgattatgaacacccaagccatgcatcattaacaacaatatcacttagcaacaacaacaacaattgaacatgaatattatcacaat 13863080  T
Q  262 tcatcaacaaccatgcataattc-accaattgag 294  Q
    ||| |||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  13863079 tcaacaacaacatagcataattcaaccaattgag 13863046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12248404 - 12248237
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||||| ||||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  12248404 attttcatcaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagtcatgcattatcatccacaacatcacttagcaac 12248305  T
Q  228 aacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgag 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  12248304 aacaacatccattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgag 12248237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 146 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16570271 - 16570122
Alignment:
Q  146 acaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatca 245  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16570271 acaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatccacgacatcacttagcaacaacaacatcaattgatca 16570172  T
Q  246 tgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgag 294  Q
    |||||  |||| ||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  16570171 tgaaacttatctcaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgag 16570122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 146 - 294
Target Start/End: Original strand, 16595391 - 16595540
Alignment:
Q  146 acaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatca 245  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16595391 acaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatccacgacatcacttagcaacaacaacatcaattgatca 16595490  T
Q  246 tgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgag 294  Q
    |||||  |||| ||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  16595491 tgaaacttatctcaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgag 16595540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 128 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 49047957 - 49047813
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || | | ||||||||||| ||||    
T  49047957 atttttaccaaactaccaacaacatctcgtttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcagcaacaacatcacttagcaac 49047858  T
Q  228 aacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaac 272  Q
    ||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| |||||||    
T  49047857 aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaac 49047813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Original strand, 13274751 - 13274918
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||| | |||| | ||||||||||| ||||    
T  13274751 atttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaacatgaatcatgcataccaaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaac 13274850  T
Q  228 aacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgag 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  13274851 aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgag 13274918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 130 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15822712 - 15822548
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 229  Q
    ||||||||||  | |||||||| || ||||| |||| |||||  |||||||||||| |||||||||| |||| | |||| | ||||| || || ||||||    
T  15822712 tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaa 15822613  T
Q  230 caacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  15822612 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccatttgag 15822548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 294
Target Start/End: Original strand, 35094780 - 35094946
Alignment:
Q  127 cattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaa 226  Q
    |||||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||||||||| | |||| ||||| |||||||||| || ||| |||| | ||||| ||| |||||    
T  35094780 cattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcaagaattatgcaaacccaagccatgatttatcatcaacaacatgactaaacaa 35094879  T
Q  227 caacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||| || | ||||||||||||| || | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  35094880 caacagcaac-attgatcatgaaacatttaacaattcatcaacaacagtgcataattcaccaattgag 35094946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 7284326 - 7284180
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| || ||||||| ||||||  ||| | ||||| || || ||||||||||||| ||||||    
T  7284326 caacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaactcaagccatgaattattatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgat 7284228  T
Q  244 catgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||    
T  7284227 catgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaggataattcaccaatt 7284180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 300
Target Start/End: Original strand, 13377491 - 13377666
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||| |||| | ||| | |||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||| ||    
T  13377491 ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacattacttagca 13377590  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaa-ttgagtataat 300  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||| |||||||   |||||||| | ||| |||||||||||    
T  13377591 acaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattaatcaatttgagtataat 13377666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 167 - 294
Target Start/End: Original strand, 12758990 - 12759117
Alignment:
Q  167 acaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatc 266  Q
    |||||| || |||| |||| |||||||||| |||||| || | | ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||| |||||| |    
T  12758990 acaaatcataaatcctgcaaacccaagccatgaattatcaccaacaacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcataattcacc 12759089  T
Q  267 aacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||    
T  12759090 aacaacatagcataattcaccaattgag 12759117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 169 - 294
Target Start/End: Original strand, 47289787 - 47289911
Alignment:
Q  169 aaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaa 268  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| |||||| ||||   ||||| |||||||| ||||| || | |||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  47289787 aaatcatgaatcatgca-acacaagccatgaattatcatcatcaacatgacttaacagcaacagcaacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaa 47289885  T
Q  269 caaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||| | |||||||||||||||||||    
T  47289886 caacaaagcataattcaccaattgag 47289911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17224205 - 17224048
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||| | |||  | ||||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  17224205 caacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcattaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 17224106  T
Q  244 catgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaa-ttgagtataat 300  Q
    |||||    ||  |||||||| |||||||   |||||||||| ||| |||||||||||    
T  17224105 catgactcttacaacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagtataat 17224048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 45452410 - 45452305
Alignment:
Q  167 acaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatc 266  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||| |||||| |||| | ||||| || || ||||||||||  | |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  45452410 acaaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacgacaattgatcatgaaacttatcacaattcatc 45452311  T
Q  267 aacaac 272  Q
    ||||||    
T  45452310 aacaac 45452305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 222 - 294
Target Start/End: Original strand, 44865288 - 44865360
Alignment:
Q  222 aacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  44865288 aacaacaacaacaacaattaatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaaaatgcataattcaccaattgag 44865360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 294
Target Start/End: Original strand, 143651 - 143769
Alignment:
Q  169 aaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaa 268  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||| |||||| |||  | ||||| |||||||||||||||      ||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  143651 aaatcatgaattatgca-acccaagccatgaattatcattaacaacatgacttaacaacaacaa------ttgatcatgaaacttttcacaattcatcaa 143743  T
Q  269 caaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||| | |||||||||||||||||||    
T  143744 caacaaagcataattcaccaattgag 143769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1937177 - 1937131
Alignment:
Q  254 atcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1937177 atcataattcatcaacaaccatacataattcaccaattgagcataat 1937131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 13866150 - 13866110
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaatt 66  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13866150 caacatatctaattcaacaacacttcatttagacatgaatt 13866110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 177
Target Start/End: Original strand, 14940715 - 14940766
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatga 177  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  14940715 ccatttttacaaaactaacaacaacaacttatttctcatcaacaaatcatga 14940766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 177
Target Start/End: Original strand, 15368308 - 15368359
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatga 177  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  15368308 ccatttttacaaaactaacaacaacaacttatttctcatcaacaaatcatga 15368359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 236
Target Start/End: Original strand, 4484709 - 4484799
Alignment:
Q  146 acaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatc 236  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||| ||||| |||||||||| | |||| | || | | || ||| ||||||||||||||||||    
T  4484709 acaacaacttatttctcatcatcaaatcatgattcatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatc 4484799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20583823 - 20583729
Alignment:
Q  142 aacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatc 236  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||| |||| | ||| | |||||||||| |||| | || | | || ||| ||||||||||||||||||    
T  20583823 aacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcccttaacaacaacaacatc 20583729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 8267997 - 8267960
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcaca 163  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  8267997 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcaca 8267960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 249
Target Start/End: Original strand, 48356617 - 48356729
Alignment:
Q  137 aaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatc 236  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| || || ||||| |||| | ||| | |||||||||| |||| | || | | || |||||||| |||||||||||||    
T  48356617 aaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatc 48356716  T
Q  237 tattgatcatgaa 249  Q
     ||||| ||||||    
T  48356717 aattgaacatgaa 48356729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 33)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15272706 - 15272431
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  15272706 caacatatctacttcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataattat 15272607  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaac-aaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15272606 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaac 15272507  T
Q  225 aacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15272506 aacaacaacatctattgatcatggaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 15272431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12837582 - 12837317
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataatt-gagcaaaacacataagta 124  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  12837582 caacatatctacttcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcccaatccaacaatttgagcaaaactcataagta 12837483  T
Q  125 tccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaac 224  Q
     |||||||||||||||   ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12837482 cccattttcaccaaac---caacaacaacttatttctca-caacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaac 12837387  T
Q  225 aacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||    
T  12837386 aacaacaacatccattgaccatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgag 12837317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 30232903 - 30232613
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataatt-gagcaaaacacataagta 124  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  30232903 caacatatctaattcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacataatatctcaatccaacaatttgagcaaaactcataagta 30232804  T
Q  125 tccattttcaccaaa-------------ct--------aacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaatta 203  Q
     ||||||||||||||             ||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  30232803 cccattttcaccaaaacaacaacaacaacttatttcacaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaataatgcatacccaagccatgaatta 30232704  T
Q  204 gcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||    
T  30232703 acatccataacatcacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgag 30232613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 52265894 - 52265628
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataatt-gagcaaaacacataagta 124  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||  || |||| ||||||||| ||||||||    
T  52265894 caacatatctaattcaacaacacttcattttgacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatctcaatttaacaatttgagcaaaactcataagta 52265795  T
Q  125 tccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaac 224  Q
     ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| | || |   || |||||||| |    
T  52265794 cccattttcaccaaaccaacaacatcaacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacatcaatatcacttagc 52265695  T
Q  225 aacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||    
T  52265694 aacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacattgcataattcaacaatt 52265628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 129 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 53705015 - 53704850
Alignment:
Q  129 ttttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaaca 228  Q
    |||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||||||||  | |||| ||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||| |||||||    
T  53705015 ttttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaaca 53704916  T
Q  229 acaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53704915 acaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 53704850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 23270219 - 23270047
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    |||||||||| |||  | |||||||| || ||||| |||| |||||  |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||    
T  23270219 ccattttcacgaaaacaccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaaca 23270120  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtata 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  23270119 acaacaacatcaattgatcatgatacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcatcaattgagtata 23270047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 55376882 - 55376710
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||| ||||  | ||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| | ||||||    
T  55376882 ccattttcatcaaaacaccaacatcatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacataatttaaca 55376783  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtata 298  Q
    ||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  55376782 acaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgtataattcaccaattgagtata 55376710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 130 - 294
Target Start/End: Original strand, 16732135 - 16732299
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 229  Q
    ||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||| ||||||    
T  16732135 tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaa 16732234  T
