View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0669_low_111 (Length: 214)

Name: NF0669_low_111
Description: NF0669
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0669_low_111
NF0669_low_111
[»] chr7 (15 HSPs)
chr7 (1-214)||(16386048-16386261)
chr7 (1-214)||(26212103-26212316)
chr7 (1-214)||(9509296-9509509)
chr7 (1-214)||(10589146-10589358)
chr7 (5-214)||(12698939-12699148)
chr7 (1-214)||(40443497-40443709)
chr7 (1-183)||(27847634-27847815)
chr7 (1-213)||(38227588-38227801)
chr7 (1-183)||(3564164-3564347)
chr7 (106-213)||(18456319-18456426)
chr7 (1-181)||(15143837-15144019)
chr7 (146-214)||(2530088-2530152)
chr7 (100-214)||(12187120-12187232)
chr7 (100-214)||(17137964-17138076)
chr7 (112-157)||(48273542-48273588)
[»] chr2 (14 HSPs)
chr2 (2-214)||(23654188-23654400)
chr2 (1-214)||(298615-298828)
chr2 (1-214)||(23285968-23286181)
chr2 (1-214)||(22737981-22738194)
chr2 (1-214)||(20309213-20309425)
chr2 (1-183)||(37917-38098)
chr2 (1-213)||(23076550-23076762)
chr2 (4-214)||(22731037-22731248)
chr2 (1-166)||(27753730-27753895)
chr2 (1-183)||(22337253-22337436)
chr2 (5-213)||(23660130-23660339)
chr2 (17-213)||(23060621-23060815)
chr2 (1-92)||(32451730-32451821)
chr2 (100-183)||(40622109-40622190)
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (1-214)||(21026787-21027000)
chr1 (1-214)||(27250530-27250743)
chr1 (1-214)||(22354373-22354586)
chr1 (1-183)||(50210013-50210196)
chr1 (1-209)||(22355974-22356184)
chr1 (1-209)||(22357660-22357870)
chr1 (1-183)||(38801192-38801373)
chr1 (1-214)||(20135294-20135508)
chr1 (1-214)||(22532376-22532590)
chr1 (1-132)||(20847020-20847151)
chr1 (4-185)||(34509916-34510098)
chr1 (100-198)||(48603637-48603735)
chr1 (146-214)||(33797626-33797694)
chr1 (111-214)||(22468608-22468710)
chr1 (136-214)||(21787978-21788056)
chr1 (34-82)||(16758890-16758938)
chr1 (100-183)||(21714685-21714768)
[»] chr4 (23 HSPs)
chr4 (1-214)||(23374160-23374373)
chr4 (1-214)||(12902864-12903077)
chr4 (1-214)||(7088984-7089197)
chr4 (1-198)||(17047873-17048070)
chr4 (1-214)||(44052936-44053149)
chr4 (1-206)||(3096759-3096963)
chr4 (3-183)||(14053105-14053284)
chr4 (4-214)||(22636542-22636751)
chr4 (1-213)||(16239770-16239983)
chr4 (4-213)||(7893811-7894018)
chr4 (4-183)||(16377325-16377506)
chr4 (1-183)||(14038786-14038969)
chr4 (111-211)||(16270147-16270247)
chr4 (1-92)||(6190691-6190782)
chr4 (86-183)||(17046623-17046719)
chr4 (1-124)||(15091093-15091217)
chr4 (146-214)||(43256106-43256174)
chr4 (1-62)||(7798956-7799017)
chr4 (112-157)||(14280466-14280512)
chr4 (144-214)||(15121747-15121816)
chr4 (112-157)||(54798675-54798721)
chr4 (149-213)||(6899998-6900062)
chr4 (137-209)||(7798886-7798958)
[»] chr5 (24 HSPs)
chr5 (1-214)||(22075126-22075339)
chr5 (1-214)||(8286643-8286856)
chr5 (1-183)||(21292771-21292952)
chr5 (4-214)||(23390300-23390510)
chr5 (1-213)||(25421640-25421853)
chr5 (1-183)||(22107174-22107356)
chr5 (1-213)||(13025418-13025631)
chr5 (1-213)||(13095602-13095815)
chr5 (5-213)||(24493676-24493885)
chr5 (1-213)||(25431502-25431715)
chr5 (1-185)||(21985947-21986132)
chr5 (1-185)||(24529356-24529541)
chr5 (1-184)||(9078089-9078273)
chr5 (1-183)||(1096605-1096788)
chr5 (154-214)||(21808343-21808403)
chr5 (154-214)||(21729018-21729078)
chr5 (146-214)||(18356420-18356488)
chr5 (146-214)||(20910745-20910813)
chr5 (106-157)||(22412337-22412388)
chr5 (100-214)||(18769905-18770017)
chr5 (100-209)||(21873359-21873467)
chr5 (100-214)||(22032422-22032534)
chr5 (144-214)||(23572185-23572254)
chr5 (100-183)||(37724039-37724122)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (1-214)||(850-1062)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (1-214)||(167780-167992)
scaffold0011 (1-213)||(52021-52232)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (1-214)||(21918801-21919014)
chr8 (5-198)||(25362945-25363138)
chr8 (1-214)||(20536315-20536528)
chr8 (1-183)||(16199447-16199628)
chr8 (1-183)||(45130799-45130980)
chr8 (1-214)||(31971363-31971575)
chr8 (1-214)||(18879038-18879250)
chr8 (1-213)||(18818210-18818422)
chr8 (1-213)||(21923729-21923941)
chr8 (5-212)||(23648662-23648870)
chr8 (1-213)||(22626843-22627056)
chr8 (8-183)||(28648851-28649027)
chr8 (3-164)||(7372927-7373088)
chr8 (1-206)||(23406496-23406701)
chr8 (1-183)||(22875202-22875386)
chr8 (1-183)||(6759393-6759577)
chr8 (4-181)||(16092144-16092323)
chr8 (100-183)||(21395883-21395965)
chr8 (100-183)||(21790376-21790458)
chr8 (113-183)||(21389366-21389435)
chr8 (118-183)||(21778697-21778761)
chr8 (100-214)||(23776736-23776849)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (1-214)||(4956-5168)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (1-214)||(6717-6930)
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (1-214)||(20360761-20360974)
chr6 (1-209)||(20638084-20638292)
chr6 (3-214)||(16920436-16920646)
chr6 (1-183)||(22831641-22831822)
chr6 (1-183)||(25629155-25629338)
chr6 (1-183)||(29060678-29060861)
chr6 (6-183)||(18409632-18409810)
chr6 (5-213)||(17287601-17287809)
chr6 (1-213)||(22780028-22780240)
chr6 (5-183)||(11185641-11185818)
chr6 (1-92)||(18821620-18821711)
chr6 (5-183)||(19303345-19303524)
chr6 (1-183)||(20593911-20594094)
chr6 (38-183)||(25603223-25603368)
chr6 (154-214)||(16496351-16496411)
chr6 (146-214)||(27415887-27415955)
chr6 (65-183)||(25611588-25611706)
[»] chr3 (22 HSPs)
chr3 (1-214)||(13442381-13442594)
chr3 (4-214)||(12399316-12399523)
chr3 (1-214)||(17487963-17488177)
chr3 (1-198)||(16796670-16796867)
chr3 (1-214)||(20698237-20698449)
chr3 (1-213)||(14576633-14576846)
chr3 (16-214)||(17499445-17499643)
chr3 (1-185)||(18438670-18438855)
chr3 (1-182)||(40213521-40213703)
chr3 (1-213)||(14572696-14572909)
chr3 (1-213)||(23083162-23083374)
chr3 (1-213)||(26686995-26687207)
chr3 (1-213)||(43841040-43841252)
chr3 (1-183)||(25476185-25476368)
chr3 (17-210)||(30029950-30030143)
chr3 (100-198)||(14179555-14179653)
chr3 (1-183)||(11424563-11424746)
chr3 (1-183)||(14972992-14973175)
chr3 (106-213)||(24153115-24153222)
chr3 (34-213)||(42386518-42386698)
chr3 (97-198)||(12339890-12339986)
chr3 (34-74)||(2051033-2051073)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (1-202)||(124704-124905)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (4-198)||(1037-1231)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (1-214)||(2059-2272)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-214)||(13318-13531)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (1-214)||(10227-10439)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (6-214)||(5927-6135)
[»] scaffold0145 (2 HSPs)
scaffold0145 (1-211)||(38870-39081)
scaffold0145 (111-211)||(33051-33151)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (1-183)||(13634-13815)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (4-214)||(1958-2168)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (1-214)||(3577-3790)
scaffold0292 (1-213)||(450-663)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (1-214)||(32172-32384)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (1-183)||(15266-15447)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (5-214)||(21018-21227)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (1-214)||(24102-24316)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (1-214)||(853-1065)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (1-183)||(16418-16599)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (1-213)||(22990-23203)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (1-162)||(3640-3801)
scaffold0165 (1-162)||(7704-7865)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (1-213)||(13200-13412)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (1-183)||(1425-1606)
scaffold0106 (1-183)||(7402-7583)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (4-211)||(26005-26213)
scaffold0026 (1-211)||(39967-40177)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (1-183)||(51718-51899)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (1-213)||(8333-8546)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (1-183)||(74-256)
scaffold0358 (1-183)||(4850-5032)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (1-183)||(40050-40233)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (1-183)||(4932-5113)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (1-183)||(339751-339933)
scaffold0003 (146-214)||(71406-71474)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (1-213)||(8587-8795)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (1-132)||(11314-11445)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (1-183)||(25865-26048)
scaffold0122 (1-183)||(33295-33478)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (1-183)||(17015-17198)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (3-141)||(17790-17928)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (1-129)||(20595-20723)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (36-183)||(2987-3134)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (1-214)||(47100-47306)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (1-183)||(27968-28151)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (1-183)||(4645-4828)
scaffold0228 (1-183)||(12227-12410)
scaffold0228 (1-183)||(22179-22362)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (1-183)||(39614-39797)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-183)||(75015-75198)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (1-92)||(51685-51776)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (10-214)||(4631-4835)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (1-183)||(16400-16583)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (5-213)||(767-976)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-157)||(10327-10484)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (146-214)||(15362-15430)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (95-183)||(3424-3513)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (117-183)||(3103-3169)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (1-77)||(16331-16408)
scaffold0120 (111-184)||(16250-16322)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (100-214)||(26929-27041)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (100-214)||(16250-16363)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (100-214)||(21707-21819)
scaffold0210 (100-214)||(29599-29711)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (144-214)||(12864-12933)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (114-214)||(23581-23680)
scaffold0023 (114-214)||(38394-38493)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (34-83)||(225645-225694)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (100-168)||(23995-24062)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (100-183)||(36593-36676)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 15)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 16386048 - 16386261
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16386048 tcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtccagagttgaacctttgggtaacattaagacttaatga 16386147  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16386148 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattgtttgaatattt 16386247  T
Q  201 aagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  16386248 aagatgttgatgaa 16386261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26212316 - 26212103
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaa-cagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||  || |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26212316 tcgcgagtgacccagaaaacagagtgatttgttag-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatg 26212218  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26212217 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 26212118  T
Q  200 taagatgttgttgaa 214  Q
    |||||||||||||||    
T  26212117 taagatgttgttgaa 26212103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9509509 - 9509296
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||    
T  9509509 tcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcaagagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatga 9509410  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  9509409 ggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatattt 9509310  T
Q  201 aagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  9509309 aagatgttgatgaa 9509296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10589358 - 10589146
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||    
T  10589358 tcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccttttttgcacgagttgtctagagttggacctttgggtaggattaagacttaatga 10589259  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||  | |||||||| |||     
T  10589258 tgaggttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatg-tttatgcattgcttgaagaatatttgaacattg 10589160  T
Q  201 aagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||||||||    
T  10589159 aagatgttgttgaa 10589146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12699148 - 12698939
Alignment:
Q  5 gagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaagag 104  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||| ||||||| ||     
T  12699148 gagtgacccagaaacaaagtgacttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgatagttgaaccttggggtagtattaagagttaatgaggat 12699049  T
Q  105 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaaga 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  12699048 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 12698949  T
Q  205 tgttgttgaa 214  Q
    ||||| ||||    
T  12698948 tgttgatgaa 12698939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 40443709 - 40443497
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||| ||||  |    
T  40443709 tcgcgagtgacccagaaacagagtgacttattggattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagatgaacccttgggtaggattaagacttaacaa 40443610  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  | |||||| |||  |    
T  40443609 tgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttgaagaatatttgtatacct 40443511  T
Q  201 aagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  40443510 aagatgttgatgaa 40443497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 27847634 - 27847815
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||| |    
T  27847634 tcgcgagtgacccaaaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataa 27847733  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  27847734 tgagattaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtgataatg-tttatgcattacttga 27847815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38227801 - 38227588
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagatttt-gcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||    
T  38227801 tcgcgagtgacccataaacagagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatg 38227702  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 199  Q
    | || ||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| | | | ||||| ||||    || |||||||||    
T  38227701 atgatgttaattataatatgtgaagatatttaagatatgttgatgttgattaagatgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatt 38227602  T
Q  200 taagatgttgttga 213  Q
    ||||||||||||||    
T  38227601 taagatgttgttga 38227588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 3564164 - 3564347
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||| |||||  ||| ||| ||||||    
T  3564164 tcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagtttaaccttggggtagtattgagacttaatg 3564263  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||    
T  3564264 atgatgttaattataacctatgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatctaatgttatacgcattacttga 3564347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Original strand, 18456319 - 18456426
Alignment:
Q  106 ttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagat 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    || |||||||||||||||    
T  18456319 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 18456418  T
Q  206 gttgttga 213  Q
    ||||||||    
T  18456419 gttgttga 18456426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 15143837 - 15144019
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||  |||||  | ||||| ||||||    
T  15143837 tcgcgagtgacctagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgctaagagttgaacctcggggtagtactaagacttaatg 15143936  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctg-tttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattactt 181  Q
    | || ||| | |||||||||| |||||| |||||||| | |||   ||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||    
T  15143937 atgatgtttaatataatctgtcaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatatgatgttatacgcattactt 15144019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 214
Target Start/End: Original strand, 2530088 - 2530152
Alignment:
Q  146 tgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2530088 tgattataatgtgatatattgttttatg----acttaagaattatttgaatattcaagatgttgttgaa 2530152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12187232 - 12187120
Alignment:
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 199  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||| | |||| |||||   ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||      
T  12187232 aagaagttaactgcaatctgtgaagctgat-aagagatgtttgagttgaatatgatgtattataatgttt-atgcattacttgaagattaattgtataca 12187135  T
Q  200 taagatgttgttgaa 214  Q
    |||||||||| ||||    
T  12187134 taagatgttgatgaa 12187120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 214
Target Start/End: Original strand, 17137964 - 17138076
Alignment:
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 199  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||| | | || |||||  |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||      
T  17137964 aagaagttaactgcaatctgtgaagctgat-atgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgttt-atgcattacttgaagattaattgtataca 17138061  T
Q  200 taagatgttgttgaa 214  Q
    |||||||||| ||||    
T  17138062 taagatgttgatgaa 17138076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 48273588 - 48273542
Alignment:
Q  112 ataatctgtgaagctgttt-aagatatgttgttgttgattatgatgt 157  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  48273588 ataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgt 48273542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 14)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 23654188 - 23654400
Alignment:
Q  2 cgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23654188 cgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaa 23654287  T
Q  102 gaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattta 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  23654288 gaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatattta 23654387  T
Q  202 agatgttgttgaa 214  Q
    |||||||| ||||    
T  23654388 agatgttgatgaa 23654400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 298615 - 298828
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  298615 tcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatga 298714  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298715 agaggttaactataatatgtgaagctgtataagatgtgttgttattaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 298814  T
Q  201 aagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||||||||    
T  298815 aagatgttgttgaa 298828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23286181 - 23285968
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  23286181 tcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcatgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatga 23286082  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  23286081 agatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatattt 23285982  T
Q  201 aagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  23285981 aagatgttgatgaa 23285968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 22737981 - 22738194
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||  ||||||| |||||||    
T  22737981 tcgcgagtgacctagaaacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaaccttggggtagtattaagacttaatga 22738080  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  22738081 ggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatattt 22738180  T
Q  201 aagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  22738181 aagatgttgatgaa 22738194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20309425 - 20309213
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||  |    
T  20309425 tcgcgagtgacccagaaacaaagtgacttgttagattttgcgacccttgttgcacgatttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaagaa 20309326  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  | |||||| |||  |    
T  20309325 tgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatatttgtatacat 20309227  T
Q  201 aagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  20309226 aagatgttgatgaa 20309213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 37917 - 38098
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |    
T  37917 tcgcgagcgacccagaaacatagtgacttgttagactttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaa 38016  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  38017 tgaggttaattataatctctgaagctgtataagacatgttgttgttgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttga 38098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23076762 - 23076550
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||  |||  ||||| ||||    
T  23076762 tcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggattttatga 23076663  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    || ||||||||||    
T  23076662 tgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatattt 23076563  T
Q  201 aagatgttgttga 213  Q
    ||||| |||||||    
T  23076562 aagatattgttga 23076550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 214
Target Start/End: Original strand, 22731037 - 22731248
Alignment:
Q  4 cgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttggg-taacattaagatttaatgaag 102  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||| ||| ||| || | ||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||| |    
T  22731037 cgagtcacccagaaacagagtgccttgttaggttttgcgatctttgttgcacgagctgttgataattgaaccttgggggtagtattaagacttaatgagg 22731136  T
Q  103 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaa 202  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  22731137 atgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaa 22731236  T
Q  203 gatgttgttgaa 214  Q
     |||||| ||||    
T  22731237 tatgttgatgaa 22731248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 27753895 - 27753730
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| || || |||||||| |||||||    
T  27753895 tcgcaagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgaccttcgttgcacgagttgtcgagagttgaagcttgggatagcattaagacttaatga 27753796  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatg 166  Q
     || ||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27753795 tgatgttaattataatatgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg 27753730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22337436 - 22337253
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagatttt-gcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||  ||||||| ||||||    
T  22337436 tcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgtgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggagtagtattaagacttaatg 22337337  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    | || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  22337336 atgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttga 22337253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23660339 - 23660130
Alignment:
Q  5 gagtgacccagaaacagagtgactttttagatttt-gcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaaga 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| | ||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||| |||||  ||| ||| ||| ||| ||    
T  23660339 gagtgacccagaaacagagtgccttgttaggtttttgtgacctttattgcacgagttattgagagttgaaccttggggtagtattgagacttattgatga 23660240  T
Q  104 ggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaag 203  Q
     ||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||   |  |||||||||||||    
T  23660239 tgttaattataatttgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaag 23660140  T
Q  204 atgttgttga 213  Q
    ||||||||||    
T  23660139 atgttgttga 23660130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23060815 - 23060621
Alignment:
Q  17 aacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaagaggttaactataat 116  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||| || |||||  |||  || ||||||| || ||||| ||||||    
T  23060815 aacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgtt-cacgagttgttgagaattgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat 23060717  T
Q  117 ctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttg-agaattatttgaatatttaagatgttgttga 213  Q
     |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||    
T  23060716 -tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattt-aatatttaagatgttgttga 23060621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 32451730 - 32451821
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaaga 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  32451730 tcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagatgaaccttggggtagcattaaga 32451821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 183
Target Start/End: Original strand, 40622109 - 40622190
Alignment:
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||| | || |||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  40622109 aagaagttaactgcaatctgtgaagctgtt-atgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatg-tttatgcattacttga 40622190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21027000 - 21026787
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21027000 tcgcgagtgacccagaaacaaagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatga 21026901  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21026900 agaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 21026801  T
Q  201 aagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||||||||    
T  21026800 aagatgttgttgaa 21026787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 27250530 - 27250743
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||    
T  27250530 tcgcgagtgacacagaaacagagtcccttgttatattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagcattgatacttaatga 27250629  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  27250630 agaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatattt 27250729  T
Q  201 aagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  27250730 aagatgttgatgaa 27250743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 22354373 - 22354586
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||  ||||||| |||||||    
T  22354373 tcgcaagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaacctttaggtagtattaagacttaatga 22354472  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  | |||||||||||||    
T  22354473 ggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatattt 22354572  T
Q  201 aagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  22354573 aagatgttgatgaa 22354586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 50210013 - 50210196
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||    
T  50210013 tcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattgagacttaatg 50210112  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  50210113 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttga 50210196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 22355974 - 22356184
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgacttt-ttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||    
T  22355974 tcgcgagtgacctagaaacagagtgacattgttagattttgagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatg 22356073  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttg-ttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatat 198  Q
    | || ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  | | |||||||||    
T  22356074 atgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaatat 22356173  T
Q  199 ttaagatgttg 209  Q
    ||| |||||||    
T  22356174 ttatgatgttg 22356184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 22357660 - 22357870
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgacttt-ttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||    
T  22357660 tcgcgagtgacctagaaacagagtgacattgttagattttgagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatg 22357759  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttg-ttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatat 198  Q
    | || ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  | | |||||||||    
T  22357760 atgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaatat 22357859  T
Q  199 ttaagatgttg 209  Q
    ||| |||||||    
T  22357860 ttatgatgttg 22357870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 38801192 - 38801373
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||| |||||||  ||||||| ||||| |    
T  38801192 tcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgtacgagttgtcggaagttgaacccttgggtaggattaagacttaataa 38801291  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  38801292 tgagattaactataatttgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattacgatgtgttataatg-tttatgcattacttga 38801373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20135508 - 20135294
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattt-tgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||  | |||||  |||||    
T  20135508 tcgcgagtaacccagaaacagagtgacttgttaggtttatgcgacctttgttgtacgagttgttgagagttgaaccttagggtagtagtaagacctaatg 20135409  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 199  Q
    | |  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||   ||  ||||||| |    
T  20135408 atgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatgatataatgttgtatgcattacttgaagttttattgaatact 20135309  T
Q  200 taagatgttgttgaa 214  Q
    |||||||||||||||    
T  20135308 taagatgttgttgaa 20135294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22532590 - 22532376
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||  ||||  ||| ||| ||||||    
T  22532590 tcgcgagtgacccaaaaacagagtgacttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatg 22532491  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatt--tgaata 197  Q
    | || ||||  ||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||||   ||||||    
T  22532490 atgatgttatttatgaactgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga--attatgaatgaata 22532393  T
Q  198 tttaagatgttgttgaa 214  Q
    |||||||||||||||||    
T  22532392 tttaagatgttgttgaa 22532376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 20847020 - 20847151
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20847020 tcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatga 20847119  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaa 132  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  20847120 agaggttaaccataatctatgaagctgtttaa 20847151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 34510098 - 34509916
Alignment:
Q  4 cgagtgacccagaaacagagtgactttttagatttt-gcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||  ||| ||| ||||||| |    
T  34510098 cgagtgacccagaaacagagtgtcatgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatg 34509999  T
