View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0671_low_8 (Length: 489)

Name: NF0671_low_8
Description: NF0671
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0671_low_8
NF0671_low_8
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (89-475)||(16884285-16884671)
chr7 (89-475)||(24261666-24262052)
chr7 (89-473)||(12405695-12406079)
chr7 (89-472)||(18413016-18413399)
chr7 (89-472)||(9185503-9185886)
chr7 (89-472)||(21645383-21645766)
chr7 (92-472)||(21988281-21988661)
chr7 (89-472)||(49091035-49091418)
chr7 (89-485)||(47675499-47675895)
chr7 (89-289)||(5817714-5817914)
chr7 (90-472)||(38394486-38394868)
chr7 (90-472)||(1048695-1049077)
chr7 (138-472)||(6593944-6594278)
chr7 (138-472)||(18391582-18391916)
chr7 (90-472)||(7093867-7094249)
chr7 (138-472)||(7351105-7351439)
chr7 (102-472)||(22135303-22135673)
chr7 (102-472)||(40550330-40550700)
chr7 (90-339)||(36083-36332)
chr7 (138-312)||(48489988-48490162)
chr7 (138-469)||(44725078-44725409)
chr7 (138-440)||(6047016-6047318)
chr7 (138-319)||(6570563-6570744)
chr7 (139-469)||(13289954-13290284)
chr7 (361-472)||(48489854-48489965)
chr7 (380-472)||(5817614-5817706)
chr7 (138-469)||(24749090-24749421)
chr7 (144-469)||(21678561-21678887)
chr7 (102-472)||(31159120-31159476)
chr7 (144-469)||(28486068-28486393)
chr7 (144-244)||(4295401-4295501)
chr7 (144-472)||(7471441-7471769)
chr7 (138-232)||(26213460-26213554)
chr7 (144-237)||(20298050-20298143)
chr7 (361-472)||(20297861-20297972)
chr7 (138-231)||(3890845-3890938)
chr7 (191-232)||(3903937-3903978)
[»] chr3 (51 HSPs)
chr3 (89-475)||(32479698-32480084)
chr3 (89-484)||(8516452-8516847)
chr3 (92-472)||(3323893-3324274)
chr3 (89-472)||(16263721-16264104)
chr3 (139-485)||(22834420-22834765)
chr3 (89-485)||(7762677-7763077)
chr3 (139-485)||(37407099-37407445)
chr3 (89-485)||(29811279-29811675)
chr3 (138-485)||(23199549-23199896)
chr3 (138-485)||(32891500-32891847)
chr3 (138-472)||(5259733-5260067)
chr3 (138-485)||(6716923-6717270)
chr3 (143-485)||(9635539-9635881)
chr3 (138-472)||(10209624-10209958)
chr3 (102-472)||(456377-456747)
chr3 (138-472)||(4600130-4600464)
chr3 (90-472)||(43226547-43226929)
chr3 (137-485)||(23409741-23410089)
chr3 (141-472)||(10058890-10059221)
chr3 (138-472)||(10056668-10057002)
chr3 (138-472)||(10061112-10061446)
chr3 (138-472)||(10063334-10063668)
chr3 (138-472)||(10065556-10065890)
chr3 (90-472)||(5192120-5192502)
chr3 (90-472)||(10957729-10958111)
chr3 (90-472)||(11168571-11168953)
chr3 (102-469)||(6065211-6065578)
chr3 (90-469)||(18098577-18098955)
chr3 (138-472)||(3315152-3315486)
chr3 (102-395)||(5897956-5898249)
chr3 (144-472)||(42990769-42991097)
chr3 (138-472)||(23633914-23634249)
chr3 (90-244)||(4309916-4310070)
chr3 (108-237)||(7769260-7769389)
chr3 (138-263)||(15830652-15830777)
chr3 (146-440)||(1619936-1620227)
chr3 (90-440)||(27421140-27421490)
chr3 (361-472)||(25637878-25637989)
chr3 (138-469)||(25634349-25634681)
chr3 (144-241)||(53917134-53917231)
chr3 (179-244)||(43422963-43423028)
chr3 (89-169)||(9602495-9602575)
chr3 (361-469)||(53917343-53917451)
chr3 (138-223)||(15822096-15822181)
chr3 (361-457)||(53597711-53597807)
chr3 (360-479)||(29913640-29913759)
chr3 (402-468)||(10621244-10621310)
chr3 (144-472)||(28101468-28101796)
chr3 (179-322)||(53597846-53597989)
chr3 (410-472)||(5886670-5886732)
chr3 (361-469)||(43423145-43423253)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (89-475)||(14652-15038)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (89-475)||(149298-149684)
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (89-475)||(10684607-10684993)
chr8 (89-475)||(35744748-35745134)
chr8 (89-472)||(18853509-18853892)
chr8 (90-485)||(6813052-6813447)
chr8 (162-472)||(23799908-23800217)
chr8 (89-326)||(26300696-26300933)
chr8 (138-485)||(34255917-34256264)
chr8 (89-472)||(4732081-4732464)
chr8 (102-472)||(43080148-43080518)
chr8 (90-472)||(18811254-18811636)
chr8 (90-472)||(27827531-27827913)
chr8 (139-342)||(5591439-5591641)
chr8 (90-315)||(450687-450912)
chr8 (90-472)||(15069113-15069495)
chr8 (138-472)||(21481042-21481376)
chr8 (138-457)||(31577748-31578066)
chr8 (207-469)||(17848038-17848300)
chr8 (288-470)||(18105637-18105819)
chr8 (138-245)||(17848299-17848406)
chr8 (361-472)||(41383206-41383317)
chr8 (273-472)||(13985412-13985615)
chr8 (144-244)||(41383427-41383527)
chr8 (386-469)||(14418897-14418980)
chr8 (367-436)||(18199287-18199356)
chr8 (381-466)||(32429528-32429613)
chr8 (140-220)||(32429287-32429367)
[»] chr6 (37 HSPs)
chr6 (92-475)||(33330789-33331172)
chr6 (89-475)||(14737915-14738301)
chr6 (89-472)||(18232218-18232601)
chr6 (134-472)||(9035700-9036038)
chr6 (177-449)||(24078354-24078628)
chr6 (138-485)||(5408480-5408827)
chr6 (138-485)||(5412805-5413152)
chr6 (138-472)||(16553099-16553433)
chr6 (138-472)||(16629655-16629989)
chr6 (138-472)||(34165307-34165641)
chr6 (102-472)||(33309381-33309750)
chr6 (102-472)||(26931981-26932351)
chr6 (153-472)||(26067864-26068183)
chr6 (90-244)||(12936655-12936809)
chr6 (89-339)||(12157875-12158125)
chr6 (288-472)||(16555308-16555492)
chr6 (288-472)||(16631864-16632048)
chr6 (102-322)||(25462883-25463103)
chr6 (134-470)||(28301322-28301663)
chr6 (134-470)||(28510410-28510751)
chr6 (138-265)||(16651566-16651693)
chr6 (326-472)||(16578101-16578247)
chr6 (326-472)||(16617133-16617279)
chr6 (138-472)||(3394889-3395221)
chr6 (141-240)||(30444016-30444115)
chr6 (144-472)||(3631403-3631731)
chr6 (410-470)||(21198602-21198662)
chr6 (138-244)||(15534056-15534162)
chr6 (361-469)||(25465282-25465389)
chr6 (90-196)||(12910979-12911085)
chr6 (360-469)||(5165528-5165637)
chr6 (138-322)||(26944165-26944349)
chr6 (410-469)||(30443809-30443868)
chr6 (138-484)||(17012542-17012888)
chr6 (134-253)||(21198474-21198593)
chr6 (360-469)||(15540826-15540935)
chr6 (361-457)||(11137078-11137174)
[»] chr2 (19 HSPs)
chr2 (89-475)||(19348635-19349021)
chr2 (89-472)||(25403008-25403391)
chr2 (89-472)||(23078813-23079196)
chr2 (89-472)||(10445786-10446169)
chr2 (90-472)||(16387824-16388204)
chr2 (102-472)||(36560559-36560929)
chr2 (90-472)||(19503742-19504124)
chr2 (102-472)||(35217388-35217758)
chr2 (90-472)||(21520100-21520482)
chr2 (90-472)||(22405336-22405718)
chr2 (288-485)||(723308-723505)
chr2 (137-244)||(34574611-34574718)
chr2 (376-472)||(3277664-3277760)
chr2 (138-472)||(6263608-6263941)
chr2 (382-472)||(30720322-30720412)
chr2 (363-485)||(42019522-42019644)
chr2 (361-479)||(34574827-34574944)
chr2 (404-456)||(28570133-28570185)
chr2 (138-206)||(42019300-42019368)
[»] chr5 (36 HSPs)
chr5 (89-475)||(33790673-33791059)
chr5 (89-475)||(31397335-31397721)
chr5 (89-475)||(37556967-37557353)
chr5 (89-475)||(27449180-27449566)
chr5 (119-484)||(43598120-43598489)
chr5 (119-484)||(43603612-43603981)
chr5 (119-484)||(43609104-43609473)
chr5 (89-472)||(24555931-24556314)
chr5 (89-472)||(24596962-24597346)
chr5 (208-472)||(42126747-42127011)
chr5 (138-485)||(9788632-9788979)
chr5 (138-470)||(26171192-26171524)
chr5 (89-485)||(534169-534565)
chr5 (138-485)||(29720785-29721132)
chr5 (90-472)||(34841975-34842360)
chr5 (186-462)||(5599353-5599629)
chr5 (138-485)||(42427842-42428188)
chr5 (90-472)||(34478825-34479207)
chr5 (138-472)||(40380539-40380873)
chr5 (102-472)||(15356267-15356637)
chr5 (102-472)||(23665537-23665907)
chr5 (138-472)||(16544860-16545197)
chr5 (102-472)||(10750189-10750559)
chr5 (90-472)||(6745559-6745941)
chr5 (90-472)||(18467175-18467557)
chr5 (102-472)||(31543224-31543594)
chr5 (90-323)||(13694504-13694736)
chr5 (144-470)||(27910925-27911251)
chr5 (145-469)||(20043479-20043802)
chr5 (139-265)||(16407965-16408091)
chr5 (144-472)||(25805952-25806280)
chr5 (144-322)||(658659-658837)
chr5 (402-472)||(23792980-23793050)
chr5 (186-224)||(31304065-31304103)
chr5 (138-220)||(32577634-32577716)
chr5 (362-485)||(13695329-13695453)
[»] chr1 (32 HSPs)
chr1 (89-475)||(41397597-41397983)
chr1 (89-472)||(19359184-19359567)
chr1 (89-472)||(47099165-47099547)
chr1 (89-472)||(17345860-17346243)
chr1 (89-472)||(9024171-9024553)
chr1 (138-472)||(28222832-28223166)
chr1 (89-472)||(31657627-31658010)
chr1 (102-472)||(16226659-16227029)
chr1 (90-472)||(51750528-51750910)
chr1 (138-342)||(3157216-3157420)
chr1 (90-472)||(27338539-27338921)
chr1 (138-408)||(50168761-50169030)
chr1 (102-472)||(47177853-47178223)
chr1 (90-472)||(51758025-51758407)
chr1 (93-436)||(20300658-20301001)
chr1 (89-203)||(775765-775879)
chr1 (90-302)||(28203105-28203317)
chr1 (90-296)||(28841089-28841295)
chr1 (102-484)||(50078212-50078594)
chr1 (90-339)||(3805544-3805793)
chr1 (144-469)||(31736936-31737261)
chr1 (146-265)||(16456348-16456467)
chr1 (138-322)||(8348519-8348703)
chr1 (144-322)||(6996225-6996403)
chr1 (90-435)||(13127141-13127486)
chr1 (210-302)||(13784790-13784882)
chr1 (288-441)||(16456048-16456201)
chr1 (382-469)||(31424720-31424807)
chr1 (361-469)||(13784941-13785049)
chr1 (361-469)||(14183293-14183401)
chr1 (382-470)||(45655324-45655412)
chr1 (138-256)||(16429655-16429773)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (89-475)||(9224747-9225133)
chr4 (89-472)||(16624351-16624734)
chr4 (89-485)||(5872225-5872621)
chr4 (141-485)||(52094776-52095120)
chr4 (138-485)||(12743339-12743686)
chr4 (138-472)||(5136515-5136849)
chr4 (138-472)||(7123131-7123465)
chr4 (138-472)||(8393842-8394175)
chr4 (102-472)||(16933566-16933936)
chr4 (90-472)||(22134023-22134405)
chr4 (90-472)||(11007974-11008356)
chr4 (102-472)||(22782155-22782525)
chr4 (138-472)||(4588375-4588709)
chr4 (89-469)||(10113406-10113786)
chr4 (90-457)||(22046121-22046488)
chr4 (138-472)||(26558132-26558466)
chr4 (153-472)||(9175941-9176263)
chr4 (144-469)||(14788893-14789218)
chr4 (144-457)||(47563315-47563628)
chr4 (140-301)||(3578150-3578311)
chr4 (102-237)||(12402514-12402649)
chr4 (145-322)||(18536965-18537142)
chr4 (274-485)||(46146943-46147153)
chr4 (147-339)||(5207083-5207275)
chr4 (144-472)||(36920958-36921286)
chr4 (361-472)||(21549164-21549275)
chr4 (288-472)||(18310979-18311163)
chr4 (288-472)||(18408956-18409140)
chr4 (144-472)||(22802197-22802525)
chr4 (134-250)||(31480949-31481065)
chr4 (296-472)||(11435500-11435676)
chr4 (102-237)||(12395278-12395412)
chr4 (102-237)||(12400240-12400374)
chr4 (361-456)||(5207485-5207580)
chr4 (153-322)||(36378979-36379148)
chr4 (368-440)||(3677844-3677916)
chr4 (361-469)||(16453851-16453959)
chr4 (134-198)||(21549308-21549372)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (89-475)||(220-606)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (89-472)||(18290-18673)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (89-472)||(1865-2248)
[»] scaffold0842 (1 HSPs)
scaffold0842 (89-472)||(3538-3921)
[»] scaffold0087 (1 HSPs)
scaffold0087 (171-472)||(37173-37474)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (132-471)||(29833-30169)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (132-471)||(42675-43011)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (141-485)||(115013-115357)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (102-472)||(22617-22987)
[»] scaffold1991 (1 HSPs)
scaffold1991 (89-217)||(1022-1150)
[»] scaffold1899 (1 HSPs)
scaffold1899 (90-472)||(115-497)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (90-427)||(34086-34423)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (90-319)||(72923-73152)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (144-469)||(50512-50837)
[»] scaffold0491 (1 HSPs)
scaffold0491 (382-485)||(10815-10918)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (273-472)||(12464-12663)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (144-469)||(80360-80685)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (144-472)||(912-1240)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (89-231)||(26778-26920)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (138-237)||(26344-26443)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 387; Significance: 0; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 89 - 475
Target Start/End: Original strand, 16884285 - 16884671
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16884285 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 16884384  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16884385 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 16884484  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16884485 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 16884584  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccc 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16884585 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccc 16884671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 89 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 24262052 - 24261666
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24262052 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 24261953  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24261952 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 24261853  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24261852 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 24261753  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccc 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24261752 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccc 24261666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 89 - 473
Target Start/End: Original strand, 12405695 - 12406079
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12405695 atcatcaagaatcttgttaaactccgtaagttgctccgagattgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 12405794  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12405795 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgtcgcggtagcttctctcgcgacatccaataagaccttatctccgagacata 12405894  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12405895 acacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 12405994  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgac 473  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12405995 ttgttgtgtcaaaactgcttgcatcttaaccttccacaactcgaaatcattacttccggtaaacttctcgatgtcccactttgac 12406079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 89 - 472
Target Start/End: Original strand, 18413016 - 18413399
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18413016 atcaacaagaatcttgttaaattccgtcaattgctccgagattgatatagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgtttcaagagttgcctatga 18413115  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18413116 gccaaagatttcgtcatgtacaatgactccaacttagctcacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 18413215  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18413216 aaacaatagcactctttgccttgtctatcatctcccgcttctcttcttgtgtcaaagttgccggcatagccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 18413315  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18413316 ttgttgtgtcaaaactgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 18413399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 89 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 9185886 - 9185503
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  9185886 atcatcaagaatcttgttaaattccgccaattgcttcgagattgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgtttcgagagctgcctatga 9185787  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9185786 gccaaagatttcatcacgtacaatgactccaacttagcccacatcgatgccacggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 9185687  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9185686 aaacaatggtactcttagccttgtctatcatctcacgcttctccacttgtgtcaaattcgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 9185587  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9185586 ttgttgtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaattattacttctggtgaacttctcgatgtcccactttga 9185503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 89 - 472
Target Start/End: Original strand, 21645383 - 21645766
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  21645383 atcatcaagaatcttgctaaattccgtcaatagctccgagattgatttagactccaccatcttgaatgaataaagttgttgtttcaagagttgcttatga 21645482  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    || |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21645483 gctaaagatttcgtcatgtacaataactccaacttagcccacatcgatgtcgcggtagcttctctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 21645582  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21645583 aaacaatagcactctttgccttgtctatcatctcctacttctcttcttgtgtcaaagttgccggcatagccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 21645682  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||  |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21645683 tttatgtgtcaaaaccgcttgcatcttaatcttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 21645766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 92 - 472
Target Start/End: Original strand, 21988281 - 21988661
Alignment:
Q  92 atcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagcc 191  Q
    ||||||||| |||||||| | ||  | ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  21988281 atcaagaattttgttaaatttcgccaattgctccaagattgatttagactccaccatcttgaatgagtagagttgttgtttcaagagttgcctatgatcc 21988380  T
Q  192 aaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataaga 291  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  21988381 aacgatttcgtcatgtacaatgactccaacttagcccacaacgaccccgcggtagcttctctcgcgacatcccttcagaccttatctccgagacataaaa 21988480  T
Q  292 caatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttg 391  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  21988481 aaatggcactctttgccttgtctatcatctcacgcttctctgcttgtgtcaaagttgccggcatcgccgctacacccttcaatgcttctacatacttttg 21988580  T
Q  392 ttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21988581 ttgtgtcaaaaccgcttgcatcttaactttccagaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 21988661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 89 - 472
Target Start/End: Original strand, 49091035 - 49091418
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  49091035 atcatcaagaattttgttaaattccatcaattgctccgagattgatttagactccaccatcttgaatgaatagaattgttgtttcaagagttgcctatga 49091134  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  49091135 gccaacgatttcgtcatgtacaatgactccaacttagcccacatcgatgccatggtagcttctctcgtgacattgcttaagaccttatctccgagacata 49091234  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49091235 aaacaatggcactctttgccttgtctattatctctcgcttctccgcttgtgtcaaactcgtcgggatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 49091334  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  49091335 ttgttgtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttctagtgaacttctcgatgtcccactttga 49091418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 89 - 485
Target Start/End: Original strand, 47675499 - 47675895
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||   |  |  || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || ||||||||||    
T  47675499 atcatcaaggattttgttgaactccgttaattgctccatcacagtctttgactccaccatcttgaatgattagagttgttgcttaaggaattgcctatga 47675598  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||| || || || || ||||| || |    
T  47675599 gccaaagatttggtcatatacaatgactcaaactttgaccacatcgacgccgcggtaggttcctttgcgacatccctcaaaactttgtcaccgaggcaca 47675698  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    | |||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||||| | ||||||||| |||  |||||| |||  ||||||||||||| ||||   |||||||    
T  47675699 atacaatggcactcctagccttgtccaccatctcggtcttctacgcttgtgtcatggtgaccggcaacgcaccttcacccttcaaagctttctcacactt 47675798  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccctatgctactc 485  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| || ||| |||||    
T  47675799 ttgttgtatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccaaaatcattacttccggtgaacttctcaatataccactttgaacccatggtactc 47675895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 89 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5817914 - 5817714
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| | | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  5817914 atcatcaagaattttattaaattccatcaattgctctgagattgatttagactccaccatcttgaatgagtagagttgttgtttcaagagtttcctatga 5817815  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5817814 gtcaacgattttgtcatatacaatgactccaacttagcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 5817715  T
Q  289 a 289  Q
    |    
T  5817714 a 5817714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 90 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 38394868 - 38394486
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||    
T  38394868 tcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcttgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgag 38394769  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataa 289  Q
    ||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || || || || || || ||||| ||||| || ||    
T  38394768 ccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctctcaaaactttatccccgaggcacaa 38394669  T
Q  290 gacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttt 389  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   ||||||||    
T  38394668 gacaatggcactcctggccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttt 38394569  T
Q  390 tgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    || ||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  38394568 tgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcgatatcccactttga 38394486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 90 - 472
Target Start/End: Original strand, 1048695 - 1049077
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||||| ||| |    
T  1048695 tcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgcg 1048794  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataa 289  Q
    ||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | || || || || || || ||||| ||||| || ||    
T  1048795 ccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctctcaaaactttatccccgaggcacaa 1048894  T
Q  290 gacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttt 389  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   ||||||||    
T  1048895 gacaatggcactcctgaccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttt 1048994  T
Q  390 tgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  1048995 tgttgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatcccactttga 1049077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 138 - 472
Target Start/End: Original strand, 6593944 - 6594278
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||    
T  6593944 gactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatg 6594043  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||| || || || || ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  6594044 ccgcggttggttccttcgcgacatccctcaaaactttgtccccgaggcacaagacaatggcgctccttgccttgtccaccatctcggtcttctcctcttg 6594143  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    ||  | |||  | |||| |||  ||||||||||||| ||||   ||||||| |||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  6594144 tgatatggtgtctggcaacgcaccttcacccttcaaagctttctcacacttctgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccacaacccaaaatcg 6594243  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||    |||||||||||||| || |||||||||||    
T  6594244 ttgagcccggtgaacttctcaatatcccactttga 6594278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 138 - 472
Target Start/End: Original strand, 18391582 - 18391916
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||    
T  18391582 gactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatg 18391681  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  18391682 ccgcggttggttccttcgcgacatccctcaaaactttatccccgaggcacaagacaatggcgctcctcgccttgtccaccatctcggtcttctcctcttg 18391781  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    || || |||  ||||||   |  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  18391782 tgacatggtgtccggcaaaccaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccacaacccaaaatcg 18391881  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||    |||||||||||||| || | |||||||||    
T  18391882 ttgagcccggtgaacttctcaatattccactttga 18391916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 90 - 472
Target Start/End: Original strand, 7093867 - 7094249
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||| | |||||    
T  7093867 tcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgtcgatgag 7093966  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataa 289  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | || || || || || || ||||| || || |||||    
T  7093967 ccaaagactttgtcatatacaaagactccaactttgcccacatcgatgtcgcggttgcttcctttgctacttctctcaaaactttatccccaaggcataa 7094066  T
Q  290 gacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttt 389  Q
    ||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||   ||||||| || ||| || |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   ||||||||    
T  7094067 gacaatgacactcctgaccttgtccaccatctcggtcttctccgctcgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttt 7094166  T
Q  390 tgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| || |||||||| || |||||||||||    
T  7094167 tgttgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatctccagtaaacttctcaatatcccactttga 7094249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 138 - 472
Target Start/End: Original strand, 7351105 - 7351439
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  7351105 gactctaccatcttgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatg 7351204  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
    ||||||| |||||| | || || ||  | || || ||||| ||||| || ||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||| || |    
T  7351205 ccgcggttgcttcctttgctacttctttcaaaactttatccccgaggcacaagacaacggcactcctggccttgtccaccatctcggtcttctccgctcg 7351304  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    || || |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   ||||||| |||||| | || ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||     
T  7351305 tgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttctgttgtattaacaccgcttccatctttaccttccatagcccgaaatcg 7351404  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||  |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  7351405 ttatctccgataaacttctcgatatcccactttga 7351439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 22135673 - 22135303
Alignment:
Q  102 ttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcg 201  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |    
T  22135673 ttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttg 22135574  T
Q  202 tcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcact 301  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| | || || || || || || ||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  22135573 tcatatacaaagattccaactttgcccatattgatgccgcggttgcttcctttgctacttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaacggcact 22135474  T
Q  302 ctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaat 401  Q
    |   |||||||| ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   ||||||| || ||| | ||     
T  22135473 ccgggccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttctgctgtattaac 22135374  T
Q  402 accgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22135373 accgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcgatatcccactttga 22135303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 40550700 - 40550330
Alignment:
Q  102 ttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcg 201  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |    
T  40550700 ttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttg 40550601  T
Q  202 tcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcact 301  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| | || || || || || || ||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  40550600 tcatatacaaagattccaactttgcccatattgatgccgcggttgcttcctttgctacttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaacggcact 40550501  T
Q  302 ctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaat 401  Q
    |   |||||||| ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   ||||||| || ||| | ||     
T  40550500 ccgggccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttctgctgtattaac 40550401  T
Q  402 accgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  40550400 accgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcgatatcccactttga 40550330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 90 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 36332 - 36083
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || |||||||||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||    
T  36332 tcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactccaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgag 36233  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataa 289  Q
    | ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || || || || || ||||| ||||| || ||    
T  36232 ctaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttcctttgctacttctctcaaaactttatccccgaggcacaa 36133  T
Q  290 gacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtg 339  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||| ||||||    
T  36132 gacaatggcactcctggccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtg 36083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 138 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 48490162 - 48489988
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  48490162 gactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagattttgtaatatacaatgactccaactttgaccacatcgacg 48490063  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgt 312  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||| || || || || ||||| || ||||||||| ||||| | |||||||    
T  48490062 ccgcagtaggttccttcgcgacatccctcaatactttgtcaccgaggcacaagacaatgacactcctagccttgt 48489988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 138 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 44725409 - 44725078
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||| | ||| | |||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  44725409 gactccaccatcctgaataagtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccaaatcgatg 44725310  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
    ||||||| | |||| | || || || || || || ||||| ||||| || ||||||||||||||| |  ||||||| ||||| ||   ||||||| ||||    
T  44725309 ccgcggttggttcctttgctacttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaatggcactcctgaccttgtccaccatgtcggtcttctccacttg 44725210  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    || || |||  |||| | |    ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||     
T  44725209 tgacatggtgaccggtaacaaaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccaaaatcg 44725110  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactt 469  Q
    |||  |||||| |||||||| || ||||||||    
T  44725109 ttatctccggtaaacttctcaatatcccactt 44725078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 138 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 6047318 - 6047016
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||  | ||| ||||    
T  6047318 gactccaccatcttgaatgagtagagttgttgctttaggaattgcgtatgagccaaagatttgttcatatacaacgactccaaatttgatcgcattgatg 6047219  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
    ||||| | | |||| |||| ||||| || || |  ||||| | |||||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||   ||||||| ||||    
T  6047218 ccgcgattggttccttcgcaacatctctaaaaaaattatccctgagacacaagacaatggcacttctagccttgtccaccatttcggtcttctccgcttg 6047119  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    || ||||||  || | |  ||  ||||||||||||||||||   || |||||| |||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6047118 tgacaaggtgaccagtaaagcatcttcacccttcaatgctttctcaaactttttttgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccaaaatca 6047019  T
Q  438 tta 440  Q
    |||    
T  6047018 tta 6047016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 138 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 6570744 - 6570563
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  6570744 gactccacaatcttgaatgaggagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagatttggtcatatacaatgactgcaactttgaccacatcgacg 6570645  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccat 319  Q
    || |  ||| |||| ||||||||||||| || |  ||||| ||||| || ||||||||| ||||| | |||||||| |||||    
T  6570644 ccacaataggttccttcgcgacatccctcaaaattttatccccgaggcacaagacaatgacactcctagccttgtccaccat 6570563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 139 - 469
Target Start/End: Original strand, 13289954 - 13290284
Alignment:
Q  139 actccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgc 238  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || || || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||     
T  13289954 actccaccatcttgaatgagtagagttgttgctttaggaattaccgatgagccaaagactttgtcatatacaatgactccaactttgaccacatcaatgt 13290053  T
Q  239 cgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgt 338  Q
    | |||| | |||| | || ||||| || || || ||||| | ||| || ||||||||| ||||  | |||||||| ||||||||   ||||||| |||||    
T  13290054 cccggttggttcctttgctacatctctcaaaactttatccctgaggcacaagacaatgacacttctggccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgt 13290153  T
Q  339 gtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcat 438  Q
    | || |||  | || | | |  |||||||||||||  |||   |||||||||||||| | |||| || ||  ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  13290154 gacatggtgactggtaactcaccttcacccttcaaatctttctcacacttttgttgtattaatatcgtttctatctttaccttccataacccaaaatcat 13290253  T
Q  439 tacttccggtgaacttctcgatgtcccactt 469  Q
    ||  |||| | | |||||| || ||||||||    
T  13290254 tatatccgttaagcttctcaatatcccactt 13290284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 361 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 48489965 - 48489854
Alignment:
Q  361 cttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgat 460  Q
    ||||||||||||| | ||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48489965 cttcacccttcaaagttttctcacacttttgttgtatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccaaaatcattacttccggtgaacttctcaat 48489866  T
