View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0673_low_14 (Length: 440)

Name: NF0673_low_14
Description: NF0673
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0673_low_14
NF0673_low_14
[»] chr2 (49 HSPs)
chr2 (1-422)||(27119895-27120315)
chr2 (1-422)||(13933000-13933420)
chr2 (1-419)||(27779608-27780025)
chr2 (1-419)||(27819365-27819782)
chr2 (1-419)||(3785867-3786284)
chr2 (1-419)||(22924601-22925018)
chr2 (1-419)||(31889944-31890361)
chr2 (1-419)||(34158218-34158635)
chr2 (1-422)||(31879657-31880077)
chr2 (1-422)||(37682348-37682768)
chr2 (1-422)||(37697613-37698033)
chr2 (1-422)||(16825791-16826211)
chr2 (1-422)||(16895269-16895689)
chr2 (1-422)||(37928740-37929160)
chr2 (1-422)||(34294525-34294945)
chr2 (1-422)||(40236879-40237299)
chr2 (1-422)||(11631637-11632057)
chr2 (1-422)||(19412954-19413374)
chr2 (1-422)||(21673628-21674048)
chr2 (1-422)||(32053174-32053594)
chr2 (1-422)||(34865055-34865475)
chr2 (1-422)||(39048272-39048692)
chr2 (1-422)||(257106-257526)
chr2 (1-422)||(12658907-12659327)
chr2 (1-422)||(21699624-21700044)
chr2 (1-422)||(27807074-27807494)
chr2 (1-422)||(20841284-20841704)
chr2 (1-422)||(39893440-39893860)
chr2 (1-422)||(9346439-9346859)
chr2 (1-422)||(12590179-12590599)
chr2 (1-422)||(27430894-27431314)
chr2 (1-422)||(37948315-37948735)
chr2 (1-419)||(16164854-16165271)
chr2 (1-422)||(12713054-12713474)
chr2 (1-422)||(23125022-23125441)
chr2 (1-422)||(37381048-37381468)
chr2 (1-422)||(19452876-19453296)
chr2 (1-419)||(27394936-27395353)
chr2 (124-412)||(27827841-27828129)
chr2 (1-258)||(34271373-34271629)
chr2 (192-423)||(28885577-28885808)
chr2 (1-251)||(28885821-28886070)
chr2 (40-299)||(34701570-34701829)
chr2 (40-299)||(42394029-42394288)
chr2 (37-359)||(34533931-34534253)
chr2 (100-374)||(26723827-26724101)
chr2 (40-416)||(12384037-12384413)
chr2 (100-317)||(21760166-21760383)
chr2 (40-317)||(22949869-22950146)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (1-419)||(44564358-44564775)
chr8 (1-419)||(15770948-15771365)
chr8 (1-423)||(18712854-18713275)
chr8 (1-422)||(31357899-31358319)
chr8 (1-422)||(27605330-27605750)
chr8 (1-423)||(14560994-14561415)
chr8 (1-422)||(19691469-19691889)
chr8 (3-422)||(29832697-29833115)
chr8 (1-422)||(18794075-18794495)
chr8 (1-422)||(19204787-19205207)
chr8 (1-422)||(9357996-9358416)
chr8 (1-422)||(2133685-2134105)
chr8 (1-422)||(28358377-28358797)
chr8 (3-422)||(33262105-33262523)
chr8 (1-423)||(21344596-21345017)
chr8 (1-422)||(12089148-12089568)
chr8 (1-422)||(19677818-19678238)
chr8 (1-422)||(31486296-31486716)
chr8 (1-419)||(22077350-22077753)
chr8 (1-267)||(19657766-19658031)
chr8 (1-268)||(33245894-33246160)
chr8 (40-356)||(19844604-19844920)
chr8 (40-299)||(22412432-22412691)
chr8 (40-299)||(14212533-14212792)
chr8 (100-374)||(16768742-16769016)
[»] chr6 (54 HSPs)
chr6 (1-419)||(13520599-13521016)
chr6 (1-419)||(14141801-14142218)
chr6 (1-419)||(26789188-26789605)
chr6 (1-419)||(27197557-27197974)
chr6 (1-419)||(27251261-27251678)
chr6 (1-422)||(29504785-29505205)
chr6 (1-422)||(28163860-28164280)
chr6 (1-422)||(30554423-30554843)
chr6 (1-422)||(34460913-34461333)
chr6 (1-419)||(27358517-27358934)
chr6 (1-419)||(27448860-27449277)
chr6 (1-422)||(33372838-33373258)
chr6 (1-421)||(13295358-13295777)
chr6 (1-422)||(16677509-16677929)
chr6 (1-422)||(27022505-27022925)
chr6 (1-422)||(27626118-27626538)
chr6 (1-422)||(4761132-4761552)
chr6 (1-422)||(24867085-24867505)
chr6 (1-422)||(27060875-27061295)
chr6 (1-422)||(29552926-29553346)
chr6 (1-419)||(8902110-8902527)
chr6 (1-423)||(16753189-16753610)
chr6 (1-422)||(27011100-27011520)
chr6 (3-422)||(27286773-27287191)
chr6 (1-423)||(22931291-22931712)
chr6 (1-423)||(23853736-23854157)
chr6 (1-422)||(4528654-4529074)
chr6 (1-422)||(27179825-27180245)
chr6 (1-422)||(27268994-27269414)
chr6 (1-422)||(27488502-27488922)
chr6 (1-419)||(26775034-26775451)
chr6 (1-423)||(26921745-26922166)
chr6 (1-422)||(4776249-4776669)
chr6 (1-422)||(15420727-15421147)
chr6 (1-422)||(26112819-26113239)
chr6 (1-422)||(28210823-28211243)
chr6 (1-422)||(29576383-29576803)
chr6 (1-419)||(3699455-3699872)
chr6 (1-422)||(4542181-4542601)
chr6 (1-422)||(4720542-4720962)
chr6 (1-422)||(16940434-16940854)
chr6 (3-422)||(17088852-17089270)
chr6 (91-419)||(22455610-22455938)
chr6 (1-422)||(20171916-20172336)
chr6 (1-422)||(22163655-22164075)
chr6 (1-268)||(24302164-24302430)
chr6 (190-423)||(26992163-26992396)
chr6 (35-317)||(23971210-23971492)
chr6 (40-299)||(18119961-18120220)
chr6 (40-299)||(18212114-18212373)
chr6 (37-374)||(27545319-27545656)
chr6 (1-117)||(15408940-15409055)
chr6 (40-317)||(9135798-9136075)
chr6 (37-359)||(25707443-25707765)
[»] chr5 (62 HSPs)
chr5 (1-419)||(33878512-33878929)
chr5 (1-422)||(24586753-24587173)
chr5 (1-422)||(8661836-8662256)
chr5 (1-422)||(18497086-18497506)
chr5 (1-422)||(30155410-30155830)
chr5 (1-422)||(33519759-33520179)
chr5 (1-422)||(43081634-43082054)
chr5 (1-422)||(30032807-30033227)
chr5 (1-422)||(33295907-33296327)
chr5 (3-419)||(29887560-29887975)
chr5 (1-419)||(9547070-9547487)
chr5 (1-422)||(11552734-11553154)
chr5 (1-422)||(23629349-23629769)
chr5 (1-422)||(25203657-25204077)
chr5 (1-422)||(25267812-25268232)
chr5 (1-419)||(40469911-40470328)
chr5 (1-422)||(9320855-9321275)
chr5 (1-422)||(15655119-15655539)
chr5 (1-419)||(3792923-3793340)
chr5 (1-423)||(22995478-22995899)
chr5 (1-422)||(12135554-12135974)
chr5 (1-422)||(22891842-22892262)
chr5 (1-422)||(24727348-24727768)
chr5 (1-422)||(26483773-26484193)
chr5 (1-422)||(24973285-24973705)
chr5 (1-422)||(28652621-28653041)
chr5 (1-422)||(31434843-31435263)
chr5 (1-422)||(34619897-34620317)
chr5 (1-422)||(37667847-37668267)
chr5 (1-422)||(37767352-37767772)
chr5 (1-419)||(11327019-11327436)
chr5 (1-422)||(41678084-41678504)
chr5 (1-419)||(13439044-13439461)
chr5 (1-422)||(33780868-33781284)
chr5 (1-422)||(37758362-37758782)
chr5 (1-422)||(30938014-30938434)
chr5 (1-422)||(31822768-31823188)
chr5 (1-422)||(37355004-37355424)
chr5 (1-419)||(18124777-18125194)
chr5 (1-422)||(30171848-30172268)
chr5 (3-422)||(13321193-13321611)
chr5 (1-419)||(13183154-13183571)
chr5 (1-422)||(15755213-15755633)
chr5 (1-422)||(28956146-28956566)
chr5 (1-419)||(18371895-18372312)
chr5 (1-422)||(6877684-6878104)
chr5 (1-422)||(32592635-32593055)
chr5 (1-422)||(5641167-5641587)
chr5 (1-422)||(2514441-2514861)
chr5 (193-422)||(24684697-24684926)
chr5 (40-299)||(3483602-3483861)
chr5 (315-422)||(23895585-23895692)
chr5 (35-374)||(351609-351948)
chr5 (40-416)||(11943821-11944197)
chr5 (40-317)||(5439624-5439901)
chr5 (40-317)||(15784124-15784401)
chr5 (40-317)||(17957581-17957858)
chr5 (100-317)||(34469106-34469323)
chr5 (40-416)||(31520692-31521068)
chr5 (40-317)||(36375361-36375638)
chr5 (40-317)||(37000015-37000292)
chr5 (100-299)||(20388448-20388647)
[»] chr3 (72 HSPs)
chr3 (1-419)||(32293964-32294381)
chr3 (1-422)||(5714406-5714826)
chr3 (1-422)||(5725316-5725736)
chr3 (1-422)||(5766632-5767052)
chr3 (1-419)||(31032743-31033160)
chr3 (1-422)||(5017047-5017467)
chr3 (1-422)||(8215068-8215488)
chr3 (1-422)||(19697823-19698243)
chr3 (1-423)||(15737601-15738022)
chr3 (1-423)||(21678035-21678456)
chr3 (1-423)||(22384085-22384506)
chr3 (1-422)||(4627118-4627538)
chr3 (1-422)||(6205236-6205656)
chr3 (1-422)||(8285977-8286397)
chr3 (1-422)||(18304161-18304581)
chr3 (1-422)||(28112461-28112881)
chr3 (1-422)||(47026786-47027206)
chr3 (1-419)||(5592864-5593281)
chr3 (1-423)||(8299303-8299724)
chr3 (1-422)||(4793142-4793562)
chr3 (1-422)||(18273559-18273979)
chr3 (1-422)||(18288860-18289280)
chr3 (1-418)||(24331500-24331916)
chr3 (1-422)||(32442484-32442904)
chr3 (1-422)||(35884099-35884519)
chr3 (1-422)||(51785356-51785776)
chr3 (1-422)||(5605821-5606241)
chr3 (1-422)||(7076539-7076959)
chr3 (1-422)||(10399477-10399897)
chr3 (1-422)||(18333963-18334383)
chr3 (1-423)||(18054594-18055015)
chr3 (1-422)||(18228529-18228949)
chr3 (1-422)||(18246074-18246494)
chr3 (1-422)||(20573350-20573770)
chr3 (1-422)||(29145263-29145683)
chr3 (1-422)||(29661477-29661897)
chr3 (1-422)||(4724964-4725384)
chr3 (1-422)||(15889212-15889632)
chr3 (1-422)||(20069373-20069793)
chr3 (1-422)||(28342510-28342930)
chr3 (1-422)||(4343183-4343603)
chr3 (1-422)||(4420248-4420668)
chr3 (1-422)||(4686988-4687408)
chr3 (1-422)||(5470321-5470741)
chr3 (1-422)||(28024615-28025035)
chr3 (1-422)||(48469260-48469680)
chr3 (1-422)||(6539249-6539669)
chr3 (1-422)||(7999893-8000313)
chr3 (1-422)||(31960962-31961382)
chr3 (1-422)||(10646406-10646826)
chr3 (1-422)||(16620997-16621417)
chr3 (1-422)||(17981456-17981876)
chr3 (1-422)||(22867355-22867775)
chr3 (1-422)||(22882414-22882834)
chr3 (1-422)||(11106866-11107279)
chr3 (90-419)||(17992526-17992855)
chr3 (1-267)||(5653573-5653838)
chr3 (40-299)||(11924903-11925162)
chr3 (40-299)||(22959909-22960168)
chr3 (60-299)||(7088592-7088831)
chr3 (40-299)||(16431861-16432120)
chr3 (40-317)||(6571792-6572069)
chr3 (35-317)||(15704911-15705193)
chr3 (38-251)||(15919021-15919234)
chr3 (35-374)||(6962973-6963312)
chr3 (38-296)||(15592454-15592712)
chr3 (1-94)||(17973368-17973460)
chr3 (38-317)||(20443555-20443834)
chr3 (40-317)||(5950347-5950624)
chr3 (40-416)||(46380673-46381049)
chr3 (40-251)||(37260254-37260465)
chr3 (100-167)||(4450363-4450430)
[»] chr7 (47 HSPs)
chr7 (1-419)||(2776626-2777043)
chr7 (1-419)||(31127279-31127696)
chr7 (1-419)||(26512045-26512462)
chr7 (1-419)||(26681455-26681872)
chr7 (1-419)||(39209488-39209905)
chr7 (1-422)||(45390589-45391009)
chr7 (1-422)||(4202758-4203178)
chr7 (1-422)||(16747866-16748286)
chr7 (1-423)||(10913218-10913639)
chr7 (1-422)||(26666263-26666683)
chr7 (1-423)||(11421128-11421549)
chr7 (1-422)||(2157943-2158363)
chr7 (3-416)||(16446357-16446769)
chr7 (1-422)||(26316197-26316617)
chr7 (1-423)||(5143689-5144110)
chr7 (1-422)||(16514779-16515199)
chr7 (1-423)||(2106512-2106933)
chr7 (1-422)||(26271435-26271855)
chr7 (1-422)||(4141595-4142015)
chr7 (1-422)||(5131365-5131785)
chr7 (1-422)||(10844989-10845409)
chr7 (1-422)||(26534222-26534642)
chr7 (1-422)||(31086971-31087391)
chr7 (1-422)||(31560739-31561159)
chr7 (1-422)||(22145564-22145984)
chr7 (1-422)||(16044688-16045104)
chr7 (1-422)||(11444256-11444676)
chr7 (1-422)||(45734682-45735096)
chr7 (1-422)||(3448675-3449095)
chr7 (1-422)||(10842343-10842763)
chr7 (1-422)||(26438626-26439046)
chr7 (1-422)||(26516161-26516581)
chr7 (1-422)||(24588883-24589303)
chr7 (1-267)||(5161907-5162172)
chr7 (40-299)||(29090008-29090267)
chr7 (40-299)||(2557027-2557286)
chr7 (60-299)||(16127225-16127464)
chr7 (40-299)||(15193575-15193834)
chr7 (35-359)||(25726929-25727252)
chr7 (40-416)||(30369333-30369709)
chr7 (100-317)||(797970-798187)
chr7 (40-317)||(16392821-16393098)
chr7 (100-374)||(1893022-1893296)
chr7 (40-416)||(9469695-9470071)
chr7 (100-317)||(16286826-16287043)
chr7 (179-297)||(16237975-16238093)
chr7 (35-144)||(16238112-16238221)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (1-419)||(28153113-28153530)
chr1 (1-422)||(10948451-10948871)
chr1 (1-417)||(16204498-16204913)
chr1 (1-422)||(10966039-10966459)
chr1 (1-419)||(51641595-51642012)
chr1 (1-422)||(28588359-28588779)
chr1 (1-421)||(3644509-3644930)
chr1 (1-422)||(41789774-41790194)
chr1 (1-422)||(21894212-21894633)
chr1 (1-422)||(20464350-20464770)
chr1 (1-264)||(20336880-20337142)
chr1 (261-422)||(20339024-20339185)
chr1 (35-359)||(22489458-22489782)
chr1 (40-416)||(5628500-5628876)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (1-422)||(22655-23075)
[»] scaffold0143 (3 HSPs)
scaffold0143 (1-422)||(7332-7752)
scaffold0143 (1-422)||(30665-31085)
scaffold0143 (1-422)||(19442-19862)
[»] chr4 (34 HSPs)
chr4 (1-422)||(27159781-27160201)
chr4 (1-422)||(1903639-1904059)
chr4 (1-422)||(31122976-31123396)
chr4 (1-422)||(21973086-21973506)
chr4 (1-422)||(54836776-54837196)
chr4 (1-423)||(34185424-34185845)
chr4 (1-422)||(14759770-14760190)
chr4 (1-422)||(36340981-36341401)
chr4 (1-422)||(5009260-5009680)
chr4 (1-422)||(17016431-17016851)
chr4 (1-422)||(40102101-40102521)
chr4 (1-422)||(6573243-6573663)
chr4 (1-422)||(18797078-18797498)
chr4 (1-422)||(20334885-20335305)
chr4 (1-422)||(24116047-24116467)
chr4 (1-422)||(30757145-30757565)
chr4 (1-419)||(18313642-18314059)
chr4 (1-423)||(24588825-24589246)
chr4 (1-422)||(15231257-15231677)
chr4 (1-422)||(14668401-14668821)
chr4 (1-422)||(39854022-39854442)
chr4 (1-419)||(14101931-14102348)
chr4 (1-422)||(33670264-33670684)
chr4 (1-422)||(15281401-15281821)
chr4 (109-419)||(15387949-15388259)
chr4 (40-299)||(14725301-14725560)
chr4 (40-299)||(19767847-19768106)
chr4 (1-123)||(5698219-5698340)
chr4 (37-359)||(1881598-1881920)
chr4 (1-114)||(15384812-15384924)
chr4 (35-359)||(22146066-22146390)
chr4 (100-314)||(12515725-12515939)
chr4 (100-253)||(55784686-55784839)
chr4 (100-167)||(18044699-18044766)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (1-423)||(9407-9828)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (1-422)||(9394-9814)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-422)||(15953-16373)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (1-422)||(3439-3859)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-422)||(11392-11812)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (1-416)||(9423-9837)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (1-422)||(12943-13363)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-422)||(11321-11741)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (1-422)||(5643-6063)
[»] scaffold0748 (1 HSPs)
scaffold0748 (1-422)||(5135-5555)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (5-398)||(43181-43591)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (261-422)||(1347-1508)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-153)||(22757-22908)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (1-151)||(118797-118946)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (40-299)||(10713-10972)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (100-257)||(34802-34959)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (40-416)||(29548-29924)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (100-314)||(4972-5186)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (35-359)||(4412-4736)
[»] scaffold0196 (1 HSPs)
scaffold0196 (2-94)||(1979-2070)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 378; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 27120315 - 27119895
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  27120315 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagctttct 27120217  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27120216 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacacaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 27120117  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27120116 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 27120017  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  27120016 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattct 27119917  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  27119916 tgatgctatcaaaagcttcttg 27119895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 13933000 - 13933420
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  13933000 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 13933098  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13933099 caaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgccgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 13933198  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13933199 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 13933298  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13933299 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 13933398  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  13933399 tgatgctatcaaaagcttcttg 13933420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 27780025 - 27779608
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  27780025 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttct 27779927  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27779926 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 27779827  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27779826 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgacca 27779727  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27779726 agtacacatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 27779627  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  27779626 tgatgctatcaaaagcttc 27779608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 27819782 - 27819365
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  27819782 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttct 27819684  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27819683 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 27819584  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27819583 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgacca 27819484  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27819483 agtacacatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 27819384  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  27819383 tgatgctatcaaaagcttc 27819365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 3786284 - 3785867
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  3786284 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 3786186  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3786185 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagaccacaaca 3786086  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3786085 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 3785986  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3785985 agcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcagttaattct 3785886  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  3785885 tgatgctatcaaaagcttc 3785867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 22924601 - 22925018
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  22924601 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttct 22924699  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22924700 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagaccacaaca 22924799  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22924800 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 22924899  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22924900 agcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggtcttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 22924999  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  22925000 tgatgctatcaaaagcttc 22925018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 31889944 - 31890361
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |    
T  31889944 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagccgctttct 31890042  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31890043 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagaacacaaca 31890142  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31890143 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 31890242  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31890243 agcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 31890342  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  31890343 tgatgctatcaaaagcttc 31890361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 34158635 - 34158218
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  34158635 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttct 34158537  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34158536 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 34158437  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  34158436 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgaccg 34158337  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34158336 agcacgcatcccacagattcatcaaacactgacatatacaaaatcagaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 34158237  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  34158236 tgatgctatcaaaagcttc 34158218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 31880077 - 31879657
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  31880077 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 31879979  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31879978 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 31879879  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  31879878 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 31879779  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31879778 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 31879679  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  31879678 tgatgctatcaaaagcttcttg 31879657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 37682348 - 37682768
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  37682348 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 37682446  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37682447 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 37682546  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  37682547 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 37682646  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37682647 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 37682746  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  37682747 tgatgctatcaaaagcttcttg 37682768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 37697613 - 37698033
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  37697613 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 37697711  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37697712 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 37697811  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  37697812 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 37697911  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37697912 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 37698011  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  37698012 tgatgctatcaaaagcttcttg 37698033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 16825791 - 16826211
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  16825791 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 16825889  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825890 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 16825989  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16825990 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 16826089  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16826090 agcacgcatcctatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 16826189  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  16826190 tgatgctatcaaaagcttcttg 16826211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 16895689 - 16895269
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  16895689 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 16895591  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16895590 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 16895491  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16895490 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 16895391  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16895390 agcacgcatcctatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 16895291  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  16895290 tgatgctatcaaaagcttcttg 16895269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 37929160 - 37928740
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  37929160 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtgacagcagctttct 37929062  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37929061 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 37928962  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  37928961 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 37928862  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37928861 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 37928762  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  37928761 tgatgctatcaaaagcttcttg 37928740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 34294945 - 34294525
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  34294945 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 34294847  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34294846 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 34294747  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34294746 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttaagtagtagatagcatgctctttctttccagtctcatcttgttgacca 34294647  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34294646 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 34294547  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  34294546 tgatgctatcaaaagcttcttg 34294525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 40237299 - 40236879
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  40237299 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttct 40237201  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40237200 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgatttaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 40237101  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  40237100 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttcccgtttcatcttgttgacca 40237001  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40237000 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 40236901  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| ||||| |||||||||||    
T  40236900 tgatgctatcgaaagcttcttg 40236879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 11631637 - 11632057
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  11631637 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 11631735  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11631736 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 11631835  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  11631836 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgacca 11631935  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11631936 agtaaacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 11632035  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  11632036 tgatgctatcaaaagcttcttg 11632057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 19412954 - 19413374
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || |    
T  19412954 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacggcagctttct 19413052  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19413053 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 19413152  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19413153 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 19413252  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19413253 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 19413352  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  19413353 tgatgctatcaaaagcttcttg 19413374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 21673628 - 21674048
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  21673628 gaatgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 21673726  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21673727 caaagatatactttattggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 21673826  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  21673827 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 21673926  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21673927 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 21674026  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  21674027 tgatgctatcaaaagcttcttg 21674048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 32053594 - 32053174
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || |    
T  32053594 gaatgctacctttgattgccttct-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccatcgtgcgatctttccagtaacagcagctttct 32053496  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32053495 caaagatatacttaatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 32053396  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  32053395 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 32053296  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32053295 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 32053196  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  32053195 tgatgctatcaaaagcttcttg 32053174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 34865475 - 34865055
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || |    
T  34865475 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttct 34865377  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34865376 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 34865277  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  34865276 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 34865177  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34865176 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 34865077  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  34865076 tgatgctatcaaaagcttcttg 34865055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 39048272 - 39048692
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |    
T  39048272 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtgacagcagctttct 39048370  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39048371 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgatttaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaagctagagcacaaca 39048470  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  39048471 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttacttaggtagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 39048570  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39048571 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 39048670  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  39048671 tgatgctatcaaaagcttcttg 39048692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 257106 - 257526
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || || |    
T  257106 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaatacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgctttct 257204  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  257205 caaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 257304  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  257305 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgctgacca 257404  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  257405 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 257504  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  257505 tgatgctatcaaaagcttcttg 257526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 12659327 - 12658907
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  12659327 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 12659229  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  12659228 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaaca 12659129  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12659128 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 12659029  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12659028 agtacgcatcccatggactcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 12658929  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  12658928 tgatgctatcaaaagcttcttg 12658907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 21699624 - 21700044
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |    
T  21699624 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcatgcaatcttcccagtaacagcagctttct 21699722  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  21699723 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcacaaca 21699822  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21699823 agtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttacttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 21699922  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21699923 agtacgcatcccacggattcatcaaatactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggattggtggttccagcaggtaattct 21700022  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||| ||||    
T  21700023 tgatgctatcaaaagctccttg 21700044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 27807494 - 27807074
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || || |    
T  27807494 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgctttct 27807396  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27807395 caaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttagcagcccaagctagggcacaaca 27807296  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27807295 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 27807196  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27807195 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 27807096  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  27807095 tgatgctatcaaaagcttcttg 27807074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 20841704 - 20841284
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  20841704 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 20841606  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  20841605 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaaca 20841506  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20841505 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 20841406  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20841405 agtacgcatcccatggactcatcaaatactgccaagtacataatcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttccagtaggtaattct 20841306  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  20841305 tgatgctatcaaaagcttcttg 20841284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 39893860 - 39893440
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || |    
T  39893860 gaatgctacctttgatggcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttct 39893762  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39893761 caaagatatactttatcgggtccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 39893662  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  39893661 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 39893562  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39893561 agtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 39893462  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  39893461 tgatgctatcaaaagcttcttg 39893440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 9346439 - 9346859
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || || |    
T  9346439 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgctttct 9346537  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9346538 caaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 9346637  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  9346638 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgacca 9346737  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9346738 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 9346837  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| || ||||||||||||||    
T  9346838 tgatgctgtcaaaagcttcttg 9346859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 12590599 - 12590179
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || || |    
T  12590599 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgctttct 12590501  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12590500 caaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttagcagcccaagctagggcacaaca 12590401  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  12590400 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 12590301  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12590300 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 12590201  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  12590200 tgatgctatcaaaagcttcttg 12590179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 27430894 - 27431314
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |    
T  27430894 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattccgacaaaagcatctgccaacgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 27430992  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  27430993 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 27431092  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  27431093 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcgccttgttgacca 27431192  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27431193 agtacgcatcccatggattcatcaaatactaccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 27431292  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  27431293 tgatgctatcaaaagcttcttg 27431314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 37948315 - 37948735
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |    
T  37948315 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgctttct 37948413  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  37948414 caaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 37948513  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  37948514 agtcttctcgagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttcaagtttcatcttgttgacca 37948613  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37948614 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 37948713  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  37948714 tgatgctatcaaaagcttcttg 37948735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 16165271 - 16164854
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || || || |    
T  16165271 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccatcgtgcaatctttccagtaacggccgctttct 16165173  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  16165172 caaagatatactttatcggatccattctagatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 16165073  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16165072 agtcttctcgagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 16164973  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16164972 agcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 16164873  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  16164872 tgatgctatcaaaagcttc 16164854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 12713054 - 12713474
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| |||||||| || || || |    
T  12713054 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacagaagcatctgccatcgtgcaatctttccagtaacggccgctttct 12713152  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  12713153 cgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagccaaagcacaaca 12713252  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  12713253 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgacca 12713352  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12713353 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattct 12713452  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  12713453 tgatgctatcaaaagcttcttg 12713474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 23125022 - 23125441
