View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0664_low_7 (Length: 411)

Name: NF0664_low_7
Description: NF0664
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0664_low_7
NF0664_low_7
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (54-390)||(882-1218)
[»] chr1 (46 HSPs)
chr1 (11-390)||(41394222-41394602)
chr1 (54-390)||(20931345-20931682)
chr1 (54-390)||(20913037-20913367)
chr1 (54-390)||(37844374-37844714)
chr1 (54-390)||(20893551-20893889)
chr1 (54-390)||(20445679-20446019)
chr1 (54-390)||(20531444-20531783)
chr1 (55-390)||(22227809-22228146)
chr1 (55-390)||(22232506-22232843)
chr1 (140-386)||(2116258-2116506)
chr1 (140-390)||(5072388-5072640)
chr1 (140-390)||(18601118-18601370)
chr1 (53-324)||(45051489-45051759)
chr1 (128-275)||(51452608-51452755)
chr1 (11-86)||(21860334-21860409)
chr1 (12-86)||(44034829-44034903)
chr1 (13-120)||(27675086-27675191)
chr1 (11-86)||(41218728-41218803)
chr1 (144-228)||(22143361-22143446)
chr1 (145-228)||(17609090-17609174)
chr1 (145-228)||(20177337-20177421)
chr1 (144-290)||(21195114-21195261)
chr1 (145-228)||(27329757-27329840)
chr1 (160-290)||(33397452-33397583)
chr1 (160-290)||(40436285-40436416)
chr1 (13-70)||(13376711-13376768)
chr1 (13-70)||(20177513-20177570)
chr1 (160-228)||(37233876-37233945)
chr1 (145-217)||(38033675-38033748)
chr1 (145-228)||(16646074-16646158)
chr1 (145-228)||(16656800-16656884)
chr1 (135-277)||(18059757-18059900)
chr1 (144-226)||(8537910-8537993)
chr1 (144-226)||(8603149-8603232)
chr1 (55-86)||(15861327-15861358)
chr1 (160-294)||(5768185-5768320)
chr1 (178-224)||(17148735-17148781)
chr1 (144-217)||(19603270-19603344)
chr1 (148-228)||(13376863-13376944)
chr1 (145-217)||(36356294-36356367)
chr1 (135-277)||(17004752-17004895)
chr1 (135-277)||(38055090-38055233)
chr1 (346-386)||(45051446-45051486)
chr1 (54-86)||(51452809-51452841)
chr1 (145-228)||(51627665-51627749)
chr1 (147-226)||(52400795-52400875)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (54-390)||(5990-6326)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (54-388)||(3508-3843)
scaffold0266 (54-390)||(1124-1462)
[»] chr5 (62 HSPs)
chr5 (54-390)||(23506965-23507302)
chr5 (54-390)||(27182471-27182810)
chr5 (54-390)||(18530988-18531330)
chr5 (54-390)||(22053753-22054096)
chr5 (128-379)||(34939289-34939540)
chr5 (140-341)||(29188284-29188486)
chr5 (143-390)||(43443398-43443647)
chr5 (140-390)||(22366481-22366733)
chr5 (140-390)||(25426628-25426880)
chr5 (143-390)||(18777995-18778244)
chr5 (140-390)||(12374-12626)
chr5 (144-390)||(27009841-27010089)
chr5 (140-390)||(19499899-19500151)
chr5 (140-390)||(21073595-21073847)
chr5 (140-390)||(4199985-4200237)
chr5 (128-275)||(20623085-20623232)
chr5 (128-275)||(21233528-21233675)
chr5 (130-274)||(25900408-25900552)
chr5 (128-275)||(16536313-16536460)
chr5 (128-275)||(37052860-37053007)
chr5 (144-228)||(21310709-21310794)
chr5 (144-226)||(29918129-29918212)
chr5 (144-228)||(19862371-19862456)
chr5 (144-228)||(23981516-23981601)
chr5 (135-224)||(32950862-32950951)
chr5 (11-85)||(11584374-11584448)
chr5 (144-228)||(21297175-21297260)
chr5 (145-228)||(5450844-5450928)
chr5 (135-277)||(10777969-10778112)
chr5 (145-228)||(21222609-21222693)
chr5 (144-226)||(22885806-22885889)
chr5 (54-224)||(23514729-23514900)
chr5 (54-277)||(1219437-1219662)
chr5 (55-224)||(11211983-11212153)
chr5 (144-228)||(432625-432710)
chr5 (145-225)||(21617181-21617262)
chr5 (54-322)||(35791015-35791287)
chr5 (144-290)||(26559815-26559962)
chr5 (13-86)||(5450695-5450768)
chr5 (135-224)||(17471587-17471676)
chr5 (13-70)||(21222462-21222519)
chr5 (146-322)||(24084144-24084322)
chr5 (54-86)||(16105967-16105999)
chr5 (145-228)||(16595669-16595753)
chr5 (54-86)||(20623286-20623318)
chr5 (54-86)||(21233442-21233474)
chr5 (54-86)||(25900320-25900352)
chr5 (145-228)||(28902353-28902437)
chr5 (145-228)||(28938748-28938832)
chr5 (346-386)||(29190482-29190522)
chr5 (135-277)||(36989769-36989912)
chr5 (54-86)||(37053061-37053093)
chr5 (144-228)||(11337186-11337271)
chr5 (349-390)||(17471803-17471844)
chr5 (144-228)||(37983526-37983611)
chr5 (54-86)||(108728-108760)
chr5 (54-86)||(9730278-9730310)
chr5 (54-86)||(16536514-16536546)
chr5 (135-277)||(21932380-21932523)
chr5 (135-277)||(21938550-21938693)
chr5 (145-185)||(23494125-23494165)
chr5 (135-277)||(35582150-35582293)
[»] chr3 (87 HSPs)
chr3 (54-390)||(14842487-14842824)
chr3 (54-390)||(2049810-2050147)
chr3 (54-390)||(12030073-12030410)
chr3 (54-379)||(13838905-13839232)
chr3 (11-390)||(16743998-16744377)
chr3 (118-391)||(51158008-51158282)
chr3 (91-390)||(15858986-15859287)
chr3 (135-390)||(15936634-15936890)
chr3 (135-387)||(15938476-15938729)
chr3 (53-386)||(15614838-15615170)
chr3 (128-390)||(17912483-17912744)
chr3 (128-390)||(13954890-13955153)
chr3 (128-390)||(13975722-13975985)
chr3 (128-390)||(45860805-45861068)
chr3 (140-390)||(55316219-55316471)
chr3 (140-390)||(41270075-41270327)
chr3 (162-390)||(16821139-16821369)
chr3 (11-193)||(19231979-19232164)
chr3 (54-228)||(19260749-19260924)
chr3 (128-275)||(2449238-2449385)
chr3 (11-89)||(15857120-15857198)
chr3 (11-86)||(3992873-3992948)
chr3 (11-86)||(55513193-55513268)
chr3 (11-86)||(2844514-2844589)
chr3 (11-86)||(54037981-54038056)
chr3 (54-290)||(54651558-54651796)
chr3 (11-86)||(17955837-17955916)
chr3 (11-86)||(7854305-7854380)
chr3 (135-290)||(11986173-11986329)
chr3 (144-228)||(14080671-14080756)
chr3 (276-390)||(47984650-47984765)
chr3 (276-390)||(48003224-48003339)
chr3 (135-390)||(15468339-15468596)
chr3 (25-86)||(45581954-45582016)
chr3 (145-228)||(47784767-47784851)
chr3 (276-390)||(47993937-47994052)
chr3 (276-390)||(48012510-48012625)
chr3 (144-226)||(4145814-4145896)
chr3 (144-289)||(6228625-6228771)
chr3 (144-228)||(17191703-17191788)
chr3 (144-228)||(17204843-17204928)
chr3 (55-277)||(25058853-25059077)
chr3 (55-322)||(12264710-12264981)
chr3 (145-228)||(17139670-17139754)
chr3 (145-228)||(30207378-30207462)
chr3 (135-277)||(49232550-49232693)
chr3 (145-227)||(3576439-3576522)
chr3 (54-224)||(12902007-12902178)
chr3 (144-290)||(14814765-14814912)
chr3 (144-228)||(9590754-9590839)
chr3 (13-70)||(17205019-17205076)
chr3 (13-86)||(38810868-38810941)
chr3 (145-228)||(12953126-12953210)
chr3 (147-226)||(13301472-13301552)
chr3 (147-226)||(13312128-13312208)
chr3 (13-68)||(12031849-12031904)
chr3 (144-226)||(15517795-15517878)
chr3 (54-224)||(18911161-18911332)
chr3 (144-226)||(41661729-41661812)
chr3 (135-390)||(22275209-22275466)
chr3 (135-224)||(5228481-5228570)
chr3 (13-86)||(13301323-13301396)
chr3 (13-86)||(13311979-13312052)
chr3 (13-70)||(17191879-17191936)
chr3 (164-228)||(34560061-34560126)
chr3 (54-86)||(2449152-2449184)
chr3 (145-228)||(14059214-14059298)
chr3 (54-86)||(16261777-16261809)
chr3 (145-228)||(16880285-16880369)
chr3 (54-86)||(16933869-16933901)
chr3 (54-86)||(17912398-17912430)
chr3 (54-86)||(23492696-23492728)
chr3 (54-86)||(38168237-38168269)
chr3 (54-86)||(53771365-53771397)
chr3 (160-226)||(31412349-31412416)
chr3 (13-70)||(3576290-3576347)
chr3 (20-85)||(15550922-15550987)
chr3 (135-277)||(1467738-1467881)
chr3 (151-226)||(11882225-11882301)
chr3 (54-86)||(11986080-11986112)
chr3 (54-86)||(13954804-13954836)
chr3 (54-86)||(14285289-14285321)
chr3 (54-86)||(19947026-19947058)
chr3 (54-86)||(30153265-30153297)
chr3 (54-86)||(33342204-33342236)
chr3 (54-86)||(45861122-45861154)
chr3 (54-86)||(51961031-51961063)
[»] chr2 (56 HSPs)
chr2 (11-390)||(20627195-20627576)
chr2 (54-385)||(462743-463075)
chr2 (11-390)||(19794586-19794967)
chr2 (11-390)||(43642838-43643220)
chr2 (54-390)||(8891242-8891581)
chr2 (54-390)||(36982364-36982704)
chr2 (54-390)||(24341309-24341652)
chr2 (128-390)||(17396653-17396916)
chr2 (128-390)||(25265390-25265653)
chr2 (178-390)||(7507894-7508107)
chr2 (140-390)||(19886661-19886913)
chr2 (128-275)||(19689401-19689548)
chr2 (128-275)||(23820187-23820334)
chr2 (128-275)||(14906440-14906587)
chr2 (128-275)||(20015127-20015274)
chr2 (54-150)||(22863169-22863267)
chr2 (11-86)||(22275045-22275120)
chr2 (11-86)||(22284278-22284353)
chr2 (11-85)||(15633538-15633612)
chr2 (144-228)||(24884848-24884933)
chr2 (145-228)||(68154-68238)
chr2 (147-226)||(19660044-19660124)
chr2 (54-224)||(12728560-12728731)
chr2 (151-225)||(19669116-19669191)
chr2 (54-224)||(34824643-34824814)
chr2 (145-215)||(22579863-22579933)
chr2 (13-70)||(43646232-43646289)
chr2 (145-228)||(22775206-22775290)
chr2 (145-228)||(22780584-22780668)
chr2 (145-224)||(43646059-43646139)
chr2 (160-290)||(9636845-9636976)
chr2 (135-224)||(12635867-12635956)
chr2 (144-228)||(19666690-19666775)
chr2 (53-86)||(19689314-19689347)
chr2 (139-224)||(23778048-23778133)
chr2 (54-86)||(9652796-9652828)
chr2 (54-86)||(14906354-14906386)
chr2 (13-65)||(19660221-19660273)
chr2 (54-86)||(23820388-23820420)
chr2 (55-86)||(25213372-25213403)
chr2 (178-224)||(3798645-3798691)
chr2 (160-290)||(24277861-24277992)
chr2 (145-217)||(3248-3321)
chr2 (13-86)||(19666848-19666921)
chr2 (13-70)||(25305769-25305826)
chr2 (13-120)||(31146032-31146138)
chr2 (54-86)||(7507757-7507789)
chr2 (135-277)||(11231337-11231480)
chr2 (54-86)||(17396567-17396599)
chr2 (54-86)||(20015328-20015360)
chr2 (135-277)||(22513184-22513327)
chr2 (135-277)||(24685780-24685923)
chr2 (145-185)||(25305637-25305677)
chr2 (54-86)||(28031134-28031166)
chr2 (135-277)||(28775806-28775949)
chr2 (54-86)||(33128372-33128404)
[»] chr8 (65 HSPs)
chr8 (54-391)||(16193643-16193980)
chr8 (54-390)||(43373392-43373731)
chr8 (11-390)||(16404857-16405235)
chr8 (54-379)||(24928716-24929043)
chr8 (140-386)||(24548986-24549233)
chr8 (140-386)||(6774258-6774505)
chr8 (144-390)||(21844576-21844824)
chr8 (144-390)||(21851969-21852217)
chr8 (140-390)||(30120722-30120974)
chr8 (128-379)||(17345581-17345832)
chr8 (128-390)||(22907214-22907476)
chr8 (140-390)||(16674392-16674644)
chr8 (203-390)||(222754-222943)
chr8 (203-390)||(736377-736566)
chr8 (203-390)||(860272-860461)
chr8 (128-275)||(5238203-5238350)
chr8 (128-275)||(24661248-24661395)
chr8 (128-275)||(43685662-43685809)
chr8 (11-86)||(274766-274841)
chr8 (11-86)||(641008-641083)
chr8 (11-86)||(826814-826889)
chr8 (11-86)||(24716719-24716794)
chr8 (144-228)||(26011656-26011741)
chr8 (145-228)||(17285366-17285450)
chr8 (11-86)||(39115598-39115673)
chr8 (144-228)||(15933460-15933545)
chr8 (144-228)||(21198152-21198237)
chr8 (55-277)||(22006176-22006400)
chr8 (144-228)||(25296320-25296405)
chr8 (144-228)||(25758340-25758425)
chr8 (144-223)||(23226076-23226156)
chr8 (203-261)||(691909-691967)
chr8 (160-290)||(33172328-33172459)
chr8 (144-228)||(5854776-5854861)
chr8 (135-224)||(16195399-16195488)
chr8 (54-224)||(13720845-13721016)
chr8 (144-290)||(18261471-18261618)
chr8 (144-229)||(23151833-23151919)
chr8 (160-294)||(24552586-24552721)
chr8 (135-277)||(13662264-13662407)
chr8 (13-70)||(17285543-17285600)
chr8 (13-70)||(21198005-21198062)
chr8 (144-185)||(23149985-23150026)
chr8 (144-228)||(23837360-23837445)
chr8 (54-86)||(5238404-5238436)
chr8 (54-86)||(22907128-22907160)
chr8 (54-86)||(24385652-24385684)
chr8 (54-86)||(24661162-24661194)
chr8 (54-86)||(43685863-43685895)
chr8 (144-226)||(37653616-37653699)
chr8 (178-224)||(16873093-16873139)
chr8 (160-290)||(22497225-22497356)
chr8 (160-290)||(22742864-22742995)
chr8 (160-290)||(45558953-45559084)
chr8 (144-185)||(23158367-23158408)
chr8 (149-217)||(33528598-33528667)
chr8 (144-228)||(33611053-33611138)
chr8 (135-277)||(271359-271502)
chr8 (135-277)||(644418-644561)
chr8 (135-277)||(830153-830296)
chr8 (54-86)||(2545265-2545297)
chr8 (54-86)||(3431176-3431208)
chr8 (135-277)||(22088793-22088936)
chr8 (54-86)||(22886654-22886686)
chr8 (144-215)||(27233090-27233162)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (54-390)||(48598-48935)
scaffold0023 (162-390)||(36093-36323)
scaffold0023 (54-277)||(153924-154149)
scaffold0023 (54-86)||(61122-61154)
[»] chr4 (51 HSPs)
chr4 (11-390)||(54118125-54118507)
chr4 (54-390)||(13246430-13246769)
chr4 (54-291)||(121989-122226)
chr4 (54-390)||(15675009-15675352)
chr4 (54-322)||(10104170-10104445)
chr4 (155-390)||(31115629-31115865)
chr4 (144-390)||(10644219-10644467)
chr4 (128-382)||(13048221-13048477)
chr4 (140-390)||(47357654-47357906)
chr4 (128-390)||(26680201-26680463)
chr4 (128-275)||(10488678-10488825)
chr4 (128-275)||(16327926-16328073)
chr4 (54-201)||(33240890-33241043)
chr4 (144-322)||(40885570-40885749)
chr4 (11-86)||(25119064-25119139)
chr4 (292-390)||(111395-111493)
chr4 (54-160)||(31132545-31132657)
chr4 (11-86)||(5682385-5682460)
chr4 (143-299)||(7850090-7850248)
chr4 (145-228)||(15044990-15045074)
chr4 (54-322)||(17145574-17145845)
chr4 (55-277)||(18169084-18169308)
chr4 (144-228)||(18276596-18276681)
chr4 (144-228)||(47535065-47535150)
chr4 (145-228)||(13809511-13809595)
chr4 (143-226)||(15013282-15013365)
chr4 (145-228)||(15109350-15109434)
chr4 (144-233)||(7964712-7964802)
chr4 (160-290)||(18238173-18238304)
chr4 (13-86)||(41165808-41165881)
chr4 (178-322)||(8374576-8374722)
chr4 (145-228)||(18494329-18494412)
chr4 (145-228)||(30232498-30232581)
chr4 (144-226)||(40904934-40905017)
chr4 (178-270)||(22738390-22738483)
chr4 (144-290)||(41256370-41256516)
chr4 (135-224)||(7132064-7132153)
chr4 (139-224)||(19020654-19020739)
chr4 (13-70)||(47534933-47534990)
chr4 (346-390)||(10104450-10104494)
chr4 (54-86)||(14952085-14952117)
chr4 (54-86)||(15135907-15135939)
chr4 (54-86)||(15272211-15272243)
chr4 (54-86)||(16327840-16327872)
chr4 (54-86)||(16609013-16609045)
chr4 (54-86)||(26680517-26680549)
chr4 (144-226)||(7185844-7185927)
chr4 (144-226)||(38764873-38764956)
chr4 (144-228)||(52265508-52265593)
chr4 (54-86)||(8045272-8045304)
chr4 (54-86)||(16523146-16523178)
[»] chr7 (72 HSPs)
chr7 (13-390)||(3059966-3060344)
chr7 (54-388)||(16211768-16212103)
chr7 (54-390)||(36052667-36053003)
chr7 (54-390)||(13036938-13037277)
chr7 (54-385)||(11580661-11580997)
chr7 (135-390)||(18253842-18254098)
chr7 (128-390)||(47481031-47481294)
chr7 (146-390)||(16478968-16479213)
chr7 (140-390)||(10989410-10989661)
chr7 (139-390)||(2437457-2437710)
chr7 (128-384)||(25292338-25292595)
chr7 (144-390)||(13572676-13572924)
chr7 (140-390)||(13911024-13911277)
chr7 (128-390)||(7293017-7293279)
chr7 (129-390)||(13321014-13321278)
chr7 (128-275)||(11516343-11516490)
chr7 (128-275)||(15441564-15441711)
chr7 (128-275)||(30262129-30262276)
chr7 (56-387)||(295893-296224)
chr7 (11-86)||(32493903-32493978)
chr7 (11-86)||(126738-126813)
chr7 (11-86)||(1936874-1936949)
chr7 (144-228)||(16914928-16915013)
chr7 (11-86)||(111126-111201)
chr7 (144-228)||(9611470-9611555)
chr7 (144-228)||(9839041-9839126)
chr7 (135-228)||(48622665-48622758)
chr7 (145-228)||(13377691-13377775)
chr7 (13-120)||(13377819-13377924)
chr7 (11-85)||(7283913-7283987)
chr7 (144-290)||(28722210-28722357)
chr7 (55-277)||(15950709-15950933)
chr7 (144-228)||(48356806-48356891)
chr7 (54-224)||(18979938-18980109)
chr7 (13-70)||(13389693-13389750)
chr7 (144-228)||(14271899-14271984)
chr7 (54-160)||(36024372-36024485)
chr7 (145-228)||(49047675-49047759)
chr7 (144-226)||(14935524-14935607)
chr7 (144-226)||(15363117-15363200)
chr7 (54-224)||(15927736-15927907)
chr7 (128-170)||(14113989-14114031)
chr7 (128-170)||(14423639-14423681)
chr7 (54-86)||(2029244-2029276)
chr7 (54-86)||(7293333-7293365)
chr7 (54-86)||(11516544-11516576)
chr7 (145-228)||(13274939-13275023)
chr7 (54-86)||(14113903-14113935)
chr7 (54-86)||(15441478-15441510)
chr7 (54-123)||(15709428-15709501)
chr7 (13-69)||(16919870-16919926)
chr7 (145-228)||(17223939-17224023)
chr7 (54-86)||(30262043-30262075)
chr7 (54-86)||(42056188-42056220)
chr7 (160-226)||(15358961-15359028)
chr7 (54-224)||(15760031-15760202)
chr7 (160-290)||(8267744-8267875)
chr7 (178-224)||(13758538-13758584)
chr7 (144-228)||(12759149-12759234)
chr7 (160-224)||(34241223-34241288)
chr7 (54-86)||(371417-371449)
chr7 (54-86)||(3049905-3049937)
chr7 (135-277)||(7822842-7822985)
chr7 (135-277)||(7830153-7830296)
chr7 (54-86)||(13321334-13321366)
chr7 (58-86)||(15516765-15516793)
chr7 (54-86)||(25124450-25124482)
chr7 (135-277)||(27101636-27101779)
chr7 (135-277)||(27108984-27109127)
chr7 (135-277)||(27176547-27176690)
chr7 (135-277)||(38783728-38783871)
chr7 (54-86)||(47480944-47480976)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (54-390)||(128095-128431)
scaffold0008 (162-390)||(31697-31928)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (54-390)||(8878-9215)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (54-390)||(12115-12450)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (57-390)||(19206-19543)
scaffold0195 (128-390)||(21290-21553)
[»] scaffold0162 (4 HSPs)
scaffold0162 (54-390)||(26340-26678)
scaffold0162 (128-390)||(8180-8440)
scaffold0162 (144-228)||(7025-7110)
scaffold0162 (13-70)||(6877-6934)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (54-386)||(41733-42066)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (54-379)||(171916-172242)
scaffold0001 (54-379)||(177619-177945)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (53-390)||(36836-37176)
scaffold0077 (11-85)||(15324-15398)
[»] chr6 (57 HSPs)
chr6 (54-379)||(23153458-23153786)
chr6 (55-386)||(14626045-14626377)
chr6 (53-386)||(1650020-1650352)
chr6 (128-379)||(1657748-1657999)
chr6 (140-390)||(25175563-25175815)
chr6 (128-390)||(35009439-35009702)
chr6 (140-390)||(27653983-27654235)
chr6 (128-379)||(15862484-15862734)
chr6 (140-390)||(16825752-16826006)
chr6 (128-322)||(29665941-29666137)
chr6 (54-123)||(23148266-23148335)
chr6 (11-86)||(19983149-19983224)
chr6 (11-86)||(35015014-35015089)
chr6 (128-213)||(27751603-27751688)
chr6 (144-228)||(18629608-18629693)
chr6 (11-86)||(18583640-18583715)
chr6 (252-390)||(27740838-27740977)
chr6 (144-226)||(29605614-29605696)
chr6 (144-228)||(16887792-16887877)
chr6 (146-226)||(17083200-17083280)
chr6 (138-228)||(17557012-17557102)
chr6 (144-228)||(35136013-35136097)
chr6 (145-228)||(21623330-21623414)
chr6 (54-224)||(1556173-1556344)
chr6 (54-224)||(16232060-16232231)
chr6 (13-70)||(21623506-21623563)
chr6 (144-228)||(22361765-22361850)
chr6 (144-228)||(33324855-33324939)
chr6 (145-228)||(18381684-18381768)
chr6 (145-228)||(18399100-18399184)
chr6 (143-228)||(15079709-15079793)
chr6 (144-252)||(33538370-33538479)
chr6 (135-224)||(18086822-18086911)
chr6 (13-70)||(22361619-22361676)
chr6 (13-85)||(14152632-14152704)
chr6 (135-277)||(16556138-16556281)
chr6 (135-277)||(16632694-16632837)
chr6 (54-86)||(18002395-18002427)
chr6 (135-277)||(22225737-22225880)
chr6 (54-86)||(23995247-23995279)
chr6 (54-86)||(26090059-26090091)
chr6 (55-86)||(4991396-4991427)
chr6 (147-217)||(15740402-15740473)
chr6 (54-84)||(15742120-15742150)
chr6 (160-290)||(22848115-22848246)
chr6 (160-290)||(23222851-23222982)
chr6 (178-224)||(23977937-23977983)
chr6 (167-228)||(25651399-25651461)
chr6 (54-86)||(1657661-1657693)
chr6 (135-277)||(10488813-10488956)
chr6 (54-86)||(15862789-15862821)
chr6 (135-277)||(16376372-16376515)
chr6 (135-277)||(16383696-16383839)
chr6 (54-86)||(18823283-18823315)
chr6 (54-86)||(18839138-18839170)
chr6 (54-86)||(27751742-27751774)
chr6 (54-86)||(32276659-32276691)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (64-390)||(4996-5324)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (54-379)||(247366-247694)
scaffold0012 (54-312)||(34075-34336)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (54-390)||(123087-123427)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (135-390)||(48187-48443)
scaffold0049 (11-85)||(20493-20567)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (54-384)||(272031-272362)
scaffold0009 (144-224)||(69623-69704)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (135-390)||(107747-108003)
scaffold0026 (144-390)||(64527-64780)
scaffold0026 (143-194)||(89863-89915)
[»] scaffold0025 (5 HSPs)
scaffold0025 (102-390)||(148721-149012)
scaffold0025 (54-390)||(8849-9192)
scaffold0025 (54-174)||(146818-146938)
scaffold0025 (161-228)||(53508-53576)
scaffold0025 (144-226)||(85697-85779)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (56-274)||(51110-51328)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (54-292)||(89378-89618)
scaffold0028 (54-179)||(107708-107835)
scaffold0028 (144-225)||(79704-79786)
scaffold0028 (55-86)||(130880-130911)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (162-386)||(9371-9596)
scaffold0215 (162-386)||(16269-16494)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (178-390)||(5254-5466)
scaffold0022 (145-228)||(102923-103007)
scaffold0022 (145-224)||(109756-109836)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (128-390)||(534-797)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (178-390)||(3722-3936)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (163-390)||(42997-43226)
scaffold0076 (135-277)||(39217-39360)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (139-390)||(21115-21367)
scaffold0139 (162-390)||(14083-14312)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (128-390)||(34460-34724)
[»] scaffold0772 (2 HSPs)
scaffold0772 (135-366)||(5552-5785)
scaffold0772 (54-86)||(5846-5878)
[»] scaffold0132 (3 HSPs)
scaffold0132 (128-390)||(13506-13769)
scaffold0132 (11-86)||(42677-42749)
scaffold0132 (54-86)||(13824-13856)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (144-390)||(35-283)
scaffold0116 (11-86)||(30417-30492)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (128-390)||(41648-41911)
scaffold0125 (54-94)||(41957-41997)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (139-386)||(2966-3215)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (128-390)||(37066-37328)
scaffold0078 (11-86)||(41632-41707)
scaffold0078 (54-86)||(36980-37012)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (140-294)||(13325-13479)
[»] scaffold0141 (4 HSPs)
scaffold0141 (128-275)||(26911-27058)
scaffold0141 (135-275)||(22656-22796)
scaffold0141 (54-86)||(22857-22889)
scaffold0141 (54-86)||(27112-27144)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (128-275)||(1582-1729)
scaffold0124 (54-86)||(1496-1528)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (140-275)||(1304-1439)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (285-390)||(48514-48620)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (285-390)||(9-115)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (128-290)||(3290-3453)
scaffold0361 (332-388)||(3210-3266)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (11-86)||(80187-80262)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (292-390)||(9382-9480)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (135-290)||(56106-56262)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (11-87)||(166121-166197)
scaffold0016 (12-87)||(162036-162111)
scaffold0016 (13-86)||(116410-116483)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (11-86)||(31137-31212)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (12-86)||(5735-5809)
scaffold0686 (12-86)||(5941-6015)
[»] scaffold0066 (3 HSPs)
scaffold0066 (178-322)||(45098-45244)
scaffold0066 (178-322)||(54484-54630)
scaffold0066 (54-86)||(45338-45370)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (144-228)||(8172-8257)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (11-87)||(309-385)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (144-335)||(22422-22615)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (54-224)||(10256-10427)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (11-85)||(1701-1775)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (144-290)||(22429-22576)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (11-85)||(19807-19881)
scaffold0122 (11-85)||(24111-24185)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (144-228)||(2687-2772)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (144-228)||(1348-1433)
scaffold0409 (144-228)||(9603-9688)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (144-228)||(70307-70391)
scaffold0058 (54-86)||(57392-57424)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (145-228)||(2317-2401)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (15-85)||(94-164)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (11-85)||(6261-6335)
scaffold0310 (48-85)||(4-41)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (144-228)||(76847-76932)
scaffold0053 (13-70)||(76699-76756)
[»] scaffold0032 (4 HSPs)
scaffold0032 (144-228)||(93773-93858)
scaffold0032 (144-228)||(104623-104708)
scaffold0032 (54-86)||(55904-55936)
scaffold0032 (54-86)||(108075-108107)
[»] scaffold0483 (2 HSPs)
scaffold0483 (145-228)||(6823-6907)
scaffold0483 (13-70)||(6999-7056)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (144-214)||(1546-1617)
scaffold0456 (144-214)||(8691-8762)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (146-228)||(28698-28781)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (145-198)||(10854-10908)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (145-226)||(31184-31266)
scaffold0010 (13-70)||(31357-31414)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (13-86)||(1363-1436)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (135-228)||(54038-54131)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (13-70)||(35816-35873)
scaffold0013 (145-228)||(35640-35724)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (180-228)||(3577-3625)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (54-224)||(1492-1663)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (144-226)||(962-1045)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (144-226)||(30128-30211)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (146-228)||(97200-97283)
[»] scaffold0670 (1 HSPs)
scaffold0670 (160-290)||(7691-7822)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (160-290)||(3351-3482)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (151-228)||(43805-43883)
scaffold0080 (144-290)||(23672-23819)
scaffold0080 (13-70)||(43651-43708)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (13-70)||(442-499)
[»] scaffold1272 (2 HSPs)
scaffold1272 (160-228)||(456-525)
scaffold1272 (13-70)||(632-689)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (53-86)||(193396-193429)
scaffold0004 (160-226)||(27661-27728)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (54-86)||(6443-6475)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (54-86)||(878-910)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (54-86)||(9882-9914)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (54-86)||(13285-13317)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (144-228)||(21674-21758)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (54-97)||(18015-18058)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (160-226)||(4769-4836)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (178-224)||(38-84)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (147-228)||(197256-197338)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (144-228)||(11256-11341)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (145-185)||(8011-8051)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (54-86)||(17209-17241)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (54-86)||(5476-5508)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (54-86)||(4346-4378)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (54-86)||(17304-17336)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (54-86)||(5549-5581)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (54-86)||(34308-34340)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (135-277)||(31423-31566)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (145-185)||(3525-3565)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (54-86)||(12418-12450)


Alignment Details
Target: scaffold0175 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 54 - 390
Target Start/End: Original strand, 882 - 1218
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 981  T
Q  154 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  982 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 1081  T
Q  254 attgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaa 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1082 attgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaattgagattttattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaa 1181  T
Q  354 taattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1182 taattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 1218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 46)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 11 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 41394602 - 41394222
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394602 cataggagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatg 41394503  T
Q  111 ttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41394502 ttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttgg 41394403  T
Q  211 tgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttg 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  41394402 tgaagttacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttatgttgagatttgattcttg 41394303  T
Q  310 ttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
     |||| ||||||||| | ||||| || ||||| |  ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394302 ctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgattgggtatgcatattcatggattgatgatg 41394222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 54 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 20931682 - 20931345
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  20931682 taaggtaagggggttagcctttatcataatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaagtttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 20931583  T
Q  154 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  20931582 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaa 20931483  T
Q  254 attgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatga 352  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||    
T  20931482 attgtgctaaattggtgaattttgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 20931383  T
Q  353 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20931382 ataatttcttgggtatgcatattcatgaattaatgatg 20931345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 54 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 20913367 - 20913037
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  20913367 taaggtaagggggttagtctttatcgtaatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaattttgcttacggataattgttgctaaattcgtgc 20913268  T
Q  154 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  20913267 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaa 20913168  T
Q  254 attgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaa 353  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||      ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||    
T  20913167 attgtgctcaattggtgaattttgcaaagttgttgtta------atttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatcttgtggttgatgaa 20913074  T
Q  354 taattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20913073 taattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 20913037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 54 - 390
Target Start/End: Original strand, 37844374 - 37844714
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  37844374 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcat 37844473  T
Q  152 gctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataat-aagttgtg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||| || || | |||    
T  37844474 gctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataaaatagtg 37844573  T
Q  251 aaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattga 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||    
T  37844574 aaaattgtgctcaattaatgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttga 37844673  T
Q  350 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  37844674 tgagtcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 37844714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 54 - 390
Target Start/End: Original strand, 20893551 - 20893889
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  20893551 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaa-ttttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattctt 20893649  T
Q  152 gctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtga 251  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||    
T  20893650 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 20893749  T
Q  252 aaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgat 350  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| || |||||    
T  20893750 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgat 20893849  T
Q  351 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20893850 gaatcattgtttgggtatgcatattcataaattgatgatg 20893889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 54 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 20446019 - 20445679
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 150  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  20446019 taaggtaagggagttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 20445920  T
Q  151 tgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtg 250  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||| |||||| |||    
T  20445919 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtg 20445820  T
Q  251 aaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattga 349  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||    
T  20445819 aaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttga 20445720  T
Q  350 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20445719 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20445679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 54 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 20531783 - 20531444
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  20531783 taaggtaaggaaattagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 20531684  T
Q  152 gctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtga 251  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||| |||||| ||||    
T  20531683 gctccaaatgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtga 20531584  T
Q  252 aaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgat 350  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |  |||||    
T  20531583 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttgat 20531484  T
Q  351 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20531483 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20531444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 55 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 22228146 - 22227809
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  ||| |||||||||||||||    
T  22228146 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 22228047  T
Q  154 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 253  Q
    ||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  22228046 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaa 22227947  T
Q  254 attgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatga 352  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22227946 attgtgtccaattgttgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatga 22227847  T
Q  353 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22227846 ataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 22227809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 55 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 22232843 - 22232506
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  ||| |||||||||||||||    
T  22232843 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 22232744  T
Q  154 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 253  Q
    ||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  22232743 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaa 22232644  T
Q  254 attgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatga 352  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22232643 attgtgtccaattgttgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatga 22232544  T
Q  353 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22232543 ataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 22232506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 140 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 2116506 - 2116258
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||| |||||||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2116506 tgctagattcgtgcttttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 2116407  T
Q  240 aataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgaga-tttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaattta 337  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |    
T  2116406 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattga 2116307  T
Q  338 tgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 386  Q
    |||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2116306 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 2116258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 140 - 390
Target Start/End: Original strand, 5072388 - 5072640
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  5072388 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 5072487  T
Q  240 aataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaattta 337  Q
     ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| || |    
T  5072488 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 5072587  T
Q  338 tgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5072588 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 5072640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 140 - 390
Target Start/End: Original strand, 18601118 - 18601370
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 239  Q
    |||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  18601118 tgctaaattcatgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 18601217  T
Q  240 aataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaattta 337  Q
     ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| || |    
T  18601218 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 18601317  T
Q  338 tgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18601318 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 18601370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 53 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 45051759 - 45051489
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||  ||||| ||||||    
T  45051759 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatg-tgattttgca--ttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgt 45051663  T
