View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0673_low_26 (Length: 387)

Name: NF0673_low_26
Description: NF0673
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0673_low_26
NF0673_low_26
[»] chr5 (40 HSPs)
chr5 (14-370)||(3349442-3349799)
chr5 (51-364)||(43511618-43511935)
chr5 (65-370)||(20975979-20976282)
chr5 (50-364)||(17513685-17514000)
chr5 (57-365)||(42291636-42291946)
chr5 (51-362)||(29156192-29156503)
chr5 (54-364)||(10591028-10591337)
chr5 (51-363)||(5829386-5829698)
chr5 (103-370)||(4734382-4734652)
chr5 (51-362)||(13474632-13474945)
chr5 (52-357)||(7390152-7390457)
chr5 (52-362)||(13423866-13424178)
chr5 (64-357)||(33281681-33281974)
chr5 (54-362)||(12661311-12661619)
chr5 (148-362)||(19099162-19099376)
chr5 (64-355)||(17325853-17326146)
chr5 (130-311)||(8379272-8379453)
chr5 (203-364)||(40956313-40956475)
chr5 (130-364)||(27351349-27351584)
chr5 (130-362)||(18873459-18873695)
chr5 (65-362)||(26377539-26377836)
chr5 (148-362)||(13656212-13656426)
chr5 (262-363)||(138145-138246)
chr5 (146-341)||(10033570-10033770)
chr5 (255-364)||(931380-931484)
chr5 (53-321)||(26312027-26312299)
chr5 (156-364)||(40779192-40779399)
chr5 (270-362)||(36718535-36718629)
chr5 (289-355)||(16515533-16515599)
chr5 (51-249)||(37046897-37047097)
chr5 (53-184)||(16515686-16515817)
chr5 (130-184)||(4177381-4177435)
chr5 (131-184)||(13288624-13288677)
chr5 (131-262)||(23069326-23069458)
chr5 (54-101)||(41612987-41613034)
chr5 (314-364)||(37029046-37029096)
chr5 (130-224)||(138284-138379)
chr5 (64-182)||(16061081-16061199)
chr5 (130-187)||(17463023-17463080)
chr5 (51-103)||(39544691-39544743)
[»] chr7 (40 HSPs)
chr7 (52-370)||(1366003-1366322)
chr7 (51-339)||(25610091-25610378)
chr7 (50-364)||(26282281-26282606)
chr7 (52-364)||(40001462-40001760)
chr7 (53-370)||(36438104-36438421)
chr7 (130-363)||(26633364-26633598)
chr7 (51-362)||(33910066-33910379)
chr7 (67-356)||(32956783-32957066)
chr7 (64-357)||(42312016-42312312)
chr7 (64-362)||(773643-773946)
chr7 (130-356)||(30739131-30739360)
chr7 (148-356)||(12251135-12251344)
chr7 (130-356)||(41852130-41852356)
chr7 (80-362)||(18015359-18015644)
chr7 (50-362)||(7636072-7636388)
chr7 (130-315)||(40841071-40841260)
chr7 (148-362)||(46221550-46221765)
chr7 (130-364)||(41908178-41908413)
chr7 (130-326)||(28589974-28590169)
chr7 (148-362)||(36796219-36796434)
chr7 (148-362)||(42160970-42161182)
chr7 (131-329)||(3799593-3799789)
chr7 (51-347)||(44875909-44876202)
chr7 (52-362)||(6379835-6380146)
chr7 (148-362)||(44893877-44894091)
chr7 (148-362)||(33418964-33419180)
chr7 (130-363)||(40737830-40738054)
chr7 (235-362)||(4099970-4100099)
chr7 (261-355)||(7366696-7366790)
chr7 (264-362)||(18895361-18895459)
chr7 (148-362)||(11672588-11672802)
chr7 (51-187)||(29741974-29742108)
chr7 (51-223)||(29730839-29731005)
chr7 (283-363)||(9479128-9479208)
chr7 (297-356)||(8358291-8358350)
chr7 (131-187)||(28105792-28105848)
chr7 (130-183)||(44002762-44002815)
chr7 (152-210)||(4100112-4100170)
chr7 (57-98)||(4100228-4100269)
chr7 (310-363)||(25061904-25061957)
[»] chr6 (30 HSPs)
chr6 (51-370)||(29308217-29308537)
chr6 (56-370)||(1092796-1093110)
chr6 (48-364)||(31861001-31861304)
chr6 (51-362)||(2618357-2618667)
chr6 (130-363)||(3748397-3748631)
chr6 (131-363)||(30915191-30915429)
chr6 (148-362)||(3514698-3514912)
chr6 (131-339)||(6294279-6294490)
chr6 (64-195)||(1690480-1690612)
chr6 (225-362)||(6754208-6754346)
chr6 (235-362)||(628030-628157)
chr6 (156-362)||(12614574-12614778)
chr6 (148-362)||(6360762-6360975)
chr6 (228-362)||(29401142-29401277)
chr6 (59-356)||(22503751-22504050)
chr6 (152-362)||(21946109-21946317)
chr6 (223-362)||(57690-57830)
chr6 (235-362)||(29149405-29149533)
chr6 (64-356)||(350422-350717)
chr6 (148-362)||(7525015-7525228)
chr6 (255-346)||(11088564-11088655)
chr6 (191-349)||(19231627-19231786)
chr6 (48-223)||(11088711-11088886)
chr6 (286-370)||(1690619-1690703)
chr6 (295-362)||(14893412-14893479)
chr6 (54-116)||(29401388-29401450)
chr6 (314-364)||(31234911-31234961)
chr6 (51-116)||(31258321-31258387)
chr6 (65-116)||(6361012-6361063)
chr6 (73-117)||(11575169-11575213)
[»] chr2 (39 HSPs)
chr2 (51-346)||(17117395-17117691)
chr2 (52-362)||(18172694-18173002)
chr2 (53-364)||(38985461-38985773)
chr2 (53-364)||(21746983-21747294)
chr2 (55-364)||(15457500-15457812)
chr2 (51-364)||(18915799-18916118)
chr2 (51-362)||(26151497-26151809)
chr2 (64-363)||(36059668-36059968)
chr2 (50-362)||(4855995-4856308)
chr2 (52-363)||(39081399-39081708)
chr2 (51-362)||(45618979-45619290)
chr2 (51-355)||(13997323-13997627)
chr2 (51-362)||(18676059-18676373)
chr2 (48-356)||(1226014-1226323)
chr2 (50-362)||(41096288-41096600)
chr2 (50-362)||(2063807-2064120)
chr2 (137-364)||(31273002-31273230)
chr2 (145-363)||(1418910-1419129)
chr2 (64-362)||(7993634-7993933)
chr2 (148-362)||(42411406-42411620)
chr2 (65-362)||(6530661-6530962)
chr2 (51-362)||(13020425-13020736)
chr2 (148-346)||(42759604-42759802)
chr2 (223-362)||(19367341-19367481)
chr2 (148-330)||(36481428-36481611)
chr2 (51-362)||(25222325-25222639)
chr2 (148-349)||(29480484-29480686)
chr2 (258-363)||(38599403-38599507)
chr2 (263-363)||(27302491-27302591)
chr2 (235-362)||(34061794-34061918)
chr2 (150-362)||(12269427-12269639)
chr2 (50-362)||(45042391-45042706)
chr2 (48-346)||(13001655-13001954)
chr2 (148-278)||(9029683-9029812)
chr2 (282-364)||(18482488-18482571)
chr2 (51-100)||(19367174-19367223)
chr2 (51-119)||(3400106-3400174)
chr2 (130-214)||(24233651-24233735)
chr2 (258-286)||(38599593-38599621)
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (56-364)||(34523709-34524015)
chr8 (55-364)||(12531559-12531871)
chr8 (51-370)||(39697695-39698008)
chr8 (64-364)||(23567040-23567338)
chr8 (131-362)||(32098007-32098240)
chr8 (52-362)||(43926076-43926385)
chr8 (51-362)||(18420355-18420671)
chr8 (148-362)||(13585301-13585515)
chr8 (52-362)||(7858087-7858398)
chr8 (148-362)||(43967918-43968132)
chr8 (64-362)||(3471602-3471900)
chr8 (152-362)||(3628598-3628809)
chr8 (67-357)||(30915052-30915345)
chr8 (148-362)||(1004060-1004272)
chr8 (142-346)||(42777763-42777969)
chr8 (223-362)||(18112118-18112259)
chr8 (235-362)||(44664980-44665108)
chr8 (235-349)||(5869259-5869371)
chr8 (130-363)||(42076109-42076344)
chr8 (145-346)||(36514999-36515202)
chr8 (258-363)||(29372358-29372463)
chr8 (252-356)||(33452799-33452903)
chr8 (255-362)||(27074576-27074684)
chr8 (263-362)||(42951727-42951831)
chr8 (290-363)||(35874927-35875000)
chr8 (130-184)||(35875080-35875134)
chr8 (51-116)||(13585555-13585620)
chr8 (131-216)||(33452907-33452993)
chr8 (51-116)||(3445782-3445847)
chr8 (55-116)||(3574849-3574910)
chr8 (65-116)||(44664367-44664418)
chr8 (277-335)||(3575117-3575175)
chr8 (65-99)||(42951558-42951592)
chr8 (131-187)||(12268754-12268810)
[»] chr4 (32 HSPs)
chr4 (55-370)||(55134202-55134519)
chr4 (157-362)||(45172502-45172707)
chr4 (51-364)||(34982224-34982539)
chr4 (50-362)||(53011714-53012030)
chr4 (130-363)||(35653809-35654043)
chr4 (65-362)||(27632400-27632699)
chr4 (52-356)||(11681492-11681798)
chr4 (52-356)||(11689771-11690077)
chr4 (130-362)||(23425994-23426228)
chr4 (56-362)||(32130544-32130852)
chr4 (52-362)||(41038252-41038565)
chr4 (131-370)||(5545323-5545563)
chr4 (64-357)||(21791313-21791604)
chr4 (51-362)||(19661381-19661695)
chr4 (158-357)||(10575380-10575580)
chr4 (148-362)||(28463436-28463650)
chr4 (148-362)||(44478041-44478256)
chr4 (148-362)||(23256596-23256810)
chr4 (148-362)||(29579882-29580095)
chr4 (148-362)||(29221469-29221683)
chr4 (266-363)||(43154754-43154851)
chr4 (223-362)||(16072596-16072740)
chr4 (290-363)||(24449127-24449200)
chr4 (64-345)||(26328795-26329077)
chr4 (148-363)||(22423685-22423900)
chr4 (130-184)||(24449280-24449334)
chr4 (223-325)||(51066347-51066449)
chr4 (51-103)||(51066061-51066113)
chr4 (130-167)||(9925295-9925332)
chr4 (65-261)||(16887747-16887943)
chr4 (55-101)||(29221377-29221423)
chr4 (65-102)||(23256860-23256897)
[»] chr1 (42 HSPs)
chr1 (53-364)||(12971406-12971718)
chr1 (130-363)||(50371135-50371369)
chr1 (67-362)||(25930606-25930902)
chr1 (130-364)||(27703363-27703593)
chr1 (67-365)||(30004673-30004972)
chr1 (65-362)||(9-310)
chr1 (145-355)||(13120710-13120921)
chr1 (130-363)||(44836555-44836784)
chr1 (148-362)||(30899658-30899876)
chr1 (51-356)||(6150729-6151037)
chr1 (130-355)||(17674183-17674409)
chr1 (148-362)||(28885519-28885733)
chr1 (51-363)||(42740111-42740419)
chr1 (148-362)||(18127785-18127999)
chr1 (148-362)||(10109722-10109940)
chr1 (223-362)||(48722292-48722432)
chr1 (51-356)||(51109848-51110157)
chr1 (131-356)||(9777421-9777649)
chr1 (137-363)||(15441291-15441516)
chr1 (135-364)||(5560483-5560713)
chr1 (55-357)||(14084451-14084758)
chr1 (148-362)||(33124489-33124692)
chr1 (148-362)||(50552497-50552711)
chr1 (130-346)||(26486204-26486419)
chr1 (130-341)||(1269574-1269788)
chr1 (263-362)||(12884100-12884199)
chr1 (51-356)||(17487028-17487339)
chr1 (51-362)||(20905035-20905349)
chr1 (148-362)||(29207946-29208160)
chr1 (51-363)||(37873506-37873825)
chr1 (131-349)||(22386666-22386886)
chr1 (270-355)||(24556815-24556900)
chr1 (130-356)||(52055560-52055788)
chr1 (235-349)||(6333453-6333565)
chr1 (148-316)||(52240384-52240552)
chr1 (252-324)||(31369356-31369428)
chr1 (290-364)||(3907471-3907545)
chr1 (51-116)||(20470862-20470928)
chr1 (130-178)||(24556989-24557037)
chr1 (131-183)||(39080451-39080503)
chr1 (314-355)||(32810365-32810406)
chr1 (304-349)||(38263879-38263924)
[»] chr3 (38 HSPs)
chr3 (50-364)||(48626778-48627093)
chr3 (51-363)||(43905603-43905906)
chr3 (52-363)||(7767064-7767379)
chr3 (54-362)||(51939307-51939618)
chr3 (64-364)||(40151895-40152194)
chr3 (51-362)||(28132484-28132797)
chr3 (52-356)||(25598833-25599142)
chr3 (137-363)||(27303188-27303413)
chr3 (130-363)||(46904743-46904977)
chr3 (156-362)||(18408193-18408399)
chr3 (148-362)||(29387601-29387816)
chr3 (148-362)||(21784627-21784846)
chr3 (148-362)||(24252622-24252837)
chr3 (261-363)||(36538147-36538249)
chr3 (261-363)||(42009223-42009325)
chr3 (52-362)||(52654873-52655185)
chr3 (51-362)||(13401461-13401772)
chr3 (68-362)||(8364174-8364470)
chr3 (148-362)||(46791545-46791759)
chr3 (261-363)||(50677275-50677377)
chr3 (148-362)||(23164420-23164634)
chr3 (51-346)||(6715457-6715753)
chr3 (226-357)||(15987207-15987338)
chr3 (130-370)||(19965706-19965950)
chr3 (148-362)||(27729617-27729831)
chr3 (148-362)||(23067573-23067787)
chr3 (148-355)||(41706899-41707110)
chr3 (235-362)||(54430554-54430682)
chr3 (76-370)||(21596329-21596623)
chr3 (51-349)||(51146952-51147252)
chr3 (255-362)||(1255007-1255112)
chr3 (64-364)||(1649604-1649895)
chr3 (148-357)||(20762056-20762266)
chr3 (151-307)||(27110723-27110879)
chr3 (289-364)||(4207347-4207418)
chr3 (50-99)||(27303453-27303502)
chr3 (56-116)||(46791451-46791509)
chr3 (50-102)||(24252884-24252935)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (65-362)||(16897-17194)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (65-362)||(16712-17011)
[»] scaffold0564 (1 HSPs)
scaffold0564 (51-339)||(1086-1376)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (130-339)||(22633-22844)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (225-355)||(46099-46228)
[»] scaffold0606 (1 HSPs)
scaffold0606 (240-362)||(8333-8457)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (64-187)||(99094-99219)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 285; Significance: 1e-160; HSPs: 40)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 14 - 370
Target Start/End: Original strand, 3349442 - 3349799
Alignment:
Q  14 atatttaaccactttttagatataacttactagaatacagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaata 113  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3349442 atatttaaccacttttaagttataacttactagaatacaggaccgtccctatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggtctccaataaaata 3349541  T
Q  114 aaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagag 212  Q
    |||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  3349542 aaaacgcaatttttttgtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagtttctaaacatgaaactaaatacaaaaaacttgagtgaaagagag 3349641  T
Q  213 gtataatttactaacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3349642 gtataatttactaacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaacggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattc 3349741  T
Q  313 tttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3349742 tttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattattccaattggtagtgg 3349799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 51 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 43511935 - 43511618
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnn---gtgtagctaagctttatt 147  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||    
T  43511935 cagggtcgtccctatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaattttttttttgtgtagctaagctttatt 43511836  T
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  43511835 aaaaaatcagaatcagcagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttactaacggtgtcgtttggatttgtc 43511736  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatta 346  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43511735 acttatccgttgtgggaaagggaaaaacgaatggtttatatgaaaaagaaatgattgttgtgattctttccatgaaatagcttttcaaattgactgatta 43511636  T
Q  347 agtcattataccaattgg 364  Q
    ||| ||||||| ||||||    
T  43511635 agtgattatacaaattgg 43511618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 65 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 20976282 - 20975979
Alignment:
Q  65 tgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcaga 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||       ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  20976282 tgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggccaccaata---taaaaacgcaatttttttgtgtagctatgctttattaaaaaatcataatcaga 20976186  T
Q  165 agagcttttaaacat-gaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtggga 263  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20976185 agagcttttaaacattgaaccaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgttgtggga 20976086  T
Q  264 aaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattg 363  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  20976085 aagacgaaaacgaatagtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaaatgattatacaaattg 20975986  T
Q  364 gtagtgg 370  Q
    || ||||    
T  20975985 gtggtgg 20975979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 50 - 364
Target Start/End: Original strand, 17513685 - 17514000
Alignment:
Q  50 acagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaa 149  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||       |||||| |||||||||||||    
T  17513685 acagggccgtccctatgtaataggaggctcgactctctatttataataggcccccaataaaataaaaatgcaattattttgtgtagttaagctttattaa 17513784  T
Q  150 aaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtgatttggatttgtcac 248  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||   |  ||||||||||||||    
T  17513785 aaaaatagaatcagaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttaccaacgacctcgtttggatttgtcac 17513884  T
Q  249 ttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaag 348  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17513885 ttatccgttgtgggaaagggaaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcagtgaaataacttttcaaattgactgattaag 17513984  T
Q  349 tcattataccaattgg 364  Q
    | ||||||| ||||||    
T  17513985 tgattatacaaattgg 17514000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 57 - 365
Target Start/End: Original strand, 42291636 - 42291946
Alignment:
Q  57 cgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaaatca 156  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||       |||||| ||| |||||| |||||||||    
T  42291636 cgtccctatgaaataggaggctcggctctctatttaaa-tagccccccaataaaataaaaacgcaatttttttgtgtagttaaactttataaaaaaatca 42291734  T
Q  157 gaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaac--ttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtgatttggatttgtcacttatc 253  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||   || ||||||||||||||| ||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  42291735 gaatcagaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttaccaacgatgacatttggatttgtcacttatc 42291834  T
Q  254 cgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatt 353  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  42291835 cgcggtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgattaagtgatt 42291934  T
Q  354 ataccaattggt 365  Q
    |||| |||||||    
T  42291935 atacaaattggt 42291946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 51 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 29156503 - 29156192
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaa 150  Q
    ||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||  |||       |||||||||| ||||||||||    
T  29156503 cagggtcgtccctataaaataggaagctcggctctctatttaaaataggctcccac-aaaataaaaatacaatttttttgtgtagctaaactttattaaa 29156405  T
Q  151 aaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtgatttggatttgtcact 249  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||| |  |||| ||||||||||    
T  29156404 aaatcaaaatcagtagagcttctaaacatgaaacaaaatacaaaaaaattaattgaaagagaggtagaatttactaacggtatcgtttgaatttgtcact 29156305  T
Q  250 tatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagt 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  29156304 tatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatatgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttttaaattgactgattaagt 29156205  T
Q  350 cattataccaatt 362  Q
     ||||||| ||||    
T  29156204 gattatacaaatt 29156192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 364
Target Start/End: Original strand, 10591028 - 10591337
Alignment:
Q  54 ggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaaa 153  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||       |||||| |||||||||||||||||    
T  10591028 ggccgtccctatgaaataggaggctcggctctctatttaaaatagacgcc-aataaa-taaaaacgcaatttttttgtgtagttaagctttattaaaaaa 10591125  T
Q  154 tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtgatttggatttgtcacttat 252  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||  | ||||||    
T  10591126 tcagaatcagaatagtttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttactaacggtgccgtttggattgattacttat 10591225  T
Q  253 ccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcat 352  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  10591226 ccgttgtgggaaaggggataacgaatgatttttgtgaaaaataaatgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattaactgattaagtgat 10591325  T
Q  353 tataccaattgg 364  Q
    ||||| ||||||    
T  10591326 tatacaaattgg 10591337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 51 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 5829698 - 5829386
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaata--ggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngt-gtagctaagctttatt 147  Q
    |||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||        | |||||||| |||||||    
T  5829698 cagggccgtccttatgaaatataggaggctcggctctttatttaaaataggcctcaaataaaataaaaatgcaattttttttttgtagctaaactttatt 5829599  T
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtgatttggatttgtca 247  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  5829598 aaaaaatcagaatcagaagagcttctaaacat-aatgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagagtttactaacagtgtcgtttggatttgtca 5829500  T
Q  248 cttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaa 347  Q
    | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5829499 cctatccgttgtaggaaagggaaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattcttttaatgaaatagcttt--aaattgactgattaa 5829402  T
Q  348 gtcattataccaattg 363  Q
    || ||||||| |||||    
T  5829401 gtgattatacaaattg 5829386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 103 - 370
Target Start/End: Original strand, 4734382 - 4734652
Alignment:
Q  103 ccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaaa-tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaac-tt 199  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||  ||||| |||||| | | ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  4734382 ccaataaaataaaaacgcaatttttttgtgtagctaaattttataaaaaaaattaaaatcaaaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaaatt 4734481  T
Q  200 gagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatg 299  Q
     ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4734482 aagtgaaagagatgtagaatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttatccgctgtgggaaatgggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatg 4734581  T
Q  300 attgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgg 370  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||  ||||||| ||||||| ||||    
T  4734582 attgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgagtgatcaagggattatacaaattggtggtgg 4734652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 51 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 13474945 - 13474632
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaa 150  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | | |||||||||| || ||       ||||||||||  |||||||||    
T  13474945 cagggccgtccccgtgaaataggaggctcgactctctttttaaaataggcctctagtaaaataaaa-cgtaatttttttgtgtagctaaattttattaaa 13474847  T
Q  151 aaa---tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaat-acaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgt 245  Q
    |||   ||||||| ||||||  || |||| |||||| |||| |||||||| || ||||||||||  ||| |||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  13474846 aaaaaatcagaataagaagaagttctaaaaatgaaaggaattacaaaaaa-ttaagtgaaagag--gtaaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgt 13474750  T
Q  246 cacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgat 344  Q
    ||||  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  13474749 cactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaacaacttttcaaattgactgat 13474650  T
Q  345 taagtcattataccaatt 362  Q
    ||||| ||||||| ||||    
T  13474649 taagtgattatacaaatt 13474632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 52 - 357
Target Start/End: Original strand, 7390152 - 7390457
Alignment:
Q  52 agggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnn-gtgtagctaagctttattaaa 150  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| ||| | |||||||||| |||  ||||||||||||||| ||        |||||||||||||| ||||||    
T  7390152 agggccgttcctatgaaatagaaggctcggttctatttttaaaatagtccct-aataaaataaaaacgtaattttttgtgtgtagctaagcttcattaaa 7390250  T
Q  151 aaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaa--aacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtca 247  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||  || || ||||||||||||||  |||||| ||||||||||  |||| ||  ||||    
T  7390251 aaatcggaatcagaagaacttttaaacataaaacaaa-acaaaataaaattaagtgaaagagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttgaat--gtca 7390347  T
Q  248 cttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaa 347  Q
    ||| |  || |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  7390348 cttctatgtcgcaggaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgtcgtgattctttcgatgaaataactttttaaattgactgattaa 7390447  T
Q  348 gtcattatac 357  Q
    || |||||||    
T  7390448 gtgattatac 7390457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 52 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 13424178 - 13423866
Alignment:
Q  52 agggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaa 151  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | | ||| ||||||||  ||       |||||| |||  || |||||||    
T  13424178 agggccgtccctgtgaaataggaggctcggctctctttttaaaataggtctctagtaagataaaaact-aatttttttgtgtagttaaatttcattaaaa 13424080  T
Q  152 aa--tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaat-acaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtca 247  Q
    ||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||| || ||||||||||  ||  |||||| | ||||||||  ||| |||||||||    
T  13424079 aaaatcagaatcagaagaacttttaaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatcgaacggtgtcgtttagatttgtca 13423982  T
Q  248 cttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatta 346  Q
    ||  ||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  13423981 ctcctctattgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttctaaattgattgatta 13423882  T
Q  347 agtcattataccaatt 362  Q
    ||| ||||||| ||||    
T  13423881 agtgattatacaaatt 13423866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 33281974 - 33281681
Alignment:
Q  64 atgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcag 163  Q
    |||||||| |||| | | |||||| ||||||||||| | | | ||||||||||||||||       |||||| ||| ||| ||||||| |||| |||||     
T  33281974 atgaaatatgaggtttgactctctttttaaaataggtctc-agtaaaataaaaacgcaatctttttgtgtagttaaacttcattaaaagatcataatcaa 33281876  T
Q  164 aagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttact-aacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgg 261  Q
    |||| ||| |||||||||||| || || |||||| |  ||||||||||||||  |||||||| |||| |||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  33281875 aagaacttctaaacatgaaacaaaatataaaaaaata-agtgaaagagaggtgaaatttacttaacgatgtcgtttgaatttgtcactcatccgttgtgg 33281777  T
Q  262 gaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattatac 357  Q
    |||| || ||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  33281776 gaaaaggaaaagcaaatggtttatgcgaaaaagaaatgattattgggattctttcaatgaaataactttttaaattgactaattaagtgattatac 33281681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12661619 - 12661311
Alignment:
Q  54 ggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaaa 153  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |   | |||||||||| || ||       ||||||||||  ||||||||||||    
T  12661619 ggccgtccctgtgaaatgggaggctcggctctctttttaaaataggtctttagtaaaataaaa-cgtaatttttttgtgtagctaaattttattaaaaaa 12661521  T
Q  154 --tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtcactt 250  Q
      |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| || |||||||||   ||  |||||| ||||| ||||  |||||||||||||||     
T  12661520 aatcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaa-ttaagtgaaagat--gtgaaatttatctaacagtgtcgtttggatttgtcactc 12661424  T
Q  251 atccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagt 349  Q
     || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12661423 ctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaatattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactggttaagt 12661324  T
Q  350 cattataccaatt 362  Q
     ||||||| ||||    
T  12661323 gattatacaaatt 12661311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Original strand, 19099162 - 19099376
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  | |||| || ||||||||||  ||  |||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  19099162 aaaaattcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaagaattaagaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtc 19099259  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatt 345  Q
    |||| || ||||||| ||  |  ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19099260 acttctcggttgtggaaagtgataaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttttaaattgactgatt 19099359  T
Q  346 aagtcattataccaatt 362  Q
    |||| ||||||| ||||    
T  19099360 aagtgattatacaaatt 19099376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 17326146 - 17325853
Alignment:
Q  64 atgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnn-gtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatca 162  Q
    |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||| || | |||||| |||||||||        ||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  17326146 atgaaatatgaggctcggttctatttttaaaataggctcc-agtaaaatcaaaacgcaattctttttgtgtagctaaaattcattaaaaaatcagaatca 17326048  T
Q  163 gaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaa--aacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgt 259  Q
    ||||| |||||||||| ||||| || ||||||  || |  ||||||||| ||||  ||||||| |||||||||  |||||| | ||||||  | ||| ||    
T  17326047 gaagaacttttaaacacgaaacaaa-acaaaataaaataaagtgaaagataggtgaaatttacctaacggtgtcgtttggaat-gtcactcctacgtcgt 17325950  T
Q  260 gggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatag-cttttcaaattgactgattaagtcattat 355  Q
     |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17325949 aggaaaggggaaagcgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagttttttcaaattgactgattaagtgattat 17325853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 130 - 311
Target Start/End: Original strand, 8379272 - 8379453
Alignment:
Q  130 gtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacg 228  Q
    |||||| || |||| |||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||  || ||||||||||||||  |||||||  ||||    
T  8379272 gtgtagttatgcttcattaaaaaataagtatcagaagatcttctaaacatgaaacgaaaaaaaaaatattaagtgaaagagaggtgaaatttacgcaacg 8379371  T
Q  229 gtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgatt 311  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  8379372 gtgtcgtttggatttgtcactcatccgttgtggg-aaggggaaaacgaatggattatgcgaaaaagaaattattgttgtgatt 8379453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 203 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 40956475 - 40956313
Alignment:
Q  203 tgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgat 301  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||| ||  |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  40956475 tgaaagagaggtgaaatttatctaacggcgtcgtttggatttgtcactcttccattgtgggaaaggggaaaacgaatggtgtatgcaaaaaagaaatgat 40956376  T
Q  302 tgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattgg 364  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||    
T  40956375 tgttgtgattcttttaatgaaatagtttttcaaattaaatgattaagtgattatacaaattgg 40956313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 130 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 27351584 - 27351349
Alignment:
Q  130 gtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacg 228  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||| |||   |||||| || ||||||||||||||  ||||||| |||      
T  27351584 gtgtagctaaacttcattaaaaaattcgaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaaataaaaaaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaata 27351485  T
Q  229 gtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagct 328  Q
    ||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||||| || |||||||||  ||||||||||||||   || |||||||| |||||||| ||    
T  27351484 gtgtcgtttagatttgtcactcctccgttgtgggaaagaagaaaatgactggtttatgcaaaaaagaaatgatttaggttattctttcaatgaaataact 27351385  T
Q  329 tttcaaattgactgattaagtcattataccaattgg 364  Q
    || ||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  27351384 ttccaaattgactgattaagtggttatacaaattgg 27351349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 130 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 18873695 - 18873459
Alignment:
Q  130 gtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaa--aacttgagtgaaagagaggtataatttac-taa 226  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||  || || ||||||||| ||||  ||||||| |||    
T  18873695 gtgtagttaaacttcattaaaaaattagaatcagaaaaacttttaaacatgaaacaaa-acaaaataaagttaagtgaaagaaaggtgaaatttacctaa 18873597  T
Q  227 cggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaat---ggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaa 323  Q
