View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0669_low_3 (Length: 597)

Name: NF0669_low_3
Description: NF0669
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0669_low_3
NF0669_low_3
[»] chr7 (22 HSPs)
chr7 (91-567)||(21763929-21764403)
chr7 (5-550)||(21771842-21772388)
chr7 (5-555)||(21628001-21628555)
chr7 (5-508)||(21788152-21788656)
chr7 (5-544)||(21725783-21726323)
chr7 (88-532)||(21704542-21704987)
chr7 (39-529)||(21651971-21652462)
chr7 (5-550)||(21714067-21714610)
chr7 (5-568)||(21681500-21682077)
chr7 (5-545)||(21785289-21785833)
chr7 (5-532)||(21992069-21992609)
chr7 (91-560)||(21807972-21808445)
chr7 (90-532)||(21663994-21664443)
chr7 (5-454)||(21646720-21647174)
chr7 (5-373)||(21623252-21623620)
chr7 (88-568)||(15713474-15713967)
chr7 (88-394)||(21745570-21745876)
chr7 (91-359)||(21792084-21792352)
chr7 (5-366)||(21689479-21689840)
chr7 (450-543)||(21740994-21741087)
chr7 (5-67)||(21764409-21764471)
chr7 (5-56)||(21664483-21664534)
[»] scaffold0182 (3 HSPs)
scaffold0182 (256-559)||(25182-25486)
scaffold0182 (7-279)||(25526-25798)
scaffold0182 (451-544)||(34421-34514)
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (105-168)||(18192060-18192123)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 372; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 91 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 21764403 - 21763929
Alignment:
Q  91 tccaagatatacagcaaagaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctatgaaagccttcaagagactttccacttaaagtta 190  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21764403 tccaagagataaagcaaagagcatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctatgaaagccttcaagagactttccagttaaagtta 21764304  T
Q  191 aaatatcgtcgctaaaacgacccttcagttcatcgattttatcagcaatctgtttgtgtagttcctctggattaagtgcagtgttttctatgtattctgc 290  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21764303 aaacatcatcgctaaaacgacccttcagttcatcgatgttatcagcaatcttttggtgtagttcctctggattaagtgcggtgttttctatgtattctgc 21764204  T
Q  291 tgcccacttaagcttgtacttctctcctaacatcagatctgatctgtcatgatggataggacctattgacaacaacttgggtgtgtagtacttccccaaa 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21764203 tgcccacttaagcttgtacttctctcctaacttcagatctgatctgtcatgatggataggacctattgacaacaacttgggtgtgtagtgcttccccaaa 21764104  T
Q  391 tttgacatctttctgcggtaatatggcaccctttgtatctt-ggtcgtgaattttggggtgtttgctttgaattttgtaactcgacaaatttttctttaa 489  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21764103 tttgacatccttctgcggtaatatggcaccctttgtatcttgggtcgtgaattttggggtgtttgctttga---ttgtagctccacaaatttttctttaa 21764007  T
Q  490 tagtttggggtgccatcattcattcaatattctaatggttgagagatattgatcttgcaaagttacgaaattatgaat 567  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21764006 gagtttgggatgccatcattcattcaatacactaatggttgagggatattgatcttgcaaagttacgaaatcatgaat 21763929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 21772388 - 21771842
Alignment:
Q  5 tctccaacaaaatcacatccatcatcaaaagaaacagttgatcaaccttaattttcatgtgccatggttcataaagattcgttttatccaagatatacag 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21772388 tctccaacaaaagcacatccatcatcacaagaaccagttgatcaaccttaatattcatgtgccatggttcattaagattcgctttctccaagatatacag 21772289  T
Q  105 caaagaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctatgaaagccttcaagagactttccacttaaagttaaaatatcgtcgcta 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||   || ||||||||| ||| |||  |    
T  21772288 caaagaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctacgaaagcctgcaagagaccatctggttgaagttaaaacatcatcgtca 21772189  T
Q  205 aaacgacccttcagttcatcgattttatcagcaatctgtttgtgtagttcctctggattaagtgcagtgttttctatgtattctgctgcccacttaagct 304  Q
    ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |   | |  | ||||||||||||| |||||||||| |||| |    
T  21772188 aaatgacccttcagttcatcaatgttatcagcaatctttttgtgtagatcctctggaatgtatccgttattttctatgtattttgctgcccacataagtt 21772089  T
Q  305 tgtacttctctcctaacatcagatctgatctgtcatgatggataggacctattgacaacaacttgggtgtgtagtacttccccaaatttgacatctttct 404  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||   | | |||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||| | |||| | || |||    | |||||    
T  21772088 tgtacttctctgctaatatcagatttgtgttatgatgatgaataggacctattgacacacacttgggtgagtaatgcttctcaaagttttttctatttct 21771989  T
Q  405 gcggtaatatggcaccctttgtatctt-ggtcgtgaattttggggtgtttgctttgaattttgtaactcgacaaatttttctttaatagtttggggtgcc 503  Q
    | |  | | | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  21771988 gagagactttagcaccctttgtatcttcggtcttgaattttggggtatttgctttgatttttgtagttccacaaatttttctttaatagtttcggatgcc 21771889  T
Q  504 atcattcattcaatattctaatggttgagagatattgatcttgcaaa 550  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21771888 atcattcattcaatatgataatggttgagggatattgatctttcaaa 21771842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 5 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 21628555 - 21628001
