View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0668_low_36 (Length: 307)

Name: NF0668_low_36
Description: NF0668
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0668_low_36
NF0668_low_36
[»] chr4 (132 HSPs)
chr4 (3-299)||(8631383-8631680)
chr4 (3-299)||(14633391-14633687)
chr4 (3-278)||(40637146-40637422)
chr4 (3-299)||(11008532-11008827)
chr4 (3-299)||(22046650-22046946)
chr4 (3-299)||(37089336-37089632)
chr4 (3-299)||(18847225-18847521)
chr4 (3-299)||(22044355-22044651)
chr4 (3-276)||(48486391-48486665)
chr4 (3-299)||(2484837-2485133)
chr4 (3-282)||(11006218-11006498)
chr4 (3-299)||(11435027-11435323)
chr4 (3-299)||(38409277-38409573)
chr4 (3-299)||(51015318-51015614)
chr4 (3-278)||(24880523-24880800)
chr4 (3-278)||(38928162-38928439)
chr4 (4-293)||(26085947-26086236)
chr4 (3-282)||(47274799-47275077)
chr4 (3-278)||(22802719-22802995)
chr4 (3-282)||(24348290-24348570)
chr4 (4-278)||(24879062-24879338)
chr4 (3-283)||(9148325-9148605)
chr4 (3-301)||(47868473-47868772)
chr4 (3-299)||(31849563-31849860)
chr4 (3-276)||(24888868-24889142)
chr4 (3-278)||(36921478-36921755)
chr4 (3-299)||(7941393-7941692)
chr4 (3-278)||(12395830-12396106)
chr4 (1-281)||(44599820-44600101)
chr4 (4-278)||(22800847-22801122)
chr4 (4-278)||(40091400-40091675)
chr4 (5-278)||(33415473-33415746)
chr4 (3-278)||(12400792-12401068)
chr4 (1-299)||(22780336-22780636)
chr4 (1-299)||(22782701-22783001)
chr4 (3-299)||(22134582-22134876)
chr4 (3-282)||(5198492-5198772)
chr4 (3-299)||(22132355-22132651)
chr4 (3-299)||(6764911-6765213)
chr4 (1-299)||(9176438-9176737)
chr4 (3-278)||(16453381-16453658)
chr4 (3-278)||(36919569-36919846)
chr4 (3-299)||(18709127-18709424)
chr4 (4-278)||(19095955-19096231)
chr4 (3-288)||(14787406-14787692)
chr4 (1-288)||(16934118-16934406)
chr4 (4-278)||(619433-619707)
chr4 (1-299)||(9174110-9174409)
chr4 (1-288)||(16931764-16932052)
chr4 (33-278)||(17662230-17662476)
chr4 (3-278)||(36378364-36378641)
chr4 (1-203)||(3824629-3824833)
chr4 (3-203)||(5637524-5637726)
chr4 (4-206)||(13544032-13544236)
chr4 (7-278)||(36380425-36380698)
chr4 (3-278)||(37313050-37313327)
chr4 (4-259)||(56030517-56030770)
chr4 (5-253)||(41997566-41997815)
chr4 (44-265)||(16455354-16455577)
chr4 (4-278)||(19322769-19323043)
chr4 (14-278)||(27499128-27499390)
chr4 (3-253)||(47210762-47211001)
chr4 (3-294)||(53405202-53405497)
chr4 (79-278)||(13547302-13547502)
chr4 (73-278)||(2891433-2891640)
chr4 (12-229)||(18537509-18537724)
chr4 (3-265)||(18409345-18409608)
chr4 (108-278)||(4215483-4215654)
chr4 (126-299)||(5635440-5635614)
chr4 (12-194)||(18534901-18535082)
chr4 (11-265)||(38890222-38890476)
chr4 (3-149)||(6132944-6133090)
chr4 (3-185)||(52942536-52942707)
chr4 (3-159)||(3937314-3937470)
chr4 (4-238)||(8756276-8756510)
chr4 (125-299)||(11437557-11437731)
chr4 (19-278)||(30136640-30136898)
chr4 (66-265)||(12102221-12102424)
chr4 (132-278)||(5101130-5101276)
chr4 (65-197)||(15032614-15032748)
chr4 (67-197)||(28453818-28453950)
chr4 (67-278)||(25357772-25357991)
chr4 (82-265)||(16185832-16186018)
chr4 (66-227)||(31983564-31983727)
chr4 (11-197)||(9863791-9863974)
chr4 (70-263)||(3982175-3982374)
chr4 (67-197)||(47150959-47151092)
chr4 (4-195)||(40999017-40999208)
chr4 (3-92)||(38270158-38270247)
chr4 (13-92)||(24446756-24446835)
chr4 (177-278)||(47563009-47563109)
chr4 (11-143)||(10112952-10113080)
chr4 (4-197)||(9022380-9022573)
chr4 (4-67)||(5101070-5101133)
chr4 (82-144)||(5336903-5336964)
chr4 (85-144)||(16489352-16489410)
chr4 (85-144)||(25699752-25699810)
chr4 (82-144)||(4570094-4570155)
chr4 (82-144)||(7050378-7050439)
chr4 (82-144)||(11853549-11853610)
chr4 (67-193)||(54906722-54906852)
chr4 (207-278)||(6133113-6133185)
chr4 (45-124)||(10114443-10114520)
chr4 (206-288)||(14789405-14789488)
chr4 (85-239)||(31300427-31300580)
chr4 (85-144)||(4556180-4556238)
chr4 (85-144)||(4558314-4558372)
chr4 (85-144)||(8529270-8529328)
chr4 (85-144)||(15316961-15317019)
chr4 (85-144)||(18586969-18587027)
chr4 (151-278)||(24446639-24446754)
chr4 (82-144)||(55822265-55822326)
chr4 (3-48)||(2891389-2891434)
chr4 (153-270)||(49088791-49088911)
chr4 (225-278)||(52942473-52942526)
chr4 (85-144)||(15831144-15831202)
chr4 (85-144)||(16689061-16689119)
chr4 (81-144)||(29609591-29609654)
chr4 (85-144)||(47566496-47566554)
chr4 (82-140)||(16638827-16638884)
chr4 (116-154)||(38270120-38270158)
chr4 (68-172)||(22295294-22295399)
chr4 (214-263)||(54867188-54867237)
chr4 (88-143)||(3760105-3760161)
chr4 (230-278)||(3937259-3937307)
chr4 (85-120)||(4884877-4884912)
chr4 (214-263)||(5269234-5269284)
chr4 (82-144)||(36771396-36771457)
chr4 (82-123)||(4874620-4874661)
chr4 (215-263)||(5143263-5143312)
chr4 (67-142)||(5516367-5516444)
chr4 (215-263)||(31985678-31985726)
[»] chr1 (105 HSPs)
chr1 (3-299)||(51750057-51750354)
chr1 (5-299)||(28840700-28840994)
chr1 (4-299)||(10399794-10400090)
chr1 (3-299)||(15294800-15295097)
chr1 (3-299)||(31735487-31735784)
chr1 (3-278)||(17324623-17324899)
chr1 (3-288)||(46431683-46431970)
chr1 (3-301)||(24325681-24325980)
chr1 (3-299)||(28842513-28842809)
chr1 (3-278)||(12302492-12302768)
chr1 (3-278)||(38925468-38925741)
chr1 (3-282)||(2510308-2510587)
chr1 (3-278)||(47906288-47906564)
chr1 (4-278)||(50076659-50076934)
chr1 (3-271)||(50307540-50307810)
chr1 (3-278)||(6995687-6995963)
chr1 (3-278)||(18307127-18307403)
chr1 (3-278)||(39462537-39462813)
chr1 (3-299)||(13761855-13762151)
chr1 (1-299)||(16226183-16226483)
chr1 (3-273)||(13215099-13215375)
chr1 (3-278)||(15823564-15823840)
chr1 (4-278)||(11457462-11457737)
chr1 (3-299)||(39932091-39932389)
chr1 (4-278)||(2949219-2949493)
chr1 (3-276)||(6823033-6823306)
chr1 (3-282)||(20302477-20302756)
chr1 (1-299)||(47179729-47180028)
chr1 (3-278)||(27336927-27337201)
chr1 (3-278)||(27339118-27339393)
chr1 (3-278)||(16428671-16428948)
chr1 (3-299)||(20291475-20291771)
chr1 (4-293)||(2617535-2617825)
chr1 (3-278)||(14097956-14098233)
chr1 (7-278)||(50078807-50079080)
chr1 (5-299)||(51752385-51752678)
chr1 (7-276)||(3579606-3579875)
chr1 (3-278)||(31425002-31425282)
chr1 (1-299)||(47177378-47177677)
chr1 (3-278)||(18839605-18839882)
chr1 (3-278)||(41646938-41647214)
chr1 (3-282)||(9463227-9463507)
chr1 (4-278)||(28998240-28998515)
chr1 (4-278)||(29003956-29004231)
chr1 (4-282)||(9459400-9459679)
chr1 (3-278)||(4131362-4131642)
chr1 (3-278)||(6756545-6756822)
chr1 (3-278)||(9241072-9241349)
chr1 (3-278)||(17186114-17186391)
chr1 (5-278)||(31489935-31490206)
chr1 (3-228)||(21948226-21948450)
chr1 (3-278)||(25127890-25128167)
chr1 (4-278)||(25251261-25251537)
chr1 (4-278)||(40133963-40134239)
chr1 (4-278)||(50248557-50248834)
chr1 (3-278)||(17318911-17319181)
chr1 (4-278)||(28207055-28207328)
chr1 (3-203)||(48665195-48665398)
chr1 (25-265)||(17324103-17324345)
chr1 (3-274)||(31422851-31423137)
chr1 (33-278)||(16432442-16432690)
chr1 (52-299)||(16231630-16231878)
chr1 (3-261)||(47451666-47451919)
chr1 (12-274)||(14183581-14183843)
chr1 (70-278)||(16429042-16429252)
chr1 (77-299)||(51757623-51757845)
chr1 (3-173)||(6823903-6824080)
chr1 (4-265)||(42922252-42922513)
chr1 (52-276)||(25248540-25248766)
chr1 (9-228)||(15669431-15669648)
chr1 (65-278)||(6115089-6115304)
chr1 (81-265)||(23785935-23786120)
chr1 (4-194)||(8347343-8347532)
chr1 (12-257)||(49495218-49495461)
chr1 (4-205)||(18800631-18800832)
chr1 (4-197)||(8349119-8349311)
chr1 (126-278)||(23816027-23816180)
chr1 (67-241)||(155788-155963)
chr1 (67-199)||(30738695-30738830)
chr1 (12-197)||(13125525-13125711)
chr1 (65-253)||(30790412-30790602)
chr1 (63-197)||(16561544-16561681)
chr1 (4-173)||(26520206-26520379)
chr1 (45-197)||(28279326-28279480)
chr1 (67-197)||(26613307-26613440)
chr1 (209-299)||(13358797-13358888)
chr1 (11-265)||(27916525-27916779)
chr1 (67-197)||(14353047-14353178)
chr1 (67-142)||(26332613-26332688)
chr1 (71-197)||(43104245-43104375)
chr1 (82-144)||(4144804-4144865)
chr1 (237-293)||(13447245-13447301)
chr1 (157-265)||(15916562-15916673)
chr1 (82-144)||(2232597-2232658)
chr1 (82-144)||(14997040-14997101)
chr1 (85-265)||(21353346-21353525)
chr1 (85-144)||(2401342-2401400)
chr1 (85-144)||(9526469-9526527)
chr1 (85-144)||(25134074-25134132)
chr1 (67-180)||(49959129-49959244)
chr1 (82-193)||(13785342-13785455)
chr1 (9-109)||(26332719-26332814)
chr1 (85-144)||(9521718-9521776)
chr1 (85-143)||(2393404-2393461)
chr1 (81-144)||(37990772-37990836)
[»] chr7 (106 HSPs)
chr7 (3-299)||(38394014-38394311)
chr7 (1-301)||(7471942-7472243)
chr7 (3-299)||(48457681-48457978)
chr7 (3-299)||(40836707-40837003)
chr7 (3-301)||(7469984-7470283)
chr7 (3-278)||(20137094-20137370)
chr7 (3-278)||(44724607-44724883)
chr7 (1-299)||(1046888-1047187)
chr7 (4-299)||(20299488-20299785)
chr7 (3-278)||(443623-443900)
chr7 (3-294)||(1850009-1850301)
chr7 (4-299)||(3878606-3878902)
chr7 (3-294)||(1049264-1049556)
chr7 (3-278)||(13099459-13099737)
chr7 (3-299)||(44592-44889)
chr7 (3-299)||(20297390-20297687)
chr7 (3-299)||(3035749-3036049)
chr7 (45-299)||(7092177-7092431)
chr7 (3-288)||(20626066-20626351)
chr7 (3-288)||(20629957-20630242)
chr7 (3-288)||(20642376-20642661)
chr7 (5-294)||(28487583-28487873)
chr7 (4-278)||(42330982-42331259)
chr7 (3-299)||(40946356-40946653)
chr7 (4-299)||(35658-35954)
chr7 (4-278)||(4295919-4296195)
chr7 (5-301)||(25542560-25542855)
chr7 (3-294)||(28485594-28485885)
chr7 (3-299)||(18345569-18345866)
chr7 (3-278)||(21592128-21592404)
chr7 (3-278)||(9680847-9681124)
chr7 (3-278)||(31435031-31435308)
chr7 (4-278)||(24748623-24748899)
chr7 (4-276)||(9679088-9679361)
chr7 (3-299)||(7351615-7351913)
chr7 (3-278)||(21680055-21680334)
chr7 (4-299)||(43253481-43253776)
chr7 (4-278)||(21990179-21990454)
chr7 (3-265)||(27306228-27306490)
chr7 (3-282)||(31155892-31156172)
chr7 (3-278)||(11355286-11355562)
chr7 (3-278)||(37412110-37412389)
chr7 (45-299)||(7094424-7094678)
chr7 (3-278)||(42223185-42223462)
chr7 (4-278)||(39145971-39146247)
chr7 (3-281)||(7349259-7349534)
chr7 (4-203)||(11757258-11757460)
chr7 (3-265)||(21678094-21678357)
chr7 (3-197)||(25276169-25276365)
chr7 (3-244)||(27832651-27832894)
chr7 (53-299)||(38396713-38396959)
chr7 (3-278)||(24258491-24258772)
chr7 (4-265)||(24813495-24813755)
chr7 (4-253)||(24817362-24817610)
chr7 (3-168)||(26804597-26804765)
chr7 (3-206)||(22828688-22828894)
chr7 (9-229)||(20091582-20091797)
chr7 (81-265)||(2935374-2935559)
chr7 (3-197)||(22251611-22251803)
chr7 (81-281)||(22137184-22137384)
chr7 (81-281)||(40552211-40552411)
chr7 (81-281)||(22108173-22108373)
chr7 (81-281)||(40549933-40550133)
chr7 (4-265)||(7188571-7188832)
chr7 (81-265)||(1606486-1606670)
chr7 (81-265)||(9027192-9027376)
chr7 (12-253)||(24465578-24465816)
chr7 (129-278)||(22393876-22394027)
chr7 (108-253)||(26295580-26295727)
chr7 (3-93)||(18567641-18567731)
chr7 (4-265)||(11081540-11081802)
chr7 (67-265)||(6332311-6332513)
chr7 (67-228)||(16297058-16297222)
chr7 (12-122)||(22392502-22392608)
chr7 (105-197)||(6348912-6349006)
chr7 (217-299)||(11759369-11759452)
chr7 (4-197)||(6048903-6049094)
chr7 (70-195)||(40281451-40281572)
chr7 (67-144)||(11084467-11084544)
chr7 (67-144)||(26210631-26210710)
chr7 (82-144)||(21369642-21369703)
chr7 (66-144)||(2120881-2120960)
chr7 (82-144)||(3320171-3320232)
chr7 (82-144)||(3324919-3324980)
chr7 (82-144)||(7069780-7069841)
chr7 (82-144)||(7074787-7074848)
chr7 (82-144)||(25351353-25351414)
chr7 (82-144)||(25357047-25357108)
chr7 (82-144)||(25405393-25405454)
chr7 (82-144)||(25410130-25410191)
chr7 (82-144)||(42006663-42006724)
chr7 (45-123)||(12310157-12310234)
chr7 (68-197)||(13290540-13290672)
chr7 (85-144)||(30246973-30247031)
chr7 (85-144)||(44512646-44512704)
chr7 (82-144)||(8378625-8378686)
chr7 (82-144)||(15541116-15541177)
chr7 (123-197)||(6046641-6046717)
chr7 (230-278)||(26804766-26804814)
chr7 (85-133)||(44143997-44144045)
chr7 (85-144)||(34546984-34547042)
chr7 (91-132)||(6067332-6067373)
chr7 (82-123)||(8260584-8260625)
chr7 (215-263)||(9190052-9190101)
chr7 (220-263)||(12097867-12097911)
chr7 (233-281)||(14653852-14653900)
[»] chr3 (149 HSPs)
chr3 (3-299)||(38890038-38890335)
chr3 (3-299)||(4103858-4104154)
chr3 (3-278)||(1313407-1313683)
chr3 (4-278)||(53917647-53917922)
chr3 (3-299)||(5191651-5191946)
chr3 (3-299)||(51726969-51727265)
chr3 (3-278)||(4308264-4308540)
chr3 (9-299)||(1321483-1321774)
chr3 (3-278)||(28101985-28102261)
chr3 (3-299)||(10955989-10956286)
chr3 (1-288)||(25388902-25389189)
chr3 (3-299)||(10084351-10084648)
chr3 (3-278)||(1626666-1626942)
chr3 (3-278)||(18099153-18099429)
chr3 (3-278)||(43228289-43228565)
chr3 (3-282)||(3859526-3859805)
chr3 (3-278)||(45882937-45883214)
chr3 (3-299)||(10958285-10958582)
chr3 (3-278)||(27101164-27101440)
chr3 (1-299)||(28412992-28413293)
chr3 (3-278)||(42990302-42990578)
chr3 (3-278)||(43421398-43421674)
chr3 (3-278)||(43423446-43423722)
chr3 (1-299)||(746753-747053)
chr3 (5-278)||(3314684-3314959)
chr3 (3-278)||(11170402-11170678)
chr3 (3-278)||(18096883-18097159)
chr3 (3-282)||(25533440-25533720)
chr3 (3-278)||(51943369-51943644)
chr3 (4-278)||(53915479-53915754)
chr3 (3-299)||(458282-458580)
chr3 (3-299)||(22114267-22114564)
chr3 (3-278)||(9604590-9604866)
chr3 (3-278)||(30005839-30006115)
chr3 (1-281)||(50493995-50494276)
chr3 (1-299)||(10621491-10621791)
chr3 (3-299)||(455905-456203)
chr3 (3-278)||(880434-880711)
chr3 (33-299)||(5522589-5522855)
chr3 (3-299)||(6065757-6066055)
chr3 (3-278)||(18162661-18162937)
chr3 (3-270)||(5926755-5927023)
chr3 (4-278)||(24979706-24979982)
chr3 (3-265)||(43226084-43226346)
chr3 (27-282)||(7606567-7606822)
chr3 (3-299)||(6063407-6063705)
chr3 (3-299)||(26720546-26720842)
chr3 (3-278)||(39715467-39715739)
chr3 (1-299)||(38210366-38210666)
chr3 (4-278)||(48361654-48361929)
chr3 (18-278)||(6484372-6484634)
chr3 (3-299)||(10191274-10191568)
chr3 (11-278)||(12267958-12268216)
chr3 (3-278)||(47148878-47149154)
chr3 (3-278)||(53468436-53468714)
chr3 (3-278)||(32264021-32264298)
chr3 (4-278)||(36011826-36012101)
chr3 (1-170)||(35777417-35777587)
chr3 (33-278)||(51674749-51674995)
chr3 (27-278)||(32219106-32219359)
chr3 (3-197)||(6561808-6562005)
chr3 (56-278)||(25688143-25688367)
chr3 (4-226)||(29956685-29956907)
chr3 (4-278)||(28761410-28761686)
chr3 (7-253)||(889781-890029)
chr3 (53-278)||(6231849-6232074)
chr3 (69-299)||(11168165-11168396)
chr3 (4-278)||(23633458-23633727)
chr3 (6-276)||(54691559-54691830)
chr3 (33-263)||(53591212-53591442)
chr3 (66-278)||(5886261-5886472)
chr3 (66-278)||(5899734-5899945)
chr3 (45-278)||(4666554-4666788)
chr3 (20-278)||(15780886-15781153)
chr3 (1-160)||(28100143-28100302)
chr3 (12-278)||(17795269-17795533)
chr3 (12-278)||(19103709-19103973)
chr3 (3-253)||(35917952-35918208)
chr3 (4-239)||(31151347-31151579)
chr3 (3-278)||(42992284-42992544)
chr3 (12-194)||(13420252-13420432)
chr3 (4-165)||(28181021-28181182)
chr3 (83-278)||(3306839-3307034)
chr3 (12-253)||(25635391-25635631)
chr3 (12-265)||(561770-562024)
chr3 (4-173)||(23637025-23637191)
chr3 (5-278)||(27635641-27635884)
chr3 (5-191)||(1673975-1674160)
chr3 (27-153)||(28137415-28137541)
chr3 (3-197)||(54884155-54884348)
chr3 (4-197)||(53597238-53597430)
chr3 (4-253)||(36871308-36871557)
chr3 (132-278)||(47701654-47701801)
chr3 (4-97)||(41849151-41849244)
chr3 (67-264)||(1620457-1620657)
chr3 (111-265)||(24181486-24181643)
chr3 (49-145)||(4560401-4560497)
chr3 (67-198)||(14634504-14634638)
chr3 (148-265)||(25634030-25634149)
chr3 (3-73)||(11163148-11163218)
chr3 (4-109)||(24177278-24177380)
chr3 (187-278)||(41849243-41849333)
chr3 (207-282)||(35919094-35919170)
chr3 (4-141)||(13419883-13420015)
chr3 (214-299)||(53894018-53894105)
chr3 (67-197)||(11066652-11066784)
chr3 (12-109)||(25633930-25634024)
chr3 (3-58)||(6231447-6231502)
chr3 (85-144)||(27762107-27762165)
chr3 (82-144)||(10094195-10094256)
chr3 (82-144)||(10201075-10201136)
chr3 (82-144)||(16462203-16462264)
chr3 (82-144)||(22626105-22626166)
chr3 (82-144)||(47883003-47883064)
chr3 (67-144)||(7768632-7768709)
chr3 (3-59)||(47701798-47701854)
chr3 (85-144)||(29914074-29914132)
chr3 (85-144)||(47878292-47878350)
chr3 (85-144)||(54193229-54193287)
chr3 (90-144)||(4535622-4535675)
chr3 (82-144)||(10100212-10100273)
chr3 (82-144)||(10208121-10208182)
chr3 (94-144)||(11007633-11007683)
chr3 (82-144)||(16996875-16996936)
chr3 (82-144)||(27544273-27544334)
chr3 (82-130)||(6303310-6303358)
chr3 (45-107)||(31021300-31021361)
chr3 (85-144)||(10897008-10897066)
chr3 (85-144)||(20031439-20031497)
chr3 (85-144)||(54188512-54188570)
chr3 (49-94)||(7606828-7606873)
chr3 (67-197)||(11073007-11073137)
chr3 (82-130)||(7418064-7418112)
chr3 (82-142)||(38002869-38002928)
chr3 (82-144)||(5858546-5858605)
chr3 (85-144)||(10595155-10595213)
chr3 (206-253)||(28181189-28181236)
chr3 (223-278)||(42992605-42992660)
chr3 (86-120)||(10949404-10949438)
chr3 (82-144)||(11079517-11079578)
chr3 (90-144)||(13893470-13893523)
chr3 (81-197)||(27420726-27420844)
chr3 (215-263)||(16264354-16264403)
chr3 (215-263)||(25795785-25795834)
chr3 (67-144)||(26763021-26763101)
chr3 (215-263)||(32143325-32143374)
chr3 (4-48)||(3306798-3306842)
chr3 (3-31)||(15780858-15780886)
chr3 (220-263)||(30236249-30236293)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (3-299)||(183605-183901)
scaffold0005 (3-288)||(52038-52324)
scaffold0005 (206-288)||(50242-50325)
[»] chr5 (101 HSPs)
chr5 (3-299)||(25804043-25804339)
chr5 (4-278)||(18511197-18511472)
chr5 (3-299)||(10529062-10529360)
chr5 (4-299)||(25921437-25921733)
chr5 (3-282)||(2174937-2175216)
chr5 (3-301)||(4236647-4236945)
chr5 (3-282)||(38882124-38882403)
chr5 (3-299)||(34477017-34477315)
chr5 (3-299)||(34479382-34479680)
chr5 (4-278)||(18509303-18509578)
chr5 (4-278)||(21948045-21948320)
chr5 (1-278)||(6745085-6745362)
chr5 (7-278)||(658341-658610)
chr5 (3-278)||(39854501-39854777)
chr5 (3-299)||(18466702-18466999)
chr5 (3-274)||(40221540-40221813)
chr5 (3-278)||(10474308-10474584)
chr5 (4-278)||(25904122-25904397)
chr5 (3-299)||(27912554-27912851)
chr5 (3-282)||(27910468-27910748)
chr5 (3-299)||(21684416-21684712)
chr5 (3-281)||(31545098-31545377)
chr5 (3-299)||(31179337-31179632)
chr5 (3-278)||(31472597-31472874)
chr5 (3-278)||(16776176-16776451)
chr5 (4-277)||(18596664-18596939)
chr5 (4-278)||(24126875-24127150)
chr5 (3-299)||(18469029-18469324)
chr5 (5-278)||(2818320-2818595)
chr5 (1-299)||(15552261-15552561)
chr5 (4-272)||(17072902-17073172)
chr5 (3-278)||(16092184-16092461)
chr5 (3-279)||(31542753-31543029)
chr5 (3-278)||(1189592-1189870)
chr5 (3-278)||(39397978-39398254)
chr5 (1-278)||(6747322-6747598)
chr5 (12-278)||(36402313-36402580)
chr5 (3-265)||(37705778-37706041)
chr5 (33-278)||(695926-696172)
chr5 (3-278)||(17818477-17818751)
chr5 (3-278)||(26097751-26098025)
chr5 (7-278)||(2954438-2954710)
chr5 (3-278)||(6756512-6756786)
chr5 (64-278)||(20505828-20506041)
chr5 (27-282)||(10586873-10587130)
chr5 (9-278)||(31465974-31466233)
chr5 (52-278)||(41585729-41585956)
chr5 (52-291)||(4410090-4410329)
chr5 (61-282)||(39798123-39798345)
chr5 (3-197)||(34530731-34530927)
chr5 (47-278)||(2723964-2724187)
chr5 (2-278)||(21288781-21289055)
chr5 (4-278)||(12555908-12556183)
chr5 (1-147)||(20045026-20045172)
chr5 (81-281)||(10749796-10749996)
chr5 (3-143)||(20043068-20043208)
chr5 (4-253)||(6661194-6661443)
chr5 (66-273)||(36208656-36208865)
chr5 (81-281)||(15354557-15354757)
chr5 (81-281)||(15356833-15357033)
chr5 (81-281)||(23665140-23665340)
chr5 (81-281)||(23793247-23793447)
chr5 (81-281)||(3373119-3373320)
chr5 (81-281)||(10757273-10757472)
chr5 (81-281)||(38960114-38960314)
chr5 (9-226)||(9020246-9020460)
chr5 (88-281)||(23741841-23742034)
chr5 (11-278)||(20053872-20054131)
chr5 (3-136)||(26098379-26098512)
chr5 (45-197)||(17413232-17413385)
chr5 (67-197)||(15143547-15143680)
chr5 (111-198)||(42770936-42771025)
chr5 (85-197)||(4897828-4897943)
chr5 (172-278)||(26098273-26098379)
chr5 (64-153)||(42770847-42770934)
chr5 (67-227)||(2144599-2144763)
chr5 (67-144)||(4754235-4754312)
chr5 (82-265)||(15445264-15445453)
chr5 (82-144)||(1170811-1170872)
chr5 (82-144)||(31782578-31782639)
chr5 (67-197)||(34033632-34033768)
chr5 (82-144)||(35385573-35385634)
chr5 (82-193)||(13295835-13295948)
chr5 (206-278)||(20043211-20043284)
chr5 (81-265)||(23667415-23667599)
chr5 (4-139)||(29748370-29748502)
chr5 (81-191)||(32520533-32520645)
chr5 (85-144)||(25452498-25452556)
chr5 (67-144)||(35430259-35430338)
chr5 (82-144)||(2298122-2298183)
chr5 (82-144)||(10627364-10627425)
chr5 (87-144)||(25445501-25445557)
chr5 (85-144)||(28786407-28786465)
chr5 (82-144)||(1240428-1240489)
chr5 (3-61)||(20507665-20507723)
chr5 (82-143)||(16093413-16093473)
chr5 (85-144)||(11962554-11962612)
chr5 (67-144)||(15224889-15224968)
chr5 (85-144)||(17841370-17841428)
chr5 (85-144)||(22672837-22672895)
chr5 (90-144)||(26406594-26406647)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (3-299)||(69256-69552)
scaffold0025 (3-80)||(73207-73284)
scaffold0025 (43-91)||(73160-73208)
[»] chr6 (87 HSPs)
chr6 (3-299)||(14507140-14507436)
chr6 (3-294)||(28241290-28241582)
chr6 (3-299)||(1230213-1230510)
chr6 (3-299)||(4816195-4816492)
chr6 (3-278)||(9019979-9020255)
chr6 (3-278)||(11983014-11983290)
chr6 (3-299)||(14458731-14459026)
chr6 (3-278)||(13057247-13057524)
chr6 (3-299)||(19704531-19704830)
chr6 (4-299)||(30967255-30967551)
chr6 (3-278)||(3629850-3630125)
chr6 (3-299)||(20915321-20915617)
chr6 (3-299)||(2628850-2629146)
chr6 (3-299)||(30034567-30034864)
chr6 (3-278)||(32280049-32280326)
chr6 (3-274)||(3390432-3390705)
chr6 (3-276)||(3631926-3632199)
chr6 (3-278)||(13039807-13040084)
chr6 (5-271)||(15532674-15532940)
chr6 (3-278)||(15541125-15541401)
chr6 (3-278)||(26065039-26065310)
chr6 (3-278)||(26085008-26085279)
chr6 (1-299)||(12195478-12195778)
chr6 (1-299)||(26932527-26932825)
chr6 (3-278)||(25477327-25477611)
chr6 (4-276)||(30728811-30729088)
chr6 (4-278)||(3233710-3233991)
chr6 (3-203)||(15530182-15530383)
chr6 (49-265)||(5273214-5273431)
chr6 (3-278)||(12161543-12161816)
chr6 (3-276)||(24338435-24338709)
chr6 (12-265)||(15719708-15719960)
chr6 (70-278)||(1069703-1069913)
chr6 (3-158)||(19227514-19227669)
chr6 (3-197)||(22490693-22490889)
chr6 (9-239)||(3027876-3028106)
chr6 (81-281)||(26066106-26066307)
chr6 (27-278)||(14466399-14466653)
chr6 (45-265)||(15367129-15367348)
chr6 (81-281)||(29754691-29754892)
chr6 (81-281)||(33308988-33309188)
chr6 (11-253)||(16455434-16455676)
chr6 (81-281)||(26068377-26068578)
chr6 (81-281)||(33311257-33311457)
chr6 (66-278)||(12186056-12186271)
chr6 (12-195)||(17012105-17012287)
chr6 (65-197)||(26945258-26945393)
chr6 (125-265)||(15346522-15346663)
chr6 (67-265)||(19696556-19696758)
chr6 (67-253)||(22857962-22858152)
chr6 (68-198)||(28037794-28037927)
chr6 (67-197)||(20526922-20527054)
chr6 (3-74)||(1072067-1072138)
chr6 (67-142)||(11138423-11138499)
chr6 (67-197)||(25078623-25078755)
chr6 (67-193)||(7542452-7542581)
chr6 (3-78)||(13870608-13870683)
chr6 (3-77)||(32447502-32447577)
chr6 (180-278)||(10584227-10584325)
chr6 (82-238)||(12937219-12937376)
chr6 (90-144)||(5165936-5165989)
chr6 (82-144)||(13878727-13878788)
chr6 (82-144)||(13883475-13883536)
chr6 (82-144)||(16785919-16785980)
chr6 (82-144)||(26887345-26887406)
chr6 (82-144)||(31248835-31248896)
chr6 (82-144)||(35201447-35201508)
chr6 (82-144)||(3577636-3577696)
chr6 (85-144)||(17036058-17036116)
chr6 (85-144)||(17694972-17695030)
chr6 (3-49)||(8995532-8995578)
chr6 (4-58)||(17852596-17852650)
chr6 (12-95)||(15346445-15346524)
chr6 (89-144)||(12166267-12166321)
chr6 (85-144)||(22351973-22352031)
chr6 (126-197)||(30445699-30445773)
chr6 (85-142)||(19701985-19702041)
chr6 (145-197)||(25465657-25465710)
chr6 (88-144)||(25941650-25941704)
chr6 (85-165)||(26643179-26643259)
chr6 (85-165)||(26749145-26749225)
chr6 (1-41)||(10584172-10584212)
chr6 (85-144)||(13467585-13467642)
chr6 (85-144)||(22342922-22342980)
chr6 (85-144)||(33215830-33215888)
chr6 (90-144)||(11262596-11262649)
chr6 (215-263)||(31936591-31936640)
[»] chr8 (84 HSPs)
chr8 (3-299)||(32339383-32339680)
chr8 (3-299)||(27829371-27829667)
chr8 (4-282)||(3874085-3874364)
chr8 (3-299)||(27827060-27827356)
chr8 (3-299)||(28283185-28283480)
chr8 (3-299)||(4424092-4424389)
chr8 (3-299)||(15809293-15809589)
chr8 (3-278)||(30480488-30480764)
chr8 (3-274)||(27911088-27911359)
chr8 (3-274)||(27957507-27957778)
chr8 (3-294)||(608808-609101)
chr8 (4-299)||(22684617-22684916)
chr8 (3-278)||(28251552-28251828)
chr8 (3-299)||(18810782-18811078)
chr8 (3-276)||(27106884-27107158)
chr8 (4-278)||(1225241-1225517)
chr8 (3-278)||(14807825-14808111)
chr8 (1-279)||(43079674-43079953)
chr8 (3-278)||(14419175-14419452)
chr8 (3-299)||(44720917-44721214)
chr8 (1-281)||(43082045-43082326)
chr8 (3-277)||(15068055-15068330)
chr8 (27-299)||(18812980-18813252)
chr8 (3-278)||(15072784-15073061)
chr8 (3-278)||(36865612-36865887)
chr8 (3-270)||(13858477-13858745)
chr8 (4-278)||(41384819-41385094)
chr8 (27-294)||(43530213-43530481)
chr8 (4-278)||(41382748-41383012)
chr8 (3-282)||(24873164-24873442)
chr8 (3-278)||(25952595-25952871)
chr8 (3-279)||(5372160-5372439)
chr8 (19-278)||(15956051-15956308)
chr8 (3-173)||(14477350-14477520)
chr8 (12-265)||(21482397-21482648)
chr8 (12-253)||(21480589-21480828)
chr8 (3-145)||(33541507-33541649)
chr8 (8-278)||(15185699-15185966)
chr8 (64-265)||(31162344-31162550)
chr8 (12-265)||(3005628-3005880)
chr8 (52-231)||(181622-181801)
chr8 (3-125)||(5622877-5622999)
chr8 (64-265)||(31035252-31035458)
chr8 (17-147)||(37214317-37214438)
chr8 (67-197)||(31578343-31578476)
chr8 (3-106)||(26775275-26775378)
chr8 (67-194)||(31573794-31573924)
chr8 (135-265)||(2468127-2468259)
chr8 (172-278)||(33541395-33541500)
chr8 (13-92)||(35872555-35872634)
chr8 (82-167)||(13985176-13985262)
chr8 (4-101)||(31035144-31035238)
chr8 (67-229)||(3895957-3896123)
chr8 (67-144)||(17847661-17847740)
chr8 (209-276)||(37214251-37214319)
chr8 (67-191)||(33838995-33839120)
chr8 (63-109)||(2468261-2468307)
chr8 (82-144)||(9021228-9021289)
chr8 (67-143)||(13985933-13986011)
chr8 (82-144)||(16752643-16752704)
chr8 (82-144)||(16757388-16757449)
chr8 (82-144)||(28327908-28327969)
chr8 (82-144)||(28895502-28895563)
chr8 (82-144)||(30423212-30423274)
chr8 (82-253)||(6376141-6376315)
chr8 (85-144)||(590797-590855)
chr8 (85-144)||(33032657-33032715)
chr8 (82-144)||(4812608-4812669)
chr8 (82-144)||(28332631-28332692)
chr8 (151-278)||(35872438-35872553)
chr8 (85-142)||(29554908-29554964)
chr8 (85-144)||(3276347-3276405)
chr8 (206-279)||(14477527-14477602)
chr8 (85-144)||(25684646-25684704)
chr8 (82-144)||(2267144-2267205)
chr8 (82-120)||(17799568-17799606)
chr8 (3-40)||(12517248-12517285)
chr8 (172-225)||(14419734-14419786)
chr8 (82-144)||(15949534-15949596)
chr8 (67-119)||(11701102-11701155)
chr8 (215-263)||(19752438-19752487)
chr8 (233-281)||(28228668-28228717)
chr8 (82-118)||(21033870-21033906)
chr8 (85-133)||(23179692-23179740)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (3-294)||(41452-41744)
[»] chr2 (91 HSPs)
chr2 (3-294)||(19501980-19502272)
chr2 (3-299)||(13910009-13910305)
chr2 (3-299)||(27104793-27105088)
chr2 (3-299)||(23452201-23452498)
chr2 (3-293)||(19504316-19504606)
chr2 (1-282)||(45279965-45280247)
chr2 (3-278)||(19007634-19007910)
chr2 (3-278)||(21520678-21520954)
chr2 (3-278)||(42923494-42923770)
chr2 (3-281)||(42064509-42064788)
chr2 (3-282)||(42452777-42453054)
chr2 (3-278)||(6258802-6259076)
chr2 (3-293)||(24162193-24162473)
chr2 (3-278)||(40032038-40032319)
chr2 (3-278)||(28196631-28196905)
chr2 (3-278)||(22287321-22287597)
chr2 (1-281)||(35215568-35215849)
chr2 (1-281)||(35217945-35218226)
chr2 (17-278)||(6264133-6264396)
chr2 (4-278)||(11739544-11739820)
chr2 (4-278)||(17848438-17848710)
chr2 (3-278)||(43623565-43623829)
chr2 (4-278)||(14837268-14837538)
chr2 (3-278)||(44289052-44289329)
chr2 (5-278)||(34979562-34979838)
chr2 (3-278)||(3022157-3022442)
chr2 (8-240)||(45239000-45239232)
chr2 (5-278)||(17849113-17849387)
chr2 (59-278)||(5375331-5375550)
chr2 (15-278)||(18800298-18800559)
chr2 (4-173)||(15539566-15539735)
chr2 (19-278)||(28459175-28459435)
chr2 (3-265)||(31732774-31733026)
chr2 (81-282)||(36558845-36559047)
chr2 (81-281)||(36561123-36561324)
chr2 (81-299)||(45332144-45332364)
chr2 (4-265)||(11578105-11578365)
chr2 (4-265)||(17897243-17897502)
chr2 (12-278)||(22874137-22874401)
chr2 (4-227)||(20146645-20146866)
chr2 (122-278)||(22407439-22407596)
chr2 (65-265)||(40699429-40699633)
chr2 (4-278)||(35107294-35107566)
chr2 (3-166)||(38020196-38020349)
chr2 (19-192)||(27136195-27136368)
chr2 (145-278)||(22707736-22707872)
chr2 (82-197)||(20589763-20589881)
chr2 (3-106)||(22163106-22163208)
chr2 (3-82)||(22407591-22407670)
chr2 (52-151)||(38414194-38414291)
chr2 (173-278)||(22163007-22163111)
chr2 (66-265)||(37962939-37963137)
chr2 (67-197)||(43139432-43139564)
chr2 (135-260)||(7462950-7463077)
chr2 (66-197)||(15693958-15694094)
chr2 (67-239)||(17921754-17921927)
chr2 (144-278)||(23870951-23871086)
chr2 (66-193)||(26345661-26345790)
chr2 (67-191)||(30720684-30720811)
chr2 (82-144)||(28458949-28459011)
chr2 (68-124)||(27583479-27583535)
chr2 (82-144)||(2740941-2741002)
chr2 (3-62)||(5377631-5377690)
chr2 (67-144)||(34575230-34575308)
chr2 (82-144)||(2736205-2736266)
chr2 (81-142)||(10942634-10942696)
chr2 (81-142)||(10948503-10948565)
chr2 (82-144)||(17462436-17462497)
chr2 (82-144)||(20054886-20054947)
chr2 (82-144)||(22712637-22712698)
chr2 (82-144)||(22717346-22717407)
chr2 (82-144)||(39686983-39687044)
chr2 (82-144)||(45567409-45567470)
chr2 (67-142)||(7502975-7503052)
chr2 (85-144)||(12781342-12781400)
chr2 (85-144)||(17932637-17932695)
chr2 (85-144)||(17943540-17943598)
chr2 (85-144)||(27517760-27517818)
chr2 (85-144)||(30478997-30479055)
chr2 (67-142)||(35028632-35028707)
chr2 (88-197)||(41303099-41303210)
chr2 (91-197)||(27247968-27248075)
chr2 (85-144)||(37170873-37170931)
chr2 (82-144)||(39680045-39680106)
chr2 (82-130)||(38190997-38191045)
chr2 (239-278)||(15539514-15539553)
chr2 (82-120)||(20050166-20050204)
chr2 (85-118)||(33674551-33674584)
chr2 (82-142)||(45158308-45158369)
chr2 (220-263)||(17057369-17057413)
chr2 (220-263)||(17085352-17085396)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (3-282)||(4024-4302)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (3-278)||(79212-79488)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (1-281)||(6224-6505)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (4-278)||(11458-11733)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (3-299)||(29198-29494)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (4-265)||(14380-14642)
scaffold0131 (3-253)||(15046-15297)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (43-291)||(1425-1673)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (3-299)||(2907-3203)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (1-282)||(66-348)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (4-274)||(79887-80158)
scaffold0004 (82-144)||(188363-188424)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (4-278)||(85258-85534)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (3-205)||(2069-2272)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (4-265)||(15818-16079)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (3-156)||(35666-35819)
scaffold0011 (230-278)||(35849-35897)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (9-197)||(16716-16903)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (45-265)||(1639-1860)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (81-281)||(22221-22421)
scaffold0140 (81-281)||(24496-24696)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (67-197)||(4901-5034)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (230-299)||(1415-1484)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (82-144)||(224819-224880)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (82-194)||(57497-57613)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (214-281)||(4661-4729)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (3-97)||(993-1092)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (85-144)||(16328-16386)
[»] scaffold0474 (1 HSPs)
scaffold0474 (149-196)||(10775-10822)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (85-144)||(17107-17165)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 132)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8631680 - 8631383
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631680 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 8631581  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  8631580 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 8631481  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||   | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8631480 gtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 8631383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 14633391 - 14633687
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14633391 gcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 14633490  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  14633491 tcttggttac-ggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatata 14633589  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccc-ccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14633590 gtg--aaacggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 14633687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 40637146 - 40637422
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40637146 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtc 40637245  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  40637246 tcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 40637345  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  40637346 gtg--gaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 40637422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 11008827 - 11008532
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11008827 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 11008728  T
Q  102 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||    
T  11008727 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-tttgtaatggtactcatcatatag 11008629  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||   |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11008628 tg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 11008532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22046946 - 22046650
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046946 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 22046847  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22046846 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatag 22046747  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccc-ccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||   | |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  22046746 tg--gatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttttgttcttctc 22046650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 37089632 - 37089336
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089632 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 37089533  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  37089532 tcttgattacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatag 37089433  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  37089432 tg--gaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 37089336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 18847225 - 18847521
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18847225 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagcattggagt 18847324  T
Q  102 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||    
T  18847325 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 18847424  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||   |  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  18847425 gtg--gattggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctgttctttgtgttcttctc 18847521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22044651 - 22044355
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044651 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattccccttgggaaacactattaggattgagtc 22044552  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22044551 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatag 22044452  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccc-ccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||   | |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  22044451 tg--gatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttttgttcttctc 22044355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 3 - 276
Target Start/End: Original strand, 48486391 - 48486665
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48486391 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 48486490  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48486491 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgaaatctcttttgtaacgttactcatcatata 48486590  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgtt 276  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||    
T  48486591 gtg--aaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattattttgtgtt 48486665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 2485133 - 2484837
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2485133 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 2485034  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  2485033 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagagataggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatag 2484934  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||   | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2484933 tg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 2484837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 11006498 - 11006218
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11006498 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 11006399  T
Q  102 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||    
T  11006398 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaatggtactcatcatata 11006299  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 282  Q
    |||   | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  11006298 gtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtgttcttctc 11006218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 11435027 - 11435323
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11435027 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 11435126  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    || ||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  11435127 tcctggttaccggaagagtctaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatag 11435226  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||   | |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  11435227 tg--gatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttccttgtgttcttctc 11435323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 38409277 - 38409573
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38409277 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 38409376  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  38409377 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatag 38409476  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||   | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  38409477 tg--gatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgagttcttctcttctttttgttcttctc 38409573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 51015318 - 51015614
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015318 gcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 51015417  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||    
T  51015418 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatag 51015517  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccc-ccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||   | |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  51015518 tg--gatcggaggtctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 51015614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 24880523 - 24880800
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24880523 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcaccttgggaaacactattaggattgagtc 24880622  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaa-gttactcatcatat 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24880623 tcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatat 24880722  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  24880723 agtg--aaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttct 24880800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 38928439 - 38928162
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38928439 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 38928340  T
Q  102 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatat 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38928339 ctcttggttacgggaaaagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatat 38928240  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  38928239 agt--aaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 38928162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 26086236 - 26085947
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26086236 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 26086137  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatagt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  26086136 cttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgttttctctttgtaacgatactcatcatatagt 26086037  T
Q  203 gaaaaacggatggctgctctctccc-ccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgtt 293  Q
    |   | |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  26086036 g--gatcggaaggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgtt 26085947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Original strand, 47274799 - 47275077
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47274799 gcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtc 47274897  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47274898 tcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatata 47274997  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 282  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47274998 gtg--aaacggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 47275077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 22802995 - 22802719
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22802995 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 22802896  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22802895 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatata 22802796  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||   |||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22802795 gtg--gaacggagggtttctctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 22802719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Original strand, 24348290 - 24348570
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348290 gcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 24348389  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24348390 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 24348489  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 282  Q
    |||   | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24348490 gtg--gatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 24348570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Original strand, 24879062 - 24879338
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24879062 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 24879161  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaa-gttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  24879162 cttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgatacacatcatata 24879261  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  24879262 gtg--aaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttct 24879338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 283
Target Start/End: Original strand, 9148325 - 9148605
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148325 gcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 9148424  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  9148425 tcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatag 9148524  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctca 283  Q
    ||   |||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9148525 tg--gaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctca 9148605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 47868473 - 47868772
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47868473 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtc 47868572  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||    
T  47868573 tcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatata 47868672  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  47868673 gtg--gaacggatggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttattctcttctttgtgttcttctc 47868770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 31849860 - 31849563
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggttt-gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31849860 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 31849761  T
Q  102 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||    
T  31849760 ctcttgcttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatata 31849661  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||   | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  31849660 gtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 31849563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 276
Target Start/End: Original strand, 24888868 - 24889142
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24888868 gcaacaacaaaactagggattgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 24888967  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  24888968 tcttggttacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcatgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatata 24889067  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgtt 276  Q
    |||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24889068 gtg--gaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 24889142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 36921755 - 36921478
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36921755 gcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 36921656  T
Q  102 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatat 199  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36921655 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatat 36921556  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  36921555 agtg--gaacggatggctgctctctcccccagactagttaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 36921478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 7941393 - 7941692
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaa--cactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941393 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttacgagcaaatgcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 7941492  T
Q  101 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcata 198  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||    
T  7941493 tctcttggttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcata 7941592  T
Q  199 tagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatc 297  Q
    |||||   |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  7941593 tagtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttttcttctttgtgttcttc 7941690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12396106 - 12395830
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12396106 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 12396007  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12396006 tcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatata 12395907  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||    
T  12395906 gtg--aaacggggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgttct 12395830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 44600101 - 44599820
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44600101 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 44600002  T
Q  100 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcata 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||    
T  44600001 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 44599902  T
Q  199 tagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttct 281  Q
    |||||   |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  44599901 tagtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttct 44599820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 22801122 - 22800847
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22801122 caacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtct 22801023  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22801022 cttgattacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatag 22800923  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||   ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22800922 tg--gaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22800847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 40091675 - 40091400
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40091675 caacaacaaaactagggattgtttagagtttgtctctttggaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtct 40091576  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40091575 cttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatag 40091476  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||  |||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  40091475 tg--aaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 40091400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 33415746 - 33415473
Alignment:
Q  5 aacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  33415746 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt-ggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatcgagtctc 33415648  T
Q  105 ttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatagt 202  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33415647 ttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagt 33415548  T
Q  203 gaaaaacggatggctgctctctccc-ccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |  ||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  33415547 g--aaacggagggctgctctctccctcaggctaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 33415473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12401068 - 12400792
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12401068 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtc 12400969  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12400968 tcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatata 12400869  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||    
T  12400868 gtg--aaacggggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgttct 12400792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22780636 - 22780336
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  22780636 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgga 22780537  T
Q  100 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcata 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||    
T  22780536 gtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcata 22780437  T
Q  199 tagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttc-tcatctttgtgttcat 296  Q
    |||||   |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| |    
T  22780436 tagtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttctt 22780339  T
Q  297 ctc 299  Q
    |||    
T  22780338 ctc 22780336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22783001 - 22782701
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  22783001 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgga 22782902  T
Q  100 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcata 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||    
T  22782901 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcata 22782802  T
Q  199 tagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttc-tcatctttgtgttcat 296  Q
    |||||   |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| |    
T  22782801 tagtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactggatcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttctt 22782704  T
Q  297 ctc 299  Q
    |||    
T  22782703 ctc 22782701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22134876 - 22134582
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134876 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttca-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 22134778  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  22134777 tcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatag 22134678  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||   |  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  22134677 tg--gattggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtcttcttctcttctttgtgttcttctc 22134582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Original strand, 5198492 - 5198772
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5198492 gcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtc 5198591  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||    
T  5198592 ttttggttacgggaagagattggggctttgtgtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatata 5198691  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 282  Q
    |||   |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  5198692 gtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtgttcttctc 5198772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22132651 - 22132355
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132651 gcaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttcg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 22132553  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  22132552 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatag 22132453  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa-tacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||   |  ||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| || |||||||| ||||||||||| ||||    
T  22132452 tg--gattggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttggtcttcttctcttctttgtgttcttctc 22132355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 6764911 - 6765213
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttc-----ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6764911 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactgttaggatt 6765010  T
Q  98 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatc 195  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  6765011 gagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatc 6765110  T
Q  196 atatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttc 294  Q
    ||||||||   |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  6765111 atatagtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttcttggtgttc 6765208  T
Q  295 atctc 299  Q
     ||||    
T  6765209 ttctc 6765213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9176737 - 9176438
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9176737 aagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 9176638  T
Q  100 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcata 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||    
T  9176637 gtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 9176538  T
Q  199 tagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatc 297  Q
    |||||   |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  9176537 tagtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagagtcaacaaatttctttgtgttattctcttctttgtgttcttc 9176440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 16453381 - 16453658
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16453381 gcaacaacaaaactagagtttgtacaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 16453480  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tat 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  16453481 tcttggttacgagaagagattgggactttgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattat 16453580  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||| |||| ||||||||||||    
T  16453581 agtg--aaacagatggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgccaaaaaattcttttgtgttct 16453658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 36919846 - 36919569
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36919846 gcaacaacaaaactagggtttggataaagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 36919747  T
Q  102 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatat 199  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  36919746 ctcttggttacgggaagaggctgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttattcatcatat 36919647  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||| || |  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  36919646 agtggaata--gatggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 36919569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18709424 - 18709127
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18709424 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagttgattcaccttgggaaacactattagggttgagtc 18709325  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  18709324 tcttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatag 18709225  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttc-tcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||   |  ||| | |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  18709224 tg--gattggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 18709127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Original strand, 19095955 - 19096231
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19095955 caacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtc 19096054  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  19096055 tcttggttacgggaagagattagagctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatata 19096154  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19096155 gtg--aaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 19096231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 14787692 - 14787406
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14787692 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 14787593  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14787592 tcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatata 14787493  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctct---cccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatcttt 288  Q
    |||  ||||||| |||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  14787492 gtg--aaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaat--tcttgtgttcttctcttcttt 14787406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16934406 - 16934118
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  16934406 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattgga 16934307  T
Q  100 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcata 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||    
T  16934306 gtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 16934207  T
Q  199 tagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatcttt 288  Q
    |||||   |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  16934206 tagtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctcttcttt 16934118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 619707 - 619433
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  619707 caacaacaaaactagggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgactgt 619608  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  619607 cttggttaagggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggaaaattattcttataacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatag 619508  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  619507 tg--aaacggatgactgctctctcccctaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 619433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9174409 - 9174110
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-a 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9174409 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttgggaaacactattaggattgaa 9174310  T
Q  100 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcata 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| | |||||||||||    
T  9174309 gtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacggtactcatcata 9174210  T
Q  199 tagtgaaaaacggatggctgctctct-cccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatc 297  Q
    |||||   |  ||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  9174209 tagtg--gattggagggctgttctctgccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctcttctttgtgttcttc 9174112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16932052 - 16931764
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  16932052 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattgga 16931953  T
Q  100 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcata 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||    
T  16931952 gtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 16931853  T
Q  199 tagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatcttt 288  Q
    |||||   |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  16931852 tagtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctcttcttt 16931764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 33 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 17662476 - 17662230
Alignment:
Q  33 ttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttg 132  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  17662476 ttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttg 17662377  T