Q  152 gctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtga 251  Q
    | ||  ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45051662 gttcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 45051563  T
Q  252 aaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttat 324  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  45051562 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttat 45051489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 51452755 - 51452608
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  51452755 atggataattgttgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 51452656  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 275  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  51452655 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 51452608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 21860409 - 21860334
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21860409 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 21860334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 86
Target Start/End: Original strand, 44034829 - 44034903
Alignment:
Q  12 ataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44034829 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 44034903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 27675191 - 27675086
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgtt 112  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |  |  |  ||||||||||||| ||||    
T  27675191 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggagataattaaggtaagggggttagaatttatcataatcgt--ttttagtgtaaattttcaattgtt 27675094  T
Q  113 gtatgaat 120  Q
    ||||||||    
T  27675093 gtatgaat 27675086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 41218803 - 41218728
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  41218803 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcatgatcat 41218728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Original strand, 22143361 - 22143446
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||  ||||||||||| || ||||||||||    
T  22143361 aaattcgtgctctaactatgatgatgtgtttgtatgcatgaaatttgtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaa 22143446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17609174 - 17609090
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  17609174 aattcgtgctctaattatgatgatatatttgaatgcatgaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 17609090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20177421 - 20177337
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  20177421 aattcgtgctccaattatgatgatatgttttaatgcacgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 20177337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21195261 - 21195114
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaataa 241  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||  ||||||| | ||||| ||||| |    
T  21195261 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtgaaaatga 21195162  T
Q  242 taagttgtgaaaattgtgctc-aattgatgaattttgctaagttgttgtt 290  Q
    ||  |||||  |||| ||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  21195161 tatattgtg--aattatgctcaaattgttgaattgtgctaggttgttgtt 21195114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Original strand, 27329757 - 27329840
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||| ||  |||||||||||| | |||| |||||    
T  27329757 aattcgtgctccaattatgatgacatgtttgtatatatgaagttatgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaa 27329840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 33397583 - 33397452
Alignment:
Q  160 tatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaataataagttgtgaaaattg 257  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||  |  |||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||  |||||  |||||    
T  33397583 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgagttgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaataatatattgtg--aattg 33397486  T
Q  258 tgctc-aattgatgaattttgctaagttgttgtt 290  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  33397485 tgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgtt 33397452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 290
Target Start/End: Original strand, 40436285 - 40436416
Alignment:
Q  160 tatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaataataagttgtgaaaattg 257  Q
    |||||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||||| ||  |||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||  |||||  |||||    
T  40436285 tatgatgatatgtttgaatatatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaatgatatattgtg--aattg 40436382  T
Q  258 tgctc-aattgatgaattttgctaagttgttgtt 290  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  40436383 tgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgtt 40436416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 13376711 - 13376768
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13376711 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 13376768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 20177570 - 20177513
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20177570 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaatggggttag 20177513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 228
Target Start/End: Original strand, 37233876 - 37233945
Alignment:
Q  160 tatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  37233876 tatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtaaaattgcatgttcaaa 37233945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 217
Target Start/End: Original strand, 38033675 - 38033748
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaatt 217  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  38033675 aattcgtgctcctattatgatgttatgtttgtatgtaagaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaatt 38033748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16646158 - 16646074
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||   ||||||| ||||| ||||||||||    
T  16646158 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataatttaattgatgttggtaaaatttcatgttcaaa 16646074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16656884 - 16656800
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| || ||| ||||||||| ||  |||||||||||| | | ||||||||    
T  16656884 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcataaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcgtgttcaaa 16656800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 277
Target Start/End: Original strand, 18059757 - 18059900
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatg 232  Q
    ||||||| |||||||||||||   || ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  18059757 attgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 18059856  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    || ||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  18059857 tataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 18059900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Original strand, 8537910 - 8537993
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    |||||||||||   | |||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  8537910 aaattcgtgctttgattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 8537993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Original strand, 8603149 - 8603232
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    |||||||||||   | |||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  8603149 aaattcgtgctttgattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 8603232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 55 - 86
Target Start/End: Original strand, 15861327 - 15861358
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861327 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15861358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 294
Target Start/End: Original strand, 5768185 - 5768320
Alignment:
Q  160 tatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaataataagttgtgaaaattg 257  Q
    ||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||  ||||||| | ||||| ||||| |||  |||||  |||||    
T  5768185 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattg 5768282  T
Q  258 tgctc-aattgatgaattttgctaagttgttgttaatt 294  Q
    ||||| ||||| |||||| || || |||||||||||||    
T  5768283 tgctctaattgttgaattgtgttatgttgttgttaatt 5768320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17148781 - 17148735
Alignment:
Q  178 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  17148781 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 17148735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19603344 - 19603270
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaatt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||    
T  19603344 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgtatgaaattggtgataattgatttgttgttggtgaaatt 19603270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 228
Target Start/End: Original strand, 13376863 - 13376944
Alignment:
Q  148 tcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||  |||| | ||||||| ||||||||||    
T  13376863 tcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattaaattgttgtcgttgaaatttcatgttcaaa 13376944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 217
Target Start/End: Original strand, 36356294 - 36356367
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaatt 217  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  36356294 aattcgtgctcctattatgatgttatgtttgtatgtaagaaattgatgataattgaaatgttgttggtgaaatt 36356367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17004895 - 17004752
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatg 232  Q
    ||||||| |||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  17004895 attgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 17004796  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    || ||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  17004795 tataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 17004752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 277
Target Start/End: Original strand, 38055090 - 38055233
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatg 232  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||| ||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  38055090 attgttgttaaattcgtgcttttactgtgatgttattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 38055189  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    || ||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  38055190 tataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 38055233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 45051486 - 45051446
Alignment:
Q  346 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 386  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45051486 ttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 45051446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 51452841 - 51452809
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51452841 taaggtaagggggttagtctttatcttaatcat 51452809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Original strand, 51627665 - 51627749
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||| |||| ||  ||||| |||||| | ||||||||||    
T  51627665 aatttgtgctccaattatgatgatatgcttgaatgcatgaatttgttgatgattgaattgttgttagtgaaacttcatgttcaaa 51627749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 52400875 - 52400795
Alignment:
Q  147 ttcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||| || |||||| ||| ||||| ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  52400875 ttcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgatagttgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 52400795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 54 - 390
Target Start/End: Original strand, 5990 - 6326
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5990 taaggtaagggggttagtctttatcataatcattttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 6089  T
Q  154 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6090 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtaaaa 6189  T
Q  254 attgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaa 353  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6190 attgtgctgaattggtgaattttgctaagttgttgttaattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttttgttatgattgatgaa 6289  T
Q  354 taattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6290 taattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 6326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 54 - 388
Target Start/End: Original strand, 3508 - 3843
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  3508 taaggtaagggggttagtctttgtcataatcatcttcattttgtaaattttcaaaagttgtatgaattttgattatagataattgttgctaaattcgtgc 3607  T
Q  154 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3608 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 3707  T
Q  254 attgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatga 352  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  3708 attgtgctcaattggtaaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgagga 3807  T
Q  353 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 388  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3808 ataattgcttgggtatgcatattgatggattgatga 3843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 54 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 1462 - 1124
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1462 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttcttatggataattgttgctaaattcgtg 1363  T
Q  153 ctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaa 252  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1362 ctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 1263  T
Q  253 aattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatg 351  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || ||||||    
T  1262 aattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatattgtggttgatg 1163  T
Q  352 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1162 aataattgcttgggtgtgcatattcatgaattgatgatg 1124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 62)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 54 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 23507302 - 23506965
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  23507302 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatctccattttgtaagatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 23507203  T
Q  154 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 253  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23507202 tccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 23507103  T
Q  254 attgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatga 352  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||    
T  23507102 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 23507003  T
Q  353 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23507002 ataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 23506965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 54 - 390
Target Start/End: Original strand, 27182471 - 27182810
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  27182471 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcat 27182570  T
Q  152 gctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtga 251  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||    
T  27182571 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 27182670  T
Q  252 aaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgat 350  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  27182671 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgat 27182770  T
Q  351 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27182771 gaatcattgcttgagtatgcatattcatgaattgatgatg 27182810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 54 - 390
Target Start/End: Original strand, 18530988 - 18531330
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatc---atcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaat-tttgattat-ggatgattgttgctaaatt 148  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| || || |||| ||||||||||||||    
T  18530988 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcgtcatcatcattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatgtttcataattggataattgttgctaaatt 18531087  T
Q  149 cgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttg 248  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||    
T  18531088 cgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttg 18531187  T
Q  249 tgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgatt 347  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| |  ||    
T  18531188 tgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgtt 18531287  T
Q  348 gatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18531288 gatgaatcattgctcgggtatacatattcatgaattgatgatg 18531330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 54 - 390
Target Start/End: Original strand, 22053753 - 22054096
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  22053753 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgaaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 22053852  T
Q  148 tcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagtt 247  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||    
T  22053853 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 22053952  T
Q  248 gtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgat 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| |  |    
T  22053953 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgt 22054052  T
Q  347 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  22054053 tgatgaatcattgcttgggtctacatattcatgaattgatgatg 22054096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 128 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 34939540 - 34939289
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34939540 atggataactgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 34939441  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatgga 327  Q
     |||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||| | |||||||||||||  ||||||||| |     
T  34939440 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagtcattgtgaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattgc 34939341  T
Q  328 tgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 379  Q
    |||||||| ||||| |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  34939340 tgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 34939289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 140 - 341
Target Start/End: Original strand, 29188284 - 29188486
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29188284 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 29188383  T
Q  240 aataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttat 338  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  29188384 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgat 29188483  T
Q  339 gtt 341  Q
    |||    
T  29188484 gtt 29188486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 143 - 390
Target Start/End: Original strand, 43443398 - 43443647
Alignment:
Q  143 taaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataat 242  Q
    |||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  43443398 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 43443497  T
Q  243 aagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgt 340  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||| || || |    
T  43443498 aagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttcttctaagttgttgttgatttgagatgtgagtcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 43443597  T
Q  341 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43443598 tatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 43443647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 140 - 390
Target Start/End: Original strand, 22366481 - 22366733
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22366481 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 22366580  T
Q  240 aataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaattta 337  Q
     ||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||| |||||| || |    
T  22366581 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 22366680  T
Q  338 tgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366681 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 22366733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 140 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 25426880 - 25426628
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25426880 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25426781  T
Q  240 aataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaattta 337  Q
     ||||||| |||| |||||||| || || ||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| || |    
T  25426780 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25426681  T
Q  338 tgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426680 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25426628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 143 - 390
Target Start/End: Original strand, 18777995 - 18778244
Alignment:
Q  143 taaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataat 242  Q
    |||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  18777995 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 18778094  T
Q  243 aagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgt 340  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| || ||| || || |    
T  18778095 aagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatattatttgatat 18778194  T
Q  341 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778195 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 18778244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 140 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 12626 - 12374
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  12626 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 12527  T
Q  240 aataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaatt-gagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaattta 337  Q
     ||||||| |||| |||||||| || || ||||||| | ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| || |    
T  12526 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 12427  T
Q  338 tgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12426 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 144 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 27010089 - 27009841
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataata 243  Q
    ||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  27010089 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 27009990  T
Q  244 agttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgtt 341  Q
    |||| |||| ||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| || || ||    
T  27009989 agttatgaatattgtactcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 27009890  T
Q  342 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27009889 atgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 27009841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 140 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 19500151 - 19499899
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19500151 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 19500052  T
Q  240 aataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaattta 337  Q
     ||||||| |||| |||||||| || || ||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| || |    
T  19500051 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19499952  T
Q  338 tgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19499951 tattatgattgattaataattgctttggtatgcatattcatggattgatgatg 19499899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 140 - 390
Target Start/End: Original strand, 21073595 - 21073847
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21073595 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 21073694  T
Q  240 aataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaattta 337  Q
     ||||||| |||| |||||||| || || ||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||  |||||| || |    
T  21073695 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatcaatgttatttga 21073794  T
Q  338 tgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073795 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 21073847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 140 - 390
Target Start/End: Original strand, 4199985 - 4200237
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  4199985 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 4200084  T
Q  240 aataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaattta 337  Q
     ||||||| |||| ||| |||| ||||| ||||||| |  || ||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| || |    
T  4200085 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttga 4200184  T
Q  338 tgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4200185 tattatgattgatgaatgattgcttgggtttgcatattcatgggttgatgatg 4200237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20623232 - 20623085
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  20623232 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 20623133  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 275  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  20623132 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 20623085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 21233528 - 21233675
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  21233528 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 21233627  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 275  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  21233628 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 21233675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 130 - 274
Target Start/End: Original strand, 25900408 - 25900552
Alignment:
Q  130 ggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaat 229  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||    
T  25900408 ggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaat 25900507  T
Q  230 atgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaatt 274  Q
    |||| ||||| | ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||    
T  25900508 atgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatt 25900552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16536460 - 16536313
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  16536460 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16536361  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 275  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  16536360 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 16536313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 37053007 - 37052860
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  37053007 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37052908  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 275  Q
    ||||||  |||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  37052907 atatgtggaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 37052860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Original strand, 21310709 - 21310794
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  21310709 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 21310794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29918212 - 29918129
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  29918212 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 29918129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19862456 - 19862371
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  19862456 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 19862371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Original strand, 23981516 - 23981601
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||  ||||||||||| || ||||||||||    
T  23981516 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgtatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaa 23981601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32950951 - 32950862
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| || || || |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  32950951 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 32950862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 11584448 - 11584374
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  11584448 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagaattcatcataatca 11584374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Original strand, 21297175 - 21297260
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  21297175 aaattcgtcctctaactatgatgatatgtttgaacgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 21297260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Original strand, 5450844 - 5450928
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  5450844 aattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 5450928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 277
Target Start/End: Original strand, 10777969 - 10778112
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatg 232  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  10777969 attgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 10778068  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    || ||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  10778069 tataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 10778112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Original strand, 21222609 - 21222693
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  21222609 aattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattaaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 21222693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22885889 - 22885806
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  22885889 aaattcgtgctttaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 22885806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23514900 - 23514729
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||  ||| ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  ||||||||||||||||||    
T  23514900 taaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtg 23514801  T
Q  153 ctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    |||   || ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23514800 ctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 23514729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 277
Target Start/End: Original strand, 1219437 - 1219662
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  ||||||||||||||||||    
T  1219437 taaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtg 1219536  T
Q  153 ctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaataataagttgtg 250  Q
    |||   || ||||| ||| ||  | ||||| |||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||  |||||| ||    
T  1219537 ctcttgctgtgatgctattttcttgtgcattaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 1219636  T
Q  251 aaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
     ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  1219637 -aaattatgcttaattgatgaaatttg 1219662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 224
Target Start/End: Original strand, 11211983 - 11212153
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  ||| |||||||||||||||    
T  11211983 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 11212082  T
Q  154 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    ||   || ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11212083 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 11212153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 432710 - 432625
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||| ||  |||||||||||| | ||||||||||    
T  432710 aaattcgcgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgtagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaa 432625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21617262 - 21617181
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 225  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||| |||||||    
T  21617262 aattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattggattgttgttagtgaaattgcatgttc 21617181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 322
Target Start/End: Original strand, 35791015 - 35791287
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  ||||||||||||||||||    
T  35791015 taaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtg 35791114  T
Q  153 ctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaataataagttgtg 250  Q
    |||   || ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||  |||||| ||    
T  35791115 ctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgagtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 35791214  T
Q  251 aaaattgtgctcaattgatg-aattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgtt 322  Q
     | ||| | || |||||||| ||||||| || ||||||||| || |||||| |||||| ||||| | |||||||    
T  35791215 -agattatacttaattgatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgtt 35791287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 290
Target Start/End: Original strand, 26559815 - 26559962
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaataa 241  Q
    ||||||||||||   ||||||| ||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||| |    
T  26559815 aaattcgtgctcttgctatgattatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga 26559914  T
Q  242 taagttgtgaaaattgtgctc-aattgatgaattttgctaagttgttgtt 290  Q
    ||  |||||  |||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||    
T  26559915 tatattgtg--aattgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgtt 26559962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 5450695 - 5450768
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||   ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  5450695 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattgataataattaaggtaagggggttagaattcatcataatcat 5450768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 224
Target Start/End: Original strand, 17471587 - 17471676
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    ||||||| |||||||||||||   || ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  17471587 attgttgataaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 17471676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 21222462 - 21222519
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21222462 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtatgggggttag 21222519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 146 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24084322 - 24084144
Alignment:
Q  146 attcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaataata 243  Q
    |||||||| | || |||| ||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||| |||    
T  24084322 attcgtgccctaattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtaaaattacatgttcatagtatgtgaaaatgata 24084223  T
Q  244 agttgtgaaaattgtgctc-aattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgtt 322  Q
      |||||  |||||||||| || || |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||| ||| || |||| || |||||||    
T  24084222 tattgtg--aattgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgtgaatcatgtttaattgatgtt 24084144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 16105999 - 16105967
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16105999 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16105967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16595753 - 16595669
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  ||| | | |||||| ||||||||||    
T  16595753 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgatagagaaatttcatgttcaaa 16595669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 20623318 - 20623286
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623318 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 20623286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 21233442 - 21233474
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233442 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 21233474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 25900320 - 25900352
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25900320 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25900352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28902437 - 28902353
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| || ||| ||||||||| ||  |||||||||||| | | ||||||||    
T  28902437 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcataaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcgtgttcaaa 28902353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28938832 - 28938748
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| || ||| ||||||||| ||  |||||||||||| | | ||||||||    
T  28938832 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcataaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcgtgttcaaa 28938748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 386
Target Start/End: Original strand, 29190482 - 29190522
Alignment:
Q  346 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 386  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29190482 ttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 29190522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 277
Target Start/End: Original strand, 36989769 - 36989912
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatg 232  Q
    ||||||| ||||||||||||| | || ||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  36989769 attgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 36989868  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    || ||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  36989869 tataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 36989912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 37053093 - 37053061
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37053093 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37053061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Original strand, 11337186 - 11337271
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatg-ataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||| | ||| ||||||| ||  ||||| ||  |||||||||||||||    
T  11337186 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa 11337271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 390
