View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0683_low_35 (Length: 303)

Name: NF0683_low_35
Description: NF0683
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0683_low_35
NF0683_low_35
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (1-288)||(21239028-21239315)
chr2 (1-288)||(21241578-21241865)
chr2 (1-285)||(24504617-24504901)
chr2 (4-285)||(20591011-20591291)
chr2 (1-285)||(31503514-31503797)
chr2 (1-285)||(31506080-31506363)
chr2 (145-285)||(12627942-12628079)
chr2 (157-285)||(28349000-28349128)
chr2 (183-285)||(44620858-44620959)
chr2 (176-285)||(23339249-23339358)
chr2 (183-283)||(41684851-41684950)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (1-285)||(8522846-8523130)
chr6 (1-285)||(15686023-15686301)
chr6 (157-285)||(15539201-15539329)
chr6 (157-282)||(2287977-2288102)
chr6 (145-285)||(16812708-16812845)
chr6 (183-285)||(16829728-16829829)
chr6 (183-285)||(16102273-16102374)
chr6 (247-285)||(12595887-12595925)
chr6 (199-283)||(29492687-29492770)
[»] chr4 (14 HSPs)
chr4 (1-285)||(41791586-41791870)
chr4 (1-285)||(16278013-16278297)
chr4 (4-285)||(53387626-53387906)
chr4 (1-285)||(14698632-14698914)
chr4 (1-285)||(4170940-4171222)
chr4 (173-285)||(56115682-56115795)
chr4 (183-285)||(287020-287121)
chr4 (183-285)||(28382754-28382855)
chr4 (183-285)||(47126914-47127015)
chr4 (183-285)||(15280172-15280272)
chr4 (176-285)||(33848836-33848945)
chr4 (59-142)||(21189768-21189851)
chr4 (222-285)||(16359434-16359495)
chr4 (247-285)||(10313645-10313683)
[»] chr3 (17 HSPs)
chr3 (1-285)||(54973300-54973584)
chr3 (1-285)||(54975910-54976194)
chr3 (1-285)||(54978520-54978804)
chr3 (1-285)||(55292327-55292610)
chr3 (1-285)||(10554350-10554633)
chr3 (145-285)||(16799737-16799876)
chr3 (145-285)||(54046645-54046782)
chr3 (145-285)||(15010208-15010345)
chr3 (184-285)||(603735-603835)
chr3 (173-285)||(10989648-10989761)
chr3 (183-285)||(2035072-2035173)
chr3 (183-285)||(2038579-2038680)
chr3 (183-285)||(2042320-2042421)
chr3 (183-285)||(14038107-14038208)
chr3 (183-285)||(14041575-14041676)
chr3 (183-285)||(39230655-39230756)
chr3 (198-285)||(18958826-18958912)
[»] chr5 (7 HSPs)
chr5 (1-288)||(26495797-26496084)
chr5 (1-285)||(29325143-29325427)
chr5 (183-285)||(4397639-4397740)
chr5 (173-285)||(22758737-22758850)
chr5 (183-285)||(26361171-26361271)
chr5 (222-285)||(23693388-23693450)
chr5 (35-108)||(27869316-27869390)
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (1-285)||(45134828-45135112)
chr8 (1-285)||(7300985-7301266)
chr8 (1-285)||(6608177-6608459)
chr8 (1-152)||(21415149-21415300)
chr8 (173-285)||(363881-363994)
chr8 (183-285)||(22059479-22059580)
chr8 (183-285)||(22145475-22145576)
chr8 (183-285)||(24707896-24707997)
chr8 (145-285)||(44431954-44432093)
chr8 (198-285)||(17795326-17795413)
chr8 (183-285)||(28853880-28853982)
chr8 (176-262)||(10829534-10829619)
[»] chr7 (12 HSPs)
chr7 (1-285)||(16006332-16006616)
chr7 (1-285)||(8776277-8776558)
chr7 (4-285)||(17505693-17505973)
chr7 (4-285)||(17547241-17547521)
chr7 (1-285)||(21743208-21743490)
chr7 (157-285)||(38828161-38828289)
chr7 (157-285)||(35366156-35366282)
chr7 (183-285)||(13395553-13395654)
chr7 (183-285)||(13733622-13733722)
chr7 (176-285)||(21065238-21065348)
chr7 (183-285)||(48785243-48785344)
chr7 (183-285)||(4993415-4993517)
[»] scaffold0525 (2 HSPs)
scaffold0525 (1-285)||(9085-9369)
scaffold0525 (183-285)||(10963-11064)
[»] chr1 (10 HSPs)
chr1 (1-285)||(20579377-20579663)
chr1 (157-285)||(2333034-2333162)
chr1 (156-285)||(294128-294257)
chr1 (183-285)||(24087349-24087449)
chr1 (183-285)||(20631246-20631347)
chr1 (183-285)||(36181505-36181606)
chr1 (176-285)||(296449-296558)
chr1 (183-285)||(37358402-37358502)
chr1 (247-285)||(14432505-14432543)
chr1 (183-285)||(45307219-45307321)
[»] scaffold0586 (1 HSPs)
scaffold0586 (1-152)||(1901-2052)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (145-285)||(8548-8687)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (173-285)||(2432-2545)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (173-285)||(162377-162490)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (183-285)||(134057-134157)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (173-285)||(137868-137981)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (198-277)||(1638-1716)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 21239028 - 21239315
Alignment:
Q  1 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21239028 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 21239127  T
Q  101 atatgatggttattatggttgttgtctcactgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21239128 atatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 21239227  T
Q  201 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgatg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21239228 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgatg 21239315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 21241578 - 21241865
Alignment:
Q  1 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21241578 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 21241677  T
Q  101 atatgatggttattatggttgttgtctcactgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21241678 atatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 21241777  T
Q  201 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgatg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21241778 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgatg 21241865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 24504901 - 24504617
Alignment:
Q  1 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24504901 aggatgtttgtaatgtttaatgatgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 24504802  T
Q  101 atatgatggttattatggttgttgtctcactgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24504801 atatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 24504702  T