Q  461 gtcccactttga 472  Q
     |||||||||||    
T  48489865 atcccactttga 48489854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 380 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 5817706 - 5817614
Alignment:
Q  380 tacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5817706 tacacaattttgttatgtcaaaactgcttgcatcttaaccttccacaactcgaaatcattacttccgatgaacttctcgatgtcccactttga 5817614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 24749421 - 24749090
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||| |||||| | || ||||| || ||||||||| || ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  24749421 gactccaccatcctgaatgagtagagttattgctttaggaattgccgatcagccaaagactttgtcatatacaaagatttcaactttgcccacatcgatg 24749322  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
    ||  ||| | |||  | || || || || || || ||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||   ||||||| || |    
T  24749321 ccatggttggttcttttgctacttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaatggcacttttggccttgtccaccatctcggtcttctcccctcg 24749222  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    || || |||  | || | ||   |||||| |||||| ||||   |||||||||| ||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||     
T  24749221 tgacatggtgactggtaacgaaccttcactcttcaaagctttctcacacttttgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccaaaatcg 24749122  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactt 469  Q
    |||  |||||| | |||||| || ||||||||    
T  24749121 ttatctccggtaatcttctcaatatcccactt 24749090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 21678887 - 21678561
Alignment:
Q  144 accatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcgg 243  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| | ||  |||| |||||||||||| || || | |||||| || || ||||||| ||||||||||| |||||    
T  21678887 accatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggaactgccgatgagccaaagactttgtaaaatacaaagattcgaactttgaccacatcgatgtcgcgg 21678788  T
Q  244 tagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaa 343  Q
    | | |||  |||  || || || || || ||||  ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||| ||| || ||| ||     
T  21678787 ttggttctttcgttacttctctcaaaactttattcccgaggcacaagacaatggcactcttggccttgtccaccatctcggtcttttccgctcgtgacat 21678688  T
Q  344 ggttgccggc-atcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattact 442  Q
    |||  ||||  | |||  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| | || ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| |||      
T  21678687 ggtgaccgggtaacgcaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtattaaaaccgcttccatctttacctttcataacccaaaatcgttatc 21678588  T
Q  443 tccggtgaacttctcgatgtcccactt 469  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||    
T  21678587 tccggtaaacttctcaatatcccactt 21678561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 472
Target Start/End: Original strand, 31159120 - 31159476
Alignment:
Q  102 ttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcg 201  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |    
T  31159120 ttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttg 31159219  T
Q  202 tcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcact 301  Q
    ||||||||             |||||||||||||||||||||| |||||| | || || || || || || ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  31159220 tcatatac-------------ttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctctcaaaactttatccccgag-cacaagacaatggcact 31159305  T
Q  302 ctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaat 401  Q
    | | |||||||| ||||||||   ||||||| || ||| || |||  |||| | |    ||||||||||||| ||||   |||||||||| ||| | ||     
T  31159306 cctggccttgtccaccatctcggtcttctccgctcgtgacatggtgaccggtaacaaaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgctgtattaac 31159405  T
Q  402 accgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||||| || || |||||||||||    
T  31159406 accgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatctccggtaaacttatcaatatcccactttga 31159476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 28486393 - 28486068
Alignment:
Q  144 accatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcgg 243  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| | || || || |||||||||||| || |||||||||||  | || ||||||| |||||||||||||||||    
T  28486393 accatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggactttccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatgccgcgg 28486294  T
Q  244 tagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaa 343  Q
    | | |||| | ||  | || || || |  ||||| ||||| || ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||   |||||||  | ||| ||     
T  28486293 ttgtttccgttgctgcttctctcaaaattttatccccgaggcacaagacaatggctctcctggccttgtccaccatctcggtcttctccgttcgtgacat 28486194  T
Q  344 ggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattactt 443  Q
    |||  |||| | ||    |||||||||||| ||||   |||||||||||||| | || |||| || |||||| |||||||||||||| ||||| |||  |    
T  28486193 ggtgaccggtaacgaacattcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtattaacaccgtttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatct 28486094  T
Q  444 ccggtgaacttctcgatgtcccactt 469  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||    
T  28486093 ccggtaaacttctcaatatcccactt 28486068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 244
Target Start/End: Original strand, 4295401 - 4295501
Alignment:
Q  144 accatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcgg 243  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4295401 accatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaacttttcccacatcgatgccgcgg 4295500  T
Q  244 t 244  Q
    |    
T  4295501 t 4295501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 472
Target Start/End: Original strand, 7471441 - 7471769
Alignment:
Q  144 accatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcgg 243  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  7471441 accatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgaccacatcgatgccgcgg 7471540  T
Q  244 tagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaa 343  Q
    | |  ||| | |  || || ||  | || ||||  ||||| || ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||   ||||||| || ||| |      
T  7471541 ttgtatcctttgttacttctctcgaaactttattcccgaggcacaagacaatggccctcctggccttgtccaccatctcggccttctccgctcgtgactt 7471640  T
Q  344 ggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattactt 443  Q
    |||  |||| | ||   ||||||||||||| | ||   ||||||| || ||| | || | ||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||  |    
T  7471641 ggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagttttctcacacttgtgctgtattaacatcgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatct 7471740  T
Q  444 ccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    || || |||||||| || |||||||||||    
T  7471741 ccagtaaacttctcaatatcccactttga 7471769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26213554 - 26213460
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacat 232  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  26213554 gactccaccatcttgaatgagtagagttgttgctttaggaattgcaaatgagccaaagatttggtcctatacaatgactccaaatttgaccacat 26213460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20298143 - 20298050
Alignment:
Q  144 accatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| | || ||| | |||||||||||| || ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  20298143 accatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgtcgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccgactttgcccacatcgatg 20298050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 20297972 - 20297861
Alignment:
Q  361 cttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgat 460  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| | || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||  || ||| |||||||| ||    
T  20297972 cttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtattaacactgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatctctggtaaacttctcaat 20297873  T
Q  461 gtcccactttga 472  Q
     |||||||||||    
T  20297872 atcccactttga 20297861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 231
Target Start/End: Original strand, 3890845 - 3890938
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccaca 231  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| | | || | || ||||||||||| |||||  || |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3890845 gactcccccatatttaatgaatagagttttggttttaggaattgcctatgagtcaaaggcttggtcatatacaataacttcaactttgcccaca 3890938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 232
Target Start/End: Original strand, 3903937 - 3903978
Alignment:
Q  191 caaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacat 232  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3903937 caaagacttggtcatatacaatgactccaactttgcccacat 3903978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 383; Significance: 0; HSPs: 51)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 89 - 475
Target Start/End: Original strand, 32479698 - 32480084
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32479698 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 32479797  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32479798 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgctgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 32479897  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32479898 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 32479997  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccc 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32479998 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccc 32480084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 89 - 484
Target Start/End: Original strand, 8516452 - 8516847
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8516452 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 8516551  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8516552 gccaaagatttcgtcatatataatgactctaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 8516651  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8516652 agacaatagcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 8516751  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccctatgctact 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8516752 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatact 8516847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 92 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 3324274 - 3323893
Alignment:
Q  92 atcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagcc 191  Q
    ||||||||| |||||||| ||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3324274 atcaagaattttgttaaattccgccaattgctccgagattgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgtttcaagagttgcctatgagcc 3324175  T
Q  192 aaagattt-cgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataag 290  Q
    || ||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  3324174 aacgattttcgtcttgtacaatgactccaacttagcccacatcgacgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaacttatttccgagacataaa 3324075  T
Q  291 acaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactttt 390  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3324074 acaatgacactcttagccttgtctatcatctcacgcttctccgcttgtgtcaaattttccggcattgccgcttcacccttcaatgcttctacaaactttt 3323975  T
Q  391 gttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  3323974 gttgtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttctagtgaacttctcgatgtcccactttga 3323893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 89 - 472
Target Start/End: Original strand, 16263721 - 16264104
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16263721 atcatcaagaattttattaaattccgccaattgctccgagattgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgtttcaagagctgcctatga 16263820  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16263821 -ccaaagatttcgtcatgtacaatgactccaacttagcccacattgacgccgcagtagcttctctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 16263919  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16263920 aaacaatggcactcttttccttgtctatcatctcacgcttctccgcttgtgtcaaactcgccggcatcgccacttcacccttcaatgcttctacacactt 16264019  T
Q  389 ttgttgtgtc-aataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16264020 ttgttgtgtcaaaaatcgcttgcatcttaaccttccacaacttgaaatcattacttccggtgaacttatcgatgtctcactttga 16264104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 139 - 485
Target Start/End: Original strand, 22834420 - 22834765
Alignment:
Q  139 actccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgc 238  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  22834420 actccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttgatcatatacaatgactccaactttgaccacatcgacgc 22834519  T
Q  239 cgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgt 338  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||| |||||    
T  22834520 cgcggttggttccttcgcgacatccctcaaaactttatcaccgaggcacaagacaatggcactcctagcc-tgtccaccatctcggtcttctccgcttgt 22834618  T
Q  339 gtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcat 438  Q
    |||| |||  |||| | | |  ||||||| ||||| ||||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  22834619 gtcatggtgaccggtaacacaccttcacctttcaaagctttctcacacttttgttgtatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacctaaaatcat 22834718  T
Q  439 tacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccctatgctactc 485  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||    
T  22834719 tacttccagtgaacttctcaatatcccactttgaacccatggtactc 22834765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 89 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 7763077 - 7762677
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||   |  |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  7763077 atcatcaaggattttgttgaactccgttaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttaaagaattgcttatga 7762978  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||   |||| |||||||||||||||| || || || ||||| || |    
T  7762977 gccaaagacttggtcatatataatgactccaactttgaccacatcgattccgcggttagttccttcgcgacatcccttaaaactttgtcaccgaggcaca 7762878  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatc----gccgcttcacccttcaatgc-ttctaca 383  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||| | |    ||  ||||||||||||| || ||||| |    
T  7762877 agacaatggcactcttagccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtcaccggtaacgcatgcaccttcacccttcaaagctttcta-a 7762779  T
Q  384 cacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccctatgctac 483  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||    
T  7762778 cacttttgttgtatcaacaccgcttgcattttcaccttccataacccaaaatcgttaattccggtgaacttctcaatatcccactttgaacccatggtac 7762679  T
Q  484 tc 485  Q
    ||    
T  7762678 tc 7762677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 139 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 37407445 - 37407099
Alignment:
Q  139 actccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgc 238  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  37407445 actccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacgactccaactttgaccacattgatgc 37407346  T
Q  239 cgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgt 338  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||| || || || || ||||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||| |||||    
T  37407345 cgcggttggttccttcgcgacatccctcaaaactttgtccccgaggcacaagacaatggcactcctagccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgt 37407246  T
Q  339 gtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcat 438  Q
    | || |||  |||| | |||  |||||||||| || ||||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |    
T  37407245 gacatggtgaccggtaacgcaccttcacccttgaaagctttctcacacttttgttgtatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacctaaaatcgt 37407146  T
Q  439 tacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccctatgctactc 485  Q
    || ||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||| |||||    
T  37407145 taattccggtaaacttctcaatatcccactttgaacccatggtactc 37407099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 89 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 29811675 - 29811279
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||   |  |  || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || |||| |||||    
T  29811675 atcatcaaggattttgttgaactccgttaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcttatga 29811576  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    ||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||| |||| | ||||||||||| || || || || ||||| || |    
T  29811575 gccaaagacctggttatatacaatgactccaactttgaccacatggacgctgcggtaggttccttagcgacatccctcaaaactttgtcaccgaggcaca 29811476  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||    ||||||| ||||||||| |||  ||| || |||  ||||||| ||||| | ||   |||||||    
T  29811475 agacaatggcactcctagccttgtccaccatcttggtcttctccgcttgtgtcatggtgaccgacaacgcaccttcaccattcaaagatttctcacactt 29811376  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccctatgctactc 485  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||    
T  29811375 ttgttgtatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccaaaatcattacttccggtgaacttctcaatatcccactttgaacccatggtactc 29811279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 138 - 485
Target Start/End: Original strand, 23199549 - 23199896
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||    
T  23199549 gactccaccatcttgaatgattagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacgattccaactttgaccatatcgatg 23199648  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
     |||||| | |||| |||| |||||||| || || || || ||||| || ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    ||||||||||||    
T  23199649 tcgcggttggttccttcgcaacatccctcaaaactttgtccccgaggcacaagacaatggcactcctagccttgtccaccatctaggtcttctcctcttg 23199748  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    || || |||  |||| | |||  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  23199749 tgacatggtgaccggtaacgcaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccaaaatcg 23199848  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccctatgctactc 485  Q
    ||| | ||||||||||||||||| || |||||||| || ||| |||||    
T  23199849 ttaatcccggtgaacttctcgatatcacactttgaacccatggtactc 23199896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 138 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 32891847 - 32891500
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||        
T  32891847 gactccaccaccttaaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagatttggtcatatacaatgactccaactttgaccacatcacca 32891748  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
    ||  || || |||| ||||||||||||| ||    ||||| ||||| || ||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||   | ||||| ||||    
T  32891747 ccatggcaggttccttcgcgacatccctaaaatttttatcaccgaggcacaagacaacggcactcctagccttgtccaccatctcggtcctctccgcttg 32891648  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    ||||| |||  ||| || |||  ||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  32891647 tgtcatggtgaccgacaacgcaccttcacccttcaatgctttctcacacttttgttgtatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccaaaatca 32891548  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccctatgctactc 485  Q
    |||||| ||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||||    
T  32891547 ttactttcggtgaacttctcaatatctcactttgaacccatggtactc 32891500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 138 - 472
Target Start/End: Original strand, 5259733 - 5260067
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  5259733 gactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacgactccaactttgaccacatagatg 5259832  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||| || || ||  |||| || ||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||| ||||    
T  5259833 ccgcggttggttccttcgcgacatcccttaaaactttttcctcgaggcacaagacaatggcactcctagccatgtccaccatctcggtcttctccacttg 5259932  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    || || |||  |||| | |||  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||| | |||||     
T  5259933 tgacatggtgaccggtaacgcaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtatcaacaccgcttgcatcttcaccttctataactcaaaatcg 5260032  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||| | ||| |||||||||| || |||||||||||    
T  5260033 ttaatcccgatgaacttctcaatatcccactttga 5260067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 138 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 6717270 - 6716923
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||  || ||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||    
T  6717270 gactccaccatcttgaatgagtagagttgtcgcttaaggaaatgtctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatg 6717171  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  6717170 ccgcggttggttccttcgcgacatccctcaaaactttatccccgaggcacaagacaatggcactcctcgccttgtccaccatctcggtcttctcctcttg 6717071  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    || || |||  |||| | |||  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  6717070 tgacatggtgaccggtaacgcaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccgaaatcg 6716971  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccctatgctactc 485  Q
    |||   |||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||    
T  6716970 ttaagcccggtgaacttctcaatatcccactttgaacccatggtactc 6716923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 143 - 485
Target Start/End: Original strand, 9635539 - 9635881
Alignment:
Q  143 caccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcg 242  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||| |||| | |||||||||    
T  9635539 caccatcttgaatgagtagatttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacggctccaactttgaccacgtagatgccgcg 9635638  T
Q  243 gtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtca 342  Q
    || | |||| ||||||||||||| || || || || ||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||| |||||| ||    
T  9635639 gttggttccttcgcgacatccctcaaaactttgtccccgaggcataagacaatggcactcctagccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgaca 9635738  T
Q  343 aggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattact 442  Q
     |||    || | |||  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||| |    
T  9635739 tggtgattggtaacgcaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtatcaacaccgcttacatcttcaccttccataacccaaaatcgttaat 9635838  T
Q  443 tccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccctatgctactc 485  Q
     |||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||    
T  9635839 cccggtgaacttctcaatatcccactttgaacccatggtactc 9635881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 138 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 10209958 - 10209624
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||    
T  10209958 gactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaatgattccaacttagaccatatcgatg 10209859  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  10209858 ccgcggttggttccttcgcgacatccctcaaaactttatccccgaggcacaagacaatggcgctcctcgccttgtccaccatctcggtcttctcctcttg 10209759  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    || || |||  ||||||   |  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  10209758 tgacatggtgtccggcaaaccaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccacaacccaaaatcg 10209659  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||  | ||||||||| |||| || |||||||||||    
T  10209658 ttgatcccggtgaacatctcaatatcccactttga 10209624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 456747 - 456377
Alignment:
Q  102 ttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcg 201  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |    
T  456747 ttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcttgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttg 456648  T
Q  202 tcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcact 301  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | || || || || || || ||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  456647 tcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttgcttcctttgctacttctctcaaaactttatctccgaggcacaagacaacggcact 456548  T
Q  302 ctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaat 401  Q
    | | |||||||| ||||||||   ||||||  || ||| || |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   |||||||||| ||| | ||     
T  456547 cctggccttgtccaccatctcggtcttctctgctcgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgctgtattaac 456448  T
Q  402 accgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  456447 accgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatctccggtaaacttctcgatatcccactttga 456377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 138 - 472
Target Start/End: Original strand, 4600130 - 4600464
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||    
T  4600130 gactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatg 4600229  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||| || || || || ||||| || ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  4600230 ccgcggttggttccttcgcgacatccctcaaaactttgtccccgaggcacaagacaatggcgctcctcgccttgtccaccatctcggtcttctcctcttg 4600329  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    || || |||  ||||||   |  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  4600330 tgacatggtgtccggcaaaccaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccacaacccaaaatcg 4600429  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||    ||||||||||| || || |||||||||||    
T  4600430 ttgagcccggtgaacttttcaatatcccactttga 4600464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 90 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 43226929 - 43226547
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||| || ||||| |||| ||| |||||||||  ||| |  || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||    
T  43226929 tcatcaaggattttgttgaacttcgtaagttgctccatgatggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgag 43226830  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataa 289  Q
    ||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||   |||| | || || || || || || ||||||||||| || ||    
T  43226829 ccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttcgttcctttgctacttctctcaaaactttatctccgaggcacaa 43226730  T
Q  290 gacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttt 389  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||| || ||| || |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   ||||||||    
T  43226729 gacaatggcactcctcgccttgtccaccatctcggtcttctccgctcgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttt 43226630  T
Q  390 tgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||||| | || || |||| |||||| |||||||||||||  ||||| |||  |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  43226629 tgttgtattaacactgcttccatctttaccttccataaccgaaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatcccactttga 43226547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 137 - 485
Target Start/End: Original strand, 23409741 - 23410089
Alignment:
Q  137 agactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgat 236  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||     
T  23409741 agactccaccatcttaaataagtagagttgttgcttaaggagttgcctatgagccaaagatttggtcatatacaatgactcaaaatttgaccatatcgac 23409840  T
Q  237 gccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctctt 336  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| || || || || |||||  | ||||||||| ||||| | || ||||| ||||||||   ||||||  |||    
T  23409841 gccgcggtaggttccttcgcgacatccctcaaaactttgtccccgaggtacaagacaatgtcactcctagcattgtccaccatctcggtcttctcggctt 23409940  T
Q  337 gtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatc 436  Q
    |||||| |||  |||  | |||   ||||||||||||  |||   |||||||||||| | |||| | |||||| ||||| |||| ||||| ||| |||||    
T  23409941 gtgtcatggtgaccgaaaacgcacattcacccttcaaatctttctcacacttttgttatatcaacagcgcttgtatcttcacctaccataccccaaaatc 23410040  T
Q  437 attacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccctatgctactc 485  Q
     || ||||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||| |||||    
T  23410041 gttgcttccggtgaacttctcaacatcccactttgaacccatggtactc 23410089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 141 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 10059221 - 10058890
Alignment:
Q  141 tccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccg 240  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||    
T  10059221 tccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccg 10059122  T
Q  241 cggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgt 340  Q
    | || | |||| ||||||||||||| || || || || ||||| || | ||||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||||||||||     
T  10059121 cagttggttccttcgcgacatccctcaaaactttgtccccgaggcacaggacaatggcactcctcgccttgtccaccatctcggtcttctcctcttgtga 10059022  T
Q  341 caaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcatta 440  Q
    || |||  ||||||   |  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||     
T  10059021 catggtgtccggcaaaccgccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccacaacccaaaatcgttg 10058922  T
Q  441 cttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
       |||||||||||||| || |||||||||||    
T  10058921 agcccggtgaacttctcaatatcccactttga 10058890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 138 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 10057002 - 10056668
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||    
T  10057002 gactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatg 10056903  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
    |||| || | |||| ||||||||||||| || || || || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  10056902 ccgcagttggttccttcgcgacatccctcaaaactttgtccccgaggcacaggacaatggcgctcctcgccttgtccaccatctcggtcttctcctcttg 10056803  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    || || |||  ||||||   |  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  10056802 tgacatggtgtccggcaaaccgccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccacaacccaaaatcg 10056703  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||    |||||||||||||| || |||||||||||    
T  10056702 ttgagcccggtgaacttctcaatatcccactttga 10056668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 138 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 10061446 - 10061112
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||    
T  10061446 gactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatg 10061347  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
    |||| || | |||| ||||||||||||| || || || || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  10061346 ccgcagttggttccttcgcgacatccctcaaaactttgtccccgaggcacaggacaatggcgctcctcgccttgtccaccatctcggtcttctcctcttg 10061247  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    || || |||  ||||||   |  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  10061246 tgacatggtgtccggcaaaccgccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccacaacccaaaatcg 10061147  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||    |||||||||||||| || |||||||||||    
T  10061146 ttgagcccggtgaacttctcaatatcccactttga 10061112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 138 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 10063668 - 10063334
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||    
T  10063668 gactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatg 10063569  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
    |||| || | |||| ||||||||||||| || || || || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  10063568 ccgcagttggttccttcgcgacatccctcaaaactttgtccccgaggcacaggacaatggcgctcctcgccttgtccaccatctcggtcttctcctcttg 10063469  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    || || |||  ||||||   |  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  10063468 tgacatggtgtccggcaaaccgccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccacaacccaaaatcg 10063369  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||    |||||||||||||| || |||||||||||    
T  10063368 ttgagcccggtgaacttctcaatatcccactttga 10063334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 138 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 10065890 - 10065556
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||    
T  10065890 gactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatg 10065791  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
    |||| || | |||| ||||||||||||| || || || || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  10065790 ccgcagttggttccttcgcgacatccctcaaaactttgtccccgaggcacaggacaatggcgctcctcgccttgtccaccatctcggtcttctcctcttg 10065691  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    || || |||  ||||||   |  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  10065690 tgacatggtgtccggcaaaccgccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccacaacccaaaatcg 10065591  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||    |||||||||||||| || |||||||||||    
T  10065590 ttgagcccggtgaacttctcaatatcccactttga 10065556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 90 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 5192502 - 5192120
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||   ||| |  || ||||| |||||| | ||||| |||||| ||||||| | || ||||  |||||    
T  5192502 tcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctcaatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagtcgttgctttaggaattgctgatgag 5192403  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataa 289  Q
    ||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| || |||||| | || || || || || || ||||| ||||| || ||    
T  5192402 ccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcagttgcttcctttgctacttctctcaaaactttatccccgaggcacaa 5192303  T
Q  290 gacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttt 389  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||||||| |||||| ||  ||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   ||||||||    