Target Start/End: Original strand, 17471803 - 17471844
Alignment:
Q  349 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17471803 atgaatcattgcttgggtacgcatattcatgaattgatgatg 17471844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37983611 - 37983526
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||    
T  37983611 aaatttgtgctctatctatggtgatatatttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatattcaaa 37983526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 108728 - 108760
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  108728 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 108760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 9730278 - 9730310
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9730278 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 9730310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 16536546 - 16536514
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16536546 taagataagggggttagtctttatcataatcat 16536514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 277
Target Start/End: Original strand, 21932380 - 21932523
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatg 232  Q
    ||||||| |||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  21932380 attgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 21932479  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    || ||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  21932480 tataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 21932523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 277
Target Start/End: Original strand, 21938550 - 21938693
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatg 232  Q
    ||||||| |||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  21938550 attgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 21938649  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    || ||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  21938650 tataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 21938693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23494165 - 23494125
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 185  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  23494165 aattcgtgctccaactatgatgacatgttcgaatgcatgaa 23494125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 35582293 - 35582150
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatg 232  Q
    ||||||| |||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  35582293 attgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 35582194  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    || ||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  35582193 tataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 35582150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 87)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 54 - 390
Target Start/End: Original strand, 14842487 - 14842824
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14842487 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 14842586  T
Q  154 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  14842587 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatgaaa 14842686  T
Q  254 attgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatga 352  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14842687 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatga 14842786  T
Q  353 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14842787 ataattgattgggtttgcatattcatggattgatgatg 14842824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 54 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 2050147 - 2049810
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  2050147 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatcaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 2050048  T
Q  154 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 253  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  2050047 tccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacatgataacttgtgaaa 2049948  T
Q  254 attgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatga 352  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||    
T  2049947 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgatga 2049848  T
Q  353 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2049847 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 2049810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 54 - 390
Target Start/End: Original strand, 12030073 - 12030410
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12030073 taaggtaagggggttaatcattatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgacttttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 12030172  T
Q  154 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  12030173 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagtgataagttgtgaaa 12030272  T
Q  254 attgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatga 352  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  12030273 gttgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttatggttgatga 12030372  T
Q  353 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12030373 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 12030410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 54 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 13839232 - 13838905
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13839232 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatgaataattgttgctaaattcgtg 13839133  T
Q  153 ctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaa 252  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||    
T  13839132 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 13839033  T
Q  253 aattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatg 351  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||    
T  13839032 aattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatg 13838933  T
Q  352 aataattgcttgggtatgcatattcatg 379  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13838932 aatcattgtttgggtatgcatattcatg 13838905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 390
Target Start/End: Original strand, 16743998 - 16744377
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16743998 cataggagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacgaggttagtctttaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatg 16744097  T
Q  111 ttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16744098 ttgtatgaattttgattatggatgattgttgttaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttgg 16744197  T
Q  211 tgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttg 309  Q
    | ||||||||| || |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||  | ||| | ||| ||||||| | |||||||||    
T  16744198 ttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttatagttgaattgagctatgattcttg 16744296  T
Q  310 ttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    | ||| ||||||| | |||| ||||  ||||| |  ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16744297 tgcaattgatgttgttgatgctaataaatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatg 16744377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 118 - 391
Target Start/End: Original strand, 51158008 - 51158282
Alignment:
Q  118 aattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatt 217  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51158008 aattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatt 51158107  T
Q  218 acatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagt 316  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |    
T  51158108 acatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaatt 51158207  T
Q  317 gatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgt 391  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  51158208 gatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 51158282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 91 - 390
Target Start/End: Original strand, 15858986 - 15859287
Alignment:
Q  91 attttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattg 188  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15858986 attttgtaaattt-caattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattg 15859084  T
Q  189 atgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttg 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15859085 atgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttg 15859184  T
Q  289 tt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatg 387  Q
    || ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15859185 ttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatg 15859284  T
Q  388 atg 390  Q
    |||    
T  15859285 atg 15859287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 135 - 390
Target Start/End: Original strand, 15936634 - 15936890
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgta 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15936634 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15936733  T
Q  235 aaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaa 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15936734 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 15936833  T
Q  334 tttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15936834 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 15936890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 135 - 387
Target Start/End: Original strand, 15938476 - 15938729
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgta 234  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15938476 attgttactaaatacgtgctccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15938575  T
Q  235 aaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaa 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15938576 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 15938675  T
Q  334 tttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatg 387  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15938676 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatg 15938729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 15615170 - 15614838
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||  ||||| ||| ||    
T  15615170 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatg-taattttgca--ttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagatttgt 15615074  T
Q  152 gctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtga 251  Q
    ||||  ||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15615073 gctcttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 15614974  T
Q  252 aaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgat 350  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |  |||||    
T  15614973 atatggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgat 15614874  T
Q  351 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 386  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15614873 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 15614838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 128 - 390
Target Start/End: Original strand, 17912483 - 17912744
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17912483 atggataattgttgctaaattcgtgctccaact-tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17912581  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatgg 326  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||||  |||||||||| |||| || ||||| ||| ||||||| | |||||| |||||||  |||||||| |    
T  17912582 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaa-tttgatatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttattg 17912680  T
Q  327 atgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
     |||||||| ||||| |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17912681 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 17912744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 128 - 390
Target Start/End: Original strand, 13954890 - 13955153
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  13954890 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13954988  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatg 325  Q
    ||| |||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  13954989 ataagtaaaaatgatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13955088  T
Q  326 gatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
     |||||| || ||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13955089 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13955153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 128 - 390
Target Start/End: Original strand, 13975722 - 13975985
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  13975722 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13975820  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatg 325  Q
    ||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  13975821 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13975920  T
Q  326 gatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
     |||||| || ||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13975921 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13975985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 128 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 45861068 - 45860805
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  45861068 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 45860970  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatg 325  Q
    ||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  45860969 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 45860870  T
Q  326 gatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
     |||||| || ||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  45860869 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 45860805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 140 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 55316471 - 55316219
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  55316471 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 55316372  T
Q  240 aataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaattta 337  Q
     ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| || |    
T  55316371 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 55316272  T
Q  338 tgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55316271 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 55316219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 140 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 41270327 - 41270075
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  41270327 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaat 41270228  T
Q  240 aataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaattta 337  Q
     ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| || |    
T  41270227 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 41270128  T
Q  338 tgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41270127 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 41270075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 162 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 16821369 - 16821139
Alignment:
Q  162 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgct 261  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||  ||||||||    
T  16821369 tgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgct 16821270  T
Q  262 caattgatgaattt-tgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattg 359  Q
     ||||| ||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  16821269 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 16821170  T
Q  360 cttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16821169 cttgggtttgcatattcatggattaatgatg 16821139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19232164 - 19231979
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaat 109  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19232164 cataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcttaatcatcatcattttgtgaaattttcaaat 19232065  T
Q  110 gttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgat 193  Q
    ||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19232064 gttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttatattcatgaattgatgat 19231979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 228
Target Start/End: Original strand, 19260749 - 19260924
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  19260749 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaagttttcaaatgttgtatgaattttttttatggataattgttgctaaattcgtgc 19260848  T
Q  154 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgat-gataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    || || |||||||||||||||  ||| ||||| | || |||||||| ||  ||||| ||  |||||||||||||||    
T  19260849 tctaattatgatgatatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa 19260924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 2449238 - 2449385
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  2449238 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 2449337  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 275  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  2449338 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 2449385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 15857120 - 15857198
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcat 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15857120 cataggagctaaagtgaagctagagctaatacttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcat 15857198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 3992948 - 3992873
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3992948 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 3992873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 55513268 - 55513193
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55513268 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 55513193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 2844589 - 2844514
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2844589 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagtttgagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 2844514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 54037981 - 54038056
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54037981 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 54038056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 54651796 - 54651558
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| ||| |  | ||||  ||||||||||||  | | || ||| || ||||||||||||||||||    
T  54651796 taaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtg 54651697  T
Q  153 ctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt-caaa-tatgtaaaaataataagttgtg 250  Q
    |||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||    
T  54651696 ctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagtgaaattgcatgttgcaaagtatgtataaatgttaagttatg 54651597  T
Q  251 aaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt 290  Q
     ||||| | |||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  54651596 -aaattatactcaattggtgaattttgatatgttgttgtt 54651558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 17955837 - 17955916
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctag----agctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17955837 cataggagcaaaagtgaagctaggtagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17955916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 7854380 - 7854305
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  7854380 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 7854305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 290
Target Start/End: Original strand, 11986173 - 11986329
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg--ttcaaatatg 232  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| || || ||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  || || ||||    
T  11986173 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgttttaaagtatg 11986272  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt 290  Q
    ||  |||   ||||| || ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  11986273 tattaatgtcaagttatg-aaattgtgctcaaatagtgaattttgctaagttgttgtt 11986329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14080756 - 14080671
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  | ||| ||||| || ||||||||||    
T  14080756 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgtggttagtgaatttgcatgttcaaa 14080671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 276 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 47984765 - 47984650
Alignment:
Q  276 tgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatat 374  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||| | | |||||||| ||||| |  ||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  47984765 tgctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatat 47984666  T
Q  375 tcatggattgatgatg 390  Q
    ||||| ||||||||||    
T  47984665 tcatgaattgatgatg 47984650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 276 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 48003339 - 48003224
Alignment:
Q  276 tgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatat 374  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||| | | |||||||| ||||| |  ||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  48003339 tgctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatat 48003240  T
Q  375 tcatggattgatgatg 390  Q
    ||||| ||||||||||    
T  48003239 tcatgaattgatgatg 48003224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 390
Target Start/End: Original strand, 15468339 - 15468596
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatg 232  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  15468339 attgttgctaaattcgtgctcttgctatgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 15468438  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgtt 331  Q
    || ||||  |||||  || ||||| | || |||||||||| |||| || ||| |  || || |||||| | |||| | ||| | ||||||| |   ||||    
T  15468439 tataaatgttaagtcatg-aaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgtt 15468537  T
Q  332 aatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    || | |||||||  |  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15468538 aactgatgttattgtgaatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 15468596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 45582016 - 45581954
Alignment:
Q  25 tgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaag-ggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  45582016 tgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaaggggggttagtttttatcataatcat 45581954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Original strand, 47784767 - 47784851
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  47784767 aattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 47784851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 276 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 47994052 - 47993937
Alignment:
Q  276 tgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatat 374  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||| | | |||||||| || || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  47994052 tgctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatat 47993953  T
Q  375 tcatggattgatgatg 390  Q
    ||||| ||||||||||    
T  47993952 tcatgaattgatgatg 47993937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 276 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 48012625 - 48012510
Alignment:
Q  276 tgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatat 374  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||| | | |||||||| || || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  48012625 tgctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatat 48012526  T
Q  375 tcatggattgatgatg 390  Q
    ||||| ||||||||||    
T  48012525 tcatgaattgatgatg 48012510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Original strand, 4145814 - 4145896
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||    
T  4145814 aaattcgtactccaattatggtgatatgtttgaatacatgaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattacatgttca 4145896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 289
Target Start/End: Original strand, 6228625 - 6228771
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaataa 241  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |    
T  6228625 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcatagtatgtgaaaatga 6228724  T
Q  242 taagttgtgaaaattgtgctc-aattgatgaattttgctaagttgttgt 289  Q
    ||  |||||  |||||||||| || || |||||| ||||| ||||||||    
T  6228725 tatattgtg--aattgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgt 6228771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17191788 - 17191703
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| | ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  17191788 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataatcgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 17191703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17204928 - 17204843
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| | ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  17204928 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataatcgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 17204843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 25059077 - 25058853
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||||||||||||||||||    
T  25059077 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgcacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 25058978  T
Q  154 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaataataagttgtga 251  Q
    ||   || ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||  |||||| ||     
T  25058977 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg- 25058879  T
Q  252 aaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  25058878 aaattatgcttaattgatgaaatttg 25058853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 322
Target Start/End: Original strand, 12264710 - 12264981
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||||||||||||||||||    
T  12264710 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 12264809  T
Q  154 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaataataagttgtga 251  Q
    ||   || ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||  |||||| ||     
T  12264810 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg- 12264908  T
Q  252 aaattgtgctcaattgatg-aattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgtt 322  Q
    | ||| | || |||||||| ||||||| || ||||||||| || |||||| |||||| ||||| | |||||||    
T  12264909 agattatacttaattgatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgtt 12264981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17139754 - 17139670
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||| || |||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  17139754 aattcgtgctccaattatgatgacatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 17139670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30207462 - 30207378
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||| | ||||||||||    
T  30207462 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaa 30207378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 49232693 - 49232550
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatg 232  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  49232693 attgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 49232594  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    || ||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  49232593 tataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 49232550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 227
Target Start/End: Original strand, 3576439 - 3576522
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  3576439 aattcgtactctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 3576522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 224
Target Start/End: Original strand, 12902007 - 12902178
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||  ||| ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| || ||| ||||||||||||||    
T  12902007 taaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataatttttgctaaattcgtg 12902106  T
Q  153 ctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    |||   || ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12902107 ctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 12902178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 290
Target Start/End: Original strand, 14814765 - 14814912
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaataa 241  Q
    |||||||||||  || |||| ||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||| |    
T  14814765 aaattcgtgctttaattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga 14814864  T
Q  242 taagttgtgaaaattgtgctc-aattgatgaattttgctaagttgttgtt 290  Q
    ||  |||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  14814865 tatattgtg--aattgtgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgtt 14814912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Original strand, 9590754 - 9590839
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgca-tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| ||  |||||||||||| | ||||||||||    
T  9590754 aaatccgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcattaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaa 9590839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 17205076 - 17205019
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17205076 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 17205019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 38810868 - 38810941
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  38810868 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataactaaggtaagggggttagaattcatcataatcat 38810941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12953210 - 12953126
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  12953210 aattcgtgttctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattagattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 12953126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 226
Target Start/End: Original strand, 13301472 - 13301552
Alignment:
Q  147 ttcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  13301472 ttcgtgctctaattatgatggtatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattattgttggtgaaattgcatgttca 13301552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 226
Target Start/End: Original strand, 13312128 - 13312208
Alignment:
Q  147 ttcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  13312128 ttcgtgctctaattatgatggtatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattattgttggtgaaattgcatgttca 13312208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 12031904 - 12031849
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggtt 68  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  12031904 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggtt 12031849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15517878 - 15517795
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  15517878 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 15517795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18911332 - 18911161
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  ||||||||||||||||||    
T  18911332 taaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtg 18911233  T
Q  153 ctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    |||    | ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18911232 ctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 18911161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 41661812 - 41661729
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  41661812 aaattcgtgctcttgctatgatgatatgtttgaatacatggaaatgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 41661729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 22275466 - 22275209
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatg 232  Q
    |||||||||||||||||||||   || |||||  || ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  22275466 attgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgccattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 22275367  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgtt 331  Q
    || ||||  |||||  || ||||| | || |||||||||| |||| || ||| |  || || |||||| | |||| | ||| | ||||||| |   ||||    
T  22275366 tataaatgttaagtcatg-aaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgtt 22275268  T
Q  332 aatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    || | |||||||  |  |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22275267 aactgatgttattgtgaatgaatcattgcttaggtatgcatattcatgaattgatgatg 22275209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5228570 - 5228481
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||| ||| |   | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5228570 attgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatttccttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 5228481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 13301323 - 13301396
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | || | | |||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  13301323 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcatcataatcat 13301396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 13311979 - 13312052
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | || | | |||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  13311979 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcatcataatcat 13312052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 17191936 - 17191879
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17191936 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 17191879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34560126 - 34560061
Alignment:
Q  164 atgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  34560126 atgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 34560061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 2449152 - 2449184
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2449152 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2449184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Original strand, 14059214 - 14059298
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  || || | |||||| ||||||||||    
T  14059214 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgtttttagagaaatttcatgttcaaa 14059298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 16261809 - 16261777
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261809 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16261777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16880369 - 16880285
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||| ||  ||||| || ||||| ||||||||||    
T  16880369 aattcgtgctccaattacgatgatatgtttgaatgcaagaagttgttgataattgaattgttgttagtaaaatttcatgttcaaa 16880285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 16933869 - 16933901
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933869 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16933901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 17912398 - 17912430
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17912398 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17912430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 23492728 - 23492696
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23492728 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23492696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 38168269 - 38168237
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38168269 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 38168237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 53771397 - 53771365
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771397 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 53771365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 226
Target Start/End: Original strand, 31412349 - 31412416
Alignment:
Q  160 tatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  31412349 tatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 31412416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 3576290 - 3576347
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||| | || | |||||||||||||||||||||||    
T  3576290 taggaggtaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgataattaaggtaagggggttag 3576347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 15550987 - 15550922
Alignment:
Q  20 taaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||    
T  15550987 taaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaagataagggggttagaattcatcataatca 15550922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 277
Target Start/End: Original strand, 1467738 - 1467881
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatg 232  Q
    ||||||| |||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  1467738 attgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 1467837  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    || ||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  1467838 tataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 1467881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 226
Target Start/End: Original strand, 11882225 - 11882301
Alignment:
Q  151 tgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    ||||| || ||||||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||  |||||||    
T  11882225 tgctctaattatgatggtatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattattgttggtgaaattgaatgttca 11882301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 11986080 - 11986112
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11986080 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 11986112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 13954804 - 13954836
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13954804 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 13954836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 14285321 - 14285289
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14285321 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 14285289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 19947058 - 19947026