Alignment:
Q  5 tctccaacaaaatcacatccatcatcaaaagaaacagttgatcaaccttaattttcatgtgccatggttcataaagattcgt---tttatccaagatata 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | |||  ||| ||| |||| ||    |||   ||| |||||||||||    
T  21628555 tctccaacaaaagcacatccatcatcacaagaaccagttgatcaagcttaatatccataggccttgggtcattaaacaacgtaactttctccaagatata 21628456  T
Q  102 cagcaaagaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctatgaaagccttcaagagactttccacttaaagttaaaatatcgtcg 201  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||| |||||| |||||  ||||| |||||| |||||||    
T  21628455 aagcaaagagcatccatccacgaacaacatccacgacagcttttcttcaaggcatccaaagccttgaagagagtttcccgttaaatttaaaacatcgtcg 21628356  T
Q  202 ctaaaacgacccttcagttcatcgattttatcagcaatctgtttgtgtagttcctctggattaagtgcagtgttttctatgtattctgctgcccacttaa 301  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| || |||||||  ||    
T  21628355 ctaaaacgacccttcagttcatcaatgttatcagcaatctttttgtgtagttcctctggaataagtccaatgttttctatgtattttgatgcccacacaa 21628256  T
Q  302 gcttgtacttctctcctaacatcagatctgatctgtcatgatggataggacctattgacaacaacttgggtgtgtagtacttccccaaatttgacatctt 401  Q
    ||||||||||||||||||   |||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||| |||| |    | ||    
T  21628255 gcttgtacttctctcctatgttcagatttgtactgccatgatggataggacctattgacacaaacttgggtgagtaatacttcccaaaatcttttttatt 21628156  T
Q  402 tctgcggtaatatggcaccctttgtatc-ttggtcgtgaattttggggtgtttgctttgaattttgtaactcgacaaatttttctttaatagtttggggt 500  Q
    |||| | | ||  | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  21628155 tctgagatgatcggccaccctttgtatctttggtcgtgcatttcggggtgtttgctttgaattttttaactccacaaatttttctttaatagtttgggat 21628056  T
Q  501 gccatcattcattcaatattctaatggttgagagatattgatcttgcaaagttac 555  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  21628055 gccatcattctttcaatataataatggttgaggaatattgatctttcaaacttac 21628001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 21788656 - 21788152
Alignment:
Q  5 tctccaacaaaatcacatccatcatcaaaagaaacagttgatcaaccttaattttcatgtgccatggttcataaagattcgttttatccaagatatacag 104  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||| ||| || | ||| || ||||||||||     
T  21788656 tctccaacagaagcacatccatcatcacaagaaccagttgatcaactttaatattcatgtgcccaggttcatcaagcttggctttctctaagatatacaa 21788557  T
Q  105 caaagaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctatgaaagccttcaagagactttccacttaaagttaaaatatcgtcgcta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |    
T  21788556 caaagaacatccatccacgaacaacatccacgacagcttttcttcgaggcttccaaagccttcaagagacttgccagttaaagttaaaacatcgtcgcca 21788457  T
Q  205 aaacgacccttcagttcatcgattttatcagcaatctgtttgtgtagttcctctggattaagtgcagtgttttctatgtattctgctgcccacttaagct 304  Q
    ||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||| || ||||||||| |  || |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  21788456 aaatgacccttcagttcatcaatgttatctgcaatctttttgtgcagatcctctggaatgtgtccagtgttttcgatgtattttgctgcccacataagct 21788357  T
Q  305 tgtacttctctcctaacatcagatctgatctgtcatgatggataggacctattgacaacaacttgggtgtgtagtacttccccaaatttgacatctttct 404  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||| | |||| | || |||    | |||||    
T  21788356 tgtacttctctcctaacttcaaatttgtgttgtcatgatggataggacctaccgacaacaacttgggcgagtaatgcttctcaaagttttttctatttct 21788257  T
Q  405 gcggtaatatggcaccctttgtatctt-ggtcgtgaattttggggtgtttgctttgaattttgtaactcgacaaatttttctttaatagtttggggtgcc 503  Q
    | | || | || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  21788256 gagatactctgccaccctttgtattttcggtcgtgaattttggggtgtttgctttgatttttgtaactccacaaatttttcattaatagtttgggatgcc 21788157  T
Q  504 atcat 508  Q
    |||||    
T  21788156 atcat 21788152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 5 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 21726323 - 21725783
Alignment:
Q  5 tctccaacaaaatcacatccatcatcaaaagaaacagttgatcaaccttaattttcatgtgccatggttcataaagattcgttttatccaagatatacag 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||||    
T  21726323 tctccaacaaaagcacatccatcatcacaagaaccagttgatcaaccctaatattcatgtgccatggtttattaagatccgctttctccaagatatacag 21726224  T
Q  105 caaagaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctatgaaagccttcaagagactttccacttaaagttaaaatatcgtcgcta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||   || ||| ||||| |||||||  |    
T  21726223 caaagaacatccatccacgaacaacatccacgacagcttttcttcaaggctacgaaagcctgcaagagaccatctggttgaagctaaaacatcgtcgtca 21726124  T
Q  205 aaacgacccttcagttcatcgattttatcagcaatctgtttgtgtagttcctctggattaagtgcagtgttttctatgtattctgctgcccacttaagct 304  Q
    ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |  || | |||||||||||||||| |||||||||| |||| |    