    |||| |  |||||| | ||||||  | ||| || ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  18873596 cggtttcgtttggaat-gtcactcctacgtcgtaggaaaggggaaaacgaataatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaa 18873498  T
Q  324 tagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 362  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||    
T  18873497 tagcttttcaaattggctgattaagtggttatacaaatt 18873459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 65 - 362
Target Start/End: Original strand, 26377539 - 26377836
Alignment:
Q  65 tgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaaa-tcagaatcag 163  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||| || |  ||       |||||||| |  || ||||||||| ||||||||||    
T  26377539 tgaaataggaggctcgactctctttttaaaataggcccctagtaaaatagaa-cataatttttttgtgtagctcaatttcattaaaaaaatcagaatcag 26377637  T
Q  164 aagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtggg 262  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||  |||| | || ||||||||||| | |  ||||| ||||||||||  |||||||||||||||  || ||||||      
T  26377638 aagaagttctaaacatgaaaggaattaaaaata-ttaagtgaaagagatgaa--atttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctcagttgtgaa 26377734  T
Q  263 aaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa--aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaa 360  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  26377735 aaaaggtaaaacgaatggtttatgcgaaggaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttctcacattgactgaataagtgattatacaaa 26377834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 13656426 - 13656212
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    ||||||| ||||| ||||||  || ||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||  ||  |||||| ||||||||||  |||| ||||| |    
T  13656426 aaaaaattagaataagaagaagttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaagtaaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttgaatttgac 13656329  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatt 345  Q
    |||  || ||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  13656328 actcctctgttgtagaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgactgatt 13656229  T
Q  346 aagtcattataccaatt 362  Q
    |||| ||||||| ||||    
T  13656228 aagtgattatacaaatt 13656212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 262 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 138246 - 138145
Alignment:
Q  262 gaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  138246 gaaaggggaaaacgaatggtttatgcggaaaaaaaataattgttgtgattatttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaat 138147  T
Q  362 tg 363  Q
    ||    
T  138146 tg 138145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 146 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10033770 - 10033570
Alignment:
Q  146 ttaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa------tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtgatttg 238  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||      || || ||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||||| |  ||||    
T  10033770 ttaaaaaatcagaatcagaagaacttttaaacatgaaacaaaacaaaataaaataaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaacggtttcgtttg 10033671  T
Q  239 gatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattg 338  Q
    || | ||||||  | ||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  10033670 gaat-gtcactcctacgtcgtaggaaaggg-aaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaataattattgtgattctttcaataaaatagcttttcaaattg 10033573  T
Q  339 act 341  Q
    |||    
T  10033572 act 10033570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 255 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 931484 - 931380
Alignment:
Q  255 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatta 354  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||     |||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  931484 gttgtgggaaaggagaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaatgattattgtgattctttc-----aatagctttctaaattgactgattaagtgatta 931390  T
Q  355 taccaattgg 364  Q
    ||| ||||||    
T  931389 tacaaattgg 931380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 26312299 - 26312027
Alignment:
Q  53 gggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaa 152  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    | |||||||||| || ||       ||||||||||  || ||||||||    
T  26312299 gggccgtccccgtgaaataggaggctcgactctcattttaaaataggctaatagtaaaataaaa-cgtaatttttttgtgtagctaaatttcattaaaaa 26312201  T
Q  153 a-tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtca--- 247  Q
    | ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||  ||||||  |||||| ||||||||||  |||||||||||||       
T  26312200 aatcagaatcagaagaagttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaa--agaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactc 26312103  T
Q  248 cttatccgttgtgggaaagggg-aaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatga 321  Q
    || ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  26312102 ctgatctgttgtggaaaaggggtaaaacgaatggtttatacgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 26312027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 40779399 - 40779192
Alignment:
Q  156 agaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtgatttggatttgtcacttatcc 254  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||| |||   |||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||| | |||  ||| |||||||||||  |||    
T  40779399 agaataagaagaaattttaaacatgaaatgaaataaaaaaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaatgatgtcgtttcgatttgtcactcctcc 40779300  T
Q  255 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaa-gaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatt 353  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||| |||||   |||    
T  40779299 attgtgggaaagg--aaaacgaatggtttatacgaaaaaagaaatgattgttgtgattc-ctcaatggaatagtttttcaaattgacttattaaacgatt 40779203  T
Q  354 ataccaattgg 364  Q
    |||| ||||||    
T  40779202 atacaaattgg 40779192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 362
Target Start/End: Original strand, 36718535 - 36718629
Alignment:
Q  270 aaaacgaatggtttatgtgaa--aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 362  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||| |||| || |||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  36718535 aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaattatggttgtgattctttcaataaaataactttacaaattgactgattaaatgattatacaaatt 36718629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 289 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16515599 - 16515533
Alignment:
Q  289 aaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattat 355  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16515599 aaaaagaaataattgttgtgattctttcaataaaataatttttcaaattgattgattaagtgattat 16515533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 37047097 - 37046897
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttatt--- 147  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  | |||||| |||||| ||       ||||||||||  ||||||       
T  37047097 cagggccgtccccgtgaaataggaggttcggctctctttttaaaataggcccttagtaaaat-aaaacgtaatttttttgtgtagctaaattttattaaa 37046999  T
Q  148 -aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgt 245  Q
     ||||||||||||| ||||||  || |||||||||||  |||  |||||| || | ||||  ||||||  |||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  37046998 aaaaaaatcagaattagaagaagttctaaacatgaaagaaattaaaaaaaattaaatgaa--agaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgt 37046901  T
Q  246 cact 249  Q
    ||||    
T  37046900 cact 37046897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 16515817 - 16515686
Alignment:
Q  53 gggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnn-gtgtagctaagctttattaaaa 151  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||  | |||||||||||||||         |||||||||||||| || ||||    
T  16515817 gggccgttcctatgaaataggaggttcggttctatttttaaaataggcccg-agtaaaataaaaacgcatttttttgtgtgtagctaagcttcatgaaaa 16515719  T
Q  152 aatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaac 184  Q
    | ||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  16515718 agtcagaatgagaagaactttaaaacatgaaac 16515686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 4177435 - 4177381
Alignment:
Q  130 gtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaac 184  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  4177435 gtgtagttaagcttcattaaaaaatcataatcagaagaacttctaaacatgaaac 4177381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 131 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13288677 - 13288624
Alignment:
Q  131 tgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaac 184  Q
    |||||||||| || |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  13288677 tgtagctaagtttcattaaaaaatcataatcagaagaacatttaaacatgaaac 13288624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 131 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23069458 - 23069326
Alignment:
Q  131 tgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacg-aatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacg 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| |||| |||||||| |||| |||||| || | ||||||| | ||  |||||| ||||||    
T  23069458 tgtagctaagcttcattaaaaaatcaaaattagaagaacttctaaatatgaaacgtaata-aaaaaaattaaatgaaagaaatgtgaaatttacctaacg 23069360  T
Q  229 gtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtggg 262  Q
    ||||  |||| ||||||||||  ||| |||||||    
T  23069359 gtgtcgtttgaatttgtcactcctccattgtggg 23069326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 54 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 41613034 - 41612987
Alignment:
Q  54 ggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcc 101  Q
    |||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  41613034 ggccgttcctatgaaataggaggctctgctctctttttaaaataggcc 41612987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 364
Target Start/End: Original strand, 37029046 - 37029096
Alignment:
Q  314 ttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattgg 364  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  37029046 ttctttgaaatagctttttaaattgattgattaagtgattatacaaattgg 37029096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 138379 - 138284
Alignment:
Q  130 gtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaa--aaacttgagtgaaagagaggtataatttact 224  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||| ||||| |||| |||||||||| ||||| || |||||  ||| || ||||||||||||||  ||||||||    
T  138379 gtgtagctaagtttcattaagaaatcaaaatcaaaagaacttttaaacaggaaac-aaaacaaaataaaattaagtgaaagagaggtgaaatttact 138284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 16061199 - 16061081
Alignment:
Q  64 atgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnn--gtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatc 161  Q
    ||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||         |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  16061199 atgaaatagaaggctcgactctttttttaaaataggccccc--taaaataaaaacataataaaaatttgtgtagttaagcttcattaaaaaatcagaatc 16061102  T
Q  162 agaagagcttttaaacatgaa 182  Q
    |||| |  || ||||||||||    
T  16061101 agaaaaaattctaaacatgaa 16061081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17463080 - 17463023
Alignment:
Q  130 gtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa 187  Q
    |||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  17463080 gtgtagttaagcttcattaaaaaactagaattagaagaacttctaaacatgaaacgaa 17463023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 39544743 - 39544691
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccc 103  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  39544743 cagggccgtcccaataaaaatggaggctcggctctcaaataaaaataggcccc 39544691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 40)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 52 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 1366322 - 1366003
Alignment:
Q  52 agggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaa 151  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||    
T  1366322 agggccgtccctatgaaatagaaggctcggctctctatttaaaatagatccccaataaaataaaaacgtaatttttttgtgtagctaagctttattaaaa 1366223  T
Q  152 aatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtgatttggatttgtcactt 250  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  1366222 aatcagaatcagaagagcttgtaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttacaaacggtgtcatttgaatatgtcaatt 1366123  T
Q  251 atccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1366122 atccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaataacttttcaaattgactgattaagtc 1366023  T
Q  351 attataccaattggtagtgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1366022 attataccaattggtagtgg 1366003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 51 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 25610378 - 25610091
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaa 150  Q
    |||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||        ||||||||||||||||||||    
T  25610378 cagggccgtccctataaaataagaggttcgactctctatttaaaatagacccc-aataaaataaaaatgcaattttttt-tgtagctaagctttattaaa 25610281  T
Q  151 aaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtgatttggatttgtcact 249  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  25610280 aaatcagaatcagaagagcttccaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagagatagaatttactaacggtgtcgtttggatttgtcacc 25610181  T
Q  250 tatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattga 339  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  25610180 tatccattgtgggaaaggggaaaactattggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatgacttttcaaattga 25610091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 50 - 364
Target Start/End: Original strand, 26282281 - 26282606
Alignment:
Q  50 acagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnn--gtgtagctaagctttatt 147  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |||||| |||||||||||    
T  26282281 acagggccgtccctatgaaataggaggctcggctcactatttaaaataggcccccaataaaataaaaaagcaatttttttttgtgtagttaagctttatt 26282380  T
Q  148 aaaaaatcagaatcagaa------gagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtgatttgga 240  Q
    ||||||||||||||||||      ||| || ||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |    
T  26282381 aaaaaatcagaatcagaatcagaagagtttctaaacatgaaatgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttactaacagtgtcatttgta 26282480  T
Q  241 tttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa--aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattg 338  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26282481 tttttcacttatatgttgtgggaaaggagaaaatgaatgatttatatgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattg 26282580  T
Q  339 actgattaagtcattataccaattgg 364  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26282581 actgattaagtgattatacaaattgg 26282606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 52 - 364
Target Start/End: Original strand, 40001462 - 40001760
Alignment:
Q  52 agggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaa 151  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||       |||||| |||||||||||| ||    
T  40001462 agggccgtctctatgaaataggaggttcgactctctatttaaaataggtttccaataaaataaaaatgcaatttttttgtgtagttaagctttattagaa 40001561  T
Q  152 aatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtgatttggatttgtcactt 250  Q
    ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  40001562 aaatagaattagaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtggaatttactaacggcgtcgtttgaatttgtcactt 40001661  T
Q  251 atccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtc 350  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||               ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40001662 atccgttgtgggaaagggaaaaacgaatggtt---------------tgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtg 40001746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 53 - 370
Target Start/End: Original strand, 36438104 - 36438421
Alignment:
Q  53 gggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaa 152  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| | | ||||||||||| ||||       |||||||||||||| ||||||||    
T  36438104 gggccgtacctacgaaataggaggctcggttctatttttaaaataggcctc-agtaaaataaaaatgcaatttttgtgtgtagctaagcttcattaaaaa 36438202  T
Q  153 atcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaa--aacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtgatttggatttgtcact 249  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||  || || ||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||    
T  36438203 atcagaatcagaagaacttttaaacatgaaacaaa-acaaaataaaattaagtgaaagataggtgaaatttacctaacggtgtcatttggaat-gtcact 36438300  T
Q  250 tatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagt 349  Q
      | ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  36438301 cctacgtcgtaggaaaagggaaaacgaatggtttatgtgaaaaataaattattgttgtgattctttcaatgaaatggtttttcaaattgactgattaagt 36438400  T
Q  350 cattataccaattggtagtgg 370  Q
     ||||||| ||||| ||||||    
T  36438401 gattatacaaattgatagtgg 36438421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 130 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 26633598 - 26633364
Alignment:
Q  130 gtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttact-aac 227  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| || || || ||| || ||||||||||||||  |||||||| |||    
T  26633598 gtgtagctaagcttcattaaaaaatcagaatcagaagaacgtctaaacatgaaacaaaataaaataaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacttaac 26633499  T
Q  228 ggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagc 327  Q
    |||||  |||||| | |||||| || ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26633498 ggtgtcgtttggaat-gtcactcatacgtcgtgggaaagggaaaaatgaatggtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagc 26633400  T
Q  328 ttttcaaattgactgattaagtcattataccaattg 363  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  26633399 ttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattg 26633364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 51 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 33910379 - 33910066
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaa 150  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| || ||       |||||||||| ||| ||||||    
T  33910379 cagggccgtccctgtgaaataggaggctcggctctctttttaaaataggcccctagtaaaataaaa-cgtaatatttttgtgtagctaaacttcattaaa 33910281  T
Q  151 aaa---tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    |||   ||||||| |||| | ||| ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||  ||  |||||| ||||||||||  |||||||||||     
T  33910280 aaaaaatcagaataagaataacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgta 33910183  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatt 345  Q
    | |  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33910182 attcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgatt 33910083  T
Q  346 aagtcattataccaatt 362  Q
    |||  ||||||| ||||    
T  33910082 aagcgattatacaaatt 33910066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 67 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 32957066 - 32956783
Alignment:
Q  67 aaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnn-gtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaa 165  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||        ||| |||||||||| |||||||||||| || || ||    
T  32957066 aaataggaggctcaactctctttttaaaataggcctccaataaaataaaactgcaattttttttgtgaagctaagcttcattaaaaaatcaaaaccaaaa 32956967  T
Q  166 gagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaa 264  Q
    || ||| |||||||||||| ||    |||||    ||||||||| ||||  ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32956966 gaacttctaaacatgaaaccaa----aaaaa----agtgaaagataggtgaaatttacctaacagtgtcgtttggatttgtcactcatccgttgtgggaa 32956875  T
Q  265 aggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattata 356  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  32956874 aggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaatcattgttgtgattctttcaatgaaataactttataaattgactgattaaatgattata 32956783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 42312312 - 42312016
Alignment:
Q  64 atgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnn-gtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatca 162  Q
    ||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| || |  |||||||||||| |||        |||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  42312312 atgaaatagaagactcgactctctttttaaaataggtccactgtaaaataaaaacacaattttttgtgtgtagttaagcttcattaaaaaattagaatca 42312213  T
Q  163 gaagagcttttaaacatgaaacgaat--acaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttact-aacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgt 259  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||   | |||||| || ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  ||| |||||||| || |||||||||    
T  42312212 gaagaacttctaaacatgaaacgaaataaaaaaaaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacttaacggtgtcgtttagatttgtcgctcatccgttgt 42312113  T
Q  260 gggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattatac 357  Q
    || ||||||||||||||||  |||| | |||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  42312112 gg-aaaggggaaaacgaattatttaagcgaaaaataaatgactgttgtgattcttttaatgaaatagcttttcaaattgactaatcaagtgattatac 42312016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 362
Target Start/End: Original strand, 773643 - 773946
Alignment:
Q  64 atgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngt---gtagctaagctttattaaaaaatcagaat 160  Q
    |||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||        |   |||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  773643 atgaaacaggaggttcgactctctttttaaaataggccgccaataaaataaaaatgtaattttttttttatgtagttaagcttcattaaaaaatcaaaat 773742  T
Q  161 cagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgt 259  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||   |||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||| ||  |||| |||||| |||  ||||||||    
T  773743 cagaagaacttctaaacatgaaacgaaataaaaaaaattaagtgaaagagatgtgaaatttacctaacggcgtcgtttgaatttgtgactcctccgttgt 773842  T
Q  260 gggaaaggggaaaacgaatggtttatgtg--aaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattatac 357  Q
     |||||||| |||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  773843 tggaaaggg-aaaacgaatggtttatgcacaaaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaataaaatagcttttcaaattgactgataaagtaattatac 773941  T
Q  358 caatt 362  Q
     ||||    
T  773942 aaatt 773946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 30739360 - 30739131
Alignment:
Q  130 gtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttga-gtgaaagagaggtataatttactaa- 226  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| || || ||| |  | |||||||||||||  ||||||| ||     
T  30739360 gtgtagctaaacttcattaaaaaatcagaatcagaagaacttctatacatgaaatgaaataaaataaaataaaagtgaaagagaggtgaaatttaccaaa 30739261  T
Q  227 cggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatag 326  Q
    |||||| ||||||||||||||||   ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||     
T  30739260 cggtgtcatttggatttgtcactccgccgttgtgaaaaaggggaaaactaattgtttatgcgaaaaggaaatgatcgttgtgattcttttaatgaaataa 30739161  T
Q  327 cttttcaaattgactgattaagtcattata 356  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30739160 cttttcaaattgactgattaagtgattata 30739131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 148 - 356
Target Start/End: Original strand, 12251135 - 12251344
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaat-acaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgt 245  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| | |||||| || ||||||||||  ||  |||||| |||||||||   |||||||||||    
T  12251135 aaaaaatcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgacgtttggatttgt 12251232  T
Q  246 cacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgat 344  Q
    ||||  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  12251233 cactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgat 12251332  T
Q  345 taagtcattata 356  Q
    ||| | ||||||    
T  12251333 taaatgattata 12251344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Original strand, 41852130 - 41852356
Alignment:
Q  130 gtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacg 228  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| | |||||| || ||||||||||| ||  |||||| ||||||    
T  41852130 gtgtagctaagtttcattaagaaatcagaatcagaagaacttttaaacgtcaaacgaa-ataaaaaaattaagtgaaagagatgtgaaatttatctaacg 41852228  T
Q  229 gtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagct 328  Q
    ||||  |||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  41852229 gtgtcgtttgaatttgtcactcctccgttgtggaaaaggggaaaatgaattatttatgcaaaaaagaaatgagtgttgcgattctttcaatgaaataact 41852328  T
Q  329 tttcaaattgactgattaagtcattata 356  Q
     || ||||||||||| ||||| ||||||    
T  41852329 ctttaaattgactgagtaagtgattata 41852356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 362
Target Start/End: Original strand, 18015359 - 18015644
Alignment:
Q  80 ggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaaa--tcagaatcagaagagcttttaaac 177  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||       ||||||||||  || |||||||||  ||||||| |||||| ||| |||||    
T  18015359 ggctctctttttaaaataggcccctaataaaataaaa-cgtaatttttttgtgtagctaaatttcattaaaaaaaatcagaattagaagaacttctaaac 18015457  T
Q  178 atgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacga 276  Q
    |||||| ||||  |||||| || ||||||||||  ||  |||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| || ||||||  |||||| |||||||    
T  18015458 atgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatcaaacggtgtcgtttgaatttgtcacttttctgttgtgtaaaagggtaaaacga 18015555  T
Q  277 atggtttatgtgaa---aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 362  Q
    |||||| ||| |||   ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  18015556 atggttaatgcgaagaaaaaaaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgattgattaagtgattatacaaatt 18015644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 362
Target Start/End: Original strand, 7636072 - 7636388
Alignment:
Q  50 acagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttatt-- 147  Q
    ||||||||||||   | |||||| || |||| |||||| ||||||||||||||| | || ||||||| || ||       |||||||||| ||| |||      
T  7636072 acagggccgtccatgtaaaatagaagactcgtctctctttttaaaataggcccctagtagaataaaa-cgtaatttttttgtgtagctaaacttcattga 7636170  T
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaat--acaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttg 244  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||  | |||||| || ||||||| ||  ||  |||||| |||||||| |  |||| |||||    
T  7636171 aaaaaatcagaatcagaacaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaaattaagtgaaaaag--gtgaaatttatctaacggtatcgtttgaatttg 7636268  T
Q  245 tcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa--aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactg 342  Q
    |||||  || ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||  ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7636269 tcactcttctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggcttatgggaagaaaaaaaatgattgttgcgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactg 7636368  T
Q  343 attaagtcattataccaatt 362  Q
    ||||||| ||||||| ||||    
T  7636369 attaagtaattatacaaatt 7636388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 130 - 315
Target Start/End: Original strand, 40841071 - 40841260
Alignment:
Q  130 gtgtagctaagctttattaaaaaa--tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttac-ta 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||  | | ||||||| ||||  ||||| | ||    
T  40841071 gtgtagctaagctttattaaaaaaaatcagaattagaagaacttctaaacatgaaacgaaataaaaaaaaaataattgaaagataggtgaaattttccta 40841170  T
Q  226 acggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattcttt 315  Q
    | ||| |  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  40841171 atggtctcgtttggatttgtcacttctccgttgtaggaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaatgagtgttgtaattcttt 40841260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Original strand, 46221550 - 46221765
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaat-acaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgt 245  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||  ||| | |||||| || ||||||||||  ||| |||||| |||||| | | ||||||||||||    
T  46221550 aaaaaatcagaattagaagaacttctaaacatgaaagaaattaaaaaaaaattaagtgaaagag--gtaaaatttatctaacgatatcatttggatttgt 46221647  T
Q  246 cacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgat 344  Q
    || |  || ||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  46221648 cattcttctgttgtggaaaatggtaaaacgaatggtttatgcgaataaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgat 46221747  T
Q  345 taagtcattataccaatt 362  Q
    ||||| ||| ||| ||||    
T  46221748 taagtgattctacaaatt 46221765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 130 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 41908413 - 41908178
Alignment:
Q  130 gtgtagctaagctttattaaaaaa-tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaac 227  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||| ||   |||||| || ||||||| ||||||  |||||| |||||    
T  41908413 gtgtaactaagcttcattaaaaaaatcagaatcagaaaaacttctaaacatgaaacaaaataaaaaaaattaagtgaaaaagaggtgaaatttatctaac 41908314  T
Q  228 ggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagc 327  Q
    | | |  ||||||| |||||||  ||||| |||  ||||| ||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  41908313 gatatcgtttggatctgtcactcctccgtagtgaaaaaggagaatacgagtg-tttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaacagc 41908215  T
Q  328 ttttcaaattgactgattaagtcattataccaattgg 364  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  41908214 ttttctaattgactgattaagtgattgtacaaattgg 41908178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 130 - 326
Target Start/End: Original strand, 28589974 - 28590169
Alignment:
Q  130 gtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacg 228  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| | | |||| || |||| |||||||||  | ||||| ||||     
T  28589974 gtgtagctaaacttcattaaaaaatcagaatcagaagaatttctaaacatgaaatgaa-atagaaaaattaagtggaagagaggtgaattttacctaaca 28590072  T
Q  229 gtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatag 326  Q
     |||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  28590073 atgtcgtttggatttgtcactcctccgttgtgggaaaggggaaaacgaatgg-ttacgcgaaaaagaaataattgttgtgattcttttaatgaaatag 28590169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Original strand, 36796219 - 36796434
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaat-acaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgt 245  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||| |||| |||| | |||||| || ||||||||||  ||  |||||| ||||||||||  ||| |||||||    
T  36796219 aaaaaatcagaatcagaagaagttctaaaca-gaaatgaattaaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgttttgatttgt 36796315  T
Q  246 cacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa--aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactga 343  Q
    ||||  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||    
T  36796316 cactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataattttccaaattgactga 36796415  T
Q  344 ttaagtcattataccaatt 362  Q
    |||||| ||||||| ||||    
