View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0676_low_9 (Length: 416)

Name: NF0676_low_9
Description: NF0676
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0676_low_9
NF0676_low_9
[»] chr1 (93 HSPs)
chr1 (29-375)||(844674-845021)
chr1 (31-367)||(35387269-35387606)
chr1 (29-367)||(42510402-42510741)
chr1 (34-367)||(45490833-45491167)
chr1 (32-367)||(1351393-1351728)
chr1 (31-367)||(6711004-6711342)
chr1 (22-364)||(41972782-41973124)
chr1 (32-367)||(16386734-16387069)
chr1 (32-367)||(28340262-28340597)
chr1 (34-367)||(16451009-16451343)
chr1 (34-364)||(32270240-32270566)
chr1 (34-367)||(51264377-51264711)
chr1 (33-363)||(17887828-17888160)
chr1 (31-369)||(7183797-7184136)
chr1 (34-336)||(12890120-12890423)
chr1 (27-375)||(44737992-44738340)
chr1 (83-367)||(26118173-26118458)
chr1 (34-367)||(24339596-24339929)
chr1 (34-367)||(50540226-50540560)
chr1 (40-372)||(50304540-50304872)
chr1 (40-367)||(31004021-31004348)
chr1 (27-373)||(16476107-16476453)
chr1 (35-367)||(17327607-17327940)
chr1 (83-363)||(30105641-30105923)
chr1 (33-367)||(41967806-41968142)
chr1 (29-367)||(39281772-39282110)
chr1 (33-363)||(16437259-16437574)
chr1 (40-367)||(42512728-42513052)
chr1 (32-364)||(46154780-46155120)
chr1 (70-367)||(32289302-32289600)
chr1 (40-374)||(11772583-11772917)
chr1 (33-367)||(51703121-51703455)
chr1 (33-367)||(1601049-1601386)
chr1 (31-367)||(6029254-6029595)
chr1 (33-367)||(26764753-26765082)
chr1 (50-373)||(15539842-15540165)
chr1 (91-367)||(45658761-45659037)
chr1 (96-367)||(49303312-49303583)
chr1 (34-364)||(3414814-3415146)
chr1 (35-367)||(5109614-5109944)
chr1 (121-367)||(42705195-42705442)
chr1 (40-348)||(38086973-38087281)
chr1 (40-367)||(10384256-10384578)
chr1 (35-364)||(6143947-6144276)
chr1 (31-350)||(16704605-16704925)
chr1 (31-271)||(25539735-25539975)
chr1 (34-336)||(13994064-13994366)
chr1 (40-246)||(38663021-38663227)
chr1 (80-306)||(20494927-20495137)
chr1 (120-362)||(50382363-50382608)
chr1 (167-367)||(7837149-7837350)
chr1 (31-236)||(34663821-34664012)
chr1 (240-367)||(8838986-8839113)
chr1 (46-311)||(570281-570549)
chr1 (103-320)||(25343213-25343431)
chr1 (264-367)||(21071727-21071830)
chr1 (272-367)||(38663228-38663323)
chr1 (91-322)||(504394-504625)
chr1 (122-369)||(6771338-6771586)
chr1 (40-195)||(8838827-8838987)
chr1 (291-374)||(40811322-40811405)
chr1 (251-352)||(7837474-7837575)
chr1 (175-372)||(26733579-26733776)
chr1 (152-274)||(46447665-46447787)
chr1 (170-367)||(39792826-39793022)
chr1 (43-154)||(21071621-21071727)
chr1 (121-236)||(32467910-32468025)
chr1 (251-373)||(33316499-33316621)
chr1 (103-229)||(34283912-34284040)
chr1 (148-373)||(46815682-46815906)
chr1 (110-330)||(2761551-2761770)
chr1 (184-364)||(17291612-17291791)
chr1 (192-259)||(23799603-23799670)
chr1 (103-195)||(15324109-15324201)
chr1 (96-364)||(47242477-47242743)
chr1 (118-364)||(31574320-31574566)
chr1 (168-373)||(40610739-40610944)
chr1 (314-367)||(25539981-25540034)
chr1 (31-76)||(30105915-30105960)
chr1 (292-364)||(23799531-23799603)
chr1 (32-76)||(26118450-26118494)
chr1 (40-119)||(23799670-23799749)
chr1 (325-367)||(16643190-16643232)
chr1 (96-198)||(49799322-49799424)
chr1 (93-181)||(7836542-7836630)
chr1 (144-235)||(16643272-16643361)
chr1 (96-200)||(52030330-52030434)
chr1 (250-377)||(7146859-7146986)
chr1 (240-330)||(8780601-8780690)
chr1 (211-364)||(30798557-30798705)
chr1 (103-161)||(47093006-47093064)
chr1 (116-192)||(30798824-30798900)
chr1 (250-314)||(35335799-35335863)
[»] chr7 (76 HSPs)
chr7 (28-374)||(36769446-36769793)
chr7 (33-367)||(47953066-47953401)
chr7 (29-374)||(10932434-10932780)
chr7 (32-367)||(3922587-3922923)
chr7 (32-367)||(11321769-11322105)
chr7 (33-367)||(26994109-26994444)
chr7 (35-372)||(43158565-43158903)
chr7 (31-367)||(46633571-46633903)
chr7 (35-367)||(21784749-21785082)
chr7 (29-367)||(43189126-43189466)
chr7 (28-373)||(18386396-18386741)
chr7 (40-362)||(18470567-18470888)
chr7 (44-367)||(26371693-26372017)
chr7 (40-365)||(41211086-41211413)
chr7 (34-364)||(32873659-32873987)
chr7 (31-375)||(43368076-43368420)
chr7 (34-363)||(1870011-1870342)
chr7 (31-367)||(40753044-40753366)
chr7 (34-367)||(30849130-30849464)
chr7 (34-367)||(47316582-47316901)
chr7 (89-367)||(29661255-29661533)
chr7 (40-363)||(3891930-3892238)
chr7 (31-377)||(9913400-9913745)
chr7 (31-377)||(9927088-9927433)
chr7 (93-373)||(11250558-11250834)
chr7 (30-367)||(48894591-48894928)
chr7 (40-367)||(34295295-34295615)
chr7 (40-367)||(329354-329687)
chr7 (121-367)||(44748660-44748906)
chr7 (31-367)||(38301223-38301554)
chr7 (31-320)||(30598939-30599229)
chr7 (57-363)||(1363538-1363843)
chr7 (41-373)||(11822116-11822440)
chr7 (32-333)||(23349209-23349510)
chr7 (40-368)||(20127171-20127501)
chr7 (91-365)||(43213811-43214085)
chr7 (40-364)||(37966858-37967182)
chr7 (39-375)||(48445404-48445740)
chr7 (115-372)||(17237035-17237292)
chr7 (40-367)||(22723916-22724243)
chr7 (43-353)||(22724429-22724739)
chr7 (34-367)||(26910295-26910624)
chr7 (33-222)||(47947636-47947826)
chr7 (32-285)||(46408771-46409021)
chr7 (34-351)||(21133248-21133567)
chr7 (40-255)||(26652750-26652965)
chr7 (192-374)||(16963174-16963356)
chr7 (115-367)||(46448528-46448780)
chr7 (103-367)||(15035135-15035401)
chr7 (103-286)||(34117399-34117581)
chr7 (175-373)||(34519527-34519725)
chr7 (32-154)||(12982178-12982301)
chr7 (40-258)||(41665568-41665786)
chr7 (31-197)||(16962986-16963149)
chr7 (251-367)||(26700572-26700688)
chr7 (33-271)||(22631609-22631853)
chr7 (121-245)||(46627135-46627259)
chr7 (131-352)||(21408526-21408745)
chr7 (92-258)||(48699334-48699500)
chr7 (91-322)||(29455778-29456006)
chr7 (115-266)||(29372764-29372915)
chr7 (276-364)||(41665485-41665573)
chr7 (112-238)||(35645403-35645529)
chr7 (289-367)||(41223320-41223398)
chr7 (91-312)||(2048887-2049107)
chr7 (251-315)||(3359773-3359837)
chr7 (33-81)||(34117349-34117397)
chr7 (89-159)||(47442769-47442840)
chr7 (156-234)||(42332059-42332137)
chr7 (115-220)||(30259938-30260043)
chr7 (260-355)||(16027823-16027918)
chr7 (166-203)||(8453285-8453322)
chr7 (35-68)||(17237005-17237038)
chr7 (132-205)||(29992741-29992813)
chr7 (118-174)||(8453204-8453260)
chr7 (138-202)||(41903603-41903667)
[»] chr3 (75 HSPs)
chr3 (31-367)||(51259657-51259994)
chr3 (31-367)||(28675661-28675998)
chr3 (29-364)||(1344587-1344923)
chr3 (40-367)||(12349048-12349376)
chr3 (34-367)||(2134944-2135278)
chr3 (34-367)||(29584749-29585083)
chr3 (32-372)||(31882894-31883234)
chr3 (35-367)||(21221238-21221570)
chr3 (31-364)||(24571153-24571486)
chr3 (31-363)||(53557676-53558009)
chr3 (34-367)||(47958309-47958643)
chr3 (26-367)||(39052715-39053058)
chr3 (68-367)||(40094411-40094711)
chr3 (34-353)||(25860312-25860632)
chr3 (80-367)||(44116859-44117147)
chr3 (40-367)||(25927204-25927533)
chr3 (27-367)||(4851340-4851674)
chr3 (32-359)||(34026554-34026867)
chr3 (40-373)||(3864548-3864879)
chr3 (40-367)||(50386333-50386660)
chr3 (89-374)||(42636273-42636559)
chr3 (30-367)||(51925085-51925422)
chr3 (29-374)||(5442160-5442494)
chr3 (32-348)||(20609544-20609846)
chr3 (121-367)||(20255007-20255252)
chr3 (29-367)||(33364655-33364993)
chr3 (33-367)||(38213227-38213562)
chr3 (33-373)||(22484614-22484954)
chr3 (40-367)||(3867526-3867848)
chr3 (32-364)||(21373812-21374135)
chr3 (33-313)||(26282315-26282599)
chr3 (40-363)||(29645946-29646270)
chr3 (115-363)||(54622678-54622925)
chr3 (44-368)||(3964173-3964497)
chr3 (130-367)||(49748788-49749025)
chr3 (122-367)||(51296544-51296787)
chr3 (32-372)||(45690778-45691112)
chr3 (40-367)||(50678677-50679006)
chr3 (83-367)||(3695184-3695449)
chr3 (30-365)||(10747088-10747406)
chr3 (164-368)||(19906767-19906971)
chr3 (138-367)||(24721463-24721693)
chr3 (222-367)||(41682930-41683075)
chr3 (40-223)||(53046667-53046846)
chr3 (27-175)||(43175436-43175585)
chr3 (103-372)||(6179376-6179639)
chr3 (115-361)||(44000217-44000462)
chr3 (108-364)||(44267691-44267941)
chr3 (273-372)||(43175589-43175688)
chr3 (161-353)||(52300439-52300633)
chr3 (98-309)||(34351303-34351514)
chr3 (103-220)||(41694925-41695042)
chr3 (166-309)||(39215404-39215547)
chr3 (115-263)||(25954407-25954554)
chr3 (125-367)||(8253640-8253881)
chr3 (247-310)||(53046605-53046668)
chr3 (91-363)||(8066939-8067210)
chr3 (115-363)||(25395570-25395818)
chr3 (184-364)||(26847351-26847532)
chr3 (98-270)||(42035652-42035824)
chr3 (176-267)||(14155438-14155528)
chr3 (118-208)||(32621828-32621918)
chr3 (155-320)||(32768588-32768755)
chr3 (93-310)||(17264606-17264822)
chr3 (249-352)||(30258962-30259065)
chr3 (30-76)||(20254945-20254991)
chr3 (176-234)||(23322158-23322216)
chr3 (108-201)||(41538131-41538225)
chr3 (31-141)||(54963985-54964095)
chr3 (32-76)||(3695441-3695485)
chr3 (103-162)||(28625001-28625060)
chr3 (247-290)||(53046517-53046560)
chr3 (140-190)||(8165833-8165883)
chr3 (291-363)||(8025895-8025967)
chr3 (96-144)||(42547463-42547511)
[»] chr2 (71 HSPs)
chr2 (32-372)||(34338681-34339022)
chr2 (43-367)||(9732813-9733138)
chr2 (30-367)||(18685705-18686043)
chr2 (31-367)||(32497785-32498122)
chr2 (32-363)||(35114656-35114988)
chr2 (35-367)||(17540588-17540922)
chr2 (29-367)||(2644970-2645308)
chr2 (29-365)||(5278720-5279056)
chr2 (32-364)||(33366481-33366814)
chr2 (32-367)||(30326215-30326550)
chr2 (32-367)||(44284508-44284836)
chr2 (32-367)||(37308527-37308863)
chr2 (57-374)||(7258792-7259111)
chr2 (35-367)||(30798372-30798703)
chr2 (34-367)||(19513571-19513906)
chr2 (34-350)||(42706231-42706549)
chr2 (29-345)||(16104142-16104459)
chr2 (31-367)||(33889128-33889450)
chr2 (34-364)||(39461187-39461518)
chr2 (121-372)||(7761451-7761702)
chr2 (32-367)||(40692176-40692504)
chr2 (40-373)||(42365456-42365790)
chr2 (35-367)||(2085946-2086269)
chr2 (31-367)||(3913343-3913679)
chr2 (45-367)||(28824440-28824762)
chr2 (31-364)||(16177769-16178100)
chr2 (32-352)||(4641387-4641706)
chr2 (31-367)||(6896040-6896375)
chr2 (97-367)||(32766387-32766658)
chr2 (32-359)||(40832360-40832692)
chr2 (34-367)||(38992954-38993284)
chr2 (31-364)||(10399756-10400084)
chr2 (130-355)||(12672373-12672594)
chr2 (31-262)||(37003856-37004089)
chr2 (35-368)||(30712732-30713068)
chr2 (40-364)||(11114752-11115074)
chr2 (31-274)||(26418793-26419037)
chr2 (40-367)||(13829318-13829633)
chr2 (40-368)||(27462684-27463010)
chr2 (44-364)||(8112189-8112505)
chr2 (28-353)||(26981606-26981912)
chr2 (33-258)||(9717113-9717322)
chr2 (78-366)||(12939202-12939474)
chr2 (34-205)||(18793306-18793478)
chr2 (189-364)||(38623190-38623365)
chr2 (241-363)||(18793180-18793300)
chr2 (267-374)||(37863242-37863349)
chr2 (171-367)||(41365993-41366189)
chr2 (103-367)||(45463005-45463256)
chr2 (54-263)||(1247049-1247250)
chr2 (276-367)||(9717317-9717408)
chr2 (44-363)||(41934465-41934785)
chr2 (34-235)||(20907468-20907664)
chr2 (283-367)||(37003774-37003858)
chr2 (90-283)||(35472967-35473160)
chr2 (105-263)||(37088218-37088376)
chr2 (176-320)||(40876554-40876697)
chr2 (29-108)||(12672596-12672674)
chr2 (184-310)||(15303180-15303306)
chr2 (104-314)||(26796173-26796382)
chr2 (264-364)||(83374-83474)
chr2 (105-229)||(13249421-13249545)
chr2 (184-364)||(18278926-18279104)
chr2 (249-315)||(6453249-6453315)
chr2 (165-364)||(16061980-16062178)
chr2 (324-367)||(26419045-26419089)
chr2 (131-278)||(38786503-38786647)
chr2 (332-367)||(1247257-1247292)
chr2 (137-195)||(31148786-31148844)
chr2 (295-364)||(31193954-31194023)
chr2 (249-304)||(12217650-12217706)
[»] chr4 (115 HSPs)
chr4 (29-367)||(23521751-23522090)
chr4 (29-373)||(24002209-24002555)
chr4 (31-373)||(56154494-56154837)
chr4 (31-367)||(29785412-29785750)
chr4 (31-367)||(38486133-38486465)
chr4 (32-367)||(20802407-20802743)
chr4 (32-367)||(49151976-49152311)
chr4 (40-367)||(55065209-55065536)
chr4 (33-367)||(12600761-12601096)
chr4 (32-367)||(21579900-21580235)
chr4 (31-365)||(33176910-33177245)
chr4 (32-367)||(52319200-52319538)
chr4 (31-367)||(9512216-9512553)
chr4 (32-351)||(37865627-37865947)
chr4 (35-367)||(55593759-55594096)
chr4 (32-344)||(21202614-21202926)
chr4 (31-367)||(36743565-36743901)
chr4 (40-367)||(50178368-50178696)
chr4 (34-367)||(6776460-6776788)
chr4 (83-377)||(33552708-33553003)
chr4 (40-367)||(52949604-52949930)
chr4 (48-367)||(54542881-54543198)
chr4 (83-367)||(1231236-1231521)
chr4 (29-364)||(20694247-20694578)
chr4 (95-365)||(2725011-2725281)
chr4 (29-367)||(36885817-36886142)
chr4 (70-374)||(20517890-20518196)
chr4 (83-363)||(24210243-24210525)
chr4 (44-367)||(44649040-44649361)
chr4 (103-367)||(50727789-50728054)
chr4 (103-367)||(50735803-50736068)
chr4 (31-367)||(9807030-9807365)
chr4 (35-367)||(42869859-42870181)
chr4 (91-367)||(44324218-44324494)
chr4 (96-367)||(46680386-46680658)
chr4 (83-367)||(29616095-29616376)
chr4 (31-367)||(29592774-29593105)
chr4 (40-367)||(3649519-3649846)
chr4 (89-367)||(36497148-36497427)
chr4 (121-367)||(38812484-38812730)
chr4 (40-352)||(34929797-34930110)
chr4 (29-367)||(2786836-2787174)
chr4 (31-346)||(47642388-47642703)
chr4 (91-367)||(32181197-32181473)
chr4 (28-263)||(43640969-43641205)
chr4 (40-367)||(50186411-50186738)
chr4 (83-367)||(47361289-47361570)
chr4 (98-367)||(4325731-4326001)
chr4 (92-373)||(11055977-11056258)
chr4 (116-367)||(41711806-41712057)
chr4 (40-377)||(22318250-22318587)
chr4 (28-367)||(7554833-7555172)
chr4 (43-314)||(37695470-37695741)
chr4 (92-364)||(39078596-39078868)
chr4 (34-367)||(53200519-53200858)
chr4 (176-367)||(2629827-2630018)
chr4 (44-373)||(16320408-16320734)
chr4 (164-367)||(50729418-50729621)
chr4 (54-367)||(26083235-26083547)
chr4 (147-363)||(28115243-28115457)
chr4 (35-257)||(37931798-37932020)
chr4 (32-208)||(14296471-14296648)
chr4 (40-364)||(30942671-30942995)
chr4 (32-208)||(14314719-14314896)
chr4 (211-367)||(6973789-6973945)
chr4 (235-367)||(14296645-14296777)
chr4 (235-367)||(14314893-14315025)
chr4 (201-367)||(42772832-42772998)
chr4 (91-258)||(23327850-23328020)
chr4 (190-367)||(25978488-25978664)
chr4 (40-278)||(13110211-13110448)
chr4 (240-367)||(56487163-56487285)
chr4 (276-367)||(23328015-23328106)
chr4 (51-281)||(7001748-7001976)
chr4 (91-266)||(43739395-43739570)
chr4 (175-312)||(9947947-9948084)
chr4 (91-312)||(45577619-45577842)
chr4 (103-364)||(44355734-44355995)
chr4 (123-217)||(42772724-42772818)
chr4 (105-377)||(20644107-20644379)
chr4 (251-367)||(44640417-44640532)
chr4 (91-369)||(43189636-43189914)
chr4 (294-364)||(13110443-13110513)
chr4 (83-160)||(53343560-53343638)
chr4 (312-364)||(2114191-2114243)
chr4 (121-203)||(56487292-56487374)
chr4 (175-311)||(3579142-3579279)
chr4 (90-202)||(985216-985327)
chr4 (184-367)||(52673838-52674024)
chr4 (54-238)||(52755417-52755601)
chr4 (91-351)||(31445768-31446027)
chr4 (276-363)||(43739557-43739644)
chr4 (35-87)||(32181161-32181213)
chr4 (32-92)||(38520438-38520498)
chr4 (40-128)||(50729641-50729729)
chr4 (32-78)||(2725283-2725329)
chr4 (91-153)||(10184879-10184941)
chr4 (176-238)||(38520518-38520580)
chr4 (34-76)||(46680658-46680700)
chr4 (35-76)||(33552995-33553036)
chr4 (149-202)||(40792409-40792462)
chr4 (91-144)||(52673762-52673815)
chr4 (80-124)||(32081080-32081124)
chr4 (328-367)||(38520597-38520637)
chr4 (93-217)||(41720779-41720903)
chr4 (301-353)||(44365940-44365992)
chr4 (34-74)||(50728048-50728088)
chr4 (34-74)||(50736062-50736102)
chr4 (29-68)||(23327803-23327842)
chr4 (110-161)||(32858276-32858327)
chr4 (48-95)||(39433510-39433557)
chr4 (115-234)||(43893535-43893654)
chr4 (50-128)||(47669219-47669297)
chr4 (266-312)||(51518482-51518528)
chr4 (90-174)||(36679926-36680009)
[»] chr8 (70 HSPs)
chr8 (28-373)||(27103826-27104172)
chr8 (31-367)||(45446325-45446662)
chr8 (31-367)||(34062998-34063335)
chr8 (31-367)||(41709647-41709984)
chr8 (34-367)||(32019899-32020233)
chr8 (32-367)||(34101379-34101715)
chr8 (31-372)||(31513476-31513818)
chr8 (31-367)||(8672953-8673290)
chr8 (32-372)||(3251549-3251890)
chr8 (29-375)||(6386444-6386791)
chr8 (32-367)||(29672220-29672557)
chr8 (31-333)||(29563158-29563461)
chr8 (35-373)||(7394706-7395045)
chr8 (31-367)||(25478118-25478450)
chr8 (83-367)||(4052404-4052687)
chr8 (57-367)||(5968762-5969073)
chr8 (34-366)||(13406834-13407167)
chr8 (32-367)||(31731935-31732257)
chr8 (83-372)||(30542915-30543205)
chr8 (31-367)||(37618290-37618626)
chr8 (83-367)||(37664180-37664466)
chr8 (40-364)||(12753226-12753550)
chr8 (91-367)||(10466995-10467271)
chr8 (31-365)||(22999128-22999463)
chr8 (31-364)||(40388911-40389244)
chr8 (71-367)||(7591345-7591641)
chr8 (40-365)||(15001346-15001671)
chr8 (40-372)||(39642763-39643095)
chr8 (34-367)||(17805563-17805898)
chr8 (91-372)||(41548549-41548830)
chr8 (27-366)||(14004943-14005268)
chr8 (29-374)||(35225531-35225876)
chr8 (34-367)||(45113929-45114262)
chr8 (31-367)||(30501016-30501352)
chr8 (32-258)||(32303592-32303819)
chr8 (91-367)||(29610953-29611229)
chr8 (40-372)||(37474599-37474912)
chr8 (167-367)||(37861866-37862065)
chr8 (32-364)||(17520468-17520798)
chr8 (98-367)||(16485707-16485976)
chr8 (113-364)||(10656587-10656838)
chr8 (45-352)||(16595063-16595369)
chr8 (152-367)||(21272676-21272874)
chr8 (118-364)||(10320180-10320424)
chr8 (49-367)||(6460152-6460465)
chr8 (276-372)||(32303501-32303597)
chr8 (295-373)||(38047481-38047559)
chr8 (73-274)||(27109532-27109735)
chr8 (175-374)||(22756307-22756501)
chr8 (115-364)||(10932691-10932940)
chr8 (106-312)||(54117-54322)
chr8 (40-124)||(21272592-21272676)
chr8 (83-144)||(37861803-37861865)
chr8 (31-144)||(37861766-37861865)
chr8 (29-100)||(955102-955173)
chr8 (126-352)||(10531244-10531472)
chr8 (165-313)||(36426201-36426347)
chr8 (117-200)||(32918842-32918925)
chr8 (139-320)||(11944854-11945035)
chr8 (91-204)||(28746254-28746367)
chr8 (32-76)||(4052368-4052412)
chr8 (149-229)||(14958948-14959027)
chr8 (287-367)||(15351820-15351900)
chr8 (105-204)||(5859533-5859632)
chr8 (103-161)||(9624180-9624239)
chr8 (139-202)||(11926893-11926956)
chr8 (110-201)||(15351686-15351776)
chr8 (34-76)||(30543197-30543239)
chr8 (35-76)||(37664458-37664499)
chr8 (253-341)||(9624310-9624397)
[»] chr5 (54 HSPs)
chr5 (40-372)||(11963220-11963553)
chr5 (31-367)||(32528585-32528922)
chr5 (29-364)||(7523039-7523376)
chr5 (31-367)||(35701147-35701484)
chr5 (33-373)||(2351552-2351893)
chr5 (66-368)||(31770479-31770782)
chr5 (40-378)||(34794766-34795105)
chr5 (27-367)||(39918374-39918714)
chr5 (31-367)||(24181513-24181835)
chr5 (31-377)||(41790342-41790688)
chr5 (83-373)||(41459511-41459801)
chr5 (83-367)||(29241300-29241585)
chr5 (32-324)||(21739093-21739381)
chr5 (32-367)||(6284189-6284524)
chr5 (32-372)||(8136710-8137049)
chr5 (40-367)||(3735237-3735564)
chr5 (33-311)||(4818085-4818364)
chr5 (40-367)||(7770168-7770495)
chr5 (31-365)||(4689589-4689923)
chr5 (32-353)||(22493322-22493643)
chr5 (31-373)||(31644318-31644659)
chr5 (33-367)||(24036105-24036436)
chr5 (83-372)||(31879960-31880250)
chr5 (83-374)||(7208112-7208404)
chr5 (56-367)||(40489232-40489543)
chr5 (83-367)||(39788114-39788400)
chr5 (83-367)||(23091193-23091478)
chr5 (40-363)||(18470321-18470644)
chr5 (29-363)||(7725702-7726036)
chr5 (49-315)||(28090461-28090726)
chr5 (122-364)||(553358-553601)
chr5 (93-367)||(5571546-5571806)
chr5 (111-367)||(8560871-8561126)
chr5 (54-364)||(32092874-32093183)
chr5 (60-344)||(700513-700798)
chr5 (35-359)||(5673018-5673329)
chr5 (40-367)||(37148478-37148790)
chr5 (32-252)||(40182335-40182556)
chr5 (149-379)||(27838951-27839180)
chr5 (91-322)||(22432243-22432471)
chr5 (164-367)||(5598484-5598687)
chr5 (252-367)||(4664923-4665038)
chr5 (137-353)||(17031134-17031350)
chr5 (32-164)||(20119642-20119777)
chr5 (31-108)||(548218-548295)
chr5 (35-172)||(32313713-32313850)
chr5 (325-367)||(40182553-40182595)
chr5 (141-201)||(1338601-1338661)
chr5 (32-76)||(29241264-29241308)
chr5 (32-76)||(31880242-31880286)
chr5 (94-207)||(29788507-29788618)
chr5 (31-76)||(7208396-7208441)
chr5 (333-367)||(21739019-21739053)
chr5 (249-311)||(35955088-35955150)
[»] chr6 (64 HSPs)
chr6 (31-364)||(2614766-2615100)
chr6 (28-373)||(15276853-15277199)
chr6 (31-372)||(3259548-3259895)
chr6 (40-374)||(17867714-17868049)
chr6 (40-374)||(17877497-17877832)
chr6 (44-367)||(32409774-32410098)
chr6 (34-367)||(24203236-24203569)
chr6 (40-339)||(24242543-24242843)
chr6 (48-374)||(15277195-15277522)
chr6 (32-365)||(10959872-10960205)
chr6 (35-367)||(11212131-11212464)
chr6 (33-367)||(3932729-3933064)
chr6 (43-365)||(10324035-10324358)
chr6 (83-368)||(166844-167130)
chr6 (31-372)||(11613708-11614035)
chr6 (40-367)||(10485038-10485364)
chr6 (83-367)||(34176752-34177037)
chr6 (33-367)||(17443135-17443464)
chr6 (73-327)||(32132342-32132597)
chr6 (137-367)||(11382041-11382269)
chr6 (32-367)||(14925378-14925713)
chr6 (40-367)||(18057399-18057726)
chr6 (122-365)||(11279090-11279333)
chr6 (40-367)||(31870019-31870349)
chr6 (45-367)||(11675296-11675619)
chr6 (40-365)||(3379591-3379915)
chr6 (40-367)||(18597080-18597407)
chr6 (31-372)||(32859922-32860263)
chr6 (123-367)||(3290635-3290866)
chr6 (31-367)||(8177804-8178141)
chr6 (41-367)||(29054239-29054563)
chr6 (34-365)||(23636097-23636428)
chr6 (91-368)||(9902579-9902857)
chr6 (40-324)||(4494079-4494348)
chr6 (28-353)||(34683929-34684247)
chr6 (35-367)||(14807940-14808254)
chr6 (32-182)||(29814736-29814887)
chr6 (32-182)||(28502330-28502482)
chr6 (110-367)||(7396048-7396302)
chr6 (184-363)||(9613998-9614177)
chr6 (31-125)||(32805348-32805442)
chr6 (91-330)||(35004087-35004326)
chr6 (91-322)||(27824620-27824849)
chr6 (32-108)||(11381964-11382040)
chr6 (291-367)||(14925139-14925215)
chr6 (186-360)||(9200316-9200491)
chr6 (297-366)||(33041403-33041472)
chr6 (34-97)||(11279012-11279075)
chr6 (297-364)||(13415861-13415928)
chr6 (169-363)||(28967221-28967414)
chr6 (214-364)||(34402850-34402992)
chr6 (91-197)||(32614030-32614136)
chr6 (31-76)||(34176715-34176760)
chr6 (28-76)||(167122-167170)
chr6 (169-225)||(27756314-27756370)
chr6 (291-363)||(29424498-29424570)
chr6 (111-226)||(29202990-29203104)
chr6 (124-202)||(16542362-16542440)
chr6 (211-273)||(24785106-24785168)
chr6 (122-204)||(29424652-29424734)
chr6 (111-202)||(15400672-15400760)
chr6 (111-202)||(15412459-15412547)
chr6 (111-202)||(15428053-15428141)
chr6 (91-195)||(7365318-7365422)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (31-367)||(101819-102156)
[»] scaffold0054 (2 HSPs)
scaffold0054 (32-372)||(23448-23787)
scaffold0054 (110-315)||(19857-20062)
[»] scaffold0208 (1 HSPs)
scaffold0208 (29-373)||(2222-2566)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (33-367)||(51311-51645)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (27-372)||(15038-15384)
[»] scaffold0169 (2 HSPs)
scaffold0169 (33-328)||(17982-18278)
scaffold0169 (33-265)||(12527-12760)
[»] scaffold0729 (1 HSPs)
scaffold0729 (34-367)||(4468-4796)
[»] scaffold0957 (1 HSPs)
scaffold0957 (57-367)||(2385-2695)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (40-363)||(5332-5656)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (89-359)||(18989-19258)
[»] scaffold0360 (3 HSPs)
scaffold0360 (83-367)||(15262-15551)
scaffold0360 (131-281)||(13554-13704)
scaffold0360 (32-76)||(15543-15587)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (121-364)||(372856-373099)
scaffold0004 (30-76)||(373130-373176)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (30-367)||(13576-13913)
[»] scaffold0650 (1 HSPs)
scaffold0650 (29-368)||(1531-1870)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (29-364)||(42843-43176)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (211-367)||(19044-19201)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (122-271)||(33530-33678)
[»] scaffold0062 (1 HSPs)
scaffold0062 (93-201)||(3683-3791)
[»] scaffold1112 (1 HSPs)
scaffold1112 (138-187)||(1078-1127)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (31-76)||(338757-338802)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 93)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 845021 - 844674
Alignment:
Q  29 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-at 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  845021 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttat 844922  T
Q  128 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  844921 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggt 844822  T
Q  228 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 327  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  844821 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 844722  T
Q  328 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaaga 375  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  844721 tgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaaga 844674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 35387606 - 35387269
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 129  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35387606 agggtctgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacataataatacaagatagaacagtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttttatgg 35387507  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  35387506 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggataaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgctgtggttt 35387407  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35387406 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 35387307  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35387306 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 35387269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 29 - 367
Target Start/End: Original strand, 42510402 - 42510741
Alignment:
Q  29 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tat 127  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  42510402 taagggtgtgtttgatttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttat 42510501  T
Q  128 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 227  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  42510502 ggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggt 42510601  T
Q  228 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 327  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42510602 ttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgtctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacgaatcaaacactggacaactagagt 42510701  T
Q  328 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42510702 tgtcctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 42510741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 34 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 45491167 - 45490833
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 132  Q
    ||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45491167 gtgtgtttggtatgcaaaacagcaattactggacagaacaatataagatagaacaatacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttgtatggcat 45491068  T
Q  133 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  45491067 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 45490968  T
Q  233 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 332  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45490967 gagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaattgttc 45490868  T
Q  333 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45490867 tgtcctgtctttcattttttagcaaatcaaacgca 45490833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 32 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 1351728 - 1351393
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  1351728 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacttgacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatggc 1351629  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  1351628 attgagta-ttttttgttttatatgatttttgagagacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 1351530  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1351529 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgttccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 1351430  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1351429 tctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 1351393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 6711342 - 6711004
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggttt-gcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atg 128  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  6711342 agggtgtgtttggttttgcaaaacatcaagtactggacagaacagtacaaaatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaagacaaattttttatg 6711243  T
Q  129 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||    
T  6711242 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaattgtgttgtggtt 6711143  T
Q  229 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 328  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6711142 tggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 6711043  T
Q  329 gttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6711042 gttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 6711004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 22 - 364
Target Start/End: Original strand, 41972782 - 41973124
Alignment:
Q  22 ttaagtctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat 121  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41972782 ttaagtttatgggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaat 41972881  T
Q  122 tttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 220  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||     
T  41972882 tttttatggcattaagtaattttttgttttatacgatttt-gagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgta 41972980  T
Q  221 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 320  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41972981 gtgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 41973080  T
Q  321 ctagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  41973081 ctagagttgttctatcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 41973124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 32 - 367
Target Start/End: Original strand, 16386734 - 16387069
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16386734 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaatacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggc 16386833  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  16386834 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttg 16386933  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  16386934 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagaactgt 16387033  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16387034 tctgtcatgtccttcattttttag-aaatcaaacgca 16387069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 32 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 28340597 - 28340262
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 130  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  28340597 gggtgtgtttggtttacaaaacagtaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacatgacaatttttttatggc 28340498  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  28340497 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttg 28340398  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28340397 atgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 28340298  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28340297 tctatcctgtcctt-attttttagcaaatcaaacgca 28340262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 34 - 367
Target Start/End: Original strand, 16451009 - 16451343
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  16451009 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaatagtacaacacatggcagaatagcacaggacaaattttttatggcat 16451108  T
Q  133 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  16451109 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 16451208  T
Q  233 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 332  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  16451209 gagagacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaactagagttgtta 16451308  T
Q  333 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16451309 tgtcctgtccttcattttttaacaaatcaaacgca 16451343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 34 - 364
Target Start/End: Original strand, 32270240 - 32270566
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcatt 133  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||| || |||    || |||||||||||||    
T  32270240 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaataggaca----aattttttatggcatt 32270335  T
Q  134 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 233  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  32270336 gagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtg 32270435  T
Q  234 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32270436 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctctacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 32270535  T
Q  334 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32270536 gtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 32270566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 34 - 367
Target Start/End: Original strand, 51264377 - 51264711
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 132  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  51264377 gtgtgtttggtttgcaaatcagcaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaatagcacaggacaaattttttatggcat 51264476  T
Q  133 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  51264477 tgagtaattttttgttttatacgatttttaaaggacaaaatgctattttagtattttaaacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 51264576  T
Q  233 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 332  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51264577 gagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttattc 51264676  T
Q  333 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51264677 tgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 51264711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 33 - 363
Target Start/End: Original strand, 17887828 - 17888160
Alignment:
Q  33 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  17887828 ggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacgggacagaatagtacaagatagaacaatacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatggca 17887927  T
Q  132 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  17887928 ttgagtaatttgttgttttatacgatttttggggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 17888027  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17888028 gcgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacaccggacaactagagttgt 17888127  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 363  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17888128 tttgtcatgtcattcattttttagcaaatcaaa 17888160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 31 - 369
Target Start/End: Original strand, 7183797 - 7184136
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||  ||| |||||||||| |||||    
T  7183797 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacaatacaggacaaattttttatgg 7183896  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||    
T  7183897 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagagacaaaatactatattggtattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgttgtggttt 7183996  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  7183997 ggtaagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacatatcaaacactggacaactaaagtta 7184096  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaac 369  Q
    ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  7184097 ttctgtcctgtctttcaaattttagcaaatcaaacgcaac 7184136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 34 - 336
Target Start/End: Original strand, 12890120 - 12890423
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 132  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  12890120 gtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtactagacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggataaattttttatggcat 12890219  T
Q  133 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  12890220 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtatcttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgat 12890319  T
Q  233 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 332  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12890320 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttatcctgtaccagaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 12890419  T
Q  333 tgtc 336  Q
    ||||    
T  12890420 tgtc 12890423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 27 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 44738340 - 44737992
Alignment:
Q  27 tctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt- 125  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  44738340 tctaaggatgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactagacagaacagtagaagatagaacaatacaacacaaggtagaacaacacatgacaaatttttt 44738241  T
Q  126 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  44738240 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggaataaaaa-ctattttgctattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtg 44738142  T
Q  226 gtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 325  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  44738141 gtttggtgagggacaaaaatatgagttttggtcctgtcccttgcctccaagttgtcatgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaattaga 44738042  T
Q  326 gttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaaga 375  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  44738041 gttgttctgtcttgtctttcattttttagcaaaacaaacgcaccctaaga 44737992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 83 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26118458 - 26118173
Alignment:
Q  83 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 181  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26118458 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 26118359  T
Q  182 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 281  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26118358 ggtattttagacaacttttacgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttgtc 26118259  T
Q  282 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26118258 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttatgtcatgtccttcattttttagcaaatcatacgca 26118173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 34 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 24339929 - 24339596
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 132  Q
    ||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24339929 gtgtgtttggtctgcaaaacagcaaatactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcat 24339830  T
Q  133 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt-gg 231  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||    
T  24339829 tgaataattttttgttttatacgatgtttgggggacaa--tgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggaaaaaaagttgtgttgtggttttgg 24339732  T
Q  232 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24339731 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttatacaaatcaaacactgaacaactagagttgtt 24339632  T
Q  332 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24339631 ctgtcctgtcctttattttttagcaaatcaaacgca 24339596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 34 - 367
Target Start/End: Original strand, 50540226 - 50540560
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  50540226 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacttgacagaacagtataagatagaacagtacaacacacgtcagaacagcacagggcaaattttttatggcat 50540325  T
Q  133 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |    
T  50540326 tgagtaatttgttgttttatatgatttttgggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgat 50540425  T
Q  233 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 332  Q
    || ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  50540426 gaaggacaaaaatatgagtttatgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagctgttt 50540525  T
Q  333 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  50540526 tgttctgtcctttcttttttagcaaatcaaacgca 50540560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 40 - 372
Target Start/End: Original strand, 50304540 - 50304872
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  50304540 ttggtttgcaaaacagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataa 50304639  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 239  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||||||     
T  50304640 ttttttgttttatacgatttttggaggacaaaatgctattttgatattttagacaacttaaacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttgcagagggac 50304739  T
Q  240 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 339  Q
    |||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  50304740 aaaaatatcagtttttgtcttgtttcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcctg 50304839  T
Q  340 tccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50304840 tccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 50304872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 40 - 367
Target Start/End: Original strand, 31004021 - 31004348
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||| |  ||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  31004021 ttggtttgcaaaacagcaagtactgtacagaacagtacaagaaagaacagcgcaatacaagggagaacatcacaggacaaatttttatggcattgaataa 31004120  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 239  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||     
T  31004121 ttttttgttttataggatttttgggggacgaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 31004220  T
Q  240 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 339  Q
    ||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  31004221 aaaaacatcagtttttgtcctgtcccgtgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcctg 31004320  T
Q  340 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31004321 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 31004348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 27 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16476453 - 16476107
Alignment:
Q  27 tctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttta 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||   || ||| |||| | |||| |||||||||||||| ||    
T  16476453 tctaagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacaatataagatagaacaacacgacataaggcataacaccacatgacaaatttgta 16476354  T
Q  127 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 226  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  16476353 tggcattgaataattttatgttttatacaatttttgggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgccgtgg 16476254  T
Q  227 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 326  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  16476253 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttatcctgtcccttgcatctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaaa 16476154  T
Q  327 ttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 373  Q
    |||| || || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  16476153 ttgtcctctcctctccttcattttttagcaaatcaaacacaccctaa 16476107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 35 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17327940 - 17327607
Alignment:
Q  35 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcatt 133  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || | ||||||||||| ||||| ||    
T  17327940 tgtgtttgatttgcaaaaaagtaagtattggacagaacagtataagatagaacagtacaatacaaggcagaacaacataggacaaattttttatggcgtt 17327841  T
Q  134 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 233  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| || |||||| || ||  ||||||||||||||| |||||||    
T  17327840 gagtaatttgttgttttatacgatttttgggggacaaaatattattttggtattttagataatttgtacatgagacaaaaagttgtgctgtgatttggtg 17327741  T
Q  234 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  17327740 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgactccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaactagagttgtttt 17327641  T
Q  334 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17327640 gtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 17327607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 83 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 30105923 - 30105641
Alignment:
Q  83 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 181  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30105923 agaacagtacaacacaaggcagaacaacactggacaaattttttatggcattaagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 30105824  T
Q  182 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 281  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30105823 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttatgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtc 30105724  T
Q  282 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatt-ttttagcaaatcaaa 363  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  30105723 ctttacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcctgtccttcatttttttagcaaatcaaa 30105641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 41968142 - 41967806
Alignment:
Q  33 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||   |||||||||||  |||||  ||||||||||||||| ||| ||    
T  41968142 ggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtgctggacagaacagtacaagacagaacaacacaacacaaggcggaacaatacatgacaaattttttatgaca 41968043  T
Q  132 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 231  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||    
T  41968042 atgagtaattttttgttttatacaatttttgggagacaaaaggctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttgg 41967943  T
Q  232 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 331  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41967942 taagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtctcttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatactggacaactagagttgtt 41967843  T
Q  332 ctgtcatgtccttcattttttag-caaatcaaacgca 367  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41967842 ctgtcctgtccttcattttttagtcaaatcaaacgca 41967806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 29 - 367
Target Start/End: Original strand, 39281772 - 39282110
Alignment:
Q  29 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 128  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | | |||| |||||||||| ||| ||||    
T  39281772 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaatagtataagatagaacagcacaacacaatgcataacaacacatgacaactttgtatg 39281871  T
Q  129 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 228  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||    
T  39281872 acattgaataattttatgttttatacgatttttggaggacgaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtactgtggtt 39281971  T
Q  229 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 328  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  39281972 tggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatctagtttgtcctgtaccttaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactgaagtt 39282071  T
Q  329 gttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
     |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39282072 atcttgtcatgtccttcatgttttagcaaatcaaacgca 39282110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 33 - 363
Target Start/End: Original strand, 16437259 - 16437574
Alignment:
Q  33 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcat 132  Q
    |||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||               | ||| ||||||||||||||||||    
T  16437259 ggtgtgtttggtttgtaaaacagcaaatactggacagaacagtataagatagaacagtaca---------------gtacaggacaaatttttatggcat 16437343  T
Q  133 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  16437344 tgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 16437443  T
Q  233 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 332  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16437444 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctctagtttgtcctgtagctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaactagagttgttc 16437543  T
Q  333 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 363  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16437544 tattctgtccttcattttttagcaaatcaaa 16437574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 40 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 42513052 - 42512728
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    |||||||||||||||   ||||| | ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||    
T  42513052 ttggtttgcaaaaca---agtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatcacattgaataa 42512956  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 239  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| ||||||||| ||||| |     
T  42512955 ttttttgttttatacgatttttgggggacaaaattctattttgatattttagacaatttgtacgtaggacaaaaagttgtgttgtggtttgctgaggcac 42512856  T
Q  240 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 339  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  42512855 aaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcctg 42512756  T
Q  340 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42512755 tcctttattttttagcaaatcaaacgca 42512728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 364
Target Start/End: Original strand, 46154780 - 46155120
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 130  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  46154780 gggtgtgtttagtttgcaaaacagtaagtactggacaaaacagtataagatagaacagtataacacaagacataacggcacatgacaaattttttatgac 46154879  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgc-------tg 223  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||       ||    
T  46154880 attgaataattttttgttttataagatttttgaaggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtaagtgggacaaaaagttgtgctgtagtttg 46154979  T
Q  224 tggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaacta 323  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||    
T  46154980 tagtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccctcacctccagtttgtccagtacctgaaataattttacaaatcaaacactgaacaatta 46155079  T
Q  324 gagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46155080 gagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 46155120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 70 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 32289600 - 32289302
Alignment:
Q  70 aacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggac 168  Q
    ||||||| |||||||||  ||| |||| |||  |||||| || | || |||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  32289600 aacagtacaagatagaagagtataacataagccagaacaacataggataaatattttatgacattgaataattttatgttttatataatttttgagggac 32289501  T
Q  169 aaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttg 268  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32289500 aaaatgctattttggtattttaaacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttg 32289401  T
Q  269 cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32289400 cctccaatttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 32289302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 40 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 11772917 - 11772583
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | |||   ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||  |||| | |    
T  11772917 ttggtttgcaaaacggtaagtactggacataacagtacaagacataacaacacaacacaaggcagaatagcacaggacaaatttttatggttttgaatta 11772818  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 239  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||| | |||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  11772817 ttttttgttttatacgatttttgggggacgaaatactattttggtatttaaaacaatttgtaggtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggac 11772718  T
Q  240 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 339  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  11772717 aaaaatatcagtttttgtcttgtcctttgcctccagattgccttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttatgtcctg 11772618  T
Q  340 tccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 374  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  11772617 tccttcattttctagcaaatcaaacgcaccctaag 11772583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 51703455 - 51703121
Alignment:
Q  33 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 131  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  51703455 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacaaaacagtacaagatataacagaacaacacaaggcaaaacaatacatgacaaattttttatggca 51703356  T
Q  132 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||||||| ||    
T  51703355 ttgagtaattttttgttttataccatttt-gagggacaaaatgttatttttgtattttagacaacatgtaggtgggacaaaaagttgtgttgtggtt-gg 51703258  T
Q  232 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 331  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51703257 tgaggaacaaaaatatgagtttttgttctgtcccttgccttcagtttatcctgtacttgaaacaattttacaaatcaaacactggacaattagagttgtt 51703158  T
Q  332 ctgtcatgtccttcattttttag-caaatcaaacgca 367  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51703157 ctgtcttgtccttcattttttagtcaaatcaaacgca 51703121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Original strand, 1601049 - 1601386
Alignment:
Q  33 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaa-----ggtagaacagcacatgacaaatttt-ta 126  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||   |||||||||     || |||||| |||| |||||||||| ||    
T  1601049 ggtgtgtttggtctgcaaaacagtaagtactggacaaaacagtacaagaaagaacaacacaacacaacacaaggcagaacaacacaagacaaatttttta 1601148  T
Q  127 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 226  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||    
T  1601149 tggcaatgagtaattttttgttttgtacgatttttggtggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtgg 1601248  T
Q  227 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 326  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  1601249 tttggtgagggacaaaa--atgagtttttgttctatcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaaccgttttacaaatcaaacactgaacaactaaag 1601346  T
Q  327 ttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1601347 ttgttctgtcatgttcttca-tttttagcaaatcaaacgca 1601386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 6029595 - 6029254
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 130  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||   ||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||     
T  6029595 agggtgcgtttggtttgcaaaatagtaagtactggacagcacagtataatgcagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttttatggt 6029496  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    ||||| |||||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  6029495 attgaataatttcttgttttatatgctttttgggggacgaaatgttattttggtgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 6029396  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6029395 gtgagggacaaaaatttcagtttttgtcctgtcccttgccttcagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgt 6029296  T
Q  331 tc-----tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||     |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6029295 tctgtcctgtcctgtccttcattttttaacaaatcaaacgca 6029254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26765082 - 26764753
Alignment:
Q  33 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcat 132  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||  | | ||||||||||||| ||||    
T  26765082 ggtgtgtttgatttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacaacacaacacaaggcagaacaatataggacaaatttttatagcat 26764983  T
Q  133 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 232  Q
    |||   |||||||  | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||    
T  26764982 tga---atttttt--tatatacgatttttgagggacgaaatattattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttcggt 26764888  T
Q  233 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 332  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26764887 gagggacaaaaatataagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttatcttgtacctaaaacaattgtacaaatcaaacactggacaactggagttgttc 26764788  T
Q  333 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  26764787 tgtcatgtcttttattttttagcaaatcaaacgca 26764753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 50 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15540165 - 15539842
Alignment:
Q  50 aaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||| | ||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15540165 aaacagtaagtactggacagaacagtacaatgcagaacagcacaacacaaggcataacaacacatgacaagtttttatggtattgaataattttttgttt 15540066  T
Q  150 tatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatga 249  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||||  || |||| | | |    
T  15540065 tatatgatttttgggggacaaaatgttattttggtgttttagacaacttctacgtatgacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaaagacaaaagtttca 15539966  T
Q  250 gtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattt 349  Q
    | ||||||| |||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  15539965 ggttttgtcctgtctcttgcctccagtttgttctgtccttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcctgtccttcattt 15539866  T
Q  350 tttagcaaatcaaacgcaacctaa 373  Q
    |||| ||||||||||||| |||||    
T  15539865 tttaacaaatcaaacgcaccctaa 15539842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 91 - 367
Target Start/End: Original strand, 45658761 - 45659037
Alignment:
Q  91 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 190  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  45658761 acaacacaagacagaatagcacatgacaaatttttatggctttgaataattttttgttttatatgatttttgggggacgaaatgctattttggtatttaa 45658860  T
Q  191 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 290  Q
     |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  45658861 aacaacttgtaggtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagcgacaaaaatatcagtttttgtcttgtcctttgtctccagtttgtcctgtacttg 45658960  T
Q  291 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45658961 aaacagttttacaaatcagacactagacaactggagttgttttgtcctgtccttcattttctagcaaatcaaacgca 45659037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 49303583 - 49303312
Alignment:
Q  96 acaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagaca 194  Q
    |||||| |||||| |||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  49303583 acaaggcagaacatcacatgacaactattttacgtcattgagtaattttttgttttatacgatttttg-gggacaaaatgttattttagtattttagaca 49303485  T
Q  195 acttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaac 294  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  49303484 acttgtacgtaggataaaaaattgtgctgtggtttggtgaaggacaaaaatatgagtttttctcttgtcccttgtctccagtttgtcttatacctgaaac 49303385  T
Q  295 agttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  49303384 agttttacaaatcaaacactggacaattagagttgttttgtcttgtactttattttttagcaaatcaaacgca 49303312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 34 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 3415146 - 3414814
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatg-acaaatttttatggcat 132  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  || ||||||||  | |||| |||||| |    ||||||||||||    
T  3415146 gtgtgtttggtttgtaaaacagtaagtactggacaaaacagtacaagatagaacaatataacacaagacaaaacaacacatgtaattttttttatggcat 3415047  T
Q  133 tgagtaa-ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 231  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||| || || ||| ||||||    
T  3415046 tgagtaatttttttgttttatatgatttttgggggacaaaatgctattttggtattttaaacaactagtacgtgggataaaaaattatgatgtagtttgg 3414947  T
Q  232 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3414946 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccctcgtctccagattgtccagtacctaaaatagttttacaaatcaaacactggataattagagttgtt 3414847  T
Q  332 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
     |||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  3414846 ttgtcatatccttcatattttaacaaatcaaac 3414814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 35 - 367
Target Start/End: Original strand, 5109614 - 5109944
Alignment:
Q  35 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattg 134  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||| | ||  |  |||||||| | | |||| || |||||||||||||| | |||||    
T  5109614 tgtgtttggtttgtaaaacagtaagtactggactgaagagtacaagacaaaatagcgcaacacaaagcataacaccatatgacaaatttttacgacattg 5109713  T
Q  135 agtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtga 234  Q
    | |  |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| | |||  |||||||||| |||||||||||||    
T  5109714 atttttttttt-ttttatacaatttttgggggacaaaatgttattttgc-attttagacaacttgtactttggacaaaaagttgtgatgtggtttggtga 5109811  T
Q  235 gggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctg 334  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  5109812 gggacaaaaacatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactggagttgttctg 5109911  T
Q  335 tcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    || ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  5109912 tcctgcacttcattttttagcaaatcaaacgca 5109944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 121 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 42705442 - 42705195
Alignment:
Q  121 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42705442 tttttatggcaatgagtaattttttgttttatatgatttttgggggacaaaatgctattttgacatttcagacaacttgtacgtgggacgaaaagttgtg 42705343  T
Q  221 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagt-ttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggaca 319  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42705342 ttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagttttttttcccgtcccttgtctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaaca 42705243  T
Q  320 actagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |  ||||||||| || ||| | ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  42705242 atcagagttgttatgacatattctttattttttcgcaaatcaaacgca 42705195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 40 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 38087281 - 38086973
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  38087281 ttggtttgcaaaacattaagtactggacataacagtacaagacagaacagtacaacataaggcagaacagcacaggacaaatttttatggcattgaataa 38087182  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 239  Q
    | ||||| ||||| | ||||||| || || |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||| |||| |||     
T  38087181 tattttgctttatgcaatttttggggaacgaaatgctattttggatttttagacaacttgtacttgggacaaaaagttgtgatgtggtttagtgaaggac 38087082  T
Q  240 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| |||| |     
T  38087081 aaaaatatgagtttttgtcatgtccattgcatccattttatcctgtacttgaaactgttttataaatcaaacacaggacaactgaagttgttttgtccta 38086982  T
Q  340 tccttcatt 348  Q
    |||||||||    
T  38086981 tccttcatt 38086973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 40 - 367
Target Start/End: Original strand, 10384256 - 10384578
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||  |||| | |||||||| || | |||| |||  ||||| ||||||| ||||||| |||    
T  10384256 ttggtttgcaaaacagtaagtactgggcataacagtacaagaccgaacagcacaacacagggcaaaacaacactggacaattttttattgcattgaataa 10384355  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 239  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||     
T  10384356 ttttttgttttataagatttttgggggacgaaatgttattttgaatttttagataatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttagtgaaggac 10384455  T
Q  240 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 339  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||      |    
T  10384456 aaaaatatgagtttttgtcttgtcctttgcatccaatttgtactgtacctgaaataattttacaaatcaaacactagacaactagagttgttc-----ag 10384550  T
Q  340 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10384551 ttcttcattttttagcaaatcaaacgca 10384578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 6144276 - 6143947
Alignment:
Q  35 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattg 134  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||  |   |||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  6144276 tgtgtttggtttgcaaaacagtaatcactgaacagaacagtacaagatagggcaacacaacataaggcagaacatcacaagacaaatttttatggtattg 6144177  T
Q  135 agtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtga 234  Q
    | ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||  ||    
T  6144176 aataattttctgttttatatgatttttgggtgacaaaatgttatttttgtgttttagacaacttctacgtgggagaaaaagttgtgttgtggtttgccga 6144077  T
Q  235 gggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctg 334  Q
    |||| ||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  6144076 gggacaaaaattgcagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtctctgaaactgttttacaaatcaaacattggacaactgcagttgttctg 6143977  T
Q  335 tcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    || ||||||||||||| || ||||||||||    