Q  103 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgaga 185  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  34509998 atgttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgaga 34509916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 48603735 - 48603637
Alignment:
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatat 198  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48603735 aagaagttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatat 48603637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 146 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33797694 - 33797626
Alignment:
Q  146 tgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33797694 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaattatttgaatattcaagatgttgttgaa 33797626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Original strand, 22468608 - 22468710
Alignment:
Q  111 tataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgaga-attatttgaatatttaagatgttg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||  |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  22468608 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgta-attatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgagatatta-ttgaataattaagatgttg 22468705  T
Q  210 ttgaa 214  Q
    |||||    
T  22468706 ttgaa 22468710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 214
Target Start/End: Original strand, 21787978 - 21788056
Alignment:
Q  136 atgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgaga-attatttgaatatttaagatgttgttgaa 214  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||| |||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  21787978 atgttgatgttgattatgatgttatataatgttatgtgcattacttaagatatta-ttgaatgattaagatgttgttgaa 21788056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 16758938 - 16758890
Alignment:
Q  34 gattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggt 82  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16758938 gattttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggggt 16758890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 21714768 - 21714685
Alignment:
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgtttta-tgcattacttga 183  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||| | || |||||  |||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  21714768 aagaagttaactgcaatctgtgaagctgtt-atgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttga 21714685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 23)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 23374160 - 23374373
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||  || |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23374160 tcgcgggtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcaacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatga 23374259  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23374260 agaggttaactataatctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 23374359  T
Q  201 aagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||||||||    
T  23374360 aagatgttgttgaa 23374373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12903077 - 12902864
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  12903077 tcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaatga 12902978  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  12902977 agaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatattt 12902878  T
Q  201 aagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  12902877 aagatgttgatgaa 12902864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7089197 - 7088984
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  7089197 tcgcgagtgacccggaaacagagtgtcttgttagattttgcgacctttgttgcaagagttgtcgagagttgaacctttgagtagcattaagacttaatga 7089098  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |    
T  7089097 agaggttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgttgctaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgt 7088998  T
Q  201 aagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  7088997 aagatgttgatgaa 7088984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 17047873 - 17048070
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  17047873 tcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatga 17047972  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatat 198  Q
    ||||  ||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17047973 agagactaattacaacctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatat 17048070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 44053149 - 44052936
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||    
T  44053149 tcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatga 44053050  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||  | |||||||||||||    
T  44053049 tgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatattt 44052950  T
Q  201 aagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  44052949 aagatgttgatgaa 44052936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 3096963 - 3096759
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || || | |||||||    
T  3096963 tcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggataaatacttaatga 3096864  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
     |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  3096863 tgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgagatacaatg-tttatgcattacttgaagaatatttgaatattt 3096765  T
Q  201 aagatg 206  Q
    | ||||    
T  3096764 atgatg 3096759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 183
Target Start/End: Original strand, 14053105 - 14053284
Alignment:
Q  3 gcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||  | |    
T  14053105 gcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatg 14053204  T
Q  103 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  14053205 aggttaattataatctgtgaagccgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttga 14053284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22636751 - 22636542
Alignment:
Q  4 cgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaaga 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||  ||||||| |||| || ||    
T  22636751 cgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaaccttggggtagtattaagacttaacgagga 22636652  T
Q  104 ggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaag 203  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  22636651 tgttaattataatctgtgaagctg-ttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaag 22636553  T
Q  204 atgttgttgaa 214  Q
    |||||| ||||    
T  22636552 atgttgatgaa 22636542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 16239770 - 16239983
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagatttt-gcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||  ||||||| ||||||    
T  16239770 tcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattaagacttaatg 16239869  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 199  Q
    | || ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||| |    || |||||||||    
T  16239870 atgatgttaattataatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatataatgttatttgcattacttaaagtataattgaatatt 16239969  T
Q  200 taagatgttgttga 213  Q
    ||||||||||||||    
T  16239970 taagatgttgttga 16239983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 7894018 - 7893811
Alignment:
Q  4 cgagtgacccagaaacagagtgactttttagatttt-gcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaag 102  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| || |    
T  7894018 cgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcatgagttgccgagagttgaaccttggggtaatattaagacttaacgatg 7893919  T
Q  103 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaa 202  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||| | |||||| | | ||||||||||||    || ||||||||||||    
T  7893918 atgttaattataatctgtgaagctgtttaagat---gtgttgctgattatgatgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaa 7893822  T
Q  203 gatgttgttga 213  Q
    |||| ||||||    
T  7893821 gatgatgttga 7893811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 183
Target Start/End: Original strand, 16377325 - 16377506
Alignment:
Q  4 cgagtgacccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtc-gagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||  ||| ||| |||||||     
T  16377325 cgagtgacccagaaacatagtgccttgttaggattttgctacctttgttgcacgagttttatgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgat 16377424  T
Q  102 gaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  16377425 gatgttaattataatctgtggagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttga 16377506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14038969 - 14038786
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| || ||| |||  |||||   ||||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||    
T  14038969 tcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatg 14038870  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    | ||  |||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  14038869 atgatattaattataatctgtgaagctgtttaacatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 14038786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 111 - 211
Target Start/End: Original strand, 16270147 - 16270247
Alignment:
Q  111 tataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    || ||||||||||||||||||||    
T  16270147 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 16270246  T
Q  211 t 211  Q
    |    
T  16270247 t 16270247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 6190782 - 6190691
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaaga 92  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  6190782 tcgcgagtgacccaaaaatagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagctgtcgagagttgaaccttggcgtagcattaaga 6190691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 17046719 - 17046623
Alignment:
Q  86 attaagatttaatgaagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    ||||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  17046719 attaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatg-tttatacattacttga 17046623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 15091217 - 15091093
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| || ||| |||  ||||    ||||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||    
T  15091217 tcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagtttctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatg 15091118  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaag 124  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||    
T  15091117 aagatgttaattataatctgtgaag 15091093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 146 - 214
Target Start/End: Original strand, 43256106 - 43256174
Alignment:
Q  146 tgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43256106 tgattataatgtgatataatattatatgcattacttaagaattatttgaatattcaagatgttgttgaa 43256174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 7799017 - 7798956
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgt 62  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  7799017 tcgcgagtgacccagaaacaaagtgtcttgttaggttttgcgacctttgtttcacgagttgt 7798956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 14280512 - 14280466
Alignment:
Q  112 ataatctgtgaagctgttt-aagatatgttgttgttgattatgatgt 157  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  14280512 ataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgt 14280466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 214
Target Start/End: Original strand, 15121747 - 15121816
Alignment:
Q  144 gttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  15121747 gttgattatgatgtattataatg-tttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 15121816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 157
Target Start/End: Original strand, 54798675 - 54798721
Alignment:
Q  112 ataatctgtgaagctgttt-aagatatgttgttgttgattatgatgt 157  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  54798675 ataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgt 54798721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899998
Alignment:
Q  149 ttatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttga 213  Q
    ||||||||| |||||||||| | | ||||||||||    || |||||||||||||||||||||||    
T  6900062 ttatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttga 6899998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798886
Alignment:
Q  137 tgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttg 209  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||| | ||||||||||||    || |||||||||||||||||||    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg 7798886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 151; Significance: 4e-80; HSPs: 24)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22075339 - 22075126
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaa-cagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||  || |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22075339 tcgcgagtgacccagaaaacagagtgacttgttag-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagcattaagacttaatg 22075241  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 199  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22075240 aagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 22075141  T
Q  200 taagatgttgttgaa 214  Q
    |||||||||||||||    
T  22075140 taagatgttgttgaa 22075126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 8286643 - 8286856
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  8286643 tcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcttgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatga 8286742  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
    ||| ||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  | | ||||| |||||    
T  8286743 agatgttaattatattatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattattt 8286842  T
Q  201 aagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  8286843 aagatgttgatgaa 8286856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 21292771 - 21292952
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||  ||||||| ||||| |    
T  21292771 tcgcgagtgacccagaaatagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgggagttggacccttgggtaggattaagacttaataa 21292870  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  21292871 tgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttga 21292952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 214
Target Start/End: Original strand, 23390300 - 23390510
Alignment:
Q  4 cgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaaga 103  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| ||||||| ||    
T  23390300 cgagtgaccctaaaacagagtgccttgttagattttgtgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagtattaagacttaatgagga 23390399  T
Q  104 ggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaag 203  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  23390400 tgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaag 23390499  T
Q  204 atgttgttgaa 214  Q
    |||||| ||||    
T  23390500 atgttgatgaa 23390510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25421853 - 25421640
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||    
T  25421853 tcgcgagtgacctagaaaccgagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatg 25421754  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 199  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    || |||||||||    
T  25421753 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 25421654  T
Q  200 taagatgttgttga 213  Q
    ||||||| ||||||    
T  25421653 taagatgctgttga 25421640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 22107174 - 22107356