Q  133 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc- 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||   | |||| ||||||||||||||||     
T  17662376 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg--gatcggagggctgctctctccccca 17662279  T
Q  230 gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17662278 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 17662230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 36378364 - 36378641
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  36378364 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtc 36378463  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tat 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  36378464 tcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctcttgtgaagttactcatcattat 36378563  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||    
T  36378564 agtg--gaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattattttgtgttct 36378641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 3824833 - 3824629
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824833 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 3824734  T
Q  101 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcata 198  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  3824733 tctattggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 3824634  T
Q  199 tagtg 203  Q
    |||||    
T  3824633 tagtg 3824629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 5637726 - 5637524
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5637726 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 5637627  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  5637626 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 5637527  T
Q  201 gtg 203  Q
    |||    
T  5637526 gtg 5637524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 206
Target Start/End: Original strand, 13544032 - 13544236
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544032 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 13544130  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544131 tcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatata 13544230  T
Q  201 gtgaaa 206  Q
    ||||||    
T  13544231 gtgaaa 13544236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 278
Target Start/End: Original strand, 36380425 - 36380698
Alignment:
Q  7 caacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36380425 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatctt 36380524  T
Q  107 ggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtg 203  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36380525 ggttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcattatagtg 36380624  T
Q  204 aaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
       ||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  36380625 --gaactgagtgctgctctctcccccagactaggtcaatttggagcgaactgggtaaacaaattcttttgtgttct 36380698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 37313327 - 37313050
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37313327 gcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagagttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtc 37313228  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt--gatctcttttgtaaagttactcatca-tat 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37313227 tcttggttacggaaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattat 37313128  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||   |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| || | | ||||||||| ||||||| ||||    
T  37313127 agtg--gaacggagggctgctctttcccccagactatgtcaatttggaccaaattggatcaacaaattcttttgttttct 37313050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 259
Target Start/End: Original strand, 56030517 - 56030770
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  56030517 caacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagttt 56030616  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |||||||||| |||| |||||||||      
T  56030617 cttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatttcttttgtaacgttattcatcatat-- 56030714  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtca 259  Q
        ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  56030715 ---gaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 56030770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 253
Target Start/End: Original strand, 41997566 - 41997815
Alignment:
Q  5 aacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41997566 aacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctc 41997665  T
Q  105 ttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt--gatctcttttgtaaagttactcatcat-atag 201  Q
    || |||||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41997666 ttagttacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcatcatag 41997765  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaact 253  Q
    ||  ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  41997766 tg--aaacggagggccgctctctccccagactaggttaatttggaccgaact 41997815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 44 - 265
Target Start/End: Original strand, 16455354 - 16455577
Alignment:
Q  44 gaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattag 143  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16455354 gaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattag 16455453  T
Q  144 gcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtca 239  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16455454 gcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcgtcattatagtg--aaacggatgactgctctctcccccagactaggtca 16455551  T
Q  240 atttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  16455552 atttggaccgaactgggtcaacaaat 16455577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Original strand, 19322769 - 19323043
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19322769 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 19322865  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tata 200  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19322866 cttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 19322965  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||   |||||| || ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| | | ||||||| |||| |||||||    
T  19322966 gtg--gaacggagggatgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaattctttagtgttct 19323043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 278
Target Start/End: Original strand, 27499128 - 27499390
Alignment:
Q  14 actagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27499128 actagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggattgagtctattggttacg 27499227  T
Q  114 ggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacgga 212  Q
      ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  ||||| |    
T  27499228 ataagagattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaacctaat-atctcttttgtaaggttactcatcattatattg--aaacgaa 27499324  T
Q  213 tggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
     ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  27499325 gggctgctctttccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27499390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 47211001 - 47210762
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||    
T  47211001 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg------------ttgggaaacactattaggattgagtc 47210914  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||    
T  47210913 tcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatata 47210814  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaact 253  Q
    |||   | |||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  47210813 gtg--gatcggagggctgctctctcccccaaactagatcaatttggaccgaact 47210762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Original strand, 53405202 - 53405497
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  53405202 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtc 53405300  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaga------cttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcat 194  Q
    |||||||||||| |||||  || |||||| |||||||||| ||||||||      |||||||||||||||||||||  ||||||||| || | |||||||    
T  53405301 tcttggttacggaaagaggctgagactttaggtagaattaagcgggagacttattcttattcttgtaacccattgatttctcttttgaaacgatactcat 53405400  T
Q  195 catatagtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttc 294  Q
    |||||||||   ||| ||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  53405401 catatagtg--gaacagagagctgctctc-ccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttttgttcttctcttctttgtgttc 53405497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 79 - 278
Target Start/End: Original strand, 13547302 - 13547502
Alignment:
Q  79 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctc 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||    
T  13547302 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatc 13547401  T
Q  177 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgt 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  13547402 ttttgtaaagttactcatcatatagtg--aaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgt 13547499  T
Q  276 tct 278  Q
    |||    
T  13547500 tct 13547502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 73 - 278
Target Start/End: Original strand, 2891433 - 2891640
Alignment:
Q  73 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg- 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  2891433 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattga 2891532  T
Q  172 -atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatact 268  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||| |||| |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  2891533 tatctcttttgtaaggttactcatcattatagtg--aaacagatgactgctctctcccccagactagtacaacttggaccgaactgggtcaacaaattct 2891630  T
Q  269 tttgtgttct 278  Q
    ||||||||||    
T  2891631 tttgtgttct 2891640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18537724 - 18537509
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||| |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18537724 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaccactagggttgg--ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtca 18537628  T
Q  112 cgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaa 208  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||    
T  18537627 cgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtg--gaa 18537530  T
Q  209 cggatggctgctctctccccc 229  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  18537529 cggagggctgctctctccccc 18537509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18409608 - 18409345
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18409608 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttcgggaacactattaggattgagtc 18409509  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat--ctcttttgtaaagttactcatcat-at 199  Q
    |||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  18409508 tcttagttataggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa-gttacccatcattat 18409410  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
    ||||||| |  ||  | ||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||    
T  18409409 agtgaaacagaga--gttgctctctccctcagactaggtcaatttggattgaactgggtaaacaaat 18409345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 108 - 278
Target Start/End: Original strand, 4215483 - 4215654
Alignment:
Q  108 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaa 205  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  4215483 gttacgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg-- 4215580  T
Q  206 aaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  4215581 gaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4215654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 126 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5635614 - 5635440
Alignment:
Q  126 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat--ctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||    
T  5635614 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat--cggagggctgctctc 5635517  T
Q  224 tccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5635516 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 5635440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18535082 - 18534901
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18535082 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtca 18534986  T
Q  112 cgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcat 194  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||    
T  18534985 cgagaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaactactcat 18534901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 38890476 - 38890222
Alignment:
Q  11 aaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| ||||||| |  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  38890476 aaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacattagggttgg--ggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgatc 38890380  T
Q  111 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaa 207  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||   |    
T  38890379 acgggaagagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtg--ga 38890282  T
Q  208 acggatggctgctctctcccc-cgactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
    || || |||||||||||||||  || |||||||  ||||||||||||| ||| |||||||    
T  38890281 acagagggctgctctctccccaagattaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaat 38890222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 149
Target Start/End: Original strand, 6132944 - 6133090
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6132944 gcaacaacaaaactagggcttgtatagagtttgtctattggcaacaaacactagggtttgagggttgagtcaccctgggaaacactattaggattgagtc 6133043  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga 149  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6133044 tcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga 6133090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 52942707 - 52942536
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52942707 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 52942608  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaa 185  Q
    |||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  52942607 tcttggttacggg-------------tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 52942536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 3937470 - 3937314
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  3937470 gcaacaaaaaaactagagtttgtatagagtttgtttcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattggaattgagtc 3937371  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattct 159  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3937370 tcttggttacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8756510 - 8756276
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8756510 caacaagaaaattaggatttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactaggattgagtct 8756414  T
Q  104 ctt-ggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tat 199  Q
    ||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||| |||    
T  8756413 ctttggtcacgggaagagattgagactttgagtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactaatcattat 8756314  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctcc-cccgactaggtc 238  Q
    ||||   ||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  8756313 agtg--gaacggatggttgctctctcctccagactaggtc 8756276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 125 - 299
Target Start/End: Original strand, 11437557 - 11437731
Alignment:
Q  125 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||    
T  11437557 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggat--cggagggctgctctc 11437654  T
Q  224 tccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  11437655 tcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttccttgtgttcttctc 11437731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 278
Target Start/End: Original strand, 30136640 - 30136898
Alignment:
Q  19 ggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 118  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||||    
T  30136640 ggtttgtatagagttta-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactatgattgggtctcttggtcacgagaag 30136736  T
Q  119 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatgg 215  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |  |||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| |||||    
T  30136737 aaattgtgactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtgactcatcgatatctcttttgtaaagttaatcatcattatagtg--aaacagatgg 30136834  T
Q  216 ctgctctctcc-cccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| | | | ||||||| ||||||||||||    
T  30136835 ctgctctctcctcaatactaggtcaatttggaccgaattggataaacaaattcttttgtgttct 30136898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 66 - 265
Target Start/End: Original strand, 12102221 - 12102424
Alignment:
Q  66 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  12102221 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggtcatgggaaaagattggaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 12102320  T
Q  165 cccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtca-atttggaccgaactaggtca 259  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  12102321 cccactgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtg--gaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaactaggtaa 12102418  T
Q  260 acaaat 265  Q
    ||||||    
T  12102419 acaaat 12102424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 132 - 278
Target Start/End: Original strand, 5101130 - 5101276
Alignment:
Q  132 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatct--cttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc 229  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||     
T  5101130 gggtagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaaatttactcatcatatagt--aaaacggagggctgctatctcccca 5101227  T
Q  230 gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  5101228 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5101276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15032748 - 15032614
Alignment:
Q  65 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 164  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15032748 ggttgattcatatttggaaacactattaggattgagtctcttggacacgagaaaagatttggacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaa 15032649  T
Q  165 cccattg--atctcttttgtaaagttactcatcat 197  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15032648 cccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 15032614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Original strand, 28453818 - 28453950
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 166  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  | ||||| |||||||||| |    
T  28453818 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggaccttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaac 28453917  T
Q  167 cattg--atctcttttgtaaagttactcatcat 197  Q
      |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  28453918 ttttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 28453950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 278
Target Start/End: Original strand, 25357772 - 25357991
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgg----gtagaatt-aggcgggagacttattcttg 161  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     ||||||| ||   | |||||||||||||    
T  25357772 ttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttggatatatagaattaagtttgaagacttattcttg 25357871  T
Q  162 taacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaat-ttggaccgaactagg 256  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||| |||| ||    
T  25357872 taaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagt--agaacggatagctgctctctcccctagactaggtcagtattggacctaactggg 25357969  T
Q  257 tcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    | |||||||  || ||||||||    
T  25357970 taaacaaatttttgtgtgttct 25357991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16186018 - 16185832
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tt 179  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||| ||||| | | ||    
T  16186018 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgatatatctt 16185919  T
Q  180 tgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||||||||| |||||||   ||| || |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||    
T  16185918 tgtaaagttactcatcattatagtg--gaacagagggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaat 16185832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983564
Alignment:
Q  66 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||    
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaa 31983628  T
Q  165 cccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctccc 227  Q
    ||| |||  |||| ||||||||| |||||||||| |||||||   |||||| ||||||||||||||    
T  31983627 ccctttgatatcttttttgtaaaattactcatcattatagtg--gaacggagggctgctctctccc 31983564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 197
Target Start/End: Original strand, 9863791 - 9863974
Alignment:
Q  11 aaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 110  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||| |||| | ||||||||||| |||| |  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  9863791 aaaactagggtttgta--gagtttgt-tcttggcaacaaacactaaggttgg--gtttgattcaccttgggaaaccctattaggattgagtcttttggtc 9863885  T
Q  111 acgggaagagattgggactttgggtagaatt-aggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcat 197  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||   | ||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  9863886 acgggaagagattgagactttgggtagaattaagtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctctttgtaaagttactcatcat 9863974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 3982374 - 3982175
Alignment:
Q  70 attcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga-ttgggactttgggtagaatt-aggcgggagacttattcttgtaacc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||   | ||||| |||||||||||     
T  3982374 attcaccttggagaaacactattaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaaca 3982275  T
Q  167 cattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctccc-ccgactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaac 261  Q
    | |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| |||||||||||||| |  ||||||||| | ||||||||||| |||| |||    
T  3982274 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtg--gaacggagggctgctctctccctcatactaggtcactattggaccgaacaaggtaaac 3982177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 47151092 - 47150959
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  47151092 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 47150993  T
Q  166 ccattg--atctcttttgtaaagttactcatcat 197  Q
    || |||  ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  47150992 cctttgatatctcttttctaaagttgctcatcat 47150959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 40999208 - 40999017
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||   ||||||||||||| ||    | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  40999208 caacaagaaaactaggggttgtatagagtttg-ctcttgacaacaaacactaggattga--gattgattcacctaggaaaacattattaggattgagtct 40999112  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatc 195  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||   |||||||   | ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  40999111 cttggtcacgggaagagatcgagactttgggtagaattaggtttggagactgtgttttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatc 40999017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 38270247 - 38270158
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatta 92  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38270247 gcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtcttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 24446835 - 24446756
Alignment:
Q  13 aactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatta 92  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24446835 aactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 24446756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 177 - 278
Target Start/End: Original strand, 47563009 - 47563109
Alignment:
Q  177 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgt 275  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  47563009 ttttgtaaggttactcatcttatagtgaaa--cggagggctgctctctccccttgactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 47563106  T
Q  276 tct 278  Q
    |||    
T  47563107 tct 47563109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 143
Target Start/End: Original strand, 10112952 - 10113080
Alignment:
Q  11 aaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 110  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||||| | ||||||||||||||||    | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  10112952 aaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttggtc 10113046  T
Q  111 ac-gggaagagattgggactttgggtagaattag 143  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10113047 acggggaagagattaggactttgggtagaattag 10113080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 197
Target Start/End: Original strand, 9022380 - 9022573
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||  |   ||||| | ||||||||||| |||| |  | |||||||||||||| |||||| ||||||||| || |     
T  9022380 caacatcaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttggagaaacagtattaggatagaatt 9022474  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac--ccattgatctct-tttgtaaagttactcatcat 197  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||   | ||||| |||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  9022475 tcttggtcacgggaagagattgagactttgggttgaattaggtttgaagactaattcttgtaacctctattgatatctctttgtaaagttactcatcat 9022573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Original strand, 5101070 - 5101133
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  5101070 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcactttggaacaaacactagggtttgagggt 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 5336964 - 5336903
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5336964 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattagg 5336903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 16489352 - 16489410
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  16489352 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 16489410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 25699752 - 25699810
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25699752 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggacttt-ggtagaattagg 25699810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 4570094 - 4570155
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  4570094 aaacactattaggatcgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 4570155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 7050439 - 7050378
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  7050439 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 7050378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 11853549 - 11853610
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  11853549 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 11853610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 193
Target Start/End: Original strand, 54906722 - 54906852
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 163  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||   |||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  54906722 ttgattcaccatggagaaacactattagaattgagtctcttggtcactggaagagattcaagactttaggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 54906821  T
Q  164 acccattgatctct-tttgtaaagttactca 193  Q
    || | ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  54906822 actctttgatatctctttgtaaagttactca 54906852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 278
Target Start/End: Original strand, 6133113 - 6133185
Alignment:
Q  207 aacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  6133113 aacggatgactgctctctcacccagactaggtcaatttggatcgaattgggtcaacaaattcttttgtgttct 6133185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 124
Target Start/End: Original strand, 10114443 - 10114520
Alignment:
Q  45 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 124  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  10114443 aacaaacactagggttgg--gattgattcactttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgataagagattg 10114520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 14789488 - 14789405
Alignment:
Q  206 aaacggatggctgctctctccccc---gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatcttt 288  Q
    ||||||| |||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  14789488 aaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat--tcttgtgttcttctcttcttt 14789405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 239
Target Start/End: Original strand, 31300427 - 31300580
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatctcttttgta 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| || | ||||| ||||||    
T  31300427 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactcaat-atctc-tttgta 31300523  T
Q  184 aagttactc--atca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtca 239  Q
    |||  ||||  |||| |||||||   |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  31300524 aagaaactcatatcattatagtg--gaacggagggctgctctctccccagactaggtca 31300580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 4556238 - 4556180
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  4556238 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 4556180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 4558314 - 4558372
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  4558314 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 4558372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 8529270 - 8529328
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  8529270 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 8529328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 15316961 - 15317019
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  15316961 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 15317019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 18586969 - 18587027
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  18586969 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 18587027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 151 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 24446754 - 24446639
Alignment:
Q  151 acttattcttgtaacccattgat--ctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggacc 248  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||            |||||||||    
T  24446754 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtg--aaacggagggctgctctctccc------------atttggacc 24446669  T
Q  249 gaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24446668 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 24446639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 55822265 - 55822326
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  55822265 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 55822326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Original strand, 2891389 - 2891434
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaaca 48  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2891389 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaca 2891434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 270
Target Start/End: Original strand, 49088791 - 49088911
Alignment:
Q  153 ttattcttgtaacccattga--tct-cttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc--gactaggtcaatttggac 247  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |  ||   || |||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  49088791 ttattcttgtaactcattgacatcttcttttgtaatgttagtcatcatatagtgaaacagagaa--ctactctctccccccagactaggtcaatttgggc 49088888  T
Q  248 cgaactaggtcaacaaatacttt 270  Q
    |||||| ||||||||||| ||||    
T  49088889 cgaactgggtcaacaaattcttt 49088911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 52942526 - 52942473
Alignment:
Q  225 cccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  52942526 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttct 52942473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 15831144 - 15831202
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  15831144 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgcgtagaattagg 15831202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16689119 - 16689061
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16689119 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16689061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 29609654 - 29609591
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  29609654 gaaacactattagaattgagtctcttgatcacggcaagagattgagacttcgagtagaattagg 29609591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 47566496 - 47566554
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  47566496 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagact-ggaatttgggtagaattagg 47566554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 140
Target Start/End: Original strand, 16638827 - 16638884
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaat 140  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16638827 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgagac-ttgggtagaat 16638884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 38270158 - 38270120
Alignment:
Q  116 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagactt 154  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38270158 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagactt 38270120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 68 - 172
Target Start/End: Original strand, 22295294 - 22295399
Alignment:
Q  68 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaatta-ggcgggagacttattcttgtaacc 166  Q
    ||||||||||| | ||||| | |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  |||||| ||| ||||| ||  | |||||||||| |||||||    
T  22295294 tgattcaccttagtaaacattgttaggatttagtctcttggtcacggaaagagattgaaactttgagtataattagggttgaagacttattcctgtaacc 22295393  T
Q  167 cattga 172  Q
    | ||||    
T  22295394 ctttga 22295399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 54867237 - 54867188
Alignment:
Q  214 ggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 263  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  54867237 ggctgctctctccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 54867188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 143
Target Start/End: Original strand, 3760105 - 3760161
Alignment:
Q  88 tattaggattgagtctcttggttacgggaagaga-ttgggactttgggtagaattag 143  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||    
T  3760105 tattaggattgagtctcttggtcacggaaagagatttagcactttgggtagaattag 3760161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 3937307 - 3937259
Alignment:
Q  230 gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  3937307 gactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcatttgtgttct 3937259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 120
Target Start/End: Original strand, 4884877 - 4884912
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4884877 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 4884912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 263
Target Start/End: Original strand, 5269234 - 5269284
Alignment:
Q  214 ggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 263  Q
    |||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5269234 ggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5269284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 36771396 - 36771457
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  36771396 aaacactattatgattgagtctcttggtcatgggaagaggctgtgac-ttgggtagaattagg 36771457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 4874661 - 4874620
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 123  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  4874661 aaacactattaagatagagtctcttggtcacgggaagagatt 4874620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 5143312 - 5143263
Alignment:
Q  215 gctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 263  Q
    ||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5143312 gctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5143263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 5516444 - 5516367
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaatta 142  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  5516444 ttgattcatcttggagaaacaccattaggtttgggtctcttgctcacgggaagagattcgagactttgcgtagaatta 5516367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 263
Target Start/End: Original strand, 31985678 - 31985726
Alignment:
Q  215 gctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 263  Q
    |||||||||||||| || |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  31985678 gctgctctctccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31985726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 105)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 51750057 - 51750354
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750057 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 51750156  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  51750157 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 51750256  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||   | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  51750257 gtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 51750354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Original strand, 28840700 - 28840994
Alignment:
Q  5 aacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840700 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 28840799  T
Q  105 ttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatagtg 203  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  28840800 ttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtg 28840899  T
Q  204 aaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
       | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28840900 --gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 28840994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 10400090 - 10399794
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10400090 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 10399991  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10399990 cttggttacgggaagagattgggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatag 10399891  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||   | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10399890 tg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 10399794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15295097 - 15294800
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15295097 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 15294998  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  15294997 tcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 15294898  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||  || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15294897 gtg--aatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 15294800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 31735784 - 31735487
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31735784 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaaggttgagtc 31735685  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | |||||||||||||    
T  31735684 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatata 31735585  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||   | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  31735584 gtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 31735487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 17324899 - 17324623
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324899 gcaacaacaaaactggggtttgtatagagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 17324800  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17324799 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatata 17324700  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17324699 gtg--aaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 17324623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 46431970 - 46431683
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431970 gcaacaacaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 46431871  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  46431870 tcttggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatag 46431771  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc---gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatcttt 288  Q
    ||   | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  46431770 tg--gatcggagggctgctctctcccccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttcttt 46431683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 24325681 - 24325980
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24325681 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtc 24325780  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24325781 tcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatata 24325880  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||  || || |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  24325881 gtg--aatcgaatggctgctctctcccccagactaagtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtccttttcttctttgtgttcttctc 24325978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 28842513 - 28842809
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28842513 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtc 28842612  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    | ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  28842613 tattggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatag 28842712  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||   |||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28842713 tg--gaacggagggctaatctctcccccagactaggtcaatttggacagaactaggtcaacaaattctattgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 28842809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12302768 - 12302492
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302768 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 12302669  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12302668 tcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatata 12302569  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12302568 gtg--aaacggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 12302492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 38925741 - 38925468
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38925741 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtc 38925642  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||      
T  38925641 tcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata-- 38925544  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
      | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  38925543 --gtaaaacggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttct 38925468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 2510587 - 2510308
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2510587 gcaaccacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtc 2510488  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2510487 ttttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggc-agagacttattcttgtaacccattgatttctctcttgtaaagttactcatcatata 2510389  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 282  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2510388 gtg--aaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 2510308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 47906288 - 47906564
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47906288 gcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtc 47906387  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  47906388 tcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 47906487  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  || |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  47906488 gtg--aatcggagggctgctctctcccccagacttggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 47906564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 50076934 - 50076659
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50076934 caacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 50076835  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50076834 cttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 50076735  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||   |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  50076734 gtg--gaacggatgactgctctctccccagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 50076659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 3 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 50307810 - 50307540
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50307810 gcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 50307711  T
Q  102 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50307710 ctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatat 50307611  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatactttt 271  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  50307610 agtg--aaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 50307540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 6995963 - 6995687
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6995963 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtc 6995864  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  6995863 tcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggatactttttcttgtaactcattgacatctcttttataacgttactcatcatata 6995764  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcc-cccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6995763 gtg--aaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 6995687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 18307127 - 18307403
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18307127 gcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtc 18307226  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18307227 tcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtgacgcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattat 18307326  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||    
T  18307327 agtg--aaacggatggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaacggagtcaacaaattcttttgtgttct 18307403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 39462537 - 39462813
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39462537 gcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 39462636  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  39462637 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttgtaaccctttgatatctcttttgaaaagttattcatcatata 39462736  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  39462737 gtg--aaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 39462813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 13761855 - 13762151
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13761855 gcaacaacataactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaacttggaaaacactattaggattgagtc 13761954  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  13761955 tcttggttacgggaagagtctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatag 13762054  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||   | |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  13762055 tg--gaccggagggcttctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 13762151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 16226183 - 16226483
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16226183 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 16226282  T
Q  100 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcata 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||    
T  16226283 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 16226382  T
Q  199 tagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttc-tcatctttgtgttcat 296  Q
    |||||   |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| |    
T  16226383 tagtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttctt 16226480  T
Q  297 ctc 299  Q
    |||    
T  16226481 ctc 16226483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Original strand, 13215099 - 13215375
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13215099 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtc 13215198  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga------tctcttttgtaaagttactcatca 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||    
T  13215199 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatttttctcttttgtaaatttactcatca 13215298  T
Q  197 -tatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgt 273  Q
     |||||||   |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  13215299 ttatagtg--gaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgtcaacaaattcttttgt 13215375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 15823564 - 15823840
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15823564 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaatattgagtc 15823663  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  15823664 tcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaacgttactcatcatata 15823763  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||   ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  15823764 gtg--gaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 15823840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 11457737 - 11457462
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| | |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11457737 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtct 11457638  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11457637 cttggttacgcgaagagattgggggtttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatag 11457538  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11457537 tg--aaacggatgtctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 11457462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 39932091 - 39932389
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39932091 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattaaccttgggaaacactattaggattgaatc 39932190  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||    
T  39932191 tcttggttacgggaagagactgagactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatata 39932290  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctct--cccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatct 298  Q
    |||   |||||| |||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  39932291 gtg--gaacggagggctgctctcttcccccatactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttct 39932388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 2949493 - 2949219
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2949493 caacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 2949394  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2949393 cttgtttacgagaatagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatag 2949294  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  2949293 tg--aaacagagggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 2949219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 276
Target Start/End: Original strand, 6823033 - 6823306
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6823033 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtc 6823131  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| | |||||||||||||    
T  6823132 tcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgatactcatcatata 6823231  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgtt 276  Q
    |||   | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6823232 gtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 6823306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Original strand, 20302477 - 20302756
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20302477 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 20302576  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| ||||    
T  20302577 tcttggttatgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcagatag 20302676  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 282  Q
    ||   | |||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20302677 tg--gatcggaggactactctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 20302756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 47179729 - 47180028
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47179729 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 47179828  T
Q  100 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcata 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||    
T  47179829 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 47179928  T
Q  199 tagtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttc-tcatctttgtgttcatc 297  Q
    |||||   |  ||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  47179929 tagtg--gattggagggctgctctctccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttc 47180026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 27337201 - 27336927
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27337201 gcaacaacaaaactagggtttttatagat-ttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgggtc 27337103  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  27337102 tcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatag 27337003  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||   | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  27337002 tg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27336927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 27339393 - 27339118
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27339393 gcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattacgattgagtc 27339294  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  27339293 tcttagttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatag 27339194  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||   | |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27339193 tg--gatcggagggctgatctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 27339118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 16428671 - 16428948
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16428671 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtc 16428770  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | |    
T  16428771 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatttt 16428870  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  16428871 agtg--aaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttct 16428948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 20291475 - 20291771
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20291475 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 20291574  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | | ||||||||||||    
T  20291575 tcttggtcacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgattctcatcatatag 20291674  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||   | |||| || || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20291675 tg--gatcggagggttgttctctcccccacactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttttgttcttctcttctttgtgttcttctc 20291771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 293
Target Start/End: Original strand, 2617535 - 2617825
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2617535 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 2617634  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2617635 cttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatag 2617734  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccc-ccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgtt 293  Q
    ||   | |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||  ||||||||| ||||| || |||||||    
T  2617735 tg--gatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattattttgtgtttttctcttcattgtgtt 2617825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14098233 - 14097956
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14098233 gcaactacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtc 14098134  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaa-gttactcatcatat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14098133 tcttggttacgggaagagattagagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttactcatcatat 14098034  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccc-ccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14098033 agtg--aaacggagggctgctctctcccacaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14097956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 50079080 - 50078807
Alignment:
Q  7 caacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  50079080 caacaaaactagggtttgcatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctt 50078981  T
Q  107 ggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtg 203  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  50078980 ggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtg 50078881  T
Q  204 aaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
       ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||    
T  50078880 --gaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaatttggtaaacaaattcttttgtgttct 50078807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Original strand, 51752385 - 51752678
Alignment:
Q  5 aacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 104  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  51752385 aacaacaaaattagggcttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgtgaaacactattag-attgagtctc 51752483  T
Q  105 ttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatagtg 203  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||| |||||||||    
T  51752484 ttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcaccatatagtg 51752583  T
Q  204 aaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
       |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  51752584 --gattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 51752678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 7 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3579875 - 3579606
Alignment:
Q  7 caacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  3579875 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacacaattaggattgagtctctt 3579776  T
Q  107 ggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatagtga 204  Q
    | |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  3579775 gattacggaaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat-tagtg- 3579678  T
Q  205 aaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgtt 276  Q
     |||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3579677 -aaacggatgattgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 3579606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 31425282 - 31425002
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31425282 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagt 31425183  T
Q  102 ---ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca 196  Q
       ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  31425182 gatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaggcttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatca 31425083  T
Q  197 -tatagtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
     |||||||  ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31425082 ttatagtg--aaacggaaggctgctctctccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 31425002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 47177378 - 47177677
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggat-tga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  47177378 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatggga 47177477  T
Q  100 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcata 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||    
T  47177478 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 47177577  T
Q  199 tagtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttc-tcatctttgtgttcatc 297  Q
    |||||   |  ||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  47177578 tagtg--gattggagggctgctctctccccagactaggtcagattggatcgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttc 47177675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 18839605 - 18839882
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18839605 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 18839704  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tat 199  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  18839705 tcttggttacgagaagagaatgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattat 18839804  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||  |||| || ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  18839805 agtg--aaacagagggctgctctttcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttcgtgttct 18839882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 41646938 - 41647214
