View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0665_high_4 (Length: 272)

Name: NF0665_high_4
Description: NF0665
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0665_high_4
NF0665_high_4
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (32-230)||(15285802-15286000)
chr4 (32-230)||(15227069-15227267)
chr4 (32-230)||(1899456-1899654)
chr4 (32-223)||(14236409-14236600)
chr4 (32-230)||(14664214-14664412)
chr4 (32-230)||(17013196-17013394)
chr4 (34-218)||(15392223-15392407)
chr4 (44-230)||(24593188-24593374)
chr4 (52-236)||(24111881-24112065)
chr4 (52-236)||(34189828-34190012)
chr4 (52-237)||(6569069-6569254)
chr4 (52-237)||(19372477-19372662)
chr4 (52-237)||(54832606-54832791)
chr4 (49-237)||(5005083-5005271)
chr4 (52-236)||(14764175-14764359)
chr4 (52-233)||(36345386-36345567)
chr4 (52-237)||(39849839-39850024)
chr4 (70-224)||(30752976-30753130)
chr4 (52-209)||(21968917-21969074)
chr4 (52-209)||(27164215-27164372)
chr4 (70-191)||(33678260-33678381)
chr4 (52-209)||(40106536-40106693)
chr4 (52-209)||(14097757-14097914)
chr4 (52-209)||(31127416-31127573)
[»] chr2 (36 HSPs)
chr2 (32-230)||(19457284-19457482)
chr2 (32-230)||(21704027-21704225)
chr2 (32-230)||(27435309-27435507)
chr2 (32-230)||(12654719-12654917)
chr2 (32-225)||(20837095-20837288)
chr2 (32-230)||(28881391-28881589)
chr2 (34-222)||(27392173-27392361)
chr2 (32-230)||(23129432-23129630)
chr2 (52-237)||(12585998-12586183)
chr2 (52-237)||(27776404-27776589)
chr2 (52-237)||(27816171-27816356)
chr2 (52-237)||(39889259-39889444)
chr2 (52-236)||(34278646-34278830)
chr2 (52-237)||(40232696-40232881)
chr2 (52-236)||(37374358-37374542)
chr2 (52-237)||(261624-261808)
chr2 (52-237)||(9350853-9351038)
chr2 (52-237)||(13937403-13937588)
chr2 (52-237)||(39052687-39052872)
chr2 (52-224)||(11636061-11636233)
chr2 (52-224)||(11642250-11642422)
chr2 (70-224)||(12717477-12717631)
chr2 (52-209)||(21678069-21678226)
chr2 (52-237)||(27802889-27803074)
chr2 (52-209)||(32048995-32049152)
chr2 (52-209)||(16830225-16830382)
chr2 (52-209)||(16891099-16891256)
chr2 (52-209)||(19417386-19417543)
chr2 (52-209)||(22926915-22927072)
chr2 (52-209)||(34860877-34861034)
chr2 (52-209)||(37686796-37686953)
chr2 (52-209)||(37702061-37702218)
chr2 (52-209)||(37924690-37924847)
chr2 (128-236)||(34285627-34285735)
chr2 (128-236)||(34290687-34290795)
chr2 (52-209)||(31875478-31875635)
[»] chr3 (53 HSPs)
chr3 (32-230)||(15334885-15335083)
chr3 (32-222)||(16627428-16627618)
chr3 (33-228)||(18529540-18529735)
chr3 (32-230)||(15893624-15893822)
chr3 (32-230)||(8302179-8302377)
chr3 (32-230)||(8295117-8295315)
chr3 (44-230)||(15741997-15742183)
chr3 (32-230)||(18050404-18050602)
chr3 (32-230)||(4797571-4797769)
chr3 (32-230)||(14447835-14448033)
chr3 (32-230)||(35879908-35880106)
chr3 (32-237)||(18329816-18330021)
chr3 (44-237)||(6191470-6191663)
chr3 (44-230)||(29149673-29149859)
chr3 (44-237)||(4720785-4720978)
chr3 (46-237)||(4347595-4347786)
chr3 (46-236)||(4892369-4892559)
chr3 (52-237)||(47022615-47022800)
chr3 (52-236)||(7072374-7072558)
chr3 (52-237)||(6543385-6543570)
chr3 (52-237)||(48465077-48465262)
chr3 (46-236)||(22388487-22388677)
chr3 (52-237)||(5466147-5466332)
chr3 (52-237)||(8210903-8211088)
chr3 (52-237)||(11111272-11111457)
chr3 (52-237)||(18241889-18242074)
chr3 (52-237)||(20577773-20577958)
chr3 (52-237)||(28020440-28020625)
chr3 (52-236)||(18277964-18278148)
chr3 (52-236)||(18293265-18293449)
chr3 (52-237)||(10395298-10395483)
chr3 (52-237)||(22871785-22871970)
chr3 (52-237)||(22886844-22887029)
chr3 (52-237)||(29665896-29666081)
chr3 (52-236)||(18308566-18308750)
chr3 (49-237)||(28116868-28117056)
chr3 (52-237)||(21673855-21674040)
chr3 (52-236)||(32438319-32438503)
chr3 (70-224)||(51781191-51781345)
chr3 (70-224)||(51796278-51796432)
chr3 (32-209)||(4416058-4416235)
chr3 (52-237)||(5597277-5597462)
chr3 (52-209)||(17985895-17986052)
chr3 (52-209)||(24327321-24327478)
chr3 (70-224)||(36998013-36998167)
chr3 (52-209)||(5610261-5610418)
chr3 (52-209)||(18224353-18224510)
chr3 (52-209)||(28338465-28338622)
chr3 (52-209)||(31965412-31965569)
chr3 (52-209)||(50135010-50135167)
chr3 (52-209)||(5012874-5013031)
chr3 (52-209)||(7995724-7995881)
chr3 (52-209)||(10642232-10642389)
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (32-222)||(20460288-20460478)
chr1 (32-230)||(16208901-16209099)
chr1 (52-209)||(28584181-28584338)
chr1 (52-209)||(10961870-10962027)
chr1 (52-209)||(41794206-41794363)
chr1 (52-209)||(51637418-51637575)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (32-230)||(19592-19790)
scaffold0124 (32-230)||(29634-29832)
[»] chr7 (29 HSPs)
chr7 (32-222)||(16450766-16450956)
chr7 (32-230)||(16040508-16040706)
chr7 (32-230)||(16519178-16519376)
chr7 (32-230)||(16504142-16504340)
chr7 (32-230)||(2153755-2153953)
chr7 (32-230)||(10917628-10917826)
chr7 (44-237)||(5127186-5127379)
chr7 (44-230)||(11425539-11425725)
chr7 (46-236)||(5120656-5120846)
chr7 (52-237)||(26538629-26538814)
chr7 (52-237)||(22142862-22143047)
chr7 (52-237)||(26434459-26434644)
chr7 (52-237)||(26486500-26486685)
chr7 (52-221)||(16737232-16737401)
chr7 (52-221)||(16752286-16752455)
chr7 (52-221)||(17522734-17522903)
chr7 (52-221)||(17530312-17530481)
chr7 (70-224)||(3444514-3444668)
chr7 (52-237)||(5148096-5148281)
chr7 (52-237)||(31124113-31124298)
chr7 (52-237)||(31565155-31565340)
chr7 (70-224)||(11440780-11440934)
chr7 (70-224)||(26670683-26670837)
chr7 (52-209)||(9617853-9618010)
chr7 (52-209)||(24593325-24593482)
chr7 (52-209)||(26275878-26276035)
chr7 (52-209)||(26320653-26320810)
chr7 (52-209)||(4145907-4146064)
chr7 (52-209)||(45386545-45386702)
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (32-230)||(25198222-25198420)
chr5 (32-230)||(23891396-23891594)
chr5 (34-230)||(24951302-24951498)
chr5 (32-224)||(24688937-24689129)
chr5 (32-230)||(30933826-30934024)
chr5 (32-230)||(23718759-23718958)
chr5 (32-237)||(11548544-11548749)
chr5 (32-237)||(33776677-33776882)
chr5 (44-230)||(22999888-23000074)
chr5 (52-224)||(9549323-9549495)
chr5 (52-236)||(15659528-15659712)
chr5 (52-237)||(13325611-13325796)
chr5 (52-233)||(31430638-31430819)
chr5 (52-237)||(32600236-32600421)
chr5 (52-237)||(34615731-34615916)
chr5 (52-236)||(28648436-28648620)
chr5 (52-236)||(33291738-33291922)
chr5 (52-236)||(41673919-41674103)
chr5 (52-237)||(3788736-3788921)
chr5 (52-237)||(18501515-18501700)
chr5 (52-237)||(37771766-37771951)
chr5 (52-237)||(40474319-40474504)
chr5 (52-237)||(43077459-43077644)
chr5 (49-237)||(37754175-37754363)
chr5 (52-237)||(37672259-37672444)
chr5 (52-236)||(28960566-28960750)
chr5 (52-209)||(2510261-2510418)
chr5 (52-237)||(37359422-37359607)
chr5 (70-224)||(24680665-24680819)
chr5 (70-224)||(24723192-24723346)
chr5 (52-209)||(8666270-8666427)
chr5 (52-209)||(9316661-9316818)
chr5 (52-209)||(12131365-12131522)
chr5 (52-209)||(15759652-15759809)
chr5 (52-209)||(26479602-26479759)
chr5 (52-209)||(29967861-29968018)
chr5 (52-209)||(30028625-30028782)
chr5 (52-209)||(30151228-30151385)
chr5 (52-209)||(30167679-30167836)
chr5 (52-209)||(33515566-33515723)
chr5 (52-170)||(6873512-6873630)
chr5 (70-224)||(31827199-31827353)
chr5 (52-209)||(5637120-5637277)
chr5 (52-209)||(18376207-18376364)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (32-225)||(16282633-16282826)
chr8 (32-230)||(16276735-16276933)
chr8 (32-225)||(19687279-19687472)
chr8 (32-230)||(27609741-27609939)
chr8 (32-230)||(2138095-2138293)
chr8 (32-230)||(14556808-14557006)
chr8 (34-218)||(22081720-22081904)
chr8 (52-237)||(3330348-3330533)
chr8 (52-237)||(19279316-19279501)
chr8 (52-237)||(19285666-19285851)
chr8 (52-237)||(19518972-19519157)
chr8 (52-237)||(29828514-29828699)
chr8 (70-224)||(18709805-18709959)
chr8 (52-237)||(12093562-12093747)
chr8 (52-237)||(19673639-19673824)
chr8 (52-209)||(31353725-31353882)
chr8 (52-209)||(19209217-19209374)
chr8 (52-209)||(28362812-28362969)
chr8 (52-209)||(33257924-33258081)
chr8 (52-209)||(31490607-31490764)
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (36-230)||(20159889-20160083)
chr6 (36-230)||(22172748-22172942)
chr6 (32-230)||(24862895-24863093)
chr6 (32-230)||(13299771-13299969)
chr6 (32-230)||(22935698-22935896)
chr6 (32-230)||(23858143-23858341)
chr6 (44-230)||(24305438-24305624)
chr6 (32-230)||(15425137-15425335)
chr6 (32-237)||(16749032-16749237)
chr6 (32-230)||(26999250-26999449)
chr6 (37-230)||(27273404-27273597)
chr6 (52-237)||(26917578-26917763)
chr6 (32-230)||(26988182-26988377)
chr6 (52-236)||(26778441-26778625)
chr6 (52-237)||(4524487-4524672)
chr6 (52-237)||(4756959-4757144)
chr6 (52-237)||(4772195-4772380)
chr6 (52-237)||(16673325-16673510)
chr6 (52-237)||(27006910-27007095)
chr6 (52-237)||(27360823-27361008)
chr6 (52-237)||(27451166-27451351)
chr6 (52-236)||(29548676-29548860)
chr6 (40-230)||(27630529-27630719)
chr6 (52-236)||(27043588-27043772)
chr6 (46-237)||(17024454-17024645)
chr6 (52-237)||(27484315-27484500)
chr6 (52-237)||(34464174-34464359)
chr6 (52-237)||(3695300-3695485)
chr6 (52-237)||(28206640-28206825)
chr6 (52-237)||(29500604-29500789)
chr6 (52-237)||(4546597-4546782)
chr6 (52-237)||(4724956-4725141)
chr6 (52-237)||(26117232-26117417)
chr6 (52-221)||(29572211-29572380)
chr6 (52-209)||(16944868-16945025)
chr6 (52-209)||(30558857-30559014)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (32-230)||(28944-29142)
scaffold0089 (32-230)||(40946-41144)
scaffold0089 (44-230)||(47862-48048)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (34-222)||(20750-20938)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (34-218)||(121070-121254)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (70-230)||(49049-49212)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (44-230)||(1007-1193)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (32-230)||(26473-26671)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (37-236)||(40847-41046)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (52-237)||(7433-7618)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (32-84)||(1-53)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (52-237)||(7138-7323)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (52-209)||(15828-15985)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (52-183)||(8163-8294)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15286000 - 15285802
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15286000 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 15285901  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15285900 gggtaattactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagcttaatggaagatgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 15285802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Original strand, 15227069 - 15227267
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15227069 caaaggtggacgtccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 15227168  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  15227169 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcattgcttccaagatagcttaatggaagacgctgcagaatggtatactagcttgagcaaagatga 15227267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Original strand, 1899456 - 1899654
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1899456 caaaggtggacgtccctaagaagttcaagatcccagagtttgaccgatacaatgggctaacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 1899555  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  1899556 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagcttaatggaagacgctgcagaatggtatactagcttgagcaaagatga 1899654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14236600 - 14236409
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14236600 caaaggtggacgtccctaaaaagttcaaagtcccggatttcgaccgatacaacgggctgacttgtcctcaaaaccacattatcaagtatgtccggaagat 14236501  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagca 223  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14236500 ggctaactactcagacaatgattcactcatgattcactgcttccaggatagcttaatggaagacgctgcagaatggtataccagcttgagca 14236409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Original strand, 14664214 - 14664412
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  14664214 caaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccgatacaacgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagat 14664313  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    ||| || |||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  14664314 gggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaagatagcttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 14664412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Original strand, 17013196 - 17013394
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  17013196 caaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccgatacaacgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagat 17013295  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    ||| || |||  |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  17013296 gggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaagatagtttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 17013394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15392407 - 15392223
Alignment:
Q  34 aaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgg 133  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  15392407 aaggtggatgtccctaagaagttcaaggttctggatttcgaccgatacaatgggctaacttgtccacagaatcacatcatcaaatatgtccggaagatgg 15392308  T
Q  134 gtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagctt 218  Q
     ||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  15392307 ctaattacgcagacaatgattcactcatgatccactgctttcaggatagtctaatggaagatgctgcataatggtataccagctt 15392223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24593374 - 24593188
Alignment:
Q  44 tccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactc 143  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||      
T  24593374 tccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccggtacaacgggctaacttgtccccaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaa 24593275  T
Q  144 agacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  24593274 agacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 24593188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 236
Target Start/End: Original strand, 24111881 - 24112065
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  24111881 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 24111980  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtcca 236  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  24111981 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtcca 24112065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 34190012 - 34189828
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  34190012 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 34189913  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtcca 236  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  34189912 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtcca 34189828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 6569069 - 6569254
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  6569069 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 6569168  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  6569169 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 6569254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 19372477 - 19372662
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  19372477 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 19372576  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  19372577 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 19372662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 54832606 - 54832791
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  54832606 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 54832705  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| || ||| ||||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  54832706 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgccgcaaaatggtatactagtctgagcaaagatgatgtccat 54832791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Original strand, 5005083 - 5005271
Alignment:
Q  49 aagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagaca 148  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   ||||    
T  5005083 aagaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggaca 5005182  T
Q  149 atgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    ||||||| || ||||| || |  |||||||| ||| | ||||| || |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  5005183 atgattcccttatgatccattatttccaagacagtctgatggaggatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 5005271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14764359 - 14764175
