View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0673_low_47 (Length: 326)

Name: NF0673_low_47
Description: NF0673
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0673_low_47
NF0673_low_47
[»] scaffold0143 (3 HSPs)
scaffold0143 (1-301)||(7452-7752)
scaffold0143 (1-301)||(19562-19862)
scaffold0143 (1-301)||(30785-31085)
[»] chr5 (61 HSPs)
chr5 (1-301)||(3793040-3793340)
chr5 (1-304)||(18497086-18497389)
chr5 (1-304)||(33878626-33878929)
chr5 (1-301)||(40469911-40470211)
chr5 (1-304)||(24586870-24587173)
chr5 (1-304)||(8661836-8662139)
chr5 (1-304)||(30155527-30155830)
chr5 (1-304)||(33519876-33520179)
chr5 (1-301)||(9320975-9321275)
chr5 (1-301)||(12135674-12135974)
chr5 (1-301)||(26483893-26484193)
chr5 (1-301)||(43081754-43082054)
chr5 (1-304)||(24727465-24727768)
chr5 (1-301)||(33296027-33296327)
chr5 (1-304)||(30032924-30033227)
chr5 (3-304)||(29887560-29887861)
chr5 (1-301)||(11552854-11553154)
chr5 (1-301)||(23629469-23629769)
chr5 (1-301)||(28652741-28653041)
chr5 (1-301)||(31434963-31435263)
chr5 (1-301)||(37767352-37767652)
chr5 (1-304)||(9547070-9547373)
chr5 (1-304)||(11327133-11327436)
chr5 (1-304)||(34620014-34620317)
chr5 (1-301)||(15655119-15655419)
chr5 (1-301)||(22891962-22892262)
chr5 (1-301)||(24973405-24973705)
chr5 (1-301)||(37667847-37668147)
chr5 (1-304)||(37758479-37758782)
chr5 (1-304)||(41678201-41678504)
chr5 (1-301)||(18371895-18372195)
chr5 (1-301)||(22995478-22995778)
chr5 (1-301)||(25203777-25204077)
chr5 (1-301)||(25267932-25268232)
chr5 (1-300)||(13183154-13183453)
chr5 (1-304)||(30171965-30172268)
chr5 (3-301)||(13321193-13321491)
chr5 (1-301)||(30938134-30938434)
chr5 (1-304)||(28956146-28956449)
chr5 (1-301)||(33780988-33781284)
chr5 (1-301)||(13439044-13439344)
chr5 (1-301)||(18124777-18125077)
chr5 (1-301)||(31822768-31823068)
chr5 (1-301)||(32592635-32592935)
chr5 (1-301)||(37355004-37355304)
chr5 (1-304)||(6877801-6878104)
chr5 (1-298)||(5641290-5641587)
chr5 (1-301)||(2514561-2514861)
chr5 (1-304)||(15755213-15755516)
chr5 (192-301)||(24684697-24684806)
chr5 (39-298)||(3483602-3483861)
chr5 (34-304)||(351609-351879)
chr5 (39-304)||(11943821-11944086)
chr5 (89-304)||(34469118-34469333)
chr5 (39-304)||(5439624-5439889)
chr5 (39-304)||(15784124-15784389)
chr5 (39-304)||(17957593-17957858)
chr5 (39-304)||(31520803-31521068)
chr5 (39-304)||(36375361-36375626)
chr5 (39-304)||(37000015-37000280)
chr5 (96-298)||(20388445-20388647)
[»] chr2 (49 HSPs)
chr2 (1-301)||(27779725-27780025)
chr2 (1-301)||(27819482-27819782)
chr2 (1-304)||(3785981-3786284)
chr2 (1-304)||(13933000-13933303)
chr2 (1-304)||(22924601-22924904)
chr2 (1-304)||(27120012-27120315)
chr2 (1-304)||(31889944-31890247)
chr2 (1-304)||(34158332-34158635)
chr2 (1-304)||(16825791-16826094)
chr2 (1-304)||(16895386-16895689)
chr2 (1-304)||(31879774-31880077)
chr2 (1-304)||(37682348-37682651)
chr2 (1-304)||(37697613-37697916)
chr2 (1-301)||(11631637-11631937)
chr2 (1-301)||(21673628-21673928)
chr2 (1-301)||(40236999-40237299)
chr2 (1-304)||(257106-257409)
chr2 (1-304)||(32053291-32053594)
chr2 (1-304)||(37928857-37929160)
chr2 (1-304)||(19412954-19413257)
chr2 (1-301)||(34294645-34294945)
chr2 (1-304)||(27807191-27807494)
chr2 (1-304)||(34865172-34865475)
chr2 (1-304)||(39048272-39048575)
chr2 (1-301)||(9346439-9346739)
chr2 (1-301)||(12590299-12590599)
chr2 (1-301)||(20841404-20841704)
chr2 (1-304)||(12713054-12713357)
chr2 (1-301)||(12659027-12659327)
chr2 (1-301)||(21699624-21699924)
chr2 (1-301)||(27430894-27431194)
chr2 (1-304)||(16164968-16165271)
chr2 (1-301)||(37381168-37381468)
chr2 (1-301)||(39893560-39893860)
chr2 (1-304)||(37948315-37948618)
chr2 (1-301)||(23125022-23125321)
chr2 (1-298)||(27395056-27395353)
chr2 (1-257)||(34271373-34271629)
chr2 (1-301)||(19452876-19453176)
chr2 (1-250)||(28885821-28886070)
chr2 (123-301)||(27827951-27828129)
chr2 (191-301)||(28885698-28885808)
chr2 (39-298)||(34701570-34701829)
chr2 (39-298)||(42394029-42394288)
chr2 (36-298)||(34533931-34534193)
chr2 (37-304)||(21760104-21760371)
chr2 (39-304)||(12384148-12384413)
chr2 (39-304)||(22949881-22950146)
chr2 (96-298)||(26723824-26724026)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (1-304)||(44564472-44564775)
chr8 (1-304)||(31358016-31358319)
chr8 (1-301)||(18712975-18713275)
chr8 (1-304)||(15771062-15771365)
chr8 (1-301)||(19204787-19205087)
chr8 (1-301)||(9358116-9358416)
chr8 (1-301)||(19691589-19691889)
chr8 (1-301)||(27605330-27605630)
chr8 (1-301)||(28358377-28358677)
chr8 (3-301)||(29832817-29833115)
chr8 (3-301)||(33262225-33262523)
chr8 (1-301)||(14561115-14561415)
chr8 (1-301)||(2133685-2133985)
chr8 (1-301)||(18794195-18794495)
chr8 (1-301)||(12089148-12089448)
chr8 (1-301)||(19677938-19678238)
chr8 (1-301)||(31486296-31486596)
chr8 (1-304)||(21344596-21344899)
chr8 (1-266)||(19657766-19658031)
chr8 (1-267)||(33245894-33246160)
chr8 (1-298)||(22077350-22077633)
chr8 (39-298)||(22412432-22412691)
chr8 (39-298)||(19844661-19844920)
chr8 (39-298)||(14212533-14212792)
chr8 (96-298)||(16768817-16769019)
[»] chr6 (54 HSPs)
chr6 (1-304)||(13520599-13520902)
chr6 (1-304)||(14141801-14142104)
chr6 (1-304)||(28163977-28164280)
chr6 (1-304)||(29504902-29505205)
chr6 (1-304)||(26789302-26789605)
chr6 (1-304)||(27197671-27197974)
chr6 (1-304)||(27251261-27251564)
chr6 (1-304)||(30554423-30554726)
chr6 (1-304)||(34460913-34461216)
chr6 (1-304)||(27358517-27358820)
chr6 (1-304)||(27448860-27449163)
chr6 (1-301)||(27060995-27061295)
chr6 (1-301)||(27626118-27626418)
chr6 (1-301)||(29576503-29576803)
chr6 (1-304)||(16677626-16677929)
chr6 (1-301)||(3699572-3699872)
chr6 (1-301)||(27011220-27011520)
chr6 (1-301)||(27179945-27180245)
chr6 (1-301)||(27268994-27269294)
chr6 (1-301)||(29553046-29553346)
chr6 (1-301)||(33372838-33373138)
chr6 (1-301)||(4761252-4761552)
chr6 (1-301)||(13295358-13295658)
chr6 (1-304)||(8902110-8902413)
chr6 (1-301)||(4776369-4776669)
chr6 (1-301)||(16753310-16753610)
chr6 (1-297)||(24867209-24867505)
chr6 (1-301)||(27022625-27022925)
chr6 (3-301)||(27286773-27287071)
chr6 (1-301)||(4528774-4529074)
chr6 (1-301)||(26921866-26922166)
chr6 (1-301)||(27488622-27488922)
chr6 (1-301)||(16940434-16940734)
chr6 (1-301)||(22931291-22931591)
chr6 (1-301)||(23853736-23854036)
chr6 (1-301)||(26112819-26113119)
chr6 (1-301)||(28210943-28211243)
chr6 (1-304)||(26775034-26775337)
chr6 (1-301)||(4542181-4542481)
chr6 (1-301)||(4720542-4720842)
chr6 (1-301)||(15420727-15421027)
chr6 (3-301)||(17088852-17089150)
chr6 (1-300)||(20172037-20172336)
chr6 (1-300)||(22163655-22163954)
chr6 (1-267)||(24302164-24302430)
chr6 (90-301)||(22455610-22455821)
chr6 (189-301)||(26992284-26992396)
chr6 (1-116)||(15408940-15409055)
chr6 (34-298)||(23971210-23971474)
chr6 (39-298)||(18119961-18120220)
chr6 (39-298)||(18212114-18212373)
chr6 (36-298)||(27545394-27545656)
chr6 (39-304)||(9135798-9136063)
chr6 (36-296)||(25707505-25707765)
[»] chr3 (72 HSPs)
chr3 (1-304)||(5714523-5714826)
chr3 (1-304)||(5725433-5725736)
chr3 (1-304)||(5766632-5766935)
chr3 (1-304)||(32294078-32294381)
chr3 (1-301)||(28112461-28112761)
chr3 (1-304)||(5592864-5593167)
chr3 (1-304)||(8215185-8215488)
chr3 (1-301)||(6205356-6205656)
chr3 (1-301)||(18228649-18228949)
chr3 (1-304)||(5017164-5017467)
chr3 (1-301)||(21678156-21678456)
chr3 (1-304)||(31032743-31033046)
chr3 (1-304)||(51785473-51785776)
chr3 (1-301)||(4627238-4627538)
chr3 (1-301)||(5605821-5606121)
chr3 (1-301)||(22384085-22384385)
chr3 (1-304)||(20573350-20573653)
chr3 (1-304)||(29661477-29661780)
chr3 (1-304)||(47026903-47027206)
chr3 (1-301)||(32442604-32442904)
chr3 (1-301)||(7076659-7076959)
chr3 (1-301)||(8285977-8286277)
chr3 (1-301)||(18304161-18304461)
chr3 (1-301)||(24331616-24331916)
chr3 (1-301)||(4725084-4725384)
chr3 (1-301)||(4793142-4793442)
chr3 (1-301)||(10399597-10399897)
chr3 (1-301)||(11106866-11107166)
chr3 (1-301)||(15737601-15737901)
chr3 (1-301)||(18246194-18246494)
chr3 (1-301)||(18273559-18273859)
chr3 (1-301)||(18288860-18289160)
chr3 (1-301)||(18334083-18334383)
chr3 (1-301)||(19697943-19698243)
chr3 (1-301)||(28024735-28025035)
chr3 (1-301)||(35884219-35884519)
chr3 (1-304)||(8299421-8299724)
chr3 (1-304)||(48469377-48469680)
chr3 (1-301)||(4420368-4420668)
chr3 (1-301)||(4687108-4687408)
chr3 (1-301)||(17981456-17981756)
chr3 (1-301)||(20069493-20069793)
chr3 (1-301)||(29145263-29145563)
chr3 (1-301)||(5470441-5470741)
chr3 (1-301)||(8000013-8000313)
chr3 (1-301)||(10646526-10646826)
chr3 (1-301)||(18054715-18055015)
chr3 (1-301)||(31960962-31961262)
chr3 (1-301)||(4343183-4343483)
chr3 (1-301)||(15889212-15889512)
chr3 (1-304)||(28342627-28342930)
chr3 (1-298)||(6539249-6539546)
chr3 (1-301)||(22867355-22867655)
chr3 (1-301)||(22882414-22882714)
chr3 (1-301)||(16620997-16621297)
chr3 (1-266)||(5653573-5653838)
chr3 (89-304)||(17992526-17992741)
chr3 (1-93)||(17973368-17973460)
chr3 (39-298)||(11924903-11925162)
chr3 (39-298)||(6571810-6572069)
chr3 (39-298)||(22959909-22960168)
chr3 (63-298)||(7088596-7088831)
chr3 (39-298)||(16431861-16432120)
chr3 (96-298)||(15704929-15705131)
chr3 (96-295)||(15918976-15919175)
chr3 (37-304)||(20443567-20443834)
chr3 (34-304)||(6962973-6963243)
chr3 (96-250)||(15592513-15592667)
chr3 (39-304)||(5950347-5950612)
chr3 (39-304)||(46380784-46381049)
chr3 (39-250)||(37260254-37260465)
chr3 (36-142)||(4450387-4450493)
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (1-301)||(16747866-16748166)
chr7 (1-304)||(2776740-2777043)
chr7 (1-304)||(31127393-31127696)
chr7 (1-304)||(26512045-26512348)
chr7 (1-304)||(26681455-26681758)
chr7 (1-304)||(39209488-39209791)
chr7 (1-304)||(45390706-45391009)
chr7 (1-301)||(26316197-26316497)
chr7 (1-304)||(26666263-26666566)
chr7 (1-304)||(4202875-4203178)
chr7 (1-301)||(5143689-5143989)
chr7 (1-301)||(26271435-26271735)
chr7 (1-301)||(2158063-2158363)
chr7 (1-301)||(10913218-10913518)
chr7 (1-301)||(11421128-11421428)
chr7 (1-301)||(5131485-5131785)
chr7 (1-301)||(16514779-16515079)
chr7 (1-300)||(2106512-2106811)
chr7 (1-301)||(22145684-22145984)
chr7 (1-301)||(31086971-31087271)
chr7 (1-304)||(4141595-4141898)
chr7 (1-301)||(24588883-24589183)
chr7 (1-301)||(26534222-26534522)
chr7 (1-301)||(31560739-31561039)
chr7 (3-301)||(16446357-16446655)
chr7 (1-304)||(3448792-3449095)
chr7 (1-304)||(26516278-26516581)
chr7 (1-301)||(16044807-16045104)
chr7 (1-301)||(10845109-10845409)
chr7 (1-301)||(11444376-11444676)
chr7 (1-301)||(26438746-26439046)
chr7 (1-298)||(10842343-10842640)
chr7 (1-304)||(45734799-45735096)
chr7 (1-266)||(5161907-5162172)
chr7 (39-298)||(29090008-29090267)
chr7 (39-298)||(2557027-2557286)
chr7 (63-298)||(16127229-16127464)
chr7 (39-298)||(15193575-15193834)
chr7 (37-304)||(797908-798175)
chr7 (39-304)||(16392821-16393086)
chr7 (39-304)||(30369333-30369598)
chr7 (39-304)||(9469806-9470071)
chr7 (37-304)||(16286764-16287031)
chr7 (96-298)||(1893019-1893221)
chr7 (178-296)||(16237975-16238093)
chr7 (34-304)||(25726983-25727252)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (1-304)||(28153227-28153530)
chr1 (1-304)||(10948568-10948871)
chr1 (1-301)||(10966159-10966459)
chr1 (1-304)||(51641709-51642012)
chr1 (1-301)||(3644629-3644930)
chr1 (1-301)||(28588479-28588779)
chr1 (1-301)||(16204498-16204798)
chr1 (1-301)||(41789774-41790074)
chr1 (1-301)||(20464470-20464770)
chr1 (1-304)||(21894212-21894516)
chr1 (1-263)||(20336880-20337142)
chr1 (34-295)||(22489521-22489782)
chr1 (39-304)||(5628500-5628765)
chr1 (260-301)||(20339024-20339065)
[»] chr4 (34 HSPs)
chr4 (1-301)||(5009380-5009680)
chr4 (1-301)||(18797078-18797378)
chr4 (1-304)||(21973203-21973506)
chr4 (1-304)||(27159781-27160084)
chr4 (1-304)||(31122976-31123279)
chr4 (1-304)||(40102101-40102404)
chr4 (1-301)||(6573363-6573663)
chr4 (1-301)||(54836896-54837196)
chr4 (1-298)||(36340981-36341278)
chr4 (1-301)||(20334885-20335185)
chr4 (1-298)||(39854145-39854442)
chr4 (1-301)||(14102048-14102348)
chr4 (1-301)||(14759770-14760070)
chr4 (1-301)||(34185424-34185724)
chr4 (1-301)||(1903759-1904059)
chr4 (1-301)||(17016551-17016851)
chr4 (1-301)||(24116167-24116467)
chr4 (1-301)||(30757265-30757565)
chr4 (1-304)||(18313642-18313945)
chr4 (1-301)||(15231377-15231677)
chr4 (1-301)||(24588825-24589125)
chr4 (1-301)||(14668521-14668821)
chr4 (1-301)||(33670264-33670564)
chr4 (1-301)||(15281401-15281701)
chr4 (107-298)||(15387948-15388139)
chr4 (1-122)||(5698219-5698340)
chr4 (1-113)||(15384812-15384924)
chr4 (39-298)||(14725301-14725560)
chr4 (39-298)||(19767847-19768106)
chr4 (96-292)||(12515746-12515942)
chr4 (36-298)||(1881598-1881860)
chr4 (34-304)||(22146066-22146336)
chr4 (37-252)||(55784686-55784901)
chr4 (36-142)||(18044723-18044829)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (1-304)||(9511-9814)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (1-301)||(9528-9828)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (1-304)||(22655-22958)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-304)||(11392-11695)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-301)||(16073-16373)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (1-301)||(3559-3859)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (1-301)||(13063-13363)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (1-301)||(9537-9837)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-301)||(11441-11741)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (1-304)||(5643-5946)
[»] scaffold0748 (1 HSPs)
scaffold0748 (1-298)||(5135-5432)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (5-301)||(43181-43492)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-148)||(22761-22908)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (1-148)||(118797-118944)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (39-298)||(10713-10972)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (96-295)||(34799-34998)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (96-292)||(4969-5165)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (39-304)||(29659-29924)
[»] scaffold0196 (1 HSPs)
scaffold0196 (2-93)||(1979-2070)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (34-304)||(4412-4682)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (260-301)||(1347-1388)


Alignment Details
Target: scaffold0143 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 3)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 7752 - 7452
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7752 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 7653  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7652 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 7553  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7552 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 7453  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  7452 g 7452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 19862 - 19562
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  19862 gaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcggacaagagcatttgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcaggtttctc 19763  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  19762 gaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcacaacaa 19663  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19662 gtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 19563  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  19562 g 19562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 31085 - 30785
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31085 gaatgctacctttgattgccttttgagccttgaacacaatgtcatattcggacaagagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcaggtttctc 30986  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  30985 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaa 30886  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30885 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 30786  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  30785 g 30785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 61)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 3793340 - 3793040
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3793340 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 3793241  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3793240 aaagatatacttgatcgggtccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 3793141  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3793140 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 3793041  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  3793040 g 3793040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 18497086 - 18497389
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18497086 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 18497185  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18497186 aaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 18497285  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18497286 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 18497385  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  18497386 gcac 18497389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 33878929 - 33878626
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33878929 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 33878830  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33878829 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 33878730  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33878729 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 33878630  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  33878629 gcac 33878626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 40469911 - 40470211
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  40469911 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgctttctc 40470010  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40470011 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 40470110  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40470111 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 40470210  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  40470211 g 40470211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 24587173 - 24586870
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24587173 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 24587074  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24587073 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 24586974  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24586973 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 24586874  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  24586873 gcac 24586870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 8661836 - 8662139
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8661836 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 8661935  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8661936 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 8662035  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8662036 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 8662135  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  8662136 gcac 8662139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 30155830 - 30155527
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30155830 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 30155731  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30155730 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 30155631  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30155630 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 30155531  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  30155530 gcac 30155527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 33520179 - 33519876
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33520179 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 33520080  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33520079 aaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 33519980  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33519979 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 33519880  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  33519879 gcac 33519876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 9321275 - 9320975
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9321275 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 9321176  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9321175 aaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 9321076  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9321075 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgaccaa 9320976  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  9320975 g 9320975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 12135974 - 12135674
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12135974 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacataatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 12135875  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12135874 aaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 12135775  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12135774 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgaccaa 12135675  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  12135674 g 12135674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 26484193 - 26483893
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26484193 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 26484094  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26484093 aaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 26483994  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  26483993 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcctgttgaccaa 26483894  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  26483893 g 26483893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 43082054 - 43081754
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  43082054 gaatgctacccttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgctttctc 43081955  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43081954 aaagatatactttatcgaatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 43081855  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43081854 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 43081755  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  43081754 g 43081754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 24727768 - 24727465
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24727768 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtgacagcagctttctc 24727669  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24727668 gaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 24727569  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24727568 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 24727469  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  24727468 gcac 24727465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 33296327 - 33296027
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33296327 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 33296228  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  33296227 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaa 33296128  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33296127 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 33296028  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  33296027 g 33296027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 30033227 - 30032924
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30033227 gaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagccttctc 30033128  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30033127 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggtagcccaagctaaagcacaacaa 30033028  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30033027 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 30032928  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  30032927 gcac 30032924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 3 - 304
Target Start/End: Original strand, 29887560 - 29887861
Alignment:
Q  3 atgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  29887560 atgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagagtgcaatcttcccagtaacaacagctttctcaa 29887659  T
Q  103 agatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagt 202  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29887660 agatatacttgataggatccatcctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacaagt 29887759  T
Q  203 cttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaagc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  29887760 cttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttattgaccaagc 29887859  T
Q  303 ac 304  Q
    ||    
T  29887860 ac 29887861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 11553154 - 11552854
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11553154 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 11553055  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  11553054 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaa 11552955  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11552954 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttaaatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 11552855  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  11552854 g 11552854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 23629769 - 23629469
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23629769 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 23629670  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  23629669 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 23629570  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23629569 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 23629470  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  23629469 g 23629469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 28653041 - 28652741
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  28653041 gaatgctacccttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgctttctc 28652942  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28652941 aaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 28652842  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28652841 gtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 28652742  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  28652741 g 28652741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 31435263 - 31434963
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435263 gaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 31435164  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435163 aaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 31435064  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  31435063 gtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaa 31434964  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  31434963 g 31434963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 37767352 - 37767652
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  37767352 gaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttctc 37767451  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37767452 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 37767551  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  37767552 gtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaa 37767651  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  37767652 g 37767652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 9547070 - 9547373
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9547070 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 9547169  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  9547170 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaa 9547269  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9547270 gtcttttcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 9547369  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  9547370 gcac 9547373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 11327436 - 11327133
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  11327436 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttctc 11327337  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11327336 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 11327237  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11327236 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcaccatcggtgaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 11327137  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  11327136 gcac 11327133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 34620317 - 34620014
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  34620317 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaacaacatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgctttctc 34620218  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34620217 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 34620118  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34620117 gtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 34620018  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  34620017 gcac 34620014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 15655119 - 15655419
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15655119 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagccgctttctc 15655218  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  15655219 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgtaggcgtttagcagcccaggccagagcacaacaa 15655318  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15655319 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 15655418  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  15655419 g 15655419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22892262 - 22891962
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22892262 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 22892163  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  22892162 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttttatgattcaccaaatagtgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcacaacaa 22892063  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22892062 gtcttttcaagcatcatataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 22891963  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  22891962 g 22891962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 24973705 - 24973405
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24973705 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccaacgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 24973606  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | || |||||||    
T  24973605 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccacgttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaaggacaacaa 24973506  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24973505 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 24973406  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  24973405 g 24973405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 37667847 - 37668147