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  23125022 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttt-gaacacaatatcgtattcagataaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 23125119  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  23125120 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 23125219  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  23125220 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcctgttgacca 23125319  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23125320 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtggcacaaggataggtggttccagcaggtaatttt 23125419  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  23125420 tgatgctatcaaaagcttcttg 23125441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 37381468 - 37381048
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || || |    
T  37381468 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccaccgtgcaatcttcccagtaacggccgctttct 37381370  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  37381369 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 37381270  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  37381269 agtcttctcaagcatcgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgacca 37381170  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37381169 agtacacatcccattgattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 37381070  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  37381069 tgatgctatcaaaagcttcttg 37381048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 19452876 - 19453296
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |    
T  19452876 gaatgctacctttgatagc-tttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcaggtttct 19452974  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||    
T  19452975 cgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttatatgattcaccaaataatgacgtaggcgtttggcggcccaggccggagcacaaca 19453074  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  19453075 agtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagataatagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgacca 19453174  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19453175 agtacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattct 19453274  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| | |||||||||| ||||    
T  19453275 tgatgccatcaaaagctccttg 19453296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 27395353 - 27394936
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || |    
T  27395353 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacaaaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttct 27395255  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27395254 caaagatatacttgattggatccatcctggatatcacccaagttgtatgattcatcaaatagtggcgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 27395155  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||     
T  27395154 agtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccg 27395055  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  27395054 agtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctt 27394955  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  27394954 tgatgctatcaaaagcttc 27394936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 124 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 27828129 - 27827841
Alignment:
Q  124 attctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtatacc 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27828129 attctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtatacc 27828030  T
Q  224 gagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27828029 gagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatggcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatc 27827930  T
Q  324 aaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatactatcaa 412  Q
    ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27827929 aaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaa 27827841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 34271373 - 34271629
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  34271373 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 34271471  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  34271472 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaaca 34271571  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatag 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  34271572 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatag 34271629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 192 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 28885808 - 28885577
Alignment:
Q  192 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatct 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28885808 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatct 28885709  T
Q  292 tgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 391  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885708 tgttgaccaagtacgcatcccatggactcatcaaatactgccaaatacataaccaagggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagca 28885609  T
Q  392 ggtaattcttgatactatcaaaagcttcttga 423  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  28885608 ggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttga 28885577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 28886070 - 28885821
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |    
T  28886070 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaattttcccagtaacagcagctttct 28885972  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  28885971 caaagatatactatatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 28885872  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgct 251  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28885871 agttttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgct 28885821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 40 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 34701829 - 34701570
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    |||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||| | ||||| | ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  34701829 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 34701730  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||    
T  34701729 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 34701630  T
Q  240 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  34701629 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 34701570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 42394288 - 42394029
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    |||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||| | ||||| | ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  42394288 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 42394189  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| || || ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||    
T  42394188 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagttaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 42394089  T
Q  240 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||  || || |||||||||||    
T  42394088 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcgtcttgttgacc 42394029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 359
Target Start/End: Original strand, 34533931 - 34534253
Alignment:
Q  37 acaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatca 136  Q
    ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || |||||  | || || | ||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  34533931 acaatatcatactcggacaataacatctgccaacgagcaattcttcctgttaaagccggcttctcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatca 34534030  T
Q  137 accaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtc 236  Q
    ||||||| || ||||| |||| ||||||||| || || || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| | ||| || |  ||||| ||    
T  34534031 accaagtagtgtgattaaccatataatgacgaagacgcttagcagcccatgccaaagcgcaacaggttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatc 34534130  T
Q  237 ggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaa 336  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||| || || || |||||||||| |||||| ||||||||||| | ||| || ||||| || || || ||||| | ||||    
T  34534131 ggtaaacttcttactcaagtagtaaatggcgtgctctttctttccagtctcgtcttgttgacccaacacacaacccatagaatcttctaacacagtcaaa 34534230  T
Q  337 tacaaaatcaaaggccttccttc 359  Q
    ||||  ||||||||||| |||||    
T  34534231 tacatgatcaaaggcctcccttc 34534253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 100 - 374
Target Start/End: Original strand, 26723827 - 26724101
Alignment:
Q  100 tcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaac 199  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||| || || || |||||||| || | ||| ||||    
T  26723827 tcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatcaaccaagtagtgtgattaaccatatagtgacgaagacgcttagcagcccatgccaaagcgcaac 26723926  T
Q  200 aagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 299  Q
    | || ||||||||||| | ||| || |  ||||| || || |||||||| ||||  ||||| || || || |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  26723927 aggttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggcgtgctctttctttccagtctcgtcttgttgacc 26724026  T
Q  300 aagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaag 374  Q
     | ||| || ||||| || || || ||||| | ||||||||  ||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  26724027 caacacacagcccatagaatcttctaacacagtcaaatacatgatcaaaggcctcccttcgaccggagggacaag 26724101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 12384413 - 12384037
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||| | || || | ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||| || ||    
T  12384413 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 12384314  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    | || || ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || ||    
T  12384313 acgtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacacgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 12384214  T
Q  240 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatac 339  Q
     ||||||||||| | ||| || || || || |||||  |||  || ||||||||||| || ||||| || |||||||| |  || |||||||  |  |||    
T  12384213 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaattttctaacactgttaggtac 12384114  T
Q  340 aaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatactatcaaaagc 416  Q
    |  |||||||| |||||||| || || ||||  || || |||||||| |||| ||| ||||| || || ||||||||    
T  12384113 atgatcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagc 12384037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 100 - 317
Target Start/End: Original strand, 21760166 - 21760383
Alignment:
Q  100 tcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaac 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||| | | || ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  21760166 tcaaagatgtacttgatcggatccatcttagatatcaaccaagtagtatgactaatcatatagtgacggaggcgtttggcggcccaggctagtgcgcaac 21760265  T
Q  200 aagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 299  Q
    | |||||||| ||||| | ||| |||| |||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| || ||  ||| ||| || |||||||| ||    
T  21760266 aggtcttctcgagcatggaatagcgagattcacaatcagtaaacttcttgctcaaataataaatggcatgctcctttcttccagtttcgtcttgttgtcc 21760365  T
Q  300 aagcacgcatcccatgga 317  Q
     ||||| || ||||||||    
T  21760366 gagcacacaacccatgga 21760383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22950146 - 22949869
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||| | || || | ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||| || ||    
T  22950146 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 22950047  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    |||| || ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || ||    
T  22950046 aagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 22949947  T
Q  240 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 317  Q
     ||||| ||||| | ||| || || || || |||||  |||  || ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  22949946 aaactttttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatgga 22949869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 363; Significance: 0; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 44564775 - 44564358
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  44564775 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttct 44564677  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44564676 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagaccacaaca 44564577  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44564576 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 44564477  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44564476 agcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 44564377  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  44564376 tgatgctatcaaaagcttc 44564358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 15771365 - 15770948
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  15771365 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 15771267  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15771266 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 15771167  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15771166 agtcctctcaaacattgtataccgagtttcacaatcggtaaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 15771067  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15771066 agcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 15770967  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  15770966 tgatgctatcaaaagcttc 15770948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 18713275 - 18712854
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  18713275 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 18713177  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18713176 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcacaaca 18713077  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18713076 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatggcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 18712977  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18712976 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactct 18712877  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttga 423  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  18712876 tgatgctatcaaaagcttcttga 18712854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 31358319 - 31357899
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  31358319 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 31358221  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31358220 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 31358121  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  31358120 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 31358021  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31358020 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 31357921  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  31357920 tgatgctatcaaaagcttcttg 31357899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 27605330 - 27605750
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  27605330 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttct 27605428  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  27605429 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaaca 27605528  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  27605529 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcctgttgacca 27605628  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27605629 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 27605728  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  27605729 tgatgctatcaaaagcttcttg 27605750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 14561415 - 14560994
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  14561415 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 14561317  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  14561316 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 14561217  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14561216 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaatttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 14561117  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14561116 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 14561017  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttga 423  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  14561016 tgatgctatcaaaagcttcttga 14560994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 19691889 - 19691469
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  19691889 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 19691791  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  19691790 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgtaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 19691691  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19691690 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 19691591  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19691590 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccgcgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 19691491  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  19691490 tgatgctatcaaaagcttcttg 19691469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 29833115 - 29832697
Alignment:
Q  3 atgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttca 102  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |||    
T  29833115 atgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgctttctca 29833017  T
Q  103 aagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaag 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29833016 aagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaag 29832917  T
Q  203 tcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaag 302  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  29832916 tcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaag 29832817  T
Q  303 cacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttg 402  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29832816 tacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttg 29832717  T
Q  403 atactatcaaaagcttcttg 422  Q
    || |||||||||||||||||    
T  29832716 atgctatcaaaagcttcttg 29832697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 18794495 - 18794075
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  18794495 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 18794397  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  18794396 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgactcatcaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 18794297  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  18794296 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcctgttgacca 18794197  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794196 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 18794097  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  18794096 tgatgctatcaaaagcttcttg 18794075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 19204787 - 19205207
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  19204787 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 19204885  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19204886 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 19204985  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  19204986 agtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgacca 19205085  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19205086 agtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattct 19205185  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  19205186 tgatgctatcaaaagcttcttg 19205207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 9358416 - 9357996
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || || |    
T  9358416 gaatgctacccttgattgcctttt-gagtcttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgctttct 9358318  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9358317 caaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 9358218  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  9358217 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 9358118  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9358117 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 9358018  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  9358017 tgatgctatcaaaagcttcttg 9357996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 2133685 - 2134105
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |    
T  2133685 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaattttcccagtaacagcagctttct 2133783  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  2133784 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaaca 2133883  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  2133884 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcgatgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttccttccagtctcatcttgttgacca 2133983  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2133984 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagtaggtaattct 2134083  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||| ||||||||    
T  2134084 tgatgctatcaaaggcttcttg 2134105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 28358377 - 28358797
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  28358377 gaatactacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttct 28358475  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28358476 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 28358575  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||    
T  28358576 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttcttcccggtttcatcttgttgacca 28358675  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28358676 agtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccgcggatgggacaaggataggtggttccagcagataattct 28358775  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  28358776 tgatgctatcaaaagcttcttg 28358797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 3 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 33262523 - 33262105
Alignment:
Q  3 atgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttca 102  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || |||    
T  33262523 atgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttctca 33262425  T
Q  103 aagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaag 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33262424 aagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaag 33262325  T
Q  203 tcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  33262324 tcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaag 33262225  T
Q  303 cacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttg 402  Q
     || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  33262224 tacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttg 33262125  T
Q  403 atactatcaaaagcttcttg 422  Q
    || |||||||||||||||||    
T  33262124 atgctatcaaaagcttcttg 33262105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 423
Target Start/End: Original strand, 21344596 - 21345017
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  21344596 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgtcagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttct 21344694  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    || |||| ||||| | | |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || | |||||||||    
T  21344695 cagagatatacttgagctgggcggttctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcctaggccaaagcacaaca 21344794  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21344795 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 21344894  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21344895 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcgaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 21344994  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttga 423  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  21344995 tgatgctatcaaaagcttcttga 21345017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 12089148 - 12089568
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || |    
T  12089148 gaatgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttct 12089246  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12089247 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 12089346  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  12089347 agtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacca 12089446  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12089447 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 12089546  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  12089547 tgatgctatcaaaagcttcttg 12089568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 19678238 - 19677818
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  19678238 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 19678140  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  19678139 cgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 19678040  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19678039 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgacca 19677940  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19677939 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattct 19677840  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| || ||||||||||||||    
T  19677839 tgatgctgtcaaaagcttcttg 19677818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 31486296 - 31486716
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |    
T  31486296 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaataccatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccggtaacagcagctttct 31486394  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  31486395 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 31486494  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  31486495 agtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtaaatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 31486594  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  31486595 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattct 31486694  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  31486695 tgatgctatcaaaagcttcttg 31486716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 22077350 - 22077753
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| |||| || |    
T  22077350 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacatcagctttct 22077448  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||        ||      ||||||||||||||||||||    
T  22077449 caaagatatacttgattggatccatcctggatatcaaccaagttgtatgattcatcaaatagtg--------gt------gcccaagctagagcacaaca 22077534  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||| |||||  | | ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||     
T  22077535 agtcttctcaagcatcgtatattgggcttcgcagtcggtaaagttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccg 22077634  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  22077635 agtacacatcccatggattcatctaacactgtcaagtacataatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctt 22077734  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  22077735 tgatgctatcaaaagcttc 22077753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 19657766 - 19658031
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |    
T  19657766 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcaactttct 19657864  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  19657865 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgatttaccaaataatggcgcaggcgtttggcggcccaggccagagcacaaca 19657964  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagca 267  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19657965 agtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagca 19658031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 33246160 - 33245894
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  33246160 gaatgctacctttgattgcctttta-agctttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgtcagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttct 33246062  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  33246061 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 33245962  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcat 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33245961 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttacttagatagtagatagcat 33245894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 40 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19844920 - 19844604
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    |||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||| | | ||| | ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  19844920 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttctagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgattggatccatcttggatatcaacc 19844821  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| || |||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| |||||    
T  19844820 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgtttggcagcccaggctaaatcacaacaagttttctcaagtaccgaatatcgggactcacaatcggt 19844721  T
Q  240 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatac 339  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||| | ||| || |||||||| || || || ||||  ||||||    
T  19844720 gaacttcttactcaaatagtagatagcttgctctttctttccggtttcatcttgttgacccaacacacagcccatggaatcttccaatactgttaaatac 19844621  T
Q  340 aaaatcaaaggccttcc 356  Q
    |  |||||||| |||||    
T  19844620 atgatcaaaggtcttcc 19844604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 40 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22412691 - 22412432
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    |||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||| | ||||| | ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  22412691 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 22412592  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||    
T  22412591 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 22412492  T
Q  240 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  22412491 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 22412432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14212792 - 14212533
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    |||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||| | ||||| | ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  14212792 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 14212693  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| || || ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||    
T  14212692 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagttaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 14212593  T
Q  240 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||  || || |||||||||||    
T  14212592 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcgtcttgttgacc 14212533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 100 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16769016 - 16768742
Alignment:
Q  100 tcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaac 199  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||| || || || |||||||| || | ||| ||||    
T  16769016 tcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatcaaccaagtagtgtgattaaccatatagtgacgaagacgcttagcagcccatgccaaagcgcaac 16768917  T
Q  200 aagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 299  Q
    | || ||||||||||| | ||| || |  ||||| || || |||||||| ||||  ||||| || || || |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16768916 aggttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggcgtgctctttctttccagtctcgtcttgttgacc 16768817  T
Q  300 aagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaag 374  Q
     | ||| || ||||| || || || ||||| | ||||||||  ||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  16768816 caacacacagcccatagaatcttctaacacagtcaaatacatgatcaaaggcctcccttcgaccggagggacaag 16768742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 363; Significance: 0; HSPs: 54)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 13520599 - 13521016
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  13520599 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 13520697  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13520698 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 13520797  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13520798 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 13520897  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13520898 agcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 13520997  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  13520998 tgatgctatcaaaagcttc 13521016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 14141801 - 14142218
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  14141801 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttct 14141899  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14141900 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 14141999  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14142000 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagataacatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 14142099  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14142100 agcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 14142199  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  14142200 tgatgctatcaaaagcttc 14142218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 26789605 - 26789188
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  26789605 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttct 26789507  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26789506 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcttttggcagcccaagctagagcacaaca 26789407  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  26789406 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgacca 26789307  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26789306 agcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 26789207  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  26789206 tgatgctatcaaaagcttc 26789188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 27197974 - 27197557
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  27197974 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttct 27197876  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27197875 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagctcaagctagagcacaaca 27197776  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  27197775 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgacca 27197676  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27197675 agcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 27197576  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  27197575 tgatgctatcaaaagcttc 27197557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 27251261 - 27251678
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  27251261 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttct 27251359  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27251360 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagctcaagctagagcacaaca 27251459  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  27251460 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgacca 27251559  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27251560 agcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 27251659  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  27251660 tgatgctatcaaaagcttc 27251678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 29505205 - 29504785
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  29505205 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 29505107  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29505106 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 29505007  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  29505006 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 29504907  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29504906 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 29504807  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  29504806 tgatgctatcaaaagcttcttg 29504785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 28164280 - 28163860
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  28164280 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 28164182  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28164181 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 28164082  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28164081 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcatcttgttgacca 28163982  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28163981 agcacgcatcccatggactcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 28163882  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  28163881 tgatgctatcaaaagcttcttg 28163860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 30554423 - 30554843
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  30554423 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 30554521  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30554522 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 30554621  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  30554622 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 30554721  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30554722 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 30554821  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  30554822 tgatgctatcaaaagcttcttg 30554843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 34460913 - 34461333
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  34460913 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 34461011  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34461012 caaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 34461111  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  34461112 agtcctctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 34461211  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34461212 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 34461311  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  34461312 tgatgctatcaaaagcttcttg 34461333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 27358517 - 27358934