Q  230 caacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    | ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  16732235 cgacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgag 16732299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 130 - 294
Target Start/End: Original strand, 34395223 - 34395387
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 229  Q
    |||||| |||| | |||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||| |||| | ||||| || || ||||||    
T  34395223 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatagcaacaa 34395322  T
Q  230 caacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34395323 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 34395387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 126 - 300
Target Start/End: Original strand, 14951724 - 14951898
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||   || | |||| | || || ||| || |    
T  14951724 ccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaatatgactaaata 14951823  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14951824 acaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 14951898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 130 - 294
Target Start/End: Original strand, 44055881 - 44056045
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 229  Q
    ||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | |||||  || ||| ||||    
T  44055881 tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatggctaaaccacaa 44055980  T
Q  230 caacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  44055981 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaattgag 44056045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 156 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21959718 - 21959580
Alignment:
Q  156 atttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatat 255  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| |||| | ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  21959718 atttctcaaccacaaactatgaatcatgcaagcccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacttat 21959619  T
Q  256 cacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  21959618 cacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgag 21959580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 130 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 25119497 - 25119333
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaa-ttatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaaca 228  Q
    |||||| |||| | |||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | || |  ||| | || || ||| |||||||    
T  25119497 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaaattatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcattatcaacaatatgactaaacaaca 25119398  T
Q  229 acaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattga 293  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25119397 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaaaaaccatgcataattcaccaattga 25119333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 169 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 820154 - 820033
Alignment:
Q  169 aaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaa 268  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  820154 aaatcatgaatcatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaaca---attgatcatgaaacttatcacaattcatcaa 820059  T
Q  269 caaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  820058 caacaatgcataattcaccaattgag 820033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 128 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 13809793 - 13809636
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||| | ||||||| ||| ||||    
T  13809793 atttttaccaaactactaacaacatctcatttctcaacaaccaatcatgaatcatgcatatccaagccatgaattatcatcaacaacatcaattagcaac 13809694  T
Q  228 aacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 285  Q
    ||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  13809693 aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattca 13809636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 128 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18494611 - 18494467
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||    
T  18494611 attttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaagtcatgaatcatgcatacccaagccatgagttaccatcaacaacatcacttaacaac 18494512  T
Q  228 aacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaac 272  Q
    |||| || | ||||||||||||   || ||||||||| |||||||    
T  18494511 aacagcaacaattgatcatgaatcttaacacaattcaacaacaac 18494467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 294
Target Start/End: Original strand, 44346790 - 44346957
Alignment:
Q  127 cattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaa 226  Q
    |||||||||||||  |  ||||||  || ||||| ||||||||||  | |||| ||||| |||||||||| |||||| |||| |  |||||||| |||||    
T  44346790 cattttcaccaaaacacaaacaacgtctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacgacatcactaaacaa 44346889  T
Q  227 caacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  44346890 caacaacaacatttgatcatgaaacatatcacaattcatgaacaacaatgtataattcaccaattgag 44346957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 53907980 - 53907818
Alignment:
Q  127 cattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaa 226  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| || ||||| ||||||||||  | |||| ||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||| | |||    
T  53907980 cattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaatcaa 53907881  T
Q  227 caacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattg 292  Q
    ||||||||   ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53907880 caacaaca---attgatcatgaaacatttcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattg 53907818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 169 - 294
Target Start/End: Original strand, 30457909 - 30458033
Alignment:
Q  169 aaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaa 268  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||| |||||| |||| |  |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30457909 aaataatgaattatgca-acccaagccatgaattatcatcaaccacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaa 30458007  T
Q  269 caaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||    
T  30458008 caacaatgcgtaattcaccaattgag 30458033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 128 - 271
Target Start/End: Original strand, 27960936 - 27961078
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||| ||||||||| |||||| | || ||||| |||||| |||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  27960936 atttttaccaaactaccaacaatatctcatttctcaacaataaatcat-aatcatgcatacccaaaccatgaattatcatcaacaacatcacttaacaac 27961034  T
Q  228 aacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaa 271  Q
    ||||||||| ||||||||||||   ||| |||||||| ||||||    
T  27961035 aacaacatcaattgatcatgaatcttataacaattcaacaacaa 27961078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 130 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5682816 - 5682646
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 229  Q
    |||||| |||| | |||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||   || | |||| | || || | | || |||||    
T  5682816 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagacatatatcatcatcaacaatatgaataaaaaacaa 5682717  T
Q  230 caacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||| | | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5682716 caacaaccaataatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 5682646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 126 - 291
Target Start/End: Original strand, 15044790 - 15044955
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||| |||| | ||| | |||||||||| |||| | |||| | ||||||||||| ||    
T  15044790 ccattttcaccaaagcaacaacaacaatttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagca 15044889  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  15044890 acaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatt 15044955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 222 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 8872660 - 8872588
Alignment:
Q  222 aacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  8872660 aacaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaacgcataattcaccaattgag 8872588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15109634 - 15109459
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||| |||| | ||| | |||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||| ||    
T  15109634 ccattttcaccaaagcaacaacaacaatttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacattacttagca 15109535  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaa-ttgagtataat 300  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||| |||||||   |||||||| | ||| |||||||||||    
T  15109534 acaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataatttatcaatttgagtataat 15109459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 15851722 - 15851595
Alignment:
Q  47 acttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataa-ttgagcaaaacacataa-gtatccattttcaccaaactaac 144  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||| ||  || ||||||||||| || || ||| |||||||||| |||| |||    
T  15851722 acttcatttaaacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcataattcatcaatttgagcaaaactcacaaggtacccattttcacaaaaccaac 15851623  T
Q  145 aacaacaacttatttcacaacaacaaat 172  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||    
T  15851622 aacaacaacttatttcacatcatcaaat 15851595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 167 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 45459099 - 45458973
Alignment:
Q  167 acaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatc 266  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| | |||| | || | ||||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||| |    
T  45459099 acaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcttcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattggtcatgaaacttatcacaattcaac 45459000  T
Q  267 aacaaccatgcataattcaccaattga 293  Q
    |||| | | ||||||||||||||||||    
T  45458999 aacagcaaagcataattcaccaattga 45458973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 19822039 - 19821940
Alignment:
Q  148 aacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatg 247  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||| | || | | |||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||    
T  19822039 aacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacatagcaacaacaacatcaattgaacatg 19821940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15675303 - 15675221
Alignment:
Q  212 aacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||| |||||||   ||| |||||||||||||||    
T  15675303 aacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgag 15675221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 300
Target Start/End: Original strand, 31115678 - 31115766
Alignment:
Q  212 aacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||| |||||||   | | ||||||||||||||| |||||    
T  31115678 aacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttaggaaaattcaccaattgagcataat 31115766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10104452 - 10104382
Alignment:
Q  224 caacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||| |||||||   ||| |||||||||||||||    
T  10104452 caacaacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgag 10104382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 41166211 - 41166109
Alignment:
Q  146 acaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatca 245  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| || | | ||| |||||||||||| || | | || | | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  41166211 acaacaactcatttctcatcaacaaatcataagttatgaatacccaagccatgattcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaaca 41166112  T
Q  246 tga 248  Q
    |||    
T  41166111 tga 41166109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 37957292 - 37957187
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    ||||||||||| ||||  || |||||||| |||||| ||||| |||||||||  |||||| ||   | ||||||||||| || |||| ||||| |||||     
T  37957292 caacaacaactcatttatcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccgtgaattatcaataacaacatcacttagcagcaaccacatcaattgaa 37957193  T
Q  244 catgaa 249  Q
    ||||||    
T  37957192 catgaa 37957187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 41917011 - 41916974
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcaca 163  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  41917011 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcaca 41916974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Original strand, 94837 - 95111
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  94837 caacatatctactccaacaacacttcatttagacatgaattcaatcataattcaacaacacaatatcacaatccaacaattgagcaaaacacataagtat 94936  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  94937 ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaaaccatgaattagcatccataacatcacttatca 95036  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  95037 acaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcactaattgagcataat 95111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 29 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25106 - 24845
Alignment:
Q  29 catatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtatcca 128  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||    ||||||  ||    
T  25106 catatccaattcaacaacacttcatttaaacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcccaattcaacaattgagcgaaa----taagtactca 25011  T
Q  129 ttttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaaca 228  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25010 ttttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgaatacccaagccaagaattaacatccataacatcacttaacaaca 24911  T
Q  229 acaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  24910 acaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgag 24845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Original strand, 55442 - 55717
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55442 caacatatctacttcaacaacacttcacttagacatgaattgaaccataattcaacaacacaatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtat 55541  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaa-ttatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaac 224  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  55542 ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttattttacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaac 55641  T
Q  225 aacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55642 aacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 55717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 30)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21274441 - 21274168
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21274441 caacatatctacttcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtat 21274342  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaa-ttatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaac 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21274341 ccattttcaccaaaccaacaaca-caacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgc-tacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaac 21274244  T
Q  225 aacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21274243 aacaacaacatctattgatcatgaaacatattacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 21274168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 9653279 - 9653015
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  9653279 caacatatctaattcaacaacacttcatttagacatgaattcaac-----------aacacaatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataattat 9653191  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaa-ttatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaac 224  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9653190 tcattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaac 9653091  T
Q  225 aacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9653090 aacatcaacatctattgatcatgaaaaatatcgcaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 9653015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 36891071 - 36890805
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataatt-gagcaaaacacataagta 124  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  36891071 caacatatctaattcaacaatacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcccaatccaataatttgagcaaaactcataagta 36890972  T
