View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0674_low_31 (Length: 331)

Name: NF0674_low_31
Description: NF0674
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0674_low_31
NF0674_low_31
[»] chr5 (75 HSPs)
chr5 (40-330)||(10463737-10464026)
chr5 (40-330)||(8336843-8337131)
chr5 (40-330)||(8313209-8313497)
chr5 (41-330)||(37103032-37103320)
chr5 (40-330)||(27307819-27308108)
chr5 (40-328)||(1683171-1683458)
chr5 (40-330)||(34785256-34785544)
chr5 (41-330)||(27335630-27335918)
chr5 (34-330)||(41139025-41139321)
chr5 (87-330)||(2003952-2004194)
chr5 (40-330)||(24636944-24637234)
chr5 (40-330)||(8404400-8404690)
chr5 (40-326)||(621632-621917)
chr5 (40-330)||(4426022-4426311)
chr5 (40-330)||(4462756-4463045)
chr5 (40-330)||(40158265-40158553)
chr5 (40-330)||(17742333-17742615)
chr5 (40-330)||(42877618-42877905)
chr5 (40-330)||(8218017-8218293)
chr5 (40-330)||(13920063-13920352)
chr5 (86-330)||(41193028-41193272)
chr5 (159-330)||(22023191-22023362)
chr5 (40-330)||(31211187-31211478)
chr5 (40-330)||(34527030-34527307)
chr5 (40-257)||(34009995-34010211)
chr5 (40-239)||(38693472-38693670)
chr5 (40-330)||(43440879-43441155)
chr5 (42-330)||(2005023-2005311)
chr5 (42-330)||(30394080-30394367)
chr5 (40-330)||(4461968-4462245)
chr5 (86-330)||(18261230-18261471)
chr5 (40-211)||(9687537-9687708)
chr5 (187-330)||(16965878-16966021)
chr5 (40-211)||(28456628-28456797)
chr5 (40-302)||(37446433-37446689)
chr5 (196-309)||(9924280-9924393)
chr5 (92-321)||(22166932-22167161)
chr5 (40-226)||(42852827-42853012)
chr5 (247-330)||(9687715-9687798)
chr5 (86-323)||(2262845-2263081)
chr5 (40-171)||(21837098-21837228)
chr5 (43-323)||(10674648-10674927)
chr5 (234-330)||(26865879-26865975)
chr5 (149-328)||(40272459-40272638)
chr5 (47-323)||(43210639-43210914)
chr5 (40-130)||(22023103-22023193)
chr5 (40-181)||(26865712-26865852)
chr5 (234-330)||(6365413-6365508)
chr5 (140-323)||(19332468-19332651)
chr5 (274-330)||(26865232-26865288)
chr5 (86-170)||(9924401-9924484)
chr5 (40-124)||(18950875-18950959)
chr5 (198-303)||(14049897-14050001)
chr5 (289-330)||(28456585-28456626)
chr5 (278-330)||(8217510-8217562)
chr5 (34-328)||(3548347-3548638)
chr5 (86-311)||(36875874-36876097)
chr5 (138-323)||(43209900-43210084)
chr5 (244-323)||(32537608-32537687)
chr5 (274-330)||(38693675-38693731)
chr5 (40-179)||(14049761-14049899)
chr5 (230-323)||(42645089-42645181)
chr5 (286-330)||(37446329-37446373)
chr5 (243-323)||(37812678-37812757)
chr5 (138-197)||(5597755-5597814)
chr5 (138-197)||(24334041-24334100)
chr5 (295-330)||(28381186-28381221)
chr5 (244-291)||(42852775-42852822)
chr5 (295-330)||(43538588-43538623)
chr5 (34-225)||(30733924-30734113)
chr5 (148-201)||(23425337-23425389)
chr5 (40-69)||(27280413-27280442)
chr5 (297-330)||(34527365-34527398)
chr5 (138-202)||(2567432-2567496)
chr5 (298-330)||(43440248-43440280)
[»] chr4 (69 HSPs)
chr4 (40-330)||(53323774-53324064)
chr4 (40-330)||(30331284-30331573)
chr4 (40-330)||(47309434-47309723)
chr4 (27-330)||(19522712-19523014)
chr4 (40-330)||(33177427-33177716)
chr4 (41-330)||(43938001-43938291)
chr4 (40-330)||(22068097-22068386)
chr4 (92-330)||(20177934-20178170)
chr4 (40-323)||(31316547-31316830)
chr4 (40-323)||(55938075-55938356)
chr4 (40-328)||(28448397-28448677)
chr4 (95-330)||(38114273-38114507)
chr4 (40-330)||(53423569-53423859)
chr4 (42-330)||(51876007-51876297)
chr4 (40-330)||(10321695-10321984)
chr4 (40-330)||(25422067-25422355)
chr4 (40-330)||(33689299-33689588)
chr4 (138-330)||(13718078-13718271)
chr4 (34-330)||(3873152-3873468)
chr4 (40-330)||(4850094-4850383)
chr4 (40-330)||(51395618-51395907)
chr4 (41-330)||(10085485-10085772)
chr4 (40-296)||(1870140-1870394)
chr4 (141-330)||(37329487-37329678)
chr4 (40-330)||(44209501-44209777)
chr4 (42-330)||(44289677-44289965)
chr4 (40-285)||(42972740-42972983)
chr4 (40-321)||(7490707-7490982)
chr4 (40-330)||(53571548-53571824)
chr4 (86-330)||(35060878-35061120)
chr4 (40-330)||(11670119-11670395)
chr4 (40-330)||(23473484-23473773)
chr4 (86-330)||(47379228-47379471)
chr4 (40-258)||(47463436-47463655)
chr4 (42-330)||(48082443-48082731)
chr4 (86-326)||(35821128-35821355)
chr4 (92-329)||(48219945-48220180)
chr4 (92-328)||(52947819-52948054)
chr4 (254-330)||(7617535-7617611)
chr4 (138-323)||(38499295-38499479)
chr4 (140-323)||(34513123-34513305)
chr4 (86-323)||(44452093-44452328)
chr4 (40-130)||(7617424-7617514)
chr4 (40-328)||(13603785-13604071)
chr4 (274-330)||(11670873-11670929)
chr4 (105-323)||(35351735-35351954)
chr4 (86-323)||(28163777-28164010)
chr4 (34-130)||(3862488-3862585)
chr4 (34-130)||(3871245-3871342)
chr4 (275-330)||(31470962-31471017)
chr4 (229-323)||(6817994-6818087)
chr4 (207-325)||(47939750-47939867)
chr4 (40-75)||(13718000-13718035)
chr4 (40-74)||(38114243-38114277)
chr4 (259-329)||(50824411-50824481)
chr4 (149-285)||(44452920-44453056)
chr4 (274-330)||(53569155-53569212)
chr4 (274-330)||(53571008-53571065)
chr4 (138-201)||(16618865-16618928)
chr4 (29-72)||(37437222-37437265)
chr4 (138-225)||(8949622-8949710)
chr4 (294-330)||(25243861-25243897)
chr4 (294-330)||(25422943-25422979)
chr4 (294-330)||(31317815-31317851)
chr4 (294-330)||(35055124-35055160)
chr4 (294-330)||(44208875-44208911)
chr4 (40-75)||(45557893-45557929)
chr4 (138-225)||(52788873-52788960)
chr4 (29-69)||(53231122-53231162)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (40-330)||(15721068-15721360)
chr6 (40-330)||(30660778-30661068)
chr6 (40-330)||(26356528-26356820)
chr6 (40-330)||(8709836-8710124)
chr6 (40-330)||(10915301-10915592)
chr6 (40-330)||(5087196-5087485)
chr6 (40-330)||(5974315-5974604)
chr6 (40-325)||(17697392-17697676)
chr6 (40-330)||(844106-844396)
chr6 (40-329)||(29691917-29692205)
chr6 (40-330)||(861364-861655)
chr6 (40-329)||(938845-939133)
chr6 (40-330)||(1820983-1821268)
chr6 (44-330)||(5079516-5079802)
chr6 (105-330)||(2087438-2087661)
chr6 (86-327)||(33518409-33518648)
chr6 (40-330)||(22732003-22732293)
chr6 (92-330)||(20510491-20510716)
chr6 (96-330)||(14256212-14256440)
chr6 (34-283)||(12481801-12482050)
chr6 (40-330)||(30492722-30492998)
chr6 (96-330)||(28476253-28476486)
chr6 (40-330)||(18502998-18503274)
chr6 (42-330)||(33744670-33744958)
chr6 (40-225)||(20977467-20977652)
chr6 (40-193)||(17245717-17245869)
chr6 (40-225)||(20977101-20977286)
chr6 (138-330)||(11400171-11400364)
chr6 (40-174)||(34046542-34046676)
chr6 (43-323)||(3375297-3375576)
chr6 (161-330)||(20898115-20898275)
chr6 (138-323)||(289461-289647)
chr6 (140-323)||(21108172-21108355)
chr6 (83-323)||(3914471-3914709)
chr6 (40-169)||(20897817-20897947)
chr6 (149-323)||(289005-289178)
chr6 (261-330)||(17246307-17246376)
chr6 (246-330)||(17244540-17244624)
chr6 (34-73)||(16736652-16736691)
chr6 (41-129)||(30353133-30353220)
chr6 (274-328)||(5079000-5079054)
chr6 (138-201)||(15053930-15053993)
chr6 (40-73)||(14256157-14256190)
chr6 (259-323)||(3913266-3913329)
chr6 (294-330)||(22972047-22972083)
chr6 (294-330)||(23816315-23816351)
chr6 (235-267)||(30916905-30916937)
[»] chr1 (70 HSPs)
chr1 (40-330)||(30719479-30719769)
chr1 (27-330)||(13501206-13501506)
chr1 (27-330)||(51561340-51561642)
chr1 (92-330)||(28700954-28701192)
chr1 (40-330)||(19791239-19791527)
chr1 (40-328)||(26020405-26020692)
chr1 (86-309)||(47008699-47008920)
chr1 (40-330)||(52493528-52493818)
chr1 (40-331)||(35530785-35531075)
chr1 (40-330)||(26805497-26805786)
chr1 (40-330)||(30982388-30982677)
chr1 (40-330)||(33708951-33709240)
chr1 (40-330)||(36367896-36368185)
chr1 (40-326)||(11999722-12000007)
chr1 (34-330)||(43504775-43505062)
chr1 (40-330)||(46596782-46597070)
chr1 (40-327)||(10041246-10041532)
chr1 (40-251)||(46517178-46517388)
chr1 (42-330)||(31400219-31400507)
chr1 (40-326)||(12368249-12368521)
chr1 (40-330)||(36248333-36248613)
chr1 (40-330)||(21091051-21091338)
chr1 (86-330)||(15053640-15053870)
chr1 (34-240)||(39681883-39682090)
chr1 (230-327)||(21794413-21794510)
chr1 (92-324)||(31024113-31024345)
chr1 (44-324)||(7565189-7565468)
chr1 (105-323)||(49767693-49767910)
chr1 (105-323)||(12251439-12251656)
chr1 (141-328)||(33707476-33707663)
chr1 (40-160)||(37986750-37986869)
chr1 (261-328)||(2059078-2059145)
chr1 (34-192)||(2059484-2059639)
chr1 (149-323)||(27550800-27550974)
chr1 (105-323)||(25351963-25352178)
chr1 (140-323)||(11397039-11397222)
chr1 (234-330)||(37986893-37986989)
chr1 (274-330)||(12367703-12367759)
chr1 (244-328)||(42971953-42972036)
chr1 (275-330)||(29231884-29231939)
chr1 (149-323)||(49768522-49768696)
chr1 (86-282)||(52882360-52882556)
chr1 (188-328)||(1297017-1297156)
chr1 (274-327)||(36249098-36249151)
chr1 (230-323)||(48218046-48218138)
chr1 (274-330)||(15054431-15054487)
chr1 (274-330)||(37986209-37986265)
chr1 (42-130)||(21794533-21794621)
chr1 (138-323)||(35188186-35188365)
chr1 (245-310)||(26207482-26207547)
chr1 (41-130)||(42972167-42972256)
chr1 (86-209)||(27551561-27551684)
chr1 (43-216)||(48410258-48410430)
chr1 (138-210)||(52881707-52881780)
chr1 (184-228)||(2059152-2059196)
chr1 (244-328)||(13083446-13083529)
chr1 (230-310)||(43396432-43396512)
chr1 (275-330)||(13501452-13501506)
chr1 (148-279)||(18996922-18997052)
chr1 (138-201)||(26507632-26507695)
chr1 (41-75)||(6216382-6216416)
chr1 (34-75)||(28479931-28479972)
chr1 (138-225)||(26451181-26451269)
chr1 (40-68)||(29231368-29231396)
chr1 (138-225)||(31861634-31861722)
chr1 (29-73)||(33707619-33707663)
chr1 (294-330)||(36362477-36362513)
chr1 (294-330)||(46596153-46596189)
chr1 (138-225)||(47632664-47632752)
chr1 (248-323)||(48410127-48410202)
[»] chr7 (68 HSPs)
chr7 (40-330)||(43597490-43597779)
chr7 (40-330)||(47791838-47792127)
chr7 (40-330)||(6588687-6588976)
chr7 (34-330)||(18059006-18059299)
chr7 (40-330)||(22378464-22378753)
chr7 (40-330)||(4926372-4926664)
chr7 (40-330)||(7238582-7238871)
chr7 (40-330)||(38158948-38159241)
chr7 (40-330)||(35482065-35482351)
chr7 (37-330)||(1961897-1962190)
chr7 (40-326)||(14990554-14990837)
chr7 (40-326)||(15420165-15420448)
chr7 (40-307)||(10620526-10620793)
chr7 (41-323)||(46044298-46044580)
chr7 (59-330)||(46330799-46331069)
chr7 (41-330)||(4899871-4900158)
chr7 (138-330)||(21109449-21109642)
chr7 (40-330)||(43574239-43574529)
chr7 (40-329)||(11396964-11397252)
chr7 (40-247)||(6330978-6331185)
chr7 (40-328)||(15652802-15653085)
chr7 (40-330)||(44167800-44168074)
chr7 (40-290)||(27727232-27727485)
chr7 (40-330)||(38199062-38199338)
chr7 (40-331)||(3495655-3495932)
chr7 (142-330)||(29156073-29156260)
chr7 (197-330)||(4883775-4883908)
chr7 (40-330)||(43083861-43084137)
chr7 (86-257)||(36019814-36019985)
chr7 (40-330)||(1544481-1544769)
chr7 (42-330)||(38598967-38599255)
chr7 (40-330)||(44080958-44081247)
chr7 (188-330)||(45958811-45958953)
chr7 (186-323)||(16080918-16081055)
chr7 (149-323)||(1066517-1066691)
chr7 (40-330)||(33624788-33625074)
chr7 (40-265)||(37539849-37540075)
chr7 (86-323)||(8832715-8832952)
chr7 (86-323)||(12621625-12621861)
chr7 (275-328)||(27727998-27728051)
chr7 (245-330)||(36020005-36020090)
chr7 (233-328)||(9633368-9633461)
chr7 (274-331)||(38199807-38199864)
chr7 (154-328)||(1260142-1260316)
chr7 (40-123)||(45958732-45958815)
chr7 (230-323)||(8081814-8081906)
chr7 (86-181)||(15130859-15130953)
chr7 (86-323)||(37107686-37107922)
chr7 (92-251)||(1065769-1065928)
chr7 (149-238)||(10463407-10463497)
chr7 (245-323)||(38593281-38593358)
chr7 (92-321)||(42974165-42974394)
chr7 (174-323)||(37108538-37108686)
chr7 (272-328)||(37537487-37537542)
chr7 (275-330)||(3496423-3496478)
chr7 (86-250)||(38594592-38594756)
chr7 (274-330)||(43083327-43083384)
chr7 (294-330)||(15131588-15131624)
chr7 (272-323)||(8082536-8082586)
chr7 (272-323)||(8833442-8833492)
chr7 (272-323)||(18798947-18798997)
chr7 (198-328)||(41571468-41571596)
chr7 (40-69)||(16080785-16080814)
chr7 (40-73)||(29155968-29156001)
chr7 (294-330)||(33625666-33625702)
chr7 (259-323)||(40304416-40304479)
chr7 (294-330)||(45958105-45958141)
chr7 (294-330)||(46043663-46043699)
[»] chr8 (73 HSPs)
chr8 (40-330)||(44265446-44265735)
chr8 (40-330)||(25101966-25102255)
chr8 (40-331)||(38706447-38706737)
chr8 (40-330)||(21135321-21135610)
chr8 (40-331)||(36470829-36471119)
chr8 (40-330)||(6018037-6018326)
chr8 (86-330)||(17498544-17498787)
chr8 (40-330)||(5250394-5250684)
chr8 (40-330)||(6590263-6590553)
chr8 (40-330)||(33322531-33322820)
chr8 (40-330)||(35863039-35863328)
chr8 (40-330)||(5695917-5696205)
chr8 (40-330)||(24451482-24451771)
chr8 (40-330)||(27875451-27875740)
chr8 (40-330)||(28015632-28015921)
chr8 (40-330)||(43622795-43623087)
chr8 (40-330)||(41590343-41590631)
chr8 (40-330)||(35369188-35369477)
chr8 (40-330)||(8784576-8784865)
chr8 (40-330)||(37967533-37967824)
chr8 (40-330)||(42499385-42499673)
chr8 (97-331)||(21159841-21160075)
chr8 (40-330)||(18839922-18840211)
chr8 (150-330)||(6413383-6413563)
chr8 (40-330)||(41281306-41281593)
chr8 (40-323)||(37706728-37707009)
chr8 (138-330)||(30658540-30658731)
chr8 (92-330)||(17842463-17842699)
chr8 (40-330)||(36063440-36063718)
chr8 (138-330)||(9252645-9252836)
chr8 (40-330)||(16472990-16473270)
chr8 (40-330)||(16477561-16477841)
chr8 (138-330)||(13323652-13323845)
chr8 (86-312)||(17062415-17062639)
chr8 (86-312)||(17585719-17585943)
chr8 (92-265)||(18304724-18304896)
chr8 (40-330)||(39336991-39337267)
chr8 (40-251)||(23483421-23483631)
chr8 (40-330)||(5765720-5766012)
chr8 (42-330)||(28755181-28755469)
chr8 (40-320)||(30968670-30968951)
chr8 (40-330)||(43988159-43988446)
chr8 (230-330)||(14121938-14122038)
chr8 (43-309)||(32514051-32514318)
chr8 (40-202)||(43936520-43936681)
chr8 (149-328)||(32244511-32244690)
chr8 (40-330)||(36018109-36018400)
chr8 (86-323)||(3865698-3865934)
chr8 (180-290)||(2826919-2827029)
chr8 (198-323)||(44894574-44894698)
chr8 (274-330)||(39337757-39337813)
chr8 (149-290)||(3866505-3866647)
chr8 (276-330)||(41255335-41255389)
chr8 (43-323)||(42024260-42024536)
chr8 (232-320)||(10409789-10409876)
chr8 (274-330)||(35369928-35369984)
chr8 (138-323)||(6243479-6243663)
chr8 (174-226)||(1663854-1663906)
chr8 (86-323)||(32243684-32243920)
chr8 (40-72)||(30658459-30658491)
chr8 (138-201)||(6244275-6244338)
chr8 (138-225)||(34050598-34050685)
chr8 (42-72)||(18304672-18304702)
chr8 (248-310)||(28701866-28701928)
chr8 (42-72)||(31185724-31185754)
chr8 (40-126)||(36126455-36126542)
chr8 (40-72)||(12469454-12469486)
chr8 (294-330)||(13323183-13323219)
chr8 (274-310)||(28694963-28694999)
chr8 (294-330)||(35863921-35863957)
chr8 (294-330)||(36062804-36062840)
chr8 (149-197)||(36333227-36333275)
chr8 (294-330)||(37706135-37706171)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (40-327)||(5923-6209)
[»] chr2 (59 HSPs)
chr2 (40-327)||(10357318-10357604)
chr2 (40-330)||(31771316-31771605)
chr2 (40-330)||(7439220-7439509)
chr2 (40-330)||(3043367-3043656)
chr2 (34-330)||(42274301-42274596)
chr2 (92-330)||(6457266-6457504)
chr2 (40-330)||(33832130-33832418)
chr2 (40-330)||(43932740-43933029)
chr2 (41-327)||(8737818-8738104)
chr2 (40-323)||(31436045-31436326)
chr2 (40-330)||(40364890-40365179)
chr2 (86-330)||(25666038-25666281)
chr2 (50-330)||(41120738-41121016)
chr2 (40-330)||(44492883-44493173)
chr2 (40-330)||(25100585-25100873)
chr2 (109-330)||(30784185-30784404)
chr2 (86-328)||(36512027-36512269)
chr2 (92-330)||(37592937-37593171)
chr2 (150-330)||(35498588-35498768)
chr2 (40-330)||(42487674-42487963)
chr2 (40-330)||(44286690-44286978)
chr2 (40-330)||(20721235-20721511)
chr2 (40-207)||(13372001-13372167)
chr2 (40-330)||(21439838-21440114)
chr2 (86-330)||(34073624-34073865)
chr2 (86-326)||(33000914-33001150)
chr2 (40-319)||(44879724-44879995)
chr2 (105-267)||(29809401-29809562)
chr2 (40-216)||(33031165-33031339)
chr2 (40-330)||(20719949-20720230)
chr2 (40-328)||(14200970-14201260)
chr2 (92-323)||(32319001-32319232)
chr2 (40-208)||(18672317-18672480)
chr2 (83-323)||(3117981-3118219)
chr2 (248-330)||(7654925-7655007)
chr2 (232-330)||(20719228-20719326)
chr2 (250-328)||(33031087-33031165)
chr2 (92-330)||(8392383-8392622)
chr2 (149-323)||(32318223-32318398)
chr2 (274-330)||(23787782-23787838)
chr2 (138-323)||(32319624-32319809)
chr2 (274-330)||(20701256-20701312)
chr2 (274-330)||(21439296-21439352)
chr2 (34-125)||(13027442-13027533)
chr2 (277-330)||(18672259-18672312)
chr2 (40-75)||(35498806-35498841)
chr2 (278-328)||(4327848-4327898)
chr2 (241-323)||(13027654-13027735)
chr2 (41-130)||(3118639-3118728)
chr2 (294-330)||(20720809-20720845)
chr2 (274-314)||(36881116-36881156)
chr2 (40-75)||(29809260-29809295)
chr2 (138-224)||(18917309-18917395)
chr2 (40-69)||(19058649-19058678)
chr2 (40-69)||(37592898-37592927)
chr2 (294-330)||(18673071-18673107)
chr2 (294-330)||(42487053-42487089)
chr2 (294-330)||(44493759-44493795)
chr2 (138-225)||(45301279-45301367)
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (41-330)||(38173902-38174190)
chr3 (27-330)||(25250016-25250316)
chr3 (40-323)||(23883396-23883678)
chr3 (40-330)||(29348275-29348561)
chr3 (40-330)||(45419791-45420078)
chr3 (40-330)||(53517790-53518079)
chr3 (44-330)||(44808849-44809135)
chr3 (40-330)||(37178941-37179231)
chr3 (40-330)||(27492313-27492603)
chr3 (86-330)||(21749566-21749809)
chr3 (41-330)||(19669699-19669988)
chr3 (40-330)||(40762606-40762895)
chr3 (54-330)||(32146996-32147271)
chr3 (42-328)||(11045404-11045691)
chr3 (92-330)||(53397095-53397334)
chr3 (40-330)||(23917328-23917609)
chr3 (40-330)||(50615090-50615366)
chr3 (40-330)||(45235350-45235641)
chr3 (40-330)||(11293800-11294083)
chr3 (34-304)||(45406701-45406958)
chr3 (40-330)||(32943000-32943275)
chr3 (42-324)||(39562557-39562839)
chr3 (40-330)||(117453-117729)
chr3 (101-330)||(19601549-19601777)
chr3 (144-331)||(28685305-28685487)
chr3 (42-330)||(46295051-46295340)
chr3 (40-330)||(44557585-44557864)
chr3 (92-330)||(53439324-53439547)
chr3 (138-328)||(54268948-54269138)
chr3 (86-290)||(25232695-25232900)
chr3 (173-328)||(15772002-15772157)
chr3 (149-328)||(44555919-44556098)
chr3 (86-323)||(52701168-52701404)
chr3 (176-293)||(45387449-45387566)
chr3 (149-328)||(33475471-33475650)
chr3 (233-328)||(3173707-3173802)
chr3 (34-297)||(34995564-34995826)
chr3 (86-323)||(33476241-33476477)
chr3 (84-323)||(8575951-8576191)
chr3 (148-310)||(26268683-26268844)
chr3 (96-225)||(9018125-9018253)
chr3 (40-182)||(23921081-23921220)
chr3 (83-323)||(31991074-31991313)
chr3 (218-326)||(53377326-53377436)
chr3 (149-323)||(41927953-41928126)
chr3 (233-330)||(37481253-37481351)
chr3 (274-330)||(116924-116980)
chr3 (274-330)||(44555364-44555420)
chr3 (274-330)||(50614546-50614602)
chr3 (86-227)||(41927360-41927501)
chr3 (92-166)||(53377430-53377503)
chr3 (106-201)||(44287839-44287933)
chr3 (41-130)||(8575377-8575466)
chr3 (241-300)||(44287969-44288028)
chr3 (272-323)||(52701897-52701947)
chr3 (40-75)||(54268860-54268895)
chr3 (138-201)||(55006177-55006240)
chr3 (149-250)||(53520018-53520120)
chr3 (145-202)||(53658029-53658086)
chr3 (294-330)||(32147859-32147895)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (40-328)||(17383-17669)
[»] scaffold0651 (2 HSPs)
scaffold0651 (40-323)||(6868-7151)
scaffold0651 (294-330)||(5819-5855)
[»] scaffold0148 (2 HSPs)
scaffold0148 (40-330)||(35273-35562)
scaffold0148 (274-330)||(38618-38674)
[»] scaffold1160 (1 HSPs)
scaffold1160 (40-328)||(1159-1449)
[»] scaffold1191 (1 HSPs)
scaffold1191 (92-330)||(669-905)
[»] scaffold0707 (1 HSPs)
scaffold0707 (86-327)||(6953-7192)
[»] scaffold0562 (1 HSPs)
scaffold0562 (34-330)||(3971-4287)
[»] scaffold0514 (1 HSPs)
scaffold0514 (57-330)||(6197-6470)
[»] scaffold0097 (4 HSPs)
scaffold0097 (40-330)||(25063-25339)
scaffold0097 (40-330)||(23787-24068)
scaffold0097 (232-330)||(23066-23164)
scaffold0097 (294-330)||(24647-24683)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (40-330)||(6931-7221)
[»] scaffold1190 (1 HSPs)
scaffold1190 (40-330)||(208-486)
[»] scaffold0640 (1 HSPs)
scaffold0640 (42-330)||(3900-4188)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (40-231)||(158034-158223)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (40-330)||(240018-240294)
scaffold0003 (274-330)||(239492-239548)
[»] scaffold0571 (2 HSPs)
scaffold0571 (184-330)||(8430-8575)
scaffold0571 (40-172)||(8610-8742)
[»] scaffold0385 (2 HSPs)
scaffold0385 (40-330)||(9966-10245)
scaffold0385 (274-330)||(9424-9479)
[»] scaffold0199 (2 HSPs)
scaffold0199 (233-330)||(6204-6301)
scaffold0199 (174-216)||(6305-6347)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (149-323)||(3260-3436)
scaffold0734 (40-124)||(2857-2941)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (40-171)||(21756-21886)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (244-330)||(48967-49053)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (187-323)||(282940-283076)
scaffold0005 (105-323)||(283308-283525)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (43-225)||(47860-48041)
[»] scaffold0245 (1 HSPs)
scaffold0245 (188-328)||(24927-25066)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (92-167)||(52512-52586)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (148-201)||(123298-123351)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 75)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 10464026 - 10463737
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  10464026 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 10463928  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  10463927 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgc 10463828  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10463827 ataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 10463737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 8337131 - 8336843
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  8337131 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgatttttt-gagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 8337034  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  8337033 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaactgcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctagacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgc 8336934  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8336933 ataggaacttttagtaatgttcttaacacgtcagtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 8336843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 8313497 - 8313209
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||    
T  8313497 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgaggcaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaattcagaattttt--aa 8313400  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  8313399 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaaaataaaattaacaaaatatggacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgc 8313300  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | | ||||||||| |||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8313299 ataagaacttttaataatgttcttaacacgtatgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 8313209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 41 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 37103320 - 37103032
Alignment:
Q  41 tttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaac 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||    
T  37103320 tttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttct-aac 37103222  T
Q  141 atgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgca 240  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||  | |||||||||||    
T  37103221 atgaaacgaattaaaaatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaattaaattttgagataattttttgca 37103122  T
Q  241 gaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  37103121 gaggaacttttagtaatgttcttaacacgtttgtaaaaaattattcaaaaattcaagagtttatgcataaattaaacaaatttgaattga 37103032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 27308108 - 27307819
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||       ||    
T  27308108 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaaaactatgaaagattcatttaccacaatttagaatttttt-aa 27308010  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  27308009 catgaaacaaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatcttgacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgc 27307910  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | || |||||| |||||| || |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27307909 atagaaactttcagtaatgtttttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 27307819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 40 - 328
Target Start/End: Original strand, 1683171 - 1683458
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||        | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       ||    
T  1683171 gtttaactatccttaaactcttaaatttttgaacgatttctttaagacaagtttagaacactatgaaaagttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 1683269  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  1683270 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaatgataaaagtaataaaatatggacgtataaatcaaattttgtgacaattttttgc 1683369  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 328  Q
    | |||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1683370 ataggagcttttagtaatgttgttaacatgtctgcaaaaaattatccaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaatt 1683458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 34785256 - 34785544
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||        | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||       ||    
T  34785256 gtttaattatccttaaattcttaaattttttaacgattttttttagacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaattta-aatttttttaa 34785354  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  34785355 cataaaacgaattaaatataaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtaaaaatcaaattttgcgacaattttttgc 34785454  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34785455 aaaggaacttttagtaatattcttaacacgtctg-aaaaaattgtacaaaaactcaaaagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 34785544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 41 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 27335918 - 27335630
Alignment:
Q  41 tttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaac 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |        | ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |        |||    
T  27335918 tttaattatccttaaactcttaaatttttgaacaatttttttaagacaagtttaaaacattatgaaaggttcatttaccaaaatttata-tttttttaac 27335820  T
Q  141 atgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||| |||||||||| ||    
T  27335819 atgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatatgggcgtaaaaatcaaattttgcgacaattttttaca 27335720  T
Q  241 gaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27335719 gaggaacttttagtaatgttcttaacacatatgcaaaaaattgtttaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 27335630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 34 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 41139321 - 41139025
Alignment:
Q  34 aaattcgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannn 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       || ||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||       
T  41139321 aaatttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacattgtgaaaggttcaattactaaaatttagaattt 41139222  T
Q  134 nnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaatt 233  Q
        | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||    
T  41139221 ttttatcatgaaatgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataatt 41139122  T
Q  234 ttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41139121 ttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacatgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagattaagcataaattaaacaaatttgaattga 41139025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 87 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 2004194 - 2003952
Alignment:
Q  87 caaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaag 186  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2004194 caagtttagaacactatgaaaggttcattttctacaatttagaattgtta-aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaag 2004096  T
Q  187 ataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttc 286  Q
    ||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||| ||||||    
T  2004095 ataaagttaacaaaatctggacataaaaatcaaattttgcgacaattttttgcagatgaacttttagtaatgttcttaacacgtacgcaaaaagttgttc 2003996  T
Q  287 aaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2003995 aaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 2003952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 24636944 - 24637234
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnng-acacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnna 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |    
T  24636944 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttttagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-a 24637042  T
Q  139 acatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttg 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| | |||||||||    
T  24637043 acatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatggcaaaacttaaagataaaagtaataaaatctggaagtagaaatcaaattttgcgataattttttg 24637142  T
Q  239 cagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  24637143 cggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaatcaaatttgaattga 24637234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 8404400 - 8404690
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||        ||    
T  8404400 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacaagtttagaacactaaaaaaggttcatttaccaaaatttagattttttttaa 8404499  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||| |||||| |||| |||||||    
T  8404500 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaataaaatttgaacttaaaaatcaaattttgcgacaactttttgc 8404599  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||| ||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8404600 agatgaatttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgtttaaaaattcaagagtttaagcataaattaaacaaacttgaattga 8404690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 326
Target Start/End: Original strand, 621632 - 621917
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||       || |||   |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||       ||    
T  621632 gtttaattatccttaaactcttaaattttagaacgatttttatgagacagatttagaacactataaaaggttcatttactagaatttacaatttttt-aa 621730  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  621731 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaacttaaagataaaattaacaaaatctggatgtagaaatcacattttgcgacaattttttgc 621830  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaa 326  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  621831 agaggaacttttagtaatgtttttaacacgtctgccaaaaattgttcaaaaactcaaaagtttaagcataaattaaagaaatttgaa 621917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 4426311 - 4426022
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || | ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||       ||    
T  4426311 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagataagtttagaacactatgaaatattcatttactaaaatttagaatttttt-aa 4426213  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||| || |||||||||||||||  ||    
T  4426212 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaatttaactaaatctagacgtaaaaattaaattttgcaacaattttgcgc 4426113  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| | || || |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4426112 ataggaacttttagtaatgttcttaagacgtatgtaaaaaattattcaaaaactcagaagtttaaacataaattaaacaaaattgaattga 4426022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 4463045 - 4462756
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       || ||||| |||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||       ||    
T  4463045 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgtacgattttttcgagacaagtttagagtactatgaaagattcattgactaaaatttagaatttgtt-aa 4462947  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  4462946 catgaaacgaattaaatatgaatttttaaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatcaggatgtagaaatcaaattttgcaacaattttttgt 4462847  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||| ||| ||| |||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  4462846 agagggactattaataatgttcttaacacgtctgcaaataattgttcaaaaactcaagagttaaagcataaatgaaacaaatttgaattga 4462756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 40158553 - 40158265
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  40158553 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttatgacaagtttataac-ctatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 40158456  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||| |||||| | | |||||||     
T  40158455 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatgacaaaagttaaagataaaattaacaaattatggacgtagatatcaaattttgcgaaatttttttgt 40158356  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  40158355 agaggaactttttgtaatgttcttaacacgtatgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattga 40158265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 17742615 - 17742333
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||        ||    
T  17742615 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagataagtttagaacactatgaaaggttcatttaccaaaacttaga-tttttttaa 17742517  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaatttttt-aaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttg 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||     
T  17742516 catgaaacgaattaaatatgaatttttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaatatttta 17742417  T
Q  239 cagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  17742416 cagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaatcgtttaaaaactcaagag--------taaattaaacaaatttgaattga 17742333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 42877618 - 42877905
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||        | ||||| ||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| |        ||    
T  42877618 gtttaattattcttaaactcttaaatttttgaaggatatttttaagacaagtttagaatgccatgaaaggttcatttaccaaaattta-attttttttaa 42877716  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||    
T  42877717 gatgaaacgaattaaatatgaattttt-aaaacgacaaaagataaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaataaaattttgcgacaattttttgc 42877815  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || | | |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  42877816 agaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctac-aaaaattgtttaaaaactcaagagtttaagcatgaattaaacaaatttgaattga 42877905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 8218017 - 8218293
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       || | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||    
T  8218017 gtttaattatccttaaagtcttaaatttttgaacgatttttttgagataagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaatttttt-aa 8218115  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  8218116 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaac-------------gataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcaataattttttgc 8218202  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8218203 ggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 8218293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 13920352 - 13920063
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||       ||    
T  13920352 gtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaatgttcaattattaaaatttagaatttttt-aa 13920254  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  13920253 catgaaattaattaaatatgaatatttgaaaatgataaaagttaaagataaaagtaataaaatttggacatataaatcaaattttgcgataattttttgc 13920154  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     |||||||||||| |||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13920153 ggaggaacttttattaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaatagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 13920063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 330
Target Start/End: Original strand, 41193028 - 41193272
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa 185  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||       ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  41193028 acaagtttagaacactatcaaaggttcatttacaaaaatttagaatttttt-aacataaaacgaattgaatatgaattttttaaaacggtaaaagttaaa 41193126  T
Q  186 gataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaa-ttgt 284  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  || |||||| ||||    
T  41193127 gataaaattaactaaatctggacgtagaattcaaattttgcgataattttttgcagaggaacttttagcaacattcttaacacggctgtaaaaaagttgt 41193226  T
Q  285 tcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41193227 tcaaaaaatcaaaagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 41193272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 159 - 330
Target Start/End: Original strand, 22023191 - 22023362
Alignment:
Q  159 gaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaata 258  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||     
T  22023191 gaattttttaaaacgaaaaaagttaaagctaaaattaacaaaattcggacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttaccgaggaacttttagtaatg 22023290  T
Q  259 ttcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22023291 ttcttaacacgtctacaaaaaattgttcaaaaattcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 22023362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 31211478 - 31211187
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnng-acacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnna 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         | ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||        |    
T  31211478 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttttaaacaagtttagaacaatatgaaaggtttatttacaaaaatttaga-ttttttta 31211380  T
Q  139 acatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttg 238  Q
    | |||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||    
T  31211379 atatgaaacgaattcaataggagttttttaaaacagcaaaagttaaagatataagtaataaaatcgggacgtagaaatcaaattttgcaataattttatg 31211280  T
Q  239 cagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgc-aaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||   | | | ||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  31211279 cagaggaacttttagtaatgttcttaactaatctacaaaaaaattgttcaaaaacttaagaatttaagtataaattaaacaaatttaaattga 31211187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 34527307 - 34527030
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||    
T  34527307 gtttaattatccttaaattcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttagaatttttttaa 34527208  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||              ||||||    
T  34527207 catgaaacaaattaaatatgaatttttaaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaa-------------attttgc 34527121  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     | ||||| ||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| || |||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  34527120 ggcggaacatttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaacaacttaagagtataagaataaattaaacaaatttgaattga 34527030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 34010211 - 34009995
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |       || ||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||       |     
T  34010211 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgtactatttttttgagacaagtttagaatactaagaaaggttcattaactaaaatttagaatttttt-ac 34010113  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||||||     
T  34010112 cataaaacaaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagtttaagataaaattaacaaaatctgaacgtagaaatcaaattttgcgtcaattttttgg 34010013  T
Q  240 agaggaacttttagtaat 257  Q
    ||||||||||||||||||    
T  34010012 agaggaacttttagtaat 34009995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 40 - 239
Target Start/End: Original strand, 38693472 - 38693670
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||       ||    
T  38693472 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaatactatgaaaggttcaattactaaaatttataatttttt-aa 38693570  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  38693571 catgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaatgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataattttttgc 38693670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 43440879 - 43441155
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||       || | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||       ||    
T  43440879 gtttgattatccttaaattcttaaatttttgaatgatttttttgagataagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttataatttttt-aa 43440977  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||             ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  43440978 catgaaacgaattcaatatgaatttttgaaaac-------------gataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgcgataattttttgc 43441064  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     |||||||||||| |||| |||||||||  | | |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43441065 ggaggaacttttaataatgttcttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 43441155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 2005311 - 2005023
Alignment:
Q  42 ttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaaca 141  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || ||        | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||       ||||    
T  2005311 ttaattatctttaaactcttaaattttttaaagattctttttatacaagattataacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt-aaca 2005213  T
Q  142 tgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaa-tttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||| |||| | |||||||| ||||||| ||||||| | | |||||| |    
T  2005212 tgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaagaaaaatatggacgtagaaatcaaatttttgcgatattttttt-c 2005114  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     ||||| |||| | |||  ||||||||| || || ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  2005113 ggaggacctttaaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttggattga 2005023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 30394367 - 30394080
Alignment:
Q  42 ttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaaca 141  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||        | ||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||       ||||    
T  30394367 ttaattatccttaaactcttaacttttttaacgattctttttatacaagtttataacactatgaa-ggttcatttgctaaaatctataatttttt-aaca 30394270  T
Q  142 tgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaa-tttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||| | |||||||| ||||||| ||||||| | | |||||| |    
T  30394269 tgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttttgcgatattttttt-c 30394171  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     ||||| |||||| |||  ||||||||| || || ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  30394170 ggaggaccttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttggattga 30394080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 4461968 - 4462245
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaa-ggttcatttactaaaatttagaannnnnnna 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||| |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||       |    
T  4461968 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttt-gagacaagtttaatacactataaaaaggttcatttactaaaatttagaactttct-a 4462065  T
Q  139 acatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttg 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||                ||||||||||||| ||| ||||| | |||| | | || ||||||    
T  4462066 acatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaagc--------------aacaaaatctggatgtagaaatctaattttacgataagtttttg 4462151  T
Q  239 cagaggaacttttagtaatattcttaacatgttt--gcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | ||||||||||||||||| |||| |||| || |  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  4462152 cggaggaacttttagtaatgttctaaacacgtatatgcaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacacatttgaattga 4462245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 86 - 330
Target Start/End: Original strand, 18261230 - 18261471
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa 185  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||       ||||||||| ||| ||| | |    ||||| |||| ||||||||| ||    
T  18261230 acaagtttataacactatgaaaggtccatttactaaaatttagaatttttt-aacatgaaatgaactaatttt----ttttttaaacgacaaaagttcaa 18261324  T
Q  186 gataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaatttt--ttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaatt 282  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| | |    
T  18261325 gataaaactaacaaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgataattttttttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtttgtaaaagaat 18261424  T
Q  283 gttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||  |||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  18261425 gtttgaaaacttaagaatttaagcat-aattaaacaaatttgaattga 18261471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 40 - 211
Target Start/End: Original strand, 9687537 - 9687708
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||       || | ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||       ||    
T  9687537 gtttaattatccttaaactcttaaatttttaatcgatttttttgatataagtttagaacactataaaaggttcgtttactaaaatttagaatttttt-aa 9687635  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaac-aacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgta 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  9687636 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgaaaaaaagttaaagataaaattaataaaattttgacgta 9687708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 187 - 330
Target Start/End: Original strand, 16965878 - 16966021
Alignment:
Q  187 ataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttc 286  Q
    |||||| ||| ||||||||||| || ||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| ||||||     
T  16965878 ataaaagtaataaaatctggacataaaaatcaaattttgcgataattttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaatattgtta 16965977  T
Q  287 aaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16965978 aaaaacgtaagactttaaacataaattaaacaaatttaaattga 16966021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 40 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 28456797 - 28456628
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       || ||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||          ||    
T  28456797 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgtacgatttttgtgagacaagtttagaatactatgaaaagttcattaactaaaatttact-tttttttaa 28456699  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgta 211  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28456698 catgaaactaattaaatatgaattttttaaacgaa-aaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgta 28456628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 40 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 37446689 - 37446433