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19947058 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 19947026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 30153297 - 30153265
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30153297 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 30153265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 33342236 - 33342204
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33342236 taaggtaagagggttagtctttatcataatcat 33342204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 45861154 - 45861122
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45861154 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 45861122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 51961031 - 51961063
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51961031 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 51961063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 56)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 390
Target Start/End: Original strand, 20627195 - 20627576
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaa-ttttcaaat 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20627195 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaaattttcaaat 20627294  T
Q  110 gttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttg 209  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20627295 attgtatgaattatgattatggataattgttgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttg 20627394  T
Q  210 gtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattctt 308  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  20627395 gtgaaattacatgtccaaatatgtaaaaatgataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttaattctt 20627494  T
Q  309 gttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||  |||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  20627495 gttcaattgattttatggttgttaattggtgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatggatattcatgaattgaggatg 20627576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 54 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 463075 - 462743
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  463075 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 462976  T
Q  154 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 253  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  462975 tccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 462876  T
Q  254 attgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatga 352  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||    
T  462875 attgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgtcgtgattgatga 462776  T
Q  353 ataattgcttgggtatgcatattcatggattga 385  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  462775 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattga 462743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 390
Target Start/End: Original strand, 19794586 - 19794967
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatg 110  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  19794586 cataagagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtaaattt-caaatg 19794684  T
Q  111 ttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgtt 208  Q
    |||||||||||||   || |||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19794685 ttgtatgaatttttgcataatggataattgtcgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgtt 19794784  T
Q  209 ggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattct 307  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  19794785 ggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattct 19794884  T
Q  308 tgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    ||||||| |||||||||    ||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19794885 tgttcaattgatgttatttccgttaattgatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19794967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 11 - 390
Target Start/End: Original strand, 43642838 - 43643220
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatg 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43642838 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaagggaaggaggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatg 43642937  T
Q  111 ttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgtt 208  Q
    |||||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43642938 ttgtatgaatttttgcatagtggataattgttgctaaatttgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgtt 43643037  T
Q  209 ggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattct 307  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  43643038 ggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttttcttagttgttattaatttgagatatgattct 43643137  T
Q  308 tgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    ||||||| ||||| ||| | |||||||| ||||| |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43643138 tgttcaattgatgctattgctgttaattgatgttgtagttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43643220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 54 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 8891581 - 8891242
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  8891581 taaggtaaaggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 8891482  T
Q  152 gctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtga 251  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||    
T  8891481 gctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 8891382  T
Q  252 aaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgat 350  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||| || |||||    
T  8891381 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgat 8891282  T
Q  351 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8891281 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 8891242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 54 - 390
Target Start/End: Original strand, 36982364 - 36982704
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  36982364 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 36982463  T
Q  151 tgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtg 250  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36982464 tgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 36982563  T
Q  251 aaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattga 349  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| |  ||||    
T  36982564 aaaattgtgctcaattggtgaattttgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttga 36982663  T
Q  350 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36982664 tgaatcattgtttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36982704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 54 - 390
Target Start/End: Original strand, 24341309 - 24341652
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  24341309 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 24341408  T
Q  148 tcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagtt 247  Q
    || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   |||||    
T  24341409 tcatgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 24341508  T
Q  248 gtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgat 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| |||||    |    
T  24341509 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttcctgt 24341608  T
Q  347 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24341609 tgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 24341652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 128 - 390
Target Start/End: Original strand, 17396653 - 17396916
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17396653 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17396751  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatg 325  Q
    ||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  17396752 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 17396851  T
Q  326 gatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
     |||||| || || |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17396852 aatgttatttgatattatgattaatggataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 17396916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 128 - 390
Target Start/End: Original strand, 25265390 - 25265653
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25265390 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 25265489  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatgg 326  Q
     |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||  |||  ||  | ||||||| ||||||| | |    
T  25265490 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 25265589  T
Q  327 atgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
     |||||||| ||||| |  || |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25265590 ttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 25265653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 178 - 390
Target Start/End: Original strand, 7507894 - 7508107
Alignment:
Q  178 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  7507894 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaatttgg 7507993  T
Q  278 ctaagttgttgttaattgagatttgattcttg-ttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 376  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || || || ||||||||| | ||||| || ||||| |  ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  7507994 ctaagttgttgttaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattc 7508093  T
Q  377 atggattgatgatg 390  Q
    ||||||||||||||    
T  7508094 atggattgatgatg 7508107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 140 - 390
Target Start/End: Original strand, 19886661 - 19886913
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  19886661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 19886760  T
Q  240 aataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaatt-gagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaattta 337  Q
     ||||||| |||| |||||||| || || ||||||| | ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| || |    
T  19886761 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19886860  T
Q  338 tgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886861 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19886913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 19689401 - 19689548
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  19689401 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 19689500  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 275  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  19689501 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 19689548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23820334 - 23820187
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  23820334 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 23820235  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 275  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  23820234 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 23820187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 14906440 - 14906587
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  14906440 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 14906539  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 275  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  14906540 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 14906587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20015274 - 20015127
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |    
T  20015274 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttga 20015175  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 275  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  20015174 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 20015127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22863267 - 22863169
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  22863267 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 22863169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22275120 - 22275045
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22275120 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcctttatcataatcat 22275045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22284353 - 22284278
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22284353 cataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22284278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 15633612 - 15633538
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15633612 cataggagcaaaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtctttatcataatca 15633538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24884933 - 24884848
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcat-gaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  24884933 aaatttgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatggaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 24884848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 68238 - 68154
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  68238 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 68154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19660124 - 19660044
Alignment:
Q  147 ttcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  19660124 ttcgtgctctaattatgatgatatgttcgtatacatgaaattggtgataattgaattattgttggtgaaattgcatgttca 19660044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12728731 - 12728560
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  ||||||||||||||||||    
T  12728731 taaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtg 12728632  T
Q  153 ctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    |||   || ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12728631 ctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 12728560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Original strand, 19669116 - 19669191
Alignment:
Q  151 tgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 225  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||    
T  19669116 tgctctaactatggtgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgagttgttgttggtgaaattgcatgttc 19669191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34824814 - 34824643
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  ||||||||||||||||||    
T  34824814 taaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtg 34824715  T
Q  153 ctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    |||   || ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  34824714 ctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 34824643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 215
Target Start/End: Original strand, 22579863 - 22579933
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaa 215  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||  ||||||||||||    
T  22579863 aattcgtgctccaattatgatgacatgtttgtatgtatgaagttatgataattgaattgttgttggtgaaa 22579933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 43646289 - 43646232
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  43646289 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 43646232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Original strand, 22775206 - 22775290
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| || |||||| ||  |||||||||||| | ||||||||||    
T  22775206 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaa 22775290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Original strand, 22780584 - 22780668
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| || |||||| ||  |||||||||||| | ||||||||||    
T  22780584 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaa 22780668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 43646139 - 43646059
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||    
T  43646139 aattcgtgctctaattatgttgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattggattgttgttggtgaaatttcatgtt 43646059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 9636976 - 9636845
Alignment:
Q  160 tatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaataataagttgtgaaaattg 257  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||| |||  |||||  ||||     
T  9636976 tatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aatta 9636879  T
Q  258 tgctc-aattgatgaattttgctaagttgttgtt 290  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  9636878 tgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgtt 9636845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 224
Target Start/End: Original strand, 12635867 - 12635956
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    |||||||||||||||||||||    | ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12635867 attgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 12635956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19666775 - 19666690
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||  || |||||||| || ||||||||||    
T  19666775 aaattcatgctctaactataatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgtttttggtgaatttgcatgttcaaa 19666690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 86
Target Start/End: Original strand, 19689314 - 19689347
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689314 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 19689347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Original strand, 23778048 - 23778133
Alignment:
Q  139 ttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    |||||||||||||||||   || ||||| ||| ||  |||||||||||||||||| || ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  23778048 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttatgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtt 23778133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 9652796 - 9652828
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9652796 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 9652828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 14906354 - 14906386
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14906354 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14906386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 19660273 - 19660221
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  19660273 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 19660221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 23820420 - 23820388
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23820420 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23820388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 55 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 25213403 - 25213372
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25213403 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25213372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Original strand, 3798645 - 3798691
Alignment:
Q  178 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3798645 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 3798691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 24277992 - 24277861
Alignment:
Q  160 tatgatgatatgtttgtatgcatga-attgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaataataagttgtgaaaattg 257  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||| |||  |||||  |||||    
T  24277992 tatgatgatatgtttgaatacatgatattggtgacaattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattg 24277895  T
Q  258 tgctc-aattgatgaattttgctaagttgttgtt 290  Q
    ||||| ||||| |||||| || || |||||||||    
T  24277894 tgctctaattgttgaattgtgttatgttgttgtt 24277861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 217
Target Start/End: Original strand, 3248 - 3321
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaatt 217  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  3248 aattcgtgctcctattatgatgttatgtttgtatgtaagaaattgatgataattgatttgttgttggtgaaatt 3321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 19666921 - 19666848
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| | || | | |||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  19666921 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcatcataatcat 19666848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 25305826 - 25305769
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||  | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  25305826 taggagttaaagtgaagcttgggctatgaattggtgataattaaggtaagggggttag 25305769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Original strand, 31146032 - 31146138
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaa-tgt 111  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||    | ||  ||| |||||||||||||||||  || |||||||||||| |  || |||||||||||||| |||    
T  31146032 taggagctaaagtgaagcttgggctagagaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatctt--ttgtgtaaattttcaaattgt 31146129  T
Q  112 tgtatgaat 120  Q
    |||||||||    
T  31146130 tgtatgaat 31146138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 7507757 - 7507789
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7507757 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 7507789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 277
Target Start/End: Original strand, 11231337 - 11231480
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatg 232  Q
    ||||||| |||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  11231337 attgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 11231436  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    || ||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  11231437 tataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 11231480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 17396567 - 17396599
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17396567 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 17396599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 20015360 - 20015328
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20015360 taaggtaagggggttagtctttatcatgatcat 20015328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 277
Target Start/End: Original strand, 22513184 - 22513327
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatg 232  Q
    ||||||| |||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  22513184 attgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 22513283  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    || ||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  22513284 tataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 22513327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 277
Target Start/End: Original strand, 24685780 - 24685923
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatg 232  Q
    ||||||| |||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  24685780 attgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 24685879  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    || ||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  24685880 tataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 24685923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 25305677 - 25305637
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 185  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  25305677 aattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaa 25305637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 28031134 - 28031166
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28031134 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 28031166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 277
Target Start/End: Original strand, 28775806 - 28775949
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatg 232  Q
    ||||||| |||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  28775806 attgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 28775905  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    || ||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  28775906 tataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 28775949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 33128404 - 33128372
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33128404 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 33128372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 65)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 54 - 391
Target Start/End: Original strand, 16193643 - 16193980
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16193643 taaggtaagggg-ttagtctttatcataatcatcatcatttggtaaattttcaaatattgtatgaattttgcttatggatgattgttgctaaattcgtgc 16193741  T
Q  154 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16193742 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16193841  T
Q  254 attgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatga 352  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||    
T  16193842 attgtgctcaattggtgaattttgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 16193941  T
Q  353 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgt 391  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16193942 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 16193980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 54 - 390
Target Start/End: Original strand, 43373392 - 43373731
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   || |||||| |||  ||||||||||||    
T  43373392 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattaatgctaaattcgt 43373491  T
Q  152 gctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtga 251  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43373492 gctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 43373591  T
Q  252 aaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgat 350  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  43373592 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgat 43373691  T
Q  351 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43373692 gaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43373731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 390
Target Start/End: Original strand, 16404857 - 16405235
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatg 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  16404857 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattt-gtaaattttcaaatg 16404955  T
Q  111 ttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgtt 208  Q
    |||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16404956 ttgtatgaatttttgcatgatggataattattgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgtt 16405055  T
Q  209 ggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaattgagatttgattctt 308  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||| || ||||||||    
T  16405056 ggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgt--taaattgacatatgattctt 16405153  T
Q  309 gttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||| ||||| |  ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16405154 gttcaattgatgttattgttgttaattgatgttttagttgatgaatcactgcttgggtatgcaaattcatgaattgatgatg 16405235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 54 - 379
Target Start/End: Original strand, 24928716 - 24929043
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24928716 taaggtaatggggttagtctttatcataatcatcgtcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggataattgttgctaaattcgtg 24928815  T
Q  153 ctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaa 252  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||    
T  24928816 ctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 24928915  T
Q  253 aattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatg 351  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||  |||||| | ||  |||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  24928916 aattgtgctcaattggtgaatttcgctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggttgttaattgatgttgtgattgatg 24929015  T
Q  352 aataattgcttgggtatgcatattcatg 379  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24929016 aatcattgcttgggtatgcatattcatg 24929043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 140 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 24549233 - 24548986
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24549233 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 24549134  T
Q  240 aataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttat 338  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  24549133 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgat 24549034  T
Q  339 gttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 386  Q
    ||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24549033 gttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 24548986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 140 - 386
Target Start/End: Original strand, 6774258 - 6774505
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6774258 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 6774357  T
Q  240 aataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttat 338  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||| || ||    
T  6774358 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgat 6774457  T
Q  339 gttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 386  Q
    ||| |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6774458 gttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 6774505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 144 - 390
Target Start/End: Original strand, 21844576 - 21844824
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataata 243  Q
    ||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  21844576 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 21844675  T
Q  244 agttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgtt 341  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| || || ||    
T  21844676 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatttttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 21844775  T
Q  342 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21844776 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcattgattgttgatg 21844824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 144 - 390
Target Start/End: Original strand, 21851969 - 21852217
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataata 243  Q
    ||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  21851969 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgata 21852068  T
Q  244 agttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgtt 341  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| || || ||    
T  21852069 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 21852168  T
Q  342 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21852169 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcattgattgttgatg 21852217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 140 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 30120974 - 30120722
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  30120974 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 30120875  T
Q  240 aataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaattta 337  Q
     ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| || |    
T  30120874 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttga 30120775  T
Q  338 tgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  30120774 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatcgattgatgatg 30120722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 128 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 17345832 - 17345581
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17345832 atggataattgttgcgaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 17345733  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatgga 327  Q
     |||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||  |||| |||| |     
T  17345732 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattgtgaattgagttatgattcttgttcagttgatattattgt 17345633  T
Q  328 tgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 379  Q
    |||||||| ||||| |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17345632 tgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 17345581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 128 - 390
Target Start/End: Original strand, 22907214 - 22907476
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  22907214 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 22907313  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatgg 326  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||  | | ||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||| | |    
T  22907314 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 22907412  T
Q  327 atgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    ||| ||||  ||||| |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22907413 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 22907476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 140 - 390
Target Start/End: Original strand, 16674392 - 16674644
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16674392 tgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 16674491  T
Q  240 aataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaattta 337  Q
     ||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| || |    
T  16674492 gataagttatgaatattgtgcttaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 16674591  T
Q  338 tgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16674592 taatatgattaatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 16674644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 203 - 390
Target Start/End: Original strand, 222754 - 222943
Alignment:
Q  203 attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaatt-gagatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||| |     
T  222754 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 222853  T
Q  301 tgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222854 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 222943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 203 - 390
Target Start/End: Original strand, 736377 - 736566
Alignment:
Q  203 attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaatt-gagatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||| |     
T  736377 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 736476  T
Q  301 tgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736477 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 736566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 203 - 390
Target Start/End: Original strand, 860272 - 860461
Alignment:
Q  203 attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaatt-gagatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||| |     
T  860272 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 860371  T
Q  301 tgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860372 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 860461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5238350 - 5238203
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  5238350 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 5238251  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 275  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  5238250 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 5238203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 24661248 - 24661395
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  24661248 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 24661347  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 275  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  24661348 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 24661395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 43685809 - 43685662
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  43685809 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 43685710  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 275  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  43685709 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 43685662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 274841 - 274766
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  274841 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 274766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 641008 - 641083
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  641008 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 641083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 826814 - 826889
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  826814 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 826889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 24716719 - 24716794
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716719 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24716794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26011741 - 26011656
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  26011741 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcaaa 26011656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17285450 - 17285366
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  17285450 aattcgtgctccaattatgatgatatgtttaaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 17285366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 39115673 - 39115598
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  39115673 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtaataattaaggtaagggtgttagttttcatcataatcat 39115598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15933545 - 15933460
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  15933545 aaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 15933460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Original strand, 21198152 - 21198237
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  21198152 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgtagataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 21198237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 277
Target Start/End: Original strand, 22006176 - 22006400
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||||||||||||||||||    
T  22006176 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 22006275  T
Q  154 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaataataagttgtga 251  Q
    ||   || ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||  |||||| ||     
T  22006276 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg- 22006374  T
Q  252 aaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  22006375 aaattatgcttaattgatgaaatttg 22006400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25296405 - 25296320