T  6143976 tcctgtccttcattttgtatcaaatcaaac 6143947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 350
Target Start/End: Original strand, 16704605 - 16704925
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 130  Q
    |||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  | |||| |||||   | |||| || | |||| || ||| ||||||||||||||||    
T  16704605 agggtgagtttggttttcaaaacagaaagtactggacataacaacacaagacagaacaacaaaacataaagcagaatagtacaagacaaatttttatggc 16704704  T
Q  131 attgagtaa-ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  || ||||||| ||||||||    
T  16704705 attaaataaattttttgttttatacgatttttggaggacaaaaagctattttggtattttagacaacttgtatgtgagacaaagagttgtgatgtggttt 16704804  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    ||| ||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||    
T  16704805 ggtaagggacaaaaatatatgtttttgtcgtgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaattgaagttg 16704904  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcatttt 350  Q
    ||||||| ||||||| |||||    
T  16704905 ttctgtcctgtcctttatttt 16704925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 31 - 271
Target Start/End: Original strand, 25539735 - 25539975
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 130  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | |||  |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  25539735 agggtgcgtttggtttgcaaaacggtaagtactggacataacagtacaagacataacaatacaacacaaggcagaatagcacaggacaaatttttatggc 25539834  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||    
T  25539835 tttgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggtatttaaaacaacttgtaggtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 25539934  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcct 271  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  25539935 gtgagggacaaaaatatcagtttttgtcttgtcctttgcct 25539975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 34 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 13994366 - 13994064
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 132  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||  |||||| |  ||   |||| |||||| |||||| |||| |||||||||| ||||  ||    
T  13994366 gtgtgtttggtttgcaaaacaataagtacagaacaaaacaacataagacaacacaacacaatacaaggcagaacaacacaagacaaattttgtatgatat 13994267  T
Q  133 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 232  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| |||||||||||    
T  13994266 tgaataattttatgttttatatgatttttg-gggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacatgagacaaaaagttgtgttgtggtttggt 13994168  T
Q  233 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 332  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||  || ||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13994167 gagggacaaaaatttcagtttttgtccagttccttgcctccaatttgtcatgtccatgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttc 13994068  T
Q  333 tgtc 336  Q
    ||||    
T  13994067 tgtc 13994064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 40 - 246
Target Start/End: Original strand, 38663021 - 38663227
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||| |||| |||||   |||| | |||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  38663021 ttggtttgcaaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacaacacaatataagggagaacaacacaggacaaatttttatgacattgaataa 38663120  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||     
T  38663121 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgctgagggac 38663220  T
Q  240 aaaaata 246  Q
    |||||||    
T  38663221 aaaaata 38663227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 80 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20495137 - 20494927
Alignment:
Q  80 gatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctat 178  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20495137 gatagaacagtacaacataaggcagaacagcacatgacaaattttttatgacattgagtaattttttgttttatactatttttgagggacaaaatgctat 20495038  T
Q  179 tttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagttt 278  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||                   ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20495037 tttggtattttagacaacttgtacgtggga-----------------cattggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagttt 20494955  T
Q  279 gtcctgtacctgaaacagttttacaaat 306  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20494954 gtcctgtacctgaaacaattttacaaat 20494927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 120 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 50382608 - 50382363
Alignment:
Q  120 atttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgt 219  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  50382608 atttttatggtattgaataatattttgttttatatgatttttgagggacaaaatgttatttttgtgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgt 50382509  T
Q  220 gctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttg---cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgg 316  Q
    | ||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||| ||||| |||   ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||      
T  50382508 gttgtggtttggtgaaggacaaaaatttcagtttttgtcctgtccattgcctcctccagtttgttatgtccctgaaacagttttaaaaatcaaacactaa 50382409  T
Q  317 acaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaa 362  Q
    |||  |||||||||| |||  | ||||||||||| || ||||||||    
T  50382408 acatgtagagttgttttgtattctccttcattttataacaaatcaa 50382363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 167 - 367
Target Start/End: Original strand, 7837149 - 7837350
Alignment:
Q  167 acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccct 266  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||| |||| |||||| | ||| |||||  | | ||||||||||||||||    
T  7837149 acaaaatactattttgatattttagacaacttgtctgtgagacaaaaagttgtgatgtgatttggtaatggacaaaaaattcaatttttgtcatgtccct 7837248  T
Q  267 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttca-ttttttagcaaatcaaacg 365  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  7837249 tgcctctagtttgtcatgttcctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactgaagttgttctatcatatccttcatttttttagcaaatcaagcg 7837348  T
Q  366 ca 367  Q
    ||    
T  7837349 ca 7837350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 236
Target Start/End: Original strand, 34663821 - 34664012
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  34663821 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta---------------caacataaggtagaagagcacatgacaaattttttatgg 34663905  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||   |||||||||| ||||||||    
T  34663906 cattaagtaattttttgttttatatgatttttgagtgacaaaatgttattttgatattttagacaatttataagtgggtcaaaaagttgtgttgtggttt 34664005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 240 - 367
Target Start/End: Original strand, 8838986 - 8839113
Alignment:
Q  240 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||    
T  8838986 aaaaatatcagtttttgtcatgtccatttcctccagtttgtcttgtaccagaaacagttttacaaatcaaacattggacaattggagttgttctgtcttg 8839085  T
Q  340 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8839086 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 8839113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 46 - 311
Target Start/End: Original strand, 570281 - 570549
Alignment:
Q  46 tgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaatttttt 145  Q
    |||||||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||   |||||| || | |||||| |||| || |||||||||||| | ||| || ||||||    
T  570281 tgcaaaacagtaagtattagacaaaatagtacaagatagaacaacacaacataaagcagaacaacacaagataaatttttatggtactgaatactttttt 570380  T
Q  146 gttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgc--tgtggtttggtgagggataaaa 243  Q
     | |||||| |||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||  |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  570381 atcttatacaatttttggtggaaaaaatgttattttgatattttagacaacttatacgcgagacaaaaagttgtgcattgtggtttggtgagggacaaaa 570480  T
Q  244 atatgagtttttgtcatgtccc-ttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaac 311  Q
    || |  |||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||  |||||||| ||||| |||||||||    
T  570481 atttctgtttttatcatgtccctttgcctccagtttatcttgtcgctgaaacaattttataaatcaaac 570549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 103 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 25343431 - 25343213
Alignment:
Q  103 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 202  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  25343431 agaacaacacaagacaaatttttatgacattgaataattttttgctttatgcgatttttgagggacgaaatactattttggatttttggacaacttgtac 25343332  T
Q  203 gtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcc-cttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttta 301  Q
    ||| ||  ||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||||| |||||| || | |||  |||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  25343331 gtgcgacaaaaagttgtactatggtttagtgaaggacaaaaatatgtgtttttatcctatccatttgcatccagtttgtcctgtatatgaaactgtttta 25343232  T
Q  302 caaatcaaacactggacaa 320  Q
     ||||||||| | ||||||    
T  25343231 taaatcaaacgcaggacaa 25343213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 264 - 367
Target Start/End: Original strand, 21071727 - 21071830
Alignment:
Q  264 ccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 363  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  21071727 ccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaattgaagttgttctgtcatgtacttcattctttagcaaatcaaa 21071826  T
Q  364 cgca 367  Q
    ||||    
T  21071827 cgca 21071830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 272 - 367
Target Start/End: Original strand, 38663228 - 38663323
Alignment:
Q  272 ccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38663228 ccagtttatcctgtccttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 38663323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 91 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 504625 - 504394
Alignment:
Q  91 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 190  Q
    ||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||| ||||   ||||||| ||  | |||||||||||  | |||||| |||| |||| |||||||    
T  504625 acaacacaaagtagaataacacatgtcaaatttttatggtattggacaatttttagtcctctacgatttttggtgaacaaaaagctactttggtatttta 504526  T
Q  191 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 290  Q
    |||||||| || ||||||  |||| ||||| | |||||| ||||| || |||| | | |||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||| |||     
T  504525 gacaacttctatgtgggacaaaaaattgtgttatggtttagtgagagacaaaattttcagtttttgtgttgtcccttgcctcaagtttgtcttgtcccta 504426  T
Q  291 aaacagttttacaaatcaaacactggacaact 322  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||| ||||||    
T  504425 aaacaattttgcaaatcaaacgctgtacaact 504394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 122 - 369
Target Start/End: Original strand, 6771338 - 6771586
Alignment:
Q  122 ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttg-agggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 220  Q
    |||||||| ||||| ||||  || || |||||||||||||  | |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  6771338 ttttatggtattgaataatacttagtcttatacgatttttttatggacaaaatattattttgatattttagtcaacttgtatgtgggagaaaaagttgtg 6771437  T
Q  221 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 320  Q
     |||| ||| ||||| || || ||| | |||||||||| ||||||||| ||| | ||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  6771438 ttgtgatttagtgagtgacaagaattttagtttttgtcttgtcccttgtctctaatttatcatgtccctaaaacagttttataaatcaaacaccgcacaa 6771537  T
Q  321 ctagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaac 369  Q
     || | ||||  |||| ||||||||  ||||||||| || ||| |||||    
T  6771538 ataaaattgtcatgtcttgtccttctatttttagcagattaaatgcaac 6771586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 195
Target Start/End: Original strand, 8838827 - 8838987
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||| |||||   |||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  8838827 ttggtttgcaaaacagtaaatactagacataactgtataagacagaacaacacaacacaagatagaaaaacacataacaaatttttatagcattgaataa 8838926  T
Q  140 -ttttttgtt----ttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaa 195  Q
     |||||||||    ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  8838927 tttttttgttttaattatatgatttttgggggacgaaatgccattttgatattttagacaa 8838987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 291 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 40811405 - 40811322
Alignment:
Q  291 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 374  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40811405 aaacagttttataaatcaaacgctggacaactaaagttgttttgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaag 40811322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 251 - 352
Target Start/End: Original strand, 7837474 - 7837575
Alignment:
Q  251 tttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatttt 350  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| |||| |||| |||||||||||    
T  7837474 tttttgtcatgtcccctgcctctagtttgtcatgttcctgaaacagttttataaatcaaacactgaacaactgaagttattctatcatatccttcatttt 7837573  T
Q  351 tt 352  Q
    ||    
T  7837574 tt 7837575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 175 - 372
Target Start/End: Original strand, 26733579 - 26733776
Alignment:
Q  175 ctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcca 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || |   |||||||||| | |||||| ||| |||| || ||| | |||||||||||||||| | | ||| |    
T  26733579 ctattttggtattttagacaacttgtacatgaggcaaaaagttgtgttatggtttagtgggggacaagaatttcagtttttgtcatgtccatcgtctcta 26733678  T
Q  275 gtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 372  Q
    |||||||| || |   ||||||||||||||||||||||  | ||||||  ||||||  |||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  26733679 gtttgtccggtcctaaaaacagttttacaaatcaaacatcgtacaactgaagttgtcatgtcttgttcttcattttttagcaagtcaaatgcacccta 26733776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 274
Target Start/End: Original strand, 46447665 - 46447787
Alignment:
Q  152 tacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagt 251  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||| |||  |||   |||| |||||||| | |||    
T  46447665 tacgatttttgatggacaaaagactattttgatattttagataacttgtacgtggaacaaaaagttgtgatgtaatttaaggaggaataaaaattttagt 46447764  T
Q  252 ttttgtcatgtcccttgcctcca 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  46447765 ttttgtcaggtcccttgcctcca 46447787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 367
Target Start/End: Original strand, 39792826 - 39793022
Alignment:
Q  170 aaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgc 269  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||  |  | |||||||| ||||||||||||| ||| || ||| | | |||||||||| ||  |||     
T  39792826 aaatgttattttattattttagacaatttgtacgtgaaacaacaagttgtgttgtggtttggtgaaggacaagaatttcaatttttgtcatatcttttgt 39792925  T
Q  270 ctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||| ||| || ||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||   ||||||  | ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  39792926 ctccaatttatcttgtccctaaaacagttttgcaaatcaaacactgtacaacctaagttgtcatttcatgtcctcca-tttttagcaaatcaaacgca 39793022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 154
Target Start/End: Original strand, 21071621 - 21071727
Alignment:
Q  43 gtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattt 142  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||     ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  21071621 gtttgtaaaacagtaagtactggactaaacagtacaagatagcac-----aacacaaggcagaacaatacatgacaaatttttattacattgaataattt 21071715  T
Q  143 tttgttttatac 154  Q
    ||||||||||||    
T  21071716 tttgttttatac 21071727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 32468025 - 32467910
Alignment:
Q  121 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 220  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||   | ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  32468025 tttttatggtattgactaattttttgtcttatatgattttttgtgaacaaaaaactattttgatattgtagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtg 32467926  T
Q  221 ctgtggtttggtgagg 236  Q
    |  |||||| ||||||    
T  32467925 cgttggtttagtgagg 32467910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 251 - 373
Target Start/End: Original strand, 33316499 - 33316621
Alignment:
Q  251 tttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatttt 350  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |||||| |||| | ||||||||||| | |||   ||||||||||||    
T  33316499 tttttgttttgtctcttgcgtccagtttgttttgtccctgaaacagatttacagatcaaatactgtagaactagagttgctatgtatcgtccttcatttt 33316598  T
Q  351 ttagcaaatcaaacgcaacctaa 373  Q
    |||||| |||||||||| |||||    
T  33316599 ttagcagatcaaacgcatcctaa 33316621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 103 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34284040 - 34283912
Alignment:
Q  103 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattt--tagacaacttgt 200  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||| ||||| ||| ||||||  || |||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||  || | |||||||    
T  34284040 agaacaacacaagacaaacttttatggtattgaataagtttttgccttgtacgattttttatggacaaaagactattttgatattttatatataacttgt 34283941  T
Q  201 acgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  34283940 acgtgagataaaaagttgtgttgtggttt 34283912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 46815906 - 46815682
Alignment:
Q  148 tttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatat 247  Q
    |||| ||| ||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||| | |||||| |||||||| ||   | |    
T  46815906 tttagacggtttttggcggacaaaatgttattttggtattttagacaactagtacgtgggaaaaaaggttgtgatatggtttagtgaggga-aatttttt 46815808  T
Q  248 gagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcat 347  Q
     ||||| ||| ||||||||||| ||   |||||| | |   ||||||| ||||||||| ||||| | | |  | ||||||| |  |||| ||||||||||    
T  46815807 tagtttgtgttatgtcccttgcgtctgatttgtcttatctttgaaacaattttacaaaccaaactccgtattattagagttatcatgtcttgtccttcat 46815708  T
Q  348 tttttagcaaatcaaacgcaacctaa 373  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||    
T  46815707 tttttagcagatcaaacgcaccctaa 46815682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 2761770 - 2761551
Alignment:
Q  110 cacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggat 209  Q
    ||||||||| | |||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||||||  | ||||||  |||||||  ||||||||| || |||||| || ||     
T  2761770 cacatgacagacttttatagtattgaataatttttggttttatatgatttttgttg-acaaaaatctatttttgtattttagataatttgtacttgagac 2761672  T
Q  210 gaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaa 309  Q
     |||| ||||| |||||||| |||||||||| |||  |  ||||||||  ||||||||||||| ||||| || |||  |  ||||| |||||||||| ||    
T  2761671 aaaaaattgtgttgtggtttagtgagggatataaaattttgtttttgttttgtcccttgcctctagtttatcatgtcgcataaacaattttacaaattaa 2761572  T
Q  310 acactggacaactagagttgt 330  Q
    ||||   |||||| |||||||    
T  2761571 acaccatacaacttgagttgt 2761551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 364
Target Start/End: Original strand, 17291612 - 17291791
Alignment:
Q  184 tattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcct 283  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||  ||||||| || |||||||| ||| |||| |||||| |  ||||||||| |||| |||| || ||  || ||||    
T  17291612 tattttatataacttgtacgagggacaaaaagttttgttgtggtttagtg-gggacaaaaatttatgtttttgtcctgtctcttgacttcaacttatcct 17291710  T
Q  284 gtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    || |   |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||| ||||||||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  17291711 gtcctaaaaacagttttacaaatcaaataccgtacaactggagttgtcctgtcatgttctcaattttttagcagatcaaac 17291791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23799670 - 23799603
Alignment:
Q  192 acaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtca 259  Q
    |||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  23799670 acaacttaaacgtgcgataaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatcagtttttgtca 23799603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 195
Target Start/End: Original strand, 15324109 - 15324201
Alignment:
Q  103 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaa 195  Q
    |||||| ||||||| ||  |||||||| | | | ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  15324109 agaacaacacatgaaaagcttttatggtaataaataattttttgtcttatacgatgtttgatggacaaattactattttgatattttagacaa 15324201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 47242743 - 47242477
Alignment:
Q  96 acaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaa 195  Q
    |||||| |||||  |||||||||||  |||| |  ||||| ||||||||  | |||||| |||||| | | ||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  47242743 acaaggcagaacgacacatgacaaacatttacgatattgaataatttttgatcttatacaattttt-atgtacaaaagactattttggtattttagacaa 47242645  T
Q  196 cttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaaca 295  Q
    ||   ||||| ||  ||||||||| ||  | |||  |||| || |||||| | |||||||||| |||| | | ||||||||||||| ||| ||  |||||    
T  47242644 ctaacacgtgagacaaaaagttgtactaggttttaatgagagaaaaaaattt-agtttttgtcttgtcacctacctccagtttgtcatgtcccataaaca 47242546  T
Q  296 gttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
     |||||||||| ||||||   ||||||  ||||||  ||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  47242545 attttacaaattaaacaccatacaactgaagttgtcatgtcatgtcatttattttttagcaaatgaaac 47242477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 364
Target Start/End: Original strand, 31574320 - 31574566
Alignment:
Q  118 aaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggac-aaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagt 216  Q
    |||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||    ||| ||||  |||||||  ||||||| ||||||||||  | |||  | ||||    
T  31574320 aaatttttgtgatattgaataattttttgttttatgcgattttttgtagactaaaaaactatttttgtattttaaacaacttgtatataggacaataagt 31574419  T
Q  217 tgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgg 316  Q
    || | ||||  || ||||| |||| |||| | ||||||||||||||  |||  |||||||||||  |||   ||||| |||||||||||||||| | ||     
T  31574420 tgcgttgtgaattagtgagagatacaaattttagtttttgtcatgtttcttatctccagtttgttttgtttttgaaatagttttacaaatcaaa-attgt 31574518  T
Q  317 acaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    ||||||  ||||||  |||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  31574519 acaactgaagttgtcatgtcatgtgcttcatttcttagcagatcaaac 31574566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 168 - 373
Target Start/End: Original strand, 40610739 - 40610944
Alignment:
Q  168 caaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtc-cct 266  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||  || ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| |  ||||||||||| ||   |    
T  40610739 caaaatgttattttggtattttagacaacttatatatgtgataaaaagttgtgttgtggtttgatgagggagaagaat-tttgtttttgtcatatctttt 40610837  T
Q  267 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgc 366  Q
    ||||| || |||||||||   | | ||||||||||||||||||||| || | || | || ||||  | |||| | ||||||||||||  ||||||||| |    
T  40610838 tgccttcaatttgtcctgccgccggaacagttttacaaatcaaacattgtaaaatttgaattgtcatatcatatacttcattttttaataaatcaaacac 40610937  T
Q  367 aacctaa 373  Q
    | |||||    
T  40610938 accctaa 40610944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 367
Target Start/End: Original strand, 25539981 - 25540034
Alignment:
Q  314 tggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25539981 tggacaactggagttgttctgtcctatccttcattttctagcaaatcaaacgca 25540034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 30105960 - 30105915
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 76  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30105960 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagta 30105915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 23799603 - 23799531
Alignment:
Q  292 aacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||  | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  23799603 aacagttttataaatcaaacactaaacaactgaaattgttgtgtcatgtcattcaatttttagcaaatcaaac 23799531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 26118494 - 26118450
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 76  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26118494 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagta 26118450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 23799749 - 23799670
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaa 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||   |||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  23799749 ttggtttacaaaacagtaagtactgtatagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacaacacatgacaa 23799670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16643232 - 16643190
Alignment:
Q  325 agttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16643232 agttgttctgttctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 16643190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 198
Target Start/End: Original strand, 49799322 - 49799424
Alignment:
Q  96 acaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaa 195  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||| |||||||  ||||| |||| ||| || |||| | |||||| | ||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  49799322 acaagctagaacaccacaagacaaacttttatgatattgaataatatttggtcttattcaattttttatggacaaaagtctattttggtattttagacaa 49799421  T
Q  196 ctt 198  Q
    |||    
T  49799422 ctt 49799424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 181
Target Start/End: Original strand, 7836542 - 7836630
Alignment:
Q  93 aacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 181  Q
    |||| ||||||||| | ||||  |||| || |||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||    
T  7836542 aacataaggtagaataacacagaacaagttattatgatattgaataattttttgttttatacgagttttggggcacaaaatgctttttt 7836630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16643361 - 16643272
Alignment:
Q  144 ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgag 235  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||||| ||||||  ||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||  ||| |||||||||    
T  16643361 ttgttttatacgattttgg--ggacgaaatggtatttttgtattttagacaacctgtatgtgggacaaaaagttgtgtcgtgatttggtgag 16643272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 52030434 - 52030330
Alignment:
Q  96 acaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaa 195  Q
    |||||| | ||||||||||| |||| ||||| || ||||| | |||||||||| |||| |||||||   ||||||||  |||||||  ||||||||| ||    
T  52030434 acaaggcataacagcacatggcaaacttttacggtattgaatcattttttgttatatatgattttttgtggacaaaaaactatttttgtattttagataa 52030335  T
Q  196 cttgt 200  Q
    |||||    
T  52030334 cttgt 52030330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 250 - 377
Target Start/End: Original strand, 7146859 - 7146986
Alignment:
Q  250 gtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattt 349  Q
    ||||||||  ||||| ||| ||| ||||| | |||| ||  ||||| ||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| |||| | ||||| | ||    
T  7146859 gtttttgttttgtcctttgtctctagtttattctgtcccaaaaacaattttacaaatcaaacactatacaactgaagttgttatgtcttatcctttaatt 7146958  T
Q  350 tttagcaaatcaaacgcaacctaagaat 377  Q
    ||||||  ||||||| || |||||||||    
T  7146959 tttagctgatcaaacacaccctaagaat 7146986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 8780690 - 8780601
Alignment:
Q  240 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||||| | |||||||| |||||| |||| | |||||||||  ||| | |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||    
T  8780690 aaaaatttcagtttttggcatgtctcttgtccccagtttgttatgtccatgaaacagttttac-aatcaaacacagtacaactacagttgt 8780601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 211 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 30798705 - 30798557
Alignment:
Q  211 aaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaa 310  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| || | | | |||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  30798705 aaaagttgtgatgtgggttagtgagggacaagactttcagtttt-gtcatgtcccctgcctccaatttgttatgtccctaaaacagtctttcaaatcaaa 30798607  T
Q  311 cactggacaactagagttgttctgtcatgtccttca-ttttttagcaaatcaaac 364  Q
    || || | || | ||||     |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  30798606 cagtgtaaaattcgagt-----tgtcatgtccttcatttttttagcagatcaaac 30798557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 47093064 - 47093006
Alignment:
Q  103 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgattttt 161  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  47093064 agaacaacacatgacaaatttttataatattgaataattttttgccttatacgattttt 47093006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 30798900 - 30798824
Alignment:
Q  116 acaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttaga 192  Q
    ||||| |||||||  ||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||||| |  |||||||| |||||||||    
T  30798900 acaaaattttatgatattgaataatttttggtcttatacgatttttggtggacaacaaactattttggtattttaga 30798824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 314
Target Start/End: Original strand, 35335799 - 35335863
Alignment:
Q  250 gtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact 314  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||  |||  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  35335799 gtttttgtcatgtctcttgtctccattttgttatgtctctacaacagttttacaaatcaaacact 35335863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 76)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 28 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 36769793 - 36769446
Alignment:
Q  28 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-a 126  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  36769793 ctaagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaatttttta 36769694  T
Q  127 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  36769693 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagagacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgg 36769594  T
Q  227 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 326  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36769593 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 36769494  T
Q  327 ttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 374  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  36769493 ttgttctattctgtccttcattttttagcaaatcaaacacaccctaag 36769446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Original strand, 47953066 - 47953401
Alignment:
Q  33 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggca 131  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47953066 ggtgtgtttgctctgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggca 47953165  T
Q  132 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  47953166 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgg 47953265  T
Q  232 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47953266 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 47953365  T
Q  332 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47953366 ctgtcctgtcgttcattttttagcaaatcaaacgca 47953401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 29 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 10932780 - 10932434
Alignment:
Q  29 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-at 127  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||    
T  10932780 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacacggcagaacagcataggacaaattttttat 10932681  T
Q  128 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||    
T  10932680 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtagt 10932581  T
Q  228 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 327  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10932580 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagt 10932481  T
Q  328 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 374  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10932480 tgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaag 10932434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 32 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3922923 - 3922587
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3922923 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaccagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggc 3922824  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3922823 attgagtatttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagataacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 3922724  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3922723 gtgaggaacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaataaaacactggacaactagagttgt 3922624  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3922623 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 3922587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 32 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 11322105 - 11321769
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 130  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  11322105 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtatcggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacatgacaaattttttatggc 11322006  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11322005 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 11321906  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11321905 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccgttgcctccagtttgtcctgtacctgaatcagttttacaaatcaaacattggacaactagagttgt 11321806  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11321805 tctgtcatgttcttcattttttagcaaatcaaacgca 11321769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26994444 - 26994109
Alignment:
Q  33 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 131  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26994444 ggtgtgtttggtttgcaaaacagaaagtactggacagaacaggacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggca 26994345  T
Q  132 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26994344 ttgagtaattttttgttttatacgattttttagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgg 26994245  T
Q  232 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 331  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26994244 tgagggacaaaaatatgagattttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 26994145  T
Q  332 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26994144 ctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 26994109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 35 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 43158903 - 43158565
Alignment:
Q  35 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcatt 133  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  43158903 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactagatagagcagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacagtacaggacaaattttttatggcatt 43158804  T
Q  134 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||     
T  43158803 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggta 43158704  T
Q  234 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43158703 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 43158604  T
Q  334 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 372  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43158603 gtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 43158565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Original strand, 46633571 - 46633903
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||    
T  46633571 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtattggacataatagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaagacaaattttttatgg 46633670  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  46633671 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 46633770  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||     | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46633771 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcttg-----ttcctccagtttgtcctgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 46633865  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46633866 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 46633903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 35 - 367
Target Start/End: Original strand, 21784749 - 21785082
Alignment:
Q  35 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcatt 133  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||    
T  21784749 tgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacagaacaaatcttttatggcatt 21784848  T
Q  134 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 233  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  21784849 gagtaattttatgttttatacgatttttggaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtg 21784948  T
Q  234 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21784949 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcatgtgcctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttct 21785048  T
Q  334 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21785049 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 21785082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 29 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 43189466 - 43189126
Alignment:
Q  29 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-at 127  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||| ||    
T  43189466 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaatagtgcatgacaaattttttat 43189367  T
Q  128 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 226  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  43189366 ggcattgagtaatttgttgtttcatacgatttttggggggacaaaatactattttggtattctagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgttgtgg 43189267  T
Q  227 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 326  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43189266 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttacctccagtttgtcctgtacctgaaacatttttataaatcaaacactggacaactagag 43189167  T
Q  327 ttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43189166 ttgttttgtcatgtcctccattttttagcaaatcaaacgca 43189126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 18386396 - 18386741
Alignment:
Q  28 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-a 126  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| || |||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  18386396 ctaagggtgagtttggtttgcaaaacagcaagtattggacaaaacggtacaaaatagaacaatacaacacaaggcagaacaacacatgacaaatttttta 18386495  T
Q  127 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 226  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18386496 tgacattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgg 18386595  T
Q  227 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 326  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18386596 tttggtgagggacaaaaatatgag-ttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaa 18386694  T
Q  327 ttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 373  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18386695 ttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacacaccctaa 18386741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 40 - 362
Target Start/End: Original strand, 18470567 - 18470888
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagta 138  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18470567 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagta 18470666  T
Q  139 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  18470667 attttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttatgctgtggtttggtgagaga 18470766  T
Q  239 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 338  Q
     ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  18470767 caaaaatatgagtttttgtcctgt--cttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactcgacaactagagttgttctatcct 18470864  T
Q  339 gtccttcattttttagcaaatcaa 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  18470865 gtccttcattttgtagcaaatcaa 18470888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 44 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26372017 - 26371693
Alignment:
Q  44 tttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattt 142  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26372017 tttgaaaaacagtaagtactggacataacagtacaagatagaacagtacaacataaaacagaacatcacatgacaaattttttatggcattgaataattt 26371918  T
Q  143 tttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  26371917 tttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttagtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagggacaaa 26371818  T
Q  243 aatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtcc 342  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  26371817 aatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaatagttttgcaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctatcc 26371718  T
Q  343 ttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26371717 ttcattttttagcaaatcaaacgca 26371693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 40 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 41211413 - 41211086
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagta 138  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| || | ||||||||||| |||||||||||||    
T  41211413 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacaaaacagtacaagatagaacaatacaacacaaggcagaacaacataggacaaattttttatggcattgagta 41211314  T
Q  139 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaa-tgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  41211313 attttttgttttatacgattttttagggataaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaggg 41211214  T
Q  238 ataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtca 337  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  41211213 acaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgggcaacttgagttgttctgtcc 41211114  T
Q  338 tgtccttcattttttagcaaatcaaacg 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41211113 tgtccttcattttttagcaaatcaaacg 41211086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 34 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 32873987 - 32873659
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 132  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  32873987 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatggcat 32873888  T
Q  133 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||    
T  32873887 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtatttcagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggt 32873788  T
Q  233 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 332  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   |||     
T  32873787 gaaggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttatccggtacctgaaacaattttacaaatcaaacaatggacaactaga---gttt 32873691  T
Q  333 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32873690 tgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 32873659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 31 - 375
Target Start/End: Original strand, 43368076 - 43368420
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 130  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |    
T  43368076 agggtgcgtttggtttgcaaaacagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacatgacaaatttttatcac 43368175  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  43368176 attgaataattttttgttttatacgattttggagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgctgtggtttg 43368275  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
     ||||| | |||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43368276 ctgaggcacaaaaatatcagtttttgtcccgtctcttgcctccagtttgtcctatacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgt 43368375  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaaga 375  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  43368376 tctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacggaccctaaga 43368420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 34 - 363
Target Start/End: Original strand, 1870011 - 1870342
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 132  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  1870011 gtgtgtttggtttgcaaaacagcatgtactgtacataacagtacaatatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgataaattttttatgacat 1870110  T
Q  133 tgagtaattttttgttttatacgatttttg-agggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  1870111 tgagtaattttttgttttatacgatttttttagggacaaaatgttattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 1870210  T
Q  232 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1870211 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttatcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgtt 1870310  T
Q  332 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 363  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  1870311 ctgcactgtccttcattttttagcaaatcaaa 1870342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Original strand, 40753044 - 40753366
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||| | |||||| |||| |||||||||| |||||    
T  40753044 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta---------------caacacaaagcagaacaacacaggacaaattttttatgg 40753128  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  40753129 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgattt 40753228  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  40753229 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaacgagagttg 40753328  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  40753329 ttctgtcatgtcccttattttttagcaaatcaaacgca 40753366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 34 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30849464 - 30849130
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||| |||| ||||| ||||| |||||||    
T  30849464 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacttgacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacaacacaggacaatttttttatggcat 30849365  T
Q  133 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||    
T  30849364 tgagtaattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttggtattttatacaacttgtatatgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 30849265  T
Q  233 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 332  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  30849264 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccaccagtttgtcctgtacctaaaacagttttacaaatcaatcattggacaactagaattgttc 30849165  T
Q  333 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30849164 tgtcttgtccttcattttttaacaaatcaaacgca 30849130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 34 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 47316901 - 47316582
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcatt 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||          |||    || |||||||||||||    
T  47316901 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacggtacaagatagaacagtacaacacaag----------aca----aattttttatggcatt 47316816  T
Q  134 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  47316815 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtaatttagacaacttgcatgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtg 47316716  T
Q  234 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47316715 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactagagttattct 47316616  T
Q  334 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47316615 gtcatatccttcattttttagcaaatcaaacgca 47316582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 89 - 367
Target Start/End: Original strand, 29661255 - 29661533
Alignment:
Q  89 gtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatt 187  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29661255 gtacaacacaaggcagaacaacacaagacaaattttttatagcattgagtaattttttgttttatacgatttttgtgggacaaaatgctattttggtatt 29661354  T
Q  188 ttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtac 287  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  29661355 ttagataacttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtac 29661454  T
Q  288 ctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29661455 ctgaatcagttctacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatc-tatccttcattttttagcaaatcaaacgca 29661533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 40 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 3892238 - 3891930
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagta 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  3892238 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcatatgacaaattttttatggcattgagta 3892139  T
Q  139 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 238  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  3892138 attttttgttttacacgatttttgaggaacaaaatgctattttggtattctagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagaga 3892039  T
Q  239 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 338  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||                |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  3892038 caaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcc----------------ttacaaatcaaacattggacaactagagttgttctgtcct 3891955  T
Q  339 gtccttcattttttagcaaatcaaa 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3891954 gtccttcattttttagcaaatcaaa 3891930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 31 - 377
Target Start/End: Original strand, 9913400 - 9913745
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 130  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||   |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  9913400 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactgtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacaccacatgacaaatttttatgga 9913499  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  9913500 attgaataatttttagttttatacgatttttgggggacgaaatgttattttggtattttagacaacctgtacgtgggaaaaaaagttgtgatgtggtttg 9913599  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    ||||| ||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  9913600 gtgagcga-caaaatatcaatttttgtcctgtcccttgcctctagtttatcctgtacctgaaatagttttacaaatcaaacaccggacaactggagttgt 9913698  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaagaat 377  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  9913699 tctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaatgcacccttagaat 9913745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 31 - 377
Target Start/End: Original strand, 9927088 - 9927433
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 130  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||   |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  9927088 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactgtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacaccacatgacaaatttttatgga 9927187  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  9927188 attgaataatttttagttttatacgatttttgggggacgaaatgttattttggtattttagacaacctgtacgtgggaaaaaaagttgtgatgtggtttg 9927287  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    ||||| ||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  9927288 gtgagcga-caaaatatcaatttttgtcctgtcccttgcctctagtttatcctgtacctgaaatagttttacaaatcaaacaccggacaactggagttgt 9927386  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaagaat 377  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  9927387 tctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaatgcacccttagaat 9927433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 93 - 373
Target Start/End: Original strand, 11250558 - 11250834
Alignment:
Q  93 aacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttag 191  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  11250558 aacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggtattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctagtttggtattttag 11250657  T
Q  192 acaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga 291  Q
    ||||||      |||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11250658 acaacta-----tgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgattttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga 11250752  T
Q  292 aacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 373  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11250753 aacaattttacaaatgaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaa 11250834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 30 - 367
Target Start/End: Original strand, 48894591 - 48894928
Alignment:
Q  30 aagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatgg 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| ||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| |    
T  48894591 aagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaaatatttgacataacagtacaagaccgaacagtacaacacaaggtaaaacagcactggacaattttttattg 48894690  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||   |||||||  | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  48894691 cattgaataattttttgttttataagatttttgggggacaaaatgttattttggatttttagatgatttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggttt 48894790  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
     ||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48894791 agtgaatgacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatccagtttgtactgtacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactggagttg 48894890  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48894891 ttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 48894928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 40 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 34295615 - 34295295
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||| |||| |||||   |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  34295615 ttggtttgcaaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacagcacaagacaaatttttatgacattgaataa 34295516  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 239  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||     
T  34295515 ttttttgttttatatgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgctgagggac 34295416  T
Q  240 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 339  Q
    |||||||| |||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |     
T  34295415 aaaaatatcagtttttgt-------cttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggataactggagttgttctgtccta 34295323  T
Q  340 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    || || |||||||||| |||||||||||    
T  34295322 tcttttattttttagctaatcaaacgca 34295295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 40 - 367
Target Start/End: Original strand, 329354 - 329687
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||| | ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  329354 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaatgcagaacagcacaacacaaggcataacagtacatgacaaatttttatggtattgaataa 329453  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 239  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||     
T  329454 tttcttgttttatatgatttttgggggacaaaatgctattttggtgttttaggcaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggac 329553  T
Q  240 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaac------tagagttgttct 333  Q
    |||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||      | |||||||| |    
T  329554 aaaaatttcagtttttgtcttgtcctttgcctccagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacacgggacaactggagttggagttgtttt 329653  T
Q  334 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  329654 gtcttgtccttcattttttaacaaatcaaacgca 329687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 121 - 367
Target Start/End: Original strand, 44748660 - 44748906
Alignment:
Q  121 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 220  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  44748660 tttttatggcaatgagtaattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgta 44748759  T
Q  221 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 320  Q
     ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44748760 ttgtggtttggtgagggacaaaaatttgagtttttgttctgtcccttgcctctagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 44748859  T
Q  321 ctagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44748860 ctagagttgttttgtcctgtcctttattttttagcaaatcaaacgca 44748906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Original strand, 38301223 - 38301554
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 130  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||| | ||||||||||| |||| |||||   |||| |||||| |||||| ||||      ||||||||| |    
T  38301223 agggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacaacacag-----atttttatgac 38301317  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||    
T  38301318 attgaataattttttgtttaatacgatttttgggggacaaaatgttattttgatattttagacaacttgt-cgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 38301416  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
     ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  38301417 ctgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaattggagttgt 38301516  T
Q  331 tctgtcatgtccttca-ttttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38301517 tctgtcctgtccttcatttttttagcaaatcaaacgca 38301554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 31 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 30599229 - 30598939
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 129  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||     
T  30599229 agggtgtgtttggtttacaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatga 30599130  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||| || ||  |||||||||| ||||||||    
T  30599129 aattgagtaatttgttgttttatacgatttttaggggacaaaatgttattttggtattttagataatttgtacttgagacaaaaagttgtgttgtggttt 30599030  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 320  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30599029 gatgagggacaaaaatatgagcttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatgaaacagtggacaa 30598939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 57 - 363
Target Start/End: Original strand, 1363538 - 1363843
Alignment:
Q  57 aagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacga 156  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||   ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  1363538 aagtactggacataacaatataagatagaacaacacatcagaaggtagaacaacacatgacaaatttttatggcattgaataattttttgttttatacaa 1363637  T
Q  157 tttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttg 256  Q
    |||||| || || ||||||||||||  |||||| |||||| |||||||| ||  |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| || |||||    
T  1363638 tttttg-ggtacgaaatgctatttttgtatttttgacaacctgtacgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttgatgagggacaaaaatatcagcttttg 1363736  T
Q  257 tcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagca 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  1363737 tcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacatgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttttgtcctatcctttattttttagca 1363836  T
Q  357 aatcaaa 363  Q
    |||||||    
T  1363837 aatcaaa 1363843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 41 - 373
Target Start/End: Original strand, 11822116 - 11822440
Alignment:
Q  41 tggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaat 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||   ||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||| |  |    
T  11822116 tggtttgcaaaacagtaagtactgaacataacagtataaaatagaacaacacaacacaaggcagaacaacataggacaaatttttatggcattgaat--t 11822213  T
Q  141 tttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggata 240  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| |||||      ||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||| |    
T  11822214 ttttttttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttgaatttttaaacaac------gtgggacaaaaagttgtgttgtggtttagtgaaggaca 11822307  T
Q  241 aaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||    
T  11822308 aaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcatccagtttgtcctgtacctcaaacagttttacgaatcaaacactggacaagtgaagttgttctgtcctgt 11822407  T
Q  341 ccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 373  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  11822408 cctttattttttagtaaatcaaacgcaccctaa 11822440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 32 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 23349510 - 23349209
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 131  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  23349510 gggtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtaatggacataacagtacaagatagaacaaaacaacataaggtagaacagcacatgacaaatttttataaca 23349411  T
Q  132 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 231  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||  |||||  |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  23349410 ttgaataattttttgttttctacgattgttgggggacgaaatgtcattttagtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 23349311  T
Q  232 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 331  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  23349310 tgagggacaaaaatatcagtttttgttctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacttgaaatagttttacaattcaaacactggacaactggagtagtt 23349211  T
Q  332 ct 333  Q
    ||    
T  23349210 ct 23349209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 40 - 368
Target Start/End: Original strand, 20127171 - 20127501
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattg----a 135  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| | |||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    |    
T  20127171 ttggtttgcaaaacagtaagtac--gatagaacagtacaagacaaaacaacacaacacaagatagaacagcacatgacaaatttttgtagcattgaatta 20127268  T
Q  136 gtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgag 235  Q
     || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||| ||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||    
T  20127269 ttatttttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgtcattttggtattttacacaaattgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttgctgag 20127368  T
Q  236 ggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgt 335  Q
    | | |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20127369 gaacaaaaatatcagcttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaatagttttaaaaatcaaacactggacaactggagttgttctgt 20127468  T
Q  336 catgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaa 368  Q
    | | || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20127469 cctatctttcatttattagcaaatcaaacgcaa 20127501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 91 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 43214085 - 43213811
Alignment:
Q  91 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 190  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||     
T  43214085 acaacacaaggtagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaatcattttttgttttataggatttttgaggcacgaaatgctattttggtattttt 43213986  T
Q  191 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 290  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || |||| || |||||||||||| |||||||||||||||       
T  43213985 gacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaaggacaaaaatatcagcttttatcttgtcccttgccttcagtttgtcctgtactga 43213886  T
Q  291 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43213885 aaacagttttacaaatcaaacactagacaactgaagttgttctgtcctgttcttcattttttagcaaatcaaacg 43213811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 40 - 364
Target Start/End: Original strand, 37966858 - 37967182
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| || | ||||||| | ||| | ||||||||| | |||| || |||| |||||||||||||| ||| | |||    
T  37966858 ttggtttgcaaaatagtaagtactagacataataatataagacataacagcacaacacaaagcagaatagtacataacaaatttttatggtattaaataa 37966957  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 239  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||   ||||||| ||||||||||||| |  |||||||||| |||||| | ||||  ||     
T  37966958 ttttttgttttatacgatttttttgggacgaaatgctattttggatttttagataacttgtacgtggaacaaaaagttgtgatgtggtctagtgaaagac 37967057  T
Q  240 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 339  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||    
T  37967058 aaaaatatgggtttttgtcttgtcccttgcatccaatttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacaccggagaactaaagttgttttgtcatg 37967157  T