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||        | ||||| |||||||  ||| || |||||| ||||||||||||||||       ||    
T  37446689 gtttaattatccttgaactcttaaattgttgaaagattttttaaa-acaagtttagaaccatataaatggttcacttactaaaatttagaatttttttaa 37446591  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |     |||||| | | | ||||||| |||||||| ||   |||||    
T  37446590 tgtgaaacgaattaaatataaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaagt-----aatctgtatgcagaaatcaaattttgcaataaaactttgc 37446496  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagttt 302  Q
      |||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37446495 gaaggaacttttagtaacgttcttaacatgtctgtaaaaaattgttcaaaaacttaagagttt 37446433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 196 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 9924393 - 9924280
Alignment:
Q  196 acaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactca 295  Q
    ||||||||| |||||| || |||| |||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  9924393 acaaaatctagacgtagaattcaaattttgtgacaatattttgcagaggaactttaagtaatgttcttaacaagtctgtaaaaaattgttcaaaaactca 9924294  T
Q  296 agagtttaaacata 309  Q
    ||||||||||||||    
T  9924293 agagtttaaacata 9924280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 92 - 321
Target Start/End: Original strand, 22166932 - 22167161
Alignment:
Q  92 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaatttttta-aaacaacaaaagttaaagataa 190  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||       |||| |||| || || ||||||||||||||  |||  | |||| || |||||||    
T  22166932 ttagaacactacgaaaggttcatttagtaaaatttagaatttttt-aacaagaaatgagtttaatatgaattttttttaaatgaaaaaatttcaagataa 22167030  T
Q  191 aattaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaa 289  Q
    ||||||||||| | ||||| || ||||||| ||||| || |||||||| | || |||||||||||||| ||||||| | || | ||||||||||||||||    
T  22167031 aattaacaaaaatatggacatagaaatcaaattttgaaataattttttacggatgaacttttagtaatgttcttaatacgtctacaaaaaattgttcaaa 22167130  T
Q  290 aactcaagagtttaaacataaattaaacaaat 321  Q
    | |  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22167131 agcataagagtttaaacat-aattaaacaaat 22167161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 42853012 - 42852827
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||        || | ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||       ||    
T  42853012 gtttaattattcttaaattcttgaatttttgaacgttttttatgagataagtttagaacaatatgaaagattcatttactaaaattta-aaatttttcaa 42852914  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgc 226  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  42852913 cgtgaaacgaatttaaaatgaattttttaaaacgactaaagttaaaaataaaagtaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgc 42852827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 247 - 330
Target Start/End: Original strand, 9687715 - 9687798
Alignment:
Q  247 cttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9687715 cttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 9687798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 323
Target Start/End: Original strand, 2262845 - 2263081
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa 185  Q
    ||||| |||||||| ||| |||  ||| |||||||||||||||||       || ||||||  |||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||    
T  2262845 acaagtttagaacattataaaaacttcgtttactaaaatttagaatttttt-aatatgaaataaattaaatataaatttttttaaaagacaaaagttcaa 2262943  T
Q  186 gataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgt 284  Q
     |||||| |||||||| |||| ||| |||||| || |||||  | ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||||    
T  2262944 aataaaagtaacaaaaatctgtacgcataaataaaattttgagataattttttgcagatgaactttttgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgt 2263043  T
Q  285 tcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    ||||||  | || ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2263044 tcaaaattttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 2263081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 21837228 - 21837098
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||       || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  21837228 gtttaattatccttaaacttttaaatttttgaatgattttttcgatacaagtttagaacactataaaaggttcatttactaaaatttagaa-ttttctaa 21837130  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaa 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21837129 catgaaacgaattaaatatgaatttcttaaaa 21837098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 10674927 - 10674648
Alignment:
Q  43 taattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacat 142  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |||||       || ||||| ||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||       |||||    
T  10674927 taattatccttaaacttttaaatctttaaacgatttttttgagacaagtttagaacaccacaaaaggttcgtttactaaaatttagaatttatt-aacat 10674829  T
Q  143 gaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcag 241  Q
     ||| ||||||||||||||| |||| |||  || |||||| ||||||||| |||||||| | |||||||| |||  || |||||  |  |||||||| |     
T  10674828 aaaatgaattaaatatgaatatttttaaaataccaaagttcaagataaaagtaacaaaaatatggacgtagaaacaaaattttgagatgattttttgtat 10674729  T
Q  242 aggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    | |||||||||||||| || ||||||  |||| |||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  10674728 atgaacttttagtaatgtttttaacacttttgtaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattatacaaattt 10674648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 234 - 330
Target Start/End: Original strand, 26865879 - 26865975
Alignment:
Q  234 ttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26865879 ttttgcggcggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 26865975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 149 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 40272638 - 40272459
Alignment:
Q  149 aattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaat-ctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaac 247  Q
    ||||||||||| ||||||| ||   ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||| | |||| || |||||  | ||||||||| ||| ||||    
T  40272638 aattaaatatggatttttttaatagacaaaagtttaaaataaaagtaacaaaattctggacgcagaaataaaattttgagataattttttgtagatgaac 40272539  T
Q  248 ttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 328  Q
    |||| ||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  40272538 ttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaatttaaatt 40272459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 323
Target Start/End: Original strand, 43210639 - 43210914
Alignment:
Q  47 tatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaa 146  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||        | ||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||| ||       |||||||||    
T  43210639 tatccttaaactctaaaatttttcaacgattttttttatacaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaattta-aaattttttaacatgaaa 43210737  T
Q  147 cgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagagga 245  Q
      ||||||||||||||||||  ||   ||||||||| || |||||| |||||||| |||||||| | |||| || |||||  | ||||||||||| | ||    
T  43210738 taaattaaatatgaatttttctaagagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatctggacgaagaaataaaattttgagataattttttgcataaga 43210837  T
Q  246 acttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    ||||||  |||| |||||||||  | | ||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  43210838 acttttcttaatgttcttaacacttgtacaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 43210914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 130
Target Start/End: Original strand, 22023103 - 22023193
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaa 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22023103 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttaaaacaccatgaaaggttcatttactaaaatttagaa 22023193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 181
Target Start/End: Original strand, 26865712 - 26865852
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||        | ||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||       ||    
T  26865712 gtttaattatccttaagctcttaaatttttgaatgaatttttttagacaagtttagaacactatgaaaggtccaattaataaaattta-aatttttttaa 26865810  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagt 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26865811 catgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagt 26865852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 234 - 330
Target Start/End: Original strand, 6365413 - 6365508
Alignment:
Q  234 ttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||   | ||| |||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6365413 ttttgcagaggaacttttactaatgttcttaacgcatctgcgaaaaat-gttcaaaaacttaatagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 6365508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 19332651 - 19332468
Alignment:
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttg 238  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| || |||||| ||| |||| |||||||| | |||| || |||||  | ||||||||     
T  19332651 catgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaaaaaaaatctggacgcagaaataaaattttgagataattttttc 19332552  T
Q  239 cagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
     ||| |||||||| ||||| |||||||||  | | ||||||||| ||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19332551 gagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtacaaaaaattattcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 19332468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 26865288 - 26865232
Alignment:
Q  274 caaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26865288 caaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 26865232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 9924484 - 9924401
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaa 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  9924484 acaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaaa-atgaaacaaattaaatatgaaatttttaaa 9924401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 124
Target Start/End: Original strand, 18950875 - 18950959
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||        | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18950875 gtttaattatccttaaactcttaaatttctgaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaat 18950959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 198 - 303
Target Start/End: Original strand, 14049897 - 14050001
Alignment:
Q  198 aaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaag 297  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||  | ||||||| |  ||| ||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||    
T  14049897 aaaatatggacgtagaaatcaaattttgagataattttt-gtggagaaacttttagtaatgttcttaacatgtgttccaaaaattgttcaaaaacttaag 14049995  T
Q  298 agttta 303  Q
    ||||||    
T  14049996 agttta 14050001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 289 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 28456626 - 28456585
Alignment:
Q  289 aaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28456626 aaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 28456585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 8217562 - 8217510
Alignment:
Q  278 aaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8217562 aaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 8217510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 328
Target Start/End: Original strand, 3548347 - 3548638
Alignment:
Q  34 aaattcgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannn 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||        | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||       
T  3548347 aaatttgtttaattatccttaaacacttaaacatttgaacgatttattttagacaaatttagaacattatgaaaggttcatttactaaaattt--aaatt 3548444  T
Q  134 nnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaa-caaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaat 232  Q
        ||  ||||| |||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||| ||| |||| | ||  | || |||| || |||||  | |||    
T  3548445 atttaatgtgaaatgaattaaatatgaatttttt-aaatgccaaaagttcaagataaaagtaaccaaattttgtgcatagaaattaaattttgagataat 3548543  T
Q  233 tttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 328  Q
    || |||  |||||| ||||| |||| ||||| |||  | | |||| ||||||||||||| | || ||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  3548544 ttcttgtcgaggaatttttaataatgttcttgacacttctacaaataattgttcaaaaagttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattttaatt 3548638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 36876097 - 36875874
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa 185  Q
    ||||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||       |||||||||  |||||||||| ||| |||| |||||| |||| ||||     
T  36876097 acaagtttggaacattattaaaggtttatttactaaaattcagaatttttt-aacatgaaataaattaaatat-aatctttttaaacaaaaaaatttaa- 36876001  T
Q  186 gataaaattaacaaa-atctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaa-ttg 283  Q
    | ||||| ||||||| || |||| ||| ||||||| |||||  |  ||||||||  | ||||||||||||| | |||||||||  | ||||||||| |||    
T  36876000 gttaaaagtaacaaatatttggatgta-aaatcaaattttgagatgattttttgtggtggaacttttagtagtgttcttaacacatctgcaaaaaaattg 36875902  T
Q  284 ttcaaaaactcaagagtttaaacataaa 311  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  36875901 ttcaaaaacttaagagtttaaccataaa 36875874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 43210084 - 43209900
Alignment:
Q  138 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaatttttt 237  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||| |||  |||||||||  | | ||| | |  |||||||||||| | |||| || |||||  | ||||||||    
T  43210084 aacatgaaataaattaaatatgattttttttaaaagacaaaagttcgaaaaaaagtaagaaaaatctggacgaagaaataaaattttgagataatttttt 43209985  T
Q  238 gcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    ||| | |||||||| ||||| ||||||| |  | ||||||||||||||||||| || || |||| || ||| ||||||||| ||||    
T  43209984 gcataagaacttttggtaatgttcttaatacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagttcaagcat-aattaaacagattt 43209900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 323
Target Start/End: Original strand, 32537608 - 32537687
Alignment:
Q  244 gaacttttagtaatattctt-aacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  32537608 gaacttttagtaatgttctttaacacttttgcaaaacattgttcaaaatctcaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 32537687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 274 - 330
Target Start/End: Original strand, 38693675 - 38693731
Alignment:
Q  274 caaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  38693675 caaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagtataaattaaacaaatatgaattga 38693731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 179
Target Start/End: Original strand, 14049761 - 14049899
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        | ||| | |||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||       ||    
T  14049761 gtttaatcatccttaaactcttaaatttttgaacgattttcttaatacacgtttagaacattacgaaaagttcatttactaatattta-aaattttttaa 14049859  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaa 179  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  14049860 catcaaatgaattaaatataaatttttttaaacgacaaaa 14049899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 323
Target Start/End: Original strand, 42645089 - 42645181
Alignment:
Q  230 aattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    ||||||||||| | ||| ||||  |||| ||||||| || | ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  42645089 aattttttgcatatgaaatttttttaatgttcttaatatttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 42645181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 37446373 - 37446329
Alignment:
Q  286 caaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  37446373 caaaaacttaagagttaaaacataaattaaacatatttgaattga 37446329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 37812757 - 37812678
Alignment:
Q  243 ggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  37812757 ggaaattttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 37812678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 197
Target Start/End: Original strand, 5597755 - 5597814
Alignment:
Q  138 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaac 197  Q
    |||||| || ||||||||||| | |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  5597755 aacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaagttcaagataaaattaac 5597814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24334100 - 24334041
Alignment:
Q  138 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaac 197  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||    
T  24334100 aacatgtaatgaattaaatatgaattttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaac 24334041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 295 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 28381221 - 28381186
Alignment:
Q  295 aagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28381221 aagagtttaaacatagattaaacaaatttgaattga 28381186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 244 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 42852822 - 42852775
Alignment:
Q  244 gaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaa 291  Q
    |||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  42852822 gaacttttagtaacgttcttaacacgtatgcaaaaaattgttcaaaaa 42852775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 295 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 43538623 - 43538588
Alignment:
Q  295 aagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43538623 aagagttttaacataaattaaacaaatttgaattga 43538588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 225
Target Start/End: Original strand, 30733924 - 30734113
Alignment:
Q  34 aaattcgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannn 133  Q
    ||||| |||||||||  ||| || |||||||||||||||| |       || ||| | |||||||| ||| ||| |||||||||||||||  |||||       
T  30733924 aaatttgtttaattactcttgaattcttaaatttttgaacaattttttggagacatgtttagaacattataaaatgttcatttactaaaaaatagaattt 30734023  T
Q  134 nnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgtataaatcaatttttg 225  Q
        ||||||| | |||||||||||||||||||  ||||  |||||||| |||| || | |||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  30734024 ttt-aacatgacaagaattaaatatgaattttt--aaacgtcaaaagttcaagaaaagagtaacaaaaatctggacgtagaaatcaaattttg 30734113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 201
Target Start/End: Original strand, 23425337 - 23425389
Alignment:
Q  148 gaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||||    
T  23425337 gaattaaatatgaattttt-aaaattgcaaaagttcaagataaaattaacaaaa 23425389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 27280442 - 27280413
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaattttt 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27280442 gtttaattatccttaaactcttaaattttt 27280413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 330
Target Start/End: Original strand, 34527365 - 34527398
Alignment:
Q  297 gagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34527365 gagtttaaacataaattaaacaaatttaaattga 34527398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Original strand, 2567432 - 2567496
Alignment:
Q  138 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaat 202  Q
    |||||| || ||||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||    
T  2567432 aacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacaccaaaaatttaagataaaactaacgaaat 2567496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 298 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 43440280 - 43440248
Alignment:
Q  298 agtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43440280 agtttaaacataaattgaacaaatttgaattga 43440248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 69)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 53324064 - 53323774
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  53324064 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 53323966  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  53323965 catgaaatgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgtgacaattttttgc 53323866  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttg-caaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53323865 ataggaacttttagtaatgttcttaacacgtatgtaaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 53323774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 30331284 - 30331573
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  30331284 gtttaattattcttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgaaacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 30331382  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  30331383 cataaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgc 30331482  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30331483 ataggaacttttagtaatgttcttaacacgcctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 30331573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 47309723 - 47309434
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||       || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  47309723 gtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacgatttttttgagacaagtttagaacactgtgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 47309625  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  47309624 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatcttgacgtataaatcaaattttgctacaattttttgc 47309525  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | ||||||||||| |||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47309524 ataggaacttttattaatgttcttaacatgtctgtaaataattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 47309434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 27 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 19523014 - 19522712
Alignment:
Q  27 tcaattgaaattcgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaattt 126  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||        | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19523014 tcaattcaaatttgtttaattattcttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaattt 19522915  T
Q  127 agaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgc 226  Q
    ||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  19522914 agaatttttt-aacatgaaacaaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaaaataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgc 19522816  T
Q  227 aacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaa 326  Q
     ||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19522815 gacaattttttgcataggactttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaa 19522716  T
Q  327 ttga 330  Q
    ||||    
T  19522715 ttga 19522712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 33177427 - 33177716
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||       ||    
T  33177427 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaatactatgaaaagttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 33177525  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  33177526 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaacgttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgagacaattttttgc 33177625  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33177626 ataggagcttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttaaattga 33177716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 41 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 43938291 - 43938001
Alignment:
Q  41 tttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaac 140  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||    
T  43938291 tttaattatcctttaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagcttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttttaac 43938192  T
Q  141 atgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaatttttt-gc 239  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| | || |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||| ||    
T  43938191 atgaaacgaattaaatatgaaaattttaaaacgaaaatagttcaagaaaaaattaacaaaatctgaacgtataaataaaattttgcgacaatttttttgc 43938092  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43938091 agaggaacttttagtaatgttcttaacatgtctacaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 43938001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22068386 - 22068097
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || | | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        ||    
T  22068386 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagatatgtttagaacactatgaaaggttcattttctaaaatttaga-tttttttaa 22068288  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| || |||| |||||| ||||||||||||    
T  22068287 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagattaaattaacaaaattgggacgtaaaagtcaaattttgcgacaattttttgc 22068188  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22068187 agaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcagaaaactattcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 22068097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 92 - 330
Target Start/End: Original strand, 20177934 - 20178170
Alignment:
Q  92 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaa 191  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |       |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20177934 ttagaacaatatggaaggttcatttactaaaattta--aattttttaacaagaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaa 20178031  T
Q  192 attaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaa 291  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  20178032 agtaacaaaatctggacgtataaatcaaattttgcgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacatgtatgtaaaaaattgttcaataa 20178131  T
Q  292 ctcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20178132 cccaagaatttaagcataaattaaacaaatttgaattga 20178170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 40 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 31316830 - 31316547
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||    
T  31316830 gtttaattatccttaaactcttaaatttctgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaatttttttaa 31316731  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  31316730 catgaaacaaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaaattaaagataaaaataataaaatttggacatataaatcaaattttgcgataattttttgc 31316631  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31316630 agaggaacttttagtaatgtttttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaattt 31316547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 40 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 55938356 - 55938075
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||       || | ||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||       ||    
T  55938356 gtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacgatttttttgaaataagtttagaacactacgaaaggt-cgtttactagaatttagaatttttt-aa 55938259  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||  |    
T  55938258 cataaaacgaattaaatctgaattttttaaaacaacaaatgttaaagataaaattaacaaaatctgcacgtagaaatcaaattttgcgacaatttttcac 55938159  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55938158 agaggtacttttagtaatattcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaattt 55938075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 328
Target Start/End: Original strand, 28448397 - 28448677
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       ||    
T  28448397 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttacaatttttt-aa 28448495  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||      |||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  28448496 catgaaacaaattgaatatgaatttttcaaaacgacaaaacttaaagataaaattaacaaaa------cgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgc 28448589  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 328  Q
    | |||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28448590 ataggaacttttagtaatgttctcaacacgtt-gcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaatt 28448677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 95 - 330
Target Start/End: Original strand, 38114273 - 38114507
Alignment:
Q  95 gaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaatt 194  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  38114273 gaacgctaggaaatgttcatttactaaaattta-aaattttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaatt 38114371  T
Q  195 aacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactc 294  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||    
T  38114372 aacaaaatctggacatataaatcaaattttgtgacaattttttgcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaatttgttaaaaaactc 38114471  T
Q  295 aagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38114472 aagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 38114507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 53423569 - 53423859
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnn-a 138  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |        | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |    
T  53423569 gtttaactatccttaaactcttaaattttttaacaattcttttaagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttttta 53423668  T
Q  139 acatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttg 238  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| | || ||| |||||| |||||||||||    
T  53423669 acatgaaataaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttatagataaaagtaacaaaatatggacgtgtgaaacaaattttgcgacaattttttg 53423768  T
Q  239 cagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  53423769 cggaggaacttttagtaatgttcttaacatgtctgcaaaaaattgtccaaaaactcaagagttt-agtataaattaaacaaatttgaattga 53423859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 42 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 51876297 - 51876007
Alignment:
Q  42 ttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttaga-annnnnnnaac 140  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||        | ||||| ||| |||| | ||||| ||||||||| ||||||||||| |       |||    
T  51876297 ttaattattcttaaactcttaaacttttgaacgaatttttttagacaagtttataacaatgtgaaatgttcatttattaaaatttagacaagtttttaac 51876198  T
Q  141 atgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa-gataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||    
T  51876197 atgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggtaaaagttaaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaaattttgtgataattttttgc 51876098  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  51876097 agaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctctaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattga 51876007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 10321984 - 10321695
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |       |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||       |     
T  10321984 gtttaattatctttaaactcttaaatttttgaacaatttttttgacacaagtttagaacactgtgaaaggttcaattactaaaatttagaatatttt-at 10321886  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  10321885 catgaaaagaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataattttttgc 10321786  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     |||| |||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  10321785 ggagggacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagtataaattaaacaaattttaattga 10321695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 25422355 - 25422067
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||       || ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||       ||    
T  25422355 gtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacgatttttttgagacaagtttagaacactatcaaaggttcaattactaaaatttagaatttttt-aa 25422257  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  25422256 cataaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaatgttaaagataaaagtaa-aaaatctggacatataaatcaaattttgcgataattttttgc 25422158  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     || || ||||||||||| ||||||||| || | ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25422157 ggatgatcttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaaatgttaaaaaacttaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 25422067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 33689299 - 33689588
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||       || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||    
T  33689299 gtttaattattcttaaattcttaaatttttaaacgatttttttgagacaagtttagagcactatgaaaggttcaattactaaaatttagaatttttt-aa 33689397  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||| |||||| | ||||||||||    
T  33689398 catgaaacgaattaaatatgaatttttaaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaaccaaattttgcgataattttttgc 33689497  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     |||||| |||||||||| |||||||||  | | |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33689498 ggaggaatttttagtaatgttcttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 33689588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 138 - 330
Target Start/End: Original strand, 13718078 - 13718271
Alignment:
Q  138 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaatttttt 237  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  13718078 aacatgaaacgcattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagatcaagataaaattaacaaaatcaggacgtagaaatcaaattttgcgacaatttttt 13718177  T
Q  238 gcagaggaacttttagtaatattcttaacatgt-ttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  13718178 gcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtctggaaaaaaattgttaaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattga 13718271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 34 - 330
Target Start/End: Original strand, 3873152 - 3873468
Alignment:
Q  34 aaattcgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannn 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  3873152 aaatttgtttaattatccttaaactcttacatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 3873251  T
Q  134 nnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaatt 233  Q
        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  3873252 ttt-aacatgaaacaaattaaatatgaattttttaaaacggaaaaagttaaagataaaattaacaaaacctgtacgtagaaatcaaattttgcgacaatt 3873350  T
Q  234 tt---------------------ttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaat 312  Q
    ||                     ||||| |||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3873351 ttttgcataggaacttttagtaattgcataggaacttttagtaatgttcttaacatgcctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaat 3873450  T
Q  313 taaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3873451 taaacaaatttgaattga 3873468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 4850383 - 4850094
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||       || |||   |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||       ||    
T  4850383 gtttaattattcttaaactcttgaatttttgaacgattttattgagacacatttagaacaatatgaaagattcatttagtaatatttagaatttttc-aa 4850285  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||| ||||||| |||||| | ||||||||||    
T  4850284 catgaaacgaatttaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaaataacaaaacttagacgtagaaatcaaattttgcgataattttttgc 4850185  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     ||| || ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  4850184 ggagaaatttttagtaacattcttaacacgtatgcaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacatatttgaattga 4850094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 51395618 - 51395907
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||||| ||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||       ||    
T  51395618 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagttta-aacactatgagtgattcatttactaaaatttagaatttttttaa 51395716  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| || |||||| ||||| |||||     
T  51395717 catgaaacaaattaaatatgaatatttcaaaacgaaaaaagttaaagataaaattaacaaaatcaggatgtagtaattaaattttgcgacaatattttgt 51395816  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | |||||||||||||||| |  |||||| || ||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51395817 acaggaacttttagtaatgtgtttaacacgtctgcaagaaattattcaaaaactcatgagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 51395907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 41 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 10085772 - 10085485
Alignment:
Q  41 tttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaac 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |  ||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||       |||    
T  10085772 tttaattatccttaaactcttaaatttttgaacggtttttttgtgacaaatttagaacactatgaaatcttcatttactaaaatttagaattttt--aac 10085675  T
Q  141 atgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaat-taacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||  || ||||||| |||||| | ||||||||||    
T  10085674 atgaaacaaattaaat-taaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaaagtaacaaaatcaggatatagaaatcaaattttgcgataattttttgc 10085576  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  10085575 ggaggaacttttagtaatgttctaaacatgtctgcaaaaaattattcacaaacttaagagttttagcataaattaaacaaatttgaattga 10085485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 1870394 - 1870140
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||        | ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||       ||    
T  1870394 gtttaactatccttaaactattaaatttttgaacgatttttta-agacaagtttagaacactataaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 1870297  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  1870296 cataaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaagtaacaaaatatggacgtataaatcaaattttgtgacaattttttgc 1870197  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaa 296  Q
     ||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||    
T  1870196 cgagaaacttttagtaatgtttttaacatgtctacaaaaaattgtcgaaaaactcaa 1870140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 141 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 37329678 - 37329487
Alignment:
Q  141 atgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtata--aatcaatttttgcaacaattttttg 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||  ||| || |||||||| |||||||||    
T  37329678 atgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggatatatataaattaaattttgcaataattttttg 37329579  T
Q  239 cagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37329578 cggatgaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaatttaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 37329487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 44209501 - 44209777
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||       ||    
T  44209501 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaagattcaattactaaaatttagaatctttt-aa 44209599  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    || |||| |||||||||||| |||||| ||||              ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  44209600 cacgaaaagaattaaatatgtatttttgaaaag-------------gataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataattttttgc 44209686  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
      | |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44209687 gtacgaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattattaaaaaacttaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 44209777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 44289965 - 44289677
Alignment:
Q  42 ttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaaca 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||        | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||       ||||    
T  44289965 ttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt-aaca 44289867  T
Q  142 tgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaa-tttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||| | |||||||| ||||||| ||||||| | | |||||| |    
T  44289866 tgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttttgcgatattttttt-c 44289768  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     || || |||||| |||  ||||||||| || || ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  44289767 ggatgaccttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttggattga 44289677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 285
Target Start/End: Original strand, 42972740 - 42972983
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        | || || |||||| |||||||||||||||||||  ||||   | ||       ||    
T  42972740 gtttaattatctttaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacgagtttagaatactatgaaaggttcatttatcaaaaa--aaaatttttttaa 42972837  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaatttt-ttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttg 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| | |||||||||||    
T  42972838 catgaaacgaattaaatatgaattttgttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttacgacaattttttg 42972937  T
Q  239 cagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgtt 285  Q
    ||| ||||| ||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  42972938 cagtggaac-tttagcaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgtt 42972983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 40 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 7490982 - 7490707
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaa-tttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnna 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |        | ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||        |    
T  7490982 gtttaattatccttaaactcttaaaatttttgaacaactttttttagacaagtttagaacactataaaaggttcaattactaaagtttaga-ttttttta 7490884  T
Q  139 acatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttg 238  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  | |||  ||||||||||    
T  7490883 agatgaaacgaattaaatatgaatattttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaaatatgcgtcaattttttg 7490784  T
Q  239 cagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaat 321  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||| || ||  ||||||||||||||     |||||| ||||||||||||||||||||    
T  7490783 cagaggaa-ttttagtaatgtgcttaacacgtctgtgaaaaattgttcaaa-----aagagtgtaaacataaattaaacaaat 7490707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 53571548 - 53571824
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||    
T  53571548 gtttaatcatccttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttagaatttttt-aa 53571646  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| || || |||||||||| ||||||  |              
T  53571647 catgaaacgaattaaatataaatttttgaaaataataaaagttaaagataaaagtaataaaatatgtacatataaatcaaattttgcggc---------- 53571736  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
       |||||||||| |||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  53571737 ---ggaacttttaataatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 53571824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 86 - 330
Target Start/End: Original strand, 35060878 - 35061120
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa 185  Q
    ||||| ||||| |||| |||||  |||| ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||    
T  35060878 acaagtttagagcactttgaaatattcaattactaaaatttagaatttttt-aacatgaaacgaattaaatatgattttttgaaaacgataaaagttaaa 35060976  T
Q  186 gataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgtt 285  Q
     |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| || | ||||||||||||    
T  35060977 aataaaagtaataaaatctggatatataaatcaaattttgcgataattttttgcggaggaacttttaataatgttcttaacacgtctacaaaaaattgtt 35061076  T
Q  286 caaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     |||| || |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  35061077 -aaaatcttaagagttttagaataaattaaacaaatttgaattga 35061120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 11670395 - 11670119
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       || ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||       ||    
T  11670395 gtttaattatccttaaactcttaaaattttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactacgaaaggttcaattaataaaatttagaatttttt-aa 11670297  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||              ||||||    
T  11670296 catgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaa-------------attttgc 11670210  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     | |||||||||| |||| ||| |||||  | | |||||||||||| ||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11670209 ggcggaacttttaataatgttcctaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagcgtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 11670119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 23473484 - 23473773
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||       || | ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||       ||    
T  23473484 gtttaattatcggtaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagataagtttagaacactgtgaaaggttcatt-actaaaattta-aaattttttaa 23473581  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| || ||  ||||| ||||||||| || ||| ||||||||||| ||  |||||| |||||| | ||||||||||    
T  23473582 catgaaacaaattaaatatgagtttttaaatacgtcaaaaattaaagatataagtaataaaatctggacataagaatcaaattttgcgataattttttgc 23473681  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgc-aaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||| ||||  ||||| ||| || | | |||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  23473682 agaggaacttttggtaacgttcttgacacgtctacaaaaaaattattcaaaaacttaagactttaagcataaattaaacaaatttgcattga 23473773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 86 - 330
Target Start/End: Original strand, 47379228 - 47379471
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa 185  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       || |||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||  | ||    
T  47379228 acaagtttagaatactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttaaaa-atgaaatgaattaaatatgtattttttaaaatgacaaaacgtcaa 47379326  T
Q  186 gataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgt 284  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||| ||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||   | |    
T  47379327 gataaaagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaattttgcgataattttttgcggaggaacttttagtattgttcttaacacgtctgcaaaagcattt 47379426  T
Q  285 tcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    || |||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  47379427 tcgaaaacttaagagtataagcat-aattaaacaaatttgaattga 47379471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 47463655 - 47463436
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaaca---ctatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnn 136  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||       || ||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |           
