View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0664_low_5 (Length: 459)

Name: NF0664_low_5
Description: NF0664
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0664_low_5
NF0664_low_5
[»] chr1 (19 HSPs)
chr1 (9-438)||(18059582-18060014)
chr1 (9-438)||(17004638-17005070)
chr1 (9-438)||(38054915-38055347)
chr1 (9-358)||(17148647-17149000)
chr1 (9-301)||(19962323-19962617)
chr1 (61-433)||(46523394-46523768)
chr1 (15-302)||(22227947-22228236)
chr1 (64-302)||(22232644-22232882)
chr1 (61-319)||(22035568-22035827)
chr1 (61-319)||(7640810-7641069)
chr1 (35-212)||(5072237-5072411)
chr1 (103-302)||(2116393-2116589)
chr1 (103-302)||(45051561-45051757)
chr1 (35-134)||(15861258-15861358)
chr1 (121-212)||(18601052-18601141)
chr1 (55-125)||(18598845-18598914)
chr1 (61-177)||(51452765-51452882)
chr1 (396-438)||(22035448-22035490)
chr1 (397-438)||(20254312-20254353)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (9-438)||(16376197-16376629)
chr6 (9-438)||(16383521-16383953)
chr6 (9-438)||(22225562-22225994)
chr6 (9-438)||(10488699-10489131)
chr6 (19-438)||(16555973-16556395)
chr6 (19-438)||(16632529-16632951)
chr6 (14-438)||(1556005-1556434)
chr6 (35-438)||(19610018-19610425)
chr6 (9-267)||(22251390-22251648)
chr6 (9-301)||(19299375-19299669)
chr6 (35-358)||(16231972-16232297)
chr6 (52-358)||(18086690-18086999)
chr6 (61-358)||(23977849-23978149)
chr6 (103-358)||(13620712-13620970)
chr6 (17-212)||(27653814-27654006)
chr6 (35-319)||(29869627-29869911)
chr6 (107-369)||(29665942-29666208)
chr6 (60-212)||(25175792-25175945)
chr6 (9-302)||(14625953-14626243)
chr6 (351-438)||(33314387-33314474)
chr6 (114-212)||(16825678-16825775)
chr6 (103-212)||(1650022-1650128)
chr6 (9-177)||(15862744-15862916)
chr6 (61-134)||(4991396-4991470)
chr6 (25-119)||(16814837-16814930)
chr6 (9-177)||(1657566-1657738)
chr6 (258-373)||(27740903-27741021)
chr6 (183-215)||(19629556-19629588)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (9-438)||(7822728-7823160)
chr7 (9-438)||(7830039-7830471)
chr7 (9-438)||(27176433-27176865)
chr7 (9-438)||(27101461-27101893)
chr7 (9-438)||(27108809-27109241)
chr7 (9-438)||(38783553-38783985)
chr7 (9-438)||(15950614-15951047)
chr7 (14-438)||(15759941-15760370)
chr7 (35-358)||(18979872-18980197)
chr7 (35-358)||(15927648-15927973)
chr7 (9-358)||(14250721-14251074)
chr7 (61-358)||(13758450-13758750)
chr7 (9-212)||(2437686-2437888)
chr7 (9-302)||(16478786-16479075)
chr7 (35-212)||(10989638-10989814)
chr7 (17-320)||(13910855-13911156)
chr7 (103-306)||(48622584-48622788)
chr7 (35-301)||(13572816-13573079)
chr7 (103-319)||(10000288-10000505)
chr7 (103-204)||(18253761-18253862)
chr7 (103-186)||(15862174-15862257)
chr7 (103-319)||(16418618-16418835)
chr7 (61-320)||(13321134-13321407)
chr7 (60-134)||(15516719-15516793)
chr7 (61-177)||(7293289-7293406)
chr7 (61-177)||(30262002-30262119)
chr7 (61-158)||(11516520-11516617)
chr7 (61-158)||(15441437-15441534)
chr7 (103-158)||(14113904-14113959)
chr7 (396-438)||(10000583-10000625)
chr7 (396-438)||(16418498-16418540)
chr7 (103-177)||(14423555-14423629)
[»] chr3 (28 HSPs)
chr3 (9-438)||(1467563-1467995)
chr3 (9-438)||(49232436-49232868)
chr3 (9-438)||(12264615-12265049)
chr3 (14-438)||(25058739-25059168)
chr3 (9-341)||(12811938-12812273)
chr3 (25-387)||(22275260-22275626)
chr3 (9-387)||(15468162-15468545)
chr3 (35-434)||(5228317-5228719)
chr3 (103-438)||(12902008-12902346)
chr3 (9-358)||(18911073-18911427)
chr3 (14-268)||(18896871-18897127)
chr3 (61-366)||(54651529-54651837)
chr3 (103-438)||(44228985-44229323)
chr3 (35-212)||(41270304-41270478)
chr3 (35-212)||(55316448-55316622)
chr3 (14-300)||(16821280-16821564)
chr3 (322-438)||(18897139-18897255)
chr3 (103-204)||(15936553-15936654)
chr3 (103-204)||(15938395-15938496)
chr3 (103-242)||(15615032-15615168)
chr3 (9-134)||(14842392-14842519)
chr3 (9-134)||(23492696-23492823)
chr3 (61-135)||(8268609-8268683)
chr3 (61-135)||(8275709-8275783)
chr3 (183-369)||(11986172-11986361)
chr3 (61-158)||(2449111-2449208)
chr3 (37-177)||(13954738-13954880)
chr3 (37-177)||(45861078-45861220)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (9-438)||(11231162-11231594)
chr2 (9-438)||(22513009-22513441)
chr2 (9-438)||(28775631-28776063)
chr2 (9-438)||(24685605-24686037)
chr2 (9-438)||(16935593-16936027)
chr2 (9-438)||(17006253-17006687)
chr2 (61-438)||(12728392-12728772)
chr2 (61-438)||(34824475-34824855)
chr2 (103-438)||(23777963-23778301)
chr2 (9-358)||(42177791-42178145)
chr2 (61-358)||(8943926-8944226)
chr2 (61-358)||(12635744-12636044)
chr2 (64-358)||(3798482-3798779)
chr2 (61-358)||(12641518-12641818)
chr2 (9-212)||(19886484-19886684)
chr2 (150-438)||(21141895-21142187)
chr2 (61-319)||(23774257-23774516)
chr2 (103-319)||(5888548-5888765)
chr2 (17-134)||(24826531-24826646)
chr2 (61-134)||(25213372-25213446)
chr2 (103-302)||(7507758-7507969)
chr2 (61-158)||(14906313-14906410)
chr2 (103-177)||(19689316-19689391)
chr2 (61-158)||(23820364-23820461)
chr2 (396-438)||(5888843-5888885)
chr2 (396-438)||(23774137-23774179)
chr2 (103-177)||(17396568-17396643)
chr2 (61-158)||(20015304-20015401)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (9-438)||(31309-31741)
scaffold0107 (152-438)||(39646-39935)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (9-438)||(39103-39535)
scaffold0076 (9-301)||(43137-43426)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (9-438)||(271184-271616)
chr8 (9-438)||(644304-644736)
chr8 (9-438)||(830039-830471)
chr8 (9-438)||(22088618-22089050)
chr8 (9-438)||(15318983-15319415)
chr8 (9-438)||(15499352-15499784)
chr8 (35-438)||(22006107-22006514)
chr8 (9-438)||(13662087-13662521)
chr8 (9-358)||(13720750-13721104)
chr8 (61-438)||(16195230-16195611)
chr8 (61-358)||(16872927-16873227)
chr8 (9-302)||(6774083-6774371)
chr8 (9-302)||(24549120-24549409)
chr8 (17-212)||(30120951-30121144)
chr8 (9-301)||(21844394-21844684)
chr8 (9-301)||(21851787-21852077)
chr8 (52-212)||(16674258-16674415)
chr8 (37-177)||(17345842-17345985)
chr8 (9-49)||(17142854-17142894)
chr8 (61-177)||(22907087-22907204)
chr8 (61-158)||(5238380-5238477)
chr8 (61-158)||(24661121-24661218)
chr8 (61-158)||(43685839-43685936)
[»] chr5 (38 HSPs)
chr5 (9-438)||(21932205-21932637)
chr5 (9-438)||(21938375-21938807)
chr5 (9-438)||(35582036-35582468)
chr5 (9-438)||(22882908-22883340)
chr5 (9-438)||(36989594-36990026)
chr5 (61-438)||(1219396-1219776)
chr5 (9-358)||(10777794-10778146)
chr5 (35-438)||(7425324-7425729)
chr5 (25-387)||(17471427-17471793)
chr5 (35-438)||(35790947-35791355)
chr5 (9-438)||(11211886-11212321)
chr5 (9-358)||(23514641-23514995)
chr5 (9-212)||(18777815-18778015)
chr5 (9-212)||(19500128-19500327)
chr5 (9-212)||(21073418-21073618)
chr5 (9-212)||(12603-12803)
chr5 (17-212)||(22366311-22366504)
chr5 (17-302)||(29188116-29188397)
chr5 (61-319)||(23328678-23328937)
chr5 (17-212)||(4199816-4200008)
chr5 (35-301)||(27009981-27010244)
chr5 (52-212)||(43443261-43443418)
chr5 (61-319)||(24616282-24616541)
chr5 (61-319)||(24712658-24712917)
chr5 (61-319)||(24745676-24745935)
chr5 (60-212)||(25426857-25427009)
chr5 (9-134)||(11343008-11343133)
chr5 (9-134)||(16105967-16106092)
chr5 (183-369)||(32950762-32950952)
chr5 (396-438)||(23328558-23328600)
chr5 (61-158)||(20623262-20623359)
chr5 (61-158)||(21233401-21233498)
chr5 (61-158)||(37053037-37053134)
chr5 (396-436)||(24616165-24616205)
chr5 (396-436)||(24712541-24712581)
chr5 (396-436)||(24745559-24745599)
chr5 (103-158)||(25900321-25900376)
chr5 (61-158)||(16536490-16536587)
[»] scaffold0213 (2 HSPs)
scaffold0213 (52-438)||(29162-29551)
scaffold0213 (9-71)||(29565-29626)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (9-438)||(18168970-18169402)
chr4 (35-438)||(15287096-15287501)
chr4 (52-438)||(15294221-15294610)
chr4 (103-438)||(19020486-19020824)
chr4 (9-358)||(7131887-7132241)
chr4 (9-438)||(17145479-17145913)
chr4 (61-358)||(20000803-20001103)
chr4 (91-438)||(18248218-18248568)
chr4 (103-318)||(22738390-22738607)
chr4 (9-300)||(10644360-10644647)
chr4 (35-304)||(22351915-22352184)
chr4 (61-319)||(26339140-26339399)
chr4 (112-227)||(8378365-8378480)
chr4 (35-212)||(47357883-47358057)
chr4 (225-438)||(8374508-8374724)
chr4 (9-135)||(14996444-14996572)
chr4 (103-178)||(9795490-9795564)
chr4 (35-134)||(14952085-14952183)
chr4 (208-369)||(40885585-40885748)
chr4 (103-141)||(8378486-8378524)
chr4 (61-158)||(16608972-16609069)
chr4 (397-438)||(22738269-22738310)
chr4 (61-158)||(26680493-26680590)
chr4 (103-158)||(16327841-16327896)
chr4 (396-438)||(22352260-22352302)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (9-438)||(153829-154263)
scaffold0023 (14-212)||(169738-169935)
scaffold0023 (17-207)||(36327-36514)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (35-438)||(1424-1831)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (25-438)||(2392-2810)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (31-438)||(10184-10595)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (9-358)||(1336-1690)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (9-438)||(7279-7712)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (9-438)||(33980-34414)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (192-438)||(3-252)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (9-302)||(5034-5329)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (9-212)||(20937-21139)
scaffold0139 (9-212)||(13883-14084)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (35-268)||(3895-4129)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (103-438)||(54416-54755)
scaffold0066 (103-369)||(45099-45369)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (9-212)||(10570-10775)
[»] scaffold0183 (2 HSPs)
scaffold0183 (52-319)||(6718-6986)
scaffold0183 (396-438)||(6598-6640)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (103-306)||(54008-54212)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (9-302)||(3101-3395)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (17-207)||(31506-31693)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (9-134)||(130880-131005)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (35-212)||(1153-1327)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (29-302)||(13169-13438)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (35-212)||(64372-64546)
scaffold0026 (103-204)||(107983-108084)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (35-299)||(177-438)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (143-306)||(3547-3711)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (35-319)||(23600-23884)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (20-134)||(17127-17241)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (103-319)||(7330-7547)
scaffold0003 (396-438)||(7210-7252)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (103-302)||(9266-9462)
scaffold0215 (103-302)||(16164-16360)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (103-207)||(12045-12149)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (183-369)||(56105-56294)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (103-178)||(13268-13342)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (35-127)||(154282-154373)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (25-134)||(803-914)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (35-134)||(5922-6022)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (103-177)||(34374-34450)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (61-158)||(22833-22930)
scaffold0141 (61-158)||(27088-27185)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (61-158)||(1455-1552)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (102-134)||(42677-42709)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 382; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Original strand, 18059582 - 18060014
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059582 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 18059681  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059682 agggggttagttattatcataatcatgtataatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 18059781  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059782 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 18059881  T
Q  307 gcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattat 405  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18059882 gcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctattgtaagtgaattat 18059981  T
Q  406 gaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059982 gatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 18060014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 17005070 - 17004638
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  17005070 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 17004971  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17004970 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 17004871  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17004870 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 17004771  T
Q  307 gcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattat 405  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  17004770 gcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattat 17004671  T
Q  406 gaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17004670 gatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 17004638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Original strand, 38054915 - 38055347
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  38054915 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 38055014  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  38055015 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcatcttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgcttttac 38055114  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055115 tgtgatgttattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 38055214  T
Q  307 gcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattat 405  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  38055215 gcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattat 38055314  T
Q  406 gaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055315 gatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 38055347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 17149000 - 17148647
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  17149000 gagaagaacaagagggttgaagggaaagcttgaggaatcaagtggggtgacataggagctgaattgaagcaagggttggggataatcaacttcaaaggta 17148901  T
Q  109 aggggg-ttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 207  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  17148900 aggggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttg 17148801  T
Q  208 ctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatta 305  Q
     |||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17148800 ttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatta 17148701  T
Q  306 tgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 358  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17148700 tacttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaatgagatgtaaatcatat 17148647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Original strand, 19962323 - 19962617
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  19962323 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggattcaatttgggcgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 19962422  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19962423 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 19962522  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 301  Q
    |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19962523 tgtaatgctattttcttgtgtttgaattgatgattatggtatgtttatgggtggaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 19962617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 61 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 46523768 - 46523394
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 160  Q
    |||||| | |||| ||||||| ||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  46523768 taggagataaattaaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttccat-tttgcattttctcatgtt 46523670  T
Q  161 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||  ||||    
T  46523669 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgtttatgttatgtttgtgggt 46523570  T
Q  261 gaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 357  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46523569 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttcattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcata 46523470  T
Q  358 ttccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattga 433  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  46523469 ttccattgatgttgttattgttaactgatgctgttgtgagtgaatcatgacttgggtatacttaattatggattga 46523394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22228236 - 22227947
Alignment:
Q  15 aacaagagtgttgaagggaa-agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaaggg 112  Q
    |||||| || |||||||||| | ||||| ||||||||| |||| | || | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22228236 aacaagggttttgaagggaataacttgaagaatcaattggggtaagcttaagagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaaggg 22228137  T
Q  113 ggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22228136 ggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtg 22228037  T
Q  213 gtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 302  Q
     || ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||    |||||||||| | |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  22228036 atgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 22227947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 64 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22232882 - 22232644
Alignment:
Q  64 gagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 163  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22232882 gagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 22232783  T
Q  164 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaa 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||    |||||    
T  22232782 tgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaa 22232683  T
Q  264 attacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 302  Q
    ||||| | |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  22232682 attacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 22232644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 61 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 22035827 - 22035568
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 160  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  ||| ||| ||||||||||    
T  22035827 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgtt 22035728  T
Q  161 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || ||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  22035727 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggat 22035629  T
Q  261 gaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 319  Q
    ||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  22035628 gaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 22035568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 61 - 319
Target Start/End: Original strand, 7640810 - 7641069
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 160  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  ||| ||| || |||||||    
T  7640810 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 7640909  T
Q  161 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || ||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  7640910 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggat 7641008  T
Q  261 gaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 319  Q
    ||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  7641009 gaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 7641069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 5072237 - 5072411
Alignment:
Q  35 agcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 134  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5072237 agctttaggaatcaagt-gggtgacttaggagctgaattgaagcaaagattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcat 5072335  T
Q  135 gtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 212  Q
    ||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  5072336 gt--aatttttgcatttactcaagttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 5072411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 103 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 2116589 - 2116393
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 202  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || || ||||||||    
T  2116589 aaggtaaaggggttagtgattatcataatcatgta--at-tttgcattttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgc 2116493  T
Q  203 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 301  Q
    | || ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| ||   ||||||||||| | |||||| |||||| ||||| |||||| ||||    
T  2116492 ttttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaa 2116394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 103 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 45051757 - 45051561
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 202  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||     
T  45051757 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgtg--at-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgt 45051661  T
Q  203 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 301  Q
    |||| ||||| || ||  ||  | ||| |||||||||||| || ||||| ||   ||||||||||| | |||||| |||||| ||||| |||||| ||||    
T  45051660 tcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaa 45051562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 134
Target Start/End: Original strand, 15861258 - 15861358
Alignment:
Q  35 agcttgaggaatcaatttgggtgac-ctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca 133  Q
    ||||||||||||||||| || | |  |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15861258 agcttgaggaatcaattgggataagtctaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagtctttatcataatca 15861357  T
Q  134 t 134  Q
    |    
T  15861358 t 15861358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 121 - 212
Target Start/End: Original strand, 18601052 - 18601141
Alignment:
Q  121 attatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 212  Q
    ||||||| |||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||    
T  18601052 attatcacaatcatgta--atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgctgtg 18601141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 55 - 125
Target Start/End: Original strand, 18598845 - 18598914
Alignment:
Q  55 gtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattat 125  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18598845 gtgacttaggagctgaattgaagcaagagttgggt-taatcttcttctaaggtaagggggttagttattat 18598914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 51452882 - 51452765
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg-- 158  Q
    |||||||| |||||||||   |||| ||  ||||| || || |||||||||||||||||  ||||| ||||||||| || |||||||| ||| |||||      
T  51452882 taggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcttaatcatgttcattctttgcaatttttcatgat 51452783  T
Q  159 ttgtatgaaaatgggttga 177  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  51452782 ttgtatg-aaatgggttga 51452765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 396 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22035490 - 22035448
Alignment:
Q  396 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22035490 agtgaattataacttgggtatacttaattatggattgatgatg 22035448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20254353 - 20254312
Alignment:
Q  397 gtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20254353 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 20254312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Original strand, 16376197 - 16376629
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  16376197 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 16376296  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16376297 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 16376396  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16376397 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 16376496  T
Q  307 gcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattat 405  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  16376497 gcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattat 16376596  T
Q  406 gaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16376597 gatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 16376629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Original strand, 16383521 - 16383953
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  16383521 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 16383620  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16383621 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 16383720  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16383721 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 16383820  T
