View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0673_low_31 (Length: 366)

Name: NF0673_low_31
Description: NF0673
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0673_low_31
NF0673_low_31
[»] chr4 (54 HSPs)
chr4 (1-366)||(3264697-3265062)
chr4 (1-366)||(11207134-11207499)
chr4 (1-366)||(29453440-29453805)
chr4 (1-366)||(44661769-44662134)
chr4 (1-366)||(20890987-20891351)
chr4 (1-366)||(33222922-33223287)
chr4 (1-366)||(16145916-16146281)
chr4 (1-366)||(1649180-1649545)
chr4 (1-366)||(15245928-15246293)
chr4 (1-366)||(15003267-15003632)
chr4 (2-366)||(51606085-51606449)
chr4 (1-366)||(15070417-15070782)
chr4 (1-318)||(15358993-15359310)
chr4 (1-297)||(27900459-27900755)
chr4 (89-298)||(16752665-16752874)
chr4 (2-366)||(29039048-29039412)
chr4 (20-366)||(16252107-16252453)
chr4 (2-366)||(8386416-8386780)
chr4 (2-366)||(23955751-23956115)
chr4 (2-366)||(12523680-12524044)
chr4 (2-366)||(14159496-14159860)
chr4 (2-366)||(14303622-14303985)
chr4 (2-366)||(18227090-18227454)
chr4 (168-366)||(42702907-42703105)
chr4 (2-366)||(14266543-14266907)
chr4 (21-366)||(14652312-14652657)
chr4 (2-366)||(18297209-18297573)
chr4 (1-181)||(15077824-15078004)
chr4 (2-366)||(40473044-40473408)
chr4 (2-366)||(12476604-12476968)
chr4 (2-366)||(14680571-14680935)
chr4 (1-266)||(15414929-15415194)
chr4 (2-366)||(19778437-19778801)
chr4 (2-366)||(27711340-27711704)
chr4 (134-366)||(7090437-7090668)
chr4 (134-366)||(15149782-15150014)
chr4 (2-303)||(8053267-8053568)
chr4 (134-366)||(14851142-14851374)
chr4 (2-366)||(16355089-16355453)
chr4 (242-366)||(18164333-18164457)
chr4 (1-280)||(9290925-9291204)
chr4 (173-366)||(15364390-15364583)
chr4 (6-222)||(8706066-8706282)
chr4 (1-280)||(14997406-14997685)
chr4 (2-277)||(55375262-55375537)
chr4 (2-280)||(15293061-15293339)
chr4 (250-366)||(14927151-14927267)
chr4 (134-280)||(13247735-13247881)
chr4 (134-280)||(16445248-16445394)
chr4 (137-235)||(16676482-16676580)
chr4 (158-280)||(12132469-12132591)
chr4 (20-225)||(1640087-1640292)
chr4 (308-357)||(15319596-15319645)
chr4 (2-74)||(12342767-12342839)
[»] chr8 (62 HSPs)
chr8 (1-366)||(6679181-6679546)
chr8 (1-366)||(804019-804384)
chr8 (1-366)||(14565212-14565577)
chr8 (1-366)||(6603728-6604093)
chr8 (1-366)||(12304828-12305193)
chr8 (1-366)||(29303772-29304137)
chr8 (1-366)||(22061779-22062144)
chr8 (1-366)||(31416820-31417185)
chr8 (1-366)||(1266309-1266673)
chr8 (1-366)||(23654997-23655362)
chr8 (49-366)||(21324803-21325121)
chr8 (1-366)||(20010246-20010611)
chr8 (158-366)||(28982427-28982635)
chr8 (158-366)||(28987647-28987855)
chr8 (2-366)||(31571189-31571553)
chr8 (1-366)||(19851481-19851846)
chr8 (1-366)||(19857517-19857882)
chr8 (41-360)||(21681856-21682175)
chr8 (164-366)||(16265127-16265329)
chr8 (1-366)||(21840487-21840852)
chr8 (23-366)||(20007920-20008263)
chr8 (1-291)||(22051008-22051298)
chr8 (2-360)||(20388175-20388533)
chr8 (1-169)||(16271570-16271738)
chr8 (2-366)||(15533450-15533814)
chr8 (227-366)||(27347296-27347435)
chr8 (2-366)||(20396472-20396836)
chr8 (134-366)||(21167016-21167248)
chr8 (2-366)||(19978037-19978401)
chr8 (14-366)||(23650111-23650463)
chr8 (2-366)||(32600214-32600578)
chr8 (2-366)||(19112760-19113124)
chr8 (2-366)||(19485217-19485581)
chr8 (20-366)||(30313509-30313855)
chr8 (2-366)||(17674370-17674734)
chr8 (2-357)||(22120521-22120876)
chr8 (2-366)||(20018097-20018461)
chr8 (130-366)||(21922210-21922446)
chr8 (2-366)||(22046443-22046807)
chr8 (135-366)||(21251012-21251243)
chr8 (2-366)||(16408392-16408756)
chr8 (130-279)||(22377928-22378077)
chr8 (130-279)||(22384103-22384252)
chr8 (134-366)||(22987271-22987503)
chr8 (134-366)||(21394344-21394576)
chr8 (134-366)||(21788837-21789069)
chr8 (137-317)||(22032151-22032331)
chr8 (2-366)||(22133388-22133752)
chr8 (1-280)||(20652679-20652958)
chr8 (137-366)||(22164673-22164902)
chr8 (1-85)||(20975997-20976081)
chr8 (171-360)||(23948965-23949154)
chr8 (2-198)||(23949158-23949353)
chr8 (2-280)||(16877442-16877720)
chr8 (2-280)||(21196849-21197127)
chr8 (2-280)||(21850684-21850962)
chr8 (222-366)||(15441251-15441395)
chr8 (134-280)||(22315347-22315493)
chr8 (1-280)||(22982592-22982869)
chr8 (20-87)||(23157376-23157443)
chr8 (194-264)||(19863229-19863299)
chr8 (194-264)||(19867866-19867936)
[»] chr7 (67 HSPs)
chr7 (1-366)||(8212018-8212383)
chr7 (1-366)||(49152295-49152660)
chr7 (1-366)||(11306153-11306518)
chr7 (1-319)||(26118495-26118813)
chr7 (1-366)||(12455696-12456061)
chr7 (1-366)||(16950361-16950726)
chr7 (1-366)||(6413505-6413870)
chr7 (1-366)||(1297-1662)
chr7 (1-366)||(13021351-13021716)
chr7 (1-366)||(19147205-19147570)
chr7 (1-365)||(14264134-14264498)
chr7 (1-366)||(14129867-14130232)
chr7 (1-366)||(14433685-14434050)
chr7 (1-366)||(20746604-20746969)
chr7 (1-366)||(14286266-14286631)
chr7 (1-366)||(16072184-16072549)
chr7 (1-366)||(15102493-15102856)
chr7 (2-366)||(18053844-18054208)
chr7 (2-366)||(23199634-23199998)
chr7 (2-366)||(23505761-23506125)
chr7 (1-199)||(12456940-12457138)
chr7 (1-366)||(12206690-12207055)
chr7 (123-366)||(26288049-26288291)
chr7 (1-366)||(13665547-13665896)
chr7 (1-216)||(15340575-15340790)
chr7 (1-366)||(11388318-11388682)
chr7 (1-146)||(13968558-13968703)
chr7 (2-366)||(11553015-11553379)
chr7 (20-366)||(14954613-14954959)
chr7 (6-366)||(15624545-15624905)
chr7 (2-366)||(23516682-23517046)
chr7 (2-366)||(12687494-12687858)
chr7 (2-366)||(8198621-8198985)
chr7 (2-366)||(8707598-8707962)
chr7 (2-366)||(14332390-14332754)
chr7 (2-366)||(15160970-15161334)
chr7 (2-366)||(17229-17593)
chr7 (14-366)||(15154582-15154929)
chr7 (2-366)||(10870988-10871352)
chr7 (2-366)||(11237126-11237490)
chr7 (2-366)||(18177735-18178099)
chr7 (2-366)||(18551671-18552035)
chr7 (2-366)||(44791264-44791628)
chr7 (2-366)||(13686057-13686421)
chr7 (21-366)||(15203872-15204217)
chr7 (104-366)||(14037800-14038062)
chr7 (104-366)||(14347830-14348092)
chr7 (2-240)||(35964763-35965001)
chr7 (1-280)||(7823979-7824258)
chr7 (1-280)||(27107686-27107965)
chr7 (2-280)||(14936426-14936704)
chr7 (282-366)||(15340490-15340574)
chr7 (1-280)||(12193635-12193914)
chr7 (2-201)||(21662119-21662318)
chr7 (134-280)||(4440007-4440153)
chr7 (134-280)||(15364019-15364165)
chr7 (20-280)||(12368507-12368767)
chr7 (1-280)||(21674445-21674724)
chr7 (2-180)||(9596236-9596414)
chr7 (156-264)||(41213-41321)
chr7 (1-280)||(13353230-13353509)
chr7 (21-88)||(45146826-45146893)
chr7 (130-216)||(11772282-11772368)
chr7 (134-280)||(13378777-13378923)
chr7 (332-366)||(26118805-26118839)
chr7 (130-201)||(17145299-17145370)
chr7 (1-90)||(15364209-15364298)
[»] chr5 (63 HSPs)
chr5 (1-366)||(14887076-14887441)
chr5 (1-366)||(37545581-37545947)
chr5 (1-366)||(20342200-20342565)
chr5 (1-366)||(24798482-24798847)
chr5 (2-366)||(22502597-22502961)
chr5 (1-366)||(25847993-25848358)
chr5 (1-366)||(22381117-22381482)
chr5 (1-366)||(23080174-23080539)
chr5 (1-366)||(22236005-22236370)
chr5 (1-366)||(22461870-22462235)
chr5 (2-366)||(17269419-17269783)
chr5 (1-366)||(20821371-20821736)
chr5 (1-366)||(21890844-21891209)
chr5 (1-366)||(28923853-28924218)
chr5 (38-366)||(23442415-23442743)
chr5 (1-366)||(28895027-28895392)
chr5 (1-366)||(24749639-24750004)
chr5 (1-366)||(24735696-24736061)
chr5 (1-366)||(20773678-20774043)
chr5 (1-366)||(21564058-21564416)
chr5 (2-366)||(22134604-22134968)
chr5 (2-366)||(22332973-22333337)
chr5 (20-366)||(26738809-26739155)
chr5 (2-366)||(16356438-16356802)
chr5 (2-366)||(34566430-34566794)
chr5 (130-366)||(23516477-23516713)
chr5 (2-366)||(27668576-27668940)
chr5 (2-318)||(18775761-18776077)
chr5 (2-366)||(20468182-20468546)
chr5 (2-366)||(23573678-23574042)
chr5 (146-366)||(24737015-24737235)
chr5 (20-359)||(21498140-21498479)
chr5 (2-366)||(14999825-15000189)
chr5 (2-366)||(27610290-27610654)
chr5 (6-366)||(27685490-27685850)
chr5 (2-366)||(22348361-22348723)
chr5 (2-366)||(37291582-37291946)
chr5 (2-366)||(40708716-40709080)
chr5 (2-366)||(41770778-41771142)
chr5 (20-366)||(21984409-21984755)
chr5 (2-366)||(19769896-19770260)
chr5 (2-366)||(27518343-27518707)
chr5 (2-366)||(29476159-29476523)
chr5 (137-366)||(20798696-20798925)
chr5 (104-366)||(23440161-23440423)
chr5 (134-366)||(25423125-25423357)
chr5 (6-280)||(11210784-11211058)
chr5 (132-366)||(23471165-23471399)
chr5 (20-280)||(23503447-23503707)
chr5 (1-280)||(21937273-21937552)
chr5 (209-366)||(20573457-20573614)
chr5 (14-168)||(21831841-21831995)
chr5 (227-366)||(21343669-21343808)
chr5 (2-280)||(24581215-24581493)
chr5 (2-201)||(21339372-21339571)
chr5 (134-280)||(27011088-27011234)
chr5 (209-366)||(21662333-21662489)
chr5 (209-366)||(21665794-21665950)
chr5 (209-363)||(21404775-21404929)
chr5 (1-36)||(1113-1148)
chr5 (2-84)||(23471447-23471529)
chr5 (158-203)||(8814243-8814288)
chr5 (20-72)||(25423419-25423471)
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (1-366)||(37677098-37677464)
chr1 (1-366)||(31550156-31550521)
chr1 (1-366)||(20294431-20294796)
chr1 (1-366)||(20940038-20940403)
chr1 (76-313)||(11382666-11382903)
chr1 (98-366)||(20075131-20075399)
chr1 (1-360)||(22433091-22433450)
chr1 (1-366)||(20835863-20836231)
chr1 (1-366)||(19854333-19854698)
chr1 (45-366)||(19664895-19665216)
chr1 (1-366)||(20856736-20857101)
chr1 (1-318)||(41307892-41308209)
chr1 (148-366)||(20244219-20244437)
chr1 (206-366)||(20395173-20395333)
chr1 (2-366)||(17044991-17045355)
chr1 (20-366)||(20249869-20250215)
chr1 (20-366)||(50620238-50620584)
chr1 (6-366)||(19760846-19761206)
chr1 (20-366)||(19106386-19106732)
chr1 (2-366)||(33391005-33391369)
chr1 (2-366)||(16350575-16350939)
chr1 (2-366)||(21830322-21830686)
chr1 (2-366)||(41354445-41354809)
chr1 (2-366)||(51333469-51333833)
chr1 (134-366)||(20136797-20137029)
chr1 (130-366)||(21747554-21747789)
chr1 (130-366)||(16369316-16369552)
chr1 (2-366)||(21836969-21837333)
chr1 (2-280)||(20914315-20914593)
chr1 (222-366)||(50612612-50612756)
chr1 (1-280)||(20831367-20831646)
chr1 (20-366)||(16078646-16078973)
chr1 (149-280)||(46518826-46518957)
chr1 (134-276)||(21202395-21202537)
chr1 (1-87)||(22135533-22135619)
chr1 (1-51)||(19663111-19663161)
chr1 (284-366)||(21163299-21163381)
chr1 (134-216)||(22135666-22135748)
[»] chr3 (68 HSPs)
chr3 (1-366)||(47123577-47123942)
chr3 (1-366)||(10383602-10383967)
chr3 (1-366)||(16329790-16330155)
chr3 (2-366)||(11961166-11961530)
chr3 (1-366)||(18134477-18134842)
chr3 (1-351)||(16836641-16836991)
chr3 (4-366)||(11303907-11304269)
chr3 (1-366)||(12360673-12361038)
chr3 (2-366)||(8759214-8759578)
chr3 (1-366)||(10420176-10420541)
chr3 (1-366)||(15953099-15953464)
chr3 (2-366)||(41177155-41177519)
chr3 (2-366)||(13941657-13942021)
chr3 (1-366)||(12850410-12850775)
chr3 (1-366)||(13322783-13323148)
chr3 (1-366)||(15227282-15227647)
chr3 (2-366)||(44776880-44777244)
chr3 (5-366)||(16381063-16381423)
chr3 (38-366)||(14571481-14571809)
chr3 (1-140)||(28754177-28754316)
chr3 (1-366)||(13972251-13972616)
chr3 (1-366)||(14086306-14086671)
chr3 (2-366)||(53385161-53385525)
chr3 (2-366)||(12497871-12498235)
chr3 (2-366)||(15725077-15725440)
chr3 (2-366)||(13252313-13252677)
chr3 (2-366)||(16635396-16635760)
chr3 (2-366)||(16756728-16757092)
chr3 (2-366)||(43162720-43163084)
chr3 (20-366)||(9522342-9522688)
chr3 (2-366)||(10005223-10005587)
chr3 (2-366)||(14876642-14877006)
chr3 (2-366)||(6600370-6600734)
chr3 (2-366)||(10905833-10906197)
chr3 (2-366)||(15348388-15348752)
chr3 (2-366)||(15589535-15589899)
chr3 (20-366)||(16807087-16807433)
chr3 (2-366)||(20062197-20062561)
chr3 (2-366)||(16371036-16371400)
chr3 (134-366)||(17489473-17489705)
chr3 (2-366)||(15338892-15339256)
chr3 (2-366)||(15402653-15403017)
chr3 (2-366)||(26792542-26792906)
chr3 (2-366)||(16691783-16692147)
chr3 (2-366)||(48425070-48425434)
chr3 (2-366)||(15247770-15248134)
chr3 (2-360)||(16412425-16412783)
chr3 (1-140)||(17492489-17492628)
chr3 (130-360)||(15208520-15208750)
chr3 (134-360)||(16492456-16492682)
chr3 (137-366)||(5425208-5425436)
chr3 (2-280)||(8274542-8274820)
chr3 (2-280)||(15576469-15576747)
chr3 (2-280)||(16742846-16743124)
chr3 (1-216)||(17192877-17193092)
chr3 (2-108)||(4678329-4678435)
chr3 (1-138)||(13001770-13001907)
chr3 (1-280)||(18748384-18748663)
chr3 (134-280)||(13975320-13975466)
chr3 (134-299)||(15016019-15016184)
chr3 (294-366)||(31945105-31945177)
chr3 (296-366)||(31689049-31689119)
chr3 (1-66)||(26009124-26009189)
chr3 (161-280)||(6153141-6153260)
chr3 (20-81)||(6153012-6153073)
chr3 (2-203)||(6712552-6712753)
chr3 (2-63)||(13975188-13975249)
chr3 (1-41)||(14573887-14573927)
[»] chr2 (53 HSPs)
chr2 (1-366)||(20832620-20832985)
chr2 (1-366)||(31830293-31830658)
chr2 (1-366)||(11358317-11358682)
chr2 (1-366)||(1063386-1063751)
chr2 (1-366)||(23293593-23293958)
chr2 (1-366)||(23276411-23276776)
chr2 (2-366)||(27787376-27787740)
chr2 (2-366)||(12573988-12574352)
chr2 (1-366)||(23087085-23087450)
chr2 (159-366)||(24653980-24654187)
chr2 (1-366)||(27365522-27365887)
chr2 (201-366)||(24945002-24945167)
chr2 (2-366)||(9609771-9610135)
chr2 (6-366)||(24878443-24878803)
chr2 (1-327)||(24825725-24826051)
chr2 (2-366)||(16924895-16925259)
chr2 (2-366)||(16998635-16998999)
chr2 (2-366)||(24262005-24262369)
chr2 (2-366)||(27217651-27218015)
chr2 (130-366)||(23138672-23138908)
chr2 (130-366)||(23550462-23550698)
chr2 (2-366)||(24675124-24675488)
chr2 (2-366)||(24707926-24708290)
chr2 (2-366)||(16981787-16982151)
chr2 (2-366)||(17063352-17063716)
chr2 (2-366)||(21145474-21145838)
chr2 (130-366)||(21325838-21326074)
chr2 (2-366)||(10868485-10868849)
chr2 (134-366)||(22757039-22757271)
chr2 (134-366)||(23063712-23063944)
chr2 (2-318)||(23188691-23189006)
chr2 (2-366)||(44386013-44386377)
chr2 (2-360)||(17067016-17067374)
chr2 (6-360)||(24709674-24710028)
chr2 (137-366)||(22325435-22325664)
chr2 (2-366)||(27370904-27371268)
chr2 (2-363)||(45529155-45529510)
chr2 (1-87)||(19652492-19652578)
chr2 (185-366)||(27377098-27377279)
chr2 (102-363)||(30211461-30211722)
chr2 (1-280)||(12640362-12640641)
chr2 (1-280)||(22276000-22276279)
chr2 (1-261)||(25128387-25128647)
chr2 (1-216)||(23817496-23817711)
chr2 (2-280)||(24831631-24831909)
chr2 (2-280)||(24570112-24570390)
chr2 (1-90)||(22762012-22762101)
chr2 (183-281)||(23817718-23817816)
chr2 (2-72)||(41608829-41608899)
chr2 (268-366)||(41609054-41609152)
chr2 (1-34)||(20828226-20828259)
chr2 (137-178)||(27368411-27368452)
chr2 (23-87)||(23063991-23064055)
[»] chr6 (69 HSPs)
chr6 (1-366)||(10468897-10469262)
chr6 (1-366)||(24364280-24364645)
chr6 (1-346)||(14381515-14381860)
chr6 (1-366)||(8766196-8766561)
chr6 (1-366)||(21471469-21471834)
chr6 (1-355)||(17415365-17415719)
chr6 (1-366)||(15459204-15459569)
chr6 (2-366)||(27560666-27561030)
chr6 (1-366)||(25768059-25768424)
chr6 (2-366)||(28282862-28283226)
chr6 (1-366)||(22796680-22797045)
chr6 (9-319)||(18800857-18801167)
chr6 (146-366)||(25750677-25750897)
chr6 (102-366)||(14131328-14131592)
chr6 (8-366)||(21564187-21564545)
chr6 (20-366)||(27331500-27331846)
chr6 (20-366)||(27392240-27392586)
chr6 (1-366)||(34645634-34645999)
chr6 (1-291)||(1640715-1641005)
chr6 (2-366)||(27187304-27187668)
chr6 (2-366)||(27261572-27261936)
chr6 (2-366)||(29591969-29592333)
chr6 (2-366)||(1543133-1543497)
chr6 (1-366)||(18794558-18794923)
chr6 (2-366)||(16626766-16627130)
chr6 (1-366)||(19879166-19879531)
chr6 (20-360)||(5839286-5839626)
chr6 (2-366)||(28263246-28263610)
chr6 (2-366)||(28292421-28292785)
chr6 (2-366)||(28341995-28342359)
chr6 (130-366)||(22078865-22079101)
chr6 (2-366)||(25765339-25765702)
chr6 (20-366)||(12497894-12498240)
chr6 (20-366)||(12510661-12511007)
chr6 (1-366)||(11280553-11280918)
chr6 (2-366)||(24313217-24313581)
chr6 (2-366)||(25112420-25112784)
chr6 (20-366)||(16963434-16963780)
chr6 (125-366)||(11287770-11288011)
chr6 (20-365)||(25609928-25610273)
chr6 (2-366)||(2874852-2875216)
chr6 (23-359)||(12505230-12505566)
chr6 (1-143)||(19453511-19453653)
chr6 (134-360)||(19864561-19864787)
chr6 (2-366)||(23078337-23078701)
chr6 (1-280)||(16098004-16098283)
chr6 (2-360)||(16927689-16928047)
chr6 (2-280)||(15078413-15078691)
chr6 (134-327)||(18408124-18408317)
chr6 (134-366)||(22762636-22762868)
chr6 (1-280)||(16382421-16382700)
chr6 (156-279)||(25750901-25751024)
chr6 (2-280)||(18837957-18838235)
chr6 (2-280)||(25743137-25743414)
chr6 (222-366)||(17032430-17032574)
chr6 (130-366)||(18197724-18197960)
chr6 (150-366)||(21833178-21833394)
chr6 (2-280)||(1648833-1649111)
chr6 (2-280)||(23996202-23996480)
chr6 (2-276)||(16233167-16233441)
chr6 (139-280)||(18571605-18571746)
chr6 (1-56)||(5297253-5297308)
chr6 (130-280)||(21413115-21413265)
chr6 (137-204)||(11291842-11291909)
chr6 (134-225)||(25655492-25655583)
chr6 (2-176)||(22433927-22434101)
chr6 (315-366)||(1640667-1640718)
chr6 (20-74)||(18571811-18571865)
chr6 (313-366)||(18787756-18787809)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (1-366)||(16619-16984)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (2-366)||(26296-26660)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (1-366)||(38793-39158)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-366)||(248648-249013)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (1-365)||(42239-42603)
scaffold0010 (1-365)||(47305-47669)
scaffold0010 (242-299)||(2252-2309)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (1-366)||(42818-43183)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (1-366)||(49113-49478)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (1-366)||(14157-14522)
scaffold0203 (257-366)||(9039-9148)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (1-366)||(4859-5224)
scaffold0034 (1-366)||(13807-14172)
[»] scaffold0058 (3 HSPs)
scaffold0058 (1-366)||(19155-19520)
scaffold0058 (132-357)||(58443-58668)
scaffold0058 (161-276)||(74025-74140)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (1-366)||(133-498)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (1-366)||(21577-21942)
scaffold0235 (1-216)||(25991-26206)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (1-366)||(47159-47524)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (1-366)||(322739-323104)
scaffold0004 (1-366)||(117603-117968)
scaffold0004 (1-366)||(385854-386219)
scaffold0004 (2-366)||(203375-203739)
scaffold0004 (21-366)||(112056-112401)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (10-366)||(20157-20513)
scaffold0114 (1-366)||(43540-43905)
scaffold0114 (1-366)||(44552-44917)
scaffold0114 (237-366)||(36090-36219)
[»] scaffold0124 (4 HSPs)
scaffold0124 (1-366)||(305-670)
scaffold0124 (1-366)||(10923-11288)
scaffold0124 (134-280)||(7849-7995)
scaffold0124 (2-63)||(7717-7778)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (1-366)||(9989-10354)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (1-366)||(17037-17402)
scaffold0298 (1-366)||(13267-13632)
scaffold0298 (1-366)||(20018-20383)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (1-366)||(57723-58087)
scaffold0053 (1-360)||(48939-49298)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (1-366)||(148605-148970)
scaffold0011 (1-366)||(195609-195973)
scaffold0011 (230-366)||(68575-68711)
scaffold0011 (130-360)||(26568-26798)
scaffold0011 (134-280)||(121989-122135)
scaffold0011 (2-88)||(180237-180323)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (1-366)||(260343-260708)
scaffold0005 (21-366)||(164635-164980)
scaffold0005 (137-366)||(308694-308923)
scaffold0005 (130-366)||(278865-279101)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (1-366)||(27554-27919)
scaffold0139 (1-360)||(1055-1413)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (1-366)||(52085-52450)
scaffold0067 (1-366)||(61119-61484)
scaffold0067 (1-366)||(67507-67872)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (1-366)||(2786-3151)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (1-366)||(4785-5150)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (1-366)||(7144-7507)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (1-366)||(12687-13052)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (1-366)||(25771-26136)
scaffold0113 (131-366)||(16711-16946)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (1-366)||(6218-6584)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (1-366)||(27261-27625)
[»] scaffold0001 (6 HSPs)
scaffold0001 (1-366)||(90838-91203)
scaffold0001 (138-366)||(162148-162376)
scaffold0001 (130-366)||(448094-448330)
scaffold0001 (134-280)||(78668-78814)
scaffold0001 (237-303)||(175361-175427)
scaffold0001 (1-36)||(114545-114580)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (2-366)||(1431-1795)
scaffold0120 (134-366)||(6058-6290)
scaffold0120 (20-280)||(22815-23075)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (1-327)||(10843-11169)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (1-366)||(18443-18808)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (1-366)||(26177-26542)
scaffold0192 (1-63)||(26862-26924)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-366)||(51769-52134)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (1-366)||(31445-31810)
scaffold0106 (134-360)||(14080-14306)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (1-366)||(3910-4275)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (1-366)||(9833-10193)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (1-305)||(5309-5613)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (30-366)||(1104-1440)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (21-366)||(39774-40118)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (1-366)||(95908-96273)
scaffold0029 (1-366)||(112594-112959)
scaffold0029 (4-366)||(109720-110082)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (1-365)||(5820-6184)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (11-366)||(3926-4281)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (5-366)||(37237-37598)
scaffold0026 (25-324)||(38103-38403)
scaffold0026 (128-324)||(27370-27566)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (5-360)||(4912-5267)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (7-366)||(6948-7307)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (79-366)||(14121-14407)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (1-366)||(10646-11010)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (9-264)||(7-262)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (1-366)||(563-928)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (1-285)||(1910-2194)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (1-246)||(1140-1385)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (123-366)||(226-469)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (1-228)||(3261-3488)
scaffold0222 (314-366)||(3487-3539)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (6-366)||(24982-25342)
scaffold0234 (135-280)||(16211-16356)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (1-188)||(5358-5545)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (1-366)||(28674-29040)
scaffold0064 (1-366)||(40665-41031)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (23-360)||(180258-180595)
[»] scaffold1710 (2 HSPs)
scaffold1710 (1-212)||(78-289)
scaffold1710 (134-280)||(949-1095)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (137-366)||(28002-28231)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (1-366)||(33583-33948)
scaffold0076 (1-280)||(40379-40658)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (2-366)||(7412-7776)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (2-366)||(14986-15350)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (2-366)||(43189-43553)
scaffold0028 (1-366)||(50420-50785)
scaffold0028 (2-366)||(8520-8884)
scaffold0028 (1-280)||(106479-106758)
scaffold0028 (137-235)||(13832-13930)
scaffold0028 (2-90)||(15258-15346)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (176-366)||(4220-4410)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (2-366)||(14395-14759)
scaffold0044 (2-366)||(655-1019)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (2-366)||(65440-65804)
scaffold0042 (230-366)||(39924-40060)
scaffold0042 (134-180)||(39858-39904)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (134-357)||(46-269)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (2-366)||(25626-25990)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (1-366)||(18884-19249)
scaffold0090 (1-318)||(23094-23411)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (2-366)||(711-1075)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (20-360)||(229084-229424)
scaffold0012 (134-327)||(219456-219649)
scaffold0012 (131-280)||(33031-33180)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (193-366)||(1212-1385)
[»] scaffold0507 (3 HSPs)
scaffold0507 (130-318)||(9053-9241)
scaffold0507 (134-279)||(372-517)
scaffold0507 (1-90)||(260-349)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (242-366)||(136154-136278)
scaffold0019 (1-42)||(136269-136310)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (20-327)||(21941-22248)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (2-360)||(949-1307)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (2-366)||(6049-6413)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (2-366)||(4312-4676)
[»] scaffold0109 (3 HSPs)
scaffold0109 (2-366)||(8631-8995)
scaffold0109 (2-366)||(33480-33844)
scaffold0109 (232-280)||(44583-44631)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (2-366)||(6972-7338)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (104-366)||(15528-15789)
scaffold0333 (104-180)||(15876-15952)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (132-366)||(16502-16736)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (6-366)||(449-809)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (2-327)||(7864-8189)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (135-303)||(6470-6638)
scaffold0403 (1-41)||(3151-3191)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (130-366)||(4067-4303)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (130-366)||(3175-3411)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (130-366)||(14912-15148)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (1-119)||(6243-6361)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (2-360)||(127106-127464)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (21-366)||(17022-17367)
[»] scaffold0894 (2 HSPs)
scaffold0894 (134-366)||(1174-1406)
scaffold0894 (20-72)||(1468-1520)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (122-366)||(5618-5861)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (134-366)||(9378-9610)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (2-309)||(12884-13191)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (130-366)||(32787-33023)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (2-300)||(687-985)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (130-366)||(5256-5492)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (21-366)||(116831-117176)
scaffold0037 (20-280)||(98136-98396)
scaffold0037 (182-296)||(23553-23667)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (130-366)||(295-531)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (146-366)||(1040-1260)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (218-366)||(13376-13524)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (2-366)||(63938-64302)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (139-366)||(26-253)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (2-280)||(293-571)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (134-280)||(10476-10622)
scaffold0447 (134-280)||(5862-6008)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (20-366)||(619-964)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (20-366)||(49528-49874)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (134-303)||(862-1030)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (130-318)||(16451-16639)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (1-280)||(14644-14923)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (1-280)||(13029-13308)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (2-280)||(961-1239)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (2-280)||(46275-46553)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (23-276)||(7522-7775)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (2-277)||(23518-23793)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (1-280)||(28172-28451)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (2-361)||(86411-86770)
scaffold0007 (2-72)||(46557-46627)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (252-366)||(2023-2137)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (134-280)||(8471-8617)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (1-280)||(3280-3559)
[»] scaffold0692 (2 HSPs)
scaffold0692 (134-280)||(3914-4060)
scaffold0692 (1-60)||(3781-3840)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (134-280)||(14776-14922)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (20-280)||(8816-9076)
[»] scaffold0551 (1 HSPs)
scaffold0551 (137-280)||(8216-8359)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (149-280)||(14778-14909)
scaffold0132 (1-280)||(43659-43938)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (134-280)||(24001-24147)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (130-202)||(4489-4561)
scaffold0023 (237-366)||(4567-4696)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (2-178)||(71442-71618)
scaffold0021 (134-280)||(13372-13518)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (222-366)||(16992-17136)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (6-280)||(9108-9382)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (134-280)||(3983-4129)
scaffold0218 (2-63)||(3851-3912)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (131-216)||(26193-26278)
scaffold0244 (1-73)||(26063-26135)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (315-363)||(8768-8816)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (6-201)||(1335-1530)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (305-366)||(45880-45941)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (134-186)||(3758-3810)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (2-90)||(7479-7567)
[»] scaffold1508 (1 HSPs)
scaffold1508 (332-366)||(874-908)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (158-263)||(10794-10899)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (1-42)||(8-49)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (322-366)||(9254-9298)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (20-72)||(25-77)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 54)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 3264697 - 3265062
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3264697 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcat 3264796  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3264797 gagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttc 3264896  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3264897 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 3264996  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3264997 gatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 3265062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 11207134 - 11207499
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  11207134 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcat 11207233  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11207234 gagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttc 11207333  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11207334 aggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatca 11207433  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11207434 gatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccacctcatctttcgaacttgca 11207499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 29453440 - 29453805
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  29453440 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtattgggacgggatttggttcat 29453539  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29453540 gagactactgagaaagtaaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttc 29453639  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29453640 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatca 29453739  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29453740 gatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 29453805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 44661769 - 44662134
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  44661769 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcat 44661868  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  44661869 gagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccgtgacaagcggagaaaggatcttgagtttc 44661968  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44661969 aggagggtgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtgttggtcgtgcgctgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatca 44662068  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44662069 gatttcagagagagttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 44662134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 20891351 - 20890987
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  20891351 tatggcaccgttcgaagctttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccgaatttggttcat 20891252  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  20891251 gagactactgagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttc 20891152  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20891151 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggttcgtatca 20891052  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  20891051 gatttcagagagggttggaacagtggcatatag-gatgggtttccaacacatctttcgaacttgca 20890987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 33223287 - 33222922
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |||    
T  33223287 tatgacaccattcaaagcattgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccagacttggttcat 33223188  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    || ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  33223187 gaaactactgagaaagtcaagttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggaacttgagtttc 33223088  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  33223087 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgacaccaaagttcattggtccgtatca 33222988  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  33222987 gatttcaaagagagttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccccatctttcgaacatgca 33222922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16146281 - 16145916
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  16146281 tatggcaccgttcgaagatttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggacagagtgttgtgttgggaccagatttggttcat 16146182  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||  ||||||||||    
T  16146181 cagactacggagaaagtcaaggtgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttc 16146082  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16146081 aggaggatgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 16145982  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16145981 gatttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 16145916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 1649180 - 1649545
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  1649180 tatgtcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagaactcctttatgctggtttgagtcatgagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcat 1649279  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    ||||||||  |||||||||   | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||    
T  1649280 gagactacgaagaaagtcaagataatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttaccacgacaagcggaggaaggaccttgagtttc 1649379  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  1649380 aggagggcgatcatgtatttctaagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgacttccaagttcattggtccgtatca 1649479  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| ||||||||  |||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  1649480 gatatcagagaggattggaactgtggcatatagagttgggttgccacctcatctttcgaatttgca 1649545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 15246293 - 15245928
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15246293 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagaactcctttattctagtttgagtcaggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcat 15246194  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     |||||||  |||| || |   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||   |||||||||    
T  15246193 cagactacgaagaaggtaaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaaacgtaggaaggcctttgagtttc 15246094  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| || || ||| |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15246093 aggagggagatcatgtatttctgagagttacccctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 15245994  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  15245993 gataacagagagggttggaacagtggcatacagagtgcgtttgccaccacatctttcgaatttgca 15245928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 15003267 - 15003632
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || |||    
T  15003267 tatggcaccgttcaaagctttgtatggtcggaagtggaggactcctttatgttggtttgagtcgggagaaagtgtggtgttgggaccagatttagttcat 15003366  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    ||||||||||    
T  15003367 cagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtagaaaatcccttgagtttc 15003466  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| ||| |||| || |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15003467 aagagggagatcatgtgtttttgagagttactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagtttattgatccatatca 15003566  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15003567 gatatctgagagagttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgca 15003632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 51606085 - 51606449
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  51606085 atggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagtgttgtgctgggaccggatttggttcagg 51606184  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||| || |||||||   |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||  |||||||||||    
T  51606185 agactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaaacggagaaaggcccttgagtttca 51606284  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     |||||||||||||| ||| | || || |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  51606285 agagggtgatcatgtatttataagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtccgtatcag 51606384  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||| | || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  51606385 atttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgca 51606449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 15070782 - 15070417
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||| || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || |||    
T  15070782 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcagaggtgcagaactccattgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcat 15070683  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  15070682 cagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggcccttgagtttc 15070583  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||  |||||||  | |||||||||| | |||||||||||||| || ||    
T  15070582 aagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtgtaggtcgtgtgttgaagtttatgaagttgactacgaagtttattggtccatacca 15070483  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15070482 gatatttgagagagttggaacagtggcatacagggtgggtttgccaccacatctttcgaatttgca 15070417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 15358993 - 15359310
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15358993 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcat 15359092  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||| || |   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||  ||||||||||    
T  15359093 cagactacggagaaggtaaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttttcatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttc 15359192  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| |||| ||| || |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  15359193 aagagggagatcatgtatttccgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaaatcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatca 15359292  T
Q  301 gatttcagagagagttgg 318  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  15359293 gatatcagagagggttgg 15359310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 27900755 - 27900459
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27900755 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggacttctttatgctggtttgagtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcat 27900656  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||| ||||||||||   |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| || || || ||||||||||    
T  27900655 gagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgatagaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttc 27900556  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgta 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| | |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27900555 aggagggtgatcatgtttttctgagggttactcctatgacgagtgtagaacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgta 27900459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16752874 - 16752665
Alignment:
Q  89 gatttggtacatgagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaagg 188  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  16752874 gatttggttcatcaaacgactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggagaaagg 16752775  T
Q  189 atcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttat 288  Q
      |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  16752774 cccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttaactccgaagttcat 16752675  T
Q  289 tggtccgtat 298  Q
    ||||||||||    
T  16752674 tggtccgtat 16752665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 29039048 - 29039412
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  29039048 atggcaccgttcgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 29039147  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  29039148 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttcc 29039246  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  29039247 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 29039346  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  29039347 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgca 29039412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 366
Target Start/End: Original strand, 16252107 - 16252453
Alignment:
Q  20 ttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtca 119  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  |  | ||  ||||||||||||| || |    
T  16252107 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattcttcagcagactactgagaaggtta 16252206  T
Q  120 gattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttt 219  Q
       ||||   ||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||    
T  16252207 agatgattcaagagaaaataaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtt 16252306  T
Q  220 tctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggt 319  Q
    | |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || || ||||||||     
T  16252307 tttgagagtcactcttgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttgga 16252406  T
Q  320 acagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || ||||| ||  |||| || || ||||||||||||||||| |||||    
T  16252407 acggtggcgtatcgagtgggattaccaccacatctttcgaatttgca 16252453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 8386780 - 8386416
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  8386780 atggcgccgttcgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 8386681  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  8386680 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttc 8386582  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  8386581 aggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 8386482  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  8386481 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 8386416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 23956115 - 23955751
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  23956115 atggcaccgttcgaggccttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 23956016  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  23956015 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttcc 23955917  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  23955916 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 23955817  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || |||||| |||| |||||    
T  23955816 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgca 23955751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 12524044 - 12523680
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  12524044 atggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggttttaggaccagagattgttcagc 12523945  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    | |||||||||||||| |   ||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||    
T  12523944 aaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaccgtaggaaagatcttgagtttca 12523845  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  12523844 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagtttattggtccgtatcag 12523745  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || || || |||||||| || ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| || |||||    
T  12523744 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagttggattaccaccgcatctttcaaatttgca 12523680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14159860 - 14159496
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||  | || ||      
T  14159860 atggcaccttttgaggctttgtacggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgagaatgtggttttgggaccggagattgttcaac 14159761  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    |||||||||| || || |   ||||   ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  14159760 agactactgaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttca 14159661  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     |  || |||||||| || ||||| || |||||  |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || | |||||||||||| ||||||    
T  14159660 aggaggagatcatgtgttcctgagagttactcccatgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaggtttattggtccatatcag 14159561  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || ||||| ||| |||| || ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  14159560 atatcagaaagaattggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 14159496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 14303622 - 14303985
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  14303622 atggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 14303721  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||||||||||||  |  ||||   ||| || ||||| || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14303722 agactactgagaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 14303821  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  14303822 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac-ccgaagttcattggtccgtatcag 14303920  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  14303921 atattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 14303985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 18227090 - 18227454
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||| ||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  18227090 atggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttttagtcaggtgaaagagtggtcttaggacccgagattgttcaga 18227189  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    |||||||| ||||||| |   ||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  18227190 agactactaagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaagaatcttgagtttca 18227289  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
    ||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  18227290 ggaaggagagcacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactctgagatttattggtccgtatcag 18227389  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || || || |||||||| |||||||| ||  |||| || || |||||  |||||||||| |||||    
T  18227390 atatcggaaagagttggaacagtggcgtatcgagtgggattaccaccgtatctttcgaatttgca 18227454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 168 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 42703105 - 42702907
Alignment:
Q  168 accatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgag 267  Q
    ||||||| || || |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| | || || |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  42703105 accatgacaaacggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttataagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgag 42703006  T
Q  268 gaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  42703005 aaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgca 42702907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 14266543 - 14266907
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  14266543 atggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 14266642  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | ||||||||||| || ||||| |||  |||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  14266643 aaactactgagaaggttcagat-gatctgagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttc 14266741  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || ||  | ||| |||| ||||| ||| |||| |||||  |||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  14266742 aggaaggagaccacatgtttttgagagtcacccctatgactggtgtatgacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatca 14266841  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  14266842 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 14266907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14652657 - 14652312
Alignment:
Q  21 tgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtcag 120  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  | |||||||| ||  | || ||  | ||||||||||| || |     
T  14652657 tgtatggtcgaaggtgcagaactccgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtatttttgggaccagaaatcgttcaacaaactactgagaaggttaa 14652558  T
Q  121 attgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgttttt 220  Q
      ||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| || |||    
T  14652557 gatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagatcacgtattt 14652458  T
Q  221 ctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggta 320  Q
     |||| ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |    
T  14652457 ttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgacttcgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaa 14652358  T
Q  321 cagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    | ||||| ||  |||| ||||  ||||| ||||||||||| |||||    
T  14652357 cggtggcgtatcgagtgggttcaccaccgcatctttcgaatttgca 14652312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 18297573 - 18297209
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  18297573 atggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 18297474  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  18297473 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttcc 18297375  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  18297374 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 18297275  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  18297274 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 18297209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15078004 - 15077824
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||| || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || |||    
T  15078004 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcagaggtgcagaactccattgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcat 15077905  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcga 181  Q
     ||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15077904 cagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcga 15077824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 40473408 - 40473044
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | || ||      
T  40473408 atggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttcgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccggagattgttcagc 40473309  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    | ||||||||||||||   | ||||   ||| || |||||||| ||| |||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40473308 aaactactgagaaagttcaaatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 40473209  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
    ||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||| |||||||    
T  40473208 ggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtctgtatcag 40473109  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || |  || |||||||| ||  |||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  40473108 atattggaaagagttggaacgatggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 40473044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 12476968 - 12476604
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  12476968 atggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 12476869  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | ||||||||| |||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||    
T  12476868 aaactactgaggaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttc 12476770  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  12476769 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 12476670  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  12476669 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgca 12476604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14680935 - 14680571
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  14680935 atggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 14680836  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    |||||||||||||||| |   ||||   ||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14680835 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttca 14680736  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
    |||  | || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |  |||||||| || |  ||||||||||||||||||    
T  14680735 ggaacgagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaataagttgaccccgagatttattggtccgtatcag 14680636  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || || || |||||||| || ||||| ||  |||| || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  14680635 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgca 14680571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 15414929 - 15415194
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||| | || ||     
T  15414929 tatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgcagaactccgttatgttggtttgagtcgggtgaaagtgtaatgttgggaccagatatagttcaa 15415028  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| || || |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||    
T  15415029 cagactacggaaaaggtcaaattgataagggagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgaatttc 15415128  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcga 266  Q
    | || || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||  |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  15415129 aagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcttgtgataggtgttggtcgtgccttgaaatcga 15415194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 19778437 - 19778801
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |  || || ||||| ||  | || ||      
T  19778437 atggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagcggtcttaggaccagagattgttcagc 19778536  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  19778537 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttcc 19778635  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  19778636 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 19778735  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  19778736 gatattggaaagagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 19778801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 27711704 - 27711340
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  27711704 atggcaccgttcgagactttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 27711605  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  27711604 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttcc 27711506  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  27711505 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 27711406  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || |||||| |||| |||||    
T  27711405 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgca 27711340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 7090668 - 7090437
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| |||||||    
T  7090668 aagatgaaagcgtcgaagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactc 7090569  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacag 333  Q
    || |||| ||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||| | |||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| |    
T  7090568 ctgtgactggtgttggatgagctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgct-cgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccg 7090470  T
Q  334 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  7090469 agtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 7090437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 366
Target Start/End: Original strand, 15149782 - 15150014
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || || || || || ||| |||| |||||||    
T  15149782 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 15149881  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacag 333  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| | ||  |    
T  15149882 ctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactctgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtgacgtatcg 15149981  T
Q  334 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  15149982 agtgggattaccaccgcatctttcgaatttgca 15150014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 303
Target Start/End: Original strand, 8053267 - 8053568
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||  || || |||||||| ||||| || || || || || ||||| ||  | || ||      
T  8053267 atggcaccgttcgaggccttgtatggtcggagatgcagaactctgttgtgttggtttgaatcaggagagagagtggtcttaggaccagaaattgttcagc 8053366  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||  |||||||| ||||    
T  8053367 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtagaagagatcttgaatttc 8053465  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  8053466 aggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 8053565  T
Q  301 gat 303  Q
    |||    
T  8053566 gat 8053568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 366
Target Start/End: Original strand, 14851142 - 14851374
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||  | ||||||||||| || || |||||||| ||| | || |||||||    
T  14851142 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaaaaccttgagtttcaagaaggagatcatgtattttttagagtcactc 14851241  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacag 333  Q
     | |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |  || ||| |||| || ||||| ||  |    
T  14851242 atgtgaccggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttaactccgaggtttattggtccgtatcagatataggaaagaattggaacggtggcgtatcg 14851341  T
Q  334 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  14851342 agtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 14851374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 16355089 - 16355453
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || | ||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  16355089 atggcaccttttgaggctttatatggtcggagatggagaattccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 16355188  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    |||||||||||||||| |   ||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| || | ||| ||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  16355189 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaataattatcatgataagcgcaggaaagatcttgaatttca 16355288  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     || ||  | || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  16355289 agaaggaaaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 16355388  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || || || ||| |||| || ||||| ||  |||| || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  16355389 atatcggaaagacttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgca 16355453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 242 - 366
Target Start/End: Original strand, 18164333 - 18164457
Alignment:
Q  242 ggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtt 341  Q
    ||||| ||| |||| |||||||| | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18164333 ggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaagctgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtggcatacagagtgggtt 18164432  T
Q  342 tgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  18164433 tgccaccacatctttcgaatttgca 18164457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 9291204 - 9290925
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||| | |||| ||||||||  | || ||     
T  9291204 tatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccattgtgttggtttgagtccggagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaa 9291105  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    || ||||| || || || |   ||||    || |||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  9291104 gaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttc 9291005  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    |||  |||||||| || ||| ||||||| | |||| |||| | |||||| | |||||||||||  |||||||||||||||    
T  9291004 aggttggtgatcaggtatttttgagggtgaatcctgtgaccgatgttggtcatgctttgaagtgtaggaagttgactcct 9290925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 173 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 15364583 - 15364390
Alignment:
Q  173 gataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagt 272  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  15364583 gataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagt 15364484  T
Q  273 tgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  15364483 tgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 15364390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8706282 - 8706066
Alignment:
Q  6 caccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagac 105  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  ||||    
T  8706282 caccattcgaagctttgtatggtcggaggtgcagaacttcgttatgttggtttgagtcgggtgaaagtgtagtgttgggaccggatattgttcaccagac 8706183  T
Q  106 tactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggag 205  Q
    ||  || ||||| |   | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || || ||||| || || || ||||| ||| ||||     
T  8706182 tatagaaaaagttaagctaataagagaaaagatgaaagcgtcgcagaatcgacacaagagttatcacgacaagcgtaggaaagaccttgaatttaaggaa 8706083  T
Q  206 ggtgatcatgtttttct 222  Q
    || ||| |||| |||||    
T  8706082 ggagattatgtgtttct 8706066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14997685 - 14997406
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||  | || |||| | |||| |||||| |  | || ||     
T  14997685 tatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtccagagagagtgctttgttaggaccgaaagttgtgcaa 14997586  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    || ||||| || || || |   ||||   |||||||||||| || || |||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  14997585 gaaactacggaaaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagtcatcatgataagaggagaaaggatattgagtttc 14997486  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    | |  ||||||||||| ||| ||||||| | || | |||| || ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14997485 aagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcttgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 14997406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 277
Target Start/End: Original strand, 55375262 - 55375537
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||| |  || || |||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| ||  | ||||| |    
T  55375262 atggcaccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtaggacactgttgtgttggtttgaatcaggtgaaagtgctttgttaggaccagaagttgtacaag 55375361  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    | ||||| || || || |   ||||     | ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  55375362 aaactacggaaaaggttaagatgattcagtagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 55375461  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgact 277  Q
     |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| | || |||||||| || ||||||||||  | ||||||||||    
T  55375462 agttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtaactggtgttggtcgagctttgaagtgtatgaagttgact 55375537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 280
Target Start/End: Original strand, 15293061 - 15293339
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||| | |||| ||||||||  | || || |    
T  15293061 atggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtccggagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaag 15293160  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    | ||||| || || || |   ||||    || |||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||  | || |||||| ||||||||||    
T  15293161 aaactacagaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataaaaggaggaaggatattgagtttca 15293260  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
     |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||  || || || |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15293261 agttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaatggagtgggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 15293339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 366
Target Start/End: Original strand, 14927151 - 14927267
Alignment:
Q  250 acgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccacca 349  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||||     
T  14927151 acgtgcattgaagtcaaagaatttgactcctagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtactgagtgggtttaccaccg 14927250  T
Q  350 catctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||||| |||||    
T  14927251 catctttcgaatttgca 14927267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13247881 - 13247735
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | ||    
T  13247881 aagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaagatattgagtttcaagttggtgatcatgtatttttgagggtgaatc 13247782  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
     | |||  |||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||    
T  13247781 atgtgatcggtgttggtcttgctttgaagtgtaggaagttgactcct 13247735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 280
Target Start/End: Original strand, 16445248 - 16445394
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | || |||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| | ||||| | ||    
T  16445248 aagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgttttttagggtgaatc 16445347  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    || |||| || || || |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16445348 ctgtgactggagtgggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 16445394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 235
Target Start/End: Original strand, 16676482 - 16676580
Alignment:
Q  137 atgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcct 235  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| | || || || || ||| |||| |||||||||    
T  16676482 atgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcagcaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcct 16676580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 280
Target Start/End: Original strand, 12132469 - 12132591
Alignment:
Q  158 cagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctt 257  Q
    ||||||||||  ||||||||| | || |||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | || | |||| ||||||||||||||||    
T  12132469 cagaagagttgtcatgataagaggaggaaggacattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcatgtgactggtgttggacgtgctt 12132568  T
Q  258 tgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    ||||||   | ||||||||||||    
T  12132569 tgaagtgtcgaaagttgactcct 12132591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Original strand, 1640087 - 1640292
Alignment:
Q  20 ttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtca 119  Q
    ||||||||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| ||  | || ||  | |||||||||||||| |    
T  1640087 ttgtatggtcgaagatgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggtgagagggtggttttaggacccgagattgttcaacaaactactgagaaagtta 1640186  T
Q  120 gattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttt 219  Q
       ||||   |||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||  || || || |||||||| || || || |||||||| ||    
T  1640187 agatgattcaagaaaagatgaaggcgtcgcagagttgacaaaagagttatcatgataagcataggaaagaccttgagttccaagaaggagatcatgtatt 1640286  T
Q  220 tctgag 225  Q
    | ||||    
T  1640287 tttgag 1640292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 15319645 - 15319596
Alignment:
Q  308 gagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttc 357  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15319645 gagagagttggaacagtggcatacagagtgggtttgccagcacatctttc 15319596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 74
Target Start/End: Original strand, 12342767 - 12342839
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtg 74  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| |||||||||| ||  | || || |||| |||||||||||||||||    
T  12342767 atggcaccgtttgaggctttgtatggttggaggtgtagaacgtcgttgtgttggtatgagtcaggtgaaagtg 12342839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 62)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 6679546 - 6679181
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6679546 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcat 6679447  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6679446 gagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttc 6679347  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6679346 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 6679247  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6679246 gatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 6679181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 804019 - 804384
