View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0682_low_4 (Length: 473)

Name: NF0682_low_4
Description: NF0682
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0682_low_4
NF0682_low_4
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (97-462)||(2041-2406)
scaffold0234 (97-462)||(10932-11297)
[»] chr7 (50 HSPs)
chr7 (101-462)||(15152565-15152926)
chr7 (97-462)||(29327906-29328271)
chr7 (97-462)||(11535782-11536147)
chr7 (97-462)||(11542700-11543065)
chr7 (97-462)||(12750948-12751313)
chr7 (97-462)||(12738658-12739023)
chr7 (97-462)||(18561129-18561485)
chr7 (97-464)||(13392270-13392637)
chr7 (91-464)||(18257559-18257929)
chr7 (97-413)||(2204543-2204854)
chr7 (97-413)||(18400095-18400406)
chr7 (97-413)||(18407079-18407390)
chr7 (97-413)||(48808496-48808807)
chr7 (97-404)||(8464999-8465301)
chr7 (363-462)||(15148264-15148363)
chr7 (97-413)||(15729742-15730053)
chr7 (97-413)||(18139338-18139649)
chr7 (97-413)||(19230879-19231190)
chr7 (109-413)||(30254129-30254428)
chr7 (97-336)||(41680968-41681203)
chr7 (97-337)||(2365169-2365407)
chr7 (109-463)||(47166871-47167221)
chr7 (97-329)||(34128647-34128875)
chr7 (97-413)||(10668901-10669213)
chr7 (119-403)||(24443349-24443628)
chr7 (97-336)||(28130628-28130863)
chr7 (182-329)||(19388626-19388774)
chr7 (99-385)||(10235361-10235644)
chr7 (97-336)||(18259124-18259359)
chr7 (281-464)||(7662569-7662751)
chr7 (119-325)||(25845498-25845700)
chr7 (119-325)||(25845917-25846119)
chr7 (366-464)||(2365015-2365112)
chr7 (135-336)||(19393462-19393659)
chr7 (97-329)||(14591924-14592153)
chr7 (97-329)||(16011515-16011744)
chr7 (183-322)||(31190524-31190660)
chr7 (271-409)||(3132849-3132986)
chr7 (326-415)||(7396358-7396450)
chr7 (197-329)||(22969024-22969153)
chr7 (108-245)||(39112138-39112275)
chr7 (295-403)||(47833875-47833983)
chr7 (304-404)||(19859122-19859221)
chr7 (171-246)||(22948499-22948574)
chr7 (97-285)||(15169290-15169474)
chr7 (281-339)||(7396469-7396527)
chr7 (187-251)||(29984308-29984372)
chr7 (304-416)||(39111980-39112092)
chr7 (194-334)||(3587978-3588118)
chr7 (315-409)||(29983141-29983234)
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (97-462)||(18252152-18252517)
chr1 (97-462)||(18532234-18532599)
chr1 (97-462)||(27131130-27131494)
chr1 (97-462)||(27310297-27310662)
chr1 (97-462)||(16358755-16359120)
chr1 (97-464)||(3855639-3856006)
chr1 (97-464)||(36816354-36816720)
chr1 (225-462)||(21171081-21171318)
chr1 (97-464)||(27277278-27277644)
chr1 (97-378)||(22641594-22641871)
chr1 (264-461)||(22657108-22657305)
chr1 (97-446)||(23507038-23507385)
chr1 (175-463)||(12014084-12014370)
chr1 (97-413)||(19706439-19706750)
chr1 (97-413)||(43802365-43802676)
chr1 (97-413)||(28134723-28135034)
chr1 (97-413)||(9456107-9456418)
chr1 (97-413)||(20391239-20391550)
chr1 (97-413)||(20779645-20779956)
chr1 (97-413)||(22670257-22670568)
chr1 (97-413)||(42816989-42817300)
chr1 (97-290)||(9916497-9916689)
chr1 (295-464)||(9917837-9918005)
chr1 (97-413)||(22612483-22612794)
chr1 (117-336)||(634001-634216)
chr1 (97-329)||(8727741-8727969)
chr1 (299-464)||(12006461-12006626)
chr1 (97-413)||(47667485-47667785)
chr1 (97-225)||(28145723-28145850)
chr1 (113-336)||(29096789-29097008)
chr1 (197-329)||(21881475-21881604)
chr1 (184-339)||(24301691-24301845)
chr1 (272-413)||(35930573-35930713)
chr1 (194-329)||(51997353-51997485)
chr1 (199-258)||(10852402-10852461)
chr1 (270-325)||(26923553-26923608)
chr1 (164-244)||(12006332-12006413)
chr1 (236-315)||(31236402-31236478)
[»] chr8 (42 HSPs)
chr8 (98-462)||(21940787-21941151)
chr8 (97-462)||(22171609-22171974)
chr8 (97-462)||(6094245-6094610)
chr8 (97-462)||(24642771-24643135)
chr8 (97-360)||(15326422-15326685)
chr8 (97-360)||(15506791-15507054)
chr8 (97-238)||(28548393-28548534)
chr8 (164-464)||(14983710-14984006)
chr8 (113-462)||(38232115-38232462)
chr8 (97-413)||(8371253-8371564)
chr8 (97-413)||(21969324-21969635)
chr8 (97-413)||(12562114-12562425)
chr8 (212-409)||(24797224-24797419)
chr8 (97-413)||(27007517-27007828)
chr8 (97-413)||(27014660-27014971)
chr8 (97-413)||(27880487-27880798)
chr8 (97-413)||(28020668-28020979)
chr8 (97-413)||(22130609-22130920)
chr8 (97-413)||(25611186-25611497)
chr8 (97-336)||(22659494-22659729)
chr8 (97-413)||(21916667-21916978)
chr8 (97-413)||(45534273-45534584)
chr8 (277-457)||(32872741-32872921)
chr8 (97-336)||(26240551-26240786)
chr8 (194-413)||(18835341-18835556)
chr8 (97-336)||(6430953-6431188)
chr8 (383-462)||(28555005-28555084)
chr8 (182-389)||(8781959-8782162)
chr8 (113-259)||(20535226-20535371)
chr8 (107-204)||(24796731-24796826)
chr8 (97-336)||(2962932-2963171)
chr8 (295-381)||(2375214-2375300)
chr8 (307-401)||(29645537-29645631)
chr8 (92-255)||(36970394-36970556)
chr8 (330-464)||(24535435-24535569)
chr8 (93-210)||(2375411-2375528)
chr8 (297-336)||(36970332-36970371)
chr8 (124-246)||(29645675-29645797)
chr8 (97-158)||(8968015-8968076)
chr8 (305-357)||(10920427-10920479)
chr8 (109-157)||(41368106-41368154)
chr8 (109-157)||(41375077-41375125)
[»] chr4 (57 HSPs)
chr4 (97-455)||(55612812-55613170)
chr4 (97-462)||(8858289-8858654)
chr4 (97-462)||(18262334-18262699)
chr4 (97-462)||(18269195-18269560)
chr4 (97-462)||(19926480-19926845)
chr4 (97-462)||(26963762-26964127)
chr4 (97-462)||(26970585-26970950)
chr4 (97-462)||(868719-869084)
chr4 (97-462)||(28392854-28393219)
chr4 (97-462)||(5707442-5707807)
chr4 (97-462)||(5714070-5714435)
chr4 (97-462)||(10621053-10621418)
chr4 (97-462)||(10628132-10628497)
chr4 (97-462)||(8845325-8845690)
chr4 (97-462)||(4426336-4426689)
chr4 (97-464)||(35223680-35224047)
chr4 (97-464)||(5667849-5668214)
chr4 (93-457)||(20311419-20311781)
chr4 (97-329)||(10677303-10677534)
chr4 (97-329)||(10890943-10891174)
chr4 (97-413)||(15461488-15461799)
chr4 (97-413)||(34975542-34975853)
chr4 (97-413)||(2677004-2677315)
chr4 (97-413)||(15815012-15815323)
chr4 (97-413)||(18111043-18111354)
chr4 (97-413)||(3369023-3369334)
chr4 (97-413)||(17299959-17300270)
chr4 (97-413)||(18163153-18163464)
chr4 (97-413)||(20243928-20244239)
chr4 (97-413)||(26531604-26531915)
chr4 (97-463)||(1941664-1942026)
chr4 (272-464)||(56516176-56516368)
chr4 (97-413)||(4675983-4676294)
chr4 (113-336)||(19365586-19365806)
chr4 (97-403)||(5870419-5870720)
chr4 (198-445)||(21453961-21454205)
chr4 (114-336)||(19362477-19362695)
chr4 (97-422)||(32646523-32646846)
chr4 (97-329)||(9487625-9487853)
chr4 (113-464)||(5616333-5616681)
chr4 (360-464)||(10677538-10677640)
chr4 (360-464)||(10891178-10891280)
chr4 (113-336)||(5528495-5528714)
chr4 (97-317)||(30040489-30040705)
chr4 (199-335)||(32636552-32636685)
chr4 (322-400)||(24700213-24700291)
chr4 (113-329)||(9538033-9538244)
chr4 (182-336)||(4546147-4546298)
chr4 (97-314)||(11421096-11421309)
chr4 (367-448)||(39074190-39074271)
chr4 (114-253)||(23056080-23056218)
chr4 (346-428)||(9937933-9938015)
chr4 (175-225)||(24701361-24701411)
chr4 (125-206)||(9937745-9937826)
chr4 (194-348)||(33888594-33888743)
chr4 (230-357)||(34777850-34777975)
chr4 (236-327)||(9937830-9937923)
[»] chr3 (48 HSPs)
chr3 (97-455)||(16482203-16482561)
chr3 (97-462)||(6110186-6110551)
chr3 (97-462)||(15341939-15342304)
chr3 (97-462)||(15357306-15357671)
chr3 (97-462)||(15600604-15600969)
chr3 (97-462)||(15607149-15607514)
chr3 (97-462)||(10572312-10572677)
chr3 (97-462)||(10579075-10579440)
chr3 (101-462)||(18522785-18523146)
chr3 (97-462)||(17780838-17781203)
chr3 (97-447)||(18520112-18520462)
chr3 (97-462)||(32056619-32056985)
chr3 (97-462)||(13248729-13249094)
chr3 (97-462)||(8490610-8490982)
chr3 (97-462)||(13211424-13211789)
chr3 (93-462)||(17199900-17200269)
chr3 (97-461)||(13516934-13517294)
chr3 (97-462)||(17136481-17136840)
chr3 (97-462)||(1647241-1647606)
chr3 (97-464)||(29925091-29925458)
chr3 (97-464)||(29974244-29974611)
chr3 (97-464)||(16200551-16200917)
chr3 (97-413)||(21034229-21034540)
chr3 (97-413)||(15846536-15846847)
chr3 (97-413)||(20147554-20147865)
chr3 (115-462)||(24253130-24253473)
chr3 (97-404)||(21398792-21399094)
chr3 (97-413)||(55427012-55427323)
chr3 (97-404)||(14890391-14890693)
chr3 (344-464)||(16200245-16200364)
chr3 (366-462)||(19089734-19089830)
chr3 (97-413)||(12299902-12300212)
chr3 (97-336)||(25978728-25978963)
chr3 (131-329)||(15526827-15527021)
chr3 (195-413)||(14147012-14147226)
chr3 (97-255)||(28088251-28088408)
chr3 (97-336)||(11787654-11787889)
chr3 (97-336)||(15317176-15317408)
chr3 (171-413)||(32280260-32280507)
chr3 (236-401)||(28953929-28954093)
chr3 (319-421)||(9504446-9504548)
chr3 (135-250)||(30464147-30464261)
chr3 (293-408)||(8251933-8252048)
chr3 (194-258)||(36138033-36138097)
chr3 (358-433)||(19345720-19345795)
chr3 (423-462)||(18640792-18640831)
chr3 (216-325)||(4189223-4189329)
chr3 (194-258)||(36142816-36142880)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (97-462)||(7229-7594)
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (97-462)||(6654-7019)
scaffold0390 (97-462)||(13670-14035)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (97-462)||(11651845-11652210)
chr6 (97-462)||(17684189-17684554)
chr6 (97-462)||(17691160-17691525)
chr6 (97-462)||(27380972-27381337)
chr6 (97-462)||(27471355-27471720)
chr6 (97-462)||(29309012-29309377)
chr6 (97-462)||(29315972-29316336)
chr6 (97-462)||(188697-189062)
chr6 (97-336)||(27296877-27297116)
chr6 (97-370)||(16394165-16394438)
chr6 (101-338)||(25536915-25537152)
chr6 (98-319)||(16559193-16559414)
chr6 (114-464)||(13359010-13359356)
chr6 (314-462)||(16566257-16566405)
chr6 (97-413)||(16789062-16789373)
chr6 (97-413)||(22859888-22860199)
chr6 (97-413)||(27508347-27508658)
chr6 (107-401)||(2669476-2669768)
chr6 (366-462)||(25537148-25537244)
chr6 (97-413)||(1586108-1586419)
chr6 (111-413)||(27527947-27528244)
chr6 (275-464)||(27925874-27926062)
chr6 (200-462)||(17850321-17850579)
chr6 (97-413)||(14074471-14074782)
chr6 (141-413)||(18019885-18020152)
chr6 (280-464)||(20553492-20553674)
chr6 (119-336)||(10359073-10359285)
chr6 (97-462)||(8612857-8613221)
chr6 (182-464)||(20736413-20736691)
chr6 (281-442)||(28172698-28172859)
chr6 (166-462)||(8510045-8510338)
chr6 (97-336)||(17120505-17120740)
chr6 (194-336)||(21994655-21994794)
chr6 (97-210)||(33317055-33317167)
chr6 (182-329)||(5758565-5758709)
chr6 (114-253)||(28756145-28756283)
chr6 (194-406)||(19218427-19218630)
chr6 (269-390)||(19347092-19347212)
chr6 (309-413)||(13995151-13995254)
chr6 (175-238)||(28172899-28172963)
chr6 (225-405)||(22560311-22560487)
[»] chr5 (37 HSPs)
chr5 (97-462)||(24695186-24695551)
chr5 (97-462)||(19714218-19714583)
chr5 (97-459)||(18569581-18569945)
chr5 (97-462)||(19706939-19707303)
chr5 (225-462)||(39538710-39538947)
chr5 (184-464)||(18806843-18807121)
chr5 (97-388)||(17298621-17298912)
chr5 (97-388)||(17285470-17285759)
chr5 (273-464)||(22546912-22547103)
chr5 (93-259)||(27347252-27347417)
chr5 (97-204)||(24701950-24702057)
chr5 (97-413)||(20941018-20941329)
chr5 (97-413)||(25805385-25805696)
chr5 (97-413)||(31890-32201)
chr5 (97-413)||(12789663-12789974)
chr5 (97-413)||(22941241-22941552)
chr5 (97-413)||(23545913-23546224)
chr5 (97-413)||(24933306-24933617)
chr5 (324-464)||(27347425-27347565)
chr5 (109-402)||(20100255-20100543)
chr5 (97-413)||(31096807-31097118)
chr5 (97-463)||(5097591-5097953)
chr5 (97-462)||(12764990-12765354)
chr5 (97-462)||(7865430-7865794)
chr5 (97-462)||(12703874-12704238)
chr5 (97-329)||(9811733-9811965)
chr5 (93-182)||(28719471-28719558)
chr5 (184-322)||(18806483-18806619)
chr5 (184-322)||(18806663-18806799)
chr5 (93-336)||(26129689-26129928)
chr5 (97-413)||(26245093-26245404)
chr5 (97-335)||(18829281-18829519)
chr5 (97-178)||(39538954-39539035)
chr5 (405-464)||(17285760-17285819)
chr5 (405-464)||(17298913-17298972)
chr5 (358-427)||(31887299-31887368)
chr5 (272-401)||(33477193-33477321)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (97-462)||(18410-18774)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (93-462)||(25706-26075)
[»] chr2 (29 HSPs)
chr2 (97-462)||(21329968-21330333)
chr2 (97-464)||(18796626-18796993)
chr2 (91-464)||(18619924-18620296)
chr2 (97-462)||(36270288-36270650)
chr2 (97-465)||(22183206-22183571)
chr2 (109-442)||(18822225-18822556)
chr2 (97-464)||(20978012-20978360)
chr2 (111-409)||(6991847-6992146)
chr2 (97-413)||(30174368-30174679)
chr2 (97-413)||(24250032-24250343)
chr2 (295-462)||(18851977-18852144)
chr2 (272-427)||(19279445-19279600)
chr2 (97-413)||(24229215-24229526)
chr2 (109-336)||(15342014-15342237)
chr2 (95-329)||(29800545-29800775)
chr2 (97-260)||(17241034-17241196)
chr2 (295-398)||(36801899-36802003)
chr2 (182-329)||(19616509-19616653)
chr2 (195-329)||(40301034-40301164)
chr2 (122-327)||(41316305-41316506)
chr2 (194-329)||(21626824-21626955)
chr2 (182-258)||(28740910-28740986)
chr2 (97-164)||(41661694-41661761)
chr2 (368-462)||(12098609-12098703)
chr2 (164-244)||(36799745-36799826)
chr2 (270-333)||(28718943-28719006)
chr2 (433-464)||(18548632-18548663)
chr2 (295-402)||(28741220-28741326)
chr2 (295-336)||(24763751-24763792)
[»] scaffold0657 (1 HSPs)
scaffold0657 (116-462)||(1115-1461)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (93-464)||(5649-6013)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (97-353)||(230111-230367)
scaffold0008 (401-461)||(230365-230425)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (97-413)||(174-485)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (97-413)||(3675-3986)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (97-413)||(119721-120032)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (97-463)||(67374-67736)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (109-462)||(12961-13310)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (135-413)||(130262-130535)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (97-336)||(26609-26844)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (194-413)||(8296-8511)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (97-404)||(39988-40290)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (295-462)||(90033-90201)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (97-287)||(102-288)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (125-327)||(8807-9005)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (97-329)||(11526-11758)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (97-336)||(53832-54066)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (194-329)||(83111-83243)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (319-464)||(92286-92432)


Alignment Details
Target: scaffold0234 (Bit Score: 338; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 2041 - 2406
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2041 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 2140  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2141 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 2240  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2241 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 2340  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  2341 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 2406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 10932 - 11297
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10932 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 11031  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11032 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 11131  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11132 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 11231  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11232 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 11297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 338; Significance: 0; HSPs: 50)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 101 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 15152926 - 15152565
Alignment:
Q  101 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152926 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 15152827  T
Q  201 gtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15152826 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 15152727  T
Q  301 caatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatag 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15152726 caatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatag 15152627  T
Q  401 tctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15152626 tctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaata 15152565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 29328271 - 29327906
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328271 catgattcatggagtacccatcaagcaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 29328172  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29328171 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 29328072  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29328071 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 29327972  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  29327971 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 29327906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 11535782 - 11536147
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535782 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 11535881  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11535882 agtggtttcaggtcgaatgttggaatacatcactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 11535981  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11535982 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctttgtgaagactggataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 11536081  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11536082 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 11536147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 11542700 - 11543065
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11542700 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagacaacgtttgaatggtgacaaatcactcgactccagcatctagggtacat 11542799  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11542800 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacatcactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacatttactatgtagtattctcatggcggatc 11542899  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11542900 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 11542999  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11543000 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 11543065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 12751313 - 12750948
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12751313 catgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacct 12751214  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12751213 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 12751114  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12751113 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgagaagaattgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatccacata 12751014  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12751013 atagtctctatgctttaatgatatccaacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaata 12750948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 12739023 - 12738658
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12739023 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacaaacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactacaacatctagggtacat 12738924  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12738923 agtagtttcaggtcgaacggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 12738824  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12738823 aatccaatataaatattatgagtaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcttcagtctacccacata 12738724  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12738723 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaata 12738658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 18561485 - 18561129
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18561485 catgattcgtgcagtacctatcaatcaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaatcactcaactccaacatctagggtacat 18561386  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||         ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   || ||    
T  18561385 agtggtttcaagtcgaagggtggaatacaccactatcactat---------ttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagagggtc 18561295  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561294 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 18561195  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18561194 atagtctctatgctttaatgatatcccacctctcaataaagcttgactacagatactttaagaata 18561129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 97 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 13392637 - 13392270
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  13392637 catgattcatggagtacccatcaaccaattttatagtcatcttgttacaaacaacgtttgtatggtgacaaagcacctgactccaacatctatggtacat 13392538  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||  || ||    
T  13392537 agtgattttaggtcaaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataaattttactatgtaatattcgcatggtgggtc 13392438  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| | | |    
T  13392437 aatccagtataaatatttctcctaatatttattcctatgtgaagacaggataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatcgatctaccaataca 13392338  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaataat 464  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  13392337 atagtctctatgttttaatgttatcccttttcacaataaagtttgactattgatactttaagaataat 13392270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 91 - 464
Target Start/End: Original strand, 18257559 - 18257929
Alignment:
Q  91 catcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagg 190  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||  |||||||||| || |||| ||||||||    
T  18257559 catcaacatgattcttcaagtacccatcaaccaactttatagttatcttgttacacacaacgtttgaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagg 18257657  T
Q  191 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatga 290  Q
    |  ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| || || |  |||||||| |||||| | |     
T  18257658 gatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacatttttcatgacat--actatgtaatattctgacgg 18257755  T
Q  291 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc 390  Q
     || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  18257756 tgggttaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcaatctatc 18257855  T
Q  391 cacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaataat 464  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18257856 cacataatagtctttatgcattattgttatcctacttaacaaaaaaacttgactacggatactttaagaataat 18257929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 2204854 - 2204543
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  2204854 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 2204756  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  2204755 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 2204659  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  2204658 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 2204560  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  2204559 atagtctcgacgcttta 2204543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 18400406 - 18400095
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  18400406 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 18400308  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  18400307 agtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 18400211  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  18400210 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 18400112  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  18400111 atagtctcgacgcttta 18400095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 18407390 - 18407079
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  18407390 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 18407292  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  18407291 agtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 18407195  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  18407194 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 18407096  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  18407095 atagtctcgacgcttta 18407079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Original strand, 48808496 - 48808807
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  48808496 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 48808594  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  48808595 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 48808691  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  48808692 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 48808790  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  48808791 atagtctcgacgcttta 48808807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 8465301 - 8464999
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||| ||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||| ||  |||    
T  8465301 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctaaggatcat 8465203  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  8465202 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 8465106  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  8465105 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 8465007  T
Q  397 atagtctc 404  Q
    ||||||||    
T  8465006 atagtctc 8464999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 363 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 15148363 - 15148264
Alignment:
Q  363 atctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15148363 atctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaata 15148264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 15730053 - 15729742
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  15730053 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 15729955  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| |   ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  15729954 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 15729858  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||  ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  15729857 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 15729759  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  15729758 atagtctcgacgcttta 15729742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Original strand, 18139338 - 18139649
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  18139338 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcat 18139436  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  18139437 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 18139533  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  18139534 aatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacctgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 18139632  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  18139633 atagtctcgacgcttta 18139649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 19231190 - 19230879
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||| |||||  |||    
T  19231190 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catttagggatcat 19231092  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  ||||||| |  ||||||||||||||| |  || ||    
T  19231091 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataacttat--tatgtagtattctcacggtgggtc 19230995  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  19230994 aatccagtataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 19230896  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  19230895 atagtctcgacgcttta 19230879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 109 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 30254428 - 30254129
Alignment:
Q  109 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  ||||||||||||| |    
T  30254428 agtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcatagtggtttcaag 30254330  T
Q  209 tcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataa 308  Q
    || ||| ||  ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||    
T  30254329 tctaagagtaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatacaa 30254233  T
Q  309 atattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatg 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||| | |    
T  30254232 atattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacg 30254134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 336
Target Start/End: Original strand, 41680968 - 41681203
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  41680968 catgattcatcaagtaccaatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 41681066  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  41681067 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 41681163  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 336  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  41681164 aatccagtataaatattactcataatatttatacctatgt 41681203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 2365407 - 2365169
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| | |   |||||| ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  2365407 catgattcgttgagcactcatcaaccgactttatagtcaatctgttacggacgacgtttgtacgacaacaaagtacttgactccaaggtctagggtacat 2365308  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggat 295  Q
    ||||| || |||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||  |||||||   |||||||| ||| |||||  || |    
T  2365307 agtggctttaggtcgaatggtgaaatacaccacttatcacaatgagaataacttatgaca-tttacataacttc--ctatgtagcattttcatggtgggt 2365211  T
Q  296 caatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg 337  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2365210 caatccaatgtaaatattactcctaatattgatatctatgtg 2365169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 109 - 463
Target Start/End: Original strand, 47166871 - 47167221
Alignment:
Q  109 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 208  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  47166871 agtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 47166969  T
Q  209 tcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataa 308  Q
    || ||| | | ||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | | |||||  ||||||||||||||||||| |  || || ||| | |||||    
T  47166970 tctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtctatctagtataa 47167066  T
Q  309 atattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatg 408  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||  ||| |||  |||| || | |  ||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||| | |    
T  47167067 atattactcataatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacg 47167165  T
Q  409 ctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatac-tttaagaataa 463  Q
    ||||| |  ||||| | |||  | |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  47167166 ctttattattatcctaattcatattaaagcttgactacaaatacatttaagaataa 47167221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 34128875 - 34128647
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  34128875 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 34128777  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||| | ||| | | ||||||||||||||||||  | | |||||   ||||||||||||||||||  | |||||    
T  34128776 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattataattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--gtactatgtagtattctcacaatggatc 34128680  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttata 329  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34128679 tatccagtataaatattactcctaatatttata 34128647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Original strand, 10668901 - 10669213
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||| | || |||| ||| || ||  |||    
T  10668901 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcatttgagtcca-catttacggatcat 10668999  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactat-gagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggat 295  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||| | ||||| |   ||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || |    
T  10669000 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcaattgcgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggt 10669096  T
Q  296 caatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacat 395  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  ||||    
T  10669097 caatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacat 10669195  T
Q  396 aatagtctctatgcttta 413  Q
    ||||||||| | ||||||    
T  10669196 aatagtctcgacgcttta 10669213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 403
Target Start/End: Original strand, 24443349 - 24443628
Alignment:
Q  119 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 218  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||    | |||||||| || ||| ||||||||||  |||| |||||||| ||| ||| |||    
T  24443349 aaccaacgttatggtcatcctgttacacacaacgtttgaataacaataaagcacttgagtcc-acatctagggatcataatggtttcaagtctaagagtg 24443447  T