Q  307 gcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattat 405  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  16383821 gcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattat 16383920  T
Q  406 gaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16383921 gatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 16383953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Original strand, 22225562 - 22225994
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22225562 gagaagaacaagagtgttgaatggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 22225661  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22225662 tgggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctctttc 22225761  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22225762 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 22225861  T
Q  307 gcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattat 405  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  22225862 gcttaattgatgaaatttgaaatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattat 22225961  T
Q  406 gaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22225962 gatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 22225994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 10489131 - 10488699
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  10489131 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 10489032  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10489031 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 10488932  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10488931 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 10488832  T
Q  307 gcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattat 405  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  10488831 gcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattat 10488732  T
Q  406 gaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10488731 gatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 10488699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 438
Target Start/End: Original strand, 16555973 - 16556395
Alignment:
Q  19 agagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttag 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16555973 agagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttag 16556072  T
Q  119 ttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgcta 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16556073 ttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgcta 16556172  T
Q  219 ttttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattga 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16556173 ttttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattga 16556272  T
Q  317 tgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggta 415  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16556273 tgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggta 16556372  T
Q  416 tacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16556373 tacttaattgtggattgatgatg 16556395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 438
Target Start/End: Original strand, 16632529 - 16632951
Alignment:
Q  19 agagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttag 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16632529 agagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttag 16632628  T
Q  119 ttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgcta 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16632629 ttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgcta 16632728  T
Q  219 ttttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattga 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16632729 ttttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattga 16632828  T
Q  317 tgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggta 415  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16632829 tgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggta 16632928  T
Q  416 tacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16632929 tacttaattgtggattgatgatg 16632951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 14 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 1556434 - 1556005
Alignment:
Q  14 gaacaagagtgttgaagggaa-agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagg 111  Q
    ||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||| ||| |   ||||| ||||| |||||||||    
T  1556434 gaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaattggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagtttgtgttaatcttcttctaaggtaagg 1556335  T
Q  112 gggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgt 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1556334 gggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgt 1556235  T
Q  212 ggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgct 309  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1556234 gatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatact 1556135  T
Q  310 taattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaa 408  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||    
T  1556134 taattgatgaaatttgatatgttttaattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgttattgtgagtgaattatgaa 1556035  T
Q  409 ttgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1556034 ttgggtatacttaattgtggattgatgatg 1556005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 35 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 19610425 - 19610018
Alignment:
Q  35 agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca 133  Q
    ||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19610425 agcttgaggaatcaattggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatca 19610326  T
Q  134 tgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttga 233  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  19610325 tgtacaatttttgcattttctgatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatga 19610226  T
Q  234 attgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgt 330  Q
    || |||| |||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  19610225 atcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttataaaattatacttcattgatgaaatttgatatgt 19610126  T
Q  331 tttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggat 430  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  19610125 tttgattgaaatgagatgtagttcatattccattgatgttgttattgttaactgatgctgttgtgagtgaatcatgacttgggtatacttaattatggat 19610026  T
Q  431 tgatgatg 438  Q
    ||||||||    
T  19610025 tgatgatg 19610018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 9 - 267
Target Start/End: Original strand, 22251390 - 22251648
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251390 gagaagaacaagagtgttgaatggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 22251489  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251490 tgggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 22251589  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaatta 267  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22251590 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaatta 22251648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 19299669 - 19299375
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  19299669 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggattcaatttgggcgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 19299570  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19299569 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 19299470  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 301  Q
    |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19299469 tgtaatgctattttcttgtgtttgaattgatgattatggtatgtttatgggtggaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 19299375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 35 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16232297 - 16231972
Alignment:
Q  35 agcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 134  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232297 agctttaggaatcaagt-gggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcat 16232199  T
Q  135 gtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaa 234  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16232198 gtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaa 16232099  T
Q  235 ttgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgtt 331  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16232098 ttgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgtt 16231999  T
Q  332 ttgattgaaatgagatgtgattcatat 358  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||    
T  16231998 ttgattgaaatgagatgtaaatcatat 16231972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 52 - 358
Target Start/End: Original strand, 18086690 - 18086999
Alignment:
Q  52 tgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattt 151  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  18086690 tgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattagtataatcatgtacaatttttgcattt 18086789  T
Q  152 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatg 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18086790 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatg 18086889  T
Q  252 tttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatg 348  Q
    |||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18086890 tttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatg 18086989  T
Q  349 tgattcatat 358  Q
    | | ||||||    
T  18086990 taaatcatat 18086999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 23978149 - 23977849
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 160  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23978149 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggcgttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 23978050  T
Q  161 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  23978049 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 23977950  T
Q  261 gaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 357  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  23977949 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcata 23977850  T
Q  358 t 358  Q
    |    
T  23977849 t 23977849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 103 - 358
Target Start/End: Original strand, 13620712 - 13620970
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 202  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13620712 aaggtaagggggttagtcttcttcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 13620811  T
Q  203 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaatt--acgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 300  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13620812 tcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 13620911  T
Q  301 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 358  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13620912 aattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 13620970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 27653814 - 27654006
Alignment:
Q  17 caagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggtt 116  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  27653814 caagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtgagggggtt 27653911  T
Q  117 agttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||    
T  27653912 agtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 27654006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 35 - 319
Target Start/End: Original strand, 29869627 - 29869911
Alignment:
Q  35 agcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatc-a 133  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29869627 agctttaggaatcaagt-gggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttgatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaa 29869725  T
Q  134 tgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttga 233  Q
    | || ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || ||||  |||||| | | |||    
T  29869726 tttaaaat-tttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gtttcttatacatga 29869823  T
Q  234 attgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 319  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||||  | ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  29869824 attgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataagtgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 29869911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 107 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 29666208 - 29665942
Alignment:
Q  107 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctct 205  Q
    |||| ||||||||  | ||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  29666208 taagtgggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatggggtgatggataattgttgttaaattcgtgctct 29666109  T
Q  206 tgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 303  Q
     |||||| || ||||||||| ||  |||||||||||| || ||||| ||  ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29666108 agctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgcataaatgtcaagttatgaaat 29666009  T
Q  304 tatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgt 369  Q
    | | || ||||| ||||  ||| || ||| |  |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  29666008 tgtactcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgt 29665942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 60 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25175945 - 25175792
Alignment:
Q  60 ctaggagctgaattgaagcaaggg-ttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcatttt-ctcat 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  25175945 ctaggagctgaattgaagcaaggggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattaccataatcatgtataat-tttgcatttttctcat 25175847  T
Q  158 gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  25175846 gttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 25175792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 302
Target Start/End: Original strand, 14625953 - 14626243
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  14625953 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gcttgaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 14626050  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctc--atgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctctt 206  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||  |||| ||  |||||  ||||||| || || || | | ||| | |||| ||| |||||||||||||||    
T  14626051 agggggttagttattatcacaatcatcttca--ctttacaaattctcaaatgttgtttg-aattgtgattatggataattattgctaaattcgtgctctt 14626147  T
Q  207 gctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 302  Q
    |||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| ||   ||||||||||| | |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  14626148 gctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 14626243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 351 - 438
Target Start/End: Original strand, 33314387 - 33314474
Alignment:
Q  351 attcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33314387 attcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 33314474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 114 - 212
Target Start/End: Original strand, 16825678 - 16825775
Alignment:
Q  114 gttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  16825678 gttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 16825775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 103 - 212
Target Start/End: Original strand, 1650022 - 1650128
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||    
T  1650022 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgta--at-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgc 1650118  T
Q  203 tcttgctgtg 212  Q
    |||| |||||    
T  1650119 tcttactgtg 1650128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15862916 - 15862744
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaa-agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaagg 106  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | || ||||| |||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| ||||    
T  15862916 gagaagaacaagagttttgaagagaatagcttgaggaatcaattggggtaagcttaggaggtgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaagg 15862817  T
Q  107 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctca--tgttgtatgaaaatgggttga 177  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| || |  ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  15862816 taagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttga 15862744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 4991470 - 4991396
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggtt-aggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4991470 taggagctgaattgaagcaagagtttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 4991396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 119
Target Start/End: Original strand, 16814837 - 16814930
Alignment:
Q  25 ttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagt 119  Q
    |||||||||| |||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16814837 ttgaagggaa-gctttagcaatcaagtggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagagggttagt 16814930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 177
Target Start/End: Original strand, 1657566 - 1657738
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaa-agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaagg 106  Q
    |||| ||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||| ||||    
T  1657566 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaattggggtaagcttaggagctgaattgaaacaagagtttgggttaatcttcttctaagg 1657665  T
Q  107 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctca--tgttgtatgaaaatgggttga 177  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| || |  ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  1657666 taagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttga 1657738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 258 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27741021 - 27740903
Alignment:
Q  258 ggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattc 354  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||| || ||  |  ||||| |||||| ||||||    
T  27741021 ggtgaaattacatgtttcgaagtatgtataaatgtcaagttatgaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtcgttgttgaattgagatatgattc 27740922  T
Q  355 atattccattgatgtggtt 373  Q
    || ||| ||||||||||||    
T  27740921 atgttcaattgatgtggtt 27740903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19629588 - 19629556
Alignment:
Q  183 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19629588 aattgttgttaaattcgtgctcttgttgtggtg 19629556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 362; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 7823160 - 7822728
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  7823160 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 7823061  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7823060 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 7822961  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7822960 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 7822861  T
Q  307 gcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattat 405  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  7822860 gcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattat 7822761  T
Q  406 gaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7822760 gatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 7822728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 7830471 - 7830039
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  7830471 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 7830372  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7830371 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 7830272  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7830271 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 7830172  T
Q  307 gcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattat 405  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  7830171 gcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattat 7830072  T
Q  406 gaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7830071 gatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 7830039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 27176865 - 27176433
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  27176865 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 27176766  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27176765 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 27176666  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27176665 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 27176566  T
Q  307 gcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattat 405  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  27176565 gcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattat 27176466  T
Q  406 gaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27176465 gatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 27176433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Original strand, 27101461 - 27101893
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  27101461 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 27101560  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101561 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 27101660  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101661 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 27101760  T
Q  307 gcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattat 405  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  27101761 gcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattat 27101860  T
Q  406 gaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101861 gatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 27101893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Original strand, 27108809 - 27109241
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  27108809 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 27108908  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27108909 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 27109008  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27109009 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 27109108  T
Q  307 gcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattat 405  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  27109109 gcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattat 27109208  T
Q  406 gaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27109209 gatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 27109241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Original strand, 38783553 - 38783985
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  38783553 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 38783652  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38783653 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 38783752  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38783753 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 38783852  T
Q  307 gcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattat 405  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  38783853 gcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattat 38783952  T
Q  406 gaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38783953 gatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 38783985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Original strand, 15950614 - 15951047
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaa-agcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggt 107  Q
    |||| ||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||    
T  15950614 gagaagaacaagggttttgaaggaaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttcaaaggt 15950713  T
Q  108 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15950714 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttg 15950813  T
Q  208 ctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatta 305  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15950814 ctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatta 15950913  T
Q  306 tgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaatta 404  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  15950914 tgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtgattattgttaactgatgctattgtaagtgaatca 15951013  T
Q  405 tgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15951014 tgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 15951047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 14 - 438