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  37667847 gaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagccgctttctc 37667946  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37667947 aaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcagcccaagctagagcacaacaa 37668046  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  37668047 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaa 37668146  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  37668147 g 37668147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 37758782 - 37758479
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37758782 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggcagctttctc 37758683  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  37758682 aaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 37758583  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37758582 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 37758483  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  37758482 gcac 37758479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 41678504 - 41678201
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41678504 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 41678405  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  41678404 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 41678305  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41678304 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 41678205  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  41678204 gcac 41678201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 18371895 - 18372195
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18371895 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggcagctttctc 18371994  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18371995 aaagatatacttgatctgatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 18372094  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18372095 gtcttttcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaa 18372194  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  18372195 g 18372195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 22995478 - 22995778
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22995478 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 22995577  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  22995578 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 22995677  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22995678 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaatttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 22995777  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  22995778 g 22995778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 25204077 - 25203777
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25204077 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 25203978  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  25203977 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaaaaatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaa 25203878  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  25203877 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtatatagcatgttctttctttcccgtctcatcttgttgaccaa 25203778  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  25203777 g 25203777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 25268232 - 25267932
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25268232 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 25268133  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  25268132 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaaaaatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaa 25268033  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  25268032 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtatatagcatgttctttctttcccgtctcatcttgttgaccaa 25267933  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  25267932 g 25267932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 13183154 - 13183453
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13183154 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattaagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 13183253  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  13183254 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaa 13183353  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13183354 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgatctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 13183453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 30172268 - 30171965
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30172268 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggcagctttctc 30172169  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  30172168 aaagatatacttgatcggatccattctggatatcaatcaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 30172069  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30172068 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 30171969  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  30171968 gcac 30171965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 13321193 - 13321491
Alignment:
Q  3 atgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaa 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  13321193 atgctacctttgatcgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccaacgtgcaatcttcccagtaacggccgctttctcaa 13321292  T
Q  103 agatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13321293 agatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagt 13321392  T
Q  203 cttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaag 301  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13321393 cttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagataatagataacatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaag 13321491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 30938434 - 30938134
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30938434 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 30938335  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  30938334 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 30938235  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30938234 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 30938135  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  30938134 g 30938134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 28956146 - 28956449
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28956146 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaatacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggcagctttctc 28956245  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||| ||||||    
T  28956246 aaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcgcaacaa 28956345  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28956346 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 28956445  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  28956446 gcac 28956449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 33781284 - 33780988
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33781284 gaatgctacctttgattgccttttg----ttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 33781189  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  33781188 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaa 33781089  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33781088 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 33780989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 13439044 - 13439344
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13439044 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacgatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtgacagcagctttctc 13439143  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  13439144 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgatttaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 13439243  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13439244 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 13439343  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  13439344 g 13439344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 18124777 - 18125077
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18124777 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaacagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 18124876  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||  || |  |||||||||    
T  18124877 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgatttaccaaataatgacgcaggcgttttgcggcccgggccaaggcacaacaa 18124976  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18124977 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 18125076  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  18125077 g 18125077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 31822768 - 31823068
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  31822768 gaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttctc 31822867  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31822868 gaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 31822967  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  31822968 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgcccaa 31823067  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  31823068 g 31823068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 32592635 - 32592935
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  32592635 gaatgctacctttgattgccttttgagctttgaacacaatatcatattcagacaacaacatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgctttctc 32592734  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32592735 aaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 32592834  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  32592835 gtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaattggtgaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccggtctcatcttgttgaccaa 32592934  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  32592935 g 32592935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 37355004 - 37355304
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  37355004 gaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttctc 37355103  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37355104 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 37355203  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  37355204 gtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaa 37355303  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  37355304 g 37355304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 6878104 - 6877801
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  6878104 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtgacggcagctttctc 6878005  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  6878004 gaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtgtgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 6877905  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6877904 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcctgttgaccaa 6877805  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  6877804 gcac 6877801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 5641587 - 5641290
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5641587 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 5641488  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  5641487 aaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccagataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 5641388  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgacc 298  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5641387 gtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtaaatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacc 5641290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 2514861 - 2514561
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  2514861 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtgacggcagctttctc 2514762  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  2514761 gaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtgtgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 2514662  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2514661 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 2514562  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  2514561 g 2514561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 15755213 - 15755516
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  15755213 gaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttctc 15755312  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15755313 aaagatatactttatcgggtccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 15755412  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15755413 gtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttaaatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaa 15755512  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  15755513 gcac 15755516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 192 - 301
Target Start/End: Original strand, 24684697 - 24684806
Alignment:
Q  192 gcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatctt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24684697 gcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctt 24684796  T
Q  292 gttgaccaag 301  Q
    ||||||||||    
T  24684797 gttgaccaag 24684806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 298
Target Start/End: Original strand, 3483602 - 3483861
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||| ||||||| | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||| ||||    
T  3483602 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 3483701  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    |||||||||| || | || ||||||||| || || ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||    
T  3483702 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagttaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 3483801  T
Q  239 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgacc 298  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    
T  3483802 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcgtcttgttgacc 3483861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 304
Target Start/End: Original strand, 351609 - 351879
Alignment:
Q  34 acacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatat 133  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||  |||| || |  || |  |||||||| |  ||||| |||||||||||| |||||||    
T  351609 acacaatatcatattcagacaataacatctgccaacgagcaattcttcctgttaacgccggcttctcaaaaaggtacttgatcggatccattttggatat 351708  T
Q  134 taaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacag 233  Q
     |||||||| || ||||  ||||  || ||||| || || || || ||||| || | ||| |||||||| ||||||||||| | ||| || |  |||||     
T  351709 caaccaagtagtgtggtaaaccatgtagtgacggagacgcttagcggcccatgccaaagcgcaacaagttttctcaagcatagaatatcgggactcacaa 351808  T
Q  234 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaagcac 304  Q
    || || |||||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  351809 tcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttctttccagtttcgtcttgttgaccaagcac 351879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 304
Target Start/End: Original strand, 11943821 - 11944086
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||| | ||||  | ||    
T  11943821 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 11943920  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    |||| || || || | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || ||    
T  11943921 aagtagtgtgattgatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtatcgagattcacattcagt 11944020  T
Q  239 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaagcac 304  Q
     ||||||||||| | ||| || || || || |||||  |||| || ||||||||||| || |||||    
T  11944021 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcac 11944086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 89 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 34469333 - 34469118
Alignment:
Q  89 agcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagct 188  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||  | ||||| |||||||| |||||  | | || ||| ||||| || ||||||||||||||  ||    
T  34469333 agcaggtttctcaaagatgtacttgatcggatccatcttagatatcaaccaagtagtatgactaatcatatagtgacggagacgtttggcagcccagact 34469234  T
Q  189 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcat 288  Q
    || || ||||| |||||||| ||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| || || ||||| || ||  |||| || ||||    
T  34469233 agtgcgcaacaggtcttctcgagcatggaatagcgagattcacagtcagtaaacttcttgctcaaataataaatggcatgctcctttcttccggtttcat 34469134  T
Q  289 cttgttgaccaagcac 304  Q
    ||||||| || |||||    
T  34469133 cttgttgtccgagcac 34469118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 304
Target Start/End: Original strand, 5439624 - 5439889
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||| | ||||  | ||    
T  5439624 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 5439723  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    |||| || || || | || ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || ||    
T  5439724 aagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgcttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 5439823  T
Q  239 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaagcac 304  Q
     ||||||||||| | ||| || || || || |||||  |||| || ||||||||||| || |||||    
T  5439824 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcac 5439889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 304
Target Start/End: Original strand, 15784124 - 15784389
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||| | ||||  | ||    
T  15784124 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 15784223  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    | || || || || | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || ||    
T  15784224 acgtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacacgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 15784323  T
Q  239 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaagcac 304  Q
     ||||||||||| | ||| || || || || |||||  |||| || ||||||||||| || |||||    
T  15784324 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcac 15784389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 17957858 - 17957593
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||| ||||  | | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||| | ||||| | ||    
T  17957858 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctatcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagatatcagcc 17957759  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    |||| || || || | || ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || ||    
T  17957758 aagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgcttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 17957659  T
Q  239 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaagcac 304  Q
     ||||||||||| | ||| || || || || |||||  |||| || ||||||||||| || |||||    
T  17957658 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcac 17957593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 31521068 - 31520803
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    ||||||||||| || |  ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||| | ||||  | ||    
T  31521068 atatcatattccgatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 31520969  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    |||| || || || | || ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || ||    
T  31520968 aagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgcttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 31520869  T
Q  239 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaagcac 304  Q
     ||||||||||| | ||| || || || || |||||  |||| || ||||||||||| || |||||    
T  31520868 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcac 31520803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 304
Target Start/End: Original strand, 36375361 - 36375626
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||| |  |||||||| || || || || ||||||||| | ||||  | ||    
T  36375361 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtatttgattggatccattttagataccagcc 36375460  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    |||| || || || | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || |  || |||| |||||| || ||    
T  36375461 aagtagtgtgattgatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagtatggagtatcgagattcacattcagt 36375560  T
Q  239 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaagcac 304  Q
     ||||| ||||| | ||| || || || ||||||||  |||| || ||||||||||| || |||||    
T  36375561 aaactttttgcttaaataataaatggcgtgttcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcac 36375626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 304
Target Start/End: Original strand, 37000015 - 37000280
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||| |  |||||||| || || || || ||||||||| | ||||  | ||    
T  37000015 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtatttgattggatccattttagataccagcc 37000114  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    |||| || || || | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || |  || |||| |||||| || ||    
T  37000115 aagtagtgtgattgatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagtatggagtatcgagattcacattcagt 37000214  T
Q  239 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaagcac 304  Q
     ||||| ||||| | ||| || || || ||||||||  |||| || ||||||||||| || |||||    
T  37000215 aaactttttgcttaaataataaatggcgtgttcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcac 37000280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 298
Target Start/End: Original strand, 20388445 - 20388647
Alignment:
Q  96 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 195  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || || || |||| ||| ||||| || ||  | |||||||| || | ||| |    
T  20388445 ttctcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatcaaccaagtagtgtgattaaccatatagtgacgaagacgcatagcagcccatgccaaagcgc 20388544  T
Q  196 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttg 295  Q
     ||| || ||||||||||| | ||| || |  ||||| || || |||||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  20388545 gacaggttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttctttccagtctcgtcttgttg 20388644  T
Q  296 acc 298  Q
    |||    
T  20388645 acc 20388647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 49)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27780025 - 27779725
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27780025 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttctc 27779926  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27779925 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 27779826  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27779825 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 27779726  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  27779725 g 27779725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27819782 - 27819482
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27819782 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttctc 27819683  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27819682 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 27819583  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27819582 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 27819483  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  27819482 g 27819482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 3786284 - 3785981
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3786284 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 3786185  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3786184 aaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagaccacaacaa 3786085  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3786084 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 3785985  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  3785984 gcac 3785981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 13933000 - 13933303
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13933000 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 13933099  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13933100 aaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgccgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 13933199  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13933200 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 13933299  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  13933300 gcac 13933303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 22924601 - 22924904
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22924601 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttctc 22924700  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22924701 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagaccacaacaa 22924800  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22924801 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 22924900  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  22924901 gcac 22924904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27120315 - 27120012
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27120315 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 27120216  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27120215 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacacaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 27120116  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27120115 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 27120016  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  27120015 gcac 27120012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 31889944 - 31890247
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31889944 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagccgctttctc 31890043  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31890044 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagaacacaacaa 31890143  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31890144 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 31890243  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  31890244 gcac 31890247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 34158635 - 34158332
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  34158635 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttctc 34158536  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34158535 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 34158436  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  34158435 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgaccga 34158336  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  34158335 gcac 34158332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 16825791 - 16826094
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825791 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 16825890  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825891 aaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 16825990  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16825991 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 16826090  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  16826091 gcac 16826094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 16895689 - 16895386
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16895689 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 16895590  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16895589 aaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 16895490  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16895489 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 16895390  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  16895389 gcac 16895386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 31880077 - 31879774
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31880077 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 31879978  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31879977 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 31879878  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31879877 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 31879778  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  31879777 gcac 31879774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 37682348 - 37682651
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37682348 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 37682447  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37682448 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 37682547  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37682548 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 37682647  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  37682648 gcac 37682651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 37697613 - 37697916
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37697613 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 37697712  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37697713 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 37697812  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37697813 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 37697912  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  37697913 gcac 37697916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 11631637 - 11631937
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11631637 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 11631736  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11631737 aaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 11631836  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11631837 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgaccaa 11631936  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  11631937 g 11631937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 21673628 - 21673928
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21673628 gaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 21673727  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21673728 aaagatatactttattggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 21673827  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21673828 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 21673927  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  21673928 g 21673928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 40237299 - 40236999