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  14764359 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 14764260  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtcca 236  Q
    |||| || ||||| || |  |||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||| ||||||||    
T  14764259 attcccttatgatccattatttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtcca 14764175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 36345567 - 36345386
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || ||||||||||||||  | || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  36345567 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtccttaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 36345468  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgt 233  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |||||    
T  36345467 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgt 36345386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 39849839 - 39850024
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  39849839 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 39849938  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||| ||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  39849939 attcccttatgatccattactttcaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 39850024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 224
Target Start/End: Original strand, 30752976 - 30753130
Alignment:
Q  70 ttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcact 169  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||  |||||||||||| || ||||| ||||    
T  30752976 ttcgaccggtacaacgggctaacttgccctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccact 30753075  T
Q  170 gcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaa 224  Q
    | || || |||||||| ||||| || || || || ||||| || || ||||||||    
T  30753076 gttttcaggatagtttgatggaggatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 30753130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 21968917 - 21969074
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  21968917 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 21969016  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || ||||||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  21969017 attcccttatgatccactgttttcaagatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 21969074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27164372 - 27164215
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||||||||| || |||  ||||||||    
T  27164372 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgccctcaaaatcacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatg 27164273  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  27164272 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggacgccgcagagtggta 27164215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 70 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33678381 - 33678260
Alignment:
Q  70 ttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcact 169  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||  |||||||||||| || ||||| ||||    
T  33678381 ttcgaccggtacaacgggctaacttgccctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccact 33678282  T
Q  170 gcttccaagatagtttaatgga 191  Q
    | || || |||||||| |||||    
T  33678281 gttttcaggatagtttgatgga 33678260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 40106693 - 40106536
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  40106693 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctgacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 40106594  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  40106593 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 40106536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 14097757 - 14097914
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  14097757 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 14097856  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  14097857 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 14097914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31127573 - 31127416
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  31127573 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 31127474  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  31127473 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 31127416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 36)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19457482 - 19457284
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19457482 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagaattcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 19457383  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19457382 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagcttgatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 19457284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21704225 - 21704027
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21704225 caaaggtggacgtccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccataaccatatcatcaagtatgtccgaaagat 21704126  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21704125 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagcttaatggaagacgctgcagaatggtatactagcttgagcaaagatga 21704027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27435507 - 27435309
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27435507 caaaggtggatgtccctaagaagttcaagatcccggacttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagat 27435408  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    |||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  27435407 gggtaattacaaagacaatgattcactcatgattcactgcttccaagatagcttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 27435309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Original strand, 12654719 - 12654917
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12654719 caaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccgatacaacgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagat 12654818  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    |||||| |||  |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  12654819 gggtaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaagatagtttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 12654917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 32 - 225
Target Start/End: Original strand, 20837095 - 20837288
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20837095 caaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccgatacaacgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagat 20837194  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaa 225  Q
    |||||| |||  |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  20837195 gggtaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaagatagtttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaa 20837288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Original strand, 28881391 - 28881589
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28881391 caaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccgatacaacgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagat 28881490  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    ||| || |||  |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  28881491 gggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaagatagtttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 28881589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 34 - 222
Target Start/End: Original strand, 27392173 - 27392361
Alignment:
Q  34 aaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgg 133  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  27392173 aaggtggatatccctaagaagttcaaggttccggatttcgaccgatacaatgggctaacttgtccacagaatcacatcatcaaatatgtccggaagatgg 27392272  T
Q  134 gtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagc 222  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27392273 ctaactactcagacaatgattcactcatgatccactactttcaagatagtctaatggaagatgctggagaatggtataccagcttgagc 27392361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23129630 - 23129432
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  23129630 caaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccaatacaacgggctgacctgtccccagaaccacatcatcaagtacatccgaaagat 23129531  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    ||| || |||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  23129530 gggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 23129432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 12585998 - 12586183
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || ||||||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  12585998 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataatgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 12586097  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  12586098 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 12586183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 27776404 - 27776589
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| |||||||||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  27776404 aagttcaaagtcccagagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 27776503  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  27776504 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 27776589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 27816171 - 27816356
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| |||||||||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  27816171 aagttcaaagtcccagagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 27816270  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  27816271 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 27816356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 39889259 - 39889444
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||  ||| || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   || ||||    
T  39889259 aagttcaaagtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggataatg 39889358  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  39889359 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtccat 39889444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 236
Target Start/End: Original strand, 34278646 - 34278830
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  34278646 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 34278745  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtcca 236  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  34278746 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtcca 34278830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 40232696 - 40232881
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| ||||| || |||||||| ||||||   |||||||    
T  40232696 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtacggaagatgggcaactacaaggacaatg 40232795  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  40232796 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtccat 40232881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 236
Target Start/End: Original strand, 37374358 - 37374542
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||||||||| |||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  37374358 aagttcaaagtcccagagtttgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 37374457  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtcca 236  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||| ||||||||    
T  37374458 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtcca 37374542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 261808 - 261624
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| || ||||| ||||||   |||||||    
T  261808 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaa-atgggcaactacaaggacaatg 261710  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  261709 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtccat 261624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9351038 - 9350853
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  9351038 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 9350939  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  9350938 attcccttatgatccattacttccaagacagcctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtccat 9350853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13937588 - 13937403
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| || ||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  13937588 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 13937489  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  13937488 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 13937403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 39052872 - 39052687
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| || ||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  39052872 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 39052773  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  39052772 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 39052687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11636233 - 11636061
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  11636233 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 11636134  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaa 224  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||    
T  11636133 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgctgcagagtggtatactagtttgagcaa 11636061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11642422 - 11642250
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  11642422 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 11642323  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaa 224  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||    
T  11642322 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgctgcagagtggtatactagtttgagcaa 11642250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12717631 - 12717477
Alignment:
Q  70 ttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcact 169  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||  |||||||||||| || ||||| ||||    
T  12717631 ttcgaccggtacaacgggctaacttgccctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccact 12717532  T
Q  170 gcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaa 224  Q
    | || || |||||||| ||||| || || || || ||||| || || ||||||||    
T  12717531 gttttcaggatagtttgatggaggatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 12717477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21678226 - 21678069
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  21678226 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 21678127  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | |||||||| || ||||| |||||    
T  21678126 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaagatgccgcagagtggta 21678069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 27802889 - 27803074
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| || ||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  27802889 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 27802988  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||  ||||||| || |||||||||    
T  27802989 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaggacgatgtccat 27803074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 32048995 - 32049152
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  32048995 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 32049094  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || ||||||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  32049095 attcccttatgatccactgttttcaagatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 32049152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16830382 - 16830225
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  16830382 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 16830283  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  16830282 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 16830225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 16891099 - 16891256
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  16891099 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 16891198  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  16891199 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 16891256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19417543 - 19417386