Q  219 gtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcc 318  Q
     ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||   |||||||||||| ||||| |  || | |||| | |||||||||||||||    
T  24443448 ttatacaccattatcactgtgagaataacttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtactctcacggtgggttaatctagtataaatattactcc 24443544  T
Q  319 taatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtct 403  Q
    ||||||| ||| ||||||  | |||  ||| || | ||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  24443545 taatattcatacctatgtataaacttaatatct-tatattcatgacccatgagatgtggtcatcagtctacatacataatagtct 24443628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 97 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 28130863 - 28130628
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || ||| ||||||| ||  |||    
T  28130863 catgattcattaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcc-acatctacggatcat 28130765  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||| ||||||||| |||  || ||||||| | ||| | | ||||||||||||||||||  ||| |||||   ||||||||| ||||||||    || ||    
T  28130764 agtgatttcaggtctaagaatgatatacactattattattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatgtaatattctcacagtgggtc 28130668  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 336  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  28130667 aatccagtataaatattactcctgatatttatacctatgt 28130628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 182 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 19388774 - 19388626
Alignment:
Q  182 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactt--ttactatgtag 279  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |  |   |||||||    
T  19388774 acatctagggctcataatggtttcaggtctaagagtggtatacactattaccactatgagaatatcttatgacac-tttcataacatactatatatgtag 19388676  T
Q  280 tattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 329  Q
    |||||||||||  |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19388675 tattctcatgattgggcaatccagtataaatattactcctaatatttata 19388626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 10235644 - 10235361
Alignment:
Q  99 tgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatag 198  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||   || |||||  ||| ||  |||||| || |||||||||||  ||||    
T  10235644 tgatttatggagtacccatcaaccgagtttatggtcatcctgctacgaacaataattaaatggcaacacagttctcgac-cctacatctagggtcgatag 10235546  T
Q  199 tggtttcaggtc-gaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatca 297  Q
    |||||||| ||| ||||| || ||| || || ||||| ||  | |||| |||||||| |||   |||||  |  |||||||  |||||||||  |  |||    
T  10235545 tggtttcatgtcagaaggatgatatgcatcattatcattacaataataacttatgactcttac-ataacact--ctatgtataattctcatggtgagtca 10235449  T
Q  298 atccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagt 385  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10235448 atccgatataaatattattcctaatatttatacatatgggaacacctgataactctttatcaatgatctgtgagatgtgatcatcagt 10235361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 97 - 336
Target Start/End: Original strand, 18259124 - 18259359
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  18259124 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 18259222  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |  ||||||||||| ||| | | ||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | | |||||  |||||||| |||||||||| |  || ||    
T  18259223 aagggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgcagtattctcacggtgggtc 18259319  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 336  Q
     ||||| |||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  18259320 tatccagtataaatattactttcaatatttatacctatgt 18259359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 281 - 464
Target Start/End: Original strand, 7662569 - 7662751
Alignment:
Q  281 attctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatca 380  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||  || |||| ||||||    
T  7662569 attctcatggcgggtcaatctaataaaaatattacttataat-tttatatctatgtgaagacttgataagtttttatacatgattcgtaagatatgatca 7662667  T
Q  381 tcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaataat 464  Q
    ||||| || |||||||||| ||  | | |||||||| ||||| ||||| || |||| ||||||||| |||  ||||| ||||||    
T  7662668 tcagtgtatccacataataatcaatgtactttaatgctatcctacttcacactaaatcttgactacaaatgttttaaaaataat 7662751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 325
Target Start/End: Original strand, 25845498 - 25845700
Alignment:
Q  119 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 218  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||| || || ||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||    
T  25845498 aaccaacgttatagttatctttttacagataaggtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtctaagagtg 25845596  T
Q  219 gtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcc 318  Q
    ||||||| || ||| | | |||||||||||||||| | |||| |||||   |||||||||||||||||| |  |  |||||||| |||||||||||||||    
T  25845597 gtatacatcattattattttgagaatatcttatgata-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgtgtcaatccagtataaatattactcc 25845693  T
Q  319 taatatt 325  Q
    |||||||    
T  25845694 taatatt 25845700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 325
Target Start/End: Original strand, 25845917 - 25846119
Alignment:
Q  119 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 218  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||| || || ||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||    
T  25845917 aaccaacgttatagttatctttttacagataaggtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtctaagagtg 25846015  T
Q  219 gtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcc 318  Q
    ||||||| || ||| | | |||||||||||||||| | |||| |||||   |||||||||||||||||| |  |  |||||||| |||||||||||||||    
T  25846016 gtatacatcattattattttgagaatatcttatgata-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgtgtcaatccagtataaatattactcc 25846112  T
Q  319 taatatt 325  Q
    |||||||    
T  25846113 taatatt 25846119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 366 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 2365112 - 2365015
Alignment:
Q  366 tgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaataat 464  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || ||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  2365112 tgtgagatgtgatcatcagtcgacccacatgatagtctctatgttttaatgttatctcatttcacaat-aaggttgactacgaatattttaagaataat 2365015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 336
Target Start/End: Original strand, 19393462 - 19393659
Alignment:
Q  135 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatca 234  Q
    ||||| |||| |||||| || ||| ||| |||||||||| || || |||||||||||  |||| ||| |||||||| ||| ||| ||||||| | |||||    
T  19393462 atccttttacagacaacattagaaaggtaacaaagcacttgagtc-aacatctagggatcatactggattcaggtctaagagtgatatacactattatca 19393560  T
Q  235 ctatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctat 334  Q
     | |||||||||||||||| | |||| |||||   |||||||||||||||||| |   | |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19393561 ttgtgagaatatcttatgaga-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtcggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctat 19393657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 14592153 - 14591924
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  | |||| | |  |   | |||| |||||  |||    
T  14592153 catgattcatcaagtacccattagccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaataaagaaatgtaagtccacatatagggatcat 14592054  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||| ||| ||| ||| ||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||    ||| ||||||||||||| |  || ||    
T  14592053 agtggtttcaagtctaagagtgatatacactattatcaatctgagaatatcttatgaca-ttttcataacaa--actgtgtagtattctcacggtgggtc 14591957  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttata 329  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14591956 aatccagtataaatattactcctaatatttata 14591924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 16011744 - 16011515
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  | |||| | |  |   | |||| |||||  |||    
T  16011744 catgattcatcaagtacccattagccaacattatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaataaagaaatgtaagtccacatatagggatcat 16011645  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||    ||| | |||||||||||||  || ||    
T  16011644 agtggtttcaggtctaagagtgatatacattattatcaatgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacaa--actgtatagtattctcatggtgggtc 16011548  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttata 329  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16011547 aatccagtataaatattactcctaatatttata 16011515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 322
Target Start/End: Original strand, 31190524 - 31190660
Alignment:
Q  183 catctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtat 282  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | || |||||   ||| |||||||||    
T  31190524 catctagggatcttagtggtttcaggtctaacagtgatatacaccattatcactatgagaatatcttaagaca-tattcataac--atacaatgtagtat 31190620  T
Q  283 tctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaat 322  Q
    |||||||  || |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  31190621 tctcatggtgggtcaatccagtataaatattgctcctaat 31190660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 271 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 3132986 - 3132849
Alignment:
Q  271 actatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtga 370  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||  |||||||||||| |||| ||| |  ||  | |||| |||    
T  3132986 actatgtagtattcttatgacaggtcaatccaatataaatatta-acataataattatacatatgtgaagacttgatatctcatattcatttatctatga 3132888  T
Q  371 gatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgc 409  Q
    ||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||    
T  3132887 gatgtgatcatcagtctaatcacattgtagtctctatgc 3132849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 326 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 7396450 - 7396358
Alignment:
Q  326 tatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc---cacataatagtctctatgctttaat 415  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  7396450 tatatttatgtgaatacttgataattctttattcatgatatgtgagatgtgatcatcagttcaccctgcacataatagtctctatgctttaat 7396358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 197 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 22969153 - 22969024
Alignment:
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   |||||||||||||||||| |  || ||    
T  22969153 agtggcttcaggtctaagagtggtatacaccgttatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtc 22969057  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttata 329  Q
    ||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  22969056 aatcttgtataaacattactcctaatatttata 22969024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 39112275 - 39112138
Alignment:
Q  108 gagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcag 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||| |   |||||  ||| || ||| |||||||| |||||||||| |||||     
T  39112275 gagtacctatcaaccaactttatagtcaccttattacagacaacgtttgaacgacaacaaaatacttgattcctacatctagagtacatagtgatttcat 39112176  T
Q  208 gtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaata 245  Q
    || |||   ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  39112175 gttgaataatggaatacaccactatcactaagagaata 39112138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 295 - 403
Target Start/End: Original strand, 47833875 - 47833983
Alignment:
Q  295 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccaca 394  Q
    |||||| |||||||||||||    ||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| ||     
T  47833875 tcaatcaaatataaatattatgagtaatatttatacctatgtgaaaacttggtaactctttattcatgatcggtgagatctgatcaccagcctacctacg 47833974  T
Q  395 taatagtct 403  Q
    |||||||||    
T  47833975 taatagtct 47833983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 304 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 19859221 - 19859122
Alignment:
Q  304 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtct 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  19859221 tataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtct 19859123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 246
Target Start/End: Original strand, 22948499 - 22948574
Alignment:
Q  171 actcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatat 246  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  22948499 actcaactcctacatctaaggtacatagcggtttcatgtcgaagggtggcatacacgactattactacgagaatat 22948574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 285
Target Start/End: Original strand, 15169290 - 15169474
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||| || |||||||||| |||| || |||||||||  || |||||||||||||  | |||||| |  | |||| ||||| |||  |||    
T  15169290 catgattcatcaagtgcctatcaaccaacgttatggttatcctgttatagataacgtttgaatggcaataaagcatttaagtcca-catcttgggatcat 15169388  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattct 285  Q
    |||||||| ||| | ||| || | |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||||||||    
T  15169389 agtggttttaggactaagagtagcatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattct 15169474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 7396527 - 7396469
Alignment:
Q  281 attctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaa 339  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  7396527 attcttatgacgggttaatccaatataaatattacccataatatttatatttatgtgaa 7396469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 29984372 - 29984308
Alignment:
Q  187 tagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttat 251  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||| ||| || ||||  |||||||||||||||||||    
T  29984372 tagggtacatggtggtttcaagttgaagggtgatatgcatcacttccactatgagaatatcttat 29984308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 39112092 - 39111980
Alignment:
Q  304 tataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtct 403  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||     ||||||||||||||||| || || ||| | | ||| |||||||||  ||||||||||    
T  39112092 tataaataatactcctaatatttatgtatatatgaagaaattgtaactctttatccatgacctatgtgatattaccattagtctacccttataatagtct 39111993  T
Q  404 ctatgctttaatg 416  Q
    ||||  |||||||    
T  39111992 ctatattttaatg 39111980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 3588118 - 3587978
Alignment:
Q  194 catagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataactt--ttactatgtagtattctcatgac 291  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||||| ||| || ||| ||||| |  |   ||||||||||||||| |      
T  3588118 catagtggtttcaggtctaagagtg-tatacatcactatcattgtgagaatatcttttgaaac-tttcataacatactatatatgtagtattctcacgtt 3588021  T
Q  292 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctat 334  Q
    || |||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  3588020 gggtcaatccagtatcaatattacccctaacatttatacctat 3587978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 29983234 - 29983141
Alignment:
Q  315 ctcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgc 409  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | | | ||||||||||||||||||| ||||  || ||| ||| ||| ||||||||||| |||| |||||    
T  29983234 ctcctaatatttatacatatgtgaaaatttgttaactctttatccatgatccgtga-ttgcgattatcggtcaacccacataattgtctgtatgc 29983141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 338; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 18252517 - 18252152
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252517 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18252418  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18252417 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18252318  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18252317 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 18252218  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18252217 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 18252152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 18532234 - 18532599
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532234 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18532333  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18532334 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18532433  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  18532434 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatctacata 18532533  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18532534 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaata 18532599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 27131130 - 27131494
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27131130 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagg-tacat 27131228  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27131229 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27131328  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27131329 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 27131428  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27131429 atagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacaaatactttgagaata 27131494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 27310297 - 27310662
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310297 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27310396  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27310397 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27310496  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310497 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccataatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 27310596  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  27310597 atagtctctatgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactactgatactttaagaata 27310662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 16358755 - 16359120
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358755 catgattcatggagtacccatcaaccaactttaaagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 16358854  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
     ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16358855 ggtggtttcaagacgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttctcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 16358954  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358955 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaaggcttgataactctttatccattatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 16359054  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  16359055 atagtctctatgctttaatgatattccatttctcaataaagcttgactagggttactttaagaata 16359120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 97 - 464
Target Start/End: Original strand, 3855639 - 3856006
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3855639 catgattcatggagtaccggtcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgcttgaatggtgacaaagcgctcaactccaacatctagggtacat 3855738  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  3855739 agtggtttcgggtcgaatggtggaatacaccactatcactgtgagaatatcttatgacacttttcataacctttactatgtagtattctcattgcgggtc 3855838  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3855839 aatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtgaagactttataactctttatccatgatttgtgagatgtgatcatcagtctacccacgta 3855938  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaataat 464  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  3855939 atagtctccatgctttaataatatcccacttcacaataaagtttgactacaaatattttaagaataat 3856006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 97 - 464
Target Start/End: Original strand, 36816354 - 36816720
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  36816354 catgatttgtggagtacctatcaaccaactttatagttatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaaacgctcgactccaacatctagggtacat 36816453  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  36816454 agtggtttcagttcaaagggtggaatacaccaccatcactatgataattt-ttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtgggtc 36816552  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36816553 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgtagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatccacata 36816652  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaataat 464  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  36816653 atagtctctatgctttaatggtatcccacttctcaataaagcttgactatggatactttaagaataat 36816720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 225 - 462
Target Start/End: Original strand, 21171081 - 21171318
Alignment:
Q  225 accactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatat 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171081 accactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatat 21171180  T
Q  325 ttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatccca 424  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21171181 ttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgttatcatcagtctacccacataatagtctttatgctttaatgatatccca 21171280  T
Q  425 cttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21171281 cttctcaataaagcttgactacggatactttaagaata 21171318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 97 - 464
Target Start/End: Original strand, 27277278 - 27277644
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  |||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27277278 catgatttatggagtacccttcaaccaactttatggtcatcttgttacaaacaatgtttgaattatgataaagcactcgactccaacatccagggtacat 27277377  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || |||||||||||| | |||||| |||  || ||    
T  27277378 agtggtttcaggtcaaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatggcactttc-atgacttttactatgcaatattcttatggtgggtc 27277476  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27277477 aatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtgaaaacatgataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatcggtctacccacata 27277576  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaataat 464  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  27277577 atagtctctatgctttaatgttatcccttttcacaataaagcctgactacggatactttaagaataat 27277644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 97 - 378
Target Start/End: Original strand, 22641594 - 22641871
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22641594 catgattcgtggagtacccatcgaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctacggtacat 22641693  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||    
T  22641694 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactgtgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagt-ttctcatggtgggtc 22641792  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgat 378  Q
    |||| | ||||||||||| ||||||   ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22641793 aatctagtataaatattattcctaa---ttatatctatgtgaacacttaataactctttatccatgatctatgagatgtgat 22641871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 264 - 461
Target Start/End: Original strand, 22657108 - 22657305
Alignment:
Q  264 aacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatga 363  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  22657108 aacttttactatgtagtattcacatggtgggtcaatctaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttaataactctttatctatga 22657207  T
Q  364 tctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaat 461  Q
     || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||   | |||||||||||    
T  22657208 gctatgagatgtgatcatcagtctatccacatgatagtctctatgctttaatgatatctcatttcagaataaagcttgactagagacactttaagaat 22657305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 97 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 23507385 - 23507038
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||| |||| |||    |||| ||| | |||||| |||| | ||  ||||||||||||||     
T  23507385 catgatttatggagtacccataaatcgaatttatagtcatcctattacagacggtatttgtatgataacaaagtactcaaatcttacatctagggtacac 23507286  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggat 295  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||| |     | || ||||| ||||| |||  || |    
T  23507285 agtggtttcaggtcgaaggatgacatactccacttatcactatgagaataacttatg---ctttttacacaacgttctctgtagcattctaatggtgggt 23507189  T
Q  296 caatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacat 395  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  23507188 taatccaatataaatattactcctattatttatatctatgtgaaaacttgataactccttatccatgatccgtgagatgtgatcatcagtctatccacct 23507089  T
Q  396 aatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactac 446  Q
     ||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| || |||| | |||||||    
T  23507088 tatattctatatactttaatgctatcccacttcacactaaatcatgactac 23507038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 175 - 463
Target Start/End: Original strand, 12014084 - 12014370
Alignment:
Q  175 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttact 273  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||| |||   |||||| |  || | ||    
T  12014084 gactcctacatctagagtacacagtgattttaggttgaagggtgaaatacaccacttatcactatgagaatgacttgtga---tttttacatattgttct 12014180  T
Q  274 atgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagat 373  Q
    |||||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  12014181 atgtaacattctcatgccgggtcaatccaatattaatattactcttaatatttatatttatgtgaagacttgataactccttatcaatgatccgtgagat 12014280  T
Q  374 gtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaataa 463  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||  |||||| |||| || |||||||| |||||| ||  |||||||||||    
T  12014281 gtgatcatcattctacccacataatggtctttacgctttaatcgtatccctcttcacactaaagcttaactacggatgttttaagaataa 12014370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Original strand, 19706439 - 19706750
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  19706439 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 19706537  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  19706538 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 19706634  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  19706635 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 19706733  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  19706734 atagtctcgacgcttta 19706750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Original strand, 43802365 - 43802676
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  43802365 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 43802463  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  43802464 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 43802560  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  43802561 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 43802659  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  43802660 atagtctcgacgcttta 43802676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Original strand, 28134723 - 28135034
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||| |||||  |||    
T  28134723 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catttagggatcat 28134821  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  |||||    
T  28134822 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtggatc 28134918  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  28134919 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 28135017  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    || ||||| | ||||||    
T  28135018 attgtctcgacgcttta 28135034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 9456418 - 9456107
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  9456418 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 9456320  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  9456319 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 9456223  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  9456222 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 9456124  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  9456123 atagtctcgacgcttta 9456107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Original strand, 20391239 - 20391550
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  20391239 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 20391337  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||  | ||||| | |||||||||||||||| |  ||| |||||  |||||||||||||||||||    || ||    
T  20391338 agtggtttcaggtctaagagcggtatacattattatcattgtgagaatatcttatga-aaatttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtc 20391434  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  20391435 aatccaatataaatattactcctaacatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 20391533  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  20391534 atagtctcgacgcttta 20391550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Original strand, 20779645 - 20779956
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  20779645 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 20779743  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  20779744 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 20779840  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  20779841 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 20779939  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  20779940 atagtctcgacgcttta 20779956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Original strand, 22670257 - 22670568
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  22670257 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 22670355  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  22670356 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 22670452  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  22670453 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 22670551  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  22670552 atagtctcgacgcttta 22670568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Original strand, 42816989 - 42817300
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  42816989 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 42817087  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  42817088 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 42817184  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  42817185 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 42817283  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  42817284 atagtctcgacgcttta 42817300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 290
Target Start/End: Original strand, 9916497 - 9916689
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||| ||||| || ||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  9916497 catgattcgtggagaactcataaactaactttatagtcaccttgttacggacaacgtttggacggtaacaaagtactcgactcctacatctagggtacat 9916596  T
Q  197 agtgg-tttcaggtcgaagggtggtatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatga 290  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||  ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9916597 agtggttttcaggtcgaagggtggaatacaccacttatcactatgagaataatttatgaca-tttacataacttt--ctatgtagtattctcatga 9916689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 295 - 464
Target Start/End: Original strand, 9917837 - 9918005
Alignment:
Q  295 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccaca 394  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||| |||    
T  9917837 tcaatccaatataaatattactca-aatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatccacgagatgtgatcatcaacctaccgaca 9917935  T
Q  395 taatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaataat 464  Q
    || || ||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| ||||   ||| ||||||||||||    
T  9917936 tagtattctctatgcttcaatgctatcccacttaacaataaagcttaactatagatattttaagaataat 9918005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 22612794 - 22612483
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  | ||||| |||  ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  22612794 catgattcatcaagtagccatcaaccaacgttatgattatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagtgatcat 22612696  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  22612695 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 22612599  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||  ||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  22612598 aatccaataaaaatattactcccaatatttatatctatgtatagacttgatatatc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 22612500  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  22612499 atagtctcgacgcttta 22612483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 117 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 634216 - 634001
Alignment:
Q  117 tcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaaggg 216  Q
    ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |    
T  634216 tcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagag 634118  T
Q  217 tggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattact 316  Q