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41646938 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 41647037  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41647038 acttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatata 41647137  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcc-cccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  41647138 gtg--aaacggagggctgctctctccatcagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttct 41647214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 9463507 - 9463227
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9463507 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagt 9463408  T
Q  102 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||    
T  9463407 ctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 9463308  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 282  Q
    |||   |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||    
T  9463307 gtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctc 9463227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 28998515 - 28998240
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998515 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 28998416  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||| || |||||||||||||| |    
T  28998415 cttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatatgg 28998316  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||  |||| || || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  28998315 tg--aaactgagggttgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28998240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 29004231 - 29003956
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004231 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 29004132  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||| || |||||||||||||| |    
T  29004131 cttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatatgg 29004032  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||  |||| || || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  29004031 tg--aaactgagggttgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 29003956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 9459679 - 9459400
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9459679 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtc 9459580  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  9459579 tcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatag 9459480  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 282  Q
    ||   |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||    
T  9459479 tg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctc 9459400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 4131642 - 4131362
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4131642 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtc 4131543  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga------tctcttttgtaaagttactcatca 196  Q
    |||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||    
T  4131542 tcttggttacaggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgagaaacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatca 4131444  T
Q  197 -tatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
     |||||||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  4131443 ttatagtg--gaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactatgtcaacaaattcttttgtgttct 4131362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 6756545 - 6756822
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6756545 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 6756644  T
Q  102 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-ta 198  Q
    ||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6756645 ct--tgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 6756742  T
Q  199 tagtgaaaaacggatggctgctctctccccc--gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||||  ||||||| | ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||    
T  6756743 tagtg--aaacggaagactgctctctccccccagactaggtcagtttggaccgaactggatcaacaaattcttttctgttct 6756822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 9241349 - 9241072
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  9241349 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacattattaggattgagtc 9241250  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tat 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9241249 tcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattat 9241150  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||   |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||    
T  9241149 agtg--gaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactggggaaacaaattcttttttgttct 9241072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 17186391 - 17186114
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17186391 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtc 17186292  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt--gatctcttttgtaaagttactcatca-tat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17186291 tcttggttacgggaagagatttgaactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattat 17186192  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    | ||   ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||    
T  17186191 aatg--gaacggagtgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattcttttgtgttct 17186114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 278
Target Start/End: Original strand, 31489935 - 31490206
Alignment:
Q  5 aacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  31489935 aacaacaaaactagggtttgtatagt--ttgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatttc 31490032  T
Q  105 ttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatagt 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  31490033 ttggttacgggaagagattgagactttggatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcatatggt 31490132  T
Q  203 gaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |  ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  31490133 g--aaacggagggctgctctccccccagactaggtcaatttggactgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 31490206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21948450 - 21948226
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21948450 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaacactattaggattgagtc 21948352  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  21948351 tcttggttacgggaagacgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 21948252  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcccc 228  Q
    |||   |||||| |||||||||||||||    
T  21948251 gtg--gaacggagggctgctctctcccc 21948226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 25127890 - 25128167
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25127890 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactatttggattgagtc 25127989  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tat 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  25127990 tcttggttacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaattcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattat 25128089  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctc-ccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    | ||  ||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25128090 attg--aaacggagggctgctctctctcccatactaggtcaattaggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 25128167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 25251537 - 25251261
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25251537 caacaacaaaactagggtttgtataacgtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtct 25251438  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tata 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||| |||| ||||    
T  25251437 ctcggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcattata 25251338  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  |||| || || ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25251337 gtg--aaacagagggttgctctctccccaatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 25251261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Original strand, 40133963 - 40134239
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  40133963 caacaacaaaacgaaggtttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactactaggattgagtct 40134062  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tata 200  Q
    |||||| |||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40134063 cttggtcacgggaagagattgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 40134162  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  40134163 gtg--aaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccggactaggtaaacaaattcttttgtgttct 40134239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 50248834 - 50248557
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50248834 caacaacaaaactatgatttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtct 50248735  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50248734 cttggttacaggaagagatcgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcatatag 50248635  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc---gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||  |||| ||||| || |||||| |||   |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  50248634 tg--aaacagatggttgttctctctcccctagactaggtcaatttggtccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttct 50248557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 17318911 - 17319181
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||      ||||||||||    
T  17318911 gcaacaacaaaactagggtttgtttagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttggaaggttgattcaccttgggaaaca------ggattgagtc 17319004  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tat 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  17319005 tcttggttacgggaacagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacttattgatatctcttttgttaagttactcatcattat 17319104  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17319105 agt--aaaacggagggctgctctctccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 17319181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 28207328 - 28207055
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28207328 caacaacaaaactagggtttgtgtaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcaccttgggaaacactattaggattgtgtct 28207229  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  28207228 cttggttacaggaagagattggggctttgaatataattacgcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc--atag 28207131  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  28207130 tg--aaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28207055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Original strand, 48665195 - 48665398
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48665195 gcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtc 48665294  T
Q  103 tcttggtta-cgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatat 199  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48665295 tcttggttaccgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatat 48665394  T
Q  200 agtg 203  Q
    ||||    
T  48665395 agtg 48665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 265
Target Start/End: Original strand, 17324103 - 17324345
Alignment:
Q  25 tatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 124  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  17324103 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgaatatgggaagagattg 17324202  T
Q  125 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctc 221  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||| |||||||  ||||||| ||||| ||    
T  17324203 gaactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtg--aaacggaaggctggtc 17324300  T
Q  222 tctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324301 tctccccatgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 17324345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 31423137 - 31422851
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaac-aaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |  |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31423137 gcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggcattaaacactagggtttgaaagttgattcaccttgggaaacactattagaattgagt 31423038  T
Q  102 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-ta 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  31423037 ctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcatta 31422938  T
Q  199 tagtgaa----------aaacggatggctgctctctcc-cccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtg 274  Q
    |||||||          |||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||    
T  31422937 tagtgaaagagagggtgaaacagagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgagctgggtgaacaaattcttttgtg 31422851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 33 - 278
Target Start/End: Original strand, 16432442 - 16432690
Alignment:
Q  33 ttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttg 132  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  16432442 ttgtctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactttg 16432541  T
Q  133 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc 229  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||  | ||||||||||||||    
T  16432542 ggtagaattatgcgggacaattattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcattatagtg--aaacggcggactgctctctccccc 16432639  T
Q  230 --gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16432640 aagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 16432690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 52 - 299
Target Start/End: Original strand, 16231630 - 16231878
Alignment:
Q  52 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggag 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16231630 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggag 16231729  T
Q  151 acttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggacc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  |||||||||||||||   |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  16231730 acttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggacc 16231827  T
Q  249 gaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttc-tcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  16231828 gaact-ggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 16231878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 261
Target Start/End: Original strand, 47451666 - 47451919
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |         |||||||||||||    
T  47451666 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattagtgt------ttaggattgagtc 47451759  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47451760 tcttggttacgggaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggaaactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatata 47451859  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaac 261  Q
    |||  ||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47451860 gtg--aaacgaatgactgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 47451919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14183843 - 14183581
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14183843 aaactagggtttgtatagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattataattgagtctcttggtta 14183747  T
Q  112 cgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaa 208  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||    
T  14183746 cgggaagagattagaattttgggtagaattaggcggaagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtg--gaa 14183649  T
Q  209 cggatggctgctctctccccc-gactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtg 274  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||  |||||||    
T  14183648 cggatggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatttttttgtg 14183581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 278
Target Start/End: Original strand, 16429042 - 16429252
Alignment:
Q  70 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16429042 attcaacttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccat 16429141  T
Q  170 tg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  16429142 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagcg--aaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaat 16429239  T
Q  266 acttttgtgttct 278  Q
     ||||||||||||    
T  16429240 tcttttgtgttct 16429252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 77 - 299
Target Start/End: Original strand, 51757623 - 51757845
Alignment:
Q  77 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctc 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  51757623 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgatttc 51757722  T
Q  177 t-tttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtg 274  Q
    | ||||||| | |||||| |||||||||   |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51757723 tctttgtaacgatactcaccatatagtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtg 51757820  T
Q  275 ttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||    
T  51757821 ttcttctcttctttgtgttcttctc 51757845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Original strand, 6823903 - 6824080
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  6823903 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattacgattgaatc 6824002  T
Q  103 tctt-------ggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 173  Q
    ||||       |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6824003 tcttggttacgggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggcagacttattcttgtaacccattgat 6824080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Original strand, 42922252 - 42922513
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| | | ||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  42922252 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggttga--ggttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtct 42922348  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42922349 cttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat-tag 42922447  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctct-cccccgactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
     |   |||||| | ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||    
T  42922448 agtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaat 42922513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 52 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 25248766 - 25248540
Alignment:
Q  52 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaga 151  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  25248766 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggaga 25248667  T
Q  152 cttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggac 247  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| | |||||||  ||||||| | |||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  25248666 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtg--aaacggaggactgctccctcccctagactaggtcaatttggac 25248569  T
Q  248 cgaactaggtcaacaaatacttttgtgtt 276  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25248568 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 25248540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15669648 - 15669431
Alignment:
Q  9 acaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 108  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15669648 acaaaagtagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 15669552  T
Q  109 ttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaa 205  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||| ||||||||| |||||||      
T  15669551 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctctcgtaaagctactcatcattatagtg-- 15669454  T
Q  206 aaacggatggctgctctctcccc 228  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  15669453 gaacggatggctgctctctcccc 15669431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 65 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 6115304 - 6115089
Alignment:
Q  65 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 164  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6115304 ggttgattcaccttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgtaa 6115205  T
Q  165 cccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaa 260  Q
    || ||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  6115204 ccaattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtg--aaacggaatgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaa 6115107  T
Q  261 caaatacttttgtgttct 278  Q
    |||||  |||||||||||    
T  6115106 caaattattttgtgttct 6115089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 81 - 265
Target Start/End: Original strand, 23785935 - 23786120
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-t 178  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23785935 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 23786034  T
Q  179 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||   | |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  23786035 ttgtaacgttactcatcaaatagtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 23786120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 8347532 - 8347343
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| | |||| |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  8347532 caacaagaaaactagggtttgtatagagattg-ctcttggcaacaaacaccaaggttag--ggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtct 8347436  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcat 194  Q
    |||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8347435 cttgatcacgggaagagattgagactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat 8347343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 49495461 - 49495218
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 111  Q
    ||||||||||||| ||| || ||| ||||| | ||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| |    
T  49495461 aaactagggtttgcatatagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gagttgattcaccttgggaaacactaataaaattgagtcttttggtca 49495366  T
Q  112 cgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaa 208  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||    
T  49495365 cggtaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtg--aaa 49495268  T
Q  209 cggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggt 257  Q
    || | ||||  |||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  49495267 cgaagggcttatctctccccaagactatgtcaatttagaccgaactaggt 49495218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18800832 - 18800631
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |  ||||| ||||||||| |  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18800832 caacaagaaaactacggtttgtatagagtttg-ctcttggccacaaatactagggttgg--ggttgattcaccctgagaaacactattaggattgagtct 18800736  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tata 200  Q
    || ||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18800735 ctaggtcacgggtagagatttgaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtatcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 18800636  T
Q  201 gtgaa 205  Q
    |||||    
T  18800635 gtgaa 18800631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 8349311 - 8349119
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8349311 caacaagaaaattaaggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggtttattcaccttgggaaacactattaggattgagttt 8349215  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcat 197  Q
      |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8349214 gatggtcacgggaagagattaggactttaggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaactcattggtatctcttttgttaagttactcatcat 8349119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 278
Target Start/End: Original strand, 23816027 - 23816180
Alignment:
Q  126 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctc 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||   | |||| || |||||||    
T  23816027 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatg--gatcggagggatgctctc 23816124  T
Q  224 tccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  23816125 tcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 23816180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 67 - 241
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155963
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   | ||| | |||||||||||    
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattaggtttgaagagtaattcttgtaac 155887  T
Q  166 ccattgatctct-tttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaat 241  Q
    |  ||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  155888 cttttgttatctctttgtaaagttactcatcattatagtg--gaacggatggctgctctctccccaaactaggtcaat 155963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 30738830 - 30738695
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 165  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  30738830 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 30738731  T
Q  166 ccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatat 199  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  30738730 cctttgatgtctcttttgtaaagttactcatcatat 30738695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13125711 - 13125525
Alignment:
Q  12 aaactagggtttg-tatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 110  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |  |||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||     
T  13125711 aaactagggtttggtatagagtttg-ctcttggcgacaaacactagggttga--ggttgattcacattgggaaacgctgttaggattgaggctcttggtc 13125615  T
Q  111 acgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcat 197  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13125614 aagggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 13125525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 30790602 - 30790412
Alignment:
Q  65 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 163  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  30790602 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 30790504  T
Q  164 acccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtca-atttggaccgaact 253  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||   || ||||| ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  30790503 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtg--gaatggatgactgctctcttcccagactaggtcagttttggaccgaact 30790412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 63 - 197
Target Start/End: Original strand, 16561544 - 16561681
Alignment:
Q  63 tgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttg 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| || |||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||    
T  16561544 tgggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattcttg 16561643  T
Q  162 taacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcat 197  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16561644 taaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 16561681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 26520379 - 26520206
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||||| | ||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26520379 caacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattga--ggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtct 26520283  T
Q  104 cttggttac------gggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 173  Q
    |||||| ||      ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  26520282 cttggtcacagtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggaaacttattcttgtaacccattgat 26520206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 197
Target Start/End: Original strand, 28279326 - 28279480
Alignment:
Q  45 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattag 143  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28279326 aacaaacactagggttgg--gattgattccccttggagaaacactattaggattgagcttcttggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattag 28279423  T
Q  144 g-cgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcat 197  Q
    |   | ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  28279424 gtttgaagactaattcttgtaactcattggcatctcttttgtaaagttactcatcat 28279480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 26613440 - 26613307
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  26613440 ttgattcaccttgggaaacactattcggattgagtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 26613341  T
Q  166 ccattg--atctcttttgtaaagttactcatcat 197  Q
    || |||  |||||||||| ||||||||| |||||    
T  26613340 cctttgatatctcttttggaaagttactaatcat 26613307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 209 - 299
Target Start/End: Original strand, 13358797 - 13358888
Alignment:
Q  209 cggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  13358797 cggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 13358888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 27916525 - 27916779
Alignment:
Q  11 aaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 110  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||     
T  27916525 aaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttggaa--ttgattcaccttggaaaacactattagaattgagtctcttggtc 27916619  T
Q  111 acgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc--cattgatctct-tttgtaaagttactcatc-atatagtgaa 205  Q
    ||  |||||||||| |||||||||| ||||||||   | ||||| |||||| |||||  | ||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||      
T  27916620 acatgaagagattgtgactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttttaaccttctttgatatctctttgtaaagttactcatcgttatagtg-- 27916717  T
Q  206 aaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
     |||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| | ||| |||||||    
T  27916718 gaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattgggtaaacaaat 27916779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Original strand, 14353047 - 14353178
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 164  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||   || || |||||||||||    
T  14353047 ttgattcaccttggagaaacactattaggatttagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattaggtttgaaac-tattcttgtaa 14353145  T
Q  165 cccattgatctcttttgtaaagttactcatcat 197  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  14353146 ccctttgaaatcttttgtaaagttattcatcat 14353178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332613
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaatta 142  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgtgtagaatta 26332613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 197
Target Start/End: Original strand, 43104245 - 43104375
Alignment:
Q  71 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggaga-cttattcttgtaaccca 168  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||| ||||  ||||||||||||||||||   | |||  || ||||||||||||     
T  43104245 ttcaccttggaaaacactattagaattgagtcttttggtcacaggaagacattgaaactttgggtagaattaggtttgaagatttttttcttgtaaccct 43104344  T
Q  169 ttg--atctcttttgtaaagttactcatcat 197  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  43104345 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 43104375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 4144865 - 4144804
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  4144865 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 4144804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13447301 - 13447245
Alignment:
Q  237 tcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgtt 293  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  13447301 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgtt 13447245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 265
Target Start/End: Original strand, 15916562 - 15916673
Alignment:
Q  157 tcttgtaacccattgat--ctcttttgtaaagttactcatcat-atagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaa-tttggaccgaa 251  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15916562 tcttgtaacccattgatatctcttttataaagttactcgtcattatagtggaa--cggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttggaccgaa 15916659  T
Q  252 ctaggtcaacaaat 265  Q
    || ||| |||||||    
T  15916660 ctgggtaaacaaat 15916673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 2232597 - 2232658
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  2232597 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2232658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 14997040 - 14997101
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14997040 aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagagattgagac-ttgggtagaattagg 14997101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21353525 - 21353346
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatctcttttgta 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| || | ||||| ||||||    
T  21353525 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactcaat-atctc-tttgta 21353429  T
Q  184 aagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
    |||  |||||||| |||||||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| ||| |||||||    
T  21353428 aagaaactcatcattatagtg--gatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatctttagaccgaactgggtaaacaaat 21353346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 2401400 - 2401342
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  2401400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2401342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 9526469 - 9526527
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  9526469 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9526527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 25134074 - 25134132
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  25134074 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25134132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 180
Target Start/End: Original strand, 49959129 - 49959244
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 164  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||| | |||||||| || |||||||   || ||| |||||| |||    
T  49959129 ttgattcaccttggagaaacactattaggaatgagtctcttggtcatgagaagagattcgagactttggataaaattaggtttgaaactgattcttttaa 49959228  T
Q  165 cccattgatctctttt 180  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  49959229 ccctttgatatctttt 49959244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13785455 - 13785342
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatctcttt 179  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||   |||||||| |||||||||||||||||||||   || |||| |||||| |||||| |||   |||||    
T  13785455 aaacacaattaggattgagtttcttggtcacaaaaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaagactgattcttataaccctttggaatcttt 13785356  T
Q  180 tgtaaagttactca 193  Q
    ||||||||||||||    
T  13785355 tgtaaagttactca 13785342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 26332814 - 26332719
Alignment:
Q  9 acaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 108  Q
    |||||| |||||||||||  ||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26332814 acaaaaatagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggtttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttgg 26332720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 9521718 - 9521776
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  9521718 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9521776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 2393461 - 2393404
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattag 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| ||||||||||||||    
T  2393461 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagtctgggac-ttgggtagaattag 2393404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 144
Target Start/End: Original strand, 37990772 - 37990836
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||| |  | ||||||||||||||||    
T  37990772 gaaacactattagaattgagtctcttgatcacgagaagagattcgaaattttgggtagaattagg 37990836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 106)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 38394014 - 38394311
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394014 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 38394113  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  38394114 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 38394213  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||   | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  38394214 gtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 38394311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 7472243 - 7471942
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472243 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 7472144  T
Q  101 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcata 198  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  7472143 tctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 7472044  T
Q  199 tagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatc 297  Q
    |||||   | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  7472043 tagtg--gatcggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttatttgtgttcttc 7471946  T
Q  298 tcac 301  Q
    ||||    
T  7471945 tcac 7471942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 48457681 - 48457978
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48457681 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttcattcacctagggaaacactattaggattgagtc 48457780  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  48457781 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 48457880  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  48457881 gtg--gaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 48457978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 40837003 - 40836707
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40837003 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 40836904  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  40836903 tcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatag 40836804  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||   | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  40836803 tg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttttgttcttctc 40836707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 7470283 - 7469984
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7470283 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtc 7470184  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  7470183 tcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 7470084  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||   | |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  7470083 gtg--gatcggagggctgctccctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttatttgtgttcttctc 7469986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20137370 - 20137094
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20137370 gcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtc 20137271  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tat 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20137270 tcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattat 20137171  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  20137170 agtg--aaacggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 20137094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 44724607 - 44724883
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724607 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 44724706  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44724707 tcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatata 44724806  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  44724807 gtg--gaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 44724883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1047187 - 1046888
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047187 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 1047088  T
Q  101 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatat 199  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||    
T  1047087 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatat 1046988  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtg-ttcttctcatctttgtgttcatc 297  Q
    ||||   |  ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  1046987 agtg--gattggagggctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttttttctcttctttgtgttcttc 1046890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Original strand, 20299488 - 20299785
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggttt-gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299488 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 20299587  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20299588 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 20299687  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||   | |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  20299688 gtg--gatcggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctctcctttgtgttcttctc 20299785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 443623 - 443900
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  443623 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 443722  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  443723 tcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatctcttttataacgttactcatcatata 443822  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctct--cccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  ||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  443823 gtg--aaacgaagggctgctctctcccccccgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 443900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Original strand, 1850009 - 1850301
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  1850009 gcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtt 1850108  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  1850109 tcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 1850208  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttc 294  Q
    |||   | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  1850209 gtg--gatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttc 1850301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Original strand, 3878606 - 3878902
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3878606 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggcttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtct 3878705  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3878706 cttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatag 3878805  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||   | |||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3878806 tg--gatcggagggctgctctctcccccagactatgttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 3878902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 1049556 - 1049264
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1049556 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtc 1049457  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  1049456 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatag 1049357  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtg-ttcttctcatctttgtgttc 294  Q
    ||   |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||    
T  1049356 tg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttttttctcttctttgtgttc 1049264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 13099737 - 13099459
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13099737 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtc 13099638  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctc---ttttgtaaagttactcatca-ta 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| ||    
T  13099637 tcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcatta 13099538  T
Q  199 tagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13099537 tagtg--aaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13099459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 44592 - 44889
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  44592 gcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtc 44691  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  44692 ttttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattatgtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 44791  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||   ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  44792 gtg--gaacggatagctgctttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 44889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 20297390 - 20297687
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297390 gcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 20297489  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||    
T  20297490 tcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatata 20297589  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||   |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20297590 gtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttcttctcctctttgtgttcttctc 20297687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 3035749 - 3036049
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035749 gcaacaacaaaactagggtttttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 3035848  T
Q  103 tcttggttacgggaaga---gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcat 197  Q
    |||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || | ||||||||||    
T  3035849 tcttggttacgggaagaagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgcaacgatactcatcat 3035948  T
Q  198 atagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcat 296  Q
    ||||||   |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  3035949 atagtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcctctcttctttgtgttctt 3036046  T
Q  297 ctc 299  Q
    |||    
T  3036047 ctc 3036049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 45 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7092431 - 7092177
Alignment:
Q  45 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7092431 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 7092332  T
Q  145 cgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7092331 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtg--aatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatt 7092234  T
Q  243 tggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  7092233 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 7092177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 288
Target Start/End: Original strand, 20626066 - 20626351
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20626066 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 20626165  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20626166 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 20626265  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatcttt 288  Q
    |||   | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20626266 gtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctcatcttt 20626351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 288
Target Start/End: Original strand, 20629957 - 20630242
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629957 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 20630056  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20630057 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 20630156  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatcttt 288  Q
    |||   | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20630157 gtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctcatcttt 20630242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 288
Target Start/End: Original strand, 20642376 - 20642661
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642376 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 20642475  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20642476 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 20642575  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatcttt 288  Q
    |||   | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20642576 gtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tctcatcttt 20642661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Original strand, 28487583 - 28487873
Alignment:
Q  5 aacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28487583 aacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctc 28487682  T
Q  105 ttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat--ctcttttgtaaagttactcatcatatagt 202  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28487683 ttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagt 28487782  T
Q  203 gaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttc 294  Q
    |||  |  || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  28487783 gaatca--gagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttcttcttttctttgtgttc 28487873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 42331259 - 42330982
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42331259 caacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 42331160  T
Q  104 cttggtt--acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatat 199  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42331159 cttggttacacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattatat 42331060  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||  ||||||| ||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  42331059 agtg--aaacggagggctattctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 42330982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 40946356 - 40946653
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  40946356 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgatttactttggaaaacactattaggattgagtc 40946455  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  40946456 tcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 40946555  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||   | || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  40946556 gtg--gatcgaagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttcttttctttgtgttcttctc 40946653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Original strand, 35658 - 35954
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35658 caacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtct 35757  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35758 cttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatag 35857  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||   ||||||  |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  35858 tg--gaacggagagctgctttctcccctagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaatttttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 35954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 4296195 - 4295919
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4296195 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 4296096  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4296095 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatata 4295996  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  |||| || ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  4295995 gtg--aaacagagggctgctatctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtgaacaaattcttttgtgttct 4295919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 301
Target Start/End: Original strand, 25542560 - 25542855
Alignment:
Q  5 aacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  25542560 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaagactattaggattgagtctc 25542658  T
Q  105 ttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatagtg 203  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  25542659 ttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtg 25542758  T
Q  204 aaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctcac 301  Q
       | ||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  25542759 --gatcggagagctgctctctcccctagactaggttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtttttctcttctttgtgttcttctcac 25542855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Original strand, 28485594 - 28485885
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28485594 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtc 28485693  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat--ctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  28485694 tcttggttacgagaagagattggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 28485793  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttc 294  Q
     ||||  |  || || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28485794 atgaatca--gagggttgctctctcctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttattctcttctttgtgttc 28485885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 18345569 - 18345866
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18345569 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 18345668  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||    
T  18345669 tcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatata 18345768  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||   | |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18345769 gtg--gatcggagggctgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 18345866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 21592404 - 21592128
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  21592404 gcaacaacaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggcaagcactattaggatttagtc 21592305  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21592304 tcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatata 21592205  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21592204 gtg--aaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 21592128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 9680847 - 9681124
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9680847 gcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagt 9680946  T
Q  102 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  9680947 ctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcatat 9681046  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  9681047 agtg--aaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgttct 9681124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 31435308 - 31435031
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435308 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 31435209  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tat 199  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31435208 tcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattat 31435109  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||   |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31435108 agtg--gaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 31435031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Original strand, 24748623 - 24748899
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24748623 caacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattacgattgagtct 24748722  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tata 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24748723 cttggttccgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattata 24748822  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcc-cccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  24748823 gtg--aaacggagggctgctctctcctccagattaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttct 24748899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 276
Target Start/End: Original strand, 9679088 - 9679361
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9679088 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 9679186  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9679187 tcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatata 9679286  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctc-tcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgtt 276  Q
    |||  |||||||   |||||||| | ||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9679287 gtg--aaacggagtactgctctctttcccagactaggtcaatttggaccagactgggtcaacaaattcttttgtgtt 9679361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7351913 - 7351615
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7351913 gcaacaacaaaactaggctttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 7351814  T
Q  102 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  7351813 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatata 7351714  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttc-tcatctttgtgttcatct 298  Q
    |||   |  ||| ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  7351713 gtg--gattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttct 7351616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 21680055 - 21680334
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21680055 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtc 21680154  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21680155 tcttggttaccggaagagattgggactttgggtagaattagacgggagatttattcttgtaacccaatgatatctcttttgtaaggttactcatcatata 21680254  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaa---ctaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  |||| ||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||||||| ||||||    
T  21680255 gtg--aaacagagagctgctctctcccccagactaggtgaatttggaccgaactgctgggtcaacaaatacttttttgttct 21680334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 43253776 - 43253481
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43253776 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 43253678  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||| |||||| |||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43253677 cttgattacggaaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatag 43253578  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccc-ccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||   | | || |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  43253577 tg--gatcagagggctgctctctccctcagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 43253481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Original strand, 21990179 - 21990454
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21990179 caacaacaaaactatgatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattagaattgagtct 21990278  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21990279 cttggttacgggaagagattgaggctttgagtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatag 21990378  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||   ||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21990379 tg--gaacagagggctgctctctccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 21990454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27306490 - 27306228
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27306490 gcaacaacaaaactagggttt-tatagagtttgtctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 27306392  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27306391 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatata 27306292  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
    |||   |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  27306291 gtg--gaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaat 27306228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 31156172 - 31155892
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31156172 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 31156073  T
Q  102 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||| ||||    
T  31156072 ctcttgggtacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcctata 31155973  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 282  Q
    |||   |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||    
T  31155972 gtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctc 31155892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 11355286 - 11355562
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11355286 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 11355385  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  11355386 tcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaacgtttctcatcatata 11355485  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||   ||| ||  ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  11355486 gtg--gaacagagagctgctctctcccctagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttatgttct 11355562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 37412389 - 37412110
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37412389 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 37412290  T
Q  102 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctc---ttttgtaaagttactcatca-t 197  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||| ||||||||||| |    
T  37412289 ctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaggttactcatcatt 37412190  T
Q  198 atagtgaaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||    
T  37412189 atagtg--gaacggatggctgctctctcccctagactgggtcaatttggaccgaactggatcaataaattcttttgtgttct 37412110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 45 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 7094678 - 7094424
Alignment:
Q  45 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7094678 aacaaaca-tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 7094580  T
Q  145 cgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaat 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7094579 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtg--aatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat 7094482  T