T  47463655 gtttaattatctttaaactcttaaattttttaacgatttttt-gagacaagtttagaacaacactatgaaaggttcatttactaaaattta-attttttt 47463558  T
Q  137 naacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttt 236  Q
     ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||  | |||||||    
T  47463557 taacattaaacaaattaaatatgaattttttaaaacagtaaaaattaaagataaaattaacaaaatatggacgtagaaatcaaattttgtgataattttt 47463458  T
Q  237 tgcagaggaacttttagtaata 258  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  47463457 tgcagaggaacttttagtaata 47463436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 48082731 - 48082443
Alignment:
Q  42 ttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaaca 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||        | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||       ||||    
T  48082731 ttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaacggttcatttacaaaaatctataatttttt-aaca 48082633  T
Q  142 tgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaa-tttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| || |||||||| | |||||||| ||||||| ||||||| | | |||||| |    
T  48082632 tgaaataaattaaatatgaattttataaaacgacaaaagtttaagatataaataacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttttgcgatattttttt-c 48082534  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     || || |||||| |||  ||||||||| || || ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  48082533 ggatgaccttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttggattga 48082443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 86 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 35821355 - 35821128
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa 185  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||| ||       ||||||||||  ||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  35821355 acaagtttagaacatcatgaaaggttcatatactagaatttacaatttttttaacatgaaacttattgaatatgaattttataaaacgacaaaacttaaa 35821256  T
Q  186 gataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgtt 285  Q
     |||||||||| ||||||||||||||   || |||||||           |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  35821255 aataaaattaataaaatctggacgtagcgat-aattttt-----------ttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgtt 35821168  T
Q  286 caaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaa 326  Q
    | |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  35821167 c-aaaatttaagagtttaagtataaattaaacaaatttgaa 35821128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 92 - 329
Target Start/End: Original strand, 48219945 - 48220180
Alignment:
Q  92 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaa 191  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||       |||| ||||  |||||||||||||| ||||||||  |||||| || || |||||    
T  48219945 ttagaacattatgaaaggttcatttgttaaaatttagaatttttt-aacaagaaattaattaaatatgaatgttttaaaatgacaaaa-ttcaatataaa 48220042  T
Q  192 attaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaa 290  Q
    | |||||||| | |||| ||| |||| || |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| | |||| ||||    
T  48220043 agtaacaaaaatttggatgtagaaattaaattttacaataattttttgcggaggaatttttagtaatgttcttaacatatctgcaaaagaatgttaaaaa 48220142  T
Q  291 actcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattg 329  Q
    ||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  48220143 acataagagtttaagcataa-ttaaacaaatttgaattg 48220180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 92 - 328
Target Start/End: Original strand, 52947819 - 52948054
Alignment:
Q  92 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaa 191  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||       ||||||| |  ||||||||||||||||||||||  | ||||| || ||||||||    
T  52947819 ttagaacattataaaaagttcatttactaaaatttagaatttttttaacatgagataaattaaatatgaattttttaaatga-caaaatttcaagataaa 52947917  T
Q  192 attaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaa 290  Q
    | | |||||| | ||| |||| ||||||||||||| |  ||||||| |  ||| ||||||||||||| || | ||||  | |  ||||||||||||||||    
T  52947918 agtcacaaaagtttggtcgtagaaatcaatttttgaactaatttttcggggagcaacttttagtaatgttttgaacacatatataaaaaattgttcaaaa 52948017  T
Q  291 actcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 328  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52948018 attcaagagtttaaacat-aattaaacaaatttgaatt 52948054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 254 - 330
Target Start/End: Original strand, 7617535 - 7617611
Alignment:
Q  254 taatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7617535 taatgttcttaacatgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 7617611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 138 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 38499479 - 38499295
Alignment:
Q  138 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaatttttt 237  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||  |||| ||||||||| ||| ||||||||||| || |||| || |||||  |  |||||||    
T  38499479 aacatgaaatgaattaaatatgaatatttttaaaagacatgagttcaagataaaagtaaaaaaatctggacatagaaataaaattttgagattatttttt 38499380  T
Q  238 gcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||  | || | |||||||||  |||||||||||||    
T  38499379 gcagatgaacttttagtaatgttcttaacacttctgcaaaaaattgttcaaaacgttaaaaatttaaacat-gattaaacaaattt 38499295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 140 - 323
Target Start/End: Original strand, 34513123 - 34513305
Alignment:
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttg 238  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| || |||||| |||||||| |||||||| | |||| || |||||  | |||||||||    
T  34513123 catgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagtttaa-ataaaagtaacaaaaatctggacgcagaaataaaattttgagataattttttg 34513221  T
Q  239 cagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
     ||| |||||||| ||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  34513222 gagatgaacttttcgtaatgttcttgacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 34513305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 44452328 - 44452093
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa 185  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||       |||||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||    
T  44452328 acaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttagaatttttt-aacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaa 44452230  T
Q  186 gataaaattaac-aaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgt 284  Q
     |||||| |||| |||||||||||| |  ||| || |||||  | || ||||||||||  ||||||| || || ||||||| |  | |||||||||||||    
T  44452229 aataaaagtaacaaaaatctggacgcaggaataaaattttgagataa-tttttgcagataaacttttcgtgatgttcttaatacttgtgcaaaaaattgt 44452131  T
Q  285 tcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    |||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  44452130 tcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 44452093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 130
Target Start/End: Original strand, 7617424 - 7617514
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaa 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7617424 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacaagtttaaaacattatgaaaggttcatttactaaaatttagaa 7617514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13604071 - 13603785
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaat-ttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnna 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||        | ||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||       |    
T  13604071 gtttaattatccttaaactcttaaatttttttaatgatattttttagacaagtttataacattataaaaggttcatttactaaaattcataa--ttttta 13603974  T
Q  139 acatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaatttttt 237  Q
    || |||||  ||||||||||||||| ||| |||| | |    |||||| ||||| |||| ||||| ||||  || ||||||  |||||  | || |||||    
T  13603973 acttgaaataaattaaatatgaattcttttaaacgaaattttttaaagttaaaagtaacaaaaatttggatataaaaatcacattttgagataaattttt 13603874  T
Q  238 gcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 328  Q
    || ||||||||||||||||| ||| ||| || | ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13603873 gcggaggaacttttagtaatgttcataaaatatctgcaaaaaattgttc-aaaacttaagagtttaagcat-aattaaacaaatttgaatt 13603785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 330
Target Start/End: Original strand, 11670873 - 11670929
Alignment:
Q  274 caaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11670873 caaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 11670929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 323
Target Start/End: Original strand, 35351735 - 35351954
Alignment:
Q  105 aaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaa-aatc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||       |||||| || ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||| || ||| | |     
T  35351735 aaaggttcatttactaaaatttaaaatttttgtaacatgtaatgaattaaatatgaatttttttcatcaacaaaagttcaagataaaagtatcaatactt 35351834  T
Q  204 tggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaa-aaaattgttcaaaaactcaagagttt 302  Q
    |  ||||| ||||||| || ||  |  ||||||||| || ||||||||  |||| || ||||||  |   ||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  35351835 tatacgtagaaatcaaattatgagatgattttttgcggatgaacttttgttaatgtttttaacacctccacaagaaagttgttcaaaaactcaggagttt 35351934  T
Q  303 aaacataaattaaacaaattt 323  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  35351935 aaacat-aattaaacaaattt 35351954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 323
Target Start/End: Original strand, 28163777 - 28164010
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa 185  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||       | |||||||  |||| |||||||||||||| |||  ||||||||| ||    
T  28163777 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttagaattattt-agcatgaaataaatttaatatgaatttttttaaaagacaaaagttgaa 28163875  T
Q  186 gataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgt 284  Q
     |||||| |||||||| |||||| | | |||| || ||  |  | ||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||||    
T  28163876 aataaaagtaacaaaaatctggaagcagaaataaaattgag--ataattttttggagatgaacttttcgtaatgttcttaacac-tgtgcaaaaaattgt 28163972  T
Q  285 tcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    ||||||  | || ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  28163973 tcaaaattttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 28164010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 130
Target Start/End: Original strand, 3862488 - 3862585
Alignment:
Q  34 aaattcgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacga-nnnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaa 130  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||        || ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3862488 aaatttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattttttttgagacaagtttagaatgcgatgaaaggttcatttactaaaatttagaa 3862585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 130
Target Start/End: Original strand, 3871245 - 3871342
Alignment:
Q  34 aaattcgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacga-nnnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaa 130  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||        || ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3871245 aaatttgtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattttttttgagacaagtttagaatgcgatgaaaggttcatttactaaaatttagaa 3871342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 31471017 - 31470962
Alignment:
Q  275 aaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31471017 aaaaaattgttaaaaaacttacgagtttaaaaataaattaaacaaatttgaattga 31470962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 323
Target Start/End: Original strand, 6817994 - 6818087
Alignment:
Q  229 caattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    ||||||||||| |||||||||| | | || ||||||| | || | ||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6817994 caattttttgcggaggaactttaatttatgttcttaaaacgtatacaaaaaattgttcaaaaatgtaagagtttaaacat-aattaaacaaattt 6818087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 325
Target Start/End: Original strand, 47939750 - 47939867
Alignment:
Q  207 acgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaac 306  Q
    ||||| ||||||| |||||  | |||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| | |||||   || ||||||| |    
T  47939750 acgtagaaatcaaattttgagataattttttgcggaaaaacttttagtaatgttcttaacatgtctacaaaaaattgcttaaaaagctaaaagtttaagc 47939849  T
Q  307 ataaattaaacaaatttga 325  Q
    || ||||||||||||||||    
T  47939850 at-aattaaacaaatttga 47939867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 75
Target Start/End: Original strand, 13718000 - 13718035
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacga 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13718000 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacga 13718035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 74
Target Start/End: Original strand, 38114243 - 38114277
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacg 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38114243 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacg 38114277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 329
Target Start/End: Original strand, 50824411 - 50824481
Alignment:
Q  259 ttcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattg 329  Q
    ||||||||| || || |||| |||||||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50824411 ttcttaacacgtctgaaaaatattgttcaaaaacttaagctattaagcataaattaaacaaatttgaattg 50824481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 149 - 285
Target Start/End: Original strand, 44452920 - 44453056
Alignment:
Q  149 aattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaat-ctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaac 247  Q
    ||||||||||||||||||||| | | |||||||| || |||||| || |||||| ||||||| | |||  ||   |||  | ||||||||||||| ||||    
T  44452920 aattaaatatgaattttttaataga-caaaagttcaaaataaaagtagcaaaattctggacgcagaaaaaaaaaattgagataattttttgcagatgaac 44453018  T
Q  248 ttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgtt 285  Q
    |||| ||||| |||||||||  | ||||||||||||||    
T  44453019 ttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgtt 44453056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 53569212 - 53569155
Alignment:
Q  274 caaaaaattgttcaaaaa-ctcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||| ||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53569212 caaaaaattgttaaaaaaacttaacagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 53569155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 53571065 - 53571008
Alignment:
Q  274 caaaaaattgttcaaaaa-ctcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||| ||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53571065 caaaaaattgttaaaaaaacttaacagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 53571008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 201
Target Start/End: Original strand, 16618865 - 16618928
Alignment:
Q  138 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa 201  Q
    |||||| || ||||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||    
T  16618865 aacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacaccaaaaattcaagataaaactaacaaaa 16618928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 29 - 72
Target Start/End: Original strand, 37437222 - 37437265
Alignment:
Q  29 aattgaaattcgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaa 72  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37437222 aattaaaatttgtttaattatgcttaaactcttaaatttttgaa 37437265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8949710 - 8949622
Alignment:
Q  138 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgtataaatcaatttttg 225  Q
    |||||| || ||||||||||| | |||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||| || |||||    
T  8949710 aacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaattaacgaaaatttggacctaaaaataaaattttg 8949622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 294 - 330
Target Start/End: Original strand, 25243861 - 25243897
Alignment:
Q  294 caagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  25243861 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattga 25243897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 294 - 330
Target Start/End: Original strand, 25422943 - 25422979
Alignment:
Q  294 caagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  25422943 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattga 25422979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 294 - 330
Target Start/End: Original strand, 31317815 - 31317851
Alignment:
Q  294 caagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  31317815 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattga 31317851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 294 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 35055160 - 35055124
Alignment:
Q  294 caagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  35055160 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattga 35055124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 294 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 44208911 - 44208875
Alignment:
Q  294 caagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  44208911 caagagtttaatcataaattgaacaaatttgaattga 44208875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 45557929 - 45557893
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactctt-aaatttttgaacga 75  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45557929 gtttaattatccttaaactcttaaaatttttgaacga 45557893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 225
Target Start/End: Original strand, 52788873 - 52788960
Alignment:
Q  138 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgtataaatcaatttttg 225  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| || |||| || |||||    
T  52788873 aacatgtaatgaattaaatat-aattttttaaaacgtcaaaagttcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaattttg 52788960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 69
Target Start/End: Original strand, 53231122 - 53231162
Alignment:
Q  29 aattgaaattcgtttaattatccttaaactcttaaattttt 69  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  53231122 aattgaaattcgtttaattatacttaaacttttatattttt 53231162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 15721068 - 15721360
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnn--gacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnn 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||           
T  15721068 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaattttagaattttttt 15721167  T
Q  138 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaatttttt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  15721168 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaatttttt 15721267  T
Q  238 gcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||| |||||||||||||||  || |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15721268 gcataggaacttttagtaaagtttttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 15721360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 30661068 - 30660778
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  30661068 gtttaattatacttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 30660970  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaatttttt-aaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttg 238  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  30660969 cataaaacgaattaaatatgaatttttttaaaacgacaaaagttaatgataaaattaacaaaatctggatgtagaaatcaaattttgcgacaattttttg 30660870  T
Q  239 cagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  30660869 cagatgaacttttagtaatattcttaacatgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattga 30660778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 26356820 - 26356528
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       ||    
T  26356820 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaattta-aaattttttaa 26356722  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  26356721 catgaaatgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgtgacaattttttgc 26356622  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttg---caaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | || ||||||||||||| ||||||||| |  ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26356621 atagaaacttttagtaatgttcttaacacgcgtgtaaaaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 26356528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 8710124 - 8709836
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        | ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||       ||    
T  8710124 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgtacgatttttttaagacaagtttagaatactatgaaaggttcattaactaaaatttagaatttttt-aa 8710026  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||     
T  8710025 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggaaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgt 8709926  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  8709925 agaggaacttttagtaatattcttaacacgtctgcaaaaaattgttc-aaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattga 8709836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 10915592 - 10915301
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||       || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  10915592 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgatcgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 10915494  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| |||||||||||     
T  10915493 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgaaaaatgttaaagataaaattaacaaaatatggacgtagaaatcaaattatgcgacaattttttgt 10915394  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgc--aaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10915393 aaaggaccttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 10915301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 5087196 - 5087485
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||         | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       ||    
T  5087196 gtttaattatccttaaactcttaactttttgaacggttgtttttagacaagtttagaacactatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 5087294  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  5087295 catgaaacaaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctgaatgtaaaaattaatttttgcgacaattttttgc 5087394  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  5087395 agaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttcaaaaagtcaagagtttaagcataaattaaacatatttgaattga 5087485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 5974315 - 5974604
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        | ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||       ||    
T  5974315 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgtacgatttttttcagacaagtttagaatactatgaaaggttcattaactaaaattta-aaattttttaa 5974413  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||     
T  5974414 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggaaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggatgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgt 5974513  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  5974514 agaggaacttttagtaatgtttttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattga 5974604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 40 - 325
Target Start/End: Original strand, 17697392 - 17697676
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  17697392 gtttaattatccttaaactcttaaacttttgaacgattttttttagaaaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttatt-aa 17697490  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||| ||     
T  17697491 gatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttacgacaattttatga 17697590  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttga 325  Q
    | |||| ||||| ||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17697591 aaaggagctttttgtaatgttcttaacacgtcttcaaaaaattgttcaaaaactcacgagtttaagcataaattaaacaaatttga 17697676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 844396 - 844106
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  844396 gtttaattattcttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 844298  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaat-taacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttg 238  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||| ||||||| |||||| | |||||||||    
T  844297 catgaaacaaattaaatatgaattttttaaaatggcaaaagttaaagataaaaagtaacaaaatctgaatgtagaaatcaaattttgcgataattttttg 844198  T
Q  239 cagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  844197 cagaggaacttttagtaatgttctaaatatgtctgcaaaaagttgttcaaaaacttaagagtttaaacataaattaagcaagtttgaattga 844106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 40 - 329
Target Start/End: Original strand, 29691917 - 29692205
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  29691917 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaaacttaaaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttatt-aa 29692015  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||  ||||||| |||||  | ||||||||||    
T  29692016 catgaaaagaattaaatatgaatttttcaaaacgacaaaagttaaagatataagtaacaaaatatggacgttgaaatcaaattttgtgagaattttttgc 29692115  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattg 329  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29692116 agaggaactttttgtaatatgtttaacacgtctacaaaaaattgttgaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattg 29692205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 861364 - 861655
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||       || | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  861364 gtttaattatttttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagaaaagttttgaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 861462  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaat-taacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttg 238  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| | |||||||||    
T  861463 catgaaacaaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaaagtaacaaaatctggatgtagaaatcaaattttgcgataattttttg 861562  T
Q  239 cagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaa-cataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | ||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  861563 ccgaggaacttttagtaatgttctaaatatgtctgcaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttaaagcataaattaagcatatttgaattga 861655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 40 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 939133 - 938845
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||       || ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||       ||    
T  939133 gtttaattatcctcaaactcctaaattttcgaacgatttttttgagacatgtttagaacactttgaaaggttcatttactaaaattta-aatttttttaa 939035  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| || |||| |||||| | ||||| ||||    
T  939034 catgaaatgaattaaatatgattttttttaaaagacaaaagttaaagataaaagcaacaaagtctggacgtagaattcaaattttgcgataatttattgc 938935  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattg 329  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  938934 ggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattg 938845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 1821268 - 1820983
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       || ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  1821268 gtttaattatctttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttataacattatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 1821170  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||  |||| |||||||    
T  1821169 cattaaatgagttaaatatgaattttttaaaacggtaaaagttaaagataaaat--acaaaatttggacgtagaaatcaaattttgtgacaactttttgc 1821072  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  1821071 agaggaacttttagtaatgttcttaatacgtatgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaa--aaacaaatttgaattga 1820983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 44 - 330
Target Start/End: Original strand, 5079516 - 5079802
Alignment:
Q  44 aattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnn-gacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacat 142  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||        || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |        |||||    
T  5079516 aattatccttaaagtcttaaatttttaaacgattttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaattta-attttttttaacat 5079614  T
Q  143 gaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcaga 242  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||| ||    
T  5079615 gaaacaaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcaataactttttgcgga 5079714  T
Q  243 ggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5079715 ggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 5079802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 105 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 2087661 - 2087438
Alignment:
Q  105 aaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||       |||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2087661 aaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aacatgagccgaattaaatatgaattttttaaaacgataaaagttaaagataaaattaacaaaatct 2087563  T
Q  205 ggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 304  Q
    ||||||| ||||||| ||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  2087562 ggacgtagaaatcaaattttatgacaattttttgcagatgaacttttagtaatgttcttaacatgtctgtaaaaatttgttcaaaaact-aagagtttaa 2087464  T
Q  305 acataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  2087463 gcataaattaaacaaatttgaattga 2087438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Original strand, 33518409 - 33518648
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||       ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  33518409 acaagtttagaacactatgaaaggtttattaactaaaatttagaattttt--aacctaaaatgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaa 33518506  T
Q  186 gataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgtt 285  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||    
T  33518507 gataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgtgacaattttttgcagatgaacttttagtaatgtttttaacacgtctgcaaaaaattgtt 33518606  T
Q  286 caaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaat 327  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  33518607 caaaaactcaagagtataagcatacattaaacaaatttgaat 33518648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 22732003 - 22732293
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaat-ttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnna 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||        | ||||| |||||||||| | | | |||||||||| ||||||||||        |    
T  22732003 gtttaattattcttaaactcttaaaaattttgaacgaattttttaagacaagtttagaacactgtaatatgttcatttaccaaaatttagatttttttta 22732102  T
Q  139 acatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttg 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  22732103 acatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaatgttaaagataaaattaacaaagtctggccgtagaaatcaaattttgcgacaattttttg 22732202  T
Q  239 cagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | || ||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  22732203 cagaggaacttttagtaatgttcttaatacgtatg-taaaaattgtttaaaaactcaagagtttaagcatagtttaaacaaatttgaattga 22732293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 92 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20510716 - 20510491
Alignment:
Q  92 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaa 191  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20510716 ttagaacactatgaaaggttcattaactaaaatttagaatttttt-aacatgaatcgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaa 20510618  T
Q  192 attaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaa 291  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  | ||            ||||||    
T  20510617 attaacaaaatctggacgtagaaattaaattttacgacaattttttgtagaggaacttttagtaatgttcttaacacatctg------------caaaaa 20510530  T
Q  292 ctcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  20510529 ctcaagagtttaagcataaaataaacaaatttgaattga 20510491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 330
Target Start/End: Original strand, 14256212 - 14256440
Alignment:
Q  96 aacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaatta 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||      | ||    
T  14256212 aacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttatt-aacatgaaaagaattaaatatgaatttttcaaaacgacaaaagttaaa------agta 14256304  T
Q  196 acaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgtt-caaaaactc 294  Q
    ||||||| |||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | | ||||||||||  ||||||||    
T  14256305 acaaaatttggacgttgaaatcaaattttgcgacaattttttgcagaggaacttttagtaatgtttttaacatgtctaccaaaaattgttaaaaaaactc 14256404  T
Q  295 aagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14256405 aagagtttaagcataaattaaataaatttgaattga 14256440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 34 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12482050 - 12481801
Alignment:
Q  34 aaattcgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannn 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       
T  12482050 aaatttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttgctaaaatttagaattt 12481951  T
Q  134 nnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaatt 233  Q
        ||||| |||  |||||||||| ||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  12481950 ttttaacataaaataaattaaatataaatattttaaaacgaaagaagttaaagataaaattaacaaaatcaggacgtagaaatcaaattttgcgacaatt 12481851  T
Q  234 ttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattg 283  Q
    ||||| || |||| |||||||| | | ||||||| || ||||||||||||    
T  12481850 ttttgtagcggaatttttagtattgtgcttaacacgtctgcaaaaaattg 12481801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 30492998 - 30492722
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||       ||    
T  30492998 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaagggttcatttactaaaatttataatttttt-aa 30492900  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||| ||    
T  30492899 catgaaacgagttaaatataatttttttaaaatgaaaaaagttaaagataaaataaacaaaatctggacgtagaaat-aaattttgcgacaatttttagc 30492801  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || ||             |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  30492800 agaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctg------------aaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacagatttgaattga 30492722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 96 - 330
Target Start/End: Original strand, 28476253 - 28476486
Alignment:
Q  96 aacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaatta 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||    
T  28476253 aacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttatt-aacatgaaaagaattaaatataaatttttcaaaacgacaaaagttaaagatataagta 28476351  T
Q  196 acaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgt-ttgcaaaaaattgttcaaaaactc 294  Q
    ||||||| |||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||| |||||||||||  |||| |  | |  |||||||||||| ||||||||    
T  28476352 acaaaatatggacgttgaaatcaaattttgtgacaatttttt-cagagaaacatttagtaatatgtttaatacatctaccaaaaaattgttgaaaaactc 28476450  T
Q  295 aagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28476451 aaaagtttaaacataaattaaacaaatttaaattga 28476486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 18502998 - 18503274
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||       ||    
T  18502998 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaattta-aatttttttaa 18503096  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    | |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||              ||||||    
T  18503097 cctgaaacgaattacatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaa-------------attttgc 18503183  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  18503184 ggcggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaagaaatttgaattga 18503274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 42 - 330
Target Start/End: Original strand, 33744670 - 33744958
Alignment:
Q  42 ttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaaca 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||        | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||       ||||    
T  33744670 ttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattttttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt-aaca 33744768  T
Q  142 tgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaa-tttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||| |||| | |||||||| ||||||| ||||||| | | |||||| |    
T  33744769 tgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaataaaaatatggacgtagaaatcaaatttttgcgatattttttt-c 33744867  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     ||||| |||||| |||  ||||||||| || || |||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  33744868 ggaggaccttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaacattgttgaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttggattga 33744958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 40 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20977652 - 20977467
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||        | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||       ||    
T  20977652 gtttaactatccttaaactcttaaatttttgaacgatattttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaatattta-aaaaaatttaa 20977554  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaag-ataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttg 225  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  20977553 catgaaaagaattaaatgtgaattttttaaaacgacaaaaattaaagaataaaaataacaaaatctggacgtagaaatcaaattttg 20977467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 17245869 - 17245717
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||    
T  17245869 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttagaa-ttttttaa 17245771  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaat 193  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  17245770 catgaaacgaaataaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaat 17245717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 40 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20977286 - 20977101
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||        | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||       ||    
T  20977286 gtttaactatccttaaactcttaaatttttgaacgattgttttaagacaagtttagaacactatgaaaggttcattttctaatattta-aaaacaattaa 20977188  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaag-ataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttg 225  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  20977187 catgaaaagaagtaaatatgaattttttaaaacgacaaaaattaaagaataaaaataacaaaatctagacgtagaaatcaaattttg 20977101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 138 - 330
Target Start/End: Original strand, 11400171 - 11400364
Alignment:
Q  138 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaatttttt 237  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| ||  ||| | ||||||||||    
T  11400171 aacatgaaactaattaaatataaattttttaaaacgccaaaagttacatataaaattaacaaaatctggacatttaaataaaagtttacgacaatttttt 11400270  T
Q  238 gcagag-gaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaa-ttgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     || ||  || |||||||||| |||||| || || || ||||||    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11400271 -caaagataatttttagtaatgttcttagcacgtatgtaaaaaaccatttaaaaaactcaagagtttaatcataaattaaacaaatttgaattga 11400364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 34046676 - 34046542
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||    
T  34046676 gtttaattatccttaaattcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttagaatttttttaa 34046577  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaa 174  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  34046576 catgaaacaaattaaatatgaatttttaaaaacaa 34046542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 3375576 - 3375297
Alignment:
Q  43 taattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacat 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||| |||||||| ||  ||| | || | ||||||||||| |||       |||||    
T  3375576 taattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacattacaaaatgctcgtatactaaaatttggaatttttt-aacat 3375478  T
Q  143 gaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcag 241  Q
     ||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| |||| || |||||  | ||||||||||||    
T  3375477 aaaatgaattaaatatgaatatttttaaacgacaaaagttcaagataaaattatcaaaaatctgaacgtagaaataaaattttgagataattttttgcag 3375378  T
Q  242 aggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
      ||| ||| |||||| |||||||||  ||| ||||||||  ||||||| || || | |||||  || ||||||||||||||    
T  3375377 gtgaaatttaagtaatgttcttaacacttttacaaaaaatccttcaaaatcttaaaattttaagtat-aattaaacaaattt 3375297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 330
Target Start/End: Original strand, 20898115 - 20898275
Alignment:
Q  161 attttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatatt 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||         |||||||| ||||||| |||||  |   |||||| | |||||| |||||||||| ||    
T  20898115 attttttaaaacgacaaaagttaaagataaaatt---------tggacgtagaaatcaaattttgtgattttttttttcggaggaagttttagtaatgtt 20898205  T
Q  261 cttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||| | || |  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  20898206 cttaagaagtcttaaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttaagcataaattaaaaaaatttgaattga 20898275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 138 - 323
Target Start/End: Original strand, 289461 - 289647
Alignment:
Q  138 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa--tctggacgtataaatcaatttttgcaacaatttt 235  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| || |||||| ||||||||  |||||||||| |||| || ||||   | ||||||    
T  289461 aacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaaatctggacgtagaaataaaattttaagataatttt 289560  T
Q  236 ttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    |||||||  |||||||  | || |||||||||  | ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  289561 ttgcagataaacttttcatgatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 289647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 140 - 323
Target Start/End: Original strand, 21108172 - 21108355
Alignment:
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttg 238  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| || |||||| |||||||| |||||||| | |||| || |||||  | | |||||||    
T  21108172 catgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatctggacgcagaaataaaattttgagatatttttttg 21108271  T
Q  239 cagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
     ||| ||| |||| ||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21108272 gagatgaaattttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 21108355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 83 - 323
Target Start/End: Original strand, 3914471 - 3914709
Alignment:
Q  83 gacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagtt 182  Q
    |||||||| |||||||| ||  ||| |||| |||||||||||||||||       |||||||||  ||||| ||||||| ||||| |||  |||||||||    
T  3914471 gacacaagtttagaacattacaaaaagttcgtttactaaaatttagaatttttt-aacatgaaataaattagatatgaaattttttaaaagacaaaagtt 3914569  T
Q  183 aaagataaaattaaca-aaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaat 281  Q
     || |||||| ||||| |||||| |||||| |||| || |||||  | ||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||  | ||| ||||||    
T  3914570 caaaataaaactaacagaaatctagacgtagaaataaaattttgagataattttttgcagatgaacattttgtaatgttcttaacacttgtgc-aaaaat 3914668  T
Q  282 tgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    | ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3914669 tattcaaaatcttaaaagtttaaacat-aattaaacaaattt 3914709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 169
Target Start/End: Original strand, 20897817 - 20897947
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnng-acacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnna 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         | ||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||       |    
T  20897817 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattattttttagacaagtttaagacgctatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttta 20897916  T
Q  139 acatgaaacgaattaaatatgaattttttaa 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20897917 acatgaaacgaattaaacatgaattttttaa 20897947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 149 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 289178 - 289005
Alignment:
Q  149 aattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaac 247  Q
    ||||||||||| ||||||||| | | |||||||| || |||||| |||||||| |||||||| | |||| || |||||  | ||||||||||||| |||     
T  289178 aattaaatatggattttttaataga-caaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatctggacgcagaaataaaattttgagataattttttgcagatgaag 289080  T
Q  248 ttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    |||| ||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||| || ||  |||||| ||| ||||||||||||||    
T  289079 ttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaatgtttaagcat-aattaaacaaattt 289005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 261 - 330
Target Start/End: Original strand, 17246307 - 17246376
Alignment:
Q  261 cttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||  ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17246307 cttaacacatttacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 17246376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 17244624 - 17244540
Alignment:
Q  246 acttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||| |||||||||  | | |||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  17244624 acttttagtaatgttcttaacacatctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacatatttgaattga 17244540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 73
Target Start/End: Original strand, 16736652 - 16736691
Alignment:
Q  34 aaattcgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaac 73  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16736652 aaatttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaac 16736691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 129
Target Start/End: Original strand, 30353133 - 30353220
Alignment:
Q  41 tttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttaga 129  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||        | ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30353133 tttaattatctttaaacacttaaatttttgaacgattttttt-agacaagtttagaacattatgaaaggttcacttactaaaatttaga 30353220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5079054 - 5079000