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  40237299 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttctc 40237200  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40237199 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgatttaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 40237100  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40237099 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttcccgtttcatcttgttgaccaa 40237000  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  40236999 g 40236999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 257106 - 257409
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  257106 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaatacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgctttctc 257205  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  257206 aaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 257305  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  257306 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgctgaccaa 257405  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  257406 gcac 257409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 32053594 - 32053291
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32053594 gaatgctacctttgattgccttctgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccatcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctc 32053495  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32053494 aaagatatacttaatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 32053395  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32053394 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 32053295  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  32053294 gcac 32053291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 37929160 - 37928857
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37929160 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtgacagcagctttctc 37929061  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37929060 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 37928961  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37928960 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 37928861  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  37928860 gcac 37928857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 19412954 - 19413257
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  19412954 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacggcagctttctc 19413053  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19413054 aaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 19413153  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19413154 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 19413253  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  19413254 gcac 19413257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 34294945 - 34294645
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34294945 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 34294846  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34294845 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 34294746  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34294745 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttaagtagtagatagcatgctctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 34294646  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  34294645 g 34294645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27807494 - 27807191
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  27807494 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgctttctc 27807395  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27807394 aaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttagcagcccaagctagggcacaacaa 27807295  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27807294 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 27807195  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  27807194 gcac 27807191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 34865475 - 34865172
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  34865475 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttctc 34865376  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34865375 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 34865276  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34865275 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 34865176  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  34865175 gcac 34865172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 39048272 - 39048575
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  39048272 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtgacagcagctttctc 39048371  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39048372 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgatttaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaagctagagcacaacaa 39048471  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39048472 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttacttaggtagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 39048571  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  39048572 gcac 39048575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 9346439 - 9346739
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  9346439 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgctttctc 9346538  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9346539 aaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 9346638  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9346639 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 9346738  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  9346739 g 9346739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 12590599 - 12590299
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12590599 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgctttctc 12590500  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12590499 aaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttagcagcccaagctagggcacaacaa 12590400  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12590399 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 12590300  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  12590299 g 12590299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 20841704 - 20841404
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20841704 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 20841605  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  20841604 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaa 20841505  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20841504 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 20841405  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  20841404 g 20841404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 12713054 - 12713357
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12713054 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacagaagcatctgccatcgtgcaatctttccagtaacggccgctttctc 12713153  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  12713154 gaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagccaaagcacaacaa 12713253  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12713254 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 12713353  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  12713354 gcac 12713357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 12659327 - 12659027
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12659327 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 12659228  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  12659227 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaa 12659128  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12659127 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 12659028  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  12659027 g 12659027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 21699624 - 21699924
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21699624 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcatgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 21699723  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  21699724 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcacaacaa 21699823  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21699824 gtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttacttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 21699923  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  21699924 g 21699924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 27430894 - 27431194
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27430894 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattccgacaaaagcatctgccaacgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 27430993  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  27430994 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 27431093  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  27431094 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcgccttgttgaccaa 27431193  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  27431194 g 27431194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 16165271 - 16164968
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16165271 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccatcgtgcaatctttccagtaacggccgctttctc 16165172  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  16165171 aaagatatactttatcggatccattctagatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 16165072  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16165071 gtcttctcgagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 16164972  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  16164971 gcac 16164968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 37381468 - 37381168
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  37381468 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccaccgtgcaatcttcccagtaacggccgctttctc 37381369  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  37381368 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 37381269  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37381268 gtcttctcaagcatcgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 37381169  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  37381168 g 37381168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 39893860 - 39893560
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  39893860 gaatgctacctttgatggccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttctc 39893761  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39893760 aaagatatactttatcgggtccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 39893661  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39893660 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 39893561  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  39893560 g 39893560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 37948315 - 37948618
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  37948315 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgctttctc 37948414  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  37948415 aaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 37948514  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  37948515 gtcttctcgagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttcaagtttcatcttgttgaccaa 37948614  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  37948615 gcac 37948618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 23125022 - 23125321
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23125022 gaatgctacctttgattgccttttgagttt-gaacacaatatcgtattcagataaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 23125120  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  23125121 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 23125220  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23125221 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcctgttgaccaa 23125320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27395353 - 27395056
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27395353 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacaaaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctc 27395254  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27395253 aaagatatacttgattggatccatcctggatatcacccaagttgtatgattcatcaaatagtggcgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 27395154  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgacc 298  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  27395153 gtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgacc 27395056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 34271373 - 34271629
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34271373 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 34271472  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  34271473 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaa 34271572  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatag 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  34271573 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatag 34271629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 19452876 - 19453176
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  19452876 gaatgctacctttgatagctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcaggtttctc 19452975  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  19452976 gaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttatatgattcaccaaataatgacgtaggcgtttggcggcccaggccggagcacaacaa 19453075  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19453076 gtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagataatagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgaccaa 19453175  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  19453176 g 19453176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 28886070 - 28885821
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  28886070 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaattttcccagtaacagcagctttctc 28885971  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  28885970 aaagatatactatatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 28885871  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgct 250  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28885870 gttttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgct 28885821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 123 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27828129 - 27827951
Alignment:
Q  123 attctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtatacc 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27828129 attctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtatacc 27828030  T
Q  223 gagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaag 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27828029 gagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatggcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaag 27827951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 191 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 28885808 - 28885698
Alignment:
Q  191 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatct 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28885808 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatct 28885709  T
Q  291 tgttgaccaag 301  Q
    |||||||||||    
T  28885708 tgttgaccaag 28885698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 34701829 - 34701570
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||| ||||||| | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||| ||||    
T  34701829 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 34701730  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    |||||||||| || | || ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||    
T  34701729 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 34701630  T
Q  239 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgacc 298  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  34701629 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 34701570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 42394288 - 42394029
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||| ||||||| | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||| ||||    
T  42394288 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 42394189  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    |||||||||| || | || ||||||||| || || ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||    
T  42394188 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagttaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 42394089  T
Q  239 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgacc 298  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    
T  42394088 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcgtcttgttgacc 42394029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 298
Target Start/End: Original strand, 34533931 - 34534193
Alignment:
Q  36 acaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatta 135  Q
    ||||||||||| || ||||| | ||| |||||||| |||||  |||| || | ||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  34533931 acaatatcatactcggacaataacatctgccaacgagcaattcttcctgttaaagccggcttctcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatca 34534030  T
Q  136 accaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtc 235  Q
    ||||||| || || || |||| ||||||||| || || || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| | ||| || |  ||||| ||    
T  34534031 accaagtagtgtgattaaccatataatgacgaagacgcttagcagcccatgccaaagcgcaacaggttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatc 34534130  T
Q  236 ggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgacc 298  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||| || || || |||||||||||||| || |||||||||||    
T  34534131 ggtaaacttcttactcaagtagtaaatggcgtgctctttctttccagtctcgtcttgttgacc 34534193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 304
Target Start/End: Original strand, 21760104 - 21760371
Alignment:
Q  37 caatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaa 136  Q
    ||||||||||||| || || | ||| ||||| || |||||  |||| || | ||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||  | ||||| ||    
T  21760104 caatatcatattcggataataacatctgccaccgggcaattcttcctgtcaaagcgggtttctcaaagatgtacttgatcggatccatcttagatatcaa 21760203  T
Q  137 ccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcg 236  Q
    |||||| |||||  | | || ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| | ||| |||| |||||| ||     
T  21760204 ccaagtagtatgactaatcatatagtgacggaggcgtttggcggcccaggctagtgcgcaacaggtcttctcgagcatggaatagcgagattcacaatca 21760303  T
Q  237 gtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaagcac 304  Q
    || ||||||||||||| ||| || || ||||| || ||  ||||||| || |||||||| || |||||    
T  21760304 gtaaacttcttgctcaaataataaatggcatgctcctttcttccagtttcgtcttgttgtccgagcac 21760371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 12384413 - 12384148
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||| | ||||  | ||    
T  12384413 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 12384314  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    | || || || || | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || ||    
T  12384313 acgtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacacgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 12384214  T
Q  239 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaagcac 304  Q
     ||||||||||| | ||| || || || || |||||  |||| || ||||||||||| || |||||    
T  12384213 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcac 12384148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 22950146 - 22949881
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||| | ||||  | ||    
T  22950146 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 22950047  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    |||| || || || | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || ||    
T  22950046 aagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 22949947  T
Q  239 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaagcac 304  Q
     ||||| ||||| | ||| || || || || |||||  |||| || ||||||||||| || |||||    
T  22949946 aaactttttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcac 22949881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 298
Target Start/End: Original strand, 26723824 - 26724026
Alignment:
Q  96 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 195  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || || || |||| ||| ||||| || || || |||||||| || | ||| |    
T  26723824 ttctcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatcaaccaagtagtgtgattaaccatatagtgacgaagacgcttagcagcccatgccaaagcgc 26723923  T
Q  196 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttg 295  Q
    |||| || ||||||||||| | ||| || |  ||||| || || |||||||| ||||  ||||| || || || |||||||||||||| || ||||||||    
T  26723924 aacaggttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggcgtgctctttctttccagtctcgtcttgttg 26724023  T
Q  296 acc 298  Q
    |||    
T  26724024 acc 26724026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 44564775 - 44564472
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  44564775 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttctc 44564676  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44564675 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagaccacaacaa 44564576  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44564575 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 44564476  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  44564475 gcac 44564472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 31358319 - 31358016
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31358319 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 31358220  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31358219 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 31358120  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31358119 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 31358020  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  31358019 gcac 31358016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18713275 - 18712975
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18713275 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 18713176  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18713175 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcacaacaa 18713076  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18713075 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatggcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 18712976  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  18712975 g 18712975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 15771365 - 15771062
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15771365 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 15771266  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15771265 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 15771166  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15771165 gtcctctcaaacattgtataccgagtttcacaatcggtaaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 15771066  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  15771065 gcac 15771062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 19204787 - 19205087
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19204787 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 19204886  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19204887 aaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 19204986  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19204987 gtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgaccaa 19205086  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  19205087 g 19205087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 9358416 - 9358116
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  9358416 gaatgctacccttgattgccttttgagtcttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgctttctc 9358317  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9358316 aaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 9358217  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9358216 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 9358117  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  9358116 g 9358116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 19691889 - 19691589
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19691889 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 19691790  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  19691789 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgtaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 19691690  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19691689 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 19691590  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  19691589 g 19691589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 27605330 - 27605630
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27605330 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttctc 27605429  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  27605430 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaa 27605529  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27605530 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcctgttgaccaa 27605629  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  27605630 g 27605630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 28358377 - 28358677
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28358377 gaatactacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttctc 28358476  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28358477 aaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 28358576  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||    
T  28358577 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttcttcccggtttcatcttgttgaccaa 28358676  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  28358677 g 28358677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 29833115 - 29832817
Alignment:
Q  3 atgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaa 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  29833115 atgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgctttctcaa 29833016  T
Q  103 agatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29833015 agatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagt 29832916  T
Q  203 cttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaag 301  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  29832915 cttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaag 29832817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 33262523 - 33262225
Alignment:
Q  3 atgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaa 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  33262523 atgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttctcaa 33262424  T
Q  103 agatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33262423 agatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagt 33262324  T
Q  203 cttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaag 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  33262323 cttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaag 33262225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 14561415 - 14561115
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14561415 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 14561316  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  14561315 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 14561216  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14561215 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaatttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 14561116  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  14561115 g 14561115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 2133685 - 2133985
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  2133685 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaattttcccagtaacagcagctttctc 2133784  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  2133785 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaa 2133884  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  2133885 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcgatgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttccttccagtctcatcttgttgaccaa 2133984  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  2133985 g 2133985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18794495 - 18794195
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18794495 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 18794396  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  18794395 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgactcatcaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 18794296  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18794295 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcctgttgaccaa 18794196  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  18794195 g 18794195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 12089148 - 12089448
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  12089148 gaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttctc 12089247  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12089248 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 12089347  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12089348 gtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaa 12089447  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  12089448 g 12089448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 19678238 - 19677938
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19678238 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 19678139  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  19678138 gaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 19678039  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19678038 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 19677939  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  19677938 g 19677938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 31486296 - 31486596
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31486296 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaataccatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccggtaacagcagctttctc 31486395  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  31486396 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 31486495  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31486496 gtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtaaatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 31486595  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  31486596 g 31486596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 21344596 - 21344899