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  804019 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcac 804118  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  804119 gagactactaagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaaaagttaccatgacaagcgaagaaaggatctggagtttc 804218  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  804219 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 804318  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  804319 gatttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 804384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14565577 - 14565212
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||     
T  14565577 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtattgtgttgggaccggatttggttcac 14565478  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  14565477 gagactactgagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaaaagttaccatgacaagcgaagaaaggatctggagtttc 14565378  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  14565377 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccatatca 14565278  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14565277 gatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 14565212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 6604093 - 6603728
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6604093 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttgtgttggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcat 6603994  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6603993 gagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttc 6603894  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6603893 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatca 6603794  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6603793 aatttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 6603728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 12305193 - 12304828
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  12305193 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggacccctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgctgtgttgggaccggacttggttcat 12305094  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12305093 gagactactgagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttc 12304994  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12304993 aggagggtgatcatgtttttcttagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcatcggtccgtatca 12304894  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12304893 gatttcagagagggttgaaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 12304828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 29303772 - 29304137
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29303772 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcat 29303871  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  29303872 gagactactgagaaagtcagaatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttc 29303971  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | || |||||||||||    
T  29303972 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccaatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaggaagttgactccaaagatcataggtccgtatca 29304071  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29304072 gatttcagagagaattggaacagtggcttatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 29304137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 22061779 - 22062144
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22061779 tatggcaccgttcaaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcat 22061878  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||| ||||||||||   |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  22061879 gagactacagagaaagtcaagatgatcagaaaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggctcttgagtttc 22061978  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22061979 aggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacatgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 22062078  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
     || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22062079 aatatcagagagggttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 22062144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 31416820 - 31417185
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  31416820 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcatgactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttagtgcat 31416919  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||||||||||||||   ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||    
T  31416920 cagactactgagaaagtcaagatgataagggaaaaggtgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcggataaaggcccttgagtttc 31417019  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  31417020 aggagggtgatcatgtttttctgagagttactcttatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatta 31417119  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31417120 gatttcagaaagggttggaacagtggcatatagagttgctttgccaccacatctttcgaacttgca 31417185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 1266673 - 1266309
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1266673 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcagaggtgcaggactcctttgtgctagtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcat 1266574  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     |||| |||||||| || |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||  ||||||||||    
T  1266573 cagacgactgagaaggtaagat-gataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgacaagcggagaaaggcccttgagtttc 1266475  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||  |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1266474 aggagggtgatcatgtatttctgagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 1266375  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1266374 gatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgca 1266309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 23655362 - 23654997
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23655362 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagaactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcat 23655263  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||    
T  23655262 cagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgatagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttc 23655163  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || |||||| | |||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23655162 aagacggagatcatttgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 23655063  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |||||||| ||| | ||||||| ||| | | | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23655062 gatatcagagagggtttgaacagtggtatatatattgggtttgccaccacatctttcgaatttgca 23654997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 49 - 366
Target Start/End: Original strand, 21324803 - 21325121
Alignment:
Q  49 atgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcg 148  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| | |||    
T  21324803 atgctggtttgagtcaggagatagtgtggtgttgggaccggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaaacgtcg 21324902  T
Q  149 cagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttg 248  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  21324903 cagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtag 21325002  T
Q  249 gacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccacc 348  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21325003 gacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcatagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccacc 21325102  T
Q  349 acatc-tttcgaacttgca 366  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  21325103 acatcatttcgaacttgca 21325121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 20010246 - 20010611
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||| || |||    
T  20010246 tatggcaccgttcgaaactttgtatggtcggaggtgtaggactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgttgttgggaccagatttagttcat 20010345  T
Q  101 gagactactgagaaagtc-agattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagttt 199  Q
     ||||||  ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||  |||||||||    
T  20010346 cagactatagagaaggtccagat-gataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaagaaggcgcttgagttt 20010444  T
Q  200 caggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatc 299  Q
    || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  20010445 caagagggagatcatgtgtttctgagagtcactccgatgacgggtgtgggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccgtacc 20010544  T
Q  300 agatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20010545 agatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgca 20010611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 158 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 28982635 - 28982427
Alignment:
Q  158 cagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctt 257  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  28982635 cagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccgttgacgggtgttggacgtgcct 28982536  T
Q  258 tgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28982535 tgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggaccgtatcagatttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttc 28982436  T
Q  358 gaacttgca 366  Q
    |||||||||    
T  28982435 gaacttgca 28982427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 158 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 28987855 - 28987647
Alignment:
Q  158 cagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctt 257  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  28987855 cagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccgttgacgggtgttggacgtgcct 28987756  T
Q  258 tgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttc 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28987755 tgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggaccgtatcagatttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttc 28987656  T
Q  358 gaacttgca 366  Q
    |||||||||    
T  28987655 gaacttgca 28987647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 31571189 - 31571553
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  31571189 atggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggttcgagtcaggagaaagtgttgtgctgggaccggatttggttcagg 31571288  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||| || |||||||   |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||    
T  31571289 agactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 31571388  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     |||||||||||||| |||||||| || |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||    
T  31571389 agagggtgatcatgtatttctgagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaaattcattggcccgtatcag 31571488  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||| | || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31571489 atttcagagagaataggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgca 31571553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 19851846 - 19851481
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||    
T  19851846 tatggaaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactccattgtgttggtttgagtcgggtgaaagtgtggtgttgggaccagatttagttcat 19851747  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     |||||||  |||| ||||   ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||  ||||||||||    
T  19851746 tagactacatagaaggtcaagatgataagagaaaatatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatggcaagcgtagaaaggcccttgagtttc 19851647  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  19851646 aagagggagatcatgtgtttctgagagtcactccgttgacggttgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccatacca 19851547  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19851546 gatatctgagagggttggaacagtggcatacaaagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgca 19851481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 19857882 - 19857517
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||    
T  19857882 tatggaaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactccattgtgttggtttgagtcgggtgaaagtgtggtgttgggaccagatttagttcat 19857783  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     |||||||  |||| ||||   ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||  ||||||||||    
T  19857782 tagactacatagaaggtcaagatgataagagaaaatatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatggcaagcgtagaaaggcccttgagtttc 19857683  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  19857682 aagagggagatcatgtgtttctgagagtcactccgttgacggttgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccatacca 19857583  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19857582 gatatctgagagggttggaacagtggcatacaaagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgca 19857517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 41 - 360
Target Start/End: Original strand, 21681856 - 21682175
Alignment:
Q  41 actcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatga 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  21681856 actcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccagatttggttcatcagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatga 21681955  T
Q  141 aagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgac 240  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| ||||    
T  21681956 aagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgac 21682055  T
Q  241 gggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggt 340  Q
    |||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  21682056 gggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggt 21682155  T
Q  341 ttgccaccacatctttcgaa 360  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21682156 ttgccaccacatctttcgaa 21682175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 164 - 366
Target Start/End: Original strand, 16265127 - 16265329
Alignment:
Q  164 agttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagt 263  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16265127 agttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtctttctgagggtcactcctttgacgggtgttggatgtgctttgaagt 16265226  T
Q  264 cgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaactt 363  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16265227 cgaggaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaactt 16265326  T
Q  364 gca 366  Q
    |||    
T  16265327 gca 16265329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21840852 - 21840487
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || |||    
T  21840852 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggacccctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtggtgttgggaccagatttagttcat 21840753  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||    
T  21840752 cagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagataaaagcgtcgcagagtcgacagaatagttaccatgacaagcgaaggaaggcacttgagtttc 21840653  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| ||||| || || |||||| | || ||||| ||| ||||  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21840652 aagagggagatcatgtgtttctaagagttactcctataacaggtgtaggaggtgcactgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatca 21840553  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||    
T  21840552 gatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgagtttgccaccacatctttcaaatttgca 21840487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 23 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 20008263 - 20007920
Alignment:
Q  23 tatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtcagat 122  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| || |       
T  20008263 tatggtcggaggtgcatgactcctttatgttggtttgagtcgggagaaagtgtggtgttgggaccagatttggttcatcagactacggagaaggtaaaga 20008164  T
Q  123 tgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttct 222  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  20008163 tgataagagaaaagatgaaagcgtcgcatagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagttccaagagggagatcatgtgtttct 20008064  T
Q  223 gagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtaca 322  Q
    ||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |  ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||    
T  20008063 gagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaacaaggtgactccaaagttcattggtccatatcagatatctgagagggttggaaca 20007964  T
Q  323 gtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20007963 gtggcatatagagtgggtttgctaccacatctttcgaatttgca 20007920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22051298 - 22051008
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  22051298 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactccgttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccagatttggttcaa 22051199  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     |||| || ||||| ||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||    
T  22051198 cagacgacagagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttc 22051099  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattgg 291  Q
    | |||||||||||||| ||| |||  || |||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||    
T  22051098 aagagggtgatcatgtatttttgaaagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcaaggaagttgactccgaagttcattgg 22051008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 20388533 - 20388175
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || || ||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||  ||| | || |||     
T  20388533 atggcaccgttcgaagctttgtatggttggaggtgcagaactccgttgtgttggtttgagtcgggttaaaatgtagtgttgggacgagatatagttcatc 20388434  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    |||||||  | || |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20388433 agactacaaaaaaggtcaaattgataagagagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacataagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgagtttca 20388334  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     || || || ||||| |||||||| |||||||   |||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||   |||||||||||| ||| ||    
T  20388333 agaaggagaccatgtgtttctgagagtcactctagtgacaggtgttggtcgtgctttgaagtctaagaagttgaccccacggtttattggtccatattag 20388234  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaa 360  Q
    || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20388233 atatctgagagagttgggacagtgacatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaa 20388175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 16271570 - 16271738
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16271570 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgcgtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcat 16271669  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttac 169  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16271670 gagactactgagaaggtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaggagttac 16271738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 15533814 - 15533450
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  15533814 atggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 15533715  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    |||||||||||||||| | | |||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  15533714 agactactgagaaagttaaaatgatacaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttca 15533615  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     || ||||| ||  | ||| |||| ||||||||| || | |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  15533614 agaaggtgaccacatgtttttgagagtcactcctgtggctggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 15533515  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || || || |||||||| || ||||| ||  |||| || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  15533514 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgca 15533450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 227 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 27347435 - 27347296
Alignment:
Q  227 gtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtgg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27347435 gtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttgggacagtgg 27347336  T
Q  327 catacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27347335 catataaagttggtttggcaccacatctttcgaacttgca 27347296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 20396472 - 20396836
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||  ||| | || ||      
T  20396472 atggcaccattcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactccgttgtgttggttcgagtcaggcgagagtgtagttttgggactagatatcgttcaac 20396571  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    | ||||||||||| || |  |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  20396572 aaactactgagaaggttaagttgatgcgagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagtgttatcatgataagcgtagaaaagaccttgagtttca 20396671  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaag-tttattggtccgtatca 300  Q
    ||| || || ||||| ||| | || ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  20396672 ggaaggagaccatgtattttttagagtcactcctgtgaccggtgtaggacgtgcattgaagtcaaggaaactgact-ctaagatttattggtctgtatca 20396770  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| ||||| ||| |||  | |||||| ||  |||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  20396771 gatatcagaaagaattgaaatagtggcgtatcgagtgggtttactaccgcatctttcgaatttgca 20396836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 134 - 366
Target Start/End: Original strand, 21167016 - 21167248
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| |||||||    
T  21167016 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 21167115  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacag 333  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||  |    
T  21167116 ctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtatcg 21167215  T
Q  334 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  21167216 agttgggttaccaccgcatctttcgaatttgca 21167248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 19978401 - 19978037
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || || |||||||| || || || ||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  19978401 atggcacctttggaggctttatatggtcgaagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 19978302  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    |||||||||||||||| |   ||||   ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19978301 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaggatcttgagtttca 19978202  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  19978201 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 19978102  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || || || | |||||| || ||||| ||  |||| || || ||||| ||||||| ||| |||||    
T  19978101 atatcggaaatagttggaacggtggcgtaacgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgca 19978037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 23650463 - 23650111
Alignment:
Q  14 gaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgaga 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||  | ||||||||||    
T  23650463 gaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgaga 23650364  T
Q  114 aagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatca 213  Q
    | || |   ||||   ||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  23650363 aggttaagatgattcaagagaagataaaagcatcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagacca 23650264  T
Q  214 tgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagaga 313  Q
      | ||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||  | |||    
T  23650263 catgtttttgagagtcactcctgtgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcgaaaaga 23650164  T
Q  314 gttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||| || ||||| ||  |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  23650163 gttggaacggtggcttatcgagttggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 23650111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 32600578 - 32600214
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| || || ||||||  |||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  32600578 atggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttcggtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagt 32600479  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||||||||| || |   ||||   ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  32600478 agactactgagaaggttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttca 32600379  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
    ||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |  ||||||||||||||||||    
T  32600378 ggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccgagatttattggtccgtatcag 32600279  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || || || |||||||| || ||||| ||  |||| || || ||||||| ||||||||| |||||    
T  32600278 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccacgtctttcgaatttgca 32600214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 19113124 - 19112760
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  |  | ||      
T  19113124 atggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattattcagc 19113025  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  19113024 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttcc 19112926  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  19112925 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 19112826  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  19112825 gatattggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 19112760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 19485217 - 19485581
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| || |||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  19485217 atggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatccggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 19485316  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | || ||||||||||| ||||| |||  |||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||     
T  19485317 aaaccactgagaaagttcagat-gatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattta 19485415  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| |||||||| |||||    
T  19485416 aggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgacctcgaagttcattggtccatatca 19485515  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  19485516 gattttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 19485581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 366
Target Start/End: Original strand, 30313509 - 30313855
Alignment:
Q  20 ttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtca 119  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||| || || || || |  ||  | || ||  |||||||||||||||| |    
T  30313509 ttgtatggtcggagatgcagaactccattgtggtggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttagggctcgagattgttcagcagactactgagaaagtta 30313608  T
Q  120 gattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttt 219  Q
       ||||   ||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || || || ||    
T  30313609 agatgattcaagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 30313708  T
Q  220 tctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggt 319  Q
    | |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || || ||||||||     
T  30313709 tttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttgga 30313808  T
Q  320 acagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || ||||| ||  |||| || || ||||| |||||||| || |||||    
T  30313809 acggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcaaatttgca 30313855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 17674370 - 17674734
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |  || || ||||| ||  | || ||      
T  17674370 atggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagcggtcttaggaccagagattgttcagc 17674469  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  17674470 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttcc 17674568  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  17674569 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 17674668  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  17674669 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 17674734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 357
Target Start/End: Original strand, 22120521 - 22120876
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||| ||||||||| || || || ||| | ||  | || ||      
T  22120521 atggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtgaggtgaaagagtggtcttaggatcagagattgttcagc 22120620  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||||||||||||  |  ||||   ||| || ||||| || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22120621 agactactgagaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 22120720  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
    ||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||  | ||||| |||||||| ||||||    
T  22120721 ggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtgggacgtgcattgaagtcaaggaagttgacctcgaagttcattggtccatatcag 22120820  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttc 357  Q
    || |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||    
T  22120821 atattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttc 22120876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 20018097 - 20018461
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  20018097 atggcaccgttcgaggccttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagaaattgttcagc 20018196  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||     
T  20018197 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgaatttg 20018295  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  20018296 aggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 20018395  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||    || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || |||||| |||| |||||    
T  20018396 gatactggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgca 20018461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 366
Target Start/End: Original strand, 21922210 - 21922446
Alignment:
Q  130 agaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtc 229  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| |||    
T  21922210 agaaaagatgaaagtgtcgcagagtccacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtc 21922309  T
Q  230 actcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcat 329  Q
    |||| | |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |  | |||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| |    
T  21922310 actcatgtgactggtgttggacaagctttgaagtcgaagaagttgactccgagatatattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgt 21922409  T
Q  330 acagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || |||| ||||| ||||| ||| ||||||| |||||    
T  21922410 accgagtgggtttaccaccgcatatttcgaatttgca 21922446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22046807 - 22046443
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || |||||||||| ||| || || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||  | ||||| ||  | || ||      
T  22046807 atggcaccttttgaggctttgtatggtcagagatgcagaactccgttgtgctggtttgaatcaggtgaaagagtggtcctaggaccagagattgttcagc 22046708  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    |||||||||||||||| |   ||||   ||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| |    
T  22046707 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagtgtcgcatagtcgacaaaagagttatcatgataaacgcaggaaggatcttgagtttta 22046608  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
    ||| || || || || ||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  22046607 ggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactccagtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaaattgactccgaggtttattggttcgtatcag 22046508  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || || || |||||||| || ||||| ||  |||| || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  22046507 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtaggattaccaccgcatctttcgaatttgca 22046443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 135 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21251243 - 21251012
Alignment:
Q  135 agatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcc 234  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||  | || || || || ||| |||| ||||||||    
T  21251243 agatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaataaggagaccacgtgtttttgagagtcactcc 21251144  T
Q  235 tttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacaga 334  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||  ||    
T  21251143 tgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcga 21251044  T
Q  335 gttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  21251043 gtgggattaccaccgcatctttcgaatttgca 21251012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 16408392 - 16408756
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| |  || ||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||  | || ||      
T  16408392 atggcaccttttgaggctttatatggtcggagatacagaactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccggagattgttcagc 16408491  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    |||||||||||||||| |   ||||   ||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||| |||| ||    
T  16408492 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttaagttcca 16408591  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     || || || || || ||  |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  16408592 agaaggagaccacgtattgttgagagtcactcttgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 16408691  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || || || |||||||| || ||||| ||  |||| || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  16408692 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgca 16408756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 130 - 279
Target Start/End: Original strand, 22377928 - 22378077
Alignment:
Q  130 agaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtc 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||| ||||||||||||| |  |||||||| ||| ||||||||    
T  22377928 agaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatattgagtttcaggaagcagatcatgtatttttgagggtc 22378027  T
Q  230 actcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcc 279  Q
    |||||  |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  22378028 actccagtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactcc 22378077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 130 - 279
Target Start/End: Original strand, 22384103 - 22384252
Alignment:
Q  130 agaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtc 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||| ||||||||||||| |  |||||||| ||| ||||||||    
T  22384103 agaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatattgagtttcaggaagcagatcatgtatttttgagggtc 22384202  T
Q  230 actcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcc 279  Q
    |||||  |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  22384203 actccagtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactcc 22384252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 134 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22987503 - 22987271
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||| || || |||||||| ||| | || |||||||    
T  22987503 aagatgaaagcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgattttcaagaaggagatcatgtattttttagagtcactc 22987404  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacag 333  Q
    |  |||| | |||||||| ||| |||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||| || ||||| ||  |    
T  22987403 cagtgactgatgttggacatgcattgaagtcaaagaagttgactctgaagtttattggtccgtatcagatatcataaagaattggaacggtggcgtatcg 22987304  T
Q  334 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  22987303 agtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 22987271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 134 - 366
Target Start/End: Original strand, 21394344 - 21394576
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||| || || || || || || ||| |||| |||||||    
T  21394344 aagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcatgaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 21394443  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacag 333  Q
    || |||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || || ||||| |  || ||||| ||| |    
T  21394444 ctgtgactggtgttggacgttctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagtcgtaacggtggcgtaccg 21394543  T
Q  334 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || || ||||| ||||||| ||| |||||    
T  21394544 agtgggattaccaccgcatcttttgaatttgca 21394576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 134 - 366
Target Start/End: Original strand, 21788837 - 21789069
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||| || || || || || || ||| |||| |||||||    
T  21788837 aagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcatgaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 21788936  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacag 333  Q
    || |||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || || ||||| |  || ||||| ||| |    
T  21788937 ctgtgactggtgttggacgttctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagtcgtaacggtggcgtaccg 21789036  T
Q  334 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || || ||||| ||||||| ||| |||||    
T  21789037 agtgggattaccaccgcatcttttgaatttgca 21789069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22032331 - 22032151
Alignment:
Q  137 atgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctt 236  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| |||| || || || || ||| |||| |||||||||     
T  22032331 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaacgtaggaaggatcttgagttttaggatggagaccacgtgtttttgagagtcactcctg 22032232  T
Q  237 tgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttg 317  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |  |||||||||  ||||||||| || || |||||||    
T  22032231 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaaattgactccgagatttattggtttgtatcagatatcggaaagagttg 22032151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 22133388 - 22133752
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || |||||||||||| | || || ||||| || ||| ||||||||||| ||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  22133388 atggcaccttttgaggctttgtatggtcggtgatgcagaactccgttgtgcgggtttgagtcaagtgaaagagtggtcttaggacccgagattgttcagc 22133487  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    | |||||||||||||| |   ||||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||    
T  22133488 aaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgtaggaaagatcttgagtttca 22133587  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
    ||| || ||   ||| ||| |||| | ||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  22133588 ggaaggagacattgtgtttttgagagacactcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 22133687  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || || || |||||||| || ||||| ||  |||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||    
T  22133688 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtcggaataccaccgcatctttcgaatttgca 22133752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 20652679 - 20652958
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||| || || || |||||| |||| || |||||||   |||| ||||||||  |||| ||     
T  20652679 tatggcaccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttaagtccggagaaagtgccttgttaggaccggaggtggtgcaa 20652778  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||| ||||| || |   ||||   ||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| | |||||||    
T  20652779 gagactacggagaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtggacagaagagttatcattataagaggagaaaggatatagagtttc 20652878  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    | |  ||||||||||| ||| |||| || | || | |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20652879 aagttggtgatcatgtatttttgagagtgaatcatgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 20652958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 137 - 366
Target Start/End: Original strand, 22164673 - 22164902
Alignment:
Q  137 atgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctt 236  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||   ||| ||| |||  ||||||| |     
T  22164673 atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaggaaggagacattgtgtttttgaaagtcactcatg 22164772  T
Q  237 tgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagt 336  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||  |  ||||    
T  22164773 tgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaataagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgcatcgagt 22164872  T
Q  337 tggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
     || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  22164873 gggattaccaccgcatctttcgaatttgca 22164902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 20975997 - 20976081
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttggga 85  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20975997 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttggga 20976081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 171 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 23949154 - 23948965
Alignment:
Q  171 atgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaa 270  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| || || || ||||| ||| |||| ||||||||| |||| ||| || ||||||||||||| || | |||    
T  23949154 atgataagcgtaggaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgactggttttagacgtgctttgaaatcaaagaa 23949055  T
Q  271 gttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaa 360  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||| ||| || |||| ||||| ||  |||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  23949054 gttgactccgaggtttgttggtccgtatcagatatcagaaagaattagtacggtggcgtagcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaa 23948965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 23949353 - 23949158
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||  | ||  |      
T  23949353 atggcacctttcgaagctctatatggtcggaggtgtaggactccgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccagaaatcgtt-agc 23949255  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtt 198  Q
    | |||||||||||||| |   ||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  23949254 aaactactgagaaagttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaggaccttgagtt 23949158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 280
Target Start/End: Original strand, 16877442 - 16877720
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || || |||| | |||| ||||||||  | || || |    
T  16877442 atggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgcaggacaccgttatgttggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaag 16877541  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    | ||||| || || || |   ||||    || |||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | || |||||| ||||||||||    
T  16877542 aaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttca 16877641  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    ||  || |||||||| ||  ||||||| | |||  |||| ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16877642 ggttggagatcatgtgttcttgagggtgaatccggtgaccggtgtcggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 16877720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 280
Target Start/End: Original strand, 21196849 - 21197127
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| || || ||||||| | |||| ||||||||  | || || |    
T  21196849 atggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgaatccggagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaag 21196948  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||   | ||||| |   ||||   ||| || |||||||| || |||||| | |||| |||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  21196949 agactatgtaaaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtctcagagttggcagaggagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 21197048  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    ||  ||||||||||| ||| |||| || | |||| | || || ||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  21197049 ggtaggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcctgtaactggagttggtcgtactttgaagtgtaggaagttgactcct 21197127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 280
Target Start/End: Original strand, 21850684 - 21850962
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || |||| | |||| || |||||  | || || |    
T  21850684 atggtaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtccggagagagtgctttgttagggccggaagttgtgcaag 21850783  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    | ||||| || || || |   ||||    ||||||||||| || || |||||| |||||||||| || ||||||||| | |  |||||| ||||||||||    
T  21850784 aaactacggaaaaggttaagatgattcaggaaaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggatgaaggatattgagtttca 21850883  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
     |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| |||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  21850884 agttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgatttgaagtgtaggaagttgactcct 21850962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 222 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 15441395 - 15441251
Alignment:
Q  222 tgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtac 321  Q
    |||| ||||||||| || | |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||    
T  15441395 tgagagtcactcctgtggctggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaac 15441296  T
Q  322 agtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
     ||||| ||  | ||| | || ||||| ||||||||||| |||||    
T  15441295 ggtggcgtatcgtgtttgattaccacctcatctttcgaatttgca 15441251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22315493 - 22315347
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | || |||||  ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| || | ||    
T  22315493 aagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatc 22315394  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    || | || ||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  22315393 ctgtaaccggtgtaggtcgtgctttgaagtgtcggaagttgactcct 22315347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22982869 - 22982592
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||| |||  |||| | |||| | ||||||  | || ||     
T  22982869 tatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtcaagtg--agtgctttgttagaaccggaagttgtgcaa 22982772  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||  || || || |   ||||   ||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||  |  |||| ||| |||||||||    
T  22982771 gagactatggaaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcatctcagagtagacagaagagttatcatgataaaaggtgaaaagatattgagtttc 22982672  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    |||  ||||||||||  ||| | || || | || | |||  |||||||| |||||||||||||    |||||||||||||    
T  22982671 aggttggtgatcatgcgttttttagagtgaatcatgtgattggtgttggtcgtgctttgaagtgtcagaagttgactcct 22982592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 23157376 - 23157443
Alignment:
Q  20 ttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggacc 87  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||    
T  23157376 ttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgaatcaggtgaaagtgctttgttaggacc 23157443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19863299 - 19863229
Alignment:
Q  194 gagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtc 264  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||| | || ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19863299 gagtttcaggaaggcgatcatgtatttttaagagtcactccggtgacgggcgttgggcgtgctttgaagtc 19863229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19867936 - 19867866
Alignment:
Q  194 gagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtc 264  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||| | || ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19867936 gagtttcaggaaggcgatcatgtatttttaagagtcactccggtgacgggcgttgggcgtgctttgaagtc 19867866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 67)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 8212018 - 8212383
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  8212018 tatggcgccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtattgggaccggatttggttcat 8212117  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8212118 gagactactgagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttc 8212217  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8212218 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 8212317  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8212318 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 8212383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 49152660 - 49152295
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49152660 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtgcat 49152561  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  49152560 gagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttc 49152461  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49152460 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgggctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 49152361  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49152360 gatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 49152295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 11306153 - 11306518
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||    
T  11306153 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtattgtgttgggaccggatttagttcat 11306252  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11306253 gagactactgagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttc 11306352  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11306353 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccgtatca 11306452  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11306453 gatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 11306518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 26118495 - 26118813
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26118495 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcat 26118594  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  26118595 gagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaggatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggagcttgagtttc 26118694  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26118695 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgtgctctgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatca 26118794  T
Q  301 gatttcagagagagttggt 319  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  26118795 gatttcagatagagttggt 26118813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 12456061 - 12455696
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12456061 tatggtaccgttcgaagctttgtatggtaggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccggacttggtacat 12455962  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||||    
T  12455961 gagactactgagaaagtcaaggtgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggccctagagtttc 12455862  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||    
T  12455861 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggatgtgcattgaagtcgaggaagttgaatccaaagttcattggtcggtatca 12455762  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12455761 gatttcagagagagttagaacagtggcttatagaattggtttgccaccacatctttcgaacctgca 12455696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 16950361 - 16950726
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  16950361 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggacaggacttggttcat 16950460  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  | ||||||||    
T  16950461 cagactactgagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagtgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccatgagtttc 16950560  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16950561 aggagggtgatcatgtttttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 16950660  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16950661 gatttcagaaagggttggaacagtggcatatagagttggtttggcaccacatctttcgaacttgca 16950726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 6413870 - 6413505
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  6413870 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgaatcaggagagagtgttgtgttgggtctggatttggttcat 6413771  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||||||||||||||   ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||   |||||||||    
T  6413770 cagactactgagaaagtcaagatgataagggaaaacatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcctttgagtttc 6413671  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| || ||||    
T  6413670 aggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcattggttcgaatca 6413571  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6413570 gatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 6413505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 1297 - 1662
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1297 tatggcaccgttcaaagctttgtatggtcagaggtgaaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcat 1396  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||    
T  1397 cagactactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcacagattcgacagaagagttaccatgacaagaggagaaaggcccttgagtttc 1496  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || ||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  1497 aggagggtgatcatgtttttgtgaaagttacttctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtctgtatca 1596  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||| ||| || ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1597 gatttaagaaagggttggaacactggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 1662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13021716 - 13021351
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||    
T  13021716 tatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggaggtgcaggactcctctatgttggtttgagtcaggaaagagtgtggtgttaggaccggacttggttcat 13021617  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||  || |||||||    
T  13021616 gagactactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggaaaaaggccctagagtttc 13021517  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13021516 aagacggtgatcatgtttttctgagggtcactcctatgacgggcgtaaaacgtgcattgaagtcgaggaagtggactccaaagtttattggtccgtatca 13021417  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13021416 gatttcagagagggttggaacagtggcttatagagttggttttccaccacatctttcgaacttgca 13021351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 19147570 - 19147205
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  19147570 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttggttcat 19147471  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |  ||||||||||    
T  19147470 cagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaagcccttgagtttc 19147371  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  19147370 aagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatca 19147271  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19147270 gatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgagtttgccaccacatctttcgaatttgca 19147205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Original strand, 14264134 - 14264498
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  14264134 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgttggtttgagtcaggagaaagtgtagtgttgggaccgtatttggttcat 14264233  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     |||||||  |||| ||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||    
T  14264234 cagactacgaagaatgtcaagatgataagcgaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcgcttgagtttc 14264333  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  14264334 aagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtccatatca 14264433  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgc 365  Q
    ||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14264434 gatatctgaaagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgc 14264498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14130232 - 14129867
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14130232 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactccgttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcat 14130133  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    ||||  |||||||| ||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||    
T  14130132 gagatgactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttc 14130033  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||| ||| | || || |||||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14130032 aggagggtgatcatgtattttttagagttactccgatgacgagtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatca 14129933  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||| ||||||  |||| ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  14129932 gattttagagaggattggaacgatggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgca 14129867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14434050 - 14433685
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14434050 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactccgttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcat 14433951  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    ||||  |||||||| ||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||    
T  14433950 gagatgactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttc 14433851  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||| ||| | || || |||||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14433850 aggagggtgatcatgtattttttagagttactccgatgacgagtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatca 14433751  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||| ||||||  |||| ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  14433750 gattttagagaggattggaacgatggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgca 14433685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 20746969 - 20746604
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || |||    
T  20746969 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcat 20746870  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |  ||||||||||    
T  20746869 cagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaagcccttgagtttc 20746770  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  20746769 aagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatca 20746670  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  20746669 gatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgagtttgccaccacatctttcgaatttgca 20746604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 14286266 - 14286631
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14286266 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgcaggactcctttgtgctggtttgagtcaatagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcat 14286365  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     |||| |||||||| ||||   ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||    
T  14286366 cagacgactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaagacccttgagtttc 14286465  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| || |||||  |||| ||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  14286466 aggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacaggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatca 14286565  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||| | ||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14286566 gatttcatataggattggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 14286631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 16072184 - 16072549
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| | |    
T  16072184 tatggcaccattcgaagctttgtatggtcggaggcgcataactcctttatgttggtttgagtcaggagaaagtgtagtgttgggaccagatttggttcgt 16072283  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||  ||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||    
T  16072284 cagactatggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggcccttgagtttc 16072383  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16072384 aagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtccatatca 16072483  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16072484 gatatctgagagggttggaacagtggcatgcaaagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgca 16072549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 15102493 - 15102856
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||  |||||||||||||| | |||    
T  15102493 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttgtgttggttcgagtcaggagagagtgttgt--tgggaccggatttgattcat 15102590  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||||||||   ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||    
T  15102591 cagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttc 15102690  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| ||| |||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15102691 aagagggagatcatgtgtttttgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 15102790  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15102791 gatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgca 15102856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 18053844 - 18054208
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||  |||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  18053844 atggcaccattcgaagctttgtatggtcgagggtgcaggactccgttgtgttggttcgagtcaggagaaagagttgtgttgggaccggatttggttcagg 18053943  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||| || |||||||   |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||    
T  18053944 agactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggaggaaggcccttgagtttca 18054043  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     |||||||||||||| |||||||| || |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  18054044 agagggtgatcatgtatttctgagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggcccgtatcag 18054143  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||| | || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  18054144 atttcagagagaataggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgca 18054208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 23199634 - 23199998
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  23199634 atggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcagaactccgttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggtccagg 23199733  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||| || |||||||   |||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||    
T  23199734 agactacagaaaaagtcaagctgatcagggagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 23199833  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     |||||||||||||| ||||| || || |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  23199834 agagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaaattcattggtccgtatcag 23199933  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||  | || ||  || |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  23199934 atttcagagaggatcggaacgatgacatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgca 23199998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 23505761 - 23506125
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  23505761 atggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcagaactccgttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggtccagg 23505860  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||| || |||||||   |||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||    
T  23505861 agactacagaaaaagtcaagctgatcagggagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 23505960  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     |||||||||||||| ||||| || || |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  23505961 agagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaaattcattggtccgtatcag 23506060  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||  | || ||  || |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  23506061 atttcagagaggatcggaacgatgacatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgca 23506125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12457138 - 12456940
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  12457138 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtataggactcctttatgctagtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccggacttggttcat 12457039  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagttt 199  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  12457038 gagactactgagaaagtcaggttcataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagttt 12456940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 12206690 - 12207055
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| | || ||     
T  12206690 tatggcaccgttcgaagttttgtatgatcggaggtgcaatactccgttatgttggtttgagtcgggtgaaagtgtaatgttgggaccggatatagttcag 12206789  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| || || |||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||||||| ||||||    
T  12206790 cagactacagaaaaggtcaaattgataaaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagtgtagaaaggatcttaagtttc 12206889  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || ||||| ||| |||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| || | ||||||||| || |||||||||||| |||| ||    
T  12206890 aagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgacaggtgttggtcgtgccttgaaatcaaagaagttgacgccgaagtttattggttcgtacca 12206989  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12206990 gatatctgagagagttgcaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgca 12207055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 123 - 366
Target Start/End: Original strand, 26288049 - 26288291
Alignment:
Q  123 tgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttct 222  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  26288049 tgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttaccatgacaagcggagaaaggccctaga-tttcaggagggtgatcatgtttttct 26288147  T
Q  223 gagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtaca 322  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| || ||| | |||    
T  26288148 gagggttactcctatgacgggtgtaggacgcgcattgaagtcgaggaagttgactccaaaattcattggtacgtatcagatttcagaaagggtttgaaca 26288247  T
Q  323 gtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26288248 gtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcaaacttgca 26288291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13665896 - 13665547
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||           | |||    
T  13665896 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggggcatgactcctttatgctggtttgagtcaggagagagttttgtgttggg-----------ttcat 13665808  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     | ||||| ||||||||||   |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||  ||||||||||    
T  13665807 caaactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatcacaagcgtaggaaggcccttgagtttc 13665708  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||  |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| || || || |||||||||| |||||||||||| ||||| |     ||||||||    
T  13665707 aagaggaagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggtcgggcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttca-----ccgtatca 13665613  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13665612 gatttcagaaagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgca 13665547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15340790 - 15340575
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  15340790 tatggcaccgttcgaagttttgtatggtcggaggtgcaggactccgttatgctagtttgagtcaggagagagtgttgtattgggaccggatttggttcat 15340691  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     |||| |||||||| ||||   ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  15340690 cagacgactgagaaggtcaagctgataagggaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttc 15340591  T
Q  201 aggagggtgatcatgt 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  15340590 aggagggtgatcatgt 15340575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 11388318 - 11388682
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||||||  |||||||||| ||  | || ||     
T  11388318 tatgacaccgttcgaagctttgtatgttcgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcag 11388417  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| || || || |  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| | ||||||||    
T  11388418 cagactacagaaaaggttaagttgataagagaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccatgagtttc 11388517  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||  |||||||| ||  |||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| || || || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  11388518 aagagga-gatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatca 11388616  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  11388617 gatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgca 11388682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 13968558 - 13968703
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  13968558 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtatgactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttagttcat 13968657  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagctt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13968658 gagactactgagaaagtcagattgataagggaaaagatgaaagctt 13968703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 11553015 - 11553379
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  11553015 atggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 11553114  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    | |||||||||||||| |   ||||   ||| || |||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11553115 aaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttatcatgataagcgcagaaaggatcttgagtttca 11553214  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