T  21726123 aaatgacccttcagttcatcaatgttatcagcaatctttttgtgtagatcctctggaatgtgtccggtgttttctatgtattttgctgcccacataagtt 21726024  T
Q  305 tgtacttctctcctaacatcagatctgatctgtcatgatggataggacctattgacaacaacttgggtgtgtagtacttccccaaatttgacatctttct 404  Q
    |||||| |||| |||| ||||||| ||   | | |||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||| | |||| | || |||    | |||||    
T  21726023 tgtactactctgctaatatcagatttgtgttctgatgatgaataggacctattgacacacacttgggtgagtaatgcttctcaaagttttttctatttct 21725924  T
Q  405 gcggtaatatggcaccctttgtatctt-ggtcgtgaattttggggtgtttgctttgaattttgtaactcgacaaatttttctttaatagtttggggtgcc 503  Q
    | |  | | | |||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  21725923 gagagactttagcaccctttgtatcttcggtcttgaattttgggatatttgctttgatttttgtagttccacaaatttttctttaatagtttcggatgcc 21725824  T
Q  504 atcattcattcaatattctaatggttgagagatattgatct 544  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||    
T  21725823 atcattcattcaatatgataatggttgagggaaattgatct 21725783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 88 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 21704987 - 21704542
Alignment:
Q  88 ttatccaagatatacagcaaagaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctatgaaagccttcaagagactttccacttaaag 187  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||  | |||||||| |||||| |||||  ||| ||    
T  21704987 ttatccaagatatggagcaaagaacatccatccatgaacaatatccacgacagcttttcatcaaggcactcaaagccttgaagagagtttccggttagag 21704888  T
Q  188 ttaaaatatcgtcgctaaaacgacccttcagttcatcgattttatcagcaatctgtttgtgtagttcctctggattaagtgcagtgttttctatgtattc 287  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||     
T  21704887 ttaaaacatcatcgctaaaacgacccttcagttcatcaatgttatctgcaatctttttgtgtagttcctctggaataagtccggtgttttctatgtattt 21704788  T
Q  288 tgctgcccacttaagcttgtacttctctcctaacatcagatctgatctgtcatgatggataggacctattgacaacaacttgggtgtgtagtacttcccc 387  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||   |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| | || | |     
T  21704787 tgctgcccacataagcttgtacttctctcctaacttcagagttggattgtcatgatggataggacctatcgacactaacttgggtgagtaatgctgctca 21704688  T
Q  388 aaatttgacatctttctgcggtaatatggcaccctttgtatc-ttggtcgtgaattttggggtgtttgctttgaattttgtaactcgacaaatttttctt 486  Q
    || |||    |  ||||| | || | | |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21704687 aagttttttctacttctgagatactcttgcaccctttgtatctttggtcgtgcatttggaggtgtttgctttgaattttttaactcgacaaatttttctt 21704588  T
Q  487 taatagtttggggtgccatcattcattcaatattctaatggttgag 532  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21704587 taatagtttgggatgccatcattcattcaatataataatggttgag 21704542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 39 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 21652462 - 21651971
Alignment:
Q  39 cagttgatcaaccttaattttcatgtgccatggttcataaagattcgttttatccaagatatacagcaaagaacatccatccacgaacaacatccacgac 138  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||  || | ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21652462 cagttgatcaaccttaatattcatgtgccctgcttcatcaacgttggctttctccaagatatgcagcaacgaacatccatccacgaacaacatccacgac 21652363  T
Q  139 aacttttcttcaaggctatgaaagccttcaagagactttccacttaaagttaaaatatcgtcgctaaaacgacccttcagttcatcgattttatcagcaa 238  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |  |||||||| ||||    
T  21652362 aacttttcttcaaggctatcaaagccttcaagagacttgccagttaaagttaaaacatcgtcgctaaaatgaccctttagttcgttaattttatcggcaa 21652263  T
Q  239 tctgtttgtgtagttcctctggattaagtgcagtgttttctatgtattctgctgcccacttaagcttgtacttctctcctaacatcagatctgatctgtc 338  Q
    ||| ||||||| | |||||| || |||   |  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||    ||| || ||   ||||    
T  21652262 tctttttgtgtcgatcctctagaataaagccgttgttttctatgtattttgctgcccacataagcttatactcctctcctggtttcatatttgtattgtc 21652163  T
Q  339 atgatggataggacctattgacaacaacttgggtgtgtagtacttccccaaatttgacatctttctgcggtaatatggcaccctttgtatc-ttggtcgt 437  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| |  ||| | |||||     | |||||| | || | |||||||||||||||| ||||||||    
T  21652162 atgatggataggacctattgaaacaaacttgggggtgtaatgtttctcaaaattgtttctatttctgagatactgtggcaccctttgtatctttggtcgt 21652063  T
Q  438 gaattttggggtgtttgctttgaattttgtaactcgacaaatttttctttaatagtttggggtgccatcattcattcaatattctaatggtt 529  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  21652062 gaattttggggtgtttgctttgatttttgtagttccacaaatttttctttaatagtttgggatgccatcattcaatcaatataataatggtt 21651971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 21714610 - 21714067
Alignment:
Q  5 tctccaacaaaatcacatccatcatcaaaagaaacagttgatcaaccttaattttcatgtgccatggttcataaagattcgttttatccaagatatacag 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||||||||||| || ||||| |||| |||||||| ||| || | | | ||||||||||  ||    