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21344596 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgtcagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttctc 21344695  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    | |||||||||| | | |  |  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| | || | ||||||||||    
T  21344696 agagatatacttgagctgggcggttctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcctaggccaaagcacaacaa 21344795  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21344796 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 21344895  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  21344896 gcac 21344899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 19657766 - 19658031
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  19657766 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcaactttctc 19657865  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  19657866 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgatttaccaaataatggcgcaggcgtttggcggcccaggccagagcacaacaa 19657965  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagca 266  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19657966 gtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagca 19658031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 33246160 - 33245894
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  33246160 gaatgctacctttgattgccttttaagctttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgtcagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttctc 33246061  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  33246060 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 33245961  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcat 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33245960 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttacttagatagtagatagcat 33245894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Original strand, 22077350 - 22077633
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22077350 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacatcagctttctc 22077449  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||        ||      |||||||||||||||||||||    
T  22077450 aaagatatacttgattggatccatcctggatatcaaccaagttgtatgattcatcaaatagtg--------gt------gcccaagctagagcacaacaa 22077535  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgacc 298  Q
    |||||||||||||| |||||  | | ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  22077536 gtcttctcaagcatcgtatattgggcttcgcagtcggtaaagttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgacc 22077633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22412691 - 22412432
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||| ||||||| | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||| ||||    
T  22412691 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 22412592  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    |||||||||| || | || ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||    
T  22412591 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 22412492  T
Q  239 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgacc 298  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22412491 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 22412432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19844920 - 19844661
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||| ||| ||| | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||| ||||    
T  19844920 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttctagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgattggatccatcttggatatcaacc 19844821  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    |||||||||| || | || ||||||||| || |||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| |||||    
T  19844820 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgtttggcagcccaggctaaatcacaacaagttttctcaagtaccgaatatcgggactcacaatcggt 19844721  T
Q  239 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgacc 298  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19844720 gaacttcttactcaaatagtagatagcttgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 19844661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 14212792 - 14212533
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||| ||||||| | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||| ||||    
T  14212792 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 14212693  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    |||||||||| || | || ||||||||| || || ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||    
T  14212692 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagttaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 14212593  T
Q  239 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgacc 298  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    
T  14212592 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcgtcttgttgacc 14212533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16769019 - 16768817
Alignment:
Q  96 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 195  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || || || |||| ||| ||||| || || || |||||||| || | ||| |    
T  16769019 ttctcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatcaaccaagtagtgtgattaaccatatagtgacgaagacgcttagcagcccatgccaaagcgc 16768920  T
Q  196 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttg 295  Q
    |||| || ||||||||||| | ||| || |  ||||| || || |||||||| ||||  ||||| || || || |||||||||||||| || ||||||||    
T  16768919 aacaggttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggcgtgctctttctttccagtctcgtcttgttg 16768820  T
Q  296 acc 298  Q
    |||    
T  16768819 acc 16768817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 54)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 13520599 - 13520902
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13520599 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 13520698  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13520699 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 13520798  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13520799 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 13520898  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  13520899 gcac 13520902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 14141801 - 14142104
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  14141801 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttctc 14141900  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14141901 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 14142000  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14142001 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagataacatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 14142100  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  14142101 gcac 14142104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 28164280 - 28163977
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28164280 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 28164181  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28164180 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 28164081  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28164080 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 28163981  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  28163980 gcac 28163977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 29505205 - 29504902
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29505205 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 29505106  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29505105 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 29505006  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29505005 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 29504906  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  29504905 gcac 29504902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 26789605 - 26789302
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  26789605 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttctc 26789506  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26789505 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcttttggcagcccaagctagagcacaacaa 26789406  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  26789405 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgaccaa 26789306  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  26789305 gcac 26789302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27197974 - 27197671
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27197974 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttctc 27197875  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27197874 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagctcaagctagagcacaacaa 27197775  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  27197774 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgaccaa 27197675  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  27197674 gcac 27197671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 27251261 - 27251564
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27251261 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttctc 27251360  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27251361 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagctcaagctagagcacaacaa 27251460  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  27251461 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgaccaa 27251560  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  27251561 gcac 27251564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 30554423 - 30554726
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30554423 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 30554522  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30554523 aaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 30554622  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30554623 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 30554722  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  30554723 gcac 30554726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 34460913 - 34461216
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34460913 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 34461012  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34461013 aaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 34461112  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34461113 gtcctctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 34461212  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  34461213 gcac 34461216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 27358517 - 27358820
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  27358517 gaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgctttctc 27358616  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27358617 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 27358716  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27358717 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaa 27358816  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  27358817 gcac 27358820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 27448860 - 27449163
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  27448860 gaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgctttctc 27448959  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27448960 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 27449059  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27449060 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaa 27449159  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  27449160 gcac 27449163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27061295 - 27060995
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27061295 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatataatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 27061196  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  27061195 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaa 27061096  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27061095 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 27060996  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  27060995 g 27060995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 27626118 - 27626418
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27626118 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccatcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 27626217  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27626218 aaagatatacttgattggatccattctagatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 27626317  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27626318 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacggtcggtgaacttcttgcttagatagtagatggcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 27626417  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  27626418 g 27626418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 29576803 - 29576503
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29576803 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 29576704  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29576703 aaagatatacttgattggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 29576604  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29576603 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgaccaa 29576504  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  29576503 g 29576503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 16677929 - 16677626
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16677929 gaatgctacctttgattgccctttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 16677830  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16677829 aaagacatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcacaacaa 16677730  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16677729 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcagtgaacttcttgctcaggtagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 16677630  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  16677629 gcac 16677626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 3699872 - 3699572
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3699872 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 3699773  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  3699772 aaagatatactttattggatccattctggatattaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 3699673  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3699672 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 3699573  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  3699572 g 3699572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27011520 - 27011220
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27011520 gaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 27011421  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27011420 aaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 27011321  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27011320 gtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaa 27011221  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  27011220 g 27011220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27180245 - 27179945
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27180245 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 27180146  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| | || ||||||||||||    
T  27180145 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtggtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcctaggccagagcacaacaa 27180046  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27180045 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 27179946  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  27179945 g 27179945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 27268994 - 27269294
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27268994 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 27269093  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| | || ||||||||||||    
T  27269094 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtggtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcctaggccagagcacaacaa 27269193  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27269194 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 27269293  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  27269294 g 27269294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 29553346 - 29553046
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29553346 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 29553247  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  29553246 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaa 29553147  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29553146 gtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 29553047  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  29553046 g 29553046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 33372838 - 33373138
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33372838 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 33372937  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33372938 aaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 33373037  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33373038 gtcttctcaagcagtgtataccgagtttcgcaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 33373137  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  33373138 g 33373138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 4761552 - 4761252
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  4761552 gaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttctc 4761453  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4761452 aaagatatactttatcggatccattctatatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 4761353  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4761352 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaa 4761253  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  4761252 g 4761252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 13295358 - 13295658
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13295358 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 13295457  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  13295458 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 13295557  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13295558 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcctgttgaccaa 13295657  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  13295658 g 13295658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 8902110 - 8902413
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  8902110 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatattcccagtaacagcagctttctc 8902209  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  8902210 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaa 8902309  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8902310 gttttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 8902409  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  8902410 gcac 8902413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 4776669 - 4776369
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  4776669 gaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgctttctc 4776570  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4776569 aaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 4776470  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4776469 gtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaa 4776370  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  4776369 g 4776369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16753610 - 16753310
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16753610 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagccgctttctc 16753511  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  16753510 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaa 16753411  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16753410 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 16753311  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  16753310 g 16753310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 24867505 - 24867209
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24867505 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccggtaacagcagctttctc 24867406  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  24867405 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaa 24867306  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgac 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24867305 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgac 24867209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27022925 - 27022625
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27022925 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 27022826  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  27022825 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgactcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 27022726  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27022725 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcctgttgaccaa 27022626  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  27022625 g 27022625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 27286773 - 27287071
Alignment:
Q  3 atgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  27286773 atgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccaacgtgcaatcttcccagtaatagcagctttctcaa 27286872  T
Q  103 agatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  27286873 agatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcatcaaatagtggcgcaggcgtttggcagcccatgccaaagcacaacaagt 27286972  T
Q  203 cttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaag 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27286973 cttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaag 27287071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 4529074 - 4528774
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  4529074 gaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttctc 4528975  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4528974 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 4528875  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4528874 gtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaa 4528775  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  4528774 g 4528774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 26922166 - 26921866
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26922166 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagccgctttctc 26922067  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||     
T  26922066 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgactcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacag 26921967  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26921966 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 26921867  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  26921866 g 26921866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27488922 - 27488622
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27488922 gaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttctc 27488823  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  27488822 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaggttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaa 27488723  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27488722 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 27488623  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  27488622 g 27488622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 16940434 - 16940734
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16940434 gaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttctc 16940533  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  16940534 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 16940633  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16940634 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaa 16940733  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  16940734 g 16940734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 22931291 - 22931591
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22931291 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 22931390  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||||    
T  22931391 gaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcggttagcggcccaggccaaagcacaacaa 22931490  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22931491 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatatcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 22931590  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  22931591 g 22931591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 23853736 - 23854036
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23853736 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 23853835  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||||    
T  23853836 gaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcggttagcggcccaggccaaagcacaacaa 23853935  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23853936 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatatcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 23854035  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  23854036 g 23854036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 26112819 - 26113119
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  26112819 gaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttctc 26112918  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26112919 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 26113018  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26113019 gtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaa 26113118  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  26113119 g 26113119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 28211243 - 28210943
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  28211243 gaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttctc 28211144  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28211143 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 28211044  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28211043 gtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaa 28210944  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  28210943 g 28210943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 26775034 - 26775337
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26775034 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacgatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 26775133  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  26775134 gaagatatactttatcggatccattttggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaa 26775233  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26775234 gtcttctcgagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 26775333  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  26775334 gcac 26775337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 4542181 - 4542481
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  4542181 gaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttctc 4542280  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4542281 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 4542380  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4542381 gtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaacttcttacttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaa 4542480  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  4542481 g 4542481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 4720542 - 4720842
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  4720542 gaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttctc 4720641  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4720642 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 4720741  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4720742 gtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaacttcttacttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaa 4720841  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  4720842 g 4720842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 15420727 - 15421027
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  15420727 gaatgctacctttgattcccttttgagttttgaacacaacatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcctagtaacagcagctttctc 15420826  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||| ||||||    
T  15420827 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccacgttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcgcaacaa 15420926  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15420927 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 15421026  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  15421027 g 15421027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 17088852 - 17089150
Alignment:
Q  3 atgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaa 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||  ||||||||||    
T  17088852 atgctacctttgattgccatttgagttttgaacacaatatcatattcggacaagagcatctgccatcgtgcaatcttccctgtaacagtcgctttctcaa 17088951  T
Q  103 agatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  17088952 agatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcacaacaagt 17089051  T
Q  203 cttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaag 301  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17089052 cttttcaagcatcgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtcccatcttgttgaccaag 17089150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20172336 - 20172037
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  20172336 gaatgctacctttgattgccttttgaaccttgaacacaatgtcatattcagataaaagcatctgccaacgtgcaatcttcccggtaacagcaggtttctc 20172237  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||    
T  20172236 gaagatgtactttatcggatccattttggatatcaaccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttagcaacccaggccagagcacaacaa 20172137  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20172136 gtcttctcaagcatagtataccgagtctcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 20172037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 22163655 - 22163954