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |    
T  27358517 gaatgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgctttct 27358615  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27358616 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 27358715  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  27358716 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacca 27358815  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27358816 agcacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 27358915  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  27358916 tgatgctatcaaaagcttc 27358934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 27448860 - 27449277
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |    
T  27448860 gaatgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgctttct 27448958  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27448959 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 27449058  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  27449059 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacca 27449158  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449159 agcacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 27449258  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  27449259 tgatgctatcaaaagcttc 27449277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 33372838 - 33373258
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  33372838 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 33372936  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33372937 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 33373036  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  33373037 agtcttctcaagcagtgtataccgagtttcgcaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgacca 33373136  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33373137 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 33373236  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| || ||||||||||||||    
T  33373237 tgatgctgtcaaaagcttcttg 33373258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Original strand, 13295358 - 13295777
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  13295358 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 13295456  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  13295457 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 13295556  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  13295557 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcctgttgacca 13295656  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13295657 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 13295756  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttctt 421  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  13295757 tgatgctatcaaaagcttctt 13295777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 16677929 - 16677509
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  16677929 gaatgctacctttgattgcccttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 16677831  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16677830 caaagacatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcacaaca 16677731  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16677730 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcagtgaacttcttgctcaggtagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 16677631  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16677630 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 16677531  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  16677530 tgatgctatcaaaagcttcttg 16677509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 27022925 - 27022505
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  27022925 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 27022827  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  27022826 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgactcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 27022727  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  27022726 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcctgttgacca 27022627  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27022626 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 27022527  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  27022526 tgatgctatcaaaagcttcttg 27022505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 27626118 - 27626538
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |    
T  27626118 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccatcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 27626216  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27626217 caaagatatacttgattggatccattctagatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 27626316  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27626317 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacggtcggtgaacttcttgcttagatagtagatggcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 27626416  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27626417 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaagtacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattct 27626516  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  27626517 tgatgctatcaaaagcttcttg 27626538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 4761552 - 4761132
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || |    
T  4761552 gaatgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttct 4761454  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4761453 caaagatatactttatcggatccattctatatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 4761354  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  4761353 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacca 4761254  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4761253 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 4761154  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  4761153 tgatgctatcaaaagcttcttg 4761132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 24867505 - 24867085
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |    
T  24867505 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccggtaacagcagctttct 24867407  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  24867406 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaaca 24867307  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  24867306 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacaa 24867207  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24867206 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactct 24867107  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  24867106 tgatgctatcaaaagcttcttg 24867085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 27061295 - 27060875
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  27061295 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatataatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 27061197  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  27061196 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaaca 27061097  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27061096 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 27060997  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27060996 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattct 27060897  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  27060896 tgatgctatcaaaagcttcttg 27060875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 29553346 - 29552926
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  29553346 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 29553248  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  29553247 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaaca 29553148  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  29553147 agtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgacca 29553048  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || || ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29553047 agtacacagcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 29552948  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  29552947 tgatgctatcaaaagcttcttg 29552926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 8902110 - 8902527
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |    
T  8902110 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatattcccagtaacagcagctttct 8902208  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  8902209 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaaca 8902308  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8902309 agttttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 8902408  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8902409 agcacgcatcccacagatgcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattca 8902508  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  8902509 tgatgctatcaaaagcttc 8902527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 16753610 - 16753189
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |    
T  16753610 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagccgctttct 16753512  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  16753511 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaaca 16753412  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16753411 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 16753312  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16753311 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattct 16753212  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttga 423  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  16753211 tgatgctatcaaaagcttcttga 16753189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 27011520 - 27011100
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  27011520 gaatgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 27011422  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27011421 caaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 27011322  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  27011321 agtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacca 27011222  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27011221 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 27011122  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  27011121 tgatgctatcaaaagcttcttg 27011100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 422
Target Start/End: Original strand, 27286773 - 27287191
Alignment:
Q  3 atgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttca 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| || |||    
T  27286773 atgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccaacgtgcaatcttcccagtaatagcagctttctca 27286871  T
Q  103 aagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaag 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  27286872 aagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcatcaaatagtggcgcaggcgtttggcagcccatgccaaagcacaacaag 27286971  T
Q  203 tcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27286972 tcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaag 27287071  T
Q  303 cacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttg 402  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27287072 tacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacaggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttg 27287171  T
Q  403 atactatcaaaagcttcttg 422  Q
    || |||||||||||||||||    
T  27287172 atgctatcaaaagcttcttg 27287191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 423
Target Start/End: Original strand, 22931291 - 22931712
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  22931291 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 22931389  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || | |||||||||    
T  22931390 cgaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcggttagcggcccaggccaaagcacaaca 22931489  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22931490 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatatcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 22931589  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22931590 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtagttccagcaggtaattct 22931689  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttga 423  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  22931690 tgatgctatcaaaagcttcttga 22931712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 423
Target Start/End: Original strand, 23853736 - 23854157
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  23853736 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 23853834  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || | |||||||||    
T  23853835 cgaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcggttagcggcccaggccaaagcacaaca 23853934  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23853935 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatatcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 23854034  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23854035 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtagttccagcaggtaattct 23854134  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttga 423  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  23854135 tgatgctatcaaaagcttcttga 23854157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 4529074 - 4528654
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || |    
T  4529074 gaatgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttct 4528976  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4528975 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 4528876  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  4528875 agtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacca 4528776  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4528775 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 4528676  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  4528675 tgatgctatcaaaagcttcttg 4528654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 27180245 - 27179825
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  27180245 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 27180147  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || |||||||||||    
T  27180146 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtggtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcctaggccagagcacaaca 27180047  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27180046 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 27179947  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27179946 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccgtccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattct 27179847  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| ||||||||| |||||||    
T  27179846 tgatgctatcaaaaacttcttg 27179825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 27268994 - 27269414
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  27268994 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 27269092  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || |||||||||||    
T  27269093 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtggtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcctaggccagagcacaaca 27269192  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27269193 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 27269292  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27269293 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccgtccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattct 27269392  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| ||||||||| |||||||    
T  27269393 tgatgctatcaaaaacttcttg 27269414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 27488922 - 27488502
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  27488922 gaatgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttct 27488824  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  27488823 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaggttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaaca 27488724  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27488723 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 27488624  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27488623 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 27488524  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  27488523 tgatgctatcaaaagcttcttg 27488502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 26775034 - 26775451
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  26775034 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacgatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 26775132  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  26775133 cgaagatatactttatcggatccattttggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaaca 26775232  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  26775233 agtcttctcgagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 26775332  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26775333 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 26775432  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  26775433 tgatgctatcaaaagcttc 26775451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 26922166 - 26921745
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |    
T  26922166 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagccgctttct 26922068  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  26922067 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgactcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaaca 26921968  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26921967 ggtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 26921868  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26921867 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaagataggtggtttcagcaggtaattct 26921768  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttga 423  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  26921767 tgatgctatcaaaagcttcttga 26921745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 4776669 - 4776249
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |    
T  4776669 gaatgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgctttct 4776571  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4776570 caaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 4776471  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  4776470 agtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacca 4776371  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4776370 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaagtaattct 4776271  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  4776270 tgatgctatcaaaagcttcttg 4776249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 15420727 - 15421147
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |    
T  15420727 gaatgctacctttgattccctttt-gagttttgaacacaacatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcctagtaacagcagctttct 15420825  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||| |||||    
T  15420826 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccacgttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcgcaaca 15420925  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15420926 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 15421025  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15421026 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 15421125  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  15421126 tgatgctatcaaaagcttcttg 15421147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 26112819 - 26113239
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || |    
T  26112819 gaatgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttct 26112917  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26112918 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 26113017  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  26113018 agtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacca 26113117  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26113118 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 26113217  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  26113218 tgatgctatcaaaagcttcttg 26113239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 28211243 - 28210823
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || |    
T  28211243 gaatgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttct 28211145  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28211144 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 28211045  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  28211044 agtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacca 28210945  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28210944 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 28210845  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  28210844 tgatgctatcaaaagcttcttg 28210823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 29576803 - 29576383
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  29576803 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 29576705  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29576704 caaagatatacttgattggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 29576605  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  29576604 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgacca 29576505  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29576504 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattct 29576405  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  29576404 tgatgctatcaaaagcttcttg 29576383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 3699872 - 3699455
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  3699872 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 3699774  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  3699773 caaagatatactttattggatccattctggatattaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 3699674  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  3699673 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 3699574  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3699573 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacacgtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 3699474  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  3699473 tgatgctatcaaaagcttc 3699455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 4542181 - 4542601
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || |    
T  4542181 gaatgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttct 4542279  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4542280 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 4542379  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  4542380 agtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaacttcttacttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacca 4542479  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542480 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 4542579  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  4542580 tgatgctatcaaaagcttcttg 4542601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 4720542 - 4720962
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || |    
T  4720542 gaatgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttct 4720640  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4720641 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 4720740  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  4720741 agtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaacttcttacttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacca 4720840  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4720841 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 4720940  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  4720941 tgatgctatcaaaagcttcttg 4720962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 16940434 - 16940854
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  16940434 gaatgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttct 16940532  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  16940533 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 16940632  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  16940633 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacca 16940732  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16940733 agtacacatcccatggattcatcaaatactgctaaatacataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 16940832  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  16940833 tgatgctatcaaaagcttcttg 16940854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 3 - 422
Target Start/End: Original strand, 17088852 - 17089270
Alignment:
Q  3 atgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttca 102  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||  || || |||    
T  17088852 atgctacctttgattgccattt-gagttttgaacacaatatcatattcggacaagagcatctgccatcgtgcaatcttccctgtaacagtcgctttctca 17088950  T
Q  103 aagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaag 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  17088951 aagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcacaacaag 17089050  T
Q  203 tcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaag 302  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  17089051 tcttttcaagcatcgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtcccatcttgttgaccaag 17089150  T
Q  303 cacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttg 402  Q
     |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17089151 tacgcatcccacggattcatcgaacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttg 17089250  T
Q  403 atactatcaaaagcttcttg 422  Q
    || |||||||||||| ||||    
T  17089251 atgctatcaaaagctccttg 17089270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 91 - 419
Target Start/End: Original strand, 22455610 - 22455938
Alignment:
Q  91 gcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagcta 190  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22455610 gcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagcta 22455709  T
Q  191 gagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatc 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22455710 gagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcgatgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatc 22455809  T
Q  291 ttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagc 390  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22455810 ttgttgaccaagtacgcatcccacggattcaccaaacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaagaataggtggttccagc 22455909  T
Q  391 aggtaattcttgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22455910 aggtaattcttgatgctatcaaaagcttc 22455938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 20172336 - 20171916
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  || |    
T  20172336 gaatgctacctttgattgcctttt-gaaccttgaacacaatgtcatattcagataaaagcatctgccaacgtgcaatcttcccggtaacagcaggtttct 20172238  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||    
T  20172237 cgaagatgtactttatcggatccattttggatatcaaccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttagcaacccaggccagagcacaaca 20172138  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  20172137 agtcttctcaagcatagtataccgagtctcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgacca 20172038  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |  || ||||| | | |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  20172037 attacacatcctacgaattcgtcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttcctgcagataactct 20171938  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20171937 tgatactatcaaaagcttcttg 20171916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 22163655 - 22164075
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  || |    
T  22163655 gaatgctacctttgattgcctttt-gaaccttgaacacaatgtcatattcagataaaagcatctgccaacgtgcaatcttcccggtaacagcaggtttct 22163753  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||    
T  22163754 cgaagatgtactttatcggatccattttggatatcaaccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttagcaacccaggccagagcacaaca 22163853  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22163854 agtcttctcaagcatagtataccgagtctcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgacca 22163953  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |  || ||||| | | |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  22163954 attacacatcctacgaattcgtcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttcctgcagataactct 22164053  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22164054 tgatactatcaaaagcttcttg 22164075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 24302164 - 24302430
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  24302164 gaatgctacctttgattgcctttt-gagctttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgtcagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 24302262  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  24302263 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcacaaca 24302362  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcat 268  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24302363 agtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacggtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcat 24302430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 190 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 26992396 - 26992163
Alignment:
Q  190 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26992396 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 26992297  T
Q  290 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 389  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26992296 cctgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 26992197  T
Q  390 caggtaattcttgatactatcaaaagcttcttga 423  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26992196 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttga 26992163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 35 - 317
Target Start/End: Original strand, 23971210 - 23971492
Alignment:
Q  35 acacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatat 134  Q
    ||||||||||||| || ||||| | ||||||||| |  |||||| | ||||| | ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||  |||||||    
T  23971210 acacaatatcatactcggacaataacatctgccatcaagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgattggatccatcttggatat 23971309  T
Q  135 caaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacag 234  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||| || || ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  |||||     
T  23971310 caaccaagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaggctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaa 23971409  T
Q  235 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 317  Q
    || ||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||  || |||||||||||||| | ||| || ||||||||    
T  23971410 tcagtgaacttcttactcaaatagtagatatcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacccaacacacagcccatgga 23971492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18120220 - 18119961
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    |||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||| | ||||| | ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  18120220 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 18120121  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| || || ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||    
T  18120120 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagttaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 18120021  T
Q  240 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||  || || |||||||||||    
T  18120020 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcgtcttgttgacc 18119961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 299
Target Start/End: Original strand, 18212114 - 18212373
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    |||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||| | ||||| | ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  18212114 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 18212213  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  |  || || |  ||||| || ||    
T  18212214 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagagtatcgggactcacaatcagt 18212313  T
Q  240 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| | || ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  18212314 gaacttcttactcaaatagtagataacgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 18212373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 27545656 - 27545319
Alignment:
Q  37 acaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatca 136  Q
    ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || |||||  | || || | ||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27545656 acaatatcatactcggacaataacatctgccaacgagcaattcttcctgttaaagccggcttctcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatca 27545557  T
Q  137 accaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtc 236  Q
    ||||||| || ||||| |||| ||| ||||| || || || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| | ||| || |  ||||| ||    
T  27545556 accaagtagtgtgattaaccatatagtgacgaagacgcttagcagcccatgccaaagcgcaacaggttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatc 27545457  T
Q  237 ggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaa 336  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||| || || || |||||||||| |||||| ||||||||||| | ||| || ||||| || || || ||||| | ||||    
T  27545456 ggtaaacttcttactcaagtagtaaatggcgtgctctttctttccagtctcgtcttgttgacccaacacacagcccatagaatcttctaacacagtcaaa 27545357  T
Q  337 tacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaag 374  Q
    ||||  ||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  27545356 tacatgatcaaaggcctcccttcgaccggagggacaag 27545319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 15408940 - 15409055
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |    
T  15408940 gaatgctacctttgattccctttt-gagttttgaacacaacatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcctagtaacagcagctttct 15409038  T
Q  101 caaagatgtactttatc 117  Q
    ||||||| |||||||||    
T  15409039 caaagatatactttatc 15409055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 317
Target Start/End: Original strand, 9135798 - 9136075
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    |||||||| ||||| |  ||||||||||| || |||||| | || || | ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||| || ||    
T  9135798 atatcatactcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 9135897  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    |||| || ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || ||    
T  9135898 aagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 9135997  T
Q  240 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 317  Q
     ||||||||||| | ||| || || || || |||||  |||  || ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  9135998 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatgga 9136075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25707765 - 25707443
Alignment:
Q  37 acaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatca 136  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||  | || || | ||||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  25707765 acaatatcatactcggacaatagcatctgccaacgagcaattcttcctgttaaagcaggcttctcaaaaatgtacttgattggatccattttggatatca 25707666  T
Q  137 accaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtc 236  Q
    ||||||| || ||||| ||||  || ||||| || || || |||||||| |  | ||| ||||| || ||||| ||||| | ||| |  |  ||||| ||    
T  25707665 accaagtagtgtgattaaccatttattgacgaagacgcttagcagcccatgtcaaagcgcaacaggttttctctagcatagaatatctggactcacaatc 25707566  T
Q  237 ggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaa 336  Q
     || |||||||| ||||  ||||| || ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||| | | ||| || ||||| || || || ||| | | |||     
T  25707565 agtaaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttttttccagtctcgtcttgttgatccaacacacagcccatagaatcttctaacccggtcaag 25707466  T
Q  337 tacaaaatcaaaggccttccttc 359  Q
    ||||  |||||||||||||||||    
T  25707465 tacatgatcaaaggccttccttc 25707443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 363; Significance: 0; HSPs: 62)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 33878929 - 33878512
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  33878929 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 33878831  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33878830 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 33878731  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33878730 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 33878631  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33878630 agcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 33878531  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  33878530 tgatgctatcaaaagcttc 33878512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 24587173 - 24586753
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  24587173 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 24587075  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24587074 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 24586975  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  24586974 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgacca 24586875  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586874 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 24586775  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  24586774 tgatgctatcaaaagcttcttg 24586753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 8661836 - 8662256
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  8661836 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 8661934  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8661935 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 8662034  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  8662035 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 8662134  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8662135 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 8662234  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  8662235 tgatgctatcaaaagcttcttg 8662256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 18497086 - 18497506