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||| | | | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||  ||||||| |||||||    
T  22107174 tcgcgagtgacccggaaatagagtgccttgtgatactttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagatgaacctttgagtagtattaagacttaatga 22107273  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  22107274 agaggttaattataatctgtgaagctgtttaaggtgtgttgttgttgattatgatgtgatataatatattatgcattacttga 22107356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13025631 - 13025418
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagatttt-gcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||    
T  13025631 tcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgatttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatg 13025532  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 199  Q
    | || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| | | ||||| ||||    || |||||||||    
T  13025531 atgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatt 13025432  T
Q  200 taagatgttgttga 213  Q
    ||||||||||||||    
T  13025431 taagatgttgttga 13025418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13095815 - 13095602
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagatttt-gcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||    
T  13095815 tcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatg 13095716  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 199  Q
    | || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| | | ||||| ||||    || |||||||||    
T  13095715 atgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatt 13095616  T
Q  200 taagatgttgttga 213  Q
    ||||||||||||||    
T  13095615 taagatgttgttga 13095602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24493885 - 24493676
Alignment:
Q  5 gagtgacccagaaacagagtgactttttagatttt-gcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaaga 103  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| | ||    
T  24493885 gagtaacccataaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaataatga 24493786  T
Q  104 ggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaag 203  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||    || |||||||||||||    
T  24493785 tgttaattataatctgtgaagctatttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaag 24493686  T
Q  204 atgttgttga 213  Q
    ||||||||||    
T  24493685 atgttgttga 24493676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25431715 - 25431502
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||  |||| |||| ||| ||||||    
T  25431715 tcgcgagtgacccagaaatcgagtgccttgttaggattttgcgacctttgttacacgagttgttgagagttgaaccttgaggtagcattgagacttaatg 25431616  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 199  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    || ||||| |||    
T  25431615 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatt 25431516  T
Q  200 taagatgttgttga 213  Q
    ||||||||||||||    
T  25431515 taagatgttgttga 25431502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 21985947 - 21986132
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagatttt-gcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||  ||| ||| || |||    
T  21985947 tcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattcagacttgatg 21986046  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgaga 185  Q
    | || |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21986047 atgatgttaactataatttgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgaatatgaggtgataaaatgttatatgcattacttgaga 21986132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 24529541 - 24529356
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagatttt-gcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||| |||||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |||||  ||| | | ||||||    
T  24529541 tcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcactagtagttgagagttgaaccttggggtagtattgaaacttaatg 24529442  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgaga 185  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  24529441 atgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgaga 24529356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 9078273 - 9078089
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| || ||| |||  ||||||  || |||||||||| |||||  ||| ||| ||||||    
T  9078273 tcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatg 9078174  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgag 184  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  9078173 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgag 9078089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 1096788 - 1096605
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttaga-ttttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| || ||| |||  ||||||  | ||||| ||||| |||||  ||| ||| ||||||    
T  1096788 tcgcgagtgacccagaaacagaatgcctttttagaattttgcgatctctgtcgcacaagttgttaaaagttggaccttggggtagtattgagacttaatg 1096689  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    | || ||||| ||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  1096688 aggatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttga 1096605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Original strand, 21808343 - 21808403
Alignment:
Q  154 atgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaa 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21808343 atgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaa 21808403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Original strand, 21729018 - 21729078
Alignment:
Q  154 atgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaa 214  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21729018 atgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaa 21729078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 146 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18356488 - 18356420
Alignment:
Q  146 tgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18356488 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaa 18356420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 146 - 214
Target Start/End: Original strand, 20910745 - 20910813
Alignment:
Q  146 tgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20910745 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaattatttgaatgttcaagatgttgttgaa 20910813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22412388 - 22412337
Alignment:
Q  106 ttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgt 157  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22412388 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgt 22412337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 214
Target Start/End: Original strand, 18769905 - 18770017
Alignment:
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 199  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||| | | || |||||  |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||      
T  18769905 aagaagttaactgcaatctgtgaagctgat-atgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgttt-atgcattacttgaagattaattgtataca 18770002  T
Q  200 taagatgttgttgaa 214  Q
    |||||||||| ||||    
T  18770003 taagatgttgatgaa 18770017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21873467 - 21873359
Alignment:
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgaga-attatttgaatat 198  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||| | || |||||  |||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||| ||| |||||| ||||      
T  21873467 aagaagttaactgcaatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattacttaagatattatt-gaatgg 21873370  T
Q  199 ttaagatgttg 209  Q
    |||||||||||    
T  21873369 ttaagatgttg 21873359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22032534 - 22032422
Alignment:
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 199  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||| | | || |||||  |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||      
T  22032534 aagaagttaactgcaatctgtgaagctgat-acgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgttt-atgcattacttgaagattaattgtataca 22032437  T
Q  200 taagatgttgttgaa 214  Q
    |||||||||| ||||    
T  22032436 taagatgttgatgaa 22032422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23572254 - 23572185
Alignment:
Q  144 gttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  23572254 gttgattatgatgtattataatg-tttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 23572185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 37724122 - 37724039
Alignment:
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgtttta-tgcattacttga 183  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||  || |||||  |||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  37724122 aagaagttaactgcaatctgtgaagctgtttt-gagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttga 37724039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 146; Significance: 4e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 850 - 1062
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  850 tcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgaattgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatga 949  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  950 agaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttgaataatatttgaatattt 1048  T
Q  201 aagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  1049 aagatgttgatgaa 1062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 146; Significance: 4e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 167780 - 167992
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  167780 tcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgaattgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatga 167879  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  167880 agaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttgaataatatttgaatattt 167978  T
Q  201 aagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  167979 aagatgttgatgaa 167992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 52232 - 52021
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||    
T  52232 tcgcgagtgacccagaaactgagtgtcttgttaggttttgcgacctt-gttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatga 52134  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||    || ||||||||||    
T  52133 tgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatattt 52034  T
Q  201 aagatgttgttga 213  Q
    |||||| ||||||    
T  52033 aagatgatgttga 52021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 21918801 - 21919014
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||    
T  21918801 tcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacccttgggtaagattaagacttaacga 21918900  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttg-agaattatttgaatatt 199  Q
     |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21918901 tgaggttaattacgatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgctgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttgaagaattatttgaatatt 21918999  T
Q  200 taagatgttgttgaa 214  Q
    |||||||||||||||    
T  21919000 taagatgttgttgaa 21919014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 198
Target Start/End: Original strand, 25362945 - 25363138
Alignment:
Q  5 gagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaagag 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| | ||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  25362945 gagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgcgacctttcttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagag 25363044  T
Q  105 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatat 198  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25363045 gctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtggtataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatat 25363138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20536528 - 20536315
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||| |||||||    
T  20536528 tcgcgagtgacccagaaacagagtgacttattaggttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagtgttgaaccttggggtagtattaagacttaatga 20536429  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
     || ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  20536428 ggatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatattt 20536329  T
Q  201 aagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  20536328 aagatgttgatgaa 20536315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 16199447 - 16199628
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||  |    
T  16199447 tcgcgagtgacccaaaaacagagtgacttattggattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaa 16199546  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16199547 tgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatg-tttatgcattacttga 16199628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 45130799 - 45130980
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||| |    
T  45130799 tcgcgagtgacccagaaacagagtgacttattagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagacttaataa 45130898  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  45130899 tgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatttgttgttgatgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttga 45130980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31971575 - 31971363
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||  |    
T  31971575 tcgcgagcgacccagaaatagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagctgaacctttgggtaggattaagacttaacaa 31971476  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  | |||||| |||  |    
T  31971475 tgaggttaattataatctgtgaagatgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttgaagaatatttgtatacat 31971377  T
Q  201 aagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  31971376 aagatgttgatgaa 31971363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 18879038 - 18879250
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||| |||| |||||||    
T  18879038 tcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcggcctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcatcaagacttaatga 18879137  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
     || |||||||||||||||||||||||  |||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||  | |||||||||||||    
T  18879138 tgatgttaactataatctgtgaagctg-ataagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatattt 18879236  T
Q  201 aagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  18879237 aagatgttgatgaa 18879250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 18818210 - 18818422
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  || |||||  ||||||| |||||||    
T  18818210 tcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaatttagggtagtattaagacttaatga 18818309  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||    || ||||||||||    
T  18818310 ggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatattt 18818409  T
Q  201 aagatgttgttga 213  Q
    |||||| ||||||    
T  18818410 aagatgatgttga 18818422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 21923729 - 21923941
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||  ||||  ||||||| |||||||    
T  21923729 tcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcccgagtagttgagagttgaaccttgaggtagtattaagacttaatga 21923828  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| | ||||||||||||    || ||||||||||    
T  21923829 tgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaataaggttatgtgcattacttgaagtataattgaatattt 21923928  T
Q  201 aagatgttgttga 213  Q
    |||||||||||||    
T  21923929 aagatgttgttga 21923941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23648870 - 23648662
Alignment:
Q  5 gagtgacccagaaacagagtgactttttagattt-tgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaaga 103  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||  |||||| ||    
