View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0676_low_3 (Length: 549)

Name: NF0676_low_3
Description: NF0676
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0676_low_3
NF0676_low_3
[»] chr4 (64 HSPs)
chr4 (37-542)||(16522748-16523252)
chr4 (101-529)||(8044935-8045365)
chr4 (37-366)||(9295624-9295953)
chr4 (161-534)||(14500046-14500418)
chr4 (168-534)||(32460537-32460890)
chr4 (101-529)||(19697217-19697633)
chr4 (101-529)||(19707802-19708218)
chr4 (101-348)||(14996122-14996368)
chr4 (87-352)||(9795195-9795461)
chr4 (436-542)||(9795533-9795639)
chr4 (436-542)||(19020793-19020899)
chr4 (221-371)||(14951875-14952025)
chr4 (84-183)||(7132244-7132342)
chr4 (221-371)||(5682519-5682669)
chr4 (221-371)||(15272304-15272454)
chr4 (202-372)||(19559457-19559623)
chr4 (37-218)||(7185981-7186159)
chr4 (256-371)||(25119199-25119314)
chr4 (205-407)||(34177595-34177797)
chr4 (130-252)||(22738293-22738414)
chr4 (72-248)||(20000690-20000864)
chr4 (65-218)||(7964848-7965000)
chr4 (113-235)||(15044834-15044955)
chr4 (209-370)||(49071788-49071949)
chr4 (73-218)||(40905071-40905214)
chr4 (113-235)||(15109469-15109590)
chr4 (65-186)||(19821944-19822065)
chr4 (115-359)||(54398391-54398634)
chr4 (115-358)||(18238154-18238396)
chr4 (72-235)||(41166066-41166228)
chr4 (436-510)||(15674967-15675041)
chr4 (437-534)||(22738577-22738675)
chr4 (64-216)||(41256508-41256660)
chr4 (436-509)||(40885418-40885491)
chr4 (437-510)||(55376452-55376525)
chr4 (113-216)||(15013421-15013523)
chr4 (65-215)||(18276392-18276541)
chr4 (436-510)||(10104128-10104202)
chr4 (436-510)||(15135865-15135939)
chr4 (436-510)||(15272169-15272243)
chr4 (272-346)||(21417471-21417545)
chr4 (438-534)||(18248527-18248624)
chr4 (436-477)||(33241011-33241052)
chr4 (439-510)||(31132628-31132699)
chr4 (436-510)||(13246737-13246811)
chr4 (65-138)||(37957241-37957314)
chr4 (113-235)||(38764715-38764836)
chr4 (167-252)||(26339081-26339165)
chr4 (282-358)||(12133606-12133682)
chr4 (85-149)||(32460890-32460953)
chr4 (436-468)||(54118168-54118200)
chr4 (436-534)||(8378493-8378592)
chr4 (72-186)||(14901197-14901311)
chr4 (398-468)||(14996409-14996477)
chr4 (84-185)||(16732146-16732247)
chr4 (115-217)||(50220078-50220179)
chr4 (113-235)||(52265628-52265749)
chr4 (436-469)||(7850314-7850347)
chr4 (87-218)||(13442813-13442946)
chr4 (436-469)||(14952085-14952118)
chr4 (436-469)||(16609012-16609045)
chr4 (436-469)||(26680517-26680550)
chr4 (436-468)||(16327840-16327872)
chr4 (167-211)||(22352197-22352241)
[»] chr5 (50 HSPs)
chr5 (37-510)||(108686-109158)
chr5 (72-529)||(9730216-9730672)
chr5 (109-534)||(7528902-7529326)
chr5 (37-371)||(16105573-16105906)
chr5 (101-534)||(17909500-17909921)
chr5 (202-371)||(21650789-21650958)
chr5 (221-371)||(2031923-2032073)
chr5 (221-371)||(11342798-11342948)
chr5 (207-509)||(25004915-25005210)
chr5 (221-371)||(21205039-21205189)
chr5 (72-248)||(10778085-10778259)
chr5 (436-529)||(34939595-34939688)
chr5 (254-370)||(22662668-22662784)
chr5 (72-183)||(23514528-23514638)
chr5 (38-120)||(11583982-11584063)
chr5 (65-235)||(7728378-7728547)
chr5 (64-218)||(24084034-24084187)
chr5 (436-510)||(27182429-27182503)
chr5 (101-218)||(29917958-29918075)
chr5 (113-218)||(23493925-23494029)
chr5 (64-218)||(6456580-6456734)
chr5 (438-510)||(18530946-18531018)
chr5 (65-218)||(21616974-21617126)
chr5 (436-510)||(22053711-22053785)
chr5 (436-510)||(23507270-23507344)
chr5 (440-510)||(32951016-32951086)
chr5 (433-510)||(23981363-23981440)
chr5 (113-225)||(23981646-23981757)
chr5 (65-218)||(37983325-37983474)
chr5 (64-185)||(1168373-1168495)
chr5 (64-185)||(3673818-3673940)
chr5 (38-76)||(24225596-24225634)
chr5 (64-235)||(5450963-5451134)
chr5 (84-185)||(11337355-11337455)
chr5 (65-102)||(32966399-32966436)
chr5 (438-510)||(2032135-2032207)
chr5 (84-235)||(19862186-19862336)
chr5 (115-358)||(21109758-21110000)
chr5 (123-218)||(26559952-26560046)
chr5 (436-469)||(16105967-16106000)
chr5 (436-469)||(20623286-20623319)
chr5 (436-469)||(21233441-21233474)
chr5 (73-137)||(22882391-22882455)
chr5 (167-252)||(23328619-23328703)
chr5 (167-252)||(24616223-24616307)
chr5 (167-252)||(24712599-24712683)
chr5 (167-252)||(24745617-24745701)
chr5 (436-469)||(25900319-25900352)
chr5 (436-469)||(37053061-37053094)
chr5 (115-183)||(19873852-19873920)
[»] chr2 (50 HSPs)
chr2 (37-467)||(24826615-24827044)
chr2 (85-529)||(17204309-17204753)
chr2 (85-534)||(28031068-28031516)
chr2 (37-371)||(25212977-25213311)
chr2 (129-510)||(33128067-33128446)
chr2 (101-371)||(15633208-15633477)
chr2 (436-542)||(7507683-7507789)
chr2 (37-235)||(19433452-19433649)
chr2 (436-542)||(23777888-23777994)
chr2 (221-371)||(22274835-22274985)
chr2 (65-186)||(3409-3529)
chr2 (72-183)||(12636047-12636157)
chr2 (72-183)||(42178148-42178258)
chr2 (221-371)||(9652888-9653038)
chr2 (72-248)||(12641757-12641931)
chr2 (72-183)||(8943813-8943923)
chr2 (221-371)||(21274041-21274191)
chr2 (72-248)||(3798718-3798892)
chr2 (203-370)||(7321612-7321779)
chr2 (257-371)||(22284104-22284218)
chr2 (37-235)||(43645824-43646020)
chr2 (64-218)||(24884643-24884796)
chr2 (436-510)||(25265261-25265335)
chr2 (437-534)||(5888480-5888578)
chr2 (437-534)||(21142203-21142301)
chr2 (436-510)||(24341267-24341341)
chr2 (115-346)||(9636753-9636983)
chr2 (87-241)||(19669222-19669376)
chr2 (436-510)||(463043-463117)
chr2 (85-186)||(25305423-25305524)
chr2 (68-235)||(67952-68119)
chr2 (167-252)||(5888740-5888824)
chr2 (437-510)||(32466177-32466249)
chr2 (436-468)||(19794629-19794661)
chr2 (64-186)||(25265573-25265695)
chr2 (115-218)||(6094724-6094826)
chr2 (436-510)||(9652754-9652828)
chr2 (436-510)||(22863235-22863309)
chr2 (84-185)||(28974026-28974127)
chr2 (436-469)||(14906353-14906386)
chr2 (167-252)||(23774198-23774282)
chr2 (436-469)||(23820388-23820421)
chr2 (113-186)||(23821773-23821846)
chr2 (113-186)||(23830852-23830925)
chr2 (113-218)||(24277767-24277871)
chr2 (113-186)||(24294691-24294764)
chr2 (436-469)||(36982363-36982396)
chr2 (65-140)||(722353-722428)
chr2 (436-468)||(19689315-19689347)
chr2 (436-468)||(22284278-22284310)
[»] chr6 (53 HSPs)
chr6 (37-542)||(18823209-18823712)
chr6 (37-542)||(18839064-18839567)
chr6 (101-526)||(32276601-32277024)
chr6 (37-371)||(4991002-4991335)
chr6 (89-529)||(19629314-19629740)
chr6 (109-352)||(16299991-16300234)
chr6 (37-371)||(18583264-18583580)
chr6 (221-371)||(26089848-26089998)
chr6 (202-370)||(22585539-22585707)
chr6 (202-370)||(22590370-22590538)
chr6 (221-371)||(18002488-18002638)
chr6 (221-371)||(35015149-35015299)
chr6 (398-529)||(16299825-16299953)
chr6 (436-534)||(13620644-13620743)
chr6 (72-183)||(16231859-16231969)
chr6 (72-183)||(18087002-18087112)
chr6 (72-183)||(13620973-13621083)
chr6 (202-370)||(15004900-15005067)
chr6 (202-370)||(15889699-15889867)
chr6 (254-371)||(19983284-19983401)
chr6 (254-371)||(15742211-15742329)
chr6 (221-371)||(23995036-23995186)
chr6 (37-159)||(17083373-17083496)
chr6 (72-248)||(23977736-23977910)
chr6 (438-529)||(15742058-15742150)
chr6 (203-370)||(25640549-25640715)
chr6 (436-529)||(18002333-18002427)
chr6 (72-186)||(18381851-18381965)
chr6 (65-235)||(22361885-22362054)
chr6 (436-510)||(26090059-26090133)
chr6 (87-358)||(19854135-19854405)
chr6 (64-235)||(18398895-18399065)
chr6 (65-218)||(25919571-25919723)
chr6 (436-510)||(23148303-23148377)
chr6 (436-510)||(23153754-23153828)
chr6 (436-510)||(27751742-27751816)
chr6 (436-506)||(35009314-35009384)
chr6 (72-235)||(21623133-21623295)
chr6 (271-358)||(17374924-17375011)
chr6 (76-218)||(33538506-33538647)
chr6 (436-510)||(23995247-23995321)
chr6 (112-218)||(25651242-25651347)
chr6 (64-236)||(34966823-34966995)
chr6 (64-218)||(29605406-29605560)
chr6 (436-510)||(29666181-29666255)
chr6 (436-469)||(1657660-1657693)
chr6 (436-469)||(15862789-15862822)
chr6 (167-252)||(29869886-29869970)
chr6 (87-186)||(33324673-33324772)
chr6 (87-186)||(35136180-35136279)
chr6 (115-218)||(29160440-29160542)
chr6 (436-468)||(1650021-1650053)
chr6 (436-468)||(18583640-18583672)
[»] chr3 (79 HSPs)
chr3 (72-534)||(16933803-16934263)
chr3 (37-529)||(19946629-19947120)
chr3 (109-534)||(14284963-14285387)
chr3 (37-352)||(9303110-9303425)
chr3 (101-352)||(8275855-8276105)
chr3 (85-352)||(11477201-11477467)
chr3 (101-352)||(8268755-8269005)
chr3 (37-371)||(7853913-7854245)
chr3 (37-371)||(54685293-54685625)
chr3 (37-371)||(33341812-33342144)
chr3 (436-542)||(12901933-12902039)
chr3 (436-542)||(15938320-15938426)
chr3 (203-372)||(18970016-18970185)
chr3 (436-542)||(15936478-15936584)
chr3 (64-371)||(30152898-30153205)
chr3 (37-186)||(47784915-47785064)
chr3 (398-534)||(11477029-11477163)
chr3 (202-371)||(38168008-38168177)
chr3 (205-407)||(48421674-48421877)
chr3 (72-183)||(18910960-18911070)
chr3 (221-371)||(45581744-45581894)
chr3 (221-371)||(53771154-53771304)
chr3 (221-371)||(16261566-16261716)
chr3 (254-371)||(55513016-55513133)
chr3 (221-328)||(54038159-54038266)
chr3 (221-371)||(2844304-2844454)
chr3 (221-371)||(3992663-3992813)
chr3 (257-371)||(17955976-17956090)
chr3 (237-371)||(23492502-23492636)
chr3 (473-542)||(9302968-9303036)
chr3 (213-370)||(15550703-15550860)
chr3 (221-371)||(28558284-28558434)
chr3 (64-218)||(12952920-12953074)
chr3 (65-186)||(38811176-38811297)
chr3 (64-218)||(1990759-1990913)
chr3 (64-352)||(6228628-6228916)
chr3 (436-510)||(11986038-11986112)
chr3 (115-358)||(31412330-31412572)
chr3 (271-358)||(12539066-12539153)
chr3 (436-510)||(16261777-16261851)
chr3 (436-509)||(51960990-51961063)
chr3 (85-235)||(17191519-17191668)
chr3 (113-235)||(12488846-12488967)
chr3 (74-215)||(17204667-17204807)
chr3 (65-182)||(34559857-34559974)
chr3 (436-510)||(53771365-53771439)
chr3 (113-218)||(4162342-4162446)
chr3 (167-358)||(10912945-10913136)
chr3 (254-358)||(38375693-38375797)
chr3 (287-358)||(37915290-37915361)
chr3 (115-218)||(41661573-41661675)
chr3 (436-510)||(2050115-2050189)
chr3 (73-186)||(9590922-9591035)
chr3 (436-510)||(38168237-38168311)
chr3 (436-510)||(54651764-54651838)
chr3 (87-235)||(3576558-3576705)
chr3 (436-469)||(13839200-13839233)
chr3 (271-352)||(14177021-14177102)
chr3 (65-102)||(17960565-17960602)
chr3 (436-468)||(15857163-15857195)
chr3 (410-469)||(8268649-8268708)
chr3 (410-469)||(8275749-8275808)
chr3 (271-358)||(17393597-17393684)
chr3 (84-185)||(14295415-14295516)
chr3 (436-510)||(33342204-33342278)
chr3 (115-358)||(43427510-43427753)
chr3 (436-469)||(2449151-2449184)
chr3 (113-186)||(11061174-11061247)
chr3 (85-185)||(11329130-11329230)
chr3 (436-469)||(14842486-14842519)
chr3 (85-185)||(17139486-17139586)
chr3 (436-469)||(17912397-17912430)
chr3 (436-469)||(19260748-19260781)
chr3 (436-469)||(23492696-23492729)
chr3 (436-468)||(7854305-7854337)
chr3 (87-186)||(14080489-14080588)
chr3 (436-468)||(15615137-15615169)
chr3 (436-468)||(17955884-17955916)
chr3 (64-218)||(33369045-33369199)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (101-534)||(6043-6477)
[»] chr8 (56 HSPs)
chr8 (72-529)||(3431114-3431570)
chr8 (85-534)||(22886305-22886753)
chr8 (85-534)||(21494290-21494725)
chr8 (101-527)||(18612401-18612815)
chr8 (101-529)||(22147433-22147849)
chr8 (101-352)||(18619306-18619556)
chr8 (101-352)||(2544944-2545191)
chr8 (415-542)||(16038713-16038839)
chr8 (398-542)||(2545229-2545371)
chr8 (202-371)||(22321438-22321607)
chr8 (72-183)||(13721107-13721217)
chr8 (202-372)||(24385743-24385913)
chr8 (221-371)||(41506801-41506951)
chr8 (221-371)||(39115388-39115538)
chr8 (232-352)||(16038892-16039012)
chr8 (206-372)||(17502259-17502425)
chr8 (210-370)||(21259484-21259644)
chr8 (64-218)||(33528383-33528535)
chr8 (257-371)||(274592-274706)
chr8 (257-371)||(641143-641257)
chr8 (257-371)||(826949-827063)
chr8 (65-218)||(5854572-5854724)
chr8 (72-235)||(21198272-21198434)
chr8 (65-218)||(38533607-38533759)
chr8 (206-370)||(4233953-4234117)
chr8 (72-248)||(16873166-16873340)
chr8 (72-235)||(23837163-23837325)
chr8 (221-333)||(24716892-24717004)
chr8 (205-370)||(23217974-23218139)
chr8 (65-218)||(26011452-26011604)
chr8 (73-218)||(27233204-27233348)
chr8 (64-218)||(18261608-18261762)
chr8 (65-186)||(22736006-22736127)
chr8 (65-218)||(15933256-15933408)
chr8 (436-510)||(24385610-24385684)
chr8 (73-218)||(33611190-33611334)
chr8 (436-510)||(43373350-43373424)
chr8 (64-218)||(18041669-18041823)
chr8 (115-358)||(22497206-22497448)
chr8 (73-215)||(37653756-37653895)
chr8 (426-468)||(16404900-16404942)
chr8 (124-218)||(38635785-38635878)
chr8 (87-218)||(45465263-45465393)
chr8 (115-218)||(45559074-45559176)
chr8 (436-466)||(17345887-17345917)
chr8 (436-506)||(41506671-41506741)
chr8 (436-469)||(5238404-5238437)
chr8 (437-510)||(7000478-7000551)
chr8 (64-218)||(22742717-22742874)
chr8 (436-469)||(22907127-22907160)
chr8 (436-469)||(24661161-24661194)
chr8 (436-469)||(31194216-31194249)
chr8 (85-185)||(39446935-39447034)
chr8 (436-469)||(43685863-43685896)
chr8 (288-352)||(22887941-22888005)
chr8 (436-468)||(24716762-24716794)
[»] chr7 (63 HSPs)
chr7 (72-529)||(371055-371511)
chr7 (436-542)||(18253685-18253792)
chr7 (436-542)||(15862226-15862332)
chr7 (72-183)||(18980200-18980310)
chr7 (221-371)||(126528-126678)
chr7 (72-183)||(14251077-14251187)
chr7 (221-371)||(111261-111411)
chr7 (221-371)||(2029034-2029184)
chr7 (221-371)||(32494038-32494188)
chr7 (72-183)||(15927535-15927645)
chr7 (221-371)||(42056281-42056431)
chr7 (435-534)||(47480878-47480977)
chr7 (200-370)||(13352044-13352214)
chr7 (37-185)||(7284229-7284376)
chr7 (221-367)||(2190182-2190328)
chr7 (202-371)||(3049677-3049845)
chr7 (72-248)||(13758337-13758511)
chr7 (37-186)||(14272054-14272203)
chr7 (206-359)||(39291513-39291666)
chr7 (282-371)||(1937009-1937098)
chr7 (72-235)||(17224058-17224220)
chr7 (65-218)||(48356602-48356754)
chr7 (64-235)||(13377485-13377656)
chr7 (436-510)||(13321334-13321408)
chr7 (65-186)||(16915096-16915217)
chr7 (436-510)||(25124450-25124524)
chr7 (202-372)||(15977832-15978002)
chr7 (284-358)||(17984753-17984827)
chr7 (65-218)||(34241325-34241477)
chr7 (437-529)||(10000225-10000318)
chr7 (113-218)||(15358803-15358907)
chr7 (436-510)||(2029244-2029318)
chr7 (64-218)||(4446168-4446322)
chr7 (436-510)||(36052971-36053045)
chr7 (436-510)||(42056146-42056220)
chr7 (167-252)||(10000480-10000564)
chr7 (113-218)||(20583691-20583795)
chr7 (437-529)||(48622521-48622614)
chr7 (271-358)||(8563344-8563431)
chr7 (64-358)||(14935319-14935610)
chr7 (64-358)||(15362912-15363203)
chr7 (115-218)||(17947729-17947831)
chr7 (436-510)||(11580619-11580693)
chr7 (436-510)||(13036896-13036970)
chr7 (436-510)||(15709469-15709543)
chr7 (436-510)||(16212071-16212145)
chr7 (437-534)||(16418805-16418903)
chr7 (124-218)||(31501190-31501283)
chr7 (167-252)||(16418559-16418643)
chr7 (64-358)||(38424175-38424469)
chr7 (87-218)||(13448964-13449094)
chr7 (87-218)||(28390292-28390422)
chr7 (436-506)||(36024452-36024523)
chr7 (113-215)||(4484733-4484834)
chr7 (84-181)||(11287394-11287491)
chr7 (436-469)||(7293333-7293366)
chr7 (436-469)||(11516544-11516577)
chr7 (85-185)||(13274765-13274865)
chr7 (436-469)||(14113902-14113935)
chr7 (436-469)||(15441477-15441510)
chr7 (436-469)||(30262042-30262075)
chr7 (436-468)||(111169-111201)
chr7 (284-328)||(15575876-15575920)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (109-534)||(5224-5647)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (68-534)||(5411-5875)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (127-542)||(61048-61461)
scaffold0023 (436-510)||(48903-48977)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (101-534)||(17695-18124)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (37-371)||(130486-130819)
scaffold0028 (87-245)||(79519-79677)
scaffold0028 (436-510)||(89336-89410)
scaffold0028 (436-510)||(107666-107740)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (72-436)||(21649967-21650329)
chr1 (130-350)||(20254336-20254556)
chr1 (398-542)||(20254595-20254736)
chr1 (221-371)||(15861418-15861568)
chr1 (72-183)||(17148534-17148644)
chr1 (231-371)||(22367141-22367281)
chr1 (221-371)||(21860124-21860274)
chr1 (237-371)||(44034963-44035097)
chr1 (72-235)||(20177140-20177302)
chr1 (64-358)||(40436266-40436560)
chr1 (73-216)||(21194980-21195122)
chr1 (65-140)||(27674755-27674829)
chr1 (436-510)||(20893509-20893583)
chr1 (113-186)||(36356461-36356534)
chr1 (66-140)||(22829638-22829712)
chr1 (65-140)||(38033888-38033962)
chr1 (72-186)||(41229107-41229221)
chr1 (72-185)||(13377009-13377122)
chr1 (65-218)||(17608886-17609038)
chr1 (436-510)||(20913335-20913409)
chr1 (65-186)||(37234028-37234149)
chr1 (167-252)||(7641044-7641128)
chr1 (113-218)||(8538047-8538151)
chr1 (113-218)||(8603286-8603390)
chr1 (65-102)||(19603055-19603092)
chr1 (87-218)||(49997418-49997548)
chr1 (268-358)||(20194185-20194276)
chr1 (151-218)||(52400675-52400741)
chr1 (436-510)||(20931650-20931724)
chr1 (268-358)||(25094019-25094109)
chr1 (436-510)||(37844332-37844406)
chr1 (167-252)||(22035509-22035593)
chr1 (73-185)||(51627833-51627945)
chr1 (436-468)||(41394527-41394559)
chr1 (272-328)||(41931279-41931335)
chr1 (436-468)||(45051726-45051758)
[»] scaffold0118 (2 HSPs)
scaffold0118 (168-534)||(34242-34607)
scaffold0118 (85-149)||(34607-34670)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (169-469)||(17208-17506)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (100-529)||(164810-165224)
scaffold0001 (436-510)||(172210-172284)
scaffold0001 (436-510)||(177913-177987)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (85-350)||(49860-50124)
scaffold0029 (398-534)||(49686-49820)
[»] scaffold0162 (5 HSPs)
scaffold0162 (101-355)||(11740-11992)
scaffold0162 (436-510)||(12063-12137)
scaffold0162 (436-509)||(8051-8125)
scaffold0162 (436-510)||(26298-26372)
scaffold0162 (121-186)||(8360-8425)
[»] scaffold0032 (6 HSPs)
scaffold0032 (436-534)||(13201-13299)
scaffold0032 (72-251)||(13395-13575)
scaffold0032 (221-371)||(55694-55844)
scaffold0032 (436-510)||(108033-108107)
scaffold0032 (436-510)||(55904-55978)
scaffold0032 (65-186)||(93940-94061)
[»] scaffold0574 (2 HSPs)
scaffold0574 (398-534)||(9345-9480)
scaffold0574 (221-352)||(9518-9649)
[»] scaffold0150 (2 HSPs)
scaffold0150 (37-235)||(28466-28663)
scaffold0150 (37-87)||(21637-21687)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (205-407)||(1456-1659)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (436-542)||(108053-108159)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (205-407)||(203-406)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (37-185)||(3230-3377)
[»] scaffold0303 (3 HSPs)
scaffold0303 (221-371)||(20-170)
scaffold0303 (221-371)||(4439-4589)
scaffold0303 (436-534)||(4279-4378)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (398-542)||(48468-48610)
[»] scaffold0706 (2 HSPs)
scaffold0706 (221-371)||(6535-6685)
scaffold0706 (436-510)||(6401-6475)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (436-534)||(41965-42063)
[»] scaffold0465 (2 HSPs)
scaffold0465 (254-371)||(9975-10092)
scaffold0465 (436-510)||(9840-9914)
[»] scaffold0387 (2 HSPs)
scaffold0387 (436-529)||(7034-7127)
scaffold0387 (113-183)||(1117-1187)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (37-181)||(21442-21586)
scaffold0120 (37-185)||(31141-31289)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (436-529)||(34312-34405)
scaffold0075 (72-248)||(4906-5081)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (202-370)||(44107-44275)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (37-185)||(75-222)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (37-185)||(24890-25036)
scaffold0158 (437-510)||(25532-25605)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (221-371)||(13378-13528)
scaffold0251 (436-510)||(13243-13317)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (221-371)||(31272-31422)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (221-371)||(41422-41572)
scaffold0078 (436-469)||(36979-37012)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (37-185)||(283-430)
scaffold0310 (37-114)||(6603-6679)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (231-371)||(30217-30357)
[»] scaffold0686 (3 HSPs)
scaffold0686 (221-371)||(6075-6225)
scaffold0686 (435-468)||(5777-5810)
scaffold0686 (435-468)||(5983-6016)
[»] scaffold0597 (2 HSPs)
scaffold0597 (221-371)||(970-1120)
scaffold0597 (436-510)||(836-910)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (221-371)||(17396-17546)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (257-371)||(15098-15212)
scaffold0175 (436-469)||(881-914)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (221-371)||(79977-80127)
scaffold0034 (113-185)||(40664-40736)
scaffold0034 (436-468)||(80187-80219)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (398-529)||(95262-95392)
scaffold0037 (258-352)||(95129-95223)
[»] scaffold0004 (4 HSPs)
scaffold0004 (221-333)||(193518-193630)
scaffold0004 (221-328)||(186561-186668)
scaffold0004 (64-215)||(27453-27604)
scaffold0004 (436-510)||(193355-193429)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (65-218)||(43935-44087)
scaffold0080 (64-218)||(23809-23963)
[»] scaffold0016 (5 HSPs)
scaffold0016 (231-371)||(162170-162310)
scaffold0016 (231-371)||(166256-166396)
scaffold0016 (72-180)||(116687-116795)
scaffold0016 (436-468)||(162078-162110)
scaffold0016 (436-468)||(166164-166196)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (202-358)||(5977-6133)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (221-371)||(12510-12662)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (257-371)||(443-557)
[»] scaffold0009 (3 HSPs)
scaffold0009 (65-218)||(69415-69567)
scaffold0009 (436-508)||(272330-272402)
scaffold0009 (206-245)||(244920-244959)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (72-235)||(76967-77129)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (436-534)||(3505-3601)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (64-218)||(6500-6654)
scaffold0077 (436-468)||(36837-36869)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (436-534)||(45338-45437)
scaffold0066 (436-529)||(54724-54818)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (65-218)||(2483-2635)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (436-502)||(13824-13890)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (65-186)||(103090-103211)
scaffold0022 (167-358)||(67954-68145)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (113-218)||(4611-4715)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (437-510)||(339-412)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (68-235)||(270-436)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (64-183)||(107967-108086)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (72-235)||(35444-35605)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (144-183)||(1693-1732)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (202-328)||(3876-4002)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (436-510)||(9183-9257)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (40-97)||(12990-13048)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (436-510)||(123045-123119)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (65-186)||(30978-31099)
[»] scaffold0670 (1 HSPs)
scaffold0670 (64-358)||(7672-7966)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (113-186)||(11100-11173)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (437-529)||(11982-12075)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (254-358)||(877-981)
[»] scaffold0253 (2 HSPs)
scaffold0253 (64-214)||(7358-7508)
scaffold0253 (64-214)||(16783-16933)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (87-218)||(37538-37668)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (64-218)||(85489-85643)
scaffold0025 (436-510)||(9160-9234)
scaffold0025 (436-510)||(146906-146980)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (68-186)||(6622-6740)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (123-225)||(2471-2572)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (436-510)||(12418-12492)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (436-510)||(1430-1504)
scaffold0266 (436-510)||(3466-3540)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (436-510)||(57350-57424)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (436-510)||(34033-34107)
scaffold0012 (436-510)||(247324-247398)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (437-534)||(7517-7615)
scaffold0003 (167-252)||(7271-7355)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (64-235)||(2436-2607)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (167-252)||(23859-23943)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (437-529)||(54182-54275)
scaffold0017 (37-77)||(12694-12734)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (115-358)||(3260-3501)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (123-187)||(4579-4643)
scaffold0447 (123-187)||(9193-9257)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (451-529)||(9203-9282)
scaffold0215 (451-529)||(16101-16180)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (167-218)||(22559-22609)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (37-72)||(3392-3427)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (436-511)||(128052-128127)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (65-218)||(197390-197545)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (84-185)||(745-846)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (436-506)||(10218-10288)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (436-510)||(55971-56045)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (84-185)||(109631-109732)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (64-159)||(1337-1433)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (436-469)||(5989-6022)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (84-185)||(11877-11977)
[»] scaffold0195 (1 HSPs)
scaffold0195 (436-465)||(19514-19543)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (167-252)||(6659-6743)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (436-469)||(22857-22890)
scaffold0141 (436-469)||(27112-27145)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (436-469)||(1495-1528)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (85-185)||(33897-33996)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (276-328)||(10994-11046)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (87-186)||(10642-10741)
[»] scaffold0153 (1 HSPs)
scaffold0153 (270-358)||(8652-8740)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (436-472)||(8331-8367)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (113-185)||(33668-33740)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (270-358)||(67894-67982)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 442; Significance: 0; HSPs: 64)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 442; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 542
Target Start/End: Original strand, 16522748 - 16523252
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16522748 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 16522847  T
Q  137 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16522848 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacctcaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 16522947  T
Q  237 agcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcacc 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  16522948 agcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacc 16523047  T
Q  337 aaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcatataaattcttactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaatta 436  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16523048 aaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgc-aaacaaacaatta 16523146  T
Q  437 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccct 536  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16523147 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcataattctccaatcttcaagttttccccct 16523246  T
Q  537 ttgcta 542  Q
    ||||||    
T  16523247 ttgcta 16523252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 101 - 529
Target Start/End: Original strand, 8044935 - 8045365
Alignment:
Q  101 tttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacac 199  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8044935 tttctcatcaacaattcatgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcagcaacaacatcaattggaacttgattcacac 8045034  T
Q  200 ccc--aattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaa 297  Q
     ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8045035 acctcaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattctcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaa 8045134  T
Q  298 ttcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcatataaattcttactcaattaagcactt 397  Q
    |||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  8045135 ttcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatataaattctcacttaattaagcactt 8045234  T
Q  398 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||    
T  8045235 tttcatacaaaccaagaaaaattgc-aaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaattcaaacttagacttca 8045333  T
Q  498 ctttagctcctaattctccaatcttcaagttt 529  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8045334 ctttagctcctaattcttcaatcttcaagttt 8045365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 37 - 366
Target Start/End: Original strand, 9295624 - 9295953
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9295624 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaactcattttacataaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 9295723  T
Q  137 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 236  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9295724 ccataattcattatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 9295823  T
Q  237 agcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcacc 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  9295824 agcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcattaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacc 9295923  T
Q  337 aaaacaagagcacgaaattcaaagattggg 366  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  9295924 aaaacaagagcacgaaaattagagattggg 9295953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 161 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 14500418 - 14500046
Alignment:
Q  161 tctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccatt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14500418 tctcagcaacaacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcacaactacccatt 14500319  T
Q  261 ttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaag 360  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14500318 ttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaataattcatttatcattaaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaag 14500219  T
Q  361 attgggttcatataaattcttactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaaccccc 460  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14500218 attgggttcatataaatacttactcaaacaagcactttttcatacaaacaaag-aaaattgcaagcaaaacaattatgattatgatgaagcctaaccccc 14500120  T
Q  461 ttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 534  Q
    ||||||||| | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14500119 ttaccttagataatgattaatccaaacttaagcttcactttagctcataattcttcaatcttcaagtttccccc 14500046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 168 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 32460890 - 32460537
Alignment:
Q  168 aacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatcc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||             |||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  32460890 aacaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaatccaacaacaacatt------------aattaaccataatttcacaactaccccttttcatac 32460803  T
Q  268 attatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32460802 attatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaaattataaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggt 32460703  T
Q  368 tcatataaattcttactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttacctt 467  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32460702 tcatataaatacttactcaattaagcactatttcatacaatccaag-aaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaagactaacccccttacctt 32460604  T
Q  468 aggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 534  Q
    || | ||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  32460603 agataatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcctaattcttcaatcttcaagtttccccc 32460537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 101 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 19697633 - 19697217
Alignment:
Q  101 tttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacc 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19697633 tttctcaccaacaatcatgatatatgaacacccaagccataat-cataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattaaaacttgattctcacc 19697535  T
Q  201 ccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattc 300  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  19697534 tcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcataacaactcattctcatacattatgaacatgttatttcataactaacaattc 19697435  T
Q  301 atttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattca-aagattgggttcatataaattcttactcaattaagcactttt 399  Q
    ||||| |||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | || | |       ||| ||||| | | |||| || |  |  |    
T  19697434 atttatcattcaattaacatactcaaaattatcaccaaaacaagagcacgaatttaacaacaat-------tatcaattcattc-caatcaacccat--t 19697345  T
Q  400 tcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcact 499  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||    
T  19697344 tcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgattaattcacacttaggcttcact 19697247  T
Q  500 ttagctcctaattctccaatcttcaagttt 529  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19697246 ttacctcctaattcttcaatcttcaagttt 19697217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 101 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 19708218 - 19707802
Alignment:
Q  101 tttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacc 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19708218 tttctcaccaacaatcatgatatatgaacacccaagccataat-cataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattaaaacttgattctcacc 19708120  T
Q  201 ccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattc 300  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  19708119 tcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcataacaactcattctcatacattatgaacatgttatttcataactaacaattc 19708020  T
Q  301 atttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattca-aagattgggttcatataaattcttactcaattaagcactttt 399  Q
    ||||| |||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | || | |       ||| ||||| | | |||| || |  |  |    
T  19708019 atttatcattcaattaacatactcaaaattatcaccaaaacaagagcacgaatttaacaacaat-------tatcaattcattc-caatcaacccat--t 19707930  T
Q  400 tcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcact 499  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||    
T  19707929 tcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgattaattcacacttaggcttcact 19707832  T
Q  500 ttagctcctaattctccaatcttcaagttt 529  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19707831 ttacctcctaattcttcaatcttcaagttt 19707802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 101 - 348
Target Start/End: Original strand, 14996122 - 14996368
Alignment:
Q  101 tttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacc 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14996122 tttctcaccaacaatcatgatatatgaacacccaagccataat-cataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattaaaacttgattctcacc 14996220  T
Q  201 ccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattc 300  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14996221 tcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 14996320  T
Q  301 atttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagca 348  Q
     |||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14996321 ttttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagca 14996368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 87 - 352
Target Start/End: Original strand, 9795195 - 9795461
Alignment:
Q  87 caacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct---cagcaacaacaacatcaatt 183  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |   || |||||||||||||||||    
T  9795195 caacaacaattcattt-ctcaacaacaatcatgatatatcaacacccaagccataa-tcataaacaacaacatgtatcaacaacaacaacaacatcaatt 9795292  T
Q  184 gaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttat 283  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||| |  |||||||||||||||||    
T  9795293 gaaacttgatttccacctcaattcaacaacaacatgtcataattcaccaattaaacataatttcacaactactcattttgacacattatgaacatgttat 9795392  T
Q  284 ttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 352  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9795393 ttcatcaccaagaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 9795461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 436 - 542
Target Start/End: Original strand, 9795533 - 9795639
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 535  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9795533 atgattatgatgataactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 9795632  T
Q  536 tttgcta 542  Q
    |||||||    
T  9795633 tttgcta 9795639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 436 - 542
Target Start/End: Original strand, 19020793 - 19020899
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 535  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  19020793 atgattatgatggtaactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcaccttagctcctaattctccaatcttcaagtttccccct 19020892  T
Q  536 tttgcta 542  Q
    |||||||    
T  19020893 tttgcta 19020899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Original strand, 14951875 - 14952025
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14951875 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 14951974  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    |||||||| |||| | | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  14951975 attcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 14952025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 84 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 7132342 - 7132244
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaatt 183  Q
    ||||||||||| || |||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7132342 caccaacaacatcttattt-ctcatcaacaattatggtatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaatt 7132244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 5682669 - 5682519
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| ||||| |||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5682669 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccaatttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 5682570  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    |||||||| |||| | |  |||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5682569 attcaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 5682519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 15272454 - 15272304
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  15272454 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccattcgtttaacatcaaattaacat 15272355  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    || ||||| |||| | | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  15272354 atccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 15272304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 202 - 372
Target Start/End: Original strand, 19559457 - 19559623
Alignment:
Q  202 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaa-caacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||    | |||| ||||||||| ||||| | |||||||| ||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19559457 caattcaacaacaacatgtcataa----taaattgagcataatt-cacaaactacccatttacatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattc 19559551  T
Q  301 atttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcata 372  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| | |||| ||||| ||| ||||||  |||||| ||||    
T  19559552 aattaacatcaaattaacatgctcaaacatatcactacaacatgagcaggaatttcaaaagttgggtacata 19559623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7186159 - 7185981
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacaccca 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||| | |||| || ||| ||||||| ||| ||||||||    
T  7186159 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttcacaaaaaca---acaacaactcatat-ctcatcatcaaatcatgatttataaacaccca 7186064  T
Q  135 agccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
    |||||| | |||| | ||| || || ||| ||||||||||||||||||| |||| ||| || || | |||||||||||||||||    
T  7186063 agccatgaatcatcaacaataatatctcttagcaacaacaacatcaatt-aaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat 7185981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 256 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 25119314 - 25119199
Alignment:
Q  256 ccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaatt 355  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |  |||  |||||||| ||    
T  25119314 ccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacgaattt 25119215  T
Q  356 caaagattgggttcat 371  Q
      ||||||||||||||    
T  25119214 tcaagattgggttcat 25119199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 205 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 34177797 - 34177595
Alignment:
Q  205 ttcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcattt 304  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||| | |||| ||||||||  || ||| |||||||||  |||| ||||||||||||||| ||    
T  34177797 ttcaacaacaacaagtcataattcaccaattgaacataatt-ctcaactacccatttatatacatcatgaacatgcaattttatcatcaacaattcaatt 34177699  T
Q  305 aacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttca-tataaattcttactcaattaagcactttttcat 403  Q
    | |||  |||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||| ||  |||||||| ||||  ||||   |||| |||||||||||||| |||||    
T  34177698 atcatgtaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaattttcaagattggattcacaataatcacttattcaattaagcacttattcat 34177599  T
Q  404 acaa 407  Q
    ||||    
T  34177598 acaa 34177595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 130 - 252
Target Start/End: Original strand, 22738293 - 22738414
Alignment:
Q  130 acccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtca 229  Q
    ||||||| |||||||||   |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||||  ||    
T  22738293 acccaagtcataattcaccctcaacaacatgtctaagcaacaacaacatccattggaacttgattcaca-ctcaattcaataacaactcatcataaacca 22738391  T
Q  230 tcaattaagcataatttcacaac 252  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22738392 tcaattaagcataatttcacaac 22738414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 248
Target Start/End: Original strand, 20000690 - 20000864
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 171  Q
    |||| |||||| |||||| |||| || |||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20000690 atttcacaaaaccaccaataacatcttattt-ctcatcaacaattatggtatatgaacacccaagcctcaaatcatactcaacaacatatctcagcaaca 20000788  T