Q  125 tccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaac 224  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||| |    
T  36890971 cccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcaacaacaaatcaagaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagc 36890872  T
Q  225 aacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||    
T  36890871 aacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacatagcataattcaccaatt 36890805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25876305 - 25876036
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataatt-gagcaaaacacataagta 124  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  25876305 caacatatctaattcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcccaatccaacaatttgagcaaaactcataagta 25876206  T
Q  125 tccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaac 224  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   | |||| ||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||| |||    
T  25876205 cccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaataacaagccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaac 25876106  T
Q  225 aacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    || ||||||| |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25876105 aataacaacaacatttgatcatgaagcatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 25876036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 160
Target Start/End: Original strand, 16935457 - 16935591
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  16935457 caacatatctaattcaacaatacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatattccaatccaacaattgagcaaaactcataagtac 16935556  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttc 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16935557 ccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttc 16935591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 160
Target Start/End: Original strand, 17006117 - 17006251
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  17006117 caacatatctaattcaacaatacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatattccaatccaacaattgagcaaaactcataagtac 17006216  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttc 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17006217 ccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttc 17006251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 294
Target Start/End: Original strand, 32465824 - 32465988
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 229  Q
    ||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||| ||||||||    
T  32465824 tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaa 32465923  T
Q  230 caacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  32465924 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaagaacaatgcataattcaccaattgag 32465988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23821992 - 23821767
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataatt-gagcaaaacacataag-t 123  Q
    ||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||  |||| ||||||||| || ||| |    
T  23821992 caacatatctaattcaacaatacttaatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcacaattcatcaatttgagcaaaactcacaaggt 23821893  T
Q  124 atccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaa 223  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||| | ||||| |||| |||| | || | | || ||||||||     
T  23821892 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccatgccatgaatcatcaacaacaatatcacttag 23821793  T
Q  224 caacaacaacatctattgatcatgaa 249  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  23821792 caacaacaacatcaattgaacatgaa 23821767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23831071 - 23830846
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataatt-gagcaaaacacataag-t 123  Q
    ||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||  |||| ||||||||| || ||| |    
T  23831071 caacatatctaattcaacaatacttaatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcacaattcatcaatttgagcaaaactcacaaggt 23830972  T
Q  124 atccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaa 223  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||| | ||||| |||| |||| | || | | || ||||||||     
T  23830971 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccatgccatgaatcatcaacaacaatatcacttag 23830872  T
Q  224 caacaacaacatctattgatcatgaa 249  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  23830871 caacaacaacatcaattgaacatgaa 23830846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 126 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23836990 - 23836822
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||| ||||  | |||||||| || ||||| ||||||||||| | |||| ||||| ||||||| || |||||| |||| | || || ||| ||||    
T  23836990 ccattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcaagaattatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaaaatgactaaaca 23836891  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23836890 acaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 23836822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 294
Target Start/End: Original strand, 28974029 - 28974179
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  28974029 caacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaattgat 28974128  T
Q  244 catgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||    
T  28974129 catgaaacttaccacaattcatcaacaacatagcataattcgccaaatgag 28974179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Original strand, 271135 - 271300
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||||||||||  | |||||||| || ||| | ||||| ||||| |||||||||||| |||||||| | |||||| |||| | ||||| || || ||||    
T  271135 attttcaccaaagcaccaacaacatctcattcctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagctatgaattatcatcaacaacatgacatatcaac 271233  T
Q  228 aacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  271234 aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaattgag 271300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 135
Target Start/End: Original strand, 19659927 - 19660037
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataa-ttgagcaaaacacataagta 124  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||    
T  19659927 caacacatctaattcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcccaattcaacaatttgagcaaaactcataaata 19660026  T
Q  125 tccattttcac 135  Q
     ||||||||||    
T  19660027 cccattttcac 19660037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 130 - 300
Target Start/End: Original strand, 22274689 - 22274858
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 229  Q
    |||||| |||| | |||||||||   ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||   || | |||| | || || ||| |||| |||    
T  22274689 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaattcatgaatcatgca-acccaagccatctatcatcatcaacaatatgactaaacatcaa 22274787  T
Q  230 caacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22274788 caacaaccattgatcatgaaacacatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 22274858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 22580126 - 22579999
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    |||||||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| || || || ||||||| ||||||    
T  22580126 caacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacatatcagcagcaacatcaattgat 22580027  T
Q  244 catgaaaaatatcacaattcatcaacaa 271  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||    
T  22580026 catgaaacttatcacaattcaacaacaa 22579999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 167 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 4448377 - 4448251
Alignment:
Q  167 acaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatc 266  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||| |    
T  4448377 acaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcataattcaac 4448278  T
Q  267 aacaaccatgcataattcaccaattga 293  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||    
T  4448277 aacaacaaagcatcattcaccaattga 4448251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 130 - 300
Target Start/End: Original strand, 22283922 - 22284091
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 229  Q
    |||||| |||| | ||||||||| | ||||| ||||| ||| | |||||||||||| |||||||||| | || | |||| | || |  ||| |||| |||    
T  22283922 tttcacaaaaccaccaacaacaattcatttctcaacagcaattcatgaatcatgca-acccaagccatgtatcatcatcaacaataagactaaacatcaa 22284020  T
Q  230 caacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
     |||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22284021 aaacaacgattgatcatgaaacacatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 22284091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 130 - 294
Target Start/End: Original strand, 25601990 - 25602154
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 229  Q
    |||||| |||| | |||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| || ||| |||  | ||||| || || ||||||    
T  25601990 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacctaagccatgatttatcataaacaacatgacatagcaacaa 25602089  T
Q  230 caacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||    
T  25602090 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaaccacatagcataactcaccaattgag 25602154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24571574 - 24571408
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||| ||||||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||| | || ||| |||| | ||||||||||||||||    
T  24571574 atttttaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatacatagccaagc-atgagttatcatcaacaacatcacttaacaac 24571476  T
Q  228 aacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgag 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||   || ||||||||| ||| |||   ||||||||| ||||||||||    
T  24571475 aacaacatcaattgatcatgaatcttaacacaattcaacaaaaacatagcataattcaaccaattgag 24571408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 130 - 250
Target Start/End: Original strand, 27261772 - 27261892
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 229  Q
    ||||||||||  | |||||||| || |||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||| ||||||    
T  27261772 tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttcttaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaa 27261871  T
Q  230 caacatctattgatcatgaaa 250  Q
    ||| ||| |||||||||||||    
T  27261872 caatatcaattgatcatgaaa 27261892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 298
Target Start/End: Original strand, 6879460 - 6879571
Alignment:
Q  187 acccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcac 286  Q
    ||||||| || | |||| |||| | ||||| ||| || |||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  6879460 acccaagacatgtattatcatcaacaacatgactaaataacaacaacaacaattgatcattaaacatatcacaattcatcaataacaatgcataattcac 6879559  T
Q  287 caattgagtata 298  Q
    ||||||||||||    
T  6879560 caattgagtata 6879571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 291
Target Start/End: Original strand, 67954 - 68119
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||| ||| | || ||||||| |||| | || | | || |||||||| ||    
T  67954 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagca 68053  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||   || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  68054 acaacaacatcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 68119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24294800 - 24294685
Alignment:
Q  134 accaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaac 233  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||| || | |||||| |||||| ||| |||| ||||||| |||| | |||| | | ||||||||| ||||||||||    
T  24294800 accaaactaccaacaattacttatttctcatccacaaatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcatcatcaacatcatcacttagcaacaacaac 24294701  T
Q  234 atctattgatcatgaa 249  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  24294700 atcaattgaacatgaa 24294685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 248
Target Start/End: Original strand, 25305418 - 25305529
Alignment:
Q  137 aaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatc 236  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||| |||| |||| | || | | ||||||||||| | |||||||||||    
T  25305418 aaactaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaggccatgaatcatcaacaacaacatcacttagccacaacaacatc 25305517  T
Q  237 tattgatcatga 248  Q
     ||||| |||||    
T  25305518 aattgaacatga 25305529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24341603 - 24341521
Alignment:
Q  212 aacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||| |||||||   ||| |||||||||||||||    
T  24341603 aacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgag 24341521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 3507 - 3403
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    ||||||||||| ||||| || | |||| | |||||| ||| | |||||||||| |||| | |||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  3507 caacaacaactcatttctcatctacaa-tcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 3409  T
Q  244 catgaa 249  Q
    ||||||    
T  3408 catgaa 3403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 19669346 - 19669273
Alignment:
Q  174 atgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatg 247  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||| | || | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  19669346 atgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatg 19669273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 19433599 - 19433495
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| | || | | || ||| |||| ||||||||||||| |||||     
T  19433599 caacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaacaacaacatcaattgaa 19433500  T
Q  244 catga 248  Q
    |||||    
T  19433499 catga 19433495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 236
Target Start/End: Original strand, 6094678 - 6094788
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||  || | |||| | ||| |||||||||| | |||| | || | | || ||| |||||||    
T  6094678 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttattccacatcacaaactcatgatttatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaaca 6094777  T
Q  226 acaacaacatc 236  Q
    |||||||||||    
T  6094778 acaacaacatc 6094788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 236
Target Start/End: Original strand, 24277741 - 24277833
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatc 236  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||| | |||  ||||||||| | |||| | || | | || ||| ||||||||||||||||||    
T  24277741 caacaacaacttatttcacatcatcaaatcatgatttatgagtacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatc 24277833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 29 - 300
Target Start/End: Original strand, 14813 - 15085
Alignment:
Q  29 catatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtatcca 128  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14813 catatctacttcaacaacacttcatttagacataaattcaaccataattcgacaacacaatatctgaatccaataattgagaaaaacacataagtatcca 14912  T
Q  129 ttttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaa-ttatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14913 ttttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaac 15012  T
Q  228 aacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15013 aacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 15085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1372 - 1097
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1372 caacatatctacttcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacttcacaatattccaatccaacaattgagcaaaacacataagtat 1273  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaa-ttatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaac 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  1272 ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaac 1173  T
Q  225 aacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1172 aacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 1097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 30 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 193877 - 193607
Alignment:
Q  30 atatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtatccat 129  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  193877 atatctacttcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccat 193778  T