T  23648870 gagtaacccagaaacagagtgacttgttaggtttatgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacctaatgatga 23648771  T
Q  104 ggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaag 203  Q
     ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||   ||  |||||||||||||    
T  23648770 tgttaattataatctgttaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaag 23648671  T
Q  204 atgttgttg 212  Q
    |||||||||    
T  23648670 atgttgttg 23648662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22627056 - 22626843
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagatttt-gcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||    
T  22627056 tcgcgagtgatctagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatg 22626957  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 199  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||||||||| ||  ||||||||||    || |||||||||    
T  22626956 aggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatt 22626857  T
Q  200 taagatgttgttga 213  Q
    ||||||||||||||    
T  22626856 taagatgttgttga 22626843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 183
Target Start/End: Original strand, 28648851 - 28649027
Alignment:
Q  8 tgacccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaagaggt 106  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||| || ||    
T  28648851 tgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgt 28648950  T
Q  107 taactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||    
T  28648951 taattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttga 28649027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 7373088 - 7372927
Alignment:
Q  3 gcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||   | | ||| ||||||| |    
T  7373088 gcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtggtagtgagacttaatgagg 7372989  T
Q  103 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataa 164  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  7372988 atgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa 7372927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23406701 - 23406496
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||| || || ||| |||  || |||||||    
T  23406701 tcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggttttgtgacctttgttgcacgagttattgagagttgaactttgggataatattgggacttaatga 23406602  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
     || ||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||| ||| |||||||||| | ||||||||||||    || ||||||||||    
T  23406601 ggatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgactatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatattt 23406502  T
Q  201 aagatg 206  Q
    ||||||    
T  23406501 aagatg 23406496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22875386 - 22875202
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagat-tttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| || ||| |||  ||||||  ||||||||||||| |||||  ||| |||| |||||    
T  22875386 tcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagggctttgcgatctatgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagatgtaatg 22875287  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgttt-aagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
      || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  22875286 gtgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttga 22875202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 6759577 - 6759393
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | || ||| |||  |||||   ||||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||    
T  6759577 tcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggattttgcaatctgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatg 6759478  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctg-tttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||    
T  6759477 atgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattaattga 6759393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 181
Target Start/End: Original strand, 16092144 - 16092323
Alignment:
Q  4 cgagtgacccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaag 102  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||| || |||  ||  ||||||  ||||||||||||| |||||| ||| ||| |||| || |    
T  16092144 cgagtgacccagaaacagagtgccctgttaggattttgcgatctgtgtcacacaagttgttaagagttgaaccttggggtaatattgagacttaaggatg 16092243  T
Q  103 aggttaactataatctgtgaagctgttt-aagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattactt 181  Q
    | ||||| |||||| || |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  16092244 atgttaattataatatgcgaagttgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattactt 16092323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 100 - 183
Target Start/End: Original strand, 21395883 - 21395965
Alignment:
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  21395883 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 21395965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 100 - 183
Target Start/End: Original strand, 21790376 - 21790458
Alignment:
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  21790376 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 21790458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 183
Target Start/End: Original strand, 21389366 - 21389435
Alignment:
Q  113 taatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  21389366 taatatgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 21389435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 183
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778761
Alignment:
Q  118 tgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 21778761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 214
Target Start/End: Original strand, 23776736 - 23776849
Alignment:
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgaga-attatttgaatat 198  Q
    |||| |||||||  ||| |||||||||||| | || |||||| |||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||| ||| |||||| ||||      
T  23776736 aagaagttaactgcaatttgtgaagctgtt-atgaaatgttgatgttgaatatgatgttatataatgttatgtgcattacttaagatattatt-gaatga 23776833  T
Q  199 ttaagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  23776834 ttaagatgttgttgaa 23776849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5168 - 4956
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||  || ||||||||| || || ||||| |||||||    
T  5168 tcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttag-ttttgccacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttggctagcaataagacttaatga 5070  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5069 aggggttagctataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatactt 4970  T
Q  201 aagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||||||||    
T  4969 aagatgttgttgaa 4956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6930 - 6717
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6930 tcgcgagtgacccataaacagagtgacatgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagatttaatga 6831  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
      ||||||  |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  | | |||||||||||    
T  6830 taaggttatttataatctgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaataatgtttgaatattt 6731  T
Q  201 aagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||||||||    
T  6730 aagatgttgttgaa 6717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 20360761 - 20360974
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  20360761 tcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattgaacctttgggtagtattaagacttaatga 20360860  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
     |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  20360861 tgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatattt 20360960  T
Q  201 aagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  20360961 aagatgttgatgaa 20360974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 20638084 - 20638292
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  20638084 tcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggataacattaagacttaatga 20638183  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  | | ||||||||||     
T  20638184 tgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaagaatgtttgaatatta 20638283  T
Q  201 aagatgttg 209  Q
    |||||||||    
T  20638284 aagatgttg 20638292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 16920436 - 16920646
Alignment:
Q  3 gcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaag 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||  | |    
T  16920436 gcgagtgacccagaaacaaagtgacttgttggattttgcgacctttgttgcacgatttctcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttaagaatg 16920535  T
Q  103 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaa 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  | |||||| |||  |||    
T  16920536 aggttaactataatctatgaagctgaataagataagttgttgttgattatgatgtggtataatg-tttatgcattacttgaagaatatttgtatacataa 16920634  T
Q  203 gatgttgttgaa 214  Q
    ||||||| ||||    
T  16920635 gatgttgatgaa 16920646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22831822 - 22831641
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||||||  ||||||| || |  |    
T  22831822 tcgcgagtgaccgagaaacagagtgacttgttggattttgcgacctttgtcgcacgattcgtcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaa 22831723  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  22831722 tgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgcattacttga 22831641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 25629155 - 25629338
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||    
T  25629155 tcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacttttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatg 25629254  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    | |  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  25629255 atgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttga 25629338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 29060861 - 29060678
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||   |||| |||||||| |||||  ||| ||| ||||||    
T  29060861 tcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgctaagagctgaaccttggggtagtattgagacttaatg 29060762  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    | ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||    
T  29060761 atgatattaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgagatataatgttatgtgcattacttga 29060678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 183
Target Start/End: Original strand, 18409632 - 18409810
Alignment:
Q  6 agtgacccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaagag 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||| ||     
T  18409632 agtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttacgacctttgttgcacgagttattgagagttgaaccttagggtagtattgagacttaatgatgat 18409731  T
Q  105 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||    
T  18409732 gttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgtattatttga 18409810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 213
Target Start/End: Original strand, 17287601 - 17287809
Alignment:
Q  5 gagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaagag 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| ||     
T  17287601 gagtgacccagaaacagagtgtcttgttagggtttgctatctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgaggat 17287700  T
Q  105 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaaga 204  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| | | | |||||||| | ||||||||||||    || ||||||||||||||    
T  17287701 gttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgaggttgattatgttatgacataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 17287800  T
Q  205 tgttgttga 213  Q
    || ||||||    
T  17287801 tgatgttga 17287809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 22780028 - 22780240
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| | | |||| ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||  || |||| |||||||    
T  22780028 tcgcgagtaacctagaaacagagtgtcctgttaggttttgtgacctttgttgcacaagttgccgagagttgaaccttggggtagtataaagacttaatga 22780127  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
     || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||||||||    || ||||||||||    
T  22780128 tgatgttaatcataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattgaatattt 22780227  T
Q  201 aagatgttgttga 213  Q
    |||||| ||||||    
T  22780228 aagatgatgttga 22780240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 11185818 - 11185641
Alignment:
Q  5 gagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaagag 104  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | | ||| |||||||  ||||||| |||||   |||    
T  11185818 gagtgacccagaaacatagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcatgggttgtcgaggatcggacccttgggtaggattaagacttaatagtgag 11185719  T
Q  105 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    ||||||  |||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||    
T  11185718 gttaaccgtaatctgtgaagatgaataagatatgttgttgctgattatgaagtgttataaag-tttatgcattacttga 11185641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 18821620 - 18821711
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaaga 92  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18821620 tcgcgagcgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggggtagcattaaga 18821711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 183
Target Start/End: Original strand, 19303345 - 19303524
Alignment:
Q  5 gagtgacccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaaga 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| || ||| |||  |||||   ||||||||||||| ||||| || | ||| ||||||| ||    
T  19303345 gagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatctatgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagcactgagaattaatgatga 19303444  T
Q  104 ggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||    
T  19303445 tgttaattataatctgtgaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtacattacttga 19303524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20594094 - 20593911
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||| || ||| |||  ||||||  || |||||||||| |||||  ||| ||| ||||||    
T  20594094 tcgcgagtgacctagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatg 20593995  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    |  | | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||    
T  20593994 ataatgataattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgttatacgcattacttga 20593911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 183
Target Start/End: Original strand, 25603223 - 25603368
Alignment:
Q  38 ttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatat 137  Q
    |||||| || ||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||| |    
T  25603223 ttgcgatctgtgtcgcatgagttgcttagagttgaacctttgggtagctttaagacttaatgacgatgtttaatagaatctgtgaagctgtttaagatgt 25603322  T
Q  138 gttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
     | ||  ||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||    
T  25603323 ttagtcattgattatgatgtgatatgatgttgtatacattacttga 25603368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16496411 - 16496351
Alignment:
Q  154 atgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaa 214  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16496411 atgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaa 16496351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 146 - 214
Target Start/End: Original strand, 27415887 - 27415955
Alignment:
Q  146 tgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  27415887 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacctaagaattatttgaatactcaagatgttgttgaa 27415955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 183
Target Start/End: Original strand, 25611588 - 25611706
Alignment:
Q  65 agagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataa 164  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| || ||||||| || ||| |  | ||||| |||||||||||||||| | | ||  ||||||||||||| |||| |    
T  25611588 agagttgaacctttgggtagctttaggacttaatgacgatgtttaacagaatctatgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgatatga 25611687  T
Q  165 tgttttatgcattacttga 183  Q
    |||| ||| ||||||||||    
T  25611688 tgttgtatacattacttga 25611706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 22)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13442594 - 13442381
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||    
T  13442594 tcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatgacattaagacttaatga 13442495  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  13442494 tgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatattt 13442395  T
Q  201 aagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  13442394 aagatgttgatgaa 13442381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12399523 - 12399316
Alignment:
Q  4 cgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaaga 103  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||| | |  || | |||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  12399523 cgagtgacccagaaacag--tgacttgttag-ttttccgacctttgttgcacgagttgttggggattaagcctttgggtagcattaagacataatgaaga 12399427  T
Q  104 ggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaag 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399426 ggttaactataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgagaattatttgaatatttaag 12399327  T
Q  204 atgttgttgaa 214  Q
    |||||||||||    
T  12399326 atgttgttgaa 12399316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17488177 - 17487963
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaa-cagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||    
T  17488177 tcgcgagtgacctagaaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatg 17488078  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 199  Q
    | || ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  17488077 atgatgttaattataatctgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatt 17487978  T
Q  200 taagatgttgttgaa 214  Q
    |||||||||| ||||    
T  17487977 taagatgttgatgaa 17487963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16796867 - 16796670
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16796867 tcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgcgacctttgttgcacgaattgttaagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatga 16796768  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatat 198  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16796767 agaggctaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatat 16796670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 20698237 - 20698449
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  20698237 tcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgtggcacgagttgtcgagagttgaacctttggatagaattaagacttaatga 20698336  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||| |    
T  20698337 tgatgttaattataatctgtgaagctgttcaagatgtgttgaagttgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttgaagaatatttgaatatat 20698435  T
Q  201 aagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  20698436 aagatgttgatgaa 20698449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 14576633 - 14576846
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  14576633 tcgcgagtgacctagaaacaaagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagatttaatg 14576732  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 199  Q
    | || ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||    
T  14576733 atgatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatt 14576832  T
Q  200 taagatgttgttga 213  Q
    ||||||||||||||    
T  14576833 taagatgttgttga 14576846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17499643 - 17499445
Alignment:
Q  16 aaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaagaggttaactataa 115  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||| || ||||| |||||    
T  17499643 aaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataa 17499544  T
Q  116 tctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaa 214  Q
    | |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17499543 tttgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaa 17499445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18438855 - 18438670
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagatttt-gcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||  ||| ||| ||||||    
T  18438855 tcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagtgttgaaccttggggtagtattgagacttaatg 18438756  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgaga 185  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18438755 atgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaga 18438670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 40213521 - 40213703
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||  ||| ||| ||||||    
T  40213521 tcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagtttaaccttggggtagtattgagacttaatg 40213620  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttg 182  Q
    | || ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  40213621 atgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 40213703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14572909 - 14572696
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagatttt-gcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||    
T  14572909 tcgcgagtgacctagaaacagagtaccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatg 14572810  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 199  Q
    | || ||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||    || |||||||||    
T  14572809 atgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatttgtttatgttgtttatgatgtgatataatgtttttttcattatttgaagtataattgaatatt 14572710  T
Q  200 taagatgttgttga 213  Q
    ||||||||||||||    
T  14572709 taagatgttgttga 14572696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 23083162 - 23083374
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||  ||||  ||||||| ||| |||    
T  23083162 tcgcgaatgacccagaaacatagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttcagagttgaaccttgaggtagtattaagacttagtga 23083261  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
     || ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||     | ||||||||||    
T  23083262 tgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatattt 23083361  T
Q  201 aagatgttgttga 213  Q
    |||||||||||||    
T  23083362 aagatgttgttga 23083374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26687207 - 26686995
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||| || | || ||||||||||| || |||||  |||  || |||||||    
T  26687207 tcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttacgacctttgttgcacgaatcgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatga 26687108  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||    || | ||||||||    
T  26687107 ggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatattt 26687008  T
Q  201 aagatgttgttga 213  Q
    |||||| ||||||    
T  26687007 aagatgatgttga 26686995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 43841252 - 43841040
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||  || || |||||  |||  || |||| ||    
T  43841252 tcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttacacgagttgttgagagtttgactttggggtagtattgggacttaacga 43841153  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||    || ||||||||||    
T  43841152 ggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatattt 43841053  T
Q  201 aagatgttgttga 213  Q
    |||||| ||||||    
T  43841052 aagatgatgttga 43841040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 25476185 - 25476368
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||  ||| ||| ||||||    
T  25476185 tcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatg 25476284  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    | || ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  25476285 aggatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatgcgcattacttga 25476368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 30030143 - 30029950
Alignment:
Q  17 aacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaagaggttaactataat 116  Q
    |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| || ||| | ||||||    
T  30030143 aacagaatgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagctttaagacttaatgatgatgtttaatataat 30030044  T
Q  117 ctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgt 210  Q
     |||||||||||||||||| | |||   ||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||   ||  |||||||||||||| |||||    
T  30030043 atgtgaagctgtttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaatatttaagacgttgt 30029950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14179653 - 14179555
Alignment:
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatat 198  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14179653 aagaagttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatat 14179555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 11424563 - 11424746
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagatttt-gcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||  ||| ||| ||||||    
T  11424563 tcgcgagcgacctagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgagacttaatg 11424662  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
      || ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  11424663 ttgatgttaattttaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgaagttgtttatgatgtgatataatgttatacgcattacttga 11424746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14973175 - 14972992
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||  | ||| |||  |||||   ||||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||    
T  14973175 tcgcaagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatg 14973076  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  14973075 atgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttga 14972992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Original strand, 24153115 - 24153222
Alignment:
Q  106 ttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagat 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| ||||    || |||||||||||||||    
T  24153115 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagat 24153214  T
Q  206 gttgttga 213  Q
    ||||||||    
T  24153215 gttgttga 24153222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 42386698 - 42386518
Alignment:
Q  34 gattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaagaggttaactataatctgtgaagctgttt-aa 132  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||| | |||||||||||| |||||  |||  || ||  | | || |||||  ||||||||||||||||||| ||    
T  42386698 gattttgcgaactttgtcgcacgagttgttgtgagttgaaccttggggtagtattgggacttgtttatgatgttaatgataatctgtgaagctgttttaa 42386599  T
Q  133 gatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatt--tgaatatttaagatgttgttga 213  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  |||||   ||||||||| ||||||||||||    
T  42386598 gatgttttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttga--attatgaatgaatatttgagatgttgttga 42386518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 97 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12339986 - 12339890
Alignment:
Q  97 atgaagaggttaactataatctgtgaagctgttt-aagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaa 195  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||      || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12339986 atgaagaggctaattataatatgtgaagctgttttaagatgtgttgttgttgat------gtgatataatgttttatgcatcacttgagaattatttgaa 12339893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 74
Target Start/End: Original strand, 2051033 - 2051073
Alignment:
Q  34 gattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaac 74  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2051033 gattttgcgatctttgtcgcatgagttgttgagagttgaac 2051073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 124905 - 124704
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||    
T  124905 tcgcgagtgacccagaaaaagagtgtcttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatga 124806  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  124805 ggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatattt 124706  T
Q  201 aa 202  Q
    ||    
T  124705 aa 124704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 127; Significance: 9e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1231 - 1037
Alignment:
Q  4 cgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaaga 103  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  1231 cgagtgacccggaaacaaagtgccttgtgagactttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacttttgggtagtattaagacttaatgaaga 1132  T
Q  104 ggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatat 198  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1131 ggctaattataatctgtgaagatgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatat 1037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2272 - 2059
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  2272 tcgcgagtgacctagaaacagagtgacatgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaatga 2173  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
      ||||||   ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||    
T  2172 taaggttattaataatatgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgagatataatgttttatgcattacttgaataatgtttgaatattt 2073  T
Q  201 aagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||||||||    
T  2072 aagatgttgttgaa 2059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13531 - 13318
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||    
T  13531 tcgcgagtgacctagaatcagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaaccttgggatagcattaagacttaatga 13432  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
     || ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  13431 tgatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatattt 13332  T
Q  201 aagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  13331 aagatgttgatgaa 13318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 122; Significance: 9e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 10227 - 10439
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||| |    
T  10227 tcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgaccattgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtagaattaagacttaataa 10326  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
      ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  | |||||| ||| ||    
T  10327 taaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatactt 10425  T
Q  201 aagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||||||||    
T  10426 aagatgttgttgaa 10439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Original strand, 5927 - 6135
Alignment:
Q  6 agtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaagagg 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||| || |    
T  5927 agtgacccagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttatcgagagtggaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatg 6026  T
Q  106 ttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagat 205  Q