T  5192302 gacaatggcactcttggccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacattgtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttt 5192203  T
Q  390 tgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    || ||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  5192202 tgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatcccactttga 5192120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 90 - 472
Target Start/End: Original strand, 10957729 - 10958111
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||| || ||||| |||| ||| |||||||||  ||| |  || ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||    
T  10957729 tcatcaaggattttgttgaacttcgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgag 10957828  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataa 289  Q
    ||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||| | || || || || || || |||||  |||| || ||    
T  10957829 ccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccaaatcgatgccacggttggttcctttgctacttctctcaaaactttatcctcgaggcacaa 10957928  T
Q  290 gacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttt 389  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||||   ||||||| || ||| || |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   ||||||||    
T  10957929 gacaatggaactcctggccttgtctaccatctcggtcttctccgctcgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttt 10958028  T
Q  390 tgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    || ||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  10958029 tgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatcccactttga 10958111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 90 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 11168953 - 11168571
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || ||||| ||||||   ||||| |||||| ||||||| | || ||||| |||||    
T  11168953 tcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatccagaatgagtagagtagttgctttaggaattgccgatgag 11168854  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataa 289  Q
    ||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   || || |  || || || ||||| ||||| || ||    
T  11168853 ccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgctgcggttgcttcctctgctacttatctcaaaactttatccccgaggcacaa 11168754  T
Q  290 gacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttt 389  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   ||||||||    
T  11168753 gacaatggcactcctagccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttt 11168654  T
Q  390 tgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    || ||| | || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  11168653 tgctgtattaacactgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttagctccggtaaacttctcaatatcccactttga 11168571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 102 - 469
Target Start/End: Original strand, 6065211 - 6065578
Alignment:
Q  102 ttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcg 201  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |    
T  6065211 ttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctacgatcttgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttg 6065310  T
Q  202 tcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcact 301  Q
    || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || || || || || || |||||  |||| || ||||||| ||||||    
T  6065311 tcgtatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctctcaaaactttatcctcgaggcacaagacaacggcact 6065410  T
Q  302 ctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaat 401  Q
    | | | |||||| ||||||||   ||||||| || ||| ||  ||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   |||||||||| ||| | ||     
T  6065411 cctgggcttgtccaccatctcggtcttctccgctcgtgacattgtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgctgtattaac 6065510  T
Q  402 accgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactt 469  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||| || ||||||||    
T  6065511 accgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatcccactt 6065578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 469
Target Start/End: Original strand, 18098577 - 18098955
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||| | || |||||||||||    
T  18098577 tcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactcaaccatcctgaataagtagagttgttgctttaggaattgcctatgag 18098676  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataa 289  Q
    ||||||| || ||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| | || || || || || || ||||| ||||| |  ||    
T  18098677 ccaaagactttgtcatatacaaagattccatctttgcccacattgatgccgcggttggttcctttgctacttctctcaaaactttatc-ccgaggcgcaa 18098775  T
Q  290 gacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttt 389  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||| || ||| || |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   ||||||||    
T  18098776 gacaatggcactcctggccttgtccaccatctcggtcttctccgctcgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttt 18098875  T
Q  390 tgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactt 469  Q
    || ||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||||| || ||||||||    
T  18098876 tgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatcccactt 18098955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 138 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 3315486 - 3315152
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||    
T  3315486 gactctaccatcttgaatgaataaagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattccaactttgcacacatcgatg 3315387  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
     |||||| | |||| | || || || || || || ||||| ||||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||| || |    
T  3315386 tcgcggttggttcctttgctacttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaatggcactcctggccttgtccaccatctcggtcttctccgctcg 3315287  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    || || |||  |||| | |||  ||||||||||||| ||||   ||||||| || ||| | || ||||||| ||| || |||||||||||||| |||||     
T  3315286 tgacatggtgaccggtaccgcaccttcacccttcaaagctttctcacacttctgctgtattaaaaccgcttccatgtttaccttccataacccaaaatcg 3315187  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||  |||||| || ||||| || |||||||||||    
T  3315186 ttatctccggtaaaattctcaatatcccactttga 3315152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 5898249 - 5897956
Alignment:
Q  102 ttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcg 201  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| || |    
T  5898249 ttgttgaactccgtaagttgctccatgatggtcttcgactccaccatcttaaatgagtagagttgttgctttaagaattgccgatgagccaaagactttg 5898150  T
Q  202 tcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcact 301  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||   |||| | || || ||  | || || ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  5898149 tcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgtcgcggttcgttcctttgctacttctatcaaaactttatccccgaggcacaagacaatggcact 5898050  T
Q  302 ctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgt 395  Q
    | | |||||||| ||||||||   ||||||  |||||| || |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||    
T  5898049 cctggccttgtccaccatctcggtcttctctgcttgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgt 5897956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 144 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 42991097 - 42990769
Alignment:
Q  144 accatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcgg 243  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  42991097 accatattgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatataaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcgg 42990998  T
Q  244 tagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaa 343  Q
    |   |||| | || || |  || || || ||||||||||| || ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||   ||||||| || ||| ||     
T  42990997 ttcgttcctttgctacttttctcaaaactttatctccgaggcacaagacaatgacactcctggccttgtccaccatctcggtcttctccgctcgtggcat 42990898  T
Q  344 ggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattactt 443  Q
    |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   |||||||||| ||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||  |||  |    
T  42990897 ggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccaaaattgttatct 42990798  T
Q  444 ccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||| |||||| | || |||||||||||    
T  42990797 ccggtaaacttcccaatatcccactttga 42990769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 23634249 - 23633914
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  | ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| || ||||||||    
T  23634249 gactccaccatcttgaatgactagagttgttgctttagaaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgacctcatcgatg 23634150  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
      || || | |||| |||| || || || || || ||||| | ||| || ||||||||||||||| | |  ||||| |||||||||  ||||||| || |    
T  23634149 atgc-gttggttccttcgctacttctctcaaaactttatccctgaggcacaagacaatggcactcctggtattgtccaccatctcagtcttctccgctcg 23634051  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcaccct-tcaatgcttctacacac-ttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaat 435  Q
    || || |||  |||| | ||| |||||||||| |||| ||||   ||||| ||||||||| | |  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  23634050 tgacatggtgaccggtaacgcagcttcaccctctcaaagctttctcacactttttgttgtattacaaccgcttccatctttaccttccataaccccaaat 23633951  T
Q  436 cattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    | |||  || ||| |||||||| || |||||||||||    
T  23633950 ctttatctcaggtaaacttctcaatatcccactttga 23633914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 244
Target Start/End: Original strand, 4309916 - 4310070
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || |||||||||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||    
T  4309916 tcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggtctttgactccaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgag 4310015  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggt 244  Q
    ||||||| || ||||||||||| || | |||||||||||| || |||||||||||    
T  4310016 ccaaagactttgtcatatacaaagatttcaactttgcccatattgatgccgcggt 4310070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 7769389 - 7769260
Alignment:
Q  108 aactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatat 207  Q
    |||||||| |||||||||  ||| |  || |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||| || |||||||    
T  7769389 aactccgtaagttgctccatgatagcctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgtttctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatat 7769290  T
Q  208 acaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  7769289 acaaagactccaactttgaccacatcgatg 7769260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 138 - 263
Target Start/End: Original strand, 15830652 - 15830777
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| |||||| | || |||||||||| ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  15830652 gactccaccatcttaaatgagtaaagttcttgctttaggaattgcctatgaaccatagacttagtcatatacaataactccaactttgaccacctcgatg 15830751  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcc 263  Q
     || ||||| |||| |||||||||||    
T  15830752 tcgtggtaggttccttcgcgacatcc 15830777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 146 - 440
Target Start/End: Original strand, 1619936 - 1620227
Alignment:
Q  146 catcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggta 245  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| | || || || |||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||     
T  1619936 catcttgaatgagtagagttgttgctttaggaattaccaatgagccaaagactttgtcatatgcaaagactccaactttgaccacatcgatgccgcagtt 1620035  T
Q  246 gcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaagg 345  Q
      | || |||| |||||  | || || ||||| ||||| || ||||||||||||||| | |||||||| |||||| |   ||||||| ||| || || ||    
T  1620036 tgtaccttcgctacatctatcaaaactttatccccgaggcacaagacaatggcactcctggccttgtccaccatccccgtcttctccgcttttgacatgg 1620135  T
Q  346 ttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcatta 440  Q
    |  |||| |     |||||||||||||| ||||   |||||||||||| | | || ||||||| ||| || |||||||||||||  |||||||||    
T  1620136 tgaccggta---aagcttcacccttcaaagctttctcacacttttgttatattaacaccgctttcatatttaccttccataacctaaaatcatta 1620227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 27421490 - 27421140
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||  |||    || ||||| |||||||| ||||| || |||||||| || | || ||||| |||||    
T  27421490 tcatcaaggatcttgttgaactccgtaagttgctccatgatgacctttgactctaccatcttgaatgagtaaagttgttgttttaggaattgccgatgag 27421391  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataa 289  Q
    |||||||||| ||||   |||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| | |||| |||  ||||| || || || ||||| || || || ||    
T  27421390 ccaaagattttgtcaataacaacgactccaactttgaccacatcaatgtcgcggttggttccttcgttacatctctcaaaactttatccccaaggcacaa 27421291  T
Q  290 gacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttt 389  Q
    ||||||| ||||| | ||||| || ||||| |    ||||||| |||||| || |||  |||| | |||   |||| | ||||| | ||   ||||||||    
T  27421290 gacaatgacactcctggccttttccaccatattggtcttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacgcacattcatcgttcaacgttttctcacacttt 27421191  T
Q  390 tgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcatta 440  Q
    |||||| | || ||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  27421190 tgttgtattaacaccgcttccatctttactttccataacccaaaatcatta 27421140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 361 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 25637989 - 25637878
Alignment:
Q  361 cttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgat 460  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||||||  |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| ||    
T  25637989 cttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcacattccataacccgaaatcgttaagcccggtgaacttctcaat 25637890  T
Q  461 gtcccactttga 472  Q
     |||||||||||    
T  25637889 atcccactttga 25637878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 25634681 - 25634349
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | || ||||  ||||| |||||| || |||||||| || ||||| ||||||| |||| ||||||    
T  25634681 gactccaccatcttgaatgagtagagttgtggctttaggaattgctgatgagtcaaagactttgtcatatataaagactctaactttgaccac-tcgatg 25634583  T
Q  238 ccgcggt---agcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctc 334  Q
    || || |   || |||| |||| || || || || || ||||| ||||| || ||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |   ||||| | |    
T  25634582 ccacgattttag-ttccttcgctacttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaatgacactcctagccttttctaccatcccgatcttcttcgc 25634484  T
Q  335 ttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaa 434  Q
    | ||| || |||  |||| | | |  ||||||||||||| ||||   ||| |||||||||| | || |||||||  ||||| |||||||||||||| |||    
T  25634483 tcgtgacatggtgaccggtaacacaccttcacccttcaaagctttctcactcttttgttgtattaaaaccgcttctatctttaccttccataacccaaaa 25634384  T
Q  435 tcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactt 469  Q
    ||||||  |||||| |||||||| || ||||||||    
T  25634383 tcattatctccggtaaacttctcaatatcccactt 25634349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 241
Target Start/End: Original strand, 53917134 - 53917231
Alignment:
Q  144 accatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgc 241  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |||||||||||  | || ||||||| |||||||||||||||    
T  53917134 accatcttaaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatgccgc 53917231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 244
Target Start/End: Original strand, 43422963 - 43423028
Alignment:
Q  179 ttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggt 244  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43422963 ttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 43423028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 9602575 - 9602495
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttg 169  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||    || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9602575 atcatcaagaatttttttaaattccgcccatttctccgagattgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttg 9602495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Original strand, 53917343 - 53917451
Alignment:
Q  361 cttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgat 460  Q
    ||||||||||||| ||||   ||||||| || ||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||| ||    
T  53917343 cttcacccttcaaagctttctcacacttctgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcaat 53917442  T
Q  461 gtcccactt 469  Q
     ||||||||    
T  53917443 atcccactt 53917451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 223
Target Start/End: Original strand, 15822096 - 15822181
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactt 223  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| | || || | ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  15822096 gactccaccattttaaacgagtagagttgttgctttaggaattacatatgagctaaagacttagtcatatacaatgcctccaactt 15822181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 53597807 - 53597711
Alignment:
Q  361 cttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 457  Q
    ||||||||||||| | ||   |||||||||||||| | || | ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  53597807 cttcacccttcaaagttttctcacacttttgttgtattaaaatcgcttccatctttaccttccataacccaaaatcattatctccggtaaacttctc 53597711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 360 - 479
Target Start/End: Original strand, 29913640 - 29913759
Alignment:
Q  360 gcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcga 459  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  | || |  ||   |||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| || |    
T  29913640 gcttctcccttcaatgcttcaacacacttttgttgaattaaaattgccctcatcttcaccttccacaacccgaagtcgttactaccggtgaacttttcaa 29913739  T
Q  460 tgtcccactttgaccctatg 479  Q
    | |||||||| || ||||||    
T  29913740 tatcccacttcgaacctatg 29913759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 402 - 468
Target Start/End: Original strand, 10621244 - 10621310
Alignment:
Q  402 accgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccact 468  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||| || |||||||    
T  10621244 accgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatcccact 10621310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 472
Target Start/End: Original strand, 28101468 - 28101796
Alignment:
Q  144 accatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcgg 243  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||| | || || || |||||||||||| || |||||||||||  | || ||||||| |||||| |||| |||||    
T  28101468 accatcttgaatgagtagagttgttactttaggaattaccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacattgatgtcgcgg 28101567  T
Q  244 tagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaa 343  Q
    | | |||  | || || ||  |  | || ||||  ||||| || |||| ||||| |||| | |||||||| || |||||   ||||||| |||||| ||     
T  28101568 ttggttcttttgctacttctatcgaaactttattcccgaggcacaagagaatggaactcctggccttgtccactatctcggtcttctccgcttgtgacat 28101667  T
Q  344 ggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattactt 443  Q
    |||  |||| | | |  ||||||||||||| ||||   ||||||| || | | | |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||  |    
T  28101668 ggtgaccggtaacacaccttcacccttcaaagctttctcacacttctgctctattagcaccgcttccatctttaccttccataacccaaaatcattatct 28101767  T
Q  444 ccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    || || || ||||| || |||||||||||    
T  28101768 ccagtaaatttctccatatcccactttga 28101796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 53597989 - 53597846
Alignment:
Q  179 ttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatct 278  Q
    ||||| |||||  ||||| || ||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||| | |||| |  | ||||| || || || |||||     
T  53597989 ttgccgatgaggtaaagactttgtcatatacaaagacttcaattttgaccacatcgatgccgcggttgattccttatctacatctctcaaaactttatca 53597890  T
Q  279 ccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctc 322  Q
     |||  || ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||    
T  53597889 tcgaagcacaagacaatggcactcctgaccttgtccaccatctc 53597846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 410 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 5886732 - 5886670
Alignment:
Q  410 catcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| || |||||||||||    
T  5886732 catctttaccttccataacccaaaatcgttattaccggtaaacttctcaatatcccactttga 5886670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Original strand, 43423145 - 43423253
Alignment:
Q  361 cttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgat 460  Q
    |||||||| |||| ||||   ||||| |||||| | | || ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||| | ||||||| |||    
T  43423145 cttcacccctcaaagctttctcacacatttgttatattaacaccgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatctccgataaacttcttgat 43423244  T
Q  461 gtcccactt 469  Q
     ||||||||    
T  43423245 atcccactt 43423253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 379; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 89 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 15038 - 14652
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15038 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 14939  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14938 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 14839  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14838 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 14739  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccc 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14738 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccc 14652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 379; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 89 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 149684 - 149298
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  149684 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 149585  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  149584 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacattgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 149485  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  149484 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 149385  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccc 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  149384 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccacttttaccc 149298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 379; Significance: 0; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 89 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 10684993 - 10684607
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10684993 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 10684894  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10684893 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 10684794  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10684793 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 10684694  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccc 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10684693 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccc 10684607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 89 - 475
Target Start/End: Original strand, 35744748 - 35745134
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35744748 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttcaagagttgtctatga 35744847  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35744848 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 35744947  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35744948 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgtcggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 35745047  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccc 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35745048 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacctgaaatcattgcttccggtgaacttatcgatgtcccactttgaccc 35745134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 89 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 18853892 - 18853509
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18853892 atcatcaagaatcttgttaaattccgccaattgctccgagatcgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgtttcaagagttgcctatga 18853793  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18853792 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaatttagcccacatcgatgccgcggttgcttctctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 18853693  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18853692 aaacaatagcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaagttgccggcatagccgcttcacccttcaatgcttctaaacactt 18853593  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18853592 tttttgtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaatccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 18853509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 90 - 485
Target Start/End: Original strand, 6813052 - 6813447
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    ||||||||||| |||||||| |  || | |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  6813052 tcatcaagaattttgttaaattttgtcaattgctccgtgattgatttagactccaccatcttcaatgagtagagttgttgtttcaagagtttcctatgag 6813151  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataa 289  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  6813152 ccaacgatttcgtcatgtacaatgactccaacttagcccacattgatgtcgcggtagattccctcgcgacatcccttaaaatcttatctctgagacataa 6813251  T
Q  290 gacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttt 389  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  6813252 aacaatggcactctttgccttgtctatcatctcacgcttctccgcttgtgtcaagtttgctggcatcgccgcttcacctttcaatgcttctacaaaattt 6813351  T
Q  390 tgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccctatgctactc 485  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  6813352 tgttgtgtcaaaaccgctttcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttctagttaacttctcgatgtcccactttgaacccatgatactc 6813447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 162 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 23800217 - 23799908
Alignment:
Q  162 agttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacat 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || | |||||||||||| || |||| ||    
T  23800217 agttgttgtttcaagagttgcctatgagccaacgatttcgtcatgtacaatgaatccaacttagcccacatagacgtcgcggtagcttctcttgcgatat 23800118  T
Q  262 cccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgc 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| |||||| |    
T  23800117 cccttaagaccttatctccgagacataaaacaatggcactttttgccttgtctatcatctcacgcttctccgcttgtgtcaaactcgccgg-atcgccac 23800019  T
Q  362 ttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatg 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23800018 ttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccaaaatcattacttccggtgaacttctcgatg 23799919  T
Q  462 tcccactttga 472  Q
    |||||||||||    
T  23799918 tcccactttga 23799908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 89 - 326
Target Start/End: Original strand, 26300696 - 26300933
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||| |||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26300696 atcatcaagaatcttgttaaattccgccaattgctccaagattgatttagattccaccaccttgaatgaatagagttgttgtttcaagagttgtctatga 26300795  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26300796 gccaaagattttgtcatgtacaatgactccaacttagcccacatcaatgctgcggtagcttctctcgcgacatcccttaagatcttatctccgagacata 26300895  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgc 326  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  26300896 aaacaatagcactctttaccttgtctatcatctcacgc 26300933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 138 - 485
Target Start/End: Original strand, 34255917 - 34256264
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  34255917 gactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacgactccaactttgaccacatcgatg 34256016  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
      ||||| | |||| ||||||||||||| || || || || ||||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||| ||||    
T  34256017 ttgcggttggttccttcgcgacatccctcaaaactttgtccccgaggcacaagacaatggcactcatagccttgtccaccatctcggtcttctccgcttg 34256116  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    || || |||  |||| | |||  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  34256117 tgacatggtgaccggtaacgcaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtatcaacaccgtttgcatcttcaccttccataacccaaaatcg 34256216  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccctatgctactc 485  Q
    ||| | |||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||    
T  34256217 ttaatcccggtgaacttctcaatatcccactttgaacccatggtactc 34256264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 89 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 4732464 - 4732081
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||   |  |  || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || ||||||||||    
T  4732464 atcatcaaggattttgttgaactccgttaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatga 4732365  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||| || || || || ||||| || |    
T  4732364 gccaaagacttggtcatatacaatgtctccaactttgaccacatcgacgccacggtaggttccttcgcgacatccctcaaaactttgtcaccgaggcaca 4732265  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
     ||||||| ||||| | |||||||| || |||||   ||||||| ||||||||| |||  |||||| |||  ||||||||||||| ||||   | |||||    
T  4732264 tgacaatgacactcctagccttgtccacaatctcggtcttctccgcttgtgtcatggtgaccggcaacgcaccttcacccttcaaagctttctcgcactt 4732165  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  4732164 ttgttgtatcaacacctcttgcatcttcaccttccataacccaaaatcgttaattccgatgaacttctcaatatcccactttga 4732081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 102 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 43080518 - 43080148
Alignment:
Q  102 ttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcg 201  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || |||||  ||||| | ||||| |||||| |||| || | || ||||| |||||||||||| || |    
T  43080518 ttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactcttccatcctgaatgagtagagtcgttgttttaggaattgccgatgagccaaagactttg 43080419  T
Q  202 tcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcact 301  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || || || || || || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  43080418 tcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctctcaaaactttatctccgaggcacaagacaatggcact 43080319  T
Q  302 ctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaat 401  Q
    | | |||||||| ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||  | ||   ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| | ||     
T  43080318 cctggccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgaccgataacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtattaac 43080219  T
Q  402 accgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  43080218 accgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcgatatcccactttga 43080148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 90 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 18811636 - 18811254
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||    
T  18811636 tcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgag 18811537  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataa 289  Q
    ||||||| || ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | || || || || || || ||||| ||||| || ||    
T  18811536 ccaaagactttgtcatatacaaagattccatctttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctctcaaaactttatccccgaggcacaa 18811437  T
Q  290 gacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttt 389  Q
    ||||||| |||||   |||||||| ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   ||||||||    
T  18811436 gacaatgacactccaggccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttt 18811337  T
Q  390 tgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    || ||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||| || || ||||||||    
T  18811336 tgctgtattaacaccgcttgcatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatctcactttga 18811254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 90 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 27827913 - 27827531
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || ||||| |||||| | ||||| |||||| ||||||| | || ||||| |||||    
T  27827913 tcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagtcgttgctttaggaattgccgatgag 27827814  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataa 289  Q
    ||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || || || || || || ||||| ||||| || ||    
T  27827813 ccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctctcaaaactttatccccgaggcacaa 27827714  T
Q  290 gacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttt 389  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||| |||||| || ||   |||| | ||   ||||||||||||| ||||   ||||||||    
T  27827713 gacaatggcactcctagccttgtccaccatctcggtcttctccacttgtgacatggcgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttt 27827614  T
Q  390 tgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    || ||| | || ||||||| |||||| ||||||||||| || ||||| |||  |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  27827613 tgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataatccaaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatcccactttga 27827531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 139 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5591641 - 5591439
Alignment:
Q  139 actccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgc 238  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  5591641 actccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttgatcatatacaatgactccaactttgaccacatcgacgc 5591542  T
Q  239 cgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgt 338  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||| |||||    
T  5591541 cgcggttggttccttcgcgacatccctcaaaactttatcaccgaggcacaagacaatggcactcctagcc-tgtccaccatctcggtcttctccgcttgt 5591443  T
Q  339 gtca 342  Q
    ||||    
T  5591442 gtca 5591439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 90 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 450912 - 450687
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||   | |||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||  |||||||    
T  450912 tcatcaagaatcttgttaaattccaccaattgctccgtgatagatttggactccaccattttaaatgagtagagttgttgtttgaaaagttatctatgag 450813  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataa 289  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| || ||| ||||||||    || ||||||||||   |||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  450812 ccaaagatttcgttatgtacaatgactccaatttagccgacatcgattatacgatagcttccctaatgacatcccttaaaaccttatcttcaagacataa 450713  T
Q  290 gacaatggcactctttgccttgtcta 315  Q
     || || ||||| |||||||||||||    
T  450712 aactatagcactttttgccttgtcta 450687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 90 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 15069495 - 15069113
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || |||||||||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||    
T  15069495 tcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactccaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgag 15069396  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataa 289  Q
    ||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || | |||  | || || ||  | || || ||||| |||||  | ||    
T  15069395 ccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcagttggttcatttgctacttctttcaaaactttatccccgaggaacaa 15069296  T
Q  290 gacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttt 389  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||| || ||| || |||  |||| | ||   ||||| |||| ||  |||   ||||||||    
T  15069295 gacaatggcactcctggccttgtccaccatctcggtcttctccgctcgtgacatggtgaccggtagcgaaccttcatccttaaaaactttctcacacttt 15069196  T
Q  390 tgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    || ||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  15069195 tgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatcccactttga 15069113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 138 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 21481376 - 21481042
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    ||||| |||||||| ||||| || | ||||| ||| | || ||| | |||||||||||| || |||||||||||  | || ||||||| |||||| ||||    
T  21481376 gactctaccatcttgaatgagtaaaattgtttctttaggaattggcgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacattgatg 21481277  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
     |||||| | |||  |||| || || || || |  ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| | ||||||||   ||||||| ||||    
T  21481276 tcgcggttggttcattcgctacttctctcaaaaatttatctccgaggcacaaaacaatggcactcttggccttgcccaccatctcgatcttctccgcttg 21481177  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    || || |||  |||| | | |  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||     
T  21481176 tgacatggtgaccggtaacacaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtattaaaaccgcttccatctttaccttccataacccaaaatcg 21481077  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||  |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  21481076 ttatctccggtaaacttctcaatatcccactttga 21481042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 138 - 457
Target Start/End: Original strand, 31577748 - 31578066
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| | || ||||| | |||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  31577748 gactccaccatcttgaat-agtagagttgttgctttaggaattgccgaagagccaaagactttgtcatatacacagactccaactttgaccacatcgatg 31577846  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
     |||  | | |||| |||| || || || || || ||||| ||||| || ||||||||| ||||  | |||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  31577847 acgcaattggttccttcgctacctctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaatgacacttctggccttgtccaccatctcgatcttctcctcttg 31577946  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    || || |||  |||| | | |   |||| ||||||| ||||   |||||||||||||| | || ||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31577947 tgacatggtgaccggtaacacacattcaaccttcaaagctttctcacacttttgttgtattaacaccgcatccatctttaccttccataacccaaaatca 31578046  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctc 457  Q
    ||   |||||| ||||||||    
T  31578047 ttctctccggtaaacttctc 31578066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 207 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 17848300 - 17848038
Alignment:
Q  207 tacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttg 306  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | | |||| |||| | ||  ||||| || |||||  |||| || |||||||||||| |||| |    
T  17848300 tacaaagactccaactttgaccacatcgattccgcgattggttccttcgctaaatgacttaaaactttatcctcgaggcaaaagacaatggcattcttgg 17848201  T
Q  307 ccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgc 406  Q
     |||| | |||||||||  |||||||||||||| || |||   ||| | | |  ||||| ||||||| |||| | |||||||||||||| || | |||||    
T  17848200 gcttgcccaccatctcagtcttctcctcttgtgacatggtgatcggtaacacaccttcatccttcaaagcttgtgcacacttttgttgtatcgaaaccgc 17848101  T
Q  407 ttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactt 469  Q
    || |||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| || ||| |||| || ||||||||    
T  17848100 ttccatcttgaccttccataacccaaaattgttacttccagttaacctctcaatatcccactt 17848038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 288 - 470
Target Start/End: Original strand, 18105637 - 18105819
Alignment:
Q  288 aagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacact 387  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||   ||||||| ||||||||| |||  |||| | | |  ||||||||||||| | ||   ||||||    
T  18105637 aagacaatgacactcctagccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgtcatggtgaccggtaacacaccttcacccttcaaagttttctcacact 18105736  T
Q  388 tttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccacttt 470  Q
    |||| ||| |||| ||||||| |||||| | |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18105737 tttggtgtatcaacaccgcttacatcttcatcttccataacctaaaatcattccttccggtgaacttctcaatatcccacttt 18105819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17848406 - 17848299
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | || || || ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  17848406 gactccaacatcttcaatgagtagagttgttgctttaggaatttccgatgagccaaagagattgtcatatacaaagactccaactttgaccacatcgatt 17848307  T
Q  238 ccgcggta 245  Q
    ||||||||    
T  17848306 ccgcggta 17848299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 361 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 41383317 - 41383206
Alignment:
Q  361 cttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgat 460  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| | || ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| |||  |||||| |||||||| ||    
T  41383317 cttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtattaacaccgcttccatctttaccttccataactcaaaatcgttatctccggtaaacttctcaat 41383218  T
Q  461 gtcccactttga 472  Q
     |||||||||||    
T  41383217 atcccactttga 41383206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 472
Target Start/End: Original strand, 13985412 - 13985615
Alignment:
Q  273 ttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttca 372  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||   ||||||| |||||| || |||  | || | | |  ||||||||||||    
T  13985412 ttatccccgaggcacaagacaatgacactcttagccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgactggtaacacaccttcacccttca 13985511  T
Q  373 atgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgctt----gcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccact 468  Q
    | | || | || ||||||||||| |||| || ||||    ||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  13985512 acgtttgtgcaaacttttgttgtatcaaaactgcttccatgcatcttgacattccataacccaaaattgttacttccagtgaacttctcaatatcccact 13985611  T
Q  469 ttga 472  Q
    ||||    
T  13985612 ttga 13985615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 41383527 - 41383427
Alignment:
Q  144 accatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcgg 243  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| | || ||||| ||||| |||||| || |||||||||||  | |  ||||||| ||||||||||| |||||    
T  41383527 accatctcaaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacatcgatgtcgcgg 41383428  T
Q  244 t 244  Q
    |    
T  41383427 t 41383427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 469
Target Start/End: Original strand, 14418897 - 14418980
Alignment:
Q  386 cttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactt 469  Q
    |||||||||| | || ||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||||| || ||||||||    
T  14418897 cttttgttgttttaacaccgcttccacctttaccttccataacccaaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatcccactt 14418980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 436
Target Start/End: Original strand, 18199287 - 18199356
Alignment:
Q  367 ccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatc 436  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||  |||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  18199287 ccttcaaagcttctgcacacttttgttgaatcaagactgcttgcatatttaccttccataatccaaaatc 18199356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 381 - 466
Target Start/End: Original strand, 32429528 - 32429613
Alignment:
Q  381 acacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtccca 466  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||| | |||||| ||||| |||| ||| ||||  || |||||||| ||||||||    
T  32429528 acacacttttgttttgtcaaaacctcttgcgtctttatcttccacaacccaaaattattgcttctagtaaacttctcaatgtccca 32429613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 220
Target Start/End: Original strand, 32429287 - 32429367
Alignment:
Q  140 ctccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaa 220  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| || ||| || ||   |||||||||| |||||||    
T  32429287 ctccaccatcctaaatgagtagagttgttgtttcaagaattgtctataagtcaatgacttgaacatatacaataactccaa 32429367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 368; Significance: 0; HSPs: 37)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 92 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 33331172 - 33330789
Alignment:
Q  92 atcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagcc 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33331172 atcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagcc 33331073  T
Q  192 aaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataaga 291  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33331072 aaagatttcatcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgctgcggtagcttctctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataaga 33330973  T
Q  292 caatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttg 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33330972 caatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttg 33330873  T
Q  392 ttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccc 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33330872 ttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccc 33330789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 89 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 14738301 - 14737915
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14738301 atcatcaagaatcttgttaaactccgtaagttgctccgagatcgatttagactccatcatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 14738202  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14738201 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgccaacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 14738102  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14738101 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatctccgcttcaccctttaatgcttctacacactt 14738002  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccc 475  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14738001 ttgttgtgtcaaaatcgcttgcatcttaaccttctacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccc 14737915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 89 - 472
Target Start/End: Original strand, 18232218 - 18232601
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    |||||||||||| |||||||| |||  || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18232218 atcatcaagaattttgttaaattcctctaattgcttcgagattgatttagactccatcatcttgaatgaatagagttgttgtttcaagagtttcctatga 18232317  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18232318 gccaacgattttgtcatgtacaatgactccaacgtagcccacatcgatgtcgtggtagcttttctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 18232417  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    | ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18232418 aaacaatggcacttttagccttgtctatcatctcacgcttctccgcttgtgtcaaattcgtcggcatcgccgtttcacctttcaatgcttctacacactt 18232517  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18232518 ttgttgtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccaaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 18232601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 134 - 472
Target Start/End: Original strand, 9035700 - 9036038
Alignment:
Q  134 tttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatc 233  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  9035700 tttagactccaccatcttgaatcagtagagttgttgtttcaacagtttcctatgggccaaagatttcatcatgtacaatgacttcgactttgcccacatc 9035799  T
Q  234 gatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcct 333  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||| |||| ||||  ||| |||||      
T  9035800 gatgtcgcggtagcttctctcgtgacatccctcaaaatcttatctctgagacataagacaatatcactttttgccttatctatcatcaaacgtttctctg 9035899  T
Q  334 cttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaa 433  Q
    ||||| |||| || | || |||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  9035900 cttgtttcaaagtagtcgccatctccgcttcacccattaatgcttccacacacttttgtggtgccaaaatcgcttgcatcttaaccttccacaacctgaa 9035999  T
Q  434 atcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  9036000 atcattacttctagtgaacttctcaatgtcccactttga 9036038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 177 - 449
Target Start/End: Original strand, 24078354 - 24078628
Alignment:
Q  177 agttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttat 276  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||| || ||||||  |  |||||||||||||| ||||| |    
T  24078354 agttacctatgagccaaagttttcgtcatgtataatgactccaaattagcccacattgatgccacgatagcttttcctgcgacatcccttaaaaccttgt 24078453  T
Q  277 ctccgagacataagacaa--tggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaat 374  Q
    |||| | |||||| |  |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||    
T  24078454 ctccaaaacataaaaataagtggtactctttgccttgtctagcatctcacgcttctccgcttgtgtcaaggtagccgacatcgcagcttcaccctttaat 24078553  T
Q  375 gcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtg 449  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24078554 gcttccacacacttttgttgtgtcaaaaccactttcatcttaaccttccatagcccgaaatcattacttccggtg 24078628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 138 - 485
Target Start/End: Original strand, 5408480 - 5408827
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  5408480 gactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagactttgtcatatacaacgactccaactttgaccacatcgatg 5408579  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
     ||||||   |||| ||||||||||||| || || || || ||||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||| ||||    
T  5408580 tcgcggttagttccttcgcgacatccctcaaaactttgtccccgaggcacaagacaatggcactcctagccttgtccaccatctcggtcttctccgcttg 5408679  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    || || |||   | | | | |  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  5408680 tgacacggtgatcagtaacccaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccaaaatcg 5408779  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccctatgctactc 485  Q
    ||| | |||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||    
T  5408780 ttaatcccggtgaacttctcaatatcccactttgaacccatggtactc 5408827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 138 - 485
Target Start/End: Original strand, 5412805 - 5413152
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  5412805 gactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagactttgtcatatacaacgactccaactttgaccacatcgatg 5412904  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
     ||||||   |||| ||||||||||||| || || || || ||||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||| ||||    
T  5412905 tcgcggttagttccttcgcgacatccctcaaaactttgtccccgaggcacaagacaatggcactcctagccttgtccaccatctcggtcttctccgcttg 5413004  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    || || |||   | | | | |  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  5413005 tgacacggtgatcagtaacccaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccaaaatcg 5413104  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccctatgctactc 485  Q
    ||| | |||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||    
T  5413105 ttaatcccggtgaacttctcaatatcccactttgaacccatggtactc 5413152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 138 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 16553433 - 16553099
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || ||| ||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||    
T  16553433 gactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgtctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatg 16553334  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||| || || || || ||||| || ||||||||||| ||| | |||||||| || |||||   |||||||| |||    
T  16553333 ccgcggttggttccttcgcgacatccctcaaaactttgtccccgaggcacaagacaatggcgctcctcgccttgtccacgatctcggtcttctccttttg 16553234  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    || || |||  |||||| |||  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  16553233 tgacatggtgaccggcaacgcaccttcacccttcaaggctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccgaaatcg 16553134  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||   |||||||||||||  || |||||||||||    
T  16553133 ttaagcccggtgaacttctaaatatcccactttga 16553099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 138 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 16629989 - 16629655
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || ||| ||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||    
T  16629989 gactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgtctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatg 16629890  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||| || || || || ||||| || ||||||||||| ||| | |||||||| || |||||   |||||||| |||    
T  16629889 ccgcggttggttccttcgcgacatccctcaaaactttgtccccgaggcacaagacaatggcgctcctcgccttgtccacgatctcggtcttctccttttg 16629790  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    || || |||  |||||| |||  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  16629789 tgacatggtgaccggcaacgcaccttcacccttcaaggctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccgaaatcg 16629690  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||   |||||||||||||  || |||||||||||    
T  16629689 ttaagcccggtgaacttctaaatatcccactttga 16629655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 138 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 34165641 - 34165307
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||    
T  34165641 gactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatg 34165542  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
    |||| || | |||| ||||||||||||| || || || || ||||| || | ||||||||| ||| | |||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  34165541 ccgcagttggttccttcgcgacatccctcaaaactttgtccccgaggcacaggacaatggcgctcctcgccttgtccaccatctcggtcttctcctcttg 34165442  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    || || |||  ||||||   |  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  34165441 tgacatggtgtccggcaaaccgccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccacaacccaaaatcg 34165342  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||    |||||||||||||| || |||||||||||    
T  34165341 ttgagcccggtgaacttctcaatatcccactttga 34165307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 102 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 33309750 - 33309381
Alignment:
Q  102 ttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcg 201  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |    
T  33309750 ttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttg 33309651  T
Q  202 tcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcact 301  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | || || || || || || ||||| ||||| || ||||||| | ||||    
T  33309650 tcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgctgcggttgcttcctttgctacttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaacgacact 33309551  T
Q  302 ctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaat 401  Q
    | | |||||||| ||||||||   ||||||| || ||| || |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   ||||||| || ||| | ||     
T  33309550 cctggccttgtccaccatctcggtcttctccgctcgtgacatggtgaccggtaacg-aacttcacccttcaaagctttctcacacttctgctgtattaac 33309452  T
Q  402 accgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  33309451 accgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcgatatcccactttga 33309381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 102 - 472
Target Start/End: Original strand, 26931981 - 26932351
Alignment:
Q  102 ttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcg 201  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || |||||  ||||||| ||||| |||||| ||||||| | || ||||| |||||||||||| || |    
T  26931981 ttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactcttccatcttgaatgagtagagtcgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttg 26932080  T
Q  202 tcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcact 301  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | || || || || || || ||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  26932081 tcatatacaaagatttcaactttgcccacaacgatgccgcggttgcttcctttgctacttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaacggcact 26932180  T
Q  302 ctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaat 401  Q
    | | |||||||| ||||||||   ||||||| || ||| || |||  |||| | ||   ||||||||||||| | ||   |||||||||| ||| | ||     
T  26932181 cctggccttgtccaccatctcggtcttctccgctcgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagttttctcacacttttgctgtattaac 26932280  T
Q  402 accgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  26932281 acctcttccatctttaccttccataaccctaaatcgttatctccggtaaacttctcgatatcccactttga 26932351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 153 - 472
Target Start/End: Original strand, 26067864 - 26068183
Alignment:
Q  153 aatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccc 252  Q
    ||||| |||||| ||||||| | || ||||  |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  26067864 aatgagtagagtcgttgctttaggaattgctgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcct 26067963  T
Q  253 tcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccgg 352  Q
    | || || ||  | || || ||||| ||||| || ||||||| | ||||| | |||||||| ||||||||   ||||||| || ||| || |||  ||||    
T  26067964 ttgctacttctatcaaaactttatccccgaggcacaagacaacgacactcctggccttgtccaccatctcggtcttctccgctcgtgacatggtgaccgg 26068063  T
Q  353 catcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaac 452  Q
     | ||   ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| |||    
T  26068064 taacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaac 26068163  T
Q  453 ttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||| || ||| |||||||    
T  26068164 ttctcaatatcctactttga 26068183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 244
Target Start/End: Original strand, 12936655 - 12936809
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||  ||| |  ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||    
T  12936655 tcatcaaggattttgttaaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcttaaatgagtagagttgttgctttaggaattgccaatgag 12936754  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggt 244  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12936755 ccaaagattttgtcatatacaaagactccaactttgaccacatcgatggcgcggt 12936809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 89 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 12158125 - 12157875
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| || |||| ||||  | | |  || |||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| | || ||||| ||||    
T  12158125 atcatcaaggatcttgttgaactctgtaagtttctccatggtggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagtgcttgctttaggaattgccaatga 12158026  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | | |||| | ||||||||||  || || || || ||||| ||||    
T  12158025 gccaaagactttgtcatatacaatgactccaactttgaccacatcgatgtcgcgtttggttccttagcgacatcccccaaaactttttccccgaggcata 12157926  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtg 339  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| ||||||||   ||||||| ||||||    
T  12157925 agacaatgtcactcctagccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtg 12157875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 288 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 16555492 - 16555308
Alignment:
Q  288 aagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacact 387  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||   |||||||||||||| || |||  |||||| |||  ||||||||||||| ||||   ||||||    
T  16555492 aagacaatggcgctcctcgccttgtccaccatctcggtcttctcctcttgtgacatggtgaccggcaacgcaccttcacccttcaaggctttctcacact 16555393  T
Q  388 tttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||    
T  16555392 tttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccgaaatcgttaagcccggtgaacttctcaatatcccactttga 16555308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 288 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 16632048 - 16631864
Alignment:
Q  288 aagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacact 387  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||   |||||||||||||| || |||  |||||| |||  ||||||||||||| ||||   ||||||    
T  16632048 aagacaatggcgctcctcgccttgtccaccatctcggtcttctcctcttgtgacatggtgaccggcaacgcaccttcacccttcaaggctttctcacact 16631949  T
Q  388 tttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||    
T  16631948 tttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccgaaatcgttaagcccggtgaacttctcaatatcccactttga 16631864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 322
Target Start/End: Original strand, 25462883 - 25463103
Alignment:
Q  102 ttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcg 201  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||| |||| || |    
T  25462883 ttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagcctaagactttg 25462982  T
Q  202 tcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcact 301  Q
    |||||||||| ||||  ||||||  | |||||||||||||| | | |||  |||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  25462983 tcatatacaaagactataactttaactacatcgatgccgcgtttggttctttcgctacatctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaatggcact 25463082  T
Q  302 ctttgccttgtctaccatctc 322  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  25463083 cttggccttgtctaccatctc 25463103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 134 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 28301663 - 28301322
Alignment:
Q  134 tttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatc 233  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||  ||||| ||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||| ||||     
T  28301663 tttagactccagcatcttgaatgactagagatgttgtttcaatagtgtcctattagccaaagatttaatcatgtataatgactccaacttagccaacatt 28301564  T
Q  234 gatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctcc------gagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgct 327  Q
    | ||||||| ||  ||||||||||||||  || || |||| || |||       ||| | || ||||| |||||||||||||||| || ||||||| | |    
T  28301563 ggtgccgcgataaattccctcgcgacataactcaaaacctcatttccaggaagaagaaaaaaaacaat-gcactctttgccttgtatatcatctcaagtt 28301465  T
Q  328 tctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatctta---accttcca 424  Q
    ||||| ||||||||||||| || | ||| || |||||||||||  || |||| ||||| ||||| |||||||| ||   ||||||||||   | ||||||    
T  28301464 tctccacttgtgtcaaggtagctgacattgcagcttcaccctt-tatacttcaacaca-ttttg-tgtgtcaaaactatttgcatcttaagtagcttcca 28301368  T
Q  425 taacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccacttt 470  Q
    | ||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||    
T  28301367 tcaccagaaatcattaaatctggtgaacttctcgatgtcccgcttt 28301322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 134 - 470
Target Start/End: Original strand, 28510410 - 28510751
Alignment:
Q  134 tttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatc 233  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||  ||||| ||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||| ||||     
T  28510410 tttagactccagcatcttgaatgactagagatgttgtttcaatagtgtcctattagccaaagatttaatcatgtataatgactccaacttagccaacatt 28510509  T
Q  234 gatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctcc------gagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgct 327  Q
    | ||||||| ||  ||||||||||||||  || || |||| || |||       ||| | || ||||| |||||||||||||||| || ||||||| | |    
T  28510510 ggtgccgcgataaattccctcgcgacataactcaaaacctcatttccaggaagaagaaaaaaaacaat-gcactctttgccttgtatatcatctcaagtt 28510608  T
Q  328 tctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatctta---accttcca 424  Q
    ||||| ||||||||||||| || | ||| || |||||||||||  || |||| ||||| ||||| |||||||| ||   ||||||||||   | ||||||    
T  28510609 tctccacttgtgtcaaggtagctgacattgcagcttcaccctt-tatacttcaacaca-ttttg-tgtgtcaaaactatttgcatcttaagtagcttcca 28510705  T
Q  425 taacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccacttt 470  Q
    | ||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||    
T  28510706 tcaccagaaatcattaaatctggtgaacttctcgatgtcccgcttt 28510751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 138 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16651693 - 16651566
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || ||| ||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||    
T  16651693 gactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgtctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatg 16651594  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatccct 265  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||    
T  16651593 ccgcggttggttccttcgcgacatccct 16651566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 326 - 472
Target Start/End: Original strand, 16578101 - 16578247
Alignment:
Q  326 cttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccat 425  Q
    |||||||||||||| || |||  |||||| |||  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||  || | |||||||||||||| |||||||||    
T  16578101 cttctcctcttgtgacatggtgaccggcaacgcaccttcacccttcaaggctttctcacacttttgttgaatccacaccgcttgcatcttcaccttccat 16578200  T
Q  426 aacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||||||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||    
T  16578201 aacccgaaatcgttaagcccggtgaacttctcaatatcccactttga 16578247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 326 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 16617279 - 16617133
Alignment:
Q  326 cttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccat 425  Q
    |||||||||||||| || |||  |||||| |||  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||  || | |||||||||||||| |||||||||    
T  16617279 cttctcctcttgtgacatggtgaccggcaacgcaccttcacccttcaaggctttctcacacttttgttgaatccacaccgcttgcatcttcaccttccat 16617180  T
Q  426 aacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||||||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||    
T  16617179 aacccgaaatcgttaagcccggtgaacttctcaatatcccactttga 16617133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 3395221 - 3394889
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  3395221 gactctaccatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggaattgccaatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcacacatcgatg 3395122  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
    | ||||| | |||| | || || || || || || ||||| ||||| || |  | |||| ||||| |||||||||| ||||||||   ||||||| || |    
T  3395121 cggcggttggttcctttgccacttctctcaaaactttatccccgaggcaca--ataatgacactccttgccttgtccaccatctcggtcttctccgctcg 3395024  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    || ||  ||   ||| |  ||  ||||||||||||| ||||   ||||||| |||||| | || || |||| ||| || |||||||||||||| ||||      
T  3395023 tgacattgtgatcggtaatgcaccttcacccttcaaagctttctcacacttctgttgtattaaaactgcttccatatttaccttccataacccaaaattg 3394924  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||  |||||| || ||||| || |||||||||||    
T  3394923 ttatctccggtaaatttctcaatatcccactttga 3394889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 141 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 30444115 - 30444016
Alignment:
Q  141 tccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccg 240  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| |||| |  | ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30444115 tccatcatcttaaatgagtagagttgtggctttagaaattgtctatgagccaaagacttggtcatatacaacgactccaactttgaccacatcgatgccg 30444016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 472