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||   ||||||||||||| ||||||||||    
T  25296405 aaattcgtgccctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattaatgataattgaattgctgttggtgaaattgcatgttcaaa 25296320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25758425 - 25758340
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||   ||||||||||||| ||||||||||    
T  25758425 aaattcgtgccctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattaatgataattgaattgctgttggtgaaattgcatgttcaaa 25758340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 223
Target Start/End: Original strand, 23226076 - 23226156
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgt 223  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||| || |||||    
T  23226076 aaatttgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgagttgttgttggtgaatttgcatgt 23226156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 203 - 261
Target Start/End: Original strand, 691909 - 691967
Alignment:
Q  203 attgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgct 261  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  691909 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 691967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 33172459 - 33172328
Alignment:
Q  160 tatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaataataagttgtgaaaattg 257  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||| |||  |||||  |||||    
T  33172459 tatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattg 33172362  T
Q  258 tgctc-aattgatgaattttgctaagttgttgtt 290  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  33172361 tgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgtt 33172328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5854861 - 5854776
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||||    
T  5854861 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggcgataattgaattgttgttggtgaaatagcatgttcaaa 5854776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16195488 - 16195399
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    ||||||||||||||||| |||   || ||||| ||||||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16195488 attgttgctaaattcgttctcgtgctgtgatgctatgttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 16195399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 224
Target Start/End: Original strand, 13720845 - 13721016
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  ||||||||||||||||||    
T  13720845 taaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtg 13720944  T
Q  153 ctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    |||    | ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  13720945 ctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 13721016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 290
Target Start/End: Original strand, 18261471 - 18261618
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaataa 241  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||| | ||||| ||||| |    
T  18261471 aaattcgtgctctagttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatcttcatagtatgtgaaaatga 18261570  T
Q  242 taagttgtgaaaattgtgctc-aattgatgaattttgctaagttgttgtt 290  Q
    ||  |||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  18261571 tatattgtg--aattgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgtt 18261618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 229
Target Start/End: Original strand, 23151833 - 23151919
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaat 229  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  23151833 aaattcgtgttccaattatgatgatatatttgaatgcatgaaactagtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaat 23151919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 294
Target Start/End: Original strand, 24552586 - 24552721
Alignment:
Q  160 tatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaataataagttgtgaaaattg 257  Q
    ||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||| |||  |||||  |||||    
T  24552586 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattg 24552683  T
Q  258 tgctc-aattgatgaattttgctaagttgttgttaatt 294  Q
    ||||| ||||| |||||| || || |||||||||||||    
T  24552684 tgctctaattgttgaattgtgttatgttgttgttaatt 24552721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 277
Target Start/End: Original strand, 13662264 - 13662407
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatg 232  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||| ||| ||  | |||||||||  ||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  13662264 attgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatgnatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 13662363  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    || ||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  13662364 tataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 13662407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 17285600 - 17285543
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17285600 taggagctaaagtgaagcttgggttaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 17285543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 21198005 - 21198062
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21198005 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaagataagggggttag 21198062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23150026 - 23149985
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 185  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  23150026 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaa 23149985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23837445 - 23837360
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||  ||||||| ||||||||||    
T  23837445 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttaaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttattgaaatttcatgttcaaa 23837360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 5238436 - 5238404
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5238436 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 5238404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 22907128 - 22907160
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907128 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22907160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 24385652 - 24385684
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385652 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24385684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 24661162 - 24661194
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661162 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24661194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 43685895 - 43685863
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43685895 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 43685863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Original strand, 37653616 - 37653699
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    |||||||||||  || |||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  37653616 aaattcgtgctttaattatggtgatgtgtttgtatgcatgaatttggtgataattgaattgttgttgctgaaattgcatgttca 37653699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Original strand, 16873093 - 16873139
Alignment:
Q  178 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16873093 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 16873139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 290
Target Start/End: Original strand, 22497225 - 22497356
Alignment:
Q  160 tatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaataataagttgtgaaaattg 257  Q
    ||||||||||||||||  |  ||| ||||| ||||||||| ||  |||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||  |||||  |||||    
T  22497225 tatgatgatatgtttgagtagatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaatgatatattgtg--aattg 22497322  T
Q  258 tgctc-aattgatgaattttgctaagttgttgtt 290  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  22497323 tgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgtt 22497356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22742995 - 22742864
Alignment:
Q  160 tatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaataataagttgtgaaaattg 257  Q
    |||| |||||||||||  |||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||| |||  |||||  |||||    
T  22742995 tatggtgatatgtttgagtgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattg 22742898  T
Q  258 tgctc-aattgatgaattttgctaagttgttgtt 290  Q
    ||||| || || |||||| ||||| |||||||||    
T  22742897 tgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgtt 22742864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 290
Target Start/End: Original strand, 45558953 - 45559084
Alignment:
Q  160 tatgatgatatgtttgtatgcatgaattga-tgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaataataagttgtgaaaattg 257  Q
    ||||||||||||||||  | |||||| | | ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||| |||  |||||  |||||    
T  45558953 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattg 45559050  T
Q  258 tgctc-aattgatgaattttgctaagttgttgtt 290  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  45559051 tgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgtt 45559084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23158408 - 23158367
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 185  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  23158408 aaattcatgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaa 23158367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 33528667 - 33528598
Alignment:
Q  149 cgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaatt 217  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||| |||||||    
T  33528667 cgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattgaattgttgttgatgaaatt 33528598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Original strand, 33611053 - 33611138
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||| |||  ||  |||||||||||| | ||||||||||    
T  33611053 aaatttgtgctctaactatgatgatatatttgaatgcatgaaattggtgatcattagattgttgttggtgaaaattcatgttcaaa 33611138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 277
Target Start/End: Original strand, 271359 - 271502
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatg 232  Q
    ||||||| |||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  271359 attgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 271458  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    || ||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  271459 tataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 271502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 644561 - 644418
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatg 232  Q
    ||||||| |||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  644561 attgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 644462  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    || ||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  644461 tataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 644418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 830296 - 830153
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatg 232  Q
    ||||||| |||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  830296 attgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 830197  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    || ||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  830196 tataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 830153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 2545297 - 2545265
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2545297 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 2545265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 3431176 - 3431208
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3431176 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 3431208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 277
Target Start/End: Original strand, 22088793 - 22088936
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatg 232  Q
    ||||||| |||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  22088793 attgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttataggtgaaattacatgtttcaaagtatg 22088892  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    || ||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  22088893 tataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 22088936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22886686 - 22886654
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22886686 taaggtaagggggttagtcttaatcataatcat 22886654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 215
Target Start/End: Original strand, 27233090 - 27233162
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaa 215  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||| ||  || |||||||||    
T  27233090 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgtttttggtgaaa 27233162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 54 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 48935 - 48598
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  48935 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 48836  T
Q  154 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  48835 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaatgataagttgtgaaa 48736  T
Q  254 attgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatga 352  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||| || |||||||    
T  48735 attgtgctcagttggtgaattttgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatga 48636  T
Q  353 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48635 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 48598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 162 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 36323 - 36093
Alignment:
Q  162 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgct 261  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  36323 tgatgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 36224  T
Q  262 caattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattg 359  Q
     ||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||  ||||||||| |||||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  36223 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaatagatgttatgaatgttatttgataatatgattgatgaataattg 36124  T
Q  360 cttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36123 cttgggtttgcatattcatggattgatgatg 36093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 277
Target Start/End: Original strand, 153924 - 154149
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  ||||||||||||||||||    
T  153924 taaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtg 154023  T
Q  153 ctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaataataagttgtg 250  Q
    |||   || ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| |||||| ||||  |||||| ||    
T  154024 ctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaagttacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 154123  T
Q  251 aaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
     ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  154124 -aaattatgcttaattgatgaaatttg 154149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 61122 - 61154
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  61122 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 61154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 51)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 390
Target Start/End: Original strand, 54118125 - 54118507
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatg 110  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  54118125 cataagagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtgaattttcaaatg 54118224  T
Q  111 ttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgtt 208  Q
    |||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54118225 ttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgtt 54118324  T
Q  209 ggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattct 307  Q
    |||||||||||||||||||||| | | || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||    
T  54118325 ggtgaaattacatgttcaaataggaacaattgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagatttagttatgattct 54118424  T
Q  308 tgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54118425 tgttcaattgatgttatagttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 54118507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 54 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 13246769 - 13246430
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| |||||||||    
T  13246769 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcgt 13246670  T
Q  152 gctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtga 251  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||    
T  13246669 gctacaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 13246570  T
Q  252 aaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgat 350  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  13246569 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgat 13246470  T
Q  351 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13246469 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13246430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 54 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 122226 - 121989
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  122226 taaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaatttgtgc 122127  T
Q  154 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  122126 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 122027  T
Q  254 attgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtta 291  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  122026 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgtta 121989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 54 - 390
Target Start/End: Original strand, 15675009 - 15675352
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  15675009 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 15675108  T
Q  148 tcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagtt 247  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||    
T  15675109 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 15675208  T
Q  248 gtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgat 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| |  |    
T  15675209 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgt 15675308  T
Q  347 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15675309 tgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 15675352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 54 - 322
Target Start/End: Original strand, 10104170 - 10104445
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||  || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  10104170 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 10104269  T
Q  148 tcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagtt 247  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||    
T  10104270 ccgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 10104369  T
Q  248 gtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgtt 322  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  10104370 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 10104445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 155 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 31115865 - 31115629
Alignment:
Q  155 ccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaa 254  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||   ||||||||||||    
T  31115865 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaa 31115766  T
Q  255 ttgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaa 353  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| |  ||||||||    
T  31115765 ttatgctcaattggtgaattttcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaa 31115666  T
Q  354 taattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31115665 tcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 31115629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 144 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 10644467 - 10644219
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataata 243  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  10644467 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 10644368  T
Q  244 agttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgtt 341  Q
    |||| |||  |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| || || ||    
T  10644367 agttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 10644268  T
Q  342 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10644267 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10644219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 128 - 382
Target Start/End: Original strand, 13048221 - 13048477
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13048221 atggataattgttgctaaattcatgctccaacttcaatgatatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 13048320  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatg 325  Q
    |||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  13048321 atatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgttgttagtttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13048420  T
Q  326 gatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 382  Q
     |||||| |  ||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13048421 aatgttattagataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggat 13048477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 140 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 47357906 - 47357654
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  47357906 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 47357807  T
Q  240 aataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaattta 337  Q
     ||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| || |    
T  47357806 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 47357707  T
Q  338 tgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47357706 tattatgattgatgaataattgattgggtatgtatattcatggattgatgatg 47357654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 128 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 26680463 - 26680201
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  26680463 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 26680364  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatgg 326  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||  | | ||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||| | |    
T  26680363 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatagatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 26680265  T
Q  327 atgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    ||| ||||  ||||| |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26680264 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 26680201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 10488825 - 10488678
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  10488825 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 10488726  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 275  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  10488725 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 10488678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 16327926 - 16328073
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  16327926 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16328025  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 275  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  16328026 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 16328073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 33241043 - 33240890
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  33241043 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 33240944  T
Q  148 tcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtat 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33240943 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtat 33240890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 144 - 322
Target Start/End: Original strand, 40885570 - 40885749
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaataat 242  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||       
T  40885570 aaattcgtactccaactgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtc 40885669  T
Q  243 aagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgtt 322  Q
    ||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  40885670 aagttatg-aaattatgctcaattggtgaactttgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 40885749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 25119064 - 25119139
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  25119064 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggagttagtttttatcataatcat 25119139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 292 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 111493 - 111395
Alignment:
Q  292 attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  111493 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 111395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 31132657 - 31132545
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  31132657 taaggtaagggggttagtcttcatcataattatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 31132558  T
Q  148 tcgtgctccaact 160  Q
    |||||||||||||    
T  31132557 tcgtgctccaact 31132545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 5682385 - 5682460
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5682385 cataggagcaaaagtgaagcatgagctaatagttggtgataattaaggtaagtgggttagtttttatcataatcat 5682460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7850248 - 7850090
Alignment:
Q  143 taaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataat 242  Q
    ||||||||||||||||    |||| |||||||| ||| ||| |||||||| || ||| |||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||       
T  7850248 taaattcgtgctccaatggagatgttatgtttgaatgaatgtattgatgaaaactgtgtgattgttggtggaattgtatgtccaattatgtgaaaatgtg 7850149  T
Q  243 aagttgtgaaaattgtgctcaattgatg-aattttgctaagttgttgtt-aattgagat 299  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  7850148 aagttatgaaaattgtgctcaagtgatgaaattttgctaagtgattgttgaattgagat 7850090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15045074 - 15044990
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  15045074 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 15044990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 322
Target Start/End: Original strand, 17145574 - 17145845
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| ||| |  ||||||  ||||||||||||  |   || ||| |  |||| || ||||||||||    
T  17145574 taaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattgatgttaaattcgtg 17145673  T
Q  153 ctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaataataagttgtg 250  Q
    |||  ||| ||||| ||| ||  | | |||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||  |||||||||    
T  17145674 ctcttactgtgatgctattttcttgtacatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttgtg 17145773  T
Q  251 aaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgtt 322  Q
     ||||| | |||||||  ||||||||| || ||||||||| || |||||| |||||| ||||| | |||||||    
T  17145774 -aaattatactcaattagtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgtt 17145845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18169308 - 18169084
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||||||||||||||||||    
T  18169308 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 18169209  T
Q  154 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaataataagttgtga 251  Q
    ||   || ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||  |||||| ||     
T  18169208 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg- 18169110  T
Q  252 aaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  18169109 aaattatgcttaattgatgaaatttg 18169084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18276681 - 18276596
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  18276681 aaattcgtgctctaaatatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattaaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 18276596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Original strand, 47535065 - 47535150
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| || |||||||    
T  47535065 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcaagttcaaa 47535150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Original strand, 13809511 - 13809595
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||| ||  |||||||||| ||| ||||||||||    
T  13809511 aattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgagatttcatgttcaaa 13809595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 226
Target Start/End: Original strand, 15013282 - 15013365
Alignment:
Q  143 taaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  15013282 taaattcgtgctctaattatgatgatatgtt-gaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 15013365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Original strand, 15109350 - 15109434
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  15109350 aattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 15109434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 233
Target Start/End: Original strand, 7964712 - 7964802
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgt 233  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  7964712 aaatccgtgctctaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaagtatgt 7964802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 290
Target Start/End: Original strand, 18238173 - 18238304
Alignment:
Q  160 tatgatgatatgtttgtatgcatga-attgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaataataagttgtgaaaattg 257  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||| |||  |||||  |||||    
T  18238173 tatgatgatatgtttgaatacatgatattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattg 18238270  T
Q  258 tgctc-aattgatgaattttgctaagttgttgtt 290  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  18238271 tgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgtt 18238304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 41165808 - 41165881
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||    
T  41165808 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaacgtaagggggttagaattcatcataatcat 41165881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 8374722 - 8374576
Alignment:
Q  178 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 275  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||  |||||| || ||||| | |||||||  |||||||    
T  8374722 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgcttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattagtgaattt 8374624  T
Q  276 tgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgtt 322  Q
    |  || ||||||||| || |||||| |||||| ||||| | |||||||    
T  8374623 taatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgtt 8374576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Original strand, 18494329 - 18494412
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||| ||  |||||||||||| | |||| |||||    
T  18494329 aattcgtgctccaattatgatgacatgttcgtatgtatgaagttatgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaa 18494412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Original strand, 30232498 - 30232581
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||| ||  |||||||||||| | |||| |||||    
T  30232498 aattcgtgctccaattatgatgacatgtttgtatatatgaagttatgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaa 30232581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Original strand, 40904934 - 40905017
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  40904934 aaattcgtgctctagttatgatgatatgtttgaatacatgaaattgctgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 40905017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22738483 - 22738390
Alignment:
Q  178 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatg 270  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  22738483 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttgtg-aaattatgcttaattgatg 22738390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 290
Target Start/End: Original strand, 41256370 - 41256516
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaataa 241  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||| |    
T  41256370 aaattcgtgctctaattatgatgaaatgtt-gaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga 41256468  T
Q  242 taagttgtgaaaattgtgctc-aattgatgaattttgctaagttgttgtt 290  Q
    ||  |||||  |||| ||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  41256469 tatattgtg--aattatgctcaaattgttgaattgtgctaggttgttgtt 41256516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 224
Target Start/End: Original strand, 7132064 - 7132153
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    |||||||||||||||||||||    | ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  7132064 attgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 7132153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19020739 - 19020654
Alignment:
Q  139 ttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    |||||||||||||||||   || ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19020739 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 19020654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 47534933 - 47534990
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | || || | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  47534933 taggagctaaagtgaagcttgggcgaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 47534990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 390
Target Start/End: Original strand, 10104450 - 10104494
Alignment:
Q  346 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10104450 ttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 10104494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 14952117 - 14952085
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952117 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14952085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 15135907 - 15135939
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15135907 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15135939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 15272211 - 15272243
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272211 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15272243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 16327840 - 16327872
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16327840 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16327872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 16609013 - 16609045
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16609013 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16609045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 26680549 - 26680517
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680549 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26680517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Original strand, 7185844 - 7185927
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||  |||||||    
T  7185844 aaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttca 7185927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 38764956 - 38764873
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    |||||||||||  || ||||  |||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  38764956 aaattcgtgctttaattatggggatatgtttgaatgaatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttca 38764873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Original strand, 52265508 - 52265593
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||| | ||||||  |||||||||    
T  52265508 aaattcgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaattttatgttcaaa 52265593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 8045304 - 8045272
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8045304 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 8045272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 16523178 - 16523146
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16523178 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 16523146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 72)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 3060344 - 3059966
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgtt 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3060344 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataatgaaggtaagggggtaagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgtt 3060245  T
Q  113 gtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtg 212  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||    
T  3060244 atatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtg 3060145  T
Q  213 aaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  3060144 aaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataaattgtgaaaattatgctcaaatggtgaattttgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgtt 3060045  T
Q  312 caagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3060044 caattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 3059966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 54 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 16212103 - 16211768
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  16212103 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggacaattgttgctaaattcgtgc 16212004  T
Q  154 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16212003 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16211904  T
Q  254 attgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatga 352  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||    
T  16211903 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 16211804  T
Q  353 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 388  Q
     | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16211803 ttcattgcttgggtatgcatattcatgaattaatga 16211768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 54 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 36053003 - 36052667
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||  |    