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  19417543 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 19417444  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  19417443 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 19417386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22927072 - 22926915
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  22927072 aagttcaagattccggacttcgaccggtataacgggctgacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 22926973  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  22926972 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 22926915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 34860877 - 34861034
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  34860877 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 34860976  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  34860977 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 34861034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37686953 - 37686796
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  37686953 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 37686854  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  37686853 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 37686796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37702218 - 37702061
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  37702218 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 37702119  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  37702118 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 37702061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 37924690 - 37924847
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  37924690 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 37924789  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  37924790 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 37924847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 236
Target Start/End: Original strand, 34285627 - 34285735
Alignment:
Q  128 agatgggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaaga 227  Q
    ||||||| ||||||   ||||||||||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  ||||||||||    
T  34285627 agatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaaga 34285726  T
Q  228 tgatgtcca 236  Q
    |||||||||    
T  34285727 tgatgtcca 34285735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 236
Target Start/End: Original strand, 34290687 - 34290795
Alignment:
Q  128 agatgggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaaga 227  Q
    ||||||| ||||||   ||||||||||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  ||||||||||    
T  34290687 agatgggcaactacaaggacaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaaga 34290786  T
Q  228 tgatgtcca 236  Q
    |||||||||    
T  34290787 tgatgtcca 34290795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 31875478 - 31875635
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  31875478 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgccctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 31875577  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  31875578 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 31875635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 53)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15335083 - 15334885
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15335083 caaaggtggacgtccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 15334984  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  15334983 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagcttaatggaagacgctgcagaatggtatactagcttgagcaaagatga 15334885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16627618 - 16627428
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16627618 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccctagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 16627519  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16627518 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagcttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagc 16627428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 33 - 228
Target Start/End: Original strand, 18529540 - 18529735
Alignment:
Q  33 aaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatg 132  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18529540 aaaggtggatgtccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggcggacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatg 18529639  T
Q  133 ggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  18529640 ggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagcttaatggaagacgctgcggaatggtatactagcttgagcaaagat 18529735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15893822 - 15893624
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15893822 caaaggtggatgtccctaagaagttcaagatcccgaatttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagat 15893723  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  15893722 gggtaactacaaagacaatgattcactcatgattcactacttccaagatagcttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 15893624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8302377 - 8302179
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8302377 caaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagat 8302278  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    |||||| |||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  8302277 gggtaattacaaagacaatgattcacttatgatccactgcttccaagatagcttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 8302179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Original strand, 8295117 - 8295315
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8295117 caaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgttcgaaagat 8295216  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    ||| || |||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  8295217 gggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttgatggaagatgccgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 8295315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15742183 - 15741997
Alignment:
Q  44 tccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactc 143  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||      
T  15742183 tccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccgatacaacgggctgacttgtccccagaatcacatcatcaagtatgtccgaaagatgggcaattacaa 15742084  T
Q  144 agacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  15742083 agacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 15741997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Original strand, 18050404 - 18050602
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||    
T  18050404 caaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaatgggctgccttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtctggaagat 18050503  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    ||| || |||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  18050504 gggcaattacaaagacaatgattcacttatgatccactgcttccaagatagcttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 18050602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4797769 - 4797571
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  4797769 caaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggacttcgaccgatacaacgggctaacttgtccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagat 4797670  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    ||| || |||  |||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  4797669 gggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 4797571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14448033 - 14447835
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  14448033 caaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccatatttcgaccgatacaacgggctaacttgtccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagat 14447934  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    ||| || |||  |||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  14447933 gggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 14447835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Original strand, 35879908 - 35880106
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  35879908 caaaggtggatttccctaagaaattcaaaatcccagatttcgaccggtacaacgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaaatacgtccgaaagat 35880007  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    ||| || |||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  35880008 gggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 35880106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 237
Target Start/End: Original strand, 18329816 - 18330021
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  |||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  18329816 caaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacttgtccccaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagat 18329915  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgat 231  Q
    ||| || |||  |||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||| |||||    
T  18329916 gggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgat 18330015  T
Q  232 gtccat 237  Q
     |||||    
T  18330016 atccat 18330021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 237
Target Start/End: Original strand, 6191470 - 6191663
Alignment:
Q  44 tccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactc 143  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||      
T  6191470 tccctaagaagttcaaaatcctagatttcgaccggtacaacgggctaacttgtccccaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaa 6191569  T
Q  144 agacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||| ||||| |||||    
T  6191570 agacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgatatccat 6191663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29149859 - 29149673
Alignment:
Q  44 tccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactc 143  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||| || |||      
T  29149859 tccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccggtacaacgggctaacttgtccccaaaaccacatcattaaatacgtccgaaagatgggcaattacaa 29149760  T
Q  144 agacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  29149759 agacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 29149673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 237
Target Start/End: Original strand, 4720785 - 4720978
Alignment:
Q  44 tccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactc 143  Q
    |||| |||||||||||  |||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||      
T  4720785 tccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacttgtccacaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaa 4720884  T
Q  144 agacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||| ||||| |||||    
T  4720885 agacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgatatccat 4720978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4347786 - 4347595
Alignment:
Q  46 cccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcag 145  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |    
T  4347786 cccaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaagg 4347687  T
Q  146 acaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    ||||||||||| | ||||| || | ||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  4347686 acaatgattcgtttatgatccattacttccaagatagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtccat 4347595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 46 - 236
Target Start/End: Original strand, 4892369 - 4892559
Alignment:
Q  46 cccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcag 145  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| ||||||||||||| |||||| | ||||||   |    
T  4892369 cccaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaagtatgtccggaagatgagcaactacaagg 4892468  T
Q  146 acaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtcca 236  Q
    |||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||    
T  4892469 acaatgattcccttatgatccattgcttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttaagcaaagatgatgtcca 4892559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 47022615 - 47022800
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||| || |||||||||||||| || || || ||| |||| || ||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  47022615 aagttcaaggtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 47022714  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  47022715 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtccat 47022800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 236
Target Start/End: Original strand, 7072374 - 7072558
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || ||||||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  7072374 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataatgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 7072473  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtcca 236  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  7072474 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtcca 7072558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6543570 - 6543385
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||  ||| || |||||||||||||| || || || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||||    
T  6543570 aagttcaaagtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccgaaagatgggcaactacaaggacaatg 6543471  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | ||||| || |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  6543470 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaggatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 6543385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 48465077 - 48465262
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  48465077 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 48465176  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  48465177 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtccat 48465262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22388677 - 22388487
Alignment:
Q  46 cccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcag 145  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| ||||||||||||| |||||| | ||||||   |    
T  22388677 cccaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaagtatgtccggaagatgagcaactacaagg 22388578  T
Q  146 acaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtcca 236  Q
    | |||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  | |||||||||||||||||    
T  22388577 ataatgattcccctatgattcattgcttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctaagcaaagatgatgtcca 22388487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 5466147 - 5466332
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||||||    
T  5466147 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaagacaatg 5466246  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    || | || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  5466247 atccccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtccat 5466332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 8210903 - 8211088
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||||||    
T  8210903 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaagacaatg 8211002  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | ||||| || |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  8211003 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaggatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 8211088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11111457 - 11111272
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| || ||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  11111457 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 11111358  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  11111357 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtccat 11111272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 18241889 - 18242074
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||||||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| || ||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  18241889 aagttcaaggtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 18241988  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  18241989 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 18242074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20577958 - 20577773