Target Start/End: Original strand, 3631403 - 3631731
Alignment:
Q  144 accatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcgg 243  Q
    |||||||| ||||| || |||| |||||| | || |||   ||||| |||||| || ||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  3631403 accatcttgaatgagtaaagttattgctttaggaattgttgatgagtcaaagactttgtcatatacaaagcttccaactttggccacatcgatgctgcgg 3631502  T
Q  244 tagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaa 343  Q
    | | |||| |||| || |  || || || ||||| ||||| || ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||  ||||||| || ||| ||     
T  3631503 tggattccttcgctacttttctcaaaactttatccccgaggcacaagacaatgacactcctggccttgtccaccatctcagtcttctccgctcgtgacat 3631602  T
Q  344 ggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattactt 443  Q
    |||  |||| | ||   ||| ||||||||| ||||   ||||||| || ||| | || | ||| | |||||| |||||| ||||||| ||||| |||  |    
T  3631603 ggtgaccggtaacgaacctttacccttcaaagctttctcacacttctgctgtattaacatcgcctccatctttaccttcaataacccaaaatcgttatct 3631702  T
Q  444 ccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||    
T  3631703 ccggtaaacttctcaatatcccactttga 3631731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 410 - 470
Target Start/End: Original strand, 21198602 - 21198662
Alignment:
Q  410 catcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccacttt 470  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  21198602 catcttaactttccataacccgaaatcattacttcaggtgaacttctcgatatcccacttt 21198662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 244
Target Start/End: Original strand, 15534056 - 15534162
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |||||||||||  | || ||||||| |||||||||||    
T  15534056 gactctaccatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccaatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatg 15534155  T
Q  238 ccgcggt 244  Q
     ||||||    
T  15534156 tcgcggt 15534162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Original strand, 25465282 - 25465389
Alignment:
Q  361 cttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgat 460  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| || ||||| ||    
T  25465282 cttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtattaaaaccgcttccatctttaccttccataaccc-aaatcattatctccggtaaatttctcaat 25465380  T
Q  461 gtcccactt 469  Q
     ||||||||    
T  25465381 atcccactt 25465389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 90 - 196
Target Start/End: Original strand, 12910979 - 12911085
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||  ||| |  ||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || || || |||||    
T  12910979 tcatcaaggattttgttaaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcttgaatgagtagagttgttgctttaggaattcccaatgag 12911078  T
Q  190 ccaaaga 196  Q
    |||||||    
T  12911079 ccaaaga 12911085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 360 - 469
Target Start/End: Original strand, 5165528 - 5165637
Alignment:
Q  360 gcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcga 459  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  | || |  ||   |||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |    
T  5165528 gcttctcccttcaatgcttcaacacacttttgttgaattaaaattgccctcatctttaccttccacaacccgaagtcgttactaccggtaaacttctcaa 5165627  T
Q  460 tgtcccactt 469  Q
    ||||||||||    
T  5165628 tgtcccactt 5165637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 26944349 - 26944165
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    ||||| |||||||| ||| | || |||||| |||| | || ||| | || ||||||||| || |||||||||||  | || ||||||| |||||||||||    
T  26944349 gactctaccatcttgaattattaaagttgtcgctttaggaattgtcgataagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatg 26944250  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctc 322  Q
     |||||| | |||| |||| | ||| || || || |||| |||||| || |||||||||| ||||   |||||||| ||||||||    
T  26944249 gcgcggttggttccttcgctatatctctcaaaactttatttccgaggcacaagacaatggtactccgggccttgtccaccatctc 26944165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 410 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 30443868 - 30443809
Alignment:
Q  410 catcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactt 469  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||    
T  30443868 catctttaccttccataacccaaaatcattatttccggtaaacttctcaatatcccactt 30443809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 17012888 - 17012542
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||   || ||||| |||||||||||| ||  ||||||||||  | || ||||||| |||||||||||    
T  17012888 gactctaccatcttgaatgagtaaagttgttgcttttggaattgccgatgagccaaagactttatcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatg 17012789  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
     ||| || | |||| | || || ||||| || || | ||   |||| || |||||||| ||| || | |||||||| ||||||||   ||| |||  | |    
T  17012788 tcgcagttggttcctttgctacttccctcaaaacttaattctcgaggcacaagacaatagcaatcatggccttgtccaccatctcggtcttttccgttcg 17012689  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    || || |||  || | | |||  ||||||||||||| ||||    ||| ||||||||| | || |||||||  ||||| |||||||||||||  |||||     
T  17012688 tgacatggtgacctgtaacgcaccttcacccttcaaagctttcttacatttttgttgtattaaaaccgcttctatctttaccttccataacctaaaatcg 17012589  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccctatgctact 484  Q
    |||  | |||| |||||||| || ||||||||||| |||||| ||||    
T  17012588 ttatcttcggtaaacttctcaatatcccactttgaacctatggtact 17012542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 253
Target Start/End: Original strand, 21198474 - 21198593
Alignment:
Q  134 tttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatc 233  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| | || || || |||||||||| ||||||  ||||  ||    
T  21198474 tttagactataccatcttaaatgagtgtaggtgttgtttcaaaagttgtctatgagcaaaataattagttatgtacaatgacttcaacttaacccatgtc 21198573  T
Q  234 gatgccgcggtagcttccct 253  Q
    |||| |||| ||||||||||    
T  21198574 gatgtcgcgatagcttccct 21198593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 469
Target Start/End: Original strand, 15540826 - 15540935
Alignment:
Q  360 gcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcga 459  Q
    |||||||||||||| ||||   ||||||| |||||| | || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||  |||  |||||| | |||||| |    
T  15540826 gcttcacccttcaaagctttctcacacttctgttgtattaaaactgcttccatctttaccttccataacccaaaattgttatctccggtaagcttctcaa 15540925  T
Q  460 tgtcccactt 469  Q
    | ||||||||    
T  15540926 tatcccactt 15540935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 11137174 - 11137078
Alignment:
Q  361 cttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 457  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||| ||| | || || | || |||||| |||||||||||||| |||||||||  || ||| ||||||||    
T  11137174 cttcacccttcaaagctttctcacacttttgctgtattaacactggttccatctttaccttccataacccaaaatcattatctctggtaaacttctc 11137078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 359; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 89 - 475
Target Start/End: Original strand, 19348635 - 19349021
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19348635 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttcaagagttgtctatga 19348734  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19348735 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgtcgcggtagcttctctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 19348834  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19348835 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 19348934  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccc 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19348935 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccaaaatcattgcttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccc 19349021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 89 - 472
Target Start/End: Original strand, 25403008 - 25403391
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25403008 atcatcaagaatcttgttaaattccgtcaattgctccgagattgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgtttcaagagttgcctatga 25403107  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25403108 gccaaagatttcgtcatgtacaatgactccaacttagcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 25403207  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    | ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25403208 aaacaatagcattctttgccttgtctatcatctcacgcttcttttcttgtgtcaaagttgccggcatagccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 25403307  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25403308 ttgttgtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 25403391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 89 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 23079196 - 23078813
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23079196 atcatcaagaattttgttaaattccgccaattgctccgagattgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgtttcaagagttgcctatga 23079097  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23079096 gccaaagatttcgtcatgtacaatgactccaacttagcccacatcgatgccgcagtagcttctcttgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 23078997  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23078996 aaacaatggtactctttgccttgtctatcatctcacgcttctccgcttgtgtcaaagttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 23078897  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23078896 ttgttgtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgttccactttga 23078813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 89 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 10446169 - 10445786
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  10446169 atcatcaagaattttgttaaatttcgccaattgctccgagattgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgtttcaagagtttcctatga 10446070  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10446069 gccaacgatttcgtcatgtacaatgactccaacttagcccacatcgacgccgcggtagcttctttcgcgacatctcttaagaccttatctccgagacata 10445970  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10445969 aaacaatggcactcttagccttgtctatcatctcacgcttctccgcttgtgtcaaattcgctggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 10445870  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10445869 ttgttgtgttaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccaaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 10445786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 90 - 472
Target Start/End: Original strand, 16387824 - 16388204
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16387824 tcatcaagaatcttgttaaattccgtcaattgctccgtgataggattagactccac-atcttgaatgaatagagttgttgtttcaacagttgcctatgag 16387922  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataa 289  Q
     |||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||| |||| |||| |||   | ||| | ||||| |||| || || | |||||||  |||||||||    
T  16387923 acaaagatttcatcatgtacaatgactataacttggccgacattgatgacgcaacaactttcgtcgcggcatctctcaaaatcttatctttgagacataa 16388022  T
Q  290 gacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttt 389  Q
     |  |||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  16388023 aaacatggcactattttc-ttgtctatcatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggtagacgacatcgcagcttcaccctttaatgcttccacacacatt 16388121  T
Q  390 tgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16388122 tgttgtgtcaaaacctcttgcatcttaaccttccacaacccaaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 16388204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 102 - 472
Target Start/End: Original strand, 36560559 - 36560929
Alignment:
Q  102 ttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcg 201  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |    
T  36560559 ttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttg 36560658  T
Q  202 tcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcact 301  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | || || || || || || ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  36560659 tcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaatggcact 36560758  T
Q  302 ctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaat 401  Q
    | | |||||||| ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   ||||||| || ||| | ||     
T  36560759 cctggccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttctgctgtattaac 36560858  T
Q  402 accgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  36560859 accgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcgatatcccactttga 36560929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 90 - 472
Target Start/End: Original strand, 19503742 - 19504124
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || ||||| | |||| | ||||| ||||||  |||||| | || ||||| |||||    
T  19503742 tcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctatcatcctgaatgagtagagtcattgctttaggaattgccgatgag 19503841  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataa 289  Q
     |||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || || || || || || ||||| ||||| || ||    
T  19503842 gcaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctctcaaaactttatccccgaggcacaa 19503941  T
Q  290 gacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttt 389  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   ||||||||    
T  19503942 gacaatggcactcctggccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttt 19504041  T
Q  390 tgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    || ||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  19504042 tgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccaaaatcattatctccggtaaacttctcaatatcccactttga 19504124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 472
Target Start/End: Original strand, 35217388 - 35217758
Alignment:
Q  102 ttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcg 201  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |    
T  35217388 ttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttg 35217487  T
Q  202 tcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcact 301  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || || || || || || ||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  35217488 tcatatataaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaacggcact 35217587  T
Q  302 ctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaat 401  Q
    | | |||||||| |||||||    ||||||| || ||| || |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   ||||||| || ||| | ||     
T  35217588 cctggccttgtccaccatcttggtcttctccgctcgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttctgctgtattaac 35217687  T
Q  402 accgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  35217688 accgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcgatatcccactttga 35217758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 90 - 472
Target Start/End: Original strand, 21520100 - 21520482
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcg-atttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||    
T  21520100 tcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcattta-actccaccatcctaaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatga 21520198  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    |||||||| || ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| | |||| | || || || || || |  ||||| ||||| || |    
T  21520199 gccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttggccacatcgatgctgcggttggttcctttgctacttctctcaaaaatttatccccgaggcaca 21520298  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||    ||||||| || ||| || |||  |||| | |    ||||||||||||| ||||   |||||||    
T  21520299 agacaatggcactcctggccttgtccaccatcttggtcttctccgctcgtgacatggtgaccggtaacaaaccttcacccttcaaagctttctcacactt 21520398  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||| ||| | || | ||||| |||||| |||||||||||||| ||||  |||  |||||| |||||||  || |||||||||||    
T  21520399 ttgatgtattaacatcgcttccatctttaccttccataacccaaaattgttatctccggtaaacttcttaatatcccactttga 21520482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 90 - 472
Target Start/End: Original strand, 22405336 - 22405718
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || |||||||||||||| ||||| |||| | ||||||| | || ||||  || ||    
T  22405336 tcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactccaccatcttgaatgagtagaatcgttgctttaggaattgctgataag 22405435  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataa 289  Q
    ||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||| || || || || || ||||| ||||| || ||    
T  22405436 ccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttggttccttcgctacttctctcaaaactttatccccgaggcacaa 22405535  T
Q  290 gacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttt 389  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||| |||   |||||||  | ||| ||  ||  |||| | ||    |||||||||||| ||||   ||||||||    
T  22405536 gacaatggcactcctagccttgtccaccagctcggtcttctccgttcgtgacatagtgaccggtaacgaacattcacccttcaaagctttctcacacttt 22405635  T
Q  390 tgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    || ||| | ||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||  || ||| |||||||| || |||||||||||    
T  22405636 tgctgtattaacgccgcttccatctttaccttccataacccgaaattgttatctctggtaaacttctcaatatcccactttga 22405718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 288 - 485
Target Start/End: Original strand, 723308 - 723505
Alignment:
Q  288 aagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacact 387  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||| ||||||||| |||  |||||| |||  ||||||||||||| ||||   ||||||    
T  723308 aagacaaaggcactcctagccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgtcatggtgaccggcaacgcaccttcacccttcaaagctttctcacact 723407  T
Q  388 tttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccctatgctactc 485  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| || ||| |||||    
T  723408 tttgttgtatcaacaccacttgcattttcaccttccataacccaaaatcgttacttccggtgaacttctcaatattccactttgaacccatggtactc 723505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 137 - 244
Target Start/End: Original strand, 34574611 - 34574718
Alignment:
Q  137 agactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgat 236  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |   || |||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  34574611 agactccaacatcttaaatgagtagagttgttgcatttggaattgcctatgagccaaaggctttgtcatatacaaagactccaactttgaccacatcgat 34574710  T
Q  237 gccgcggt 244  Q
    ||||||||    
T  34574711 gccgcggt 34574718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 376 - 472
Target Start/End: Original strand, 3277664 - 3277760
Alignment:
Q  376 cttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  3277664 cttcaacacacttttgttgagtcaaaactgtttgcatcttaaccttccataacccaaaatcataatttccagtgaacttctcgatgtcccgctttga 3277760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 138 - 472
Target Start/End: Original strand, 6263608 - 6263941
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |||||||||||  |    ||||||| |||||||||||    
T  6263608 gactctaccatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatatctgaactttgaccacatcgatg 6263707  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
    ||||||| | |||| |||   | || ||  | || ||||  ||||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||  ||||    
T  6263708 ccgcggttgtttccttcgttgcttctctcgaaactttattcccgaggcacaagacaatggcactcctagccttgtccaccatctcggtcttctctgcttg 6263807  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    || || |||  || | | |    ||||||||||||| ||||   |||||||||| ||| | |  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||     
T  6263808 tgacatggtgaccagtaacataccttcacccttcaaagctttctcacacttttgatgtattatcaccgctttcatctttaccttccataaccc-aaatcg 6263906  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  6263907 ttatctccggtgaacttctcaatatcccactttga 6263941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 382 - 472
Target Start/End: Original strand, 30720322 - 30720412
Alignment:
Q  382 cacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||||||||||||| |||| || |||| ||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30720322 cacacttttgttgtatcaaaactgcttccattttgaccttccataacccaaaatcattacatccggtgaacttctcgatatcccactttga 30720412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 363 - 485
Target Start/End: Original strand, 42019522 - 42019644
Alignment:
Q  363 tcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgt 462  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| || | ||  | ||| ||||||    
T  42019522 tcacccttcaaagatttttcacacttttgttgtgtcaaaaccacttgcatctttaccttcaataacccaaaatcattattttcagttcatttcccgatgt 42019621  T
Q  463 cccactttgaccctatgctactc 485  Q
    ||||||||||  ||||| |||||    
T  42019622 cccactttgaaactatgatactc 42019644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 479
Target Start/End: Original strand, 34574827 - 34574944
Alignment:
Q  361 cttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgat 460  Q
    |||||||| |||| |||| | |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||||| |  ||    
T  34574827 cttcacccgtcaaagcttgtgcacacttttgttgtatcaaaaccgcttccatcttgaccttccataa-ctaaaatagttacttccggtgaacttatgaat 34574925  T
Q  461 gtcccactttgaccctatg 479  Q
     ||||||||||| ||||||    
T  34574926 atcccactttgaacctatg 34574944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 404 - 456
Target Start/End: Original strand, 28570133 - 28570185
Alignment:
Q  404 cgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttct 456  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||    
T  28570133 cgcttccatctttaccttccataacccaaaatcattatctccggtaaacttct 28570185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 206
Target Start/End: Original strand, 42019300 - 42019368
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcata 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| || || | || |||||||| ||||||||| || ||||||    
T  42019300 gactccaccatcttaaatgtataaagttggtgttttaggaattgcctataagccaaagacttggtcata 42019368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 36)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 89 - 475
Target Start/End: Original strand, 33790673 - 33791059
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33790673 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttcaagagttgtctatga 33790772  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33790773 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 33790872  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33790873 agacaatggcactctttgccttgtccaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctagacactt 33790972  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccc 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33790973 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaactttccataacccgaaatcattgcttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccc 33791059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 89 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 31397721 - 31397335
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31397721 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 31397622  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31397621 gccaaagattttgtcatatagaatgactccaacttttcccacattgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagactttatctccgagacata 31397522  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31397521 agacaatagtactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 31397422  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccc 475  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31397421 ttgttgtgtcaataccacttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccagtgaacttctcgatgtcccactttgaccc 31397335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 89 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 37557353 - 37556967
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37557353 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 37557254  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37557253 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgtcgcggtagcttctctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 37557154  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37557153 agacaatagcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacattt 37557054  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccc 475  Q
    |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37557053 ttgttaagtcaaaaccgcttccatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccc 37556967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 89 - 475
Target Start/End: Original strand, 27449180 - 27449566
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449180 atcatcaagaatcttgttaaactccgtcaattgctccgagattgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 27449279  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27449280 gctaaagattttgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacatccattaagaccttatctccgagacata 27449379  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27449380 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcaccctttaatgcttctacacactt 27449479  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccc 475  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449480 ttgttgtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccc 27449566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 119 - 484
Target Start/End: Original strand, 43598120 - 43598489
Alignment:
Q  119 ttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactcc 218  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43598120 ttgctccgagattgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcccatgagctaaagatttcgtcatatacaatgactcc 43598219  T
Q  219 aactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgt----ct 314  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  43598220 aacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctacct 43598319  T
Q  315 accatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatct 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43598320 accatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccgacatcgccgcttcaccctttaatgcttctacacacttttgttgtgtcaaaaccgcttgcatct 43598419  T
Q  415 taaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccctatgctact 484  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  43598420 taaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatact 43598489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 119 - 484
Target Start/End: Original strand, 43603612 - 43603981
Alignment:
Q  119 ttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactcc 218  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43603612 ttgctccgagattgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcccatgagctaaagatttcgtcatatacaatgactcc 43603711  T
Q  219 aactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgt----ct 314  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  43603712 aacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctacct 43603811  T
Q  315 accatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatct 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43603812 accatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccgacatcgccgcttcaccctttaatgcttctacacacttttgttgtgtcaaaaccgcttgcatct 43603911  T
Q  415 taaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccctatgctact 484  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  43603912 taaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatact 43603981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 119 - 484
Target Start/End: Original strand, 43609104 - 43609473
Alignment:
Q  119 ttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactcc 218  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43609104 ttgctccgagattgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcccatgagctaaagatttcgtcatatacaatgactcc 43609203  T
Q  219 aactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgt----ct 314  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  43609204 aacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctacct 43609303  T
Q  315 accatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatct 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43609304 accatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccgacatcgccgcttcaccctttaatgcttctacacacttttgttgtgtcaaaaccgcttgcatct 43609403  T
Q  415 taaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccctatgctact 484  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  43609404 taaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatact 43609473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 89 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 24556314 - 24555931
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    |||||||||||| | |||||| | ||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  24556314 atcatcaagaatttcgttaaatttcgtcaattgctccgagattgatttagaccccaccatcttgaatgaatagagttgttatttcaagagttgtctatga 24556215  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24556214 gccaacgatttagtcatgtacaatgactccaacttagcccacagagatgccgcagcagcttcccttgcgacatcccttaaaaccttatctccgagacata 24556115  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24556114 aaacaatggcactcttagccttgtctatcatctcacgcttctccgcttgtgtcaaattcgtcggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 24556015  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24556014 tttttgtgtcaaaaccgcttacatcttaaccttccacaacccgaaatcatttctttcggtgaacttctcgatgtcccactttga 24555931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 89 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 24597346 - 24596962
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    |||||||||||| | |||||| | ||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  24597346 atcatcaagaatttcgttaaatttcgtcaattgctccgagattgatttagaccccaccatcttgaatgaatagagttgttatttcaagagttgtctatga 24597247  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24597246 gccaacgatttagtcatgtacaatgactccaacttagcccacagagatgccgcagcagcttcccttgcgacatcccttaaaaccttatctccgagacata 24597147  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacac-t 387  Q
    | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24597146 aaacaatggcactcttagccttgtctatcatctcacgcttctccgcttgtgtcaaattcgtcggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 24597047  T
Q  388 tttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24597046 ttttttgtgtcaaaaccgcttacatcttaaccttccacaacccgaaatcatttctttcggtgaacttctcgatgtcccactttga 24596962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 208 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 42127011 - 42126747
Alignment:
Q  208 acaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgc 307  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  42127011 acaatgactccaacttagcccatatcgacgtcgcggtagcttctctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataaaaaaatggcactcttagc 42126912  T
Q  308 cttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgct 407  Q
    |||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  42126911 cttgtctatcatctctcgcttctctgcttgtgtcaaactcgccggcatcaccgcttcacccttcaatgcttctaaacacttttgttgtgtcaaaaccgct 42126812  T
Q  408 tgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42126811 tgtatcttaaccttccacaacccaaaatcattatttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 42126747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 138 - 485
Target Start/End: Original strand, 9788632 - 9788979
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||    
T  9788632 gactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacgattccaactttgaccatatcgatg 9788731  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||| || || || || ||||| || ||||||||||||||| | |||||||| | ||||||   ||||||||||||    
T  9788732 ccgcggttggttccttcgcgacatccctcaaaactttgtccccgaggcacaagacaatggcactcctagccttgtccatcatctcggtcttctcctcttg 9788831  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    || || |||  |||| |  ||  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  9788832 tgacatggtgtccggtaaagcaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccaaaatcg 9788931  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccctatgctactc 485  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||    
T  9788932 ttaattccggtgaacttctcgatatcccactttgaacccatggtactc 9788979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 138 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 26171524 - 26171192
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||    
T  26171524 gactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacgattccaactttgaccatatcgatg 26171425  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
    || |||| | |||| |||||||||||||||| || || ||  |||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  26171424 ccacggttggttccttcgcgacatcccttaaaactttgtcctcgaggcacaagacaatggcactcctagccttgtccaccatctcggtcttctcctcttg 26171325  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    || || |||  |||| | |||  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  26171324 tgacatggtgaccggtaacgcaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccaaaatcg 26171225  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccacttt 470  Q
    ||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  26171224 ttaatcccggtgaacttctcgatatcccacttt 26171192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 89 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 534565 - 534169
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||   |  |  || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || |||||||| |    
T  534565 atcatcaagtattttgttgaactccgttaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatca 534466  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
     ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||| |||| ||| ||||||||| || || || || ||||| || |    
T  534465 accaaagacttggtcatatacaatgactccaactttgaccacatcaacgccgccgtaggttccttcgggacatccctcaaaactttgtcaccgaggcaca 534366  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||| ||| || || |||   ||| | |||  ||||||||||||| ||||   |||||||    
T  534365 agacaatggcactcctagccttgtccaccatctcggtcttctccgcttctgacatggtgaacggtaacgcaccttcacccttcaaagctttctcacactt 534266  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccctatgctactc 485  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||    