T  21714610 tctccaacaaaagcacatccatcattacaagaacaagttgatcaaccttgatattcatttgccctggttcatcaagcttggctctctccaagatatgaag 21714511  T
Q  105 caaagaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctatgaaagccttcaagagactttccacttaaagttaaaatatcgtcgcta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |   || ||| ||||| ||||| |  |    
T  21714510 caaagaacatccatccacgaacaacatccacgatagcttttcttcaaggctaccaaagccttcaagagaccaactggttgaagctaaaacatcgttgtca 21714411  T
Q  205 aaacgacccttcagttcatcgattttatcagcaatctgtttgtgtagttcctctggattaagtgcagtgttttctatgtattctgctgcccacttaagct 304  Q
    ||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |  ||   |||||||||||||||| |||||||||| |||| |    
T  21714410 aaatgacccttcagttcatcaatgttatctgcaatctttttgtgtagatcctctggaatgtgtctggtgttttctatgtattttgctgcccacataagtt 21714311  T
Q  305 tgtacttctctcctaacatcagatctgatctgtcatgatggataggacctattgacaacaacttgggtgtgtagtacttccccaaatttgacatctttct 404  Q
    ||||||||||||||  | |||||| ||   ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| | |||| | |||||||   | |||||    
T  21714310 tgtacttctctcctttcttcagatttggattgtcatgatggataggacctaatgacacaaacttgggtgagtaatgcttctcaaaatttgttctatttct 21714211  T
Q  405 g---cggtaatatggcaccctttgtatctt-ggtcgtgaattttggggtgtttgctttgaattttgtaactcgacaaatttttctttaatagtttggggt 500  Q
    |   |||| |     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  21714210 gaaacggtca---accaccctttgtatcttcggtcgtgaattttggggtgtttgcattgatttttgtagctccacaaatttttctttaatagtttgggat 21714114  T
Q  501 gccatcattcattcaatattctaatggttgagagatattgatcttgcaaa 550  Q
    |||||| |||||||||||   ||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  21714113 gccatccttcattcaata---taatatttgagggatattgatctttcaaa 21714067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 21682077 - 21681500
Alignment:
Q  5 tctccaacaaaatcacatccatcatcaaaagaaacagttgatcaaccttaattttcatgtgccatggttcataaagattcgttttatccaagatatacag 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||||||  ||    
T  21682077 tctccaacaaaagcacatccatcatcacaagaaccagttgatcaaccttaacattcatgtgccctggttcataaagcatggttttctccaagatatgtag 21681978  T
Q  105 caaagaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctatgaaagccttcaagagactttccacttaaagttaaaatatcgtcgcta 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||  |||||||||||| ||||||||||    
T  21681977 caaagaacatccatccacgaacaacatccatgataacttttcttcaaggctatgatagccttcaagagactcgccggttaaagttaaaacatcgtcgcta 21681878  T
Q  205 aaacgacccttcagttcatcgattttatcagcaatctgtttgtgtagttcctctggattaagtgcagtgttttctatgtattctgctgcccacttaagct 304  Q
    ||| | ||||||| |||||| || ||||||||||| | ||||| ||| |||| | || |   | |||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||    
T  21681877 aaatggcccttcaattcatcaatgttatcagcaatttttttgtatagatccttttgaatgcttccagtgtttttgatgtattttgctgcccacataagct 21681778  T
Q  305 tgtacttctctcctaacatcagatctgatctgtcatgatggataggacctattgacaacaacttgggtgtgtagtacttccccaaatttgacatctttct 404  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||   || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| | || |   || ||||   | ||| |    
T  21681777 tgtacttctctcctaactttagatctgtattgccatgatggataggacctattgacacaaacttggggctgtaatgctccttaaattttgttctattttt 21681678  T
Q  405 gcggtaatatggcaccctttgtatc-ttggtcgtgaattttggggtgtttgctttgaat---------tttgtaactcgacaaatttttctttaa---ta 491  Q
    |   ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||         |||||| ||| ||||  ||||||| ||   ||    
T  21681677 gacataccgtggcaccctttgtatctttggtcgtgaattttggggtgtttgatttgtatctatgtatatttgtagctccacaatattttcttcaagggta 21681578  T
Q  492 gtttggggtgccatcattcattcaatattctaatggttgagagatattgatcttgcaaagtt-acgaaattatgaatc 568  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| |  |||||||||||  ||||||||||| |||| || |||||||||| ||||    
T  21681577 gtttgggatgacatcattcattcaatgtaataatggttgaggaatattgatctttcaaacttaacgaaattataaatc 21681500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 21785833 - 21785289
Alignment:
Q  5 tctccaacaaaatcacatccatcatcaaaagaaacagttgatcaaccttaattttcatgtgccatggttcataaagattcgttttatccaagatatacag 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||| || | ||| ||||||||||  ||    
T  21785833 tctccaacaaaagcacatccatcatcacaagaaccagttgatcaaccttaatattcatttgccctggtacatgaagcttggctttctccaagatatgtag 21785734  T
Q  105 caaagaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctatgaaagccttcaagagactttccacttaaagttaaaatatcgtcgcta 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||  ||  |||||||||||| ||| ||||||    
T  21785733 caaagaacatccatccacaaacaacatccacgacagcttttcttcaaggctaccaaagtcttcaagagactggccggttaaagttaaaacatcatcgcta 21785634  T
Q  205 aaacgacccttcagttcatcgattttatcagcaatctgtttgtgtagttcctctggattaagtgcagtgttttctatgtattctgctgcccacttaagct 304  Q
    ||| |||||||||||||||  || ||||| ||||||| ||||||||| ||   ||||||  |  |  | || || | ||||| ||| |||||| ||||||    