T  36053003 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattgttgctaaatttat 36052904  T
Q  152 gctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtga 251  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36052903 actccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 36052804  T
Q  252 aaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatg 351  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| || ||||||    
T  36052803 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgt--taatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtggttgttaattgatgttgtggttgatg 36052706  T
Q  352 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36052705 aataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36052667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 54 - 390
Target Start/End: Original strand, 13036938 - 13037277
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  13036938 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 13037037  T
Q  152 gctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtga 251  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | | |||| |||||||||||    
T  13037038 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 13037137  T
Q  252 aaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgat 350  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| | |||||||| || |||||| ||||| || |||||    
T  13037138 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatgaatattaattgatgttgtggttgat 13037237  T
Q  351 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13037238 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13037277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 54 - 385
Target Start/End: Original strand, 11580661 - 11580997
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg---attatggatgattgttgctaaattc 149  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    || |||||| ||| |||||||||||    
T  11580661 taaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttttgcataatggataattattgctaaattc 11580760  T
Q  150 gtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgt 249  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||    
T  11580761 gtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgt 11580860  T
Q  250 gaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattg 348  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||    
T  11580861 gaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttg 11580960  T
Q  349 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattga 385  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  11580961 atgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattga 11580997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 135 - 390
Target Start/End: Original strand, 18253842 - 18254098
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgta 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18253842 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 18253941  T
Q  235 aaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaa 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18253942 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 18254041  T
Q  334 tttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18254042 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 18254098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 128 - 390
Target Start/End: Original strand, 47481031 - 47481294
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47481031 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaa 47481130  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatgg 326  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |    
T  47481131 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatcg 47481230  T
Q  327 atgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
     | |||||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47481231 ctcttaattgatgtttttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 47481294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 390
Target Start/End: Original strand, 16478968 - 16479213
Alignment:
Q  146 attcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataag 245  Q
    ||||||||||  |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16478968 attcgtgctcttactgcgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataag 16479067  T
Q  246 ttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatg 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||| || ||||| |     
T  16479068 ttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgtt 16479167  T
Q  345 attgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
     ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16479168 gttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 16479213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 140 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 10989661 - 10989410
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  10989661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 10989562  T
Q  240 aataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttat 338  Q
     ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||    
T  10989561 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgtaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgat 10989462  T
Q  339 gttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10989461 attatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10989410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 139 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 2437710 - 2437457
Alignment:
Q  139 ttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 238  Q
    |||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  2437710 ttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 2437611  T
Q  239 taataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaa-ttttgctaagttgttgttaat-tgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaattt 336  Q
    | ||||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||     
T  2437610 tgataagttatgaagattgtgttcaattggtgaatttttcctaagttgttgttaatatgagatttgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 2437511  T
Q  337 atgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  2437510 atattatgattgatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 2437457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 128 - 384
Target Start/End: Original strand, 25292338 - 25292595
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25292338 atggataattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 25292437  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatgg 326  Q
    |||||||||||  ||||| | |||| |||||||||||||| |||||| | ||| ||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||     
T  25292438 atatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgctcaattggtgaattctcctaggttgtcgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatga 25292537  T
Q  327 atgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattg 384  Q
    |||||| || || |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25292538 atgttatttgatattatgactaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattg 25292595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 144 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 13572924 - 13572676
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataata 243  Q
    ||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  13572924 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 13572825  T
Q  244 agttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgtt 341  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| || || ||    
T  13572824 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 13572725  T
Q  342 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13572724 atgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13572676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 140 - 390
Target Start/End: Original strand, 13911024 - 13911277
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13911024 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 13911123  T
Q  240 aataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgct-aagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaattt 336  Q
     ||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||| | || ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||     
T  13911124 gataagttatgaatattatgctcaattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttg 13911223  T
Q  337 atgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13911224 atattatgattgatgaataatttcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 13911277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 128 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 7293279 - 7293017
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  7293279 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 7293180  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatgg 326  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||  | ||||||||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||| | |    
T  7293179 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 7293081  T
Q  327 atgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    ||| ||||  ||||| |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7293080 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 7293017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 129 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 13321278 - 13321014
Alignment:
Q  129 tggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaa 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13321278 tggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaa 13321179  T
Q  228 a-tatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttg-ttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttat 324  Q
    | |||||| ||||   ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  13321178 agtatgtataaatgtcaagttatg-aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 13321080  T
Q  325 ggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
     | |||||||| ||||| |  ||||||||| ||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  13321079 tgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtttgcacattcatgaattgatgatg 13321014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 11516490 - 11516343
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  11516490 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 11516391  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 275  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  11516390 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 11516343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 15441564 - 15441711
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  15441564 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 15441663  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 275  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  15441664 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 15441711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 30262129 - 30262276
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  30262129 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 30262228  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 275  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  30262229 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 30262276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 56 - 387
Target Start/End: Original strand, 295893 - 296224
Alignment:
Q  56 aggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa-ttttg-attatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||||||| |  |||||||||  ||||||||| ||||| || ||| || ||||||||||||||||||     
T  295893 aggtaagggggtttgtcttcaacataattctcatcatttt-tgcattttcaaactttgtatgaaattttgcataatgaataattgttgctaaattcgtgt 295991  T
Q  154 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 253  Q
    || || |  | || ||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||||| | |||    
T  295992 tctaattgaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaatgagaagttataaaa 296091  T
Q  254 attgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt--aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatg 351  Q
    ||| |   ||| || ||||||||||||| ||| ||||  ||||| | | |||||| ||||||| ||||||| | | | |||||| |||||    ||||||    
T  296092 attatatccaaatggtgaattttgctaaattgatgtttgaattgtgttgtgattcatgttcaattgatgttgttgctattaattgatgtt---gttgatg 296188  T
Q  352 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatg 387  Q
    ||| | || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  296189 aattactgattgggtatgcttattcatggattgatg 296224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 32493903 - 32493978
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32493903 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 32493978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 126813 - 126738
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  126813 cataggagcaaaaatgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 126738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 1936874 - 1936949
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1936874 catagaagcaaaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtttttatcataatcat 1936949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Original strand, 16914928 - 16915013
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  16914928 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 16915013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 111126 - 111201
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  111126 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaaaagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 111201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9611555 - 9611470
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  9611555 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 9611470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9839126 - 9839041
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  9839126 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 9839041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Original strand, 48622665 - 48622758
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  48622665 attgatgctaaattcgtgctcttactgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttcaaa 48622758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13377775 - 13377691
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  13377775 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 13377691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 13377924 - 13377819
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgtt 112  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||  |  |  ||||||||||||| ||||    
T  13377924 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcatcataatcat--ttttagtgtaaattttcaattgtt 13377827  T
Q  113 gtatgaat 120  Q
    ||||||||    
T  13377826 gtatgaat 13377819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 7283913 - 7283987
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || || |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  7283913 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaataattggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 7283987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 28722357 - 28722210
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaataa 241  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||| |    
T  28722357 aaattcgtgctctagttatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga 28722258  T
Q  242 taagttgtgaaaattgtgctc-aattgatgaattttgctaagttgttgtt 290  Q
    ||  |||||  |||| ||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  28722257 tatattgtg--aattatgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgtt 28722210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 277
Target Start/End: Original strand, 15950709 - 15950933
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||||||||||||||||||    
T  15950709 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 15950808  T
Q  154 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaataataagttgtga 251  Q
    ||   || ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||  |||||| ||     
T  15950809 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg- 15950907  T
Q  252 aaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  15950908 aaattatgcttaattgatgaaatttg 15950933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 48356891 - 48356806
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  48356891 aaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 48356806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 224
Target Start/End: Original strand, 18979938 - 18980109
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  ||||||||||||||||||    
T  18979938 taaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtg 18980037  T
Q  153 ctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    |||   || ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18980038 ctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 18980109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 13389750 - 13389693
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13389750 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 13389693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Original strand, 14271899 - 14271984
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  14271899 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattcaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 14271984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 36024485 - 36024372
Alignment:
Q  54 taaggtaaggggg-ttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaa 146  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    |||  || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||| |||||    
T  36024485 taaggtaaggggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgtttctaaa 36024386  T
Q  147 ttcgtgctccaact 160  Q
    ||||||||||||||    
T  36024385 ttcgtgctccaact 36024372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Original strand, 49047675 - 49047759
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||| ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  49047675 aatttgtgctccaattataatgacatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 49047759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14935607 - 14935524
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    |||||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  14935607 aaattcgtgctctagttatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 14935524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15363200 - 15363117
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    |||||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  15363200 aaattcgtgctctagttatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 15363117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15927907 - 15927736
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatga-ttgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | ||||   ||| | |||||||||||||||||    
T  15927907 taaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgatcaattgttgctaaattcgtg 15927808  T
Q  153 ctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    |||    | ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15927807 ctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgcttgtgggtgaaattacatgtt 15927736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 170
Target Start/End: Original strand, 14113989 - 14114031
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatat 170  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14113989 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 14114031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 170
Target Start/End: Original strand, 14423639 - 14423681
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatat 170  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14423639 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 14423681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 2029276 - 2029244
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029276 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2029244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 7293365 - 7293333
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293365 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 7293333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 11516576 - 11516544
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11516576 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 11516544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13275023 - 13274939
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||| || |||||| ||  ||||| || ||||| ||||||||||    
T  13275023 aattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcaagaagttgttggtaattgaattgttgttagtaaaatttcatgttcaaa 13274939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 14113903 - 14113935
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14113903 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14113935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 15441478 - 15441510
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441478 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15441510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15709501 - 15709428
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatc----attttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 123  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    |||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  15709501 taaggtaagaggattagtcttcatcataatcatcatcatcaattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttt 15709428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 16919926 - 16919870
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggtta 69  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||| |||||||||||    
T  16919926 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaagataagggggtta 16919870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Original strand, 17223939 - 17224023
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||| |||  |||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||    
T  17223939 aattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcacgaagttgtggataattgaattgttgtttgtgaaatttcatgttcaaa 17224023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 30262043 - 30262075
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30262043 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 30262075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 42056188 - 42056220
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056188 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 42056220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15359028 - 15358961
Alignment:
Q  160 tatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  15359028 tatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 15358961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 54 - 224
Target Start/End: Original strand, 15760031 - 15760202
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||  ||| ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  ||| ||||||||||||||    
T  15760031 taaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtg 15760130  T
Q  153 ctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    |||   || ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||||    
T  15760131 ctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatgatatgtttgtgggtgaaattacatgtt 15760202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 290
Target Start/End: Original strand, 8267744 - 8267875
Alignment:
Q  160 tatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaataataagttgtgaaaattg 257  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||||| ||  |||||| ||||||| |||||||| | ||||| ||||| |||  |||||  |||||    
T  8267744 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattg 8267841  T
Q  258 tgctc-aattgatgaattttgctaagttgttgtt 290  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  8267842 tgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgtt 8267875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13758584 - 13758538
Alignment:
Q  178 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  13758584 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 13758538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12759234 - 12759149
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgat-gataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||| | || |||||||| ||  ||||||||  |||||||||||||||    
T  12759234 aaatttgtgctccaattatgatgatatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaa 12759149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Original strand, 34241223 - 34241288
Alignment:
Q  160 tatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||    
T  34241223 tatgatgttatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgtt 34241288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 371449 - 371417
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  371449 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 371417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 3049937 - 3049905
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3049937 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 3049905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7822985 - 7822842
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatg 232  Q
    ||||||| |||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  7822985 attgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 7822886  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    || ||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  7822885 tataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 7822842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7830296 - 7830153
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatg 232  Q
    ||||||| |||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  7830296 attgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 7830197  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    || ||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  7830196 tataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 7830153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 13321366 - 13321334
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13321366 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 13321334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 58 - 86
Target Start/End: Original strand, 15516765 - 15516793
Alignment:
Q  58 gtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516765 gtaagggggttagtctttatcataatcat 15516793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 25124482 - 25124450
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25124482 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 25124450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 277
Target Start/End: Original strand, 27101636 - 27101779
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatg 232  Q
    ||||||| |||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  27101636 attgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 27101735  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    || ||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  27101736 tataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 27101779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 277
Target Start/End: Original strand, 27108984 - 27109127
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatg 232  Q
    ||||||| |||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  27108984 attgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 27109083  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    || ||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  27109084 tataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 27109127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27176690 - 27176547
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatg 232  Q
    ||||||| |||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  27176690 attgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 27176591  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    || ||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  27176590 tataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 27176547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 277
Target Start/End: Original strand, 38783728 - 38783871
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatg 232  Q
    ||||||| |||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  38783728 attgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 38783827  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    || ||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  38783828 tataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 38783871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 47480944 - 47480976
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47480944 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 47480976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 54 - 390
Target Start/End: Original strand, 128095 - 128431
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  128095 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 128194  T
Q  154 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 253  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  ||||||||||||    
T  128195 ttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtgaaa 128294  T
Q  254 attgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaa 353  Q
    ||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  128295 attgtgctcaattggcgaattttgttaggttgttgttaattgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatggatgttgtgattgatgaa 128394  T
Q  354 taattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  128395 taattgattgggtatgcatattcatgaattgatgatg 128431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 162 - 390
Target Start/End: Original strand, 31697 - 31928
Alignment:
Q  162 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgct 261  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||    
T  31697 tgatgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 31796  T
Q  262 caattgatgaattt-tgct-aagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataatt 358  Q
    |||||| ||||||| | || ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||    
T  31797 caattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttaatattatgattgatgaataatt 31896  T
Q  359 gcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  31897 gcttgggtttgcatattcatggattaatgatg 31928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 54 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 9215 - 8878
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  9215 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtacgaattttgcttatggaaaattgttgctaaattcgtgc 9116  T
Q  154 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 253  Q
    ||||  | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  9115 tccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgttaagttgtgaaa 9016  T
Q  254 attgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatga 352  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  9015 attgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatga 8916  T
Q  353 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8915 ataattgcttgggtatgcatattcatgtattgatgatg 8878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 54 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 12450 - 12115
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa-ttttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12450 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttaattttgtaacttt-caaatgctgtatgaaattttgattatggataattgttgctaaattcgtg 12352  T
Q  153 ctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaa 252  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  12351 ctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaa 12252  T
Q  253 aattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatga 352  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12251 aattgtgctaaattggtgaattttgttaagttgttg-taattgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattcatga 12153  T
Q  353 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12152 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 57 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 19543 - 19206
Alignment:
Q  57 ggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||    
T  19543 ggtaagggggttagtcttcatcataatcatcataatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgc 19444  T
Q  154 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19443 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 19344  T
Q  254 attgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatga 352  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| |  |||||||    
T  19343 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 19244  T
Q  353 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19243 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 19206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 128 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 21553 - 21290
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21553 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 21454  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatgg 326  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||| |    
T  21453 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattg 21354  T
Q  327 atgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
     |||||||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21353 ctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 21290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 4)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 54 - 390
Target Start/End: Original strand, 26340 - 26678
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||    
T  26340 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatgatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatgtataattgttgctaaattcgtg 26439  T
Q  153 ctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaa 252  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26440 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 26539  T
Q  253 aattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatg 351  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  26540 aattgttctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatg 26639  T
Q  352 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  26640 aatcattgcttgggtatgcatattgatgaattgaggatg 26678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 128 - 390
Target Start/End: Original strand, 8180 - 8440
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8180 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaa 8279  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatgga 327  Q
     |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||  |||  ||  | ||||||| ||||||| | |     
T  8280 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgttg--aattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgt 8377  T
Q  328 tgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||||||| ||||| |  || |||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  8378 tgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatatacatgaattgatgatg 8440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Original strand, 7025 - 7110
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||  |||||||||    
T  7025 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagtgaaatttaatgttcaaa 7110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 6877 - 6934
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  6877 taggagttaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 6934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 54 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 42066 - 41733
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  42066 taaggtaagggggttggtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 41967  T
Q  154 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  41966 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaatgataatttgtgaaa 41867  T
Q  254 attgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatga 352  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||| |   ||||||    
T  41866 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatggctgttaattgttgttgtagatgatga 41767  T
Q  353 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 386  Q
    || |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  41766 atcattggttgggtatgcatattcatgaattgat 41733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 54 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 172242 - 171916
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  172242 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgc 172143  T
Q  154 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||    
T  172142 tccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 172043  T
Q  254 attgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatga 352  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||    
T  172042 attgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatga 171943  T
Q  353 ataattgcttgggtatgcatattcatg 379  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||    
T  171942 atcattgcttaggtatgcatattcatg 171916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 54 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 177945 - 177619
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  177945 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgc 177846  T
Q  154 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||    
T  177845 tccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 177746  T
Q  254 attgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatga 352  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||    
T  177745 attgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatga 177646  T
Q  353 ataattgcttgggtatgcatattcatg 379  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||    
T  177645 atcattgcttaggtatgcatattcatg 177619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 53 - 390
Target Start/End: Original strand, 36836 - 37176
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| ||||||||    