T  36796416 ttaagttattatacaaatt 36796434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Original strand, 42160970 - 42161182
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||  ||  |||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  42160970 aaaaaatcagaatcagaataacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtc 42161067  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatta 346  Q
    |||  || ||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||| || || || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |    
T  42161068 actcctctgttgtggaaaaaggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaattg-ttgctgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattaactgatca 42161166  T
Q  347 agtcattataccaatt 362  Q
    ||| ||||||| ||||    
T  42161167 agtgattatacaaatt 42161182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 131 - 329
Target Start/End: Original strand, 3799593 - 3799789
Alignment:
Q  131 tgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacgg 229  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  3799593 tgtagctaaacttcatttaaaaatcagaatcagaagaacttctaaacatgaaacgaa-ataaaaaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaacgg 3799691  T
Q  230 tgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagctt 329  Q
    |||  |||||||||| | ||  ||| |||||||||     ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3799692 tgtcgtttggatttg-cgctcctccattgtgggaatttctaaaacgaatggtttatgcggaaaa-aaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctt 3799789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 51 - 347
Target Start/End: Original strand, 44875909 - 44876202
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaa 150  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| | |         ||||||||| ||| ||||||    
T  44875909 cagggccgtccctatgaaataggaggctcgactctctttttaaaataggtccctactaaaataaaaatgtattttatttttgtagctaaacttcattaaa 44876008  T
Q  151 aaa-tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaat--acaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtgatttggatttgtca 247  Q
    ||| ||||||| ||||   ||| ||||||||||| |||   | |||||| || |||||||||||| |  |||||||  |  ||||  |||||||||||||    
T  44876009 aaaatcagaataagaa---cttctaaacatgaaatgaaataaaaaaaaaattaagtgaaagagagatgaaatttacctaaagtgtcgtttggatttgtca 44876105  T
Q  248 cttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaa 347  Q
    ||  | | |||||| ||  |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  44876106 ctccttcattgtggaaa--gggaaaacgaatggtttatgcggaaaa-aaatgattgttgtgattcttttaatgaaatagctttctaaattgactgattaa 44876202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 362
Target Start/End: Original strand, 6379835 - 6380146
Alignment:
Q  52 agggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaa 151  Q
    |||| ||||||  ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||  | |||||||||| || ||       |||||| ||| ||| |||||||    
T  6379835 agggtcgtccctgtgaaatatgaggctcggctcactttttaaaataggcccatagtaaaataaaa-cgtaatttttttgtgtagttaaacttcattaaaa 6379933  T
Q  152 aa--tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtcac 248  Q
    ||  ||||||||  |||| ||| |||| |||||| ||||  |||||| || ||||||||||  ||  |||||| | |||  |||  ||||||||||||||    
T  6379934 aaaatcagaatcgaaagaacttctaaatatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatccaacaatgtcgtttggatttgtcac 6380031  T
Q  249 ttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaa-atgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaa 347  Q
    |  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||| |||||||    
T  6380032 tcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaatatgattgttgtgattctttcaatgaaatagacttccaaattgattgattaa 6380131  T
Q  348 gtcattataccaatt 362  Q
    || ||||||| ||||    
T  6380132 gtgattatacaaatt 6380146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Original strand, 44893877 - 44894091
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    ||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||| ||||  |||||| || ||||||||||  ||  ||||||  |||||||||  |||| ||||||     
T  44893877 aaaaaatcataatcagaagaagttgtaagcatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatgtaacggtgtcgtttgaatttgta 44893974  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatt 345  Q
    |||  |  | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||    
T  44893975 actcctttgctgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgtgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaataaaatagctttccaaattgattgatt 44894074  T
Q  346 aagtcattataccaatt 362  Q
    |||| ||||||| ||||    
T  44894075 aagtgattatacaaatt 44894091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Original strand, 33418964 - 33419180
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaat-acaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgt 245  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||  |||| | ||||||  | ||||||||||  ||  |||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  33418964 aaaaaatcagaatcagaagaagttctaaacatgaatggaattaaaaaaaaaataagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgt 33419061  T
Q  246 cacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgac-tga 343  Q
    ||||  || ||||| | ||| || ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |    
T  33419062 cactcctctgttgtagaaaatggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattattgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgacttaa 33419161  T
Q  344 ttaagtcattataccaatt 362  Q
    |||||| ||||||| ||||    
T  33419162 ttaagtgattatacaaatt 33419180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 130 - 363
Target Start/End: Original strand, 40737830 - 40738054
Alignment:
Q  130 gtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaac-gaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaac 227  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||  |||| || ||| |  ||||||||||||||  |||||| |||||    
T  40737830 gtgtagctaagcttcattaaaaagtcagaatcaaaagaacttttaaa-atgaaacaaaataaaataaaataaagtgaaagagaggtgaaatttacctaac 40737928  T
Q  228 ggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagc 327  Q
    ||||| |||| ||  |||||||  | ||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||         |||||||||||||| || |||||||    
T  40737929 ggtgtcattt-gaaatgtcactcctacgtcgtaggaaaggggaaaacgaatagtttatgcgaaaaa---------gttgtgattctttcaataaaatagc 40738018  T
Q  328 ttttcaaattgactgattaagtcattataccaattg 363  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  40738019 tttttaaattgactgattaagtaattatacaaattg 40738054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 235 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 4100099 - 4099970
Alignment:
Q  235 tttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaa-cgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttc 332  Q
    |||||||||||||||  || ||||||| |||||| |||| |||||||||| || ||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4100099 tttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaaacgaatggtttttgcgaagaaaaaaatgattgttgtaattctttcaatgaaatagcttttc 4100000  T
Q  333 aaattgactgattaagtcattataccaatt 362  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  4099999 aaattgattgattaagtgattatacaaatt 4099970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 261 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 7366790 - 7366696
Alignment:
Q  261 ggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattat 355  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||  ||||||| |||||    
T  7366790 ggaaaggggaaaatgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaataaaatagtttttcaaattgacaaattaagtaattat 7366696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 264 - 362
Target Start/End: Original strand, 18895361 - 18895459
Alignment:
Q  264 aaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 362  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  18895361 aaggggaaaacgaattgtttatgcgaaaaggaaataattgttgtgattctttcaatgaaataactttttaaattgactgattaattgattatacaaatt 18895459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 11672802 - 11672588
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    ||||||||||||  | ||||  || ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||  ||  |||||| | |||| |||  ||| ||||||||    
T  11672802 aaaaaatcagaactataagaagttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatcaaacgatgtcgtttagatttgtc 11672705  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatt 345  Q
    |||  || ||||||| |||| | |||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  11672704 actcctctgttgtggaaaagagtaaaacgaatgatttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcattgaaataactttccaaattgactgatt 11672605  T
Q  346 aagtcattataccaatt 362  Q
    |||| ||||||| ||||    
T  11672604 aagtgattatacaaatt 11672588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 29742108 - 29741974
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaa 150  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||        |||||||||| || ||||||    
T  29742108 cagggtcgttcctatgaaataggaggctcgactctctttttaaaataggcccccagtaaaataaaaa--caatttttttttgtagctaagtttcattaaa 29742011  T
Q  151 aaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa 187  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  29742010 aaatcacaatcagaaaaacttctaaacatgaaacgaa 29741974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 223
Target Start/End: Original strand, 29730839 - 29731005
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaa 150  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||   ||        |||||||||| || ||||||    
T  29730839 cagggtcgttcctatgaaataggaggctcgactctctttttaaaataggcccccagtaaaataaaaa--taatttttttttgtagctaagtttcattaaa 29730936  T
Q  151 aaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttac 223  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||   |||||| || ||||||||||||||  |||||||    
T  29730937 aaatcacaatcagaaaaacttctaaacatgaaacgaa---aaaaaaatt-agtgaaagagaggtgaaatttac 29731005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 283 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 9479208 - 9479128
Alignment:
Q  283 tatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattg 363  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  9479208 tatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaacgaaatagttttttaaattgactgattaagtaattatacaaattg 9479128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 356
Target Start/End: Original strand, 8358291 - 8358350
Alignment:
Q  297 atgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattata 356  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  8358291 atgattgttgtgattctttcaatgagataactttttaaattgactgattaagtgattata 8358350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 131 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 28105848 - 28105792
Alignment:
Q  131 tgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa 187  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  28105848 tgtagctaagcttcattaagaaattagaatcagaaaaacttttaaacatgaaacgaa 28105792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 183
Target Start/End: Original strand, 44002762 - 44002815
Alignment:
Q  130 gtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaa 183  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||    
T  44002762 gtgtagctaagcttcattaaaaaattataatcagaagaacttctaaacatgaaa 44002815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4100170 - 4100112
Alignment:
Q  152 aatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagag 210  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||    
T  4100170 aatcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagag 4100112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 4100269 - 4100228
Alignment:
Q  57 cgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaatag 98  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4100269 cgtccctatgaaataggaggttcggctctctttttaaaatag 4100228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 25061957 - 25061904
Alignment:
Q  310 ttctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattg 363  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||| |||||    
T  25061957 ttctttcaatgaaatagcttttcaaattaactgataaagtgattgtacaaattg 25061904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 51 - 370
Target Start/End: Original strand, 29308217 - 29308537
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaa 150  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||| ||||||||||||||    
T  29308217 cagggccgtccccatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaatttttttgtgtagttaagctttattaaa 29308316  T
Q  151 aaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtgatttggatttgtcact 249  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  29308317 aaatcagaatcataagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttactaacggtgtcatttagatttatcact 29308416  T
Q  250 tatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagt 349  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29308417 tatccattgtgggaaaggggaaaacgaatgatttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattacttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagt 29308516  T
Q  350 cattataccaattggtagtgg 370  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  29308517 cattataccaattggtagtgg 29308537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 56 - 370
Target Start/End: Original strand, 1092796 - 1093110
Alignment:
Q  56 ccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaaatc 155  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||     
T  1092796 ccgtccctatgaaataggaggctcggttctctatttaaaataggcctctaataaaataaaaacgcaatttttttatgtagctaagctttattaaaaaatt 1092895  T
Q  156 agaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtgatttggatttgtcacttatcc 254  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1092896 agaatcaaaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagatgtagaatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttatcc 1092995  T
Q  255 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatta 354  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  1092996 gttttgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttc-atgaaatagctttttaaattgactgatttagtcatta 1093094  T
Q  355 taccaattggtagtgg 370  Q
    ||||||||||||||||    
T  1093095 taccaattggtagtgg 1093110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 48 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 31861304 - 31861001
Alignment:
Q  48 atacagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaa-cgcaannnnnnngtgtagctaagctttat 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||       |||||| ||||||||||    
T  31861304 atacagggccgtccctatgaaataggaggctcgactctctatttaaaataggcccccaatagaataaaaaacgcaatttttttgtgtagttaagctttat 31861205  T
Q  147 taaaaaatc-agaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtgatttggatttg 244  Q
    |||||||   ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||  ||  |||| |||||    
T  31861204 taaaaaaaatagaattagaagagcttctaaacataaaacgaaatacaaaaaa-ttaagtgaaagagagatagaatttactaacgacgttgtttgaatttg 31861106  T
Q  245 tcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgat 344  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||               ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31861105 tcacttatccgttgtgggaaagggaaaaacgaatggtt---------------tgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgat 31861021  T
Q  345 taagtcattataccaattgg 364  Q
    ||||| ||||||| ||||||    
T  31861020 taagtaattatacaaattgg 31861001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 51 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 2618667 - 2618357
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaa 150  Q
    |||||||||||   |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| || ||       |||||| |||  || ||||||    
T  2618667 cagggccgtccatgtgaaataggaggttcggctctctttttaaaataggcccctagtaaaataaaa-cgtaatttttttgtgtagttaaatttcattaaa 2618569  T
Q  151 aaa-tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtcac 248  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||  |||  |||||| || ||||||||||  ||  |||||| | ||||||||  ||||||||||||||    
T  2618568 aaaatcagaataagaagaacttttaaacatgaaagcaattaaaaaaa-ttaagtgaaagag--gtgaaatttatccaacggtgtcgtttggatttgtcac 2618472  T
Q  249 ttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaa 347  Q
    |  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2618471 tcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaa 2618372  T
Q  348 gtcattataccaatt 362  Q
    || ||||||| ||||    
T  2618371 gtgattatacaaatt 2618357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 363
Target Start/End: Original strand, 3748397 - 3748631
Alignment:
Q  130 gtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaa--aacttgagtgaaagagaggtataatttac-taa 226  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||  || ||||||  || || ||||||||||| ||  ||||||| |||    
T  3748397 gtgtagctaagcttcattaaaaagtcaaaatcagaagaacttttaaatatgaaataaa-acaaaataaaattaagtgaaagagatgtgaaatttacctaa 3748495  T
Q  227 cggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatag 326  Q
    |||||| ||||||| | ||||||  | ||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3748496 cggtgtcatttggaat-gtcactcctacgtcgcatgaaaggggaaaacgaatagtttatgtgacaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatag 3748594  T
Q  327 cttttcaaattgactgattaagtcattataccaattg 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  3748595 cttttcaaattgattgattaagtgattatacaaattg 3748631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 131 - 363
Target Start/End: Original strand, 30915191 - 30915429
Alignment:
Q  131 tgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacg 228  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || || || ||| || |||||||||||| || ||||||| |||||    
T  30915191 tgtagttaagcttcattaaaaaatcagaatcagaagaacttataaacatgaaacaaaataaaataaaattaagtgaaagagagataaaatttacataacg 30915290  T
Q  229 gtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaa-----gaaatgattgttgtgattctttctatgaaa 323  Q
    ||||  |||| | | ||||||| | ||| ||  ||||||||| || |||||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  30915291 gtgtcgtttgaaat-gtcacttctacgtcgtaagaaaggggataatgaatggtttatgcgaaaaattaaagaaatgattgttgtgattctttcaattaaa 30915389  T
Q  324 tagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattg 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  30915390 tagcttttcaaattgactgattaagtaattatacaaattg 30915429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Original strand, 3514698 - 3514912
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||  ||  |||||| |||| |||||  ||||||||| ||    
T  3514698 aaaaaatcagaatcagaagaacttttaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaatggtgtcgtttggatttttc 3514795  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatt 345  Q
    |||  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||    
T  3514796 actcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgatatagctttccaaattgaatgatt 3514895  T
Q  346 aagtcattataccaatt 362  Q
    | || ||||||| ||||    
T  3514896 acgtgattatacaaatt 3514912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 131 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 6294490 - 6294279
Alignment:
Q  131 tgtagctaagctttattaaaaaa--tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttac-taa 226  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| ||| |||||||||||| || || || ||| ||  |||||||||||||  ||||||| |||    
T  6294490 tgtagctaagcttcattaaaaaaaatcagaatcaaaagaacttctaaacatgaaacaaaataaaataaaattatgtgaaagagaggtgaaatttacctaa 6294391  T
Q  227 cggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatag 326  Q
    ||||||  |||||| | ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  6294390 cggtgtcgtttggaat-gtcactcctacgtcgtgggaaaggggaaaacgaatagtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaattg 6294292  T
Q  327 cttttcaaattga 339  Q
    |||||||||||||    
T  6294291 cttttcaaattga 6294279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 195
Target Start/End: Original strand, 1690480 - 1690612
Alignment:
Q  64 atgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcag 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||       |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1690480 atgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcctccaataaaataaaaatgcaatttttttgtgtagctaaactttataaaaaaatcagaatcag 1690579  T
Q  164 aagagcttttaaacatgaaacg-aatacaaaaa 195  Q
    || ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  1690580 aaaagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaa 1690612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 225 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 6754346 - 6754208
Alignment:
Q  225 aacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaa 323  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6754346 aacggtgtcatttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaa 6754247  T
Q  324 tagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 362  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  6754246 tagctttccaaattgactgattaagtgactatacaaatt 6754208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 235 - 362
Target Start/End: Original strand, 628030 - 628157
Alignment:
Q  235 tttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttca 333  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  628030 tttggatttatcacttctctgttgtggaaaaggg-aaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttca 628128  T
Q  334 aattgactgattaagtcattataccaatt 362  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  628129 aattgactgattaagtgattatacaaatt 628157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 156 - 362
Target Start/End: Original strand, 12614574 - 12614778
Alignment:
Q  156 agaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtcacttatcc 254  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||  ||  |||||| ||||||||    |||| |||||| |||  ||     
T  12614574 agaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtcg--tttgaatttgttactcctct 12614669  T
Q  255 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatt 353  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12614670 gttgtggaaaagggtaaaacggatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgatt 12614769  T
Q  354 ataccaatt 362  Q
    |||| ||||    
T  12614770 atacaaatt 12614778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 6360975 - 6360762
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||  ||||||  | ||||||||||| | |  ||||| ||||||||||  |||| |||||||    
T  6360975 aaaaaatcaaaatcaaaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaataagtgaaagagatgaa--atttatctaacggtgtcgtttgaatttgtc 6360878  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatt 345  Q
    |||  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  6360877 actcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatacgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatg-aataacttttcaaattgactgatt 6360779  T
Q  346 aagtcattataccaatt 362  Q
    |||| ||||||| ||||    
T  6360778 aagtgattatacaaatt 6360762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 228 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 29401277 - 29401142
Alignment:
Q  228 ggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatag 326  Q
    ||||| ||||||||||||||||  || || |||| |||||| || |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  29401277 ggtgtcatttggatttgtcactcctctgtcgtggaaaagggtaagacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataa 29401178  T
Q  327 cttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  29401177 cttttcaaattgactgattaagtgattatactaatt 29401142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 59 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22504050 - 22503751
Alignment:
Q  59 tcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaaat---c 155  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| || |||||||||| || ||       ||||||||||  || |||||||||    |    
T  22504050 tccctatgaaataggaggctcggttctctttttaaaatagaccctcagtaaaataaaa-cgtaatttttttgtgtagctaaatttcattaaaaaaaaaac 22503952  T
Q  156 agaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaac-ttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtcacttatc 253  Q
    ||||||||||||  || ||||||| ||| ||||  ||||||  || ||||||   |||||  |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  22503951 agaatcagaagaagttctaaacataaaaggaatttaaaaaaaattaagtgaa---gaggtgaaatttatctaacggtgtcatttgaatttgtcacttctc 22503855  T
Q  254 cgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcat 352  Q
     ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||| | |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  22503854 tgttgtggaaaagggtaaaatgaatggtttatacgaagaaaaaaatgattgttttaattctttcaacgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgat 22503755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 152 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21946317 - 21946109
Alignment:
Q  152 aatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaa-aacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtgatttggatttgtcact 249  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||| || |||||| || || ||||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||| ||  ||||||    
T  21946317 aatcagaatcagaataacttttaaatatgaaacaaa-acaaaataaattaagtgaaagagaggtggaatttacctaacggtgtcgtttgaat--gtcact 21946221  T
Q  250 tatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagt 349  Q
      | ||| || |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21946220 cttacgt-gtaggaaagaggaaaacgaattgtttatgcgaaaaagaaataattgttatggttctttcaatgaaatagcttttcaaatagactgattaagt 21946122  T
Q  350 cattataccaatt 362  Q
     ||||||| ||||    
T  21946121 gattatacaaatt 21946109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 223 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 57830 - 57690
Alignment:
Q  223 ctaacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatga 321  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||  ||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  57830 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctattgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttgaatga 57731  T
Q  322 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 362  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  57730 aatagctttctaaattgactgattaagtgattatacaaatt 57690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 235 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 29149533 - 29149405
Alignment:
Q  235 tttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttca 333  Q
    |||||||||||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||    
T  29149533 tttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaactaactttcca 29149434  T
Q  334 aattgactgattaagtcattataccaatt 362  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  29149433 aattgactgattaagtgattatacaaatt 29149405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 350717 - 350422
Alignment:
Q  64 atgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcag 163  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||  ||       |||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||    
T  350717 atgaaataggaggttcgactctctttttaaaataggtcccc--taaaataaaaacataacttttttgtgtagctaaacttcattaaaaaattagaattag 350620  T
Q  164 aa-gagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagaga--ggtataatttac-taacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttg 258  Q
    || || ||| ||||||||||||||| || |||||| || | ||||||| |  |||  ||||||| | |||||||  ||| ||||| ||| |  ||||||     
T  350619 aaagaacttctaaacatgaaacgaaataaaaaaaaattaaatgaaagatataggtgaaatttacctgacggtgtcgttttgatttatcattcctccgtta 350520  T
Q  259 tgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcta-tgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattata 356  Q
    ||||||| |||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  350519 tgggaaaagggaaa-caaattgtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttttattgaaatagctttcgaaattgactgattgagtgattata 350422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Original strand, 7525015 - 7525228
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    ||||||||||||| |||| |  || ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||| ||  ||  |||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  7525015 aaaaaatcagaataagaaaaagttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaatag--gtgaaatttatctaacggtgtc-tttggatttgtc 7525111  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatt 345  Q
    |||  || ||||||| |||||| ||||  ||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||    
T  7525112 actcctctgttgtggaaaagggtaaaataaattgtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaataaaataactttccaaattgactgatt 7525211  T
Q  346 aagtcattataccaatt 362  Q
    |||| ||||||| ||||    
T  7525212 aagtgattatacaaatt 7525228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 255 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 11088655 - 11088564
Alignment:
Q  255 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcta-tgaaatagcttttcaaattgactgatta 346  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11088655 gttgtggtaaaggggaaa-caaatggtttatgcaaaaaagaaatgattgttgtgattctttttattgaaatagcttttcaaattgactgatta 11088564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 191 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 19231786 - 19231627
Alignment:
Q  191 aaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtga 289  Q
    |||||| || ||||||||||||||  ||||||| |||  || |  ||||||||| |||||| ||| ||||||||||   ||||| |||| ||||||  ||    
T  19231786 aaaaaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaagagtattgtttggatttatcacttctccattgtgggaaaattgaaaaagaatagtttatacga 19231687  T
Q  290 aaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagt 349  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19231686 aaaagaaatgattgttgtgattttttcaatgtcatagcttttcaaattgattgattaagt 19231627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11088886 - 11088711
Alignment:
Q  48 atacagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttatt 147  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||   ||       |||||||||| ||| |||    
T  11088886 atacagggccgtttctatgaaataggaggctcaactctctttttaaaataggccccc--taaaataaaaatataaattttttgtgtagctaaacttcatt 11088789  T
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacg-aatacaaaaa-acttgagtgaaagagaggtataatttac 223  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||| | || ||||||||||||||  |||||||    
T  11088788 aaaaaatcagaattagaagaacttctaaacatgaaacgaaataaaaaaagaattaagtgaaagagaggtgaaatttac 11088711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 286 - 370
Target Start/End: Original strand, 1690619 - 1690703
Alignment:
Q  286 gtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||| ||||    
T  1690619 gtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataaattttcaaattgattgatcaagtgattatacaaattggtggtgg 1690703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 295 - 362
Target Start/End: Original strand, 14893412 - 14893479
Alignment:
Q  295 aaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 362  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  14893412 aaatgattgttgtgattcttttaacgaaatagtttttcaaattgactgattaagtaattatacaaatt 14893479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 29401450 - 29401388
Alignment:
Q  54 ggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaa 116  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29401450 ggccgtccccgtgaaataggaggctcgactctctttttaaaataggcccctagtaaaataaaa 29401388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 31234961 - 31234911