T  21785633 aaatgacccttcagttcattaatgttatcggcaatctttttgtgtagatcgcgtggattgcggcctatattctcgaggtattttgcggcccacataagct 21785534  T
Q  305 tgtacttctctcctaacatcagatctgatctgtcatgatggataggacctattgacaacaacttgggtgtgtagtacttccccaaatttgacatctttct 404  Q
    ||||||||||||||  | |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| | |||| | || |||  | | |||||    
T  21785533 tgtacttctctcctgtcttcagatttggattgtcatgatggataggacctattgacactaacttgggtgagtaatgcttctcaaagtttttcctatttct 21785434  T
Q  405 gcggtaatatggcaccctttgtatc-ttggtcgtgaattttggggtgtttgctttgaattttgtaactcgacaaatttttctttaa---tagtttggggt 500  Q
      | || | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||| || ||   ||||||||| |    
T  21785433 tagatactcttgcaccctttgtatctttggtcgtgaattttggggtatttgctttgaattttctagctccacaatttttttttcaagggtagtttgggat 21785334  T
Q  501 gccatcattcattcaatattctaatggttgagagatattgatctt 545  Q
    | ||||||| |||||||||  |||||||| || ||||||||||||    
T  21785333 gtcatcattgattcaatatgataatggttaagggatattgatctt 21785289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 21992609 - 21992069
Alignment:
Q  5 tctccaacaaaatcacatccatcatcaaaagaaacagttgatcaaccttaattttcatgtgccatggttcataaagattcgttttatccaagatatacag 104  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||| ||| || | ||| || ||||||||||     
T  21992609 tctccaacagaagcacatccatcatcacaagaaccagttgatcaactttaatattcatgtgcccaggttcatcaagcttggctttctctaagatatacaa 21992510  T
Q  105 caaagaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctatgaaagccttcaagagactttccacttaaagttaaaatatcgtcgcta 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||    
T  21992509 caaagaacatccatccacgaacaacatccatgacagcttttcttcgaggcttccaaagccttcaagagactttccagctaaagttaaaacatcgtcacta 21992410  T
Q  205 aaacgacccttcagttcatcgattttatcagcaatctgtttgtgtagttcctctggattaagtgcagtgttttctatgtattctgctgcccacttaagct 304  Q
    ||| |||||||||||||||| || |||||   ||||| ||||||||| ||   |||||||||| | |  ||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  21992409 aaatgacccttcagttcatcaatgttatcgataatctttttgtgtagatcgcatggattaagtcctgcattttcgatgtattttgctgcccacgtaagct 21992310  T
Q  305 tgtacttctctcctaacatcagatctg-at--------ctgtcatgatggataggacctattgacaacaacttgggtgtgtagtacttccccaaatttga 395  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||         || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||| | || | |      
T  21992309 tgtacttctctcctaacttcagatttgcattgcttgtattgccatgatggataggacctattgacaccaatttgggtgagtagtgcttctcaaagtcttt 21992210  T
Q  396 catctttctgcggtaatatggcaccctttgtatct-tggtcgtgaattttggggtgtttgctttgaattttgtaactcgacaaatttttctttaa---ta 491  Q
      | ||| || | || | || |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||    |    
T  21992209 tctatttttgagatactctgccaccctttgtatctgtgttcgtgaattttggggtatttgctttgaattttctagctccacaattttttcttcaagggaa 21992110  T
Q  492 gtttggggtgccatcattcattcaatattctaatggttgag 532  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21992109 gtttgggatgccatcattcattcaatataataatggttgag 21992069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 91 - 560
Target Start/End: Original strand, 21807972 - 21808445
Alignment:
Q  91 tccaagatatacagcaaagaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctatgaaagccttcaagagactttccacttaaagtta 190  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||  |||||||||    
T  21807972 tccaagatataaagcaaagagcatccatccacgaacaacatccatgacagcttttcttcaaggctaccaaagccttcaagagactggccggttaaagtta 21808071  T
Q  191 aaatatcgtcgctaaaacgacccttcagttcatcgattttatcagcaatctgtttgtgtagttcctctggattaagtgcagtgttttctatgtattctgc 290  Q
    ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||   |  |||||||||||||||  ||    
T  21808072 aaacatcgtcgccaaaatgacccttcagttcatcgatgttatcagcaatctttttgtgtagatcctctagaataaagccgctgttttctatgtatttcgc 21808171  T
Q  291 tgcccacttaagcttgtacttctctcctaacatcagatctgatctgt-catgatggataggacctattgacaacaacttgggtgtgtagtacttccccaa 389  Q
     | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | || | | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| | |||| | |     
T  21808172 agaccacataagcttgtacttctctcctaacttcagat-ttatatttccatgatggataggacctattgataccaacttgggtgagtaatgcttctcaag 21808270  T
Q  390 atttgacatctttctgcggtaatatggcaccctttgtatc-ttggtcgtgaattttggggtgtttgctttgaattttgtaactcgacaaatttttcttta 488  Q
    |||||   | |||||| | || |  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||| ||||  |||| || |    
T  21808271 atttgttctatttctgagatactcagccaccctttgtatctttggtcgtgaattttggggtatttgatttgaattttttagctccacaatctttttttca 21808370  T
Q  489 a---tagtttggggtgccatcattcattcaatattctaatggttgagagatattgatcttgcaaagttacgaaat 560  Q
    |   ||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  21808371 agggtagtttgggattccatcattcattcaatataataatggctgaggaatattgatcttgcaaagtaacgaaat 21808445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 90 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 21664443 - 21663994