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaac-aaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaaca 228  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193777 tttcacgaaaccaacaacaacaacttatttcgcaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaaca 193678  T
Q  229 acaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  193677 acaacatctattgatcatgaaacatatcacaa-taatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 193607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 30 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 186918 - 186645
Alignment:
Q  30 atatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtatccat 129  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  186918 atatctacttcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtatccat 186819  T
Q  130 tttcaccaaactaacaacaa---caacttatttcacaacaac-aaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  186818 tttcaccaaaccaacaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaaca 186719  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  186718 acaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaa-taatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 186645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6931 - 6662
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6931 caacatatctacttcaacaacacttcatttagacatgaattcaatcataatttaacaatacaatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtat 6832  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    |||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6831 ccattttcaccaa-----caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaaca 6737  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6736 acaacaagatctattgatcatcaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 6662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 9900 - 9626
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9900 caacatatctaattcaacaatacttcatttagacatgaattcaaccatcattcgacaacacaatatcccaatccaacaattgagcaaaacacataagtat 9801  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9800 ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacgtcacttaaca 9701  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  9700 acaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataagtcactaattgagcataat 9626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 30)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 30 - 300
Target Start/End: Original strand, 21650561 - 21650831
Alignment:
Q  30 atatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtatccat 129  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21650561 atatctacttcaacaacatttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcccaatctaacaattgagcaaaacacataagtatccat 21650660  T
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21650661 tttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcaccacaacaaattatgaatcatgcatacccaaaccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaa 21650760  T
Q  230 caacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21650761 caacatctattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 21650831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Original strand, 21204787 - 21205062
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21204787 caacatatctacttcaacaacacttcatttagacatgaatttaaccataatttaacaacacaatatcccaattcaacaattgagcaaaacacataagtat 21204886  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaac-aaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaac 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||    
T  21204887 ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagaataaataacatcacttaac 21204986  T
Q  225 aacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21204987 aacaacaacaaatattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 21205062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 294
Target Start/End: Original strand, 20711937 - 20712206
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataatt-gagcaaaacacataagta 124  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||    
T  20711937 caacatatctaattcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcccaatccaacaatttgagcaaaactcatcagta 20712036  T
Q  125 tccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaac 224  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||| |||||||    
T  20712037 cccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatcaacaacatgacttaac 20712136  T
Q  225 aacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  20712137 aacaacaacatcaattgatcatgcaacttatcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaattgag 20712206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 1168489 - 1168321
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||| ||||  | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||| ||    
T  1168489 ccattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagca 1168390  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1168389 acaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacattgcataattcaccaattgag 1168321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 156 - 300
Target Start/End: Original strand, 2031802 - 2031946
Alignment:
Q  156 atttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatat 255  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | || || ||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  2031802 atttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatat 2031901  T
Q  256 cacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2031902 cacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 2031946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 126 - 300
Target Start/End: Original strand, 11342646 - 11342821
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    |||||||||||||   | |||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||   || | |||| | || || ||| ||||    
T  11342646 ccattttcaccaagacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaatatgactaaaca 11342745  T
Q  226 a-caacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    | |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11342746 aacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 11342821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 130 - 294
Target Start/End: Original strand, 21397055 - 21397222
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 229  Q
    ||||||||||  | ||| |||| || ||||| ||| ||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||||||    
T  21397055 tttcaccaaaacaccaagaacatctcatttctcaataacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaa 21397154  T
Q  230 ---caacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
       ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21397155 taacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 21397222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 127 - 285
Target Start/End: Original strand, 23493882 - 23494040
Alignment:
Q  127 cattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaa 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| | |||| | ||||||||||| |||    
T  23493882 cattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaa 23493981  T
Q  227 caacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 285  Q
    |||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  23493982 caacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattca 23494040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 127 - 294
Target Start/End: Original strand, 24475546 - 24475708
Alignment:
Q  127 cattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaa 226  Q
    |||||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||||||||  | |||| ||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||| |||||    
T  24475546 cattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaa 24475645  T
Q  227 caacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||||   ||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24475646 caacaaca---attgatcatgaaacata--acaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 24475708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 294
Target Start/End: Original strand, 28261501 - 28261651
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||  | |||| ||||| |||||||||| |||||| ||||   ||||| ||| ||||||||||||| | ||||||    
T  28261501 caacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcagcaacatgactaaacaacaacaacaacaattgat 28261600  T
Q  244 catgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28261601 cataaaacatatcacaatttatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 28261651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 127 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 21647023 - 21646857
Alignment:
Q  127 cattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaa 226  Q
    |||||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||||||||  |  ||| || || |||||||||| |||||| |||| | | ||| ||| |||||    
T  21647023 cattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaataattatacaaacccaagccatgaattatcatcaacatcatgactaaacaa 21646924  T
Q  227 caacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattga 293  Q
    ||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21646923 caacagcaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacgatacataattcaccaattga 21646857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 162 - 264
Target Start/End: Original strand, 23466455 - 23466557
Alignment:
Q  162 caacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaat 261  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||| | | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  23466455 caacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaactatcatcaacatcatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaat 23466554  T
Q  262 tca 264  Q
    |||    
T  23466555 tca 23466557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 126 - 291
Target Start/End: Original strand, 3673824 - 3673989
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||  ||| | ||| | |||||||||| |||| | |||| |  || || |||| ||    
T  3673824 ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcgtgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaaccacctcgcttagca 3673923  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  3673924 acaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 3673989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 285
Target Start/End: Original strand, 19405517 - 19405658
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    |||||||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| || ||  ||||| ||| ||||||    
T  19405517 caacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacataccagtaacaatatcaattgat 19405616  T
Q  244 catgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 285  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||| |  |||||||||    
T  19405617 catgaaacttatcacaattcaacaacaacgaatcataattca 19405658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 11337452 - 11337303
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||| | |||||||||| | || ||||||| |||||| |||| |  |||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11337452 caacaacatctcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgtaaactcaagccatgaattatcatcaacgacatgacttagcaacaacaacatcaattgat 11337354  T
Q  244 catgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||    
T  11337353 catgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaaatgag 11337303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 294
Target Start/End: Original strand, 4865224 - 4865393
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaa-ttagcatccataacatcacttaac 224  Q
    ||||||||| ||||  | |||||||| || || || ||||||||| | | |||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||| | ||||| | | |||    
T  4865224 ccattttcatcaaaacaccaacaacacctcatctctcaacaacaattcaagaattatgcaaacccaagccatgaaattatcatcaacaacatgaataaac 4865323  T
Q  225 aacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||| | |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4865324 aaccataacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaaccacaatgcataattcaccaattgag 4865393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 5451128 - 5450963
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||| |||| | |||   | |||||||| |||| | |||| | ||||||||||| ||    
T  5451128 ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgatcatccaagccaagaatcatcatcaacaacatcacttagca 5451029  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
    |||||||||||  |||| ||||||   |||||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  5451028 acaacaacatcagttgaacatgaattttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatt 5450963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 174 - 293
Target Start/End: Original strand, 21906730 - 21906846
Alignment:
Q  174 atgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaacc 273  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||   |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  21906730 atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaaca---acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaca 21906826  T
Q  274 atgcataattcaccaattga 293  Q
      |||||||||| |||||||    
T  21906827 tagcataattcatcaattga 21906846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 145 - 294
Target Start/End: Original strand, 11584032 - 11584184
Alignment:
Q  145 aacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcata-cccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| | ||||||||| |||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| | ||||||    
T  11584032 aacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaaacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 11584130  T
Q  244 catgaaaaatatcacaattcatcaacaaccat---gcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| |    |||||||||||||||||||    
T  11584131 catgaaacatatcacaattcaacaacaacaacaaagcataattcaccaattgag 11584184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 168 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24183372 - 24183249
Alignment:
Q  168 caaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatca 267  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||   ||||| || || |||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||||| ||    
T  24183372 caaatcatgaatcatgcaaacccaagccattaattatcatc---aacatgacatatcaacaacaccatcaattgatcatgaaactcatcacaattcaaca 24183276  T
Q  268 acaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||    
T  24183275 acaacaaagcataattcaccaattgag 24183249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 291
Target Start/End: Original strand, 7728400 - 7728547
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    |||||||| || || || || |||||| | |||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  7728400 caacaacacctcatctctcaccaacaattcatgaattatgcacacccaagcgataaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 7728499  T
Q  244 catgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
    ||||||   |||||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  7728500 catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 7728547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 249
Target Start/End: Original strand, 432425 - 432548
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||| |||| |||| || |||||||||||||||| ||  | ||||| || ||| ||| |||||||||||| |||| | || | | || |||||||| ||    
T  432425 ccattctcacaaaaccaataacaacaacttatttctcatgatcaaatcataaattatgaatacccaagccaggaatcatcaacaacaatatcacttagca 432524  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaa 249  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||    
T  432525 acaacaacatcaattgaacatgaa 432548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 291
Target Start/End: Original strand, 19862189 - 19862336
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||| ||| | ||||||| || |||| | || | |||| |||||||| ||||||||||||| ||||      
T  19862189 caacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaattgca 19862288  T
Q  244 catgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
    |||||    |||||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  19862289 catgattcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 19862336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 128 - 249
Target Start/End: Original strand, 16595472 - 16595593
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| || ||||| || |||||| | |||||||||||| ||||||| || |||||| ||   | | ||||| ||||||||    
T  16595472 atttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaagtcatgaattatcaataacatcatcatttaacaac 16595571  T