     | ||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | | |||||  ||||||||||||||||||| |  || | |||||| |||||||||||||    
T  634117 cgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggttaatccagtataaatattact 634021  T
Q  317 cctaatatttatatctatgt 336  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  634020 cctaatatttatacctatgt 634001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 8727969 - 8727741
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||  |||||||||  |||    
T  8727969 catgattcatcaagtacccattagccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtccg-catctagggatcat 8727871  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||| |||||| ||| ||| |||||||   |||||||| ||||||||||||||  | |||| |||||   |||||||||||||||||| |  |||||    
T  8727870 agtggttccaggtctaagagtgatatacactcttatcactaagagaatatcttatggta-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtggatc 8727774  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttata 329  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  8727773 aatccagtataaatattacttctaatatttata 8727741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 299 - 464
Target Start/End: Original strand, 12006461 - 12006626
Alignment:
Q  299 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataat 398  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||| |||||||| ||||| |||||  || || ||||||||||||||||  |||||||     
T  12006461 tccagtataaatattactcttaatatttatatctgtgcgaacacttgataactccttatcaatgattcgtaagttgtgatcatcagtctatgcacataac 12006560  T
Q  399 agtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaataat 464  Q
    | |||||| | ||||||| |||||| |||| || ||| ||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  12006561 aatctctaagttttaatgttatccctcttcacactaaggcttgactacgaatgttttaataataat 12006626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Original strand, 47667485 - 47667785
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  47667485 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 47667583  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||  |||||           ||| |  || ||    
T  47667584 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttact-----------tcacggtgggtc 47667669  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  47667670 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 47667768  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  47667769 atagtctcgacgcttta 47667785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 225
Target Start/End: Original strand, 28145723 - 28145850
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||  |||    
T  28145723 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagggatcat 28145821  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtataca 225  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  28145822 agtggtttcaggtctaagagtgatataca 28145850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 29097008 - 29096789
Alignment:
Q  113 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 212  Q
    ||||| ||||||| |||| || ||||| |||| || ||||||||||| |  | ||| |||| || ||||  ||||||||  ||||||||||||| ||| |    
T  29097008 cccattaaccaacgttatggttatcctattacagataacgtttgaatcgaaataaaacacttgagtccat-atctagggatcatagtggtttcatgtcta 29096910  T
Q  213 agggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatat 312  Q
    || |||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||   | ||||||||||||| || |  ||||||||| | |||||||||    
T  29096909 agagtgtgaaacaccattatcattatgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atgctatgtagtattcacacggtggatcaatctagtataaatat 29096813  T
Q  313 tactcctaatatttatatctatgt 336  Q
    || ||||||||| |||| ||||||    
T  29096812 tattcctaatatgtatacctatgt 29096789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 197 - 329
Target Start/End: Original strand, 21881475 - 21881604
Alignment:
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   |||||||||||||||||| |  || ||    
T  21881475 agtggcttcaggtctaagagtggtatacaccgttatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtc 21881571  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttata 329  Q
    ||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  21881572 aatcttgtataaacattactcctaatatttata 21881604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 339
Target Start/End: Original strand, 24301691 - 24301845
Alignment:
Q  184 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtatt 283  Q
    ||||||||  |||| || ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |||||  | ||||||| |||||    
T  24301691 atctagggatcataatgattttaggtcaaagggttgtatacaccactatcactatgagaatgtcttatgatacttaacataac--tcactatgtggtatt 24301788  T
Q  284 ctcatgacggatcaatccaata-taaatattactcctaatatttatatctatgtgaa 339  Q
    ||| ||| || |   || ||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  24301789 ctcgtgatgggtatttctaatagcaaatattactcctaatatgtatacctatgtgaa 24301845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 35930713 - 35930573
Alignment:
Q  272 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 371  Q
    |||||||||||||||| |   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  ||| |||  |||| |||| |  ||||    
T  35930713 ctatgtagtattctcacggtaggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgag 35930615  T
Q  372 atgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgcttta 413  Q
    ||| | |||||||||||   ||||||||||||| | ||||||    
T  35930614 atgcggtcatcagtctatatacataatagtctcgacgcttta 35930573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 51997485 - 51997353
Alignment:
Q  194 catagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 293  Q
    |||||| ||||| |||| ||| |||||||| | || ||||| |||||||||| ||||||| || ||  ||||  |||  || ||||||||||||||  ||    
T  51997485 catagtagtttctggtctaagcgtggtatatatcattatcaatatgagaataacttatgatacattc-ataatattt--tacgtagtattctcatggtgg 51997389  T
Q  294 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 329  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51997388 gtcaatctaatataaatattactcctaatatttata 51997353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 258
Target Start/End: Original strand, 10852402 - 10852461
Alignment:
Q  199 tggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 258  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||    
T  10852402 tggtttcaggttgaagggtgacatacaccattatcactttaaaaatatcttatgacactt 10852461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 325
Target Start/End: Original strand, 26923553 - 26923608
Alignment:
Q  270 tactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatt 325  Q
    |||||||||||||||||| |  || ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  26923553 tactatgtagtattctcacggtgggtcaattcagtataaatattactcctaatatt 26923608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 244
Target Start/End: Original strand, 12006332 - 12006413
Alignment:
Q  164 acaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccac-tatcactatgagaat 244  Q
    |||||| ||| |||| | |||||||| ||||| | || |||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||    
T  12006332 acaaagtacttgacttctacatctagagtacacaatgatttcaggtcgaagggtggaaaacaccacttatcagtatgagaat 12006413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 315
Target Start/End: Original strand, 31236402 - 31236478
Alignment:
Q  236 tatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattac 315  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||  | |||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||||    
T  31236402 tatgagaatatcttacgacactttc-ataa--tatactatgtagtattctcatgatagatcaattcagtataagtattac 31236478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 98 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 21941151 - 21940787
Alignment:
Q  98 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacata 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21941151 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacata 21941052  T
Q  198 gtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatca 297  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21941051 gtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatca 21940952  T
Q  298 atccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataa 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21940951 atccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataa 21940852  T
Q  398 tagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21940851 tagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 21940787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 22171974 - 22171609
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171974 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 22171875  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22171874 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 22171775  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22171774 aatccaatataaatattactcataatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctatgagatgtgatcatcagtctacctacata 22171675  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22171674 atagtctctatgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 22171609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 6094610 - 6094245
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094610 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacgaacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 6094511  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  6094510 agtggtttctggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatatagtattctcatggcggatc 6094411  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  6094410 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcactctacccatata 6094311  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  6094310 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaaaaata 6094245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 24643135 - 24642771
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  24643135 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacagaccacgtttgaatggtgacaaaacacttgactccaacatctagggtacat 24643036  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  24643035 agtggtttcagttcgaagggtggaatacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataa-ttttactatgtagtattctcatggaggatc 24642937  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642936 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 24642837  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642836 atagtctctatactttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 24642771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 97 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15326685 - 15326422
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15326685 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15326586  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15326585 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15326486  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatcca 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15326485 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttctcca 15326422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 97 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15507054 - 15506791
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15507054 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15506955  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15506954 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15506855  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatcca 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15506854 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttctcca 15506791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 97 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 28548534 - 28548393
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28548534 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcaccctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 28548435  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactat 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28548434 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactat 28548393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 164 - 464
Target Start/End: Original strand, 14983710 - 14984006
Alignment:
Q  164 acaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacacttttta 262  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||  |    
T  14983710 acaaagtactcgactcttacatctagggtacatagtgatttcaggtcgaaggacggaatacaccacttatcactatgagaataacttatgaca-tttaca 14983808  T
Q  263 taacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatg 362  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  14983809 taacttt--ctatgtagtattctcatggcgggtcattctaatataa-tattactcctaatatctacatctatgtgaagacttgataacactttttccatg 14983905  T
Q  363 atctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||| |||||||  |||| ||   ||||||||||||||    
T  14983906 atccgtgagatatgatcattagtctacccacataatagtccctattc-ttaatgttatcccacttcacaataaattttgattatagatactttaagaata 14984004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 113 - 462
Target Start/End: Original strand, 38232115 - 38232462
Alignment:
Q  113 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 212  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||| | |   |||||| |||||||| | ||||| |||||||| |    ||||| |||      
T  38232115 cccatcaaccaactttataaccatcatgtcacggacaacgtttgtacgacaacaaagtactcgacttctacatcaagggtacacatcaatttcaagtctg 38232214  T
Q  213 agggtggtatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaata 311  Q
    ||| ||| |||||||||| |||| |||| ||||| | | ||||| |||  ||||||||  |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  38232215 aggatggaatacaccacttatcattatgcgaataacctgtgaca-tttacataacttt--ctatgtagcattctcacggcggatcaatccaatataaata 38232311  T
Q  312 ttactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctt 411  Q
    |||| | |||||| | ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  38232312 ttacccataatatgtgtatctatgtcaagactggatcactctttatccatgatccgtgagatgtgattatcagtctacccacaaaatagtttttatgctt 38232411  T
Q  412 taatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||   |||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  38232412 taagactatctcactttacaataaagtttgactacaaatactttaagaata 38232462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Original strand, 8371253 - 8371564
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  8371253 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgatcatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 8371351  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  8371352 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 8371448  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  8371449 aatccaatataaatattactcttaatatttatacctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 8371547  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| ||||||||    
T  8371548 atagtctcgatgcttta 8371564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 21969635 - 21969324
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  21969635 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 21969537  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  21969536 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 21969440  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| ||||||  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  21969439 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgatccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 21969341  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  21969340 atagtctcgacgcttta 21969324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 12562425 - 12562114
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  12562425 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 12562327  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  12562326 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 12562230  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  12562229 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 12562131  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  12562130 atagtctcgacgcttta 12562114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 212 - 409
Target Start/End: Original strand, 24797224 - 24797419
Alignment:
Q  212 aagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaata 311  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||     
T  24797224 aagggtggaatacaccac-atcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgggtcaatccagtataaatt 24797322  T
Q  312 ttactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgc 409  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||  |||| | || ||||||||| |  ||||||||  |||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  24797323 ttactcataatatttatacctacgtgaagacatgatatc-ctatatccatgacccatgagatgtagtcatcaatatactcacataatagtctctatgc 24797419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Original strand, 27007517 - 27007828
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  27007517 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 27007615  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  27007616 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 27007712  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  27007713 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 27007811  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  27007812 atagtctcgacgcttta 27007828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Original strand, 27014660 - 27014971
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  27014660 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 27014758  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  27014759 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 27014855  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  27014856 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 27014954  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  27014955 atagtctcgacgcttta 27014971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Original strand, 27880487 - 27880798
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  27880487 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 27880585  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  27880586 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 27880682  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  27880683 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 27880781  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  27880782 atagtctcgacgcttta 27880798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Original strand, 28020668 - 28020979
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  28020668 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 28020766  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  28020767 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 28020863  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  28020864 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 28020962  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  28020963 atagtctcgacgcttta 28020979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Original strand, 22130609 - 22130920
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  22130609 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 22130707  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  22130708 agtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 22130804  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  22130805 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 22130903  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  22130904 atagtctcgacgcttta 22130920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 25611497 - 25611186
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  25611497 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacactatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 25611399  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  25611398 agtggtttcaggtctaagagtgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacagtttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 25611302  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  |||||||   ||||||||||||  |||||    
T  25611301 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcagtcatcagtctacatacata 25611203  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  25611202 atagtctcgacgcttta 25611186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 336
Target Start/End: Original strand, 22659494 - 22659729
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  22659494 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 22659592  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  22659593 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 22659689  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 336  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22659690 aatccagtatacatattactcctaatatttatacctatgt 22659729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 21916978 - 21916667
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  21916978 catgattcatcaagtgcccatcaaccaaagttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 21916880  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  || ||||||||||||||    || ||    
T  21916879 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--acaatgtagtattctcacagtgggtc 21916783  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  21916782 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgcatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 21916684  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  21916683 atagtctcgacgcttta 21916667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Original strand, 45534273 - 45534584
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  45534273 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttatagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 45534371  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| |   ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  45534372 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 45534468  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||  ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  45534469 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 45534567  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  45534568 atagtctcgacgcttta 45534584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 277 - 457
Target Start/End: Original strand, 32872741 - 32872921
Alignment:
Q  277 tagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtg 376  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||  | |||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||  |    
T  32872741 tagtattctcatgacagatcaattcaatataaatattattactaatacttatgccgatgtaaagacttgatacctctttattcatgatctgtgagataag 32872840  T
Q  377 atcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaa 457  Q
    ||| | |||| | || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| |||||    
T  32872841 atcgtgagtccagccgcataatagtctctatgctttgatgttatcccacttcacaataaatcttaactacaaatattttaa 32872921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 26240786 - 26240551
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||  |||||||| |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  26240786 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacaaacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 26240688  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||| ||||| ||| | | ||||||  |  |||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  26240687 agtggttttaggtctaagagcgatatacattataatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 26240591  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26240590 aatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgt 26240551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 194 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 18835556 - 18835341
Alignment:
Q  194 catagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 293  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||| |  ||    
T  18835556 cataatggtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcactgtgtgaatatcttatgaca-tttttaaaacat--actatgtagtattctcacggtgg 18835460  T
Q  294 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccac 393  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||  ||| |||  |||| |||| |  ||||||||| | ||||||||||  ||    
T  18835459 gtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacttatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgtggtaatcagtctacatac 18835361  T
Q  394 ataatagtctctatgcttta 413  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  18835360 ataatagtctcgatgcttta 18835341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 6431188 - 6430953
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  6431188 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 6431090  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||| |||||||||  || | | ||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | | |||||  ||||||||||||||||||| |  || ||    
T  6431089 agtgatttcaggtcttagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 6430993  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 336  Q
     ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6430992 tatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 6430953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 383 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 28555084 - 28555005
Alignment:
Q  383 agtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  28555084 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatacttttagaata 28555005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 182 - 389
Target Start/End: Original strand, 8781959 - 8782162
Alignment:
Q  182 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 281  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||    |||||||||||    
T  8781959 acatctagggatcatagtggtttcaagtctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--agactatgtagta 8782055  T
Q  282 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 381  Q
    |||||| |  ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||   |||||  |||||| ||| |||  ||||||||| || | ||| ||| ||||    
T  8782056 ttctcacggtggatcaatcaagtataaatattagtcctaatatttatgcttatgtatagactaaatatctc-atatccatgacctataagacgtggtcat 8782154  T
Q  382 cagtctac 389  Q
    ||||||||    
T  8782155 cagtctac 8782162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 259
Target Start/End: Original strand, 20535226 - 20535371
Alignment:
Q  113 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 212  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||| || ||||  || || ||  |||||||||| |||||| |    
T  20535226 cccattaaccaacattatggttatcctgttatagacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtccat-atttaaggatcatagtggttccaggtcta 20535324  T
Q  213 agggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttt 259  Q
    || ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20535325 agagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacacttt 20535371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 24796731 - 24796826
Alignment:
Q  107 ggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggttt 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||  | |||| ||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24796731 ggagtacccatcaaccaattttatagccattatattacaga--acgattgaatggtgataaagcactcgactccaacatctagggtatatagtggttt 24796826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 336
Target Start/End: Original strand, 2962932 - 2963171
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| || ||||| || | ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| | |||||||  |||    
T  2962932 catgattcatcaagtaaccatcaaccaacgttatggttatccttttgcagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcca-cgtctagggatcat 2963030  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacact---ttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 293  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||| | | ||||| | |||||||||||||||||| |   | | ||||  | |||||||||||||||||  |   |    
T  2963031 agtggtttcaggtctaagagggatatacgctattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataa--tgtactatgtagtattctcgcggtag 2963128  T
Q  294 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 336  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2963129 gtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 2963171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 295 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 2375300 - 2375214
Alignment:
Q  295 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 381  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| | | |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||    
T  2375300 tcaatccaatatacatattactcataatatttatatttatgtgaaaatttgataactcattatccatgatacgtgtgatgtgatcat 2375214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 29645631 - 29645537
Alignment:
Q  307 aaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagt 401  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||||| |  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  29645631 aaatattactcttaatgtttatatatatgtgaagagttgataaatctttatgcatgaaccatgagatgtggtcatcagtttacccacgtaatagt 29645537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 36970556 - 36970394
Alignment:
Q  92 atcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctaggg 191  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || | ||| ||||  | |||||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||    
T  36970556 atcagcatgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttacccttttacatataacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctaggg 36970458  T
Q  192 tacatagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgaca 255  Q
      ||||||||||||||||| ||| |   ||||||| | ||||| |   ||||||||||||||||    
T  36970457 atcatagtggtttcaggtctaagagcaatatacactattatcattgcaagaatatcttatgaca 36970394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 330 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 24535569 - 24535435
Alignment:
Q  330 tctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttct 429  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||| || |||| ||||||||||| ||| |||| |||| |||| ||| || |||| |||| ||||||     
T  24535569 tctatgtgaaaacttgataactcattattcatgatccgtaagatatgatcatcagtgtactcacaaaataatctcgatgtttcaatgttatctcacttca 24535470  T
Q  430 caataaagcttgactacgaatactttaagaataat 464  Q
    || ||||| || | ||| |||  ||||||||||||    
T  24535469 cactaaagtttaattacaaatgttttaagaataat 24535435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2375528 - 2375411
Alignment:
Q  93 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 192  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||  | ||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  2375528 tcatcataattcatggagcacccatcaaccgactttatagttatccaattgcggatgatgtttgtatagcaacaaagtactcgactcctacatctatggt 2375429  T
Q  193 acatagtggtttcaggtc 210  Q
    | ||| | ||||||||||    
T  2375428 aaataatagtttcaggtc 2375411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 36970371 - 36970332
Alignment:
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36970371 aatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 36970332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 29645797 - 29645675
Alignment:
Q  124 actttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggtata 223  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||| |||||| |   |||||| | | || ||| | ||||||| ||| |||  ||||||||||||| ||||   ||    
T  29645797 actttatagtcatccttttacaaacaacatttgaacgtctacaaagaaattgaatcctatatctaggatacgtagaagtttcaggtcgaatggtgaagta 29645698  T
Q  224 caccactatcactatgagaatat 246  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  29645697 catcactatcactatgagaatat 29645675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 158
Target Start/End: Original strand, 8968015 - 8968076
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaa 158  Q
    ||||||| |||||||||||||||  | |||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||    
T  8968015 catgatttatggagtacccatcagtcgactttataatcatctttttatggacaacgtttgaa 8968076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 305 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10920479 - 10920427
Alignment:
Q  305 ataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttat 357  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| | | |||||||||||||    
T  10920479 ataaatattactcataatatttatacatatgtgaatatttgataactctttat 10920427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 157
Target Start/End: Original strand, 41368106 - 41368154
Alignment:
Q  109 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttga 157  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  41368106 agtacctattaaccaactttatagttatcatgttacagacaacgtttga 41368154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 157
Target Start/End: Original strand, 41375077 - 41375125
Alignment:
Q  109 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttga 157  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  41375077 agtacctattaaccaactttatagttatcatgttacagacaacgtttga 41375125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 335; Significance: 0; HSPs: 57)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 55613170 - 55612812