Q  172 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttca 248  Q
    |||||||| ||| | |  ||||| ||| | || |||||| | ||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  20000789 acaacatcgatt-acatatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttca 20000864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7965000 - 7964848
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 163  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||| ||||||||| |||||||| | |||| | |||||| ||  ||    
T  7965000 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactca-tttctcatcatcaaatcatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcact 7964902  T
Q  164 cagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
     ||||||||||| ||||||| |||| |||||| || |  ||||||||||||||||    
T  7964901 tagcaacaacaaaatcaatt-aaacatgattctcatcataattcaacaacaacat 7964848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 235
Target Start/End: Original strand, 15044834 - 15044955
Alignment:
Q  113 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaa 212  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||| | ||| ||  | | |||||||||||    
T  15044834 aatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaa-catgaatcttatcacaattcaacaa 15044932  T
Q  213 caacatgtcataagtcatcaatt 235  Q
    ||||||  ||||| |||||||||    
T  15044933 caacatagcataattcatcaatt 15044955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 370
Target Start/End: Original strand, 49071788 - 49071949
Alignment:
Q  209 acaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttca-caacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaac 307  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||  |  ||| | |||  || |||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||    
T  49071788 acaacaacatgtcataattcatcaattgagcata-tttcatcaagtattcatatacatatatcatgaacatgcaatttcatcatcaataattcaattaac 49071886  T
Q  308 atcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttca 370  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| | || | ||||||||| ||||| | |||||||||    
T  49071887 atcaaattaacatactcaaacatatcactacaatatgagcacgaatttcaacggttgggttca 49071949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 40905214 - 40905071
Alignment:
Q  73 ttttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 171  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||  | |||| | |||||| || ||| |||||||    
T  40905214 ttttacaaaaccaacaacaacaacttattt-ctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccacgagtcatcaacaacaatatctcttagcaaca 40905116  T
Q  172 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
    ||||||||||||  ||| |||||| || | |||||||||||||||||    
T  40905115 acaacatcaatt--aacatgattctcatcacaattcaacaacaacat 40905071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15109590 - 15109469
Alignment:
Q  113 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaa 212  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||| | ||| ||  | | |||||||||||    
T  15109590 aatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacattacttagcaacaacaacatcaattgaa-catgaatcttatcacaattcaacaa 15109492  T
Q  213 caacatgtcataagtcatcaatt 235  Q
    ||||||  ||||| | |||||||    
T  15109491 caacatagcataatttatcaatt 15109469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 19822065 - 19821944
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 163  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||| | |||| | |||||||||  |     
T  19822065 tcaactcattttacaaagtcaccaaaaacaactcattt-ctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcaca 19821967  T
Q  164 cagcaacaacaacatcaattgaa 186  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  19821966 tagcaacaacaacatcaattgaa 19821944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 359
Target Start/End: Original strand, 54398391 - 54398634
Alignment:
Q  115 tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaaca 214  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| | |||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | ||| |||||||||    
T  54398391 tcatgatttataaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaaatcaacaaca 54398489  T
Q  215 acatgtcataagtcatcaatta-agcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaa 313  Q
    ||||  || || ||| |||||| |||| || ||||||| |    ||||||||  | ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||| || |||     
T  54398490 acataacacaattcaacaattagagcacaa-ttcacaatatattattttcatatactatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaat 54398588  T
Q  314 ttaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaa 359  Q
    || |  || |||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  54398589 ttcatgtactcaaacatatcaacataacaagagcacgaatttcaaa 54398634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 18238396 - 18238154
Alignment:
Q  115 tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaaca 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||    
T  18238396 tcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaaca 18238298  T
Q  215 acatgtcataagtcatcaatta-agcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaa 313  Q
    ||||  || || ||| |||||| |||| || ||||||| |   ||||||||   | ||||||||||  |||||| || |||||||||| ||| || |||     
T  18238297 acatagcacaattcaacaattagagcacaa-ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaat 18238199  T
Q  314 ttaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaa 358  Q
     | |  ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  18238198 atcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 18238154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41166228 - 41166066
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaac 170  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||| |||| |  |||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||  || ||||||    
T  41166228 atttcacaaaaccacccacaacaactcattt-ctcatcaacaaatcataagttatgaatacccaagccatgattcatcaacaacaacatcacttagcaac 41166130  T
Q  171 aacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 235  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||   || |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  41166129 aacaacatcaattgaa-catgactcttgccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 41166066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 15675041 - 15674967
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    |||||  |||||||||||||||||||    
T  15675041 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcactttagctcctaa 15674967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 437 - 534
Target Start/End: Original strand, 22738577 - 22738675
Alignment:
Q  437 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttttcccc 534  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| | |||   |||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  22738577 tgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaattgcttcaatcttcaagtttccccc 22738675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41256660 - 41256508
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 161  Q
    ||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| ||||||||||||| |||| | |||| | |||||| || |    
T  41256660 atcaacccatttttataaaaccaacaacaacaactcattt-ctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatct 41256562  T
Q  162 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaac 216  Q
    || | ||||||||||||||||| |||| || ||| || | |||||||||||||||    
T  41256561 cttaacaacaacaacatcaatt-aaacatggttctcatcacaattcaacaacaac 41256508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 40885491 - 40885418
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctccta 509  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  40885491 atgattatgatgaattctaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcactttagctccta 40885418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 437 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 55376525 - 55376452
Alignment:
Q  437 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  55376525 tgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaggatcaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 55376452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15013523 - 15013421
Alignment:
Q  113 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaa 212  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| || ||| | ||||||||| ||||||| |||| |||||| || | |||||||||||    
T  15013523 aatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaatatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaa 15013425  T
Q  213 caac 216  Q
    ||||    
T  15013424 caac 15013421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 215
Target Start/End: Original strand, 18276392 - 18276541
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 163  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |  |||| |  ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  ||    
T  18276392 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaata-ctcatcgtcaaatcatgatttatgaacacccaagccatcaatcatcaacaacaatatcact 18276490  T
Q  164 cagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa 215  Q
      ||||||||||||||||||| ||| ||| || || | ||||||||||||||    
T  18276491 ttgcaacaacaacatcaattg-aacatgaatctcatcacaattcaacaacaa 18276541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 10104202 - 10104128
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    |||||  |||| ||||||||||||||    
T  10104202 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggctttactttagctcctaa 10104128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 15135939 - 15135865
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  15135939 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 15135865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 15272243 - 15272169
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  15272243 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 15272169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 346
Target Start/End: Original strand, 21417471 - 21417545
Alignment:
Q  272 tgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagag 346  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  21417471 tgaacatgaaatttcatcatcaacaattcaattatcaacaaattcacatattcaaacatatctctaaaacaagag 21417545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 438 - 534
Target Start/End: Original strand, 18248527 - 18248624
Alignment:
Q  438 gattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttttcccc 534  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||| |||   ||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  18248527 gattatgataataactaacccccttaccttagatgatgattaatcttaacttaagcttcactttaactcctaattgcttcaatcttcaagtttccccc 18248624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 477
Target Start/End: Original strand, 33241011 - 33241052
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgat 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33241011 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgat 33241052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 439 - 510
Target Start/End: Original strand, 31132628 - 31132699
Alignment:
Q  439 attatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    |||||  ||| |||||||||||||||    
T  31132628 attatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggctccactttagctcctaa 31132699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Original strand, 13246737 - 13246811
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  13246737 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 13246811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 37957314 - 37957241
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagcc 138  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||  |||| |||||||||||    
T  37957314 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactca-tttatcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagcc 37957241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 235
Target Start/End: Original strand, 38764715 - 38764836
Alignment:
Q  113 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaa 212  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  || | ||||||||||||||||| |||| |||||| || |  |||| |||||    
T  38764715 aatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattccttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcataattgaacaa 38764813  T
Q  213 caacatgtcataagtcatcaatt 235  Q
    ||||||  ||||| ||| |||||    
T  38764814 caacatcgcataattcaacaatt 38764836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 252
Target Start/End: Original strand, 26339081 - 26339165
Alignment:
Q  167 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaac 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||| ||||| | ||| || |||| ||||||||| |||||||||||    
T  26339081 caacaacaacatccattgaaacttgtttctctcctcaattcaac-acaacttatcacaaatcattaattaagcaaaatttcacaac 26339165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 12133682 - 12133606
Alignment:
Q  282 atttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaa 358  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| |||||| | ||| ||||||| || |||||    
T  12133682 atttcatcattaacaattcaattaacaacaaattaacatacccaaacatatcactacaactagagcaccaatttcaa 12133606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 32460953 - 32460890
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataa 149  Q
    |||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  32460953 accaacaacatctcaatt-ctcaccaacaatcatgatatatgcacacccaagtcataaatcataa 32460890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 54118200 - 54118168
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54118200 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 54118168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 534
Target Start/End: Original strand, 8378493 - 8378592
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttttcccc 534  Q
    ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| | ||| | |||   ||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  8378493 atgattatgataataactaatccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaagcttcactttaactcctaattgcttcaatcttcaagtttccccc 8378592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 14901197 - 14901311
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaac 170  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| || ||| ||||||  |||| ||||||| | ||| | |||| | ||||| |||  || ||||||    
T  14901197 attttacaaaaccaccaacaacaaccca-tttctcatcatcaattcatgaattatgcacacccatgtcatgaatcatcaacaacagcatcacttagcaac 14901295  T
Q  171 aacaacatcaattgaa 186  Q
    ||||||||||||||||    
T  14901296 aacaacatcaattgaa 14901311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 468
Target Start/End: Original strand, 14996409 - 14996477
Alignment:
Q  398 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttacctta 468  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  14996409 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgataataactaacccccttacctta 14996477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 185
Target Start/End: Original strand, 16732146 - 16732247
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaat 182  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   ||| | ||||||||||| | | || |||||||||||  || ||||||||| ||||||||    
T  16732146 caccaacaacatctcattt-ctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacgacatcaat 16732244  T
Q  183 tga 185  Q
    |||    
T  16732245 tga 16732247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 50220179 - 50220078
Alignment:
Q  115 tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaaca 214  Q
    ||||||| ||||||||||||| | || | |||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | ||| |||||||||    
T  50220179 tcatgatttatgaacacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaaatcaacaaca 50220081  T
Q  215 aca 217  Q
    |||    
T  50220080 aca 50220078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 52265749 - 52265628
Alignment:
Q  113 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaa 212  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| | |||| | || ||| ||  || |||||||||||||||||||||| | ||| ||  | | |||||||||||    
T  52265749 aatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacatcaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa-catgaatcttatcacaattcaacaa 52265651  T
Q  213 caacatgtcataagtcatcaatt 235  Q
    ||||||  ||||| ||| |||||    
T  52265650 caacattgcataattcaacaatt 52265628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Original strand, 7850314 - 7850347
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7850314 atgattatggtgaagactaacccccttaccttag 7850347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13442946 - 13442813
Alignment:
Q  87 caacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct---cagcaacaacaacatcaat 182  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||| ||| || ||||||||||||||| || | |||| | |||||| || |||   || ||||||||||||||||    
T  13442946 caacaacaactcattt-ctcatcatcaattcataatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaaaatctcttaacaacaacaacaacatcaat 13442848  T
Q  183 tgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
    | |||| |||||| || | ||||||||||| |||||    
T  13442847 t-aaacatgattctcatcacaattcaacaataacat 13442813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Original strand, 14952085 - 14952118
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14952085 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 14952118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 16609045 - 16609012
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16609045 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 16609012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Original strand, 26680517 - 26680550
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26680517 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 26680550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 16327872 - 16327840
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 468  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16327872 atgattatgataaagactaacccccttacctta 16327840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 22352241 - 22352197
Alignment:
Q  167 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaaca 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  22352241 caacaacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaattcaaca 22352197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 50)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 109158 - 108686
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109158 acatcatcaaaatcaaacttcttctctatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 109059  T
Q  137 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109058 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 108959  T
Q  237 agcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcacc 336  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  108958 agcataatttcacaacaatccattttcatacattatgaacatgttaattcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacc 108859  T
Q  337 aaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcatataaattcttactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaatta 436  Q
    ||||||||||||||||| | |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  108858 aaaacaagagcacgaaaattagggattgggttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgc-aaacaaacaatta 108760  T
Q  437 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  ||||||||||| |||||||    
T  108759 tgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttacctcctaa 108686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 9730672 - 9730216
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 171  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||    
T  9730672 atttcacaaaaccaccaacaacatcttattt-ctcacaaacaatcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaatatgtctcagcaaca 9730574  T
Q  172 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccatta 271  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9730573 acaacatcaatcgaaacttgattctcaccttaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacatta 9730474  T
Q  272 tgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  9730473 tgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaatcttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 9730374  T
Q  372 ataaattcttactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggt 471  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9730373 atgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgc-aaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggt 9730275  T
Q  472 tatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttt 529  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  9730274 tatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaattgcttcaatcttcaagttt 9730216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 109 - 534
Target Start/End: Original strand, 7528902 - 7529326
Alignment:
Q  109 caacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattca 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  7528902 caacaatcatgatatatgaacacccaagtcataaatcataaacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattca 7529001  T
Q  209 acaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaaca 308  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  7529002 acaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcatacactatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatca 7529101  T
Q  309 tcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcatataaattcttactcaattaagcactttttcatacaaa 408  Q
    |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7529102 ttcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaagggttgggttcatataaatacttactcaattaagcactatttcatacaaa 7529201  T
Q  409 ccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcct 508  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||     
T  7529202 ccaag-aaaattgcaaacaaaacaattatgattatgaagaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcactttagctccc 7529300  T
Q  509 aattctccaatcttcaagttttcccc 534  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||    
T  7529301 aattcttcaatcttcaagtttccccc 7529326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 37 - 371
Target Start/End: Original strand, 16105573 - 16105906
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16105573 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacctaag 16105672  T
Q  137 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16105673 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 16105772  T
Q  237 agcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcacc 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |     
T  16105773 agcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatattatttcatcatcaaccattcatttaacatc-aattaacatatccaaacatatctct 16105871  T
Q  337 aaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16105872 acaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 16105906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 101 - 534
Target Start/End: Original strand, 17909500 - 17909921
Alignment:
Q  101 tttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacc 200  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17909500 tttctcaccaccaatcatgatatatgaacacccaagccataat-cataaacaacaacatgtcgcatcagcaacaacatcaattaaaacttgattctcacc 17909598  T
Q  201 ccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattc 300  Q
     ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17909599 tcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 17909698  T
Q  301 atttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattca-aagattgggttcatataaattcttactcaattaagcactttt 399  Q
    ||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | || | |       ||| ||||| | | |||| || |  |  |    
T  17909699 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaatttaacaacaat-------tatcaattcattc-caatcaacccat--t 17909788  T
Q  400 tcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcact 499  Q
    ||||||||  |||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||    
T  17909789 tcatacaa--caaggaaaattgctaacaaaacaatcatgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaacttaggcttcact 17909886  T
Q  500 ttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 534  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17909887 ttaactcctaattcttcaatcttcaagtttccccc 17909921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 202 - 371
Target Start/End: Original strand, 21650789 - 21650958
Alignment:
Q  202 caattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattc 300  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  21650789 caattcaacaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattc 21650887  T
Q  301 atttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  21650888 atttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 21650958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Original strand, 2031923 - 2032073
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2031923 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 2032022  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    |||||||| |||| | | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  2032023 attcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 2032073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Original strand, 11342798 - 11342948
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11342798 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 11342897  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    |||||||| |||| | | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  11342898 attcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 11342948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 207 - 509
Target Start/End: Original strand, 25004915 - 25005210
Alignment:
Q  207 caacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatt-tcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcattta 305  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| ||| |||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||| || ||||||||| |||    
T  25004915 caacaacaacatgtcataaatcaccaattgagcataattctca-aactacccatttacatacatcatgaacatgcaatttcataattaacaattcaatta 25005013  T
Q  306 acatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttca-tataaattcttactcaattaagcactttttcata 404  Q
     | | ||||||||| | |||||| ||||||   |||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||   |||| |||||| ||||||| ||||||    
T  25005014 tccttaaattaacacactcaaacatatcacttcaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcacaataatcacttattcaattgagcacttattcata 25005113  T
Q  405 caaaccaagaaaaattgcaaaac-aaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttag 503  Q
    |        || ||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||| |||||||  ||||||||||||    
T  25005114 c--------aacaattgaaaaactaaacta-aatgattatgatgaagactaacccccttactttagataatgattaatccaaacttaggcttcactttag 25005204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Original strand, 21205039 - 21205189
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21205039 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 21205138  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    || ||||| |||| | | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  21205139 atccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 21205189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 10778259 - 10778085
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 171  Q
    |||| |||||| ||||| ||||| || |||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10778259 atttcacaaaaccaccaccaacatcttattt-ctcatcaacaattatggtatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca 10778161  T
Q  172 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttca 248  Q
    |||||||||||| | |  ||||| ||| | || |||||  | ||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  10778160 acaacatcaatt-acatatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttca 10778085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 436 - 529
Target Start/End: Original strand, 34939595 - 34939688
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttt 529  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34939595 atgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgattaattcacacttagacttcactttagctcctaattcttcaatcttcaagttt 34939688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 254 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22662784 - 22662668
Alignment:
Q  254 acccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaa 353  Q
    ||||||||  || ||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||| | |||| |||||||||     
T  22662784 acccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattatcatcaaattaacatattcaaatatatcactacaacatgagcacgaat 22662685  T
Q  354 ttcaaagattgggttca 370  Q
    |||||||||||||||||    
T  22662684 ttcaaagattgggttca 22662668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 183
Target Start/End: Original strand, 23514528 - 23514638
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 171  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||| |||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||    
T  23514528 atttcacaaaaccaccaacaacatcttattt-ctcatcaataattatggtatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatctctcaagaaca 23514626  T
Q  172 acaacatcaatt 183  Q
    ||||||||||||    
T  23514627 acaacatcaatt 23514638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 120
Target Start/End: Original strand, 11583982 - 11584063
Alignment:
Q  38 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatga 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11583982 catcatcaaaaacaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaaccacgaacaacaactca-tttctcaacaacaatcatga 11584063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 235
Target Start/End: Original strand, 7728378 - 7728547
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 163  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| | |||| ||||||| |||||  |||| |||||||||| |||| | || |||||||||||  ||    
T  7728378 tcaacccatttttcaaagtcaccaacaacacctcatct-ctcaccaacaattcatgaattatgcacacccaagcgataaattatcatcaacaacatcact 7728476  T
Q  164 cagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 235  Q
     |||||||||||||||||||||| | ||| ||  | | |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  7728477 tagcaacaacaacatcaattgaa-catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 7728547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 218
Target Start/End: Original strand, 24084034 - 24084187
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttc-tcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 161  Q
    ||||||||||||| |||||| || | ||||||||| |||||| ||| |||  |||||||| ||  |||||||||||||| | || | | |||||| || |    
T  24084034 atcaacccatttttacaaaaccaaccacaacaacttattttcatcatcaa--atcatgatttactaacacccaagccatgaatcttcaacaacaatattt 24084131  T
Q  162 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  24084132 cttagcaacaacaacatcaatt-aaacatgattcacatcacaattcaacaacaacat 24084187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 27182503 - 27182429
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  27182503 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 27182429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 218
Target Start/End: Original strand, 29917958 - 29918075
Alignment:
Q  101 tttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacac 199  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| || ||| |||||||||||||||| || |||| |||||| ||     
T  29917958 tttctcaacatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaacaacaacatcagtt-aaacatgattctcat 29918056  T
Q  200 cccaattcaacaacaacat 218  Q
    |  ||||||||||||||||    
T  29918057 cataattcaacaacaacat 29918075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 218
Target Start/End: Original strand, 23493925 - 23494029
Alignment:
Q  113 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaa 212  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||| | ||| ||  | | |||||||||||    
T  23493925 aatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaa-catgaatcttatcacaattcaacaa 23494023  T
Q  213 caacat 218  Q
    ||||||    
T  23494024 caacat 23494029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 218
Target Start/End: Original strand, 6456580 - 6456734
Alignment:
Q  64 atcaacccattt-tacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 161  Q
    |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||| |||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||| | |||| | |||| | || |    
T  6456580 atcaacccgtttgtacaaaaacaacaacaacaacttattt-ctcatcatcaaatcatgattcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacgatatct 6456678  T
Q  162 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
    || | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||    
T  6456679 cttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaacaacat 6456734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 438 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 18531018 - 18530946
Alignment:
Q  438 gattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    |||||  |||||||||||||||||||    
T  18531018 gattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcactttagctcctaa 18530946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 218
Target Start/End: Original strand, 21616974 - 21617126
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 163  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||| |||| || |||| || ||| ||||||  |||||||||||||||||| | |||  | |||||| ||  ||    
T  21616974 tcaacccattttacaaaaccaaccacaacagctcactt-ctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcaacaacaacaatatcact 21617072  T
Q  164 cagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
     |||||||||||||||||||| ||| ||| || || | |||||||||||||||||    
T  21617073 tagcaacaacaacatcaattg-aacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat 21617126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 22053785 - 22053711
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    |||||   ||||||||||||||||||    
T  22053785 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttagacttcactttagctcctaa 22053711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Original strand, 23507270 - 23507344
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||||| |||||  ||||||||||| |||||||    
T  23507270 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaattccaacttatgcttcactttaactcctaa 23507344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 440 - 510
Target Start/End: Original strand, 32951016 - 32951086
Alignment:
Q  440 ttatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||    
T  32951016 ttatgatgaagactaacccccttaccttaaataatgattaattcaaacttagacttcaatttagctcctaa 32951086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 23981440 - 23981363
Alignment:
Q  433 attatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | | ||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  23981440 attatgattttgatgaagactaacccccttacctaagatgaagattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 23981363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23981757 - 23981646
Alignment:
Q  113 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaa 212  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  || |||||||||||||||||||||| | || ||| || |  ||||||||||    
T  23981757 aatcatgagttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa-catggttctcatcataattcaacaa 23981659  T
Q  213 caacatgtcataa 225  Q
    |||||| ||||||    
T  23981658 caacatatcataa 23981646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 218
Target Start/End: Original strand, 37983325 - 37983474
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 163  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| || ||| || |||| ||||||||||||||| || | |||| | |||||| ||  ||    
T  37983325 tcaacccattttacaaaa---ccaacaacaactcatttt-tcatcatcaaatcctgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatcact 37983420  T
Q  164 cagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
     | ||||||||||||||||| |||| |||||| ||   ||||||||||| |||||    
T  37983421 taacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcattacaattcaacaataacat 37983474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 1168495 - 1168373
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 161  Q
    ||||||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   ||| | ||||||||||| | | || |||||||||||      
T  1168495 atcaacccattttcatcaaaacaccaacaacatctcattt-ctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatga 1168397  T
Q  162 ctcagcaacaacaacatcaattga 185  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  1168396 cttagcaacaacaacatcaattga 1168373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 185
Target Start/End: Original strand, 3673818 - 3673940
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 161  Q
    ||||||||||||| || ||| || ||||||||||| |||| |||| || ||| || |||| |||||||||||||||||| | |||| |||||| || |      
T  3673818 atcaacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttattt-ctcatcatcaaatcgtgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaaccacctcg 3673916  T
Q  162 ctcagcaacaacaacatcaattga 185  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  3673917 cttagcaacaacaacatcaattga 3673940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 24225634 - 24225596
Alignment:
Q  38 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccatttt 76  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24225634 catcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccatttt 24225596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5451134 - 5450963
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 161  Q
    ||||||||||||| || ||| || ||||||||||| |||| |||| || ||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||||||||||      
T  5451134 atcaacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttattt-ctcatcatcaaatcatgatttatgatcatccaagccaagaatcatcatcaacaacatca 5451036  T
Q  162 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 235  Q
    || |||||||||||||||| ||| ||| ||| |   | | |||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  5451035 cttagcaacaacaacatcagttg-aacatgaattttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatt 5450963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 11337455 - 11337355
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaatt 183  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||   ||| | || |||||||| | | || |||||| ||||  || |||||||||||||||||||    
T  11337455 caccaacaacatctcattt-ctcaacaacaatcatgaatcatgtaaactcaagccatgaattatcatcaacgacatgacttagcaacaacaacatcaatt 11337357  T
Q  184 ga 185  Q
    ||    
T  11337356 ga 11337355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 32966436 - 32966399
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32966436 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcattt 32966399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 438 - 510
Target Start/End: Original strand, 2032135 - 2032207
Alignment:
Q  438 gattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||| ||  |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  2032135 gattatgatgaaaactaacccccttaccttagataaggattaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 2032207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 235
Target Start/End: Original strand, 19862186 - 19862336
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaat 182  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||  |||||||||||||| ||| | |||| | ||| || ||  || ||||||||||||||||||    
T  19862186 caccaacaacaactcattt-ctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaat 19862284  T
Q  183 tgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 235  Q
    ||  || ||||||  | | |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  19862285 tg-cacatgattcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 19862336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 358
Target Start/End: Original strand, 21109758 - 21110000
Alignment:
Q  115 tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaaca 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||| |  ||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | ||| |||||||||    
T  21109758 tcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaataacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaaatcaacaaca 21109856  T
Q  215 acatgtcataagtcatcaatta-agcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaa 313  Q
    ||||  || || ||| |||||| |||| || ||||||| |   ||||||||   | ||||||||||  |||||| || |||||||||| |||  | |||     
T  21109857 acataacacaattcaacaattagagcacaa-ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattattaccaat 21109955  T
Q  314 ttaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaa 358  Q
    || |  || |||||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  21109956 ttcatgtactcaaacatatcatcagaacaagagcacgaatttcaa 21110000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26560046 - 26559952
Alignment:
Q  123 tatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
    |||||||||||||||||  | |||| | |||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||| | |||| || | ||| |||||||||||||    
T  26560046 tatgaacacccaagccaagaatcatcaccaacaatatctcttagcaacaacaacatcaatt-aaacataattctcatcacaaatcaacaacaacat 26559952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Original strand, 16105967 - 16106000
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16105967 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 16106000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Original strand, 20623286 - 20623319
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20623286 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 20623319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 21233474 - 21233441
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21233474 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 21233441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 137
Target Start/End: Original strand, 22882391 - 22882455
Alignment:
Q  73 ttttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagc 137  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  22882391 ttttacaaaaccaacaacaacaacttattt-ctcaacatcaattcatgatttatgaacacccaagc 22882455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 252
Target Start/End: Original strand, 23328619 - 23328703
Alignment:
Q  167 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaac 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| |||| ||||| | ||| || |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  23328619 caacaacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaatccaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttcacaac 23328703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 252
Target Start/End: Original strand, 24616223 - 24616307
Alignment:
Q  167 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaac 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| |||| ||||| | ||| || |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  24616223 caacaacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaatccaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttcacaac 24616307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 252