Q  201 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24504701 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcatagattgttgatg 24504617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 4 - 285
Target Start/End: Original strand, 20591011 - 20591291
Alignment:
Q  4 atgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgtata 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20591011 atgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatataatatgaaagattttgatatgagtcctacttgttgtata 20591110  T
Q  104 tgatggttattatggttgttgtctcactgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgcatt 203  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20591111 tgatggttattattattgttgtctcgctgcttgttattatatgttgctgttg-attgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcataaatgcatt 20591209  T
Q  204 caattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20591210 caattggattatacaagatgttggtttaggttgtaaggctgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 20591291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 31503797 - 31503514
Alignment:
Q  1 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  31503797 aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaatatgttgatatgagtcctacttgttgt 31503698  T
Q  101 atatgatggttattatggttgttgtctcactgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 200  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31503697 atatgatgattattattattgttgtctcgctgcttgttattatatgttgctgttg-attgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgc 31503599  T
Q  201 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    |||||||| || | |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31503598 attcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcatagattgttgatg 31503514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 31506363 - 31506080
Alignment:
Q  1 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  31506363 aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaatatgttgatatgagtcctacttgttgt 31506264  T
Q  101 atatgatggttattatggttgttgtctcactgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 200  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31506263 atatgatgattattattattgttgtctcgctgcttgttattatatgttgctgttg-attgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgc 31506165  T
Q  201 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    |||||||| || | |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31506164 attcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcatagattgttgatg 31506080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 285
Target Start/End: Original strand, 12627942 - 12628079
Alignment:
Q  145 tgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttg 244  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| | || |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||  |||||||| |||    
T  12627942 tgttgttgttga-ttgattatgatt-gttgatgattgctggtttatgcttaactgcattcaattagaacatacaaggtgttggttcgagttgtaag-ttg 12628038  T
Q  245 caagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12628039 cgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 12628079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 157 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 28349128 - 28349000
Alignment:
Q  157 attgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgta-aggttgcaagttgtcgt 255  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| || || ||||| ||| |||||  |||||| | |||||||||||||||    
T  28349128 attgaatatgatt-gttgctgattgctggtttatgcttaactgcattccattagaatacacaaggtgtaggttcgagttgtagaagttgcaagttgtcgt 28349030  T
Q  256 tctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28349029 tctaagtaacggagtcataggttgttgatg 28349000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 44620959 - 44620858
Alignment:
Q  183 tggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 282  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620959 tggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 44620861  T
Q  283 atg 285  Q
    |||    
T  44620860 atg 44620858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 285
Target Start/End: Original strand, 23339249 - 23339358
Alignment:
Q  176 tgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtt-ctaagtaacggagtcata 274  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23339249 tgatcgttggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgtttctaagtaacggagtcata 23339347  T
Q  275 ggttgttgatg 285  Q
    |||||||||||    
T  23339348 ggttgttgatg 23339358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 283
Target Start/End: Original strand, 41684851 - 41684950
Alignment:
Q  183 tggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 282  Q
    |||||||| | ||| | ||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41684851 tggtttatacttaactacattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaggtaacggagtcataggttgttg 41684949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8523130 - 8522846
Alignment:
Q  1 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8523130 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 8523031  T
Q  101 atatgatggttattatggttgttgtctcactgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8523030 atatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 8522931  T
Q  201 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8522930 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 8522846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 15686023 - 15686301
Alignment:
Q  1 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15686023 aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggatatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctacttgttgt 15686122  T