Target Start/End: Original strand, 15759941 - 15760370
Alignment:
Q  14 gaacaagagtgttgaagggaa-agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagg 111  Q
    ||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||| ||| |   ||||| ||||| |||||||||    
T  15759941 gaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaattggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagtttgtgttaatcttcttctaaggtaagg 15760040  T
Q  112 gggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgt 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15760041 gggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgt 15760140  T
Q  212 ggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgct 309  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15760141 gatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatgatatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatact 15760240  T
Q  310 taattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaa 408  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| || ||||||| |||||    
T  15760241 taattgatgaaatttgatatgttttaattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgttattgtgagtgaataatgaa 15760340  T
Q  409 ttgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15760341 ttgggtatacttaattgtggattgatgatg 15760370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 35 - 358
Target Start/End: Original strand, 18979872 - 18980197
Alignment:
Q  35 agcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 134  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18979872 agctttaggaatcaagt-gggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcat 18979970  T
Q  135 gtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaa 234  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18979971 gtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaa 18980070  T
Q  235 ttgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgtt 331  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  18980071 ttgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgtt 18980170  T
Q  332 ttgattgaaatgagatgtgattcatat 358  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||    
T  18980171 ttgattgaaatgagatgtaaatcatat 18980197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 35 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 15927973 - 15927648
Alignment:
Q  35 agcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 134  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15927973 agctttaggaatcaagt-gggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcat 15927875  T
Q  135 gtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaa 234  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  15927874 gtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgatcaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaa 15927775  T
Q  235 ttgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgtt 331  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15927774 ttgatgattatggtatgcttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgtt 15927675  T
Q  332 ttgattgaaatgagatgtgattcatat 358  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||    
T  15927674 ttgattgaaatgagatgtaaatcatat 15927648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Original strand, 14250721 - 14251074
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaa-agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaagg 106  Q
    |||| ||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||||||||||||| ||| | | | ||| ||||| ||||    
T  14250721 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaattggggtaagattaggagctgaattgaagcaagagtttg-agttatcttcttctaagg 14250819  T
Q  107 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctctt 206  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14250820 taagggggttagttatcatcgtaatcatgttcattttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctctt 14250919  T
Q  207 gctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 304  Q
    | |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14250920 gttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 14251019  T
Q  305 atgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 358  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14251020 atacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 14251074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 13758750 - 13758450
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 160  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13758750 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 13758651  T
Q  161 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  13758650 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 13758551  T
Q  261 gaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 357  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  13758550 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcata 13758451  T
Q  358 t 358  Q
    |    
T  13758450 t 13758450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2437888 - 2437686
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437888 gagaagaacaggagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 2437789  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  2437788 agggggttagttattatcataatcatgtacaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggataatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgt 2437690  T
Q  209 tgtg 212  Q
    ||||    
T  2437689 tgtg 2437686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 302
Target Start/End: Original strand, 16478786 - 16479075
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  16478786 gagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaagtgaagctagggttaaggataatcaacttcaaaggta 16478884  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |    
T  16478885 agggggttagtgattatcataatcattt--aat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttagattcgtgctcttac 16478981  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 302  Q
    || | || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| ||   ||||||||||| | |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  16478982 tgcgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16479075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10989814 - 10989638
Alignment:
Q  35 agcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 134  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  10989814 agcttgaggaatcaagtgaggtgacataggagcttaattgaagcaagggttagggataatcaacttcaaaggtatgggggttagtgattatcataatcat 10989715  T
Q  135 gtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 212  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||    
T  10989714 gtataat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 10989638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 320
Target Start/End: Original strand, 13910855 - 13911156
Alignment:
Q  17 caagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggtt 116  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  13910855 caagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggtt 13910952  T
Q  117 agttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgc 216  Q
    | | ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||| ||     
T  13910953 attgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgt 13911051  T
Q  217 tattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-attatgcttaatt 314  Q
    ||| ||  | ||| |||||||||| | || ||||| ||   ||||||||||| | |||| | |||| | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  13911052 tatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctcaatt 13911150  T
Q  315 gatgaa 320  Q
    | ||||    
T  13911151 ggtgaa 13911156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 103 - 306
Target Start/End: Original strand, 48622584 - 48622788
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 202  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |  ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  48622584 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaatttttgcattttctcatgttttacgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgc 48622683  T
Q  203 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 301  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||| ||| |||| ||||||||| ||||    
T  48622684 tcttactgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttcaaagcatgcataattgttaagttgtgaa 48622783  T
Q  302 attat 306  Q
    |||||    
T  48622784 attat 48622788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 35 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 13573079 - 13572816
Alignment:
Q  35 agcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 134  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13573079 agctttaggaatcaagt-gggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcat 13572981  T
Q  135 gtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaa 234  Q
    |||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| ||||    
T  13572980 gta--atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa 13572883  T
Q  235 ttgatgattatggtatgtttaggggtgaaattacgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 301  Q
    |||||||| || || || ||   ||||||||||| | |  || |||||| ||||| |||||||||||    
T  13572882 ttgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaa 13572816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 103 - 319
Target Start/End: Original strand, 10000288 - 10000505
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 202  Q
    |||||||||||||| ||  | ||||||||||  | |||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  10000288 aaggtaagggggtttgtcttcatcataatcaatttcaaattttgcatcttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaattcgtgc 10000387  T
Q  203 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 300  Q
    ||||| | || || |  |||||| | | ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  10000388 tcttgttatgttg-ttgtttcttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtga 10000486  T
Q  301 aattatgcttaattgatga 319  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  10000487 aattttgcttaattgatga 10000505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 103 - 204
Target Start/End: Original strand, 18253761 - 18253862
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 202  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18253761 aaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgc 18253860  T
Q  203 tc 204  Q
    ||    
T  18253861 tc 18253862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 103 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15862257 - 15862174
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862257 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 15862174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 103 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 16418835 - 16418618
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 202  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||  | |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  16418835 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 16418736  T
Q  203 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 300  Q
    ||||| | || ||||  || ||| | | ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  16418735 tcttgttatgttgct-gttgcttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtga 16418637  T
Q  301 aattatgcttaattgatga 319  Q
    |||| ||| ||||| ||||    
T  16418636 aattttgcctaattaatga 16418618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 13321407 - 13321134
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcat--g 158  Q
    |||||||| || ||||||   |||| ||| |||||||  || |||||||||||||||||  | ||||||||||||| || |  ||||| ||||||||  |    
T  13321407 taggagctaaagtgaagcctaggtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttg 13321308  T
Q  159 ttgtatgaaaatgggttga----------tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggt 248  Q
    ||||||||| |||||||||          || | |||||||| ||||||||||||||  ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||    
T  13321307 ttgtatgaatatgggttgaattgaataagtggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgt 13321208  T
Q  249 atgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa 320  Q
    ||| ||   |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  13321207 atgattgttggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaaattgtgctcaattggtgaa 13321134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Original strand, 15516719 - 15516793
Alignment:
Q  60 ctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15516719 ctaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaatgtaagggggttagtctttatcataatcat 15516793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 7293406 - 7293289
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg-- 158  Q
    |||||||| |||||||||   |||| ||  ||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||      
T  7293406 taggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgat 7293307  T
Q  159 ttgtatgaaaatgggttga 177  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  7293306 ttgtatg-aaatgggttga 7293289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 177
Target Start/End: Original strand, 30262002 - 30262119
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg-- 158  Q
    |||||||| |||||||||   |||| ||  ||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||      
T  30262002 taggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgat 30262101  T
Q  159 ttgtatgaaaatgggttga 177  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  30262102 ttgtatg-aaatgggttga 30262119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 11516617 - 11516520
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 158  Q
    |||||||| |||||||||   |||| ||  ||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  11516617 taggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 11516520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 158
Target Start/End: Original strand, 15441437 - 15441534
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 158  Q
    |||||||| |||||||||   |||| ||  ||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  15441437 taggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 15441534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 158
Target Start/End: Original strand, 14113904 - 14113959
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 158  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  14113904 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 14113959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 396 - 438
Target Start/End: Original strand, 10000583 - 10000625
Alignment:
Q  396 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10000583 agtgaattataacttgggtatacttaattatggattgatgatg 10000625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 396 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 16418540 - 16418498
Alignment:
Q  396 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16418540 agtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 16418498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 177
Target Start/End: Original strand, 14423555 - 14423629
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg--ttgtatgaaaatgggttga 177  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  14423555 aaggtaagggggttagtc-ttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttgtatg-aaatgggttga 14423629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 362; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Original strand, 1467563 - 1467995
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  1467563 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 1467662  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1467663 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 1467762  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1467763 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 1467862  T
Q  307 gcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattat 405  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  1467863 gcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattat 1467962  T
Q  406 gaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1467963 gatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 1467995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 49232868 - 49232436
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  49232868 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctatgagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 49232769  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49232768 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgc 49232669  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49232668 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 49232569  T
Q  307 gcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattat 405  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  49232568 gcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattat 49232469  T
Q  406 gaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49232468 gatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 49232436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Original strand, 12264615 - 12265049
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttggg-tgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggt 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  12264615 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttggggtgacctaggagctgaattgaagcaaaggttgggattaatcatcttcaaaggt 12264714  T
Q  108 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12264715 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttg 12264814  T
Q  208 ctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatta 305  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12264815 ctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgagatta 12264914  T
Q  306 tgcttaattgatgaaa--ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaatt 403  Q
    | ||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  | | |||||||| | | ||  |||||||    
T  12264915 tacttaattgatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaatt 12265014  T
Q  404 atgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12265015 atgacttgggtatacataattatggattgatgatg 12265049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 14 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 25059168 - 25058739
Alignment:
Q  14 gaacaagagtgttgaagggaa-agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagg 111  Q
    ||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||   |||||  ||||| |||||||||||||||    
T  25059168 gaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaattggggtaagcttaggagctgaattgaagcaaaaattagggttaatcttcttcaaaggtaagg 25059069  T
Q  112 gggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25059068 gggttagttattatcataatcatgcacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgt 25058969  T
Q  212 ggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgct 309  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25058968 gatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgct 25058869  T
Q  310 taattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaa 408  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| || ||||||| ||||     
T  25058868 taattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaacttatgctattgtgagtgaatcatgat 25058769  T
Q  409 ttgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25058768 ttgagtatacttaattgtgaattgatgatg 25058739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 9 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 12812273 - 12811938
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||    
T  12812273 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaactttaaaggta 12812174  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12812173 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatattgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 12812074  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12812073 tgtaatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtggaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaatttat 12811974  T
Q  307 gcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaa 341  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12811973 gcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaa 12811938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 25 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 22275626 - 22275260
Alignment:
Q  25 ttgaagggaa-agcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttatt 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||  |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22275626 ttgaagggaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaaaagttaaggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttatt 22275527  T
Q  124 atcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttc 223  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22275526 atcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgccattttc 22275427  T
Q  224 ttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa 321  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22275426 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcatgaaattatacttaattgatgaaa 22275327  T
Q  322 -ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatg 387  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22275326 tttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatg 22275260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 9 - 387
Target Start/End: Original strand, 15468162 - 15468545
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaa-agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaagg 106  Q
    |||| ||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||  |||||  ||||| ||||||||||    
T  15468162 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaattggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagaattagggttaatcttcttcaaagg 15468261  T
Q  107 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctctt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  15468262 taagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgaggaacaattgttgctaaattcgtgctctt 15468361  T
Q  207 gctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 304  Q
    ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15468362 gctatgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcatgaaatt 15468461  T
Q  305 atgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatg 387  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15468462 atacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatg 15468545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 35 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 5228719 - 5228317
Alignment:
Q  35 agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca 133  Q
    ||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5228719 agcttgaggaatcaattggggtaagcttaggagctgaattgaaacaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttatcatcataatca 5228620  T
Q  134 tgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttga 233  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||    
T  5228619 tgttcaatttttgcattttctcatgtgttatgaaaatgggttgatgaaca-ttgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatttccttgtgcatga 5228521  T
Q  234 attgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgt 330  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  5228520 attgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaaatatgtataaatgttaagttatgagattatacttaattgatgaaatttgatatgt 5228421  T
Q  331 tttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggat 430  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  5228420 tttgattgaaatgaggtgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtgaat 5228321  T
Q  431 tgat 434  Q
    ||||    
T  5228320 tgat 5228317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 103 - 438
Target Start/End: Original strand, 12902008 - 12902346
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 202  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  12902008 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataatttttgctaaattcgtgc 12902107  T
Q  203 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 300  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902108 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 12902207  T
Q  301 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtg 399  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||| || ||||    
T  12902208 aattatacttaattgattaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattattaactgatactattgtgagtg 12902307  T
Q  400 aattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    ||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  12902308 aatcatgatttggatatacttaattgtggattaatgatg 12902346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 18911427 - 18911073
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaa-agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaagg 106  Q