Target Start/End: Original strand, 24712599 - 24712683
Alignment:
Q  167 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaac 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| |||| ||||| | ||| || |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  24712599 caacaacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaatccaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttcacaac 24712683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 252
Target Start/End: Original strand, 24745617 - 24745701
Alignment:
Q  167 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaac 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| |||| ||||| | ||| || |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  24745617 caacaacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaatccaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttcacaac 24745701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 25900352 - 25900319
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25900352 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 25900319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Original strand, 37053061 - 37053094
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37053061 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 37053094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 183
Target Start/End: Original strand, 19873852 - 19873920
Alignment:
Q  115 tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaatt 183  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||| | |||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  19873852 tcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt 19873920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 50)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 24827044 - 24826615
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 136  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  24827044 acatcatcaatatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacagctcattttctcaacaacaatcatgataaatgagcacccaag 24826945  T
Q  137 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 236  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24826944 ccataattcataatcaacaacgtatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacctcaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 24826845  T
Q  237 agcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcacc 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  24826844 agcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacc 24826745  T
Q  337 aaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcatataaattcttactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaatta 436  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24826744 aaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgc-aagcaaacaatta 24826646  T
Q  437 tgattatgatgaagactaacccccttacctt 467  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24826645 tgattatgatgatgactaacccctttacctt 24826615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 85 - 529
Target Start/End: Original strand, 17204309 - 17204753
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattg 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17204309 accaacaacatctcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacatataagccataattcataatcaacaatatatctcagcaacaacaacatcaattg 17204408  T
Q  185 aaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatt 284  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17204409 aaacttgattcacacctcaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatt 17204508  T
Q  285 tcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcatataaattcttact 384  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||| |||    
T  17204509 tcatcaccaacaattcatttatgatgcaattaacatactcaatcttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcact 17204608  T
Q  385 caattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattca 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  17204609 caattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgc-aaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttactttaggttatgattaatcca 17204707  T
Q  485 aacttgagcttcactttagctcctaa-ttctccaatcttcaagttt 529  Q
    |||||   |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17204708 aacttagacttcactttaactcctaatttcttcaatcttcaagttt 17204753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 85 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 28031516 - 28031068
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattg 184  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28031516 accaacaacatctcattttctcatcaacaatcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatatctcaacaacaacaacatcaattg 28031417  T
Q  185 aaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatt 284  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  28031416 aaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatatcataattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcacacattatgaacatgttatt 28031317  T
Q  285 tcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcatataaattcttact 384  Q
    |||||| |||||||||||||| ||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  28031316 tcatcaccaacaattcatttatcaatcaattaacatactaaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcatataaatacttgct 28031217  T
Q  385 caattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattca 484  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  28031216 caattaagcactttctcatacaaaccaag-aaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaatgattaattca 28031118  T
Q  485 aacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 534  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28031117 aacttaggcttcactttaactcctaattcttcaatcttcaagtttccccc 28031068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 37 - 371
Target Start/End: Original strand, 25212977 - 25213311
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttt-ctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaa 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25212977 acatcatcaaaatcaaatttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaa 25213076  T
Q  136 gccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 235  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25213077 gccataattcattatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 25213176  T
Q  236 aagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcac 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |    
T  25213177 aagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatattatttcatcatcaaccattcatttaacatc-aattaacatatccaaacatatctc 25213275  T
Q  336 caaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
     | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  25213276 tacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 25213311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 129 - 510
Target Start/End: Original strand, 33128067 - 33128446
Alignment:
Q  129 cacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtc 228  Q
    |||||||||||| | |||| | |||||| || ||| | | ||||||| ||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  33128067 cacccaagccatgaatcattaacaacaatatctcttaaccacaacaatatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatgtcataagtc 33128165  T
Q  229 atcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  33128166 atcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaac 33128265  T
Q  329 ttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcatataaattcttactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaaaca 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33128266 ttatcaccaaaacaagagcacgaaaattaaagattgggttcataaaaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgc-aaaca 33128364  T
Q  429 aacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  33128365 aacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcctaa 33128446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 101 - 371
Target Start/End: Original strand, 15633208 - 15633477
Alignment:
Q  101 tttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacc 200  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  15633208 tttctcactaacaatcatgatatatgaacacccaagccataaatcatag-caacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgtttctcacc 15633306  T
Q  201 ccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattc 300  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15633307 tcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcaaacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 15633406  T
Q  301 atttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    ||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15633407 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaagaattgggttcat 15633477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 436 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 7507789 - 7507683
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7507789 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagtttcactttaactcctaattctccaatcttcaagctttccccc 7507690  T
Q  536 tttgcta 542  Q
    |||||||    
T  7507689 tttgcta 7507683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19433649 - 19433452
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaa 135  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||    
T  19433649 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactca-tttctcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaa 19433551  T
Q  136 gccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 235  Q
    ||||| | |||| | |||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||  |||||||| ||||||||  ||||| ||| |||||    
T  19433550 gccatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaacaacaacatcaattg-aacatgattcttacaacaattcaataacaacatagcataattcaacaatt 19433452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 436 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 23777994 - 23777888
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 535  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23777994 atgattatgatgataactaacccctttaccttaggttatgatcaattcaaatttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttctagttttccccc 23777895  T
Q  536 tttgcta 542  Q
    |||||||    
T  23777894 tttgcta 23777888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Original strand, 22274835 - 22274985
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22274835 cataattcaccaattgagcataatttacaaacaacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 22274934  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    |||||||| |||| | |  |||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22274935 attcaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 22274985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 3529 - 3409
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctc 164  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||     
T  3529 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcattt-ctcatctacaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcactt 3431  T
Q  165 agcaacaacaacatcaattgaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3430 agcaacaacaacatcaattgaa 3409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 12636157 - 12636047
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 171  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12636157 atttcacaaaaccaccaacaacatcttattt-ctcatcaacaattatggtatatgaacacccaatccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca 12636059  T
Q  172 acaacatcaatt 183  Q
    ||||||||||||    
T  12636058 acaacatcaatt 12636047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 42178258 - 42178148
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 171  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||| |||| |||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42178258 atttcacaaaaccaccaacaacatcttattt-ctcatcaacaattttggtatatgaacacccaagccataagtcataatcaacaacatatctcagcaaca 42178160  T
Q  172 acaacatcaatt 183  Q
    ||||||||||||    
T  42178159 acaacatcaatt 42178148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 9653038 - 9652888
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| || |||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9653038 cataattcaccaattgagtataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 9652939  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    |||||||| |||| | | ||||  | |||||| ||||||||||||||||||    
T  9652938 attcaaacatatctctacaacataaccacgaatttcaaagattgggttcat 9652888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12641931 - 12641757
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 171  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12641931 atttcacaaaaccaccaacaacatcttattt-ctcatcaacacttatggtatatgaacacccaagccataaatcatactcaacaacatatctcagcaaca 12641833  T
Q  172 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttca 248  Q
    |||||||||||| | |  ||||| ||| | || |||||| | ||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  12641832 acaacatcaatt-acatatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttca 12641757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 183
Target Start/End: Original strand, 8943813 - 8943923
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 171  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8943813 atttcacaaaaccaccaacaacatcttattt-ctcattaacaattatggtatatgaacacccaatccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca 8943911  T
Q  172 acaacatcaatt 183  Q
    ||||||||||||    
T  8943912 acaacatcaatt 8943923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 21274191 - 21274041
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| || |||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21274191 cataattcaccaattgagtataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccattcatttaacatcaaattaacat 21274092  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    || ||||| |||| | | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  21274091 atccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 21274041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 3798892 - 3798718
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 171  Q
    |||| |||||| |||||| |||| || |||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3798892 atttcacaaaaccaccaataacatcttattt-ctcatcaacaattatggtatatgaacacccaagcctcaaatcatactcaacaacatatctcagcaaca 3798794  T
Q  172 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttca 248  Q
    |||||||||||| | |  ||||| ||| | || |||||| | ||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  3798793 acaacatcaatt-acatatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttca 3798718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 203 - 370
Target Start/End: Original strand, 7321612 - 7321779
Alignment:
Q  203 aattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaa-caacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattca 301  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||| ||||| | ||||||||  || ||| || ||||||  |||||||||| || ||||||    
T  7321612 aattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattgagcacaatt-cacaaactacccatttatatacatcataaacatgaaatttcatcataaaaaattca 7321710  T
Q  302 tttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttca 370  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||| ||||||  |||||||||    
T  7321711 attatcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttgggttca 7321779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 257 - 371
Target Start/End: Original strand, 22284104 - 22284218
Alignment:
Q  257 cattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattc 356  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |  |||  |||||||| |||    
T  22284104 cattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacattaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacgaatttc 22284203  T
Q  357 aaagattgggttcat 371  Q
    |||||||| ||||||    
T  22284204 aaagattgagttcat 22284218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 43645824 - 43646020
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 136  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |  || ||  ||||||||  ||||||||||||||    
T  43645824 acatcatcaaaatcaaactttttcattaccaacccattttacaaaaccaccaccaacaactca-aatgacatcacaaatcatgaattatgaacacccaag 43645922  T
Q  137 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 235  Q
     ||| | ||||   |||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||| || ||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  43645923 tcatgaatcatcgacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg-aacatgattcttaccacagttcaacaacaacatagcataattcaacaatt 43646020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 218
Target Start/End: Original strand, 24884643 - 24884796
Alignment:
Q  64 atcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatc 162  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||  || | ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||| | |||||| || |     
T  24884643 atcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactca-tttctcctcatcaaatcatgatttatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatcta 24884741  T
Q  163 tcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| || || | ||||||||||| |||||    
T  24884742 ttagcaacaacaacatcaatt-aaacatgaatctcatcacaattcaacaataacat 24884796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 25265335 - 25265261
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||| ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  25265335 atgattatgatgaagactaacccccttacattagataatgattaatccaaacctaggcttcactttagctcctaa 25265261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 437 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 5888578 - 5888480
Alignment:
Q  437 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttttcccc 534  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||| | |||   ||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  5888578 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaagcttcactttagctcctaattgcgtcaatcttcaagtttccccc 5888480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 437 - 534
Target Start/End: Original strand, 21142203 - 21142301
Alignment:
Q  437 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttttcccc 534  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||| | |||   |||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  21142203 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaattgcttcaatcttcaagtttccccc 21142301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 24341341 - 24341267
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    |||||  |||||| ||||||||||||    
T  24341341 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcattttagctcctaa 24341267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 346
Target Start/End: Original strand, 9636753 - 9636983
Alignment:
Q  115 tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaaca 214  Q
    ||||||| |||||| |||||| | || | |||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||    
T  9636753 tcatgatttatgaatacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaaca 9636851  T
Q  215 acatgtcataagtcatcaatta-agcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaa 313  Q
    ||||  || || ||| |||||| ||||||| ||||||| |   ||||||||   | ||||||||||  |||||| || |||||||||| ||| || |||     
T  9636852 acatagcacaattcaacaattagagcataa-ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaat 9636950  T
Q  314 ttaacatattcaaacttatcaccaaaacaagag 346  Q
    || |  ||||||||| ||||| || ||||||||    
T  9636951 ttcatgtattcaaacatatcatcataacaagag 9636983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19669376 - 19669222
Alignment:
Q  87 caacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 185  Q
    ||||||||||||||||| ||| || || | |||||  |||||| ||||||||||| | |||| | ||| |||||  || ||||||||||||||||||||     
T  19669376 caacaacaactcatttt-tcatcatcagttcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataacatcacttagcaacaacaacatcaattg- 19669279  T
Q  186 aacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtc-atcaattaagcat 241  Q
    ||| || |||||| |  |||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||    
T  19669278 aacatggttcacatcataattcaacaacaacatatcataattcaaccaattaagcat 19669222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Original strand, 463043 - 463117
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  463043 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 463117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 186
Target Start/End: Original strand, 25305423 - 25305524
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaatt 183  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  |||||| ||||| ||||| | |||| | |||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  25305423 accaacaacaactcattt-ctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaggccatgaatcatcaacaacaacatcacttagccacaacaacatcaatt 25305521  T
Q  184 gaa 186  Q
    |||    
T  25305522 gaa 25305524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 235
Target Start/End: Original strand, 67952 - 68119
Alignment:
Q  68 acccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctca 165  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||| |||| |||| || ||| ||||||  ||||||||| |||||||| | |||  | |||||| ||  || |    
T  67952 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttattt-ctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 68050  T
Q  166 gcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 235  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  68051 gcaacaacaacatcaattg-aacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 68119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 5888824 - 5888740
Alignment:
Q  167 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaac 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| | ||| || |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  5888824 caacaacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaattcaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttcacaac 5888740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 437 - 510
Target Start/End: Original strand, 32466177 - 32466249
Alignment:
Q  437 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  32466177 tgattatgatgaagactaa-ccccttaccttagataaggatcaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 32466249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 19794661 - 19794629
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19794661 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 19794629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 25265695 - 25265573
Alignment:
Q  64 atcaacccattttaca-aaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 161  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||  |||||| || |||| ||||| ||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||      
T  25265695 atcaacccattt-acataaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatga-atatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatca 25265598  T
Q  162 ctcagcaacaacaacatcaattgaa 186  Q
     | | ||||||||||||||||||||    
T  25265597 attaacaacaacaacatcaattgaa 25265573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 218
Target Start/End: Original strand, 6094724 - 6094826
Alignment:
Q  115 tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaaca 214  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || | |||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | ||| |||||||||    
T  6094724 tcatgatttatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaaatcaacaaca 6094822  T
Q  215 acat 218  Q
    ||||    
T  6094823 acat 6094826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 9652828 - 9652754
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  | |||| ||||||||||||    
T  9652828 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggtttcaatttagctcctaa 9652754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Original strand, 22863235 - 22863309
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  ||| || ||||||||||||    
T  22863235 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggctgcaatttagctcctaa 22863309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 185
Target Start/End: Original strand, 28974026 - 28974127
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaat 182  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||   ||| | ||||||||||| | | || |||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  28974026 caccaacaacatctcattt-ctcatcaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaat 28974124  T
Q  183 tga 185  Q
    |||    
T  28974125 tga 28974127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 14906386 - 14906353
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14906386 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 14906353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 252
Target Start/End: Original strand, 23774198 - 23774282
Alignment:
Q  167 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaac 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| |||| ||||| | ||| || |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  23774198 caacaacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaatccaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttcacaac 23774282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Original strand, 23820388 - 23820421
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23820388 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 23820421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23821846 - 23821773
Alignment:
Q  113 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaa 186  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||| | |||| | |||||| ||  || ||||||||||||||||||||||    
T  23821846 aatcatgaattatgaacacccatgccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 23821773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23830925 - 23830852
Alignment:
Q  113 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaa 186  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||| | |||| | |||||| ||  || ||||||||||||||||||||||    
T  23830925 aatcatgaattatgaacacccatgccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 23830852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 218
Target Start/End: Original strand, 24277767 - 24277871
Alignment:
Q  113 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaa 212  Q
    ||||||||| |||||  |||||||| || | |||| | |||||| || ||| | ||||||||||||| ||| |||| |||||| || | |||||||||||    
T  24277767 aatcatgatttatgagtacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatc-atttaaacatgattctcatcacaattcaacaa 24277865  T
Q  213 caacat 218  Q
    ||||||    
T  24277866 caacat 24277871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 24294764 - 24294691
Alignment:
Q  113 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaa 186  Q
    ||||||||  |||||| || |||||||| | |||| ||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||    
T  24294764 aatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcatcatcaacatcatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 24294691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 36982396 - 36982363
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36982396 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 36982363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 140
Target Start/End: Original strand, 722353 - 722428
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaa-caatcatgatatatgaacacccaagccat 140  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||  ||||||||  |||| |||||||||||||    
T  722353 tcaaccaattttacaaagtcaccaacaacaactca-tatctcatcaataaatcatgaattatgcacacccaagccat 722428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 19689347 - 19689315
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 468  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19689347 atgattatgataaagactaacccccttacctta 19689315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 468
Target Start/End: Original strand, 22284278 - 22284310
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 468  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22284278 atgattatgataaagactaacccccttacctta 22284310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 338; Significance: 0; HSPs: 53)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 18823712 - 18823209
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||| | |||||||    
T  18823712 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaagccattttacaaaaccaccaccaacaactcattt-ctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaag 18823614  T
Q  137 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 236  Q
    ||||   | || |||||||||||  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18823613 ccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccgcaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 18823514  T
Q  237 agcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcacc 336  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  18823513 agcataacttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacc 18823414  T
Q  337 aaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcatataaattcttactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaatta 436  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18823413 aaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcactcacttaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgc-aaacaaacaatta 18823315  T
Q  437 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccct 536  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18823314 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaacttaaacttcactttagctcctaattctccaatctttaagttttccccct 18823215  T
Q  537 ttgcta 542  Q
    ||||||    
T  18823214 ttgcta 18823209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 18839567 - 18839064
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||| | |||||||    
T  18839567 acatcatcaaaatcaaacttcttctttttcaactcattttacaaaaccaccaccaacaactcattt-ctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaag 18839469  T
Q  137 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 236  Q
    ||||   | || |||||||||||  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18839468 ccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaataacatgtcataagtcatcaatta 18839369  T
Q  237 agcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcacc 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||||||| ||||||||||||||    
T  18839368 agcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcagttaacatactcaaacttatcacc 18839269  T
Q  337 aaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcatataaattcttactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaatta 436  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18839268 aaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgc-aaacaaacaatta 18839170  T
Q  437 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccct 536  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18839169 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaacttaagcttcactttagcttctaattctccaatctttaagttttccccct 18839070  T
Q  537 ttgcta 542  Q
    ||||||    
T  18839069 ttgcta 18839064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 101 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 32277024 - 32276601
Alignment:
Q  101 tttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacc 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32277024 tttctcaccaacaatcatgatatatgaacacccaagccataat-cataaacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattctcacc 32276926  T
Q  201 ccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattc 300  Q
     ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32276925 tcaattcaacaataacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 32276826  T
Q  301 atttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcatataaattcttactcaattaagcacttttt 400  Q
    ||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  32276825 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcagataaatacttgctcaattaagcacttttt 32276726  T
Q  401 catacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactt 500  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  32276725 catacaaataaag-aaaattgcaaacaaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaagcttcactt 32276627  T
Q  501 tagctcctaattctccaatcttcaag 526  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  32276626 tagctcctaattcttcaatcttcaag 32276601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 37 - 371
Target Start/End: Original strand, 4991002 - 4991335
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991002 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 4991101  T
Q  137 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 236  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991102 ccaaaattcatgatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacaccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 4991201  T
Q  237 agcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcacc 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |     
T  4991202 agcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatattatttcatcatcaaccattcatttaacatcaaa-taacatatccaaacatatctct 4991300  T
Q  337 aaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  4991301 acaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 4991335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 89 - 529
Target Start/End: Original strand, 19629314 - 19629740
Alignment:
Q  89 acaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaac 188  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  19629314 acaacaactcattt-ctcaccaacaatcatgatatatgaacacccaagccataat-cataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattaaatc 19629411  T
Q  189 ttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcat 288  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19629412 ttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcat 19629511  T
Q  289 catcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattca-aagattgggttcatataaattcttactcaa 387  Q
    || |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || | |       ||| ||||| | | |||    
T  19629512 caccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccacaacaagagcacgaatttaacaacaat-------tatcaattcattc-caa 19629603  T
Q  388 ttaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaac 487  Q
    | || |  |  |||||||||  |||| |||||| ||||  ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19629604 tcaacccat--ttcatacaa--caaggaaaattccaaacaaaacaatcatgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaat 19629699  T
Q  488 ttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttt 529  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19629700 ttgagcttcac-ttagctcctaattctccaatcttcaagttt 19629740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 109 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 16300234 - 16299991
Alignment:
Q  109 caacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattca 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  16300234 caacaatcatgatatatgaacacccaagccataaatcatatacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattca 16300135  T
Q  209 acaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaaca 308  Q
    || |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  16300134 accacaacatgtcataatttatcaattaggcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatca 16300035  T
Q  309 tcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 352  Q
    |  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16300034 ttcaattaacatactcaaacttatcaccgaaacaagagcacgaa 16299991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 371
Target Start/End: Original strand, 18583264 - 18583580
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||| | |||||||    
T  18583264 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattt-ctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaag 18583362  T
Q  137 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaatt 235  Q
    |||| | | || ||||||||||                |||||||||||  | |||  || | | ||||||| ||||||| ||| ||||| ||| |||||    
T  18583363 ccatgaattatcatcaacaaca----------------acatcaattgat-catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaatt 18583444  T
Q  236 aagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcac 335  Q
     ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  18583445 gagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacacatctc 18583544  T
Q  336 caaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
     | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  18583545 tacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 18583580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Original strand, 26089848 - 26089998
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26089848 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacattatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 26089947  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    |||||||| |||| | | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  26089948 attcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 26089998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 202 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22585707 - 22585539
Alignment:
Q  202 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaa-caacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||  || ||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22585707 caattcaacaacaacatgtcataattcttcaattgagcataatt-cacaaactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattc 22585609  T
Q  301 atttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttca 370  Q
    | ||| ||||||||||| ||| |||||| |||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22585608 aattatcatcaaattaaaatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttca 22585539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 202 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22590538 - 22590370
Alignment:
Q  202 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaa-caacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||  || ||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22590538 caattcaacaacaacatgtcataattcttcaattgagcataatt-cacaaactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattc 22590440  T
Q  301 atttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttca 370  Q
    | ||| ||||||||||| ||| |||||| |||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22590439 aattatcatcaaattaaaatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttca 22590370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18002638 - 18002488
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18002638 cataattcatcaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaatgaacat 18002539  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    |||||||| |||| | | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  18002538 attcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 18002488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 35015299 - 35015149
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35015299 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 35015200  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    |||||||| |||| | | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  35015199 attcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 35015149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 398 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 16299953 - 16299825
Alignment:
Q  398 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 497  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||||    
T  16299953 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaa-caaacaatcatgattaagaagaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttaggcttca 16299857  T
Q  498 ctttagctcctaattctccaatcttcaagttt 529  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16299856 ctttagctcctaattcttcaatcttcaagttt 16299825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 436 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 13620743 - 13620644
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa-ttctccaatcttcaagttttcccc 534  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13620743 atgattatgaagaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaactcaggcttcactttagctcctaatttcttcaatcttcaagttttcccc 13620644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 183
Target Start/End: Original strand, 16231859 - 16231969
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 171  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16231859 atttcacaaaaccaccaacaacatcttattt-ctcatcaacaattatggtatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca 16231957  T
Q  172 acaacatcaatt 183  Q
    ||||||||||||    
T  16231958 acaacatcaatt 16231969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 18087112 - 18087002
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 171  Q
    |||| |||||| ||||| ||||| || |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18087112 atttcacaaaaccaccaccaacatcttattt-ctcatcaacaattatgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca 18087014  T
Q  172 acaacatcaatt 183  Q
    ||||||||||||    
T  18087013 acaacatcaatt 18087002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 13621083 - 13620973
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 171  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||  |||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13621083 atttcacaaaaccaccaacaacatcttattg-ctcatcaacaattatggtatatgaacacccaagtcataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 13620985  T
Q  172 acaacatcaatt 183  Q
    ||||||||||||    
T  13620984 acaacatcaatt 13620973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 202 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15005067 - 15004900
Alignment:
Q  202 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcac-aacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||| ||||||||  || ||| || ||||||  ||||| |||||||||||||    
T  15005067 caattcaacaacaacatgtcataattcatcaattgaacataa-ttcacaaactacccatttatatacatcataaacatgcaatttcctcatcaacaattc 15004969  T
Q  301 atttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttca 370  Q
    | | ||||||||||| ||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15004968 aatcaacatcaaatt-acatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttca 15004900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 202 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15889867 - 15889699
Alignment:
Q  202 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaa-caacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattc 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| || | ||||||| ||||| | ||||||||  || ||| |||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  15889867 caattcatcaacaacatgtcataattcatcagttgaacataatt-cacaaactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaaatc 15889769  T
Q  301 atttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttca 370  Q
    | ||| ||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15889768 aattatcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaggttgggttca 15889699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 254 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 19983401 - 19983284
