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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
Legend |
| Query |
| Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF0668_low_28 (Length: 322)
Name: NF0668_low_28
Description: NF0668
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
[»] NF0668_low_28 |
 |  |
|
[»] scaffold0310 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold1164 (1 HSPs) |
 |  |
|
[»] chr7 (47 HSPs) |
 |  |
|
[»] scaffold0049 (1 HSPs) |
 |  |
|
[»] scaffold0077 (1 HSPs) |
 |  |
|
[»] scaffold0122 (2 HSPs) |
 |  |
|
[»] scaffold0008 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0035 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0447 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0383 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0673 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0396 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0068 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0338 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0160 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0012 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0190 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0158 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0037 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0083 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0001 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0117 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0022 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0014 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0359 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0021 (5 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold1867 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0740 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0480 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0075 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0016 (6 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0240 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0044 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0011 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0103 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0031 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0120 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0610 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0554 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0876 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0034 (4 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0816 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0342 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0025 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0095 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0092 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0053 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0589 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0162 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0243 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0686 (3 HSPs) |
 |  |
|
[»] scaffold0006 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0013 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0184 (2 HSPs) |
 |  |
|
[»] scaffold0078 (2 HSPs) |
 |  |
|
[»] scaffold0009 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0700 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0123 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0195 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0150 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0483 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0456 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0116 (1 HSPs) |
 |  |
|
[»] scaffold0032 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0132 (1 HSPs) |
 |  |
|
[»] scaffold0409 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0028 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0026 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0010 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0389 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0091 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0234 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0138 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0706 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0597 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0251 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0175 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0058 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0387 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0080 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0465 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0574 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0507 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0039 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0004 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: scaffold0310 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:
Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 6577 - 6258
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
6577 |
atcattaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcacgaattaagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtatttc |
6478 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |
|
|
T |
6477 |
aactaacaacaatccaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataaatatagcacgaatttcatcatttatgaacagttaatcaattcatc |
6378 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaact |
300 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | || |
|
|
T |
6377 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcacccactattaactcaagct |
6278 |
T |
 |
Q |
301 |
tcacttttgctcctatgatt |
320 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
T |
6277 |
tcacttttgctcctatgatt |
6258 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 283 - 1
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
283 |
atcattaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcacgaattaagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtatttc |
184 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| |
|
|
T |
183 |
aactaacaacaatccaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatatagcacgaatttcatcatttattaacatttaatcaattcatc |
84 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcacc |
283 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
83 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcacc |
1 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1164 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:
Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Original strand, 1459 - 1780
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
1459 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaatcacataacataattcaacaattgagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatataattc |
1558 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |
|
|
T |
1559 |
aaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacataggaacaattaatcaattcacc |
1658 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaact |
300 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |
|
|
T |
1659 |
caattaagcacttatcatccaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagct |
1758 |
T |
 |
Q |
301 |
tcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
1759 |
tcacttttgctcctatgattct |
1780 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 47)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 7284229 - 7283908
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
7284229 |
atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaggataattcaccaattaagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatacaattc |
7284130 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
7284129 |
aactaataacaattcaatcatccataacttcacacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcaccacttatgaacaattaatcaattcatc |
7284030 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaact |
300 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || |
|
|
T |
7284029 |
caattaagcacttatcatataaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaattattaactcaagct |
7283930 |
T |
 |
Q |
301 |
tcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
7283929 |
tcacttttgctcctatgattct |
7283908 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 3895103 - 3895376
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
3895103 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgcaattc |
3895202 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
3895203 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatttcatcagaattagagcatgaatttcatcaattatgaacaattaatcaattcatc |
3895302 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
3895303 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
3895376 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 11287495 - 11287768
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
11287495 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
11287594 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |
|
|
T |
11287595 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcaacataatcagagcactaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacc |
11287694 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
11287695 |
caattaaacacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
11287768 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15822600 - 15822327
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||| |
|
|
T |
15822600 |
atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccatttgagcatattttcaacatataccattttcatacattttgaacatgtaattc |
15822501 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |
|
|
T |
15822500 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaa-catgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacc |
15822402 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
15822401 |
caattaagcacttttcatacaaataactgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
15822327 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 44865308 - 44865582
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacatgtaat |
98 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
44865308 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaaaaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcatacactttgaacatgtaat |
44865406 |
T |
 |
Q |
99 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
198 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
44865407 |
tcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca |
44865506 |
T |
 |
Q |
199 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
44865507 |
tccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaa-tctaacccccttacctta |
44865582 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 45452335 - 45452063
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
45452335 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcatg--tcacaaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattc |
45452238 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |
|
|
T |
45452237 |
aactaacaacaatccaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacc |
45452138 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
45452137 |
caattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
45452063 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12370009 - 12369735
Alignment:
Q |
1 |
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100 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
12370009 |
atcatgaaagttatcacaattcaacaacaacaaggcataattcaccaattgagcatattttcaacagatacccatttttcatactttgaacatgtaattc |
12369910 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| |||||||| |||||| | |
|
|
T |
12369909 |
aaccaacaacaattcaattatccgtaacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttaatcatttatgaacaattaattaattcacc |
12369810 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
12369809 |
caattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataaatgataatgatgaaatctaacccccttacctta |
12369735 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 143717 - 143991
Alignment:
Q |
1 |
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98 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
143717 |
atcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcatacactttgaacatgtaat |
143815 |
T |
 |
Q |
99 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
198 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
143816 |
tcaactaaca-caattcaattatttataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
143914 |
T |
 |
Q |
199 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
143915 |
tccaattaagcactttttatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
143991 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 35094894 - 35095166
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaactt-ctcatactttgaacatgtaatt |
99 |
Q |
|
|
|||||||||| | | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || | ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
35094894 |
atcatgaaacatttaacaattcatcaacaacagtgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattttcatatactttgaacatgtaatt |
35094992 |
T |
 |
Q |
100 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
35094993 |
caactaaca-caattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgttatcacaattagagcatgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcat |
35095091 |
T |
 |
Q |
200 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
35095092 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
35095166 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 47289859 - 47290138
Alignment:
Q |
1 |
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98 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
47289859 |
atcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcatacactttgaacatgtaat |
47289957 |
T |
 |
Q |
99 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
198 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
47289958 |
tcaactaaca-caattcaattattcataacttcatatatctaaacatggcatcataattagagctcgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
47290056 |
T |
 |
Q |
199 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaatta |
278 |
Q |
|
|
|||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
47290057 |
tccaattaagcatttttcatacaaataattgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttaatta |
47290138 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 12759065 - 12759340
Alignment:
Q |
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atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||| |
|
|
T |
12759065 |
atcatgaaacttatcataattcaccaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccctttttcacattttgaacatgtaattc |
12759164 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |
|
|
T |
12759165 |
aaccaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatatcatcataattggagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacc |
12759264 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
12759265 |
caattaaacacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
12759340 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13863089 - 13862828
Alignment:
Q |
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ttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaa |
109 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
13863089 |
ttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaa |
13862990 |
T |
 |
Q |
110 |
caattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagc |
209 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
T |
13862989 |
caattcaattattcataacttcatacatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcatttatggacaattaatctattcacccaattaagc |
13862890 |
T |
 |
Q |
210 |
acttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
13862889 |
----ttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
13862828 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 39046792 - 39046523
Alignment:
Q |
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atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | || ||| |||||||| ||||| |
|
|
T |
39046792 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag-atattttca-catatactcatttttcaa---ttgaacatacaattc |
39046698 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
39046697 |
aactaacaataattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatc |
39046598 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
39046597 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaaataacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
39046523 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 26070433 - 26070161
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
26070433 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaattaagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgtaattc |
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T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |
|
|
T |
26070333 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaatt-aca |
26070235 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
T |
26070234 |
caattaagcacttattcatac-cataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaa-ccccttacctta |
26070161 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 26094220 - 26093948
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Q |
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atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
26094220 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaattaagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgtaattc |
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T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |
|
|
T |
26094120 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaatt-aca |
26094022 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
T |
26094021 |
caattaagcacttattcatac-cataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaa-ccccttacctta |
26093948 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12248290 - 12248015
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Q |
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Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||| |
|
|
T |
12248290 |
atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatatactattttctcatactttaaacatgaaatt |
12248191 |
T |
 |
Q |
100 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| || |
|
|
T |
12248190 |
caactaataacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaagtaatcaatt-at |
12248092 |
T |
 |
Q |
200 |
ccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaa-ttacaaaag-tgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
12248091 |
ccaattaagcacttattcatacaa-taattgaaaaattgcaatatatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
12248015 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16570175 - 16569902
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Q |
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atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
99 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
16570175 |
atcatgaaacttatctcaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttccagatataccattttctcatactttgaacatgaaatt |
16570076 |
T |
 |
Q |
100 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| || |
|
|
T |
16570075 |
caactaacaacaaatcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataatgagagcacgaatttcatcatttatgagcaaataatcaatt-at |
16569977 |
T |
 |
Q |
200 |
ccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctt |
273 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
16569976 |
ccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattttaacccccttacctt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 16595487 - 16595760
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Q |
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atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
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Q |
|
|
||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
16595487 |
atcatgaaacttatctcaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttccagatataccattttctcatactttgaacatgaaatt |
16595586 |
T |
 |
Q |
100 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| || |
|
|
T |
16595587 |
caactaacaacaaatcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataatgagagcacgaatttcatcatttatgagcaaataatcaatt-at |
16595685 |
T |
 |
Q |
200 |
ccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctt |
273 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
16595686 |
ccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattttaacccccttacctt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 49047843 - 49047569
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|
T |
49047843 |
atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacataacataattcaaccaattgagcatattt-caacatataccactctctcatactttgaacatgaaatt |
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 |
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100 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
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|
|
|| |||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||| |||| | |||||| |||| | || | ||| ||||||||||||| | |
|
|
T |
49047744 |
tcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatgtcattataattggagcacaaattctaacaattctgaacaattaatcaatt-ac |
49047646 |
T |
 |
Q |
200 |
ccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
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Q |
|
|
|||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
49047645 |
tcaattaagcacttattcata-taacaattgaaaaatggcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 315
Target Start/End: Original strand, 13377609 - 13377924
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catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattaatcaatttgagtataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc |
13377707 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| | || ||||| ||||||||| ||| | | |
|
|
T |
13377708 |
accaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcgatt-actc |
13377806 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctct |
296 |
Q |
|
|
||| || |||||| |||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |
|
|
T |
13377807 |
aatgaatcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagccca |
13377905 |
T |
 |
Q |
297 |
aacttcacttttgctccta |
315 |
Q |
|
|
| ||||||||| ||||||| |
|
|
T |
13377906 |
agcttcactttagctccta |
13377924 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 17224092 - 17223797
Alignment:
Q |
16 |
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114 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
T |
17224092 |
acaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagtataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcacaaacaacaatt |
17223994 |
T |
 |
Q |
115 |
caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt- |
213 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| | || | ||| |||||||| ||| | ||||||||||||| |
|
|
T |
17223993 |
caattatccacaacttcgtgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattataacaactttgaacaattaat-tatttactcaattaagcactta |
17223895 |
T |
 |
Q |
214 |
atcatacaaataattg-aaaattac---aaaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttt |
307 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | | ||||||||| |
|
|
T |
17223894 |
atcata-aaataattgaaaaattacactaaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcttagcccaagcttcacttt |
17223797 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 111200 - 111121
Alignment:
Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
111200 |
tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaacttttagctcaagcttcacttttgctcctatgattct |
111121 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Original strand, 126739 - 126818
Alignment:
Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
126739 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcatttttgctcctatgattct |
126818 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 13274865 - 13275129
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
99 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
13274865 |
atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatat-----------accactttctcatactttgaacatgaaatt |
13274953 |
T |
 |
Q |
100 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| | | |||||| | ||| |||||| ||||||||| | ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| | |
|
|
T |
13274954 |
ttactaacaacaattcaattaccaacaacttcttgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-ac |
13275052 |
T |
 |
Q |
200 |
ccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
13275053 |
tcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaaatggcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
13275129 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 32493977 - 32493898
Alignment:
Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
32493977 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct |
32493898 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16915095 - 16914781
Alignment:
Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| || |||| ||||||| ||||||| |||| |||||| | || ||||||| || ||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
16915095 |
catgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacgtttagagcataatt-caacatataacactttcacatactttgaacatgcaatttc |
16914997 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||| || | | |
|
|
T |
16914996 |
accaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcactt-actc |
16914898 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcactt-atcatacaaataattgaaaa-ttaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcta |
297 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||| || || | |||| | | |
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|
T |
16914897 |
aattaagcacttaatcatac-aataattgaaaagttacactaaatgattgtgattgaattctaacccctttaccttaattaggacaaattcctagcccaa |
16914799 |
T |
 |
Q |
298 |
acttcacttttgctccta |
315 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||| |
|
|
T |
16914798 |
acttcactttagctccta |
16914781 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 9838959 - 9839236
Alignment:
Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| || |||| ||||||| ||||||| |||| |||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
9838959 |
catgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcacatactttgaacatgcaatttc |
9839057 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||| | | | |
|
|
T |
9839058 |
accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcacgt-actc |
9839156 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
278 |
Q |
|
|
|||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
9839157 |
aattaagcacttaatgatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaaccctcttaccttaatta |
9839236 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 1936948 - 1936869
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Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
|||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
1936948 |
tgattatgataaaaactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttttgcttctatgattct |
1936869 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Original strand, 3060272 - 3060351
Alignment:
Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
|||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
3060272 |
tgattatgataaagacttacccccttaccttcattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctacgattct |
3060351 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 14272009 - 14271782
Alignment:
Q |
60 |
ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatag |
159 |
Q |
|
|
||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||| | || ||||| ||| |||||| ||| ||||| ||| |
|
|
T |
14272009 |
ttcaacatatatcattttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattgaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcaccataattag |
14271910 |
T |
 |
Q |
160 |
agcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatga-tga |
254 |
Q |
|
|
||||||||||| | || ||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
14271909 |
agcacgaatttga-caactatgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattatgattga |
14271813 |
T |
 |
Q |
255 |
acactaacccccttaccttaattatcaccaa |
285 |
Q |
|
|
| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
14271812 |
attctaattcccttaccttaattatcaccaa |
14271782 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 48356724 - 48357001
Alignment:
Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| || |||| ||||||| ||||||| | || |||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
48356724 |
catgaatctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcacatactttgaacatgcaatttc |
48356822 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||| | || ||||| |||||||||| || | | |
|
|
T |
48356823 |
accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttaacaactatgaacaattaatcactt-actc |
48356921 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
278 |
Q |
|
|
||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
48356922 |
aattaagcatttaatcatacaacgaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaatta |
48357001 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 278
Target Start/End: Original strand, 9611445 - 9611665
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Q |
60 |
ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatag |
159 |
Q |
|
|
||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
9611445 |
ttcaacatataacactttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattag |
9611544 |
T |
 |
Q |
160 |
agcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaa |
255 |
Q |
|
|
||||||||||| | || ||||| |||||||||| | | ||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |
|
|
T |
9611545 |
agcacgaattttaacaactatgaacaattaatcacgt-actcaattaagcacttaatgatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaa |
9611642 |
T |
 |
Q |
256 |
cactaacccccttaccttaatta |
278 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
9611643 |
ttctaaccctcttaccttaatta |
9611665 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 3049661 - 3049717
Alignment:
Q |
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atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
3049661 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcata |
3049717 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 172
Target Start/End: Original strand, 28722200 - 28722359
Alignment:
Q |
13 |
atcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaaca |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| ||||||| || || ||||| || ||| |||||| |||||||| |||| || ||||||| |
|
|
T |
28722200 |
atcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcataatt-cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaaca |
28722298 |
T |
 |
Q |
112 |
attcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttca |
172 |
Q |
|
|
||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
28722299 |
attcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataactagagcacgaatttca |
28722359 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 274
Target Start/End: Original strand, 31501263 - 31501526
Alignment:
Q |
13 |
atcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaaca |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| | |||| ||||| || ||| |||||| |||||||| |||| || || |||| |
|
|
T |
31501263 |
atcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcat-tattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaataaca |
31501361 |
T |
 |
Q |
112 |
attcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcac |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| || ||||| || ||||||| || |||||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||| |||||| || || ||||||||||| |
|
|
T |
31501362 |
attcaattatcaccaatttcatgtatttaaacatatcttcataattagatcactaatttcatcaactatgaacaaataatcactt-attcaattaagcac |
31501460 |
T |
 |
Q |
212 |
tt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgatta-tgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|| ||||| ||| ||| |||||||||||| || |||||| || |||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
31501461 |
ttaatcatgcaattaa-tgaaaattacaactaattgattattgttgaattctaacccccttacctta |
31501526 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Original strand, 16919646 - 16919758
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Q |
10 |
cttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaaca |
108 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||| || || | |
|
|
T |
16919646 |
cttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatattttgaacatgaaatttcaccaata |
16919744 |
T |
 |
Q |
109 |
acaattcaattatc |
122 |
Q |
|
|
||||||| |||||| |
|
|
T |
16919745 |
acaattcgattatc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
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Q |
1 |
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Q |
|
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|
|
T |
111446 |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 126493 - 126549
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
126493 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
126549 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 2028999 - 2029055
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
2028999 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcata |
2029055 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 2190363 - 2190307
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
2190363 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
2190307 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 32494223 - 32494167
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
32494223 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
32494167 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 42056466 - 42056410
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
42056466 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
42056410 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34241317 - 34241101
Alignment:
Q |
60 |
ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatag |
159 |
Q |
|
|
||||||||||| | ||| |||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||| || |
|
|
T |
34241317 |
ttcaacatatattactttcacatacttttaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacataacatcataattat |
34241218 |
T |
 |
Q |
160 |
agcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaac |
256 |
Q |
|
|
| ||||||||| |||| ||||| |||||||||| || | ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| |
|
|
T |
34241217 |
aacacgaattttatcaactatgaacaattaatcactt-actcaattaatcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaat |
34241119 |
T |
 |
Q |
257 |
actaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |
|
|
T |
34241118 |
tctaacccccttacctta |
34241101 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 172
Target Start/End: Original strand, 14935517 - 14935609
Alignment:
Q |
80 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttca |
172 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
14935517 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataactagagcacgaatttca |
14935609 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 172
Target Start/End: Original strand, 15363110 - 15363202
Alignment:
Q |
80 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttca |
172 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
15363110 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataactagagcacgaatttca |
15363202 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 201 - 274
Target Start/End: Original strand, 25124407 - 25124482
Alignment:
Q |
201 |
caattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
25124407 |
caattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgatgaagactaacccccttacctta |
25124482 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 315
Target Start/End: Original strand, 13389693 - 13389750
Alignment:
Q |
258 |
ctaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
315 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||| | |||| | | ||||||||| ||||||| |
|
|
T |
13389693 |
ctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta |
13389750 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0049 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:
Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 26 - 322
Target Start/End: Original strand, 20275 - 20572
Alignment:
Q |
26 |
aacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatcc |
123 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
20275 |
aacaacaaagcataattaaccaattgagcatattttcaacatatatcta-ttttcatacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattc |
20373 |
T |
 |
Q |
124 |
ataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaa |
223 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
20374 |
ataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaa |
20473 |
T |
 |
Q |
224 |
taattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
20474 |
taattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcatttttgctcctatgattct |
20572 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0077 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:
Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 15640 - 15319
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctc-atactttgaacatgtaatt |
99 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || | ||||||||||||| |||| |
|
|
T |
15640 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccatttttttatactttgaacatacaatt |
15542 |
T |
 |
Q |
100 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
15541 |
caactaacaacaattcaattgtccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcaccacttatgaacaattaatcaattcat |
15442 |
T |
 |
Q |
200 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaac |
299 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | | |
|
|
T |
15441 |
ccaattaagcacttatcatacaaataatttaaaattacaaaagtgattatgatgaatgctaacccccttaccttaattatctccaactattagcccaagc |
15342 |
T |
 |
Q |
300 |
ttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
15341 |
ttcacttttgctcctatgattct |
15319 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 11584129 - 11584451
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaa---agcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaa |
97 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| | |
|
|
T |
11584129 |
atcatgaaacatatcacaattcaacaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatatacccttttcatacacttgaaacatgaat |
11584228 |
T |
 |
Q |
98 |
ttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattc |
197 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| |
|
|
T |
11584229 |
ttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaatatgtcatcataaatagagcacgaatttcaccactcatgaacaattaattaattc |
11584328 |
T |
 |
Q |
198 |
atccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcta |
297 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |
|
|
T |
11584329 |
atccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaa |
11584428 |
T |
 |
Q |
298 |
acttcacttttgctcctatgatt |
320 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
11584429 |
gcttcacttttgctcctatgatt |
11584451 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 21397170 - 21397444
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacatgtaat |
98 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
21397170 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcatacactttgaacatgtaat |
21397268 |
T |
 |
Q |
99 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
198 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
21397269 |
tcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca |
21397367 |
T |
 |
Q |
199 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
21397368 |
tccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
21397444 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 4865341 - 4865613
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | || ||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
4865341 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaaccacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaccc-atacccatttttcatactttgaacatacaattc |
4865439 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
4865440 |
aactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcaccatttatgaacaattaatcaattcatc |
4865539 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
4865540 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
4865613 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24183301 - 24183027
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |
|
|
T |
24183301 |
atcatgaaactcatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatatacccttttcatacactttgaacatgtaattc |
24183202 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |
|
|
T |
24183201 |
gactaacaacaattcaattatccatgacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacc |
24183102 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
24183101 |
caattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
24183027 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 28261599 - 28261867
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttca-acatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
99 |
Q |
|
|
||||| |||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
28261599 |
atcataaaacatatcacaatttatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcacacatat------ttttcatactttgaacatacaatt |
28261692 |
T |
 |
Q |
100 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
28261693 |
caactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataactagagcacgaatttcaccacttatgaacaattaatcaattcat |
28261792 |
T |
 |
Q |
200 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
28261793 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
28261867 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 20712154 - 20712428
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
20712154 |
atcatgcaacttatcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattatcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattc |
20712253 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
|| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
20712254 |
aatcaacaacaattcagttatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca-ttatgaacaattaatcaattcact |
20712352 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
20712353 |
caattaagcacttttcatacaagtaattgaaaattgcaaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
20712428 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11337355 - 11337081
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
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Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
11337355 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaaatgagcatattttcaacatttaccatattctcatactttgaacatgtaattc |
11337256 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
T |
11337255 |
aactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaaccaattcatc |
11337156 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
11337155 |
caattaagcacttattcatac-aataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
11337081 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1168373 - 1168100
Alignment:
Q |
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100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
1168373 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacattgcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatcattttctcatactttgaacatgtaattc |
1168274 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
|||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |
|
|
T |
1168273 |
aactaacaaccattctattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacc |
1168174 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
1168173 |
aaaataagcatttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtga-tatgatgaattctaacccccttacctta |
1168100 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 19405615 - 19405891
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Q |
1 |
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99 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
19405615 |
atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacgaatcataattcaactaattgagcatattttcaacatatacccttttctcatactttgaacatgaaatt |
19405714 |
T |
 |
Q |
100 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
19405715 |
caactaacaataattcaattatccataacttcatacattcaaatatgtcatcataattagagcataaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcac |
19405814 |
T |
 |
Q |
200 |
ccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
19405815 |
ccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
19405891 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21646908 - 21646636
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Q |
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99 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
21646908 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaacgatacataattcaccaattgaacatattttcatacatac-ccattttcatacacttttaacatgtaatt |
21646810 |
T |
 |
Q |
100 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
T |
21646809 |
caactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcacatatgaacatttaatcaattcac |
21646711 |
T |
 |
Q |
200 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
21646710 |
ccaaataagcacttttcatacaaataattg-aaattgcaataagtgattatgatgaattttaacccccttacctta |
21646636 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
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Target Start/End: Original strand, 24475671 - 24475861
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Q |
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113 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
24475671 |
acaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattt-tcatacactttgaacatgtaattcaactaaca-caat |
24475767 |
T |
 |
Q |
114 |
tcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaa |
207 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
24475768 |
tcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagaacacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaa |
24475861 |
T |
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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
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Target Start/End: Original strand, 21906855 - 21907011
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Q |
79 |
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178 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
21906855 |
tcatactttgaacatgtaattcaaccaacatcaattcaattatccataacttcatatgtctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcattt |
21906954 |
T |
 |
Q |
179 |
atgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaatt |
235 |
Q |
|
|
|||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
21906955 |
atgaacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaatt |
21907011 |
T |
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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 315
Target Start/End: Original strand, 19862296 - 19862604
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Q |
10 |
cttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaaca |
108 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| || |||| |
|
|
T |
19862296 |
cttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaaca |
19862394 |
T |
 |
Q |
109 |
acaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaag |
208 |
Q |
|
|
|||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||| || | |||||||| |
|
|
T |
19862395 |
acaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcactt-actcaattaag |
19862493 |
T |
 |
Q |
209 |
cactta-tcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcac |
304 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |
|
|
T |
19862494 |
cacttattcatacaacaaatgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcaccaatttttagcctaaacttcac |
19862593 |
T |
 |
Q |
305 |
ttttgctccta |
315 |
Q |
|
|
||| ||||||| |
|
|
T |
19862594 |
tttagctccta |
19862604 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 3673940 - 3674215
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Q |
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99 |
Q |
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|
|||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |
|
|
T |
3673940 |
atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt-caacatataccactttctcatactttgatcatgaaatt |
3674038 |
T |
 |
Q |
100 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| | ||||| || || |||||| ||||||||| | ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| | |
|
|
T |
3674039 |
tccctaacaacaattcaattatcaacaacttaatgtattcaaacatatcatcataatttgagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-ac |
3674137 |
T |
 |
Q |
200 |
ccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
3674138 |
tcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaaattacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
3674215 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
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Target Start/End: Complemental strand, 23981606 - 23981433
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Q |
80 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
179 |
Q |
|
|
||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
23981606 |
catactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatacaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcactta |
23981507 |
T |
 |
Q |
180 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgat |
252 |
Q |
|
|
||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
T |
23981506 |
tgaacaattaatcaatgcactaaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgat |
23981433 |
T |
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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 274
Target Start/End: Original strand, 16595603 - 16595860
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Q |
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117 |
Q |
|
|
||||||| | ||||| | |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |
|
|
T |
16595603 |
aattcaacatcaacataacataattcacaatttgagcatattt-caacatataccactttctcatactttgaacatgaaatttctctatcaacaattcaa |
16595701 |
T |
 |
Q |
118 |
ttatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tc |
216 |
Q |
|
|
||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| | || ||||| |||||| |||||| | |||||||||||||| || |
|
|
T |
16595702 |
ttatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattagtcaatt-actcaattaagcacttattc |
16595800 |
T |
 |
Q |
217 |
atacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
16595801 |
atac-aataattgaaaatttacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16595860 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 5451002 - 5450731
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Q |
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ttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaa |
109 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| || ||||| |
|
|
T |
5451002 |
ttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaa |
5450904 |
T |
 |
Q |
110 |
caattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagc |
209 |
Q |
|
|
||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||| ||||| | || ||||| ||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
T |
5450903 |
caattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagc |
5450805 |
T |
 |
Q |
210 |
actta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattat |
279 |
Q |
|
|
| ||| | || | || ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
5450804 |
atttatttatgc-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaattat |
5450731 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 274
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Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
23493999 |
catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaatttcgcatatct-caacatatacctattcttcatactttgaacataaaattcc |
23494097 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||| | || ||||| |||||||| ||| | | |
|
|
T |
23494098 |
actaataacaattcaattttccacaacttcatgcattcgaacatgtcatcatagttggagcacgaattctaacaattatgaacaattaattgatt-actc |
23494196 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || |||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
23494197 |
aattaagcacttattcatac-aacaattgaaatttacactaaaaatgattatgatgatttctaacccccttacctta |
23494272 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 274
Target Start/End: Original strand, 28902271 - 28902545
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Q |
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catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | | || |
|
|
T |
28902271 |
catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattgatcaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacacgaagtttc |
28902369 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||| | ||||| || ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| | | |
|
|
T |
28902370 |
accaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actc |
28902468 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatta----caaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || |||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
28902469 |
aattaagcacttattcatac-aacaattgaaaattaacactacaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
28902545 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 274
Target Start/End: Original strand, 28938666 - 28938940
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Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | | || |
|
|
T |
28938666 |
catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattgatcaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacacgaagtttc |
28938764 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||| | ||||| || ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| | | |
|
|
T |
28938765 |
accaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actc |
28938863 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatta----caaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || |||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
28938864 |
aattaagcacttattcatac-aacaattgaaaattaacactacaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
28938940 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
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Q |
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Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
7728500 |
catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc |
7728598 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
|
|| |||||||| ||||||||| || ||||| ||| ||| || | |||||| | ||| ||||||| | || ||||| ||||||||||||| | | |
|
|
T |
7728599 |
accaacaacaaatcaattatcaccaatttcatccattcaaatataacttcataattggagtacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actc |
7728697 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatta---caaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
7728698 |
aattaagcacttattcatacaacaaatgaaaatttacaccaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
7728774 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 21222775 - 21222462
Alignment:
Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| | || || ||||||| || ||||||||| || ||| |||||||||||||| |||| |
|
|
T |
21222775 |
catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcacaattaaacatttagagcataatt-caacatataacactttcatatactttgaacatgcaatttc |
21222677 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
|
|| |||||||||| ||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| | | |
|
|
T |
21222676 |
accaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattctaacaactatgaacaattaatcaat--actc |
21222579 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcta |
297 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || | ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | | |
|
|
T |
21222578 |
aattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaataattatgattgaactctaacccccataccttaattatcaccaattcctagcccaa |
21222480 |
T |
 |
Q |
298 |
acttcacttttgctccta |
315 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||| |
|
|
T |
21222479 |
gcttcactttagctccta |
21222462 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 274
Target Start/End: Original strand, 432543 - 432815
Alignment:
Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| |||| |||||| ||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| | || |
|
|
T |
432543 |
catgaatcttaccacaatccaacaacaacatagtataattcatcaatttgagcataatt-caacatatatcattttctcatactttgaacatgaagtttc |
432641 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||| | |||| ||| ||| |||||| ||||||||| | |||| ||||||| | || ||||| ||||||||| ||| | | |
|
|
T |
432642 |
accaacaacaattcaattatcaacaactacatgcattcaaacatatcatcataattggagcgcgaattttaacaattatgatcaattaatc-atttactc |
432740 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||| | || ||||| |||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
432741 |
aattaagcacttattcatgc-aacaattgaaaaattgcagtaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
432815 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 274
Target Start/End: Original strand, 23466558 - 23466787
Alignment:
Q |
44 |
accaattgagcatattttcaacatataccaactt-ctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaa |
142 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||| |||| | || || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |
|
|
T |
23466558 |
accaattgagcatattt-caacatacaccatttttctcatactttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattat-cataacttcttacatacaaa |
23466655 |
T |
 |
Q |
143 |
catgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-a |
240 |
Q |
|
|
||||| ||||| | ||||||||||| | | ||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||| | |
|
|
T |
23466656 |
catgttgccataattggagcacgaattctaataattatgaacaattaatcaatt-acacaattaatcacttattcatac-aataattgaaaattgcaata |
23466753 |
T |
 |
Q |
241 |
agtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
23466754 |
attgattatgatgaattctaacccccttacctta |
23466787 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21310819 - 21310603
Alignment:
Q |
60 |
ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatag |
159 |
Q |
|
|
||||||||||| || ||| || |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||| ||| |
|
|
T |
21310819 |
ttcaacatatatcattttcacaaactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttag |
21310720 |
T |
 |
Q |
160 |
agcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatgatgaac |
256 |
Q |
|
|
||||||||||| | || ||||| |||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
T |
21310719 |
agcacgaattttaacatttatgaacaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaaatgattatgatgaat |
21310621 |
T |
 |
Q |
257 |
actaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |
|
|
T |
21310620 |
tttaacccccttacctta |
21310603 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 21650773 - 21650829
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
21650773 |
atcatgaaacttatcacaattcaacaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
21650829 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21297285 - 21297069
Alignment:
Q |
60 |
ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatag |
159 |
Q |
|
|
||||||||||| || ||| || |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| | | |||||| |||||||| ||| |
|
|
T |
21297285 |
ttcaacatatatcattttcacaaactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcgttcaaacatatcatcatagttag |
21297186 |
T |
 |
Q |
160 |
agcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatgatgaac |
256 |
Q |
|
|
|| |||||||| | || ||||| |||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||| |
|
|
T |
21297185 |
aggacgaattttaacatttatgaacaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaaataattatgatgaat |
21297087 |
T |
 |
Q |
257 |
actaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |
|
|
T |
21297086 |
tctaacccccttacctta |
21297069 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 21906795 - 21906857
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttca |
63 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
T |
21906795 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcatcaattgaacatattttca |
21906857 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 21617096 - 21617374
Alignment:
Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| || |||||||||||| ||||||| || | |||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| |||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
21617096 |
catgaatctcatcacaattcaacaacaacatagaacaattcaacatttagagcatagtt-caacatataacactttcatatacttggaacatgcaatttc |
21617194 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatt-tcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| | | || |||| ||||||||| || | |
|
|
T |
21617195 |
actaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattctaacaactaatgaacaattaatccctt-act |
21617293 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
278 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
21617294 |
caattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaatta |
21617374 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 2031888 - 2031944
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
2031888 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
2031944 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 11342763 - 11342819
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
11342763 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
11342819 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 21205004 - 21205060
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
21205004 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
21205060 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 214
Target Start/End: Original strand, 22885799 - 22885932
Alignment:
Q |
80 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
179 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||| || | |
|
|
T |
22885799 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattaaagcacgaatttcaacaacca |
22885898 |
T |
 |
Q |
180 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta |
214 |
Q |
|
|
||| ||| | ||||||| || |||||||||||||| |
|
|
T |
22885899 |
tgaacaaattatcaatt-attcaattaagcactta |
22885932 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 315
Target Start/End: Original strand, 37983521 - 37983758
Alignment:
Q |
80 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
179 |
Q |
|
|
||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| ||| || ||| |||| ||||||||| ||||| | || || |
|
|
T |
37983521 |
catactttgaatatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcaccatagatagagcacaaattttaacaacta |
37983620 |
T |
 |
Q |
180 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaat |
276 |
Q |
|
|
||| |||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |
|
|
T |
37983621 |
tgaacaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagt |
37983719 |
T |
 |
Q |
277 |
tatcaccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
315 |
Q |
|
|
|| ||| || | |||| | | ||||||||| ||||||| |
|
|
T |
37983720 |
tagcacaaatttctagcccaagcttcactttagctccta |
37983758 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 172
Target Start/End: Original strand, 29918122 - 29918214
Alignment:
Q |
80 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttca |
172 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
29918122 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtattcaaacatatcatcataattggagcacgaatttca |
29918214 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 18570357 - 18570630
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
18570357 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattt |
18570456 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
18570457 |
aactaataacaattcaattatccataacatcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatc |
18570556 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
18570557 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaattgattatgatgaattctaacccccttacctta |
18570630 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 32898868 - 32899142
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
32898868 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattc |
32898967 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |
|
|
T |
32898968 |
aactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacc |
32899067 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
32899068 |
aaattaagcacttttcataccaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
32899142 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 16086095 - 16086369
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | || || ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
16086095 |
atcatgaaacttatcataattcaacaacaacaaggtataattcaccaattaagcatattttcaacacatacccatttttcgtactttgaacatgtaattc |
16086194 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | |
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T |
16086195 |
aacaaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaattaattcacc |
16086294 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
16086295 |
caattaagcacttttcatacaattaattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16086369 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 16106594 - 16106868
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100 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
16106594 |
atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaggtataattcaccaattaagcatattttcaacacatactcatttttcatactttgaacatgtaattc |
16106693 |
T |
 |
Q |
101 |
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200 |
Q |
|
|
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || || |||||||| |||||| |
|
|
T |
16106694 |
aaccaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttacgaacaattaattaattcact |
16106793 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
16106794 |
caattaagcacttttcatacaattaattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16106868 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 22441012 - 22441285
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Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
22441012 |
atcatgaaacttatcacaaatcatgaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaactcatacccatttttcatacttttaacatgtaattc |
22441111 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
22441112 |
accccatcacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagtacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattcact |
22441211 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
22441212 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattgcaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
22441285 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 18432721 - 18432994
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Q |
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atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
18432721 |
atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattaagcatattttcaacatacacccatttttcatacttttaacatgtaattc |
18432820 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
|| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| | |
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|
T |
18432821 |
aatcaacaacaattcaagtattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaaataatcaattcacc |
18432920 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaa-ttacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||| ||| |||||| |||||||||||| || ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
18432921 |
caattaagctcttttcatac-aataattgaaaatttgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
18432994 |
T |
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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 31628346 - 31628552
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Q |
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atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
31628346 |
atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattaagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
31628445 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |
|
|
T |
31628446 |
aactaacaacaattcaattatcaataacttcatacatctaaacatgtaatcataattcgaatacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacc |
31628545 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaa |
207 |
Q |
|
|
||||||| |
|
|
T |
31628546 |
caattaa |
31628552 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13014874 - 13014603
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Q |
5 |
tgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaact |
104 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | || |||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
T |
13014874 |
tgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatatttccaactcatacccatttttcatacttc-aacatacaattcaact |
13014776 |
T |
 |
Q |
105 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaat |
204 |
Q |
|
|
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
13014775 |
aacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattaaagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaat |
13014676 |
T |
 |
Q |
205 |
taagcacttatcatacaa--ataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
T |
13014675 |
ttagcacttttcatacaaacataattgaaaattacaataagtgattatgataaattctaacccccttacctta |
13014603 |
T |
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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 18777224 - 18777481
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Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
18777224 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgaacatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattc |
18777323 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
18777324 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagaacacgaatttcatcttttatga-----------------a |
18777406 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
18777407 |
caattaagcacttttcatacaaataattgaaaattccaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
18777481 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 274
Target Start/End: Original strand, 18399018 - 18399290
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Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
18399018 |
catgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt-caacatatactattttctcatactttgaacatgaaatttc |
18399116 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| | || ||||| |||||| |||||| | | |
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|
T |
18399117 |
tctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattagtcaatt-actc |
18399215 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
18399216 |
aattaagcacttattcatac-aataattgaaatttacactaaaatgattatgaagaattctaacccccttacctta |
18399290 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 315
Target Start/End: Original strand, 21623255 - 21623563
Alignment:
Q |
10 |
cttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaaca |
108 |
Q |
|
|
|||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| | |||| |
|
|
T |
21623255 |
cttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcagcaaca |
21623353 |
T |
 |
Q |
109 |
acaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaag |
208 |
Q |
|
|
|||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| | |||||||| |
|
|
T |
21623354 |
acaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataccatcataattggagcacgaattctaacatttatgaacaattaatcaatt-actcaattaag |
21623452 |
T |
 |
Q |
209 |
cactta-tcatacaaataattga-aaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttca |
303 |
Q |
|
|
|||||| |||||| || |||||| |||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| | | ||||| |
|
|
T |
21623453 |
cacttattcatac-aacaattgagaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttca |
21623551 |
T |
 |
Q |
304 |
cttttgctccta |
315 |
Q |
|
|
|||| ||||||| |
|
|
T |
21623552 |
ctttagctccta |
21623563 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 22361922 - 22361649
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Q |
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atcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaaca |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || |||| ||| || ||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |
|
|
T |
22361922 |
atcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataatt-caacttatgtcactttctcatactttgaacatgaaatttcagcaacaaca |
22361824 |
T |
 |
Q |
112 |
attcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcac |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| | || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||| || | ||||||||||| |
|
|
T |
22361823 |
attcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttatcatctatgaacaattaatcatttgct-caattaagcac |
22361725 |
T |
 |
Q |
212 |
tta-tcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatcaccaa |
285 |
Q |
|
|
||| |||||| || ||||| |||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
22361724 |
ttattcatac-aacaattgaaaaattactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcaccaa |
22361649 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25367404 - 25367130
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Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||| ||||||| | || |||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
25367404 |
catgaatcttatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacaatttgagcatattt-caacataaaccactttctcatactttgaacatgaaatttc |
25367306 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatc-cataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| | |
|
|
T |
25367305 |
tctaacaacaattccattatcaaaaaacttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattgct- |
25367207 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
25367206 |
caattaagcacttattcatac-aataattgaaaatttacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
25367130 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21411191 - 21410944
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Q |
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caacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataa |
127 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| | || |
|
|
T |
21411191 |
caacatagcataattcacaatttgagcatattt-caacatataccactttctcatactttgaacatgaaatttatttaacaaccattcaattatcaacaa |
21411093 |
T |
 |
Q |
128 |
cttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataa |
226 |
Q |
|
|
|||||| ||| | |||| |||||||| | |||||| |||| | | ||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
T |
21411092 |
cttcatgcattcatacataacatcataattggagcacaaattctaacgattatgaacaattagtcaattcct-caattaagcacttattcatac-aataa |
21410995 |
T |
 |
Q |
227 |
ttgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
21410994 |
ttgaaaatttacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
21410944 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Original strand, 18583641 - 18583720
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Q |
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tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
18583641 |
tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatgattct |
18583720 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 19983223 - 19983144
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Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
19983223 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct |
19983144 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 35015088 - 35015009
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Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
35015088 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct |
35015009 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 18381843 - 18381684
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Q |
10 |
cttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattga-gcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaaca |
108 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| || |||| |
|
|
T |
18381843 |
cttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaacaatttaagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaaca |
18381745 |
T |
 |
Q |
109 |
acaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatt |
169 |
Q |
|
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|| ||||||||||| | |||||||| || ||| || ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
T |
18381744 |
accattcaattatcaacaacttcatgtattcaaaaatatcatcataattagagcacaaatt |
18381684 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28195250 - 28195108
Alignment:
Q |
13 |
atcacaattcaataacaacaaagcataattcacc-aattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaaca |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||| || |||||||||| | ||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |
|
|
T |
28195250 |
atcacaattcaacaacatcatggcataattcaactaattgagcacattt-catcatataccattttctcatactatgaacatgaaattttactaacaaca |
28195152 |
T |
 |
Q |
112 |
attcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataa |
155 |
Q |
|
|
||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
T |
28195151 |
attcaattatcaacaacttcatacattcaaacatatcatcataa |
28195108 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 17557127 - 17556909
Alignment:
Q |
60 |
ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatag |
159 |
Q |
|
|
||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
17557127 |
ttcaacatataacactttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatc-aaacatatcatcataattag |
17557029 |
T |
 |
Q |
160 |
agcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaaaag-tgattatga-tgaac |
256 |
Q |
|
|