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  20577958 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 20577859  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  20577858 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 20577773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 28020440 - 28020625
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||  ||| || | |||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   ||||| |    
T  28020440 aagttcaaagtcccggagttcgacaaatataacgagctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaacg 28020539  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  28020540 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtccat 28020625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18278148 - 18277964
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| ||||| || ||| |||| |||||||| |||||||| |||||    |||||||    
T  18278148 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcagaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactataaggacaatg 18278049  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtcca 236  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||| ||||||||    
T  18278048 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtcca 18277964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18293449 - 18293265
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| ||||| || ||| |||| |||||||| |||||||| |||||    |||||||    
T  18293449 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcagaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactataaggacaatg 18293350  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtcca 236  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||| ||||||||    
T  18293349 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtcca 18293265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 10395298 - 10395483
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| ||||| || |||||||| ||||||   |||||||    
T  10395298 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgttcggaagatgggcaactacaaggacaatg 10395397  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  10395398 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 10395483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22871970 - 22871785
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  22871970 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 22871871  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  22871870 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 22871785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22887029 - 22886844
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  22887029 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 22886930  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  22886929 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 22886844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29666081 - 29665896
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  29666081 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 29665982  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  29665981 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 29665896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18308750 - 18308566
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || ||  ||||||||||||| ||||| || ||| |||| |||||||| |||||||| |||||    |||||||    
T  18308750 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacaggctgacttgtcctcagaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactataaggacaatg 18308651  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtcca 236  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||| ||||||||    
T  18308650 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtcca 18308566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28117056 - 28116868
Alignment:
Q  49 aagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagaca 148  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   ||||    
T  28117056 aagaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggaca 28116957  T
Q  149 atgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    ||||||| || ||||| || |  |||||||| ||| | ||||| || |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  28116956 atgattcccttatgatccattatttccaagacagtctgatggaggatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 28116868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 21673855 - 21674040
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   || ||||    
T  21673855 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggataatg 21673954  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  21673955 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 21674040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 236
Target Start/End: Original strand, 32438319 - 32438503
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| || ||||| ||||||   |||||||    
T  32438319 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaaaatgggcaactacaaggacaatg 32438418  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtcca 236  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||  ||| | ||||| || |||||||| ||||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  32438419 attcccttatgatccattacttccaaggcagtctgatggaggatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtcca 32438503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 224
Target Start/End: Original strand, 51781191 - 51781345
Alignment:
Q  70 ttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcact 169  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||  |||||||||||| || ||||| ||||    
T  51781191 ttcgaccggtacaacgggctaacttgccctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccact 51781290  T
Q  170 gcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaa 224  Q
    | || || |||||||| ||||| || || || || ||||| || || ||||||||    
T  51781291 gttttcaggatagtttgatggaggatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 51781345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 224
Target Start/End: Original strand, 51796278 - 51796432
Alignment:
Q  70 ttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcact 169  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||  |||||||||||| || ||||| ||||    
T  51796278 ttcgaccggtacaacgggctaacttgccctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccact 51796377  T
Q  170 gcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaa 224  Q
    | || || |||||||| ||||| || || || || ||||| || || ||||||||    
T  51796378 gttttcaggatagtttgatggaggatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 51796432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 209
Target Start/End: Original strand, 4416058 - 4416235
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    |||| |||||| |||| || ||||||||| | || || |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  4416058 caaaagtggacgtccctaaaaagttcaagattccggacttcgaccggtataacgggctgacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagat 4416157  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    ||| || |||  |||||||||||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  4416158 gggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 4416235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5597462 - 5597277
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || || ||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  5597462 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacggactgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 5597363  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| |  ||  |||||||||| |||||||||    
T  5597362 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatagtagtctgagcaaagacgatgtccat 5597277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17986052 - 17985895
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  17986052 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 17985953  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || |||||||||||    
T  17985952 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagaatggta 17985895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 24327321 - 24327478
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  24327321 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 24327420  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || ||||||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  24327421 attcccttatgatccactgttttcaagatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 24327478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 36998167 - 36998013
Alignment:
Q  70 ttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcact 169  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||   |||||||||||| || ||||| ||||    
T  36998167 ttcgaccggtacaacgggctaacttgccctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattataaagacaatgattcccttatgatccact 36998068  T
Q  170 gcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaa 224  Q
    | || || |||||||| ||||| || || || || ||||| || || ||||||||    
T  36998067 gttttcaggatagtttgatggaggatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 36998013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5610418 - 5610261
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  5610418 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 5610319  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  5610318 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 5610261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 18224353 - 18224510
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  18224353 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 18224452  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  18224453 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 18224510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 28338465 - 28338622
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  28338465 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 28338564  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  28338565 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 28338622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31965569 - 31965412
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  31965569 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 31965470  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  31965469 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 31965412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 50135167 - 50135010
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  50135167 aagttcaagattccggacttcgaccggtataacgggctgacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 50135068  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  50135067 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 50135010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 5012874 - 5013031
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||  ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  5012874 aagttcaagattccggacttcgaccagtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 5012973  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  5012974 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 5013031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 7995724 - 7995881
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  7995724 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgccctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 7995823  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  7995824 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 7995881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 10642232 - 10642389
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  10642232 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgccctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 10642331  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  10642332 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 10642389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 222
Target Start/End: Original strand, 20460288 - 20460478
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20460288 caaaggtggacattcccaagaagttcaaggtcccagagttcaaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 20460387  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20460388 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagcttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagc 20460478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16209099 - 16208901
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16209099 caaaggtggatgtccccaagaagttcaaggtcccggagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 16209000  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    |||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  16208999 gggtaactataaagacaatgattcactcatgattcactgcttccaagatagcttaatggaagacgctgcagaatggtatactagcttgagcaaaaatga 16208901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 28584181 - 28584338
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  28584181 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtccccaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 28584280  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  28584281 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 28584338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 10961870 - 10962027
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  10961870 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 10961969  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  10961970 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 10962027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 41794363 - 41794206
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  41794363 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 41794264  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  41794263 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 41794206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 51637418 - 51637575
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  51637418 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 51637517  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  51637518 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 51637575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Original strand, 19592 - 19790
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19592 caaaggtggacgtccccaagaagttcaaagtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 19691  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19692 gggtaactacaaagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagcttaatggaagacgctgcagaatggtatactagcttgagcaaagatga 19790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Original strand, 29634 - 29832
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  29634 caaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggacttcgaccgatacaacgggctaacttgtccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagat 29733  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    ||| || |||  |||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  29734 gggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 29832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 29)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 32 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16450956 - 16450766
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16450956 caaaggtggacgtccctaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 16450857  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagc 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16450856 gggtaactactccgacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagattaatggaagacgctgcagaatggtatactagcttgagc 16450766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Original strand, 16040508 - 16040706
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16040508 caaaggtggacgtccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccataaccacattatcaagtatgtccgaaagat 16040607  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16040608 gggtaactactcagacaatgattcacttatgattcactgcttccaagatagcctaatggaagacactgcagaatggtatactagcttgagcaaagatga 16040706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16519376 - 16519178
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16519376 caaaggtggatgtccctaagaagttcaagatcccggatttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagat 16519277  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    |||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  16519276 gggtaattacaaagacaatgattcactcatgattcactgcttccaagatagcttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 16519178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16504340 - 16504142