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  18497086 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 18497184  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18497185 caaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 18497284  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18497285 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 18497384  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18497385 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 18497484  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  18497485 tgatgctatcaaaagcttcttg 18497506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 30155830 - 30155410
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  30155830 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 30155732  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30155731 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 30155632  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  30155631 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 30155532  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30155531 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 30155432  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  30155431 tgatgctatcaaaagcttcttg 30155410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 33520179 - 33519759
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  33520179 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 33520081  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33520080 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 33519981  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  33519980 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 33519881  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33519880 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 33519781  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  33519780 tgatgctatcaaaagcttcttg 33519759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 43082054 - 43081634
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || || |    
T  43082054 gaatgctacccttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgctttct 43081956  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43081955 caaagatatactttatcgaatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 43081856  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43081855 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcatcttgttgacca 43081756  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43081755 agtacacatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 43081656  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  43081655 tgatgctatcaaaagcttcttg 43081634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 30033227 - 30032807
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  30033227 gaatgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagccttct 30033129  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  30033128 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggtagcccaagctaaagcacaaca 30033029  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  30033028 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 30032929  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30032928 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 30032829  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  30032828 tgatgctatcaaaagcttcttg 30032807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 33296327 - 33295907
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  33296327 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 33296229  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  33296228 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaaca 33296129  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33296128 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 33296029  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33296028 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 33295929  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  33295928 tgatgctatcaaaagcttcttg 33295907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 419
Target Start/End: Original strand, 29887560 - 29887975
Alignment:
Q  3 atgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttca 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| || |||    
T  29887560 atgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagagtgcaatcttcccagtaacaacagctttctca 29887658  T
Q  103 aagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaag 202  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29887659 aagatatacttgataggatccatcctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacaag 29887758  T
Q  203 tcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  29887759 tcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttattgaccaag 29887858  T
Q  303 cacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttg 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29887859 cacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacggatgagacaaggataggtggttccagcaggtaattcttg 29887958  T
Q  403 atactatcaaaagcttc 419  Q
    || ||||||||||||||    
T  29887959 atgctatcaaaagcttc 29887975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 9547070 - 9547487
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  9547070 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 9547168  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  9547169 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaaca 9547268  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9547269 agtcttttcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 9547368  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9547369 agcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 9547468  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||||||||||||||||||    
T  9547469 tgatactatcaaaagcttc 9547487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 11553154 - 11552734
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  11553154 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 11553056  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  11553055 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaaca 11552956  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11552955 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttaaatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 11552856  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11552855 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 11552756  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  11552755 tgatgctatcaaaagcttcttg 11552734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 23629769 - 23629349
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  23629769 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 23629671  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  23629670 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 23629571  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23629570 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 23629471  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23629470 agtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 23629371  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  23629370 tgatgctatcaaaagcttcttg 23629349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 25204077 - 25203657
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  25204077 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 25203979  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  25203978 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaaaaatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaaca 25203879  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25203878 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtatatagcatgttctttctttcccgtctcatcttgttgacca 25203779  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25203778 agtacgcatcccatggattcatcaaacactgacaagtacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 25203679  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||| ||||    
T  25203678 tgatgctatcaaaagctccttg 25203657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 25268232 - 25267812
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  25268232 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 25268134  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  25268133 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaaaaatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaaca 25268034  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25268033 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtatatagcatgttctttctttcccgtctcatcttgttgacca 25267934  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25267933 agtacgcatcccatggattcatcaaacactgacaagtacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 25267834  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||| ||||    
T  25267833 tgatgctatcaaaagctccttg 25267812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 40469911 - 40470328
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |    
T  40469911 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgctttct 40470009  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40470010 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 40470109  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  40470110 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgacca 40470209  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40470210 agtacacatcccatggattcatcaaataccgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattct 40470309  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  40470310 tgatgctatcaaaagcttc 40470328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 9321275 - 9320855
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  9321275 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 9321177  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9321176 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 9321077  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  9321076 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgacca 9320977  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9320976 agtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattct 9320877  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  9320876 tgatgctatcaaaagcttcttg 9320855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 15655119 - 15655539
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  15655119 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagccgctttct 15655217  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  15655218 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgtaggcgtttagcagcccaggccagagcacaaca 15655317  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15655318 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgacca 15655417  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15655418 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 15655517  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  15655518 tgatgctatcaaaagcttcttg 15655539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 3793340 - 3792923
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  3793340 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 3793242  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3793241 caaagatatacttgatcgggtccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 3793142  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  3793141 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgacca 3793042  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3793041 agtacacatcccatggattcatcaaataccgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattct 3792942  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  3792941 tgatgctatcaaaagcttc 3792923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 423
Target Start/End: Original strand, 22995478 - 22995899
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  22995478 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 22995576  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  22995577 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 22995676  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22995677 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaatttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 22995776  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22995777 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 22995876  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttga 423  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  22995877 tgatgctatcaaaagcttcttga 22995899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 12135974 - 12135554
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  12135974 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacataatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 12135876  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12135875 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 12135776  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  12135775 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgacca 12135676  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12135675 agtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattct 12135576  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  12135575 tgatgctatcaaaagcttcttg 12135554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 22892262 - 22891842
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  22892262 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 22892164  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  22892163 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttttatgattcaccaaatagtgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcacaaca 22892064  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22892063 agtcttttcaagcatcatataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 22891964  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22891963 agtacgcatcccacggattcgtcaaacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 22891864  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||| ||||    
T  22891863 tgatgctatcaaaagctccttg 22891842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 24727768 - 24727348
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |    
T  24727768 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtgacagcagctttct 24727670  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24727669 cgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 24727570  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  24727569 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgacca 24727470  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24727469 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattct 24727370  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  24727369 tgatgctatcaaaagcttcttg 24727348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 26484193 - 26483773
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  26484193 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 26484095  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26484094 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 26483995  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| |||||||||    
T  26483994 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcctgttgacca 26483895  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26483894 agtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattct 26483795  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  26483794 tgatgctatcaaaagcttcttg 26483773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 24973705 - 24973285
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |    
T  24973705 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccaacgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 24973607  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | || ||||||    
T  24973606 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccacgttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaaggacaaca 24973507  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24973506 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 24973407  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24973406 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 24973307  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  24973306 tgatgctatcaaaagcttcttg 24973285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 28653041 - 28652621
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || || |    
T  28653041 gaatgctacccttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgctttct 28652943  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28652942 caaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 28652843  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28652842 agtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcatcttgttgacca 28652743  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28652742 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaagtaattct 28652643  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  28652642 tgatgctatcaaaagcttcttg 28652621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 31435263 - 31434843
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  31435263 gaatgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 31435165  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435164 caaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 31435065  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  31435064 agtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacca 31434965  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31434964 agtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 31434865  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  31434864 tgatgctatcaaaagcttcttg 31434843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 34620317 - 34619897
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |    
T  34620317 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaacaacatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgctttct 34620219  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34620218 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 34620119  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  34620118 agtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 34620019  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  34620018 agcacgcatcccatggattcattaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattct 34619919  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  34619918 tgatgctatcaaaagcctcttg 34619897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 37667847 - 37668267
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |    
T  37667847 gaatgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagccgctttct 37667945  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37667946 caaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcagcccaagctagagcacaaca 37668045  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  37668046 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacca 37668145  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37668146 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 37668245  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  37668246 tgatgctatcaaaagcttcttg 37668267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 37767352 - 37767772
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  37767352 gaatgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttct 37767450  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37767451 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 37767550  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  37767551 agtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacca 37767650  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37767651 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccagatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 37767750  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  37767751 tgatgctatcaaaagcttcttg 37767772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 11327436 - 11327019
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || |    
T  11327436 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttct 11327338  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11327337 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 11327238  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11327237 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcaccatcggtgaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 11327138  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11327137 agcacgcatcccacaggttcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccatgggagggacaaggataggtggttctagcaggtaattct 11327038  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  11327037 tgatgctatcaaaagcttc 11327019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 41678504 - 41678084
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  41678504 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 41678406  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  41678405 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 41678306  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41678305 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 41678206  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41678205 agcacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 41678106  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  41678105 tgatgctatcaaaagcttcttg 41678084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 13439044 - 13439461
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |    
T  13439044 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacgatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtgacagcagctttct 13439142  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  13439143 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgatttaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 13439242  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13439243 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 13439342  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13439343 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 13439442  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  13439443 tgatgctatcaaaagcttc 13439461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 33781284 - 33780868
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  33781284 gaatgctacctttgattgccttttg-----ttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 33781190  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  33781189 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaaca 33781090  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33781089 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 33780990  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33780989 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattct 33780890  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  33780889 tgatgctatcaaaagcttcttg 33780868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 37758782 - 37758362
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |    
T  37758782 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggcagctttct 37758684  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  37758683 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 37758584  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  37758583 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 37758484  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37758483 agcacgcatcccatggattcatcaaataccgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 37758384  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  37758383 tgatgctatcaaaagcttcttg 37758362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 30938434 - 30938014
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  30938434 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 30938336  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  30938335 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 30938236  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30938235 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcatcttgttgacca 30938136  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  30938135 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatatgtggttccagcaggtaactct 30938036  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    || | |||||||||||||||||    
T  30938035 tggtgctatcaaaagcttcttg 30938014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 31822768 - 31823188
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || |    
T  31822768 gaatgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttct 31822866  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31822867 cgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 31822966  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  31822967 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgccca 31823066  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31823067 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 31823166  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  31823167 tgatgctatcaaaagcttcttg 31823188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 37355004 - 37355424
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || |    
T  37355004 gaatgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttct 37355102  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37355103 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 37355202  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  37355203 agtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacca 37355302  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37355303 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 37355402  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  37355403 tgatgctatcaaaagcttcttg 37355424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 18124777 - 18125194
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  18124777 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcgtattcagacaacagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 18124875  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  || |  ||||||||    
T  18124876 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgatttaccaaataatgacgcaggcgttttgcggcccgggccaaggcacaaca 18124975  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18124976 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 18125075  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18125076 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 18125175  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  18125176 tgatgctatcaaaagcttc 18125194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 30172268 - 30171848
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |    
T  30172268 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggcagctttct 30172170  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  30172169 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaatcaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 30172070  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  30172069 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 30171970  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30171969 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 30171870  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  30171869 tgatgctatcaaaagcttcttg 30171848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 3 - 422
Target Start/End: Original strand, 13321193 - 13321611
Alignment:
Q  3 atgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttca 102  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || || |||    
T  13321193 atgctacctttgatcgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccaacgtgcaatcttcccagtaacggccgctttctca 13321291  T
Q  103 aagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaag 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13321292 aagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaag 13321391  T
Q  203 tcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaag 302  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13321392 tcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagataatagataacatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaag 13321491  T
Q  303 cacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttg 402  Q
     || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13321492 tacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttg 13321591  T
Q  403 atactatcaaaagcttcttg 422  Q
    || |||||||||||||||||    
T  13321592 atgctatcaaaagcttcttg 13321611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 13183154 - 13183571
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  13183154 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattaagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 13183252  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  13183253 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaaca 13183352  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13183353 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgatctttctttccagtttcatcttgttgacca 13183452  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |  || ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13183453 attacacatcccacggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattct 13183552  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  13183553 tgatgctatcaaaagcttc 13183571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 15755213 - 15755633
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || |    
T  15755213 gaatgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttct 15755311  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15755312 caaagatatactttatcgggtccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 15755411  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  15755412 agtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttaaatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacca 15755511  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15755512 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgctaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 15755611  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  15755612 tgatgctatcaaaagcttcttg 15755633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 28956146 - 28956566
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |    
T  28956146 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaatacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggcagctttct 28956244  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||| |||||    
T  28956245 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcgcaaca 28956344  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  28956345 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 28956444  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  28956445 agcacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattct 28956544  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  28956545 tgatgctatcaaaagcctcttg 28956566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 18371895 - 18372312
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |    
T  18371895 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggcagctttct 18371993  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18371994 caaagatatacttgatctgatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 18372093  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  18372094 agtcttttcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacca 18372193  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372194 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 18372293  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  18372294 tgatgctatcaaaagcttc 18372312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 6878104 - 6877684
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
T  6878104 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtgacggcagctttct 6878006  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  6878005 cgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtgtgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 6877906  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  6877905 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcctgttgacca 6877806  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6877805 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 6877706  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  6877705 tgatgctatcaaaagcttcttg 6877684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 32592635 - 32593055
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| || || || |    
T  32592635 gaatgctacctttgattgcctttt-gagctttgaacacaatatcatattcagacaacaacatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgctttct 32592733  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32592734 caaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 32592833  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  32592834 agtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaattggtgaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccggtctcatcttgttgacca 32592933  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  32592934 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattct 32593033  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  32593034 tgatgctatcaaaagcctcttg 32593055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 5641587 - 5641167
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  5641587 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 5641489  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  5641488 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccagataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 5641389  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  5641388 agtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtaaatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccc 5641289  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  5641288 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattct 5641189  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  5641188 tgatgctatcaaaagcttcttg 5641167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 2514861 - 2514441
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
T  2514861 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtgacggcagctttct 2514763  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  2514762 cgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtgtgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 2514663  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  2514662 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 2514563  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||    
T  2514562 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaactct 2514463  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  2514462 tgatgctatcaaaagcctcttg 2514441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 193 - 422
Target Start/End: Original strand, 24684697 - 24684926
Alignment:
Q  193 gcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatctt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24684697 gcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctt 24684796  T
Q  293 gttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcag 392  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24684797 gttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcag 24684896  T
Q  393 gtaattcttgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  24684897 gtaactcttgatgctatcaaaagcttcttg 24684926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 299
Target Start/End: Original strand, 3483602 - 3483861
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    |||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||| | ||||| | ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  3483602 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 3483701  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| || || ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||    
T  3483702 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagttaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 3483801  T
Q  240 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||  || || |||||||||||    
T  3483802 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcgtcttgttgacc 3483861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 315 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 23895692 - 23895585
Alignment:
Q  315 ggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatactatcaaaa 414  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  23895692 ggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaatttttgatgctatcataa 23895593  T
Q  415 gcttcttg 422  Q
    ||||||||    
T  23895592 gcttcttg 23895585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 374
Target Start/End: Original strand, 351609 - 351948
Alignment:
Q  35 acacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaat-cttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggata 133  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||   |||| || | ||| ||||| | |||||| |||||||||||| ||||||    
T  351609 acacaatatcatattcagacaataacatctgccaacgagcaattcttcctgttaac-gccggcttctcaaaaaggtacttgatcggatccattttggata 351707  T
Q  134 tcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcaca 233  Q
    |||||||||| || || |  ||||  || ||||| || || || || ||||| || | ||| |||||||| ||||||||||| | ||| || |  |||||    
T  351708 tcaaccaagtagtgtggtaaaccatgtagtgacggagacgcttagcggcccatgccaaagcgcaacaagttttctcaagcatagaatatcgggactcaca 351807  T
Q  234 gtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgac 333  Q
     || || |||||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | |    
T  351808 atcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttctttccagtttcgtcttgttgaccaagcacgcagcccatagaatcatccaacacagtc 351907  T
Q  334 aaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaag 374  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  351908 aaatacatgatcaaaggccttccttcaactggagggacaag 351948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 40 - 416
Target Start/End: Original strand, 11943821 - 11944197
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||| | || || | ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||| || ||    
T  11943821 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 11943920  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    |||| || ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || ||    
