View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0674_high_19 (Length: 286)

Name: NF0674_high_19
Description: NF0674
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0674_high_19
NF0674_high_19
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (1-247)||(6729-6975)
scaffold0390 (1-247)||(13745-13991)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (1-247)||(2116-2362)
scaffold0234 (1-247)||(11007-11253)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (1-247)||(18454-18700)
[»] chr8 (36 HSPs)
chr8 (1-247)||(21940831-21941077)
chr8 (1-247)||(22171653-22171899)
chr8 (1-247)||(6094289-6094535)
chr8 (4-247)||(24642815-24643057)
chr8 (1-189)||(15326422-15326610)
chr8 (1-189)||(15506791-15506979)
chr8 (1-236)||(14983718-14983950)
chr8 (41-238)||(24797224-24797419)
chr8 (46-241)||(38232219-38232412)
chr8 (11-233)||(12562123-12562341)
chr8 (23-233)||(21969333-21969539)
chr8 (11-241)||(8371337-8371563)
chr8 (23-233)||(25611195-25611401)
chr8 (23-241)||(18835342-18835556)
chr8 (23-233)||(22130705-22130911)
chr8 (23-233)||(27007613-27007819)
chr8 (23-233)||(27014756-27014962)
chr8 (23-233)||(27880583-27880789)
chr8 (23-233)||(28020764-28020970)
chr8 (1-67)||(28548393-28548459)
chr8 (23-233)||(21916676-21916882)
chr8 (106-245)||(32872741-32872880)
chr8 (11-232)||(22659578-22659795)
chr8 (11-218)||(8781959-8782162)
chr8 (67-233)||(45534413-45534575)
chr8 (67-165)||(26240551-26240646)
chr8 (124-210)||(2375214-2375300)
chr8 (11-165)||(6430953-6431104)
chr8 (136-230)||(29645537-29645631)
chr8 (23-88)||(20535306-20535371)
chr8 (212-247)||(28555049-28555084)
chr8 (126-165)||(36970332-36970371)
chr8 (127-165)||(2963133-2963171)
chr8 (13-75)||(29645675-29645737)
chr8 (134-186)||(10920427-10920479)
chr8 (1-33)||(24796794-24796826)
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (1-247)||(15152609-15152855)
chr7 (1-247)||(29327950-29328196)
chr7 (1-247)||(11542775-11543021)
chr7 (1-247)||(11535857-11536103)
chr7 (1-252)||(12750987-12751238)
chr7 (1-247)||(12738702-12738948)
chr7 (5-247)||(18561173-18561406)
chr7 (4-237)||(13392326-13392559)
chr7 (11-238)||(18257649-18257874)
chr7 (23-233)||(8464999-8465205)
chr7 (23-233)||(2204552-2204758)
chr7 (23-233)||(18400104-18400310)
chr7 (23-233)||(18407088-18407294)
chr7 (23-233)||(48808592-48808798)
chr7 (4-166)||(2365169-2365329)
chr7 (23-233)||(19230888-19231094)
chr7 (67-233)||(30254138-30254300)
chr7 (23-233)||(18139434-18139640)
chr7 (11-241)||(19388544-19388774)
chr7 (67-233)||(15729751-15729913)
chr7 (11-165)||(41681052-41681203)
chr7 (124-214)||(10235361-10235451)
chr7 (192-247)||(15148308-15148363)
chr7 (68-233)||(10669043-10669204)
chr7 (11-232)||(24443411-24443628)
chr7 (124-232)||(47833875-47833983)
chr7 (11-233)||(47166943-47167161)
chr7 (9-165)||(19393506-19393659)
chr7 (133-242)||(19859113-19859221)
chr7 (11-235)||(25845560-25845780)
chr7 (11-235)||(25845979-25846199)
chr7 (23-158)||(14591924-14592056)
chr7 (23-158)||(16011515-16011647)
chr7 (12-151)||(31190524-31190660)
chr7 (11-158)||(34128647-34128791)
chr7 (100-238)||(3132849-3132986)
chr7 (110-228)||(7662569-7662686)
chr7 (26-158)||(22969024-22969153)
chr7 (155-241)||(7396361-7396450)
chr7 (5-75)||(22948504-22948574)
chr7 (110-168)||(7396469-7396527)
chr7 (67-165)||(28130628-28130723)
chr7 (11-74)||(39112138-39112201)
chr7 (195-237)||(2365070-2365112)
chr7 (23-114)||(15169386-15169474)
chr7 (16-80)||(29984308-29984372)
[»] chr6 (38 HSPs)
chr6 (1-247)||(17684264-17684510)
chr6 (1-247)||(27381047-27381293)
chr6 (1-247)||(27471430-27471676)
chr6 (4-247)||(29309056-29309299)
chr6 (4-247)||(29316016-29316259)
chr6 (1-247)||(188772-189018)
chr6 (1-247)||(11651889-11652135)
chr6 (1-247)||(17691235-17691481)
chr6 (1-165)||(27296877-27297041)
chr6 (1-199)||(16394240-16394438)
chr6 (1-167)||(25536986-25537152)
chr6 (1-148)||(16559267-16559414)
chr6 (1-251)||(13359068-13359314)
chr6 (143-247)||(16566257-16566361)
chr6 (4-230)||(2669476-2669700)
chr6 (23-233)||(16789071-16789277)
chr6 (67-233)||(18019981-18020143)
chr6 (23-233)||(22859984-22860190)
chr6 (23-233)||(27508443-27508649)
chr6 (23-233)||(27528029-27528235)
chr6 (29-232)||(17850321-17850521)
chr6 (11-163)||(20736413-20736562)
chr6 (104-232)||(27925935-27926062)
chr6 (67-233)||(1586248-1586410)
chr6 (110-215)||(28172754-28172859)
chr6 (109-241)||(20553492-20553622)
chr6 (11-233)||(14074480-14074698)
chr6 (11-233)||(8612915-8613137)
chr6 (11-165)||(10359135-10359285)
chr6 (195-247)||(25537148-25537200)
chr6 (1-155)||(8510181-8510332)
chr6 (23-165)||(21994655-21994794)
chr6 (4-67)||(28172899-28172963)
chr6 (138-233)||(13995151-13995245)
chr6 (98-219)||(19347092-19347212)
chr6 (54-234)||(22560311-22560487)
chr6 (11-158)||(5758565-5758709)
chr6 (197-233)||(20736594-20736630)
[»] chr4 (57 HSPs)
chr4 (1-247)||(18262378-18262624)
chr4 (1-247)||(18269239-18269485)
chr4 (1-247)||(55612849-55613095)
chr4 (1-247)||(26963806-26964052)
chr4 (1-247)||(26970629-26970875)
chr4 (1-247)||(868763-869009)
chr4 (1-247)||(5707486-5707732)
chr4 (1-247)||(5714114-5714360)
chr4 (1-247)||(10621128-10621374)
chr4 (1-247)||(19926555-19926801)
chr4 (1-241)||(10628207-10628447)
chr4 (1-247)||(8858333-8858579)
chr4 (1-247)||(28392929-28393175)
chr4 (1-247)||(8845369-8845615)
chr4 (1-247)||(4426411-4426645)
chr4 (1-241)||(35223732-35223972)
chr4 (8-237)||(5667929-5668156)
chr4 (1-247)||(20311458-20311702)
chr4 (1-158)||(10677377-10677534)
chr4 (1-158)||(10891017-10891174)
chr4 (101-237)||(56516232-56516368)
chr4 (11-233)||(15461497-15461715)
chr4 (27-177)||(21453961-21454110)
chr4 (11-233)||(34975551-34975769)
chr4 (23-233)||(2677013-2677219)
chr4 (23-233)||(15815021-15815227)
chr4 (23-233)||(17300055-17300261)
chr4 (23-233)||(18111139-18111345)
chr4 (23-233)||(3369119-3369325)
chr4 (23-232)||(5870419-5870624)
chr4 (23-165)||(19362477-19362616)
chr4 (23-233)||(26531613-26531819)
chr4 (11-165)||(19365586-19365738)
chr4 (124-212)||(32646719-32646807)
chr4 (67-233)||(4676123-4676285)
chr4 (67-233)||(18163162-18163324)
chr4 (67-233)||(20243937-20244099)
chr4 (28-233)||(32636484-32636685)
chr4 (11-158)||(9487625-9487769)
chr4 (11-165)||(1941791-1941942)
chr4 (151-229)||(24700213-24700291)
chr4 (11-146)||(30040573-30040705)
chr4 (11-165)||(4546147-4546298)
chr4 (11-158)||(5616469-5616613)
chr4 (11-165)||(5528563-5528714)
chr4 (4-54)||(24701361-24701411)
chr4 (67-158)||(9538033-9538121)
chr4 (189-241)||(10677538-10677590)
chr4 (189-241)||(10891178-10891230)
chr4 (175-245)||(9937933-9938003)
chr4 (23-177)||(33888594-33888743)
chr4 (59-186)||(34777850-34777975)
chr4 (23-143)||(11421096-11421213)
chr4 (197-241)||(5616387-5616431)
chr4 (65-156)||(9937830-9937923)
chr4 (197-233)||(11421016-11421052)
chr4 (197-241)||(30040740-30040784)
[»] chr3 (46 HSPs)
chr3 (1-247)||(6110230-6110476)
chr3 (1-247)||(15600679-15600925)
chr3 (1-247)||(15607224-15607470)
chr3 (1-247)||(16482278-16482524)
chr3 (1-247)||(10579150-10579396)
chr3 (1-247)||(15342014-15342260)
chr3 (1-247)||(10572387-10572633)
chr3 (1-247)||(15357381-15357627)
chr3 (1-247)||(18520141-18520387)
chr3 (1-240)||(18522836-18523075)
chr3 (1-247)||(17780913-17781159)
chr3 (1-232)||(8490676-8490907)
chr3 (1-247)||(13211468-13211714)
chr3 (1-241)||(13248779-13249019)
chr3 (1-247)||(32056694-32056941)
chr3 (1-247)||(17199979-17200225)
chr3 (1-247)||(13516977-13517219)
chr3 (1-241)||(1647316-1647556)
chr3 (1-247)||(17136525-17136765)
chr3 (5-247)||(29925137-29925379)
chr3 (5-247)||(29974290-29974532)
chr3 (1-216)||(16200627-16200842)
chr3 (11-241)||(24253197-24253423)
chr3 (11-233)||(15846620-15846838)
chr3 (23-233)||(21034238-21034444)
chr3 (67-233)||(14890391-14890553)
chr3 (23-233)||(20147650-20147856)
chr3 (11-233)||(21398792-21399010)
chr3 (24-241)||(14147013-14147226)
chr3 (23-233)||(12299911-12300116)
chr3 (67-233)||(55427021-55427183)
chr3 (11-165)||(25978812-25978963)
chr3 (1-192)||(32280313-32280506)
chr3 (23-158)||(15526827-15526959)
chr3 (195-247)||(19089734-19089786)
chr3 (65-194)||(28953965-28954093)
chr3 (98-165)||(11787654-11787721)
chr3 (11-165)||(15317257-15317408)
chr3 (173-247)||(16200291-16200364)
chr3 (148-241)||(9504455-9504548)
chr3 (11-79)||(30464147-30464215)
chr3 (122-237)||(8251933-8252048)
chr3 (23-87)||(36138033-36138097)
chr3 (11-84)||(28088251-28088324)
chr3 (102-154)||(4189223-4189275)
chr3 (23-87)||(36142816-36142880)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (1-247)||(18252196-18252442)
chr1 (1-247)||(18532309-18532555)
chr1 (1-247)||(27131205-27131450)
chr1 (1-247)||(27310372-27310618)
chr1 (1-247)||(16358830-16359076)
chr1 (1-241)||(36816429-36816668)
chr1 (5-241)||(3855718-3855954)
chr1 (54-247)||(21171081-21171274)
chr1 (1-241)||(27277353-27277592)
chr1 (1-207)||(22641669-22641871)
chr1 (93-247)||(22657108-22657262)
chr1 (4-241)||(12014084-12014319)
chr1 (11-217)||(23507096-23507300)
chr1 (11-233)||(19706523-19706741)
chr1 (11-233)||(43802449-43802667)
chr1 (23-233)||(28134819-28135025)
chr1 (124-240)||(9917837-9917952)
chr1 (23-233)||(9456116-9456322)
chr1 (23-233)||(20779741-20779947)
chr1 (23-233)||(22670353-22670559)
chr1 (23-233)||(42817085-42817291)
chr1 (1-119)||(9916572-9916689)
chr1 (23-233)||(20391335-20391541)
chr1 (23-233)||(22612492-22612698)
chr1 (11-242)||(633925-634152)
chr1 (124-233)||(47667668-47667776)
chr1 (12-158)||(8727741-8727884)
chr1 (13-165)||(29096789-29096938)
chr1 (101-233)||(35930582-35930713)
chr1 (128-217)||(12006461-12006550)
chr1 (26-158)||(21881475-21881604)
chr1 (13-168)||(24301691-24301845)
chr1 (105-158)||(51997353-51997406)
chr1 (99-225)||(26923553-26923678)
chr1 (28-87)||(10852402-10852461)
chr1 (11-73)||(12006350-12006413)
chr1 (65-144)||(31236402-31236478)
[»] chr5 (32 HSPs)
chr5 (1-241)||(24695261-24695501)
chr5 (1-247)||(19714293-19714539)
chr5 (1-247)||(18569656-18569904)
chr5 (1-247)||(19707014-19707259)
chr5 (48-247)||(39538754-39538953)
chr5 (13-241)||(18806843-18807069)
chr5 (1-217)||(17298696-17298912)
chr5 (15-217)||(17285559-17285759)
chr5 (102-236)||(22546912-22547046)
chr5 (11-233)||(20941027-20941245)
chr5 (11-233)||(25805469-25805687)
chr5 (1-88)||(27347330-27347417)
chr5 (23-233)||(31899-32105)
chr5 (11-233)||(22941250-22941468)
chr5 (23-233)||(23545922-23546128)
chr5 (23-233)||(12789759-12789965)
chr5 (23-231)||(20100339-20100543)
chr5 (13-151)||(18806483-18806619)
chr5 (13-151)||(18806663-18806799)
chr5 (67-233)||(24933446-24933608)
chr5 (11-233)||(31096816-31097034)
chr5 (153-241)||(27347425-27347513)
chr5 (11-233)||(7865514-7865736)
chr5 (23-233)||(12765086-12765296)
chr5 (23-233)||(5097651-5097857)
chr5 (20-164)||(18829377-18829519)
chr5 (99-233)||(9811906-9812039)
chr5 (99-233)||(12704047-12704180)
chr5 (23-165)||(26129789-26129928)
chr5 (121-233)||(26245102-26245213)
chr5 (1-33)||(24702025-24702057)
chr5 (188-232)||(39535465-39535509)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (1-247)||(7273-7519)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (1-247)||(25785-26031)
[»] chr2 (29 HSPs)
chr2 (1-247)||(21330043-21330289)
chr2 (1-247)||(18796672-18796918)
chr2 (1-241)||(18619976-18620215)
chr2 (1-238)||(6991909-6992146)
chr2 (2-241)||(36270338-36270574)
chr2 (1-197)||(20978091-20978285)
chr2 (1-241)||(22183281-22183518)
chr2 (4-247)||(18822249-18822490)
chr2 (101-241)||(19279460-19279600)
chr2 (124-232)||(18851977-18852085)
chr2 (23-233)||(24250128-24250334)
chr2 (23-233)||(30174377-30174583)
chr2 (11-165)||(15342086-15342237)
chr2 (11-233)||(24229299-24229517)
chr2 (11-158)||(29800545-29800689)
chr2 (4-89)||(17241034-17241118)
chr2 (124-227)||(36801899-36802003)
chr2 (11-158)||(19616509-19616653)
chr2 (24-158)||(40301034-40301164)
chr2 (4-73)||(36799756-36799826)
chr2 (23-158)||(21626824-21626955)
chr2 (11-87)||(28740910-28740986)
chr2 (99-162)||(28718943-28719006)
chr2 (124-231)||(28741220-28741326)
chr2 (197-237)||(12098609-12098649)
chr2 (11-156)||(41316364-41316506)
chr2 (124-165)||(24763751-24763792)
chr2 (197-233)||(19616435-19616471)
chr2 (200-232)||(29800468-29800500)
[»] scaffold0657 (1 HSPs)
scaffold0657 (1-247)||(1159-1405)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (4-247)||(5695-5931)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (1-182)||(230186-230367)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (23-233)||(8305-8511)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (23-233)||(183-389)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (11-233)||(130308-130526)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (23-233)||(3771-3977)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (23-233)||(119730-119936)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (11-233)||(13033-13251)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (23-233)||(40084-40290)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (23-165)||(26609-26748)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (124-241)||(90033-90151)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (11-165)||(67458-67609)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (27-156)||(8807-8933)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (23-158)||(83111-83243)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (11-116)||(102-204)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (99-158)||(11699-11758)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (197-241)||(15089-15133)


Alignment Details
Target: scaffold0390 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 6729 - 6975
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6729 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 6828  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6829 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 6928  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6929 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 6975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 13745 - 13991
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13745 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 13844  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13845 ttatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctttgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 13944  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  13945 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctttatgctttaatgat 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 2116 - 2362
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2116 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 2215  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2216 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 2315  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2316 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 2362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 11007 - 11253
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11007 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 11106  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11107 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 11206  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11207 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 11253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18700 - 18454
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18700 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 18601  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18600 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 18501  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18500 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 18454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 36)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21941077 - 21940831
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21941077 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 21940978  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21940977 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 21940878  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21940877 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 21940831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22171899 - 22171653
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22171899 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 22171800  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  22171799 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctatgag 22171700  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22171699 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 22171653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6094535 - 6094289
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6094535 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttctggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 6094436  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6094435 ctatatagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 6094336  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  6094335 atgtgatcatcactctacccatataatagtctctatgctttaatgat 6094289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24643057 - 24642815
Alignment:
Q  4 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttacta 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  24643057 gactccaacatctagggtacatagtggtttcagttcgaagggtggaatacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataa-ttttacta 24642959  T
Q  104 tgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatg 203  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642958 tgtagtattctcatggaggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatg 24642859  T
Q  204 tgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  24642858 tgatcatcagtctacccacataatagtctctatactttaatgat 24642815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15326610 - 15326422
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15326610 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 15326511  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatcca 189  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15326510 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttctcca 15326422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15506979 - 15506791
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15506979 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 15506880  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatcca 189  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15506879 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttctcca 15506791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 14983718 - 14983950
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataactttt 99  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||     
T  14983718 ctcgactcttacatctagggtacatagtgatttcaggtcgaaggacggaatacaccacttatcactatgagaataacttatgaca-tttacataacttt- 14983815  T
Q  100 actatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtga 199  Q
     |||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||    
T  14983816 -ctatgtagtattctcatggcgggtcattctaatataa-tattactcctaatatctacatctatgtgaagacttgataacactttttccatgatccgtga 14983913  T
Q  200 gatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 236  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  14983914 gatatgatcattagtctacccacataatagtccctat 14983950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 41 - 238
Target Start/End: Original strand, 24797224 - 24797419
Alignment:
Q  41 aagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaata 140  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||     
T  24797224 aagggtggaatacaccac-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgggtcaatccagtataaatt 24797322  T
Q  141 ttactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgc 238  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||  |||| | || ||||||||| |  ||||||||  |||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  24797323 ttactcataatatttatacctacgtgaagacatgatatc-ctatatccatgacccatgagatgtagtcatcaatatactcacataatagtctctatgc 24797419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 46 - 241
Target Start/End: Original strand, 38232219 - 38232412
Alignment:
Q  46 tggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattac 144  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||| | | ||||| |||  ||||||||  |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  38232219 tggaatacaccacttatcattatgcgaataacctgtgaca-tttacataacttt--ctatgtagcattctcacggcggatcaatccaatataaatattac 38232315  T
Q  145 tcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 241  Q
     | |||||| | ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  38232316 ccataatatgtgtatctatgtcaagactggatcactctttatccatgatccgtgagatgtgattatcagtctacccacaaaatagtttttatgcttt 38232412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12562341 - 12562123
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||    
T  12562341 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagta 12562245  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 210  Q
    |||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||    
T  12562244 ttctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcat 12562146  T
Q  211 cagtctacctacataatagtctc 233  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  12562145 cagtctacatacataatagtctc 12562123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21969539 - 21969333
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  ||    
T  21969539 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgg 21969443  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| ||||||  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  21969442 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgatccatgagatgcggtcatcagtctacatac 21969344  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  21969343 ataatagtctc 21969333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 8371337 - 8371563
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||    
T  8371337 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagta 8371433  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 210  Q
    |||||| |  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||    
T  8371434 ttctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcttaatatttatacctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcat 8371532  T
Q  211 cagtctacctacataatagtctctatgcttt 241  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  8371533 cagtctacatacataatagtctcgatgcttt 8371563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25611401 - 25611195
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  ||    
T  25611401 catagtggtttcaggtctaagagtgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacagtttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgg 25611305  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  |||||||   |||||||||||| |||    
T  25611304 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcagtcatcagtctacatac 25611206  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  25611205 ataatagtctc 25611195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18835556 - 18835342
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||| |  ||    
T  18835556 cataatggtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcactgtgtgaatatcttatgaca-tttttaaaacat--actatgtagtattctcacggtgg 18835460  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||  ||| |||  |||| |||| |  ||||||||| | |||||||||| |||    
T  18835459 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacttatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgtggtaatcagtctacatac 18835361  T
Q  223 ataatagtctctatgcttt 241  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  18835360 ataatagtctcgatgcttt 18835342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Original strand, 22130705 - 22130911
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    ||    
T  22130705 catagtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgg 22130801  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  22130802 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 22130900  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  22130901 ataatagtctc 22130911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Original strand, 27007613 - 27007819
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    ||    
T  27007613 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgg 27007709  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  27007710 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 27007808  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  27007809 ataatagtctc 27007819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Original strand, 27014756 - 27014962
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    ||    
T  27014756 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgg 27014852  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  27014853 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 27014951  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  27014952 ataatagtctc 27014962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Original strand, 27880583 - 27880789
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    ||    
T  27880583 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgg 27880679  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  27880680 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 27880778  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  27880779 ataatagtctc 27880789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Original strand, 28020764 - 28020970
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    ||    
T  28020764 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgg 28020860  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  28020861 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 28020959  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  28020960 ataatagtctc 28020970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 28548459 - 28548393
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548459 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactat 28548393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21916882 - 21916676
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  || ||||||||||||||    ||    
T  21916882 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--acaatgtagtattctcacagtgg 21916786  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  21916785 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgcatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 21916687  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  21916686 ataatagtctc 21916676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 245
Target Start/End: Original strand, 32872741 - 32872880
Alignment:
Q  106 tagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtg 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||  | |||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||  |    
T  32872741 tagtattctcatgacagatcaattcaatataaatattattactaatacttatgccgatgtaaagacttgatacctctttattcatgatctgtgagataag 32872840  T
Q  206 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatg 245  Q
    ||| | |||| | |  ||||||||||||||||||||||||    
T  32872841 atcgtgagtccagccgcataatagtctctatgctttgatg 32872880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 22659578 - 22659795
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||    
T  22659578 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagta 22659674  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 210  Q
    |||||| |  || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  ||| |||  |||| |||| |  |||||||   ||||    
T  22659675 ttctcacggtgggtcaatccagtatacatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcagtcat 22659773  T
Q  211 cagtctacctacataatagtct 232  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  22659774 cagtctacatacataatagtct 22659795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 218
Target Start/End: Original strand, 8781959 - 8782162
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||    |||||||||||    
T  8781959 acatctagggatcatagtggtttcaagtctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--agactatgtagta 8782055  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 210  Q
    |||||| |  ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||   |||||  |||||| ||| |||  ||||||||| || | ||| ||| ||||    
T  8782056 ttctcacggtggatcaatcaagtataaatattagtcctaatatttatgcttatgtatagactaaatatctc-atatccatgacctataagacgtggtcat 8782154  T
Q  211 cagtctac 218  Q
    ||||||||    
T  8782155 cagtctac 8782162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Original strand, 45534413 - 45534575
Alignment:
Q  67 tgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 166  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  45534413 tgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgta 45534509  T
Q  167 aagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 233  Q
     |||||  ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  45534510 tagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 45534575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 26240646 - 26240551
Alignment:
Q  67 tgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 165  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26240646 tgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgt 26240551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2375300 - 2375214
Alignment:
Q  124 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| | | |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||    
T  2375300 tcaatccaatatacatattactcataatatttatatttatgtgaaaatttgataactcattatccatgatacgtgtgatgtgatcat 2375214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 6431104 - 6430953
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||  || | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | |  |||||||  |||||||||||    
T  6431104 acatctagggatcatagtgatttcaggtcttagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatctc-ataactt--actatgtagta 6431008  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 165  Q
    |||||| |  || || ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6431007 ttctcacggtgggtctatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 6430953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29645631 - 29645537
Alignment:
Q  136 aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagt 230  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||||| |  ||||||||| |||||||| |||| || |||||||    
T  29645631 aaatattactcttaatgtttatatatatgtgaagagttgataaatctttatgcatgaaccatgagatgtggtcatcagtttacccacgtaatagt 29645537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 88
Target Start/End: Original strand, 20535306 - 20535371
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttt 88  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20535306 catagtggttccaggtctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacacttt 20535371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28555084 - 28555049
Alignment:
Q  212 agtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28555084 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 28555049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 36970371 - 36970332
Alignment:
Q  126 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 165  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36970371 aatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 36970332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 165
Target Start/End: Original strand, 2963133 - 2963171
Alignment:
Q  127 atccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 165  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2963133 atccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 2963171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 29645737 - 29645675
Alignment:
Q  13 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 75  Q
    ||||||| ||| |||  ||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  29645737 atctaggatacgtagaagtttcaggtcgaatggtgaagtacatcactatcactatgagaatat 29645675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 10920479 - 10920427
Alignment:
Q  134 ataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttat 186  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| | | |||||||||||||    
T  10920479 ataaatattactcataatatttatacatatgtgaatatttgataactctttat 10920427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 24796794 - 24796826
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggttt 33  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24796794 ctcgactccaacatctagggtatatagtggttt 24796826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15152855 - 15152609
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15152855 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 15152756  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15152755 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 15152656  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15152655 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 15152609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 29328196 - 29327950
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29328196 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 29328097  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29328096 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 29327997  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29327996 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 29327950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 11542775 - 11543021
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  11542775 ctcgactccagcatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacatcactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacattta 11542874  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11542875 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 11542974  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11542975 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 11543021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 11535857 - 11536103
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11535857 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaatgttggaatacatcactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 11535956  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11535957 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctttgtgaagactggataactctttatccatgatctgtgag 11536056  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11536057 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 11536103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 12751238 - 12750987
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12751238 ctcgactccaacatctagggtacctagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 12751139  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  12751138 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgagaagaattgataactctttatccatgatctgtgag 12751039  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgatgtcca 252  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12751038 atgtgatcatcagtctatccacataatagtctctatgctttaatgatatcca 12750987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 12738948 - 12738702
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12738948 ctcgactacaacatctagggtacatagtagtttcaggtcgaacggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 12738849  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12738848 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattatgagtaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 12738749  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  12738748 atgtgatcttcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgat 12738702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18561406 - 18561173
Alignment:
Q  5 actccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18561406 actccaacatctagggtacatagtggtttcaagtcgaagggtggaatacaccactatcactat---------ttatgacacttttcataacttttactat 18561316  T
Q  105 gtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgt 204  Q
    |||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561315 gtagtattctcatagagggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgt 18561216  T
Q  205 gatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  18561215 gatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgat 18561173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13392559 - 13392326
Alignment:
Q  4 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttacta 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13392559 gactccaacatctatggtacatagtgattttaggtcaaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataaattttacta 13392460  T
Q  104 tgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatg 203  Q
    |||| ||||| ||||  || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  13392459 tgtaatattcgcatggtgggtcaatccagtataaatatttctcctaatatttattcctatgtgaagacaggataactctttatctatgatccgtgagatg 13392360  T
Q  204 tgatcatcagtctacctacataatagtctctatg 237  Q
    ||||||||  |||||| | | |||||||||||||    
T  13392359 tgatcatcgatctaccaatacaatagtctctatg 13392326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 18257649 - 18257874
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||  |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| || || |  |||||||| ||    
T  18257649 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacatttttcatgacat--actatgtaata 18257746  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 210  Q
    |||| | |  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18257747 ttctgacggtgggttaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 18257846  T
Q  211 cagtctacctacataatagtctctatgc 238  Q
    || |||| | |||||||||||| |||||    
T  18257847 caatctatccacataatagtctttatgc 18257874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8465205 - 8464999
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  ||    
T  8465205 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgg 8465109  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  8465108 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 8465010  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  8465009 ataatagtctc 8464999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2204758 - 2204552
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    ||    
T  2204758 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgg 2204662  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  2204661 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 2204563  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  2204562 ataatagtctc 2204552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18400310 - 18400104
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    ||    
T  18400310 catagtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgg 18400214  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  18400213 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 18400115  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  18400114 ataatagtctc 18400104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18407294 - 18407088
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    ||    
T  18407294 catagtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgg 18407198  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  18407197 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 18407099  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  18407098 ataatagtctc 18407088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Original strand, 48808592 - 48808798
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    ||    
T  48808592 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgg 48808688  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  48808689 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 48808787  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  48808788 ataatagtctc 48808798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 2365329 - 2365169
Alignment:
Q  4 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttact 102  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||  |||||||   ||    
T  2365329 gactccaaggtctagggtacatagtggctttaggtcgaatggtgaaatacaccacttatcacaatgagaataacttatgaca-tttacataacttc--ct 2365233  T
Q  103 atgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 166  Q
    |||||| ||| |||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2365232 atgtagcattttcatggtgggtcaatccaatgtaaatattactcctaatattgatatctatgtg 2365169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19231094 - 19230888
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||    
T  19231094 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataacttat--tatgtagtattctcacggtgg 19230998  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  19230997 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 19230899  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  19230898 ataatagtctc 19230888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30254300 - 30254138
Alignment:
Q  67 tgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 166  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30254300 tgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgta 30254204  T
Q  167 aagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 233  Q
     ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  30254203 tagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 30254138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Original strand, 18139434 - 18139640
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    ||    
T  18139434 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgg 18139530  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  18139531 gtcaatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacctgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 18139629  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  18139630 ataatagtctc 18139640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19388774 - 19388544
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactt--ttactatgtag 108  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |  |   |||||||    
T  19388774 acatctagggctcataatggtttcaggtctaagagtggtatacactattaccactatgagaatatcttatgacac-tttcataacatactatatatgtag 19388676  T
Q  109 tattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatc 208  Q
    |||||||||||  |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||  | |||  ||| |||  ||| ||||| | ||||||| || ||    
T  19388675 tattctcatgattgggcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctttgtacaaacttaatatctc-atattcatgacccgtgagatatggtc 19388577  T
Q  209 atcagtctacctacataatagtctctatgcttt 241  Q
    |||| ||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  19388576 atcaatctatatacataataatctctatgcttt 19388544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15729913 - 15729751
Alignment:
Q  67 tgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 166  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  15729913 tgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgta 15729817  T
Q  167 aagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 233  Q
     |||||  ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15729816 tagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 15729751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 165
Target Start/End: Original strand, 41681052 - 41681203
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||    
T  41681052 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagta 41681148  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 165  Q
    |||||| |  || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  41681149 ttctcacggtgggtcaatccagtataaatattactcataatatttatacctatgt 41681203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10235451 - 10235361
Alignment:
Q  124 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagt 214  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10235451 tcaatccgatataaatattattcctaatatttatacatatgggaacacctgataactctttatcaatgatctgtgagatgtgatcatcagt 10235361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15148363 - 15148308
Alignment:
Q  192 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15148363 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 15148308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 233
Target Start/End: Original strand, 10669043 - 10669204
Alignment:
Q  68 gagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtga 167  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  10669043 gagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtat 10669139  T
Q  168 agactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 233  Q
    |||||  ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10669140 agacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 10669204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 24443411 - 24443628
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  |||| |||||||| ||| ||| |||  |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||    
T  24443411 acatctagggatcataatggtttcaagtctaagagtgttatacaccattatcactgtgagaataacttatgaca-ttttcataacat--actatgtagta 24443507  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 210  Q
     ||||| |  || | |||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | |||  ||| || | ||| ||||| |  ||||||||| ||||    
T  24443508 ctctcacggtgggttaatctagtataaatattactcctaatattcatacctatgtataaacttaatatct-tatattcatgacccatgagatgtggtcat 24443606  T
Q  211 cagtctacctacataatagtct 232  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  24443607 cagtctacatacataatagtct 24443628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 232
Target Start/End: Original strand, 47833875 - 47833983
Alignment:
Q  124 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 223  Q
    |||||| |||||||||||||    ||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||     
T  47833875 tcaatcaaatataaatattatgagtaatatttatacctatgtgaaaacttggtaactctttattcatgatcggtgagatctgatcaccagcctacctacg 47833974  T
Q  224 taatagtct 232  Q
    |||||||||    
T  47833975 taatagtct 47833983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 47166943 - 47167161
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | |  |||||||  |||||||||||    
T  47166943 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatctc-ataactt--actatgtagta 47167039  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 210  Q
    |||||| |  || || ||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||  ||| |||  |||| || | |  ||||||| | ||||    
T  47167040 ttctcacggtgggtctatctagtataaatattactcataatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcat 47167138  T
Q  211 cagtctacctacataatagtctc 233  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  47167139 cagtctacatacataatagtctc 47167161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 19393506 - 19393659
Alignment:
Q  9 caacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtag 108  Q
    ||||||||||||  |||| ||| |||||||| ||| |||  |||||| | ||||| | |||||||||||||||| | |||| ||||| |  |||||||||    
T  19393506 caacatctagggatcatactggattcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaga-ttttcataacat--actatgtag 19393602  T