Alignment:
Q  254 acccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaa 353  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||  ||||||||     
T  19983401 acccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaat 19983302  T
Q  354 ttcaaagattgggttcat 371  Q
    |||||||||||| |||||    
T  19983301 ttcaaagattggattcat 19983284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 254 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 15742329 - 15742211
Alignment:
Q  254 acccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaa-catcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 352  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| | | ||||  ||||||||    
T  15742329 acccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaatcatcaaattaacataatcaaacatatctctacaacataagcacgaa 15742230  T
Q  353 attcaaagattgggttcat 371  Q
     ||||||||||||||||||    
T  15742229 tttcaaagattgggttcat 15742211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Original strand, 23995036 - 23995186
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23995036 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccattcatttaacatcaaattaacat 23995135  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    || ||||| |||| | | ||||  |||||||| | |||| |||||||||||    
T  23995136 atccaaacatatctctacaacataagcacgaattccaaatattgggttcat 23995186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 17083496 - 17083373
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacaccca 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||| | || | ||||||||| ||||||||||||    
T  17083496 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttcacaaaaacaacaacaacaactca-tttctaatcatcaaatcatgatttatgaacaccca 17083398  T
Q  135 agccataattcataatcaacaacat 159  Q
    |||||| | |||| | |||||||||    
T  17083397 agccatgaatcatcaacaacaacat 17083373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 248
Target Start/End: Original strand, 23977736 - 23977910
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 171  Q
    |||| |||||| |||||| |||| || |||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23977736 atttcacaaaaccaccaataacatcttattt-ctcatcaacaattatggtatatgaacacccaagcctcaaatcatactcaacaacatatctcagcaaca 23977834  T
Q  172 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttca 248  Q
    |||||||||||| | |  ||||| ||| | || |||||| | ||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  23977835 acaacatcaatt-acatatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttca 23977910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 438 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 15742150 - 15742058
Alignment:
Q  438 gattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcct-aattctccaatcttcaagttt 529  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  15742150 gattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcctaaatccttcaatcttcaagttt 15742058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 203 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 25640715 - 25640549
Alignment:
Q  203 aattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaa-caacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattca 301  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||| ||||| | ||||||||   | ||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  25640715 aattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattgagcacaatt-cacaaactacccatttatctacatcatgaacatgcaatttcatcatcaaaaattca 25640617  T
Q  302 tttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttca 370  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||| |||| | | |||| ||||||||| ||||||  |||||||||    
T  25640616 attatcatcaaattaacatactcaaacatatc-ctacaacatgagcacgaatttcaaaagttgggttca 25640549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 436 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 18002427 - 18002333
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcct-aattctccaatcttcaagttt 529  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||   |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  18002427 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggttatgattaatctaaacttagccttcactttagctcctaaatccttcaatcttcaagttt 18002333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 18381965 - 18381851
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaac 170  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||| | |||| | |||||||||  || ||||||    
T  18381965 atttcacaaaaccaccaacaacaactcattt-ctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaac 18381867  T
Q  171 aacaacatcaattgaa 186  Q
    ||||||||||||||||    
T  18381866 aacaacatcaattgaa 18381851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22362054 - 22361885
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 163  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| || |||| || |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  ||    
T  22362054 tcaacccattttacaaaactaacaacaacaactcaatt-ctcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcact 22361956  T
Q  164 cagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 235  Q
     |||||||||||||||||||||| | ||| |  || | |||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  22361955 tagcaacaacaacatcaattgaa-catgaatttcatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatt 22361885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Original strand, 26090059 - 26090133
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||  |||||||||||||||||||    
T  26090059 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 26090133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 358
Target Start/End: Original strand, 19854135 - 19854405
Alignment:
Q  87 caacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 185  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||| |||||| ||||||||||||||| || | |||| | |||||| || ||| ||||||||||||||||||| |    
T  19854135 caacaacaactcattt-ctcatcatcaattcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaacaacaacatcaatt-a 19854232  T
Q  186 aacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta-agcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatt 284  Q
    ||| |||||| || | ||||||||||| |||||  || || |||| | ||| |||| ||  |||||| |  |||||||||   | ||||||||||  |||    
T  19854233 aacatgattctcatcacaattcaacaataacatagcacaattcattatttagagcacaa-ctcacaatataccattttcacatactatgaacatgcaatt 19854331  T
Q  285 tcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaa 358  Q
    ||| || |||||||||| ||| |||||| || |  || |||||| || || || |||||||||||||| |||||    
T  19854332 tcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtactcaaacataacatcataacaagagcacgaatttcaa 19854405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 235
Target Start/End: Original strand, 18398895 - 18399065
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatc 162  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| || | ||  | ||||||  |||| ||||||||||||| | | || |||||||||||  |    
T  18398895 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactcattt-cttatcacaattcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcac 18398993  T
Q  163 tcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 235  Q
    | |||||||||||||||||||| ||| ||| || || | |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  18398994 ttagcaacaacaacatcaattg-aacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 18399065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 218
Target Start/End: Original strand, 25919571 - 25919723
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacat-atc 162  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||| | |||| | ||||||||| ||     
T  25919571 tcaactcattttacaaagtcaccaacaataactcatttt-tcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcata 25919669  T
Q  163 tcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
    | |||||||||||||||||||||| | || ||| || |  ||||||||||||||||    
T  25919670 t-agcaacaacaacatcaattgaa-catggttctcatcataattcaacaacaacat 25919723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Original strand, 23148303 - 23148377
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  23148303 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 23148377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Original strand, 23153754 - 23153828
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  23153754 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 23153828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Original strand, 27751742 - 27751816
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  27751742 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaagattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 27751816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 35009384 - 35009314
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctc 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||| |||||||  |||||||||||||||    
T  35009384 atgattatgatgaagactaacccccttactttagataatgattaatccaaactttggcttcactttagctc 35009314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 235
Target Start/End: Original strand, 21623133 - 21623295
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaac 170  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||  |||||| ||||||||||| | |||| | || ||||||  || ||||||    
T  21623133 attttaccaaactaccaacaacaactcatttt-tcatccacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgactcattaacatcaacatcacttagcaac 21623231  T
Q  171 aacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 235  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  21623232 aacaacatcaatag-aacatgattcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 21623295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 17375011 - 17374924
Alignment:
Q  271 atgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaa 358  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| || ||||||| |||| |||||| |||||| | ||| |||||||||| |||||    
T  17375011 atgaacatgtaatttcatcatcaataattcaattatcaacaaattagcatactcaaacatatcactacaactagagcacgaatttcaa 17374924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33538647 - 33538506
Alignment:
Q  76 tacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaaca 174  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| ||||||||| |||||||| | |||| | |||||| ||  || ||||| ||||    
T  33538647 tacaaaaccaacaacaacaactcattt-ctcatcatcaaatcatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaataaca 33538549  T
Q  175 acatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
    ||||||||| |||| |||||| || | ||||||||||| |||||    
T  33538548 acatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaataacat 33538506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Original strand, 23995247 - 23995321
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  23995247 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 23995321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 218
Target Start/End: Original strand, 25651242 - 25651347
Alignment:
Q  112 caatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaaca 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  || |||||||||||||||||||||| | ||| || || |  |||||||||    
T  25651242 caatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa-catgaatctcatcataattcaaca 25651340  T
Q  212 acaacat 218  Q
    |||||||    
T  25651341 acaacat 25651347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 236
Target Start/End: Original strand, 34966823 - 34966995
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 161  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||| | || ||  || ||||||| ||||||||||||||| || | |||| | |||||| || |    
T  34966823 atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttattt-cacatcacgaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatct 34966921  T
Q  162 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 236  Q
    || | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | ||| |||||||||||||  ||||| ||| ||||||    
T  34966922 cttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacatagcataattcaacaatta 34966995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 218
Target Start/End: Original strand, 29605406 - 29605560
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 161  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||| ||||||| |||| ||||  | |||| |||||| |||| |||||||| |||| | |||| | |||||| || |    
T  29605406 atcaacccatttttacaaaaccaacaagaacaacttattt-ctcattatcaattcatgatttatgcacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatattt 29605504  T
Q  162 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
    || ||||||||||||||||||| || | ||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  29605505 cttagcaacaacaacatcaatt-aagcatgattcacatcataattcaacaacaacat 29605560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Original strand, 29666181 - 29666255
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  29666181 atgattatgatgaagactaacccacttatgttagataatgattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 29666255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 1657693 - 1657660
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1657693 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 1657660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Original strand, 15862789 - 15862822
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862789 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 15862822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 29869970 - 29869886
Alignment:
Q  167 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaac 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| | ||| || |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  29869970 caacaacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaattcaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttcacaac 29869886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 186
Target Start/End: Original strand, 33324673 - 33324772
Alignment:
Q  87 caacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 185  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||||| | |||| | |||||||||  || ||||| |||||||||||||||    
T  33324673 caacaacaactcattt-ctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattga 33324771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 35136279 - 35136180
Alignment:
Q  87 caacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 185  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||||| | |||| | |||||||||  || ||||| |||||||||||||||    
T  35136279 caacaacaactcattt-ctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattga 35136181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29160542 - 29160440
Alignment:
Q  115 tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaaca 214  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || | |||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | ||| |||||||||    
T  29160542 tcatgatttatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcgcaaatcaacaaca 29160444  T
Q  215 acat 218  Q
    ||||    
T  29160443 acat 29160440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 1650053 - 1650021
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 468  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1650053 atgattatgataaagactaacccccttacctta 1650021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 468
Target Start/End: Original strand, 18583640 - 18583672
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 468  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18583640 atgattatgatgaaaactaacccccttacctta 18583672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 79)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 16934263 - 16933803
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 171  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||| ||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16934263 atttcacaaaaccaccaacaacatcttattt-ctcacaaacaatcatgatttatgaatacccaagccataaatcataaacaacaacatgtctcagcaaca 16934165  T
Q  172 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccatta 271  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16934164 acaacatcaattgaaacttgattctcaccttaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacatta 16934065  T
Q  272 tgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  16934064 tgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaatcttatcatcaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 16933965  T
Q  372 ataaattcttactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggt 471  Q
    || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16933964 atgaattctcacttaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgc-aaactaacaattatgattatgataaagactaacccccttaccttaggt 16933866  T
Q  472 tatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933865 tatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 16933803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 37 - 529
Target Start/End: Original strand, 19946629 - 19947120
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 136  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||| | |||||||    
T  19946629 acatcatcaaaatcaaacttctatattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattt-ctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaag 19946727  T
Q  137 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 236  Q
    ||||   | || |||||||||||  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19946728 ccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacctcaattcaacaacaacatgtcataaatcatcaatta 19946827  T
Q  237 agcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcacc 336  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  19946828 agcataatttcacaactactcattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaatttatcacc 19946927  T
Q  337 aaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcatataaattcttactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaatta 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19946928 aaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcatataaattcttactcaattaagcattttttcaaacaaaccaag-aaaattgcaaaacaaacaatta 19947026  T
Q  437 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcct-aattctccaatcttcaagttt 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||    
T  19947027 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaacttaggcttcactttaactcctaaatccttcaatcttcaagttt 19947120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 109 - 534
Target Start/End: Original strand, 14284963 - 14285387
Alignment:
Q  109 caacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattca 208  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  14284963 caacattcatgatatatgaacacccaagtcataaatcataaacaacaacatatctgagcaacaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattca 14285062  T
Q  209 acaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaaca 308  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  14285063 acaacaacatgtcataattcatcaattaagcatattttcacaactacccattttcatacactatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatca 14285162  T
Q  309 tcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcatataaattcttactcaattaagcactttttcatacaaa 408  Q
    |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14285163 ttcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaagggttgggttcatataaatacttactcaattaagcactatttcatacaaa 14285262  T
Q  409 ccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcct 508  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  14285263 ccaag-aaaattgcaaacaaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaagcttcactttagctcct 14285361  T
Q  509 aattctccaatcttcaagttttcccc 534  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||    
T  14285362 aattcttcaatcttcaagtttccccc 14285387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 37 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 9303425 - 9303110
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9303425 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccgttttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatggtatatgaacacccaag 9303326  T
Q  137 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 236  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9303325 ccataattcatagtcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacagcaacatgtcataagtcatcaatta 9303226  T
Q  237 agcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcacc 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  9303225 agcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacc 9303126  T
Q  337 aaaacaagagcacgaa 352  Q
    ||||||||||||||||    
T  9303125 aaaacaagagcacgaa 9303110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 101 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 8276105 - 8275855
Alignment:
Q  101 tttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacc 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8276105 tttctcaccaacaatcatgatatatgaacacccaagccataat-cataaacaacaacatgtctcagcaacaataacatcaattaaaacttgattctcacc 8276007  T
Q  201 ccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattc 300  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8276006 tcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 8275907  T
Q  301 atttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 352  Q
    ||||| | |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8275906 atttatcgttcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 8275855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 85 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 11477467 - 11477201
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattg 184  Q
    |||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11477467 accaacaacatcttatttt-tcatcaacaatcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatatctcagcagcaacaacatcaattg 11477369  T
Q  185 aaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatt 284  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11477368 aaacttgattctcacctcaattcaaccacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatgcattatgaacatgttatt 11477269  T
Q  285 tcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 352  Q
    | || | | |||| ||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11477268 ttattaaccacaaatcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 11477201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 101 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 8269005 - 8268755
Alignment:
Q  101 tttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacc 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8269005 tttctcaccaacaatcatgatatatgaacacccaagccataat-cataaacaacaacatgtctcagcaacaataacatcaattaaaacttgattctcacc 8268907  T
Q  201 ccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattc 300  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8268906 tcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcataacaaccaattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 8268807  T
Q  301 atttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 352  Q
    ||||| | |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8268806 atttatcgttcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 8268755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 371
Target Start/End: Original strand, 7853913 - 7854245
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| | |||||||    
T  7853913 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactca-tttctcaacaacaatcatgattcatgcaaacccaag 7854011  T
Q  137 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaatt 235  Q
    |||| | | || |||||| | ||  || | ||||||||||| | |||| | | |||  || | | ||||||| |||||| |||| ||||| ||| |||||    
T  7854012 ccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattg-atcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatg-cataattcaccaatt 7854109  T
Q  236 aagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcac 335  Q
     | ||||||||  |||  | |||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  7854110 gaacataatttaccaattatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctc 7854209  T
Q  336 caaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
     | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  7854210 tacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 7854245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 54685625 - 54685293
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||   ||| | | |||||    
T  54685625 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaacagcaactcattt-ctcaacaacaatcatgaatcatgcaaatccaag 54685527  T
Q  137 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaatt 235  Q
    |||| | | || |||||| | ||  || | ||||||||||| | |||||  | |||  || | | ||||||| ||||||| ||| ||||| ||| |||||    
T  54685526 ccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgat-catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaatt 54685429  T
Q  236 aagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcac 335  Q
     ||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  54685428 gagcataatttaccaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctc 54685329  T
Q  336 caaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
     | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  54685328 tacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 54685293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 371
Target Start/End: Original strand, 33341812 - 33342144
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 136  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||| | |||||||    
T  33341812 acataatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattt-ctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaag 33341910  T
Q  137 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaatt 235  Q
    |||| | | || |||||| | ||  || | ||||||||||| | |||||  | |||  || | |  |||||| ||||||| ||| ||||| ||| |||||    
T  33341911 ccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgat-catgaaacatatcataattcatcaacaaccatg-cataattcaccaatt 33342008  T
Q  236 aagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcac 335  Q
     ||||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  33342009 gagcataatttaccaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcattaaacatcaaattaacatattcaaacatatctc 33342108  T
Q  336 caaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
     |  |||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  33342109 taccacattagcacgaatttcaaagattgggttcat 33342144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 436 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 12902039 - 12901933
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 535  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12902039 atgattatgatgataactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttaactcctaattctccaatcttcaaattttccccc 12901940  T
Q  536 tttgcta 542  Q
    |||||||    
T  12901939 tttgcta 12901933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 436 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 15938426 - 15938320
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 535  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15938426 atgattataatgataactaacccccttaccttaggctatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 15938327  T
Q  536 tttgcta 542  Q
    |||||||    
T  15938326 tttgcta 15938320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 203 - 372
Target Start/End: Original strand, 18970016 - 18970185
Alignment:
Q  203 aattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaa-caacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18970016 aattcaacaacaacatgtcataattcatcaattgagcataatt-cacaaactacccatttacatacatcatgaacatgaaatttcatcatcaacaattca 18970114  T
Q  302 tttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcata 372  Q
     ||||||||||||||||||| | |||| |||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18970115 attaacatcaaattaacatacttaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcata 18970185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 436 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 15936584 - 15936478
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 535  Q
    |||||||| ||||  |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15936584 atgattataatgataactaacccccataccttaggctacgatcaattcaaacttgagcttcacttttgctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 15936485  T
Q  536 tttgcta 542  Q
    |||||||    
T  15936484 tttgcta 15936478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 64 - 371
Target Start/End: Original strand, 30152898 - 30153205
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 161  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||   ||| | ||||||||||||  |||| |||||||| ||      
T  30152898 atcaacccattttcaccaaaacaccaacaacaatccattt-ctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaatatga 30152996  T
Q  162 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccatt 260  Q
    || | ||||||||||| | |||||  | |||  || | | ||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||    
T  30152997 ctaaacaacaacaacaaccattgat-catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccatt 30153094  T
Q  261 ttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaag 360  Q
    ||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||  |||||||| |||||||    
T  30153095 ttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaag 30153194  T
Q  361 attgggttcat 371  Q
    |||||||||||    
T  30153195 attgggttcat 30153205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 47785064 - 47784915
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaa 135  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||    
T  47785064 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacagaatcaccaacaacaactca-tttctcaccaacaaatcatgaattatgaacacccaa 47784966  T
Q  136 gccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaa 186  Q
    ||||| | |||| | |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||    
T  47784965 gccatgaatcattaacaacaacatcacttaacaacaacaacatcaactgaa 47784915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 398 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 11477163 - 11477029
Alignment:
Q  398 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 497  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||    
T  11477163 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaagactaacccccttaccttaggtaatgattaattcaaacttaggcttca 11477066  T
Q  498 ctttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 534  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  11477065 ctttaactcctaattcttcaatcttcaagtttccccc 11477029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 202 - 371
Target Start/End: Original strand, 38168008 - 38168177
Alignment:
Q  202 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattca 301  Q
    ||||||| |||||||||  ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  38168008 caattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 38168107  T
Q  302 tttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  | | ||||  || ||||| ||||||||||||||||||    
T  38168108 tttaacatcaaattaacatattcaaacatatttctacaacataagtacgaatttcaaagattgggttcat 38168177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 205 - 407
Target Start/End: Original strand, 48421674 - 48421877
Alignment:
Q  205 ttcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatt-tcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatt 303  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||| ||| ||| ||||||||  || ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| |    
T  48421674 ttcaacaacaacatgtcataattcaccaattgaacataattctca-aactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcaccaacaattcaat 48421772  T
Q  304 taacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttca-tataaattcttactcaattaagcactttttca 402  Q
    || ||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||| ||| |||||||||||||||||  ||||   |||| |||||||||||||| ||||    
T  48421773 tatcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcatgaatttcaaagattgggttcacaataatcacttattcaattaagcacttattca 48421872  T
Q  403 tacaa 407  Q
    |||||    
T  48421873 tacaa 48421877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 183
Target Start/End: Original strand, 18910960 - 18911070
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 171  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18910960 atttcacaaaaccaccaacaacatcttattt-ctcatcaacaattatggtatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca 18911058  T
Q  172 acaacatcaatt 183  Q
    ||||||||||||    
T  18911059 acaacatcaatt 18911070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Original strand, 45581744 - 45581894
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  45581744 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcattaatcatcaaattaacat 45581843  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    |||||||| |||| | | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  45581844 attcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 45581894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Original strand, 53771154 - 53771304
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53771154 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccattcatttaacatcaaattaacat 53771253  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    || ||||| |||| | | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  53771254 atccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 53771304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Original strand, 16261566 - 16261716
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||| | ||| |||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16261566 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcgtacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccattcatttaacatcaaattaacat 16261665  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    || ||||| |||| | | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16261666 atccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 16261716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 254 - 371
Target Start/End: Original strand, 55513016 - 55513133
Alignment:
Q  254 acccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaa 353  Q
    |||||||||||| ||| || ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | | ||||  ||||||||     
T  55513016 acccattttcatacatcattaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcgaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaat 55513115  T
Q  354 ttcaaagattgggttcat 371  Q
    ||||||||||||||||||    
T  55513116 ttcaaagattgggttcat 55513133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 221 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 54038266 - 54038159
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54038266 cataattcaccaatttagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 54038167  T
Q  321 attcaaac 328  Q
    ||||||||    
T  54038166 attcaaac 54038159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Original strand, 2844304 - 2844454
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2844304 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 2844403  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    ||| ||||  |   | | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  2844404 attaaaacaaaaatctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 2844454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Original strand, 3992663 - 3992813
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||| | ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3992663 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcctacatcatgaacctgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 3992762  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    |||||||| |||| | | ||||  |||||| | ||||||| ||| ||||||    
T  3992763 attcaaacatatctctacaacataagcacggatttcaaaggttgagttcat 3992813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 257 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 17956090 - 17955976
Alignment:
Q  257 cattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattc 356  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |  |||  |||||||| |||    
T  17956090 cattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcagacatatctctaccacataagcacgaatttc 17955991  T
Q  357 aaagattgggttcat 371  Q
    |||||||||||||||    
T  17955990 aaagattgggttcat 17955976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 371
Target Start/End: Original strand, 23492502 - 23492636
Alignment:
Q  237 agcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcacc 336  Q
    ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |     
T  23492502 agcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcataatcaacaattcatttaacatcaaattaacacattcaaacatatctct 23492601  T
Q  337 aaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    | ||||  |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23492602 acaacataagcaagaatttcaaagattgggttcat 23492636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 473 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 9303036 - 9302968
Alignment:
Q  473 atgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccctttgcta 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9303036 atgatcaattcaaacttgagcttcactttaactcctaattctccaatcttcaag-tttccccctttgcta 9302968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 370
Target Start/End: Original strand, 15550703 - 15550860
Alignment:
Q  213 caacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaa-caacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatca 311  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||| |||| ||||| | ||||||||  || ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  15550703 caacatgtcacaattcatcaattgagcacaatt-cacaaactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaaaaattcaattatcatca 15550801  T
Q  312 aattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttca 370  Q
    |||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||| ||||||  |||||||||    
T  15550802 aattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttgggttca 15550860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Original strand, 28558284 - 28558434
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||| ||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28558284 cataattcaccaattgagcatcatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaatttatttatcatcaaattaacat 28558383  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    |||||||| |||| | |  |||  |||||||| |||||||||| |||||||    
T  28558384 attcaaacatatctctatcacataagcacgaatttcaaagattaggttcat 28558434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 218
Target Start/End: Original strand, 12952920 - 12953074
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 161  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| || |    
T  12952920 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactcattt-ctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatct 12953018  T
Q  162 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| | | || || | |||||||||||||||||    
T  12953019 cttagcaacaacaacatcaatt-aaacataaatctcatcacaattcaacaacaacat 12953074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 38811297 - 38811176
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 163  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | || |||  |||||  |||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||    
T  38811297 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcattt-ctgatcatcaaaacatgaattatgcacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcact 38811199  T
Q  164 cagcaacaacaacatcaattgaa 186  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  38811198 tagcaacaacaacatcaattgaa 38811176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 218
Target Start/End: Original strand, 1990759 - 1990913
Alignment:
Q  64 atcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaac-acccaagccataattcataatcaacaacatat 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||| ||||||| | ||||||||| | |||| | |||||| || |    
T  1990759 atcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactca-tttctcatcatcaaatcatgatttatgaacaaaccaagccatgaatcatcaacaacaatatct 1990857  T
Q  162 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
    || | ||||||||||||| ||| |||| |||||| || | || ||||||||||||||    
T  1990858 cttaacaacaacaacatc-atttaaacatgattctcatcacagttcaacaacaacat 1990913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 6228916 - 6228628
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 161  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |  |||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| || |    
T  6228916 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactta-attctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattt 6228818  T
Q  162 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta-agcataatttcacaacaacccatt 260  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |  ||||| ||||||||||  || || ||| || ||| |||| || ||||||| |   ||||    
T  6228817 cttagcaacaacaacatcaatt-aaacatgatccacatcataattcgacaacaacatagcacaattcaacatttagagcacaa-ttcacaatatatcatt 6228720  T
Q  261 ttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 352  Q
    ||||   | ||||||||||| |||||| || |||||||||| ||| || ||| || |  ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||    
T  6228719 ttcacatactatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcaccataattagagcacgaa 6228628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 11986112 - 11986038
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  11986112 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 11986038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 31412572 - 31412330
Alignment:
Q  115 tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaaca 214  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || | |||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| | |||| || | |||||||||||||    
T  31412572 tcatgatttatgaacactcaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacctaattctcatcacaattcaacaaca 31412474  T
Q  215 acatgtcataagtcatcaatt-aagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaa 313  Q
    |||| ||| || ||| ||||| ||||| || ||||||| |   ||||||||   | ||||||||||  |||||| || |||||||||| ||| || |||     
T  31412473 acatatcacaattcaacaattaaagcacaa-ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaat 31412375  T
Q  314 ttaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaa 358  Q
    || |  ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  31412374 ttcatgtattcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 31412330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 271 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 12539153 - 12539066
Alignment:
Q  271 atgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaa 358  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||| |||| | |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  12539153 atgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattatcaacaaattcacatactcaaccatatcactaaaacaagagcacgaatttcaa 12539066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Original strand, 16261777 - 16261851