Alignment:
Q  314 ttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattgg 364  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  31234961 ttctttgaaatagcttttcaaattgattgattaagtgattatacaaattgg 31234911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 116
Target Start/End: Original strand, 31258321 - 31258387
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctattt-aaaataggcccccaataaaataaaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | ||||||||||    
T  31258321 cagggccgtccccgtgaaataggaggctcggctctctttttaaaaacaggcccctagtaaaataaaa 31258387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 6361063 - 6361012
Alignment:
Q  65 tgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaa 116  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  6361063 tgaaatagaaggctcggctctctttttaaaataggtccctagtaaaataaaa 6361012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 11575213 - 11575169
Alignment:
Q  73 gaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaa 117  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  11575213 gaggctcggctctcaatcaaaaataggcccctaataaaataaaaa 11575169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 39)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 51 - 346
Target Start/End: Original strand, 17117395 - 17117691
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaa 150  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||    
T  17117395 cagggccgtccctatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaatgcaatttttttgtgtagctaagctttattaaa 17117494  T
Q  151 aaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtgatttggatttgtcact 249  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17117495 aaatcagaatcagaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttactaacggtgtcgtttggatttgtcact 17117594  T
Q  250 tatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatta 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17117595 tatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatatgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgatta 17117691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 52 - 362
Target Start/End: Original strand, 18172694 - 18173002
Alignment:
Q  52 agggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaa 151  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||||| ||||||||||||||    
T  18172694 agggccgtccctatgaaatag-aggttcggctctctatttaaaataggtccccaataaaataaaaacgcaatttttttgtgtagccaagctttattaaaa 18172792  T
Q  152 aatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtgatttggatttgtcactt 250  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  18172793 aatcagaatcagaagagtttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattg--tgaaagagaggtagaatttaccaacggcgtcgtttggatttgtcactt 18172890  T
Q  251 atccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtc 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  18172891 atccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcgatgaaatagcttttcaaattgagtgattaagtg 18172990  T
Q  351 attataccaatt 362  Q
    ||||||| ||||    
T  18172991 attatacaaatt 18173002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 53 - 364
Target Start/End: Original strand, 38985461 - 38985773
Alignment:
Q  53 gggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnn-gtgtagctaagctttattaaaa 151  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||        |||||| |||||||||||||||    
T  38985461 gggccgtccctatgaaatag-aggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgtaattttttgtgtgtagttaagctttattaaaa 38985559  T
Q  152 aatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtgatttggatttgtcactt 250  Q
    ||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||| |||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  38985560 aatcagaatcagaagagtttctaaaaatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagatgtagaattcactaacggcgtcttttggatttgtcactt 38985659  T
Q  251 atccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtc 350  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |     
T  38985660 atccgttgtggaaaaggggaaaacaaatgttttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgattgattaaatg 38985759  T
Q  351 attataccaattgg 364  Q
    ||||||| ||||||    
T  38985760 attatacaaattgg 38985773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 53 - 364
Target Start/End: Original strand, 21746983 - 21747294
Alignment:
Q  53 gggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaa 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||       |||||  ||||||||||||||||    
T  21746983 gggccgtccctatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggtctccaataaaataaaaacacaatttttttgtgtaattaagctttattaaaaa 21747082  T
Q  153 atcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtgatttggatttgtcactta 251  Q
    |  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||    
T  21747083 aatagaatcaaaagagcttttaaacatgaaacgaaatacaaaaaa-ttcagtgaaagagaggtagaatttactaacggcgtcgtttgaatttctcactta 21747181  T
Q  252 tccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtca 351  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||||| |    
T  21747182 tctgttgtgggaaagggaaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaattattgttgtgattctttcaatgacatagtattttaaattgactgattaagtga 21747281  T
Q  352 ttataccaattgg 364  Q
    |||||| ||||||    
T  21747282 ttatacaaattgg 21747294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 55 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15457812 - 15457500
Alignment:
Q  55 gccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnn-gtgtagctaagctttattaaaaaa 153  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||        ||||||||||||||||||||||||    
T  15457812 gccgtccctatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggtcttcaataaaataaaaacacaattctttttgtgtagctaagctttattaaaaaa 15457713  T
Q  154 tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaata-caaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtgatttggatttgtcacttat 252  Q
    ||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| || ||||||||||| | ||  |||||||||||||||| |    
T  15457712 tcaaaataagaagagcttctgaacatgaaacgaaaaacaaaaaaattaagtgaaagagagatagaatttactaacagcgtcgtttggatttgtcacttgt 15457613  T
Q  253 ccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtg-aaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtca 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15457612 ccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttgtgtgaaaaaaaaaattattgttgtgattctttcaataaaatagcttttcaaattgactgattaagtga 15457513  T
Q  352 ttataccaattgg 364  Q
    |||||| ||||||    
T  15457512 ttatacaaattgg 15457500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 51 - 364
Target Start/End: Original strand, 18915799 - 18916118
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnn----gtgtagctaagctttat 146  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||           ||| || ||||||||||    
T  18915799 cagggccgtccctataaaataggaggctcggctctctatttaaaatagggccccaataaaataaaaatgcaatttttttttttgtgcagttaagctttat 18915898  T
Q  147 taaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtgatttggatttg- 244  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||      
T  18915899 taaaaaaatagaatcagaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttactaacggcgtcgtttcgatttta 18915998  T
Q  245 tcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgat 344  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  18915999 tcacttatccgttgtgggaaagggaaaaacaaatagtttatgtgaaaaagaaatgattgctgtgattctttcagtgaaatagcttttcaaattgattgat 18916098  T
Q  345 taagtcattataccaattgg 364  Q
    ||||| ||||||| ||||||    
T  18916099 taagtgattatacaaattgg 18916118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 51 - 362
Target Start/End: Original strand, 26151497 - 26151809
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaa 150  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| || ||       ||||||||||  || ||||||    
T  26151497 cagggccgtccccgtgaaataggaggcttggctctctttttaaaataggcccctagtaaaataaaa-cgtaatttttttgtgtagctaaatttcattaaa 26151595  T
Q  151 aaa--tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtca 247  Q
    |||  ||||||||||||||  || |||||||||||  |||  |||||| || ||||||||||  ||  |||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  26151596 aaaaatcagaatcagaagaagttctaaacatgaaagtaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtca 26151693  T
Q  248 cttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatta 346  Q
    ||  || ||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26151694 ctcctctgttgtagaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgatta 26151793  T
Q  347 agtcattataccaatt 362  Q
    ||| ||||||| ||||    
T  26151794 agtgattatacaaatt 26151809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 64 - 363
Target Start/End: Original strand, 36059668 - 36059968
Alignment:
Q  64 atgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngt-gtagctaagctttattaaaaaatcagaatca 162  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||  || | ||||||||||||||||        | |||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  36059668 atgaaataggaggctcgactctttttttaaaataggtacc-agtaaaataaaaacgcaattttttttttgtagctaaacttcattaaaaaatcagattca 36059766  T
Q  163 gaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtg 260  Q
     |||| ||| |||||||||||| || || || ||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  |||||| | |||||| || ||| |||    
T  36059767 caagaacttctaaacatgaaacaaaataaaataaaattaagtgaaagagaggtaaaatttacgtaacggcgtcgtttggaat-gtcactcatacgtcgtg 36059865  T
Q  261 ggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaa 360  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  36059866 ggaaaagggaaaacgaatggtttatgcaaaaaagaaatgattgttgtggttctttcaatgaaatagctttttaaattaactgattaagtgattatacaaa 36059965  T
Q  361 ttg 363  Q
    |||    
T  36059966 ttg 36059968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 50 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 4856308 - 4855995
Alignment:
Q  50 acagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaa 149  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||| || ||       ||||||||||  || |||||    
T  4856308 acagggtcgtccccgtgaaataggaggctcgactctctttttaaaataggcccctagtaaaataaaa-cgtaatttttttgtgtagctaaatttcattaa 4856210  T
Q  150 aaaa--tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    ||||  ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||  ||  |||||| |||||  |||  ||||||||||||    
T  4856209 aaaaaatcagaatcagaagaagttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacaatgtcgtttggatttgtc 4856112  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatt 345  Q
    |||  || ||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4856111 actcctctgttgtggaaaaggttaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattcactgatt 4856012  T
Q  346 aagtcattataccaatt 362  Q
    |||| ||||||| ||||    
T  4856011 aagtgattatacaaatt 4855995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 52 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 39081708 - 39081399
Alignment:
Q  52 agggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaa 151  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||| ||| | ||||||||||||  ||       |||||| ||||||| |||| ||    
T  39081708 agggccgttcctatgaaataggaggttcggttctatttttaaaataggtccc-agtaaaataaaaacataatttttttgtgtagttaagcttcattataa 39081610  T
Q  152 aatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaa--aacttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtgatttggatttgtcact 249  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||| || ||||||  || || ||||||||||||||  |||||||  |  |||| ||||||| | ||||||    
T  39081609 aatcagaatcataagaacttttaaatatgaaacaaa-acaaaataaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaatgtgtcatttggaat-gtcact 39081512  T
Q  250 tatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagt 349  Q
      | ||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39081511 cctacgtcgtaggaaaggggaaaactaatggtttatatgaaaa-gaaataattgttgtaattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagt 39081413  T
Q  350 cattataccaattg 363  Q
     ||||||| |||||    
T  39081412 gattatacaaattg 39081399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 51 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 45619290 - 45618979
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaa 150  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||||||| || ||       ||| ||||||  || ||||||    
T  45619290 cagggccgtccccgtgaaatacgaggctcgactctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaa-cgtaatttgtttgtgaagctaaatttcattaaa 45619192  T
Q  151 aaa--tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtca 247  Q
    |||  ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||  ||  |||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  45619191 aaaaatcagaatcagaagaagttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtca 45619094  T
Q  248 cttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatta 346  Q
    ||  || ||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  45619093 ctcctctgttgtggaaaagggtaaaacaaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagc-ttccaaattgactgatta 45618995  T
Q  347 agtcattataccaatt 362  Q
    ||| ||||||| ||||    
T  45618994 agtgattatacaaatt 45618979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 51 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 13997627 - 13997323
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnn-gtgtagctaagctttattaa 149  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| | | |||||| |||||||||        |||||||||||||| |||||    
T  13997627 caggaccgttcctatgaaataggaggctcggttctatttttaaaataggccac-agtaaaatcaaaacgcaattctttttgtgtagctaagcttcattaa 13997529  T
Q  150 aaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtgatttggatttgtca 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||| || || || ||  || ||||||||||| ||  ||||||| |||  ||||  |||||| | ||||    
T  13997528 aaaatcagaatcagaagaacttttaaacacaaaacaaaataaaacaagattaagtgaaagagatgtgaaatttacctaaatgtgttgtttggaat-gtca 13997430  T
Q  248 cttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaa 347  Q
    || || ||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  13997429 ctcatacgtcgtaggaaaggg-aaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactcattaa 13997331  T
Q  348 gtcattat 355  Q
    || |||||    
T  13997330 gtgattat 13997323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 51 - 362
Target Start/End: Original strand, 18676059 - 18676373
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaa 150  Q
    ||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||| | |||||||||| || ||       ||||||||||  || ||||||    
T  18676059 cagggtcgtccctgtgaaataagaggctcagctctctttataaaataggcccctagtaaaataaaa-cgtaatttttttgtgtagctaaatttcattaaa 18676157  T
Q  151 aaa---tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    |||   |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||  ||  | |||| ||||||||||  |||| |||||||    
T  18676158 aaaaaatcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaactttatctaacggtgtcgtttgaatttgtc 18676255  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa--aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgat 344  Q
    |||  ||  |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18676256 actcctcttttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcaaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgat 18676355  T
Q  345 taagtcattataccaatt 362  Q
    ||||| ||||||| ||||    
T  18676356 taagttattatacaaatt 18676373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 48 - 356
Target Start/End: Original strand, 1226014 - 1226323
Alignment:
Q  48 atacagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnn-gtgtagctaagctttat 146  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||   ||||||||||||  ||        |||||||||| ||| ||    
T  1226014 atacagggccgttcctatgaaataggaggctcgactctctttttaaaataggcccct--taaaataaaaacataattttttttgtgtagctaaacttcat 1226111  T
Q  147 taaaaaa-tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtgatttggattt 243  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||| |  ||||||| ||||| |||  |||||||||    
T  1226112 taaaaaaatcagaattagaagaacttctaaacatgaaacgaaataaaaaaaaattaagtgaaagagagatgaaatttacctaacgatgtcgtttggattt 1226211  T
Q  244 gtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcta-tgaaatagcttttcaaattgactg 342  Q
     | | |  | |||||||||  |||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||    
T  1226212 atgattccttcgttgtggggtagg--aaaacaaatggtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttttattgaaataacttttcaaattgtctg 1226309  T
Q  343 attaagtcattata 356  Q
    ||| ||| ||||||    
T  1226310 attgagtgattata 1226323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 50 - 362
Target Start/End: Original strand, 41096288 - 41096600
Alignment:
Q  50 acagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaa 149  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||| || ||       |||||| |||  || |||||    
T  41096288 acagggccgtccctgtgaaataggaggctcggctctctttttaaaatagacccctagtaaaataaaa-cgtaattttt--gtgtagttaaatttcattaa 41096384  T
Q  150 aaaat-cagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaat-acaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    ||||  || ||| |||||| ||| ||||||||||| |||| | ||||||  | ||||||||||  ||  |||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  41096385 aaaaaacataataagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaaataagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtc 41096482  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa--aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgat 344  Q
    |||  || ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  41096483 actcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggttaatgcgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagttttccaaattgactgat 41096582  T
Q  345 taagtcattataccaatt 362  Q
    ||||| ||||||| ||||    
T  41096583 taagtgattatacaaatt 41096600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 50 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 2064120 - 2063807
Alignment:
Q  50 acagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaa 149  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||  | |||||||||| || ||       |||||||||| ||| |||||    
T  2064120 acagggccgttcctgtgaaataggaggctcaactctctttttaaaataggtccgtagtaaaataaaa-cgtaatatctttgtgtagctaaacttcattaa 2064022  T
Q  150 aaaa-tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaat-acaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||| ||| || |||| | |||||| || ||||||||||  ||  |||||| ||||||||||  |||| |||||||    
T  2064021 aaaaatcagaatcagaagaccttctaaatatggaaggaattaaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttgaatttgtc 2063924  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtga-aaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatt 345  Q
    |||  || ||||||| ||| || |||||||||||||| || |  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2063923 actcctctgttgtggaaaaaggtaaaacgaatggtttttgcgggaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgatt 2063824  T
Q  346 aagtcattataccaatt 362  Q
    |||| ||||||| ||||    
T  2063823 aagtgattatacaaatt 2063807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 137 - 364
Target Start/End: Original strand, 31273002 - 31273230
Alignment:
Q  137 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtgat 235  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||| || ||||||||  | |||| || || |||||||| ||  ||||||| |||| ||||  |    
T  31273002 taagcttcattaaaaaatcaaaatcagaagaacttctaaaaattaaacgaattaagaaaaattaagcgaaagagaagtgaaatttacctaactgtgtcgt 31273101  T
Q  236 ttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaa 335  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||  || ||||    
T  31273102 ttggatttgtcacttttctgttgtgggaaagagaaaaacaaatggtttatgcgaaaaagaaatgaatgttatgattcttttaatgaaatagtattccaaa 31273201  T
Q  336 ttgactgattaagtcattataccaattgg 364  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  31273202 ttgactgattaaatgattatacaaattgg 31273230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 145 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 1419129 - 1418910
Alignment:
Q  145 attaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaa--aacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtgatttggat 241  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||  || || ||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| |||||||     
T  1419129 attaaaaagtcaaaatcagaagaacttttaaacatgaaacaaa-acaaaataaaattaagtgaaagagaagtgaaatttacctaacggtgtcatttggaa 1419031  T
Q  242 ttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgact 341  Q
    | |||||| || |||  | |||||||  |||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  1419030 t-gtcactcatacgtcataggaaaggaaaaaatgaatagtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagctttacaaattgact 1418932  T
Q  342 gattaagtcattataccaattg 363  Q
    |||||||| ||||||| |||||    
T  1418931 gattaagtgattatacaaattg 1418910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 64 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 7993933 - 7993634
Alignment:
Q  64 atgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaaa--tcagaatc 161  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || | |||||||||| |  ||       |||||| |||  || |||||||||  ||||||||    
T  7993933 atgaaataggaggttcggctctctttttaaaataggcacctagtaaaataaaa-cataatttttttgtgtagttaaatttcattaaaaaaaatcagaatc 7993835  T
Q  162 agaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtg 260  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| |  |||||||||   ||  |||||| ||||||||||  |||||||||||||||  ||  |||||    
T  7993834 agaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaata-agtgaaagat--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctattgtg 7993738  T
Q  261 ggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa--aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattatacc 358  Q
    | |||||| ||||||||||||||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||     
T  7993737 gaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaaagattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattggctgattaagtgattataca 7993638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Original strand, 42411406 - 42411620
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||  |||| | || ||||||||||  ||  |||||| ||||||||||  ||||||||| ||    
T  42411406 aaaaaatcagaatcagaagaacttttaaacatgaaagaaattaaaaataattaagtgaaagag--gttaaatttatctaacggtgtcgtttggatttttc 42411503  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaa-aagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatt 345  Q
    |||  || ||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  42411504 actcctctgttgtgaaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagtaaaaaatgattgttgtgattctttaaatgaaatagctttccaaattgactaatt 42411603  T
Q  346 aagtcattataccaatt 362  Q
    |||| ||||||| ||||    
T  42411604 aagtgattatacaaatt 42411620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 65 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 6530962 - 6530661
Alignment:
Q  65 tgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaaa-----tcagaa 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||| || ||       ||||||||||  || |||||||||     ||||||    
T  6530962 tgaaataggaggctcggctctctttttaaaataggctcctattaaaataaaa-cgtaatttctttgtgtagctaaatttcattaaaaaaaaaaatcagaa 6530864  T
Q  160 tcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttg 258  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||| | |  ||||| ||||| |||   |||| || |||||||  || ||||    
T  6530863 tcaaaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagagatgaa--atttatctaacagtgacgtttgaatctgtcactcctctgttg 6530766  T
Q  259 tgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaaga-aatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattatac 357  Q
    ||| | |||  ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6530765 tggaataggataaaacgaatggtttatgcgaagaaaataatgattgttgtgattctttcaatgaaataccttttcaaattgactgattaagtgattatac 6530666  T
Q  358 caatt 362  Q
     ||||    
T  6530665 aaatt 6530661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 51 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 13020736 - 13020425
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaa 150  Q
    ||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| || ||       |||| |||||  || ||||||    
T  13020736 cagggccgtccccgtagaataggaggttcggctctctttttaaaataggcccctagtaaaataaaa-cgtaatttttttgtgttgctaaatttcattaaa 13020638  T
Q  151 aaa--tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtca 247  Q
    |||  ||||||| ||||||  || ||||||||||| ||||| |||| | || ||||||||||  ||  |||||| |||||||||| ||||| |||| |||    
T  13020637 aaaaatcagaattagaagaagttctaaacatgaaaggaataaaaaaga-ttaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcatttgaatttttca 13020541  T
Q  248 cttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatta 346  Q
    ||  || ||||||  ||| || ||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13020540 ctcctctgttgtgaaaaaaggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaattattgttgtgattctttaaatgaaatagctttccaaattgactgatta 13020441  T
Q  347 agtcattataccaatt 362  Q
    ||| ||||||| ||||    
T  13020440 agtgattatacaaatt 13020425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 346
Target Start/End: Original strand, 42759604 - 42759802
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||| | |  ||||| ||||||||||  |||| |||||||    
T  42759604 aaaaaatcagaatcagaagaagttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagagatgga--atttatctaacggtgtcgtttgaatttgtc 42759701  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatt 345  Q
    ||   ||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  42759702 acccctctattgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttccaaattgactgatt 42759801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 223 - 362
Target Start/End: Original strand, 19367341 - 19367481
Alignment:
Q  223 ctaacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatga 321  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||   | ||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  19367341 ctaacggtgtcgtttgaatttgtcactccactgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttattcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatga 19367440  T
Q  322 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  19367441 aatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaaatt 19367481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 148 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 36481611 - 36481428
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaat-acaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgt 245  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| | |||||| || ||||||||||  ||  |||||| ||| ||||||  |||||||||||    
T  36481611 aaaaaatcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaccggtgtcgtttggatttgt 36481514  T
Q  246 cacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttt 330  Q
    ||||  || ||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36481513 cactcctctgttgtggaaaagggtaaaatgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttt 36481428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 25222639 - 25222325
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaa 150  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||| | |||||| |||||||| | |||||||||| || ||       ||||||||||  |||||||||    
T  25222639 cagggccgtccccgtgaaatagaaggtttggctctttttttaaagtaggcccctagtaaaataaaa-cgtaatttttttgtgtagctaaattttattaaa 25222541  T
Q  151 aaa----tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtgatttggatttgt 245  Q
    |||    ||| |||||||| |  || ||||||||||| ||||  |||||| || |||||||||   ||  ||||||  |||||||||  |||| ||||||    
T  25222540 aaaaaaatcaaaatcagaaaaagttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagat--gtgaaatttatataacggtgttgtttgaatttgt 25222443  T
Q  246 cacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgat 344  Q
    ||||  || ||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||| ||    
T  25222442 cactcctctgttgtgaaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttctaaattgactaat 25222343  T
Q  345 taagtcattataccaatt 362  Q
    ||||| ||||||| ||||    
T  25222342 taagtgattatacaaatt 25222325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 349
Target Start/End: Original strand, 29480484 - 29480686
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaa--aacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtgatttggatttg 244  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| || ||||||  || || ||||||||||||||  | ||||| |||||||||  |||||| | |    
T  29480484 aaaaaatcagaatcagaagaacttttaaatacgaaacaaa-acaaaataaaattaagtgaaagagaggtgaactttacctaacggtgtcgtttggaat-g 29480581  T
Q  245 tcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgat 344  Q
    |||||  |  || ||  |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||     
T  29480582 tcactcctatgtcgtaagaaaggggaagacaaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaataatttttcaaattgactgaa 29480681  T
Q  345 taagt 349  Q
    |||||    
T  29480682 taagt 29480686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 258 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 38599507 - 38599403
Alignment:
Q  258 gtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattatac 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  38599507 gtgggaaaggggaaaacgaatggtttatga-aaaaataaataattgttttgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgattgattaagtgattatac 38599409  T
Q  358 caattg 363  Q
     |||||    
T  38599408 aaattg 38599403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 363
Target Start/End: Original strand, 27302491 - 27302591
Alignment:
Q  263 aaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 362  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  27302491 aaaggtgaaaatgaatggtttatgcgaaaaataaatgattgttgtgattcttttaatgatatagcttttcaaattgaccgattaagtgattatacaaatt 27302590  T
Q  363 g 363  Q
    |    
T  27302591 g 27302591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 235 - 362
Target Start/End: Original strand, 34061794 - 34061918
Alignment:
Q  235 tttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttca 333  Q
    ||||||||||||||| |||    |||| |||||| |||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  34061794 tttggatttgtcactcatc----gtggaaaagggtaaaacggatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttcca 34061889  T
Q  334 aattgactgattaagtcattataccaatt 362  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||    
T  34061890 aattgactgattaagtaatcatacaaatt 34061918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 150 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12269639 - 12269427
Alignment:
Q  150 aaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtca 247  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||||| || ||||||  ||||||  |||||| ||||||||||  |||| ||||||||    
T  12269639 aaaatcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaagtgaa--agaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttgaatttgtca 12269542  T
Q  248 cttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatta 346  Q
     |  || | ||||| ||| |  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||  ||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  12269541 ttcctctgctgtggaaaaagataaaacgaatggtttatgtgaagaaaaaaatgattgtggtgatttttttaatgaaatagctttccaaa-tcactgatta 12269443  T
Q  347 agtcattataccaatt 362  Q
    ||| ||||||| ||||    
T  12269442 agtgattatacaaatt 12269427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 45042706 - 45042391