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55613170 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 55613071  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55613070 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 55612971  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55612970 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 55612871  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatacttt 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55612870 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatacttt 55612812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 8858654 - 8858289
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858654 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 8858555  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8858554 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 8858455  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8858454 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatatgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagcctacccacata 8858355  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8858354 atagtctctatgctttaatgatatccgacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaata 8858289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 18262699 - 18262334
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262699 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18262600  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18262599 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18262500  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18262499 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 18262400  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18262399 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaata 18262334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 18269560 - 18269195
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269560 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18269461  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18269460 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18269361  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18269360 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 18269261  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18269260 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaata 18269195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 19926480 - 19926845
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926480 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 19926579  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19926580 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 19926679  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19926680 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatttgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 19926779  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  19926780 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 19926845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 26964127 - 26963762
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26964127 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 26964028  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26964027 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 26963928  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26963927 aatccaatataaatattactgctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 26963828  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  26963827 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacggatactttgagaata 26963762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 26970950 - 26970585
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970950 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 26970851  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26970850 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 26970751  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26970750 aatccaatataaatattactgctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 26970651  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  26970650 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacggatactttgagaata 26970585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 869084 - 868719
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  869084 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 868985  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  868984 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 868885  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  868884 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 868785  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  868784 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaata 868719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 28392854 - 28393219
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28392854 catgattcatggagtactcatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 28392953  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28392954 agtggtttcaggttgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 28393053  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28393054 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 28393153  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28393154 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaata 28393219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 5707807 - 5707442
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707807 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 5707708  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5707707 agtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 5707608  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5707607 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 5707508  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5707507 atagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 5707442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 5714435 - 5714070
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714435 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 5714336  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5714335 agtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 5714236  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5714235 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 5714136  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5714135 atagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 5714070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 10621053 - 10621418
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621053 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 10621152  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10621153 agtggtttcaggtcgaagggtggaaaacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 10621252  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10621253 aatccaatataaatattactcctaaaatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 10621352  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  10621353 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaata 10621418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 10628132 - 10628497
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628132 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 10628231  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10628232 agtggtttcaggtcgaagggtggaaaacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 10628331  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10628332 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 10628431  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  10628432 atagtctctatgctttaataatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaata 10628497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 8845690 - 8845325
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845690 catgattcatggagtacccatcaaccaaatttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 8845591  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8845590 agtggtttcaggtcgaaggatggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 8845491  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8845490 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatataaagaattgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagcctacccacata 8845391  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8845390 atagtctctatgctttaatgatatccgacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaata 8845325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 4426336 - 4426689
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426336 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctattacggacaatgtttgaatggtaacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 4426435  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||            ||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4426436 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaa------------cttttcatagattttactatgtagtattctcatggcggatc 4426523  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426524 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 4426623  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4426624 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaata 4426689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 97 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 35224047 - 35223680
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35224047 catgattcgtggagtacacatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatgttgataaagcactcgactccaacatctaaggtacat 35223948  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
     ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  || ||    
T  35223947 cgtggtttcaggtcaaagggtggaatacaacactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatatagtattctcatggtggttc 35223848  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35223847 aatccagtataaatattactcctaatatttatacatatgtaaagacatgataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatccgtctacccacata 35223748  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaataat 464  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||   ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35223747 atagtctatatgctttaatgttatccttttttacaataaagcttgactacgaatactttaagaataat 35223680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 97 - 464
Target Start/End: Original strand, 5667849 - 5668214
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5667849 catgattcgtggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgac--caacatctagggtacat 5667946  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  ||    
T  5667947 agtggtttcaggtctaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtgagtc 5668046  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||| ||||| |||||||    
T  5668047 aatccagtataaatattactcctaatatttatacctacgtgaagatatgataactctttatctatgatccgtgaga--tgatcatcggtctatccacata 5668144  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacga--atactttaagaataat 464  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  5668145 atagtctctatgatttaatgttatctcttttcacaataaagcttgactacaaatatactttaagaataat 5668214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 93 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 20311781 - 20311419
Alignment:
Q  93 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 192  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  20311781 tcatcatgattcgtggagtaccgattaaccgactttatagtcatcctgctacggacaacgtttgtacgggaacaaagtactcgaatcctacatctagggt 20311682  T
Q  193 acatagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgac 291  Q
    | |||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   ||||| | ||   |||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  20311681 aaatagtggtttcaagtagaagggtggaatacaccacttatcactatgagaataatgtatgatagttac-ataactgt--ctatgtagtattctcatgac 20311585  T
Q  292 ggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccc 391  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||    
T  20311584 aggtcaatccaatataaaaattactcctaatatttacatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatccatgatatgtgatcatcaatctaccc 20311485  T
Q  392 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaa 457  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  20311484 acaaaatagtctctatgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgacaacaaatactttaa 20311419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 97 - 329
Target Start/End: Original strand, 10677303 - 10677534
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10677303 catggttcatggagtacccatctaccaactttat-gtcatcttattacaaacaacgtttaaatggtggtaaagcactcgactcctacatctaggatacat 10677401  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||   || ||    
T  10677402 agtggtttcaagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacatttactatgtagtattctcatagtgggtc 10677501  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttata 329  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10677502 aatccagtataaatattactcctaatatttata 10677534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 97 - 329
Target Start/End: Original strand, 10890943 - 10891174
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10890943 catggttcatggagtacccatctaccaactttat-gtcatcttattacaaacaacgtttaaatggtggtaaagcactcgactcctacatctaggatacat 10891041  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||   || ||    
T  10891042 agtggtttcaagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacatttactatgtagtattctcatagtgggtc 10891141  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttata 329  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10891142 aatccagtataaatattactcctaatatttata 10891174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 15461799 - 15461488
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  15461799 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 15461701  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  15461700 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 15461604  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  15461603 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 15461505  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  15461504 atagtctcgacgcttta 15461488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 34975853 - 34975542
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  34975853 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 34975755  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  34975754 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 34975658  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  34975657 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 34975559  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  34975558 atagtctcgacgcttta 34975542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 2677315 - 2677004
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  2677315 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 2677217  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  2677216 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 2677120  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  2677119 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 2677021  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  2677020 atagtctcgacgcttta 2677004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 15815323 - 15815012
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  15815323 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 15815225  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  15815224 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 15815128  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  15815127 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 15815029  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  15815028 atagtctcgacgcttta 15815012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Original strand, 18111043 - 18111354
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  18111043 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 18111141  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  18111142 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 18111238  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  18111239 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 18111337  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  18111338 atagtctcgacgcttta 18111354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Original strand, 3369023 - 3369334
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||| || |  |||    
T  3369023 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catcaagagatcat 3369121  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  3369122 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 3369218  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  3369219 aatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 3369317  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  3369318 atagtctcgacgcttta 3369334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Original strand, 17299959 - 17300270
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||| | ||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  17299959 catgattcatcaagtgctcatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 17300057  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  17300058 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 17300154  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  17300155 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 17300253  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  17300254 atagtctcgacgcttta 17300270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 18163464 - 18163153
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  18163464 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcc-acatctagagatcat 18163366  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| |   ||||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||  |||||||||||||||||||    || |     
T  18163365 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctcacagtgggtg 18163269  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||  ||| |||  |||| |||| |  ||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  18163268 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcgatcatcagtctacatacata 18163170  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  18163169 atagtctcgacgcttta 18163153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 20244239 - 20243928
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  20244239 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 20244141  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| |   ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  20244140 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 20244044  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||  ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  20244043 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 20243945  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  20243944 atagtctcgacgcttta 20243928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 26531915 - 26531604
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  26531915 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 26531817  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  26531816 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 26531720  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  26531719 aatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtatagccttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 26531621  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  26531620 atagtctcgacgcttta 26531604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 1942026 - 1941664
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| || ||||||  |||||| ||| || |||| |||||||||  |||    
T  1942026 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacattagaatggcaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcat 1941928  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||| | ||||| | ||||||||||| ||||||  | | |||||  ||||||||||||||||||| |  || |     
T  1941927 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatctcatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtt 1941831  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||   |||||    
T  1941830 aatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctatatacata 1941732  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatac-tttaagaataa 463  Q
    |||||||| | |||||| |  ||||| | |||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1941731 atagtctcgacgctttattattatcctaattcatattaaagcttgactacgaatacatttaagaataa 1941664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 272 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 56516368 - 56516176
Alignment:
Q  272 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 371  Q
    ||||||||| |||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  56516368 ctatgtagtgttctcatagcgagtcaatccaatataaatattactcatgatatttatacgtatgtgaagacttgataactctttatccattatctgtgag 56516269  T
Q  372 atgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaataat 464  Q
    || ||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||    ||| ||||||||||||||||   |||||| |||||||||    
T  56516268 atttgatcattaatctacctacataatagtctctatgttttaatactatcgttattcacaataaagcttgactatagatacttcaagaataat 56516176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Original strand, 4675983 - 4676294
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||||||  |||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  4675983 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttataatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 4676081  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| |   ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  4676082 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 4676178  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||  ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  4676179 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 4676277  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  4676278 atagtctcgacgcttta 4676294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 113 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 19365806 - 19365586
Alignment:
Q  113 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 212  Q
    ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||   | |||||||| || |||| |||||||||  |||| |||||||||||| |    
T  19365806 cccattaactaacgttatggtcatcctgttacagacaacgtttgaatgacaataaagcacttgagtcca-catctagggatcataatggtttcaggtcta 19365708  T
Q  213 agggtggtatacaccactatcacta-tgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaata 311  Q
    || ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||| ||||| |  || |||||||| ||||||||    
T  19365707 agagtggtatacaccattatcattggtgagaatatcttatgacactttc-ataacat--actatgtagtactctcacggtgggtcaatccagtataaata 19365611  T
Q  312 ttactcctaatatttatatctatgt 336  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  19365610 ttactcctaatatttatacctatgt 19365586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 5870720 - 5870419
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| || ||||| |||  ||||||||| |||||   ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  5870720 catgattcatcaagtactcatcaaccaacgttattgttatcctattatagacaacgttagaatgacaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcat 5870622  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||| ||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  5870621 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcatatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 5870525  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  5870524 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 5870426  T
Q  397 atagtct 403  Q
    |||||||    
T  5870425 atagtct 5870419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 198 - 445
Target Start/End: Original strand, 21453961 - 21454205
Alignment:
Q  198 gtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatca 297  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||  ||||||  || |||||||||||||||||  || |||    
T  21453961 gtggtttcaggtcgaagggtgacatacaccactatcacaatgaaaatatcttatgatattttacataactcata-tatgtagtattctcatggtgggtca 21454059  T
Q  298 atccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataa 397  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||    ||||| |||   ||||  ||||||||| ||||| |||||||    
T  21454060 attcaatataaatattactcctaatatttatatgtatgtgaaaacttgatatctc-aagtccattatc-ccgagagatgatcatcaatctactcacataa 21454157  T
Q  398 tagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgacta 445  Q
    || ||| ||||| ||| || |||| || ||| |||||||| |||||||    
T  21454158 taatctttatgcattattgttatctcatttcacaataaagtttgacta 21454205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 19362695 - 19362477
Alignment:
Q  114 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 213  Q
    |||| ||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||   | |||||| |  | |||| |||||| ||  ||||||||||||||||  ||    
T  19362695 ccattaaccaccgttatggtcatcctgttacagacaacgtttgaatgacaataaagcatttaagtcca-catctaaggatcatagtggtttcaggtttaa 19362597  T
Q  214 gggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatt 313  Q
    | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||    
T  19362596 gagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacactttg-ataacat--actatgtagtactctcacgatgggtcaatccagtataaatatt 19362500  T
Q  314 actcctaatatttatatctatgt 336  Q
    |||||||||||| ||| ||||||    
T  19362499 actcctaatattaatacctatgt 19362477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 422
Target Start/End: Original strand, 32646523 - 32646846
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||  ||||||| | |   |||||| || ||||||  ||||| ||| ||||     
T  32646523 catgattcatccggtacccatcaaccgacttcataatcatcctgttatggatgacgtttgtacgacaacaaagtacccgactcatacatccaggatacag 32646622  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggat 295  Q
    ||| |||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| | |||| || | ||||  | |  ||||| |||  ||||||| ||||| |||   | |    
T  32646623 agttgtttcaggtcgaagggtaaaatacaccacttatcactacgggaatgtcatgtgact-tatacataaccttt--tatgtagcattcttatggtaggt 32646719  T
Q  296 caatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacat 395  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||| |||||||||||||||||   || ||||||    
T  32646720 caatccaatgtaaatattattcctaatatttatatctatgtgaagactcgatattcctttatcaatgatccgtgagatgtgatcatcaacatatccacat 32646819  T
Q  396 aatagtctctatgctttaatgatatcc 422  Q
    ||||||||  || |||||||| |||||    
T  32646820 aatagtcttcattctttaatgttatcc 32646846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 9487853 - 9487625
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| |||||||||  ||||   |||||  ||| || |||| |||||||||  |||    
T  9487853 catgattcatcaagtacccatcaaccaatgttatggttatcctattacagacaacgttataatgacaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcat 9487755  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | |  |||||||  ||||||||||||||||| || || ||    
T  9487754 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatctc-ataactt--actatgtagtattctcacgatgggtc 9487658  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttata 329  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9487657 tatccagtataaatattactcctaatatttata 9487625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 5616681 - 5616333
Alignment:
Q  113 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 212  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||  |||||||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||| || |    
T  5616681 cccattaaccaacgttacagttatcttgttacaaacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagatcta 5616583  T
Q  213 agggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatat 312  Q
    ||  |||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||| ||| ||||  |  ||| ||||||||||||| |   | |||||||| |||||||||    
T  5616582 agattggtatacaccattatcattgtaagaatatcttatgacac-tttcataa--taaactctgtagtattctcacggttggtcaatccagtataaatat 5616486  T
Q  313 tactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgcttt 412  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||  | |||  | | |||  |||  |||| |  ||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| |||||||    
T  5616485 tacttctaatatttatacctacgtatatacttaacatctc-atatttatgacccatgagatgtggtcatcaatctacatacataatagtctcaatgcttt 5616387  T
Q  413 aatgatatcccacttctcaataaagc--ttgactacgaatactttaagaataat 464  Q
    | | |||||||| |||  |||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  5616386 attaatatcccaattcataataaaacctttgacaacggatactttaagaataat 5616333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 360 - 464
Target Start/End: Original strand, 10677538 - 10677640
Alignment:
Q  360 atgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaaga 459  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  | ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  10677538 atgatccgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctatatactttaatgttatctca--tttcactaaagcttgactacggatactttaaga 10677635  T
Q  460 ataat 464  Q
    |||||    
T  10677636 ataat 10677640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 360 - 464
Target Start/End: Original strand, 10891178 - 10891280
Alignment:
Q  360 atgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaaga 459  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  | ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  10891178 atgatccgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctatatactttaatgttatctca--tttcactaaagcttgactacggatactttaaga 10891275  T
Q  460 ataat 464  Q
    |||||    
T  10891276 ataat 10891280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 336
Target Start/End: Original strand, 5528495 - 5528714
Alignment:
Q  113 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 212  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||||| || |||||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||  |||||  |||||||||  |    
T  5528495 cccattaaccaacattatggttatcctgttacagataacgtttgaatggaaataaagcacttgagtcca-catctagggatcatagcagtttcaggtata 5528593  T
Q  213 agggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatat 312  Q
    || ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||  | ||||| || ||||||||| |  || | ||| ||||||||||||    
T  5528594 agagtgttatacaccattatcattatgagaatatcttatggca-ttttcataa--tatactacgtggtattctcacgttgggttaatacaatataaatat 5528690  T
Q  313 tactcctaatatttatatctatgt 336  Q
     |||||||||||||||| ||||||    
T  5528691 cactcctaatatttatacctatgt 5528714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 317
Target Start/End: Original strand, 30040489 - 30040705
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||| || ||||| ||||  ||||| || |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  30040489 catgattcatcaagtactcattaaccaacgttatggttatccttttacaaacaacattagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 30040587  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   |||||||||||| |||||||  || ||    
T  30040588 agtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtactctcatggtgggtc 30040684  T
Q  297 aatccaatataaatattactc 317  Q
    |||| | ||||||||||||||    
T  30040685 aatctagtataaatattactc 30040705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 199 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 32636685 - 32636552
Alignment:
Q  199 tggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 298  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||    
T  32636685 tggtttcacgtcggagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacattgggtcaa 32636589  T
Q  299 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatg 335  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  32636588 tccaatataaatattactcataatatttatacctatg 32636552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 322 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 24700291 - 24700213
Alignment:
Q  322 tatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatag 400  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24700291 tatttatatctatgtgaagacttaatatctctttatccaagatctgtaagatgtgattatcagtctacccacataatag 24700213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 9538244 - 9538033
Alignment:
Q  113 cccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcga 212  Q
    ||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||| || |||| |||| | ||  ||| ||||||| ||||| |    
T  9538244 cccattaaccaacgttatggttatcctgttacggacaatgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catccaaggatcatggtggtttgaggtcta 9538146  T
Q  213 agggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatat 312  Q
    ||  ||| | || ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||| |   |||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||||    