    |||| ||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| ||||    
T  18911427 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaattggggtaagattaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaagg 18911328  T
Q  107 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctctt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18911327 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctctt 18911228  T
Q  207 gctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 304  Q
    | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18911227 gttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 18911128  T
Q  305 atgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 358  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18911127 atacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 18911073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 268
Target Start/End: Original strand, 18896871 - 18897127
Alignment:
Q  14 gaacaagagtgttgaagggaa-agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagg 111  Q
    ||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| |||||||||    
T  18896871 gaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaattggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttccaaggtaagg 18896970  T
Q  112 gggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18896971 gggttagttattatcataatcatgtacaagttttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctcttgctgt 18897070  T
Q  212 ggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac 268  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  18897071 gatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtggaattac 18897127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 61 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 54651837 - 54651529
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 160  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| ||  |||||||| || |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  54651837 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 54651738  T
Q  161 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggt 260  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||  | ||    
T  54651737 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagt 54651638  T
Q  261 gaaatt--acgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 357  Q
    ||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||     
T  54651637 gaaattgcatgttgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatg 54651538  T
Q  358 ttccattga 366  Q
    |||||||||    
T  54651537 ttccattga 54651529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 103 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 44229323 - 44228985
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtg 201  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |  ||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  44229323 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaattttttca-tttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaatccgtg 44229225  T
Q  202 ctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 299  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  44229224 ctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagctatg 44229125  T
Q  300 aaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagt 398  Q
    ||||||| || ||||  ||||  |||||||||| |  || |||||||||||||||||| ||||||| | ||  ||  | | |||||||| | | ||  ||    
T  44229124 aaattatactcaattagtgaatcttgatatgttgttgttaaaatgagatgtgattcatgttccattaaggttattgctattaactgatgttgttgtgggt 44229025  T
Q  399 gaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  44229024 gaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 44228985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 41270478 - 41270304
Alignment:
Q  35 agcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 134  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41270478 agctttaggaatcaagt-gggtgacttaggagctgaattgaagcaaggattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcat 41270380  T
Q  135 gtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 212  Q
    ||  ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  41270379 gt--aatttttgcatctactcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 41270304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 55316622 - 55316448
Alignment:
Q  35 agcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 134  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  55316622 agctttaggaatcaagt-gggtgacttaggagctgaattgaagcaaggattagggttaatcttcttcaaaggtaaaggggttagttattatcacaatcat 55316524  T
Q  135 gtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 212  Q
    ||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  55316523 gt--aatttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 55316448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16821564 - 16821280
Alignment:
Q  14 gaacaagagtgttgaagggaa-agcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaaggg 112  Q
    ||||||| || |||||||||| | ||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||| |   ||||| ||||||||||||||||    
T  16821564 gaacaagggttttgaagggaataacttgaagaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagagtttgtgttaatcttcttcaaaggtaaggg 16821465  T
Q  113 ggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||    
T  16821464 ggttagttattatcacaatcatgt--aat-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaatccgtgctcttgctgtg 16821368  T
Q  213 gtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 300  Q
     || ||| ||  | ||| | |||||||||| || ||||| ||   ||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  16821367 atgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgttaagctatga 16821280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 322 - 438
Target Start/End: Original strand, 18897139 - 18897255
Alignment:
Q  322 ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatactta 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||    
T  18897139 ttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatactta 18897238  T
Q  422 attgtggattgatgatg 438  Q
    |||||||||||||||||    
T  18897239 attgtggattgatgatg 18897255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 103 - 204
Target Start/End: Original strand, 15936553 - 15936654
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 202  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15936553 aaggtatgggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgc 15936652  T
Q  203 tc 204  Q
    ||    
T  15936653 tc 15936654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 103 - 204
Target Start/End: Original strand, 15938395 - 15938496
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 202  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  15938395 aaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaatacgtgc 15938494  T
Q  203 tc 204  Q
    ||    
T  15938495 tc 15938496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 103 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15615168 - 15615032
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||| ||||    
T  15615168 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgta--at-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagatttgtgc 15615072  T
Q  203 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgat 242  Q
    |||| |||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||||    
T  15615071 tcttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgat 15615032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 14842392 - 14842519
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaa-agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaagg 106  Q
    |||| ||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||||||| |||| | || |||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||    
T  14842392 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgagggatcaattggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcttcttctaagg 14842491  T
Q  107 taagggggttagttattatcataatcat 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||    
T  14842492 taagggggttagtctttatcataatcat 14842519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 23492823 - 23492696
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaa-agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaagg 106  Q
    |||| ||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| || || ||||    
T  23492823 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaatttgggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcatctaagg 23492724  T
Q  107 taagggggttagttattatcataatcat 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||    
T  23492723 taagggggttagtctttatcataatcat 23492696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 135
Target Start/End: Original strand, 8268609 - 8268683
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 135  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8268609 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 8268683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 135
Target Start/End: Original strand, 8275709 - 8275783
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 135  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8275709 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 8275783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 369
Target Start/End: Original strand, 11986172 - 11986361
Alignment:
Q  183 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| ||  || |||||||||  |||| |||||||    
T  11986172 aattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgttttaaagtat 11986271  T
Q  281 gtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgt 369  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||| || |  ||||  ||| || ||| |  |||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  11986272 gtattaatgtcaagttatgaaattgtgctcaaatagtgaattttgctaagttgttgttgaaaagatatgtgattcatgttccattgatgt 11986361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 158
Target Start/End: Original strand, 2449111 - 2449208
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 158  Q
    |||||||| |||||||||   |||| ||  ||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  2449111 taggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 2449208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 13954738 - 13954880
Alignment:
Q  37 cttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 135  Q
    ||||| ||||| | |||||||| || ||||||| |||||||||   |||| ||  ||||| || || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  13954738 cttgaagaatccaattgggtgagcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttaccataatcatg 13954837  T
Q  136 tacaatctttgcattttctcatg--ttgtatgaaaatgggttga 177  Q
    | || |||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  13954838 ttcattctttgcaatttttcatgaattgtatg-aaatgggttga 13954880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 45861220 - 45861078
Alignment:
Q  37 cttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 135  Q
    ||||| ||||| | |||||||| || ||||||| |||||||||   |||| ||  ||||| || || |||||||||||||||||  ||| |||||||||     
T  45861220 cttgaagaatccaattgggtgagcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttaccataatcata 45861121  T
Q  136 tacaatctttgcattttctcatg--ttgtatgaaaatgggttga 177  Q
    | || |||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  45861120 ttcattctttgcaatttttcatgaattgtatg-aaatgggttga 45861078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 362; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Original strand, 11231162 - 11231594
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  11231162 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 11231261  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11231262 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 11231361  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11231362 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 11231461  T
Q  307 gcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattat 405  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  11231462 gcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattat 11231561  T
Q  406 gaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11231562 gatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 11231594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Original strand, 22513009 - 22513441
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  22513009 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 22513108  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22513109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 22513208  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22513209 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 22513308  T
Q  307 gcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattat 405  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  22513309 gcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattat 22513408  T
Q  406 gaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22513409 gatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 22513441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Original strand, 28775631 - 28776063
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  28775631 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 28775730  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28775731 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 28775830  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28775831 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 28775930  T
Q  307 gcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattat 405  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  28775931 gcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattat 28776030  T
Q  406 gaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28776031 gatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 28776063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Original strand, 24685605 - 24686037
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  24685605 gagaagaacaaaagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 24685704  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24685705 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 24685804  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24685805 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 24685904  T
Q  307 gcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattat 405  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24685905 gcttaattgatgaaatttgatgtgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattat 24686004  T
Q  406 gaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24686005 gatttaggtatacttaattgtggattgatgatg 24686037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 16936027 - 16935593
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaa-agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaagg 106  Q
    |||| ||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||| ||| ||| ||  ||||| ||||| ||||    
T  16936027 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaattggggtaagcttaggagctgaattgaagaaagagtttgggttaatcttcttctaagg 16935928  T
Q  107 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctctt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16935927 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctctt 16935828  T
Q  207 gctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 304  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16935827 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 16935728  T
Q  305 atgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaatt 403  Q
    || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||     
T  16935727 atactttattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaaatgatgctattgtgagtgaatc 16935628  T
Q  404 atgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16935627 atgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 16935593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 17006687 - 17006253
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaa-agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaagg 106  Q
    |||| ||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||| ||| ||| ||  ||||| ||||| ||||    
T  17006687 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaattggggtaagcttaggagctgaattgaagaaagagtttgggttaatcttcttctaagg 17006588  T
Q  107 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctctt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17006587 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctctt 17006488  T
Q  207 gctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 304  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17006487 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 17006388  T
Q  305 atgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaatt 403  Q
    || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||     
T  17006387 atactttattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaaatgatgctattgtgagtgaatc 17006288  T
Q  404 atgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17006287 atgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 17006253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 61 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 12728772 - 12728392
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 160  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12728772 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 12728673  T
Q  161 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  12728672 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 12728573  T
Q  261 gaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 357  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12728572 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattattcttaattgatgaaatttgatatgtttttattgaaatgagatgtgattcata 12728473  T
Q  358 ttccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12728472 ttccattgatgtggttattgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 12728392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 61 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 34824855 - 34824475
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 160  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34824855 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 34824756  T
Q  161 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  34824755 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 34824656  T
Q  261 gaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 357  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34824655 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattattcttaattgatgaaatttgatatgtttttattgaaatgagatgtgattcata 34824556  T
Q  358 ttccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34824555 ttccattgatgtggttattgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 34824475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 103 - 438
Target Start/End: Original strand, 23777963 - 23778301
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 202  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23777963 aaggtaaaggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 23778062  T
Q  203 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 300  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23778063 tcttgctgtgatgctattttcttatgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 23778162  T
Q  301 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtg 399  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||    
T  23778163 aattatacttaattgatgaaatttgatatgatttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgctattgtgagtg 23778262  T
Q  400 aattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23778263 aatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 23778301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Original strand, 42177791 - 42178145
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaa-agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaagg 106  Q
    |||| ||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |  | ||| |||||||||||||||| |||  |  ||||| ||||| ||||    
T  42177791 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaattggggtaagattaggggctgaattgaagcaagagtttaggttaatcttcttctaagg 42177890  T
Q  107 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctctt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42177891 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctctt 42177990  T
Q  207 gctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 304  Q
    | |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42177991 gttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 42178090  T
Q  305 atgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 358  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  42178091 atacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 42178145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 8944226 - 8943926
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 160  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8944226 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 8944127  T
Q  161 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  8944126 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatatttgtgggt 8944027  T
Q  261 gaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 357  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  8944026 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcata 8943927  T
Q  358 t 358  Q
    |    
T  8943926 t 8943926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Original strand, 12635744 - 12636044
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 160  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  12635744 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcatttcctcatgtt 12635843  T
Q  161 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggt 260  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  12635844 gtatgaaaataggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 12635943  T
Q  261 gaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 357  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  12635944 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcata 12636043  T
Q  358 t 358  Q
    |    
T  12636044 t 12636044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 64 - 358
Target Start/End: Original strand, 3798482 - 3798779
Alignment:
Q  64 gagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 163  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3798482 gagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgta 3798581  T
Q  164 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaa 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  3798582 tgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 3798681  T
Q  264 attac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 358  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  3798682 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 3798779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Original strand, 12641518 - 12641818
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 160  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12641518 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcatctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 12641617  T
Q  161 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |    
T  12641618 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggct 12641717  T
Q  261 gaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 357  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  12641718 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcata 12641817  T
Q  358 t 358  Q
    |    
T  12641818 t 12641818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Original strand, 19886484 - 19886684
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | ||||||| |||||||||||    
T  19886484 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggta 19886581  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  19886582 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgc 19886680  T
Q  209 tgtg 212  Q
    ||||    
T  19886681 tgtg 19886684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 150 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 21142187 - 21141895
Alignment:
Q  150 tttctcatg-ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggt 248  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21142187 tttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaggattatggt 21142088  T
Q  249 atgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgag 345  Q
    ||||||  || |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||  ||||  |||||||||| |  || |||||||    
T  21142087 atgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagctatgaaattatactcaattagtgaatcttgatatgttgttgttaaaatgag 21141988  T