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16504340 caaaggtggatgtccctaagaagttcaagatctcggatttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagat 16504241  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    |||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  16504240 gggtaattacaaagacaatgattcactcatgattcactgcttccaagatagcttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 16504142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Original strand, 2153755 - 2153953
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2153755 caaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaacgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagat 2153854  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    ||| || |||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  2153855 gggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 2153953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10917826 - 10917628
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  10917826 caaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccgatacaacgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagat 10917727  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    ||| || |||  | |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  10917726 gggaaattacaaacacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagcttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 10917628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 44 - 237
Target Start/End: Original strand, 5127186 - 5127379
Alignment:
Q  44 tccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactc 143  Q
    |||| |||||||||||  |||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||      
T  5127186 tccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacttgtccccagaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaa 5127285  T
Q  144 agacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||| ||||| |||||    
T  5127286 agacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgatatccat 5127379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11425725 - 11425539
Alignment:
Q  44 tccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactc 143  Q
    |||| |||||||||||  |||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||      
T  11425725 tccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacttgtccccagaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaa 11425626  T
Q  144 agacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  11425625 agacaatgattctcttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 11425539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 46 - 236
Target Start/End: Original strand, 5120656 - 5120846
Alignment:
Q  46 cccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcag 145  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| ||||||||||||| |||||| | ||||||   |    
T  5120656 cccaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaagtatgtccggaagatgagcaactacaagg 5120755  T
Q  146 acaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtcca 236  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  | |||||||||||||||||    
T  5120756 ataatgattcccttatgattcattgcttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctaagcaaagatgatgtcca 5120846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26538814 - 26538629
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || ||||||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  26538814 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataatgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 26538715  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  26538714 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 26538629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 22142862 - 22143047
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  22142862 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 22142961  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  22142962 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 22143047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 26434459 - 26434644
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  26434459 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 26434558  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || |||||||| | ||||||||| ||| | ||||| || |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  26434559 attcccttatgattcattacttccaagacagtctgatggaggatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 26434644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26486685 - 26486500
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  26486685 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 26486586  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||| |||||||||| |||||||||    
T  26486585 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagcctgagcaaagacgatgtccat 26486500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16737401 - 16737232
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||||||||| || |||  ||||||||    
T  16737401 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatg 16737302  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgag 221  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  16737301 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaagatgccgcagagtggtataccagtttgag 16737232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16752455 - 16752286
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||||||||| || |||  ||||||||    
T  16752455 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatg 16752356  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgag 221  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  16752355 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaagatgccgcagagtggtataccagtttgag 16752286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 221
Target Start/End: Original strand, 17522734 - 17522903
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||||||||| || |||  ||||||||    
T  17522734 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatg 17522833  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgag 221  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  17522834 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaagatgccgcagagtggtataccagtttgag 17522903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17530481 - 17530312
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||||||||| || |||  ||||||||    
T  17530481 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatg 17530382  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgag 221  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  17530381 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaagatgccgcagagtggtataccagtttgag 17530312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 224
Target Start/End: Original strand, 3444514 - 3444668
Alignment:
Q  70 ttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcact 169  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||  |||||||||||| || ||||| ||||    
T  3444514 ttcgaccggtacaacgggctaacttgccctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccact 3444613  T
Q  170 gcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaa 224  Q
    | || || |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || ||||||||    
T  3444614 gttttcaggatagtttgatggaggatgctgctgagtggtatactagtttgagcaa 3444668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5148281 - 5148096
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  5148281 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 5148182  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||| | ||||| || ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  5148181 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaaaatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 5148096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 31124113 - 31124298
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || ||||||||||| || || || || ||| |||| || ||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  31124113 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgccctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 31124212  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  31124213 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtccat 31124298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31565340 - 31565155
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| |||||  ||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| || ||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  31565340 aagttcaaagtcccgtagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 31565241  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  31565240 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 31565155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 224
Target Start/End: Original strand, 11440780 - 11440934
Alignment:
Q  70 ttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcact 169  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||  |||||||||||| || ||||| ||||    
T  11440780 ttcgaccggtacaacgggctaacttgccctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccact 11440879  T
Q  170 gcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaa 224  Q
    | || || |||||||| ||||| || || || || ||||| || || ||||||||    
T  11440880 gttttcaggatagtttgatggaggatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 11440934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26670837 - 26670683
Alignment:
Q  70 ttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcact 169  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||  |||||||||||| || ||||| ||||    
T  26670837 ttcgaccggtacaacgggctaacttgccctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccact 26670738  T
Q  170 gcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaa 224  Q
    | || || |||||||| ||||| || || || || ||||| || || ||||||||    
T  26670737 gttttcaggatagtttgatggaggatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 26670683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 9617853 - 9618010
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  9617853 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 9617952  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  9617953 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 9618010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24593482 - 24593325
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  24593482 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 24593383  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  24593382 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 24593325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26276035 - 26275878
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  26276035 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 26275936  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  26275935 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 26275878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26320810 - 26320653
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  26320810 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 26320711  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  26320710 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 26320653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4146064 - 4145907
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  4146064 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaatttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 4145965  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  4145964 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 4145907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 45386545 - 45386702
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  45386545 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgccctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 45386644  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  45386645 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 45386702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Original strand, 25198222 - 25198420
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25198222 caaaggtggacgtccccaagaagttcaaggtcccggagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 25198321  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25198322 gggtaactacaaagacaatgattcactcatgattcactgcttccaagatagcttaatggaagatgctgcagaatggtatactagcttgagcaaagatga 25198420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Original strand, 23891396 - 23891594
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23891396 caaaggtggatgtccccaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagat 23891495  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23891496 gggtaactacaaagacaatgattcactcattattcactgcttccaagatagcttaatggaagatgctgcagaatggtatactagcttgagcaaagatga 23891594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 230
Target Start/End: Original strand, 24951302 - 24951498
Alignment:
Q  34 aaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgg 133  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24951302 aaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagatgg 24951401  T
Q  134 gtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  24951402 gtaactacaaagacaatgattcactcatgattcactgcttccaagatagcttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 24951498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 32 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24689129 - 24688937
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  24689129 caaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaggtatgtccgaaagat 24689030  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaa 224  Q
    |||||| |||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||    
T  24689029 gggtaattacaaagacaatgattcacttatgattcactgcttccaagatagcttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaa 24688937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Original strand, 30933826 - 30934024
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  || | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30933826 caaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatctcggatttcgaccgatacaacgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagat 30933925  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    ||| || |||  |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  30933926 gggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaagatagtttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 30934024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23718958 - 23718759
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  23718958 caaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccggtacaacgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagat 23718859  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctg-cagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    ||| || |||  |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  23718858 gggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaagatagtttgatggaagatgctgacagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 23718759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 237
Target Start/End: Original strand, 11548544 - 11548749
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  11548544 caaaggtggatgtccctaagaaattcaaaatcccagatttcgaccggtacaacgggctaacttgtccccaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagat 11548643  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgat 231  Q
    ||| || |||  |||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||| |||||    
T  11548644 gggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgat 11548743  T
Q  232 gtccat 237  Q
     |||||    
T  11548744 atccat 11548749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 237
Target Start/End: Original strand, 33776677 - 33776882
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  33776677 caaaggtggatgtccctaagaaattcaaaatcccagatttcgaccggtacaacgggctaacttgtccccagaaccacatcatcaaatacgtccgaaagat 33776776  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgat 231  Q
    ||| || |||  |||||||||||| || ||||| | |||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||| |||||    
T  33776777 gggcaattacaaagacaatgattcccttatgatcctctgctttcaggatagtttgatggaagatgccgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgat 33776876  T
Q  232 gtccat 237  Q