T  9538145 agactgg-acacgccattatcattgtgagaatatcttatgacactttc-ataacatg--ctatgtagtattctcacgctgggtcaatccagtataaatat 9538050  T
Q  313 tactcctaatatttata 329  Q
    ||||||||| |||||||    
T  9538049 tactcctaacatttata 9538033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 182 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 4546298 - 4546147
Alignment:
Q  182 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 281  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| | | ||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | |  |||||||  |||||||||||    
T  4546298 acatctagggatcatagtggttttaggtcaaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatctc-ataactt--actatgtagta 4546202  T
Q  282 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 336  Q
    |||||| |  || ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4546201 ttctcacggtgggtctgtccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 4546147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11421309 - 11421096
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   | |||||||| || | || |||||| ||  |||    
T  11421309 catgattcatcgagtacccattagccaacattatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaataaagcacttgagtaca-catctacggatcat 11421211  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| | | ||| ||||||  | |||| || ||| |||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||| | |  || ||    
T  11421210 agtggtttcaggtctatgagtgatatacattattatccctgtgataatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtattctaacggtgggtc 11421114  T
Q  297 aatccaatataaatatta 314  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11421113 aatccaatataaatatta 11421096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 367 - 448
Target Start/End: Original strand, 39074190 - 39074271
Alignment:
Q  367 gtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacga 448  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||    
T  39074190 gtgagatgtgatcaacaatcaacccacgtaatagtctccatgctttaatgatatctcacttcacaataaagtatgactacga 39074271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 23056080 - 23056218
Alignment:
Q  114 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 213  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||   | ||| |||| || | || |||||||||  ||||||||||| ||||| ||    
T  23056080 ccattaaccaactttatagttatcctgttacagataacatttgaatgtcaataaaacacttgagttca-catctagggatcatagtggtttgaggtctaa 23056178  T
Q  214 gggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatga 253  Q
    | ||||||||||  | || | |||||||||||||||||||    
T  23056179 gagtggtatacaatattacctctatgagaatatcttatga 23056218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 346 - 428
Target Start/End: Original strand, 9937933 - 9938015
Alignment:
Q  346 ataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttc 428  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||  ||| |||| ||||||    
T  9937933 ataactctttattcatgatttatgagatgtgatcatgactctacccacacaatagtctatatgcttcgatgctatctcacttc 9938015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24701411 - 24701361
Alignment:
Q  175 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggtataca 225  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  24701411 gactcctacatctagggtacacagtggttttaggtcgaagggtggaataca 24701361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 125 - 206
Target Start/End: Original strand, 9937745 - 9937826
Alignment:
Q  125 ctttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttca 206  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  || |||| | |||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  9937745 ctttatagtcatccttttacgaacaatgtttgaacgacgataaagtattcgactcttacatctagggtacatagtgatttca 9937826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 194 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 33888743 - 33888594
Alignment:
Q  194 catagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 293  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||| ||| ||||| | |||||||| |||||||  ||||   | | ||||| ||||| |||||  ||    
T  33888743 catagtgatttcaggtcgaaatgtggcatacaccactgtcaatatgatattatcttatcacactttacataa--atcattatgtggtattatcatggtgg 33888646  T
Q  294 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagata 348  Q
     ||||| |   ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  33888645 gtcaattc---ataaatattacacataatatttatatctatgtgaaaacttgata 33888594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 357
Target Start/End: Original strand, 34777850 - 34777975
Alignment:
Q  230 tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 329  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||  |||| |   | | |||||||||||||||  || |||||| |||| ||| ||||||| | |||||||||    
T  34777850 tatcactatcaaaatatcttatgacactttacataagtc--aatgtgtagtattctcatggagggtcaatctaatacaaaaattactcattatatttata 34777947  T
Q  330 tctatgtgaagactagataactctttat 357  Q
      ||| |||||||| ||||||| |||||    
T  34777948 catatttgaagacttgataactttttat 34777975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 327
Target Start/End: Original strand, 9937830 - 9937923
Alignment:
Q  236 tatgagaatatcttatgacactttttataacttttacta---tgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatattta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||| |  |||||    |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  9937830 tatgagaatatcttatggcacatttcataattcatactaagtagtagtattctcatgacgg-tcactgcaatataaatattacttctattattta 9937923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 335; Significance: 0; HSPs: 48)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 455
Target Start/End: Original strand, 16482203 - 16482561
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482203 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 16482302  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16482303 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 16482402  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16482403 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 16482502  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatacttt 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16482503 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatacttt 16482561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 6110551 - 6110186
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110551 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 6110452  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6110451 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 6110352  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6110351 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 6110252  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  6110251 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaata 6110186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 15341939 - 15342304
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15341939 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15342038  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342039 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataatttttactatgtagtattctcatgacggatc 15342138  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15342139 aatccaatataaatattactcctaatttttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 15342238  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15342239 atagtctctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 15342304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 15357306 - 15357671
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357306 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15357405  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15357406 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15357505  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15357506 aacccaatataaatattactcctaatttttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 15357605  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15357606 atagtctctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 15357671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 15600604 - 15600969
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600604 catgattcatggggtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15600703  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15600704 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15600803  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15600804 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 15600903  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15600904 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaata 15600969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 15607149 - 15607514
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607149 catgattcatggggtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 15607248  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15607249 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 15607348  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15607349 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 15607448  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15607449 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaata 15607514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 10572312 - 10572677
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10572312 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctacggtacat 10572411  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10572412 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacagttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 10572511  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10572512 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 10572611  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  10572612 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaata 10572677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 10579075 - 10579440
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579075 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 10579174  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10579175 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcggatc 10579274  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10579275 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 10579374  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  10579375 atagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaata 10579440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 101 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 18523146 - 18522785
Alignment:
Q  101 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18523146 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 18523047  T
Q  201 gtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18523046 gtttcaggtcgaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattttcatggcggatcaatc 18522947  T
Q  301 caatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatag 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18522946 caatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatag 18522847  T
Q  401 tctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18522846 tctctatgcttaaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaata 18522785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 17780838 - 17781203
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17780838 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctattacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 17780937  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17780938 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataatttttactatgtagtattctcatggcggatc 17781037  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17781038 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatctatgatttgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 17781137  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  17781138 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 17781203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 97 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 18520462 - 18520112
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520462 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttatggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18520363  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18520362 agtggtttcagttcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18520263  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18520262 aatcaaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 18520163  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacg 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520162 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacg 18520112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 32056619 - 32056985
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056619 catgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 32056718  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32056719 agtggtttcaggttgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 32056818  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaata-tttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacat 395  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32056819 aatccaatataaatattactcataatattttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcattagtctacccacat 32056918  T
Q  396 aatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  32056919 aatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagtttgactacggacactttaagaata 32056985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 13249094 - 13248729
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13249094 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctaggttacat 13248995  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||    
T  13248994 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtaatattctcatggcgaatc 13248895  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  13248894 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagttgtgatcatcagtctacctacata 13248795  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13248794 atagtctctatgctttaatgttatcccacttctcaacaaagcttgactacgaatactttgagaata 13248729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 8490982 - 8490610
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490982 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 8490883  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8490882 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 8490783  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8490782 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 8490683  T
Q  397 a-------tagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  8490682 atcgtctgtagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacagatactttgagaata 8490610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 13211789 - 13211424
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13211789 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctaggttacat 13211690  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  13211689 aatggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtaatattctcatggcggatc 13211590  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  13211589 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagttgtgatcatcagtctacctacata 13211490  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13211489 atagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaata 13211424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 93 - 462
Target Start/End: Original strand, 17199900 - 17200269
Alignment:
Q  93 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  17199900 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgatacgaacaacatttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctaaggt 17199999  T
Q  193 acatagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  17200000 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagcg 17200099  T
Q  293 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccca 392  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17200100 ggtcaatccaatacaaatactactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccacgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccca 17200199  T
Q  393 cataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  17200200 cataatagtctctatgctttaatgatatcacacatctcaataaagcttaactacggatactttaagaata 17200269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 97 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 13517294 - 13516934
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13517294 catgattcatggagtacccatctaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgataaagcactcgactccaacatctagggtacat 13517195  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  13517194 agtggtttcaggtcgaagggtgggg----ccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatttagtattctcatggaggatc 13517099  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13517098 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 13516999  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaat 461  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  13516998 atagtctctgtgctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaat 13516934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 17136840 - 17136481
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17136840 catgattcatggagtatccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatgtttactaagcactcgactccaacatctagggtacat 17136741  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  17136740 agtggtttcaagtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttcaataacttttactatgtagtattctcatggtgggtc 17136641  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17136640 aatccaatataaatattactccta------atatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaaatgtgatcatcagtctacccacata 17136547  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17136546 atagtctctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaata 17136481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 1647241 - 1647606
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1647241 catgattcatggagtactcatcaaccaaatttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtatat 1647340  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||    
T  1647341 agtggttttaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgggaatatcgtatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcgagtc 1647440  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1647441 aatcaaatataaacattactcctaatatttatatctatgtgtagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatccacata 1647540  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  1647541 atagtctctatgctttaattatatcccttttctcaataaagcttgattacggatactttaaaaata 1647606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 97 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 29925458 - 29925091
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29925458 catgattcgtggagtatccatcaaccaactttataatcatcttgttacagacaacgtttgattggtgacaaagcactcaactccaacgtctagggtacat 29925359  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    | |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  || ||    
T  29925358 aatggtttcaggtcaaatggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgcagtattctctaggtgggtc 29925259  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||    
T  29925258 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttaatgactctttatccatgatctatgagatgtgatcatcgatctatccacata 29925159  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaataat 464  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  29925158 atagcctccatgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgactacatatattttaagaataat 29925091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 97 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 29974611 - 29974244
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29974611 catgattcgtggagtatccatcaaccaactttataatcatcttgttacagacaacgtttgattggtgacaaagcactcaactccaacgtctagggtacat 29974512  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    | |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  || ||    
T  29974511 aatggtttcaggtcaaatggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgcagtattctctaggtgggtc 29974412  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||    
T  29974411 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttaatgactctttatccatgatctatgagatgtgatcatcgatctatccacata 29974312  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaataat 464  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  29974311 atagcctccatgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgactacatatattttaagaataat 29974244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 97 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 16200917 - 16200551
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16200917 catgattcgtggagtatccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacatttgaatggtgacaaagcactcgacttcaacatctagggtacat 16200818  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| |||||||||||||||||||  || ||    
T  16200817 agtggtttcaggtcaaagggttgaatacaccactatcactatgagaatatcttatgatactttacataattttgactatgtagtattctcatggtgggtc 16200718  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||| |    
T  16200717 aatccaatatgaatattacacctaatatttgtatctatatgaatacttgataattctttatccatgatctgtaagatatgatcatcagtctctccaca-a 16200619  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaataat 464  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16200618 atagtcttcatgctttaatgacatcccacttcacaataaatcttgactacgaatactttaagaataat 16200551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 21034540 - 21034229
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  21034540 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 21034442  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  21034441 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 21034345  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  21034344 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 21034246  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  21034245 atagtctcgacgcttta 21034229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Original strand, 15846536 - 15846847
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| |||||||||  |||    
T  15846536 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagggatcat 15846634  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  15846635 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 15846731  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  15846732 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 15846830  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  15846831 atagtctcgacgcttta 15846847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Original strand, 20147554 - 20147865
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  20147554 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 20147652  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  20147653 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 20147749  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  20147750 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 20147848  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  20147849 atagtctcgacgcttta 20147865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 115 - 462
Target Start/End: Original strand, 24253130 - 24253473
Alignment:
Q  115 catcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaag 214  Q
    ||||||| |||||||| ||||  |||| |  ||||| ||||||| |   |||||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  24253130 catcaactaactttatggtcactctgtaattgacaatgtttgaacgacaacaaagtactcgagtcatacatctaaggtacatagtggttttaggtcgaat 24253229  T
Q  215 ggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatatta 314  Q
    | ||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||   ||||| ||  ||||| | ||||||||||  || |||| ||||||||||||| |    
T  24253230 g-tggaatacaccgttatcactatgagaataacttatgatccttaa-ataacatt--ctatgcattattctcatggagggtcaaaccaatataaatataa 24253325  T
Q  315 ctcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaa 414  Q
    ||| |||| ||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24253326 ctcttaatgtttataagtatgtgaaaacttgataactctttatccataattcgtgagatatgatcattagtctaccgacataatagtctctatgctttaa 24253425  T
Q  415 tgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    || || | |||||  |||||||  ||||| ||  ||||||||||||||    
T  24253426 tgttacctcactttacaataaattttgaccacatatactttaagaata 24253473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 97 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 21399094 - 21398792
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  21399094 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 21398996  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | | |||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  21398995 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtaagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 21398899  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | |||| |||||||  |||||    
T  21398898 aatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgaggtcataagtctacatacata 21398800  T
Q  397 atagtctc 404  Q
    ||||||||    
T  21398799 atagtctc 21398792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 55427323 - 55427012
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  55427323 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 55427225  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| |   ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  55427224 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 55427128  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||  ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  55427127 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 55427029  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  55427028 atagtctcgacgcttta 55427012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 14890693 - 14890391
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| ||||||| |  ||     
T  14890693 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttataattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcac 14890595  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||| ||||||||| ||| |   ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  14890594 agtgctttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 14890498  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  14890497 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 14890399  T
Q  397 atagtctc 404  Q
    ||||||||    
T  14890398 atagtctc 14890391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 344 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 16200364 - 16200245
Alignment:
Q  344 agataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgac 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16200364 agataactctttatccatgatctgtaagatatgatcatcagtctctccaca-aatagtctccatgctttaatgatatcccacttcacaataaatcttgac 16200266  T
Q  444 tacgaatactttaagaataat 464  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16200265 tacgaatactttaagaataat 16200245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 366 - 462
Target Start/End: Original strand, 19089734 - 19089830
Alignment:
Q  366 tgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19089734 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgatttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaata 19089830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 12300212 - 12299902
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  12300212 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaatcacttgagtcca-catctagagatcat 12300114  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  12300113 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 12300017  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  12300016 aatccaatataaatattactcctaacatttatatctatg-atagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 12299919  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  12299918 atagtctcgacgcttta 12299902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 336
Target Start/End: Original strand, 25978728 - 25978963
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| |||||||||  |||    
T  25978728 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcat 25978826  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | | |||||  ||||||||||||||||||| |  || ||    
T  25978827 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 25978923  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 336  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25978924 tatccagtataaatattactcctaataattatacctatgt 25978963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15527021 - 15526827
Alignment:
Q  131 agtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccact 230  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||| || ||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  15527021 agtcatgctgttacagacaacgtttgaatggttataaagcacttgagtcca-catgtatggatcatagtggtttcaggtctaagagtggtatacaccatt 15526923  T
Q  231 atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 329  Q
    | || | | |||||||||||||||| |||| ||| |   |||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  15526922 aacattgtaagaatatcttatgaca-ttttcatagc--atactatttagtactctcacgatgggtcaatccagtataaatattactcctaagatttata 15526827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 14147226 - 14147012
Alignment:
Q  195 atagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgga 294  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||| | ||||||||||||| |||| |||| ||||| |  ||||||||| ||||||| | | |     
T  14147226 atagtggtttcaggtctaagagtgatatacacctttatcaatgtgagaatatcttacgaca-ttttcataacat--actatgtagcattctcacggcagg 14147130  T
Q  295 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccaca 394  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||  |||||  ||| |||  ||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||  | |    
T  14147129 tcaatccagtataaatattcctcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatccatgacccatgagatgtggtcatcagtctacatata 14147031  T
Q  395 taatagtctctatgcttta 413  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  14147030 taatagtctctgtgcttta 14147012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 28088408 - 28088251
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||||| || || |||| |||||||||  |||    
T  28088408 catgattcatcaagtatccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcccttgagtcca-catctagggatcat 28088310  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgaca 255  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||    
T  28088309 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca 28088251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 11787889 - 11787654
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || |  |  ||||||||  |||    
T  11787889 catgattcattaagtacccatcaaccaacgttatggttatccatttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgattatag-atctagggatcat 11787791  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    | |||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||| | | |  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  11787790 aatggtttcaggtctaagagcgatatacaatattatcattgtgagaatatcttatgaaaatatc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 11787694  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 336  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11787693 tatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 11787654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 97 - 336
Target Start/End: Original strand, 15317176 - 15317408
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||  | ||||  |||| ||||||||| |||||   |||||| ||| || |||| |||||||||  |||    
T  15317176 catgattcatcaagtacccgtcaaccaacgttatgattatccgtttacagacaacgttagaatg---acaaagtacttgagtcca-catctagggatcat 15317271  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | | ||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  | | |||||   |||||||||||||||||| |  || ||    
T  15317272 agtggtttcaggtctaagagcgatttacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atctcataac--gtactatgtagtattctcacggtgggtc 15317368  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 336  Q
     ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15317369 tatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 15317408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 32280507 - 32280260
Alignment:
Q  171 actcgactccaacatctagggtacata----gtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataac 266  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||| ||  || |||   ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  32280507 actcgactcctacatctagggtacatatatagtggtttcaagtgaaaaggtaaaataaatcattatcactatgagaatatcttatgacactttacatgac 32280408  T
Q  267 ttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatct 366  Q
    |   |||||||| |||||||||   || |||| | | | ||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |     