Q  346 atgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||  ||  | | |||||||| | | ||  |||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21141987 atgtgattcatgttccattaaggttattgctattaactgatgttgttgtgggtgaattacgacttgggtatacataattatggattgatgatg 21141895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 61 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 23774516 - 23774257
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 160  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||| ||| || |||||||    
T  23774516 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaagttcaaattttacatcttttcatgtt 23774417  T
Q  161 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || ||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  23774416 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggat 23774318  T
Q  261 gaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 319  Q
    ||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  23774317 gaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 23774257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 103 - 319
Target Start/End: Original strand, 5888548 - 5888765
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 202  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||  | |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  5888548 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 5888647  T
Q  203 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 300  Q
    ||||| | || ||||  || ||| | | ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  5888648 tcttgttatgttgct-gttgcttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtga 5888746  T
Q  301 aattatgcttaattgatga 319  Q
    |||| ||| ||||| ||||    
T  5888747 aattttgcctaattaatga 5888765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 134
Target Start/End: Original strand, 24826531 - 24826646
Alignment:
Q  17 caagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggtt 116  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  24826531 caagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaaaggggtt 24826628  T
Q  117 agttattatcataatcat 134  Q
    ||| || |||||||||||    
T  24826629 agtcatcatcataatcat 24826646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 25213446 - 25213372
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggtt-aggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25213446 taggagctgaattgaagcaagagtttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25213372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 103 - 302
Target Start/End: Original strand, 7507758 - 7507969
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcat--gttgtatgaaaatgggttga----------tgaacaattgttg 190  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||| || |  ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||          |||| |||| |||    
T  7507758 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaatgaatgaataattattg 7507857  T
Q  191 ttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatg 289  Q
     |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||   ||||||||||| | |||||| |||||| ||||     
T  7507858 ctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaata 7507956  T
Q  290 ttaagttatgaaa 302  Q
     ||||||||||||    
T  7507957 ataagttatgaaa 7507969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 158
Target Start/End: Original strand, 14906313 - 14906410
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 158  Q
    |||||||| |||||||||   |||| ||  ||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  14906313 taggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 14906410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 103 - 177
Target Start/End: Original strand, 19689316 - 19689391
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg--ttgtatgaaaatgggttga 177  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  19689316 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttgtatg-aaatgggttga 19689391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 23820461 - 23820364
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 158  Q
    |||||||| |||||||||   |||| ||  ||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  23820461 taggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 23820364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 396 - 438
Target Start/End: Original strand, 5888843 - 5888885
Alignment:
Q  396 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5888843 agtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 5888885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 396 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 23774179 - 23774137
Alignment:
Q  396 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23774179 agtgaattataacttgggtatacttaattatggattgatgatg 23774137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 177
Target Start/End: Original strand, 17396568 - 17396643
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg--ttgtatgaaaatgggttga 177  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  17396568 aaggtaagggggttagtctttaccataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttgtatg-aaatgggttga 17396643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 20015401 - 20015304
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 158  Q
    |||||||| |||||||||   |||| ||  ||||| || || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  20015401 taggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcatgatcatgttcattctttgcaatttttcatg 20015304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 31741 - 31309
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  31741 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 31642  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31641 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 31542  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31541 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 31442  T
Q  307 gcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattat 405  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  31441 gcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattat 31342  T
Q  406 gaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31341 gatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 31309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 152 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 39935 - 39646
Alignment:
Q  152 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatg 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  39935 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgattctattttcctgtgcatgaattgatgattatggtatt 39836  T
Q  252 tttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatg 348  Q
    |||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  39835 tttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattattcttaattgatgaaatttgatatgttttttttgaaatgagatg 39736  T
Q  349 tgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    | ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39735 ttattcatatttcattgatgttgttattgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 39646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 39535 - 39103
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  39535 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 39436  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39435 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 39336  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39335 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 39236  T
Q  307 gcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattat 405  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  39235 gcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattat 39136  T
Q  406 gaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39135 gatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 39103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 43426 - 43137
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||||    
T  43426 gagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagt-gggtgatctaggagctgaagtgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 43328  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcatttt-ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 207  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||    
T  43327 agggggttagttactatcacaaacatgta--at-tttgcatttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgtcaaattcgtgctcttg 43231  T
Q  208 ctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 301  Q
    ||| | || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| ||   ||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  43230 ctgggatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatgaa 43137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Original strand, 271184 - 271616
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  271184 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 271283  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  271284 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 271383  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  271384 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 271483  T
Q  307 gcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattat 405  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  271484 gcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattat 271583  T
Q  406 gaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  271584 gatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 271616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 644736 - 644304
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  644736 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 644637  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  644636 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 644537  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  644536 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 644437  T
Q  307 gcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattat 405  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  644436 gcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattat 644337  T
Q  406 gaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  644336 gatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 644304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 830471 - 830039
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  830471 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 830372  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  830371 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 830272  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  830271 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 830172  T
Q  307 gcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattat 405  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  830171 gcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattat 830072  T
Q  406 gaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  830071 gatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 830039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Original strand, 22088618 - 22089050
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  22088618 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 22088717  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22088718 agggggttagttatcatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgtgttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 22088817  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22088818 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttataggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 22088917  T
Q  307 gcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattat 405  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  22088918 gcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattat 22089017  T
Q  406 gaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22089018 gatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 22089050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Original strand, 15318983 - 15319415
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  15318983 gagaagaacaagagtgttgaaggaaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 15319082  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15319083 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 15319182  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15319183 tgtgatactattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttctaagtatgtataaatgttgagttatgaaattat 15319282  T
Q  307 gcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattat 405  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  15319283 gcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatgttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattat 15319382  T
Q  406 gaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15319383 gatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 15319415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Original strand, 15499352 - 15499784
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  15499352 gagaagaacaagagtgttgaaggaaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 15499451  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15499452 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 15499551  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15499552 tgtgatactattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttctaagtatgtataaatgttgagttatgaaattat 15499651  T
Q  307 gcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattat 405  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  15499652 gcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatgttccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattat 15499751  T
Q  406 gaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15499752 gatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 15499784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 35 - 438
Target Start/End: Original strand, 22006107 - 22006514
Alignment:
Q  35 agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca 133  Q
    ||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||| ||| |   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006107 agcttgaggaatcaattggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagtttgagttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca 22006206  T
Q  134 tgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttga 233  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  22006207 tgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatga 22006306  T
Q  234 attgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgt 330  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22006307 attgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgt 22006406  T
Q  331 tttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggat 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  22006407 tttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaactgatgttattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggac 22006506  T
Q  431 tgatgatg 438  Q
    ||||||||    
T  22006507 tgatgatg 22006514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Original strand, 13662087 - 13662521
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaa-agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaagg 106  Q
    |||| ||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| ||||    
T  13662087 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaattggggtaagattaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaagg 13662186  T
Q  107 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctctt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13662187 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgataaacaattgttgctaaattcgtgctctt 13662286  T
Q  207 gctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 304  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13662287 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaatgnatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 13662386  T
Q  305 atgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaatt 403  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||     
T  13662387 atgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaactgatgctattgtgagtgaatc 13662486  T
Q  404 atgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  13662487 atgatttgggtatacataattatggattgatgatg 13662521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Original strand, 13720750 - 13721104
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaa-agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaagg 106  Q
    |||| ||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| ||||    
T  13720750 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaattggggtaagattaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaagg 13720849  T
Q  107 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctctt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13720850 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctctt 13720949  T
Q  207 gctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 304  Q
    | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13720950 gttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 13721049  T
Q  305 atgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 358  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13721050 atacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 13721104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 61 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 16195611 - 16195230
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 160  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16195611 taggagttgaattgaagcaagagtttgggttaatcatcttctaaggtaagggggttaattattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 16195512  T
Q  161 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  16195511 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgttctcgtgctgtgatgctatgttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 16195412  T
Q  261 gaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa--ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcat 356  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  16195411 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgagattatacttaatttatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcat 16195312  T
Q  357 attccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
     |||||||||||| |||  | | |||||||| | | |   ||||||||||| || ||||||  ||||| |||||||||||||    
T  16195311 gttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgagggtgaattatgacttaggtatatataattatggattgatgatg 16195230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Original strand, 16872927 - 16873227
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 160  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |   ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16872927 taggagctaaattgaagcaagagtttgagttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 16873026  T
Q  161 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  16873027 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 16873126  T
Q  261 gaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 357  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  16873127 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcata 16873226  T
Q  358 t 358  Q
    |    
T  16873227 t 16873227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 302
Target Start/End: Original strand, 6774083 - 6774371
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  6774083 gagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagt-gggtgac-taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 6774180  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||| |    
T  6774181 agggggttagtgattatcataatcatgt--aat-tttgcattttctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttac 6774277  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 302  Q
    |||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| ||   ||||||||||| | |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  6774278 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 6774371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 24549409 - 24549120
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  24549409 gagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaagtgaagctagggttaaggataatcaacttctaaggta 24549311  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||| |    
T  24549310 agggggttagtgattatcataatcatgt--aat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttac 24549214  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 302  Q
    |||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| ||   ||||||||||| | |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  24549213 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 24549120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 30121144 - 30120951
Alignment:
Q  17 caagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggtt 116  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  30121144 caagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagtaagggttagagataatcatcttcaaaggtaagggggtt 30121047  T
Q  117 agttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  30121046 agtgattatcataatcatgtgtaatttttgtataatctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 30120951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Original strand, 21844394 - 21844684
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaaggga-aagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggt 107  Q
    |||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| || ||| ||| ||| | ||||||| |||||| |||    
T  21844394 gagaagaacaagagtgttggagggggaagcttgaggaatcaagt-gggtgacctagaagctgaagtggagctaggattaaggataatcaacttcaacggt 21844492  T
Q  108 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  21844493 aagggggttagttattatcacaatcatgta--atttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 21844590  T
Q  208 ctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattacgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 301  Q
    ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| ||   ||||||||||| | |  || |||||| ||||| |||||||||||    
T  21844591 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaa 21844684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Original strand, 21851787 - 21852077
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaaggga-aagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggt 107  Q
    |||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| || ||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||    
T  21851787 gagaagaacaagagtgttggagggggaagcttgaggaatcaagt-gggtgacctagaagctgaagtggagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 21851885  T
Q  108 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  21851886 aagggggttagttattatcacaatcatgta--atttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 21851983  T
Q  208 ctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattacgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 301  Q
    ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| ||   ||||||||||  | |  || |||||| ||||| |||||||||||    
T  21851984 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaa 21852077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 52 - 212
Target Start/End: Original strand, 16674258 - 16674415
Alignment:
Q  52 tgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattt 151  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| |||  |  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  16674258 tgggtgacttatgagctgaattgaagcaagagttgagt-taatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--atttttgcattt 16674354  T
Q  152 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 212  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||| |||||    
T  16674355 gctcatgttgtatgaaaatgggttgttgaacaattcatgctaaattcgtgctctttctgtg 16674415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17345985 - 17345842
Alignment:
Q  37 cttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 135  Q
    ||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||  ||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  17345985 cttgaggaatcaattggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttcttaggtaagggggttagtcttcatcataatcatg 17345886  T
Q  136 tacaatctttgcattttctca--tgttgtatgaaaatgggttga 177  Q
    | || |  ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  17345885 ttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttga 17345842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 49
Target Start/End: Original strand, 17142854 - 17142894
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaa 49  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17142854 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaa 17142894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 177
Target Start/End: Original strand, 22907087 - 22907204
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg-- 158  Q
    |||||||| |||||||||   |||| ||  ||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||      