    ||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  11553215 ggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagtttattggtccgtatcag 11553314  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || || || |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11553315 atatcggaaagagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgca 11553379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14954959 - 14954613
Alignment:
Q  20 ttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtca 119  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||  |||||||||||||||| |    
T  14954959 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgtccagcagactactgagaaagtta 14954860  T
Q  120 gattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttt 219  Q
       ||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || ||    
T  14954859 agatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcagaaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 14954760  T
Q  220 tctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggt 319  Q
    | |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||     
T  14954759 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccaaagtttattggtccgtataagatatcagaaagagttgga 14954660  T
Q  320 acagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || ||||| ||  ||||  |||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  14954659 acggtggcttatcgagtgagtttaccaccgcatctttcgaatttgca 14954613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 15624905 - 15624545
Alignment:
Q  6 caccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagac 105  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  | |||||||| ||  | || ||| | ||    
T  15624905 caccattcgaagcactgtatggtcggaggtgtaggactccattgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtaattttgggaccagaaatcgttcatcaaac 15624806  T
Q  106 tactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggag 205  Q
    |||| |||| || |  |||||   ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  || || || ||||||||||||||     
T  15624805 tacttagaaggttaagttgatccaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgatagaagagttatcatgataagcttaggaaagaccttgagtttcaggaa 15624706  T
Q  206 ggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagattt 305  Q
    || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| | |||||||||| | |||||||| |    
T  15624705 ggagaccatgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaggaaattgactccgaggtttattggttcatatcagatat 15624606  T
Q  306 cagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||| ||| |||| || ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  15624605 cagaaagaattggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 15624545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 23516682 - 23517046
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || ||| ||||||||||||||||||| || || || ||||  ||  | || ||      
T  23516682 atggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgccggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggacaagagattgttcagc 23516781  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||  |||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  23516782 aaactactgagaaagttcagat-gatccgagagaaaatgaaggcatcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttc 23516880  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  23516881 aggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatca 23516980  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  23516981 gattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 23517046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 12687858 - 12687494
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||||||  | || || ||||| ||  | || ||      
T  12687858 atggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagaatggtcttaggaccagagattgtccaac 12687759  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    |||||||||||||||| |   ||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  12687758 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttca 12687659  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
    ||| || || || || ||| || | ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  12687658 ggaaggagaccacgtgtttttgcgagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagtttattggtccgtatcag 12687559  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || ||||| |||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  12687558 atatcagaaagagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccaccgcatctttcaaatttgca 12687494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 8198985 - 8198621
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  8198985 atggcaccgttcgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 8198886  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  8198885 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattcc 8198787  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  8198786 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 8198687  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  8198686 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 8198621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 8707962 - 8707598
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  8707962 atggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaac 8707863  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |    
T  8707862 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttcc 8707764  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  8707763 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 8707664  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  8707663 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 8707598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14332754 - 14332390
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| | ||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  14332754 atggcaccgttcgaggccttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaataaggagaaagagtggtcttaggaccagaaattgttcagc 14332655  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  14332654 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtagaaaagatcttgaatttc 14332556  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  14332555 aggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 14332456  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||    || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  14332455 gatactggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgca 14332390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 15160970 - 15161334
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  15160970 atggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 15161069  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| |  |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |    
T  15161070 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagagaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttcc 15161168  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  15161169 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 15161268  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  15161269 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 15161334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 17229 - 17593
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||| ||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  17229 atggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttcagtcaggtgaaagagtggtcttaggacccgaaattgttcagc 17328  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    |||||||||||||||| |   ||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  17329 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaaaagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttca 17428  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||  |  |||||||| |||||||||    
T  17429 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactctgagatttattggcccgtatcag 17528  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || || || |||||||| || ||||| ||  |||| || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  17529 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgca 17593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 366
Target Start/End: Original strand, 15154582 - 15154929
Alignment:
Q  14 gaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgaga 113  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||| || || || |||   ||||  || ||  | ||||||||||    
T  15154582 gaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttagga---gatt--gttcaacaaactactgaga 15154676  T
Q  114 aagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatca 213  Q
    |||| |   ||||   ||||||||||||||  || | ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || ||    
T  15154677 aagttaagatgattcaagaaaagatgaaagtgtcaccgagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaagaaggagacca 15154776  T
Q  214 tgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagaga 313  Q
     || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  15154777 cgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaaga 15154876  T
Q  314 gttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||| || ||||| ||| |||| ||||| ||||  ||||||||||| |||||    
T  15154877 gttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccactgcatctttcgaatttgca 15154929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 10871352 - 10870988
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  10871352 atggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 10871253  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  10871252 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgaatttc 10871154  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || | ||| ||||||||||||||    
T  10871153 aggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaggttcattggtccgtatca 10871054  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  10871053 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgca 10870988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 11237126 - 11237490
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  11237126 atggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaaccccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 11237225  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    | ||||||||||||||  |  ||||   ||| |  ||||| || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11237226 aaactactgagaaagttcggatgatccaagagagaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 11237325  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  11237326 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcag 11237425  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  11237426 atattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 11237490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 18178099 - 18177735
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  18178099 atggcaccttttgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 18178000  T
Q  102 agactactgagaaagtc-agattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | ||||||||||||||  |||| |||  |||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18177999 aaactactgagaaagtttagat-gattcgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttc 18177901  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || || || ||  |||| ||||||||| | || ||||| | ||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  18177900 aggaaggagaccacgtgttcttgagagtcactcctataactggtgtagaacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatca 18177801  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  18177800 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 18177735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 18551671 - 18552035
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  18551671 atggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 18551770  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |    
T  18551771 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttcc 18551869  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| |||| || ||||| ||||||||||||||    
T  18551870 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagctgaccccgaagttcattggtccgtatca 18551969  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || |||||| |||| |||||    
T  18551970 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgca 18552035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 44791264 - 44791628
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  44791264 atggcaccgttcgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 44791363  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  44791364 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattcc 44791462  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  44791463 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaaattgaccccgaagttcattggtccgtatca 44791562  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || |||||| |||| |||||    
T  44791563 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgca 44791628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13686421 - 13686057
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  13686421 atggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgatggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 13686322  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| |  |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |    
T  13686321 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagagaatgaaagcatcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttcc 13686223  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  13686222 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 13686123  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
     || |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| ||  | ||||||||||| |||||    
T  13686122 aatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgtcgcatctttcgaatttgca 13686057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 15204217 - 15203872
Alignment:
Q  21 tgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtcag 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || || ||||| |||| |||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||  | ||||| ||||| || |     
T  15204217 tgtatggtcagaggtgtaggactccgttgtgttggttcgagtaaggtgatagtgtagttttgggaccagattttgttcagcaaactacagagaaggttaa 15204118  T
Q  121 attgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgttttt 220  Q
     |||||    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| || || || ||||| |||    
T  15204117 gttgatccatgaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgttt 15204018  T
Q  221 ctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggta 320  Q
     | || ||||||  | |||| |||||||| || || |||||||| |  ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||| |    
T  15204017 tttagagtcacttttgtgactggtgttggccgcgcattgaagtcaaataagttgactccgaggtttattggtctgtatcagattacagaaagaattggaa 15203918  T
Q  321 cagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    | || |  ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  15203917 cggtagagtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 15203872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14038062 - 14037800
Alignment:
Q  104 actactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcagg 203  Q
    |||||||||||||| | | ||||   ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| || |    
T  14038062 actactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagttccaag 14037963  T
Q  204 agggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagat 303  Q
    | || ||||| || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| || |  ||||||||| | ||||||||    
T  14037962 aaggagatcacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgttgggcgtgcattgaagtcaaagaagttgacaccaagatttattggttcatatcagat 14037863  T
Q  304 ttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
     || || |||||| | |  ||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  14037862 atcggaaagagtttgaatggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 14037800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14348092 - 14347830
Alignment:
Q  104 actactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcagg 203  Q
    |||||||||||||| | | ||||   ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| || |    
T  14348092 actactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagttccaag 14347993  T
Q  204 agggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagat 303  Q
    | || ||||| || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| || |  ||||||||| | ||||||||    
T  14347992 aaggagatcacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgttgggcgtgcattgaagtcaaagaagttgacaccaagatttattggttcatatcagat 14347893  T
Q  304 ttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
     || || |||||| | |  ||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  14347892 atcggaaagagtttgaatggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 14347830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 35964763 - 35965001
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || || |||| |||||| || || ||||| ||  ||||||| ||  | || ||      
T  35964763 atggcaccgttcgaagcgttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtatgagtctggcgatagtgtagtactgggaccagacattgttcaac 35964862  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    | ||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  35964863 aaactactgagaaggttaagttgattagagaaaagatgaaggcgtcgcagagtagacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaggatcttgagtttca 35964962  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgac 240  Q
     || || || ||||| ||| |||| ||||||||| ||||    
T  35964963 agaaggggaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgac 35965001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 7824258 - 7823979
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| || || ||||||| | |||| || |||||  | || ||     
T  7824258 tatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgaatccggagaaagtgctttgtttgggccggaagttgtgcaa 7824159  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    || ||||| || || || |   ||||    || |||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  7824158 gaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttc 7824059  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    | |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  7824058 aagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcct 7823979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 27107686 - 27107965
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| || || ||||||| | |||| || |||||  | || ||     
T  27107686 tatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgaatccggagaaagtgctttgtttgggccggaagttgtgcaa 27107785  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    || ||||| || || || |   ||||    || |||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  27107786 gaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttc 27107885  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    | |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  27107886 aagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcct 27107965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14936704 - 14936426
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  | || || |||||||| ||||||||| ||| | |||| ||||||||  | || ||      
T  14936704 atggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacgtcgttgtgttggtttgaatcaggtgaaggtgctttgttaggaccggaagttgtgcaat 14936605  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    | ||||  || || || |   ||||   ||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||  ||||||||||    
T  14936604 aaactaaggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggacattgagtttca 14936505  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    ||  ||||||||||| ||| |||| || | || | |||| |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  14936504 ggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcttgtgactggtgttggtcgtgctttgaagtgtcggaagttgactcct 14936426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 282 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 15340574 - 15340490
Alignment:
Q  282 agtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15340574 agttcattggtccgtatcagatttcagagaggattggaacggtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 15340490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12193914 - 12193635
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||| || | |||| |||||| |  | || ||     
T  12193914 tatgacaccgtttgaagctttgtatggtcggaggtgtagaactcctttgtgttggtatgagtcaggtgaaaatgctttgttaggaccgaaggttgtgcaa 12193815  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    || ||||| ||||| || |   ||||   ||| ||||||| ||| || |||||| | ||||||||||| |||| |||| | || || ||  |||| ||||    
T  12193814 gaaactacggagaaggttaagatgattcaagagaagatgagagcgtctcagagtaggcagaagagttatcatgttaagaggaggaatgacattgattttc 12193715  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    |||  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| | || |||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  12193714 aggttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcctgtaaccggtgttggacgtgctttgaaatgccggaagttgactcct 12193635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21662318 - 21662119
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || || ||   |||||| ||||| ||||| ||  ||||||| ||  | || ||      
T  21662318 atggcaccgttcgaagcgttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttgtgatgagtccggtgagagtgtggtactgggaccagacattgttcaac 21662219  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    |||||| ||| || || |  ||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21662218 agactaatgaaaatgttaagttgattagagaaaagatgaaagcgtcacagagtagacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaggatcttgagtttca 21662119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 4440153 - 4440007
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | || |||||  ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| || |  |    
T  4440153 aagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaacc 4440054  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    || |||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4440053 ctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 4440007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15364165 - 15364019
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| || | ||    
T  15364165 aagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggacattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatc 15364066  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
     | |||| |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  15364065 ttgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtcggaagttgactcct 15364019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 280
Target Start/End: Original strand, 12368507 - 12368767
Alignment:
Q  20 ttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| || || || ||||||| | |||| ||||||||  | || || ||||||||  | || || |    
T  12368507 ttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggttcgaatccggagaaagtgctttgtttggaccggaagttgtgcaagagactacgaaaaaggtta 12368606  T
Q  120 gattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttt 219  Q
       ||||   ||| || ||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| |||||||  |||||||| || ||    
T  12368607 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgactttcaggttggtgatcacgtgtt 12368706  T
Q  220 tctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    | |||| || | || | ||||  ||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||    
T  12368707 tttgagagtgaatcttgtgaccagtgttggtcatgctttgaagtgtaggaagttgactcct 12368767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 21674445 - 21674724
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||  | || || |||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||  | || ||     
T  21674445 tatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaagacaacgttgtgttggtttgagtcaggagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaa 21674544  T
Q  101 gagactactgagaaa-gtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagttt 199  Q
    |||||||| || |||  | ||| ||||   ||| ||||||||||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||| | || |||||  |||| |||    
T  21674545 gagactacggaaaaatataaga-tgattcaagagaagatgaaagcgtctcaaagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgaattt 21674643  T
Q  200 caggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    || |  ||||||||||| ||| |||| || |  | | |||  ||| ||||||||||||||||||  | ||| |||||||||    
T  21674644 caagttggtgatcatgtgtttttgagagtgaaccttgtgattggtattggacgtgctttgaagtgtaagaaattgactcct 21674724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 9596414 - 9596236
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||| | || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  9596414 atggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgtagaacttcgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 9596315  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcg 180  Q
    ||||||| |||||||| |   ||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  9596314 agactacagagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 9596236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 264
Target Start/End: Original strand, 41213 - 41321
Alignment:
Q  156 gacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgc 255  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||  |  | ||||||||||| || |||||||| ||| | || ||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  41213 gacagaagagctatcatgataaacgaagaaaataattggagtttcaggaaggggatcatgtatttttaagagtcactccggtgacgggcgttggacgtgc 41312  T
Q  256 tttgaagtc 264  Q
    |||||||||    
T  41313 tttgaagtc 41321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13353509 - 13353230
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||| || || ||||||||| | |||||||||||  | || || |||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||  | || ||     
T  13353509 tatggcaccgtttgaggctttgtatggtagaaggtgtaggacgtcgttgtgttggtatgagtcaggtgaaagtgctttgttaggaccggaggttgtgcaa 13353410  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    ||||||||  | || || |   ||||   ||| |||| || ||| || ||||||   ||||||||||| ||||||||| | || |||||  ||||||| |    
T  13353409 gagactacgaaaaaggttaagatgatttaagagaagacgagagcatctcagagtacgcagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgagttcc 13353310  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    |    ||||||| ||| |||||||| || | | || |||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||    
T  13353309 aaattggtgatcttgtgtttctgagagtgaatactgtgactggtgttggacgtgctttgaagtgttgaaagttgactcct 13353230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 45146893 - 45146826
Alignment:
Q  21 tgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccg 88  Q
    |||||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||    
T  45146893 tgtatggtcggaggtgtaggacgccattgtgttggtttgaatcaggtgaaagtgctttgttaggaccg 45146826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 216
Target Start/End: Original strand, 11772282 - 11772368
Alignment:
Q  130 agaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgt 216  Q
    ||||| ||||||| | ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| || || ||||||||    
T  11772282 agaaatgatgaaaacgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagatcatgt 11772368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13378923 - 13378777
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||| ||||  |||||||| | |||||| |  ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| || | ||    
T  13378923 aagatgaaagcatctcagagtagacagaagcgttattatgataagaggagaaagaaaattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatc 13378824  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    || | ||  | ||||| ||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  13378823 ctataacttgagttggtcgtgctttgaattgtcggaagttgactcct 13378777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 332 - 366
Target Start/End: Original strand, 26118805 - 26118839
Alignment:
Q  332 agagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26118805 agagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 26118839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 130 - 201
Target Start/End: Original strand, 17145299 - 17145370
Alignment:
Q  130 agaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||| | |  |||||| ||||||||||    
T  17145299 agaaaatatgaaagcttctcagagtaggcagaagagttatcatgataagaggatgaaggatattgagtttca 17145370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 15364298 - 15364209
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccgga 90  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  | || || |||||||| | ||| ||||||| | ||||  |||||||    
T  15364298 tatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacgacgttgtgttggtttgaataaggagaaagtgatatgttaagaccgga 15364209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 63)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 14887076 - 14887441
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14887076 tatggcaccgttcgaagccttgtatggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtgcat 14887175  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14887176 gagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttc 14887275  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14887276 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 14887375  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14887376 gatttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 14887441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 37545581 - 37545947
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37545581 tatggcactgttcgaagccttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 37545680  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37545681 gagactactgagaaagtaaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaacagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttc 37545780  T
Q  201 aggagggtgatcatg-tttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatc 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37545781 aggagggtgatcatgttttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatc 37545880  T
Q  300 agatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37545881 agatttctgagagagttggtactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 37545947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 20342565 - 20342200
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  20342565 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctagtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcat 20342466  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20342465 gagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttc 20342366  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20342365 aggagcgtgatcatgtttttctgagagtcacccctttgacaggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatca 20342266  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20342265 gatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccacctcatctttcgaacttgca 20342200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 24798482 - 24798847
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  24798482 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggactggatttggttcac 24798581  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  24798582 gagactactgagaaagtcagaatgataagggaaaagatgagagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttc 24798681  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24798682 tggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgttggacgggctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggaccgtatca 24798781  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24798782 gatttcagagagagttggtactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 24798847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22502961 - 22502597
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  22502961 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatg 22502862  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22502861 agactactgagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttca 22502762  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22502761 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcag 22502662  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22502661 atttcagagagagttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 22502597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 25848358 - 25847993
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  25848358 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcat 25848259  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  25848258 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggaaaaaggatcttgagtttc 25848159  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  25848158 aggagggtgatcatgtttttttgagagtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactcctaaattcattggtccgtatca 25848059  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25848058 gatttcagagagagttggaactgtggcatacagagttggtttgccacctcatctttcgaacttgca 25847993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22381482 - 22381117
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22381482 tatggcactattcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcat 22381383  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  22381382 gagactactgagaaggtcaaaatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttc 22381283  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22381282 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccgatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 22381183  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381182 gatttcagagagggttggaacggtggcttatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 22381117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 23080174 - 23080539
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |||    
T  23080174 tatggcaccgttcgaagctttatatggtcggaggtgcaggactcctctatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccagacttggtgcat 23080273  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  ||  ||||||    
T  23080274 gagactactgagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagattcgacagaagagttatcatgacaagcggagaaaggccctatagtttc 23080373  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23080374 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctatgacgggtgtaagacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 23080473  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23080474 gatttcagagagggttggaacagtggcttatagagttggtttaccaccacatctttcgaacttgca 23080539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 22236005 - 22236370
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  22236005 tatggcatcgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaagactcctttattctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggagttggttcat 22236104  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||||||||   || | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||  ||||||||||    
T  22236105 cagactacagagaaagtcaagatggtcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttc 22236204  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22236205 aggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 22236304  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22236305 gatatcagagagggttggaacagtgtcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 22236370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22462235 - 22461870
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  22462235 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggttcgagtcgggagaaagtgttgtgttggggccggaattggttcat 22462136  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    || ||||| ||||||||||   |||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  22462135 gaaactacagagaaagtcaagatgattagggagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttc 22462036  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||    
T  22462035 aggaaggtgaccatgtttttctgagggttactcctatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttacca 22461936  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22461935 gatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttggtttgccacctcatctttcgaatttgca 22461870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 17269419 - 17269783
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  17269419 atggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcagg 17269518  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||| || |||||||   |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||    
T  17269519 agactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 17269618  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     |||||||||||||| ||||| || || |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  17269619 agagggtgatcatgtatttctaagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcag 17269718  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||  | || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  17269719 atttcagagaggatcgggacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgca 17269783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 20821736 - 20821371
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  20821736 tatggcaccatttgaagctttatatggtcggaagtgtaggactcctctatgttggtttgagtcgggagaaagtgttgtgttggggccggatttggttcat 20821637  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcg-aagaaaggatcttgagttt 199  Q
    |||||||| |||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||| |||    
T  20821636 gagactacagagaaagttaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctaccatgacaagcgtaagaaag-accttgaattt 20821538  T
Q  200 caggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatc 299  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  20821537 caggaaggtgatcatgtttttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttatc 20821438  T
Q  300 agatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||| || ||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  20821437 agatttcagaaagggttggaactgtggcgtatagaattggtttgccacctcatctttcgaatttgca 20821371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 21890844 - 21891209
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||| | |||||||| |||    
T  21890844 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtacaagactccattatgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaacagatttggttcat 21890943  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||    
T  21890944 cagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgatagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttc 21891043  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| || || ||| |||| ||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21891044 aagagggagatcatgtgtttctgagagttacacctatgactggtgtaggatgtgcgttgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtccgtatca 21891143  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21891144 gatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgca 21891209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 28923853 - 28924218
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  28923853 tatggcaccattcgaagctttatatggtcggaagtgtaggactcctctatgttggttcgagtcgggagaaagtgttgttttgggaccggatttggttcat 28923952  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||| || ||||||||  |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || || ||||| ||||    
T  28923953 gagactacggaaaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttc 28924052  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  28924053 aggaaggtgaccatgtttttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccttatca 28924152  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  28924153 gatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttggattaccacctcatctttcgaatttgca 28924218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 38 - 366
Target Start/End: Original strand, 23442415 - 23442743
Alignment:
Q  38 aggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtcagattgataagagaaaaga 137  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||    
T  23442415 aggactcctttatgttggtttgagacgggagaaagtgtagtgttgggaccggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaaga 23442514  T
Q  138 tgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccttt 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||||||| |    
T  23442515 tgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggctcttgagtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagtcactcctat 23442614  T
Q  238 gacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagtt 337  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| | || ||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||| |||     
T  23442615 gacgggtgtaggacgtgtgttgaagtctaagatgttgactccaaagttcattggtccgtatcagttatctgagagggttggaacagtggcatacaaagtg 23442714  T
Q  338 ggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23442715 gttttgccaccacatctttcgaatttgca 23442743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 28895027 - 28895392
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  28895027 tatggcaccattcgaagctttatatggtcggaagtgtaggactcctctatgttggttcgagtcgggagaaagtgttgttttgggaccggatttggttcat 28895126  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||| || ||||||||  |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || || ||||| ||||    
T  28895127 gagactacggaaaaagtcaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttc 28895226  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  28895227 aggaaggtgaccatgtttttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccttatca 28895326  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||| |||||||| ||  |||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  28895327 gatttcagaaagagttggaactctggcgtatagagttggattaccacctcatctttcgaatttgca 28895392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 24749639 - 24750004
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||| ||  | || ||     
T  24749639 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcag 24749738  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| || || || |  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  24749739 cagactacagaaaaggttaagttgataagagaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttc 24749838  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||| |||||||||| || ||||| || || || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  24749839 aagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacgggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatca 24749938  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  24749939 gatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgca 24750004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 24735696 - 24736061
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| ||  | || ||     
T  24735696 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcggaagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcag 24735795  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| || || || |  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  24735796 cagactacagaaaaggttaagttgataagagaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttc 24735895  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||| |||||||||| || ||||| || || || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  24735896 aagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacgggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatca 24735995  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  24735996 gatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgca 24736061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 20774043 - 20773678
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  20774043 tatggcaccattcgaagctttatatggtcggaagtgtaagactcctttatgttggttcgagtcgggagaaaatgttgttttgggaccggaattggttcat 20773944  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||| ||||||||||   |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||  | || || ||| ||||||    
T  20773943 gagactacagagaaagtcaagatgattagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtcggaaagagcttcagtttc 20773844  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || |  ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  20773843 aggaagggggccatgtttttctgagggttactcctatgacgggcgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccttatca 20773744  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  20773743 gatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttggattaccacctcatctttcgaatttgca 20773678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 21564058 - 21564416
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||       |||||| ||||||||||  ||| | || |||    
T  21564058 tatgacaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagaactccgttatgttggtttgagt-------aagtgtagtgttgggactagatatagttcat 21564150  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| || || |||| |||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21564151 cagactacagaaaaggtcaaattgataagagagaagacgaaagtgtcgcaaagtcggcagaagagttatcatgacaagcgaagaaaggaccttgagtttc 21564250  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || ||||| |||||||| ||||||| | ||||  ||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||   |||||||||||| |||||    
T  21564251 aagaaggagaccatgtgtttctgagagtcactcatgtgacacgtgttagtcgtgctttgaagtctaagaatttgactccacggtttattggtccatatca 21564350  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || || |||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21564351 gatatctgatagagtttggacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgca 21564416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22134968 - 22134604
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||| || |||| |||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  22134968 atggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctagtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 22134869  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22134868 agactactgagaaagttcagat-gattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgcagaaaagatcttgagtttc 22134770  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  22134769 aggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 22134670  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  22134669 gatattggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 22134604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 22332973 - 22333337
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  22332973 atggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 22333072  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||   ||| || ||||| || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22333073 agactactgagaaagtccggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 22333172  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  22333173 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcag 22333272  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  22333273 atattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 22333337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 366
Target Start/End: Original strand, 26738809 - 26739155
Alignment:
Q  20 ttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtca 119  Q
    ||||||||| |||| || || ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||  | |||||  | |||||||||||||| |    
T  26738809 ttgtatggttggagatgcagaactccattgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgtacaacaaactactgagaaagtta 26738908  T
Q  120 gattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttt 219  Q
       ||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||  | |||||| | ||    
T  26738909 agatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgagtttcaagaaagagatcatatatt 26739008  T
Q  220 tctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggt 319  Q
    | |||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||     
T  26739009 tttgagggtcactcctgtgactggtgttggatgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattgga 26739108  T
Q  320 acagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || ||||| ||  |||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  26739109 acggtggcgtatcgagtgggtttaccaacgcatctttcgaatttgca 26739155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16356802 - 16356438
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  16356802 atggcaccgttcgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 16356703  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  16356702 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttcc 16356604  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  16356603 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 16356504  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  16356503 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgca 16356438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 34566794 - 34566430
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  34566794 atggcaccgttcgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 34566695  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  34566694 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttcc 34566596  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  34566595 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 34566496  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  34566495 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgca 34566430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 130 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 23516713 - 23516477
Alignment:
Q  130 agaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtc 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || || || || || ||| |||| |||    
T  23516713 agaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 23516614  T
Q  230 actcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcat 329  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  23516613 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtattagatatcagaaagagttggaacggtggcat 23516514  T
Q  330 acagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |  ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  23516513 atcgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 23516477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 27668576 - 27668940
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  27668576 atggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 27668675  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  27668676 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttc 27668774  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  27668775 aggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatca 27668874  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  27668875 gattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 27668940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 18776077 - 18775761
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  18776077 atggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggacccgagattgttcagc 18775978  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    |||||||||||||||| |   ||||   ||| |  |||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18775977 agactactgagaaagttaagatgattcaagagagaatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttca 18775878  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
    |||||| || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  18775877 ggagggagaccacgtctttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccctgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 18775778  T
Q  302 atttcagagagagttgg 318  Q
    || || || ||||||||    
T  18775777 atatcggaaagagttgg 18775761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 20468182 - 20468546
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || |||||  || |||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||  |  | || ||      
T  20468182 atggcaccatttgaagctctgcatggtcggaggtgtaggactccgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccataaatcgttcagc 20468281  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    | ||||||||||| || |  |||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||    
T  20468282 aaactactgagaatgttaagttgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagttgactgaagagttatcatgataaacgtaggaaagaccttgaatttca 20468381  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
    ||| || || ||||| ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||| ||||    
T  20468382 ggaaggagaccatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactctgaggtttattggtccgtgtcag 20468481  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || | ||| ||| | |  |||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20468482 atattagaaagaatagaaacagtggcgtattgagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgca 20468546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 23574042 - 23573678
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  23574042 atggcaccttttgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 23573943  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    |||||||||||||||| |   ||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  23573942 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttca 23573843  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  23573842 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 23573743  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || || || |||||||| || ||||| ||  |||| || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  23573742 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgca 23573678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 146 - 366
Target Start/End: Original strand, 24737015 - 24737235
Alignment:
Q  146 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 245  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||| |||||||||    
T  24737015 tcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacgggtg 24737114  T
Q  246 ttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgcc 345  Q
    | || ||||| || || || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24737115 taggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgcc 24737214  T
Q  346 accacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| ||||||||||| |||||    
T  24737215 acctcatctttcgaatttgca 24737235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 21498140 - 21498479
Alignment:
Q  20 ttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtca 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||  | || ||  | ||||| ||||| || |    
T  21498140 ttgtatggtcggagatgtagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagtgtggttttaggacccgagattgttcaacaaactaccgagaaggtta 21498239  T
Q  120 gattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttt 219  Q
       ||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||  | |||||||| ||||| ||||||||  |    
T  21498240 agatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggatagacatcgagtttcaagagggagatcatgtagt 21498339  T
Q  220 tctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggt 319  Q
    | |||| ||||||| | |||| |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  21498340 tttgagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgaattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttgga 21498439  T
Q  320 acagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcga 359  Q
    || ||||  ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  21498440 acggtggtgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcga 21498479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 14999825 - 15000189
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| |||||  | || ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  14999825 atggcacctttcgagactttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 14999924  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| |    
T  14999925 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgtagaaaagatcttgagttcc 15000023  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  15000024 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 15000123  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  15000124 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 15000189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 27610654 - 27610290
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  27610654 atggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 27610555  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  27610554 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaagcgccgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttc 27610456  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  27610455 aggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 27610356  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| ||||| || ||| |||| |||||    
T  27610355 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcaacttgcgaatttgca 27610290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 366
Target Start/End: Original strand, 27685490 - 27685850
Alignment:
Q  6 caccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagac 105  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||  | ||    
T  27685490 cacctttcgaggccttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaac 27685589  T
Q  106 tactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcagga 204  Q
    |||||||||||| ||||| |||   ||| |  |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||    
T  27685590 tactgagaaagttcagat-gatccaagagagaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttccaaga 27685688  T
Q  205 gggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatt 304  Q
     || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||     
T  27685689 aggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagata 27685788  T
Q  305 tcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  27685789 ttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 27685850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22348723 - 22348361
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  22348723 atggcacctttcgaggctttatatggtcggaggtgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtagtcttaggaccagagattgttcagc 22348624  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || || ||||| ||||||| |||||| |||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||    
T  22348623 aaactactgagaaagttcagat-gattcaagagaaaattaaagcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcacgataagcgtagaaa--atcttgagtttc 22348527  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
     ||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  22348526 gggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 22348427  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  22348426 gatattggaaagagttggaacggtggcctaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 22348361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 37291582 - 37291946
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  37291582 atggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 37291681  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||   ||| || |||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||| | || || ||||||||||| |    
T  37291682 agactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagtgtaggaaagatcttgagttcc 37291780  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  37291781 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaaaaagttgaccccgaagtttattggtccgtatca 37291880  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  37291881 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 37291946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 40709080 - 40708716
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  40709080 atggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 40708981  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  40708980 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttcc 40708882  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || |  || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  40708881 aagaaggagaccgcgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 40708782  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  40708781 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 40708716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 41771142 - 41770778
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |  || || ||||| ||  | || ||      
T  41771142 atggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagcggtcttaggaccagagattgttcagc 41771043  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  41771042 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcacagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttc 41770944  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  41770943 aggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 41770844  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || |||||| |||| |||||    
T  41770843 gattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgca 41770778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 366
Target Start/End: Original strand, 21984409 - 21984755
Alignment:
Q  20 ttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtca 119  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||  | ||||| ||||| || |    
T  21984409 ttgtatggtcggagatgcagaactccattgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacaaactaccgagaaggtta 21984508  T
Q  120 gattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttt 219  Q
       ||||   ||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||    
T  21984509 agatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaaaagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagagggagaccacgtatt 21984608  T
Q  220 tctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggt 319  Q
    | |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || || |||| |||     
T  21984609 tttgagagtcactcctgtgattggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagctgga 21984708  T
Q  320 acagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || ||||| ||  |||| || || ||||| || ||||||||||||||    
T  21984709 acggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcacctttcgaacttgca 21984755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 19770260 - 19769896
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  19770260 atggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 19770161  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  19770160 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttcc 19770062  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  19770061 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 19769962  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || ||||| || || ||||| ||| |||| ||||| || || |||||| |||| |||||    
T  19769961 gatattggaaagagtcggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgca 19769896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 27518707 - 27518343
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  27518707 atggcaccgttcgaggctttgtatggttggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 27518608  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  27518607 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttc 27518509  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || |  || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  27518508 aggaaggagacctcgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 27518409  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || |||||| |||| |||||    
T  27518408 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgca 27518343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 29476159 - 29476523
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  29476159 atggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaac 29476258  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    |||||||||| |||||  |  ||||   ||| || ||||| || || |||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29476259 agactactgaaaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcacagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 29476358  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
    ||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||  | ||||| |||||||| ||||||    
T  29476359 ggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgacggatgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccacgaagttcattggtccatatcag 29476458  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
     | |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  29476459 gtattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 29476523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 137 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 20798925 - 20798696
Alignment:
Q  137 atgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctt 236  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || || || || || ||| |||| |||||||||     
T  20798925 atgaaagcgtcgcaaagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctg 20798826  T
Q  237 tgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagt 336  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||  || |    
T  20798825 tgaccggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcaaatatcagaaagagttggaccggtggcatatcgatt 20798726  T
Q  337 tggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
     || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  20798725 gggattaccaccgcatctttcgaatttgca 20798696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 104 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 23440423 - 23440161
Alignment:
Q  104 actactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcagg 203  Q
    |||||||||||||| | | ||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  23440423 actactgagaaagttaaaatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttaagtttcaag 23440324  T
Q  204 agggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagat 303  Q
    | || || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  23440323 aaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaatgaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 23440224  T
Q  304 ttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
     || || |||||||| || ||||| ||  |||  || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  23440223 atcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagagggattaccaccgcatctttcgaatttgca 23440161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 25423357 - 25423125
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || || || || ||| |||| |||||||    
T  25423357 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 25423258  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcata-ca 332  Q
     | |||| |||||||||||||| |||||||  | |||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||| || ||    
T  25423257 ttgtgactggtgttggacgtgcgttgaagtgaaagaagttgactccgagatttattggcccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatca 25423158  T
Q  333 gagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  25423157 g-gtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 25423125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 280
Target Start/End: Original strand, 11210784 - 11211058
Alignment:
Q  6 caccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagac 105  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||  | || || ||||||||||| || || |||||| |||| ||||||||  | || || |||||    
T  11210784 caccgtttgaggccttgtatggtaggaggtgtaggacatcgttgtgttggtttgagtccggagagagtgttttgttaggaccggaagttgtgcaagagac 11210883  T
Q  106 tactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggag 205  Q
    ||| || ||||| |   ||||    || ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | || || ||| |||||||||| |      
T  11210884 tacggaaaaagttaagatgattcaggagaagatgaaagcatctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaagatattgagtttcaagtt 11210983  T
Q  206 ggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11210984 ggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 11211058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 132 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 23471399 - 23471165
Alignment:
Q  132 aaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcac 231  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || |||||| | ||||||||||| ||  | || ||||||||||| || || |||||||| ||| |||| |||||    
T  23471399 aaaagatgaaagcgtctcagagtcggcaaaagagtaatcatgataagcgtaggcaagaccttgagtttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtcac 23471300  T
Q  232 tcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatac 331  Q
    ||   |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||   | ||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||| || ||||| ||     
T  23471299 tcaagtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgacttggaggtttattggtccgtatcaggtatcagaaagaattggaacggtggcgtat 23471200  T
Q  332 agagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
     |||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  23471199 cgagtgggtttaccaacgcatctttcgaatttgca 23471165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23503707 - 23503447
Alignment:
Q  20 ttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtca 119  Q
    |||||||||||||||| |||||| || || || ||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||  |||| || |||||||| || || || |    
T  23503707 ttgtatggtcggaggtctaggacaccgttgtgttggtttgagtctggtgaaagtgctttgttaggaccggaagtggtgcaagagactacggaaaaggtta 23503608  T
Q  120 gattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttt 219  Q
       ||||    || ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||    ||||||||||| ||    
T  23503607 agatgattcaggagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaaattggtgatcatgtgtt 23503508  T
Q  220 tctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    | | ||||| | || | |||| |||||||| ||| |||||||||  |||||||||| ||||    
T  23503507 ttttagggtgaatcatgtgaccggtgttggtcgtcctttgaagtgtaggaagttgaatcct 23503447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 21937273 - 21937552
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| || || ||||||| | |||| || |||||  | || ||     
T  21937273 tatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgaatccggagaaagtgctttgtttgggccggaagttgtgcaa 21937372  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    || ||||| || || || |   ||||    || |||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  21937373 gaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttc 21937472  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    | |  ||||||||||| ||| | ||||| | |||| |||| || ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21937473 aagttggtgatcatgtgtttttaagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 21937552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 209 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 20573614 - 20573457
Alignment:
Q  209 gatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcag 308  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || |    