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  22163655 gaatgctacctttgattgccttttgaaccttgaacacaatgtcatattcagataaaagcatctgccaacgtgcaatcttcccggtaacagcaggtttctc 22163754  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||    
T  22163755 gaagatgtactttatcggatccattttggatatcaaccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttagcaacccaggccagagcacaacaa 22163854  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22163855 gtcttctcaagcatagtataccgagtctcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 22163954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 24302164 - 24302430
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24302164 gaatgctacctttgattgccttttgagctttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgtcagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 24302263  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  24302264 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcacaacaa 24302363  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcat 267  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24302364 gtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacggtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcat 24302430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 90 - 301
Target Start/End: Original strand, 22455610 - 22455821
Alignment:
Q  90 gcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagcta 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22455610 gcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagcta 22455709  T
Q  190 gagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatc 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22455710 gagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcgatgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatc 22455809  T
Q  290 ttgttgaccaag 301  Q
    ||||||||||||    
T  22455810 ttgttgaccaag 22455821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 189 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 26992396 - 26992284
Alignment:
Q  189 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcat 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26992396 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 26992297  T
Q  289 cttgttgaccaag 301  Q
    | |||||||||||    
T  26992296 cctgttgaccaag 26992284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 15408940 - 15409055
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  15408940 gaatgctacctttgattcccttttgagttttgaacacaacatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcctagtaacagcagctttctc 15409039  T
Q  101 aaagatatactttatc 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  15409040 aaagatatactttatc 15409055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 34 - 298
Target Start/End: Original strand, 23971210 - 23971474
Alignment:
Q  34 acacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatat 133  Q
    ||||||||||||| || ||||| | ||| ||||| |  |||||| ||||||| | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||  |||||||    
T  23971210 acacaatatcatactcggacaataacatctgccatcaagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgattggatccatcttggatat 23971309  T
Q  134 taaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacag 233  Q
     |||||||||||||| || | || ||||||||| || || ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  |||||     
T  23971310 caaccaagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaggctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaa 23971409  T
Q  234 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgacc 298  Q
    || ||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23971410 tcagtgaacttcttactcaaatagtagatatcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 23971474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18120220 - 18119961
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||| ||||||| | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||| ||||    
T  18120220 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 18120121  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    |||||||||| || | || ||||||||| || || ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||    
T  18120120 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagttaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 18120021  T
Q  239 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgacc 298  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    
T  18120020 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcgtcttgttgacc 18119961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 298
Target Start/End: Original strand, 18212114 - 18212373
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||| ||||||| | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||| ||||    
T  18212114 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 18212213  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    |||||||||| || | || ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  |  || || |  ||||| || ||    
T  18212214 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagagtatcgggactcacaatcagt 18212313  T
Q  239 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgacc 298  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| | || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18212314 gaacttcttactcaaatagtagataacgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 18212373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27545656 - 27545394
Alignment:
Q  36 acaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatta 135  Q
    ||||||||||| || ||||| | ||| |||||||| |||||  |||| || | ||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  27545656 acaatatcatactcggacaataacatctgccaacgagcaattcttcctgttaaagccggcttctcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatca 27545557  T
Q  136 accaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtc 235  Q
    ||||||| || || || |||| ||| ||||| || || || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| | ||| || |  ||||| ||    
T  27545556 accaagtagtgtgattaaccatatagtgacgaagacgcttagcagcccatgccaaagcgcaacaggttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatc 27545457  T
Q  236 ggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgacc 298  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||| || || || |||||||||||||| || |||||||||||    
T  27545456 ggtaaacttcttactcaagtagtaaatggcgtgctctttctttccagtctcgtcttgttgacc 27545394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 304
Target Start/End: Original strand, 9135798 - 9136063
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    |||||||| ||||| |  ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||| | ||||  | ||    
T  9135798 atatcatactcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 9135897  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    |||| || || || | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || ||    
T  9135898 aagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 9135997  T
Q  239 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaagcac 304  Q
     ||||||||||| | ||| || || || || |||||  |||| || ||||||||||| || |||||    
T  9135998 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcac 9136063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 36 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 25707765 - 25707505
Alignment:
Q  36 acaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatta 135  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||  |||| || | |||||  |||||||| || ||||| || ||||||||| ||||||| |    
T  25707765 acaatatcatactcggacaatagcatctgccaacgagcaattcttcctgttaaagcaggcttctcaaaaatgtacttgattggatccattttggatatca 25707666  T
Q  136 accaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtc 235  Q
    ||||||| || || || ||||  || ||||| || || || |||||||| |  | ||| ||||| || ||||| ||||| | ||| |  |  ||||| ||    
T  25707665 accaagtagtgtgattaaccatttattgacgaagacgcttagcagcccatgtcaaagcgcaacaggttttctctagcatagaatatctggactcacaatc 25707566  T
Q  236 ggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttga 296  Q
     || |||||||| ||||  ||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||    
T  25707565 agtaaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttttttccagtctcgtcttgttga 25707505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 72)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 5714826 - 5714523
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714826 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatactcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 5714727  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5714726 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagggcacaacaa 5714627  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5714626 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 5714527  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  5714526 gcac 5714523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 5725736 - 5725433
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5725736 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatactcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 5725637  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5725636 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagggcacaacaa 5725537  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5725536 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 5725437  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  5725436 gcac 5725433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 5766632 - 5766935
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5766632 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatactcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 5766731  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5766732 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagggcacaacaa 5766831  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5766832 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 5766931  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  5766932 gcac 5766935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 32294381 - 32294078
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32294381 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 32294282  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32294281 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 32294182  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32294181 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 32294082  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  32294081 gcac 32294078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 28112461 - 28112761
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28112461 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 28112560  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28112561 aaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 28112660  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28112661 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 28112760  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  28112761 g 28112761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 5592864 - 5593167
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5592864 gaatgctacctttgattgccttttgcgttttgaacacaatatcatattcagacagaagcatctgccagtgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 5592963  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5592964 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 5593063  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5593064 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 5593163  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  5593164 gcac 5593167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 8215488 - 8215185
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8215488 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 8215389  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8215388 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 8215289  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8215288 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtaggtagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgaccaa 8215189  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  8215188 gcac 8215185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 6205656 - 6205356
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6205656 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccaacgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 6205557  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  6205556 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaagccagagcacaacaa 6205457  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6205456 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 6205357  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  6205356 g 6205356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18228949 - 18228649
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18228949 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 18228850  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18228849 aaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 18228750  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18228749 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 18228650  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  18228649 g 18228649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 5017467 - 5017164
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5017467 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 5017368  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5017367 aaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggtagcccaagctagagcacaacaa 5017268  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5017267 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 5017168  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  5017167 gcac 5017164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 21678456 - 21678156
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21678456 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttctc 21678357  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678356 aaagatatactttatcggatccattctggatatcatccaagttgtatgatttaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 21678257  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  21678256 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttcccgtttcatcttgttgaccaa 21678157  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  21678156 g 21678156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 31032743 - 31033046
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31032743 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 31032842  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||    
T  31032843 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaagccaaagcacaacaa 31032942  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31032943 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 31033042  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  31033043 gcac 31033046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 51785776 - 51785473
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  51785776 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtgacagcagctttctc 51785677  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51785676 gaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 51785577  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51785576 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 51785477  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  51785476 gcac 51785473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 4627538 - 4627238
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4627538 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaacagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 4627439  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4627438 aaagatatactttattggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaagctagagcacaacaa 4627339  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4627338 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 4627239  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  4627238 g 4627238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 5605821 - 5606121
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5605821 gaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcggacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctc 5605920  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5605921 aaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 5606020  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5606021 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 5606120  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  5606121 g 5606121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 22384085 - 22384385
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22384085 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 22384184  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  22384185 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 22384284  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22384285 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 22384384  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  22384385 g 22384385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 20573350 - 20573653
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20573350 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccatcgtgcaatctttccagtaacggccgctttctc 20573449  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20573450 aaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttagcagcccaagctagggcacaacaa 20573549  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20573550 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 20573649  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  20573650 gcac 20573653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 29661477 - 29661780
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  29661477 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacagaagcatctgccatcgtgcaatctttccagtaacggccgctttctc 29661576  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29661577 aaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagggcacaacaa 29661676  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29661677 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 29661776  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  29661777 gcac 29661780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 47027206 - 47026903
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47027206 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtgacagcagctttctc 47027107  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47027106 aaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 47027007  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47027006 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 47026907  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  47026906 gcac 47026903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 32442904 - 32442604
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32442904 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccatcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 32442805  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  32442804 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 32442705  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32442704 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 32442605  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  32442604 g 32442604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 7076959 - 7076659
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7076959 gaatactacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 7076860  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  7076859 aaagatatattttatcggatccattctggatgtcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaa 7076760  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7076759 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 7076660  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  7076659 g 7076659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 8285977 - 8286277
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8285977 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccggtaacagcagctttctc 8286076  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||    
T  8286077 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaagccaaagcacaacaa 8286176  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8286177 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 8286276  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  8286277 g 8286277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 18304161 - 18304461
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18304161 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 18304260  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  18304261 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 18304360  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18304361 gccttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 18304460  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  18304461 g 18304461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 24331916 - 24331616
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  24331916 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgctttctc 24331817  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24331816 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcacaacaa 24331717  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  24331716 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaa 24331617  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  24331616 g 24331616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 4725384 - 4725084
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4725384 gaatgctacctttgatttccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 4725285  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  4725284 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 4725185  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4725184 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 4725085  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  4725084 g 4725084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 4793142 - 4793442
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4793142 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 4793241  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  4793242 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgactcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 4793341  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4793342 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcctgttgaccaa 4793441  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  4793442 g 4793442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10399897 - 10399597
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10399897 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagccgctttctc 10399798  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  10399797 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 10399698  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10399697 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 10399598  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  10399597 g 10399597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 11106866 - 11107166
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11106866 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 11106965  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||| || | ||||||||||    
T  11106966 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagaggcccaggccaaagcacaacaa 11107065  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11107066 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaatttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 11107165  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  11107166 g 11107166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 15737601 - 15737901
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15737601 gaatgctacatttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 15737700  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  15737701 aaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 15737800  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15737801 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 15737900  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  15737901 g 15737901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18246494 - 18246194
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  18246494 gaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttctc 18246395  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18246394 aaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 18246295  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18246294 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 18246195  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  18246194 g 18246194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 18273559 - 18273859
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18273559 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 18273658  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  18273659 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 18273758  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18273759 gccttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttccttctttccagtctcatcttgttgaccaa 18273858  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  18273859 g 18273859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 18288860 - 18289160
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18288860 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 18288959  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  18288960 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 18289059  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18289060 gccttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttccttctttccagtctcatcttgttgaccaa 18289159  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  18289160 g 18289160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18334383 - 18334083
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18334383 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 18334284  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  18334283 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 18334184  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18334183 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 18334084  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  18334083 g 18334083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 19698243 - 19697943
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19698243 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaatacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgggcaatcttcccagtaacagcagctttctc 19698144  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  19698143 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaa 19698044  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19698043 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 19697944  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  19697943 g 19697943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 28025035 - 28024735
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  28025035 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaacaacatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgctttctc 28024936  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28024935 aaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 28024836  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28024835 gtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaattggtgaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 28024736  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  28024735 g 28024735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 35884519 - 35884219
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35884519 gaatgctacctttaattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 35884420  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  35884419 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaa 35884320  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35884319 gtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 35884220  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  35884219 g 35884219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 8299724 - 8299421
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8299724 gaattctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 8299625  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||    
T  8299624 aaagatatactttatcggatccattatggatatcaaccaagttgtatgattcatcaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaagccaaagcacaacaa 8299525  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  8299524 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccaatctcatcttgttgaccaa 8299425  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  8299424 gcac 8299421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 48469680 - 48469377
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  48469680 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgcgcaatctttccagtaacggccgctttctc 48469581  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  48469580 aaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 48469481  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48469480 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 48469381  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  48469380 gcac 48469377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 4420668 - 4420368
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  4420668 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgctttctc 4420569  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4420568 aaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcacaacaa 4420469  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4420468 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagataatagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 4420369  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  4420368 g 4420368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 4687408 - 4687108
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4687408 gaatgctacctttgactgtcttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 4687309  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  4687308 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 4687209  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4687208 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 4687109  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  4687108 g 4687108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 17981456 - 17981756