    |||| |||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  6027 ttaattataaaatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagat 6126  T
Q  206 gttgttgaa 214  Q
    |||| ||||    
T  6127 gttgatgaa 6135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 116; Significance: 3e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 39081 - 38870
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagatttt-gcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||    
T  39081 tcgcgagtgacccagaaacatagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatg 38982  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 199  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    || |||||||||    
T  38981 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 38882  T
Q  200 taagatgttgtt 211  Q
    ||||||||||||    
T  38881 taagatgttgtt 38870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 111 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 33151 - 33051
Alignment:
Q  111 tataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    || ||||||||||||||||||||    
T  33151 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 33052  T
Q  211 t 211  Q
    |    
T  33051 t 33051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 13815 - 13634
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||  |    
T  13815 tcgcgagcgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacttttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttcggtaggattaagacttaacaa 13716  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  13715 tgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttga 13634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2168 - 1958
Alignment:
Q  4 cgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaaga 103  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| ||||||| ||    
T  2168 cgagtgaccctaaaacagagtgccttgttagattttgtgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggatagtattaagacttaatgagga 2069  T
Q  104 ggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaag 203  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  2068 tgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaag 1969  T
Q  204 atgttgttgaa 214  Q
    |||||| ||||    
T  1968 atgttgatgaa 1958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 114; Significance: 5e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3790 - 3577
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || |||||  ||||||| |||||||    
T  3790 tcgcgagtgacccaaaaacagagtgagttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaactttggggtagtattaagacttaatga 3691  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
     || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  3690 ggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatattt 3591  T
Q  201 aagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  3590 aagatgttgatgaa 3577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 663 - 450
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagatttt-gcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||    
T  663 tcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcaacctttgttgcatgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatg 564  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 199  Q
    | || ||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    || | |||||||    
T  563 aggatgttaattataatatatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatt 464  T
Q  200 taagatgttgttga 213  Q
    ||||||||||||||    
T  463 taagatgttgttga 450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 114; Significance: 5e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 32384 - 32172
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||  |    
T  32384 tcgcgagtgacccagaaacagagttacttttttgattttgcgacctttgttgctctagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaa 32285  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  | |||||| |||  |    
T  32284 tgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatg-tttatgcattacttgaagaatatttgtatacct 32186  T
Q  201 aagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  32185 aagatgttgatgaa 32172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 15266 - 15447
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||  ||||||| ||||| |    
T  15266 tcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgactcgttgggtaggattaagacttaataa 15365  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
      ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  15366 taaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataat-atttatgcattacttga 15447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21227 - 21018
Alignment:
Q  5 gagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaagag 104  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||     
T  21227 gagtgacccaaaaacagagtgacttgttgagttttgcgacctttgttgcacgagttgatcagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagat 21128  T
Q  105 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttg-agaattatttgaatatttaag 203  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||    
T  21127 gttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgtagaa-catttgaatatataag 21029  T
Q  204 atgttgttgaa 214  Q
    |||||||||||    
T  21028 atgttgttgaa 21018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 24102 - 24316
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||  ||||||| ||| |||    
T  24102 tcgcgagtgacctagaaacaaagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaactttgggatagtattaagacttattga 24201  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttg-attatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 199  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||||||    
T  24202 ggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatt 24301  T
Q  200 taagatgttgttgaa 214  Q
    |||||||||| ||||    
T  24302 taagatgttgatgaa 24316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 853 - 1065
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||  |    
T  853 tcgcgagtaacccagaaacagagtgacttgttagattttgcaacctttgttgcacgatttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagtcttaagaa 952  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  | |||||| |||  |    
T  953 tgaggttaactataatctgtgaagctgtataaaatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatatttgtatacat 1051  T
Q  201 aagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  1052 aagatgttgatgaa 1065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16599 - 16418
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||  |||||||  ||||||| ||||| |    
T  16599 tcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttggattttgtgacctttgttgcacgatttctcgagagttgaacgcttgggtaggattaagacttaataa 16500  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  16499 tgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgcattacttga 16418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 102; Significance: 8e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23203 - 22990
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagatttt-gcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||    
T  23203 tcgcgagtgacctagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatg 23104  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 199  Q
    | || ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||    || |||||||||    
T  23103 atgatgttatttataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 23004  T
Q  200 taagatgttgttga 213  Q
    ||||||||||||||    
T  23003 taagatgttgttga 22990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 102; Significance: 8e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 3801 - 3640
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  3801 tcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgtgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatga 3702  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatat 162  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3701 agaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 3640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 7865 - 7704
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  7865 tcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgagactttgtgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatga 7766  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatat 162  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7765 agaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 7704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13412 - 13200
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||  |||  || |||||||    
T  13412 tcgcgagtgacccagaaactgagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattgggacttaatga 13313  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||    || ||||||||||    
T  13312 agatgttaattataatctgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatattt 13213  T
Q  201 aagatgttgttga 213  Q
    |||||| ||||||    
T  13212 aagatgatgttga 13200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 1606 - 1425
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||  |    
T  1606 tcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttggagtttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagacttaagaa 1507  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  1506 tgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 1425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 7583 - 7402
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||  |    
T  7583 tcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttggagtttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagacttaagaa 7484  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  7483 tgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 7402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 97; Significance: 7e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 26213 - 26005
Alignment:
Q  4 cgagtgacccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaag 102  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| |    
T  26213 cgagtgacccagaaaccaagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgatttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgagg 26114  T
Q  103 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaa 202  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    || |||||||||| |    
T  26113 atgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttga 26014  T
Q  203 gatgttgtt 211  Q
    |||||||||    
T  26013 gatgttgtt 26005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 40177 - 39967
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgacttttta-gattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||    
T  40177 tcgcgggtgacctagaaaccgagtgccttgttatgattttgcgacctttgttgcacaatttgttgagagttgaacctt-gggtagcattgagacttaatg 40079  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 199  Q
    | || ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    || |||||||||    
T  40078 aggatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatt 39979  T
Q  200 taagatgttgtt 211  Q
    | ||||||||||    
T  39978 tgagatgttgtt 39967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 51899 - 51718
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||  ||||||| ||||       
T  51899 tcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacttttgttgcacgagttgtcgagaattggacccttgggtaggattaagacttaagag 51800  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||| |||||    
T  51799 tgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgaatatgaagtgttataatg-tttatgcatttcttga 51718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 8333 - 8546
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttggg-taacattaagatttaatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || ||| ||  |||  || ||||||    
T  8333 tcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgcgaccttcgttgcacgagttgttgagagttgaacgttgggggtagtattgggacttaatg 8432  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 199  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||    || |||||||||    
T  8433 aggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 8532  T
Q  200 taagatgttgttga 213  Q
    ||||||| ||||||    
T  8533 taagatgatgttga 8546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 92; Significance: 7e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 256 - 74
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagatttt-gcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    |||| ||||||||| ||  |||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||      
T  256 tcgcaagtgacccataataagagtgacttgttagatttttgcaacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaacctttgggtaggattaagacttaaca 157  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  156 atgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatg-tttatgccttacttga 74  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 5032 - 4850
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagatttt-gcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    |||| ||||||||| ||  |||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||      
T  5032 tcgcaagtgacccataataagagtgacttgttagatttttgcaacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaacctttgggtaggattaagacttaaca 4933  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  4932 atgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatg-tttatgccttacttga 4850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 92; Significance: 7e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 40233 - 40050
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagat-tttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||    
T  40233 tcgcgagtgacccagaaacagagtaccttgttaggtgtttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatg 40134  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    | || ||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  40133 atgatgttaattataatctgtgaagctctttatgatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 40050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 4932 - 5113
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |    
T  4932 tcgcgagtgacacagaaacagagtgacttattggattttgagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagatttaataa 5031  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
      ||||||| |||||| |||||| |||  ||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  5032 taaggttaattataatatgtgaaactgaataaaatatgttgttgttgattaagatgtgttataatg-tttatacattacttga 5113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 339751 - 339933
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||  || |||||||||| |||||  ||| ||| |||||||    
T  339751 tcgcgagtgacccagaaatagagtgccttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagtcgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaatga 339850  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||    
T  339851 tgacgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttga 339933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 146 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 71474 - 71406
Alignment:
Q  146 tgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  71474 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacctaagaattatttgaatactcaagatgttgttgaa 71406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8795 - 8587
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||  ||||||| |||||||    
T  8795 tcgcgaatgacccagaaacagagtgtcttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggagtagtattaagacttaatga 8696  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattt 200  Q
     || ||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    ||||||| | ||||||||||||     | |||||| |||    
T  8695 tgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaggatgtgttgatgttgattatgatgt----taatgttatgtgcattacttgaagtacacttgaatgttt 8600  T
Q  201 aagatgttgttga 213  Q