Q  340 tccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  37967158 tccttcattttttagcaaatcaaac 37967182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 39 - 375
Target Start/End: Original strand, 48445404 - 48445740
Alignment:
Q  39 attggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagta 138  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||   | |||   ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  48445404 attggtttgcaagacagtaagtactggacaaaacagtacaatgcataacaacacaacacaaggcataacaacacatgacaaatttttatggtattgaata 48445503  T
Q  139 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 238  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||| | | ||  ||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  48445504 atttcttgttttatatgatttttgggggacaaaatgttattttcgtgttttagacaacttgtatgcgagacaaaaagttgtcctgtgatttggtgaagga 48445603  T
Q  239 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 338  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||| |    
T  48445604 caaaaatttcagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgttctgtccctcaaacagttttacaaattaaacattggataactggagttgttctgtctt 48445703  T
Q  339 gtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaaga 375  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  48445704 ttccttcattttttaacaaattaaacgcaccctaaga 48445740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 115 - 372
Target Start/End: Original strand, 17237035 - 17237292
Alignment:
Q  115 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 214  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||   ||||||| || ||||||||| ||  ||||    
T  17237035 gacaattttttattgcattgaataattttttgttttataagatttttgggggacgaaatgttattttggatttttagataatttgtacgtgagacaaaaa 17237134  T
Q  215 gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact 314  Q
    |||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  17237135 gttgtgttgtggtttagtgaatgacaaaaatatgagtttttgtcatgttccttgcatccagtttgtactgtacctgaaataattttacaaatcaaacact 17237234  T
Q  315 ggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 372  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17237235 ggacaactggagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 17237292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 40 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22724243 - 22723916
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||| || |||||||||||| ||   |||||| |||| |||||| |||| || |||||||||||| ||||| |||    
T  22724243 ttggtttgcaaaatagtaaataccggacaaaatagtataagataggacaacacaacataaggcagaacaacacaagataaatttttatggtattgaataa 22724144  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 239  Q
    |||| ||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || |||     
T  22724143 ttttctgtattatatgatttttgggtgacgaaatgctatttttgtattttatacaacttgtacgtgggataaaaagttgcgttgtggtttggcgatggac 22724044  T
Q  240 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 339  Q
    ||| ||   |||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  22724043 aaacattgcagtttttgtcctgtcccttacctcgagtttgtccggtccctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcaca 22723944  T
Q  340 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22723943 tccttcattttttatcaaatcaaacgca 22723916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 43 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22724739 - 22724429
Alignment:
Q  43 gtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattt 142  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||| |||| |||||| |||| || |||||||| ||| ||||| ||||||    
T  22724739 gtttgcaaaatagtaagtactggacagaacagtacaagatagaatatcacaacataaggcagaacaacacaagataaatttttctggtattgaataattt 22724640  T
Q  143 tttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaa 242  Q
    | ||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  22724639 tctgtattatatgatttttgggcgacgaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacgtgggacataaagttgcgctgtggtttggtgagggacaaa 22724540  T
Q  243 aatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtcc 342  Q
    |||   || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||| | |||    
T  22724539 aattgcagcttttgtcatatcccttgcctccagtttgtcctgtccctgaaactgttttacaaatcaaacgctgaacaactggaattgttctgtcctatcc 22724440  T
Q  343 ttcatttttta 353  Q
    || | ||||||    
T  22724439 tttacttttta 22724429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 34 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26910624 - 26910295
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcatt 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||   | |||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||    
T  26910624 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacaatataggataggacatcataacacaaggtagaacagcgcaagacaaatttt-atggtatt 26910526  T
Q  134 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 233  Q
    || ||||||| || |||||  |||||||| | ||| || | |||||||  |||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| |    
T  26910525 gaataattttctgatttat--gatttttgggtgacgaattactatttttgtatttttgacaacttgtacgtgtgacaaaaagttgtgttgtggtttggcg 26910428  T
Q  234 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 333  Q
    ||||| ||||||   ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26910427 agggacaaaaattgcagtttttatcctgtcccttgcctccagtttgccctgtccctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaactgtagttgttct 26910328  T
Q  334 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  26910327 gtcatgtccttca-tttatatcaaatcaaacgca 26910295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 33 - 222
Target Start/End: Original strand, 47947636 - 47947826
Alignment:
Q  33 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggca 131  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47947636 ggtgtgtttgctctgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggca 47947735  T
Q  132 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgct 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  47947736 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgct 47947826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 32 - 285
Target Start/End: Original strand, 46408771 - 46409021
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||      |||||||||||    
T  46408771 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtattggatagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacatcacat------tttttatggca 46408864  T
Q  132 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||    
T  46408865 ttgagtaattttttattttatacgatttttgagagacaatatgctattttgatattttagacaacttgtatgtcggacaaaaagttgtgctgtggtttgg 46408964  T
Q  232 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcc----cttgcctccagtttgtcctgt 285  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    |||| ||||||||||||||||    
T  46408965 tgagggacaaaaatatgag-ttttgtcctgtccctttcttgtctccagtttgtcctgt 46409021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 34 - 351
Target Start/End: Original strand, 21133248 - 21133567
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 132  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||  ||| |||| || |||| |||||   ||||||||||| |||||| ||||  |||||||||| ||| |||    
T  21133248 gtgtgtttggttggcaaaatagtaagtactatacataacaatacaagaaagaacatcacaacacaaggcagaacaacacagtacaaattttttatgacat 21133347  T
Q  133 tgagtaatttt-ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 231  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||  |||||||||| ||||||||      
T  21133348 tgagtaatttttttgttttatacgatttttgggagacgaaatgctattttggtattttagacaatttgtatgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttat 21133447  T
Q  232 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 331  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||||||||    
T  21133448 tgagggaaaataatatcagtttttgtcttgtcccttgccttcagtttgtcctgtacttgaaacagttttacaaattaaacattaaataactagagttgtt 21133547  T
Q  332 ctgtcatgtccttcattttt 351  Q
    || |||| ||||||||||||    
T  21133548 ctatcatttccttcattttt 21133567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 40 - 255
Target Start/End: Original strand, 26652750 - 26652965
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    |||||||| ||||||  |||||| | ||| |||||||||||| | ||| | |||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||    
T  26652750 ttggtttgtaaaacatcaagtacagtacataacagtataagaaaaaacagcacaatacaagggagaacagcataggacaaatttttatgacattgaataa 26652849  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 239  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||     
T  26652850 ttttttgttttatacgatttttggcggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgctgagggac 26652949  T
Q  240 aaaaatatgagttttt 255  Q
    |||||||| |||||||    
T  26652950 aaaaatatcagttttt 26652965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 192 - 374
Target Start/End: Original strand, 16963174 - 16963356
Alignment:
Q  192 acaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga 291  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16963174 acaacttgtacgtgggacaaaaagttgtattgtggtttgataagggacaaaaatatgagtttttgtcctatcccttgcctctagtttgtcatgtacctga 16963273  T
Q  292 aacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16963274 aacagttttacaaatcaaacactggacaattagagttgttctgtcctgtccttcattttttaacaaatcaaacgcaccctaag 16963356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 115 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 46448780 - 46448528
Alignment:
Q  115 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 214  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||||   ||||||| || || ||| |||||  ||||    
T  46448780 gacaattttttattgcattgaataattttttgttttataagatttttaggggacgaaatgttattttggatttttagataatttatacatgggacaaaaa 46448681  T
Q  215 gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact 314  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46448680 gttgtgctgtggtttagtgacggacaaaaatatgagtttttatcatgtcccttgcatccagtttgtaccgtacctgaaacaattttacaaatcaaacact 46448581  T
Q  315 ggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
     |||||||  ||||||||| || |||| |  |||||||| |||||||||||||    
T  46448580 agacaactgaagttgttctatcttgtcttctattttttaacaaatcaaacgca 46448528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 103 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15035401 - 15035135
Alignment:
Q  103 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 202  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||     
T  15035401 agaacaacacatgacaaatttttatggtattgaataattttttgttttgtacgatttttggtgggcaaaatgttattttgatattttagacaatttgtat 15035302  T
Q  203 gtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacag--tttt 300  Q
    |||| |  |||||||||| |||||| |||||||| | || ||| | | |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||| | || | |||  ||||    
T  15035301 gtggtacaaaaagttgtgttgtggtctggtgaggaacaagaatttcaattttcgtcctgtcctttgcttccagtttgtcctgtccttggagcagtttttt 15035202  T
Q  301 acaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||| ||||| || | || |||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15035201 acaaattaaacattgtataattagagttgtcatgtcatgtatttcattttttagcaaatcaaacgca 15035135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 103 - 286
Target Start/End: Original strand, 34117399 - 34117581
Alignment:
Q  103 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 202  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  34117399 agaacaacacaagacaaatttttatggcattgaataatttttcgttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggcattttagacaacttgtac 34117498  T
Q  203 gtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgta 286  Q
     ||| |  |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  34117499 atggaacaaaaaattgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttatcatat-ccttgccttaagtttgtcctgta 34117581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 175 - 373
Target Start/End: Original strand, 34519527 - 34519725
Alignment:
Q  175 ctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcca 274  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||   |||||||||| |||||||||||||||    
T  34519527 ctatttttgtattttagacaacttgtacctgggacaaaaagttgtgttgtggtttggcgagggacaaaaattgcagtttttgtcctgtcccttgcctcca 34519626  T
Q  275 gtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 373  Q
    | ||||| ||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||    
T  34519627 gcttgtcatgtccctgaaactgttttacaattcgaacactggacaactgaagttgttctgtcctgtcctttattttttattaaatcaaacgcaccctaa 34519725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 32 - 154
Target Start/End: Original strand, 12982178 - 12982301
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgac-aaatttttatggc 130  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12982178 gggtgtgtttggtttgcaaaagagcaagtactggagagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaaatttttatggc 12982277  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatac 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12982278 attgagtaattttttgttttatac 12982301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 41665786 - 41665568
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||| |||| || ||||||| || | |||||| || | | || |||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  41665786 ttggtttacaaaacagtaagtacggaacataacaatacaagataggacagcacaacataacgcataatagcacaagacaaatttttatggtattgaataa 41665687  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 239  Q
    |||| |||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| ||||||     
T  41665686 ttttctgttttatataatttttgggtgacgaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttggcgagggac 41665587  T
Q  240 aaaaatatgagtttttgtc 258  Q
    ||||||   ||||||||||    
T  41665586 aaaaattgcagtttttgtc 41665568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 197
Target Start/End: Original strand, 16962986 - 16963149
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |   | | ||| | ||      ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16962986 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaacacaaggcagaacagcgcat-----aacagcacatgacaaattttttatgg 16963080  T
Q  130 cattgagtaatttt-ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaact 197  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16963081 cattgagtaatttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaact 16963149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 251 - 367
Target Start/End: Original strand, 26700572 - 26700688
Alignment:
Q  251 tttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatttt 350  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  26700572 tttttgtcctttctcttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttatacaaatcaaacactggacaactggaattgttatgtcatgtccttcatttt 26700671  T
Q  351 ttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||| |||||||||||||    
T  26700672 ttaccaaatcaaacgca 26700688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 271
Target Start/End: Original strand, 22631609 - 22631853
Alignment:
Q  33 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaa-----ggtagaacagcacatgacaaatttttat 127  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| | |||   |||||||||     || |||||| ||||||||||||| |||     
T  22631609 ggtgtgtttcgtttgcaaaacaataagtattggacagaacagtacaagacataacaacacaacacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattattag 22631708  T
Q  128 ggcattgagtaatttt-ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 226  Q
     ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||   |||||| |||||||||||||||||||||   |  ||||||| || |||||    
T  22631709 agcattaaataatttttttgttttatacgatttttgggggacgaaatatcattttggtattttagacaacttgtacgtataacaaaaagttatgttgtgg 22631808  T
Q  227 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcct 271  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||| |||||  |||||||||||    
T  22631809 tttggtgaaggacaaaaatatcagttattgtcgcgtcccttgcct 22631853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 121 - 245
Target Start/End: Original strand, 46627135 - 46627259
Alignment:
Q  121 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||| |||||||  ||||||||||||   ||||||| ||  |||| |||||    
T  46627135 tttttatggcattgaataattttttgttttatacaatttttgggagacgaaatactatttttgtattttagacaatccgtacgtgagacaaaaaattgtg 46627234  T
Q  221 ctgtggtttggtgagggataaaaat 245  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  46627235 ctgtggtttgatgagggataaaaat 46627259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 131 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 21408745 - 21408526
Alignment:
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||   |||| |||  |||||||  ||||||||| ||||||||| ||  || ||||||| || ||||||||     
T  21408745 attgaataattttttatcttatacgatttttagtggacgaaaa-ctatttttgtattttagataacttgtacatgaaataaaaagttatgttgtggttta 21408647  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
     ||||||| |||  | |  || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||| ||||||||||||| | || |||||||||| |||    
T  21408646 atgagggacaaatgtttt-gtctttgtcatgtcccttgcctccagtttgtgttgtcccaaaaacagctttacaaatcaaatattgtacaactagagatgt 21408548  T
Q  331 tctgtcatgtccttcatttttt 352  Q
      ||||||||||||||||||||    
T  21408547 catgtcatgtccttcatttttt 21408526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 258
Target Start/End: Original strand, 48699334 - 48699500
Alignment:
Q  92 caacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttag 191  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||  |||||||| ||||| | | |||| || || ||||||||||   ||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  48699334 caacataaggcagaacagcacaagacaagcttttatggtattgaatgacttttggtcttgtacgattttttgtggacataagtctattttggtattttag 48699433  T
Q  192 acaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtc 258  Q
    ||||||||||||||| |  || ||||||| |||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||    
T  48699434 acaacttgtacgtggaacaaatagttgtgttgtggtttagtgagggacaagaatttcagtttttgtc 48699500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 29456006 - 29455778
Alignment:
Q  91 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 190  Q
    |||||| |||| | |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| || ||||| |||||| | || |||||| ||||||||| |||||||    
T  29456006 acaacataaggcaaaacaacacatgacaaacttttatggtattgaataatatttggtcttatatgattttggtgg-acaaaacgctattttggtatttta 29455908  T
Q  191 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 290  Q
     |  ||| ||| ||||||  |||||||||| ||| |||  | || ||| || ||| | | ||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||  |||    
T  29455907 ta--actagtatgtgggacaaaaagttgtgttgttgttaagcgaaggacaagaatttcactttttgttatgtcccttgcctccaatttctactgtctctg 29455810  T
Q  291 aaacagttttacaaatcaaacactggacaact 322  Q
    ||| ||| |||||||||||||| || ||||||    
T  29455809 aaatagtgttacaaatcaaacattgcacaact 29455778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 29372915 - 29372764
Alignment:
Q  115 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 214  Q
    |||||| |||||||| ||| | |||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | || ||||| |||||||||||||||||| ||| |   |||    
T  29372915 gacaaacttttatggtattaaataatttttggtcttatatgatttttggtggataaaaggttaatttgaaattttagacaacttgtacatggaacagaaa 29372816  T
Q  215 gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccct 266  Q
    |||||| |||||||| |||| ||| |||||| | |||||||||| |||||||    
T  29372815 gttgtgttgtggtttagtgacggacaaaaattttagtttttgtcgtgtccct 29372764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 276 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 41665573 - 41665485
Alignment:
Q  276 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||    
T  41665573 tttgtcctgttcttgaaacagttttataattgaaacactggacaactggagttgttctgtcctatcctttattatttatcaaatcaaac 41665485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Original strand, 35645403 - 35645529
Alignment:
Q  112 catgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatg-ctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatg 210  Q
    ||||| ||| ||||||||  ||| || ||||||| | |||||||||||| || | | |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  |||     
T  35645403 catgataaacttttatggtgttgggtcattttttatcttatacgattttggatgaa-aaaatgactattttattattttagacaacttgtacgtacgata 35645501  T
Q  211 aaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 238  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  35645502 aaaagttgtgttgtggtttagtgaggga 35645529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 289 - 367
Target Start/End: Original strand, 41223320 - 41223398
Alignment:
Q  289 tgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||   || ||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41223320 tgaaacagttttacaaatcaaacacggaacaatcggaattgttttatcatatccttcattttttagcatatcaaacgca 41223398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 312
Target Start/End: Original strand, 2048887 - 2049107
Alignment:
Q  91 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 190  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||| |  ||||| |||   ||| |||| || |||||| |||||| | ||||||||  |||||||  ||||||     
T  2048887 acaacacaaggcagaacaacacatgataaactcgtatggtattacataagttttggtcttatacaattttttatggacaaaaa-ctatttttgtattttt 2048985  T
Q  191 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 290  Q
     | ||||| |||||||||  ||| ||| || |||||||| |||| ||| |||||| |   ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| || ||      
T  2048986 tataacttctacgtgggacaaaatgttttgttgtggtttagtgatggacaaaaatttatatttttgttatgttccttgcctctagtttgtcccgtcccaa 2049085  T
Q  291 aaacagttttacaaatcaaaca 312  Q
    ||||| |||| |||||||||||    
T  2049086 aaacaatttttcaaatcaaaca 2049107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 3359837 - 3359773
Alignment:
Q  251 tttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactg 315  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3359837 tttttgtcatgtcccttacctctagtttatcttgtgccagaaacagttttacaaatcaaagactg 3359773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 81
Target Start/End: Original strand, 34117349 - 34117397
Alignment:
Q  33 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataaga 81  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  34117349 ggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacagtacaaga 34117397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 159
Target Start/End: Original strand, 47442769 - 47442840
Alignment:
Q  89 gtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgattt 159  Q
    |||||||| |||| ||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47442769 gtacaacataaggcagaacactacaggacaaattttttatgacattgagtaattttttgttttatacaattt 47442840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 234
Target Start/End: Original strand, 42332059 - 42332137
Alignment:
Q  156 atttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtga 234  Q
    |||||||  ||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||||    
T  42332059 atttttggtggataaaatgttattttgatatttaagacaatttgtatgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttggtga 42332137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30260043 - 30259938
Alignment:
Q  115 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 214  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||  | |||||||| |||||| | | ||||   || ||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||    
T  30260043 gacaaatttttatgatattgaataatttttgatcttatacgagttttgatgaataaaaaattaatttgatattttagacaacttgtaagtaagataaaaa 30259944  T
Q  215 gttgtg 220  Q
    ||||||    
T  30259943 gttgtg 30259938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 260 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16027918 - 16027823
Alignment:
Q  260 tgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagc 355  Q
    ||||| ||| ||||| |||||| |||   ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |  |||||| |||||| || ||||||    
T  16027918 tgtccattgtctccaatttgtcttgtctttgaaacaattttacaaatcaaacactatacaactagagttatcttgtcatatccttcgttctttagc 16027823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 203
Target Start/End: Original strand, 8453285 - 8453322
Alignment:
Q  166 gacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacg 203  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  8453285 gacaaaatgttattttgatattttagacaatttgtacg 8453322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 68
Target Start/End: Original strand, 17237005 - 17237038
Alignment:
Q  35 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggaca 68  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17237005 tgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggaca 17237038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 29992813 - 29992741
Alignment:
Q  132 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtg 205  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||  ||||||||   ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  29992813 ttgaataatttttggtcttatacgatttttggtggacaaaaaattattttg-tattttagataacttgtacgtg 29992741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 174
Target Start/End: Original strand, 8453204 - 8453260
Alignment:
Q  118 aaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatg 174  Q
    |||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  8453204 aaatttttatggtattgaatatttgtttgtcttatacgatttttaagagacaaaatg 8453260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 41903667 - 41903603
Alignment:
Q  138 aattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 202  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||    
T  41903667 aattttttgttttatatgatgtttggtggacaaaagactattttagtattttagacaatttgtac 41903603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 75)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 51259994 - 51259657
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatgg 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  51259994 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggatagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaagacaaaatttttatgg 51259895  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  51259894 cattgagtaattttttgttttatatgatttttaagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgccgtggttt 51259795  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51259794 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 51259695  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51259694 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 51259657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Original strand, 28675661 - 28675998
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||    
T  28675661 agggtgtgtttggtttgcaaaacaataagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatgg 28675760  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  28675761 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 28675860  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28675861 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctatcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaattg 28675960  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  28675961 ttctgtcctgttcttcattttttaacaaatcaaacgca 28675998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 29 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1344923 - 1344587
Alignment:
Q  29 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-at 127  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||| ||    
T  1344923 taagggtgtgtttggtttgcaaaatagcaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacatcacatgacaatttttttat 1344824  T
Q  128 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  1344823 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggt 1344724  T
Q  228 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 327  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1344723 ttggtgagggacaaaaatatgagtttctgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaatagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 1344624  T
Q  328 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1344623 tgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 1344587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 40 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12349376 - 12349048
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagta 138  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12349376 ttggtttgcaaaagagcaagtattggacataacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagta 12349277  T
Q  139 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||    
T  12349276 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacataaagttgtgctgtggtttggtgagaga 12349177  T
Q  239 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 338  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  12349176 caaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttatgtcct 12349077  T
Q  339 gtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12349076 gtccttcattttttagcaaatcaaacgca 12349048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 34 - 367
Target Start/End: Original strand, 2134944 - 2135278
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 132  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  || |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  2134944 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactagacagaacgttacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaagacaaattttttatggcat 2135043  T
Q  133 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2135044 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaagtgctattttggtattttagataatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggt 2135143  T
Q  233 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 332  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2135144 gagggacaaaaatatgagtttttgttctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 2135243  T
Q  333 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2135244 tgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 2135278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 34 - 367
Target Start/End: Original strand, 29584749 - 29585083
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 132  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||  |||||||||| || ||||    
T  29584749 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggcagaacagtacagaacaaattttttattgcat 29584848  T
Q  133 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 232  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  29584849 tgagtaattttttattttatacgatttttgaaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 29584948  T
Q  233 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 332  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29584949 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcacttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 29585048  T
Q  333 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29585049 tgtcctgtcctttattttttagcaaatcaaacgca 29585083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 32 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 31883234 - 31882894
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 131  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||| | ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  31883234 gggtgtgtttggtttgcaaaatagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacaacacaggacaaatttttatgaca 31883135  T
Q  132 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  31883134 ttgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgc 31883035  T
Q  232 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 331  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31883034 tgaggcacaaaaatatcagtttttgtcgtgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgtt 31882935  T
Q  332 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31882934 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 31882894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 35 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 21221570 - 21221238
Alignment:
Q  35 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcatt 133  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21221570 tgtgtttggtttgcaatacagcaagtactagacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggcagaacagcacaagacaaattttttatggcatt 21221471  T
Q  134 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 233  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  21221470 gagtaattttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtg 21221371  T
Q  234 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21221370 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccag-ttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatattggacaactagagttgttct 21221272  T
Q  334 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21221271 gtcctgtcctttattttttagcaaatcaaacgca 21221238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 31 - 364
Target Start/End: Original strand, 24571153 - 24571486
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 129  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  24571153 agggtgtgtttggtttgtaaaacagtaagtactggacaga-cactataagatagaacaatacaacataaggcagaacagtacatgacaaattttttatgg 24571251  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  24571252 cattgagtaatttgttgttttattcgatttttgggggacaaaatcctatttttgtattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgctgtggttt 24571351  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24571352 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 24571451  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24571452 ttttgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 24571486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 31 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 53558009 - 53557676
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53558009 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacttgacagaacaatacaaggtataacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgg 53557910  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  53557909 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgcagtggttt 53557810  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  53557809 ggtgagggacaaaactatgagtttttgtcctgtccattgcctccagtttgtcctgtacctaaaacagttttacaaatcaaacattgaacaactagagttg 53557710  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 363  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  53557709 ctctgtcatatcctttattttttagcaaatcaaa 53557676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 34 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 47958643 - 47958309
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 132  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| |||||| ||||||||| |  |||||||||| ||| |||    
T  47958643 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacaatacaagatagaacactacaatacaaggcagaacagcatagaacaaattttttatgtcat 47958544  T
Q  133 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  47958543 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtagtttggt 47958444  T
Q  233 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 332  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47958443 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttttcctgtacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 47958344  T
Q  333 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    | |  ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  47958343 tatactgtccatcgttttttagcaaatcaaacgca 47958309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 26 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 39053058 - 39052715
Alignment:
Q  26 gtctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt 125  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  39053058 gtcttagggtgtgtttggtttgcaaaatagtaaatgctgaacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagatagaacaacacatgacaaattttt 39052959  T
Q  126 --atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctg 223  Q
      || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  39052958 ttatagcattgagtaatttgttgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttg 39052859  T
Q  224 tggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaacta 323  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39052858 tggtttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcctgtccattgcctccagtttgtcctgtgcctgaaacagttttacaaatcaaacactagacaacta 39052759  T
Q  324 gagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39052758 gagttgttttgtcttgtctttcattttttagcaaatcaaacgca 39052715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 68 - 367
Target Start/End: Original strand, 40094411 - 40094711
Alignment:
Q  68 agaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggg 166  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40094411 agaacagtacaagatagaacaatacaacacaaggcagaacaacacatgacaaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatgcgatttttgaggg 40094510  T
Q  167 acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccct 266  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  40094511 acaaaatgctattttggtattttagacaatttgtacgtgaaacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccct 40094610  T
Q  267 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgc 366  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40094611 tgcctccagtttgttctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgc 40094710  T
Q  367 a 367  Q
    |    
T  40094711 a 40094711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 34 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 25860632 - 25860312
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 132  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| | |||| |||| ||||||||||| ||||||     
T  25860632 gtgtgtttggtttgcaaaacggtaagcactggacagaacagtacaagatagaacagcacaacaaaaggcataacaacacaggacaaattttttatggcaa 25860533  T
Q  133 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||    
T  25860532 tgagtaattttttgttttatacgatttttggagaacaaaatgctatttcggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttggt 25860433  T
Q  233 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 332  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25860432 gagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 25860333  T
Q  333 tgtcatgtccttcatttttta 353  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  25860332 tgtcaagtccttcatttttta 25860312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 80 - 367
Target Start/End: Original strand, 44116859 - 44117147
Alignment:
Q  80 gatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctat 178  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116859 gatagaacagtacaacacaagtcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctat 44116958  T
Q  179 tttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagttt 278  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44116959 ttttgtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgcagtggtttgatgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagttt 44117058  T
Q  279 gtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44117059 gtcctgtacctgaaacggttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtccagtccttcattttttagcaaatcaaacgca 44117147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 40 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 25927533 - 25927204
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaa-cagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagt 137  Q
    ||||||||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25927533 ttggtttgcaaaaacaacaagtaccggacaaaacagtataagatagaacagtacaatacaaggtagaacagcacaagacaaattttttatggcattgagt 25927434  T
Q  138 aattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggg 237  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||| ||||    
T  25927433 gattttttgttttatacgatttttgaggaacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtgttttggtaaggg 25927334  T
Q  238 ataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtca 337  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  25927333 acaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtatttgaaacagttttacaaatcaaacattagacaactagagttgttctgtcc 25927234  T
Q  338 tgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25927233 tgtccatcattttttagcaaatcaaacgca 25927204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 27 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4851674 - 4851340
Alignment:
Q  27 tctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt- 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||     
T  4851674 tctaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtaccggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaagacaggacaaatttttt 4851575  T
Q  126 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  4851574 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtg 4851475  T
Q  226 gtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 325  Q
    | ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4851474 ggttggtgagggacaaaa--atgagtttttgtcctgtcccttgcctccaaattgtcttgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 4851377  T
Q  326 gttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||     |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4851376 gttgttc-----tgtccttcattttttaacaaatcaaacgca 4851340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 32 - 359
Target Start/End: Original strand, 34026554 - 34026867
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  34026554 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta---------------caacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggt 34026638  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||    
T  34026639 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaattgtgttgtggtttg 34026738  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  34026739 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctatacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaaatagagttgt 34026838  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaat 359  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34026839 tctgtcctgtccttcattttttagcaaat 34026867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 40 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 3864879 - 3864548
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagta 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||| || | | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  3864879 ttggtttgcaaaacagtaagtactgcacagaacagtacaagatagaacattacaacataacgcataacagcacaggacaaattttttatggcattgagta 3864780  T
Q  139 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3864779 attttttgttttatatgatttttg-gggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggcgaggga 3864681  T
Q  239 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 338  Q
     ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  3864680 caaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacaccggacaactaaagttgttctgtcct 3864581  T
Q  339 gtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 373  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  3864580 gtc--tcattttttagcaaatgaaacgcaccctaa 3864548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 40 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 50386660 - 50386333
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || | ||||| | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||    
T  50386660 ttggtttgcaaaacagcaagtacagtacagaacagtacaaaaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatcacattgaataa 50386561  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 239  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| |     
T  50386560 ttttttgttttatacaatttttggggaacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgctgtggtttgttgaggcac 50386461  T
Q  240 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 339  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  50386460 aaaaatatcaatttttgtcatgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactagacaactggagttgttctgtcctg 50386361  T
Q  340 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50386360 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 50386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 89 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 42636559 - 42636273
Alignment:
Q  89 gtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatt 187  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  42636559 gtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattaagtaattttttgttttaaacgatttttgagggacaaaatgttattttggtatt 42636460  T
Q  188 ttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtac 287  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  42636459 ttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgttctgtcccttgcctccagtttgtcctatac 42636360  T
Q  288 ctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 374  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  42636359 ctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaattgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaatgcaccctaag 42636273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 30 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 51925422 - 51925085
Alignment:
Q  30 aagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatgg 129  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51925422 aagggtgcgtttggtttgcaaaacggtaagtactggatataacagtacaagacataacagcacaacacaaggcagaacagcacatgacaaatttttatgg 51925323  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||  | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  51925322 cattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgttattttggtattaaaaacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 51925223  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  51925222 ggtgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaactggagttg 51925123  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51925122 ttctgtcctatccttcattttctagcaaatcaaacgca 51925085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 29 - 374
Target Start/End: Original strand, 5442160 - 5442494
Alignment:
Q  29 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tat 127  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  5442160 taagggtgtgtttggtttgcaaaatagcaagtactggacagaacagtacaatttagaacagtacaatacaaggtataacaacacatgacaaattttttat 5442259  T
Q  128 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 227  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  5442260 ggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggataaaatgctattttgatattttagacagcttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgat 5442359  T
Q  228 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 327  Q
    ||||||||||| |||||            || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5442360 ttggtgagggacaaaaa-----------ctc-tgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagctttacaaatcaaacactggacaactagagt 5442447  T
Q  328 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5442448 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaag 5442494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 32 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 20609846 - 20609544
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  20609846 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta---------------caacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgac 20609762  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20609761 attgagtaattttttgttatatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 20609662  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20609661 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccaccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaactagagttgt 20609562  T
Q  331 tctgtcatgtccttcatt 348  Q
    |||||| |||||||||||    
T  20609561 tctgtcctgtccttcatt 20609544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 121 - 367
Target Start/End: Original strand, 20255007 - 20255252
Alignment:
Q  121 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||    
T  20255007 tttttatggcattgagtaattttttgttttataagatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgta-gtgggacaagaagttgtg 20255105  T
Q  221 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 320  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20255106 ctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgttccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 20255205  T
Q  321 ctagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20255206 ctagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 20255252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 29 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33364993 - 33364655
Alignment:
Q  29 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 128  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||| |||| ||||  | |||| |||||  |||||| | || ||||||||||||||    
T  33364993 taagggtgcgtttggtttgcaaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaatagcacaatacaagagagaacaacccaggacaaatttttatg 33364894  T
Q  129 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 228  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  33364893 acattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgatgtggtt 33364794  T
Q  229 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 328  Q
    || ||||||  |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  33364793 tgctgaggggcaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaataaaacactggacaactgaagtt 33364694  T
Q  329 gttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33364693 gttctgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 33364655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Original strand, 38213227 - 38213562
Alignment:
Q  33 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggca 131  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| | |||   | ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38213227 ggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtattgtacagaacagtacaagacaaaacaacataacattaggcagaacagcacatgacaaattttttatggca 38213326  T
Q  132 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |    
T  38213327 atgagtaattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatggtattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttcg 38213426  T
Q  232 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 331  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38213427 tgagtgacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagattgtcctatacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 38213526  T
Q  332 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    || || |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  38213527 ctatcctgtctttcattttttagcaaataaaacgca 38213562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 33 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 22484954 - 22484614
Alignment:
Q  33 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcat 132  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  22484954 ggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacagtataagataggacaacacaacataaggtagaacagcacaagacaaatttttatggtat 22484855  T
Q  133 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 232  Q
    ||| ||||||| ||| |||||  ||||||| | ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||| ||||||     
T  22484854 tgaataattttctgtattatataatttttgggtgacgaaatgctatttttgtattttagacaacttatacgtgggacaaaaagttgtgttgtagtttggc 22484755  T
Q  233 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 332  Q
     ||| | ||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  22484754 aaggaacaaaaattgtagcttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcatgtccctgaaactgttttacaaatcaatcactggacaattggagttgttc 22484655  T
Q  333 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 373  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  22484654 tgtcctgtccttcattttttatcaaatcaaacgcaccctaa 22484614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 40 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3867848 - 3867526
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||   |||||||     ||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  3867848 ttggtttgcaaaacagtaagtactgaacataacagtacaatgcagaacgg-----cacaaggcataacaacacatgacaagtttttatggtattgaataa 3867754  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 239  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  3867753 tttcttgttttatatgatttttgggggacaaaatgctattttggtgttttagaaaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggac 3867654  T
Q  240 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 339  Q
    |||||| | || |||||||||||| |||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  3867653 aaaaatttcaggttttgtcatgtctcttgtctccagtatgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacaccggacaactggagttgttctgtcttg 3867554  T
Q  340 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  3867553 tccttcattttttaacaaatcaaacgca 3867526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 364
Target Start/End: Original strand, 21373812 - 21374135
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||| | ||||||||||         |||| |||||||||||||||||    
T  21373812 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtattggacagaacaatacaagacagaacagcacaacacaaga--------cacaggacaaatttttatggca 21373903  T
Q  132 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 231  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||   ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  21373904 ttgaataattttta-ttttatacgatttttggccgaagaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 21374002  T
Q  232 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 331  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  21374003 tgagggacaaaaatatgagattttgtcctgtcccttgcctcaagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactagacaactgaagttgtt 21374102  T
Q  332 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
     |||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  21374103 atgtcattttcttcattttttagcaaaccaaac 21374135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 33 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26282599 - 26282315
Alignment:
Q  33 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 131  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26282599 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggatagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacagcacatgacaaattttttatggca 26282500  T
Q  132 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  26282499 ttgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttatacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttga 26282400  T
Q  232 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga---aacagttttacaaatcaaacac 313  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||||||| ||||||| |   || |||||||||||||||||||    
T  26282399 tgagagacaaaaatataagtttttgtcccgtctcttacctccagtttgtcttgtaccttaaataatagttttacaaatcaaacac 26282315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 40 - 363
Target Start/End: Original strand, 29645946 - 29646270
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    ||||||||||||| |  ||||| ||||||||||| || |||| | |||   |||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  29645946 ttggtttgcaaaataacaagtattggacagaacaatacaagacaaaacaacacaacataaggtataacatcacaagacaaatttttatggcattaaataa 29646045  T
Q  140 tttt-ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 238  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  29646046 tttttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttggtattttaaacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgaggga 29646145  T
Q  239 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 338  Q
     ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||| |    
T  29646146 caaaaatatatgtttttgtcctatcccttgcctccagtttatcgtgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactggaattgttttgtctt 29646245  T
Q  339 gtccttcattttttagcaaatcaaa 363  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  29646246 gtccttcattttttagaaaatcaaa 29646270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 115 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 54622925 - 54622678
Alignment:
Q  115 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 214  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54622925 gacaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaa 54622826  T
Q  215 gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact 314  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  54622825 gttgtgttgtggtttcgtgagcgacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatttagtttgt-cagtacctgaaacagttttacaaatcaaatacc 54622727  T
Q  315 ggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 363  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54622726 ggacaactgaagttgttttgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 54622678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 44 - 368
Target Start/End: Original strand, 3964173 - 3964497
Alignment:
Q  44 tttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattt 142  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| | |||| |  ||   |||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||    
T  3964173 tttgcaaaacagtaagtacttgatagaacagcacaagacaacacaacacaatacaaggcagaacagcacaagacaaattttgtatgatattgaataattt 3964272  T
Q  143 tttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaa 242  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3964273 tatgttttatatgatttttg-gggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaa 3964371  T
Q  243 aatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtcc 342  Q
    ||| | ||||||||||  || ||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||    
T  3964372 aatttcagtttttgtccagttccttgcctccaatttgtcatgtccatgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcctatcc 3964471  T
Q  343 ttcattttttagcaaatcaaacgcaa 368  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3964472 ttcattttttatcaaatcaaacgcaa 3964497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 130 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 49749025 - 49748788
Alignment:
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  49749025 cattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgttattttggtatttaaaacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 49748926  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  49748925 ggtgagggacaaaaatatcagtttttgtcatgtcctttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactaaacaacttgagttg 49748826  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49748825 ttctatcctatccttcattttctagcaaatcaaacgca 49748788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 122 - 367
Target Start/End: Original strand, 51296544 - 51296787
Alignment:
Q  122 ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgc 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||  |||| |||||     
T  51296544 ttttatggtattgagtaattttttgttttatacgattttttggggacaaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacttaggacaaaaaattgtgt 51296643  T
Q  222 tgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaac 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  51296644 tgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaat 51296743  T
Q  322 tagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||||  |||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  51296744 tagagttgttctgttctgtcttt--atttttagcaaatcaaacgca 51296787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 32 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 45691112 - 45690778
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 131  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||   |||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  45691112 gggtgtgtttgatttacaaaacactaagtactggatagaacagtacaagacagaacaacacaatataagatagaataacacatgacaaatttttatagca 45691013  T
Q  132 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 231  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||        
T  45691012 ttgaataattttt-gttttatacgatttttggaggacgaaatgcgattttggtattttagacaacttatgcgtgagacaaaaagttgtgctgtggt---- 45690918  T
Q  232 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 331  Q
     |||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  45690917 -gagggagaaaaatatcagtttttgtcctgtcctttgcctccaatttatcctgtacctgaaacagttttgcaaatcaaacactggacaactgaagttgtt 45690819  T
Q  332 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 372  Q
    || || ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  45690818 ctatcctgtccttcactttatagcaaatcaaacgcacccta 45690778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 367
Target Start/End: Original strand, 50678677 - 50679006
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    ||||||| | |||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||  | |||||| |||||| || | | || |||||||||||||   ||||| | |    
T  50678677 ttggtttacgaaaccgtaagtactagacataacaatataagatagaatagcacaacataaggtataatatcgcaagacaaatttttatattattgaatta 50678776  T
Q  140 --ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggg 237  Q
      |||||||||||||| ||||| || || |  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| |    
T  50678777 ttttttttgttttataggatttatgtggaatgaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagag 50678876  T
Q  238 ataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtca 337  Q
    | |||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||     
T  50678877 acaaaaatatcagtttttgtcctgttctttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttttcaaatcaaacactggacaacttgaattgttatgtct 50678976  T
Q  338 tgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50678977 tgtacttcattttttagcaaatcaaacgca 50679006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 83 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3695449 - 3695184
Alignment:
Q  83 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttg 182  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  3695449 agaacagtacaacacaaggcagaacaggaca----aattttttatggcattgagtaatttgttgttttatacaatttttgggggataaaatactattttg 3695354  T
Q  183 atattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcc 282  Q
     |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||               |||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  3695353 gtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaggttgtgatgtggtttggtgag---------------tttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtca 3695269  T
Q  283 tgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3695268 tgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttttgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 3695184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 10747088 - 10747406
Alignment:
Q  30 aagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatgg 129  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||| | | | ||||||| |||| |||||   |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  10747088 aagggtgcgtttggtttgcaaaacagcaagtacagtataaaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacagcacaagacaaatttttatga 10747187  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgattttt-gagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  |||||||    
T  10747188 cattgaataattttttgttttatacgatttttggggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacg------------------tgtggtt 10747269  T
Q  229 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 328  Q
    || ||| | | |||||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  10747270 tgctgacgaacaaaaatatcagtttttgtcctatctcttgtctccagtttgtcctgtacctaaaatagttttacaaatcaaacactgaacaactgaaatt 10747369  T
Q  329 gttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 365  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10747370 gttttgtcctgtccttcattttttaacaaatcaaacg 10747406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 164 - 368
Target Start/End: Original strand, 19906767 - 19906971
Alignment:
Q  164 gggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtc 263  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||    
T  19906767 gggacgaaatgctattttggtgttttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcctgtc 19906866  T
Q  264 ccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 363  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||     
T  19906867 ccttgcctccagtttgttctgtccctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttttatcctgtccttcattttttaacaaatcaat 19906966  T
Q  364 cgcaa 368  Q
    |||||    
T  19906967 cgcaa 19906971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 138 - 367
Target Start/End: Original strand, 24721463 - 24721693
Alignment:
Q  138 aattttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagg 236  Q
    ||||| |||||||||| | |||||| ||| |  ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  24721463 aatttcttgttttatatgctttttggggggatgaaatgctattttggtgttttagacaacttgtatgtgggataaaaagttgtgttgtggtttgttgagg 24721562  T