Q  228 aacaacatctattgatcatgaa 249  Q
    | | ||||| ||||| ||||||    
T  16595572 atctacatcaattgaacatgaa 16595593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23981800 - 23981680
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||| | |||||| |||| | ||| | |||||||||| |||| | || | | || |||||||| ||    
T  23981800 ccattctcacaaaaccaataacaacaacttatttcacatc-acaaatcatgagttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagca 23981702  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatg 247  Q
    ||||||||||| ||||| ||||    
T  23981701 acaacaacatcaattgaacatg 23981680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 236
Target Start/End: Original strand, 6456602 - 6456696
Alignment:
Q  142 aacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatc 236  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||||| | |||||||||| |||| | || | |  | ||| ||||||||||||||||||    
T  6456602 aacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgattcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacgatatctcttaacaacaacaacatc 6456696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22054047 - 22053965
Alignment:
Q  212 aacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||| |||||||   ||| |||||||||||||||    
T  22054047 aacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgag 22053965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 14342398 - 14342365
Alignment:
Q  47 acttcatttagacatgaattcaatcataattcaa 80  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14342398 acttcatttagacatgaattcaaccataattcaa 14342365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18531281 - 18531200
Alignment:
Q  212 aacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattga 293  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||| |||||||   ||| ||||||||||||||    
T  18531281 aacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattga 18531200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 272
Target Start/End: Original strand, 21617020 - 21617124
Alignment:
Q  168 caaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatca 267  Q
    ||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| | || | | || |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    ||||||||||| ||    
T  21617020 caaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcaacaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaaca 21617119  T
Q  268 acaac 272  Q
    |||||    
T  21617120 acaac 21617124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17797 - 17523
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  17797 caacatatctacttcaacaacatttcatttagacattaattcaaccataattcaacaacacaatatatcaatctaacaattgagcaaaacatataagtat 17698  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17697 ccatttccaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacatattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaaca 17598  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17597 acaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 17523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 26 - 294
Target Start/End: Original strand, 146462 - 146731
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataatt-gagcaaaacacataagta 124  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  146462 caacatatctacttcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatattccaatccaacaatttgagcaaaactcataagta 146561  T
Q  125 tccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaac 224  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  146562 cccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaaaaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatgcataacatcacttaac 146661  T
Q  225 aacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  146662 aacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacctagcataattcaccaattgag 146731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 26 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 10359 - 10094
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||    
T  10359 caacatatctacttcaacagcacttcaattatacatgaattcaaccgtaattcaacaacacaatatctcaatctaacaattgagcaaaacacataaatat 10260  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10259 ccactttcaccaaaccatcaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaaca 10160  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10159 acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccaagcataattcgccaatt 10094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15859 - 15588
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  15859 caacatatctaattcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaactcaatatcccaatccaacaattgagcaaaactcataagtac 15760  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  15759 ccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaaaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatctataacatgactaaaca 15660  T
Q  226 acaac---aacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||||   |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15659 acaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 15588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 294
Target Start/End: Original strand, 35054621 - 35054886
Alignment:
Q  29 catatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtatcca 128  Q
    |||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||    
T  35054621 catatctaattcaacaatacttcattgagacatgaattcaaccataattcaacagcacaatatctcaatccaacaattgagtaaaactcataagtaccca 35054720  T
Q  129 ttttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaaca 228  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35054721 ttttcaccaaaccaacaacaacaacttattccacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaaca 35054820  T
Q  229 acaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  35054821 acaacatccattgatcatgaaacttatcacagttcatcaactacatagcataattcaccaattgag 35054886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27330138 - 27329872
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataatt-gagcaaaacacataagta 124  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  27330138 caacatatctaattcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcccaatccaacaatttgagcaaaactcataagta 27330039  T
Q  125 tccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaac 224  Q
     | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27330038 cctattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttgacaacaa---attatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaac 27329942  T
Q  225 aacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||    
T  27329941 aacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgag 27329872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Original strand, 21859873 - 21860147
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||| |     
T  21859873 caacatatctaattcaacaacacttcatttagacatgaattcaaccataaatcaacaacacaatatcctaatccaacaattgagaaaaactcataagcac 21859972  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | || | |||| | || || ||| ||||    
T  21859973 tcattttcaccaaaccaacaacaacaattcatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaacccgagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaaca 21860072  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21860073 acaacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 21860147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 126 - 300
Target Start/End: Original strand, 22366981 - 22367154
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| || | || | |||| | || || ||| ||||    
T  22366981 ccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatatgactaaaca 22367080  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22367081 acaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcat-attcaccaattgagcataat 22367154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 35522601 - 35522436
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| || || ||||    
T  35522601 attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacgtatcaac 35522503  T
Q  228 aacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  35522502 aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgag 35522436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 126 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15861717 - 15861545
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| || | || | |||| | || || ||| ||||    
T  15861717 ccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgcatcatcatcaacaatatgactaaaca 15861618  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    |  |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15861617 a--acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 15861545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 174 - 294
Target Start/End: Original strand, 49967660 - 49967780
Alignment:
Q  174 atgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaacc 273  Q
    |||||||||||| ||| |||| | |||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  49967660 atgaatcatgcaaaccgaagcaatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacgtatcacaattcatcaacaaca 49967759  T
Q  274 atgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  49967760 atgtataattcaccaattgag 49967780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 128 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 51627947 - 51627805
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||| ||||||| | |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | | ||||||||| ||||    
T  51627947 atttttaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacagcaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacatcatcacttagcaac 51627848  T
Q  228 aacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaaca 270  Q
    ||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  51627847 aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaaca 51627805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 126 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22403395 - 22403227
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaatt-atgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaac 224  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| || ||||| | | |||||| | |||||||||| | |||||||||| |||||| |||| | ||||| |||||||    
T  22403395 ccattttcatcaaaataccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaatcatgaa-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaac 22403297  T
Q  225 aacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||||||||| |  || |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22403296 aacaacaacaacagttaatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 22403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 156 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 44035233 - 44035090
Alignment:
Q  156 atttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatat 255  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||  | | | |||| |  | || ||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  44035233 atttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaactcaagccatta-tcatcatcaactatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatat 44035135  T
Q  256 cacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  44035134 cacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaaatgagcataat 44035090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Original strand, 41212033 - 41212202
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca-- 225  Q
    ||||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||||||||  | |||| ||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||| ||||      
T  41212033 attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaac 41212132  T
Q  226 -acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
     ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  41212133 aacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacagtgcataattcactaattgag 41212202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 174 - 294
Target Start/End: Original strand, 21718238 - 21718358
Alignment:
Q  174 atgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaacc 273  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||     
T  21718238 atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaaatcatcaacaaca 21718337  T
Q  274 atgcataattcaccaattgag 294  Q
      |||||||||||||||||||    
T  21718338 tagcataattcaccaattgag 21718358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 291
Target Start/End: Original strand, 20177141 - 20177302
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 229  Q
    |||||| |||| | ||||||||||| ||||| |  |||||||| |||||| ||| ||| |||||||| |||| | |||| | ||||||||||| ||||||    
T  20177141 tttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcttcaacaaatcatgaattatgaatatccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaa 20177240  T
Q  230 caacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
    ||||||| ||||| | |||    || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  20177241 caacatcaattgaacttgacttttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 20177302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 9784343 - 9784239
Alignment:
Q  168 caaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatca 267  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||| | |||| | ||||| || || ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||    
T  9784343 caaatcatgaatcatgcaagcccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcttgaaacttatcacaattcaaca 9784244  T
Q  268 acaac 272  Q
    |||||    
T  9784243 acaac 9784239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13377107 - 13377003
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    ||||||||| | ||||| || |||||||| |||||| ||| |||| ||||||| |||| | |||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  13377107 caacaacaattcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcaacatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgag 13377008  T
Q  244 catga 248  Q
    |||||    
T  13377007 catga 13377003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 41229216 - 41229102
Alignment:
Q  134 accaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaac 233  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| |||||| ||| | || ||||||| |||| |  | | | ||||||||||| ||||||||||    
T  41229216 accaaactaccaacaacaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcaacaacaac 41229117  T
Q  234 atctattgatcatga 248  Q
    ||| ||||| |||||    
T  41229116 atcaattgaacatga 41229102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 224 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 9784248 - 9784184
Alignment:
Q  224 caacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||   |||||||| | ||||||||||||||||    
T  9784248 caacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaat---tcaacaacaaagcataattcaccaatt 9784184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 249
Target Start/End: Original strand, 27674777 - 27674881
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| |||| |||||| ||||| |||||||||| |||||| ||   | ||||||||||||||||||| ||| | |||||     
T  27674777 caacaacaactcatttctcatcaa-aaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcaataacaacatcacttaacaacaactacaccaattgaa 27674875  T
Q  244 catgaa 249  Q
    ||||||    
T  27674876 catgaa 27674881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22829691 - 22829632
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaatta 203  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  22829691 caacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccatgaatta 22829632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 36356557 - 36356455
Alignment:
Q  147 caacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcat 246  Q
    |||||||| ||||| || | |||||| |||||| ||| | ||||||||||  ||| | |||| | |||||||||||  |||||||||||| ||||| |||    
T  36356557 caacaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaacacccaagccataaatcatcatcaacaacatcacttagaaacaacaacatcaattgaacat 36356458  T
Q  247 gaa 249  Q
    |||    
T  36356457 gaa 36356455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 40436554 - 40436517
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcaca 163  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  40436554 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcaca 40436517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8538185 - 8538085
Alignment:
Q  136 caaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacat 235  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| || | | ||| | |||||||||| |||| | || | | || ||  |||||||||||||||||    