     |||||    
T  33776877 atccat 33776882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23000074 - 22999888
Alignment:
Q  44 tccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactc 143  Q
    |||| |||||||||||  |||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||      
T  23000074 tccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacttgtccccataaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaa 22999975  T
Q  144 agacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  22999974 agacaatgattcacttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 22999888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9549495 - 9549323
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||  |||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||  ||||||||    
T  9549495 aagttcaaaatcccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatg 9549396  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaa 224  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||    
T  9549395 attcccttatgatccactgttttcaggatagtttgatggaagacgccgcagagtggtatactagtttgagcaa 9549323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15659712 - 15659528
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||||||    
T  15659712 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaagacaatg 15659613  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtcca 236  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  15659612 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtcca 15659528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13325796 - 13325611
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||  ||| || |||||||||||||| || || || ||| |||| || ||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  13325796 aagttcaaagtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 13325697  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  13325696 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtccat 13325611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 233
Target Start/End: Original strand, 31430638 - 31430819
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  31430638 aagttcaaagtcccggagttcgacaaatataatgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 31430737  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgt 233  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||  ||||||||||||||||    
T  31430738 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagatgatgt 31430819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 32600421 - 32600236
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  32600421 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 32600322  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  32600321 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtccat 32600236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 34615731 - 34615916
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  34615731 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaagtatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 34615830  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    ||||  | ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  34615831 attcctttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtccat 34615916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 236
Target Start/End: Original strand, 28648436 - 28648620
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| || ||||| |||||||||||||||   |||||||    
T  28648436 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaagatgggtaactacaaggacaatg 28648535  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtcca 236  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  28648536 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtcca 28648620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 236
Target Start/End: Original strand, 33291738 - 33291922
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||| || ||||| |||||||||  ||| || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  33291738 aagtttaaagtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 33291837  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtcca 236  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  33291838 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtcca 33291922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 236
Target Start/End: Original strand, 41673919 - 41674103
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  41673919 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 41674018  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtcca 236  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  41674019 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtcca 41674103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 3788736 - 3788921
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  3788736 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 3788835  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  3788836 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 3788921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18501700 - 18501515
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  18501700 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 18501601  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  18501600 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 18501515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 37771951 - 37771766
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||  |||| |||||||||  ||| || |||||||||||||| || || || ||| |||| || ||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  37771951 aagttcaaaatcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 37771852  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  37771851 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtccat 37771766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40474504 - 40474319
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  40474504 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 40474405  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || |||||||| | ||||||||| ||| | ||||| || |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  40474404 attcccttatgattcattacttccaagacagtctgatggaggatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 40474319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 43077459 - 43077644
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||||||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  43077459 aagttcaaggtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 43077558  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  43077559 attccctgatgatccattacttccaagacagtatgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 43077644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Original strand, 37754175 - 37754363
Alignment:
Q  49 aagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagaca 148  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   ||||    
T  37754175 aagaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggaca 37754274  T
Q  149 atgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    ||||| | || ||||| ||   ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  37754275 atgatccccttatgatccatcacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtccat 37754363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 37672444 - 37672259
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| || ||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  37672444 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 37672345  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  37672344 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 37672259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28960750 - 28960566
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| || || |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  28960750 aagttcaaagttccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 28960651  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtcca 236  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||| ||| ||||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  28960650 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgtagagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtcca 28960566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 2510261 - 2510418
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||  ||||||||    
T  2510261 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggtaattacaaagacaatg 2510360  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | |||||||| || ||||| |||||    
T  2510361 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaagatgccgcagagtggta 2510418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 37359607 - 37359422
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| || ||||| || ||||| ||||||   |||||||    
T  37359607 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaaaatgggcaactacaaggacaatg 37359508  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  37359507 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 37359422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 224
Target Start/End: Original strand, 24680665 - 24680819
Alignment:
Q  70 ttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcact 169  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||  |||||||||||| || ||||| ||||    
T  24680665 ttcgaccggtacaacgggctaacttgccctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccact 24680764  T
Q  170 gcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaa 224  Q
    | || || |||||||| ||||| || || || || ||||| || || ||||||||    
T  24680765 gttttcaggatagtttgatggaggatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 24680819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 224
Target Start/End: Original strand, 24723192 - 24723346
Alignment:
Q  70 ttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcact 169  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||  |||||||||||| || ||||| ||||    
T  24723192 ttcgaccggtacaacgggctaacttgccctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccact 24723291  T
Q  170 gcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaa 224  Q
    | || || |||||||| ||||| || || || || ||||| || || ||||||||    
T  24723292 gttttcaggatagtttgatggaggatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 24723346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8666427 - 8666270
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  8666427 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 8666328  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | |||||||| || ||||| |||||    
T  8666327 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaagatgccgcagagtggta 8666270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 9316661 - 9316818
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  9316661 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 9316760  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  9316761 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 9316818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 12131365 - 12131522
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  12131365 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 12131464  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  12131465 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 12131522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15759809 - 15759652
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  15759809 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 15759710  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  15759709 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 15759652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 26479602 - 26479759
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  26479602 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 26479701  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  26479702 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 26479759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29968018 - 29967861
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  29968018 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 29967919  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  29967918 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 29967861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 30028625 - 30028782
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  30028625 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 30028724  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  30028725 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 30028782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 30151228 - 30151385
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  30151228 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 30151327  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  30151328 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 30151385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 30167679 - 30167836
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  30167679 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 30167778  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  30167779 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 30167836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 33515566 - 33515723
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  33515566 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 33515665  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  33515666 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 33515723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 170
Target Start/End: Original strand, 6873512 - 6873630
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  6873512 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 6873611  T
Q  152 attcgctcatgattcactg 170  Q
    |||| || ||||| |||||    
T  6873612 attcccttatgatccactg 6873630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31827353 - 31827199
Alignment:
Q  70 ttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcact 169  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||  |||||||||||| || ||||| || |    
T  31827353 ttcgaccggtacaacggactaacttgccctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccatt 31827254  T
Q  170 gcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaa 224  Q
    | || || |||||||| ||||| || || || || ||||| || || ||||||||    
T  31827253 gttttcaggatagtttgatggaggatgccgctgagtggtatactagtttgagcaa 31827199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 5637120 - 5637277
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  5637120 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacctgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 5637219  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  5637220 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 5637277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18376364 - 18376207
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  18376364 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgccctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 18376265  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  18376264 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 18376207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 32 - 225
Target Start/End: Original strand, 16282633 - 16282826
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  | || |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16282633 caaaggtggatgttcctaagaagttcaagatcccggattacgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagat 16282732  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaa 225  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  16282733 gggtaactacaaagacaatgattcactcatgattcactgcttccaagatagcttaatggaagatgctgcagaatggtatactagcttgagcaaa 16282826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Original strand, 16276735 - 16276933
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16276735 caaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaacgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagat 16276834  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    ||| || |||  |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  16276835 gggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaagatagtttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 16276933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 32 - 225
Target Start/End: Original strand, 19687279 - 19687472