Q  237 gataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtc 336  Q
     |  ||||| | |||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24721563 taccaaaattttagtttttgtcctgtcctttacctccagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctgtc 24721662  T
Q  337 atgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  24721663 atgtccttcattttttaacaaattaaacgca 24721693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 222 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 41683075 - 41682930
Alignment:
Q  222 tgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaac 321  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41683075 tgtggtttgctgagggacaaaagtatcagtttttgtcttgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaac 41682976  T
Q  322 tagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41682975 tgaagttgttttgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 41682930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 40 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 53046846 - 53046667
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagta 138  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  53046846 ttggtttgcaaaacaacaagtactgaacagaacaatacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacagaacaaattttttatggcattgagta 53046747  T
Q  139 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     ||||||||||  |||||||||||||    
T  53046746 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagac-----gtacgtgggacaaaaagttgtgctg 53046667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 175
Target Start/End: Original strand, 43175436 - 43175585
Alignment:
Q  27 tctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-ttttt 125  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| || |||||  ||||||||||| || ||| |||||    
T  43175436 tctatgggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtataatacaagacagaacagcacacgataaatttttt 43175535  T
Q  126 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgc 175  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43175536 atggtattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgc 43175585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 103 - 372
Target Start/End: Original strand, 6179376 - 6179639
Alignment:
Q  103 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 202  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||| |||||||  | ||| ||||| ||||||  |||||||||||       |    
T  6179376 agaacaacacaagacgaatttttatggtattgaataattttctttattatatgattttttggtgacgaaatgttatttttgtattttagaca-------c 6179468  T
Q  203 gtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggg-ataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttta 301  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  ||||||| ||||||    
T  6179469 gtgtgacaaaaagttgtgctgtggtttggcgaggggacaaaaattacagtttttgtcctgtcccttacctccagtttgacctgtttctgaaactgtttta 6179568  T
Q  302 caaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 372  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  6179569 caaatcaaacactggacaactggagttgttttatcctgtccttcattttttataaaatcaaacgcacccta 6179639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 115 - 361
Target Start/End: Original strand, 44000217 - 44000462
Alignment:
Q  115 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 214  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||||||||  |||||||  ||||| ||| |||||||||||||||  ||||    
T  44000217 gacaaacttttatggtattgaataatttttggtcttatacgatttttggtggacaaaaaactatttttgtatttcagataacttgtacgtgggacaaaaa 44000316  T
Q  215 gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact 314  Q
     ||||| |||||||| |||||||| |||||  |  ||||||||||||||| ||||||  ||||| || | | ||  |||||||||||||||| ||||||     
T  44000317 attgtgatgtggtttagtgagggaaaaaaaattctgtttttgtcatgtcctttgccttgagtttatcatttcccaaaaacagttttacaaatgaaacacg 44000416  T
Q  315 ggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatca 361  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  44000417 gtacaactagagttgtcatgtcatgtcattca-tttttagcaaatca 44000462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 108 - 364
Target Start/End: Original strand, 44267691 - 44267941
Alignment:
Q  108 agcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtggg 207  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||    
T  44267691 agcacaagacaaatttttatcgtattcaataattttttgttttatatgatttttggatgacgaaatgctatttttgtattttagacaatttgtatgtggg 44267790  T
Q  208 atgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatc 307  Q
    || ||||||| || |||||||||| |||||| |     || | ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | ||| |||| ||||||||||||    
T  44267791 ataaaaagttatgttgtggtttggcgagggaca-----attattttttgtcatgtcccttacctacagtttgtcatat-cctaaaactgttttacaaatc 44267884  T
Q  308 aaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    |||||  | ||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  44267885 aaacatcgaacaactgaagttgttcgatcatgtccttcattttttatcaaataaaac 44267941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 273 - 372
Target Start/End: Original strand, 43175589 - 43175688
Alignment:
Q  273 cagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 372  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43175589 cagtttgtcctatacctgaaatagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgttctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 43175688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 161 - 353
Target Start/End: Original strand, 52300439 - 52300633
Alignment:
Q  161 tgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcat 260  Q
    |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||| |    
T  52300439 tgagggacgaaatgatattttggtgttttagacaacttgtac-tgggacaaaaaattgcgttgtggtttggtgatggacaaaaatttcagtttttgtcct 52300537  T
Q  261 gtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag---agttgttctgtcatgtccttcatttttta 353  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52300538 gtcccttacctgcagtttgtcccgtctctgaaacagttttatgaatcaaacattggacaacaaccgaagttgttctgtcatgtccttcatttttta 52300633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 34351514 - 34351303
Alignment:
Q  98 aaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaact 197  Q
    |||| |||||| || ||||| ||||||||| | ||||| |||||| | || || ||||||||||   ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34351514 aaggcagaacaacatatgacgaatttttatagtattgaataatttatggtcttgtacgattttttgtggataaaatgttattttgatattttagacaact 34351415  T
Q  198 tgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagt 297  Q
    |||| ||| ||  |||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| |  ||||||||| ||||  || |||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  34351414 tgtatgtgcgacaaaaagttgtgttgtggtttgatgagggacaataatttttgtttttgtcgtgtctatttcctctagtttgtcatgtccctgaaacagt 34351315  T
Q  298 tttacaaatcaa 309  Q
    ||||||||||||    
T  34351314 tttacaaatcaa 34351303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 103 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 41695042 - 41694925
Alignment:
Q  103 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 202  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||     
T  41695042 agaacagcacagaacaaatttttatgacattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctatttcagtattttagacaacttgtat 41694943  T
Q  203 gtgggatgaaaagttgtg 220  Q
    ||||||  ||||||||||    
T  41694942 gtgggacaaaaagttgtg 41694925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 166 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 39215547 - 39215404
Alignment:
Q  166 gacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccc 265  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| || || | ||||| ||| |||| ||||||| | |||||||||| ||||||    
T  39215547 gacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaattatgatttggttcggtaaggggtaaaaatttcagtttttgtcttgtccc 39215448  T
Q  266 ttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaa 309  Q
    || ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  39215447 ttacctccggtttgtcctgttcttgaaacagttttacaaatcaa 39215404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 263
Target Start/End: Original strand, 25954407 - 25954554
Alignment:
Q  115 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 214  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| ||  ||||||| ||||||| || ||| ||  ||||    
T  25954407 gacaaatttttatgatattgaataattttttattttatacgctttttg-gggacgaaatgttatattagtattttaaacaacttatatgtgagacaaaaa 25954505  T
Q  215 gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtc 263  Q
    ||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  25954506 gttgtgctgtaatttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcgtgtc 25954554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 125 - 367
Target Start/End: Original strand, 8253640 - 8253881
Alignment:
Q  125 tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgt 224  Q
    ||||| ||||| ||||||||  | |||||| |||||||| | | |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||  ||||   || |||||||  ||    
T  8253640 tatggtattgattaatttttaatcttatacaatttttgatgaataaaatgttattttggtattttagacaacttttaattggggcaaagagttgtgtcgt 8253739  T
Q  225 ggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 324  Q
    ||||| || || || || ||  | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||| | |||||||  |||||||||| |||| |  ||||||||    
T  8253740 ggtttagt-agagacaagaacttcagtttttatcatgttccttgactccagtttgtcttgtccttgaaacaactttacaaatcgaacattatacaactag 8253838  T
Q  325 agttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||  |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  8253839 agttgtcttgtcttatccttcattttttagtagatcaaacgca 8253881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 247 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 53046668 - 53046605
Alignment:
Q  247 tgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaa 310  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53046668 tgagtttttgtcctgtcccttacctccagtttgtcctatacctgaaacagttttacaaatcaaa 53046605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 8067210 - 8066939
Alignment:
Q  91 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 190  Q
    ||||||||||  ||| || ||||||||| | |||||||| ||||| | ||||||  | ||||| ||||| |   |||||||| |||||||||||||||||    
T  8067210 acaacacaagacagaccaacacatgacatacttttatggtattgaatgatttttgatcttatatgatttctagtggacaaaaagctattttgatatttta 8067111  T
Q  191 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 290  Q
     | |||||||||||| ||  ||||||||| || || ||| |||| ||| | |||| | |  ||||||| |||| | |||||| |  ||||  ||| ||||    
T  8067110 tataacttgtacgtgtgacaaaaagttgtactatgattttgtgaaggacacaaatttta-attttgtcttgtcacctgcctcaatcttgttttgtccctg 8067012  T
Q  291 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 363  Q
    ||||| ||||||||||||||  | | | |||||| |||||| |||| ||||| |||||||||| || ||||||    
T  8067011 aaacaattttacaaatcaaatgcggtataactagtgttgttatgtcttgtccctcattttttaacagatcaaa 8066939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 363
Target Start/End: Original strand, 25395570 - 25395818
Alignment:
Q  115 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 214  Q
    |||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||| ||||    
T  25395570 gacaaacttttatgacattgcattattttttgttttatacgatttttagtgaacaaaatgttattttggtattttagacaacttatatttaggataaaaa 25395669  T
Q  215 gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttg-cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacac 313  Q
    ||||   | ||||||  ||||||| || ||| | |||||||||| | |  |||| || |||  ||||| ||| ||| |||||||||||| ||| ||||      
T  25395670 gttgcattttggtttaatgagggacaagaatttcagtttttgtcttatgtcttgccccccaacttgtcatgtccctaaaacagttttac-aataaaacga 25395768  T
Q  314 tggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 363  Q
    || |||||| |||||||| | ||||||  || |||| |||||||||||||    
T  25395769 tgtacaactggagttgttatatcatgtgatttatttcttagcaaatcaaa 25395818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 364
Target Start/End: Original strand, 26847351 - 26847532
Alignment:
Q  184 tattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa-gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcc 282  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| || |||| |||  | ||||| |  ||| | |||||||||| |||| |||||||||| |||||      
T  26847351 tattttagacaacttgtatgtgggacaaaaaagttttgttgtgattttataagggacatgaatttcagtttttgtcctgtctcttgcctccaatttgtta 26847450  T
Q  283 tgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    | |  || |||||||||||||||| |||||||  |||| | |||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  26847451 tatcacttaaacagttttacaaattaaacactatacaagtggagttgtcatgtcatatgcttcattttttagcaaatcaaac 26847532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 42035824 - 42035652
Alignment:
Q  98 aaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaact 197  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||  |||||||| | |||||| || |||   |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  42035824 aaggtagaacaacacttgacaaacttttatggtattgaacaattttttctcttatactatgttttgtggacaaaatgctgttttgctattttacacaact 42035725  T
Q  198 tgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcc 270  Q
    ||||| |||| ||  ||||||   |||||||| ||||  || || ||| | |||||||||  |||||||||||    
T  42035724 tgtacttgggttgccaagttgcattgtggtttagtgaaagacaagaatttcagtttttgttgtgtcccttgcc 42035652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 176 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14155528 - 14155438
Alignment:
Q  176 tattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccctt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| | || ||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  14155528 tattttgatattttagacaacttgtacttgagacaaaaagttgtgttatgatttagtgagggat-aaaatttcagtttttgtcatgtccctt 14155438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 208
Target Start/End: Original strand, 32621828 - 32621918
Alignment:
Q  118 aaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtggga 208  Q
    ||||| |||||  ||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  32621828 aaattgttatgctattgaataattttttgttgtatacaatttttgatggacaacatattattttggtattttagacaacttgtacatggga 32621918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 320
Target Start/End: Original strand, 32768588 - 32768755
Alignment:
Q  155 gatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttt 254  Q
    |||||||| | ||||||| | ||||||  |||||||||||| | |||  ||| | | ||||||||| |||||||| |||||||| || ||| | | ||||    
T  32768588 gatttttgggtgacaaaaggttattttagtattttagacaaatagtaattggaacggaaagttgtgatgtggtttagtgagggacaataatttcaatttt 32768687  T
Q  255 tgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctg--tacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 320  Q
    ||||||||| ||||| |   ||||||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  32768688 tgtcatgtctcttgctttttgtttgtcatgtctccctgaaacaattttacaaatcaaacactgtacaa 32768755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17264822 - 17264606
Alignment:
Q  93 aacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagg--gacaaaatgctattttgatatttta 190  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||| | ||| |||| ||  || |||||| ||||||| ||  |||||||  |||||||  |||||||    
T  17264822 aacataaggtagatcagcacaagacaaaattttatggtactgaataatgtt--gtcttatacaatttttgtggtcgacaaaaa-ctatttttgtatttta 17264726  T
Q  191 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 290  Q
     |||||||||||||||||  |||  || |  |||||||| |||| |||||| ||| | || |||||||||||  ||||| ||| ||||||  |||   ||    
T  17264725 cacaacttgtacgtgggacaaaatttttttatgtggtttagtgaaggataataatttcagcttttgtcatgtatcttgcttcctgtttgttatgtttttg 17264626  T
Q  291 aaacagttttacaaatcaaa 310  Q
     |||||||||||||||||||    
T  17264625 taacagttttacaaatcaaa 17264606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 249 - 352
Target Start/End: Original strand, 30258962 - 30259065
Alignment:
Q  249 agtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatt 348  Q
    |||||||||| || || ||||||| ||||| ||||||   ||||||| |||||||||||||||| || | |||||| |||||   ||| |||||||||||    
T  30258962 agtttttgtcttgcccattgcctcgagtttatcctgtctttgaaacaattttacaaatcaaacattgtataactagggttgtcgcgtcttgtccttcatt 30259061  T
Q  349 tttt 352  Q
    ||||    
T  30259062 tttt 30259065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 76
Target Start/End: Original strand, 20254945 - 20254991
Alignment:
Q  30 aagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 76  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20254945 aagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacataacagta 20254991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 234
Target Start/End: Original strand, 23322158 - 23322216
Alignment:
Q  176 tattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtga 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  23322158 tattttgatatattagacaacttgtacgagagataaaaagttgtgttgtggtttagtga 23322216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 41538225 - 41538131
Alignment:
Q  108 agcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgcta-ttttgatattttagacaacttgta 201  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||||| | ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  41538225 agcacatgataaacttttatgatattgaatgatttttgattttatacgattttttatggacaaaatactatttttgacattttaaacaacttgta 41538131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 54964095 - 54963985
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 130  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||   | |||| || | ||| || ||||  ||||||||||||||     
T  54964095 agggtatgtttggtttgcaaaatagtacgtactggacataacagtataagataggacaccataacataaagcagagcaacacaaaacaaatttttatggt 54963996  T
Q  131 attgagtaatt 141  Q
    ||||| |||||    
T  54963995 attgaataatt 54963985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 3695485 - 3695441
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 76  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3695485 gggtgtgtttggtttgcaaaaatgtaagtactggacagaacagta 3695441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 28625060 - 28625001
Alignment:
Q  103 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttg 162  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28625060 agaacaacacaagacaaacttttatggtattgaataattttttgtcttataagatttttg 28625001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 247 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 53046560 - 53046517
Alignment:
Q  247 tgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 290  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  53046560 tgagtttttgtcctgtcccttacctccagtttgtcctatacctg 53046517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 8165883 - 8165833
Alignment:
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 190  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  8165883 ttttttgttttatactatgtttgatggacaaaatgttagtttgatatttta 8165833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 291 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 8025967 - 8025895
Alignment:
Q  291 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 363  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||| |||||| || ||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  8025967 aaacagttttacatatcaaccgctgtacaacttgaattgttcgatcatatcctttattttttagcagatcaaa 8025895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 42547511 - 42547463
Alignment:
Q  96 acaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttt 144  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  42547511 acaaggtagaacaacacatgacaaacttttatgatattgaataattttt 42547463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 71)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 32 - 372
Target Start/End: Original strand, 34338681 - 34339022
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatggc 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  34338681 gggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaaatttttatggc 34338780  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34338781 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtgcgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 34338880  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34338881 gtgagggtcaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 34338980  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 372  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34338981 tctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 34339022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 43 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9733138 - 9732813
Alignment:
Q  43 gtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaatt 141  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  9733138 gtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacggcacaggacaaattttttatggcattgaataatt 9733039  T
Q  142 ttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  9733038 ttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaa 9732939  T
Q  242 aaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtc 341  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9732938 aaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtc 9732839  T
Q  342 cttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  9732838 cttcattttttaacaaatcaaacgca 9732813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 30 - 367
Target Start/End: Original strand, 18685705 - 18686043
Alignment:
Q  30 aagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatg 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  18685705 aagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacagcacaggacaaattttttatg 18685804  T
Q  129 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18685805 gcattgagtaattttttgttttataggatttttgagggacaaaatgttattttaatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtt 18685904  T
Q  229 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 328  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18685905 tggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcttgtcctttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 18686004  T
Q  329 gttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18686005 attctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 18686043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Original strand, 32497785 - 32498122
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  32497785 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacaatacaagatagaacagtacaacaaaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgg 32497884  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  32497885 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggttt 32497984  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32497985 ggtgaggtacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccttcagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 32498084  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32498085 ttctgccatgcccttcattttttagcaaatcaaacgca 32498122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 32 - 363
Target Start/End: Original strand, 35114656 - 35114988
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  35114656 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacggcacaggacaaattttttatggc 35114755  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||    
T  35114756 aatgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaattgtgttgtggtttg 35114855  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35114856 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactagacaactagagttgt 35114955  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 363  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35114956 cctgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaa 35114988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 35 - 367
Target Start/End: Original strand, 17540588 - 17540922
Alignment:
Q  35 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcatt 133  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  17540588 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggatagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacatattttttatggcatt 17540687  T
Q  134 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt-gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17540688 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatactatttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggt 17540787  T
Q  233 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 332  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17540788 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaaattgttc 17540887  T
Q  333 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  17540888 tgtcatatctttcattttttaacaaatcaaacgca 17540922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 29 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 2645308 - 2644970
Alignment:
Q  29 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-at 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| ||    
T  2645308 taagggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtacttgatagaacagtataagatagaacagtacaacataaggcagaacagcactggacaaattttttat 2645209  T
Q  128 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  2645208 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggaacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgctgtggt 2645109  T
Q  228 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 327  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2645108 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctct-ccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 2645010  T
Q  328 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2645009 tgttctatcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 2644970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 29 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 5279056 - 5278720
Alignment:
Q  29 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-at 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  5279056 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacttgacagaacagtacaagatagaacaatacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttat 5278957  T
Q  128 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  5278956 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaattgtgctgtggt 5278857  T
Q  228 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 327  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||    
T  5278856 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacacctaacaattagagt 5278757  T
Q  328 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 365  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5278756 tgttctgtcatatcctt-attttttagcaaatcaaacg 5278720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 32 - 364
Target Start/End: Original strand, 33366481 - 33366814
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  33366481 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacaatacaagatagaacagtacaacacaagtcagaacagcacaggacaaattttttatggc 33366580  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||    
T  33366581 attgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtatgtgggagaaaaagttgtgttgtggtttg 33366680  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  33366681 gtgaggaacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaattagaattgt 33366780  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33366781 tctgtcatatccttcattttttagcaaatcaaac 33366814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 32 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30326550 - 30326215
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatggc 130  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||     
T  30326550 gggtgtgtttggtttgcaaaagagcaagtactggacagaacagtacaagatagaaccgtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaaatttttatgga 30326451  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  30326450 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttg 30326351  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    | ||| || |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30326350 gcgagagacaaaa-tatgagtttttgtcctgtcccctgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgc 30326252  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30326251 tctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 30326215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 32 - 367
Target Start/End: Original strand, 44284508 - 44284836
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||        |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44284508 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaac--------acaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggc 44284599  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||     
T  44284600 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgttattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggttta 44284699  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  44284700 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactctagttgt 44284799  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44284800 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 44284836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 32 - 367
Target Start/End: Original strand, 37308527 - 37308863
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  37308527 gggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatggc 37308626  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  37308627 attgagtaatttttttgttt-tacgattttttagggacaaaatactattttggtattttagacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 37308725  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37308726 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 37308825  T
Q  331 tctgtcatgtccttca-ttttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37308826 tctgtcctgtccttcatttttttagcaaatcaaacgca 37308863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 57 - 374
Target Start/End: Original strand, 7258792 - 7259111
Alignment:
Q  57 aagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacg 155  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  7258792 aagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaatagtacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttataca 7258891  T
Q  156 atttttgagggacaaaa-tgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttt 254  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7258892 atttttgagggacaaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttt 7258991  T
Q  255 tgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttag 354  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7258992 tgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactagacagctagagttgttctgtcatgtccttcattttttaa 7259091  T
Q  355 caaatcaaacgcaacctaag 374  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  7259092 caaatcaaacgcagcctaag 7259111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 35 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30798703 - 30798372
Alignment:
Q  35 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcatt 133  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  30798703 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtataagatagaacagta--acataagacagaacagcacatgacaaattttgtatggtatt 30798606  T
Q  134 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 233  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  30798605 tagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagataacttgtacgtgggataaaaagttgtgatgtggtttggtg 30798506  T
Q  234 agggataaaaatatgagt-ttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 332  Q
    ||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30798505 agggacaaaaatatgagttttttttcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 30798406  T
Q  333 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  30798405 tgtc-tgcccttcattttttagcaaatcaaacgca 30798372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 34 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 19513906 - 19513571
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||| | |||  ||||||||||  ||||||||||| |||| ||    
T  19513906 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggataaaacagtacaagatagaacagtacaatagaagacagaacagcacgggacaaattttttatggtat 19513807  T
Q  133 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 232  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19513806 tgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggt 19513707  T
Q  233 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 332  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19513706 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctcccgtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggaaaactagagttgttc 19513607  T
Q  333 tgtcatgtccttcatt-ttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19513606 tgtcctgtccttcatttttttagcaaatgaaacgca 19513571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 34 - 350
Target Start/End: Original strand, 42706231 - 42706549
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  42706231 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagcacttgacataacagtacaagatagaacaatacaacacaagacagaacagcacaggacaaattttttatggcat 42706330  T
Q  133 tgagtaatttt-ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 231  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  42706331 tgagtaatttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 42706430  T
Q  232 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42706431 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcttatcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaattgtt 42706530  T
Q  332 ctgtcatgtccttcatttt 350  Q
    ||||| ||||||| |||||    
T  42706531 ctgtcctgtcctttatttt 42706549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 29 - 345
Target Start/End: Original strand, 16104142 - 16104459
Alignment:
Q  29 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tat 127  Q
    |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| |||    
T  16104142 taagggtgtatttggtttgcaaaacaacaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacagggcaaattttttat 16104241  T
Q  128 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  16104242 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaatttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggt 16104341  T
Q  228 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 327  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16104342 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtcgtgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactatagt 16104441  T
Q  328 tgttctgtcatgtccttc 345  Q
    ||||||||| | ||||||    
T  16104442 tgttctgtcctatccttc 16104459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Original strand, 33889128 - 33889450
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  33889128 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta---------------caacacaaggcagaacagcacataacaaattttttatgg 33889212  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  33889213 tattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggttt 33889312  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33889313 ggtgagggaaaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtatctgaaacaattttacaaatcaaacactagacaactagagttg 33889412  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33889413 ttctgtcctgtccttcattttttagtaaatcaaacgca 33889450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 34 - 364
Target Start/End: Original strand, 39461187 - 39461518
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39461187 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacaatacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcat 39461286  T
Q  133 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttg---tgctgtggttt 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||   || |||| |||    
T  39461287 tgagtaattttttattttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacagcttgtacgtgagataaaaagttgtgttgttgtgattt 39461386  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    ||||||||| |||||    | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  39461387 ggtgagggacaaaaa---caatttttgtcctgtcacttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaaattg 39461483  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  39461484 ttctatcctgtccttcattttttagcaaatcaaac 39461518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 121 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 7761702 - 7761451
Alignment:
Q  121 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  7761702 tttttatgacattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtg 7761603  T
Q  221 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 320  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7761602 ctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 7761503  T
Q  321 ctagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 372  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7761502 ctagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 7761451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 32 - 367
Target Start/End: Original strand, 40692176 - 40692504
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 130  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  40692176 gggtgtgtttgatttgcaaaacagtaaatactagacataacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcaaaacagcacaggacaaattttttatggc 40692275  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  40692276 attgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatt--------ttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgttctgtggtttg 40692367  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40692368 gtgagggacaaaaatacgagtttttgtcctgtcccttgtctccagtttgtcttgtacctaaaacagtttcacaaattaaacactggacaactagagttgt 40692467  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40692468 tctgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 40692504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 40 - 373
Target Start/End: Original strand, 42365456 - 42365790
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagta 138  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  42365456 ttggtttgcaaaacagtaagtattggaaaaaacaacataagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaagataaattttttatggcattgagta 42365555  T
Q  139 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  42365556 attttttgttttatatgatttttaggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtccgtgatataaaaagttgtgttgtggtttgatgaagga 42365655  T
Q  239 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 338  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  42365656 caaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacggttttacaaatcaaacactagacaactagagttgttatgtcat 42365755  T
Q  339 gtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  42365756 gtccttcattttttagcaaatcaaacacaccctaa 42365790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 35 - 367
Target Start/End: Original strand, 2085946 - 2086269
Alignment:
Q  35 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcatt 133  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  2085946 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatgccatt 2086045  T
Q  134 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||      
T  2086046 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtatttcagacaacttgtacgtgaaacaaaaagttgtactgtggtttgggt 2086145  T
Q  234 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 333  Q
    ||||| |||||||||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2086146 agggacaaaaatatgagtttttg---------ttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg-tct 2086235  T
Q  334 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2086236 gtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 2086269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3913679 - 3913343
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 130  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||   ||||||||||| |||||| || | || |||||||||||||    
T  3913679 agggtgtgtttgatttgcaaaacagtaaatacttgatagaacagtataagacagaacaacacaacacaaggcagaacaacataggataaatttttatggc 3913580  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  3913579 attgaataatattttgttttatacgatttttggggagcaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgttgtggtttg 3913480  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3913479 gtgagggacaaacatgtgagtttttgtcctgtttcttgcctccagtttgtcatatacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaattgt 3913380  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3913379 tttgtcatgtcctttattttttagcaaatcaaacgca 3913343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 45 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 28824762 - 28824440
Alignment:
Q  45 ttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttt 144  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| | |||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||| ||| || ||| ||||    
T  28824762 ttgcaaaacagtaagtactggactgaacagtacaagacagaacagcacaacataagacagaacaatacatgacaaatttttatgacatggaataaatttt 28824663  T
Q  145 tgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaa 244  Q
    |||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28824662 tgttttatacaatttttggggtgcgaaatgctattttagtattttagacaacttgcacgtgagataaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaa 28824563  T
Q  245 tatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtcctt 344  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  28824562 tatgagtttttgtcctgacccttgactccagtatgtgctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcatgtcctt 28824463  T
Q  345 cattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  28824462 cattttttagcaaatcaaacgca 28824440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 31 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 16178100 - 16177769
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | | |   |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  16178100 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtgcaagacatatcaacacaacacaagatagaacaacacacgacaaatttttatagc 16178001  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||    
T  16178000 attgaataatttt--gttttatacgatttttgggggacgaaattccattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttg 16177903  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    || || || |||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16177902 gtaagcgacaaaaatatcagtttatgtcctgtccattgcctccagtttatcctgtacttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaattggagttgt 16177803  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16177802 tatgtcatatccttcattttttagcaaatcaaac 16177769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 352
Target Start/End: Original strand, 4641387 - 4641706
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 130  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| ||  |    
T  4641387 gggtgtgtttgctttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtaaaatatagaacagtacaacataaggcagaacaacacaggacaaattttttatacc 4641486  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  4641487 attgagtaattttttgttttatacgatttttgaggaacaaaatgctattttggtattttaaacaacttgtatgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttg 4641586  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||   |||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4641587 gtgagagacaaaaatatgaatttttgttccgtccc--acctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactaaagttgt 4641684  T
Q  331 tctgtcatgtccttcatttttt 352  Q
    |||||| | |||||||||||||    
T  4641685 tctgtcttttccttcatttttt 4641706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Original strand, 6896040 - 6896375
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 130  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||   |||||   ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||     
T  6896040 agggtgcgtttggtttgcaaaacagtaagtacta-acagaacagtataatgcagaacaacacaacacaaggcataacaacacatgacaaatttttatggt 6896138  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  6896139 attgaataatttcttgttttatatgccttttgggggacgaaatgctattttggtgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgttgtttg 6896238  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||||||| |||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  6896239 gtgagggacaaaaatttcagtttttatcctgtcccttgcctccagtttgttttgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgt 6896338  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  6896339 tctgtcctgtctttcattttttaacaaatcaaacgca 6896375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 97 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 32766658 - 32766387
Alignment:
Q  97 caaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaac 196  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  32766658 caagggagaacaacacaggacaaatttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttggaggacgaaatgttattttggtattttagacaac 32766559  T
Q  197 ttgtacgtgggatgaaaa-gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaaca 295  Q
     ||||||| |||  |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32766558 ctgtacgtaggacaaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaaca 32766459  T
Q  296 gttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32766458 gttttacaaatcaaacactggacaattatagttgttctgttctgtccttcgttttttagcaaatcaaacgca 32766387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 40832692 - 40832360
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagta---agtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||   |||| | ||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  40832692 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtagtaagtattagacagaatagtacaagatagaacagcacaacacaaggtagaacaacacatgacaaatttttata 40832593  T
Q  129 gcattgagtaat--tttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 226  Q
      ||||| | ||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||    
T  40832592 ttattgaattattatttttgttttatacgatttttgggggacgaaatactattttggtattttagactacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtgg 40832493  T
Q  227 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 326  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  40832492 tttggtgagggacaaaaatatccgtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaatagctttacaaatcaaacactggacaacttaag 40832393  T
Q  327 ttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaat 359  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  40832392 ttgttatgtcatgtgcttccttttttagcaaat 40832360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 34 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 38993284 - 38992954
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcatt 133  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||| |||| |||||| |||| ||||||||   |||| |||    
T  38993284 gtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtactggacagaacaatataagataggacagcacaacataaggcagaacaacacaagacaaatt---atggtatt 38993188  T
Q  134 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 233  Q
    || ||||||| ||| |||||  ||||||| | ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  |    
T  38993187 gaataattttctgtattatattatttttgggtgacgaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgacg 38993088  T
Q  234 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 333  Q
    ||| | ||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  38993087 aggaacaaaaattgtagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctcttcctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaactggagttattct 38992988  T
Q  334 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38992987 gtcatgtccttcattttttatcaaatcaaacgca 38992954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 10400084 - 10399756
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 130  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||| |||| | |||   |||||| ||||     |||||||||| |||||||||||||    
T  10400084 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtgagtactgaacacaatagtacaagacaaaacatcacaacataagg-----cagcacatgataaatttttatggc 10399990  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| || ||  |||||||||| ||||||||     
T  10399989 attgaataattttttgttttatacgacttttgggggacaaaatgctattttggatttttagacaacttatacatgagacaaaaagttgtgttgtggttta 10399890  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  10399889 gtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcctgtatcttgcatctagtttgtcctgtacctgaaatagttttacaaatcaaacactgaacaactgaagttgt 10399790  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399789 tctatcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 10399756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 12672594 - 12672373
Alignment:
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||    
T  12672594 cattgagtaattttttgttttatacgatttttggaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacttgggataaaaacttgtgttgtggttt 12672495  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12672494 ggtgagggacaaaaatatgagattttgtcccgtcccttgcctccagtttgtcctatacctgaaacagttttacaaatcaaacacaggacaactagagttg 12672395  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcattttttagc 355  Q
     |||    ||||||||||||||||||    
T  12672394 ctct----tgtccttcattttttagc 12672373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 31 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 37004089 - 37003856
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatg-acaaattttt-atg 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| |||    
T  37004089 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactagacagaacagtataagatagaacagtacaatacaaggtaaaacagcacaaggacaaattttttatg 37003990  T
Q  129 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 228  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  37003989 gcattgaataattttttattttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtt 37003890  T
Q  229 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgt 262  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  37003889 tggtgagggacaaaaatatgagtttttgttatgt 37003856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 35 - 368
Target Start/End: Original strand, 30712732 - 30713068
Alignment:
Q  35 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattg 134  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||   |||||   ||||||||  | | ||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  30712732 tgtgtttggtttgtaaaaaagtaagtactggacagaacagtacaatgcagaacaacacaacacagcgcataacagcaaaggacaaatttttatggtattg 30712831  T
Q  135 agtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt----tg 230  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    ||    
T  30712832 aataattttttgttttatatgatttttg-gggatgaaatgatattttggtgttttagacaacttctacgtgggataaaaagttgtgttgtggttaatttg 30712930  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||||||| |||||| | ||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  30712931 gtgagggacaaaaatttcagtttgtgtcctgtcccttgcctccaggttgttctgtccctgaaacagtattacaaatcaaacactggataactggagttgt 30713030  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaa 368  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30713031 tttgtcatgtctttcattttttaacaaatcaaacgcaa 30713068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 40 - 364
Target Start/End: Original strand, 11114752 - 11115074
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||| |||| |||||   ||||||||||  ||||||  | | || |||||||||||||||||| |||    
T  11114752 ttggtttgcaaaacagtaagtactaaacataattgtacaagacagaacaacacaacacaagacagaacaatataagaaaaatttttatggcattgaataa 11114851  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 239  Q
    ||||| ||||||||||||| ||   |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |     
T  11114852 tttttcgttttatacgattgttagcggacgaaatactattttggaattttagacaacttgtgcgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgaggaac 11114951  T
Q  240 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 339  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||| ||    
T  11114952 aaaaatatgattttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtaactg-aacag-tttacaaatcaaacattggacaattggagttgttttgtcctg 11115049  T
Q  340 tccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11115050 tccttcattttttagcaaatcaaac 11115074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 31 - 274
Target Start/End: Original strand, 26418793 - 26419037
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatgg 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||| ||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||  ||||||||    
T  26418793 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtatttgacagaacagtgcaagacagaacagcacaacgcaaggcagaacaacacatgacaaaaattttatgg 26418892  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  26418893 caatgagtaattttttgttttatacaatttttgggggataaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 26418992  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcca 274  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26418993 ggtgaggaacaaaaatatgagtttttgtcatgtccctcgcctcca 26419037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 40 - 367
Target Start/End: Original strand, 13829318 - 13829633
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||   ||||| | ||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||  ||||| |||    
T  13829318 ttggtttgcaaaacagtaattattggacaaaacagtacaaagcagaacagcacaacacaaggcagaacatcacagaacaaatttttatgatattgaataa 13829417  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 239  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| |||||| | |||| |||     
T  13829418 ttttttgttttatatgatttttgagggacgaaatgatattttggtgttttagataacttgtacctgggacaaaaagttgtgatgtggtctagtgatggac 13829517  T
Q  240 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 339  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||            |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13829518 aaaaatttcagtttttgtcctgtcccttacctccagtttgtcct------------gtttcacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctg 13829605  T
Q  340 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13829606 tccttcattttttaacaaatcaaacgca 13829633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 27463010 - 27462684
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||  || | ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  27463010 ttggtttgcaaaacagcaagtattggataaaacagtgcaaaacagaacagcacaacacaaggtagaacaacacatgacaaatttatatgacattgaataa 27462911  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 239  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || || ||||||||||||| |||||| |||||  |||| | | ||| |||||||||| |||||||||||||||||     
T  27462910 ttttttgtttt-tacgatttttagggcacgaaatgctattttggtatttttgacaatatgtatg-gtgataaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 27462813  T
Q  240 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 339  Q
    |||||||  || ||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| | || ||    
T  27462812 aaaaataacagcttttgtcttgtcccttgtctacagtttgtcatgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaaattgttatatcctg 27462713  T
Q  340 tccttcattttttagcaaatcaaacgcaa 368  Q
    || ||||| |||||  |||||||||||||    
T  27462712 tctttcatcttttaaaaaatcaaacgcaa 27462684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 44 - 364
Target Start/End: Original strand, 8112189 - 8112505
Alignment:
Q  44 tttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattt 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||        | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  8112189 tttgcaaaacagtaagtactcgacggaacaatataagatagaacaatacaacacaa--------atcacatgacaaattttgtatgacattgagtaattt 8112280  T
Q  143 tttgttttatacgatttttgagggacaaaa-tgctattttgatatttt-agacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggata 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||| |||||| |||| | |||||  ||| |  |||||||||| |||||||||||||| || |    
T  8112281 tttgttttatacgatttttaagggaaaaaaatgttattttggtatttttagactatttgtatctggaacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagagaca 8112380  T
Q  241 aaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaaca-ctggacaactagagttgttctgtcatg 339  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||  |||||||    
T  8112381 aaaatatgagtttttgtattgtctcttgcctccagtttgttctgtacctgaaacaattttacaaatcaaacaccttgacaactagagtagtattgtcatg 8112480  T
Q  340 tccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    | ||| || |||||| |||||||||    
T  8112481 ttctttatcttttagtaaatcaaac 8112505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 26981912 - 26981606
Alignment:
Q  28 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-- 125  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||      
T  26981912 ctaagggggtgtttggtttgcaag-caataagtactggacagaacagtacaagacaaaacagcacaacacaaggcagaacagcacaggataaattttttt 26981814  T
Q  126 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtg 225  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||                     ||||||||||||||||||||| | |  ||||||| || ||||    
T  26981813 atgacaatgagtaattttttgttttatacgatttttgg--------------------tattttagacaacttgtacgtagaacaaaaagttttgttgtg 26981734  T
Q  226 gtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 325  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26981733 gtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcatttgcctcccgtttgtcttgtatctggaacagttttacaaatcaaacactggacaactgga 26981634  T
Q  326 gttgttctgtcatgtccttcatttttta 353  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26981633 gttgttctgttctgtccttcatttttta 26981606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 33 - 258
Target Start/End: Original strand, 9717113 - 9717322
Alignment:
Q  33 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcat 132  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |  ||              |||||||||||||||    
T  9717113 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacga--ta--------------aaatttttatggcat 9717196  T
Q  133 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 232  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9717197 tgggtaattttttgtttgatacgatttttgagggacaaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggt 9717296  T
Q  233 gagggataaaaatatgagtttttgtc 258  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||    
T  9717297 gagggacaaaaacatgagtttttgtc 9717322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 78 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 12939474 - 12939202
Alignment:
Q  78 aagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaat--tttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgc 175  Q
    |||| ||||| | ||||||||||| |||||| |||| || ||||||| ||  |||||| || |  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  12939474 aagacagaacagcacaacacaaggcagaacaacacaagataaattttaataacattgaatattgttttttgttttatatgatttttgggggacaaaatgt 12939375  T
Q  176 tattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccag 275  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12939374 tattttggtatcttagacaacttgtacgtgagataaaaagttgtgctgtggtttggtgaaggacaaaaatatcagtttttgtcatgtcccttgcctccag 12939275  T
Q  276 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgc 366  Q
                      |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  12939274 ------------------cagttttataaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcttatccttcattttttagtaaatcaaacgc 12939202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18793478 - 18793306
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 132  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||    
T  18793478 gtgtgtttggtttgcaaaataataagtactggacaaaacagtataaaatagaacagtacaacataaggtagaacatcacaagacaaattttttatgggat 18793379  T
Q  133 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtg 205  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18793378 tgagtaattttttgttttatacaatttttggaggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtg 18793306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 189 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 38623365 - 38623190
Alignment:
Q  189 tagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacc 288  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  38623365 tagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcttttccattgcctcaagtttgtcctgtccc 38623266  T
Q  289 tgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  38623265 tgaaacagttttacaaatcaaacattggataactgaagttgttatgtcatgtccttcaatttttaacaaatcaaac 38623190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 241 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18793300 - 18793180
Alignment:
Q  241 aaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18793300 aaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcc--tttgtactgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgagcaactagagttgttctgtcatgt 18793203  T
Q  341 ccttcattttttagcaaatcaaa 363  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  18793202 ccttcattttttagcaaatcaaa 18793180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 267 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 37863349 - 37863242
Alignment:
Q  267 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgc 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37863349 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaagcgc 37863250  T
Q  367 aacctaag 374  Q
    | ||||||    
T  37863249 accctaag 37863242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 171 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 41366189 - 41365993
Alignment:
Q  171 aatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcc 270  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| | || ||||||    
T  41366189 aatgttattttggtattttagacaacttgtatgtgagacaaaaaattgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcctatctcttgcc 41366090  T
Q  271 tccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| || |||| | |||||||||| || |||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  41366089 tccagtttgtcatgtccctgaaactgtttcacaaatcaaacattgcacaattggagttgttctatcttgtttttcagtttttagcaaatcaaacgca 41365993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 103 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 45463256 - 45463005
Alignment:
Q  103 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 202  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  45463256 agaacaacacatgacaaatttttattgcattaaataattttttgttttatacgatttctg-gggacgaaatgttattttgatattttagacaatctgtac 45463158  T
Q  203 gtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttac 302  Q
    ||  ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||             |||||  |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  45463157 gtatgacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagtgacaaaaat-------------atgtctattgcctcctgtttgtcttgtacctgaagcagttttac 45463071  T
Q  303 aaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattt-tttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||   || |||||| |||||||| |||||| || ||||||| |||| |||||||||||||    
T  45463070 aaatcaaatgttgaacaactggagttgttatgtcatctctttcatttgtttaacaaatcaaacgca 45463005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 263
Target Start/End: Original strand, 1247049 - 1247250
Alignment:
Q  54 agtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttata 153  Q
    |||||||| | |||| ||||||| |||| |||||   ||||||||| | || |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  1247049 agtaagtagttgacataacagtacaagacagaacaacacaacacaaagcagtacagtacaagacaaatttttatggcattgaataattttttattttata 1247148  T
Q  154 cgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagttt 253  Q
    ||||||||| || || ||||||        |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  1247149 cgatttttggggaacgaaatgc--------tattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgcagtggtttggtgagggacaaaaatatgagatt 1247240  T
Q  254 ttgtcatgtc 263  Q
    ||||| ||||    
T  1247241 ttgtcctgtc 1247250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 276 - 367
Target Start/End: Original strand, 9717317 - 9717408
Alignment:
Q  276 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9717317 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 9717408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 363
Target Start/End: Original strand, 41934465 - 41934785
Alignment:
Q  44 tttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaatttt 143  Q
    ||||||||||||||||||| | | |  |||||| ||||||||||   |||||||||| || || | | ||| ||||||||||| || ||||| | |||||    
T  41934465 tttgcaaaacagtaagtaccgtataacacagtacaagatagaacaacacaacacaagataaaataacgcataacaaatttttacggtattgaatgatttt 41934564  T
Q  144 ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaa 243  Q
     ||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||| |||||||| |||| | | || |    
T  41934565 atgtcttatatgatttttggtggacaaaatgttattttggtattttagacaacttatacgtaggacaaaaagttgtgttgtggtttagtgaagtacaaga 41934664  T