T  8538185 caaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcattatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattccttaacaacaacaacat 8538086  T
Q  236 c 236  Q
    |    
T  8538085 c 8538085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8603424 - 8603324
Alignment:
Q  136 caaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacat 235  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| || | | ||| | |||||||||| |||| | || | | || ||  |||||||||||||||||    
T  8603424 caaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcattatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattccttaacaacaacaacat 8603325  T
Q  236 c 236  Q
    |    
T  8603324 c 8603324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22897 - 22701
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22897 caacatatctacttcaacaacacttcatttagacatgaattcaatcataattcaacaacacaatatcacaatccaacaattgagcaaaacacataagtat 22798  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcactta 222  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22797 ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaaaccatgaattagcatccataacatcactta 22701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 27 - 300
Target Start/End: Original strand, 79724 - 80000
Alignment:
Q  27 aacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtatc 126  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |    
T  79724 aacatatctaattcaacaatacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcccaatccaacaagtgagcaaaactcataagtacc 79823  T
Q  127 cattttcaccaaactaaca---acaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaa 223  Q
    |||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |  | || ||| ||    
T  79824 cattttcaccaaaccaacaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaa 79923  T
Q  224 caacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  79924 caacaacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcataat 80000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 294
Target Start/End: Original strand, 46025 - 46295
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacacca-cttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataatt-gagcaaaacacataagt 123  Q
    ||||||||||| ||||||| || | ||| ||  |||||||||||| |||||||||| |||||| |||  |||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  46025 caacatatctaattcaacaacaacctcaattgaacatgaattcaaccataattcaacaacacagtatttcaatccaacaatttgagcaaaactcataagt 46124  T
Q  124 atccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaa 223  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| | || | | || ||||||||     
T  46125 acccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacattatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttag 46224  T
Q  224 caacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
     |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||    
T  46225 aaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgag 46295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 294
Target Start/End: Original strand, 40552 - 40788
Alignment:
Q  58 acatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataatt-gagcaaaacacataagtatccattttcaccaaactaacaacaacaactta 156  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||| | | | || ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  40552 acatgaattgaaccataattcaacaacacagtattccaatccaacaatttgagcaaaactcttga-tacccattttcaccaaaccaacaacaacagctta 40650  T
Q  157 tttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatc 256  Q
    ||||| |  | ||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| | || | | || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  40651 tttcaaattatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatccattgatcatgaaacttatc 40750  T
Q  257 acaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||||  | ||||||    |||||||||||||||||||    
T  40751 acaatgtaacaacaatatagcataattcaccaattgag 40788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 405 - 147
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||            ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  405 caacatatctacttcaacaacacttcatttggacatgaattcaac-----------aacacaatatcacaatccaacaattgagcaaaacacataagtat 317  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    |||||||||||||     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  316 ccattttcaccaa-----caacaacaacttatttcacaacaataaattatgaatcatgcatactcaagccatgaattagcatccataacatcacttaaca 222  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  221 acaacaacatttattgatcatgaaacttatcataattcatcaattattatgcataattcaccaattgagcataat 147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 19294 - 19049
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||     
T  19294 caacatatctaattcaacaatacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcccaattcaacaattgagcaaaactcataagtac 19195  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |  | || ||| ||||    
T  19194 ctattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaaca 19095  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaa 271  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19094 acaacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaa 19049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 128 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12811 - 12639
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |  | || ||| ||||||    
T  12811 attttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaac 12712  T
Q  228 aacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  12711 aacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcataat 12639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 293
Target Start/End: Original strand, 88158 - 88404
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataattgagcaaaacacataagtat 125  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||     
T  88158 caacatatcttattcaacaacacttcatttaaacatgaattcaaccataatgcaacaacacaatatcccaatcaaacaattgaccaaaactcataagtac 88257  T
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
     ||||||||||||||                     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  88258 tcattttcaccaaac---------------------caacaacaaattatggatcatgcatacccaagccaagaattagcatccataacatcacttaaca 88336  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattga 293  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  88337 acagcaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattga 88404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 132531 - 132367
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 229  Q
    ||||||||||  | ||||||||  | ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||||||    
T  132531 tttcaccaaaacaccaacaacatttcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaa 132432  T
Q  230 caacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  132431 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacgatgcataattcaccaattgag 132367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 294
Target Start/End: Original strand, 11667 - 11818
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11667 caacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcataaccaagccatgaattatcatcaacaacgtcacttagcaacaacaacatcaattgat 11766  T
Q  244 catgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgag 294  Q
    |||||||  |||||||||||  |||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  11767 catgaaacttatcacaattctacaacaacatagcataattcaaccaattgag 11818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 269
Target Start/End: Original strand, 5802 - 6045
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataatt-gagcaaaacacataagta 124  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| | ||||||||    
T  5802 caacatatctaattcaacaacacttcattaagacatgaaatcaaccataattcaacaacacaatatctcaatccaacaatttgagcaaa-ctcataagta 5900  T
Q  125 tccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaac 224  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||| || ||| | || ||||||| |||| | || | | || |||||||| |    
T  5901 cccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagc 6000  T
Q  225 aacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaac 269  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||| ||||    
T  6001 aacaacaacatcaattgaacatgaatattatcacaattcaacaac 6045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 156 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 714 - 570
Alignment:
Q  156 atttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatat 255  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | || | |||| | || || | | || | |||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  714 atttctcaacaacaaattattaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgagtaaatatcaacaacaaccattgatcatgaaacatat 615  T
Q  256 cacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  614 cacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 57 - 294
Target Start/End: Original strand, 4455 - 4694
Alignment:
Q  57 gacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataatt-gagcaaaacacataagtatccattttcaccaaactaacaacaacaactt 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4455 gacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcccaatccaacaatttgagcaaaactcataagtaccaattttcaccaaaccaacaacaacaactt 4554  T
Q  156 atttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatat 255  Q
    |||||||| || ||||| ||| || ||| | |||||||||| |||| | || | | || |||||||| ||||||||||||| |||||  ||||| | |||    
T  4555 atttcacatcatcaaatcatggattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaaaatgaatattat 4654  T
Q  256 cacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgag 294  Q
    ||||||| | |||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  4655 cacaattaaacaacaacatagcataattcaaccaattgag 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 57 - 294
Target Start/End: Original strand, 9069 - 9308
Alignment:
Q  57 gacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataatt-gagcaaaacacataagtatccattttcaccaaactaacaacaacaactt 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9069 gacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcccaatccaacaatttgagcaaaactcataagtaccaattttcaccaaaccaacaacaacaactt 9168  T
Q  156 atttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatat 255  Q
    |||||||| || ||||| ||| || ||| | |||||||||| |||| | || | | || |||||||| ||||||||||||| |||||  ||||| | |||    
T  9169 atttcacatcatcaaatcatggattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaaaatgaatattat 9268  T
Q  256 cacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgag 294  Q
    ||||||| | |||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  9269 cacaattaaacaacaacatagcataattcaaccaattgag 9308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 291
Target Start/End: Original strand, 33525 - 33789
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacacca-cttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataatt-gagcaaaacacataagt 123  Q
    ||||||||||| || |||| || ||||| ||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  |||||||    
T  33525 caacatatctaatttaacaacaacttcaattgaacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatctcaatccaacaatttgagcaaaattcataagt 33624  T
Q  124 atccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaa 223  Q
    | |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||| ||| | |||| ||||| |||| | || | | || ||||||||     
T  33625 acccattttcaccaaac---caacaacaacttatttcacattatcaaatcatgaattatgaacaccctagccatgaatcatcaacaacaatatcacttag 33721  T
Q  224 caacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  33722 caacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcaaaattcatcaacaacatagcataattcaccaatt 33789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5531 - 5363
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||| |||||| |||| | ||||| ||||| ||    
T  5531 ccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacttagca 5432  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5431 acaacaacatcaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcctaattcaccaattgag 5363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 146 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9147 - 8998
Alignment:
Q  146 acaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatca 245  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  9147 acaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacctaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatca 9048  T
Q  246 tgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgag 294  Q
    |||||  |||||||||| | |||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  9047 tgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaaccaattgag 8998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 294
Target Start/End: Original strand, 7063 - 7303
Alignment:
Q  57 gacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataatt-gagcaaaacacataagtatccattttcaccaaactaacaacaacaactt 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7063 gacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcccaatccaacaatttgagcaaaactcataagtaccaattttcaccaaaccaacaacaacaactt 7162  T
Q  156 atttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacat-ctattgatcatgaaaaata 254  Q
    |||||||| || ||||| ||| || ||| | |||||||||| |||| | || | | || |||||||| |||||||||||| | |||||  ||||| | ||    
T  7163 atttcacatcatcaaatcatggattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatccaattgaaaatgaatatta 7262  T
Q  255 tcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgag 294  Q
    |||||||| | |||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  7263 tcacaattaaacaacaacatagcataattcaaccaattgag 7303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 128 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 109745 - 109582
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||| ||||    
T  109745 attttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaatcccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaac 109646  T
Q  228 aacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  109645 aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacttagcataattcaccaatt 109582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 128 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 118246 - 118081
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||| ||||    
T  118246 attttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaccccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaac 118147  T
Q  228 aacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattga 293  Q
    ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  118146 aacaacatcaactgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattga 118081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 130 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 31569 - 31399
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 229  Q
    |||||| |||| | |||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | || | |||| | || || ||| ||||||||    
T  31569 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaacctaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaacaa 31470  T
Q  230 caacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31469 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 31399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 130 - 300
Target Start/End: Original strand, 41275 - 41445
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 229  Q
    |||||| |||| | |||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | || | |||| | || || ||| ||||||||    
T  41275 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaacctaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaacaa 41374  T
Q  230 caacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41375 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 41445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 130 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6372 - 6202
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 229  Q
    |||||| |||| | |||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| || | || | |||| | || || ||| ||||||||    
T  6372 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatattactaaacaacaa 6273  T
Q  230 caacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6272 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 6202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 859 - 693
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||| ||||    
T  859 attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaac 760  T
Q  228 aacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||    