Alignment:
Q  90 atccaagatatacagcaaagaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctatgaaagccttcaagagactttccacttaaagtt 189  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  21664443 atccaagatataaagcaaagagcatccatccacgaacaatatccacgacagcttttcttcaaggcttccaaagccttcaagagacttgccggttaaagtt 21664344  T
Q  190 aaaat---atcgtcgctaaaacgacccttcagttcatcgattttatcagcaatctgtttgtgtagttcctctggattaagtgcagtgttttctatgtatt 286  Q
    |||||   ||| |||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| |||  |||||| |||   || ||||| |||||||    
T  21664343 aaaattacatcatcgtcaaaatgacccttcagttcatcgatgttatcaaaaatctttttgtgtagatcccgtggattgagtcttgtattttcaatgtatt 21664244  T
Q  287 ctgctgcccacttaagcttgtacttctctcctaacatcagatctgatctgtcatgatggataggacctattgacaacaacttgggtgtgtagtacttccc 386  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||   || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||| |    
T  21664243 ttgctgcccacataagcttgtacttccctcctaacttcagatctgtattgccatgatggataggacctattgacaggaacttgggtgagtaatacttctc 21664144  T
Q  387 caaatttgacatctttctgcggtaatatggcaccctttgtatc-ttggtcgtgaattttggggtgtttgctttgaattttgtaactcgacaaatttttct 485  Q
     || |||    | |||||| | |  | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||| |    
T  21664143 aaagttttttctgtttctgagattgtgtggcaccctttgtatctttggtcgtgaactttggggtatttgctttgaattttctagctccacaatttttttt 21664044  T
Q  486 ttaa---tagtttggggtgccatcattcattcaatattctaatggttgag 532  Q
    | ||   ||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  21664043 tcaagggtagtttgggatgccatcattctttcaatataataatggttgag 21663994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 21647174 - 21646720
Alignment:
Q  5 tctccaacaaaatcacatccatcatcaaaagaaacagttgatcaaccttaattttcatgtgccatggttcataaagattcgttttatccaagatatacag 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||| || | ||| || ||||||| |||    
T  21647174 tctccaacaaaagcacatccatcatcacaagaaccagtttatcaaccttaatattcatctgccctggttcatgaagcttggctttctctaagatatgcag 21647075  T
Q  105 caaagaacatccat----ccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctatgaaagccttcaagagactttccacttaaagttaaaatatcgtc 200  Q
    ||||||||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||  | ||||||||||  |||||    
T  21647074 caaagaacatccatatatccacgaacaatatccacgacaacttttcttcaaggctacggaagcctttaagagacttgccggtcaaagttaaaacgtcgtc 21646975  T
Q  201 gctaaaacgacccttcagttcatcgattttatcagcaatctgtttgtgtagttcc-tctggattaagtgcagtgttttctatgtattctgctgcccactt 299  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||||  |||||| ||||||||| ||| |||  |||   | | |||||||  ||||||| |||||||||| |    
T  21646974 gctaaaatgacccttcagttcatcaatgttatctacaatctttttgtgtagatccttcttaatt-cttcccgtgtttttgatgtattttgctgcccacat 21646876  T
Q  300 aagcttgtacttctctcctaacatcagatctgatctgtcatgatggataggacctattgacaacaacttgggtgtgtagtacttccccaaatttgacatc 399  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||| | ||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | || | | || ||||   |     
T  21646875 aagcttgtatttctctcctatcttcagctttggattgtcatgatggataggacctattgacaccaacttgggggtgtaatgctcctcaaattttgttcta 21646776  T
Q  400 tttctgcggtaatatggcaccctttgtatc-ttggtcgtgaattttggggtgtttg 454  Q
    |||||| | || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21646775 tttctgagatactgtggcaccctttgtatctttggtcgtgaattttggggtgtttg 21646720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 21623620 - 21623252
Alignment:
Q  5 tctccaacaaaatcacatccatcatcaaaagaaacagttgatcaaccttaattttcatgtgccatggttcataaagattcgttttatccaagatatacag 104  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||  | ||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||| ||| || | | |||||| ||||| |||    
T  21623620 tctccaacaaaaccacatcaatcatcacaagattccgttgatcaagcttaatattcatctgccctggttcatgaagcttggctgtatccatgatatgcag 21623521  T
Q  105 caaagaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctatgaaagccttcaagagactttccacttaaagttaaaatatcgtcgcta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||    
T  21623520 caaagaacatccatccacgaacaacatccacgacagcttttctttaatgctaccaaagccttcaagagactttccggttaaagttaaaacatcgtcacta 21623421  T
Q  205 aaacgacccttcagttcatcgattttatcagcaatctgtttgtgtagttcc-tctgga-ttaagtgcagtgttttctatgtattctgctgcccacttaag 302  Q
    ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| |  ||| |||| | ||   ||  |||||||  ||||||| |||||||||| ||||    
T  21623420 aaatgacccttcagttcatcaatattatcagcaatcttgttgtgcatatccttctgaacttttctg--gtgtttttgatgtattttgctgcccacataag 21623323  T
Q  303 cttgtacttctctcctaacatcagatctgatctgtcatgatggataggacctattgacaacaacttgggtg 373  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||   || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21623322 cttgtacttctctcctaacttcagatttgtattgccatgatggataggacctattgacaccaacttgggtg 21623252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 88 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 15713967 - 15713474