T  534265 ttgttgtatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccaaaatcattacttccggtgaacttctcaatatcccactttgaacccatgatactc 534169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 138 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 29721132 - 29720785
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  29721132 gactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacgattccaactttgaccacatcgatg 29721033  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||| || || || || ||||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  29721032 ccgcggttggttccttcgcgacatccctcaaaactttgtccccgaggcacaagacaatggcactcctagccttgtccaccatctcggtcttctcctcttg 29720933  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    || || ||| ||||| | |||  ||||||| ||||  ||||   |||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  29720932 tgacatggtagccggtaacgcaccttcaccattcacggctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccaaaatcg 29720833  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccctatgctactc 485  Q
    |||   |||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||    
T  29720832 ttaagcccggtgaacttctcaatatcccactttgaacccatggtactc 29720785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 90 - 472
Target Start/End: Original strand, 34841975 - 34842360
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||||||| ||||| | ||| | | |||||||  ||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| | ||| ||| |||    
T  34841975 tcatcaagaatcatgttagattccatcaattgctccatgataggtttagactccaccatcttgaatgagtagagttgttatttcaaaaattgtctacgag 34842074  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataa 289  Q
    | |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||    
T  34842075 ctaaagattttgtcatgtacaatggctccaacttagcccacatcgatgtcacagtagctttcctcgcgacatcctttaaaaccttatctttgagacataa 34842174  T
Q  290 gacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgc---cggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacac 386  Q
     |||||  |||| ||||| ||||||| ||||| || ||||||| ||||||| ||| | ||   || |  ||| |||||| |||| |||||||  ||||||    
T  34842175 aacaatatcactatttgctttgtctatcatcttacacttctccgcttgtgttaagttagcttacgtcgacgcagcttcatcctttaatgctttaacacac 34842274  T
Q  387 ttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  34842275 ttttattgtgtcaaaaccgcttgcatcttaactttctctaacccaaaatcattaattccgatgaacttctcaatgtcacactttga 34842360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 186 - 462
Target Start/End: Original strand, 5599353 - 5599629
Alignment:
Q  186 tgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagac 285  Q
    |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||  |||| |||||| || || |||||||||  |||||    
T  5599353 tgagtcaaagattttatcatatataatgactccaacttagtccacatcaatgccgcagtagcttttctcgtgacatctctcaaaaccttatctatgagac 5599452  T
Q  286 ataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacaca 385  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||  |||||||||| || |||||||||| |||| ||||  || ||||||||| |||||||| | |||    
T  5599453 ataaaacaatgacactctttgctttgtctatcatcctacgcttctccgctagtgtcaaggtagccgacatcatcgattcaccctttaatgcttccaaaca 5599552  T
Q  386 cttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgt 462  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  5599553 cttttgctgtgtcaaaaccgcttgcatcttaactttccaaaacacaaaatcaatacttctggtgaacttctcgatgt 5599629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 138 - 485
Target Start/End: Original strand, 42427842 - 42428188
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||||||        
T  42427842 gactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaatgactacaactttgaccacatcacct 42427941  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
    | ||||||| |||| ||||||||||||| || || || || || || || ||||||||| ||||  | |||||||| ||||||||   |||||||  |||    
T  42427942 ctgcggtaggttccttcgcgacatccctcaaaactttgtcaccaaggcacaagacaatgacacttctagccttgtccaccatctcggtcttctccgtttg 42428041  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    ||||| |||   ||| | |||  ||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||      
T  42428042 tgtcatggtgatcggaaacgcaccttcacccttcaaagctttctcacaattttgttgtat-aacaccgcttgcatcttcaccttccataacccaaaattg 42428140  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccctatgctactc 485  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||    
T  42428141 ttactttcggtgaacttctcaatatcccactttgaacctatggtactc 42428188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 90 - 472
Target Start/End: Original strand, 34478825 - 34479207
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||| | |||||    
T  34478825 tcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgtcgatgag 34478924  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataa 289  Q
    ||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | || || || || || || ||||| ||||| || ||    
T  34478925 ccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttgcttcctttgctacttctctcaaaactttatccccgaggcacaa 34479024  T
Q  290 gacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttt 389  Q
    ||||| ||||||| | |||||||| ||||||||   |||||||||||||| || |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   ||||||||    
T  34479025 gacaacggcactcctggccttgtccaccatctcggtcttctcctcttgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttt 34479124  T
Q  390 tgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    || ||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  34479125 tgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaccttctcgatatcccactttga 34479207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 138 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 40380873 - 40380539
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || ||| ||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||    
T  40380873 gactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgtctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatg 40380774  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||| || || || || ||||| || ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  40380773 ccgcggttggttccttcgcgacatccctcaaaactttgtccccgaggcacaagacaatggcgctcctcgccttgtccaccatctcggtcttctcctcttg 40380674  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    || || |||  |||||| |||  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  40380673 tgacatggtgtccggcaacgcaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccacaacccaaaatcg 40380574  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||    |||||||||||||| || || ||||||||    
T  40380573 ttgagcccggtgaacttctcaatatctcactttga 40380539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 102 - 472
Target Start/End: Original strand, 15356267 - 15356637
Alignment:
Q  102 ttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcg 201  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |    
T  15356267 ttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttg 15356366  T
Q  202 tcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcact 301  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | || || || || || || ||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  15356367 tcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaacggcact 15356466  T
Q  302 ctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaat 401  Q
    |   |||||||| ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   ||||||| || ||| | ||     
T  15356467 ccgggccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttctgctgtattaac 15356566  T
Q  402 accgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15356567 accgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcgatatcccactttga 15356637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 102 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 23665907 - 23665537
Alignment:
Q  102 ttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcg 201  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |    
T  23665907 ttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttg 23665808  T
Q  202 tcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcact 301  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | || || || || || || ||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  23665807 tcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaacggcact 23665708  T
Q  302 ctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaat 401  Q
    |   |||||||| ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   ||||||| || ||| | ||     
T  23665707 ccgggccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttctgctgtattaac 23665608  T
Q  402 accgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23665607 accgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcgatatcccactttga 23665537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 138 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 16545197 - 16544860
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttc---gtcatatacaatgactccaactttgcccacatcg 234  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||| || ||    ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||    
T  16545197 gactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttgttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcg 16545098  T
Q  235 atgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctc 334  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||| || || || || ||||| || ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||   |||||||||    
T  16545097 atgccgcggttggttccttcgcgacatccctcaaaactttgtccccgaggcacaagacaatggcgctcctcgccttgtccaccatctcggtcttctcctc 16544998  T
Q  335 ttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaa 434  Q
    ||||| || |||  ||||||   |  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  16544997 ttgtgacatggtgtccggcaaaccaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccacaacccaaaa 16544898  T
Q  435 tcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    || ||    |||||||||||||| || |||||||||||    
T  16544897 tcgttgagcccggtgaacttctcaatatcccactttga 16544860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 10750559 - 10750189
Alignment:
Q  102 ttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcg 201  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |    
T  10750559 ttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttg 10750460  T
Q  202 tcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcact 301  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  | || || || || || ||||| ||||| || |||||||  |||||    
T  10750459 tcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttcctacttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaacagcact 10750360  T
Q  302 ctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaat 401  Q
    | | |||||||| ||||||||   ||||||| || ||| || |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   ||||||| |||||| | ||     
T  10750359 cctggccttgtccaccatctcggtcttctccgctcgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttctgttgtattaac 10750260  T
Q  402 accgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||  ||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  10750259 accgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccagtaaacttctcgatatcccactttga 10750189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 90 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 6745941 - 6745559
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || |||||||||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||    
T  6745941 tcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactccaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgag 6745842  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataa 289  Q
    ||||||| || ||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||   |||| | || || || || || || ||||| ||||| || ||    
T  6745841 ccaaagactttgtcatatacaaagattacaactttgcccacattgatgccgcggttcgttcctttgctacttctctcaaaactttatccccgaggcacaa 6745742  T
Q  290 gacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttt 389  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||   ||||||| || ||| || |||  | || | ||   ||||||||||||| ||||   ||||||||    
T  6745741 gacaatggcactcctggccttgtctaccatctcggtcttctccgctcgtgacatggtgactggtaacgaaacttcacccttcaaagctttctcacacttt 6745642  T
Q  390 tgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    || ||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  6745641 tgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatccctctttga 6745559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 90 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 18467557 - 18467175
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| | |||||||  ||| |  || |||||||||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||    
T  18467557 tcatcaaggattttgttgaactccgtaaattgctccatgatggtctttgactccaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgag 18467458  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataa 289  Q
    ||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||   |||| | || || || || || || |||||||||||||| ||    
T  18467457 ccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgtcgcggttcgttcctttgctacttctctcaaaactttatctccgagacacaa 18467358  T
Q  290 gacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttt 389  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||| || ||| || |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   ||||||||    
T  18467357 gacaatggcactcctggccttgtccaccatctcggtcttctccgctcgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttt 18467258  T
Q  390 tgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||||| | || ||| ||| |||||| ||||||||||| || ||||| |||  |||||| || ||||| || |||||||||||    
T  18467257 tgttgtattaacaccacttccatctttaccttccataaaccaaaatcgttatctccggtaaaattctcaatatcccactttga 18467175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 31543594 - 31543224
Alignment:
Q  102 ttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcg 201  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || |||||  ||||||| ||||| |||||| ||||||| | || ||||| |||||||||||| || |    
T  31543594 ttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactcttccatcttgaatgagtagagtcgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttg 31543495  T
Q  202 tcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcact 301  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |||||| | || || || || || || ||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  31543494 tcatatacaaagattctaactttgcccacatcgatgtcgcggttgcttcctttgctacttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaacggcact 31543395  T
Q  302 ctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaat 401  Q
    | | |||||||| ||||||||   ||||||| ||| || || |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   |||||||||| ||| | ||     
T  31543394 cctggccttgtccaccatctcggtcttctccgcttatgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgctgtattaac 31543295  T
Q  402 accgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||  || ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  31543294 accgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctctggtaaacttctcgatatcccactttga 31543224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 323
Target Start/End: Original strand, 13694504 - 13694736
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  |||    || |||||||||||||||||| | ||||||||||| |  | || |||| ||||||    
T  13694504 tcatcaaggattttgttgaactccgttagttgctccatgatgacatttgactccaccatcttaaataagtagagttgttgatataggaattgcatatgag 13694603  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataa 289  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||  |||||||| |||| ||| || || ||| || || ||||| ||||| || ||    
T  13694604 ccaaagatttggtcatatacaacgactccaaatttgaccacatcaatatcgcggtaggttccttcgtgatat-cctcaaaactttatccccgaggcacaa 13694702  T
Q  290 gacaatggcactctttgccttgtctaccatctca 323  Q
    || ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13694703 gaaaatagcactcattgccttgtctaccatctca 13694736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 27911251 - 27910925
Alignment:
Q  144 accatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcgg 243  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| | || || || |||||||||||| || |||||||||||  | || ||||||| ||||||||||||||| |    
T  27911251 accatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggactttccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatgccgcag 27911152  T
Q  244 tagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaa 343  Q
    | | |||| | || || || || || || ||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||  || ||| ||     
T  27911151 ttgattcctttgctacttctctcaaaactttatctccgaggcacaagacaatggcactcctggccttgtccaccatctcggtcttctctgctcgtgacat 27911052  T
Q  344 ggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattactt 443  Q
    |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   |||||||||| ||| | || ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| |||  |    
T  27911051 ggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgatgtattaacaccgctttcatctttaccttccataactcaaaatcgttatct 27910952  T
Q  444 ccggtgaacttctcgatgtcccacttt 470  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||    
T  27910951 ccggtaaacttctcaatatcccacttt 27910925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 145 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 20043802 - 20043479
Alignment:
Q  145 ccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggt 244  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |||||||||||  | || ||||||| | |||||||||| | | |    
T  20043802 ccatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgactacatcgatgctgagtt 20043703  T
Q  245 agcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaag 344  Q
     | |||| |||| ||||| || ||  | ||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||||||  |||||| || |    
T  20043702 gg-ttccttcgctacatctctcaaatctttatccccgaggcacaaaacaatggcactcttggccttgtccaccatctcggtcttctctgcttgtgacatg 20043604  T
Q  345 gttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttc 444  Q
    ||  |||| | |||  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||    
T  20043603 gtgaccggtaacgcaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatctc 20043504  T
Q  445 cggtgaacttctcgatgtcccactt 469  Q
    || | |||||||| || ||||||||    
T  20043503 cgataaacttctcaatatcccactt 20043479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16408091 - 16407965
Alignment:
Q  139 actccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgc 238  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||  || |||||| |    
T  16408091 actccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacgattccaactttgatcatatcgattc 16407992  T
Q  239 cgcggtagcttccctcgcgacatccct 265  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||    
T  16407991 cgcggttggttccttcgcgacatccct 16407965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 25806280 - 25805952
Alignment:
Q  144 accatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcgg 243  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| | || || || |||||||||||| || || ||||||||  | || ||||||| |||||||||||| ||||    
T  25806280 accatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggactttccaatgagccaaagactttgtaatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatgctgcgg 25806181  T
Q  244 tagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaa 343  Q
    | | |||| | ||  | || ||  | || ||||  ||||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||| || ||| ||     
T  25806180 ttgtttccattgctgcttctctcgaaactttatacccgaggcacaagacaatggcactcctggccttgtccaccatctcggtcttctccgctcgtgacat 25806081  T
Q  344 ggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattactt 443  Q
    |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| | || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||  |||  |    
T  25806080 ggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtattaacacggcttccatctttaccttccataacccaaaattgttatct 25805981  T
Q  444 ccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||    
T  25805980 ccggtaaacttctcaatatcccactttga 25805952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 658837 - 658659
Alignment:
Q  144 accatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcgg 243  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |||||||||||  | || ||||||| ||||||||||| |||||    
T  658837 accatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatgtcgcgg 658738  T
Q  244 tagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctc 322  Q
    | | |||| | || || || || || || ||||| ||||| || ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||    
T  658737 ttggttcctttgctacttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaatggcactcctgaccttgtccaccatctc 658659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 402 - 472
Target Start/End: Original strand, 23792980 - 23793050
Alignment:
Q  402 accgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23792980 accgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcgatatcccactttga 23793050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 224
Target Start/End: Original strand, 31304065 - 31304103
Alignment:
Q  186 tgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttt 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  31304065 tgagccaaagatttcgtcatgtacaatgactccgacttt 31304103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 32577716 - 32577634
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaa 220  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||  | || ||||| |||||  || || ||||||||||||||||||||    
T  32577716 gactccatcatcctaaaggaatagagttgttgtttcagaaatttcctataagccagcgacttggtcatatacaatgactccaa 32577634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 362 - 485
Target Start/End: Original strand, 13695329 - 13695453
Alignment:
Q  362 ttcacccttcaatgcttctacacactttt-gttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgat 460  Q
    |||||||||||| ||||   ||||||||| ||||| |||| || | ||| | ||| |||||||||||||||||||| |||| | || | || |||| |||    
T  13695329 ttcacccttcaaagctttctcacactttttgttgtatcaaaacgggttgaaactttaccttccataacccgaaatcgttaccttcgataaatttcttgat 13695428  T
Q  461 gtcccactttgaccctatgctactc 485  Q
    ||||||| |||| || ||| |||||    
T  13695429 gtcccacattgaacccatgatactc 13695453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 89 - 475
Target Start/End: Original strand, 41397597 - 41397983
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41397597 atcatcaagaatcttgttaaactccgtaagttgctccgagatcgatttagactccatcatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 41397696  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41397697 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 41397796  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41397797 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttgacccttcaatgcttctacacactt 41397896  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccc 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41397897 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttctggtgaacttctcgatgtcccactttgaccc 41397983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 89 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 19359567 - 19359184
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||| |||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19359567 atcatcaagaatcttgttaaattccgccaattgctccaagattgatttagattccaccaccttgaatgaatagagttgttgtttcaagagttgcctatga 19359468  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19359467 gccaaagatttcgtcatgtacaatgacttcaacttagcccacatcgatgccgcggtagcttctctcacgacatccgttaagaccttatctccgagacata 19359368  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19359367 aaacaatagcactctttgccttgtctatcatctcacgcttctctacttgtgtcaaagttgccggcatagccgcttcacccttcagtgcttctacacactt 19359268  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19359267 ttgttgtgtcaaaaacgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 19359184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 89 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 47099547 - 47099165
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    |||||||||||| |||||||| |||   | ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  47099547 atcatcaagaattttgttaaattccaccaattgcttcgagattgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgtttcacgagttgcctatga 47099448  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47099447 gccaacgatttcgtcatgtaaaatgactccaacttagcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgtgacatcccttaaaaccttatctccgagacata 47099348  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    | |||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  47099347 aaacaatggcactcttagcattgtttatcatctcacgcttctccgtttgtgtcaagtttgctggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacac-ttt 47099249  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    || | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47099248 ttttggtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcaatgtcccactttga 47099165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 89 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 17346243 - 17345860
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| | | |||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  17346243 atcatcaagaattttgttaaattccatcaattgctccatgattgatttagactctaccatcttgaatgagtagagttgttgtttcaagagttgcctatca 17346144  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||| |||||    
T  17346143 accaacgatttcgtcatgtacaatgactccaatttagcccacattgatgatgcggtagcttccctcacgacatcccttaaaaccttatattcgatacata 17346044  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    | |||| |  ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17346043 aaacaacgatacttttttccttgtctatcatctcacgcttctccacttgtgtcaaatttgtcagcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 17345944  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||| ||||    
T  17345943 ttgttgtttcaaaactgcttgcattttaaccttccataacccgaaatcattactttcgattaaattctcgatgtcccacattga 17345860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 89 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 9024553 - 9024171
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||| | | |||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  9024553 atcatcaagaattttgttaaatttcgtcaat-gctccgtgattgatttagactccaccatcttgactgaatagagttgttgtttcaagagtttcctatga 9024455  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| |||| | || | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  9024454 gccaatgatttcgtcatgtacaataactccatcttagcccacattgatgtcacgatggcttccctcgcgacataccttaaaaccttatcttcgagacata 9024355  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    | |||||  || | ||| |||||| || |||||||| ||| ||| ||||| ||||  || || |||| || | |||| |||||||||||| |||||||||    
T  9024354 aaacaattacattattttccttgtatatcatctcacccttttccgcttgtatcaaattttccagcatggcgggttcatccttcaatgcttgtacacactt 9024255  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  9024254 ttgttgtattaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaatacgaaatcattacttccagtgaacttctcggtgtcccactttga 9024171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 138 - 472
Target Start/End: Original strand, 28222832 - 28223166
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  28222832 gactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagatttggtcatatacaatgacaccaactttgaccacatcgatg 28222931  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
    | ||||| | |||| ||||||||||||| || || || || ||||| || |||||||||  | || | |||||||| || |||||   ||||||| ||||    
T  28222932 ctgcggttggttccttcgcgacatccctcaaaactttgtcaccgaggcacaagacaatgaaattcctagccttgtccactatctcggtcttctccgcttg 28223031  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    ||||| |||  |||||| |||   |||||||||||| ||||   || ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  28223032 tgtcatggtgcccggcaacgcactttcacccttcaaagctttctcatacttttgttgtatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccaaaatcg 28223131  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  28223132 ttacttccggtaaacttctcaatatcccactttga 28223166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 89 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 31658010 - 31657627
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||| |||||| |  |  |  || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| | || || ||||| |    
T  31658010 atcatcaaggattttgttgaactccgttaattgctctgtcacggtctttgactccaccatcttgaatgagtaaagttgttgcttaaggaatttcctataa 31657911  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||| || |||||||||| || || || || ||||| || |    
T  31657910 gccaaagatttggtcatatacaatgactccaactttgaccacatcgacgccgcggttggttccttcacgacatccctcaaaactttgtcaccgaggcaca 31657811  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||  ||||||||| | |  ||| || |||  ||||||||||||| | ||   |||| ||    
T  31657810 agacaatggcactcctagccttgtccaccatctcggtcttctctgcttgtgtcatgatgaccgacaacgcaccttcacccttcaaagttttctcacagtt 31657711  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||||| | ||  || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  31657710 ttgttgtataaacgccacttgcatcttcaccttccataacccaaaatcattacttccggtgaacttctcaatatcccactttga 31657627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 102 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 16227029 - 16226659
Alignment:
Q  102 ttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcg 201  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || |||||  ||||| | ||||| |||||| ||||||| | || ||||| |||||||||||| || |    
T  16227029 ttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactcttccatcctgaatgagtagagtcgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttg 16226930  T
Q  202 tcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcact 301  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  || || ||||| || ||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  16226929 tcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgttacttctcttaaaactttatccccgaggcacaagacaacggcact 16226830  T
Q  302 ctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaat 401  Q
    | | |||||||| ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| | ||     
T  16226829 cctggccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtattaac 16226730  T
Q  402 accgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16226729 accgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcgatatcccactttga 16226659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 90 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 51750910 - 51750528
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||    
T  51750910 tcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgag 51750811  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataa 289  Q
    ||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || || || || || || ||||| ||||| || ||    
T  51750810 ccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctctcaaaactttatccccgaggcacaa 51750711  T
Q  290 gacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttt 389  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||| || ||| || |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   ||||||||    
T  51750710 gacaatggcactcctggccttgtccaccatctcggtcttctccgctcgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttt 51750611  T
Q  390 tgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    || ||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  51750610 tgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatcccactttga 51750528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 138 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3157420 - 3157216
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  3157420 gactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttaaggaattgtctatgagccaaagacttggtcatatagaatgactccaactttgaccacatcgacg 3157321  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| || || ||  | ||||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  3157320 ccgcggtaggttccttcgcgacatccctcaaaactttgccaccgaggcacaagacaatggcactcctagccttgtccaccatctcggtcttctcctcttg 3157221  T
Q  338 tgtca 342  Q
    |||||    
T  3157220 tgtca 3157216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 90 - 472
Target Start/End: Original strand, 27338539 - 27338921
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || |||||||||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||    
T  27338539 tcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggtctttgactccaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccaatgag 27338638  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataa 289  Q
     |||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |   |||| | || || || || || |  ||||| || || || ||    
T  27338639 tcaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcgattcattcctttgctacttctctcaaaaatttatccccaaggcacaa 27338738  T
Q  290 gacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttt 389  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||| || ||| || |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   ||||||||    
T  27338739 gacaatggcactcctggccttgtccaccatctcggtcttctccgctcgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttt 27338838  T
Q  390 tgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  27338839 tgttgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatcccactttga 27338921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 138 - 408
Target Start/End: Original strand, 50168761 - 50169030
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |    
T  50168761 gactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaaaacttggtcatatacaa-gactccaactttgaccatatcgacg 50168859  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
     || ||| | |||| ||||||||||||| || || || || | ||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||| ||||    
T  50168860 tcgtggttggttccttcgcgacatccctcaaaactttgtcactgaggcacaagacaatggcactcctagccttgtccaccatctcggtcttctccgcttg 50168959  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgctt 408  Q
    ||||| |||  |||| |   |  ||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||| |||||||    