Q  109 tattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 165  Q
    |||||||| |   | |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19393603 tattctcacggtcggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 19393659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19859221 - 19859113
Alignment:
Q  133 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  19859221 tataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtct 19859123  T
Q  233 ctatgctttg 242  Q
    | | ||||||    
T  19859122 cgacgctttg 19859113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 25845560 - 25845780
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||| ||||| || ||| | | |||||||||||||||| | |||| |||||   ||||||||||||    
T  25845560 acatctagggatcataatggtttcaggtctaagagtggtatacatcattattattttgagaatatcttatgata-ttttcataac--atactatgtagta 25845656  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 210  Q
    |||||| |  |  |||||||| |||||||||||||||||||||| | |  || ||  |||||  ||| |||  ||| ||||| |  ||||||||| ||||    
T  25845657 ttctcacggtgtgtcaatccagtataaatattactcctaatattgacacatacgtatagacttaatatctc-atattcatgagcaatgagatgtggtcat 25845755  T
Q  211 cagtctacctacataatagtctcta 235  Q
    |||||||| | ||||||||||||||    
T  25845756 cagtctacatgcataatagtctcta 25845780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 25845979 - 25846199
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||| ||||| || ||| | | |||||||||||||||| | |||| |||||   ||||||||||||    
T  25845979 acatctagggatcataatggtttcaggtctaagagtggtatacatcattattattttgagaatatcttatgata-ttttcataac--atactatgtagta 25846075  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 210  Q
    |||||| |  |  |||||||| |||||||||||||||||||||| | |  || ||  |||||  ||| |||  ||| ||||| |  ||||||||| ||||    
T  25846076 ttctcacggtgtgtcaatccagtataaatattactcctaatattgacacatacgtatagacttaatatctc-atattcatgagcaatgagatgtggtcat 25846174  T
Q  211 cagtctacctacataatagtctcta 235  Q
    |||||||| | ||||||||||||||    
T  25846175 cagtctacatgcataatagtctcta 25846199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 14592056 - 14591924
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||    ||| ||||||||||||| |  ||    
T  14592056 catagtggtttcaagtctaagagtgatatacactattatcaatctgagaatatcttatgaca-ttttcataacaa--actgtgtagtattctcacggtgg 14591960  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 158  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14591959 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 14591924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 16011647 - 16011515
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||    ||| | |||||||||||||  ||    
T  16011647 catagtggtttcaggtctaagagtgatatacattattatcaatgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacaa--actgtatagtattctcatggtgg 16011551  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 158  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16011550 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 16011515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 151
Target Start/End: Original strand, 31190524 - 31190660
Alignment:
Q  12 catctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtat 111  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | || |||||   ||| |||||||||    
T  31190524 catctagggatcttagtggtttcaggtctaacagtgatatacaccattatcactatgagaatatcttaagaca-tattcataac--atacaatgtagtat 31190620  T
Q  112 tctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaat 151  Q
    |||||||  || |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  31190621 tctcatggtgggtcaatccagtataaatattgctcctaat 31190660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 34128791 - 34128647
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||| | | |||||||||||||||||| | |  ||||| |  |||||||||||    
T  34128791 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattataattgtgagaatatcttatgacaatctc-ataacgt--actatgtagta 34128695  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 158  Q
    ||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34128694 ttctcacaatggatctatccagtataaatattactcctaatatttata 34128647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3132986 - 3132849
Alignment:
Q  100 actatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtga 199  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||  |||||||||||| |||| ||| |  ||  | |||| |||    
T  3132986 actatgtagtattcttatgacaggtcaatccaatataaatatta-acataataattatacatatgtgaagacttgatatctcatattcatttatctatga 3132888  T
Q  200 gatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgc 238  Q
    ||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||||    
T  3132887 gatgtgatcatcagtctaatcacattgtagtctctatgc 3132849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 228
Target Start/End: Original strand, 7662569 - 7662686
Alignment:
Q  110 attctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatca 209  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||  || |||| ||||||    
T  7662569 attctcatggcgggtcaatctaataaaaatattacttataat-tttatatctatgtgaagacttgataagtttttatacatgattcgtaagatatgatca 7662667  T
Q  210 tcagtctacctacataata 228  Q
    ||||| || | ||||||||    
T  7662668 tcagtgtatccacataata 7662686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22969153 - 22969024
Alignment:
Q  26 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 125  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   |||||||||||||||||| |  || ||    
T  22969153 agtggcttcaggtctaagagtggtatacaccgttatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtc 22969057  T
Q  126 aatccaatataaatattactcctaatatttata 158  Q
    ||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  22969056 aatcttgtataaacattactcctaatatttata 22969024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7396450 - 7396361
Alignment:
Q  155 tatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc---tacataatagtctctatgcttt 241  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||    |||||||||||||||||||||    
T  7396450 tatatttatgtgaatacttgataattctttattcatgatatgtgagatgtgatcatcagttcaccctgcacataatagtctctatgcttt 7396361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 75
Target Start/End: Original strand, 22948504 - 22948574
Alignment:
Q  5 actccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatat 75  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  22948504 actcctacatctaaggtacatagcggtttcatgtcgaagggtggcatacacgactattactacgagaatat 22948574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 7396527 - 7396469
Alignment:
Q  110 attctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaa 168  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  7396527 attcttatgacgggttaatccaatataaatattacccataatatttatatttatgtgaa 7396469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 28130723 - 28130628
Alignment:
Q  67 tgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 165  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||| |  |||||||| ||||||||    || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  28130723 tgagaatatcttatgacaatttc-ataacat--actatgtaatattctcacagtgggtcaatccagtataaatattactcctgatatttatacctatgt 28130628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 39112201 - 39112138
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaata 74  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| || |||   ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39112201 acatctagagtacatagtgatttcatgttgaataatggaatacaccactatcactaagagaata 39112138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2365112 - 2365070
Alignment:
Q  195 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  2365112 tgtgagatgtgatcatcagtcgacccacatgatagtctctatg 2365070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 114
Target Start/End: Original strand, 15169386 - 15169474
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattct 114  Q
    ||||||||||| ||| | ||| || | |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||||||||    
T  15169386 catagtggttttaggactaagagtagcatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattct 15169474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 29984372 - 29984308
Alignment:
Q  16 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttat 80  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||  || || ||||  |||||||||||||||||||    
T  29984372 tagggtacatggtggtttcaagttgaagggtgatatgcatcacttccactatgagaatatcttat 29984308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 38)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 17684264 - 17684510
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17684264 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 17684363  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17684364 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 17684463  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17684464 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 17684510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 27381047 - 27381293
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27381047 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 27381146  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27381147 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 27381246  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27381247 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 27381293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 27471430 - 27471676
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27471430 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 27471529  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27471530 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 27471629  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27471630 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 27471676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 4 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 29309299 - 29309056
Alignment:
Q  4 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttacta 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29309299 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttacta 29309200  T
Q  104 tgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29309199 tgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatg 29309100  T
Q  204 tgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29309099 tgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 29309056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 4 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 29316259 - 29316016
Alignment:
Q  4 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttacta 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29316259 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttacta 29316160  T
Q  104 tgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29316159 tgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatg 29316060  T
Q  204 tgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29316059 tgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 29316016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 188772 - 189018
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  188772 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 188871  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  188872 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgag 188971  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  188972 atgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgat 189018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 11652135 - 11651889
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11652135 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcattatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 11652036  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11652035 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 11651936  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11651935 atgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgat 11651889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 17691235 - 17691481
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17691235 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 17691334  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  17691335 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgag 17691434  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  17691435 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctttatgctttaatgat 17691481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 27297041 - 27296877
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27297041 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 27296942  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 165  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27296941 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatcaatgt 27296877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 16394240 - 16394438
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16394240 ctcgattccaacatctagggtacatagtggtttcaagtcaaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatgacacttttcataactttta 16394339  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtga 199  Q
    ||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  16394340 ctacgtagtattctcatggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactgtttatccatgatatgtga 16394438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 25536986 - 25537152
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25536986 ctcgactccaacatctagggtaaatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactgtcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 25537085  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtga 167  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  25537086 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatatgacacctaatatttatatctatgtga 25537152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 16559267 - 16559414
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16559267 ctcgactccaacatctacggtacatagcggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 16559366  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcct 148  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16559367 ctatgtagtattctcatggtggatcaatccaatataaatattactcct 16559414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 13359068 - 13359314
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataactttt 99  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||  |||| |||     
T  13359068 ctcgactcctacatctaaggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccacttatcactatgagaataatttatgaca-tttacataattttc 13359166  T
Q  100 actatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtga 199  Q
    |  |||||||||||  |||  |   |||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||| || ||    
T  13359167 a--atgtagtattc--atggtgagacaattcaatataaatactacttctaatacttatatctaagtgaagatttgataactttttatccatgatttgcga 13359262  T
Q  200 gatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgatgtcc 251  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  13359263 gatgtgatcatcagtctatccatataatagtctctacgctttaatgttgtcc 13359314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 247
Target Start/End: Original strand, 16566257 - 16566361
Alignment:
Q  143 actcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttg 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16566257 actcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 16566356  T
Q  243 atgat 247  Q
    |||||    
T  16566357 atgat 16566361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2669700 - 2669476
Alignment:
Q  4 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccacta-tcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttact 102  Q
    |||||| |||||||| ||||||| || ||||||||| ||  ||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||| ||||   | ||| ||  ||    
T  2669700 gactcctacatctagagtacataatgatttcaggtcaaatagtggaatacacaacttgtcactatgagaataacttatgatacttaa-acaacatt--ct 2669604  T
Q  103 atgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagat 202  Q
    |||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||| |||||   ||||||    
T  2669603 atgtagtattttcatgatgtgtcaatcaaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaatacatgataactcttaatcaatgattcatgagat 2669504  T
Q  203 gtgatcatcagtctacctacataatagt 230  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||    
T  2669503 gtgatcatcaatctacccatataatagt 2669476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16789277 - 16789071
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    ||    
T  16789277 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgg 16789181  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  16789180 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 16789082  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  16789081 ataatagtctc 16789071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Original strand, 18019981 - 18020143
Alignment:
Q  67 tgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 166  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18019981 tgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgta 18020077  T
Q  167 aagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 233  Q
     ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18020078 tagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 18020143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Original strand, 22859984 - 22860190
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    ||    
T  22859984 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgg 22860080  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  22860081 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 22860179  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  22860180 ataatagtctc 22860190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Original strand, 27508443 - 27508649
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||    ||    
T  27508443 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataactt--actatgtagtattctcacagtgg 27508539  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  27508540 gtcaatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 27508638  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||| ||||||    
T  27508639 ataacagtctc 27508649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Original strand, 27528029 - 27528235
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||    ||    
T  27528029 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataactt--actatgtagtattctcacagtgg 27528125  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  27528126 gtcaatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 27528224  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||| ||||||    
T  27528225 ataacagtctc 27528235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 232
Target Start/End: Original strand, 17850321 - 17850521
Alignment:
Q  29 ggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttt-tataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 127  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||   || |||     | |||||||||||| | |  || ||||    
T  17850321 ggtttcaggtcaaagggtggtatacatcactatcactataagaataacttatgatacttacataaaacc----caatgtagtattcttaaggagggtcaa 17850416  T
Q  128 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 227  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||||||| || || ||||||| | |||| |||||||||||||||| | |||||    
T  17850417 tccaatatatatattactcataatatttatacctatgtgaatacacgataactcgttgtcaatgatctataagatatgatcatcagtctacccatataat 17850516  T
Q  228 agtct 232  Q
    |||||    
T  17850517 agtct 17850521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 163
Target Start/End: Original strand, 20736413 - 20736562
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  |||||| |||| ||||| ||| |||  |||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| | |  | |||||||||    
T  20736413 acatctagggatcatagtagttttaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcatagcat--aatatgtagta 20736509  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctat 163  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20736510 ttctcacgatggatcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctat 20736562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27926062 - 27925935
Alignment:
Q  104 tgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatg 203  Q
    ||||||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27926062 tgtagtattatcatggcgagtcaattcaatataaatattattcctaat-ttaatatctatgtgaaaacttcataaatctttatccatgatccgtgagatg 27925964  T
Q  204 tgatcatcagtctacctacataatagtct 232  Q
     |||||||||| || | ||||||||||||    
T  27925963 agatcatcagtttatccacataatagtct 27925935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Original strand, 1586248 - 1586410
Alignment:
Q  67 tgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 166  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  1586248 tgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgta 1586344  T
Q  167 aagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 233  Q
     |||||  ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1586345 tagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 1586410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 28172859 - 28172754
Alignment:
Q  110 attctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatca 209  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||    
T  28172859 attctcatggagggtcaatccaatataaacactacccttaatatttatatctatgtaaagacttgataactttttaacaatgatctgtaagatgtgatca 28172760  T
Q  210 tcagtc 215  Q
    ||||||    
T  28172759 tcagtc 28172754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 241
Target Start/End: Original strand, 20553492 - 20553622
Alignment:
Q  109 tattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatc 208  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||   | ||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20553492 tattctcatgatgggtcaatc-aatataaatattattcttaatatt-atatctatgtgaatgtttgatatttctttatcgatgatatgtgagatgtgatc 20553589  T
Q  209 atcagtctacctacataatagtctctatgcttt 241  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| ||||||||    
T  20553590 atcagtctaccaacataaaaatctttatgcttt 20553622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14074698 - 14074480
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |    ||||||   ||||| | ||| |||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||    
T  14074698 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcaatatacacttttatcattgtgaaaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagta 14074602  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 210  Q
    |||||| |  || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||  ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||    
T  14074601 ttctcacggtgggtcaatccattataaatattactcccaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcat 14074503  T
Q  211 cagtctacctacataatagtctc 233  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  14074502 cagtctacatacataatagtctc 14074480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8613137 - 8612915
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt---ataacttttactatgta 107  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||  |   ||||| |  ||||||||    
T  8613137 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgta 8613040  T
Q  108 gtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgat 207  Q
    ||||||||| |  || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |    