T  759 aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaaatgag 693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 144 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 255081 - 254931
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||| || ||||||| |||||| |||| | ||||| || || ||||||||||||| ||||||    
T  255081 caacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgat 254982  T
Q  244 catgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  254981 catgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 254931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 144 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 261687 - 261537
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||| || ||||||| |||||| |||| | ||||| || || ||||||||||||| ||||||    
T  261687 caacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgat 261588  T
Q  244 catgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  261587 catgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 261537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 201
Target Start/End: Original strand, 147417 - 147590
Alignment:
Q  26 caacatatctacttcaacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataa-ttgagcaaaacacataagta 124  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||  |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  147417 caacatatctaattcaacaacactcaatttagacttgaattcaaccataattcaacaacacaatatcccaatccaacaatttaagcaaaactcataagta 147516  T
Q  125 tccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaat 201  Q
     |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| || ||||| ||| || ||| | |||||||||| ||||    
T  147517 cccattttcaccaaac---caacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaacacccaagccatgaat 147590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 130 - 291
Target Start/End: Original strand, 85298 - 85459
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 229  Q
    ||||||||||  | |||||||  || ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||| |||| | ||||| ||||| ||||||    
T  85298 tttcaccaaaacaccaacaacgtctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaa 85397  T
Q  230 caacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  85398 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacctagcataattcaccaatt 85459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 128 - 300
Target Start/End: Original strand, 159266 - 159436
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||   ||||||||||| ||||    
T  159266 attttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccaaaaattatcatc---aacatcacttagcaac 159362  T
Q  228 aacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgagtataat 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| || ||||   ||||||||| |||||||||| |||||    
T  159363 aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacatcaacatagcataattcaaccaattgagcataat 159436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 126 - 294
Target Start/End: Original strand, 32165 - 32333
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||||||||  | | || ||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||| ||||    
T  32165 ccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaaggattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca 32264  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  32265 acaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaattcataattcaccaattgag 32333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 126 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 42138 - 41970
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||||||||  | | || ||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||| ||||    
T  42138 ccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaaggattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca 42039  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  42038 acaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaattcataattcaccaattgag 41970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 126 - 294
Target Start/End: Original strand, 164177 - 164345
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||||||||  | ||||| || || ||||| ||||||||||  | |||| ||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||| ||||    
T  164177 ccattttcaccaaaacaccaacaccatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattaccatcaacaacatgactaaaca 164276  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  164277 acaacaacaacatttgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 164345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 130 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 162468 - 162297
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaa-ca 228  Q
    |||||| |||| | |||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||   || | |||| | || || ||| ||||| ||    
T  162468 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaatatgactaaacaaaca 162369  T
Q  229 acaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  162368 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcagaattcaccaattgagcataat 162297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 225 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 166458 - 166383
Alignment:
Q  225 aacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 300  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  166458 aacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcagaattcaccaattgagcataat 166383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 130 - 294
Target Start/End: Original strand, 22657 - 22821
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 229  Q
    ||||||||||  | |||||||| || ||||| ||| ||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||  ||||||||    
T  22657 tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaataacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacaaaacaacaa 22756  T
Q  230 caacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22757 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaaaatgcataattcaccaattgag 22821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 130 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 70903 - 70739
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 229  Q
    ||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||| || |||||| |||| | ||||| ||| ||||||||    
T  70903 tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaa 70804  T
Q  230 caacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  70803 caacatccaatgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaattgag 70739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 167 - 298
Target Start/End: Original strand, 60809 - 60940
Alignment:
Q  167 acaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatc 266  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| || |||||| |||| | ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |    
T  60809 acaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaac 60908  T
Q  267 aacaaccatgcataattcaccaattgagtata 298  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  60909 aacaacaaagcataattcaccaattaagtata 60940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Original strand, 8951 - 9117
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||| ||||    
T  8951 attttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcaagcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaac 9050  T
Q  228 aacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||||| | ||||| |||||  |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  9051 aacaacatcaagtgatcttgaaacttatcacaaatcatcaacaacatagcataattcaccaattgag 9117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 801 - 635
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||| |||| | ||||| |||||  |||    
T  801 attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagtaac 702  T
Q  228 aacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||    
T  701 aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaaatgag 635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 137 - 294
Target Start/End: Original strand, 118 - 274
Alignment:
Q  137 aaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatc 236  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| || || |||||||||||||    
T  118 aaaccaacaacaacaactcatttctcagcaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatc 216  T
Q  237 tattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
     |||||||||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  217 aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgag 274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 130 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 1103 - 939
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 229  Q
    ||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| || || ||||||    
T  1103 tttcaccaaatcaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaa 1004  T
Q  230 caacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||| | |||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  1003 caacaacaattgatcatgaaacttatcacaaatcatcaataacaatgcataattcaccaattgag 939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 126 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 7133 - 6962
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||| ||||  | |||||||| || ||||| ||||||||||  | |||| ||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||| ||||    
T  7133 ccattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca 7034  T
Q  226 acaacaacatcta---ttgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||||| | |   ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7033 acaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 6962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 130 - 291
Target Start/End: Original strand, 1285 - 1444
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 229  Q
    ||||||||||  |||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| | |||| | ||||| || || ||||||    
T  1285 tttcaccaaa--aacaccaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaa 1382  T
Q  230 caacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  1383 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaatt 1444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 11875 - 11771
Alignment:
Q  187 acccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcac 286  Q
    |||||||||| |||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11875 acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaaca---attgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaatgcataattcac 11779  T
Q  287 caattgag 294  Q
     |||||||    
T  11778 taattgag 11771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 176 - 294
Target Start/End: Original strand, 7581 - 7699
Alignment:
Q  176 gaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccat 275  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| ||||||||| ||    
T  7581 gaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcataatttatcaacaacaat 7680  T
Q  276 gcataattcaccaattgag 294  Q
    |||||||||||||||||||    
T  7681 gcataattcaccaattgag 7699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 294
Target Start/End: Original strand, 9917 - 10067
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    |||||||| || ||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| | |||| | ||||| || || ||||||||||||| ||||||    
T  9917 caacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaataatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgat 10016  T
Q  244 catgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  10017 catgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgag 10067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 294
Target Start/End: Original strand, 21492 - 21642
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||| ||||||||||||| | | ||    
T  21492 caacaacaactcatttcttaacaacaattcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaaataat 21591  T
Q  244 catgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  21592 catgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgag 21642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 294
Target Start/End: Original strand, 31191 - 31341
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||| |||||| |||||| ||||||    
T  31191 caacaacaactcatttctcaacaacaattcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaaaaacatcaattgat 31290  T
Q  244 catgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
     ||||||  ||||||||||||||||||||   | |||||| ||||||||||    
T  31291 aatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagtataatttaccaattgag 31341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 126 - 294
Target Start/End: Original strand, 14839 - 15004
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||| ||||  | |||||||| || ||||| ||||||||||    |||| ||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||| ||||    
T  14839 ccattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccgagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca 14938  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14939 acaacaaca---attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 15004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 234
Target Start/End: Original strand, 14179 - 14287
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||| ||||  | |||||||| || ||||| ||||||||||    |||| ||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| ||| ||||    
T  14179 ccattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccgagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca 14278  T
Q  226 acaacaaca 234  Q
    |||||||||    
T  14279 acaacaaca 14287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 130 - 275
Target Start/End: Original strand, 30057 - 30202
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 229  Q
    |||||| |||| | |||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | || || ||| ||||||||    
T  30057 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaatatgactaaacaacaa 30156  T
Q  230 caacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccat 275  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30157 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccat 30202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 128 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 34010 - 33854
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||  ||| | ||||||||||| ||||    
T  34010 atttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcat-aatcatgcatacccaagccatgaattattatcaacaacatcacttagcaac 33912  T
Q  228 aacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 285  Q
    ||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  33911 aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattca 33854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 264
Target Start/End: Original strand, 3291 - 3419
Alignment:
Q  136 caaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacat 235  Q
    ||||||| |||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  3291 caaactaccaactacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccacaacatcacttagcaacatcaacat 3390  T
Q  236 ctattgatcatgaaaaatatcacaattca 264  Q
    | ||||||||||||   ||||||||||||    
T  3391 caattgatcatgaatcttatcacaattca 3419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 130 - 294
Target Start/End: Original strand, 38264 - 38428
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 229  Q
    ||||||||||  | ||||| || || ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||  | |||||| |||| | ||||| ||| ||||||||    
T  38264 tttcaccaaaacaccaacatcatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagttatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaa 38363  T
Q  230 caacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38364 caacgtcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcgccaattgag 38428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 128 - 272
Target Start/End: Original strand, 109554 - 109698
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||| ||||    
T  109554 atttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcgtgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaac 109653  T
Q  228 aacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaac 272  Q
    ||||||||| | ||||||||||   |||||||||||| |||||||    
T  109654 aacaacatcaactgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaac 109698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 112809 - 112662