T  50168960 tgtcatggtgaccggaaatacaccttcacccttcaatgctttctcacacttttgttgtatcaacaccgctt 50169030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 102 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 47178223 - 47177853
Alignment:
Q  102 ttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcg 201  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || |||||  ||||| | ||||| |||||| |||| || | || ||||| ||||||||| || || |    
T  47178223 ttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactcttccatcctgaatgagtagagtcgttgttttaggaattgccgatgagccaatgactttg 47178124  T
Q  202 tcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcact 301  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | || || || ||||| || ||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  47178123 tcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcgattgcttcctttgctacttctcttaaaactttatccccgaggcacaagacaacggcact 47178024  T
Q  302 ctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaat 401  Q
    | | |||||||| ||||||||   ||||||| || ||| || |||   ||| | ||   ||||||||||||| ||||   ||||||| |||||| | ||     
T  47178023 cctggccttgtccaccatctcggtcttctccgctcgtgacatggtgatcggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttctgttgtattaac 47177924  T
Q  402 accgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||  |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  47177923 accgcttccatctttaccttccataacccgaaattgttatctccggtaaacttctcaatatcccactttga 47177853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 51758407 - 51758025
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||| ||||  ||| |  || ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||| | |||||    
T  51758407 tcatcaaggattttgttgaactccgtaagttactccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgtcgatgag 51758308  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataa 289  Q
    ||||||| || ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| | || || || || || |  ||||| ||||| || ||    
T  51758307 ccaaagactttgtcgtatacaaagattccaattttgcccacatcgatgtcgcggttgcttcctttgctacttctctcaaaattttatccccgaggcacaa 51758208  T
Q  290 gacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttt 389  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||| | ||   ||||||| ||||| ||||   ||||||||    
T  51758207 gacaatggcactcctggccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacctttcaaagctttctcacacttt 51758108  T
Q  390 tgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    || ||| | || ||||||| |||||| | |||||||||||| ||||| |||  || ||| |||||||| || |||||||||||    
T  51758107 tgctgtattaacaccgcttccatctttatcttccataacccaaaatcgttatctctggtaaacttctcaatatcccactttga 51758025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 93 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 20301001 - 20300658
Alignment:
Q  93 tcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagcca 192  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||| | ||||||||    
T  20301001 tcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgacgatgagcca 20300902  T
Q  193 aagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagac 292  Q
    |||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||   |||| | || || || || || || ||||||||||| || |||||    
T  20300901 aagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgccacggtttgttcctttgctacttctctcaaaactttatctccgaggcacaagac 20300802  T
Q  293 aatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgc-ttctacacacttttg 391  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||    ||||||| |||||| || |||  |||| | ||   ||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  20300801 aatggcactcctggccttgtccaccatcttggtcttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagcattct-cacacttttg 20300703  T
Q  392 ttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatc 436  Q
     ||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  20300702 ctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccaaaatc 20300658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 89 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 775879 - 775765
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||  | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  775879 atcatcaagaattttgttaaattccgccaattgctccgagattgatttagactccagcatcttgaatgaatagagttgttgtttcaagagttgcctatga 775780  T
Q  189 gccaaagatttcgtc 203  Q
    ||||| |||||||||    
T  775779 gccaacgatttcgtc 775765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 302
Target Start/End: Original strand, 28203105 - 28203317
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || ||| | |||||    
T  28203105 tcatcaaggattttgttgaactccgtcagttgctccatgatggcttttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgctttaggaattgtcgatgag 28203204  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataa 289  Q
     |||||| || ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | || || || || || || ||||| ||||| || ||    
T  28203205 tcaaagactttgtcttatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttggttcctttgctacttctctcaaaactttatccccgaggcacaa 28203304  T
Q  290 gacaatggcactc 302  Q
    |||||||||||||    
T  28203305 gacaatggcactc 28203317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 90 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 28841295 - 28841089
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||    
T  28841295 tcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgag 28841196  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataa 289  Q
    ||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || || || || || || ||||| ||||| || ||    
T  28841195 ccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctctcaaaactttatccccgaggcacaa 28841096  T
Q  290 gacaatg 296  Q
    |||||||    
T  28841095 gacaatg 28841089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 102 - 484
Target Start/End: Original strand, 50078212 - 50078594
Alignment:
Q  102 ttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcg 201  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || ||||| |  ||||| ||||| || ||||||||||| | || ||||| ||||||| ||||||| |    
T  50078212 ttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctataatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagcccaagattttg 50078311  T
Q  202 tcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcact 301  Q
    ||||||||||  | || ||||||| |||||| |||||||| || | |||| |||| || || ||  | || ||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  50078312 tcatatacaaatattcaaactttgaccacattgatgccgcagttgtttccttcgctacttctctcgaaactttattcccgaggcacaagacaatggcact 50078411  T
Q  302 ctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaat 401  Q
    ||| |||||||| ||||||||   ||| ||| || ||| || |||  |||| | ||   |||||||||||||  |||   |||||||||||||| | ||     
T  50078412 cttggccttgtccaccatctcggacttatccgctcgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaacctttctcacacttttgttgtattaac 50078511  T
Q  402 accgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccctatgctact 484  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||||| || |||||||| || |||||| ||||    
T  50078512 accgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatcccacttcgaacctatggtact 50078594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 90 - 339
Target Start/End: Original strand, 3805544 - 3805793
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || |||||  ||||||| ||||| || ||||||||||| | || ||||| |||||    
T  3805544 tcatcaagaattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctgccatcttgaatgattacagttgttgctttaggaattgccaatgag 3805643  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataa 289  Q
    |||||||||| |||||| ||||  |||| ||| ||| ||||||||||| |||||| | |||| |||| | ||| || || || ||||| |||||||| ||    
T  3805644 ccaaagatttggtcataaacaacaactctaacgttgaccacatcgatgtcgcggttggttccttcgctatatctctcaaaactttatccccgagacacaa 3805743  T
Q  290 gacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtg 339  Q
    ||||||| ||||  | || ||||| ||||||||   ||||||| ||||||    
T  3805744 gacaatgacacttctggcattgtccaccatctcggtcttctccgcttgtg 3805793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 469
Target Start/End: Original strand, 31736936 - 31737261
Alignment:
Q  144 accatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcgg 243  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| | || || || |||||||||||| || |||||||||||  | || ||||||| |||||||||||||||||    
T  31736936 accatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggactttccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatgccgcgg 31737035  T
Q  244 tagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaa 343  Q
    |   |||| | ||  | || ||  | || ||||  ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||||||| || ||| ||     
T  31737036 ttcgttcctttgctgcttctctcgaaactttatacccgaggcacaagacaatggcactcttggccttgtccaccatctcggtcttctccgctcgtgacat 31737135  T
Q  344 ggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattactt 443  Q
    |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   ||||||| |||||| | || ||||||| |||||| ||||| ||||| || ||||| |||  |    
T  31737136 ggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttctgttgtattaacaccgcttccatctttacctttcataatccaaaatcgttatct 31737235  T
Q  444 ccggtgaacttctcgatgtcccactt 469  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||    
T  31737236 ccggtaaacttctcaatatcccactt 31737261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 146 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16456467 - 16456348
Alignment:
Q  146 catcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggta 245  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||| ||     
T  16456467 catcttgaatgagtagagttgttgctttaggatttgcctatgagccaaagtcttggtcatatacaatgactccaactttgatcacatcaacgccgcagtt 16456368  T
Q  246 gcttccctcgcgacatccct 265  Q
    | |||| |||||||||||||    
T  16456367 ggttccttcgcgacatccct 16456348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 322
Target Start/End: Original strand, 8348519 - 8348703
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || ||| | |||  ||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |    
T  8348519 gactccaccatcttgaatgagtagagttgttgctttaggaattgtcgatgtcccaaagactttgtcatatacaaagactctaactttgaccacatcgacg 8348618  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctc 322  Q
    || |||| | || | |||| || ||  | || || ||||| | ||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  8348619 ccacggttggtttcttcgctacttctttcaaaactttatccctgaggcataagacaatgacactcatggccttgtctaccatctc 8348703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 6996403 - 6996225
Alignment:
Q  144 accatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcgg 243  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |||||||||||  | || ||||||| ||||||||||| |||||    
T  6996403 accatcttaaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatgtcgcgg 6996304  T
Q  244 tagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctc 322  Q
    | |  ||| | |  || || || || || ||||| |||||  | ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  6996303 ttggatcctttgttacttctctcaaaactttatccccgaggtacaagacaatggcactcctggccttgtccaccatctc 6996225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 90 - 435
Target Start/End: Original strand, 13127141 - 13127486
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgat-ttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    |||||||| || |||||||||||| | ||||||| |  ||| ||| || |||||| |||| || ||||| || ||||||| ||| |||| ||| | ||||    
T  13127141 tcatcaaggattttgttaaactccataagttgctacatgat-gatctttgactccgccatattgaatgagtatagttgtttctttaagaattgtcgatga 13127239  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||| ||||||   || | |||| ||||| || || |  ||||| | ||| || |    
T  13127240 gccaaagaatttgtcatatacaaagactccaactttgaagacatcgatgtcgcggttagttacttcgctacatctctcaaaattttatcccagaggcaca 13127339  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatg-cttctacacact 387  Q
    ||| |||||||||| | || ||||| |||||||||  ||||||| |||||| || |||  |||  | |||  |||||| ||| || | ||||| ||||||    
T  13127340 agaaaatggcactcctggctttgtccaccatctcagtcttctccgcttgtgacatggtgaccgataacgcaccttcactctttaaagccttct-cacact 13127438  T
Q  388 tttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaat 435  Q
    |||||||| | || ||||||| |||||| | ||| |||||||| ||||    
T  13127439 tttgttgtattaacaccgcttccatctttaactttcataacccaaaat 13127486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 210 - 302
Target Start/End: Original strand, 13784790 - 13784882
Alignment:
Q  210 aatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactc 302  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| || |  ||||||| ||| || ||||||||| |||||    
T  13784790 aatgactccaactttgaccacatcgatgttgcggtaggttccttcgcgacatccctcaaaattttatctctgaggcacaagacaatgccactc 13784882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 16456201 - 16456048
Alignment:
Q  288 aagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacact 387  Q
    ||||||||||||||| |  || |||| ||||| ||   ||| ||| ||||||||| |||  |||| | |||  ||||||||||||| ||||   |  |||    
T  16456201 aagacaatggcactcctacccatgtccaccatgtcggtcttatccgcttgtgtcatggtgaccggtaacgcaccttcacccttcaaagctttctcgtact 16456102  T
Q  388 tttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattac 441  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  16456101 tttgttgtatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccaaaatcgttac 16456048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 382 - 469
Target Start/End: Original strand, 31424720 - 31424807
Alignment:
Q  382 cacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactt 469  Q
    ||||| |||||||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||||| || ||||||||    
T  31424720 cacacatttgttgtattaaaaccgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatcccactt 31424807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Original strand, 13784941 - 13785049
Alignment:
Q  361 cttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgat 460  Q
    |||||||||| || ||||   || ||||||||||| |||| | | |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||  | |||| |||||||| ||    
T  13784941 cttcaccctttaacgctttctcatacttttgttgtatcaacaacacttgcatctttaccttccataacccaaaataattatcttcggtaaacttctcaat 13785040  T
Q  461 gtcccactt 469  Q
     ||||||||    
T  13785041 atcccactt 13785049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Original strand, 14183293 - 14183401
Alignment:
Q  361 cttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgat 460  Q
    ||||||||||||| | ||   |||||||||||||| | || ||||||| |||| | |||||||||||||| ||||| |||  |||||| || ||||| ||    
T  14183293 cttcacccttcaaagttttctcacacttttgttgtattaacaccgcttccatccttaccttccataacccaaaatcgttatctccggtaaatttctcaat 14183392  T
Q  461 gtcccactt 469  Q
     ||||||||    
T  14183393 atcccactt 14183401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 470
Target Start/End: Original strand, 45655324 - 45655412
Alignment:
Q  382 cacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccacttt 470  Q
    |||||||||||||| ||||   ||||| |||||| ||||||||||| || ||||  ||||||  ||||||||||| ||| |||||||||    
T  45655324 cacacttttgttgtatcaaagtcgcttccatcttgaccttccataatccaaaattgttacttatggtgaacttcttgatatcccacttt 45655412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16429773 - 16429655
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||| ||| | || || |  |||||||||||| || |||||||||||  |||  ||||||  ||||||||| |    
T  16429773 gactctaccatcttgaatgagtaaagttgttactttaggaatttctgatgagccaaagactttgtcatatacaaacacttgaactttaaccacatcgacg 16429674  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgc 256  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  16429673 ccgcggtagattccttcgc 16429655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 351; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 89 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 9225133 - 9224747
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9225133 atcatcaagaatcttgttaaactccgtaagttgctccgagattgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 9225034  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9225033 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 9224934  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9224933 agacaatgacactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 9224834  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccc 475  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9224833 ttgttgtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttcttgatgtcccactttgaccc 9224747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 89 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 16624734 - 16624351
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||  | ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16624734 atcatcaagaattttattaaattccgccaattgcttcgagattgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgtttcaagagtttcctatga 16624635  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16624634 gccaacgatttcgtcatgtacaatgactccaacttagcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacatcccttaagaacttatctccgagacata 16624535  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    | ||||| ||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||  | | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16624534 aaacaatagcaatcttaaccttgtctatcatctcacgcttctaaacttgtgtcaaaatagacggcatagccgcttcacccttcaatacttctacacactt 16624435  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16624434 ttgttgtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 16624351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 89 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 5872621 - 5872225
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    ||||||||| || ||||| |||||| ||| |||||||   || |  || |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||    
T  5872621 atcatcaaggattttgttgaactccattaattgctccatcatggtctttgactccaccatcttgaatgagtagatttgttgcttaaggaattgcctatga 5872522  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||| | |||| ||||||| ||||| || || || || ||||| || |    
T  5872521 gccaaagacttggtcatatgcaacgactccaactttgaccacatcgacggcgcggttggttccttcgcgacctccctcaaaactttgtcaccgaggcaca 5872422  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||| ||||||||| |||  |||||| |||  ||||||||||||| ||||   |||||||    
T  5872421 agacaatggcactcatagccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgtcatggtgaccggcaacgcaccttcacccttcaaagctttctcacactt 5872322  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccctatgctactc 485  Q
    ||||||| |||| | ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||    
T  5872321 ttgttgtatcaacatcgcctgcatcttcaccttccataacccaaaatcgttactttcggtgaacttctcaatatcccactttgaacccatgatactc 5872225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 141 - 485
Target Start/End: Original strand, 52094776 - 52095120
Alignment:
Q  141 tccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccg 240  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52094776 tccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaatgactccaactttgaccacatcgatgccg 52094875  T
Q  241 cggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgt 340  Q
    |||||| |||| ||| || |||||| || || || || ||||  || ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||   ||||||| ||||||     
T  52094876 cggtaggttccttcgtgaaatccctcaaaactttgtcaccgaagcacaagacaatgacactcatagccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtga 52094975  T
Q  341 caaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcatta 440  Q
    || |||  |||  | |||  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  52094976 catggtgaccgataacgcaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtatcaacactgcttgcatcttcaccttccataacccaaaatcgtta 52095075  T
Q  441 cttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccctatgctactc 485  Q
     |||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||    
T  52095076 attccggtgaacttctcaatatcccactttgaacccatggtactc 52095120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 138 - 485
Target Start/End: Original strand, 12743339 - 12743686
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| | || |||||||| ||||||||| || |||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |    
T  12743339 gactccaccatcttgaatgagtatagttgtttcttaaggaattgcctataagccaaagacttggtcatatacaatgatttcaactttgaccacatcgacg 12743438  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||| || || || || ||||| || | ||||||||||||  | |||||||| ||||||||   ||||||| | ||    
T  12743439 ccgcggtaggttccttcacgacatccctcaaaactttgtcaccgaggcacacgacaatggcacttctagccttgtccaccatctcggtcttctccgcatg 12743538  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    ||||| |||  |||||| |||  |||||||||| || ||||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  12743539 tgtcatggtgaccggcagcgcaccttcacccttaaaagctttctcacacttttgttgtatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccaaaatcg 12743638  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccctatgctactc 485  Q
    ||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||| |||||    
T  12743639 ttaattccggtaaacttctcaatatcccactttgaacccatggtactc 12743686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 138 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 5136849 - 5136515
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||    
T  5136849 gactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatg 5136750  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||| || || || || ||||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  5136749 ccgcggttggttccttcgcgacatccctcaaaactttgtccccgaggcacaagacaatggcactcctcgccttgtccaccatctcggtcttctcctcttg 5136650  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    || || |||  ||||||   |  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  5136649 tgacatggtgtccggcaaaccaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccacaacccaaaatcg 5136550  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||    |||||||||||||| || |||||||||||    
T  5136549 ttgagcccggtgaacttctcaatatcccactttga 5136515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 138 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 7123465 - 7123131
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || ||| ||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||    
T  7123465 gactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgtctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatg 7123366  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
    ||||| | | |||| ||||||||||||| || || || || ||||| || ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  7123365 ccgcgtttggttccttcgcgacatccctcaaaactttgtccccgaggcacaagacaatggcgctcctcgccttgtccaccatctcggtcttctcctcttg 7123266  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    || || |||  |||||| |||  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  7123265 tgacatggtgtccggcaacgcaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccacaacccaaaatcg 7123166  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||    |||||||||||||| || |||||||||||    
T  7123165 ttgagcccggtgaacttctcaatatcccactttga 7123131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 138 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 8394175 - 8393842
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || ||| ||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||    
T  8394175 gactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttgaggaattgtctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatg 8394076  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||| || |  ||||| ||||| || ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  8394075 ccgcggttggttccttcgcgacatccctcaa-aatttatccccgaggcacaagacaatggcgctcctcgccttgtccaccatctcggtcttctcctcttg 8393977  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    || || |||  |||| |   |   |||||||||||| ||||   |||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  8393976 tgacatggtgaccggtaaaccacattcacccttcaaagctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccgaaatcg 8393877  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||   |||||||||||||| || |||||||||||    
T  8393876 ttaagcccggtgaacttctcaatatcccactttga 8393842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 472
Target Start/End: Original strand, 16933566 - 16933936
Alignment:
Q  102 ttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcg 201  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || |||||  ||||| | ||||| |||||| |||| || | || ||||| |||||||||||| || |    
T  16933566 ttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactcttccatcctgaatgagtagagtcgttgttttaggaattgccgatgagccaaagactttg 16933665  T
Q  202 tcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcact 301  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || || || || || || ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16933666 tcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaatggcact 16933765  T
Q  302 ctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaat 401  Q
    | | |||||||| ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   |||||||||| | | | ||     
T  16933766 cctggccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgctatattaac 16933865  T
Q  402 accgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16933866 accgcttccatctttaccttccataacccgaaatcattatctccggtaaacttctcgatatcccactttga 16933936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 90 - 472
Target Start/End: Original strand, 22134023 - 22134405
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||    
T  22134023 tcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgag 22134122  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataa 289  Q
    ||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || || || || || || ||||| ||||| || ||    
T  22134123 ccaaagactttgtcatataaaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctctcaaaactttatccccgaggcacaa 22134222  T
Q  290 gacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttt 389  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||    |||||| |||||| || |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   ||||||||    
T  22134223 gacaatggcactcctggccttgtccaccatctcggttttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttt 22134322  T
Q  390 tgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    || ||| | || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  22134323 tgctgtattaacacctcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatcccactttga 22134405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 90 - 472
Target Start/End: Original strand, 11007974 - 11008356
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || ||||| |||||| | ||||| |||| | ||||||| | || ||||| |||||    
T  11007974 tcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagattcgttgctttaggaattgccgatgag 11008073  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataa 289  Q
    ||||||| || ||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| | || || || || || || ||||||||||| || ||    
T  11008074 ccaaagactttgtcatatacaaagattccatcttttcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctctcaaaactttatctccgaggcacaa 11008173  T
Q  290 gacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttt 389  Q
    ||||| ||||||| | |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| || |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   ||||||||    
T  11008174 gacaacggcactcctggccttgtccaccatctcagtcttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttt 11008273  T
Q  390 tgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    || ||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  11008274 tgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatcccactttga 11008356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 472
Target Start/End: Original strand, 22782155 - 22782525
Alignment:
Q  102 ttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcg 201  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||| | |||||||||||| || |    
T  22782155 ttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgtcgatgagccaaagactttg 22782254  T
Q  202 tcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcact 301  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || || || || || || ||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  22782255 tcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaacggcact 22782354  T
Q  302 ctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaat 401  Q
    | | |||||||| ||||||||    |||||| || ||| || |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   ||||||| || ||| | ||     
T  22782355 cctggccttgtccaccatctcggttttctccgctcgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttctgctgtattaac 22782454  T
Q  402 accgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22782455 accgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcgatatcccactttga 22782525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 138 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 4588709 - 4588375
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| || ||      
T  4588709 gactccaccatcttgaatgagtagaattgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagatttggtcatatacaatgactccaactttcaccagattgact 4588610  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| | || || || || || || |  |||| | ||| |||||| |||||||| ||||||||   |||||||   ||    
T  4588609 ccgcggtagattccttcacgacatccttcaaaactttgtcaccaaggcccaagatattggaactcttagccttgtccaccatctcggtcttctccgtctg 4588510  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    || || |||   ||||| | |  |||||||||||||  |||   |||| ||||||||| |||| |  ||||||||||| ||| || ||||||| || |||    
T  4588509 tgacatggtgatcggcaacacaccttcacccttcaaaactttctcacatttttgttgtatcaacattgcttgcatcttcaccatcaataacccaaattca 4588410  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  4588409 ttatttccggtgaacttctcaatatcccactttga 4588375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 89 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 10113786 - 10113406
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||  ||| |  || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || | || |||||| |||    
T  10113786 atcatcaaggattttgttgaactctgttagtcgctccatgatggcctttgactccaccgtcttgaatgagtagagttgttgatttaggaattgcctgtga 10113687  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| || |||| ||| |||||| || || || ||||  | ||| || |    
T  10113686 gccaaagacttagtcatatacaatgactccaactttgaccacatcgatattgcggaaggttccttcgtgacatctctgaaaactttattcctgaggcaca 10113587  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    |||||| ||||||| |  |||  || ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||| | | |  ||||||||||||| ||||   |||||||    
T  10113586 agacaacggcactcctgacctattccaccatctcggtcttctccacttgtgacatggtgaccggtaacacaccttcacccttcaaagctttctcacactt 10113487  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactt 469  Q
    ||  ||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||  || ||| |||||||| || ||||||||    
T  10113486 tttatgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccaaaatcattatctctggtaaacttctcaatatcccactt 10113406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 90 - 457
Target Start/End: Original strand, 22046121 - 22046488
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || ||||| |||||| | ||||| |||||| ||||||| | || ||||| |||||    
T  22046121 tcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagtcgttgctttaggaattgccgatgag 22046220  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataa 289  Q
    ||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| | | || || || || || || |||||  |||| || ||    
T  22046221 ccaaagactttgtcatatacaaagattccaaatttgcccacatcgatgccgaggttgcttactttgctacttctctcaaaactttatcctcgaggcacaa 22046320  T
Q  290 gacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttt 389  Q
    ||||||||||| | | |||||||| ||||||||   ||||||| |||||| || |||  | || | ||   ||||||||||||| ||||   |||||||     
T  22046321 gacaatggcacacctggccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgactggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttc 22046420  T
Q  390 tgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 457  Q
    || ||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||    
T  22046421 tgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatctccggtaaacttctc 22046488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 138 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 26558466 - 26558132
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    | |||| ||| |||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||    
T  26558466 gactccaccatcttgaatgagtagagttgatgctttcgaaattgcatataagccaaggatatggtcatatacaacgactccaactttgaccatatccatg 26558367  T
Q  238 ccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttg 337  Q
    ||||||| | |||| | |||||||||||||| || |||||  |||| || ||||||||| ||||    ||||||     ||||||   ||||||| ||||    
T  26558366 ccgcggttggttcctttgcgacatcccttaaaactttatcctcgaggcacaagacaatgtcacttcgagccttgaacgtcatctcggtcttctccgcttg 26558267  T
Q  338 tgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatca 437  Q
    || || |||  |||  | |||  ||||| |||| || |||| | |||||||||| ||| |||| | ||||| |||||| |||||||||||||| |||||     
T  26558266 tgacatggtcaccgataacgcaccttcatccttaaaagcttgtgcacacttttgctgtatcaaaatcgctttcatcttgaccttccataacccaaaatcg 26558167  T
Q  438 ttacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  26558166 ttacttctggtgaacttctcgatatcccactttga 26558132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 153 - 472
Target Start/End: Original strand, 9175941 - 9176263
Alignment:
Q  153 aatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccc 252  Q
    ||||| |||||| ||||||| | || ||||| || ||||||||| || ||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||| || ||| ||||||     
T  9175941 aatgagtagagtcgttgctttaggaattgccgatcagccaaagactttgtcatatacaaagattcccacttttcccacatcgatgtcgtggttgcttcct 9176040  T
Q  253 tcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgcctt---gtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgc 349  Q
    | || || || || || || ||||||||||| || ||||||| ||||||| | |||||   ||| ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |    
T  9176041 ttgctacttctctcaaaactttatctccgaggcacaagacaacggcactcctggccttcttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgac 9176140  T
Q  350 cggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtg 449  Q