Q  101 atatgatggttattatggttgttgtctcactgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 200  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15686123 atatgatggttattattgctgttgtctcgctgcttattattatatgttgctgttg-attga-----atttgctgctgattgttggtttatgcataaacgc 15686216  T
Q  201 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15686217 attcaattggattatacaagatgttggtgccggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcctaggttgttgatg 15686301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 157 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15539329 - 15539201
Alignment:
Q  157 attgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtt 256  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15539329 attgaatatgatttgatgctgattgttagtttatgcataaatgcattccatgggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtt 15539230  T
Q  257 ctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15539229 ctaagtaacagagtcataggttgttgatg 15539201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 157 - 282
Target Start/End: Original strand, 2287977 - 2288102
Alignment:
Q  157 attgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtt 256  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2287977 attgaatatgatttgatgctgattgttggtttatgcataaatgcattccatgggattatacaagatgttgattcaggttgtaaggttgcaagttgacgtt 2288076  T
Q  257 ctaagtaacggagtcataggttgttg 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  2288077 ctaagtaacggagtcataggttgttg 2288102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 145 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 16812845 - 16812708
Alignment:
Q  145 tgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttg 244  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| | || ||| ||||||||||| | ||| || |||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  16812845 tgttgttgttga-ttgattatgatt-gttgatgaatgttggtttatacttaactgtattcaattagaatatacaaggtgttggttcgggttgtaag-ttg 16812749  T
Q  245 caagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16812748 tgagttgtcgttataagtaacggagtcataggttgttgatg 16812708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 16829829 - 16829728
Alignment:
Q  183 tggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 282  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16829829 tggtttatacttaactgcattcaattagaatatacaaggtgttggttcgggttgtaag-ttgttagttgtcgttataagtaacagagtcataggttgttg 16829731  T
Q  283 atg 285  Q
    |||    
T  16829730 atg 16829728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 16102374 - 16102273
Alignment:
Q  183 tggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 282  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16102374 tggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 16102276  T
Q  283 atg 285  Q
    |||    
T  16102275 atg 16102273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 12595925 - 12595887
Alignment:
Q  247 agttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12595925 agttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 12595887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 199 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 29492770 - 29492687
Alignment:
Q  199 gcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttga 283  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||  || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  29492770 gcattcaattagaatatacaaggtgtgggttcgggttgtaag-ttgtgagatgtcgttataagtaacggagtcataagttgttga 29492687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 14)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 41791870 - 41791586
Alignment:
Q  1 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41791870 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 41791771  T
Q  101 atatgatggttattatggttgttgtctcactgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41791770 atatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 41791671  T
Q  201 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41791670 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 41791586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 16278013 - 16278297
Alignment:
Q  1 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16278013 aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgtttatatgagtcctacttgttgt 16278112  T
Q  101 atatgatggttattatggttgttgtctcactgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 200  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16278113 atatgatggttattattattgttgtctcgctgcttgttattatatgttgttgttg-attgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgc 16278211  T
Q  201 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcg-ttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16278212 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtttctaagtaatggagtcataggttgttgatg 16278297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 4 - 285
Target Start/End: Original strand, 53387626 - 53387906
Alignment:
Q  4 atgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgtata 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53387626 atgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatataatatgaaagatgttgatatgagtcctacttgttgtata 53387725  T
Q  104 tgatggttattatggttgttgtctcactgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgcatt 203  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||    
T  53387726 tgatggttattattattgttgtctcgctgcttgttattatatgttgctgttg-attgaatatgatttgctactgattgttggtgtatgcatgcatgcatt 53387824  T
Q  204 caattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  53387825 caattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcagaggatgttgatg 53387906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 14698914 - 14698632
Alignment:
Q  1 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14698914 aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaa-tgaggggatagttatataatatgaaagatgttgatatgagtcctacttgttgt 14698816  T