Alignment:
Q  274 caaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 328  Q
    |||||||||||| ||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5079054 caaaaaattgttaaaaacttaaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaatt 5079000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15053993 - 15053930
Alignment:
Q  138 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa 201  Q
    |||||| || ||||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||    
T  15053993 aacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacaccaaaaattcaagataaaactaacaaaa 15053930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 73
Target Start/End: Original strand, 14256157 - 14256190
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaac 73  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14256157 gtttaattatccttaaattcttaaatttttgaac 14256190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 3913329 - 3913266
Alignment:
Q  259 ttcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| || || | ||||| ||| ||||||||||||||    
T  3913329 ttcttaacatttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaaatttaagcat-aattaaacaaattt 3913266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 294 - 330
Target Start/End: Original strand, 22972047 - 22972083
Alignment:
Q  294 caagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22972047 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattga 22972083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 294 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23816351 - 23816315
Alignment:
Q  294 caagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  23816351 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattga 23816315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 267
Target Start/End: Original strand, 30916905 - 30916937
Alignment:
Q  235 tttgcagaggaacttttagtaatattcttaaca 267  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30916905 tttgcagagtaacttttagtaatattcttaaca 30916937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 70)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 30719769 - 30719479
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  30719769 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 30719671  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  30719670 catgaatcgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgc 30719571  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgt-ttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | || ||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30719570 atagaaacttttagtaatgttcttaacacgtcttgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 30719479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 13501506 - 13501206
Alignment:
Q  27 tcaattgaaattcgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaattt 126  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |       || ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13501506 tcaattcaaatttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacaatttttttgagacaagtttagaacact--gaaaggttcatttactaaaattt 13501409  T
Q  127 agaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgc 226  Q
    ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13501408 agaatttttt-aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaaaataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgc 13501310  T
Q  227 aacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaa 326  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13501309 gacaattttttgcataggaacttttagtaatgttattaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaa 13501210  T
Q  327 ttga 330  Q
    ||||    
T  13501209 ttga 13501206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 330
Target Start/End: Original strand, 51561340 - 51561642
Alignment:
Q  27 tcaattgaaattcgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaattt 126  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51561340 tcaattcaaatttgttaaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaattt 51561439  T
Q  127 agaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgc 226  Q
    ||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  51561440 agaatttttt-aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatggcaaaagttaaaaataaaataaacaaaatttgaacgtagaaatcaaattttgc 51561538  T
Q  227 aacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaa 326  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51561539 gacaattttttgcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaagtaaacaaatttgaa 51561638  T
Q  327 ttga 330  Q
    ||||    
T  51561639 ttga 51561642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 92 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 28701192 - 28700954
Alignment:
Q  92 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaa 191  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28701192 ttagaacactatgagaggttcatttactaaaatttagaacttttt-aacataaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaa 28701094  T
Q  192 attaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaa-aaaattgttcaaaa 290  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  28701093 attaacaaaatctggacgtggaaatcaaattttgctacaatttttcgcagaggaacttttagtaatattcttaacacatttgcaaaaaaattgttcaaaa 28700994  T
Q  291 actcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28700993 actcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 28700954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 19791527 - 19791239
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        |  |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||       ||    
T  19791527 gtttaattatctttaaactcttaaatttttgaacgattttttt-atgcaagtttataacactatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 19791430  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||     
T  19791429 catgaaacgaattaaatatgaattttttataacgacaaaagttaaagataaaattaacaaattttggaggtagaaatcaaattttgcgacaattttttgt 19791330  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19791329 agatgaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 19791239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 40 - 328
Target Start/End: Original strand, 26020405 - 26020692
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||       |  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  26020405 gtttaattatcattaaactcttgaatttttgaacgatttttttgtgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 26020503  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| ||     
T  26020504 cattaaatgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaatttaaagataaaattaacaaaatctgaacgtagaaatcaaattttgcgacaattttatgt 26020603  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 328  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26020604 agaggagcttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcaagattttaagcataaattaaacaaatttgaatt 26020692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 86 - 309
Target Start/End: Original strand, 47008699 - 47008920
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47008699 acaagtttagaacactatgaaaggtttatttactaaaatttagaattttt--aacataaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaa 47008796  T
Q  186 gataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgtt 285  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  47008797 gataaaattaacaaaatgtggacgtagaaattaaattttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtt 47008896  T
Q  286 caaaaactcaagagtttaaacata 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  47008897 caaaaactcaagagtttaaacata 47008920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 52493818 - 52493528
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnng-acacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnna 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |    
T  52493818 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttttagacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-a 52493720  T
Q  139 acatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttg 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| | |||||||||    
T  52493719 acatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatggcaaaacttaaagataaaagtaataaaatctggaagtagaaatcaaattttgcgataattttttg 52493620  T
Q  239 cagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  52493619 cggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaatcaaatttgaattga 52493528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 40 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 35531075 - 35530785
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||        ||    
T  35531075 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttta-agacaaatttagaacactatgaaatgttcatttaccaaaatttagattttttttaa 35530977  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    || |||||||||||||||| | ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  35530976 caagaaacgaattaaatataatttttttaaaatgataaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcaacatttttttgc 35530877  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattgat 331  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35530876 aggggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaagattgtttaaaagctcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgat 35530785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 26805497 - 26805786
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |        | ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |        ||    
T  26805497 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaactatttttttaagacaagtttagaacactaagaaatgttcatttaccaaaatttatattttttttaa 26805596  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |   ||||||||    
T  26805597 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctgaacgtaaaaatcaaattttgtgaattttttttgc 26805696  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  26805697 agaggaacttttagtaatattcttaacacgtctacaaaaaattgtttaaaaattcaagagtttaagcat-aattaaacaaatttgaattga 26805786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 30982388 - 30982677
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||       || ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||       ||    
T  30982388 gtttaaatatccttaaaatcttaaatttttgaacgattttttcgagacaagtttagaacaatatgaaaggttcaattactaaaatttagaatttttt-aa 30982486  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||  | ||||||| ||    
T  30982487 catgaagcgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgtgataatttttagc 30982586  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     ||||||||||||||||  ||||||||| || | |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30982587 ggaggaacttttagtaaagttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 30982677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 33708951 - 33709240
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||    
T  33708951 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaatttttt-aa 33709049  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
     |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  33709050 tatgaaaagaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatttagacatataaatcaaattttgcgataattttttgc 33709149  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||| |||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33709150 ggaggaacttttaggaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaatcttaagagtttaagtataaattaaacaaatttgaattga 33709240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 36367896 - 36368185
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||       ||    
T  36367896 gtttaattatttttaaactcataaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggtttaattactaaaatttagaatttttt-aa 36367994  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||||    
T  36367995 catgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaatttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaattaaattttgcgataattttttgc 36368094  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36368095 ggagaaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 36368185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 40 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 12000007 - 11999722
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       || ||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||       ||    
T  12000007 gtttaattatccttaaagtcttaaatttttgaacgattattttgagacatgtttagaacactatgaaatgttcaattactaaaatttagaatttttt-aa 11999909  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || | ||||||||    
T  11999908 catgaaacgaattaaatatgaatttttaaaaacgataaaaattaaagataaaagtactaaaatctggacatataaatcaaattttgaaatatttttttgc 11999809  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaa 326  Q
     || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11999808 ggatgaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattattaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaa 11999722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 34 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 43505062 - 43504775
Alignment:
Q  34 aaattcgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannn 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||          | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       
T  43505062 aaatttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaactgttttttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttggaattt 43504963  T
Q  134 nnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaatt 233  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| |    
T  43504962 ttt-aacatgaaacgaattaaatatgaattttttagaacgacaaaagttaaa-------ttaacaaaatctggacgtaaaaatcaaattta-caacaact 43504872  T
Q  234 ttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||  | ||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43504871 ttttgtagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttctgttaaaaattgttcaaaaactcaaaagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 43504775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 46596782 - 46597070
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||         | ||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||        ||    
T  46596782 gtttaattattcttaaactcttaaatttttgaacggttttttttagacaagtttagaacactgtgaaaggttcaattattaaaatttaga-tttttttaa 46596880  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||| ||  || |||||| | ||||||||||    
T  46596881 cataaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaa-tctggacatatcaactaaattttgcgataattttttgc 46596979  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     || |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46596980 ggatgaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 46597070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 327
Target Start/End: Original strand, 10041246 - 10041532
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||        | | ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||       ||    
T  10041246 gtttaattatctttaaactcttaaattttttaacgatttttttaagaaaagtttagaacaccatgaaaggttcatttaccaaaattta-aatttttttaa 10041344  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||| | ||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| || |||||| ||||||||| |     
T  10041345 cattatacgaattaaatataaattttctaaaacggcaaaagttaaagataaaattaataaaatctgaacgtagaaattaaattttgcgacaatttttcga 10041444  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaat 327  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||    |  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10041445 agaggaacttttagtaatgtgtttaacacacctataaaaaattgtttaaaaactcaagaatttaaacataaattaaacaaatttgaat 10041532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 251
Target Start/End: Original strand, 46517178 - 46517388
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||       |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||    
T  46517178 gtttaattatccttaaactcttaaaattttgatcgatttttttgggacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttaga-cttttttaa 46517276  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||  |||||||||||     
T  46517277 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgaaaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattatgtgacaattttttgt 46517376  T
Q  240 agaggaactttt 251  Q
    |||||| |||||    
T  46517377 agaggacctttt 46517388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 31400507 - 31400219
Alignment:
Q  42 ttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaaca 141  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||        | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||       | ||    
T  31400507 ttaattatccttaaactcttaaatattttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt-atca 31400409  T
Q  142 tgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaa-tttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||| | |||||||| ||||||| ||||||| | | |||||| |    
T  31400408 tgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttttgcgatattttttt-c 31400310  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     ||||| |||||| |||  ||||||||| || || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31400309 ggaggaccttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 31400219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 40 - 326
Target Start/End: Original strand, 12368249 - 12368521
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||    
T  12368249 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttagaa-ttttttaa 12368347  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| || || ||||||||||              ||||||    
T  12368348 catgaaacgtattaaatattaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatgaacatataaatcaa-------------attttgc 12368434  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaa 326  Q
     | |||||||||| |||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  12368435 ggcggaacttttaataatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaa 12368521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 36248613 - 36248333
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       || ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||       ||    
T  36248613 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgaattttttgagacaagtttaaaacactatgaaaggttcaattaataaaattta-aaattttttaa 36248515  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaat----taacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaatttt 235  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |    ||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||          
T  36248514 catgaaacaaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaattaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgcgac------ 36248421  T
Q  236 ttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
           |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  36248420 -------ggaacttttagtaatattcttaacatgtctacaagaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 36248333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 21091338 - 21091051
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||        | ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||       ||    
T  21091338 gtttgattatcctcaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacactgtgaaaggttcatttattaaaatttataatttttt-aa 21091240  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |  |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||| || |||||||||| |||||  | ||||| |||     
T  21091239 cgcgaaatgaattaaatatgaattttt-aaaacatcaaaagttaaagattaaagtaataaaatctgaacatataaatcaaattttgagataatttattgt 21091141  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     || |||||||  ||||| ||| ||||| || | ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21091140 ggatgaactttatgtaatgttcgtaacacgtctacaaaaaattgtt-taaaacttaagagtttaaacataaactaaacaaatttgaattga 21091051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 86 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15053870 - 15053640
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15053870 acaagtttagaacactatgaaaggctcaatcaataaaatttagaatgtttt-aacatgaaacgaattaaatataaatttttgaaaacaataaaagttaaa 15053772  T
Q  186 gataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgtt 285  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| |||||           ||  | ||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||    
T  15053771 gataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttg-----------tg--gcggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgtt 15053685  T
Q  286 caaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15053684 aaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 15053640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 39682090 - 39681883
Alignment:
Q  34 aaattcgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannn 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |        | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  39682090 aaatttgtttaattatccttaaactcttaagtttatgaacaatttttttaagacaagtttaaaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 39681991  T
Q  134 nnnnaacatgaaa-cgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaat 232  Q
        ||||||||| || |||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| | |||    
T  39681990 ttttaacatgaaaacggattaaataggatttttttaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggatgtagaaatcaaattttgcgataat 39681891  T
Q  233 tttttgca 240  Q
    ||||||||    
T  39681890 tttttgca 39681883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 230 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 21794510 - 21794413
Alignment:
Q  230 aattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaat 327  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21794510 aattttttgtagaggaacttttattaatgttcttaacacgtgtgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaat 21794413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 92 - 324
Target Start/End: Original strand, 31024113 - 31024345
Alignment:
Q  92 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaa 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |       ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||    
T  31024113 ttagaacactacgaaaggttcatttactaaaatctaggatttttttaacatgaaatgtatttaatatgaatttttttaaacgaaaaaagttcaagataaa 31024212  T
Q  192 attaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaa 290  Q
    |||||||||| | || || || ||||||| ||||   | ||||| || | || ||||||||||||||  |||||||| || | ||| |||||||||||||    
T  31024213 attaacaaaaatatgaacatagaaatcaaattttaagataatttgttacggatgaacttttagtaatggtcttaacacgtctacaagaaattgttcaaaa 31024312  T
Q  291 actcaagagtttaaacataaattaaacaaatttg 324  Q
    ||  |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31024313 acataagagtttaaacat-aattgaacaaatttg 31024345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 44 - 324
Target Start/End: Original strand, 7565189 - 7565468
Alignment:
Q  44 aattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatg 143  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||| |||||       || ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||       ||||||    
T  7565189 aattatcttcaaactcttaacttttttaacgatttttatgagacaagtttagaacattacgaaaggtacatttactaaaatttagaatttttt-aacatg 7565287  T
Q  144 aaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcaga 242  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||| |||||  | |||||||| | ||    
T  7565288 aaatgaatttaatatgaatttttttaaacgagaaaagttcaagataaaattaacaaaaatatggacatagaaatcaaattttgagataattttttacgga 7565387  T
Q  243 ggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttg 324  Q
     ||| ||||| |||| || |||||| || | ||| ||||||||||||| |  |||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  7565388 tgaatttttattaatgtttttaacacgtctacaagaaattgttcaaaagcataagaatttaaacat-aactaaacaaatttg 7565468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 49767910 - 49767693
Alignment:
Q  105 aaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tc 203  Q
    |||||||| |||||||||||||||||       |||||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| || |||||| |||||||| ||    
T  49767910 aaaggttcgtttactaaaatttagaatttttt-aacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagtttaaaataaaagtaacaaaaatc 49767812  T
Q  204 tggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagttta 303  Q
    |||||| | |||| ||||||||  | |||||||||||||  ||||||| || || ||||||| |  | ||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  49767811 tggacgcagaaataaatttttgagataattttttgcagataaacttttcgtgatgttcttaatacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagttta 49767712  T
Q  304 aacataaattaaacaaattt 323  Q
    | ||| ||||||||||||||    
T  49767711 agcat-aattaaacaaattt 49767693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 323
Target Start/End: Original strand, 12251439 - 12251656
Alignment:
Q  105 aaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaat-c 203  Q
    |||||||| |||||||||||||||||       || ||||||  ||||||||||| ||||||| ||   ||||||||| || |||||| ||||||||| |    
T  12251439 aaaggttcgtttactaaaatttagaatttttt-aatatgaaataaattaaatatggatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaattc 12251537  T
Q  204 tggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagttta 303  Q
    |||||| | |||| || |||||  | ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  12251538 tggacgcagaaataaaattttgagataattttttgcagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagttta 12251637  T
Q  304 aacataaattaaacaaattt 323  Q
    | ||| ||||||||||||||    
T  12251638 agcat-aattaaacaaattt 12251656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 141 - 328
Target Start/End: Original strand, 33707476 - 33707663
Alignment:
Q  141 atgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||| |||| | ||||||| |||||||||  ||||||| | || ||||| ||||||| |||||  | ||||||||||    
T  33707476 atgaaatgtattaaatataaattttttcaaacgataaaagttcaagataaaagcaacaaaaatttgaacgtagaaatcaaattttgagataattttttgc 33707575  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 328  Q
      |||||||||||||||| |||| |||| || ||||||| |||||||||||| | ||||||||||  || |||||||||||||| ||||    
T  33707576 gaaggaacttttagtaatgttctcaacacgtctgcaaaagattgttcaaaaaattaagagtttaagaat-aattaaacaaatttaaatt 33707663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 160
Target Start/End: Original strand, 37986750 - 37986869
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||    
T  37986750 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttagaa-ttgtttaa 37986848  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatga 160  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  37986849 catgaaacgaattaaatatga 37986869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 261 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 2059145 - 2059078
Alignment:
Q  261 cttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 328  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2059145 cttaacacgtatgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaatt 2059078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 2059639 - 2059484
Alignment:
Q  34 aaattcgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannn 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        | | ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||       
T  2059639 aaatttgtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacgattttttt-agataagtttagaacattataaaaggttcatttactaaaatttagaattt 2059541  T
Q  134 nnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaa 192  Q
        |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  2059540 gtt-aacatgaaacaaattaaatatgaatattttaaaacga-aaaagttaaagataaaa 2059484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 149 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 27550974 - 27550800
Alignment:
Q  149 aattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaat-ctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaac 247  Q
    ||||||||||| ||||||| ||   ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||| | |||| || |||||  | ||||||||||||| ||||    
T  27550974 aattaaatatggatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaattctggacgcagaaataaaattttgagataattttttgcagatgaac 27550875  T
Q  248 ttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    |||| ||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||| || || |||||||  || ||||||||||||||    
T  27550874 ttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagtat-aattaaacaaattt 27550800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 25352178 - 25351963
Alignment:
Q  105 aaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tc 203  Q
    |||||||| |||||||||||||||||       | |||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| || |||||| |||||||| ||    
T  25352178 aaaggttcgtttactaaaatttagaattattt-agcatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttgaaaataaaagtaacaaaaatc 25352080  T
Q  204 tggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagttta 303  Q
    |||||| |||||| || ||  |  | ||||||||| ||| |||||||| ||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  25352079 tggacgcataaataaaattgag--ataattttttggagatgaacttttcgtaatgtttttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagttta 25351982  T
Q  304 aacataaattaaacaaattt 323  Q
    | ||| ||||||||||||||    
T  25351981 agcat-aattaaacaaattt 25351963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 11397222 - 11397039
Alignment:
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttg 238  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||  || |||||| |||||||| | |||||| | |||| || |||||  | |||||||||    
T  11397222 catgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagtgcaaaataaaagtaacaaaaatatggacgcagaaataaaattttgagataattttttg 11397123  T
Q  239 cagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
     ||| |||||||| ||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||| || ||  |||||| ||| ||||||||||||||    
T  11397122 gagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaatgtttaagcat-aattaaacaaattt 11397039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 234 - 330
Target Start/End: Original strand, 37986893 - 37986989
Alignment:
Q  234 ttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  37986893 ttttgcggcggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaatttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 37986989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 274 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 12367759 - 12367703
Alignment:
Q  274 caaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12367759 caaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 12367703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 244 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 42972036 - 42971953
Alignment:
Q  244 gaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  42972036 gaacttttagtaatattcttaacacgtctacaaaagatttttctaaaacttaagagtttaaacat-aattaaacagatttgaatt 42971953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 330
Target Start/End: Original strand, 29231884 - 29231939
Alignment:
Q  275 aaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29231884 aaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 29231939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 149 - 323
Target Start/End: Original strand, 49768522 - 49768696
Alignment:
Q  149 aattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaat-ctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaac 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||   ||||||||| || |||||| ||| ||||| ||||||||| |||| || |||||  | ||||||||||| | ||||    
T  49768522 aattaaatatgaatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaataaaattctggacgtagaaataaaattttgagataattttttgcaaatgaac 49768621  T
Q  248 ttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    |||| ||||| |||||||||  | | |||||||   ||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  49768622 ttttcgtaatgttcttaacacttgtccaaaaaaaatttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 49768696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 282
Target Start/End: Original strand, 52882360 - 52882556
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa 185  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||       |||||||||  ||||||||||||||||||| |||  |||||| || ||    
T  52882360 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttagaatttttt-aacatgaaattaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaatttcaa 52882458  T
Q  186 gataaaattaac-aaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaatt 282  Q
     |||||| |||| |||||||||| | | |||| || |||||  | ||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||  | |||||||||||    
T  52882459 aataaaagtaacaaaaatctggaggcagaaataaaattttgagataatttgttggagatgaacttttcttaatattcttaacacttgtgcaaaaaatt 52882556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 328
Target Start/End: Original strand, 1297017 - 1297156
Alignment:
Q  188 taaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttc 286  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||  | |||| | ||  || ||||| |||||||| || |||| || || |||||||||| |||    
T  1297017 taaaattaacaaaaatttggacgtagaaatcaaattttgagataattatatgaggatgaactcttagtaatgtt-ttaatattttagcaaaaaattattc 1297115  T
Q  287 aaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 328  Q
    ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1297116 aaaaatttaagagtttaaacat-aattaaacaaatttgaatt 1297156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 274 - 327
Target Start/End: Original strand, 36249098 - 36249151
Alignment:
Q  274 caaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaat 327  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36249098 caaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaat 36249151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 230 - 323
Target Start/End: Original strand, 48218046 - 48218138
Alignment:
Q  230 aattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||| ||  | ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  48218046 aattttttgcagatgaactttttgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatctttaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 48218138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 330
Target Start/End: Original strand, 15054431 - 15054487
Alignment:
Q  274 caaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15054431 caaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaataaatttgaattga 15054487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 37986265 - 37986209
Alignment:
Q  274 caaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37986265 caaaaaattgttaaaaaatttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 37986209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 21794621 - 21794533
Alignment:
Q  42 ttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaa 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||       || ||||| |||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21794621 ttaattatccttaaactcttaaatttttgtacgaattttttgagacaagtttagaatattaagaaaggttcattaactaaaatttagaa 21794533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 35188365 - 35188186
Alignment:
Q  138 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaa-tttttgcaacaatttt 235  Q
    |||||||||  |||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |  | ||| ||||||| ||||||| | | ||||    
T  35188365 aacatgaaataaattaaatat-attttttttaaacaacaaaagtttaagataaaagtaacaaaaatataaatgtagaaatcaaatttttgcgatattttt 35188267  T
Q  236 ttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgtt-caaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    |||| |||||||||||| ||        | || |||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35188266 ttgctgaggaacttttaata--------agcacgtttgcgaaaaattgttgaaaaaaattaagagtttaaacataaattaaacaaattt 35188186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26207547 - 26207482
Alignment:
Q  245 aacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataa 310  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||    
T  26207547 aacttttagtaatgttcttaacatgtttcgaaaaaattgttctaaaacttaagagtctaagcataa 26207482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 41 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 42972256 - 42972167
Alignment:
Q  41 tttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaa 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||       || |||   |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42972256 tttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatttttcggagacacttttagaagattataaaaggttcatttactaaaatttagaa 42972167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 209
Target Start/End: Original strand, 27551561 - 27551684
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa 185  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||       | |||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||    
T  27551561 acaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttagaattttttta-catgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaa 27551659  T
Q  186 gataaaattaac-aaaatctggacg 209  Q
     |||||| |||| ||||||||||||    
T  27551660 aataaaagtaacaaaaatctggacg 27551684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 48410430 - 48410258
Alignment:
Q  43 taattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacat 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||         || ||||| ||| || | ||  ||||||||  | ||||||||||||||       |||||    
T  48410430 taattatccttaaactcttaaatttttgaacagtctttttgagacaagtttaaaaaattacaaaaggttcggtcactaaaatttagaa-ttttttaacat 48410332  T
Q  143 gaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgtataaat 216  Q
    |||| | ||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  48410331 gaaatggattaaatat-aatttttttaaaagacaaaagttcaagataaaagtaacaaaaatctggacgtataaat 48410258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 52881780 - 52881707
Alignment:
Q  138 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgt 210  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||    
T  52881780 aacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatctggacgt 52881707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2059196 - 2059152
Alignment:
Q  184 aagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaa 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  2059196 aagataaaattaacaaaatcaggacgtagaaatcaaattttgcaa 2059152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13083529 - 13083446
Alignment:
Q  244 gaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||||||||||  ||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  13083529 gaacttttagtaatgttcttaacacatctgaaaaaagttgttcaaaaacttgagagtataagcat-aattaaacaagtttgaatt 13083446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 310
Target Start/End: Original strand, 43396432 - 43396512
Alignment:
Q  230 aattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataa 310  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||| ||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  43396432 aatttgttgcggagaaacttttagcaacgttcttaacatggtcacaaaaaattgtttaaaaacttaagagtttaatcataa 43396512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 330
Target Start/End: Original strand, 13501452 - 13501506
Alignment:
Q  275 aaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  13501452 aaaaaattgttcaaaaatttaagagtttaaggat-aattaaacaaatttgaattga 13501506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 18997052 - 18996922
Alignment:
Q  148 gaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaac 247  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||||||  ||||||||| ||||| || |||| || ||||  |   ||||||||| ||  |||    
T  18997052 gaattaaatatgaattttttagaa-gccaaaagttcaagataaatgtaacaaaatttggacctaaaaataaaattttaaacttattttttgcggataaac 18996954  T
Q  248 ttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaa 279  Q
    ||||  ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18996953 tttttataatattctaaacatgtatgcaaaaa 18996922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26507695 - 26507632
Alignment:
Q  138 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa 201  Q
    |||||| || ||||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||    
T  26507695 aacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacaccaaaaattcaagataaaactaacaaaa 26507632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 75
Target Start/End: Original strand, 6216382 - 6216416
Alignment:
Q  41 tttaattatccttaaactcttaaatttttgaacga 75  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6216382 tttaattatccttaaactattaaatttttgaacga 6216416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 28479972 - 28479931
Alignment:
Q  34 aaattcgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacga 75  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  28479972 aaatttgtttaattatccttaaactattaagtttttgaacga 28479931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26451269 - 26451181
Alignment:
Q  138 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgtataaatcaatttttg 225  Q
    |||||| || ||||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||| || |||| || |||||    
T  26451269 aacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacaccaaaaattcaagataaaactaacgaaaatttggacctaaaaataaaattttg 26451181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 29231396 - 29231368
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttt 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29231396 gtttaattatccttaaactcttaaatttt 29231368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 225
Target Start/End: Original strand, 31861634 - 31861722
Alignment:
Q  138 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgtataaatcaatttttg 225  Q
    |||||| || ||||||||||| | |||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||| || |||||    
T  31861634 aacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaattaacgaaaatatggacctaaaaataaaattttg 31861722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 33707663 - 33707619
Alignment:
Q  29 aattgaaattcgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaac 73  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  33707663 aatttaaatttgtttaattattcttaaactcttaattttttgaac 33707619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 294 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 36362513 - 36362477
Alignment:
Q  294 caagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  36362513 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattga 36362477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 294 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 46596189 - 46596153
Alignment:
Q  294 caagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  46596189 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattga 46596153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 225
Target Start/End: Original strand, 47632664 - 47632752
Alignment:
Q  138 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgtataaatcaatttttg 225  Q
    |||||| || ||||||||||| | |||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||| || |||||    
T  47632664 aacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaattaacgaaaatttggacctaaaaataaaattttg 47632752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 48410202 - 48410127
Alignment:
Q  248 ttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaac-tcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    |||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||| | | || ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  48410202 ttttagtaatgttcttaacacttctgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 48410127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 68)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 43597490 - 43597779
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||        | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  43597490 gtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatttattttagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 43597588  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||    
T  43597589 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggaaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgataattttttgc 43597688  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43597689 ataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 43597779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 47792127 - 47791838
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |        | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||        ||    
T  47792127 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacaatgtttttaagacaagtttagaacactatgaaaggttcatctaccaaaatttaga-tttttttaa 47792029  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  47792028 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgc 47791929  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47791928 agaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgtttaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 47791838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 6588976 - 6588687
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  6588976 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttatgacaagtttataacactaggaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 6588878  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  6588877 catgaaacgaattaaatataaattttttaaaatgacaaaagttaaagataaaattaacaaattctggacgtagaaatcaaattttgcaacaattttttgg 6588778  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6588777 agatgaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 6588687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 34 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 18059299 - 18059006
Alignment:
Q  34 aaattcgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannn 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  18059299 aaatttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttggaca--agtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 18059202  T
Q  134 nnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaatt 233  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  || || ||||||| |||||| ||||||    
T  18059201 ttt-aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaaattaaagataaaattaacaaaatctaaacataaaaatcaaattttgcgacaatt 18059103  T
Q  234 ttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059102 ttttgcagaggaacctttagtaactttcttaacacgtctgcaaaaatttgttcgaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 18059006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 22378464 - 22378753
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||       ||    
T  22378464 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactacgaaaggtacatttactaaaatttagaatttttt-aa 22378562  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  22378563 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacatttttttgc 22378662  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  22378663 ataggaacttttagtaacgttcttaacatgtctgtaaaaaactgttcaaaaactcaatagtttaagtataaattaaacaaatttaaattga 22378753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 4926664 - 4926372