    ||| | ||   ||||||||||||| ||||   ||||||| |||||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||     
T  9176141 cggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttatgttgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggta 9176240  T
Q  450 aacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||||||| || || ||||||||    
T  9176241 aacttctctatatcgcactttga 9176263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 469
Target Start/End: Original strand, 14788893 - 14789218
Alignment:
Q  144 accatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcgg 243  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |||||||||||  | || | ||||| |||||||||||||||||    
T  14788893 accatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgatctttgaccacatcgatgccgcgg 14788992  T
Q  244 tagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaa 343  Q
    |||  ||  | || || || || || || ||||| |||||    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||| || ||| ||     
T  14788993 tagtatcttttgctacttctctcaaaactttatccccgaggagcaagacaatggcactcatggccttgtccaccatctcggtcttctccgctcgtgacat 14789092  T
Q  344 ggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattactt 443  Q
    |||  |||| |  |   ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||  |    
T  14789093 ggtgaccggtaatgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatct 14789192  T
Q  444 ccggtgaacttctcgatgtcccactt 469  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||    
T  14789193 ccggtaaacttctcaatatcccactt 14789218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 47563628 - 47563315
Alignment:
Q  144 accatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcgg 243  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| | || ||| | ||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  47563628 accatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggaattgtcgatgagccaacgactttgtcatatacaaagattccaacttttcccacatcgatgtcgcgg 47563529  T
Q  244 tagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaa 343  Q
    | |  ||| | || || || || || || ||||| ||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||   |||| || || ||| ||     
T  47563528 ttgtatcctttgctacttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaatgtcactcttggccttgtccatcatctcggtcttccccgctcgtgacat 47563429  T
Q  344 ggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattactt 443  Q
    |||  |||| | |||  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| | || || | || |||||| |||||||||||||| ||||| |||| |    
T  47563428 ggtgaccggtaacgcaccttcacccttcaaagcttgctcacacttttgttgtattaaaactgattccatctttaccttccataacccaaaatcgttacct 47563329  T
Q  444 ccggtgaacttctc 457  Q
    ||||| ||||||||    
T  47563328 ccggtaaacttctc 47563315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 140 - 301
Target Start/End: Original strand, 3578150 - 3578311
Alignment:
Q  140 ctccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgcc 239  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  3578150 ctccaccatcttgaatgagtagagttgttgctttaaaagttggcgatgatccaaagactttgtcatatataaagactccaactttgaccacatcgatgtc 3578249  T
Q  240 gcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcact 301  Q
    ||||| | |||| || | ||||| || || || ||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  3578250 gcggttggttccttcactacatctctcaaaactttatctctgaggcacaagacaatggcact 3578311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 237
Target Start/End: Original strand, 12402514 - 12402649
Alignment:
Q  102 ttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcg 201  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || |||||||||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |    
T  12402514 ttgttgaactccgtaagttgctccatgatggccttcgactccaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttg 12402613  T
Q  202 tcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  12402614 tcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatg 12402649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 145 - 322
Target Start/End: Original strand, 18536965 - 18537142
Alignment:
Q  145 ccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggt 244  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |||||||||||  |  | ||||||| |||||||||||||||| |    
T  18536965 ccatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatatacgaactttgaccacatcgatgccgcgat 18537064  T
Q  245 agcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctc 322  Q
     | |||| |||| ||||| ||||| || ||||  ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  18537065 tggttccttcgctacatctcttaaaactttattcccgaggcacaagacaatggcactcttggccttgtccactatctc 18537142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 274 - 485
Target Start/End: Original strand, 46146943 - 46147153
Alignment:
Q  274 tatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaa 373  Q
    |||| ||||| || ||||||||| ||||| | || ||||| ||||||||   ||||||| ||||||||| |||  ||||||  ||  |||||||||||||    
T  46146943 tatcaccgaggcacaagacaatgacactcctagcattgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgtcatggtgaccggcaatgcatcttcacccttcaa 46147042  T
Q  374 tgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgac 473  Q
     ||||    ||||||| ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||     
T  46147043 agctttctgacacttt-gttgtatcaacaccgtttgcatcttcaccttccataacccaaaatcattgcttccagtgaacttctcaatatctcactttgaa 46147141  T
Q  474 cctatgctactc 485  Q
    || ||| |||||    
T  46147142 cccatgatactc 46147153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 339
Target Start/End: Original strand, 5207083 - 5207275
Alignment:
Q  147 atcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtag 246  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || | || ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||   |||||  ||||||     
T  5207083 atcttaaatgagtagatttgttgatttaggatttgtctatgagccaaagactttgtcatatacaaagactccaactttgcccatgccgatgttgcggtac 5207182  T
Q  247 cttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtg 339  Q
     |||| || | |||||||| || || ||||| ||||| || || ||||| |||||| || | ||||| ||||||||   ||||||||||||||    
T  5207183 gttccttcacaacatccctcaacactttatccccgaggcacaatacaatagcactcattcctttgtccaccatctcggccttctcctcttgtg 5207275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 472
Target Start/End: Original strand, 36920958 - 36921286
Alignment:
Q  144 accatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcgg 243  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||     
T  36920958 accatcttgaatgagtaaagttgttgctttaagacttgccaatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcaaactttgaccacatcgatgccgcga 36921057  T
Q  244 tagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaa 343  Q
    | |  ||| | ||  | || || || || ||||| |||||  | |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||    |||||| || ||| ||     
T  36921058 ttggatcctttgctgcttctctcaaaactttatccccgaggtacaagacagtggcactcctggccttgtccaccatctcggtgttctccgctcgtgacat 36921157  T
Q  344 ggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattactt 443  Q
    |||  | ||   ||   ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||  |||  |    
T  36921158 ggtgactggttacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccaaaattgttatct 36921257  T
Q  444 ccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  36921258 ccggtaaaattctcaatatcccactttga 36921286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 361 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 21549275 - 21549164
Alignment:
Q  361 cttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgat 460  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||| | |||| ||| ||||| |||||||| || ||    
T  21549275 cttcaccctttaacgcttcaacacactttcgttgtgtcaacaatgcttgcatattaaccttccataactcaaaataattgcttccagtgaacttttcaat 21549176  T
Q  461 gtcccactttga 472  Q
    ||||||||||||    
T  21549175 gtcccactttga 21549164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 288 - 472
Target Start/End: Original strand, 18310979 - 18311163
Alignment:
Q  288 aagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacact 387  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||   ||||||| |||||| || ||| ||||| | |||  ||||||||||||| ||||   ||||      
T  18310979 aagacaatggcactcctgaccttgtccaccatctcggtcttctccacttgtgacatggtggccggtaacgcaccttcacccttcaaagctttctcacaac 18311078  T
Q  388 tttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||||||| | || | ||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  18311079 tttgttgtattaacatcgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatcccactttga 18311163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 288 - 472
Target Start/End: Original strand, 18408956 - 18409140
Alignment:
Q  288 aagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacact 387  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||   ||||||| |||||| || ||| ||||| | |||  ||||||||||||| ||||   ||||      
T  18408956 aagacaatggcactcctgaccttgtccaccatctcggtcttctccacttgtgacatggtggccggtaacgcaccttcacccttcaaagctttctcacaac 18409055  T
Q  388 tttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||||||| | || | ||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  18409056 tttgttgtattaacatcgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatcccactttga 18409140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 472
Target Start/End: Original strand, 22802197 - 22802525
Alignment:
Q  144 accatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcgg 243  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |||||||||||  | || ||||||| |||||| |||| |||||    
T  22802197 accatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacattgatgtcgcgg 22802296  T
Q  244 tagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaa 343  Q
    | | |||| | |   | || || ||  | ||||  ||||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||| || ||| ||     
T  22802297 ttgtttcctttgttgcttctctcaaatctttattcccgaggcacaagacaatggcactcctggccttgtccaccatctcggtcttctccgctcgtgacat 22802396  T
Q  344 ggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattactt 443  Q
    |||  |||| | ||    |||||||||||| | ||   |||||||||| ||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||  ||||| |||  |    
T  22802397 ggtgaccggtaacgaactttcacccttcaaagttttctcacacttttgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacctaaaatcgttatct 22802496  T
Q  444 ccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||    
T  22802497 ccggtaaacttctcaatatcccactttga 22802525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 250
Target Start/End: Original strand, 31480949 - 31481065
Alignment:
Q  134 tttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatc 233  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| |||||   | |||||    
T  31480949 tttagactccaccatccaaaatgagtagaattgttgtttcaagagatgcctatgagccaaatattttgtcatgtataatgactcaaacttcaactacatc 31481048  T
Q  234 gatgccgcggtagcttc 250  Q
     ||| ||||||||||||    
T  31481049 aatgtcgcggtagcttc 31481065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 296 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 11435676 - 11435500
Alignment:
Q  296 ggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgt 395  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   |||||||||| |||    
T  11435676 ggcactcctggccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgctgt 11435577  T
Q  396 gtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
     | || ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || |||||||| || |||||||||||    
T  11435576 attaacaccgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttacctccagtaaacttctcaatatcccactttga 11435500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 237
Target Start/End: Original strand, 12395278 - 12395412
Alignment:
Q  102 ttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcg 201  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || || ||||||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| ||      
T  12395278 ttgttgaactccgtaagttgctccatgatggccttcgattccaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttt 12395377  T
Q  202 tcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  12395378 tca-atacaaagattccaactttgcccacatcgatg 12395412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 237
Target Start/End: Original strand, 12400240 - 12400374
Alignment:
Q  102 ttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcg 201  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || || ||||||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| ||      
T  12400240 ttgttgaactccgtaagttgctccatgatggccttcgattccaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttt 12400339  T
Q  202 tcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  12400340 tca-atacaaagattccaactttgcccacatcgatg 12400374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 361 - 456
Target Start/End: Original strand, 5207485 - 5207580
Alignment:
Q  361 cttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttct 456  Q
    ||||||||||||| ||||   ||||||| |||||| |||| || ||||||||||| |  ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||    
T  5207485 cttcacccttcaaagctttctcacacttatgttgtatcaaaactgcttgcatcttcaatttccataactcaaaatcgttacttccagtgaacttct 5207580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 153 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 36379148 - 36378979
Alignment:
Q  153 aatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccc 252  Q
    ||||| || ||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |||||||||||  | || ||||||| | ||||||||||| |||| | ||||     
T  36379148 aatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgactacatcgatgccacggttggttcct 36379049  T
Q  253 tcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctc 322  Q
    |||| || || || ||  | ||||  ||||| || ||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||    
T  36379048 tcgctacttctctcaaatctttattcccgaggcacaagacaatgacactcctgaccttgtccaccatctc 36378979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 368 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 3677916 - 3677844
Alignment:
Q  368 cttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcatta 440  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||| |||| ||| |||||||  || ||||||| ||||| |||||||||    
T  3677916 cttcaaagcttttgcacacttttgttgtatcaaaaccacttgcattgtagccttccacaacccaaaatcatta 3677844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 16453959 - 16453851
Alignment:
Q  361 cttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgat 460  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||| ||| | || ||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| |||  |||| | ||||| || ||    
T  16453959 cttcacccttcaaagctttctcacacttttgatgtattaacaccgcttccatctttacattccataacccaaaatcgttatctccgataaacttttcaat 16453860  T
Q  461 gtcccactt 469  Q
     ||||||||    
T  16453859 atcccactt 16453851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21549372 - 21549308
Alignment:
Q  134 tttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatt 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||   ||| ||||||||||||||||    
T  21549372 tttagactccatcatcttaaatgagtagggatgttgtttcaaatattgtctatgagccaaagatt 21549308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 89 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 606 - 220
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  606 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttgaatgaataaagttgttgcttcaagagttgcctatga 507  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  506 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgtcgctgtagcttctctcgtgacatcccttaagaccttatctccgagacata 407  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  406 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacattt 307  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccc 475  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  306 ttgttttgtcaatacctctttcatcttaaccttccataacctgaaatcattacttccggtgaacttcttgatgtcccactttgaccc 220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 89 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 18673 - 18290
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18673 atcatcaagaatcttgttaaattccgccaattgctccgagattgatttagactccgccatcttggatgcatagagttgttgtttcaaaagttgcctatga 18574  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18573 gccaaagatttcgtcatgtacaatgactccaacttagcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 18474  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18473 aaacaatagcactctttgccttgtctatcatctcacgcttctcttcttgtgtcaaagttgccggcatagccgcttcacccttcaatacttctacacactt 18374  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18373 ttgttgtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaatttctcgatgtcccactttga 18290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 89 - 472
Target Start/End: Original strand, 1865 - 2248
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||  | || || |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1865 atcatcaagaattttgttaaatttcgccaattacttcgagattgatttagactccaccattttgaatgaatagagttgttgtttcaagagttgcctatga 1964  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1965 gccaacgatttcgtcatgtacaatgactccaacttagcccacatcgacgccattgtagcttctgtcgcgacatcccttaaaaccttatctccgagacata 2064  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2065 aaacaatggcactcttagccttgtctatcatctcacgcttctccgcttgtgtcaaattcgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 2164  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2165 ttgttgtatcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 2248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0842 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0842
Description:

Target: scaffold0842; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 89 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 3921 - 3538
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    |||||||||||| |||||||| |||   | |||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3921 atcatcaagaattttgttaaattccaccaattgctccgagattgatttagacctcaccatcttgaataaatagagttgttgtttcaagagttgcctatga 3822  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacata 288  Q
    |  |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3821 gtgaaagttttcgtcatgtacaatgactccaacttagcccacatcgatgccgtggtagcttctctcgtgacatcccttaagaccttatctccgagacata 3722  T
Q  289 agacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 388  Q
    | | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3721 aaataatggaactctttgccttgtctatcatctcacgcttctccgcttgtgtcaaattttccggcatcaccgcttcacccttcaatgcttctacacactt 3622  T
Q  389 ttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3621 ttgttgtgtcaaaatcacttgcatcttaaccttccacaacccaaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 3538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 171 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 37474 - 37173
Alignment:
Q  171 ttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaaga 270  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37474 ttcaagagttgcctatgagcagaagatttcgtcatgtaaaatgactccaacttagcccgcatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacatcccttaaga 37375  T
Q  271 ccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcaccctt 370  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  37374 ccttatctccaagacataaaacaatggcactctttgccttgtctatcatctcacgtttctccgcttgtgtcaaagttgccggaatcgccgcttcaccctt 37275  T
Q  371 caatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccacttt 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37274 caatgcttctacacacttttgttgtgtcaaaatcgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttatcgatgtcccacttt 37175  T
Q  471 ga 472  Q
    ||    
T  37174 ga 37173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 158; Significance: 7e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 132 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 30169 - 29833
Alignment:
Q  132 gatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccaca 231  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || || ||||    
T  30169 gatttagactccaccatcttgaaagagtagagttgttgtttcaagagttgccaatgagccaacaatttcgtcatgtacaatgactccaagttagctcaca 30070  T
Q  232 tcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctc 331  Q
    |  |   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  30069 ttaacatcgcggtagcttccctcgcgacatcccttaaaaccttatttctgagacataaaacaatgatactttttgccttgtctatcatctcatgcttctc 29970  T
Q  332 ctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccg 431  Q
    | ||||||||||  || |||||||  ||| || |||||||||| ||  |||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29969 cgcttgtgtcaaatttcccggcatttccgttttacccttcaattctcttacacaatt---ttgtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccataacctg 29873  T
Q  432 aaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttg 471  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  29872 aaatcattattttcggtgaacttctcgatgtcctactttg 29833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 158; Significance: 7e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 132 - 471
Target Start/End: Original strand, 42675 - 43011
Alignment:
Q  132 gatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccaca 231  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || || ||||    
T  42675 gatttagactccaccatcttgaaagagtagagttgttgtttcaagagttgccaatgagccaacaatttcgtcatgtacaatgactccaagttagctcaca 42774  T
Q  232 tcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctc 331  Q
    |  |   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  42775 ttaacatcgcggtagcttccctcgcgacatcccttaaaaccttatttctgagacataaaacaatgatactttttgccttgtctatcatctcatgcttctc 42874  T
Q  332 ctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccg 431  Q
    | ||||||||||  || |||||||  ||| || |||||||||| ||  |||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42875 cgcttgtgtcaaatttcccggcatttccgttttacccttcaattctcttacacaatt---ttgtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccataacctg 42971  T
Q  432 aaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttg 471  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  42972 aaatcattattttcggtgaacttctcgatgtcctactttg 43011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 141 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 115357 - 115013
Alignment:
Q  141 tccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccg 240  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  115357 tccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgtctatgagccaaagacttggtcatatacaatgactacaactttgaccacgtcgatgccg 115258  T
Q  241 cggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgt 340  Q
    |||| | |||| |||||||||| || || || || || ||||| || ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||  ||||| | |||||||    
T  115257 cggttggttccttcgcgacatcgctcaaaactttgtcaccgaggcacaagacaatggcactcctagccttgtccaccatctcagtcttcttcgcttgtgt 115158  T
Q  341 caaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcatta 440  Q
    || |||  |||| | |||   |||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  115157 catggtgaccggtaacgcactttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccaaaatcgtta 115058  T
Q  441 cttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccctatgctactc 485  Q
     |||||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||    
T  115057 attccggtgaacttctcaatatcccactttgaacccatggtactc 115013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 102 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 22987 - 22617
Alignment:
Q  102 ttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcg 201  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |    
T  22987 ttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttg 22888  T
Q  202 tcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcact 301  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | || || || || || || ||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  22887 tcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaacggcact 22788  T
Q  302 ctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaat 401  Q
    |   |||||||| ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   ||||||| || ||| | ||     
T  22787 ccgggccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttctgctgtattaac 22688  T
Q  402 accgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22687 accgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcgatatcccactttga 22617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1991 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold1991
Description:

Target: scaffold1991; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 89 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1150 - 1022
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1150 atcatcaagaatcttgttaaactccgtcaattgctttgagattgatttagactccaccatcttgaatgaatagagttgttgtttcaagagttgcctatga 1051  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactc 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1050 gccaaagatttcgtcatatacaatgactc 1022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1899
Description:

Target: scaffold1899; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 90 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 497 - 115
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || ||||| |||||| | ||||| |||||| ||||||| | || ||||| |||||    
T  497 tcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagtagagtcgttgctttaggaattgccgatgag 398  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataa 289  Q
    ||||||  || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | || || || || || || ||||| ||||| || ||    
T  397 ccaaaggctttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccacggttgcttcctttgctacttctctcaaaactttatccccgaggcacaa 298  T
Q  290 gacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttt 389  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||| ||| |||||| || |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   ||||||||    
T  297 gacaatggcactcctggccttgtccaccatctcggtcttttccgcttgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttt 198  T
Q  390 tgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    || ||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || |||||||| || |||||||||||    
T  197 tgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttacctccagtaaacttctcaatatcccactttga 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 90 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 34423 - 34086
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||  ||| |  || |||||||||||| | ||||| | |||||||||||| | || ||||| |||||    
T  34423 tcatcaaggattttgtttaactccgtgagttgctccatgatggcctttgactccaccatcctgaatgagtggagttgttgctttaggaattgccgatgag 34324  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataa 289  Q
    ||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  || | |||| | || || || ||||| || ||||||||||| || ||    
T  34323 ccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgttgttgtttcctttgctacttctcttaaaactttatctccgaggcacaa 34224  T
Q  290 gacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttt 389  Q
    |||| || ||||| |||||||||| ||||||||   ||||||| || ||| || |||  |||| | |    ||||||||||||| ||||   ||||||||    
T  34223 gacattgtcactccttgccttgtccaccatctcggtcttctccgctcgtgacatggtgaccggtaactaaccttcacccttcaaagctttctcacacttt 34124  T
Q  390 tgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataa 427  Q
    || ||| | || ||||||| |||||| |||||||||||    
T  34123 tgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataa 34086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 319
Target Start/End: Original strand, 72923 - 73152
Alignment:
Q  90 tcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgag 189  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||  ||| |  || |||||||||||| | ||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||    
T  72923 tcatcaaggattttgttgaactctgtaagttgctccatgatggtctttgactccaccatcctgaatgagtagagttgttgctttaggaattgccgatgag 73022  T
Q  190 ccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataa 289  Q
     ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||   |||| | || || || || || || ||||||||||| || ||    
T  73023 tcaaagattttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatagatgccgcagttcgttcctttgctacttctctcaaaactttatctccgaggcacaa 73122  T
Q  290 gacaatggcactctttgccttgtctaccat 319  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  73123 gacaatggcactcctggccttgtccaccat 73152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 50837 - 50512
Alignment:
Q  144 accatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcgg 243  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |||||||||||  | || | ||||| |||||||||||||||||    
T  50837 accatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgatctttgaccacatcgatgccgcgg 50738  T
Q  244 tagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaa 343  Q
    |||  ||  | || || || || || || ||||| |||||    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||| || ||| ||     
T  50737 tagtatcttttgctacttctctcaaaactttatccccgaggagcaagacaatggcactcatggccttgtccaccatctcggtcttctccgctcgtgacat 50638  T
Q  344 ggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattactt 443  Q
    |||  |||| |  |   ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||  |    
T  50637 ggtgaccggtaatgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatct 50538  T
Q  444 ccggtgaacttctcgatgtcccactt 469  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||    
T  50537 ccggtaaacttctcaatatcccactt 50512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 382 - 485
Target Start/End: Original strand, 10815 - 10918
Alignment:
Q  382 cacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccctatgct 481  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||  |||||||||| || ||| |    
T  10815 cacacttttgttgtatcaacacctctttcatcttcaccttccataacccaaaatcgttaatcccggtgaacttctcgataccccactttgaacccatggt 10914  T
Q  482 actc 485  Q
    ||||    
T  10915 actc 10918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 273 - 472
Target Start/End: Original strand, 12464 - 12663
Alignment:
Q  273 ttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcacccttca 372  Q
    ||||| ||||| || ||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||| | ||   ||||||||||||    
T  12464 ttatccccgaggcacaagacaacggcactcctggccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttca 12563  T
Q  373 atgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    | | ||   |||||||||| ||| | ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  12564 aagttttctcacacttttgctgtattaatactgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatcccactttga 12663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 80685 - 80360
Alignment:
Q  144 accatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcgg 243  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| | || || ||  ||||||||||| || |||||||||||  | || ||||||| ||||||||||| |||||    
T  80685 accatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggactttccgttgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatggcgcgg 80586  T
Q  244 tagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaa 343  Q
    | | |||| | || || || ||  | || ||||  ||||| || ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||   | ||||| || ||| ||     
T  80585 ttgtttcctttgctacttctctctaaactttattcccgaggcacaagacaatgacactcatggccttgtccaccatctcggtcatctccactcgtgacat 80486  T
Q  344 ggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattactt 443  Q
    |||  || | | ||   ||||||||||||| ||||   |||||||||| ||| | || ||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| |||  |    
T  80485 ggtgaccagtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgctgtattaaaaccgcttccacctttaccttccataacccaaaatcgttatct 80386  T
Q  444 ccggtgaacttctcgatgtcccactt 469  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||    
T  80385 ccggtaaacttctcaatatcccactt 80360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 472
Target Start/End: Original strand, 912 - 1240
Alignment:
Q  144 accatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcgg 243  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| | || || || || ||||||||| || |||||||||||  | || || |||| ||||||||||| |||||    
T  912 accatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggactttccgataagccaaagactttgtcatatacaaaaattcaaaatttgaccacatcgatgacgcgg 1011  T
Q  244 tagcttccctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaa 343  Q
    | | |||| | ||  | || ||  | || ||||  ||||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||   ||||||| || ||| ||     
T  1012 ttgtttcctttgctgcttctctcgaaactttatacccgaggcaaaagacaatggcactcctggccttgtcgaccatatcggtcttctccgctcgtgacat 1111  T
Q  344 ggttgccggcatcgccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattactt 443  Q
    |||  |||| | ||   ||||||||||||| ||||   |||||||| | ||| | || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||  |    
T  1112 ggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctttctcacactttagctgtattaacactgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatct 1211  T
Q  444 ccggtgaacttctcgatgtcccactttga 472  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||    
T  1212 ccggtaaacttctcaatatcccactttga 1240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 231
Target Start/End: Original strand, 26778 - 26920
Alignment:
Q  89 atcatcaagaatcttgttaaactccgttagttgctccgagatcgatttagactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatga 188  Q
    |||||||||||| |  || |||||| ||||||||||| |||     || ||||||||||||||||| || ||||| ||| | || | || |||  |||||    
T  26778 atcatcaagaatttgtttgaactccattagttgctccaagacaacctttgactccaccatcttaaacgagtagagatgtagttttaggaattgtgtatga 26877  T
Q  189 gccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccaca 231  Q
    |||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  26878 gccaaagaatttgtcacatacaacgactccaactttgaccaca 26920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 26344 - 26443
Alignment:
Q  138 gactccaccatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatg 237  Q
    ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||   || ||||| |||||||||||| ||  ||||||||||  | || ||||||| |||||||||||    
T  26344 gactctaccatcttgaatgagtaaagttgttgcttttggaattgccgatgagccaaagactttatcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatg 26443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 2567 times since January 2019
Visitors: 4010