T  11943921 aagtagtgtgattgatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtatcgagattcacattcagt 11944020  T
Q  240 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatac 339  Q
     ||||||||||| | ||| || || || || |||||  |||  || ||||||||||| || ||||| || |||||||| |  || |||||||  |  |||    
T  11944021 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaattttctaacactgttaggtac 11944120  T
Q  340 aaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatactatcaaaagc 416  Q
    |  |||||||| |||||||| || || ||||  || || |||||||| |||| ||| ||||| || || ||||||||    
T  11944121 atgatcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagc 11944197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 317
Target Start/End: Original strand, 5439624 - 5439901
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||| | || || | ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||| || ||    
T  5439624 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 5439723  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    |||| || ||||| | || ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || ||    
T  5439724 aagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgcttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 5439823  T
Q  240 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 317  Q
     ||||||||||| | ||| || || || || |||||  |||  || ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  5439824 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatgga 5439901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 317
Target Start/End: Original strand, 15784124 - 15784401
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||| | || || | ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||| || ||    
T  15784124 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 15784223  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    | || || ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || ||    
T  15784224 acgtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacacgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 15784323  T
Q  240 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 317  Q
     ||||||||||| | ||| || || || || |||||  |||  || ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  15784324 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatgga 15784401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 17957858 - 17957581
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||| | ||  | | ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||| ||    
T  17957858 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctatcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagatatcagcc 17957759  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    |||| || ||||| | || ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || ||    
T  17957758 aagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgcttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 17957659  T
Q  240 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 317  Q
     ||||||||||| | ||| || || || || |||||  |||  || ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  17957658 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatgga 17957581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 100 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 34469323 - 34469106
Alignment:
Q  100 tcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaac 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||| | | || ||| ||||| || ||||||||||||||  |||| || ||||    
T  34469323 tcaaagatgtacttgatcggatccatcttagatatcaaccaagtagtatgactaatcatatagtgacggagacgtttggcagcccagactagtgcgcaac 34469224  T
Q  200 aagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 299  Q
    | |||||||| ||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| || || ||||| || ||  |||  || ||||||||||| ||    
T  34469223 aggtcttctcgagcatggaatagcgagattcacagtcagtaaacttcttgctcaaataataaatggcatgctcctttcttccggtttcatcttgttgtcc 34469124  T
Q  300 aagcacgcatcccatgga 317  Q
     ||||| || ||||||||    
T  34469123 gagcacacaacccatgga 34469106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 31521068 - 31520692
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    ||||||||||| || |  ||||||||||| || |||||| | || || | ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||| || ||    
T  31521068 atatcatattccgatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 31520969  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    |||| || ||||| | || ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || ||    
T  31520968 aagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgcttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 31520869  T
Q  240 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatac 339  Q
     ||||||||||| | ||| || || || || |||||  |||  || ||||||||||| || ||||| || |||||||| |  || |||||||  |  |||    
T  31520868 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaattttctaacactgttaggtac 31520769  T
Q  340 aaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatactatcaaaagc 416  Q
    |  |||||||| |||||||| || || ||||  || || |||||||| |||| ||| ||||| || || ||||||||    
T  31520768 atgatcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagc 31520692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 317
Target Start/End: Original strand, 36375361 - 36375638
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||| | || || | ||| | ||| ||||| ||||| || || ||||||||| | |||| || ||    
T  36375361 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtatttgattggatccattttagataccagcc 36375460  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    |||| || ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || |  || |||| |||||| || ||    
T  36375461 aagtagtgtgattgatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagtatggagtatcgagattcacattcagt 36375560  T
Q  240 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 317  Q
     ||||| ||||| | ||| || || || ||||||||  |||  || ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  36375561 aaactttttgcttaaataataaatggcgtgttcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatgga 36375638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 317
Target Start/End: Original strand, 37000015 - 37000292
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||| | || || | ||| | ||| ||||| ||||| || || ||||||||| | |||| || ||    
T  37000015 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtatttgattggatccattttagataccagcc 37000114  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    |||| || ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || |  || |||| |||||| || ||    
T  37000115 aagtagtgtgattgatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagtatggagtatcgagattcacattcagt 37000214  T
Q  240 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 317  Q
     ||||| ||||| | ||| || || || ||||||||  |||  || ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  37000215 aaactttttgcttaaataataaatggcgtgttcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatgga 37000292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Original strand, 20388448 - 20388647
Alignment:
Q  100 tcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaac 199  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||| || ||  | |||||||| || | ||| | ||    
T  20388448 tcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatcaaccaagtagtgtgattaaccatatagtgacgaagacgcatagcagcccatgccaaagcgcgac 20388547  T
Q  200 aagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 299  Q
    | || ||||||||||| | ||| || |  ||||| || || |||||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  20388548 aggttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgacc 20388647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 363; Significance: 0; HSPs: 72)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 32294381 - 32293964
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  32294381 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 32294283  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32294282 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 32294183  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32294182 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 32294083  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32294082 agcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 32293983  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  32293982 tgatgctatcaaaagcttc 32293964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 5714826 - 5714406
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  5714826 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatactcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 5714728  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5714727 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagggcacaaca 5714628  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5714627 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 5714528  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714527 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 5714428  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  5714427 tgatgctatcaaaagcttcttg 5714406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 5725736 - 5725316
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  5725736 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatactcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 5725638  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5725637 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagggcacaaca 5725538  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5725537 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 5725438  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5725437 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 5725338  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  5725337 tgatgctatcaaaagcttcttg 5725316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 5766632 - 5767052
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  5766632 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatactcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 5766730  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5766731 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagggcacaaca 5766830  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5766831 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 5766930  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5766931 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 5767030  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  5767031 tgatgctatcaaaagcttcttg 5767052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 31032743 - 31033160
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  31032743 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 31032841  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||    
T  31032842 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaagccaaagcacaaca 31032941  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31032942 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 31033041  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31033042 agcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 31033141  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  31033142 tgatgctatcaaaagcttc 31033160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 5017467 - 5017047
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  5017467 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 5017369  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5017368 caaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggtagcccaagctagagcacaaca 5017269  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5017268 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 5017169  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5017168 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 5017069  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  5017068 tgatgctatcaaaagcttcttg 5017047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 8215488 - 8215068
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  8215488 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 8215390  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8215389 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 8215290  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  8215289 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtaggtagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgacca 8215190  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8215189 agcacgcatcccatggactcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattct 8215090  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  8215089 tgatgctatcaaaagcttcttg 8215068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 19698243 - 19697823
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  19698243 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaatacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgggcaatcttcccagtaacagcagctttct 19698145  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  19698144 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaaca 19698045  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19698044 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 19697945  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19697944 agtacgcatcccatggattcatcgaacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 19697845  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||  |||||||||||||||||    
T  19697844 tgacgctatcaaaagcttcttg 19697823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 423
Target Start/End: Original strand, 15737601 - 15738022
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  15737601 gaatgctacatttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 15737699  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  15737700 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 15737799  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15737800 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 15737899  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15737900 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 15737999  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttga 423  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  15738000 tgatgctatcaaaagcttcttga 15738022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 21678456 - 21678035
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  21678456 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttct 21678358  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678357 caaagatatactttatcggatccattctggatatcatccaagttgtatgatttaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 21678258  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  21678257 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttcccgtttcatcttgttgacca 21678158  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678157 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 21678058  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttga 423  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  21678057 tgatgctatcaaaagcttcttga 21678035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 423
Target Start/End: Original strand, 22384085 - 22384506
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  22384085 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 22384183  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  22384184 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 22384283  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22384284 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 22384383  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22384384 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 22384483  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttga 423  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  22384484 tgatgctatcaaaagcttcttga 22384506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 4627538 - 4627118
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  4627538 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaacagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 4627440  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  4627439 caaagatatactttattggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaagctagagcacaaca 4627340  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  4627339 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 4627240  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || ||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4627239 agtacacatcccatggattcatcgaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 4627140  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  4627139 tgatgctatcaaaagcttcttg 4627118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 6205656 - 6205236
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |    
T  6205656 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccaacgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 6205558  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  6205557 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaagccagagcacaaca 6205458  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6205457 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 6205358  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6205357 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaagggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattct 6205258  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  6205257 tgatgctatcaaaagcttcttg 6205236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 8285977 - 8286397
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |    
T  8285977 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccggtaacagcagctttct 8286075  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||    
T  8286076 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaagccaaagcacaaca 8286175  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8286176 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 8286275  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286276 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 8286375  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  8286376 tgatgctatcaaaagcttcttg 8286397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 18304161 - 18304581
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  18304161 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 18304259  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  18304260 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 18304359  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18304360 agccttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 18304459  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18304460 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 18304559  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  18304560 tgatgctatcaaaagcttcttg 18304581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 28112461 - 28112881
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  28112461 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 28112559  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28112560 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 28112659  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  28112660 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 28112759  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28112760 agtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattct 28112859  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||| ||||    
T  28112860 tgatgctatcaaaagctccttg 28112881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 47027206 - 47026786
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  47027206 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtgacagcagctttct 47027108  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47027107 caaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 47027008  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  47027007 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 47026908  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47026907 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 47026808  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  47026807 tgatgctatcaaaagcttcttg 47026786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 5592864 - 5593281
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |    
T  5592864 gaatgctacctttgattgcctttt-gcgttttgaacacaatatcatattcagacagaagcatctgccagtgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 5592962  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5592963 caaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 5593062  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5593063 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 5593162  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5593163 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 5593262  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  5593263 tgatgctatcaaaagcttc 5593281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 8299724 - 8299303
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  8299724 gaattctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 8299626  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||    
T  8299625 caaagatatactttatcggatccattatggatatcaaccaagttgtatgattcatcaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaagccaaagcacaaca 8299526  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  8299525 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccaatctcatcttgttgacca 8299426  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8299425 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 8299326  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttga 423  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  8299325 tgatgctatcaaaagcttcttga 8299303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 4793142 - 4793562
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  4793142 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 4793240  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  4793241 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgactcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 4793340  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  4793341 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcctgttgacca 4793440  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4793441 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 4793540  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  4793541 tgatgctatcaaaagcttcttg 4793562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 18273559 - 18273979
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  18273559 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 18273657  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  18273658 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 18273757  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18273758 agccttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttccttctttccagtctcatcttgttgacca 18273857  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18273858 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 18273957  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  18273958 tgatgctatcaaaagcttcttg 18273979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 18288860 - 18289280
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  18288860 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 18288958  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  18288959 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 18289058  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18289059 agccttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttccttctttccagtctcatcttgttgacca 18289158  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18289159 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 18289258  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  18289259 tgatgctatcaaaagcttcttg 18289280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 24331916 - 24331500
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |    
T  24331916 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgctttct 24331818  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24331817 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcacaaca 24331718  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  24331717 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacca 24331618  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24331617 agtacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 24331518  T
Q  401 tgatactatcaaaagctt 418  Q
    |||| |||||||||||||    
T  24331517 tgatgctatcaaaagctt 24331500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 32442904 - 32442484
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |    
T  32442904 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccatcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 32442806  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  32442805 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 32442706  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32442705 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 32442606  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32442605 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 32442506  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  32442505 tgatgctatcaaaagcttcttg 32442484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 35884519 - 35884099
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  35884519 gaatgctacctttaattgcctttt-gagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 35884421  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  35884420 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaaca 35884321  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35884320 agtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 35884221  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35884220 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 35884121  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  35884120 tgatgctatcaaaagcttcttg 35884099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 51785776 - 51785356
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |    
T  51785776 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtgacagcagctttct 51785678  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51785677 cgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 51785578  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  51785577 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgacca 51785478  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51785477 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattct 51785378  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  51785377 tgatgctatcaaaagcttcttg 51785356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 5605821 - 5606241
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |    
T  5605821 gaatgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcggacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttct 5605919  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5605920 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 5606019  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5606020 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgacca 5606119  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5606120 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 5606219  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  5606220 tgatgctatcaaaagcttcttg 5606241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 7076959 - 7076539
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  7076959 gaatactacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 7076861  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  7076860 caaagatatattttatcggatccattctggatgtcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaaca 7076761  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7076760 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 7076661  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7076660 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 7076561  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  7076560 tgatgctatcaaaagcttcttg 7076539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 10399897 - 10399477
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |    
T  10399897 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagccgctttct 10399799  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  10399798 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 10399699  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10399698 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 10399599  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10399598 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattct 10399499  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  10399498 tgatgctatcaaaagcttcttg 10399477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 18334383 - 18333963
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  18334383 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 18334285  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  18334284 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 18334185  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18334184 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 18334085  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18334084 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggttccagcaggtaattct 18333985  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  18333984 tgatgctatcaaaagcttcttg 18333963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 18055015 - 18054594
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  18055015 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 18054917  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | |||||||||||    
T  18054916 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccagaccagagcacaaca 18054817  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18054816 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttacttaaatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 18054717  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18054716 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 18054617  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttga 423  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  18054616 tgatgctatcaaaagcttcttga 18054594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 18228949 - 18228529
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  18228949 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 18228851  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18228850 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 18228751  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18228750 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 18228651  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18228650 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattct 18228551  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  18228550 tgatgctatcaaaagcttcttg 18228529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 18246494 - 18246074
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || |    
T  18246494 gaatgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttct 18246396  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18246395 caaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 18246296  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18246295 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 18246196  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18246195 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 18246096  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  18246095 tgatgctatcaaaagcttcttg 18246074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 20573350 - 20573770
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || || || |    
T  20573350 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccatcgtgcaatctttccagtaacggccgctttct 20573448  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20573449 caaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttagcagcccaagctagggcacaaca 20573548  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  20573549 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 20573648  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20573649 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 20573748  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  20573749 tgatgctatcaaaagcttcttg 20573770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 29145263 - 29145683
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |    
T  29145263 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagataaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccggtaacagccgctttct 29145361  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  29145362 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 29145461  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29145462 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 29145561  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29145562 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccctccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 29145661  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  29145662 tgatgctatcaaaagcttcttg 29145683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 29661477 - 29661897
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| |||||||| || || || |    
T  29661477 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacagaagcatctgccatcgtgcaatctttccagtaacggccgctttct 29661575  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29661576 caaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagggcacaaca 29661675  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  29661676 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgacca 29661775  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29661776 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 29661875  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  29661876 tgatgctatcaaaagcttcttg 29661897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 4725384 - 4724964
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  4725384 gaatgctacctttgatttcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 4725286  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  4725285 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 4725186  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4725185 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 4725086  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4725085 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaagggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggtttcagcaggtaattct 4724986  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  4724985 tgatgctatcaaaagcttcttg 4724964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 15889212 - 15889632
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  15889212 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttct 15889310  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||    
T  15889311 caaagatatactttaccggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgcttagcggcccaggccagagcacaaca 15889410  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  15889411 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtgaacttcttgcttatatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcctgttgacca 15889510  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15889511 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 15889610  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  15889611 tgatgctatcaaaagcttcttg 15889632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 20069793 - 20069373
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  20069793 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaacagcatctgctagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 20069695  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  20069694 caaagatatactttatcggatccattctggatttcaaccaagttgtatgattcaccagataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaaca 20069595  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20069594 agtcttctcaagcattgcataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 20069495  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20069494 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattct 20069395  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  20069394 tgatgctatcaaaagcttcttg 20069373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 28342930 - 28342510
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || |    
T  28342930 gaatgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttct 28342832  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  28342831 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 28342732  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  28342731 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 28342632  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28342631 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 28342532  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  28342531 tgatgctatcaaaagcttcttg 28342510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 4343183 - 4343603
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  4343183 gaatgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaacaacatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttct 4343281  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  4343282 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggctaaagcacaaca 4343381  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  4343382 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacca 4343481  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4343482 agtacgcatcccatggattcatcaaatactaccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 4343581  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  4343582 tgatgctatcaaaagcttcttg 4343603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 4420668 - 4420248
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |    