Q  242 ttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  7094481 ttggactgaactgggtcaataaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 7094424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 42223185 - 42223462
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42223185 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagt 42223284  T
Q  102 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42223285 ctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctattgatatctcttttgtaacgttactcatcatat 42223384  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  42223385 agtg--aaatggatggctgctctctcccccatactaggtcaattttgatcgaactgggtcaacaaattcttttgttttct 42223462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 39146247 - 39145971
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  39146247 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtct 39146148  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat--ctcttttgtaaagttactcatcat-ata 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  39146147 cttggttacgggaagagattggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattata 39146048  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcccccga-ctaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||||  |||  ||||||||| | |||  | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  39146047 gtgaaa--cggggggctgctcttttccctaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 39145971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 7349534 - 7349259
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7349534 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 7349435  T
Q  102 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  7349434 ctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatata 7349335  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttct 281  Q
    |||   |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    ||||||||||   |||||||||||||    
T  7349334 gtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa----gtcaacaaatttctttgtgttcttct 7349259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 203
Target Start/End: Original strand, 11757258 - 11757460
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggttt-gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757258 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 11757357  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  11757358 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 11757457  T
Q  201 gtg 203  Q
    |||    
T  11757458 gtg 11757460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 265
Target Start/End: Original strand, 21678094 - 21678357
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678094 gcaacatcaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 21678193  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatct--cttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||||||    
T  21678194 tcttggttacgagaagatattgggactttgggtagcattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcatata 21678293  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
    |||||| |  |  |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  21678294 gtgaaacagtg--ggctgctctctcccctagactaggttaatttggaccgaactgggacaacaaat 21678357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 197
Target Start/End: Original strand, 25276169 - 25276365
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25276169 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtc 25276268  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcat 197  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  25276269 tcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 25276365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27832894 - 27832651
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27832894 gcaacaacagaactaaggtttgtatagagtttgtctcttggcaacatacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 27832795  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tat 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  27832794 tcttggttacgggaagagattgagactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttctgtaaagttactcatcattat 27832695  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttg 244  Q
    ||||  ||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27832694 agtg--aaatggagggcttctctctcccccagactaggtcaatttg 27832651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 53 - 299
Target Start/End: Original strand, 38396713 - 38396959
Alignment:
Q  53 ctagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac 152  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38396713 ctaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagac 38396812  T
Q  153 ttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccc-ccgactaggtcaatttggaccga 250  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||   | |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  38396813 ttatttttgtaacccattgatttctctttgtaactttactcatcatatagtg--gatcggagggcttctctctccctcagactaggtcaatttggaccga 38396910  T
Q  251 actaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  38396911 actgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 38396959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 24258491 - 24258772
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24258491 gcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtc 24258590  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca---- 196  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||        
T  24258591 tcttggtcacgggaaaagattgagactttggatagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattat 24258690  T
Q  197 tatagtgaaaaacggatggctgctctctc-ccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaac-aaatacttttgtgttct 278  Q
    |||||||   |||||| ||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||    
T  24258691 tatagtg--gaacggagggctgctctctctttcagactaggtcaatttggaccgaattagatgaacaaaattcttttgtgttct 24258772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24813755 - 24813495
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24813755 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaagaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaagcactattaggattgagtct 24813660  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt--gatctcttttgtaaagttactcatca-tata 200  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  24813659 cttggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttactcatcattata 24813560  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
    |||   | |||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||    
T  24813559 gtg--gagcggatggctgctttctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaat 24813495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24817610 - 24817362
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  24817610 caacaagagaactagggtttgtatagagtttg-ctctttgcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttggaaagcagtattaggattgagtct 24817515  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatca-tata 200  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24817514 cttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatgtctcttttgtaaagttactcatcattata 24817415  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtca-atttggaccgaact 253  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||    
T  24817414 gtg--gaacggatggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaact 24817362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 168
Target Start/End: Original strand, 26804597 - 26804765
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactag---ggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26804597 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattta 26804696  T
Q  100 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 168  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804697 gtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 26804765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22828894 - 22828688
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||   |||||||||||| |||||  ||||||||||  || | |||||||||||||||||||||    
T  22828894 gcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttatctcttgaaaacaaacactagagtttgatggttgattcagattagaaaacactattaggattgagtc 22828795  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tat 199  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| | |||    
T  22828794 tcttggttatgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcattattat 22828695  T
Q  200 agtgaaa 206  Q
    |||||||    
T  22828694 agtgaaa 22828688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20091797 - 20091582
Alignment:
Q  9 acaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || || | |||||| | ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  20091797 acaaaactagggtttgtatagagtttg-ctattggcaacaaagattagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaatctcttgg 20091701  T
Q  109 ttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat--ctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaa 206  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  20091700 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcata--gtggaa 20091603  T
Q  207 aacggatggctgctctctccccc 229  Q
      |||| ||||||||||||||||    
T  20091602 --cggagggctgctctctccccc 20091582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 81 - 265
Target Start/End: Original strand, 2935374 - 2935559
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-t 178  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  2935374 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 2935473  T
Q  179 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||   | |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  2935474 ttgtaacgttactcatcaaatagtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 2935559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22251803 - 22251611
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||        ||||||||||||    
T  22251803 gcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttggga--------taggattgagtc 22251712  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga------tctcttttgtaaagttactcatca 196  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||    
T  22251711 tcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatca 22251612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 81 - 281
Target Start/End: Original strand, 22137184 - 22137384
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-t 178  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  22137184 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctct 22137282  T
Q  179 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 277  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||   | |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  22137283 ttgtaacgttactcatcaaatagtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 22137380  T
Q  278 ttct 281  Q
    ||||    
T  22137381 ttct 22137384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 81 - 281
Target Start/End: Original strand, 40552211 - 40552411
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-t 178  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  40552211 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctct 40552309  T
Q  179 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 277  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||   | |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  40552310 ttgtaacgttactcatcaaatagtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 40552407  T
Q  278 ttct 281  Q
    ||||    
T  40552408 ttct 40552411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 81 - 281
Target Start/End: Original strand, 22108173 - 22108373
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-t 178  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  22108173 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctct 22108271  T
Q  179 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 277  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||   | |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  22108272 ttgtaacgttactcatcaaatagtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 22108369  T
Q  278 ttct 281  Q
    ||||    
T  22108370 ttct 22108373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 81 - 281
Target Start/End: Original strand, 40549933 - 40550133
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-t 178  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  40549933 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctct 40550031  T
Q  179 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 277  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||   | |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  40550032 ttgtaacgttactcatcaaatagtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 40550129  T
Q  278 ttct 281  Q
    ||||    
T  40550130 ttct 40550133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Original strand, 7188571 - 7188832
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7188571 caacaataaaaatagggtttgtatagggtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtct 7188667  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tata 200  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  7188668 cttggtcacgggaatagattgagactttgggtagaattaagcgggagacttatttttataacccattgatatttcttttgtaaagttattcatcattata 7188767  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctc-tcccccgactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
    |||   |||||| |||||||||| ||||| | ||| ||||  ||||||| ||||||||| |||||||    
T  7188768 gtg--gaacggaaggctgctctcttccccagtctatgtcagttttggactgaactaggtaaacaaat 7188832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 81 - 265
Target Start/End: Original strand, 1606486 - 1606670
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-t 178  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  1606486 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctct 1606584  T
Q  179 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||   | |||| |||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||| |||||||||||    
T  1606585 ttgtaacgttactcatcaaatagtg--gatcggagggctgctctctcccccagactagatcagattggaccgaactgggtcaacaaat 1606670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 81 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9027376 - 9027192
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-t 178  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  9027376 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctct 9027278  T
Q  179 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  9027277 ttgtaacgttactcatcaaatagtggata--ggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 9027192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 253
Target Start/End: Original strand, 24465578 - 24465816
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 111  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  24465578 aaactagggtttgtatagcgtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gaattgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggtca 24465673  T
Q  112 cgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaa 208  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||  || |||||||||||| ||||||||| |||| ||  |||    
T  24465674 tgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttttaactcattgatatgtcttttgtaaag-tactcatcattataatg--aaa 24465770  T
Q  209 cggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaact 253  Q
    ||| || |||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||    
T  24465771 cgggtgactgctctctcccccagactagatcaatatgaaccgaact 24465816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 129 - 278
Target Start/End: Original strand, 22393876 - 22394027
Alignment:
Q  129 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| || || ||||||    
T  22393876 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtg--aaacggagggttgttctctc 22393973  T
Q  226 ccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  22393974 ccctagactaggtcaatttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttct 22394027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 108 - 253
Target Start/End: Original strand, 26295580 - 26295727
Alignment:
Q  108 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtga 204  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  26295580 gttacaggaagcgattgtgactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtg- 26295678  T
Q  205 aaaacggatggctgctctctcc-cccgactaggtcaatttggaccgaact 253  Q
     |||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  26295679 -aaacagatgactgctctctcctccagactaggtcaatttggactgaact 26295727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 93
Target Start/End: Original strand, 18567641 - 18567731
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattag 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18567641 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 18567731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Original strand, 11081540 - 11081802
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |   ||||| | ||||||||||||||||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11081540 caacaacaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcactttgggaaacactattaggattgagtct 11081634  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccatt----gatctcttttgtaaagttactcatc-at 197  Q
    |||| | ||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||   | ||||| ||||||||||||| ||     ||||||| ||||||||||||||||  |    
T  11081635 cttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttttgatatctcttgtgtaaagttactcatcttt 11081734  T
Q  198 atagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
    | | ||   ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  11081735 aaaatg--gaacggatggttgctctctcccccagactaggtcaatattggaccgaactgggtaaacaaat 11081802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 67 - 265
Target Start/End: Original strand, 6332311 - 6332513
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggc-gggagacttattcttgtaac 165  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  6332311 ttgattcagtttggaaaacactattaagattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaac 6332410  T
Q  166 ccatt--gatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaa 260  Q
    || ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| | ||| |||||||||  |||||||||| | |||||||||||| ||| ||    
T  6332411 cctttaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtg--gaacggaagactgttctctcccctagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaa 6332508  T
Q  261 caaat 265  Q
    |||||    
T  6332509 caaat 6332513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16297058
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattag-gcgggagacttattcttgtaac 165  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    | ||| | |||||||||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagatttgaagattgattcttgtaac 16297123  T
Q  166 ccatt---gatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctcccc 228  Q
    || ||    |||||||||| |||||||||||||| ||||||  | ||||||  ||||||||||||||    
T  16297122 ccttttaatatctcttttgcaaagttactcatcattatagt--agaacggagagctgctctctcccc 16297058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 122
Target Start/End: Original strand, 22392502 - 22392608
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 111  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || || | ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22392502 aaactagggtttgtatagaatttg-ctattggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtca 22392597  T
Q  112 cgggaagagat 122  Q
    |||||||||||    
T  22392598 cgggaagagat 22392608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 197
Target Start/End: Original strand, 6348912 - 6349006
Alignment:
Q  105 ttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcat 197  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  6348912 ttggtcacgggaaaagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcat 6349006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 217 - 299
Target Start/End: Original strand, 11759369 - 11759452
Alignment:
Q  217 tgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  11759369 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctctcctttgtgttcttctc 11759452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 197
Target Start/End: Original strand, 6048903 - 6049094
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||  |   ||||| | ||||||||||||| |||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||    
T  6048903 caacatcaaaactagggtttgtaaagaatt---ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggattgattcaccttgaagaaacactattaggattgaatc 6048997  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatct-cttttgtaaagttactcatcat 197  Q
    ||||||| ||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||   | |||| ||||||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  6048998 tcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaattaggtttgaagacgtattcttataaccctttgatatccctttgtaaagttactcatcat 6049094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 40281572 - 40281451
Alignment:
Q  70 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccca 168  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||   | |||||||||||||||||||     
T  40281572 attcaccttgggaaacaccgttaggattgagtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaagacttattcttgtaaccct 40281473  T
Q  169 ttgatctcttttgtaaagttactcatc 195  Q
    ||||     ||||||||||||||||||    
T  40281472 ttga-----tttgtaaagttactcatc 40281451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 144
Target Start/End: Original strand, 11084467 - 11084544
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  11084467 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattcgaactttgggtaaaattagg 11084544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 144
Target Start/End: Original strand, 26210631 - 26210710
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  26210631 ttgattcaccttggagaaatactattaggattgagtctcttggtaacggaaagagattcgggactttcggtagaattagg 26210710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 21369642 - 21369703
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  21369642 aaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggac-ttgggtaaaattagg 21369703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 144
Target Start/End: Original strand, 2120881 - 2120960
Alignment:
Q  66 gttgattcaccttggg--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  2120881 gttgattcaccttggacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2120960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 3320232 - 3320171
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  3320232 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3320171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 3324980 - 3324919
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  3324980 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3324919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 7069780 - 7069841
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  7069780 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 7069841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 7074787 - 7074848
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  7074787 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 7074848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 25351353 - 25351414
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  25351353 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25351414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 25357047 - 25357108
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  25357047 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25357108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 25405393 - 25405454
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  25405393 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25405454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 25410130 - 25410191
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  25410130 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25410191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 42006663 - 42006724
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  42006663 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 42006724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 12310234 - 12310157
Alignment:
Q  45 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 123  Q
    |||||||||||||||| |  | |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12310234 aacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgaacaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 12310157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13290672 - 13290540
Alignment:
Q  68 tgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 165  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||| ||| | ||| ||||||||||||||   | ||| | |||||||||||    
T  13290672 tgattcaccttcgagaaacactattagaatttagtctcttggtcacaggaagatattagaactctgggtagaattaggtttgaagaataattcttgtaac 13290573  T
Q  166 ccattgatctct-tttgtaaagttactcatcat 197  Q
    |  ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  13290572 cttttgatatctctttgtaaagttactcatcat 13290540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 30246973 - 30247031
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  30246973 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 30247031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 44512704 - 44512646
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  44512704 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 44512646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 8378686 - 8378625
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  8378686 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 8378625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 15541177 - 15541116
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| |||||||    
T  15541177 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtataattagg 15541116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 123 - 197
Target Start/End: Original strand, 6046641 - 6046717
Alignment:
Q  123 tgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  6046641 tgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaacctttgatatctctttgtaaagttactcatcat 6046717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 278
Target Start/End: Original strand, 26804766 - 26804814
Alignment:
Q  230 gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  26804766 gactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 26804814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 44144045 - 44143997
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  44144045 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttgg 44143997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 34547042 - 34546984
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| |||||||    
T  34547042 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattagg 34546984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 6067373 - 6067332
Alignment:
Q  91 taggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttg 132  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  6067373 taggatttagtctcttggtcacgggaagagattgagactttg 6067332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Original strand, 8260584 - 8260625
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 123  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  8260584 aaaccctattaggattgagtgtcttggtcacgggaagagatt 8260625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 263
Target Start/End: Original strand, 9190052 - 9190101
Alignment:
Q  215 gctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 263  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  9190052 gctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9190101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 12097911 - 12097867
Alignment:
Q  220 tctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 263  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12097911 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 12097867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 14653900 - 14653852
Alignment:
Q  233 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttct 281  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  14653900 taggtcaatttagactgaactaggtaaacaaatattgttgtgttcttct 14653852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 149)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 38890038 - 38890335
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890038 gcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 38890137  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  38890138 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 38890237  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||   | |||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  38890238 gtg--gatcggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 38890335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 4104154 - 4103858
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4104154 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 4104055  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  4104054 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatag 4103955  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||   | |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4103954 tg--gatcggagggctgctatctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 4103858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 1313407 - 1313683
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1313407 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 1313506  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1313507 tcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatata 1313606  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  1313607 gtg--aaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1313683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 53917922 - 53917647
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53917922 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 53917823  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53917822 cttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatag 53917723  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  53917722 tg--aaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 53917647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 5191651 - 5191946
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191651 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 5191750  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  5191751 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatag 5191850  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||   | | || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5191851 tg--gatcagagggctgttctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 5191946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 51727265 - 51726969
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51727265 gcaacaacaaaactagggtatgtatagagtttgtctctttggaacaaacact-gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 51727167  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  51727166 tcttggttacggtaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 51727067  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  51727066 gtg--gaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 51726969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 4308540 - 4308264
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308540 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 4308441  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  4308440 tcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 4308341  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||   |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  4308340 gtg--gaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4308264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 299
Target Start/End: Original strand, 1321483 - 1321774
Alignment:
Q  9 acaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321483 acaaaactcgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 1321582  T
Q  109 ttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaa 206  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||       
T  1321583 ttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg--g 1321680  T
Q  207 aacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1321681 atcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 1321774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 28102261 - 28101985
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28102261 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtc 28102162  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28102161 tcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttacttatcatata 28102062  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcccccga-ctaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28102061 gtg--gaacggatggctgctctctccccaaagctaggtcaatttggaccaaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 28101985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 10956286 - 10955989
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10956286 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacattattaggattgagtc 10956187  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  10956186 tcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 10956087  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcc-cccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||   |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10956086 gtg--gaacggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 10955989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 25388902 - 25389189
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  25388902 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-ggaaacactattaggattgga 25389000  T
Q  100 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcata 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  25389001 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacatattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 25389100  T
Q  199 tagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatcttt 288  Q
    |||||   | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  25389101 tagtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctcttcttt 25389189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 10084648 - 10084351
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10084648 gcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtc 10084549  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  10084548 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 10084449  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||   | |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10084448 gtg--gatcggagggctgctctctccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 10084351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 1626942 - 1626666
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1626942 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtc 1626843  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1626842 tcttggttacggggagagattgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatata 1626743  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctc-ccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1626742 gtg--aaacggagggctgctctctcgcccagactaggtcgatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 1626666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18099429 - 18099153
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099429 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 18099330  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18099329 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacattactcatcatata 18099230  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||   |||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  18099229 gtg--gaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatatggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 18099153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 43228289 - 43228565
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43228289 gcaacaacaaaactagcgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 43228388  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  43228389 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 43228488  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||   | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  43228489 gtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttct 43228565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Original strand, 3859526 - 3859805
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859526 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 3859625  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||    
T  3859626 tcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctctttgtaacaatactcatcatatag 3859725  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 282  Q
    ||   | || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3859726 tg--gatcgtagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 3859805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 45882937 - 45883214
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45882937 gcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 45883036  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45883037 tcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatata 45883136  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc--gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||   |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  45883137 gtg--gaacggagggctgctctctccccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 45883214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 10958582 - 10958285
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10958582 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 10958483  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||| ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10958482 tcttggttatgggaagaggctgacactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcttcatata 10958383  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10958382 gtg--gaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttatgttcttctcttctttgtgttcttctc 10958285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 27101440 - 27101164
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101440 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 27101341  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||    
T  27101340 tcttggttacaggaagagaatgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgcaacgttactcatcatata 27101241  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  27101240 gtg--gaacggatggctgctctctcccccagaataggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttct 27101164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28413293 - 28412992
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-a 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28413293 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaa 28413194  T
Q  100 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcata 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||    
T  28413193 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 28413094  T
Q  199 tagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa-tacttttgtgttcttc-tcatctttgtgttca 295  Q
    |||||   |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||     
T  28413093 tagtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaattaggtcaacaaatttcttttgtgttcttcttcttctttgtgttct 28412996  T
Q  296 tctc 299  Q
    ||||    
T  28412995 tctc 28412992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 42990302 - 42990578
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990302 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 42990401  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||     
T  42990402 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatg 42990501  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  42990502 gtg--aatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 42990578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 43421674 - 43421398
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43421674 gcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtc 43421575  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43421574 tcttggttacgggaaaagattggggatttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatata 43421475  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  43421474 gtg--aaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 43421398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 43423722 - 43423446
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43423722 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 43423623  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43423622 tcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatata 43423523  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccc-ccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  |||| ||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  43423522 gtg--aaactgagagctgctctctccctgagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 43423446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 746753 - 747053
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  746753 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 746852  T
Q  100 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcata 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  746853 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 746952  T
Q  199 tagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttc-tcatctttgtgttcat 296  Q
    |||||   | |||| | |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||| || ||||||||||| |    
T  746953 tagtg--gatcggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttctt 747050  T
Q  297 ctc 299  Q
    |||    
T  747051 ctc 747053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 278
Target Start/End: Original strand, 3314684 - 3314959
Alignment:
Q  5 aacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3314684 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 3314783  T
Q  105 ttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatag 201  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  3314784 ttggttacaggaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattattcatcattatag 3314883  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  3314884 tg--aaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3314959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 11170402 - 11170678
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11170402 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgcggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtg 11170501  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  11170502 tcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 11170601  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  11170602 gtg--gaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgggccgaactgggtcaacaaattcttttgttttct 11170678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18097159 - 18096883
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18097159 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 18097060  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||    
T  18097059 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttcccttttgtaacgttactcatcatata 18096960  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||   ||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  18096959 gtg--gaacggagagctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacgaattcttttgtgttct 18096883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Original strand, 25533440 - 25533720
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533440 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 25533539  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    | ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  25533540 ttttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 25533639  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 282  Q
    |||   | |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25533640 gtg--gatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 25533720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 51943369 - 51943644
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51943369 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 51943468  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  51943469 tcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggcgggagactt-ttcttgtaactcattgacgtctcttttgtaacgttactcatcatata 51943567  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  51943568 gtg--aaacggatggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttct 51943644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 53915754 - 53915479
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  53915754 caacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgtgaaacattattaggattgagtct 53915655  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  53915654 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatttag 53915555  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  53915554 tg--aaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttgactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 53915479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 458282 - 458580
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  458282 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 458381  T
Q  102 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  458382 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatata 458481  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttc-tcatctttgtgttcatct 298  Q
    |||   |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  458482 gtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcaggttggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttct 458579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22114564 - 22114267
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114564 gcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 22114465  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  22114464 tcttggttacgggaagaggctgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 22114365  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
     ||  || |||| || || ||||||||||  || | || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  22114364 atg--aatcggagggatgatctctcccccaaacaaagtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttttttgtgttcttctc 22114267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 9604866 - 9604590
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9604866 gcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 9604767  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  9604766 tcttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 9604667  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||   | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9604666 gtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 9604590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 30005839 - 30006115
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30005839 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatc 30005938  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  30005939 tcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 30006038  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||   |||||| |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  30006039 gtg--gaacggagggctgctctctcccctagattagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 30006115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Original strand, 50493995 - 50494276
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50493995 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 50494094  T
Q  100 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcata 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||    
T  50494095 gtctcttggttacgggaagggattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 50494194  T
Q  199 tagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttct 281  Q
    |||||   |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  50494195 tagtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttct 50494276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 10621791 - 10621491
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10621791 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 10621692  T
Q  100 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcata 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||    
T  10621691 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 10621592  T
Q  199 tagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttc-tcatctttgtgttcat 296  Q
    |||||   |  ||| |||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||| || ||||||||||| |    
T  10621591 tagtg--gattggagggctgctctctcccccagactagctcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttctt 10621494  T
Q  297 ctc 299  Q
    |||    
T  10621493 ctc 10621491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 455905 - 456203
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  455905 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 456004  T
Q  102 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  456005 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatata 456104  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttc-tcatctttgtgttcatct 298  Q
    |||   |  ||| |||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  456105 gtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcgggttggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttct 456202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 880711 - 880434
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  880711 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagttcgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagcattgagt 880612  T
Q  102 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatat 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  880611 ctcttggttacggaaagagattggggctttgggtagaattagacgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatat 880512  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  |||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  880511 agt--aaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgttct 880434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 33 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5522855 - 5522589
Alignment:
Q  33 ttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttg 132  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5522855 ttgtctcttcggaacaaacactcgggtttgtgggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttg 5522756  T
Q  133 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccc-ccg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||   | |||| |||||||||||||| | |    
T  5522755 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtg--gatcggagggctgctctctcccgcag 5522658  T
Q  231 actaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5522657 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 5522589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6066055 - 6065757
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6066055 gcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 6065956  T
Q  102 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  6065955 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatata 6065856  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttct-catctttgtgttcatct 298  Q
    |||   |  |||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  6065855 gtg--gattggatggctgctctctcccctagactaggtcagattggacagaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctccttctttgtgttcttct 6065758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 18162661 - 18162937
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18162661 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 18162760  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaa-gttactcatcatat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||| ||||||||||||||    
T  18162761 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatttattttgtaaacgttactcatcatat 18162860  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||  |||||||||||    
T  18162861 agtg--aaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga-cgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttct 18162937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 5927023 - 5926755
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5927023 gcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgccttgggaaacactattaggattgagtc 5926924  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt--gatctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||    
T  5926923 tcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatatcttttgtaaggttactcatcatata 5926824  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccc-ccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttt 270  Q
     ||  ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5926823 atg--aaacggatgactgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 5926755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Original strand, 24979706 - 24979982
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24979706 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtct 24979805  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt--gatctcttttgtaaa-gttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||   |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  24979806 cttggttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacaaattaatatcttttttgtaaacgttactcatcatata 24979905  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24979906 gtg--aaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 24979982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 3 - 265
Target Start/End: Original strand, 43226084 - 43226346
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43226084 gcaacaacaaaactacg-tttgtatagagtttgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 43226182  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  43226183 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 43226282  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
    |||   | |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43226283 gtg--gatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 43226346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 27 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 7606822 - 7606567
Alignment:
Q  27 tagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 126  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  7606822 tagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 7606723  T
Q  127 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctc 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||   | |||| ||||||||||||    
T  7606722 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctatttgtaacgttactcgtcatatagtg--gatcggagggctgctctctc 7606625  T
Q  226 cccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 282  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7606624 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 7606567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6063705 - 6063407
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6063705 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 6063606  T
Q  102 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  6063605 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatata 6063506  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttct-catctttgtgttcatct 298  Q
    |||   |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||   ||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  6063505 gtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtccacaaatttctttgtgttcttctccttctttgtgttcttct 6063408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 26720546 - 26720842
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||     
T  26720546 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggtta-actattaggattgagtt 26720644  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||| | |||||||||||||    
T  26720645 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttttaaccctttgatttctcttttgtaacgatactcatcatata 26720744  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||   |||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26720745 gtg--gaacggatgactgctctctcccctagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaccaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 26720842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 39715467 - 39715739
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39715467 gcaacaccaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtc 39715566  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  39715567 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc--ata 39715664  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  |||| ||||| ||||||| ||||  ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39715665 gtg--aaacagatggttgctctc-ccccatactagatcattttggaccaaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 39715739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 38210366 - 38210666
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38210366 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 38210465  T
Q  100 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcata 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||    
T  38210466 gtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 38210565  T
Q  199 tagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt-ctcatctttgtgttcat 296  Q
    |||||   |  |||  |||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  38210566 tagtg--gattggagagctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcctcttctttgtgttctt 38210663  T
Q  297 ctc 299  Q
    |||    
T  38210664 ctc 38210666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 48361929 - 48361654
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48361929 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtct 48361830  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  48361829 cttagttacgggaagagattggggcttttggtagaattaggcggaagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcataatatag 48361730  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |  ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  48361729 t--aaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 48361654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 278
Target Start/End: Original strand, 6484372 - 6484634
Alignment:
Q  18 gggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6484372 gggtttgtgtagagtttgtctcttcggcaacaaataccggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttggttacggga 6484471  T
Q  117 agagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatg 214  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  6484472 agagattggggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatatcttttttgtaaagttactcatcatatagtg--aaacggagg 6484569  T
Q  215 gctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  6484570 gctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6484634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 10191568 - 10191274
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10191568 gcaataacaaaactagggtttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtc 10191469  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  10191468 tcttggttacaggaagaggct-ggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttcatttctcttttgtaacgttactcatcatata 10191370  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccc-ccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||   | |||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10191369 gtg--gatcggagggctgctctctccctaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat--tattgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 10191274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12268216 - 12267958
Alignment:
Q  11 aaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12268216 aaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttcggaaacactattaggattgagtctcttggt 12268117  T
Q  110 tacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaac 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  12268116 tacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa---------ctcttttgtaacgttactcatcatatagtg--aaac 12268028  T
Q  210 ggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
     || ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12268027 agagggctgctctctcccccaaactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 12267958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 47149154 - 47148878
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaa-caaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || ||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  47149154 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggttgattcaccttgg-aaacactattatgattgagt 47149056  T
Q  102 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  47149055 ctcttggttacgggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtatcgttactcatcatat 47148956  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||  |||| || | |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  47148955 agtg--aaacagaggactgctctctcccccagactatgtcaatttggcccgaactaggtcaacaaattattctgtgttct 47148878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 53468714 - 53468436