Alignment:
Q  50 acagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaa 149  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||  ||||||| || |||||||||| |||  | |||||||||| || ||       |||||||||| ||| |||||    
T  45042706 acagggccgtccctgtgaaatatgagaatcggctcactttttaaaatagacccatagtaaaataaaa-cgtaatttttttgtgtagctaaacttcattaa 45042608  T
Q  150 aaaa---tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgt 245  Q
    ||||   |||||||| ||||| ||| |||| |||||| ||||  |||||| || ||||||| ||  ||  |||||| | |||  |||  |||| ||||||    
T  45042607 aaaaaaatcagaatcggaagaacttctaaatatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaatag--gtgaaatttatccaacaatgtcgtttgaatttgt 45042510  T
Q  246 cacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagctttt---caaattgact 341  Q
    ||||  || ||||||| |||||| ||  ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||   ||||||||||    
T  45042509 cactcctctgttgtggaaaagggtaa--cgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagactttcaccaaattgact 45042412  T
Q  342 gattaagtcattataccaatt 362  Q
    |||||||| ||||||| ||||    
T  45042411 gattaagtgattatacaaatt 45042391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 48 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 13001954 - 13001655
Alignment:
Q  48 atacagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagcttt-at 146  Q
    |||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||| | || ||        ||||| |||| ||| ||    
T  13001954 atacagggccgttcctataaaatatgaggatcgactctctttttaaaataggcccccggtaaaataatagcggaattttta--tgtagttaaggttttat 13001857  T
Q  147 taaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaact--tgagtgaaagagaggtataatttact-aacggtgtgatttggattt 243  Q
     |||||||||||||||  |||  || |||||| |||||||| | |||||| |  | ||||||||||| ||  |||||||  ||| ||||  |||||||||    
T  13001856 aaaaaaatcagaatcaatagaatttctaaacacgaaacgaa-ataaaaaattaataagtgaaagagaagtgcaatttaccgaacagtgtcgtttggattt 13001758  T
Q  244 gtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatg-tgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactg 342  Q
    ||||||  |  ||||||||||||| |||||||||| || |||  ||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||     
T  13001757 gtcactcctttgttgtgggaaaggagaaaacgaattgtatatactgaaaaa-aaatgattattgtgattcttttaatgaaatagctttataaattgacta 13001659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 9029812 - 9029683
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaact--tgagtgaaagagaggtataatttactaa-cggtgtgatttggatttg 244  Q
    ||||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||||||| | |||||| |  | ||||||||||||||  ||||||| || ||||||  ||||||||||    
T  9029812 aaaaaatcataatcaatagaacttctaaacatgaaacgaa-ataaaaaattaataagtgaaagagaggtgaaatttaccaaacggtgtcgtttggatttg 9029714  T
Q  245 tcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaat 278  Q
    ||||   ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  9029713 tcac---tccgttgtgagaaaggagaaaacgaat 9029683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 282 - 364
Target Start/End: Original strand, 18482488 - 18482571
Alignment:
Q  282 ttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttt-tcaaattgactgattaagtcattataccaattgg 364  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| || | | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  18482488 ttatgagaaaaagacattattgttgttattctttcaatgaaataactgtgttaaattgactgattaagcgattatacaaattgg 18482571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 100
Target Start/End: Original strand, 19367174 - 19367223
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggc 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  19367174 cagggccgtccctgtgaaataggaggcttgactctctttttaaaataggc 19367223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 3400174 - 3400106
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacg 119  Q
    |||||||||||| | | | | |||||||||||||||   |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  3400174 cagggccgtccctaagtattcggaggctcggctctcatgttaaaataggcccttaataaaataaaaacg 3400106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 130 - 214
Target Start/End: Original strand, 24233651 - 24233735
Alignment:
Q  130 gtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggt 214  Q
    |||||||||||||  ||  | |||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||  ||||||| || || |||||||||||    
T  24233651 gtgtagctaagctacatacacaaatcagaattagaagaacttctaaacatgcaacgaaatcaaaaaaattaagcgaaagagaggt 24233735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 38599621 - 38599593
Alignment:
Q  258 gtgggaaaggggaaaacgaatggtttatg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38599621 gtgggaaaggggaaaacgaatggtttatg 38599593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 56 - 364
Target Start/End: Original strand, 34523709 - 34524015
Alignment:
Q  56 ccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaaatc 155  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| ||    
T  34523709 ccgtccctatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaatttttttgtgtagctaagctttattaaaaa-tc 34523807  T
Q  156 agaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtgatttggatttgtcacttatcc 254  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||  ||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34523808 agaatcagaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagag--gtagaatttaataacggtgtcgtttggatttgtcacttatcc 34523905  T
Q  255 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatta 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34523906 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatatgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgatta 34524005  T
Q  355 taccaattgg 364  Q
    ||| ||||||    
T  34524006 tacaaattgg 34524015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 55 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 12531871 - 12531559
Alignment:
Q  55 gccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgt--agctaagctttattaaaaa 152  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||       ||||  |||||||||||||||||||    
T  12531871 gccgtccctatgaaataggaggcttggctctctatttaaaataggctcccaataaaataaaaacacaatttttttgtgtgtagctaagctttattaaaaa 12531772  T
Q  153 atcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtgatttggatttgtcactta 251  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||    
T  12531771 atcagaataagaagagcttctaaacatgaaacgaaatataaaaaaattaagtgaaagagaggtataatttactaacggcgtcgtttgaatttgtcattta 12531672  T
Q  252 tccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtca 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  12531671 tccgttgtgggaaaggggaaaacaaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagatttttaaattgactgattaagtga 12531572  T
Q  352 ttataccaattgg 364  Q
    |||||| ||||||    
T  12531571 ttatacaaattgg 12531559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 51 - 370
Target Start/End: Original strand, 39697695 - 39698008
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnn-gtgtagctaagctttattaa 149  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||        |||||||||     ||||||    
T  39697695 cagggccgtccctatgaaataggaggcttgggtctctatttaaaataggcccccaata---taaaaatgcaattttttttgtgtagcta-----tattaa 39697786  T
Q  150 aaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtgatttggatttgtcac 248  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  39697787 aaaatcagaatcagaagagtttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaaataagtgaaagagaggtagaatttactaacagtgtcatttggatttgtcac 39697886  T
Q  249 ttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaag 348  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  39697887 ttatccgttgtgggaaaggcgaaaacgaatggtttatgtaaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactaattaaa 39697986  T
Q  349 tcattataccaattggtagtgg 370  Q
    | || |||| ||||||| ||||    
T  39697987 tgatcatacaaattggtggtgg 39698008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 64 - 364
Target Start/End: Original strand, 23567040 - 23567338
Alignment:
Q  64 atgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnn--gtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatc 161  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||         |||||  || ||||||||||||||  |||||     
T  23567040 atgaaatagg-ggctcaactctctatttaaaataagcccccaataaaataaaaacgcaatttttttttgtgtaattatgctttattaaaaaaatagaat- 23567137  T
Q  162 agaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtg 260  Q
      |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  23567138 --aagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaa-ttaagtgaaagagtggtagaatttactaacggcgtcgtttggatttgtcatttatccgttgtg 23567234  T
Q  261 ggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaa 360  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  23567235 ggaaaaggaaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatcattgttgtgatactttcaatgaaatagtatttcaaattgactgattaagtgattatacaaa 23567334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 131 - 362
Target Start/End: Original strand, 32098007 - 32098240
Alignment:
Q  131 tgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacg 228  Q
    |||| |||||| | |||||||||||  ||||||| || ||| ||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||||    
T  32098007 tgtaactaagcatcattaaaaaatcgaaatcagatgaacttctaaacatgaaacgaaataaaaaaaaattaagtgaaagagaagtgaaatttacgtaacg 32098106  T
Q  229 gtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagct 328  Q
    ||||  |||||||| ||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  32098107 gtgtcgtttggattcgtcactcctctgttgtgggaatggggaaaacgaatggtttatgcaaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagtt 32098206  T
Q  329 tttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 362  Q
    || |||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  32098207 ttccaaattgactgattaagtgatcatacaaatt 32098240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 362
Target Start/End: Original strand, 43926076 - 43926385
Alignment:
Q  52 agggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaa 151  Q
    ||||||||| |  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   | |||||||||| || ||       ||||||||||  || | |||||    
T  43926076 agggccgtctccgtgaaataggaagctcggctctctttttaaaataggcctttagtaaaataaaa-cgtaatttttttgtgtagctaaatttcactaaaa 43926174  T
Q  152 aatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtgatttggatttgtcactt 250  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |||||| || || |||||||  ||  ||||||  |||||||||  |||||||||||||||     
T  43926175 aatcagaatcagaagaagttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaagagaaagag--gtgaaatttatgtaacggtgtcgtttggatttgtcactc 43926272  T
Q  251 atccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagt 349  Q
     ||  |||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926273 ctctattgtggaaaagggtaaagcgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagt 43926372  T
Q  350 cattataccaatt 362  Q
     ||||||| ||||    
T  43926373 aattatacaaatt 43926385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 51 - 362
Target Start/End: Original strand, 18420355 - 18420671
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaa 150  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || | |||||||||| || ||       ||||||||||  || ||||||    
T  18420355 cagggtcgtccctgtgaaataggaggctcggctctctttttaaaatagtctcctagtaaaataaaa-cgtaatttttttgtgtagctaaatttcattaaa 18420453  T
Q  151 aaa-----tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaat-acaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggattt 243  Q
    |||     |||||||||||| | ||| ||||||||||| |||| | |||||| || ||||||| ||  ||  |||||| ||||||||||  |||||||||    
T  18420454 aaaaaaaatcagaatcagaataacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaagtgaaaaag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggattt 18420551  T
Q  244 gtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactg 342  Q
    ||||||  || ||||||  ||| || ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18420552 gtcactcctctgttgtgaaaaaaggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaacagcttttcaaattgactg 18420651  T
Q  343 attaagtcattataccaatt 362  Q
    ||||||| ||||||| ||||    
T  18420652 attaagtgattatacaaatt 18420671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 13585515 - 13585301
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||| ||  ||  |||||| ||||||| ||  |||||| |||||    
T  13585515 aaaaaatcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaaaag--gtgaaatttatctaacggcgtcgtttggacttgtc 13585418  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatt 345  Q
    |||  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13585417 actcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgatt 13585318  T
Q  346 aagtcattataccaatt 362  Q
    || | ||||||| ||||    
T  13585317 aattgattatacaaatt 13585301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 52 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 7858398 - 7858087
Alignment:
Q  52 agggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaa 151  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||| || ||       |||  |||||  || |||||||    
T  7858398 agggccgtccccgtggaataggaggctcgactctctttttaaaataggcccctagtaaaataaaa-cgtaatttttttgtgctgctaaatttcattaaaa 7858300  T
Q  152 aa---tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtca 247  Q
    ||   ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| | |  ||||||||||  ||  |||||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  7858299 aaaaatcagaatcagaagaagttctaaacatgaaaggaataaaaaaga-taaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcatttggatttttca 7858203  T
Q  248 cttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatta 346  Q
    ||  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| || |||| |||||||||||||||    
T  7858202 ctcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttaaatgaattaactttccaaattgactgatta 7858103  T
Q  347 agtcattataccaatt 362  Q
    ||| ||||||| ||||    
T  7858102 agtgattatacaaatt 7858087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Original strand, 43967918 - 43968132
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||  |||||| || ||||||||||  ||  |||||| |||| | |||  ||||||||||||    
T  43967918 aaaaaatcagaatcagaagaacttctaaatatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaaggatgtcgtttggatttgtc 43968015  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatt 345  Q
    |||  || ||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  43968016 actcctctgttgtggaaaagagtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgattgatt 43968115  T
Q  346 aagtcattataccaatt 362  Q
    |||| ||||||| ||||    
T  43968116 aagtgattatacaaatt 43968132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 3471900 - 3471602
Alignment:
Q  64 atgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaaa--tcagaatc 161  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |  | |||| ||||| || ||       |||||||||| ||| |||||||||  ||||||||    
T  3471900 atgaaataggaggctcggctctctttttaaaataagctcttagtaaagtaaaa-cgtaatttttttgtgtagctaaacttcattaaaaaaaatcagaatc 3471802  T
Q  162 agaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtg 260  Q
    | |||| ||| ||||||| ||| ||||  |||||| || ||||||| ||  ||  |||||| ||||||||||  ||||||| | |||||  || ||||||    
T  3471801 ataagaacttctaaacattaaaggaattaaaaaaa-ttaagtgaaatag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatctatcactcctctgttgtg 3471705  T
Q  261 ggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattatacca 359  Q
    | |||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  3471704 gaaaagggtaaaatgaatggttcatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaa 3471605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 152 - 362
Target Start/End: Original strand, 3628598 - 3628809
Alignment:
Q  152 aatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaa--aacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtgatttggatttgtcac 248  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||  || || ||||||||||||||  ||||||| |||| ||||  |||||| | |||||    
T  3628598 aatcagaatcaaaagaacttttaaacatgaaa-gaaaacaaaataaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaactgtgtcgtttggaat-gtcac 3628695  T
Q  249 ttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaag 348  Q
    |  | ||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  3628696 tcctacgtcgtaggaaacggaaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgactgattatg 3628795  T
Q  349 tcattataccaatt 362  Q
    | ||||||| ||||    
T  3628796 tgattatacaaatt 3628809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 67 - 357
Target Start/End: Original strand, 30915052 - 30915345
Alignment:
Q  67 aaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaag 166  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||  |||||||||||||  ||        ||||| |||| || |||||||||||| |||||||||    
T  30915052 aaataggaggttcggctctctttttaaaatagactcc--ataaaataaaaacataattgttttatgtagttaagtttcattaaaaaatcataatcagaag 30915149  T
Q  167 agcttttaaacatgaaacgaatacaaaaa----acttgagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgg 261  Q
    | | | |||| ||||||||||   |||||    | || |||||||||||| |  ||||| | | ||||||| |||||||||| ||| || || |||||||    
T  30915150 aacgtctaaaaatgaaacgaaataaaaaataataattaagtgaaagagagttgaaattttcctgacggtgttatttggatttatcatttctctgttgtgg 30915249  T
Q  262 gaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcta-tgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattatac 357  Q
    ||| ||||||| | |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30915250 gaatggggaaa-caaattatttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttttaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatac 30915345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1004272 - 1004060
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||  ||  |||||| ||||||||||  ||||   |||||    
T  1004272 aaaaaatcagaatcagaagaagttttaaacatgaaaggaattaaaaaaa-ttaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttg---ttgtc 1004179  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtga--aaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaat-agcttttcaaattgactga 343  Q
    |||  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||    
T  1004178 actcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgatgaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataattttttcaaattgactga 1004079  T
Q  344 ttaagtcattataccaatt 362  Q
    |||||| ||||||| ||||    
T  1004078 ttaagtgattatacaaatt 1004060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 142 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 42777969 - 42777763
Alignment:
Q  142 tttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaact--tgagtgaaagagaggtataatttact-aacggtgtgatttg 238  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||| ||| ||  ||||||||||| | |||||| |  | ||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||    
T  42777969 tttattaaaaaattagaatcaatagaacttctattcatgaaacgaa-ataaaaaattaataagtgaaagagaggtgaaatttactgaacggtgtggtttg 42777871  T
Q  239 gatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattg 338  Q
    | |||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||  ||||||    
T  42777870 gttttgtcactcctccgttgtgggaaatgagaaaacgaatggtatatgcggaaaaaaaatgattgttgtgattcttttaattaaatagctttctaaattg 42777771  T
Q  339 actgatta 346  Q
    ||| ||||    
T  42777770 actaatta 42777763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 223 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 18112259 - 18112118
Alignment:
Q  223 ctaacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa--aaagaaatgattgttgtgattctttctatg 320  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||  ||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||| ||     
T  18112259 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctattgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaata 18112160  T
Q  321 aaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 362  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18112159 aaatagttttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 18112118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 235 - 362
Target Start/End: Original strand, 44664980 - 44665108
Alignment:
Q  235 tttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttca 333  Q
    |||||||||||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  44664980 tttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttcca 44665079  T
Q  334 aattgactgattaagtcattataccaatt 362  Q
    ||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  44665080 aatagactgattaagtgatgatacaaatt 44665108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 235 - 349
Target Start/End: Original strand, 5869259 - 5869371
Alignment:
Q  235 tttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaa 334  Q
    |||| ||||||||||  | | |||||||||  |||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5869259 tttgaatttgtcactccttcattgtgggaa--gggaaaacaaatggtttatgcggaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaa 5869356  T
Q  335 attgactgattaagt 349  Q
    |||||||||||||||    
T  5869357 attgactgattaagt 5869371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 130 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 42076344 - 42076109
Alignment:
Q  130 gtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaa--aaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaa 226  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||  ||| || ||||||||| ||||  |||||| ||||    
T  42076344 gtgtagataagcttcattaaaaaatcagaatcaaaagaacttttaaacatgaaac-aaaacaaaataaaattaagtgaaagataggtgaaatttacctaa 42076246  T
Q  227 cggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtg--aaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaat 324  Q
    |||||| |||||||  |||||||  | | | || | |||||||||||||||| ||||||| |  |||||  ||| ||| || |||||||||| |||  ||    
T  42076245 cggtgtcatttgga-atgtcactcctac-tcgtagaaaaggggaaaacgaatagtttatgcggaaaaaaataattattattatgattctttcaatgttat 42076148  T
Q  325 agcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattg 363  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  42076147 agcttttcaaattgattgattaagttattatacaaattg 42076109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 346
Target Start/End: Original strand, 36514999 - 36515202
Alignment:
Q  145 attaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaa--aaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggat 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||  ||| || |||||||||||| |  |||||| ||||||||||  ||||||     
T  36514999 attaaaaaatcagaatcagaagaacttttaaacacgaaac-aaaacaaaataaaattaagtgaaagagagctgaaatttatctaacggtgtcgtttgga- 36515096  T
Q  242 ttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgac 340  Q
     |||||||  | ||| || ||||| |||||||| |||| |||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||    
T  36515097 atgtcactcctacgtcgtaggaaatgggaaaacaaatgatttatgcgaagaaaaaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagttttttaaattaac 36515196  T
Q  341 tgatta 346  Q
    ||||||    
T  36515197 tgatta 36515202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 258 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 29372463 - 29372358
Alignment:
Q  258 gtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattatac 357  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  29372463 gtggcaaaggggaaaatgaatggtttatgcgaaaaataaatgattgttgtcattctttcaattgaataactttccaaattgactgattaaatgattatac 29372364  T
Q  358 caattg 363  Q
     |||||    
T  29372363 aaattg 29372358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 33452903 - 33452799
Alignment:
Q  252 tccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcta-tgaaatagcttttcaaattgactgattaagtc 350  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||| | ||| |||     
T  33452903 tccgttgtgggaaaggggaaa-caaatgatttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttttattaaaataacttttcaaattgattaattgagtg 33452805  T
Q  351 attata 356  Q
    ||||||    
T  33452804 attata 33452799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 255 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 27074684 - 27074576
Alignment:
Q  255 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatt 353  Q
    ||||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||    
T  27074684 gttgtggaaaaaggtaaaacaaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattttttcaatgaaatagacttttaaattgactgattaagtgatt 27074585  T
Q  354 ataccaatt 362  Q
    |||| ||||    
T  27074584 atacaaatt 27074576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 263 - 362
Target Start/End: Original strand, 42951727 - 42951831
Alignment:
Q  263 aaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtg----attctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattatac 357  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42951727 aaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgtgtgattctttcaataaaataacttttcaaattgactgattaagtgattatac 42951826  T
Q  358 caatt 362  Q
     ||||    
T  42951827 aaatt 42951831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 290 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 35875000 - 35874927
Alignment:
Q  290 aaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattg 363  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  35875000 aaaagaaataattgttgtggttctttctaagaaatagtttttcaaattgaccgattaagtgattatacaaattg 35874927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 35875134 - 35875080
Alignment:
Q  130 gtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaac 184  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35875134 gtgtaactaagcttcattaaaaaatcagaatcagaagaacttttaaacatgaaac 35875080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 51 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 13585620 - 13585555
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaa 116  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13585620 cagggccgtccctgtgaaataggaggctcgactctctttttaaaataggcccctagtaaaataaaa 13585555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 131 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33452993 - 33452907
Alignment:
Q  131 tgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacg-aatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtat 216  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||| || ||||||| ||||||||    
T  33452993 tgtagctaaacttcattaaaaaatcataattagaagaacttctaaacatgaaacgaaataaaaaaaaattaagtgaaatagaggtat 33452907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 3445847 - 3445782
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaa 116  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3445847 caggaccgtccctgtgaaataggaggctcgactctctttttaaaataggcccctagtaaaataaaa 3445782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 116
Target Start/End: Original strand, 3574849 - 3574910
Alignment:
Q  55 gccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaa 116  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  3574849 gccgttcctatgaaataggaggctcgactctctatttaaaataggtcctcagtaaaataaaa 3574910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 116
Target Start/End: Original strand, 44664367 - 44664418
Alignment:
Q  65 tgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaa 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  44664367 tgaaataggtggctcggctctctttttaaaataggtccctagtaaaataaaa 44664418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 335
Target Start/End: Original strand, 3575117 - 3575175
Alignment:
Q  277 atggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaa 335  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3575117 atggtttatgcaaaaatgaaatgatttaggtgattctttcaatgaaatagcttttcaaa 3575175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 99
Target Start/End: Original strand, 42951558 - 42951592
Alignment:
Q  65 tgaaataggaggctcggctctctatttaaaatagg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42951558 tgaaataggaggctcggctctctttttaaaatagg 42951592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 187
Target Start/End: Original strand, 12268754 - 12268810
Alignment:
Q  131 tgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa 187  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| | ||  |||||||||||||||    
T  12268754 tgtagataagcttcattaaaaaatcataatcagaataactactaaacatgaaacgaa 12268810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 32)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 55 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 55134519 - 55134202
Alignment:
Q  55 gccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaaat 154  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||||||    
T  55134519 gccgtccctatgaaatatgaggctcggctctctatttaaaataggtccccaataaaataaaaacacaatttttttgtgtagctaagctttattaaaaaat 55134420  T
Q  155 cagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtgatttggatttgtcacttatc 253  Q
    ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||    
T  55134419 caggatcaaaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttactaacagtgtcatttggatttattacttatc 55134320  T
Q  254 cgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaa-gaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcat 352  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55134319 cgttgcgggaaaagggaaaacgaatgatttatgtaaaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcat 55134220  T
Q  353 tataccaattggtagtgg 370  Q
    ||||||||||||||||||    
T  55134219 tataccaattggtagtgg 55134202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 157 - 362
Target Start/End: Original strand, 45172502 - 45172707
Alignment:
Q  157 gaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtgatttggatttgtcacttatccg 255  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45172502 gaatcagcagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaata-agtgaaagagaggtagaatttactaacggtgtcatttggatttgtcacttatccg 45172600  T
Q  256 ttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattat 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45172601 ttgtgggaaaggggaaaacgaatggtctatatgaaaaagaaatgattgttgtgattctttccatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattat 45172700  T
Q  356 accaatt 362  Q
    || ||||    
T  45172701 acaaatt 45172707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 51 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 34982539 - 34982224
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnn-gtgtagctaagctttattaa 149  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||        |||||| |||||||||||||    
T  34982539 cagggtcgtccctataaaataggaggctcggttctctattgaaaataggtcctcaataaaataaaaatgcaattttttttgtgtagttaagctttattaa 34982440  T
Q  150 aaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtgatttg-gatttgtca 247  Q
    ||| ||||||||||||||  || ||||||| ||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||| |||||||||    
T  34982439 aaa-tcagaatcagaagaaattctaaacataaaacgaaatacaaaaaaattaagtaaaagagaggtagaatttactaacggggtcgtttgagatttgtca 34982341  T
Q  248 cttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaa 347  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34982340 tttatctgttgtgggaaaggggaaaacaaatgatttatatgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaacgaaatagtttttccaattgactgattaa 34982241  T
Q  348 gtcattataccaattgg 364  Q
    || ||||||| ||||||    
T  34982240 gtgattatacaaattgg 34982224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 53012030 - 53011714
Alignment:
Q  50 acagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaa 149  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  | |||||||||| || ||       ||||||||||  || |||||    