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  4926664 gtttaattatctttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagataagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 4926566  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  4926565 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcacaagttaaagataaaattaacaaaatctgaacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgc 4926466  T
Q  240 a---gaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |    |||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4926465 atagtaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgtttaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 4926372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 7238582 - 7238871
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||       || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  7238582 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgatcgatttttttgagacaagtttagaacattatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 7238680  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||     
T  7238681 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgaaaaagtttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattatgcgacaattttttgt 7238780  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7238781 agaggaccttttaataatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaacctcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 7238871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 38159241 - 38158948
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  38159241 gtttaattatccttacactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 38159143  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  38159142 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaa-ttaacaaaatctggaggtagaaatcaaattttgcgacaattttttgc 38159044  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttg-caaaaaattgttcaaaaactcaagag----tttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38159043 ataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaaattgttcaaaaactcaagagttaatttaaacataaattaaacaaatttgaattga 38158948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 35482065 - 35482351
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||             
T  35482065 gtttaattatctttaaactgttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt--- 35482161  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||||    
T  35482162 cattaaatgaattaaatatgaattttttaaa-cgctaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttaggacaattttttgc 35482260  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35482261 agaggaacttttaataattttcttaacatgtatgcaaaaaattgttcaaaaactcaatagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 35482351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 1962190 - 1961897
Alignment:
Q  37 ttcgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnn 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || |||||  ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||          
T  1962190 ttcgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatatttttgagacaagtatagaacactatgaaaggtcaatttattaaaatttagaatttttt 1962091  T
Q  137 naacatgaaacgaattaaatatgaatttttta-aaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaatttt 235  Q
     |||||||||||||| ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||    
T  1962090 -aacatgaaacgaatgaaatatgtattttttttaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaattaaattttgcgacaatttt 1961992  T
Q  236 ttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| |||| || ||  ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1961991 ttgcagatgaacttttagtaatgttctaaacacgtctgtgaaaaattgttcaaaaactcaaaaatttaagcataaatgaaacaaatttgaattga 1961897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 326
Target Start/End: Original strand, 14990554 - 14990837
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||       || | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||       ||    
T  14990554 gtttaattatccttaaactcttaagtttttgaatgatttttttgagagaagtttagaacactatgaaaggttcatt-actaaaatttataatttttt-aa 14990651  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| | | ||||||||||    
T  14990652 catgaaatgaattaaatatgaattttttaaaagg-caaaagttaaagataaaattaacaaaatctgaatgtagaaatcaaattttacgataattttttgc 14990750  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaa 326  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14990751 agaggaacttttagtaatgttcctaacacgtatgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaa 14990837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 326
Target Start/End: Original strand, 15420165 - 15420448
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||       || | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||       ||    
T  15420165 gtttaattatccttaaactcttaagtttttgaatgatttttttgagagaagtttagaacactatgaaaggttcatt-actaaaatttataatttttt-aa 15420262  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| | | ||||||||||    
T  15420263 catgaaatgaattaaatatgaattttttaaaagg-caaaagttaaagataaaattaacaaaatctgaatgtagaaatcaaattttacgataattttttgc 15420361  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaa 326  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15420362 agaggaacttttagtaatgttcctaacacgtatgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaa 15420448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 40 - 307
Target Start/End: Original strand, 10620526 - 10620793
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||        | ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       ||    
T  10620526 gtttaattattcttaaactcttaaatttttgaacgatttcattaagacaagttttgaacactatgaaaagttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 10620624  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaa-ttttttg 238  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  10620625 catgaaacgaattaaatatgatttttttaaaacgacaaaagttaatgataaaagtaacaaaatatggacgtataaatcaaattttgtaacaatttttttg 10620724  T
Q  239 cagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaaca 307  Q
    ||||| | ||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||| |||||||    
T  10620725 cagagaagcttttagtaatgttcttaacatgtatacaaaatattatccaaaaactcaagagattaaaca 10620793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 41 - 323
Target Start/End: Original strand, 46044298 - 46044580
Alignment:
Q  41 tttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaac 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       |||    
T  46044298 tttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaatttttt-aac 46044396  T
Q  141 atgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgc-aacaattttttgc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||| || |||||| |  |||||||| |    
T  46044397 atgaaacgaattaaatatgaatttttaaaaatgataaaagttaaagataaaagtaataaaatttggacatataaataaaattttgcgataaattttttac 46044496  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    ||| |||| ||||||||| || |||||| || | |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  46044497 agatgaacatttagtaatgtttttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcattaattaaacaaattt 46044580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 59 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 46331069 - 46330799
Alignment:
Q  59 cttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatat 158  Q
    |||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       |||||| ||||||||||||||    
T  46331069 cttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaatttttt-aacatgtaacgaattaaatat 46330971  T
Q  159 gaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaata 258  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||||| || ||||||||||||||     
T  46330970 gaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctcgacatataaatcaaattttgcgataattttttgcggatgaacttttagtaatg 46330871  T
Q  259 ttcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||  || | |||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  46330870 ttcttaacgcgtctacaaaaaattgttaaaaaacttgagagtttaagcataaattaaacatatttgaattga 46330799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 41 - 330
Target Start/End: Original strand, 4899871 - 4900158
Alignment:
Q  41 tttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaac 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||       || ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||    
T  4899871 tttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgatttttttgagacaaatttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttct--aac 4899968  T
Q  141 atgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaat-taacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| | ||||||| ||    
T  4899969 atgaaacaaattaaatatgaattttttcaaaccgcaaaacttaaagataaaaagtaacaaaatctggatgtagaaatcaaattttgcgataatttttcgc 4900068  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
      ||||||||||| |||| |||| |||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4900069 gaaggaacttttattaatgttctaaacaagtctgcaaaaaattgtt-aaaaacttaagagtttaagtataaattaaacaaatttgaattga 4900158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 138 - 330
Target Start/End: Original strand, 21109449 - 21109642
Alignment:
Q  138 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaat-taacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||||| |||||| | |||||||    
T  21109449 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaaattaaagataaaaagtaacaaaatctcgatgtagaaatcaaattttgctataattttt 21109548  T
Q  237 tgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  21109549 tgcagaggaacttttagtaatgttctaaacacgtatgcaaaaaattgttcaaaaatttaagagtttaagcataaatgaaacaaatttgaattga 21109642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 43574529 - 43574239
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||       |  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||       ||    
T  43574529 gtttaattattcttaaactctaaaatgtttgaacgatttttttgtgacaagtttagaacactataaaatgttcatttattaaaatttagaattttct-aa 43574431  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaat-taacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttg 238  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| ||||| | || ||| ||||||| |||||| | |||||||||    
T  43574430 cttgaaacgaattaaatataaattttttaaaatgacaaaagttaaagataaaaagtaataaaatttagatgtagaaatcaaattttgcgataattttttg 43574331  T
Q  239 cagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |  || ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43574330 cgaagtaacttatagtaatgttctaaacatgtctgcaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 43574239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 40 - 329
Target Start/End: Original strand, 11396964 - 11397252
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||| | ||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||       |     
T  11396964 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttgtgtaagacaggtttataacactgtgaatggatcatttactaaaatttagaatttttttag 11397063  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||  || || ||||||| |||| | | | |||||| |    
T  11397064 cgtgaaacaaattaaatatgaattttttaaaacgtcaaaagttaaagataaaagtaacaaa-tctaaacatagaaatcaaattttccgatatttttttac 11397162  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattg 329  Q
    | |||||||||||| ||| || |||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11397163 aaaggaacttttagcaatgtttttaacacgtatgcaaaagattgttcaaaaacttaagagtttgaacataaattaaacaaatttgaattg 11397252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6331185 - 6330978
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  6331185 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttaaaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 6331087  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttg 238  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||| | |||||||||||    
T  6331086 catgaaatgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaaatctggacatagaaatcaaattttacgacaattttttg 6330987  T
Q  239 cagaggaac 247  Q
    || ||||||    
T  6330986 cataggaac 6330978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 40 - 328
Target Start/End: Original strand, 15652802 - 15653085
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnn-a 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||       || | | | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||         |    
T  15652802 gtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgatttttttgagatacgtttagaacaatatgaaaggtttatttattaaaatttagattttttttta 15652901  T
Q  139 acatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttg 238  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||      | ||||||||| |||||||| ||||||| |||| | | |||||||||    
T  15652902 atatgaaacaaattaaatatgaattttttaaaatgacaaaagttaaa------agtaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttacgataattttttg 15652995  T
Q  239 cagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 328  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15652996 tggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtttgtaaaaaattgttcaaaaatttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaatt 15653085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 44167800 - 44168074
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||    
T  44167800 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttataacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaatttttt-aa 44167898  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||             ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||    
T  44167899 catgaaatgaattaaatatgaattttttaaaac-------------gataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttacgataattttttgc 44167985  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| || |  | ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44167986 ggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtct--acaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 44168074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 40 - 290
Target Start/End: Original strand, 27727232 - 27727485
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||       || ||||| |||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||        |    
T  27727232 gtttaattatctttaaactcttaaatttttgtacgatttttttgagacaagtttagaatactaagaaaggttcattaacttaaatttagaatttttttta 27727331  T
Q  140 c-atgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaatt-aacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaatttttt 237  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  27727332 ccataaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttcaagataaaatttaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaatttttt 27727431  T
Q  238 gcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgc-aaaaaattgttcaaaa 290  Q
    | ||||||| |||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  27727432 gtagaggaatttttagtaatgttcttaacacgtgtgcaaaaaaattgttcaaaa 27727485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 38199338 - 38199062
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||| |||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||       ||    
T  38199338 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaatactatgaaaggttcaatcaataaaatttagaatttttt-aa 38199240  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||              ||||||    
T  38199239 catgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaaaaaaaattaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaa-------------attttgc 38199153  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     | ||||||||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38199152 ggcggaacttttaggaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 38199062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 40 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3495932 - 3495655
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       ||  |||| ||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||       ||    
T  3495932 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgaattttttgaggcaagtttaaaacactatgaaagattcaattaataaaattta-aatttttttaa 3495834  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||           |||||| ||     
T  3495833 catgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatca-----------aattttgtg- 3495746  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattgat 331  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  3495745 -gcggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagcgtttaagaataaattaaacaaatttgaattgat 3495655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 142 - 330
Target Start/End: Original strand, 29156073 - 29156260
Alignment:
Q  142 tgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcag 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || | ||||||||| || ||||||| |||||| | |||||||||  |    
T  29156073 tgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagctaaaagcaatagaatctggacatagaaatcaaattttgcgataattttttgtgg 29156172  T
Q  242 aggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||| |||||| |||| ||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  29156173 aggacctttta-taatgttcataacatgtctacaagaaattgttcaaaaacttaagagtttaagcataaattatataaatttgaattga 29156260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 197 - 330
Target Start/End: Original strand, 4883775 - 4883908
Alignment:
Q  197 caaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaa 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  4883775 caaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgcataggaacgtttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattattcaaaaactcaa 4883874  T
Q  297 gagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4883875 gagtttaaacataaattaaacaaatttaaattga 4883908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 43083861 - 43084137
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||    
T  43083861 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttagaa-ttttttaa 43083959  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||| ||| ||||| || |  ||||||||||              ||||||    
T  43083960 catgaaaaaaattaaatatgaatttttgaaaacaattaaagataaagataaaagtaataaaatatgaaaatataaatcaa-------------attttgc 43084046  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     | || |||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  43084047 ggcggtacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 43084137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 86 - 257
Target Start/End: Original strand, 36019814 - 36019985
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa 185  Q
    ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  36019814 acaagtttataacattatgaaatgttcatttactaaaatttagaacttttt-aacatgaaacgaattagatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaa 36019912  T
Q  186 gataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaa-ttttttgcagaggaacttttagtaat 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  36019913 gataaaattaacaaaatctagacgtagaaatcaaattttgcgacaatttttttgcatagaaacttttagtaat 36019985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 1544481 - 1544769
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||  |||| ||||||||||||||||   |||||| |||| |||| |||       ||    
T  1544481 gtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacgatatttttgagtcaagtttagaacactatgaaaaactcatttgctaagattttgaatttttt-aa 1544579  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||| ||||||| |||| | | ||  |||||     
T  1544580 cttgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagatgaaagtaacaaaatcgggatgtagaaatcaaattttacgataagcttttgt 1544679  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
      || |||||||| |||| ||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||  | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1544680 gaagtaacttttaataatgttcttaacacgtatg-gaaaaattgttcaacaactttaaagtttaagcataaatcaaacaaatttgaattga 1544769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 38599255 - 38598967
Alignment:
Q  42 ttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaaca 141  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||        | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||       ||||    
T  38599255 ttaattatctttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaagattcatttactaaaatctataatttttt-aaca 38599157  T
Q  142 tgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaa-tttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| || |||||||| | |||||||| ||||||| ||||||| | | ||||||      
T  38599156 tgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaattttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttttgcgatattttttttg 38599057  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     ||||| | |||| |||  ||||||||| || ||  |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  38599056 -gaggaccatttaataacgttcttaacacgtctgtgaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttggattga 38598967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 44081247 - 44080958
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||        | ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||       ||    
T  44081247 gtttaattatacttaaattcttaaatttttgagcgaatttttttagacaaatttagaatactatgaaaggttcatttactaaaatttaaaatttttaaaa 44081148  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttg 238  Q
      |||||  |||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||||||| |||||||| | |||||||| |||| || |||||| |  ||||||||    
T  44081147 t-tgaaattaattaaatatgaattttttaaaacgactaaacatcaagataaaagtaacaaaaatatggacgtagaaattaaattttgcgatcattttttg 44081049  T
Q  239 cagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||   ||||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  44081048 cggaggaacttttagtattgttcttaacacgtttgcaaaagcatgtttgaaaacttaagagtttaagcat-aattaaacaagtttgaattga 44080958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 188 - 330
Target Start/End: Original strand, 45958811 - 45958953
Alignment:
Q  188 taaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgc-aaaaaattgttc 286  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| || | | |||||||||||     
T  45958811 taaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgaaataattttttgcggaggaacttttagtaatgttattaacacgtctacaaaaaaattgtt- 45958909  T
Q  287 aaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  45958910 aaaaacttaagagtttaagcagaaattaaacaaatttgaattga 45958953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 186 - 323
Target Start/End: Original strand, 16080918 - 16081055
Alignment:
Q  186 gataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgt 284  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||  ||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||    
T  16080918 gataaaagtaacaaaaatctggatgtagaaatcaaaatttgagatacttttttgcagaggaacttttagtaatatttttaacatgtatacaaataattgt 16081017  T
Q  285 tcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    || |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16081018 tcgaaaacttaagagtttaagcat-aattaaacaaattt 16081055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 149 - 323
Target Start/End: Original strand, 1066517 - 1066691
Alignment:
Q  149 aattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaat-ctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaac 247  Q
    ||||||||||| ||||||| ||   ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||| |||| || |||||  |  |||||||||| | ||||    
T  1066517 aattaaatatggatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaattctggacgtagaaataaaattttgagatcattttttgcatatgaac 1066616  T
Q  248 ttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    |||| ||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1066617 ttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 1066691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 33625074 - 33624788
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||        | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||    
T  33625074 gtttaattatccttaaactcttaaattttaga--gattttttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaatttttt-aa 33624978  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||             ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  33624977 catgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaac-------------gataaaagtaataaaatttggacatataaatcaaattttgcgataattttttgc 33624891  T
Q  240 agag-------------gaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaa 326  Q
     ||              ||| |||||||||| ||||||||| || | |||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  33624890 ggataatttggacatatgaatttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaa-ttgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaa 33624792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 37540075 - 37539849
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       || | |   |||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  37540075 gtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacgatttttccgagatatatttagaacatttcaaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 37539977  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaatt-ttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaatttttt 237  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||  ||| ||||  | ||| |  ||||||| |||||  | ||||||||    
T  37539976 catgaaatgaattaaatatgaattttttttaaacgacaaaagttcaagataaaagcaacaaaaaattagacttggaaatcaaattttgagataatttttt 37539877  T
Q  238 gcagaggaacttttagtaatattcttaa 265  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||    
T  37539876 acagaggaacttttagtaatgttcttaa 37539849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 8832952 - 8832715
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa 185  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||        | |||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||    
T  8832952 acaagtttagaacattacaaaaggttcatttactaaaatttaga-cctatttagcatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagtttaa 8832854  T
Q  186 gataaaattaac-aaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaata-ttcttaacatgtttgcaaaaaattg 283  Q
     |||||| |||| |||||||||||| | |||| || |||||  | |||| || | ||| |||||||| |||||| ||||| |||  | ||||||||||||    
T  8832853 aataaaagtaacaaaaatctggacgcagaaataaaattttgagataattattcggagatgaacttttcgtaatagttcttgacacttgtgcaaaaaattg 8832754  T
Q  284 ttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    || |||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8832753 ttaaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 8832715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 323
Target Start/End: Original strand, 12621625 - 12621861
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa 185  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||| ||       |||||||||  ||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||    
T  12621625 acaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaattta-aaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacgaaagttcaa 12621723  T
Q  186 gataaaattaac-aaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgt 284  Q
     |||||| |||| |||||||||||| |  ||| || |||||  | |||||||||||||  ||||||| || || ||||||| |  | ||| |||||||||    
T  12621724 aataaaagtaacaaaaatctggacgcaggaataaaattttgagataattttttgcagataaacttttcgtgatgttcttaatacttgtgctaaaaattgt 12621823  T
Q  285 tcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    |||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  12621824 tcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 12621861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 328
Target Start/End: Original strand, 27727998 - 27728051
Alignment:
Q  275 aaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27727998 aaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaatt 27728051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 330
Target Start/End: Original strand, 36020005 - 36020090
Alignment:
Q  245 aacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  36020005 aacttttagtaatgttcttgacacatttgtaaaaaattgtttaaaaactcaagagtttaagtataaattaaacaaatttaaattga 36020090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 328
Target Start/End: Original strand, 9633368 - 9633461
Alignment:
Q  233 tttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 328  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| || | ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  9633368 tttttgcggaggaacttttagtaatgttcataaaatatctgcaaaaaattgttc-aaaacttaagagtttaagcat-aattaaacaaatttgaatt 9633461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 274 - 331
Target Start/End: Original strand, 38199807 - 38199864
Alignment:
Q  274 caaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattgat 331  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38199807 caaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattgat 38199864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 1260316 - 1260142
Alignment:
Q  154 aatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaactttta 252  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||   |||||| | || || || |||| || ||| |  | |||||||||  ||||||||||||    
T  1260316 aatatgactttttttaaacaacaaaagttcaagataaaagccacaaaaatttgaacatagaaattaaatttagagataattttttgtggaggaactttta 1260217  T
Q  253 gtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 328  Q
    | ||| || |||||| || | |||||||||| | ||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  1260216 gcaatgtttttaacacgtcttcaaaaaattgcttaaaaacttaaaagtttaaacat-aattaaacaattttgaatt 1260142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 123
Target Start/End: Original strand, 45958732 - 45958815
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaa 123  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45958732 gtttaattatttttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaa 45958815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 230 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 8081906 - 8081814
Alignment:
Q  230 aattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8081906 aattttttggagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 8081814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15130953 - 15130859
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagt 181  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       || || ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  15130953 acaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaa-tttttaaatattaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagt 15130859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 37107922 - 37107686
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa 185  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||       |||||||||  |||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||    
T  37107922 acaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttagaatttttc-aacatgaaataaattaaatataaattttttaaaaagacaaaagttcaa 37107824  T
Q  186 gataaaattaac-aaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgt 284  Q
     ||||||  ||| |||||||||||| |  ||| || ||||   | ||||||||||||   || |||| || || ||||||| |  | |||||||||||||    
T  37107823 aataaaagcaacaaaaatctggacgcaggaataaaattttaagataattttttgcagttaaaattttcgtgatgttcttaatacttgtgcaaaaaattgt 37107724  T
Q  285 tcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    |||||| || || ||||||| ||| |||||| |||||||    
T  37107723 tcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaagcaaattt 37107686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1065928 - 1065769
Alignment:
Q  92 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaa 191  Q
    |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||       |||||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| || |||||    
T  1065928 ttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttagaatttttt-aacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaa 1065830  T
Q  192 attaac-aaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaactttt 251  Q
    | |||| ||||||| ||||||  ||| || |||||  | |||||||||||||  |||||||    
T  1065829 agtaacaaaaatctagacgtaggaataaaattttgagataattttttgcagataaactttt 1065769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 149 - 238
Target Start/End: Original strand, 10463407 - 10463497
Alignment:
Q  149 aattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttg 238  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||  || |||||||||    
T  10463407 aattaaatatgaatttttttaaaagacaaaaatttaagataaaagtaacaaaaatctggacgtagaaataaatttttcaaataattttttg 10463497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 38593358 - 38593281
Alignment:
Q  245 aacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    ||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  38593358 aacttttcgtaatgttcttaacacttttgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 38593281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 321
Target Start/End: Original strand, 42974165 - 42974394
Alignment:
Q  92 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaaca-acaaaagttaaagataa 190  Q
    |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||       |||||| ||  |||||||||||| ||||||  || | |||||||||  | ||||    
T  42974165 ttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttagaattattt-aacatggaataaattaaatatgatttttttttaaaagacaaaagtttgaaataa 42974263  T
Q  191 aattaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaa 289  Q
    || |||||||| |||||||| | |||| || |||||  | || |||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||  | |||||||||||||| |||    
T  42974264 aagtaacaaaaatctggacgcagaaataaaattttgagataagtttttggagatgaacttttcgtaatgttcttgacacttgtgcaaaaaattgtttaaa 42974363  T
Q  290 aactcaagagtttaaacataaattaaacaaat 321  Q
    | || || ||||||| ||| ||||||||||||    
T  42974364 atcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaat 42974394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 323
Target Start/End: Original strand, 37108538 - 37108686
Alignment:
Q  174 acaaaagttaaagataaaattaacaaaat-ctggacgtataaatcaa-tttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtt 271  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||| | |||| || ||||||  | ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  |     
T  37108538 acaaaagttcaaaataaaagtaacaaaattctggacggaaaaataaaatttttgagataattttttgcagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttg 37108637  T
Q  272 tgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    |||  |||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||| |||||||    
T  37108638 tgc--aaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaagcaaattt 37108686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 37537542 - 37537487
Alignment:
Q  272 tgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 328  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  37537542 tgcaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttaagcat-aattaaccaaatttgaatt 37537487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 330
Target Start/End: Original strand, 3496423 - 3496478
Alignment:
Q  275 aaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  3496423 aaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcatgaattaaacaaatttaaattga 3496478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 38594756 - 38594592
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa 185  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||       | |||||||  ||| ||||||||||||||| |||  ||||||||| ||    
T  38594756 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttagaattattt-agcatgaaataaatcaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaa 38594658  T
Q  186 gataaaattaac-aaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttt 250  Q
     |||||| |||| ||||||| |||| |||||| || |||||  | ||||||||| ||| |||||||    
T  38594657 aataaaagtaacaaaaatctagacgcataaattaaattttgagataattttttggagatgaacttt 38594592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 43083384 - 43083327
Alignment:
Q  274 caaaaaattgttcaaaaa-ctcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  43083384 caaaaaattgttaaaaaaacttaagagtttaagtataaattaaacaaatttgaattga 43083327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 330
Target Start/End: Original strand, 15131588 - 15131624
Alignment:
Q  294 caagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15131588 caagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 15131624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 323
Target Start/End: Original strand, 8082536 - 8082586
Alignment:
Q  272 tgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8082536 tgcaaaaaattgttcaaaatctcaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 8082586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 323
Target Start/End: Original strand, 8833442 - 8833492
Alignment:
Q  272 tgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8833442 tgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaaacat-aattaaacaaattt 8833492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 18798997 - 18798947
Alignment:
Q  272 tgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18798997 tgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaaacat-aattaaacaaattt 18798947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 41571596 - 41571468
Alignment:
Q  198 aaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaag 297  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||    |||| |||| ||||||||||| | |||| ||||||| |||| |  |||||||||||||| |||| ||     
T  41571596 aaaatcaggacgtagaaatcaaattttgagctaattatttggagaggaacttt-actaatgttcttaatatgtctaaaaaaaattgttcaagaacttaaa 41571498  T
Q  298 agtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 328  Q
    ||| ||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  41571497 agtgtaagcat-aattcaacaaatttgaatt 41571468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 69
Target Start/End: Original strand, 16080785 - 16080814
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaattttt 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16080785 gtttaattatccttaaactcttaaattttt 16080814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 73
Target Start/End: Original strand, 29155968 - 29156001
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaac 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29155968 gtttaattatccttaaactcttaaatttatgaac 29156001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 294 - 330
Target Start/End: Original strand, 33625666 - 33625702
Alignment:
Q  294 caagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  33625666 caagagtttaatcataaattgaacaaatttgaattga 33625702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 323
Target Start/End: Original strand, 40304416 - 40304479
Alignment:
Q  259 ttcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  40304416 ttcttaatatttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 40304479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 294 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 45958141 - 45958105
Alignment:
Q  294 caagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  45958141 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattga 45958105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 294 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 46043699 - 46043663
Alignment:
Q  294 caagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  46043699 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattga 46043663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 73)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 44265735 - 44265446
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||       || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||    
T  44265735 gtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacgattttttcgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttgctaaaatttagaatttttt-aa 44265637  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  44265636 catgaaaagaattaaatatgagttttttaaaacgccaaaaattaaagataaaatcaacaaaatctggacttagaaatcaaattttgcaacaattttttgc 44265537  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44265536 agaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttaaattga 44265446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 25101966 - 25102255
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |       || ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||    
T  25101966 gtttaattatccttaaactcttaaacttttgaacaatttttttgagacaagtttaaaacactatgaaaggttcacttactaaaatttagaatttttt-aa 25102064  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  25102065 catgaaacgaattaaatatgaatttttcaaaacggcaaaagttaaaaataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgtgacaattttttgc 25102164  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25102165 ataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcgagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 25102255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 40 - 331
Target Start/End: Original strand, 38706447 - 38706737
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||       || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  38706447 gtttaattattcttaaacacttcaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacaatatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 38706545  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  38706546 catgaaacaaattagatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgc 38706645  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattgat 331  Q
    | | | |||||||||||  ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38706646 acaagcacttttagtaacgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattgat 38706737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 21135610 - 21135321
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||       ||    
T  21135610 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaaatttagaacattatgaaaggttcaattactaaaatttagaattttttaaa 21135511  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  21135510 -atgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataattttttgc 21135412  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21135411 ggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 21135321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 40 - 331
Target Start/End: Original strand, 36470829 - 36471119
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||        | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  36470829 gtttaattatccttaaactcttcaatttttgaacgatttttttaagataagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 36470927  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |    
T  36470928 catgaaacgaattagatatgaattttttaaaacagcgaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttac 36471027  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattgat 331  Q
    | |||||||||| ||||  ||||||| |  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36471028 ataggaacttttggtaacgttcttaatacatctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattgat 36471119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 6018326 - 6018037
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |       || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||       ||    
T  6018326 gtttaattattcttaaacttttaaatttttgaacaatttttatgagacaagtttagaacattatgaaaggttcatttactaaaatttataatttttt-aa 6018228  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| || |||||| ||||||||||||    
T  6018227 catgaaacaaattaaatatgaatttattaaaacaacaaaagataaagataaaactaacaaaatctgaacgtaaaaattaaattttgcgacaattttttgc 6018128  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  6018127 agaggaacttttagtaatgtttttaacatgtctgcaaaaaactgttcaaaaactcaagagtttatgcataaattaaacaaatttgaattga 6018037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 86 - 330
Target Start/End: Original strand, 17498544 - 17498787
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa 185  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17498544 acaagtttagaacactataaaagattcatttactaaaatttagaatttttt-aatatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaa 17498642  T
Q  186 gataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgtt 285  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||    
T  17498643 gataaaattaacaaaatttgaacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgcagaggaacttttagtaattttctttatatgtctgcaaaaaattgtt 17498742  T
Q  286 caaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17498743 caaaaactcaaaagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 17498787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 5250394 - 5250684
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||  | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  5250394 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaaattcagaacgctgcgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 5250492  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaa-gttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttg 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||||||||| |    
T  5250493 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaaagttaaagataaaattaacaaaatctaaacgtagaaatcaaattttgcgacaatttttgg 5250592  T
Q  239 cagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5250593 cataggaacttttagtaatgttcttaacacgtcagtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 5250684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 6590553 - 6590263
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |       || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||    
T  6590553 gtttaattattcttaaactcttaaatttttgaaccatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagattttttttaa 6590454  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||| | ||| |||||||||||||||||||  | || ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  6590453 catgaaaaaaattaaatatgatttttttaaaacgagaaaaataaaatataaaattaacaaaatctgagcctagaaatcaaattttgcgacaattttttgc 6590354  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6590353 agaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctccaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 6590263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 33322820 - 33322531
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||        | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        ||    
T  33322820 gtttaattatctttaaactcttaaaattttgaacgattttttcaatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttaccaaaatttaga-tttttttaa 33322722  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  33322721 catgaaacgaattaaatataaattttttaaaacgaaaaaagttaaagataaaattaacaaaatctagacgtaaaaatcaaattttgcgacaattttttgc 33322622  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33322621 agaggaacttttagtaatgtttttaacacgtctgcaaaaaattgtttgaaaactcatgagtttaagtataaattaaacaaatttgaattga 33322531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 35863328 - 35863039
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |       || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||       ||    
T  35863328 gtttaattatccttaaactcttaaacttttgaacaatatttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaattta-aaattttttaa 35863230  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35863229 catgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaactataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcaacaattttttgc 35863130  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     ||| | ||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  35863129 ggagaatcttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaataaatttgaattga 35863039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 5695917 - 5696205