T  20573614 gatcatgtatttttgagagtcactccactgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaggaagttgacttcaaggtttattggtccgtatcagatatcgg 20573515  T
Q  309 agagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    | ||| |||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  20573514 aaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 20573457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Original strand, 21831841 - 21831995
Alignment:
Q  14 gaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgaga 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||| | || ||  |||||||  | |    
T  21831841 gaagctttgtatggtcggaggtgcagaactccgttatgttggtttgagtcgggtgagggtgtagtgttgggaccggatattgttcaccagactacataaa 21831940  T
Q  114 aagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagtta 168  Q
    | || |   | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21831941 aggttaagctaataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagtta 21831995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 366
Target Start/End: Original strand, 21343669 - 21343808
Alignment:
Q  227 gtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtgg 326  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || ||||    
T  21343669 gtcactcctgtgactggtgttggacgagcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtataagatatcagaaagagttggaacggtgg 21343768  T
Q  327 catacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    | ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  21343769 cgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 21343808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24581493 - 24581215
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || |||| | |||| ||||||||  | || || |    
T  24581493 atggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaag 24581394  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    | || || || || || |   ||||    || |||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | || |||||| ||||||||||    
T  24581393 aaaccacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttca 24581294  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
     |  |||||||| || ||| | ||||| | |||| |||| || ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24581293 agttggtgatcacgtgtttgtaagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 24581215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 21339372 - 21339571
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  | || ||      
T  21339372 atggcaccattcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaac 21339471  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    | ||||||||||| || |   ||||   ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||    
T  21339472 aaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttca 21339571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 27011234 - 27011088
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    |||||||| || || |||||| |||| |||||||| ||||||||| | || |||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | ||    
T  27011234 aagatgaaggcgtctcagagtagacataagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatc 27011135  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
     | |||| || ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27011134 atgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 27011088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 366
Target Start/End: Original strand, 21662333 - 21662489
Alignment:
Q  209 gatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcag 308  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||| |||  |||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||| | | ||||||||||  ||||||||| || |    
T  21662333 gatcatgtgtttctaagagtcactcctatgataggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttgacttcgaggtttattggtt-gtatcagatatcgg 21662431  T
Q  309 agagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    | |||||||| ||| || | || ||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  21662432 aaagagttggaacaatgacgtatagagtgggtttgccaccgcatcttttgaatttgca 21662489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 366
Target Start/End: Original strand, 21665794 - 21665950
Alignment:
Q  209 gatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcag 308  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||| |||  |||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||| | | ||||||||||  ||||||||| || |    
T  21665794 gatcatgtgtttctaagagtcactcctatgataggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttgacttcgaggtttattggtt-gtatcagatatcgg 21665892  T
Q  309 agagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    | |||||||| ||| || | || ||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  21665893 aaagagttggaacaatgacgtatagagtgggtttgccaccgcatcttttgaatttgca 21665950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 21404929 - 21404775
Alignment:
Q  209 gatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcag 308  Q
    |||||||| ||| | || ||||||| | |||| ||||||||||||||  | || || | |||  |||||||   |||||||||  ||||||||||||| |    
T  21404929 gatcatgtgttttttagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgcgctaaaatcaaagaaactgactccgtggtttattggctcgtatcagatttcgg 21404830  T
Q  309 agagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaactt 363  Q
    | |||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21404829 aaagagttgggacagttgcgtatagagtgggtttaccaccacatctttcgaactt 21404775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Original strand, 1113 - 1148
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtg 36  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1113 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtg 1148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 23471529 - 23471447
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttggg 84  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  23471529 atggcaccttttgatgctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgagagtgtagttttggg 23471447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 203
Target Start/End: Original strand, 8814243 - 8814288
Alignment:
Q  158 cagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcagg 203  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||    
T  8814243 cagaagagttaccatgataagaagagaaaggatattgagtttcagg 8814288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 25423471 - 25423419
Alignment:
Q  20 ttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaag 72  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  25423471 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaag 25423419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 37677464 - 37677098
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37677464 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcat 37677365  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  37677364 gagactactgagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatctggagtttc 37677265  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttc-tgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatc 299  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37677264 aggagggtgatcatgtttttcttgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatc 37677165  T
Q  300 agatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37677164 agatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 37677098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 31550156 - 31550521
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  31550156 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttagttcat 31550255  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31550256 gagactacggagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcaaagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttc 31550355  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31550356 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatca 31550455  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31550456 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgca 31550521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 20294796 - 20294431
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  20294796 tatggcaccgttcgaagccttgtatggttggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcat 20294697  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  20294696 gagactactgagaaggtcagaatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttc 20294597  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  20294596 aagagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccatatca 20294497  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20294496 gatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 20294431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 20940038 - 20940403
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20940038 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtataggactcctttatgctagtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcat 20940137  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     | ||||  ||||||||||   |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||    
T  20940138 caaactatagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaggcccttgagtttc 20940237  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20940238 aggagggtgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 20940337  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20940338 gatatcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 20940403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 76 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 11382903 - 11382666
Alignment:
Q  76 tgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgat 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11382903 tgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgac 11382804  T
Q  176 aagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 275  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11382803 aagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaagttga 11382704  T
Q  276 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagaga 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11382703 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagaga 11382666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 98 - 366
Target Start/End: Original strand, 20075131 - 20075399
Alignment:
Q  98 catgagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  20075131 catgagactactgagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcaaagtcgatagaagagttaccatgacaagcggagaaaggctcttgagt 20075230  T
Q  198 ttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgta 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20075231 ttcaggagggtgatcatgtttttctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgta 20075330  T
Q  298 tcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20075331 tcagatttcagagagagtgggaacagtggcatataaagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 20075399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 22433091 - 22433450
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  22433091 tatggcaccattcgaagctttgtatggttggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggagcgagtgtggtgttgggaccgaatttggttcat 22433190  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||| || ||||| |   |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||    
T  22433191 gagactacagaaaaagttaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaagccccttgagtttc 22433290  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| || ||| |||||||    
T  22433291 aggagggtgatcatgtgttcctgagggttactcctatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcatcggttcgtatca 22433390  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaa 360  Q
    |||||||||||| ||||  || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22433391 gatttcagagagggttgcaactgtggcctatagagttggtttgccaccacatctttcgaa 22433450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 20835863 - 20836231
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  20835863 tatggctccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtagaactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgttttgggaccagatttggttcat 20835962  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||||||||   |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||  ||| |||||     
T  20835963 cagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttatcatgacaagcgttggaaggcccttaagtttt 20836062  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtc---gaggaagttgactcctaagtttattggtccgta 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||| | || |||||   || |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20836063 aggagggtgatcatgtttttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtacatttaagtcgaagaagaagttgactccaaagttcattggtccgta 20836162  T
Q  298 tcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20836163 tcagatttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 20836231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 19854698 - 19854333
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19854698 tatggcacggttcgaagctttgtatagtcggaggtgcaggactcctttacgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcat 19854599  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||||||||   |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||  ||||||||||    
T  19854598 cagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttc 19854499  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| || || || |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  19854498 aagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggtcgggcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatca 19854399  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19854398 gatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccaaatctttcgaatttgca 19854333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 45 - 366
Target Start/End: Original strand, 19664895 - 19665216
Alignment:
Q  45 ctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagc 144  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||   |||| ||||| |||||||||||    
T  19664895 ctttatgttggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggatcggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagc 19664994  T
Q  145 ttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggt 244  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||||     
T  19664995 gtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaagcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggg 19665094  T
Q  245 gttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgc 344  Q
    || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  19665095 gtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgc 19665194  T
Q  345 caccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  19665195 caccacatctttcgaatttgca 19665216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 20856736 - 20857101
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||    
T  20856736 tatggcaccgtttgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggttcgagtcgggagaaagtgttgtgttggggctggaattggttcat 20856835  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    || ||||| ||||||||||   |||| || || ||||||||||  |||||||||||||| ||||| || || || ||||| || ||||| |||| |||||    
T  20856836 gaaactacggagaaagtcaagatgattagggagaagatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagctatcacgacaagcgtaggaaggaccttgcgtttc 20856935  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||    
T  20856936 aggaaggtgaccatgtttttctgagggttactcctatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttacca 20857035  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  20857036 gatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttggtttgccacctcatctttcgaatttgca 20857101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 41308209 - 41307892
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||  || |||||||| |||||||||| ||||||||| |||    
T  41308209 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcgaaggtgcatgactcctttatgttggtttgagttgggagaaagtgtggtgttgggactggatttggttcat 41308110  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||    
T  41308109 cagactacggagaaagtcaaaataataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaagccccttgagtttc 41308010  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| || ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41308009 aagagggagaccatgtgtttctgagggttactcctatgacgggtgtatgacgtgcattgaagtctaaaaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 41307910  T
Q  301 gatttcagagagagttgg 318  Q
    ||| || ||||| |||||    
T  41307909 gatatctgagagggttgg 41307892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 148 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 20244437 - 20244219
Alignment:
Q  148 gcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgtt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||     
T  20244437 gcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtctttctgagggttactcctatgacgggtgtg 20244338  T
Q  248 ggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccac 347  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||    
T  20244337 ggacatgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccatatcagatttcagagagggttggaacagtggcctatagagttggttttccac 20244238  T
Q  348 cacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20244237 cacatctttcgaacttgca 20244219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 206 - 366
Target Start/End: Original strand, 20395173 - 20395333
Alignment:
Q  206 ggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagattt 305  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20395173 ggtgatcatgtttttcttagggtcactcctttgacgggtgtcggtcgtgctttgaagtcgaggaatttgactcctaagttcatcggtccgtatcagattt 20395272  T
Q  306 cagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20395273 cagagagagttggaatagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgca 20395333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 17044991 - 17045355
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  17044991 atggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 17045090  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    |||||||||||||||| |   ||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  17045091 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttca 17045190  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
    ||| || || ||||| ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |  ||||||||||||||||||    
T  17045191 ggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgaccggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccgagatttattggtccgtatcag 17045290  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || || || |||||||| || ||||| ||  |||| || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  17045291 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgca 17045355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 20250215 - 20249869
Alignment:
Q  20 ttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtca 119  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||||||| | ||||| || || || ||||| ||  | || ||  | |||||||||||||| |    
T  20250215 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaagcgaaagagtggtcttaggaccagagatcgttcaacaaactactgagaaagtta 20250116  T
Q  120 gattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttt 219  Q
       ||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||    
T  20250115 agatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatt 20250016  T
Q  220 tctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggt 319  Q
    | |||| ||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| | |||||||||||| || ||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||     
T  20250015 tttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagcgttgaagtcaaagaagttgactccgaaatttattgttccgtataagatatcagaaagagttgga 20249916  T
Q  320 acagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || ||||| ||| |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  20249915 acggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcacctttcgaatttgca 20249869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 366
Target Start/End: Original strand, 50620238 - 50620584
Alignment:
Q  20 ttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtca 119  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||  | || ||  | ||||||||||| || |    
T  50620238 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagtgtggttttaggacctgagattgttcaataaactactgagaaggtta 50620337  T
Q  120 gattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttt 219  Q
       ||||   | |||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||  ||||| || ||    
T  50620338 agatgattcaacaaaagatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaggaagatcacgtatt 50620437  T
Q  220 tctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggt 319  Q
    | |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  50620438 tttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagagttgga 50620537  T
Q  320 acagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |  ||||||||  |||| ||||| |||||  |||||||||| |||||    
T  50620538 atggtggcatatcgagtgggtttaccaccgtatctttcgaatttgca 50620584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 366
Target Start/End: Original strand, 19760846 - 19761206
Alignment:
Q  6 caccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagac 105  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||| | || ||  | ||    
T  19760846 cacctttcgaagctctgtatggtcggaggtgtaggactccgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccagatatcgttcagcaaac 19760945  T
Q  106 tactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggag 205  Q
    ||||||||| || |  |||||   ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| ||     
T  19760946 tactgagaaggttaagttgatccaagaaaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaa 19761045  T
Q  206 ggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagattt 305  Q
    || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||  |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| |    
T  19761046 ggagaccatgtgtttttgagagtcactcttgtgattggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggaccgtatcagatat 19761145  T
Q  306 cagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    | || ||| |||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  19761146 ccgaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcacctttcgaatttgca 19761206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 19106732 - 19106386
Alignment:
Q  20 ttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtca 119  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||  | |||||||||||||| |    
T  19106732 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttcgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagtta 19106633  T
Q  120 gattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttt 219  Q
       ||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||    
T  19106632 agatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcggagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 19106533  T
Q  220 tctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggt 319  Q
    | |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||     
T  19106532 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgaccccgaagtttattggtccatatcagatatcggaaagagttgga 19106433  T
Q  320 acagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || ||||| ||  ||||||| || | ||| ||||||||||| |||||    
T  19106432 acggtggcgtatcgagttggattactaccgcatctttcgaatttgca 19106386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 33391005 - 33391369
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  33391005 atggcaccgttcgaggccttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 33391104  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  33391105 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttcc 33391203  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  33391204 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 33391303  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || |||||| |||| |||||    
T  33391304 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgca 33391369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 16350575 - 16350939
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  16350575 atggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagaaattgttcagc 16350674  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  16350675 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttcc 16350773  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  16350774 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 16350873  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  16350874 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 16350939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21830686 - 21830322
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  21830686 atggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgtagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 21830587  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | ||||||||||| || ||||| |||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||  |||| |||||||||||||    
T  21830586 aaactactgagaaggttcagat-gatctaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtggaaaagatcttgagtttc 21830488  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  21830487 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatca 21830388  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  21830387 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 21830322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 41354445 - 41354809
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| || |||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  41354445 atggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatccggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 41354544  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | || ||||||||||| ||||| |||  |||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||     
T  41354545 aaaccactgagaaagttcagat-gatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattta 41354643  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| |||||||| |||||    
T  41354644 aggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgacctcgaagttcattggtccatatca 41354743  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  41354744 gattttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 41354809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 51333469 - 51333833
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  51333469 atggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 51333568  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  51333569 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttcc 51333667  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |  | || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  51333668 aataaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 51333767  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
     || |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  51333768 tatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 51333833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 20137029 - 20136797
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || || |  || ||| |||| |||||||    
T  20137029 aagatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagacctcgtgtttttgagagtcactc 20136930  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacag 333  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| || || |||||||| |||||||| ||  |    
T  20136929 ctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtctgtatcagatatcggaaagagttgggacagtggcgtatcg 20136830  T
Q  334 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
     |||||||| ||||  ||||||||||| |||||    
T  20136829 tgttggtttaccacggcatctttcgaatttgca 20136797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 130 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21747789 - 21747554
Alignment:
Q  130 agaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtc 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||  || || || ||  | | | |||| |||    
T  21747789 agaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccataataagcgtagaaag-atcttgagtttctagaaggagaccacatatgtttgagagtc 21747691  T
Q  230 actcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcat 329  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| |  ||||||||| |||||||||| || || |||||||| || ||||| |    
T  21747690 actcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaatccgagatttattggttcgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgt 21747591  T
Q  330 acagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21747590 accgagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgca 21747554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16369552 - 16369316
Alignment:
Q  130 agaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtc 229  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||| || || || ||||| || || || || |||||||| ||| |||| |||    
T  16369552 agaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagggttatcatgataagcgtaggaaagaccttgaattccaagaaggagatcatgtatttttgagagtc 16369453  T
Q  230 actcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcat 329  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| | |||||||||| | | |||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |    
T  16369452 actcctgtgacaagtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgacttcgaggtttattggtctatatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgt 16369353  T
Q  330 acagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  16369352 accgtgttggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 16369316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21837333 - 21836969
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || |  ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  21837333 atggcaccgttcgacgctttgtatggtcggagatgcacaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaac 21837234  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||| ||| ||||| |||   ||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| |    
T  21837233 aaactactgagacagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcatagtcgacaaaagagttatcatgatcagcgtagaaaagatcttgagttcc 21837135  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  21837134 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 21837035  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || |||||| |||| |||||    
T  21837034 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgca 21836969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 20914593 - 20914315
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||| | |||| | ||||||  | || || |    
T  20914593 atggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtccggagaaagtgctatgttagaaccggaagttgtgcaag 20914494  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||| || || || |   ||||    || |||||||| || || |||||| || |||||||||| ||| ||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  20914493 agactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagagagaagagttatcattataaatggagaaaggatattgagtttca 20914394  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
     |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20914393 agttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 20914315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 222 - 366
Target Start/End: Original strand, 50612612 - 50612756
Alignment:
Q  222 tgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtac 321  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |     
T  50612612 tgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaat 50612711  T
Q  322 agtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
     ||||||||  |||| ||||| |||||  |||||||||| |||||    
T  50612712 ggtggcatatcgagtgggtttaccaccgtatctttcgaatttgca 50612756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 20831367 - 20831646
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| || || ||||||| | |||| || |||||  | || ||     
T  20831367 tatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgaatccggagaaagtgctttgtttgggccggaagttgtgcaa 20831466  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    || ||||| || || || |   ||||    || |||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  20831467 gaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttc 20831566  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    | |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  20831567 aagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcct 20831646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 366
Target Start/End: Original strand, 16078646 - 16078973
Alignment:
Q  20 ttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtca 119  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||  |||||||||||||||| |    
T  16078646 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagtta 16078745  T
Q  120 gattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttt 219  Q
       ||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||                   || || || ||    
T  16078746 agatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaagga-------------------gaccacgtgtt 16078826  T
Q  220 tctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggt 319  Q
    | |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || || ||||||||     
T  16078827 tttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttgga 16078926  T
Q  320 acagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |  ||||| ||  |||| || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  16078927 atggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgca 16078973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 149 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 46518957 - 46518826
Alignment:
Q  149 cagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttg 248  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||| | || |||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| |||||||    
T  46518957 cagagtagacagaagagctatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttg 46518858  T
Q  249 gacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    | |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  46518857 gtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 46518826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 276
Target Start/End: Original strand, 21202395 - 21202537
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    ||||||||||| || |||||  | ||||||||||| ||||||||| | | ||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||| |||| || | ||    
T  21202395 aagatgaaagcatctcagagaaggcagaagagttatcatgataagaggacaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatatgtttttgagagtgaatc 21202494  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgac 276  Q
    || | || |||||||||||| |||||||||   ||||||||||    
T  21202495 ctataaccggtgttggacgtactttgaagtgtcggaagttgac 21202537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 22135533 - 22135619
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggacc 87  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  22135533 tatggcaccgtttgaggctttgtatggtcgaaggtgtaggacgccattgtgttggtttgagtcaggtgaaagtgctttgttaggacc 22135619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 19663111 - 19663161
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatg 51  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  19663111 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtccatgactcctttatg 19663161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21163381 - 21163299
Alignment:
Q  284 tttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||| |||||    
T  21163381 tttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatatttcgaatttgca 21163299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 216
Target Start/End: Original strand, 22135666 - 22135748
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgt 216  Q
    ||||||||||| || |||||| | ||||||||||| ||||||||| | ||||||||  || |||||||||  ||||| |||||    
T  22135666 aagatgaaagcgtctcagagtaggcagaagagttatcatgataagaggagaaaggacattaagtttcaggttggtgaccatgt 22135748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 68)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 47123942 - 47123577
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47123942 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtgcat 47123843  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  47123842 gagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcggcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgaatttc 47123743  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47123742 aggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgttggacgggctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 47123643  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47123642 gatttcagagagagttggtactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgca 47123577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 10383967 - 10383602
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||    
T  10383967 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttgtgctggtttgagtcgggtgaaagtattgtgttgggaccggatttagttcat 10383868  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10383867 gagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttc 10383768  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  10383767 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgtcggtcgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaaattcattggtccgtatca 10383668  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10383667 gatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacacctttcgaacttgca 10383602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 16329790 - 16330155
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16329790 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctctatgttggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcat 16329889  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  16329890 gagactactgagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcacagagtcgacataagagttaccatgacaagcaaagaaaggctcttgagtttc 16329989  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  16329990 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacaggtgttggacgtgcattgaagtcgaggtagttgactccaaagttcatcggtccgtatca 16330089  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16330090 gatttcagagagagttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 16330155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 11961166 - 11961530
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11961166 atggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccggatgtggttcatg 11961265  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    |||| ||||| || |||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  11961266 agacgactgaaaaggtcaaaatgataagggaaaagatgaaggctttgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggctcttgagtttca 11961365  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  11961366 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgagtgtacgacgtgcattgaagtcgaggaaattgactccaaagttcattggtccgtatcag 11961465  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  11961466 atttcagagagagttggaatagtggcttatagagttgatttgcccccacatctttcgaacttgca 11961530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 18134477 - 18134842
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18134477 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggaatcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcat 18134576  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| || ||||||| | ||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||  ||||||||||    
T  18134577 cagactacagataaagtcaaaatgatcggagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttc 18134676  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| || |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18134677 aggagggtgatcttgtatttctgagagttactcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 18134776  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18134777 gatttcagagagggttggaacagtggcttatagagttggtttgccaccacatctttcaaacttgca 18134842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 16836641 - 16836991
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  16836641 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactccgttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccagatttggttcat 16836740  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    ||||| |||||||| ||||   ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||    
T  16836741 gagacgactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttc 16836840  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| || |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16836841 aggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatca 16836940  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccaca 351  Q
    ||||||||||||  |||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16836941 gatttcagagaggattggaacggtgacatatagagttggtttgccaccaca 16836991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Original strand, 11303907 - 11304269
Alignment:
Q  4 ggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgag 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||    
T  11303907 ggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccgaatttgattcatcag 11304006  T
Q  104 actactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcagg 203  Q
     |||| ||||| || |   |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||| |    
T  11304007 gctacggagaaggtaaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcaaagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtatgaaggctcttgagtttcaag 11304106  T
Q  204 agggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagat 303  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||    ||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11304107 agggtgatcatgtatttctgagagttttccctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagat 11304206  T
Q  304 ttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
     |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11304207 atcagagagggttggaatagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 11304269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 12360673 - 12361038
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||| || ||||| |||    
T  12360673 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactccattatgctggtttgagtcaggagagagtgctgtattgggaccagacttggttcat 12360772  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
      |||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||  ||||||||||    
T  12360773 cggactacagagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttc 12360872  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||| || ||||  |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12360873 aggagggtgatcatgtatttctgagagttacttctatgacatgtgtaggacgtgcattgaaatcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 12360972  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12360973 gatttcagagaaggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 12361038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 8759214 - 8759578
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  8759214 atggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcagg 8759313  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||| || |||||||   |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||    
T  8759314 agactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 8759413  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     |||||||||||||| ||||| || || |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  8759414 agagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcag 8759513  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||| | || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  8759514 atttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgca 8759578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 10420176 - 10420541
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10420176 tatggcaccatttgaagctttatatggtcggaggtgtaggactcctctatgttggtttgagtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcat 10420275  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    ||||| || |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||    
T  10420276 gagaccacggagaaagtcaggatgattagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctaccatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttc 10420375  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  10420376 aggaaggtgatcatgtttttctgagggttactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttatca 10420475  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  10420476 gatttcagaaagagtcggaactgtggcgtatagaattggtttgccacctcatctttcgaatttgca 10420541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 15953099 - 15953464
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15953099 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagaactcctttatgtttgtttgagtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcat 15953198  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||    
T  15953199 cagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttc 15953298  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||  | |||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  15953299 aagagggagatcatgtatttctgagatttactcctatgacgggtgtacgacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggttcgtatca 15953398  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15953399 gatatctgagagggttggaacagtggcatacaaagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgca 15953464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 41177519 - 41177155
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  41177519 atggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagtgttgtgctgggaccggatttggttcagg 41177420  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||| || |||||||   |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||    
T  41177419 agactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 41177320  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     |||||||||||||| ||||| || || |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  41177319 agagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtccgtatcag 41177220  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||| | || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  41177219 atttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgca 41177155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13942021 - 13941657
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  13942021 atggcacccttcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgaataaggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcagg 13941922  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||| || |||||||   |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||    
T  13941921 agactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 13941822  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     |||||||||||||| ||||| || || |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  13941821 agagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtccgtatcag 13941722  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||| | || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  13941721 atttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgca 13941657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 12850410 - 12850775
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || |||    
T  12850410 tatggcaccgttcaaagatttgtatggtcggaggtgcagaactccattgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcat 12850509  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     | |||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||    
T  12850510 caaactacataaaaagtcaaattgataagagaaaagatgaaagtgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaataaaggcccttgagtttc 12850609  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||  |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| | || ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  12850610 aagaggaagatcatgtgtttctgagagtcactcctgtgacgggtataggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccatacca 12850709  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  12850710 gatatctgagagagttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttggaatttgca 12850775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 13322783 - 13323148
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  13322783 tatggcaccattcgaagctttgtacggtcggaggtgcagaactcctttatgctggtttgagtcaggtcagagtgctgtgttgggaccggatttggttcat 13322882  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||||||||   |||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || || ||||||| |||||    
T  13322883 cagactacagagaaagtcaagatgatcatagaaaggatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaagatcttgggtttc 13322982  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| || |||||| ||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13322983 aggagggagaccatgtgtttctgagagttactcctatgacgggggtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 13323082  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  |||||  |||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13323083 gatattggagaggattggaacagtggcatataggattggttttccaccacatctttcgaatttgca 13323148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 15227647 - 15227282
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||  ||||| ||||  |||||||||| ||||| || ||     
T  15227647 tatggcaccgttcgaagatttgtatggttggaggtgcagaactccgttatgttggtttgagtcgagtgaaggtgtaatgttgggaccagatttagttcag 15227548  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     |||||||  | || |||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15227547 cagactacaaaaaaggtcaaattgataagagagaagatgaaagtgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttc 15227448  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || ||||| ||| |||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  15227447 aagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgacaggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttgacgccgaagtttattggtccgtacca 15227348  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15227347 gatatctgagagagttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgca 15227282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 44777244 - 44776880
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  44777244 atggcaccattcgaagcattatatggtcgaaggtgcaggactcctttgtgttggttcgagacaggagaaagtgttgtgttgggaccagatttagttcagg 44777145  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||| || |||||||   |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||  |||||||| ||    
T  44777144 agactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagaggaggaaggcccttgagttcca 44777045  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     |||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  44777044 agagggtgatcatgtatttctaagagtcactccgatgacaggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttaactccgaagttcattggcccgtatcag 44776945  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||  | || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  44776944 atttcagagaggatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgca 44776880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 366
Target Start/End: Original strand, 16381063 - 16381423
Alignment:
Q  5 gcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgtt--gggaccggatttggtacatga 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || |||||| || |  ||||||||||||||| |||||    
T  16381063 gcaccgttcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgtgctggtttgagtccggagagagtgttatggttggggaccggatttggttcatga 16381162  T
Q  103 gactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcag 202  Q
    |||||| || || ||||   |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||  |||||||||| |    
T  16381163 gactacagaaaaggtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaga---gttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcgg 16381259  T
Q  203 gagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcaga 302  Q
    || ||||||||||| ||| | || || |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16381260 gatggtgatcatgtatttttaagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcaga 16381359  T
Q  303 tttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||||  |||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16381360 tttcagagaggattgggacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgca 16381423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 38 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14571809 - 14571481
Alignment:
Q  38 aggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtcagattgataagagaaaaga 137  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||   |||||||||||||||    
T  14571809 aggactcctttgtgttggtttgaatcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagaccacggagaaagtcaagatgataagagaaaaga 14571710  T
Q  138 tgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccttt 237  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| || ||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| || |||||| |    
T  14571709 tgaaagcgtcgcagagtcgactgaagagttaccgtgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagttactcctat 14571610  T
Q  238 gacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagtt 337  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||     
T  14571609 gacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaatttgactcctaagtttattggtccttatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtg 14571510  T
Q  338 ggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || ||||||||| |||||||||| |||||    
T  14571509 ggcttgccaccatatctttcgaatttgca 14571481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 28754316 - 28754177
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28754316 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgcgttgggaccggatttggtacat 28754217  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatga 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28754216 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatga 28754177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 13972251 - 13972616
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||||||  |||||||||| ||  | || ||     
T  13972251 tatggcaccgtttgaagccttgtatggtcgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaa 13972350  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     | ||||| || || || |  || |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  13972351 caaactacggaaaaggttaagttaataagagaacggatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttc 13972450  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| || || || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  13972451 aagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccttatca 13972550  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  13972551 gatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttggattaccacctcatctttcgaatttgca 13972616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14086671 - 14086306
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||||||  |||||||||| ||  | || ||     
T  14086671 tatggcaccgtttgaagccttgtatggtcgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaa 14086572  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     | ||||| || || || |  || |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  14086571 caaactacggaaaaggttaagttaataagagaacggatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttc 14086472  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| || || || | |||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  14086471 aagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatca 14086372  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || |||||||| || |||||||| || || || |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  14086371 gatatctgagagagtcgggacagtggcttatagggtgggtttgccccctcatctttcgaatttgca 14086306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 53385161 - 53385525
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  53385161 atggcaccgttcgaggctctgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 53385260  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  53385261 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttc 53385359  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  53385360 aggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaaaaagttgaccccgaagttcattggtccatatca 53385459  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  53385460 gattttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 53385525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 12498235 - 12497871
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  12498235 atggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 12498136  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    |||||||||||||||| |   ||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  12498135 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttca 12498036  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  12498035 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 12497936  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || || || |||||||| || ||||| ||  |||| || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  12497935 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgca 12497871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 15725077 - 15725440
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  15725077 atggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 15725176  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    |||||||||||||| || || ||||   ||| || ||||| || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15725177 agactactgagaaattcgga-tgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 15725275  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
    ||| || || || || ||| | || ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15725276 ggaaggagaccacgtgttttttagagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagtttattggtccgtatcag 15725375  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  15725376 atattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 15725440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13252677 - 13252313
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  13252677 atggcaccgttcgaggccttgtatggtcggagatgcaggactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 13252578  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  13252577 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttc 13252479  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  13252478 aggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 13252379  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  13252378 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgca 13252313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16635760 - 16635396
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  16635760 atggcaccgttcgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 16635661  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  16635660 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttcc 16635562  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  16635561 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 16635462  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  16635461 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgca 16635396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 16756728 - 16757092
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || || ||||||||||||| |||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  16756728 atggcatcgttcgaggccttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcagatgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 16756827  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||  |||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||     
T  16756828 aaactactgagaaagttcagat-gatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattta 16756926  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || ||  | ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  16756927 aggaaggagaccacatgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatca 16757026  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
     ||||  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  16757027 tattttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 16757092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 43163084 - 43162720
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  43163084 atggcaccgttcgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 43162985  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  43162984 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttcc 43162886  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  43162885 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 43162786  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  43162785 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgca 43162720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 9522688 - 9522342
Alignment:
Q  20 ttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtca 119  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || |  ||||||||||||||||| || || || || ||||| ||  | || ||  | ||||||||||| || |    
T  9522688 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtcttggtttgagtcaggtgagagagtggtcttaggaccagagattgttcaacaaactactgagaaggtta 9522589  T
Q  120 gattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttt 219  Q
     | ||||   ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||    
T  9522588 aaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtagaaaagatcttgactttcaagaaggagaccacgtgtt 9522489  T
Q  220 tctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggt 319  Q
    | |||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||     
T  9522488 tttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcaaaaagagttgga 9522389  T
Q  320 acagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||| ||| |||||    
T  9522388 acggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatcttttgaatttgca 9522342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 10005587 - 10005223
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  10005587 atggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 10005488  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  10005487 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttc 10005389  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  10005388 aggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 10005289  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  10005288 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgca 10005223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 14876642 - 14877006
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| ||  | || ||      
T  14876642 atggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagcggtcttaggacccgagattgttcagc 14876741  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||| ||||| || |   ||||   ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  14876742 agactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgagtttca 14876841  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     || || || || || ||| |||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  14876842 agaaggagaccacgtgtttttgagagttactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 14876941  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || || || |||||||| || ||||| ||  ||||||| || ||||  ||||||||||| |||||    
T  14876942 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagttggattaccactgcatctttcgaatttgca 14877006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 6600734 - 6600370
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||  || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  6600734 atggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactctgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 6600635  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||  |||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||      
T  6600634 aaactactgagaaagttcagat-gatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattca 6600536  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  6600535 aggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatca 6600436  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||  || | |||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  6600435 gattttggaaaaagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 6600370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 10906197 - 10905833
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  10906197 atggcaccgttcgaggctttgtatggttggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 10906098  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  10906097 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttc 10905999  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  10905998 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 10905899  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  10905898 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 10905833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 15348388 - 15348752
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || |||||  |  | || ||      
T  15348388 atggcaccgttcgaggccttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccaaagattgttcagc 15348487  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  15348488 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttcc 15348586  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  15348587 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 15348686  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || |||||| |||| |||||    
T  15348687 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgca 15348752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 15589535 - 15589899
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  15589535 atggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 15589634  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  15589635 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttc 15589733  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  15589734 aggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 15589833  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || |||||| |||| |||||    
T  15589834 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgca 15589899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 366
Target Start/End: Original strand, 16807087 - 16807433
Alignment:
Q  20 ttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtca 119  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||  |||||||||||||||| |    
T  16807087 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagtta 16807186  T
Q  120 gattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttt 219  Q
     | ||||   ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || || || ||    
T  16807187 aaatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaaagtcgacagaagaattatcatgataagcgcagaaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtt 16807286  T
Q  220 tctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggt 319  Q
    | |||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||  |  ||| | |||||||||||||| ||  | | | ||||     
T  16807287 tttgagagtcactcctgtgactggtgttggatgtgctttgaagtcaaagaagttgactctgagatttttcggtccgtatcagatatcgaaaaaatttgga 16807386  T
Q  320 acagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || ||||| ||  |||| || || ||||| |||||||||||||||||    
T  16807387 acggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaacttgca 16807433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 20062197 - 20062561
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  20062197 atggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 20062296  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  20062297 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttc 20062395  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| || || ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  20062396 aggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggcgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 20062495  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || |||||| |||| |||||    
T  20062496 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgca 20062561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16371400 - 16371036
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  16371400 atggcaccttttgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 16371301  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    |||||||||||||||| |   ||||   ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  16371300 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgaatttca 16371201  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     || |  ||  | || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  16371200 agaagaagactacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggatgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 16371101  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || ||||| |||||||| || ||||| ||  |||| || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  16371100 atatcagaaagagttgggacggtggcgtattgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgca 16371036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 134 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 17489705 - 17489473
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || || || || || ||| |||| |||||||    
T  17489705 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 17489606  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacag 333  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||  |    
T  17489605 ctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcg 17489506  T
Q  334 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || || ||||| || |||||||| |||||    
T  17489505 agtgggattaccaccgcacctttcgaatttgca 17489473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 15339256 - 15338892
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| |  || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || |||     
T  15339256 atggcacctttcgaggctttatatggtcggagatacagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcatc 15339157  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | ||||||||||| || ||||| |||   |||  | |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||     