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  16261777 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaattccaacttaggcttcactttagctcctaa 16261851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 51961063 - 51960990
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctccta 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||   |||||||||| ||||||    
T  51961063 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttagacttcactttacctccta 51960990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 235
Target Start/End: Original strand, 17191519 - 17191668
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaatt 183  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||||||||| |||||||| | |||| | |||||||||  || ||||||| |||||||||||    
T  17191519 accaccaacaactcattt-ctcatcaacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaacattacttagcaacagcaacatcaatt 17191617  T
Q  184 gaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 235  Q
     |||| ||||||  | | ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||    
T  17191618 -aaacatgattcttatcacaattcagcaacaacataacataattcatcaatt 17191668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 113 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12488967 - 12488846
Alignment:
Q  113 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaa 212  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||| | | ||| ||  | | |||||||||||    
T  12488967 aatcatgaattatgaacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg-atcatgaatcttatcacaattcaacaa 12488869  T
Q  213 caacatgtcataagtcatcaatt 235  Q
    ||||||  ||||| |||||||||    
T  12488868 caacataacataattcatcaatt 12488846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 215
Target Start/End: Original strand, 17204667 - 17204807
Alignment:
Q  74 tttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaa 172  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||| |||||||||||||| | |||| | |||||| ||  || ||||||||    
T  17204667 tttacaaaaccactaacaacaactcattt-ctcatcaacaaatcatgaattataaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattacttagcaacaa 17204765  T
Q  173 caacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa 215  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||  | | ||||||||||||||    
T  17204766 caacatccatt-aaacatgattcctatcacaattcaacaacaa 17204807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 182
Target Start/End: Original strand, 34559857 - 34559974
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 163  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||| || | ||| ||||| ||||||||| |||||||| | |||| | |||||| ||  ||    
T  34559857 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactca-attctcatcatcaaattatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcact 34559955  T
Q  164 cagcaacaacaacatcaat 182  Q
     ||||||||||||||||||    
T  34559956 tagcaacaacaacatcaat 34559974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Original strand, 53771365 - 53771439
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  53771365 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 53771439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4162446 - 4162342
Alignment:
Q  113 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaa 212  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| |  ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |   |||||||||    
T  4162446 aatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatagttcttagcaacaacaacatcaatt-aaacatgattcacgtcatcattcaacaa 4162348  T
Q  213 caacat 218  Q
    ||||||    
T  4162347 caacat 4162342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 358
Target Start/End: Original strand, 10912945 - 10913136
Alignment:
Q  167 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta-agcataatttcacaaca-acccattttca 264  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| || |||| || |||||| |||||||  || || ||| |||||| |||| |||| ||||| | |||||||||||    
T  10912945 caacaacaacatcaatt-aaacatgaatctcaccacatttcaaccacaacatagcacaattcaacaattagagcacaatt-cacaatatacccattttca 10913042  T
Q  265 tccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaa 358  Q
       |||||| |||||  ||||||||| |||||||||| ||| || |||||| |  || |||||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  10913043 catattatggacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 10913136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 38375797 - 38375693
Alignment:
Q  254 acccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaa 353  Q
    |||||||||||   ||||||||||||  ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| |  || |||||| ||||| || ||||||||||||||     
T  38375797 acccattttcacaaattatgaacatgcaatttcatctacaacaattcaattatcatcaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaat 38375698  T
Q  354 ttcaa 358  Q
    |||||    
T  38375697 ttcaa 38375693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 287 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 37915361 - 37915290
Alignment:
Q  287 atcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaa 358  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| |||||| | ||| |||||||||| |||||    
T  37915361 atcatcaacaattcaattaacaacaaattaacatacccaaacatatcactacaactagagcacgaatttcaa 37915290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 218
Target Start/End: Original strand, 41661573 - 41661675
Alignment:
Q  115 tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaaca 214  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || | |||| | |||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| || | ||||||||||| |    
T  41661573 tcatgatttatgaacactcaagctatgaatcatcaacaacaatatctctcaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaata 41661671  T
Q  215 acat 218  Q
    ||||    
T  41661672 acat 41661675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Original strand, 2050115 - 2050189
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  2050115 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 2050189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 9591035 - 9590922
Alignment:
Q  73 ttttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 171  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| |||| || ||| ||||||  |||||||||||||| ||| | |||| | |||||| ||  || | |||||    
T  9591035 ttttacaaaaccaacaacaacaactcattt-ctcatcatcaaatcatgaactatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaaca 9590937  T
Q  172 acaacatcaattgaa 186  Q
    |||||||||||||||    
T  9590936 acaacatcaattgaa 9590922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Original strand, 38168237 - 38168311
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  38168237 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 38168311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Original strand, 54651764 - 54651838
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||  |||||||  |||||| || |||||||||    
T  54651764 atgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatgatgattaacccaaacttttgcttcaattaagctcctaa 54651838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3576705 - 3576558
Alignment:
Q  87 caacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 185  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||| | |||| | | |||| ||  || ||||||||||||||||| | |    
T  3576705 caacaacaactcattt-ctcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaaccacaatattacttagcaacaacaacatcaa-tca 3576608  T
Q  186 aacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 235  Q
    ||| ||| ||  | | |||||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  3576607 aacatgactcttatcacaattcaacaacaacatagcataatccatcaatt 3576558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Original strand, 13839200 - 13839233
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13839200 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 13839233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 271 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 14177102 - 14177021
Alignment:
Q  271 atgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 352  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| | |||| |||||| | |||| ||| |||||    
T  14177102 atgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattatcatcaaatgaacatactgaaacatatcactacaacatgaggacgaa 14177021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 17960602 - 17960565
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17960602 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcattt 17960565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 15857195 - 15857163
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15857195 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 15857163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 410 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 8268708 - 8268649
Alignment:
Q  410 caagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  8268708 caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgataataactaacccccttaccttag 8268649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 410 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 8275808 - 8275749
Alignment:
Q  410 caagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  8275808 caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgataataactaacccccttaccttag 8275749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 358
Target Start/End: Original strand, 17393597 - 17393684
Alignment:
Q  271 atgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaa 358  Q
    |||||||||  |||||||| |||| |||||| ||| || ||||||||||||  ||||| |||||| | ||| |||||||||| |||||    
T  17393597 atgaacatgcaatttcatcgtcaataattcaattatcaacaaattaacatacccaaacatatcactacaactagagcacgaatttcaa 17393684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 185
Target Start/End: Original strand, 14295415 - 14295516
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaat 182  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   ||| | ||||||||||| | | || |||||||||||  || || |||||||||||||||    
T  14295415 caccaacaacatctcattt-ctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagaaacaacaacatcaat 14295513  T
Q  183 tga 185  Q
    |||    
T  14295514 tga 14295516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Original strand, 33342204 - 33342278
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  33342204 atgattatgataaagactaaccctcttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 33342278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 43427753 - 43427510
Alignment:
Q  115 tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaaca 214  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || | |||| | ||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || | |||||| || | ||| |||||||||    
T  43427753 tcatgatttatgaacaccaaagctatgaatcatcaacaacaa--tatctcaacaacaacaacatcaatt-aatcatgattctcatcacaactcaacaaca 43427657  T
Q  215 acatgtcataagtcatcaatta-agcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaa 313  Q
    ||||  || || ||| |||||| |||| ||||| |||| |   ||||||||   | ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||| || |||     
T  43427656 acatagcacaattcaacaattagagcacaattt-acaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaat 43427558  T
Q  314 ttaacata---ttcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaa 358  Q
    || |  ||    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  43427557 ttcatgtactcatcaaacatatcaccataacaagagcacgaatttcaa 43427510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 2449184 - 2449151
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2449184 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 2449151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 11061247 - 11061174
Alignment:
Q  113 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaa 186  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  || |||| |||||||||||||||||    
T  11061247 aatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaccaacaacatcaattgaa 11061174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 11329230 - 11329130
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaatt 183  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||   ||| | ||||||||||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  11329230 accaacaacatctcattt-ctcatcaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaatt 11329132  T
Q  184 ga 185  Q
    ||    
T  11329131 ga 11329130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 14842519 - 14842486
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14842519 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 14842486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 185
Target Start/End: Original strand, 17139486 - 17139586
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaatt 183  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||   ||| | ||||||||||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  17139486 accaacaacatctcattt-cgcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaatt 17139584  T
Q  184 ga 185  Q
    ||    
T  17139585 ga 17139586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 17912430 - 17912397
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17912430 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 17912397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 19260781 - 19260748
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19260781 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 19260748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Original strand, 23492696 - 23492729
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23492696 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 23492729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 468
Target Start/End: Original strand, 7854305 - 7854337
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 468  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7854305 atgattatgatgaaaactaacccccttacctta 7854337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 186
Target Start/End: Original strand, 14080489 - 14080588
Alignment:
Q  87 caacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 185  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| ||| |||| | |||||||||  ||  |||| |||||||||||||||    
T  14080489 caacaacaactcattt-ctcatcaccaaatcatgaattatgaatacccaagccgtaaatcatcaacaacaacattacttcgcaataacaacatcaattga 14080587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 468
Target Start/End: Original strand, 15615137 - 15615169
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 468  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15615137 atgattatgataaagactaacccccttacctta 15615169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 17955916 - 17955884
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 468  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17955916 atgattatgataaagactaacccccttacctta 17955884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33369199 - 33369045
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 161  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||| | |||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||||| ||| | || | | |||||| ||      
T  33369199 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaatttattt-ctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagtcatgaatcgtcaacaacaatattc 33369101  T
Q  162 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
    || | |||||| |||||||||| |||| |||||| || |  ||||||||||||||||    
T  33369100 cttaacaacaaaaacatcaatt-aaacatgattctcatcataattcaacaacaacat 33369045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 101 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 6477 - 6043
Alignment:
Q  101 tttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacc 200  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6477 tttctcatcaacaattatgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcatcaacaacatcaattgaaacttgattcacacc 6378  T
Q  201 ccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6377 ccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcttaatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 6278  T
Q  301 atttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcatataaattcttac-tcaattaagcactttt 399  Q
    ||||| |||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||| || | || |||||||||||    
T  6277 atttatcattcaattaacatactcaatcttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcacttaaactaagcactttt 6178  T
Q  400 tcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcact 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6177 tcatacaaaccaagaaaaattgc-aaacaaacaattatgattatgtttaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcact 6079  T
Q  500 ttagctcctaa-ttctccaatcttcaagttttcccc 534  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  6078 ttagctcctaatttcttcaatcttcaagttttcccc 6043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 56)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 72 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 3431570 - 3431114
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 171  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  3431570 atttcacaaaaccaccaacaacatcttattt-ctcacaaacaatcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatgtctcagcaaca 3431472  T
Q  172 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccatta 271  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3431471 acaacatcaatcgaaacttgattctcaccttaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaactcattttcatacatta 3431372  T
Q  272 tgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  3431371 tgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaatcttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 3431272  T
Q  372 ataaattcttactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggt 471  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3431271 atgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgc-aaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggt 3431173  T
Q  472 tatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttt 529  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  3431172 tatgatcaatccaaacttgggcttcactttagctcctaattgcttcaatcttcaagttt 3431114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 85 - 534
Target Start/End: Original strand, 22886305 - 22886753
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattg 184  Q
    |||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22886305 accaacaacatcttaatttctcatcaacaatcatgatatatgaacacccaagtcataaatcataaacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattg 22886404  T
Q  185 aaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatt 284  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22886405 aaacttgattctcacctcaattca-caacaacatgtcatagttcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatt 22886503  T
Q  285 tcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcatataaattcttact 384  Q
    |||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22886504 tcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttattaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattggattcatataaattcttact 22886603  T
Q  385 caattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattca 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  22886604 caattaagcactttttcatacaaaccaag-aaaattgcaaaaaaaacaattatgattatgattaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatcca 22886702  T
Q  485 aacttgagcttcactttagctcctaa-ttctccaatcttcaagttttcccc 534  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  22886703 aacttaagcttcactttagctcctaatttcttcaatcttcaagtttccccc 22886753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 85 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 21494725 - 21494290
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattg 184  Q
    |||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21494725 accaacaacatctcaatt-ctcaccaacaatcatgatatatgcacacccaagttataaatcataaacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattg 21494627  T
Q  185 aaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatt 284  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||            |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21494626 aaacttgattctcacctcaatccaacaacaacat------------caattaagcataatttcacaactaccccttttcatacattatgaacatgttatt 21494539  T
Q  285 tcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcatataaattcttact 384  Q
    |||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21494538 tcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaaattatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcatataaatacttact 21494439  T
Q  385 caattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattca 484  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||    
T  21494438 caattaagcactatttcatacaaaccaag-aaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaagactaacccccttaccttagataatgattaatcca 21494340  T
Q  485 aacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 534  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21494339 aacttaggcttcactttagctcctaattcttcaatcttcaagtttacccc 21494290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 101 - 527
Target Start/End: Original strand, 18612401 - 18612815
Alignment:
Q  101 tttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacc 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||    
T  18612401 tttctcaccaacaatcatgatatatgaacactcaagccataat-cataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattaaatcttgatttccacc 18612499  T
Q  201 ccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattc 300  Q
     ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18612500 tcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcataacaatccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 18612599  T
Q  301 atttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattca-aagattgggttcatataaattcttactcaattaagcactttt 399  Q
    ||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | || | |       ||| ||||| | | |||| || |  |  |    
T  18612600 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaatttaacaacaat-------tatcaattcattc-caatcaacccat--t 18612689  T
Q  400 tcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcact 499  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  18612690 tcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattgtgaagaacactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaatttgggcttcact 18612787  T
Q  500 ttagctcctaattctccaatcttcaagt 527  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18612788 ttagctcctaattcttcaatcttcaagt 18612815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 101 - 529
Target Start/End: Original strand, 22147433 - 22147849
Alignment:
Q  101 tttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacc 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  22147433 tttctcaccaacaatcatgatatatgaacacctaagccataata-atatacaacgacatgtctcagcaacaacaacatcaattaaaatttgattctcacc 22147531  T
Q  201 ccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattc 300  Q
     ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22147532 tcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 22147631  T
Q  301 atttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattca-aagattgggttcatataaattcttactcaattaagcactttt 399  Q
    ||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | || | |       ||| ||||| | | |||| || |  |  |    
T  22147632 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaatttaacaacaat-------tatcaattcattc-caatcaacccat--t 22147721  T
Q  400 tcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcact 499  Q
    ||||||||  |||| ||||||| |||  ||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22147722 tcatacaa--caaggaaaattgaaaacaaaacaatcatgattatgaagaacactaaaccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcacc 22147819  T
Q  500 ttagctcctaattctccaatcttcaagttt 529  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22147820 ttagctcctaattcttcaatcttcaagttt 22147849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 101 - 352
Target Start/End: Original strand, 18619306 - 18619556
Alignment:
Q  101 tttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacc 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||    
T  18619306 tttctcaccaacaatcatgatatatgaacactcaagccataat-cataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattaaatcttgatttccacc 18619404  T
Q  201 ccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattc 300  Q
     ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18619405 tcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcataacaatccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 18619504  T
Q  301 atttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 352  Q
    ||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18619505 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 18619556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 101 - 352
Target Start/End: Original strand, 2544944 - 2545191
Alignment:
Q  101 tttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2544944 tttctcaacaacaatcatgatatatcaacacccaagccataat-cataaacaacaacatgtatca---acaacaacatcaattgaaacttgattcccacc 2545039  T
Q  201 ccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattc 300  Q
     ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2545040 tcaattcaacaacaacatgttataattcatcaattaagcataattttacaactacccattttcacacattatgaatatgttatttcatcaccaacaattc 2545139  T
Q  301 atttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 352  Q
    ||||| |||  |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2545140 atttatcattcaattaacatactcaaacttattaccaaaataagagcacgaa 2545191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 415 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 16038839 - 16038713
Alignment:
Q  415 aaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattct 514  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16038839 aaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgatgaagacaaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattct 16038740  T
Q  515 ccaatcttcaagttttccccctttgcta 542  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  16038739 ccaatcttcaag-tttccccctttgcta 16038713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 398 - 542
Target Start/End: Original strand, 2545229 - 2545371
Alignment:
Q  398 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 497  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  2545229 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaattcaaatttaagcttca 2545326  T
Q  498 ctttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccctttgcta 542  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2545327 ctttagctcctaattcttcaatcttcaagttttccccctttgcta 2545371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 202 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22321607 - 22321438
Alignment:
Q  202 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattca 301  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| | | |||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  22321607 caatttaacaataacatgttataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacgtcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 22321508  T
Q  302 tttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22321507 attaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacctgagcacgaatttcaaagattgggttcat 22321438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 13721217 - 13721107
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 171  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13721217 atttcacaaaaccaccaacaacatcttattt-ctcatcaacaattatggtatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca 13721119  T
Q  172 acaacatcaatt 183  Q
    ||||||||||||    
T  13721118 acaacatcaatt 13721107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 202 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 24385913 - 24385743
Alignment:
Q  202 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattca 301  Q
    ||||||| ||||||||   | ||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  24385913 caattcatcaacaacaatgcttaattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 24385814  T
Q  302 tttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcata 372  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24385813 tttaacatcaaattatcatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcata 24385743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 41506951 - 41506801
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41506951 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 41506852  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    |||||||| |||| | | ||||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  41506851 attcaaacatatctctacaacataagcacggatttcaaagattgggttcat 41506801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Original strand, 39115388 - 39115538
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||  |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39115388 cataattcaccaattgagcataatttacaaattacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 39115487  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    |||||||| ||||   | ||||  ||||||||  |||||||||||||||||    
T  39115488 attcaaacatatctttacaacataagcacgaatgtcaaagattgggttcat 39115538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 232 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 16039012 - 16038892
Alignment:
Q  232 aattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaactta 331  Q
    |||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||     
T  16039012 aattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttc 16038913  T
Q  332 tcaccaaaacaagagcacgaa 352  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16038912 tcaccaaaacaagagcacgaa 16038892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 206 - 372
Target Start/End: Original strand, 17502259 - 17502425
Alignment:
Q  206 tcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaa-caacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcattt 304  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||| | |||| |||  || ||| |||||||||  |||||||||| ||||||||| |     
T  17502259 tcaacaaaaacatgtcataattcatcaattgaacataatt-cacaaactacccttttatatacatcatgaacatgcaatttcatcattaacaattcaatc 17502357  T
Q  305 aacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcata 372  Q
    | ||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||| || |||||||||||||||||||    
T  17502358 atcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacaaatttcaaagattgggttcata 17502425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 210 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21259644 - 21259484
Alignment:
Q  210 caacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaa-caacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaaca 308  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||| |||| ||||| | ||||||||  || ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  21259644 caacaacatgtcacaattcatcaattgagcacaatt-cacaaactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaaaaattcaattatca 21259546  T
Q  309 tcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttca 370  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||| ||||||  |||||||||    
T  21259545 tcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttgggttca 21259484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 218
Target Start/End: Original strand, 33528383 - 33528535
Alignment:
Q  64 atcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatc 162  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||| |   || |||||||| |||||    
T  33528383 atcaacccattttacaaaatcaacaacaacaaccca-tttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatga---atcatcaacaaaatatc 33528478  T
Q  163 tc--agcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
    ||  ||||||||||||||||||| |||| ||| || || | |||||||||||||||||    
T  33528479 tcttagcaacaacaacatcaatt-aaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat 33528535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 257 - 371
Target Start/End: Original strand, 274592 - 274706
Alignment:
Q  257 cattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattc 356  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |  |||   ||||||| |||    
T  274592 cattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttagcatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacatacgcacgaatttc 274691  T
Q  357 aaagattgggttcat 371  Q
    |||||||||||||||    
T  274692 aaagattgggttcat 274706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 257 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 641257 - 641143
Alignment:
Q  257 cattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattc 356  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |  |||   ||||||| |||    
T  641257 cattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttagcatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacatacgcacgaatttc 641158  T
Q  357 aaagattgggttcat 371  Q
    |||||||||||||||    
T  641157 aaagattgggttcat 641143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 257 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 827063 - 826949
Alignment:
Q  257 cattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattc 356  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |  |||   ||||||| |||    
T  827063 cattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttagcatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacatacgcacgaatttc 826964  T
Q  357 aaagattgggttcat 371  Q
    |||||||||||||||    
T  826963 aaagattgggttcat 826949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 218
Target Start/End: Original strand, 5854572 - 5854724
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 163  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  ||    
T  5854572 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaatt-ctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcact 5854670  T
Q  164 cagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
     |||||||||||||||||||| ||| ||| || || | |||||||||||||||||    
T  5854671 tagcaacaacaacatcaattg-aacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat 5854724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21198434 - 21198272
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaac 170  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||  |||||||||||||||||| | |||| | || ||||||  || ||||||    
T  21198434 attttaccaaaccaccaacaacaactcattt-ctcatccacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcattaacagcaacatcacttagcaac 21198336  T
Q  171 aacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 235  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  21198335 aacaacatcaattg-aacatgattcttaccacaattcaacaacaacataacataattcaacaatt 21198272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 218
Target Start/End: Original strand, 38533607 - 38533759
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 163  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||  |||| ||||||||||||| | | || |||||||||||  |     
T  38533607 tcaacccattttacaaagtctccaacaacatctcattt-ctcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacc 38533705  T
Q  164 cagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
     |||||||||||||||||||| ||| ||| || || | |||||||||||||||||    
T  38533706 tagcaacaacaacatcaattg-aacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat 38533759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 206 - 370
Target Start/End: Original strand, 4233953 - 4234117
Alignment:
Q  206 tcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaa-caacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcattt 304  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| |  |||||| ||||| | ||||||||  || ||| || ||||||  |||||||||| ||||||||| |     
T  4233953 tcaacaacaacttgtcataattcatcaattgaaaataatt-cacaaactacccatttatatacatcataaacatgcaatttcatcattaacaattcaatc 4234051  T
Q  305 aacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttca 370  Q
    | ||||||||||||||| |||||| ||||||   |||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  4234052 atcatcaaattaacatactcaaacatatcactgcaacatgagcacaaatttcaaagattgggttca 4234117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16873340 - 16873166
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 171  Q
    |||| |||||| |||||| |||| || |||| |||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16873340 atttcacaaaaccaccaataacatcttattt-ctcatcaataattatggtatatgaacacccaagcctcaaatcatactcaacaacatatctcagcaaca 16873242  T
Q  172 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttca 248  Q
    |||||||| ||| | |  ||||| ||| | || |||||| | ||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  16873241 acaacatcgatt-acatatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttca 16873166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 235
Target Start/End: Original strand, 23837163 - 23837325
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaac 170  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||| | |||| | |||||||||  || ||||||    
T  23837163 atttcacaaaaccaccaccaacaactcattt-ctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaac 23837261  T
Q  171 aacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 235  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  23837262 aacaacatcaattg-aacatgactcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 23837325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 24717004 - 24716892
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| | |||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24717004 cataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcgtgaacttgcaatttcattatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 24716905  T
Q  321 attcaaacttatc 333  Q
    |||||||| ||||    
T  24716904 attcaaacatatc 24716892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 205 - 370
Target Start/End: Original strand, 23217974 - 23218139
Alignment:
Q  205 ttcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaa-caacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatt 303  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||| | | ||||||  || ||| || ||||||  |||||||||| ||||||||| |    
T  23217974 ttcaacaacaacatgtcataattcatcaattgaacataatt-cacaaactagccatttatatacatcattaacatgcaatttcatcattaacaattcaat 23218072  T
Q  304 taacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttca 370  Q
     | ||||||||||||||| |||||| |||||| |  |||  |||||||| ||||||  |||||||||    
T  23218073 catcatcaaattaacatactcaaacatatcactaccacataagcacgaatttcaaaagttgggttca 23218139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 218
Target Start/End: Original strand, 26011452 - 26011604
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 163  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| |  |||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  ||    
T  26011452 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactta-attctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcact 26011550  T
Q  164 cagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
     |||||||||||||||||||  ||| ||| || || | |||||||||||||||||    
T  26011551 tagcaacaacaacatcaatt-caacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat 26011604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27233348 - 27233204
Alignment:
Q  73 ttttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 171  Q
    |||||||||| || ||||||||||| | |||||||  | | ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| || ||| | |||||    
T  27233348 ttttacaaaaccaacaacaacaactta-tttctcattatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaaca 27233250  T
Q  172 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
    |||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||    
T  27233249 acaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaacaacat 27233204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18261762 - 18261608
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 161  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | || |||| || ||| ||||||| ||||||||||||||| || | |||| | |||||| || |    
T  18261762 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttaatt-ctcatcatcaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatct 18261664  T
Q  162 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
    || | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||    
T  18261663 cttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaacaacat 18261608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22736127 - 22736006
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccat-aattcataatcaacaacatatc 162  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||  |||| ||||||||||||| |||| | || |||||||||       
T  22736127 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttt-tcatcaacaattcatgaattatgcacacccaagccatgaattaacaa-caacaacatcag 22736030  T
Q  163 tcagcaacaacaacatcaattgaa 186  Q
    | ||||| ||||||||||||||||    
T  22736029 ttagcaagaacaacatcaattgaa 22736006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 218
Target Start/End: Original strand, 15933256 - 15933408
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 163  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||| |  ||| ||||||| ||  |||||||||||||| | |||| | |||||| ||  ||    
T  15933256 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaatt-ctcatcttcaaatcatgatttacaaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcact 15933354  T
Q  164 cagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
     |||||||||||||||||||||| | ||| || || |  ||||||||||||||||    
T  15933355 tagcaacaacaacatcaattgaa-catgaatctcatcataattcaacaacaacat 15933408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 24385684 - 24385610
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  24385684 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 24385610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33611334 - 33611190
Alignment:
Q  73 ttttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 171  Q
    |||||||||| || ||||||||||| | | ||||| || | ||||||||| ||||||||| |||||||| | |||| | |||||| ||  || |||||||    
T  33611334 ttttacaaaaccaacaacaacaactta-tatctcatcatcaaatcatgatttatgaacacacaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaaca 33611236  T
Q  172 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
    |||||||||||| |||| || ||| || | |||||||||||||||||    
T  33611235 acaacatcaatt-aaacatggttctcaacacaattcaacaacaacat 33611190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 43373424 - 43373350
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  43373424 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 43373350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18041823 - 18041669
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 161  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||| | || ||  || ||||||| |||||||||| |||| || | |||| | |||||| ||||    
T  18041823 atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttattt-cacatcataaactcatgatttatgaacacctaagctatgaatcatcaacaacaatatat 18041725  T
Q  162 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
    || | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | ||| |||||||||||||    
T  18041724 cttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacat 18041669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22497448 - 22497206
Alignment:
Q  115 tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaaca 214  Q