Q  101 atatgatggttattatggttgttgtctcactgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 200  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  14698815 atatgatgattattattattgttgtctcgctgcttgttattatatgttgctgttga-ttgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgc 14698717  T
Q  201 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14698716 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcatagattgttgatg 14698632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 4171222 - 4170940
Alignment:
Q  1 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  4171222 aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaa-tgaggggatagttatataatatgaaaaatgttgatatgagtcctacttgttgt 4171124  T
Q  101 atatgatggttattatggttgttgtctcactgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 200  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4171123 atatgatgattattattattgttgtctcgctgcttgttattatatgttgctgttga-ttgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgc 4171025  T
Q  201 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4171024 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcatagattgttgatg 4170940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 285
Target Start/End: Original strand, 56115682 - 56115795
Alignment:
Q  173 tgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaag-gttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtc 271  Q
    ||||||||| | |||||||  ||| ||||||| ||| || || ||||| ||| |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56115682 tgctgattgctagtttatgtttaactgcattccattagaatacacaaggtgtaggttcgagttgtaaaagttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtc 56115781  T
Q  272 ataggttgttgatg 285  Q
    ||||||||||||||    
T  56115782 ataggttgttgatg 56115795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 287121 - 287020
Alignment:
Q  183 tggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 282  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  287121 tggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 287023  T
Q  283 atg 285  Q
    |||    
T  287022 atg 287020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 28382855 - 28382754
Alignment:
Q  183 tggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 282  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28382855 tggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 28382757  T
Q  283 atg 285  Q
    |||    
T  28382756 atg 28382754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 285
Target Start/End: Original strand, 47126914 - 47127015
Alignment:
Q  183 tggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 282  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47126914 tggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 47127012  T
Q  283 atg 285  Q
    |||    
T  47127013 atg 47127015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 285
Target Start/End: Original strand, 15280172 - 15280272
Alignment:
Q  183 tggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 282  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15280172 tggtttatacttaactgcattcaattagaatatacaatgtgttggttc-ggttgtaag-ttgtgagttgtcgttataagtaatggagtcataggttgttg 15280269  T
Q  283 atg 285  Q
    |||    
T  15280270 atg 15280272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 33848945 - 33848836
Alignment:
Q  176 tgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtt-ctaagtaacggagtcata 274  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33848945 tgatcgttggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgtttctaagtaacggagtcata 33848847  T
Q  275 ggttgttgatg 285  Q
    |||||||||||    
T  33848846 ggttgttgatg 33848836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 142
Target Start/End: Original strand, 21189768 - 21189851
Alignment:
Q  59 ttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgtatatgatggttattatggttgttgtctcactgcttattatta 142  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||| ||||||| |||| || ||  |||||||||||||    
T  21189768 ttatatgttatgaaagatgttgatatcagttatacttgttgtatatgatgattattattgttggtgacttgctgcttattatta 21189851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 16359495 - 16359434
Alignment:
Q  222 tgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    ||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359495 tgttggttc-ggttgtaag-ttgtgagttgtcgttataagtaacggagtcataggttgttgatg 16359434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 10313683 - 10313645
Alignment:
Q  247 agttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  10313683 agttgtcgttctaagcaacgaagtcataggttgttgatg 10313645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 17)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 54973584 - 54973300
Alignment:
Q  1 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54973584 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 54973485  T
Q  101 atatgatggttattatggttgttgtctcactgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54973484 atatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 54973385  T
Q  201 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54973384 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 54973300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 54976194 - 54975910
Alignment:
Q  1 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54976194 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 54976095  T
Q  101 atatgatggttattatggttgttgtctcactgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54976094 atatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 54975995  T
Q  201 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54975994 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 54975910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 54978804 - 54978520
Alignment:
Q  1 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54978804 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 54978705  T