Q  244 atatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag-ttgttctgtcatgtcc 342  Q
    || | |||||||||| ||||  |||| |||||||| ||   | ||| || ||||||||||||||| |||||  |||||| ||| ||||  | |||||| |    
T  41934665 atttcagtttttgtcttgtcttttgcatccagtttatctcatcccttaatcagttttacaaatcacacactatacaacttgagtttgtcatatcatgttc 41934764  T
Q  343 ttcattttttagcaaatcaaa 363  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  41934765 ttcattttttaacaaatcaaa 41934785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 235
Target Start/End: Original strand, 20907468 - 20907664
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcatt 133  Q
    ||||| ||||||||||||| || | |||| | | ||||||||| |||| |||||     ||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  20907468 gtgtgtttggtttgcaaaatagcaggtaccgtatagaacagtacaagaaagaac-----aacacaagggagaacaacatatgacaaatttttatgtcatt 20907562  T
Q  134 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 233  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||||||| |||| |||||| | |||  |||| |||| |||||||||||||    
T  20907563 gaataattttttgttttgtacgatttttgggggataaaatgttattttagtattttatacaatttgtacataggacaaaaaattgttctgtggtttggtg 20907662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 283 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 37003858 - 37003774
Alignment:
Q  283 tgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37003858 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaacttgagttgttatgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 37003774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 90 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 35473160 - 35472967
Alignment:
Q  90 tacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttt 189  Q
    ||||| ||||| ||||||| || |||||||||||| |||| ||| | |||||||| || |||||| | |||| | |||||||| | |||| || ||||||    
T  35473160 tacaatacaagttagaacaacatatgacaaattttgatggtattaaataatttttggtcttatacaaatttttatggacaaaaggatattatggtatttt 35473061  T
Q  190 agacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcct 283  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||    ||||||| |||||| |||| ||| | |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  35473060 agacaacttgtacgtgggacaaaaaattgcagagtggtttagtgaggaataagaatttcagtttttgacttgtcccttgcctccaatttgtcct 35472967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 263
Target Start/End: Original strand, 37088218 - 37088376
Alignment:
Q  105 aacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgt 204  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||  |||||| ||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||  |    
T  37088218 aacagcacaagacaaatttgtatggtattgaacaattttgtgtcttatccgatgtttgatggacaaaatgctattttggtattttaaacatcatgtattt 37088317  T
Q  205 gggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtc 263  Q
     |||||||||| |||| ||||| || |||||||| || ||| | |||||||||| ||||    
T  37088318 aggatgaaaagatgtgttgtggcttagtgagggacaagaatttcagtttttgtcttgtc 37088376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 40876697 - 40876554
Alignment:
Q  176 tattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccag 275  Q
    ||||||| ||| ||| |||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |    
T  40876697 tattttggtatattaaacaatttgtacttgg-atgaaaagttgtgttgtggtttaatgaaagataaaaatttgagcttttgtcatgtcccttacctccgg 40876599  T
Q  276 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 320  Q
    | |||| ||| | | ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  40876598 tgtgtcatgtccttaaaatagttttacaaatcaaacattggacaa 40876554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 12672674 - 12672596
Alignment:
Q  29 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaaca 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| || | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12672674 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaaatactagacataa-aatataagatagaacagtacaacacaaggcagaaca 12672596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15303306 - 15303180
Alignment:
Q  184 tattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcct 283  Q
    |||||||||||||||  | |||| |  |||||||||| ||| ||||| | | ||| |||||| |  |||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  15303306 tattttagacaacttacatgtggaacaaaaagttgtgatgtagtttgataaaggacaaaaatttatgtttttgtcatgtgtcttgcctctagtttgtcct 15303207  T
Q  284 gtacctgaaacagttttacaaatcaaa 310  Q
    ||  ||||| |||||||||||||||||    
T  15303206 gtctctgaagcagttttacaaatcaaa 15303180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 314
Target Start/End: Original strand, 26796173 - 26796382
Alignment:
Q  104 gaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacg 203  Q
    ||||| |||| |||||| | || ||| |||||||| ||||   | ||||| ||||||||  ||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  26796173 gaacaacacaagacaaactattctggtattgagtatttttggctcttatatgatttttggtggacaaaagactatttgg-tattttagacaacttgtacg 26796271  T
Q  204 tgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttaca 303  Q
    || ||  |||||||| | |||| ||| |||||||| | |||| | | ||||| || | ||| ||||||  |||||||  ||| | || ||||||||||||    
T  26796272 tgtgacaaaaagttgcgttgtgctttagtgagggacacaaattttaatttttatcctatccattgcctgaagtttgttttgtccttgtaacagttttaca 26796371  T
Q  304 aatcaaacact 314  Q
    |||||||||||    
T  26796372 aatcaaacact 26796382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 364
Target Start/End: Original strand, 83374 - 83474
Alignment:
Q  264 ccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 363  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||  ||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  83374 ccttacctctagtttgtcatgtcccacaaacagttttacaaatcaaacactgtgcaactgaagttgtcttgtcatgtccttcgttttttaacagatcaaa 83473  T
Q  364 c 364  Q
    |    
T  83474 c 83474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13249545 - 13249421
Alignment:
Q  105 aacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgt 204  Q
    |||| |||| |||| ||||||| | |||||| ||||||||| || ||| | || ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  13249545 aacaacacaagacacatttttaagacattgaataattttttattatattctatatttgatggacaaaagtctattttgatattttaaacaacttgtactt 13249446  T
Q  205 gggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
     |||  |||| ||||| ||||||||    
T  13249445 tggacaaaaaattgtgttgtggttt 13249421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 364
Target Start/End: Original strand, 18278926 - 18279104
Alignment:
Q  184 tattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcct 283  Q
    ||||||| |||| ||||| ||| ||  ||||||||||  ||| ||| |||||| | |||||| | |||||||||   |||| ||| |||||||||||| |    
T  18278926 tattttatacaatttgtatgtgagacaaaaagttgtgacgtgatttagtgaggaacaaaaattttagtttttgtgccgtcctttgtctccagtttgtctt 18279025  T
Q  284 gtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    || ||| ||||| ||||| |||||||||| || ||||||| | ||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18279026 gtccctaaaaca-ttttataaatcaaacattgcacaacta-aattgtcatgtcctgtccttaattttttagcagatcaaac 18279104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 249 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 6453315 - 6453249
Alignment:
Q  249 agtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactg 315  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6453315 agtttttgtcttgtcccttacctccggtttatcctgtccctgaaacaattttaaaaatcaaacactg 6453249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 16062178 - 16061980
Alignment:
Q  165 ggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtggga-tgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtc 263  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||   || ||||| ||||||| || ||| |  ||||||||||| ||    
T  16062178 ggacaaaatgttattttgtcattttagacaa-ttgtatgtgggacaaaaaagttgtatcgtagtttgatgagggacaagaatttatgtttttgtcatatc 16062080  T
Q  264 ccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 363  Q
    |||| || ||| ||| |  |||  ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||  || | | || || |||||| |||||||||||    
T  16062079 ccttaccaccaatttattttgtgtctg-aacagttttacaaatcaaaaactgtacaacttgagttgtcttgacctatcttttatttttgagcaaatcaaa 16061981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 367
Target Start/End: Original strand, 26419045 - 26419089
Alignment:
Q  324 gagttgttctgtcatgtccttca-ttttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26419045 gagttgttatgtcatgtccttcatttttttagcaaatcaaacgca 26419089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 38786647 - 38786503
Alignment:
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||||  | ||||||||  ||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||  ||| |||||| | ||||||     
T  38786647 attgaataatttttggtgttctacgattttgtacggacaaaagtctattttcatattt-agacaacttatacgtgagacaaaatgttgtgttttggttta 38786549  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagttt 278  Q
    ||||| ||  ||||| | ||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  38786548 gtgagaga--aaaatttcagtttttatcttgtccattgcctccagttt 38786503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 332 - 367
Target Start/End: Original strand, 1247257 - 1247292
Alignment:
Q  332 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1247257 ctgtcatgtcctttattttttagcaaatcaaacgca 1247292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 195
Target Start/End: Original strand, 31148786 - 31148844
Alignment:
Q  137 taattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaa 195  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  31148786 taattttttgttttatacaatttgtgttggataaaaaactattttgatattttagacaa 31148844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 31194023 - 31193954
Alignment:
Q  295 agttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||  ||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||||    
T  31194023 agttttacaaatcaaacattatacaactgaagttgttatgttttatccttcattttttagcatatcaaac 31193954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 249 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 12217706 - 12217650
Alignment:
Q  249 agtttttgtcatgtcccttg-cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaa 304  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  12217706 agtttttgtcatgtctcttgtcccccagtttgccctgtccctgtaacagttttacaa 12217650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 115)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 29 - 367
Target Start/End: Original strand, 23521751 - 23522090
Alignment:
Q  29 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tat 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  23521751 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagataaaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttat 23521850  T
Q  128 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  23521851 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggt 23521950  T
Q  228 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 327  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23521951 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctatcccttgcttccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 23522050  T
Q  328 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23522051 tgttttgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 23522090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 29 - 373
Target Start/End: Original strand, 24002209 - 24002555
Alignment:
Q  29 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttat- 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |     
T  24002209 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaatttttttt 24002308  T
Q  128 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaa-tgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24002309 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgg 24002408  T
Q  227 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 326  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24002409 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaactagag 24002508  T
Q  327 ttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 373  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24002509 ttgttctgtactgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaa 24002555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 31 - 373
Target Start/End: Original strand, 56154494 - 56154837
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  56154494 agggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacatgacaaattttttatgg 56154593  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  56154594 cattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 56154693  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  56154694 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgttctgtcccttgcctccagtttttcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttg 56154793  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 373  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  56154794 ttctgtcctaaccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaa 56154837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 29785750 - 29785412
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 129  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29785750 agggtgtgtttgatttgcaaaacaataagtactgaacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgg 29785651  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  29785650 cattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagctgtgttgtggttt 29785551  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29785550 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgttctgtcccttgtctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 29785451  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcatt-ttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29785450 ttctgtcatgtccttcatttttttagcaaatcaaacgca 29785412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 38486465 - 38486133
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 129  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |     ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  38486465 agggtgtgtttcgtttgcaaaacagtaagtactagacagaacagtgcaagatagaacag-----cacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgg 38486371  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||    
T  38486370 cgttgagtaattttttgttttatactatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgttagacaaaaagttgtgctgtggttt 38486271  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38486270 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttatcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 38486171  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38486170 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 38486133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 32 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 20802743 - 20802407
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  20802743 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactgaacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggc 20802644  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  20802643 attgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttg 20802544  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20802543 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggataactaaagttgt 20802444  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  20802443 tctgtcctatccttcattttttaacaaatcaaacgca 20802407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 32 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 49152311 - 49151976
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  49152311 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggc 49152212  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  49152211 attgagtaattttttgttttatacgatttttgatggacaaaatgttattttggt-ttttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgttgtggtttg 49152113  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  49152112 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcgtgtcccttgcatccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggataactaaagttgt 49152013  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49152012 tctgttctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 49151976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 40 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 55065536 - 55065209
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55065536 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacataacagtataagataaaatagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaatttttatggcattgagtaa 55065437  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 239  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||     
T  55065436 ttttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 55065337  T
Q  240 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttg-cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 338  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  55065336 aaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaataactagagttgttctgtcat 55065237  T
Q  339 gtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  55065236 gtcctt-attttttagcaaattaaacgca 55065209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Original strand, 12600761 - 12601096
Alignment:
Q  33 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggca 131  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12600761 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagtcagaacagcacttgacaaattttttatggca 12600860  T
Q  132 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 231  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||     
T  12600861 ttgagtagttttttgttttaaacgattttttagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttga 12600960  T
Q  232 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12600961 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttatctccagtttgtcctgtacctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 12601060  T
Q  332 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12601061 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 12601096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 32 - 367
Target Start/End: Original strand, 21579900 - 21580235
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||     
T  21579900 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggt 21579999  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| |||||||||    
T  21580000 attgagtaatttttagttttatacgatttttgagggacaacatgctattttggtattttagacaatttgtacgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttg 21580099  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  21580100 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatactggacaattagaattgt 21580199  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21580200 tctgtcctgtcctt-attttttagcaaatcaaacgca 21580235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 31 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 33177245 - 33176910
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatgg 129  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| || | ||||||| ||||||||    
T  33177245 agggtgtgcttggtttgcaaaacggtaagtacttgacagaacagtataagatagaacagtacaacacaagacagaacaacaaaggacaaatattttatgg 33177146  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  33177145 cattgagtaattttatgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtgcgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 33177046  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  33177045 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaaattg 33176946  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 365  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  33176945 ttctgtcatatcctttattttttagcaaatcaaacg 33176910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 32 - 367
Target Start/End: Original strand, 52319200 - 52319538
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  52319200 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacataacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggc 52319299  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  52319300 attgagtaattt---gttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttgacattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 52319396  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt--- 327  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||       
T  52319397 gtgagggacaaaaatatgagttttcgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaactagagttgt 52319496  T
Q  328 --tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
      ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52319497 tctgttctgtcctgtccttcattttttaacaaatcaaacgca 52319538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9512553 - 9512216
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||  || ||||| |||  |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  9512553 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtacgtgacagaacagtacaagatagaatagtgcaacaaaagacagaatagcacatgacaaattttttatgg 9512454  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9512453 cattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 9512354  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9512353 ggtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcctgttacttgcctccagtttatcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttg 9512254  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9512253 ttctatcatgtccttcgttttttagcaaatcaaacgca 9512216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 32 - 351
Target Start/End: Original strand, 37865627 - 37865947
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 130  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  37865627 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacgggacataacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaatttttttatggc 37865726  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| ||||    
T  37865727 attgaataattttttgttttatacgatttctgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgttgtgatttg 37865826  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37865827 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtctcttgcctccagattgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 37865926  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttt 351  Q
    | |||| ||||||||||||||    
T  37865927 tatgtcgtgtccttcattttt 37865947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 35 - 367
Target Start/End: Original strand, 55593759 - 55594096
Alignment:
Q  35 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggac---agaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 130  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||   ||  ||||||||| ||||||    
T  55593759 tgtgtttggtttgtaaatcagtaagtactggacgacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaatgcaaaacaaattttttatggc 55593858  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55593859 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggtttg 55593958  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55593959 gtgagggactaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttatcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaatactggacaactagagttgt 55594058  T
Q  331 tctgtcatgtccttca-ttttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  55594059 tctgtcctgttcttcatttttttagcaaatcaaacgca 55594096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 32 - 344
Target Start/End: Original strand, 21202614 - 21202926
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 130  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| | |||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21202614 gggtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtactggacaaaacagtacaagacagaacagcacaacacaaaacagaacagcacatgacaaattttttatggc 21202713  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  21202714 aatgagtaattttttgttttatacgatttttg-gggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 21202812  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21202813 gtgagggacaaaattatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtaccttaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 21202912  T
Q  331 tctgtcatgtcctt 344  Q
    |||||| |||||||    
T  21202913 tctgtcctgtcctt 21202926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 36743901 - 36743565
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 129  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||||||| || ||||| ||| |||||||||   ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36743901 agggtgtgtttggtttgaaaaatagtaagtactagatagaacggtacaagatagaataatacaacataaggcagaacagcacaagacaaattttttatgg 36743802  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  36743801 cattgagtaatttgttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtagttt 36743702  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  36743701 ggtgagggacaaaaatatgaatttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaattcaaacactgaacaactagagttg 36743602  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    || ||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  36743601 ttttgttatatccttcat-ttttagcaaatcaaacgca 36743565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 40 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 50178696 - 50178368
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||| |||||   |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  50178696 ttggtttgcaaaacagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacatcacaatacaagggagaacatcacaggacaaatttttatgacattgaataa 50178597  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa-gttgtgctgtggtttggtgaggga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||| |    
T  50178596 ttttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaagttgtgctgtggtttgctgaggca 50178497  T
Q  239 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 338  Q
     |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  50178496 caaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcct 50178397  T
Q  339 gtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50178396 gtccttcattttttagcaaatcaaacgca 50178368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 34 - 367
Target Start/End: Original strand, 6776460 - 6776788
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcat 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  6776460 gtgtgtttggtttgcaaaacag------ctggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcat 6776553  T
Q  133 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  6776554 tgagtaattttttgttttatacgattttttagagacaaaatgatattttgatgttttagacaacttttacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 6776653  T
Q  233 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 332  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6776654 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtgctatacctaaatcaattttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 6776753  T
Q  333 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6776754 tgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 6776788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 83 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 33553003 - 33552708
Alignment:
Q  83 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 181  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33553003 agaacagtacaacacaaggcaaaacaacacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 33552904  T
Q  182 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 281  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  33552903 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcatccaatttgtc 33552804  T
Q  282 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaagaat 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  33552803 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttttgtcctgtcctttattttttagcaaatcaaacgcacccttagaat 33552708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 40 - 367
Target Start/End: Original strand, 52949604 - 52949930
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  52949604 ttggtttgcaaaacagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaatagcacaggacaaatttttatgacattgaataa 52949703  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 239  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||     
T  52949704 tttt-tgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgctgagggac 52949802  T
Q  240 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 339  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  52949803 aaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatgaaacactggacaactagagttgttttgtcgtg 52949902  T
Q  340 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  52949903 tccttcattttttaacaaatcaaacgca 52949930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 48 - 367
Target Start/End: Original strand, 54542881 - 54543198
Alignment:
Q  48 caaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttg 146  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| | |||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  54542881 caaaacagtaagtacta-acagaatagtacaggatagaacagtacaacacaaagcagaacagcacaagacaaattttttatgtcattgagtaattttttg 54542979  T
Q  147 ttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaata 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  54542980 ttttatacgatttttgagggacaaaatgatattttggtattttagacaacttgtacgtgggac-aaaagttgtgctatggtttggtgagggacaaaaata 54543078  T
Q  247 tgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttca 346  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54543079 tgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtcctgtacttgaaatagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctgtcatgt-cttca 54543177  T
Q  347 ttttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  54543178 ttttttagcaaatcaaacgca 54543198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 83 - 367
Target Start/End: Original strand, 1231236 - 1231521
Alignment:
Q  83 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 181  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1231236 agaacagtacaacacaaggtagaacagcacaagataaattttttatggcattatgtaatattttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttatttt 1231335  T
Q  182 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||    
T  1231336 gatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttttgtgagggacaaaaatatgagtttttgtccagtctcttgcctccagtttatc 1231435  T
Q  282 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1231436 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctatccttcattttttagcaaatcaaacgca 1231521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 29 - 364
Target Start/End: Original strand, 20694247 - 20694578
Alignment:
Q  29 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tat 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||     ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  20694247 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtaatggatagaacagtacaagatagaac-----aacacaaggcagaatagcacatgacaaattttgtat 20694341  T
Q  128 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||| | ||||||    
T  20694342 ggcaatgagtaattttttgttttatataatttttgggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgttggacaaaaagttgcgttgtggt 20694441  T
Q  228 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 327  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20694442 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgccttcagtttgtcctgtacctaaaacagttttacaaattaaacactggacaactagagt 20694541  T
Q  328 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20694542 tgttctgtgttgtccttcagtttttagcaaatcaaac 20694578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 95 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 2725281 - 2725011
Alignment:
Q  95 cacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagac 193  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2725281 cacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgacattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagac 2725182  T
Q  194 aacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaa 293  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2725181 aacttgtacgtgg-acaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctaaaa 2725083  T
Q  294 cagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 365  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2725082 gagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacg 2725011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 29 - 367
Target Start/End: Original strand, 36885817 - 36886142
Alignment:
Q  29 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |          |||    || ||||||||    
T  36885817 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcgagtactagacagaacagtacaagatagaacagtacaacacagg----------aca----aattttttatg 36885902  T
Q  129 gcattgagt-aattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36885903 gcattgagttaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttaggtattttagacaatttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggt 36886002  T
Q  228 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 327  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36886003 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 36886102  T
Q  328 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36886103 tgttttgtcttgtcctttattttttagcaaatcaaacgca 36886142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 70 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 20518196 - 20517890
Alignment:
Q  70 aacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggac 168  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20518196 aacagtacaagatagaatagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatagaatttttgagggac 20518097  T
Q  169 aaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttg 268  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  20518096 aaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaagaagttatgctgtgatttggtgagggacaaaaatatgactttttgtcctgtctcttg 20517997  T
Q  269 cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatt-ttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20517996 cctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctgtcctgtccttcatttttttagcaaatcaaacgca 20517897  T
Q  368 acctaag 374  Q
     ||||||    
T  20517896 ccctaag 20517890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 83 - 363
Target Start/End: Original strand, 24210243 - 24210525
Alignment:
Q  83 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaa-tgctattt 180  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24210243 agaacgatacaacacaaggcagaacaacacatgacaaatattttatggtattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaaatgctattt 24210342  T
Q  181 tgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgt 280  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24210343 tggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaataatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgt 24210442  T
Q  281 cctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||    
T  24210443 cctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacaccggacaattagagttgttccgtcctatctttcattttttagcaaatcaaa 24210525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 44 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 44649361 - 44649040
Alignment:
Q  44 tttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaatttt 143  Q
    |||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  44649361 tttgcaaaacggcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagtacaatacaagggagaacaacacatgacaaattttgatgacattgaataatttt 44649262  T
Q  144 ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaa 243  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  44649261 --gttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgttgtggtttgctgagggacaaaa 44649164  T
Q  244 atatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtcct 343  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  44649163 atatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaaaactggataactggagttgttctgtcctgtcct 44649064  T
Q  344 tcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  44649063 tcattttttagcaaatcaaacgca 44649040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 103 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 50728054 - 50727789
Alignment:
Q  103 agaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgta 201  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  50728054 agaacagcactggacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgta 50727955  T
Q  202 cgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttta 301  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50727954 cgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgatgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccttcagtttgtcatgtacctgaaacagtttta 50727855  T
Q  302 caaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50727854 caaatcaaacacttgacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 50727789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 103 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 50736068 - 50735803
Alignment:
Q  103 agaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgta 201  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  50736068 agaacagcactggacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgta 50735969  T
Q  202 cgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttta 301  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50735968 cgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgatgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccttcagtttgtcatgtacctgaaacagtttta 50735869  T
Q  302 caaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50735868 caaatcaaacacttgacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 50735803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Original strand, 9807030 - 9807365
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 130  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9807030 agggtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatggc 9807129  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||    
T  9807130 attgaataattttatgttttatacgatttttggaggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtactgtggtttg 9807229  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||| ||| |||||  |||||||||||| ||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  9807230 gtga-ggacaaaaagttgagtttttgtcctgtccattgcatctagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgt 9807328  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
     ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  9807329 cctgtcctatccttcatgttttagcaaatcaaacgca 9807365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 35 - 367
Target Start/End: Original strand, 42869859 - 42870181
Alignment:
Q  35 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaagg-tagaacagcacatgacaaatttttatggcatt 133  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||         || |||||||||||||    
T  42869859 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactcgacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggatagaaca---------aattttttatggcatt 42869949  T
Q  134 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaa-tgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  42869950 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaaatgctatttttgtattttagacaacttatacgtgggac---aagttgtgctgtggtttggt 42870046  T
Q  233 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 332  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  42870047 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcccccagtttgtcctgtaccagaaacagttttacaaatcaaacaccggacaactagagttgtta 42870146  T
Q  333 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42870147 tgtcatgtccttcatttcttagcaaatcaaacgca 42870181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 91 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 44324494 - 44324218
Alignment:
Q  91 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 190  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  44324494 acaacataaggcagaacagcacatgacaaatttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggtatttaa 44324395  T
Q  191 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 290  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  44324394 aacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatcagtttttgtcccgtcttttgcctctagtttgtcctgtacctg 44324295  T
Q  291 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44324294 aaacagttttacaaatcaaacactgaacaactggagttgttctgtcatgtccttcattttctagcaaatcaaacgca 44324218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 46680658 - 46680386
Alignment:
Q  96 acaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagaca 194  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  46680658 acaagatagaacagtacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatatgattttttagggacaaaatgctattatggtattttagaca 46680559  T
Q  195 acttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaac 294  Q
    | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46680558 atttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtaagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaac 46680459  T
Q  295 agttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46680458 agttttacaaatcaaacactgaacaactagaattgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 46680386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 83 - 367
Target Start/End: Original strand, 29616095 - 29616376
Alignment:
Q  83 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 181  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  29616095 agaacagtacaacacaagacagaacaacacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttaagggacaaaatgttatttt 29616194  T
Q  182 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 281  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29616195 ggtattttagacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtc-----agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtc 29616289  T
Q  282 ctgtacct-gaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29616290 ctgtaccttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 29616376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Original strand, 29592774 - 29593105
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 130  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||     ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  29592774 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaaatactggacatatcagtacaagacagaac-----aacacaaggcagaacagaacaagacaaatttttttggc 29592868  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||   ||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||     
T  29592869 attgaataattttttgttttatatgatttttgggggacgaaatgccattttggatttttagacaacttttatgtgggacaaaaagttgtgctgtggttta 29592968  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  29592969 gtgaagtacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcatccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaaggtgt 29593068  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29593069 tctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 29593105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 40 - 367
Target Start/End: Original strand, 3649519 - 3649846
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||   ||||| | ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  3649519 ttggtttgcaaaatagtaagtactggacaacacagtataatgcagaacagcacaacacaaggcataacagcacatcacaaatttttatggtattgaataa 3649618  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 239  Q
    ||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  3649619 tttcttgttttatatgttttttgggggacgaaatgttattttggtgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggac 3649718  T
Q  240 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 339  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  3649719 aaaaattttagtttttgtcctgtcccttgccttcagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactagacaactggagttgttctgtcttg 3649818  T
Q  340 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  3649819 tccttcattttttaacaaatcaaacgca 3649846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 89 - 367
Target Start/End: Original strand, 36497148 - 36497427
Alignment:
Q  89 gtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatt-tttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatt 187  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36497148 gtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaaaaatttatagcattgagtaattttttattttatacgatttttgagggacagaatgctattttgatatt 36497247  T
Q  188 ttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtac 287  Q
    |||||||||||||| || |||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  36497248 ttagacaacttgtatgttggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgtctccagtttgtcctgtac 36497347  T
Q  288 ctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36497348 ctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttttgtcctatccttcattttttagcaaatcaaacgca 36497427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 121 - 367
Target Start/End: Original strand, 38812484 - 38812730
Alignment:
Q  121 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 220  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  38812484 tttttatgacaatgagtaattttttgttttatacgatttttgcggaacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 38812583  T
Q  221 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 320  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38812584 ttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 38812683  T
Q  321 ctagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  38812684 ctagagttgttatgtcctgtcctttattttttagcaaatgaaacgca 38812730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 40 - 352
Target Start/End: Original strand, 34929797 - 34930110
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatggcattgagta 138  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||| || ||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  34929797 ttggtttgcaaaacagtaaaaactagacaaaacagtacaaaataaaatagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaaatttttatggcattcagta 34929896  T
Q  139 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 238  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||||||||||||||||| |    
T  34929897 aatttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtatatggggcaaaaagttgtgctgtggtttggtgaggaa 34929996  T
Q  239 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 338  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  34929997 caaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttattctgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaattagagttattctgtcat 34930096  T
Q  339 gtccttcatttttt 352  Q
    |  ||| |||||||    
T  34930097 gatctttatttttt 34930110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 29 - 367
Target Start/End: Original strand, 2786836 - 2787174
Alignment:
Q  29 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||   |||||| |||| | ||||||||  ||||| |||||||     
T  2786836 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacagtacaagaccgaacaacacaacataaggcaaaacagcactagacaattttttatt 2786935  T
Q  129 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 228  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||   ||||||| || ||||||||||||  |||| ||||| |||||||    
T  2786936 gcattgaataattttttgttttataagatttttgggggacgaaatgttattttggatttttagataatttgtacgtgggacaaaaatttgtgatgtggtt 2787035  T
Q  229 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 328  Q
    | |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2787036 tagtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatccagtttgtactgtacctgaaacaattttacaaatcaaacactagacaactagagtt 2787135  T
Q  329 gttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2787136 gttatgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 2787174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 31 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 47642703 - 47642388
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 130  Q
    |||||| | |||||||||||||||  |||||  | ||||||||||| |||| |||||   |||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||| |    
T  47642703 agggtgcgtttggtttgcaaaacaacaagtatagtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacagcacaggataaatttttatgac 47642604  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  47642603 attgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 47642504  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
     ||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  47642503 ctgagggacaaaaatatcagtttttatcttgtctcttacctccagtttgtcctgtgcctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactggagttgt 47642404  T
Q  331 tctgtcatgtccttca 346  Q
    |||||| |||||||||    
T  47642403 tctgtcctgtccttca 47642388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 91 - 367
Target Start/End: Original strand, 32181197 - 32181473
Alignment:
Q  91 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 190  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  32181197 acaatacaagatagaacagcacaggacaaatttgtatgacattgaataattttatgttttatactatttttgggggacgaaatgctattttggtatttta 32181296  T
Q  191 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 290  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  32181297 gacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatctagtttgtcctgtacttg 32181396  T
Q  291 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32181397 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgtcatgtcctatccttcattttttagcaaatcaaacgca 32181473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 28 - 263
Target Start/End: Original strand, 43640969 - 43641205
Alignment:
Q  28 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-ttttta 126  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  43640969 ctaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactagacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaaattttta 43641068  T
Q  127 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43641069 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgg 43641168  T
Q  227 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtc 263  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  43641169 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtc 43641205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 40 - 367
Target Start/End: Original strand, 50186411 - 50186738
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||  | |||||| |||  | |||| || | |||||||||||||| |||||| |||    
T  50186411 ttggtttgcaaaacagtaagtacttgactgaacagtataagacaaaatagcacaacataagacataacaacataggacaaatttttatgacattgaataa 50186510  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 239  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||     
T  50186511 ttttttattttatacgatttttggggtgcgaaatgctatttttgtattttagacaacttgtatgtgggataaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 50186610  T
Q  240 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 339  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  50186611 aaaaatatgagtttttatcccgtcccttgcctctagtttgtcctgcacctaaaacaattttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctttcttg 50186710  T
Q  340 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50186711 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 50186738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 83 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 47361570 - 47361289
Alignment:
Q  83 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 181  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  47361570 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgatattgagtaattttttgttttatacgaatttttagggacaaaatgctatttt 47361471  T
Q  182 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 281  Q
    | |||||||||||||||||     |||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  47361470 ggtattttagacaacttgtt----ggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgaatttt-gtcttgtcccttgcctccggtttgtc 47361376  T
Q  282 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatt-ttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47361375 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgttctgtcctgtccttcatttttttagcaaatcaaacgca 47361289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 98 - 367
Target Start/End: Original strand, 4325731 - 4326001
Alignment:
Q  98 aaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaac 196  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4325731 aaggcagaacaacacacgacaaattttttatggcaatgagtaattttttgttttatgcgatttttgggggacaaaatgctattttggtattttagacaac 4325830  T
Q  197 ttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacag 296  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4325831 ttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgcggttttgtgagagacaaaaatatgagtttttctcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacag 4325930  T
Q  297 ttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  4325931 ttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttttgtcttgtactttattttttagcaaatcaaacgca 4326001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 92 - 373
Target Start/End: Original strand, 11055977 - 11056258
Alignment:
Q  92 caacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttag 191  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||| |    
T  11055977 caacacaaggtagaacagtacgggacaaatctttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgaggcacgaaatgttattttggtatttttg 11056076  T
Q  192 acaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga 291  Q
    ||||  ||||| |||||   ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11056077 acaatctgtacatgggacataaagttgtgttgtggtttggtaagggacaaaaatatcagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga 11056176  T
Q  292 aacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11056177 aacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttttatcctgaccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaa 11056258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 116 - 367
Target Start/End: Original strand, 41711806 - 41712057
Alignment:
Q  116 acaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaag 215  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||  |||||    
T  41711806 acaaatttttatgctattgaataattttttgttttatacgatatttgggggacgaaatgctattttggtattttagacaacctgtacgtgagacaaaaag 41711905  T
Q  216 ttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactg 315  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41711906 ttgtactgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtctttgtcctgtcccttgccttcagtttgtcctgtacctgaaacagctttacaaatcaaacactg 41712005  T
Q  316 gacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||    
T  41712006 gacaactagagttgttctgttctatcattcattttttagtaaatcaaacgca 41712057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 40 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 22318587 - 22318250
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   ||||| | ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  22318587 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaagagtacaatgcagaacagcacaacacaagacataacaacacatgacaaatttttatgatattgaataa 22318488  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 239  Q
    ||| |||||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||  ||  |||||||||| |||||||||||||||||     
T  22318487 tttcttgttttatatgatttttggatgacaaaatgttattttggtgttttagacaacttctacgtaagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 22318388  T
Q  240 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 339  Q
    |||||| | |  ||||||| |||| ||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||    
T  22318387 aaaaatttcaaattttgtcctgtctcttgccttcagtttgttctgtccctaaaacagttttacaaatcaaacactagacagctggggttgttctgtcatg 22318288  T
Q  340 tccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaagaat 377  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  22318287 tccttcattttttaacaaatcaaacgcaccctaagaat 22318250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 28 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 7555172 - 7554833
Alignment:
Q  28 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttat 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||| | |||   ||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  7555172 ctaagggtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtattggacttaacagtacaagacaaaacaacacaacacaagacagaacatcacacgacaaatttttat 7555073  T
Q  128 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 227  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | ||||    
T  7555072 ggcattgaataattttttgttttatacgatttttggaggccgaaatgctattttggatttttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttatggt 7554973  T
Q  228 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 327  Q
    || |||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |    
T  7554972 ttagtgaaggacaaaaatacgagtttttatcatgtctcttgcattcagtttgttttgtacatgaaacagttttacaaatcaaacactggacagctgaaat 7554873  T
Q  328 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  7554872 tgttctgtcatatctttcactttttagcaaatcaaacgca 7554833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 43 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 37695741 - 37695470
Alignment:
Q  43 gtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattt 142  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||||   |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37695741 gtttgcaaaacaacaagtactgtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacagcacaagacaaatttttatggcattgaataattt 37695642  T
Q  143 tttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaa 242  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  37695641 tttgttttatacgatttttgggggacgaaatgttattttgatattttagacaacctgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgatgagggacaaa 37695542  T
Q  243 aatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact 314  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||| |||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  37695541 aatatcagtttttgtcttgtctcttacctccaatttatcatgtacctgaaacagttttccaaataaaacact 37695470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 92 - 364
Target Start/End: Original strand, 39078596 - 39078868
Alignment:
Q  92 caacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttag 191  Q
    |||||||||| | |||| |||| || |||||||||||| ||||| |||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  39078596 caacacaaggcataacaacacaggataaatttttatggtattgaataatttcttattttatatgatttttgggggacaaaatgttattttggtgttttag 39078695  T
Q  192 acaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga 291  Q
    |||||| |||||| |||  |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || ||||||| | || |||||||||||||||| |||| |||||    
T  39078696 acaactcgtacgtaggacaaaaatttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatttcaggttttgtcctatctcttgcctccagtttgttctgtccctga 39078795  T
Q  292 aacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39078796 aacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcatgtccttcattttttaacaaatcaaac 39078868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 34 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 53200858 - 53200519
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaaca-----gtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 128  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||     ||| || | |||||   |||||| |||| | |||| ||||  |||||||||||||    
T  53200858 gtgtgtttggtttgcaaaagagtaagtactggatagaacatatcagtacaaaacagaacatcacaacataaggcataacaacacagaacaaatttttatg 53200759  T
Q  129 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa-gttgtgctgtggt 227  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  53200758 gtattgaataattttttgttttgtatgatttttgagggacgaaatactattttgatgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaaagttgtgctgtggt 53200659  T
Q  228 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 327  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||  |||    
T  53200658 ttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcatgttccttgcctccagtttatcctgtctctgaaacagttttgcaaatcaaacactaaacagctgaagt 53200559  T
Q  328 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    | || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53200558 tattatgtcttgtccttcattttttaacaaatcaaacgca 53200519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 176 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 2630018 - 2629827
Alignment:
Q  176 tattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccag 275  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  2630018 tattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgatttggtctggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcctttgcctctag 2629919  T
Q  276 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629918 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacacgggacaactagagttgttatgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 2629827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 44 - 373
Target Start/End: Original strand, 16320408 - 16320734
Alignment:
Q  44 tttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaatttt 143  Q
    |||||||||||| |||||||| | | | || || |||| |||||   |||| | |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16320408 tttgcaaaacagcaagtactgtataaagcaatacaagaaagaacaacacaatagaagggagaacaacacaagacaaatttttatggcattgaataatttt 16320507  T
Q  144 ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaa 243  Q
      ||||||||||| ||||| ||||  |||| |||||||  |||||||| |||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16320508 --gttttatacgagttttgggggatgaaattctatttttgtattttaggcaacctgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaa 16320605  T
Q  244 atatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtcct 343  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  16320606 atatcagtttttatcctgtcccttgcctccagtttttcctatacctgagacagttttacaaatcaaatactggacaactggagttgttctgtccagtcct 16320705  T
Q  344 tcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 373  Q
    | ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  16320706 t-attttttagcatatcaaacgcaccctaa 16320734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 164 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 50729621 - 50729418
Alignment:
Q  164 gggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtc 263  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||||||||    
T  50729621 gggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgatagacaaaaatttcagtttttgtcatgtc 50729522  T
Q  264 ccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 363  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  50729521 ccttgcctccagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcttgtccttcattttttaacaaatcaaa 50729422  T
Q  364 cgca 367  Q
    ||||    
T  50729421 cgca 50729418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 54 - 367
Target Start/End: Original strand, 26083235 - 26083547
Alignment:
Q  54 agtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttata 153  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||   |||||   ||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||    
T  26083235 agtaagtattggactgaacaatataatgcagaacaacacaacacaaggcataacagtacacgacaaatttttatggtattgaataatttcatgttttata 26083334  T
Q  154 cgatttttgagggacaaaatgctattttga-tattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtt 252  Q
     | |||||| ||||| ||||| |||||||  | |||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  26083335 tgctttttgggggacgaaatgttattttgggtgttttagacaacttgtaagtgggacaaaaagttatgctgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtt 26083434  T
Q  253 tttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatttttt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||  ||||||||||||| |    
T  26083435 tttgtcatgtcccttgcctccagtttgttctgtccctgaaacaattttacaaatcaaacactaaacaactgaagttgttctgt--tgtccttcattttct 26083532  T
Q  353 agcaaatcaaacgca 367  Q
    | ||||| |||||||    
T  26083533 aacaaattaaacgca 26083547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 147 - 363
Target Start/End: Original strand, 28115243 - 28115457
Alignment:
Q  147 ttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaata 246  Q
    ||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  28115243 ttttataagattcttg-gggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaata 28115341  T
Q  247 tgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttca 346  Q
    | | ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | | | |||||    
T  28115342 tcaatttttctcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacc-aaaacagttttacaaatcaaacactagacaacttgagttgttctgccctttgcttca 28115440  T
Q  347 ttttttagcaaatcaaa 363  Q
    |||||||||||||||||    
T  28115441 ttttttagcaaatcaaa 28115457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 35 - 257