T  8613039 gtattctcacggtgggtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggt 8612941  T
Q  208 catcagtctacctacataatagtctc 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8612940 catcagtctacatacataatagtctc 8612915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 165
Target Start/End: Original strand, 10359135 - 10359285
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||  || |||||   ||||||||||||    
T  10359135 acatctagggatcatagtggtttcaagtctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacac--ttcataac--atactatgtagta 10359230  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 165  Q
    || ||| |  || || ||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  10359231 ttttcacggtgggtcgatccagtataaatattacctataatatttatatctatgt 10359285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 247
Target Start/End: Original strand, 25537148 - 25537200
Alignment:
Q  195 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  25537148 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctttatgctttaatgat 25537200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 8510332 - 8510181
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||  || ||| |||||| |||||||||||| || || ||||||| ||  ||||| ||      
T  8510332 ctcgactcctacatctaaggtacatagtggttccaggccgaagcatgtaatgcaccaccatcactatgagagtaactaatgacac-ttacataacatt-- 8510236  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatattt 155  Q
    |||||||||||| ||||    | |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8510235 ctatgtagtattatcattgtaggtcaatcaaatataaatattacttctaatattt 8510181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 21994794 - 21994655
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||  |||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| |||||||||||||  ||    
T  21994794 catagtcgtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcattgtgaaaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatttagtattctcatggtgg 21994698  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 165  Q
     ||| |||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  21994697 gtcattccagtataaatattactcgtaatgtttatagctatgt 21994655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 28172963 - 28172899
Alignment:
Q  4 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactat 67  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28172963 gactcctatatctagggtacatactggtttccggtcgaagggtggaatacaccacttatcactat 28172899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 233
Target Start/End: Original strand, 13995151 - 13995245
Alignment:
Q  138 atattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13995151 atattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 13995245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 219
Target Start/End: Original strand, 19347092 - 19347212
Alignment:
Q  98 ttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgt 197  Q
    ||||||||||||||||| ||| | | |||||||| || |||||||| || |||| ||||||  |||||||| ||  || ||||||||||| ||||| |||    
T  19347092 ttactatgtagtattctaatggcagttcaatccattacaaatattattc-taatgtttatacttatgtgaaaacatgacaactctttatcaatgatatgt 19347190  T
Q  198 gagatgtgatcatcagtctacc 219  Q
    ||||| || |||||| ||||||    
T  19347191 gagatatggtcatcaatctacc 19347212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 234
Target Start/End: Original strand, 22560311 - 22560487
Alignment:
Q  54 accactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatat 153  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||| |||||||    | ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22560311 accattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtgttctcatagtaggtcaatacagtataaatattactcctaatat 22560407  T
Q  154 ttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctct 234  Q
    ||| | ||||||  | |||  ||| |||  ||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||    
T  22560408 ttaaacctatgtataaacttaatatctc-atatccatgacccatgagatgtggtcatcggtctacatgcataatagtctct 22560487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 158
Target Start/End: Original strand, 5758565 - 5758709
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||| | | ||||||||||||||| || | |  ||||| |  |||||||||||    
T  5758565 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattataattgtgagaatatcttatggcaatctc-ataacgt--actatgtagta 5758661  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 158  Q
    ||||||    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5758662 ttctcacagtggatctatccagtataaatattactcctaatatttata 5758709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 233
Target Start/End: Original strand, 20736594 - 20736630
Alignment:
Q  197 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 233  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20736594 tgagatgtggtcatcagtctacatacataatagtctc 20736630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 57)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18262624 - 18262378
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18262624 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 18262525  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18262524 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 18262425  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18262424 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 18262378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18269485 - 18269239
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18269485 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 18269386  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18269385 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 18269286  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18269285 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 18269239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 55613095 - 55612849
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55613095 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 55612996  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  55612995 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 55612896  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55612895 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 55612849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 26964052 - 26963806
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26964052 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 26963953  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26963952 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactgctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 26963853  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26963852 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 26963806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 26970875 - 26970629
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26970875 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 26970776  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26970775 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactgctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 26970676  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26970675 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 26970629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 869009 - 868763
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  869009 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 868910  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  868909 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtgag 868810  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  868809 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 868763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5707732 - 5707486
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5707732 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 5707633  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5707632 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 5707533  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5707532 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 5707486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5714360 - 5714114
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5714360 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 5714261  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5714260 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 5714161  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5714160 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 5714114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 10621128 - 10621374
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10621128 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaaaacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 10621227  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10621228 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaaaatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 10621327  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10621328 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 10621374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 19926555 - 19926801
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19926555 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataactttta 19926654  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19926655 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatttgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 19926754  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19926755 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 19926801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 10628207 - 10628447
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10628207 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaaaacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 10628306  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10628307 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 10628406  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628407 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 10628447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 8858579 - 8858333
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8858579 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 8858480  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8858479 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatatgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 8858380  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  8858379 atgtgatcatcagcctacccacataatagtctctatgctttaatgat 8858333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 28392929 - 28393175
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28392929 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 28393028  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  28393029 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgag 28393128  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  28393129 atgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgat 28393175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 8845615 - 8845369
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  8845615 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataactttta 8845516  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  8845515 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatataaagaattgataactctttatccatgatctgtgag 8845416  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  8845415 atgtgatcatcagcctacccacataatagtctctatgctttaatgat 8845369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 4426411 - 4426645
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||| |||  |||||    
T  4426411 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaa------------cttttcatagatttta 4426498  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4426499 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 4426598  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  4426599 atgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgat 4426645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 35223972 - 35223732
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35223972 ctcgactccaacatctaaggtacatcgtggtttcaggtcaaagggtggaatacaacactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 35223873  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||| |||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||  |||||||||||||| |||||| |||||    
T  35223872 ctatatagtattctcatggtggttcaatccagtataaatattactcctaatatttatacatatgtaaagacatgataactctttatctatgatccgtgag 35223773  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 241  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  35223772 atgtgatcatccgtctacccacataatagtctatatgcttt 35223732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 237
Target Start/End: Original strand, 5667929 - 5668156
Alignment:
Q  8 ccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5667929 ccaacatctagggtacatagtggtttcaggtctaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgta 5668028  T
Q  108 gtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgat 207  Q
    |||||||||||  |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  5668029 gtattctcatggtgagtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctacgtgaagatatgataactctttatctatgatccgtgaga--tgat 5668126  T
Q  208 catcagtctacctacataatagtctctatg 237  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  5668127 catcggtctatccacataatagtctctatg 5668156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 20311702 - 20311458
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataactttt 99  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||| | ||   |||||| |     
T  20311702 ctcgaatcctacatctagggtaaatagtggtttcaagtagaagggtggaatacaccacttatcactatgagaataatgtatgatagttac-ataactgt- 20311605  T
Q  100 actatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtga 199  Q
     |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||    
T  20311604 -ctatgtagtattctcatgacaggtcaatccaatataaaaattactcctaatatttacatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatccatga 20311506  T
Q  200 gatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
     |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20311505 tatgtgatcatcaatctacccacaaaatagtctctatgctttaatgat 20311458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 10677377 - 10677534
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  10677377 ctcgactcctacatctaggatacatagtggtttcaagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacattta 10677476  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 158  Q
    |||||||||||||||||   || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10677477 ctatgtagtattctcatagtgggtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 10677534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 10891017 - 10891174
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  10891017 ctcgactcctacatctaggatacatagtggtttcaagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacattta 10891116  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 158  Q
    |||||||||||||||||   || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10891117 ctatgtagtattctcatagtgggtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 10891174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 101 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 56516368 - 56516232
Alignment:
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    ||||||||| |||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  56516368 ctatgtagtgttctcatagcgagtcaatccaatataaatattactcatgatatttatacgtatgtgaagacttgataactctttatccattatctgtgag 56516269  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatg 237  Q
    || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  56516268 atttgatcattaatctacctacataatagtctctatg 56516232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15461715 - 15461497
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||    
T  15461715 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagta 15461619  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 210  Q
    |||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||    
T  15461618 ttctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcat 15461520  T
Q  211 cagtctacctacataatagtctc 233  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  15461519 cagtctacatacataatagtctc 15461497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 177
Target Start/End: Original strand, 21453961 - 21454110
Alignment:
Q  27 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatca 126  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||  ||||||  || |||||||||||||||||  || |||    
T  21453961 gtggtttcaggtcgaagggtgacatacaccactatcacaatgaaaatatcttatgatattttacataactcata-tatgtagtattctcatggtgggtca 21454059  T
Q  127 atccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagata 177  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  21454060 attcaatataaatattactcctaatatttatatgtatgtgaaaacttgata 21454110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 34975769 - 34975551
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||    
T  34975769 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagta 34975673  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 210  Q
    ||||||    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||    
T  34975672 ttctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcat 34975574  T
Q  211 cagtctacctacataatagtctc 233  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  34975573 cagtctacatacataatagtctc 34975551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2677219 - 2677013
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    ||    
T  2677219 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgg 2677123  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  2677122 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 2677024  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  2677023 ataatagtctc 2677013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15815227 - 15815021
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    ||    
T  15815227 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgg 15815131  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  15815130 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 15815032  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  15815031 ataatagtctc 15815021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Original strand, 17300055 - 17300261
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    ||    
T  17300055 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgg 17300151  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  17300152 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 17300250  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  17300251 ataatagtctc 17300261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Original strand, 18111139 - 18111345
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    ||    
T  18111139 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgg 18111235  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  18111236 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 18111334  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  18111335 ataatagtctc 18111345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Original strand, 3369119 - 3369325
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    ||    
T  3369119 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgg 3369215  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  3369216 gtcaatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 3369314  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  3369315 ataatagtctc 3369325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5870624 - 5870419
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||| ||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    ||    
T  5870624 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcatatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgg 5870528  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  5870527 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 5870429  T
Q  223 ataatagtct 232  Q
    ||||||||||    
T  5870428 ataatagtct 5870419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 19362616 - 19362477
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||| ||||| || ||    
T  19362616 catagtggtttcaggtttaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacactttg-ataacat--actatgtagtactctcacgatgg 19362520  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 165  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  19362519 gtcaatccagtataaatattactcctaatattaatacctatgt 19362477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26531819 - 26531613
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    ||    
T  26531819 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgg 26531723  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  26531722 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtatagccttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 26531624  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  26531623 ataatagtctc 26531613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 19365738 - 19365586
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcacta-tgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagt 109  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||    
T  19365738 acatctagggatcataatggtttcaggtctaagagtggtatacaccattatcattggtgagaatatcttatgacactttc-ataacat--actatgtagt 19365642  T
Q  110 attctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 165  Q
    | ||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19365641 actctcacggtgggtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 19365586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 124 - 212
Target Start/End: Original strand, 32646719 - 32646807
Alignment:
Q  124 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatca 212  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  32646719 tcaatccaatgtaaatattattcctaatatttatatctatgtgaagactcgatattcctttatcaatgatccgtgagatgtgatcatca 32646807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Original strand, 4676123 - 4676285
Alignment:
Q  67 tgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 166  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  4676123 tgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgta 4676219  T
Q  167 aagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 233  Q
     |||||  ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  4676220 tagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 4676285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18163324 - 18163162
Alignment:
Q  67 tgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 166  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  18163324 tgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtgaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgta 18163228  T
Q  167 aagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 233  Q
     |||||  ||| |||  |||| |||| |  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18163227 tagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcgatcatcagtctacatacataatagtctc 18163162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20244099 - 20243937
Alignment:
Q  67 tgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 166  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  20244099 tgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgta 20244003  T