T  32280407 tc--actatgtattattctcattgtgggtcaaccgagtgtaaatattattcgtaatgattatacctatgtgaagattaaataactctttatccatga-cc 32280311  T
Q  367 gtgagatg--tga--tcatcagtctacccacataatagtctctatgcttta 413  Q
     |||||||  |||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  32280310 atgagatgaatgaggtcatcagtctacccacatattagtctatacgcttta 32280260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 236 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 28954093 - 28953929
Alignment:
Q  236 tatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatat-aaatattactcctaatatttatatctat 334  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||||| || | ||||||| |  |||||||||||||||| | ||||  |||    
T  28954093 tatgagaatatcatatgacactttaaataacttat--tatgtagtattctcatgatgggttaatccaacaacaaatattactcctaatgtgtatacatat 28953996  T
Q  335 gtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagt 401  Q
    |||||||||   |||||||||||| |||||| || |||| || | |||| | || ||||||||||||    
T  28953995 gtgaagactttgtaactctttatcaatgatcagttagatatggtaatcaatatatccacataatagt 28953929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 319 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 9504548 - 9504446
Alignment:
Q  319 taatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgat 418  Q
    |||||||| ||| ||||| || ||| |||||||| |||||||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  9504548 taatatttttatgtatgttaatacttgataactccttatccatgacccgtgagataagattatcagtctacccacataatagtttctatcctttaaagat 9504449  T
Q  419 atc 421  Q
    |||    
T  9504448 atc 9504446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 30464261 - 30464147
Alignment:
Q  135 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatca 234  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||   | ||| |||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||    
T  30464261 atccttttacagacaacgtttgaatgtcaataaaacacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtggtatagaccattatca 30464163  T
Q  235 ctatgagaatatctta 250  Q
     |||||||||||||||    
T  30464162 ttatgagaatatctta 30464147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 408
Target Start/End: Original strand, 8251933 - 8252048
Alignment:
Q  293 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccca 392  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||| || || ||||| |||| | ||||||  ||||| ||||||| || |||||||||| |||||| | |||    
T  8251933 gatcaatcaaatataaatattactcgaaatatgtaaatttatgtaaagatttgataacattttattcatgatccgtaagatgtgatcttcagtccatcca 8252032  T
Q  393 cataatagtctctatg 408  Q
    ||| ||||||| ||||    
T  8252033 catgatagtctatatg 8252048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 258
Target Start/End: Original strand, 36138033 - 36138097
Alignment:
Q  194 catagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 258  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  36138033 catagtgatttcaggttgaagggtggtatacaccattatcactttggaaatatcttatggcactt 36138097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 19345795 - 19345720
Alignment:
Q  358 ccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaat 433  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| || ||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  19345795 ccatgatctatgagacgtgatcatcagtatacccacataatgatctttacgctttaatgttataccacttcacaat 19345720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 423 - 462
Target Start/End: Original strand, 18640792 - 18640831
Alignment:
Q  423 cacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18640792 cacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 18640831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 4189329 - 4189223
Alignment:
Q  216 gtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattac 315  Q
    |||||||| ||||  |||| ||||||||||| ||||||||| ||  ||||  |||  |||||| |||||||||||| |||||||  | ||||||||||||    
T  4189329 gtggtataaaccataatcaatatgagaatattttatgacaccttc-ataatattt--tatgtaatattctcatgacagatcaatatagtataaatattac 4189233  T
Q  316 tcctaatatt 325  Q
    || |||||||    
T  4189232 tcataatatt 4189223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 194 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 36142880 - 36142816
Alignment:
Q  194 catagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 258  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  36142880 catagtggtttcaggttgaagggtgacatacatcattatcactttggaaatatcttatggcactt 36142816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 7594 - 7229
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7594 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 7495  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7494 agttgtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 7395  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7394 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 7295  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  7294 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatacttttagaata 7229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 6654 - 7019
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6654 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttatggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 6753  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6754 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 6853  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6854 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 6953  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  6954 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 7019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 13670 - 14035
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13670 catgattcatggagtaaccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 13769  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13770 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcggatc 13869  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13870 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctttgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 13969  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  13970 atagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaata 14035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 11652210 - 11651845
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652210 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 11652111  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11652110 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcattatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 11652011  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652010 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 11651911  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  11651910 atagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactactgatacttttagaata 11651845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 17684189 - 17684554
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684189 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 17684288  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17684289 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 17684388  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17684389 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 17684488  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  17684489 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaata 17684554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 17691160 - 17691525
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691160 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 17691259  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17691260 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 17691359  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17691360 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 17691459  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17691460 atagtctttatgctttaatgatatcccacttctcactaaagcttgactacggatactttaagaata 17691525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 27380972 - 27381337
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27380972 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27381071  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27381072 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27381171  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27381172 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 27381271  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  27381272 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactatggatactttgagaata 27381337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 27471355 - 27471720
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471355 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27471454  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27471455 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27471554  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27471555 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 27471654  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  27471655 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactatggatactttgagaata 27471720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 29309377 - 29309012
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29309377 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcacctgactccaacatctagggtacat 29309278  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29309277 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 29309178  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29309177 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 29309078  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  29309077 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 29309012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 29316336 - 29315972
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29316336 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcact-gactccaacatctagggtacat 29316238  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29316237 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 29316138  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29316137 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 29316038  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  29316037 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 29315972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 188697 - 189062
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188697 catgatttatggagtatccatcaatcaactttatagtcattctgttacagacaatatttgaatgataacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 188796  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  188797 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 188896  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  188897 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 188996  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  188997 atagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacaaatactttaagaata 189062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 97 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 27297116 - 27296877
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27297116 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 27297017  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27297016 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 27296917  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27296916 aatccaatataaatattactcctaatatttatatcaatgt 27296877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 97 - 370
Target Start/End: Original strand, 16394165 - 16394438
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16394165 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacagacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgattccaacatctagggtacat 16394264  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  || ||    
T  16394265 agtggtttcaagtcaaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatgacacttttcataacttttactacgtagtattctcatggtgggtc 16394364  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtga 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  16394365 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactgtttatccatgatatgtga 16394438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 101 - 338
Target Start/End: Original strand, 25536915 - 25537152
Alignment:
Q  101 attcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25536915 attcatggagtacccatcaaccaactttataatcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtaaatagtg 25537014  T
Q  201 gtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatc 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25537015 gtttcaggtcgaagggtggaatacaccactgtcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatc 25537114  T
Q  301 caatataaatattactcctaatatttatatctatgtga 338  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  25537115 caatataaatatgacacctaatatttatatctatgtga 25537152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 98 - 319
Target Start/End: Original strand, 16559193 - 16559414
Alignment:
Q  98 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacata 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16559193 atgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctacggtacata 16559292  T
Q  198 gtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatca 297  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16559293 gcggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtggatca 16559392  T
Q  298 atccaatataaatattactcct 319  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16559393 atccaatataaatattactcct 16559414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 114 - 464
Target Start/End: Original strand, 13359010 - 13359356
Alignment:
Q  114 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||  |||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13359010 ccatcaaccgactttatagtcatcctgttacggacgatgtttgtacggcaacaaaatactcgactcctacatctaaggtacatagtggtttcaggtcgaa 13359109  T
Q  214 gggtggtatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatat 312  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||  |||| ||| |  |||||||||||  |||  |   |||| |||||||||||     
T  13359110 gggtggaatacaccacttatcactatgagaataatttatgaca-tttacataattttca--atgtagtattc--atggtgagacaattcaatataaatac 13359204  T
Q  313 tactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgcttt 412  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  13359205 tacttctaatacttatatctaagtgaagatttgataactttttatccatgatttgcgagatgtgatcatcagtctatccatataatagtctctacgcttt 13359304  T
Q  413 aatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaataat 464  Q
    |||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  13359305 aatgttgtcccatttcacaataaaggttgactacggatactttaaaaataat 13359356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 314 - 462
Target Start/End: Original strand, 16566257 - 16566405
Alignment:
Q  314 actcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16566257 actcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 16566356  T
Q  414 atgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16566357 atgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaata 16566405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 16789373 - 16789062
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  16789373 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 16789275  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  16789274 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 16789178  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  16789177 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 16789079  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  16789078 atagtctcgacgcttta 16789062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Original strand, 22859888 - 22860199
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  22859888 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcat 22859986  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  22859987 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 22860083  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  22860084 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 22860182  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  22860183 atagtctcgacgcttta 22860199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Original strand, 27508347 - 27508658
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  27508347 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcat 27508445  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  27508446 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 27508542  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  27508543 aatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 27508641  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    | |||||| | ||||||    
T  27508642 acagtctcgacgcttta 27508658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 107 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 2669768 - 2669476
Alignment:
Q  107 ggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttca 206  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  || ||| |||||| |   |||||| ||  |||||| |||||||| ||||||| || |||||    
T  2669768 ggagtaccaatcaactgactttatagtcatcctgttatagataacatttgaacgacaacaaagtaccggactcctacatctagagtacataatgatttca 2669669  T
Q  207 ggtcgaagggtggtatacaccacta-tcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaata 305  Q
    |||| ||  |||| |||||| |||  |||||||||||||| ||||||| ||||   | ||| ||  |||||||||||| |||||| |  |||||| ||||    
T  2669668 ggtcaaatagtggaatacacaacttgtcactatgagaataacttatgatacttaa-acaacatt--ctatgtagtattttcatgatgtgtcaatcaaata 2669572  T
Q  306 taaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagt 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  2669571 taaatattactcctaatatttatatctatgtgaatacatgataactcttaatcaatgattcatgagatgtgatcatcaatctacccatataatagt 2669476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 366 - 462
Target Start/End: Original strand, 25537148 - 25537244
Alignment:
Q  366 tgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537148 tgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 25537244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Original strand, 1586108 - 1586419
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  1586108 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 1586206  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| |   ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  1586207 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 1586303  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||  ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  1586304 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 1586402  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  1586403 atagtctcgacgcttta 1586419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 111 - 413
Target Start/End: Original strand, 27527947 - 27528244
Alignment:
Q  111 tacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtc 210  Q
    ||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||||||||||||||    
T  27527947 tacccatcaaccaacgttatttttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgaatcca-catctagagatcatagtggtttcaggtc 27528045  T
Q  211 gaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaat 310  Q
     ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||    || ||||||||||| ||||    
T  27528046 taagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatacaaat 27528142  T
Q  311 attactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgct 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||| |||||| | |||    
T  27528143 attactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataacagtctcgacgct 27528241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 275 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 27926062 - 27925874
Alignment:
Q  275 tgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatg 374  Q
    ||||||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27926062 tgtagtattatcatggcgagtcaattcaatataaatattattcctaat-ttaatatctatgtgaaaacttcataaatctttatccatgatccgtgagatg 27925964  T
Q  375 tgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaataat 464  Q
     |||||||||| || |||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||  ||||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  27925963 agatcatcagtttatccacataatagtctttgtgcttcaatgctataccacttccaaataaagtttgactagagatactttaagaataat 27925874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 200 - 462
Target Start/End: Original strand, 17850321 - 17850579
Alignment:
Q  200 ggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttt-tataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaa 298  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||   || |||     | |||||||||||| | |  || ||||    
T  17850321 ggtttcaggtcaaagggtggtatacatcactatcactataagaataacttatgatacttacataaaacc----caatgtagtattcttaaggagggtcaa 17850416  T
Q  299 tccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataat 398  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||||||| || || ||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  17850417 tccaatatatatattactcataatatttatacctatgtgaatacacgataactcgttgtcaatgatctataagatatgatcatcagtctacccatataat 17850516  T
Q  399 agtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||| ||| ||| |||| |||   ||||| ||| |||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  17850517 agtctatatacttgaatgttatttgacttcacaa-aaagcttgactatggataatttaagaata 17850579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 14074782 - 14074471
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||| ||| ||  |||||||||| || || | |||||||||  |||    
T  14074782 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaatgttagaaaggcaacaaagcacttgagtcta-catctagggatcat 14074684  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| |   |||||||   ||||| | ||| |||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  14074683 agtggtttcaggtctaagagcaatatacacttttatcattgtgaaaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 14074587  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||  ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  14074586 aatccattataaatattactcccaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 14074488  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  14074487 atagtctcgacgcttta 14074471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 141 - 413
Target Start/End: Original strand, 18019885 - 18020152
Alignment:
Q  141 ttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatga 240  Q
    |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || || | ||||||| |  ||||||| ||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||    
T  18019885 ttacagacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcga-catctagagatcatagtgatttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtga 18019983  T
Q  241 gaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaag 340  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  18019984 gaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatag 18020080  T
Q  341 actagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgcttta 413  Q
    ||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||    
T  18020081 acttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 18020152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 280 - 464
Target Start/End: Original strand, 20553492 - 20553674
Alignment:
Q  280 tattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatc 379  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||   | ||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20553492 tattctcatgatgggtcaatc-aatataaatattattcttaatatt-atatctatgtgaatgtttgatatttctttatcgatgatatgtgagatgtgatc 20553589  T
Q  380 atcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaataat 464  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||  |||| |||||| |||||||  || |||||| || |||||||||||||    
T  20553590 atcagtctaccaacataaaaatctttatgctttaattttatctcacttcacaataaaaattcactacggatgctttaagaataat 20553674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 336
Target Start/End: Original strand, 10359073 - 10359285
Alignment:
Q  119 aaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtg 218  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||   | ||||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||    
T  10359073 aaccaacttaatggttatcctgttacggacaatgtttgaatgacaataaagcacacgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaagtctaagagtg 10359171  T
Q  219 gtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcc 318  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||  || |||||   |||||||||||||| ||| |  || || ||||| ||||||||||||       
T  10359172 gtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacac--ttcataac--atactatgtagtattttcacggtgggtcgatccagtataaatattaccta 10359267  T
Q  319 taatatttatatctatgt 336  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10359268 taatatttatatctatgt 10359285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 8613221 - 8612857
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||| ||  |||||  ||| || |||| |||||||||  |||    
T  8613221 catgattcatcaagtacccatcaaccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaagggaaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcat 8613123  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacact---ttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 293  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |   | | |||||   |||||||||||||||||| |  ||    
T  8613122 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataac--gtactatgtagtattctcacggtgg 8613025  T
Q  294 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccac 393  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  ||| |||  |||| || | |  ||||||| | ||||||||||||  ||    
T  8613024 gtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 8612926  T
Q  394 ataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatac-tttaagaata 462  Q
    ||||||||||| | |||||| |  ||||| | || | | ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  8612925 ataatagtctcgacgctttattattatcctaattat-attaaagcttgactacggatacatttaagaata 8612857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 182 - 464
Target Start/End: Original strand, 20736413 - 20736691
Alignment:
Q  182 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 281  Q
    ||||||||||  |||||| |||| ||||| ||| ||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| | |  | |||||||||    
T  20736413 acatctagggatcatagtagttttaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcatagcat--aatatgtagta 20736509  T
Q  282 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcat 381  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |  | |||  ||| |||  |||| || |    ||||||||| ||||    
T  20736510 ttctcacgatggatcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctat-tataaacttaatatctc-atatctataacacatgagatgtggtcat 20736607  T
Q  382 cagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatac-tttaagaataat 464  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | |||||| |  ||||||| |||| | ||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  20736608 cagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcccagttcttattaaagcttgactacagatacatttaagaataat 20736691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 281 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 28172859 - 28172698
Alignment:
Q  281 attctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatca 380  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||    
T  28172859 attctcatggagggtcaatccaatataaacactacccttaatatttatatctatgtaaagacttgataactttttaacaatgatctgtaagatgtgatca 28172760  T
Q  381 tcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttga 442  Q
    |||||| |  ||||||||| | ||||| ||| | || ||||||||||| || |||| |||||    
T  28172759 tcagtccattcacataataatttctattcttcagtgttatcccacttcacactaaaacttga 28172698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 166 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 8510338 - 8510045
Alignment:
Q  166 aaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataa 265  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||  || |||||| |||||||||||| || || ||||||| ||  ||||    
T  8510338 aaagtactcgactcctacatctaaggtacatagtggttccaggccgaagcatgtaatgcaccaccatcactatgagagtaactaatgacac-ttacataa 8510240  T
Q  266 cttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaata-tttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgat 364  Q
    | ||  |||||||||||| ||||    | |||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||   |||||||  ||| || ||||    
T  8510239 catt--ctatgtagtattatcattgtaggtcaatcaaatataaatattacttctaatattttttatctatatgaagaaatgataactacttacccgtgat 8510142  T
Q  365 ctgtgagatgtgat-catcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
     |||  ||||| || ||||  | ||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| || |||  |||||||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  8510141 atgtacgatgttatacatc--tttacgcacataatagtctttatgttttaatgctatctcatttcataataaagcttaactacatatactttaataata 8510045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 336
Target Start/End: Original strand, 17120505 - 17120740
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||| || ||||| | || ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| ||| |||||  |||    
T  17120505 catgattcatcaagcacccatcaaccaacgttatggttatcctttgacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catatagggatcat 17120603  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||   |||||| ||| |||||||    || ||    
T  17120604 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatttagcattctcacagtgggtc 17120700  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 336  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  17120701 aatccagtataaatactactcctagtatttatacctatgt 17120740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 21994794 - 21994655
Alignment:
Q  194 catagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 293  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| |||||||||||||  ||    
T  21994794 catagtcgtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcattgtgaaaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatttagtattctcatggtgg 21994698  T
Q  294 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 336  Q
     ||| |||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  21994697 gtcattccagtataaatattactcgtaatgtttatagctatgt 21994655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 33317167 - 33317055
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  33317167 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 33317069  T
Q  197 agtggtttcaggtc 210  Q
    ||||||||||||||    
T  33317068 agtggtttcaggtc 33317055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 329
Target Start/End: Original strand, 5758565 - 5758709
Alignment:
Q  182 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 281  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | | ||||||| | ||| | | ||||||||||||||| || | |  ||||| |  |||||||||||    
T  5758565 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattataattgtgagaatatcttatggcaatctc-ataacgt--actatgtagta 5758661  T
Q  282 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 329  Q
    ||||||    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5758662 ttctcacagtggatctatccagtataaatattactcctaatatttata 5758709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 253
Target Start/End: Original strand, 28756145 - 28756283
Alignment:
Q  114 ccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaa 213  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||| |||||| |||| ||  |||||| |||| || |||||| ||||||||||||||  |    
T  28756145 ccatcaaccgactttataggcatcttgttacatacaacatttga-tggtgataaagtacatgactcctacatatatggtacacagtggtttcaggtcata 28756243  T
Q  214 gggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatga 253  Q
    || ||  ||| | || ||||||||||||||||| ||||||    
T  28756244 ggatgagataaatcattatcactatgagaatattttatga 28756283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 19218630 - 19218427
Alignment:
Q  194 catagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 293  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||| | || ||||| | |||||||||||||||| | |||| |||||   |||||||||||||||||| |  ||    
T  19218630 catagtggtttcaggtctaagagtagtatatatcattatcattctgagaatatcttatga-aattttcataac--atactatgtagtattctcacggtgg 19218534  T
Q  294 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccac 393  Q
     |     |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||  |||||  ||| |||  ||| ||||| |  |||| |||| ||||||||||||  ||    
T  19218533 gt-----caatataaattttactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atattcatgacccatgaggtgtggtcatcagtctacatac 19218440  T
Q  394 ataatagtctcta 406  Q
    |||||||||||||    
T  19218439 ataatagtctcta 19218427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 390
Target Start/End: Original strand, 19347092 - 19347212
Alignment:
Q  269 ttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgt 368  Q