T  36836 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcg 36935  T
Q  151 tgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtg 250  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36936 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 37035  T
Q  251 aaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattga 349  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||| | ||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| || ||||    
T  37036 aaaattgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaattgatgttgtggttga 37135  T
Q  350 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37136 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 37176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 15324 - 15398
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  15324 cataggagcaaaagtgaagcttgggctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcattcatcataatca 15398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 57)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 54 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 23153786 - 23153458
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||| ||||||||||    
T  23153786 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtttctaaattcgt 23153687  T
Q  152 gctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtga 251  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||    
T  23153686 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 23153587  T
Q  252 aaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgat 350  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  23153586 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaattgatgttgtggttgat 23153487  T
Q  351 gaataattgcttgggtatgcatattcatg 379  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  23153486 gaatcattacttgggtatacatattcatg 23153458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 55 - 386
Target Start/End: Original strand, 14626045 - 14626377
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgct 154  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14626045 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtttgaattgtgattatggataattattgctaaattcgtgct 14626144  T
Q  155 ccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaa 254  Q
    |   || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14626145 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaa 14626244  T
Q  255 ttgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaa 353  Q
    |||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||    
T  14626245 ttgtgtgcaattggtgaattatgctaagttgttgttaacttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaa 14626344  T
Q  354 taattgcttgggtatgcatattcatggattgat 386  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14626345 tcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 14626377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 53 - 386
Target Start/End: Original strand, 1650020 - 1650352
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||  ||||| ||||||    
T  1650020 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatg-taattttgca--ttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgt 1650116  T
Q  152 gctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtga 251  Q
    ||||  ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  1650117 gctcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaatgataagttgtga 1650216  T
Q  252 aaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgat 350  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||| || ||||| |  |||||    
T  1650217 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgat 1650316  T
Q  351 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 386  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1650317 gaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 1650352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 128 - 379
Target Start/End: Original strand, 1657748 - 1657999
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1657748 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 1657847  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatgga 327  Q
     |||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||  ||||||||| |     
T  1657848 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattgtgaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattgt 1657947  T
Q  328 tgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 379  Q
    |||||||| ||||| |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1657948 tgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 1657999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 140 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 25175815 - 25175563
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25175815 tgctaaattcgtgctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25175716  T
Q  240 aataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaatt-gagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaattta 337  Q
     ||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| || |    
T  25175715 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25175616  T
Q  338 tgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175615 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25175563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 128 - 390
Target Start/End: Original strand, 35009439 - 35009702
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35009439 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 35009538  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatgg 326  Q
     |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||  |||  ||  | ||||||| ||||||| | |    
T  35009539 ttatgtaaaaatgtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 35009638  T
Q  327 atgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
     |||||||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35009639 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 35009702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 140 - 390
Target Start/End: Original strand, 27653983 - 27654235
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  27653983 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 27654082  T
Q  240 aataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaattta 337  Q
     ||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| | |||||||||| |||||| || |    
T  27654083 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatgaatgttatttga 27654182  T
Q  338 tgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27654183 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattaatgatg 27654235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 128 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15862734 - 15862484
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15862734 atggataattgttactaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 15862635  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatgga 327  Q
     |||||| ||||   ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||| | | ||||||| |     
T  15862634 ttatgtataaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattgtgaattgagttatgattcttgttc-atttatgttattgc 15862536  T
Q  328 tgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 379  Q
    || ||||| ||||| |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15862535 tgataattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 15862484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 140 - 390
Target Start/End: Original strand, 16825752 - 16826006
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgta--tgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaa 237  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16825752 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaa 16825851  T
Q  238 ataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaatt-gagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatt 335  Q
    || ||||||| |||| |||||||| ||||| || |||| | |||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||  |    
T  16825852 atgataagttatgaagattgtgctaaattggtggatttctcctaatttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatct 16825951  T
Q  336 tatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
     || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16825952 gatattatgattgatgaataattgctttgttatgcatattcatggattgatgatg 16826006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 128 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 29666137 - 29665941
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttca 226  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| | || ||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  29666137 atggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttca 29666038  T
Q  227 aa-tatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgtt 322  Q
    || |||| | ||||   ||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  29666037 aagtatgcataaatgtcaagttatg-aaattgtactcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgtt 29665941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 23148335 - 23148266
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23148335 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 23148266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 19983149 - 19983224
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19983149 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 19983224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 35015014 - 35015089
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35015014 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 35015089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 128 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27751688 - 27751603
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtga 213  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27751688 atggataaatgtagctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggtga 27751603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Original strand, 18629608 - 18629693
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  18629608 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 18629693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 18583715 - 18583640
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18583715 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 18583640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 252 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 27740977 - 27740838
Alignment:
Q  252 aaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgat 350  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||  | | | |||  | ||||| |  | |||    
T  27740977 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtcgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtggttgctattatctgatgttgttgtggat 27740878  T
Q  351 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27740877 gaatcatggtttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 27740838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29605696 - 29605614
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  29605696 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttca 29605614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Original strand, 16887792 - 16887877
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||| || ||||||||||    
T  16887792 aaattcgtgctctaactatgataatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaactgttgttggtgaatttgcatgttcaaa 16887877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 146 - 226
Target Start/End: Original strand, 17083200 - 17083280
Alignment:
Q  146 attcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||  |||||||    
T  17083200 attcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttca 17083280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 228
Target Start/End: Original strand, 17557012 - 17557102
Alignment:
Q  138 gttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  17557012 gttgttaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttg-atgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 17557102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Original strand, 35136013 - 35136097
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||| ||||| || ||||||||||    
T  35136013 aaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgtt-gtgaatttgcatgttcaaa 35136097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21623414 - 21623330
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||| ||||||| ||||||||||    
T  21623414 aattcgtgctccaattatgatggtatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttgctgaaatttcatgttcaaa 21623330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1556344 - 1556173
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||  ||| ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  ||||||||||||||||||    
T  1556344 taaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtg 1556245  T
Q  153 ctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    |||   || ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1556244 ctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 1556173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16232231 - 16232060
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  ||||||||||||||||||    
T  16232231 taaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtg 16232132  T
Q  153 ctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    |||   || ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16232131 ctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 16232060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 21623563 - 21623506
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21623563 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 21623506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Original strand, 22361765 - 22361850
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||| ||||||| ||||||||||    
T  22361765 aaatttgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattgaattgttgttgctgaaatttcatgttcaaa 22361850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33324939 - 33324855
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||  ||||| ||||| || ||||||||||    
T  33324939 aaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaaattgttgataattgaattgttgtt-gtgaatttgcatgttcaaa 33324855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Original strand, 18381684 - 18381768
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||| |||||| || ||||||||||| |||| || |||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  18381684 aatttgtgctctaattatgatgatatttttgaatacatgaagttgttgataattgaatggttgttggtgaaatttcatgttcaaa 18381768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18399184 - 18399100
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||| | |||||| ||||||||||    
T  18399184 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaa 18399100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 228
Target Start/End: Original strand, 15079709 - 15079793
Alignment:
Q  143 taaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||    
T  15079709 taaattcgtgctctaactaggatgatatg-ttgtatgcatgaagttgaggataattgaattgttgtt-gtgaaattgcatgttcaaa 15079793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 252
Target Start/End: Original strand, 33538370 - 33538479
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaataa 241  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||| ||||| ||| ||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| | |    
T  33538370 aaattcgtgctctaactatggtgatatatttgaatgcatgaaattggtga-aattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtga 33538468  T
Q  242 taagttgtgaa 252  Q
    || ||||||||    
T  33538469 tatgttgtgaa 33538479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 224
Target Start/End: Original strand, 18086822 - 18086911
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    |||||||||||||||||||||    | ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18086822 attgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 18086911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 22361619 - 22361676
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22361619 taggagctaaagtgaagcttggcctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 22361676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 14152704 - 14152632
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | || | | ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  14152704 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggcaagggggttattcttcatcataatca 14152632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 277
Target Start/End: Original strand, 16556138 - 16556281
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatg 232  Q
    ||||||| ||||||||||||||  || ||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  16556138 attgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 16556237  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    || ||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  16556238 tataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 16556281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 277
Target Start/End: Original strand, 16632694 - 16632837
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatg 232  Q
    ||||||| ||||||||||||||  || ||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  16632694 attgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 16632793  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    || ||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  16632794 tataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 16632837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 18002395 - 18002427
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18002395 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 18002427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 277
Target Start/End: Original strand, 22225737 - 22225880
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatg 232  Q
    ||||||| |||||||||||||   || ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  22225737 attgttgttaaattcgtgctctttctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 22225836  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    || ||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  22225837 tataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 22225880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 23995279 - 23995247
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995279 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23995247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 26090091 - 26090059
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090091 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26090059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 55 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 4991427 - 4991396
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991427 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 4991396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15740473 - 15740402
Alignment:
Q  147 ttcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaatt 217  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| | | ||||| |||||||||  || ||||||||||||||    
T  15740473 ttcgtgctccaattatgatgctatgtttgtatgtaagaaattggtgataattgattggttgttggtgaaatt 15740402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 84
Target Start/End: Original strand, 15742120 - 15742150
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatc 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15742120 taaggtaagggggttagtctttatcataatc 15742150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22848246 - 22848115
Alignment:
Q  160 tatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaataataagttgtgaaaattg 257  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||  ||  |||||  |||||    
T  22848246 tatgatgatatgtttaaatgcaagaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcatagtatgtgaaaatgttatattgtg--aattg 22848149  T
Q  258 tgctc-aattgatgaattttgctaagttgttgtt 290  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  22848148 tgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgtt 22848115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 23222982 - 23222851
Alignment:
Q  160 tatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaataataagttgtgaaaattg 257  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||||| ||  |||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||  |||||  |||||    
T  23222982 tatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaatgatatattgtg--aattg 23222885  T
Q  258 tgctc-aattgatgaattttgctaagttgttgtt 290  Q
    ||||| ||||| |||||| | ||| |||||||||    
T  23222884 tgctctaattgttgaattgtactatgttgttgtt 23222851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23977983 - 23977937
Alignment:
Q  178 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23977983 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 23977937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25651461 - 25651399
Alignment:
Q  167 atatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  25651461 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 25651399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 1657661 - 1657693
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1657661 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 1657693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10488956 - 10488813
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatg 232  Q
    ||||||| |||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  10488956 attgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 10488857  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    || ||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  10488856 tataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 10488813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 15862821 - 15862789
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15862821 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 15862789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 277
Target Start/End: Original strand, 16376372 - 16376515
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatg 232  Q
    ||||||| |||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  16376372 attgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 16376471  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    || ||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  16376472 tataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 16376515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 277
Target Start/End: Original strand, 16383696 - 16383839
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatg 232  Q
    ||||||| |||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  16383696 attgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 16383795  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    || ||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  16383796 tataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 16383839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 18823283 - 18823315
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18823283 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 18823315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 18839138 - 18839170
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18839138 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 18839170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 27751774 - 27751742
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27751774 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 27751742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 32276659 - 32276691
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32276659 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 32276691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 64 - 390
Target Start/End: Original strand, 4996 - 5324
Alignment:
Q  64 gggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactat 162  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  4996 gggttagtctttatcataatcattatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatggataattgttgctaaattcgtactccaactgt 5095  T
Q  163 gatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctc 262  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5096 gacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 5195  T
Q  263 aattgatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgct 361  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| | |||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  5196 aattggtgaattttgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgct 5295  T
Q  362 tgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5296 tgggtatgcatattcatgaattgaggatg 5324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 54 - 379
Target Start/End: Original strand, 247366 - 247694
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  247366 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 247465  T
Q  152 gctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtga 251  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | | |||| |||||||||||    
T  247466 gctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 247565  T
Q  252 aaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgat 350  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| || |||||    
T  247566 aaattgtgctcaattggtaaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgat 247665  T
Q  351 gaataattgcttgggtatgcatattcatg 379  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  247666 gaatcattgcttgggtatgcatattcatg 247694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 312
Target Start/End: Original strand, 34075 - 34336
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaat-gttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| |  ||||||  || |||||||||| |  | | ||| |  ||||||||||||||||||    
T  34075 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcattgttgtatgaaatgggttgatgaaaaattgttgctaaattcgtg 34174  T
Q  153 ctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt-caaa-tatgtaaaaataataagttgtg 250  Q
    |||   || ||| | ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||    
T  34175 ctcttgctgtgaagctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 34274  T
Q  251 aaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttc 312  Q
    ||  || | || ||||||||||||| | || ||||||||| || |||||| |||||| |||||    
T  34275 aag-ttatacttaattgatgaatttggatatgttgttgttgaaatgagatatgattcatgttc 34336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 54 - 390
Target Start/End: Original strand, 123087 - 123427
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 150  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  123087 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcataatttttgtaaatttgcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 123186  T
Q  151 tgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtg 250  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||    
T  123187 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 123286  T
Q  251 aaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattga 349  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||    
T  123287 aaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttga 123386  T
Q  350 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  123387 tgaataatggcttgggtatgcatattcatgaattgaagatg 123427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 135 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 48443 - 48187
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgta 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48443 attgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 48344  T
Q  235 aaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaa 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  48343 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgttaa 48244  T
Q  334 tttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48243 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgggtatgcatattcatggattgatgatg 48187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 20567 - 20493
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20567 cataggagcaaaaatgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 20493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 54 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 272362 - 272031
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | | ||||||||| ||| |    
T  272362 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatattgtataaattttgattatggataaatattgctaaatacgtac 272263  T
Q  154 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 253  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||    
T  272262 tccaactgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 272163  T
Q  254 attgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatga 352  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||| | |||||||||||||| || |||||| | |||||||| ||||| || |||||||    
T  272162 attgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaattgatgttgtggttgatga 272063  T
Q  353 ataattgcttgggtatgcatattcatggattg 384  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  272062 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattg 272031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 69704 - 69623
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||| ||  |||| ||||||||| ||||||    
T  69704 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttaaatgcatgaaattggttataattgaattgttgtaggtgaaattgcatgtt 69623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 135 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 108003 - 107747
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgta 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  108003 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgca 107904  T
Q  235 aaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaa 333  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  107903 aaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 107804  T
Q  334 tttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  107803 ttgatgttgtgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 107747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 144 - 390
Target Start/End: Original strand, 64527 - 64780
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaatt-----gatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 238  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||| ||||||||||||     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  64527 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattatattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaa 64626  T
Q  239 taataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaattt 336  Q
    | ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||     
T  64627 tgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 64726  T
Q  337 atgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  64727 atattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 64780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 194
Target Start/End: Original strand, 89863 - 89915
Alignment:
Q  143 taaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgata 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  89863 taaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgata 89915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 5)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 102 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 149012 - 148721
Alignment:
Q  102 tttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||   || || ||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  149012 tttcaaatgttgtatgaatttttgcataattgataattgttgttaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgt 148913  T
Q  200 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgaga 298  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  148912 aagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgaga 148813  T
Q  299 tttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  148812 tttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgaagttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgtatattcatgaattgatgatg 148721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 54 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 9192 - 8849
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 147  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| ||||| |||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  9192 taaggtaagtgtgttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgtatttttcataattggataattgttgctaaat 9093  T
Q  148 tcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagtt 247  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||    
T  9092 tcgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 8993  T
Q  248 gtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgat 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||| ||||||||| | | |||||| ||||| |  |    
T  8992 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctattaattgatgttgttgt 8893  T
Q  347 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8892 tgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 8849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 54 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 146938 - 146818
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||    
T  146938 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttcctaaattcatgc 146839  T
Q  154 tccaactatgatgatatgttt 174  Q
    |  || |||||||| ||||||    
T  146838 tttaattatgatgacatgttt 146818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 53576 - 53508
Alignment:
Q  161 atgatgatatgtttgtatgcatga-attgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  53576 atgatgatatgtttgaatgcatgatattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 53508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 85779 - 85697
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  85779 aaattcgtgctctaattatgatgatatgttta-atgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 85697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 56 - 274
Target Start/End: Original strand, 51110 - 51328
Alignment:
Q  56 aggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctc 155  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51110 aggtaaggagattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctc 51209  T
Q  156 caactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaat 255  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  51210 caactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaatgataagttgtgaaaat 51309  T
Q  256 tgtgctcaattgatgaatt 274  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  51310 tgtgctcaattggtgaatt 51328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 54 - 292
Target Start/End: Original strand, 89378 - 89618
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  89378 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttctatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 89477  T
Q  152 gctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtga 251  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||    
T  89478 gctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaattataagttgtga 89577  T
Q  252 aaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaa 292  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  89578 aaattgtgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttaa 89618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 179
Target Start/End: Original strand, 107708 - 107835
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||||||    
T  107708 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataatttttgctaaattcgt 107807  T
Q  152 gctccaactatgatgatatgtttgtatg 179  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  107808 gctccaactgtgatgatatatttgtatg 107835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 79786 - 79704
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 225  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |  ||| |||||||||| |||||||    
T  79786 aaattcgtgcactaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgagttgttggtggtgaaattgcatgttc 79704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 55 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 130911 - 130880
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130911 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 130880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 162 - 386
Target Start/End: Original strand, 9371 - 9596
Alignment:
Q  162 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgct 261  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  9371 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgct 9470  T
Q  262 caattgatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgc 360  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||| |||||    
T  9471 caattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgc 9570  T
Q  361 ttgggtatgcatattcatggattgat 386  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  9571 ttgggtatgcatattcatgaattgat 9596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 162 - 386
Target Start/End: Original strand, 16269 - 16494
Alignment:
Q  162 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgct 261  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16269 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgct 16368  T
Q  262 caattgatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgc 360  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||| |||||    
T  16369 caattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgc 16468  T
Q  361 ttgggtatgcatattcatggattgat 386  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16469 ttgggtatgcatattcatgaattgat 16494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 178 - 390
Target Start/End: Original strand, 5254 - 5466
Alignment:
Q  178 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5254 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattttg 5353  T
Q  278 ctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 376  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  5354 ctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttgtgattaatgaataattgcttgggt-tgcatattc 5452  T
Q  377 atggattgatgatg 390  Q
    ||||||||||||||    
T  5453 atggattgatgatg 5466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Original strand, 102923 - 103007
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||    