Q  167 aagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 233  Q
     |||||  ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20244002 tagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 20243937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 32636685 - 32636484
Alignment:
Q  28 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 127  Q
    |||||||| |||| || |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  32636685 tggtttcacgtcggagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacattgggtcaa 32636589  T
Q  128 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataat 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    ||||  ||| |||  ||| ||||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  32636588 tccaatataaatattactcataatatttatacctatgcatggacttaatatctc-gtattcatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataat 32636490  T
Q  228 agtctc 233  Q
    ||||||    
T  32636489 agtctc 32636484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 9487769 - 9487625
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | |  |||||||  |||||||||||    
T  9487769 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatctc-ataactt--actatgtagta 9487673  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 158  Q
    |||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9487672 ttctcacgatgggtctatccagtataaatattactcctaatatttata 9487625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 1941942 - 1941791
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||| |||||| | |  |||||||  |||||||||||    
T  1941942 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatctcatgacaatctc-ataactt--actatgtagta 1941846  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 165  Q
    |||||| |  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1941845 ttctcacggtgggttaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgt 1941791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24700291 - 24700213
Alignment:
Q  151 tatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatag 229  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24700291 tatttatatctatgtgaagacttaatatctctttatccaagatctgtaagatgtgattatcagtctacccacataatag 24700213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 146
Target Start/End: Original strand, 30040573 - 30040705
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||||    
T  30040573 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagta 30040669  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactc 146  Q
     |||||||  || |||||| | ||||||||||||||    
T  30040670 ctctcatggtgggtcaatctagtataaatattactc 30040705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 4546298 - 4546147
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | |  |||||||  |||||||||||    
T  4546298 acatctagggatcatagtggttttaggtcaaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatctc-ataactt--actatgtagta 4546202  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 165  Q
    |||||| |  || ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4546201 ttctcacggtgggtctgtccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 4546147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 5616613 - 5616469
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| || |||  ||| |||||||| ||||| | | ||||||||||||||||| ||| ||||  |  ||| |||||||    
T  5616613 acatctagggatcatagtggtttcagatctaagattggtatacaccattatcattgtaagaatatcttatgacac-tttcataa--taaactctgtagta 5616517  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 158  Q
    |||||| |   | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  5616516 ttctcacggttggtcaatccagtataaatattacttctaatatttata 5616469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 165
Target Start/End: Original strand, 5528563 - 5528714
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  |||||  |||||||||  ||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||  | ||||| || |||    
T  5528563 acatctagggatcatagcagtttcaggtataagagtgttatacaccattatcattatgagaatatcttatggca-ttttcataa--tatactacgtggta 5528659  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 165  Q
    |||||| |  || | ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  5528660 ttctcacgttgggttaatacaatataaatatcactcctaatatttatacctatgt 5528714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 24701411 - 24701361
Alignment:
Q  4 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaataca 54  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24701411 gactcctacatctagggtacacagtggttttaggtcgaagggtggaataca 24701361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 9538121 - 9538033
Alignment:
Q  67 tgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 158  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |   |||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  9538121 tgagaatatcttatgacactttc-ataacatg--ctatgtagtattctcacgctgggtcaatccagtataaatattactcctaacatttata 9538033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 189 - 241
Target Start/End: Original strand, 10677538 - 10677590
Alignment:
Q  189 atgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 241  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  10677538 atgatccgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctatatacttt 10677590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 189 - 241
Target Start/End: Original strand, 10891178 - 10891230
Alignment:
Q  189 atgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 241  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  10891178 atgatccgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctatatacttt 10891230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 245
Target Start/End: Original strand, 9937933 - 9938003
Alignment:
Q  175 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatg 245  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||    
T  9937933 ataactctttattcatgatttatgagatgtgatcatgactctacccacacaatagtctatatgcttcgatg 9938003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 33888743 - 33888594
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||| ||| ||||| | |||||||| |||||||  ||||   | | ||||| ||||| |||||  ||    
T  33888743 catagtgatttcaggtcgaaatgtggcatacaccactgtcaatatgatattatcttatcacactttacataa--atcattatgtggtattatcatggtgg 33888646  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagata 177  Q
     ||||| |   ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  33888645 gtcaattc---ataaatattacacataatatttatatctatgtgaaaacttgata 33888594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 186
Target Start/End: Original strand, 34777850 - 34777975
Alignment:
Q  59 tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 158  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||  |||| |   | | |||||||||||||||  || |||||| |||| ||| ||||||| | |||||||||    
T  34777850 tatcactatcaaaatatcttatgacactttacataagtc--aatgtgtagtattctcatggagggtcaatctaatacaaaaattactcattatatttata 34777947  T
Q  159 tctatgtgaagactagataactctttat 186  Q
      ||| |||||||| ||||||| |||||    
T  34777948 catatttgaagacttgataactttttat 34777975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 11421213 - 11421096
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| | | |||  |||||  | |||| || ||| |||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||| | |  ||    
T  11421213 catagtggtttcaggtctatgagtgatatacattattatccctgtgataatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctaacggtgg 11421117  T
Q  123 atcaatccaatataaatatta 143  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  11421116 gtcaatccaatataaatatta 11421096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5616431 - 5616387
Alignment:
Q  197 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 241  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  5616431 tgagatgtggtcatcaatctacatacataatagtctcaatgcttt 5616387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 156
Target Start/End: Original strand, 9937830 - 9937923
Alignment:
Q  65 tatgagaatatcttatgacactttttataacttttacta---tgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatattta 156  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||| |  |||||    |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  9937830 tatgagaatatcttatggcacatttcataattcatactaagtagtagtattctcatgacgg-tcactgcaatataaatattacttctattattta 9937923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11421052 - 11421016
Alignment:
Q  197 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 233  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11421052 tgagatgtggtcatcagtctacatacataatagtctc 11421016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Original strand, 30040740 - 30040784
Alignment:
Q  197 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 241  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  30040740 tgagatgtggtcatcagtctatatacataatagtctcgatgcttt 30040784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 46)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6110476 - 6110230
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6110476 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 6110377  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6110376 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 6110277  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6110276 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 6110230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 15600679 - 15600925
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15600679 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 15600778  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15600779 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 15600878  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15600879 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 15600925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 15607224 - 15607470
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15607224 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 15607323  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15607324 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 15607423  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15607424 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 15607470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 16482278 - 16482524
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16482278 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 16482377  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16482378 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 16482477  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16482478 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 16482524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 10579150 - 10579396
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10579150 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 10579249  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10579250 ttatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 10579349  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10579350 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 10579396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 15342014 - 15342260
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15342014 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataattttta 15342113  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342114 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatttttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 15342213  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15342214 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgttttaatgat 15342260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 10572387 - 10572633
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  10572387 ctcgactccaacatctacggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacagttttcataactttta 10572486  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10572487 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 10572586  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10572587 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 10572633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 15357381 - 15357627
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15357381 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 15357480  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357481 ctatgtagtattctcatggcggatcaacccaatataaatattactcctaatttttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 15357580  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15357581 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgttttaatgat 15357627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18520387 - 18520141
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18520387 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagttcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 18520288  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18520287 ctatgtagtattctcatggcggatcaatcaaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 18520188  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18520187 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 18520141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18523075 - 18522836
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18523075 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 18522976  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18522975 ctatgtagtattttcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 18522876  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522875 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctt 18522836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 17780913 - 17781159
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  17780913 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataattttta 17781012  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  17781013 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatctatgatttgtgag 17781112  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17781113 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 17781159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8490907 - 8490676
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8490907 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 8490808  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8490807 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 8490708  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtct 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8490707 atgtgatcatcagtctacctacataatcgtct 8490676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 13211714 - 13211468
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  13211714 ctcgactccaacatctaggttacataatggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataactttta 13211615  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13211614 ctatgtaatattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 13211515  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13211514 ttgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 13211468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13249019 - 13248779
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  13249019 ctcgactccaacatctaggttacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataactttta 13248920  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13248919 ctatgtaatattctcatggcgaatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 13248820  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 241  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248819 ttgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 13248779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 32056694 - 32056941
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32056694 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 32056793  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaata-tttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtga 199  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32056794 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcataatattttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtga 32056893  T
Q  200 gatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  32056894 gatgtgatcattagtctacccacataatagtctctatgctttaatgat 32056941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 17199979 - 17200225
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17199979 ctcgactccaacatctaaggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 17200078  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17200079 ctatgtagtattctcatagcgggtcaatccaatacaaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccacgatctgtgag 17200178  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  17200179 atgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgat 17200225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 13517219 - 13516977
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13517219 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtgggg----ccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 13517124  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13517123 ctatttagtattctcatggaggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 13517024  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  13517023 atgtgatcatcagtctacccacataatagtctctgtgctttaatgat 13516977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 1647316 - 1647556
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1647316 ctcgactccaacatctagggtatatagtggttttaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgggaatatcgtatgacacttttcataactttta 1647415  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
     ||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1647416 ttatgtagtattctcatggcgagtcaatcaaatataaacattactcctaatatttatatctatgtgtagacttgataactctttatccatgatctgtgag 1647515  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 241  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  1647516 atgtgatcatcagtctatccacataatagtctctatgcttt 1647556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17136765 - 17136525
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17136765 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaagtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttcaataactttta 17136666  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  17136665 ctatgtagtattctcatggtgggtcaatccaatataaatattactccta------atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaa 17136572  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  17136571 atgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgttttaatgat 17136525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 29925379 - 29925137
Alignment:
Q  5 actccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactat 104  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29925379 actccaacgtctagggtacataatggtttcaggtcaaatggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactat 29925280  T
Q  105 gtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgt 204  Q
    | |||||||||  |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  29925279 gcagtattctctaggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttaatgactctttatccatgatctatgagatgt 29925180  T
Q  205 gatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    |||||||  |||| | ||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  29925179 gatcatcgatctatccacataatagcctccatgctttaatgat 29925137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 29974532 - 29974290
Alignment:
Q  5 actccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactat 104  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29974532 actccaacgtctagggtacataatggtttcaggtcaaatggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactat 29974433  T
Q  105 gtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgt 204  Q
    | |||||||||  |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  29974432 gcagtattctctaggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttaatgactctttatccatgatctatgagatgt 29974333  T
Q  205 gatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    |||||||  |||| | ||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  29974332 gatcatcgatctatccacataatagcctccatgctttaatgat 29974290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16200842 - 16200627
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| |    
T  16200842 ctcgacttcaacatctagggtacatagtggtttcaggtcaaagggttgaatacaccactatcactatgagaatatcttatgatactttacataattttga 16200743  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  16200742 ctatgtagtattctcatggtgggtcaatccaatatgaatattacacctaatatttgtatctatatgaatacttgataattctttatccatgatctgtaag 16200643  T
Q  201 atgtgatcatcagtct 216  Q
    || |||||||||||||    
T  16200642 atatgatcatcagtct 16200627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 24253197 - 24253423
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||   ||||| ||  ||||| | ||    
T  24253197 acatctaaggtacatagtggttttaggtcgaatg-tggaatacaccgttatcactatgagaataacttatgatccttaa-ataacatt--ctatgcatta 24253292  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 210  Q
    ||||||||  || |||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  24253293 ttctcatggagggtcaaaccaatataaatataactcttaatgtttataagtatgtgaaaacttgataactctttatccataattcgtgagatatgatcat 24253392  T
Q  211 cagtctacctacataatagtctctatgcttt 241  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24253393 tagtctaccgacataatagtctctatgcttt 24253423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 15846620 - 15846838
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||    
T  15846620 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagta 15846716  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 210  Q
    |||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||    
T  15846717 ttctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcat 15846815  T
Q  211 cagtctacctacataatagtctc 233  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  15846816 cagtctacatacataatagtctc 15846838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21034444 - 21034238
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  ||    
T  21034444 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgg 21034348  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  21034347 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 21034249  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  21034248 ataatagtctc 21034238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14890553 - 14890391
Alignment:
Q  67 tgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 166  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14890553 tgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgta 14890457  T
Q  167 aagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 233  Q
     ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14890456 tagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 14890391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Original strand, 20147650 - 20147856
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    ||    
T  20147650 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgg 20147746  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  20147747 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 20147845  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  20147846 ataatagtctc 20147856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21399010 - 21398792