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19687279 caaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaacgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagat 19687378  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaa 225  Q
    |||||| |||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  19687379 gggtaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaagatagcttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaa 19687472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27609939 - 27609741
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27609939 caaaggtggatgtccctaaaaagttcaaaatcccagatttcgaccgatacaacgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagat 27609840  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    ||| || |||  |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  27609839 gggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaagatagtttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 27609741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2138293 - 2138095
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2138293 caaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaacgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagat 2138194  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    |||||| |||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  2138193 gggtaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttgatggaagatgttgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 2138095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Original strand, 14556808 - 14557006
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  |||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  14556808 caaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatataacgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagat 14556907  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    |||||| |||  |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  14556908 gggtaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaagatagtttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 14557006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22081904 - 22081720
Alignment:
Q  34 aaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgg 133  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||    
T  22081904 aaggtggatgtccctaagaagttcaaggttccggatttcgaccgatacaatgggctaacttgtccacagaatcccatcatcaaatatgtccggaagatgg 22081805  T
Q  134 gtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagctt 218  Q
     |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22081804 ctaactacttagacaatgattcactcatgatccactgctttcaggatagtctaatggaagatgctgcagaatggtataccagctt 22081720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3330533 - 3330348
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  3330533 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 3330434  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  3330433 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtccat 3330348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19279501 - 19279316
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  19279501 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 19279402  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  19279401 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 19279316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 19285666 - 19285851
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  19285666 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 19285765  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| || ||| ||||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  19285766 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgccgcaaaatggtatactagtctgagcaaagatgatgtccat 19285851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19519157 - 19518972
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  19519157 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 19519058  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  19519057 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 19518972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 29828514 - 29828699
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| || ||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  29828514 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 29828613  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  29828614 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtccat 29828699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 70 - 224
Target Start/End: Original strand, 18709805 - 18709959
Alignment:
Q  70 ttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcact 169  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||  |||||||||||| || ||||| ||||    
T  18709805 ttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccact 18709904  T
Q  170 gcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaa 224  Q
    | || || |||||||| ||||| || || ||||| ||||| || || ||||||||    
T  18709905 gttttcaggatagtttgatggaggatgccgcagagtggtatactagtttgagcaa 18709959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12093747 - 12093562
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| || ||||| || ||||| ||||||   |||||||    
T  12093747 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaaaatgggcaactacaaggacaatg 12093648  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  12093647 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtccat 12093562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 19673639 - 19673824
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||||||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   ||||| |    
T  19673639 aagttcaaggtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaacg 19673738  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || |  |||||||| ||| | ||||| || |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  19673739 attcccttatgatccattatttccaagacagtctgatggaggatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 19673824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 31353725 - 31353882
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  31353725 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 31353824  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| |||||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  31353825 attccctcatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 31353882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19209374 - 19209217
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  19209374 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 19209275  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  19209274 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 19209217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 28362969 - 28362812
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  28362969 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 28362870  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  28362869 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 28362812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 33257924 - 33258081
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  33257924 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 33258023  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  33258024 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 33258081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31490764 - 31490607
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  31490764 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgccctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 31490665  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  31490664 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 31490607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 36 - 230
Target Start/End: Original strand, 20159889 - 20160083
Alignment:
Q  36 ggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggt 135  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||| ||    
T  20159889 ggtggacatccctaagaagttcaaggtcccggagttcgaccgatacaatgggctgacttgtcctcagaatcatatcatcaagtacgtccgcaagatgagt 20159988  T
Q  136 aactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    ||||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  20159989 aactatttggacaatgattcactcatgattcattgcttccaagatagcttaatggaagatgctgcagaatggtacactagcttgagcaaggatga 20160083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 36 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22172942 - 22172748
Alignment:
Q  36 ggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggt 135  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||| ||    
T  22172942 ggtggacatccctaagaagttcaaggtcccggagttcgaccgatacaatgggctgacttgtcctcagaatcatatcatcaagtacgtccgcaagatgagt 22172843  T
Q  136 aactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    ||||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22172842 aactatttggacaatgattcactcatgattcattgcttccaagatagcttaatggaagatgctgcagaatggtacactagcttgagcaaggatga 22172748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Original strand, 24862895 - 24863093
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24862895 caaaggtggatatccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagat 24862994  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    |||||| |||  |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  24862995 gggtaattacaaagacaatgattcacttatgatccactgctttcaagatagtttgatggaagatgttgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 24863093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13299969 - 13299771
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13299969 caaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccatatttcgaccgatacaacgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagat 13299870  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    ||| || |||  |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  13299869 gggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgctttcaagatagtttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 13299771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22935896 - 22935698
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| || ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22935896 caaaggtggatgtccctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagat 22935797  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    |||||| |||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||| ||||    
T  22935796 gggtaattacaaagacaatgattcacttatgatccactgcttccaagatagcttgatggaagatgctgcagagtggtatactaatttgagcaaaaatga 22935698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23858341 - 23858143
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| || ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23858341 caaaggtggatgtccctaaaaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagat 23858242  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    |||||| |||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||| ||||    
T  23858241 gggtaattacaaagacaatgattcacttatgatccactgcttccaagatagcttgatggaagatgctgcagagtggtatactaatttgagcaaaaatga 23858143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24305624 - 24305438
Alignment:
Q  44 tccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactc 143  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||      
T  24305624 tccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccgatacaacgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggtaattacaa 24305525  T
Q  144 agacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  24305524 agacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 24305438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15425335 - 15425137
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15425335 caaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccgatacaacgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagat 15425236  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    ||| || |||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  15425235 gggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagcttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 15425137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 237
Target Start/End: Original strand, 16749032 - 16749237
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  16749032 caaaggtggatgtccctaagaaattcaaaatcccagatttcgaccggtacaacgggctaacttgtccccaaaaccacatcatcaaatacgtccgaaagat 16749131  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgat 231  Q
    ||| || |||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| |||||    
T  16749132 gggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgat 16749231  T
Q  232 gtccat 237  Q
     |||||    
T  16749232 atccat 16749237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Original strand, 26999250 - 26999449
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  26999250 caaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggacttcgaccgatacaacgggctaacttgtccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagat 26999349  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaaga-tagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    ||| || |||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||| |||||||| | |||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  26999350 gggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggattagtttgatggaagatgttgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 26999449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27273597 - 27273404
Alignment:
Q  37 gtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggta 136  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| || || || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  27273597 gtggacatcccgaagaaattcaagctcccagagttcgacaagtacaacgggctgacttgtcctcaaaatcatatcatcaagtatgtccgcaagatgggaa 27273498  T
Q  137 actactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    | |||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||    
T  27273497 attacaaagacaatgattcgcttatgatacactgcttccaagatagcttgatggaagatgctgcagagtggtatactggtttgagcaaggatga 27273404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 26917578 - 26917763
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||  |||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||  ||||||||    
T  26917578 aagttcaaaatcccggatttcgaccggtacaacgggctaacttgtccccagaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaaagacaatg 26917677  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||| ||||| |||||    
T  26917678 attcccttatgatccactgctttcaggatagtttgatggaagatgccgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatgatatccat 26917763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Original strand, 26988182 - 26988377
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  |||| || ||||||||||||||  |||| || ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  26988182 caaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggacttcgaccgatacaa-cggctaac-tgt-cccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagat 26988278  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    ||| || |||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  26988279 gggcaattacaaagacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttgatggaagatgttgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 26988377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26778625 - 26778441
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||  ||| || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  26778625 aagttcaaagtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 26778526  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtcca 236  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  26778525 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtcca 26778441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 4524487 - 4524672
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||  ||| || |||||||||||||| || || || ||| |||| || ||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  4524487 aagttcaaagtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 4524586  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  4524587 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtccat 4524672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 4756959 - 4757144
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||  ||| || |||||||||||||| || || || ||| |||| || ||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  4756959 aagttcaaagtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 4757058  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  4757059 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtccat 4757144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 4772195 - 4772380