Target Start/End: Original strand, 37931798 - 37932020
Alignment:
Q  35 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattg 134  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||    | || |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37931798 tgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacagtacaagacataataacataatacaaggcagaacagcacaagacaactttttatggcattg 37931897  T
Q  135 agtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtga 234  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||  |||||||||| |||||||||||||    
T  37931898 aataatttttcgttttatacaatttttgggggacgaaatgctattttgacattttaaacaacttgtatgtaggacaaaaagttgtgttgtggtttggtga 37931997  T
Q  235 gggataaaaatatgagtttttgt 257  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  37931998 gggacaaaaatatgagtttttgt 37932020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 32 - 208
Target Start/End: Original strand, 14296471 - 14296648
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 130  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14296471 gggtgtgtttgatttgcaaaacaataagtactggacagaacagaacaatatagaacagtacaacacaaagcagaacagcacaggacaaattttttatggc 14296570  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtggga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14296571 attgagtaattttttgttttatacgatttttgggagacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtggga 14296648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 40 - 364
Target Start/End: Original strand, 30942671 - 30942995
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||   |||||  ||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  30942671 ttggtttgtaaaacagtaagtattggacaaaacagtacaattaagaacattacaatacaaggtataatagcatatgacaaatttttatagcattgaataa 30942770  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 239  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||| || ||| |   ||| |||||| |||||||||||||| ||     
T  30942771 tttcttgttttatatgatttttgggggatgaaatgatattttggtgttttagacaacttatatgtgaggcaaaatgttgtgttgtggtttggtgagagac 30942870  T
Q  240 aaaaatatgag-tttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 338  Q
    | |||| | || ||||||||  ||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |    
T  30942871 agaaatttcagttttttgtcccgtctcttgcctccaatttgttctgtccctgaaacagttttataaatcaaacactgaataactggagttgttctgtctt 30942970  T
Q  339 gtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||    
T  30942971 atcctt-attttttaacaaatcaaac 30942995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 32 - 208
Target Start/End: Original strand, 14314719 - 14314896
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 130  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14314719 gggtgtgtttgatttgctaaacaataagtactggacagaacagaacaatatagaacagtacaacacaaagcagaacagcacaggacaaattttttatggc 14314818  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtggga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14314819 attgagtaattttttgttttatacgatttttgggagacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtggga 14314896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 6973945 - 6973789
Alignment:
Q  211 aaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaa 310  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6973945 aaaagttgtgttgtggtttggcgagggacaaaattatgagtttttgtcctgtcaattgcctcccgtttgtccagtacctgaaacagttttacaaatcaaa 6973846  T
Q  311 cactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6973845 cactggacaacaaaagttgttctatcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 6973789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 235 - 367
Target Start/End: Original strand, 14296645 - 14296777
Alignment:
Q  235 gggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctg 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  14296645 gggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctcaagtttgtcctatacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaattagagttgttatg 14296744  T
Q  335 tcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14296745 tcctgtcctttattttttagcaaatcaaacgca 14296777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 235 - 367
Target Start/End: Original strand, 14314893 - 14315025
Alignment:
Q  235 gggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctg 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  14314893 gggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctcaagtttgtcctatacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaattagagttgttatg 14314992  T
Q  335 tcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14314993 tcctgtcctttattttttagcaaatcaaacgca 14315025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 201 - 367
Target Start/End: Original strand, 42772832 - 42772998
Alignment:
Q  201 acgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttt 300  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  42772832 acgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcttgtctcttgcctcaagtttgtcatgtacctgaaacaatttt 42772931  T
Q  301 acaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||   |||||||||||    
T  42772932 acaaatcaaacacttgaaaactaaagttgttatgtcatgtcattcattttttaatgaatcaaacgca 42772998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Original strand, 23327850 - 23328020
Alignment:
Q  91 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattttttgttttatacgattttt-gagggacaaaatgctattttgatattt 188  Q
    ||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||| |||||    
T  23327850 acaacacaaagtagaacattacaggacaaattttttatggcaatgagtaattttttgttttatacgatttttggggggataaaatgttattttggtattt 23327949  T
Q  189 tagacaacttgtacgtggga-tgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtc 258  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  23327950 tagacaacttgtacgtgggacaaaaaagttgtgttgtggtttgctgagggacaaaaatatgagtttttgtc 23328020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 190 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 25978664 - 25978488
Alignment:
Q  190 agacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacct 289  Q
    |||||||||||| ||| ||  |||||||||| | ||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||| |||    
T  25978664 agacaacttgtaagtgagacaaaaagttgtgatatggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcctgttcattgcctccaatttgtcatgt-cct 25978566  T
Q  290 gaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  25978565 gaaacagttttacaaatcaaacactggataattgaagttgttttgtcatgtcctttattttttaacaaatcaaacgca 25978488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 278
Target Start/End: Original strand, 13110211 - 13110448
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | |||| || ||||||||||   | | |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||  |||    
T  13110211 ttggtttgcaaaacagtaagtagtggataaaacaatacaagatagaacaacatagcacaaggtagaacaacgcagaacaaatttttatggcattgcataa 13110310  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg-tttggtgaggga 238  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||||| || |||||||||  || ||||||| ||||| ||| |||| |||    
T  13110311 ttttt-gttttgtatgatttttgggggacgaaatgctattttggatttttagacaaattttacgtgggacaaacagttgtgttgtggttttagtgaagga 13110409  T
Q  239 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagttt 278  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13110410 caaaaatatgag-ttttgtcatgtcctttgcatccagttt 13110448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 240 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 56487285 - 56487163
Alignment:
Q  240 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 339  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||    
T  56487285 aaaaatataaatttttgtcctgtcccttgcctcaagtttgtcctatatctgaaacagttttacaaatcaaac-----acaactagagttgttctgtcatg 56487191  T
Q  340 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  56487190 tctttcattttttagcaaatcaaacgca 56487163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 276 - 367
Target Start/End: Original strand, 23328015 - 23328106
Alignment:
Q  276 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23328015 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaagtcaaacacatgacaactagagttgttctgtcatatccttcattttttagcaaatcaaacgca 23328106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 51 - 281
Target Start/End: Original strand, 7001748 - 7001976
Alignment:
Q  51 aacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgtttt 150  Q
    |||||||| ||||||||| || |||| |||| |||||   ||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  7001748 aacagtaaatactggacaaaatagtacaagacagaacatcacaacacaagacagaacaatacaggacaaatttttatggcattgaataatttttggtctt 7001847  T
Q  151 atacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgag 250  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| ||||||| || |||||||||||| ||| | | |  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  |    
T  7001848 atacgatttttggtggac-aaatgttattttggta-tttagacaacttatacatagaacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatttttg 7001945  T
Q  251 tttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 281  Q
    |||||||  |||| |||||||| ||||||||    
T  7001946 tttttgttctgtctcttgcctcgagtttgtc 7001976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 91 - 266
Target Start/End: Original strand, 43739395 - 43739570
Alignment:
Q  91 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 190  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||| ||| | |||||||| || |||||| ||||||   ||| |||||| |||||| ||||||||    
T  43739395 acaacataaggcagaacaacacatgataaatttttttggtattaaataatttttggtcttatacaattttttgtggataaaatgttattttaatatttta 43739494  T
Q  191 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccct 266  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||    
T  43739495 gacaacttgtatgtgggacaaaatgttgtgttgtggtttggtgagggacaataatttcagtttttgtcatgtccct 43739570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 175 - 312
Target Start/End: Original strand, 9947947 - 9948084
Alignment:
Q  175 ctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcca 274  Q
    |||||||| ||||||  | |||||||||||| ||  |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| |    
T  9947947 ctattttggtattttgaataacttgtacgtgagacaaaaagttgtaatgtggtttagtgagggataagaattttagtttttgtcatgtctcttgcctcaa 9948046  T
Q  275 gtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaaca 312  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9948047 gtttgtcatgttccttaaacagttttacaaatcaaaca 9948084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 91 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 45577842 - 45577619
Alignment:
Q  91 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 190  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||  || |||  | ||||||   ||||||||||  |||||| |||||||    
T  45577842 acaacataaggttgaacaacacatgacaaagttttatggtattgaataatttt--gtcttaatcaattttttgtggacaaaatgtcattttggtatttta 45577745  T
Q  191 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaat---atgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtac 287  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| | |||| | || |||   ||   ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  45577744 gacaacttgcacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttagcgaggaacaagaatttcatttttttttgtcatgtctcttgcctccagtttgtcatgtcc 45577645  T
Q  288 ctgaaacag-ttttacaaatcaaaca 312  Q
     | |||||| ||||||||||||||||    
T  45577644 ataaaacagcttttacaaatcaaaca 45577619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 44355995 - 44355734
Alignment:
Q  103 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 202  Q
    |||||| |||| | |||| |||||||  ||||| ||| |||| || || |||||||||||| ||||||||  |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  44355995 agaacaacacaggccaaacttttatgctattgaataacttttggtcttgtacgatttttgatggacaaaagactattttggtatatcatacaacttgtac 44355896  T
Q  203 gtgggatgaaaag-ttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttta 301  Q
    ||  ||  ||||  ||||| ||||||||  ||||||| |||||| | | |||||||| | || ||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||    
T  44355895 gtaagacaaaaaaattgtgttgtggtttaatgagggacaaaaatttcaatttttgtcctctctcttacctccagtttgtcctatccctaaaacag-ttta 44355797  T
Q  302 caaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||||  | |||| |||||||||||||| || |||||||    
T  44355796 caaatcaaacaccacacaactagatttgtcatatcatatccttcattttttaacatatcaaac 44355734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 217
Target Start/End: Original strand, 42772724 - 42772818
Alignment:
Q  123 tttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagtt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||  |||||||    
T  42772724 tttatggcattgagtaattttttgttttatatgatttttggaggaaaaaatgttattttggtattttagataacttatacgtgggacaaaaagtt 42772818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 20644379 - 20644107
Alignment:
Q  105 aacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgt 204  Q
    |||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||  |||||||  ||| ||||| |||||||||      
T  20644379 aacaacacatgacacacttttatcgcattgaataatttttgattttatacgatttttggtgtacaaaaatctatttttgtatcttagataacttgtacac 20644280  T
Q  205 gggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaa 304  Q
    | ||  | ||| || | |||||||| ||||| || |||||| |   |||||| ||||| | ||||||| |||||    ||| || |||| |||||| |||    
T  20644279 gagacaagaagctgggatgtggtttagtgagagacaaaaatttatatttttgacatgttcattgcctctagtttagattgtcccagaaatagttttgcaa 20644180  T
Q  305 atcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaagaat 377  Q
    ||||||||| | | ||||  | || | |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  20644179 atcaaacaccgtataactgaaattatcctgtcatgtccttcattttttaacagatcaaacgcaccctaagaat 20644107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 251 - 367
Target Start/End: Original strand, 44640417 - 44640532
Alignment:
Q  251 tttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatttt 350  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||||| | | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||| ||||||||    
T  44640417 tttttgtcttgtctcttgcctctagtttgtcattttccataaacagttttacaaatcaaacactgtacaactgaagttgttctgtc-tgtcattcatttt 44640515  T
Q  351 ttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||| | ||||||||||    
T  44640516 ttagtagatcaaacgca 44640532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 91 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 43189914 - 43189636
Alignment:
Q  91 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 190  Q
    |||| |||||| ||| || ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||   |||||| | | ||||||  ||||| |    
T  43189914 acaatacaaggaagagcaacacatgataaacttttatggtattgaataattttttgtcttatacgatatttagtggacaataagttatttttgtattt-a 43189816  T
Q  191 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 290  Q
    || |||||| |  |||||  |||| |||||  ||||||| |||||  | |||||  |  ||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |  |      
T  43189815 gataacttgcatttgggacaaaaacttgtgtcgtggtttagtgagacacaaaaaattatgtttttgtcttgtcccttgccttcagtttgtcatatttcaa 43189716  T
Q  291 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttca-ttttttagcaaatcaaacgcaac 369  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||| | || |||| |||||||||| |||||| |||||    
T  43189715 aaacaattttacaaatcaaacactgtacaactaaaattgttatgtcttatctttcatttttttagcagatcaaatgcaac 43189636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 294 - 364
Target Start/End: Original strand, 13110443 - 13110513
Alignment:
Q  294 cagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13110443 cagttttacaaatcaaacactggacaactgaaatttttctgtcatgtctttcattttttagcaaatcaaac 13110513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 53343638 - 53343560
Alignment:
Q  83 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttt 160  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53343638 agaacagtacaacacaatgcagaacaacacatgacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttt 53343560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 364
Target Start/End: Original strand, 2114191 - 2114243
Alignment:
Q  312 actggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2114191 actggacaactggagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 2114243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 56487374 - 56487292
Alignment:
Q  121 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacg 203  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  56487374 tttttatgtcattgattgattttttgttttatatgatttttggaggacaaaatgttattttggtattttaaacaacttgtacg 56487292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 311
Target Start/End: Original strand, 3579142 - 3579279
Alignment:
Q  175 ctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataa-aaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcc 273  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | || |||  |||||||||| | |||||| |||| ||| || |||| |   ||||||||||||||||||||||     
T  3579142 ctattttggtattttagacaacttgaatgttggacaaaaagttgtgatatggtttagtgatggaaaataaatttacttttttgtcatgtcccttgcctca 3579241  T
Q  274 agtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaac 311  Q
    |||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||    
T  3579242 agtttgtcctgcccctaaaacagatttacgaatcaaac 3579279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 202
Target Start/End: Original strand, 985216 - 985327
Alignment:
Q  90 tacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttt 189  Q
    |||||||||||  | |||| || | |||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||| ||||||||  ||||||||  |||||||||||||||    
T  985216 tacaacacaagacaaaacatcataagacaaatttttatggt-ttgaataatttttggtcttatatgatttttgctggacaaaagactattttgatatttt 985314  T
Q  190 agacaacttgtac 202  Q
    | |||||||||||    
T  985315 aaacaacttgtac 985327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 367
Target Start/End: Original strand, 52673838 - 52674024
Alignment:
Q  184 tattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttg---t 280  Q
    ||||||||| ||||  |||||| ||  |||| ||||| || ||||| |||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||   |    
T  52673838 tattttagataactcatacgtgagacaaaaaattgtgttgaggtttagtgagggacaaaaatttctgtttttgtcatgtcccttgactccagtttgtgat 52673937  T
Q  281 cctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||  | ||  ||||||||||| ||| || | |||  |||||| ||||| |  | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  52673938 cccttcccaaaaacagttttataaaccagatactatacaactggagttatcttatcatgtccttcgttttttagcagatcaaacgca 52674024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 238
Target Start/End: Original strand, 52755417 - 52755601
Alignment:
Q  54 agtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttata 153  Q
    |||||||||| || ||||| ||| ||||||| |  || ||| ||||||| ||||| | |  |||||||| ||||||  ||||  ||||||||||||||||    
T  52755417 agtaagtacttgatagaaccgtaaaagataggatagtgcaaaacaaggttgaacaacgctggacaaattgttatggtgttgaacaattttttgttttata 52755516  T
Q  154 cgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 238  Q
    | || ||||| ||| |||||| ||||||| || |||| ||| ||||| | ||| |  |||||||||  |||| ||||||||||||    
T  52755517 caatgtttgatggaaaaaatgttattttgctaatttacacagcttgtgcttggaacaaaaagttgttttgtgctttggtgaggga 52755601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 31446027 - 31445768
Alignment:
Q  91 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 190  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||  | || ||||||||||   | |||||| | ||||||  |||||||    
T  31446027 acaacacaaagtagaaaaacacatgacaaacttttatggtattggataattttta-tcttgtacgattttttgtgaacaaaaagttatttttgtatttta 31445929  T
Q  191 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 290  Q
    || || ||||||||| |   |||||||||| ||| |||| ||| |||| |||  | |  ||||| ||  ||||| |||||||| ||||||| | |  |      
T  31445928 gataatttgtacgtgtggcaaaaagttgtgatgttgtttagtg-gggacaaaggtttatgtttt-gtgttgtcctttgcctcccgtttgtcatatctcaa 31445831  T
Q  291 aaacagttttacaaatcaaacac--tggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttt 351  Q
    |||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  31445830 aaacagttttacaaatcaaagacattgtacaactagagttgtcatgtcatgtccttcattttt 31445768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 363
Target Start/End: Original strand, 43739557 - 43739644
Alignment:
Q  276 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 363  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||  ||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43739557 tttgtcatgtccctcaaacagttttacaaatcaaacattttacaactgaagttgtcttatcacgtccttcattttttagcaaatcaaa 43739644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 32181161 - 32181213
Alignment:
Q  35 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaac 87  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  32181161 tgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggatagaacaatacaagatagaac 32181213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 92
Target Start/End: Original strand, 38520438 - 38520498
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtac 92  Q
    ||||||| |||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38520438 gggtgtgtttggtttgcaaaacaactagtattggacagaacagtataagatagaacagtac 38520498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 50729729 - 50729641
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 128  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||   ||||| | ||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||    
T  50729729 ttggtttgcaaaatagtaaatactggacggcacagtataatgcagaacagcacaacacaaggcataacagcacagaacaaatttttatg 50729641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 2725329 - 2725283
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtata 78  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2725329 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacaatata 2725283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 10184941 - 10184879
Alignment:
Q  91 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttata 153  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||||    
T  10184941 acaatacaaggtggaacagcacatgacaaacttttatggtattgaacaattttttgtcttata 10184879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 238
Target Start/End: Original strand, 38520518 - 38520580
Alignment:
Q  176 tattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 238  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  38520518 tattttggtattttatacaacttgtgcgtgggacaaaaaattatgctgtggtttggtgaggga 38520580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 46680700 - 46680658
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 76  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46680700 gtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtactggacagaacagta 46680658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 33553036 - 33552995
Alignment:
Q  35 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 76  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33553036 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagta 33552995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 202
Target Start/End: Original strand, 40792409 - 40792462
Alignment:
Q  149 ttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 202  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  40792409 ttatacgatttttgatggacaaaaagctatttttgtattttagataacttgtac 40792462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 144
Target Start/End: Original strand, 52673762 - 52673815
Alignment:
Q  91 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttt 144  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  52673762 acaacacaaggcagaactgcacatgacaaacttttatggtattgaataattttt 52673815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 124
Target Start/End: Original strand, 32081080 - 32081124
Alignment:
Q  80 gatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt 124  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32081080 gatagaacagtacaacataaggtagaacagcacaagacaaatttt 32081124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 367
Target Start/End: Original strand, 38520597 - 38520637
Alignment:
Q  328 tgttctgtcatgtccttcatt-ttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38520597 tgttctgtcatgtccttcattcttttagcaaatcaaacgca 38520637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 217
Target Start/End: Original strand, 41720779 - 41720903
Alignment:
Q  93 aacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttaga 192  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||  ||||  |||||||| || |||||| ||||||   ||||||||   ||||||  |||||||||    
T  41720779 aacacaaagtagaacaacacatgacaaactttaatgatattgtataatttttagtcttatactattttttgtggacaaaaaattatttttgtattttaga 41720878  T
Q  193 caacttgtacgtgggatgaaaagtt 217  Q
     || ||||||||||||  |||||||    
T  41720879 taatttgtacgtgggacaaaaagtt 41720903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 44365992 - 44365940
Alignment:
Q  301 acaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatttttta 353  Q
    |||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44365992 acaaatcagacattgtacaacttgagttgttctgtcatgtacttcatttttta 44365940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 50728088 - 50728048
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacag 74  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50728088 gtgtgtttggtttgcaaaacaataagtactggacagaacag 50728048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 50736102 - 50736062
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacag 74  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50736102 gtgtgtttggtttgcaaaacaataagtactggacagaacag 50736062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 68
Target Start/End: Original strand, 23327803 - 23327842
Alignment:
Q  29 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggaca 68  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23327803 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtaccggaca 23327842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 161
Target Start/End: Original strand, 32858276 - 32858327
Alignment:
Q  110 cacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgattttt 161  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  32858276 cacatgccaaatttttatagtattgaataattttttgttttatacaattttt 32858327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 48 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 39433557 - 39433510
Alignment:
Q  48 caaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaac 95  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  39433557 caaaatagtaagtactggacagaacagtgtaagataggacagtacaac 39433510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 234
Target Start/End: Original strand, 43893535 - 43893654
Alignment:
Q  115 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 214  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |  ||||||||||||||  |||||||  ||||||||  |||||||  ||||||||| ||| || ||||| ||  ||||    
T  43893535 gacaactttttatggtattgattttttttttgttttatataatttttggtggacaaaaaactatttttgtattttagataacctgcacgtgagacaaaaa 43893634  T
Q  215 gttgtgctgtggtttggtga 234  Q
     ||||| |||||||| ||||    
T  43893635 attgtgttgtggtttagtga 43893654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 47669297 - 47669219
Alignment:
Q  50 aaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||  ||||||| |||| | |||||| || |||||| |||||||    
T  47669297 aaacagtaagtattggacagaacaatacaagatggaacaatacaacataaggcaaaacagcgcacgacaaacttttatg 47669219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 312
Target Start/End: Original strand, 51518482 - 51518528
Alignment:
Q  266 ttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaaca 312  Q
    |||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  51518482 ttgcttccagcttgtcctgtatcagaaacagttttacaaatcaaaca 51518528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 174
Target Start/End: Original strand, 36679926 - 36680009
Alignment:
Q  90 tacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatg 174  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||| |  ||||||||| |||||  ||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  36679926 tacaacataaggtagaacaatacatga-atttttttatggtattgatcaatgttttgttttataagatgtttgatggacaaaatg 36680009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 70)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 27103826 - 27104172
Alignment:
Q  28 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-ta 126  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  27103826 ctaagggtgtgtttgatttgcaaaacaacaagtactggacagaacagtacaagatagaacattacaacacaaggcagaacagcacatgacaaatttttta 27103925  T
Q  127 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  27103926 tggcattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgcagtgg 27104025  T
Q  227 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 326  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  27104026 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattgaacaactagag 27104125  T
Q  327 ttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 373  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27104126 ttgttctgttctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaa 27104172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Original strand, 45446325 - 45446662
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  45446325 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgg 45446424  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  45446425 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 45446524  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45446525 ggtgaggaacaaaaatatgagtttttatcctgtcccttgcctccagtttgtcgtgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtta 45446624  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45446625 ttttgtcttatccttcattttttagcaaatcaaacgca 45446662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Original strand, 34062998 - 34063335
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 129  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| |||||    
T  34062998 agggtgtgtttggtttgcaaaaccgcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggcagcacaacacatgacaaattttttatgg 34063097  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  34063098 cattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 34063197  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34063198 ggcgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaagagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 34063297  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34063298 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 34063335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Original strand, 41709647 - 41709984
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  41709647 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacaatacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaatttttttatgg 41709746  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  41709747 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagataacttgtacgttggacaaaaagttgtgctgtggttt 41709846  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41709847 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcatttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 41709946  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41709947 ttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 41709984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 34 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 32020233 - 32019899
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 132  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32020233 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcat 32020134  T
Q  133 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  32020133 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgctgtggtttggt 32020034  T
Q  233 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32020033 gagggataaaaatatgagtttttgtcctaccccttgcttccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttc 32019934  T
Q  333 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32019933 tgtcctgtccttcaatttttagcaaatcaaacgca 32019899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 32 - 367
Target Start/End: Original strand, 34101379 - 34101715
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 130  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  34101379 gggtgtgtttggtttgcaaaaaagtaagtactggacaaaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacatcacaggacaaattttttatggc 34101478  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||||||||    
T  34101479 gttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtggaaaaaaaagttatgttgtggtttg 34101578  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34101579 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtgttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 34101678  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34101679 tctgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 34101715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 31 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 31513818 - 31513476
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31513818 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtattggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatgg 31513719  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||    
T  31513718 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacctaggacaaaaagttgtgctgtggttt 31513619  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31513618 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatctacctgaaacaattttacaaatcaaacactggataactagagttg 31513519  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31513518 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 31513476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8673290 - 8672953
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatgg 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||    
T  8673290 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcaaaacagcacaggacaaaatttttatgg 8673191  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  8673190 cattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 8673091  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8673090 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactatagttg 8672991  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8672990 ttttgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 8672953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 32 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 3251890 - 3251549
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 130  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  3251890 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtatcggacagaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcataggacaaattttttatggc 3251791  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  3251790 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtaggataaaaagttgtgatgtggtttg 3251691  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3251690 gtgagggacaaaaatataagtttttgttctgtcgcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttataaatcaaacactggacaactagagttgt 3251591  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 372  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3251590 tctgtcttatcctttattttttagcaaatcaaacgcacccta 3251549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 29 - 375
Target Start/End: Original strand, 6386444 - 6386791
Alignment:
Q  29 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tat 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||    
T  6386444 taagggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaaaacaaattttttat 6386543  T
Q  128 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||    
T  6386544 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggt 6386643  T
Q  228 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 327  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  6386644 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctatcttttacctccagtttgtcctatacctgaaacagttttataaatcaaacactggacaactacagt 6386743  T
Q  328 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaaga 375  Q
    |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6386744 tgttatgttttgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaaga 6386791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 32 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 29672557 - 29672220
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 130  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||  |||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  29672557 gggtgtgtttggtttgtaaaacagtaagaactggacagaacaatacaagatagaacagtgcaacacaagacagaacaacacaggacaaatttttcatggc 29672458  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  29672457 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagataacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 29672358  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29672357 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacgaatcaaacactggacaactagagttgt 29672258  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttt-tagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29672257 tctgtcttgtccttcatttttaaagcaaatcaaacgca 29672220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 31 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 29563461 - 29563158
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  29563461 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtattgaacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggtagaacaacacatgacaaattttttatgg 29563362  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  29563361 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 29563262  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29563261 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctcgagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggataactagagttg 29563162  T
Q  330 ttct 333  Q
    ||||    
T  29563161 ttct 29563158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 35 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 7395045 - 7394706
Alignment:
Q  35 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcatt 133  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||| ||||| |||||| |    
T  7395045 tgtgtttggtttgcaaaacagtaggtacttgacagaacaatataagatagaacagtacaacacaagacagaacagcataggacaagttttttatggcact 7394946  T
Q  134 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 233  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||||||    
T  7394945 gagtaattttttgttttatgcgatttttgaaggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttatggtttggtg 7394846  T
Q  234 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7394845 agggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctctagtttgtcatgtacctgaaacagttttgtaaatcaaacactggacaactagagttgttct 7394746  T
Q  334 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7394745 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaa 7394706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Original strand, 25478118 - 25478450
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 130  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||    || ||||||||||    
T  25478118 agggtgtgtttggtttgtaaaacagtaagtacttgacaaaacagtataagatagaacaatacaacacaaggcagaacaggaca----aattttttatggc 25478213  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||    
T  25478214 attgagtaattttttgttttatacgattttttagggacaaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgctgtgatttg 25478313  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
     ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25478314 atgagggacaaaaatatgagtttttttcctgtcccttgtctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaactagagttgt 25478413  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25478414 tatgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 25478450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 83 - 367
Target Start/End: Original strand, 4052404 - 4052687
Alignment:
Q  83 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 181  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4052404 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaatttt--gttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 4052501  T
Q  182 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 281  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  4052502 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtc 4052601  T
Q  282 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4052602 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtcctttattttttagcaaatcaaacgca 4052687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 57 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 5969073 - 5968762
Alignment:
Q  57 aagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacg 155  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5969073 aagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacataggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacg 5968974  T
Q  156 atttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagttttt 255  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  5968973 atttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaatttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggtttggtgaaggacaaaaatatgagttttt 5968874  T
Q  256 gtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagc 355  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  5968873 gtcctgtcccttgcctctagtttgtcatgtaccttaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttttgtcctatccttcattttttagc 5968774  T
Q  356 aaatcaaacgca 367  Q
    |||| |||||||    
T  5968773 aaattaaacgca 5968762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 34 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13407167 - 13406834
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 132  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||    
T  13407167 gtgtgtttggtttacaaaacagtaagtactggacagaacagtacaatatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatagcat 13407068  T
Q  133 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||||||||    
T  13407067 tgagtaattttttgttttatacgatttttggggcacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaaattatgctgtggtttggt 13406968  T
Q  233 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 332  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  13406967 gagggacaaaaatatgagtttttgttctgttccttgcctccagtttgtcatatacctgaaacagttttacaaattaaacactagacaactagagttgttc 13406868  T
Q  333 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgc 366  Q
    || | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  13406867 tgccctatccttcattttttagcaaatcaaacgc 13406834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 32 - 367
Target Start/End: Original strand, 31731935 - 31732257
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatggc 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  31731935 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaaaagtataagatagaacagtacaacacaagacagaatagcacatgacaaaatttttatggc 31732034  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  31732035 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgagacaaaaagttgtactgtggtttg 31732134  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||              |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31732135 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcaagtttgtc--------------gttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgt 31732220  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31732221 tctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 31732257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 83 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 30543205 - 30542915
Alignment:
Q  83 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 181  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  30543205 agaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaatattttatggcattgagtaattttatgttttatacgatttttgggggacaaaatgttatttt 30543106  T
Q  182 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 281  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  30543105 ggtattttagacaacttgtacgtgggacgaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccattgcctccagtttgtc 30543006  T
Q  282 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 372  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30543005 atgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgttatgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 30542915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 37618626 - 37618290
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 130  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || | | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37618626 agggtgcgtttggtttgcaaaacggtaagtactggacataacagtacaaaacataacagcacaacacaaggcagaacagcacatgacaaatgtttatggc 37618527  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||    
T  37618526 attgaataattttttgttttatacaatttttgggggacgaaatgctattttggtatttaaaacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttg 37618427  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  37618426 gtgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtcctttgcctccaatttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacaccggacaactggagttgt 37618327  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37618326 tctgtcatgtccttcattttctagcaaatcaaacgca 37618290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 83 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 37664466 - 37664180
Alignment:
Q  83 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 181  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  37664466 agaacagtacaacacaatgcagaacagcacaagacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatatgatttttgagcgacaaaatgctatttt 37664367  T
Q  182 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 281  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  37664366 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtc 37664267  T
Q  282 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatt-ttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37664266 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttattctgtcctgtccttcatttttttagcaaatcaaacgca 37664180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 40 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 12753550 - 12753226
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcattgagta 138  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||  |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12753550 ttggtttgcaaaacag-aagtattggacagaacagtacaagatagaacaatacaacacaagacagaacaacacatgacaaaaattttatggcattgagta 12753452  T
Q  139 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 238  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  12753451 atttgttgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaggaa 12753352  T
Q  239 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 338  Q
     ||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  12753351 caaaaatatgagtttttgtcttgtcatttgccttcagtttgtcctgtacctgaaacagtcttacaaatcaaacactggacaactagagttgttttgtcct 12753252  T
Q  339 gtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  12753251 gtccttcattttttagcaaatcaaac 12753226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 91 - 367
Target Start/End: Original strand, 10466995 - 10467271
Alignment:
Q  91 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 190  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10466995 acaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacatagaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatatttta 10467094  T
Q  191 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 290  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||     
T  10467095 gacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgctgaggaacaaaaatatcagtttttgtcttgtctcttgcctccagtttgtcctgtaccta 10467194  T
Q  291 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10467195 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 10467271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 31 - 365
Target Start/End: Original strand, 22999128 - 22999463
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 130  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||   ||| ||||||| |||| ||||| | |||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| |    
T  22999128 agggtgcgtttggtttgcaaaacagcaagtacaatacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacagaacaaatttttatgac 22999227  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa-gttgtgctgtggttt 229  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||    
T  22999228 attgaataattttttgttttatacgatttttggaggacaaaatgctattttgatattttagacaagttgtacgtgggacaaaaaagttttgctatggttt 22999327  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    | ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  22999328 gctgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaaccggagttg 22999427  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22999428 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 22999463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 31 - 364
Target Start/End: Original strand, 40388911 - 40389244
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 130  Q
    |||||| | |||||||||||||  |||||||||||||| || |||| |||| | ||| | ||||||||||| |||||| |||| || ||| |||||||||    
T  40388911 agggtgcgtttggtttgcaaaatggtaagtactggacataagagtacaagacataacagcacaacacaaggcagaacaacacaggaaaaaattttatggc 40389010  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||| | |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  40389011 attgaataattttttattttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggcatttaaaacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 40389110  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40389111 gtgagagataaaaatatcagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgt 40389210  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40389211 tctgtcatgtccttcattttctagcaaatcaaac 40389244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 71 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 7591641 - 7591345
Alignment:
Q  71 acagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaa 170  Q
    |||||| |||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7591641 acagtacaagaaagaacagtacaatacaagggagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaa 7591542  T
Q  171 aatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  7591541 aatgctattttgatattttagacaacttatacgtgtgacaaaaagttgtgttgtggtttgctgaggcacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcc 7591442  T
Q  271 tccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7591441 tccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaaacaaacgca 7591345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 40 - 365
Target Start/End: Original strand, 15001346 - 15001671
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagta 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||| |||||| |||| || |||||||| |||| ||||| ||    
T  15001346 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagacagaacagcacaacacaaggcagaacaacacaagataaattttttatggtattgaata 15001445  T
Q  139 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 238  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  15001446 attttctgttttatatgatttttgggggacaaa-tgctattttggtattttagataacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaggga 15001544  T
Q  239 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 338  Q
     |||||| | |||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  15001545 caaaaatttcagtttttgttctgtctattgcctccagtttgtcctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcct 15001644  T
Q  339 gtccttcattttttagcaaatcaaacg 365  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15001645 gtccttcattttttatcaaatcaaacg 15001671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 40 - 372
Target Start/End: Original strand, 39642763 - 39643095
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| |||| |||||   ||||   |||  |||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  39642763 ttggtttgcaaaatagtaagtattgtacagaatagtacaagaaagaacaacacaatgtaagagagaacatcacaagacaaatttttatgacattgaataa 39642862  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 239  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||     
T  39642863 ttttttgttttatacaatttttgggggatgaaatgctattttggtattttagacaacctgtacgtgggacagaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 39642962  T
Q  240 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 339  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  39642963 aaaaatatcagtttttatcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttaaaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcatg 39643062  T
Q  340 tccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39643063 tccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 39643095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 34 - 367
Target Start/End: Original strand, 17805563 - 17805898
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||     
T  17805563 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacttgacaaaacagtacaagacagaataacacaacacaaggtagaacaacacaggacaaattttttagggcaa 17805662  T
Q  133 tgagtaattttttgttttatacgatttttgag-ggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 231  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||| ||||||||    
T  17805663 cgagtaattttttgttttatacgatttttgggaggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaagagttgtgctttggtttgg 17805762  T
Q  232 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 331  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  17805763 tgaggaacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctctagtttgtcctgtacttgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaattagagttggt 17805862  T
Q  332 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  17805863 ctgttatgtccttcatttttaaacaaattaaacgca 17805898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 91 - 372
Target Start/End: Original strand, 41548549 - 41548830
Alignment:
Q  91 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 190  Q
    |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  41548549 acaatacaagggagaacatcacaggacaaatttttatgacattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttgatatttta 41548648  T
Q  191 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 290  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||||| | |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  41548649 gacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtctgctgaggtacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcatgtatctg 41548748  T
Q  291 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  41548749 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaattaaacgcacccta 41548830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14005268 - 14004943
Alignment:
Q  27 tctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt- 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||               |||||||||  |||||| || | |||||||||||     
T  14005268 tctaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagta---------------caacacaagacagaacaacataggacaaatttttt 14005184  T
Q  126 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtg 225  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  14005183 atgacattgagtaattttttgttttatacaattttttatggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtg 14005084  T
Q  226 gtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 325  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  14005083 gtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctcaaacagttttacaaatcaaatactggacaactaaa 14004984  T
Q  326 gttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgc 366  Q
     ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  14004983 attgttatgtcctatccttcattttttagcaaatcaaacgc 14004943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 374
Target Start/End: Original strand, 35225531 - 35225876
Alignment:
Q  29 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 128  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||   ||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||    
T  35225531 taaggatgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaatagtacaagacaggacaacacaacacaagacagaacaacacaagacaaatttttatg 35225630  T
Q  129 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 228  Q
    | ||||| ||||||  ||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| |||||||    
T  35225631 gtattgaataatttcctgttttatatgatttttgggtgacgaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacttgtgacaaaaagttgtgatgtggtt 35225730  T
Q  229 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 328  Q
    ||| |||||| ||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  35225731 tggcgagggacaaaaattgcagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtccctgaaactgttttacaaaccaaacactggacaactggagtt 35225830  T
Q  329 gttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 374  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  35225831 gttctgtcctatccttcattttttatcaaatcaaacgcaccctaag 35225876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 34 - 367
Target Start/End: Original strand, 45113929 - 45114262
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcatt 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | | ||||||||||| | |||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  45113929 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacagtacaagatagagcagcacaacacaaggcataacaacacatgataaatttgtatgacatt 45114028  T
Q  134 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 233  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||| |||||||||||||    
T  45114029 gaataattttatgttttatacgatttttggaggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacctatgacaaaaagttgtactgtggtttggtg 45114128  T
Q  234 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||  |    
T  45114129 agggacaaaaatatgagtttttgtcctctcccttgcatctcgtttgttctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaattgaagttgtcat 45114228  T
Q  334 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45114229 gtcctgtccttcatgttttagcaaatcaaacgca 45114262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Original strand, 30501016 - 30501352
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 130  Q
    |||||| | |||||||||||||||  || |||| |||| || |||| |||| |||||   |||||| |||  | |||| || | |||||||||||||| |    
T  30501016 agggtgcgtttggtttgcaaaacaacaaatacttgacataatagtacaagacagaacaacacaacataagacaaaacaccataggacaaatttttatgac 30501115  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  30501116 attgaataattttttgttttatacgatttttggggctcgaaatgttatttttgtattttaggcaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 30501215  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  30501216 gtgagggacaaaaatatgtgtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgggcaactgaagttgt 30501315  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30501316 tctgccatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 30501352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 32 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 32303819 - 32303592
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  32303819 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacaaaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggc 32303720  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  32303719 attgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 32303620  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtc 258  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  32303619 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtc 32303592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 91 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 29611229 - 29610953
Alignment:
Q  91 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 190  Q
    ||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||| | |||||    
T  29611229 acaacacaaggcataacaacacaggacaaatttttatggtattgaataatttcttgttttatatgctttttgggggacgaaatgctattttggtgtttta 29611130  T
Q  191 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 290  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  29611129 gacaacttttacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggcgagggacaaaaatttcagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgttctgtccctg 29611030  T
Q  291 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29611029 aaacagttttacaaatcaaacattggacaactgaagttgttctgtcatgtccttcattttttaacaaatcaaacgca 29610953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 40 - 372
Target Start/End: Original strand, 37474599 - 37474912
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    |||||||||||||||| |||||| | | | | ||||| |||| ||||| | |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  37474599 ttggtttgcaaaacagcaagtacagcatatagcagtacaagaaagaacagcacaatacaagggataacagcacatgacaaatttttatgacattgaataa 37474698  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 239  Q
    |||||| |||||||||||||||| || | |||| |||| |||| |||||||||||||||||||                   ||||||||| |||||||     
T  37474699 ttttttattttatacgatttttggggaaaaaaacgctagtttggtattttagacaacttgtac-------------------tgtggtttgctgagggac 37474779  T
Q  240 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 339  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  37474780 aaaaatataagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcata 37474879  T
Q  340 tccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37474880 tccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 37474912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 167 - 367
Target Start/End: Original strand, 37861866 - 37862065
Alignment:
Q  167 acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccct 266  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  37861866 acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtaggacaaatagttatgatgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcctgtcact 37861965  T
Q  267 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgc 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37861966 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttactaatcaaacattgaacaactagagttg-tatgttctgtccttcattttttagcaaatcaaacgc 37862064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 364
Target Start/End: Original strand, 17520468 - 17520798
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtata-----agatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttta 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |     ||| ||||    ||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||    
T  17520468 gggtgtggttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagaacagaagaagacagaataacacaacacaagacagaacagtacaggacaaattttta 17520567  T
Q  127 tggcattgagtaatttttt--gttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgt 224  Q
    | || |||  | |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        ||||||||||| ||||||  |||||||||| |||    
T  17520568 tagcgttggattattttttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttg--------gacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgt 17520659  T
Q  225 ggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 324  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||| || || |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  17520660 ggtttggtgagggacaaaa-tataagtttttgccctgtcccttgcctccattttatcatgcacctaaaacacttttacaaatcaaacaccggacaactgg 17520758  T
Q  325 agttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17520759 agttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaattaaac 17520798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 98 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16485976 - 16485707
Alignment:
Q  98 aaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaact 197  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  16485976 aaggcagaacagcacaaaacaaatttttatggtattgaataattttctgtattatatgatttttgggtgacgaaatgctatttttgtattttagaaaact 16485877  T
Q  198 tgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagt 297  Q
    | ||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   |||||||||  ||||| |||||| || |||||| ||| ||||||||  |    
T  16485876 tatacgtaggacaaaaagttgtgctgtggtttggcgagggacaaaaattgcagtttttgttctgtcctttgccttcaatttgtcatgtccctgaaactat 16485777  T
Q  298 tttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  16485776 tttacaaatcaaacactggacaactgaaattgttctatcatgtccttcattctttatcaaatcaaacgca 16485707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 113 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 10656838 - 10656587
Alignment:
Q  113 atgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaa 212  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||    