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17981456 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 17981555  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  17981556 aaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 17981655  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17981656 gtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtaaatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 17981755  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  17981756 g 17981756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 20069793 - 20069493
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20069793 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaacagcatctgctagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 20069694  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  20069693 aaagatatactttatcggatccattctggatttcaaccaagttgtatgattcaccagataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaa 20069594  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20069593 gtcttctcaagcattgcataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 20069494  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  20069493 g 20069493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 29145263 - 29145563
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  29145263 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagataaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccggtaacagccgctttctc 29145362  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  29145363 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 29145462  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29145463 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 29145562  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  29145563 g 29145563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 5470741 - 5470441
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  5470741 gaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgctttctc 5470642  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5470641 aaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccacgctagagcacaacaa 5470542  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5470541 gtcttctctagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaa 5470442  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  5470441 g 5470441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 8000313 - 8000013
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  8000313 gaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttctc 8000214  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8000213 aaagatatactttattggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcacaacaa 8000114  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  8000113 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaa 8000014  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  8000013 g 8000013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10646826 - 10646526
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  10646826 gaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttctc 10646727  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10646726 aaagatatactttattggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcacaacaa 10646627  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10646626 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaa 10646527  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  10646526 g 10646526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18055015 - 18054715
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18055015 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 18054916  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||  | ||||||||||||    
T  18054915 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccagaccagagcacaacaa 18054816  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18054815 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttacttaaatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 18054716  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  18054715 g 18054715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 31960962 - 31961262
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  31960962 gaatgctgtctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttctc 31961061  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31961062 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcacaacaa 31961161  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  31961162 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaa 31961261  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  31961262 g 31961262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 4343183 - 4343483
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  4343183 gaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaacaacatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttctc 4343282  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||    
T  4343283 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggctaaagcacaacaa 4343382  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4343383 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaa 4343482  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  4343483 g 4343483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 15889212 - 15889512
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15889212 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttctc 15889311  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||    
T  15889312 aaagatatactttaccggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgcttagcggcccaggccagagcacaacaa 15889411  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15889412 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtgaacttcttgcttatatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcctgttgaccaa 15889511  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  15889512 g 15889512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 28342930 - 28342627
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  28342930 gaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttctc 28342831  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  28342830 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 28342731  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28342730 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 28342631  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  28342630 gcac 28342627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Original strand, 6539249 - 6539546
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  6539249 gaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttccccgtaacggccgctttctc 6539348  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6539349 aaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcacaacaa 6539448  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgacc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  6539449 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 6539546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 22867355 - 22867655
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  22867355 gaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttctc 22867454  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22867455 aaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagtgcacaacaa 22867554  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  22867555 gtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgctctttctttccggttttatcttgttgaccaa 22867654  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  22867655 g 22867655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 22882414 - 22882714
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  22882414 gaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttctc 22882513  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22882514 aaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagtgcacaacaa 22882613  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  22882614 gtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgctctttctttccggttttatcttgttgaccaa 22882713  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  22882714 g 22882714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 16620997 - 16621297
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  16620997 gaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatctgccagcgtgcaatcttcctagtaacagcaggtttctc 16621096  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  | ||||||||||||    
T  16621097 gaagatatactttatctgatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaagcgtttggcggcccagaccagagcacaacaa 16621196  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16621197 gtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcagtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 16621296  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  16621297 g 16621297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5653838 - 5653573
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5653838 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcacctgtcagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttctc 5653739  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||| |||||    
T  5653738 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaagcgtttagcggcccaggccagagcataacaa 5653639  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagca 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  5653638 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgagcttcttgcttagatagtagatagca 5653573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 89 - 304
Target Start/End: Original strand, 17992526 - 17992741
Alignment:
Q  89 agcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagct 188  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17992526 agcagctttctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagct 17992625  T
Q  189 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcat 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17992626 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcat 17992725  T
Q  289 cttgttgaccaagcac 304  Q
    || ||||||| |||||    
T  17992726 ctcgttgaccgagcac 17992741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 17973368 - 17973460
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcag 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17973368 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcag 17973460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 298
Target Start/End: Original strand, 11924903 - 11925162
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||| ||||||| | ||| |  |||||||| || ||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  11924903 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcctggatatcaacc 11925002  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    |||||||||| || | || ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||    
T  11925003 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 11925102  T
Q  239 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgacc 298  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  11925103 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 11925162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 6572069 - 6571810
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    |||||||| || ||||| | ||||||||| || || ||| ||||||| | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||| ||||    
T  6572069 atatcatactcggacaataacatttgccagcgagcgatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgattggatccatcttggatatcaacc 6571970  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    |||||||||| || | || ||||||||| || || ||||| ||||| || | |||||||||||| |||||||| |  | ||| ||||  ||||| || ||    
T  6571969 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcggcccaggccaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgagactcacaatcagt 6571870  T
Q  239 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgacc 298  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  6571869 gaacttcttactcaaatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 6571810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22960168 - 22959909
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||| ||||||| | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||| ||||    
T  22960168 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 22960069  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    |||||||||| || | || ||||||||| || || ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||    
T  22960068 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagttaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 22959969  T
Q  239 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgacc 298  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22959968 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 22959909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 63 - 298
Target Start/End: Original strand, 7088596 - 7088831
Alignment:
Q  63 tgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataat 162  Q
    ||||| || |||||| ||||||| | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||| |||||||||||||| || | || |||||    
T  7088596 tgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaaccaagttgtatgattaatcatataat 7088695  T
Q  163 gacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagat 262  Q
    |||| || || ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||||||||||| |||| |||||||||    
T  7088696 gacggagacgcttggcagcccaggctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaacttcttactcaaatagtagat 7088795  T
Q  263 agcatgttctttctttccagtatcatcttgttgacc 298  Q
    ||| || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7088796 agcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 7088831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16432120 - 16431861
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||| ||||||| | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||| ||||    
T  16432120 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 16432021  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    |||||||||| || | || ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  |  || || |  ||||| || ||    
T  16432020 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagagtatcgggactcacaatcagt 16431921  T
Q  239 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgacc 298  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| | || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16431920 gaacttcttactcaaatagtagataacgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 16431861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 96 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15705131 - 15704929
Alignment:
Q  96 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 195  Q
    |||||||| || ||||| || || |||||  ||||||| |||||||||||||| || | || ||||||||| || || ||||||||||| |||| |||||    
T  15705131 ttctcaaatatgtacttgattgggtccatcttggatatcaaccaagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaggctaaagcac 15705032  T
Q  196 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttg 295  Q
    ||||||| |||||||| |  |  || || |  ||||| || ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15705031 aacaagttttctcaagtacagagtatcgggactcacaatcagtgaatttcttactcaaatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttg 15704932  T
Q  296 acc 298  Q
    |||    
T  15704931 acc 15704929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 15919175 - 15918976
Alignment:
Q  96 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 195  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| |||||  | | || ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  15919175 ttctcaaatatgtacttgattggatccattttggatatcaaccaagtagtatgactaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggccagagcac 15919076  T
Q  196 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttg 295  Q
    |||||||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||| ||||| | ||| || || || || || ||| ||||| | |||||||||||    
T  15919075 aacaagtcctctcaagcatggaatagcgagattcacagtcagtaaactttttgcttaaataataaatggcgtgctccttccttccaatttcatcttgttg 15918976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 20443834 - 20443567
Alignment:
Q  37 caatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaa 136  Q
    ||||||||||||| || || | ||| ||||| || |||||  |||| || | ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||  | ||||| ||    
T  20443834 caatatcatattcggataataacatctgccaccgggcaattcttcctgtcaaagcaggtttctcaaagatgtacttgatcggatccatcttagatatcaa 20443735  T
Q  137 ccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcg 236  Q
    |||||| |||||  | | || ||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| | ||| |||| |||||||||     
T  20443734 ccaagtagtatgactaatcatatagtgacggagacgtttagcagcccaggctagtgcgcaacaagtcttctcgagcatggaatagcgagattcacagtca 20443635  T
Q  237 gtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaagcac 304  Q
    || ||||||||||||| ||| || || ||||| || ||  ||||||| || |||||||| || |||||    
T  20443634 gtaaacttcttgctcaaataataaatggcatgctcctttcttccagtttcgtcttgttgtccgagcac 20443567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 304
Target Start/End: Original strand, 6962973 - 6963243
Alignment:
Q  34 acacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatat 133  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||  |||| || |  || |  |||||||| |  ||||| |||||||||||| |||||||    
T  6962973 acacaatatcatattcagacaataacatctgccaacgagcaattcttcctgttaacgccggcttctcaaaaaggtacttgatcggatccattttggatat 6963072  T
Q  134 taaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacag 233  Q
     |||||||| || ||||  ||||  || ||||| || || || || ||||| || | ||| |||||||| ||||||||||| | ||| || |  |||||     
T  6963073 caaccaagtagtgtggtaaaccatgtagtgacggagacgcttagcggcccatgccaaagcgcaacaagttttctcaagcatagaatatcgggactcacaa 6963172  T
Q  234 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaagcac 304  Q
    || || |||||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  6963173 tcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttctttccagtttcgtcttgttgaccaagcac 6963243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 250
Target Start/End: Original strand, 15592513 - 15592667
Alignment:
Q  96 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 195  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||| | |||||| |||||  | | || ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15592513 ttctcaaatatgtacttgatcggatccattttagatatcagccaagtagtatgactaatcatataatgacggaggcgtttggcaacccaggctagagcac 15592612  T
Q  196 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgct 250  Q
    |||||||| |||||||||| | ||| |||| ||||| ||| || |||||||||||    
T  15592613 aacaagtcctctcaagcatggaatagcgagattcaccgtcagtaaacttcttgct 15592667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 304
Target Start/End: Original strand, 5950347 - 5950612
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||| | ||||  | ||    
T  5950347 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 5950446  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    |||| || || || | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || ||    
T  5950447 aagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacacgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 5950546  T
Q  239 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaagcac 304  Q
     ||||||||||| | ||| || || || || |||||  |||| || ||||||||||| || |||||    
T  5950547 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcac 5950612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 46381049 - 46380784
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||| | ||||||||| || || || || ||||||||| | ||||  | ||    
T  46381049 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggtttctcaaatatgtatttgattggatccattttagataccagcc 46380950  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    |||| || ||||| | || ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || ||    
T  46380949 aagtagtgtggttaatcatataatgacggaggcgcttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 46380850  T
Q  239 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaagcac 304  Q
     ||||||||||| | ||| || || || || |||||  |||| || ||||||||||| || |||||    
T  46380849 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcac 46380784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 250
Target Start/End: Original strand, 37260254 - 37260465
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||| |||| || | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||| | ||||  | ||    
T  37260254 atatcatattcagatagtagcatttgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 37260353  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    |||| |  || || |  | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || ||    
T  37260354 aagtagcgtgattaattatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtatcgagattcacattcagt 37260453  T
Q  239 gaacttcttgct 250  Q
     |||||||||||    
T  37260454 aaacttcttgct 37260465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 4450493 - 4450387
Alignment:
Q  36 acaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatta 135  Q
    ||||||||||| ||  |||| | |||||||||||| |||||  |||| || | ||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  4450493 acaatatcatactcgaacaataacatttgccaacgagcaattcttcctgttaaagccggcttctcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatca 4450394  T
Q  136 accaagt 142  Q
    |||||||    
T  4450393 accaagt 4450387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 16747866 - 16748166
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16747866 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 16747965  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16747966 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 16748065  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16748066 gtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 16748165  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  16748166 g 16748166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 2777043 - 2776740
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2777043 gaatgctacctttgattgccttttgagctttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttctc 2776944  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2776943 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 2776844  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2776843 gtcttcgcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 2776744  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  2776743 gcac 2776740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 31127696 - 31127393
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31127696 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttctc 31127597  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31127596 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcatcaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 31127497  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  31127496 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgaccaa 31127397  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  31127396 gcac 31127393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 26512045 - 26512348
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  26512045 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttctc 26512144  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26512145 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaatcaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 26512244  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  26512245 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgaccga 26512344  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  26512345 gcac 26512348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 26681455 - 26681758
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  26681455 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgcccgcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttctc 26681554  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26681555 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 26681654  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  26681655 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgaccga 26681754  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  26681755 gcac 26681758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 39209488 - 39209791
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  39209488 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttctc 39209587  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39209588 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaatcaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 39209687  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  39209688 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgaccga 39209787  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  39209788 gcac 39209791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 45391009 - 45390706
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45391009 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 45390910  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45390909 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 45390810  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45390809 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 45390710  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  45390709 gcac 45390706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 26316197 - 26316497
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26316197 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 26316296  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26316297 aaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 26316396  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26316397 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgaccaa 26316496  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  26316497 g 26316497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 26666263 - 26666566
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26666263 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtgacagcagctttctc 26666362  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26666363 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 26666462  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26666463 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 26666562  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  26666563 gcac 26666566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 4203178 - 4202875
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4203178 gaatgctacctttgatggccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 4203079  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4203078 aaagatatatttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 4202979  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4202978 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 4202879  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  4202878 gcac 4202875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 5143689 - 5143989
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  5143689 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggctgctttctc 5143788  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5143789 aaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 5143888  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5143889 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 5143988  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  5143989 g 5143989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 26271435 - 26271735
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  26271435 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttcccgtaacaacagctttctc 26271534  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26271535 aaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 26271634  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26271635 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgaccaa 26271734  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  26271735 g 26271735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 2158363 - 2158063
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2158363 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 2158264  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  2158263 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 2158164  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  2158163 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaa 2158064  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  2158063 g 2158063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 10913218 - 10913518
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10913218 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 10913317  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  10913318 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 10913417  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10913418 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 10913517  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  10913518 g 10913518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 11421128 - 11421428
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11421128 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 11421227  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  11421228 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaa 11421327  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11421328 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 11421427  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  11421428 g 11421428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 5131785 - 5131485
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  5131785 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcctagtaacagcagctttctc 5131686  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||| | || ||||||||||||    
T  5131685 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacacaggcgtttagcggcctaggccagagcacaacaa 5131586  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5131585 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 5131486  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  5131485 g 5131485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 16514779 - 16515079
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16514779 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 16514878  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  16514879 aaagatatactttatcggatctattctggatatcaaccacgttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaa 16514978  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16514979 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 16515078  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  16515079 g 16515079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 2106512 - 2106811