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| || |   ||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  112809 caacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcaac---aacatgacttaacaacaacaacataaattgat 112713  T
Q  244 catgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||   ||||||||||| |||||||    
T  112712 catgaaacttatcacaattcatcaaccacatagcataattcactaattgag 112662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 103189 - 103048
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    ||||||||||| ||||  || |||||| | |||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||| | |||||||||||  ||||| |||||| |||||     
T  103189 caacaacaactcatttatcaccaacaattcatgaattatgcacacccaaaccatgaattatcatcaacaacatcacttagaaacaataacatcaattgaa 103090  T
Q  244 catgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 285  Q
    ||||||   |||||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  103089 catgaatgttatcacaattcaacaacaacatagcataattca 103048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 136 - 243
Target Start/End: Original strand, 7806 - 7913
Alignment:
Q  136 caaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacat 235  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  7806 caaactaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccacaacatcacttagcaacaacaacat 7905  T
Q  236 ctattgat 243  Q
    | ||||||    
T  7906 caattgat 7913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 11990 - 11825
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||||||||||  | ||| |||| || ||||| ||||| ||| | ||||| |||||| || ||||||| |||||| |||| | ||||| ||||| ||||    
T  11990 attttcaccaaaacaccaaaaacatctcatttctcaacaccaa-tcatgaaccatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaac 11892  T
Q  228 aacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11891 aacaacatcaattgatcatgaaacttatcaaaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 11825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 272
Target Start/End: Original strand, 3280 - 3407
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | ||||| || || ||||||||||||| ||||||    
T  3280 caacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgat 3378  T
Q  244 catgaaaaatatcacaattcatcaacaac 272  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3379 catgaaacttatcacaattcatcaacaac 3407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 247
Target Start/End: Original strand, 10970 - 11177
Alignment:
Q  40 caacaccacttcatttagacatgaattcaatcataattcaataacacaatatcccaatccaataa-ttgagcaaaacacataagtatccattttcaccaa 138  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||| || ||||| ||||||| | |||    
T  10970 caacaacacttcatttagacatgaattcaaccataattcaacaacacaatatcacaatccatcaatttgagcaaaactcacaagtacccattttta-caa 11068  T
Q  139 actaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatcta 238  Q
    || ||||||||||||||||||| || || ||||| ||||   ||| | ||| |||||| |||| |  | | | |||||||| || ||||||||||||| |    
T  11069 accaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatctatgaacacctaagccatgaatcataaacaacaacatcacatagcaacaacaacatcaa 11168  T
Q  239 ttgatcatg 247  Q
    |||| ||||    
T  11169 ttgaacatg 11177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 268
Target Start/End: Original strand, 1343 - 1485
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||||||||  | |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||| |||| | ||||| || || ||    
T  1343 ccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgatttatcatcaacaacatgacatagca 1442  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaa 268  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1443 acagcaacatttattgatcatgaaacttatcacaattcatcaa 1485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 130 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 253270 - 253106
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 229  Q
    |||||| |||| | |||||||||   ||||| || ||| |||| |||||||||||| |||||||||  |||||| |||| | ||||| ||||||||| ||    
T  253270 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcatcaagaaatcatgaatcatgcaaacccaagccttgaattatcatcaacaacatgacttaacaaaaa 253171  T
Q  230 caacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    ||||| | |||||||||||||  |||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  253170 caacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcatgattcaccaattgag 253106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 294
Target Start/End: Original strand, 13 - 151
Alignment:
Q  156 atttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatat 255  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| | || || || || ||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  13 atttctcaacaacaaataatgaaacatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaagatgacatagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttat 112  T
Q  256 cacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||||||||||||| ||   ||||||||||| |||||||    
T  113 cacaattcatcaaccacgtagcataattcacgaattgag 151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 236
Target Start/End: Original strand, 3511 - 3591
Alignment:
Q  156 atttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatc 236  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| | || || || || |||||||||||||    
T  3511 atttctcaacaacaaataatgaaacatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaagatgacatagcaacaacaacatc 3591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 128 - 249
Target Start/End: Original strand, 1880 - 2001
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||   ||||| ||||| ||||    
T  1880 attttcaccaaaccactaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatactcaagccaagaattatcatcatcaacatgacttagcaac 1979  T
Q  228 aacaacatctattgatcatgaa 249  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  1980 aacaacatcaattgatcatgaa 2001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 294
Target Start/End: Original strand, 24940 - 25088
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | |||||  | || ||||||||||| | ||||||    
T  24940 caacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgccatatcaacaacaacaacaattgat 25037  T
Q  244 catgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    | |||||  |||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  25038 cgtgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaattgag 25088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 174 - 294
Target Start/End: Original strand, 25222 - 25341
Alignment:
Q  174 atgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaacc 273  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | |||||  | || ||||||||||| | ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||     
T  25222 atgaatcatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgccatatcaacaacaacaacaattgatcgtgaaacttatcacaattcaacaacaaca 25320  T
Q  274 atgcataattcaccaattgag 294  Q
    |  ||||||||||||||||||    
T  25321 aaacataattcaccaattgag 25341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 130 - 291
Target Start/End: Original strand, 4907 - 5068
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 229  Q
    |||||| |||| | |||||||||   ||||| || || ||||| |||||| ||| | | |||||||| |||||| |||| | ||||| ||||| ||||||    
T  4907 tttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcatcagcaaatcatgaattatgaacaaccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaa 5006  T
Q  230 caacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||    
T  5007 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaatcataattcaccaatt 5068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 2601 - 2436
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||  |||||| ||| |  ||||||||| |||| | |||| | |||||||||||  |    
T  2601 ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaaacatgaattatgaacgcccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagga 2502  T
Q  226 acaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
    ||||||||||| ||||| |||||    ||||| |||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  2501 acaacaacatcaattgaacatgagtcttatcataattcaacaacaacatagcataattcatcaatt 2436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 269
Target Start/End: Original strand, 31024 - 31149
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||| |||| || || |||||||||| ||| ||    
T  31024 caacaacatctcatttctcaacaacaagtcatgaatcatgcatacccaagccataaattatcatcaaaaacctcacatatcagcaacaacatcaattaat 31123  T
Q  244 catgaaaaatatcacaattcatcaac 269  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||    
T  31124 catgaaacttatcacaattcaacaac 31149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 285
Target Start/End: Original strand, 70676 - 70734
Alignment:
Q  227 caacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  70676 caacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattca 70734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 11812 - 11688
Alignment:
Q  167 acaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatc 266  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||| || |||||| |||| | ||||| || || ||||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||| |    
T  11812 acaaatcatgaattatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacataaattgatcatgaaactgatcacaattcaac 11713  T
Q  267 aacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
    |||||| | ||||||||||||||||    
T  11712 aacaacaaagcataattcaccaatt 11688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 247
Target Start/End: Original strand, 2419 - 2538
Alignment:
Q  128 attttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaac 227  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| || || ||||| | |||| ||| |||||||||||| |||| | || | | ||||||||||| ||||    
T  2419 attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaataaggaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaac 2518  T
Q  228 aacaacatctattgatcatg 247  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  2519 aacaacatcaattgaacatg 2538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 368 - 234
Alignment:
Q  156 atttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatat 255  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||| | |||||| |||| | ||||| || || ||||||||||||| ||||||||| |||  |||    
T  368 atttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagctatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcattaaacttat 270  T
Q  256 cacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
    ||||||||| ||||||| |  |||||||||| ||||    
T  269 cacaattcaacaacaacaaaacataattcacgaatt 234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 169 - 294
Target Start/End: Original strand, 48153 - 48277
Alignment:
Q  169 aaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaa 268  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||| |||||| |||| | |||||  ||||||||||| || | | |||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  48153 aaatcatgaattatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatggcttaacaacaataataacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaa 48251  T
Q  269 caaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||    
T  48252 caacaaaacataattcaccaattgag 48277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 169 - 294
Target Start/End: Original strand, 61601 - 61725
Alignment:
Q  169 aaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaa 268  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||| |||||| |||| | |||||  ||||||||||| || | | |||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  61601 aaatcatgaattatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatggcttaacaacaataataacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaa 61699  T
Q  269 caaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||    
T  61700 caacaaaacataattcaccaattgag 61725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 77128 - 76967
Alignment:
Q  130 tttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaa 229  Q
    |||||| |||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||| | ||   | || |||||||| ||||||    
T  77128 tttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaatatcacttagcaacaa 77029  T
Q  230 caacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 291  Q
    ||||||| ||||| ||||||    | ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  77028 caacatcaattgaacatgaatctcaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 76967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0740
Description:

Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Original strand, 4359 - 4414
Alignment:
Q  238 attgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattga 293  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4359 attgatcataaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattga 4414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 247
Target Start/End: Original strand, 79517 - 79622
Alignment:
Q  142 aacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattg 241  Q
    ||||||||||||| ||||| || || ||| | |||||| ||| |||||||||||| |||| | || | |||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  79517 aacaacaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaattg 79616  T
Q  242 atcatg 247  Q
    | ||||    
T  79617 aacatg 79622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 89655 - 89586
Alignment:
Q  225 aacaacaacatctattgatcatgaaaaatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 294  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  89655 aacaacaacatcaattgttcatgaaacttatcacaatttaacaacaacaaagcataattcaccaattgag 89586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 248
Target Start/End: Original strand, 35463 - 35562
Alignment:
Q  149 acaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatga 248  Q
    |||||| ||||| || |||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||| | || | | ||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||    
T  35463 acaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaaaaacatcaattgaacatga 35562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24452 - 24374
Alignment:
Q  156 atttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaaca 234  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||| |||| | ||||| || || |||||||||||    
T  24452 atttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagacatgaattatcatcaacaacatgacatagcaacaacaaca 24374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 248
Target Start/End: Original strand, 289 - 393
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 243  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| |||   ||||||| || |||| | || | | ||||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  289 caacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgagcacccaaggcatgaataatcaacaaaaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 388  T
Q  244 catga 248  Q
    |||||    
T  389 catga 393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 126 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 90129 - 90078
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatga 177  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  90129 ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatga 90078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0670 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
Description:

Target: scaffold0670; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7960 - 7850
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaaca 225  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||  || | |||| | ||| | |||||||| | |||| | || | | || ||| |||||||    
T  7960 ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcacaaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaaca 7861  T
Q  226 acaacaacatc 236  Q
    |||||||||||    
T  7860 acaacaacatc 7850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 242
Target Start/End: Original strand, 28516 - 28614
Alignment:
Q  144 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccacgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattga 242  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| |||| |||||| ||| | |||||||||| |||| |  | | | ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  28516 caacaacaactcatttctcaccaataaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattga 28614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 163
Target Start/End: Original strand, 1797 - 1834
Alignment:
Q  126 ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcaca 163  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  1797 ccatttttacaaaactaacaacaacaacttatttcaca 1834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 878 times since January 2019
Visitors: 4101