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  5695917 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgattttttcgagacaagtttaaaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 5696015  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
     |||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  5696016 tatgagatgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctgaac-taaaaatcaaattttgtgacaattttttgc 5696114  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||| | ||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5696115 agaggaactttcaataatgatcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactgaagagtttaatcataaattaaacaaatttgaattga 5696205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 24451771 - 24451482
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||       || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||    
T  24451771 gtttaattattcttaaactcttaaaattttgaatgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaatttttt-aa 24451673  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  24451672 catgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataattttttgc 24451573  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| || | || ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24451572 ggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacacaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 24451482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 27875451 - 27875740
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||| ||||        | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  27875451 gtttaattatttataaactcttaaatttttggacgattttttttagacaagtttagaacactattaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 27875549  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||    
T  27875550 cattaaatgaattaaatatgaattttttaacacgacaaaagttaaagataaaataaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttacgacaattttttgc 27875649  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  27875650 agaggaacttttagtaatgtttttaacacgtttgtaaaaaattgttcaaaagctcaagagtttaagcataaaataaacaaatttgaattga 27875740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 28015632 - 28015921
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||| ||||        | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  28015632 gtttaattatttataaactcttaaatttttggacgattttttttagacaagtttagaacactattaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 28015730  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||    
T  28015731 cattaaatgaattaaatatgaattttttaacacgacaaaagttaaagataaaataaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttacgacaattttttgc 28015830  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  28015831 agaggaacttttagtaatgtttttaacacgtttgtaaaaaattgttcaaaagctcaagagtttaagcataaaataaacaaatttgaattga 28015921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 43622795 - 43623087
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttact-aaaatttagaannnnnnna 138  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||          ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||       |    
T  43622795 gtttaattatctttaaactcttaaatttttaaacgatttttttatgacaagtttataacactatgaaaggtgcatttacttaaaatttagaattttttta 43622894  T
Q  139 acatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaa-caaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaatttttt 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  43622895 acatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatgacaaaagttaaagataaaattaaacaaattatggacgtagaaatcaaattttgcgacaatttttt 43622994  T
Q  238 gcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | |||||||||||||||||| || |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43622995 gaagaggaacttttagtaatgtttttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 43623087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 41590343 - 41590631
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |          ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||       ||    
T  41590343 gtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacaatttttttatgacaagtttataacactatgaaaggttcatt-actaaaatttagaatttttt-aa 41590440  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||     
T  41590441 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatgacaaaagttaaagataaatttaacaaattctggaagtagaaatcaaattttgcgacaattttttgt 41590540  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  41590541 agaggaacttttagtaatgttcttaacacgtatgcgaaaaattgttcaaaagctcaagagtttaagcacaaattaaacaaatttgaattga 41590631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 35369477 - 35369188
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       || | ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||       ||    
T  35369477 gtttaattatccttaaagtcttaaatttttgaacgatttttttgagataagtttagaacactatgaaaggttcaattgctaaaatttagaatttttt-aa 35369379  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  35369378 catgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatttggacatataaatcaaattttgcaataattttttgc 35369279  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     ||| ||||||||||||| || |||||| || | |||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  35369278 ggagtaacttttagtaatgttgttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagttgaagcataaattaaacaaatttgaattga 35369188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 8784865 - 8784576
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |       |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||       ||    
T  8784865 gtttaattatccgtaaactctcaaattttcgaacaatttttttgacataagtttagaacactataaaaggttcatttactaaaattta-aaattttttaa 8784767  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  8784766 cataaaaagaattaaatatgaattttttaaaacggctgaagttaaagataaaattaataaaatctgaacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgc 8784667  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8784666 agagaaacttttagtaatgttcttaacacgtcagcaaaaacttgtttaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 8784576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 37967824 - 37967533
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngac-acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnna 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||        |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        |    
T  37967824 gtttaatcatccttaaactcttaaagttttgaacgattttttttaagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttaccaaaatttaga-tattttta 37967726  T
Q  139 acatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaaca-acaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaatttttt 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  37967725 acatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatggaaaaaagttaaagataaaattaacaaaatatggacgtagaaatcaaattttgcgacaatttttt 37967626  T
Q  238 gcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    || |||||| |||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  37967625 gcggaggaagttttagtaatgttctttacacgtctgcgaaaaattgtttaaaagctcaagagtttatgcataaattaaacaaatttgaattga 37967533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 42499385 - 42499673
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  42499385 gtttaattattcttaaactcttaaatttttgaacgatttttt-gagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 42499482  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||| |||| || |||||| ||||||||||||    
T  42499483 cataaaacgaattaaatatgaatttttaaaaacgacaaaagttaaagatacaattaaaacaatatggacgtaaaaattaaattttgcgacaattttttgc 42499582  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | |  | ||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  42499583 atataagcttttagtaatgttcttaatacgtctgcaaaaaattgttcaaaaacttaatagtttatgcataaattaaacaaaattgaattga 42499673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 97 - 331
Target Start/End: Original strand, 21159841 - 21160075
Alignment:
Q  97 acactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||       || |||||||| ||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||    
T  21159841 acactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttttaatatgaaacggattaaatataaattttttaaaatggcaaaagttaaagataaagttaa 21159940  T
Q  197 caaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaa 296  Q
    |||||||| || ||| ||||||| || ||| |||| ||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21159941 caaaatctagatgtagaaatcaaattgtgcgacaactttttgcggatgaacttttagtgatgttcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaa 21160040  T
Q  297 gagtttaaacataaattaaacaaatttgaattgat 331  Q
     ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21160041 aagtataagcataaattaaacaaatttgaattgat 21160075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 18839922 - 18840211
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||          | | | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||       ||    
T  18839922 gtttaattatccttaaactcttaaattttcgaacgattttttttggatatgtttagaacactatgaaaggttcatctactaaaacttagaatttttt-aa 18840020  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||||||    
T  18840021 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgaaaagagttaaagataaaagtaataaaatctggacatagaaatcaaattttgcgataattttttgc 18840120  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||  | | ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18840121 agaggaacttctagtaatgttcttaacacatgtacaaaaaattgttcaaaaacttgagagtttaagtataaattaaacaaatttgaattga 18840211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 150 - 330
Target Start/End: Original strand, 6413383 - 6413563
Alignment:
Q  150 attaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaactt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6413383 attaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggatgtaggaatcaaattttgcgacaattttttgaagaggaactt 6413482  T
Q  250 ttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6413483 ttagtgatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 6413563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 41281306 - 41281593
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||        | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||       ||    
T  41281306 gtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaagtttagaatttttt-aa 41281404  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||  |||||||||  |||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  41281405 catgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaatgaaatctggatatataaatcaaattttgcgataattttttgc 41281504  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| | || | | |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41281505 tgaggaacttttagtaatgttcttaagacgtctac-aaaaattgtt-aaaaaattaagagtttaaacataaattaaacaaatttaaattga 41281593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 40 - 323
Target Start/End: Original strand, 37706728 - 37707009
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||    
T  37706728 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttt-agacaagattagaacactatgaaaggttcaattattaaaatttagaattttct-aa 37706825  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | | |||||||| || |||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  37706826 catgaaacgaattaaatatgaatttttaaaaacgataaaagttaaagataaaagtgataaaatctgaacatataaatcaaattttgcgataattttttgc 37706925  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
     ||||||||||||||||| |||| || | || | |||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  37706926 ggaggaacttttagtaatgttctcaatacgtctacaaaaaattgttaaaaaacataagagtttaagcataaattacacaaattt 37707009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 138 - 330
Target Start/End: Original strand, 30658540 - 30658731
Alignment:
Q  138 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaaca-attttt 236  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||    
T  30658540 aacatgaaacaaattaattatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcaacattttttt 30658639  T
Q  237 tgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  30658640 tgaagaggaacttttagtaatgttcttaatacgtctgcaaaaaattgtttaaaaactcaagag-ttaagcat-aattaaacaaatttgaattga 30658731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 92 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 17842699 - 17842463
Alignment:
Q  92 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaa 191  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17842699 ttagaacactataaaaagttcatttactaaaatttagaatttttt-aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaa 17842601  T
Q  192 attaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaa 291  Q
    | ||| |||||||||||||| |||||||  ||||| |  ||||||||| || | |||| ||||||| || ||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  17842600 agtaataaaatctggacgtagaaatcaaaatttgcga-tattttttgctgatgtacttctagtaatgtttttaacatgtatacaaaaaattgttgaaaaa 17842502  T
Q  292 ctcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17842501 cttaagagtttaagtataaattaaacaaatttgaattga 17842463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 36063440 - 36063718
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||       ||    
T  36063440 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacattatgaaaggttcaattactaaaatttagaatttttt-aa 36063538  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||             ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  36063539 catgaaacgaattaaatatgaatttttaaaaac-------------gataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataattttttgc 36063625  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgc--aaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| || | |  ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36063626 ggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaaaattgttaaaaaacttaagaatttaaacataaattaaacaaatttgaattga 36063718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 9252836 - 9252645
Alignment:
Q  138 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaatttttt 237  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||  |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||    
T  9252836 aacataaaacaaattaaatataaattttg-aaaacggtaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggaagtagaaatcaaattttgcggcaatttttt 9252738  T
Q  238 gcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9252737 gcaaaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 9252645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16473270 - 16472990
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       || ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||          ||    
T  16473270 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgatttttttgagacaaatttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttattttttttttaa 16473171  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  16473170 catgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaa-aaaatctggacatataaatcaaattttgcgataattttttgc 16473072  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||| || | |||||||| ||| ||||||      |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16473071 agaggaacttt---taataatcttaacacgtctacaaaaaatggttaaaaaac------gtttaagcataaattaaacaaatttgtattga 16472990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16477841 - 16477561
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       || ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||          ||    
T  16477841 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgatttttttgagacaaatttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttattttttttttaa 16477742  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  16477741 catgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaa-aaaatctggacatataaatcaaattttgcgataattttttgc 16477643  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||| || | |||||||| ||| ||||||      |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16477642 agaggaacttt---taataatcttaacacgtctacaaaaaatggttaaaaaac------gtttaagcataaattaaacaaatttgtattga 16477561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 138 - 330
Target Start/End: Original strand, 13323652 - 13323845
Alignment:
Q  138 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaatttttt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||| |||||| | ||||||||    
T  13323652 aacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaatgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctgaacatataaatcaaattttgcgataatttttt 13323751  T
Q  238 gcagaggaac-ttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |  ||||||| |||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13323752 gtggaggaactttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 13323845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 86 - 312
Target Start/End: Original strand, 17062415 - 17062639
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa 185  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  17062415 acaagtttaaaacactatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt-aacatcaaacgaattaaatatgaattttttaaaatgagaaaagttaaa 17062513  T
Q  186 gataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgtt 285  Q
    ||  ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || |  | |||||||||    
T  17062514 gacgaaattaacaaaatctggacatagaaatcaaattttgcgacaa-tttttgcagaagaacttttaataatgttcttaacacgtctatacaaaattgtt 17062612  T
Q  286 caaaaactcaagagtttaaacataaat 312  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  17062613 caaaaactcaaaagtttaagcataaat 17062639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 86 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 17585943 - 17585719
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa 185  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  17585943 acaagtttaaaacactatgaaatgttcatttactaaaatttagaatttttt-aacatcaaacgaattaaatatgaattttttaaaatgagaaaagttaaa 17585845  T
Q  186 gataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgtt 285  Q
    ||  ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || |  | |||||||||    
T  17585844 gacgaaattaacaaaatctggacatagaaatcaaattttgcgacaa-tttttgcagaagaacttttaataatgttcttaacacgtctatacaaaattgtt 17585746  T
Q  286 caaaaactcaagagtttaaacataaat 312  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  17585745 caaaaactcaaaagtttaagcataaat 17585719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 92 - 265
Target Start/End: Original strand, 18304724 - 18304896
Alignment:
Q  92 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaa 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||        ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  18304724 ttagaacactatgaaaggttcattttccaaaatttaga-tttttgtaacttcaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaatttaaagataaa 18304822  T
Q  192 attaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaa 265  Q
    || |||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18304823 atcaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgcagaggaacttttagtaatgttcttaa 18304896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 39337267 - 39336991
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||       ||    
T  39337267 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgaatcttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaattta-aatttttttaa 39337169  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||  |              
T  39337168 cattaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaatagaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgcggc---------- 39337079  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
       ||||||||||||||| ||||||||| ||   |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  39337078 ---ggaacttttagtaatgttcttaacacgtcaacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 39336991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23483631 - 23483421
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |       || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||        ||    
T  23483631 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacaatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttattaaaatttaga-gttttttaa 23483533  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||| |||| | | |||||||||     
T  23483532 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaattgcaaaagttaaagatcaaattaaccaaatgtggacgtagaaatcaaattttacgataattttttgt 23483433  T
Q  240 agaggaactttt 251  Q
    ||| ||||||||    
T  23483432 agaagaactttt 23483421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 5765720 - 5766012
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||        | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||       ||    
T  5765720 gtttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt-aa 5765818  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgtataaatc-aatttttgcaacaatttttt 237  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| |  |||||||    
T  5765819 catgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttttgcga-tatttttt 5765917  T
Q  238 gcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttg--caaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     |  |||| |||||| |||  ||||||||| || ||   ||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  5765918 tcgaaggaccttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaaaattgttgaaaaacttcagagtttaagcataaattaaacaaatttggattga 5766012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 330
Target Start/End: Original strand, 28755181 - 28755469
Alignment:
Q  42 ttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaaca 141  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||||        | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||       ||||    
T  28755181 ttaattattgttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt-aaca 28755279  T
Q  142 tgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaa-tttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||| | || ||||| ||||||| ||||||| | | |||||| |    
T  28755280 tgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatgaacgtagaaatcaaatttttgcgatattttttt-c 28755378  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     ||||| |||||| |||  ||||||||| || || ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  28755379 ggaggaccttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttgaaaaacttaagaatttaagcataaattaaacaaatttggattga 28755469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 30968951 - 30968670
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||         | ||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||       ||    
T  30968951 gtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacggttttttttagacaagtttagaacaatatgaaatgttcgtttactaaaatttagaatttttt-aa 30968853  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagat-aaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttg 238  Q
     ||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||| | ||| ||||||  |||||| | |||||||||    
T  30968852 tatgtaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaatgataaaaagcaacaaaatctgaatgtagaaatcatattttgcgataattttttg 30968753  T
Q  239 cagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaa-aattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaa 320  Q
     |||| ||||||||||||| || | |||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  30968752 tagagaaacttttagtaatgttataaacacgtatgcaaaataattgtttaaaaacttaagagtttatgcataaattaaacaaa 30968670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 43988159 - 43988446
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||        ||  ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||       ||    
T  43988159 gtttaattatacttaaactcttaaattttttagcgattttttttacctaagtttagaacactatgaaaggtttatatactaaaatttagaatttttt-aa 43988257  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttg 238  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| | ||| |||||    
T  43988258 cataaaatgagttaaatatgaattttttaaaacagcaaaagttaaagataaaagtaacaaaaatctggatgtaaaaatcaaattttgcgataatattttg 43988357  T
Q  239 cagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
      ||||| || |||||||  |||| ||||    ||||||| | ||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  43988358 tggaggagctattagtaacgttctaaaca--catgcaaaataatgttcgaaaacttaagagtttaagcat-aattaaacaaatttgaattga 43988446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 230 - 330
Target Start/End: Original strand, 14121938 - 14122038
Alignment:
Q  230 aattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattg 329  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14121938 aatttgttgcataggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattg 14122037  T
Q  330 a 330  Q
    |    
T  14122038 a 14122038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 309
Target Start/End: Original strand, 32514051 - 32514318
Alignment:
Q  43 taattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacat 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||       || ||||| |||||||  ||  |||||||| ||||||||||||||||        |||||    
T  32514051 taattatccttaaactcttaaatttttaaacgattattttgagacaagtttagaacgttacaaaaggttcgtttactaaaatttagattttttttaacat 32514150  T
Q  143 gaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcag 241  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  |||  | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || || ||||   | ||||||||||||    
T  32514151 gaaatgaattaaatataaatttttgtaaaggaaaaaagttaaagataaaagtaacaaaattctggacgtagatataaaattttcagataattttttgcag 32514250  T
Q  242 aggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacata 309  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||  | || ||||||||||| |||| || || ||||||| ||||    
T  32514251 atgaactattagtaatgttcttaacacttctgtaaaaaattgtttaaaatcttaaaagtttaagcata 32514318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 202
Target Start/End: Original strand, 43936520 - 43936681
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||||| || |||| ||||||||| || |||||| |||||||| |        ||    
T  43936520 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacaagttttgaacgctatgaaagatttatttaccaaaattta-attttttttaa 43936618  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaat 202  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43936619 catgaaacgaattaaaaataaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaat 43936681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 149 - 328
Target Start/End: Original strand, 32244511 - 32244690
Alignment:
Q  149 aattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaat-ctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaac 247  Q
    ||||||||||| ||||||| |    ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||| |||||| || |||||  | ||||||||| ||| ||||    
T  32244511 aattaaatatggatttttttagtagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaattctggacgcataaataaaattttgagataattttttgtagatgaac 32244610  T
Q  248 ttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 328  Q
    |||| ||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  32244611 ttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaatttaaatt 32244690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 36018400 - 36018109
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |       || ||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||        ||    
T  36018400 gtttaattattcttaaactcttaaatttcttaacaatttttttgagacaagttttgaacactataaaaggttcatttattaaaatctaga-tttttttaa 36018302  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaa-tttttgcaacaat-tttt 236  Q
    |||||||  ||| ||||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||||||| |||||||| | || | ||| ||||||| ||||||| | ||| ||||    
T  36018301 catgaaataaataaaatatgtatttttttaaaccaaaaaagtttaagataaaagtaacaaaaatatgaatgtagaaatcaaatttttgcgataatgtttt 36018202  T
Q  237 tgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||| ||| |||||||| ||   ||||||||| || |  ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  36018201 tgcggagaaacttttaatagcgttcttaacacgtcta-aaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagcataaatgaaacaaatttggattga 36018109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 3865934 - 3865698
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa 185  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||| ||||||||| |||||||       |||||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||    
T  3865934 acaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaactttagaatttttt-aacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaa 3865836  T
Q  186 gataaaattaac-aaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgt 284  Q
     |||||| |||| |||||||||||| |  ||| || |||||  | ||||||||| |||  ||||||| || || ||||||| |  | |||||||||||||    
T  3865835 aataaaagtaacaaaaatctggacgcaggaataaaattttgagataattttttggagataaacttttcgtgatgttcttaatacttgtgcaaaaaattgt 3865736  T
Q  285 tcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    |||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3865735 tcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 3865698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 2827029 - 2826919
Alignment:
Q  180 gttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaa 279  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |  || ||||||| |||||| |  ||||||||  || |||||||||||||| || |||||| || ||||||||    
T  2827029 gttaaagataaaagtaacaaaatctgaatatagaaatcaaattttgcgatgattttttgtggatgaacttttagtaatgtttttaacacgtctgcaaaaa 2826930  T
Q  280 attgttcaaaa 290  Q
    |||||||||||    
T  2826929 attgttcaaaa 2826919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 198 - 323
Target Start/End: Original strand, 44894574 - 44894698
Alignment:
Q  198 aaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaag 297  Q
    |||||||||||| | |||| || |||||  | ||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||| || ||     
T  44894574 aaaatctggacgcagaaataaaattttgagataattttttggagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaa 44894673  T
Q  298 agtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  44894674 agtttaagcat-aattaaacaaattt 44894698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 330
Target Start/End: Original strand, 39337757 - 39337813
Alignment:
Q  274 caaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39337757 caaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 39337813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 290
Target Start/End: Original strand, 3866505 - 3866647
Alignment:
Q  149 aattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaat-ctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaac 247  Q
    ||||||||||| ||||||| ||   ||||||||| || |||||| ||||||||| ||| ||  | |||| || |||||  | ||||||||||| | ||||    
T  3866505 aattaaatatggatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaattctgaacacagaaataaaattttgagataattttttgcatatgaac 3866604  T
Q  248 ttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaa 290  Q
    |||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  3866605 ttttcgtaatattcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaa 3866647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 41255389 - 41255335
Alignment:
Q  276 aaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41255389 aaaaattgttcaaaaactcaagagattaaacactaattaaacaaatttgaattga 41255335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 323
Target Start/End: Original strand, 42024260 - 42024536
Alignment:
Q  43 taattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacat 142  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||       |  ||||| |||||||| ||  ||| |||  |||||||||||||||||       | |||    
T  42024260 taattatctttaaactcttaaatttttgaacgattttttag--acaagtttagaacattaccaaaagtttgtttactaaaatttagaa-ttttataccat 42024356  T
Q  143 gaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaatttt-ttgca 240  Q
    |||| |  |||||||||||||||||  ||  ||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||| || |||||  | | |||| |||||    
T  42024357 gaaatgggttaaatatgaatttttttgaaagacaaaagttcaagataaaagtaacaaaaatctcgacgtagaaataaaattttg--agatttttcttgca 42024454  T
Q  241 gaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||  | |||||||||||||| ||||  | || | |||||| || ||||||||||||||    
T  42024455 gatgaaattttagtaatgttcttaacacttctgcaaaaaattgtttaaaatattaaaaatttaaatat-aattaaacaaattt 42024536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 10409876 - 10409789
Alignment:
Q  232 ttttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaa 320  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |  |||| ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  10409876 ttttttgcagatgaacttttagtaatgttcttaacacttccgcaagaaattgttcaaaatcttaaaagtttaaacat-aattaaacaaa 10409789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 330
Target Start/End: Original strand, 35369928 - 35369984
Alignment:
Q  274 caaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35369928 caaaaaattattaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 35369984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 6243663 - 6243479
Alignment:
Q  138 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttt 236  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||||| || |||||| |||| ||||| |||| | | |||| || |||||  | |||||||    
T  6243663 aacatgaaacaaattaaatatgaatttttttaaaagataaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatatggatgcagaaattaaattttgagataattttt 6243564  T
Q  237 tgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||  |||||  | |||||||| |||||| |||| | || ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  6243563 tgcggatgaacttttcgtaatgttactaacacttgtgcaaaaatttgttc-aaaatttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 6243479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1663906 - 1663854
Alignment:
Q  174 acaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgc 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  1663906 acaaaagttaaagataaaagtaacaaaatctggacatagaaataaatttttgc 1663854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 32243920 - 32243684
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa 185  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||| ||       |||||||||  | |||||||| | |||||| |||  ||||||||| ||    
T  32243920 acaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttataatttttt-aacatgaaataatttaaatataattttttttaaaagacaaaagttcaa 32243822  T
Q  186 gataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgt 284  Q
     |||||| ||| |||| ||| |||| |  ||| || |||||  | |||||||||||||  ||||||| || || ||||||| |  | |||||||||||||    
T  32243821 aataaaagtaaaaaaaatctagacgcaggaataaaattttgagataattttttgcagataaacttttcgtgatgttcttaatacttgtgcaaaaaattgt 32243722  T
Q  285 tcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    |||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  32243721 tcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 32243684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 72
Target Start/End: Original strand, 30658459 - 30658491
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaa 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30658459 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaa 30658491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 201
Target Start/End: Original strand, 6244275 - 6244338
Alignment:
Q  138 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa 201  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| || |||||| ||||||||    
T  6244275 aacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaa 6244338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 225
Target Start/End: Original strand, 34050598 - 34050685
Alignment:
Q  138 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttg 225  Q
    |||||| || ||||||||||| | |||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || |||| || |||||    
T  34050598 aacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaatttggacctaaaaataaaattttg 34050685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 72
Target Start/End: Original strand, 18304672 - 18304702
Alignment:
Q  42 ttaattatccttaaactcttaaatttttgaa 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18304672 ttaattatccttaaactcttaaatttttgaa 18304702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 310
Target Start/End: Original strand, 28701866 - 28701928
Alignment:
Q  248 ttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataa 310  Q
    ||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||| || || ||||||| |||||    
T  28701866 ttttagtaatattcttaacacttctacaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcataa 28701928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 31185754 - 31185724
Alignment:
Q  42 ttaattatccttaaactcttaaatttttgaa 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31185754 ttaattatccttaaactcttaaatttttgaa 31185724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 36126542 - 36126455
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaattttt-gaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaattt 126  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||        | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36126542 gtttaactatccttaaactattaaattttttgaacgatttttttaagacaagtttaaaacactataaaaggttcatttactaaaattt 36126455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 12469486 - 12469454
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaa 72  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12469486 gtttaattatccttaaactcctaaatttttgaa 12469454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 294 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 13323219 - 13323183
Alignment:
Q  294 caagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  13323219 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattga 13323183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 28694999 - 28694963
Alignment:
Q  274 caaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataa 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  28694999 caaaaaattgttcaaaaactctagagtttaagcataa 28694963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 294 - 330
Target Start/End: Original strand, 35863921 - 35863957
Alignment:
Q  294 caagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  35863921 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattga 35863957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 294 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 36062840 - 36062804
Alignment:
Q  294 caagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  36062840 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattga 36062804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 149 - 197
Target Start/End: Original strand, 36333227 - 36333275
Alignment:
Q  149 aattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaac 197  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  36333227 aattaaatataaatattttaaaatgataaaagttaaagataaaattaac 36333275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 294 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 37706171 - 37706135
Alignment:
Q  294 caagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  37706171 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattga 37706135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 40 - 327
Target Start/End: Original strand, 5923 - 6209
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||       || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  5923 gtttaattatccttaaactcttgattttttgaacgatttttttgagacaagtttggaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 6021  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  6022 catcaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggaaaaagttaaagataaaattaacaaaatctgaacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgc 6121  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaat 327  Q
    | || ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6122 atagtaacttttagtaatgttcttaacacgtttgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaat 6209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 59)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 40 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 10357604 - 10357318
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  10357604 gtttaattatctttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 10357506  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| | ||||||||||||    
T  10357505 ccttaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggtaaaagttaaagataaaattaacaaaatctgggcgtagaaatcaaatttttcgacaattttttgc 10357406  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaat 327  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10357405 agaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaat 10357318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 31771605 - 31771316
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||       ||    
T  31771605 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgacacaagtttagaacactatgaaagtttcatttactaaaattta-aaattttttaa 31771507  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  31771506 catgaaatgaattaaatatgaatttttgaaaacgacaaaagttaaagataaaagtaataaaatctggatgtagaaattaaattttgcaataattttttgc 31771407  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  31771406 ggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtttacaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttatgcatcaattaaacaaatttgaattga 31771316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 7439509 - 7439220
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||       || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||       ||    
T  7439509 gtttaattattcttaaactcttaaatttttaaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttagtaaaatttagaatttttt-aa 7439411  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||     
T  7439410 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaattaaattttgcgacaattttttgt 7439311  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  7439310 agaggaacttttagtaatgttcttgacacgtcagtaaaaaattgttcaaaaacacaagagtttaagcataaattaaaaaaaattgaattga 7439220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 3043367 - 3043656
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||       || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||       ||    
T  3043367 gtttaattatccttaaactcataaattttttaacgaattttttgagacaagtttagaacaatatgaaaggttcatttactaaaattcagaatatttt-aa 3043465  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  3043466 cataaaactaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgccacaattttttgc 3043565  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||| | ||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3043566 agagtagcttttagtaatgtttttaacacgtctgcaaaaaattgttcaataattcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 3043656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 34 - 330
Target Start/End: Original strand, 42274301 - 42274596
Alignment:
Q  34 aaattcgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannn 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||        
T  42274301 aaatttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacaagtttagaacattatgaaaggttcatttaccaaaatttaga-ttt 42274399  T
Q  134 nnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaatt 233  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||| ||||||    
T  42274400 ttttaatatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctagacatagaaatcaaattttgcgacaatt 42274499  T
Q  234 ttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42274500 ttttgcagaggaacttttagtaatgtttttaacacgtctgcaaaaatttgtttgaaaactcatgagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 42274596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 92 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 6457504 - 6457266
Alignment:
Q  92 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaa 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6457504 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaacttagaatttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaa 6457405  T
Q  192 attaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaa 291  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |   |||||||||||||| |||||| |||| |||| |||| || | ||||||||||||||||||    
T  6457404 attaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttacgaattttttttgcagaggagcttttattaatgttctcaacacgtcttcaaaaaattgttcaaaaa 6457305  T
Q  292 ctcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6457304 ctcaagagtttaaccataaattaaacaaatttgaattga 6457266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 33832130 - 33832418
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||          ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  33832130 gtttaattatccttaaactcttaaatttttaaacgatttttttatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaaa 33832229  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||     
T  33832230 --tgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatgacaaaagtataagataaaattaacaaattctggacgtacaaatcaaattttgcgacaattttttgt 33832327  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33832328 agaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 33832418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 43932740 - 43933029
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || | ||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||    
T  43932740 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagagaagtttagaacaatatgaaaggttcaattattaaaatttagaatttttt-aa 43932838  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  43932839 catgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagtgaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataattttttgc 43932938  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43932939 ggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattattaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 43933029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 327
Target Start/End: Original strand, 8737818 - 8738104
Alignment:
Q  41 tttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaac 140  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||         | | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||       |||    
T  8737818 tttaattatccttaaaatcttaaatttttgaacggttttttttagaaaagtttagaacactatgaaaggttcgtttactaaaattta-aatttttttaac 8737916  T
Q  141 atgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaa-ttttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  8737917 atgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacagcaaaagttaaagataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacaatttttttgc 8738016  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaat 327  Q
    |||| ||||||| ||||| || |||||| || || | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8738017 agagaaacttttcgtaatgtttttaacacgtctgtataaaattgttcaaaaactcaagaatttaagcataaattaaacaaatttgaat 8738104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 40 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 31436326 - 31436045