    ||||||| ||||||||||||| | || | |||| | |||||| |  ||| | ||||||||||||||||| |||| ||| || || | ||| |||||||||    
T  22497448 tcatgatttatgaacacccaaactatgaatcattaacaacaatacctcttatcaacaacaacatcaatt-aaacatgaatctcatcacaaatcaacaaca 22497350  T
Q  215 acatgtcataagtcatcaatta-agcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaa 313  Q
    ||||  || || ||| |||||| |||| |||| ||||| |   ||||||||   ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||| || |||     
T  22497349 acatagcacaattcaacaattagagcacaatt-cacaatatatcattttcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaat 22497251  T
Q  314 ttaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaa 358  Q
    || |  || |||||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  22497250 ttcatctactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 22497206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 37653895 - 37653756
Alignment:
Q  73 ttttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 171  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| || | |||||||  ||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||  || | |||||    
T  37653895 ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttt-tcatcatcaaatcatg--atatgaacacccaagccataaatcatcaacaacaatattccttaacaaca 37653799  T
Q  172 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa 215  Q
    |||||||||||| |||| |||||| || |  |||||||||||||    
T  37653798 acaacatcaatt-aaacatgattctcaacagaattcaacaacaa 37653756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 426 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 16404942 - 16404900
Alignment:
Q  426 acaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttacctta 468  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16404942 acaaataatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 16404900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 38635878 - 38635785
Alignment:
Q  124 atgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
    ||||||||||||||||| | |||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| || |  ||||||||||||||||    
T  38635878 atgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcataattcaacaacaacat 38635785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 45465393 - 45465263
Alignment:
Q  87 caacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 185  Q
    |||||||||||||||| | || || |||| |||||| ||||||||||||| | || | |||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||||| |    
T  45465393 caacaacaactcatttcc-catcatcaattcatgatttatgaacacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-a 45465296  T
Q  186 aacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
    ||| |||||| || | ||||||||||| |||||    
T  45465295 aacatgattctcatcacaattcaacaataacat 45465263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 45559176 - 45559074
Alignment:
Q  115 tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaaca 214  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| || | |||| | |||||| ||  || | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||    
T  45559176 tcatgatttatgaccacccaagctatgaatcatcaacaacaatatcccttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaaca 45559078  T
Q  215 acat 218  Q
    ||||    
T  45559077 acat 45559074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 466
Target Start/End: Original strand, 17345887 - 17345917
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttacct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17345887 atgattatgatgaagactaacccccttacct 17345917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 41506741 - 41506671
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctc 506  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||| ||  |||||||  |||||| ||||||||    
T  41506741 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttagataaggattaacccaaacttaggcttcaatttagctc 41506671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Original strand, 5238404 - 5238437
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5238404 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 5238437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 7000551 - 7000478
Alignment:
Q  437 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| | | ||| ||  |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  7000551 tgattatgatgaaaactaacccccttactttagataaggattaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 7000478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 218
Target Start/End: Original strand, 22742717 - 22742874
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatc-atgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 161  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||| |||| |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | |||| | |||||| ||      
T  22742717 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttattt-ctcatcaacaaaccaagatttatgaacacccaagccacgaatcatcaacaacaatattc 22742815  T
Q  162 ct---cagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
    ||   || ||||||||||||||||| |||| |||||| || |  ||||||||||||||||    
T  22742816 ctcaacaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcataattcaacaacaacat 22742874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 22907160 - 22907127
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22907160 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 22907127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 24661194 - 24661161
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24661194 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 24661161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 31194249 - 31194216
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31194249 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttag 31194216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 39447034 - 39446935
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaatt 183  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||  ||| | ||||||||||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  39447034 accaacaacatctcattt-ctcaacaacaaatcataatc-atgcatacccaagccatgaattattatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaatt 39446937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Original strand, 43685863 - 43685896
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43685863 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 43685896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 352
Target Start/End: Original strand, 22887941 - 22888005
Alignment:
Q  288 tcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 352  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||| | ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  22887941 tcatcaacaattcaaatatcatcaaattcatatactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 22888005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 24716794 - 24716762
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 468  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24716794 atgattatgataaagactaacccccttacctta 24716762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 63)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 72 - 529
Target Start/End: Original strand, 371055 - 371511
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 171  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  371055 atttcacaaaaccaccaacaacatcttattt-ctcacaaacaatcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatgtctcggcaaca 371153  T
Q  172 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccatta 271  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  371154 acaacatcaatcgaaacttgattctcaccttaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacatta 371253  T
Q  272 tgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  371254 tgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaatcttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 371353  T
Q  372 ataaattcttactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggt 471  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  371354 atgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgc-aaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggt 371452  T
Q  472 tatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttt 529  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  371453 tatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaattgcttcaatattcaagttt 371511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 436 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 18253792 - 18253685
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaag-ttttcccc 534  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18253792 atgattataatgataactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaatttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagtttttcccc 18253693  T
Q  535 ctttgcta 542  Q
    ||||||||    
T  18253692 ctttgcta 18253685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 436 - 542
Target Start/End: Original strand, 15862226 - 15862332
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 535  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862226 atgattatgataataactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcaacttaactcctaattctccaatcttcaagttttccccc 15862325  T
Q  536 tttgcta 542  Q
    |||||||    
T  15862326 tttgcta 15862332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 18980310 - 18980200
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 171  Q
    |||| |||||| ||||| ||||| || |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18980310 atttcacaaaaccaccaccaacatcttattt-ctcatcaacaattatgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca 18980212  T
Q  172 acaacatcaatt 183  Q
    ||||||||||||    
T  18980211 acaacatcaatt 18980200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Original strand, 126528 - 126678
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  126528 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 126627  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    |||||||| |||| |   ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  126628 attcaaacatatctctgcaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 126678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14251187 - 14251077
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 171  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||| |||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14251187 atttcacaaaaccaccaacaacatcttattt-ctcatcaacaattatggtatctgaacacccaagccataagtcataatcaacaacatatctcagcaaca 14251089  T
Q  172 acaacatcaatt 183  Q
    ||||||||||||    
T  14251088 acaacatcaatt 14251077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 111411 - 111261
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  111411 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccattcatttaacatcaaattaacat 111312  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    |||||||| |||| | | ||||  |||||||| |||||| |||||||||||    
T  111311 attcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaatattgggttcat 111261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Original strand, 2029034 - 2029184
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||| | ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029034 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcgtacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 2029133  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    |||||||| |||  | | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  2029134 attcaaacatatatctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 2029184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 32494188 - 32494038
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32494188 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaatttatttaacatcaaattaacat 32494089  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    |||||||| |||| | | ||||  | |||||| ||||||||||||||||||    
T  32494088 attcaaacatatctctacaacataaacacgaatttcaaagattgggttcat 32494038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 183
Target Start/End: Original strand, 15927535 - 15927645
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 171  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||| |||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15927535 atttcacaaaaccaccaacaacatcttattt-ctcatcaacaattatggtatgtgaacacccaagccatagatcataatcaacaacatatctcagcaaca 15927633  T
Q  172 acaacatcaatt 183  Q
    ||||||||||||    
T  15927634 acaacatcaatt 15927645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 42056431 - 42056281
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaa-caacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaaca 319  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42056431 cataattcaccaattgagcataatt-cacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccattcatttaacatcaaattaaca 42056333  T
Q  320 tattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    ||| ||||| |||| | | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  42056332 tatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 42056281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 435 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 47480977 - 47480878
Alignment:
Q  435 tatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  47480977 tatgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcactttacctcctaattcttcaatcttcaagtttccccc 47480878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 200 - 370
Target Start/End: Original strand, 13352044 - 13352214
Alignment:
Q  200 cccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaatt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |  || ||||||||  || ||| |||||||||  |||||| ||||||||| |    
T  13352044 cccaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattgagcataattaaaatactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcaccatcaacaaat 13352143  T
Q  300 catttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttca 370  Q
    ||  || ||||||||||||||| | |||| |||||| | |||| ||||||||| ||||| | |||||||||    
T  13352144 caaatatcatcaaattaacatactgaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaagggttgggttca 13352214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 7284376 - 7284229
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 136  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| | || ||||    
T  7284376 acatcgtcaaaatcaaacttctccattatcaacccatttaacaaaaccaccaacaacaactca-tttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaactcaag 7284278  T
Q  137 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 185  Q
    |||| | | || |||||||||||  |  | |||||||||||||||||||    
T  7284277 ccatgaattattatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 7284229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 2190328 - 2190182
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| | |||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2190328 cataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccattcatttaacatcaaattaacat 2190229  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggt 367  Q
    || ||||| |||| | | ||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  2190228 atccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggt 2190182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 202 - 371
Target Start/End: Original strand, 3049677 - 3049845
Alignment:
Q  202 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattca 301  Q
    ||||||| |||||||||  ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||| ||||| ||| |||||| ||  |||||||||||  |||||||    
T  3049677 caattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccatattcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcc-caattca 3049775  T
Q  302 tttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | | || |  | |||||| ||||||||||||||||||    
T  3049776 tttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaatataaacacgaatttcaaagattgggttcat 3049845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 248
Target Start/End: Original strand, 13758337 - 13758511
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 171  Q
    |||| |||||| |||||| |||| || |||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13758337 atttcacaaaaccaccaataacatcttattt-ctcatcaacaattatggtatatgaacacccaagcctcaaatcatactcaacaacatatctcagcaaca 13758435  T
Q  172 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttca 248  Q
    |||||||||||| | |  ||||| ||| | || |||||| | ||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  13758436 acaacatcaatt-acatatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttca 13758511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 14272203 - 14272054
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaa 135  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| || | ||||||||  ||||||||| |||    
T  14272203 acatcattaaaataaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaaccaccaccaacaactca-tttctcatcatctaatcatgaattatgaacactcaa 14272105  T
Q  136 gccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaa 186  Q
    ||||| | |||| | |||||| ||   | ||||||||||||||||||||||    
T  14272104 gccatgaatcatcaacaacaatatcatttagcaacaacaacatcaattgaa 14272054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 206 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 39291666 - 39291513
Alignment:
Q  206 tcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaa-caacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcattt 304  Q
    |||||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||  || ||| || ||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  39291666 tcaacaacaatatgtcacaattcaccaattgagcataatt-cacaaactacccatttatatacatcatcaacatgcaatttcatcatcaacaattcaatt 39291568  T
Q  305 aacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaa 359  Q
    | ||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||| ||||||    
T  39291567 atcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaa 39291513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 282 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1937098 - 1937009
Alignment:
Q  282 atttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |  |||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1937098 atttcatcatgaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 1937009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17224220 - 17224058
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaac 170  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||| | |||| || ||||||||  || ||||||    
T  17224220 attttacaaaaccaccaacaacaactcattt-ctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcattaacaacatcacttagcaac 17224122  T
Q  171 aacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 235  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||  ||  |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  17224121 aacaacatcaattgaa-catgactcttacaacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 17224058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 218
Target Start/End: Original strand, 48356602 - 48356754
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 163  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  ||    
T  48356602 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaatt-ctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcact 48356700  T
Q  164 cagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
     |||||||||||||||||||||| | ||| || || |  ||||||||||||||||    
T  48356701 tagcaacaacaacatcaattgaa-catgaatctcatcataattcaacaacaacat 48356754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 235
Target Start/End: Original strand, 13377485 - 13377656
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 161  Q
    ||||||||||||| || ||| || ||||||||||| |||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||      
T  13377485 atcaacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttattt-ctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatta 13377583  T
Q  162 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 235  Q
    || |||||||||||||||||||||| | ||| ||  | | |||||||||||||||||  ||||| | |||||||    
T  13377584 cttagcaacaacaacatcaattgaa-catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattaatcaatt 13377656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Original strand, 13321334 - 13321408
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  13321334 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacctaggcttcactttagctcctaa 13321408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16915217 - 16915096
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 163  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||  || ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  ||    
T  16915217 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaatt-ctcttcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatgact 16915119  T
Q  164 cagcaacaacaacatcaattgaa 186  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  16915118 tagcaacaacaacatcaattgaa 16915096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Original strand, 25124450 - 25124524
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||    
T  25124450 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 25124524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 15978002 - 15977832
Alignment:
Q  202 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||   |||  | |||| |  || ||  |||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  15978002 caattcaacaacaacatgtcataattcatcatttgagtataattcatcaagtatccatatatatacaccatgaacatgcaatttcatcatcaataattca 15977903  T
Q  302 tttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcata 372  Q
     ||| || |||||||||||| |||||| |||||| | ||| |||||| ||| |||||| |||  |||||||    
T  15977902 attatcaacaaattaacatactcaaacatatcactacaactagagcatgaatttcaaacatttagttcata 15977832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 17984827 - 17984753
Alignment:
Q  284 ttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaa 358  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  17984827 ttcatcatcaacaattcaattatcaacaaattaacatacccaaacatatcactaaaacaagagcacgaatttcaa 17984753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34241477 - 34241325
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 163  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||| ||||||||| |||||||| | |||| | ||||||  |  ||    
T  34241477 tcaaccctttttacaaaaccaacaacaacaactcatttt-tcatcatcaaatcatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatgtcact 34241379  T
Q  164 cagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
     | ||||||||||||||||| |||| |||||| || |  ||||||||||||||||    
T  34241378 tatcaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcataattcaacaacaacat 34241325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 437 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 10000318 - 10000225
Alignment:
Q  437 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttt 529  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| | |||   |||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  10000318 tgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaattgcttcaatcttcaagttt 10000225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 218
Target Start/End: Original strand, 15358803 - 15358907
Alignment:
Q  113 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaa 212  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||| |  ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||    
T  15358803 aatcttgatatatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaaaacttcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattcccatcacaattcaacaa 15358901  T
Q  213 caacat 218  Q
    ||||||    
T  15358902 caacat 15358907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Original strand, 2029244 - 2029318
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||||| |||||  |||||| ||||||||||||    
T  2029244 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaattccaacttaggcttcaatttagctcctaa 2029318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 218
Target Start/End: Original strand, 4446168 - 4446322
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattca-taatcaacaacata 160  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||| || || ||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||| | | || || |||     
T  4446168 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactca-tttcacatcatcaattcatgatttatgaacacccaagccatgaatcattcaacatcagcatc 4446266  T
Q  161 tctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
    ||| | |||||||||||||||||  ||| |||||| || | |||||||||||||||||    
T  4446267 tcttatcaacaacaacatcaatt--aacatgattctcatcacaattcaacaacaacat 4446322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Original strand, 36052971 - 36053045
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  36052971 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 36053045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 42056220 - 42056146
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  42056220 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 42056146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 10000564 - 10000480
Alignment:
Q  167 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaac 252  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| | ||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  10000564 caacagcaacatccattgaaacttgtttctcacctcaattcaac-acaacttatcacaaatcatcaattaagcaaaatttcacaac 10000480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20583795 - 20583691
Alignment:
Q  113 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaa 212  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  || | ||||||||||||||||| |||| |||||| || |  ||||||||||    
T  20583795 aatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcccttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcataattcaacaa 20583697  T
Q  213 caacat 218  Q
    ||||||    
T  20583696 caacat 20583691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 437 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 48622614 - 48622521
Alignment:
Q  437 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttt 529  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||| | |||   |||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  48622614 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaattgcttcaatcttcaagttt 48622521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 8563431 - 8563344
Alignment:
Q  271 atgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaa 358  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | ||| |||||| ||||| || ||||||||||| || |||||    
T  8563431 atgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcatcaaattcatatactcaaacatatcatcataacaagagcacaaatttcaa 8563344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 358
Target Start/End: Original strand, 14935319 - 14935610
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 161  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| | || | | |||||| || |    
T  14935319 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactgattt-ctcatcaacaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcttcaacaacaatatct 14935417  T
Q  162 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaa-ttaagcataatttcacaacaacccatt 260  Q
    ||    |||||||||||| ||| |||  |||||| || |  |||||||||||||||| ||| || ||| ||| || ||||||| ||||||| |   ||||    
T  14935418 ct---taacaacaacatc-atttaaaaatgattctcatcataattcaacaacaacatatcacaattcaacaatttgagcataa-ttcacaatatatcatt 14935512  T
Q  261 ttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaa 358  Q
    ||||   | ||||||||||  |||||| || |||||||||| ||| || ||| || |   |||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  14935513 ttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataactagagcacgaatttcaa 14935610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 358
Target Start/End: Original strand, 15362912 - 15363203
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 161  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| | || | | |||||| || |    
T  15362912 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactgattt-ctcatcaacaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcttcaacaacaatatct 15363010  T
Q  162 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaa-ttaagcataatttcacaacaacccatt 260  Q
    ||    |||||||||||| ||| |||  |||||| || |  |||||||||||||||| ||| || ||| ||| || ||||||| ||||||| |   ||||    
T  15363011 ct---taacaacaacatc-atttaaaaatgattctcatcataattcaacaacaacatatcacaattcaacaatttgagcataa-ttcacaatatatcatt 15363105  T
Q  261 ttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaa 358  Q
    ||||   | ||||||||||  |||||| || |||||||||| ||| || ||| || |   |||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  15363106 ttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataactagagcacgaatttcaa 15363203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17947831 - 17947729
Alignment:
Q  115 tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaaca 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | ||| |||||||||    
T  17947831 tcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaaatcaacaaca 17947733  T
Q  215 acat 218  Q
    ||||    
T  17947732 acat 17947729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 11580693 - 11580619
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  11580693 atgattatgataaagactaatccccttaccttagattaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 11580619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 13036970 - 13036896
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  13036970 atgattatggtgaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 13036896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Original strand, 15709469 - 15709543
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||    |||||  |||||||||||||||||||    
T  15709469 atgattatgatgaagactaatcctcttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcactttagctcctaa 15709543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Original strand, 16212071 - 16212145
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  16212071 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 16212145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 534
Target Start/End: Original strand, 16418805 - 16418903
Alignment:
Q  437 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttttcccc 534  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||| | |||   ||||  ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||    
T  16418805 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaactaaagcttcactttagctcctaattgtttcaatcttcaagtttccccc 16418903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 218
Target Start/End: Original strand, 31501190 - 31501283
Alignment:
Q  124 atgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
    ||||||||||||||||| | |||| | |||||| || ||  | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||    
T  31501190 atgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcataacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaacaacat 31501283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 252
Target Start/End: Original strand, 16418559 - 16418643
Alignment:
Q  167 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaac 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| | ||| || |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  16418559 caacaacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaattcaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttcacaac 16418643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 358
Target Start/End: Original strand, 38424175 - 38424469
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 161  Q
    ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||| ||| || ||| ||||||| |||||||||||||| ||| | |||| | |||||| || |    
T  38424175 atcaacccatttttacaaaacccacaacaacaacttatttt-tcaccatcaaatcatgatttatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatct 38424273  T
Q  162 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaa-ttaagcataatttcacaacaacccatt 260  Q
    || | |||||||||||||| || |||| | |||| || |  ||||||||||||||||   | || ||| ||| || ||||||| ||||||| |   ||||    
T  38424274 cttaacaacaacaacatcactt-aaacataattctcatcataattcaacaacaacatagaacaattcaacaatttgagcataa-ttcacaatatatcatt 38424371  T
Q  261 ttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaa 358  Q
    ||||   | ||||||||||  |||||| || |||||||||| ||| || ||| || |  ||||||||| ||||| || ||| |||||||||| |||||    
T  38424372 ttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattttatgtattcaaacatatcatcataaccagagcacgaatttcaa 38424469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13449094 - 13448964
Alignment:
Q  87 caacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 185  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||| |||||| ||| ||||||||||| |  | |||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||||| |    
T  13449094 caacaacaactcattt-ctcatcatcaattcatgatttatcaacacccaagctacgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-a 13448997  T
Q  186 aacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
    ||| |||||| || | ||||||||||| |||||    
T  13448996 aacatgattctcatcacaattcaacaataacat 13448964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 218
Target Start/End: Original strand, 28390292 - 28390422
Alignment:
Q  87 caacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 185  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||| |||||| ||||||||||||| | || | |||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||||| |    
T  28390292 caacaacaactcattt-ctcatcatcaattcatgatttatgaacacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-a 28390389  T
Q  186 aacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
    ||| |||||  || | ||||||||||| |||||    
T  28390390 aacatgattatcatcacaattcaacaataacat 28390422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 506
Target Start/End: Original strand, 36024452 - 36024523
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaa-cccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctc 506  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||    |||||  |||||||||||||||    
T  36024452 atgattatgatgaagactaaccccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcactttagctc 36024523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 215
Target Start/End: Original strand, 4484733 - 4484834
Alignment:
Q  113 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaa 212  Q
    |||||||||  ||||| |||||||| || | |||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||    
T  4484733 aatcatgattcatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaa 4484831  T
Q  213 caa 215  Q
    |||    
T  4484832 caa 4484834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 181
Target Start/End: Original strand, 11287394 - 11287491
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaa 181  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   ||| | ||||||||||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  11287394 caccaacaacatctcattt-ctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaa 11287491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Original strand, 7293333 - 7293366
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7293333 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 7293366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Original strand, 11516544 - 11516577
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11516544 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 11516577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 185
Target Start/End: Original strand, 13274765 - 13274865
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaatt 183  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||   ||| | ||| ||||||| | |||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  13274765 accaacaacatctcattt-ctcaacaacaaaacatgaatcatgcataccaaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaatt 13274863  T
Q  184 ga 185  Q
    ||    
T  13274864 ga 13274865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 14113935 - 14113902
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14113935 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 14113902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 15441510 - 15441477
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15441510 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 15441477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 30262075 - 30262042
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30262075 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 30262042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 111201 - 111169
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 468  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  111201 atgattatgatgaaaactaacccccttacctta 111169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 284 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15575920 - 15575876
Alignment:
Q  284 ttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaac 328  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||    
T  15575920 ttcatcatcaacaacttaattaacatcaaattaacatatccaaac 15575876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 109 - 534
Target Start/End: Original strand, 5224 - 5647
Alignment:
Q  109 caacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||    
T  5224 caacaatcatgatatatgaacacccaagccataat-cataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattaaatcttgattctcacctcaattca 5322  T
Q  209 acaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaaca 308  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  5323 acaacaacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatca 5422  T
Q  309 tcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcatataaattcttactcaattaagcactttttcatacaaa 408  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5423 atcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcatataaattcttactcaattaagcactttttcatacaaa 5522  T
Q  409 ccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcct 508  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  5523 ccaag-aaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttgggcttcattttagctcct 5621  T
Q  509 aattctccaatcttcaagttttcccc 534  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||    
T  5622 aattcttcaatcttcaagtttccccc 5647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 68 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 5875 - 5411
Alignment:
Q  68 acccattt-tacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcag 166  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  5875 acccatttatacaaaacaaccaacaacatctcattt-ctcaccaacaatcatgacatatgaacacccaagtcataaatcataaacaacaacatttctcag 5777  T
Q  167 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatc 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  5776 caacaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcattaattaagcataatttcaaaacaacccattttcata 5677  T
Q  267 cattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattggg 366  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  5676 cattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattaga 5577  T
Q  367 ttcatataaattcttactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttacct 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5576 ttcatataaattcttactcaattaagcactttttcttacaaactaag-aaaattgcaaacaaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttacct 5478  T
Q  467 taggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 534  Q
    ||||| ||||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  5477 taggtaatgattaatccaatcttaggcttcactttagctcctaa-tcttcaatcttcaagtttccccc 5411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 127 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 61461 - 61048
Alignment:
Q  127 aacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataag 226  Q
    ||||| |||||||| | |||| | |||||| || ||| | | ||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  61461 aacacacaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaaccacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatgtcataag 61363  T
Q  227 tcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaa 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||    
T  61362 tcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaa 61263  T
Q  327 acttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcatataaattcttactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaaa 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  61262 acttatcaccaaaacaagagcacgaaaattaaagattgggttcatacaaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgc-aaa 61164  T
Q  427 caaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaag 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  61163 caaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttaactttagctcataattctccaatcttcaag 61064  T
Q  527 ttttccccctttgcta 542  Q
    ||||||||||||||||    
T  61063 ttttccccctttgcta 61048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Original strand, 48903 - 48977
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||  |||| ||||||||||||||    
T  48903 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggctttactttagctcctaa 48977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 101 - 534
Target Start/End: Original strand, 17695 - 18124
Alignment:
Q  101 tttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacc 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17695 tttctcaccaacaatcatgatatatgagcacccaagccataaatcataaacaacaacttgtctcagcaac---aacatcaattgaaacttgattctcacc 17791  T
Q  201 ccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattc 300  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17792 tcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 17891  T
Q  301 atttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcatataaattcttactcaattaagcacttttt 400  Q
    ||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17892 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcatataaatacttactcaattaagcacttttt 17991  T
Q  401 catacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactt 500  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||  |||||||||    
T  17992 catacaaacaaag-aaaattgcaaacaaaataattatgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcactt 18090  T
Q  501 tagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 534  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  18091 taactcctaattcttcaatcttcatgtttccccc 18124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 37 - 371
Target Start/End: Original strand, 130486 - 130819
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130486 acatcatcaaaatcaaacttcttctttattaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 130585  T
Q  137 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130586 ccataattcataatcaacaacatatctcaacaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 130685  T
Q  237 agcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcacc 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| |     
T  130686 agcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatattatttcatcatcaaccattcatttaacatc-aattaacgtatccaaacatatctct 130784  T
Q  337 aaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  130785 acaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcat 130819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 245