T  15339156 aaactactgagaaggttcagat-gatccaagagcaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtagaaaagatcttgagtttt 15339058  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| || || ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  15339057 aggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggcgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 15338958  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || ||| |||| || || || ||| |||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  15338957 gatattggaaagaattggaacggtagcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgca 15338892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 15402653 - 15403017
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||| || ||  |||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  15402653 atggcacctttcgaggctttacatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 15402752  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | ||||||||||| || ||||| |||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  15402753 aaactactgagaaggttcagat-gatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtagaaaagattttgagtttc 15402851  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| || || ||||||||||||||||| | ||||||||| || | ||| ||||||||||||||    
T  15402852 aggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggcgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgatgttcattggtccgtatca 15402951  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || ||| |||| || ||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  15402952 gatattggaaagaattggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgca 15403017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 26792542 - 26792906
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  26792542 atggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccattatgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 26792641  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |    
T  26792642 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttcc 26792740  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| | || ||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  26792741 aagaaggagaccacgtgtttttaagagtcactcctatgactagtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 26792840  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| ||  |||| ||| |||| | ||| || || ||||||||||| |||||    
T  26792841 gatattggaaagagttggaacgatggcttaccgagtggatttaccgccgcatctttcgaatttgca 26792906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16692147 - 16691783
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||  || || ||||| || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  16692147 atggcaccttttgaggctttgtatggtcggatatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggacccgagattgttcagc 16692048  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    |||||||||| ||||| |   ||||   ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  16692047 agactactgaaaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgcaagaaggatcttgagtttca 16691948  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
    ||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  ||||||||  |||||||     
T  16691947 ggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgggtcgtatcaa 16691848  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || || || || ||||| || ||||||||  | || || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  16691847 atatcggaaagggttggaacggtggcatatcgtgtgggattaccaccgcatctttcgaatttgca 16691783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 48425434 - 48425070
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||  ||  | || ||      
T  48425434 atggcaccgttcaaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggactagagattgttcagc 48425335  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  48425334 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattcc 48425236  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  48425235 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 48425136  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  48425135 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 48425070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 15248134 - 15247770
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || |||||| ||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  | || ||      
T  15248134 atggcaccttttgaggctttgtatagtcggagatgtagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaac 15248035  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    | ||||||||||| || |   ||||   ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  |   |||||||||    
T  15248034 aaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaaaacaatgagtttca 15247935  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     || || |||||||| ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| | |||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  15247934 agaaggagatcatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtgtattggtccgtattag 15247835  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || || || ||| |||| || ||||| ||  |||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  15247834 atatcggaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttacaaccgcatctttcgaatttgca 15247770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 360
Target Start/End: Original strand, 16412425 - 16412783
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||| || || |||||| |||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  16412425 atggcacctttcgaggctttatatggttggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 16412524  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||| ||||||| ||||| |||   ||| || |||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||    
T  16412525 aaactactaagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagttggcaaaagagttatcatgataagcgtaggaatgaccttgagtttc 16412623  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  16412624 atgaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 16412723  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaa 360  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || |||||||||||    
T  16412724 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaa 16412783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 17492628 - 17492489
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17492628 tatggcaccgatcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttaagctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcat 17492529  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatga 140  Q
     ||||||| ||||| || |   ||||||| ||||||||||    
T  17492528 cagactacggagaaggtaaagatgataagggaaaagatga 17492489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 130 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15208750 - 15208520
Alignment:
Q  130 agaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtc 229  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  |  |||||||||| || || |||||||| ||| |||| |||    
T  15208750 agaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaaaacattgagtttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtc 15208651  T
Q  230 actcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcat 329  Q
    |||||| |||| ||||||||||| || |||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||| || ||||  |    
T  15208650 actcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtaaaagaagttgactccgaggtttattggtccgaatcagatatcagaaagaattggaacggtggagt 15208551  T
Q  330 acagagttggtttgccaccacatctttcgaa 360  Q
    |  |||| ||||| | ||| |||||||||||    
T  15208550 atcgagtgggtttacaaccgcatctttcgaa 15208520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 134 - 360
Target Start/End: Original strand, 16492456 - 16492682
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || || || || || ||| |||| |||||||    
T  16492456 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 16492555  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacag 333  Q
    || |||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||  |    
T  16492556 ctgtgactggtgttggacgagctttaaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtctgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcgtatcg 16492655  T
Q  334 agttggtttgccaccacatctttcgaa 360  Q
    ||| || || ||||| |||||||||||    
T  16492656 agtgggattaccaccgcatctttcgaa 16492682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 137 - 366
Target Start/End: Original strand, 5425208 - 5425436
Alignment:
Q  137 atgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctt 236  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || || || ||  || |||| |||||||||     
T  5425208 atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgaatttcaggaaggagaccacgtgctt-tgagagtcactccta 5425306  T
Q  237 tgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagt 336  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||| ||||    
T  5425307 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagt 5425406  T
Q  337 tggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
     ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  5425407 gggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 5425436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 280
Target Start/End: Original strand, 8274542 - 8274820
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || |||| | |||| ||||||||  | || || |    
T  8274542 atggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaag 8274641  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    | ||||| || || || |   ||||    || |||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  8274642 aaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 8274741  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
     |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| || ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8274742 agttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 8274820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15576747 - 15576469
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || |||| | |||| ||||||||  | || |  |    
T  15576747 atggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagaacaccgttatgttggtttgagtctggagagagtgctttgtttggaccggaagttgtgcgag 15576648  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||| || || || |   ||||    || |||||||| || || |||||| |||||||||| || ||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  15576647 agactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 15576548  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    ||  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| || ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15576547 ggttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 15576469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 280
Target Start/End: Original strand, 16742846 - 16743124
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || |||| | |||| ||||||||  | || || |    
T  16742846 atggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttttgttggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaag 16742945  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||| || || || |   ||||    || |||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||| |||    
T  16742946 agactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtgtca 16743045  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
     |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| || ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16743046 agttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 16743124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17193092 - 17192877
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||  | || ||     
T  17193092 tatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacgccgttgtgttggtttgaataaggagaaagtgttgtgttacgaccggaagttgtgcaa 17192993  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||| ||| || || || |   ||||   ||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  17192992 gagagtacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttc 17192893  T
Q  201 aggagggtgatcatgt 216  Q
    |||  |||||||||||    
T  17192892 aggttggtgatcatgt 17192877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 4678435 - 4678329
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  4678435 atggcacccttcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagtgttgtgctgggaccggatttggttcagg 4678336  T
Q  102 agactac 108  Q
    |||||||    
T  4678335 agactac 4678329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 13001907 - 13001770
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || |||    
T  13001907 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaaaactccattatgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcat 13001808  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagat 138  Q
     | ||||| || || ||||  |||||||||||||||||    
T  13001807 caaactacagaaaatgtcaagttgataagagaaaagat 13001770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18748663 - 18748384
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||  | || || |||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||  | || ||     
T  18748663 tatggcaccgtttgagggtttgtatggtcggaggtgtaggacgtcgttgtgttggtttgaatcaggtgaaagtgctttgttaggaccggaggttgtgcaa 18748564  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||| || ||||| |   ||||   ||| ||||||||||  || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | || ||| |  |||||||||    
T  18748563 gagactacggaaaaagttaagatgattcaagataagatgaaagtgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaagaacattgagtttc 18748464  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    | |  ||||||||||| ||| | || || |  ||| | || ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||    
T  18748463 aagttggtgatcatgtgtttttaagagtgaaccctgtaactggtgttggacgtgctttgaagtgtcgaaagttgactcct 18748384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 280
Target Start/End: Original strand, 13975320 - 13975466
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    |||||||| || || |||||| |||||||||| || ||||||||| | ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | ||    
T  13975320 aagatgaaggcatctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatc 13975419  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    || |||| || ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  13975420 ctgtgaccggagttggtcgtgttttgaagtgtaggaagttgactcct 13975466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 299
Target Start/End: Original strand, 15016019 - 15016184
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    ||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||| |||| |||||||    
T  15016019 aagatgaaagcgtctcagagtagacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactc 15016118  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatc 299  Q
    || |||| ||||||||| | ||  | ||||||| |||  | ||||| | |||||||| ||||||||    
T  15016119 ctgtgaccggtgttggatgagcactaaagtcgaagaaactaactccgaggtttattgctccgtatc 15016184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 294 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 31945177 - 31945105
Alignment:
Q  294 cgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31945177 cgtatcagatatcagaaagggttggaacagtggcatataaagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 31945105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 296 - 366
Target Start/End: Original strand, 31689049 - 31689119
Alignment:
Q  296 tatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31689049 tatcagatatcagaaagggttggaacagtggcatatagagttggtttgacaccacatctttcgaacttgca 31689119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 26009124 - 26009189
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcagg 66  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||    
T  26009124 tatggcaccgtttgaagccttgtatggtcgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgagtcagg 26009189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 280
Target Start/End: Original strand, 6153141 - 6153260
Alignment:
Q  161 aagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttga 260  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||| || ||||||| |  ||||||||||| |||||||| || | || | |||| ||||| || ||||||||||    
T  6153141 aagagttatcatgataagaggagaaaggatattaagtttcaagttggtgatcatgtgtttctgagagtgaatcatgtgaccggtgtcggtcgtgctttga 6153240  T
Q  261 agtcgaggaagttgactcct 280  Q
    |||  || ||||||||||||    
T  6153241 agtgcagaaagttgactcct 6153260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Original strand, 6153012 - 6153073
Alignment:
Q  20 ttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgtt 81  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  6153012 ttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgaatccggagaaagtgttgtgtt 6153073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Original strand, 6712552 - 6712753
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| | |||||||| || || || || |||| ||||||||| ||||||| | |||| ||||||||  | ||||| |    
T  6712552 atggcaccgtttgaggctttgtatggtagaaggtgtagaacgccgttgtgttggtatgagtcaggcgaaagtgctttgttaggaccggaggttgtacaag 6712651  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    |||||||  | || || |   ||||   | | ||||||||||| || |||||| | ||||||||||| ||||||||| | || |||||  ||||||||||    
T  6712652 agactacataaaaggttaagatgattcaaaagaagatgaaagcgtctcagagtaggcagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgagtttca 6712751  T
Q  202 gg 203  Q
    ||    
T  6712752 gg 6712753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 63
Target Start/End: Original strand, 13975188 - 13975249
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtc 63  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  13975188 atggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtc 13975249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 14573927 - 14573887
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtagga 41  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  14573927 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagga 14573887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 53)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 20832985 - 20832620
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  20832985 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtattgggaccggatttggttcat 20832886  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20832885 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttc 20832786  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20832785 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatca 20832686  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20832685 gatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 20832620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 31830658 - 31830293
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31830658 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtgcat 31830559  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  31830558 gagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcggcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgaatttc 31830459  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31830458 aggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgttggacgggctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 31830359  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31830358 gatttcagagagagttggtactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgca 31830293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 11358317 - 11358682
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  11358317 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcat 11358416  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11358417 gagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggatcttgagtttc 11358516  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11358517 aggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgttggtcgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatca 11358616  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11358617 gatttcagagaaagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 11358682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 1063751 - 1063386
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1063751 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgtgtgagagtgttgtgttgggaccagatttggtacat 1063652  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1063651 gagactactgagaaagtaaggttgataagagaaaagatgagagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttc 1063552  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1063551 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatca 1063452  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1063451 gatttcagagagaattggtactgtggcatatagagttgctttgccaccacatctttcgaacttgca 1063386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 23293958 - 23293593
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23293958 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggttgaggactcctttatgtcggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcat 23293859  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||  ||||||||||   |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||  ||||||||||    
T  23293858 cagactatagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacggaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttc 23293759  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23293758 aggagggtgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 23293659  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23293658 gatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttctaacttgca 23293593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 23276776 - 23276411
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23276776 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggacttctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcat 23276677  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||||||||   |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||  ||||||||||    
T  23276676 cagactacggagaaagtcatgatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttc 23276577  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  | |||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23276576 aggagggtgatcatgtatttctgagatttactcctatgatgggtgtgggacgtgcattgaagtcgagtaagtcgactccaaagttcattggtccgtatca 23276477  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23276476 gatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 23276411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 27787740 - 27787376
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  27787740 atggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagtgttgtgctgggaccggatttggttcagg 27787641  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||| || |||||||   |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||    
T  27787640 agactacagaaaaagtcaaggtgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 27787541  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     |||||||||||||| ||||| || || |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  27787540 agagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtccgtatcag 27787441  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||| | || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  27787440 atttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgca 27787376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 12574352 - 12573988
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  12574352 atggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggttcgagtcaagagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcagg 12574253  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||| || |||||||   |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||    
T  12574252 agactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggaggaaggcccttgagtttca 12574153  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| || ||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  12574152 agagggtgatcatgtatttctaagggttaccccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcag 12574053  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||  |||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12574052 atttcagagaggattgggacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgca 12573988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 23087450 - 23087085
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||| | || | |    
T  23087450 tatggcaccattcgaagctttgtatggtcggaggtgcggaactccgttatgttggtttgagtcgggtgaaagtgtaatgttgggaccagatattgttcgt 23087351  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     |||||| ||| || || | |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||  ||||||||||    
T  23087350 cagactattgaaaaggttaaattgataagagagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgacaagtgtagaaaggtccttgagtttc 23087251  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||    
T  23087250 aagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcttgtgacaggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttgacgccgaggtttattggtccatatca 23087151  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23087150 gatatctgagagagttggaacagtggcgtatagagtgtgtttgccaccacatctttcgaatttgca 23087085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 159 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 24654187 - 24653980
Alignment:
Q  159 agaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgcttt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||| ||    
T  24654187 agaagagttatcatgataagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacttgcatt 24654088  T
Q  259 gaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcg 358  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24654087 gaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagtgaaggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcg 24653988  T
Q  359 aacttgca 366  Q
    ||||||||    
T  24653987 aacttgca 24653980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 27365522 - 27365887
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||||||  |||||||||| ||  | || ||     
T  27365522 tatggcaccgtttgaagccttgtatggacgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaa 27365621  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     | ||||| || || || |  || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  27365622 caaactacggaaaaggttaagttaataagagaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttc 27365721  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| ||  |||||||||||||| |||| ||||| || ||||| || || || | |||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  27365722 aagagggagatcatgtgttcttgagggtcactcctatgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagttcattggtccttatca 27365821  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  27365822 gatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttggattaccacctcatctttcgaatttgca 27365887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 201 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 24945167 - 24945002
Alignment:
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24945167 aggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 24945068  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24945067 gatttcaaagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 24945002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 9610135 - 9609771
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  9610135 atggcaccgttcgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 9610036  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  9610035 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttcc 9609937  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  9609936 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 9609837  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  9609836 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgca 9609771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 366
Target Start/End: Original strand, 24878443 - 24878803
Alignment:
Q  6 caccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagac 105  Q
    |||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||  | ||    
T  24878443 cacctttcgaggctttatatggtcggaggtgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaac 24878542  T
Q  106 tactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggag 205  Q
    ||||||||||||  |  ||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  24878543 tactgagaaagttcggatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaa 24878642  T
Q  206 ggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagattt 305  Q
    || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |    
T  24878643 ggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagatat 24878742  T
Q  306 cagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
      || |||||||| || ||||| |||  ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  24878743 tggaaagagttggaacggtggcttaccaagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 24878803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 24825725 - 24826051
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||  | || ||     
T  24825725 tatggcaccttttgaagctctgtatggtcggaggtgtaggactccgttgtgttgggttgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccagaaattgttcag 24825824  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     | ||||||||||| || |   ||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| || || || |||||||||     
T  24825825 caaactactgagaaggttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaggagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttt 24825924  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || ||| |||| ||| | || ||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| | |||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  24825925 aggaaggagataatgtatttttaagagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggttcgtatca 24826024  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggc 327  Q
    ||| ||||| ||| |||| || |||||    
T  24826025 gatatcagaaagaattgggacggtggc 24826051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16925259 - 16924895
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  16925259 atggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 16925160  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  16925159 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttcc 16925061  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  16925060 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 16924961  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  16924960 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 16924895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16998999 - 16998635
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  16998999 atggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 16998900  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  16998899 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttcc 16998801  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  16998800 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 16998701  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  16998700 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 16998635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 24262369 - 24262005
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  24262369 atggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 24262270  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |    
T  24262269 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttcc 24262171  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  24262170 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtctgtatca 24262071  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
     || |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  24262070 tatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgca 24262005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 27218015 - 27217651
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  |  | ||      
T  27218015 atggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagatttttcagc 27217916  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||  ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  27217915 aaactactgagaaagttcagat-gatacaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttc 27217817  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  27217816 aggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 27217717  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  27217716 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 27217651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 130 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 23138908 - 23138672
Alignment:
Q  130 agaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtc 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  || || || |||||||| || || || || || ||| |||| |||    
T  23138908 agaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtacgaaagacctcgagtttcaagaaggagaccaggtatttttgagagtc 23138809  T
Q  230 actcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcat 329  Q
    |||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  23138808 actcttgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcat 23138709  T
Q  330 acagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |  |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  23138708 atcgagtaggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 23138672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 130 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 23550698 - 23550462
Alignment:
Q  130 agaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtc 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  || || || |||||||| || || || || || ||| |||| |||    
T  23550698 agaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtacgaaagacctcgagtttcaagaaggagaccaggtatttttgagagtc 23550599  T
Q  230 actcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcat 329  Q
    |||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  23550598 actcttgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcat 23550499  T
Q  330 acagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |  |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  23550498 atcgagtaggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 23550462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 24675488 - 24675124
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  24675488 atggcaccttttgaggctttatatggtcggagatgcagaactccattgtgttggtttgaatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 24675389  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    |||||||||||||||| |   ||||   ||| || |||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24675388 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 24675289  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     || || || || || ||| |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  24675288 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcacccctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 24675189  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || || || |||||||| || ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||||| ||| |||||    
T  24675188 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagttggattaccaccgcatcttttgaatttgca 24675124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 24707926 - 24708290
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  24707926 atggcaccttttgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagaaattgttcagc 24708025  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    |||||||||||||||| |   ||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| ||||  || ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24708026 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagaaatatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttca 24708125  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  24708126 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcctagattttttggtccgtatcag 24708225  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || || || |||||||| || ||||| ||  |||| || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  24708226 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgca 24708290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16982151 - 16981787
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  16982151 atggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 16982052  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  16982051 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattcc 16981953  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  16981952 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 16981853  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  16981852 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 16981787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 17063716 - 17063352
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  17063716 atggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 17063617  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  17063616 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattcc 17063518  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  17063517 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 17063418  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  17063417 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 17063352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 21145474 - 21145838
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| || |  ||||| || ||||||||||||| ||||||||| || || || |||||  |  | || ||      
T  21145474 atggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaaaactccgttgtgctggtttgagttaggtgaaagagtggtcttaggaccaaagattgtccagc 21145573  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21145574 aaactactgagaaagttcagat-gattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttc 21145672  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||| || |||||||||| || ||||||    
T  21145673 aggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcaaagaagttgaccccgaagtttattgatctgtatca 21145772  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| ||  |||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  21145773 gatattggaaagagttggaacgatggcttatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 21145838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 130 - 366
Target Start/End: Original strand, 21325838 - 21326074
Alignment:
Q  130 agaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtc 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || || || || || ||| |||| |||    
T  21325838 agaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 21325937  T
Q  230 actcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcat 329  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| || || |||||||| || ||||| |    
T  21325938 actcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagatatcggaaagagttgggacggtggcgt 21326037  T
Q  330 acagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |  |||| || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  21326038 atcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgca 21326074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 10868849 - 10868485
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  10868849 atggcaccgttcgaggctttgtacggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagggtggtcttaggaccagagattgttcagc 10868750  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| |  |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||| ||||    
T  10868749 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgataagcgtaggaaagatcttgaatttc 10868651  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  10868650 aggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 10868551  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  10868550 gatattggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 10868485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 366
Target Start/End: Original strand, 22757039 - 22757271
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||  | || || || ||| |||| |||||||    
T  22757039 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaagagaccacgtgtttttgagagtcactc 22757138  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacag 333  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||  |    
T  22757139 ctgtgactggtgttggacgtgctttgaaatcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcg 22757238  T
Q  334 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  22757239 agtgggattaccaccgcatctttcgaatttgca 22757271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 23063944 - 23063712
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || || || |||||| | || |||||||    
T  23063944 aagatgaaagcgtcgcagagtagacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgttttttttagagtcactc 23063845  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacag 333  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| || || |||||||| || ||||| ||  |    
T  23063844 ctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtttcagatatctgaaagagttggaacggtggcgtatcg 23063745  T
Q  334 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || || ||||| || |||||||| |||||    
T  23063744 agtgggattaccaccgcacctttcgaatttgca 23063712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 23189006 - 23188691
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| |  || |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  23189006 atggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgtg-tgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 23188908  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||||||||| || | || |||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||| |||    
T  23188907 agactactgagaaggttaaatagattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtgtca 23188808  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
    ||| || || ||  | ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  23188807 ggaaggagaccacatgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccaagatttattggtccgtatcag 23188708  T
Q  302 atttcagagagagttgg 318  Q
    || || || ||||||||    
T  23188707 atatcggaaagagttgg 23188691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 44386013 - 44386377
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |  || || ||||| ||  | || ||      
T  44386013 atggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagcggtcttaggaccagagattgttcagc 44386112  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || | ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  44386113 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaacgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgaatttc 44386211  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || || || ||||||||||||||    
T  44386212 aggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaaattcattggtccgtatca 44386311  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  44386312 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgca 44386377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 17067374 - 17067016
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  17067374 atggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 17067275  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  17067274 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattcc 17067176  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  17067175 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 17067076  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaa 360  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| |   |||| ||||| || || |||||||||||    
T  17067075 gatattggaaagagttggaacggtggctttacgagtgggtttaccgccgcatctttcgaa 17067016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 24710028 - 24709674
Alignment:
Q  6 caccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagac 105  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |  || || ||||| ||  | || ||  | ||    
T  24710028 caccgtttgaggccttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagcggtcttaggaccagagattgttcagcaaac 24709929  T
Q  106 tactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcagga 204  Q
    |||||||||||| ||||| |||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||    
T  24709928 tactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaaga 24709830  T
Q  205 gggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatt 304  Q
     || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||     
T  24709829 aggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtattagata 24709730  T
Q  305 tcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaa 360  Q
    |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || |||||| ||||    
T  24709729 ttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaa 24709674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 137 - 366
Target Start/End: Original strand, 22325435 - 22325664
Alignment:
Q  137 atgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctt 236  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||| |||| |||||||||     
T  22325435 atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactccta 22325534  T
Q  237 tgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagt 336  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||| ||||    
T  22325535 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaacaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagt 22325634  T
Q  337 tggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
     ||||| || || |||||| |||| |||||    
T  22325635 gggtttaccgccgcatcttgcgaatttgca 22325664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 27371268 - 27370904
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||   || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  27371268 atggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgaagaactatgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 27371169  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  27371168 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttcc 27371070  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  27371069 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggatgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 27370970  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| | ||| || || |||||| |||| |||||    
T  27370969 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtggatttaccgccgcatcttgcgaatttgca 27370904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 45529510 - 45529155
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  ||||| || || |||| |||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || ||      
T  45529510 atggcaccgttcgaagcgttgtatggtcggagatgcaaaactccattgtgttggtatgagtccggtgagagtgtggtattgggaccggacattgttcaac 45529411  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    |||||||| |||| || |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||      
T  45529410 agactactaagaaggttaagttgattagagaaaagatgaaagcatcgcagagtagacaaaagagttatcatgataagcctaggaaggatcttgagttt-- 45529313  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
        |  || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||  | || || | |||  ||||||| | ||||||||  || ||||||    
T  45529312 ----gaagaccatgtgtttatgagagtcactcttgtgactggtgttggacgtgcgctaaaatcaaagaaactgactccgaggtttattgacccatatcag 45529217  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaactt 363  Q
    ||||| || |||||||| || || || || ||||| ||||| ||||  ||||||| ||||||    
T  45529216 atttcggaaagagttgggacggttgcgtatagagtgggtttaccactgcatcttttgaactt 45529155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 19652492 - 19652578
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggacc 87  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19652492 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggacc 19652578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 185 - 366
Target Start/End: Original strand, 27377098 - 27377279
Alignment:
Q  185 aaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagt 284  Q
    |||||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  |    
T  27377098 aaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagat 27377197  T
Q  285 ttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  27377198 ttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgggttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 27377279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 363
Target Start/End: Original strand, 30211461 - 30211722
Alignment:
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||||||||| || |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  30211461 agactactgagaaggttaagttgattagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtagacaaaagagttaccgtgataagcgtaggaaggatcttgagtttca 30211560  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     || || || ||||| ||| | || ||||| | | |||| ||||||||||| ||  | || || | |||  ||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  30211561 agaaggagaccatgtgttttttagagtcacccatgtgaccggtgttggacgggcgctaaaatcaaagaaactgactccgaggtttattggcccgtatcag 30211660  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaactt 363  Q
    ||||| || | ||||||    || || || | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30211661 atttcggaaaaagttggggtggttgcgtataaagtgggtttaccaccgcatctttcgaactt 30211722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 12640362 - 12640641
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||| | |||| ||||||||  | || ||     
T  12640362 tatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttatgttggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaa 12640461  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    || ||||| || || || |   ||||    || |||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | || |||||| |||||||||    
T  12640462 gaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttc 12640561  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    |||  || |||||||| ||  ||||||| | |||  |||| ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12640562 aggttggagatcatgtgttcttgagggtgaatccggtgaccggtgtcggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 12640641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22276279 - 22276000
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || ||||   |||| |||| |||  | || ||     
T  22276279 tatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtccggagagagtgccttgttaggactggaagttgtgcaa 22276180  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    || ||||| || || || |   ||||    || |||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  22276179 gaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttc 22276080  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    |||  ||||||||||| ||| |||| || | |||| |||| |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||    
T  22276079 aggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagggtaggaagttgactcct 22276000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 25128647 - 25128387
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||  | || ||     
T  25128647 tatgacaccgtttgatgctttgtatggtcggaggtgtaggacgccgttatgttggtttgagtcgggtgaaagtgttttgttaggatcggaggttgtccaa 25128548  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||| || ||||| |   ||||   ||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||| |  | || |||||  |||||||||    
T  25128547 gagactacggaaaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcatctcagagtagacagaagagttatcatgatgaaaggaggaaggacattgagtttc 25128448  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaa 261  Q
    | |  ||||||||||| ||| |||| || |  | | |||| ||||||||||| ||||||||    
T  25128447 aagttggtgatcatgtgtttttgagagtgaaccatgtgactggtgttggacgcgctttgaa 25128387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 23817496 - 23817711
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||| |  |||||| | |||| ||||||||  | || ||     
T  23817496 tatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggagatgtaggacaccgttgtgttggtttgagtcaagataaagtgctttgttaggaccggaggttgtgcaa 23817595  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||| || ||||| |   ||||   ||| ||||| ||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||    
T  23817596 gagactacggaaaaagttaagatgatccaagagaagatcaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataaaaggagaaaggatattgagtttc 23817695  T
Q  201 aggagggtgatcatgt 216  Q
    |||  |||||||||||    
T  23817696 aggttggtgatcatgt 23817711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 280
Target Start/End: Original strand, 24831631 - 24831909
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || | || | |||| ||||||||  | || || |    
T  24831631 atggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtccggagagaatgctttgttaggaccggaagttgtgcaag 24831730  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    | ||||| || || || |   ||||    || |||||||| |  || |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||  |||||| ||||||||||    
T  24831731 aaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggtgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagagaacgaaggatattgagtttca 24831830  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
     |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| || || || |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24831831 agttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctatgactggagtgggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 24831909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 280
Target Start/End: Original strand, 24570112 - 24570390
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||| || || || ||| ||| |||||||||||| || || || |||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||  | ||  | |    
T  24570112 atggcaccgtttgaggctttatatcgtcagaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagttaggagaaagtgttttgttaggaccggaagttgtgaaag 24570211  T
Q  102 agactactgagaaagtca-gattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    ||||||| || || || | |||  || | ||| ||||||||| | || |||||| || ||||||| || ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  24570212 agactacggaaaaggttaagatgaatca-agagaagatgaaaacgtctcagagtagatagaagagctatcatgataagaggagaaaggatattgagtttc 24570310  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    |||  ||||||||||| ||  |||| || | || | | || |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  24570311 aggttggtgatcatgtattcttgagagtgaatcatgtaactggtgttggtcgtgctttgaagtgttggaagttgactcct 24570390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 22762012 - 22762101
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccgga 90  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  | || || |||||||| ||||| ||||||| | |||| ||||||||    
T  22762012 tatggcaccgtttgaagctttgtatggtcggaggtgtaggacgtcgttgtgttggtttgaatcaggagaaagtgctttgttaggaccgga 22762101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 281
Target Start/End: Original strand, 23817718 - 23817816
Alignment:
Q  183 gaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactccta 281  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| || | || | |||| |||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||    
T  23817718 gaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcttgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtcggaagttgactccta 23817816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 72
Target Start/End: Original strand, 41608829 - 41608899
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaag 72  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  41608829 atggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaag 41608899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 366
Target Start/End: Original strand, 41609054 - 41609152
Alignment:
Q  268 gaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| |  || ||||||||||| |||||    
T  41609054 gaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttacagccgcatctttcgaatttgca 41609152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Complemental strand, 20828259 - 20828226
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggagg 34  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20828259 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggagg 20828226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 178
Target Start/End: Original strand, 27368411 - 27368452
Alignment:
Q  137 atgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataag 178  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  27368411 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataag 27368452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 23064055 - 23063991
Alignment:
Q  23 tatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggacc 87  Q
    ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  23064055 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagtgtggtcttaggacc 23063991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 69)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 10468897 - 10469262
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10468897 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcat 10468996  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10468997 gagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttc 10469096  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10469097 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 10469196  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10469197 gatttcagagagggttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacctgca 10469262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 24364645 - 24364280
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  24364645 tatggcatcgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgagtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcat 24364546  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24364545 gagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggatcttgagtttc 24364446  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24364445 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgtgcgctgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatca 24364346  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24364345 gatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 24364280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Original strand, 14381515 - 14381860
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  14381515 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcatgagagagtgtcgtgttgggatcggatttggttcat 14381614  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||  ||||||||||    
T  14381615 cagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtggacagaagagttatcacgacaagcggagaaaggcccttgagtttc 14381714  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14381715 aggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 14381814  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgcca 346  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14381815 gatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgcca 14381860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 8766196 - 8766561
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  8766196 tatggcaccgttcgaagctttgtatggttggaggtgcaggactcatttatgctggtttgagtcaggagagagtgtcgtgtggggaccggatttggttcat 8766295  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||| ||||||||||   |||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||    
T  8766296 gagactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaggcgtcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttc 8766395  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||  | || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  8766396 aggagggtgatcatgtgtttctgagggttacttctatgacaagggtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcatcggtccgtatca 8766495  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8766496 gatttcagagagggttggaacagtggcttacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgca 8766561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21471834 - 21471469
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  21471834 tatggcaccgttcgaagctttgtatggacggaggtgcaggactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgcagtgttgggaccggatttggttcat 21471735  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21471734 cagactacggagaaggtcaagttaataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttc 21471635  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| || | |||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  21471634 aagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggggtaggacgtgcgttgaaatctaagaagttgactccgaagtttattgatccgtacca 21471535  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21471534 gatatctgagagagttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgca 21471469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 17415719 - 17415365
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17415719 tatgacaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcagaagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcat 17415620  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||  ||||||||||    
T  17415619 cagactacagagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttaccatggcaagcgtagaaaggcccttgagtttc 17415520  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| ||| |||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17415519 aagagggagatcatgtgtttatgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 17415420  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctt 355  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  17415419 gatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccgcatctt 17415365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 15459569 - 15459204
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  15459569 tatggcaccatttgaagctttatatggtcggaggtgtaggactcctctatgttggtttgagtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcac 15459470  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  15459469 gagactacggagaaagtcaggatgattagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctaccatgacaagcgtaggaaagatcttgagtttc 15459370  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  15459369 aggaaggtgaccatgtttttctgagggttactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttatca 15459270  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  15459269 gatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagtgggattaccacctcatctttcgaatttgca 15459204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 27560666 - 27561030
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  27560666 atggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccattgtgttggtttgaatcaggagaaagtgttgtgttgggaccggatttagttcagg 27560765  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||| || |||||||   |||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||    
T  27560766 agactacagaaaaagtcaagatgatcagggagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 27560865  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     |||||||||||||| ||||| || || |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  27560866 agagggtgatcatgtatttctaagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcag 27560965  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||  |||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  27560966 atttcagagaggattggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgca 27561030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 25768424 - 25768059
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||    
T  25768424 tatggcaccgttcgaagctttgtgtggtcggaggtgcaggactccattgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtggtctttggaccggatttagttcat 25768325  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     | ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  25768324 caaactacggagaaggtcaagttgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggatcttgagtttc 25768225  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || |||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  25768224 aagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactcttatgacgggtgtaggacgtgcgttgaagtctaagaaattgacttcaaagtttattggtccgtacca 25768125  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  25768124 gatatctgagagagttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttccaatttgca 25768059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 28282862 - 28283226
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  28282862 atggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagtgttgtgctgggaccggatttggttcagg 28282961  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||| || |||||||   |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||    
T  28282962 agactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 28283061  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     |||||||||||||| ||||| || || |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  28283062 agagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggcccgtatcag 28283161  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||  | || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  28283162 atttcagagaggatcgggacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgca 28283226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 22796680 - 22797045
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  22796680 tatggcaccgttcaaagctttgtacggtcggaggtgcaggactcctttatgttgatttgagtcaggagagagtgtagtgttgcgaccggatttggttcat 22796779  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||| || |   ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||    
T  22796780 cagactacagagaaggttaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcaaagtctacataagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttc 22796879  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22796880 aagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaggaagttgactcctaagtttattggtctgtatca 22796979  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
     || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22796980 tatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgca 22797045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 18801167 - 18800857
Alignment:
Q  9 cgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactac 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18801167 cgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagttaggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactac 18801068  T
Q  109 tgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggt 208  Q
     ||||||||||   |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| |||||     
T  18801067 ggagaaagtcaagatgattagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggg 18800968  T
Q  209 gatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcag 308  Q
    |||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||  ||||||  |||||||||| | |||||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  18800967 gatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaagacgtgaattgaagtcgaagcagttgacttcaaagttcattggtccatatcagatatcag 18800868  T
Q  309 agagagttggt 319  Q
    |||| ||||||    
T  18800867 agagggttggt 18800857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 146 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 25750897 - 25750677
Alignment:
Q  146 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||    
T  25750897 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactcttgtgacgggtg 25750798  T
Q  246 ttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgcc 345  Q
    |  ||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  25750797 taagacgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggcatacagagtgggtttgcc 25750698  T
Q  346 accacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  25750697 accacatctttcgaatttgca 25750677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 102 - 366
Target Start/End: Original strand, 14131328 - 14131592
Alignment:
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||| || || |||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| || ||||||||    
T  14131328 agactacagaaaaggtcaaattgatatgagaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaggacctggagtttca 14131427  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
    ||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14131428 ggaaggagatcatgtgtttctgagggtcactcctatgacaggtgtaggtcgtgcattgaagtctaagaagttgacttcgaagtttattggtccgtatcag 14131527  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  14131528 atatctgagagagttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacaacatctttcgaatttgca 14131592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 366
Target Start/End: Original strand, 21564187 - 21564545
Alignment:
Q  8 ccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagacta 107  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||  | || ||  ||||||    
T  21564187 ccgttcgaagctttgtacggtcggaggtgccggactcctttatgttggtttgagtcaggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcagcagacta 21564286  T
Q  108 ctgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggaggg 207  Q
       | || || |  |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  21564287 aaaaaaaggttaagttgataagagaacagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagctatcatgacaaacgtaggaaggaccttgagtttcaagaggg 21564386  T
Q  208 tgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttca 307  Q
     |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || || || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||     
T  21564387 agatcatgtgttcttgagagtcactcctttgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatct 21564486  T
Q  308 gagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| || ||||||| ||| |||||    
T  21564487 gagagggttggaacagtggcgtatagagtgggtttgccgcctcatctttagaatttgca 21564545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 366
Target Start/End: Original strand, 27331500 - 27331846
Alignment:
Q  20 ttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtca 119  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||    || ||  | |||||||||||||| |    
T  27331500 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagggtggttttaggacccgagaatgttcaacaaactactgagaaagtta 27331599  T
Q  120 gattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttt 219  Q
     | ||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| || ||    
T  27331600 aaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttaccatgataagcgtagaaaagaccttgagtttcaagaaggggatcacgtatt 27331699  T
Q  220 tctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggt 319  Q
    | |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||     
T  27331700 tttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtaaaggaagttgactccgagatttattggtccatatcagatatcagaaagagttgga 27331799  T
Q  320 acagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  27331800 acggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 27331846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 366
Target Start/End: Original strand, 27392240 - 27392586
Alignment:
Q  20 ttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtca 119  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||    || ||  | |||||||||||||| |    
T  27392240 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagggtggttttaggacccgagaatgttcaacaaactactgagaaagtta 27392339  T
Q  120 gattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttt 219  Q
     | ||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| || ||    
T  27392340 aaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttaccatgataagcgtagaaaagaccttgagtttcaagaaggggatcacgtatt 27392439  T
Q  220 tctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggt 319  Q
    | |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||     
T  27392440 tttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtaaaggaagttgactccgagatttattggtccatatcagatatcagaaagagttgga 27392539  T
Q  320 acagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  27392540 acggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 27392586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 34645634 - 34645999
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||  |||||||||| ||  | || ||     
T  34645634 tatggcaccgtttgaagcattgtatggtcgcagatgcaggactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaa 34645733  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     | ||||| || || || |  |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  34645734 caaactacagaaaaggttaagttgataagagaacatatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttc 34645833  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| ||  |||||||||||||| |||| ||||| || ||||| || || || | |||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  34645834 aagagggagatcatgtgttcttgagggtcactcctatgacaggtgtgggtcgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatca 34645933  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||||||||| || ||||| || ||| |||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  34645934 gatatctgagagagttggaactgtggcgtatagaattggattaccacctcatctttcgaatttgca 34645999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 1641005 - 1640715
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||||||| ||| | || |||    
T  1641005 tatggcaccgttcgaagctttgcatggacggaggtgcagaactccgttatgttggtttaagtcgggtgaaagtgtaatgttgggaccagatatagttcat 1640906  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| || || |||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||     
T  1640905 cagactacagaaaaggtcaaattgataagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgaatttt 1640806  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattgg 291  Q
    |||| || |||||||| ||||| || ||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| || | |||||||||    
T  1640805 aggaaggagatcatgtgtttctaagagtcacccctgtgacaggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttgaccccgaggtttattgg 1640715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 27187668 - 27187304
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  27187668 atggcaccgttcgaggctctgtatggtcggagatgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 27187569  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||  |||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  27187568 aaactactgagaaagttcagat-gatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgaagaaaagatcttgaattta 27187470  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || || || |||||||| |||||    
T  27187469 aggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgaccccgaaattcattggtccatatca 27187370  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || |  ||||||||||| |||||    
T  27187369 gattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgcagcatctttcgaatttgca 27187304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 27261572 - 27261936
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  27261572 atggcaccgttcgaggctctgtatggtcggagatgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 27261671  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||  |||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  27261672 aaactactgagaaagttcagat-gatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgaagaaaagatcttgaattta 27261770  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || || || |||||||| |||||    
T  27261771 aggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgaccccgaaattcattggtccatatca 27261870  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || |  ||||||||||| |||||    
T  27261871 gattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgcagcatctttcgaatttgca 27261936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 29591969 - 29592333
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  29591969 atggcaccgttcgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 29592068  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  29592069 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttcc 29592167  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  29592168 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 29592267  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  29592268 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgca 29592333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 1543133 - 1543497
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  1543133 atggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcataactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 1543232  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    | |||||||||||||| |   ||||   ||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1543233 aaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcccagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgcagaaaagatcttgagtttca 1543332  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
    ||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||| |||||||    
T  1543333 ggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtagggcgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtctgtatcag 1543432  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  1543433 atattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 1543497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 18794923 - 18794558
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||| || |||||||||| ||| ||||||||  ||||||| || ||  | || ||     
T  18794923 tatggcaccatttgaagccttgtacggtcgaaggtgcataactcctttgtgttggtttgagttaggagaaagtgtgatgttggggccagacatagtgcaa 18794824  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| || || || |  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || || || || || ||| ||||||    
T  18794823 cagactacagaaaaggttaagttgataagagaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaatcgtaggaaagaccttcagtttc 18794724  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| || || || | |||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  18794723 aagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtgtaggccgtgccttaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatca 18794624  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| ||  |||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18794623 gatatctaagagggttggaacagtggcatatcgagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgca 18794558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 16626766 - 16627130
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  16626766 atggcaccgttcgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 16626865  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||| ||||||||| ||||| |||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  16626866 aaactattgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttcc 16626964  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  16626965 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 16627064  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || |||||| |||| |||||    
T  16627065 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgca 16627130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 19879531 - 19879166
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || |||||||| || || ||||||||  ||||||| || ||  | || ||     
T  19879531 tatggcaccgtttgaagcattgtatggacgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgaatcgggagaaagtgtgatgttggggccagacatagttcaa 19879432  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     | ||||| || || || |  || ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  19879431 caaactacagaaaaggttaagttaataagagaacagatgaaagggtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttc 19879332  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||| || | ||||| || ||||| ||||| || | |||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  19879331 aagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatggcaggtgtaggccgtgcattgaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatca 19879232  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||| || || || ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  19879231 gatatctgagagagttggaacagtggcttatagggtgggtttaccccctcatctttcgaatttgca 19879166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Original strand, 5839286 - 5839626
Alignment:
Q  20 ttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtca 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| | || || |||||||| ||||| || || || || || ||||| ||  | || ||  ||||||| ||||||||||    
T  5839286 ttgtatggtcggagatgtagaacttcgttgtgttggtttgaatcaggagatagggtggtcttaggaccagagattgttcagcagactacagagaaagtca 5839385  T
Q  120 gattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttt 219  Q
       ||||   ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || || || ||    ||    
T  5839386 agatgatttaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacacgtt 5839485  T
Q  220 tctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggt 319  Q
    | |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||     
T  5839486 tttgagagtcactcctatgacaggtgtaggacgtgcgttgaagtctaagaagttgacttcgaagtttattggtccgtatcagatatcggaaagagttgga 5839585  T
Q  320 acagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaa 360  Q
    |||||||| ||  |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5839586 acagtggcgtatcgagttggtttaccaccgcatctttcgaa 5839626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 28263246 - 28263610
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||  || || ||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  28263246 atggcacctttcgaggctttatatggtcggatatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 28263345  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||  |||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||     
T  28263346 aaactactgagaaagttcagat-gatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattta 28263444  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  28263445 aggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 28263544  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  28263545 gatattggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 28263610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 28292421 - 28292785
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  28292421 atggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 28292520  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||  |||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| |||     
T  28292521 aaactactgagaaagttcagat-gatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgtagaaaagatcttgaattta 28292619  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||  | ||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  28292620 aggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagttaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatca 28292719  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  28292720 gattttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 28292785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 28341995 - 28342359
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||  || || ||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  28341995 atggcacctttcgaggctttatatggtcggatatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 28342094  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||  |||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||     
T  28342095 aaactactgagaaagttcagat-gatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattta 28342193  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  28342194 aggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 28342293  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  28342294 gatattggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 28342359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 130 - 366
Target Start/End: Original strand, 22078865 - 22079101
Alignment:
Q  130 agaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtc 229  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||  || || |||||||||||||| || || || || || ||| |||| |||    
T  22078865 agaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcttaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtc 22078964  T
Q  230 actcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcat 329  Q
    |||||| |||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
T  22078965 actcctgtgattggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattcgtccgtatcagatatcggaaagagttggtacggtggcgt 22079064  T
Q  330 acagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |  |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  22079065 atcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 22079101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 25765339 - 25765702
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||  || || || ||||| ||  | || ||      
T  25765339 atggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccattgtgttggtttgagtcaggtgaaaaagtggtcttaggaccagagattgttcagc 25765438  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    |||||||||||||||| |   ||||   ||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  25765439 agactactgagaaagtaaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 25765538  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     || || || || ||  || |||| ||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||| |||||||    
T  25765539 agaaggagaccacgtgcttttgagagtcacgc-tgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtctgtatcag 25765637  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || || || |||||||| || ||||  ||  |||| || || ||||| |||||||||||||||||    
T  25765638 atatcggaaagagttggaacggtggtgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaacttgca 25765702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 12498240 - 12497894
Alignment:
Q  20 ttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtca 119  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||||  | || || ||||| ||  | || ||  | |||||||||||||| |    
T  12498240 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagaatggtcttaggacccgagattgttcaacaaactactgagaaagtta 12498141  T
Q  120 gattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttt 219  Q
       ||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || || || ||    
T  12498140 agatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 12498041  T
Q  220 tctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggt 319  Q
    | |||| ||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| || | |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| || || ||||||||     
T  12498040 tttgagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgccttgaattcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtaacagatatcggaaagagttgga 12497941  T
Q  320 acagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || ||||| ||  |||| || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  12497940 acggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgca 12497894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 366
Target Start/End: Original strand, 12510661 - 12511007
Alignment:
Q  20 ttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtca 119  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||||  | || || ||||| ||  | || ||  | |||||||||||||| |    
T  12510661 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagaatggtcttaggacccgagattgttcaacaaactactgagaaagtta 12510760  T
Q  120 gattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttt 219  Q
       ||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || || || ||    
T  12510761 agatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 12510860  T
Q  220 tctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggt 319  Q
    | |||| ||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| || | |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| || || ||||||||     
T  12510861 tttgagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgccttgaattcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtaacagatatcggaaagagttgga 12510960  T
Q  320 acagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || ||||| ||  |||| || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  12510961 acggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgca 12511007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 11280553 - 11280918
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||| || || || |||||||| || ||||||||||| || ||||||||  |||||||||| ||  | || ||     
T  11280553 tatggcaccgtttgaagcattgtatgatcgaagatgcagaactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaa 11280652  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     | ||||| || || || |  || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  11280653 caaactacagaaaaggttaagttaataagagaacatatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttc 11280752  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| ||  ||||  |||| ||| |||| ||||| |||| ||| || || || | |||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  11280753 aagagggagatcatgtgttcttgagaatcacacctatgacaggtgtaggacatgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatca 11280852  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||| || || || ||||| || || |||||||| || |||||    
T  11280853 gatatctgagagagttggaacagtggcttatagggtgggtttaccccctcatctttcaaatttgca 11280918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 24313217 - 24313581
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  24313217 atggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 24313316  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  || || ||||||||||| |    
T  24313317 aaactactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcataggaaagatcttgagttcc 24313415  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  24313416 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 24313515  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  24313516 gatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 24313581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 25112784 - 25112420
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || | ||| |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||| |   | || ||      
T  25112784 atggcaccttttgaggctttatatggtcggagatgcagaattccgttatgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagcgatcgttcagc 25112685  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || || ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  25112684 aaactactgagaaagttcagat-gattcaagagaaaattaaagcgtcgcagagtcgacaaaagacttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttc 25112586  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| |||| || ||||| ||||||||||||||    
T  25112585 aggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagctgaccccgaagttcattggtccgtatca 25112486  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || ||||| || || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  25112485 gatattggaaagagtcggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 25112420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 366
Target Start/End: Original strand, 16963434 - 16963780
Alignment:
Q  20 ttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtca 119  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || || || ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||  ||||||| |||||||| |    
T  16963434 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttgatttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactacagagaaagtaa 16963533  T
Q  120 gattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttt 219  Q
       ||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || || || || || ||    
T  16963534 agatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccaagtgtt 16963633  T
Q  220 tctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggt 319  Q
    | |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || | ||||||     
T  16963634 tttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtaaaagaagttgactccgagatttattggtccatatcagatatcggaaatagttgga 16963733  T
Q  320 acagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||  |||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  16963734 acgatggcgtatcgtgttggattaccaccgcatctttcgaatttgca 16963780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 125 - 366
Target Start/End: Original strand, 11287770 - 11288011
Alignment:
Q  125 ataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 224  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||    
T  11287770 ataagagaacatatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttga 11287869  T
Q  225 gggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagt 324  Q
    | ||||| ||| |||||||||| || ||||| || || || | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  11287870 gagtcacccctatgacgggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagt 11287969  T
Q  325 ggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || || || ||||| || || |||||||| || |||||    
T  11287970 ggcttatagggtgggtttaccccctcatctttcaaatttgca 11288011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 365
Target Start/End: Original strand, 25609928 - 25610273
Alignment:
Q  20 ttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtca 119  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||  | ||||| ||||| || |    
T  25609928 ttgtatggtcggagatgcagaactccattgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggtta 25610027  T
Q  120 gattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttt 219  Q
       ||||   ||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || || ||  | ||    
T  25610028 agatgattcaagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacatgtt 25610127  T
Q  220 tctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggt 319  Q
    | |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |  ||||||||||||||| |||| || || ||||||||     
T  25610128 tttgagagtcacacctgtgaccggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgattccgagatttattggtccgtattagatatcggaaagagttgga 25610227  T
Q  320 acagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgc 365  Q
    || ||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  25610228 acggtggcgtatcgtgttggtttaccaccgcatctttcgaatttgc 25610273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 2874852 - 2875216
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || || || || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  2874852 atggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaaccccgttgtgctggtttgagtcgggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 2874951  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    | ||||||||||||||  |  ||||   ||| || ||||| || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  2874952 aaactactgagaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagattttgagtttca 2875051  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     || || || || |  ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  2875052 agaaggagaccacgagtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaataagttgaccccgaagttcattggtccgtatcag 2875151  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || |  || |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  2875152 atattggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 2875216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12505566 - 12505230
Alignment:
Q  23 tatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtcagat 122  Q
    ||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||||  | || || ||||| ||  | || ||| | ||||||||||| || |       
T  12505566 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagattggtcttaggacccgagattgttcatcatactactgagaatgttaaga 12505467  T
Q  123 tgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttct 222  Q
    ||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || || || ||| |    
T  12505466 tgattcaagagaatatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttt 12505367  T
Q  223 gagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtaca 322  Q
    ||| ||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| || | |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||     
T  12505366 gagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgccttgaattcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtaacagatatcggaaagagttggaacg 12505267  T
Q  323 gtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcga 359  Q
    ||||| ||  |||| || || ||||| ||||||||||    
T  12505266 gtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcga 12505230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 19453653 - 19453511
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  19453653 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccagatttggttcat 19453554  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaag 143  Q
     ||||||| |||||||| |   |||| ||||| ||||||||||    
T  19453553 cagactacagagaaagttaagatgatcagagagaagatgaaag 19453511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 134 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 19864787 - 19864561
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| | || |||||||    
T  19864787 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgcagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttttttagagtcactc 19864688  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacag 333  Q
    || |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || || ||| |||| || ||||| ||  |    
T  19864687 ctgtgactggtgttggatgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagatttggaacggtggcgtatcg 19864588  T
Q  334 agttggtttgccaccacatctttcgaa 360  Q
    ||| || || ||||| |||||||||||    
T  19864587 agtgggattaccaccgcatctttcgaa 19864561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 23078701 - 23078337
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || |  ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  | || ||      
T  23078701 atggcaccttttgaggctttatatggtcggagatgcataactccgttgtgttggtttgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaac 23078602  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    | |||||||||||||| |   ||||   ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||    
T  23078601 aaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcatcgcagactcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttca 23078502  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     ||||| ||||| || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||| || || |||||||| | |||||||||||| |  |||||| || ||||||||    
T  23078501 agagggagatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttgggcgcgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttatttgttcgtatcag 23078402  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || || || ||||||   || ||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  23078401 atatcggaaagagtttaaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 23078337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16098283 - 16098004
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| |||||||   |||| ||||||||  | || ||     
T  16098283 tatggctccgtttgaagctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagtgccttgttaggaccggaagttgtgcaa 16098184  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    ||||||||  | || || |   ||||   ||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  16098183 gagactacataaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtcttagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttc 16098084  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    |||  ||||||||||| ||| |||| || |  ||| |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16098083 aggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaaacctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 16098004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 360
Target Start/End: Original strand, 16927689 - 16928047
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  16927689 atggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 16927788  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||| | |||||| |   ||||   |||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  16927789 agactacagggaaagtaaagatgattcaagaaaagatgaaagcgccgcagagtcgaaaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttca 16927888  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  16927889 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgactagtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 16927988  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaa 360  Q
    || |  || |||||||| || ||||| ||  |  |||| || ||||| |||||||||||    
T  16927989 atattggaaagagttggaacggtggcgtatcgtcttggattaccaccgcatctttcgaa 16928047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 280
Target Start/End: Original strand, 15078413 - 15078691
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||| || || ||||||| ||||||||||| ||| || || || |||||||||||||| |||||||   |||| ||||||||  | || || |    
T  15078413 atggcaccgtttgaggctttgtatgatcggaggtgtaagacaccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagtgccttgttaggaccggaagttgtgcaag 15078512  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||| || || || |   ||||  |||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||| |||||||||   ||||||||| | ||||||||    
T  15078513 agactacggaaaaggttaagatgatccgagaaaagatgaaagcgtctcagagtagacataagagttatcatgataagaagagaaaggatatcgagtttca 15078612  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    ||  ||||||||||| ||| ||||  | | |||  |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15078613 ggttggtgatcatgtatttttgagactgaatccagtgactggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 15078691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 327
Target Start/End: Original strand, 18408124 - 18408317
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |  || || || ||| |||| || ||||    
T  18408124 aagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaatagttaccatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtatttttgagagtaactc 18408223  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggc 327  Q
     | |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||    
T  18408224 gtgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggc 18408317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 366
Target Start/End: Original strand, 22762636 - 22762868
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| || |  |||||||||||||| || || || || || ||| |||| |||||||    
T  22762636 aagatgaaagtttcggagagtcgacaatagagttacaatgataagcgtaggacagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttgtgagagtcactc 22762735  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacag 333  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || |  |||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||  |||| ||       
T  22762736 ctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgaccccgagatttattggtccgaatcagatatcggaaagagttggaacgatggcgtatca 22762835  T
Q  334 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  22762836 agtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 22762868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 16382421 - 16382700
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || |||| | |||| ||||||||  | || ||     
T  16382421 tatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaa 16382520  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    || ||||| || || || |   ||||    || |||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  16382521 gaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttc 16382620  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    | |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  16382621 aagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcct 16382700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25751024 - 25750901
Alignment:
Q  156 gacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgc 255  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  25751024 gacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactcctgtgacgggtgtaggacgtgc 25750925  T
Q  256 tttgaagtcgaggaagttgactcc 279  Q
     ||||| || | ||||| ||||||    
T  25750924 gttgaaatctaagaagtggactcc 25750901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 280
Target Start/End: Original strand, 18837957 - 18838235
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || |||| | |||| | ||||||  | || || |    
T  18837957 atggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtccggagagagtgctatgttagcaccggaagttgtgcaag 18838056  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||| || || || |   ||||   |||||||||||| || || ||||||  | |||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  18838057 agactacggaaaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaggcgtctcagagtacatagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 18838156  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
     |  ||||||||||| ||| || |||| | |||| |||| |||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||    
T  18838157 agttggtgatcatgtgtttttgtgggtgaatcctgtgaccggtgttggtcatgctttgaagtgtaggaagttgactcct 18838235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 280
Target Start/End: Original strand, 25743137 - 25743414
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||  | || || |    
T  25743137 atggctccgtttgaggctttgtatggtcggagctgtaggacaccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagtgctttgtagg-accggaagttgtgcaag 25743235  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||| || || || |   ||||   ||| ||||||| ||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  25743236 agactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgagagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 25743335  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
     |  |||||||| || ||| ||||||  | || | |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  25743336 agttggtgatcaagtgtttttgagggagaatcttgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 25743414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 222 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 17032574 - 17032430
Alignment:
Q  222 tgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtac 321  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||    
T  17032574 tgagagtcactcctatgactggtgtgggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgaccccgaagtttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaac 17032475  T
Q  322 agtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
     ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  17032474 ggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 17032430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 130 - 366
Target Start/End: Original strand, 18197724 - 18197960
Alignment:
Q  130 agaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtc 229  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | || || ||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||  |||    
T  18197724 agaaaagatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtcggaaagaccttaagtttcaagagggatatcatgtatttctgaaagtc 18197823  T
Q  230 actcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcat 329  Q
    |||| | ||||  |||| ||||| |  |||||||| | |||||||||||| | ||||||||||| |||| |||| || || ||| ||   |||||||| |    
T  18197824 actcttgtgacaagtgtaggacgcgaattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtctgtataagatatcggaaagaatttaaacagtggcgt 18197923  T
Q  330 acagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |  |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18197924 atcgagtgggtttgccaccgcatctttcgaatttgca 18197960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 150 - 366
Target Start/End: Original strand, 21833178 - 21833394
Alignment:
Q  150 agagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttgg 249  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||  | ||  | ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  21833178 agagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgaatttcaagaaggaaaccacatgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttgg 21833277  T
Q  250 acgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccacca 349  Q
    | ||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |  ||||| ||  |||| || || |||||     
T  21833278 aggtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttataggtccgtatcagatatcggaaagagttggaatggtggcgtatcgagtgggattaccaccg 21833377  T
Q  350 catctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||||| |||||    
T  21833378 catctttcgaatttgca 21833394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 280
Target Start/End: Original strand, 1648833 - 1649111
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || | || | | || ||||||||  | || || |    
T  1648833 atggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtccggagagaatgctttattaggaccggaagttgtgcaag 1648932  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    | ||||| || || || |   ||||    ||||||||||| || || |||||| |||||||||| || ||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  1648933 aaactacggaaaaggttaagatgattcaggaaaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 1649032  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
     |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| || ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  1649033 agttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtgggaagttgactcct 1649111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23996480 - 23996202
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || |||| | |||| ||||||||  | || || |    
T  23996480 atggcactgtttgaggccttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaag 23996381  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    | ||||| || || || |   ||||    || |||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | || |||||| ||||||||||    
T  23996380 aaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttca 23996281  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
     |  |||||||| || ||| | ||||| | |||| |||| || ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23996280 agttggtgatcacgtgtttttaagggtgaatcctatgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 23996202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 16233441 - 16233167
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| || || |||| | |||| |||| |||  | || || |    
T  16233441 atggcaccgtttgaggctttgtatggtcgaaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtccggagagagtgctttgttaggactggaagttgtgcaag 16233342  T
Q  102 agactactgagaaagtca-gattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    ||||||| || || || | ||||  | | |||||||||||| || || || ||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  16233341 agactacggaaaaggttaagattattca-agaaaagatgaaggcgtctcaaagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttc 16233243  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgac 276  Q
    | |  ||||||||||| ||| | ||||| | |||| |||| || ||||| ||||| |||||||  |||||||||||    
T  16233242 aagttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgcgttgaagtgtaggaagttgac 16233167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18571746 - 18571605
Alignment:
Q  139 gaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttg 238  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | || | ||    
T  18571746 gaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcatgtg 18571647  T
Q  239 acgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    || | |||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  18571646 accgatgttggtcgtgctttgaagtataggaagtagactcct 18571605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Original strand, 5297253 - 5297308
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggt 56  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5297253 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggt 5297308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 130 - 280
Target Start/End: Original strand, 21413115 - 21413265
Alignment:
Q  130 agaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtc 229  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||  || | ||     
T  21413115 agaaaagatgaaagcgtctcagagtagaccgaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatatgttcttgtgagtg 21413214  T
Q  230 actcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    | |||| | || |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  21413215 aatcctgtaactggtgttggtcgtgctttgaagtgtcggaagttgactcct 21413265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11291909 - 11291842
Alignment:
Q  137 atgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcagga 204  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  11291909 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgtagaaaagatcttgagtttcagga 11291842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25655583 - 25655492
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgag 225  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||    
T  25655583 aagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcataataagaggagaaaggacattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgag 25655492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22434101 - 22433927
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  22434101 atggcaccttttgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 22434002  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgata 176  Q
    |||||||||||||||| |   ||||   ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22434001 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgata 22433927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 315 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 1640718 - 1640667
Alignment:
Q  315 ttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1640718 ttgggacagtggcatatagagtggatttgccaccacatctttcgaatttgca 1640667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 18571865 - 18571811
Alignment:
Q  20 ttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtg 74  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||    
T  18571865 ttgtatggtaggaggtgtaggacactgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagtg 18571811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 18787809 - 18787756
Alignment:
Q  313 agttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  18787809 agttggaacagtggcatatagagtgggtttgccatcacatatttcgaatttgca 18787756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 16619 - 16984
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16619 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttaagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcat 16718  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16719 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagccgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttc 16818  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  16819 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgtcggtcgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatta 16918  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16919 gatttcagagagagttggaacagtggcatatagagttggtttgccacctcatctttcgaacttgca 16984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 26660 - 26296
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  26660 atggtaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgttggtttgagtcaggtgaaaatgttgtgttgggaccagatttggttcatg 26561  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  26560 agactactgagaaagttaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagtgaagaaaggctcttgagtttca 26461  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  26460 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcag 26361  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||||| || || |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26360 atttcagagagggtgggaacagtggcttatagagctggtttgccaccacatctttcgaacttgca 26296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 38793 - 39158
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  38793 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagcgttgtgttgggaccggatttggttcat 38892  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  38893 gagactactgagaaagtcaggttgataaggaaaaagatgaaagcttcgtagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgaagaaaggatcttgaatttc 38992  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  38993 aggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgtcggtcgtgccttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcatcggtccgtatca 39092  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39093 gatttcagagagagttggagcagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgca 39158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 249013 - 248648
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||| |||    
T  249013 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtaggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccgaacttggttcat 248914  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   || |||||||    
T  248913 gagactactaagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaagtccctagagtttc 248814  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  248813 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 248714  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  248713 gatttcagagaaagttggaaaagtggcttatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 248648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Original strand, 42239 - 42603
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  42239 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccgtatttggttcat 42338  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||||||||   |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||  ||||||||||    
T  42339 cagactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatggaagcgtcgcagagtcgactgaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttc 42438  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  42439 aggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggaagtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 42538  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgc 365  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42539 gatttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgc 42603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Original strand, 47305 - 47669
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  47305 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgaaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccgtatttggttcat 47404  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||||||||   |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||  ||||||||||    
T  47405 cagactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatggaagcgtcgcagagtcgactgaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttc 47504  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  47505 aggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggaaatgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 47604  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgc 365  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47605 gatttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgc 47669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 2309 - 2252
Alignment:
Q  242 ggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatc 299  Q
    |||||||||||||| ||||| || | |||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  2309 ggtgttggacgtgcattgaaatcaaagaagttgactctgaggtttattggtccgtatc 2252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 43183 - 42818
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  43183 tatggcaccgttcgaagcgttgtatggtcggaggtgtaggactcctctatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccggacttggttcat 43084  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||   || |||||||    
T  43083 gagactactaagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaatagttaccatgacaagcggagaaagtccctagagtttc 42984  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  42983 aggagggtgatcatgtttttcttagggtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 42884  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42883 gatttcagagaaggttggaacagtggcttatagagttggtttgccaccacatcttttgaacttgca 42818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 49113 - 49478
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  49113 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccagatttggttcat 49212  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||| || |||||||   |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||    
T  49213 gagactacagaaaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttc 49312  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  49313 aagagggtgatcatgtgtttctgagggtcattcctatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcatcggtccgtatca 49412  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49413 gatttcagagagggttggaactgtggcctatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 49478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 14157 - 14522
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  14157 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatcctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggtttat 14256  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||  |||| |||||   |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  |||||||||     
T  14257 cagactatagagatagtcaagatgatcaaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaggcccttgagtttt 14356  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14357 aggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 14456  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14457 gatttcagagagggttggaacagtggcatataaagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 14522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 257 - 366
Target Start/End: Original strand, 9039 - 9148
Alignment:
Q  257 ttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatcttt 356  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  9039 ttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatataaagttggtttgccaccacatcttt 9138  T
Q  357 cgaacttgca 366  Q
    ||||||||||    
T  9139 cgaacttgca 9148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 4859 - 5224
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4859 tatggcaccgttcgaatctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaagagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcat 4958  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||||||||   |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||  ||||||||||    
T  4959 tagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttc 5058  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5059 aggaggatgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 5158  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5159 gatatcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 5224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 13807 - 14172
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13807 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggagatgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcat 13906  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||    
T  13907 cagactactgagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttc 14006  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| ||| | || || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14007 aagagggggatcatgtgtttttaagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaaattgactccaaagttcattggtccgtatca 14106  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| ||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14107 gatatcagaaaggattggaacagtggcatatagagttgggttgccaccacatctttcgaacttgca 14172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 3)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 19520 - 19155
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  19520 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttattctggtttgagtcaggatagagtgttgtattgggaccggatttggttcat 19421  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||| ||||||||||   |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  19420 gagactacagagaaagtcaagatgatcagggaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggaccttgagtttc 19321  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||    
T  19320 aggatggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacatgcattgaagtcgaggaagttgactccaaaattcattggttcgtatca 19221  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19220 gatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgca 19155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 132 - 357
Target Start/End: Original strand, 58443 - 58668
Alignment:
Q  132 aaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcac 231  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| || || || ||||| ||| |||| | |||    
T  58443 aaaagatgaaagcgtcgcatagtagacaaaagagttatcatgataagcataggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagccac 58542  T
Q  232 tcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatac 331  Q
    || | |||| |||||||||| |||  |||| || | |||  ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || || || ||     
T  58543 tcatgtgaccggtgttggacatgcactgaaatcaaagaaactgactccgaggtttattggcccgtatcagatttcagaaagaattgggacggttgcgtat 58642  T
Q  332 agagttggtttgccaccacatctttc 357  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  58643 agagtgggtttaccaccgcatctttc 58668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 74140 - 74025
Alignment:
Q  161 aagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttga 260  Q
    ||||| || ||||||||| | || || ||| ||||||||||||  | ||||||||| |||||||| || | |||| | || |||||||||||||||||||    
T  74140 aagagctatcatgataagagcaggaaagatattgagtttcaggttgatgatcatgtgtttctgagagtgaatcctgtaaccggtgttggacgtgctttga 74041  T
Q  261 agtcgaggaagttgac 276  Q
    |||   ||||||||||    
T  74040 agtgttggaagttgac 74025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 498 - 133
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  498 tatggcaccgttcgaagctttgtacggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcat 399  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||    
T  398 cagactacagagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcatcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaagggcccttgagtttc 299  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  298 aagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtatgacgtgctttgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 199  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  198 gatatcagagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgca 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 21577 - 21942
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  21577 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagtgggtgttgtgttgggaccggacttggttcat 21676  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||    
T  21677 cagactactgagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttc 21776  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | |||||| | ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||| |    
T  21777 aagagggtaaccatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgattccgaagttcattggtccgtataa 21876  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21877 gatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 21942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26206 - 25991
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| || || ||||||| | |||| ||||||||  | || ||     
T  26206 tatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgaatccggagaaagtgctttgtttggaccggaagttgtgcaa 26107  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    || ||||| || || || |   ||||    || |||||||| || || || ||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  26106 gaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcatagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttc 26007  T
Q  201 aggagggtgatcatgt 216  Q
    | |  |||||||||||    
T  26006 aagttggtgatcatgt 25991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 47524 - 47159
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  47524 tatgacaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttagttcat 47425  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||    
T  47424 cagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgaaaagcgtaggaaggcccttgagtttc 47325  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47324 aagagggagatcatgtgtttctgagggttactcctataacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 47225  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47224 gatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgca 47159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 323104 - 322739
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  323104 tatggcaccgttcgaagctttgtatgatcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgaatcaggagagagtgttgtgttgggtccggatttggttcat 323005  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||||||||   |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||  ||||||||||    
T  323004 cagactacggagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttc 322905  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  322904 aggagggtgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccatatca 322805  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  322804 gatatcagagagggttggaacaatggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 322739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 117968 - 117603
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  117968 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaagactcctttatgttggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcat 117869  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     | ||||| ||||||||||   |||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||  ||||||||||    
T  117868 catactacggagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttc 117769  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  117768 aggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgagtgtgggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 117669  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  117668 gatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgca 117603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 386219 - 385854
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || |||    
T  386219 tatggcactgttctaagctttgtatggtcggaggtgcaggactccattgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcat 386120  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||| || |   |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||    
T  386119 tagactacggagaaggttaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtccacagaagagttaccatgacaagcgaagaaagacccttgagtttc 386020  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||| | |||||||| |||||||||  ||||||||| ||  |||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||| | || ||    
T  386019 aagagggagatcatctatttctgagagtcactcctacgacgggtgtaggttgtgcgttgaagtataagaagttgactccgaagtttataggttcatacca 385920  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  385919 gatatctgagagagttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgca 385854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 203375 - 203739
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| || | || ||      
T  203375 atggcaccattcaaagctttgtatggtcggaggtgcagaactctgttatgttggtttgagtcgggtgagagtgtagtgttgggaccgaatattgttcacc 203474  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    |||||||  | || || |   | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || || || ||||| |||||    
T  203475 agactacataaaaggttaagctaataagagaaaatatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagatttatcacgataagcgcaggaaagaccttgaatttca 203574  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     || || || ||||| ||||| || ||||||| | |||| |||| ||| |||||||||||| | | ||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  203575 agaaggagaccatgtgtttctaagagtcactcttgtgacaggtgctggccgtgctttgaagccaaagaagttgacgccgaggtttattggtccgtatcag 203674  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || ||  | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  203675 atatctaaaagagttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaacttgca 203739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 112401 - 112056
Alignment:
Q  21 tgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtcag 120  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||| | || ||  | |||| |||||| || |     
T  112401 tgtatggtcggaggtgcagaactccgttgtgttggttcgagtcaggagagagtgtagttttgggaccagatatcgttcaacaaactattgagaaggttaa 112302  T
Q  121 attgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgttttt 220  Q
     |||||   ||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||    
T  112301 gttgatccaagaaaagatgatagcatcacagagtcgacaaaagagatatcatgataagcgtaagaaggaccttgagtttcaggaaggagaccatgtattt 112202  T
Q  221 ctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggta 320  Q
     |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |    
T  112201 ttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactcccaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaa 112102  T
Q  321 cagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    | ||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  112101 cggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 112056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 20513 - 20157
Alignment:
Q  10 gttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactact 109  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  20513 gttcgaagctttgtatagtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcatgagactacg 20414  T
Q  110 gagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtg 209  Q
     | |||||||   |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  20413 aaaaaagtcaagatgattagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtg 20314  T
Q  210 atcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcaga 309  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20313 atcatgtgtttctgagggttactcttatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcaga 20214  T
Q  310 gagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| ||||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20213 gagtgttggaattgtggcctatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 20157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 43905 - 43540
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  43905 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtatgagtcaggagagagtgtggtgttgggaacggatttggttcat 43806  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||| || ||||| |   |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||||||||    
T  43805 gagactacagaaaaagttaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgatagaagagttgccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttc 43706  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  43705 aggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcctatgaccggggtaggacgtgcattgaattcgaggaagttgactccaaagttcatcggtccgtatca 43606  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43605 gatttcagagagggttggaactgtggcctatagagttggttttccaccacatctttcgaacttgca 43540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 44917 - 44552
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  44917 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtatgagtcaggagagagtgtggtgttgggaacggatttggttcat 44818  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||| || ||||| |   |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||||||||    
T  44817 gagactacagaaaaagttaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgatagaagagttgccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttc 44718  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  44717 aggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcctatgaccggggtaggacgtgcattgaattcgaggaagttgactccaaagttcatcggtccgtatca 44618  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44617 gatttcagagagggttggaactgtggcctatagagttggttttccaccacatctttcgaacttgca 44552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 237 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 36219 - 36090
Alignment:
Q  237 tgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagt 336  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| || |||||    
T  36219 tgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagtgttggaattgtggcctatagagt 36120  T
Q  337 tggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36119 tggtttgccaccacatctttcgaacttgca 36090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 4)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 305 - 670
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  305 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcatttatgctggtttgagtcaatagagagtgttgtgttgggaccggaattgattcat 404  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||||||||   |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||  ||||||||||    
T  405 cagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttgagtttc 504  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  505 aggagggtgatcatgtatttcttagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 604  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  605 gatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgca 670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 11288 - 10923
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  11288 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcatttatgctggtttgagtcaatagagagtgttgtgttgggaccggaattgattcat 11189  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||||||||   |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||  ||||||||||    
T  11188 cagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttgagtttc 11089  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11088 aggagggtgatcatgtatttcttagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 10989  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10988 gatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgca 10923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 280
Target Start/End: Original strand, 7849 - 7995
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    |||||||| || || |||||| |||||||||| || ||||||||| | || |||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| |||| || | ||    
T  7849 aagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatc 7948  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    || |||| || ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7949 ctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 7995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 63
Target Start/End: Original strand, 7717 - 7778
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtc 63  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  7717 atggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtc 7778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 9989 - 10354
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9989 tatggcaccattcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgggtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcat 10088  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||| ||||||||||   |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || || ||||||||||    
T  10089 gagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcatcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttc 10188  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  10189 aggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccatatca 10288  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || |||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  10289 gagttcagaaagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccacctcatctttcgaatttgca 10354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 17037 - 17402
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  17037 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcatttatgctggtttgagtcaatagagagtgttgtgttgggaccggaattgattcat 17136  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||||||||   |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||  ||||||||||    
T  17137 cagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttgagtttc 17236  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17237 aggagggtgatcatgtatttcttagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 17336  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17337 gatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgca 17402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 13267 - 13632
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  13267 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcatttatgctggtttgagtcaatagagagtgttgtgttgggaccggaattgattcat 13366  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||||||||   |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||  ||||||||||    
T  13367 cagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttgagtttc 13466  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13467 aggagggtgatcatgtatttctaagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 13566  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13567 gatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgca 13632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 20383 - 20018
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  20383 tatgacaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtcttgggaccggatttggttcat 20284  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||  |||||| |||   ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||||    
T  20283 cagactatagagaaactcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcccagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttc 20184  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20183 aagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcgttgaagtcgaagaagtttactccaaagttcattggtccgtatca 20084  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20083 gatatcagagaaggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgca 20018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 57723 - 58087