T  22907087 taggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgat 22907186  T
Q  159 ttgtatgaaaatgggttga 177  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  22907187 ttgtatg-aaatgggttga 22907204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 5238477 - 5238380
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 158  Q
    |||||||| |||||||||   |||| ||  ||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  5238477 taggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 5238380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 158
Target Start/End: Original strand, 24661121 - 24661218
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 158  Q
    |||||||| |||||||||   |||| ||  ||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  24661121 taggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 24661218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 43685936 - 43685839
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 158  Q
    |||||||| |||||||||   |||| ||  ||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  43685936 taggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 43685839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Original strand, 21932205 - 21932637
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  21932205 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 21932304  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21932305 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 21932404  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21932405 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 21932504  T
Q  307 gcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattat 405  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  21932505 gcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgccattgtaagtgaattat 21932604  T
Q  406 gaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21932605 gatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 21932637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Original strand, 21938375 - 21938807
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  21938375 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 21938474  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21938475 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 21938574  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21938575 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 21938674  T
Q  307 gcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattat 405  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  21938675 gcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgccattgtaagtgaattat 21938774  T
Q  406 gaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21938775 gatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 21938807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 35582468 - 35582036
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  35582468 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 35582369  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35582368 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 35582269  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35582268 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 35582169  T
Q  307 gcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattat 405  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  35582168 gcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattat 35582069  T
Q  406 gaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35582068 gatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 35582036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Original strand, 22882908 - 22883340
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  22882908 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgggaaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagggataatcaacttcaaagata 22883007  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22883008 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaatttgtgctcttgc 22883107  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22883108 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 22883207  T
Q  307 gcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattat 405  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  22883208 gcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattat 22883307  T
Q  406 gaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22883308 gatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 22883340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Original strand, 36989594 - 36990026
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  36989594 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 36989693  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36989694 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctctagc 36989793  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36989794 tgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 36989893  T
Q  307 gcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattat 405  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  36989894 gcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattat 36989993  T
Q  406 gaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36989994 gatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 36990026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 61 - 438
Target Start/End: Original strand, 1219396 - 1219776
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 160  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1219396 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 1219495  T
Q  161 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  1219496 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcattaattgatgattatggtatgtttgtgggt 1219595  T
Q  261 gaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 357  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1219596 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 1219695  T
Q  358 ttccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1219696 tttcattgatgtggttattgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 1219776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Original strand, 10777794 - 10778146
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  10777794 gagaagaacaagagagttgaaggggaagcttgaggaatcaagtggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaaggataatcatcttcaaaggta 10777893  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10777894 aggggggtagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgc 10777993  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10777994 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 10778093  T
Q  307 gcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 358  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  10778094 gcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 10778146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 35 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 7425729 - 7425324
Alignment:
Q  35 agcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 134  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7425729 agctttaggaatcaagt-gggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcat 7425631  T
Q  135 gtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaa 234  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  7425630 gtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaa 7425531  T
Q  235 ttgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgtt 331  Q
    | |||| |||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  7425530 tcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttcattgatgaaatttgatatgtt 7425431  T
Q  332 ttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggatt 431  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  7425430 ttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgctgttgtgagtgaatcatgacttggatatacttaattatggatt 7425331  T
Q  432 gatgatg 438  Q
    |||||||    
T  7425330 gatgatg 7425324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 25 - 387
Target Start/End: Original strand, 17471427 - 17471793
Alignment:
Q  25 ttgaagggaa-agcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttatt 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17471427 ttgaagggaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagagtttgagttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttatt 17471526  T
Q  124 atcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttc 223  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17471527 atcataatcatgtacaaattttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 17471626  T
Q  224 ttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa 321  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  17471627 ttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtaatgaaattatacttaattgatgaaa 17471726  T
Q  322 -ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatg 387  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17471727 tttgatatgttttgattgaaataagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatg 17471793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 35 - 438
Target Start/End: Original strand, 35790947 - 35791355
Alignment:
Q  35 agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca 133  Q
    ||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35790947 agcttgaggaatcaattggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatca 35791046  T
Q  134 tgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttga 233  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  35791047 tgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatga 35791146  T
Q  234 attgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa--ttgatatg 329  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  35791147 attgatgattatggtatgtttgtgagtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgagattatacttaattgatgaaattttgatatg 35791246  T
Q  330 ttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtgga 429  Q
    || |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  | | |||||||| | | |   ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  35791247 ttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgagggtgaattatgacttgggtatacataattatgga 35791346  T
Q  430 ttgatgatg 438  Q
    |||||||||    
T  35791347 ttgatgatg 35791355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Original strand, 11211886 - 11212321
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaa-agcttgaggaatcaa--tttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaag 105  Q
    |||| ||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||  || |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  11211886 gagaagaacaagggttttgaagggaatagcttgaagaatcaaaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaag 11211985  T
Q  106 gtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctct 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  11211986 gtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctct 11212085  T
Q  206 tgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 303  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11212086 tgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtgtgtataaatgttaagttatgaaat 11212185  T
Q  304 tatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaat 402  Q
    ||| || || |  ||||  || ||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  | | |||||||| | | ||  ||| ||    
T  11212186 tatactcaagtagtgaattttaatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtggat 11212285  T
Q  403 tatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11212286 tatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 11212321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 23514995 - 23514641
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaa-agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaagg 106  Q
    |||| ||||||| || |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| ||||    
T  23514995 gagaagaacaagggttttgaagagaataacttgaggaatcaattggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaagg 23514896  T
Q  107 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctctt 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23514895 taagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctctt 23514796  T
Q  207 gctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 304  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23514795 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 23514696  T
Q  305 atgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 358  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  23514695 atacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 23514641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Original strand, 18777815 - 18778015
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||    
T  18777815 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gcttgaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataattaacttcaaaggta 18777912  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18777913 agggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttaaattcgtgctcttgc 18778011  T
Q  209 tgtg 212  Q
    ||||    
T  18778012 tgtg 18778015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19500327 - 19500128
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  19500327 gagaagaacaagagagttgaagggaa-gcttgaggaatcaagt-gggtgac-taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 19500231  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||    
T  19500230 agggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacacttcatgctaaattcgtgctcttgc 19500132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Original strand, 21073418 - 21073618
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||||    
T  21073418 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 21073515  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  21073516 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttaatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgc 21073614  T
Q  209 tgtg 212  Q
    ||||    
T  21073615 tgtg 21073618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12803 - 12603
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| | ||||||| |||||||||||    
T  12803 gagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggta 12706  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  12705 agggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgc 12607  T
Q  209 tgtg 212  Q
    ||||    
T  12606 tgtg 12603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 22366311 - 22366504
Alignment:
Q  17 caagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggtt 116  Q
    |||||| ||||||||||| |||| || |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22366311 caagagggttgaagggaa-gctttagcaatcaagtggggtgacctaggagttgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggtt 22366409  T
Q  117 agttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 212  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||    
T  22366410 agtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 22366504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 302
Target Start/End: Original strand, 29188116 - 29188397
Alignment:
Q  17 caagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggtt 116  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  29188116 caagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggtt 29188214  T
Q  117 agttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgc 216  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || || |||||||||||| ||||| ||     
T  29188215 agtgattattataatcatgt--aat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggtcgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttactgtgatgt 29188311  T
Q  217 tattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 302  Q
    ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| ||   ||||||||||| | |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  29188312 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 29188397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 61 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 23328937 - 23328678
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 160  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  ||| ||| || |||||||    
T  23328937 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 23328838  T
Q  161 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || ||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  23328837 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggat 23328739  T
Q  261 gaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 319  Q
    ||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  23328738 gaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 23328678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 212
Target Start/End: Original strand, 4199816 - 4200008
Alignment:
Q  17 caagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggtt 116  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  4199816 caagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggtt 4199913  T
Q  117 agttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 212  Q
    ||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  || |||||||||||||||| ||||    
T  4199914 agggattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtg 4200008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 35 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27010244 - 27009981
Alignment:
Q  35 agcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 134  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27010244 agctttaggaatcaagt-gggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcat 27010146  T
Q  135 gtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaa 234  Q
    |||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| ||||    
T  27010145 gta--atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa 27010048  T
Q  235 ttgatgattatggtatgtttaggggtgaaattacgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 301  Q
    |||||||| || |||||  |   ||||||||||| | |  || |||||| ||||| |||||||||||    
T  27010047 ttgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaa 27009981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 52 - 212
Target Start/End: Original strand, 43443261 - 43443418
Alignment:
Q  52 tgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||   |||||| |    
T  43443261 tgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaa---ttgcatat 43443357  T
Q  152 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 212  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  43443358 tctcatgttatatgaaaatggattgatgaacaattcatgttaaattcgtgctcttgctgtg 43443418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 61 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 24616541 - 24616282
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 160  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  ||| ||| || |||||||    
T  24616541 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 24616442  T
Q  161 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || ||||  |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||  || |    
T  24616441 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgataattatggtatgtttgtggat 24616343  T
Q  261 gaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 319  Q
    ||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  24616342 gaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 24616282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 61 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 24712917 - 24712658
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 160  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  ||| ||| || |||||||    
T  24712917 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 24712818  T
Q  161 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || ||||  |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||  || |    
T  24712817 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgataattatggtatgtttgtggat 24712719  T
Q  261 gaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 319  Q
    ||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  24712718 gaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 24712658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 61 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 24745935 - 24745676
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 160  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  ||| ||| || |||||||    
T  24745935 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 24745836  T
Q  161 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || ||||  |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||  || |    
T  24745835 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgataattatggtatgtttgtggat 24745737  T
Q  261 gaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 319  Q
    ||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  24745736 gaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 24745676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25427009 - 25426857
Alignment:
Q  60 ctaggagctgaattgaagcaaggg-ttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  25427009 ctaggagctgaattgaagcaaggggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcattttctcatg 25426911  T
Q  159 ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  25426910 ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 25426857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 11343133 - 11343008
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  11343133 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaagtggggtgacctaggagctgaattgaagcagaggttagggttaatcttcttcaaaggta 11343034  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcat 134  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  11343033 agggggttagtttttatcataatcat 11343008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16106092 - 16105967
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||  |  ||||| ||||| ||||||    
T  16106092 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagagtttaggttaatcttcttctaaggta 16105993  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcat 134  Q
    |||||||||||  |||||||||||||    
T  16105992 agggggttagtctttatcataatcat 16105967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 32950952 - 32950762
Alignment:
Q  183 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||  ||| |||||||| || ||||| ||  || |||||||||  ||||||||||||    
T  32950952 aattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtttcaaagtat 32950853  T
Q  281 gtataaatgt-taagttatgaaattatgcttaattgatgaaattga-tatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgt 369  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||| |||| || || |||| || | |||||| |  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  32950852 gtataaaggtcaaagttatgaaattgtgctcaaatggtgaattttactatgttgttgttgaaaagagatgtgattcatgttccattgatgt 32950762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 23328600 - 23328558
Alignment:
Q  396 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23328600 agtgaattataacttgggtatacttaattgtggattgatgatg 23328558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 20623359 - 20623262
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 158  Q
    |||||||| |||||||||   |||| ||  ||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  20623359 taggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 20623262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 158
Target Start/End: Original strand, 21233401 - 21233498
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 158  Q
    |||||||| |||||||||   |||| ||  ||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  21233401 taggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 21233498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 37053134 - 37053037
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 158  Q
    |||||||| |||||||||   |||| ||  ||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  37053134 taggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 37053037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 24616205 - 24616165
Alignment:
Q  396 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatga 436  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24616205 agtgaattataacttgggtatacttaattgtggattgatga 24616165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 24712581 - 24712541
Alignment:
Q  396 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatga 436  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24712581 agtgaattataacttgggtatacttaattgtggattgatga 24712541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 24745599 - 24745559
Alignment:
Q  396 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatga 436  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24745599 agtgaattataacttgggtatacttaattgtggattgatga 24745559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 158