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2106512 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttctc 2106611  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  2106612 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 2106711  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2106712 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 2106811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22145984 - 22145684
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22145984 gaatgctacctttgattgcctttcgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 22145885  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  22145884 aaagatatactttatcggatccattatggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 22145785  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22145784 gtcttctcgagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 22145685  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  22145684 g 22145684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 31086971 - 31087271
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31086971 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacagaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 31087070  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  31087071 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 31087170  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31087171 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 31087270  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  31087271 g 31087271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 4141595 - 4141898
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4141595 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagccgctttctc 4141694  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  4141695 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtgtgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 4141794  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4141795 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 4141894  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  4141895 gcac 4141898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 24588883 - 24589183
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24588883 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 24588982  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  24588983 aaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 24589082  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24589083 gtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtaaatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 24589182  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  24589183 g 24589183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 26534222 - 26534522
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26534222 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 26534321  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  26534322 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 26534421  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26534422 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcaccatcggtgaatttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaa 26534521  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  26534522 g 26534522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 31560739 - 31561039
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  31560739 gaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttctc 31560838  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31560839 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 31560938  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  31560939 gtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaa 31561038  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  31561039 g 31561039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 301
Target Start/End: Original strand, 16446357 - 16446655
Alignment:
Q  3 atgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16446357 atgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaataccatattcagacaagagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttctcaa 16446456  T
Q  103 agatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || ||||||||||||||    
T  16446457 agatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttaacggcccaggccagagcacaacaagt 16446556  T
Q  203 cttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaag 301  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16446557 cttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaag 16446655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 3449095 - 3448792
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  3449095 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtgacggcagctttctc 3448996  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  3448995 gaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtgtgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 3448896  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3448895 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcctgttgaccaa 3448796  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  3448795 gcac 3448792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 26516581 - 26516278
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26516581 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacagaagcatctgccatcgtgcaatctttccagtaacggccgctttctc 26516482  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  26516481 aaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 26516382  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  26516381 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccga 26516282  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  26516281 gcac 26516278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16045104 - 16044807
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16045104 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctaccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 16045005  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||   ||||    
T  16045004 aaagatatactttatcgaatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaagccagagc---acaa 16044908  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16044907 gtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 16044808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10845409 - 10845109
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  10845409 gaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcggacaagagcatttgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcaggtttctc 10845310  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  10845309 gaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcacaacaa 10845210  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10845209 gtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 10845110  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  10845109 g 10845109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 11444676 - 11444376
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11444676 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 11444577  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  11444576 gaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtgtgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 11444477  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11444476 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaa 11444377  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  11444376 g 11444376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 26439046 - 26438746
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  26439046 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttctc 26438947  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  26438946 aaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 26438847  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26438846 gtcttctcgagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatggcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 26438747  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  26438746 g 26438746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Original strand, 10842343 - 10842640
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  10842343 gaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcggacaagagcatttgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcaggtttctc 10842442  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  10842443 gaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcacaacaa 10842542  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgacc 298  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10842543 gtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacc 10842640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 45735096 - 45734799
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45735096 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 45734997  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||      |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  45734996 aaagata------atcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 45734903  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45734902 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 45734803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5162172 - 5161907
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5162172 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcacctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttctc 5162073  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  5162072 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaa 5161973  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagca 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5161972 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagca 5161907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 29090267 - 29090008
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||| ||||||| | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||| ||||    
T  29090267 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 29090168  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    |||||||||| || | || ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||    
T  29090167 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 29090068  T
Q  239 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgacc 298  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  29090067 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 29090008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 2557286 - 2557027
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||| ||||||| | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||| ||||    
T  2557286 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 2557187  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    |||||||||| || | || ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||    
T  2557186 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 2557087  T
Q  239 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgacc 298  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    
T  2557086 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcgtcttgttgacc 2557027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 63 - 298
Target Start/End: Original strand, 16127229 - 16127464
Alignment:
Q  63 tgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataat 162  Q
    ||||| || |||||| ||||||| | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||| |||||||||||||| || | || |||||    
T  16127229 tgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaaccaagttgtatgattaatcatataat 16127328  T
Q  163 gacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagat 262  Q
    |||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||||||||||| |||| |||||||||    
T  16127329 gacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaacttcttactcaaatagtagat 16127428  T
Q  263 agcatgttctttctttccagtatcatcttgttgacc 298  Q
    ||| || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16127429 agcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 16127464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15193834 - 15193575
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||| ||||||| | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||| ||||    
T  15193834 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 15193735  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    |||||||||| || | || ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |  | ||| || |  ||||| || ||    
T  15193734 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaaatacagaatatcgggactcacaatcagt 15193635  T
Q  239 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgacc 298  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  15193634 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttcttcccggtttcatcttgttgacc 15193575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 304
Target Start/End: Original strand, 797908 - 798175
Alignment:
Q  37 caatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaa 136  Q
    ||||||||||||| || || | ||| ||||| || |||||  |||| || | ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  797908 caatatcatattcggataataacatctgccaccgggcaattcttcctgtcaaagcgggtttctcaaagatgtacttgatcggatccatcctagatatcaa 798007  T
Q  137 ccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcg 236  Q
    |||||| |||||  | | || ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| | ||| | ||| |||| |||||| |||    
T  798008 ccaagtagtatgactaatcatatagtgacggaggcgtttggcggcccaggctagtgcgcaacaggtcttctcgaccatggaatagcgagattcacaatcg 798107  T
Q  237 gtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaagcac 304  Q
    || ||||||||||||| ||| || || ||||| || ||  ||||||| || |||||||| || |||||    
T  798108 gtaaacttcttgctcaaataataaatggcatgctcctttcttccagtttcgtcttgttgtccgagcac 798175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 304
Target Start/End: Original strand, 16392821 - 16393086
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||| | ||||  | ||    
T  16392821 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 16392920  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    |||| || || || | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || ||    
T  16392921 aagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacacgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 16393020  T
Q  239 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaagcac 304  Q
     ||||||||||| | ||| || || || || |||||  |||| || ||||||||||| || |||||    
T  16393021 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcac 16393086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 304
Target Start/End: Original strand, 30369333 - 30369598
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||| | ||||  | ||    
T  30369333 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 30369432  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    |||| || || || | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || ||    
T  30369433 aagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacacgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 30369532  T
Q  239 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaagcac 304  Q
     ||||||||||| | ||| || || || || |||||  |||| || ||||||||||| || |||||    
T  30369533 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcac 30369598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 9470071 - 9469806
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||| | ||||  | ||    
T  9470071 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 9469972  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    | || || || || | || ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || ||    
T  9469971 acgtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtctggcagcccaggctagagcacaacacgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 9469872  T
Q  239 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaagcac 304  Q
     ||||||||||| | ||| || || || || |||||  |||| || ||||||||||| || |||||    
T  9469871 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcac 9469806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 304
Target Start/End: Original strand, 16286764 - 16287031
Alignment:
Q  37 caatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaa 136  Q
    ||||||||||||| || || | ||| ||||| || |||||  |||| || | ||| | |||||||||||  ||||| |||||||||||  | ||||| ||    
T  16286764 caatatcatattcggataataacatctgccaccgggcaattcttcctgtcaaagcgggtttctcaaagacgtacttgatcggatccatcttagatatcaa 16286863  T
Q  137 ccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcg 236  Q
    ||| || |||||  | | || ||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| | ||| |||| |||||||||     
T  16286864 ccatgtagtatgactaatcatatagtggcggaggcgttttgcagcccaggctagtgcacaacaggttttctcgagcatgggatagcgagattcacagtca 16286963  T
Q  237 gtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaagcac 304  Q
    || ||||||||||||| ||| || || ||||| || ||  |||| || ||||||||||| || |||||    
T  16286964 gtaaacttcttgctcaaataataaatggcatgctcctttcttccggtttcatcttgttgtccgagcac 16287031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 298
Target Start/End: Original strand, 1893019 - 1893221
Alignment:
Q  96 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 195  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || || || |||| ||| ||||| || || || |||||||| || | ||| |    
T  1893019 ttctcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatcaaccaagtagtgtgattaaccatatagtgacgaagacgcttagcagcccatgccaaagcgc 1893118  T
Q  196 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttg 295  Q
    |||| || ||||||||||| | ||| || |  ||||| || || |||||||| ||||  ||||| || |  || |||||||||||||| || ||||||||    
T  1893119 aacaggttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggtgtgctctttctttccagtctcgtcttgttg 1893218  T
Q  296 acc 298  Q
    |||    
T  1893219 acc 1893221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 16238093 - 16237975
Alignment:
Q  178 cagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctt 277  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| || | ||| || |  ||||| || ||||||||||| |||| |||| ||||||| || ||||||||    
T  16238093 cagcccaggctaaagcacaacaagttttctcaagtatagaatatcgggactcacaatcagtgaacttcttactcaaataggagatagcgtgctctttctt 16237994  T
Q  278 tccagtatcatcttgttga 296  Q
    ||| || ||||||||||||    
T  16237993 tccggtttcatcttgttga 16237975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 25727252 - 25726983
Alignment:
Q  34 acacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatat 133  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| || |||||  |||| || | ||| |  |||||||| || ||||| ||||| |||||| |||| ||    
T  25727252 acacaatatcatactcagacaataacatctgccagcgagcaattcttcctgttaaagccggcttctcaaaaatgtacttgatcgggtccattttggacat 25727153  T
Q  134 taaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacag 233  Q
     |||||||| || || || ||||  || ||||| ||  | || |||||||| || | ||| |||||||| |||||||| |  | ||| || |  |||||     
T  25727152 caaccaagtagtgtgattaaccatgtagtgacggagatgcttagcagcccatgcaa-agcgcaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaa 25727054  T
Q  234 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaagcac 304  Q
    || ||||||||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25727053 tcagtgaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccaagcac 25726983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 28153530 - 28153227
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28153530 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttctc 28153431  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28153430 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 28153331  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28153330 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 28153231  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  28153230 gcac 28153227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 10948871 - 10948568
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10948871 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 10948772  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10948771 aaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 10948672  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10948671 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 10948572  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  10948571 gcac 10948568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10966459 - 10966159
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10966459 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 10966360  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10966359 aaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 10966260  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10966259 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgaccaa 10966160  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  10966159 g 10966159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 51642012 - 51641709
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51642012 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacagtatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 51641913  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51641912 aaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatggttcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 51641813  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51641812 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 51641713  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  51641712 gcac 51641709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 3644930 - 3644629
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3644930 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaatacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgctttctc 3644831  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3644830 aaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 3644731  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgag-tttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgacca 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3644730 gtcttctcaagcattgtataccgagttttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacca 3644631  T
Q  300 ag 301  Q
    ||    
T  3644630 ag 3644629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 28588779 - 28588479
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  28588779 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagataaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgctttctc 28588680  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28588679 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 28588580  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28588579 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaa 28588480  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  28588479 g 28588479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 16204498 - 16204798
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16204498 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatcttccagcgggcaatctttccagtaacagcagctttctc 16204597  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||    
T  16204598 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcctaggccagagcacaacaa 16204697  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16204698 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 16204797  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  16204798 g 16204798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 41789774 - 41790074
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  41789774 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgctttctc 41789873  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  41789874 aaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgcttagcagcccaagctagagcacaacaa 41789973  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41789974 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 41790073  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  41790074 g 41790074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 20464770 - 20464470
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  20464770 gaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcaggtttctc 20464671  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||||||||||||    
T  20464670 gaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcattttgcggcccaggccagagcacaacaa 20464571  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20464570 gtcttttcaagtatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 20464471  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  20464470 g 20464470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 21894212 - 21894516
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  21894212 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaatagcatctgccagcgtgcaaccttcccagtaacagccgctttctc 21894311  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||    
T  21894312 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgcttagcggcccaggccagagcacaacaa 21894411  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagca-tgttctttctttccagtatcatcttgttgacca 299  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21894412 gtcctctcaaacattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcagtgctctttctttccggtttcatcttgttgacca 21894511  T
Q  300 agcac 304  Q
    |||||    
T  21894512 agcac 21894516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 20336880 - 20337142
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20336880 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagataagagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 20336979  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  20336980 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcacaacaa 20337079  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagata 263  Q
    || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20337080 gttttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagata 20337142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22489782 - 22489521
Alignment:
Q  34 acacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatat 133  Q
    |||| |||||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||| ||||||| | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||  |||||||    
T  22489782 acacgatatcatactcggacaataacatctgccatcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgattggatccatcttggatat 22489683  T
Q  134 taaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacag 233  Q
     |||||||||||||| || | || ||||||||| || || ||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||| | || ||| || |  |||||     
T  22489682 caaccaagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaggctaaatcacaacaagttttctcaagtactgaatatcgggactcacaa 22489583  T
Q  234 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttg 295  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  22489582 tcagtgaacttcttactcagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttg 22489521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 304
Target Start/End: Original strand, 5628500 - 5628765
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||| | ||||||||| || ||||| || ||||||||| | ||||  | ||    
T  5628500 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggtttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 5628599  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    |||| || ||||| | || ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || ||    
T  5628600 aagtagtgtggttaatcatataatgacggaggcgcttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 5628699  T
Q  239 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaagcac 304  Q
     ||||||||||| | ||| || || || || |||||  |||| || ||||||||||| || |||||    
T  5628700 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcac 5628765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 301
Target Start/End: Original strand, 20339024 - 20339065
Alignment:
Q  260 gatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaag 301  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  20339024 gatagcatgttctttctttcaagtttcatcttgttgaccaag 20339065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 34)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 5009680 - 5009380
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5009680 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 5009581  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5009580 aaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagccagagcacaacaa 5009481  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5009480 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 5009381  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  5009380 g 5009380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 18797078 - 18797378
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797078 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 18797177  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797178 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccacgttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 18797277  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18797278 gtcttctcgagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgtccaa 18797377  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  18797378 g 18797378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 21973506 - 21973203
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21973506 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 21973407  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21973406 aaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 21973307  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21973306 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 21973207  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  21973206 gcac 21973203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 27159781 - 27160084
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27159781 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 27159880  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27159881 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 27159980  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27159981 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 27160080  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  27160081 gcac 27160084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 31122976 - 31123279
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31122976 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 31123075  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31123076 aaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 31123175  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31123176 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 31123275  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  31123276 gcac 31123279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 40102101 - 40102404