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | | |||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||    
T  21399010 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtaagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagta 21398914  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 210  Q
    |||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||    
T  21398913 ttctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgaggtcat 21398815  T
Q  211 cagtctacctacataatagtctc 233  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  21398814 aagtctacatacataatagtctc 21398792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14147226 - 14147013
Alignment:
Q  24 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgga 123  Q
    |||||||||||||||| ||| |||  |||||||  ||||| | ||||||||||||| |||| |||| ||||| |  ||||||||| ||||||| | | |     
T  14147226 atagtggtttcaggtctaagagtgatatacacctttatcaatgtgagaatatcttacgaca-ttttcataacat--actatgtagcattctcacggcagg 14147130  T
Q  124 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 223  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||  |||||  ||| |||  ||||||||| |  ||||||||| |||||||||||| || |    
T  14147129 tcaatccagtataaatattcctcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatccatgacccatgagatgtggtcatcagtctacatata 14147031  T
Q  224 taatagtctctatgcttt 241  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  14147030 taatagtctctgtgcttt 14147013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12300116 - 12299911
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    ||    
T  12300116 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgg 12300020  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  12300019 gtcaatccaatataaatattactcctaacatttatatctatg-atagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 12299922  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  12299921 ataatagtctc 12299911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 55427183 - 55427021
Alignment:
Q  67 tgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 166  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  55427183 tgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgta 55427087  T
Q  167 aagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 233  Q
     |||||  ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  55427086 tagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 55427021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 165
Target Start/End: Original strand, 25978812 - 25978963
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | |  |||||||  |||||||||||    
T  25978812 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatctc-ataactt--actatgtagta 25978908  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 165  Q
    |||||| |  || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25978909 ttctcacggtgggtctatccagtataaatattactcctaataattatacctatgt 25978963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 32280506 - 32280313
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacata----gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataact 96  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||| ||  || |||  |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||     
T  32280506 ctcgactcctacatctagggtacatatatagtggtttcaagtgaaaaggtaaaataaatcattatcactatgagaatatcttatgacactttacatgac- 32280408  T
Q  97 tttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatga 192  Q
     | |||||||| |||||||||   || |||| | | | ||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  32280407 -tcactatgtattattctcattgtgggtcaaccgagtgtaaatattattcgtaatgattatacctatgtgaagattaaataactctttatccatga 32280313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 15526959 - 15526827
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || || | | |||||||||||||||| |||| ||| | |  ||||| ||||| ||||| || ||    
T  15526959 catagtggtttcaggtctaagagtggtatacaccattaacattgtaagaatatcttatgaca-ttttcatagcat--actatttagtactctcacgatgg 15526863  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 158  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  15526862 gtcaatccagtataaatattactcctaagatttata 15526827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 247
Target Start/End: Original strand, 19089734 - 19089786
Alignment:
Q  195 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  19089734 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgatttaatgat 19089786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 28954093 - 28953965
Alignment:
Q  65 tatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctat 163  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||| || | ||||||| |  |||||||||||||||| | ||||  |||    
T  28954093 tatgagaatatcatatgacactttaaataacttat--tatgtagtattctcatgatgggttaatccaacaacaaatattactcctaatgtgtatacatat 28953996  T
Q  164 gtgaagactagataactctttatccatgatc 194  Q
    |||||||||   |||||||||||| ||||||    
T  28953995 gtgaagactttgtaactctttatcaatgatc 28953965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 11787721 - 11787654
Alignment:
Q  98 ttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 165  Q
    ||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11787721 ttactatgtagtattctcacggtgggtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 11787654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 165
Target Start/End: Original strand, 15317257 - 15317408
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |   ||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | |  ||||| |  |||||||||||    
T  15317257 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatttacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatctc-ataacgt--actatgtagta 15317353  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 165  Q
    |||||| |  || || ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15317354 ttctcacggtgggtctatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 15317408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16200364 - 16200291
Alignment:
Q  173 agataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  | ||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  16200364 agataactctttatccatgatctgtaagatatgatcatcagtctctccaca-aatagtctccatgctttaatgat 16200291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9504548 - 9504455
Alignment:
Q  148 taatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 241  Q
    |||||||| ||| ||||| || ||| |||||||| |||||||||| | |||||||  ||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  9504548 taatatttttatgtatgttaatacttgataactccttatccatgacccgtgagataagattatcagtctacccacataatagtttctatccttt 9504455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 30464215 - 30464147
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatctta 79  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  30464215 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtggtatagaccattatcattatgagaatatctta 30464147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 237
Target Start/End: Original strand, 8251933 - 8252048
Alignment:
Q  122 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccta 221  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||| || || ||||| |||| | ||||||  ||||| ||||||| || |||||||||| |||||| | | |    
T  8251933 gatcaatcaaatataaatattactcgaaatatgtaaatttatgtaaagatttgataacattttattcatgatccgtaagatgtgatcttcagtccatcca 8252032  T
Q  222 cataatagtctctatg 237  Q
    ||| ||||||| ||||    
T  8252033 catgatagtctatatg 8252048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 87
Target Start/End: Original strand, 36138033 - 36138097
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 87  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  36138033 catagtgatttcaggttgaagggtggtatacaccattatcactttggaaatatcttatggcactt 36138097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 28088324 - 28088251
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgaca 84  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||    
T  28088324 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca 28088251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 4189275 - 4189223
Alignment:
Q  102 tatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatt 154  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  4189275 tatgtaatattctcatgacagatcaatatagtataaatattactcataatatt 4189223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 36142880 - 36142816
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 87  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  36142880 catagtggtttcaggttgaagggtgacatacatcattatcactttggaaatatcttatggcactt 36142816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18252442 - 18252196
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18252442 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 18252343  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18252342 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 18252243  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18252242 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 18252196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 18532309 - 18532555
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18532309 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 18532408  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18532409 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 18532508  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18532509 atgtgatcatcagtctatctacataatagtctctatgctttaatgat 18532555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 27131205 - 27131450
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27131205 ctcgactccaacatctagg-tacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 27131303  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27131304 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 27131403  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  27131404 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctttatgctttaatgat 27131450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 27310372 - 27310618
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27310372 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatgacacttttcataactttta 27310471  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27310472 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccataatctgtgag 27310571  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  27310572 atgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgat 27310618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 16358830 - 16359076
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16358830 ctcgactccaacatctagggtacatggtggtttcaagacgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttctcataactttta 16358929  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16358930 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaaggcttgataactctttatccattatctgtgag 16359029  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  16359030 atgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgat 16359076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 36816429 - 36816668
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  36816429 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagttcaaagggtggaatacaccaccatcactatgataattt-ttatgacacttttcataactttta 36816527  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36816528 ctatgtagtattctcatggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgtagacttgataactctttatccatgatctgtgag 36816627  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 241  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  36816628 atgtgatcatcagtctatccacataatagtctctatgcttt 36816668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 241
Target Start/End: Original strand, 3855718 - 3855954
Alignment:
Q  5 actccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  3855718 actccaacatctagggtacatagtggtttcgggtcgaatggtggaatacaccactatcactgtgagaatatcttatgacacttttcataacctttactat 3855817  T
Q  105 gtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgt 204  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3855818 gtagtattctcattgcgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtgaagactttataactctttatccatgatttgtgagatgt 3855917  T
Q  205 gatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 241  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  3855918 gatcatcagtctacccacgtaatagtctccatgcttt 3855954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 247
Target Start/End: Original strand, 21171081 - 21171274
Alignment:
Q  54 accactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171081 accactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatat 21171180  T
Q  154 ttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  21171181 ttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgttatcatcagtctacccacataatagtctttatgctttaatgat 21171274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 27277353 - 27277592
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || |||||||    
T  27277353 ctcgactccaacatccagggtacatagtggtttcaggtcaaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatggcactttc-atgactttta 27277451  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    ||||| | |||||| |||  || |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||| |||||    
T  27277452 ctatgcaatattcttatggtgggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtgaaaacatgataactctttatctatgatccgtgag 27277551  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 241  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27277552 atgtgatcatcggtctacccacataatagtctctatgcttt 27277592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 22641669 - 22641871
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22641669 ctcgactccaacatctacggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactgtgagaatatcttatgacactttttataactttta 22641768  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    ||||||||| ||||||||  || |||||| | ||||||||||| ||||||   ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22641769 ctatgtagt-ttctcatggtgggtcaatctagtataaatattattcctaa---ttatatctatgtgaacacttaataactctttatccatgatctatgag 22641864  T
Q  201 atgtgat 207  Q
    |||||||    
T  22641865 atgtgat 22641871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 93 - 247
Target Start/End: Original strand, 22657108 - 22657262
Alignment:
Q  93 aacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatga 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  22657108 aacttttactatgtagtattcacatggtgggtcaatctaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttaataactctttatctatga 22657207  T
Q  193 tctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
     || ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||    
T  22657208 gctatgagatgtgatcatcagtctatccacatgatagtctctatgctttaatgat 22657262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 241
Target Start/End: Original strand, 12014084 - 12014319
Alignment:
Q  4 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttact 102  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||   |||||| |  || | ||    
T  12014084 gactcctacatctagagtacacagtgattttaggttgaagggtgaaatacaccacttatcactatgagaatgacttgtga---tttttacatattgttct 12014180  T
Q  103 atgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagat 202  Q
    |||||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  12014181 atgtaacattctcatgccgggtcaatccaatattaatattactcttaatatttatatttatgtgaagacttgataactccttatcaatgatccgtgagat 12014280  T
Q  203 gtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 241  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||| || |||||    
T  12014281 gtgatcatcattctacccacataatggtctttacgcttt 12014319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23507300 - 23507096
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagt 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||| |     | || |||||     
T  23507300 acatctagggtacacagtggtttcaggtcgaaggatgacatactccacttatcactatgagaataacttatg---ctttttacacaacgttctctgtagc 23507204  T
Q  110 attctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatca 209  Q
    ||||| |||  || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  23507203 attctaatggtgggttaatccaatataaatattactcctattatttatatctatgtgaaaacttgataactccttatccatgatccgtgagatgtgatca 23507104  T
Q  210 tcagtcta 217  Q
    ||||||||    
T  23507103 tcagtcta 23507096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 19706523 - 19706741
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||    
T  19706523 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagta 19706619  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 210  Q
    |||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||    
T  19706620 ttctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcat 19706718  T
Q  211 cagtctacctacataatagtctc 233  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  19706719 cagtctacatacataatagtctc 19706741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 43802449 - 43802667
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||    
T  43802449 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagta 43802545  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 210  Q
    |||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||    
T  43802546 ttctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcat 43802644  T
Q  211 cagtctacctacataatagtctc 233  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  43802645 cagtctacatacataatagtctc 43802667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Original strand, 28134819 - 28135025
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  ||    
T  28134819 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgg 28134915  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  28134916 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 28135014  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    ||||| |||||    
T  28135015 ataattgtctc 28135025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 240
Target Start/End: Original strand, 9917837 - 9917952
Alignment:
Q  124 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 223  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||| |||    
T  9917837 tcaatccaatataaatattactca-aatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatccacgagatgtgatcatcaacctaccgaca 9917935  T
Q  224 taatagtctctatgctt 240  Q
    || || |||||||||||    
T  9917936 tagtattctctatgctt 9917952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9456322 - 9456116
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    ||    
T  9456322 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgg 9456226  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  9456225 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 9456127  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  9456126 ataatagtctc 9456116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Original strand, 20779741 - 20779947
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    ||    
T  20779741 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgg 20779837  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  20779838 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 20779936  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  20779937 ataatagtctc 20779947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Original strand, 22670353 - 22670559
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    ||    
T  22670353 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgg 22670449  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  22670450 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 22670548  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  22670549 ataatagtctc 22670559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Original strand, 42817085 - 42817291
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    ||    
T  42817085 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgg 42817181  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  42817182 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 42817280  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  42817281 ataatagtctc 42817291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 9916572 - 9916689
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtgg-tttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttt 98  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||  ||||||||    
T  9916572 ctcgactcctacatctagggtacatagtggttttcaggtcgaagggtggaatacaccacttatcactatgagaataatttatgaca-tttacataacttt 9916670  T
Q  99 tactatgtagtattctcatga 119  Q
      |||||||||||||||||||    
T  9916671 --ctatgtagtattctcatga 9916689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Original strand, 20391335 - 20391541
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | || |||||  | ||||| | |||||||||||||||| |  ||| |||||  |||||||||||||||||||    ||    
T  20391335 catagtggtttcaggtctaagagcggtatacattattatcattgtgagaatatcttatga-aaatttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgg 20391431  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  20391432 gtcaatccaatataaatattactcctaacatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 20391530  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  20391531 ataatagtctc 20391541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22612698 - 22612492
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  ||    
T  22612698 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgg 22612602  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||  ||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  22612601 gtcaatccaataaaaatattactcccaatatttatatctatgtatagacttgatatatc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 22612503  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  22612502 ataatagtctc 22612492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 634152 - 633925
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | |  |||||||  |||||||||||    
T  634152 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatctc-ataactt--actatgtagta 634056  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 210  Q
    |||||| |  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  ||| |||  || | |||| |  ||||||| | ||||    
T  634055 ttctcacggtgggttaatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atagctatgacccatgagatgcggtcat 633957  T
Q  211 cagtctacctacataatagtctctatgctttg 242  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  633956 cagtctacatacataatagtctcgacgctttg 633925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 233
Target Start/End: Original strand, 47667668 - 47667776
Alignment:
Q  124 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||    
T  47667668 tcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacataca 47667766  T
Q  224 taatagtctc 233  Q
    ||||||||||    
T  47667767 taatagtctc 47667776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 8727884 - 8727741
Alignment:
Q  12 catctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtat 111  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||| ||| |||  ||||||   |||||||| ||||||||||||||  | |||| ||||| |  ||||||||||||    
T  8727884 catctagggatcatagtggttccaggtctaagagtgatatacactcttatcactaagagaatatcttatggta-ttttcataacat--actatgtagtat 8727788  T
Q  112 tctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 158  Q
    ||||| |  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  8727787 tctcacggtggatcaatccagtataaatattacttctaatatttata 8727741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 29096938 - 29096789
Alignment:
Q  13 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtatt 112  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||   | ||||||||||||    