Alignment:
Q  88 ttatccaagatatacagcaaagaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctatgaaagccttcaagagactttccacttaaag 187  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||  ||| |||| ||| ||||||||  ||||||    
T  15713967 ttatccaagatatgcagcaaagagcatccatccacgaacaacatccatgacagcttttcttctaggctaccaaatccttgaagtgactttccggttaaag 15713868  T
Q  188 ttaaaatatcgtcgctaaaacgacccttcagttcatcgattttatcagcaatctgtttgtgtagttcctctggattaagtgcagtgttttctatgtattc 287  Q
    |||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||| || |   | |||||||||  |||||||     
T  15713867 ttaaaacatcgtcactaaaatgacacttcagttcatcaatgttatcagcaatctttttgtgcagttcctctagaatgcttccagtgtttttgatgtattt 15713768  T
Q  288 tgctgcccacttaagcttgtacttctctcctaacatcagatctgatctgtcatgatggataggacctattgacaacaacttgggtgtgtagtacttcccc 387  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||| ||| || | |||| ||   |||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||| ||| | | || |     
T  15713767 tgccgcccacataagcttgtacttctcccctgactttagatttgtattgtcatgatggatagggcctattgaaaccaacttaggtgcgtaatgcatctca 15713668  T
Q  388 aaatttgacatctttctgcggtaatatggcaccctttgtatc-ttggtcgtgaattttggggtgtttgctttg---------aattttgtaactcgacaa 477  Q
     |||||    | |||||| | ||   |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||         || |||||| ||| ||||    
T  15713667 taatttttactttttctgagatagcctggcaccctttgtatctttggtcgtgaactttggggtgtttgctttgtatttatgtaactttgtagctccacaa 15713568  T
Q  478 atttttctttaa---tagtttggggtgccatcattcattcaatattctaatggttgagagatattgatcttgcaaagttacgaaattatgaatc 568  Q
     ||||| || ||   ||||||| | |||||||||||||||| |||  | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15713567 tttttttttcaagggtagtttgcgatgccatcattcattcattataatcatggttgagggatattgatcttgcaaagtcacgaaattatgaatc 15713474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 88 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 21745876 - 21745570
Alignment:
Q  88 ttatccaagatatacagcaaagaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctatgaaagccttcaagagactttccacttaaag 187  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  21745876 ttatccaagatatggagcaaagaacatccatctacgaataacatccacgacagcttttcttcaaggcattcaaagccttgaagagaatttccagttaaag 21745777  T
Q  188 ttaaaatatcgtcgctaaaacgacccttcagttcatcgattttatcagcaatctgtttgtgtagttcctctggattaagtgcagtgttttctatgtattc 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||| || || | ||||||  |  | || || || | |||||     
T  21745776 ttaaaacatcgtcgctaaaacgacccttcagttcatcaatgttatcaacaatctttttgtgcagatcgtgtggattgtggcctgtattctcgaggtattt 21745677  T
Q  288 tgctgcccacttaagcttgtacttctctcctaacatcagatctgatctgtcatgatggataggacctattgacaacaacttgggtgtgtagtacttcccc 387  Q
    |||||||||| ||||||| ||||  ||||||  | | |||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||| |     
T  21745676 tgctgcccacataagcttatactcttctcctgtctttagatttggattgtcatgatggataggacctaatgacaccaacttgggtgagtaatgcttctca 21745577  T
Q  388 aaatttg 394  Q
    |||||||    
T  21745576 aaatttg 21745570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 91 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21792352 - 21792084
Alignment:
Q  91 tccaagatatacagcaaagaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctatgaaagccttcaagagactttccacttaaagtta 190  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||| |   |||||||||    
T  21792352 tccaagatatgcaacaaagaacatccatccacgaacaatatccatgacagcttttcttcgaggctaccaaagccgtcaagagacttgcgggttaaagtta 21792253  T
Q  191 aaatatcgtcgctaaaacgacccttcagttcatcgattttatcagcaatctgtttgtgtagttcctctggattaagtgcagtgttttctatgtattctgc 290  Q
    ||| ||| |||||||||||| |||||||   ||| || ||||| ||||||| |||||| || || |   || |   | |||| ||||  |||||||||||    
T  21792252 aaacatcatcgctaaaacgatccttcagcgtatcaatgttatcggcaatctttttgtgcagatctttcagaatgctttcagtttttttgatgtattctgc 21792153  T
Q  291 tgcccacttaagcttgtacttctctcctaacatcagatctgatctgtcatgatggataggacctattga 359  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||    
T  21792152 tgcccacataagcttgtacttctctcctaactccagatctgtactgccatgatggatgggacctattga 21792084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21689840 - 21689479
Alignment:
Q  5 tctccaacaaaatcacatccatcatcaaaagaaacagttgatcaaccttaattttcatgtgccatggttcataaagattcgttttatccaagatatacag 104  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||| || |   ||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||  |||  |   ||| ||||||||||| ||    
T  21689840 tctctaacaaaagcacatccaccatcacaatagctagttgatcaaccttaatatccataggccctggttcaacaagcctgtctttctccaagatataaag 21689741  T
Q  105 caaagaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctatgaaagccttcaagagactttccacttaaagttaaaatatcgtcgcta 204  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||  | || ||||||| ||||||   |    