    ||||||||||||||||| ||| | | |||||||| || |||||||| || |||| ||||||  |||||||| ||  || ||||||||||| ||||| |||    
T  19347092 ttactatgtagtattctaatggcagttcaatccattacaaatattattc-taatgtttatacttatgtgaaaacatgacaactctttatcaatgatatgt 19347190  T
Q  369 gagatgtgatcatcagtctacc 390  Q
    ||||| || |||||| ||||||    
T  19347191 gagatatggtcatcaatctacc 19347212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 413
Target Start/End: Original strand, 13995151 - 13995254
Alignment:
Q  309 atattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatg 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||| | |    
T  13995151 atattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacg 13995249  T
Q  409 cttta 413  Q
    |||||    
T  13995250 cttta 13995254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 28172963 - 28172899
Alignment:
Q  175 gactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccac-tatcactat 238  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  28172963 gactcctatatctagggtacatactggtttccggtcgaagggtggaatacaccacttatcactat 28172899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 405
Target Start/End: Original strand, 22560311 - 22560487
Alignment:
Q  225 accactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatat 324  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||| |||||||    | ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22560311 accattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatgtagtgttctcatagtaggtcaatacagtataaatattactcctaatat 22560407  T
Q  325 ttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctct 405  Q
    ||| | ||||||  | |||  ||| |||  ||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||    
T  22560408 ttaaacctatgtataaacttaatatctc-atatccatgacccatgagatgtggtcatcggtctacatgcataatagtctct 22560487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 37)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 24695186 - 24695551
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695186 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 24695285  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24695286 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 24695385  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24695386 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 24695485  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24695486 atagtctctatgctttattgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatacttttagaata 24695551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 19714218 - 19714583
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714218 catgattcatgtagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaaagtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 19714317  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19714318 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacacaactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 19714417  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19714418 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 19714517  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  19714518 atagtctctatgctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgacttcggatattttaagaata 19714583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 97 - 459
Target Start/End: Original strand, 18569581 - 18569945
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18569581 catgattcatgaagtacccatcaaccaattttatagtcatcctgttacggacaacatttgaatggtgataaagcactcgactccaacatgtagggtacat 18569680  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  18569681 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgataatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgggtc 18569780  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctt--tatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccaca 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18569781 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgatatctctttatatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctaccaaca 18569880  T
Q  395 taatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaaga 459  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18569881 taatagtctttatgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactacggatactttaaga 18569945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 19706939 - 19707303
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19706939 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcttgttacggacaacgtttgaatggtgacagagcactcgactccaatatctagggtacat 19707038  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||  || ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19707039 agttatt-caggtcgaagggtggaatacacaattatcactatgagaaaatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 19707137  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19707138 aatccaatataaatattactcctagtatttatatctatgtgaagatttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 19707237  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  19707238 atagtctctatgctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgacttcggatattttaagaata 19707303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 225 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 39538947 - 39538710
Alignment:
Q  225 accactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatat 324  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39538947 accactatcactatgagaatattttatgacacttttcataacttttactatgtagtattttcatggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatat 39538848  T
Q  325 ttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatccca 424  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  39538847 ttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgaaatatgaccatcagtctacccacataatagtcttcatgctttaatgatatccca 39538748  T
Q  425 cttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||| ||||||||||| |||| | ||| ||||||||||    
T  39538747 cttcacaataaagcttaactatggatattttaagaata 39538710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 184 - 464
Target Start/End: Original strand, 18806843 - 18807121
Alignment:
Q  184 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtat 282  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||   | ||||||  |||||||  ||    
T  18806843 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgacagttacaa-aacttt--ctatgtatcat 18806939  T
Q  283 tctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatc 382  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  18806940 tctcatggtggatcaatccaatataaacattacttctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatatgaaatgtgatcatc 18807039  T
Q  383 agtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaataat 464  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||||||    
T  18807040 agtctacccgcataatagtctctatgctttattgttatcttacttcacaataacgcttgactatagatactttaagaataat 18807121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 97 - 388
Target Start/End: Original strand, 17298621 - 17298912
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||| |||||||||| | | |||||||||||    
T  17298621 catgaatcatggagcacccatcaaccgattttatagtcatcctattacggacaacgtttgtacggaaacaaagtactcgactcctaaacctagggtacat 17298720  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggat 295  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||  ||| ||||||||||||||  || |    
T  17298721 attggtttcaggttgaagggtggaatacgccacttatcactatgagaataacttatgaca-tttacataacttt--ctacgtagtattctcatggtgggt 17298817  T
Q  296 caatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgaga--tgtgatcatcagtcta 388  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| | |||| |  ||||||||||||||||    
T  17298818 caatccaatataaatattactcttaatatttatatctatgtgaagatttaataactctttatccatgacccgtgatatgtgtgatcatcagtcta 17298912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 97 - 388
Target Start/End: Original strand, 17285470 - 17285759
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||  |||||| |||||| ||| | | |||||||||||    
T  17285470 catgaatcatggagcacccatcaaccgattttatagtcatcctattacggacaaagtttgtacggaaacaaagtactcgaatcctaaacctagggtacat 17285569  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggat 295  Q
    | || ||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||| |||| ||||||| | | |  ||||||||  |||||||||||||||||   || |    
T  17285570 attgatttcaggtcgaagagtggaatataccacttatcactatgataataacttatgata-tatacataacttt--ctatgtagtattctcattgtgggt 17285666  T
Q  296 caatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtcta 388  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  17285667 caatccaatataaatattactcttaatatttatatctatgtaaagacttgataactctttatccatgacctgtgatatgtgatcatcagtcta 17285759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 273 - 464
Target Start/End: Original strand, 22546912 - 22547103
Alignment:
Q  273 tatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgaga 372  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22546912 tatgtagtattctcatggctggtcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatatgaaaacttgataactctttatccatgatttgtgaga 22547011  T
Q  373 tgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaataat 464  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  22547012 tgtgatcatcggtctatccacataatagtctctatattttaatgttatctcacttcacaataaagtttgactgcgaatactttaaaaataat 22547103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 93 - 259
Target Start/End: Original strand, 27347252 - 27347417
Alignment:
Q  93 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 192  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27347252 tcatcatgattcgtggagtacccatcaaccaactttat-gtcatcttgttaaagataacatttgaatggtgacaaaacactcgactccaacatctagggt 27347350  T
Q  193 acatagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttt 259  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27347351 acatagtggtttcgtgtcaaagggtggaatacacaactatcactatgagaatatcttatgacacttt 27347417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 97 - 204
Target Start/End: Original strand, 24701950 - 24702057
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24701950 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 24702049  T
Q  197 agtggttt 204  Q
    ||||||||    
T  24702050 agtggttt 24702057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 20941329 - 20941018
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  20941329 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 20941231  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  20941230 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 20941134  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  20941133 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 20941035  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  20941034 atagtctcgacgcttta 20941018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Original strand, 25805385 - 25805696
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  25805385 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 25805483  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||  ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  25805484 agtggtttcaggtgtaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 25805580  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  25805581 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 25805679  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  25805680 atagtctcgacgcttta 25805696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 32201 - 31890
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  32201 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 32103  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  32102 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 32006  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  32005 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 31907  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  31906 atagtctcgacgcttta 31890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Original strand, 12789663 - 12789974
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  12789663 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 12789761  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| |  |||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  12789762 agtggtttcaggtctaagagcagtatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 12789858  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  12789859 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 12789957  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  12789958 atagtctcgacgcttta 12789974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 22941552 - 22941241
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  22941552 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcat 22941454  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  22941453 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 22941357  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||  | ||||||||||||  |||||    
T  22941356 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtataaacttgatatctc-atatctatgacccatgagatacggtcatcagtctacatacata 22941258  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  22941257 atagtctcgacgcttta 22941241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 23546224 - 23545913
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  23546224 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 23546126  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  23546125 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 23546029  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  23546028 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 23545930  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  23545929 atagtctcgacgcttta 23545913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Original strand, 24933306 - 24933617
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  24933306 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 24933404  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| |   ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  24933405 agtggtttcaggtctaagagcaatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 24933501  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||  ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  24933502 aatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 24933600  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  24933601 atagtctcgacgcttta 24933617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 324 - 464
Target Start/End: Original strand, 27347425 - 27347565
Alignment:
Q  324 tttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatccc 423  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27347425 tttatacctatgtgaagacatgataactctttatctatgatctgtgagatgtgatcatcggcctatccacaaaatagtctctatgctttaatgttatccc 27347524  T
Q  424 acttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaataat 464  Q
      ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  27347525 ttttcacaataaagcttgactacatatactttaagaataat 27347565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 109 - 402
Target Start/End: Original strand, 20100255 - 20100543
Alignment:
Q  109 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 208  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||  | |||||||| || |||| ||||| |||  ||||||||||||| |    
T  20100255 agtacccatcaaccaacattatggttatccttttacagacaacgtttgaatggcaataaagcacttgagtcca-catcttgggatcatagtggtttcatg 20100353  T
Q  209 tcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataa 308  Q
    || ||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||| |||||| |  || |||| ||| |||||    
T  20100354 tctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagttttctcacgttgggtcaagccagtataa 20100450  T
Q  309 atattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtc 402  Q
     |||||||||||||||| ||| |||| |  |||||  ||| |||  ||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20100451 gtattactcctaatattgatacctatctatagacttaatatctc-atattcatgacccatgagatgtgatcatcagtctacatacataatagtc 20100543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 31097118 - 31096807
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  |||    
T  31097118 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgattcca-catctagggatcat 31097020  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    | |||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  31097019 aatggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 31096923  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||  ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  31096922 aatccaatataaatattactcctataatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 31096824  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  31096823 atagtctcgacgcttta 31096807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 5097953 - 5097591
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||   |||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||| |||  |||    
T  5097953 catgattcatcatgtacccatcaacaaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctcgggatcat 5097855  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||| | ||||| | |||||||| |||||||||  ||| |||||   |||||||||||||||||| |  || |     
T  5097854 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaataacttatgaca-atttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtt 5097758  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||  |||||  ||| |||  |||| |||| |  ||||||||  ||||||||||||  |||||    
T  5097757 aatccaatataaatattactcataatatttatacttatgtatagacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgtagtcatcagtctacatacata 5097659  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatac-tttaagaataa 463  Q
    |||||||| | |||||| |  ||||| | |||  | |||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5097658 atagtctcgacgctttattattatcctaattcatattaaaacttgactacaaatacatttaagaataa 5097591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 12764990 - 12765354
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||| || |  |||    
T  12764990 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatcaagagatcat 12765088  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacact---ttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 293  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||| | ||||| | ||||||| |||||||||| |   | | |||||  ||||||||||||||||||| |  ||    
T  12765089 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatgtcttatgacaattaatctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgg 12765186  T
Q  294 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccac 393  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||  ||| |||  |||| || | |  ||||||||| ||||||||||||  ||    
T  12765187 gtctatccaatataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgtggtcatcagtctacatac 12765285  T
Q  394 ataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatac-tttaagaata 462  Q
    ||||||||||| | |||||| |  ||||| | || | | ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12765286 ataatagtctcgacgctttattattatcctaattat-attaaagcttgactacggatacatttaagaata 12765354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 7865430 - 7865794
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||| ||  |||||  ||| || |||| |||||||||  |||    
T  7865430 catgattcatcaagtacccatcaaccaatgttatggttatccttttacagacaacgttagaagggaaacaaaatacttgagtcca-catctagggatcat 7865528  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacact---ttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 293  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |   | | |||||   |||||||||||||||||| |  ||    
T  7865529 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataac--gtactatgtagtattctcacggtgg 7865626  T
Q  294 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccac 393  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  ||| |||  |||| || | |  ||||||| | ||||||||||||  ||    
T  7865627 gtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 7865725  T
Q  394 ataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatac-tttaagaata 462  Q
    ||||||||||| | |||||| |  ||||| | || | | ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  7865726 ataatagtctcgacgctttattattatcctaattat-attaaagcttgactacggatacatttaagaata 7865794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 12703874 - 12704238
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||| || |  |||    
T  12703874 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatcaagagatcat 12703972  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacact---ttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 293  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||| | ||||| | |||||| ||||||||||| |   | | |||||   |||||||||||||||||| |  ||    
T  12703973 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaaaatcttatgacaattaatctcataac--gtactatgtagtattctcacggtgg 12704070  T
Q  294 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccac 393  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||  ||| |||  |||| || | |  ||||||||| ||||||||||||  ||    
T  12704071 gtctatccaatataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgtggtcatcagtctacatac 12704169  T
Q  394 ataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatac-tttaagaata 462  Q
    ||| ||||||| | |||||| |  ||||| | || | | ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12704170 atagtagtctcgacgctttattattatcctaattat-attaaagcttgactacggatacatttaagaata 12704238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 329
Target Start/End: Original strand, 9811733 - 9811965
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || || || |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||| || |  |||    
T  9811733 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttattcttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatcaagagatcat 9811831  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacact---ttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 293  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||| | ||||| | |||||| ||||||||||| |   | | |||||   |||||||||||||||||| |  ||    
T  9811832 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaaaatcttatgacaattaatctcataac--gtactatgtagtattctcacggtgg 9811929  T
Q  294 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 329  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9811930 gtctatccaatataaatattactcctaatatttata 9811965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 182
Target Start/End: Original strand, 28719471 - 28719558
Alignment:
Q  93 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaa 182  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  28719471 tcatcatgattcgtggagtacccatcaaccaactttat-gtcatcttgttacagacaacgtttg-acggtgataaagcactcgactccaa 28719558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 184 - 322
Target Start/End: Original strand, 18806483 - 18806619
Alignment:
Q  184 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtat 282  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  ||  | ||||||  |||||||  ||    
T  18806483 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgaca-gttacaaaacttt--ctatgtatcat 18806579  T
Q  283 tctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaat 322  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18806580 tctcatggtggatcaatccaatataaacattacttctaat 18806619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 184 - 322
Target Start/End: Original strand, 18806663 - 18806799
Alignment:
Q  184 atctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccac-tatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtat 282  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  ||  | ||||||  |||||||  ||    
T  18806663 atctagtgtacatagtggtttcaggttgaagggtggaatacatcacttatcactatgagaataacttatgaca-gttacaaaacttt--ctatgtatcat 18806759  T
Q  283 tctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaat 322  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18806760 tctcatggtggatcaatccaatataaacattacttctaat 18806799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 336
Target Start/End: Original strand, 26129689 - 26129928
Alignment:
Q  93 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 192  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| | ||||| |||| || ||| | |||  ||||| ||| ||||||  | |||||||| || |||| ||||||| |     
T  26129689 tcatcatgattcattaagtacccattagccaacgttatggttatctttttatagacaatgttagaatggcaataaagcacttgagtcca-catctagtga 26129787  T
Q  193 acatagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacg 292  Q
     ||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| |||| |||||   |||||||| ||||| ||| |  |    
T  26129788 tcatagtggtttcatgtctaagagtgatatacaccattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataac--atactatgtggtattttcacggtg 26129884  T
Q  293 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 336  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  26129885 ggtcaatccagtataaatattactcataatatttgtatatatgt 26129928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 26245404 - 26245093
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||  ||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   ||||||||||  | ||||  |||||| |  |||    
T  26245404 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgctatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttaagtccat-atctagagatcat 26245306  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    | |||||||||||| ||| | | ||||||| | || || | |||||||||||||||||| |||  ||||| |  |||||| |||||||| |    |||||    
T  26245305 aatggtttcaggtctaagagcgatatacactattaacattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataacat--actatgcagtattctgacagtggatc 26245209  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||  ||| |||  |||| |||| |  |||||||  |||||||||||||  |||||    
T  26245208 aatcaagtataaatattactcctaatatttatacctatgtataaacttaatatctc-atatctatgacccatgagatgcaatcatcagtctacatacata 26245110  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  26245109 atagtctcgacgcttta 26245093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 335
Target Start/End: Original strand, 18829281 - 18829519
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaa---ccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggta 193  Q
    |||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | |||  ||  || |||| | |   |||||| || ||||||  ||||| || |||    
T  18829281 catgatccatggagtacccatcaataaccaactttatagtcatcattttatagatgacatttgtacgacaacaaagtacacgactctcacatc-agtgta 18829379  T
Q  194 catagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacg 292  Q
    ||||||||||| ||||| || | ||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||  ||||   ||||||||  |||||||  |||||||||  |    
T  18829380 catagtggttttaggtcaaatgatggaatacaccacttatcattatgagaataacttatggaacttac-ataacttt--ctatgtatcattctcatggtg 18829476  T
Q  293 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatg 335  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  18829477 ggtcaatccaatataaatattggtcctaatatttatatatatg 18829519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 39539035 - 39538954
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgact 178  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| || |  ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  39539035 catgattcgtggagtacctaccaaccaactttataatcatcctattccaaacaacatttgaatggtgataaagcactcgact 39538954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 464
Target Start/End: Original strand, 17285760 - 17285819
Alignment:
Q  405 tatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaataat 464  Q
    |||||||||||  ||||||| ||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  17285760 tatgctttaatactatcccaattcacaataaagatcgactatgaatactttaagaataat 17285819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 464
Target Start/End: Original strand, 17298913 - 17298972
Alignment:
Q  405 tatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaataat 464  Q
    |||||||||||  ||||||||||  |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  17298913 tatgctttaatactatcccacttaacaataaagatcgactatgaatactttaagaataat 17298972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 31887368 - 31887299
Alignment:
Q  358 ccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccactt 427  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||  ||| || ||||||||| ||| ||||||    
T  31887368 ccatgatccgtgagaaatgatcatcagtatacccacataatgatctttacgctttaatgttataccactt 31887299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 401
Target Start/End: Original strand, 33477193 - 33477321
Alignment:
Q  272 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 371  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| || ||| | ||||  ||  ||||||||| || |||     
T  33477193 ctatgtagtattcttatggcagatcaattatgtataaatattactcttaatattaatatttatttgtagatttgatatttc-atatccatgacctttgat 33477291  T
Q  372 atgtgatcatcagtctacccacataatagt 401  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  33477292 atgtgattatcagtttactcacataatagt 33477321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 18774 - 18410
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18774 catgattcatggagtacc-atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 18676  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18675 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 18576  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18575 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacata 18476  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18475 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaata 18410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 93 - 462
Target Start/End: Original strand, 25706 - 26075
Alignment:
Q  93 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 192  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25706 tcatcatgatttatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 25805  T
Q  193 acatagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25806 acatagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcg 25905  T
Q  293 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccca 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25906 gatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagtcttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctaccta 26005  T
Q  393 cataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26006 cataatagtcgctatgctttaatgatatcccacttttcaataaagcttgactacggatactttgagaata 26075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Original strand, 21329968 - 21330333
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329968 catgattcatggagtccccatcaacctactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 21330067  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21330068 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatc 21330167  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  21330168 aatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtccacctacata 21330267  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21330268 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaata 21330333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 97 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 18796993 - 18796626
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18796993 catgattcatggtgtacccatcaacaaactttatagtcatcctgttacgtacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatttagggtacat 18796894  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  18796893 agtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccaccatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagaggatc 18796794  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796793 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 18796694  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaataat 464  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  18796693 atagtctcaatgctttaatgatataccacttcacaataaagcttgactacagataatttaagaataat 18796626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 91 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 18620296 - 18619924
Alignment:
Q  91 catcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagg 190  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||   | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  18620296 catcagcatgattagtggagtacccatcaaccaactttatggtcatcttgttacatacataatgtgaatggtgataaagcactcgactccaacatttagg 18620197  T
Q  191 gtacatagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatga 290  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  18620196 gtacatagtggtttcaggtcaaagggtgggatacaccaatatcaccatgagaatatcttatgacactttc-ataacttttactatgtagtattctcatgg 18620098  T
Q  291 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc 390  Q
     || |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  18620097 tgggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtgaagacatgataactctttatctatgatccgtgagatgtgatcatcggcctacc 18619998  T
Q  391 cacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaataat 464  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||  ||| |||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  18619997 cacataatagtctatatgctttaatattatcccttttcacaataaagtttgaccacagatactttaagaataat 18619924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 97 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 36270650 - 36270288