Q  101 atatgatggttattatggttgttgtctcactgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54978704 atatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 54978605  T
Q  201 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54978604 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 54978520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 55292327 - 55292610
Alignment:
Q  1 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55292327 aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctacttgttgt 55292426  T
Q  101 atatgatggttattatggttgttgtctcactgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55292427 atatgatggttattatcgttgttgtctcgctgcttattattatatgttgctgttg-attgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 55292525  T
Q  201 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  55292526 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttccaagtaacggagtcataggttgttgatg 55292610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 10554633 - 10554350
Alignment:
Q  1 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10554633 aggatgtttataatgtttattgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctacttgttgt 10554534  T
Q  101 atatgatggttattatggttgttgtctcactgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10554533 atatgatggttattatcgttgttgtctcgctgcttattattatatgttgctgttg-attgaatatgatttgctgctgattgttggtttatggataaatgc 10554435  T
Q  201 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10554434 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 10554350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 145 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 16799876 - 16799737
Alignment:
Q  145 tgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttg 244  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16799876 tgttgttgttga-ttgaatatgatttgatgttgattgttggtttatgcataaatgcattccatgggattatacaagatgttgattcaggttgtaaggttg 16799778  T
Q  245 caagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16799777 caagttgacgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 16799737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 145 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 54046782 - 54046645
Alignment:
Q  145 tgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttg 244  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| | || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||  |||||||| |||    
T  54046782 tgttgttgttga-ttgattatgatt-gttgatgattgttggtttatgcttaactgcattcaattagaatatacaaggtgttggttcgagttgtaag-ttg 54046686  T
Q  245 caagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54046685 cgagttgtcgttctaagtaacggagtcatagtttgttgatg 54046645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 285
Target Start/End: Original strand, 15010208 - 15010345
Alignment:
Q  145 tgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttg 244  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| | || |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||  |||||||| |||    
T  15010208 tgttgttgttga-ttgattatgatt-gttgatgattgatggtttatgcttaactgcattcaattagaatatacaaggtgttggttcgagttgtaag-ttg 15010304  T
Q  245 caagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15010305 agagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 15010345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 184 - 285
Target Start/End: Original strand, 603735 - 603835
Alignment:
Q  184 ggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttga 283  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| || |||| ||| |||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  603735 ggtttatgcttaactgcattcaattagaatatataaggtgttggttcgagttgtaag-ttgcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttga 603833  T
Q  284 tg 285  Q
    ||    
T  603834 tg 603835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 285
Target Start/End: Original strand, 10989648 - 10989761
Alignment:
Q  173 tgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaag-gttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtc 271  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||| || || ||||| ||| |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10989648 tgctgattgttgatttatgtttaactgcattccattagaatacacaaggtgtaggttcgagttgtaaaagttgcaagttgtcgttctaagtaaaggagtc 10989747  T
Q  272 ataggttgttgatg 285  Q
    ||||||||||||||    
T  10989748 ataggttgttgatg 10989761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 285
Target Start/End: Original strand, 2035072 - 2035173
Alignment:
Q  183 tggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 282  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2035072 tggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 2035170  T
Q  283 atg 285  Q
    |||    
T  2035171 atg 2035173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 285
Target Start/End: Original strand, 2038579 - 2038680
Alignment:
Q  183 tggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 282  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2038579 tggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 2038677  T
Q  283 atg 285  Q
    |||    
T  2038678 atg 2038680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 285
Target Start/End: Original strand, 2042320 - 2042421
Alignment:
Q  183 tggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 282  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2042320 tggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 2042418  T
Q  283 atg 285  Q
    |||    
T  2042419 atg 2042421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 14038208 - 14038107
Alignment:
Q  183 tggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 282  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14038208 tggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 14038110  T
Q  283 atg 285  Q