T  21689740 caaagagcatccatccaccaacaacatccacgatagcttttcttcaagactatcaaagccttcgagagaatttccggtcaatgttaaaacatcgtcatca 21689641  T
Q  205 aaacgacccttcagttcatcgattttatcagcaatctgtttgtgtag-ttcctctggattaagtgcagtgttttctatgtattctgctgcccacttaagc 303  Q
    ||| |||||||||||| ||| || |||||| |||| | ||||||||| | ||||| || |   | |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||    
T  21689640 aaatgacccttcagtttatcaatgttatcaacaatgtttttgtgtagatccctct-gaatgcttccagtgtttttgatgtattttgctgcccacataagc 21689542  T
Q  304 ttgtacttctctcctaacatcagatctgatctgtcatgatggataggacctattgacaacaac 366  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |    || ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21689541 ttgtacttctctcctaactttagagatttattgccatgatggataggaccttttgacatcaac 21689479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 450 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 21741087 - 21740994
Alignment:
Q  450 gtttgctttgaattttgtaactcgacaaatttttctttaatagtttggggtgccatcattcattcaatattctaatggttgagagatattgatc 543  Q
    ||||||||| | ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  21741087 gtttgctttaatttttgtagctccacaattttttctttaatagtttgggatgccatcattcattcaatataataatggttgaggaatattgatc 21740994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 21764471 - 21764409
Alignment:
Q  5 tctccaacaaaatcacatccatcatcaaaagaaacagttgatcaaccttaattttcatgtgcc 67  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21764471 tctccaacaaaagcacatccatcatcacaagaaccagttgaccaaccttaatcttcatgtgcc 21764409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 21664534 - 21664483
Alignment:
Q  5 tctccaacaaaatcacatccatcatcaaaagaaacagttgatcaaccttaat 56  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21664534 tctccaacaaaagcacatccatcatcacaagaaccagttgatcaaccttaat 21664483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 3)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 256 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 25486 - 25182
Alignment:
Q  256 tctggattaagtgcagtgttttctatgtattctgctgcccacttaagcttgtacttctctcctaacatcagatctgatctgtcatgatggataggaccta 355  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    |||||||||||||||||||||    
T  25486 tctggattaagtggagtgttttctatgtattctgctgcccacttaagcttgtacttctctcctaacttcagatttttattgtcatgatggataggaccta 25387  T
Q  356 ttgacaacaacttgggtgtgtagtacttccccaaatttgacatctttctgcggtaatatggcaccctttgtatcttgg-tcgtgaattttggggtgtttg 454  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  25386 ttgacaccaacttgggtttgtagtacttcctcaaatttggtatctttctgcggtaatatgccaccctttgtatcttgggtggtgaattttggggtgtttg 25287  T
Q  455 ctttgaattttgtaactcgacaaatttttctttaatagtttggggtgccatcattcattcaatattctaatggttgagagatattgatcttgcaaagtta 554  Q
    |||||| ||||||| |||  ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25286 ctttgatttttgtagctcctcaattttttctttaagagtttgggctgccatcattcattcaatacactaatggttgagggatattgatcttgcaaagtta 25187  T
Q  555 cgaaa 559  Q
    |||||    
T  25186 cgaaa 25182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25798 - 25526
Alignment:
Q  7 tccaacaaaatcacatccatcatcaaaagaaacagttgatcaaccttaattttcatgtgccatggttcataaagattcgttttatccaagatatacagca 106  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| | || ||| | || | |  | |  || ||||||||||  ||||    
T  25798 tccaacaaaaccacatccaccatcacaagaaaaagttgatcaaccttaatattcattttccctgggttattacgtctggcattctccaagatatgtagca 25699  T
Q  107 aagaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctatgaaagccttcaagagactttccacttaaagttaaaatatcgtcgctaaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  25698 aagaacatccatccacgaacaacatcaacgacagcttttcttcaagggtaccaaagccttcaagagactttttagttaaagttaaaacatcctcgctaaa 25599  T
Q  207 acgacccttcagttcatcgattttatcagcaatctgtttgtgtagttcctctggattaagtgcagtgttttct 279  Q
    | |||||||||  | || ||| |  ||| |||||| ||||| ||||| |||||  |||||||||  |||||||    
T  25598 atgacccttcaaattattgatgtcttcatcaatctttttgtatagtttctctgctttaagtgcaaagttttct 25526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 451 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 34514 - 34421
Alignment:
Q  451 tttgctttgaattttgtaactcgacaaatttttctttaatagtttggggtgccatcattcattcaatattctaatggttgagagatattgatct 544  Q
    |||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||    
T  34514 tttgctttgatttttgtagttccacaaatttttctttaatagtttcggatgccatcattcattcaatatgataatggttgagggaaattgatct 34421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 168
Target Start/End: Original strand, 18192060 - 18192123
Alignment:
Q  105 caaagaacatccatccacgaacaacatccacgacaacttttcttcaaggctatgaaagccttca 168  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | | ||| ||||||||||    
T  18192060 caaagaacatccatccacaaacaacatccatgatagcttttcttccaagttatcaaagccttca 18192123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 2650 times since January 2019
Visitors: 4010