    |||||||||||||    
T  8599 aagatgttgttga 8587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 11314 - 11445
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  11314 tcgcgagtgacacagaaacaaagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtagagagttgaacctttgggtagaattaagacttaatga 11413  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaa 132  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  11414 tgaggttaattataatctgtgaagctgattaa 11445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 25865 - 26048
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||   |||| |||||||| |||||  ||| ||| ||||||    
T  25865 tcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgctaagagctgaaccttggggtagtattgagacttaatg 25964  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  25965 atgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttga 26048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 33295 - 33478
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||| || |||   |  ||||||  ||||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||    
T  33295 tcgcgtgtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcatacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatg 33394  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    | || ||||| ||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  33395 atgatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttga 33478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 17015 - 17198
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||  ||| ||| |||||     
T  17015 tcgcgagtgacccagaaacagagtaccttattaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttaaaccttggggtagtattgagacttaatc 17114  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    | || ||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  17115 atgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagacgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttga 17198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Original strand, 17790 - 17928
Alignment:
Q  3 gcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaag 102  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||| |    
T  17790 gcgagtcacccagaaatagagtgacttgttaggttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagtattaagacttaatgagg 17889  T
Q  103 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttg 141  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17890 atgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 17928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 20723 - 20595
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||    
T  20723 tcgcgagcgacctagaaacagagtgccttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggaatagcattaagacttaatga 20624  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtt 129  Q
     || |||||||||||||||||||||||||    
T  20623 tgatgttaactataatctgtgaagctgtt 20595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 183
Target Start/End: Original strand, 2987 - 3134
Alignment:
Q  36 ttttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagat 135  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2987 ttttgcgacctgtgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagctgtttaagat 3086  T
Q  136 atgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
      |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  3087 gcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttga 3134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 47306 - 47100
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatga 100  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||  |    
T  47306 tcgcgagtgacccaaaaccagagtgacttgttagaaatggcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaa 47207  T
Q  101 agaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattactt-gagaattatttgaatatt 199  Q
     |||      |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||      
T  47206 tgag------tataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgtttatgatgtgatataatg-tttatgcattacttggagaa-tatttgtataca 47115  T
Q  200 taagatgttgttgaa 214  Q
    |||||||||| ||||    
T  47114 taagatgttgatgaa 47100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 28151 - 27968
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||| | || ||| |||  ||||||  ||||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||    
T  28151 tcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcaatctgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatg 28052  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  28051 atgatgttaattataacctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttga 27968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 4828 - 4645
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||  |||| ||||||||| |  ||| |||  ||||||  ||||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||    
T  4828 tcgcgagtgacccagaaacagggtacctagttaggattttgcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatg 4729  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  4728 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttga 4645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 12410 - 12227
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||  |||| ||||||||| |  ||| |||  ||||||  ||||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||    
T  12410 tcgcgagtgacccagaaacagggtacctagttaggattttgcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatg 12311  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  12310 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttga 12227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22362 - 22179
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||  |||| ||||||||| |  ||| |||  ||||||  ||||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||    
T  22362 tcgcgagtgacccagaaacagggtacctagttaggattttgcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatg 22263  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  22262 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttga 22179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 39797 - 39614
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||| || ||| |||  ||||||  || |||||||||| |||||  ||| ||| |||||     
T  39797 tcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaata 39698  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  39697 atgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 39614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 75015 - 75198
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||| || ||| |||  ||||||  || |||||||||| |||||  ||| ||| |||||     
T  75015 tcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggtagtattgagacttaata 75114  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  75115 atgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 75198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 51685 - 51776
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaaga 92  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  51685 tcgctagtgacccagaaacagagtgacttgttagattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggggtagcattaaga 51776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4835 - 4631
Alignment:
Q  10 acccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaagaggtta 108  Q
    ||||||||||||| || | | |||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||  ||||  ||| ||| ||| |||||| ||||    
T  4835 acccagaaacagaatgccatgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttgaggtagtattgagacttattgaagatgtta 4736  T
Q  109 actataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgtt 208  Q
    | |||||| ||||| ||||||| | | |||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    ||  |||||||||||||||||    
T  4735 attataatttgtgaggctgtttta-agatgttgatgttgatcatgatgtgatataatgtattatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgtt 4637  T
Q  209 gttgaa 214  Q
    ||||||    
T  4636 gttgaa 4631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 16400 - 16583
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| || | ||||||||| || ||| |||  ||||||   |||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||    
T  16400 tcgcgagtgacccaaaaacagagtgccttgttgggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaggagttgaaccttggggtagtattgagacttaatg 16499  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    | || ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  16500 atgatgttaattatagtctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatacgcattacttga 16583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 213
Target Start/End: Original strand, 767 - 976
Alignment:
Q  5 gagtgacccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatgaaga 103  Q
    |||||||| |||||||||| | ||| |||| ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||  ||||  ||| ||| ||||||  ||    
T  767 gagtgacctagaaacagagagtcttgttaggatttttcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatggtga 866  T
Q  104 ggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattat--ttgaatattta 201  Q
     | ||  ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||  |||||||  ||||||||||     
T  867 tgctatttatgatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtcgattacgatgtgatataatgttatgtgcattactt--gaattatgattgaatatttg 964  T
Q  202 agatgttgttga 213  Q
    |||| |||||||    
T  965 agattttgttga 976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 10484 - 10327
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggtaacattaagatttaatg 99  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||| |||| ||||||||| || ||| |||  ||||||  ||||||||||||| |||||  ||| ||| |||||     
T  10484 tcgcgagtgacctagaaacaaagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaata 10385  T
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgt 157  Q
    | || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10384 atgatgttaataataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgt 10327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 146 - 214
Target Start/End: Original strand, 15362 - 15430
Alignment:
Q  146 tgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15362 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaattatttgaatattcaagatgttgttgaa 15430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 183
Target Start/End: Original strand, 3424 - 3513
Alignment:
Q  95 taatgaagaggttaactataatctgtgaagctgttt-aagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  3424 taatgatgatgttaattataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttga 3513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 183
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3169
Alignment:
Q  117 ctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttga 183  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  3103 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttga 3169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 16408 - 16331
Alignment:
Q  1 tcgcgagtgacccagaaacagagtgactttttagatttt-gcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctt 77  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16408 tcgcaagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctt 16331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 16322 - 16250
Alignment:
Q  111 tataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgag 184  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  16322 tataatctgtgaagctgtttta-agatgttgatgttgatcatgacgtgatataatgttatatgcattacttgag 16250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27041 - 26929
Alignment:
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 199  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||| | || |||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  | |||||| |||      
T  27041 aagaagttaactgcaatctgtgaagctgtt-atgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatg-tttatgcattacttgaagaatatttgtataca 26944  T
Q  200 taagatgttgttgaa 214  Q
    |||||||||| ||||    
T  26943 taagatgttgatgaa 26929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 214
Target Start/End: Original strand, 16250 - 16363
Alignment:
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgaga-attatttgaatat 198  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||| | || |||||  |||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||| ||| |||||| ||||      
T  16250 aagaagttaactgcaatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattacttaagatattatt-gaatga 16347  T
Q  199 ttaagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  16348 ttaagatgttgttgaa 16363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 214
Target Start/End: Original strand, 21707 - 21819
Alignment:
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 199  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||| | || |||||  ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||      
T  21707 aagatgttaactgcaatctgtgaagctgtt-atgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgttt-atgcattacttgaagattaattgtataca 21804  T
Q  200 taagatgttgttgaa 214  Q
    |||||||||| ||||    
T  21805 taagatgttgatgaa 21819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 214
Target Start/End: Original strand, 29599 - 29711
Alignment:
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 199  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||| | || |||||  ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||      
T  29599 aagatgttaactgcaatctgtgaagctgtt-atgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgttt-atgcattacttgaagattaattgtataca 29696  T
Q  200 taagatgttgttgaa 214  Q
    |||||||||| ||||    
T  29697 taagatgttgatgaa 29711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12933 - 12864
Alignment:
Q  144 gttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaa 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  12933 gttgattatgatgtattataatg-tttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 12864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Original strand, 23581 - 23680
Alignment:
Q  114 aatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgaga-attatttgaatatttaagatgttgttg 212  Q
    |||||||||||||||| | || |||||  |||||| |||||||| |||||| ||| | |||||||||| ||| |||||| ||||  ||||||||||||||    
T  23581 aatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattacttaagatattatt-gaatgattaagatgttgttg 23678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Original strand, 38394 - 38493
Alignment:
Q  114 aatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgaga-attatttgaatatttaagatgttgttg 212  Q
    |||||||||||||||| | || |||||  |||||| |||||||| |||||| ||| | |||||||||| ||| |||||| ||||  ||||||||||||||    
T  38394 aatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattacttaagatattatt-gaatgattaagatgttgttg 38491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 225694 - 225645
Alignment:
Q  34 gattttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaacctttgggta 83  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  225694 gattttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggggta 225645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 24062 - 23995
Alignment:
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgtt 168  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||| |||||| |||||  |||||| |||||||| ||||||||||    
T  24062 aagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttaagagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtt 23995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 36676 - 36593
Alignment:
Q  100 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgtttta-tgcattacttga 183  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||| | || |||||  |||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  36676 aagaagttaactgcaatctgtgaagctgtt-atgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttga 36593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University