T  53012030 acagggccgttcctgtgaaataggaggctcggctctctttttaaaataggctcatagtaaaataaaa-cgtaatttttttgtgtagctaaatttcattaa 53011932  T
Q  150 aaaa--tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaat---acaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggattt 243  Q
    ||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||   | |||||| || ||||||||||  ||  |||||| ||||||||||  |||||||||    
T  53011931 aaaaaatcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggattt 53011834  T
Q  244 gtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactg 342  Q
    ||||||  || ||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  53011833 gtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaatgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattcttttaatgaaatagctttccaaattgactg 53011734  T
Q  343 attaagtcattataccaatt 362  Q
    ||||||| ||||||| ||||    
T  53011733 attaagtgattatacaaatt 53011714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 130 - 363
Target Start/End: Original strand, 35653809 - 35654043
Alignment:
Q  130 gtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaa--aacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaa 226  Q
    |||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||  || || ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  35653809 gtgtagttaagcttcattaaaaagtccgaatcagaagaacttttaaacatgaaacaaa-acaaaataaaattaagtgaaagagaggtgaaatttatctaa 35653907  T
Q  227 cggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatag 326  Q
    |||||| ||||| | | ||||||  | ||| || |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  35653908 cggtgtcatttgaaat-gtcactcctacgtcgtaggaaagggaaaaacgaatagtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatag 35654006  T
Q  327 cttttcaaattgactgattaagtcattataccaattg 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  35654007 cttttcaaattgattgattaagtgattatacaaattg 35654043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 65 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 27632699 - 27632400
Alignment:
Q  65 tgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaaa---tcagaatc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||| || ||       |||||| ||| ||| |||||||||   ||||||||    
T  27632699 tgaaataggaggctcggctctcattttaaaataggcccctagtaaaataaaa-cgtaatttttttgtgtagttaaacttcattaaaaaaaaatcagaatc 27632601  T
Q  162 agaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtg 260  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||  ||  |||||| ||||||||||  |||||||||||||||  || ||||||    
T  27632600 agaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgttgtttggatttgtcactactctgttgtg 27632503  T
Q  261 ggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattatacca 359  Q
    | |||||| ||| |||||| |||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  27632502 gaaaagggtaaagcgaatgatttatgcgaagaaaaaaatgattgatgtgattctttcaatgaagtagcttttcaaattgactaattaagtgattatacaa 27632403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 52 - 356
Target Start/End: Original strand, 11681492 - 11681798
Alignment:
Q  52 agggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaa 151  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |  ||       ||||||||||  || |||||||    
T  11681492 agggccgtccccgtgaaataggaggctcgactctctttttaaaataggcccctagtaaaataaaa-cataacttttttgtgtagctaaatttcattaaaa 11681590  T
Q  152 aa--tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaat-acaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtca 247  Q
    ||  |||||||||||| |  || ||||||||||| |||| | |||||| || ||||||||||  ||  |||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  11681591 aaaatcagaatcagaaaaagttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgttgtttggatttgtca 11681688  T
Q  248 cttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatta 346  Q
    || ||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  11681689 ctcatctgttgtggaaaagggtaaaacggatggtttattcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttccaaattgactgatta 11681788  T
Q  347 agtcattata 356  Q
    ||| ||||||    
T  11681789 agtgattata 11681798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 52 - 356
Target Start/End: Original strand, 11689771 - 11690077
Alignment:
Q  52 agggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaa 151  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |  ||       ||||||||||  || |||||||    
T  11689771 agggccgtccccgtgaaataggaggctcgactctctttttaaaataggcccctagtaaaataaaa-cataacttttttgtgtagctaaatttcattaaaa 11689869  T
Q  152 aa--tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaat-acaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtca 247  Q
    ||  |||||||||||| |  || ||||||||||| |||| | |||||| || ||||||||||  ||  |||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  11689870 aaaatcagaatcagaaaaagttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgttgtttggatttgtca 11689967  T
Q  248 cttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatta 346  Q
    || ||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  11689968 ctcatctgttgtggaaaagggtaaaacggatggtttattcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttccaaattgactgatta 11690067  T
Q  347 agtcattata 356  Q
    ||| ||||||    
T  11690068 agtgattata 11690077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 130 - 362
Target Start/End: Original strand, 23425994 - 23426228
Alignment:
Q  130 gtgtagctaagctttattaaaaaa--tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaa 226  Q
    ||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||  ||  |||||| ||||    
T  23425994 gtgtagctaaattttattaaaaaaaattagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaa 23426091  T
Q  227 cggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaata 325  Q
    ||| ||  |||||||||||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23426092 cggcgttgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaata 23426191  T
Q  326 gcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  23426192 gctttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 23426228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 56 - 362
Target Start/End: Original strand, 32130544 - 32130852
Alignment:
Q  56 ccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaaa-- 153  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||  | |||||||||| || ||       ||||||||||  ||||||||||||      
T  32130544 ccgtccctgtgaaataggaggctcggctcttcttttaaaataggtccttagtaaaataaaa-cgtaatttttttgtgtagctaaattttattaaaaaaaa 32130642  T
Q  154 -tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtcactta 251  Q
     |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||| | |  ||||| ||||  ||||  |||| ||||||||||      
T  32130643 atcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagagatgaa--atttatctaattgtgtcgtttgaatttgtcactcc 32130740  T
Q  252 tccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtc 350  Q
    || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  32130741 tctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagtg 32130840  T
Q  351 attataccaatt 362  Q
    ||||||| ||||    
T  32130841 attatacaaatt 32130852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 52 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 41038565 - 41038252
Alignment:
Q  52 agggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaa 151  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    |        ||||||||||  || |||||||    
T  41038565 agggccgtcccggtgaaataggaggctcggctctctttttaaaataggcccctagtaaaataaaatgtaattttttttgtgtagctaaa-ttcattaaaa 41038467  T
Q  152 aa-----tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgt 245  Q
    ||     ||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||  ||  |||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  41038466 aaaaaaatcaaaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaa-ttaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgt 41038370  T
Q  246 cacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgat 344  Q
    ||||  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  41038369 cactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagttttccaaattgactgat 41038270  T
Q  345 taagtcattataccaatt 362  Q
    ||||| ||||||| ||||    
T  41038269 taagtgattatacaaatt 41038252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 131 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 5545563 - 5545323
Alignment:
Q  131 tgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaat--acaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttac-taac 227  Q
    |||||||||| || | |||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||   | |||||| || |||||||||   ||  ||||||| ||||    
T  5545563 tgtagctaagattcagtaaaaaaatagaatcagaagaacttctaaacatgaaacgaaataaaaaaaaaattaagtgaaagac--gtgaaatttacctaac 5545466  T
Q  228 ggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagc 327  Q
    |||||  |||| ||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5545465 ggtgtcgtttgaatttgtcactcctccgttgtgagaagggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaataaatgattgttgtgattcttttaatgaaatagc 5545366  T
Q  328 ttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgg 370  Q
    ||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  5545365 tttccaaattgaccgattaagtgattatacaaattggtggtgg 5545323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 64 - 357
Target Start/End: Original strand, 21791313 - 21791604
Alignment:
Q  64 atgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcag 163  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| || | ||||||| ||| ||||       ||| |||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  21791313 atgaaatatgaggctcgactctctttttaaaataggctcc-agtaaaatagaaatgcaatttttctgtgcagctaaactttattaaaaatt-agaatcag 21791410  T
Q  164 aagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgg 261  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||| || || ||| |  | | ||||||||||  ||||||| ||||  |||  |||||||| |||||| || ||| ||||    
T  21791411 aagaacttctaaacatgaaatgaaataaaataaaataaatttaaagagaggtgaaatttacctaacaatgtcgtttggatt-gtcactcattcgtcgtgg 21791509  T
Q  262 gaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattatac 357  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21791510 gaaaggggaaa-caaatggtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgactgattaagtgattatac 21791604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 51 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 19661695 - 19661381
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaa 150  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || | |||||||||| |  ||       |||||| |||  || ||||||    
T  19661695 cagggccgtcctagtgaaataggaggctctgctctctttttaaaataggctcctagtaaaataaaa-cataatttttttgtgtagttaaatttcattaaa 19661597  T
Q  151 aaat----cagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgt 245  Q
    |||     ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||  ||  |||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  19661596 aaaaaaaacagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgt 19661499  T
Q  246 cacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgat 344  Q
    ||||  |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||  || ||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  19661498 cactcctttgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcaaagaaaaaaaggattgttgtgtttctttcaatgaaatagctttccaaattgactgat 19661399  T
Q  345 taagtcattataccaatt 362  Q
    ||||| ||||||| ||||    
T  19661398 taagtgattatacaaatt 19661381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 158 - 357
Target Start/End: Original strand, 10575380 - 10575580
Alignment:
Q  158 aatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtgatttggatttgtcacttatccg 255  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| || || ||| |  ||||||| |||| |  ||||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||  ||||    
T  10575380 aatcagaagaacttctaaacatgaaacgaaataaaataaaataaagtgaaaaagagatgaaatttacctgacggtgtcattcggatt-gtcactcctccg 10575478  T
Q  256 ttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattat 355  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  10575479 tcgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattatttcaatgaaataactttctaaattgactgattaagtgattat 10575578  T
Q  356 ac 357  Q
    ||    
T  10575579 ac 10575580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Original strand, 28463436 - 28463650
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||| ||| ||||  |||||| || ||||||||||  ||  |||||| ||||||||||  |||| |||||||    
T  28463436 aaaaaatcagaatcagaagaagttctaaacatcaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttgaatttgtc 28463533  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatt 345  Q
    |||  ||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28463534 actcctctattgtggaaaagggcaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattttttcaatgaaatagcttttcaacttgattgatt 28463633  T
Q  346 aagtcattataccaatt 362  Q
    |||| ||||||| ||||    
T  28463634 aagtgattatacaaatt 28463650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 44478256 - 44478041
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    |||||||| || ||||||||  || ||||||| | | ||||  |||||| || ||||||||||  ||  |||||| ||||||||||  |||| |||||||    
T  44478256 aaaaaatccgagtcagaagaagttctaaacataagaggaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttgaatttgtc 44478159  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa--aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgat 344  Q
    |||  || ||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  44478158 actcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatagtttatgcgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgat 44478059  T
Q  345 taagtcattataccaatt 362  Q
    | ||| ||||||| ||||    
T  44478058 ttagtgattatacaaatt 44478041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23256810 - 23256596
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagag-cttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgt 245  Q
    ||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||  |||||| || ||| ||| ||  ||  |||||| ||| ||||||  |||| ||||||    
T  23256810 aaaaaatcagaatcagaagaaacttccaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaagtaaaatag--gtgaaatttatctaccggtgtcgtttgaatttgt 23256713  T
Q  246 cacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatt 345  Q
    ||||  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||    
T  23256712 cactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgggaagaaaaaatgattgttgtgattctttcattgaaatagctttctaaattgactgatt 23256613  T
Q  346 aagtcattataccaatt 362  Q
    ||||  |||||| ||||    
T  23256612 aagtggttatacaaatt 23256596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 29580095 - 29579882
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||| |||| || ||| ||||  |||||| || ||||||||||  ||  |||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  29580095 aaaaaatcaaaatcaaaagaacttctaaatat-aaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtatcatttggatttgtc 29579999  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatt 345  Q
    |||  || ||||||| ||| || ||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29579998 actactctgttgtggaaaatggtaaaacgaattgtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcattgaaatagcttttcaatttgactgatt 29579899  T
Q  346 aagtcattataccaatt 362  Q
    || | ||||||| ||||    
T  29579898 aattaattatacaaatt 29579882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Original strand, 29221469 - 29221683
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||  |||||| || ||||||||||  ||  |||| | | ||||||||  |||  |||||||    
T  29221469 aaaaaatcagaatcagaagaacttctaaatatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaattaatccaacggtgtcgtttaaatttgtc 29221566  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatt 345  Q
    |||  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||| | ||    
T  29221567 actcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattccttcaatgaaatagacttccaaattgaccgttt 29221666  T
Q  346 aagtcattataccaatt 362  Q
    |||| ||||||| ||||    
T  29221667 aagtgattatacaaatt 29221683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 266 - 363
Target Start/End: Original strand, 43154754 - 43154851
Alignment:
Q  266 ggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattg 363  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  43154754 ggggaaaacgaatgatttatgcgaaaaataaataattgttgtgattcttttaatgaaataactttttaaattgactgattaagtgattatacaaattg 43154851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 223 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 16072740 - 16072596
Alignment:
Q  223 ctaacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctat-- 319  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||  || ||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |      
T  16072740 ctaacgatgtcatttgggtttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacaaatagtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttctttca 16072641  T
Q  320 --gaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 362  Q
      ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  16072640 ttgaaatagtttttcaaattgactgattaaatgattatacaaatt 16072596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 290 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 24449200 - 24449127
Alignment:
Q  290 aaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattg 363  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  24449200 aaaagaaataattgttgtggttctttctaagaaatagtttttcaaattgaccgattaagtgattatacaaattg 24449127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 345
Target Start/End: Original strand, 26328795 - 26329077
Alignment:
Q  64 atgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaaa-tcagaatca 162  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||  ||       |||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |    
T  26328795 atgaaataggaggttcgactctctttttaaaataggctccc--taaaataaaaacataatttttt-gtgtagctaaacttcattaaaaaaatcagaatta 26328891  T
Q  163 gaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaa-acttgagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgt 259  Q
    |||||  || ||||||||||| ||| || ||||| | || ||| ||||||||||  ||||||| |||  ||||  |||| |||| ||| |  ||||||||    
T  26328892 gaagaatttctaaacatgaaaagaaataaaaaaagaattaagtaaaagagaggtgaaatttacctaaaagtgtcgtttgaatttatcattcctccgttgt 26328991  T
Q  260 gggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcta-tgaaatagcttttcaaattgactgatt 345  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||  ||||||  |||||||||||||    
T  26328992 gggaaagggg-aaacaaatggtttatccaaaaaataaatgatcgttgtgattctttttattgaagcagctttctaaattgactgatt 26329077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 22423900 - 22423685
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaa--aacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttg 244  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| || ||||||  || || ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||  |||||| | |    
T  22423900 aaaaaatcagaatcagaa---cttttaaacatgaaacaaa-acaaaataaaattaagtgaaacagaggtgaaatttatctaacggtgtcgtttggaat-g 22423806  T
Q  245 tcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtg--aaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactg 342  Q
    |||||  |  || ||  |||| || |||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||| ||    
T  22423805 tcactcctatgtcgtatgaaatggaaaaacgaatgatttatgtggaaaaaataaataattgttttgattctttcaataaaatagtttttcaaattgattg 22423706  T
Q  343 attaagtcattataccaattg 363  Q
    ||||||| || |||| |||||    
T  22423705 attaagtgatcatacaaattg 22423685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 24449334 - 24449280
Alignment:
Q  130 gtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaac 184  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24449334 gtgtaactaagcttcattaaaaaatcagaatcagaagaacttttaaacatgaaac 24449280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 325
Target Start/End: Original strand, 51066347 - 51066449
Alignment:
Q  223 ctaacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtg--aaaaagaaatgattgttgtgattctttctatg 320  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||  | |||| ||||||  |||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  51066347 ctaacagtgtcatttggatttgtcactccttcgttttgggaa--gggaaaacaaatggtttatgcggaaaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatg 51066444  T
Q  321 aaata 325  Q
    |||||    
T  51066445 aaata 51066449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 103
Target Start/End: Original strand, 51066061 - 51066113
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccc 103  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51066061 cagggacgtccctatgaaataggaggctcggttctctatttaaaataggcccc 51066113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 9925332 - 9925295
Alignment:
Q  130 gtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaaga 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9925332 gtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaaga 9925295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 261
Target Start/End: Original strand, 16887747 - 16887943
Alignment:
Q  65 tgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaaa--tcagaatca 162  Q
    ||||||| |||||| | |||||  ||||||||||||||  |||||||||||| || ||       |||||||||| ||| |||||||||  ||| |||||    
T  16887747 tgaaatatgaggcttgactctccttttaaaataggcccttaataaaataaaa-cgtaatttttctgtgtagctaaacttcattaaaaaaaatcataatca 16887845  T
Q  163 gaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgg 261  Q
    ||| | ||| |||| |||||| ||||  |||||| || ||||||||||  ||  |||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  16887846 gaataacttctaaatatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcatctgttgtgg 16887943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 101
Target Start/End: Original strand, 29221377 - 29221423
Alignment:
Q  55 gccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcc 101  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29221377 gccgtccctgtgaaataggaggctcggctctctttttaaaataggcc 29221423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 23256897 - 23256860
Alignment:
Q  65 tgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggccc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23256897 tgaaataggaggctcggctctctttttaaaataggccc 23256860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 42)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 53 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 12971718 - 12971406
Alignment:
Q  53 gggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaa 152  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||       || ||||||| ||||||||||||    
T  12971718 gggctgtccctataaaataggaggctcggctctctatttaaaataaacccctaataaaataaaaacgcaatttttttgtatagctaaactttattaaaaa 12971619  T
Q  153 atcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtgatttggatttgtcactta 251  Q
    |||||||||||   ||||| | ||||||||||||| |||||||||  | ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  12971618 atcagaatcagtttagcttcttaacatgaaacgaaatacaaaaaaaataagtgaaagataggtagaatttactaacggagtcgtttggatttgtcactta 12971519  T
Q  252 tccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtca 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12971518 tccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcgatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtga 12971419  T
Q  352 ttataccaattgg 364  Q
    |||||| ||||||    
T  12971418 ttatacaaattgg 12971406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 130 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 50371369 - 50371135
Alignment:
Q  130 gtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacg 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||   |||||| || ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  50371369 gtgtagctaagcttcattaaaaaatcagaatcataagaacttctaaacatgaaacgaaataaaaaaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaacg 50371270  T
Q  229 gtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagct 328  Q
     |||  |||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  50371269 atgttgtttggatttgtcactcctccgttgtgggtaagggaaaaactaatgatttatgcgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcaatgaaacagtt 50371170  T
Q  329 tttcaaattgactgattaagtcattataccaattg 363  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  50371169 tttcaaattgactgattaagtgattatacaaattg 50371135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 67 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 25930902 - 25930606
Alignment:
Q  67 aaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaaa--tcagaatcaga 164  Q
    |||||||| ||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| ||       |||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||    
T  25930902 aaataggaagctcgactctcttttgaaaataggcccctaataaaataaaaacgtaatttttttgtgtagctaaacttcattaaaaaaaatcagaatcaga 25930803  T
Q  165 agagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtggga 263  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||  |||||| || ||||||||||| | |  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  25930802 agagcttctaaatatgaaaagaattaaaaaaaattaagtgaaagagatgaa--atttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcatctgttgtggaa 25930705  T
Q  264 aaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 362  Q
    ||||| ||||| ||||||||||   || || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  25930704 aagggtaaaacaaatggtttatccaaagaaaaaatgattgttgtgatcctttcaatgaaatagcttttcaagttgactgattaagtgattatacaaatt 25930606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 130 - 364
Target Start/End: Original strand, 27703363 - 27703593
Alignment:
Q  130 gtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacg 228  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||    | ||| || |||||| |||||||  ||||||| ||||     
T  27703363 gtgtagttaagctttgttaaaaaatcagaatcataataacttctaaacatgaaacgaa----ataaaattaagtgaaggagaggtgaaatttacctaaca 27703458  T
Q  229 gtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagct 328  Q
    ||||  |||||||| ||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27703459 gtgtcgtttggatt-gtcactcttccgtggtggaaaagggaaaaacgaatggtttatgcgaaaatgaaatgattgttgtgattctttcgatgaaatagct 27703557  T
Q  329 tttcaaattgactgattaagtcattataccaattgg 364  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27703558 ttccaaattgactgattaagtgattatacaaattgg 27703593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 67 - 365
Target Start/End: Original strand, 30004673 - 30004972
Alignment:
Q  67 aaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaa--aaatcagaatcaga 164  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||| || ||       |||||||||| ||| ||| ||  ||||||||||||||    
T  30004673 aaataggaggctcggctctctttttaaaataggcccatagtaaaataaaa-cgtaatttttttgtgtagctaaacttcattgaattaaatcagaatcaga 30004771  T
Q  165 agagcttttaaacatgaaacgaat-acaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtggg 262  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||| | |||||| || ||||||| ||  ||  |||||| |||||||| |  |||| ||||||||||  || |||||||     
T  30004772 agaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaagtgaaaaag--gtgaaatttatctaacggtatcgtttgaatttgtcactcctctgttgtgga 30004869  T
Q  263 aaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 362  Q
    ||| || ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||    
T  30004870 aaaaggtaaaacgaatggtttatgggaagaacaaatgattgttgcgattctttcaatgaaatagcttttcaaattaattgattaagtgattatacaaatt 30004969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 310 - 9
Alignment:
Q  65 tgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaaa----tcagaat 160  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||| || ||       |||||||||| ||| |||||||||    ||| |||    
T  310 tgaaataggaggctcggttctctttttaaaataggctcccagtaaaataaaa-cgtaatttttttgtgtagctaaacttcattaaaaaaaaaatcaaaat 212  T
Q  161 cagaagagcttttaaacatgaaacgaat-acaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttg 258  Q
    || |||| |||  |||||||||| |||| | |||||| || ||||||||||  ||  |||||| ||||||||||  |||||||||||||||  || ||||    
T  211 caaaagaacttccaaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttg 114  T
Q  259 tgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattatac 357  Q
    | | |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  113 tagaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatcactttccaaattgactgattaagtgattatac 14  T
Q  358 caatt 362  Q
     ||||    
T  13 aaatt 9  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 145 - 355
Target Start/End: Original strand, 13120710 - 13120921
Alignment:
Q  145 attaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaa--aacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtgatttggat 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||  || || ||||| ||||||||  ||||||| |||||||||  ||||||     
T  13120710 attaaaaaatcagaatcagaagaacttttaaacacgaaacaaa-acaaaataaaattaagtgatagagaggtgaaatttacctaacggtgtcgtttggaa 13120808  T
Q  242 ttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgact 341  Q
    | ||||||  | ||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  13120809 t-gtcactcctacgtcgtaggaaaggggaaaatgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgtggtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgact 13120907  T
Q  342 gattaagtcattat 355  Q
    |||||||| |||||    
T  13120908 gattaagtgattat 13120921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 130 - 363
Target Start/End: Original strand, 44836555 - 44836784
Alignment:
Q  130 gtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttac-taac 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| || || || ||| || ||||||||||| ||  ||||||| || |    
T  44836555 gtgtagctaag-tttattaaaaaattagaatcataagaacttttaaacatgaaacaaaataaaataaaattaagtgaaagagatgtgaaatttacctagc 44836653  T
Q  228 ggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagc 327  Q
    ||||| ||||||| | ||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||  ||||||||     
T  44836654 ggtgtcatttggaat-gtcactcctacgtcgtgggaaagggaaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaatgat----gtgattctttcagtgaaatagt 44836748  T
Q  328 ttttcaaattgactgattaagtcattataccaattg 363  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  44836749 ttttcaaattgactgattaagtgattatacaaattg 44836784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 30899876 - 30899658
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaat--acaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttg 244  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  | |||||| || ||||||||||  ||  |||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  30899876 aaaaaatcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttg 30899779  T
Q  245 tcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa---aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgact 341  Q
    ||| |  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  30899778 tcattcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgact 30899679  T
Q  342 gattaagtcattataccaatt 362  Q
     ||||||| ||||||| ||||    
T  30899678 aattaagtgattatacaaatt 30899658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 51 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 6151037 - 6150729
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaa 150  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  | |||||||||| |  ||       ||||||||||  || ||||||    
T  6151037 cagggccgtccctgtgaaataggaggctcgactctctttttaaaataagcccttagtaaaataaaa-cataatttttttgtgtagctaaatttcattaaa 6150939  T