    |||    
T  14038109 atg 14038107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 14041676 - 14041575
Alignment:
Q  183 tggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 282  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14041676 tggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 14041578  T
Q  283 atg 285  Q
    |||    
T  14041577 atg 14041575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 39230756 - 39230655
Alignment:
Q  183 tggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 282  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39230756 tggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 39230658  T
Q  283 atg 285  Q
    |||    
T  39230657 atg 39230655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 18958912 - 18958826
Alignment:
Q  198 tgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    ||||||||||| || | ||||| ||||||||||  |||||||| | || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  18958912 tgcattcaattagaatgtacaatatgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacgtagttataggttgttgatg 18958826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 7)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 26496084 - 26495797
Alignment:
Q  1 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26496084 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgtaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 26495985  T
Q  101 atatgatggttattatggttgttgtctcactgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26495984 atatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 26495885  T
Q  201 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgatg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26495884 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgatg 26495797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 29325143 - 29325427
Alignment:
Q  1 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29325143 aggatgtctgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 29325242  T
Q  101 atatgatggttattatggttgttgtctcactgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29325243 atatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 29325342  T
Q  201 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29325343 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 29325427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 4397740 - 4397639
Alignment:
Q  183 tggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 282  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  4397740 tggtttatacttaactgcattcaattcgaatatacaaggtgttggttcgggttgtaag-ttgtgagttgtcgttataagaaacggagtcataggttgttg 4397642  T
Q  283 atg 285  Q
    |||    
T  4397641 atg 4397639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 285
Target Start/End: Original strand, 22758737 - 22758850
Alignment:
Q  173 tgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaag-gttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtc 271  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| ||||||| ||| || || ||||| ||| |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22758737 tgctgattgctggtttatgtttaactgcattccattagaatacacaaggtgtaggttcgagttgtaaaagttgcaagttgtcgttctaagtaatggagtc 22758836  T
Q  272 ataggttgttgatg 285  Q
    | ||||||||||||    
T  22758837 aaaggttgttgatg 22758850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 285
Target Start/End: Original strand, 26361171 - 26361271
Alignment:
Q  183 tggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 282  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  26361171 tggtttatacttaactgcattcaattagaatatacaatgtgttggttc-ggttgtaag-ttgtgagttgtcgttataagaaacggagtcataggttgttg 26361268  T
Q  283 atg 285  Q
    |||    
T  26361269 atg 26361271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 222 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 23693450 - 23693388
Alignment:
Q  222 tgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    |||||||||  |||||||| | || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  23693450 tgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacaaagtcataggttgttgatg 23693388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 108
Target Start/End: Original strand, 27869316 - 27869390
Alignment:
Q  35 gttgatgaa-caaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgtatatgatg 108  Q
    ||||||||| |||| | ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||    
T  27869316 gttgatgaatcaaaagtggaaataattatatatcatgaaagatgttgatatgagttacacttgttgtatatgatg 27869390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 45134828 - 45135112
Alignment:
Q  1 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45134828 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 45134927  T
Q  101 atatgatggttattatggttgttgtctcactgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45134928 atatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 45135027  T
Q  201 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45135028 attcaattgaattatacaagatgttggttcaagtggtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 45135112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 7300985 - 7301266
Alignment:
Q  1 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7300985 aggacgtttgtaatgtttaatgacatcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 7301084  T
Q  101 atatgatggttattatggttgttgtctcactgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7301085 atatgatggttattatggtcgttgtctcgctgcttgttattata---tgttgttgaattgaatatgatttgctgttgattgttggtttatgcataaatgc 7301181  T
Q  201 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7301182 attcaattagattatacaagatgttagttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 7301266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 6608177 - 6608459
Alignment:
Q  1 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6608177 aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaac-gaggggatagttatataatatgaaagatgttgatatgagtcctacttgttgt 6608275  T
Q  101 atatgatggttattatggttgttgtctcactgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 200  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  6608276 atatgatgattattattattgttgtctcgctgcttgttattatatgttgttgttga-ttgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgc 6608374  T
Q  201 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6608375 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcatagattgttgatg 6608459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 21415149 - 21415300
Alignment:
Q  1 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  21415149 aggatgtatataatgtttaatgacgtcgatttaagttaataaacaaatgaggagatagttaaatattatgaaagatgttgatatgagttatacttgttgt 21415248  T
Q  101 atatgatggttattatggttgttgtctcactgcttattattatatgttgttg 152  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  21415249 atatgatgattattattgttgttgacttgctgcttattattatatgatgttg 21415300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 363994 - 363881
Alignment:
Q  173 tgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaag-gttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtc 271  Q
    ||||||||| | |||||||  ||| ||||||| ||| || || ||||| ||| |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  363994 tgctgattgctagtttatgtttaactgcattccattagaatacacaaggtgtaggttcgagttgtaaaagttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtc 363895  T
Q  272 ataggttgttgatg 285  Q
    ||||||||||||||    
T  363894 ataggttgttgatg 363881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 285
Target Start/End: Original strand, 22059479 - 22059580
Alignment:
Q  183 tggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 282  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| |||| |||||  |||| ||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22059479 tggtttatacttaactgcattcaattagattgtacaatgtgttagttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 22059577  T
Q  283 atg 285  Q
    |||    
T  22059578 atg 22059580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 285
Target Start/End: Original strand, 22145475 - 22145576
Alignment:
Q  183 tggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 282  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22145475 tggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 22145573  T
Q  283 atg 285  Q
    |||    
T  22145574 atg 22145576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 285
Target Start/End: Original strand, 24707896 - 24707997
Alignment:
Q  183 tggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 282  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||| |||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24707896 tggtttatacttaactgcattcaattagaatatacaatgtgttggttcgggttgtaag-ttgtgagttgtcattataagtaacggagtcataggttgttg 24707994  T
Q  283 atg 285  Q
    |||    
T  24707995 atg 24707997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 44432093 - 44431954
Alignment:
Q  145 tgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaag-gtt 243  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| | ||||| ||| || || ||||| ||| |||||  |||||||  |||    
T  44432093 tgttgttgttga-ttgagtatgatt-gttgctgattgatggtttatgtttaactacattccattagaatacacaaggtgtaggttcgagttgtaaaagtt 44431996  T
Q  244 gcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  44431995 gcaagttgtcgttctaaataacggagtcatatgttgttgatg 44431954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 198 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 17795413 - 17795326
Alignment:
Q  198 tgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtt-ctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17795413 tgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgtttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 17795326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 28853982 - 28853880
Alignment:
Q  183 tggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtt-ctaagtaacggagtcataggttgtt 281  Q
    |||||||| | ||| |||||||| || || | |||||  |||||||||| |||||||| | ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28853982 tggtttatacttaattgcattcagttagaatgtacaatgtgttggttcaagttgtaag-tggcgggttgtcgtttctaagtaacggagtcataggttgtt 28853884  T
Q  282 gatg 285  Q
    ||||    
T  28853883 gatg 28853880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 262
Target Start/End: Original strand, 10829534 - 10829619
Alignment:
Q  176 tgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagt 262  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||  ||||| || |||||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10829534 tgattgctggtttatgcataactacaaacaattagaatatacaaggtgttggttcgagttgtaa-gttgcgagttgtcgttctaagt 10829619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 12)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 16006616 - 16006332
Alignment:
Q  1 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16006616 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagataattatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 16006517  T
Q  101 atatgatggttattatggttgttgtctcactgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16006516 atatgatggttattattgttgtagtctcgctgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 16006417  T
Q  201 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16006416 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataagttgttgatg 16006332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8776558 - 8776277
Alignment:
Q  1 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8776558 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttaatatgagtcctactcgttgt 8776459  T
Q  101 atatgatggttattatggttgttgtctcactgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8776458 atatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatgtt---gttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 8776362  T