||||||||||| | || ||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| || || ||| |||| ||||||||| || ||||||||| |||| |
|
|
T |
17557028 |
agcacgaattt-aacaactatgaacaaataatcaatt-attcaattaagcacttaataatgcaattaatgaaaaattacactagatgattatgattgaat |
17556931 |
T |
 |
Q |
257 |
actaacccccttaccttaatta |
278 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
17556930 |
tctaacccccttaccttaatta |
17556909 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18629712 - 18629502
Alignment:
Q |
66 |
atataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacg |
165 |
Q |
|
|
|||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
18629712 |
atataccactttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacg |
18629613 |
T |
 |
Q |
166 |
aatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaac |
262 |
Q |
|
|
||||| | || ||||| |||||||||| || || ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||| |
|
|
T |
18629612 |
aattttaacaactatgaacaattaatcactt-attcaattaaacacttaatcatacaacaaataaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaac |
18629514 |
T |
 |
Q |
263 |
ccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||| |
|
|
T |
18629513 |
ccccttacctta |
18629502 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Original strand, 33324874 - 33325046
Alignment:
Q |
105 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaat |
204 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| | || ||||| ||| |||||| ||||| || |||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
33324874 |
aacaacaattcaattatcaacaatttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcaatt-atccaat |
33324972 |
T |
 |
Q |
205 |
taagcactta-tcatacaaataattgaa--aattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||| |||||| |||||| | |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
33324973 |
taatcacttattcatac-attaattgaaataattacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
33325046 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17083364 - 17083093
Alignment:
Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| || |||||||||||| ||||||| |||| |||||| || || ||||| | ||||||||||| || ||| |||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
17083364 |
catgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcaca-attcaacatatatcattttcacatactatgaacatacaatttc |
17083266 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
|
|| ||||||||||||||||| || | ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | | || ||||| |||||||||| || || | |
|
|
T |
17083265 |
accaacaacaattcaattat-caccaattcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatattaacaactatgaacaattaatcactt-attc |
17083168 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
17083167 |
aattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattaaaatgaattctaacccccttacctta |
17083093 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 35136078 - 35135906
Alignment:
Q |
105 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaat |
204 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||| || |||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| ||| ||| |
|
|
T |
35136078 |
aacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcaatt-atctaat |
35135980 |
T |
 |
Q |
205 |
taagcactta-tcatacaaataattg--aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
35135979 |
taatcacttattcatac-aataattgaaaaaattacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
35135906 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 214
Target Start/End: Original strand, 29605607 - 29605739
Alignment:
Q |
80 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
179 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||| || || |
|
|
T |
29605607 |
catactatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcactaa-ttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaatttcaacaacta |
29605705 |
T |
 |
Q |
180 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta |
214 |
Q |
|
|
||| ||| |||||| || || |||||||||||||| |
|
|
T |
29605706 |
tgaacaaataatcactt-attcaattaagcactta |
29605739 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 26089813 - 26089869
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
26089813 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
26089869 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 15742397 - 15742341
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
15742397 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
15742341 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 18583395 - 18583451
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
18583395 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
18583451 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 23995001 - 23995057
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
23995001 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
23995057 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Original strand, 25651317 - 25651436
Alignment:
Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| || |||| ||||||| ||||||| |||| |||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
25651317 |
catgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcacatactttgaacatgcaatttc |
25651415 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatc |
122 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
25651416 |
accaacaacaattcaattatc |
25651436 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 35015334 - 35015278
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
35015334 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
35015278 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16887879 - 16887685
Alignment:
Q |
83 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga |
182 |
Q |
|
|
|||||||||||| || | || ||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||| | |||||| |||||||||||||| | || ||||| |
|
|
T |
16887879 |
actttgaacatgcaaattcaccaacaacagttcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatattatcatagttagagcacgaattttaacatctatga |
16887780 |
T |
 |
Q |
183 |
ccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||| || || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
16887779 |
acaattaatcattt-attcaattaatcacttattcatacaa-taattgaaaaattatactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16887685 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15079795 - 15079606
Alignment:
Q |
83 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga |
182 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||| | || ||||| |
|
|
T |
15079795 |
actttgaacatgcaatttcac-aacaacaattcaattatcctcaacttcatgcat-acaacatatcatcctagttagagcacgaattt-aacatctatga |
15079699 |
T |
 |
Q |
183 |
ccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||| | |||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
T |
15079698 |
ataattaatcaatt-atccaattaatcccttattcata-aaataattgaaaaattacactaaaatgattatgatgaattctaa-ccccttacctta |
15079606 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 18002673 - 18002617
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
18002673 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcatcaattgagcata |
18002617 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 25744382 - 25744331
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattga |
52 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
T |
25744382 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccacttga |
25744331 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 214
Target Start/End: Original strand, 22848172 - 22848304
Alignment:
Q |
80 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
179 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||| | ||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||| || || |
|
|
T |
22848172 |
catactatgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcttgcatttaaacatatcatcataattaatgcacgaatttcaacaacta |
22848271 |
T |
 |
Q |
180 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta |
214 |
Q |
|
|
||| ||| ||||||||| || ||| |||||||||| |
|
|
T |
22848272 |
tgaacaa-taatcaatt-attcaactaagcactta |
22848304 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0122 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:
Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 83 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 20041 - 19802
Alignment:
Q |
83 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga |
182 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
20041 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
19942 |
T |
 |
Q |
183 |
ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcac |
282 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
19941 |
acaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcac |
19842 |
T |
 |
Q |
283 |
caactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
19841 |
caactattaactcaagcttcacttttgctcctatgattct |
19802 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 83 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24345 - 24106
Alignment:
Q |
83 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatga |
182 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
24345 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
24246 |
T |
 |
Q |
183 |
ccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcac |
282 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
24245 |
acaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcac |
24146 |
T |
 |
Q |
283 |
caactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
24145 |
caactattaactcaagcttcatttttgctcctatgattct |
24106 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 82)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12349708 - 12349434
Alignment:
Q |
1 |
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100 |
Q |
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T |
12349708 |
atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataacaacttctcacactttgaacatgtaattc |
12349609 |
T |
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Q |
101 |
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200 |
Q |
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T |
12349608 |
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12349509 |
T |
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Q |
201 |
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274 |
Q |
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T |
12349508 |
caattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
12349434 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 54424090 - 54424364
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
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|
|
T |
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atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatcaatttctcatactttgaacatgtaattc |
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T |
 |
Q |
101 |
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200 |
Q |
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T |
54424190 |
aactaaccacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacc |
54424289 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaatt-acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
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||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
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T |
54424290 |
caattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgaaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
54424364 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Original strand, 8631871 - 8632142
Alignment:
Q |
4 |
atgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaac |
103 |
Q |
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T |
8631871 |
atgaaacttatcacaatccaacaacaacaaagcataattcactaaataagcatattttcaacatataccaacttctcaaactttgaacatgtaattcaac |
8631970 |
T |
 |
Q |
104 |
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203 |
Q |
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T |
8631971 |
taacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcacttaagaacaattaattaattcatccaa |
8632070 |
T |
 |
Q |
204 |
ttaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
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T |
8632071 |
ttaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaatcctaacccccttacctta |
8632142 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 50112220 - 50111946
Alignment:
Q |
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100 |
Q |
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T |
50112220 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattc |
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T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
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T |
50112120 |
aaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatc |
50112021 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
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T |
50112020 |
caattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
50111946 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 317677 - 317405
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Q |
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100 |
Q |
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T |
317677 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatttagcatattttca-cacatacccatttttcatactttgaacatacaattc |
317579 |
T |
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Q |
101 |
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200 |
Q |
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T |
317578 |
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317479 |
T |
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Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
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T |
317478 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
317405 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 13817590 - 13817862
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Q |
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atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacatgtaat |
98 |
Q |
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T |
13817590 |
atcatgaaacttatcacaattcaccaacaacaatgcataattcaccaattgagcatatttcca-catatacccattt-tcatacactttgaacatgtaat |
13817687 |
T |
 |
Q |
99 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
198 |
Q |
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T |
13817688 |
tcaactaacat-aattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgtacaattaatcaattca |
13817786 |
T |
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Q |
199 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
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T |
13817787 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
13817862 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 17100731 - 17101004
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Q |
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100 |
Q |
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T |
17100731 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatgtttcatactttgaacatgtaattc |
17100830 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
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T |
17100831 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatggacaattaatcaattcacc |
17100930 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
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T |
17100931 |
caattaagcacttttcatacaaa-aattgaaaatagcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
17101004 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 17101416 - 17101689
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Q |
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100 |
Q |
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T |
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atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatgtttcatactttgaacatgtaattc |
17101515 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
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T |
17101516 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatggacaattaatcaattcacc |
17101615 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
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T |
17101616 |
caattaagcacttttcatacaaa-aattgaaaatagcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
17101689 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16996228 - 16995956
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Q |
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atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
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T |
16996228 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccatttttcatactttgaacatacaattc |
16996130 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
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T |
16996129 |
aagtaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcaccacttatgaataattaatcaattcatc |
16996030 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
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|
T |
16996029 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16995956 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19570857 - 19570586
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Q |
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atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatatac-caacttctcatactttgaacatgtaatt |
99 |
Q |
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T |
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atcatgaaacttatcacaattcaccaacaacaatgcataattcaccaattgagcatatttcca-catatactcattttcatacactttgaacatgtaatt |
19570759 |
T |
 |
Q |
100 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
Q |
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T |
19570758 |
caactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcaaaattagagcacaaatttcatcacatatgaaaaattaatcaattcat |
19570660 |
T |
 |
Q |
200 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
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T |
19570659 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaa-ccccttacctta |
19570586 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16182114 - 16181842
Alignment:
Q |
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atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacatgtaat |
98 |
Q |
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|
T |
16182114 |
atcattaaacttatcacaattcatcaacgacaatgcataattcaccaatttggcatattttca-cacatacccattt-tcatacactttgaacatgtaat |
16182017 |
T |
 |
Q |
99 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
198 |
Q |
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T |
16182016 |
ttaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca |
16181918 |
T |
 |
Q |
199 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
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|
T |
16181917 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16181842 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22144441 - 22144167
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacatgtaat |
98 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
22144441 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcatacttcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcatacactttgaacatgtaat |
22144343 |
T |
 |
Q |
99 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
198 |
Q |
|
|
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|
T |
22144342 |
tcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcagttatgaacagttaatcaattca |
22144244 |
T |
 |
Q |
199 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattac-aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
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|
T |
22144243 |
cccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
22144167 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34439512 - 34439237
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Q |
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100 |
Q |
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T |
34439512 |
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34439413 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatc-taaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
Q |
|
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||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |
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|
T |
34439412 |
aaccaacaacaattcatttatccataacttcatacctcataaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcat |
34439313 |
T |
 |
Q |
200 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
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|
T |
34439312 |
ccaattaaacacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaatctccttacctta |
34439237 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 14298499 - 14298773
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Q |
|
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T |
14298499 |
atcatgaaacttatcacaattcgacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacgtaaccatatcatacactttgaacatgtaattc |
14298598 |
T |
 |
Q |
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aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
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T |
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aactaaccacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacc |
14298698 |
T |
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Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
14298699 |
caattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
14298773 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 14304126 - 14304400
Alignment:
Q |
1 |
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100 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | || | |||||||||||||||||| |
|
|
T |
14304126 |
atcatgaaacttatcacaattcgacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacgtaaccatatcatacactttgaacatgtaattc |
14304225 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |
|
|
T |
14304226 |
aactaaccacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacc |
14304325 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
14304326 |
caattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
14304400 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 35123774 - 35124047
Alignment:
Q |
1 |
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99 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| || ||||||||||| |
|
|
T |
35123774 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacc--cttttcatacactttaacatgtaatt |
35123871 |
T |
 |
Q |
100 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
Q |
|
|
| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| || || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
35123872 |
cgactaacaacaattcaattatccataatttcatacatccaaacacgtcatcataattaaagtacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcac |
35123971 |
T |
 |
Q |
200 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
T |
35123972 |
ccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccctttacctta |
35124047 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 14295516 - 14295790
Alignment:
Q |
1 |
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99 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |
|
|
T |
14295516 |
atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgaattt |
14295615 |
T |
 |
Q |
100 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
14295616 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcac |
14295715 |
T |
 |
Q |
200 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||| || ||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
14295716 |
ccattttagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
14295790 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 14301143 - 14301417
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
99 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |
|
|
T |
14301143 |
atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgaattt |
14301242 |
T |
 |
Q |
100 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
14301243 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcac |
14301342 |
T |
 |
Q |
200 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||| || ||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
14301343 |
ccattttagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
14301417 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6154500 - 6154226
Alignment:
Q |
1 |
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98 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
6154500 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaataacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcataaactttgaacatgtaat |
6154402 |
T |
 |
Q |
99 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
198 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
6154401 |
tcaactaaca-caattcaactattcataatttcatacatctaaacatgtcattataattagaggacgaatttcatgacttatgaacaattaatcaattca |
6154303 |
T |
 |
Q |
199 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
6154302 |
tccaattaagcacttttcatagaaataattgaaaattataataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
6154226 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 17523057 - 17522780
Alignment:
Q |
2 |
tcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
17523057 |
tcatgaaacttatcacaattcatcaataacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccattttgttatactttgaacatgtaattca |
17522958 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||| || |
|
|
T |
17522957 |
actaacaacaattcaattatccacatcttcatacatccaaaactgtcatcataattagagcacgaagttcatcatttatgaacaaataatcaattcaccc |
17522858 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattat |
279 |
Q |
|
|
|| ||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
17522857 |
aaataagcacttctcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttat |
17522780 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 17938652 - 17938925
Alignment:
Q |
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100 |
Q |
|
|
||||||||| | | |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
17938652 |
atcatgaaaataaccacaatccaacaacaacaaagcataattcatcaattaagcatattttcaacatatatcaacttctcatactttgaacatgcaattc |
17938751 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||| | |
|
|
T |
17938752 |
aactaacaacaattcgcttaaccat-gctttatacatccaaacatgtcaccataattagagcacgaatttcatcactcaagaacaattaattaattcacc |
17938850 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
T |
17938851 |
caattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaaccctaacccccttatctta |
17938925 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 274
Target Start/End: Original strand, 38527841 - 38528079
Alignment:
Q |
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132 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
38527841 |
gcataattcaccaattgagcatattttcc-cacatacccattt-tcatacactttgaacatgtaattcaactaacat-aattcaattattcataacttca |
38527937 |
T |
 |
Q |
133 |
tacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
232 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
T |
38527938 |
tacatctaaacatgtcatcataattatagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaatagttgaaa |
38528037 |
T |
 |
Q |
233 |
attacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
38528038 |
attacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
38528079 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 55441018 - 55440803
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
99 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
55441018 |
atcatgaaacttatcacaattcaaccacaacatagtataattcaaccagttgagcatattttcatcatatatcattttctcatactttgaacatgaaatt |
55440919 |
T |
 |
Q |
100 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
Q |
|
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
55440918 |
ccactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcac |
55440819 |
T |
 |
Q |
200 |
ccaattaagcacttat |
215 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |
|
|
T |
55440818 |
ccaattaagcacttat |
55440803 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 3578166 - 3578440
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
99 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
3578166 |
atcatgaaacttatcgcaattcaaccacaacatagcgtaattcaaccagttgagcatattttcaacatatactattttctcatactttgaacatgaaatt |
3578265 |
T |
 |
Q |
100 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||| |||||| ||||| ||||||||||||| | |
|
|
T |
3578266 |
caactaataacaattcaattatccataacttcatacat-tcaacatgtcatcataattagagaatgaatatcatcatttatgaacaattaatcaatttac |
3578364 |
T |
 |
Q |
200 |
ccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
T |
3578365 |
ccaattaagcacttattcctac-aataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccgcttacctta |
3578440 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19261008 - 19260839
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
19261008 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacttagtataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattc |
19260909 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaattt |
170 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
19260908 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
19260839 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11061165 - 11060902
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Q |
11 |
ttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaa |
109 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
T |
11061165 |
ttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacctgaaattcaactaacaa |
11061066 |
T |
 |
Q |
110 |
caattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagc |
209 |
Q |
|
|
|||| ||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||| ||||||||||||||||||| || | ||| |||| |||| |||||||||||| |
|
|
T |
11061065 |
caatccaattattcataacttcatacatttaaaaat-tgatcataattagagcacgaatttcatcatccattaacaaataattaatt-atccaattaagc |
11060968 |
T |
 |
Q |
210 |
actta-tcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||| |||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
T |
11060967 |
acttattcatac-aataattgaaaaattgcaattatgattatgatgaattccaacccccttacctta |
11060902 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 53898624 - 53898450
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Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtaat |
98 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||| |||| |
|
|
T |
53898624 |
atcatgaaacttatcacaatgcaacaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacataccca-ttttcatacactttgaacatttaat |
53898526 |
T |
 |
Q |
99 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca |
175 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
53898525 |
gcaactaac-acaattcaattattcataacttcatagatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca |
53898450 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11329130 - 11328859
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
99 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
11329130 |
atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt-caacatataccactttctcatactttgaacatgaaatt |
11329032 |
T |
 |
Q |
100 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| | ||||| || | ||||||||||||||| | ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| | |
|
|
T |
11329031 |
tcactaacaacaattcaattattaacaactttatgc-----aacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-ac |
11328938 |
T |
 |
Q |
200 |
ccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
11328937 |
tcaattaagcacttattcatac-aataattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
11328859 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 6146913 - 6146764
Alignment:
Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
6146913 |
catgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcatgattcaccaattgagcatattttcaacacataccca-ttttcatacactttgaacatgtaattc |
6146815 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatca |
152 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
6146814 |
aactaa-tacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatca |
6146764 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 17139586 - 17139861
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
99 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |
|
|
T |
17139586 |
atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcatgattcaaccaattgagcatattt-caacatataccattttctcatagtttgaacatgaaatt |
17139684 |
T |
 |
Q |
100 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||| | | |||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | || ||||| || |||||||||| | |
|
|
T |
17139685 |
tcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacacttaatcaatt-ac |
17139783 |
T |
 |
Q |
200 |
ccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||| || |||||||| |||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
17139784 |
tcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaatttacactaagaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
17139861 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 274
Target Start/End: Original strand, 16880203 - 16880477
Alignment:
Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataatt-caccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
16880203 |
catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataatttcacaaattgagcatattct-aacatataccactttctcatactttgaacatgaaatttt |
16880301 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| | |||||| | ||| |||||| ||||| ||| | ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| | | |
|
|
T |
16880302 |
actaacaacaattcaattatcaacaacttcttgcattcaaacatatcatcgtaattggagcacgaattcaaacaattatgaacaattaatcaatt-actc |
16880400 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcactt-atcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
16880401 |
aattaaacacttgttcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16880477 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 170 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6146769 - 6146664
Alignment:
Q |
170 |
tcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccctt |
268 |
Q |
|
|
||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
6146769 |
tcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaaccccctt |
6146670 |
T |
 |
Q |
269 |
acctta |
274 |
Q |
|
|
|||||| |
|
|
T |
6146669 |
acctta |
6146664 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12560405 - 12560131
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
99 |
Q |
|
|
|||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
12560405 |
atcatgaatcatatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccagttgggcatattttca-catataccactttctcatactttgaacatgaaatt |
12560307 |
T |
 |
Q |
100 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
Q |
|
|
||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||| || ||| |||||||| | ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| | |
|
|
T |
12560306 |
tctctaacaaaaattcaagtatcaataacttcaagcattcaatcataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-ac |
12560208 |
T |
 |
Q |
200 |
ccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
12560207 |
tcaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattttaacccccttacctta |
12560131 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 11196456 - 11196291
Alignment:
Q |
26 |
aacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatcca |
124 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
11196456 |
aacaacaaatcataattcaaccaattaagcatattttcaacatataccattttctca--------acataaaattcaactaacaacaattcaattatcca |
11196365 |
T |
 |
Q |
125 |
taacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
198 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
11196364 |
taacttcatacattcaaacatatcatcattattagagcacaaatttcatcatccatgaacaattaatcaattca |
11196291 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 315
Target Start/End: Original strand, 17191628 - 17191936
Alignment:
Q |
10 |
cttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaaca |
108 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| | || ||||||||||||||||||| |||| || |||| |
|
|
T |
17191628 |
cttatcacaattcagcaacaacataacataattcatcaatttgagcataatt-caacataaatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaaca |
17191726 |
T |
 |
Q |
109 |
acaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaag |
208 |
Q |
|
|
||||||| |||||| | || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
T |
17191727 |
acaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatctatgaacaattaatc-atttactcaattaag |
17191825 |
T |
 |
Q |
209 |
cactt-atcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttca |
303 |
Q |
|
|
|| || |||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| |
|
|
T |
17191826 |
caattgttcatac-aacaattgaaaaattacactaaaatgattgtgattgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaaacttca |
17191924 |
T |
 |
Q |
304 |
cttttgctccta |
315 |
Q |
|
|
|||| ||||||| |
|
|
T |
17191925 |
ctttagctccta |
17191936 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 14059372 - 14059112
Alignment:
Q |
11 |
ttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaa |
109 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||| || |
|
|
T |
14059372 |
ttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaaattgagcatattt-caacatatgtcattttctcatactttgaacatgaaatttctctaaaaa |
14059274 |
T |
 |
Q |
110 |
caattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagc |
209 |
Q |
|
|
||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| | || |||| |||||| |||||| | ||||||||| |
|
|
T |
14059273 |
caattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaatcatgaacaattagtcaatt-agtcaattaagc |
14059175 |
T |
 |
Q |
210 |
actta-tcatacaaataattgaaaatt--acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttac |
270 |
Q |
|
|
||||| |||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
14059174 |
acttattcatac-aataattgaaaattgcactaaaatgattatgatgaattataacccccttac |
14059112 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14528110 - 14527975
Alignment:
Q |
140 |
aaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattaca |
238 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| || |
|
|
T |
14528110 |
aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacctaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgca |
14528012 |
T |
 |
Q |
239 |
a-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
14528011 |
ataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
14527975 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Original strand, 7854306 - 7854385
Alignment:
Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
7854306 |
tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct |
7854385 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3576598 - 3576323
Alignment:
Q |
10 |
cttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaaca |
108 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||| || ||| ||||| || ||||||||| ||||||||| |||| || |||| |
|
|
T |
3576598 |
cttatcacaattcaacaacaacatagcataatccatcaatttgagcataatt-caatatatatcactttctcatacattgaacatgaaatttcaccaaca |
3576500 |
T |
 |
Q |
109 |
acaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaag |
208 |
Q |
|
|
|||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||| | || | ||| ||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
T |
3576499 |
acaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagtacgaattataacaactttgaacaattaatc-atttactcaattaag |
3576401 |
T |
 |
Q |
209 |
cactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatcac |
282 |
Q |
|
|
|||||| || ||| || ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
3576400 |
cacttattcgtac-aacaattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcac |
3576323 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Original strand, 3992874 - 3992953
Alignment:
Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
3992874 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct |
3992953 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Original strand, 19232090 - 19232169
Alignment:
Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
19232090 |
tgattaagataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
19232169 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 54038055 - 54037976
Alignment:
Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
54038055 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct |
54037976 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Original strand, 55513194 - 55513273
Alignment:
Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
55513194 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct |
55513273 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 320
Target Start/End: Original strand, 17204818 - 17205081
Alignment:
Q |
60 |
ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatag |
159 |
Q |
|
|
||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||| | || ||||| ||| |||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
17204818 |
ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattag |
17204917 |
T |
 |
Q |
160 |
agcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgat-ga |
254 |
Q |
|
|
||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||| ||| |||||||||| || |
|
|
T |
17204918 |
agcacgaattttatcatctatgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttgttcgtac-cacaattgaaaaattacactaaaatgattatgatgga |
17205015 |
T |
 |
Q |
255 |
acactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgatt |
320 |
Q |
|
|
| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| | | ||||||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
17205016 |
attctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctcctaggatt |
17205081 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Original strand, 39656606 - 39656817
Alignment:
Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
39656606 |
catgaatcttacaacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc |
39656704 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||| |||||||| | ||||||| |||| | || ||||| ||||||||| ||| | | |
|
|
T |
39656705 |
actaacaacaattcaattatcaccaatttcataaattcaaacataacatcataattggagcacggattttaacaattatgaacaattaatc-atttactc |
39656803 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcacttat |
215 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |
|
|
T |
39656804 |
aattaagcacttat |
39656817 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Original strand, 2844515 - 2844594
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Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
2844515 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctcaaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct |
2844594 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 243 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 15857194 - 15857116
Alignment:
Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattc |
321 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
15857194 |
tgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaagtattagctctagcttcactttagctcctatgattc |
15857116 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 12488895 - 12488727
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
99 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
12488895 |
atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacataacataattcatcaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatt |
12488797 |
T |
 |
Q |
100 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatt |
169 |
Q |
|
|
| |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| |
|
|
T |
12488796 |
tcatcaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatccaaacacaatatcataattagagcatgaatt |
12488727 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 274
Target Start/End: Original strand, 30207298 - 30207570
Alignment:
Q |
5 |
tgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattga-gcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaac |
103 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||||| | ||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| | || || |
|
|
T |
30207298 |
tgaatcttatcacaattgaacaacaacatagcacaattcatcaatttaagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaagtttcac |
30207396 |
T |
 |
Q |
104 |
taacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaa |
203 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| | | ||||| |||||||||||| | ||| |
|
|
T |
30207397 |
caacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaaccagtatgaataattaatcaatt-actcaa |
30207495 |
T |
 |
Q |
204 |
ttaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
30207496 |
ttaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattataacccccttacctta |
30207570 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 47784876 - 47784767
Alignment:
Q |
60 |
ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatag |
159 |
Q |
|
|
||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
47784876 |
ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattag |
47784777 |
T |
 |
Q |
160 |
agcacgaatt |
169 |
Q |
|
|
|||||||||| |
|
|
T |
47784776 |
agcacgaatt |
47784767 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 17955915 - 17955832
Alignment:
Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagct----ctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
17955915 |
tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctacctagcttcacttttgctcctatgattct |
17955832 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16744072 - 16743993
Alignment:
Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
|||||||| | || ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
16744072 |
tgattatggtaaagactaacctcgttaccttaattatctccaactattagctctagcttcactttagctcctatgattct |
16743993 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 196
Target Start/End: Original strand, 15876221 - 15876341
Alignment:
Q |
76 |
ttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca |
175 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||| ||||| | ||| |||| ||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
15876221 |
ttctcatacttggaacataaaatttcatcaacaacaattcagttatcaacaacatcatgcatttaaacatattatcataattagagcacgaatttcatca |
15876320 |
T |
 |
Q |
176 |
catatgaccaattaatcaatt |
196 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
15876321 |
tctatgaacaattaatcaatt |
15876341 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Original strand, 45581955 - 45582034
Alignment:
Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccc-cttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
|||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
T |
45581955 |
tgattatgataaaaactaaccccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttca-tttttctcctatgattct |
45582034 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14814925 - 14814658
Alignment:
Q |
10 |
cttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaaca |
108 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| ||||| | || || ||||| || ||| |||||| |||||||| |||| || |||| |
|
|
T |
14814925 |
cttatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcacaatt-cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaaca |
14814827 |
T |
 |
Q |
109 |
acaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaag |
208 |
Q |
|
|
|||||||||||||| || ||||| || |||||| ||| ||||| || ||||||||||||| || ||||| ||| |||||| || || |||||||| |
|
|
T |
14814826 |
acaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattaaagcacgaatttcaacaactatgagcaaataatcactt-attcaattaag |
14814728 |
T |
 |
Q |
209 |
cactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattat-gatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||| ||||| ||| |||| |||||||||| || ||||||| | |||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
14814727 |
cacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacccccttacctta |
14814658 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 12349899 - 12349834
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaaca |
66 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
12349899 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaactacgatgcataattcaccaattgagcatattatcaaca |
12349834 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 3992628 - 3992684
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
3992628 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
3992684 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 38167992 - 38168048
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
38167992 |
atcatgaaacttattacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcata |
38168048 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 14528181 - 14528118
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattc-accaattgagcatattttca |
63 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
14528181 |
atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcatgattcaaccaattgagcatattttca |
14528118 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 274
Target Start/End: Original strand, 14080666 - 14080863
Alignment:
Q |
80 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
179 |
Q |
|
|
||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||||| | || || |
|
|
T |
14080666 |
catactttgaacatgcaaattcactaaccacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattttaacatcta |
14080765 |
T |
 |
Q |
180 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|| ||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
14080766 |
tgcacaattaatc-atttatccaattaaacacttattcatac-catagttgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
14080863 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 2844269 - 2844325
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
2844269 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaagaaccatgcataattcaccaattgagcata |
2844325 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 16261531 - 16261587
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
16261531 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
16261587 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 30153020 - 30153076
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
30153020 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
30153076 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 53771119 - 53771175
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
53771119 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
53771175 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 54685478 - 54685422
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
54685478 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
54685422 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 274
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Q |
80 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
179 |
Q |
|
|
||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||| || || || ||| |||||| |||||||| ||||||||| |||| | || || |
|
|
T |
9590844 |
catactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttaatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacggattttaacaacta |
9590745 |
T |
 |
Q |
180 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||| ||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
T |
9590744 |
tgaacaattaaccactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaatttgaaaaattacactaaatgattatgatgaattctaatccccttacctta |
9590648 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #67
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Q |
13 |
atcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaaca |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||| |||| |||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| |||||||||||||| |||| || ||||||| |
|
|
T |
12953054 |
atcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcatatactttgaacatgcaatttcaccaacaaca |
12953152 |
T |
 |
Q |
112 |
attcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatt |
169 |
Q |
|
|
|| ||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||| |
|
|
T |
12953153 |
atctaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagaacacgaatt |
12953210 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #68
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Q |
80 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
179 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| |||| || ||||| |||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||| ||||||||||| |||| || || |
|
|
T |
13301559 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacataccatcataattagagcacgaaattcaacatcta |
13301460 |
T |
 |
Q |
180 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaatt |
277 |
Q |
|
|
|| | | |||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
13301459 |
agaaccaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaatcacactaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaatt |
13301361 |
T |
 |
Q |
278 |
atcaccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
315 |
Q |
|
|
| ||| || | |||| | | ||||||||| ||||||| |
|
|
T |
13301360 |
agcacaaattcctagcccaagcttcactttagctccta |
13301323 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 13312215 - 13311979
Alignment:
Q |
80 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
179 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| |||| || ||||| |||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||| ||||||||||| |||| || || |
|
|
T |
13312215 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacataccatcataattagagcacgaaattcaacatcta |
13312116 |
T |
 |
Q |
180 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaatt |
277 |
Q |
|
|
|| | | |||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
13312115 |
agaaccaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaatcacactaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaatt |
13312017 |
T |
 |
Q |
278 |
atcaccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
315 |
Q |
|
|
| ||| || | |||| | | ||||||||| ||||||| |
|
|
T |
13312016 |
agcacaaattcctagcccaagcttcactttagctccta |
13311979 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 285
Target Start/End: Original strand, 15550919 - 15550964
Alignment:
Q |
240 |
aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaa |
285 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
15550919 |
aagtgattatgatgaattctaacccccttatcttaattatcaccaa |
15550964 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 38810945 - 38810868
Alignment:
Q |
238 |
aaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
315 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||| | | ||||||||| ||||||| |
|
|
T |
38810945 |
aaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta |
38810868 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 33341959 - 33342015
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
33341959 |
atcatgaaacatatcataattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
33342015 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 45581709 - 45581765
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
45581709 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcata |
45581765 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 201 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 51961106 - 51961031
Alignment:
Q |
201 |
caattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
51961106 |
caattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgatgaagactaacccccttacctta |
51961031 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 6228715 - 6228625
Alignment:
Q |
80 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaattt |
170 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
6228715 |
catactatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattagagcacgaattt |
6228625 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 7854060 - 7854116
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
7854060 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgaacata |
7854116 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11882240 - 11882113
Alignment:
Q |
148 |
catcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtga |
245 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||| ||| |||| || || || ||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| || ||| |
|
|
T |
11882240 |
catcataattagagcatgaaattcaacatctaagaacaaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaattaaaagttacactaaatga |
11882142 |
T |
 |
Q |
246 |
ttatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
11882141 |
ttatgatgaattctaacccccttacctta |
11882113 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 17956161 - 17956109
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgag |
53 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
17956161 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataatacaccaattgag |
17956109 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 23492451 - 23492507
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
23492451 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatccataattcaccatttgagcata |
23492507 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 31412423 - 31412331
Alignment:
Q |
80 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttca |
172 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
31412423 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttca |
31412331 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 172
Target Start/End: Original strand, 50313344 - 50313436
Alignment:
Q |
80 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttca |
172 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||| |||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
50313344 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcactcaaacatatcattataacaagagcacgaatttca |
50313436 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 54038301 - 54038245
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
54038301 |
atcatgaaacatatcacatttcatcaacaaccatgcataattcaccaatttagcata |
54038245 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:
Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 22769 - 23043
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
22769 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaaaaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattc |
22868 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
22869 |
aactaacaacaattcaattattcaaaacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatc |
22968 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
22969 |
caattaagcacttttgatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
23043 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 40)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 55376766 - 55376494
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| | || |||||||| |||||| ||||| |
|
|
T |
55376766 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgtataattcaccaattgagtatattttca-cacatacccatttttcatacttagaacatacaattc |
55376668 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
55376667 |
aactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatc |
55376568 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
55376567 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaatttcaaaagtgattatgatgaagactaacccccttacctta |
55376494 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12837367 - 12837096
Alignment:
Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaa |
102 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
12837367 |
catgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaattcaa |
12837268 |
T |
 |
Q |
103 |
ctaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcca |
202 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
12837267 |
ctaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatatcatcatttatggacaattaatcaattcaccca |
12837168 |
T |
 |
Q |
203 |
attaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
12837167 |
attaagcacttttcattcaaa-aattgaaaatagcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
12837096 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 16732247 - 16732520
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
16732247 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
16732346 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |
|
|
T |
16732347 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacc |
16732446 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataatt-gaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||| | |||||||| |
|
|
T |
16732447 |
caattaagcacttttcatac-actaattaaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacctctttacctta |
16732520 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 30457981 - 30458255
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
30457981 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcgtaattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttacatactttgaacatgtaattc |
30458080 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
30458081 |
aaccaacaacaatttaattatccataacttcatacatctaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatc |
30458180 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
30458181 |
caattaagcacttttcatacaaataattcaaaattacaataagtaattatgatgaattctaacccccttacctta |
30458255 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 44055993 - 44056266
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
44055993 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatattcatttttcatactttgaacatgtaattc |
44056092 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
44056093 |
aactaacaacaattcaaa-attcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatc |
44056191 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
44056192 |
caattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
44056266 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 44346905 - 44347177
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaactt-ctcatactttgaacatgtaatt |
99 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || || | ||||||||||||||||| |
|
|
T |
44346905 |
atcatgaaacatatcacaattcatgaacaacaatgtataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattttcttacactttgaacatgtaatt |
44347003 |
T |
 |
Q |
100 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
44347004 |
caactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcat |
44347102 |
T |
 |
Q |
200 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
44347103 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaactcccttacctta |
44347177 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 53704902 - 53704629
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
53704902 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccatttttcatactttgaacatacaattc |
53704804 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
53704803 |
aactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatc |
53704704 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
53704703 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaaataacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
53704629 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 8872640 - 8872372
Alignment:
Q |
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100 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
8872640 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaacgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccatttttcatactttgaacatacaattc |
8872542 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
8872541 |
aactaacaacacttcaatcattcatagcttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcaccacttatgaacaattaatcaattcatc |
8872442 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttac |
270 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
8872441 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttac |
8872372 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 45459023 - 45458769
Alignment:
Q |
2 |
tcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
45459023 |
tcatgaaacttatcacaattcaacaacagcaaagcataattcaccaattgaacatatctttaacatatacaaacttctcatattttgagcatgtaattca |
45458924 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |
|
|
T |
45458923 |
actaacaacaattcaattatctatcacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcaccc |
45458824 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaa |
255 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |
|
|
T |
45458823 |
aattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaa |
45458769 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23270103 - 23269829
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Q |
1 |
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98 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| | || |||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
23270103 |
atcatgatacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcatcaattgagtatattttcaacacatacccattt-tcatacactttgaacatgtaat |
23270005 |
T |
 |
Q |
99 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
198 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
23270004 |
tcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca |
23269906 |
T |
 |
Q |
199 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
23269905 |
tccaattaaacacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
23269829 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 34395335 - 34395609
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacatgtaat |
98 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
34395335 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcatacactttgaacatgtaat |
34395433 |
T |
 |
Q |
99 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
198 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |
|
|
T |
34395434 |
tcaactaaca-caattcaattattcattacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcatttatgaacaattaatcagttca |
34395532 |
T |
 |
Q |
199 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
34395533 |
cccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgataatgatgaattctaacccccttacctta |
34395609 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21959632 - 21959359
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
21959632 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgag-atgtaattc |
21959534 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
|| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||| | |
|
|
T |
21959533 |
aatcaacaacaattcaaatatccataacttcatacatttaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaatcaattaattcacc |
21959434 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
21959433 |
caaataagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
21959359 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 53907868 - 53907604
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Q |
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atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
|||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||| ||| | |
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|
T |
53907868 |
atcatgaaacatttcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgggcatattttca-cacatacccatttttcatactttgaacatacaatcc |
53907770 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |
|
|
T |
53907769 |
aactaataacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaatta--------atc |
53907678 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
53907677 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaactacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
53907604 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 59 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 20813658 - 20813442
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Q |
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tttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaata |
158 |
Q |
|
|
|||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
20813658 |
tttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataatta |
20813559 |
T |
 |
Q |
159 |
gagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaaca |
257 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
20813558 |
gagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcatttttcatacaaataatttaaaattgcaataagtgattatgatgaatt |
20813459 |
T |
 |
Q |
258 |
ctaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |
|
|
T |
20813458 |
ctaacccccttacctta |
20813442 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 820085 - 819826
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Q |
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atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||| | ||| | |
|
|
T |
820085 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacacattt-tcaca-----aac--------c |
820000 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |
|
|
T |
819999 |
aac-aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcaccataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacc |
819901 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
819900 |
caattaagcatttttcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
819826 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 52265675 - 52265403
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Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
52265675 |
catgaatcttatcacaattcaacaacaacattgcataattcaacaatttgagcatattt-caacatataccactttctcatactttgaacataaaatttc |
52265577 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | || |
|
|
T |
52265576 |
tctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattagagcacgaatttcatcatctatgaacaattaatcaatt-accc |
52265478 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||| |||||| |||||| |||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
52265477 |
aattaaacacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
52265403 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13809679 - 13809405
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Q |
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Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
13809679 |
atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaactaattgagcatattt-caacatataccattttctcatactttgaacatgaaatc |
13809581 |
T |
 |
Q |
100 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||| | | |||||||| ||| |||||| ||||||||| | ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| | |
|
|
T |
13809580 |
tcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattact |
13809481 |
T |
 |
Q |
200 |
ccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatta-caa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
13809480 |
c-aattaagcacttattcatacaa-taattgaaaaatggcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
13809405 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 27961049 - 27961324
Alignment:
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Q |
|
|
|||||||| ||||| ||||||||| ||||| | | ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
27961049 |
atcatgaatcttataacaattcaacaacaatataacataattcaaccaatttagcatattt-caacatatacc-acttcttcatactttgaacatgaaat |
27961146 |
T |
 |
Q |
99 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
198 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| | || ||||| ||||||||||||| | |
|
|
T |
27961147 |
tccactaacaacaattcaattattcataacttcatgcattcaaacatgtcatcataattggagcacggattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
27961245 |
T |
 |
Q |
199 |
tccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||| || |||||||| |||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
27961246 |
ctcaattaagcacttattcatac-aacaattgaaatttacactaacaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
27961324 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 30232665 - 30232391
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca--tactttgaacatgtaat |
98 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| |||||||| |||| | | |
|
|
T |
30232665 |
atcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttca-cata-acccacttttcacatactttgatcatgaagt |
30232568 |
T |
 |
Q |
99 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
198 |
Q |
|
|
| || |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| | |
|
|
T |
30232567 |
ttcaccaacaacaattcaattatc-ataacttcatatatacaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
30232470 |
T |
 |
Q |
199 |
tccaattaagcactta-tcatacaaataattg--aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
T |
30232469 |
cacaattaagcacttattcatac-cataattgaaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccctcttacctta |
30232391 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 274
Target Start/End: Original strand, 15044908 - 15045181
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3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
15044908 |
catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc |
15045006 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| | | |
|
|
T |
15045007 |
accaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actc |
15045105 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || |||||| |||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
15045106 |
aattaagcacttattcatac-aacaattgagaatttaaactaaaatgattatgatgaaatctaacccccttacctta |
15045181 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18494497 - 18494224
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Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaactt-ctcatactttgaacatgtaat |
98 |
Q |
|
|
|||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| || || ||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||| | | |
|
|
T |
18494497 |
atcatgaatcttaacacaattcaacaacaacatagcatcatccaaccaattgagcacattt-caacatataccatttttctcatactttgatcatgaagt |
18494399 |
T |
 |
Q |
99 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
198 |
Q |
|
|
| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| | || ||||| ||||| ||||||| | |
|
|
T |
18494398 |
ttcaccaacaacaattcaattatc-ataacttcatacatacgaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattgatcaatt-a |
18494301 |
T |
 |
Q |
199 |
tccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
18494300 |
cacaattaagcacctattcatac-cataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
18494224 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 47535225 - 47535042
Alignment:
Q |
10 |
cttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaaca |
108 |
Q |
|
|
||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| || |||| || |||| |
|
|
T |
47535225 |
cttatcataattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcatattt-caacatatatcactttctcatactttgaacttgaaatttcaccaaca |
47535127 |
T |
 |
Q |
109 |
acaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatca |
193 |
Q |
|
|
|||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |
|
|
T |
47535126 |
acaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatca |
47535042 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 54118199 - 54118120
Alignment:
Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
54118199 |
tgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcttatgattct |
54118120 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15109516 - 15109243
Alignment:
Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
15109516 |
catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataatttatcaatttgagtataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc |
15109418 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||| ||||| | | ||||| |||||||||||| | | |
|
|
T |
15109417 |
accaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaattctaactattatgaataattaatcaatt-actc |
15109319 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || |||||| |||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
15109318 |
aattaagcacttattcatac-aacaattgagaatttaaactaaaatgattatgatgaaatctaacccccttacctta |
15109243 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 7186011 - 7185701
Alignment:
Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| || |||||||||||| ||||||| |||| |||||| || || | ||| | || ||||||||| || ||| |||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
7186011 |
catgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcatcatttagtgcacaatt-caacatatatcattttcacatactatgaacatacaatttc |
7185913 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||| | || ||||| |||||||||| || || | |
|
|
T |
7185912 |
accaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttaacaactatgaacaattaatcactt-attc |
7185814 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaac |
299 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || | |||| | ||| |
|
|
T |
7185813 |
aattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgatgaattctaacctccttaccttaattagcacaaattcctagcccaaac |
7185714 |
T |
 |
Q |
300 |
ttcacttttgctc |
312 |
Q |
|
|
|||||||| |||| |
|
|
T |
7185713 |
ttcactttagctc |
7185701 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 25119138 - 25119059
Alignment:
Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
25119138 |
tgattatgataaaaactaactcccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct |
25119059 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 5682459 - 5682380
Alignment:
Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
5682459 |
tgattatgataaaaactaacccacttaccttaattatcaccaactattagctcatgcttcacttttgctcctatgattct |
5682380 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 41166101 - 41165983
Alignment:
Q |
15 |
cacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaat |
113 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
T |
41166101 |
cacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcactaacaacaat |
41166003 |
T |
 |
Q |
114 |
tcaattatccataacttcat |
133 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||||| |
|
|
T |
41166002 |
tcaattatcaacaacttcat |
41165983 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 41256526 - 41256263
Alignment:
Q |
13 |
atcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaaca |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| ||||||| || || ||||| || ||| |||||| |||||||| |||| || ||||||| |
|
|
T |
41256526 |
atcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataatt-cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaaca |
41256428 |
T |
 |
Q |
112 |
attcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcac |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| || ||||| ||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||| || || ||||||||||| |
|
|
T |
41256427 |
attcaattatcaccaatttcatgcat-tcaacatttcatcataattagagcacgaatttcaacaactatgaacaattaatcactt-attcaattaagcac |
41256330 |
T |
 |
Q |
212 |
tt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|| | ||||||| ||| |||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
41256329 |
ttaaacatacaacaaatgaaaaattacaactaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta |
41256263 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 14901319 - 14901584
Alignment:
Q |
10 |
cttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaaca |
108 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||| |||| | ||||||||| || || |||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| |||| || |||| |
|
|
T |
14901319 |
cttaccacaattcaataataacatatcataattcaacattttgagcatattta-aacatatatcactttctcatacttcaaacatgaaatttcaccaaca |
14901417 |
T |
 |
Q |
109 |
acaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaag |
208 |
Q |
|
|
||||| ||||| || | || ||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||| | || |||||| ||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
T |
14901418 |
acaat-caattttcaacaatttcatacattcaaacatattgtcataattagagcacgaattataacaaatatgaacaattaatc-atttactcaattaag |
14901515 |
T |
 |
Q |
209 |
cactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||| |||||| |||||||| |||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
14901516 |
cacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaaatgattatgatgaaatttaacccccttacctta |
14901584 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15013372 - 15013137
Alignment:
Q |
80 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
179 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||| | || || |
|
|
T |
15013372 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcat-tcaacatatcatcataattagagcacgaatttaaacaacta |
15013274 |
T |
 |
Q |
180 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaa |
275 |
Q |
|
|
||| |||||||||| || || ||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
15013273 |
tgaacaattaatcactt-attcaattaagcacttaaacatac-aacaaatgaaaattacaactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttag |
15013176 |
T |
 |
Q |
276 |
ttatcaccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
315 |
Q |
|
|
||| || ||| | |||||| | ||||||||| ||||||| |
|
|
T |
15013175 |
ttagca-caaatcctagctcaagcttcactttagctccta |
15013137 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 233
Target Start/End: Original strand, 18276514 - 18276743
Alignment:
Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| || |||||||||||| ||||| | |||| |||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| ||| ||||||||||| |||| |
|
|
T |
18276514 |
catgaatctcatcacaattcaacaacaatatagcacaattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcacatgctttgaacatgcaatttc |
18276612 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
|
|| |||||||||| ||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||| | | | |
|
|
T |
18276613 |
accaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatatttagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcacat-actc |
18276711 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcactt-atcatacaaataattgaaaa |
233 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
18276712 |
aattaagcacttaatcatac-aataattgaaaa |
18276743 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 7964868 - 7964565
Alignment:
Q |
13 |
atcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaaca |
111 |
Q |
|
|
|||| ||||||| ||||||| |||| |||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| ||||||| ||||||| |||| || ||||||| |
|
|
T |
7964868 |
atcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcacatactt-gaacatgcaatttcaccaacaaca |
7964771 |
T |
 |
Q |
112 |
attcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcac |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||| ||||||||| |||| | || ||||| |||||| ||| || | ||||||||||| |
|
|
T |
7964770 |
attcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagagcacggattttaacaactatgaacaattactcactt-actcaattaagcac |
7964672 |
T |
 |
Q |
212 |
tt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcactttt |
308 |
Q |
|
|
|| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||| || | | || | ||||||||||| |
|
|
T |
7964671 |
ttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagttagcacaaattccttgcccaaacttcacttta |
7964572 |
T |
 |
Q |
309 |
gctccta |
315 |
Q |
|
|
||||||| |
|
|
T |
7964571 |
gctccta |
7964565 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 5682704 - 5682648
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
5682704 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
5682648 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 14951840 - 14951896
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
14951840 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
14951896 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 41165885 - 41165808
Alignment:
Q |
238 |
aaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
315 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||| | | ||||||||| ||||||| |
|
|
T |
41165885 |
aaaaatgattatgatgaattctaacccccttacgttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta |
41165808 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 15272489 - 15272433
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||| ||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
15272489 |
atcatggaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
15272433 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 40905024 - 40904932
Alignment:
Q |
80 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttca |
172 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
40905024 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcagcaatttcatgtattcaaacatatcatcataactagagcacgaatttca |
40904932 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 278
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Alignment:
Q |
80 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
179 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| || ||||| || ||||||||||||| || || |
|
|
T |
38764866 |
catactatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcattcattcaaacatatccccataattaaagcacgaatttcaacaacta |
38764965 |
T |
 |
Q |
180 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcac-ttatcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattat-gatgaacactaacccccttaccttaa |
275 |
Q |
|
|
||| || ||||||||| || ||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| || ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |
|
|
T |
38764966 |
tga-aaaataatcaatt-attcaactaagcactttatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaaccctcttaccttaa |
38765063 |
T |
 |
Q |
276 |
tta |
278 |
Q |
|
|
||| |
|
|
T |
38765064 |
tta |
38765066 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 25119384 - 25119328
Alignment:
Q |
1 |
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Q |
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|||||||||| |||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
25119384 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaaaaaccatgcataattcaccaattgatcata |
25119328 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 30)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9784230 - 9783959
Alignment:
Q |
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atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
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|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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T |
9784230 |
atcatgaaacttatcacaattcaa---caacaaagcataattcaccaattaagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
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T |
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Q |
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aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | |
|
|
T |
9784133 |
aatcaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcacttatgaacaatttatcaattcacc |
9784034 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
9784033 |
caattaagcacttttcataccaataattgaaaattgcagtaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
9783959 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22403279 - 22403005
Alignment:
Q |
1 |
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98 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
22403279 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcatacactttgaacatgtaat |
22403181 |
T |
 |
Q |
99 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
198 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
22403180 |
tcaactaaca-caatttaattattcataacttcatacatctagacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca |
22403082 |
T |
 |
Q |
199 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
22403081 |
cccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
22403005 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 49967728 - 49968002
Alignment:
Q |
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atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || | ||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
49967728 |
atcatgaaacgtatcacaattcatcaacaacaatgtataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttttataatttgaacatgtaattc |
49967827 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
49967828 |
aactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatgatttttgaacaattaatcaattcatc |
49967927 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
49967928 |
caattaagcacttttcatgcaaataattgaaaattacaataagtgattacgatgaattctaacccccttacctta |
49968002 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 21718306 - 21718537
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
21718306 |
atcatgaaacttatcacaaatcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttgaacacataccaatttctcatactttgaacatgtaattc |
21718405 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |
|
|
T |
21718406 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatccatgaacaattaatcaattcacc |
21718505 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
233 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
21718506 |
caattaagcacttttcatac-aataattgaaaa |
21718537 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 35054834 - 35055108
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Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
35054834 |
atcatgaaacttatcacagttcatcaactacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattc |
35054933 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||| | |
|
|
T |
35054934 |
aactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaattaaatcatttatgaacaattaaccaattcacc |
35055033 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaat-tacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
35055034 |
caattaagcacttttcatacaaataattgaaaatagaaataagtgattatgatgaattttaacccccttacctta |
35055108 |
T |
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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 41212150 - 41212415
Alignment:
Q |
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atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| | || ||||||||||||||| | ||| |
|
|
T |
41212150 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaacagtgcataattcactaattgagcatattttta-cacatacccatttttcatactttgaacatacagttc |
41212248 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
41212249 |
aactaacaacaattcaattattcataacttcatacctctaaacaggtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatc |
41212348 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccct |
267 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
41212349 |
caattaaacacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaaccccct |
41212415 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 90 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 35522432 - 35522247
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Q |
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189 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
T |
35522432 |
acatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaatta |
35522333 |
T |
 |
Q |
190 |
atcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
35522332 |
atcaattcacccaattaagcccttttcatacaaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaactcccttacctta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 315
Target Start/End: Original strand, 20177267 - 20177570
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Q |
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cacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaat |
113 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |
|
|
T |
20177267 |
cacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaat |
20177365 |
T |
 |
Q |
114 |
tcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt |
213 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| | ||| |||||| ||||||||| | ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
T |
20177366 |
tcaattatcaacaacttcgtgcattaaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcactt |
20177464 |
T |
 |
Q |
214 |
-atcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcactttt |
308 |
Q |
|
|
| ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||| | | ||||||||| |
|
|
T |
20177465 |
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20177563 |
T |
 |
Q |
309 |
gctccta |
315 |
Q |
|
|
||||||| |
|
|
T |
20177564 |
gctccta |
20177570 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 60 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 13376969 - 13376711
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Q |
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ttcaacatataccaacttct-catactttgaacatgtaatt-caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaat |
157 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| ||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||| | |
|
|
T |
13376969 |
ttcaacatatacca-cttcttcatactttgaacatgaaatttcaacga-caacaatttaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataatt |
13376872 |
T |
 |
Q |
158 |
agagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatga-t |
252 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| | |
|
|
T |
13376871 |
agagcacgattctcatcatctatgaacaattaatcaatt-actaaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattatgatt |
13376774 |
T |
 |
Q |
253 |
gaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
315 |
Q |
|
|
||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
13376773 |
gaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaaacttcactttagctccta |
13376711 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 27329924 - 27329757
Alignment:
Q |
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atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaac--ttctcatactttgaacatgtaat |
98 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||| |||| | | |
|
|
T |
27329924 |
atcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttc-acata-acccacttttcacatactttgatcatgaagt |
27329827 |
T |
 |
Q |
99 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatt |
169 |
Q |
|
|
| || ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
T |
27329826 |
ttcaccaacaacaattcaattat-cataacttcatatatacaaacatgtcatcataattggagcacgaatt |
27329757 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 274
Target Start/End: Original strand, 16656718 - 16656992
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Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | | || |
|
|
T |
16656718 |
catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattgatcaatttgagcata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacacgaagtttc |
16656816 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||| | ||||| || ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| | | |
|
|
T |
16656817 |
accaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actc |
16656915 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatta----caaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
16656916 |
aattaagcacttattcatac-aacaattgaaaattaacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16656992 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 274
Target Start/End: Original strand, 16645992 - 16646266
Alignment:
Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
16645992 |
catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattaatcaatttgagaataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttt |
16646090 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
|
|| |||| ||||| ||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| | | |
|
|
T |
16646091 |
accaacatcaattaaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actc |
16646189 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
16646190 |
aattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16646266 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 51627833 - 51627558
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Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
99 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |
|
|
T |
51627833 |
atcatgaatcttatcacaattcaacaacaccatatcataattcaaccaattgaacatattt-caacatataccattttctcatactttgaacatgaagtt |
51627735 |
T |
 |
Q |
100 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| ||| | || ||||| ||| || ||| ||||||||| | |||||| |||| | | ||||| ||| ||||||||| | |
|
|
T |
51627734 |
tcactaacaacaattcaatcatcaacaaattcatgcattcaagcatatcatcataattggagcacaaattctaacgattatgaacaaataatcaatt-ac |
51627636 |
T |
 |
Q |
200 |
ccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||| | || |||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
51627635 |
tcaattaagcacttattcatgc-aacaattgaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
51627558 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Original strand, 21860335 - 21860414
Alignment:
Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
21860335 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct |
21860414 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Original strand, 41218729 - 41218808
Alignment:
Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
|||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
41218729 |
tgatcatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct |
41218808 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Original strand, 41394528 - 41394607
Alignment:
Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
41394528 |
tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcactttagctcctatgattct |
41394607 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 44034902 - 44034823
Alignment:
Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
44034902 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctataattct |
44034823 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 35522488 - 35522432
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
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|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
35522488 |
atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
35522432 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22143451 - 22143256
Alignment:
Q |
80 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
179 |
Q |
|
|
||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| | || || |
|
|
T |
22143451 |
catactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcacaaatttcatgcatacaaacacatcatcatagttagagcacgaattttaacatcta |
22143352 |
T |
 |
Q |
180 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
T |
22143351 |
tgaacaattaatc-atttatccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattatgatgaattctaa-ccccttacctta |
22143256 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 37234027 - 37233750
Alignment:
Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| |||||||||||||| |||| |
|
|
T |
37234027 |
catgaatctcatcacaattcaaccacaacatagcataattcaacatttagagcataatt-caacatatatcactttcatatactttgaacatgcaatttt |
37233929 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| || |||||||||| | || ||| | |||||| ||| || | | |
|
|
T |
37233928 |
accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataactaaagcacgaattctaacaactattaacaattactcactt-actc |
37233830 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
278 |
Q |
|
|
|||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
37233829 |
aattaagcacttaataatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaatta |
37233750 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 274
Target Start/End: Original strand, 17609008 - 17609281
Alignment:
Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| || |||| ||||||| ||||||| |||| |||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| |||||||||||||| |||| |
|
|
T |
17609008 |
catgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcatatactttgaacatgcaatttc |
17609106 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
|
|| ||||||||| |||||||| || ||||| ||| ||| || ||||||||| ||||||||||||| | || ||||| ||| |||||| || | | |
|
|
T |
17609107 |
accaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcatcataattagagcacgaattctaacaactatgatcaactaatcactt-actc |
17609205 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
17609206 |
aattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta |
17609281 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Original strand, 19603279 - 19603449
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Q |
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aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaat |
204 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| | |||| |
|
|
T |
19603279 |
aacaacaaatcaattatcaccaatttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaattttaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaat |
19603377 |
T |
 |
Q |
205 |
taagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
T |
19603378 |
taagcacttattcatac-aataattgaaaatttgcactaaa-tgattatgatgaattctagcccccttacctta |
19603449 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 274
Target Start/End: Original strand, 21195104 - 21195368
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Q |
13 |
atcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaaca |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| ||||||| || || ||||| || ||| |||||| ||||||| |||| || ||||||| |
|
|
T |
21195104 |
atcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataatt-cacaatatatcattttcacatactatgaacatacaatttcaccaacaaca |
21195202 |
T |
 |
Q |
112 |
attcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcac |
211 |
Q |
|
|
||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||| || || ||||||||||| |
|
|
T |
21195203 |
attcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcactt-attcaattaagcac |
21195301 |
T |
 |
Q |
212 |
tt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|| | ||||||| ||| |||||||||| || ||||||||| |||| |||| |||||||||||| |
|
|
T |
21195302 |
ttaaacatacaacaaatgaaaaattacaactaaatgattatgattgaattctaaaccccttacctta |
21195368 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 15861603 - 15861547
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Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
15861603 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
15861547 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 21860089 - 21860145
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
21860089 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
21860145 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8538000 - 8537803
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Q |
80 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
179 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||| || | |
|
|
T |
8538000 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataatcaaagcacgaatttcaacaacca |
8537901 |
T |
 |
Q |
180 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||| | | ||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
8537900 |
tgaacgaataatcaatt-attcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaattctaactcccttacctta |
8537803 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8603239 - 8603042
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Q |
80 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
179 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||| || | |
|
|
T |
8603239 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataatcaaagcacgaatttcaacaacca |
8603140 |
T |
 |
Q |
180 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||| | | ||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
8603139 |
tgaacgaataatcaatt-attcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaattctaactcccttacctta |
8603042 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 44035148 - 44035092
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Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
44035148 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaaatgagcata |
44035092 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 49997371 - 49997174
Alignment:
Q |
80 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
179 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || |||||| || |||||| ||| ||||| ||| |||| ||||||| || | |
|
|
T |
49997371 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatatattcaaacatatcaccataactagggcacaaatttcaacaatca |
49997272 |
T |
 |
Q |
180 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatg-atgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||| ||| |||||| || || ||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
49997271 |
tgaacaaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgtttgaattctaacccccttacctta |
49997174 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 22367097 - 22367152
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
22367097 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcat-attcaccaattgagcata |
22367152 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0035 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:
Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 118132 - 117857
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
118132 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgaacatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
118033 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |
|
|
T |
118032 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcagc |
117933 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattg---aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
117932 |
caattaagcacttttcatac-aataattgaaaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
117857 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 109631 - 109356
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
109631 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacttagcataattcaccaatttatcatattttcaatatataccaatttctcatactttgaacatgtaattc |
109532 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |
|
|
T |
109531 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcagc |
109432 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattg---aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
109431 |
caattaagcacttttcatac-aataattgaaaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
109356 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0447 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:
Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 4651 - 4913
Alignment:
Q |
11 |
ttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaa |
109 |
Q |
|
|
||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
4651 |
ttatcacaattaaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaa |
4750 |
T |
 |
Q |
110 |
caattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagc |
209 |
Q |
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T |
4751 |
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4850 |
T |
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Q |
210 |
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274 |
Q |
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T |
4851 |
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4913 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 9265 - 9527
Alignment:
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109 |
Q |
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T |
9265 |
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9364 |
T |
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Q |
110 |
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209 |
Q |
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T |
9365 |
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9464 |
T |
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Q |
210 |
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274 |
Q |
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T |
9465 |
acttatcatacaaataattgaaaattac--aagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
9527 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0383 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:
Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Original strand, 7260 - 7522
Alignment:
Q |
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ttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaa |
109 |
Q |
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T |
7260 |
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7359 |
T |
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Q |
110 |
caattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagc |
209 |
Q |
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T |
7360 |
caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattcatccaattaagc |
7459 |
T |
 |
Q |
210 |
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274 |
Q |
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T |
7460 |
acttatcatacaaataattgaaaattac--aagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
7522 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0673 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:
Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 991 - 717
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Q |
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T |
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892 |
T |
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Q |
101 |
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200 |
Q |
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T |
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792 |
T |
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Q |
201 |
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274 |
Q |
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T |
791 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
717 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 7014 - 6749
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Q |
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98 |
Q |
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T |
7014 |
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6917 |
T |
 |
Q |
99 |
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198 |
Q |
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T |
6916 |
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6817 |
T |
 |
Q |
199 |
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265 |
Q |
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T |
6816 |
cccaattaagcactgatcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccc |
6749 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0396 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:
Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11877 - 11603
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Q |
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100 |
Q |
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T |
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11778 |
T |
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Q |
101 |
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200 |
Q |
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T |
11777 |
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11678 |
T |
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Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
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T |
11677 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttagctta |
11603 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 41)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 20561800 - 20561526
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Q |
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atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
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Q |
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T |
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T |
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Q |
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200 |
Q |
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T |
20561700 |
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20561601 |
T |
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Q |
201 |
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274 |
Q |
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T |
20561600 |
caattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
20561526 |
T |
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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 20573361 - 20573087
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100 |
Q |
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T |
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T |
 |
Q |
101 |
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200 |
Q |
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T |
20573261 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacc |
20573162 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
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|
T |
20573161 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
20573087 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 37611746 - 37612020
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Q |
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Q |
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|
T |
37611746 |
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37611844 |
T |
 |
Q |
99 |
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198 |
Q |
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T |
37611845 |
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37611943 |
T |
 |
Q |
199 |
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274 |
Q |
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|
T |
37611944 |
tctaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattataataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
37612020 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22234972 - 22234700
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Q |
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atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacatgtaat |
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Q |
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|
T |
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T |
 |
Q |
99 |
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198 |
Q |
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T |
22234874 |
tcaactaaca-caattaaattattcataacttcatacatctaaacacgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca |
22234776 |
T |
 |
Q |
199 |
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274 |
Q |
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|
T |
22234775 |
ttcaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
22234700 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
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Q |
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atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
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Q |
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T |
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atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattaagcatattt-catcatatacccatttttcctacttttaacatgtaattc |
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T |
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Q |
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200 |
Q |
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T |
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41246934 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
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T |
41246935 |
caattaagcacttttcatacaactaattgaaaattacaataagtgattatgatgaactctaacccccttacctta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 20481683 - 20481955
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Q |
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atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
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T |
20481683 |
atcatgcaacttatcacaattcatcaacaacaaagtataattcaccaattgagcatattatcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattc |
20481782 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
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T |
20481783 |
aactaacaacaattcaattattcataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatccatgaacaaataatcaatt-atc |
20481881 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
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|
T |
20481882 |
caattaagcacttattcatac-attaattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattttaacccccttacctta |
20481955 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19993220 - 19992952
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Q |
4 |
atgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
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T |
19993220 |
atgaaatttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattt-tcatacactttgaacaagtaattca |
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T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
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T |
19993122 |
actaaca-caattcaattattcataacttcgtacatctaaacatgtcatcataattagagtacggatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatcc |
19993024 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
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|
T |
19993023 |
aattaagcacttttcatacaaataattg-aaattacaaaagtgattatgatgaattataacccccttacctta |
19992952 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 21681080 - 21681356