T  29096938 atctagggatcatagtggtttcatgtctaagagtgtgaaacaccattatcattatgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atgctatgtagtatt 29096842  T
Q  113 ctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 165  Q
    | || |  ||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  29096841 cacacggtggatcaatctagtataaatattattcctaatatgtatacctatgt 29096789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 35930713 - 35930582
Alignment:
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||| |   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  ||| |||  |||| |||| |  ||||    
T  35930713 ctatgtagtattctcacggtaggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgag 35930615  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 233  Q
    ||| | |||||||||||  ||||||||||||||    
T  35930614 atgcggtcatcagtctatatacataatagtctc 35930582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 128 - 217
Target Start/End: Original strand, 12006461 - 12006550
Alignment:
Q  128 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtcta 217  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||| |||||||| ||||| |||||  || || ||||||||||||||||    
T  12006461 tccagtataaatattactcttaatatttatatctgtgcgaacacttgataactccttatcaatgattcgtaagttgtgatcatcagtcta 12006550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 158
Target Start/End: Original strand, 21881475 - 21881604
Alignment:
Q  26 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 125  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   |||||||||||||||||| |  || ||    
T  21881475 agtggcttcaggtctaagagtggtatacaccgttatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtc 21881571  T
Q  126 aatccaatataaatattactcctaatatttata 158  Q
    ||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  21881572 aatcttgtataaacattactcctaatatttata 21881604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 24301691 - 24301845
Alignment:
Q  13 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtatt 112  Q
    ||||||||  |||| || ||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |||||  | ||||||| |||||    
T  24301691 atctagggatcataatgattttaggtcaaagggttgtatacaccactatcactatgagaatgtcttatgatacttaacataac--tcactatgtggtatt 24301788  T
Q  113 ctcatgacggatcaatccaata-taaatattactcctaatatttatatctatgtgaa 168  Q
    ||| ||| || |   || ||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  24301789 ctcgtgatgggtatttctaatagcaaatattactcctaatatgtatacctatgtgaa 24301845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 51997406 - 51997353
Alignment:
Q  105 gtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 158  Q
    ||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51997406 gtagtattctcatggtgggtcaatctaatataaatattactcctaatatttata 51997353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Original strand, 26923553 - 26923678
Alignment:
Q  99 tactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtg 198  Q
    |||||||||||||||||| |  || ||||| || |||||||||||||||||||||| ||| | ||||  |||||  ||| |||  |||| |||| |  ||    
T  26923553 tactatgtagtattctcacggtgggtcaattcagtataaatattactcctaatattcataccaatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatg 26923651  T
Q  199 agatgtgatcatcagtctacctacata 225  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  26923652 agatgtggtcatcagtctacatacata 26923678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 87
Target Start/End: Original strand, 10852402 - 10852461
Alignment:
Q  28 tggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 87  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||    
T  10852402 tggtttcaggttgaagggtgacatacaccattatcactttaaaaatatcttatgacactt 10852461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Original strand, 12006350 - 12006413
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaat 73  Q
    |||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  12006350 acatctagagtacacaatgatttcaggtcgaagggtggaaaacaccacttatcagtatgagaat 12006413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 144
Target Start/End: Original strand, 31236402 - 31236478
Alignment:
Q  65 tatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattac 144  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||  | |||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||||    
T  31236402 tatgagaatatcttacgacactttc-ataa--tatactatgtagtattctcatgatagatcaattcagtataagtattac 31236478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 32)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 24695261 - 24695501
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24695261 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 24695360  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24695361 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 24695460  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695461 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 24695501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 19714293 - 19714539
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19714293 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacacaactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 19714392  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19714393 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 19714492  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  19714493 atgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgat 19714539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 18569656 - 18569904
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18569656 ctcgactccaacatgtagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgataatatcttatgacacttttcataactttta 18569755  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctt--tatccatgatctgtg 198  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||| ||||    
T  18569756 ctatgtagtattctcatggcgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgatatctctttatatccatgatatgtg 18569855  T
Q  199 agatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  18569856 agatgtgatcatcagtctaccaacataatagtctttatgctttaatgat 18569904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 19707014 - 19707259
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19707014 ctcgactccaatatctagggtacatagttatt-caggtcgaagggtggaatacacaattatcactatgagaaaatcttatgacacttttcataactttta 19707112  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  19707113 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctagtatttatatctatgtgaagatttgataactctttatccatgatctgtgag 19707212  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  19707213 atgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgat 19707259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 48 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 39538953 - 39538754
Alignment:
Q  48 gaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcc 147  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  39538953 gaatataccactatcactatgagaatattttatgacacttttcataacttttactatgtagtattttcatggtgggtcaatccaatataaatattactcc 39538854  T
Q  148 taatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||    
T  39538853 taatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaaatatgaccatcagtctacccacataatagtcttcatgctttaatgat 39538754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Original strand, 18806843 - 18807069
Alignment:
Q  13 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtat 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||   | ||||||  |||||||  ||    
T  18806843 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgacagttacaa-aacttt--ctatgtatcat 18806939  T
Q  112 tctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatc 211  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  18806940 tctcatggtggatcaatccaatataaacattacttctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatatgaaatgtgatcatc 18807039  T
Q  212 agtctacctacataatagtctctatgcttt 241  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18807040 agtctacccgcataatagtctctatgcttt 18807069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 17298696 - 17298912
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataactttt 99  Q
    ||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||     
T  17298696 ctcgactcctaaacctagggtacatattggtttcaggttgaagggtggaatacgccacttatcactatgagaataacttatgaca-tttacataacttt- 17298793  T
Q  100 actatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtga 199  Q
     ||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||||    
T  17298794 -ctacgtagtattctcatggtgggtcaatccaatataaatattactcttaatatttatatctatgtgaagatttaataactctttatccatgacccgtga 17298892  T
Q  200 ga--tgtgatcatcagtcta 217  Q
     |  ||||||||||||||||    
T  17298893 tatgtgtgatcatcagtcta 17298912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Original strand, 17285559 - 17285759
Alignment:
Q  15 ctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattc 113  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||| | | |  ||||||||  |||||||||||||    
T  17285559 ctagggtacatattgatttcaggtcgaagagtggaatataccacttatcactatgataataacttatgata-tatacataacttt--ctatgtagtattc 17285655  T
Q  114 tcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcag 213  Q
    ||||   || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17285656 tcattgtgggtcaatccaatataaatattactcttaatatttatatctatgtaaagacttgataactctttatccatgacctgtgatatgtgatcatcag 17285755  T
Q  214 tcta 217  Q
    ||||    
T  17285756 tcta 17285759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 102 - 236
Target Start/End: Original strand, 22546912 - 22547046
Alignment:
Q  102 tatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgaga 201  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22546912 tatgtagtattctcatggctggtcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatatgaaaacttgataactctttatccatgatttgtgaga 22547011  T
Q  202 tgtgatcatcagtctacctacataatagtctctat 236  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  22547012 tgtgatcatcggtctatccacataatagtctctat 22547046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20941245 - 20941027
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||    
T  20941245 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagta 20941149  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 210  Q
    |||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||    
T  20941148 ttctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcat 20941050  T
Q  211 cagtctacctacataatagtctc 233  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  20941049 cagtctacatacataatagtctc 20941027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 25805469 - 25805687
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||    
T  25805469 acatctagggatcatagtggtttcaggtgtaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagta 25805565  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 210  Q
    |||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||    
T  25805566 ttctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcat 25805664  T
Q  211 cagtctacctacataatagtctc 233  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  25805665 cagtctacatacataatagtctc 25805687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 27347330 - 27347417
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttt 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27347330 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcgtgtcaaagggtggaatacacaactatcactatgagaatatcttatgacacttt 27347417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 32105 - 31899
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    ||    
T  32105 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgg 32009  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  32008 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 31910  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  31909 ataatagtctc 31899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22941468 - 22941250
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||    
T  22941468 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagta 22941372  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 210  Q
    |||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||  | ||||    
T  22941371 ttctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtataaacttgatatctc-atatctatgacccatgagatacggtcat 22941273  T
Q  211 cagtctacctacataatagtctc 233  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  22941272 cagtctacatacataatagtctc 22941250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23546128 - 23545922
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    ||    
T  23546128 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgg 23546032  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  23546031 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 23545933  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  23545932 ataatagtctc 23545922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Original strand, 12789759 - 12789965
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  | |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    ||    
T  12789759 catagtggtttcaggtctaagagcagtatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgg 12789855  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  12789856 gtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 12789954  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  12789955 ataatagtctc 12789965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Original strand, 20100339 - 20100543
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||| |||||| |  ||    
T  20100339 catagtggtttcatgtctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagttttctcacgttgg 20100435  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     |||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||| |  |||||  ||| |||  ||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| |||    
T  20100436 gtcaagccagtataagtattactcctaatattgatacctatctatagacttaatatctc-atattcatgacccatgagatgtgatcatcagtctacatac 20100534  T
Q  223 ataatagtc 231  Q
    |||||||||    
T  20100535 ataatagtc 20100543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 151
Target Start/End: Original strand, 18806483 - 18806619
Alignment:
Q  13 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtat 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  ||  | ||||||  |||||||  ||    
T  18806483 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgaca-gttacaaaacttt--ctatgtatcat 18806579  T
Q  112 tctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaat 151  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18806580 tctcatggtggatcaatccaatataaacattacttctaat 18806619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 151
Target Start/End: Original strand, 18806663 - 18806799
Alignment:
Q  13 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtat 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  ||  | ||||||  |||||||  ||    
T  18806663 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgaca-gttacaaaacttt--ctatgtatcat 18806759  T
Q  112 tctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaat 151  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18806760 tctcatggtggatcaatccaatataaacattacttctaat 18806799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Original strand, 24933446 - 24933608
Alignment:
Q  67 tgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 166  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  24933446 tgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgta 24933542  T
Q  167 aagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 233  Q
     |||||  ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24933543 tagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctc 24933608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31097034 - 31096816
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||    
T  31097034 acatctagggatcataatggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagta 31096938  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 210  Q
    |||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||  ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||    
T  31096937 ttctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctataatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcat 31096839  T
Q  211 cagtctacctacataatagtctc 233  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  31096838 cagtctacatacataatagtctc 31096816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 241
Target Start/End: Original strand, 27347425 - 27347513
Alignment:
Q  153 tttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 241  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| | ||| |||||||||||||||||    
T  27347425 tttatacctatgtgaagacatgataactctttatctatgatctgtgagatgtgatcatcggcctatccacaaaatagtctctatgcttt 27347513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 7865514 - 7865736
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt---ataacttttactatgta 107  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||  |   ||||| |  ||||||||    
T  7865514 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataacgt--actatgta 7865611  T
Q  108 gtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgat 207  Q
    ||||||||| |  || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |    
T  7865612 gtattctcacggtgggtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggt 7865710  T
Q  208 catcagtctacctacataatagtctc 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  7865711 catcagtctacatacataatagtctc 7865736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Original strand, 12765086 - 12765296
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt---ataacttttactatgtagtattctcatga 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||| |||||||||| ||  |   |||||||  ||||||||||||||||| |     
T  12765086 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatgtcttatgacaattaatctcataactt--actatgtagtattctcacgg 12765183  T
Q  120 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc 219  Q
     || || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||  ||| |||  |||| || | |  ||||||||| ||||||||||||     
T  12765184 tgggtctatccaatataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgtggtcatcagtctaca 12765282  T
Q  220 tacataatagtctc 233  Q
    ||||||||||||||    
T  12765283 tacataatagtctc 12765296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5097857 - 5097651
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||| ||||||||| |||  ||||| |  ||||||||||||||||| |  ||    
T  5097857 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaataacttatgacaatttc-ataacat--actatgtagtattctcacggtgg 5097761  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||  |||||  ||| |||  |||| |||| |  ||||||||  |||||||||||| |||    
T  5097760 gttaatccaatataaatattactcataatatttatacttatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgtagtcatcagtctacatac 5097662  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  5097661 ataatagtctc 5097651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 164
Target Start/End: Original strand, 18829377 - 18829519
Alignment:
Q  20 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatg 118  Q
    |||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  ||||   ||||||||  |||||||  |||||||||    
T  18829377 gtacatagtggttttaggtcaaatgatggaatacaccacttatcattatgagaataacttatggaacttac-ataacttt--ctatgtatcattctcatg 18829473  T
Q  119 acggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatg 164  Q
      || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  18829474 gtgggtcaatccaatataaatattggtcctaatatttatatatatg 18829519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 233
Target Start/End: Original strand, 9811906 - 9812039
Alignment:
Q  99 tactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtg 198  Q
    |||||||||||||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||  ||| |||  |||| || | |  ||    
T  9811906 tactatgtagtattctcacggtgggtctatccaatataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatg 9812004  T
Q  199 agatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 233  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  9812005 agatgtggtcatcagtctacatacatagtagtctc 9812039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 233
Target Start/End: Original strand, 12704047 - 12704180
Alignment:
Q  99 tactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtg 198  Q
    |||||||||||||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||  ||| |||  |||| || | |  ||    
T  12704047 tactatgtagtattctcacggtgggtctatccaatataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatg 12704145  T
Q  199 agatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 233  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  12704146 agatgtggtcatcagtctacatacatagtagtctc 12704180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 165
Target Start/End: Original strand, 26129789 - 26129928
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| |||| ||||| |  ||||||| ||||| ||| |  ||    
T  26129789 catagtggtttcatgtctaagagtgatatacaccattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtggtattttcacggtgg 26129885  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 165  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  26129886 gtcaatccagtataaatattactcataatatttgtatatatgt 26129928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26245213 - 26245102
Alignment:
Q  121 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacct 220  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||  ||| |||  |||| |||| |  |||||||  ||||||||||||| |    
T  26245213 ggatcaatcaagtataaatattactcctaatatttatacctatgtataaacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcaatcatcagtctacat 26245115  T
Q  221 acataatagtctc 233  Q
    |||||||||||||    
T  26245114 acataatagtctc 26245102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 24702025 - 24702057
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggttt 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702025 ctcgactccaacatctagggtacatagtggttt 24702057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39535509 - 39535465
Alignment:
Q  188 catgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 232  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  39535509 catgacctatgagatgtggtcatcagtctacatacataatagtct 39535465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 7519 - 7273
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7519 ctcgactccaacatctagggtacatagttgtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 7420  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7419 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 7320  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7319 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 7273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 25785 - 26031
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25785 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 25884  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  25885 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagtcttgataactctttatccatgatctgtgag 25984  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  25985 atgtgatcatcagtctacctacataatagtcgctatgctttaatgat 26031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 29)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 21330043 - 21330289
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21330043 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 21330142  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21330143 ctatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 21330242  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21330243 atgtgatcatcagtccacctacataatagtctctatgctttaatgat 21330289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18796918 - 18796672