T  4420668 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgctttct 4420570  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4420569 caaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcacaaca 4420470  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  4420469 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagataatagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 4420370  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4420369 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 4420270  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  4420269 tgatgctatcaaaagcttcttg 4420248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 4687408 - 4686988
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  4687408 gaatgctacctttgactgtctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 4687310  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  4687309 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 4687210  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4687209 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 4687110  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4687109 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaagggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggtttcagcaggtaattct 4687010  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  4687009 tgatgctatcaaaagcttcttg 4686988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 5470741 - 5470321
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |    
T  5470741 gaatgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgctttct 5470643  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5470642 caaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccacgctagagcacaaca 5470543  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  5470542 agtcttctctagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacca 5470443  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5470442 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 5470343  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  5470342 tgatgctatcaaaagcttcttg 5470321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 28025035 - 28024615
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| || || || |    
T  28025035 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaacaacatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgctttct 28024937  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28024936 caaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 28024837  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28024836 agtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaattggtgaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 28024737  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  28024736 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattct 28024637  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  28024636 tgatgctatcaaaagcctcttg 28024615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 48469680 - 48469260
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || |    
T  48469680 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgcgcaatctttccagtaacggccgctttct 48469582  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  48469581 caaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 48469482  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  48469481 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 48469382  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48469381 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 48469282  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  48469281 tgatgctatcaaaagcttcttg 48469260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 6539249 - 6539669
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || |    
T  6539249 gaatgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttccccgtaacggccgctttct 6539347  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6539348 caaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcacaaca 6539447  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||     
T  6539448 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccg 6539547  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6539548 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 6539647  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  6539648 tgatgctatcaaaagcttcttg 6539669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 8000313 - 7999893
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || |    
T  8000313 gaatgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttct 8000215  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8000214 caaagatatactttattggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcacaaca 8000115  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  8000114 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacca 8000015  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8000014 agtacacatcccatggattcgtcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 7999915  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  7999914 tgatgctatcaaaagcttcttg 7999893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 31960962 - 31961382
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || |    
T  31960962 gaatgctgtctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttct 31961060  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31961061 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcacaaca 31961160  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  31961161 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacca 31961260  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31961261 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaagaataggtggttccagcaggtaattct 31961360  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  31961361 tgatgctatcaaaagcttcttg 31961382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 10646826 - 10646406
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || |    
T  10646826 gaatgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttct 10646728  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10646727 caaagatatactttattggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcacaaca 10646628  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  10646627 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacca 10646528  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10646527 agtacacatctcatggattcgtcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 10646428  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  10646427 tgatgctatcaaaagcttcttg 10646406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 16620997 - 16621417
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  || |    
T  16620997 gaatgctacctttgattgc-tttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatctgccagcgtgcaatcttcctagtaacagcaggtttct 16621095  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  | |||||||||||    
T  16621096 cgaagatatactttatctgatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaagcgtttggcggcccagaccagagcacaaca 16621195  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16621196 agtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcagtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 16621295  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16621296 agtacgcatcccacggattcatcaaacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttctagcaggtaattct 16621395  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||| ||||    
T  16621396 tgatgctatcaaaagctccttg 16621417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 17981456 - 17981876
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  17981456 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 17981554  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  17981555 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 17981654  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17981655 agtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtaaatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 17981754  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17981755 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattct 17981854  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  17981855 tgatgctatcaaaagcttcttg 17981876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 22867355 - 22867775
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || |    
T  22867355 gaatgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttct 22867453  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22867454 caaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagtgcacaaca 22867553  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||  || | |||||||||||||    
T  22867554 agtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgctctttctttccggttttatcttgttgacca 22867653  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22867654 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 22867753  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  22867754 tgatgctatcaaaagcttcttg 22867775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 22882414 - 22882834
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || |    
T  22882414 gaatgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttct 22882512  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22882513 caaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagtgcacaaca 22882612  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||  || | |||||||||||||    
T  22882613 agtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgctctttctttccggttttatcttgttgacca 22882712  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22882713 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 22882812  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  22882813 tgatgctatcaaaagcttcttg 22882834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 11106866 - 11107279
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  11106866 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 11106964  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| || | |||||||||    
T  11106965 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagaggcccaggccaaagcacaaca 11107064  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  11107065 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaatttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgacca 11107164  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||||||       |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  11107165 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttccttcca-------gacaaggataggtggttccaacaagtaattct 11107257  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  11107258 tgatgctatcaaaagcttcttg 11107279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 90 - 419
Target Start/End: Original strand, 17992526 - 17992855
Alignment:
Q  90 agcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagct 189  Q
    |||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17992526 agcagctttctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagct 17992625  T
Q  190 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17992626 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 17992725  T
Q  290 cttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccag 389  Q
    || ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17992726 ctcgttgaccgagcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccag 17992825  T
Q  390 caggtaattcttgatactatcaaaagcttc 419  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17992826 caggtaattcttgatgctatcaaaagcttc 17992855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 5653838 - 5653573
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  5653838 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcacctgtcagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttct 5653740  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||| ||||    
T  5653739 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaagcgtttagcggcccaggccagagcataaca 5653640  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagca 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  5653639 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgagcttcttgcttagatagtagatagca 5653573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 40 - 299
Target Start/End: Original strand, 11924903 - 11925162
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    |||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||| | ||||| | ||| | ||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  11924903 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcctggatatcaacc 11925002  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||    
T  11925003 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 11925102  T
Q  240 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  11925103 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 11925162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22960168 - 22959909
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    |||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||| | ||||| | ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  22960168 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 22960069  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| || || ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||    
T  22960068 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagttaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 22959969  T
Q  240 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  22959968 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 22959909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 299
Target Start/End: Original strand, 7088592 - 7088831
Alignment:
Q  60 catctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaa 159  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||| | ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  7088592 catctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaaccaagttgtatgattaatcata 7088691  T
Q  160 taatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagt 259  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||||||||||| |||| |||||    
T  7088692 taatgacggagacgcttggcagcccaggctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaacttcttactcaaatagt 7088791  T
Q  260 agatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 299  Q
    ||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  7088792 agatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 7088831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16432120 - 16431861
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    |||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||| | ||||| | ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  16432120 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 16432021  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  |  || || |  ||||| || ||    
T  16432020 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagagtatcgggactcacaatcagt 16431921  T
Q  240 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| | || ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  16431920 gaacttcttactcaaatagtagataacgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 16431861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 40 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 6572069 - 6571792
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    |||||||| || ||||| | ||| |||||||| || ||| | ||||| | ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  6572069 atatcatactcggacaataacatttgccagcgagcgatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgattggatccatcttggatatcaacc 6571970  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| || || ||||| ||||| || | |||||||||||| |||||||| |  | ||| ||||  ||||| || ||    
T  6571969 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcggcccaggccaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgagactcacaatcagt 6571870  T
Q  240 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 317  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| | ||| || ||||||||    
T  6571869 gaacttcttactcaaatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacctaacacacagcccatgga 6571792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 35 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15705193 - 15704911
Alignment:
Q  35 acacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatat 134  Q
    |||| |||||||| || || || | |||||||||||| |||||| | || || | ||| | ||| ||||| |||||||| || || |||||  |||||||    
T  15705193 acacgatatcatactcggataataacatctgccagcgagcaatccttccggttaaagctggcttctcaaatatgtacttgattgggtccatcttggatat 15705094  T
Q  135 caaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacag 234  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||| || || ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |  |  || || |  |||||     
T  15705093 caaccaagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaggctaaagcacaacaagttttctcaagtacagagtatcgggactcacaa 15704994  T
Q  235 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 317  Q
    || ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||| || ||||||||    
T  15704993 tcagtgaatttcttactcaaatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgacctaacacacagcccatgga 15704911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15919234 - 15919021
Alignment:
Q  38 caatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaa 137  Q
    |||||||||| || ||||| | ||||||||| || |||||| ||||  | | ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  15919234 caatatcatactcggacaataacatctgccaccgggcaatcctccctttcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttggatatcaa 15919135  T
Q  138 ccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcg 237  Q
    |||||| |||||| | | || ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||| |||||||||     
T  15919134 ccaagtagtatgactaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggccagagcacaacaagtcctctcaagcatggaatagcgagattcacagtca 15919035  T
Q  238 gtgaacttcttgct 251  Q
    || ||||| |||||    
T  15919034 gtaaactttttgct 15919021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 35 - 374
Target Start/End: Original strand, 6962973 - 6963312
Alignment:
Q  35 acacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaat-cttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggata 133  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||   |||| || | ||| ||||| | |||||| |||||||||||| ||||||    
T  6962973 acacaatatcatattcagacaataacatctgccaacgagcaattcttcctgttaac-gccggcttctcaaaaaggtacttgatcggatccattttggata 6963071  T
Q  134 tcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcaca 233  Q
    |||||||||| || || |  ||||  || ||||| || || || || ||||| || | ||| |||||||| ||||||||||| | ||| || |  |||||    
T  6963072 tcaaccaagtagtgtggtaaaccatgtagtgacggagacgcttagcggcccatgccaaagcgcaacaagttttctcaagcatagaatatcgggactcaca 6963171  T
Q  234 gtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgac 333  Q
     || || |||||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | |    
T  6963172 atcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttctttccagtttcgtcttgttgaccaagcacgcagcccatagaatcatccaacacagtc 6963271  T
Q  334 aaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaag 374  Q
    || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  6963272 aagtacatgatcaaaggccttccttcaactggagggacaag 6963312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 296
Target Start/End: Original strand, 15592454 - 15592712
Alignment:
Q  38 caatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaa 137  Q
    |||||||||| || || || ||||||||||| || | |||| |||| || | ||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||     
T  15592454 caatatcatactcggataatagcatctgccaccgggaaatcctccctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgatcggatccattttagatatcag 15592553  T
Q  138 ccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcg 237  Q
    |||||| |||||| | | || ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||| ||||| |||     
T  15592554 ccaagtagtatgactaatcatataatgacggaggcgtttggcaacccaggctagagcacaacaagtcctctcaagcatggaatagcgagattcaccgtca 15592653  T
Q  238 gtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttg 296  Q
    || ||||||||||| | ||| || || || || || ||  ||||||| |||||||||||    
T  15592654 gtaaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcctttcttctagtttcatcttgttg 15592712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 17973368 - 17973460
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcag 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17973368 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcag 17973460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20443834 - 20443555
Alignment:
Q  38 caatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaa 137  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||| || |||||  | || || | |||||  || |||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||    
T  20443834 caatatcatattcggataataacatctgccaccgggcaattcttcctgtcaaagcaggtttctcaaagatgtacttgatcggatccatcttagatatcaa 20443735  T
Q  138 ccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcg 237  Q
    |||||| |||||| | | || ||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| | ||| |||| |||||||||     
T  20443734 ccaagtagtatgactaatcatatagtgacggagacgtttagcagcccaggctagtgcgcaacaagtcttctcgagcatggaatagcgagattcacagtca 20443635  T
Q  238 gtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 317  Q
    || ||||||||||||| ||| || || ||||| || ||  ||| ||| || |||||||| || ||||| || ||||||||    
T  20443634 gtaaacttcttgctcaaataataaatggcatgctcctttcttccagtttcgtcttgttgtccgagcacacaacccatgga 20443555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 317
Target Start/End: Original strand, 5950347 - 5950624
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||| | || || | ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||| || ||    
T  5950347 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 5950446  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    |||| || ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || ||    
T  5950447 aagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacacgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 5950546  T
Q  240 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 317  Q
     ||||||||||| | ||| || || || || |||||  |||  || ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  5950547 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatgga 5950624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 46381049 - 46380673
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||| | || || | ||| |  || ||||| ||||| || || ||||||||| | |||| || ||    
T  46381049 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggtttctcaaatatgtatttgattggatccattttagataccagcc 46380950  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    |||| || || || | || ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || ||    
T  46380949 aagtagtgtggttaatcatataatgacggaggcgcttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 46380850  T
Q  240 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatac 339  Q
     ||||||||||| | ||| || || || || |||||  |||  || ||||||||||| || ||||| || |||||||| || || ||||| |  |  |||    
T  46380849 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaatcttctaacaccgttaggtac 46380750  T
Q  340 aaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatactatcaaaagc 416  Q
    |  |||||||| |||||||| || || ||||  || || |||||||| |||| ||| ||||| || || ||||||||    
T  46380749 atgatcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagc 46380673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 251
Target Start/End: Original strand, 37260254 - 37260465
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||| || |||||| | || || | ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||| || ||    
T  37260254 atatcatattcagatagtagcatttgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 37260353  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    |||| |  ||||| |  | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || ||    
T  37260354 aagtagcgtgattaattatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtatcgagattcacattcagt 37260453  T
Q  240 gaacttcttgct 251  Q
     |||||||||||    
T  37260454 aaacttcttgct 37260465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 4450430 - 4450363
Alignment:
Q  100 tcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacg 167  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||| ||| |||||    
T  4450430 tcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatcaaccaagtagtgtgattaaccatatagtgacg 4450363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 359; Significance: 0; HSPs: 47)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 2777043 - 2776626
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  2777043 gaatgctacctttgattgcctttt-gagctttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttct 2776945  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2776944 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 2776845  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2776844 agtcttcgcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 2776745  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2776744 agcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 2776645  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  2776644 tgatgctatcaaaagcttc 2776626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 31127696 - 31127279
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  31127696 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttct 31127598  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31127597 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcatcaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 31127498  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  31127497 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgacca 31127398  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31127397 agcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 31127298  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  31127297 tgatgctatcaaaagcttc 31127279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 26512045 - 26512462
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  26512045 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttct 26512143  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26512144 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaatcaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 26512243  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  26512244 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgaccg 26512343  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26512344 agcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 26512443  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  26512444 tgatgctatcaaaagcttc 26512462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 26681455 - 26681872
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  26681455 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgcccgcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttct 26681553  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26681554 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 26681653  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  26681654 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgaccg 26681753  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26681754 agcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 26681853  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  26681854 tgatgctatcaaaagcttc 26681872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 39209488 - 39209905
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  39209488 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttct 39209586  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39209587 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaatcaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 39209686  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  39209687 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgaccg 39209786  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39209787 agcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaagtaattct 39209886  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  39209887 tgatgctatcaaaagcttc 39209905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 45391009 - 45390589
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  45391009 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 45390911  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45390910 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 45390811  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  45390810 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 45390711  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45390710 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 45390611  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  45390610 tgatgctatcaaaagcttcttg 45390589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 4203178 - 4202758
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  4203178 gaatgctacctttgatggcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 4203080  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4203079 caaagatatatttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 4202980  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  4202979 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 4202880  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4202879 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattct 4202780  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  4202779 tgatgctatcaaaagcttcttg 4202758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 16747866 - 16748286
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  16747866 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 16747964  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16747965 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 16748064  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16748065 agtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 16748164  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||    
T  16748165 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataactct 16748264  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  16748265 tgatgctatcaaaagcttcttg 16748286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 423
Target Start/End: Original strand, 10913218 - 10913639
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  10913218 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 10913316  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  10913317 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 10913416  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10913417 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 10913516  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10913517 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 10913616  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttga 423  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  10913617 tgatgctatcaaaagcttcttga 10913639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 26666263 - 26666683
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  26666263 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtgacagcagctttct 26666361  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26666362 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 26666461  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  26666462 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 26666561  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26666562 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggttccagcaggtaattct 26666661  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  26666662 tgatgctatcaaaagcttcttg 26666683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 423
Target Start/End: Original strand, 11421128 - 11421549
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  11421128 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 11421226  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  11421227 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaaca 11421326  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11421327 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 11421426  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11421427 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 11421526  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttga 423  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  11421527 tgatgctatcaaaagcttcttga 11421549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 2158363 - 2157943
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  2158363 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 2158265  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  2158264 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 2158165  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2158164 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 2158065  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2158064 agtacgcatcccatggactcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 2157965  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  2157964 tgatgctatcaaaagcttcttg 2157943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 416
Target Start/End: Original strand, 16446357 - 16446769
Alignment:
Q  3 atgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttca 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||    
T  16446357 atgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaataccatattcagacaagagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttctca 16446455  T
Q  103 aagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaag 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||    
T  16446456 aagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttaacggcccaggccagagcacaacaag 16446555  T
Q  203 tcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaag 302  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16446556 tcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaag 16446655  T
Q  303 cacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttg 402  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446656 tacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttg 16446755  T
Q  403 atactatcaaaagc 416  Q
    || |||||||||||    
T  16446756 atgctatcaaaagc 16446769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 26316197 - 26316617
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  26316197 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 26316295  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26316296 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 26316395  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  26316396 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgacca 26316495  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26316496 agtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattct 26316595  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  26316596 tgatgctatcaaaagcttcttg 26316617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 423
Target Start/End: Original strand, 5143689 - 5144110
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |    
T  5143689 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggctgctttct 5143787  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5143788 caaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 5143887  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5143888 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 5143987  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5143988 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 5144087  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttga 423  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  5144088 tgatgctatcaaaagcttcttga 5144110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 16514779 - 16515199
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  16514779 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 16514877  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  16514878 caaagatatactttatcggatctattctggatatcaaccacgttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaaca 16514977  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16514978 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 16515077  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16515078 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 16515177  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||| ||||||    
T  16515178 tgatgctatcaaaagattcttg 16515199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 423
Target Start/End: Original strand, 2106512 - 2106933
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  2106512 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttct 2106610  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  2106611 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 2106710  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2106711 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 2106810  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2106811 attacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 2106910  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttga 423  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  2106911 tgatgctatcaaaagcttcttga 2106933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 26271435 - 26271855
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| || |    
T  26271435 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttcccgtaacaacagctttct 26271533  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26271534 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 26271633  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  26271634 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgacca 26271733  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26271734 agtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 26271833  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||| ||||||||    
T  26271834 tgatgctatcaaaggcttcttg 26271855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 4141595 - 4142015
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |    
T  4141595 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagccgctttct 4141693  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  4141694 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtgtgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 4141793  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  4141794 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 4141893  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4141894 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 4141993  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  4141994 tgatgctatcaaaagcttcttg 4142015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 5131785 - 5131365
