View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0669_low_105 (Length: 233)

Name: NF0669_low_105
Description: NF0669
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0669_low_105
NF0669_low_105
[»] chr7 (126 HSPs)
chr7 (13-233)||(23520920-23521140)
chr7 (12-227)||(19439227-19439444)
chr7 (12-228)||(13019623-13019841)
chr7 (30-229)||(16843908-16844108)
chr7 (16-233)||(12461438-12461656)
chr7 (87-233)||(46649762-46649909)
chr7 (74-233)||(46174303-46174465)
chr7 (87-233)||(17468284-17468432)
chr7 (87-233)||(17584782-17584930)
chr7 (74-233)||(2388589-2388750)
chr7 (87-233)||(13964033-13964182)
chr7 (11-133)||(30271871-30271993)
chr7 (87-233)||(37285201-37285350)
chr7 (93-233)||(49158740-49158883)
chr7 (87-233)||(2438876-2439025)
chr7 (93-233)||(11339769-11339912)
chr7 (93-233)||(11879065-11879208)
chr7 (93-233)||(11899340-11899483)
chr7 (93-233)||(26113786-26113929)
chr7 (93-233)||(642548-642691)
chr7 (93-233)||(17726363-17726506)
chr7 (93-233)||(18437197-18437340)
chr7 (87-233)||(20019701-20019851)
chr7 (93-233)||(26120399-26120542)
chr7 (94-233)||(11299684-11299826)
chr7 (94-233)||(11308048-11308190)
chr7 (93-233)||(32627395-32627538)
chr7 (94-233)||(8197230-8197372)
chr7 (94-233)||(8213301-8213443)
chr7 (95-233)||(1317766-1317907)
chr7 (95-233)||(26089981-26090122)
chr7 (95-233)||(40684793-40684934)
chr7 (94-233)||(5187273-5187416)
chr7 (94-200)||(2281085-2281192)
chr7 (94-200)||(42058548-42058655)
chr7 (95-233)||(49150585-49150727)
chr7 (95-233)||(49157275-49157417)
chr7 (94-233)||(40922953-40923095)
chr7 (95-233)||(749843-749984)
chr7 (95-233)||(48987951-48988092)
chr7 (94-200)||(2026290-2026397)
chr7 (93-233)||(33404651-33404794)
chr7 (156-229)||(30271819-30271892)
chr7 (86-215)||(32771486-32771619)
chr7 (95-215)||(14179061-14179185)
chr7 (156-233)||(13453832-13453911)
chr7 (20-155)||(19145488-19145629)
chr7 (20-155)||(20744887-20745028)
chr7 (156-233)||(21757354-21757433)
chr7 (86-215)||(3327791-3327924)
chr7 (61-215)||(10519804-10519960)
chr7 (74-215)||(37244359-37244506)
chr7 (95-215)||(46682244-46682370)
chr7 (86-215)||(18958480-18958614)
chr7 (156-233)||(37379952-37380031)
chr7 (45-215)||(46624790-46624967)
chr7 (86-215)||(15085974-15086107)
chr7 (95-215)||(82128-82254)
chr7 (95-215)||(15098017-15098143)
chr7 (95-215)||(15104394-15104520)
chr7 (12-87)||(15455306-15455382)
chr7 (95-215)||(11881580-11881704)
chr7 (43-153)||(147014-147126)
chr7 (43-153)||(2965878-2965990)
chr7 (43-153)||(14320683-14320795)
chr7 (27-215)||(45185379-45185572)
chr7 (62-215)||(46348805-46348961)
chr7 (43-153)||(14565655-14565767)
chr7 (43-153)||(15166721-15166833)
chr7 (43-153)||(18871813-18871925)
chr7 (43-153)||(29182169-29182281)
chr7 (95-215)||(15437658-15437783)
chr7 (20-154)||(19151790-19151930)
chr7 (20-154)||(20751189-20751329)
chr7 (41-153)||(31154312-31154426)
chr7 (43-153)||(16089968-16090080)
chr7 (93-185)||(16952319-16952414)
chr7 (43-153)||(20907478-20907590)
chr7 (94-215)||(26289819-26289945)
chr7 (74-138)||(37379914-37379978)
chr7 (95-215)||(12547171-12547296)
chr7 (95-155)||(14431989-14432051)
chr7 (95-155)||(15338826-15338888)
chr7 (87-138)||(15622161-15622212)
chr7 (95-155)||(15723330-15723392)
chr7 (54-153)||(20328365-20328467)
chr7 (95-155)||(35962852-35962914)
chr7 (93-139)||(13453884-13453930)
chr7 (93-139)||(21757335-21757381)
chr7 (43-153)||(23665944-23666057)
chr7 (33-155)||(13678217-13678345)
chr7 (43-111)||(29795677-29795746)
chr7 (43-111)||(29799496-29799565)
chr7 (93-138)||(30602946-30602991)
chr7 (43-153)||(10897301-10897413)
chr7 (95-155)||(11220227-11220290)
chr7 (45-154)||(14266118-14266232)
chr7 (43-153)||(16008031-16008143)
chr7 (95-155)||(15711106-15711168)
chr7 (95-155)||(16109181-16109243)
chr7 (34-155)||(21232149-21232274)
chr7 (95-215)||(16074022-16074146)
chr7 (33-153)||(18606801-18606926)
chr7 (43-111)||(11302799-11302868)
chr7 (95-174)||(11308991-11309073)
chr7 (95-174)||(11312299-11312381)
chr7 (12-69)||(32771369-32771429)
chr7 (43-153)||(3858473-3858585)
chr7 (95-155)||(1612623-1612685)
chr7 (95-155)||(6411821-6411883)
chr7 (95-155)||(14281760-14281822)
chr7 (74-177)||(4279941-4280049)
chr7 (124-185)||(16187796-16187858)
chr7 (97-152)||(19599844-19599901)
chr7 (74-177)||(19616273-19616381)
chr7 (154-233)||(30602892-30602974)
chr7 (83-153)||(36306152-36306225)
chr7 (68-183)||(833031-833148)
chr7 (68-183)||(1198211-1198328)
chr7 (12-77)||(4279864-4279932)
chr7 (45-155)||(14255841-14255956)
chr7 (120-215)||(14582725-14582822)
chr7 (12-77)||(19616196-19616264)
chr7 (95-154)||(16575546-16575608)
chr7 (95-154)||(16590054-16590116)
chr7 (95-154)||(23442259-23442321)
[»] chr5 (106 HSPs)
chr5 (11-229)||(26650318-26650536)
chr5 (11-229)||(26921903-26922121)
chr5 (12-233)||(23081759-23081983)
chr5 (12-233)||(23076311-23076535)
chr5 (11-233)||(16775062-16775285)
chr5 (12-229)||(24057515-24057734)
chr5 (12-229)||(5341743-5341962)
chr5 (12-228)||(25419735-25419954)
chr5 (32-229)||(18941238-18941436)
chr5 (12-228)||(39608898-39609116)
chr5 (12-233)||(23544881-23545105)
chr5 (43-233)||(20990250-20990440)
chr5 (42-233)||(28259893-28260085)
chr5 (12-233)||(37565953-37566177)
chr5 (43-233)||(41878024-41878216)
chr5 (32-229)||(19801909-19802109)
chr5 (21-233)||(7773668-7773881)
chr5 (32-233)||(19362533-19362737)
chr5 (74-233)||(22507487-22507649)
chr5 (94-233)||(22500927-22501068)
chr5 (74-230)||(19800362-19800522)
chr5 (93-233)||(597221-597364)
chr5 (93-229)||(19508110-19508249)
chr5 (93-233)||(5454436-5454579)
chr5 (93-233)||(5582296-5582439)
chr5 (93-233)||(10686092-10686235)
chr5 (93-233)||(25852923-25853066)
chr5 (93-233)||(40010991-40011134)
chr5 (93-233)||(25846291-25846434)
chr5 (93-233)||(30781012-30781155)
chr5 (95-231)||(15461421-15461560)
chr5 (93-233)||(43028988-43029131)
chr5 (94-233)||(1111697-1111839)
chr5 (94-233)||(14614969-14615111)
chr5 (94-233)||(22248260-22248402)
chr5 (94-233)||(38013682-38013824)
chr5 (94-233)||(7508033-7508176)
chr5 (94-233)||(14889010-14889153)
chr5 (94-233)||(17938902-17939045)
chr5 (11-133)||(22379440-22379564)
chr5 (93-233)||(18895014-18895157)
chr5 (94-233)||(24795035-24795177)
chr5 (94-233)||(24800402-24800544)
chr5 (94-233)||(37539977-37540119)
chr5 (94-233)||(37547521-37547663)
chr5 (94-179)||(11995085-11995170)
chr5 (94-233)||(14882333-14882476)
chr5 (156-233)||(22379543-22379620)
chr5 (156-233)||(41877854-41877932)
chr5 (74-215)||(27635930-27636076)
chr5 (95-215)||(23444254-23444380)
chr5 (135-215)||(21829546-21829626)
chr5 (95-215)||(21574071-21574195)
chr5 (29-215)||(23561664-23561853)
chr5 (74-215)||(24751584-24751729)
chr5 (95-215)||(427215-427341)
chr5 (159-233)||(18566603-18566679)
chr5 (74-215)||(24669046-24669191)
chr5 (74-215)||(24738815-24738960)
chr5 (43-153)||(19235794-19235906)
chr5 (43-153)||(28371543-28371655)
chr5 (156-233)||(29746612-29746692)
chr5 (43-153)||(38145870-38145982)
chr5 (43-153)||(42960029-42960141)
chr5 (74-138)||(29746666-29746731)
chr5 (43-153)||(22336054-22336166)
chr5 (43-153)||(22460049-22460161)
chr5 (43-153)||(22466673-22466785)
chr5 (43-153)||(22749700-22749812)
chr5 (43-153)||(34828975-34829087)
chr5 (95-215)||(20843142-20843267)
chr5 (43-153)||(23112854-23112967)
chr5 (43-153)||(22339592-22339704)
chr5 (87-138)||(20347129-20347180)
chr5 (147-215)||(26753620-26753690)
chr5 (43-153)||(9775414-9775527)
chr5 (43-153)||(37805432-37805545)
chr5 (95-133)||(41877911-41877949)
chr5 (159-233)||(20340553-20340630)
chr5 (159-233)||(20347157-20347234)
chr5 (20-90)||(10035032-10035104)
chr5 (95-155)||(758365-758427)
chr5 (87-138)||(18566575-18566626)
chr5 (87-138)||(20340525-20340576)
chr5 (95-155)||(22312943-22313005)
chr5 (95-155)||(22509284-22509346)
chr5 (43-153)||(24930984-24931095)
chr5 (45-153)||(28890476-28890586)
chr5 (45-153)||(28897180-28897290)
chr5 (45-153)||(28910380-28910490)
chr5 (45-153)||(28925648-28925758)
chr5 (45-153)||(28932071-28932181)
chr5 (45-153)||(28933575-28933685)
chr5 (45-153)||(28946775-28946885)
chr5 (32-153)||(18409149-18409276)
chr5 (43-153)||(37599411-37599523)
chr5 (95-155)||(20937594-20937656)
chr5 (124-185)||(18409071-18409133)
chr5 (98-174)||(21888550-21888630)
chr5 (12-77)||(20831679-20831747)
chr5 (133-174)||(24617806-24617846)
chr5 (133-174)||(24714037-24714077)
chr5 (133-174)||(24747065-24747105)
chr5 (12-69)||(43243873-43243933)
chr5 (45-84)||(21494878-21494918)
chr5 (119-174)||(25013621-25013677)
[»] chr8 (80 HSPs)
chr8 (11-233)||(43687316-43687538)
chr8 (12-233)||(14416564-14416788)
chr8 (12-233)||(29328112-29328335)
chr8 (11-233)||(29299069-29299292)
chr8 (11-233)||(29305615-29305838)
chr8 (43-233)||(11392596-11392788)
chr8 (12-233)||(25701558-25701782)
chr8 (74-233)||(27345695-27345857)
chr8 (74-233)||(40144284-40144445)
chr8 (74-233)||(16266860-16267021)
chr8 (87-233)||(23117202-23117351)
chr8 (87-233)||(10956674-10956823)
chr8 (87-233)||(26486009-26486158)
chr8 (12-232)||(14746509-14746748)
chr8 (87-233)||(3224672-3224821)
chr8 (87-229)||(3697636-3697781)
chr8 (93-233)||(16887287-16887430)
chr8 (94-233)||(14563541-14563683)
chr8 (94-233)||(27909573-27909715)
chr8 (94-233)||(27955992-27956134)
chr8 (94-233)||(36800431-36800573)
chr8 (95-233)||(9205339-9205480)
chr8 (94-233)||(4520722-4520865)
chr8 (93-200)||(14736845-14736953)
chr8 (94-200)||(14765587-14765694)
chr8 (93-233)||(35541047-35541190)
chr8 (94-233)||(28980724-28980866)
chr8 (94-233)||(28985944-28986086)
chr8 (93-199)||(23224772-23224878)
chr8 (12-215)||(23653753-23653962)
chr8 (31-185)||(23653071-23653231)
chr8 (12-131)||(27873714-27873834)
chr8 (12-131)||(27889844-27889964)
chr8 (12-131)||(27948502-27948622)
chr8 (159-233)||(27873818-27873893)
chr8 (159-233)||(27889948-27890023)
chr8 (159-233)||(27948606-27948681)
chr8 (156-233)||(6588132-6588211)
chr8 (95-215)||(21690487-21690611)
chr8 (95-215)||(39363480-39363604)
chr8 (135-215)||(20783927-20784006)
chr8 (95-215)||(19859506-19859631)
chr8 (74-213)||(31412565-31412710)
chr8 (74-213)||(31418747-31418892)
chr8 (95-215)||(21686162-21686287)
chr8 (43-153)||(24321720-24321832)
chr8 (61-215)||(36445806-36445964)
chr8 (95-215)||(14594808-14594933)
chr8 (43-153)||(8729130-8729242)
chr8 (35-153)||(18609730-18609853)
chr8 (12-154)||(21839393-21839537)
chr8 (12-84)||(21930528-21930602)
chr8 (134-215)||(38186014-38186096)
chr8 (135-215)||(16259558-16259637)
chr8 (43-153)||(27942291-27942403)
chr8 (61-215)||(21683745-21683902)
chr8 (61-215)||(21688094-21688251)
chr8 (74-138)||(6588093-6588158)
chr8 (94-138)||(213986-214030)
chr8 (94-138)||(238224-238268)
chr8 (94-138)||(727609-727653)
chr8 (94-138)||(800110-800154)
chr8 (94-138)||(851503-851547)
chr8 (95-155)||(22025700-22025762)
chr8 (95-155)||(22050201-22050263)
chr8 (95-155)||(22055719-22055781)
chr8 (95-155)||(22177586-22177648)
chr8 (54-177)||(14057698-14057825)
chr8 (83-153)||(21282046-21282119)
chr8 (43-153)||(8596208-8596320)
chr8 (118-155)||(22063703-22063740)
chr8 (95-215)||(22743702-22743827)
chr8 (86-177)||(23825115-23825210)
chr8 (154-233)||(214002-214085)
chr8 (154-233)||(238169-238252)
chr8 (154-233)||(727625-727708)
chr8 (154-233)||(800126-800209)
chr8 (154-233)||(851519-851602)
chr8 (95-155)||(21300291-21300354)
chr8 (95-155)||(41009574-41009637)
[»] chr2 (75 HSPs)
chr2 (11-229)||(36800473-36800692)
chr2 (12-229)||(32911485-32911705)
chr2 (12-233)||(15643288-15643511)
chr2 (12-233)||(13101172-13101396)
chr2 (12-233)||(45028424-45028648)
chr2 (32-233)||(25590200-25590402)
chr2 (13-233)||(27272169-27272392)
chr2 (43-233)||(17592531-17592724)
chr2 (94-233)||(14563832-14563972)
chr2 (94-233)||(35244025-35244167)
chr2 (87-233)||(27037237-27037386)
chr2 (93-233)||(11466070-11466212)
chr2 (87-233)||(22013103-22013252)
chr2 (87-229)||(34043-34188)
chr2 (93-233)||(4077419-4077562)
chr2 (94-233)||(24481590-24481732)
chr2 (93-179)||(27729507-27729593)
chr2 (86-233)||(28292711-28292861)
chr2 (94-233)||(30196505-30196647)
chr2 (94-233)||(4071534-4071677)
chr2 (94-233)||(20850189-20850332)
chr2 (93-233)||(24426831-24426975)
chr2 (94-200)||(11360265-11360372)
chr2 (93-233)||(44091079-44091222)
chr2 (87-233)||(2385912-2386062)
chr2 (94-233)||(21604764-21604906)
chr2 (94-233)||(31828612-31828755)
chr2 (94-233)||(31833964-31834107)
chr2 (94-233)||(36984555-36984698)
chr2 (94-233)||(1067096-1067238)
chr2 (94-179)||(71521-71606)
chr2 (94-175)||(35585357-35585438)
chr2 (94-179)||(1061713-1061798)
chr2 (74-215)||(28971332-28971478)
chr2 (45-215)||(24660405-24660581)
chr2 (86-215)||(21133306-21133440)
chr2 (95-215)||(25267199-25267325)
chr2 (119-215)||(8890022-8890121)
chr2 (27-215)||(22860234-22860425)
chr2 (29-215)||(38931613-38931806)
chr2 (43-153)||(9469-9581)
chr2 (135-215)||(23062590-23062672)
chr2 (95-215)||(20648069-20648195)
chr2 (43-153)||(19662942-19663054)
chr2 (43-153)||(26884100-26884212)
chr2 (43-153)||(27211097-27211209)
chr2 (95-215)||(19035478-19035603)
chr2 (43-153)||(10685741-10685854)
chr2 (57-175)||(23062462-23062585)
chr2 (43-153)||(29280888-29281000)
chr2 (86-153)||(19649660-19649730)
chr2 (95-215)||(25107524-25107648)
chr2 (43-177)||(9241280-9241419)
chr2 (43-153)||(6261664-6261776)
chr2 (124-210)||(22796688-22796776)
chr2 (27-177)||(22796767-22796919)
chr2 (95-215)||(20914388-20914513)
chr2 (32-153)||(23263917-23264043)
chr2 (43-153)||(20260771-20260884)
chr2 (95-155)||(2105577-2105640)
chr2 (12-77)||(19649753-19649821)
chr2 (12-77)||(21133462-21133530)
chr2 (27-177)||(6482251-6482408)
chr2 (95-155)||(20724032-20724095)
chr2 (45-154)||(21123991-21124105)
chr2 (32-153)||(21907182-21907309)
chr2 (95-155)||(22809882-22809944)
chr2 (74-177)||(200619-200727)
chr2 (45-153)||(21074096-21074209)
chr2 (12-77)||(6744532-6744600)
chr2 (95-149)||(22703489-22703545)
chr2 (86-177)||(27367674-27367769)
chr2 (12-68)||(11465974-11466033)
chr2 (32-109)||(23877772-23877852)
chr2 (95-155)||(24658773-24658836)
[»] chr3 (119 HSPs)
chr3 (11-229)||(11956628-11956847)
chr3 (12-233)||(8373953-8374176)
chr3 (11-233)||(12725152-12725373)
chr3 (12-229)||(30596891-30597110)
chr3 (12-228)||(32388050-32388268)
chr3 (12-233)||(54519957-54520181)
chr3 (32-229)||(49163087-49163284)
chr3 (27-233)||(16833148-16833356)
chr3 (12-233)||(9691435-9691658)
chr3 (12-233)||(16331621-16331843)
chr3 (12-233)||(29550835-29551058)
chr3 (21-233)||(19344180-19344393)
chr3 (12-233)||(20377268-20377491)
chr3 (12-233)||(46071138-46071361)
chr3 (43-233)||(29545190-29545382)
chr3 (112-233)||(20187754-20187876)
chr3 (12-233)||(38742818-38743057)
chr3 (74-233)||(48774644-48774807)
chr3 (95-233)||(54520256-54520396)
chr3 (93-233)||(9771942-9772085)
chr3 (87-229)||(12271425-12271570)
chr3 (93-233)||(2499070-2499213)
chr3 (93-233)||(45611646-45611789)
chr3 (93-200)||(10767736-10767844)
chr3 (94-233)||(53571260-53571402)
chr3 (94-233)||(29493534-29493677)
chr3 (93-233)||(21151483-21151626)
chr3 (94-233)||(43724090-43724232)
chr3 (94-233)||(50656014-50656156)
chr3 (95-233)||(28758881-28759022)
chr3 (95-233)||(47121129-47121270)
chr3 (95-233)||(47128497-47128638)
chr3 (95-233)||(50142795-50142936)
chr3 (94-233)||(3782777-3782920)
chr3 (94-233)||(10381920-10382063)
chr3 (94-233)||(10410573-10410716)
chr3 (32-146)||(18957698-18957814)
chr3 (74-177)||(20187671-20187775)
chr3 (93-200)||(54833248-54833356)
chr3 (12-133)||(15374595-15374718)
chr3 (94-197)||(14845232-14845336)
chr3 (42-139)||(27029558-27029655)
chr3 (42-139)||(27031726-27031823)
chr3 (12-133)||(54091821-54091943)
chr3 (142-233)||(18961002-18961093)
chr3 (156-233)||(3802554-3802632)
chr3 (156-233)||(3802716-3802794)
chr3 (156-233)||(54091764-54091842)
chr3 (156-233)||(15374697-15374775)
chr3 (43-133)||(3802484-3802575)
chr3 (68-215)||(2270315-2270464)
chr3 (135-215)||(11644873-11644953)
chr3 (86-215)||(10597787-10597920)
chr3 (86-215)||(18757016-18757150)
chr3 (94-215)||(11850717-11850841)
chr3 (65-215)||(12152823-12152975)
chr3 (95-215)||(12274221-12274347)
chr3 (112-215)||(17512558-17512663)
chr3 (43-153)||(17130644-17130756)
chr3 (68-215)||(11305825-11305974)
chr3 (86-215)||(12419382-12419515)
chr3 (32-155)||(18913940-18914069)
chr3 (43-153)||(12034465-12034577)
chr3 (43-153)||(14764248-14764360)
chr3 (43-153)||(23371994-23372106)
chr3 (43-153)||(38312268-38312380)
chr3 (43-153)||(51300049-51300161)
chr3 (95-215)||(15955068-15955193)
chr3 (43-153)||(19236124-19236235)
chr3 (20-84)||(42109036-42109102)
chr3 (68-215)||(17496094-17496243)
chr3 (12-177)||(24123294-24123465)
chr3 (95-155)||(16382994-16383056)
chr3 (95-133)||(3802699-3802737)
chr3 (95-215)||(14569795-14569921)
chr3 (43-153)||(14864735-14864847)
chr3 (95-155)||(13203653-13203715)
chr3 (95-155)||(14652830-14652892)
chr3 (95-215)||(15935047-15935172)
chr3 (95-153)||(19443469-19443528)
chr3 (45-153)||(10553822-10553932)
chr3 (124-185)||(12356042-12356104)
chr3 (124-185)||(12362591-12362653)
chr3 (98-155)||(14292706-14292765)
chr3 (119-174)||(16823843-16823899)
chr3 (32-153)||(17243796-17243923)
chr3 (43-153)||(20249254-20249366)
chr3 (74-153)||(31690713-31690796)
chr3 (120-183)||(14289058-14289120)
chr3 (33-153)||(18888901-18889027)
chr3 (74-177)||(8583385-8583493)
chr3 (45-153)||(10390515-10390625)
chr3 (45-153)||(10415624-10415734)
chr3 (45-153)||(10422294-10422404)
chr3 (165-215)||(12202353-12202403)
chr3 (43-153)||(12304696-12304809)
chr3 (124-185)||(12479777-12479839)
chr3 (74-177)||(14084509-14084617)
chr3 (74-177)||(14089910-14090018)
chr3 (95-153)||(18719251-18719312)
chr3 (12-77)||(8583502-8583570)
chr3 (95-177)||(11964993-11965080)
chr3 (95-177)||(12363445-12363532)
chr3 (86-177)||(13968924-13969019)
chr3 (12-77)||(13969069-13969137)
chr3 (86-177)||(13974399-13974494)
chr3 (12-77)||(13974544-13974612)
chr3 (12-77)||(14084432-14084500)
chr3 (12-77)||(14089833-14089901)
chr3 (95-153)||(14544308-14544368)
chr3 (12-69)||(14648384-14648444)
chr3 (12-69)||(20187568-20187627)
chr3 (11-174)||(24284550-24284726)
chr3 (12-77)||(31690805-31690873)
chr3 (12-77)||(31943342-31943410)
chr3 (12-77)||(49399374-49399442)
chr3 (23-73)||(9778-9830)
chr3 (95-155)||(12961517-12961580)
chr3 (45-84)||(14289166-14289206)
[»] chr6 (76 HSPs)
chr6 (11-233)||(29925610-29925833)
chr6 (16-233)||(10470746-10470965)
chr6 (16-233)||(10464224-10464443)
chr6 (12-229)||(12447215-12447435)
chr6 (12-233)||(17207753-17207976)
chr6 (11-233)||(27767273-27767498)
chr6 (12-228)||(13940348-13940567)
chr6 (32-233)||(23021364-23021568)
chr6 (74-233)||(14582783-14582943)
chr6 (74-233)||(94504-94666)
chr6 (74-233)||(8069703-8069865)
chr6 (12-159)||(17894611-17894760)
chr6 (87-229)||(4106688-4106833)
chr6 (125-233)||(13128281-13128390)
chr6 (87-233)||(29159059-29159209)
chr6 (93-233)||(24369185-24369327)
chr6 (93-233)||(25315654-25315797)
chr6 (93-233)||(26203148-26203291)
chr6 (93-233)||(30799446-30799588)
chr6 (94-233)||(1070616-1070758)
chr6 (94-233)||(15332131-15332273)
chr6 (94-233)||(17309672-17309814)
chr6 (94-233)||(25463839-25463981)
chr6 (94-233)||(34133979-34134121)
chr6 (95-233)||(16223667-16223808)
chr6 (43-215)||(25347029-25347206)
chr6 (94-179)||(22406620-22406705)
chr6 (61-215)||(10582895-10583051)
chr6 (135-215)||(17414038-17414118)
chr6 (86-215)||(26418719-26418853)
chr6 (45-215)||(19472379-19472556)
chr6 (11-215)||(18785975-18786187)
chr6 (42-129)||(13135929-13136016)
chr6 (93-215)||(23234982-23235108)
chr6 (45-215)||(25395948-25396125)
chr6 (41-153)||(15457410-15457524)
chr6 (41-153)||(15464005-15464119)
chr6 (61-215)||(23233463-23233620)
chr6 (95-215)||(24720594-24720720)
chr6 (74-215)||(5290196-5290341)
chr6 (12-84)||(25749621-25749695)
chr6 (135-215)||(19451326-19451407)
chr6 (135-215)||(19467858-19467939)
chr6 (11-209)||(14133105-14133310)
chr6 (43-153)||(20008998-20009110)
chr6 (43-153)||(31250239-31250351)
chr6 (43-153)||(9100127-9100238)
chr6 (43-153)||(29096753-29096864)
chr6 (94-155)||(1592758-1592821)
chr6 (43-153)||(4476312-4476424)
chr6 (95-153)||(19300787-19300846)
chr6 (43-128)||(20011082-20011169)
chr6 (43-153)||(12941747-12941860)
chr6 (87-133)||(19096815-19096861)
chr6 (43-153)||(28290324-28290437)
chr6 (61-215)||(22798574-22798730)
chr6 (98-155)||(21724875-21724934)
chr6 (95-153)||(14581975-14582034)
chr6 (95-155)||(19726606-19726668)
chr6 (93-138)||(24362610-24362654)
chr6 (12-68)||(7429332-7429391)
chr6 (135-175)||(19449332-19449372)
chr6 (43-153)||(21365585-21365697)
chr6 (43-153)||(23969567-23969679)
chr6 (112-155)||(22906984-22907027)
chr6 (95-215)||(24412341-24412466)
chr6 (95-153)||(8760544-8760605)
chr6 (30-153)||(24513944-24514072)
chr6 (74-177)||(24562260-24562368)
chr6 (12-77)||(24562183-24562251)
chr6 (82-177)||(29615290-29615389)
chr6 (12-68)||(8069883-8069942)
chr6 (95-155)||(14375426-14375489)
chr6 (16-68)||(23235146-23235201)
chr6 (156-233)||(24362628-24362708)
chr6 (43-153)||(25634095-25634207)
[»] chr4 (84 HSPs)
chr4 (11-229)||(30396063-30396281)
chr4 (30-229)||(33096977-33097178)
chr4 (17-233)||(42220302-42220520)
chr4 (12-233)||(20889240-20889464)
chr4 (12-233)||(20894859-20895083)
chr4 (12-233)||(31664925-31665149)
chr4 (12-229)||(46044868-46045088)
chr4 (43-233)||(19128336-19128528)
chr4 (12-233)||(49548577-49548801)
chr4 (12-233)||(33221236-33221459)
chr4 (11-233)||(2972726-2972950)
chr4 (12-233)||(21881458-21881681)
chr4 (12-233)||(41404701-41404924)
chr4 (32-233)||(899481-899682)
chr4 (87-233)||(35462605-35462752)
chr4 (43-233)||(36037460-36037652)
chr4 (74-233)||(7359175-7359337)
chr4 (74-233)||(47872415-47872577)
chr4 (74-233)||(54844941-54845103)
chr4 (94-233)||(34772115-34772257)
chr4 (86-233)||(45959734-45959884)
chr4 (95-233)||(49548362-49548502)
chr4 (93-233)||(45142542-45142685)
chr4 (87-233)||(1583850-1583999)
chr4 (87-233)||(5938865-5939014)
chr4 (74-228)||(7356182-7356339)
chr4 (87-229)||(11202427-11202572)
chr4 (74-231)||(42956017-42956177)
chr4 (93-233)||(3259984-3260127)
chr4 (93-233)||(52500497-52500640)
chr4 (93-200)||(391072-391180)
chr4 (93-200)||(29382792-29382900)
chr4 (93-233)||(23435975-23436118)
chr4 (87-233)||(21396756-21396906)
chr4 (94-233)||(29448669-29448811)
chr4 (94-233)||(29455353-29455495)
chr4 (93-179)||(50082206-50082292)
chr4 (94-200)||(11937105-11937212)
chr4 (94-233)||(26395632-26395774)
chr4 (94-233)||(39266230-39266371)
chr4 (86-233)||(49240837-49240987)
chr4 (86-233)||(49749551-49749701)
chr4 (95-233)||(3266612-3266753)
chr4 (93-175)||(45151372-45151454)
chr4 (12-161)||(10977129-10977285)
chr4 (95-215)||(15360879-15361003)
chr4 (61-215)||(53905371-53905529)
chr4 (95-215)||(13899671-13899797)
chr4 (54-215)||(15306959-15307126)
chr4 (86-185)||(13452217-13452319)
chr4 (95-215)||(16484596-16484721)
chr4 (86-213)||(37881387-37881519)
chr4 (135-212)||(18166345-18166422)
chr4 (45-215)||(13886614-13886791)
chr4 (43-153)||(14910532-14910645)
chr4 (57-215)||(14821317-14821479)
chr4 (94-215)||(15244098-15244224)
chr4 (98-215)||(16229175-16229297)
chr4 (95-212)||(18271262-18271384)
chr4 (135-215)||(12931881-12931962)
chr4 (43-153)||(16147891-16148003)
chr4 (95-212)||(18261297-18261419)
chr4 (95-155)||(23121599-23121661)
chr4 (32-153)||(14485444-14485570)
chr4 (54-155)||(15406870-15406973)
chr4 (95-215)||(15005024-15005149)
chr4 (95-155)||(20940260-20940322)
chr4 (95-153)||(27905211-27905270)
chr4 (95-153)||(40908583-40908642)
chr4 (95-185)||(8833771-8833866)
chr4 (94-128)||(15470652-15470686)
chr4 (43-153)||(15533733-15533846)
chr4 (95-174)||(13444207-13444290)
chr4 (12-69)||(13452101-13452161)
chr4 (133-185)||(15546609-15546661)
chr4 (95-153)||(1651177-1651236)
chr4 (95-177)||(2585260-2585346)
chr4 (95-155)||(4831203-4831265)
chr4 (95-155)||(4834498-4834560)
chr4 (54-177)||(11847012-11847139)
chr4 (133-174)||(22725968-22726008)
chr4 (156-233)||(391175-391255)
chr4 (98-155)||(14484432-14484491)
chr4 (27-153)||(14556199-14556327)
[»] chr1 (77 HSPs)
chr1 (12-229)||(49327948-49328167)
chr1 (32-229)||(47484043-47484241)
chr1 (13-233)||(29596833-29597055)
chr1 (32-233)||(36614870-36615074)
chr1 (43-233)||(43088338-43088530)
chr1 (12-233)||(21920712-21920935)
chr1 (108-233)||(29602268-29602394)
chr1 (86-233)||(4231178-4231328)
chr1 (74-233)||(42626177-42626339)
chr1 (87-229)||(21962996-21963141)
chr1 (87-233)||(17146249-17146397)
chr1 (93-229)||(20570738-20570877)
chr1 (87-233)||(20292671-20292820)
chr1 (93-233)||(6740515-6740658)
chr1 (93-233)||(18026727-18026870)
chr1 (93-233)||(28556477-28556620)
chr1 (93-200)||(3652709-3652817)
chr1 (93-233)||(20277227-20277370)
chr1 (94-233)||(38908029-38908171)
chr1 (94-233)||(39094319-39094461)
chr1 (94-233)||(37682084-37682227)
chr1 (93-233)||(18418121-18418264)
chr1 (94-200)||(37675391-37675498)
chr1 (74-179)||(9269910-9270016)
chr1 (94-233)||(22185579-22185721)
chr1 (74-171)||(24850077-24850175)
chr1 (93-179)||(36212043-36212129)
chr1 (95-233)||(31535275-31535416)
chr1 (95-233)||(31563992-31564133)
chr1 (95-233)||(48427852-48427993)
chr1 (94-233)||(39189656-39189798)
chr1 (93-177)||(20396911-20396995)
chr1 (74-177)||(52990692-52990796)
chr1 (129-233)||(20076926-20077033)
chr1 (112-179)||(20396865-20396932)
chr1 (61-215)||(15316561-15316718)
chr1 (86-215)||(24109078-24109212)
chr1 (86-215)||(24079542-24079676)
chr1 (68-215)||(19853005-19853155)
chr1 (68-215)||(19859140-19859290)
chr1 (86-185)||(23195560-23195662)
chr1 (29-211)||(20848955-20849145)
chr1 (95-215)||(21410731-21410857)
chr1 (62-215)||(21664128-21664284)
chr1 (135-215)||(11141058-11141138)
chr1 (68-215)||(19666787-19666938)
chr1 (43-153)||(20852183-20852295)
chr1 (43-153)||(20858809-20858921)
chr1 (43-153)||(21705169-21705281)
chr1 (87-138)||(20299349-20299400)
chr1 (54-177)||(19664220-19664348)
chr1 (36-215)||(21987020-21987205)
chr1 (93-174)||(10813614-10813697)
chr1 (124-215)||(11157038-11157131)
chr1 (95-233)||(21698132-21698275)
chr1 (43-153)||(16371484-16371596)
chr1 (95-155)||(3706877-3706939)
chr1 (95-196)||(22448334-22448440)
chr1 (61-215)||(30491493-30491649)
chr1 (156-233)||(20299374-20299454)
chr1 (95-155)||(955157-955219)
chr1 (119-185)||(22030782-22030849)
chr1 (95-215)||(23630954-23631078)
chr1 (133-215)||(31927473-31927556)
chr1 (45-153)||(16669390-16669500)
chr1 (95-177)||(20941947-20942034)
chr1 (95-155)||(20824467-20824530)
chr1 (95-155)||(23066816-23066878)
chr1 (95-185)||(29534939-29535033)
chr1 (20-84)||(20108727-20108793)
chr1 (74-177)||(21542034-21542142)
chr1 (12-77)||(21541957-21542025)
chr1 (16-77)||(23195684-23195748)
chr1 (86-177)||(42095994-42096089)
chr1 (12-77)||(42096111-42096179)
chr1 (95-155)||(20838286-20838349)
chr1 (95-155)||(29554560-29554623)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (12-229)||(74155-74374)
scaffold0031 (95-185)||(120787-120881)
scaffold0031 (95-185)||(131664-131758)
[»] scaffold0310 (3 HSPs)
scaffold0310 (12-233)||(7629-7852)
scaffold0310 (12-133)||(12820-12942)
scaffold0310 (156-233)||(12921-12999)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (12-233)||(539-763)
[»] scaffold0076 (6 HSPs)
scaffold0076 (43-233)||(8-200)
scaffold0076 (74-177)||(30236-30344)
scaffold0076 (74-177)||(35637-35745)
scaffold0076 (12-77)||(30353-30421)
scaffold0076 (12-77)||(35754-35822)
scaffold0076 (117-177)||(51791-51854)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (12-233)||(1931-2153)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (32-228)||(41168-41364)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (12-233)||(101683-101906)
scaffold0037 (45-146)||(97464-97570)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (32-229)||(246955-247154)
scaffold0009 (32-229)||(253469-253668)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (32-233)||(178938-179142)
scaffold0001 (87-233)||(512554-512702)
scaffold0001 (43-153)||(494075-494187)
scaffold0001 (20-84)||(524565-524631)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (12-233)||(65323-65547)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (12-233)||(24563-24786)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (107-233)||(30845-30971)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (12-233)||(15004-15242)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (12-161)||(143877-144028)
scaffold0019 (177-233)||(137159-137215)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (74-232)||(1038-1200)
[»] scaffold0214 (1 HSPs)
scaffold0214 (74-233)||(15218-15380)
[»] scaffold0103 (2 HSPs)
scaffold0103 (74-233)||(19586-19748)
scaffold0103 (74-233)||(23837-23999)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (94-233)||(4658-4799)
scaffold0188 (86-215)||(31627-31761)
[»] scaffold0320 (1 HSPs)
scaffold0320 (74-233)||(870-1033)
[»] scaffold0113 (5 HSPs)
scaffold0113 (112-233)||(19231-19353)
scaffold0113 (12-177)||(19085-19252)
scaffold0113 (156-233)||(15177-15255)
scaffold0113 (12-133)||(15075-15198)
scaffold0113 (95-182)||(26865-26956)
[»] scaffold0279 (1 HSPs)
scaffold0279 (87-229)||(5745-5890)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (87-233)||(25033-25181)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (93-233)||(18438-18581)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (87-233)||(31632-31781)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (93-233)||(18542-18685)
scaffold0089 (33-177)||(1830-1981)
scaffold0089 (135-215)||(1984-2066)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (94-233)||(12246-12388)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (94-233)||(104286-104428)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (94-200)||(13405-13512)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (93-179)||(16100-16186)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (94-233)||(50000-50142)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (12-215)||(4178-4388)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (19-215)||(1208-1410)
[»] scaffold1251 (1 HSPs)
scaffold1251 (11-77)||(2236-2302)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (61-215)||(8442-8598)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (86-215)||(26082-26215)
scaffold0104 (86-215)||(27464-27597)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (61-215)||(3353-3509)
[»] scaffold0124 (4 HSPs)
scaffold0124 (61-215)||(9192-9348)
scaffold0124 (61-215)||(44862-45018)
scaffold0124 (43-177)||(36908-37047)
scaffold0124 (32-153)||(44134-44261)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (95-215)||(47877-48001)
scaffold0114 (95-155)||(41931-41993)
[»] scaffold0298 (2 HSPs)
scaffold0298 (61-215)||(8204-8360)
scaffold0298 (61-215)||(18288-18444)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (61-215)||(9205-9361)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (61-215)||(17484-17640)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (11-214)||(1-211)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (45-215)||(129747-129924)
scaffold0004 (32-153)||(115670-115796)
scaffold0004 (95-155)||(321062-321125)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (95-211)||(5067-5187)
scaffold0556 (133-174)||(10946-10987)
[»] scaffold1726 (1 HSPs)
scaffold1726 (86-215)||(215-349)
[»] scaffold0011 (8 HSPs)
scaffold0011 (119-215)||(75156-75255)
scaffold0011 (68-215)||(146981-147131)
scaffold0011 (68-215)||(251858-252008)
scaffold0011 (95-215)||(56821-56947)
scaffold0011 (150-215)||(154186-154252)
scaffold0011 (74-177)||(174652-174760)
scaffold0011 (12-77)||(174769-174837)
scaffold0011 (95-155)||(197555-197618)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (61-215)||(6092-6250)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (61-211)||(18473-18626)
[»] scaffold0301 (1 HSPs)
scaffold0301 (29-215)||(3141-3330)
[»] scaffold0249 (3 HSPs)
scaffold0249 (41-153)||(14915-15029)
scaffold0249 (45-177)||(7899-8038)
scaffold0249 (27-84)||(6983-7042)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (95-215)||(1409-1535)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (95-215)||(65-191)
[»] scaffold0026 (6 HSPs)
scaffold0026 (95-215)||(27973-28099)
scaffold0026 (95-215)||(38810-38936)
scaffold0026 (43-153)||(110140-110252)
scaffold0026 (69-185)||(142605-142723)
scaffold0026 (95-155)||(63308-63370)
scaffold0026 (95-153)||(124588-124649)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (27-215)||(481-672)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (19-153)||(103045-103183)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (93-215)||(5182-5308)
scaffold0120 (12-77)||(5338-5406)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (95-215)||(2868-2993)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (95-215)||(64965-65090)
scaffold0028 (135-215)||(999-1080)
scaffold0028 (74-177)||(47070-47178)
scaffold0028 (74-177)||(52475-52583)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (31-215)||(76648-76840)
[»] scaffold1517 (1 HSPs)
scaffold1517 (16-77)||(1-63)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (98-215)||(2252-2375)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (176-233)||(9835-9893)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (29-215)||(25518-25707)
[»] scaffold0102 (3 HSPs)
scaffold0102 (95-215)||(29801-29927)
scaffold0102 (95-215)||(44580-44706)
scaffold0102 (95-215)||(38421-38547)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (57-215)||(18230-18392)
scaffold0005 (95-155)||(258674-258736)
scaffold0005 (95-155)||(265100-265162)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (43-153)||(2967-3079)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (119-215)||(28634-28733)
scaffold0106 (95-215)||(36180-36306)
scaffold0106 (74-177)||(38379-38487)
scaffold0106 (12-77)||(38302-38370)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (45-215)||(27942-28119)
scaffold0222 (95-155)||(5122-5184)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (135-215)||(9372-9454)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (45-215)||(51079-51256)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (95-211)||(56003-56124)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (95-215)||(207839-207964)
[»] scaffold0326 (4 HSPs)
scaffold0326 (93-215)||(446-571)
scaffold0326 (61-204)||(16376-16521)
scaffold0326 (119-215)||(5468-5566)
scaffold0326 (61-159)||(8474-8574)
[»] scaffold0167 (2 HSPs)
scaffold0167 (61-215)||(19762-19919)
scaffold0167 (62-177)||(6908-7025)
[»] scaffold0720 (1 HSPs)
scaffold0720 (43-153)||(4286-4398)
[»] scaffold0661 (1 HSPs)
scaffold0661 (119-215)||(4145-4244)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (43-153)||(254-366)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (43-153)||(80551-80663)
[»] scaffold1584 (2 HSPs)
scaffold1584 (86-153)||(311-381)
scaffold1584 (12-69)||(220-280)
[»] scaffold1290 (1 HSPs)
scaffold1290 (95-215)||(1322-1447)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (95-155)||(3658-3720)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (45-215)||(19454-19631)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (45-177)||(16137-16275)
scaffold0139 (124-212)||(16056-16146)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (95-155)||(141326-141388)
scaffold0021 (95-155)||(146566-146629)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (135-212)||(443-521)
[»] scaffold0169 (1 HSPs)
scaffold0169 (12-84)||(5839-5913)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (54-154)||(43012-43116)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (33-155)||(110-238)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (95-215)||(10713-10839)
scaffold0261 (95-215)||(18892-19019)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (54-155)||(41732-41835)
[»] scaffold0693 (1 HSPs)
scaffold0693 (32-153)||(1972-2099)
[»] scaffold0461 (2 HSPs)
scaffold0461 (32-153)||(1197-1324)
scaffold0461 (32-153)||(8133-8260)
[»] scaffold0535 (1 HSPs)
scaffold0535 (95-155)||(6146-6208)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (95-155)||(14611-14673)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (164-215)||(27309-27362)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (119-215)||(45527-45625)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (54-155)||(17054-17157)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (95-174)||(11713-11796)
[»] scaffold0098 (2 HSPs)
scaffold0098 (12-77)||(52846-52914)
scaffold0098 (86-153)||(52753-52823)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (95-153)||(51088-51148)
[»] scaffold0034 (10 HSPs)
scaffold0034 (12-77)||(10315-10383)
scaffold0034 (79-153)||(10223-10301)
scaffold0034 (124-205)||(35742-35825)
scaffold0034 (95-153)||(72229-72288)
scaffold0034 (124-177)||(566-620)
scaffold0034 (124-177)||(6725-6779)
scaffold0034 (57-177)||(35816-35941)
scaffold0034 (124-185)||(47041-47103)
scaffold0034 (62-177)||(611-728)
scaffold0034 (62-177)||(6770-6887)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (95-155)||(1841-1904)
scaffold0348 (95-155)||(15579-15641)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (95-155)||(27861-27924)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (95-212)||(22767-22889)
scaffold0091 (121-212)||(26964-27057)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (43-153)||(92251-92363)
scaffold0029 (43-153)||(97977-98089)
[»] scaffold1615 (1 HSPs)
scaffold1615 (60-155)||(532-629)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (95-155)||(10341-10403)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (134-215)||(6679-6762)
scaffold0192 (95-155)||(6593-6656)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (54-177)||(2525-2652)
[»] scaffold0610 (2 HSPs)
scaffold0610 (124-185)||(5590-5652)
scaffold0610 (95-155)||(5513-5576)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (121-174)||(4841-4895)
scaffold0420 (83-153)||(9990-10063)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (95-159)||(1022-1090)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (119-215)||(3812-3909)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (62-155)||(44231-44325)
scaffold0010 (62-155)||(49297-49391)
[»] scaffold2015 (1 HSPs)
scaffold2015 (12-69)||(553-613)
[»] scaffold1853 (1 HSPs)
scaffold1853 (95-156)||(921-987)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (95-158)||(9523-9590)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (95-153)||(47529-47589)
scaffold0067 (95-153)||(56563-56623)
scaffold0067 (95-153)||(62949-63009)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (95-185)||(370396-370491)
[»] scaffold1773 (1 HSPs)
scaffold1773 (127-196)||(17-88)
[»] scaffold1469 (1 HSPs)
scaffold1469 (43-153)||(240-352)
[»] scaffold0790 (1 HSPs)
scaffold0790 (54-90)||(4372-4408)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (45-84)||(189-229)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (16-68)||(1656-1711)
[»] scaffold0178 (1 HSPs)
scaffold0178 (45-84)||(25447-25487)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (124-210)||(57245-57333)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (124-210)||(141300-141388)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 126)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Original strand, 23520920 - 23521140
Alignment:
Q  13 atcatcaatatgacaattacaaccaacaacaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaac 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23520920 atcatcaatatgacaattacacccaacaacaagactcatgcatgacatgacaacatcactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaat 23521019  T
Q  113 aggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctccc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23521020 aggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctccc 23521119  T
Q  213 gctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23521120 gctgtttatgcatatgcaatg 23521140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 19439227 - 19439444
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    |||||||| ||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||    
T  19439227 catcatcattataaaaattaccaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtatca 19439326  T
Q  110 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  19439327 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcat 19439426  T
Q  210 cccgctgtttatgcatat 227  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19439427 cccgctgtttatgcatat 19439444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 13019623 - 13019841
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  13019623 catcatcattatgacaattaccaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgataccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca 13019722  T
Q  110 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcct 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13019723 aacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcatgatcgaagtcctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcct 13019822  T
Q  210 cccgctgtttatgcatatg 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  13019823 cccgctgtttatgcatatg 13019841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 30 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16844108 - 16843908
Alignment:
Q  30 tacaaccaacaaca-agactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16844108 tacaaccaacaacagagactcatgcatgacatgacgacacccctaagactcctcaataaatgcat-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 16844010  T
Q  128 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16844009 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatat 16843910  T
Q  228 gc 229  Q
    ||    
T  16843909 gc 16843908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 233
Target Start/End: Original strand, 12461438 - 12461656
Alignment:
Q  16 atcaatatgacaattacaaccaacaaca-agactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaacag 114  Q
    ||||||||| ||| |||||||||  | | |||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||    
T  12461438 atcaatatggcaactacaaccaatgagagagactcatgcatgacatgatgacaccattaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacag 12461537  T
Q  115 gaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgc 214  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12461538 gaccgaagccctcaccgcatttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagcattcaccgctgtgaacaactagtgctccatgacatgagccctcccgc 12461637  T
Q  215 tgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12461638 tgtttatgcatatgcaatg 12461656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Original strand, 46649762 - 46649909
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaat 186  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  46649762 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccactgtgaacaac 46649861  T
Q  187 tagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46649862 tagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 46649909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 74 - 233
Target Start/End: Original strand, 46174303 - 46174465
Alignment:
Q  74 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 172  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46174303 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 46174402  T
Q  173 ccgctg-tgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  46174403 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcccctccgctgtttatgcatatgcaatg 46174465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17468432 - 17468284
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  17468432 atgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcattaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 17468333  T
Q  186 ttagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17468332 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 17468284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Original strand, 17584782 - 17584930
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  17584782 atgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcattaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 17584881  T
Q  186 ttagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17584882 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 17584930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 74 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2388750 - 2388589
Alignment:
Q  74 agacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcac 173  Q
    |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2388750 agactcctcaaatatgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcac 2388651  T
Q  174 cgctg-tgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  2388650 cgctgttgagcaactagtgctccagaacatgagtcctctctgctgtttatgcatatgcaatg 2388589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13964182 - 13964033
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  13964182 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 13964083  T
Q  186 ttagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
     |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  13964082 ctagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatg 13964033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 30271993 - 30271871
Alignment:
Q  11 acatcatcaatatgacaattacaaccaacaacaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  30271993 acatcatcaacatgacaattacaaccaacaacaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcgataatgcagttatgcatgtggtatcaa 30271894  T
Q  111 acaggaccgaagccctcaccgct 133  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  30271893 acaggaccgaagccctcaccgct 30271871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Original strand, 37285201 - 37285350
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 185  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||    
T  37285201 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagggccgaagctctcaccgctgttgagcaa 37285300  T
Q  186 ttagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
     |||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  37285301 ctagtactccaggacatgagtcatctccgctgttttatgcatatgcaatg 37285350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Original strand, 49158740 - 49158883
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  49158740 atatgcatgtggtaccaaacatgaccaaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcatgaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 49158839  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  49158840 ctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatg 49158883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Original strand, 2438876 - 2439025
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  2438876 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 2438975  T
Q  186 ttagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
     |||| |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  2438976 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 2439025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Original strand, 11339769 - 11339912
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  11339769 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 11339868  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  11339869 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 11339912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Original strand, 11879065 - 11879208
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  11879065 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 11879164  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctgttt-atgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  11879165 ctccaggaccgaagccctcaccgctgtttcatgcatatgcaatg 11879208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11899483 - 11899340
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  11899483 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 11899384  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  11899383 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 11899340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26113929 - 26113786
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  26113929 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 26113830  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctgttt-atgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  26113829 ctccaggaccgaagccctcaccgctgtttaatgcatatgcaatg 26113786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Original strand, 642548 - 642691
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||     
T  642548 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgttgttgagcaactagta 642647  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  642648 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 642691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17726506 - 17726363
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||     
T  17726506 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcactgctgttgagcaactagta 17726407  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  17726406 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 17726363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18437340 - 18437197
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  18437340 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcttcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 18437241  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  18437240 ctccaggactgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 18437197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20019851 - 20019701
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 185  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  20019851 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 20019752  T
Q  186 ttagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatg 233  Q
     |||| |||||||||   || |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  20019751 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatg 20019701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26120542 - 26120399
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  26120542 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcacgaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 26120443  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  26120442 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 26120399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11299826 - 11299684
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  11299826 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 11299727  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  11299726 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 11299684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11308190 - 11308048
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  11308190 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 11308091  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  11308090 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 11308048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Original strand, 32627395 - 32627538
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  32627395 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 32627494  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||| ||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  32627495 ctccagaaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 32627538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8197372 - 8197230
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  8197372 tatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 8197273  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  8197272 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 8197230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8213443 - 8213301
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  8213443 tatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 8213344  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  8213343 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 8213301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 95 - 233
Target Start/End: Original strand, 1317766 - 1317907
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgct 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||    
T  1317766 atgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtact 1317865  T
Q  194 ccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  1317866 ccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 1317907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 95 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26090122 - 26089981
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgct 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||    
T  26090122 atgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtact 26090023  T
Q  194 ccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  26090022 ccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 26089981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 95 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40684934 - 40684793
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgct 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||    
T  40684934 atgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtact 40684835  T
Q  194 ccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  40684834 ccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 40684793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5187416 - 5187273
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  5187416 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 5187317  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  5187316 tccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatg 5187273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 200
Target Start/End: Original strand, 2281085 - 2281192
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  2281085 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 2281184  T
Q  193 tccaggac 200  Q
    ||||||||    
T  2281185 tccaggac 2281192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 200
Target Start/End: Original strand, 42058548 - 42058655
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  42058548 tatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 42058647  T
Q  193 tccaggac 200  Q
    ||||||||    
T  42058648 tccaggac 42058655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 95 - 233
Target Start/End: Original strand, 49150585 - 49150727
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgct 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||    
T  49150585 atgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtact 49150684  T
Q  194 ccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||   || |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  49150685 ccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatg 49150727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 95 - 233
Target Start/End: Original strand, 49157275 - 49157417
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgct 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||    
T  49157275 atgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtact 49157374  T
Q  194 ccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||   || |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  49157375 ccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatg 49157417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40923095 - 40922953
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||| |    
T  40923095 tatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgatgttgagcaactagtac 40922996  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  40922995 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 40922953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 95 - 233
Target Start/End: Original strand, 749843 - 749984
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgct 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||    
T  749843 atgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtact 749942  T
Q  194 ccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  749943 ccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 749984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 95 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 48988092 - 48987951
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgct 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||    
T  48988092 atgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagggccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtact 48987993  T
Q  194 ccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  48987992 ccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 48987951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 2026397 - 2026290
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  2026397 tatgcatgtggtaccaatcgggaccgaagccctcgccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 2026298  T
Q  193 tccaggac 200  Q
    ||||||||    
T  2026297 tccaggac 2026290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Original strand, 33404651 - 33404794
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  33404651 atatgcatgtggtaccaaataggaccgaagccgtcatcgcttttgaatggttaaagcattcataaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 33404750  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||| |||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  33404751 ctctaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 33404794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 156 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30271892 - 30271819
Alignment:
Q  156 caggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30271892 caggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgc 30271819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 86 - 215
Target Start/End: Original strand, 32771486 - 32771619
Alignment:
Q  86 aatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaa 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  32771486 aatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaa 32771585  T
Q  183 caatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||  | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  32771586 caacaaggtgttccaggacatgagtcctcccgct 32771619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14179185 - 14179061
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagt 190  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||    
T  14179185 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaataagt 14179086  T
Q  191 gctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  14179085 gttccaggacatgagtcctcccgct 14179061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13453911 - 13453832
Alignment:
Q  156 caggaccgaagccctcaccgctgt-gaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13453911 caggaccgaagccctcaccgctgttgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 13453832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 19145488 - 19145629
Alignment:
Q  20 atatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaa---aca 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||   ||||||||||||||||    |||    
T  19145488 atatgacaatttcaaccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccattttaca 19145587  T
Q  114 ggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19145588 gggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcat 19145629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 20744887 - 20745028
Alignment:
Q  20 atatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaa---aca 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||   ||||||||||||||||    |||    
T  20744887 atatgacaatttcaaccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccattttaca 20744986  T
Q  114 ggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    || | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20744987 gggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcat 20745028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 233
Target Start/End: Original strand, 21757354 - 21757433
Alignment:
Q  156 caggaccgaagccctcaccgctgt-gaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21757354 caggaccgaagccctcaccgctgttgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 21757433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 215
Target Start/End: Original strand, 3327791 - 3327924
Alignment:
Q  86 aatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctttt-gaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaa 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||    
T  3327791 aatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccaaagccctcaccgctttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctttgaa 3327890  T
Q  183 caatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||  | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  3327891 caacaaggtgttccaggacataagtcctcccgct 3327924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Original strand, 10519804 - 10519960
Alignment:
Q  61 gacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatc 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||| ||  ||||||||||||||   |||||   |||||||||||||  | || |||||||||||||||||||    
T  10519804 gacaacaccactaagactcctcgacaatgcacat--gcatgtggtaccaatttacagggaagaagccctcaccggatattaaatggttaaagcattcatc 10519901  T
Q  157 aggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| |  |||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  10519902 agggcataagccctcaccgctttgaacaataagtgttccagaacatgagtcctcccgct 10519960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 37244506 - 37244359
Alignment:
Q  74 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagcc 168  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  37244506 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtc 37244407  T
Q  169 ctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||||| | |||||||  | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  37244406 ctcaccgttttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctcccgct 37244359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 46682370 - 46682244
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatt--a 188  Q
    |||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||  |    
T  46682370 atgcatttggtaccaatttacaggacagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaa 46682271  T
Q  189 gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  46682270 gtgttccaggacatgagtcctcccgct 46682244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18958614 - 18958480
Alignment:
Q  86 aatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtga 181  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||| |||    
T  18958614 aatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatcatgacataagtcctcaccgctttga 18958515  T
Q  182 acaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||  | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  18958514 acaacaaggtgttccaggacataagtcctcccgct 18958480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 156 - 233
Target Start/End: Original strand, 37379952 - 37380031
Alignment:
Q  156 caggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37379952 caggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 37380031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 215
Target Start/End: Original strand, 46624790 - 46624967
Alignment:
Q  45 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttga 138  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| || |||   ||||||||||||||| |   ||||| | |||||||||||||  | ||||    
T  46624790 gactcatgcaatgacatcacaacacctctaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccgatttacagggcagaagccctcaccggatattga 46624889  T
Q  139 atggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaa-ttagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  46624890 atggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 46624967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15086107 - 15085974
Alignment:
Q  86 aatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaa 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||    
T  15086107 aatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggctgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctttgaa 15086008  T
Q  183 caatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||  | ||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  15086007 caacaaggtgttccatgacataagtcctcccgct 15085974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 82254 - 82128
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatt--a 188  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||| |||||||||  |    
T  82254 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcactcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaa 82155  T
Q  189 gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  82154 gtgttccaggacatgagtcctcccgct 82128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15098143 - 15098017
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatt--a 188  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||  |    
T  15098143 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaa 15098044  T
Q  189 gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15098043 gtgttccaggacatgagtccttccgct 15098017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15104520 - 15104394
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatt--a 188  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||  |    
T  15104520 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaa 15104421  T
Q  189 gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15104420 gtgttccagaacatgagtcctcccgct 15104394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 15455306 - 15455382
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa 87  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15455306 catcatcattataacaattaccaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataa 15455382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11881704 - 11881580
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagt 190  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||     ||||||||||||| |||||||| |||    
T  11881704 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcattagggtatgagccctcaccgctttgaacaataagt 11881605  T
Q  191 gctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  11881604 gttccaggacatgagtcctcccgct 11881580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 147014 - 147126
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| | | ||||    
T  147014 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcaccgttatagaat 147113  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  147114 ggttaaagcattc 147126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 2965878 - 2965990
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | ||||    
T  2965878 aagactcatgcaggacatgacaaccccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaat 2965977  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  2965978 ggttaaagcattc 2965990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 14320795 - 14320683
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| | | ||||    
T  14320795 aagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccggagccctcaccgttatagaat 14320696  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  14320695 ggttaaagcattc 14320683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 215
Target Start/End: Original strand, 45185379 - 45185572
Alignment:
Q  27 aattacaaccaacaacaa-gactcatgcatg-acatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaa 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||   ||  ||||||||| ||||||| |||| | |||||| ||  |||||||| |||||   ||||| | |||    
T  45185379 aattacaaccaacaacaacgactcatgcaactactcgacaacaccgctaagactcctcgacaatgcacat--gcatgtgggaccaatttacagggcagaa 45185476  T
Q  122 gccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaat-tagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||  | ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  45185477 gccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatcagggcataaaccctcaccaatttgaacaataaagtgttccaggacatgagacctcccgct 45185572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 46348961 - 46348805
Alignment:
Q  62 acaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat-c 156  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||   ||||| | | ||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| |    
T  46348961 acaactccactaagacccctcaacaatgcacat--gcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcactggatattgaatggttaaagcattcattc 46348864  T
Q  157 aggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    | | |  |||||||||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||    
T  46348863 atggcataagccctcaccgctttgaacaataagtgttcgtggacatgagtcctcccgct 46348805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 14565655 - 14565767
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| | | ||||    
T  14565655 aagactcatgcaggacatgacaactctactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcaccgttatagaat 14565754  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  14565755 ggttaaagcattc 14565767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 15166721 - 15166833
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | ||||    
T  15166721 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaat 15166820  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  15166821 ggttaaagcattc 15166833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 18871813 - 18871925
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | ||||    
T  18871813 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaat 18871912  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  18871913 ggttaaagcattc 18871925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 29182281 - 29182169
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||| || ||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |  | | ||||    
T  29182281 aagactcatgcaggacatgacaactctactaagactcctcaacaattgcaactatgcatgtggtaccataacagggccgaagccctcatctttatagaat 29182182  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  29182181 ggttaaagcattc 29182169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15437783 - 15437658
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-g 189  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| |||||||  | |    
T  15437783 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagctctcaccgctttgaacaacaagg 15437684  T
Q  190 tgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    || || ||||||||||||||||||||    
T  15437683 tgttctaggacatgagtcctcccgct 15437658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 154
Target Start/End: Original strand, 19151790 - 19151930
Alignment:
Q  20 atatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgc-atgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca---aaca 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||||    ||||||||||||||||    |||    
T  19151790 atatgacaatttcaaccaacaacaacgactcatgcaatgacacgacaacaccactaagactccttaacaaatgtgactatgcatgtggtaccattttaca 19151889  T
Q  114 ggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattca 154  Q
    || | |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  19151890 gggcagaagccgtcaccgaatttgaatggttaaagcattca 19151930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 154
Target Start/End: Original strand, 20751189 - 20751329
Alignment:
Q  20 atatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgc-atgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca---aaca 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||||    ||||||||||||||||    |||    
T  20751189 atatgacaatttcaaccaacaacaacgactcatgcaatgacacgacaacaccactaagactccttaacaaatgtgactatgcatgtggtaccattttaca 20751288  T
Q  114 ggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattca 154  Q
    || | |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20751289 gggcagaagccgtcaccgaatttgaatggttaaagcattca 20751329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 153
Target Start/End: Original strand, 31154312 - 31154426
Alignment:
Q  41 acaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctc-aataatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 138  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||| |  ||||||  |||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||| | | ||    
T  31154312 acaagactcatgcatgacatgacgactcctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccgaggccctcaccgttataga 31154411  T
Q  139 atggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||||    
T  31154412 atggttaaagcattc 31154426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 16089968 - 16090080
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||| || ||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||  | | ||||    
T  16089968 aagactcatgcaggacatgacaactctactaagactcctcaacaattgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcacctttatagaat 16090067  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    ||||||| |||||    
T  16090068 ggttaaaccattc 16090080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16952414 - 16952319
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaa 185  Q
    ||||||||| ||||||| |  |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||| |||||||    
T  16952414 atatgcatgcggtaccatattcagggccgaagacctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcttcaggacataagtcctcaccgctttgaacaa 16952319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20907590 - 20907478
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||   ||||||||||| || | | ||||    
T  20907590 aagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagtcgaagccctcatcgttatagaat 20907491  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  20907490 ggttaaagcattc 20907478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26289945 - 26289819
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta- 188  Q
    |||||||||||||||| |  || | || |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| | |||||||  |     
T  26289945 tatgcatgtggtaccataatcaaggccaaagccctcaccgttgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgttttgaacaacaag 26289846  T
Q  189 gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  26289845 gtgttccaggacataagtcctcccgct 26289819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 138
Target Start/End: Original strand, 37379914 - 37379978
Alignment:
Q  74 agacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttga 138  Q
    |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  37379914 agactcctcaaatatgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctcaccgctgttga 37379978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Original strand, 12547171 - 12547296
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-g 189  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | ||| |||||||||  | |||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||| |||||||  | |    
T  12547171 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaatccctcaccggatattgaatggttaaagcatttatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaagg 12547270  T
Q  190 tgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    || ||||||||||||||| |||||||    
T  12547271 tgttccaggacatgagtcgtcccgct 12547296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Original strand, 14431989 - 14432051
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14431989 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 14432051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Original strand, 15338826 - 15338888
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15338826 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 15338888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 138
Target Start/End: Original strand, 15622161 - 15622212
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttga 138  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15622161 atgcaaatatgcatgtggtaccaaataggaccgaagccctcaccgctgttga 15622212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15723392 - 15723330
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15723392 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 15723330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20328467 - 20328365
Alignment:
Q  54 atgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagca 150  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | || |||   |||||||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  20328467 atgacatgacaacacctctaagacccctcgacaaatgctactatgcatgtggtaccatatacaggaccgtagcccacaccgctgtcgaatggttaaagca 20328368  T
Q  151 ttc 153  Q
    |||    
T  20328367 ttc 20328365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 35962914 - 35962852
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  35962914 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 35962852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 13453930 - 13453884
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 139  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  13453930 atatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctcaccgctgttgaa 13453884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 139
Target Start/End: Original strand, 21757335 - 21757381
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 139  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  21757335 atatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctcaccgctgttgaa 21757381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 23666057 - 23665944
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaa 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||  |||| |||   ||| |||| || | |||    
T  23666057 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaaatcagggccgtgacccacaccactgtcgaa 23665958  T
Q  140 tggttaaagcattc 153  Q
    ||||||||||||||    
T  23665957 tggttaaagcattc 23665944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 155
Target Start/End: Original strand, 13678217 - 13678345
Alignment:
Q  33 aaccaacaacaa-gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctc 127  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||  ||||||| |||||| || ||||  |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  13678217 aaccaacgacaacgactcatgcaatgacatgacgacacttctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc 13678316  T
Q  128 accgctt-ttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  13678317 acctctaattgaatggttaaagcattcat 13678345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 111
Target Start/End: Original strand, 29795677 - 29795746
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtaccaaa 111  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||    
T  29795677 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaa 29795746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 111
Target Start/End: Original strand, 29799496 - 29799565
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtaccaaa 111  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||    
T  29799496 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaa 29799565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 30602991 - 30602946
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttga 138  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  30602991 atatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgctgttga 30602946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 10897413 - 10897301
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |  | | ||||    
T  10897413 aagactcatgcaggacatgacaactctactaagacttctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatctttatagaat 10897314  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  10897313 ggttaaagcattc 10897301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11220290 - 11220227
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11220290 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctatttgaatggttaaagcattcat 11220227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 14266232 - 14266118
Alignment:
Q  45 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca---aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||   ||||||||||||||||    ||||| | || ||||||||||  ||||||    
T  14266232 gactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccattttacagggcagaggccctcaccgaatttgaa 14266133  T
Q  140 tggttaaagcattca 154  Q
    ||||||| |||||||    
T  14266132 tggttaacgcattca 14266118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 16008031 - 16008143
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | ||||    
T  16008031 aagactcatgtaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaaccatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaat 16008130  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  16008131 ggttaaagcattc 16008143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15711168 - 15711106
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  15711168 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaatcattcat 15711106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16109243 - 16109181
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16109243 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 16109181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 21232274 - 21232149
Alignment:
Q  34 accaacaacaa-gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctca 128  Q
    ||||||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||||| |||| | || ||||  |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||     
T  21232274 accaacaacaacgactcatgtaatgccatgacaacacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc- 21232176  T
Q  129 ccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||    
T  21232175 ccgctaatgaatggttaaagcattcat 21232149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16074146 - 16074022
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-gt 190  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||| |   |||||||||| || |||||||  | ||    
T  16074146 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaatcccacaccgaatttgaatggttaaagcattcttcagggcatcagccctcaccactttgaacaacaaggt 16074047  T
Q  191 gctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    | |||| ||||||||||||||||||    
T  16074046 gttccaagacatgagtcctcccgct 16074022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 33 - 153
Target Start/End: Original strand, 18606801 - 18606926
Alignment:
Q  33 aaccaacaacaa-gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctc 127  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||  ||||||| |||||| || ||||  ||||||||||||||||    |||||||| ||||| |    
T  18606801 aaccaacgacaacgactcatgcaatgacatgacgacacttctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccatgttcaggaccgtagcccac 18606900  T
Q  128 accgcttttgaatggttaaagcattc 153  Q
    |||||| | |||||||||||||||||    
T  18606901 accgctgtcgaatggttaaagcattc 18606926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 111
Target Start/End: Original strand, 11302799 - 11302868
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtaccaaa 111  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||    
T  11302799 aagactcatgcaagacatgaaaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaa 11302868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 174
Target Start/End: Original strand, 11308991 - 11309073
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 174  Q
    |||||||||||||||    |||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11308991 atgcatgtggtaccattttacaggacataagccctcaccggattttgaatggttaaagcattca-caggaccgaagtcctcacc 11309073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 174
Target Start/End: Original strand, 11312299 - 11312381
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 174  Q
    |||||||||||||||    |||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11312299 atgcatgtggtaccattttacaggacataagccctcaccggattttgaatggttaaagcattca-caggaccgaagtcctcacc 11312381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 69
Target Start/End: Original strand, 32771369 - 32771429
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaaca-agactcatgc--atgacatgacaacacc 69  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||    
T  32771369 catcatcaatatggcaattacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacacc 32771429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 3858585 - 3858473
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||  ||||||| |||| || | | ||||    
T  3858585 aagactcatgcaagacatgacaactcttctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccatatcagagccgaagctctcatcgttatagaat 3858486  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  3858485 ggttaaagcattc 3858473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Original strand, 1612623 - 1612685
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  1612623 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagcccccaccgctgtagaatggttaaagcattcat 1612685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Original strand, 6411821 - 6411883
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  6411821 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgtagaattgttaaagcattcat 6411883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14281822 - 14281760
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14281822 atgcatgtggtaccataatcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 14281760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 177
Target Start/End: Original strand, 4279941 - 4280049
Alignment:
Q  74 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagcc 168  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| |    
T  4279941 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 4280040  T
Q  169 ctcaccgct 177  Q
    |||||||||    
T  4280041 ctcaccgct 4280049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16187858 - 16187796
Alignment:
Q  124 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattca-tcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaa 185  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||| || |||||||    
T  16187858 cctcaccgctattgaatggttaaagcattcattcaggacataagtcctcaccactttgaacaa 16187796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 152
Target Start/End: Original strand, 19599844 - 19599901
Alignment:
Q  97 gcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatt 152  Q
    ||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19599844 gcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcatt 19599901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 177
Target Start/End: Original strand, 19616273 - 19616381
Alignment:
Q  74 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagcc 168  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| |    
T  19616273 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 19616372  T
Q  169 ctcaccgct 177  Q
    |||||||||    
T  19616373 ctcaccgct 19616381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30602974 - 30602892
Alignment:
Q  154 atcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  30602974 atcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 30602892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 36306225 - 36306152
Alignment:
Q  83 aataatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 153  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  36306225 aataatgcaaatatgcatgtggtaccatattcaagaccgaagccctcaccactagtcgaatggttaaagcattc 36306152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 833148 - 833031
Alignment:
Q  68 ccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattca-tcaggaccg 163  Q
    |||||||||| |||||| |||||   |||||||||||||||| |  |||   || |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||      
T  833148 ccactaagactcctcaacaatgcg--tatgcatgtggtaccatattcagagtcggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattcaggacat 833051  T
Q  164 aagccctcaccgctgtgaac 183  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  833050 aagtcctcaccgctttgaac 833031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 1198328 - 1198211
Alignment:
Q  68 ccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattca-tcaggaccg 163  Q
    |||||||||| |||||| |||||   |||||||||||||||| |  |||   || |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||      
T  1198328 ccactaagactcctcaacaatgcg--tatgcatgtggtaccatattcagagtcggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattcaggacat 1198231  T
Q  164 aagccctcaccgctgtgaac 183  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  1198230 aagtcctcaccgctttgaac 1198211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Original strand, 4279864 - 4279932
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaaca-agactcatgc--atgacatgacaacaccactaagac 77  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  4279864 catcgtcaatatggcaactacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 4279932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14255956 - 14255841
Alignment:
Q  45 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca---aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 139  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||   ||||||||||||||||    ||||| | || ||||||||||  ||||||    
T  14255956 gactcatgcaataacatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccattttacagggcagaggccctcaccgaatttgaa 14255857  T
Q  140 tggttaaagcattcat 155  Q
    || |||||| ||||||    
T  14255856 tgcttaaagtattcat 14255841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 120 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14582822 - 14582725
Alignment:
Q  120 aagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaat-tagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |  ||  |||||||  | ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14582822 aagccctcaccgaattttgaacggttaaagcattcatcagggcataaaacctcaccaatttgaacaataaagtgttccaggacatgagccctcccgct 14582725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Original strand, 19616196 - 19616264
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaaca-agactcatgc--atgacatgacaacaccactaagac 77  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  19616196 catcgtcaatatggcaactacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 19616264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16575608 - 16575546
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattca 154  Q
    |||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16575608 atgcatgtggtaccattttacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattca 16575546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Original strand, 16590054 - 16590116
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattca 154  Q
    |||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16590054 atgcatgtggtaccattttacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattca 16590116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Original strand, 23442259 - 23442321
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattca 154  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  23442259 atgcatgtggtaccaatttacagggcataagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattca 23442321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 106)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 26650318 - 26650536
Alignment:
Q  11 acatcatcaatatgacaattacaaccaacaacaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26650318 acatcatcaatatgacaattacaaccaacaacaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa 26650417  T
Q  111 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  26650418 acaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccatgacatgagtcctc 26650517  T
Q  211 ccgctgtttatgcatatgc 229  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26650518 ccgctgtttatgcatatgc 26650536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 26921903 - 26922121
Alignment:
Q  11 acatcatcaatatgacaattacaaccaacaacaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26921903 acatcatcaatatgacaattacaaccaacaacaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa 26922002  T
Q  111 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  26922003 acaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccatgacatgagtcctc 26922102  T
Q  211 ccgctgtttatgcatatgc 229  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26922103 ccgctgtttatgcatatgc 26922121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23081983 - 23081759
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  23081983 catcatcaatatggcaattacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca 23081884  T
Q  110 aa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcc 208  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23081883 aaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcc 23081784  T
Q  209 tcccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23081783 tcccgctgtttatgcatatgcaatg 23081759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23076535 - 23076311
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  23076535 catcatcaatatggcaattacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca 23076436  T
Q  110 aa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcc 208  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23076435 aaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgtttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcc 23076336  T
Q  209 tcccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23076335 tcccgctgtttatgcatatgcaatg 23076311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16775285 - 16775062
Alignment:
Q  11 acatcatcaatatgacaattacaaccaacaacaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||| |||||    
T  16775285 acatcatcaatatgacaattacaaccaacatcaagactcatccatgacatgacaacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggcaccaa 16775186  T
Q  111 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  16775185 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgttgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcatc 16775086  T
Q  211 -ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  16775085 tccgctgtttatgcatatgcaatg 16775062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Original strand, 24057515 - 24057734
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  24057515 catcatcattataacaattacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca 24057614  T
Q  110 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcct 209  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24057615 aataggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcct 24057714  T
Q  210 cccgctgtttatgcatatgc 229  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  24057715 cccgctgtgtatgcatatgc 24057734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5341962 - 5341743
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    |||||||| ||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||    
T  5341962 catcatcattataaaaattaccaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgtaattatgcatgtggtacca 5341863  T
Q  110 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5341862 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcct 5341763  T
Q  210 cccgctgtttatgcatatgc 229  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5341762 cccgctgtttatgcatatgc 5341743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 25419735 - 25419954
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  25419735 catcatcattataacaattacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgtcaccactaagacccctcaataaatgcatttatgcatgtggtacca 25419834  T
Q  110 aa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcc 208  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25419835 aaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccaaagccctcaccgctgtgaacaaatagtgctccaggacatgagtcc 25419934  T
Q  209 tcccgctgtttatgcatatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  25419935 tcccgctgtttatgcatatg 25419954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 32 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18941436 - 18941238
Alignment:
Q  32 caaccaacaaca-agactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcacc 130  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18941436 caaccaacaacagagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcacc 18941337  T
Q  131 gcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18941336 gcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagccctcgccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagccctcccgctgtttatgcatatgc 18941238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39609116 - 39608898
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  39609116 catcatcattataacaattacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagaccccttaataaatgcaattatgcatgtggtacca 39609017  T
Q  110 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcct 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39609016 aacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcatgatcgaagtcctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcct 39608917  T
Q  210 cccgctgtttatgcatatg 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  39608916 cccgctgtttatgcatatg 39608898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23545105 - 23544881
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||| |||||||    
T  23545105 catcatcaatatggcaattacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagatccctcaataaatgcaattatgcatgcggtacca 23545006  T
Q  110 aa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcc 208  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||     
T  23545005 aaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgccccaggacattagtca 23544906  T
Q  209 tcccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23544905 tcccgctgtttatgcatatgcaatg 23544881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 43 - 233
Target Start/End: Original strand, 20990250 - 20990440
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgg 142  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20990250 aagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaata-tgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgg 20990348  T
Q  143 ttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20990349 ttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 20990440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 42 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28260085 - 28259893
Alignment:
Q  42 caagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatg 141  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28260085 caagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcactgcttttgaatg 28259986  T
Q  142 gttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28259985 gttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 28259893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Original strand, 37565953 - 37566177
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaata-atgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||  ||||||||||||||||    
T  37565953 catcatcaatgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgataacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca 37566052  T
Q  110 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcct 209  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  37566053 gacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgttgtgaacaactagtgctccagaacatgagtcat 37566152  T
Q  210 c-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  37566153 ctccgctgtttatgcatatgcaatg 37566177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 43 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41878216 - 41878024
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaata-atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatg 141  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41878216 aagactcatgcaagacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatacaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatg 41878117  T
Q  142 gttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41878116 gttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 41878024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 32 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19802109 - 19801909
Alignment:
Q  32 caaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctca 128  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19802109 caaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctca 19802010  T
Q  129 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19802009 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcatcccgctgtttatgcatatg 19801910  T
Q  229 c 229  Q
    |    
T  19801909 c 19801909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7773881 - 7773668
Alignment:
Q  21 tatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 119  Q
    |||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||  |||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7773881 tatggcaactacatccaacaacaaagactcatgcatgacatgactacaccactaagactctccaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa-caggaccg 7773783  T
Q  120 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7773782 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtt 7773683  T
Q  219 tatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||| ||||    
T  7773682 tatgcatatgaaatg 7773668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 32 - 233
Target Start/End: Original strand, 19362533 - 19362737
Alignment:
Q  32 caaccaacaacaag-actcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctca 128  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19362533 caaccaacaacaaacactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaatcatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctca 19362632  T
Q  129 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19362633 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctgtgaacaacaagtgctccaggacatgagtcatcccgctgtttatgcatatg 19362732  T
Q  229 caatg 233  Q
    |||||    
T  19362733 caatg 19362737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 74 - 233
Target Start/End: Original strand, 22507487 - 22507649
Alignment:
Q  74 agacccctcaata-atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 172  Q
    |||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22507487 agactcctcaatagatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccaaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 22507586  T
Q  173 ccgctg-tgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22507587 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 22507649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Original strand, 22500927 - 22501068
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  22500927 tatgcatgtggtaccaaacaggaccaaaaccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgc 22501026  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22501027 tccaagacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 22501068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 74 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19800522 - 19800362
Alignment:
Q  74 agacccctcaata-atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 172  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19800522 agactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagccctca 19800423  T
Q  173 ccgctg-tgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgca 230  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  19800422 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccactgttttatgcatatgca 19800362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Original strand, 597221 - 597364
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  597221 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 597320  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  597321 ctcctggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatg 597364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 93 - 229
Target Start/End: Original strand, 19508110 - 19508249
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  19508110 atatacatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 19508209  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgc 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  19508210 ctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgc 19508249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Original strand, 5454436 - 5454579
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  5454436 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 5454535  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  5454536 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 5454579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5582439 - 5582296
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  5582439 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 5582340  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  5582339 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 5582296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Original strand, 10686092 - 10686235
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  10686092 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 10686191  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  10686192 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 10686235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Original strand, 25852923 - 25853066
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  25852923 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 25853022  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  25853023 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 25853066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40011134 - 40010991
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  40011134 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 40011035  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  40011034 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 40010991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Original strand, 25846291 - 25846434
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||     
T  25846291 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgttgttgagcaactagta 25846390  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  25846391 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 25846434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Original strand, 30781012 - 30781155
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  30781012 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaggccctcaccgctgttgagcaactagta 30781111  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  30781112 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 30781155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 95 - 231
Target Start/End: Original strand, 15461421 - 15461560
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgct 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||    
T  15461421 atgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtact 15461520  T
Q  194 ccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaa 231  Q
    |||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||    
T  15461521 ccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaa 15461560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Original strand, 43028988 - 43029131
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  43028988 atatgcatgtggtaccaatcaagaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 43029087  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  43029088 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 43029131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1111839 - 1111697
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  1111839 tatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 1111740  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  1111739 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 1111697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14615111 - 14614969
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  14615111 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 14615012  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  14615011 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 14614969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22248402 - 22248260
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  22248402 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 22248303  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  22248302 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 22248260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Original strand, 38013682 - 38013824
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  38013682 tatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 38013781  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  38013782 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 38013824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7508176 - 7508033
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  7508176 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 7508077  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  7508076 tccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatg 7508033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14889153 - 14889010
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  14889153 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 14889054  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  14889053 tccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatg 14889010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17939045 - 17938902
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  17939045 tatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 17938946  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  17938945 tccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatg 17938902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 22379440 - 22379564
Alignment:
Q  11 acatcatcaatatgacaattacaaccaacaaca-agactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtacc 108  Q
    |||||||| ||||  ||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22379440 acatcatcgatatagcaactacaaccaacgacagagactaatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataaatgcagatatgcatgtggtacc 22379539  T
Q  109 aaacaggaccgaagccctcaccgct 133  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  22379540 aaacaggaccaaagccctcaccgct 22379564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18895157 - 18895014
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  18895157 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagggctgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 18895058  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  18895057 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 18895014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24795177 - 24795035
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  24795177 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggtcctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 24795078  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24795077 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 24795035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24800544 - 24800402
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  24800544 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggtcctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 24800445  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24800444 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 24800402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 37540119 - 37539977
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||| |    
T  37540119 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagtaactagtac 37540020  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  37540019 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 37539977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 37547663 - 37547521
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||| |    
T  37547663 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagtaactagtac 37547564  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  37547563 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 37547521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 179
Target Start/End: Original strand, 11995085 - 11995170
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 179  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11995085 tatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 11995170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14882476 - 14882333
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  14882476 tatgcatgcggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 14882377  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  14882376 tccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatg 14882333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 156 - 233
Target Start/End: Original strand, 22379543 - 22379620
Alignment:
Q  156 caggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22379543 caggaccaaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatg 22379620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41877932 - 41877854
Alignment:
Q  156 caggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41877932 caggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 41877854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27636076 - 27635930
Alignment:
Q  74 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccc 169  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  27636076 agactcctcaataagtgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcc 27635977  T
Q  170 tcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||||||| |||||||  | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  27635976 tcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctcccgct 27635930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23444380 - 23444254
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatt--a 188  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||  |    
T  23444380 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaa 23444281  T
Q  189 gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23444280 gtgttccaggacatgagtcctcccgct 23444254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 215
Target Start/End: Original strand, 21829546 - 21829626
Alignment:
Q  135 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21829546 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctcccgct 21829626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21574195 - 21574071
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagt 190  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||  |||||||| |||    
T  21574195 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatagttaaagcattcatcagggcctaagccatcaccgcactgaacaataagt 21574096  T
Q  191 gctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  21574095 gttccaggacatgagtcctcccgct 21574071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23561853 - 23561664
Alignment:
Q  29 ttacaaccaacaacaagactcatgcatg-acatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagcc 124  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||   ||  |||| |||||||||||| |||| | |||||| ||  ||||||||||||||   ||||| | | ||||    
T  23561853 ttacaaccaataacacgactcatgcaactactcgacagcaccactaagactcctcgacaatgcacat--gcatgtggtaccaatttacagggcagtagcc 23561756  T
Q  125 ctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||  || |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23561755 ctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgcttggaccaataagtgttccaggacatgagtcctcccgct 23561664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 74 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24751729 - 24751584
Alignment:
Q  74 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccct 170  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |  |||| ||    
T  24751729 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatcagagcataagctct 24751630  T
Q  171 caccgctgtgaacaa-ttagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  24751629 caccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 24751584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Original strand, 427215 - 427341
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatt--a 188  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||| |||||||||  |    
T  427215 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcatggcataagccctcaccgctttgaacaattaaa 427314  T
Q  189 gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  427315 gtgttccaggacatgagtcctcccgct 427341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 233
Target Start/End: Original strand, 18566603 - 18566679
Alignment:
Q  159 gaccgaagccctcaccgctgt-gaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18566603 gaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 18566679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 74 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24669191 - 24669046
Alignment:
Q  74 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccct 170  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  ||||  || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |  |||| ||    
T  24669191 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggtcgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatcagagcataagctct 24669092  T
Q  171 caccgctgtgaacaa-ttagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  24669091 caccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 24669046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 74 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24738960 - 24738815
Alignment:
Q  74 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccct 170  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  ||||  || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |  |||| ||    
T  24738960 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggtcgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatcagagcataagctct 24738861  T
Q  171 caccgctgtgaacaa-ttagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  24738860 caccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 24738815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 19235794 - 19235906
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | ||||    
T  19235794 aagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaat 19235893  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  19235894 ggttaaagcattc 19235906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 28371655 - 28371543
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| | | ||||    
T  28371655 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcaccgttatagaat 28371556  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  28371555 ggttaaagcattc 28371543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 156 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29746692 - 29746612
Alignment:
Q  156 caggaccgaagccctcaccgctgt-gaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  29746692 caggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatg 29746612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 38145982 - 38145870
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| | | ||||    
T  38145982 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcaccgttatagaat 38145883  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  38145882 ggttaaagcattc 38145870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 42960029 - 42960141
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| | | ||||    
T  42960029 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcaccgttatagaat 42960128  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  42960129 ggttaaagcattc 42960141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 29746731 - 29746666
Alignment:
Q  74 agacccctcaata-atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttga 138  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29746731 agactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgctgttga 29746666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 22336054 - 22336166
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | ||||    
T  22336054 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaat 22336153  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  22336154 ggttaaagcattc 22336166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 22460049 - 22460161
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||  | | | ||||    
T  22460049 aagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcattgttatagaat 22460148  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  22460149 ggttaaagcattc 22460161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 22466673 - 22466785
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | ||||    
T  22466673 aagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcatcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaat 22466772  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  22466773 ggttaaagcattc 22466785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 22749700 - 22749812
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | ||||    
T  22749700 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaat 22749799  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  22749800 ggttaaagcattc 22749812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 34828975 - 34829087
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||| | | ||||    
T  34828975 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccggagccctcaccgttatagaat 34829074  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  34829075 ggttaaagcattc 34829087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Original strand, 20843142 - 20843267
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-g 189  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||| |||||||  | |    
T  20843142 atgcatgtggtaccaatttacagggcaggagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataggccctcaccgctttgaacaacaagg 20843241  T
Q  190 tgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  20843242 tgttccaggacatgagtcctcccgct 20843267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 23112967 - 23112854
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaa 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||  |||||||||||||||| |  |||| |||   ||||||||||| | |||    
T  23112967 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggccgtgaccctcaccgctgtcgaa 23112868  T
Q  140 tggttaaagcattc 153  Q
    ||||||||||||||    
T  23112867 tggttaaagcattc 23112854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 22339592 - 22339704
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||| |||||| | |||  |||||||||||| || | | ||||    
T  22339592 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtcgtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaat 22339691  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  22339692 ggttaaagcattc 22339704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 138
Target Start/End: Original strand, 20347129 - 20347180
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttga 138  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  20347129 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaagaccgaagccctcaccgctgttga 20347180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 215
Target Start/End: Original strand, 26753620 - 26753690
Alignment:
Q  147 agcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatt--agtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  26753620 agcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 26753690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 9775414 - 9775527
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaa 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||  |||| |||   ||| |||| || | |||    
T  9775414 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaaatcagggccgtgacccacaccactgtcgaa 9775513  T
Q  140 tggttaaagcattc 153  Q
    ||||||||||||||    
T  9775514 tggttaaagcattc 9775527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 37805545 - 37805432
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaa 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||  ||||  ||   ||| ||||||| | |||    
T  37805545 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaaatcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaa 37805446  T
Q  140 tggttaaagcattc 153  Q
    ||||||||||||||    
T  37805445 tggttaaagcattc 37805432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 41877949 - 41877911
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41877949 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 41877911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 233
Target Start/End: Original strand, 20340553 - 20340630
Alignment:
Q  159 gaccgaagccctcaccgctgt-gaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20340553 gaccgaagccatcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatg 20340630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 233
Target Start/End: Original strand, 20347157 - 20347234
Alignment:
Q  159 gaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20347157 gaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgaatcctctccgctgttttatgcatatgcaatg 20347234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 90
Target Start/End: Original strand, 10035032 - 10035104
Alignment:
Q  20 atatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatg-acatgacaacaccactaagacccctcaataatgc 90  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  10035032 atatgacaatttcaaccaacaacaacgactcatgcaactacatgacaacaccactaagactcctcaacaatgc 10035104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 758427 - 758365
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  758427 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 758365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 138
Target Start/End: Original strand, 18566575 - 18566626
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttga 138  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18566575 atgcaaatatgcatgtggtaccagacatgaccgaagccctcaccgctgttga 18566626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 138
Target Start/End: Original strand, 20340525 - 20340576
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttga 138  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  20340525 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaagaccgaagccatcaccgctgttga 20340576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22313005 - 22312943
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22313005 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22312943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22509346 - 22509284
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    |||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22509346 atgcatgtggtaccaaaatcaagaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22509284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 24931095 - 24930984
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatg 141  Q
    |||||||||||| ||||||||| | | |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |  | | |||||    
T  24931095 aagactcatgcaagacatgacacctctactaagactcctcaacaatgaaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagctctcatctttatagaatg 24930996  T
Q  142 gttaaagcattc 153  Q
    ||||||||||||    
T  24930995 gttaaagcattc 24930984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 28890586 - 28890476
Alignment:
Q  45 gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgg 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |   || ||||||    
T  28890586 gactcatgcaagacatgacaactctactaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccataacagagccgaagctctcatcttattagaatgg 28890487  T
Q  143 ttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||    
T  28890486 ttaaagcattc 28890476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 28897290 - 28897180
Alignment:
Q  45 gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgg 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |   || ||||||    
T  28897290 gactcatgcaagacatgacaactctactaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccataacagagccgaagctctcatcttattagaatgg 28897191  T
Q  143 ttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||    
T  28897190 ttaaagcattc 28897180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 28910490 - 28910380
Alignment:
Q  45 gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgg 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |   || ||||||    
T  28910490 gactcatgcaagacatgacaactctactaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccataacagagccgaagctctcatcttattagaatgg 28910391  T
Q  143 ttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||    
T  28910390 ttaaagcattc 28910380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 28925758 - 28925648
Alignment:
Q  45 gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgg 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |   || ||||||    
T  28925758 gactcatgcaagacatgacaactctactaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccataacagagccgaagctctcatcttattagaatgg 28925659  T
Q  143 ttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||    
T  28925658 ttaaagcattc 28925648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 28932181 - 28932071
Alignment:
Q  45 gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgg 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |   || ||||||    
T  28932181 gactcatgcaagacatgacaactctactaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccataacagagccgaagctctcatcttattagaatgg 28932082  T
Q  143 ttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||    
T  28932081 ttaaagcattc 28932071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 28933685 - 28933575
Alignment:
Q  45 gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgg 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |   || ||||||    
T  28933685 gactcatgcaagacatgacaactctactaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccataacagagccgaagctctcatcttattagaatgg 28933586  T
Q  143 ttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||    
T  28933585 ttaaagcattc 28933575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 28946885 - 28946775
Alignment:
Q  45 gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgg 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |   || ||||||    
T  28946885 gactcatgcaagacatgacaactctactaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccataacagagccgaagctctcatcttattagaatgg 28946786  T
Q  143 ttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||    
T  28946785 ttaaagcattc 28946775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 18409276 - 18409149
Alignment:
Q  32 caaccaacaacaa-gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 126  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||| ||||||| |||| | || ||||  |||||| ||||||||| |  |||| ||||||| ||    
T  18409276 caaccaacaacaacgactcatgcaatttcatgacaacacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcacgtggtaccatattcagggccgaagctct 18409177  T
Q  127 caccgctt-ttgaatggttaaagcattc 153  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||    
T  18409176 caccgctaattgaatggttaaagcattc 18409149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 37599523 - 37599411
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||   ||||||||||| |  | | ||||    
T  37599523 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagacttctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagtcgaagccctcatctttatagaat 37599424  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    | |||||||||||    
T  37599423 gattaaagcattc 37599411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Original strand, 20937594 - 20937656
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  20937594 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgatgtagaatggttaaagcattcat 20937656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18409133 - 18409071
Alignment:
Q  124 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattca-tcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaa 185  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||| ||| |||||||    
T  18409133 cctcaccgctattgaatggttaaagcattcattcaggacataagtcctcactgctttgaacaa 18409071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 174
Target Start/End: Original strand, 21888550 - 21888630
Alignment:
Q  98 catgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 174  Q
    |||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  21888550 catgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcttcagggcataagccctcacc 21888630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Original strand, 20831679 - 20831747
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgca--tgacatgacaacaccactaagac 77  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  20831679 catcgtcaatatggcaattacatccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 20831747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 24617846 - 24617806
Alignment:
Q  133 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 174  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24617846 ttttgaatggttaaagcattca-caggaccgaagtcctcacc 24617806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 24714077 - 24714037
Alignment:
Q  133 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 174  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24714077 ttttgaatggttaaagcattca-caggaccgaagtcctcacc 24714037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 24747105 - 24747065
Alignment:
Q  133 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 174  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24747105 ttttgaatggttaaagcattca-caggaccgaagtcctcacc 24747065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 43243933 - 43243873
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaaca-agactcatgc--atgacatgacaacacc 69  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||    
T  43243933 catcatcaatatggcatttacaaccaacaacatcgactcatgcaaatgacatgacaacacc 43243873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 84
Target Start/End: Original strand, 21494878 - 21494918
Alignment:
Q  45 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaa 84  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21494878 gactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaa 21494918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 174
Target Start/End: Original strand, 25013621 - 25013677
Alignment:
Q  119 gaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 174  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  25013621 gaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcttcagggcataagccctcacc 25013677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 80)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 43687316 - 43687538
Alignment:
Q  11 acatcatcaatatgacaattacaaccaacaacaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43687316 acatcatcaacatgacaattacaaccaacaacaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa 43687415  T
Q  111 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43687416 acaggaccgaagtcctcaccgcttttgaacggttaaagtattcatcaggaccgaaaccctcaccgctgtgagcaactagtgctccaggacatgagtcctc 43687515  T
Q  211 ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  43687516 ccgctgtttatgcatatgtaatg 43687538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14416788 - 14416564
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    |||||||||||| ||||  ||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  14416788 catcatcaatataacaaccacagccaacaataaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca 14416689  T
Q  110 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14416688 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgattaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcct 14416589  T
Q  210 c-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  14416588 ctccgctgtttatgcatatgcaatg 14416564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Original strand, 29328112 - 29328335
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa 110  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  ||||| |||||||||| |||||||    
T  29328112 catcatcaatgtggcaaatacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacgacaccactacgactcctcaactatgcatatatgcatgtcgtaccaa 29328211  T
Q  111 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29328212 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgattaaagcattcatcaagaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 29328311  T
Q  211 -ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  29328312 tccgctgtttatgcatatgcaatg 29328335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29299292 - 29299069
Alignment:
Q  11 acatcatcaatatgacaatt-acaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtacc 108  Q
    |||||||||||||| |||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  29299292 acatcatcaatatggcaaaccacaaccaacaaccaagactcatgcatgacatgactacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtacc 29299193  T
Q  109 aaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcc 208  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29299192 aaacaggaccgaagccgtc-ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaatccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcc 29299094  T
Q  209 tcccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  29299093 tcccgctgtttatgcatatgcaatg 29299069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29305838 - 29305615
Alignment:
Q  11 acatcatcaatatgacaatt-acaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtacc 108  Q
    |||||||||||||| |||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  29305838 acatcatcaatatggcaaaccacaaccaacaaccaagactcatgcatgacatgactacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtacc 29305739  T
Q  109 aaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcc 208  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29305738 aaacaggaccgaagccctc-ccgcttttgaatggtttaagcattcatcaggaccgaatccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcc 29305640  T
Q  209 tcccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  29305639 tcccgctgtttatgcatatgcaatg 29305615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 43 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11392788 - 11392596
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatg 141  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11392788 aagactcatgcatgacatgacgacatcactaagactcctcaataaatgcagatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatg 11392689  T
Q  142 gttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  11392688 gttaaagaattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctctgctgtttatgcatatgcaatg 11392596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25701782 - 25701558
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaata-atgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| | |||||   |||||||||||||||    
T  25701782 catcatcaatatggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacattacaacaccactgagactcctcaaaatatgcaataatgcatgtggtacca 25701683  T
Q  110 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcc- 208  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||     
T  25701682 aacaagaccgaagccctcaccgcttctgaatggttaaagcattcatcaggatcgtagccctcaccgctgtgagcaactagtgctccaggacatgagtcct 25701583  T
Q  209 tcccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    | ||||||||||||| |||||||||    
T  25701582 ttccgctgtttatgcttatgcaatg 25701558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 74 - 233
Target Start/End: Original strand, 27345695 - 27345857
Alignment:
Q  74 agacccctcaata-atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 172  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27345695 agactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 27345794  T
Q  173 ccgctg-tgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27345795 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 27345857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 74 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40144445 - 40144284
Alignment:
Q  74 agacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcac 173  Q
    |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40144445 agactcctcaaatatgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcac 40144346  T
Q  174 cgctg-tgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40144345 cgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 40144284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 74 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16267021 - 16266860
Alignment:
Q  74 agacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcac 173  Q
    |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16267021 agactcctcaaatatgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcac 16266922  T
Q  174 cgctg-tgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16266921 cgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 16266860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Original strand, 23117202 - 23117351
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  23117202 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 23117301  T
Q  186 ttagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
     |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  23117302 ctagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatg 23117351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10956823 - 10956674
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  10956823 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 10956724  T
Q  186 ttagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
     |||| ||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  10956723 ctagtactccagggcatgagtcctctccgttgttttatgcatatgcaatg 10956674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26486158 - 26486009
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 185  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||    
T  26486158 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcatgaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 26486059  T
Q  186 ttagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
     |||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  26486058 ctagtactccaggacatgagtcctctccactgttttatgcatatgcaatg 26486009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14746748 - 14746509
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgc--atgacatgacaacaccactaagac----cc--------ctcaataatgcagatat 96  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||  |||||||    ||        |||||  |||||  |||    
T  14746748 catcatcaatataacaattacaatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaaatatgcaagtat 14746649  T
Q  97 gcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgctcc 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  14746648 gcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccttcaccgctgttgagcaactagtgctcc 14746549  T
Q  196 aggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaat 232  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  14746548 aggacttgagtcctctccgctgtttttatgcatatgcaat 14746509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3224821 - 3224672
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 185  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  3224821 atgcaaatatacatgtggtaccaaacaggaccgaagtcctcatcgcttttgaatagttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 3224722  T
Q  186 ttagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
     |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  3224721 ctagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatg 3224672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 87 - 229
Target Start/End: Original strand, 3697636 - 3697781
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 185  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||    
T  3697636 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggtccgaagccctcaccgctgttgagcaa 3697735  T
Q  186 ttagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgc 229  Q
     |||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  3697736 ctagtactccagtacatgagtcctcaccgctgttttatgcatatgc 3697781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16887430 - 16887287
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  16887430 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 16887331  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  16887330 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 16887287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Original strand, 14563541 - 14563683
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  14563541 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 14563640  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  14563641 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 14563683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27909715 - 27909573
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  27909715 tatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 27909616  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27909615 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 27909573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27956134 - 27955992
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  27956134 tatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 27956035  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27956034 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 27955992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 36800573 - 36800431
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  36800573 tatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 36800474  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  36800473 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 36800431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 95 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9205480 - 9205339
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgct 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||    
T  9205480 atgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtact 9205381  T
Q  194 ccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  9205380 ccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 9205339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4520865 - 4520722
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  4520865 tatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 4520766  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  4520765 tccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatg 4520722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 93 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 14736953 - 14736845
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  14736953 atatgcatggggtaccaaacaggaccgacgccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 14736854  T
Q  192 ctccaggac 200  Q
    |||||||||    
T  14736853 ctccaggac 14736845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 200
Target Start/End: Original strand, 14765587 - 14765694
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  14765587 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatctggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 14765686  T
Q  193 tccaggac 200  Q
    ||||||||    
T  14765687 tccaggac 14765694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Original strand, 35541047 - 35541190
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||     
T  35541047 atatgcatgtggtaccaaacaggaccaaagccctcatcgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactcgta 35541146  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  35541147 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 35541190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Original strand, 28980724 - 28980866
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  28980724 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaaaccctcaccgctgttgagcaactagtac 28980823  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28980824 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 28980866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Original strand, 28985944 - 28986086
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  28985944 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaaaccctcaccgctgttgagcaactagtac 28986043  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28986044 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 28986086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 93 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23224878 - 23224772
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||     
T  23224878 atatgcatgtggtaccaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagcactcaccgctgttgagcaactagta 23224780  T
Q  192 ctccagga 199  Q
    ||||||||    
T  23224779 ctccagga 23224772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Original strand, 23653753 - 23653962
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgca--tgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtac 107  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||  ||||||||||||||    
T  23653753 catcatcaatatggcaaatgcaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccccta-gactcctcaagaaatgcaactatgcatgtggtac 23653851  T
Q  108 caaa--caggaccgaagccctcaccgctttt-gaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatga 204  Q
    || |  |||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||    
T  23653852 catattcagggccgaagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattcattaggacataagtcctcaccgctttgaacaacaagtgttccaggacatga 23653951  T
Q  205 gtcctcccgct 215  Q
    |||||||||||    
T  23653952 gtcctcccgct 23653962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23653231 - 23653071
Alignment:
Q  31 acaaccaacaacaa-gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccc 125  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||  |||||||||||||||| |  |||| |||||||||    
T  23653231 acaaccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccc 23653132  T
Q  126 tcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaa 185  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| |||||||    
T  23653131 tcaccgctaattgaatggttaaagcatttatcaggacataagtcctcaccgctttgaacaa 23653071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 131
Target Start/End: Original strand, 27873714 - 27873834
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa 110  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||    
T  27873714 catcattaatatgacaactacaaccaacgaccaagactcatgcaggacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa 27873813  T
Q  111 acaggaccgaagccctcaccg 131  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  27873814 acatgaccgaagccctcaccg 27873834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 131
Target Start/End: Original strand, 27889844 - 27889964
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa 110  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||    
T  27889844 catcattaatatgacaactacaaccaacgaccaagactcatgcaggacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa 27889943  T
Q  111 acaggaccgaagccctcaccg 131  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  27889944 acatgaccgaagccctcaccg 27889964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 131
Target Start/End: Original strand, 27948502 - 27948622
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa 110  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||    
T  27948502 catcattaatatgacaactacaaccaacgaccaagactcatgcaggacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa 27948601  T
Q  111 acaggaccgaagccctcaccg 131  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  27948602 acatgaccgaagccctcaccg 27948622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 233
Target Start/End: Original strand, 27873818 - 27873893
Alignment:
Q  159 gaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27873818 gaccgaagccctcaccgttgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 27873893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 233
Target Start/End: Original strand, 27889948 - 27890023
Alignment:
Q  159 gaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27889948 gaccgaagccctcaccgttgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 27890023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 233
Target Start/End: Original strand, 27948606 - 27948681
Alignment:
Q  159 gaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27948606 gaccgaagccctcaccgttgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 27948681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 156 - 233
Target Start/End: Original strand, 6588132 - 6588211
Alignment:
Q  156 caggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6588132 caggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 6588211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21690611 - 21690487
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaat-tagt 190  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  | ||||||||  |||    
T  21690611 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccaatttgaacaataaagt 21690512  T
Q  191 gctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  21690511 gttccaggacatgagtcctcccgct 21690487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Original strand, 39363480 - 39363604
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-gt 190  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||| |||||||  | ||    
T  39363480 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaaacattcatcaggacccaggtcctcaccgctttgaacaacaaggt 39363579  T
Q  191 gctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    | |||||||||| ||||||||||||    
T  39363580 gttccaggacataagtcctcccgct 39363604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20784006 - 20783927
Alignment:
Q  135 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20784006 ttgaatggttaaagcattcatcaggacctaagcc-tcaccgctttgaacaataagtgtgccaggacatgagtcctcccgct 20783927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Original strand, 19859506 - 19859631
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-g 189  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||  | |    
T  19859506 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaagg 19859605  T
Q  190 tgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  19859606 tgttccaggacatgagtcctcccgct 19859631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 74 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31412710 - 31412565
Alignment:
Q  74 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagcc 168  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  31412710 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtc 31412611  T
Q  169 ctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccg 213  Q
    ||||| ||| |||||| | | ||| |||||||||  ||||||||||    
T  31412610 ctcactgctttgaacattaaggtgttccaggacaaaagtcctcccg 31412565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 74 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31418892 - 31418747
Alignment:
Q  74 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagcc 168  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  31418892 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtc 31418793  T
Q  169 ctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccg 213  Q
    ||||| ||| |||||| | | ||| |||||||||  ||||||||||    
T  31418792 ctcactgctttgaacattaaggtgttccaggacaaaagtcctcccg 31418747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21686287 - 21686162
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatt--ag 189  Q
    ||||||||||||||||   | ||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||  | |||||||||  ||    
T  21686287 atgcatgtggtaccaatttatagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcatcagggcataagtcctcaccaatttgaacaattaaag 21686188  T
Q  190 tgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  21686187 tgttccaggacatgagtcctcccgct 21686162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 24321832 - 24321720
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | ||||    
T  24321832 aagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaat 24321733  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  24321732 ggttaaagcattc 24321720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 36445964 - 36445806
Alignment:
Q  61 gacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatc 156  Q
    |||||| |||||||||| |||| | |||||| ||  ||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  36445964 gacaactccactaagactcctctacaatgcacat--gcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatc 36445867  T
Q  157 aggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatt--agtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| |  |||||||||||  | |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  36445866 agggcataagccctcaccaatttgaacaattaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 36445806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14594933 - 14594808
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcacc-gcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-g 189  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||  | |    
T  14594933 atgcatgtggtaccaatctacagggcagaagccctcaccagatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccactttgaacaacaagg 14594834  T
Q  190 tgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  14594833 tgttccaggacatgagtcctcccgct 14594808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 8729242 - 8729130
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | ||||    
T  8729242 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaat 8729143  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  8729142 ggttaaagcattc 8729130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 153
Target Start/End: Original strand, 18609730 - 18609853
Alignment:
Q  35 ccaacaacaa-gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcac 129  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||  |||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||    
T  18609730 ccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacaacacctctaagactcctcgataattgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcac 18609829  T
Q  130 cgcttttgaatggttaaagcattc 153  Q
     ||| | |||||||||||||||||    
T  18609830 tgctatcgaatggttaaagcattc 18609853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 154
Target Start/End: Original strand, 21839393 - 21839537
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |  ||  |||||||||||||||||    
T  21839393 catcaacaatatggcaatttcaaccaacaccaacgactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctc-acagggc--atatgcatgtggtacca 21839489  T
Q  110 ---aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattca 154  Q
        ||||| | ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  21839490 ttttacagggcagaagccctcgccgaatttgaatggttaaagcattca 21839537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 84
Target Start/End: Original strand, 21930528 - 21930602
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaa 84  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21930528 catcaacaatatggcaatttcaaccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaa 21930602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 38186096 - 38186014
Alignment:
Q  134 tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||  | ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  38186096 tttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagttctcccgct 38186014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 215
Target Start/End: Original strand, 16259558 - 16259637
Alignment:
Q  135 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16259558 ttgaatggttaaagcattcatcaaagcataagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatga-tcctcccgct 16259637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 27942403 - 27942291
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| | | ||||    
T  27942403 aagactcatgcaagacatgacaactcaactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcaccgttatagaat 27942304  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    ||||||| |||||    
T  27942303 ggttaaaacattc 27942291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21683902 - 21683745
Alignment:
Q  61 gacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatc 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||| ||  ||||||||| ||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||    
T  21683902 gacaacaccactaagactcctcgacaatgcacat--gcatgtggtgccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatgattaaagcattcatc 21683805  T
Q  157 aggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| |  ||||||||| |||| |||||||  | ||| || | ||||||||||||||||||    
T  21683804 agggcataagccctcatcgctttgaacaacaaggtgttctaagacatgagtcctcccgct 21683745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21688251 - 21688094
Alignment:
Q  61 gacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatc 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||| ||  ||||||||| ||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||    
T  21688251 gacaacaccactaagactcctcgacaatgcacat--gcatgtggtgccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatgattaaagcattcatc 21688154  T
Q  157 aggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| |  ||||||||| |||| |||||||  | ||| || | ||||||||||||||||||    
T  21688153 agggcataagccctcatcgctttgaacaacaaggtgttctaagacatgagtcctcccgct 21688094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 138
Target Start/End: Original strand, 6588093 - 6588158
Alignment:
Q  74 agacccctcaata-atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttga 138  Q
    |||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  6588093 agactcctcaatagatgcaattatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctcaccgctgttga 6588158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 138
Target Start/End: Original strand, 213986 - 214030
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttga 138  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  213986 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgctgttga 214030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 238268 - 238224
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttga 138  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  238268 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgctgttga 238224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 138
Target Start/End: Original strand, 727609 - 727653
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttga 138  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  727609 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgctgttga 727653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 138
Target Start/End: Original strand, 800110 - 800154
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttga 138  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  800110 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgctgttga 800154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 138
Target Start/End: Original strand, 851503 - 851547
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttga 138  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  851503 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgctgttga 851547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22025762 - 22025700
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22025762 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22025700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Original strand, 22050201 - 22050263
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22050201 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22050263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Original strand, 22055719 - 22055781
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22055719 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22055781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Original strand, 22177586 - 22177648
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22177586 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22177648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14057825 - 14057698
Alignment:
Q  54 atgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagca 150  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||| | || ||||  |||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  14057825 atgacatgacaac-cctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctatcgaatggttaaagca 14057727  T
Q  151 ttc--atcaggaccgaagccctcaccgct 177  Q
    |||  ||||||||  ||| ||||||||||    
T  14057726 ttcttatcaggacataagtcctcaccgct 14057698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 153
Target Start/End: Original strand, 21282046 - 21282119
Alignment:
Q  83 aataatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 153  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  21282046 aataatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattc 21282119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 8596320 - 8596208
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||  ||||||| |||| || | | ||||    
T  8596320 aagactcatgcaagacatgacaactcttctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccatatcagagccgaagctctcatcgttatagaat 8596221  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  8596220 ggttaaagcattc 8596208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22063740 - 22063703
Alignment:
Q  118 cgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22063740 cgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22063703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Original strand, 22743702 - 22743827
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc--ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta- 188  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||  | |||||||  |     
T  22743702 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatttttgaatggttaaagcattc-tcagggcataagccctcaccaatttgaacaacaag 22743800  T
Q  189 gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| |||||| |||||| |||||||||    
T  22743801 gtgttccagggcatgagccctcccgct 22743827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 177
Target Start/End: Original strand, 23825115 - 23825210
Alignment:
Q  86 aatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagccctcaccgct 177  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23825115 aatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 23825210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 233
Target Start/End: Original strand, 214002 - 214085
Alignment:
Q  154 atcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||   || |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  214002 atcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatg 214085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 238252 - 238169
Alignment:
Q  154 atcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||   || |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  238252 atcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatg 238169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 233
Target Start/End: Original strand, 727625 - 727708
Alignment:
Q  154 atcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||   || |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  727625 atcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatg 727708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 233
Target Start/End: Original strand, 800126 - 800209
Alignment:
Q  154 atcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||   || |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  800126 atcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatg 800209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 233
Target Start/End: Original strand, 851519 - 851602
Alignment:
Q  154 atcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||   || |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  851519 atcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatg 851602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 21300354 - 21300291
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21300354 atgcatgtggtaccatattcagggtcgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 21300291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 41009637 - 41009574
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41009637 atgcatgtggtaccataatcagggccgaaaccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 41009574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 75)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 36800473 - 36800692
Alignment:
Q  11 acatcatcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36800473 acatcatcaatatggcaattacaacccacaaccaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgccgatatgcatgtggtacca 36800572  T
Q  110 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcct 209  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36800573 aacaggaccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaggcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcct 36800672  T
Q  210 cccgctgtttatgcatatgc 229  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  36800673 cccgctgtttatgcatatgc 36800692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 32911705 - 32911485
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  32911705 catcatcaatatggcaattacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca 32911606  T
Q  110 aa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcc 208  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32911605 aaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgtttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcc 32911506  T
Q  209 tcccgctgtttatgcatatgc 229  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  32911505 tcccgctgtttatgcatatgc 32911485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15643511 - 15643288
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaag-actcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  15643511 catcatcaatataacaatcacaaccaacaacaaggactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca 15643412  T
Q  110 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcct 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15643411 aacaggaccgaagccctcacctcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcgccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcct 15643312  T
Q  210 cccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15643311 cccgctgtttatgcatatgcaatg 15643288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13101396 - 13101172
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    |||||||||||| ||||  |||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  13101396 catcatcaatataacaaccacaatcaacaataaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaataaatgcatatatgcatgtggtacca 13101297  T
Q  110 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcct 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  13101296 aacatgaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcat 13101197  T
Q  210 c-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  13101196 ctccgctgtttatgcatatgcaatg 13101172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Original strand, 45028424 - 45028648
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||    
T  45028424 catcatcaatatggcaattaccaccaacaaccaagactcatgcatgacatgacgacatcactaagacccctcgataaatgcaattatgcatgtggtacca 45028523  T
Q  110 aa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcc 208  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  45028524 aaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagtcctcaccgttgtgaacaactagttctccaggacatgagtcc 45028623  T
Q  209 tcccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  45028624 tcccgctgtttatgcatatgcaatg 45028648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 32 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25590402 - 25590200
Alignment:
Q  32 caaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcacc 130  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25590402 caaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccattaagacccctcaataatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcacc 25590303  T
Q  131 gcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgca 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  25590302 gcttttgaatggttaaagcattcatcaggacaaaagcactcaccgctgtgaacaactagtgaaccaggacataagtcatcccgctgtttatgcatatgaa 25590203  T
Q  231 atg 233  Q
    |||    
T  25590202 atg 25590200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Original strand, 27272169 - 27272392
Alignment:
Q  13 atcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaa 111  Q
    |||| ||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||  |||||  ||||||||||||||||||    
T  27272169 atcaacaatatggcaactacatccaacaacaaagactcatgcatgacatcactacaccactaagaatcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa 27272268  T
Q  112 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt-gaacaattagtgctccaggacatgagtcctc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||| |||||||||||||||    
T  27272269 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtcgagcaaccagtgctctaggacatgagtcctc 27272368  T
Q  211 -ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  27272369 tccgctgtttatgcatatgcaatg 27272392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 43 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17592724 - 17592531
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaacaggac--cgaagccctcaccgcttttgaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17592724 aagactcatgcatgacatgacgacatcacta-gactcctcaataaatgcagatatgcatgtggtaccagacaggacaccgaagccctcaccgcttttgaa 17592626  T
Q  140 tggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17592625 tggttaaagcattcatcaggaccgaaaccctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 17592531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Original strand, 14563832 - 14563972
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgct 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14563832 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaaaaactagtgct 14563931  T
Q  194 ccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14563932 ccaggacatgattcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 14563972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 35244167 - 35244025
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  35244167 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgc 35244068  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  35244067 tccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatg 35244025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Original strand, 27037237 - 27037386
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  27037237 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 27037336  T
Q  186 ttagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
     |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27037337 ctagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatg 27037386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Original strand, 11466070 - 11466212
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||    
T  11466070 atatgcatgtggtaccaaacaggatcgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcatcgctgttgagcaactagtg 11466169  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11466170 ctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 11466212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22013252 - 22013103
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  22013252 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 22013153  T
Q  186 ttagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
     || | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  22013152 ctaatactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatg 22013103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 87 - 229
Target Start/End: Original strand, 34043 - 34188
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  34043 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccttcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggactgaagccctcaccgctgttgagcaa 34142  T
Q  186 ttagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgc 229  Q
     |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  34143 ctagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgc 34188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Original strand, 4077419 - 4077562
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||     
T  4077419 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagtcctcaccgctgttgagcaactagta 4077518  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  4077519 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 4077562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24481732 - 24481590
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  24481732 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 24481633  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24481632 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 24481590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 93 - 179
Target Start/End: Original strand, 27729507 - 27729593
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27729507 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 27729593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 86 - 233
Target Start/End: Original strand, 28292711 - 28292861
Alignment:
Q  86 aatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaaca 184  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  28292711 aatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccatcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagca 28292810  T
Q  185 attagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    | |||| ||||||||||  || | || |||||| |||||||||||||||||    
T  28292811 actagtactccaggacaaaagacatcaccgctgttttatgcatatgcaatg 28292861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30196647 - 30196505
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  30196647 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaggccctcaccgctgttgagcaactagtac 30196548  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  30196547 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 30196505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4071677 - 4071534
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  4071677 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 4071578  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  4071577 tccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatg 4071534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Original strand, 20850189 - 20850332
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  20850189 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 20850288  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  20850289 tccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatg 20850332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24426975 - 24426831
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgctttt-gaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagt 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  24426975 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgctttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 24426876  T
Q  191 gctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
     |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24426875 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 24426831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 11360372 - 11360265
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  11360372 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 11360273  T
Q  193 tccaggac 200  Q
    ||||||||    
T  11360272 tccaggac 11360265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 44091222 - 44091079
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  44091222 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcattgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 44091123  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  44091122 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 44091079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2386062 - 2385912
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaaca 184  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  2386062 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgctttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagca 2385963  T
Q  185 attagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    | |||| |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  2385962 actagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 2385912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Original strand, 21604764 - 21604906
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  21604764 tatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 21604863  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21604864 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 21604906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Original strand, 31828612 - 31828755
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  31828612 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 31828711  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  31828712 tccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatg 31828755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Original strand, 31833964 - 31834107
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  31833964 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 31834063  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  31834064 tccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatg 31834107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 36984698 - 36984555
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  36984698 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 36984599  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  36984598 tccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatg 36984555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Original strand, 1067096 - 1067238
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  1067096 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgctttggaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 1067195  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  1067196 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 1067238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 71606 - 71521
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 179  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  71606 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 71521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 175
Target Start/End: Original strand, 35585357 - 35585438
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccg 175  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35585357 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccg 35585438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 179
Target Start/End: Original strand, 1061713 - 1061798
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 179  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1061713 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgctttggaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 1061798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 28971478 - 28971332
Alignment:
Q  74 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccc 169  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  28971478 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcaggaccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcc 28971379  T
Q  170 tcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||| ||| |||||||  | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  28971378 tcactgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctcccgct 28971332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 215
Target Start/End: Original strand, 24660405 - 24660581
Alignment:
Q  45 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaa 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||   |||||||||||||||||   ||| | | ||||||||||  |  | |||||    
T  24660405 gactcatgcaatgacatgacaacacctctaagactcctcaacaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacaaggcagaagccctcagtggatattgaa 24660504  T
Q  140 tggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaa-ttagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  24660505 tggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 24660581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21133440 - 21133306
Alignment:
Q  86 aatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtga 181  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||    
T  21133440 aatgcaaatatgcatgtagtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctttga 21133341  T
Q  182 acaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||  | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21133340 acaacaaggtgttccaggacataagtcctcccgct 21133306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Original strand, 25267199 - 25267325
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatt--a 188  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||  |    
T  25267199 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaa 25267298  T
Q  189 gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  25267299 gtgttccaggacatgagtcctcccgct 25267325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8890121 - 8890022
Alignment:
Q  119 gaagccctcacc-gcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatt--agtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8890121 gaagccctcaccagatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 8890022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 215
Target Start/End: Original strand, 22860234 - 22860425
Alignment:
Q  27 aattacaaccaacaacaagactcatgcatg-acatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaag 122  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||   ||  |||||| |||||||||| |||| | |||| | ||  ||||||||||||||   ||||| | | ||    