T  10656838 atgacaaatttttatgttattgaataattttttcttttatacgattttttgtggacaaattgttattttgatattttagacaatttgtacgtgagacaaa 10656739  T
Q  213 aagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaaca 312  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||| |||||  | |||||||||| ||||  ||||||| |||||||| |||  || ||| || ||||||||||||| |    
T  10656738 aagttgtgttgtggttttgtgaaggacaaaaaattcagtttttgtcctgtcttttgcctctagtttgtcatgtctctaaaaaagatttacaaatcaaata 10656639  T
Q  313 ctggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    |||||||| |   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10656638 ctggacaattgaggttgttctgacatgtccttcattttttagcaaatcaaac 10656587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 45 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 16595369 - 16595063
Alignment:
Q  45 ttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttt 144  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   | ||||||||| |||| || | ||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  16595369 ttgctaaacagtatgtactggacagaacagtataagacagaacaacaaaacacaaggcagaaaagtaaatggcaaacttttttggtattgaataattttt 16595270  T
Q  145 tgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaa 244  Q
     || ||||||||||||||  | |||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||| || | |||||| ||||     
T  16595269 ggtcttatacgatttttggtgaacaaaaagctatttttgtattttagataacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggattagcgagggacaaaac 16595170  T
Q  245 tatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtcctt 344  Q
    |    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| || ||||||  ||||||||||||||| |  |||||| | ||||| |||||||||||||    
T  16595169 ttcatgtttttgtcctgtcccttgcctacagtttgttctgtcccagaaaca-atttacaaatcaaacaatatacaactggtgttgtcctgtcatgtcctt 16595071  T
Q  345 catttttt 352  Q
    ||||||||    
T  16595070 catttttt 16595063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 152 - 367
Target Start/End: Original strand, 21272676 - 21272874
Alignment:
Q  152 tacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagt 251  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21272676 tacgatttttaaaggacaaaatgctattttagtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagt 21272775  T
Q  252 ttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttt 351  Q
    ||||||| ||||                  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||| ||    
T  21272776 ttttgtcctgtc-----------------gctgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgttctctcgtgtcattcattctt 21272858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 118 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 10320424 - 10320180
Alignment:
Q  118 aaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagtt 217  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  10320424 aaatttttatggtattgaataatttttggttttatacgattgttgttagacaaaatgttattttgatattttagacaacttgtacgtgtggtaaaaagtt 10320325  T
Q  218 gtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgga 317  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| |  |||||| |   |||||||| ||| |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| |  |    
T  10320324 gtgttgtggtttggtgagggataagaatttctgttttt-tttcgtcccttg-ctcaagtttgtcatgtccctaaaacggttttacaaatcaaacattata 10320227  T
Q  318 caactagagttgttctgtcatgtccttca-ttttttagcaaatcaaac 364  Q
    ||||| || ||||| || || |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  10320226 caacttgaattgttttg-cacggtcttcatttttttagcaaatcaaac 10320180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 49 - 367
Target Start/End: Original strand, 6460152 - 6460465
Alignment:
Q  49 aaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgtt 148  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| | || | ||| | ||| |||| || |||  |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||  ||     
T  6460152 aaaacagtaagtacttgacaaaacagtacaggacaaaacagcacagcacagggcagagtagcacaggacaaatttttatggtattgaataatttt--gtc 6460249  T
Q  149 ttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtggga-tgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatat 247  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||   |||||||||| |||||||||||||| || |||         
T  6460250 ttatacgattttttatggacaaaatgttattttggtattttagacaacttatacgtgggacaaaaaagttgtgatgtggtttggtgagagacaaa----- 6460344  T
Q  248 gagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttac-aaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttca 346  Q
       |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  || |||||| ||||| |||||||||| || |||||| | ||| |  |||| | |||||||    
T  6460345 ---tttttgtcttgtcccttgcctccagattgtcatgtctctaaaacagctttacaaaatcaaacaatgtacaacttgggttatcatgtcttatccttca 6460441  T
Q  347 ---ttttttagcaaatcaaacgca 367  Q
       |||||||||||||||||||||    
T  6460442 tttttttttagcaaatcaaacgca 6460465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 276 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 32303597 - 32303501
Alignment:
Q  276 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  32303597 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactaaagttgttctatcatttccttcgttttttagcaaatcaaacgcacccta 32303501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 373
Target Start/End: Original strand, 38047481 - 38047559
Alignment:
Q  295 agttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38047481 agttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaa 38047559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 73 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27109735 - 27109532
Alignment:
Q  73 agtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaatttttt--gttttatacgatttttgagggacaa 170  Q
    |||| ||||||||||   |||| |||| | ||||| | ||| |||||||||| || ||||||| |||||||||  |||||||| |||||||| ||||| |    
T  27109735 agtacaagatagaacaacacaatacaatgcagaacggtacaggacaaattttaatagcattgaataattttttttgttttatatgatttttgggggacga 27109636  T
Q  171 aatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcc 270  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  27109635 aatgttattttggtattttaaacaatttgtacgcgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtaaggaacaaaaatatctgattttatcatgtcccttgcc 27109536  T
Q  271 tcca 274  Q
    ||||    
T  27109535 tcca 27109532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 175 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22756501 - 22756307
Alignment:
Q  175 ctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcca 274  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||| |||||| |  |||||||||||||| |  ||||||||| |||| |||||||| |    
T  22756501 ctatttttgtattttagataacttgtacgtgatacaaaaagttgtgttgtggtataatgagggataaaaatttatgtttttgtcttgtctcttgcctcaa 22756402  T
Q  275 gtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 374  Q
     |||||||| | || ||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||      ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  22756401 atttgtcctatcccagaaacagttttacaaatcaaacattgtataactggagttgtt-----ttgtccttcattttttagcagatcaaacacaccctaag 22756307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 115 - 364
Target Start/End: Original strand, 10932691 - 10932940
Alignment:
Q  115 gacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaa 214  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||  |  ||| | ||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||| |  ||||    
T  10932691 gacaaatttgtatggtattgaataatttttggtcttataaaaaattttatggacaaaagactattttggtattttagacaaattgtacgtggaactaaaa 10932790  T
Q  215 gttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact 314  Q
    |||||| |||||||| ||||||||  ||||| | ||||||| ||||||| |||||||| | |||||| ||| ||  ||||| ||||| |||||||||||     
T  10932791 gttgtgatgtggtttagtgaggga-caaaattttagtttttatcatgtctcttgcctctactttgtcttgtcccataaacaattttataaatcaaacacc 10932889  T
Q  315 ggacaactagagttgttctgtcatgtccttca-ttttttagcaaatcaaac 364  Q
      ||||||  |||||||  ||| ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  10932890 atacaactgaagttgtttggtcttgtcctttatttttttagtaaatcaaac 10932940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 312
Target Start/End: Original strand, 54117 - 54322
Alignment:
Q  106 acagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtg 205  Q
    |||||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||   ||| |||||  ||||||| |||||| || |||||||| |||    
T  54117 acagcacaagataaacttttatggtattgaataattttttgtcttaaacgattttttgtggataaaatattattttg-tattttcgataacttgtatgtg 54215  T
Q  206 ggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaa 305  Q
    |||  |||||||||| |||||||| |  | ||| |||||| |  |||||||||||||||||||  ||| | ||||| |||  | ||||||||||||||||    
T  54216 ggacaaaaagttgtgatgtggtttagcaaaggacaaaaatttatgtttttgtcatgtcccttgtgtccggattgtcatgtctcagaaacagttttacaaa 54315  T
Q  306 tcaaaca 312  Q
    |||||||    
T  54316 tcaaaca 54322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 124
Target Start/End: Original strand, 21272592 - 21272676
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt 124  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  21272592 ttggtttgcaaaacagcaagtattggacagaacaatacaagatagatcagtacaacacaaggcagaacagcataggacaaatttt 21272676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 144
Target Start/End: Original strand, 37861803 - 37861865
Alignment:
Q  83 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatggcattgagtaattttt 144  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37861803 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaattttt 37861865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 144
Target Start/End: Original strand, 37861766 - 37861865
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatgg 129  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  37861766 agggtgtgtttgatttgcaaaacagtaagtactggacagaaca---------------gtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgg 37861850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 955173 - 955102
Alignment:
Q  29 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaag 100  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  955173 taagagtgtgtttggtttacaaaacagcaagtacttgacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaag 955102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 352
Target Start/End: Original strand, 10531244 - 10531472
Alignment:
Q  126 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtg 225  Q
    |||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||||| | ||||||||   ||||||| |||| || |||| ||||| ||| ||| |||||||||  | ||    
T  10531244 atggtattgaataattttttatcttataagattttttatggacaaaagattattttggtattctaaacaatttgtatgtgagataaaaagttgtattttg 10531343  T
Q  226 gtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga--aacagttttacaaatcaaacactggacaacta 323  Q
    |||| |||||| | || ||| | ||||||| |||||||  |||| ||| ||||||| | | ||  |  || |||| ||||||||||||| || |||||||    
T  10531344 gtttagtgaggaacaagaatttcagtttttatcatgtcttttgcatccggtttgtcatatgcccaataaatagttctacaaatcaaacattgtacaacta 10531443  T
Q  324 gagttgttctgtcatgtccttcatttttt 352  Q
    |||||||| |||| ||| ||| |||||||    
T  10531444 gagttgttttgtcttgtacttaatttttt 10531472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 36426347 - 36426201
Alignment:
Q  165 ggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcc 264  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||| |||||||| || |  || |||| | | |||||||||| | |||    
T  36426347 ggacaaaagactattttggtattttagacaacttgtatgtgagacaaaaagatgtgttgtggtttagtaaatgacaaaatttttagtttttgtcttatcc 36426248  T
Q  265 cttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacac 313  Q
    |||||||| || ||||| |||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  36426247 cttgcctcaagattgtcgtgt--ctgaaccaattttacaaatcaaacac 36426201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 200
Target Start/End: Original strand, 32918842 - 32918925
Alignment:
Q  117 caaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgt 200  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  32918842 caaatttttatgacattaaataattttttgttttatacaattttggggggacgaaatgctattttggtattaaaaacaacttgt 32918925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 320
Target Start/End: Original strand, 11944854 - 11945035
Alignment:
Q  139 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 238  Q
    |||||| || |||||| |||||||||| | ||||  |||||||| |||||||||||| |||||| || ||  |||||||||  |||||||| ||| || |    
T  11944854 atttttagtcttatacaatttttgaggcaaaaaagactattttggtattttagacaaattgtacatgagacaaaaagttgtagtgtggtttagtggggaa 11944953  T
Q  239 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 320  Q
      | | | |||||||||   ||||| |||||||| |||||||| | | | | ||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  11944954 ctagagtttgagtttttactatgtctcttgcctctagtttgtcatctccataaaacaattttacatatcaaacactgtacaa 11945035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 204
Target Start/End: Original strand, 28746254 - 28746367
Alignment:
Q  91 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 190  Q
    |||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||  | || |||||||||||  | |||||||  ||||||| |||||||    
T  28746254 acaacataagataaaacagcacatgataaatttttatgacattgaataatttttgatcttgtacgatttttggtgaacaaaattttattttggtatttta 28746353  T
Q  191 gacaacttgtacgt 204  Q
     | | |||||||||    
T  28746354 aatagcttgtacgt 28746367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Original strand, 4052368 - 4052412
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 76  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4052368 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagta 4052412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 229
Target Start/End: Original strand, 14958948 - 14959027
Alignment:
Q  149 ttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    |||||||||||||   || ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  14958948 ttatacgattttttgtgggcaaaaagttattttgatattttagaca-cttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 14959027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 367
Target Start/End: Original strand, 15351820 - 15351900
Alignment:
Q  287 cctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||  ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||    
T  15351820 cctgaaacaattttacaaatcaaacacggcataactgtagttgttctgttacatcattcattttttagcaaatgaaacgca 15351900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5859632 - 5859533
Alignment:
Q  105 aacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgt 204  Q
    |||| ||||| | ||| |||||| | ||||| ||||| || || ||||| ||||||| | ||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  5859632 aacatcacataagaaacttttattgtattgattaattattggtcttataagattttttatggacaaaatactattttagtattttagataacttgtacgt 5859533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 161
Target Start/End: Original strand, 9624180 - 9624239
Alignment:
Q  103 agaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa-ttttttgttttatacgattttt 161  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| ||||||    
T  9624180 agaacaacacatgacaaatttttatggtattgaataatttttttgtcttatacaattttt 9624239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11926956 - 11926893
Alignment:
Q  139 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 202  Q
    |||||| || |||||| |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  11926956 atttttagtcttatacaatttttgaggcacaaaagactattttggtattttagacaaattgtac 11926893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 201
Target Start/End: Original strand, 15351686 - 15351776
Alignment:
Q  110 cacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgta 201  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||| |||||||   ||||||||||||||||   || |||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  15351686 cacatgataaatttttatgatattgaataattttga-ttttatacgatttttggttgataaaatgttattttggtattttagacaatttgta 15351776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 30543239 - 30543197
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 76  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  30543239 gtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtattggacagaacagta 30543197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 37664499 - 37664458
Alignment:
Q  35 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 76  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  37664499 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagcactggacagaacagta 37664458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 341
Target Start/End: Original strand, 9624310 - 9624397
Alignment:
Q  253 tttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtc 341  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||| ||| || |||||| |||||||||| ||||| || ||||||  ||||||  |||||||||    
T  9624310 tttgtcatgtctcttgtctcccgtttgtcttgtcccagaaacaattttacaaat-aaacagtgtacaactgaagttgtcatgtcatgtc 9624397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 54)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 40 - 372
Target Start/End: Original strand, 11963220 - 11963553
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagta 138  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11963220 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaagcagaataacacatgacaaattttttatggcattgagta 11963319  T
Q  139 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 238  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11963320 attttgtattttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgcacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 11963419  T
Q  239 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 338  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11963420 caaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcct 11963519  T
Q  339 gtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11963520 gtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 11963553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Original strand, 32528585 - 32528922
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 129  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  32528585 agggtgtgtttgatttgcaaaatagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggcagaacagcacatgacaaattttttatgg 32528684  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  32528685 cattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 32528784  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32528785 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgtctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttg 32528884  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32528885 tcctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 32528922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 29 - 364
Target Start/End: Original strand, 7523039 - 7523376
Alignment:
Q  29 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-at 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  7523039 taagggtgtgtttggtttgcaaaacaggaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttat 7523138  T
Q  128 ggcattgagtaatttt-ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 226  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  7523139 gacattgagtaatttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtgg 7523238  T
Q  227 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 326  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7523239 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaa 7523338  T
Q  327 ttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  7523339 ttgttctgtcctatccttcattttttagcaaatcaaac 7523376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Original strand, 35701147 - 35701484
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| |||||||||| |||||    
T  35701147 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaataacacaggacaaattttttatgg 35701246  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||||    
T  35701247 caatgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttatgttgtggttt 35701346  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35701347 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtaccagaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 35701446  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35701447 ttctatcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 35701484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 33 - 373
Target Start/End: Original strand, 2351552 - 2351893
Alignment:
Q  33 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggca 131  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||||| |||||||    
T  2351552 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggataaattttttatggca 2351651  T
Q  132 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2351652 ttgagtaattttttgttttgtacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgg 2351751  T
Q  232 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  2351752 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcacttgcctccagtttgtcctataccttaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgtc 2351851  T
Q  332 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 373  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2351852 ctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaa 2351893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 66 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 31770782 - 31770479
Alignment:
Q  66 acagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgag 164  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31770782 acagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatatgatttttgag 31770683  T
Q  165 ggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcc 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31770682 ggacaaaatgctattttggtatttcagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcctgtcc 31770583  T
Q  265 cttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31770582 cttgcctccagtttgtcttgtacatgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttatgtcatgtcctttattttttagcaaatcaaac 31770483  T
Q  365 gcaa 368  Q
    ||||    
T  31770482 gcaa 31770479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 40 - 378
Target Start/End: Original strand, 34794766 - 34795105
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttta-tggcattgagta 138  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| ||    
T  34794766 ttggtttgcaaaacagtaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgataaattttttgtggcattgaata 34794865  T
Q  139 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 238  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  34794866 attttttgttttatacgaattttggggaacaaaatgctattttggtattttagacaacttatacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgaggga 34794965  T
Q  239 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 338  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  34794966 caaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatattggacaactagagttgttctgtcat 34795065  T
Q  339 gtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaagaatg 378  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  34795066 gtccttcattttttaacaaatcaaacgcaccctaataatg 34795105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 27 - 367
Target Start/End: Original strand, 39918374 - 39918714
Alignment:
Q  27 tctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-tttt 125  Q
    |||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  39918374 tctatgggtgtgtttggtttgcaat-cagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggtagaacaacacaggacaaatatttt 39918472  T
Q  126 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtg 225  Q
    || | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  39918473 atagtattgagtaattttatgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtg 39918572  T
Q  226 gtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 325  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39918573 gtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 39918672  T
Q  326 gttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39918673 gttgtcttgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 39918714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 24181835 - 24181513
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atgg 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24181835 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta---------------caacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgg 24181751  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  24181750 cattgagtaatttgttgttttatacgatctttgggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttatacgtgggacaaaaagttatgctgtggttt 24181651  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24181650 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttggctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 24181551  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24181550 ttttgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 24181513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 31 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 41790688 - 41790342
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatgg 129  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41790688 agggtgtgtttggtttacaaaacagtaagtactggacagaacagtataaaatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaatattttatgg 41790589  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| ||||||||    
T  41790588 cattgagtaattttatgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttagtattttagacaatttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggttt 41790489  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  41790488 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtttattgcctccagtttgtcctgta-ctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaaattg 41790390  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaagaat 377  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  41790389 ttctgtcctgtctttcattttttagcgaatcaaatgcatcctaagaat 41790342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 83 - 373
Target Start/End: Original strand, 41459511 - 41459801
Alignment:
Q  83 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttta-tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 181  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41459511 agaacagtacaacacaaggtagaacagcacaggacaaaaatttaatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttatttt 41459610  T
Q  182 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  41459611 gatattttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgctctggtttggtgagggacaaaaatatgagttttt-tcttgtcccttgcctccagtttgtc 41459709  T
Q  282 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41459710 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatactaaacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaa 41459801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 83 - 367
Target Start/End: Original strand, 29241300 - 29241585
Alignment:
Q  83 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 181  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29241300 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 29241399  T
Q  182 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 281  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  29241400 gatattttagccaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggcgagggacaaaaatatgagcttttggcctgtcccttgcctccaatttgtc 29241499  T
Q  282 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  29241500 atgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctggcctggccttcattttttagcaaatcaaacgca 29241585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 32 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 21739381 - 21739093
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||    || |||||||||||    
T  21739381 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacataacaatataagatagaacagtacaacacaagacagaacaggaca----aattttttatggca 21739286  T
Q  132 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 231  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21739285 ttgtgtaattttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgg 21739186  T
Q  232 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 324  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21739185 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 21739093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 32 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 6284524 - 6284189
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 130  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  6284524 gggtgtgtttgatttacaaaacagcaagtactggacagaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagtacagcacaagacaaattttttatggc 6284425  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt-gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  6284424 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttttggtattttggacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 6284325  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  6284324 ggtgagggacaaaaaaataagtttttgtcctgtcccatgcctccagtttgtcctgtacctgaagcagttttacaaatcaaacactggacaactaaagtta 6284225  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||  ||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6284224 ttc--tcccgtccttcattttttaacaaatcaaacgca 6284189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 32 - 372
Target Start/End: Original strand, 8136710 - 8137049
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 130  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  8136710 gggtgtgtttggtttgtaaaacagtaagtactggacagaatagtacaagatagaacagtacaacacaaggcataacaacacaggacaatttttttatggc 8136809  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||    
T  8136810 attgagtaatgttttgttttatactattttttggggacaa--tgttattttggtattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgttgtggtttg 8136907  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8136908 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtatctgaaacagttttacaaaacaaacactggacaactagagttgt 8137007  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 372  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8137008 tctgtcctatccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 8137049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 40 - 367
Target Start/End: Original strand, 3735237 - 3735564
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||| ||||  | |||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||    
T  3735237 ttggtttgcaaaacagcaggtactgtacagaacagtacaagaaagaatagcacaatacaagggagaacagcataggacaaatttttatgacattgaataa 3735336  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 239  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||     
T  3735337 ttttttgttttatacgatttttggaggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgatggac 3735436  T
Q  240 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 339  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3735437 aaaaatatcagtttttgtcctgtccattgcctccattttgtcatgtacctgaaacggttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcatg 3735536  T
Q  340 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  3735537 ttcttcattttttagcaaatcaaacgca 3735564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 33 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4818364 - 4818085
Alignment:
Q  33 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 131  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  4818364 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtgcaacacaaggcagaacaacacaagacaaattttttatggca 4818265  T
Q  132 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  4818264 ttgagtaattttttgttttatacgattttttagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgg 4818165  T
Q  232 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaac 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4818164 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgttccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaac 4818085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 40 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 7770495 - 7770168
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||| |||||   ||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  7770495 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacataatcgtacaagacagaacaacacaacacaagacagaatagcacaggacaaatttttatgacattgaataa 7770396  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 239  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||     
T  7770395 ttttttgttttatacgatttttggggctcgaaatgttatttttgtattttaggcaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaaggac 7770296  T
Q  240 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 339  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7770295 aaaaatatgtgtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcatg 7770196  T
Q  340 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7770195 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 7770168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 31 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 4689923 - 4689589
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 130  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| |||||   |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4689923 agggtgcgtttggtttgcaaaacagcaagtaatggacataacagtacaagacagaacaacacaacataaggcagaacaacacatgacaaatttttatgac 4689824  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  | ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  4689823 attgaataattttttgttttatacgacttttggggctcgaaatgttatttttgtattttaggcaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 4689724  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  4689723 gtgagggacaaaaatatgtgtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgt 4689624  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4689623 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 4689589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 32 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22493643 - 22493322
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 130  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||  |||| ||||    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  22493643 gggtgtgtttggttcgcaaaacaacaagtattggacagaacagtgcaagacagaataacacaacacaaggtagaacagcacagaacaaattttttatggc 22493544  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  22493543 aatgagtaattttttgttttatacgatttttgcgg-acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgtgacaaaaagttgtgctgtggtttg 22493445  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22493444 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcctttggctccagtttatcctgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaactagagttgt 22493345  T
Q  331 tctgtcatgtccttcatttttta 353  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  22493344 tctgtcctgtccttcatttttta 22493322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 31 - 373
Target Start/End: Original strand, 31644318 - 31644659
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 130  Q
    |||||| | |||||||||||||||| | |||| |  |||||||||| |||| ||||  | |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  31644318 agggtgcgtttggtttgcaaaacagcatgtacagtgcagaacagtacaaga-agaatagcacaatacaaggtagaacaacacaagacaaatttttatgac 31644416  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31644417 attgaataattttatgttttatatgatttttaggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 31644516  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31644517 gtgagggacaaaaatatgagtatttgtcttg-ctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 31644615  T
Q  331 tctgtcatgtccttcatttttt-agcaaatcaaacgcaacctaa 373  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  31644616 tctgtcccgtccttcattttttaagcaaatcaaacgcaccctaa 31644659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Original strand, 24036105 - 24036436
Alignment:
Q  33 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcat 132  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||| ||||| | |||||| |||  |||||| ||||||||||||||||  | |||    
T  24036105 ggtgtgtttggtttgcaaaacaataagtactgtactgaacagtacaagacagaacagcacaacataagacagaacaacacatgacaaattttt--gacat 24036202  T
Q  133 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 232  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  24036203 tgaataattttttgttttatacgatttttggggtgcaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgatgtggtttggt 24036302  T
Q  233 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||     
T  24036303 gagggacaaaaatatgagattttgtcctgtcccttgcctccaatttgtgctgtacctgaaacagttttccaaatcaaacactggacaacttgaattgttt 24036402  T
Q  333 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24036403 tgtcctgt-cttcattttttagcaaatcaaacgca 24036436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 83 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 31880250 - 31879960
Alignment:
Q  83 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 181  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  31880250 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacatgacaaattttttatgacattgaataattttttgtattatacgattgttgggggacaaaatgctatttt 31880151  T
Q  182 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 281  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||  || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  31880150 ggtattttagacaacttgtacgtaggacaaatagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcacttgcctccagtttgtc 31880051  T
Q  282 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 372  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31880050 ctgtacctgaaacagttttactaatcaaacactgaacaactagagttgttatatcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 31879960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 83 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 7208404 - 7208112
Alignment:
Q  83 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 181  Q
    ||||| |||||| |||||   |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7208404 agaacagtacaatacaagacggaacagcacgggacaaatattttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggaacaaaatgctatttt 7208305  T
Q  182 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 281  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||    
T  7208304 ggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagttttggttctgtctcttgcatccagtttgtc 7208205  T
Q  282 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 374  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  7208204 ccgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgttctgttctgtccttcattttttagcaaatcaaatgcaccctaag 7208112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 56 - 367
Target Start/End: Original strand, 40489232 - 40489543
Alignment:
Q  56 taagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattttttgttttatac 154  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| |||| |||||||| || | ||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40489232 taagtattggacagaatagtacaagattgaacagtacaacataaagcagaacaatgcatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatac 40489331  T
Q  155 gatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttt 254  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  40489332 aatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagggacaaaaatatgagtttt 40489431  T
Q  255 tgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttag 354  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  40489432 tgtcccgtcccttgcctccagtttgtcttctacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaattagagttattctgtcctgtcctt-attttttag 40489530  T
Q  355 caaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||    
T  40489531 caaatcaaacgca 40489543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 83 - 367
Target Start/End: Original strand, 39788114 - 39788400
Alignment:
Q  83 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaa-tgctattt 180  Q
    ||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  39788114 agaacagtacaacataatgcagaacagcacatgacaaattttttatggtattgagtaattttttgttttatacgatttttgggggacaaaaatgttattt 39788213  T
Q  181 tgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgt 280  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  39788214 tagtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctacagtttgt 39788313  T
Q  281 cctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  39788314 cctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatactggacaactagaattgttctgtcctgtcctttattttttaacaaatcaaacgca 39788400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 83 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23091478 - 23091193
Alignment:
Q  83 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattt-ttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 181  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23091478 agaacagtacaacacaagatagaacaacacaagacaaatttcttatggcattgagtaatgttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttatttt 23091379  T
Q  182 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 281  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||  |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  23091378 gatattttagacaatttatacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttgatgacggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttatc 23091279  T
Q  282 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23091278 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaacttgagtagttatatcttgtcattcattttttagcaaatcaaacgca 23091193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 40 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18470644 - 18470321
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||   ||||| | |||| |||||  | |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||    
T  18470644 ttggtttgcaaaatagtaagtactggacagcacagtataatgcagaacagcacaatacaagacataacagcacagaacaaatttttatggtattgaataa 18470545  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 239  Q
    ||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  18470544 tttcttgttttatatgctttttgggggacgaaatgttattttggtgttttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggtttggtaagggac 18470445  T
Q  240 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 339  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  18470444 aaaaatttcagtttttgtcttgtcccttgccttcagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggataactggagttgttctgtcttg 18470345  T
Q  340 tccttcattttttagcaaatcaaa 363  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  18470344 tccttcattttttaacaaatcaaa 18470321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 29 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 7726036 - 7725702
Alignment:
Q  29 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 128  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||   |||||||||||||||| || | | ||||||||||||||    
T  7726036 taagggtgtgtttgatttgcaaaacagtaagtactagacataacagtacaagacagtacatcacaacacaaggtagaatagtataggacaaatttttatg 7725937  T
Q  129 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttg-atattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 227  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||    
T  7725936 gaattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggatattt-agacaacttatacgtgggacaaaaagttgtgttgtggt 7725838  T
Q  228 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 327  Q
    ||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  7725837 ttaatgaaggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcatccagtttgttctgcacctgaaacaattttactaatcaaacactggacaactgaagt 7725738  T
Q  328 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 363  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  7725737 tgttttgtcctgtccttaattttttagcaaatcaaa 7725702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 49 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 28090726 - 28090461
Alignment:
Q  49 aaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgt 147  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||    
T  28090726 aaaacattaagtattggacagaaca--ataagatagaacagtacaactcacggcagaacagtacaggacaaattttttatattattgagtaattttttgt 28090629  T
Q  148 tttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28090628 tttatacgatttttgagggacaaaatgttatttttgtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtagtttggtgagggacaaaaatat 28090529  T
Q  248 gagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28090528 gagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgccttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactg 28090461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 364
Target Start/End: Original strand, 553358 - 553601
Alignment:
Q  122 ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggg-acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 220  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  553358 ttttatggcattgaataattttatgttttatacgatttttggggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 553457  T
Q  221 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 320  Q
     |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  553458 ttgtggtttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcttgtctcttgcctccagtttgtcctgtacttgaaacagttttataaatcaaacactagacaa 553557  T
Q  321 ctagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
     || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  553558 ttaaagttgttctgtcatattcttcattttttagcaaatcaaac 553601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 93 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 5571806 - 5571546
Alignment:
Q  93 aacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttag 191  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  5571806 aacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgggggacaa--tgctattttggtattttag 5571709  T
Q  192 acaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga 291  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5571708 acaacttgtacgttggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgaatttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg- 5571610  T
Q  292 aacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
                |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5571609 ------------aatcaaacactggacaactagagttgttttgttttgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 5571546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 111 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8561126 - 8560871
Alignment:
Q  111 acatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |      
T  8561126 acatgacaaatttttatggcattgattaattttttgttttatacgatttttg-gggacgaaatgttattttggtattttagacaacttgtacctggaaca 8561028  T
Q  211 aaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaa 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8561027 aaaagttgtgatgtggtttggtgaggaacaaaaatatcagtttttgtcttgtcctttgctttcagtttgtcctgtatctgaaacagttttacaaatcaaa 8560928  T
Q  311 cactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||| | ||||  ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8560927 cactgaataactgaagttgttatgtcacgtccttcgttttttagcaaatcaaacgca 8560871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 54 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 32093183 - 32092874
Alignment:
Q  54 agtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttata 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||   | ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||  | |||| |||||||||    
T  32093183 agtaagtactggacagaacagtaagagacagaacaacataacacaaggcagaacagcacaacacaaatttttatggtattgaaaatttttatgttttata 32093084  T
Q  154 cgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagttt 253  Q
      ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||    
T  32093083 taatttttgggggacgaaatgctattttggtattttagataatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtga-ggacaaaaatttcagttt 32092985  T
Q  254 ttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatttttta 353  Q
    ||||| | ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32092984 ttgtcctatcctttgcctccaatttgtcctgttcctgaaacaattttacaaatcaaacactgcacaactggagttgttctgtcttgtccttcatttttta 32092885  T
Q  354 gcaaatcaaac 364  Q
      |||||||||    
T  32092884 taaaatcaaac 32092874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 60 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 700798 - 700513
Alignment:
Q  60 tactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaa-tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatt 158  Q
    ||||||||| ||||||| |||| | ||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  700798 tactggacataacagtacaagacaaaataatacaacacaaggtagaacagcacatgacaaaatttttatggcaatgagtaattttttgttttatatgatt 700699  T
Q  159 tttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtc 258  Q
    || | ||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||     
T  700698 ttcgggggacaaaataatattttggtattttagataacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaggaacaaaaatatgaatttttgtt 700599  T
Q  259 atgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtcctt 344  Q
     ||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  700598 ttgtcccttgtctcttgtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaatcattgaacaactagagttgttttgtcatgtcctt 700513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 35 - 359
Target Start/End: Original strand, 5673018 - 5673329
Alignment:
Q  35 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcatt 133  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| | |||| || | ||||||| |||||||||| |    
T  5673018 tgtgtttggtttacaaaacagtaagtacttgacagaacagtacaagatataacagcacaacacaaggcataacatcaaaggacaaatattttatggcaat 5673117  T
Q  134 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  5673118 gagtaattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttgatattttagac-----gtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtg 5673212  T
Q  234 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||         ||||||||||||    ||||||||||||||| |    
T  5673213 agggacaaaaatatgagtttttgacttgtcccttgcctccagtttatcgtgtacctga---------acaaatcaaacatcaaacaactagagttgttat 5673303  T
Q  334 gtcatgtccttcattttttagcaaat 359  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  5673304 gtcttgtccttcattttttagcaaat 5673329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 40 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 37148790 - 37148478
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  37148790 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacaaaacagtataatacagaacagcacaacacaaggtataacagcacaggacaaatttttatggtattgaataa 37148691  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 239  Q
    ||| || |||||||   |||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||               |||||||| |||||||||||||| |     
T  37148690 tttcttattttatattctttttgggggacgaaatgctattttggtgttttagacaactt---------------agttgtgccgtggtttggtgaggaac 37148606  T
Q  240 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 339  Q
    |||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||     
T  37148605 aaaaatttcagtttttgtcccgtcccttgcctccagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacaattgacaactggagttgttctgtcata 37148506  T
Q  340 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  37148505 tccttcattttttaacaaatcaaacgca 37148478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 32 - 252
Target Start/End: Original strand, 40182335 - 40182556
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggc 130  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  40182335 gggtgtgtttggtttccaaaacagcaagtactggacagaacaatacaagaaagaacagtacaacacaaggcaaaacagcacatgacaaattttttatggc 40182434  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  40182435 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagagacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgatgtggtttg 40182534  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtt 252  Q
    |||||||| |||||||| ||||    
T  40182535 gtgagggacaaaaatataagtt 40182556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 149 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27839180 - 27838951
Alignment:
Q  149 ttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatg 248  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||  |||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |     
T  27839180 ttatacgatttttggaggacaaaaggctattttggtattttagacaacttgtacatgagacaaaaagttgttttatggtttggtgagggacaaaaattta 27839081  T
Q  249 agtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatt 348  Q
     |||||  || ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27839080 tgtttta-tcctgtccattgccttcagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcatgtccttcatt 27838982  T
Q  349 ttttagcaaatcaaacgcaacctaagaatga 379  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  27838981 ttttaacaaatcaaacgcaccctaaggatga 27838951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 91 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 22432471 - 22432243
Alignment:
Q  91 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 190  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| |   ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22432471 acaacacaaggtagaacaacacatgacaaatttttatatgattgatt---ttttttttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggtatttta 22432375  T
Q  191 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 290  Q
    |||||||||||| || ||  |||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  22432374 gacaacttgtacttgagacaaaaaattgtgttgtggtttgatgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttatcctgaacctg 22432275  T
Q  291 aaacagttttacaaatcaaacactggacaact 322  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22432274 aaacagttttacaaatcaaacataggacaact 22432243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 164 - 367
Target Start/End: Original strand, 5598484 - 5598687
Alignment:
Q  164 gggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtc 263  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||| | ||    
T  5598484 gggacgaaatgttattttgatattttagacaagttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgttgtttgatgaaggacaaaaatatctgtttttgtcctctc 5598583  T
Q  264 ccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 363  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  5598584 ccttgcctccagtttgtctcgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaacttgagttgttctgttctgtgcttcattttttagcaaatcaaa 5598683  T
Q  364 cgca 367  Q
    ||||    
T  5598684 cgca 5598687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 252 - 367
Target Start/End: Original strand, 4664923 - 4665038
Alignment:
Q  252 ttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttt 351  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4664923 ttttgtcatgtcccttgcctcctgtttgtcctgtccctgaaactgttttacaaatcaaacactggataactggagttgttctgtcatgtccttcattttt 4665022  T
Q  352 tagcaaatcaaacgca 367  Q
     | |||||||||||||    
T  4665023 aatcaaatcaaacgca 4665038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 137 - 353
Target Start/End: Original strand, 17031134 - 17031350
Alignment:
Q  137 taattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagg 236  Q
    |||||||| || ||||| |||||||   |||||||| ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||    
T  17031134 taatttttggtcttatatgattttttgtggacaaaaagctatttttgtattttaaataacttgtacgtgggacgaaaagttgtgctgtgatttaatgagg 17031233  T
Q  237 gataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtc 336  Q
    |  |||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| | |||||||  ||||    
T  17031234 ggcaaaaatttatgtttttgtcctgtcctttgcctccaatttgtactgtccctgaaacagttttacaaatcaaacattatacaagtggagttgtgttgtc 17031333  T
Q  337 atgtccttcatttttta 353  Q
     ||||||||||||||||    
T  17031334 ttgtccttcatttttta 17031350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 164
Target Start/End: Original strand, 20119642 - 20119777
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||    
T  20119642 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtattggacagaacagtacaagatagaacagcacaacacaaggcagaacagtacatgacaaattttaatagca 20119741  T
Q  132 ttgagtaa---ttttttgttttatacgatttttgag 164  Q
    |||| |||   || ||||||||||| ||||||||||    
T  20119742 ttgaataatatttgtttgttttatatgatttttgag 20119777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 108
Target Start/End: Original strand, 548218 - 548295
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaaca 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  548218 agggtgtgtttggtttgcaaaacattaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggcagaaca 548295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 172
Target Start/End: Original strand, 32313713 - 32313850
Alignment:
Q  35 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattg 134  Q
    |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||| || ||||||||| |||||   | ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| | ||||    
T  32313713 tgtgtttgatttgctaaacaataagtacttgacataaaagtataagacagaacaacataacacaagacagaacaacacatgacaaatttgtatagtattg 32313812  T
Q  135 agtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaa 172  Q
    | ||||||||  | ||||||||||||||  ||||||||    
T  32313813 attaatttttgatcttatacgatttttgctggacaaaa 32313850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 325 - 367
Target Start/End: Original strand, 40182553 - 40182595
Alignment:
Q  325 agttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40182553 agttgttctgtcatttccttcattttttagcaaatcaaacgca 40182595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 201
Target Start/End: Original strand, 1338601 - 1338661
Alignment:
Q  141 tttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgta 201  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  1338601 tttttgttatatacgatatttgatggacaaaaaattattttgatattttagacaacttgta 1338661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Original strand, 29241264 - 29241308
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 76  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29241264 gggtgtgcttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagta 29241308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 31880286 - 31880242
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 76  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31880286 gggtgtgtttgatttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 31880242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29788618 - 29788507
Alignment:
Q  94 acacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagac 193  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| || ||||  || |||||| |||||||   ||  ||||| |||||| |||||||||||    
T  29788618 acacaagatagaacaacacatgataaacttttatggtattgaatagtttt--gtcttatacaatttttggttgatcaaatgttattttaatattttagac 29788521  T
Q  194 aacttgtacgtggg 207  Q
    |||||| |||||||    
T  29788520 aacttgaacgtggg 29788507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 7208441 - 7208396
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 76  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  7208441 agggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtactggacagaacagta 7208396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 333 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 21739053 - 21739019
Alignment:
Q  333 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21739053 tgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 21739019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 249 - 311
Target Start/End: Original strand, 35955088 - 35955150
Alignment:
Q  249 agtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaac 311  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||||    
T  35955088 agtttttgtcttgtctcatgcctccagtttgtcatgtctttgaaacaattttacaaatcaaac 35955150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 64)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 31 - 364
Target Start/End: Original strand, 2614766 - 2615100
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  2614766 agggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtactggacaaaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatgg 2614865  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  2614866 cattgagtaattttttattttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 2614965  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2614966 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtcctgtacctgaaacaattttacaaatcaaacagtggacaactagagttg 2615065  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2615066 ttctgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaac 2615100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15277199 - 15276853
Alignment:
Q  28 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-tttta 126  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||  |||||    
T  15277199 ctaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggcagaacaacacatgacaaaaatttta 15277100  T
Q  127 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtgg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  15277099 tggcattgagtaattttttgttttataagatttttgagggacaaaatgctattttgttcttttagacaacttgtacgtgggaaaaaaagttgtgatgtgg 15277000  T
Q  227 tttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 326  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  15276999 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattagacaactagag 15276900  T
Q  327 ttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15276899 ttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaatgcaccctaa 15276853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 31 - 372
Target Start/End: Original strand, 3259548 - 3259895
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgac------aaatttt 124  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||      || ||||    
T  3259548 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaggattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacatgacaaattttt 3259647  T
Q  125 tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  3259648 tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgttgt 3259747  T
Q  225 ggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 324  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3259748 ggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 3259847  T
Q  325 agttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 372  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3259848 agttgttttgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcatccta 3259895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 40 - 374
Target Start/End: Original strand, 17867714 - 17868049
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagta 138  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  17867714 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaacatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggcattgagta 17867813  T
Q  139 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  17867814 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgatgaggga 17867913  T
Q  239 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 338  Q
     |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  17867914 caaaaatatgagtttttatcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacagctagagttgttctgtcct 17868013  T
Q  339 gtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17868014 gtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaag 17868049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 40 - 374
Target Start/End: Original strand, 17877497 - 17877832
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagta 138  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  17877497 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaacatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggcattgagta 17877596  T
Q  139 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  17877597 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgatgaggga 17877696  T
Q  239 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 338  Q
     |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  17877697 caaaaatatgagtttttatcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacagctagagttgttctgtcct 17877796  T
Q  339 gtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaag 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17877797 gtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaag 17877832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 44 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 32410098 - 32409774
Alignment:
Q  44 tttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattt 142  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  32410098 tttgcaaaacagtaaatactagacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgacattgaataattt 32409999  T
Q  143 tttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  32409998 tttgttttatacgatttttgagggacaaaatactattttggtattttagacaacttgtgagtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaa 32409899  T