Target Start/End: Original strand, 25900321 - 25900376
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 158  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  25900321 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 25900376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 16536587 - 16536490
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 158  Q
    |||||||| |||||||||   |||| ||  ||||| || || ||| |||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  16536587 taggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagataagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 16536490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 2)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 52 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 29551 - 29162
Alignment:
Q  52 tgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattt 151  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29551 tgggtgacctaggagctgaagtgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattt 29452  T
Q  152 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatg 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  29451 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgttgattatgttatg 29352  T
Q  252 tttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatg 348  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29351 tttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtgtaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatg 29252  T
Q  349 tgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  29251 tgattcatattccattgatgtggttattgttaatttatgttattgttagtgaattatgatttggttatacttaattgtgtattgatgatg 29162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 29626 - 29565
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaa 71  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  29626 gagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaa-gtgggtgacctaggagctgaa 29565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 18169402 - 18168970
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaa-agcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggt 107  Q
    |||| ||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||  ||||| ||||||| |||    
T  18169402 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagaattagggttaatcttcttcaa-ggt 18169304  T
Q  108 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18169303 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttg 18169204  T
Q  208 ctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatta 305  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18169203 ctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatta 18169104  T
Q  306 tgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaatta 404  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| || ||||||| |    
T  18169103 tgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaaataatgctattgtgagtgaatca 18169004  T
Q  405 tgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  18169003 tgatttggatatacttaattgtgaattgatgatg 18168970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 35 - 438
Target Start/End: Original strand, 15287096 - 15287501
Alignment:
Q  35 agcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 134  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15287096 agctttaggaatcaagt-gggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcat 15287194  T
Q  135 gtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaa 234  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15287195 gtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaa 15287294  T
Q  235 ttgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgtt 331  Q
    | |||| |||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||    
T  15287295 tcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactccattgatgaaatttgatatgtt 15287394  T
Q  332 ttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggatt 431  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15287395 ttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgctgttgtgagtgaatcatgacttgggtatacttaattatggatt 15287494  T
Q  432 gatgatg 438  Q
    |||||||    
T  15287495 gatgatg 15287501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 52 - 438
Target Start/End: Original strand, 15294221 - 15294610
Alignment:
Q  52 tgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattt 151  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15294221 tgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattt 15294320  T
Q  152 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatg 251  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  15294321 tctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatg 15294420  T
Q  252 tttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatg 348  Q
    |||  ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15294421 tttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatatataaatgttaagttatgaaattatactccattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatg 15294520  T
Q  349 tgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15294521 taattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgctgttgtgagtgaatcatgacttgggtatacttaattatggattgatgatg 15294610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 103 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 19020824 - 19020486
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19020824 aaggtaagggggttagttaccatcataatcatgttcaatttttgcattttgtcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 19020725  T
Q  203 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19020724 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 19020625  T
Q  301 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtg 399  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||    
T  19020624 aattatccttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgctattgtgagtg 19020525  T
Q  400 aattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19020524 aatcatgatttgagtatacttaattgtggattgatgatg 19020486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Original strand, 7131887 - 7132241
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaa-agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaagg 106  Q
    |||| ||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||    
T  7131887 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaattggggtaagattaggagctgaattgaagcaagagtttggattaatcttcttctaagg 7131986  T
Q  107 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctctt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7131987 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctctt 7132086  T
Q  207 gctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 304  Q
    | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7132087 gttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 7132186  T
Q  305 atgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 358  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  7132187 atacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 7132241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Original strand, 17145479 - 17145913
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaa-agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaagg 106  Q
    |||| ||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||| ||| ||| |   ||||| ||||| ||||    
T  17145479 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaattggggtaagcttaggagctgaattgaagtaagagtttgtgttaatcttcttctaagg 17145578  T
Q  107 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctctt 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17145579 taagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctctt 17145678  T
Q  207 gctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 304  Q
     ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17145679 actgtgatgctattttcttgtacatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttgtgaaatt 17145778  T
Q  305 atgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaatt 403  Q
    || || ||||  ||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  | | |||||||| | | ||  |||||||    
T  17145779 atactcaattagtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaatt 17145878  T
Q  404 atgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  17145879 atgacttgggtatacataattacggattgatgatg 17145913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 20001103 - 20000803
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 160  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20001103 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 20001004  T
Q  161 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  20001003 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttctgggt 20000904  T
Q  261 gaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 357  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  20000903 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcata 20000804  T
Q  358 t 358  Q
    |    
T  20000803 t 20000803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 91 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 18248568 - 18248218
Alignment:
Q  91 taatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttg 190  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18248568 taatcatcatctaaggtaagggggttagttattatcataatcttgtacaatttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatg 18248469  T
Q  191 ttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaat 288  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  || |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18248468 ttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaggattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaat 18248369  T
Q  289 gttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatg 387  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||  ||||  || ||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  | | ||||||||    
T  18248368 gttaagatatgaaattatactcaattagtgaattttaatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatg 18248269  T
Q  388 ctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
     | | ||  ||||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||||    
T  18248268 ttgttgtgggtgaattatgactttggtatacataattatcgattgatgatg 18248218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 103 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 22738607 - 22738390
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 202  Q
    |||||||||||||| ||  | ||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||     
T  22738607 aaggtaagggggtttgtcttcatcataatcaatttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggctgaggaacaattgatgttaaattcgtgt 22738508  T
Q  203 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22738507 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttgtga 22738408  T
Q  301 aattatgcttaattgatg 318  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22738407 aattatgcttaattgatg 22738390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 10644647 - 10644360
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||  ||| ||| | ||||||| |||||||||||    
T  10644647 gagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagt-gggtgatctaggagctgaagtgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggta 10644549  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  10644548 agggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 10644452  T
Q  209 tgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 300  Q
    |||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| ||    |||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  10644451 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 10644360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 35 - 304
Target Start/End: Original strand, 22351915 - 22352184
Alignment:
Q  35 agcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 134  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22351915 agctttaggaatcaagt-gggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaa 22352013  T
Q  135 gtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaa 234  Q
     | |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| | || ||||  |||||| | | ||||    
T  22352014 tttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcatgctcttgttatgttgct-gtttcttatacatgaa 22352112  T
Q  235 ttgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 304  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22352113 ttgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaatt 22352184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 61 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 26339399 - 26339140
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 160  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  ||| ||| || |||||||    
T  26339399 taggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgtt 26339300  T
Q  161 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || ||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  26339299 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggat 26339201  T
Q  261 gaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 319  Q
    ||||||||  | |||||  ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  26339200 gaaattacatggttcaatctatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcttaattaatga 26339140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8378480 - 8378365
Alignment:
Q  112 gggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8378480 gggttagttattatcataatcatgtacaatttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgt 8378381  T
Q  212 ggtgctattttcttgt 227  Q
    | ||||||||||||||    
T  8378380 gatgctattttcttgt 8378365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 47358057 - 47357883
Alignment:
Q  35 agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca 133  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47358057 agcttaaggaatcaattggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagttgggt-taatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatca 47357959  T
Q  134 tgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 212  Q
    ||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  47357958 tgta--at-tttgcatttcctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 47357883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 225 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 8374724 - 8374508
Alignment:
Q  225 tgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattacgt--ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-a 321  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||      
T  8374724 tgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgcttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattagtgaatt 8374625  T
Q  322 ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatactta 421  Q
    || ||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  | | |||||||| | | ||  ||||||||||  |||||||||| ||    
T  8374624 ttaatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatggcttgggtatacata 8374525  T
Q  422 attgtggattgatgatg 438  Q
    ||| | |||||||||||    
T  8374524 attatcgattgatgatg 8374508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 14996572 - 14996444
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaa-agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaagg 106  Q
    |||| ||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||  ||||    
T  14996572 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaattggggtaagtttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttttaagg 14996473  T
Q  107 taagggggttagttattatcataatcatg 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14996472 taagggggttagttattatcataatcatg 14996444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 103 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 9795564 - 9795490
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgat 178  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9795564 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaattttttcattttctcatgttgtatg-aaatgggttgat 9795490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 14952183 - 14952085
Alignment:
Q  35 agcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 134  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14952183 agctttaggaatcaagt-gggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14952085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 208 - 369
Target Start/End: Original strand, 40885585 - 40885748
Alignment:
Q  208 ctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    |||||||||||| ||  | ||| ||||||| |||| || | ||||||   ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40885585 ctgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaaattat 40885684  T
Q  307 gcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgt 369  Q
    ||| ||||| ||||  ||| || ||| |  ||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  40885685 gctcaattggtgaactttgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgt 40885748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 8378524 - 8378486
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaat 141  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8378524 aaggtaaggggattagttattatcataatcatgtacaat 8378486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 158
Target Start/End: Original strand, 16608972 - 16609069
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 158  Q
    |||||||| |||||||||   |||| ||  ||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  16608972 taggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 16609069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22738310 - 22738269
Alignment:
Q  397 gtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22738310 gtgaattatgacttgggtatacttaattgtggattaatgatg 22738269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 26680590 - 26680493
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 158  Q
    |||||||| |||||||||   |||| ||  ||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  26680590 taggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 26680493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 158
Target Start/End: Original strand, 16327841 - 16327896
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 158  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  16327841 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 16327896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 396 - 438
Target Start/End: Original strand, 22352260 - 22352302
Alignment:
Q  396 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22352260 agtgaattataacttgggtatacttaattatggattgatgatg 22352302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Original strand, 153829 - 154263
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaa-agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaagg 106  Q
    |||| ||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||| ||| |   ||||| ||||| ||||    
T  153829 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaattggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagtttgagttaatcttcttctaagg 153928  T
Q  107 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctctt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  153929 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctctt 154028  T
Q  207 gctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 304  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  154029 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaagttacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 154128  T
Q  305 atgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaatt 403  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||  ||||||     
T  154129 atgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgaatcatattccattgatgtggttattgttaacttatgctattgtgggtgaatc 154228  T
Q  404 atgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  154229 atgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 154263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 212
Target Start/End: Original strand, 169738 - 169935
Alignment:
Q  14 gaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggg 113  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  169738 gaacaagagagttgaaggcgaagcttgaggaatcaagtggggtgacataagagctgaattgaagcaagggttagtgataatcatcttcaaaagtaagggg 169837  T
Q  114 gttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  169838 gttagtgattatcataatcatgtataat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 169935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 36514 - 36327
Alignment:
Q  17 caagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggtt 116  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  36514 caagagggttgaagg-aaagctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagggataatcaacttcaaaggtaagggggtt 36417  T
Q  117 agttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 207  Q
    | | ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  36416 aatgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaactgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 36327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 35 - 438
Target Start/End: Original strand, 1424 - 1831
Alignment:
Q  35 agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca 133  Q
    ||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1424 agcttgaggaatcaattggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagggtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatca 1523  T
Q  134 tgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttga 233  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  1524 tgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaaatcgtgcacttgctgtgatgctattttcttgtgcatga 1623  T
Q  234 attgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgt 330  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1624 attgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgt 1723  T
Q  331 tttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggat 430  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||   |||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  1724 tttgattgaaatgagatgtaaatcatataaaattgatgttgttattgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggat 1823  T
Q  431 tgatgatg 438  Q
    ||||||||    
T  1824 tgatgatg 1831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 25 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 2810 - 2392
Alignment:
Q  25 ttgaagggaa-agcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttatt 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2810 ttgaagggaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttatt 2711  T
Q  124 atcataatcatgtacaa-tctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctatttt 222  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  2710 atcataatcatgtacaaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctcaattcgtgctcttgccgtgatgctatttt 2611  T
Q  223 cttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa 320  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  2610 cttgtgcatgaattgatgcttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcatgaaattatacttaattgatgaa 2511  T
Q  321 a-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatact 419  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| || ||||||| |||  |||||||||||    
T  2510 atttgatatgtttttattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgttattgtgagtgaatcatggtttgggtatact 2411  T
Q  420 taattgtggattgatgatg 438  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2410 taattgtggattgatgatg 2392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 31 - 438
Target Start/End: Original strand, 10184 - 10595
Alignment:
Q  31 ggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcata 129  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | || | ||||| || ||||||    ||| ||  |||||||| || |||||||||||||| ||  |  |||||    
T  10184 ggaaagcttgaggaatcaattggggtaagcttatgagctaaagtgaagcctaagttggggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcttcata 10283  T
Q  130 atcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgc 229  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  10284 atcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgatattttcttgtgc 10383  T
Q  230 ttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgat 326  Q
     ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10384 atgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgctaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgat 10483  T
Q  327 atgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgt 426  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| || || |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  10484 atgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttgttgttaactgatgctattgtgagggaatcatgacttgggtatacttaattgt 10583  T
Q  427 ggattgatgatg 438  Q
    ||||||||||||    
T  10584 ggattgatgatg 10595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Original strand, 1336 - 1690
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaa-agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaagg 106  Q