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |    
T  5131785 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcctagtaacagcagctttct 5131687  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| | || |||||||||||    
T  5131686 caaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacacaggcgtttagcggcctaggccagagcacaaca 5131587  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5131586 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 5131487  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5131486 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggcctcccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 5131387  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  5131386 tgatgctatcaaaagcttcttg 5131365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 10845409 - 10844989
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  || |    
T  10845409 gaatgctacctttgattgc-tttttgagccttgaacacaatgtcatattcggacaagagcatttgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcaggtttct 10845311  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  10845310 cgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcacaaca 10845211  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10845210 agtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 10845111  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10845110 agtacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttacagcaggtaattct 10845011  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  10845010 tgatgctatcaaaagcttcttg 10844989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 26534222 - 26534642
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  26534222 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 26534320  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  26534321 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 26534420  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  26534421 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcaccatcggtgaatttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacca 26534520  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26534521 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 26534620  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  26534621 tgatgctatcaaaagcttcttg 26534642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 31086971 - 31087391
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  31086971 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacagaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 31087069  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  31087070 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 31087169  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  31087170 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 31087269  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  31087270 agtacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggatagggggctccagcaggtaattct 31087369  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  31087370 tgatgctatcaaaagcttcttg 31087391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 31560739 - 31561159
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || |    
T  31560739 gaatgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttct 31560837  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31560838 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 31560937  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  31560938 agtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacca 31561037  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31561038 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 31561137  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  31561138 tgatgctatcaaaagcttcttg 31561159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 22145984 - 22145564
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  22145984 gaatgctacctttgattgcctttc-gagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 22145886  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  22145885 caaagatatactttatcggatccattatggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 22145786  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22145785 agtcttctcgagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgacca 22145686  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22145685 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 22145586  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  22145585 tgatgctatcaaaagcttcttg 22145564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 16045104 - 16044688
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  16045104 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctaccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 16045006  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||   |||    
T  16045005 caaagatatactttatcgaatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaagccagagc---aca 16044909  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16044908 agtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 16044809  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16044808 agtacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacataatcaaagg-cttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattct 16044710  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||| |||||| |||||    
T  16044709 tgatgctattaaaagcctcttg 16044688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 11444676 - 11444256
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  11444676 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 11444578  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  11444577 cgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtgtgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 11444478  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  11444477 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgctctttctttccggtttcatcttgttgacca 11444378  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11444377 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 11444278  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  11444277 tgatgctatcaaaagcttcttg 11444256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 45735096 - 45734682
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  45735096 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 45734998  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    |||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  45734997 caaagata------atcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 45734904  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45734903 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 45734804  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45734803 agcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggtcttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 45734704  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  45734703 tgatgctatcaaaagcttcttg 45734682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3449095 - 3448675
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
T  3449095 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtgacggcagctttct 3448997  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  3448996 cgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtgtgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 3448897  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  3448896 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcctgttgacca 3448797  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3448796 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 3448697  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  3448696 tgatgctatcaaaagcttcttg 3448675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 10842343 - 10842763
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  || |    
T  10842343 gaatgctacctttgattgc-tttttgagccttgaacacaatgtcatattcggacaagagcatttgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcaggtttct 10842441  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  10842442 cgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcacaaca 10842541  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  10842542 agtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacct 10842641  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |  ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10842642 attacgcaccccacagattcatcaaacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattct 10842741  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||| ||||    
T  10842742 tgatgctatcaaaagctccttg 10842763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 26439046 - 26438626
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || |    
T  26439046 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttct 26438948  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  26438947 caaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 26438848  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26438847 agtcttctcgagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatggcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 26438748  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  26438747 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataattct 26438648  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  26438647 tgatgctatcaaaagcttcttg 26438626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 26516581 - 26516161
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| |||||||| || || || |    
T  26516581 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacagaagcatctgccatcgtgcaatctttccagtaacggccgctttct 26516483  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  26516482 caaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 26516383  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  26516382 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccg 26516283  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26516282 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattct 26516183  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  26516182 tgatgctatcaaaagcttcttg 26516161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 24588883 - 24589303
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  24588883 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 24588981  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  24588982 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 24589081  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  24589082 agtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtaaatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 24589181  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  24589182 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgattccaacaagtaattct 24589281  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  24589282 tgatgctatcaaaagcttcttg 24589303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 5162172 - 5161907
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  5162172 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcacctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttct 5162074  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  5162073 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaaca 5161974  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagca 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5161973 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagca 5161907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 40 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 29090267 - 29090008
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    |||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||| | ||||| | ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  29090267 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 29090168  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||    
T  29090167 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 29090068  T
Q  240 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  29090067 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 29090008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 2557286 - 2557027
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    |||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||| | ||||| | ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  2557286 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 2557187  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||    
T  2557186 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 2557087  T
Q  240 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||  || || |||||||||||    
T  2557086 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcgtcttgttgacc 2557027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 299
Target Start/End: Original strand, 16127225 - 16127464
Alignment:
Q  60 catctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaa 159  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||| | ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  16127225 catctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaaccaagttgtatgattaatcata 16127324  T
Q  160 taatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagt 259  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||||||||||| |||| |||||    
T  16127325 taatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaacttcttactcaaatagt 16127424  T
Q  260 agatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 299  Q
    ||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  16127425 agatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 16127464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15193834 - 15193575
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    |||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||| | ||||| | ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  15193834 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 15193735  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |  | ||| || |  ||||| || ||    
T  15193734 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaaatacagaatatcgggactcacaatcagt 15193635  T
Q  240 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||| |  || ||||||||||||||    
T  15193634 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttcttcccggtttcatcttgttgacc 15193575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25727252 - 25726929
Alignment:
Q  35 acacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatat 134  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||  | || || | ||| | ||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||    
T  25727252 acacaatatcatactcagacaataacatctgccagcgagcaattcttcctgttaaagccggcttctcaaaaatgtacttgatcgggtccattttggacat 25727153  T
Q  135 caaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacag 234  Q
    ||||||||| || ||||| ||||  || ||||| ||  | || |||||||| || | ||| |||||||| |||||||| |  | ||| || |  |||||     
T  25727152 caaccaagtagtgtgattaaccatgtagtgacggagatgcttagcagcccatgcaa-agcgcaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaa 25727054  T
Q  235 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgaca 334  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| | ||    
T  25727053 tcagtgaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccaagcacacagcccatagaatcatctaacacagtca 25726954  T
Q  335 aatacaaaatcaaaggccttccttc 359  Q
    ||||||  ||||| |||||||||||    
T  25726953 aatacatgatcaacggccttccttc 25726929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 40 - 416
Target Start/End: Original strand, 30369333 - 30369709
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||| | || || | ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||| || ||    
T  30369333 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 30369432  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    |||| || ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || ||    
T  30369433 aagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacacgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 30369532  T
Q  240 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatac 339  Q
     ||||||||||| | ||| || || || || |||||  |||  || ||||||||||| || ||||| || |||||||| |  || |||||||  |  |||    
T  30369533 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaattttctaacactgttaggtac 30369632  T
Q  340 aaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatactatcaaaagc 416  Q
    |  |||||||| |||||||| || || ||||  || || |||||||| |||| ||| ||||| || || ||||||||    
T  30369633 atgatcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagc 30369709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 100 - 317
Target Start/End: Original strand, 797970 - 798187
Alignment:
Q  100 tcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaac 199  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||| | | || ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  797970 tcaaagatgtacttgatcggatccatcctagatatcaaccaagtagtatgactaatcatatagtgacggaggcgtttggcggcccaggctagtgcgcaac 798069  T
Q  200 aagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 299  Q
    | |||||||| | ||| | ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| || || ||||| || ||  ||| ||| || |||||||| ||    
T  798070 aggtcttctcgaccatggaatagcgagattcacaatcggtaaacttcttgctcaaataataaatggcatgctcctttcttccagtttcgtcttgttgtcc 798169  T
Q  300 aagcacgcatcccatgga 317  Q
     ||||| || ||||||||    
T  798170 gagcacacaacccatgga 798187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 317
Target Start/End: Original strand, 16392821 - 16393098
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||| | || || | ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||| || ||    
T  16392821 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 16392920  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    |||| || ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || ||    
T  16392921 aagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacacgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 16393020  T
Q  240 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatgga 317  Q
     ||||||||||| | ||| || || || || |||||  |||  || ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  16393021 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatgga 16393098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 100 - 374
Target Start/End: Original strand, 1893022 - 1893296
Alignment:
Q  100 tcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaac 199  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||| || || || |||||||| || | ||| ||||    
T  1893022 tcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatcaaccaagtagtgtgattaaccatatagtgacgaagacgcttagcagcccatgccaaagcgcaac 1893121  T
Q  200 aagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 299  Q
    | || ||||||||||| | ||| || |  ||||| || || |||||||| ||||  ||||| || |  || |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  1893122 aggttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggtgtgctctttctttccagtctcgtcttgttgacc 1893221  T
Q  300 aagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaag 374  Q
     | ||| || ||||| || || || ||||| | ||||||||  ||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  1893222 caacacacagcccatagaatcttctaacacagtcaaatacatgatcaaaggcctcccttcgaccggagggacaag 1893296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 9470071 - 9469695
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||| | || || | ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||| || ||    
T  9470071 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 9469972  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    | || || ||||| | || ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || ||    
T  9469971 acgtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtctggcagcccaggctagagcacaacacgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 9469872  T
Q  240 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatac 339  Q
     ||||||||||| | ||| || || || || |||||  |||  || ||||||||||| || ||||| || |||||||| |  || |||||||  |  |||    
T  9469871 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaattttctaacactgttaggtac 9469772  T
Q  340 aaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatactatcaaaagc 416  Q
    |  |||||||| |||||||| || || ||||  || || |||||||| |||| ||| ||||| || || ||||||||    
T  9469771 atgatcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagc 9469695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 317
Target Start/End: Original strand, 16286826 - 16287043
Alignment:
Q  100 tcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaac 199  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||  | ||||||||||| || |||||| | | || ||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  16286826 tcaaagacgtacttgatcggatccatcttagatatcaaccatgtagtatgactaatcatatagtggcggaggcgttttgcagcccaggctagtgcacaac 16286925  T
Q  200 aagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 299  Q
    | || ||||| ||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| || || ||||| || ||  |||  || ||||||||||| ||    
T  16286926 aggttttctcgagcatgggatagcgagattcacagtcagtaaacttcttgctcaaataataaatggcatgctcctttcttccggtttcatcttgttgtcc 16287025  T
Q  300 aagcacgcatcccatgga 317  Q
     ||||| || ||||||||    
T  16287026 gagcacacaacccatgga 16287043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 179 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16238093 - 16237975
Alignment:
Q  179 cagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctt 278  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| || | ||| || |  ||||| || ||||||||||| |||| |||| ||||||| || ||||||||    
T  16238093 cagcccaggctaaagcacaacaagttttctcaagtatagaatatcgggactcacaatcagtgaacttcttactcaaataggagatagcgtgctctttctt 16237994  T
Q  279 tctagtctcatcttgttga 297  Q
    ||  || ||||||||||||    
T  16237993 tccggtttcatcttgttga 16237975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16238221 - 16238112
Alignment:
Q  35 acacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatat 134  Q
    ||||||||||||| || ||||| | ||||||||| || |||||| | ||||| | ||  | ||| ||||| |||||||| || ||||||||  |||||||    
T  16238221 acacaatatcatactcggacaataacatctgccatcgagcaatccttccagttaaagttggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatat 16238122  T
Q  135 caaccaagtt 144  Q
    ||||||||||    
T  16238121 caaccaagtt 16238112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 359; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 28153530 - 28153113
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  28153530 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttct 28153432  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28153431 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 28153332  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28153331 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 28153232  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28153231 agcacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 28153132  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  28153131 tgatgctatcaaaagcttc 28153113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 10948871 - 10948451
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  10948871 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 10948773  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10948772 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 10948673  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10948672 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 10948573  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10948572 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 10948473  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  10948472 tgatgctatcaaaagcttcttg 10948451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 417
Target Start/End: Original strand, 16204498 - 16204913
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  16204498 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatcttccagcgggcaatctttccagtaacagcagctttct 16204596  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||    
T  16204597 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcctaggccagagcacaaca 16204696  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16204697 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 16204796  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16204797 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 16204896  T
Q  401 tgatactatcaaaagct 417  Q
    |||| ||||||||||||    
T  16204897 tgatgctatcaaaagct 16204913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 10966459 - 10966039
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  10966459 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 10966361  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10966360 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 10966261  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  10966260 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgacca 10966161  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10966160 agtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattct 10966061  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  10966060 tgatgctatcaaaagcttcttg 10966039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 51642012 - 51641595
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  51642012 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacagtatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 51641914  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51641913 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatggttcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 51641814  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51641813 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcatcttgttgacca 51641714  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51641713 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 51641614  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  51641613 tgatgctatcaaaagcttc 51641595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 28588779 - 28588359
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || || |    
T  28588779 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagataaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgctttct 28588681  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28588680 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 28588581  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  28588580 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacca 28588481  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28588480 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 28588381  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  28588380 tgatgctatcaaaagcttcttg 28588359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 3644930 - 3644509
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || || |    
T  3644930 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaatacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgctttct 3644832  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3644831 caaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 3644732  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgag-tttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3644731 agtcttctcaagcattgtataccgagttttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacc 3644632  T
Q  300 aagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattc 399  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  3644631 aagtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattc 3644532  T
Q  400 -ttgatactatcaaaagcttctt 421  Q
     ||||| ||||||||||||||||    
T  3644531 tttgatgctatcaaaagcttctt 3644509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 41789774 - 41790194
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |    
T  41789774 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgctttct 41789872  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  41789873 caaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgcttagcagcccaagctagagcacaaca 41789972  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  41789973 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 41790072  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41790073 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattct 41790172  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  41790173 tgatgctatcaaaagcttcttg 41790194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 21894212 - 21894633
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || || |    
T  21894212 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaatagcatctgccagcgtgcaaccttcccagtaacagccgctttct 21894310  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||    
T  21894311 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgcttagcggcccaggccagagcacaaca 21894410  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagca-tgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 299  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  21894411 agtcctctcaaacattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcagtgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 21894510  T
Q  300 aagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21894511 aagcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattc 21894610  T
Q  400 ttgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  21894611 ttgatgctatcaaaagcttcttg 21894633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 20464770 - 20464350
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |    
T  20464770 gaatgctacctttgattgc-tttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcaggtttct 20464672  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||    
T  20464671 cgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcattttgcggcccaggccagagcacaaca 20464572  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20464571 agtcttttcaagtatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 20464472  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20464471 agtacgcatcccacggattcatcaaacactgacaaatacataattaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtgtttccagcaggtaattct 20464372  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||| ||||    
T  20464371 tgatgctatcaaaagctccttg 20464350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 20336880 - 20337142
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  20336880 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagataagagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 20336978  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  20336979 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcacaaca 20337078  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagata 264  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20337079 agttttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagata 20337142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 422
Target Start/End: Original strand, 20339024 - 20339185
Alignment:
Q  261 gatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttcc 360  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20339024 gatagcatgttctttctttcaagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccacggattcatcaaacattgacaaatacataatcaaaggccttccttcc 20339123  T
Q  361 acgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  20339124 acgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttg 20339185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22489782 - 22489458
Alignment:
Q  35 acacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatat 134  Q
    |||| |||||||| || ||||| | ||||||||| || |||||| | ||||| | ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||  |||||||    
T  22489782 acacgatatcatactcggacaataacatctgccatcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgattggatccatcttggatat 22489683  T
Q  135 caaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacag 234  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||| || || ||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||| | || ||| || |  |||||     
T  22489682 caaccaagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaggctaaatcacaacaagttttctcaagtactgaatatcgggactcacaa 22489583  T
Q  235 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgaca 334  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||| || | ||| || |||||||| ||  | || ||||  |    
T  22489582 tcagtgaacttcttactcagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttggcccaacacacagcccatggaatctcccaatactgtta 22489483  T
Q  335 aatacaaaatcaaaggccttccttc 359  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||    
T  22489482 aatacatgatcaaaggtcttccttc 22489458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 416
Target Start/End: Original strand, 5628500 - 5628876
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||| | || || | ||| |  || ||||| |||||||| || ||||||||| | |||| || ||    
T  5628500 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggtttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 5628599  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    |||| || || || | || ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || ||    
T  5628600 aagtagtgtggttaatcatataatgacggaggcgcttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 5628699  T
Q  240 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatac 339  Q
     ||||||||||| | ||| || || || || |||||  |||  || ||||||||||| || ||||| || |||||||| || || ||||| |  |  |||    
T  5628700 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaatcttctaacaccgttaggtac 5628799  T
Q  340 aaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatactatcaaaagc 416  Q
    |  |||||||| |||||||| || || ||||  || || |||||||| |||| ||| ||||| || || ||||||||    
T  5628800 atgatcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagc 5628876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 354; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 22655 - 23075
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  22655 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacagaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 22753  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22754 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 22853  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22854 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 22953  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22954 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 23053  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  23054 tgatgctatcaaaagcttcttg 23075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 354; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 7752 - 7332
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  7752 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 7654  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7653 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 7554  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  7553 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgacca 7454  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7453 agtacacatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattct 7354  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  7353 tgatgctatcaaaagcttcttg 7332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 31085 - 30665
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |    
T  31085 gaatgctacctttgattgcctttt-gagccttgaacacaatgtcatattcggacaagagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcaggtttct 30987  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  30986 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaaca 30887  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30886 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 30787  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30786 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 30687  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  30686 tgatgctatcaaaagcttcttg 30665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 19862 - 19442
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  || |    
T  19862 gaatgctacctttgattgc-tttttgagccttgaacacaatgtcatattcggacaagagcatttgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcaggtttct 19764  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  19763 cgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcacaaca 19664  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19663 agtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 19564  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19563 agtacgcatcccacagattcatcaaacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattct 19464  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||| ||||    
T  19463 tgatgctatcaaaagctccttg 19442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 354; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 27159781 - 27160201
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  27159781 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 27159879  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27159880 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 27159979  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27159980 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 27160079  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27160080 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 27160179  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  27160180 tgatgctatcaaaagcttcttg 27160201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 1904059 - 1903639
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  1904059 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 1903961  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  1903960 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcacaaca 1903861  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1903860 agtcttttcaagcatcatataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 1903761  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1903760 agtacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 1903661  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||| ||||    
T  1903660 tgatgctatcaaaagctccttg 1903639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 31122976 - 31123396
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  31122976 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 31123074  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31123075 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 31123174  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  31123175 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 31123274  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31123275 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 31123374  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  31123375 tgatgctatcaaaagcttcttg 31123396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 21973506 - 21973086