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Q |
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|
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T |
21681080 |
atcatgaaactaatcacaattcaacaacaacaaagcataatttaaccaattgagcatattttcaacatatacccttctctcatactttaaacatgaaatt |
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T |
 |
Q |
100 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
Q |
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T |
21681180 |
caactaacaataattcaattatccataaacttatacattcaaatatgtcatcataattagatcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattcaa |
21681279 |
T |
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Q |
200 |
ccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
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Q |
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|
| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
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|
T |
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caaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Original strand, 25122618 - 25122793
Alignment:
Q |
99 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
198 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
25122618 |
tcaactagcaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattggagcacgaatttgatcatttatgaacaattaatcaattca |
25122717 |
T |
 |
Q |
199 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
25122718 |
tccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattataataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
25122793 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 21198312 - 21198005
Alignment:
Q |
10 |
cttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaaca |
108 |
Q |
|
|
|||| |||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| || |||| |
|
|
T |
21198312 |
cttaccacaattcaacaacaacataacataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaaca |
21198214 |
T |
 |
Q |
109 |
acaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaag |
208 |
Q |
|
|
|||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||| |
|
|
T |
21198213 |
acaattcaattatctacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcatctatgaacaattaatcaatt-actcaattaag |
21198115 |
T |
 |
Q |
209 |
cactt-atcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcac |
304 |
Q |
|
|
||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| | | |||||| |
|
|
T |
21198114 |
cacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattataatgaattctaacccccttatcttaattatcaccaattcctagcccaagcttcac |
21198016 |
T |
 |
Q |
305 |
ttttgctccta |
315 |
Q |
|
|
||| ||||||| |
|
|
T |
21198015 |
tttagctccta |
21198005 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 20654074 - 20653944
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
20654074 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacttagcataattcaccaattaagcatattttcaatatataccaatttctcatactttgaacatgtaattc |
20653975 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttc |
131 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
20653974 |
aactaacaacaattcaattatccataacttc |
20653944 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 22981351 - 22981622
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
99 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
22981351 |
atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt-caacatataccactttctcatactttgaacatgaaatt |
22981449 |
T |
 |
Q |
100 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||| | |
|
|
T |
22981450 |
tctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattagagcacaaatttcat--catctgaacaattaatcaatt-ac |
22981546 |
T |
 |
Q |
200 |
ccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
22981547 |
ccaattaagcacttattcatacaa--aattgaaaaattgcaatatatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
22981622 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 283
Target Start/End: Original strand, 23837285 - 23837561
Alignment:
Q |
10 |
cttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaaca |
108 |
Q |
|
|
|||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| | ||||| |
|
|
T |
23837285 |
cttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatagtt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaataaca |
23837383 |
T |
 |
Q |
109 |
acaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaag |
208 |
Q |
|
|
|||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
T |
23837384 |
acaattcaattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatctatgaacaattaatc-atttactcaattaag |
23837482 |
T |
 |
Q |
209 |
cactta-tcatacaaataattgaaaat---tacaaaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatcacc |
283 |
Q |
|
|
|||||| |||||| || |||||||||| || ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
23837483 |
cacttattcatac-aacaattgaaaatctatattaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcacc |
23837561 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 39446935 - 39446660
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttct-catactttgaacatgtaat |
98 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||| |||||| ||| |
|
|
T |
39446935 |
atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaatttagcatattt-caacatataaca-cttcttcatactttaaacatgaaat |
39446838 |
T |
 |
Q |
99 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
198 |
Q |
|
|
|| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||| ||||| | || ||||| ||||||||||||| | |
|
|
T |
39446837 |
tccactaacaacaattcaattatccacaacttcaagcattcaaacatgtcatcataattggagcatgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
39446739 |
T |
 |
Q |
199 |
tccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||| ||| |||||| || |||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
39446738 |
ctcaattaagcatttattcatac-aacaattgaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
39446660 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 20647998 - 20647882
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
20647998 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattaaacataatttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaattc |
20647899 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaa |
117 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |
|
|
T |
20647898 |
aactaacaacaattcaa |
20647882 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 170 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 7000624 - 7000524
Alignment:
Q |
170 |
tcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaaccccctta |
269 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
7000624 |
tcatcacatatgaacaattaatcaattcatcctattaagcacttatcatacaaataattgaaaattaaaaaagtgattatgatgaaaactaaccccctta |
7000525 |
T |
 |
Q |
270 |
c |
270 |
Q |
|
|
| |
|
|
T |
7000524 |
c |
7000524 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 285
Target Start/End: Original strand, 17285341 - 17285570
Alignment:
Q |
60 |
ttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatag |
159 |
Q |
|
|
||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| ||||||||| | | |
|
|
T |
17285341 |
ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatcataattgg |
17285440 |
T |
 |
Q |
160 |
agcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatga-tg |
253 |
Q |
|
|
|||||||||| | || ||||| |||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||| || |
|
|
T |
17285441 |
agcacgaattctaacaattatgaacaattattcaatt-attcaattaagcacttaatcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgattg |
17285538 |
T |
 |
Q |
254 |
aacactaacccccttaccttaattatcaccaa |
285 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
17285539 |
aattctaacccccttaccttaattatcaccaa |
17285570 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16404931 - 16404852
Alignment:
Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
16404931 |
tgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct |
16404852 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24716793 - 24716714
Alignment:
Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
24716793 |
tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct |
24716714 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Original strand, 274767 - 274846
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Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
274767 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct |
274846 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 641082 - 641003
Alignment:
Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
641082 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct |
641003 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 826888 - 826809
Alignment:
Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
826888 |
tgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct |
826809 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 26011574 - 26011848
Alignment:
Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| || |||||||||||| ||||||| |||| |||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
26011574 |
catgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcacatactttgaacatgtaatttc |
26011672 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||| || | | |
|
|
T |
26011673 |
accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcactt-actc |
26011771 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
278 |
Q |
|
|
|||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
26011772 |
aattaaacacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaa---taacccccttaccttaatta |
26011848 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 20529839 - 20529748
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Q |
184 |
caattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
20529839 |
caattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattataacccccttacctta |
20529748 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 169
Target Start/End: Original strand, 38533729 - 38533895
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Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
38533729 |
catgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcataattcaataatttgagcatattt-caacatataccattttctcatactttgaacatgagatttc |
38533827 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatt |
169 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| | ||| ||||||| |
|
|
T |
38533828 |
tctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagtacgaatt |
38533895 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Original strand, 39115599 - 39115678
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Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
39115599 |
tgattatgatgaaaactaacacccttaccttaattattaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct |
39115678 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 5854694 - 5854971
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Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| || |||||||||||| ||||||| |||| || ||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| |||||||||||||| ||| |
|
|
T |
5854694 |
catgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaactcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcatatactttgaacatgctatttc |
5854792 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||| || | | |
|
|
T |
5854793 |
accaacaacaattcaattatcgccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcactt-actc |
5854891 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
278 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
5854892 |
aattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacctccttaccttaatta |
5854971 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 315
Target Start/End: Original strand, 33528607 - 33528819
Alignment:
Q |
105 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaat |
204 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| | || ||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||| | |||| || || || |||||||||| || || |||| |
|
|
T |
33528607 |
aacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacggaattcaacatctaagaacaattaatcactt-attcaat |
33528705 |
T |
 |
Q |
205 |
taagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaactt |
301 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||| || | |||||| ||||| |
|
|
T |
33528706 |
taagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagttagcacaaattcctagctcaaactt |
33528805 |
T |
 |
Q |
302 |
cacttttgctccta |
315 |
Q |
|
|
|||||| ||||||| |
|
|
T |
33528806 |
cactttagctccta |
33528819 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 15933378 - 15933655
Alignment:
Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| || |||| ||||||| ||||||| | || |||||| || || ||||||| || |||||| || || ||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
15933378 |
catgaatctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaacatttagagcataatt-caacatttaacactttcacatactttgaacatgcaatttc |
15933476 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||| | || ||||| |||||||||| || || |
|
|
T |
15933477 |
accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttaacaactatgaacaattaatcacttactc- |
15933575 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttacaa-aagtgattatgatg-aacactaacccccttaccttaatta |
278 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
15933576 |
aattaagcacttaatcatacaa-taattgaaaaattacactaaatgattatgatttaattctaacccccttaccttaatta |
15933655 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 29306497 - 29306776
Alignment:
Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| || |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || ||| || ||||||||||| || | |
|
|
T |
29306497 |
catgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcattttcacaaactttgaacatacaaattc |
29306595 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||| | | || ||||| |||| ||||| || || | |
|
|
T |
29306596 |
accaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattagaacatatcatcatagttagagcacgaatattaacatctatgaacaatcaatcactt-attc |
29306694 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccc-cttaccttaatta |
278 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
29306695 |
aattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccctcttaccttaatta |
29306776 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 274521 - 274577
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
274521 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgaacata |
274577 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 641328 - 641272
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
641328 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgaacata |
641272 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 827134 - 827078
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
827134 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgaacata |
827078 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 16039058 - 16039002
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
16039058 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcactaattgagcata |
16039002 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 41506986 - 41506930
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
41506986 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
41506930 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 278
Target Start/End: Original strand, 22742921 - 22743122
Alignment:
Q |
80 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
179 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||| ||||| | ||||||||||||| || || |
|
|
T |
22742921 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcactcaaacatatcaccataatcaaagcacgaatttcaacaacta |
22743020 |
T |
 |
Q |
180 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattat-gatgaacactaacccccttaccttaa |
275 |
Q |
|
|
||| ||| ||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| || ||||||| | |||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
22743021 |
tgaacaaataatcaatt-attcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacccccttaccttaa |
22743119 |
T |
 |
Q |
276 |
tta |
278 |
Q |
|
|
||| |
|
|
T |
22743120 |
tta |
22743122 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 38635731 - 38635541
Alignment:
Q |
87 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaa |
186 |
Q |
|
|
|||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||| |||| |||| |||||||||||||||| || ||||| ||| |
|
|
T |
38635731 |
tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgtattcaaacatatcatgataactagagcacgaatttcaacaactatgaacaa |
38635632 |
T |
 |
Q |
187 |
ttaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattat-gatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
| ||| || || ||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| || ||||||| | |||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
38635631 |
agattcactt-attcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatggttgaattctaacccccttacctta |
38635541 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 39115353 - 39115409
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
39115353 |
atcatgaaacatatcacgattcatcaacaactatgcataattcaccaattgagcata |
39115409 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 24717037 - 24716983
Alignment:
Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
24717037 |
catgaaacaaatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
24716983 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23151918 - 23151810
Alignment:
Q |
85 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgacc |
184 |
Q |
|
|
|||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| ||| || ||||||||| | || ||||||||| | || |||||| | |
|
|
T |
23151918 |
tttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcactagtttcatgcattcaaatatatcatcataattggaacacgaattttaacaaatatgaac |
23151819 |
T |
 |
Q |
185 |
aattaatca |
193 |
Q |
|
|
||||||||| |
|
|
T |
23151818 |
aattaatca |
23151810 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 31194253 - 31194217
Alignment:
Q |
238 |
aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
31194253 |
aaaaatgattatgatgaaaactaacccccttacctta |
31194217 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0068 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:
Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 48225 - 48496
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | || ||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
48225 |
atcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaaacataattcaccaattgagcatatttt-aacacatacccatttttcatactttgaacataaaattc |
48323 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
48324 |
aactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatc |
48423 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |
|
|
T |
48424 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgataaattctaa-ccccttacctta |
48496 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 61673 - 61944
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | || ||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
61673 |
atcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaaacataattcaccaattgagcatatttt-aacacatacccatttttcatactttgaacataaaattc |
61771 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
61772 |
aactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatc |
61871 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |
|
|
T |
61872 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgataaattctaa-ccccttacctta |
61944 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0338 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:
Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 274
Target Start/End: Original strand, 9069 - 9339
Alignment:
Q |
5 |
tgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaact |
104 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
9069 |
tgaaacttatcacaaatcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaact |
9168 |
T |
 |
Q |
105 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaat |
204 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
T |
9169 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaaaattaatcaattcactcaat |
9268 |
T |
 |
Q |
205 |
taagcacttatcatacaaataattg--aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | |||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
T |
9269 |
taagcacttttcatac-aataattgaaaaaattgcaataatgattatgataaattctaacccccttacctta |
9339 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0160 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:
Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 99 - 370
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
99 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaaccacgtagcataattcacgaattgagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgcaattc |
198 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | |
|
|
T |
199 |
aaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcat---tagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaattaattcacc |
295 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
296 |
caattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaagactaacccccttacctta |
370 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:
Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 253158 - 252903
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
253158 |
atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcatgattcaccaattgagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaaaatgtaattc |
253059 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| | |
|
|
T |
253058 |
aactaacaacaattcaattatccctaacttcatacatccaaacatgtcatcataatcaaagcacgaattttatcatttatgcacaattaatcaattcacc |
252959 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaa |
255 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
252958 |
caattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaa |
252903 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0190 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:
Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 10015 - 10289
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatact--ttgaacatgtaat |
98 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
10015 |
atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatatacc--cttttcatactctttgaacatgtaat |
10112 |
T |
 |
Q |
99 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
198 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
10113 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattca |
10212 |
T |
 |
Q |
199 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa-ttacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
10213 |
cccaattaagcacttttcatacaaagaattgaaaatttgcaataatgattattatgaattctaacccccttacctta |
10289 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0158 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:
Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 274
Target Start/End: Original strand, 25293 - 25563
Alignment:
Q |
5 |
tgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaact |
104 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| | ||||||| |
|
|
T |
25293 |
tgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaattgagcatattttcaacatatacccttttcctacacttgaaacatgaatttcaact |
25392 |
T |
 |
Q |
105 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaat |
204 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
25393 |
aacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatgtcatcataaatagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaat |
25492 |
T |
 |
Q |
205 |
taagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
25493 |
taagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaagactaacccccttacctta |
25563 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 175
Target Start/End: Original strand, 25040 - 25210
Alignment:
Q |
5 |
tgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaact |
104 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| | ||||||| |
|
|
T |
25040 |
tgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaattgagcatattttcaacatatacccttttcctacacttgaaacatgaatttcaact |
25139 |
T |
 |
Q |
105 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatca |
175 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
25140 |
aacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatgtcatcataaatagagcacaaatttcatca |
25210 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0037 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:
Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24897 - 24623
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
24897 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatatgttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattc |
24798 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| | |
|
|
T |
24797 |
aactaacaacaatttaattatcaataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatggacaattaatcaattcacc |
24698 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
24697 |
taattaagcacttttcatacaaataattgaaaatttcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
24623 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 95053 - 95109
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
95053 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcactaattgagcata |
95109 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0083 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:
Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 14952 - 15224
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacatgtaat |
98 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
14952 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattt-tcatacactttgaacatgtaat |
15049 |
T |
 |
Q |
99 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
198 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
15050 |
ctaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca |
15148 |
T |
 |
Q |
199 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
15149 |
tccaattaagcacttatcatacatataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
15224 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 32)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25876088 - 25875816
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacatgtaat |
98 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
25876088 |
atcatgaagcatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccattt-tcatacactttgaacatgtaat |
25875991 |
T |
 |
Q |
99 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
198 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
25875990 |
tcaactaacat-aattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca |
25875892 |
T |
 |
Q |
199 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
25875891 |
tccaattaaacacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
25875816 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 36890854 - 36890581
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
36890854 |
atcatgaaacttatcacaatttatcaacaacatagcataattcaccaattaagcatattttcaacatattccattttctcatactttgaacatgtaattc |
36890755 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |
|
|
T |
36890754 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgccatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacc |
36890655 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
36890654 |
caaataagcacttttcatac-cataattgaaaataacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
36890581 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23836874 - 23836601
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcat--actttgaacatgtaat |
98 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
23836874 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatatttttcacacataccca-ttttcatacactttgaacatgtaat |
23836776 |
T |
 |
Q |
99 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
198 |
Q |
|
|
|| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
23836775 |
tccactaac-acaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca |
23836677 |
T |
 |
Q |
199 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
23836676 |
tctaattaagcacttatcattcaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
23836601 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 271248 - 271521
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| | |||||||||||||||||| |
|
|
T |
271248 |
atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttcatacactttgaacatgtaattc |
271347 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| | |
|
|
T |
271348 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcttcatttatgaataattaatcaattcacc |
271447 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
271448 |
caattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
271521 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 4448302 - 4448028
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| | ||| | |||||||||||||||||| |
|
|
T |
4448302 |
atcatgaaacttatcataattcaacaacaacaaagcatcattcaccaattgaacatattttcaacacaaacccatttcatacactttgaacatgtaattc |
4448203 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
4448202 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcact |
4448103 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
4448102 |
caattaagcacttttcatataaataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
4448028 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 32465936 - 32466207
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | | || ||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
32465936 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaagaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatatccatttttcatactttgaacatacaattc |
32466034 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
32466035 |
aactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatt |
32466134 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||| |||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
32466135 |
caaataagcacttatcgtacaaataattaaaattttcaaaagtgattatgatgaagactaa-ccccttacctta |
32466207 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 25602102 - 25602377
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
25602102 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaaccacatagcataactcaccaattgagcatattttcaacatatatcaatttctcatactttgaacatgtaattc |
25602201 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |
|
|
T |
25602202 |
aaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcatccatgaacaattaatcaattcacc |
25602301 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
25602302 |
caattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
25602377 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 28974127 - 28974400
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
28974127 |
atcatgaaacttaccacaattcatcaacaacatagcataattcgccaaatgagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgtaattc |
28974226 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
|| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |
|
|
T |
28974227 |
aattaacaacaattctattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacc |
28974326 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
28974327 |
aaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgaaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
28974400 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 34 - 274
Target Start/End: Original strand, 27261915 - 27262156
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Q |
34 |
agcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcat |
133 |
Q |
|
|
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T |
27261915 |
agcataattcaccaat-gagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaattgaactaacaacaattcaattatccataactttat |
27262013 |
T |
 |
Q |
134 |
acatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aa |
231 |
Q |
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||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |
|
|
T |
27262014 |
acatccaaacatgtcatcataattagggcacaaatttcatcatccatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttattcatac-aataattgaaa |
27262112 |
T |
 |
Q |
232 |
aattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||| ||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
27262113 |
aattgcaataaatgattatgatgaattctaactcccttacctta |
27262156 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24571461 - 24571188
Alignment:
Q |
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99 |
Q |
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|||||||| |||| |||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||| |
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T |
24571461 |
atcatgaatcttaacacaattcaacaaaaacatagcataattcaaccaattgagcatattt-caacatatatcattttctcataccttgaacatgaaatt |
24571363 |
T |
 |
Q |
100 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |
|
|
T |
24571362 |
tctctaacaacaattcaagtatccacaacttcatgcattcaaacgtgtcatcaaaattagagcacgaatttcatcatctatgaacaattaatcaatt-ac |
24571264 |
T |
 |
Q |
200 |
ccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaa-attacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
T |
24571263 |
ccaattaagcatttattcatac-aataattgaaacattgcaataatgattatgatgaattctaaccccctaacctta |
24571188 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22580028 - 22579758
Alignment:
Q |
1 |
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98 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||| ||| | | |
|
|
T |
22580028 |
atcatgaaacttatcacaattcaa---caacaaagcataattcaaccaattgagcatattt-caacatataacatttttctcataccttgatcataaagt |
22579933 |
T |
 |
Q |
99 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
198 |
Q |
|
|
| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| | |
|
|
T |
22579932 |
ttcaccaacaacaattcaattatc-ataacttcatacatacaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
22579835 |
T |
 |
Q |
199 |
tccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
22579834 |
cacaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaatagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
22579758 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 68072 - 68351
Alignment:
Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
68072 |
catgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttc |
68170 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| | || ||||| ||||||||| ||| || |
|
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T |
68171 |
accaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatctattactc- |
68269 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcacttat-catacaaataattgaaaatt---ac-aaaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaattat |
279 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
68270 |
aattaagcacttattcatacaac-aattgaaaatttatactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttat |
68351 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Original strand, 22284279 - 22284358
Alignment:
Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
22284279 |
tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
22284358 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 19794660 - 19794581
Alignment:
Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
19794660 |
tgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcttatgattct |
19794581 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 315
Target Start/End: Original strand, 43645980 - 43646289
Alignment:
Q |
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cttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaaca |
108 |
Q |
|
|
|||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||| || |||| |
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|
T |
43645980 |
cttaccacagttcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttaaacatgaaatttcaccaaca |
43646078 |
T |
 |
Q |
109 |
acaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaag |
208 |
Q |
|
|
||||| |||||||| | |||||||| ||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||| | || | ||| ||||||||| ||| | ||||||| |
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|
T |
43646079 |
acaatccaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcaacataattagagcacgaattataacaactttgaacaattaatc-atttactcaattaaa |
43646177 |
T |
 |
Q |
209 |
cactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttca |
303 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| | | |||| |||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| | | ||||| |
|
|
T |
43646178 |
cacttattcatacaacaattggaaatttacactaaaaatgattatgactgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttca |
43646277 |
T |
 |
Q |
304 |
cttttgctccta |
315 |
Q |
|
|
|||| ||||||| |
|
|
T |
43646278 |
ctttagctccta |
43646289 |
T |
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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 31146340 - 31146073
Alignment:
Q |
10 |
cttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaaca |
108 |
Q |
|
|
||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
T |
31146340 |
cttattacaattcaacaaca-catagcataattcaacaatttgagcatattt-caacatatatcactttctcatactttgaacataaaatttctctaaca |
31146243 |
T |
 |
Q |
109 |
acaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaag |
208 |
Q |
|
|
|||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| | || |||||||| | || |||| ||||||||||||| | || ||||| |
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|
T |
31146242 |
acaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataccatcataattggaacacgaattctaacaattatggacaattaatcaatt-actcagttaag |
31146144 |
T |
 |
Q |
209 |
cactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaag-tgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
31146143 |
cacttattcatacaacaatttgaaaatttacacaaaagatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
31146073 |
T |
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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 20627269 - 20627190
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Q |
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tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
|||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
20627269 |
tgattatgataaagactaaccccgttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct |
20627190 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Original strand, 22275046 - 22275125
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Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
22275046 |
tgattatgataaaggctaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct |
22275125 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 240 - 322
Target Start/End: Original strand, 15633535 - 15633617
Alignment:
Q |
240 |
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322 |
Q |
|
|
||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
15633535 |
aagtgattatgataaagactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttttgctcctatgattct |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 43642912 - 43642833
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Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
|||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
43642912 |
tgattatgataaagactaacctccttcccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct |
43642833 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
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Target Start/End: Original strand, 19666685 - 19666921
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Q |
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catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
179 |
Q |
|
|
||||||||||||||| || | || || ||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||| ||| ||||||| |||||| | || || |
|
|
T |
19666685 |
catactttgaacatgcaaattcaccaaaaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcattatagttagagcatgaattttaacaacta |
19666784 |
T |
 |
Q |
180 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaa-ttacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaat |
276 |
Q |
|
|
||| |||||||||| || || |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
19666785 |
tgaacaattaatcactt-attcaattaagcatttattcatacaa-taattgaaaaattacactaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaat |
19666882 |
T |
 |
Q |
277 |
tatcaccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
315 |
Q |
|
|
|| ||| || | |||| | ||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
19666883 |
tagcacaaattcctagcccaaacttcactttagctccta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 315
Target Start/End: Original strand, 19660037 - 19660273
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Q |
80 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
179 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| |||| || ||||| |||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||| |||| || || |
|
|
T |
19660037 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaataattcaattatcaccaatttcatgtatacgaacatatcatcataattagagcacgaaattcaacatcta |
19660136 |
T |
 |
Q |
180 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaat |
276 |
Q |
|
|
|| ||| |||||| || |||| |||| |||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
T |
19660137 |
agaacaaataatcacttattcca-ttaaacacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaagtgattatgatgaattctaacccc-ttaccttaat |
19660234 |
T |
 |
Q |
277 |
tatcaccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
315 |
Q |
|
|
||||||||| | |||| | | ||||||||| ||||||| |
|
|
T |
19660235 |
tatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta |
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T |
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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
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Q |
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101 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| || || | || ||||||||| | ||||||||||||||||||| | || |
|
|
T |
22775372 |
catgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattcataaatttgaacacaatt-caacatatataactttctcatactttgaacatgaagtttc |
22775274 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatt |
169 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||| | | |||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| |
|
|
T |
22775273 |
accaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
22775206 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 169
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Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| || || | || ||||||||| | ||||||||||||||||||| | || |
|
|
T |
22780750 |
catgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattcataaatttgaacacaatt-caacatatataactttctcatactttgaacatgaagtttc |
22780652 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatt |
169 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||| | | |||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| |
|
|
T |
22780651 |
accaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
22780584 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
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taattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaa |
194 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||||||| | |||||| | ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||| |
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T |
23821714 |
taattcaatcaacaacaattcaattatcaacaacttcctgcattcaaacataacatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcac |
23821615 |
T |
 |
Q |
195 |
ttcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|| | ||||||||||||| | ||| | |||||||| ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
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|
T |
23821614 |
tt-actcaattaagcacttaagcatgc-aataattgaaaaattacactaaatgattataatgaaatctaacccccttacctta |
23821534 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
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Target Start/End: Complemental strand, 23830793 - 23830613
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Q |
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taattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaa |
194 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||||||| | |||||| | ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||| |
|
|
T |
23830793 |
taattcaatcaacaacaattcaattatcaacaacttcctgcattcaaacataacatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcac |
23830694 |
T |
 |
Q |
195 |
ttcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|| | ||||||||||||| | ||| | |||||||| ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
23830693 |
tt-actcaattaagcacttaagcatgc-aataattgaaaaattacactaaatgattataatgaaatctaacccccttacctta |
23830613 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19669199 - 19669003
Alignment:
Q |
80 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
179 |
Q |
|
|
||||||| ||||||| |||| || |||||||| ||||||||| || ||||| ||| |||||| ||| |||| ||||||| | |||| | || || |
|
|
T |
19669199 |
catacttagaacatgcaatttcaccaacaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcaccatagttagagcatggattttaacatcta |
19669100 |
T |
 |
Q |
180 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaa-ttaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||| |||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
T |
19669099 |
tgaacaattaatcattt-atccaattaatcacttattcatacaa-taattgaaaaattacactaaaatgattatgatgaattctaaccccgttacctta |
19669003 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 6879515 - 6879577
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttca |
63 |
Q |
|
|
||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
6879515 |
atcattaaacatatcacaattcatcaataacaatgcataattcaccaattgagtatattttca |
6879577 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 22274800 - 22274856
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
22274800 |
atcatgaaacacatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
22274856 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 22284033 - 22284089
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
22284033 |
atcatgaaacacatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
22284089 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 9636835 - 9636944
Alignment:
Q |
13 |
atcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaaca |
111 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| ||||||| || || ||||| || ||| |||||| |||||||| |||| || ||||||| |
|
|
T |
9636835 |
atcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcataatt-cacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaaca |
9636933 |
T |
 |
Q |
112 |
attcaattatc |
122 |
Q |
|
|
||||||||||| |
|
|
T |
9636934 |
attcaattatc |
9636944 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 21274226 - 21274174
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgag |
53 |
Q |
|
|
|||||||||| ||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
21274226 |
atcatgaaacatattacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag |
21274174 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:
Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 60884 - 61159
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||| | || |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
60884 |
atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattaagtatatttttaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattc |
60983 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |
|
|
T |
60984 |
aaccaacaacaattcaattattcataacatcatacatctaaacatgttatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacc |
61083 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
61084 |
caattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
61159 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 70791 - 70552
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
70791 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacctacttttcatactttgaacatgtaattc |
70692 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatcca-taacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
Q |
|
|
||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |
|
|
T |
70691 |
aactaacaataaatcaattattcattaacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaactcat |
70592 |
T |
 |
Q |
200 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa |
239 |
Q |
|
|
|||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
70591 |
ccaaataagcacttttcttacaaataattgaaaattacaa |
70552 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 135 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 79925 - 79785
Alignment:
Q |
135 |
catctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaat |
234 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
79925 |
catctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaat |
79826 |
T |
 |
Q |
235 |
tacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||| |
|
|
T |
79825 |
tacaatgagtgattatgatcaattctaacccccttagctta |
79785 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0117 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:
Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11737 - 11464
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
11737 |
atcatgaaactgatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattaagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattc |
11638 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
11637 |
aatcaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca-a |
11539 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
T |
11538 |
caattaaacacttttcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccatacctta |
11464 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:
Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 112714 - 112441
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
112714 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaaccacatagcataattcactaattgagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaattc |
112615 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |
|
|
T |
112614 |
aactaacaacaattcaattgttcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacc |
112515 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||| |||| |||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
112514 |
caaataagtacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
112441 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 103081 - 102815
Alignment:
Q |
11 |
ttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaa-ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaa |
109 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
T |
103081 |
ttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaaatttagcatattc-caccatataccactttctcatactttgaacatgaaatttcactaacaa |
102983 |
T |
 |
Q |
110 |
caattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagc |
209 |
Q |
|
|
||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||| | ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
T |
102982 |
caattcaattatcaaaaacttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagc |
102884 |
T |
 |
Q |
210 |
actta-tcatacaaataattgaaaa-ttac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||| |||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
T |
102883 |
acttattcatac-aacaattgaaaatttacacaaaaaatgattatgatgaattataaaccccttacctta |
102815 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 109668 - 109821
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
99 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |
|
|
T |
109668 |
atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcaaaattcaacaatttgagcatattt-caacatataccactttctcatactttaaacatgaaatt |
109766 |
T |
 |
Q |
100 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcata |
154 |
Q |
|
|
| ||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||| |||||||| |
|
|
T |
109767 |
tcattaacaacaattcaattatcaacaacttcatggattcaaacatatcatcata |
109821 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:
Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 85410 - 85683
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
85410 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacctagcataattcaccaattaagcatattttcaatatataccaatttctcatactttgaacatgtaattc |
85509 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | |
|
|
T |
85510 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttataaacaattaatcaattcacc |
85609 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
85610 |
caattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
85683 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 159377 - 159651
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
99 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
159377 |
atcatgaaacttatcacaattcaacatcaacatagcataattcaaccaattgagcataatttcaactcatatcattttctcatactttgaacatgaaatt |
159476 |
T |
 |
Q |
100 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
Q |
|
|
|||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
159477 |
caactaacaacaatgccattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcac |
159576 |
T |
 |
Q |
200 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||||| || ||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
159577 |
ccaattaagcacttttcgtac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
159651 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0359 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:
Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11823 - 11548
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacatgtaat |
98 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
11823 |
atcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaatgcataattcactaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcatacactttgaacatgtaat |
11725 |
T |
 |
Q |
99 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
198 |
Q |
|
|
||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
11724 |
tcaaccaagaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattca |
11625 |
T |
 |
Q |
199 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
11624 |
tccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
11548 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 1395 - 1667
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
1395 |
atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattaagcatattttcatcacatacccatttttcatactttgaacatgtaattc |
1494 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
1495 |
aaccaccaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcatgattagagcacgaatttcatcatttatacacaattaatcaattcatt |
1594 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
T |
1595 |
caattaaccacttttcatacaaataattg--aattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttgcctta |
1667 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:
Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 132419 - 132144
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
132419 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacgatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatataattc |
132320 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |
|
|
T |
132319 |
aacaaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacc |
132220 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
T |
132219 |
caattaagcacttttcatagaaataattgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattccaacccccttacctta |
132144 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 88353 - 88631
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
88353 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgatcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattc |
88452 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |
|
|
T |
88453 |
aactaacaacattttaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacgaatttcatcatttatggacaattaatcaattcacc |
88552 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaatta |
278 |
Q |
|
|
||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
88553 |
caattaaacacttttcatacaaataattgaaaatagcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctttatta |
88631 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 11765 - 12041
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
99 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
11765 |
atcatgaaacttatcacaattctacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatgttttcaactcatatctttttctcatactttgaacatgaaatt |
11864 |
T |
 |
Q |
100 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| | |
|
|
T |
11865 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacattgaaacatgtcatcataattagagcacgaaattcatcatttatgaacaattaatcaattgac |
11964 |
T |
 |
Q |
200 |
ccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaat--tacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
T |
11965 |
ccaattaagcacttattcatac-aataattgaaattgcaccaaaaatgattatgatgaattctaaccaccttacctta |
12041 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 46 - 274
Target Start/End: Original strand, 16022 - 16253
Alignment:
Q |
46 |
caattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacat |
145 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
16022 |
caatggagcatattttcaactcatatcattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacat |
16121 |
T |
 |
Q |
146 |
gtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatg-accaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaat--tacaaaa |
241 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||| |
|
|
T |
16122 |
gtcatcataattagagcacggatttcatcatttatgaacaaattaatcaattcacccaattaagcacttgttcatac-aataattgaaattgcaccaaaa |
16220 |
T |
 |
Q |
242 |
gtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
16221 |
atgattatgatgaattctaacccccttacctta |
16253 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 46 - 274
Target Start/End: Original strand, 25553 - 25784
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Q |
46 |
caattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacat |
145 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
25553 |
caatggagcatattttcaactcatatcattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattaaaacat |
25652 |
T |
 |
Q |
146 |
gtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatg-accaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaat--tacaaaa |
241 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||| |
|
|
T |
25653 |
gtcatcataattagagcacggatttcatcatttatgaacaaattaatcaattcacccaattaagcacttgttcatac-aataattgaaattgcaccaaaa |
25751 |
T |
 |
Q |
242 |
gtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
25752 |
atgattatgatgaattctaacccccttacctta |
25784 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1867 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:
Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 222 - 496
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Q |
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atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| | ||| |
|
|
T |
222 |
atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatatacccttttcatacacttgaaacatgaatttc |
321 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |
|
|
T |
322 |
aaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacc |
421 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
T |
422 |
caattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgattaattctaacccccttacctta |
496 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0740 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0740
Description:
Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 4363 - 4635
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacatgtaat |
98 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| | || |||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
4363 |
atcataaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgaacatattttca-cacatacccattt-tcatacactttgaacatgtaat |
4460 |
T |
 |
Q |
99 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
198 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
4461 |
tcaactaaca-caattcaattattcataatttgatacatctaaacatgtcattataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca |
4559 |
T |
 |
Q |
199 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
4560 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaacgtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
4635 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0480 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:
Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5415 - 5143
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Q |
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atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacatgtaat |
98 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
5415 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcctaattcaccaattgagcatattttcg-cacatacctattt-tcatacactttgaacatgtaat |
5318 |
T |
 |
Q |
99 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
198 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
5317 |
tcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatctcatcataataagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca |
5219 |
T |
 |
Q |
199 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
5218 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattagaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
5143 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9051 - 8776
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Q |
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atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
99 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
9051 |
atcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatatat-caacatatatcattttctcatactttgaacatgaaatt |
8953 |
T |
 |
Q |
100 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
8952 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattttc |
8853 |
T |
 |
Q |
200 |
ccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaat--tacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
8852 |
ccaattaagcacttattcatac-aataattgaaattgcaccaaaaatgattatgatgaactctaacccccttacctta |
8776 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0075 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:
Target: scaffold0075; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 5019 - 5231
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Q |
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atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
5019 |
atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaatcataattcaccaattaagcatattttcaacatataccaacttctcatactgtgaacatgtaattc |
5118 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||| | |
|
|
T |
5119 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaattaattcacc |
5218 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcactt |
213 |
Q |
|
|
||||||||||||| |
|
|
T |
5219 |
caattaagcactt |
5231 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 6)
Name: scaffold0016
Description:
Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 164293 - 164565
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Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacatgtaat |
98 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| | || |||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
164293 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatatcttca-cacatacccattt-tcatacactttgaacatgtaat |
164390 |
T |
 |
Q |
99 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
198 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
164391 |
tcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcacttatgaaaaattaatcaattca |
164489 |
T |
 |
Q |
199 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
164490 |
tccaattaagcacttaccatacaattaattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
164565 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 243 - 322
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Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
166195 |
tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct |
166116 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016; HSP #3
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Query Start/End: Original strand, 243 - 316
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Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctat |
316 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
162109 |
tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016; HSP #4
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Q |
59 |
tttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaata |
158 |
Q |
|
|
|||||||||||| || ||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||| | || ||||| | | |||||| |||||||| | |
|
|
T |
116664 |
tttcaacatatatcattttctcatactttgaacatgaaaacccac-----acaattcaattatcaacaatttcatgccttcaaacataacatcataattg |
116570 |
T |
 |
Q |
159 |
gagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaattaca---aaagtgattatgatga |
254 |
Q |
|
|
||||||||||| | || ||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||||| ||| |||||||||||| |
|
|
T |
116569 |
gagcacgaattctaacaattatgagcaattaat-aatttactcaattaagcacttattcatacaaccattcaaaatttacactaaaaatgattatgatga |
116471 |
T |
 |
Q |
255 |
acactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
315 |
Q |
|
|
| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| | | ||||||||| ||||||| |
|
|
T |
116470 |
aatctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta |
116410 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016; HSP #5
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|
|
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0016; HSP #6
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Q |
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Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0240 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:
Target: scaffold0240; HSP #1
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Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
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|||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||| |
|
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T |
7647 |
atcatgaaacttatcataatttatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcatcatatacccatttttcatactttgaacatgtaattc |
7746 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacat-gtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
Q |
|
|
||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
7747 |
aaccaacaacaattcaattatttataacttcatacatctaaacataggcatcataattagatcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcat |
7846 |
T |
 |
Q |
200 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
7847 |
ccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtaattatgatgaattctaacccccttacctta |
7922 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:
Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 38376 - 38650
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
T |
38376 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcgccaattgagcatattttcaacatatacccatttctcttcctttgaacatgtaattc |
38475 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||| | |
|
|
T |
38476 |
aaccaacaaaaattcaattattcataaattcataaatctaaacatgtcatcataattagagcgcgtatttcatcatttatgaacaattaattaattcacc |
38575 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
38576 |
caattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
38650 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:
Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 254983 - 254710
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacatgtaat |
98 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
254983 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcatacactttgaacatgtaat |
254885 |
T |
 |
Q |
99 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
198 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
254884 |
tcaacta-caacaattcaattattcataacttcatacatctaagcatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattca |
254786 |
T |
 |
Q |
199 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
T |
254785 |
tccaattaaacacttatcatacaaataattg-aaattacaataagtgattatgatgaattatatcccccttacctta |
254710 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 261589 - 261316
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatac--tttgaacatgtaat |
98 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
261589 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattt-tcatacactttgaacatgtaat |
261491 |
T |
 |
Q |
99 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
198 |
Q |
|
|
||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
261490 |
tcaacta-ctacaattcaattattcataacttcatacatctaagcatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattca |
261392 |
T |
 |
Q |
199 |
tccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
T |
261391 |
tccaattaaacacttatcatacaaataattg-aaattacaataagtgattatgatgaattatatcccccttacctta |
261316 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0103 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:
Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 33740 - 34014
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
33740 |
atcatgaaacttatcaaaattcatcaacaacatagcataattcaccaattaaacataatttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgtaattc |
33839 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |
|
|
T |
33840 |
aactaacaacaattcaattatctataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttacgaacaattaatcaattcatc |
33939 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
T |
33940 |
caattaagcacttaatcatac-agtaattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaatccccttacctta |
34014 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:
Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 70691 - 70964
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
99 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
70691 |
atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaaccaattaagcatattttcaacatattccattttctcatactttgaacatg-aatt |
70789 |
T |
 |
Q |
100 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||| |||||| |
|
|
T |
70790 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttataaactattaattaattcac |
70889 |
T |
 |
Q |
200 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
70890 |
ccaattaagcacttttcatac-aataactgaaaattacaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
70964 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 31122 - 31352
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataa-ttcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
99 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |
|
|
T |
31122 |
atcatgaaacttatcacaattcaacaactacaaa-cataacttaacaaattgagcatattttcaacatataccattttcttatactttgaacatg-aatt |
31219 |
T |
 |
Q |
100 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| |
|
|
T |
31220 |
caactaaccacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaaataatcaattcac |
31319 |
T |
 |
Q |
200 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaa |
233 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
31320 |
ccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaa |
31352 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 97365 - 97088
Alignment:
Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| || |||| ||||||| | ||||| ||||||||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
97365 |
catgaatctcatcataattcaacaccaacatagcataattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcacatactttgaacatgcaattcc |
97267 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||| || || || ||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | | || ||||| |||||||||| | || | |
|
|
T |
97266 |
accaacaacaattcaattatcaccaattttatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatcttaacaactatgaacaattaatcact-cactc |
97168 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcactta-tcatacaaataattgaaaa-ttacaa-aagtgattatgat-gaacactaacccccttaccttaatta |
278 |
Q |
|
|
|||||| |||| | |||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
97167 |
aattaaacactaaatcatacaa-taattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttcatta |
97088 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:
Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 21590 - 21862
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
21590 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgtaattc |
21689 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |
|
|
T |
21690 |
aactaacaacaatccaattat-cataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcgcc |
21788 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||| || |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
21789 |
caattaagcctttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattataacccccttacctta |
21862 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Original strand, 31292 - 31561
Alignment:
Q |
4 |
atgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaac |
103 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
31292 |
atgaaacttatcacaattcatcaacaacatagtataatttaccaattgagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatttaattcaac |
31391 |
T |
 |
Q |
104 |
taacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaa |
203 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
T |
31392 |
taacaacaatccaattat-cataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagatcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcgcccaa |
31490 |
T |
 |
Q |
204 |
ttaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
31491 |
ttaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
31561 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 47554 - 47445
Alignment:
Q |
165 |
gaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacc |
263 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
47554 |
gaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcgcccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacc |
47456 |
T |
 |
Q |
264 |
cccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||| |
|
|
T |
47455 |
cccttacctta |
47445 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0610 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:
Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 745 - 471
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattc |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
745 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaaatgagcatattttcaacatataccattttctcatactttgaacatgtaattc |
646 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatc |
200 |
Q |
|
|
|| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |
|
|
T |
645 |
aattaacaacaattctattatccataatttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacc |
546 |
T |
 |
Q |
201 |
caattaagcactta-tcatacaaataattgaaaatta-caa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
545 |
caattaagcacttattcatac-aataattgaaaaatagcaataaatga-tatgatgaattctaacccccttacctta |
471 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0554 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:
Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 1994 - 2263
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
99 |
Q |
|
|
|||||||| ||||| |||| |||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
1994 |
atcatgaatcttataacaaatcaacaaca-catagcataattcaaccaattgagcatattttcatcatataccattttcgcatactttgaacatgaaatt |
2092 |
T |
 |
Q |
100 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
2093 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgagcaattaatcaattcac |
2192 |
T |
 |
Q |
200 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattg-aaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttac |
270 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
2193 |
ccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataatgattatgatgaattctaacccccttac |
2263 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0876 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:
Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 150 - 320
Target Start/End: Original strand, 1 - 171
Alignment:
Q |
150 |
tcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattat |
249 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
1 |
tcataaatagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaaaagtgattat |
100 |
T |
 |
Q |
250 |
gatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgatt |
320 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
101 |
gatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctccaatgatt |
171 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:
Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 46243 - 46521
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca--tactttgaacatgtaat |
98 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| |||||||| |||| | | |
|
|
T |
46243 |
atcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttca-cata-acccacttttcacatactttgatcatgaagt |
46340 |
T |
 |
Q |
99 |
t-caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattc |
197 |
Q |
|
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
46341 |
ttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcaaaattagagtacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattc |
46440 |
T |
 |
Q |
198 |
atccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaatta |
278 |
Q |
|
|
| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
46441 |
acccaattaagcacttttcatac-aataattaaaaattgcaataaatgattatgatgaattataaccctcttaccttaatta |
46521 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
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Target Start/End: Original strand, 40736 - 41010
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Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctca--tactttgaacatgtaat |
98 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| |||||||| |||| | | |
|
|
T |
40736 |
atcatgaaacttatcacaatgtaacaacaatatagcataattcaccaattgagcatattttca-cata-acccacttttcacatactttgatcatgaagt |
40833 |
T |
 |
Q |
99 |
t-caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattc |
197 |
Q |
|
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
40834 |
ttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattc |
40933 |
T |
 |
Q |
198 |
atccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
40934 |
acccaattaagcactattcatac-aataattaaaaattgcaataaatgattatgatgaattataacccccttacctta |