Q  151 aaatca---gaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    |||  |   ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||| ||  ||  |||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  6150938 aaaaaaatagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaatag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtc 6150841  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaagggg-aaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaat-gattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgat 344  Q
    |||  || ||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6150840 actcctctgttgtggaaaaaaggtaaaacgaatggtttatgtgaagaaaaaattgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgat 6150741  T
Q  345 taagtcattata 356  Q
    ||| | ||||||    
T  6150740 taaatgattata 6150729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 130 - 355
Target Start/End: Original strand, 17674183 - 17674409
Alignment:
Q  130 gtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaa--aacttgagtgaaagagaggtataatttac-taa 226  Q
    |||||| ||| ||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||  || || ||||||| | ||||  ||||||| |||    
T  17674183 gtgtagttaaacttcattaaaaagtcatattcagaagaacttttaaacacgaaacaaa-acaaaataaaattaagtgaaaaataggtgaaatttacctaa 17674281  T
Q  227 cggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatag 326  Q
    |||||| ||||||| | ||||||  | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17674282 cggtgtcatttggaat-gtcactcttacgtcgtaggaaaggggaaaacaaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatag 17674380  T
Q  327 cttttcaaattgactgattaagtcattat 355  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17674381 tttttcaaattgactgattaagtgattat 17674409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Original strand, 28885519 - 28885733
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||  ||  |||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  28885519 aaaaaatcagaattagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtc 28885616  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatt 345  Q
    ||| ||| ||||||| ||| |  ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| |||||    
T  28885617 actcatctgttgtggaaaaagataaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattcttacaatgaaatagctttcaaaattgattgatt 28885716  T
Q  346 aagtcattataccaatt 362  Q
    |||| ||||||| ||||    
T  28885717 aagtgattatacaaatt 28885733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 51 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 42740419 - 42740111
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnn-gtgtagctaagctttattaa 149  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||        |||| | ||| ||| |||||    
T  42740419 cagggccgttcctatgaaataggaggctcggttctatttttaaaataggcccc-agtaaaataaaaacgtaattttttttgtgtggttaaacttcattaa 42740321  T
Q  150 aaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaa--aacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    ||||||||||   ||||| |||||||||||||||| || ||||||  || || ||||||||| ||||   |||||| |||| || | ||||||| | |||    
T  42740320 aaaatcagaa---gaagaacttttaaacatgaaacaaa-acaaaataaaattaagtgaaagataggtg--atttacctaacagtttcatttggaat-gtc 42740228  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatta 346  Q
    |||  | ||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  42740227 actcctacgtcgtaggaaaggggaaaacgaattgtttatgcgaaaaagaaataattgttgcgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactaatta 42740128  T
Q  347 agtcattataccaattg 363  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  42740127 agttattatacaaattg 42740111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Original strand, 18127785 - 18127999
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    |||||| |||||||| |||| ||| ||||||| |||  |||  |||||| || ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  18127785 aaaaaaacagaatcataagaacttctaaacattaaagaaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtaaaatttacctaacggtgtcgtttggatttgtc 18127882  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatt 345  Q
    |||  |  ||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18127883 actcctttgttgtggaaaagggtaaaacgaatagtttatgcgaagaaaaaaataattgttgtgattcttgcaatgaaatagcttttcaaattgactgatt 18127982  T
Q  346 aagtcattataccaatt 362  Q
    |||| ||||||| ||||    
T  18127983 aagtgattatacaaatt 18127999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 10109940 - 10109722
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaat----acaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatt 242  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    | |||||| || ||||||||||  ||  |||||| ||||||| ||  ||||||||    
T  10109940 aaaaactcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggcgtcgtttggatt 10109843  T
Q  243 tgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgact 341  Q
    |||||||  || ||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  10109842 tgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatagtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaattgctttccaaattgact 10109743  T
Q  342 gattaagtcattataccaatt 362  Q
    |||||||| ||||||| ||||    
T  10109742 gattaagtgattatacaaatt 10109722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 223 - 362
Target Start/End: Original strand, 48722292 - 48722432
Alignment:
Q  223 ctaacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatga 321  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  48722292 ctaacggtgtcgtttggatttgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattatttcaatga 48722391  T
Q  322 aatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 362  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  48722392 aatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 48722432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 51 - 356
Target Start/End: Original strand, 51109848 - 51110157
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngt-gtagctaagctttattaa 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| || ||        | ||||||||  || |||||    
T  51109848 cagggccgtccctgtgaaataggaggctcggctctctttttaaaataggcccctagtaaaataaaa-cgtaattttttttttgtagctaaatttcattaa 51109946  T
Q  150 aaaa----tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttg 244  Q
    ||||    ||||||| ||||||  || ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||  ||  |||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  51109947 aaaaaaaatcagaattagaagaatttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcatttgaatttg 51110044  T
Q  245 tcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaa-tgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactga 343  Q
    |||||  |  ||||||| |||||  ||||| ||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  51110045 tcactcctttgttgtggaaaaggataaaacaaatggtttatgcgaagaaaaaacttattgttgtgattctttcaatgaaatagctttctaaattgactga 51110144  T
Q  344 ttaagtcattata 356  Q
    |||||| ||||||    
T  51110145 ttaagtgattata 51110157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 131 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 9777649 - 9777421
Alignment:
Q  131 tgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa--tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaac 227  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||| ||   | |||||| || ||||||||||| ||  |||||| |||||    
T  9777649 tgtagctaaacttcattaaaaaatcagaattagaataacttctaaacatgaaactaaataaaaaaaaaattaagtgaaagagaagtgaaatttacctaac 9777550  T
Q  228 ggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttcta-tgaaatag 326  Q
    |||||  ||||||||| ||| | |||| || ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  9777549 ggtgtcgtttggatttatcattcatccattatgggaaagggg-aaacaaatggtttatgagaaaaggtaatgattgttgtgattctttttattgaaatag 9777451  T
Q  327 cttttcaaattgactgattaagtcattata 356  Q
     | |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  9777450 ttattcaaattgactgattgagtgattata 9777421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 137 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 15441516 - 15441291
Alignment:
Q  137 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaac-gaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtga 234  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||  | ||||||||||||||  |||||| ||||||| ||      
T  15441516 taagcttcattaaaaaatcaaaatcagaagaacttctaaacatgaaacggaataaaaaaaa--taagtgaaagagaggtgaaatttacctaacggcgtcg 15441419  T
Q  235 tttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttct-atgaaatagcttttca 333  Q
    |||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||  |    
T  15441418 tttggatttgtcactcttctgttgt-ggaaaagggaaaatgaatgatttatgcaaaaaag-aattattgttgtgattctttttaatgaaatagctttata 15441321  T
Q  334 aattgactgattaagtcattataccaattg 363  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  15441320 aattgagtgattaagtgattatacaaattg 15441291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 135 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 5560713 - 5560483
Alignment:
Q  135 gctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-taca-aaaaacttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgt 232  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| |||||| |||| ||| |||||||||||| || || | |||||  | ||||||||||| | |  ||||||  |||||||    
T  5560713 gctaaacttcattaaaagatctgaatcaaaagaacttctaaacatgaaacaaaataaataaaaaaataagtgaaagagatgaa--atttacgtacggtgt 5560616  T
Q  233 gatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaa-atgattgttgtgattctttctatgaaatagctttt 331  Q
     ||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||| |||| ||||||| | |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  5560615 tatttggatttgtcactcctccgttgtgggaaaagagaaaatgaatagtttatgcggaaaaaaatatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttt 5560516  T
Q  332 caaattgactgattaagtcattataccaattgg 364  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5560515 taaattgactgattaagtgattatacaaattgg 5560483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 357
Target Start/End: Original strand, 14084451 - 14084758
Alignment:
Q  55 gccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngt-gtagctaagctttattaaaaaa 153  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||| || ||       || ||||||||  || |||||||||    
T  14084451 gccgtcccagtaaaataggaggctcggctctctttttaaaatagacctataataaaataaaa-cgtaatttttttgttgtagctaaatttcattaaaaaa 14084549  T
Q  154 ---tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaat-acaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtcac 248  Q
       |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| | |||||| || | ||||||||  ||  |||||| |||| |||||  ||||||||||||||    
T  14084550 aaatcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaaatgaaagag--gtgaaatttatctaatggtgtcgtttggatttgtcac 14084647  T
Q  249 ttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaa--tgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatta 346  Q
    |  || |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14084648 tcctctgttgtggagaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaattgattattgtgattctttcaatgaaatagctttctaaattgactgatta 14084747  T
Q  347 agtcattatac 357  Q
    ||| |||||||    
T  14084748 agtgattatac 14084758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Original strand, 33124489 - 33124692
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtgatttggatttgtca 247  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||  ||  ||||          ||  |||||||||||||    
T  33124489 aaaaattcagaatcagaagaacttttaaacatgaaacgaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatt----------gtcgtttggatttgtca 33124576  T
Q  248 cttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatta 346  Q
    ||  || ||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33124577 ctcctctgttgtggaaaatggtataacgaatggtttatgtgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgacttatta 33124676  T
Q  347 agtcattataccaatt 362  Q
    ||| ||||||| ||||    
T  33124677 agtgattatacaaatt 33124692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 50552711 - 50552497
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||| | |  ||||| |||| |||||  ||||||||||||    
T  50552711 aaaaaatcagaatcaaaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagagatgaa--atttatctaatggtgtcgtttggatttgtc 50552614  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatt 345  Q
    |||  |  ||||||| ||| || |||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  50552613 actcctatgttgtggaaaaaggtaaaatgaatggtttatacgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgaccgatt 50552514  T
Q  346 aagtcattataccaatt 362  Q
    |||| ||||||| ||||    
T  50552513 aagtgattatacaaatt 50552497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 130 - 346
Target Start/End: Original strand, 26486204 - 26486419
Alignment:
Q  130 gtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttactaa-c 227  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || || ||| || | ||||||||  ||  ||||||| || |    
T  26486204 gtgtagctaagcttcatttaaaaatcagaatcagaagaacttttaaacatgaaacaaaataaaataaaattaattgaaagag--gtgaaatttaccaaac 26486301  T
Q  228 ggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagc 327  Q
    ||||| ||||||| | ||||||| | ||| || |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  26486302 ggtgtcatttggaat-gtcacttctacgtcgtaggaaagaggaaaacgaatagtttatgcgaaaaagaaataattgttatgattttttcaatgaaatagc 26486400  T
Q  328 ttttcaaattgactgatta 346  Q
    |||||| ||| | ||||||    
T  26486401 ttttcagattaagtgatta 26486419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 130 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1269788 - 1269574
Alignment:
Q  130 gtgtagctaagcttt-attaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaact--tgagtgaaagagaggtataatttact-a 225  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||   |||||| |  | ||||||||| ||||  |||||||  |    
T  1269788 gtgtagttaagcttttattaaaaaatcagaatcaatagaacttctaaacatgaaacgaaataaaaaaattaataagtgaaagaaaggtgaaatttacgga 1269689  T
Q  226 acggtgtgatttggatttgtcacttatccg-ttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaat 324  Q
    |||||||  |||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| | |||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1269688 acggtgtcgtttggatttgtcactcctccgcttgtgggaaaggagaaaacgaatg-tatatgcggaaaa-aaatgattgttgtgattcttttaatgaaat 1269591  T
Q  325 agcttttcaaattgact 341  Q
    |||||||||||||||||    
T  1269590 agcttttcaaattgact 1269574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 263 - 362
Target Start/End: Original strand, 12884100 - 12884199
Alignment:
Q  263 aaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 362  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  12884100 aaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttttaaattgactgattaagtgattatacaaatt 12884199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 51 - 356
Target Start/End: Original strand, 17487028 - 17487339
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaa 150  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||||||| || ||       ||||||||||  || ||| ||    
T  17487028 cagggtcgtccccgtgaaataggaggctcgactctctttttaaaataggcccttagtaaaataaaa-cgtaatttttttgtgtagctaaatttcattgaa 17487126  T
Q  151 aaa---tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaat----acaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatt 242  Q
    |||   ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||    | |||||| || ||||||||||  ||  |||||| ||||||| ||  ||||||||    
T  17487127 aaaaactcagaatcagaagaagttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggcgttgtttggatt 17487224  T
Q  243 tgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgact 341  Q
    |||||||  || ||||||| |||||  |||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |    
T  17487225 tgtcactcctctgttgtggaaaaggataaaacgaatggtttatgcaaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttccaaattgatt 17487324  T
Q  342 gattaagtcattata 356  Q
     ||||||| ||||||    
T  17487325 tattaagtgattata 17487339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 51 - 362
Target Start/End: Original strand, 20905035 - 20905349
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaa 150  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| | ||| |||||| || ||       |||||||||| ||| ||||||    
T  20905035 cagggtcgtccctgtgaaataggaggctcgactctctttttaaaataggtccctagtaagataaaa-cgtaatttttttgtgtagctaaacttcattaaa 20905133  T
Q  151 aaat--cagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaat-acaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    |||   |||||| |||||| ||| |||| |||||| |||| | ||||||||| |||||||| |  ||  |||||| | ||||||||  ||||||||||||    
T  20905134 aaaaaccagaataagaagaacttctaaatatgaaaggaattaaaaaaaacttaagtgaaagtg--gtgaaatttatccaacggtgtcgtttggatttgtc 20905231  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaagggg-aaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgat 344  Q
    |||  || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||  ||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||     
T  20905232 actcctctgttgtggaaaaagggtaaaacgaatggtttatacgaagaaaaaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagacttccaaattgactgaa 20905331  T
Q  345 taagtcattataccaatt 362  Q
    ||||| ||||||| ||||    
T  20905332 taagtgattatacaaatt 20905349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Original strand, 29207946 - 29208160
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||   ||  |||||| || ||| ||||||| | |  ||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  29207946 aaaaaatcagaatcagaagaacttctaaatatgaaagacatttaaaaaaattaagtaaaagagatgaa--atttatccaacggtgtcatttggatttgtc 29208043  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatt 345  Q
    |||  ||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  || || |||||||||||    
T  29208044 actcctctattgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagacttccagattgactgatt 29208143  T
Q  346 aagtcattataccaatt 362  Q
    || | ||||||| ||||    
T  29208144 aaatgattatacaaatt 29208160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 363
Target Start/End: Original strand, 37873506 - 37873825
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnn-gtgtagctaagctttattaa 149  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||| | ||||||||||| | ||        |||||| ||||||| |||||    
T  37873506 cagggccgtttctatgaaataggaggctcgattctatttttaaaataggcccc-agtaaaataaaaatgtaattttttgtgtgtagttaagcttcattaa 37873604  T
Q  150 aaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaa-aaaacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| || || || |||| || ||||||||||||||  ||||||| |||| ||||  |||||  | |||    
T  37873605 aaaattagaatcataagaacttttaaacatgaaacaaactaaaataaaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacgtaacagtgtcgtttggcat-gtc 37873703  T
Q  247 acttatccgttgtg-----ggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgact 341  Q
    |||  | ||| ||      ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||    
T  37873704 actcctacgtcgtatcgtaggaaaggggaaaacgaatggtttatgcagaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaacagtttttcaaattaact 37873803  T
Q  342 gattaagtcattataccaattg 363  Q
    |||||||| | ||||| |||||    
T  37873804 gattaagtgactatacaaattg 37873825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 131 - 349
Target Start/End: Original strand, 22386666 - 22386886
Alignment:
Q  131 tgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttact-aacg 228  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| || || || ||| || ||||||||||| ||  |||||| | ||||    
T  22386666 tgtagttaagtttcattaaaaaatcagaatcataagattttttaaacacgaaacaaaataaaataaaattaagtgaaagagatgtgaaatttatttaacg 22386765  T
Q  229 gtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatga-ttgttgtgattctttctatgaaatagc 327  Q
     |||  |||||| | ||||||  | ||| || |||||||||||||| |||||||||||  ||||| | || | |||||||||||||||| |||||||||     
T  22386766 atgtcgtttggaat-gtcactcctacgtcgtaggaaaggggaaaacaaatggtttatgcaaaaaaaatattaattgttgtgattctttcaatgaaatagt 22386864  T
Q  328 ttttcaaattgactgattaagt 349  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22386865 ttttcaaattgactgattaagt 22386886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 270 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 24556900 - 24556815
Alignment:
Q  270 aaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattat 355  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24556900 aaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttaaatgaaatagtttttcaaattgacttattaagtgattat 24556815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 52055788 - 52055560
Alignment:
Q  130 gtgtagctaagctttattaaaaaa--tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-cta 225  Q
    |||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||| | ||| ||| ||||||| ||| || |||| |  | ||||||  ||||||| |||||| |||    
T  52055788 gtgtagctaaacttcattaaaaaaaatcagaatcagaaaaacttctaagcatgaaaggaattaaaaaataaataagtgaa--agaggtaaaatttatcta 52055691  T
Q  226 acggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaat 324  Q
    |||||||  ||| |||||||||||  | | |||||  |||||| ||||||||||||||||| |||  || || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  52055690 acggtgtcgtttagatttgtcactcct-ctttgtgtaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaaggaaaaactgattgttgtgattctttcaatgaaat 52055592  T
Q  325 agcttttcaaattgactgattaagtcattata 356  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  52055591 agctttccaaattgattgattaagtgattata 52055560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 235 - 349
Target Start/End: Original strand, 6333453 - 6333565
Alignment:
Q  235 tttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaa 334  Q
    ||||||||  ||||| || |||||||||||  |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||    
T  6333453 tttggattcttcactcattcgttgtgggaa--gggaaagcgaatggtttatgcggaaaaaaaatgattgttgtgattcttttaataaaataactttccaa 6333550  T
Q  335 attgactgattaagt 349  Q
     ||||||||||||||    
T  6333551 tttgactgattaagt 6333565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 316
Target Start/End: Original strand, 52240384 - 52240552
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||  |||||| || ||||||  ||||||  |||||| ||||| ||||  |||| |||||||    
T  52240384 aaaaaatcagaatcagaagaacttctaaatatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaa--agaggtgaaatttatctaacagtgtcgtttgaatttgtc 52240481  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttc 316  Q
     ||  || ||||||| |||||| |||| ||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  52240482 gctcctctgttgtggaaaagggcaaaatgaatgatttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttc 52240552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 252 - 324
Target Start/End: Original strand, 31369356 - 31369428
Alignment:
Q  252 tccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaat 324  Q
    |||||||||||| | || |||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  31369356 tccgttgtgggataaggaaaaatgaatggtttatgcaaaaaagaaatgatttttgtgattcttttaatgaaat 31369428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 3907545 - 3907471
Alignment:
Q  290 aaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattgg 364  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||    
T  3907545 aaaagaaattatttttatgattctttcaatgaaataatttttcaaattgattgattaaatgattatacaaattgg 3907471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 20470928 - 20470862
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctattt-aaaataggcccccaataaaataaaa 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | ||||||||||    
T  20470928 cagggccgtccccgtgaaataggaggctcggctctctttttaaaaacaggcccctagtaaaataaaa 20470862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24557037 - 24556989
Alignment:
Q  130 gtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaaca 178  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24557037 gtgtagctaagcttcattgaaaaattagaatcagaagaacttttaaaca 24556989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 183
Target Start/End: Original strand, 39080451 - 39080503
Alignment:
Q  131 tgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaa 183  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  39080451 tgtagctaagcttcattgaaaaatcagaatcataagaacttctaaacatgaaa 39080503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 355
Target Start/End: Original strand, 32810365 - 32810406
Alignment:
Q  314 ttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattat 355  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  32810365 ttctttgaaatagcttttcaaattgattgattaagtgattat 32810406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 38263924 - 38263879
Alignment:
Q  304 ttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagt 349  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  38263924 ttgtgattctatcaatgaaatagttttttaaattgactgattaagt 38263879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 38)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 50 - 364
Target Start/End: Original strand, 48626778 - 48627093
Alignment:
Q  50 acagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaa 149  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||       |||||| ||| |||||| ||    
T  48626778 acaggaccgtccctatgaaataggaggctcggttctctatttaaaataggccttcaataaaataaaaacgcaatttttttgtgtagttaaactttataaa 48626877  T
Q  150 aaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaact-tgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtgatttggatttgtca 247  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||   | ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  48626878 aaaattagaatcagaagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaaaataagtgaaagagaggtagaatttactaacagtgtcatttggatttgtca 48626977  T
Q  248 cttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaa 347  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  48626978 cttatccgctgtgggaatggg-aaaacgaatggtttatgtgaaaaataaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagattttcaaattgactgatcaa 48627076  T
Q  348 gtcattataccaattgg 364  Q
    || ||||||| ||||||    
T  48627077 gtgattatacaaattgg 48627093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 51 - 363
Target Start/End: Original strand, 43905603 - 43905906
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaa 150  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       |||| | ||||||||| ||||    
T  43905603 cagggtcgtccctatgaaataggaggctcgactctctatttaaaatagacccccaataaaataaaaacgcaatttttttgtgttgttaagctttactaaa 43905702  T
Q  151 aaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttactaacggtgtgatttggatttgtcact 249  Q
    |||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43905703 aaaatagaatcataagagcttctaaacatgaaacgaaatacaaaaaaattaagtgaaagagaggtagaatttactaacggtgtcatttggatttgtcact 43905802  T
Q  250 tatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagt 349  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  43905803 tatccgctgtgggaaagggaaaaatgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtg----------tgaaataacttttcaaattgactgattgagt 43905892  T
Q  350 cattataccaattg 363  Q
     ||||||| |||||    
T  43905893 gattatacaaattg 43905906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 52 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 7767379 - 7767064
Alignment:
Q  52 agggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnn-gtgtagctaagctttattaaa 150  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  | ||| |||||||||||         |||||||||||||| ||||||    
T  7767379 agggccgttcctatgaaataggaggctcggttctatttttaaaataggccca-agtaagataaaaacgcatttttttgtgtgtagctaagcttcattaaa 7767281  T
Q  151 aaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaa-tacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtgatttggatttgtcac 248  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||| || || || ||| || ||||||||||| ||  ||||||| |||| |||| ||||||| | |||||    
T  7767280 aagtcagaatcagaagaacttttaaacatgaaacaaaataaaataaaattaagtgaaagagatgtgaaatttacctaactgtgtcatttggaat-gtcac 7767182  T
Q  249 ttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa---aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatt 345  Q
    |  | |||  | ||||| |||||||||||| |||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7767181 tcctacgtcttaggaaatgggaaaacgaatagtttatgtgaagaaaaaaaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgatt 7767082  T
Q  346 aagtcattataccaattg 363  Q
    |||| ||||||| |||||    
T  7767081 aagtgattatacaaattg 7767064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 362
Target Start/End: Original strand, 51939307 - 51939618
Alignment:
Q  54 ggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaaa 153  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| || | ||||||| || || ||       ||||||||||  || |||||||||    
T  51939307 ggccgtccctgtgaaatagtaggctcgactctctttttaaaataggctcctattaaaatataa-cgtaatttttttgtgtagctaaatttcattaaaaaa 51939405  T
Q  154 ---tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtcact 249  Q
       ||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||  ||  |||||| | ||| ||||  |||||||||||||||    
T  51939406 aaatcagaatgagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttaaccaactgtgtcgtttggatttgtcact 51939503  T
Q  250 tatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa--aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaa 347  Q
    | |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51939504 tctatgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgtgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaa 51939603  T
Q  348 gtcattataccaatt 362  Q
    || ||||||| ||||    
T  51939604 gtgattatacaaatt 51939618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 364
Target Start/End: Original strand, 40151895 - 40152194
Alignment:
Q  64 atgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcag 163  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||  |||||||||||   ||       |||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  40151895 atgaaataggaggctcgactctctttttaaaatagactccc--taaaataaaaatataattgttttgtgtagttaagcttcattaaaaaatcagaatcat 40151992  T
Q  164 aagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtggg 262  Q
    || | |||||||| ||||||||||   |||||| || | ||||||||||||  |||||| |||| |||||  ||||||| | ||| |  |||||||||||    
T  40151993 aaaaacttttaaatatgaaacgaaataaaaaaaattaaatgaaagagaggtgaaatttacctaaaggtgttgtttggatgtatcattcctccgttgtggg 40152092  T
Q  263 aaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattc-tttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaat 361  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  40152093 aaagggg-aaacaaatggtttatgcgcaaaagaaatgattgttgtgattcgttttaatgaaatagtttttcaaattgaccgattaagtgattatacaaat 40152191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 51 - 362
Target Start/End: Original strand, 28132484 - 28132797
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnn-gtgtagctaagctttattaa 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    |         ||||||||||  || |||||    
T  28132484 cagggccgtccctgtgaaataggaggctcggctctctttttaaaataggcccctagtaaaataaaatataatttttttttgtgtagctaaatttcattaa 28132583  T
Q  150 aa--aatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    ||  ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||  ||  |||||| ||||||| ||  |||| | |||||    
T  28132584 aagaaatcaaaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggcgtcgtttgaacttgtc 28132681  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatta 346  Q
    |||  || ||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28132682 actcctctgttgtggaaaatggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgatta 28132781  T
Q  347 agtcattataccaatt 362  Q
    ||| ||||||| ||||    