Target Start/End: Original strand, 79519 - 79677
Alignment:
Q  87 caacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 185  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||||| | |||| | ||| || ||  || ||||||||||||||||||||     
T  79519 caacaacaactcattt-ctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaattg- 79616  T
Q  186 aacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtc-atcaattaagcataatt 245  Q
    ||| || |||||| |  |||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||    
T  79617 aacatggttcacatcataattcaacaacaacatatcataattcaaccaattaagcataatt 79677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 89410 - 89336
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| |||| |||||||    
T  89410 atgatcatgatgaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttaactcctaa 89336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 107740 - 107666
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| |||| |||||||    
T  107740 atgatcatgatgaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttaactcctaa 107666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 245; Significance: 1e-135; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 72 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 21650329 - 21649967
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 171  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  21650329 atttcacaaaaccaccaacaacatcttattt-ctcacaaacaatcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatgtctcaacaaca 21650231  T
Q  172 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccatta 271  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21650230 acaacatcaattgaaacttgattctcaccttaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacatta 21650131  T
Q  272 tgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||    
T  21650130 tgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaatcttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgagttcat 21650031  T
Q  372 ataaattcttactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaatta 436  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21650030 atgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgc-aaacaaacaatta 21649967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 130 - 350
Target Start/End: Original strand, 20254336 - 20254556
Alignment:
Q  130 acccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtca 229  Q
    ||||||| |||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||    
T  20254336 acccaagtcataattcacccacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattca 20254435  T
Q  230 tcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaact 329  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||    
T  20254436 tcaattaagcataatttcataacaactcattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaact 20254535  T
Q  330 tatcaccaaaacaagagcacg 350  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20254536 tatcaccaaaacaagagcacg 20254556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 398 - 542
Target Start/End: Original strand, 20254595 - 20254736
Alignment:
Q  398 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 497  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20254595 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 20254692  T
Q  498 ctttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccctttgcta 542  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20254693 ctttagctcataattcctcaatcttcaag-tttccccctttgcta 20254736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 15861568 - 15861418
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861568 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 15861469  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    |||||||| |||| | | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  15861468 attcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 15861418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 183
Target Start/End: Original strand, 17148534 - 17148644
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 171  Q
    |||| |||||| ||||| ||||| || |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17148534 atttcacaaaaccaccaccaacatcttattt-ctcatcaacaattatgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca 17148632  T
Q  172 acaacatcaatt 183  Q
    ||||||||||||    
T  17148633 acaacatcaatt 17148644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 231 - 371
Target Start/End: Original strand, 22367141 - 22367281
Alignment:
Q  231 caattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaactt 330  Q
    ||||| ||||||||||   ||| || ||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22367141 caattgagcataatttacaaactactcattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacat 22367240  T
Q  331 atcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    ||| | | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22367241 atctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 22367281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Original strand, 21860124 - 21860274
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| || ||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21860124 cataattcaccaattgagcataatttacaaactactcattttcattcatcatgaacttgcaatttcatcattaacaattcatttaacatcaaattaacat 21860223  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    |||||||| |||| | |  |||  || ||||| ||||||||||||||||||    
T  21860224 attcaaacatatctctaccacataagtacgaatttcaaagattgggttcat 21860274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 44035097 - 44034963
Alignment:
Q  237 agcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcacc 336  Q
    ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |     
T  44035097 agcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcattaaacatcaaattaacatattcaaacatatatct 44034998  T
Q  337 aaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    | ||||  | || ||| ||||||||||||||||||    
T  44034997 acaacataaacaagaatttcaaagattgggttcat 44034963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 235
Target Start/End: Original strand, 20177140 - 20177302
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaac 170  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||  |||||| | ||||||||| | |||| |||||||||||  || ||||||    
T  20177140 atttcacaaaaccaccaacaacaactcattt-ctcttcaacaaatcatgaattatgaatatccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaac 20177238  T
Q  171 aacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 235  Q
    |||||||||||||| ||||||| |   ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  20177239 aacaacatcaattg-aacttgacttttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 20177302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 40436560 - 40436266
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 161  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||| | || ||  || ||||||| | ||||||||||||| || | |||| | |||||| || |    
T  40436560 atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttattt-cacatcataaactcatgatttgtgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatct 40436462  T
Q  162 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta-agcataatttcacaacaacccatt 260  Q
    || |  |||||||||||||||| |||| | |||| || | ||| |||||||||||||  || || ||| |||||| |||| |||| ||||| |   ||||    
T  40436461 cttaaaaacaacaacatcaatt-aaacataattctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaatt-cacaatatatcatt 40436364  T
Q  261 ttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaa 358  Q
    ||||   ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||| || ||| || | |||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  40436363 ttcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatatattcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 40436266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 216
Target Start/End: Original strand, 21194980 - 21195122
Alignment:
Q  73 ttttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 171  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| || ||| | |||||    
T  21194980 ttttataaaaccaacaacaacaactcattt-ctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaaca 21195078  T
Q  172 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaac 216  Q
    ||||||| |||| |||| |||||| || | |||||||||||||||    
T  21195079 acaacattaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaacaac 21195122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 140
Target Start/End: Original strand, 27674755 - 27674829
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccat 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  |||| |||||||||||||    
T  27674755 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactca-tttctcatcaaaaatcatgaattatgcacacccaagccat 27674829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 20893583 - 20893509
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  20893583 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 20893509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 36356534 - 36356461
Alignment:
Q  113 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaa 186  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  36356534 aatcatgaattatgaacacccaagccataaatcatcatcaacaacatcacttagaaacaacaacatcaattgaa 36356461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 22829712 - 22829638
Alignment:
Q  66 caacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagccat 140  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  |||| |||||||||||||    
T  22829712 caacccattttacaaagtcaccaacaacaactca-tttctcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccat 22829638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 38033962 - 38033888
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccat 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||  |||| |||||||||||||    
T  38033962 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactta-tttctcatcaacaatcgtgaactatgcacacccaagccat 38033888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 41229221 - 41229107
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaac 170  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||  ||||||||| |||||||| | |||| | |||||||||  || ||||||    
T  41229221 attttaccaaactaccaacaacaactcattt-ctcatccacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcaac 41229123  T
Q  171 aacaacatcaattgaa 186  Q
    ||||||||||||||||    
T  41229122 aacaacatcaattgaa 41229107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 13377122 - 13377009
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaac 170  Q
    |||| |||||| | |||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||  |||||| || |||||||| | |||  |||||||||||  || ||||||    
T  13377122 atttcacaaaaccgccaacaacaattcattt-ctcatcaacaaatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcaacatcaacaacatcacttagcaac 13377024  T
Q  171 aacaacatcaattga 185  Q
    |||||||||||||||    
T  13377023 aacaacatcaattga 13377009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 218
Target Start/End: Original strand, 17608886 - 17609038
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 163  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||| || ||||  | ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  ||    
T  17608886 tcaacccattttccaaaaccaacaacaacaactcaatt-ctcataatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcact 17608984  T
Q  164 cagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
     | ||||||||||| |||||||| | ||| || || |  ||||||||||||||||    
T  17608985 taacaacaacaacaacaattgaa-catgaatctcatcataattcaacaacaacat 17609038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Original strand, 20913335 - 20913409
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  20913335 atgattacgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 20913409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 37234149 - 37234028
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 163  Q
    |||||||||||||||||| || | |||| |||||| ||| ||| || ||| ||||||| |||| ||||||||| ||| | |||| | |||||| ||  ||    
T  37234149 tcaacccattttacaaaaccaaccacaaaaactcaattt-tcatcatcaaatcatgatttatggacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatcact 37234051  T
Q  164 cagcaacaacaacatcaattgaa 186  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  37234050 tagcaacaacaacatcaattgaa 37234028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 7641128 - 7641044
Alignment:
Q  167 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaac 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| | ||| || |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  7641128 caacaacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaattcaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttcacaac 7641044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 113 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8538151 - 8538047
Alignment:
Q  113 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaa 212  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  || | ||||||||||||||||| |||| |||||| || |  ||||||||||    
T  8538151 aatcattatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattccttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcataattcaacaa 8538053  T
Q  213 caacat 218  Q
    ||||||    
T  8538052 caacat 8538047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 113 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8603390 - 8603286
Alignment:
Q  113 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaa 212  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  || | ||||||||||||||||| |||| |||||| || |  ||||||||||    
T  8603390 aatcattatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattccttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcataattcaacaa 8603292  T
Q  213 caacat 218  Q
    ||||||    
T  8603291 caacat 8603286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 102
Target Start/End: Original strand, 19603055 - 19603092
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19603055 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcattt 19603092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 49997548 - 49997418
Alignment:
Q  87 caacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctca-gcaacaacaacatcaattga 185  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||| |||||| |||||||||| || |||| | | || | |||||| || ||| | ||||||||||||||| || |    
T  49997548 caacaacaacttattt-ctcatcaacaaccatgatttatgaacaccaaatccatgaatgatcaacaacaatatctcttaagcaacaacaacatcagtt-a 49997451  T
Q  186 aacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
    ||| |||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  49997450 aacatgattctcaccttaattcaacaacaacat 49997418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 358
Target Start/End: Original strand, 20194185 - 20194276
Alignment:
Q  268 attatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattc-aaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaa 358  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||| || |||||| | ||| || |||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  20194185 attatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaaattcatatactcaaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 20194276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 218
Target Start/End: Original strand, 52400675 - 52400741
Alignment:
Q  151 caacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||| || |  ||||||||||||||||    
T  52400675 caacaacatctctcagcaacaacaacgtcaatt-aaacatgattctcatcataattcaacaacaacat 52400741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Original strand, 20931650 - 20931724
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||| ||||    
T  20931650 atgattatgataaaggctaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctgctaa 20931724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 358
Target Start/End: Original strand, 25094019 - 25094109
Alignment:
Q  268 attatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaa 358  Q
    |||||| |||||  ||||||||| |||||||||| ||| || |||||| |  || |||||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  25094019 attatggacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 25094109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 37844406 - 37844332
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |  || ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  37844406 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaaaattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 37844332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 252
Target Start/End: Original strand, 22035509 - 22035593
Alignment:
Q  167 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaac 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| |||| ||||| | ||| || |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  22035509 caacaacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaatccaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttcacaac 22035593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 51627945 - 51627833
Alignment:
Q  73 ttttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 171  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||   ||| | ||||||||||| | | || ||||||| |||  || |||||||    
T  51627945 ttttaccaaaccaccaacaacatctcattt-ctcaacagcaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacatcatcacttagcaaca 51627847  T
Q  172 acaacatcaattga 185  Q
    ||||||||||||||    
T  51627846 acaacatcaattga 51627833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 468
Target Start/End: Original strand, 41394527 - 41394559
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 468  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41394527 atgattatgataaagactaacccccttacctta 41394559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 41931335 - 41931279
Alignment:
Q  272 tgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaac 328  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | | ||| ||||||||| |||||| |||||    
T  41931335 tgaacatgtaatttcatcatcaacaacttaattatcatcaaattcacatatccaaac 41931279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 468
Target Start/End: Original strand, 45051726 - 45051758
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 468  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45051726 atgattatgataaagactaacccccttacctta 45051758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 2)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 168 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 34607 - 34242
Alignment:
Q  168 aacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatcc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  34607 aacaacaacatcaattgaaacttgattttcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcacac 34508  T
Q  268 attatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  34507 attatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcattaaaacaagagcacgaaattcaaggattaggt 34408  T
Q  368 tcatataaattcttactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttacctt 467  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34407 tcgtataaatacttactcaattaagcactatttcatacaaactaag-aaaattgcaaacaaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttacctt 34309  T
Q  468 aggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 534  Q
    || | ||||| ||| |||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34308 agataatgattaatccaaacttaggcttcattttagctcctaattcttcaatctttaagtttccccc 34242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 34670 - 34607
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataa 149  Q
    |||||||||| |||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  34670 accaacaacatctcaatt-ctcaccaacaatcatgttatatgaacacccaagtcataaatcataa 34607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 169 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 17506 - 17208
Alignment:
Q  169 acaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatcca 268  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  17506 acaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacagcaacccattttcataca 17408  T
Q  269 ttatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggtt 368  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  17407 ttatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcatacttatcaccaaaacaagagtacgaaaattaaagattgggtt 17308  T
Q  369 catataaattcttactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttacctta 468  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17307 catacaaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgc-aaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttacctta 17209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 100 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 165224 - 164810
Alignment:
Q  100 ttttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacac 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  165224 ttttctcaccaacaatcatgatatatgaacacccaagccataat-cataa---acaacatgtctcagcaacaacaacatcaattaaaacttgattctcac 165129  T
Q  200 cccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaatt 299  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  165128 ctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcataagaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaatt 165029  T
Q  300 catttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattca-aagattgggttcatataaattcttactcaattaagcacttt 398  Q
    |||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | || | |       ||| ||||| | | |||| || |  |      
T  165028 catttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaatttaacaacaat-------tatcaattcattc-caatcaatccat-- 164939  T
Q  399 ttcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcac 498  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  164938 ttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgattaattcaaatttaagcttcac 164841  T
Q  499 tttagctcctaattctccaatcttcaagttt 529  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  164840 tttagctcctaattcttcaatcttcaagttt 164810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Original strand, 172210 - 172284
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  172210 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 172284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Original strand, 177913 - 177987
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  177913 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 177987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 85 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 50124 - 49860
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattg 184  Q
    |||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50124 accaacaacatcttatttt-tcatcaacaatcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattg 50026  T
Q  185 aaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatt 284  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  50025 aaacttgattctcacctcaattcaaccacaacatgtcataattcatcaattaagtataatttcacaactacccattttcatacactatgaacatgttatt 49926  T
Q  285 tcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacg 350  Q
    |||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49925 tcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacg 49860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 398 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 49820 - 49686
Alignment:
Q  398 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 497  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||||    
T  49820 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttaggcttca 49723  T
Q  498 ctttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 534  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  49722 ctttagctcctaattcttcaatcttcaagtttccccc 49686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 175; Significance: 6e-94; HSPs: 5)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 101 - 355
Target Start/End: Original strand, 11740 - 11992
Alignment:
Q  101 tttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacc 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11740 tttctcaccaacaatcatgatatatgaacacccaagccataaatcataa-caacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattctcacc 11838  T
Q  201 ccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattc 300  Q
     ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11839 tcaattcaacaa-aacatgtcatgattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcaaacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 11937  T
Q  301 atttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaatt 355  Q
    ||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11938 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaatagcacgaaatt 11992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Original strand, 12063 - 12137
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  12063 atgattatgatgaagactaacccccttatcttagataatgattaatccaaactttggcttcaatttagctcctaa 12137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 8125 - 8051
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaaccccc-ttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctccta 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||  |||||| |||||||||||    
T  8125 atgattatgatgaagactaaccccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcattttagctccta 8051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 26372 - 26298
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | | |||  |||||| ||||||||||||    
T  26372 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccatcttaggcttcaatttagctcctaa 26298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 8425 - 8360
Alignment:
Q  121 tatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaa 186  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||   | | ||||||||||||||||||||    
T  8425 tatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaa 8360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 91; Significance: 8e-44; HSPs: 6)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 436 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 13299 - 13201
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 534  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13299 atgattatgatgataactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 13201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13575 - 13395
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct---cagca 168  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |   || ||    
T  13575 atttcacaaaaccactaacaacaatccattt-ctcaacaagaatcatgatatatcaacacccaagccataa-tcataaacaacaacatgtatcaacaaca 13478  T
Q  169 acaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaa 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  13477 acaacaacatcaattgaaacttgatttccacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaaacataatttcacaa 13395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Original strand, 55694 - 55844
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||| | ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55694 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcctacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 55793  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    |||||||| |||  | | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  55794 attcaaacatatatctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 55844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 108107 - 108033
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||||| |||||  |||||| || |||||||||    
T  108107 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaattccaacttaggcttcaattcagctcctaa 108033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Original strand, 55904 - 55978
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | || ||  |||||| ||||||||||||    
T  55904 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaatttaggcttcaatttagctcctaa 55978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 94061 - 93940
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 163  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||  ||||  |||||||  ||| | | || |||||||||||  ||    
T  94061 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacatctca-tttctcaccaacaaatcatgaattatgttcacccaaatcatgaattatcatcaacaacatcact 93963  T
Q  164 cagcaacaacaacatcaattgaa 186  Q
     |  || ||||||||||||||||    
T  93962 tattaataacaacatcaattgaa 93940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 398 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 9480 - 9345
Alignment:
Q  398 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 497  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9480 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttca 9383  T
Q  498 ctttagctcctaa-ttctccaatcttcaagttttcccc 534  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  9382 ctttagctcctaatttcttcaatcttcaagtttccccc 9345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 221 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 9649 - 9518
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| || ||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||    
T  9649 cataagtcactaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcataaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttagcaatcaattaacat 9550  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 352  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9549 actcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 9518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 28466 - 28663
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaa 135  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||  |||||||||||||    
T  28466 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattt-ctcaccaataaatcatgaattatgaacacccaa 28564  T
Q  136 gccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 235  Q
    ||||| | |||| | |||||||||  || |||||||||||||||||||||| | | ||||  ||  |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  28565 gccatgaatcattaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaa-cataattcttactacaattcaacaacaacataccataattcaacaatt 28663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 87
Target Start/End: Original strand, 21637 - 21687
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcacc 87  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21637 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccacc 21687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 1659 - 1456
Alignment:
Q  205 ttcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatt-tcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatt 303  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||| || |||||  || ||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  1659 ttcaacaacaacatgtcataattcatcaattgagcataattctca-aactactcatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaat 1561  T
Q  304 taacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttca-tataaattcttactcaattaagcactttttca 402  Q
    || ||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||    ||| |||||||||||||| ||||    
T  1560 tatcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcacaataatcatttattcaattaagcacttattca 1461  T
Q  403 tacaa 407  Q
    |||||    
T  1460 tacaa 1456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 436 - 542
Target Start/End: Original strand, 108053 - 108159
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 535  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  108053 atgattataatgataactaacccccttaccttaggctataatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaaaatttccccc 108152  T
Q  536 tttgcta 542  Q
    |||||||    
T  108153 tttgcta 108159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 205 - 407
Target Start/End: Original strand, 203 - 406
Alignment:
Q  205 ttcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaa-caacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatt 303  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| | || |||||  || ||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  203 ttcaacaacaacatgtcataattcaacaattgagcataatt-cacaaactacacatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaat 301  T
Q  304 taacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttca-tataaattcttactcaattaagcactttttca 402  Q
    || ||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||| ||| |||||||||||||||||  ||||   |||| |||||||||||||| ||||    
T  302 tatcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcaagaatttcaaagattgggttcacaataatcacttattcaattaagcacttattca 401  T
Q  403 tacaa 407  Q
    |||||    
T  402 tacaa 406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Original strand, 3230 - 3377
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| | |||||||    
T  3230 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactca-tttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaag 3328  T
Q  137 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 185  Q
    |||| | | || |||||||||||  |  | |||||||||||||||||||    
T  3329 ccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 3377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 170 - 20
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  170 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 71  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    |||||||| |||| | | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  70 attcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 20  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 4589 - 4439
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4589 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 4490  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    ||| |||| |||| | | ||||  ||||| || ||||||||||||||||||    
T  4489 atttaaacatatctctacaacataagcactaatttcaaagattgggttcat 4439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 436 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 4378 - 4279
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcct-aattctccaatcttcaagttttcccc 534  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||    
T  4378 atgattatgataaagtctaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttttgcttcactttagctcctaaatccttcaatcttcaagtttacccc 4279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 398 - 542
Target Start/End: Original strand, 48468 - 48610
Alignment:
Q  398 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 497  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  48468 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacattcatgattatgaagaagactaacccccttacattaggttatgattaattcaaatttgggcttca 48565  T
Q  498 ctttagctcctaa-ttctccaatcttcaagttttccccctttgcta 542  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  48566 ctttagctcctaatttcttcaatcttcaag-tttccccctttgcta 48610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 6685 - 6535
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6685 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttgacatcaaattaacat 6586  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    |||||||| |||| | | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  6585 attcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 6475 - 6401
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||  ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  6475 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaggaataatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 6401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 436 - 534
Target Start/End: Original strand, 41965 - 42063
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  41965 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcctaattcttcaatcttcaagtttccccc 42063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 254 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 10092 - 9975
Alignment:
Q  254 acccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaa 353  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||  ||||||||     
T  10092 acccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaat 9993  T
Q  354 ttcaaagattgggttcat 371  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9992 ttcaaagattgggttcat 9975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 9914 - 9840
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  9914 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 9840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 436 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 7127 - 7034
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttt 529  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7127 atgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgattaattcaaatttaagcttcactttagctcctaattcttcaatcttcaagttt 7034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 1187 - 1117
Alignment:
Q  113 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaatt 183  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  || |||||||||||||||||||    
T  1187 aatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattccttagcaacaacaacatcaatt 1117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 181
Target Start/End: Original strand, 21442 - 21586
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaa 135  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||   ||| | ||||||    
T  21442 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactca-tttcttaacaacaattcatgaatcatgcaaacccaa 21540  T
Q  136 gccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaa 181  Q
    ||||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  21541 gccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaa 21586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Original strand, 31141 - 31289
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaa 135  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||   ||| | ||||||    
T  31141 acatcatcaaaatcaaactttttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactca-tttctcaacaacaattcatgaatcatgcaaacccaa 31239  T
Q  136 gccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 185  Q
    ||||| | | || |||||||||||  || |||||||| ||||||||||||    
T  31240 gccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaaaaacatcaattga 31289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 436 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 34405 - 34312
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttt 529  Q
    ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34405 atgattatgataataactaaccctcttaccttaggtaatgatcaattcaagcttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttt 34312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 248
Target Start/End: Original strand, 4906 - 5081
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaac 170  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||||| |||| || ||| ||||||  |||||||| ||||||||| | | || |||||||||||  || ||||||    
T  4906 atttcacaaaaccaccaacaacaatccattt-ctcatcagcaaatcatgaattatgaacaaccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaac 5004  T
Q  171 aacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttca 248  Q
    |||||||||||||| | | |||  |  | | ||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  5005 aacaacatcaattg-atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaatcataattcaccaattaagcatattttca 5081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 202 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 44275 - 44107
Alignment:
Q  202 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaa-caacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| | ||||| | ||  |||| ||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  44275 caattcaacaacaacatgtcataattcgtcaattgagcataact-cacaaactacttatttacatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattc 44177  T
Q  301 atttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttca 370  Q
    | ||| ||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  44176 aattaccatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattaggttca 44107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Original strand, 75 - 222
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||   ||| | |||||||    
T  75 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactca-tttctcagcaacaatcatgaatcatgcaaacccaag 173  T
Q  137 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 185  Q
    |||| | | || |||||||||||  |  | |||||||||||||||||||    
T  174 ccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Original strand, 24890 - 25036
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| | |||||||    
T  24890 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactca-tttctcaacaacaatcatgaatcatgca-acccaag 24987  T
Q  137 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 185  Q
    |||| | | || |||||||||||  |  | ||||||||||| |||||||    
T  24988 ccatgaattatcatcaacaacatgccatatcaacaacaacaacaattga 25036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 437 - 510
Target Start/End: Original strand, 25532 - 25605
Alignment:
Q  437 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||  |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  25532 tgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaggattaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 25605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 13528 - 13378
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13528 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccattcatttaacatcaaattaacat 13429  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    || ||||| |||| | | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13428 atccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 13378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 13317 - 13243
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  13317 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 13243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 31422 - 31272
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31422 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 31323  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    ||||||||  ||  | | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31322 attcaaacacatgtctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 31272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Original strand, 41422 - 41572
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41422 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 41521  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    ||||||||  ||  | | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  41522 attcaaacacatgtctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 41572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 37012 - 36979
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37012 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 36979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 430 - 283
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||   ||| | |||||||    
T  430 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaaaagctca-tttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaag 332  T
Q  137 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 185  Q
    | || | | || |||||||||||  |  | |||||||||||||||||||    
T  331 ctatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 6679 - 6603