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40102101 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 40102200  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40102201 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 40102300  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40102301 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 40102400  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  40102401 gcac 40102404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 6573663 - 6573363
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6573663 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 6573564  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  6573563 aaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaaactaaagcacaacaa 6573464  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6573463 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 6573364  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  6573363 g 6573363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 54837196 - 54836896
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54837196 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 54837097  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54837096 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 54836997  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54836996 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 54836897  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  54836896 g 54836896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Original strand, 36340981 - 36341278
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  36340981 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgctttctc 36341080  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36341081 aaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 36341180  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgacc 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36341181 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcgtgttctttctttccagtttcatcttgttgacc 36341278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 20334885 - 20335185
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20334885 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 20334984  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||||    
T  20334985 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggaggcccaggccaaagcacaacaa 20335084  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20335085 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 20335184  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  20335185 g 20335185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 39854442 - 39854145
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  39854442 gaatgctacccttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgctttctc 39854343  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854342 gaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 39854243  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgacc 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39854242 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacc 39854145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 14102348 - 14102048
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14102348 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggcagctttctc 14102249  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14102248 aaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 14102149  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14102148 gtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaa 14102049  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  14102048 g 14102048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 14759770 - 14760070
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14759770 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 14759869  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  14759870 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 14759969  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14759970 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 14760069  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  14760070 g 14760070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 34185424 - 34185724
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34185424 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 34185523  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || ||||||||||||    
T  34185524 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttatcggcccaggccagagcacaacaa 34185623  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34185624 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 34185723  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  34185724 g 34185724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 1904059 - 1903759
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1904059 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 1903960  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  1903959 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcacaacaa 1903860  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1903859 gtcttttcaagcatcatataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 1903760  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  1903759 g 1903759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 17016851 - 17016551
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17016851 gaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 17016752  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  17016751 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaa 17016652  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17016651 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcctgttgaccaa 17016552  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  17016551 g 17016551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 24116467 - 24116167
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24116467 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttctc 24116368  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  24116367 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 24116268  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24116267 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 24116168  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  24116167 g 24116167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 30757565 - 30757265
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30757565 gaatgctacctttgattgccttttgagctttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtgacagcagctttctc 30757466  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30757465 gaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 30757366  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  30757365 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaa 30757266  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  30757265 g 30757265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 18313642 - 18313945
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  18313642 gaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttctc 18313741  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  18313742 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaa 18313841  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18313842 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaa 18313941  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  18313942 gcac 18313945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 15231677 - 15231377
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15231677 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgtgcaacctttccagtaacagcagctttctc 15231578  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||    
T  15231577 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggtggcccaggccagagcacaacaa 15231478  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15231477 gtcttttcaagcatcgtataacgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagataacatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 15231378  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  15231377 g 15231377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 24588825 - 24589125
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24588825 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 24588924  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  24588925 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 24589024  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24589025 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagttatcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 24589124  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  24589125 g 24589125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 14668821 - 14668521
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14668821 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatatttagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccggtaacagcagctttctc 14668722  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  14668721 aaagatatactttatcggatccatcttggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcagacgtttagcggcccaggccagagcacaacaa 14668622  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14668621 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 14668522  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  14668521 g 14668521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 33670264 - 33670564
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33670264 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 33670363  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  33670364 gaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 33670463  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33670464 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagataacatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 33670563  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  33670564 g 33670564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 15281401 - 15281701
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15281401 gaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacataatgtcatatttggacaagagcatttgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcaggtttctc 15281500  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||  ||||||    
T  15281501 gaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcttttggcggcccaggccagagagcaacaa 15281600  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15281601 gtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 15281700  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  15281701 g 15281701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 107 - 298
Target Start/End: Original strand, 15387948 - 15388139
Alignment:
Q  107 atactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttc 206  Q
    |||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15387948 atacttgattggatccatcctggatatcaaccaagttgtatgattcatcaaatagtggcgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttc 15388047  T
Q  207 tcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgacc 298  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  15388048 tcaagcatcgtatatcgggcttcgcagtcggtaaacttcttgctcaaatagtagatagcatgctctttctttccagtcttgtcttgttgacc 15388139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 5698340 - 5698219
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5698340 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 5698241  T
Q  101 aaagatatactttatcggatcc 122  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  5698240 aaagatatacttgatcggatcc 5698219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 15384812 - 15384924
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15384812 gaatgctacctttgattgacttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctc 15384911  T
Q  101 aaagatatacttt 113  Q
    |||||||||||||    
T  15384912 aaagatatacttt 15384924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 298
Target Start/End: Original strand, 14725301 - 14725560
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    ||||||||||| ||||| | ||| ||||| || |||||| ||||||| | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||| ||||    
T  14725301 atatcatattcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 14725400  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    |||||||||| || | || ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||    
T  14725401 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 14725500  T
Q  239 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgacc 298  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14725501 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 14725560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19768106 - 19767847
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||| ||||||| | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||| ||||    
T  19768106 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 19768007  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    |||||||||| || | || ||||||||| |  || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||    
T  19768006 aagttgtatgattaatcatataatgacggaaacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 19767907  T
Q  239 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgacc 298  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19767906 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacc 19767847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 12515942 - 12515746
Alignment:
Q  96 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 195  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||| | ||||| |||||||| || || || | || ||||||||| || || ||||||||||| |||| |||||    
T  12515942 ttctcaaagacatacttgattggatccattttagatatcaaccaagtagtgtgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaggctaaagcac 12515843  T
Q  196 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttg 292  Q
    | |||||||||||||| ||   ||||||||  ||||  || || ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||| || |||||    
T  12515842 atcaagtcttctcaagtatgaaataccgagactcactatctgtaaacttcttgctcaaatagtaaataacatgttctttccttccagtttcttcttg 12515746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 298
Target Start/End: Original strand, 1881598 - 1881860
Alignment:
Q  36 acaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatta 135  Q
    ||||||||||| || ||||| | ||| |||||||| |||||  |||| || | ||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  1881598 acaatatcatactcggacaataacatctgccaacgagcaattcttcctgttaaagccggcttctcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatca 1881697  T
Q  136 accaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtc 235  Q
    ||||||| || || || |||| ||||||||| || || || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| | ||| || |  ||||| ||    
T  1881698 accaagtagtgtgattaaccatataatgacgaagacgcttagcagcccatgccaaagcgcaacaggttttctcaagcatagaatatcgggactcacaatc 1881797  T
Q  236 ggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgacc 298  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||| || || || |||||||||||||| || |||||||||||    
T  1881798 ggtaaacttcttactcaagtagtaaatggcgtgctctttctttccagtctcgtcttgttgacc 1881860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 304
Target Start/End: Original strand, 22146066 - 22146336
Alignment:
Q  34 acacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatat 133  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||  |||| || |  || |  |||||||| |  ||||| |||||||||||| |||||||    
T  22146066 acacaatatcatattcagacaataacatctgccaacgagcaattcttcctgttaacgccggcttctcaaaaaggtacttgatcggatccattttggatat 22146165  T
Q  134 taaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacag 233  Q
     |||||||| || ||||  ||||  || ||||| || || || || ||||| || | ||| |||||||| ||||||||||| | ||| || |  |||||     
T  22146166 caaccaagtagtgtggtaaaccatgtagtgacggagacgcttagcggcccatgccaaagcgcaacaagttttctcaagcatagaatatcgggactcacaa 22146265  T
Q  234 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaagcac 304  Q
    || || |||||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22146266 tcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttctttccagtttcgtcttgttgaccaagcac 22146336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 55784901 - 55784686
Alignment:
Q  37 caatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaa 136  Q
    ||||||||||||| || || | ||| ||||| || |||||  |||| || | ||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||||| ||    
T  55784901 caatatcatattcggataataacatctgccaccgggcaattcttcctgtcaaagcgggtttctcaaagatgtacttgatcgggtccatcttagatatcaa 55784802  T
Q  137 ccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcg 236  Q
    |||||| |||||  | | || ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| | ||| |||| |||||| ||     
T  55784801 ccaagtagtatgactaatcatatagtgacggaggcgtttggcagcccaggctagtgcgcaacaggtcttctcgagcatggaatagcgagattcacaatca 55784702  T
Q  237 gtgaacttcttgctca 252  Q
    || |||||||||||||    
T  55784701 gtaaacttcttgctca 55784686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 18044829 - 18044723
Alignment:
Q  36 acaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatta 135  Q
    ||||||||||| ||  |||| | |||||||||||| |||||  |||| || | ||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  18044829 acaatatcatactcgaacaataacatttgccaacgagcaattcttcctgttaaagccggcttctcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatca 18044730  T
Q  136 accaagt 142  Q
    |||||||    
T  18044729 accaagt 18044723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 9814 - 9511
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9814 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 9715  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9714 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 9615  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  9614 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaa 9515  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  9514 gcac 9511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 9828 - 9528
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9828 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 9729  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9728 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcacaacaa 9629  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9628 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatggcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 9529  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  9528 g 9528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 22655 - 22958
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22655 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacagaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 22754  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22755 aaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 22854  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22855 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 22954  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  22955 gcac 22958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 11392 - 11695
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11392 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 11491  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11492 aaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcacaacaa 11591  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11592 gtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgaccaa 11691  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  11692 gcac 11695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 253; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16373 - 16073
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16373 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 16274  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||    
T  16273 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgcttagcggcccaggccagagcacaacaa 16174  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16173 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 16074  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  16073 g 16073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 3859 - 3559
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3859 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 3760  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  3759 aaagatatactttatcgaatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaacaa 3660  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3659 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 3560  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  3559 g 3559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 13363 - 13063
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||    
T  13363 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgccttctc 13264  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||| ||||||||||    
T  13263 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagtggcccaggctaaagcacaacaa 13164  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13163 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaa 13064  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  13063 g 13063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 9837 - 9537
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9837 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaacatcatattcagacaagagcatctgccagcttgcaatcttcccagtaacagcagctttctc 9738  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||    
T  9737 aaagatatattttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggccaaggccagagcacaacaa 9638  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9637 gtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaa 9538  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  9537 g 9537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 11741 - 11441
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  11741 gaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttctc 11642  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11641 aaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 11542  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11541 gtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaa 11442  T
Q  301 g 301  Q
    |    
T  11441 g 11441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 5643 - 5946
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  5643 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtgacggcagctttctc 5742  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||    
T  5743 gaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtgtgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaacaa 5842  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5843 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcctgttgaccaa 5942  T
Q  301 gcac 304  Q
    ||||    
T  5943 gcac 5946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0748
Description:

Target: scaffold0748; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Original strand, 5135 - 5432
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  5135 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagtgtgcaatcttcccagtaacagcaggcttctc 5234  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaa 200  Q
     ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  5235 gaagatatacttgattggatccatcctggatatcaaccaagtagtatgatttaccaggtaatgacgaaggcgtttggcagcccaggctagagcacagcaa 5334  T
Q  201 gtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgacc 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  5335 gtcttctcaagcatcgtataccgaatttcgcagtcggtaaacttcttgcttagatagtagatggcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgacc 5432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 301
Target Start/End: Original strand, 43181 - 43492
Alignment:
Q  5 gctacctttgattgcctttt-gagtttt-gaacacaatatc-atattcagacaaaa-gcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagcttt-ct 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  43181 gctacctttgattgcctttttgagtttttgaacacaatatctatattcagacaaaaagcatctgccaacgtgcaatcttcccagtaacagcagctttact 43280  T
Q  100 caaagata-tactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttc-accaaataat-gacgcagg-cgtttggcagccca--agctagagc 193  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| || |||||  | | | ||     
T  43281 caaagatattactttatcggatccattctggatatcaaccacgttgtatgattcaaccaaataatagacgcaggtcgtttagcggcccaggaccaaaagg 43380  T
Q  194 ac-aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttc-acagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc-tttccagtatca-tc 289  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  43381 acaaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttctacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttcttttccagtctcattc 43480  T
Q  290 ttgttgaccaag 301  Q
    ||||||||||||    
T  43481 ttgttgaccaag 43492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 22908 - 22761
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22908 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctttctc 22809  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatg 148  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22808 aaagatatacttgattggatccatcctggatatcaaccaagttgtatg 22761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 118797 - 118944
Alignment:
Q  1 gaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctc 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  118797 gaatgctacctttgatagctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacaggtttctc 118896  T
Q  101 aaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatg 148  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  118897 gaagatatactttatcggatccattctggatatcacccaagttgtatg 118944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 10972 - 10713
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| || |||||| ||||||| | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||| ||||    
T  10972 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 10873  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    |||||||||| || | || ||||||||| || || ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  ||||| || ||    
T  10872 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagttaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 10773  T
Q  239 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgacc 298  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    
T  10772 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcgtcttgttgacc 10713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 295
Target Start/End: Original strand, 34799 - 34998
Alignment:
Q  96 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 195  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||| | |||||| |||||  | | || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34799 ttctcaaatatgtacttgatcggatccattttagatatcagccaagtagtatgactaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcac 34898  T
Q  196 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttg 295  Q
    |||||||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || || || ||  ||||||| |||||||||||    
T  34899 aacaagtcctctcaagcatggaatagcgagattcacagtcagtaaacttcttgcttagataataaatggcgtgctcctttcttccagtttcatcttgttg 34998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 292
Target Start/End: Original strand, 4969 - 5165
Alignment:
Q  96 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 195  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||| | ||||| |||||||| || || || | || ||||||||| || || ||||||||||| |||| |||||    
T  4969 ttctcaaagacatacttgattggatccattttagatatcaaccaagtagtgtgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaggctaaagcac 5068  T
Q  196 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttg 292  Q
    | |||||||||||||| ||   ||||||||  ||||  || || ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||| || |||||    
T  5069 atcaagtcttctcaagtatgaaataccgagactcactatctgtaaacttcttgctcaaatagtaaataacatgttctttccttccagtttcttcttg 5165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 29924 - 29659
Alignment:
Q  39 atatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaacc 138  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||| |  |||||||| || ||| | || ||||||||| | ||||  | ||    
T  29924 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacctgattggatccattttagataccagcc 29825  T
Q  139 aagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggt 238  Q
    |||| || || || | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| |||||| || ||    
T  29824 aagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtatcgagattcacattcagt 29725  T
Q  239 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaagcac 304  Q
     ||||||||||| | ||| || || || || |||||  |||| || ||||||||||| || |||||    
T  29724 aaacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcac 29659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0196 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0196
Description:

Target: scaffold0196; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 2070 - 1979
Alignment:
Q  2 aatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcag 93  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | |||||||||||    
T  2070 aatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgccatattcagacaagagcatctgccagcgtccaatcttcctagtaacagcag 1979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 304
Target Start/End: Original strand, 4412 - 4682
Alignment:
Q  34 acacaatatcatattcagacaaaagcatttgccaacgtgcaatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatat 133  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||| ||| |||| |||||  |||| || |  || |  |||||||| |  ||||| |||||||||||| |||||||    
T  4412 acacaatatcataatcagacaataacatctgcaaacgagcaattcttcctgttaacgccggcttctcaaaaaggtacttgatcggatccattttggatat 4511  T
Q  134 taaccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacag 233  Q
     |||||||| || ||||  ||||  || ||||| || || || || ||||| || | ||| |||||||| ||||||||||| |  || || |  |||||     
T  4512 caaccaagtagtgtggtaaaccatgtagtgacggagacgcttagcggcccatgccaaagcgcaacaagttttctcaagcatagagtatcgggactcacaa 4611  T
Q  234 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaagcac 304  Q
    || || |||||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  4612 tcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttctttccagtttcgtcttgttgaccaagcac 4682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 301
Target Start/End: Original strand, 1347 - 1388
Alignment:
Q  260 gatagcatgttctttctttccagtatcatcttgttgaccaag 301  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  1347 gatagcatgttctttctttcaagtttcatcttgttgaccaag 1388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1568 times since January 2019
Visitors: 4422