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||  ||| || |||||||||||||| || || || ||| |||| || ||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  4772195 aagttcaaagtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 4772294  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  4772295 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtccat 4772380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 16673325 - 16673510
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  16673325 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 16673424  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  16673425 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagacgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtccat 16673510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 27006910 - 27007095
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||  ||| || |||||||||||||| || || || ||| |||| || ||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  27006910 aagttcaaagtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 27007009  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  27007010 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtccat 27007095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 27361008 - 27360823
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||  ||| || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  27361008 aagttcaaagtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 27360909  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  27360908 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 27360823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 27451351 - 27451166
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||  ||| || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  27451351 aagttcaaagtcccggagttcgacaaatataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 27451252  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  27451251 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 27451166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 236
Target Start/End: Original strand, 29548676 - 29548860
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||| ||||||   |||||||    
T  29548676 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcagaatcatattgtcaaatatgttcggaagatgggcaactacaaggacaatg 29548775  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtcca 236  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  29548776 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtcca 29548860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27630719 - 27630529
Alignment:
Q  40 gacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaact 139  Q
    ||||| || ||||| |||||| |||| |||||||||   ||||| |||||||||||||| || || || || ||||| |||||||| |||||||| || |    
T  27630719 gacattccgaagaaattcaagctcccggagttcgacaagtacaacgggctgacttgtcctcaaaatcatatcatcaaatatgtccgcaagatgggaaatt 27630620  T
Q  140 actcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    ||  ||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||  | |||||||| |||||    
T  27630619 acaaagacaatgactcacttatgatccactgcttccaggatagtctgatggaagatgctgcagagtggtatactggtttgagcaaggatga 27630529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 236
Target Start/End: Original strand, 27043588 - 27043772
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  27043588 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 27043687  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtcca 236  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | ||||| || |||||||| ||||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  27043688 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaggatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtcca 27043772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 237
Target Start/End: Original strand, 17024454 - 17024645
Alignment:
Q  46 cccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcag 145  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |    
T  17024454 cccaaaaagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaagg 17024553  T
Q  146 acaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||||||||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  17024554 acaatgattcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 17024645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 27484315 - 27484500
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||||||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| || ||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  27484315 aagttcaaggtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 27484414  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  27484415 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 27484500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34464359 - 34464174
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| || ||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  34464359 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 34464260  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  34464259 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtccat 34464174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 3695300 - 3695485
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  3695300 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 3695399  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||| ||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  3695400 attcccttatgatccattactttcaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 3695485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 28206640 - 28206825
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| || ||||| || ||||| ||||||   |||||||    
T  28206640 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaaaatgggcaactacaaggacaatg 28206739  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  28206740 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtccat 28206825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 29500604 - 29500789
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  29500604 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 29500703  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| ||   ||||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  29500704 attcccttatgatccatcacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 29500789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4546782 - 4546597
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| || ||||| || ||||| ||||||   |||||||    
T  4546782 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaaaatgggcaactacaaggacaatg 4546683  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  4546682 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 4546597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4725141 - 4724956
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| || ||||| || ||||| ||||||   |||||||    
T  4725141 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaaaatgggcaactacaaggacaatg 4725042  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | ||||| || |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  4725041 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaggatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 4724956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26117417 - 26117232
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| || ||||| || ||||| ||||||   |||||||    
T  26117417 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaaaatgggcaactacaaggacaatg 26117318  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | ||||| || |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  26117317 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaggatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 26117232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 221
Target Start/End: Original strand, 29572211 - 29572380
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  29572211 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 29572310  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgag 221  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||||| || |||||    
T  29572311 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggtacactagtttgag 29572380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16945025 - 16944868
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  16945025 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 16944926  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  16944925 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 16944868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 30559014 - 30558857
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  30559014 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 30558915  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  30558914 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 30558857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Original strand, 28944 - 29142
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28944 caaaggtggatgtccctaagaagttcaagatcccggatttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaaatatgtccgaaagat 29043  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  29044 gggtaactacaaagacaatgattcactcatgattcactgcttccaagatagcttgatggaagatgctacagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 29142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 41144 - 40946
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41144 caaaggtggatgtccctaagaagttcaaaatcccggatttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatgtccgaaagat 41045  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    |||||| |||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  41044 gggtaattacaaagacaatgattcacttatgattcactgcttccaagatagcttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 40946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 48048 - 47862
Alignment:
Q  44 tccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactc 143  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||      
T  48048 tccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccgatacaacgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtacgtccgaaagatgggaaattacaa 47949  T
Q  144 agacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  47948 agacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 47862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 34 - 222
Target Start/End: Original strand, 20750 - 20938
Alignment:
Q  34 aaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgg 133  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  20750 aaggtggatatccctaagaagttcaaggttccggatttcgaccgatacaatgggctaacttgtccacagaatcacatcatcaaatatgtccggaagatgg 20849  T
Q  134 gtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagc 222  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  20850 ctaactactcagacaatgattcactcatgatccactgctttcaggatagtctaatggaagatgctgcagaatggtataccagcttgagc 20938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 34 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 121254 - 121070
Alignment:
Q  34 aaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgg 133  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  121254 aaggtggatatccctaagaagttcaaggttccggatttcgaccgatacaatgggctaacttgtccacagaatcacatcatcaaatatgtccggaagatgg 121155  T
Q  134 gtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagctt 218  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  121154 ctaactactcagacaatgattcactcatgatccactgctttcaggatagtctaatggaagatgctgcagaatggtataccagctt 121070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 49212 - 49049
Alignment:
Q  70 ttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtat-gtccgaaagatgggtaactactcagacaatgattcgctcatga-ttca 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||    
T  49212 ttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaagtatagtccgaaagatgggtaactacaaagacaatgattcactcatgatttca 49113  T
Q  168 ctgcttccaagatagtttaatggaagacgctgc-agaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  49112 ctgcttccaagatagcttgatggaagatgctgctagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 49049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1193 - 1007
Alignment:
Q  44 tccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactc 143  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||      
T  1193 tccctaagaagttcaaaatcccagatttcgaccggtacaacgggctgacttgtccccagaaccacatcatcaaatacgtccgaaagatgggcaattacaa 1094  T
Q  144 agacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  1093 agacaatgattcccttatgatccactgcttccaggatagtttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 1007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Original strand, 26473 - 26671
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagat 131  Q
    ||||||||||  |||| ||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  26473 caaaggtggatgtccctaagaaattcaaaatcccagatttcgaccgatacaacgggctaacttgtcctcagaaccacatcatcaaatacgtccgaaagat 26572  T
Q  132 gggtaactactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatga 230  Q
    ||| || |||  |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  26573 gggcaattacaaagacaatgattcacttatgatccactgctttcaagatagtttgatggaagatgctgcagagtggtatactagtttgagcaaaaatga 26671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 236
Target Start/End: Original strand, 40847 - 41046
Alignment:
Q  37 gtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggta 136  Q
    |||||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||||   ||||| |||||||||||||| || || || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  40847 gtggacattccgaagaaattcaagctcccagaattcgacaagtacaacgggctgacttgtcctcaaaatcatatcatcaagtatgtccgcaagatgggaa 40946  T
Q  137 actactcagacaatgattcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtcca 236  Q
    | |||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||  | |||||||| |||||| ||||    
T  40947 attacaaagacaatgattcgcttatgatacactgcttccaagatagcttgatggaagatgccgcagagtggtatactggtttgagcaaggatgatatcca 41046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 7433 - 7618
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||   |||||||    
T  7433 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatatgtccggaagatgggcaactacaaggacaatg 7532  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | ||||| || |||||||| ||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  7533 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaggatgctgcagagtggtatactagtctgagcaaagacgatgtccat 7618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 53 - 1
Alignment:
Q  32 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaat 84  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53 caaaggtggacatccccaagaagttcaaggttccagagttcgaccgatacaat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 7138 - 7323
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   || || |||||||||||||| || || || ||| |||| || ||||| || ||||| ||||||   |||||||    
T  7138 aagttcaaagtcccggagttcgacaagtataacgggctgacttgtcctcaaaatcatattgtcaaatacgtccggaaaatgggcaactacaaggacaatg 7237  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggtacaccagcttgagcaaagatgatgtccat 237  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  7238 attcccttatgatccattacttccaagacagtctgatggaagatgctgcggagtggtatactagtctgagcaaagatgatgtccat 7323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15985 - 15828
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  15985 aagttcaagattccggacttcgaccgatacaacgggctaacttgccctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 15886  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagtttaatggaagacgctgcagaatggta 209  Q
    |||| || ||||| ||||| || || |||||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  15885 attcccttatgatccactgttttcaggatagtctgatggaggatgccgcagagtggta 15828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 8294 - 8163
Alignment:
Q  52 aagttcaaggtcccagagttcgaccgatacaatgggctgacttgtccccagaaccacattatcaagtatgtccgaaagatgggtaactactcagacaatg 151  Q
    ||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||  ||||||||    
T  8294 aagttcaagattccggacttcgaccggtacaacgggctaacttgtcctcaaaatcacatcatcaaatacgtccggaagatgggcaattacaaagacaatg 8195  T
Q  152 attcgctcatgattcactgcttccaagatagt 183  Q
    |||| || ||||| ||||| || || ||||||    
T  8194 attcccttatgatccactgttttcaggatagt 8163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 608 times since January 2019
Visitors: 4091