T  102923 aattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagtttttgataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaa 103007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 109836 - 109756
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||  |||||  ||||||| ||||||    
T  109836 aattcgtgatccaagtatgatgatatgtttgaatccatgaagttgttgataattgaattgttgttaatgaaatttcatgtt 109756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 128 - 390
Target Start/End: Original strand, 534 - 797
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  534 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 633  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtta-attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatgg 326  Q
    ||| | | |||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| || | ||||||||||| || |||||||||||    
T  634 ataggaacaaatgatgagttgtgaaaattgtactcaattggtgaattttgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatgg 733  T
Q  327 atgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
     || ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  734 ctgctaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcaggaattgaggatg 797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 178 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 3936 - 3722
Alignment:
Q  178 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa-taataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaatttt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||  |||||| ||||||||    
T  3936 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaatttt 3837  T
Q  277 gctaagttgttgttaatt-gagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatatt 375  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  3836 gctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattacttgggtttgcatatt 3737  T
Q  376 catggattgatgatg 390  Q
    |||||||||||||||    
T  3736 catggattgatgatg 3722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 163 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 43226 - 42997
Alignment:
Q  163 gatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctc 262  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||     
T  43226 gatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgcta 43127  T
Q  263 aattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgc 360  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  43126 aattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgc 43027  T
Q  361 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43026 ttgggtttgcatattcatggattgatgatg 42997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 39360 - 39217
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatg 232  Q
    ||||||| |||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  39360 attgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 39261  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    || ||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  39260 tataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 39217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 139 - 390
Target Start/End: Original strand, 21115 - 21367
Alignment:
Q  139 ttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 238  Q
    |||||||||||||||||    | ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21115 ttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 21214  T
Q  239 taataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaattta 337  Q
    | ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| || |    
T  21215 tgataagttatgaagattgagctcaattggtgaattttcctaagttgttgttaatttgagattggattcttgttcaattgatgttatgaatgttatttga 21314  T
Q  338 tgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  21315 tgttatgattgatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattaatgatg 21367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 162 - 390
Target Start/End: Original strand, 14083 - 14312
Alignment:
Q  162 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgct 261  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  14083 tgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtgct 14182  T
Q  262 caattgatgaattttgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgc 360  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  14183 caattggtgaattttcctaagttgttgataatttgagattggattcttgttcaattaatgttatgaatgttgtttgatgttatgattgatgaataattgc 14282  T
Q  361 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14283 ttgagtttgcatattcatggattgatgatg 14312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 128 - 390
Target Start/End: Original strand, 34460 - 34724
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34460 atggataattattgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 34559  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttg-ttcaagtgatgttatg 325  Q
     | ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || || || |||||||||     
T  34560 ttgtgtaaaaatatgaagttgtgaaaattgttctcaataggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttatt 34659  T
Q  326 gatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    | ||||| || ||||| |  ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34660 gttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactacttgggtatgcatattcatggattgatgatg 34724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 135 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 5785 - 5552
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgta 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5785 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgta 5686  T
Q  235 aaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgtta 332  Q
    ||||| ||||||  |||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  5685 aaaatgataagtcatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 5586  T
Q  333 atttatgttatgattgatgaataattgcttgggt 366  Q
     || ||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5585 tttgataatatgattaatgaataattgcttgggt 5552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 5878 - 5846
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5878 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 5846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 128 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 13769 - 13506
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13769 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 13670  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatgg 326  Q
     |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||  ||  | ||||||| ||||||| | |    
T  13669 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 13570  T
Q  327 atgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
     |||||||| ||||| |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13569 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatgaattgacgatg 13506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 42749 - 42677
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42749 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagata---aaggtaagggggttagtttttatcataatcat 42677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 13856 - 13824
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13856 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 13824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 144 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 283 - 35
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataata 243  Q
    ||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  283 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 184  T
Q  244 agttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgtt 341  Q
    |||| || | |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| || || ||    
T  183 agttatgtatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 84  T
Q  342 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  83 atgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatgaattgttgatg 35  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 30492 - 30417
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||| || || |||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  30492 catagaagcaaaagtgaagcttgagttaataattggtgataattaaggtaagggggttatttttcatcataatcat 30417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 128 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 41911 - 41648
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41911 atggataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 41812  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatgg 326  Q
     |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||  |||  ||  | ||||||| ||||||| | |    
T  41811 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 41712  T
Q  327 atgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
     |||||| | ||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41711 ttgttaaatgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 41648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 41997 - 41957
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattt 94  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  41997 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcattt 41957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 139 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 3215 - 2966
Alignment:
Q  139 ttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 238  Q
    |||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3215 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaa 3116  T
Q  239 taataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttg-ttcaagtgatgttatggatgttaattt 336  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || || || ||||||||| | ||||| ||     
T  3115 tgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttg 3016  T
Q  337 atgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 386  Q
    ||||| |  ||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3015 atgttgttgttgatgaatcactgcttgtgtatgcatattcatgaattgat 2966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 128 - 390
Target Start/End: Original strand, 37066 - 37328
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  37066 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37165  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatgg 326  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||  | ||||| |||  |||||| | |||||||||| ||| ||||||| | |    
T  37166 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 37264  T
Q  327 atgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    ||| ||||  ||||| |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37265 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 37328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 41707 - 41632
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41707 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcat 41632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 36980 - 37012
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36980 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 140 - 294
Target Start/End: Original strand, 13325 - 13479
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||| ||||||||||  | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13325 tgctagattcgtgctcttagtgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 13424  T
Q  240 aataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgttaatt 294  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  13425 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatt 13479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 4)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 27058 - 26911
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  27058 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 26959  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 275  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  26958 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 26911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 135 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22796 - 22656
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgta 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||     
T  22796 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtg 22697  T
Q  235 aaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 275  Q
    ||||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  22696 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 22656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22889 - 22857
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22889 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 27144 - 27112
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27144 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 27112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 1582 - 1729
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  1582 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 1681  T
Q  228 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 275  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  1682 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 1729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 1496 - 1528
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1496 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 1528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 140 - 275
Target Start/End: Original strand, 1304 - 1439
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1304 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 1403  T
Q  240 aataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 275  Q
     ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  1404 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaattt 1439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 285 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 48620 - 48514
Alignment:
Q  285 gttgttaatt-gagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggatt 383  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48620 gttgttaatttgagatttgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 48521  T
Q  384 gatgatg 390  Q
    |||||||    
T  48520 gatgatg 48514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 285 - 390
Target Start/End: Original strand, 9 - 115
Alignment:
Q  285 gttgttaatt-gagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggatt 383  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9 gttgttaatttgatatttgattcttgttcaaatgatattatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 108  T
Q  384 gatgatg 390  Q
    |||||||    
T  109 gatgatg 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 128 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 3453 - 3290
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacat-gttca 226  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  3453 atggataattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacatatttca 3354  T
Q  227 aa-tatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt 290  Q
    || |||||| |||||  ||||| || ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  3353 aagtatgtataaatatcaagttatg-aaattgtactcaaatggtgaattttgctaagttgttgtt 3290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 3266 - 3210
Alignment:
Q  332 aatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 388  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3266 aattgatgttgtgattgatgaatcattgtttgggtaggcatattcatgaattgatga 3210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 80262 - 80187
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80262 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 80187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 292 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 9480 - 9382
Alignment:
Q  292 attgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 390  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9480 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 9382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 135 - 290
Target Start/End: Original strand, 56106 - 56262
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg--ttcaaatatg 232  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  || || ||||    
T  56106 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtatg 56205  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt 290  Q
    || ||||   ||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  56206 tataaatgtcaagttatg-aaattgtgctcaaatggtgaattttgctaagttgttgtt 56262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Original strand, 166121 - 166197
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatc 87  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  166121 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatc 166197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 162036 - 162111
Alignment:
Q  12 ataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatc 87  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  162036 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatc 162111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 116410 - 116483
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  116410 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagatttcatcataatcat 116483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 31137 - 31212
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31137 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcat 31212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 86
Target Start/End: Original strand, 5735 - 5809
Alignment:
Q  12 ataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  5735 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 5809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 86
Target Start/End: Original strand, 5941 - 6015
Alignment:
Q  12 ataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  5941 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 6015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 178 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 45244 - 45098
Alignment:
Q  178 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||   ||||| || ||||||| |||||||| |||||||    
T  45244 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttttg-aaattgtactcaattggtgaattt 45146  T
Q  276 tgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgtt 322  Q
    || || ||||||||| || |||||| |||||| ||||| | |||||||    
T  45145 tgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgtt 45098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 178 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 54630 - 54484
Alignment:
Q  178 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||| ||||   ||||| || ||||||| |||||||| |||||||    
T  54630 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatg-aaattgtactcaattggtgaattt 54532  T
Q  276 tgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgtt 322  Q
    || || ||||||||| || |||||| |||||| ||||| | |||||||    
T  54531 tgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgtt 54484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 45370 - 45338
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45370 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 45338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8257 - 8172
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||| || ||||||||||    
T  8257 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaa 8172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Original strand, 309 - 385
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatc 87  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  309 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaacggggttattctttatcataatcatc 385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 335
Target Start/End: Original strand, 22422 - 22615
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc-aaatatgtaaaaataa 241  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||      
T  22422 aaattcgtgctctaaatatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataatttaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaaatatgtataaatgc 22521  T
Q  242 taagttgtgaaaattgtgctc-aattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatt 335  Q
    ||| || ||  |||| ||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||| || |||| || ||||||| | | ||||||||    
T  22522 taacttatg--aattatgctcaaattattgaattgtgctatgttgttgttgaattgagatgtgaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaatt 22615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 224
Target Start/End: Original strand, 10256 - 10427
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||| ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| || ||||||||||||||||||    
T  10256 taaggtaagggggtttgtcttcttcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtg 10355  T
Q  153 ctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    |||   || ||||||||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  10356 ctcttgctgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 10427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 1775 - 1701
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1775 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 1701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 290
Target Start/End: Original strand, 22429 - 22576
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaataa 241  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||| || |||||||||| | |||| || |      
T  22429 aaattcgtgctctaactaggataatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtgtgtataagtgt 22528  T
Q  242 taagttgtgaaaattgtgctcaatt-gatgaattttgctaagttgttgtt 290  Q
    ||| |||||  |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  22529 taacttgtg--aattatgctcaattgggtgaattatgctaagttgttgtt 22576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 19807 - 19881
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19807 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 19881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 24111 - 24185
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24111 cataggagcaaaaatgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 24185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2772 - 2687
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  2772 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttggatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 2687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Original strand, 1348 - 1433
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcat-gaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||| |||||    
T  1348 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcataaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatggtcaaa 1433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Original strand, 9603 - 9688
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcat-gaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||| |||||    
T  9603 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcataaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatggtcaaa 9688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Original strand, 70307 - 70391
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||| ||||| || ||||||||||    
T  70307 aaattcgtactccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattcaattattgtt-gtgaatttgcatgttcaaa 70391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 57392 - 57424
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57392 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Original strand, 2317 - 2401
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  2317 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 2401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 164 - 94
Alignment:
Q  15 ggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    ||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  164 ggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 94  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 6261 - 6335
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || |||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  6261 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagtgggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 6335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 85
Target Start/End: Original strand, 4 - 41
Alignment:
Q  48 gataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 41  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Original strand, 76847 - 76932
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  76847 aaattcatgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 76932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 76699 - 76756
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||  |||||||||||||||||||||||    
T  76699 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattgctgataattaaggtaagggggttag 76756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 4)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Original strand, 93773 - 93858
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||| | |||||| ||||||||||    
T  93773 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtatgtatgcatgaagtttttgataattgaatggttgttagagaaatttcatgttcaaa 93858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Original strand, 104623 - 104708
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgca-tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||  ||||||||||| || || |||||||    
T  104623 aaattcatgctctaactatgatgatatgtttgtatgcattaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcaggttcaaa 104708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 55936 - 55904
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55936 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 55904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 108075 - 108107
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108075 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 108107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6907 - 6823
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  6907 aattcgtgctataattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 6823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 7056 - 6999
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  7056 taggagctaaagtgaaggttgggctaggaattggtgataattatggtaagggggttag 6999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 214
Target Start/End: Original strand, 1546 - 1617
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaa 214  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||  |||||||||||    
T  1546 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaa 1617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 214
Target Start/End: Original strand, 8691 - 8762
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaa 214  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||  |||||||||||    
T  8691 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaa 8762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28781 - 28698
Alignment:
Q  146 attcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| || ||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  28781 attcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaacttgttgataactgaattgttgttggtgaaattatatgttcaaa 28698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10908 - 10854
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattg 198  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10908 aattcgtgctctatctatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattg 10854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31266 - 31184
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  31266 aattcgtgctctaattatgatgatatatttgaatgcatgaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatgttca 31184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 31414 - 31357
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | || | | |||||||||||||||||||||    
T  31414 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttag 31357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 1363 - 1436
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||    
T  1363 taggaactaaagtgaagcttgagctaggaattggtgataattgaggtaagggggttagaattcatcataatcat 1436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 54131 - 54038
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||| ||||| | | ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  54131 attgatgctaaattcgtgctcttactgtgatgctgttttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttcaaa 54038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 35873 - 35816
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35873 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 35816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35724 - 35640
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||    
T  35724 aattcgtgctccaatcatgatgatatgtttgaatgcatgaagttattgataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaa 35640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3625 - 3577
Alignment:
Q  180 catgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3625 catgaattgatgattatggtatgattgtgggtgaaattacatgttcaaa 3577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 224
Target Start/End: Original strand, 1492 - 1663
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||| ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||||||||||| |||||    
T  1492 taaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaaatcgtg 1591  T
Q  153 ctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    | |   || ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1592 cacttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 1663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Original strand, 962 - 1045
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  962 aaattcgtgttctaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 1045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30211 - 30128
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||| ||  |||| ||||||||| ||||||||    
T  30211 aaattcgtgctcttactatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgtaggtgaaattgcatgttca 30128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 228
Target Start/End: Original strand, 97200 - 97283
Alignment:
Q  146 attcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcat-gaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||| ||||||||||    
T  97200 attcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcataaaattggtgataattgaattgttgttggtggaattgcatgttcaaa 97283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0670 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
Description:

Target: scaffold0670; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 290
Target Start/End: Original strand, 7691 - 7822
Alignment:
Q  160 tatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaataataagttgtgaaaattg 257  Q
    ||||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||| |||  |||||  |||||    
T  7691 tatgatgatatgtttgactacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattg 7788  T
Q  258 tgctc-aattgatgaattttgctaagttgttgtt 290  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  7789 tgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgtt 7822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 3482 - 3351
Alignment:
Q  160 tatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaataataagttgtgaaaattg 257  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||| |||  |||||  |||||    
T  3482 tatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtg--aattg 3385  T
Q  258 tgctc-aattgatgaattttgctaagttgttgtt 290  Q
     |||| ||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  3384 ggctctaattgttgaattgtgctatgttgttgtt 3351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 228
Target Start/End: Original strand, 43805 - 43883
Alignment:
Q  151 tgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    ||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  43805 tgctctaattatgatgctatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 43883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 290
Target Start/End: Original strand, 23672 - 23819
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaataa 241  Q
    |||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||||| | ||||| ||||| |    
T  23672 aaattcgtgctttaattatggtgatatgtttgtatacatgaaatttttgataattgaattgttgttggagaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatga 23771  T
Q  242 taagttgtgaaaattgtgctc-aattgatgaattttgctaagttgttgtt 290  Q
    ||  |||||  |||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||    
T  23772 tatattgtg--aattgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgtt 23819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 43651 - 43708
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | || | | |||||||||||||||||||||    
T  43651 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttag 43708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 499 - 442
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||| | |||||||||||||||    
T  499 taggagctaaagtgaagcttgagctaggaattggtgataactgaggtaagggggttag 442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 525 - 456
Alignment:
Q  160 tatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  525 tatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattatattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 689 - 632
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | || | |||||||| ||||||||||||||    
T  689 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattagtgataattatggtaagggggttag 632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 86
Target Start/End: Original strand, 193396 - 193429
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193396 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 193429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27728 - 27661
Alignment:
Q  160 tatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  27728 tatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 27661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 6443 - 6475
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6443 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 6475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 878 - 910
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  878 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 9882 - 9914
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 9914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 13285 - 13317
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13285 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 13317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21758 - 21674
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||| ||| ||||| | |||||||||| ||  ||||| ||  |||||||||||||||    
T  21758 aaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatgataattggattgttgttagttgaattacatgttcaaa 21674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 54 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 18058 - 18015
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  18058 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcataattattttgt 18015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4836 - 4769
Alignment:
Q  160 tatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 226  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  4836 tatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 4769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Original strand, 38 - 84
Alignment:
Q  178 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 224  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  38 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 84  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 228
Target Start/End: Original strand, 197256 - 197338
Alignment:
Q  147 ttcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| || |||||||    
T  197256 ttcgggctctaattatgatgatatgtttgaatgtatgaaattgttgataattgaattgttgttggtgaaattgcaagttcaaa 197338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11341 - 11256
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 228  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||| || |  ||||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||    
T  11341 aaattcatgttccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaactagtgataattgaattgttgtttgtgaaatttcatgttcaaa 11256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 8051 - 8011
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 185  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  8051 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 8011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 17209 - 17241
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17209 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 17241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 5476 - 5508
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5476 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 5508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 4346 - 4378
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4346 taaggtaagggggttagactttatcataatcat 4378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 17304 - 17336
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17304 taaggtaagcgggttagtctttatcataatcat 17336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 5581 - 5549
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5581 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 5549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 34308 - 34340
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34308 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 34340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31566 - 31423
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatg 232  Q
    ||||||| |||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| ||||    
T  31566 attgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 31467  T
Q  233 taaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 277  Q
    || ||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  31466 tataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 31423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 3565 - 3525
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 185  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  3565 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 3525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 12418 - 12450
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12418 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 12450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 563 times since January 2019
Visitors: 4090