T  28132782 agtgattatacaaatt 28132797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 52 - 356
Target Start/End: Original strand, 25598833 - 25599142
Alignment:
Q  52 agggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaa 151  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |   | |||||||||| || ||       |||||||||| ||| |||||||    
T  25598833 agggccgttcctataaaataggaggctcggctctctttttaaaataggtctttagtaaaataaaa-cgtaatttttttgtgtagctaaacttcattaaaa 25598931  T
Q  152 aa--tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaat-----acaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggattt 243  Q
    ||  |||||||||||||| ||| |||||||||||  |||     | |||||| || ||||||||||  ||  |||||| ||||||||||  |||| ||||    
T  25598932 aaaatcagaatcagaagaacttctaaacatgaaagaaattaaaaaaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttgaattt 25599029  T
Q  244 gtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactga 343  Q
    ||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  25599030 gtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaacatgattgttgtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactga 25599129  T
Q  344 ttaagtcattata 356  Q
    |||||| ||||||    
T  25599130 ttaagtgattata 25599142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 137 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 27303413 - 27303188
Alignment:
Q  137 taagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaa--aacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtg 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||  || || ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||     
T  27303413 taagcttcattaaaaaatcagaatcagaagaacttttaaacatgaaacaaa-acaaaataaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaatggtgtc 27303315  T
Q  234 atttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttca 333  Q
     |||| ||  ||||||  | ||| || |||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27303314 gtttgaat--gtcactcctacgtcgtaggaaaggg-aaaacaaatagtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttca 27303218  T
Q  334 aattgactgattaagtcattataccaattg 363  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  27303217 aattgattgattaagtgattatacaaattg 27303188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 130 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 46904977 - 46904743
Alignment:
Q  130 gtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaa--aacttgagtgaaagagaggtataatttac-taa 226  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||  || || ||||||||||||||  ||||||| |||    
T  46904977 gtgtagcgaagcttcattaaaaaatcagaataagaagaacttttaaacatgaaacaaa-acaaaataaaattaagtgaaagagaggtgaaatttacctaa 46904879  T
Q  227 cggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatag 326  Q
    ||||||  |||||| | ||||||  | ||| || |||||||| ||||  || ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  46904878 cggtgtcgtttggaat-gtcactcctacgtcgtaggaaagggaaaaataaaaggtttatgcaaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatag 46904780  T
Q  327 cttttcaaattgactgattaagtcattataccaattg 363  Q
     |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  46904779 ttttttaaattgactgattaagtgattatacaaattg 46904743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 156 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 18408399 - 18408193
Alignment:
Q  156 agaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtcacttatcc 254  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||  ||  |||||| | ||||||||  |||||||||||||||  ||     
T  18408399 agaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatcaaacggtgtcgtttggatttgtcactgctct 18408302  T
Q  255 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaa-tgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatt 353  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18408301 gttgtggaaaagggtaaaacgaattgtttatgcgaaaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatggattagcttttcaaattgactgattaagtgatt 18408202  T
Q  354 ataccaatt 362  Q
    |||| ||||    
T  18408201 atacaaatt 18408193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Original strand, 29387601 - 29387816
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaat--acaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttg 244  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  | |||||| || ||||||||||  ||  |||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  29387601 aaaaaatcagaatcagaagaacttataaacatgaaa-gaattaaaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgttgtttggatttg 29387697  T
Q  245 tcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactga 343  Q
    |||||  ||  |||| | |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  29387698 tcactcctctattgtagaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataacttttcaaattgattga 29387797  T
Q  344 ttaagtcattataccaatt 362  Q
    |||||| ||||||| ||||    
T  29387798 ttaagtgattatacaaatt 29387816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Original strand, 21784627 - 21784846
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagctt----ttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatt 242  Q
    ||||||||||||||| |||| |||    |||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||  ||  |||||| ||||||| ||  ||||||||    
T  21784627 aaaaaatcagaatcaaaagaacttctaattaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggcgtcgtttggatt 21784724  T
Q  243 tgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa--aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgac 340  Q
    |||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  21784725 tgtcactcctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattaac 21784824  T
Q  341 tgattaagtcattataccaatt 362  Q
    ||||||||| ||||||| ||||    
T  21784825 tgattaagtgattatacaaatt 21784846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24252837 - 24252622
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaat-acaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgt 245  Q
    ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| |||| | |||||| || ||||||||||  ||  |||||| ||||||| ||  |||||||||||    
T  24252837 aaaaaattagaatcagaagaagttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggggtcgtttggatttgt 24252740  T
Q  246 cacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgat 344  Q
    |||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||||||    
T  24252739 cactcatctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattcttgcactgaaataactttccaaattgactgat 24252640  T
Q  345 taagtcattataccaatt 362  Q
    ||||| ||||||| ||||    
T  24252639 taagtgattatacaaatt 24252622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 261 - 363
Target Start/End: Original strand, 36538147 - 36538249
Alignment:
Q  261 ggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  36538147 ggaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattatacaaa 36538246  T
Q  361 ttg 363  Q
    |||    
T  36538247 ttg 36538249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 261 - 363
Target Start/End: Original strand, 42009223 - 42009325
Alignment:
Q  261 ggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  42009223 ggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaataattgttgtgattctttcaatgaaataactttttaaattgactgattaagtgattatacaaa 42009322  T
Q  361 ttg 363  Q
    |||    
T  42009323 ttg 42009325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 52 - 362
Target Start/End: Original strand, 52654873 - 52655185
Alignment:
Q  52 agggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaa 151  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| || ||       |||||| |||  || |||||||    
T  52654873 agggccgttcctgtgaaataggaggctcaactctctttttaaaataggtccctagtaaaataaaa-cgtaatttttttgtgtagttaaatttcattaaaa 52654971  T
Q  152 aa--tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaat-acaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtca 247  Q
    ||  | |||||||||||| ||| ||||||||||| |||| | ||||||  | ||||||||||  ||  |||||| |||||||| |  |||| ||||||||    
T  52654972 aaaattagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaaataagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtatcgtttgaatttgtca 52655069  T
Q  248 cttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatta 346  Q
    ||  |  ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52655070 ctcctatgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaggaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattgactgatta 52655169  T
Q  347 agtcattataccaatt 362  Q
    ||| ||||||| ||||    
T  52655170 agtgattatacaaatt 52655185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 51 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 13401772 - 13401461
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaa 150  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||  | ||       |||||| ||| ||| ||||||    
T  13401772 cagggccgtccctgtaaaataggaggctcgactctctttttaaaataggtccttagtaaaataaaat-gtaacttttttgtgtagttaaacttcattaaa 13401674  T
Q  151 aaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtcact 249  Q
    |||    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| || | ||||||||  ||  |||||| || |||||||  |||| ||||| ||||    
T  13401673 aaaatgaaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaattgaaagag--gtgaaatttatcttacggtgtcgtttgaatttggcact 13401576  T
Q  250 tatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtg--aaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaa 347  Q
      || ||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13401575 cctctgttgtggaaaagggtaaaacaaatggtttatgcgggaaaaaaaaatgattgttgtgattcttccaatgaaatagcttttcaaattgactgattaa 13401476  T
Q  348 gtcattataccaatt 362  Q
    || ||||||| ||||    
T  13401475 gtgattatacaaatt 13401461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 68 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 8364470 - 8364174
Alignment:
Q  68 aataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaaa--tcagaatcagaa 165  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||||||| || ||       |||| |||||  || |||||||||  | ||||||||||    
T  8364470 aataggaggctcgactctctttttaaaataggcccatagtaaaataaaa-cgtaatttttttgtgttgctaaatttcattaaaaaaaattagaatcagaa 8364372  T
Q  166 gagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaa 264  Q
    ||  || ||||||||||| ||||  |||||  || ||||||||||  ||  |||||| ||||||||||  |||||||||||| ||  || ||||||| ||    
T  8364371 gaagttctaaacatgaaaggaattaaaaaacattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtctctcctctgttgtggaaa 8364274  T
Q  265 aggggaaaacgaatggtttatgtgaa--aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 362  Q
    |||| ||||| |||||||| || |||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  8364273 agggtaaaacaaatggtttgtgcgaagaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaataactttccaaattgactgattaagtgattatacaaatt 8364174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Original strand, 46791545 - 46791759
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||  ||  |||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  46791545 aaaaaaccagaatctgaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtc 46791642  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatt 345  Q
    |||  || ||||||| ||||||  ||  |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  46791643 actcctctgttgtggaaaagggtcaagtgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattcttgcaatgaaatagttttccaaattgactgatt 46791742  T
Q  346 aagtcattataccaatt 362  Q
    |||| ||||||| ||||    
T  46791743 aagtgattatacaaatt 46791759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 261 - 363
Target Start/End: Original strand, 50677275 - 50677377
Alignment:
Q  261 ggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaa 360  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  50677275 ggaaaggggaaaacgaattgtttatgcgaaaaagaaataattgttgtgattgtttcaatgaaatagtttttcaaattgactgattaagtgattatacaaa 50677374  T
Q  361 ttg 363  Q
    |||    
T  50677375 ttg 50677377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Original strand, 23164420 - 23164634
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||| ||||  |||||| || ||||||||||  ||  |||||| | ||||||||  ||||||||||||    
T  23164420 aaaaaattagaatcagaagaacttctaaatatgaaaagaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatccaacggtgtcgtttggatttgtc 23164517  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatt 345  Q
    |||  || ||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||| |||||    
T  23164518 actcctctgttgtggaaaaaggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaattattgttgtgattctttcaatgaaatagacttccaaattgattgatt 23164617  T
Q  346 aagtcattataccaatt 362  Q
    |||| ||||||| ||||    
T  23164618 aagtgattatacaaatt 23164634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 51 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 6715753 - 6715457
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaa 150  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  | |||||||||| || ||       ||||||||||  || ||||||    
T  6715753 cagggccgtccccgtgaaataggaggctcggctctctttttaaaatagatccttagtaaaataaaa-cgtaatttttttgtgtagctaaatttcattaaa 6715655  T
Q  151 aaa--tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtgatttggatttgtca 247  Q
    |||  |||||| |||||||   | |||||||| || ||||  |||||| || ||||||||||  ||  ||||||  ||| |||||  |||||||||||||    
T  6715654 aaaaatcagaagcagaagaagatctaaacatggaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatataatggtgtcgtttggatttgtca 6715557  T
Q  248 cttatccgttgtgggaaagggg-aaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatta 346  Q
    ||  || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  6715556 ctcctctgttgtggaaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaaaaaaaaatgattgttatgattctttcaatgaaataactttcaaaattgactgatta 6715457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 226 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 15987338 - 15987207
Alignment:
Q  226 acggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaata 325  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||  ||||||||    
T  15987338 acggtgtcatttgaatttgtcactcctccgttgtgggaaagggaaaaacgaatggtttatgcgaaaaataaatgatagttgtaattcttttaatgaaata 15987239  T
Q  326 gcttttcaaattgactgattaagtcattatac 357  Q
     ||||  ||||||| ||||||||| |||||||    
T  15987238 actttcgaaattgaatgattaagtgattatac 15987207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 130 - 370
Target Start/End: Original strand, 19965706 - 19965950
Alignment:
Q  130 gtgtagctaagctttattaaaaa-atcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttac-taa- 226  Q
    ||||||||  |||| |||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||   ||||||  | ||||||||||||||  ||||||| |||     
T  19965706 gtgtagctttgcttcattaaaaatatcaaaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaaataaaaaaaaataagtgaaagagaggtgaaatttacctaaa 19965805  T
Q  227 -cggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgtt-gtgattctttctatgaaat 324  Q
     |||  | ||||| |||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  19965806 gcggcatcatttgaatttctcattcatccgttgtgggaaaggagaaaacgaatggtttatgcgggaaa-aaatgattgtttgtgattcttttaatgaaat 19965904  T
Q  325 agcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgg 370  Q
    |||||||||| || ||| ||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  19965905 agcttttcaatttaactaattaagtgattatacaaattggcagtgg 19965950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Original strand, 27729617 - 27729831
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||  ||  |||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  27729617 aaaaaattaaaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacagtgtcgtttggatttgtc 27729714  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaaga-aatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgatt 345  Q
    |||| |  ||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||| |||||    
T  27729715 acttctatgttgtgaaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaataatgattgttgtgattctttcgatcaaattgctttccaaattgattgatt 27729814  T
Q  346 aagtcattataccaatt 362  Q
    | || ||||||| ||||    
T  27729815 atgtgattatacaaatt 27729831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 148 - 362
Target Start/End: Original strand, 23067573 - 23067787
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    ||||||||| ||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| | || ||||||||||  ||  |||||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  23067573 aaaaaatcaaaatcagaagaagttctaaacatgaaaggaataaaaaaga-ttaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcatttggatttttc 23067669  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgt-tgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgat 344  Q
    |||  || ||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||  || |||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |    
T  23067670 actcctctgttgtggaaaagggtaaaacaaatggtttatgcgaattaaaaaatgattgtgtgtgattctttaaatgaaataacttttcaaattgactggt 23067769  T
Q  345 taagtcattataccaatt 362  Q
     |||| ||||||| ||||    
T  23067770 gaagtgattatacaaatt 23067787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 355
Target Start/End: Original strand, 41706899 - 41707110
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaa-gagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgt 245  Q
    ||||||| ||||| |||| || ||| ||||||||||| ||||  |||||| || |||||||| |  ||  |||||| |||||| |||  |||||||||||    
T  41706899 aaaaaattagaattagaaagaacttctaaacatgaaaagaattaaaaaaaattaagtgaaaggg--gtgaaatttatctaacgttgtcgtttggatttgt 41706996  T
Q  246 cacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa----aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgact 341  Q
    ||||  || | ||||  |||||| ||| ||||||||||||| |||    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41706997 cactcctctggtgtgaaaaagggtaaagcgaatggtttatgcgaagaaaaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgact 41707096  T
Q  342 gattaagtcattat 355  Q
    |||||||| |||||    
T  41707097 gattaagtgattat 41707110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 235 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 54430682 - 54430554
Alignment:
Q  235 tttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttca 333  Q
    |||||||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||    
T  54430682 tttggatttgtcactcgtttgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgcaattcttttaatgaaataacttttca 54430583  T
Q  334 aattgactgattaagtcattataccaatt 362  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  54430582 aattgactgattaagtgattatacaaatt 54430554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 76 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21596623 - 21596329
Alignment:
Q  76 gctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcagaagagcttttaa 175  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||        | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  21596623 gctcggttctctttttaaaatatgcccctaataaaataaaaatgtaatttttttttatagctaagcttcattaaaaaatcagaatcaaaagaacttctaa 21596524  T
Q  176 acatgaaacg-aatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaa 273  Q
    |||||||| | |||| ||| || || | ||||||| |  |  ||||||| |||| | ||  ||||  |||||||||  ||| |||||| |||||| ||||    
T  21596523 acatgaaatgtaataaaaagaa-ttaaatgaaagaaaaatgaaatttacctaacagcgtcgtttgattttgtcactcctccattgtgg-aaagggaaaaa 21596426  T
Q  274 cgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattggtagtgg 370  Q
    | ||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  21596425 caaatggtttgagcaaaaaataaatgattgttgtgattcttgtaatgaaatagctttccaaatcgactgattaagtgattatacaaattgggagtgg 21596329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 51 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 51147252 - 51146952
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtg--tagctaagctttatta 148  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||| |||||||| |||| | ||        ||  ||| ||||||| ||||    
T  51147252 cagggccgttcctatgaaataggaggctcggttctatttttaaaatagacccc-aataaaattaaaatgtaatttttttttgcgtaggtaagcttcatta 51147154  T
Q  149 aaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaa--aacttgagtgaaagagaggtataatttac-taacggtgtgatttggatttgt 245  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||| ||||| || ||||||  || |  |||||||||||| || ||||||| |||||||||  |||||| | ||    
T  51147153 aaaaatcataatcagaagaactcttaaacacgaaacaaa-acaaaataaaatgaagtgaaagagagataaaatttacctaacggtgtcgtttggaat-gt 51147056  T
Q  246 cacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaa-aagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgat 344  Q
    ||||| |  || || | |||||| ||||||||||||||||| || | || |||| ||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||    
T  51147055 cacttctatgtcgtagaaaaggg-aaaacgaatggtttatgcgagagaaaaaataattgttgtgattctttcaataaaatagttttttaaattgactgat 51146957  T
Q  345 taagt 349  Q
    |||||    
T  51146956 taagt 51146952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 255 - 362
Target Start/End: Original strand, 1255007 - 1255112
Alignment:
Q  255 gttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcatta 354  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  1255007 gttgcgggaaaggggaaaacgaatggtttatgcgaaaaacaaattattgt--tgattctttcaatgaaataactttctaaattgaccgattaagtcatta 1255104  T
Q  355 taccaatt 362  Q
    ||| ||||    
T  1255105 tacaaatt 1255112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 364
Target Start/End: Original strand, 1649604 - 1649895
Alignment:
Q  64 atgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaaatcagaatcag 163  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||       ||||| | |||||| ||||||||||| || | |     
T  1649604 atgaaatgggaggctcggctctctatttaaaatagttccccagtaaaataaaaacacaatttgtttgtgtaccgaagcttcattaaaaaatcggagttat 1649703  T
Q  164 aagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttact-aacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtggg 262  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| | ||| ||        ||| | | ||  |||||||| ||| || |  |||||||||||||||  |||||| | ||    
T  1649704 aagaacttctaaacatgaaacgaa-ataaagaa--------aaaaataagtgaaatttacttaacagtttcgtttggatttgtcactcctccgttatagg 1649794  T
Q  263 aaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaatt 362  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  |||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  1649795 aaaggg-aaaacaaatggcttatgcaaaaaagaattgattgttgcgaagctttcagtgaaatagattttcaaattgaatgattaagtgattatacaaatt 1649893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20762266 - 20762056
Alignment:
Q  148 aaaaaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaat-acaaaaaacttgagtgaaagagaggtataatttact-aacggtgtgatttggatttgt 245  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||| |||| | |||||| || ||||||||||  ||  |||||| | |||||| |  |||| ||||||    
T  20762266 aaaaaatcagaatcggaagaacttctaaatatgaaatgaattaaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttattcaacggtatcgtttgtatttgt 20762169  T
Q  246 cacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgat 344  Q
    ||||  ||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||  || |||||| ||||||    
T  20762168 cactcctctattgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgacgaaaaaaatgattgttatgattctttcaatgaaatagacttccaaattaactgat 20762069  T
Q  345 taagtcattatac 357  Q
     |||| |||||||    
T  20762068 caagtgattatac 20762056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 307
Target Start/End: Original strand, 27110723 - 27110879
Alignment:
Q  151 aaatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtcact 249  Q
    |||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||  ||  |||||| ||||||||||  |||| ||||||||||    
T  27110723 aaatcagaatcataagaagttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttgaatttgtcact 27110820  T
Q  250 tatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgt 307  Q
      || ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||    
T  27110821 cctctgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaaggaaaaaatgattgttgt 27110879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 364
Target Start/End: Original strand, 4207347 - 4207418
Alignment:
Q  289 aaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaattgg 364  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    ||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  4207347 aaaaagaaaggattgttgtgattctt----tgaaatatctttccaaattgaatgattaagtgattatacaaattgg 4207418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 27303502 - 27303453
Alignment:
Q  50 acagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaatagg 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  27303502 acagggccgttccaatgaaataggaggctcggttctatttttaaaatagg 27303453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 116
Target Start/End: Original strand, 46791451 - 46791509
Alignment:
Q  56 ccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaa 116  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  46791451 ccgtccctgtgaaataggaggctcggctctc--tttaaaataggcccctagtaaaataaaa 46791509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 24252935 - 24252884
Alignment:
Q  50 acagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggccc 102  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  24252935 acagggccgtcccg-tgaaataggaggttcgtctctctttttaaaataggccc 24252884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 362
Target Start/End: Original strand, 16897 - 17194
Alignment:
Q  65 tgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaa--aaatcagaatca 162  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||       ||||||||||  || ||||||  |||||||||||     
T  16897 tgaaataggaggctcggctctctttttaaaataggcccctaataaaataaaa-cgtaatttttttgtgtagctaaatttcattaaataaaatcagaatct 16995  T
Q  163 gaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgg 261  Q
    |||||  || ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||  ||  |||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |  |||||||    
T  16996 gaagaagttctaaacatgaaaggaattaaaaaaa-ttaagtgaaagag--gtgaaatttatccaacggtgtcgtttgaatttgtcacttctttgttgtgg 17092  T
Q  262 gaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaa-tgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattataccaa 360  Q
     ||| || ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17093 aaaatggtaaaacgaatggtttatgcgaagaagaaaatgattgttgtgattctttcaacgaaatagctttccaaattgactgattaagtgattatacaaa 17192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 17011 - 16712
Alignment:
Q  65 tgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaaaaa---tcagaatc 161  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| | ||||||| || || ||       ||||||||||  || |||||||||   | ||||||    
T  17011 tgaaataggaggctcaactctctttttaaaataggcccctagtaaaatataa-cgtaatttttttgtgtagctaaatttcattaaaaaaaaattagaatc 16913  T
Q  162 agaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtg 260  Q
    ||||||  || ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||  ||  |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||  || ||||||    
T  16912 agaagaagttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgttactcctctgttgtg 16815  T
Q  261 ggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaa-atgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtcattatacca 359  Q
    | |||||| ||||||||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  16814 gaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaatatgatcgttgtgattctttcaatgaaatagcttttcaaattgactgattaagtgattatacaa 16715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0564 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0564
Description:

Target: scaffold0564; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 51 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 1376 - 1086
Alignment:
Q  51 cagggccgtcccaatgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngtgtagctaagctttattaaa 150  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  || | |||||||||| || ||       ||||||||||  || ||||||    
T  1376 cagggccgtccccgtgaaataggaggctcggctctctttttaaaataagttcctagtaaaataaaa-cgtaatttttttgtgtagctaaatttcattaaa 1278  T
Q  151 aaa--tcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaat-acaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaacggtgtgatttggatttgtc 246  Q
    |||  ||||||||||||||  || ||||||||||| |||| | |||||| || | ||||||||  ||  |||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  1277 aaaaatcagaatcagaagaagttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaaattaaatgaaagag--gtgaaatttatctaacggtgtcgtttggatttgtc 1180  T
Q  247 acttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaattga 339  Q
    |||  |  ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  1179 actcctatgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaatgattgttgtgattctttcaatgaaatagctttccaaattga 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 130 - 339
Target Start/End: Original strand, 22633 - 22844
Alignment:
Q  130 gtgtagctaagctttattaaaa--aatcagaatcagaagagcttttaaacatgaaacgaatacaaaaaacttgagtgaaagagaggtataattta-ctaa 226  Q
    ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| || ||||||  ||||||  |||||| ||||    
T  22633 gtgtagctaaattttattaaaaaaaatcagaatcagaagaacttctaaacatgaaaggaattaaaaaaaattaagtgaa--agaggtgaaatttatctaa 22730  T
Q  227 cggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaa-aaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaata 325  Q
    ||||||  |||| ||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22731 cggtgtcgtttgaatttgtcactcctatgttgtggaaaagggtaaaacgaatggtttatgcgaagaaaaaaataattattgtgattctttcaatgaaata 22830  T
Q  326 gcttttcaaattga 339  Q
    | |||||| |||||    
T  22831 gtttttcatattga 22844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 225 - 355
Target Start/End: Original strand, 46099 - 46228
Alignment:
Q  225 aacggtgtgatttggatttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtgaaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaat 324  Q
    ||||||||  |||||||||||||||  ||  |||||  |||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  46099 aacggtgtcgtttggatttgtcactcctct-ttgtgaaaaagagtaaaacgaatggtttatgtgaagaaaaaatgattgttgtgattatttcaatgaaat 46197  T
Q  325 agcttttcaaattgactgattaagtcattat 355  Q
    ||  || |||||||||||||||||| |||||    
T  46198 agacttccaaattgactgattaagtgattat 46228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0606 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0606
Description:

Target: scaffold0606; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 240 - 362
Target Start/End: Original strand, 8333 - 8457
Alignment:
Q  240 atttgtcacttatccgttgtgggaaaggggaaaacgaatggtttatgtg--aaaaagaaatgattgttgtgattctttctatgaaatagcttttcaaatt 337  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||  |||||    
T  8333 atttgtcactcctccgttgcgggaagggggaaaacgaatggtttgtgtggaaaaaaaaaataatttttgtgattctttcaatgaaatagttttcgaaatt 8432  T
Q  338 gactgattaagtcattataccaatt 362  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||    
T  8433 gactgattaattgattatacaaatt 8457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 99219 - 99094
Alignment:
Q  64 atgaaataggaggctcggctctctatttaaaataggcccccaataaaataaaaacgcaannnnnnngt--gtagctaagctttattaaaaaatcagaatc 161  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||        |  |||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  99219 atgaaataggaggctcaaatctctttttaaaataggccctcagtaaaataaaaatgcaatttttttttttgtagctagccttcattaaaaaatcagaatc 99120  T
Q  162 agaagagcttttaaacatgaaacgaa 187  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||    
T  99119 agaagaacttctaaacatgaaacgaa 99094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 86 times since January 2019
Visitors: 4369