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  21973506 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 21973408  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21973407 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 21973308  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  21973307 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 21973208  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21973207 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 21973108  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  21973107 tgatgctatcaaaagcttcttg 21973086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 54837196 - 54836776
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  54837196 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 54837098  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54837097 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 54836998  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  54836997 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgacca 54836898  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54836897 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 54836798  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  54836797 tgatgctatcaaaagcttcttg 54836776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 423
Target Start/End: Original strand, 34185424 - 34185845
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  34185424 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 34185522  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||    
T  34185523 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttatcggcccaggccagagcacaaca 34185622  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34185623 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 34185722  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34185723 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 34185822  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttga 423  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  34185823 tgatgctatcaaaagcttcttga 34185845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 14759770 - 14760190
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  14759770 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 14759868  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  14759869 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 14759968  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14759969 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 14760068  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14760069 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 14760168  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  14760169 tgatgctatcaaaagcttcttg 14760190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 36340981 - 36341401
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |    
T  36340981 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgctttct 36341079  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36341080 caaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 36341179  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  36341180 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcgtgttctttctttccagtttcatcttgttgaccc 36341279  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36341280 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 36341379  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  36341380 tgatgctatcaaaagcttcttg 36341401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 5009680 - 5009260
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  5009680 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 5009582  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5009581 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagccagagcacaaca 5009482  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5009481 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 5009382  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5009381 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattct 5009282  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  5009281 tgatgctatcaaaagcttcttg 5009260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 17016851 - 17016431
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  17016851 gaatgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 17016753  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  17016752 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaaca 17016653  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  17016652 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcctgttgacca 17016553  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17016552 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 17016453  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  17016452 tgatgctatcaaaagcttcttg 17016431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 40102101 - 40102521
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  40102101 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 40102199  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40102200 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 40102299  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  40102300 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 40102399  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40102400 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 40102499  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  40102500 tgatgctatcaaaagcttcttg 40102521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 6573663 - 6573243
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  6573663 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 6573565  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6573564 caaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaaactaaagcacaaca 6573465  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  6573464 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 6573365  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || || ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6573364 agtacacaacccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 6573265  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  6573264 tgatgctatcaaaagcttcttg 6573243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 18797078 - 18797498
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  18797078 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 18797176  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797177 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccacgttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 18797276  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  18797277 agtcttctcgagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgtcca 18797376  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18797377 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtacttct 18797476  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  18797477 tgatgctatcaaaagcttcttg 18797498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 20334885 - 20335305
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  20334885 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 20334983  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || | |||||||||    
T  20334984 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggaggcccaggccaaagcacaaca 20335083  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  20335084 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgacca 20335183  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20335184 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttctacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 20335283  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  20335284 tgatgctatcaaaagcttcttg 20335305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 24116467 - 24116047
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  24116467 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttct 24116369  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  24116368 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 24116269  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24116268 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 24116169  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24116168 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggttccagcaggtaattct 24116069  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  24116068 tgatgctatcaaaagcttcttg 24116047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 30757565 - 30757145
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |    
T  30757565 gaatgctacctttgattgcctttt-gagctttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtgacagcagctttct 30757467  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30757466 cgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 30757367  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  30757366 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgacca 30757267  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30757266 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 30757167  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  30757166 tgatgctatcaaaagcttcttg 30757145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 18313642 - 18314059
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  18313642 gaatgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttct 18313740  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  18313741 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaaca 18313840  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  18313841 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacca 18313940  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18313941 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 18314040  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  18314041 tgatgctatcaaaagcttc 18314059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 423
Target Start/End: Original strand, 24588825 - 24589246
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  24588825 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 24588923  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  24588924 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 24589023  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24589024 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagttatcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 24589123  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24589124 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattct 24589223  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttga 423  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  24589224 tgatgctatcaaaagcttcttga 24589246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 15231677 - 15231257
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| || |    
T  15231677 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgtgcaacctttccagtaacagcagctttct 15231579  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||    
T  15231578 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggtggcccaggccagagcacaaca 15231479  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15231478 agtcttttcaagcatcgtataacgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagataacatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 15231379  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15231378 agtacgcatcccacggattcattaaacactgacaaatacataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 15231279  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||| ||||    
T  15231278 tgatgctatcaaaagctccttg 15231257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 14668821 - 14668401
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |    
T  14668821 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatatttagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccggtaacagcagctttct 14668723  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  14668722 caaagatatactttatcggatccatcttggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcagacgtttagcggcccaggccagagcacaaca 14668623  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14668622 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 14668523  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14668522 agtacgcatcccatggattcatcaaatacttccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 14668423  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  14668422 tgatgctatcaaaagcttcttg 14668401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 39854442 - 39854022
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || || |    
T  39854442 gaatgctacccttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgctttct 39854344  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854343 cgaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 39854244  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  39854243 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccg 39854144  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  39854143 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataattct 39854044  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  39854043 tgatgctatcaaaagcttcttg 39854022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 14102348 - 14101931
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |    
T  14102348 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggcagctttct 14102250  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14102249 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 14102150  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  14102149 agtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacca 14102050  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14102049 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 14101950  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttc 419  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  14101949 tgatgctatcaaaagcttc 14101931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 33670264 - 33670684
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  33670264 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 33670362  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  33670363 cgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 33670462  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  33670463 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagataacatgttctttctttccagtttcatcttgttgacca 33670562  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33670563 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattct 33670662  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| || ||||||||||||||    
T  33670663 tgatgctgtcaaaagcttcttg 33670684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 15281401 - 15281821
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  || |    
T  15281401 gaatgctacctttgattgc-tttttgagccttgaacataatgtcatatttggacaagagcatttgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcaggtttct 15281499  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||  |||||    
T  15281500 cgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcttttggcggcccaggccagagagcaaca 15281599  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15281600 agtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 15281699  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15281700 agtacgcatcccacgaattcatcaaacactgacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaaatct 15281799  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||| ||||    
T  15281800 tgatgctatcaaaagctccttg 15281821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 109 - 419
Target Start/End: Original strand, 15387949 - 15388259
Alignment:
Q  109 tactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttct 208  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15387949 tacttgattggatccatcctggatatcaaccaagttgtatgattcatcaaatagtggcgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttct 15388048  T
Q  209 caagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgca 308  Q
    ||||||| ||||| || | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||| || || ||    
T  15388049 caagcatcgtatatcgggcttcgcagtcggtaaacttcttgctcaaatagtagatagcatgctctttctttccagtcttgtcttgttgaccgagtacaca 15388148  T
Q  309 tcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatacta 408  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||    
T  15388149 tcccatggattcatctaacactatcaagtacataatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgcta 15388248  T
Q  409 tcaaaagcttc 419  Q
    |||||||||||    
T  15388249 tcaaaagcttc 15388259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 40 - 299
Target Start/End: Original strand, 14725301 - 14725560
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||| | ||||| | ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  14725301 atatcatattcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 14725400  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||    
T  14725401 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 14725500  T
Q  240 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  14725501 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 14725560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19768106 - 19767847
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    |||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||| | ||||| | ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  19768106 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 19768007  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| |  || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||    
T  19768006 aagttgtatgattaatcatataatgacggaaacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 19767907  T
Q  240 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  19767906 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 19767847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 5698340 - 5698219
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  5698340 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 5698242  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatcc 123  Q
    ||||||| ||||| |||||||||    
T  5698241 caaagatatacttgatcggatcc 5698219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 359
Target Start/End: Original strand, 1881598 - 1881920
Alignment:
Q  37 acaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatca 136  Q
    ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || |||||  | || || | ||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  1881598 acaatatcatactcggacaataacatctgccaacgagcaattcttcctgttaaagccggcttctcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatca 1881697  T
Q  137 accaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtc 236  Q
    ||||||| || ||||| |||| ||||||||| || || || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| | ||| || |  ||||| ||    
T  1881698 accaagtagtgtgattaaccatataatgacgaagacgcttagcagcccatgccaaagcgcaacaggttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatc 1881797  T
Q  237 ggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaa 336  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||| || || || |||||||||| |||||| ||||||||||| | ||| || ||||| || || || ||||| | ||||    
T  1881798 ggtaaacttcttactcaagtagtaaatggcgtgctctttctttccagtctcgtcttgttgacccaacacacaacccatagaatcttctaacacagtcaaa 1881897  T
Q  337 tacaaaatcaaaggccttccttc 359  Q
    ||||  ||||||||||| |||||    
T  1881898 tacatgatcaaaggcctcccttc 1881920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 15384812 - 15384924
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || |    
T  15384812 gaatgctacctttgattgactttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttct 15384910  T
Q  101 caaagatgtacttt 114  Q
    ||||||| ||||||    
T  15384911 caaagatatacttt 15384924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 359
Target Start/End: Original strand, 22146066 - 22146390
Alignment:
Q  35 acacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaat-cttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggata 133  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||   |||| || | ||| ||||| | |||||| |||||||||||| ||||||    
T  22146066 acacaatatcatattcagacaataacatctgccaacgagcaattcttcctgttaac-gccggcttctcaaaaaggtacttgatcggatccattttggata 22146164  T
Q  134 tcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcaca 233  Q
    |||||||||| || || |  ||||  || ||||| || || || || ||||| || | ||| |||||||| ||||||||||| | ||| || |  |||||    
T  22146165 tcaaccaagtagtgtggtaaaccatgtagtgacggagacgcttagcggcccatgccaaagcgcaacaagttttctcaagcatagaatatcgggactcaca 22146264  T
Q  234 gtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgac 333  Q
     || || |||||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | |    
T  22146265 atcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttctttccagtttcgtcttgttgaccaagcacgcagcccatagaatcatccaacacagtc 22146364  T
Q  334 aaatacaaaatcaaaggccttccttc 359  Q
    || ||||  |||||||||||||||||    
T  22146365 aagtacatgatcaaaggccttccttc 22146390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12515939 - 12515725
Alignment:
Q  100 tcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaac 199  Q
    |||||||  ||||| || ||||||||| | |||||||||||||| || ||||| | || ||||||||| || || ||||||||||| |||| |||||| |    
T  12515939 tcaaagacatacttgattggatccattttagatatcaaccaagtagtgtgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaggctaaagcacatc 12515840  T
Q  200 aagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 299  Q
    ||||||||||||| ||   ||||||||  ||||  || || ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||| ||| || ||||| || ||    
T  12515839 aagtcttctcaagtatgaaataccgagactcactatctgtaaacttcttgctcaaatagtaaataacatgttctttccttccagtttcttcttgctgccc 12515740  T
Q  300 aagcacgcatcccat 314  Q
     ||||| || |||||    
T  12515739 gagcacacaacccat 12515725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 55784839 - 55784686
Alignment:
Q  100 tcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaac 199  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| |||||| | | || ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  55784839 tcaaagatgtacttgatcgggtccatcttagatatcaaccaagtagtatgactaatcatatagtgacggaggcgtttggcagcccaggctagtgcgcaac 55784740  T
Q  200 aagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctca 253  Q
    | |||||||| ||||| | ||| |||| |||||| || || |||||||||||||    
T  55784739 aggtcttctcgagcatggaatagcgagattcacaatcagtaaacttcttgctca 55784686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18044766 - 18044699
Alignment:
Q  100 tcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacg 167  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||| ||| |||||    
T  18044766 tcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatcaaccaagtagtgtgattaaccatatagtgacg 18044699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 351; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 9828 - 9407
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  9828 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 9730  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9729 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcacaaca 9630  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9629 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatggcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 9530  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9529 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactct 9430  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttga 423  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  9429 tgatgctatcaaaagcttcttga 9407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 9814 - 9394
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  9814 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 9716  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9715 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 9616  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  9615 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacca 9516  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9515 agcacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 9416  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  9415 tgatgctatcaaaagcttcttg 9394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 16373 - 15953
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  16373 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 16275  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||    
T  16274 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgcttagcggcccaggccagagcacaaca 16175  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16174 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 16075  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16074 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattct 15975  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  15974 tgatgctatcaaaagcttcttg 15953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3859 - 3439
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  3859 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 3761  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  3760 caaagatatactttatcgaatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaaca 3661  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3660 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 3561  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3560 agtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 3461  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  3460 tgatgctatcaaaagcttcttg 3439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 338; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 11392 - 11812
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  11392 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 11490  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11491 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaaca 11590  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  11591 agtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgacca 11690  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11691 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 11790  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  11791 tgatgctatcaaaagcttcttg 11812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 9837 - 9423
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |    
T  9837 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaacatcatattcagacaagagcatctgccagcttgcaatcttcccagtaacagcagctttct 9739  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||    
T  9738 caaagatatattttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggccaaggccagagcacaaca 9639  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9638 agtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 9539  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9538 agtacgcatcccatggattcatcaaacactgacagatacataatcaaaggccttccttccacaagtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 9439  T
Q  401 tgatactatcaaaagc 416  Q
    ||||  ||||||||||    
T  9438 tgatgttatcaaaagc 9423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 13363 - 12943
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  13363 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgccttct 13265  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||| |||||||||    
T  13264 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagtggcccaggctaaagcacaaca 13165  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13164 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacca 13065  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13064 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggataaggataggtggttccagcaggtaattct 12965  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  12964 tgatgctatcaaaagcttcttg 12943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 11741 - 11321
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || |    
T  11741 gaatgctgcctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttct 11643  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11642 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 11543  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  11542 agtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacca 11443  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11442 agtacacatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 11343  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  11342 tgatgctatcaaaagcttcttg 11321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 5643 - 6063
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
T  5643 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtgacggcagctttct 5741  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  5742 cgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtgtgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 5841  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  5842 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcctgttgacca 5941  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  5942 agcacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattct 6041  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  6042 tgatactatcaaaagcctcttg 6063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0748
Description:

Target: scaffold0748; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 5135 - 5555
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  5135 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagtgtgcaatcttcccagtaacagcaggcttct 5233  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 200  Q
    | ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  5234 cgaagatatacttgattggatccatcctggatatcaaccaagtagtatgatttaccaggtaatgacgaaggcgtttggcagcccaggctagagcacagca 5333  T
Q  201 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacca 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||     
T  5334 agtcttctcaagcatcgtataccgaatttcgcagtcggtaaacttcttgcttagatagtagatggcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccc 5433  T
Q  301 agcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattct 400  Q
    |  || |||||||| ||||||||||||||||| | |||||  ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  5434 aatacacatcccatagattcatcaaacactgatagatacatgatcaacgaccttccttccacaggtgggacaaggataggtggctctaacaggtaattct 5533  T
Q  401 tgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  5534 tgatgctatcaaaagcctcttg 5555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 398
Target Start/End: Original strand, 43181 - 43591
Alignment:
Q  5 gctacctttgattgcctttttgagtttt-gaacacaatatc-atattcagacaaga-gcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttt-t 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  43181 gctacctttgattgcctttttgagtttttgaacacaatatctatattcagacaaaaagcatctgccaacgtgcaatcttcccagtaacagcagctttact 43280  T
Q  101 caaagatgt-actttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattca-ccaaataat-gacgcagg-cgtttggcagcccaag--ctagagc 194  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |  | | ||     
T  43281 caaagatattactttatcggatccattctggatatcaaccacgttgtatgattcaaccaaataatagacgcaggtcgtttagcggcccaggaccaaaagg 43380  T
Q  195 acaa-caagtcttctcaagcattgtataccgagtttc-acagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc-tttctagtctca-tc 290  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  43381 acaaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttctacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttcttttccagtctcattc 43480  T
Q  291 ttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaataca-aaatc-aaaggccttccttccacgggtgggacaaggat-aggtggttcc 387  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43481 ttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgccaaatacataaatcaaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataaggtggttcc 43580  T
Q  388 agcaggtaatt 398  Q
    |||||||||||    
T  43581 agcaggtaatt 43591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 261 - 422
Target Start/End: Original strand, 1347 - 1508
Alignment:
Q  261 gatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatacaaaatcaaaggccttccttcc 360  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1347 gatagcatgttctttctttcaagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccacggattcatcaaacattgacaaatacataatcaaaggccttccttcc 1446  T
Q  361 acgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatactatcaaaagcttcttg 422  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  1447 acgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttg 1508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 22908 - 22757
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || |    
T  22908 gaatgctacctttgattgcctttt-gagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttct 22810  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattc 153  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22809 caaagatatacttgattggatccatcctggatatcaaccaagttgtatgattc 22757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 118797 - 118946
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagcctttt 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  || |    
T  118797 gaatgctacctttgatagc-tttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacaggtttct 118895  T
Q  101 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgat 151  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  118896 cgaagatatactttatcggatccattctggatatcacccaagttgtatgat 118946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 10972 - 10713
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    |||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||| | ||||| | ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  10972 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 10873  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| || || ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||    
T  10872 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagttaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 10773  T
Q  240 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||  || || |||||||||||    
T  10772 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcgtcttgttgacc 10713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 257
Target Start/End: Original strand, 34802 - 34959
Alignment:
Q  100 tcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaac 199  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||| |||||| | | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34802 tcaaatatgtacttgatcggatccattttagatatcagccaagtagtatgactaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaac 34901  T
Q  200 aagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagata 257  Q
    ||||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  34902 aagtcctctcaagcatggaatagcgagattcacagtcagtaaacttcttgcttagata 34959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 29924 - 29548
Alignment:
Q  40 atatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaacc 139  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||| | || || | ||| | ||| ||||| |||||| | || ||||||||| | |||| || ||    
T  29924 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacctgattggatccattttagataccagcc 29825  T
Q  140 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 239  Q
    |||| || ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || ||    
T  29824 aagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtatcgagattcacattcagt 29725  T
Q  240 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgacaaatac 339  Q
     ||||||||||| | ||| || || || || |||||  |||  || ||||||||||| || ||||| || |||||||| |  || ||||| |  |  |||    
T  29724 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaattttctaacaccgttaggtac 29625  T
Q  340 aaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatactatcaaaagc 416  Q
    |  |||||||| |||||||| || || |||| ||| || |||||||| |||| ||| ||||| || || ||||||||    
T  29624 atgatcaaaggtcttccttcaactggagggataagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagc 29548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 314
Target Start/End: Original strand, 4972 - 5186
Alignment:
Q  100 tcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaac 199  Q
    |||||||  ||||| || ||||||||| | |||||||||||||| || ||||| | || ||||||||| || || ||||||||||| |||| |||||| |    
T  4972 tcaaagacatacttgattggatccattttagatatcaaccaagtagtgtgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaggctaaagcacatc 5071  T
Q  200 aagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgacc 299  Q
    ||||||||||||| ||   ||||||||  ||||  || || ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||| ||| || ||||| || ||    
T  5072 aagtcttctcaagtatgaaataccgagactcactatctgtaaacttcttgctcaaatagtaaataacatgttctttccttccagtttcttcttgctgccc 5171  T
Q  300 aagcacgcatcccat 314  Q
     ||||| || |||||    
T  5172 gagcacacaacccat 5186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 359
Target Start/End: Original strand, 4412 - 4736
Alignment:
Q  35 acacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaat-cttcccagtaacagcagccttttcaaagatgtactttatcggatccattctggata 133  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||||| | || ||||| |||||   |||| || | ||| ||||| | |||||| |||||||||||| ||||||    
T  4412 acacaatatcataatcagacaataacatctgcaaacgagcaattcttcctgttaac-gccggcttctcaaaaaggtacttgatcggatccattttggata 4510  T
Q  134 tcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcaca 233  Q
    |||||||||| || || |  ||||  || ||||| || || || || ||||| || | ||| |||||||| ||||||||||| |  || || |  |||||    
T  4511 tcaaccaagtagtgtggtaaaccatgtagtgacggagacgcttagcggcccatgccaaagcgcaacaagttttctcaagcatagagtatcgggactcaca 4610  T
Q  234 gtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgac 333  Q
     || || |||||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | |    
T  4611 atcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttctttccagtttcgtcttgttgaccaagcacgcaacccatagaatcatccaacacagtc 4710  T
Q  334 aaatacaaaatcaaaggccttccttc 359  Q
    || ||||  ||||||||| |||||||    
T  4711 aagtacatgatcaaaggcattccttc 4736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0196 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0196
Description:

Target: scaffold0196; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 2070 - 1979
Alignment:
Q  2 aatgctacctttgattgcctttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcag 94  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  2070 aatgctacctttgattgc-tttttgagccttgaacacaatgccatattcagacaagagcatctgccagcgtccaatcttcctagtaacagcag 1979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 870 times since January 2019
Visitors: 4397