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  53468714 gcaacaacaaaaccagg-tttgtatagagtttgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcaccttgggaaacactattaggattgaatc 53468616  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tat 199  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  53468615 tcttggttacggggagagattgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattat 53468516  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccccc---gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||  ||||||| |||||||||  |||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  53468515 agtg--aaacggagggctgctctaccccccagacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 53468436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 32264298 - 32264021
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32264298 gcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 32264199  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctc---ttttgtaaagttactcatca-ta 198  Q
    ||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| ||    
T  32264198 tcttggttatgggaagaggctggaactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcatta 32264099  T
Q  199 tagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||||   |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  32264098 tagtg--gaacggagggctgctctctcccccagactaggtctatttggaccaaactggatcaac-aattcttttgtgttct 32264021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Original strand, 36011826 - 36012101
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |    
T  36011826 caacaacgaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcacgttgggaaacactattaggattgaatat 36011925  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36011926 cttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattagttgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatag 36012025  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctc-tcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||   ||| || |||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  36012026 tg--gaacagagggctgctctcttcttcagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttct 36012101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 35777417 - 35777587
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35777417 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 35777516  T
Q  100 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35777517 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 35777587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 33 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 51674995 - 51674749
Alignment:
Q  33 ttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttg 132  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  51674995 ttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggattttg 51674896  T
Q  133 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc- 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||     
T  51674895 gatagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatactg--aaatggagggctgctctctccccca 51674798  T
Q  230 gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  51674797 taccaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 51674749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 278
Target Start/End: Original strand, 32219106 - 32219359
Alignment:
Q  27 tagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 126  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32219106 tagagtttgtctctttgtaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttgcgggaagagattggg 32219205  T
Q  127 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaa-gttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctc 223  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  32219206 actttgggcagaattaggcggaagacttatttttgtaacccattgatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtg--aaacggatggctgctctc 32219303  T
Q  224 tc-ccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    || ||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  32219304 tctcccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 32219359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 197
Target Start/End: Original strand, 6561808 - 6562005
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6561808 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 6561907  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctc---ttttgtaaagttactcatcat 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   |||||||| || |||||||||    
T  6561908 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctttttgtaaggtaactcatcat 6562005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 56 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 25688367 - 25688143
Alignment:
Q  56 gggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagactta 155  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688367 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactta 25688268  T
Q  156 ttcttgtaacccattg--atctcttttgtaaa-gttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaa 251  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25688267 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtg--aaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 25688170  T
Q  252 ctaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    || |||||| || | ||||||||||||    
T  25688169 ctgggtcaaaaagttcttttgtgttct 25688143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 226
Target Start/End: Original strand, 29956685 - 29956907
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29956685 caacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatct 29956784  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29956785 cttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatag 29956884  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctcc 226  Q
    ||   |||||| |||||||||||||    
T  29956885 tg--gaacggagggctgctctctcc 29956907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 28761686 - 28761410
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28761686 caacaacaaaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtct 28761588  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tata 200  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28761587 cttggttacaggaagatattgagactttaggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 28761488  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaa-tttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||| ||||||| ||||    
T  28761487 gtg--aaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaattttggatcgaactgggtaaacaaattcttttgttttct 28761410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 890029 - 889781
Alignment:
Q  7 caacaaaac-tagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| || || |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  890029 caacaaaacctagggtttgtatagagtttgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 889930  T
Q  105 ttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatagt 202  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  889929 ttggttacgggaagag-ttggggctttgggtagaattaggcaggagagttattcttgtaacccactgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagt 889831  T
Q  203 gaaaaacggatggctgctctctccc-ccgactaggtcaatttggaccgaact 253  Q
    |  ||||||| ||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  889830 g--aaacggagggctgatttctcccgcagactaggtcaatttggaccgaact 889781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 53 - 278
Target Start/End: Original strand, 6231849 - 6232074
Alignment:
Q  53 ctagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac 152  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6231849 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtagaattaggcgggagac 6231947  T
Q  153 ttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctct-cccccgactaggtcaatttggacc 248  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || ||||   |||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  6231948 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagctactcatcattacagtg---aacggagggctgctgtctccccccgattaggtcaatttggacc 6232044  T
Q  249 gaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  6232045 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6232074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 69 - 299
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168396
Alignment:
Q  69 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccca 11168264  T
Q  169 ttga--tctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
    ||||  |||||||||||| |||||| |||||||| ||   |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  11168265 ttgatttctcttttgtaacgttacttatcatatattg--gaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaacttggtcaacaaat 11168362  T
Q  266 acttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
     |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  11168363 tcttttgtgttcttctcttctttttgttcttctc 11168396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Original strand, 23633458 - 23633727
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23633458 caacaagaaaactagggtttgtatagtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgatttacc--gggaaacactattaggattgagtct 23633552  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatca-tatag 201  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  23633553 cttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccgatgatatctctttgtaaagttactcatcattatag 23633652  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||    
T  23633653 tgaaaa--ggagggctgctctctccccagactaggtcaatttagaccgaaatgggtaaacaaattcttttgtgttct 23633727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 54691830 - 54691559
Alignment:
Q  6 acaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |    
T  54691830 acaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaattttt 54691731  T
Q  106 tggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatagtg 203  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||   |||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  54691730 tggttatgggaagagattagggctttgagttgaattaggcgggagacttattcttgtatttcattgatatctcttttgtaacgttacccatcatatagt- 54691632  T
Q  204 aaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgtt 276  Q
      ||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  54691631 -taaacggagggctgctctctcccctagactatgtcaatttgaactgaactaggtcgacaaattcttttatgtt 54691559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 33 - 263
Target Start/End: Original strand, 53591212 - 53591442
Alignment:
Q  33 ttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttg 132  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||    
T  53591212 ttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattcgaattgagtctcttggttacgagaatagatttggattttg 53591311  T
Q  133 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctcccccg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||| | || |||||||||||| |    
T  53591312 ggtagaattaggcgggagacttattcttctaatccattgatatctcatttgtaacgttactcatcatatagtg--aaacgaagggatgctctctccccag 53591409  T
Q  231 actaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53591410 actaggtcaatttggatcgaactaggtcaacaa 53591442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 66 - 278
Target Start/End: Original strand, 5886261 - 5886472
Alignment:
Q  66 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 165  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5886261 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5886359  T
Q  166 ccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 263  Q
    |||||||| | | |||| || ||||||||||||||||||   | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5886360 ccattgatttgtctttgaaacgttactcatcatatagtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 5886457  T
Q  264 atacttttgtgttct 278  Q
    || ||||||||||||    
T  5886458 attcttttgtgttct 5886472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 66 - 278
Target Start/End: Original strand, 5899734 - 5899945
Alignment:
Q  66 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 165  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5899734 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5899832  T
Q  166 ccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 263  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||   | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5899833 ccattgatttctctttgcaacgttactcatcatatagtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 5899930  T
Q  264 atacttttgtgttct 278  Q
    || ||||||||||||    
T  5899931 attcttttgtgttct 5899945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 45 - 278
Target Start/End: Original strand, 4666554 - 4666788
Alignment:
Q  45 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4666554 aacagacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 4666653  T
Q  145 cgggaga--cttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtca 239  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| |||||  |||||||| ||||||||||    
T  4666654 cgggagatccttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtg--aaacggagggctg--ctctccccagactaggtca 4666749  T
Q  240 atttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  4666750 atttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttct 4666788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 278
Target Start/End: Original strand, 15780886 - 15781153
Alignment:
Q  20 gtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 119  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15780886 gtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaaga 15780985  T
Q  120 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga------tctcttttgtaaagttactcatca-tatagt-gaaaaacgg 211  Q
    |  || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||| | |||| |||||| |||  | ||    
T  15780986 ggctgagactttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatatttctcttttgtaaagttatttatcattatagtggaacgaagg 15781085  T
Q  212 atggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
      | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  15781086 gcgcctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttct 15781153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 28100302 - 28100143
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  28100302 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacgctattaggattgag 28100203  T
Q  101 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 160  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28100202 tcttttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 278
Target Start/End: Original strand, 17795269 - 17795533
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 111  Q
    ||||||| || ||||||||| ||| || || | ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  17795269 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtca 17795364  T
Q  112 cgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaa 208  Q
    ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||    
T  17795365 cggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatg--aaa 17795462  T
Q  209 cggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| || |||||||||    
T  17795463 cggaaggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgttct 17795533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 278
Target Start/End: Original strand, 19103709 - 19103973
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 111  Q
    ||||||| || ||||||||| ||| || || | ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  19103709 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtca 19103804  T
Q  112 cgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaa 208  Q
    ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||    
T  19103805 cggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatg--aaa 19103902  T
Q  209 cggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| || |||||||||    
T  19103903 cggaaggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgttct 19103973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 35918208 - 35917952
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacac------tagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggat 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||      ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  35918208 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgcgaaacactattagaat 35918109  T
Q  97 tgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcat 194  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  35918108 tgagtctcttggttacgagaagagactgggaatttgggtagaaataggagggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcat 35918009  T
Q  195 catatagtgaaaaacggatggctgctctctccc-ccgactaggtcaatttggaccgaact 253  Q
     ||||||||   ||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||    
T  35918008 tatatagtg--gaacggagagctgctctctccctcagact-ggtcaatttagaccgaact 35917952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Original strand, 31151347 - 31151579
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31151347 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 31151443  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctcttttgtaaagttactca-tcatatagt 202  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  31151444 cttggtcacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaaccctgatatctcttttgtaaagttactcattgttatagt 31151543  T
Q  203 gaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtca 239  Q
    |   |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  31151544 g--gaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 31151579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 42992284 - 42992544
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42992284 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtc 42992383  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||               ||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  42992384 tcttggttatgggaagagagt-ggactttgggtag---------------ttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttagtcatcatata 42992467  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  || |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  42992468 gtg--aatcggggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttttttgtgttct 42992544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13420432 - 13420252
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 111  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||  | ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13420432 aaactagggtttgtatagagttt-tctctaggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtca 13420337  T
Q  112 cgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcat 194  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13420336 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcat 13420252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Original strand, 28181021 - 28181182
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  28181021 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattcactttgggaaacaccattaggattgagtct 28181120  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 165  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  28181121 attggttacgggaagagattgggactttggatagaattaggcgggagacgtattcttataac 28181182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 83 - 278
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3307034
Alignment:
Q  83 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctctttt 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3306839 aacactattaggattgagtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctctttt 3306938  T
Q  181 gtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3306939 gtaaagttactcatcattatagtgaaaa--ggatggttgctctct-cctagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtgttct 3307034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 253
Target Start/End: Original strand, 25635391 - 25635631
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 111  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  25635391 aaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattggttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggtca 25635487  T
Q  112 cgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaa 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||| |||  |||    
T  25635488 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcattatggtg--aaa 25635585  T
Q  209 cggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaact 253  Q
    | || || |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  25635586 cagagggttgctctctcccctcggctaggccaatttggaccaaact 25635631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 562024 - 561770
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 111  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  562024 aaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttca--ggttgattcacattgggaaacactattaggatttagtctcttggtca 561928  T
Q  112 cgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaa 208  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||   ||    
T  561927 cgtgaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaagtcattgatatcttttttgtaaagttactcatcattatagtg--gaa 561830  T
Q  209 cggatggctgctctctcc--cccgactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
    || | |||||||||||||  || ||||||||||  ||||||||||||  ||| |||||||    
T  561829 cgaagggctgctctctccctccagactaggtcagttttggaccgaaccgggtaaacaaat 561770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 173
Target Start/End: Original strand, 23637025 - 23637191
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  || ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23637025 caacaagaaaactagggtttgtatagagtctg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgatttaccttgagaaacactattaggattgagtct 23637121  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 173  Q
    |||| | | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23637122 cttgttcatgggaagatattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 23637191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 27635884 - 27635641
Alignment:
Q  5 aacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||                   |||||||| ||||| |||||||||||    
T  27635884 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggt-------------------gggaaacaatattaagattgagtctc 27635804  T
Q  105 ttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatatagt 202  Q
    |||||||||||            ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27635803 ttggttacggg------------ctttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagt 27635716  T
Q  203 gaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  27635715 gaaa--cggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27635641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 191
Target Start/End: Original strand, 1673975 - 1674160
Alignment:
Q  5 aacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 104  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1673975 aacaagaaaactagtgtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttag--gattgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctc 1674071  T
Q  105 ttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttact 191  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||  || |||||||||||||||||    
T  1674072 ttgatcacgggaagagattgggactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaaccctttgatatgtcttttgtaaagttact 1674160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 28137541 - 28137415
Alignment:
Q  27 tagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 126  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28137541 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatgaagtctcttggttacgggaagagattggg 28137442  T
Q  127 actttgggtagaattaggcgggagact 153  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  28137441 gctttgggtagaattaggcggaagact 28137415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 197
Target Start/End: Original strand, 54884155 - 54884348
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||  ||||||  ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  54884155 gcaacaacaaaactagaatttgta--gagtttgtttctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcatcttggaaaacactattaggattgagtc 54884252  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcat 197  Q
    |||||||||| | |||||||||  ||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  54884253 tcttggttacagaaagagattgaaactttgaatagaattaggagggagacttatt-ttgtaatctattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 54884348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 197
Target Start/End: Original strand, 53597238 - 53597430
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53597238 caacaagaaaactaggggttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 53597334  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcat 197  Q
    |||||| | | ||| |||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  53597335 cttggtcatgagaatagattgagattttgagtagaattaggcaagagacttattcttgtaacccgttgatatttcttttgtaaagttactcatcat 53597430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 36871557 - 36871308
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||| |  | |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  36871557 caacaagaaaactagggcttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttag--gattgattcaccttggaaaacactgttaagattgagtct 36871461  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatca-tata 200  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||| ||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  36871460 cttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgttatctctttgtaaagttaatcatcattata 36871361  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaat-ttggaccgaact 253  Q
    |||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  36871360 gtg--gaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaact 36871308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 132 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 47701801 - 47701654
Alignment:
Q  132 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  47701801 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtg--aaacggagggctgctctctccccc 47701704  T
Q  230 -gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
     || |||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||| |||||    
T  47701703 agattaggtcaatttggatcgaactggatcaacaaattcttttgcgttct 47701654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 97
Target Start/End: Original strand, 41849151 - 41849244
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41849151 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaactctattaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1620657 - 1620457
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 165  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | || ||  ||||||||||    
T  1620657 ttgattcaccttggaaaacactattaggattaggtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaaggctagttcttgtaac 1620558  T
Q  166 ccattgatctct-tttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaac 261  Q
    || ||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||   |||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||| |||    
T  1620557 cctttgatatctctttgtaaacttactcatcattatagtg--gaacggagggctgctctctcccctagactaggtcagtattggaccaaactaggtgaac 1620460  T
Q  262 aaa 264  Q
    |||    
T  1620459 aaa 1620457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 111 - 265
Target Start/End: Original strand, 24181486 - 24181643
Alignment:
Q  111 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaa 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||   |    
T  24181486 acgggaaaagattgggactttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtg--ga 24181583  T
Q  208 acggatggctgctctctcc-cccgactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||  ||||||||||| | ||| |||||||    
T  24181584 acggatgactgctctctcctccaaactaggtcagttttggaccgaattgggtaaacaaat 24181643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 4560497 - 4560401
Alignment:
Q  49 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggc 145  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  4560497 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagcctgttggttaccggaagagattggagctttgggtagaattaggc 4560401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 67 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14634638 - 14634504
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||   | ||||| ||||||||||     
T  14634638 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggtagcattaggtttgaagactgattcttgtaaa 14634539  T
Q  166 ccattg--atctcttttgtaaagttactcatcata 198  Q
    || |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14634538 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcata 14634504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 148 - 265
Target Start/End: Original strand, 25634030 - 25634149
Alignment:
Q  148 gagacttattcttgtaacccattgat--ctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctcc-cccgactaggtcaattt 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  25634030 gagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtg--aaacgaatggctgctctctccaccagactaggacaattt 25634127  T
Q  244 ggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
    | |||||||||||| |||||||    
T  25634128 gcaccgaactaggtaaacaaat 25634149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 73
Target Start/End: Original strand, 11163148 - 11163218
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattc 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11163148 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtggattgattc 11163218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 109
Target Start/End: Original strand, 24177278 - 24177380
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24177278 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtct 24177374  T
Q  104 cttggt 109  Q
    ||||||    
T  24177375 cttggt 24177380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 278
Target Start/End: Original strand, 41849243 - 41849333
Alignment:
Q  187 ttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  41849243 ttactcatcatatagtgaaaca--gagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 41849333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 207 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 35919170 - 35919094
Alignment:
Q  207 aacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 282  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35919170 aacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 35919094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 141
Target Start/End: Original strand, 13419883 - 13420015
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  13419883 caacaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattaggatcaagtct 13419977  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaatt 141  Q
    |||||| |||| ||||||||   | |||||||||||||    
T  13419978 cttggtcacggaaagagattcaaattttgggtagaatt 13420015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 214 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 53894105 - 53894018
Alignment:
Q  214 ggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttc-tcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  53894105 ggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 53894018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Original strand, 11066652 - 11066784
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 164  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||| ||||||||||    
T  11066652 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgaatcttttgatcacgggaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaaactgattcttgtaa 11066751  T
Q  165 cccattgatctcttttgtaaagttactcatcat 197  Q
     |  |||   | ||||||| |||||||||||||    
T  11066752 acatttggaatgttttgtatagttactcatcat 11066784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 109
Target Start/End: Original strand, 25633930 - 25634024
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| | |  | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25633930 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggctgg--gattgattcaccttgggagacattattaggattgagtctcttggt 25634024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Original strand, 6231447 - 6231502
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactaggg 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  6231447 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 6231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 27762165 - 27762107
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27762165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 27762107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 10094256 - 10094195
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  10094256 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10094195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 10201136 - 10201075
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  10201136 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10201075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 16462203 - 16462264
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16462203 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16462264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22626166 - 22626105
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  22626166 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22626105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 47883064 - 47883003
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  47883064 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 47883003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 144
Target Start/End: Original strand, 7768632 - 7768709
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||   | ||||| |||||| |||||||||||    
T  7768632 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgctcacgggctaaaattggaactttgagtagaattagg 7768709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 47701854 - 47701798
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggt 59  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||    
T  47701854 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacaccagggt 47701798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 29914132 - 29914074
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  29914132 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 29914074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 47878350 - 47878292
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  47878350 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 47878292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 54193229 - 54193287
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  54193229 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 54193287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 144
Target Start/End: Original strand, 4535622 - 4535675
Alignment:
Q  90 ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  4535622 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggga-attgggtagaattagg 4535675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 10100273 - 10100212
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| |||||||    
T  10100273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattagg 10100212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 10208182 - 10208121
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  10208182 aaacactattacgattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10208121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 11007683 - 11007633
Alignment:
Q  94 gattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11007683 gattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 11007633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 16996875 - 16996936
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16996875 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacggaaagaaattggga-tttgggtagaattagg 16996936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 27544273 - 27544334
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  27544273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagcgtggaac-ttgggtagaattagg 27544334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 130
Target Start/End: Original strand, 6303310 - 6303358
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  6303310 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 6303358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 31021361 - 31021300
Alignment:
Q  45 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttg 107  Q
    |||||||||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31021361 aacaaacactagggttgg--gattgattcaccttggagaaacactattaggattgagtctcttg 31021300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 10897008 - 10897066
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  10897008 cactattaggattgattctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10897066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 20031497 - 20031439
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| |||||||    
T  20031497 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattagg 20031439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 54188512 - 54188570
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  54188512 cactattagaattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 54188570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 7606873 - 7606828
Alignment:
Q  49 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 94  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606873 aacagtaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 7606828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Original strand, 11073007 - 11073137
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga-ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 164  Q
    |||||||||||| | ||||||||  || |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    | ||| ||||||||||    
T  11073007 ttgattcaccttcgagaaacact--tatgattgagtctcttggtcacgagaagagatttgggactttaggtagaattaggttcaaaactgattcttgtaa 11073104  T
Q  165 cccattgatctcttttgtaaagttactcatcat 197  Q
     |  |||   | |||||||||||||||||||||    
T  11073105 acatttggaatgttttgtaaagttactcatcat 11073137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 130
Target Start/End: Original strand, 7418064 - 7418112
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 130  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  7418064 aaacaccattatgattgagtctattggtcacgggaagagattgggactt 7418112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 142
Target Start/End: Original strand, 38002869 - 38002928
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaatta 142  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  38002869 aaacaccattaggtttgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaatta 38002928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 5858546 - 5858605
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  5858546 aaacactattaggattgag--tcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 5858605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 10595213 - 10595155
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  10595213 cactattaggattaagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 10595155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 206 - 253
Target Start/End: Original strand, 28181189 - 28181236
Alignment:
Q  206 aaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaact 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  28181189 aaacggaaggctgctctctccctagactaggtcaatttggactgaact 28181236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 278
Target Start/End: Original strand, 42992605 - 42992660
Alignment:
Q  223 ctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||    
T  42992605 ctccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaaaaaattcttttgtattct 42992660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 10949438 - 10949404
Alignment:
Q  86 actattaggattgagtctcttggttacgggaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10949438 actattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 10949404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 11079517 - 11079578
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| || ||||||||||||    
T  11079517 aaacactatcaggattgagtctcttggtcacgggaaaaggctgggac-ttaggtagaattagg 11079578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 144
Target Start/End: Original strand, 13893470 - 13893523
Alignment:
Q  90 ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  13893470 ttagaattgagtctcttggtcacgggaagagattgagac-ttgggtaaaattagg 13893523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 197
Target Start/End: Original strand, 27420726 - 27420844
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg-gactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatctctt 178  Q
    |||| |||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||| | |  ||| |||| |||||||   || |||| ||||||||||||| |||   ||||    
T  27420726 gaaatactattagaactcagtctcttggtcacgggaagagattcgaggttttcggtataattaggtttgaagactgattcttgtaaccctttggaatctt 27420825  T
Q  179 ttgtaaagttactcatcat 197  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27420826 ttgtaaagttactcatcat 27420844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16264403 - 16264354
Alignment:
Q  215 gctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 263  Q
    ||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16264403 gctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 16264354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 25795834 - 25795785
Alignment:
Q  215 gctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 263  Q
    ||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25795834 gctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 25795785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 144
Target Start/End: Original strand, 26763021 - 26763101
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttggg--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||   ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| |||||||||||||    
T  26763021 ttgattcaccttggacaaaacattattaggataaagtctcttggttatgggaagaaattcgagacttcgggtagaattagg 26763101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 32143374 - 32143325
Alignment:
Q  215 gctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 263  Q
    ||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32143374 gctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 32143325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 48
Target Start/End: Original strand, 3306798 - 3306842
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaaca 48  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  3306798 caacaacaaaactaggatttgaatagagtttgtctctttggaaca 3306842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 31
Target Start/End: Original strand, 15780858 - 15780886
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagag 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15780858 gcaacaacaaaactagggtttgtatagag 15780886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 263
Target Start/End: Original strand, 30236249 - 30236293
Alignment:
Q  220 tctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 263  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30236249 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 30236293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 183901 - 183605
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183901 gcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 183802  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  183801 tcttggttac-ggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatata 183703  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccc-ccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  183702 gtg--aaacggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 183605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 288
Target Start/End: Original strand, 52038 - 52324
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52038 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 52137  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52138 tcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatata 52237  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctct---cccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatcttt 288  Q
    |||  ||||||| |||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  52238 gtg--aaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaat--tcttgtgttcttctcttcttt 52324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 206 - 288
Target Start/End: Original strand, 50242 - 50325
Alignment:
Q  206 aaacggatggctgctctctccccc---gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatcttt 288  Q
    ||||||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  50242 aaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggacctaactgggtcaacaaat--tcttgtgttcttctcttcttt 50325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 101)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 25804043 - 25804339
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804043 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 25804142  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  25804143 tcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 25804242  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||   |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  25804243 gtg--gaacggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttcttgtcttctttgtgttcttctc 25804339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18511472 - 18511197
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511472 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 18511373  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511372 cttggttacgggaagagattgggactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaaagttactcatcatatag 18511273  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18511272 tg--aaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 18511197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 10529360 - 10529062
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10529360 gcaacaacaaaactaggatttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 10529261  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  10529260 tcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 10529161  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatac-ttttgtgttcttctcatctttgtgttcatct 298  Q
    |||  || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  10529160 gtg--aatcggaaggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttttgtgttcttctcttctttgtgttcttct 10529063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25921733 - 25921437
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25921733 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtct 25921634  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25921633 cttggttacgggaagaggctgggactctgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatag 25921534  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||   ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  25921533 tg--gaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 25921437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Original strand, 2174937 - 2175216
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2174937 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtc 2175036  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  2175037 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttacttatcatatag 2175136  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 282  Q
    ||   | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2175137 tg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 2175216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 4236647 - 4236945
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4236647 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtc 4236746  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  4236747 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 4236846  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||   | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  4236847 gtg--gatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaact-ggtcaataaattcttttgtgttcttctcttatttgtgttcttctc 4236943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Original strand, 38882124 - 38882403
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882124 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 38882223  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  38882224 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatag 38882323  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctcc-cccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 282  Q
    ||   | |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38882324 tg--gatcggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 38882403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 34477315 - 34477017
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  34477315 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattggagt 34477216  T
Q  102 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  34477215 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatat 34477116  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatct 298  Q
    ||||   | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  34477115 agtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttcttctcttctttgtgttcttct 34477018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 34479680 - 34479382
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  34479680 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattggagt 34479581  T
Q  102 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatat 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  34479580 ctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatat 34479481  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatct 298  Q
    ||||   | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  34479480 agtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttct 34479383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18509578 - 18509303
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18509578 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 18509479  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18509478 cttggttacgggaagagaatgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcgttgatatctattttgtaaagttactcatcatatag 18509379  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||  ||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18509378 tg--aaacggtgggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 18509303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Original strand, 21948045 - 21948320
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948045 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 21948144  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21948145 cttggttatgggaagaggctgggactttgggtggaattaggcgggagacttattcttgtaaccccttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatag 21948244  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21948245 tg--aaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 21948320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 6745085 - 6745362
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745085 aagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 6745183  T
Q  101 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcata 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  6745184 tctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 6745283  T
Q  199 tagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||||   | |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  6745284 tagtg--gatcggagggctgctctctcccccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6745362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 658610 - 658341
Alignment:
Q  7 caacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  658610 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctctt 658511  T
Q  107 ggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatagtga 204  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  658510 ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg- 658412  T
Q  205 aaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
     |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  658411 -aaacggatggctg--ctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 658341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 39854501 - 39854777
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854501 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 39854600  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  39854601 tcatggttacgggaagagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgctactcatcatata 39854700  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||   | |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39854701 gtg--gatcggagggctgctctctcccccagactagatcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 39854777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 18466702 - 18466999
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466702 gcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 18466801  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||    
T  18466802 tcttggttacggaaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatata 18466901  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
     ||   ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  18466902 atg--gaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttcttctcttctttgtgttcttctc 18466999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 274
Target Start/End: Original strand, 40221540 - 40221813
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40221540 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtc 40221639  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tat 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40221640 tcttggttacaggaagagattgggacttttggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattat 40221739  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtg 274  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  40221740 agtg--gaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtg 40221813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 10474584 - 10474308
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  10474584 gcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacaccttgggaaacactattaagattgaatc 10474485  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10474484 tcttggttacaggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttctaaggttactcatcatata 10474385  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10474384 gtg--aaacggatggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 10474308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Original strand, 25904122 - 25904397
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25904122 caacaacaaaactagggattgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 25904221  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  25904222 cttggttacgggaagagattagggctttgagtataattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctattgtaacgttacttatcatatag 25904321  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25904322 tg--aaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattattttgtgttct 25904397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 27912554 - 27912851
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912554 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 27912653  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||    
T  27912654 tcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatata 27912753  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||   ||| ||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27912754 gtg--gaacagagaactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 27912851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Original strand, 27910468 - 27910748
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27910468 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatc 27910567  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||    
T  27910568 tcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatata 27910667  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 282  Q
     ||   ||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27910668 atg--gaacggagagctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 27910748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21684712 - 21684416
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  21684712 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactattaggattgagtc 21684613  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||    
T  21684612 tcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacaatactcatcatatag 21684513  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||   | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  21684512 tg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcgtttgtgttcttctcttttttgtgttcttctc 21684416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 281
Target Start/End: Original strand, 31545098 - 31545377
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31545098 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattagagt 31545197  T
Q  102 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||    
T  31545198 ctcttggttacgggaagaaattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacagtactcatcatata 31545297  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttct 281  Q
    |||   |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||    
T  31545298 gtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 31545377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 31179632 - 31179337
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31179632 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 31179533  T
Q  102 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  31179532 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattcatttctctttgtaacgaaactcatcatata 31179433  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||   |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  31179432 gtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat--ttctgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 31179337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 31472874 - 31472597
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31472874 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 31472775  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tat 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | | ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31472774 tcttggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggatgcatcttcttctaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattat 31472675  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||  ||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31472674 agtg--aaacggagggttgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 31472597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 16776176 - 16776451
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16776176 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 16776275  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16776276 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatttctcttttgtaacgttacttatcatata 16776374  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||   | |||| ||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16776375 gtg--gatcggagggctgctatctcccccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 16776451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 277
Target Start/End: Original strand, 18596664 - 18596939
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18596664 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtct 18596763  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18596764 cttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 18596863  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcc-cccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 277  Q
    |||   |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  18596864 gtg--gaacggatggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacagattcttttgtgttc 18596939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Original strand, 24126875 - 24127150
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||| |||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24126875 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgaccttgggaaacactattaggattaagtct 24126974  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24126975 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgatagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatag 24127074  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24127075 tg--aaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 24127150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 18469029 - 18469324
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18469029 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 18469128  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||| ||    
T  18469129 tcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatcta 18469228  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||   |||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18469229 gtg--gaacgaagagctgctctct-cccagactaggtcaatttggaccgaactggattaacaaattcttttgcgttcttctcttctttgtgttcttctc 18469324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 2818595 - 2818320
Alignment:
Q  5 aacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt-gattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2818595 aacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtttgattcaccttggaaaacactattacgattgagtct 2818496  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2818495 cttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatag 2818396  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||  ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  2818395 tg--aaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 2818320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 15552261 - 15552561
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15552261 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 15552360  T
Q  100 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcata 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||    
T  15552361 gtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 15552460  T
Q  199 tagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttc-tcatctttgtgttcat 296  Q
    |||||   |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||| || ||||||||||| |    
T  15552461 tagtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttctt 15552558  T
Q  297 ctc 299  Q
    |||    
T  15552559 ctc 15552561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 272
Target Start/End: Original strand, 17072902 - 17073172
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17072902 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatct 17073001  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tata 200  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17073002 cttggttaggggaagagattggggctttcgatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattata 17073101  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttg 272  Q
    ||  |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17073102 gt--aaaacggagggctgctctctcccccagactcggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 17073172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 16092461 - 16092184
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092461 gcaacaacaaaattagggtttgtatagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 16092362  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt--gatctcttttgtaaagttactcatca-tat 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  16092361 tcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgagatctcttttgtaaggttactcatcattat 16092262  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctcc-cccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||  ||||||| || |||||||||| |  |||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  16092261 agtg--aaacggagggttgctctctcctctagactaggtcaatttagactgaactggatcaacaaattcttttgtgttct 16092184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 31542753 - 31543029
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31542753 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 31542852  T
Q  102 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||    
T  31542853 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctcg-aacccattgatttctctttgtaacagtactcatcatata 31542951  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 279  Q
    |||   |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||    
T  31542952 gtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 31543029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 1189870 - 1189592
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  1189870 gcaacaacaaaactacggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgggaaacactattatgattgagtc 1189771  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tat 199  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  1189770 tcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcataattat 1189671  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctc--ccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||   |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  1189670 agtg--gaacggagggatgctctctcctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1189592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 39398254 - 39397978
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39398254 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 39398156  T
Q  102 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatat 199  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||  || ||||    
T  39398155 ctcttggttacggaaagagattggaactttgggtagaattaggcagtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtgacgttaccaattatat 39398056  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccc-ccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  39398055 agt--aaaacggatggctgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaaacattcttttgtgttct 39397978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 6747322 - 6747598
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6747322 aagcaacaacaaaactagagtttgtataaaatttgtctctttgaaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 6747420  T
Q  101 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctc-ttttgtaaagttactcatcatat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||| ||||||    
T  6747421 tctcttggttacgggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctttttgtaacgttactcgtcatat 6747520  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctc-ccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||   | |||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  6747521 agtg--gatcggagggctgctctctctctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6747598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 36402580 - 36402313
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  36402580 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaatactattaggattgaatctcttggtta 36402481  T
Q  112 cgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaac 209  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  36402480 cgggaggagattggaactttgggtaaaattaggctggagacttattattgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg--aaac 36402383  T
Q  210 ggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
     |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36402382 agatgtctgctctctcccccagactaggtcaatttagatcgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 36402313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 37706041 - 37705778
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37706041 gcaacgacaaatctagggtttgtatagactttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 37705942  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37705941 tcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatata 37705842  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
    |||  ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37705841 gtg--aaacgaatggctattctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 37705778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 33 - 278
Target Start/End: Original strand, 695926 - 696172
Alignment:
Q  33 ttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttg 132  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  695926 ttgtatctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttg 696024  T
Q  133 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  696025 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtg--aaacggagggctgctctctccccc 696122  T
Q  230 -gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  696123 agacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 696172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 17818751 - 17818477
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  17818751 gcaacaacaaaactagagtttgtatagagttcgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgggaaacactattaagactgagtc 17818652  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17818651 tcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcataca 17818552  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||   ||| || |||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17818551 gtg--gaacagagggcttctctc-ccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 17818477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 26097751 - 26098025
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26097751 gcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgattcaccttgg-aaacactattaggaatgagtc 26097849  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26097850 tcttggttacgggaaaatgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatata 26097949  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcc-cccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||   ||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  26097950 gtg--gaacaga-ggctgctctctcctccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 26098025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 278
Target Start/End: Original strand, 2954438 - 2954710
Alignment:
Q  7 caacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct 105  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2954438 caacaaaactagggtttgtgtataatttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttggaaaacactattaggattgagtctct 2954537  T
Q  106 tggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatagtga 204  Q
    | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  2954538 tagttacgagaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctctttgtaaagttactcatcatatagtg- 2954636  T
Q  205 aaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
     || |||| || |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  2954637 -aagcggagggatgctctctcccccaaactaggtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 2954710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 6756512 - 6756786
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  6756512 gcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattctccttgggaaacactattaggattgagta 6756611  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tat 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||| |||||||| ||||| ||||| |||    
T  6756612 tcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa--cattgatatcttttttgtaaggttacacatcattat 6756709  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||||||    || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||    
T  6756710 agtgaaa---cgagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaaatcttttgtgttct 6756786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 64 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20506041 - 20505828
Alignment:
Q  64 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20506041 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 20505942  T
Q  164 acccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaac 261  Q
    || |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20505941 acacattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg--aaacggagggctgctctc-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 20505845  T
Q  262 aaatacttttgtgttct 278  Q
    |||| ||||||||||||    
T  20505844 aaattcttttgtgttct 20505828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 27 - 282
Target Start/End: Original strand, 10586873 - 10587130
Alignment:
Q  27 tagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 125  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||     
T  10586873 tagagtttgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattcagtctcttgcttacggaaagagattga 10586972  T
Q  126 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctct 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||   | |||| |||||||||||    
T  10586973 gactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtg--gatcggagggctgctctct 10587070  T
Q  225 ccccc--gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 282  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10587071 ccccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 10587130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 31466233 - 31465974
Alignment:
Q  9 acaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  31466233 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacaccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacagtattaggattgagtctcttgg 31466134  T
Q  109 ttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaa 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||         
T  31466133 ttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcatatag----- 31466040  T
Q  207 aacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
           |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  31466039 -------ggctgctctcacccccagactagttcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtattct 31465974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 52 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 41585956 - 41585729
Alignment:
Q  52 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaga 151  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  41585956 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggaga 41585857  T
Q  152 cttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggacc 248  Q
    |||||| ||||||  |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  41585856 cttatttttgtaagtcattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtg--aaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggacc 41585759  T
Q  249 gaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  41585758 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 41585729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 52 - 291
Target Start/End: Original strand, 4410090 - 4410329
Alignment:
Q  52 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaga 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410090 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 4410189  T
Q  152 cttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccg 249  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||   |  |||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  4410190 cttattcttgtaacctattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtg--gattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccg 4410287  T
Q  250 aactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtg 291  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  4410288 aactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctctactttgtg 4410329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 61 - 282
Target Start/End: Original strand, 39798123 - 39798345
Alignment:
Q  61 tgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798123 tgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattctt 39798222  T
Q  161 gtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggt 257  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||| |||||||   | |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  39798223 gtaacccattgatttctcttttataatgatactcatcgtatagtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggatcgaactgggt 39798320  T
Q  258 caacaaatacttttgtgttcttctc 282  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  39798321 caacaaattcttttgtgttcttctc 39798345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34530927 - 34530731
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34530927 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 34530828  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcat 197  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34530827 tcttggctacgggaagagattaggactttgagtagaattaggcgggagatttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttgctcatcat 34530731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 47 - 278
Target Start/End: Original strand, 2723964 - 2724187
Alignment:
Q  47 caaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg 146  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||    
T  2723964 caaacactagggtttgagggatgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg---------tagaattaggcg 2724054  T
Q  147 ggagacttattcttgtaacccattgat--ctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaattt 243  Q
    || || |||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2724055 ggtgatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcatatagtgaaa--cggagggctgctctctcccccagactaggtcaattt 2724152  T
Q  244 ggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  2724153 ggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 2724187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 278
Target Start/End: Original strand, 21288781 - 21289055
Alignment:
Q  2 agcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtt------tgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga 95  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||      || ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  21288781 agcaacaataaaaatagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagggtttgagggttgattcaccttga-aaacactattagga 21288879  T
Q  96 ttgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctcttttgtaaagttactcatc 195  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| ||      |||||||||| ||||||||||    
T  21288880 ttgagtatcttggttacgggaagagattaggactttggatagaattaagcgggagattttttcttgtaactca------tcttttgtaacgttactcatc 21288973  T
Q  196 atatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
     |||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  21288974 ttatagtg--aaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttct 21289055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12556183 - 12555908
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12556183 caacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtct 12556084  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctc-ttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||  ||||| |||||||| |||||||||| || |    
T  12556083 cttggctacgggaagagatt-ggagttttggtagaattagacaagagactttttcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcttaaa 12555985  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    | |  ||||||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  12555984 gcg--aaacggagggctgctatctcccccatactagttcaatttggactgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 12555908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 20045026 - 20045172
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20045026 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgag 20045125  T
Q  101 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 147  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20045126 tctcttggttccgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 20045172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 81 - 281
Target Start/End: Original strand, 10749796 - 10749996
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-t 178  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  10749796 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 10749895  T
Q  179 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 277  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||   | |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  10749896 ttgtaacgttactcatcaaatagtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc-tttgtgttc 10749992  T
Q  278 ttct 281  Q
    ||||    
T  10749993 ttct 10749996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 143
Target Start/End: Original strand, 20043068 - 20043208
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20043068 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 20043167  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattag 143  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  20043168 tcttggttacgggaagagattgagactttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6661443 - 6661194
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||| |||| |||| | |||||||||||| ||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6661443 caacaagaaaattagggtatgtatagagtttgt-tcttggcaacaaacactagagttgg--ggttgattcaccatgggaaacactattaggattgagtct 6661347  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tata 200  Q
    |||||| ||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  6661346 cttggtcacgggaagaaattgagattttgggtacaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttgctcataattata 6661247  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccc-ccgactaggtca-atttggaccgaact 253  Q
    |||   |||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  6661246 gtg--gaacggatgactgctctctccctcagactaggtcagatttggaccgaact 6661194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 66 - 273
Target Start/End: Original strand, 36208656 - 36208865
Alignment:
Q  66 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 164  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  36208656 gttgattcaccttgggaaacattactaagattgagtctcttggtaacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaa 36208755  T
Q  165 cccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaac 261  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  36208756 cccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtg--aaacggcgggctgctctttccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtaaac 36208853  T
Q  262 aaatacttttgt 273  Q
    |||| |||||||    
T  36208854 aaattcttttgt 36208865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 81 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 15354757 - 15354557
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-t 178  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  15354757 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctct 15354659  T
Q  179 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 277  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||   | |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  15354658 ttgtaacgttactcattaaatagtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 15354561  T
Q  278 ttct 281  Q
    ||||    
T  15354560 ttct 15354557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 81 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 15357033 - 15356833
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-t 178  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  15357033 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctct 15356935  T
Q  179 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 277  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||   | |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  15356934 ttgtaacgttactcattaaatagtg--gatcggagggctgctctctcccccggactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 15356837  T
Q  278 ttct 281  Q
    ||||    
T  15356836 ttct 15356833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 81 - 281
Target Start/End: Original strand, 23665140 - 23665340
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-t 178  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  23665140 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctct 23665238  T
Q  179 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctc-tcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 277  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||   | |||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  23665239 ttgtaacgttactcatcaaatagtg--gatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 23665336  T
Q  278 ttct 281  Q
    ||||    
T  23665337 ttct 23665340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 81 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 23793447 - 23793247
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-t 178  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  23793447 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctct 23793349  T
Q  179 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctc-tcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 277  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||   | |||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  23793348 ttgtaacgttactcatcaaatagtg--gatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 23793251  T
Q  278 ttct 281  Q
    ||||    
T  23793250 ttct 23793247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 81 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 3373320 - 3373119
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-t 178  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  3373320 gaaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 3373221  T
Q  179 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 277  Q
    |||||| |  |||||||||||||||   |  ||| || ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   |||||||||    
T  3373220 ttgtaacgaaactcatcatatagtg--gattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 3373123  T
Q  278 ttct 281  Q
    ||||    
T  3373122 ttct 3373119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 81 - 281
Target Start/End: Original strand, 10757273 - 10757472
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-t 178  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |    
T  10757273 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgg-aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttttct 10757371  T
Q  179 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 277  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||   | |||| |||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  10757372 ttgtaacgttactcatcaaatagtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattagaccgaactgggtcaacaaattc-tttgtgttc 10757468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 81 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 38960314 - 38960114
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-t 178  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  38960314 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagac-tattcttgtaacccattgatttctct 38960216  T
Q  179 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 277  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||   | |||| ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||| |||||||||||   |||||||||    
T  38960215 ttgtaacgttactcatcaaatagtg--gatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 38960118  T
Q  278 ttct 281  Q
    ||||    
T  38960117 ttct 38960114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 226
Target Start/End: Original strand, 9020246 - 9020460
Alignment:
Q  9 acaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 108  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||   |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  9020246 acaaaagtagggtttgtatagag-ttg-ctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttggaaaacactattaagattgagtttcttgg 9020341  T
Q  109 ttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaa 205  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||      
T  9020342 tcacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtg-- 9020439  T
Q  206 aaacggatggctgctctctcc 226  Q
     | ||||||||||||||||||    
T  9020440 gatcggatggctgctctctcc 9020460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 88 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 23742034 - 23741841
Alignment:
Q  88 tattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaa 185  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  23742034 tattaggattggagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctctttgtaac 23741936  T
Q  186 gttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctc-tcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttct 281  Q
    ||||||||||| ||||||   | |||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  23741935 gttactcatcaaatagtg--gatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttct 23741841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 278
Target Start/End: Original strand, 20053872 - 20054131
Alignment:
Q  11 aaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 110  Q
    |||||||| |||| |||| || ||| ||||| | ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20053872 aaaactagagtttatataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 20053968  T
Q  111 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaac 209  Q
      |     |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||    
T  20053969 tgg-----agattgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccgat-atctcttttgtaaagttactcatcattatagt--agaac 20054060  T
Q  210 ggatggctgctctctcc-cccgactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||| ||||||||||||| ||  |||||||||  |||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||    
T  20054061 ggaaggctgctctctcctccatactaggtcagttttggaccgaactgcgtaaacaaattcttttgtgttct 20054131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 26098512 - 26098379
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  26098512 gcaacaagaagactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgacaaacactattatgattgagtc 26098413  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggta 136  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  26098412 tcttggttacggaaagagattggggttttgggta 26098379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 17413385 - 17413232
Alignment:
Q  45 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  17413385 aacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaagggaagagattgagactttaggtagaattagg 17413288  T
Q  145 -cgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcat 197  Q
       | | ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17413287 tttgaaaacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 17413232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Original strand, 15143547 - 15143680
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 165  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  15143547 ttgattcacctttggaagcactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 15143646  T
Q  166 ccattg--atctcttttgtaaagttactcatcat 197  Q
    || |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15143647 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 15143680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 111 - 198
Target Start/End: Original strand, 42770936 - 42771025
Alignment:
Q  111 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcata 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  42770936 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 42771025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 85 - 197
Target Start/End: Original strand, 4897828 - 4897943
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggc-gggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttg 181  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||  |||  |||||| |||    
T  4897828 cactgttaggattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctattg 4897927  T
Q  182 taaagttactcatcat 197  Q
    ||||||||||||||||    
T  4897928 taaagttactcatcat 4897943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 172 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26098379 - 26098273
Alignment:
Q  172 atctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctcccccga--ctaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatactt 269  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  26098379 atctcttttgtaacgttactcatcatatggtgaaa--cggagggctgctctctccccccatactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattctt 26098282  T
Q  270 ttgtgttct 278  Q
    || ||||||    
T  26098281 ttatgttct 26098273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 153
Target Start/End: Original strand, 42770847 - 42770934
Alignment:
Q  64 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact 153  Q
    ||||| ||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  42770847 gggttcattcaccatgggaaac--tattaggactgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgagagact 42770934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2144763 - 2144599
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||   | ||||| |||||||||    
T  2144763 ttgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggtcgcgggaagagattcaggactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttgta 2144664  T
Q  164 acc-cattgatctct-tttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctccc 227  Q
    |||   || || ||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||||| ||||||||||||||    
T  2144663 accttttttatatctctttgtaaagttactcatcattatagtg--gaacggagggctgctctctccc 2144599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 144
Target Start/End: Original strand, 4754235 - 4754312
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4754235 ttgattcaccttgaaaaacactattagaattgagcctcttggtcactggaagagattgtgactttggatagaattagg 4754312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15445453 - 15445264
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggtt---acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgat--ct 175  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||     ||  |||||||||| ||||||| |||||||||||   || || | ||||||||||||| |||||  ||    
T  15445453 aaacactgttaggattgagtctcttggcggccacatgaagagattgagactttgagtagaattaggtttgaagaatgattcttgtaaccctttgatatct 15445354  T
Q  176 cttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||   |||| | ||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| ||||| ||| |||||||    
T  15445353 cttttgtaaagttactcatcattatagtg--gaacgaagggctgctctcttcccagactaggtcagtattggactgaactgggtaaacaaat 15445264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 1170811 - 1170872
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  1170811 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 1170872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 31782639 - 31782578
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31782639 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggga-attgggtagaattagg 31782578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34033768 - 34033632
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaatt-aggcgggagacttattcttgta 163  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||   | |||||| || | |||    
T  34033768 ttgatttaccttggagaaacactattaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattcaggattttgggtagaattaagtttgaagacttgttatggta 34033669  T
Q  164 acccatt---gatctcttttgtaaagttactcatcat 197  Q
    |||| ||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  34033668 accccttcgatatctcttttgtaaagttactcatcat 34033632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 35385634 - 35385573
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  35385634 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 35385573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 193
Target Start/End: Original strand, 13295835 - 13295948
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaatt-aggcgggagacttattcttgtaacccattgatctcttt 179  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||||| | |||||||||||||||| ||   | ||||| ||||||||||||| ||||  |||||    
T  13295835 aaacacttttaggattgagtctcttgatcacatgaagagattcgagactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaaccctttgaaatcttt 13295934  T
Q  180 tgtaaagttactca 193  Q
    ||||||||||||||    
T  13295935 tgtaaagttactca 13295948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 206 - 278
Target Start/End: Original strand, 20043211 - 20043284
Alignment:
Q  206 aaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  20043211 aaacgaatggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattcttttgtgttct 20043284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 265
Target Start/End: Original strand, 23667415 - 23667599
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-t 178  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| |||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||  | || ||| |||| ||||||||||| ||| |    
T  23667415 gaaacactataaggattggactctcttgcttacagaaagagattgggactttggaaagaattaggcgaaaaac-tatgcttgcaacccattgatttctct 23667513  T
Q  179 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctc-tcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
    |||||| || |||||||| ||| ||   | |||| |||||||||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||| || ||||||||    
T  23667514 ttgtaacgtcactcatcaaataatg--gatcggagggctgctctcttccccagactaggacagattggaccgaactgggccaacaaat 23667599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 139
Target Start/End: Original strand, 29748370 - 29748502
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||  |   ||||| | |||||||| ||||||| |  | |||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  29748370 caacaagaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacagtagggttag--gattgattcgtcttggagaaacactaataggattgagtc 29748464  T
Q  103 tcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaa 139  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29748465 tcttggtcacgggaatagattcgggactttgggtagaa 29748502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 191
Target Start/End: Original strand, 32520533 - 32520645
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatctctt 178  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||   | | ||| ||||||||||||| |||   ||||    
T  32520533 gaaacactattaagattgagtctctcgattacgggaagagattcatgactttgggtagaattaggtttgaaaactgattcttgtaaccctttggaatctt 32520632  T
Q  179 ttgtaaagttact 191  Q
    |||||||||||||    
T  32520633 ttgtaaagttact 32520645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 25452498 - 25452556
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  25452498 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25452556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 144
Target Start/End: Original strand, 35430259 - 35430338
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  35430259 ttgattcaccttggagaaacactattacaattgagtctcttggtctagggaagagattcgggtctttgggtagaattagg 35430338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 2298183 - 2298122
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  2298183 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 2298122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 10627364 - 10627425
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  10627364 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagac-tagggtagaattagg 10627425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 144
Target Start/End: Original strand, 25445501 - 25445557
Alignment:
Q  87 ctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  25445501 ctattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25445557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 28786407 - 28786465
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  28786407 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggcagaattagg 28786465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 1240428 - 1240489
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  1240428 aaacactattaggattgagtctcttaggcacgggaagaggctggga-tttgggtagaattagg 1240489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 20507723 - 20507665
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggttt 61  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20507723 gcaacaaaaaaattaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacaagggttt 20507665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16093473 - 16093413
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| || |||||||||||    
T  16093473 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagtctgggac-ttaggtagaattag 16093413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 11962612 - 11962554
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  11962612 cactattaggattgtgtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 11962554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 15224968 - 15224889
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||||| | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  15224968 ttgattcaccttgaagaaacactattaggataaagtcttttggtcatgggaagagattcgagactttgggtaaaattagg 15224889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 17841428 - 17841370
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  17841428 cactattaggattgagtctctaggtcacgggaagaggctggaac-ttgggtagaattagg 17841370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 22672837 - 22672895
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  22672837 cactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 22672895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 26406647 - 26406594
Alignment:
Q  90 ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  26406647 ttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgagac-ttgagtagaattagg 26406594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 69552 - 69256
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69552 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 69453  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  69452 tcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatag 69353  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||   | ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  69352 tg--gatcggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 69256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 73284 - 73207
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg 80  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  73284 gcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 73207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 73208 - 73160
Alignment:
Q  43 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 91  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  73208 ggaaaaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 73160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 87)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14507436 - 14507140
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14507436 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 14507337  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||||||||    
T  14507336 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatacttatcatatag 14507237  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||  || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14507236 tg--aatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 14507140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 28241582 - 28241290
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241582 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 28241483  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  28241482 tcttggttacgggaagaggctgggactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 28241383  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttc 294  Q
    |||  || |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  28241382 gtg--aatcggagggctgctctctcccccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttc 28241290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1230510 - 1230213
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1230510 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactc 1230411  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  1230410 tcttggttattggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 1230311  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  1230310 gtg--gaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttcattgtgttcttctc 1230213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 4816492 - 4816195
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4816492 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtc 4816393  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||    
T  4816392 tcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacggtactcatcatata 4816293  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||   |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4816292 gtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 4816195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 9019979 - 9020255
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9019979 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 9020078  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9020079 tcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatata 9020178  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  ||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  9020179 gtg--aaacggggggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 9020255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 11983290 - 11983014
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983290 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 11983191  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  11983190 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 11983091  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||   | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11983090 gtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11983014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14459026 - 14458731
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14459026 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggctgattc--cttgggaaacactattaggattgagtc 14458929  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  14458928 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 14458829  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||   | | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14458828 gtg--gatcagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 14458731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 13057247 - 13057524
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13057247 gcaagaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtc 13057346  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  13057347 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattat 13057446  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||  ||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13057447 agtg--aaacggagggctactctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactcggtcaacaaattcttttgtgttct 13057524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19704830 - 19704531
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19704830 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 19704731  T
Q  102 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct---tttgtaaagttactcatcata 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| | |||||||||||    
T  19704730 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctctttgtaacggtactcatcata 19704631  T
Q  199 tagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatc 297  Q
    |||||   |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  19704630 tagtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttcttctcttctttgtgttcttc 19704533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Original strand, 30967255 - 30967551
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30967255 caacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 30967354  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30967355 cttggttacgggaagaggctgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatag 30967454  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||   | ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30967455 tg--gatcggagagctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 30967551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 3630125 - 3629850
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3630125 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatc 3630026  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||    
T  3630025 tcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactaataatata 3629926  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  |||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  3629925 gtg--aaactgagggctgctctctccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3629850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20915617 - 20915321
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20915617 gcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 20915518  T
Q  102 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||    
T  20915517 ctcttggttacgagaagagattgggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 20915418  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||   |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20915417 gtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc-tctgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 20915321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 2629146 - 2628850
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629146 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 2629047  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  2629046 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggagaatttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatag 2628947  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||   | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2628946 tg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 2628850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 30034864 - 30034567
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30034864 gcaacaacaaaattagagtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 30034765  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
      ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  30034764 aattggttaagggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 30034665  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    | |   | |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  30034664 gcg--gatcggagggctgctctctcccccagactgggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttattatcttctttgtgttcttctc 30034567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 32280049 - 32280326
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32280049 gcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 32280148  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatc-atat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  32280149 tcttggttacgggaagagattgggacttcaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttat 32280248  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||    
T  32280249 agt--aaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaaaaaattctcttgtgttct 32280326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 274
Target Start/End: Original strand, 3390432 - 3390705
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390432 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 3390531  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tat 199  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  3390532 tcttggttacagaaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattac 3390631  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtg 274  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||    
T  3390632 agtg--aaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccaaattgggtcaacaaattcttttgtg 3390705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3632199 - 3631926
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3632199 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtc 3632100  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tat 199  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  3632099 tctttgttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattat 3632000  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgtt 276  Q
    ||||  ||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3631999 agtg--aaacggagggctgctctgt-cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 3631926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 13039807 - 13040084
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13039807 gcaagaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtc 13039906  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tat 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  13039907 tcttggttacgggaagagattgagactttgcgtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattat 13040006  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13040007 agtg--aaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13040084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 15532940 - 15532674
Alignment:
Q  5 aacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15532940 aacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctc 15532841  T
Q  105 ttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatagt 202  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15532840 ttggtcatgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagt 15532741  T
Q  203 gaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatactttt 271  Q
    |  ||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15532740 g--aaacggagggctgctctatccctagactaggtcaattttgactgaactaggtcaacaaattctttt 15532674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 15541401 - 15541125
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15541401 gcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtc 15541302  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15541301 tcttggtcacgagaagagattgggactttgggtaggattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatata 15541202  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcc-cccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  |||| ||  |||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  15541201 gtg--aaacagaaagctgctctctcctccagactaggttaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 15541125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 26065039 - 26065310
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26065039 gcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 26065135  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||    
T  26065136 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctctttgtaacgttactcgttatatag 26065235  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||   | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  26065236 tg--gatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 26065310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 26085008 - 26085279
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26085008 gcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 26085104  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||    
T  26085105 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctctttgtaacgttactcgttatatag 26085204  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||   | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  26085205 tg--gatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 26085279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12195778 - 12195478
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12195778 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 12195679  T
Q  100 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcata 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||    
T  12195678 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaatcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 12195579  T
Q  199 tagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttc-tcatctttgtgttcat 296  Q
    |||||   |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |   |||||||||||| || ||||||||||| |    
T  12195578 tagtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaagtttctttgtgttcttcttcttctttgtgttctt 12195481  T
Q  297 ctc 299  Q
    |||    
T  12195480 ctc 12195478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26932825 - 26932527
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  26932825 aagcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattgga 26932726  T
Q  100 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcata 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||    
T  26932725 gtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 26932626  T
Q  199 tagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa-tacttttgtgttcttctcatctttgtgttcat 296  Q
    |||||   |  ||| || ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  26932625 tagtg--gattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttcttttgtgttcttct--tctttgtgttctt 26932530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 25477327 - 25477611
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25477327 gcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 25477426  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaa-------agttactca 193  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||        ||||||||    
T  25477427 tcttggtcacggaaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcgttactca 25477526  T
Q  194 tca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||| |||||||  |||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||    
T  25477527 tcattatagtg--aaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaaatgggtcaacaaattcttttgtattct 25477611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 30729088 - 30728811
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30729088 caacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactct 30728989  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga------tctcttttgtaaagttactcatcat 197  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||      ||||||||||||||||||||||  |    
T  30728988 cttggttacgggaagaggctggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctttctcttttgtaaagttactcatatt 30728889  T
Q  198 atagtgaaaaacggatggctgctctctccc-ccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgtt 276  Q
    ||||||   |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30728888 atagtg--gaacggaaggctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 30728811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 3233991 - 3233710
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3233991 caacaacaaaactaaggtttgtatatagtttgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 3233892  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||| | ||||    
T  3233891 tcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcaccgtata 3233792  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcccccg-actaggtcaatttggaccgaacta-----ggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||      ||||||||||| ||||||||||||    
T  3233791 gtgaaa--cggagggctgctctctcccccacactaggtcaattttgaccgaactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3233710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15530383 - 15530182
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15530383 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 15530284  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15530283 tcttggttacgggaagagattgaggctttgggttgaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatata 15530185  T
Q  201 gtg 203  Q
    |||    
T  15530184 gtg 15530182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 49 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 5273431 - 5273214
Alignment:
Q  49 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5273431 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 5273332  T
Q  148 gagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttgg 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||| |||||||   |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5273331 gagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcttatagtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgg 5273234  T
Q  246 accgaactaggtcaacaaat 265  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  5273233 accgaactgggtcaacaaat 5273214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12161816 - 12161543
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  12161816 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct--ggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacgttgggaaacactattaagatcgagtc 12161719  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12161718 tattggttacgggaagagattgagactttaggtataattaagtgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatata 12161619  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||  |||| ||||||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||    
T  12161618 gt--aaaatggatggctgttctctccctaaactaggttaatttggaccgaactgaatcaacaaattattttgtgttct 12161543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 24338709 - 24338435
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactaggg-tttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| | |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24338709 gcaacaacaaaactagggtttgcataaagtttgtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttaccttggaaaacactattaagattgagt 24338610  T
Q  102 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-ta 198  Q
    || ||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  24338609 cttttggttatggaaagagattaagactttgggtagaattagtcagaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatta 24338510  T
Q  199 tagtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgtt 276  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24338509 tagtg--aaacggagggctgctctc-ccccagactatgtcaatttggaccgaactaggtaaacaaatatttttgtgtt 24338435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 265
Target Start/End: Original strand, 15719708 - 15719960
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || || | ||||||||||||||||   | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15719708 aaactagggtttgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtca 15719803  T
Q  112 cgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaa 208  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||    
T  15719804 tgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtg--aaa 15719901  T
Q  209 cggatggctgctctctccccc--gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
    | ||  | |||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15719902 cagagagttgctctttccccccatactaggtcaatttggaccgaacttggtaaacaaat 15719960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 70 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 1069913 - 1069703
Alignment:
Q  70 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1069913 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 1069814  T
Q  170 tg--atctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctc-tcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaata 266  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||||||| ||  || ||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||   |||||||||     
T  1069813 tgatatctcttttgtaaggttactcatcat-tatagagaaacggagggctgctctcttccccatactaggtcaatttggaccgaactgaatcaacaaatt 1069715  T
Q  267 cttttgtgttct 278  Q
    ||||| ||||||    