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18796918 ctcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccaccatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 18796819  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18796818 ctatgtagtattctcatagaggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgag 18796719  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18796718 atgtgatcatcagtctacccacataatagtctcaatgctttaatgat 18796672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18620215 - 18619976
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18620215 ctcgactccaacatttagggtacatagtggtttcaggtcaaagggtgggatacaccaatatcaccatgagaatatcttatgacactttc-ataactttta 18620117  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||    
T  18620116 ctatgtagtattctcatggtgggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtgaagacatgataactctttatctatgatccgtgag 18620017  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 241  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  18620016 atgtgatcatcggcctacccacataatagtctatatgcttt 18619976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 6991909 - 6992146
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataactttt 99  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||   |||| |||     
T  6991909 ctcgactcctacatctagggaacatagtgatttcaggccgaagggtggaatacaccacttatcactatgagaatagtttatgtcacttac-ataatttt- 6992006  T
Q  100 actatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaag--actagataactctttatccatgatctgt 197  Q
     ||||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||  || ||||||    
T  6992007 -ctatgtagcgttcttatggaggatcaatccaatataaatattactcctgagatttatacctatgtgaagatacttgataaatctttatttataatctgt 6992105  T
Q  198 gagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgc 238  Q
    ||||| ||||||| |||||||| | |||||| ||| |||||    
T  6992106 gagatatgatcattagtctacccatataataatctttatgc 6992146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 36270574 - 36270338
Alignment:
Q  2 tcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    |||||||  ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||| ||||  |||| |||      
T  36270574 tcgactcatacatctagggtgcatggtggttttaggtcgaagggtg-aatacaccacttatcactatgagaatgacttgtgac-ctttacataatttt-- 36270479  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||| || ||||   |||||    
T  36270478 ctatgtaacattctcatggcgagtcaatccaatataaatattactcctaatatttaaatcgaagtgaaaacttgataactctttctctatgactcgtgag 36270379  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 241  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||    
T  36270378 atgtgatcatcagtctacccacacaatagtctttatacttt 36270338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20978285 - 20978091
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataactttt 99  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| |||     
T  20978285 ctcgaatcctacatctagggtacatagtagtgtcatgtcaaagagtggaatacaccacttatcactacgagaataacttatgaca-ttttcataatttt- 20978188  T
Q  100 actatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgt 197  Q
     | || ||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20978187 -ccatataaaattctcatggcgggtcaatccaatataaatattactcataataattatatctcggtgaagacttgataactctttatccatgatctgt 20978091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 22183281 - 22183518
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataactttt 99  Q
    ||||||||| ||||| || |||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||||  |||  ||||| ||     
T  22183281 ctcgactcctacatcaagagtacacgttggtttcaggtcaaagggtggaatacaccacttatcactatgagaatgacctgtgact-tttacataacatta 22183379  T
Q  100 actatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtga 199  Q
      ||||||  ||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||    
T  22183380 --tatgtaacattgtcatggcgggtcaatccaatataa-tattactcttaatatttatatctatgtgaagacttgataactccttatcaaagatctgtga 22183476  T
Q  200 gatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 241  Q
    ||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||    
T  22183477 gatttgatcatcaatctacccacgtaatagtctctatacttt 22183518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18822490 - 18822249
Alignment:
Q  4 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttact 102  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||  |||  ||  ||||  ||||| |||  |    
T  18822490 gactcctacatctagggtacacagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccacttatctatatgagaatgacttgagat-ctttacataacgttt--t 18822394  T
Q  103 atgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagat 202  Q
    |||||  | ||||||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||| |||||| |||| ||    
T  18822393 atgtaacaatctcatggcagatcaatccaatataaatattaccattaatatttatatctatgtgaaaagttgataactccttatcaatgatccgtgatat 18822294  T
Q  203 gtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    |||||||||||||||   |||||||| ||| | |||||| |||||    
T  18822293 gtgatcatcagtctattgacataataatctatctgctttaatgat 18822249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 101 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19279600 - 19279460
Alignment:
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||  |||||    
T  19279600 ctatgtggtattctcatgacgtgtcaatccaatataaatattactccaaatatctatatctatctgaaaacttgataactttttatccatgatacgtgag 19279501  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 241  Q
    |||||||||| |||| ||   ||||||||||| ||||||||    
T  19279500 atgtgatcattagtcaactcgcataatagtctttatgcttt 19279460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 232
Target Start/End: Original strand, 18851977 - 18852085
Alignment:
Q  124 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||    
T  18851977 tcaatccaatataaatattactcttaatatttatacatatttgaagacttgataactctttattcatgatccgtgagatgggatcattagtctaccgaca 18852076  T
Q  224 taatagtct 232  Q
    |||||||||    
T  18852077 taatagtct 18852085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Original strand, 24250128 - 24250334
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    ||    
T  24250128 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgg 24250224  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  24250225 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 24250323  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  24250324 ataatagtctc 24250334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30174583 - 30174377
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    ||    
T  30174583 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgg 30174487  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  30174486 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 30174388  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  30174387 ataatagtctc 30174377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 165
Target Start/End: Original strand, 15342086 - 15342237
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||| |  |||||||||||    
T  15342086 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtggcatacaccactatcattgtgagactatcttatgacactttc-ataacat--actatgtagta 15342182  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 165  Q
    || ||| |  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15342183 ttttcacggtgggttaatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 15342237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 24229299 - 24229517
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| | | ||| | |  |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||    
T  24229299 acatctagggatcatagtggtttcaaggctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagta 24229395  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 210  Q
    |||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||    
T  24229396 ttctcacggtgggtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgaaccatgagatgcggtcat 24229494  T
Q  211 cagtctacctacataatagtctc 233  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  24229495 cagtctacatacataatagtctc 24229517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 29800689 - 29800545
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||  | |||||||||| | | |||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  29800689 acatctagggatcatagtggtttcaagtctaagagtggtatacaccattatccttgtgagaatatcatgttacactttt-ataacat--actatgtagta 29800593  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 158  Q
    |||||| |  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29800592 ttctcacggtgggtcaatccagtataaatattactcctaatatttata 29800545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 17241118 - 17241034
Alignment:
Q  4 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttt 89  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17241118 gactcctacatctacagtacatagtggttttaggtcgaagg-tgaaatacaccattatcactatgagaatatcttattacactttt 17241034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 227
Target Start/End: Original strand, 36801899 - 36802003
Alignment:
Q  124 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatct-atgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| | ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||    
T  36801899 tcaattcaatataaatattacccttaatatttatattttatgcgaagacttgataactcattatcaatgatttgtgaggtgtgatcatcagtctactcac 36801998  T
Q  223 ataat 227  Q
    |||||    
T  36801999 ataat 36802003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 19616653 - 19616509
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||    ||||||||||||    
T  19616653 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcatatgaca-ttttcataa--aatactatgtagta 19616557  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 158  Q
    |||||| |  || ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  19616556 ttctcacggtgggtcaattcagaataaatgttactcctaatatttata 19616509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 158
Target Start/End: Original strand, 40301034 - 40301164
Alignment:
Q  24 atagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgga 123  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||  || ||||| | |  |||||||||||||||||  ||     
T  40301034 atagtggtttcatgtctaagagtggtatacatcattatcactatgagactatcttatgacac--ttcataacatgt--tatgtagtattctcatggtggg 40301129  T
Q  124 tcaatccaatataaatattactcctaatatttata 158  Q
    ||||||   ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  40301130 tcaatctggtataaatattacttctaatatgtata 40301164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 73
Target Start/End: Original strand, 36799756 - 36799826
Alignment:
Q  4 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccac-tatcactatgagaat 73  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  36799756 gactcctacatctagggcgcatagtggtttcaggtcaaacggtagaatacaccacttatcactatgagaat 36799826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 21626955 - 21626824
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||| ||||||||| ||  |||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   ||   |||||||||||||||  ||    
T  21626955 catagtgatttcaggtctaacagtggtagacactattatcactatgagaatatcttatgacac-tttcataac--atagcgtgtagtattctcatggtgg 21626859  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 158  Q
     ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21626858 -tcaattcaatataaatattactcatattatttata 21626824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Original strand, 28740910 - 28740986
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 87  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| || |||  ||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  28740910 acatctagggatcatagtggtttcagatctaagaatggtatacaccattatcattatgagaatgtcttatgacactt 28740986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 162
Target Start/End: Original strand, 28718943 - 28719006
Alignment:
Q  99 tactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatcta 162  Q
    |||| ||||||||||||| || |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28718943 tactgtgtagtattctcacgatgagtcaatcaagtataaatattactcctaatatttatatcta 28719006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Original strand, 28741220 - 28741326
Alignment:
Q  124 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctaca 223  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||  ||| ||| | || |||||    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  28741220 tcaatccggtataaatattactcctaatatttatacctatgtacatacttaatatctcat-attcatgacgcatgagatgtgatcatcagtctacataca 28741318  T
Q  224 taatagtc 231  Q
    ||||||||    
T  28741319 taatagtc 28741326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 237
Target Start/End: Original strand, 12098609 - 12098649
Alignment:
Q  197 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatg 237  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12098609 tgagatctgatcatcagtctacatacataatagtctctatg 12098649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 156
Target Start/End: Original strand, 41316364 - 41316506
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||| |||  ||| || | ||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||| || ||    
T  41316364 acatctagggatcatagtggattcaggtctaagaatggtattctccgttatcagtatgagaatatcttatgacac-tttcataac--atactatataata 41316460  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatattta 156  Q
    ||||||||  || || ||  | |||||||||||||| |||||||||    
T  41316461 ttctcatggtgggtcgattaagtataaatattactcataatattta 41316506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 165
Target Start/End: Original strand, 24763751 - 24763792
Alignment:
Q  124 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 165  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24763751 tcaatccagtataaatattactcataatatttatacctatgt 24763792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19616471 - 19616435
Alignment:
Q  197 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctc 233  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  19616471 tgagatgtggtcatcagtctacatacataatagtctc 19616435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29800500 - 29800468
Alignment:
Q  200 gatgtgatcatcagtctacctacataatagtct 232  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29800500 gatgtgatcatcagtctacatacataatagtct 29800468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 1405 - 1159
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1405 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgatacttttcataactttta 1306  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 200  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  1305 ctatgtagtattctcatggcagatcaatccaatataaatattactcttaatatttatatctatggcaagacttgataactttttatccatgatctgtgag 1206  T
Q  201 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1205 atgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgat 1159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5931 - 5695
Alignment:
Q  4 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaaggg-tggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt-ataacttttac 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5931 gactccaacatctagggtacatagtggtttcatgtcgaaaggatggaatgcac---------tatgagaatatcttatgacactttttcataacttttac 5841  T
Q  102 tatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgaga 201  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5840 tatgtagtattcacatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgacctgtgaga 5741  T
Q  202 tgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttgatgat 247  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  5740 tgtgatcatcagtctacccacataatagtctttatgctttaatgat 5695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 230186 - 230367
Alignment:
Q  1 ctcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactttta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  230186 ctcgactccaacatctagggtacataatggtttcaggtcgaagggtagaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataactttta 230285  T
Q  101 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactct 182  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  230286 ctatgtagtattctcatggcagatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactct 230367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8511 - 8305
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  ||    
T  8511 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgg 8415  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  8414 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 8316  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  8315 ataatagtctc 8305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 389 - 183
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  ||    
T  389 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgg 293  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||||| ||||||||| || |||    
T  292 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgtggtcatcagtcgacatac 194  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  193 ataatagtctc 183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 130308 - 130526
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||    
T  130308 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagta 130404  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 210  Q
    ||||||    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||    
T  130405 ttctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcat 130503  T
Q  211 cagtctacctacataatagtctc 233  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  130504 cagtctacatacataatagtctc 130526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Original strand, 3771 - 3977
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    ||    
T  3771 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgg 3867  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  3868 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 3966  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  3967 ataatagtctc 3977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 119936 - 119730
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |  |||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    ||    
T  119936 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgg 119840  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||||||||||| |||    
T  119839 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacgtac 119741  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  119740 ataatagtctc 119730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 13033 - 13251
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||| |  |||||||||||    
T  13033 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattatgagaatatcttatgacaatttc-ataacat--actatgtagta 13129  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 210  Q
    |||||| |  || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  ||| |||  |||  |||| |  ||||||||| ||||    
T  13130 ttctcacggtgggtcaatccggtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatatatgacccatgagatgtggtcat 13228  T
Q  211 cagtctacctacataatagtctc 233  Q
    | |||||| ||||||||||||||    
T  13229 cggtctacatacataatagtctc 13251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 233
Target Start/End: Original strand, 40084 - 40290
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||   |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||||||||||    ||    
T  40084 catagtggtttcaagtctaagagttatatacaccattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattctcacagtgg 40180  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
     |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  ||| |||  ||||||||| |  |||||||||  ||||||||||| |||    
T  40181 gtcaatccggtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatccatgacccatgagatgtggccatcagtctacatac 40279  T
Q  223 ataatagtctc 233  Q
    |||||||||||    
T  40280 ataatagtctc 40290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 26748 - 26609
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||||||||| |  ||    
T  26748 catagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatatagtattctcaaggtgg 26652  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 165  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26651 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 26609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 124 - 241
Target Start/End: Original strand, 90033 - 90151
Alignment:
Q  124 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactcttt-atccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac 222  Q
    |||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  90033 tcaatccaatataaatgttatacgtaatatttatatctatgtgaagtgttgataactcttttacccatgatccgtgagatgtgattatcagtctatctac 90132  T
Q  223 ataatagtctctatgcttt 241  Q
    ||| |||||| ||||||||    
T  90133 atagtagtctttatgcttt 90151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 165
Target Start/End: Original strand, 67458 - 67609
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  |||||| | ||||| | ||||||||||| |||||| | |  |||||||  |||||||||||    
T  67458 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatctcatgacaatctc-ataactt--actatgtagta 67554  T
Q  111 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 165  Q
    |||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  67555 ttctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgt 67609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 8933 - 8807
Alignment:
Q  27 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatca 126  Q
    ||||||||||||| | | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||   ||||| |||||||||||||   || |||    
T  8933 gtggtttcaggtctaggagtggtatacaccattatcactatgagaatatcttatgaca-tcttcataac--atactaagtagtattctcattgggggtca 8837  T
Q  127 atccaatataaatattactcctaatattta 156  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  8836 atctagtataaatattactcctaatattta 8807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 158
Target Start/End: Original strand, 83111 - 83243
Alignment:
Q  23 catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 122  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||  ||  ||||   |||||||||||||||||||   ||    
T  83111 catactggtttcaggtctaagagtggagtacaccaatatgactatgataatatcttatgacac-cttcgtaac--atactatgtagtattctcattgtgg 83207  T
Q  123 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 158  Q
     |||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  83208 gtcaatccagtataaatattacttctgatatttata 83243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 204 - 102
Alignment:
Q  11 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 110  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| ||| |||  |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||  |||||||||||||    
T  204 acatctagggatcagagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagta 108  T
Q  111 ttctca 116  Q
    ||||||    
T  107 ttctca 102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 158
Target Start/End: Original strand, 11699 - 11758
Alignment:
Q  99 tactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 158  Q
    ||||||||||||||||||    || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11699 tactatgtagtattctcacagtgggtctatccagtataaatattactcctaatatttata 11758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Original strand, 15089 - 15133
Alignment:
Q  197 tgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttt 241  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15089 tgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgatgcttt 15133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1509 times since January 2019
Visitors: 4421