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||          ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  31436326 gtttaattatccttaaacacttaaatttttgaacgatttttttatgacaagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 31436228  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  31436227 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaatga-caaaagttaaagataaaattaacaaattctgaacgtagaaatcaaattttgcaacaattttttgt 31436129  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    ||| |||||||||||| | ||||||  | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31436128 agatgaacttttagtattgttcttagtacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaattt 31436045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 40364890 - 40365179
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||        | ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||       ||    
T  40364890 gtttaactatcctcaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacaagtttagaacactattgaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 40364988  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  40364989 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaagtaacaaaatatggacgtataaatcaaattttgtgacaattttttgc 40365088  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagag-tttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     || |||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40365089 cgatgaacttttagtaatgttcttaacatataagcaaaaaattg-tccaaaactcaagggttttaaacataaattaaacaaatttaaattga 40365179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 86 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 25666281 - 25666038
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  25666281 acaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaattta-attttttttaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaaattaaa 25666183  T
Q  186 gataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgtt 285  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| | || || |||||||||||    
T  25666182 agtaaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaatttttcgcataggaacttttagtaatgttcttaatacgtctgtaaaaaattgtt 25666083  T
Q  286 caaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  25666082 caaaaactcaagagtttaaatataaattaaataaatttgaattga 25666038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 50 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 41121016 - 41120738
Alignment:
Q  50 ccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacga 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||        | ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||        ||||||||||||    
T  41121016 ccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacaagtttagaacactatgaaaagttcatttaccaaaatttaga-cttttttaacatgaaacga 41120918  T
Q  150 attaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaactt 249  Q
    |||||||| |||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||    
T  41120917 attaaataagaattttttaaa-cggcaaaaattaaagataaaattaacaaaatatggacgtagaaatcaaatttcacgacaattttttgcagaggaactt 41120819  T
Q  250 ttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41120818 ttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgtttaaaaactcaaaagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 41120738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 44493173 - 44492883
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || | ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||       ||    
T  44493173 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttattgagataagtttagaactctatgaaaggttcaattactaaaatttataatatttt-aa 44493075  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaac-aacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttg 238  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||    
T  44493074 catcaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgaaaaaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataattttttg 44492975  T
Q  239 cagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  44492974 cagggaaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttcaacataacttaaacaaatttgaattga 44492883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 25100873 - 25100585
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||          |     
T  25100873 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttt-gagacaagtttagaacactatgaaaggttcacttactaaaatttaatttttttttag 25100775  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || ||||||||||||    
T  25100774 catgaaacgaaataaatatgaatcttttaaaacggcaaaagttaaagctaaaattaacaaaatctgaacgtaaaaatcaaatttagcgacaattttttgc 25100675  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || || |||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25100674 agaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaatattgttcaaaaacttaagagattaca-ataaattaaacaaatttgaattga 25100585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 109 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 30784404 - 30784185
Alignment:
Q  109 gttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggac 208  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  30784404 gttcatttactaaaatttagaatttttt-aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaa-tatggac 30784307  T
Q  209 gtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacat 308  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  30784306 gtagaaatcaaattttgcgacaattatttgcagatgagcttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgttctaaaacttaagagtttaagcat 30784207  T
Q  309 aaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  30784206 aaattaaacaaatttgaattga 30784185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 86 - 328
Target Start/End: Original strand, 36512027 - 36512269
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa 185  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||       ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  36512027 acaagtttagaacactatgaaatgtttattttctaaaatttagaattttgt-aacataaaacaaattaaatatggattttttaaaacgacaaatgttaaa 36512125  T
Q  186 gataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgt-ttgcaaaaaattgt 284  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  36512126 gataaaattaataaaatctggatgtaaaaatcaaattttgcgacaattttttacagagaaacttttagtaatattcttaacacgtcctgcaaaaaattgt 36512225  T
Q  285 tcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 328  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  36512226 tcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaattagaatt 36512269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 92 - 330
Target Start/End: Original strand, 37592937 - 37593171
Alignment:
Q  92 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaa 191  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||    
T  37592937 ttagaacaccatgaaaagttcatttactaaaatttagaatttttt-aacatgaaacggattaaatatgaattt---aaaatgacaaaagttaaagataaa 37593032  T
Q  192 attaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaa 291  Q
    ||||||||||| || ||||| || |||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  37593033 attaacaaaatttgaacgtaaaagtcaaattttgcggcaattttttgcaaaggaacttttagtaatattcttaacacagctgcaaaaaattgttcaaaaa 37593132  T
Q  292 ctcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37593133 ctcaggaatttaagcataaattaaacaaatttgaattga 37593171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 150 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 35498768 - 35498588
Alignment:
Q  150 attaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaactt 249  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||| |||| |||||    
T  35498768 attaaatatgaatttttaaaaatgacaaaagttaaagataaaattaacaaattctggacgtagaaatcaaatttcgcgacaattttttgtagagaaactt 35498669  T
Q  250 ttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35498668 ttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaacaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 35498588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 42487674 - 42487963
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||       || ||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |        ||    
T  42487674 gtttgattatctttaaactcttaaatttttgaatgatttttttgagacaagtttaaaacgctatgaaaggttcaattactaaaatttaaattttttttaa 42487773  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  42487774 catgaaatgaattcaatatgaattttttaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgcgattattttttgc 42487873  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||  | | |||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42487874 agaggaacttttaataatgttcttaacacatctacaaaaaattgtt-aaaaaattaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 42487963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 44286690 - 44286978
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||       ||    
T  44286690 gtttaattatccttaaactcttaaacttttgaacgatttttttgagacaaatttagaacactatgaaagattcatttactaaaatttacaatttttt-aa 44286788  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || ||||||||||      
T  44286789 catgaaacgaatta----tgaattttttaaaacgccaaaacttaaagataaaattaacaaaatctgaacgtagaaatcaaatttagcgacaatttttttt 44286884  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagttta---aacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | | |||||||||||||| | ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||||||    
T  44286885 aaatgaacttttagtaatgtgcttaacacgtccgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagtattataaattaaacaaatttgaattga 44286978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 20721235 - 20721511
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||    
T  20721235 gtttaattatcgttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttagaatttttt-aa 20721333  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||           |||||| ||     
T  20721334 catgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatca-----------aattttgtg- 20721421  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20721422 -gcggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 20721511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 40 - 207
Target Start/End: Original strand, 13372001 - 13372167
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  13372001 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaaattttt-aa 13372099  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctgga 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13372100 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaataaacaaaatctgga 13372167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 21439838 - 21440114
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||       ||    
T  21439838 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaattta-aatttttttaa 21439936  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||           ||||| ||     
T  21439937 cttgaaacgaattaaatataaatttttaaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaa-----------attttatg- 21440024  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21440025 -gcggaacttttagtaatgttcttaacacgattacaaaaaattgtttaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 21440114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 86 - 330
Target Start/End: Original strand, 34073624 - 34073865
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa 185  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34073624 acaagtttagaacactaagaaagattcatttaataaaatttagaattttct-aacaagaaacgaattaaatatgaattttttaaaactacaaaagttaaa 34073722  T
Q  186 gat-aaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgt 284  Q
    ||| |||| ||||||||| |||| ||| |||| || |||||| | ||||||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  34073723 gataaaaagtaacaaaatatggatgtagaaattaaattttgcgataattttttatggaggaacttttagtaatgttctaaacatgtctgcaaaaaattgt 34073822  T
Q  285 tcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | |||||  ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||    
T  34073823 tgaaaaa--caagagtttaggcataaa-taaacaaatttaaattga 34073865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 86 - 326
Target Start/End: Original strand, 33000914 - 33001150
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa 185  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  33000914 acaagtttagaacaatatgaaatgttcaattactaaaatttagaatttttttaacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaa 33001013  T
Q  186 gataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgtt 285  Q
    || |||| ||  ||| ||||||| ||||| |||| |||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||    
T  33001014 gagaaaagtattaaa-tctggacatataa-tcaaattttgcgataattttttgcggagtaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgtt 33001111  T
Q  286 caaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaa 326  Q
     ||||||| ||||||||    |||||||||| |||||||||    
T  33001112 aaaaaacttaagagttt--gtataaattaaagaaatttgaa 33001150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 319
Target Start/End: Original strand, 44879724 - 44879995
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||        | ||||  |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||        ||    
T  44879724 gtttaactatctctaaactcttaaatttttgaacgatttttttaagacaaatttagaacactatgaaaagttcatttaacaaaatttaga-tttttttaa 44879822  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| || ||||||| |||||| |||| |||||||    
T  44879823 catgaaacgaattaaatatgaattttttt------caaaagttagagataaagttaagaaaatctggacata-aaatcaaattttgcgacaaatttttgc 44879915  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaa 319  Q
    | |  |||||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  44879916 acataaacttttagtaatgatcttaacacatctgcaaaaaattgtttaaaaactcaaaagtttaagcataaattaaacaa 44879995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 105 - 267
Target Start/End: Original strand, 29809401 - 29809562
Alignment:
Q  105 aaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  29809401 aaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aacatgaaaggaattaaatatgatttttttaaaacgacaaaagttaatgataaaattaacaaaattt 29809499  T
Q  205 ggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaaca 267  Q
    ||| ||| ||||||  |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  29809500 ggatgtagaaatcagattttgcgataattttttgtagatgaacttttagtaatgttcttaaca 29809562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33031339 - 33031165
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        | ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||        ||    
T  33031339 gtttaattatccttaaattcttaaatttttgaacgatttttttaagacaagtttagaacactataaaaggttcatttaccaaaatttaga-tttttttaa 33031241  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaat 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33031240 catgaaacgaattaa-tatgaattttttaaaacggaaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtaaaaat 33031165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20720230 - 20719949
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||       || ||||| |||||||||       |||||| ||||||||||||||||       ||    
T  20720230 gtttaattatttttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacac-------ggttcaattactaaaatttagaatttttt-aa 20720139  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgc-aacaattttttg 238  Q
      ||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||| |||||| |  | |||||||    
T  20720138 tttgaaatgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctgaacatataaatcaaattttgcgattatttttttg 20720039  T
Q  239 cagaggaacttttagtaatattcttaacatgt-ttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| || |   ||||||||||| |||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20720038 cggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctataaaaaaattgttaaaaaact---tagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 20719949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 40 - 328
Target Start/End: Original strand, 14200970 - 14201260
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |       || ||||| |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||       ||    
T  14200970 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacaatttttctgagacaagcttagaacattacaaaaggttcatttaataaaatttagaatttttt-aa 14201068  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaatttttta-aaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatct-ggacgtataaatcaatttttgcaacaatttttt 237  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||  |||  ||||||||| |||||||||  || ||||  | ||||||| ||||||| |||||  | ||||||||    
T  14201069 catgaaatgaattaaatatggattttttttaaatgacaaaagttcaagataaaagcaaaaaaaaattggacgtagaaatcaaattttgagataatttttt 14201168  T
Q  238 gca--gaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 328  Q
      |  || |||||||||||||| ||||||||| |  | ||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  14201169 ttacggatgaacttttagtaatgttcttaacacggctacaaaaaattattcacaaacttaagagtttaagcat-aattaaacaaatttgaatt 14201260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 92 - 323
Target Start/End: Original strand, 32319001 - 32319232
Alignment:
Q  92 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaa 191  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||       |||||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| || |||||    
T  32319001 ttagaacattactaaaggttcatttactaaattttagaatttttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaa 32319100  T
Q  192 attaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaa 290  Q
    | |||||||| |||||||| |  ||| ||||||||  | |||||||||||||  |||||||  | || |||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  32319101 agtaacaaaaatctggacgcaggaataaatttttgagataattttttgcagataaacttttcatgatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaa 32319200  T
Q  291 actcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
     || || ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  32319201 tcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 32319232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18672480 - 18672317
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||       ||    
T  18672480 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttataa-ttttttaa 18672382  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggac 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || | |||    |||||||||| ||| |||||||||||    
T  18672381 catgaaacgaattaaatatgaatttttgaagacgataaa----aaagataaaagtaataaaatctggac 18672317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 83 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 3118219 - 3117981
Alignment:
Q  83 gacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagtt 182  Q
    |||||||| |||||||| ||  |||||||| ||||||||| |||||||       |||||||||  ||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  3118219 gacacaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaa-tttagaatttttt-aacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagtt 3118122  T
Q  183 aaagataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaat 281  Q
     || |||||| ||| |||| ||| |||| | |||| || |||||  |  |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| | ||||| || |    
T  3118121 caaaataaaagtaaaaaaaatctagacgcagaaataaaattttgagattattttttgcagatgaacttttcgtaatgttcttaacatttgtgcaataatt 3118022  T
Q  282 tgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3118021 tgttcaaaatcttaaaagtttaaacat-aattaaacaaattt 3117981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 248 - 330
Target Start/End: Original strand, 7654925 - 7655007
Alignment:
Q  248 ttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  7654925 ttttagtaatgttcttaatatgtttgcaaaaaactattcaaaaactcaagagtttaaccataaattaaacaaatttaaattga 7655007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 232 - 330
Target Start/End: Original strand, 20719228 - 20719326
Alignment:
Q  232 ttttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||   ||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20719228 ttttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtcaacaaaaaattgttagaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 20719326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 250 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 33031165 - 33031087
Alignment:
Q  250 ttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 328  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33031165 ttagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgtttaaaaattcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 33031087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 330
Target Start/End: Original strand, 8392383 - 8392622
Alignment:
Q  92 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaa 191  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||       ||| |||||  ||||||||||||||||||  |||| |||||||||  |||||||    
T  8392383 ttagaacaatataaaaggttcatttaataaaatctagaatttttt-aacgtgaaataaattaaatatgaatttttgtaaacgacaaaagtttcagataaa 8392481  T
Q  192 attaac-aaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaatt-ttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaa 289  Q
    | |||| ||||| |  || || ||||||||||||      ||| ||||   ||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  8392482 agtaaccaaaatgtacacatagaaatcaattttttatgatattcttttatggagaaacttttaataacattcttaacacgtttgtaaaaaattgttgaaa 8392581  T
Q  290 aactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  8392582 aacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttggattga 8392622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 149 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 32318398 - 32318223
Alignment:
Q  149 aattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaac 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||   ||||||||| || |||||| |||| |||||||||||| | |||| || |||||  | |||  |||||||| ||||    
T  32318398 aattaaatatgaatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatctggacgcagaaataaaattttgagataatcatttgcagatgaac 32318299  T
Q  248 ttttagtaatattcttaacatgtttgc-aaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    |||| ||||| |||||||||  | ||| |||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  32318298 ttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 32318223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 330
Target Start/End: Original strand, 23787782 - 23787838
Alignment:
Q  274 caaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23787782 caaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 23787838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 323
Target Start/End: Original strand, 32319624 - 32319809
Alignment:
Q  138 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttt 236  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||| |||    ||||||| || |||||| |||||||| |||||||| |  ||| || |||||  | |||||||    
T  32319624 aacatgaaataaattaaatatgattttttttaaaagtgaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatctggacgcaggaataaaattttgagataattttt 32319723  T
Q  237 tgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    ||||||  |||||||  | || |||||||||  | ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  32319724 tgcagataaacttttcatgatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcataaaagtttaaacat-aattaaacaaattt 32319809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20701312 - 20701256
Alignment:
Q  274 caaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20701312 caaaaaattgttaaaaaacttaaaagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 20701256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 21439352 - 21439296
Alignment:
Q  274 caaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21439352 caaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaataaatttgaattga 21439296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 125
Target Start/End: Original strand, 13027442 - 13027533
Alignment:
Q  34 aaattcgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatt 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |       || ||| | |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  13027442 aaatttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacaatttttcggagacacgtttagaacattataaaaggttcgtttactaaaatt 13027533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 18672312 - 18672259
Alignment:
Q  277 aaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  18672312 aaaattgttaaaaaacttaagagttcaagcataaattaaacaaatttgaattga 18672259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 35498841 - 35498806
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacga 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35498841 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacga 35498806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 328
Target Start/End: Original strand, 4327848 - 4327898
Alignment:
Q  278 aaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 328  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4327848 aaattgttcaaaagcttaatagtttaagcataaattaaacaaatttgaatt 4327898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 323
Target Start/End: Original strand, 13027654 - 13027735
Alignment:
Q  241 gaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||  | |  ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  13027654 gaggaacttatagtaatgttcttaacaaatgtataaaaaattgttcaaaaacttaagtgtttaagcat-aattaaacaaattt 13027735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 130
Target Start/End: Original strand, 3118639 - 3118728
Alignment:
Q  41 tttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaa 130  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||       || ||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3118639 tttaactatccttaaactcttaaaatttttaacgaattttttgatacaagtttagaacattacaaaaggtttatttactaaaatttagaa 3118728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 330
Target Start/End: Original strand, 20720809 - 20720845
Alignment:
Q  294 caagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20720809 caagagtttaaacataaattgaacaaatttgaattga 20720845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 36881156 - 36881116
Alignment:
Q  274 caaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaatta 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36881156 caaaaaattattcaaaaactcaagagattaaacataaatta 36881116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 40 - 75
Target Start/End: Original strand, 29809260 - 29809295
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacga 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29809260 gtttaattatccttaaactcttaaattttggaacga 29809295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18917395 - 18917309
Alignment:
Q  138 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaattttt 224  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| |||  | |||| |||||| | | |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18917395 aacatgaaacaaattaaatatgattttttttaaatgagaaaatttaaaggttatagaaacaaaatctgaacgtaaaaatcaattttt 18917309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 69
Target Start/End: Original strand, 19058649 - 19058678
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaattttt 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19058649 gtttaattatccttaaactcttaaattttt 19058678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 69
Target Start/End: Original strand, 37592898 - 37592927
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaattttt 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37592898 gtttaattatccttaaactcttaaattttt 37592927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 294 - 330
Target Start/End: Original strand, 18673071 - 18673107
Alignment:
Q  294 caagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18673071 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattga 18673107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 294 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 42487089 - 42487053
Alignment:
Q  294 caagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  42487089 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattga 42487053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 294 - 330
Target Start/End: Original strand, 44493759 - 44493795
Alignment:
Q  294 caagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  44493759 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattga 44493795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 225
Target Start/End: Original strand, 45301279 - 45301367
Alignment:
Q  138 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgtataaatcaatttttg 225  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||  ||||| || ||||||| |||||| ||||| ||||| || |||| || |||||    
T  45301279 aacatgaaatgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataagattaacgaaaatttggacctaaaaataaaattttg 45301367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 41 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 38174190 - 38173902
Alignment:
Q  41 tttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaac 140  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||       || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||       |||    
T  38174190 tttaattatctttaaactcttaaattattgaacgatttttttgaaacaagtttagaacactatgaaaggttcatatactaaaattta-aatttttttaac 38174092  T
Q  141 atgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgca 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  38174091 atgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacagaaaaagttaaagataaaattaacaaaatctagacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgta 38173992  T
Q  241 gaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38173991 taggaacttttagtaatgttcttaacacgcctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 38173902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 25250316 - 25250016
Alignment:
Q  27 tcaattgaaattcgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaattt 126  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||       || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25250316 tcaattcaaatttgttaaattatccttaaactcttaaatttttgaatgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaattt 25250217  T
Q  127 agaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgc 226  Q
    ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  25250216 agaatttttt-aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaaaataaaat--acaaaatttggacgtagaaatcaaattttgc 25250120  T
Q  227 aacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaa 326  Q
     ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25250119 gacaattttttgcatagaaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtaaaaaattattcaaaaactcaagagtttaaatataaattaaacaaatttgaa 25250020  T
Q  327 ttga 330  Q
    ||||    
T  25250019 ttga 25250016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 40 - 323
Target Start/End: Original strand, 23883396 - 23883678
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |        | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||       ||    
T  23883396 gtttaattattcttaaactcttaaattttagaacaattttttttagacaagtttagaacactataaaaggttcatttactaatatttacaatttttt-aa 23883494  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  23883495 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaacttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgtaacaattttttgc 23883594  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23883595 agaggaacttttagtaatgttcttaacacgtatgcaaaaaattgttcaaaaactccagagtttaagcataaattaaacaaattt 23883678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 29348561 - 29348275
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||        | ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  29348561 gtttaattatatttaaactcttaaatttttgaacgattttttt-agacaaatttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 29348464  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  29348463 cataaaacgaactaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtaaaaatcaaattttgcgacaattttttgc 29348364  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29348363 aaaggaacttttagtaatattcttaacacttctgcaaaaaattgttcaaaaactca--agtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 29348275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 45419791 - 45420078
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  45419791 gtttaattatctttaaactcttaaatttttgaacgattttttttagacaagtttagaacattatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 45419889  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  45419890 cattaaatgagttaaatatgaattttttaaaacggtaaaagttaaatataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgc 45419989  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  45419990 agaggaacttttagtaatgttcttaacacgtatgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaa--aaacaaatttgaattga 45420078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 53517790 - 53518079
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||          | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  53517790 gtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacgatttttttatgataagtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaaattttt-aa 53517888  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||     
T  53517889 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaaagacaaaagttaaagataaatttaacaaattctggacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgt 53517988  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53517989 agatgaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcgaaaaattgttcaaaaactcaaaagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 53518079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 44 - 330
Target Start/End: Original strand, 44808849 - 44809135
Alignment:
Q  44 aattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnng-acacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacat 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||         | ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||    
T  44808849 aattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttttagacaggtttataacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aacat 44808947  T
Q  143 gaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcaga 242  Q
     ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| |    
T  44808948 aaaatgaattaaatatgaatttttaaaaacgacaaaagttaaagataaaattaacaaaattttgacgtaaaaatcaaattttgcgacaactttttgcaaa 44809047  T
Q  243 ggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44809048 ggaacttttagtaatattcttaacacgtgtgcaaaaaattgtttaaaaactccagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 44809135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 37179231 - 37178941
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||    
T  37179231 gtttaattatccttaaattcttaaaattttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaatttttttaa 37179132  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  37179131 catcaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaatgtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataattttttgc 37179032  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     || |||||||||||||| ||||||||| || |  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37179031 ggatgaacttttagtaatgttcttaacacgtctataaaaaattgttaaaaaatttaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 37178941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 27492603 - 27492313
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||       ||    
T  27492603 gtttaattatccttaaactcccaaatttttgaacgatatttttgagacaagtttagaacactatgaaatgttcatttattaaaatttagaattttct-aa 27492505  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaat-taacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttg 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||| |||||| | |||||||||    
T  27492504 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacgaaaaaagttaaagataaaaagtaacaaaatttggatgtagaaatcaaattttgcgataattttttg 27492405  T
Q  239 cagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | ||| ||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27492404 cggagaaacttttagtaatgttttaaacatgtatgcaaaaaattgttcaaaaacctaagaatttaaacataaattaaacaaatttgaattga 27492313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 86 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 21749809 - 21749566
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa 185  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||       || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21749809 acaagtttagaatactgtgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aatatgaaacgaattaaaaatgaattttttaaaacgacaaaagttaaa 21749711  T
Q  186 gataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgtt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||   ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||    
T  21749710 gataaaattaacaaaatctggacgtagaaattaaattttaagacaattttttgcatagaaacttttagtaatgttcttaacacgttcgtaaaaaattgtt 21749611  T
Q  286 caaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21749610 caaaaactcaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 21749566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 41 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 19669988 - 19669699
Alignment:
Q  41 tttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaac 140  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||        | ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||       |||    
T  19669988 tttaattattcttgaactcttaaatttttgaacgattttttt-agacaagtttagaacactatcaaaggttcaattactaaaatttagaatttttttaac 19669890  T
Q  141 atgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgca 240  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||     
T  19669889 atgaaacgaattaaatacgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcaataactttttgcg 19669790  T
Q  241 gaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaac-tcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19669789 gaggaacatttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 19669699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 40762606 - 40762895
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        | ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||       ||    
T  40762606 gtttaattatccttaaactcttaaaattttgaacgattttttttaaacaagtttagaacactatgaaagattcaattactaaaatctagaatttttt-aa 40762704  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| | | ||| |||||     
T  40762705 catgaaatgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagatgaaattaacaaaatcttgacgtagaaatcaaattttacgataatattttgt 40762804  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| || |   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40762805 agaggagcttttagtaatgttcttaacacgtctatcaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 40762895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 54 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 32147271 - 32146996
Alignment:
Q  54 aaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaatta 153  Q
    ||||||||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||||||    
T  32147271 aaactcttaaatttttgaacgattttttggagacaagtttagaacactatgaaatgttcaattactaaaatttagaatttttt-aacatgaaacgaatta 32147173  T
Q  154 aatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttag 253  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  32147172 aatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataagagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgcgataattttttgcggaggaacttttag 32147073  T
Q  254 taatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  32147072 taatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattagacaaatttgaattga 32146996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 42 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11045691 - 11045404
Alignment:
Q  42 ttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaaca 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||       || ||||| |||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||       | ||    
T  11045691 ttaattatccttaaactcttaaatttttgtacgatttttttgagacaagtttagaatagtgagaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-acca 11045593  T
Q  142 tgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcag 241  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  11045592 taaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttcaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgcag 11045493  T
Q  242 aggaacttttagtaatattcttaa---catgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 328  Q
    |||||||||||| ||| |||||||    | || |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  11045492 aggaacttttagcaattttcttaatacgacgtgtgcaaagaa-tgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaaattgaatt 11045404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 92 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 53397334 - 53397095
Alignment:
Q  92 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa-catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataa 190  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       || |||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||     
T  53397334 ttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaattttttaaaacatgaaacaaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagatag 53397235  T
Q  191 aattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaa 290  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||   |||||||||||| ||||    
T  53397234 aagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataaatttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtcgacaaaaaattgttaaaaa 53397135  T
Q  291 actcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53397134 acttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 53397095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23917609 - 23917328
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       || ||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||   |||           ||    
T  23917609 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgtacgatttttttgagacaaatttagaatactatgaaaggttcattaactatttttt------tttttaa 23917516  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||   ||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  23917515 catgaaacgaat---ataggaatttcttaaaacgacaaaagttaaaaataaaattaacacaatttggacgtagaaatcaaattttgcgacaattttttgc 23917419  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  23917418 agagaaacttttagtaatgttcttaacacgtttgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaacttgaattga 23917328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 50615090 - 50615366
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||       ||    
T  50615090 gtttaattttccttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaaaaaaatttagaatttttt-aa 50615188  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||              ||||||    
T  50615189 catgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaa-------------attttgc 50615275  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     | ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  50615276 ggcggaacttttagtaatattcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 50615366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 45235350 - 45235641
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||        || ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||       ||    
T  45235350 gtttaattatccataaactcttaaattttttaacggttttattgagacaagtttagaacactttgaaaggttcaattactaaaatttagaatatttt-aa 45235448  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagtt-aaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaa-tttttt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| || ||||||| || |||  |||||||||| ||||||| || |||||| | || ||||||    
T  45235449 catgaaacgaattaaatatgaatttttaaaaacgataaaattttaaagatacaagtaattaaatctggacatataaataaaattttgcgataaatttttt 45235548  T
Q  238 gcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    || |||||||||||| |||| ||||||||| || |  ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45235549 gcggaggaacttttaataatgttcttaacacgtctataaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 45235641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 11294083 - 11293800
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       ||    
T  11294083 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgacttcttttacacaagtttagaacactatgaaaagttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 11293985  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa-gataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttg 238  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||    
T  11293984 gatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatggtaaaagttaaaagataaaataaacaaaatctggacttagaaataaaattttgcaacaattttttg 11293885  T
Q  239 cagaggaacttttagtaatattcttaaca---tgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||          ||| ||| |||||||||    || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  11293884 ca----------taggaatgttcttaacacgtcgtctgcaaaaaattgttcaaaaattcaagagtttaagcatagattaaacagatttgaattga 11293800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 45406958 - 45406701
Alignment:
Q  34 aaattcgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannn 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  45406958 aaatttgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttataagaaaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 45406859  T
Q  134 nnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaaga-taaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaat 232  Q
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||                 
T  45406858 tct-aacatgaatcgaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagattaaaagtaacaaaatctggatgtaaaaatcaa------------- 45406773  T
Q  233 tttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaa 304  Q
     |||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  45406772 attttgcggagaaacttttagtaatgttctaaacatgtctgcaaaaaattgttcaaaaatttaagagtttaa 45406701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 32943275 - 32943000
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||    
T  32943275 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagttttgaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaatttttt-aa 32943177  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
     || ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||             || ||||||  ||| |||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  32943176 tattaaaagaattaaatatgaatttttgaaa-caacaaaagt-------------aataaaatcaagacatataaatcaaattttgcgataattttttgc 32943091  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32943090 ggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 32943000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 324
Target Start/End: Original strand, 39562557 - 39562839
Alignment:
Q  42 ttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaaca 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |        | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||       ||||    
T  39562557 ttaattatccttaaactcttaaattttttaacaattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt-aaca 39562655  T
Q  142 tgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaa-tttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||| | |||||||| ||||||| ||||||| | | |||||| |    