T  1069714 cttttatgttct 1069703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 19227669 - 19227514
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227669 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 19227570  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattc 158  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227569 tcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 19227514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 197
Target Start/End: Original strand, 22490693 - 22490889
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22490693 gcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttgcctctttggaacaaacactagggtttgaggaggtatacaccttgcgaaacactattaggattgagtc 22490792  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcat 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  22490793 tcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattatgcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcat 22490889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 3028106 - 3027876
Alignment:
Q  9 acaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3028106 acaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 3028010  T
Q  109 ttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaa 205  Q
    | ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  3028009 tcacgtgaagagattgagactttgagtagaattaggctggagatttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtg-- 3027912  T
Q  206 aaacggatggctgctctctccccc--gactaggtca 239  Q
     |||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  3027911 gaacggagggctgctctttccccccagactaggtca 3027876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 81 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 26066307 - 26066106
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-t 178  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  26066307 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 26066208  T
Q  179 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 277  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||   | |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||    
T  26066207 ttgtaacgttacttatcaaatagtg--gatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 26066110  T
Q  278 ttct 281  Q
    ||||    
T  26066109 ttct 26066106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 278
Target Start/End: Original strand, 14466399 - 14466653
Alignment:
Q  27 tagaggttgtctcttcggaacaaacactagggttt-gtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 125  Q
    ||||| |||||| || | ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14466399 tagagtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgg 14466498  T
Q  126 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctct 222  Q
    || |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||| |||||| |||||||  || |||||| ||||| |    
T  14466499 gagtttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtg--aaccggatgactgctgt 14466596  T
Q  223 ctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
     ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||    
T  14466597 ttcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcagcaaattctcttgtgttct 14466653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 45 - 265
Target Start/End: Original strand, 15367129 - 15367348
Alignment:
Q  45 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||||| |||||      
T  15367129 aacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctcttcgtcgcgggaagagattgaaactttgggtaaaattaat 15367225  T
Q  145 cgggagacttattcttgtaacccatt--gatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctg--ctctctcccccgactaggtcaa 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||    
T  15367226 cgggagacttattcttgtaacccattaatatctctattgtaaagttattcatcatatagtg--aaacggaaggctgctctctctccccagactaggtcaa 15367323  T
Q  241 tttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||    
T  15367324 tttggaccgaactgggtaaacaaat 15367348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 81 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 29754892 - 29754691
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-t 178  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  29754892 gaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctct 29754793  T
Q  179 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 277  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||   | |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  29754792 ttgtaacgttactcatcaaatagtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 29754695  T
Q  278 ttct 281  Q
    ||||    
T  29754694 ttct 29754691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 81 - 281
Target Start/End: Original strand, 33308988 - 33309188
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-t 178  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  33308988 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctct 33309086  T
Q  179 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 277  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||   | |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   |||||||||    
T  33309087 ttgtaacgttactcatcaaatagtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 33309184  T
Q  278 ttct 281  Q
    ||||    
T  33309185 ttct 33309188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16455676 - 16455434
Alignment:
Q  11 aaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 110  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||| | ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |     
T  16455676 aaaactagggtttgtacagagttt-tctcttggcaacgaacactagggtt-gtgg-ttgattcaccttgggaaacactgttaggattaagtctcttgctc 16455580  T
Q  111 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaa 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||   |    
T  16455579 acggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtg--ga 16455482  T
Q  208 acggatggctgctctctccccc-gactaggtcaat-ttggaccgaact 253  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||    
T  16455481 acggagggctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccgaact 16455434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 81 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 26068578 - 26068377
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-t 178  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  26068578 gaaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 26068479  T
Q  179 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 277  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||   | |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||    
T  26068478 ttgtaacgttgctcatcaaatagtg--gatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 26068381  T
Q  278 ttct 281  Q
    ||||    
T  26068380 ttct 26068377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 81 - 281
Target Start/End: Original strand, 33311257 - 33311457
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-t 178  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  33311257 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctct 33311355  T
Q  179 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 277  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||   | |||| ||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   |||||||||    
T  33311356 ttgtaacgttactcatcaaatagtg--gatcggagggctgctttctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 33311453  T
Q  278 ttct 281  Q
    ||||    
T  33311454 ttct 33311457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 66 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12186271 - 12186056
Alignment:
Q  66 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  12186271 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaa 12186172  T
Q  165 cccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctct-cccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaa 260  Q
    | |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  12186171 ctcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtg--gaacggagggctgctctctgcctcggactaggtcaatttgaaccgaactgggtaaa 12186074  T
Q  261 caaatacttttgtgttct 278  Q
    |||||  |||||||||||    
T  12186073 caaattattttgtgttct 12186056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 195
Target Start/End: Original strand, 17012105 - 17012287
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 111  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||| | ||||||||||||||||    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  17012105 aaactagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--ggttgattcaccttctgaaacaatattaggattgagtctcttggtca 17012201  T
Q  112 cgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatc 195  Q
    || ||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17012202 cgagaagagattgatgcttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatc 17012287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 197
Target Start/End: Original strand, 26945258 - 26945393
Alignment:
Q  65 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 163  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  26945258 ggttgagtcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgta 26945357  T
Q  164 acccattg--atctcttttgtaaagttactcatcat 197  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26945358 actcattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 26945393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 125 - 265
Target Start/End: Original strand, 15346522 - 15346663
Alignment:
Q  125 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctct 222  Q
    |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||  ||||||||    
T  15346522 ggactttgagtaaaattaagcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagttattcatcatatagtg--aaacggaaagctgctct 15346619  T
Q  223 ctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15346620 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaat 15346663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 67 - 265
Target Start/End: Original strand, 19696556 - 19696758
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||| |||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||     
T  19696556 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctctttgtcactgaaagagattgagactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaat 19696655  T
Q  166 ccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctc-ccccgactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaa 260  Q
    || |||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||| ||    
T  19696656 cctttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtg--gaacagatagctgctctctctcccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaa 19696753  T
Q  261 caaat 265  Q
    |||||    
T  19696754 caaat 19696758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22858152 - 22857962
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||| |||||   | ||||| |||||||||||    
T  22858152 ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagatttaggtttgaagactaattcttgtaac 22858053  T
Q  166 cc-attgatctct-tttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaat-ttggaccgaact 253  Q
    ||  ||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  22858052 ccttttgatatatctttgtaaagttactcatcattatagtg--gaacggatggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaact 22857962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 68 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28037927 - 28037794
Alignment:
Q  68 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaga-cttattcttgtaacc 166  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| || |||||| |||||||||||||||||||    | | |||||||||||||||    
T  28037927 tgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaacc 28037828  T
Q  167 cattg--atctcttttgtaaagttactcatcata 198  Q
    | |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  28037827 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcata 28037794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Original strand, 20526922 - 20527054
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 165  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  |||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  20526922 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaagaagagattaagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 20527021  T
Q  166 ccattgatctct-tttgtaaagttactcatcat 197  Q
    |  ||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  20527022 cttttgatatctctttgtaaagttattcatcat 20527054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 1072138 - 1072067
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattca 74  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1072138 gcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgagttgattca 1072067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 142
Target Start/End: Original strand, 11138423 - 11138499
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaatta 142  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11138423 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagtcacttggtcacgggaagagatggggactttaggtagaatta 11138499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25078755 - 25078623
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 165  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||  |||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  25078755 ttgattcaccttggtaaacaccgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgaga-tttaagtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 25078657  T
Q  166 ccattg--atctcttttgtaaagttactcatcat 197  Q
    || |||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25078656 cctttgatatctcttttgtaaagttactcgtcat 25078623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 7542581 - 7542452
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga-ttgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 164  Q
    ||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||   | ||||| ||| ||||||    
T  7542581 ttgattcacttggagaaacactattatgattgagtctcttggtcacgggaagagatttgggaatttggatagaattaggtttgaagactaatttttgtaa 7542482  T
Q  165 cccattgatctct-tttgtaaagttactca 193  Q
    ||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  7542481 ccctttgatatctctttgtaaagttactca 7542452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 13870683 - 13870608
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 78  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13870683 gcaacaacaaaactagggtttatataaagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcacctt 13870608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 32447577 - 32447502
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactag-ggtttgtgggttgattcacct 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  32447577 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagagttttgagggttgattcacct 32447502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 180 - 278
Target Start/End: Original strand, 10584227 - 10584325
Alignment:
Q  180 tgtaaagttactcatcat-atagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 277  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||    
T  10584227 tgtaaggttactcatcattatagtgaaa--cggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttc 10584324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12937376 - 12937219
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatctct-tt 179  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||   || | || ||||||||||||  || || ||| ||    
T  12937376 aaacactattaagattgagtctcttagtcacgagaatagattgaaacttttggtagaattaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctctt 12937277  T
Q  180 tgtaaagttactcatcat-atagtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtc 238  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  12937276 tgtaaagttactcatcattatagtggaa--cggagggctgctctctccccagactaggtc 12937219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 5165989 - 5165936
Alignment:
Q  90 ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5165989 ttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattagg 5165936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 13878727 - 13878788
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  13878727 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 13878788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 13883475 - 13883536
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  13883475 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 13883536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 16785919 - 16785980
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16785919 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16785980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 26887406 - 26887345
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  26887406 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 26887345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 31248896 - 31248835
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  31248896 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 31248835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 35201508 - 35201447
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  35201508 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 35201447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 3577696 - 3577636
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  3577696 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 3577636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 17036058 - 17036116
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  17036058 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17036116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 17695030 - 17694972
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  17695030 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17694972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 49
Target Start/End: Original strand, 8995532 - 8995578
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaa 49  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  8995532 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 8995578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 58
Target Start/End: Original strand, 17852596 - 17852650
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactaggg 58  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  17852596 caacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactaggg 17852650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 95
Target Start/End: Original strand, 15346445 - 15346524
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga 95  Q
    ||||||||||||||||| |  ||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15346445 aaactagggtttgtataaaatttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttagga 15346524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 12166321 - 12166267
Alignment:
Q  89 attaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  12166321 attaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 12166267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22352031 - 22351973
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || || ||||||||||||||||    
T  22352031 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgaga-tttgggtagaattagg 22351973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 197
Target Start/End: Original strand, 30445699 - 30445773
Alignment:
Q  126 gactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgat--ctcttttgtaaagttactcatcat 197  Q
    |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  30445699 gactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 30445773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 19702041 - 19701985
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaatta 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  19702041 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaatta 19701985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25465710 - 25465657
Alignment:
Q  145 cgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcat 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  25465710 cgggagacttattcttgtacccctttgatatctctttgtaaagttactcatcat 25465657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 144
Target Start/End: Original strand, 25941650 - 25941704
Alignment:
Q  88 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  25941650 tattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 25941704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 165
Target Start/End: Original strand, 26643179 - 26643259
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||   |||||| |||||||||||||||  || ||||| |||||||||||    
T  26643179 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctgggac-ttgggtagaattaggttggaagactaattcttgtaac 26643259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 165
Target Start/End: Original strand, 26749145 - 26749225
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||   |||||| |||||||||||||||  || ||||| |||||||||||    
T  26749145 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctgggac-ttgggtagaattaggttggaagactaattcttgtaac 26749225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 10584172 - 10584212
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctctt 41  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  10584172 aagcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctt 10584212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 13467642 - 13467585
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||  ||||||||||||    
T  13467642 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgtgactt--ggtagaattagg 13467585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22342980 - 22342922
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||    
T  22342980 cactattaggattgcgtctcttggtcacgggaagaggctggga-tttgggtagtattagg 22342922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 33215830 - 33215888
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| |||| ||||||||||    
T  33215830 cactattaggattgagtctcttggtcacggcaagaggctgggac-ttggatagaattagg 33215888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 144
Target Start/End: Original strand, 11262596 - 11262649
Alignment:
Q  90 ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  11262596 ttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgaga-tttaggtagaattagg 11262649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31936640 - 31936591
Alignment:
Q  215 gctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 263  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31936640 gctgctctctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 31936591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 84)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 32339383 - 32339680
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32339383 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtc 32339482  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  32339483 tcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgatactcatcatata 32339582  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||   | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  32339583 gtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggttaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 32339680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 27829371 - 27829667
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829371 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 27829470  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||    
T  27829471 tcttggttacgggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatag 27829570  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||   | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27829571 tg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 27829667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 282
Target Start/End: Original strand, 3874085 - 3874364
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3874085 caacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtct 3874184  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3874185 cttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatag 3874284  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 282  Q
    ||   | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3874285 tg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 3874364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 27827060 - 27827356
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827060 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 27827159  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||    
T  27827160 tcttggttacaggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatag 27827259  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||   | |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27827260 tg--gatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 27827356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28283480 - 28283185
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  28283480 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgaatc 28283381  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  28283380 tcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatag 28283281  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||   | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28283280 tg--gatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 28283185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 4424092 - 4424389
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4424092 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcgcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccgtgggaaacactattaggattgagtc 4424191  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||  ||||||||||||||    
T  4424192 tcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttatcttttgtaacattactcatcatata 4424291  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||   | | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4424292 gtg--gatcagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 4424389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 15809293 - 15809589
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15809293 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttt-ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtc 15809391  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  15809392 tcttggttacgggaagaaactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 15809491  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctc-tcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||   | | || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15809492 gtg--gatcagagggctgctctcttccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 15809589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 30480764 - 30480488
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30480764 gcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 30480665  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  30480664 tcttggtcacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttagtcatcatata 30480565  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  30480564 gtg--aaatggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 30480488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 274
Target Start/End: Original strand, 27911088 - 27911359
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27911088 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 27911187  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27911188 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatata 27911287  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtg 274  Q
    |||  ||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  27911288 gtg--aaacggagggttgctctctccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattcttttgtg 27911359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 274
Target Start/End: Original strand, 27957507 - 27957778
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27957507 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 27957606  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27957607 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatata 27957706  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtg 274  Q
    |||  ||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  27957707 gtg--aaacggagggttgctctctccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattcttttgtg 27957778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Original strand, 608808 - 609101
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  608808 gcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtc 608907  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  608908 tcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 609007  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatac-ttttgtgttcttctcatctttgtgttc 294  Q
    |||   | |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  609008 gtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttttgtgttcttctcttctttgtgttc 609101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22684916 - 22684617
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22684916 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 22684817  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc---attga--tctcttttgtaaagttactcatcata 198  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||  ||||| |||||| |||||||||||||    
T  22684816 cttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccaatattgatttctctattgtaacgttactcatcata 22684717  T
Q  199 tagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatc 297  Q
    |||||   |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  22684716 tagtg--gaacggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttc 22684619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 28251828 - 28251552
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28251828 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 28251729  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  28251728 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttataacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatata 28251629  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||   | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  28251628 gtg--gatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28251552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 18810782 - 18811078
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18810782 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 18810881  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||    
T  18810882 tcttggttacgggaataggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatag 18810981  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||   |  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18810982 tg--gattggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 18811078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 27107158 - 27106884
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27107158 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 27107059  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27107058 tcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatagatatctcttttgtagggttactcatcatata 27106959  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcc-cccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgtt 276  Q
    |||  ||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||    
T  27106958 gtg--aaacggagggctgctatctcctccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttgtgtt 27106884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Original strand, 1225241 - 1225517
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1225241 caacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 1225340  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctc-ttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1225341 cttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatata 1225440  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccc-ccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  ||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1225441 gtg--aaacggatggccgctctctccctcatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 1225517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 14807825 - 14808111
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14807825 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 14807924  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  14807925 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 14808024  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-----------gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||   |||||| ||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14808025 gtg--gaacggagggctgctctctccccctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14808111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 43079674 - 43079953
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43079674 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 43079773  T
Q  100 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcata 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||    
T  43079774 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 43079873  T
Q  199 tagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 279  Q
    |||||   |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||    
T  43079874 tagtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 43079953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14419452 - 14419175
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14419452 gcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtc 14419353  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt--gatctcttttgtaaagttactcatca-tat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||| |||    
T  14419352 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatgtcttttgtaaggttactcatcattat 14419253  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14419252 agtg--aaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14419175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 44720917 - 44721214
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa-cactattaggattgagt 101  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44720917 gcaacaacaaaactatgttttgtatagagtctgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaacactattaggattgagt 44721016  T
Q  102 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||    
T  44721017 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatata 44721116  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccc-ccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||   |  |||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  44721117 gtg--gattggagagctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 44721214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Original strand, 43082045 - 43082326
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  43082045 aagcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgga 43082144  T
Q  100 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcata 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||    
T  43082145 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 43082244  T
Q  199 tagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttct 281  Q
    |||||   |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||    
T  43082245 tagtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 43082326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 277
Target Start/End: Original strand, 15068055 - 15068330
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15068055 gcaacaacaaaaccagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaatactattaggattgagtc 15068154  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    | |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15068155 ttttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatata 15068254  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 277  Q
     ||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  15068255 atg--gaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggccaacaaattcttttgtgttc 15068330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 27 - 299
Target Start/End: Original strand, 18812980 - 18813252
Alignment:
Q  27 tagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |    
T  18812980 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgggtacgggaagaggctgtg 18813079  T
Q  127 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctc 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||   |  ||| ||||||||||||    
T  18813080 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtg--gattggagggctgctctctc 18813177  T
Q  226 cccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18813178 ccccatattaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 18813252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 15072784 - 15073061
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15072784 gcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtc 15072883  T
Q  103 tcttggttacgggaaga-gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatat 199  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||     
T  15072884 tcttggttacgagaagagggttgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatac 15072983  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  15072984 agtg--gaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 15073061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 36865612 - 36865887
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36865612 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 36865711  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt--gatctcttttgtaaagttactcatca-tat 199  Q
    |||   | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36865712 tct---tcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattat 36865808  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccccc--gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||  |||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  36865809 agtg--aaacggaatgctgctctctcccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattctcttgtgttct 36865887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 13858745 - 13858477
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13858745 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtt 13858646  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt-gatctcttttgtaaagttactcatca-tata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13858645 tcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgcagcccattatatctcttttgtaaagttactcatcattata 13858546  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttt 270  Q
    |||  |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||    
T  13858545 gtg--aaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggacagaactgggtaaacaaattcttt 13858477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Original strand, 41384819 - 41385094
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41384819 caacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtct 41384918  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41384919 cttggttacgggaagagattggagctttaggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatag 41385018  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||  |||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  41385019 tg--aaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttctgttct 41385094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 27 - 294
Target Start/End: Original strand, 43530213 - 43530481
Alignment:
Q  27 tagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 126  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  43530213 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagaggctggg 43530312  T
Q  127 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctct 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||   | |||| ||||||| |||    
T  43530313 actttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaacccattgatttctcttttgtaacgctactcatcatatagtg--gatcggagggctgctgtct 43530410  T
Q  225 c-ccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttc 294  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  43530411 ctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttc 43530481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Original strand, 41382748 - 41383012
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||           |||| ||||||||||    
T  41382748 caacaacaaaattagggtttgtatagaatttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacct-----------attatgattgagtct 41382836  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41382837 cttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatag 41382936  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||  |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41382937 tg--aaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 41383012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24873442 - 24873164
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24873442 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctttggaaacactattaggattggagt 24873343  T
Q  102 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  24873342 ctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccgattgatttctctttgtaacgaaactcatcatata 24873243  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 282  Q
    |||   |  ||| ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||| |  ||||||||||  || ||||||||||||    
T  24873242 gtg--gattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaattgagtcaacaaat--ttctgtgttcttctc 24873164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 25952595 - 25952871
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  25952595 gcaacaataaaattagggtt-gtatatagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacaatattaggattgagtc 25952693  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tat 199  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  25952694 tcttggttacgagaagaaattgagacattgggtagaattaggcagaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattat 25952793  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||   |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25952794 agtg--gaacggagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 25952871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 5372439 - 5372160
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5372439 gcaacaacaaaattagggtttatatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 5372340  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tat 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  5372339 tcttggttatgggaagagattgggactttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaaggttactcatcattat 5372240  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccccc--gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttctt 279  Q
    ||||  ||||||| || | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||  |||| |||||||    
T  5372239 agtg--aaacggagggttactctctccccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattattttctgttctt 5372160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 278
Target Start/End: Original strand, 15956051 - 15956308
Alignment:
Q  19 ggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 118  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  15956051 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaag 15956146  T
Q  119 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatgg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||    
T  15956147 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtg--aaacggaggg 15956244  T
Q  216 ctgctctctccc-ccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
     | ||||||||| | || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  15956245 tttctctctccctcagattaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtattct 15956308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Original strand, 14477350 - 14477520
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14477350 gcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtc 14477449  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 173  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14477450 tcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgat 14477520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 265
Target Start/End: Original strand, 21482397 - 21482648
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 111  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21482397 aaactagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggtta 21482492  T
Q  112 cgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaac 209  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||   | ||||    
T  21482493 tgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgagtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat-tataaagaaac 21482591  T
Q  210 ggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21482592 ggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaat 21482648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 253
Target Start/End: Original strand, 21480589 - 21480828
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 111  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21480589 aaactagggtttgtatggagtttg-ctcttggcaacaaacactaggttt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggtta 21480684  T
Q  112 cgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaa 208  Q
    |||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||    
T  21480685 cgggaagatattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtg--aaa 21480782  T
Q  209 cggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaact 253  Q
    | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21480783 cagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaacgaact 21480828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 33541649 - 33541507
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  33541649 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagta 33541550  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggc 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33541549 tcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggc 33541507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 15185966 - 15185699
Alignment:
Q  8 aacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct-- 105  Q
    |||||||||| ||||| |||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||      
T  15185966 aacaaaactatggtttatataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtaaaacactattagaattgagtctctct 15185867  T
Q  106 tggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat--ctcttttgtaaagttactcatcat-atagt 202  Q
    ||||||||||||||||||       |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  15185866 tggttacgggaagagatt-------tgggtagaattaggcgagagacctattcttgtaacccattgatatctcttttttaaggttactcatcattatagt 15185774  T
Q  203 gaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||  |||| | ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  15185773 gaaa--cggaggactgttctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttttgttct 15185699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 64 - 265
Target Start/End: Original strand, 31162344 - 31162550
Alignment:
Q  64 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  31162344 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaccggaagagattgggactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgta 31162443  T
Q  164 acccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc---gactaggtcaat-ttggaccgaactagg 256  Q
    || |||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||   ||| || ||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||| ||    
T  31162444 actcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtg--gaacagagggctgctctctcccccccagactaggtcagtattggaccgaactggg 31162541  T
Q  257 tcaacaaat 265  Q
    | |||||||    
T  31162542 taaacaaat 31162550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3005880 - 3005628
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 111  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||   |||||||| |||||||   || ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  3005880 aaactagagtttgtatagagtttg-ctcttaacaacaaacaatagggtt---ggattgattcactttggaaaacactattagcattgagtctcttggtca 3005785  T
Q  112 cgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaa 208  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||    
T  3005784 cggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtg--gaa 3005687  T
Q  209 cggatggctgctctctccccc-gactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
    |||| || ||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||| ||| |||||||    
T  3005686 cggaggggtgctctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaat 3005628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 181622 - 181801
Alignment:
Q  52 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt-aggattgagtctcttggttacg--ggaagagattgggactttgggtagaattaggcggg 148  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  181622 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatttaggattaagtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcgga 181721  T
Q  149 agacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctcccccga 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||    
T  181722 agacttattcttgtaacccattgatatctctttgtaaagttactcatc--atagtg--aaacagatgactgctctctcccccga 181801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 5622999 - 5622877
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  5622999 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctattgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctttggaaacattatttggattgagtc 5622900  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgg 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  5622899 tcttgattacgggaagagattgg 5622877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 265
Target Start/End: Original strand, 31035252 - 31035458
Alignment:
Q  64 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  31035252 gggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttgt 31035351  T
Q  163 aacccattgatctct-tttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gac--taggtcaat-ttggaccgaactagg 256  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| | |||||||||||| ||    
T  31035352 aaccctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtg--gaacggagggctgctctctcccccagactataggtcagtattggaccgaactggg 31035449  T
Q  257 tcaacaaat 265  Q
    | |||||||    
T  31035450 taaacaaat 31035458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 37214438 - 37214317
Alignment:
Q  17 agggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 116  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||    
T  37214438 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaac---------attgagtctcttggttacggga 37214348  T
Q  117 agagattgggactttgggtagaattaggcgg 147  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  37214347 agcgattggaactttgggtagaattaggcgg 37214317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578343
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  31578476 ttgattcaccttgggaaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 31578377  T
Q  166 ccattg--atctcttttgtaaagttactcatcat 197  Q
    |  |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  31578376 cttttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 31578343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 106
Target Start/End: Original strand, 26775275 - 26775378
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  26775275 gcaacaacaatactagggtttgtatatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttggaaaacactattagaattgagtc 26775374  T
Q  103 tctt 106  Q
    ||||    
T  26775375 tctt 26775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 31573924 - 31573794
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||     
T  31573924 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaat 31573825  T
Q  166 ccattg--atctcttttgtaaagttactcat 194  Q
     | |||  |||||||||||||||||||||||    
T  31573824 tctttgatatctcttttgtaaagttactcat 31573794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 135 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 2468259 - 2468127
Alignment:
Q  135 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctc-ccccg 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || |||||||||||| ||| |    
T  2468259 tagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaata--gagggctgctctctctcccag 2468162  T
Q  231 actaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  2468161 attaggtcaatttggacagaactaggtaaacaaat 2468127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 172 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 33541500 - 33541395
Alignment:
Q  172 atctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttt 270  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| || | ||||    
T  33541500 atctcttttgtaaggttactcatcatatagtg--aaacggaaggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaaaaatttcttt 33541403  T
Q  271 tgtgttct 278  Q
    ||||||||    
T  33541402 tgtgttct 33541395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 35872634 - 35872555
Alignment:
Q  13 aactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatta 92  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35872634 aactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 35872555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 13985262 - 13985176
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||| |||||||||||||    
T  13985262 aaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaaactgattcttgtaaccc 13985176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 101
Target Start/End: Original strand, 31035144 - 31035238
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31035144 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacaccattaggattgagt 31035238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 229
Target Start/End: Original strand, 3895957 - 3896123
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagactt-attcttgtaa 164  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||   || | || ||||||||||    
T  3895957 ttgattcactttggagaaacactattgcgattgagtctcttcgtcacgggaagaaattgggactttgagtataattaggtttgaaaattaattcttgtaa 3896056  T
Q  165 cccat-tg--atctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc 229  Q
    | | | ||  |||||||||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||||||||||||||    
T  3896057 ctcttatgatatctcttttgtaaagttactcatcat-taaagtagaacggatggctgctctctccccc 3896123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 144
Target Start/End: Original strand, 17847661 - 17847740
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg--gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17847661 ttgattcaccttgaacgaaacactattaggattgaatctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 17847740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 209 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 37214319 - 37214251
Alignment:
Q  209 cggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgtt 276  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  37214319 cggatggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 37214251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33839120 - 33838995
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 163  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||   |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  33839120 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggt--caggaagagattcaagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 33839023  T
Q  164 acccattgatctcttttgtaaagttact 191  Q
    |||| |||   |||||||||||||||||    
T  33839022 accctttggaatcttttgtaaagttact 33838995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 2468307 - 2468261
Alignment:
Q  63 tgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2468307 tgggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 9021289 - 9021228
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  9021289 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9021228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 13986011 - 13985933
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattag 143  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  13986011 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagactcttaatcacgggaagagattcgggactttgggtataattag 13985933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16752704 - 16752643
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16752704 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16752643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16757449 - 16757388
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16757449 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16757388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 28327908 - 28327969
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  28327908 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28327969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 28895502 - 28895563
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  28895502 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28895563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 30423212 - 30423274
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  30423212 aaacacttttaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattggaactttggatagaattagg 30423274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 253
Target Start/End: Original strand, 6376141 - 6376315
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tt 179  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||  |||||||||||   | ||||| |||||||| |||  ||||| ||| ||    
T  6376141 aaacactgttaagattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttatgtagaattaggtttgaagactaattcttgttaccttttgatatctctt 6376240  T
Q  180 tgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctccc-ccgactaggtcaat-ttggaccgaact 253  Q
    ||||||||||||||||| |||||||   ||| || |||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||    
T  6376241 tgtaaagttactcatcattatagtg--gaacagaaggctgctctctccctcagactaggtcagtattggaccgaact 6376315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 590797 - 590855
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  590797 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 590855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 33032657 - 33032715
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  33032657 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 33032715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 4812669 - 4812608
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  4812669 aaacactattaggattgagtcttttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 4812608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 28332631 - 28332692
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  28332631 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28332692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 151 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 35872553 - 35872438
Alignment:
Q  151 acttattcttgtaacccattgat--ctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggacc 248  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||            |||||||||    
T  35872553 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtg--aaacggagggctgctctctccc------------atttggacc 35872468  T
Q  249 gaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  35872467 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 35872438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 29554964 - 29554908
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaatta 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  29554964 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaatta 29554908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 3276347 - 3276405
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  3276347 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3276405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 279
Target Start/End: Original strand, 14477527 - 14477602
Alignment:
Q  206 aaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaact-aggtcaacaaatacttttgtgttctt 279  Q
    |||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  14477527 aaacggatggctactctttaccccagactaggtcaatttggatcgaactgcggtcaacaaattcttttgtgttctt 14477602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 25684646 - 25684704
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  25684646 cactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagacagggac-ttgggtagaattagg 25684704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 2267205 - 2267144
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  2267205 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattaggac-ttgggtagaattagg 2267144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 17799606 - 17799568
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17799606 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 17799568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 12517285 - 12517248
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctct 40  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12517285 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 12517248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 225
Target Start/End: Original strand, 14419734 - 14419786
Alignment:
Q  172 atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctc 225  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  14419734 atctcttttgtaaggttactcatcattatagt--aaaacggatggctgctctctc 14419786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 15949534 - 15949596