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  6679 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaagaacaactca-attctcaacaacaa 6603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 231 - 371
Target Start/End: Original strand, 30217 - 30357
Alignment:
Q  231 caattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaactt 330  Q
    ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30217 caattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacat 30316  T
Q  331 atcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    ||| | | ||||  |||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  30317 atctctacaacataagcatgaatttcaaagatagggttcat 30357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 6225 - 6075
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6225 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcattaacaaatcatttaacatcaaattaacat 6126  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    ||||||||  ||| | | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  6125 attcaaacacatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 6075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 435 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 5810 - 5777
Alignment:
Q  435 tatgattatgatgaagactaacccccttacctta 468  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5810 tatgattatgatgaaaactaacccccttacctta 5777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 435 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 6016 - 5983
Alignment:
Q  435 tatgattatgatgaagactaacccccttacctta 468  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6016 tatgattatgatgaaaactaacccccttacctta 5983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1120 - 970
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1120 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 1021  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    ||| ||||  | | | | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1020 attaaaacaaacctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 910 - 836
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  910 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 17546 - 17396
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17546 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaaaatcaaattaacat 17447  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    |||||||| |||| | |  |||  ||||| || ||||||||||||||||||    
T  17446 attcaaacatatctctaccacataagcactaatttcaaagattgggttcat 17396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 257 - 371
Target Start/End: Original strand, 15098 - 15212
Alignment:
Q  257 cattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattc 356  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |  |||  |||||||| |||    
T  15098 cattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacgacataagcacgaatttc 15197  T
Q  357 aaagattgggttcat 371  Q
    |||||||||||||||    
T  15198 aaagattgggttcat 15212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 914 - 881
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  914 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Original strand, 79977 - 80127
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  79977 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaatttatttaacatcaaattaacat 80076  T
Q  321 attcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    |||||||| |||| | |  |||  ||||| || ||||||||||||||||||    
T  80077 attcaaacatatctctaccacataagcacaaatttcaaagattgggttcat 80127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 113 - 185
Target Start/End: Original strand, 40664 - 40736
Alignment:
Q  113 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 185  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  || ||||||||||||||| |||||    
T  40664 aatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatccattga 40736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 468
Target Start/End: Original strand, 80187 - 80219
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 468  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  80187 atgattatgataaagactaacccccttacctta 80219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 398 - 529
Target Start/End: Original strand, 95262 - 95392
Alignment:
Q  398 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 497  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |  ||||||    
T  95262 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacctaggcttca 95359  T
Q  498 ctttagctcct-aattctccaatcttcaagttt 529  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  95360 ctttagctcctaaatccttcaatcttcaagttt 95392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 258 - 352
Target Start/End: Original strand, 95129 - 95223
Alignment:
Q  258 attttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 352  Q
    |||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  95129 attttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 95223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 4)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 221 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 193630 - 193518
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193630 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 193531  T
Q  321 attcaaacttatc 333  Q
    |||||||| ||||    
T  193530 attcaaacatatc 193518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 221 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 186668 - 186561
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 320  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  186668 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 186569  T
Q  321 attcaaac 328  Q
    ||||||||    
T  186568 attcaaac 186561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 215
Target Start/End: Original strand, 27453 - 27604
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 161  Q
    ||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||| | || || ||| ||||||| ||||||||||||||| || | |||| | |||||| || |    
T  27453 atcaacccatttttacaaaaccgacaacaacaactcattt-cacatcatcaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatct 27551  T
Q  162 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa 215  Q
    || | |||||||| |||||||| |||| |||||| || | ||||||||||||||    
T  27552 cttaacaacaacatcatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaacaa 27604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 193429 - 193355
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  193429 atgattatgataaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 193355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 44087 - 43935
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 163  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  ||    
T  44087 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcattt-ctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcact 43989  T
Q  164 cagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
     ||||||||||||||||||| |||| |||||| || |  ||||||||||||||||    
T  43988 tagcaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcataattcaacaacaacat 43935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23963 - 23809
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 161  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||| | ||||| ||| || ||| | |||||||| |||||| |||||||| | |||| | |||||| ||      
T  23963 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaatttatttt-tcatcatcaaattatgatatacgaacacacaagccatgaatcatcaacaacaatattc 23865  T
Q  162 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
    || | |||||||||| |||||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||    
T  23864 cttaacaacaacaacgtcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaacaacat 23809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 5)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 231 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 162310 - 162170
Alignment:
Q  231 caattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaactt 330  Q
    ||||| ||||||||||   ||| |||||||| ||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||      
T  162310 caattgagcataatttacaaactacccatttacatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaaatcatttaatatcaaattaacatattcaaacac 162211  T
Q  331 atcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    ||| | | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  162210 atctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 162170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 231 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 166396 - 166256
Alignment:
Q  231 caattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaactt 330  Q
    ||||| ||||||||||   ||| |||||||| ||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||      
T  166396 caattgagcataatttacaaactacccatttacatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaaatcatttaatatcaaattaacatattcaaacac 166297  T
Q  331 atcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    ||| | | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  166296 atctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 166256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 116795 - 116687
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaac 170  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  || ||||||    
T  116795 attttacaaaaccaccaacaacaatccatttt-tcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaac 116697  T
Q  171 aacaacatca 180  Q
    ||||||||||    
T  116696 aacaacatca 116687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 162110 - 162078
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 468  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  162110 atgattatgatgaaaactaacccccttacctta 162078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 166196 - 166164
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 468  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  166196 atgattatgatgaaaactaacccccttacctta 166164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 202 - 358
Target Start/End: Original strand, 5977 - 6133
Alignment:
Q  202 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaa-caacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattc 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| | |||||||| | |  || |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5977 caattcaactacaacatgtcataaatcatcaattgagcacaatt-cacaaactacccatttacttatatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattc 6075  T
Q  301 atttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaa 358  Q
    | ||| |||||| |||||||| |||||| |||||| | |||| |||||| || |||||    
T  6076 aattatcatcaatttaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacaaatttcaa 6133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 221 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 12662 - 12510
Alignment:
Q  221 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattca--tttaacatcaaattaac 318  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||    
T  12662 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcacattaatcatcaaattaac 12563  T
Q  319 atattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 371  Q
    |||||||||| |||| | | ||||  ||||| || ||||||||||||||||||    
T  12562 atattcaaacatatctctacaacataagcacaaatttcaaagattgggttcat 12510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 257 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 557 - 443
Alignment:
Q  257 cattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattc 356  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | | ||||  ||||| || |||    
T  557 cattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatctacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaatatatctctacaacataagcacaaatttc 458  T
Q  357 aaagattgggttcat 371  Q
    ||| |||||||||||    
T  457 aaatattgggttcat 443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 218
Target Start/End: Original strand, 69415 - 69567
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 163  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||| || |||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  ||    
T  69415 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacacctcaatt-ctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcact 69513  T
Q  164 cagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
     |||||||||||||||||||| ||| ||| || || | |||||||||||||||||    
T  69514 tagcaacaacaacatcaattg-aacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat 69567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 508
Target Start/End: Original strand, 272330 - 272402
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcct 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||    
T  272330 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcct 272402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 244959 - 244920
Alignment:
Q  206 tcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatt 245  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  244959 tcaacaacaacatgtcataattcatcaattgagcataatt 244920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 77129 - 76967
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaac 170  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  |||||| ||||||||||| | |||| |  ||||| ||  || ||||||    
T  77129 atttcacaaaaccaccaacaacaactca-tttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaatatcacttagcaac 77031  T
Q  171 aacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 235  Q
    |||||||||||||| ||| ||| || |||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  77030 aacaacatcaattg-aacatgaatctcaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 76967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 436 - 534
Target Start/End: Original strand, 3505 - 3601
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 534  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  3505 atgattatgaggaagaataacccc-ttaccttagatgatgattaattcaaacttaggcttcactttagctcctaa-tcttcaatcttcaagtttccccc 3601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 218
Target Start/End: Original strand, 6500 - 6654
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 161  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||||||| || | ||||||||| |||||||||| ||||||| | |||| | |||||| || |    
T  6500 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactta-tttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacctaagccatgaatcatcaacaacaatatct 6598  T
Q  162 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
    || |||||||||| |||||||| |||| |||||| || |  ||||||||||||||||    
T  6599 cttagcaacaacatcatcaatt-aaacatgattctcatcataattcaacaacaacat 6654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 36869 - 36837
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 468  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36869 atgattatgataaagactaacccccttacctta 36837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 436 - 534
Target Start/End: Original strand, 45338 - 45437
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa-ttctccaatcttcaagttttcccc 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||| |||||||  |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||| ||||    
T  45338 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatggttaatccaaacttaggcttcaattaagctcctaagctcttcaatcttcaagtttccccc 45437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 529
Target Start/End: Original strand, 54724 - 54818
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa-ttctccaatcttcaagttt 529  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| | ||| ||||||| ||||||| || |||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  54724 atgattatgatgaagactaaccaccttaccttagataatggttaatccaaacttaagcttcaattaagctcctaagctcttcaatcttcaagttt 54818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 218
Target Start/End: Original strand, 2483 - 2635
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 163  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||| |||| || ||| ||||||| ||||||||||||| |||| | |||| | |||||| ||  ||    
T  2483 tcaacccattttagaaaaccaacaacaacaagtcattt-ctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcact 2581  T
Q  164 cagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
     |||||||||||||||||||||| | ||| || || |  ||||||||||||||||    
T  2582 tagcaacaacaacatcaattgaa-catgaatctcatcataattcaacaacaacat 2635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 502
Target Start/End: Original strand, 13824 - 13890
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcacttta 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||  |||||||||||    
T  13824 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcacttta 13890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 103211 - 103090
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 163  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||  |||| |||||||| |||| | | || |||||||||||  ||    
T  103211 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactca-tttatcaccaacaattcatgaattatgcacacccaaaccatgaattatcatcaacaacatcact 103113  T
Q  164 cagcaacaacaacatcaattgaa 186  Q
     || ||||| |||||||||||||    
T  103112 tagaaacaataacatcaattgaa 103090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 68145 - 67954
Alignment:
Q  167 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta-agcataatttcacaaca-acccattttca 264  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| || |||| || ||||||||||||||  || || ||| |||||| |||| |||| ||||| | |||||||||||    
T  68145 caacaacaacatcaatt-aaacatgaatctcaccacatttcaacaacaacataacacaattcaacaattagagcacaatt-cacaatatacccattttca 68048  T
Q  265 tccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaa 358  Q
       ||||||||||||  ||||||||  |||||||||| ||| || |||||| |  || | |||| ||||| || ||||||| |||||| |||||    
T  68047 catattatgaacatgcaatttcatctacaacaattcaattatcaccaaattcatgtacttaaacatatcatcataacaagaacacgaatttcaa 67954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 218
Target Start/End: Original strand, 4611 - 4715
Alignment:
Q  113 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaa 212  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||| |  ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||    
T  4611 aatcttgatatatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaaaacttcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattcccatcacaattcaacaa 4709  T
Q  213 caacat 218  Q
    ||||||    
T  4710 caacat 4715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 437 - 510
Target Start/End: Original strand, 339 - 412
Alignment:
Q  437 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  339 tgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaggattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 235
Target Start/End: Original strand, 270 - 436
Alignment:
Q  68 acccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcag 166  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||| |||||||| ||| | | || | ||| |||||  || ||    
T  270 acccagtttacaaaaccaccaacaacaactca-tttctcatcaacaaatcatgaattatgagcacccaaggcatgaataatcaacaaaaacatcacttag 368  T
Q  167 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 235  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||  ||| ||||||||||| |||||  ||||| ||| |||||    
T  369 caacaacaacatcaattg-aacatgactcttaccacaattcaacaataacatagcataattcaacaatt 436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 183
Target Start/End: Original strand, 107967 - 108086
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatc 162  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||| |||| ||| | ||||||| ||||||||||||||| || | |||| | |||||| |||||    
T  107967 atcaacccatttttaaaaaaccaacaacaacaacttattt-ctcatcaaaattcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatatc 108065  T
Q  163 tcagcaacaacaacatcaatt 183  Q
    | | |||||||||||||||||    
T  108066 ttaacaacaacaacatcaatt 108086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 235
Target Start/End: Original strand, 35444 - 35605
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaac 170  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||| | |||| | |||||||||  || ||||||    
T  35444 attttacaaaaccaccaaca-caactcattt-ctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaac 35541  T
Q  171 aacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 235  Q
    || ||||||||||| ||| ||| ||  ||| || ||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  35542 aaaaacatcaattg-aacatgactcttaccacatttcaacaacaacatagcataaatcaacaatt 35605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 1732 - 1693
Alignment:
Q  144 tcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaatt 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1732 tcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaatt 1693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 4002 - 3876
Alignment:
Q  202 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaa-caacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattc 300  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||  ||  || |||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  4002 caattcaataacaacatgtcgtaattcatcaattgaacataatt-cacaaactacccatttatatatatcatgaacatgcaatttcatcattaacaattc 3904  T
Q  301 atttaacatcaaattaacatattcaaac 328  Q
    | | | ||||||||||||||| ||||||    
T  3903 aatcatcatcaaattaacatactcaaac 3876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Original strand, 9183 - 9257
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  9183 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 9257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 40 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 13048 - 12990
Alignment:
Q  40 tcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaact 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  13048 tcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttcacaaaaccatcaacaacaact 12990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 123119 - 123045
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  123119 atgattatggtgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 123045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 186
Target Start/End: Original strand, 30978 - 31099
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 163  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||| || | |||| |||| ||||||||| |||||||| | |||| | |||||  ||  ||    
T  30978 tcaacccattttacaaaagcaacaacaacaactca-attctcatcatcaaatcttgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacagtatcact 31076  T
Q  164 cagcaacaacaacatcaattgaa 186  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  31077 tagcaacaacaacatcaattgaa 31099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0670 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
Description:

Target: scaffold0670; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 7966 - 7672
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 161  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||| | || ||  || ||||||| ||||||||||||||| || | |||| | |||||| || |    
T  7966 atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttattt-cacatcacaaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatct 7868  T
Q  162 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta-agcataatttcacaacaacccatt 260  Q
    || | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | ||| |||||||||||||  || || ||| |||||| |||| || ||||||| |   ||||    
T  7867 cttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaa-ttcacaatatatcatt 7770  T
Q  261 ttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaa 358  Q
    ||||   | ||||||||||  |||||| || |||||||||| ||| || ||| || |  || |||||| ||||| || ||||||||||| || |||||    
T  7769 ttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtagtcaaacatatcatcataacaagagcacaaatttcaa 7672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 186
Target Start/End: Original strand, 11100 - 11173
Alignment:
Q  113 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaa 186  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  11100 aatcatgatctatgaacacctaagccatgaatcataaacaacaacatcacatagcaacaacaacatcaattgaa 11173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 437 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 12075 - 11982
Alignment:
Q  437 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttt 529  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||| | ||||  |||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  12075 tgattatgataataactaacccccttaccttagatgatgtttaattttaacttaggcttcactttagctcctaattgcttcaatcttcaagttt 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 981 - 877
Alignment:
Q  254 acccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaa 353  Q
    |||||||||||   ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||| || |||||| |  || |||||| ||||| || ||||||||||||||     
T  981 acccattttcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaaattcatttactcaaacatatcatcataacaagagcacgaat 882  T
Q  354 ttcaa 358  Q
    |||||    
T  881 ttcaa 877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 214
Target Start/End: Original strand, 7358 - 7508
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 161  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||| |||| || ||| ||||||| |||||  ||||||||||| | |||| | |||||| || |    
T  7358 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttattt-ctcatcatcaaatcatgatttatgagtacccaagccatgaatcattagcaacaatatct 7456  T
Q  162 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaaca 214  Q
    || ||||||| ||||||||||| |||| |||||| || |  ||||||||||||    
T  7457 cttagcaacaccaacatcaatt-aaacatgattctcatcataattcaacaaca 7508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 214
Target Start/End: Original strand, 16783 - 16933
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 161  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||| |||| || ||| ||||||| |||||  ||||||||||| | |||| | |||||| || |    
T  16783 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttattt-ctcatcatcaaatcatgatttatgagtacccaagccatgaatcattagcaacaatatct 16881  T
Q  162 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaaca 214  Q
    || ||||||| ||||||||||| |||| |||||| || |  ||||||||||||    
T  16882 cttagcaacaccaacatcaatt-aaacatgattctcatcataattcaacaaca 16933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 218
Target Start/End: Original strand, 37538 - 37668
Alignment:
Q  87 caacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 185  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||| |||||| ||||||||||||||| || | |||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||||| |    
T  37538 caacaacaactcattt-ctcatcatcaattcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-a 37635  T
Q  186 aacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
    ||| |||||| |  | ||||||||||| |||||    
T  37636 aacatgattctcgtctcaattcaacaataacat 37668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 218
Target Start/End: Original strand, 85489 - 85643
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatc-atgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 161  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||| ||| |||||| | ||||| |||||||||||||| ||| | |||| | |||||| || |    
T  85489 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacctatttt-tcatcaacaaaccatgatttatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatct 85587  T
Q  162 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
    || ||||||||||| |||| || |||| |||||| || |  ||||||||||||||||    
T  85588 cttagcaacaacaatatcactt-aaacatgattctcatcataattcaacaacaacat 85643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Original strand, 9160 - 9234
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||    |||||  |||||||||||||||||||    
T  9160 atgattatgatgaagactaacacacttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcactttagctcctaa 9234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Original strand, 146906 - 146980
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  146906 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 146980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 186
Target Start/End: Original strand, 6622 - 6740
Alignment:
Q  68 acccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcag 166  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||||| | |||| | ||| |||||  || ||    
T  6622 acccagtttacaaaaccaccaacaacaactca-tttctcatcaacaaatcatgaattatgaccacccaagccatgaatcatcaacaaaaacatcacttag 6720  T
Q  167 caacaacaacatcaattgaa 186  Q
     |  ||||||||||||||||    
T  6721 gagtaacaacatcaattgaa 6740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 225
Target Start/End: Original strand, 2471 - 2572
Alignment:
Q  123 tatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtca 222  Q
    |||||| ||||||||||| | |||| | |||||||||  || |||||||||||||||||||||| | || ||| || |  |||||||||||||||| |||    
T  2471 tatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaa-catggttctcatcataattcaacaacaacatatca 2569  T
Q  223 taa 225  Q
    |||    
T  2570 taa 2572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Original strand, 12418 - 12492
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |   ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  12418 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatagagattaatcctaacttaggcttcactttagctcctaa 12492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Original strand, 1430 - 1504
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| |||   |||||  |||||||||||||||||||    
T  1430 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcacaacttaggcttcactttagctcctaa 1504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 3540 - 3466
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  3540 atgattatgacaaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 3466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 57424 - 57350
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||| ||||    
T  57424 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctactaa 57350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 34107 - 34033
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||   |||||| ||||||||||||    
T  34107 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaa 34033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 247398 - 247324
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  247398 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 247324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 534
Target Start/End: Original strand, 7517 - 7615
Alignment:
Q  437 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttttcccc 534  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||| | |||   ||||  ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||    
T  7517 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaactaaagcttcactttagctcctaattgtttcaatcttcaagtttccccc 7615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 252
Target Start/End: Original strand, 7271 - 7355
Alignment:
Q  167 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaac 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| | ||| || |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  7271 caacaacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaattcaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttcacaac 7355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2607 - 2436
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 161  Q
    ||||||||||||| || ||| || ||||||||||| |||| |||| || |||  |||||  ||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||      
T  2607 atcaacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttattt-ctcatcatcaaaacatgaattatgaacgcccaagccatgaatcatcatcaacaacatca 2509  T
Q  162 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 235  Q
    || || ||||||||||||||||| ||| ||| ||  | |  ||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  2508 cttaggaacaacaacatcaattg-aacatgagtcttatcataattcaacaacaacatagcataattcatcaatt 2436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 23943 - 23859
Alignment:
Q  167 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaac 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| | ||| || |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  23943 caacaacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaattcaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttcacaac 23859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 437 - 529
Target Start/End: Original strand, 54182 - 54275
Alignment:
Q  437 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttt 529  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||| | |||   |||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  54182 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactatagctcctaattgcttcaatcttcaagttt 54275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 77
Target Start/End: Original strand, 12694 - 12734
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccatttta 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12694 acatcatcaaaatcaaacttcttcactatcaacccatttta 12734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 358
Target Start/End: Original strand, 3260 - 3501
Alignment:
Q  115 tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaaca 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||  || | |||||||||||||    
T  3260 tcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgatt-tcatcacaattcaacaaca 3357  T
Q  215 acatgtcataagtcatcaatta-agcataatttcacaacaacccattttcatccattatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaa 313  Q
    ||||  || || ||| |||||| |||  || ||||||| |   ||||||||   | ||||||||||  |||||| || |||||||||| ||| || |||     
T  3358 acatagcacaattcaacaattagagcccaa-ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaat 3456  T
Q  314 ttaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaa 358  Q
    || |  ||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||    
T  3457 ttcatgtattcaaacatatcatcataacaagcgcacgaatttcaa 3501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Original strand, 4579 - 4643
Alignment:
Q  123 tatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaa 187  Q
    |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  || |||||||||||||||||||||||    
T  4579 tatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaaa 4643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 187
Target Start/End: Original strand, 9193 - 9257
Alignment:
Q  123 tatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaa 187  Q
    |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  || |||||||||||||||||||||||    
T  9193 tatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaaa 9257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 451 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 9282 - 9203
Alignment:
Q  451 actaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttt 529  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | |||   |||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  9282 actaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaattgcttcaatcttcaagttt 9203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 451 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 16180 - 16101
Alignment:
Q  451 actaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttt 529  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | |||   |||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16180 actaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaattgcttcaatcttcaagttt 16101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22609 - 22559
Alignment:
Q  167 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22609 caacaacaacatcaatt-aaacatgattcacatctcaattcaacaacaacat 22559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 3427 - 3392
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaaccca 72  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3427 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaccca 3392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 128127 - 128052
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaat 511  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| |||| ||||||||    
T  128127 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcattttatctcctaat 128052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 197545 - 197390
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaat---caccaacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacata 160  Q
    ||||||||||||||||||    || ||||||||||||| || |||| || |||  |||||| |||||| |||||| |||| | |||| | |||||| ||     
T  197545 tcaacccattttacaaaactaacaacaacaacaactcaatt-ctcatcatcaaagcatgatttatgaagacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatc 197447  T
Q  161 tctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 218  Q
     || |||||||||||||||||||| ||| ||| || || | |||||||||||||||||    
T  197446 acttagcaacaacaacatcaattg-aacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat 197390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 846 - 745
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaat 182  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||   ||||||||||| | | || |||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  846 caccaacaacatctcattt-ctcaacaacaaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaat 748  T
Q  183 tga 185  Q
    |||    
T  747 tga 745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 10288 - 10218
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctc 506  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||| ||  | |||||  |||||||||||||||    
T  10288 atgattatgaagaagacaaacccccttaccttagatgatgattaaccccaacttaggcttcactttagctc 10218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 56045 - 55971
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||| ||| |||||||  |||| | |||| |||||||    
T  56045 atgattatgatgaagactaaccccctgaccgtagataatgattaatccaaacttaggctttaatttatctcctaa 55971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 109732 - 109631
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaat 182  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   ||| |  |||||||||| | | || |||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  109732 caccaacaacatctcattt-ctcaacaacaaatcatgaatcatgcaatcccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaat 109634  T
Q  183 tga 185  Q
    |||    
T  109633 tga 109631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 159
Target Start/End: Original strand, 1337 - 1433
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacat 159  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   ||| | ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  1337 atcaacccattttcaccaaaacaccaacaacatctcattt-ctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgatttatcatcaacaacat 1433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 6022 - 5989
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6022 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 5989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 11977 - 11877
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaatt 183  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||   ||| | || |||||||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  11977 caccaaaaacatctcattt-ctcaacaccaatcatgaaccatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt 11879  T
Q  184 ga 185  Q
    ||    
T  11878 ga 11877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 465
Target Start/End: Original strand, 19514 - 19543
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttacc 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19514 atgattatgatgaagactaacccccttacc 19543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 252
Target Start/End: Original strand, 6659 - 6743
Alignment:
Q  167 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaac 252  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||| |||| |||| |||| ||||| | ||| || |||| ||||||||| |||||||||||    
T  6659 caacaataacatccattgaaacttgtttctcacctcaatccaac-acaacttatcacaaatcattaattaagcaaaatttcacaac 6743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Original strand, 22857 - 22890
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22857 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 22890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Original strand, 27112 - 27145
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27112 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 27145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 1528 - 1495
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1528 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 1495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 33996 - 33897
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaatt 183  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||  ||| | ||||||||||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  33996 accaacaacatctcattt-ctcaacaacaaatcataatc-atgcatacccaagccatgaattattatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaatt 33899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 276 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11046 - 10994
Alignment:
Q  276 catgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaac 328  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||||    
T  11046 catgtaatttcatcatcaacaactcaatcaacatcaaattcacatactcaaac 10994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 186
Target Start/End: Original strand, 10642 - 10741
Alignment:
Q  87 caacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 185  Q
    ||||||||| ||||||| ||| || |||| |||||  |||||||||||||||||| | | || | |||||||||  || ||||| |||||||||||||||    
T  10642 caacaacaattcatttt-tcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatgatcaacaacaacatcacttagcaaaaacaacatcaattga 10740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 270 - 358
Target Start/End: Original strand, 8652 - 8740
Alignment:
Q  270 tatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaa 358  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||| || ||| || |  || |||||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  8652 tatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtactcaaacatatcatcacaacaagagcacgaatttcaa 8740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 436 - 472
Target Start/End: Original strand, 8331 - 8367
Alignment:
Q  436 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtt 472  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8331 atgattatgatgaattctaacccccttaccttaggtt 8367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 113 - 185
Target Start/End: Original strand, 33668 - 33740
Alignment:
Q  113 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 185  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||| | |||| | |||||| ||  || |||||||||||||||||||||    
T  33668 aatcatgaattatgaacaccctagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattga 33740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 270 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 67982 - 67894
Alignment:
Q  270 tatgaacatgttatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaa 358  Q
    ||||||||||  |||||| || |||||||||| ||| || ||| || || || |||||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  67982 tatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcacgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaatttcaa 67894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1230 times since January 2019
Visitors: 4365