    |||| ||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||||||||||||| |||  |  ||||| ||||| ||||    
T  1336 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaattggggtaagattaggagctgaattgaagcaagagtttaggttaatcttcttctaagg 1435  T
Q  107 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctctt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1436 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctctt 1535  T
Q  207 gctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 304  Q
    | |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1536 gttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 1635  T
Q  305 atgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 358  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  1636 atacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 1690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Original strand, 7279 - 7712
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaa-agcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggt 107  Q
    |||| ||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||  ||||| |||||||||||    
T  7279 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagaattagggttaatcttcttcaaaggt 7378  T
Q  108 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  7379 aagggggttagttattatcataatcatgttccatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattactaaattcgtgctcttg 7478  T
Q  208 ctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatta 305  Q
     |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  || |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  7479 ttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaagattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagctatgaaatta 7578  T
Q  306 tgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaatta 404  Q
    | || ||||  ||||  |||||||||| |  || |||||||||||||||||| ||||||| | ||  || || | |||||||| | | || |||||||||    
T  7579 tactcaattagtgaatcttgatatgttgttgttaaaatgagatgtgattcatgttccattaaggttattgttattaactgatgttgttgtgagtgaatta 7678  T
Q  405 tgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  7679 tgacttgggtatacataattatggattgatgatg 7712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 438
Target Start/End: Original strand, 33980 - 34414
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaa-agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaagg 106  Q
    |||| ||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| | || | || ||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||| || || ||||    
T  33980 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaattggcgtaagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcatctaagg 34079  T
Q  107 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctct 205  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  34080 taagggggttagtcttcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcattgttgtatgaaa-tgggttgatgaaaaattgttgctaaattcgtgctct 34178  T
Q  206 tgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 303  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34179 tgctgtgaagctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaagt 34278  T
Q  304 tatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagtgaat 402  Q
    ||| ||||||||||||| || |||||||| |  |||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||  | | |||||||||||| || |||||||    
T  34279 tatacttaattgatgaatttggatatgttgttgttgaaatgagatatgattcatgttccattaatgttgttgctattaactgatgctattgtgagtgaat 34378  T
Q  403 tatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
     |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  34379 catgacttgggtatactaaattatggattgatgatg 34414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 192 - 438
Target Start/End: Original strand, 3 - 252
Alignment:
Q  192 taaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatg 289  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  3 taaattcgtgctcttgctgtgaggctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtgtaaatg 102  T
Q  290 ttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgc 388  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  103 ttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttaattgaaatgagatgtaattcatattacattgatgtagttattgttaactgatgc 202  T
Q  389 tatggtaagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    ||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  203 tattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 302
Target Start/End: Original strand, 5034 - 5329
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaa-agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaagg 106  Q
    |||| ||||||| || || ||||||| ||||||| ||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  5034 gagaagaacaagggtttttaagggaatagcttgaagaatcaattggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaagg 5133  T
Q  107 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctctt 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5134 taagggagttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcacgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgttaaattcgtgctctt 5233  T
Q  207 gctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 302  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||   ||||||||||| | |||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  5234 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 5329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Original strand, 20937 - 21139
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20937 gagaagaacaagagttttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagggttaggattaatcatcttcaaaggta 21036  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  21037 agggggttagttattatcataatcatgtacaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgt 21135  T
Q  209 tgtg 212  Q
    ||||    
T  21136 tgtg 21139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Original strand, 13883 - 14084
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13883 gagaagaacaagagttttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagggttaggattaatcatcttcaaaggta 13982  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  13983 agggggttagttattatcataatcatgtacaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgcacaattcttgctaaa-tcgtgctcttgc 14080  T
Q  209 tgtg 212  Q
    ||||    
T  14081 tgtg 14084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 4129 - 3895
Alignment:
Q  35 agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca 133  Q
    ||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4129 agcttgaggaatcaattggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttctaaggtaaggggtttagttattatcataatca 4030  T
Q  134 tgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttga 233  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  4029 tgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatga 3930  T
Q  234 attgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac 268  Q
    ||||||||| || ||||| ||   |||||||||||    
T  3929 attgatgataattgtatgattgttggtgaaattac 3895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 103 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 54755 - 54416
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtg 201  Q
    ||||||||| |||||||  | ||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54755 aaggtaaggtggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtg 54656  T
Q  202 ctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaatt--acgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 299  Q
      ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||  ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54655 tccttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatg 54556  T
Q  300 aaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaactgatgctatggtaagt 398  Q
    ||||| | || ||||| ||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  | | |||||||| | | ||  ||    
T  54555 aaattgtactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggt 54456  T
Q  399 gaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    |||| |||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  54455 gaatcatgagttgggtatacatatttatggattgatgatg 54416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 103 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 45369 - 45099
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtg 201  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45369 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtg 45270  T
Q  202 ctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 299  Q
    | |||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||| || ||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  45269 cccttgttgtgatgctattttgatgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttttg 45170  T
Q  300 aaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgt 369  Q
    ||||| | || ||||| ||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45169 aaattgtactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgt 45099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 212
Target Start/End: Original strand, 10570 - 10775
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaa-agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaagg 106  Q
    |||| ||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||  ||| |  | |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  10570 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaattgtggtaagattaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaagg 10669  T
Q  107 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctctt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10670 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctctt 10769  T
Q  207 gctgtg 212  Q
    | ||||    
T  10770 gttgtg 10775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 52 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 6986 - 6718
Alignment:
Q  52 tgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattt 151  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  ||| ||| |    
T  6986 tgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatct 6887  T
Q  152 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || ||||  |||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  6886 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gtttcttatacatgaattgatgattatggtatg 6788  T
Q  252 tttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 319  Q
    |||  || |||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  6787 tttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcttaattaatga 6718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 6640 - 6598
Alignment:
Q  396 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6640 agtgaattataacttgggtatacttaattgtggattgatgatg 6598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 113; Significance: 5e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 103 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 54212 - 54008
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 202  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  54212 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaatttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgc 54113  T
Q  203 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 301  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  54112 tcttactgtgatgctgttttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttcaaagcatgtataattgttaagttgtgaa 54013  T
Q  302 attat 306  Q
    |||||    
T  54012 attat 54008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 3395 - 3101
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaa-agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaagg 106  Q
    |||| ||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||| |||  |  ||||| ||||| ||||    
T  3395 gagaagaacaagggttttgaagggaatagcttgaagaatcaattggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagtttcggttaatcttcttctaagg 3296  T
Q  107 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctctt 206  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  3295 taagggggttaattattatcataattatgtacaat-tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctctt 3197  T
Q  207 gctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattacgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 302  Q
    |||||| || ||| ||  | | | |||||||||||| || ||||| ||   ||||||||||| | |  || |||||| |||||| ||||| |||||    
T  3196 gctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaa 3101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 207
Target Start/End: Original strand, 31506 - 31693
Alignment:
Q  17 caagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggtt 116  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31506 caagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaatgtaagggggtt 31603  T
Q  117 agttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 207  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  31604 agtgattatcataatcatgtgtaat-tttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 31693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 131005 - 130880
Alignment:
Q  9 gagatgaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggta 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  131005 gagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggcataatcatcttcaaaggta 130906  T
Q  109 agggggttagttattatcataatcat 134  Q
    |||||||||||  |||||||||||||    
T  130905 agggggttagtctttatcataatcat 130880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 1153 - 1327
Alignment:
Q  35 agcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 134  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  1153 agctttaggaatcaagttgg-tgacttaggagctgaattgaagcaaggattagggttaatcttcttcaaaggtaggggggttagttattatcacaatcat 1251  T
Q  135 gtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 212  Q
    ||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  1252 gt--aatttttgcatttactcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 1327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 302
Target Start/End: Original strand, 13169 - 13438
Alignment:
Q  29 agggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcat 128  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13169 aggggaagcttgaggaatcaagt-gggtgacctaggaactgaagtgaagctagggttaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcat 13267  T
Q  129 aatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtg 228  Q
    ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||  |||| || ||| ||  | ||    
T  13268 aatcatgt--aat-ttttcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttagtgtgatgttatgtttgtatg 13364  T
Q  229 cttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 302  Q
    | |||||||||||| || ||||| ||   ||||||||||| | |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  13365 catgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 13438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 35 - 212
Target Start/End: Original strand, 64372 - 64546
Alignment:
Q  35 agcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 134  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  64372 agcttaaggaatcaagt-gggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcat 64470  T
Q  135 gtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtg 212  Q
    ||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  64471 gt--aatttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtg 64546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 103 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 108084 - 107983
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 202  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  108084 aaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgc 107985  T
Q  203 tc 204  Q
    ||    
T  107984 tc 107983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 438 - 177
Alignment:
Q  35 agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca 133  Q
    ||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||| || ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  438 agcttgaggaatcaattggggtaagcttaggagctgaattgaagcgagagtttggattaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcaaaatca 339  T
Q  134 tgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttga 233  Q
    ||||  || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||    
T  338 tgta--at-tttgcattg-ctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatga 243  T
Q  234 attgatgattatggtatgtttaggggtgaaattacgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 299  Q
    ||||||||| || ||||| ||   ||||||||||| | |  || |||||| ||||| |||||||||    
T  242 attgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatg 177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 143 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 3711 - 3547
Alignment:
Q  143 tttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgat 242  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||| || | ||||||||| | ||||||||||||    
T  3711 tttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattagtgctcttactgtgatgttgttttcttgtccatgaattgatgat 3612  T
Q  243 tatggtatgtttaggggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 306  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  3611 tatggtatgattgtgggtgaaattacatgttcaaagcatgtataattgttaagttgtgaaattat 3547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 35 - 319
Target Start/End: Original strand, 23600 - 23884
Alignment:
Q  35 agcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 134  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||     
T  23600 agctttaggaatcaagt-gggtgacttaggaactgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaagttaagggggttagttattatcatattcaa 23698  T
Q  135 gtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaa 234  Q
     | |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||| | | || || |  |||||| | | || |    
T  23699 tttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaactcatgtcaaattcgtgctctggttatgttg-ttgtttcttatacatgga 23797  T
Q  235 ttgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 319  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  23798 ttgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 23884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 134
Target Start/End: Original strand, 17127 - 17241
Alignment:
Q  20 gagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagt 119  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  17127 gagtgttgaaaggaaagcttgaggaatcaattggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataataatcttctaaggtaagggggttagt 17226  T
Q  120 tattatcataatcat 134  Q
      | |||||||||||    
T  17227 cttcatcataatcat 17241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 103 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 7547 - 7330
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 202  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||  | |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  7547 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 7448  T
Q  203 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 300  Q
    ||||| | || ||||  || ||| | | ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  7447 tcttgttatgttgct-gttgcttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtga 7349  T
Q  301 aattatgcttaattgatga 319  Q
    |||| ||| ||||| ||||    
T  7348 aattttgcctaattaatga 7330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 396 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 7252 - 7210
Alignment:
Q  396 agtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 438  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  7252 agtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 7210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 103 - 302
Target Start/End: Original strand, 9266 - 9462
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  9266 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 9362  T
Q  203 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 301  Q
    | |||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| ||   ||||||||||| | |||||| |||||| ||||| |||||| ||||    
T  9363 ttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaa 9461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 103 - 302
Target Start/End: Original strand, 16164 - 16360
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  16164 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 16260  T
Q  203 tcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattacgt-ttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 301  Q
    | |||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| ||   ||||||||||| | |||||| |||||| ||||| |||||| ||||    
T  16261 ttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaa 16359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 103 - 207
Target Start/End: Original strand, 12045 - 12149
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtg 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12045 aaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaatttttca-tttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtg 12143  T
Q  202 ctcttg 207  Q
    ||||||    
T  12144 ctcttg 12149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 369
Target Start/End: Original strand, 56105 - 56294
Alignment:
Q  183 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttaggggtgaaattac--gtttcaaagtat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||| ||  || |||||||||  |||| |||||||    
T  56105 aattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtat 56204  T
Q  281 gtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgt 369  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||  ||| || ||| |  |||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  56205 gtataaatgtcaagttatgaaattgtgctcaaatggtgaattttgctaagttgttgttgaaaagatatgtgattcatgttccattgatgt 56294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 178
Target Start/End: Original strand, 13268 - 13342
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgat 178  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13268 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatg-aaatgggttgat 13342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 127
Target Start/End: Original strand, 154282 - 154373
Alignment:
Q  35 agcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatca 127  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  154282 agctttaggaatcaagt-gggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatca 154373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 134
Target Start/End: Original strand, 803 - 914
Alignment:
Q  25 ttgaagggaa-agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttat 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||||||  |    
T  803 ttgaagggaatagcttgaggaatcaattggggtaagcttaggagctgaattgaatcaagagttggggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtctt 902  T
Q  123 tatcataatcat 134  Q
    ||||||||||||    
T  903 tatcataatcat 914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 134
Target Start/End: Original strand, 5922 - 6022
Alignment:
Q  35 agcttgaggaatcaatttgggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatct-tcaaaggtaagggggttagttattatcataatc 132  Q
    ||||||||||||||||| | || | || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5922 agcttgaggaatcaattagagtaagcttaggagctgaattgaagcaagagttaggattaatc-tctatctaaggtaagggggttagtctttatcataatc 6020  T
Q  133 at 134  Q
    ||    
T  6021 at 6022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 177
Target Start/End: Original strand, 34374 - 34450
Alignment:
Q  103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctca--tgttgtatgaaaatgggttga 177  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  34374 aaggtaagagggttagttattatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttga 34450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22930 - 22833
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 158  Q
    |||||||| |||||||||   |||| ||  ||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  22930 taggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 22833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 27185 - 27088
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 158  Q
    |||||||| |||||||||   |||| ||  ||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||| ||| |||||    
T  27185 taggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttccttctttgcaatttttcatg 27088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 158
Target Start/End: Original strand, 1455 - 1552
Alignment:
Q  61 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatg 158  Q
    |||||||| |||||||||   |||| ||  ||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  1455 taggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 1552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 42709 - 42677
Alignment:
Q  102 aaaggtaagggggttagttattatcataatcat 134  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42709 aaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 42677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 392 times since January 2019
Visitors: 4084