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  15949534 aaacactattaggatatagtctcttggtcacgggaagagattcgggac-ttgggtaaaattagg 15949596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 11701155 - 11701102
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 119  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  11701155 ttgattcaccttgaagaaacattattagaattgagtctcttggtcacgggaaga 11701102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 263
Target Start/End: Original strand, 19752438 - 19752487
Alignment:
Q  215 gctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 263  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19752438 gctgctctctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 19752487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 281
Target Start/End: Original strand, 28228668 - 28228717
Alignment:
Q  233 taggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttct 281  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  28228668 taggtcaatattggaccgaactaggtaaacacattcttttgtgttcttct 28228717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 118
Target Start/End: Original strand, 21033870 - 21033906
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21033870 aaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaag 21033906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23179740 - 23179692
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||  || ||||||||    
T  23179740 cactattaggattgagtctcttggtcaccggaagaggctgtgactttgg 23179692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 41744 - 41452
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41744 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 41645  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  41644 tcttggttacgggaagaggctgggactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 41545  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttc 294  Q
    |||  || |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  41544 gtg--aatcggagggctgctctctcccccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttc 41452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 91)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19502272 - 19501980
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19502272 gcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 19502173  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||    
T  19502172 tcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatata 19502073  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttc 294  Q
    |||   | || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19502072 gtg--gatcgaagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttc 19501980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13910305 - 13910009
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13910305 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtc 13910206  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||    
T  13910205 tcttggttacgggaagagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatag 13910106  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||   | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  13910105 tg--gatcagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 13910009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 27104793 - 27105088
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104793 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 27104891  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||    
T  27104892 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacattactcatcatatag 27104991  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||   | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27104992 tg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 27105088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23452498 - 23452201
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23452498 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtc 23452399  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||    
T  23452398 tcttggttacgggaagaggctgggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatata 23452299  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||   |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23452298 gtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 23452201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 19504606 - 19504316
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504606 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 19504507  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||    
T  19504506 tcttggttac-ggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatata 19504408  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgtt 293  Q
    |||   | |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19504407 gtg--gatcggagggctgctatctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgtt 19504316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 45280247 - 45279965
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45280247 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttgggatacactattaggattgag 45280148  T
Q  101 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcata 198  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  45280147 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 45280048  T
Q  199 tagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 282  Q
    |||||   | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45280047 tagtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 45279965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 19007634 - 19007910
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  19007634 gcaacaacaaaattatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtt 19007733  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19007734 tcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatata 19007833  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19007834 gtg--aaacgaagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 19007910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 21520954 - 21520678
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21520954 gcaacaacaaaactagggcttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtc 21520855  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21520854 tcttggttacaggaagaggctaggactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatata 21520755  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  21520754 gtg--aaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactttgtcaacaaattcttttgtgttct 21520678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 42923770 - 42923494
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42923770 gcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtc 42923671  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42923670 tcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcatata 42923571  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  42923570 gtg--aaacggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 42923494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 281
Target Start/End: Original strand, 42064509 - 42064788
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064509 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 42064608  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||    
T  42064609 tcttggttacgggaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatag 42064708  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtc-aatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttct 281  Q
    ||   | |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  42064709 tg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 42064788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Original strand, 42452777 - 42453054
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452777 gcaacaacaaaactagagtttgtataaagtttgtctct--gtaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 42452874  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  42452875 tcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 42452974  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 282  Q
    |||   | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42452975 gtg--gatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 42453054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 6259076 - 6258802
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6259076 gcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 6258977  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tat 199  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  6258976 tcttggttacggga--agattggggctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattat 6258879  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  6258878 agtg--aaacggagggctgctctctccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6258802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 24162473 - 24162193
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24162473 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtc 24162374  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||||||| |          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  24162373 tcttggttgc----------tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaatgctactcatcatatag 24162284  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgtt 293  Q
    ||   |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24162283 tg--gattggatggctgctctctcccccggactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtgtt 24162193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 40032319 - 40032038
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40032319 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 40032220  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga------tctcttttgtaaagttactcatca 196  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      ||||||||| ||||||||||||||    
T  40032219 tcttggttacaggaagaggttaggactttgggtagaattaggcgtgagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgcaaagttactcatca 40032120  T
Q  197 -tatagtgaaaaacggatggctgctctctccc-ccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
     |||||||  ||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  40032119 ttatagtg--aaacggagggccgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtattct 40032038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 28196631 - 28196905
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28196631 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 28196730  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28196731 tcttggttatgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatata 28196830  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  28196831 gtg--aaacgaatggctgctctctcccccagactaggtcaatt--gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28196905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 22287597 - 22287321
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22287597 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacggtattaggattgagtc 22287498  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22287497 tcttagttacgggaagagattgacacttcgggtagaattgggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaacgttactcatcatata 22287398  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  ||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22287397 gtg--aaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22287321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 35215849 - 35215568
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35215849 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 35215750  T
Q  100 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcata 198  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||    
T  35215749 gtctcttggttacgggaagagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 35215650  T
Q  199 tagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttct 281  Q
    |||||   |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  35215649 tagtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttct 35215568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 35218226 - 35217945
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35218226 aagcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 35218127  T
Q  100 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcata 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |  ||||||||||    
T  35218126 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccgttgatttctctttgtaacgaaactcatcata 35218027  T
Q  199 tagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttct 281  Q
    |||||   |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  35218026 tagtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttct 35217945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 6264396 - 6264133
Alignment:
Q  17 agggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 116  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |    
T  6264396 agggtttgtatagagtttgtctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgata 6264297  T
Q  117 agagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggat 213  Q
    | |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||     
T  6264296 aaagattggggctttggatagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtg--aaacggag 6264199  T
Q  214 ggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  6264198 ggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6264133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 11739820 - 11739544
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11739820 caacaacaaaattagggtttgtatggagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattct 11739721  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tata 200  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||  |||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  11739720 cttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttggaatccattgatatctcttttgaaaggttactcatcattata 11739621  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||   |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11739620 gtg--gaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11739544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Original strand, 17848438 - 17848710
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17848438 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtc 17848537  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17848538 tcttggttacgggaagagattgaggctttgggtaga---aggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatata 17848633  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17848634 gtg--aaacggatgactgctctctcccccatactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 17848710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 43623829 - 43623565
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||            |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43623829 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc------------actaggttttgagggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtc 43623742  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43623741 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatata 43623642  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||   |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43623641 gtg--gaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 43623565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Original strand, 14837268 - 14837538
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14837268 caacaacaaaactagggtttgtacatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 14837367  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tata 200  Q
    |||||      |||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14837368 cttgg------gaagagattgagactttaagtagaattaggcgggggacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattata 14837461  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  14837462 gtg--aaacggatggatgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttct 14837538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 44289329 - 44289052
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44289329 gcaacaacaaaactagagtttgtatagagtctgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 44289230  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tat 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || | ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||| |||    
T  44289229 acttggttacgggaagagattgggacttagggtagaattaagtggaaaacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaagattactcatcattat 44289130  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||  |||| ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  44289129 agtg--aaacagatggttgctctttcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 44289052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 34979838 - 34979562
Alignment:
Q  5 aacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34979838 aacaaaaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctc 34979739  T
Q  105 ttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt--gatctcttttgtaaagttactcatca-tatag 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  34979738 ttggttacgggaagagattcggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccatttatatctcttttgtaaggttcctcatcattatag 34979639  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc--gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||   |||| | |||| ||||| |||||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  34979638 tg--gaacgaagggctactctccccccccaaactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 34979562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 3022157 - 3022442
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3022157 gcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtc 3022256  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcat---- 197  Q
    |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||        
T  3022257 tcttggttaccggaagagattgaggttttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctttataaagttactcatcattatc 3022356  T
Q  198 atagtga----aaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    || || |     |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  3022357 atcgttataatgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3022442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 45239232 - 45239000
Alignment:
Q  8 aacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45239232 aacaaaactagggtttgtatagactttctct-ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 45239134  T
Q  108 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaa 205  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  45239133 gttacgggaagagattggggtttttggtagaattaagcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtg-- 45239036  T
Q  206 aaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaa 240  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  45239035 aaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaa 45239000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 278
Target Start/End: Original strand, 17849113 - 17849387
Alignment:
Q  5 aacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 104  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  17849113 aacaacaaaactagagttcgtatagagtttgcctctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctc 17849212  T
Q  105 ttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat--ctcttttgtaaagttactcatcat-atag 201  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  17849213 ttggttacggtaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatag 17849312  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctcccccg-actaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||||  |||  |||||||||||||| |  |||||||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17849313 tgaaa--cggg-ggctgctctctcccacatactaggtcaatttggacaagactgggtcaacaaattcttttgtgttct 17849387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 59 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 5375550 - 5375331
Alignment:
Q  59 tttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattc 158  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5375550 tttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggc-ggagacttattc 5375452  T
Q  159 ttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactag 255  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  5375451 ttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtg--gaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgg 5375354  T
Q  256 gtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  5375353 gtcaacaaattcttttgtgttct 5375331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18800559 - 18800298
Alignment:
Q  15 ctagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  18800559 ctagggtttgtatagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacag 18800464  T
Q  115 gaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacgg 211  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||    
T  18800463 gaagagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcattatagtg--aaacgg 18800366  T
Q  212 atggctgctctctcccccgactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    | |||| |||||||||| ||| ||||||  |||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  18800365 agggctactctctccccagaccaggtcagttttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttct 18800298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 15539735 - 15539566
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15539735 caacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattct 15539636  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 173  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15539635 cttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 15539566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 28459435 - 28459175
Alignment:
Q  19 ggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28459435 ggtttgtatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 28459336  T
Q  119 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatgg 215  Q
    || ||||| |||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||    
T  28459335 agtttggggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttttaaagttactcatcattatagtg--aaacggaggg 28459238  T
Q  216 ctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    || |||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  28459237 cttctctctacctagactaggtcaatttggatcgaactagataaacaaattcttttgtgttct 28459175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31733026 - 31732774
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  31733026 gcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgttgggaaacactgttaggattgagtc 31732927  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||            |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31732926 tcttggtt------------tgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat-ta 31732840  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
     ||  ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  31732839 ttgtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtaaacaaat 31732774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 81 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 36559047 - 36558845
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-t 178  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  36559047 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 36558948  T
Q  179 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 277  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||   | |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  36558947 ttgtaacgttactcatcaaatagtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 36558850  T
Q  278 ttctc 282  Q
    |||||    
T  36558849 ttctc 36558845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 81 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 36561324 - 36561123
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-t 178  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  36561324 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 36561225  T
Q  179 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 277  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||   | |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  36561224 ttgtaacgttactcatcaaatagtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 36561127  T
Q  278 ttct 281  Q
    ||||    
T  36561126 ttct 36561123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 81 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 45332364 - 45332144
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-t 178  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  45332364 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttctct 45332265  T
Q  179 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 277  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  45332264 ttgtaaaggtactcatcatatagtg--aattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttc 45332167  T
Q  278 ttc-tcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||| || ||||||||||| ||||    
T  45332166 ttcttcttctttgtgttcttctc 45332144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 11578365 - 11578105
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||  ||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11578365 caacaaaaaaactagggtttgtatagaatttttctcttggcaacaaac--tagggttgg--ggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtct 11578270  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tata 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11578269 cttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattata 11578170  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtca-atttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
    ||    |||||| ||||||||| |||||| |||||| |||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  11578169 gt--cgaacggagggctgctctttcccccagactagatcagttttagaccgaactaggtaaacaaat 11578105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 17897502 - 17897243
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17897502 caacaataaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttcgcaacaaacactagg--ttgaga-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 17897407  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tata 200  Q
    |||||| | | ||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  17897406 cttggtcatgagaaaagattgagattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttactcatcattata 17897307  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||| ||| |||||||    
T  17897306 gt--agaacggatggctgctctctccccagactaggtcagtattggtccgaactgggtaaacaaat 17897243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 278
Target Start/End: Original strand, 22874137 - 22874401
Alignment:
Q  12 aaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  22874137 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gggttgattcaccttggaaaacagtattaggattgagtctcttagtca 22874232  T
Q  112 cgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaa 208  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||    
T  22874233 cgggaagagattgaggctttcggtagaattaggtgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtg--aaa 22874330  T
Q  209 cggatggctgctctctccc-ccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    | ||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| || |||||||||    
T  22874331 ctgagagctgctctctccctcatactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattctcttgtgttct 22874401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20146866 - 20146645
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||| | ||||||||||| |||| |  | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  20146866 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttgcc-cttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaacaatagtaggattgagtct 20146770  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tata 200  Q
    |||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20146769 cttggtcacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 20146670  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccc 227  Q
    |||   |||||| ||||||||||||||    
T  20146669 gtg--gaacggagggctgctctctccc 20146645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 122 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 22407596 - 22407439
Alignment:
Q  122 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgc 219  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  22407596 ttgggacttttggtagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg--aaacggagggctgc 22407499  T
Q  220 tctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22407498 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 22407439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699633
Alignment:
Q  65 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  40699429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgta 40699528  T
Q  164 acccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaat-ttggaccgaactaggtc 258  Q
    | || |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||| || || |||||| |||||| |||||||||| | || |||||||||||||     
T  40699529 atcctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtg--gaacagagggatgctctttcccccagactaggtcagtattagaccgaactaggta 40699626  T
Q  259 aacaaat 265  Q
    |||||||    
T  40699627 aacaaat 40699633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Original strand, 35107294 - 35107566
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||    || ||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  35107294 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaaca----gggttg-ggattgattcaccttgagaaacattattaggattgagtct 35107387  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattag--gcgggagacttattcttgtaacccat-tgatctcttttgtaaagttactcatca-tat 199  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||     | ||||||||||||||||||  | | ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  35107388 cttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattagattttgaagacttattcttgtaacctttgttatctcttttgtaatgttactcatcattat 35107487  T
Q  200 agtgaaaaacggatggctgctctc-tcccccgactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||   ||||||||| || |||| | ||| |||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  35107488 agtg--gaacggatggttgttctctttcccagactaggtcagtattggaccgaaataggtaaacaaatatttttgtgttct 35107566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 38020196 - 38020349
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  38020196 gcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccatggtaaacactattaggattgagtc 38020295  T
Q  103 tcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 166  Q
    |||||||           ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38020296 tcttggt-----------attgggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 38020349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 27136368 - 27136195
Alignment:
Q  19 ggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 118  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  27136368 ggtttatatagagcttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaag 27136272  T
Q  119 agattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactc 192  Q
    | |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  27136271 aaattgggactttgagtagaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactc 27136195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 145 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 22707872 - 22707736
Alignment:
Q  145 cgggagacttattcttgtaacccattgat--ctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc---gactaggtca 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||| ||    ||||||||||    
T  22707872 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaaca--gagggctgctctctctcctccagactaggtca 22707775  T
Q  240 atttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22707774 atttggactgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 22707736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 82 - 197
Target Start/End: Original strand, 20589763 - 20589881
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattg--atctctt 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  20589763 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctctt 20589862  T
Q  179 ttgtaaagttactcatcat 197  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  20589863 ttgtgaagttactcatcat 20589881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 22163208 - 22163106
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22163208 gcaacaacaacactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagg-ttgagtc 22163110  T
Q  103 tctt 106  Q
    ||||    
T  22163109 tctt 22163106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 22407670 - 22407591
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggga 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22407670 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 22407591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 38414291 - 38414194
Alignment:
Q  52 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaga 151  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38414291 actagggtttgagg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcac-ggaaaagattgggacttttggtagaattaggcgggaga 38414194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 173 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 22163111 - 22163007
Alignment:
Q  173 tctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatactttt 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  22163111 tctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaa--cggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattctttt 22163014  T
Q  272 gtgttct 278  Q
    |||||||    
T  22163013 gtgttct 22163007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 37963137 - 37962939
Alignment:
Q  66 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 165  Q
    |||||||| |||| | ||||| ||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  37963137 gttgattccccttagaaaacattattgagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaat 37963038  T
Q  166 ccattgatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctc-ccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 263  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||  |||| |  | ||| |||||| |||  ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  37963037 ccattgat-ttttttgtaaagttattcatcattatagtg--aaacagtggactgatctctctcccacactaggttaatttggaccgaactgggtaaacaa 37962941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Original strand, 43139432 - 43139564
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 165  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |   ||||| ||| |||||||    
T  43139432 ttgattcatcttgggaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagatattgagactttaggtagaattaggtctaaagactaattattgtaac 43139531  T
Q  166 ccattgatctct-tttgtaaagttactcatcat 197  Q
    |  ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  43139532 cttttgatttctctttgtaaagttactcatcat 43139564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 135 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7462950
Alignment:
Q  135 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-ga 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||| ||| ||||||||   | |||| |||||||||||||||| ||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttacccattatatagtg--gatcggagggctgctctctcccccaga 7462980  T
Q  232 ctaggtcaa-tttggaccgaactaggtcaa 260  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  7462979 ctaggtcaattttggaccgaactgggtcaa 7462950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 197
Target Start/End: Original strand, 15693958 - 15694094
Alignment:
Q  66 gttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga-ttgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 162  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||    
T  15693958 gttgattcaccgtggagaaacactattaggataaagtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 15694057  T
Q  163 aacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcat 197  Q
    ||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15694058 aaccttttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 15694094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 239
Target Start/End: Original strand, 17921754 - 17921927
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 163  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||     | ||| ||||||| |    
T  17921754 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggttttaaaactgattcttgca 17921853  T
Q  164 acccattgatctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtca 239  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||| |||||| |||||||   |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17921854 accctttgat-tctttcataaagttagtcatcattatagtg--gaacggagggctgctctctacccagactaggtca 17921927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 278
Target Start/End: Original strand, 23870951 - 23871086
Alignment:
Q  144 gcgggagacttattcttgtaacccattgat--ctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaa 240  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||   || ||||||||    
T  23870951 gcggcagacttattcttgtaacccattaatatctctttagtaaggttactcatcatatagtgaaa--cggagggttgctctctcccttagattaggtcaa 23871048  T
Q  241 tttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23871049 tttggatcaaactaggtcaacaaattcttttgagttct 23871086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 193
Target Start/End: Original strand, 26345661 - 26345790
Alignment:
Q  66 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaatt-aggcgggagacttattcttgta 163  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||| ||   | ||||| ||||||| |    
T  26345661 gttgattcaccttagcaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgaa 26345760  T
Q  164 acccattgatctcttttgtaaagttactca 193  Q
    ||||||||   |||||| ||||||||||||    
T  26345761 acccattggaatcttttataaagttactca 26345790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 30720811 - 30720684
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg-gactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgta 163  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||   || |||| |||||||||    
T  30720811 ttgattcatcttggagaaacactattaggattgagtctctttggcacgagaagagattcgtgactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 30720712  T
Q  164 acccattgatctcttttgtaaagttact 191  Q
    |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  30720711 accctttgaaatcttttgtaaagttact 30720684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 28459011 - 28458949
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28459011 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattagg 28458949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 27583535 - 27583479
Alignment:
Q  68 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27583535 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattg 27583479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 2740941 - 2741002
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2740941 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 2741002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 5377690 - 5377631
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttg 62  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5377690 gcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttg 5377631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 34575308 - 34575230
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34575308 ttgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggtctcgggaa-agattcgggactttgggtagaattagg 34575230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 2736205 - 2736266
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  2736205 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 2736266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 10942696 - 10942634
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaatta 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  10942696 gaaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaatta 10942634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 10948565 - 10948503
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaatta 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  10948565 gaaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaatta 10948503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 17462436 - 17462497
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  17462436 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17462497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 20054947 - 20054886
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  20054947 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 20054886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22712698 - 22712637
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  22712698 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22712637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22717407 - 22717346
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  22717407 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22717346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 39686983 - 39687044
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  39686983 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 39687044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 45567409 - 45567470
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  45567409 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 45567470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 142
Target Start/End: Original strand, 7502975 - 7503052
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga-ttgggactttgggtagaatta 142  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7502975 ttgatccaccttggagaaacactattaggattgagtatcttggtcaagggaagagatttgagactttgggtagaatta 7503052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 12781400 - 12781342
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  12781400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 12781342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 17932637 - 17932695
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  17932637 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17932695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 17943540 - 17943598
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  17943540 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17943598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 27517818 - 27517760
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  27517818 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 27517760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 30478997 - 30479055
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  30478997 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 30479055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 142
Target Start/End: Original strand, 35028632 - 35028707
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaatta 142  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  35028632 ttgattcgcattggaaaacactattatgattgagtctcttgatcacgagaagagattgacactttgggtagaatta 35028707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 41303210 - 41303099
Alignment:
Q  88 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaatta-ggcgggagacttattcttgtaacccattgatctcttttgtaaa 185  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |   | ||||| |||| |||||||  |||   |||||||||||    
T  41303210 tattaggattaagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattatgtttgaagactgattcatgtaaccttttggaatcttttgtaaa 41303111  T
Q  186 gttactcatcat 197  Q
    ||||||||||||    
T  41303110 gttactcatcat 41303099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 27248075 - 27247968
Alignment:
Q  91 taggattgagtctcttggttacgggaagagat-tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctcttttgtaaagtta 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||   || ||  | ||||||||| | |||   |||||||||||||||    
T  27248075 taggattgagtctcttggtcacgggaagagatccaggactttgggtagaattaggtttgaaacagactcttgtaactctttggaatcttttgtaaagtta 27247976  T
Q  190 ctcatcat 197  Q
    || |||||    
T  27247975 cttatcat 27247968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 37170931 - 37170873
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  37170931 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 37170873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 39680045 - 39680106
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  39680045 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 39680106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 130
Target Start/End: Original strand, 38190997 - 38191045
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 130  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  38190997 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 38191045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 239 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 15539553 - 15539514
Alignment:
Q  239 aatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  15539553 aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 15539514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 20050204 - 20050166
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  20050204 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagag 20050166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 33674584 - 33674551
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33674584 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 33674551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 142
Target Start/End: Original strand, 45158308 - 45158369
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaatta 142  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  45158308 aaacactgttaggatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaatta 45158369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 17057413 - 17057369
Alignment:
Q  220 tctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 263  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17057413 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17057369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 17085396 - 17085352
Alignment:
Q  220 tctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaa 263  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17085396 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17085352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Original strand, 4024 - 4302
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4024 gcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtc 4122  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4123 tcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatata 4222  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctcccccgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 282  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4223 gtg--aaacggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttcttctc 4302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 79212 - 79488
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79212 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 79311  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  79312 tcttggttacgggaagaggctgagaatttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 79411  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||   |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||    
T  79412 gtg--gaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttgtgttct 79488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Original strand, 6224 - 6505
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-a 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6224 aagcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaa 6323  T
Q  100 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcata 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |    
T  6324 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcaaa 6423  T
Q  199 tagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttct 281  Q
    |||||   | |||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||    
T  6424 tagtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgagtcaacaaatttctttgtgttcttct 6505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 11733 - 11458
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11733 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattttccttgggaaacactattaggattgagtct 11634  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11633 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatag 11534  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    ||   |  |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  11533 tg--gattggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttct 11458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 29198 - 29494
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  29198 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactattaggattgagtc 29297  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||    
T  29298 tcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacaatactcatcatatag 29397  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||   | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  29398 tg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcgtttgtgttcttctcttttttgtgttcttctc 29494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14642 - 14380
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14642 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtct 14543  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14542 cttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatag 14443  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
    ||   |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14442 tg--gaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 14380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 253
Target Start/End: Original strand, 15046 - 15297
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15046 gcaacaacaaaactagggtttttataaagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 15145  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15146 tcttggttacggaaagagattcagactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatata 15245  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaact 253  Q
    |||   |||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  15246 gtg--gaacggaaggctgctgtctcccccatgctaggtcaatttggaccgaact 15297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 43 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 1673 - 1425
Alignment:
Q  43 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaatta 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1673 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 1574  T
Q  143 ggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaa 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||   | |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  1573 ggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaa 1476  T
Q  241 tttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtg 291  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  1475 tttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 1425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 2907 - 3203
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2907 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtc 3006  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  3007 tcttggttatgggaagaggcttggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatag 3106  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    ||   |  ||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3107 tg--gattggagggctgctatctccccgagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaaatattttgtgttcttctcttctttgtgttcttctc 3203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 66 - 348
Alignment:
Q  1 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  66 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 165  T
Q  100 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-tttgtaaagttactcatcata 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||||    
T  166 gtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 265  T
Q  199 tagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctc 282  Q
    |||||   |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||    
T  266 tagtg--gattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctc 348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Original strand, 79887 - 80158
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  79887 caacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtc 79986  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  79987 tcttggttacgggaagagattggggctttgggtag-attaggcaggagacttattcctgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatata 80085  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtg 274  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  80086 gtg--aaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggattgaactgggtcaacaaattcttttgtg 80158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 188424 - 188363
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  188424 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 188363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Original strand, 85258 - 85534
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  85258 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttggaaaacactactaggattgagtct 85357  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tata 200  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  85358 tttggttacgagaagagattgtgactttgagtagaatcagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttcgtaaagttactcatcattata 85457  T
Q  201 gtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  85458 gtg--gaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatttgaactgaaccaggtaaacaaattcttttgtgttct 85534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 205
Target Start/End: Original strand, 2069 - 2272
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2069 gcaacaacaaaactagggtttgtacagagtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 2167  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga--tctcttttgtaaagttactcatcatata 200  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  2168 tcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattaatttctcttttgtaacgttcctcatcatata 2267  T
Q  201 gtgaa 205  Q
    |||||    
T  2268 gtgaa 2272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16079 - 15818
Alignment:
Q  4 caacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| | | ||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16079 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggttga--ggttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtct 15983  T
Q  104 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcatatag 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15982 cttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat-tag 15884  T
Q  202 tgaaaaacggatggctgctctct-cccccgactaggtcaat-ttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
     |   |||||| | ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||    
T  15883 agtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaat 15818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Original strand, 35666 - 35819
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  35666 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagggaaacactattaggattaagtc 35765  T
Q  103 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 156  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35766 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 278
Target Start/End: Original strand, 35849 - 35897
Alignment:
Q  230 gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttct 278  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||    
T  35849 gactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattattttgtgttct 35897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16903 - 16716
Alignment:
Q  9 acaaaactagggtttgtatagaggttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16903 acaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttaggaaacactattaggattgagtcacttgg 16807  T
Q  109 ttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatcat 197  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16806 tgacgggaagagattgagactttgggtagaattaggccagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 16716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 45 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 1860 - 1639
Alignment:
Q  45 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1860 aacaaacactagggtt-gtgg-ttgattcaccttgggaaacacaattaggattgagtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 1763  T
Q  145 cgggagacttattcttgtaacccattg--atctcttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtca- 239  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| | ||||||||||||||||  |||||||||     
T  1762 cgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtg--gaacgtagggctgctctctcccccatactaggtcag 1665  T
Q  240 atttggaccgaactaggtcaacaaat 265  Q
     ||| ||||||||| ||| |||||||    
T  1664 tttttgaccgaactgggtaaacaaat 1639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 81 - 281
Target Start/End: Original strand, 22221 - 22421
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-t 178  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||| |    
T  22221 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaactcattgatttctct 22319  T
Q  179 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 277  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||   | |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  22320 ttgtaacgttactcatcaaatagtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 22417  T
Q  278 ttct 281  Q
    ||||    
T  22418 ttct 22421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 81 - 281
Target Start/End: Original strand, 24496 - 24696
Alignment:
Q  81 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatctct-t 178  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||| |    
T  24496 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaactcattgatttctct 24594  T
Q  179 ttgtaaagttactcatcatatagtgaaaaacggatggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttc 277  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||   | |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  24595 ttgtaacgttactcatcaaatagtg--gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 24692  T
Q  278 ttct 281  Q
    ||||    
T  24693 ttct 24696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Original strand, 4901 - 5034
Alignment:
Q  67 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 166  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4901 ttgattcatgttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaagagattgaagcttttggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 5000  T
Q  167 cattgatctc---ttttgtaaagttactcatcat 197  Q
    ||||||| ||   |||||||||| ||||||||||    
T  5001 cattgatatctctttttgtaaagatactcatcat 5034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 230 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1484 - 1415
Alignment:
Q  230 gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttctcatctttgtgttcatctc 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  1484 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtccttttcttctttgtgttcttctc 1415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 144
Target Start/End: Original strand, 224819 - 224880
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  224819 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 224880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 57613 - 57497
Alignment:
Q  82 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattg--atctct 177  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||| |||||||||||| ||||||||   | |||  |||||||||||||| |||  |||| |    
T  57613 aaacactattaggattgaatctcttggtcattggaagagattcgggactttgggtggaattaggtttgaagatctattcttgtaaccctttgatatctat 57514  T
Q  178 tttgtaaagttactcat 194  Q
    |||||||||||||||||    
T  57513 tttgtaaagttactcat 57497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 4729 - 4661
Alignment:
Q  214 ggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatacttttgtgttcttct 281  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||| ||||    
T  4729 ggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgttgttct 4661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 1092 - 993
Alignment:
Q  3 gcaacaacaaaactagggtttgtatagaggttgtctc-----ttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     || ||||||||||||| | || | |||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  1092 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagtttggaacaaacactacgtttggagggttgatccaccttgcgaaatacttttaggatt 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Original strand, 16328 - 16386
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16328 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0474 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0474
Description:

Target: scaffold0474; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 196
Target Start/End: Original strand, 10775 - 10822
Alignment:
Q  149 agacttattcttgtaacccattgatctcttttgtaaagttactcatca 196  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10775 agactaattcttgtaaccctttgaaatcttttgtaaagttactcatca 10822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 17165 - 17107
Alignment:
Q  85 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||| |||||||||||||||    
T  17165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaagctaggac-ttgggtagaattagg 17107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1224 times since January 2019
Visitors: 4114