Q  243 aatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtcc 342  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  32409898 aatatgagtttttgtcctgtcccttgtctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggataactagagttattctgtcatgtcc 32409799  T
Q  343 ttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  32409798 ttcattttttagcaaatcaaacgca 32409774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 34 - 367
Target Start/End: Original strand, 24203236 - 24203569
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 132  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24203236 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtattggacagaacagtacatgatagaacagtacaacacaaggcaaaacagcacaggacaaattttttatggcat 24203335  T
Q  133 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 232  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24203336 tgagtaattttttgttttatacaatttt-gagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggt 24203434  T
Q  233 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 332  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24203435 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactatagttgttc 24203534  T
Q  333 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24203535 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 24203569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 40 - 339
Target Start/End: Original strand, 24242543 - 24242843
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagta 138  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  24242543 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagataaaagagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgacattgagta 24242642  T
Q  139 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  24242643 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgaggga 24242742  T
Q  239 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 338  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24242743 caaaaatatgagtttttgttgtgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 24242842  T
Q  339 g 339  Q
    |    
T  24242843 g 24242843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 48 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15277522 - 15277195
Alignment:
Q  48 caaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttg 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  15277522 caaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggtaaaacaacacagaacaaattttttatagcattgagtaatttgttg 15277423  T
Q  147 ttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaata 246  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  15277422 ttttatacgatttttggaagacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaata 15277323  T
Q  247 tgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttca 346  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||    
T  15277322 tgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtaccttaaacaattttacaaatcaaacactggacaaatagagttgttttgtcttgtctttca 15277223  T
Q  347 ttttttagcaaatcaaacgcaacctaag 374  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15277222 ttttttagcaaatcaaacgcaccctaag 15277195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 32 - 365
Target Start/End: Original strand, 10959872 - 10960205
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 131  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||   ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10959872 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggatagaacagtacaagacagaacatcacagcacaaggcagaacaacacatgacaaatttttatggca 10959971  T
Q  132 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 231  Q
    |||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||     
T  10959972 ttgaatgatattttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgt 10960071  T
Q  232 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10960072 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccttcagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgtt 10960171  T
Q  332 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 365  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10960172 ctgtcctatccttcattttttagcaaatcaaacg 10960205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 35 - 367
Target Start/End: Original strand, 11212131 - 11212464
Alignment:
Q  35 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaat-ttttatggcatt 133  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  11212131 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaatgttttatggcctt 11212230  T
Q  134 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 233  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||| || ||||||||||||    
T  11212231 gagtaattttttgttttattcgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgcacgtgagacaaaaggttatgttgtggtttggtg 11212330  T
Q  234 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 333  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11212331 agggacaaaagtatgagtttttgtcatgtcccttatctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 11212430  T
Q  334 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11212431 gtcccgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 11212464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3933064 - 3932729
Alignment:
Q  33 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 131  Q
    |||||| ||||||||||||| |  ||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3933064 ggtgtgtttggtttgcaaaataacaagtattggataaaacagtataagatagaacagtacaacacaagacaaaacagcacaggacaaattttttatggca 3932965  T
Q  132 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  3932964 ttgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttgg 3932865  T
Q  232 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 331  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3932864 tgagagacaaaaatatgagtttttgtcctgccccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagaattgtt 3932765  T
Q  332 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3932764 ctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 3932729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 43 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 10324358 - 10324035
Alignment:
Q  43 gtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaatt 141  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||    
T  10324358 gtttgcaaaacagtaagtaccggacagaacagtacaagatagaacattacaacacaaggtagaacagcacagaacaaattttttatgggattgagtaatt 10324259  T
Q  142 ttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataa 241  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  10324258 ttttgttttatacgattttttggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaa 10324159  T
Q  242 aaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtc 341  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  10324158 aaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaattaaacactgaacaactagagttgttctgttctgtc 10324059  T
Q  342 cttcattttttagcaaatcaaacg 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  10324058 cttcattttttagcaaatcaaacg 10324035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 83 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 167130 - 166844
Alignment:
Q  83 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 181  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  167130 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgacattgagtaattttttgttttatatgatttttaagggacgaaatgctatttt 167031  T
Q  182 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 281  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  167030 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgttatgtcccttgcctctagtttgtc 166931  T
Q  282 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaa 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  166930 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaagtagagttgttctgtcatatccttcattttttagcaaatcaaacgcaa 166844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 31 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 11614035 - 11613708
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 130  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |          |||    || ||||||||||    
T  11614035 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtattggacagaacagtacacgatagaacagtacaacacagg----------aca----aattttttatggc 11613950  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11613949 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttatacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 11613850  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11613849 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgttccttgtctccattttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgt 11613750  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 372  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11613749 tctgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 11613708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 40 - 367
Target Start/End: Original strand, 10485038 - 10485364
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    |||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||| | |||| |||| ||||||| |||||| |||||| |||    
T  10485038 ttggtttgtaaaacagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaaggga-aacaacacaggacaaatatttatgacattgaataa 10485136  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 239  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||     
T  10485137 ttttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgctgagggac 10485236  T
Q  240 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 339  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  10485237 aaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaataattttacaaatcaaacactggacaactggagttgttttgtcttg 10485336  T
Q  340 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10485337 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 10485364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 83 - 367
Target Start/End: Original strand, 34176752 - 34177037
Alignment:
Q  83 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 181  Q
    ||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34176752 agaacagtacaacataagacagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 34176851  T
Q  182 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 281  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34176852 ggtattttagactacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcatgtcacttgcctccagtttgtc 34176951  T
Q  282 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34176952 atgtacctgaaacagttttacaaatcaaacaagtgacaactagagttgttctgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 34177037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Original strand, 17443135 - 17443464
Alignment:
Q  33 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcat 132  Q
    |||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  17443135 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatattggacagaacagtacaagatagaacaacacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatgacat 17443234  T
Q  133 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 232  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  17443235 tgaataattttatgttttatacgatttttggaggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtactgtggtttggt 17443334  T
Q  233 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||         
T  17443335 gagggataaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatctagtttgtcctgtacctgaaatggttttacaaatcaaacactggacaactaaagt----- 17443429  T
Q  333 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17443430 tgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 17443464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 73 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 32132597 - 32132342
Alignment:
Q  73 agtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaa 171  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32132597 agtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaatttgttgttttatacgatttttgggggacaaa 32132498  T
Q  172 atgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcct 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32132497 atgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggattggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcct 32132398  T
Q  272 ccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 327  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32132397 ccagtttgtcctgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 32132342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 137 - 367
Target Start/End: Original strand, 11382041 - 11382269
Alignment:
Q  137 taattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagg 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||     
T  11382041 taattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgag- 11382139  T
Q  237 gataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtc 336  Q
     | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11382140 -acaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaactagagttgttctgtc 11382238  T
Q  337 atgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11382239 atgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 11382269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 32 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 14925713 - 14925378
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggca 131  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||   ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  14925713 gggtgtgtttggtttgcaaagaagtaagtacgggacataacagtaaaagatagaacaacacaacacaaggcataacagcacaggacaaatttgtatgaca 14925614  T
Q  132 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 231  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  14925613 ttgaataattttatgttttatacgatttttaggggacggaatgctattttggtattttagacaacttgtaagtgggacaaaaagttgtactgtggtttgg 14925514  T
Q  232 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  14925513 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtc 14925414  T
Q  332 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
     |||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  14925413 atgtcctgtccttcattttttaacgaatcaaacgca 14925378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 40 - 367
Target Start/End: Original strand, 18057399 - 18057726
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||| | || |||||| ||||||||| |||| |||||| |||    
T  18057399 ttggtttgcaaaacagtaagtattggatagaacagtaaaagatagaacagcacaacacaaggcataatagcacaggacaaatttgtatgacattgaataa 18057498  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 239  Q
    |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  18057499 ttttatgttttatacgatttttagaggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgagggac 18057598  T
Q  240 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||| || || ||    
T  18057599 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttacatctagtttgtcatgtatctcaaacagttttacaaatcaaacattggacaattgaagttgtcctatcctg 18057698  T
Q  340 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18057699 tccttcattttttagcgaatcaaacgca 18057726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 122 - 365
Target Start/End: Original strand, 11279090 - 11279333
Alignment:
Q  122 ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgc 221  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||     
T  11279090 ttttatggccttgagtaattttttgttttattcgatttttgagggataaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgt 11279189  T
Q  222 tgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaac 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11279190 tgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccatgcctccagtttgtcctgtacttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaac 11279289  T
Q  322 tagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 365  Q
    | |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11279290 tggagttgttctgtcccgtctttcattttttagcaaatcaaacg 11279333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 40 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 31870349 - 31870019
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||||| || ||| ||||||| |||| |||||   |||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31870349 ttggtttgcaaaacatcaagtattgtacataacagtacaagaaagaacaacacaatataagggagaacaacacatgacaaatttttatggcattgaataa 31870250  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||     
T  31870249 ttttttgttttatacgagttttgggggacgaaatgctatttttgtattttagacaacctatacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 31870150  T
Q  240 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcc---tgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtc 336  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||| |   ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31870149 aaaaatatcagtttttgttttgtcccttgcctctagtttgttctgttgttcctgagacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttatgtc 31870050  T
Q  337 atgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31870049 cagtccttcattttttagcaaatcaaacgca 31870019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 45 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 11675619 - 11675296
Alignment:
Q  45 ttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttt 144  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| || |||| |||||   |||||| |||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  11675619 ttgcaaaacagtaagtattggacataacaatacaagacagaacaacacaacaaaaggtaaaatagcacatgacaaatttctatagcattgaataattttt 11675520  T
Q  145 t-gttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaa 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| | |||| |||| | ||||||| | | |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| || ||||    
T  11675519 ttgttttatacgatttttgggggacgagatgccatttaggtattttacaaagcttgtacgtgggataaaaagttgtgttatggtttggtgagagacaaaa 11675420  T
Q  244 atatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtcct 343  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||| |||| |    
T  11675419 atatcagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactggaattgttttgtcttgtctt 11675320  T
Q  344 tcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |  |||||||||||||||||||||    
T  11675319 tatttttttagcaaatcaaacgca 11675296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 40 - 365
Target Start/End: Original strand, 3379591 - 3379915
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    |||||||||||||| | |||||  |||||||||| || |||| ||||    ||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |  |||||||  ||    
T  3379591 ttggtttgcaaaaccgcaagtatcggacagaacaatacaagacagaataacacaacacaatgcagaacagtacatgtcaaattttaa--gcattgaacaa 3379688  T
Q  140 tttt-ttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 238  Q
    |||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  3379689 tttttttgttttatatgatttttggaggacgaaatgctattttggtatttaagacaacttgtatgtgagacaaaaagttgtgctatggtttggtgagcga 3379788  T
Q  239 taaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 338  Q
     |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3379789 caaaaatatcagtttttgtcttgtctcttgcctccagtttgtcctgtatctgaaacagttttataaatcaaacactggacaactaaagttgttctatcat 3379888  T
Q  339 gtccttcattttttagcaaatcaaacg 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  3379889 gtccttcattttttagcaaatcaaacg 3379915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 40 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 18597407 - 18597080
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||   |||||   ||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||    
T  18597407 ttggtttgtaaaacagtaagtattggacagaacagtacaaagcagaacaacacaacactaggtagaacaacacataataaatttttatggtattgaataa 18597308  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 239  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||     
T  18597307 ttttttgttttatatgatttttgagggacgaagtactattttagcgttttagacaacttatacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 18597208  T
Q  240 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 339  Q
    |||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||  ||  |    
T  18597207 aaaaatttcagattttgtcatgtcccttgcctccggtttgtcatatccctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactgaaattgttcaatcccg 18597108  T
Q  340 tccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18597107 tccttcattttttaacaaatcaaacgca 18597080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 31 - 372
Target Start/End: Original strand, 32859922 - 32860263
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 130  Q
    |||||||| ||| |||| | ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||   |||| | |||| |||||||||||  ||||||||||||||     
T  32859922 agggtgtgtttgatttgtagaacagtaagtattggacataacagtacaagataggacaacacaatataaggcagaacagcacaatacaaatttttatggt 32860021  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||  |||||||| | ||| ||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||    
T  32860022 attgaataattttctgtattatttgatttttgggtgacgaaatgttatttttgtattttagaaaacttgtacgtgagacaaaaggttgtgctgtggtttg 32860121  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    | || ||| ||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  32860122 gcgatggacaaaaattgcagcttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcatgtccctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaattggagttgt 32860221  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 372  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  32860222 tttgtcatgtccttcattttttatcaaatcaaacgcacccta 32860263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 123 - 367
Target Start/End: Original strand, 3290635 - 3290866
Alignment:
Q  123 tttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgct 222  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |    
T  3290635 tttatgacattgaataattgtttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttatacgtggga--aaaagttgtgtt 3290732  T
Q  223 gtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaact 322  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||           ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3290733 gtggtttggtaagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt-----------tgacacagttatacaaatcaaacactgaacaact 3290821  T
Q  323 agagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3290822 agagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 3290866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8178141 - 8177804
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggc 130  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||| |||||| |||||| || |||||||||  | ||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| || ||    
T  8178141 agggtgtgtttggtttgcaaaacatgaagcactggatagaacaatacaagatagaatagcacaacacaagacagaacagtacatgacaagttttaatagc 8178042  T
Q  131 attga--gtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 228  Q
    |||||   |  |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||    
T  8178041 attgaacatttttttttgttttatatgatttttgggggacgaaatgttattttggtattttagacaacttgaacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtt 8177942  T
Q  229 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 328  Q
    |||| ||||| |||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |  ||||    
T  8177941 tggtaagggacaaaaatatca-tttttatcctgtcccttgcctccagtttgttttgtacctgaaacagttttataaatcaaacaccggataattgaagtt 8177843  T
Q  329 gttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8177842 gttttttcatgtcctttattttttagcaaatcaatcgca 8177804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 41 - 367
Target Start/End: Original strand, 29054239 - 29054563
Alignment:
Q  41 tggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaat 140  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||   |||||| |||  ||||||||||| || ||||||| |||| ||||| ||||    
T  29054239 tggtttgcaaaataataagtactggacataacagtacaagataggacaacacaacataagacagaacagcacaagataaatttt-atggtattgaataat 29054337  T
Q  141 tttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggata 240  Q
    ||| ||| ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  29054338 tttctgtattatatgatttttgggtgacgaaatgttattttg-tattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggcgagggaca 29054436  T
Q  241 aaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgt 340  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||  | || ||||||  |||    
T  29054437 aaaattgtagtttttgtcatgtcccttgcttccaatttgtcctgttcctgaaactgttttacaaatcaaacattggacagctttaattattctgttctgt 29054536  T
Q  341 ccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  29054537 ccttcattttttatcaaatcaaacgca 29054563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 34 - 365
Target Start/End: Original strand, 23636097 - 23636428
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcatt 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| |||||   |||||| |||| ||||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  23636097 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaaatactggatataacagtacaagacagaacaacacaacagaaggcagaactgtacatgacagttttttatggcatt 23636196  T
Q  134 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtg 233  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||   ||||| | |||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||  ||    
T  23636197 gaataattttttgttttatacaattttggggggacgaaatgctattttggatttttaaataacttgtacgtgagacaaaaatttgtgttgtggtttaatg 23636296  T
Q  234 agggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 333  Q
    |   | |||||||||||||||| || | | |||||| |||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  23636297 aataacaaaaatatgagtttttatcctattccttgcatccagtttatcatgtacctaaaacaattttacaaatcaaacactgaacaactgaagttgttct 23636396  T
Q  334 gtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacg 365  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23636397 gtcatatccttcattttttagcaaatcaaacg 23636428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 91 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 9902857 - 9902579
Alignment:
Q  91 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaat-tttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttt 189  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||| |||| |||||||  |||||| |||  |||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  9902857 acaacacaaggcagatcagtacataacaattttttataacattgaataaaatttttggtttatatgatttttgggggacgaaatgttattttggtatttt 9902758  T
Q  190 agacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacct 289  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  9902757 agacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttaatgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtcccttacctctagtttgtcctatacct 9902658  T
Q  290 gaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaa 368  Q
    |||||||||  |||||| |||||||| ||||||  ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9902657 gaaacagttcaacaaattaaacactgaacaactgaagttgttctatcctatccttcattttttagcaaatcaaacgcaa 9902579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 40 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 4494348 - 4494079
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagta 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| | |||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  4494348 ttggtttgcaaaacagtaagtactagacagaacagtacaggatagaacagcacaacataaggcagaacaacacaggacaaattttttatggcaatgagta 4494249  T
Q  139 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgaggga 238  Q
    ||||||||                 ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4494248 attttttg-----------------gggacaaaatgttatttcggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgaggga 4494166  T
Q  239 taaaaatatgagt-ttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 324  Q
     |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4494165 caaaaatatgagttttttgtcctgtcacttgcctccagtttgtcctgtacctgaaagagtcttacaaatcaaacactggacaactag 4494079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 34684247 - 34683929
Alignment:
Q  28 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatt--ttt 125  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| || ||   |||||| |||| | |||| |||| || |||    |||    
T  34684247 ctaagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtattggacaaaacagtacaagacaggacaacacaacataaggcataacaacacaggataaaaaagttt 34684148  T
Q  126 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgata-ttttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgt 224  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||    
T  34684147 atgacaatgagtaattttttgttttatacgatttttggaggacaaaatgctattttggtatttttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgttgt 34684048  T
Q  225 ggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 324  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||        |||||||||||||| |||||||||||||    
T  34684047 ggtttggtgagggacaaaa--atgagtttttgtcgtgtcccttgcctccagtttgtcatgtacc--------ttttacaaatcaaaaactggacaactag 34683958  T
Q  325 agttgttctgtcatgtccttcatttttta 353  Q
    ||||| |||| | | ||||| ||||||||    
T  34683957 agttggtctgacctatcctttatttttta 34683929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 14808254 - 14807940
Alignment:
Q  35 tgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattg 134  Q
    |||| |||||||||||||||  || || || ||||||||||| |||| |||||   |||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14808254 tgtgtttggtttgcaaaacaacaaatattgtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaatagcacaggacaaatttttatggaattg 14808155  T
Q  135 agtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtga 234  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||| ||  ||||||||| | |||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  14808154 aataatttttagttttatacgatttttgggggatgaaatgttattttggta-cttagacaacctatacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtga 14808056  T
Q  235 gggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctg 334  Q
    |||| |||||||| | ||||| || | ||||||||||| |||||                  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14808055 gggacaaaaatatcaatttttatcctatcccttgcctctagttt-----------------attttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctg 14807973  T
Q  335 tcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14807972 tcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 14807940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 32 - 182
Target Start/End: Original strand, 29814736 - 29814887
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaa-atttttatggc 130  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||    
T  29814736 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaatttttttatggc 29814835  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttg 182  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  29814836 attgagtaatgttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttg 29814887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 182
Target Start/End: Original strand, 28502330 - 28502482
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt--atgg 129  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||   |||    
T  28502330 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaatttttttattgg 28502429  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttg 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28502430 cattgagtaatgttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttg 28502482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 110 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 7396302 - 7396048
Alignment:
Q  110 cacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggat 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  || | |||| |||||||| ||||||||  |||||||  ||||||||| |||||||||||| ||     
T  7396302 cacatgacaaatttttatggtattgaataatttt--gtctcataccatttttgatggacaaaacactatttttgtattttagataacttgtacgtgagac 7396205  T
Q  210 gaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaa 309  Q
     ||||||||||  ||||||| |||||||| || | | |  ||||||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||| || ||||||| ||||||||||||    
T  7396204 aaaaagttgtgtagtggtttagtgagggacaagatt-tctgtttttgtcctgtccattgcttccagcttgtcatgtcccagaaacagctttacaaatcaa 7396106  T
Q  310 acactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||   ||||||  | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7396105 acaccatacaactgaaattgttttgtcatgtccttcatttcttagcaaatcaaacgca 7396048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 184 - 363
Target Start/End: Original strand, 9613998 - 9614177
Alignment:
Q  184 tattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcct 283  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |  |||| ||||| || ||||| |||||  | |||||  | |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9613998 tattttagacaacttatacgtggaacaaaaaattgtgttgcggtttagtgagtaacaaaaacttcaaattttgtcatgtcccttgcctccagtttatcct 9614097  T
Q  284 gtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 363  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  9614098 gtccttgaaacagttttacaaatcaaacattgtacaactgaagttttcttgttatgtccttcattttttagcagatcaaa 9614177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 125
Target Start/End: Original strand, 32805348 - 32805442
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32805348 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacataacagtacaagatagaacaatacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttt 32805442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 91 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 35004326 - 35004087
Alignment:
Q  91 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 190  Q
    |||| |||||| |||||| ||||| ||||| |||||||  ||||| || ||||| || |||||| |||||| |  |||||||  ||||||||||||||||    
T  35004326 acaatacaaggcagaacaacacataacaaacttttatgatattgaatagtttttggtattatacaattttttattgacaaaaatctattttgatatttta 35004227  T
Q  191 gacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 290  Q
    || |||||||||||||||  || ||||||| |||||||   |||| || |||||  | |||||||||| |||| |||| |||| |||| || ||| |       
T  35004226 gaaaacttgtacgtgggacaaagagttgtgttgtggttatatgagagacaaaaaatttagtttttgtcttgtctcttgtctccggtttatcttgtcctat 35004127  T
Q  291 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  35004126 aaaccgttttacaaatcaaacaccgcacaactggagttgt 35004087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 27824849 - 27824620
Alignment:
Q  91 acaacacaaggtag-aacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttt 189  Q
    |||||||||||| | ||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  | ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||  ||||||    
T  27824849 acaacacaaggttggaacaatacatgacaaacttttatggtattgaataatttttgatcttatatgatttttgttggacaaaaagctatttttgtatttt 27824750  T
Q  190 agacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacct 289  Q
     || |||| ||||||||||  |||||||||| |||||| |  ||||||| ||   | |   || || || | ||||||||||| |||||||||| | ||     
T  27824749 ggataactcgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtataatgagggacaatttttt---ttcttctcttatcccttgcctctagtttgtcctttccca 27824653  T
Q  290 gaaacagttttacaaatcaaacactggacaact 322  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27824652 aaaacagttttacaaatcaaacactgtacaact 27824620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 108
Target Start/End: Original strand, 11381964 - 11382040
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaaca 108  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11381964 gggtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtactgaacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaaca 11382040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 291 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 14925215 - 14925139
Alignment:
Q  291 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14925215 aaacaattttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcatgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 14925139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 186 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 9200491 - 9200316
Alignment:
Q  186 ttttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccctt-gcctccagtttgtcctg 284  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||  |||||||||  | ||||||||||||||| || ||| |  ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| ||    
T  9200491 ttttaaacaatttgtatgtgggacaaaaagttgttatatggtttggtgagggagaagaatttttgtttttgtcttgtctcttagcctctagtttgtcatg 9200392  T
Q  285 tacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatc 360  Q
    |   | |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||  |||| ||||||| | |||||||||||||    
T  9200391 tctttaaaacagttttacaaatcaaacattgtacaacttgagttgtcatgtcttgtccttaactttttagcaaatc 9200316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 297 - 366
Target Start/End: Original strand, 33041403 - 33041472
Alignment:
Q  297 ttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgc 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||    
T  33041403 ttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcctattcttcattttttaacaaatcaaacgc 33041472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 97
Target Start/End: Original strand, 11279012 - 11279075
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacac 97  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  11279012 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggatagaacagtacaagatagaacagtacaacac 11279075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 297 - 364
Target Start/End: Original strand, 13415861 - 13415928
Alignment:
Q  297 ttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  13415861 ttttacaaatcaaacactgtacaactagagttgttatgttctgtctttcgttttttagcaaatcaaac 13415928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 28967414 - 28967221
Alignment:
Q  169 aaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttg 268  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  || |||||||| | |||||||  ||||   | ||  |  |  |||||||||  ||| | ||    
T  28967414 aaaatgctattttgataatttagacaacttgtacttgaaataaaaagttgggttgtggttcagtgaaaaacaatcacttttgtttttgtcccgtctcgtg 28967315  T
Q  269 cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 363  Q
    ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||| ||| |||  | || |  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28967314 cctccagtttgtcatgttcttggaacagttttacaaattaaagactctataattgaagtt-ttatgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 28967221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 364
Target Start/End: Original strand, 34402850 - 34402992
Alignment:
Q  214 agttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacac 313  Q
    |||||||||||| |||| | ||||| || ||| | |||||||||| | |||||   |||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||    |    
T  34402850 agttgtgctgtgatttgataagggacaataatttcagtttttgtcgtatccct---ctccagtttgttttgt-cctgaaacaattttacaaatca----c 34402941  T
Q  314 tggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    ||||||| |  |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  34402942 tggacaattgaagttgttctgtcttgtcctccattttttaacaaatcaaac 34402992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 32614136 - 32614030
Alignment:
Q  91 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 190  Q
    ||||||||||| | |||| || |||||||| |||||||| |||   |||||||| || ||||||||||||||  |||||||| | |||||| ||||||||    
T  32614136 acaacacaaggcataacaacatatgacaaacttttatggtattatataatttttggtcttatacgatttttggtggacaaaaagttatttttatatttta 32614037  T
Q  191 gacaact 197  Q
    || ||||    
T  32614036 gataact 32614030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 76
Target Start/End: Original strand, 34176715 - 34176760
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 76  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34176715 agggtgggtttggtttgcaaaacggtaagtactggacagaacagta 34176760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 167170 - 167122
Alignment:
Q  28 ctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 76  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  167170 ctaagggtgtgtttgatgtgcaaaacagtaaatactggacagaacagta 167122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 225
Target Start/End: Original strand, 27756314 - 27756370
Alignment:
Q  169 aaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtg 225  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| ||||    
T  27756314 aaaatgttattttgatattttagacaacttatacgggggacaaaaagttgtgttgtg 27756370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 29424570 - 29424498
Alignment:
Q  291 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaa 363  Q
    ||||| |||||||||| |||||||  | || |||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  29424570 aaacaattttacaaataaaacactatagaattagagttgtcatgtcatgtcctttattttctagcaaatcaaa 29424498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 111 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29203104 - 29202990
Alignment:
Q  111 acatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatg 210  Q
    ||||||||||||||||||  |||||  |||| ||||| ||||| || ||||   ||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| || ||      
T  29203104 acatgacaaatttttatgatattgaacaattatttgtcttatatgaatttttgtggacaaaatgct-ctttggtattttaaacaacttgtacttgagaga 29203006  T
Q  211 aaaagttgtgctgtgg 226  Q
    |||||||||| |||||    
T  29203005 aaaagttgtgttgtgg 29202990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16542440 - 16542362
Alignment:
Q  124 ttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 202  Q
    |||||| ||||| ||||||||| | |||||| |||||||  | | |||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16542440 ttatggtattgaataattttttatcttatacaatttttgttgcataaaaggttattttggtattttagacaacttgtac 16542362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 211 - 273
Target Start/End: Original strand, 24785106 - 24785168
Alignment:
Q  211 aaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcc 273  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || || ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  24785106 aaaaattgtgttgtggtttagtgagcgacaagaatttcagtttttgtcatgtcccttgcctcc 24785168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29424734 - 29424652
Alignment:
Q  122 ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgt 204  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || || |||| ||||||  ||||||||  |||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  29424734 ttttatggtattgaataatttttggtcttgtacgttttttggtggacaaaaaactatttttgtattttagataacttgtacgt 29424652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15400760 - 15400672
Alignment:
Q  111 acatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 202  Q
    |||||||||| |||||||| |||||   ||||||||| | |||| || | ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15400760 acatgacaaacttttatggtattga---attttttgtctcatacaatgtatgatggacaaaagactattttgatattttaaacaatttgtac 15400672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15412547 - 15412459
Alignment:
Q  111 acatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 202  Q
    |||||||||| |||||||| |||||   ||||||||| | |||| || | ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15412547 acatgacaaacttttatggtattga---attttttgtctcatacaatgtatgatggacaaaagactattttgatattttaaacaatttgtac 15412459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15428141 - 15428053
Alignment:
Q  111 acatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtac 202  Q
    |||||||||| |||||||| |||||   ||||||||| | |||| || | ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15428141 acatgacaaacttttatggtattga---attttttgtctcatacaatgtatgatggacaaaagactattttgatattttaaacaatttgtac 15428053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 195
Target Start/End: Original strand, 7365318 - 7365422
Alignment:
Q  91 acaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatttta 190  Q
    |||||||||| || || | ||||| | | |||||||||| ||| | |||||||| || |||||| ||||||   |||||||   ||||||||||||||||    
T  7365318 acaacacaagttaaaataacacataatatatttttatggtattaaataatttttagtcttataccattttttgcggacaaatgactattttgatatttta 7365417  T
Q  191 gacaa 195  Q
    |||||    
T  7365418 gacaa 7365422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Original strand, 101819 - 102156
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttt-tatgg 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  101819 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtaccggacagaacagtataagatagaacagtacaatataaggtagaacagcacaggacaaattttttatgg 101918  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  101919 cattgagtaattttttgttttatacgattttttagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggttt 102018  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  102019 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtccgttgcctccaagttgtcctgtacatgaaacagttttacaaatcaaacactggataactagagttg 102118  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  102119 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 102156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 2)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 32 - 372
Target Start/End: Original strand, 23448 - 23787
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggc 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  23448 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactggacagaacagtacaagatagaacaatacaacacaaggcagaacagcactggacaaattttttatggc 23547  T
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  23548 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaa--tgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 23645  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 330  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23646 gtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcaagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 23745  T
Q  331 tctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 372  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23746 tctgtcctgcccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 23787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 315
Target Start/End: Original strand, 19857 - 20062
Alignment:
Q  110 cacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggat 209  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| |  |||| |||||||||| | ||||||  |||||||| ||||| | ||||||||||||||  |     
T  19857 cacatgacaaacttttatggtattgaataatatttggcgttatgcgatttttgatgaacaaaagactattttggtatttcaaacaacttgtacgtgaaac 19956  T
Q  210 gaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaa 309  Q
     ||||||||| | ||||||| ||||| || || ||| | |||||||||||| ||||||  || || |||||| | |  || ||||||||||||| |||||    
T  19957 aaaaagttgtacagtggtttagtgagtgacaagaatttcagtttttgtcatatcccttttctacaatttgtcttatctctaaaacagttttacatatcaa 20056  T
Q  310 acactg 315  Q
    ||||||    
T  20057 acactg 20062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 29 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 2566 - 2222
Alignment:
Q  29 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-at 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  2566 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaatagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttat 2467  T
Q  128 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggt 227  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2466 gacattgagtaattttttgttttataggatttttatgggacaaaaaactattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggt 2367  T
Q  228 ttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 327  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  2366 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact-gaaaactaaagt 2268  T
Q  328 tgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaacctaa 373  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2267 tgttctatcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaccctaa 2222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Original strand, 51311 - 51645
Alignment:
Q  33 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 131  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||  ||||||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  51311 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaatatagaacagtataatacaagacagaacagcacaagacaaattttttatgaca 51410  T
Q  132 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  51411 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt-g 51509  T
Q  232 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  51510 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcatccagtttgttctgcacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaattaaagttgtt 51609  T
Q  332 ctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51610 ctgttttgtccttcattttttatcaaatcaaacgca 51645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 27 - 372
Target Start/End: Original strand, 15038 - 15384
Alignment:
Q  27 tctaagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatt-ttt 125  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||   |||    
T  15038 tctatgggggtgtttggtttgcaaaacagtaagtaccggacagaacagtacaaaatagaacagtacaacataaggcagaacaacacatgaaaaaaaattt 15137  T
Q  126 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtg 225  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||    
T  15138 atggcattgagtaatttgttgttttataagatttttgggggacaaaatactattttagtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtg 15237  T
Q  226 gtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 325  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15238 gtttggtgggggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaattaga 15337  T
Q  326 gttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaaccta 372  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15338 gttgttttgtcttgtccttcattttttagcaaatcaaacgcacccta 15384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 33 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18278 - 17982
Alignment:
Q  33 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 131  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  18278 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggatagaacagtacaagatagaacagtacaacacatgtcagaacagcacaagacaaattttttatagca 18179  T
Q  132 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  18178 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 18079  T
Q  232 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 328  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18078 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 17982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 33 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12760 - 12527
Alignment:
Q  33 ggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggca 131  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  12760 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggatagaacagtacaagatagaacagtacaacacatgtcagaacagcacaagacaaattttttatagca 12661  T
Q  132 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttgg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  12660 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 12561  T
Q  232 tgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtccc 265  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  12560 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccc 12527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0729 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0729
Description:

Target: scaffold0729; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 34 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4796 - 4468
Alignment:
Q  34 gtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcat 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4796 gtgtgtttggtttgcaaaacag------ctggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcat 4703  T
Q  133 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggt 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  4702 tgagtaattttttgttttatacgattttttagagacaaaatgatattttgatgttttagacaacttttacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 4603  T
Q  233 gagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 332  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4602 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtgctatacctaaatcaattttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 4503  T
Q  333 tgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4502 tgtcctgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 4468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0957 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0957
Description:

Target: scaffold0957; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 57 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 2695 - 2385
Alignment:
Q  57 aagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacg 155  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  2695 aagtactggacataacagtataagatagaacaatacaacacaaggtagaacaacacatgacaaattttttatgagattgggtaattttttgttttatacg 2596  T
Q  156 atttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagttttt 255  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  || ||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  2595 atttttgggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagac-aatagttgtgttgtggtttggttagggacaaagatatgagttttt 2497  T
Q  256 gtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagc 355  Q
    ||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  2496 gtcctgtccctttcctccaatttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttatgtcttgtccttcaatttttagc 2397  T
Q  356 aaatcaaacgca 367  Q
    ||||||||||||    
T  2396 aaatcaaacgca 2385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 40 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 5656 - 5332
Alignment:
Q  40 ttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaa 139  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||   ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  5656 ttggtttgcaaaacagcaagtactggacataacagtacaagacagaacaacacaacacaaggcagaacagcacaggacaaatttttatgacattgaataa 5557  T
Q  140 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggat 239  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||||  |||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||     
T  5556 ttttttgttttatacgatttttggggctcgaaatgttatttttgtattttaggcaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggac 5457  T
Q  240 aaaaatatgag-tttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcat 338  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |    
T  5456 aaaaatatgtgttttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgttct 5357  T
Q  339 gtccttcattttttagcaaatcaaa 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  5356 gtccttcattttttagcaaatcaaa 5332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 89 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 19258 - 18989
Alignment:
Q  89 gtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatt 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  19258 gtacaacacaaggtagaacagcacatggcaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgttattttggtatt 19159  T
Q  188 ttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtac 287  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19158 ttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagggacaaaaatatgag-ttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtac 19060  T
Q  288 ctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaat 359  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19059 ctg-aacagttttacaaatcaaacactggacaaatataattgttctgtcctgtccttcattttttagcaaat 18989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 3)
Name: scaffold0360
Description:

Target: scaffold0360; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 83 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15551 - 15262
Alignment:
Q  83 agaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttt-atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 181  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  15551 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggataaattttttatgacattgagtaattttttgttttatacgatttttgagg----aaatgctatttt 15456  T
Q  182 gatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtca--------tgtcccttgcctcc 273  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        ||||||||||||||    
T  15455 ggtattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtgatcttgtcccttgcctcc 15356  T
Q  274 agtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15355 agtttatcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctatcatgttcttcattttttagcaaatcaaacgca 15262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 13704 - 13554
Alignment:
Q  131 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtttg 230  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| || ||  ||||||||||  ||  |||     
T  13704 attgattaattattggtcttatacgatttttgatggacaaaatactattttggtattctagacaacttgtacatgtgacaaaaagttgtgtcgtatttta 13605  T
Q  231 gtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 281  Q
    ||||| || | |||| | | |||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  13604 gtgagagacacaaatttcaatttttgtcatgtctattgcctccaatttgtc 13554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 15587 - 15543
Alignment:
Q  32 gggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 76  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15587 gggtgtgtttggtttgtaaaacagtaagtactggacagaacagta 15543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 121 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 373099 - 372856
Alignment:
Q  121 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtg 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  373099 tttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgatattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 373000  T
Q  221 ctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 320  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  372999 ttatggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatatcccttgtctccagttttttctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacatttgacaa 372900  T
Q  321 ctagagttgttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  372899 ctaaaattgttctgtcatatccttcattttttagcaaataaaac 372856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 373176 - 373130
Alignment:
Q  30 aagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 76  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  373176 aaggatgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactgaacagaacagta 373130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 30 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 13913 - 13576
Alignment:
Q  30 aagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatgg 129  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||   | || |||||| | ||  ||||| |||||||||||||||    
T  13913 aagggtgcgtttgatttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataatgcagaacaacaaaatacaaggcataattgcacaggacaaatttttatgg 13814  T
Q  130 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggttt 229  Q
     ||||| |||||| |||||||||| | |||||| |||||  |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||    
T  13813 tattgaataatttcttgttttatatgctttttgggggacggaatgctattttggtgttttagacaacttgtaagtgggacaaaaagttgtactgtggttt 13714  T
Q  230 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 329  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13713 ggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcctatcccttgcctccagtttgttctgtccctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactggagttg 13614  T
Q  330 ttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13613 ttctgtcctgtccttcattttttaacaaatcaaacgca 13576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0650 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0650
Description:

Target: scaffold0650; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 29 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 1870 - 1531
Alignment:
Q  29 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 128  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| |||||| | |||||||| ||| ||   | ||| | ||||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||    
T  1870 taagggtgcgtttgatttgcaaaacaataagtatttgacagaactgtacaaagcaaaacagcacaacacaagagagaacaacacagaacaaatttttatg 1771  T
Q  129 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 228  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  1770 gtattgaataattttttgttttatatgacttttgagggacgaaatgctattttggttttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtt 1671  T
Q  229 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 328  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  1670 tggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcctatccttgaaacagttttacaaatcaaacactggagaactgaagtt 1571  T
Q  329 gttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaacgcaa 368  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1570 gttctgttttgtccttcattttttaacaaatcaaacgcaa 1531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 43176 - 42843
Alignment:
Q  29 taagggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacggtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatg 128  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||   ||||| | |||| |||||| | || |  |||   ||||||||| ||    
T  43176 taagggtgcgtttggtttgcaaaacagtaagtactagacagagcagtacaatgcagaacagcacaatacaaggcataataatacagatcaaatttttgtg 43077  T
Q  129 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgctgtggtt 228  Q
    | ||||| |||||| |||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  43076 gtattgaataatttcttgttttatatgattgtttggggacaacatgctattttggtgttttagacaa-ttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtt 42978  T
Q  229 tggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 328  Q
    |||||||||| | |||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||    
T  42977 tggtgagggacacaaatttcagtttttgttctgtcccttgcctccagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggacta-tggagtt 42879  T
Q  329 gttctgtcatgtccttcattttttagcaaatcaaac 364  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  42878 gttctgtcttatccttcattttttaacaaatcaaac 42843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 211 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 19201 - 19044
Alignment:
Q  211 aaaagttgtgctgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaa 310  Q
    |||||||||| || | |||| ||||||| |||||| | |||||||||| ||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19201 aaaagttgtgttgagctttgatgagggacaaaaatttcagtttttgtcctgtccattgcctcctgtttattctgtccctgaaacagttttacaaatcaaa 19102  T
Q  311 cactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatt-ttttagcaaatcaaacgca 367  Q
    ||||||| |||| || ||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19101 cactggataactggaattgttatgtcctatccttcatttttttaacaaatcaaacgca 19044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 33678 - 33530
Alignment:
Q  122 ttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggatgaaaagttgtgc 221  Q
    |||||||  ||||| |||||||| || |||||| | |||||| ||||||||  |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||     
T  33678 ttttatgatattgaataatttttggtcttatacaagttttgatggacaaaagcctattttggtattttatacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgt 33579  T
Q  222 tgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcct 271  Q
    ||||||||| ||||||| || ||| | | |||||||||||||||||||||    
T  33578 tgtggtttgatgagggacaagaatttca-tttttgtcatgtcccttgcct 33530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 3791 - 3683
Alignment:
Q  93 aacacaaggtagaacagcacatgacaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttaga 192  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| | ||||| ||||||||  ||| ||||  |||||||  |||||||||    
T  3791 aacacaaggtagaatagtacatgacaaacttttatgatattgaataattttttatcttatatgatttttggtggataaaaaactatttttgtattttaga 3692  T
Q  193 caacttgta 201  Q
     ||||||||    
T  3691 taacttgta 3683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1112 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1112
Description:

Target: scaffold1112; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 187
Target Start/End: Original strand, 1078 - 1127
Alignment:
Q  138 aattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatatt 187  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  1078 aatttttggttttatacgatttttgagggacaagatgatattttgatatt 1127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 76
Target Start/End: Original strand, 338757 - 338802
Alignment:
Q  31 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagta 76  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  338757 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacataacagta 338802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 344 times since January 2019
Visitors: 4379