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||| | ||  |||||| | |||||||  ||||||||||| |||    
T  36270650 catgattcattgagtacccaacaaccgactttatagtcatcctgttacgaacgacttttgtacggcaacaaagtattcgactcatacatctagggtgcat 36270551  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggat 295  Q
     ||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||| |||| ||||  |||| |||  |||||||  ||||||||| ||  |    
T  36270550 ggtggttttaggtcgaagggtga-atacaccacttatcactatgagaatgacttgtgac-ctttacataatttt--ctatgtaacattctcatggcgagt 36270455  T
Q  296 caatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||| || ||||   ||||||||||||||||||||||||||||     
T  36270454 caatccaatataaatattactcctaatatttaaatcgaagtgaaaacttgataactctttctctatgactcgtgagatgtgatcatcagtctacccacac 36270355  T
Q  396 aatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||| |||| || |||||||||| |||| ||  ||||||||||    
T  36270354 aatagtctttatactttaatgttatccctcttcacactaaagcttgattacggatgttttaagaata 36270288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 97 - 465
Target Start/End: Original strand, 22183206 - 22183571
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||| |     |||||| |||||||||| ||||| || |||||     
T  22183206 catgattcatcaaatacccatcaatcgactttatagtcatcctgttacaaacaacgtttgtacaacaacaaagtactcgactcctacatcaagagtacac 22183305  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggat 295  Q
      |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||  | | ||||  |||  ||||| ||   ||||||  ||| ||||| ||| |    
T  22183306 gttggtttcaggtcaaagggtggaatacaccacttatcactatgagaatgacctgtgact-tttacataacatta--tatgtaacattgtcatggcgggt 22183402  T
Q  296 caatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacat 395  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  22183403 caatccaatataa-tattactcttaatatttatatctatgtgaagacttgataactccttatcaaagatctgtgagatttgatcatcaatctacccacgt 22183501  T
Q  396 aatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaataatc 465  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||   ||| || |||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  22183502 aatagtctctatactttaatgttatccattttcacactaaagcttgactacaaatatttcaagaataatc 22183571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 109 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 18822556 - 18822225
Alignment:
Q  109 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||  |||   | |||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18822556 agtacccattaaccaactttatagtcattgtgttacggatgacgtttatatgacaaaaaagtacttgactcctacatctagggtacacagtggtttcagg 18822457  T
Q  209 tcgaagggtggtatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatata 307  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||  |||  ||  ||||  ||||| |||  ||||||  | ||||||| | |||||||||||||||    
T  18822456 tcgaagggtggaatacaccacttatctatatgagaatgacttgagat-ctttacataacgttt--tatgtaacaatctcatggcagatcaatccaatata 18822360  T
Q  308 aatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctat 407  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| | |    
T  18822359 aatattaccattaatatttatatctatgtgaaaagttgataactccttatcaatgatccgtgatatgtgatcatcagtctattgacataataatctatct 18822260  T
Q  408 gctttaatgatatcccacttctcaataaagcttga 442  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  18822259 gctttaatgatatcccacttcaaactaaagcttga 18822225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 20978360 - 20978012
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| ||||||  |||    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  20978360 catgatttgtggagtatccatcaatcgactttatagttatcatgttacggactacgtttatatgacatcaaagtactcgaatcctacatctagggtacat 20978261  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggat 295  Q
    ||| || ||| ||| ||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| |||  | || ||  ||||||||| ||| |    
T  20978260 agtagtgtcatgtcaaagagtggaatacaccacttatcactacgagaataacttatgaca-ttttcataatttt--ccatataaaattctcatggcgggt 20978164  T
Q  296 caatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacat 395  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||                 ||||| ||||||    
T  20978163 caatccaatataaatattactcataataattatatctcggtgaagacttgataactctttatccatgatct-----------------gtctatccacat 20978081  T
Q  396 aatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaataat 464  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  20978080 aatagtctctatgctttagtgatatctcacttcacattaaagcttgactacggatgttttaagaataat 20978012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 111 - 409
Target Start/End: Original strand, 6991847 - 6992146
Alignment:
Q  111 tacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaa-gcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggt 209  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||  |  ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||     
T  6991847 tacccatcaaccgactttatagtcatcgtgtcatagacaacgtttaaacagaaacaaaagtactcgactcctacatctagggaacatagtgatttcaggc 6991946  T
Q  210 cgaagggtggtatacaccact-atcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataa 308  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||   |||| |||  ||||||||  |||| |||  |||||||||||||||||    
T  6991947 cgaagggtggaatacaccacttatcactatgagaatagtttatgtcacttac-ataatttt--ctatgtagcgttcttatggaggatcaatccaatataa 6992043  T
Q  309 atattactcctaatatttatatctatgtgaag--actagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctcta 406  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||  || ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||| ||    
T  6992044 atattactcctgagatttatacctatgtgaagatacttgataaatctttatttataatctgtgagatatgatcattagtctacccatataataatcttta 6992143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 30174679 - 30174368
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  30174679 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 30174581  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  30174580 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 30174484  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  30174483 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 30174385  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  30174384 atagtctcgacgcttta 30174368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Original strand, 24250032 - 24250343
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||| |  |||    
T  24250032 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaaacacttgagtcca-catctagagatcat 24250130  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  24250131 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 24250227  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  24250228 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 24250326  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  24250327 atagtctcgacgcttta 24250343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 295 - 462
Target Start/End: Original strand, 18851977 - 18852144
Alignment:
Q  295 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccaca 394  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||    
T  18851977 tcaatccaatataaatattactcttaatatttatacatatttgaagacttgataactctttattcatgatccgtgagatgggatcattagtctaccgaca 18852076  T
Q  395 taatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||||||||| ||   ||||||| ||||| ||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||    
T  18852077 taatagtctatacaatttaatgttatcctacttcacaataaagttggactacatatactttaagaata 18852144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 272 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 19279600 - 19279445
Alignment:
Q  272 ctatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgag 371  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||  |||||    
T  19279600 ctatgtggtattctcatgacgtgtcaatccaatataaatattactccaaatatctatatctatctgaaaacttgataactttttatccatgatacgtgag 19279501  T
Q  372 atgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccactt 427  Q
    |||||||||| |||| || | ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  19279500 atgtgatcattagtcaactcgcataatagtctttatgctttaaagttatcccactt 19279445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Original strand, 24229215 - 24229526
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| |||||   |||||||||| || || | |||||||||  |||    
T  24229215 catgattcatcaagtacccttcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatgacaacaaagcacttgagtcta-catctagggatcat 24229313  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||| | | ||| | | ||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  24229314 agtggtttcaaggctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 24229410  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  ||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  24229411 aatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctatgaaccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 24229509  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  24229510 atagtctcgacgcttta 24229526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 109 - 336
Target Start/End: Original strand, 15342014 - 15342237
Alignment:
Q  109 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 208  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||  ||||  ||||||| |  | |||||| | || | || |||||||||  |||||||||||||||    
T  15342014 agtacccattaaccaacgttatggtcatcctgttacaaacaatttttgaattgcaataaagcatttgagttca-catctagggatcatagtggtttcagg 15342112  T
Q  209 tcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataa 308  Q
    || ||| |||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||||| ||| |  || | |||||| |||||    
T  15342113 tctaagagtggcatacaccactatcattgtgagactatcttatgacactttc-ataacat--actatgtagtattttcacggtgggttaatccagtataa 15342209  T
Q  309 atattactcctaatatttatatctatgt 336  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15342210 atattactcctaatatttatacctatgt 15342237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 95 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 29800775 - 29800545
Alignment:
Q  95 atcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtac 194  Q
    |||||||||| |  ||| ||||| ||||||| ||||  | |||||||||| ||||| |||||||||   | |||||||| || |||| |||||||||  |    
T  29800775 atcatgattcgtcaagtgcccattaaccaacattatgattatcctgttacagacaatgtttgaatgacaataaagcacttgagtcca-catctagggatc 29800677  T
Q  195 atagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgga 294  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||  | |||||||||| | | |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |  ||     
T  29800676 atagtggtttcaagtctaagagtggtatacaccattatccttgtgagaatatcatgttacactttt-ataacat--actatgtagtattctcacggtggg 29800580  T
Q  295 tcaatccaatataaatattactcctaatatttata 329  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29800579 tcaatccagtataaatattactcctaatatttata 29800545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 97 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 17241196 - 17241034
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||| |||||| |||||  ||| ||| | ||||||| | || ||||||  |||||||||||  ||||| |||| ||| |||||| |||||||  ||||||    
T  17241196 catgtttcatgaagtacatatctaccgattttataggcttcatgttacacacaacgtttgagcggtgataaagtacttgactcctacatctacagtacat 17241097  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttt 260  Q
    |||||||| |||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17241096 agtggttttaggtcgaa-ggtgaaatacaccattatcactatgagaatatcttattacactttt 17241034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 295 - 398
Target Start/End: Original strand, 36801899 - 36802003
Alignment:
Q  295 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatct-atgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccac 393  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| | ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||    
T  36801899 tcaattcaatataaatattacccttaatatttatattttatgcgaagacttgataactcattatcaatgatttgtgaggtgtgatcatcagtctactcac 36801998  T
Q  394 ataat 398  Q
    |||||    
T  36801999 ataat 36802003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 182 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 19616653 - 19616509
Alignment:
Q  182 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagta 281  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||    ||||||||||||    
T  19616653 acatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcatatgaca-ttttcataa--aatactatgtagta 19616557  T
Q  282 ttctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttata 329  Q
    |||||| |  || ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  19616556 ttctcacggtgggtcaattcagaataaatgttactcctaatatttata 19616509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 329
Target Start/End: Original strand, 40301034 - 40301164
Alignment:
Q  195 atagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgga 294  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||  || ||||| | |  |||||||||||||||||  ||     
T  40301034 atagtggtttcatgtctaagagtggtatacatcattatcactatgagactatcttatgacac--ttcataacatgt--tatgtagtattctcatggtggg 40301129  T
Q  295 tcaatccaatataaatattactcctaatatttata 329  Q
    ||||||   ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  40301130 tcaatctggtataaatattacttctaatatgtata 40301164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 327
Target Start/End: Original strand, 41316305 - 41316506
Alignment:
Q  122 caactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggta 221  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||   | ||||| ||  | |||| |||||||||  |||||||| |||||||| |||  |||||    
T  41316305 caactttatagttatcctgttacagataacgtttgaatgacaataaagcccttaagtcca-catctagggatcatagtggattcaggtctaagaatggta 41316403  T
Q  222 tacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaa 321  Q
    | | ||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||| || ||||||||||  || || ||  | |||||||||||||| |||    
T  41316404 ttctccgttatcagtatgagaatatcttatgacac-tttcataac--atactatataatattctcatggtgggtcgattaagtataaatattactcataa 41316500  T
Q  322 tattta 327  Q
    ||||||    
T  41316501 tattta 41316506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 21626955 - 21626824
Alignment:
Q  194 catagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 293  Q
    ||||||| ||||||||| ||  |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   ||   |||||||||||||||  ||    
T  21626955 catagtgatttcaggtctaacagtggtagacactattatcactatgagaatatcttatgacac-tttcataac--atagcgtgtagtattctcatggtgg 21626859  T
Q  294 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 329  Q
     ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21626858 -tcaattcaatataaatattactcatattatttata 21626824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 258
Target Start/End: Original strand, 28740910 - 28740986
Alignment:
Q  182 acatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactt 258  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| || |||  |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  28740910 acatctagggatcatagtggtttcagatctaagaatggtatacaccattatcattatgagaatgtcttatgacactt 28740986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 41661761 - 41661694
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtga 164  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||  |||||||||||||||||||    
T  41661761 catgtttcatggagtacccatcaaccaactttatgatcatcttattatagacaacgtttgaatggtga 41661694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 368 - 462
Target Start/End: Original strand, 12098609 - 12098703
Alignment:
Q  368 tgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |  ||||| | |||  | |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12098609 tgagatctgatcatcagtctacatacataatagtctctatgttttattactatccaatttcatattaaaacttgactacgaatactttaaaaata 12098703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 244
Target Start/End: Original strand, 36799745 - 36799826
Alignment:
Q  164 acaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccac-tatcactatgagaat 244  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  36799745 acaaagtacttgactcctacatctagggcgcatagtggtttcaggtcaaacggtagaatacaccacttatcactatgagaat 36799826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 270 - 333
Target Start/End: Original strand, 28718943 - 28719006
Alignment:
Q  270 tactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatcta 333  Q
    |||| ||||||||||||| || |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28718943 tactgtgtagtattctcacgatgagtcaatcaagtataaatattactcctaatatttatatcta 28719006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 464
Target Start/End: Original strand, 18548632 - 18548663
Alignment:
Q  433 taaagcttgactacgaatactttaagaataat 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18548632 taaagcttgactacgaatactttaagaataat 18548663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 402
Target Start/End: Original strand, 28741220 - 28741326
Alignment:
Q  295 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccaca 394  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||  ||| |||  ||| |||||    ||||||||||||||||||||||  |||    
T  28741220 tcaatccggtataaatattactcctaatatttatacctatgtacatacttaatatctc-atattcatgacgcatgagatgtgatcatcagtctacataca 28741318  T
Q  395 taatagtc 402  Q
    ||||||||    
T  28741319 taatagtc 28741326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 336
Target Start/End: Original strand, 24763751 - 24763792
Alignment:
Q  295 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 336  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24763751 tcaatccagtataaatattactcataatatttatacctatgt 24763792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 116 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 1461 - 1115
Alignment:
Q  116 atcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagg 215  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1461 atcaaccaactttatatttatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagg 1362  T
Q  216 gtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattac 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  1361 gtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgatacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcagatcaatccaatataaatattac 1262  T
Q  316 tcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaat 415  Q
    || |||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1261 tcttaatatttatatctatggcaagacttgataactttttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaat 1162  T
Q  416 gatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  1161 gatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaata 1115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 93 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 6013 - 5649
Alignment:
Q  93 tcatcatgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggt 192  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6013 tcatcatgattgatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcacttgactccaacatctagggt 5914  T
Q  193 acatagtggtttcaggtcgaaggg-tggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt-ataacttttactatgtagtattctcatga 290  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||| || |||         |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||     
T  5913 acatagtggtttcatgtcgaaaggatggaatgcac---------tatgagaatatcttatgacactttttcataacttttactatgtagtattcacatgg 5823  T
Q  291 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacc 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5822 cggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgacctgtgagatgtgatcatcagtctacc 5723  T
Q  391 cacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaataat 464  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5722 cacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacatatactttaagaataat 5649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 97 - 353
Target Start/End: Original strand, 230111 - 230367
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230111 catgattcatggtgtatccaccaaccaactttattgtcatcttgttacagacaacgtttgaatagtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 230210  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  230211 aatggtttcaggtcgaagggtagaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcagatc 230310  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactct 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  230311 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactct 230367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 401 - 461
Target Start/End: Original strand, 230365 - 230425
Alignment:
Q  401 tctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaat 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  230365 tctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacaaatactttaagaat 230425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 485 - 174
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  485 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatgattatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 387  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  || ||    
T  386 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgggtc 290  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||||| ||||||||| ||  |||||    
T  289 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgtggtcatcagtcgacatacata 191  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  190 atagtctcgacgcttta 174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Original strand, 3675 - 3986
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  3675 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 3773  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  3774 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 3870  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  3871 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacata 3969  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  3970 atagtctcgacgcttta 3986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 120032 - 119721
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| ||||||| |  |||    
T  120032 catgattcatcaagtgcccatcaaccaacgttattgttatccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagagatcat 119934  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||    
T  119933 agtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtc 119837  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  119836 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacgtacata 119738  T
Q  397 atagtctctatgcttta 413  Q
    |||||||| | ||||||    
T  119737 atagtctcgacgcttta 119721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 463
Target Start/End: Original strand, 67374 - 67736
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  |||    
T  67374 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcat 67472  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||| | ||||| | ||||||||||| ||||||  | | |||||  ||||||||||||||||||| |  || ||    
T  67473 agtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatctcatgaca-atctcataac--ttactatgtagtattctcacggtgggtc 67569  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  ||| |||  |||| || | |  ||||||| | |||||||||||   |||||    
T  67570 aatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatctataacccatgagatgcggtcatcagtctatatacata 67668  T
Q  397 atagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatac-tttaagaataa 463  Q
    |||||||| | |||||| |  ||||| | |||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  67669 atagtctcgacgctttattattatcctaattcatattaaagcttgactacgaatacatttaagaataa 67736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 109 - 462
Target Start/End: Original strand, 12961 - 13310
Alignment:
Q  109 agtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcagg 208  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |||||||| | || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  12961 agtacccatcaaccaactttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggcaacaaagcaattgagtcca-catctagggatcatagtggtttcagg 13059  T
Q  209 tcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataa 308  Q
    || ||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||   |||||||||||||||||| |  || |||||||  |||||    
T  13060 tctaagagtgatatacactattatcattatgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtcaatccggtataa 13156  T
Q  309 atattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatg 408  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  ||| |||  |||  |||| |  ||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||| | |    
T  13157 atattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatatatgacccatgagatgtggtcatcggtctacatacataatagtctcgacg 13255  T
Q  409 ctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatac-tttaagaata 462  Q
    ||||| |  ||||||| ||   | ||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  13256 ctttattattatcccaattaatattaaagcttgactatggatacatttaagaata 13310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 135 - 413
Target Start/End: Original strand, 130262 - 130535
Alignment:
Q  135 atcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatca 234  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| | | ||||||  | |||||    
T  130262 atccttttacagacaacgttagaatggcaacaaagcacttgagtcca-catctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatca 130360  T
Q  235 ctatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctat 334  Q
     | |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130361 ttgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctat 130457  T
Q  335 gtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgcttta 413  Q
    ||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||    
T  130458 gtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgcttta 130535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 26844 - 26609
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||||| |||| |||||| ||  ||||   | ||||||||||| |||| ||| |||||  |||    
T  26844 catgattcatcgagtacccattatccaacgttatggttatccttttacagacaacattaaaatgacaataaagcactcgagtcca-catatagggatcat 26746  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||||||||| |  || ||    
T  26745 agtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcataacat--actatatagtattctcaaggtgggtc 26649  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26648 aatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgt 26609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 194 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 8511 - 8296
Alignment:
Q  194 catagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 293  Q
    ||||||||||||||||| ||| | | ||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||| |  ||    
T  8511 catagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttc-ataactt--actatgtagtattctcacggtgg 8415  T
Q  294 atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccac 393  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||  ||    
T  8414 gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctc-atatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatac 8316  T
Q  394 ataatagtctctatgcttta 413  Q
    ||||||||||| | ||||||    
T  8315 ataatagtctcgacgcttta 8296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 404
Target Start/End: Original strand, 39988 - 40290
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  |||| |||| | |||||||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  | |||||||| || ||||  || |||||  |||    
T  39988 catgattcatcaagtaaccattagccaactttatggttatccttttacaaacaacgttagaatggaaataaagcacttgagtccat-atttagggatcat 40086  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||| ||| ||| ||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||||||||||    || ||    
T  40087 agtggtttcaagtctaagagttatatacaccattatcactgtgagaatatcttatgaca-ttttcataac--atactatgtagtattctcacagtgggtc 40183  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacata 396  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  ||| |||  ||||||||| |  |||||||||  |||||||||||  |||||    
T  40184 aatccggtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctc-atatccatgacccatgagatgtggccatcagtctacatacata 40282  T
Q  397 atagtctc 404  Q
    ||||||||    
T  40283 atagtctc 40290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 295 - 462
Target Start/End: Original strand, 90033 - 90201
Alignment:
Q  295 tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagactagataactcttt-atccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccac 393  Q
    |||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||    
T  90033 tcaatccaatataaatgttatacgtaatatttatatctatgtgaagtgttgataactcttttacccatgatccgtgagatgtgattatcagtctatctac 90132  T
Q  394 ataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaata 462  Q
    ||| |||||| |||||||||||  ||||||||||  |  ||||| |||| |||||||  ||||||||||    
T  90133 atagtagtctttatgctttaatattatcccactttaccctaaagattgaatacgaatggtttaagaata 90201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 288 - 102
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  |||||| ||| || |||| |||||||||  ||     
T  288 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatggcaacaaagtacttgagtcca-catctagggatcag 190  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctca 287  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  189 agtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgaca-atttcataac--ttactatgtagtattctca 102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 9005 - 8807
Alignment:
Q  125 ctttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacatagtggtttcaggtcgaagggtggtatac 224  Q
    ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||   | ||| |||| ||||||| ||| || ||  ||| ||||||||||||| | | |||||||||    
T  9005 ctttatagttatcatgttacagagaacgtttgaatgacaataaaacacttgactcca-catttaaggatcattgtggtttcaggtctaggagtggtatac 8907  T
Q  225 accactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatcaatccaatataaatattactcctaatat 324  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||   ||||| |||||||||||||   || |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  8906 accattatcactatgagaatatcttatgaca-tcttcataac--atactaagtagtattctcattgggggtcaatctagtataaatattactcctaatat 8810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 329
Target Start/End: Original strand, 11526 - 11758
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||| || ||| ||||||||||  ||     
T  11526 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacagacaacgttagaatggaaacaaagtacttgagtcc-acatctagggatcaa 11624  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttt---ataacttttactatgtagtattctcatgacgg 293  Q
    |||||||||||||| ||| | | | |||||   ||||| | |||||||||||||||||| ||  |   |||||   ||||||||||||||||||    ||    
T  11625 agtggtttcaggtctaagagcgatgtacactgttatcattgtgagaatatcttatgacaattaatcacataac--gtactatgtagtattctcacagtgg 11722  T
Q  294 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 329  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11723 gtctatccagtataaatattactcctaatatttata 11758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 54066 - 53832
Alignment:
Q  97 catgattcatggagtacccatcaaccaactttatagtcatcctgttacggacaacgtttgaatggtgacaaagcactcgactccaacatctagggtacat 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||  | |||||||| || ||| ||| ||||||  |||    
T  54066 catgattcatcaagtacccatcaaccaacgttatggttatccttttacatacaacgttagaatgg-cataaagcacttgagtcc-acacctagggatcat 53969  T
Q  197 agtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacggatc 296  Q
    |||||||||||||| ||| |   |||| || | || ||   ||||||||||||||||||  ||| |||||   |||||||||||||||||| |  || ||    
T  53968 agtggtttcaggtctaagagcaatataaactattaacatgttgagaatatcttatgaca-atttcataac--atactatgtagtattctcacggtgggtc 53872  T
Q  297 aatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt 336  Q
    || ||| | | |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  53871 aacccagtgtgaatattactcttaatatttatacctatgt 53832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 329
Target Start/End: Original strand, 83111 - 83243
Alignment:
Q  194 catagtggtttcaggtcgaagggtggtatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagtattctcatgacgg 293  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||   |||| |  ||||||||||||||||||   ||    
T  83111 catactggtttcaggtctaagagtggagtacaccaatatgactatgataatatcttatgacaccttcg-taacat--actatgtagtattctcattgtgg 83207  T
Q  294 atcaatccaatataaatattactcctaatatttata 329  Q
     |||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  83208 gtcaatccagtataaatattacttctgatatttata 83243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 319 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 92432 - 92286
Alignment:
Q  319 taatatttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatg-ctttaatga 417  Q
    |||||||||||| | || || |||| ||||| || ||||||||||   |||| |||| |||||||||||| ||| |||||||| |||| |  ||||| |     
T  92432 taatatttatatatgtgcgatgacttgataattccttatccatgactcgtgacatgtaatcatcagtctagccatataatagtttctaagattttaaagt 92333  T
Q  418 tatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaataat 464  Q
    |||||| || | || ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  92332 tatccctctccacactaaagcttgactacgaatgttttaagaataat 92286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1074 times since January 2019
Visitors: 4363