41010 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034; HSP #3
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Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Original strand, 80188 - 80267
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Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
80188 |
tgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct |
80267 |
T |
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Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 79942 - 79998
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Q |
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atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
79942 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcata |
79998 |
T |
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Target: scaffold0816 (Bit Score: 124; Significance: 9e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0816
Description:
Target: scaffold0816; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
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Target Start/End: Complemental strand, 3112 - 2961
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Q |
123 |
cataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaa |
222 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
3112 |
cataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcatttatcatacaa |
3013 |
T |
 |
Q |
223 |
ataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
3012 |
ataattgaaaattacaaaagtgattatgatgaattctaacccccttacctta |
2961 |
T |
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Target: scaffold0342 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0342
Description:
Target: scaffold0342; HSP #1
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Q |
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ttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaactt-ctcatactttgaacatgtaattcaactaaca |
108 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||| |
|
|
T |
6028 |
ttatcacaattcaacaaccacatagcataatttaaccaattgagcatattttcaacatataccatttttctcatactttgaacatgaaattctaccaaca |
6127 |
T |
 |
Q |
109 |
acaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaag |
208 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
T |
6128 |
acaatccaattatccataacttcatacattcaaacatgtcgtcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcaccaaattaag |
6227 |
T |
 |
Q |
209 |
cacttatcatacaaataattgaaaa |
233 |
Q |
|
|
||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
6228 |
cacttttcatac-aataattgaaaa |
6251 |
T |
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Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
|||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
383 |
tgattatgataaagaataaccccgttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatgattct |
304 |
T |
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Target: scaffold0342; HSP #3
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Query Start/End: Original strand, 1 - 57
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Q |
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atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
628 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
572 |
T |
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Target: scaffold0025 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:
Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
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100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
146679 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacctagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattc |
146778 |
T |
 |
Q |
101 |
aactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaattt |
170 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |
|
|
T |
146779 |
aactaacaacagttcaattatacataacttcatacatctaaacatgtcatcataattaaagcatgaattt |
146848 |
T |
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Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
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Target Start/End: Original strand, 53426 - 53703
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3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| || ||||||||||| ||||| | ||||||||| | || || ||||||| || ||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
53426 |
catgaatctcatcacaattcatcaacaaaatagcataattgaacatttagagcataatt-caacatataacaccttcacatactttgaacatgcaatttc |
53524 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||| || |||| ||| |||||| ||||||| | ||||||| ||||| | || ||||| |||||||||| || | | |
|
|
T |
53525 |
accaacaacaattcaattatcaccaatatcatgcattcaaacatatcatcattattagagcatgaattctaacaactatgaacaattaatcactt-actc |
53623 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
278 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
53624 |
aattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaatta |
53703 |
T |
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Target: scaffold0025; HSP #3
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Target Start/End: Original strand, 85690 - 85818
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Q |
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catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
179 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || || |
|
|
T |
85690 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcat-taaacatatcatcataattagagcacgaatttcaacaacta |
85788 |
T |
 |
Q |
180 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagca |
210 |
Q |
|
|
||| |||||||||| || || |||||||||| |
|
|
T |
85789 |
tgaacaattaatcactt-attcaattaagca |
85818 |
T |
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Target: scaffold0095 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:
Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
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Target Start/End: Complemental strand, 33897 - 33622
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Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattca-ccaattgagcatattttcaacatataccaacttct-catactttgaacatgtaat |
98 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||| |||||| ||| |
|
|
T |
33897 |
atcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaatttagcatattt-caacatataaca-cttcttcatactttaaacatgaaat |
33800 |
T |
 |
Q |
99 |
tcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattca |
198 |
Q |
|
|
|| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||| ||||| | || ||||| ||||||||||||| | |
|
|
T |
33799 |
tccactaacaacaattcaattatccacaacttcaagcattcaaacatgtcatcataattggagcatgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-a |
33701 |
T |
 |
Q |
199 |
tccaattaagcactta-tcatacaaataattgaaaattac---aaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||| ||| |||||| || |||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
33700 |
ctcaattaagcatttattcatac-aacaattgaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
33622 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0092 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
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Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
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Target Start/End: Original strand, 3397 - 3671
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Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattc-accaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaatt |
99 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
3397 |
atcatgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattggaccaattgagcatattttca-catataccactttctcatactttgaacattaaatt |
3495 |
T |
 |
Q |
100 |
caactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcat |
199 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| | |
|
|
T |
3496 |
tctctaacaacaattcaattataaataacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-ac |
3594 |
T |
 |
Q |
200 |
ccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
3595 |
tcaattaagcacttattcatac-aataattgtaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
3671 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0053 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
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Target: scaffold0053; HSP #1
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Q |
15 |
cacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaat |
113 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |
|
|
T |
77002 |
cacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgaacataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaat |
76904 |
T |
 |
Q |
114 |
tcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt |
213 |
Q |
|
|
||||||||| | || ||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||| | |||||||| |||| |
|
|
T |
76903 |
tcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcatgaatttcatcatctatgaacaattactcaatt-actcaattaagtactt |
76805 |
T |
 |
Q |
214 |
-atcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcactttt |
308 |
Q |
|
|
||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| | | ||||||||| |
|
|
T |
76804 |
aatcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcagcaattcctagcccaagcttcacttta |
76706 |
T |
 |
Q |
309 |
gctccta |
315 |
Q |
|
|
||||||| |
|
|
T |
76705 |
gctccta |
76699 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0589 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:
Target: scaffold0589; HSP #1
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accaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaac |
143 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |
|
|
T |
7927 |
accaattgagcatattttca-catataccactttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaattataaataacttcatgcattcaaac |
8025 |
T |
 |
Q |
144 |
atgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattacaa-a |
240 |
Q |
|
|
|| |||||||| | ||||||||||| | || |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | |
|
|
T |
8026 |
ataacatcataattggagcacgaattctaacaaatatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aataattgtaaaattgcaata |
8123 |
T |
 |
Q |
241 |
agtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
8124 |
aatgattacgatgaattctaacccccttacctta |
8157 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:
Target: scaffold0162; HSP #1
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Q |
10 |
cttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaaca |
108 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
T |
7185 |
cttatcacaatccaataacaacataacataattaaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacattaaatttcactaaca |
7087 |
T |
 |
Q |
109 |
acaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaag |
208 |
Q |
|
|
|||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||| | |||||||| |
|
|
T |
7086 |
acaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttgacaattatgaacaacaaatc-atttactcaattaag |
6988 |
T |
 |
Q |
209 |
cactta-tcatacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatcaccaa |
285 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| | | ||||||||| ||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
6987 |
cacttattcatacaacgattgaaaaattacattaaaatgattataattgaattctaacccccttaccttaattatcaccaa |
6907 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0243 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:
Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 2476 - 2211
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Q |
10 |
cttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaaca |
108 |
Q |
|
|
||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||| |||| || |||| |
|
|
T |
2476 |
cttatcataattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcataatt-caacatatgtcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaaca |
2378 |
T |
 |
Q |
109 |
acaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaag |
208 |
Q |
|
|
|||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||| | | ||||| |||||||||||| | |||||||| |
|
|
T |
2377 |
acaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaataattatgattaattaatcaatt-actcaattaag |
2279 |
T |
 |
Q |
209 |
cactta-tcatacaaataattgaaaatt--acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||| |||||| || |||| |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
2278 |
cacttattcatac-aacaattaaaaattgcactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
2211 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0686 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0686
Description:
Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 5808 - 5729
Alignment:
Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
5808 |
tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctataattct |
5729 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 6014 - 5935
Alignment:
Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
6014 |
tgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctataattct |
5935 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0686; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 6260 - 6204
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
6260 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
6204 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:
Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 197420 - 197143
Alignment:
Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| || |||||||||||| ||||||| || | |||||| || || ||||||| || |||| |||| || ||| |||||||||||| || |||| |
|
|
T |
197420 |
catgaatctcatcacaattcaacaacaacataggacaattcaacatttagagcataatt-caacttataacactttcacatactttgaacttgcaatttc |
197322 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||| |||| || || || |||||||||| || |||| |
|
|
T |
197321 |
accaacaacaattcaattatcaacaatttcatacattcaaacatatcatcataattagagcccgaaattcaacatctaagaacaattaatcactt-atcc |
197223 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
278 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
197222 |
aattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaatta |
197143 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0013 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:
Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 315
Target Start/End: Original strand, 35565 - 35873
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Q |
10 |
cttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaaca |
108 |
Q |
|
|
|||| |||| ||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
T |
35565 |
cttaccacatttcaacaacaacatagcataaatcaacaatttgagtataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcactaaca |
35663 |
T |
 |
Q |
109 |
acaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaag |
208 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||| | | ||||||||||| | | | ||| ||||||||| || | |||||||| |
|
|
T |
35664 |
acaattcaattatcaataacttcatgcattcaaacatatcatcatgattggagcacgaattataagaactttgaacaattaatc-ttttactcaattaag |
35762 |
T |
 |
Q |
209 |
cactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttca |
303 |
Q |
|
|
||| || |||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| | | ||||| |
|
|
T |
35763 |
cacctattcatac-aacaattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttca |
35861 |
T |
 |
Q |
304 |
cttttgctccta |
315 |
Q |
|
|
|||| ||||||| |
|
|
T |
35862 |
ctttagctccta |
35873 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0184 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:
Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 31211 - 31132
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Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
31211 |
tgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct |
31132 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 31457 - 31401
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
31457 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
31401 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0078 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:
Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
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Target Start/End: Original strand, 41633 - 41712
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Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
41633 |
tgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct |
41712 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 41387 - 41443
Alignment:
Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
41387 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
41443 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:
Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
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Target Start/End: Original strand, 69537 - 69814
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Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| || |||||||||||| ||||||| |||| |||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
T |
69537 |
catgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcacatactttaaacatgcaatttc |
69635 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||| || | | |
|
|
T |
69636 |
acctacaacaattcaattataaccaatttcatgcatttaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcactttct-c |
69734 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaatta |
278 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
69735 |
aattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttatcttaatta |
69814 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0700 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:
Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 193
Target Start/End: Original strand, 2605 - 2795
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Q |
3 |
catgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattca |
101 |
Q |
|
|
|||||| || |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| || || ||||||| || ||||||||| || ||| |||||||||||||| |||| |
|
|
T |
2605 |
catgaatctcatcataattcaacaacaacatagcataattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcatatactttgaacatgcaatttc |
2703 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatca |
193 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||| |
|
|
T |
2704 |
accaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatccaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatca |
2795 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0123 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:
Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
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Target Start/End: Original strand, 8167 - 8363
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Q |
80 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
179 |
Q |
|
|
||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | || || |
|
|
T |
8167 |
catactttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatcta |
8266 |
T |
 |
Q |
180 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactta-tcatacaaataattg-aaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
8267 |
tgaacaattaatc-atttatccaattaatcacttattcatac-aataattgaaaaattacattaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
8363 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:
Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 687 - 618
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Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatata |
70 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
687 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaaatgagcatattttcaacatata |
618 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0150 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:
Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Original strand, 28629 - 28781
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Q |
16 |
acaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaatt |
114 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |
|
|
T |
28629 |
acaattcaacaacaacataccataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatataatttcaccaacaacaatt |
28727 |
T |
 |
Q |
115 |
caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaat |
168 |
Q |
|
|
|| ||||| | || ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
28728 |
cagttatcaacaagttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaat |
28781 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0483 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:
Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 6748 - 6907
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Q |
10 |
cttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt-gagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaaca |
108 |
Q |
|
|
|||| |||||||||| || | || ||||||||||| ||||| ||||| | || ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| || |||| |
|
|
T |
6748 |
cttaccacaattcaacaatagcatagcataattcaacaatttgagcaaaatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaaca |
6846 |
T |
 |
Q |
109 |
acaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatt |
169 |
Q |
|
|
|||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||| || |||||||||| |
|
|
T |
6847 |
acaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattatagcacgaatt |
6907 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0456 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:
Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1611 - 1440
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Q |
105 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaat |
204 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||| ||| ||||||| |
|
|
T |
1611 |
aacaacaattcaattatcactaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatc-atttatccaat |
1513 |
T |
 |
Q |
205 |
taagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
T |
1512 |
taagcacttattcatac-aataattgaaaatttacactaaaataattatgatgaattctaaaccccttacctta |
1440 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8756 - 8585
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Q |
105 |
aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaat |
204 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||| ||| ||||||| |
|
|
T |
8756 |
aacaacaattcaattatcactaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatc-atttatccaat |
8658 |
T |
 |
Q |
205 |
taagcactta-tcatacaaataattgaaaatt---acaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
T |
8657 |
taagcacttattcatac-aataattgaaaatttacactaaaataattatgatgaattctaaaccccttacctta |
8585 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0116 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:
Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Original strand, 30418 - 30497
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Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctcctatgattct |
322 |
Q |
|
|
||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
30418 |
tgattatgatgaaaaataacccccttaccttaattatcaccaattattaactcaagcttcacttttgcttctatgattct |
30497 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:
Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
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Target Start/End: Complemental strand, 93893 - 93728
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Q |
49 |
ttgagcatattttcaacatataccaacttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtc |
148 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| | |||| || |
|
|
T |
93893 |
ttgagcatattt-caacaaataccattttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaaccattcaattatcaaaaacttcatgcatacatacatatc |
93795 |
T |
 |
Q |
149 |
atcataaatagagcacgaatttc-atcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat |
215 |
Q |
|
|
||||||| | ||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||| |
|
|
T |
93794 |
atcataattggagcacgaatttctaacagttatgaacaattaat-aatttacccaattaagcacttat |
93728 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032; HSP #2
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Target Start/End: Original strand, 55659 - 55715
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Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
55659 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
55715 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032; HSP #3
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179 |
Q |
|
|
|||||||||||| || || | || |||||||||||||||||| || || || ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| | || || |
|
|
T |
104713 |
catactttgaacctgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttaatgcatacaaacatatcatcatagttagagcatgaattttaacatcta |
104614 |
T |
 |
Q |
180 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaa-ttacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttaccttaat |
276 |
Q |
|
|
||| |||||||||| || || ||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
104613 |
tgaacaattaatcacttactc-aattaagcaattattcatacaac-aattgaaaaattacactaaatgattatgatgaattctaacccacttaccttaat |
104516 |
T |
 |
Q |
277 |
tatcaccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
315 |
Q |
|
|
|| ||| || | ||||| | | ||||||||| ||||||| |
|
|
T |
104515 |
tagcacaaattcttagcccaagcttcactttagctccta |
104477 |
T |
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Target: scaffold0132; HSP #1
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322 |
Q |
|
|
|||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
42678 |
tgattatgataaaaactaacccccttacctt---tatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatgattct |
42754 |
T |
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Target: scaffold0409 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
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Target: scaffold0409; HSP #1
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Q |
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catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
179 |
Q |
|
|
|||||||||| |||| |||| || ||||||||| |||||||| || || || ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | || || |
|
|
T |
1438 |
catactttgaccatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatcta |
1339 |
T |
 |
Q |
180 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaa-ttaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
1338 |
tgaacaattaatcattt-atccaattaagcacttattcatacaa-taattgaaaaattacactaatatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
1242 |
T |
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Target: scaffold0409; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 80 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9693 - 9497
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Q |
80 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
179 |
Q |
|
|
|||||||||| |||| |||| || ||||||||| |||||||| || || || ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | || || |
|
|
T |
9693 |
catactttgaccatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaattttatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatcta |
9594 |
T |
 |
Q |
180 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaa-ttaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
9593 |
tgaacaattaatcattt-atccaattaagcacttattcatacaa-taattgaaaaattacactaatatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
9497 |
T |
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Target: scaffold0028; HSP #1
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Q |
2 |
tcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagca |
55 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
89637 |
tcatgaaacttatcacaatttaacaacaacaaagcataattcaccaattgagca |
89584 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
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Target: scaffold0026; HSP #1
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aacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaat |
204 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||| || ||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
89929 |
aacaacaattcaagtatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttaa-catctatgaacaattaatcaatt-atccaat |
89832 |
T |
 |
Q |
205 |
taagcacttat-catacaaataattgaaaattaca--aaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
89831 |
taatcacttattcatacaa-taattgaaaattacactaaaaagattatgatgaattctaacccccttacctta |
89760 |
T |
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Target: scaffold0010 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
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Target: scaffold0010; HSP #1
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3 |
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101 |
Q |
|
|
|||||| || |||||||||||| || |||| |||| |||||| || || |||||| ||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||| |
|
|
T |
31100 |
catgaatctcatcacaattcaacaagaacatagcacaattcaacatttaaagcata-attcaacatataacactttcacatactatgaacatgcaatttc |
31198 |
T |
 |
Q |
102 |
actaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatcc |
201 |
Q |
|
|
|| ||||||||| |||||||| || ||||| ||| ||| || ||||||||| ||||||||||||| | || ||||| |||||||||| || | | |
|
|
T |
31199 |
accaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaatatatcatcataattagagcacgaattctaacaactatgaacaattaatcactt-actc |
31297 |
T |
 |
Q |
202 |
aattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcta |
297 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| || | |||| | | |
|
|
T |
31298 |
aattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattagcacaaattcctagcccaa |
31396 |
T |
 |
Q |
298 |
acttcacttttgctccta |
315 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||| |
|
|
T |
31397 |
gcttcactttagctccta |
31414 |
T |
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Target: scaffold0389 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
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Target: scaffold0389; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 10845 - 11014
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205 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||| |||||||| |
|
|
T |
10845 |
acaacaactcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagatagagcacgaattataacatctatgaacaattaat-tatttatccaatt |
10943 |
T |
 |
Q |
206 |
aagcactta-tcatacaaataattgaaaat--tacaaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|| |||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
10944 |
aatcacttattcatac-aataattgaaaattatactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
11014 |
T |
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Target: scaffold0091; HSP #1
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Q |
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atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaa |
64 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
32281 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaattcataattcaccaattgagcatattttcaa |
32344 |
T |
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Target: scaffold0091; HSP #2
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Q |
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atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaa |
64 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
42022 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaattcataattcaccaattgagcatattttcaa |
41959 |
T |
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Target: scaffold0234 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
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Target: scaffold0234; HSP #1
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Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
17581 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
17525 |
T |
 |
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Target: scaffold0138; HSP #1
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Q |
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182 |
Q |
|
|
|||||||||||| || | || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| | ||| || |||||||||||||| | || ||||| |
|
|
T |
22516 |
actttgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatattatcctagttagagcacgaattttaacatctatga |
22417 |
T |
 |
Q |
183 |
ccaattaatcaattcatccaattaagcacttat-catacaaataattgaaaatta---caaaagtgattatgatgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
|||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||| || | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
22416 |
acaatcaatcaat-catccaattaatcacttattcatacaa-taattaaaaaataacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
22323 |
T |
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Target: scaffold0706; HSP #1
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Q |
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atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
6720 |
atcatcaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
6664 |
T |
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Target: scaffold0597; HSP #1
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Q |
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atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
1155 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
1099 |
T |
 |
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Target: scaffold0251; HSP #1
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Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
13563 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
13507 |
T |
 |
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Q |
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atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
21537 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
21481 |
T |
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Target: scaffold0175; HSP #1
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atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
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Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
15027 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
15083 |
T |
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Q |
|
|
||||| ||||||||||||| || || |||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
70298 |
tatgaacaattaatcaatt-atacatttaatcacttattcatacaa-taattgaaaatttcacaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta |
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T |
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catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
179 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||| |||| ||||||||| | || || |
|
|
T |
1052 |
catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagaacacgaattttaacaacta |
953 |
T |
 |
Q |
180 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
|
|
||| ||| |||||| || || |||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
952 |
tgaacaaataatcactt-atttaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaaatctaacccccttacctta |
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T |
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159 |
Q |
|
|
||||||||||| || ||| || ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||| ||| |
|
|
T |
43908 |
ttcaacatatatcactttcatatcctttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatagcatcataattag |
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T |
 |
Q |
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agcacgaatttcatcacatatgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattg-aaaattaca-aaagtgattatga-tgaa |
255 |
Q |
|
|
|||| ||||| | || ||||| |||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |
|
|
T |
43808 |
agcattaattttaacaactatgaacaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatac-aacaattgaaaaattacactaaatgattatgattgaa |
43711 |
T |
 |
Q |
256 |
cactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttttgctccta |
315 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| ||| || | |||| | | ||||||||| ||||||| |
|
|
T |
43710 |
ttctaacccccttaccttaattagcacaaattcctagcccaagcttcactttagctccta |
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T |
 |
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 |
Q |
180 |
tgaccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatga-tgaacactaacccccttaccttaat |
276 |
Q |
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||| ||| ||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||| |||||| |
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T |
23662 |
tgaacaaataatcaatt-attcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaatcattatgattgaattctaacccccttatcttaat |
23564 |
T |
 |
Q |
277 |
ta |
278 |
Q |
|
|
|| |
|
|
T |
23563 |
ta |
23562 |
T |
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Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaatt |
50 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |
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|
T |
10143 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccaagcataattcgccaatt |
10094 |
T |
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Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
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T |
9684 |
atcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataagtcactaattgagcata |
9628 |
T |
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Q |
243 |
tgattatgatgaacactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctaacttcacttt |
307 |
Q |
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T |
1435 |
tgattatgatgaattctaacccccttacctcaattatcaccaattcctagctcaagcttcacttt |
1371 |
T |
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Back To:
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Q |
1 |
atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
57 |
Q |
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|||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |
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T |
12697 |
atcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcata |
12641 |
T |
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Target: scaffold0004 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
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Q |
80 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatagagcacgaatttcatcacata |
179 |
Q |
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T |
27654 |
catactatgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacaaatttcaacaacta |
27753 |
T |
 |
Q |
180 |
tga-ccaattaatcaattcatccaattaagcactt-atcatacaaataattgaaaattacaa--aagtgattatga-tgaacactaacccccttacctta |
274 |
Q |
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||| | || ||||| ||| || ||||||||||||| | ||| ||| |||| |||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
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T |
27754 |
tgagcaaaataatc-atttattcaattaagcacttaagcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaaatctaacccccttacctta |
27852 |
T |
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Q |
275 |
atta |
278 |
Q |
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T |
27853 |
atta |
27856 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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