T  39562656 tgaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataactaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttttgcgatattttttt-c 39562754  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttg 324  Q
     ||||| |||||| |||  ||||||||| || || ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39562755 ggaggaccttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttg 39562839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 117453 - 117729
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||       ||    
T  117453 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaatgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaattta-aatttttttaa 117551  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||              ||||||    
T  117552 catgaaacgaattaaaaatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaa-------------attttgc 117638  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||  | |  ||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  117639 ggcggaacttttagtaatgttcttaacacatctaaaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 117729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 101 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 19601777 - 19601549
Alignment:
Q  101 tatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaa 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||       |||| ||||  |||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  19601777 tatgaaaggttcatttgctaaaatttagaatttttt-aacacgaaattaattaaatatgaatgttttaaaatgacaaaagttcaagataaaagtaacaaa 19601679  T
Q  201 a-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagag 299  Q
    | |||||| ||| |||| || |||||| | |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||  |||||    
T  19601678 aatctggatgtagaaattaaattttgcgataattttttgtggaggaacttttagtaatgttcttaacatgtttgcaaaagaatgttaaaaaacataagag 19601579  T
Q  300 tttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19601578 tttaaacat-aattaaacaaatttgaattga 19601549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 144 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 28685487 - 28685305
Alignment:
Q  144 aaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagag 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| || |||||     ||||||| | |||    
T  28685487 aaacgaattaaatatgaattttttaaaacggtaaaagttaaagataaaattaataaaatttggacatataaattaaattttg-----attttttacggag 28685393  T
Q  244 gaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattgat 331  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||| |||||||    
T  28685392 gaacttttagtaatgttcttaacacgtctgcaaataattgttcaaaaacttaagagtttaagcataaattaatcacatttaaattgat 28685305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 46295340 - 46295051
Alignment:
Q  42 ttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaaca 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||        | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||       ||||    
T  46295340 ttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt-aaca 46295242  T
Q  142 tgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaa-gttaaagataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaa-tttttgcaacaattttttg 238  Q
    | |||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| || |||||||| | |||||||| ||||||| ||||||| | | ||||||     
T  46295241 ttaaataaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggacgtagaaatcaaatttttgcgatattttttt- 46295143  T
Q  239 cagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | ||||| |||||| |||  ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  46295142 cggaggaccttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaatttgttgaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttggattga 46295051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 44557585 - 44557864
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |        ||    
T  44557585 gtttaattatccttaatctcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaattta-attttttttaa 44557683  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| |              
T  44557684 catgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaataataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatcaaattttgcagc---------- 44557773  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgtt---caaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
       ||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||    |||||   |||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  44557774 ---ggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaaaaaaaaaagagtttaggaataaattaaacaaatttgaattga 44557864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 92 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 53439547 - 53439324
Alignment:
Q  92 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaa 191  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||       ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  53439547 ttagaacactatgaaaggttcaattactaaa-tttagaatttttt-aacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaa 53439450  T
Q  192 attaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaa 291  Q
    | ||| ||||| ||||| ||||||| || ||||||              ||||||||||||||||| ||||||||| ||    ||||||||||| |||||    
T  53439449 agtaataaaatttggacatataaataaaattttgcg-------------gaggaacttttagtaatgttcttaacacgtcgaaaaaaaattgttaaaaaa 53439363  T
Q  292 ctcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53439362 cgtaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 53439324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 138 - 328
Target Start/End: Original strand, 54268948 - 54269138
Alignment:
Q  138 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatct-ggacgtataaatcaatttttgcaacaattttt 236  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||||  | |||||||||  |||||||  | |||| || ||||||| |||||  | |||||||    
T  54268948 aacatgaaataaattaaatataaatttttttaaacgacaaaaaatcaagataaaagcaacaaaaaattggacttagaaatcaaattttgagataattttt 54269047  T
Q  237 tgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 328  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  54269048 tacagaggaacttttagtaatgttcttaacacgcatgcaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttaagcat-aattaaccaaatttgaatt 54269138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 86 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 25232900 - 25232695
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa 185  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||       |||||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||    
T  25232900 acaagtttagaacattagaaaaggttcgtttactaaaatttagaaattttttaacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagtttaa 25232801  T
Q  186 gataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgt 284  Q
     |||||| |||||||| |||||||| |||||| || |||||  | ||||||||| ||| ||| |||| ||||| |||||||||  | |||||||||||||    
T  25232800 aataaaagtaacaaaaatctggacgcataaataaaattttgagataattttttgtagatgaaattttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgt 25232701  T
Q  285 tcaaaa 290  Q
    ||||||    
T  25232700 tcaaaa 25232695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 173 - 328
Target Start/End: Original strand, 15772002 - 15772157
Alignment:
Q  173 aacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtt 271  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||| | | |||||| ||||||| |||||  | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  15772002 aacaaaagttcaagataaaagaaacaaaaatttcgacgtagaaatcaaattttgagataattttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtc 15772101  T
Q  272 tgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 328  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15772102 tacaaaaaattgtttaaaaacttaagattttaagcat-aattaaacaaatttgaatt 15772157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 149 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 44556098 - 44555919
Alignment:
Q  149 aattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaat-ctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaac 247  Q
    ||||||||||| ||||||| ||   ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| | |||| || |||||  | ||||||||||||| ||||    
T  44556098 aattaaatatggatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaattaacaaaattctggacgcagaaataaaattttgagataattttttgcagatgaac 44555999  T
Q  248 ttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 328  Q
    |||| ||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  44555998 ttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaatttaaatt 44555919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 52701404 - 52701168
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa 185  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||       | |||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||    
T  52701404 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttagaattattt-agcatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaggacaaaagttcaa 52701306  T
Q  186 gataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgt 284  Q
     |||||| |||||||| ||| |||| |||||| || |||||  | ||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||  | || ||||||||||    
T  52701305 aataaaagtaacaaaaatctagacgcataaataaaattttgagataattttttggagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgtaaaaaattgt 52701206  T
Q  285 tcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    |||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  52701205 tcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 52701168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 176 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 45387566 - 45387449
Alignment:
Q  176 aaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgca 275  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| || | ||    
T  45387566 aaaagtaaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcgataattttttgcgtaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctaca 45387467  T
Q  276 aaaaattgttcaaaaact 293  Q
    |||||||||| |||||||    
T  45387466 aaaaattgttaaaaaact 45387449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 149 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 33475650 - 33475471
Alignment:
Q  149 aattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaat-ctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaac 247  Q
    ||||||||||| ||||||| ||   ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||| |||| || |||||  | ||||||||| ||| ||||    
T  33475650 aattaaatatggatttttttaatagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaattctggacgtagaaataaaattttgtgataattttttgtagatgaac 33475551  T
Q  248 ttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 328  Q
    |||| ||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  33475550 ttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaatttaaatt 33475471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 233 - 328
Target Start/End: Original strand, 3173707 - 3173802
Alignment:
Q  233 tttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 328  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3173707 tttttgcagagaaacttatagtaatgttcttaacgcgtctgcaaaaaattgttcaaaaattcaagaatttaatcataaattaaacaaatttgaatt 3173802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 34995826 - 34995564
Alignment:
Q  34 aaattcgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnng-acacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaann 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||       | | |||   |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  34995826 aaatttgtttaattatccttaaactattaaattttagaacgatttttttggaaacacttttagaacattataaaaggttcatttactaaaatttagaatt 34995727  T
Q  133 nnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaat 232  Q
         ||||||| | ||||||||||||| |||||| |||  |||||| || ||||||||| | ||||  | |||||||| ||||||||||||| |  |||    
T  34995726 tttt-aacatgagatgaattaaatatgattttttttaaatgacaaaatttcaagataaaagtcacaagct-tggacgtagaaatcaatttttgaactaat 34995629  T
Q  233 tttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaag 297  Q
    |||| |  ||| ||||||||||||| || | |||| || |  |||||||||||||||||||||||    
T  34995628 ttttcgtggagcaacttttagtaatgttttgaacacgtctataaaaaattgttcaaaaactcaag 34995564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 323
Target Start/End: Original strand, 33476241 - 33476477
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa 185  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||       |||||||||  |||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||    
T  33476241 acaagtttagaacattactaaaggttcgtttactaaaatttagaatttttt-aacatgaaataaattaaatataaatttttttaaaagacaaaagttcaa 33476339  T
Q  186 gataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgt 284  Q
     |||||| ||| |||| |||||||| || ||| || |||||  | |||||||||||||  ||||||| || || ||||||| |  | |||||||||||||    
T  33476340 aataaaagtaaaaaaaatctggacgcatgaataaaattttgagataattttttgcagataaacttttcgtgatgttcttaatacctgtgcaaaaaattgt 33476439  T
Q  285 tcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    |||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  33476440 tcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 33476477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 323
Target Start/End: Original strand, 8575951 - 8576191
Alignment:
Q  84 acacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaaca-acaaaagtt 182  Q
    ||||||| |||||||| ||  | |||||| |||||||||||||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||    
T  8575951 acacaagtttagaacattacaagaggttcgtttactaaaatttagaatttttt-aacatgaaatgaattaaatatgaattttttttaaaagacaaaagtt 8576049  T
Q  183 aaagataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaa-tattcttaacatgtttgcaaaaaa 280  Q
     || |||||| |||||||| ||| |||  | |||| || |||||  | ||||||||||| | ||||||||  ||| | |||||||||  | |||||||||    
T  8576050 caaaataaaagtaacaaaaatctagacacagaaataaaattttgagataattttttgcatatgaacttttcctaaatgttcttaacacttgtgcaaaaaa 8576149  T
Q  281 ttgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    |||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8576150 ttgttcaaaatcttaaaagtttaaacat-aattaaacaaattt 8576191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 310
Target Start/End: Original strand, 26268683 - 26268844
Alignment:
Q  148 gaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaa 246  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||| ||| |||| | ||| |||| ||||||| |||||    |||||||||||||| ||    
T  26268683 gaattaaatatgaattttttaa--cgacaaaagttcaagataaaagtaataaaaatatgggcgtagaaatcaaattttgagctaattttttgcagagaaa 26268780  T
Q  247 cttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataa 310  Q
    ||||||||||| ||||||| | || | ||||||||||||| |||||  || | |||||||||||    
T  26268781 cttttagtaatgttcttaatacgtctacaaaaaattgttcgaaaacataatattttaaacataa 26268844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9018253 - 9018125
Alignment:
Q  96 aacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaatta 195  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||       |||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  9018253 aacactgtgaaaggttcatttacaaaaatttagaatttttt-aacatgaaataaattcaatatgaattttttaaaacgacaaaagttaaagataaaataa 9018155  T
Q  196 acaaaatctggacgtataaatcaatttttg 225  Q
      ||||| |||| ||| ||||||| |||||    
T  9018154 caaaaatatggaagtaaaaatcaaattttg 9018125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 182
Target Start/End: Original strand, 23921081 - 23921220
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | | ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||       ||    
T  23921081 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttt-agataagtttataacactatgaaaggctcattttctaaaatttagaa-ttttttaa 23921178  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagtt 182  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23921179 catgaaa-gaattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtt 23921220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 83 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 31991313 - 31991074
Alignment:
Q  83 gacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagtt 182  Q
    |||| ||| |||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||       |||||||||  ||||||||| ||||||||| |||  |||||||||    
T  31991313 gacaaaagtttagaacattacaaaaggtttgtttactaaaatttagaatttttt-aacatgaaataaattaaataagaatttttttaaaagacaaaagtt 31991215  T
Q  183 aaagataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaat 281  Q
     || |||||| |||||||| | |||||| | |||| || |||||  | || |||||||| |  ||||||| ||||| || ||||||  | ||||||||||    
T  31991214 caaaataaaagtaacaaaaatttggacgcagaaataaaattttgagataagtttttgcaaataaacttttcgtaatgtttttaacacttgtgcaaaaaat 31991115  T
Q  282 tgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31991114 tgttcaaaatcttaaaagtttaaacat-aattaaacaaattt 31991074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 218 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 53377436 - 53377326
Alignment:
Q  218 aatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattctt--aacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaa 315  Q
    ||||||||| | ||||||| ||  ||||||||||| |||| |||||  |||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  53377436 aatttttgcgataatttttcgcgaaggaacttttattaatgttcttttaacacgtctgcaaacaattgttcaaaaacttaagagtttaagcataaattaa 53377337  T
Q  316 acaaatttgaa 326  Q
    |||||||||||    
T  53377336 acaaatttgaa 53377326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 149 - 323
Target Start/End: Original strand, 41927953 - 41928126
Alignment:
Q  149 aattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaac 247  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||| || |||||| |||||||| | |||||| | |||| || |||||  | ||||||||||| | ||||    
T  41927953 aattaaatatgaattttttaaag--acaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatttggacgcagaaataaaattttgatataattttttgcatatgaac 41928050  T
Q  248 ttttagtaatattctt-aacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    |||| ||||| ||||| ||||  | ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  41928051 ttttcgtaatgttctttaacacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 41928126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 330
Target Start/End: Original strand, 37481253 - 37481351
Alignment:
Q  233 tttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaac-tcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  | |  ||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  37481253 tttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacatctataaaaaattgttaaaaaacattaagagtttaagcataaattaaacaaatttaaattga 37481351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 116980 - 116924
Alignment:
Q  274 caaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  116980 caaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 116924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 44555420 - 44555364
Alignment:
Q  274 caaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44555420 caaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 44555364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 50614602 - 50614546
Alignment:
Q  274 caaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50614602 caaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 50614546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 41927501 - 41927360
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa 185  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||| |||||| ||||||||||       |||||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||    
T  41927501 acaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactgaaatttagaatttttt-aacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaa 41927403  T
Q  186 gataaaattaac-aaaatctggacgtataaatcaatttttgca 227  Q
     |||||| |||| |||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  41927402 aataaaagtaacaaaaatctggacgcagaaataaatttttgca 41927360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 53377503 - 53377430
Alignment:
Q  92 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttt 166  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53377503 ttagaacactctgaaaggttcatttactaaaatttagaa-ttttctaacatggaacgaattaaatatgaattttt 53377430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 201
Target Start/End: Original strand, 44287839 - 44287933
Alignment:
Q  106 aaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa 201  Q
    ||||||||||| |||||||||||||       ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || || ||| ||||||||| ||||||||    
T  44287839 aaggttcatttgctaaaatttagaatttttt-aacatgaaatgaattaaatatgaatttttttaaacgacgaaggtttaagataaaagtaacaaaa 44287933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 41 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 8575466 - 8575377
Alignment:
Q  41 tttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaa 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||       || ||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  8575466 tttaactatccttaaactcttaaattttttaacgaattttttgatacaagtttagaacattacaaaaggttcgtttactaaaatttagaa 8575377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 241 - 300
Target Start/End: Original strand, 44287969 - 44288028
Alignment:
Q  241 gaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagt 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||  |||| ||||||||||||| ||||||    
T  44287969 gaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctgtcaaaagttgttcaaaaacttaagagt 44288028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 323
Target Start/End: Original strand, 52701897 - 52701947
Alignment:
Q  272 tgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  52701897 tgcaaaaaattgttcaaaatcttaagagtttaagcat-aattaaacaaattt 52701947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 40 - 75
Target Start/End: Original strand, 54268860 - 54268895
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacga 75  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54268860 gtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacga 54268895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 55006240 - 55006177
Alignment:
Q  138 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa 201  Q
    |||||| || ||||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||    
T  55006240 aacatgtaatgaattaaatataatttttttaaaacaccaaaaattcaagataaaactaacaaaa 55006177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 53520120 - 53520018
Alignment:
Q  149 aattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaac 247  Q
    ||||||||||||||||||  |||||  |||| |||||||| ||| ||| |||| | ||||| || |||||||||||||  | ||||||||||| || |||    
T  53520120 aattaaatatgaatttttctaaacacaaaaaattaaagattaaaataataaaactttggacctaaaaatcaatttttgacataattttttgcaaagaaac 53520021  T
Q  248 ttt 250  Q
    |||    
T  53520020 ttt 53520018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 202
Target Start/End: Original strand, 53658029 - 53658086
Alignment:
Q  145 aacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaat 202  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||  ||||| || ||||||||| |||||||||    
T  53658029 aacgaattaaatataatttttttaaaacgccaaaaattcaagataaaactaacaaaat 53658086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 294 - 330
Target Start/End: Original strand, 32147859 - 32147895
Alignment:
Q  294 caagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  32147859 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattga 32147895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 40 - 328
Target Start/End: Original strand, 17383 - 17669
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       || ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||       ||    
T  17383 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaaagatttttttgagacaagtttagaacaccatgatagattcatttactaaaatttagaattttt--aa 17480  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||| |    
T  17481 catgaaacgaattaaatatgatttttttaaaacaacaaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacttaaaaatcaaattttgcaataattttttac 17580  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 328  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17581 ggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttcaaaaacttaagagtttaactataaattaaacaaatttgaatt 17669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0651 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0651
Description:

Target: scaffold0651; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 40 - 323
Target Start/End: Original strand, 6868 - 7151
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||    
T  6868 gtttaattatccttaaactcttaaatttctgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattactaaaatttagaatttttttaa 6967  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  6968 catgaaacaaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaaattaaagataaaaataataaaatttggacatataaatcaaattttgcgataattttttgc 7067  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7068 agaggaacttttagtaatgtttttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaattt 7151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0651; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 294 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 5855 - 5819
Alignment:
Q  294 caagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  5855 caagagtttaagcataaattgaacaaatttgaattga 5819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 35562 - 35273
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       || ||||| |||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||       ||    
T  35562 gtttaattatccttaaagtcttaaatttttgaacgatttttttgaaacaagtttagattattatgaaaggttcaattactaaaatttagaatttttt-aa 35464  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  35463 catgaaacgaattaaatataaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctggacatataaatcaaattttgcaataattttttgc 35364  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     |||||||||||| |||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35363 ggaggaacttttactaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 35273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 330
Target Start/End: Original strand, 38618 - 38674
Alignment:
Q  274 caaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  38618 caaaaaattgttaaaaaacttaagagttcaagcataaattaaacaaatttgaattga 38674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1160 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold1160
Description:

Target: scaffold1160; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 1449 - 1159
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  1449 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgaggcaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aa 1351  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaatttttta---aaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttt 236  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    |||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  1350 catgaaacgaattaaatatgatttttttttttaaatggtaaaagctaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaatcaaattttgcgacaattttt 1251  T
Q  237 tgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 328  Q
    |||| || |||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  1250 tgcaaagaaactttaagtaatgttcttaacacgtctgcaaaaaattgttcaaaaactcatgagtttaagcataaataaaacaaatttgaatt 1159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1191 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold1191
Description:

Target: scaffold1191; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 92 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 905 - 669
Alignment:
Q  92 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaa 191  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  905 ttagaacactataaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aagatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaatgaaaaaagttaaagataaa 807  T
Q  192 attaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaa 291  Q
    ||||||||| |||||||  | ||||||| |||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  806 attaacaaattctggactcaaaaatcaaattttgcgacaatttgt-gcagatgaacttttagtaatgttcttatcacgtctgcaaaaaattgttcaaaaa 708  T
Q  292 ctcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  707 ctcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0707 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0707
Description:

Target: scaffold0707; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 86 - 327
Target Start/End: Original strand, 6953 - 7192
Alignment:
Q  86 acaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaa 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||       ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6953 acaagtttagaacactatgaaaggtttattaactaaaatttagaattttt--aacctaaaatgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaa 7050  T
Q  186 gataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgtt 285  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||    
T  7051 gataaaattaacaaaatttggacgtagaaatcaaattttgtgacaattttttgcagatgaacttttagtaatgtttttaacacgtctgcaaaaaattgtt 7150  T
Q  286 caaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaat 327  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  7151 caaaaactcaagagtataagcatacattaaacaaatttgaat 7192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0562 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0562
Description:

Target: scaffold0562; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 34 - 330
Target Start/End: Original strand, 3971 - 4287
Alignment:
Q  34 aaattcgtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannn 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  3971 aaatttgtttaattatccttaaactcttacatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaattt 4070  T
Q  134 nnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaatt 233  Q
        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  4071 ttt-aacatgaaacaaattaaatatgaattttttaaaacggaaaaagttaaagataaaattaacaaaacctgtacgtagaaatcaaattttgcgacaatt 4169  T
Q  234 tt---------------------ttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaat 312  Q
    ||                     ||||| |||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4170 ttttgcataggaacttttagtaattgcataggaacttttagtaatgttcttaacatgcctgtaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaat 4269  T
Q  313 taaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4270 taaacaaatttgaattga 4287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0514 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0514
Description:

Target: scaffold0514; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 57 - 330
Target Start/End: Original strand, 6197 - 6470
Alignment:
Q  57 ctcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaa--ttaa 154  Q
    |||||||||||||||||||       ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||  ||  ||||    
T  6197 ctcttaaatttttgaacgattttttcgaggcaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-aacatgaaaaaaaaattaa 6295  T
Q  155 atatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagt 254  Q
    |||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||| | ||| | || ||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  6296 atatgatttttttaaaaccagaaaaattaaagataaa-ttaacaaagtttgggcctagaaatcaaattttgcgacaattttttgtagatgaacttttagt 6394  T
Q  255 aatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6395 aatgttcttaacacgtctccaaaaaattgttgaaaaactcaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 6470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 4)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 25063 - 25339
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||    
T  25063 gtttaattatcgttaaactcttaaatttttgaacgaattttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttagaatttttt-aa 25161  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||           |||||| ||     
T  25162 catgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatataaatca-----------aattttgtg- 25249  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25250 -gcggaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 25339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 24068 - 23787
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||       || ||||| |||||||||       |||||| ||||||||||||||||       ||    
T  24068 gtttaattatttttaaactcttaaatttttgaacgatttttttgagacaagtttagaacac-------ggttcaattactaaaatttagaatttttt-aa 23977  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgc-aacaattttttg 238  Q
      ||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||| |||||| |  | |||||||    
T  23976 tttgaaatgaattaaatatgaatttttgaaaacgataaaagttaaagataaaagtaataaaatctgaacatataaatcaaattttgcgattatttttttg 23877  T
Q  239 cagaggaacttttagtaatattcttaacatgt-ttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| || |   ||||||||||| |||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23876 cggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctataaaaaaattgttaaaaaact---tagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 23787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 232 - 330
Target Start/End: Original strand, 23066 - 23164
Alignment:
Q  232 ttttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||   ||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23066 ttttttgcggaggaacttttagtaatgttcttaacacgtcaacaaaaaattgttagaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 23164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 330
Target Start/End: Original strand, 24647 - 24683
Alignment:
Q  294 caagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24647 caagagtttaaacataaattgaacaaatttgaattga 24683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 7221 - 6931
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||       || ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||       ||    
T  7221 gtttaattatcattaaactcttaaattttttaatgatttttttgagacaagtttagaacaatatgaaaagttcatttactaaaatttagaattttct-aa 7123  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaa-ttaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttg 238  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||| ||||||| |||||| | |||||||||    
T  7122 cacgaaacaaattaaatatgaattttttaaaaagataaaagttaaatataaaaattaacaaaatttggatgtagaaatcaaattttgctataattttttg 7023  T
Q  239 cagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    | ||| ||||||||||||| |||| ||||||   |||||||| | || ||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7022 cggagaaacttttagtaatgttctaaacatgccagcaaaaaactattaaaaaatttaagaatttaagcataaattaaacaaatttgaattga 6931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1190 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold1190
Description:

Target: scaffold1190; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 208 - 486
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  208 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgattttttcgagacaagttcagaacactacgaaaggttcatttactaaaatttagaattttttaaa 307  T
Q  140 catgaaacgaa-ttaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttg 238  Q
     ||||||  || |||||||| | ||||| ||||| ||||||            ||||||||||||||| | || ||||||| |||||  |||||||||||    
T  308 -atgaaaaaaaattaaatataattttttgaaaacgacaaaa------------attaacaaaatctgggcctagaaatcaaattttgtgacaattttttg 394  T
Q  239 cagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  395 cagaggaacttttagtaatgttcttaacacgtctccaaaaaattgttcaaaaactcatgtgtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0640 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0640
Description:

Target: scaffold0640; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 42 - 330
Target Start/End: Original strand, 3900 - 4188
Alignment:
Q  42 ttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaaca 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||        | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||       ||||    
T  3900 ttaattatccttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatctataatttttt-aaca 3998  T
Q  142 tgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaa-tttttgcaacaattttttgc 239  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| | || ||||| ||||||| ||||||  | | ||||||      
T  3999 tgaaataaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatgaacgtagaaatcaaatttttgtgatattttttttg 4098  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     |||||  ||||| |||  |||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  4099 -gaggacgttttaataacgttcttaacatgtctgtaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttggattga 4188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 40 - 231
Target Start/End: Original strand, 158034 - 158223
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |     
T  158034 gtttaattctccttaaactcttcaatttttgaacgatttttt-gagacaagtttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaatttttt-ac 158131  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||    
T  158132 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacggcaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtagaaattaaattttgcgacaa 158223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 240018 - 240294
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||    
T  240018 gtttaattatccttcaactgttaaatttttgaacgacttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttagaatttttt-aa 240116  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||| |||||              ||||||    
T  240117 catgaaacgaattaaatatgaatatttgaaaacaataaaagttaaagataaaagtaataaaatatggacatatagatcaa-------------attttgc 240203  T
Q  240 agaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||  | |  ||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  240204 ggcggaacttttagtaatgttcttaacacatctaaaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 240294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 239548 - 239492
Alignment:
Q  274 caaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  239548 caaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 239492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0571 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0571
Description:

Target: scaffold0571; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 184 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 8575 - 8430
Alignment:
Q  184 aagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattg 283  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||| ||||||| | ||||| |||||||||| ||| || ||| ||||| | ||||||||||    
T  8575 aagataaaattaacaaaatttggacgcaaaaatcaaattttgcgacaatttgt-gcagatgaacttttagcaatgttgttaccatgtctacaaaaaattg 8477  T
Q  284 ttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8476 ttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 8430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0571; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 8742 - 8610
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaa-ggttcatttactaaaatttagaannnnnnna 138  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||        | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       |    
T  8742 gtttgattattcttaaattcttaaatttttgaacgattttttttagataaggttagaacactatgaaaaggttcatttactaaaatttagaa-tttttta 8644  T
Q  139 acatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaac 172  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8643 agatgaaacgaattaaatatgaatttcttaaaac 8610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0385
Description:

Target: scaffold0385; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 40 - 330
Target Start/End: Original strand, 9966 - 10245
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnn-gacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnn- 137  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||        || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||               
T  9966 gtttaattattcttaaactcttaaattttttaatgaatttttttgagacaagtttagaacactatgaaaggttcaattaataaaatttaatttttttttt 10065  T
Q  138 aacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaatcaatttttgcaacaatttttt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||              ||||    
T  10066 aacatgaaacgaattaaatatgaatttttgaaaacaataaaagttaaagataaaaacaataaaatatggacatataaatcaa-------------atttt 10152  T
Q  238 gcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    || | |||||||||| |||| ||||||||| || | |||||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10153 gcggcggaacttttaataatgttcttaacacgtctacaaaaaattgtaaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 10245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 274 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 9479 - 9424
Alignment:
Q  274 caaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9479 caaaaaattgttaaaaaacttaa-agtttaagcataaattaaacaaatttgaattga 9424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 233 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 6301 - 6204
Alignment:
Q  233 tttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  6301 tttttgctgaggaacttttagtaacgttcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaacttaaaagtttaagcataaattaaacatatttgaattga 6204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6347 - 6305
Alignment:
Q  174 acaaaagttaaagataaaattaacaaaatctggacgtataaat 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  6347 acaaaagttaaagataaaagtaacaaaatctggacatagaaat 6305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 149 - 323
Target Start/End: Original strand, 3260 - 3436
Alignment:
Q  149 aattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatctggacgtataaatc-aatttttgcaacaattttttgcagaggaa 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||| ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| |  ||||||| | |||||     
T  3260 aattaaatatgaattttttaaaacgacaaaagtttaagatataagtaacaaaaatatggatgtagaaatcaaatttttgcga-tatttttttcggaggat 3358  T
Q  247 cttttagtaatattcttaacatgtttg-caaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    |||||| |||  ||||||||| || ||  ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3359 cttttaataacgttcttaacacgtctgtaaaaaaattgttgaaaaacttaagagtttaagcataaattaaacaaattt 3436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 124
Target Start/End: Original strand, 2857 - 2941
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaat 124  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||        | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2857 gtttaattatcgttaaactcttaaattttttaacgattctttttatacaagtttagcacactatgaaaggttcatttactaaaat 2941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 171
Target Start/End: Original strand, 21756 - 21886
Alignment:
Q  40 gtttaattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaa 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  21756 gtttaattatccttaaacttttaaatttttgaacgattttttcgagacaagtttagaacactataaaaggttcatttactaaaatttagaa-ttttctaa 21854  T
Q  140 catgaaacgaattaaatatgaattttttaaaa 171  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21855 catgaaacgaattaaatttgaatttcttaaaa 21886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 244 - 330
Target Start/End: Original strand, 48967 - 49053
Alignment:
Q  244 gaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaattga 330  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  48967 gaacttttagtaatgttcttaacacgtctacaaaaaattgttaaaaaacttaagagtttaagaataaattaaacaaatttgaattga 49053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 283076 - 282940
Alignment:
Q  187 ataaaattaacaaaat-ctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgtt 285  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | |||| || |||||  | ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  | ||||||||||||||    
T  283076 ataaaagtaacaaaattctggacgcagaaataaaattttgagataattttttgcagatgaacttttcgtaatgttcttaacacttgtgcaaaaaattgtt 282977  T
Q  286 caaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaattt 323  Q
    ||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  282976 caaaatcttaaaagtttaagcat-aattaaacaaattt 282940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 323
Target Start/End: Original strand, 283308 - 283525
Alignment:
Q  105 aaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaac-aaaatc 203  Q
    |||||||| |||||||||||||||||       |||||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| || |||||| |||| ||||||    
T  283308 aaaggttcgtttactaaaatttagaatttttt-aacatgaaataaattaaatatgaatttttttaaaagacaaaagttcaaaataaaagtaacaaaaatc 283406  T
Q  204 tggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttcaaaaactcaagagttta 303  Q
    |||||| |  |||  | |||||  | |||||||||||||  || |||| || || ||||||| |  | ||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  283407 tggacgcaggaatacaattttgagataattttttgcagataaaattttcgtgatgttcttaatacttgtgcaaaaaattgttcaaaatcttaaaagttta 283506  T
Q  304 aacataaattaaacaaattt 323  Q
    | ||| ||||||||||||||    
T  283507 agcat-aattaaacaaattt 283525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 225
Target Start/End: Original strand, 47860 - 48041
Alignment:
Q  43 taattatccttaaactcttaaatttttgaacgannnnnnngacacaaggttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacat 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |       || ||||| |||||||| ||  | |||||| ||| |||||||||||||       |||||    
T  47860 taattatccttaaactcttaaatttttgaacaattttcttgagacaagtttagaacattacaagaggttcgttttctaaaatttagaatttttt-aacat 47958  T
Q  143 gaaacgaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaa-atctggacgtataaatcaatttttg 225  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| || |||||    
T  47959 gaaatgaattaaatataaatttttt-aaacgacaaaagttcaagataaaagtaacaaatatccggacgtagaaataaaattttg 48041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0245 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0245
Description:

Target: scaffold0245; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 328
Target Start/End: Original strand, 24927 - 25066
Alignment:
Q  188 taaaattaacaaaa-tctggacgtataaatcaatttttgcaacaattttttgcagaggaacttttagtaatattcttaacatgtttgcaaaaaattgttc 286  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||  | |||| | ||  || ||||| |||||||| || |||| || || |||||||||| |||    
T  24927 taaaattaacaaaaatttggacgtagaaatcaaattttgagataattatatgaggatgaactcttagtaatgtt-ttaatattttagcaaaaaattattc 25025  T
Q  287 aaaaactcaagagtttaaacataaattaaacaaatttgaatt 328  Q
    ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25026 aaaaatttaagagtttaaacat-aattaaacaaatttgaatt 25066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 52586 - 52512
Alignment:
Q  92 ttagaacactatgaaaggttcatttactaaaatttagaannnnnnnaacatgaaacgaattaaatatgaatttttt 167  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |       ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  52586 ttagaacattataaaaggttcatttactaaaatttag-atttttttaacttgaaatgaattaaatatgaatttttt 52512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 201
Target Start/End: Original strand, 123298 - 123351
Alignment:
Q  148 gaattaaatatgaattttttaaaacaacaaaagttaaagataaaattaacaaaa 201  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  123298 gaattaaatataaattttttcaaacagcaaatgtttaagataaaagtaacaaaa 123351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1211 times since January 2019
Visitors: 4407