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  57723 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactccgttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcat 57822  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     |||| |||||||  ||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  57823 cagacgactgagagggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaa-agttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttc 57921  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    || ||||||||||||| ||| |||| || |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  57922 agaagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtctgtatca 58021  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||||||  |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58022 gatttcagagaggattggaacggtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 58087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 48939 - 49298
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||| |||    
T  48939 tatggcaccgtacgaagctttgtatggtcggaggtgcagaactcctttatgttggttcgagtcacgtgaaagtgtggtattgggactggatttggttcat 49038  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||    
T  49039 cagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgatagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttc 49138  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | |||||  ||||||| |||||||| || || ||| |||| ||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49139 aagagggaaatcatgtgtttctgagagtaacacctatgacaggtgtaggaagtgcgttgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtccgtatca 49238  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaa 360  Q
    ||| || ||||| ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  49239 gatatctgagagggttggaacagcggcatacaaagtgggtttgccaccacatctttcgaa 49298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 148970 - 148605
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  148970 tatggctccgttcgaacctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcat 148871  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||  |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||  ||| ||||      
T  148870 cagactatagagaaagtcaggatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacggaagagttaccatgacaaccgtagaaaggcccttaagttct 148771  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  148770 aagagggtgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 148671  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  148670 gatatgagagagggttggaacagtggcatacagagtaggtttgccaccacatctttcgaatttgca 148605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 195609 - 195973
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  195609 tatggcaccgttcgaagctttatatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggacttggttcat 195708  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||||||||   |||| | ||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||  ||||||||||    
T  195709 cagactacagagaaagtcaagatgatcatagagaagatgaaagcgtcgtagagacgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttc 195808  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  195809 aggagggtgatcatg-ttttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 195907  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  195908 gatatcagagaaggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgca 195973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 230 - 366
Target Start/End: Original strand, 68575 - 68711
Alignment:
Q  230 actcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcat 329  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  68575 actcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagtggcat 68674  T
Q  330 acagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  68675 acagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgca 68711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 130 - 360
Target Start/End: Original strand, 26568 - 26798
Alignment:
Q  130 agaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtc 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| || ||||| || ||| |||| ||     
T  26568 agaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagaccttgagttccaggaaggagatcacgtatttttgagagtt 26667  T
Q  230 actcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcat 329  Q
    |||||| |||| ||||||||||| || |||||||  | |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||  || ||||| |    
T  26668 actcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtgaaagaagttgactccgaggtttattggcccgtatcagatatcagaaaggattgaaacggtggcgt 26767  T
Q  330 acagagttggtttgccaccacatctttcgaa 360  Q
    |  |||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  26768 atcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaa 26798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 134 - 280
Target Start/End: Original strand, 121989 - 122135
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | ||    
T  121989 aagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtatttttgagggtgaatc 122088  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    || |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  122089 ctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 122135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 180323 - 180237
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccg 88  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||    
T  180323 atggcaccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtaggacaccattgtgttggtttgagtccggagaaagtgttttgttaggaccg 180237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 260708 - 260343
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  260708 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactctgttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtattgggaccggatttggttcat 260609  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     |||| |||||||| ||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  260608 cagacgactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttc 260509  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| || |||||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  260508 aggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttaaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatca 260409  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||||||  || | || |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  260408 gatttcagagaggattagaacggtggcatatagagtttgtttgccaccatatctttcgaacttgca 260343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 366
Target Start/End: Original strand, 164635 - 164980
Alignment:
Q  21 tgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtcag 120  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  | |||||||| ||  | || ||  | ||||||||||| || |     
T  164635 tgtatggtcgaaggtgcagaactccgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtatttttgggaccagaaatcgttcaacaaactactgagaaggttaa 164734  T
Q  121 attgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgttttt 220  Q
      ||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| || |||    
T  164735 gatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagatcacgtattt 164834  T
Q  221 ctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggta 320  Q
     |||| ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |    
T  164835 ttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgacttcgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaa 164934  T
Q  321 cagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    | ||||| ||  |||| ||||  ||||| ||||||||||| |||||    
T  164935 cggtggcgtatcgagtgggttcaccaccgcatctttcgaatttgca 164980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 137 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 308923 - 308694
Alignment:
Q  137 atgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctt 236  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| |||||||||     
T  308923 atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactccta 308824  T
Q  237 tgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagt 336  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||| || || ||||||||||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||| ||| ||||    
T  308823 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttaaccccaaagtttattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagt 308724  T
Q  337 tggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
     ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  308723 gggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 308694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 366
Target Start/End: Original strand, 278865 - 279101
Alignment:
Q  130 agaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtc 229  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| |||    
T  278865 agaaaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtc 278964  T
Q  230 actcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcat 329  Q
    |||||| |||| ||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| || || |||||||| || ||||| |    
T  278965 actcctgtgactggtgtgggacaagctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttataggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgt 279064  T
Q  330 acagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |  |||| || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  279065 atcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgca 279101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 27919 - 27554
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  27919 tatggcaccgttcgaagttttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagaaagtgttgtgttgggaccagattcggttcat 27820  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||||||||   |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||  ||||||||||    
T  27819 cagactacagagaaagtcaagatgatcaaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttc 27720  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  27719 aggagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacaggtgtaggacgtgcatcgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtataa 27620  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  27619 gatatcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatcttttgaatttgca 27554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 1055 - 1413
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| ||||| || |||    
T  1055 tatggaaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctctatgttggtttgagtcaagagaaaatgtggtgttgggaccagatttagttcat 1154  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     |||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||    
T  1155 cagactacgaagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttc 1254  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||  ||| |||| |||||||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  1255 aagagggagatcatgtgtttctgagaatcattcctatgacgggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaag-ttattggtccgtatca 1353  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaa 360  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||  |||||||||||||||    
T  1354 gatatctgagagggttggaacagtggcataaaaagtaggtttgaaaccacatctttcgaa 1413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 52085 - 52450
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||| | |||||||| |||    
T  52085 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagggtggtgttgggatcagatttggttcat 52184  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||| ||||||||||   |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||    
T  52185 gagactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttc 52284  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  52285 aggagggcgatcatgtatttctgagggttactcctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatca 52384  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| ||  | || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  52385 gatatctaaaagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaaattgca 52450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 61119 - 61484
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||| | |||||||| |||    
T  61119 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagggtggtgttgggatcagatttggttcat 61218  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||| ||||||||||   |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||    
T  61219 gagactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttc 61318  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  61319 aggagggcgatcatgtatttctgagggttactcctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatca 61418  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| ||  | || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  61419 gatatctaaaagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgca 61484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 67507 - 67872
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||| | |||||||| |||    
T  67507 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagggtggtgttgggatcagatttggttcat 67606  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||| ||||||||||   |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||    
T  67607 gagactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttc 67706  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  67707 aggagggcgatcatgtatttctgagggttactcctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatca 67806  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| ||  | || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  67807 gatatctaaaagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgca 67872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 3151 - 2786
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3151 tatggcaccgttcaaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcat 3052  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     |||| || ||||||||||   ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||    
T  3051 cagacaacagagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagtgtcgcagagtcgacagaagggttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttc 2952  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | |||||  ||||||| ||| |||| || |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  2951 aagagggatatcatgtatttatgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctgagaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 2852  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2851 gatatcagagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgca 2786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 5150 - 4785
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  5150 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcagaggtgcagaactcctttataatggtttgagtcaggagaaagtgtggtgttgggaccagatttggttcat 5051  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||    
T  5050 cagactactgagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttc 4951  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  4950 aagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaaattgactccaaagttcattggtccgtataa 4851  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  4850 gatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcaaatttgca 4785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 7144 - 7507
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7144 tatggcgccgttcgaagctttatatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgtgtcaggagagggtgttgtgttgggaccggatttggttcat 7243  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     || |||| ||||||||||   |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||  ||| ||||||    
T  7244 cagtctacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacataagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttaagtttc 7343  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  7344 aggagggtgatcatgtatttctgagggttacttctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 7443  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7444 gatttcaga-ag-gttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatatttcgaacttgca 7507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 12687 - 13052
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||    
T  12687 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcttttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtattaggaccagatttggttcat 12786  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     |||| |||||||| ||||   ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  12787 cagacgactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgatagaaaagttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttc 12886  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| || |||||  |||||||||| | |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |    
T  12887 aggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggtgtagaacgtgctttgaaatcaaggaagttaactccgaagttcattggtccgtatta 12986  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12987 gatttcagagaggattggaacggtggcatacagagttggcttgccaccacatctttcgaacttgca 13052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 25771 - 26136
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  25771 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaagaatcctttatgctggtttgagttaggagagagtgttgtgctgggaccggatttggtccat 25870  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||| || |   ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||    
T  25871 cagactacggagaaggtaaagatgataagggaaaagatgaaagcgtctcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttc 25970  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  25971 aagagggggatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggatgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 26070  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26071 gatatcaaaaagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcaaacttgca 26136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 131 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16946 - 16711
Alignment:
Q  131 gaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtca 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16946 gaaaagatgaaagcttcgcagagtcggcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtca 16847  T
Q  231 ctcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  16846 ctcctttgacgggtgttggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaatagtggcata 16747  T
Q  331 cagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16746 tagtgttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 16711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 6584 - 6218
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6584 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgcttgtttgagttgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcat 6485  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||||||||||||||   |||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || || ||||||||||    
T  6484 gagactactgagaaagtcaagatgatcatagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttc 6385  T
Q  201 aggagggtgatcatgttttt-ctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatc 299  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  6384 aggaaggtgaccatgtttttcctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttatc 6285  T
Q  300 agatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||| ||| |||| || |||||||| ||| ||||||||||| | | ||||||||| |||||    
T  6284 agatttcagaaagatttggaactgtggcatatagatttggtttgccatctcttctttcgaatttgca 6218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 27625 - 27261
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||    
T  27625 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggttcgagtcaggagaaaatgttgtgttgggaccagatttggttcat 27526  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||  ||||| ||||    
T  27525 cagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgccgtagagtcgacagaagagttaccatgacgagcgtaggaagg-ccttgaatttc 27427  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | |||||  ||||||| |||||||| || |||||| || ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27426 aagagggatatcatgtatttctgagagttactcctatgtcgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 27327  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  27326 gatatcagagagggttggaaccgtggcatacagagtgggattgccaccacatctttcgaatttgca 27261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 6)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 90838 - 91203
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| || |||    
T  90838 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagaactcctttatgttggtttgagtcaggagaaagtgtagcgttgggaccagatttagttcat 90937  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||    
T  90938 cagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttc 91037  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| || ||||||  ||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||| | ||||||||| |||| ||| |    
T  91038 aagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctacgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgacttcaaagtttattagtccatatta 91137  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  91138 gatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtaggtttgccaccacatctttcgaatttgca 91203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 138 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 162376 - 162148
Alignment:
Q  138 tgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccttt 237  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||| || |  || || || ||| |||| ||||||||| |    
T  162376 tgaaagcgtcgcagagtcaacaaaagagttatcatgataagcgtaaaaaagatcttgtgtttcaagaagtagaccacgtatttttgagagtcactcctat 162277  T
Q  238 gacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagtt 337  Q
    ||| ||||||||||| || | |||||| | ||| |||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| ||||     
T  162276 gactggtgttggacgagcgtcgaagtcaaagaacttgactccgagatttattggcccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagtg 162177  T
Q  338 ggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  162176 ggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 162148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 130 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 448330 - 448094
Alignment:
Q  130 agaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtc 229  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||| || || ||||| || ||| | || |||    
T  448330 agaaaagatgaaagtgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagatcacgtattttttagagtc 448231  T
Q  230 actcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcat 329  Q
    |||||| | ||   ||||||||| || |||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||| || || || ||| |||| || |||||      
T  448230 actcctgtaactattgttggacgagcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcaaatatcggaaagaattggaacggtggcgc 448131  T
Q  330 acagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |   ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  448130 atcaagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 448094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 280
Target Start/End: Original strand, 78668 - 78814
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    |||||||| || || |||| | ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| |||| || | ||    
T  78668 aagatgaaggcatctcagattagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatc 78767  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
     | |||| || ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  78768 atgtgacaggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 78814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 237 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 175427 - 175361
Alignment:
Q  237 tgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagat 303  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  175427 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgatcccgaagtttattggtccgtatcagat 175361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 114580 - 114545
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtg 36  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  114580 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtg 114545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 1431 - 1795
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  1431 atggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaagactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtattgggaccggatttggttcatc 1530  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||  ||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || ||||  |||||||||||    
T  1531 agactagagagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagtgtaggaaggcccttgagtttca 1630  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
    || ||  |||||||| |||| ||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  1631 ggtggaagatcatgtatttcggagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattagtccgtatcag 1730  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  1731 atatcagaaagggttggaacagtggcatatagagttggtttcccaccacatctttcgaatttgca 1795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 134 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 6290 - 6058
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||| |    
T  6290 aagatgaaagcatcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcacac 6191  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacag 333  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||  |    
T  6190 ctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccaagatttattggcccgtatcagatatcggaaagagttgggacggtggcgtatcg 6091  T
Q  334 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  6090 agtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 6058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23075 - 22815
Alignment:
Q  20 ttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtca 119  Q
    ||||||||| |||||||| |||| || || || |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||  | || || |||||||| || || || |    
T  23075 ttgtatggtaggaggtgttggacaccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggtta 22976  T
Q  120 gattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttt 219  Q
       ||||    || |||||||| |  || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  22975 agatgattcaggagaagatgaaggagtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtt 22876  T
Q  220 tctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    | |||| || | || | |||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22875 tttgagagtgaatcatgtgaccggtgttggttgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 22815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 11169 - 10843
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  11169 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagttaggagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcat 11070  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||| ||||||||||   |||| |||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||    
T  11069 gagactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaatgcgtcttagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttc 10970  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| || ||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  10969 aggagggtgatcatgtgtttcttagggttacttctatgacatgtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcatcggtccgtatca 10870  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggc 327  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||    
T  10869 gatttcagagaggattggaacagtggc 10843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 18443 - 18808
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| || |||    
T  18443 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaaaactcctttatgttgatttgagtcaggagaaagtgtagagttgggaccagatttagttcat 18542  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||    
T  18543 cagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttc 18642  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  18643 aagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagtttattggtttgtatca 18742  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  18743 gatatcagagagggttagaacagtggcatacagagtgggttttccaccacatcttttgaatttgca 18808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 26542 - 26177
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||  |||||||||| || |||| ||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  26542 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaagactcctttgtgtcggtttgagtcgggagaaaatgtagtgttgggagcggatttggttcat 26443  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||  ||||||||||    
T  26442 cagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatcaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccattacaagcgtagaaaggcccttgagtttc 26343  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  26342 aagagggagatcatgtgtttttgagagtcactcctatgacgggtgtaggccgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccgtacca 26243  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  26242 gatatctgagagagttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatcttttgaatttgca 26177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 26924 - 26862
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtc 63  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||  ||||||||||    
T  26924 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaagactcctttgtgtcggtttgagtc 26862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 51769 - 52134
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  51769 tatgacaccgttcgaagctttgtatagtcggaggtgcatgactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccggatttggttcat 51868  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     | ||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||    
T  51869 caaactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcttcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttc 51968  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  51969 aagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtgtaggacatgcattgaagtctaagaagttgactccaaagtttagtggtccatatca 52068  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52069 gatatctgaaagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgca 52134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 31810 - 31445
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  31810 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcatgactcctttatgctggtttgagttaggagaaagcgttgtgttgggatcggatttggttcat 31711  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     | |||||  |||||||||   |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||    
T  31710 caaactacatagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaatagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttc 31611  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | |||||  ||||||| |||||||| || ||| || |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31610 aagagggatatcatgtgtttctgagagttacttctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 31511  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || || ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31510 gatatctgataggtttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgca 31445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 134 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 14306 - 14080
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||| || || || ||  | ||| |||  |||||||    
T  14306 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggagagatcttgagtttcaagaaggagaccacatgtttttgatagtcactc 14207  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacag 333  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |  |||||||||| |||| |||| || || |||||||| || ||||| ||  |    
T  14206 ctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagtagttgactccgagatttattggtctgtatgagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcg 14107  T
Q  334 agttggtttgccaccacatctttcgaa 360  Q
    |||  | || ||||| |||||||||||    
T  14106 agtgagattaccaccgcatctttcgaa 14080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 4275 - 3910
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || |||    
T  4275 tatggcaccgttcgaagcttcgtatggtcggaggtgcaggactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcat 4176  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| || || |  ||||||||||    
T  4175 cagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcggagaatcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaagtccttgagtttc 4076  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  4075 aagagggagatcatgtgtttctgatagtcactcctatgacaggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatca 3976  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3975 gatatctgagagtgttggaacagtggcttacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgca 3910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 10193 - 9833
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||||||||| ||||| || |||    
T  10193 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagaactcctttatgttggtttgagacgggagaaagtgtggtgttgggaccagatttagttcat 10094  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |     | ||||||||    
T  10093 cagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagga-----cgtgagtttc 9999  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| || |||||| || ||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  9998 aagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatggcgggtgtaggacgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccttatca 9899  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  9898 gatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatcttttgaatttgca 9833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 5613 - 5309
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5613 tatggcaccgttcaaagctttgtatggtcggaagtgcaggactccgttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcat 5514  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     |||| |||||||| ||||   |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||    
T  5513 cagacgactgagaaggtcaagatgataaggaaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttc 5414  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| || |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5413 aggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatca 5314  T
Q  301 gattt 305  Q
    |||||    
T  5313 gattt 5309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 30 - 366
Target Start/End: Original strand, 1104 - 1440
Alignment:
Q  30 ggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtcagattgataag 129  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||   | |||||    
T  1104 ggaggtgcaggactcctttgtgttggttcgagtcaggagaaagtgttatgttgggaccggatttggttcattagactacggagaaggtcaagataataag 1203  T
Q  130 agaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtc 229  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||     
T  1204 agaaaagatgaaagcgtctcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtt 1303  T
Q  230 actcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcat 329  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  1304 actcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtggcat 1403  T
Q  330 acagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    | | | | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1404 aaaaaataggtttgccaccacatctttcgaaattgca 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 40118 - 39774
Alignment:
Q  21 tgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtca- 119  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||     
T  40118 tgtatggtcggaggtgcag-actcctttatgttggtttgagtcgggagaaagtgtggtattgggaccggatttggttcatcagactaacgagaaagtcaa 40020  T
Q  120 gattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttt 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  40019 gatt-ataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttactatgacaagcgtagaaaggaccttgagtttcaggagggagatcatgtatt 39921  T
Q  220 tctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggt 319  Q
    |||||| || |||||| |||||||||| ||||| ||  | ||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| || ||||| |||||     
T  39920 tctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgcgcactcaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatccgatatctgagagggttgga 39821  T
Q  320 acagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  39820 acagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctctcgaatttgca 39774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 95908 - 96273
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  95908 tatggcaccattcgaagctttatatggtcggaggtgtagaactcctctatgttggtttgagtcgggagaaagtgttgtgttggggccggacttggttcat 96007  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||| |||||||| ||  |||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || || ||||| ||||    
T  96008 gagactacggagaaagttagggtgatcagggagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttc 96107  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  96108 aggaaggtgaccatgtttttttgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccttatca 96207  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  96208 gatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagaattggtttgccacctcatctttcgaatttgca 96273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 112959 - 112594
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || || ||||||||  |||||||||| ||  | || ||     
T  112959 tatggcaccgtttgaagcattgtatggtcgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgaatcgggggaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaa 112860  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     | |||||  | || || |  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  112859 caaactacataaaaggtaaacttgataagagaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggatcttgagtttc 112760  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| || || || | |||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  112759 aagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatca 112660  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||| || || || ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  112659 gatatctgagagagttggaacagtggcttatagggtgggtttaccccctcatctttcgaatttgca 112594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Original strand, 109720 - 110082
Alignment:
Q  4 ggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgag 103  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||  |     
T  109720 ggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaa 109819  T
Q  104 actactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcag 202  Q
    |||||||||||||| ||||| |||   ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  109820 actactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcag 109918  T
Q  203 gagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcaga 302  Q
    || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||| |||||||    
T  109919 gaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcaga 110018  T
Q  303 tttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    | |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  110019 tattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 110082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Original strand, 5820 - 6184
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || | |    
T  5820 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagaactccattgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcgt 5919  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     | ||||| || || ||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||    
T  5920 caaactacagaaaaggtcaagttgataagagaaaagatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttc 6019  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| | |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  6020 aagagggagctcatgtgtttctgagggttactcctatgacgggtgtaggtcgtgcattgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccatacca 6119  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgc 365  Q
    ||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6120 gatatctgagagagttggaactgtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgc 6184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 4281 - 3926
Alignment:
Q  11 ttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactg 110  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||  |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||  || ||||||| |    
T  4281 ttcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactcctatatattggtttgagtcaagagaaagtgtagtgttgggaccggatttagtttatcagactacgg 4182  T
Q  111 agaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtga 210  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| || || ||    
T  4181 agaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacataagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagatggaga 4082  T
Q  211 tcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagag 310  Q
    |||||| |||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||    
T  4081 tcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagttcattggtctgtatcagatatctgag 3982  T
Q  311 agagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  3981 agggttggaacagtggcatacatagttgttttgcctccacatctttcgaatttgca 3926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 37598 - 37237
Alignment:
Q  5 gcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgaga 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  37598 gcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggacccctttgtgttggtttgagtcaggagaaactgttgtgttgggaccggatttggttcatcaga 37499  T
Q  105 ctactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcagga 204  Q
    |||| |||||||| |   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||   |||||||||| |     
T  37498 ctacggagaaagttaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggccattgagtttcaagg 37399  T
Q  205 gggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatt 304  Q
    | | |||||||| ||||| || ||||| ||| |||| ||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||     
T  37398 gagagatcatgtgtttcttagagtcacccctatgacaggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtctatatcagata 37299  T
Q  305 tcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  37298 tctgaaagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccacctcatctttcaaatttgca 37237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 25 - 324
Target Start/End: Original strand, 38103 - 38403
Alignment:
Q  25 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggttt-gagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtcagatt 123  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| ||||||||||   |    
T  38103 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggttttgagtcaggagaaagtgttgtgttgggaccggatttgaatcatcagactacggagaaagtcaagat 38202  T
Q  124 gataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctg 223  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  38203 gattagagaaaagatggaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccaagacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctg 38302  T
Q  224 agggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacag 323  Q
    || || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||  || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  38303 agagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcaaaaattaattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacag 38402  T
Q  324 t 324  Q
    |    
T  38403 t 38403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 128 - 324
Target Start/End: Original strand, 27370 - 27566
Alignment:
Q  128 agagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgaggg 227  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |    
T  27370 agagaaaagatggaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccacgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagag 27469  T
Q  228 tcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagt 324  Q
    | |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||  || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  27470 ttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcaaaaattaattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagt 27566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 360
Target Start/End: Original strand, 4912 - 5267
Alignment:
Q  5 gcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgaga 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||| ||||||| |||  |||| || ||| |||    
T  4912 gcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttgtgttggtttgagtggggagaaagtgtggtgttggaaccatatttagttcatcaga 5011  T
Q  105 ctactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcagga 204  Q
    | || ||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| ||    
T  5012 ccacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaaga 5111  T
Q  205 gggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatt 304  Q
    ||| |||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||| ||  |||  |||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||     
T  5112 gggagatcatgtgtttctgagaatcactcctatgacgggtgtaggttgtgtgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggttcgtatcagata 5211  T
Q  305 tcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaa 360  Q
    ||  |||| ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  5212 tctaagagggttggaacactggcatacatagtgggtttgccaccacatctttcgaa 5267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 366
Target Start/End: Original strand, 6948 - 7307
Alignment:
Q  7 accgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagact 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  || || |||||||||||    |||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | |||    
T  6948 accgttcgaagcattgtatggtcggaggtgcagaactcaattgtgttggtttgagtcgacagaaagtgtggtgttgggaccagatttagttcatcaaact 7047  T
Q  107 actgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagg 206  Q
    || || || ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||| ||| ||||    
T  7048 acagaaaaggtcaagttgataagagaaaatatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaagcccttgagtgtcaagagg 7147  T
Q  207 gtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttc 306  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||    
T  7148 gagatcatgtgtttctgagggttactcctatgacaggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagttcattggtccataccagatatc 7247  T
Q  307 agagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7248 tgagagagttggaacagtggcttacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgca 7307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 79 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14407 - 14121
Alignment:
Q  79 gttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataag 178  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14407 gttgggaccggatttggttcatcagactacggagaatgtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaag 14308  T
Q  179 cgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactc 278  Q
    |  |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  14307 catagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtgtaggtcgtgcgttgaagtcgaagaagttgactc 14208  T
Q  279 ctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    | |||||||| ||| ||||  |||| || || || ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14207 cgaagtttatcggttcgtactagatatctgaaag-gttggaacagtggcatacaaagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgca 14121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 10646 - 11010
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||| | || ||     
T  10646 tatggcaccgttcgaagctttgtgtggtcggaggtgcagaactccgttacgttggtttgagtcgggtgaaagtgtaatgttgggaccagatatagttcaa 10745  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||| | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| |    
T  10746 cagactacagagaaggcca-attgataagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagtgtagaaaggatcttgagttac 10844  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || ||||| ||| |||| ||||||||| |||| ||| | || ||||| ||||| |||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||    
T  10845 aagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgacaggtataggtcgtgccttgaaatcgaagaagttgacaccgaggtttattggtccatatca 10944  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || |||| |||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  10945 gatatctgagaaagttggaacagtggcatatagagtggatttgccaccacatctttcgaatttgca 11010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 262 - 7
Alignment:
Q  9 cgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactac 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  262 cgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactccattatgttggtttgagtcaggagaaagtgtagtgttgggaccggatttggttcatcagactac 163  T
Q  109 tgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggt 208  Q
     ||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| |||||     
T  162 ggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcatagagtcggcagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagaggga 63  T
Q  209 gatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtc 264  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  62 gatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtc 7  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 928 - 563
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||| ||  | || ||     
T  928 tatggctcctttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcag 829  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| || || || |  ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||| || | ||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  828 cagactacagaaaaggttaagttgataagaaaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagctatcgtgacaagcgtaggaaggaccttgagtttc 729  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| ||  |||| || |||||| |||| ||||| ||  |||| || || || | |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  728 aagagggagatcatgtgttcttgagagttactcctatgacaggtgtaggcagtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttatcggtccgtatca 629  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  628 aatttcagagagggttggaacagtggcttacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgca 563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 2194 - 1910
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | | |    
T  2194 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgttggttcgagtcaggagaaagtgtggtgttgggaccagatttgattctt 2095  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||  ||||   |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || ||||  ||||||||||    
T  2094 cagactacggagagggtcaagatgataagagaaaaggtgaaagcgacgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcataggaaggcccttgagtttc 1995  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtt 285  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||    
T  1994 aagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagtt 1910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 1140 - 1385
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  1140 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggttcgagacgggagaaagtgttgtgttggggccggatttggttcat 1239  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||| ||||||||||   |||| || || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| || || || ||||||||||    
T  1240 gagactacggagaaagtcaagatgattagggagaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttc 1339  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgt 246  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1340 aggaaggtgaccatgtttttctgagggttactcctatgacgggtgt 1385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 123 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 469 - 226
Alignment:
Q  123 tgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttct 222  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  469 tgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttcaggagggtgaccatgtttttct 370  T
Q  223 gagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtaca 322  Q
    |||||| |||||| |||||||| | |||||||| ||||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  369 gagggttactcctatgacgggtataggacgtgcgttgaagttgaagaacttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagaaagagttggaact 270  T
Q  323 gtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  269 gtggcatatagagttggtttgcctcctcatctttcgaatttgca 226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 3261 - 3488
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  3261 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaacggatttggttcat 3360  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| |||||||| |   |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || || ||||  |||  |||||    
T  3361 cagactacagagaaagttaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcgtgataaacgtaggaaggcccttttgtttc 3460  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3461 aggagggtgatcatgtatttctgagggt 3488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 366
Target Start/End: Original strand, 3487 - 3539
Alignment:
Q  314 gttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3487 gttggaacagtggcatatagagttggtttgccacctcatctttcgaacttgca 3539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 366
Target Start/End: Original strand, 24982 - 25342
Alignment:
Q  6 caccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagac 105  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||  ||||    
T  24982 caccattcgaagctttgcatggtcggaggtgcagaactccgttctgttggtttgagtcgggtgaaagtgtagtgttgggaccggatattgttcaccagac 25081  T
Q  106 tactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggag 205  Q
    ||| || || || |   | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || || || || || || |||||||| ||||| |      
T  25082 tacagaaaaggttaagctaataagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagacttatcacgacaaacgtaggaaagatcttgaatttcaagca 25181  T
Q  206 ggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagattt 305  Q
    || || ||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |  | |||||||||  |||||||||| |    
T  25182 ggagaccatgtgtttctaagagtcactcctgtgacaggtgttggtcgtgctttgaaatcgaagaagttgacgctgaggtttattggctcgtatcagatat 25281  T
Q  306 cagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    | || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25282 cggaaagagttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgca 25342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 280
Target Start/End: Original strand, 16211 - 16356
Alignment:
Q  135 agatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcc 234  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | || |||||| | || ||||| |  || |||||||| ||| | ||||| | |||    
T  16211 agatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatatagactttcaagttggggatcatgtgtttttaagggtgaatcc 16310  T
Q  235 tttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    | |||| |||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16311 tgtgaccggtgtttgtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 16356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 5358 - 5545
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  5358 tatggcaccgttcgaagctttggatggtcggaggtgtaggactcctttctgatggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcat 5457  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaagg 188  Q
    |||||||  ||||||||||   |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5458 gagactatagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaagg 5545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 28674 - 29040
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  ||||  | ||||||||  ||||| ||||  |||||||||||  || | || |||    
T  28674 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagaactctgttatctttgtttgagttgggtgacagtgcagtgttgggaccatatatagttcat 28773  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaa-aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagttt 199  Q
     ||||||  || || |||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  28774 cagactatagaaaaggtcaaattgataagaggagaagatgaaagcatcgcaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgagttt 28873  T
Q  200 caggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatc 299  Q
    || || || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| |||||  | |||||||||||||| | ||||||||||||   |||||||||||| ||||    
T  28874 caagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgacaggtgtctgtcgtgctttgaagtcaaagaagttgactccacggtttattggtccatatc 28973  T
Q  300 agatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||| ||||| |||||    
T  28974 agatctctgagagagttgggacagtggcatatagagtgggttacccatcacatctctcgaatttgca 29040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 40665 - 41031
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  ||||  | ||||||||  ||||| ||||  |||||||||||  || | || |||    
T  40665 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagaactctgttatctttgtttgagttgggtgacagtgcagtgttgggaccatatatagttcat 40764  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaa-aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagttt 199  Q
     ||||||  || || |||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  40765 cagactatagaaaaggtcaaattgataagaggagaagatgaaagcatcgcaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgagttt 40864  T
Q  200 caggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatc 299  Q
    || || || || ||||| ||| |||| ||||||| | |||| |||||  | |||||||||||||| | ||||||||||||   |||||||||||| ||||    
T  40865 caagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgacaggtgtctgtcgtgctttgaagtcaaagaagttgactccacggtttattggtccatatc 40964  T
Q  300 agatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||| ||||| |||||    
T  40965 agatctctgagagagttgggacagtggcatatagagtgggttacccatcacatctctcgaatttgca 41031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 180595 - 180258
Alignment:
Q  23 tatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtcagat 122  Q
    ||||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||| | || ||  |||||| ||||||||| |       
T  180595 tatggtcggagatgcagaactccattgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagatattgttcagcagactattgagaaagttaaga 180496  T
Q  123 tgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttct 222  Q
    ||||   ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  180495 tgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgtgttttt 180396  T
Q  223 gagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtaca 322  Q
    ||| || |||||  |||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| | |||    
T  180395 gagagttactccggtgactggtgttggacctgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagatatcagaaagagttagaaca 180296  T
Q  323 gtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaa 360  Q
    ||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||||||    
T  180295 gtggcgtatcgagttggcttaccaccgcatctttcgaa 180258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 289 - 78
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  289 tatggcaccgttcgaagctttatatggtcggaggtgcaggaatcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccagatttggttcat 190  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| ||||||||||   |||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||     
T  189 cagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcatcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttt 90  T
Q  201 aggagggtgatc 212  Q
    ||||| ||||||    
T  89 aggagtgtgatc 78  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 280
Target Start/End: Original strand, 949 - 1095
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    |||||||| || || |||||| |||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | ||    
T  949 aagatgaaggcgtctcagagtagacataagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatc 1048  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    || |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  1049 ctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 1095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 137 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 28231 - 28002
Alignment:
Q  137 atgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctt 236  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| || |||||      
T  28231 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaggatcttgaatttcaagagggtgatcatgtgtttttgagagttactccgg 28132  T
Q  237 tgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagt 336  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||  |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||  ||||    
T  28131 tgactggtgttggacgtgctgtgaagtcaaagaagttgaatcctagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtatcgagt 28032  T
Q  337 tggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  28031 tggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 28002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 33583 - 33948
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||||||  |||||||||| ||  | || ||     
T  33583 tatggcaccgtttgaagccttgtatggtcgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaa 33682  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     | ||||| || || || |  || |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  33683 caaactacggaaaaggttaagttaataagagaacggatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttc 33782  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| || || || | |||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  33783 aagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatca 33882  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || |||||||| || |||||||| || || || |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  33883 gatatctgagagagtcgggacagtggcttatagggtgggtttgccccctcatctttcgaatttgca 33948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 40658 - 40379
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| || || ||||||| | |||| || |||||  | || ||     
T  40658 tatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgaatccggagaaagtgctttgtttgggccggaagttgtgcaa 40559  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    || ||||| || || || |   ||||    || |||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  40558 gaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttc 40459  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    | |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  40458 aagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcct 40379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 7776 - 7412
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||    || ||      
T  7776 atggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttcgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccggagactgttcaac 7677  T
Q  102 agactactgagaaag-tcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||    
T  7676 agactactgagaaagttcaga-tgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataaacgtagaaaagatcttgagtttc 7578  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  7577 aggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 7478  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  ||||||||||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  7477 gatattggagagagttggaacggtggcttagcgagtgggtttaccacctcatctttcgaatttgca 7412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 109; Significance: 9e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 14986 - 15350
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || |||||  |||||||||||||||| || ||| | || || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||| | || ||      
T  14986 atggcaccatttgaagctctgtatggtcggaggtgcagaacttcgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccagatatcgttcaac 15085  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    | ||||||||||| || |  |||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||    
T  15086 aaactactgagaaggttaagttgatccaagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttca 15185  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
    ||| || |||||||| | | |||| ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||  | ||| ||||||| |||||||    
T  15186 ggaaggagatcatgtatctttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactctaaggttaattggtctgtatcag 15285  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || ||||| ||| |||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  15286 atatcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 15350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 109; Significance: 9e-55; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 43553 - 43189
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||| || || |||| |||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  43553 atggcacctttcgaggctttatatgttcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 43454  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    | |||||||||||||| |   ||||   ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  43453 aaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaaagtcgacaaaagagttaccatgataagtgcagaaaagatcttgagtttca 43354  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
    ||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  43353 ggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtagggcgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcag 43254  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || |  || |||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  43253 atattggaaagagttggaacggtggcatactgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 43189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 50420 - 50785
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||||||  |||||||||| ||  | || ||     
T  50420 tatggcaccgtttgaagccttgtatggtcgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgagtcgggggaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaa 50519  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     | ||||| || || || |  || |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||| | ||||| || ||||| ||||||||||    
T  50520 caaactacggaaaaggttaagttaataagagaacggatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctgtcataacaagcgtaggaaggaccttgagtttc 50619  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| || || || | |||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  50620 aagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatca 50719  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || |||||||| || |||||||| || || || |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  50720 gatatctgagagagtcgggacagtggcttatagggtgggtttgccccctcatctttcgaatttgca 50785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 8884 - 8520
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||| ||||||||| || || || ||||||||  | || ||      
T  8884 atggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttcgagttaggtgaaagagtggtcttaggaccggagattgttcagc 8785  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||     
T  8784 agactactgagaaagttcagat-gattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataaacgtagaaaagatcttgagtttt 8686  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  8685 aggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 8586  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| |  || |||||||| |  ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  8585 gatattggaaagagttggaagggtggcttaccgagtgggtttaccacctcatctttcgaatttgca 8520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 106479 - 106758
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||| || || || |||||||| ||  | ||||||| | |||| ||||||||  | || ||     
T  106479 tatggctccgtttgaggctttgtatggttggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgaatccagagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaa 106578  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    || ||||| || || || ||  ||||    || ||||||||||| || |||||| |||| |||| ||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  106579 gaaactacggaaaaggttaggatgattcaggagaagatgaaagcatctcagagtagacataagatttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttc 106678  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    | |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| |||||||| | |||||| ||||  |||||||||||||||    
T  106679 aagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcctgctttaaagtgtaggaagttgactcct 106758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13930 - 13832
Alignment:
Q  137 atgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcct 235  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||| |||| || || || || ||| |||| |||||||||    
T  13930 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataaacgtagaaaagatcttgagttttaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcct 13832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 15346 - 15258
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccgga 90  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||    
T  15346 atggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttcgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccgga 15258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 176 - 366
Target Start/End: Original strand, 4220 - 4410
Alignment:
Q  176 aagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttga 275  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||| | || || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  4220 aagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggggatcatgtgtttttaagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttga 4319  T
Q  276 ctcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4320 ctccaaagttcatcggtccgtatcagatttcaaagagggttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 4410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14759 - 14395
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||| ||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  14759 atggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgtagaactccgttgtgttggtttgagtcaagtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 14660  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    |||||||||||||||| |   ||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14659 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttca 14560  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
    ||| ||  | || || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  14559 ggaaggataccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 14460  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || || || |||||||| || ||||| ||  | || || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  14459 atatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgggtgggattaccaccgcatctttcgaatttgca 14395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 1019 - 655
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  1019 atggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 920  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||| | ||||||| ||||| |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  919 agactagtaagaaagttcagat-gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcaccataagcgtagaaaagatcttgagtttc 821  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  820 aagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatca 721  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