T  22860234 aattacaaccaataacacgactcatgcaaatactcgacaactccactaagactcctcgacaatgtacat--gcatgtggtaccaatttacagggcagtag 22860331  T
Q  123 ccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  22860332 ccctcaccggatgttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccactttgaacaataagtgttccaggacacgagtcctcccgct 22860425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 38931806 - 38931613
Alignment:
Q  29 ttacaaccaacaacaa-gactcatgcatg-acatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagc 123  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||   ||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||    ||||||||||||||||   ||||| | |||||    
T  38931806 ttacaaccaacaacaatgactcatgcaactactcgacaacaccgctaagactcctcaacaatgcgacaatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagc 38931707  T
Q  124 cctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaat-tagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||  |||| || |||| ||||||||| |||||    
T  38931706 cctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaataaagtgttctaggatatgagtccttccgct 38931613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 9469 - 9581
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctc-aataatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | ||||    
T  9469 aagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaaaaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaat 9568  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  9569 ggttaaagcattc 9581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 215
Target Start/End: Original strand, 23062590 - 23062672
Alignment:
Q  135 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatt--agtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23062590 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaagtgttccaggacatgaatcctcccgct 23062672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Original strand, 20648069 - 20648195
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatt--a 188  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||  |    
T  20648069 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcactggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccactttgaacaattaaa 20648168  T
Q  189 gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20648169 gtgttccaggacatgagtccttccgct 20648195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 19663054 - 19662942
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | ||||    
T  19663054 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaat 19662955  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  19662954 ggttaaagcattc 19662942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 26884100 - 26884212
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||| |||  |||||||||| | | ||||    
T  26884100 aagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccggggccctcaccgttatagaat 26884199  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  26884200 ggttaaagcattc 26884212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 27211209 - 27211097
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| | | ||||    
T  27211209 aagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccggagccctcaccgttatagaat 27211110  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    ||||||| |||||    
T  27211109 ggttaaaacattc 27211097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Original strand, 19035478 - 19035603
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-g 189  Q
    ||||||||||||||||   |||||   |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||  | |    
T  19035478 atgcatgtggtaccaatttacagggtagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccactttgaacaacaagg 19035577  T
Q  190 tgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  19035578 tgttccaggacatgagtcctcccgct 19035603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 10685854 - 10685741
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaa 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||  |||| |||   ||| ||||||| | |||    
T  10685854 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaa 10685755  T
Q  140 tggttaaagcattc 153  Q
    ||||||||||||||    
T  10685754 tggttaaagcattc 10685741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 175
Target Start/End: Original strand, 23062462 - 23062585
Alignment:
Q  57 acatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcatt 152  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||| || ||||  |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  23062462 acatgacaacacttctaagactcctcaacaagtgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcatt 23062561  T
Q  153 ca-tcaggaccgaagccctcaccg 175  Q
    || |||||||  ||| ||||||||    
T  23062562 cattcaggacataagtcctcaccg 23062585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 29280888 - 29281000
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| |  | | ||||    
T  29280888 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatctttatagaat 29280987  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  29280988 ggttaaagcattc 29281000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 19649730 - 19649660
Alignment:
Q  86 aatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19649730 aatgcagatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattc 19649660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25107648 - 25107524
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattag- 189  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | || ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||  ||     
T  25107648 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattaaatggttaaagcattca-cagggcctaagccctcaccgctttgaacaacaagg 25107550  T
Q  190 tgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  25107549 tgttccaggacatgagtcctcccgct 25107524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 177
Target Start/End: Original strand, 9241280 - 9241419
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacc--aaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||  || ||||  ||   ||| ||||||| | |||    
T  9241280 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaa 9241379  T
Q  140 tggttaaagcat--tcatcaggaccgaagccctcaccgct 177  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  ||| ||||||||||    
T  9241380 tggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgct 9241419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 6261776 - 6261664
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||||| || ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||  ||||| ||||||||| | | ||||    
T  6261776 aagactcatgcaggacatgacaactctactaaaactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaaaccctcaccgttatagaat 6261677  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  6261676 ggttaaagcattc 6261664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22796776 - 22796688
Alignment:
Q  124 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattca-tcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaa-ttagtgctccaggacatgagtcctc 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||    
T  22796776 cctcaccgctattgaatggttaaagcattcattccggacataagtcctcaccgctgtgaacaacaaagtgttctaggacatgagtcctc 22796688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22796919 - 22796767
Alignment:
Q  27 aattacaaccaacaacaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagcc 124  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||  ||   ||||| |||||||||| |||| | |||||| ||  ||||||||||||| |  |||| ||  ||||    
T  22796919 aattataaccaacaacatgactcatgcaacactcaacaactccactaagactcctctacaatgcacat--gcatgtggtaccatattcagggccagagcc 22796822  T
Q  125 ctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattca-tcaggaccgaagccctcaccgct 177  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||    
T  22796821 ctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattcaggacataagtcctcaccgct 22796767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20914513 - 20914388
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-g 189  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||  | |||||||  | |    
T  20914513 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcttcagggcataagccctcaccaatttgaacaacaagg 20914414  T
Q  190 tgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    || |||||| |||||| |||||||||    
T  20914413 tgttccagggcatgagccctcccgct 20914388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 153
Target Start/End: Original strand, 23263917 - 23264043
Alignment:
Q  32 caaccaacaacaa-gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 126  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| | || ||||  || ||||||||||||| |  |||| ||| ||||||    
T  23263917 caaccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacaacacctctaagactcctcgacaattgcaactaagcatgtggtaccatattcagggccggagccct 23264016  T
Q  127 caccgcttttgaatggttaaagcattc 153  Q
    |||| || | ||||| |||||||||||    
T  23264017 caccactatcgaatgattaaagcattc 23264043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 20260771 - 20260884
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaa 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  || |||  ||||||||||||||||||  |||| |||   ||| |||| || | |||    
T  20260771 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaaagcaactatgcatgtggtaccaaaatcagggccgtgacccacaccactgtcgaa 20260870  T
Q  140 tggttaaagcattc 153  Q
    ||||||||||||||    
T  20260871 tggttaaagcattc 20260884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Original strand, 2105577 - 2105640
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa---caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |   |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  2105577 atgcatgtggtaccataattcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 2105640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 19649821 - 19649753
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaaca-agactcatgc--atgacatgacaacaccactaagac 77  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||    
T  19649821 catcatcaatatggcaattacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgtcaacaccgctaagac 19649753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 21133530 - 21133462
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaaca-agactcatgc--atgacatgacaacaccactaagac 77  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  21133530 catcatcaatatggcatttacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 21133462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 177
Target Start/End: Original strand, 6482251 - 6482408
Alignment:
Q  27 aattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa---caggaccgaa 121  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||   || |||| || ||||||||| ||||  |||||||||||||||| |   |||| |||      
T  6482251 aattaaaaccaacaacaacgactcatgcaagacatgacattccccctaatactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccgtg 6482350  T
Q  122 gccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagccctcaccgct 177  Q
     ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  6482351 acccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgct 6482408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Original strand, 20724032 - 20724095
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20724032 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 20724095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 21124105 - 21123991
Alignment:
Q  45 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca---aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |   ||||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| |  ||||||    
T  21124105 gactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaacaaattcgactatgcatgtggtaccattttacagagcagaagccctcactgaatttgaa 21124006  T
Q  140 tggttaaagcattca 154  Q
    |||||||||||||||    
T  21124005 tggttaaagcattca 21123991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 153
Target Start/End: Original strand, 21907182 - 21907309
Alignment:
Q  32 caaccaacaacaa-gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctc-aataatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 126  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||  |||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||    
T  21907182 caaccaactacaacgactcatgcaatgacatgacaacacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccct 21907281  T
Q  127 caccgct-tttgaatggttaaagcattc 153  Q
    |||||||  | ||||||||||| |||||    
T  21907282 caccgctaatcgaatggttaaaacattc 21907309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Original strand, 22809882 - 22809944
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22809882 atgcatgtggtaccatatccagggccgaggccctcaccgctatagaatggttaaagcattcat 22809944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 177
Target Start/End: Original strand, 200619 - 200727
Alignment:
Q  74 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagcc 168  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| |    
T  200619 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 200718  T
Q  169 ctcaccgct 177  Q
    |||||||||    
T  200719 ctcaccgct 200727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21074209 - 21074096
Alignment:
Q  45 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctttt-gaa 139  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||  ||||||| |||||| || ||||  |||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  | |||    
T  21074209 gactcatgcaatgacatgacgacacttctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaatcgaa 21074110  T
Q  140 tggttaaagcattc 153  Q
    ||||||||||||||    
T  21074109 tggttaaagcattc 21074096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 6744600 - 6744532
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgca--tgacatgacaacaccactaagac 77  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  6744600 catcgtcaatatggcaactacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 6744532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 149
Target Start/End: Original strand, 22703489 - 22703545
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagc 149  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22703489 atgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgctttagaatggttaaagc 22703545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27367769 - 27367674
Alignment:
Q  86 aatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagccctcaccgct 177  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  27367769 aatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 27367674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 68
Target Start/End: Original strand, 11465974 - 11466033
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaaca-agactcatgc--atgacatgacaacac 68  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||    
T  11465974 catcatcaatatggcatttacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacac 11466033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 109
Target Start/End: Original strand, 23877772 - 23877852
Alignment:
Q  32 caaccaacaacaa-gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || | | || ||||  ||||||||||||||||    
T  23877772 caaccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacaacacctctaagactccccgacaattgcaactatgcatgtggtacca 23877852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Original strand, 24658773 - 24658836
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24658773 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 24658836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 119)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11956847 - 11956628
Alignment:
Q  11 acatcatcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11956847 acatcatcaatatggcaattacaaccctcaaccaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaaca 11956748  T
Q  110 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  11956747 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctccccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcct 11956648  T
Q  210 cccgctgtttatgcatatgc 229  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11956647 cccgctgtttatgcatatgc 11956628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8374176 - 8373953
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  8374176 catcaacaatatggcaattacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacaacacctctaagacccctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 8374077  T
Q  110 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcct 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  8374076 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccaaagccctcaccgctgtgaagaactagtgctccaggacatgagtcct 8373977  T
Q  210 cccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  8373976 cccgctgtttatgcatatgcaatg 8373953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12725373 - 12725152
Alignment:
Q  11 acatcatcaatatgacaattacaaccaacaacaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12725373 acatcatcaatatgacaattacaaccaacaatgagacacatgcatgacatgacaacatcactaagaccc-tcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa 12725275  T
Q  111 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12725274 acaggaccgaagtcctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacctctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 12725175  T
Q  211 ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||| |||||||||||| ||||    
T  12725174 ccgctatttatgcatatgaaatg 12725152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30597110 - 30596891
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    |||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  30597110 catcatcaatataacaattacaagcagcaacaatgactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca 30597011  T
Q  110 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  30597010 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcct 30596911  T
Q  210 cccgctgtttatgcatatgc 229  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  30596910 cccgctgtttatgcatatgc 30596891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32388268 - 32388050
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  32388268 catcatcattataacaattaccaccaacaacaaagactcatgcatgacatgatgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca 32388169  T
Q  110 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcct 209  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32388168 aacaggaccaaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcct 32388069  T
Q  210 cccgctgtttatgcatatg 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  32388068 cccgctgtttatgcatatg 32388050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Original strand, 54519957 - 54520181
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaata-atgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||  ||||||||||||||||    
T  54519957 catcatcaatgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaatactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca 54520056  T
Q  110 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcct 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54520057 aacaggaccgaagccctcaccgtttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcct 54520156  T
Q  210 c-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  54520157 ctccgctgtttatgcatatgcaatg 54520181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 32 - 229
Target Start/End: Original strand, 49163087 - 49163284
Alignment:
Q  32 caaccaacaacaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49163087 caaccaacaacaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctcaccg 49163186  T
Q  132 cttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgc 229  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49163187 cttttgaatggttcaagcattcatcaggacataagccctcaccgctgtgaacaaccaatgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgc 49163284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 27 - 233
Target Start/End: Original strand, 16833148 - 16833356
Alignment:
Q  27 aattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccc 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16833148 aattacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtgccaaacaggaccgaagccc 16833247  T
Q  126 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgca 224  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16833248 tcaccgtttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgca 16833347  T
Q  225 tatgcaatg 233  Q
    |||||||||    
T  16833348 tatgcaatg 16833356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9691658 - 9691435
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa 110  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||    
T  9691658 catcatcaatataacaaccacaaccaacaataaagactcatgcatgacataacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa 9691559  T
Q  111 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9691558 tcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 9691459  T
Q  211 -ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  9691458 tccgctgtttatgcatatgcaatg 9691435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16331843 - 16331621
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa 110  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||     
T  16331843 catcatcaatataacaactacaaccaacaataaagagtcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaata-tgcaattatgcatgtggtaccag 16331745  T
Q  111 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16331744 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctatgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 16331645  T
Q  211 -ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  16331644 tccgctgtttatgcatatgcaatg 16331621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Original strand, 29550835 - 29551058
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa 110  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||    
T  29550835 catcattaatatgacaactacaaccaacgaccacgactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa 29550934  T
Q  111 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  29550935 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggactgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctc 29551034  T
Q  211 -ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
     ||| |||||||||||||||||||    
T  29551035 tccgttgtttatgcatatgcaatg 29551058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19344393 - 19344180
Alignment:
Q  21 tatgacaattacaaccaacaacaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccga 120  Q
    |||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  || ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  19344393 tatggcaactacaaccaacaatcagactcatgcatgacatgatgacaccactaagactcctcaaatatccaattatgcatgtggtaccaaacaggaccga 19344294  T
Q  121 agccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgttt 219  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  19344293 agccctcaccgcttttgaatagttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccagaacatgagtcatctccgctgttt 19344194  T
Q  220 atgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||||||||    
T  19344193 atgcatatgcaatg 19344180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20377491 - 20377268
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa 110  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||   |||||  |||||||||||||||||    
T  20377491 catcattaatatgtcaactacaaccaacgaccaagactcatgcatgacatgacgacactactaagactcctcagatatgcaattatgcatgtggtaccaa 20377392  T
Q  111 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc 210  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20377391 ataagaccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 20377292  T
Q  211 -ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  20377291 tccgctgtttatgcatatgcaatg 20377268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 46071361 - 46071138
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa 110  Q
    ||||||||  ||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||   |||||  |||||||||||||||||    
T  46071361 catcatcatcatgtcaactacgaccaacaaccaagactcatgcatgacatgacgacactactaagactcctcagatatgcaattatgcatgtggtaccaa 46071262  T
Q  111 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc 210  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  46071261 acaggaccgaagcccttatcgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcttc 46071162  T
Q  211 -ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  46071161 tccgctgtttatgcatatgcaatg 46071138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 43 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29545382 - 29545190
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatg 141  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29545382 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaaaaaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatg 29545283  T
Q  142 gttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  29545282 gttaaagcattcatcaggaccgaagccttcaccgctgtgaacaactagtgttccaggacatgagtcctctccgttgtttatgcatatgcaatg 29545190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 112 - 233
Target Start/End: Original strand, 20187754 - 20187876
Alignment:
Q  112 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc- 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  20187754 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctct 20187853  T
Q  211 ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20187854 ccgctgtttatgcatatgcaatg 20187876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Original strand, 38742818 - 38743057
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgca--tgacatgacaacaccactaagacc------------cctcaataatgcagatat 96  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||             ||||||  ||||| || |    
T  38742818 catcatcaatataacaattacaatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaaatatgcaaattt 38742917  T
Q  97 gcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaa-caattagtgctcc 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  38742918 gcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagccctcaccgctgttaagcaactagtgctcc 38743017  T
Q  196 aggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  38743018 aggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatg 38743057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 74 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 48774807 - 48774644
Alignment:
Q  74 agacccctcaata-atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 172  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48774807 agactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 48774708  T
Q  173 ccgctg-tgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  48774707 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccactgttttatgcatatgcaatg 48774644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 95 - 233
Target Start/End: Original strand, 54520256 - 54520396
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgct 193  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54520256 atgcatgtggtaccatatcagggccggagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgct 54520355  T
Q  194 ccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54520356 ccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 54520396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9772085 - 9771942
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||| ||||     
T  9772085 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcagggccgaagccctcatcgctgttgagcaactagta 9771986  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  9771985 ctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatg 9771942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 87 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12271570 - 12271425
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 185  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  12271570 atgcaaatatgcatgttgtaccaaagaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 12271471  T
Q  186 ttagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgc 229  Q
     |||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  12271470 ctagtactccaggacatgagtcatcaccgctgttttatgcatatgc 12271425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2499213 - 2499070
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  2499213 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 2499114  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  2499113 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 2499070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Original strand, 45611646 - 45611789
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  45611646 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 45611745  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  45611746 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 45611789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 93 - 200
Target Start/End: Original strand, 10767736 - 10767844
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  10767736 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 10767835  T
Q  192 ctccaggac 200  Q
    |||||||||    
T  10767836 ctccaggac 10767844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 53571402 - 53571260
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  53571402 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaggccctcaccgctgttgagcaactagtac 53571303  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  53571302 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 53571260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Original strand, 29493534 - 29493677
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  29493534 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 29493633  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  29493634 tccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatg 29493677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21151626 - 21151483
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| || |     
T  21151626 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagggccgaagccctcaccgctgttgagcaactatta 21151527  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21151526 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 21151483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 43724232 - 43724090
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  43724232 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 43724133  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  43724132 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 43724090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 50656156 - 50656014
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  50656156 tatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 50656057  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  50656056 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 50656014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 95 - 233
Target Start/End: Original strand, 28758881 - 28759022
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgct 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||    
T  28758881 atgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtact 28758980  T
Q  194 ccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28758981 ccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 28759022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 95 - 233
Target Start/End: Original strand, 47121129 - 47121270
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgct 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||    
T  47121129 atgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtact 47121228  T
Q  194 ccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  47121229 ccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 47121270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 95 - 233
Target Start/End: Original strand, 47128497 - 47128638
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgct 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||    
T  47128497 atgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtact 47128596  T
Q  194 ccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  47128597 ccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 47128638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 95 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 50142936 - 50142795
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgct 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||    
T  50142936 atgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtact 50142837  T
Q  194 ccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  50142836 ccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 50142795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3782920 - 3782777
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  3782920 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 3782821  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  3782820 tccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatg 3782777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Original strand, 10381920 - 10382063
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  10381920 tatgcatgtgataccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 10382019  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  10382020 tccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatg 10382063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Original strand, 10410573 - 10410716
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  10410573 tatgcatgtgataccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 10410672  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  10410673 tccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatg 10410716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 146
Target Start/End: Original strand, 18957698 - 18957814
Alignment:
Q  32 caaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcac 129  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18957698 caaccaactacaatgaatcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcac 18957797  T
Q  130 cgcttttgaatggttaa 146  Q
    |||||||||||||||||    
T  18957798 cgcttttgaatggttaa 18957814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 74 - 177
Target Start/End: Original strand, 20187671 - 20187775
Alignment:
Q  74 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 172  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20187671 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccttcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 20187770  T
Q  173 ccgct 177  Q
    |||||    
T  20187771 ccgct 20187775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 93 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 54833356 - 54833248
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||     
T  54833356 atatgcatgtggtaccaaacaggactgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccttcaccgctgttgagcaactagta 54833257  T
Q  192 ctccaggac 200  Q
    |||||||||    
T  54833256 ctccaggac 54833248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 133
Target Start/End: Original strand, 15374595 - 15374718
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15374595 catcatcaatataacaaccacaaccaacaataaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaataaatgcagatatgcatgtggtacca 15374694  T
Q  110 aacaggaccgaagccctcaccgct 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  15374695 aacaggaccgaagtcctcaccgct 15374718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14845336 - 14845232
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||    
T  14845336 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgttgttgagcaactagtgc 14845237  T
Q  193 tccag 197  Q
    |||||    
T  14845236 tccag 14845232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 27029655 - 27029558
Alignment:
Q  42 caagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27029655 caagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 27029558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 27031823 - 27031726
Alignment:
Q  42 caagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27031823 caagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 27031726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 54091943 - 54091821
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa 110  Q
    |||||||||||| ||||  ||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||    
T  54091943 catcatcaatataacaaccacagccaacaataaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa 54091844  T
Q  111 acaggaccgaagccctcaccgct 133  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  54091843 acaggaccgaagccctcaccgct 54091821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Original strand, 18961002 - 18961093
Alignment:
Q  142 gttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18961002 gttaaagcattcatcgggacataagccctcaccgctgtgaacaacaagtgcttcaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatg 18961093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 233
Target Start/End: Original strand, 3802554 - 3802632
Alignment:
Q  156 caggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3802554 caggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 3802632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 233
Target Start/End: Original strand, 3802716 - 3802794
Alignment:
Q  156 caggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3802716 caggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 3802794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 54091842 - 54091764
Alignment:
Q  156 caggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54091842 caggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 54091764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 156 - 233
Target Start/End: Original strand, 15374697 - 15374775
Alignment:
Q  156 caggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15374697 caggaccgaagtcctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 15374775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 133
Target Start/End: Original strand, 3802484 - 3802575
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 133  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802484 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 3802575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 68 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2270464 - 2270315
Alignment:
Q  68 ccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat-caggaccg 163  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||      
T  2270464 ccactaagactcctcaacaatgcacat--gcatgtggtaccatattcagggccaaagccctcaccgctaattgaatgattaaagcattcattcaggacat 2270367  T
Q  164 aagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  2270366 aagtcctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctcccgct 2270315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11644953 - 11644873
Alignment:
Q  135 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11644953 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaggccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctcccgct 11644873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10597920 - 10597787
Alignment:
Q  86 aatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaa 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||    
T  10597920 aatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccgtcaccactgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctttgaa 10597821  T
Q  183 caatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||  | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  10597820 caacaaggtgttccaggacataagtcctcccgct 10597787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18757150 - 18757016
Alignment:
Q  86 aatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtga 181  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||  ||| |||||||||| |||    
T  18757150 aatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcaatcattaggacaaaagtcctcaccgctttga 18757051  T
Q  182 acaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||  | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  18757050 acaacaaggtgttccaggacataagtcctcccgct 18757016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 94 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11850841 - 11850717
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaa-ttagt 190  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |  |||| ||||||||| |||||||   |||    
T  11850841 tatgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatcagagcataagctctcaccgctttgaacaacaaagt 11850742  T
Q  191 gctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  11850741 gttccaggacatgagtcctcccgct 11850717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 215
Target Start/End: Original strand, 12152823 - 12152975
Alignment:
Q  65 acaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcagga 160  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||| ||  ||||||||||||||   ||| | | |||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||     
T  12152823 acaccactaagactcctcgacaatgcacat--gcatgtggtaccaatttacaaggcagaagccctcatcggatattgaatggttaaagcattcatcaggg 12152920  T
Q  161 ccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |  ||||| ||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  12152921 cataagccatcaccactttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctcccgct 12152975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Original strand, 12274221 - 12274347
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatt--a 188  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  | |||||||||  |    
T  12274221 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccaatttgaacaattaaa 12274320  T
Q  189 gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  12274321 gtgttccaagacatgagtcctcccgct 12274347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 112 - 215
Target Start/End: Original strand, 17512558 - 17512663
Alignment:
Q  112 caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcct 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||  | ||| || ||||||| ||||||    
T  17512558 cagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacctaggtcctcaccgctttgaacaacaaggtgttcaaggacataagtcct 17512657  T
Q  210 cccgct 215  Q
    ||||||    
T  17512658 cccgct 17512663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 17130644 - 17130756
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | ||||    
T  17130644 aagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaat 17130743  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  17130744 ggttaaagcattc 17130756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11305974 - 11305825
Alignment:
Q  68 ccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccg 163  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||  ||||| |||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  11305974 ccactaagactcctcaacaatgcacata--catgtagtaccaatttacagggcagtagccctcaccgaatattgaatggttaaagcattcatcagggcct 11305877  T
Q  164 aagccctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||||||||||||| |||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11305876 aagccctcaccgct-tgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctcccgct 11305825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 215
Target Start/End: Original strand, 12419382 - 12419515
Alignment:
Q  86 aatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaa 182  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |  |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||    
T  12419382 aatgcaaatatgcatatggtaccataatcagggccgaagccctcactgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctttgaa 12419481  T
Q  183 caatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
     ||  | ||| ||||||| || ||||||||||||    
T  12419482 aaacaaggtgttccaggagataagtcctcccgct 12419515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 155
Target Start/End: Original strand, 18913940 - 18914069
Alignment:
Q  32 caaccaacaacaa-gactcatgcat-gacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | || ||||  |||||||||||||||| |  || | ||||||||||    
T  18913940 caaccaacaacaacgactcatgcattgacatgacaacacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcaaggccgaagccct 18914039  T
Q  127 caccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18914040 caccgctaattgaatggttaaagcattcat 18914069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 12034577 - 12034465
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| || ||  |||||||||||| |  | | ||||    
T  12034577 aagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccataatagagccgaagccctcatctttatagaat 12034478  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  12034477 ggttaaagcattc 12034465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 14764360 - 14764248
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | ||||    
T  14764360 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaat 14764261  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  14764260 ggttaaagcattc 14764248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 23372106 - 23371994
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | ||||    
T  23372106 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaat 23372007  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  23372006 ggttaaagcattc 23371994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 38312380 - 38312268
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| | | ||||    
T  38312380 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccggagccctcaccgttatagaat 38312281  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    ||||||| |||||    
T  38312280 ggttaaaacattc 38312268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 51300049 - 51300161
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | ||||    
T  51300049 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaat 51300148  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  51300149 ggttaaagcattc 51300161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15955193 - 15955068
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc-gctgtgaacaat-tag 189  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||   | ||||||||  ||    
T  15955193 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccaaatttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccaaatttgaacaataaag 15955094  T
Q  190 tgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  15955093 tgttccaggacatgagtcctcccgct 15955068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 19236235 - 19236124
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatg 141  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |  | | |||||    
T  19236235 aagactcatgcaagacatgacaactctactaagactcctcaacaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagctctcatctttatagaatg 19236136  T
Q  142 gttaaagcattc 153  Q
    ||||||||||||    
T  19236135 gttaaagcattc 19236124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 84
Target Start/End: Original strand, 42109036 - 42109102
Alignment:
Q  20 atatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaa 84  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42109036 atatgacaatttcaaccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaa 42109102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 215
Target Start/End: Original strand, 17496094 - 17496243
Alignment:
Q  68 ccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccga 164  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |   |    
T  17496094 ccactaagactcctcaacaatgcacat--gcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcatcagaatata 17496191  T
Q  165 agccctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    || ||||||| || |||||||  | ||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  17496192 agtcctcaccactttgaacaacaaggtgttccaagacatgaatcctcccgct 17496243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24123465 - 24123294
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgca--tgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtac 107  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  24123465 catcgtcaatatggcaactacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacacc-cta-gactcctcaataaatgcaaatatgcacgtggtac 24123368  T
Q  108 caaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagccctcaccgct 177  Q
    || |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24123367 cataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 24123294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16383056 - 16382994
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16383056 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 16382994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 133
Target Start/End: Original strand, 3802699 - 3802737
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802699 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 3802737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Original strand, 14569795 - 14569921
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttg-aatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc-gctgtgaacaat-ta 188  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||   | ||||||||  |    
T  14569795 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatatggaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccaaatttgaacaataaa 14569894  T
Q  189 gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14569895 gtgttccaggacatgagtcctcccgct 14569921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 14864735 - 14864847
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |  | | ||||    
T  14864735 aagactcatgcaggacatgacaactctactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatctttatagaat 14864834  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    ||||||| |||||    
T  14864835 ggttaaaacattc 14864847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 13203715 - 13203653
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtacca--aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  13203715 atgcatgtggtaccataaacaggaccgtagccctcaccgctgtagaatagttaaagcattcat 13203653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14652892 - 14652830
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14652892 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 14652830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15935172 - 15935047
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc-gctgtgaacaat-tag 189  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||   | ||||||||  ||    
T  15935172 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcactgaatttgaatggttaaagcattcatcagagcataagccctcaccaaatttgaacaataaag 15935073  T
Q  190 tgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  15935072 tgttccaggacatgagtcctcccgct 15935047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 153
Target Start/End: Original strand, 19443469 - 19443528
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 153  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  19443469 atgcatgtggtaccataacagggccggagccctcaccgctatagaatggttaaagcattc 19443528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 153
Target Start/End: Original strand, 10553822 - 10553932
Alignment:
Q  45 gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgg 142  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||  || |||| |||| || | | ||||||    
T  10553822 gactcatgcatgacatgacgactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccaaagctctcatcgttgtagaatgg 10553921  T
Q  143 ttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||    
T  10553922 ttaaagcattc 10553932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 124 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12356104 - 12356042
Alignment:
Q  124 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattca-tcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaa 185  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||| |||||||    
T  12356104 cctcaccgctattgaatggttaaagcattcattcaggacataagtcctcaccgctttgaacaa 12356042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 124 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12362653 - 12362591
Alignment:
Q  124 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattca-tcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaa 185  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||| |||||||    
T  12362653 cctcaccgctattgaatggttaaagcattcattcaggacataagtcctcaccgctttgaacaa 12362591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 155
Target Start/End: Original strand, 14292706 - 14292765
Alignment:
Q  98 catgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    |||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14292706 catgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 14292765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16823899 - 16823843
Alignment:
Q  119 gaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 174  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  16823899 gaagccctcaccgagttttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 16823843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 17243923 - 17243796
Alignment:
Q  32 caaccaacaacaa-gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctc-aataatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 126  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||  |||||||||||||||| |  ||||  || ||||||    
T  17243923 caaccaacaacaacgactgatgcaatgacatgacaacacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcggagccct 17243824  T
Q  127 caccgct-tttgaatggttaaagcattc 153  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||    
T  17243823 caccgctagtcgaatggttaaagcattc 17243796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20249366 - 20249254
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||| | |||  ||||| |||||| || | | ||||    
T  20249366 aagactcatgcaggacatgacaactccattaagactcctcaacaaatgcaaccatgcatgtggtaccatatcagagccgaaaccctcatcgttatagaat 20249267  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  20249266 ggttaaagcattc 20249254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 31690796 - 31690713
Alignment:
Q  74 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 153  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  31690796 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattc 31690713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14289120 - 14289058
Alignment:
Q  120 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaac 183  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| |||||    
T  14289120 aagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattca-cagggcataagccctcaccgctttgaac 14289058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 153
Target Start/End: Original strand, 18888901 - 18889027
Alignment:
Q  33 aaccaacaacaa-gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctc 127  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||  ||||||| |||||| || ||||  |||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||    
T  18888901 aaccaacgacaacgactcatgcaatgacatgacgacacttctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctc 18889000  T
Q  128 accgctttt-gaatggttaaagcattc 153  Q
    ||||||  | |||||||||||||||||    
T  18889001 accgctaatcgaatggttaaagcattc 18889027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 8583493 - 8583385
Alignment:
Q  74 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagcc 168  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| |    
T  8583493 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 8583394  T
Q  169 ctcaccgct 177  Q
    |||||||||    
T  8583393 ctcaccgct 8583385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 10390625 - 10390515
Alignment:
Q  45 gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgg 142  Q
    |||||||||| |||| |||||| | |||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||   |||  ||||||| |||| || | | ||||||    
T  10390625 gactcatgcaagacacgacaactctactaagactcctcaactaatgcaattatgcatgtggtaccatttcagagccgaagctctcatcgttatagaatgg 10390526  T
Q  143 ttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||    
T  10390525 ttaaagcattc 10390515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 10415734 - 10415624
Alignment:
Q  45 gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgg 142  Q
    |||||||||| |||| |||||| | |||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||   |||  ||||||| |||| || | | ||||||    
T  10415734 gactcatgcaagacacgacaactctactaagactcctcaactaatgcaattatgcatgtggtaccatttcagagccgaagctctcatcgttatagaatgg 10415635  T
Q  143 ttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||    
T  10415634 ttaaagcattc 10415624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 10422404 - 10422294
Alignment:
Q  45 gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgg 142  Q
    |||||||||| |||| |||||| | |||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||   |||  ||||||| |||| || | | ||||||    
T  10422404 gactcatgcaagacacgacaactctactaagactcctcaactaatgcaattatgcatgtggtaccatttcagagccgaagctctcatcgttatagaatgg 10422305  T
Q  143 ttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||    
T  10422304 ttaaagcattc 10422294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 215
Target Start/End: Original strand, 12202353 - 12202403
Alignment:
Q  165 agccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||||||||| || |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12202353 agccctcaccactttgaacaataagtgttccaggatatgagtcctcccgct 12202403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 12304696 - 12304809
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaa 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||| |||||||| ||||  |||| |||   ||| ||||| | | |||    
T  12304696 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgtatgtggtatcaaaatcagggccgtgacccacaccgttgtcgaa 12304795  T
Q  140 tggttaaagcattc 153  Q
    ||||||||||||||    
T  12304796 tggttaaagcattc 12304809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12479839 - 12479777
Alignment:
Q  124 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattca-tcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaa 185  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||  ||| |||||||||| |||||||    
T  12479839 cctcaccgctattgaatggttaaagcactcattcaggacgtaagtcctcaccgctttgaacaa 12479777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 177
Target Start/End: Original strand, 14084509 - 14084617
Alignment:
Q  74 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagcc 168  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| |    
T  14084509 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 14084608  T
Q  169 ctcaccgct 177  Q
    |||||||||    
T  14084609 ctcaccgct 14084617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 177
Target Start/End: Original strand, 14089910 - 14090018
Alignment:
Q  74 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagcc 168  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| |    
T  14089910 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 14090009  T
Q  169 ctcaccgct 177  Q
    |||||||||    
T  14090010 ctcaccgct 14090018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 18719312 - 18719251
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattc 153  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  18719312 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgcttatcgaatggttaaagcattc 18719251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 8583570 - 8583502
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgca--tgacatgacaacaccactaagac 77  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  8583570 catcgtcaatatggcaactacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 8583502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 11965080 - 11964993
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctttt-gaatggttaaagcattca--tcaggaccgaagccctcaccgct 177  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||    
T  11965080 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattcatttcaggacctaagtcctcaccgct 11964993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 177
Target Start/End: Original strand, 12363445 - 12363532
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattca--tcaggaccgaagccctcaccgct 177  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||    
T  12363445 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcatttcaggacataagtcctcaccgct 12363532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13969019 - 13968924
Alignment:
Q  86 aatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagccctcaccgct 177  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  13969019 aatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 13968924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 13969137 - 13969069
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgca--tgacatgacaacaccactaagac 77  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  13969137 catcgtcaatatggcaactacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 13969069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13974494 - 13974399
Alignment:
Q  86 aatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagccctcaccgct 177  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  13974494 aatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 13974399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 13974612 - 13974544
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgca--tgacatgacaacaccactaagac 77  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  13974612 catcgtcaatatggcaactacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 13974544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Original strand, 14084432 - 14084500
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaaca-agactcatgc--atgacatgacaacaccactaagac 77  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  14084432 catcgtcaatatggcaactacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 14084500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Original strand, 14089833 - 14089901
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaaca-agactcatgc--atgacatgacaacaccactaagac 77  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  14089833 catcgtcaatatggcaactacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 14089901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 14544368 - 14544308
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 153  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  14544368 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattc 14544308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 14648444 - 14648384
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaaca-agactcatgc--atgacatgacaacacc 69  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||    
T  14648444 catcatcaatatggcatttacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacacc 14648384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 69
Target Start/End: Original strand, 20187568 - 20187627
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaaca-agactcatgc--atgacatgacaacacc 69  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||    
T  20187568 catcatcaa-atgacaattacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacacc 20187627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 24284726 - 24284550
Alignment:
Q  11 acatcatcaatatg--acaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatg-acatgacaacaccactaagacccctcaataatgc------agatatgcat 100  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||| |||| ||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| |||||        | ||||||    
T  24284726 acatcatcaatatgtgacaatttcaactaacagcaacgactcatgcaactacatgacaacaccactaagactcctcaacaatgcgactatgcacatgcat 24284627  T
Q  101 gtggtacca---aacaggaccgaagccctcaccg-cttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 174  Q
    |||||||||    ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  24284626 gtggtaccattttacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattc-tcagggcataagccctcacc 24284550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 31690873 - 31690805
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaaca-agactcatgc--atgacatgacaacaccactaagac 77  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||  |||||||||||||||  |||||||    
T  31690873 catcatcaatatggcaattacatccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacacagctaagac 31690805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Original strand, 31943342 - 31943410
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaaca-agactcatgc--atgacatgacaacaccactaagac 77  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||  |||||||||||||||  |||||||    
T  31943342 catcatcaatatggcaattacatccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagac 31943410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Original strand, 49399374 - 49399442
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaaca-agactcatgc--atgacatgacaacaccactaagac 77  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  49399374 catcgtcaatatggcaactacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 49399442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 73
Target Start/End: Original strand, 9778 - 9830
Alignment:
Q  23 tgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgc-atgacatgacaacaccacta 73  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9778 tgacaatttcaaccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacaactccacta 9830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 12961580 - 12961517
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12961580 atgcatgtggtaccataatcagggccgaaaccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 12961517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 14289206 - 14289166
Alignment:
Q  45 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaa 84  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14289206 gactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaa 14289166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 76)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 29925610 - 29925833
Alignment:
Q  11 acatcatcaatatgacaa-ttacaaccaacaacaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  29925610 acatcatcaatatgacaacttacaaccaacaacaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaattatgcaaatatgcatgtggtacca 29925709  T
Q  110 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcct 209  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  29925710 aacaggaccgaagtcctcaccccttttgaatggttaaagcattcatcaggactgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgttccaggacatgagtcct 29925809  T
Q  210 cccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  29925810 cccgctgtttatgcatatgcaatg 29925833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10470965 - 10470746
Alignment:
Q  16 atcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaacag 114  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||    
T  10470965 atcaatatggcaattacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacag 10470866  T
Q  115 gaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  10470865 gaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccg 10470766  T
Q  214 ctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10470765 ctgtttatgcatatgcaatg 10470746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10464443 - 10464224
Alignment:
Q  16 atcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaacag 114  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||    
T  10464443 atcaatatggcaattacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacag 10464344  T
Q  115 gaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||    
T  10464343 gaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagttctctccg 10464244  T
Q  214 ctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10464243 ctgtttatgcatatgcaatg 10464224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12447435 - 12447215
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  12447435 catcatcaatatgacatttacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca 12447336  T
Q  110 aa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcc 208  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  12447335 aaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgtagccctcaccgctgtgaacaacaagtgctctaggacatgagtcc 12447236  T
Q  209 tcccgctgtttatgcatatgc 229  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12447235 tcccgctgtttatgcatatgc 12447215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17207976 - 17207753
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  17207976 catcatcaatatggcaattacaaccaacaataaagactcatgcatgacatgacgaccccactaagactcctcaataatgcaattatgcatgtggtaccaa 17207877  T
Q  111 a-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcct 209  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17207876 aacaggaccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgatatgaacaactagtgctccaggacatgagtcct 17207777  T
Q  210 cccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  17207776 cccactgtttatgcatatgcaatg 17207753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 27767273 - 27767498
Alignment:
Q  11 acatcatcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtacc 108  Q
    ||||||||||||| | ||  ||| |||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  27767273 acatcatcaatataataaccacacccaacaatgaagactcttgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaataaatgcatatatgcatgtggtacc 27767372  T
Q  109 aaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27767373 aaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcc 27767472  T
Q  209 tc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  27767473 tctccgctgtttatgcatatgcaatg 27767498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 13940348 - 13940567
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaata-atgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  13940348 catcatcaatatggcaattacgaacaacaacaaagactcatggatgacatgactacaccactaagacccctcaatagatgcaattatgcatgtggtacca 13940447  T
Q  110 aa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcc 208  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  13940448 aaacaggaccgaagtcctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccatgacatgagtcc 13940547  T
Q  209 tcccgctgtttatgcatatg 228  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  13940548 tcccgttgtttatgcatatg 13940567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 32 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23021568 - 23021364
Alignment:
Q  32 caaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctca 128  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23021568 caaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacacctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctca 23021469  T
Q  129 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatg 228  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23021468 ccgctttagaatggttaaagaattcatcaggacataagtcctcaccgctgtgaacaacaagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatg 23021369  T
Q  229 caatg 233  Q
    |||||    
T  23021368 caatg 23021364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 74 - 233
Target Start/End: Original strand, 14582783 - 14582943
Alignment:
Q  74 agacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcac 173  Q
    |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14582783 agactcctcaaatatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcac 14582882  T
Q  174 cgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcct-cccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  14582883 cgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctccccactgtttatgcatatgcaatg 14582943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 74 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 94666 - 94504
Alignment:
Q  74 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 172  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94666 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 94567  T
Q  173 ccgctg-tgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  94566 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 94504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 74 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8069865 - 8069703
Alignment:
Q  74 agacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcac 173  Q
    |||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8069865 agactcctcaaatatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggactgaagccctcaccgcttttgaatgattaaagcattcatcaggaccgaagccctcac 8069766  T
Q  174 cgctg-tgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  8069765 cgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatg 8069703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 17894760 - 17894611
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaata-atgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  ||||||||||||||||    
T  17894760 catcatcaatgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca 17894661  T
Q  110 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagg 159  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17894660 gacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagg 17894611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 87 - 229
Target Start/End: Original strand, 4106688 - 4106833
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 185  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  4106688 atgcaaatatgaatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 4106787  T
Q  186 ttagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgc 229  Q
     |||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  4106788 ctagtactccaggacatgagccctctccgctgttttatgcatatgc 4106833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 125 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13128390 - 13128281
Alignment:
Q  125 ctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgc 223  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  13128390 ctcaccacttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgg 13128291  T
Q  224 atatgcaatg 233  Q
    ||||||||||    
T  13128290 atatgcaatg 13128281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Original strand, 29159059 - 29159209
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgctttt-gaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaaca 184  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  29159059 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgctttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagca 29159158  T
Q  185 attagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    | |||| |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  29159159 actagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 29159209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Original strand, 24369185 - 24369327
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  24369185 atatgcatgtggtaccaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 24369283  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24369284 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 24369327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25315797 - 25315654
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  25315797 atatgcatgtggtaccaaacatgaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 25315698  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  25315697 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 25315654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26203291 - 26203148
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  26203291 atatgcatgtggtaccaaacatgaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 26203192  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  26203191 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 26203148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30799588 - 30799446
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  30799588 atatgcatgtggtaccaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 30799490  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  30799489 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 30799446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Original strand, 1070616 - 1070758
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  1070616 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 1070715  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  1070716 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 1070758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15332273 - 15332131
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  15332273 tatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 15332174  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  15332173 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 15332131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Original strand, 17309672 - 17309814
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  17309672 tatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 17309771  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  17309772 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 17309814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Original strand, 25463839 - 25463981
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  25463839 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 25463938  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  25463939 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 25463981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 34134121 - 34133979
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  34134121 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 34134022  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  34134021 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 34133979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 95 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16223808 - 16223667
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgct 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||    
T  16223808 atgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtact 16223709  T
Q  194 ccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  16223708 ccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 16223667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 215
Target Start/End: Original strand, 25347029 - 25347206
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttga 138  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||  |||||||||||||||| |  ||||  |||||||||||||||| |||||    
T  25347029 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagacacctcaaaaaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggtcgaagccctcaccgctgtttga 25347128  T
Q  139 atggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25347129 atggttaaagcattcatcaggacctaggccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctcccgct 25347206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 179
Target Start/End: Original strand, 22406620 - 22406705
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 179  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22406620 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 22406705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10583051 - 10582895
Alignment:
Q  61 gacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatc 156  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  10583051 gacaacaccactaagacccctcgacaatgcacat--gcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatc 10582954  T
Q  157 aggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| |  |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  10582953 agggcataagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacttgagtcctcccgct 10582895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 215
Target Start/End: Original strand, 17414038 - 17414118
Alignment:
Q  135 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17414038 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctcccgct 17414118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26418853 - 26418719
Alignment:
Q  86 aatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtga 181  Q
    |||||| |||||||||||||| || |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||    
T  26418853 aatgcaaatatgcatgtggtatcataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctttga 26418754  T
Q  182 acaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||  | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  26418753 acaacaaggtgttccaggacataagtcctcccgct 26418719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19472556 - 19472379
Alignment:
Q  45 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcacc-gcttttga 138  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||   ||||| | || ||||||||  | | ||||    
T  19472556 gactcatgcaatgacatgacaatacctctaagacccctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacagggcagaggccctcacgagatattga 19472457  T
Q  139 atggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaa-ttagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19472456 atggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 19472379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Original strand, 18785975 - 18786187
Alignment:
Q  11 acatcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtac 107  Q
    ||||||||| |||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||| || || ||||  ||||||||||||||    
T  18785975 acatcatcactatggcaaatgcaaccaacaacaacgactcatgcaattacaggacaacaccaataagactcctgaacaaatgcaactatgcatgtggtac 18786074  T
Q  108 caaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat-caggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattag-tgctccaggacat 202  Q
    || |  |||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||  ||| |||||||||| | |||||  || || ||||||||||    
T  18786075 catattcagggcagaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcatttattcaggacataagtcctcaccgcttttaacaacaaggtgttccaggacat 18786174  T
Q  203 gagtcctcccgct 215  Q
    |||||||||||||    
T  18786175 gagtcctcccgct 18786187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 13136016 - 13135929
Alignment:
Q  42 caagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcac 129  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||   || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13136016 caagactcatgcatgacatgacgacactactaagactcctcatatattcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcac 13135929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23235108 - 23234982
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaa-tta 188  Q
    ||||||||||||||||| |  || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| |||||||  |     
T  23235108 atatgcatgtggtaccatattcaaggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtactcaccgctttgaacaacatg 23235009  T
Q  189 gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23235008 gtgttccaggacataagtcctcccgct 23234982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 215
Target Start/End: Original strand, 25395948 - 25396125
Alignment:
Q  45 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcacc-gcttttga 138  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||| |||||| || |||   |||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||| | | ||||    
T  25395948 gactcatgcaatgatatgacgacacctctaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccagatattga 25396047  T
Q  139 atggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||  | ||| || ||||||||||||||||||||    
T  25396048 atggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttctaggacatgagtcctcccgct 25396125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 153
Target Start/End: Original strand, 15457410 - 15457524
Alignment:
Q  41 acaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 138  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| | | ||    
T  15457410 acaagactcatgcatgacatgacgactcctctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccgaagccctcaccgttataga 15457509  T
Q  139 atggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||||    
T  15457510 atggttaaagcattc 15457524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 153
Target Start/End: Original strand, 15464005 - 15464119
Alignment:
Q  41 acaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 138  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| | | ||    
T  15464005 acaagactcatgcatgacatgacgactcctctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccgaagccctcaccgttataga 15464104  T
Q  139 atggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||||    
T  15464105 atggttaaagcattc 15464119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23233620 - 23233463
Alignment:
Q  61 gacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatc 156  Q
    |||||| |||||||||| |||| | |||||| ||  |||||| |||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  23233620 gacaactccactaagactcctctacaatgcacat--gcatgtagtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatc 23233523  T
Q  157 aggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| || |||||||||||||| |||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23233522 agggcctaagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctcccgct 23233463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Original strand, 24720594 - 24720720
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatt--a 188  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||| |||||||||  |    
T  24720594 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcatggcataagccctcaccgctttgaacaattaaa 24720693  T
Q  189 gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24720694 gtgttccaggacatgagtcctcccgct 24720720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 74 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5290341 - 5290196
Alignment:
Q  74 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccct 170  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  ||||  || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |  |||| ||    
T  5290341 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggacgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatcagagcataagctct 5290242  T
Q  171 caccgctgtgaacaa-ttagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||||| |||||||   |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5290241 caccgctttgaacaacaaagtgttccagaacatgagtcctcccgct 5290196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 84
Target Start/End: Original strand, 25749621 - 25749695
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaa 84  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25749621 catcatcaatatggcaatttcaaccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaa 25749695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 215
Target Start/End: Original strand, 19451326 - 19451407
Alignment:
Q  135 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19451326 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctcccgct 19451407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 215
Target Start/End: Original strand, 19467858 - 19467939
Alignment:
Q  135 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19467858 ttgaatggttaaagcattcattagggcctaagccctcaccgatttgaacaataaggtgttccaggacatgagtcctcccgct 19467939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14133310 - 14133105
Alignment:
Q  11 acatcatcaata-tgacaattacaaccaacaac---aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggta 106  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||     |||||||||||| |||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||| || ||  |||||||    
T  14133310 acatcatcaataatggcaattacaaccaacacagcaaagactcatgcacgactcgacaacaccgctaagactcctcaacaatgcacatgtg--tgtggta 14133213  T
Q  107 ccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggaca 201  Q
    ||||   ||||| | ||||||||| |||  | ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||  | ||| || ||||||    
T  14133212 ccaatctacagggcagaagccctccccgaatattgaatgattaaagcattcatcagggcagaagccctcaccgttttgaacaacaaggtgttctaggaca 14133113  T
Q  202 tgagtcct 209  Q
    ||||||||    
T  14133112 tgagtcct 14133105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20009110 - 20008998
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |  |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | ||||    
T  20009110 aagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgtaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaat 20009011  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  20009010 ggttaaagcattc 20008998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 31250239 - 31250351
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||  ||| | |||| ||||||||||||||| | | ||||    
T  31250239 aagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggcgccatatcagggccgaagccctcaccgttatagaat 31250338  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  31250339 ggttaaagcattc 31250351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 9100238 - 9100127
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatg 141  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |  | | |||||    
T  9100238 aagactcatgcaagacatgacaactctactaagactcctcaacaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagctctcatctttatagaatg 9100139  T
Q  142 gttaaagcattc 153  Q
    ||||||||||||    
T  9100138 gttaaagcattc 9100127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 29096753 - 29096864
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatg 141  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |  | | |||||    
T  29096753 aagactcatgcaagacatgacaactctactaagactcctcaacaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagctctcatctttatagaatg 29096852  T
Q  142 gttaaagcattc 153  Q
    ||||||||||||    
T  29096853 gttaaagcattc 29096864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 155
Target Start/End: Original strand, 1592758 - 1592821
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  1592758 tatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtcgaatggttaaagcattcat 1592821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 4476312 - 4476424
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||   |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | ||||    
T  4476312 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaat 4476411  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  4476412 ggttaaagcattc 4476424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 19300846 - 19300787
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 153  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  19300846 atgcatgtggtaccatatcaggaccgaagccctcaccgctatagaatggttaaagcattc 19300787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 20011169 - 20011082
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctca 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  20011169 aagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctca 20011082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 12941747 - 12941860
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaa 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |  ||||||||||||||||||  |||| |||   ||| ||||||| | |||    
T  12941747 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgaaactatgcatgtggtaccaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaa 12941846  T
Q  140 tggttaaagcattc 153  Q
    ||||||||||||||    
T  12941847 tggttaaagcattc 12941860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 19096861 - 19096815
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19096861 atgcaaatatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgct 19096815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 28290437 - 28290324
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaa 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||  |||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||    
T  28290437 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaa 28290338  T
Q  140 tggttaaagcattc 153  Q
    ||||||||||||||    
T  28290337 tggttaaagcattc 28290324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22798730 - 22798574
Alignment:
Q  61 gacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatca 157  Q
    ||||||||| ||||||| |||| | |||||| ||  ||||||||||||||   ||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||    
T  22798730 gacaacaccgctaagactcctcgacaatgcacat--gcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcactgagtttgaatggttaaagtattcatca 22798633  T
Q  158 ggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    || |  |||||||||||  | |||||||  | ||| |||||| |||||| |||||||||    
T  22798632 gggcataagccctcaccaatttgaacaacaaggtgttccagggcatgagccctcccgct 22798574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 21724934 - 21724875
Alignment:
Q  98 catgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  21724934 catgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctatagaatggttaaagcattcat 21724875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 14582034 - 14581975
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 153  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14582034 atgcatgtggtaccataacagggccgaggccctcaccgctatagaatggttaaagcattc 14581975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Original strand, 19726606 - 19726668
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19726606 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 19726668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 138
Target Start/End: Original strand, 24362610 - 24362654
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttga 138  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24362610 atatgcatgtggtaccaa-caggaccgaagccctcaccgctgttga 24362654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 68
Target Start/End: Original strand, 7429332 - 7429391
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaaca-agactcatgc--atgacatgacaacac 68  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||    
T  7429332 catcatcaatatgacatttacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacac 7429391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 175
Target Start/End: Original strand, 19449332 - 19449372
Alignment:
Q  135 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccg 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  19449332 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccg 19449372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21365697 - 21365585
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||  ||||||| |||| || | | ||||    
T  21365697 aagactcatgcaagacatgacaacccttctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccatatcagagccgaagctctcatcgttatagaat 21365598  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  21365597 ggttaaagcattc 21365585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 23969679 - 23969567
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||  ||||||| |||| || | | ||||    
T  23969679 aagactcatgcaagacatgacaacccttctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccatatcagagccgaagctctcatcgttatagaat 23969580  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  23969579 ggttaaagcattc 23969567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 155
Target Start/End: Original strand, 22906984 - 22907027
Alignment:
Q  112 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22906984 caggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22907027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24412466 - 24412341
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-g 189  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  |  |||||||||||  | |||||||  | |    
T  24412466 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcttcagagcataagccctcaccaatttgaacaacaagg 24412367  T
Q  190 tgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    || |||||| |||||| |||||||||    
T  24412366 tgttccagggcatgagccctcccgct 24412341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 8760605 - 8760544
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattc 153  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  8760605 atgcatgtggtaccataatcaggaccgaagccctcaccacttatcgaatggttaaagcattc 8760544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 24514072 - 24513944
Alignment:
Q  30 tacaaccaacaacaa-gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagcc 124  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| | || ||||||||||  |||||||| |||| | || |||| ||||||||||||||||| |  |||| ||| ||||    
T  24514072 tacaatcaacaacaacgactcatgtaatggcatgacaacattactaagactcctcgacaaatgca-atatgcatgtggtaccatattcagggccggagcc 24513974  T
Q  125 ctcaccgctttt-gaatggttaaagcattc 153  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24513973 ctcaccgctattcgaatggttaaagcattc 24513944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 177
Target Start/End: Original strand, 24562260 - 24562368
Alignment:
Q  74 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagcc 168  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| |    
T  24562260 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 24562359  T
Q  169 ctcaccgct 177  Q
    |||||||||    
T  24562360 ctcaccgct 24562368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Original strand, 24562183 - 24562251
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaaca-agactcatgc--atgacatgacaacaccactaagac 77  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  24562183 catcgtcaatatggcaactacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 24562251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 29615389 - 29615290
Alignment:
Q  82 caataatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagccctcaccgct 177  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29615389 caataatgcaactatgcatgtggtaccataaccagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 29615290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 8069942 - 8069883
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgca--tgacatgacaacac 68  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8069942 catcatcaatgtaacaattacaatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacac 8069883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14375489 - 14375426
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  14375489 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaaggattcat 14375426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 23235201 - 23235146
Alignment:
Q  16 atcaatatgacaattacaaccaacaaca-agactcatgc--atgacatgacaacac 68  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||    
T  23235201 atcaatatggcaattacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacac 23235146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 233
Target Start/End: Original strand, 24362628 - 24362708
Alignment:
Q  156 caggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24362628 caggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 24362708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 25634095 - 25634207
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||  ||||||| |||| || | | ||||    
T  25634095 aagactcatgcaagacatgacaactctactaagacttatcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagctctcatcgttatagaat 25634194  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  25634195 ggttaaagcattc 25634207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 84)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 30396063 - 30396281
Alignment:
Q  11 acatcatcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30396063 acatcatcaatatggcaattacaacccacaaccaagactcatgcatgacatgacaaaaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtacca 30396162  T
Q  110 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcct 209  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30396163 aataggaccgaagccctcaccgc-tttgaatggttaaagtattcatcaggaccgaagccctcaacgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcct 30396261  T
Q  210 cccgctgtttatgcatatgc 229  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  30396262 cccgctgtttatgcatatgc 30396281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 30 - 229
Target Start/End: Original strand, 33096977 - 33097178
Alignment:
Q  30 tacaaccaacaaca-agactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 127  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33096977 tacaaccaacgacagagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaataaatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 33097076  T
Q  128 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatat 227  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33097077 gccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatat 33097176  T
Q  228 gc 229  Q
    ||    
T  33097177 gc 33097178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 233
Target Start/End: Original strand, 42220302 - 42220520
Alignment:
Q  17 tcaatatgacaattacaaccaacaaca-agactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaacag 114  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  42220302 tcaatatggcaactacaaccaacgacagagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacag 42220401  T
Q  115 gaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgc 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42220402 gaccgaagtcctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggactgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgc 42220501  T
Q  215 tgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||||||||||||    
T  42220502 tgtttatgcatatgcaatg 42220520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Original strand, 20889240 - 20889464
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaata-atgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  ||||||||||||||||    
T  20889240 catcatcaatgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca 20889339  T
Q  110 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  20889340 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcgccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcat 20889439  T
Q  210 c-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  20889440 ctccgctgtttatgcatatgcaatg 20889464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Original strand, 20894859 - 20895083
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaata-atgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  ||||||||||||||||    
T  20894859 catcatcaatgtggcaactacaaccaacaactaagattcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca 20894958  T
Q  110 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20894959 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcct 20895058  T
Q  210 c-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  20895059 ctccgctgtttatgcatatgcaatg 20895083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Original strand, 31664925 - 31665149
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaata-atgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  31664925 catcatcaatttggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcagttatgcatgtggtacca 31665024  T
Q  110 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcct 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31665025 gacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatagttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcct 31665124  T
Q  210 c-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  31665125 ctccgctgtttatgcatatgcaatg 31665149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 46045088 - 46044868
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  46045088 catcatcaatatggcaattacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgatgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca 46044989  T
Q  110 aa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcc 208  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46044988 aaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacattagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcc 46044889  T
Q  209 tcccgctgtttatgcatatgc 229  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  46044888 tcccgctgtttatgcatatgc 46044868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 43 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19128528 - 19128336
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatg 141  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19128528 aagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaataaatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgagtg 19128429  T
Q  142 gttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  19128428 gttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgttgtttatgcatatgcaatg 19128336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 49548801 - 49548577
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaata-atgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  ||||||||||||||||    
T  49548801 catcatcaatgtggcaactacaaccaacaactaaaactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca 49548702  T
Q  110 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  49548701 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagttct 49548602  T
Q  210 c-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  49548601 ctccgctgtttatgcatatgcaatg 49548577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Original strand, 33221236 - 33221459
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa 110  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  33221236 catcatcaatgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacgacaccaccaagactcctcaactatgcaaatatgcatgtggtaccaa 33221335  T
Q  111 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  33221336 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatttatcatgaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacacgagtcctc 33221435  T
Q  211 -ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  33221436 tccgctgtttatgcatatgcaatg 33221459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2972950 - 2972726
Alignment:
Q  11 acatcatcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  2972950 acatcatcaatataataaccacaaccaacaatgaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcttcaaatatgcaattatgcatgtggtacca 2972851  T
Q  110 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcct 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2972850 aacaggaccgaagcactcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcct 2972751  T
Q  210 c-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  2972750 ctccgctgtttatgcatatgcaatg 2972726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Original strand, 21881458 - 21881681
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa 110  Q
    |||||||||||| ||||  |||| |||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||    
T  21881458 catcatcaatataacaaccacaatcaacaataaagattcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa 21881557  T
Q  111 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  21881558 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgaggcatc 21881657  T
Q  211 -ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  21881658 tccgctgtttatgcatatgcaatg 21881681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41404924 - 41404701
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  41404924 catcatcaatatggcaattacaaccaacaacaaagactcatgcatgacataacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca 41404825  T
Q  110 aa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcc 208  Q
    || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||     
T  41404824 aaactggaccgaagccctcaccacttttgaatggttaaagcattcatcatgaccaaagccctcaccgctgtgaacaactagtgttccaggacatgagtct 41404725  T
Q  209 tcccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  41404724 tcccgctg-ttatgcatatgcaatg 41404701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 32 - 233
Target Start/End: Original strand, 899481 - 899682
Alignment:
Q  32 caaccaacaacaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcacc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  899481 caaccaacaacaagactcatgcatgacatgatgacaccactaagaccc-tcaataaatgcaattatgcatgcggtaccaaacaggactgaagccctcacc 899579  T
Q  131 gcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgca 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  899580 gcttttgaatggttaaagcattcatcagaacataagccatcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgca 899679  T
Q  231 atg 233  Q
    |||    
T  899680 atg 899682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 35462752 - 35462605
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaat 186  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35462752 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaac 35462653  T
Q  187 tagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35462652 tagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 35462605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 43 - 233
Target Start/End: Original strand, 36037460 - 36037652
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatg 141  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| | || ||||  |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36037460 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctctacaaatgcaactatgcatgcggtaccaaccaggaccgaagtcctcaccgcttttgaatg 36037559  T
Q  142 gttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36037560 gttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactaatgttccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 36037652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 74 - 233
Target Start/End: Original strand, 7359175 - 7359337
Alignment:
Q  74 agacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcac 173  Q
    |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7359175 agacacctcaaatatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcac 7359274  T
Q  174 cgctg-tgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  7359275 cgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatg 7359337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 74 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 47872577 - 47872415
Alignment:
Q  74 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 172  Q
    |||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47872577 agactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgattaaagcattcatcaggaccgaagccctca 47872478  T
Q  173 ccgctg-tgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47872477 ccgctgttgagcaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 47872415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 74 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 54845103 - 54844941
Alignment:
Q  74 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 172  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54845103 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagacctca 54845004  T
Q  173 ccgctg-tgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  54845003 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatacaatg 54844941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Original strand, 34772115 - 34772257
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  34772115 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgattggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgc 34772214  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  34772215 tccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatg 34772257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 86 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 45959884 - 45959734
Alignment:
Q  86 aatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaaca 184  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  45959884 aatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagca 45959785  T
Q  185 attagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  45959784 actagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatg 45959734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 95 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 49548502 - 49548362
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgct 193  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49548502 atgcatgtggtaccatatcagggccggagccctcaccgcttttaaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgct 49548403  T
Q  194 ccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49548402 ccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 49548362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 45142685 - 45142542
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  45142685 atatgtatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtg 45142586  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  45142585 ctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatg 45142542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Original strand, 1583850 - 1583999
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 185  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  1583850 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggactgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 1583949  T
Q  186 ttagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
     |||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  1583950 ctagtactccaggacatgagtcatctccgctgttttatgcatatgcaatg 1583999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Original strand, 5938865 - 5939014
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgc-tgtgaacaa 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||    
T  5938865 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgcttttgagcaa 5938964  T
Q  186 ttagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
     |||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  5938965 ctagtactccaagacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatg 5939014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 74 - 228
Target Start/End: Original strand, 7356182 - 7356339
Alignment:
Q  74 agacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcac 173  Q
    |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7356182 agacacctcaaatatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgctttttaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcac 7356281  T
Q  174 cgctg-tgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatg 228  Q
    ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  7356282 cgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatg 7356339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 87 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11202572 - 11202427
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 185  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  11202572 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaacccctcaccgctgttgagcaa 11202473  T
Q  186 ttagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgc 229  Q
     |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  11202472 ctagtactccaggacatgagtcctcaccgctgttttatgcatatgc 11202427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 74 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 42956177 - 42956017
Alignment:
Q  74 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 172  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42956177 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgtagccctca 42956078  T
Q  173 ccgctg-tgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaa 231  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  42956077 ccgctgttgagcaactagtgctccagaacatgagtcatctctgctgtttatgcatatgcaa 42956017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3260127 - 3259984
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  3260127 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 3260028  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  3260027 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 3259984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Original strand, 52500497 - 52500640
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  52500497 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 52500596  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  52500597 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 52500640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 93 - 200
Target Start/End: Original strand, 391072 - 391180
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  391072 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 391171  T
Q  192 ctccaggac 200  Q
    |||||||||    
T  391172 ctccaggac 391180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 93 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 29382900 - 29382792
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  29382900 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 29382801  T
Q  192 ctccaggac 200  Q
    |||||||||    
T  29382800 ctccaggac 29382792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23436118 - 23435975
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  23436118 atatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 23436019  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  23436018 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 23435975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Original strand, 21396756 - 21396906
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgctttt-gaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaaca 184  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  21396756 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgctttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagca 21396855  T
Q  185 attagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    | |||| |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21396856 actagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 21396906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29448811 - 29448669
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  29448811 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 29448712  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  29448711 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 29448669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29455495 - 29455353
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  29455495 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 29455396  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  29455395 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 29455353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 93 - 179
Target Start/End: Original strand, 50082206 - 50082292
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50082206 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 50082292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 200
Target Start/End: Original strand, 11937105 - 11937212
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  11937105 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 11937204  T
Q  193 tccaggac 200  Q
    ||||||||    
T  11937205 tccaggac 11937212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Original strand, 26395632 - 26395774
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  26395632 tatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 26395731  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  26395732 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 26395774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 39266371 - 39266230
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  39266371 tatgcatgtggtaccaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 39266273  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  39266272 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 39266230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 86 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 49240987 - 49240837
Alignment:
Q  86 aatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaaca 184  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  49240987 aatgcagtaatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagca 49240888  T
Q  185 attagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    | |||| |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  49240887 actagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 49240837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 86 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 49749701 - 49749551
Alignment:
Q  86 aatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaaca 184  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  49749701 aatgcagtaatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagca 49749602  T
Q  185 attagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    | |||| |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  49749601 actagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 49749551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 95 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3266753 - 3266612
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgct 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||    
T  3266753 atgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtact 3266654  T
Q  194 ccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  3266653 ccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 3266612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 93 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 45151454 - 45151372
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccg 175  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45151454 atatgtatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccg 45151372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 10977285 - 10977129
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgca--tgacatgacaacaccactaagacccctcaat-aatgcagatatgcatgtggtac 107  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   ||||||||||||||    
T  10977285 catcatcaatatagcaattccaaccaacaataacgactcatgcaaatgacatgacaacaccactaagactcctcaataaatgcgactatgcatgtggtac 10977186  T
Q  108 caaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggac 161  Q
    || |  |||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  10977185 catattcagagccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcatcaggac 10977129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15361003 - 15360879
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagt 190  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  ||    
T  15361003 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaataggt 15360904  T
Q  191 gctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  15360903 gttccaggacatgagtcctcccgct 15360879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 53905529 - 53905371
Alignment:
Q  61 gacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatc 156  Q
    ||||||||||||||||| |||  | ||||||  |||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  53905529 gacaacaccactaagactccttgacaatgca--tatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatc 53905432  T
Q  157 aggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatt--agtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| |  |||| ||||||| | |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  53905431 agggcataagctctcaccgatttgaacaattaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 53905371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13899797 - 13899671
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatt--a 188  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||  |    
T  13899797 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaa 13899698  T
Q  189 gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||    
T  13899697 gtgttctaggacatgagtcctcccgct 13899671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 215
Target Start/End: Original strand, 15306959 - 15307126
Alignment:
Q  54 atgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaag 148  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||   |||||||||||||||||   ||||| |  ||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  15306959 atgacatgacaacacctctaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacagggcaaaagccctcaccggatattgaatggttaaag 15307058  T
Q  149 cattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaa-ttagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||   || | |||||||||||||||||||||||    
T  15307059 cattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaagcgttccaggacatgagtcctcccgct 15307126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 185
Target Start/End: Original strand, 13452217 - 13452319
Alignment:
Q  86 aatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaa 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||| ||||    
T  13452217 aatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcactgctttgaa 13452316  T
Q  183 caa 185  Q
    |||    
T  13452317 caa 13452319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Original strand, 16484596 - 16484721
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-g 189  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||  | |    
T  16484596 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaagg 16484695  T
Q  190 tgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  16484696 tgttccaggacatgagtcctcccgct 16484721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 213
Target Start/End: Original strand, 37881387 - 37881519
Alignment:
Q  86 aatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtga 181  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||| |||    
T  37881387 aatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagagccgaagccctcaccgctattttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcatcaccgctttga 37881486  T
Q  182 acaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccg 213  Q
    ||||  | ||| |||||||||| ||||||||||    
T  37881487 acaacaaggtgttccaggacataagtcctcccg 37881519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18166422 - 18166345
Alignment:
Q  135 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctccc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  18166422 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgttttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctccc 18166345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 215
Target Start/End: Original strand, 13886614 - 13886791
Alignment:
Q  45 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttga 138  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||| || |||   |||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||    
T  13886614 gactcatgcaatgacttgacaacacccctaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattga 13886713  T
Q  139 atggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaa-ttagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||   |||| || |||||||||||| |||||||    
T  13886714 atggttaaagcattcattagggcttaagccctcaccgctttgaacaacaaagtgttcgaggacatgagtcatcccgct 13886791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 14910532 - 14910645
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacc--aaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||  ||||||  |||||||||||||||  || |||| ||| ||||||||||||| | |||    
T  14910532 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactactcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggccggagccctcaccgctatagaa 14910631  T
Q  140 tggttaaagcattc 153  Q
    ||||||||||||||    
T  14910632 tggttaaagcattc 14910645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 215
Target Start/End: Original strand, 14821317 - 14821479
Alignment:
Q  57 acatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatt 152  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || |||   |||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14821317 acatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcatt 14821416  T
Q  153 catcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    || |||| |  |||||||||||  | |||||||  | ||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  14821417 ca-cagggcataagccctcaccaatttgaacaacaaggtgttccaggacaggagccctcccgct 14821479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 215
Target Start/End: Original strand, 15244098 - 15244224
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaa-tta 188  Q
    |||||||||| ||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||   |    
T  15244098 tatgcatgtgttaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaa 15244197  T
Q  189 gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||    
T  15244198 gtgttctaggacatgagtcctcccgct 15244224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16229297 - 16229175
Alignment:
Q  98 catgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-gtgc 192  Q
    |||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||  | |||     
T  16229297 catgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccactttgaacaacaaggtgt 16229198  T
Q  193 tccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16229197 tccaggacatgagtcctcccgct 16229175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 212
Target Start/End: Original strand, 18271262 - 18271384
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc-gctgtgaacaat-tag 189  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||   | ||||||||  ||    
T  18271262 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccaaatttgaacaataaag 18271361  T
Q  190 tgctccaggacatgagtcctccc 212  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  18271362 tgttccaggacatgagtcctccc 18271384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 215
Target Start/End: Original strand, 12931881 - 12931962
Alignment:
Q  135 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||  | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  12931881 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctcccgct 12931962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16148003 - 16147891
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||| || ||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |  | | ||||    
T  16148003 aagactcatgcaggacatgacaactctactaagactcctcaacaattgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatctttatagaat 16147904  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  16147903 ggttaaagcattc 16147891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 212
Target Start/End: Original strand, 18261297 - 18261419
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc-gctgtgaacaat-tag 189  Q
    ||||||||||||||||   |||||   |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||   | ||||||||  ||    
T  18261297 atgcatgtggtaccaatttacagggtagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccaaatttgaacaataaag 18261396  T
Q  190 tgctccaggacatgagtcctccc 212  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  18261397 tgttccaggacatgagtcctccc 18261419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Original strand, 23121599 - 23121661
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  23121599 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 23121661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 153
Target Start/End: Original strand, 14485444 - 14485570
Alignment:
Q  32 caaccaacaacaa-gactcatgcat-gacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcaga-tatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctc 127  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||   || ||||| |||||||||| |  ||| |||||||||||    
T  14485444 caaccaacaacaacgactcatgcattgacatgacaacacctctaagactcctcgataattacgactatgcttgtggtaccatattagggccgaagccctc 14485543  T
Q  128 accgct-tttgaatggttaaagcattc 153  Q
    ||||||  | |||||||||||||||||    
T  14485544 accgctaatcgaatggttaaagcattc 14485570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 155
Target Start/End: Original strand, 15406870 - 15406973
Alignment:
Q  54 atgacatgacaacaccactaagac-ccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagca 150  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || | |  ||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  15406870 atgacatgacaacacctctaagactccttgacaaatgcagctatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc-ccgctaatgaatggttaaagca 15406968  T
Q  151 ttcat 155  Q
    |||||    
T  15406969 ttcat 15406973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15005149 - 15005024
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa---caggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaat-tag 189  Q
    |||||||||||||||||   |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||  | ||||||||  ||    
T  15005149 atgcatgtggtaccaaattacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatcagggcataagcccacaccaatttgaacaataaag 15005050  T
Q  190 tgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    || | |||| |||||| |||||||||    
T  15005049 tgtttcagggcatgagccctcccgct 15005024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Original strand, 20940260 - 20940322
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  20940260 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgttgtagaatggttaaagcattcat 20940322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 153
Target Start/End: Original strand, 27905211 - 27905270
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 153  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  27905211 atgcatgtggtaccatatcaggactgaagccctcaccgctatagaatggttaaagcattc 27905270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 153
Target Start/End: Original strand, 40908583 - 40908642
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 153  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  40908583 atgcatgtggtaccataacagggccggagccctcaccgctatagaatggttaaagcattc 40908642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 185
Target Start/End: Original strand, 8833771 - 8833866
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa----acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaa 185  Q
    ||||||||||||||||    ||||| | ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||    
T  8833771 atgcatgtggtaccaattttacagggcagaagccctcgccgaattttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagtcctcaccactttgaacaa 8833866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 15470686 - 15470652
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470686 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 15470652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 15533733 - 15533846
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaa 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  || |||  ||||||||||||||||||  |||| |||   ||| |||| || | |||    
T  15533733 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaaagcaactatgcatgtggtaccaaaatcagggccgtgacccacaccactgtcgaa 15533832  T
Q  140 tggttaaagcattc 153  Q
    ||||||||||||||    
T  15533833 tggttaaagcattc 15533846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 174
Target Start/End: Original strand, 13444207 - 13444290
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 174  Q
    |||| |||||||||||   ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  13444207 atgcctgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 13444290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 69
Target Start/End: Original strand, 13452101 - 13452161
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaaca-agactcatgc--atgacatgacaacacc 69  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||    
T  13452101 catcatcaatatggcaattacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacacc 13452161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 185
Target Start/End: Original strand, 15546609 - 15546661
Alignment:
Q  133 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaa 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||    
T  15546609 ttttgaatggttaaagcattcatcagagcataagccctcaccgctttgaacaa 15546661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 1651236 - 1651177
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 153  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  1651236 atgcatgtggtaccataacagggtcggagccctcaccgctatagaatggttaaagcattc 1651177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 2585346 - 2585260
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattca-tcaggaccgaagccctcaccgct 177  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||    
T  2585346 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatgattaaagcattcattcaggacataagtcctcaccgct 2585260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 4831265 - 4831203
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  4831265 atgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 4831203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 4834560 - 4834498
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  4834560 atgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 4834498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 177
Target Start/End: Original strand, 11847012 - 11847139
Alignment:
Q  54 atgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtacca--aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagca 150  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||| |||| ||||  ||||||||||||||||  |||||| |||   ||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  11847012 atgacatgacacc-ccactaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccataaacagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 11847110  T
Q  151 t--tcatcaggaccgaagccctcaccgct 177  Q
    |  ||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  11847111 ttctcaacaggacctaagtcctcaccgct 11847139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22726008 - 22725968
Alignment:
Q  133 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 174  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22726008 ttttgaatggttaaagcattca-caggaccgaagtcctcacc 22725968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 233
Target Start/End: Original strand, 391175 - 391255
Alignment:
Q  156 caggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  391175 caggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 391255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 155
Target Start/End: Original strand, 14484432 - 14484491
Alignment:
Q  98 catgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    |||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  14484432 catgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaaacattcat 14484491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 14556327 - 14556199
Alignment:
Q  27 aattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagc 123  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||  || | ||||| |||||||||| |||| | | |||| ||  ||||||||||||| |  |||| |||||||    
T  14556327 aattaaaaccaacaacatcgactcatgcaacacttaacaactccactaagactcctctacagtgcacat--gcatgtggtaccatattcagggccgaagc 14556230  T
Q  124 cctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 153  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  14556229 cctcaccgctaatcgaatggttaaagcattc 14556199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 77)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Original strand, 49327948 - 49328167
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  49327948 catcatcattataacaattaccaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca 49328047  T
Q  110 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49328048 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcct 49328147  T
Q  210 cccgctgtttatgcatatgc 229  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  49328148 cccgctgtttatgcatatgc 49328167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 32 - 229
Target Start/End: Original strand, 47484043 - 47484241
Alignment:
Q  32 caaccaacaacaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcacc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47484043 caaccaacaacaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagaccccttaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctcacc 47484142  T
Q  131 gcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47484143 gcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgc 47484241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29597055 - 29596833
Alignment:
Q  13 atcatcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaa 111  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||   |||||  ||||||||||||||||||    
T  29597055 atcattaatatgtcaactacaaccaacgaccaagactcatgcatgacatgacgacactactaagactcctcagatatgcaattatgcatgtggtaccaaa 29596956  T
Q  112 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc- 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  29596955 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgatgccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctct 29596856  T
Q  211 ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  29596855 ccgctgtttatgcatatgtaatg 29596833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 32 - 233
Target Start/End: Original strand, 36614870 - 36615074
Alignment:
Q  32 caaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctca 128  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  36614870 caaccaacaacaaagactcatgcatgacatgaagacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacagggccgaaaccctca 36614969  T
Q  129 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36614970 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctgtgaacaacaagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatg 36615069  T
Q  229 caatg 233  Q
    |||||    
T  36615070 caatg 36615074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 43 - 233
Target Start/End: Original strand, 43088338 - 43088530
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43088338 aagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 43088437  T
Q  141 ggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||| |||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43088438 ggttaaagtattcattaggacataagtcctcaccgctgtgaacaacaagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatg 43088530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Original strand, 21920712 - 21920935
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa 110  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||   |||||  |||||||||||||||||    
T  21920712 catcattaatatgtcaactacaaccaacgaccaagactcatgcatgacatgacgacactactaagactcctcagatatgcaattatgcatgtggtaccaa 21920811  T
Q  111 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc 210  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  21920812 aaaagaccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtactccaggacataagtcctc 21920911  T
Q  211 -ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  21920912 tccgctgtttatgcatatgcaatg 21920935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 108 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29602394 - 29602268
Alignment:
Q  108 caaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29602394 caaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtc 29602295  T
Q  208 ctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  29602294 ctctccgctgtttatgcatatgcaatg 29602268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 233
Target Start/End: Original strand, 4231178 - 4231328
Alignment:
Q  86 aatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaaca 184  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  4231178 aatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagca 4231277  T
Q  185 attagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  4231278 actagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatg 4231328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 74 - 233
Target Start/End: Original strand, 42626177 - 42626339
Alignment:
Q  74 agacccctcaata-atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 172  Q
    |||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42626177 agactcctcaatagatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccacttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 42626276  T
Q  173 ccgctg-tgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    || ||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42626277 ccactgttgagcaactagtgctccaggacatgggtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 42626339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 87 - 229
Target Start/End: Original strand, 21962996 - 21963141
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 185  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  21962996 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 21963095  T
Q  186 ttagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgc 229  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21963096 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgc 21963141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Original strand, 17146249 - 17146397
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  17146249 atgcaaatatgcatgtggtaccaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 17146347  T
Q  186 ttagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
     |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  17146348 ctagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatg 17146397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 93 - 229
Target Start/End: Original strand, 20570738 - 20570877
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaa-caattagtg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||     
T  20570738 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctctccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttaagcaactagta 20570837  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgc 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  20570838 ctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgc 20570877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Original strand, 20292671 - 20292820
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgc-tgtgaacaa 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||    
T  20292671 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggatcgaagccctcaccgcttttgagcaa 20292770  T
Q  186 ttagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
     |||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  20292771 ctagtactccaggacatgagtcatctccgctgttttatgcatatgcaatg 20292820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Original strand, 6740515 - 6740658
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  6740515 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 6740614  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  6740615 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 6740658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18026870 - 18026727
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  18026870 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 18026771  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  18026770 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 18026727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28556620 - 28556477
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  28556620 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 28556521  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28556520 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 28556477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 93 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 3652817 - 3652709
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  3652817 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 3652718  T
Q  192 ctccaggac 200  Q
    |||||||||    
T  3652717 ctccaggac 3652709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20277370 - 20277227
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  20277370 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 20277271  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20277270 ctccaggaccaaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 20277227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 38908171 - 38908029
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  38908171 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 38908072  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  38908071 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 38908029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Original strand, 39094319 - 39094461
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  39094319 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 39094418  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  39094419 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 39094461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Original strand, 37682084 - 37682227
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  37682084 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 37682183  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  37682184 tccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatg 37682227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Original strand, 18418121 - 18418264
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||     
T  18418121 atatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgttgttgagcaactagta 18418220  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  18418221 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 18418264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 200
Target Start/End: Original strand, 37675391 - 37675498
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  37675391 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 37675490  T
Q  193 tccaggac 200  Q
    ||||||||    
T  37675491 tccaggac 37675498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 74 - 179
Target Start/End: Original strand, 9269910 - 9270016
Alignment:
Q  74 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 172  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9269910 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagaaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggactgaagccctca 9270009  T
Q  173 ccgctgt 179  Q
    |||||||    
T  9270010 ccgctgt 9270016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22185721 - 22185579
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  22185721 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 22185622  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  22185621 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 22185579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 74 - 171
Target Start/End: Original strand, 24850077 - 24850175
Alignment:
Q  74 agacccctcaata-atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctc 171  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24850077 agactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctc 24850175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 93 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 36212129 - 36212043
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36212129 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccttcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 36212043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 95 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31535416 - 31535275
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgct 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||    
T  31535416 atgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtact 31535317  T
Q  194 ccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  31535316 ccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 31535275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 95 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31564133 - 31563992
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgct 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||    
T  31564133 atgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtact 31564034  T
Q  194 ccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  31564033 ccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 31563992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 95 - 233
Target Start/End: Original strand, 48427852 - 48427993
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgct 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||    
T  48427852 atgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtact 48427951  T
Q  194 ccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  48427952 ccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 48427993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 39189798 - 39189656
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  39189798 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggtcctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 39189699  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  39189698 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 39189656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 93 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20396995 - 20396911
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 177  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20396995 atatgcatgtggtaccaaacagggccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcgttcatcaggaccgaagccctcaccgct 20396911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 74 - 177
Target Start/End: Original strand, 52990692 - 52990796
Alignment:
Q  74 agacccctcaata-atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 172  Q
    |||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52990692 agactcctcaatagatgcaattatgcatgtggtaccagacaggaccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 52990791  T
Q  173 ccgct 177  Q
    |||||    
T  52990792 ccgct 52990796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 129 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20077033 - 20076926
Alignment:
Q  129 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  20077033 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcatcgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctctgctgttttatgcat 20076934  T
Q  226 atgcaatg 233  Q
    ||||||||    
T  20076933 atgcaatg 20076926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20396932 - 20396865
Alignment:
Q  112 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20396932 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 20396865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15316718 - 15316561
Alignment:
Q  61 gacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa----acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||| ||  ||||||||||||||    ||||| | | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  15316718 gacaacaccactaagactcctcgacaatgcacat--gcatgtggtaccaattttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcat 15316621  T
Q  156 caggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||| |  |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  15316620 cagggcataagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctcccgct 15316561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24109212 - 24109078
Alignment:
Q  86 aatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtga 181  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||    
T  24109212 aatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctttga 24109113  T
Q  182 acaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||  | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  24109112 acaacgaggtgttccaggacataagtcctcccgct 24109078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 215
Target Start/End: Original strand, 24079542 - 24079676
Alignment:
Q  86 aatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtga 181  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||    
T  24079542 aatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctttga 24079641  T
Q  182 acaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||  | ||| |||||||||| |||| |||||||    
T  24079642 acaacaaggtgttccaggacataagtcttcccgct 24079676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 68 - 215
Target Start/End: Original strand, 19853005 - 19853155
Alignment:
Q  68 ccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat-caggacc 162  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| |     
T  19853005 ccactaagacccctcaacaatgcacat--gcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcattcagggca 19853102  T
Q  163 gaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
     ||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19853103 taagccctcagcgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctcccgct 19853155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 68 - 215
Target Start/End: Original strand, 19859140 - 19859290
Alignment:
Q  68 ccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat-caggacc 162  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| |     
T  19859140 ccactaagacccctcaacaatgcacat--gcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcattcagggca 19859237  T
Q  163 gaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
     ||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19859238 taagccctcagcgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctcccgct 19859290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23195662 - 23195560
Alignment:
Q  86 aatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaa 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||    
T  23195662 aatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctttgaa 23195563  T
Q  183 caa 185  Q
    |||    
T  23195562 caa 23195560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 211
Target Start/End: Original strand, 20848955 - 20849145
Alignment:
Q  29 ttacaaccaacaacaa-gactcatgcatg-acatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagc 123  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||   ||  ||||||||| ||||||| |||| | ||||||   ||||||||||||||||   ||||| | |||||    
T  20848955 ttacaaccaacaacaatgactcatgcaactactggacaacaccgctaagactcctcgacaatgcaacaatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagc 20849054  T
Q  124 cctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatt--agtgctccaggacatgagtcctcc 211  Q
    ||||||||  | |||||| |||||| ||||||||| | |  |||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  20849055 cctcaccggatattgaattgttaaaacattcatcaaggcataagccctcaccgctttgaacaattaaagtgttccaggacatgagtcctcc 20849145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21410857 - 21410731
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatt--a 188  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||  |    
T  21410857 atgcatgtggtaccaatttacaggtcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaa 21410758  T
Q  189 gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| || || |||||||||||||||||    
T  21410757 gtgttctagtacatgagtcctcccgct 21410731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Original strand, 21664128 - 21664284
Alignment:
Q  62 acaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatca 157  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||| |||  |||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  21664128 acaactccactaagactcctcaacaatgcacata--catgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatca 21664225  T
Q  158 ggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    || || |||||||||| ||| |||||||  | ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21664226 gggcctaagccctcactgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtccttccgct 21664284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11141138 - 11141058
Alignment:
Q  135 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11141138 ttgaatggttaaagcattcatcaaagcataagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctcccgct 11141058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19666938 - 19666787
Alignment:
Q  68 ccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat-caggacc 162  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  19666938 ccactaagacccctcaacaatgcacat--gcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcattcagggcc 19666841  T
Q  163 gaagccctcaccgctgtgaacaattag-tgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
     |||||||||||||| |||||||  || || | |||||||||||||||||||||    
T  19666840 taagccctcaccgctttgaacaacaaggtgtttcaggacatgagtcctcccgct 19666787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20852295 - 20852183
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | ||||    
T  20852295 aagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaat 20852196  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  20852195 ggttaaagcattc 20852183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20858921 - 20858809
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | ||||    
T  20858921 aagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaat 20858822  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  20858821 ggttaaagcattc 20858809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 21705169 - 21705281
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | ||||    
T  21705169 aagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaat 21705268  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  21705269 ggttaaagcattc 21705281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 138
Target Start/End: Original strand, 20299349 - 20299400
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttga 138  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299349 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttga 20299400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19664348 - 19664220
Alignment:
Q  54 atgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagca 150  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  19664348 atgacatgacaacacctctaagactcctcaacaaatgcagctatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcactgctatcgaatggttaaagca 19664249  T
Q  151 ttc--atcaggaccgaagccctcaccgct 177  Q
    |||  ||||||||  ||| ||||||||||    
T  19664248 ttcttatcaggacataagtcctcaccgct 19664220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21987205 - 21987020
Alignment:
Q  36 caacaacaa-gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca---aacaggaccgaagccctcac 129  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||   ||||||||||||||||    ||||| | |||||| ||||    
T  21987205 caacaacaacgactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccattttacagggcagaagccttcac 21987106  T
Q  130 cgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||  | |||||||  | ||| |||||| |||||| |||||||||    
T  21987105 cgaatttgaatggttaaagcattca-cagggcataagccctcaccaatttgaacaacaaggtgttccagggcatgagccctcccgct 21987020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 93 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10813697 - 10813614
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 174  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10813697 atatgcatgtggtaccatattcaggaccgaagtcctcaccggagtttgaatggttaaagcattca-caggaccgaagccctcacc 10813614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 215
Target Start/End: Original strand, 11157038 - 11157131
Alignment:
Q  124 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattca-tcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaa-ttagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| |||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11157038 cctcaccgctattgaatggttaaagcattcattcaggacataagtcctcaacgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 11157131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 233
Target Start/End: Original strand, 21698132 - 21698275
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaat-tag 189  Q
    |||||||||||| |||   ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||  | ||||||||  ||    
T  21698132 atgcatgtggtatcaatttacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatcatggcataagccctcaccaatttgaacaataaag 21698231  T
Q  190 tgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    || |||||| |||||| ||||||||| | ||||| |||||||||    
T  21698232 tgttccagggcatgagccctcccgctttatatgcttatgcaatg 21698275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 16371484 - 16371596
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | ||||    
T  16371484 aagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaaccatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaat 16371583  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  16371584 ggttaaagcattc 16371596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3706939 - 3706877
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3706939 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 3706877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22448440 - 22448334
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat---caggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattag 189  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||  ||| ||||||| || ||| ||| |||    
T  22448440 atgcatgtggtaccataatcagggccgtagccctcaccgctgttgaatggttaaagcattcatttacaggacataagtcctcaccactttgagcaactag 22448341  T
Q  190 tgctcca 196  Q
    |||||||    
T  22448340 tgctcca 22448334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 30491649 - 30491493
Alignment:
Q  61 gacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatca 157  Q
    ||||||||| ||||||| |||| | |||||| ||  ||||||||||||||   ||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||    
T  30491649 gacaacaccgctaagactcctcgacaatgcacat--gcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcactgagtttgaatggttaaagtattcatca 30491552  T
Q  158 ggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    || |  |||||||||||  | |||||||  | ||| |||||| |||||| |||||||||    
T  30491551 gggcataagccctcaccaatttgaacaacaaggtgttccagggcatgagccctcccgct 30491493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 233
Target Start/End: Original strand, 20299374 - 20299454
Alignment:
Q  156 caggaccgaagccctcaccgc-tgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  20299374 caggaccgaagccctcaccgcttttgagcaactagtactccaggacatgagtcatctccgctgttttatgcatatgcaatg 20299454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 955219 - 955157
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  955219 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccactgtagaatggttaaagcattcat 955157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 22030849 - 22030782
Alignment:
Q  119 gaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaa 185  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  22030849 gaagccctcaccgaattttgaatggtcaaagcattcatcagggcctaagccctcaccactttgaacaa 22030782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Original strand, 23630954 - 23631078
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcacc-gcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-g 189  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| |||||||  | |    
T  23630954 atgcatgtggtaccaatttacagg-cagaagccctcaccagatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcactgctttgaacaacaagg 23631052  T
Q  190 tgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    || |||||| |||||| |||||||||    
T  23631053 tgttccagggcatgagccctcccgct 23631078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 31927556 - 31927473
Alignment:
Q  133 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  | |||||||  | ||| || ||||||||||||||||||||    
T  31927556 ttttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccaatttgaacaacaaggtgttctaggacatgagtcctcccgct 31927473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16669500 - 16669390
Alignment:
Q  45 gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgg 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |   || ||||||    
T  16669500 gactcatgcaagacatgacaactctactaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccataacagagccgaagctctcatcttattagaatgg 16669401  T
Q  143 ttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||    
T  16669400 ttaaagcattc 16669390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20942034 - 20941947
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattca--tcaggaccgaagccctcaccgct 177  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||    
T  20942034 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctatttgaatggttaaagcattcatttcaggacataagtcctcaccgct 20941947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20824530 - 20824467
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctttt-gaatggttaaagcattcat 155  Q
    |||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  20824530 atgcatgtggtaccaaattcaggaccagagccctcaccgctattagaatggttaaagcattcat 20824467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23066878 - 23066816
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  23066878 atgcatgtggtaccaaaatcaggatcgtagccctctccgctgtagaatggttaaagcattcat 23066816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 185
Target Start/End: Original strand, 29534939 - 29535033
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattca-tcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaa 185  Q
    ||||||||||||||| |  ||||  || |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||| |||||||    
T  29534939 atgcatgtggtaccatattcagggtcggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattcaggacataagtcctcaccgctttgaacaa 29535033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 20108793 - 20108727
Alignment:
Q  20 atatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatg-acatgacaacaccactaagacccctcaa 84  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20108793 atatggcaatttcaaccaacaacaacgactcatgcaactacatgacaacaccactaagactcctcaa 20108727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 177
Target Start/End: Original strand, 21542034 - 21542142
Alignment:
Q  74 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagcc 168  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| |    
T  21542034 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 21542133  T
Q  169 ctcaccgct 177  Q
    |||||||||    
T  21542134 ctcaccgct 21542142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Original strand, 21541957 - 21542025
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaaca-agactcatgc--atgacatgacaacaccactaagac 77  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  21541957 catcgtcaatatggcaactacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 21542025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 23195748 - 23195684
Alignment:
Q  16 atcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgca--tgacatgacaacaccactaagac 77  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  23195748 atcaatatgtcatttacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 23195684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 42096089 - 42095994
Alignment:
Q  86 aatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagccctcaccgct 177  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  42096089 aatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 42095994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 42096179 - 42096111
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgca--tgacatgacaacaccactaagac 77  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  42096179 catcgtcaatatggcaactacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 42096111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20838349 - 20838286
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  20838349 atgcatgtggtaccaaattcagggccggagccctcaccgctattagaatggttaaagtattcat 20838286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 29554623 - 29554560
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  29554623 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcactgctaattgaatggttaaagcattcat 29554560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 74374 - 74155
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaat-aatgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||    
T  74374 catcatcattataacaattaccaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaattaatgcaattatgcatgtggtatca 74275  T
Q  110 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  74274 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcct 74175  T
Q  210 cccgctgtttatgcatatgc 229  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  74174 cccgctgtttatgcatatgc 74155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 185
Target Start/End: Original strand, 120787 - 120881
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaa 185  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||    
T  120787 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaaatttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccactttgaacaa 120881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 185
Target Start/End: Original strand, 131664 - 131758
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaa 185  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||    
T  131664 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaaatttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccactttgaacaa 131758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 3)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Original strand, 7629 - 7852
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa 110  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  7629 catcattaatatggcaactacaaccaacaaccaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaattatgcaattatgcatgtggtaccaa 7728  T
Q  111 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7729 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccaaagccctcaccgatgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 7828  T
Q  211 -ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  7829 tccgctgtttatgcatatgcaatg 7852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 133
Target Start/End: Original strand, 12820 - 12942
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa 110  Q
    |||||| |||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |  |||||||||||||||||    
T  12820 catcattaatatggcaactacaacaaacaaccaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatggaattatgcatgtggtaccaa 12919  T
Q  111 acaggaccgaagccctcaccgct 133  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12920 acaggaccgaagccctcaccgct 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 233
Target Start/End: Original strand, 12921 - 12999
Alignment:
Q  156 caggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12921 caggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 12999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Original strand, 539 - 763
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaata-atgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||  ||||||||||||||||    
T  539 catcatcaatgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacatcactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacca 638  T
Q  110 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  639 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctctgaacaactagtgctccaggacatgagtcct 738  T
Q  210 c-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  739 ctccgctgtttatgcatatgcaatg 763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 6)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 43 - 233
Target Start/End: Original strand, 8 - 200
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8 aagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 107  T
Q  141 ggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108 ggttaaaacattcatcaggaccgaaaccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatg 200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 30344 - 30236
Alignment:
Q  74 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagcc 168  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| |    
T  30344 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 30245  T
Q  169 ctcaccgct 177  Q
    |||||||||    
T  30244 ctcaccgct 30236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 35745 - 35637
Alignment:
Q  74 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagcc 168  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| |    
T  35745 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 35646  T
Q  169 ctcaccgct 177  Q
    |||||||||    
T  35645 ctcaccgct 35637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 30421 - 30353
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgca--tgacatgacaacaccactaagac 77  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  30421 catcgtcaatatggcaactacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 30353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 35822 - 35754
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgca--tgacatgacaacaccactaagac 77  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  35822 catcgtcaatatggcaactacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 35754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 51854 - 51791
Alignment:
Q  117 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattca---tcaggaccgaagccctcaccgct 177  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||    
T  51854 ccgaggccctcaccgctatagaatggttaaagcattcattttcaggacataagccctcaccgct 51791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Original strand, 1931 - 2153
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa 110  Q
    |||||||||||| ||||  ||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  1931 catcatcaatataacaaccacagccaacaataaagactcatgcatgacatgacgacaccactacgactcctcaata-tgcaattatgcatgtggtaccaa 2029  T
Q  111 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2030 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgattaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 2129  T
Q  211 -ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  2130 tccgctgtttatgcatatgcaatg 2153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 32 - 228
Target Start/End: Original strand, 41168 - 41364
Alignment:
Q  32 caaccaacaacaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41168 caaccaacaacaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccg 41267  T
Q  132 cttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  41268 cttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagccctcaccgaagtgaacaacaaatgctccaggacatgagtactcccactgtttatgcatatg 41364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 101906 - 101683
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa 110  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||   ||||||| |||||||||    
T  101906 catcattaatatgtcaactacaaccagcgaccaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcgactatgcatctggtaccaa 101807  T
Q  111 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  101806 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcactgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc 101707  T
Q  211 -ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  101706 tccgctgtttatgcatatgcaatg 101683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 97570 - 97464
Alignment:
Q  45 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca---aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||   ||||||||||||||||    ||||| | ||||||||| |||  ||||||    
T  97570 gactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccattttacagggcagaagccctccccgaatttgaa 97471  T
Q  140 tggttaa 146  Q
    |||||||    
T  97470 tggttaa 97464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 32 - 229
Target Start/End: Original strand, 246955 - 247154
Alignment:
Q  32 caaccaacaaca-agactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcac 129  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  246955 caaccaacaagagagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataatgcaattatgcatgtggtacgaaaacaggatcgaagccctcac 247054  T
Q  130 cgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  247055 cgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgc 247154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 32 - 229
Target Start/End: Original strand, 253469 - 253668
Alignment:
Q  32 caaccaacaaca-agactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcac 129  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  253469 caaccaacaagagagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataatgcaattatgcatgtggtacgaaaacaggatcgaagccctcac 253568  T
Q  130 cgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  253569 cgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgc 253668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 32 - 233
Target Start/End: Original strand, 178938 - 179142
Alignment:
Q  32 caaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctca 128  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  178938 caaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaatcatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctca 179037  T
Q  129 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  179038 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctgtgaacaacaagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatg 179137  T
Q  229 caatg 233  Q
    |||||    
T  179138 caatg 179142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 512702 - 512554
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 185  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  512702 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 512603  T
Q  186 ttagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
     |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  512602 ctagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 512554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 494187 - 494075
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||| |||  |||||||||| | | ||||    
T  494187 aagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccggggccctcaccgttatagaat 494088  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  494087 ggttaaagcattc 494075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 84
Target Start/End: Original strand, 524565 - 524631
Alignment:
Q  20 atatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaa 84  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  524565 atatggcaatttcaaccaacaacaacgactcatgaaatgacatgacgacaccactaagactcctcaa 524631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 65547 - 65323
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaata-atgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    ||||||| || || ||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||  ||| ||||||||||||    
T  65547 catcatccatgtggcaactacaatcaacaactaagactcattcatgacatgacaataccactaagactcctcaaaatatgcaattattcatgtggtacca 65448  T
Q  110 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  65447 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgtttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgttgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcct 65348  T
Q  210 c-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  65347 ctccgctgtttatgcatatgcaatg 65323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Original strand, 24563 - 24786
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa 110  Q
    |||||||||| ||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||  |||   || ||||||||||||||     
T  24563 catcatcaatgtggaaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacataaccacaccactaagactcctcaactatgtgaatgtgcatgtggtaccag 24662  T
Q  111 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  24663 acaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagtattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctc 24762  T
Q  211 -ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  24763 tccgctgtttatgcatatgcaatg 24786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 107 - 233
Target Start/End: Original strand, 30845 - 30971
Alignment:
Q  107 ccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30845 ccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagt 30944  T
Q  207 cctcccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  30945 cctcccgctgtttatgcatatgcaatg 30971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Original strand, 15004 - 15242
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaa-caagactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacc------------cctcaata-atgcagatat 96  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||             |||||||| ||||| ||||    
T  15004 catcatcaatataacaactacaaccaacaatcaagactcatgcaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaatagatgcaaatat 15103  T
Q  97 gcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgctcc 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  15104 gcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctcc 15203  T
Q  196 aggacatgagtcct-cccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15204 aggaaatgagtcctccccgctgtttatgcatatgcaatg 15242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 143877 - 144028
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtacca 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  143877 catcatcaatatggcaattacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca 143976  T
Q  110 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggac 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  143977 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggac 144028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 177 - 233
Target Start/End: Original strand, 137159 - 137215
Alignment:
Q  177 tgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  137159 tgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatg 137215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 74 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1200 - 1038
Alignment:
Q  74 agacccctcaata-atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 172  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1200 agactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 1101  T
Q  173 ccgctg-tgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtt-tatgcatatgcaat 232  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1100 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttctatgcatatgcaat 1038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0214
Description:

Target: scaffold0214; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 74 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15380 - 15218
Alignment:
Q  74 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 172  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15380 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtactaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaggattcatcaggaccgaagccctca 15281  T
Q  173 ccgctg-tgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||| |||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15280 ccgctgttgagtaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 15218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 74 - 233
Target Start/End: Original strand, 19586 - 19748
Alignment:
Q  74 agacccctcaata-atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 172  Q
    |||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19586 agactcctcaatagatgcaattatgcatgtggtaccagacaggaccgaagcccttaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 19685  T
Q  173 ccgctg-tgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19686 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttattcatatgcaatg 19748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 74 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23999 - 23837
Alignment:
Q  74 agacccctcaata-atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 172  Q
    |||| |||||||| |||||  |||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23999 agactcctcaatagatgcaattatgcatgtggtaccttataggaccgaagcccttaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaatccctca 23900  T
Q  173 ccgctg-tgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23899 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttattcatatgcaatg 23837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4799 - 4658
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaa-caattagtgc 192  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  4799 tatgcatgtggtaccagacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagaaccgaagccctcaccgctgttaagcaactagtgc 4700  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4699 tccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 4658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 31761 - 31627
Alignment:
Q  86 aatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtga 181  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||    
T  31761 aatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccaaagcactcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctttga 31662  T
Q  182 acaattag-tgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||  || || |||||||||| ||||||||||||    
T  31661 acaacaagatgttccaggacataagtcctcccgct 31627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0320 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0320
Description:

Target: scaffold0320; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 74 - 233
Target Start/End: Original strand, 870 - 1033
Alignment:
Q  74 agacccctcaata-atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 172  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  870 agactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagataggaccgaagccctcaccacttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 969  T
Q  173 ccgctg-tgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  970 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatg 1033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 5)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 112 - 233
Target Start/End: Original strand, 19231 - 19353
Alignment:
Q  112 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc- 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  19231 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgttccaggacatgagtcctct 19330  T
Q  211 ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    | |||||||||||||||| ||||    
T  19331 ctgctgtttatgcatatgaaatg 19353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 177
Target Start/End: Original strand, 19085 - 19252
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgcatgac-atgacaacaccactaagacccctcaata-atgcagatatgcatgtggtacc 108  Q
    |||||||||| || ||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| | |||||  |||||||||||||||    
T  19085 catcatcaatgtggcatctacaaccaacaactaagactcatgcatgaccatgacaacaccactaa-actcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtacc 19183  T
Q  109 aaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 177  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19184 agacaggacggaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 19252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 233
Target Start/End: Original strand, 15177 - 15255
Alignment:
Q  156 caggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  15177 caggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgttccaagacatgagtcctctctgctgtttacgcatatgcaatg 15255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 133
Target Start/End: Original strand, 15075 - 15198
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgcatgac-atgacaacaccactaagacccctcaata-atgcagatatgcatgtggtacc 108  Q
    |||||||||| || ||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||| || | |||||  ||||||||||||||     
T  15075 catcatcaatgtggcatctacaaccaacaactaagactcatgcatgaccatgacaacaccactga-actcctaaaaatatgcaattatgcatgtggtact 15173  T
Q  109 aaacaggaccgaagccctcaccgct 133  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  15174 agacaggaccgaagccctcaccgct 15198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 26956 - 26865
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaa 182  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  26956 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaa 26865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0279 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0279
Description:

Target: scaffold0279; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 87 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5890 - 5745
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 185  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||    
T  5890 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagggccgaagccctcaccgctgttgagcaa 5791  T
Q  186 ttagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgc 229  Q
     |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  5790 ctagtactccaggacatgagtcctcaccgctgttttatgcatatgc 5745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Original strand, 25033 - 25181
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct-gtgaacaa 185  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  25033 atgcaaatatgcatgtggtaacaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctattgagcaa 25131  T
Q  186 ttagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  25132 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgtaatg 25181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18581 - 18438
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  18581 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 18482  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  18481 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 18438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Original strand, 31632 - 31781
Alignment:
Q  87 atgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaa 185  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  31632 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgattaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 31731  T
Q  186 ttagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgttt-atgcatatgcaatg 233  Q
     |||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  31732 ctagtactccaggacaaaagacctcaccgctgtttaatgcatatgcaatg 31781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18685 - 18542
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  18685 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 18586  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  18585 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 18542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 177
Target Start/End: Original strand, 1830 - 1981
Alignment:
Q  33 aaccaacaacaa-gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctc 127  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||  ||||||| |||||| || ||||  |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  1830 aaccaacgacaacgactcatgcaatgacatgacgacacttctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc 1929  T
Q  128 accgctt-ttgaatggttaaagcattca-tcaggaccgaagccctcaccgct 177  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||    
T  1930 accgctaattgaatggttaaagcattcattcaggacataagtcctcaccgct 1981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 215
Target Start/End: Original strand, 1984 - 2066
Alignment:
Q  135 ttgaatggttaaagcattcat-caggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||| |||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1984 ttgaatggttaaagcattcattcaggacataagtcctcaccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 2066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12388 - 12246
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  12388 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 12289  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12288 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 12246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Original strand, 104286 - 104428
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  104286 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 104385  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  104386 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 104428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 200
Target Start/End: Original strand, 13405 - 13512
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    
T  13405 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 13504  T
Q  193 tccaggac 200  Q
    ||||||||    
T  13505 tccaggac 13512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 93 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 16186 - 16100
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16186 atatgcatgtggtaccaaacaggaccaaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 16100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Original strand, 50000 - 50142
Alignment:
Q  94 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tgaacaattagtgc 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||| |    
T  50000 tatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgatgttgagcaactagtac 50099  T
Q  193 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 233  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  50100 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatg 50142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 4388 - 4178
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtacc 108  Q
    |||||||||||||  || | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||  |||||||||||||||    
T  4388 catcatcaatatggaaaatgcaaccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtacc 4289  T
Q  109 aaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagt-gctccaggacatga 204  Q
    | |  |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||  | | | ||||||||||||    
T  4288 atattcagggccgaagccctcacctctaattgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctttgaacaacaatttgttccaggacatga 4189  T
Q  205 gtcctcccgct 215  Q
    |||||||||||    
T  4188 gtcctcccgct 4178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Original strand, 1208 - 1410
Alignment:
Q  19 aatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---aca 113  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    ||||||||||||||||   |||    
T  1208 aatatggcaatt-caaccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacaacacctctaagactcctcaacaatgcgacgatgcatgtggtaccaatttaca 1306  T
Q  114 ggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcc 211  Q
     | | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||  | ||| |||||||||||||||||||    
T  1307 aggcagaagccctcaccgtatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctcc 1406  T
Q  212 cgct 215  Q
    ||||    
T  1407 cgct 1410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1251 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1251
Description:

Target: scaffold1251; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 77
Target Start/End: Original strand, 2236 - 2302
Alignment:
Q  11 acatcatcaatatgacaattacaaccaacaacaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagac 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2236 acatcatcaatatgacaattacaaccaacaacaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagac 2302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Original strand, 8442 - 8598
Alignment:
Q  61 gacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcacc-gcttttgaatggttaaagcattcatc 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||| ||  ||||||||||||||   ||||| | | |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  8442 gacaacaccactaagactcctcgacaatgcacat--gcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccagatattgaatggttaaagcattcatc 8539  T
Q  157 aggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| |  |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8540 agggcataagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctcccgct 8598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 215
Target Start/End: Original strand, 26082 - 26215
Alignment:
Q  86 aatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaa 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||    
T  26082 aatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcattagggcataagccctcaccgctttgaa 26181  T
Q  183 caatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||  | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  26182 caacaaggtgttccaggacatgagtcctcccgct 26215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 215
Target Start/End: Original strand, 27464 - 27597
Alignment:
Q  86 aatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaa 182  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||    
T  27464 aatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcattagggcataagccctcaccgctttgaa 27563  T
Q  183 caa-ttagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  27564 caacaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 27597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3509 - 3353
Alignment:
Q  61 gacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatc 156  Q
    |||||| |||||||||| |||| | |||||| ||  ||||||||||| ||   ||||| | | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3509 gacaactccactaagactcctctacaatgcacat--gcatgtggtactaatttacagggcagtagccctcaccggattttgaatggttaaagcattcatc 3412  T
Q  157 aggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| || |||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  3411 agggcctaagccctcaccgctttgaacaataagggttccaggacatgagtcctcccgct 3353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 4)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Original strand, 9192 - 9348
Alignment:
Q  61 gacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatc 156  Q
    |||||| |||||||||| |||| | |||||| || |  ||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  9192 gacaactccactaagactcctctacaatgcacatgt--atgtggtaccaattcacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatc 9289  T
Q  157 aggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| || |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  9290 agggcctaagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctcccgct 9348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Original strand, 44862 - 45018
Alignment:
Q  61 gacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatc 156  Q
    |||||| |||||||||| |||| | |||||| || |  ||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  44862 gacaactccactaagactcctctacaatgcacatgt--atgtggtaccaattcacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatc 44959  T
Q  157 aggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| || |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  44960 agggcctaagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctcccgct 45018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 37047 - 36908
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacc--aaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||  || |||| ||    ||| ||||||| | |||    
T  37047 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggccatgacccacaccgctgtcgaa 36948  T
Q  140 tggttaaagcattc--atcaggaccgaagccctcaccgct 177  Q
    ||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||||    
T  36947 tggttaaagcattcttatcaggacataagtcctcaccgct 36908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 44261 - 44134
Alignment:
Q  32 caaccaacaacaa-gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 126  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||| | || ||||  ||| |||||||||||| |  |||| ||  ||||||    
T  44261 caaccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacagcacctctaagactcctcgacaaatgcaactatccatgtggtaccatattcagggccagagccct 44162  T
Q  127 caccgctttt-gaatggttaaagcattc 153  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||    
T  44161 caccgctaatcgaatggttaaagcattc 44134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 48001 - 47877
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagt 190  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||    
T  48001 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaataagt 47902  T
Q  191 gctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    | || ||||||||||||||||||||    
T  47901 gttctaggacatgagtcctcccgct 47877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Original strand, 41931 - 41993
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  41931 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 41993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Original strand, 8204 - 8360
Alignment:
Q  61 gacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatc 156  Q
    |||||| |||||||||| |||| | |||||| || |  ||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  8204 gacaactccactaagactcctctacaatgcacatgt--atgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatc 8301  T
Q  157 aggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| || |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  8302 agggcctaagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgactcctcccgct 8360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Original strand, 18288 - 18444
Alignment:
Q  61 gacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatc 156  Q
    |||||| |||||||||| |||| | |||||| || |  ||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  18288 gacaactccactaagactcctctacaatgcacatgt--atgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatc 18385  T
Q  157 aggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| || |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18386 agggcctaagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgactcctcccgct 18444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Original strand, 9205 - 9361
Alignment:
Q  61 gacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatc 156  Q
    |||||| |||||||||| |||| | |||||| || |  ||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  9205 gacaactccactaagactcctctacaatgcacatgt--atgtggtaccaattcacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatc 9302  T
Q  157 aggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| || |||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9303 agggcctaagccctcaccgctttgaacaataagtgttccagaacatgagtcctcccgct 9361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17640 - 17484
Alignment:
Q  61 gacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatc 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||| ||  ||||||||||||||   ||||| | |  ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  17640 gacaacaccactaagactcctcgacaatgcacat--gcatgtggtaccaatttacagggcagtggccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatc 17543  T
Q  157 aggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| |  |||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17542 agggcataagccctcactgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctcccgct 17484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 211 - 1
Alignment:
Q  11 acatcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtac 107  Q
    ||||||||| | || ||| | ||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||| || || ||||  ||||||||||||||    
T  211 acatcatcactttggcaaatgcaaccaacaacaacgactcatgcaattacaggacaacaccaataagactcctgaacaaatgcaactatgcatgtggtac 112  T
Q  108 caaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatg 203  Q
    || |  |||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||| |||||||  | ||| |||||||||||    
T  111 catattcagggccgaagccctcaccgctaattgaacggttaaagcattcatcgagacataagtcctcaccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatg 12  T
Q  204 agtcctcccgc 214  Q
    |||||||||||    
T  11 agtcctcccgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 129924 - 129747
Alignment:
Q  45 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttga 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||   |||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||    
T  129924 gactcatgcaatgacatgacaacacctctaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattga 129825  T
Q  139 atggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaa-ttagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| | |||||||   |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  129824 atggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgttttgaacaacaaagtgttccagggcatgagtcctcccgct 129747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 153
Target Start/End: Original strand, 115670 - 115796
Alignment:
Q  32 caaccaacaacaa-gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 126  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| | || ||||  |||||||||||||||| |   ||| ||| ||||||    
T  115670 caaccaacaacaaagactcatgcaatgacatgacaacacctctaagactcctcgacaattgcaactatgcatgtggtaccatatttagggccggagccct 115769  T
Q  127 caccgcttttgaatggttaaagcattc 153  Q
    |||| || | |||||||||||||||||    
T  115770 caccactatcgaatggttaaagcattc 115796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Original strand, 321062 - 321125
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  321062 atgcatgtggtaccataatcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 321125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 95 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 5187 - 5067
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagt 190  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||    
T  5187 atgcatgtggtaccaatttacagggccgtagccctcaccggatattgaatggttaaatcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaataagt 5088  T
Q  191 gctccaggacatgagtcctcc 211  Q
    | |||| ||||||||||||||    
T  5087 gttccacgacatgagtcctcc 5067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 174
Target Start/End: Original strand, 10946 - 10987
Alignment:
Q  133 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  10946 ttttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 10987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1726 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1726
Description:

Target: scaffold1726; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 215
Target Start/End: Original strand, 215 - 349
Alignment:
Q  86 aatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtga 181  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  || | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||    
T  215 aatgcaaatatgcatgtggtaccataatcaaggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctttga 314  T
Q  182 acaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||  | ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  315 acaacaaggtgttccaggacataagtcctaccgct 349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 8)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 215
Target Start/End: Original strand, 75156 - 75255
Alignment:
Q  119 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatt--agtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  75156 gaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 75255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 215
Target Start/End: Original strand, 146981 - 147131
Alignment:
Q  68 ccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccg 163  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||| ||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  146981 ccactaagactcctcaacaatgcacat--gcatgtgataccaatatacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcct 147078  T
Q  164 aagccctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||||||||||||| |||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  147079 aagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctcccgct 147131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 215
Target Start/End: Original strand, 251858 - 252008
Alignment:
Q  68 ccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatc-aggacc 162  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||  ||| |     
T  251858 ccactaagacccctcaacaatgcacat--gcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatttagggca 251955  T
Q  163 gaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
     |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  251956 taagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacacgagtcctcccgct 252008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 56947 - 56821
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatt--a 188  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||  |    
T  56947 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaa 56848  T
Q  189 gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||||    
T  56847 gtgttccaggaattgagtcctcccgct 56821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 150 - 215
Target Start/End: Original strand, 154186 - 154252
Alignment:
Q  150 attcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  154186 attcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctcccgct 154252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 174760 - 174652
Alignment:
Q  74 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagcc 168  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| |    
T  174760 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 174661  T
Q  169 ctcaccgct 177  Q
    |||||||||    
T  174660 ctcaccgct 174652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 174837 - 174769
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgca--tgacatgacaacaccactaagac 77  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  174837 catcgtcaatatggcaactacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 174769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 197618 - 197555
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  197618 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 197555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Original strand, 6092 - 6250
Alignment:
Q  61 gacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa--acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatca 157  Q
    ||||||||| ||||||| |||| | ||||||   ||||||||||||||||  ||||| | ||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  6092 gacaacaccgctaagactcctcgacaatgcaataatgcatgtggtaccaattacagggcagaaaccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatca 6191  T
Q  158 ggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    || |  |||||||||||||| |||||||  | ||| | |||||||||||||||||||||    
T  6192 gggcataagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttacaggacatgagtcctcccgct 6250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 211
Target Start/End: Original strand, 18473 - 18626
Alignment:
Q  61 gacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcacc-gcttttgaatggttaaagcattcatc 156  Q
    |||||| |||||||||| |||| | |||||| ||  ||||||||||||||   ||||| | |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  18473 gacaactccactaagactcctcgacaatgcacat--gcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccagatattgaatggttaaagcattcatc 18570  T
Q  157 aggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcc 211  Q
    ||| |  |||||||||||||| |||||||  | ||| |||||||||||||||||||    
T  18571 agggcataagccctcaccgctttgaacaacgaggtgttccaggacatgagtcctcc 18626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 215
Target Start/End: Original strand, 3141 - 3330
Alignment:
Q  29 ttacaaccaacaacaagactcatgcatg-acatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagcc 124  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||   ||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| ||  ||||||||||||||   ||||| | | ||||    
T  3141 ttacaaccaataacacgactcatgcaactactcgacaacaccactaagactcctcgacaatgcacat--gcatgtggtaccaatttacagggcagtagcc 3238  T
Q  125 ctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||||||  | |||||||||||| || ||||||||| |  |||||||||||| | |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  3239 ctcaccggatattgaatggttaaggcgttcatcagggcataagccctcaccgatttgaacaataagtgttccaggatatgagtcctcccgct 3330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 15029 - 14915
Alignment:
Q  41 acaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttga 138  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| | | ||    
T  15029 acaagactcatgcatgacatgacgactcctctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccgaagccctcaccgttataga 14930  T
Q  139 atggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||||    
T  14929 atggttaaagcattc 14915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 8038 - 7899
Alignment:
Q  45 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaa 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||  ||||||| |||||||| |  | || ||| ||||||||| |||  |||||    
T  8038 gactcatgcaatgacatgacaacacctctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatatggtaccatattctgggccggagccctcactgctaattgaa 7939  T
Q  140 tggttaaagcattca--tcaggaccgaagccctcaccgct 177  Q
    |||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||    
T  7938 tggttaaagcattcatttcaggacataagtcctcaccgct 7899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 7042 - 6983
Alignment:
Q  27 aattacaaccaacaacaa-gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaa 84  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7042 aatttcaaccaacatcaacgactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaa 6983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1535 - 1409
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatt--a 188  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  | |||||||||  |    
T  1535 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccaatttgaacaattaaa 1436  T
Q  189 gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  1435 gtgttccaagacatgagtcctcccgct 1409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 191 - 65
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatt--a 188  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||  |    
T  191 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaa 92  T
Q  189 gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  91 gtgttccagaacatgagacctcccgct 65  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 6)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 28099 - 27973
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatt--a 188  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||  |    
T  28099 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccactttgaacaattaaa 28000  T
Q  189 gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  27999 gtgttccatgacatgagtcctcccgct 27973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 38936 - 38810
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatt--a 188  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||  |    
T  38936 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccactttgaacaattaaa 38837  T
Q  189 gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  38836 gtgttccatgacatgagtcctcccgct 38810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 110140 - 110252
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | ||||    
T  110140 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaat 110239  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  110240 ggttaaagcattc 110252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 185
Target Start/End: Original strand, 142605 - 142723
Alignment:
Q  69 cactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaa 165  Q
    ||||||||| |||||| |||||   ||||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |  ||    
T  142605 cactaagactcctcaacaatgcgactatgcatgtggtaccattatacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcat-agggcataa 142703  T
Q  166 gccctcaccgctgtgaacaa 185  Q
    |||||||||  |||||||||    
T  142704 gccctcaccaatgtgaacaa 142723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 63370 - 63308
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  63370 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 63308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 124649 - 124588
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattc 153  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  124649 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgcttatcgaatggttaaagcattc 124588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 215
Target Start/End: Original strand, 481 - 672
Alignment:
Q  27 aattacaaccaacaacaagactcatgcatg-acatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaa---caggaccgaag 122  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||   ||  |||||| |||||||||| | || | |||||| ||  |||||||||||||||   |||| | | ||    
T  481 aattacaaccaataacacgactcatgcaactactcgacaaccccactaagactcatcgacaatgcacat--gcatgtggtaccaaattacagggcagtag 578  T
Q  123 ccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||||||||  | ||||||||||||| || |||||||| |  ||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  579 ccctcaccggatattgaatggttaaatcaatcatcagggcataagccctcatcgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctcccgct 672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 103183 - 103045
Alignment:
Q  19 aatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--ca 113  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||  |||||||||||||||| |  ||    
T  103183 aatataacaatt-caaccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacaacacctctaagactcctcgataattgcaactatgcatgtggtaccatattca 103085  T
Q  114 ggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 153  Q
    || ||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  103084 gggccggagccctcacttctttcgaatggttaaagcattc 103045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5308 - 5182
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta- 188  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| |||||||  |     
T  5308 atatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccactaattgaatggttaaagcattcatcaggacataagtactcaccgctttgaacaacaag 5209  T
Q  189 gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  5208 gtgttccaggacataagtcctcccgct 5182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 5406 - 5338
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaaca-agactcatgc--atgacatgacaacaccactaagac 77  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  5406 catcatcaatatggcaattacatccaacaacaccgactcatgcaaatgacataacaacaccactaagac 5338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Original strand, 2868 - 2993
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-g 189  Q
    ||||||||||||||||   | ||||| | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||  | |    
T  2868 atgcatgtggtaccaatttataggacagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccttcaccgctttgaacaacaagg 2967  T
Q  190 tgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  2968 tgttccaggacatgagtcctcccgct 2993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Original strand, 64965 - 65090
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-g 189  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||  | |    
T  64965 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaatg 65064  T
Q  190 tgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    || ||||||||| |||||||||||||    
T  65065 tgttccaggacacgagtcctcccgct 65090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 215
Target Start/End: Original strand, 999 - 1080
Alignment:
Q  135 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaa-ttagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  999 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacagagtgttccaggacatgagtcctcccgct 1080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 47178 - 47070
Alignment:
Q  74 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagcc 168  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| |    
T  47178 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 47079  T
Q  169 ctcaccgct 177  Q
    |||||||||    
T  47078 ctcaccgct 47070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 52583 - 52475
Alignment:
Q  74 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagcc 168  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| |    
T  52583 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 52484  T
Q  169 ctcaccgct 177  Q
    |||||||||    
T  52483 ctcaccgct 52475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 215
Target Start/End: Original strand, 76648 - 76840
Alignment:
Q  31 acaaccaacaacaa-gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccc 125  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||| ||||||| |||| | ||| |    ||||||||||||||||   ||| | | |||||||    
T  76648 acaaccaacaacaatgactcatgcaattactcgacaacaccgctaagactcctcgacaatacgacaatgcatgtggtaccaatttacaaggcagaagccc 76747  T
Q  126 tcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatt--agtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  76748 tcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagagcataagccctcaccgctttgaacaattaaagtgttccaggacatgagtcctctcgct 76840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1517 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1517
Description:

Target: scaffold1517; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 63 - 1
Alignment:
Q  16 atcaatatgacaattacaaccaacaac-aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagac 77  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  63 atcaatatggcaattacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagac 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 215
Target Start/End: Original strand, 2252 - 2375
Alignment:
Q  98 catgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatt--agtg 191  Q
    |||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||  ||||    
T  2252 catgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatattgaatggttaaggcattcatcagggcctaagccctcaccaatttgaacaattaaagtg 2351  T
Q  192 ctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  2352 ttccaggacatgagtcctcccgct 2375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 176 - 233
Target Start/End: Original strand, 9835 - 9893
Alignment:
Q  176 ctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatg 233  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9835 ctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatg 9893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 215
Target Start/End: Original strand, 25518 - 25707
Alignment:
Q  29 ttacaaccaacaacaagactcatgcatg-acatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagcc 124  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||   ||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| ||  ||||||||||||||   ||||| | | ||||    
T  25518 ttacaaccaataacacgactcatgcaactactcgacaacaccactaagactcctcgacaatgcacat--gcatgtggtaccaatttacagggcagtagcc 25615  T
Q  125 ctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||| |  |||||||||    
T  25616 ctcaccgaatattgaatggttaaagcattcatcacggcataagccctcaccgctttgaaccataagtgttccaggacataaaccctcccgct 25707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Original strand, 29801 - 29927
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatt--a 188  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||  |    
T  29801 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcaggttataagccctcaccgctttgaacaattaaa 29900  T
Q  189 gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
     || | |||||||||||||||||||||    
T  29901 atgtttcaggacatgagtcctcccgct 29927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Original strand, 44580 - 44706
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta- 188  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | ||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||| |||||||  |     
T  44580 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcgccactattttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtccacaccgctttgaacaacaag 44679  T
Q  189 gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  44680 gtgttccagaacatgagtcctcccgct 44706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Original strand, 38421 - 38547
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctttt--gaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta- 188  Q
    ||||||||||||||||   ||||  | |||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||| |||||||  |     
T  38421 atgcatgtggtaccaatttacagagcagaagccctcaccactatttcgaatggttaaagcattcatcaagacataagtcctcaccgctttgaacaacaag 38520  T
Q  189 gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||    
T  38521 gtgttctaggacatgagtcctcccgct 38547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18392 - 18230
Alignment:
Q  57 acatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatt 152  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || |||   |||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18392 acatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcatt 18293  T
Q  153 catcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    || |||| |  |||||||||||  | |||||||  | ||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  18292 ca-cagggcataagccctcaccaatttgaacaacaaggtgttccaggacaagagccctcccgct 18230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Original strand, 258674 - 258736
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  258674 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccttcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 258736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Original strand, 265100 - 265162
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  265100 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccttcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 265162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 3079 - 2967
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | ||||    
T  3079 aagactcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaat 2980  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  2979 ggttaaagcattc 2967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 215
Target Start/End: Original strand, 28634 - 28733
Alignment:
Q  119 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatt--agtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||| |   ||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28634 gaagccctcaccggatattgaatagttaaagcattcatcagggcatgagccctcaccgctttgaacaattaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 28733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Original strand, 36180 - 36306
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatt--a 188  Q
    |||||||||||| |||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |   ||||||||||||| |||||||||  |    
T  36180 atgcatgtggtaacaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcaaggcatgagccctcaccgctttgaacaattaaa 36279  T
Q  189 gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| |  |||||||||||| |||||||    
T  36280 gtgttttaggacatgagtcatcccgct 36306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 177
Target Start/End: Original strand, 38379 - 38487
Alignment:
Q  74 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagcc 168  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| |    
T  38379 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtc 38478  T
Q  169 ctcaccgct 177  Q
    |||||||||    
T  38479 ctcaccgct 38487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Original strand, 38302 - 38370
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaaca-agactcatgc--atgacatgacaacaccactaagac 77  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  38302 catcgtcaatatggcaactacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 38370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 215
Target Start/End: Original strand, 27942 - 28119
Alignment:
Q  45 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttga 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||    
T  27942 gactcatgcaatgacatgacaacacctctaagactcctcaacaaatgcgacaatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattga 28041  T
Q  139 atggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaa-ttagtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |  |||||||||||||| ||| |  |||||||| ||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28042 actgttaaagcattcattagggcataagccctcgccgctttgaacaactaagtgttccaggacatgagtccttccgct 28119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 5184 - 5122
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5184 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 5122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 215
Target Start/End: Original strand, 9372 - 9454
Alignment:
Q  135 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatt--agtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||| ||||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  9372 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaaaaattaaagtgttctaggacatgagtcctcccgct 9454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 215
Target Start/End: Original strand, 51079 - 51256
Alignment:
Q  45 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttga 138  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||| |||||| || |||   |||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||    
T  51079 gactcatgcaatgatatgacgacacctctaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattga 51178  T
Q  139 atggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||  || |||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  51179 atggttaaagcattcatcagggcataagccctcacttctttgaataacaaggtgttccaggacatgagtcctcccgct 51256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 56124 - 56003
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaat-tag 189  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  | ||||||||  ||    
T  56124 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcgccgaattttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccaatttgaacaatgaag 56025  T
Q  190 tgctccaggacatgagtcctcc 211  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  56024 tgttccaggacatgagtcctcc 56003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 207964 - 207839
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaat-tag 189  Q
    ||||||||||||||||   | ||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  | ||||||||  ||    
T  207964 atgcatgtggtaccaatttatagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccaatttgaacaataaag 207865  T
Q  190 tgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    || | |||||||||||||||||||||    
T  207864 tgtttcaggacatgagtcctcccgct 207839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 4)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 571 - 446
Alignment:
Q  93 atatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaa-ttag 189  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||  |  |||| ||||||||| |||||||   ||    
T  571 atatgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccactgtagaatgattaaagcattcatcagagcataagctctcaccgctttgaacaacaaag 472  T
Q  190 tgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  471 tgttccaggacatgagtcctcccgct 446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 204
Target Start/End: Original strand, 16376 - 16521
Alignment:
Q  61 gacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatc 156  Q
    |||||| |||||||||| |||| | |||||| ||  ||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  16376 gacaactccactaagactcctcgacaatgcacat--gcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatc 16473  T
Q  157 aggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctccaggacatga 204  Q
    ||| |  ||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  16474 agggcataagccttcatcgctttgaacaataagtgttccaggacatga 16521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 119 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5566 - 5468
Alignment:
Q  119 gaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  | |||||||  | ||| |||||| |||||| |||||||||    
T  5566 gaagccctcaccgagttttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccaatttgaacaacaaggtgttccagggcatgagccctcccgct 5468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 159
Target Start/End: Original strand, 8474 - 8574
Alignment:
Q  61 gacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatc 156  Q
    |||||| |||||||||| |||| | |||||| ||  ||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  8474 gacaactccactaagactcctcgacaatgcacat--gcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatc 8571  T
Q  157 agg 159  Q
    |||    
T  8572 agg 8574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Original strand, 19762 - 19919
Alignment:
Q  61 gacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatc 156  Q
    ||||||||| ||||||| |||| | |||||| ||  ||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  19762 gacaacaccgctaagactcctcgacaatgcacat--gcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatc 19859  T
Q  157 aggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| |  |||||||||| ||| |||||||  | ||| |||||| |||||| |||||||||    
T  19860 agggcataagccctcacggctttgaacaacaaggtgttccagggcatgagccctcccgct 19919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 62 - 177
Target Start/End: Original strand, 6908 - 7025
Alignment:
Q  62 acaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattca-tca 157  Q
    ||||| |||||||||| |||| | |||||| ||  |||||||||||||    |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  6908 acaactccactaagactcctctacaatgcacat--gcatgtggtaccatgttcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattca 7005  T
Q  158 ggaccgaagccctcaccgct 177  Q
    ||||  ||| ||||||||||    
T  7006 ggacataagtcctcaccgct 7025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0720 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0720
Description:

Target: scaffold0720; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 4398 - 4286
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||| |||  |||||||||| | | ||||    
T  4398 aagactcatgcaggacatgacgactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccgttgccctcaccgttatagaat 4299  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  4298 ggttaaagcattc 4286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0661 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0661
Description:

Target: scaffold0661; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 4244 - 4145
Alignment:
Q  119 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatt--agtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  | |||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  4244 gaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccaatttgaacaattaaagtgttccaggacctgagtcctcccgct 4145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 366 - 254
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||| |||| |||||  | |||||||||| || | | ||||    
T  366 aagactcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtgggaccataacagagctgaagccctcatcgttatagaat 267  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  266 ggttaaagcattc 254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 80663 - 80551
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||| || ||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |  | | ||||    
T  80663 aagactcatgcaggacatgacaactctactaagactcctcaacaattgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatctttatagaat 80564  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  80563 ggttaaagcattc 80551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1584 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold1584
Description:

Target: scaffold1584; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 153
Target Start/End: Original strand, 311 - 381
Alignment:
Q  86 aatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  311 aatgcagatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattc 381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1584; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 69
Target Start/End: Original strand, 220 - 280
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaaca-agactcatgc--atgacatgacaacacc 69  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||| |||||||    
T  220 catcatcaatatggcaattacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgtcaacacc 280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1290 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1290
Description:

Target: scaffold1290; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1447 - 1322
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaat-tag 189  Q
    ||||||||||||||||   | ||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||  | ||||||||  ||    
T  1447 atgcatgtggtaccaatttatagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatcagggcataaaccctcaccaatttgaacaataaag 1348  T
Q  190 tgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    || ||||||||||||| |||||||||    
T  1347 tgttccaggacatgagacctcccgct 1322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Original strand, 3658 - 3720
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3658 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 3720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19631 - 19454
Alignment:
Q  45 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttga 138  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||| || |||   |||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||    
T  19631 gactcatgcaatgacatgacatcacctctaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattga 19532  T
Q  139 atggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  ||||| | |||||| |||||||  | ||| || |||||||||||| |||||||    
T  19531 atggttaaagcattcattagggcttaagcctttaccgctttgaacaacaatgtgttctaggacatgagtcttcccgct 19454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16275 - 16137
Alignment:
Q  45 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaa 139  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||  ||||||| |||||| || ||||  |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||    
T  16275 gactcatgcactgacatgacgacacttctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaa 16176  T
Q  140 tggttaaagcattca-tcaggaccgaagccctcaccgct 177  Q
    |||||||| |||||| |||||||  ||| ||||||||||    
T  16175 tggttaaaacattcattcaggacataagtcctcaccgct 16137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 124 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16146 - 16056
Alignment:
Q  124 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattca-tcaggaccgaagccctcaccgctgtgaac-aattagtgctccaggacatgagtcctccc 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||  ||| |||||||||| ||||| |   |||| ||||||||||||||||||||    
T  16146 cctcaccgctattgaatggttaaagaattcattcaggacataagtcctcaccgctttgaacgacaaagtgttccaggacatgagtcctccc 16056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Original strand, 141326 - 141388
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  141326 atgcatgtggtaccataatcaggaccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 141388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Original strand, 146566 - 146629
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  146566 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagtcctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 146629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 212
Target Start/End: Original strand, 443 - 521
Alignment:
Q  135 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctccc 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| |||||||  | ||| ||||||||||||||||||||    
T  443 ttgaatggttaaagcattcaccagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctccc 521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 84
Target Start/End: Original strand, 5839 - 5913
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaacaa-gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaa 84  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5839 catcaacaatatggcaatttcaaccaacaacgacgactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaa 5913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 43116 - 43012
Alignment:
Q  54 atgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca---aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagc 149  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||   ||||||||||||||||    ||||| | ||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  43116 atgacatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccattttacagggcagaagccctcacctaatttgaatggttaaagc 43017  T
Q  150 attca 154  Q
    |||||    
T  43016 attca 43012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 155
Target Start/End: Original strand, 110 - 238
Alignment:
Q  33 aaccaacaacaa-gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctc 127  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||  ||||||| |||||| || ||||  |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  110 aaccaacgacaacgactcatgcaatgacatgacgacacttctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc 209  T
Q  128 accgctt-ttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  210 accactaattgaatggttaaagcattcat 238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10839 - 10713
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa--acaggaccgaagccctcaccgc--ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatt--a 188  Q
    ||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||    |||||||||  |    
T  10839 atgcatgtggtaccaattacagggcagaagccctcaccgaatttttgaatggttaaaacattcatcagggcataagccctcaccaaattgaacaattaaa 10740  T
Q  189 gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||||    
T  10739 gtgttccaggacatgaatccttccgct 10713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19019 - 18892
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc--ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatt-- 187  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||    |||||||||      
T  19019 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatttttgaatggttaaaacattcatcagggcataagccctcaccaaattgaacaattaa 18920  T
Q  188 agtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||    
T  18919 agtgttccaggacatgaatccttccgct 18892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 41835 - 41732
Alignment:
Q  54 atgacatgacaacaccactaagacccctc-aataatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagca 150  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||  |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  41835 atgacatgacaacacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc-ccgctaatgaatggttaaagca 41737  T
Q  151 ttcat 155  Q
    |||||    
T  41736 ttcat 41732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0693 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0693
Description:

Target: scaffold0693; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 153
Target Start/End: Original strand, 1972 - 2099
Alignment:
Q  32 caaccaacaacaa-gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctc-aataatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 126  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||| |  ||||||  |||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||    
T  1972 caaccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacagcacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccct 2071  T
Q  127 caccgct-tttgaatggttaaagcattc 153  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||    
T  2072 caccgctaatcgaatggttaaagcattc 2099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 1324 - 1197
Alignment:
Q  32 caaccaacaacaa-gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 126  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||| | || ||||  |||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||    
T  1324 caaccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacagcacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccct 1225  T
Q  127 caccgctttt-gaatggttaaagcattc 153  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||    
T  1224 caccgctaatcgaatggttaaagcattc 1197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 8260 - 8133
Alignment:
Q  32 caaccaacaacaa-gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 126  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||| | || ||||  |||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||    
T  8260 caaccaacaacaacgactcatgcaatgacatgacagcacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccct 8161  T
Q  127 caccgctttt-gaatggttaaagcattc 153  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||    
T  8160 caccgctaatcgaatggttaaagcattc 8133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0535 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0535
Description:

Target: scaffold0535; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 6208 - 6146
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  6208 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 6146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14673 - 14611
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14673 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 14611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 27309 - 27362
Alignment:
Q  164 aagccctcaccgctgtgaacaatta--gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27309 aagccctcaccgctttgaacaattaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 27362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 119 - 215
Target Start/End: Original strand, 45527 - 45625
Alignment:
Q  119 gaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  | |||||||  | ||| |||||| |||||| |||||||||    
T  45527 gaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccaatttgaacaacaaggtgttccagggcatgagccctcccgct 45625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17157 - 17054
Alignment:
Q  54 atgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagca 150  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||| | || ||||  |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  17157 atgacttgacaacacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc-ccgctaatgaatggttaaagca 17059  T
Q  151 ttcat 155  Q
    |||||    
T  17058 ttcat 17054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 11796 - 11713
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 174  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  11796 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 11713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 52914 - 52846
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaaca-agactcatgc--atgacatgacaacaccactaagac 77  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||    
T  52914 catcatcaatatggcaattacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgtcaacaccgctaagac 52846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 52823 - 52753
Alignment:
Q  86 aatgcagatatgcatgtggtacc--aaacaggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 153  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  52823 aatgctgatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattc 52753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 51148 - 51088
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 153  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  51148 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattc 51088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 10)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 10383 - 10315
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaaca-agactcatgca--tgacatgacaacaccactaagac 77  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  10383 catcatcatcatggcaattacaaccaacaacacagactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagac 10315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 10301 - 10223
Alignment:
Q  79 cctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 153  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  10301 cctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattc 10223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 35825 - 35742
Alignment:
Q  124 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattc-atcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaa-ttagtgctccaggacatgag 205  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||| |||||||   |||| |||||||||||||    
T  35825 cctcaccgctattgaatggttaaagcattcgttcaggacgtaagtcctcaccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgag 35742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 153
Target Start/End: Original strand, 72229 - 72288
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 153  Q
    ||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  72229 atgcatgtggtaccatatcaaggccgaagccctcaccgctatagaatggttaaagcattc 72288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 620 - 566
Alignment:
Q  124 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattca-tcaggaccgaagccctcaccgct 177  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||    
T  620 cctcaccgctattgaatggttaaagcattcattcaggacataagtcctcaccgct 566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 6779 - 6725
Alignment:
Q  124 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattca-tcaggaccgaagccctcaccgct 177  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||    
T  6779 cctcaccgctattgaatggttaaagcattcattcaggacataagtcctcaccgct 6725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 35941 - 35816
Alignment:
Q  57 acatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcatt 152  Q
    ||||||| ||||  ||||||| |||||| || ||||  |||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  35941 acatgacgacacttctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagagccgaagccctcaccgctaattgaaaggttaaagcatt 35842  T
Q  153 ca-tcaggaccgaagccctcaccgct 177  Q
    || |||||||  ||| ||||||||||    
T  35841 cattcaggacataagtcctcaccgct 35816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 47103 - 47041
Alignment:
Q  124 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattc-atcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaa 185  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||| |||||||    
T  47103 cctcaccgctattgaatggttaaagcattcgttcaggacgtaagtcctcaccgctttgaacaa 47041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 62 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 728 - 611
Alignment:
Q  62 acaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtacc--aaacaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattca-tca 157  Q
    ||||| |||||||||| |||| | |||||| ||  |||| |||||||  || |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  728 acaactccactaagactcctctacaatgcacat--gcatatggtaccgtaatcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattca 631  T
Q  158 ggaccgaagccctcaccgct 177  Q
    ||||  ||| ||||||||||    
T  630 ggacataagtcctcaccgct 611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 62 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 6887 - 6770
Alignment:
Q  62 acaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtacc--aaacaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattca-tca 157  Q
    ||||| |||||||||| |||| | |||||| ||  |||| |||||||  || |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  6887 acaactccactaagactcctctacaatgcacat--gcatatggtaccgtaatcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattca 6790  T
Q  158 ggaccgaagccctcaccgct 177  Q
    ||||  ||| ||||||||||    
T  6789 ggacataagtcctcaccgct 6770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1904 - 1841
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1904 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 1841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15641 - 15579
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  15641 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaagcattcat 15579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Original strand, 27861 - 27924
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27861 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 27924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22889 - 22767
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaat-tag 189  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||  | ||||||||  ||    
T  22889 atgcatgtggtaccaatttacagggcaaaagccctcaccgagttttgaatggttaaagcattcatcagggcataagtcctcaccaatttgaacaataaag 22790  T
Q  190 tgctccaggacatgagtcctccc 212  Q
    || |||||| |||||| ||||||    
T  22789 tgttccagggcatgagccctccc 22767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 121 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27057 - 26964
Alignment:
Q  121 agccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaat-tagtgctccaggacatgagtcctccc 212  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||  | ||||||||  |||| |||||| |||||| ||||||    
T  27057 agccctcaccgagttttgaatggttaaagcattcatcagggcataagtcctcaccaatttgaacaataaagtgttccagggcatgagccctccc 26964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 92363 - 92251
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||  ||||||| |||| || | | ||||    
T  92363 aagactcatgcaagacatgacaactcttctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccatatcagagccgaagctctcatcgttatagaat 92264  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  92263 ggttaaagcattc 92251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 98089 - 97977
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |  ||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||  ||||||| |||| || | | ||||    
T  98089 aagactcatgcaagacatgacaactcttctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccatatcagagccgaagctctcatcgttatagaat 97990  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  97989 ggttaaagcattc 97977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1615 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1615
Description:

Target: scaffold1615; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 629 - 532
Alignment:
Q  60 tgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    |||||||||| ||||||||||||   || ||||  |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  629 tgacaacacctctaagacccctcggcaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc-ccgctaatgaatggttaaagcattcat 532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Original strand, 10341 - 10403
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  10341 atgcatgtggtaccataatcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 10403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 215
Target Start/End: Original strand, 6679 - 6762
Alignment:
Q  134 tttgaatggttaaagcattcat-caggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||| |||||||  | ||| || ||||||||||||||||||||    
T  6679 tttgaaaggttaaagcattcattcaggacataagtcctcaccgctttgaacaacaaagtgttctaggacatgagtcctcccgct 6762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Original strand, 6593 - 6656
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6593 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 6656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 177
Target Start/End: Original strand, 2525 - 2652
Alignment:
Q  54 atgacatgacaacaccactaagacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagca 150  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||| |||| ||||  |||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  2525 atgacatgacacc-ccactaagactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagca 2623  T
Q  151 t--tcatcaggaccgaagccctcaccgct 177  Q
    |  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  2624 ttctcatcaggacctaagtcctcaccgct 2652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 185
Target Start/End: Original strand, 5590 - 5652
Alignment:
Q  124 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattc-atcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaa 185  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||| |||||||    
T  5590 cctcaccgctattgaatggttaaagcattcgttcaggacataagtcctcaccgctttgaacaa 5652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Original strand, 5513 - 5576
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  5513 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaattgttaaagcattcat 5576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 4895 - 4841
Alignment:
Q  121 agccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 174  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  4895 agccctcaccgagttttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 4841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 153
Target Start/End: Original strand, 9990 - 10063
Alignment:
Q  83 aataatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 153  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  9990 aataatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagtcctcaccgctaatcgaatggttaaagcattc 10063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 1090 - 1022
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcagg 159  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  1090 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagg 1022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3909 - 3812
Alignment:
Q  119 gaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaatta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 215  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||  | |||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  3909 gaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattc-tcagggcataagccctcaccaatttgaacaacaaggtgttccaggacatgagccctcccgct 3812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 44325 - 44231
Alignment:
Q  62 acaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||| |||||||||| |||| | |||||| ||  ||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  44325 acaactccactaagactcctctacaatgcacat--gcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 44231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 49391 - 49297
Alignment:
Q  62 acaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 155  Q
    ||||| |||||||||| |||| | |||||| ||  ||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  49391 acaactccactaagactcctctacaatgcacat--gcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 49297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2015 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold2015
Description:

Target: scaffold2015; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 613 - 553
Alignment:
Q  12 catcatcaatatgacaattacaaccaacaaca-agactcatgc--atgacatgacaacacc 69  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||    
T  613 catcatcaatatggcatttacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacacc 553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1853 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1853
Description:

Target: scaffold1853; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 987 - 921
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc--ttttgaatggttaaagcattcatc 156  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  987 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatttttgaatggttaaagcattcatc 921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 158
Target Start/End: Original strand, 9523 - 9590
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcag 158  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  9523 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcttcag 9590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 47589 - 47529
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 153  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  47589 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattc 47529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 56623 - 56563
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 153  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  56623 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattc 56563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 63009 - 62949
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 153  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  63009 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattc 62949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 185
Target Start/End: Original strand, 370396 - 370491
Alignment:
Q  95 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattca--tcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaa 185  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||| || |||||||    
T  370396 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcatttcaggacataagtcctcaccactttgaacaa 370491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1773 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1773
Description:

Target: scaffold1773; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 196
Target Start/End: Original strand, 17 - 88
Alignment:
Q  127 caccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaattagtgctcca 196  Q
    ||||||| | |||||||||||||||  ||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  17 caccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctttgaacaactagtgttcca 88  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1469 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1469
Description:

Target: scaffold1469; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 153
Target Start/End: Original strand, 240 - 352
Alignment:
Q  43 aagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaa-taatgcagatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaat 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||   ||||  ||||||  |||||||||||||||| | |||  ||||||| |||| || | | ||||    
T  240 aagactcatgcaagacatgacaactctactaagacttatcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagctctcatcgttatagaat 339  T
Q  141 ggttaaagcattc 153  Q
    |||||||||||||    
T  340 ggttaaagcattc 352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0790 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0790
Description:

Target: scaffold0790; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 90
Target Start/End: Original strand, 4372 - 4408
Alignment:
Q  54 atgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgc 90  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  4372 atgacatgacaacaccactaagactcctcaacaatgc 4408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 229 - 189
Alignment:
Q  45 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaa 84  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  229 gactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaa 189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 1711 - 1656
Alignment:
Q  16 atcaatatgacaattacaaccaacaaca-agactcatgc--atgacatgacaacac 68  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||    
T  1711 atcaatatgacatttacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacac 1656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0178 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0178
Description:

Target: scaffold0178; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 84
Target Start/End: Original strand, 25447 - 25487
Alignment:
Q  45 gactcatgca-tgacatgacaacaccactaagacccctcaa 84  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25447 gactcatgcaatgacatgacaacaccactaagactcctcaa 25487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 57333 - 57245
Alignment:
Q  124 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattca-tcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaa-ttagtgctccaggacatgagtcctc 210  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||  ||| | |||| ||||| |||||   |||| ||||||||||||||||||    
T  57333 cctcaccactattgaatggttaaagcattcattcaggacataagacatcactgctgtaaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctc 57245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 210
Target Start/End: Original strand, 141300 - 141388
Alignment:
Q  124 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattca-tcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaa-ttagtgctccaggacatgagtcctc 210  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||  ||| | |||| ||||| |||||   |||| ||||||||||||||||||    
T  141300 cctcaccactattgaatggttaaagcattcattcaggacataagacatcactgctgtaaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctc 141388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 2775 times since January 2019
Visitors: 4012