     || |  || |||||||| || ||||| |||  ||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  720 aatattggaaagagttggaacggtggcttaccaagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 65804 - 65440
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  65804 atggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 65705  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    |||||||||||||||| |   ||||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  65704 agactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttca 65605  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  65604 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggcgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 65505  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || ||||| |||||||| || ||||| ||  |||| || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  65504 atatcagaaagagttggaacggtggcttatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgca 65440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 230 - 366
Target Start/End: Original strand, 39924 - 40060
Alignment:
Q  230 actcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcat 329  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||| |  || |||||||| || ||||| |    
T  39924 actcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaatttgactccgagatttattggtccgtatcggatatgggaaagagttggaacggtggcgt 40023  T
Q  330 acagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |  ||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  40024 attgagttggattaccaccgcatctttcgaacttgca 40060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 180
Target Start/End: Original strand, 39858 - 39904
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcg 180  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39858 aagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgataagcg 39904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 134 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 269 - 46
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||| |||| ||    
T  269 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaccgtagaaaggatcttgagtttcaagagggttatcatgtgtttttgagagtcaatc 170  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacag 333  Q
    |  |||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| | |||||||||  |    
T  169 cggtgactggtgttggacgtgctttgaagtaaaaaaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaatagtggcatatcg 70  T
Q  334 agttggtttgccaccacatctttc 357  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||    
T  69 agttggtttaccaccgcatctttc 46  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 25626 - 25990
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| || |||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||| | || ||      
T  25626 atggcaccattcgaagctttgtatggtcagaagtgtagaactccgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccagatatcgttcagc 25725  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    | ||||||||||| || |  || ||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || |||||  ||||||||||    
T  25726 aaactactgagaaggttaagttaatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagaattatcatgataagcgtaggaaggactttgagtttca 25825  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
    ||| ||  | ||||| ||| | || ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| |||||  | ||||  | |||||||||||||||||||    
T  25826 ggaaggaaaccatgtattttttagagtcactcctatgactggggttggacgtgcattgaagtcaaggaaactaactcggatgtttattggtccgtatcag 25925  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || ||||| ||| |||| || ||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  25926 atatcagaaagaattggaaccgtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 25990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 19249 - 18884
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||| ||  |  | || ||     
T  19249 tatggcaccgtttgaagcattgtatggtcgaagatgcagaactcctttgtgttggttcgagtcgggagaaagtgtgatgttggggccatacatagttcaa 19150  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| || ||  | |  ||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |  ||||| ||||||||||    
T  19149 cagactacagaaaagattaagttgataaaagaacagatgaaagcgtcgcagagtcaacagaagagctatcatgacaagcgtatgaaggaccttgagtttc 19050  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| || ||||| ||  |||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| || || || | |||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  19049 aagagggagaccatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtgtaggtcgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatca 18950  T
Q  301 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18949 gatatctgagagagttgggacagtggcgtatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgca 18884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 23411 - 23094
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||| ||  |  | || ||     
T  23411 tatggcaccgtttgaagcattgtatggtcgaagatgcagaactcctttgtgttggttcgagtcgggagaaagtgtgatgttggggccatacatagttcaa 23312  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
     ||||||| || ||  | |  ||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |  ||||| ||||||||||    
T  23311 cagactacagaaaagattaagttgataaaagaacagatgaaagcgtcgcagagtcaacagaagagctatcatgacaagcgtatgaaggaccttgagtttc 23212  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | ||||| || ||||| ||  |||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| || || || | |||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  23211 aagagggagaccatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtgtaggtcgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatca 23112  T
Q  301 gatttcagagagagttgg 318  Q
    ||| || |||||||||||    
T  23111 gatatctgagagagttgg 23094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 1075 - 711
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || ||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  | || ||      
T  1075 atggcaccttttgaggctttgtatgttcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgatagtgtggttttaggaccagagattgttcaac 976  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    | |||||||||||||| |   ||||   ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  975 aaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcaacaaaagagttatcatgataagcatagaaaagatcttgagtttca 876  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  875 agaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 776  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || || || || ||||| |  ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  775 atatcggaaagggttggaatggtggcgtatcgtgttggcttaccaccgcatctttcgaatttgca 711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 229424 - 229084
Alignment:
Q  20 ttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtca 119  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||  | || ||  | ||||||||||| || |    
T  229424 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagtgtggttttaggaccagagattgttcaacaaactactgagaaggtta 229325  T
Q  120 gattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttt 219  Q
       ||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  229324 agatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataaacgtagaaaagaccttgaatttcaagaaggagatcatgtatt 229225  T
Q  220 tctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggt 319  Q
    | |||| ||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| || || ||||||||     
T  229224 tttgagagtcactcctattactggtgtgggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttgttggtccgtatcagatatcggaaagagttgga 229125  T
Q  320 acagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaa 360  Q
    || ||||| ||| || | || || ||||| |||||||||||    
T  229124 acggtggcgtaccgaatagggttaccaccgcatctttcgaa 229084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 327
Target Start/End: Original strand, 219456 - 219649
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| || |  ||||| || ||| |||| |||||||    
T  219456 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaagaagatcacgtatttttgagagtcactc 219555  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggc 327  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| || |||||    
T  219556 ctgtgactggtgttggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaacggtggc 219649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 131 - 280
Target Start/End: Original strand, 33031 - 33180
Alignment:
Q  131 gaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtca 230  Q
    ||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| |    
T  33031 gaaaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtga 33130  T
Q  231 ctcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
      ||| |||| |||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||    
T  33131 aacctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaagaagttgactcct 33180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 193 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 1385 - 1212
Alignment:
Q  193 tgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggt 292  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  1385 tgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacaggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggt 1286  T
Q  293 ccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    | ||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1285 ctgtatcagatatcttagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgca 1212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 130 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 9241 - 9053
Alignment:
Q  130 agaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtc 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || |||||||| ||| |||| |||    
T  9241 agaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggggatcatgtatttttgagagtc 9142  T
Q  230 actcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttgg 318  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||    
T  9141 actcctgtgaccggtgttggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtctgtatcagatatcagaaagaattgg 9053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 279
Target Start/End: Original strand, 372 - 517
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    ||||||||||| || |||||| | ||||||||||| ||||||||| | || |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  |||| || | ||    
T  372 aagatgaaagcatctcagagtaggcagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgttcttgagagtgaatc 471  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcc 279  Q
    || | ||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  472 ctgtaactagtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 260 - 349
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccgga 90  Q
    ||||||||| || || || |||| |||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  260 tatggcaccatttgaggctttgtgtggtcgaaggtgtaggacgcggttatgttggtttgattcaggtgaaagtgctttgttaggaccgga 349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 242 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 136278 - 136154
Alignment:
Q  242 ggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtt 341  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  136278 ggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtt 136179  T
Q  342 tgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  136178 ttccaccacatctttcgaacttgca 136154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 136310 - 136269
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggac 42  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  136310 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggac 136269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22248 - 21941
Alignment:
Q  20 ttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtca 119  Q
    |||||||||||||| || ||  |||| || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||  |||||| ||||||||| |    
T  22248 ttgtatggtcggagatgcagatctccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactattgagaaagtta 22149  T
Q  120 gattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttt 219  Q
     | ||||   ||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| || || || || || ||    
T  22148 aaatgattcaagagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgcaggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtt 22049  T
Q  220 tctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggt 319  Q
    | |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || || ||||||||     
T  22048 tttgagagtcactcctgcgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttgga 21949  T
Q  320 acagtggc 327  Q
    || |||||    
T  21948 acggtggc 21941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 1307 - 949
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| || ||||  || || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| | || ||      
T  1307 atggcaccattcgaagctttgtatggttggaggtgcagaactctgttgtgttggtttgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccagatatcgttcagc 1208  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    | |||||||||||  | |  | |||   ||||||||| ||||| ||||||| | |||| |||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||    
T  1207 aaactactgagaagattaagtggatccaagaaaagattaaagcgtcgcagatttgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttca 1108  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
    ||| || || ||||| ||| | || ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |  | ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||    
T  1107 ggaaggagaccatgtattttttagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaaatgaaagaaattgaatccgaggtttattggtccatatcag 1008  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaa 360  Q
    || ||||| ||| |||| |||||||||||  || | ||||| ||||| |||||||||||    
T  1007 atatcagaaagaattggaacagtggcatatcgattgggtttaccaccgcatctttcgaa 949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 6413 - 6049
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||| || || ||||  || || |||||||| ||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  6413 atggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactctgttgtgttggtttgaatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgtgcagc 6314  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    | |||||||||||||| |   ||||   ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  6313 aaactactgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcataataagcgcaggcaggatcttgagtttca 6214  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     ||||| || || || ||| | || ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  6213 agagggagaccacgtgtttttaagagtcactcctgtgactggtgtttgacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 6114  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || | ||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| || ||||| || |||||||| |||||    
T  6113 atattagaaagagttggaatggtggcgtatcgagttggattaccaccgcagctttcgaatttgca 6049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 4312 - 4676
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  4312 atggcaccttttgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccattgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaac 4411  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||| |||||||| |   ||||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  4412 agactaccgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttca 4511  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     || || || || || ||  |||  ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| |  ||||||||||||||||||    
T  4512 agaaggagaccacgtgttattgaaagtcactcttgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttaactccgagatttattggtccgtatcag 4611  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || ||  | |||||||| |||||||| ||  |||| || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  4612 atatcgaaaagagttggaacagtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgca 4676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 8995 - 8631
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  8995 atggcaccttttgaagctttgtatggtcggagatgcagaactccattgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaac 8896  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||| |||||||| |   ||||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  8895 agactaccgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttca 8796  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     || || || || || ||  |||  ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| |  ||||||||||||||||||    
T  8795 agaaggagaccacgtgttattgaaagtcactcttgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttaactccgagatttattggtccgtatcag 8696  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || ||  | |||||||| |||||||| ||  |||| || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  8695 atatcgaaaagagttggaacagtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgca 8631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 33480 - 33844
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||| |||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  33480 atggcaccttttgaagctttgtatggttggagatgcagaactccattgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaac 33579  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||| |||||||| |   ||||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  33580 agactaccgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttca 33679  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
    ||| || || || || ||  |||  ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  33680 ggaaggagaccacgtgttattgaaagtcactcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 33779  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || ||  | |||||||| |||||||| ||  |||| || || | ||| ||||||||||| |||||    
T  33780 atatcgaaaagagttggaacagtggcgtatcgagtgggattactaccgcatctttcgaatttgca 33844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 280
Target Start/End: Original strand, 44583 - 44631
Alignment:
Q  232 tcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  44583 tcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 44631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 7338 - 6972
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  7338 atggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgtagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 7239  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | ||||||||||| || ||||| |||   ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||  |||| |||||||||||||    
T  7238 aaactactgagaaggttcagat-gatctaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtggaaaagatcttgagtttc 7140  T
Q  201 aggagggtgatcatgt-ttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatc 299  Q
    | || || || || || |||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  7139 aagaaggagaccacgtgttttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatc 7040  T
Q  300 agatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccaca-tctttcgaacttgca 366  Q
    |||| |  || |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || || ||||||||| |||||    
T  7039 agatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcattctttcgaatttgca 6972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 104 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 15789 - 15528
Alignment:
Q  104 actactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcagg 203  Q
    |||||||||||||| | | ||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||  | || |||||||| |    
T  15789 actactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaatacctcgagtttcaag 15690  T
Q  204 agggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagat 303  Q
    | || || || || ||| |||  |||| || | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  15689 aaggagaccacgtatttttgacagtcattcttgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattggttcgtatcagat 15590  T
Q  304 ttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
     || || |||||||| || ||||||||  |||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  15589 atcggaaagagttggaacggtggcatatcgagtaggtttaccaccacat-tttcgaatttgca 15528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15952 - 15876
Alignment:
Q  104 actactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcg 180  Q
    |||||||||||||| | | ||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15952 actactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcg 15876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 132 - 366
Target Start/End: Original strand, 16502 - 16736
Alignment:
Q  132 aaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcac 231  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||| |||||    
T  16502 aaaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagagggagatcacgtatttttgagagtcac 16601  T
Q  232 tcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatac 331  Q
    |||| |||| |||||||||||  | |||||||| | |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||| || ||||| ||     
T  16602 tcctgtgactggtgttggacgcacattgaagtcaaagaagttgactcagaggtttactggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacggtggcgtat 16701  T
Q  332 agagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
     |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  16702 cgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 16736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 809 - 449
Alignment:
Q  6 caccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagac 105  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |  || || ||||| ||  | || ||  | ||    
T  809 caccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagcggtcttaggaccagagattgttcagcaaac 710  T
Q  106 tactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcagga 204  Q
    |||||||||||| ||||| |||   ||| || | ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  709 tactgagaaagttcagat-gatccaagagaaaacgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgaatttcagga 611  T
Q  205 gggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatt 304  Q
     || || || || ||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || || || |||||||||||||||||     
T  610 aggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaaattcattggtccgtatcagata 511  T
Q  305 tcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |  || |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  510 ttggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgca 449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 8189 - 7864
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || |||||||||||| | || || ||||| || || |||||||||||| ||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  8189 atggcaccttttgaggctttgtatggtcggtgatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaagtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 8090  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||||||||| || |   ||||   ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  8089 agactactgagaaggttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttca 7990  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
    ||| || || || || ||| |||| |||||| |  |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  7989 ggaaggagaccacgtgtttttgagagtcacttcggtgaccggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcag 7890  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggc 327  Q
    || || || |||||||| || |||||    
T  7889 atatcggaaagagttggaacggtggc 7864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 135 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 6638 - 6470
Alignment:
Q  135 agatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcc 234  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||| |||| |||||||     
T  6638 agatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataaacgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactca 6539  T
Q  235 tttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagat 303  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  6538 tgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 6470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 3191 - 3151
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtagga 41  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  3191 tatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagga 3151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 4303 - 4067
Alignment:
Q  130 agaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtc 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || || || ||||||||| | || || |||||||| ||| |||| |||    
T  4303 agaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttactatgataagcgtaggaaagaccttgagttttaagaaggagatcatgtatttttgagagtc 4204  T
Q  230 actcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcat 329  Q
    |||||| |||| ||||||||||| || |||||||| | |||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||  |||| || ||||| |    
T  4203 actcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccatatcagatatcagaaaggattggaacggtggcgt 4104  T
Q  330 acagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |   ||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  4103 atcaagtgggtttactaccgcatctttcgaatttgca 4067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 3411 - 3175
Alignment:
Q  130 agaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtc 229  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||| ||||||| || || |||||||| ||| |||| |||    
T  3411 agaaaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttaagtttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtc 3312  T
Q  230 actcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcat 329  Q
    |||||| |||| ||||||||||| || |||||||| | |||||||||| | | |||||||||| |||||||||| |  || ||| |||| || ||||| |    
T  3311 actcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttgacttcgaggtttattggttcgtatcagatatttgaaagaattggaacggtggcgt 3212  T
Q  330 acagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |  |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  3211 atcgagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgca 3175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 15148 - 14912
Alignment:
Q  130 agaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtc 229  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||||||||  || || || ||||||||||| || || |||||||| ||| |||  |||    
T  15148 agaaaagatgaaagcgtctcagagtcgacatatgagttatcatgataagcttaggaaagaccttgagtttcatgaaggagatcatgtatttttgatagtc 15049  T
Q  230 actcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcat 329  Q
    |||||| |||| ||||||||||| || |||||||| |  ||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||| |    
T  15048 actcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaataagttgactccgaggtttattggtccgtatcaaatatcagaaagaattggaacggtggcgt 14949  T
Q  330 acagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || |||| || || ||||| |||||||||||||||||    
T  14948 accgagtgggcttaccaccgcatctttcgaacttgca 14912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 6243 - 6361
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  6243 tatggcatcgttcgaagctttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcagaagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcat 6342  T
Q  101 gagactactgagaaagtca 119  Q
    |||||||| || |||||||    
T  6343 gagactacagaaaaagtca 6361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 360
Target Start/End: Original strand, 127106 - 127464
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||| |||||||||| ||||| || || ||||| ||  | || ||      
T  127106 atggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttaagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaac 127205  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    | ||||||||||| || |   ||||   ||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||| ||    
T  127206 aaactactgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgttccagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagttcca 127305  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     || || ||||| || ||| |||| ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  ||||||| ||||||||||    
T  127306 agaaggagatcacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgatccgtatcag 127405  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaa 360  Q
    || ||||| |||||||| |  ||||| ||  |||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  127406 atatcagaaagagttggaatggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaa 127464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 17367 - 17022
Alignment:
Q  21 tgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtcag 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| | ||| || |||||||| ||  |  | ||  | ||||||| ||| || |     
T  17367 tgtatggtcggaggtgtagaactccgttgtgttggttcgagtcaggtgagattgtagttttgggaccagaaatcattcaacaaactactgtgaaggttaa 17268  T
Q  121 attgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgttttt 220  Q
      ||||   ||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| || || ||||| || |||    
T  17267 gatgattcaagaaaagatgaaagtgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagatcacgtattt 17168  T
Q  221 ctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggta 320  Q
     |||| ||||||| | |||   ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |    
T  17167 ttgagagtcactcatgtgatttgtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaa 17068  T
Q  321 cagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    | ||||| ||   ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  17067 cggtggcgtatcaagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 17022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 1406 - 1174
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| | || || |||||||||||||| || || || || || ||| | || |||||||    
T  1406 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaaaagttaccatgataagtgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtattttttagagtcactc 1307  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacag 333  Q
    || |||| |||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| |    
T  1306 ctgtgactggtgttcgacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgttccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccg 1207  T
Q  334 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  1206 agtggatttaccaccgcatctttcgaatttgca 1174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 1520 - 1468
Alignment:
Q  20 ttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaag 72  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||    
T  1520 ttgtatggtcggagatgtagaactccgttgtgttggtttgagtcgggtgaaag 1468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 122 - 366
Target Start/End: Original strand, 5618 - 5861
Alignment:
Q  122 ttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttc 221  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| || || || ||||| |||     
T  5618 ttgattagagagaagatgaaagcgtcgcagagtagacaaaagagttatcatgataagcgca-aaaggatcttgagtttcaagaaggagaccatgtatttt 5716  T
Q  222 tgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtac 321  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||  | ||||||| |||  || |||| | ||||| |||| ||||||| |||||| | |||||||| ||    
T  5717 tgagagtcactcctgtgaccggtgttggacgagcactaaagtcgaagaaactgtctccgaggtttaatggttcgtatcatatttcataaagagttgggac 5816  T
Q  322 agtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| || || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5817 agttgcgtatagagtgagtttaccaccacatctttcgaatttgca 5861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 9610 - 9378
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    |||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| || || || || || ||  |||| |||||||    
T  9610 aagatgaaggcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagaccacgtattgttgagagtcactc 9511  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacag 333  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||| ||||||||| || || |||||||| || ||||| ||| |    
T  9510 ctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaaggtgactcctagatttattggtctgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccg 9411  T
Q  334 agttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  9410 agtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 9378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 309
Target Start/End: Original strand, 12884 - 13191
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||| | ||||  || |||||||| ||  |  | ||      
T  12884 atggcaccattcgaagctctgtatggtcggaggtgtaggactccattgtgttggttcgagtcaggttagagtgcagttttgggaccagaaattcttcagc 12983  T
Q  102 agactactgagaaagtc-agattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | ||||||||||||||  |||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||    
T  12984 aaactactgagaaagtttagat-gatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgaatttc 13082  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    | || || || ||||| ||  |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||| | |  |||||| || |||||||    
T  13083 aagaaggagaccatgtgttattgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtctaagaaattgacttcgagatttattagttcgtatca 13182  T
Q  301 gatttcaga 309  Q
    ||| |||||    
T  13183 gatatcaga 13191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 130 - 366
Target Start/End: Original strand, 32787 - 33023
Alignment:
Q  130 agaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtc 229  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| | || || ||||| || ||| |||| |||    
T  32787 agaaaagatgaaagcatcgtagggtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttttaagaaggagatcacgtatttttgagagtc 32886  T
Q  230 actcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcat 329  Q
    |||| | |||| |||||||||| ||| |||||||  | |||||||||| | |  |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||| |    
T  32887 actcttgtgactggtgttggacttgcattgaagttaaagaagttgacttcgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgt 32986  T
Q  330 acagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  32987 accgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 33023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 300
Target Start/End: Original strand, 687 - 985
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||      
T  687 atggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccattgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagc 786  T
Q  102 agactactgagaaagt-cagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||   ||| || |||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  787 aaactactgagaaagttcagat-gattcaagagaaaatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttta 885  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 300  Q
    |||| || || || || ||| | || ||||||||| |||| ||||| ||||||||  ||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  886 aggaaggagaccacgtattttttagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcactgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 130 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 5492 - 5256
Alignment:
Q  130 agaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtc 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||| || || || |||||||||||| | || || || ||  | ||| |||| |||    
T  5492 agaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatggtaaacgcaggaaagatcttgagtttaaagaaggagaccacatatttttgagagtc 5393  T
Q  230 actcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcat 329  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |    
T  5392 actcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaggaagtcgactccgagatttattggtctgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgt 5293  T
Q  330 acagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |  |||| || || ||||  ||||||||||| |||||    
T  5292 atcgagtgggattaccactgcatctttcgaatttgca 5256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 366
Target Start/End: Original strand, 116831 - 117176
Alignment:
Q  21 tgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtcag 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||  |  | || ||  | ||||||||||| || |     
T  116831 tgtatggtcggaggtgtaggactctgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccataaatcgttcagcaaactactgagaaggttaa 116930  T
Q  121 attgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgttttt 220  Q
     |||||   ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||  | || || || |||    
T  116931 gttgatccaagaaaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaacgtaggaaagaccttgagtttcaagaaagagaacaagtattt 117030  T
Q  221 ctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggta 320  Q
     |||| ||||||| | |||   ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||  |    
T  117031 ttgagagtcactcatgtgaatagtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcaaatatcagaaagaattgtaa 117130  T
Q  321 cagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    | ||||| ||  |||| ||||| |||||  || ||||||| |||||    
T  117131 cggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgtatatttcgaatttgca 117176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 98396 - 98136
Alignment:
Q  20 ttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || |||||| |||| ||||| ||  | || || || ||||| || || || |    
T  98396 ttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtccggagagagtgttttgttaggaccagaagttgtgcaagaaactacggaaaaggtta 98297  T
Q  120 gattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttt 219  Q
       ||||    || |||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | || |||||| |||||||||| |  |||||||| || ||    
T  98296 agatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagtaaggatattgagtttcaagttggtgatcacgtgtt 98197  T
Q  220 tctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    | | ||||| | |||| |||| || ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  98196 tttaagggtgaatcctatgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 98136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 182 - 296
Target Start/End: Original strand, 23553 - 23667
Alignment:
Q  182 agaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactccta 281  Q
    ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||      
T  23553 agaaaggatattgagtttcatgttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcccc 23652  T
Q  282 agtttattggtccgt 296  Q
    | |||||||| ||||    
T  23653 attttattggaccgt 23667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 130 - 366
Target Start/End: Original strand, 295 - 531
Alignment:
Q  130 agaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtc 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||| || || ||  |||||||||| || || || ||||| ||| |||| |||    
T  295 agaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaacaactaccatgataagcgtaggaaagacattgagtttcaagaaggggaccatgtgtttttgagagtc 394  T
Q  230 actcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcat 329  Q
    | |||| | || |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| |  ||||| |    
T  395 aatcctgtaaccggtgttggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaaggattggaatggtggcgt 494  T
Q  330 acagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |  |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  495 atcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 146 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 1260 - 1040
Alignment:
Q  146 tcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtg 245  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||  | || || |||||||| ||  |||| ||||| ||| |||| ||||    
T  1260 tcgcagagtcggcaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgagttcaaagaaggagatcatgtattcttgagagtcacccctgtgactggtg 1161  T
Q  246 ttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgcc 345  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| || || |||||||| ||  |||| ||| |||| ||||| ||    
T  1160 ttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcggatatcggaaagagttggaacgttggcgtaccgagtgggtttacc 1061  T
Q  346 accacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||| ||||||||||| |||||    
T  1060 accgcatctttcgaatttgca 1040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 218 - 366
Target Start/End: Original strand, 13376 - 13524
Alignment:
Q  218 tttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttg 317  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||| |||| ||| |||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||| || ||||| ||||    
T  13376 tttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacatgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttaattggtaagtatcagatatctgagagggttg 13475  T
Q  318 gtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13476 gaacagtgacatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgca 13524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 366
Target Start/End: Original strand, 63938 - 64302
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| || || ||||| || || |||||||||| ||| ||||| || || || ||||| ||| | || ||      
T  63938 atggcaccttttgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagttaggagaaagagtggtcttaggaccagatattgttcagc 64037  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    |||||||||||||| | |   ||||   ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||    
T  64038 agactactgagaaaattaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagaattatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttcca 64137  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     || || || || || ||| |||| ||||||||| || | || |||||||||||||||||||| | ||||||||||   |  || |||||||||||||||    
T  64138 agaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtggctggagttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactgtgagattcattggtccgtatcag 64237  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || ||||| |||||||| || ||||| ||  |||| || || ||||| ||||||| ||| |||||    
T  64238 atatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgca 64302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 139 - 366
Target Start/End: Original strand, 26 - 253
Alignment:
Q  139 gaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttg 238  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || || || ||||||||||| || || |||||||| ||| | || ||||||| | ||    
T  26 gaaagcgtcgcagagtcgacaaaagaattatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagatcatgtattttttagagtcactcatgtg 125  T
Q  239 acgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttg 338  Q
    || |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||  |  |||||||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||  ||||      
T  126 actggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactctgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagtgttggaacggtggcgtatcgagtga 225  T
Q  339 gtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  226 gtttaccaccgcatctttcgaatttgca 253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 280
Target Start/End: Original strand, 293 - 571
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||  | ||  | |    
T  293 atggcaccatttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtccggtgaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgaaag 392  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||| || || || |   ||||    || |||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  393 agactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 492  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
     |  |||| |||||| ||| ||||||| | |||| |||| |||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  493 agttggtgctcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggccgtgctttggagtgtaggaagttgactcct 571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 10622 - 10476
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | ||    
T  10622 aagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatc 10523  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  10522 ctttgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagtcgactcct 10476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 6008 - 5862
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | ||    
T  6008 aagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtatcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatc 5909  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    || |||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  5908 ctatgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagtcgactcct 5862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 366
Target Start/End: Original strand, 619 - 964
Alignment:
Q  20 ttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtca 119  Q
    |||||||||||||| || |  ||||| || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||  | || ||  | ||||| |||||||| |    
T  619 ttgtatggtcggagatgcaaaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacaaactaccgagaaagtta 718  T
Q  120 gattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttt 219  Q
       ||||   ||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||| ||||||| || || || || || ||    
T  719 agatgattcaagagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttaagtttcaagaaggagaccacgtgtt 818  T
Q  220 tctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggt 319  Q
    | |||| ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||     
T  819 t-tgagagtccctcgtgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttgga 917  T
Q  320 acagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || ||||| ||  | || || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  918 acggtggcgtatcgtgtgggattaccaccgcatctttcgaatttgca 964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 49874 - 49528
Alignment:
Q  20 ttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtca 119  Q
    |||||||||| ||| || || ||||| || || ||||||||||||||| |||| ||||| || ||||  ||  | || ||  | |||||||||||||| |    
T  49874 ttgtatggtcagagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggttaaagggttgttttaggactcgagattgttcaacaaactactgagaaagtta 49775  T
Q  120 gattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttt 219  Q
       ||||   |||||||| |||||| ||||||||| | || |||| ||| ||||||||||| || || || ||||||||||| || || || ||  | ||    
T  49774 agatgattcaagaaaagaggaaagcgtcgcagagttggcaaaagatttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagaccacatatt 49675  T
Q  220 tctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggt 319  Q
    | | || ||||||||| |||  | ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| || || ||||||||     
T  49674 ttttagagtcactcctgtgattgttgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattggcccgtatcagatatcggaaagagttgga 49575  T
Q  320 acagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    || ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  49574 acggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 49528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 303
Target Start/End: Original strand, 862 - 1030
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    |||||| |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || || || |||||| |||| |||||||    
T  862 aagatggaagcgtcacagagtcgacaaaagagttatcatgaaaagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgttttt-tgagagtcactc 960  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagat 303  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  961 ctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagat 1030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 130 - 318
Target Start/End: Original strand, 16451 - 16639
Alignment:
Q  130 agaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtc 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||   ||||| || || |||||||| ||| | ||||||    
T  16451 agaaaagatgaaagcgtcgcagactcgacaaaagagttatcatgataagcgtagggaggatcttatatttcaagaaggagatcatgtattttttagggtc 16550  T
Q  230 actcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttgg 318  Q
    |||||  |||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |  ||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  16551 actccagtgattggtgttggacgtgcattgaagtcgaagaagttgacaccgagatttattggtccgtataagatatcagaaagaattgg 16639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14923 - 14644
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||   | || || | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  | || ||     
T  14923 tatggcaccgtttgaggctttgtatggtccgaggtgtaggatgtcgttgtgtttgtttgagtcaggtgaaagtgttttgttaggaccggaagttgtgcaa 14824  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||| || ||| | |   ||||   ||| ||||||||||  || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | || |||||  |||||||||    
T  14823 gagactacggaaaaatttaagatgattgaagagaagatgaaagagtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgagtttc 14724  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    |||  || |||||||| ||| |||| || | || | |||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  14723 aggttggggatcatgtgtttttgagagtgaatcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtgtcggaagttgactcct 14644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13308 - 13029
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||| || || || |||||||| || || || || |   |||| ||||||||  | || ||     
T  13308 tatggcaccgtttgaggctttgtatggtcagaggtgtaggacaccattgtgttggtttgaatccggagagagagccttgttaggaccggaagttgtgcaa 13209  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||| || || || | | ||||   ||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  13208 gagactacggaaaaggttaaaatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttc 13109  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    |||  ||||||||||| ||  |||| || |  ||| |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13108 aggttggtgatcatgtgttgttgagagtgaaccctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 13029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 280
Target Start/End: Original strand, 961 - 1239
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||  | || || |    
T  961 atggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccaatgtgttggtttgagttaggtgaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaag 1060  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||| || || || |   || |   ||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||||     
T  1061 agactacggaaaaggttaagatggtccaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaagatattgagtttct 1160  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    ||  || |||||||| ||| | || || | |||| |||| |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  1161 ggttggcgatcatgtattttttagagtgaatcctgtgactggtgttggtcgtgctttgaagtgtcggaagttgactcct 1239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 46553 - 46275
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || |||| | |||| ||||||||  | || || |    
T  46553 atggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaag 46454  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    | ||||| || || || |   ||||    || |||||||| || || |||||| |||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  46453 aaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacaaaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 46354  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
     |  ||||||||||| ||| ||||||| | |||| | || |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  46353 agttggtgatcatgtgtttttgagggtaaatcctgtaaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 46275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 7775 - 7522
Alignment:
Q  23 tatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtcagat 122  Q
    ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||| ||||||||| || || || |||||  |  | || ||  | |||||||||||||| |       
T  7775 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagttaggtgaaagagtggtcttaggaccaaagattgttcagcaaactactgagaaagttaaga 7676  T
Q  123 tgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttct 222  Q
    ||||   ||| || |||||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |    
T  7675 tgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaaagtcgacaaatgagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtattttt 7576  T
Q  223 gagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgac 276  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  7575 gagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 7522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23793 - 23518
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||| | |||| ||||||||  | || || |    
T  23793 atggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttatgttggtttgagtctggagagagtgctttgttaggaccggaggttgtgcaag 23694  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    | ||||| || || || |   ||||    || ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  23693 aaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 23594  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgact 277  Q
     |   ||||||| || ||| ||||||| | || | |||| || ||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  23593 agttagtgatcacgtgtttttgagggtgaatcatgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgact 23518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 28172 - 28451
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||| ||||||| || || ||||||||| | ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |  | || ||     
T  28172 tatgacaccgtttgaggctttgtatggtagaaggtgtaggacaccattgtgttggtttgagtcaggtgaaagtgctttgttaggaccgaaagttgtgcaa 28271  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    || ||||| || || || |   ||||   ||| |||||||| || || || ||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| |    
T  28272 gaaactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaggcatctcaaagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagttac 28371  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    | |  ||||||||||| ||| ||||||| | || | |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  28372 aagtaggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcatgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 28451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 361
Target Start/End: Original strand, 86411 - 86770
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| || || ||||  || || |||| |||||| ||||| | ||| ||  ||||||| ||  |  | ||      
T  86411 atggtaccgttcgaagcgttgtatggtcggagatgcagaactctgttgtgttggtatgagtccggtgagactgtggtactgggaccagacatttttcaac 86510  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||||||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||| || |||||| |||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  86511 agactactgagaaggttaagttgataagagaaaagatggaagcgtcacagagtagacaaaagagttatcatgataatcgtaggaaggatcttgagtttca 86610  T
Q  202 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 301  Q
     || ||  | ||||| ||| | || ||||||| | |||| ||||||||||||||  | || || | |||  ||||| | | ||||||||| ||||||||     
T  86611 agaaggataccatgtgttttttagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgcactaaaatcaaagaaactgacttcgaggtttattggcccgtatcaa 86710  T
Q  302 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaac 361  Q
    ||||| || ||||||||  | || || || ||||| ||||| ||||| || |||||||||    
T  86711 atttcggaaagagttgggtcggttgcgtatagagtgggtttaccaccgcaactttcgaac 86770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 46627 - 46557
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaag 72  Q
    |||||||| ||||| || || |||||| |||| || || ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  46627 atggcacctttcgaggctttatatggtaggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaag 46557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 252 - 366
Target Start/End: Original strand, 2023 - 2137
Alignment:
Q  252 gtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccaca 351  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  2023 gtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcggagagggttggaacagtggcatacagagtgggttttacaccaca 2122  T
Q  352 tctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||| |||||    
T  2123 tctttcgaatttgca 2137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 8617 - 8471
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | ||    
T  8617 aagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtatcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatc 8518  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    || |||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  8517 ctatgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagtcgactcct 8471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 3559 - 3280
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||| || |||| ||| || || || | |||||| ||||| ||||||| | |||| ||||||||  | || ||     
T  3559 tatggcaccgtttgaggctttgtatggtcgaagatgtaagacaccgttgtgttagtttgaatcaggagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaa 3460  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||  || || || |   ||||   ||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||  | |||||||    
T  3459 gagactatggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggacatcgagtttc 3360  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    |||  ||||||||||| ||| |||| || | |||| |||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  3359 aggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcctgtgaccggtattggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 3280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 280
Target Start/End: Original strand, 3914 - 4060
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  | ||||||||| ||| | || || | ||    
T  3914 aagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttgatgatcatgtgtttttaagagtgaatc 4013  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    || |||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  4014 ctgtgaccggtgttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcct 4060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 3781 - 3840
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttga 60  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||    
T  3781 tatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccattgtgttggtttga 3840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 280
Target Start/End: Original strand, 14776 - 14922
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| |||||||  ||||||||||| ||| ||||||| | ||    
T  14776 aagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgaatttcaggttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatc 14875  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
     | ||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14876 atgtgaccagtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 14922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 280
Target Start/End: Original strand, 8816 - 9076
Alignment:
Q  20 ttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| || |  ||||||| | |||| ||||||||  | || || |||||||| || || || |    
T  8816 ttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgaatccgaagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggtta 8915  T
Q  120 gattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttt 219  Q
       ||||   ||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | || |||||  ||||||||||||  ||||||||| | ||    
T  8916 agatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgagtttcaggttggtgatcatctgtt 9015  T
Q  220 tctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    | ||||||| | || | | || |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  9016 tttgagggtgaatcatgtcaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtcggaagttgactcct 9076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0551
Description:

Target: scaffold0551; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 137 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 8359 - 8216
Alignment:
Q  137 atgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctt 236  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||| | || |     
T  8359 atgaaagcgtctcagagtagacagaagacttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcatg 8260  T
Q  237 tgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  8259 tgaccggtgttggtcgtgctttgatgtgtaggaagttgactcct 8216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 149 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14909 - 14778
Alignment:
Q  149 cagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttg 248  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| | ||||| | |||| |||| |||||||    
T  14909 cagagtagacagaaaagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgtgactggtgttg 14810  T
Q  249 gacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    | |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14809 gtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 14778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 43938 - 43659
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacat 100  Q
    |||||||||||| || || ||||||||| ||||||||| ||| ||  | || ||||||||||| || ||||||| | | || ||||||||  | || ||     
T  43938 tatggcaccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtatgacaccgctgtgttggtttgagtccggagaaagtgctttattaggaccggaagttgtgcaa 43839  T
Q  101 gagactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttc 200  Q
    |||||||| || || || |   ||||    || ||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  43838 gagactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaagcgtctcagagtagacataagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttc 43739  T
Q  201 aggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    |    ||||||||||| ||| ||| ||| | |||| | || |  ||||| |||||||| ||||  ||||| |||||||||    
T  43738 aacttggtgatcatgtgtttttgacggtgaatcctgtaaccgtagttggtcgtgctttaaagtgtaggaaattgactcct 43659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24147 - 24001
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| | || || | ||    
T  24147 aagattaaagcatctcaaagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgttttttagagttaatc 24048  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    |  |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24047 cggtgactggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcct 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 130 - 202
Target Start/End: Original strand, 4489 - 4561
Alignment:
Q  130 agaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcag 202  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||    
T  4489 agaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagatctcgagtttcag 4561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 366
Target Start/End: Original strand, 4567 - 4696
Alignment:
Q  237 tgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagt 336  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| |  |||||||||||||||||| | || || ||| |||| || ||||| ||  ||||    
T  4567 tgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagtttactccgagatttattggtccgtatcaggtatcggaaagaattggaacggtggcgtatcgagt 4666  T
Q  337 tggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
     ||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  4667 gggtttaccatcgcatctttcgaatttgca 4696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 71618 - 71442
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatg 101  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||  | || || |    
T  71618 atggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacactgttgtgttggtttgaatctggagaaagtgttgtgttaggaccggaagttgtgcaag 71519  T
Q  102 agactactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataag 178  Q
    ||||||| || || || |   ||||   ||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  71518 agactacggaaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataag 71442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13518 - 13372
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    ||||||||||| || |||||| || ||||||| || ||||||||  | ||||||||| ||||||||||||  |||||||| || ||  |||| || | ||    
T  13518 aagatgaaagcgtctcagagtagatagaagagctatcatgataaaaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcacgtattcttgagagttaatc 13419  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    || | || |||||||| ||||| || ||||   ||||||||||||||    
T  13418 ctgtaactggtgttggtcgtgcgttaaagtgtcggaagttgactcct 13372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 222 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 17136 - 16992
Alignment:
Q  222 tgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtac 321  Q
    |||| ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  |||||| || |||||||||| || || ||||||   ||    
T  17136 tgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatttgttcgtatcagatatcggaaagagttttaac 17037  T
Q  322 agtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
     ||||| ||  |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  17036 ggtggcgtattgagttggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 16992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 9382 - 9108
Alignment:
Q  6 caccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagac 105  Q
    ||||||| || || ||||||||||| || ||||||   || || || |||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||  | || || |||||    
T  9382 caccgtttgaggctttgtatggtcgaagatgtaggttaccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagtgctttgttaggacaggaagttgtgcaagagac 9283  T
Q  106 tactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggag 205  Q
    ||| || || || |   ||||   ||| ||||||||||| || |||||| || ||||||| || |||||||||   ||||||||| ||||||||||||      
T  9282 tacagaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagatagaagagctatcatgataagatgagaaaggatattgagtttcaggtt 9183  T
Q  206 ggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
    ||||||||||| ||  |||| || | || | | || |||||||| |||||||||||||   |||| |||||||||    
T  9182 ggtgatcatgtattcttgagagtgaatcatgtaactggtgttggtcgtgctttgaagtgttggaatttgactcct 9108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 280
Target Start/End: Original strand, 3983 - 4129
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactc 233  Q
    |||||||| || || || ||| |||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| || | |     
T  3983 aagatgaaggcgtctcaaagtagacataagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatt 4082  T
Q  234 ctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcct 280  Q
       |||| |||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  4083 tggtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaatttgactcct 4129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 63
Target Start/End: Original strand, 3851 - 3912
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtc 63  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  3851 atggctccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtc 3912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 131 - 216
Target Start/End: Original strand, 26193 - 26278
Alignment:
Q  131 gaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgt 216  Q
    ||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  26193 gaaaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgt 26278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 26063 - 26135
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagt 73  Q
    |||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||| || || || |||||| | || |||||||||    
T  26063 tatggcaccgtttgaggctttgtatggtccgaggtgtaggacaccgttgtgttggttttaatccggtgaaagt 26135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 8816 - 8768
Alignment:
Q  315 ttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaactt 363  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8816 ttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaactt 8768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Original strand, 1335 - 1530
Alignment:
Q  6 caccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagac 105  Q
    ||||||| || || |||||||| | |||||||||||| || || || | ||||||||||||||||||||   |||| ||||||||  | || || |||||    
T  1335 caccgtttgaggctttgtatggactgaggtgtaggacaccgttgtgttagtttgagtcaggtgaaagtgccttgttaggaccggaagttgtgcaagagac 1434  T
Q  106 tactgagaaagtcagattgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttca 201  Q
    ||| || || || |   ||||   ||| ||||||||||| || |||||| || |||||||||| |||||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  1435 tacggaaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtagatagaagagttatcatgataagaagagaaaggatattgagtttca 1530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 45941 - 45880
Alignment:
Q  305 tcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  45941 tcagagagggttggaacagtggcatatagagttggttttccaccacatcattcgaatttgca 45880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 134 - 186
Target Start/End: Original strand, 3758 - 3810
Alignment:
Q  134 aagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcgaagaaa 186  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  3758 aagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 3810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 7567 - 7479
Alignment:
Q  2 atggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaagtgttgtgttgggaccgga 90  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  7567 atggcaccgtttgagactttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagtgctttgttaggaccgga 7479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1508 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1508
Description:

Target: scaffold1508; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 332 - 366
Target Start/End: Original strand, 874 - 908
Alignment:
Q  332 agagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  874 agagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 10899 - 10794
Alignment:
Q  158 cagaagagttaccatgataagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctt 257  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||  ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| || | |  | | || ||||||||||||||||    
T  10899 cagaagagttaccatgataagaggaggaaggacattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaattttgtaaccggtgttggacgtgctt 10800  T
Q  258 tgaagt 263  Q
    | ||||    
T  10799 tcaagt 10794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 49 - 8
Alignment:
Q  1 tatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggac 42  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  49 tatggcaccgtttgaggccttgtatggtcggaggtgtaggac 8  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 322 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 9298 - 9254
Alignment:
Q  322 agtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 366  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||    
T  9298 agtggcatacagagtgggattgccaccatatctttcgaatttgca 9254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 77 - 25
Alignment:
Q  20 ttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgaaag 72  Q
    |||||||||||||| || || ||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  77 ttgtatggtcggagatgcagaacttcattatgttggtttgagtcaggtgaaag 25  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 615 times since January 2019
Visitors: 4387