Q  201 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8776361 attcaattgaattatacaagatgttggttcaagtggtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 8776277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 4 - 285
Target Start/End: Original strand, 17505693 - 17505973
Alignment:
Q  4 atgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgtata 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17505693 atgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatataatatgaaagatgttgatatgagtcctacttgttgtata 17505792  T
Q  104 tgatggttattatggttgttgtctcactgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgcatt 203  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  17505793 tgatggttattattattgttgtctcgctgcttgttattatatgttgctgttg-attgaatatgatttgctactgattgttggtgtatgcatacatgcatt 17505891  T
Q  204 caattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17505892 caattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcagagggtgttgatg 17505973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 4 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 17547521 - 17547241
Alignment:
Q  4 atgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgtata 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17547521 atgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatataatatgaaagatgttgatatgagtcctacttgttgtata 17547422  T
Q  104 tgatggttattatggttgttgtctcactgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgcatt 203  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  17547421 tgatggttattattattgttgtctcgctgcttgttattatatgttgctgttg-attgaatatgatttgctactgattgttggtgtatgcatacatgcatt 17547323  T
Q  204 caattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17547322 caattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcagagggtgttgatg 17547241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 21743208 - 21743490
Alignment:
Q  1 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21743208 aggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaa-tgaggggatagttatataatatgaaagatgttgatatgagtcctacttgttgt 21743306  T
Q  101 atatgatggttattatggttgttgtctcactgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 200  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  21743307 atatgatgattattattattgttgtctcgctgcttgttattatatgttgctgttga-ttgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgc 21743405  T
Q  201 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21743406 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcatagattgttgatg 21743490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 157 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 38828289 - 38828161
Alignment:
Q  157 attgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtt 256  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||  ||||||||||| || |||||||| ||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  38828289 attgaatatgatttgttgctgactgctggtttgtgcatagctgcattcaattagaatatacaaggtgtgggttcgagttgtaaagttgcaagttgtcgtt 38828190  T
Q  257 ctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38828189 ctaagtaacggagtcataggttgttgatg 38828161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 157 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 35366282 - 35366156
Alignment:
Q  157 attgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtt 256  Q
    ||||||||||||| | || |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||  |||||||| ||  | |||||||||    
T  35366282 attgaatatgatt-gttgatgattgctggtttatgcttaattgcattcaattagaatatacaaggtgttggttcgagttgtaagttttga-gttgtcgtt 35366185  T
Q  257 ctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35366184 ctaagtaacggagtcataggttgttgatg 35366156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 285
Target Start/End: Original strand, 13395553 - 13395654
Alignment:
Q  183 tggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 282  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13395553 tggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 13395651  T
Q  283 atg 285  Q
    |||    
T  13395652 atg 13395654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 285
Target Start/End: Original strand, 13733622 - 13733722
Alignment:
Q  183 tggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 282  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13733622 tggtttatacttaactgcattcaattagaatatacaatgtgttggttc-ggttgtaag-ttgtgagttgtcgttataagtaacggagtcataggttgttg 13733719  T
Q  283 atg 285  Q
    |||    
T  13733720 atg 13733722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 176 - 285
Target Start/End: Original strand, 21065238 - 21065348
Alignment:
Q  176 tgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaag-gttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcata 274  Q
    |||||| || ||| ||| ||| ||||||| ||| || || ||||| ||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21065238 tgattgctgatttgtgcttaactgcattccattagaatacacaaggtgtaggttcgcgttgtaaaagttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcata 21065337  T
Q  275 ggttgttgatg 285  Q
    |||||||||||    
T  21065338 ggttgttgatg 21065348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 48785344 - 48785243
Alignment:
Q  183 tggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 282  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48785344 tggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 48785246  T
Q  283 atg 285  Q
    |||    
T  48785245 atg 48785243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 4993517 - 4993415
Alignment:
Q  183 tggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtt-ctaagtaacggagtcataggttgtt 281  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4993517 tggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgtttctaagtaacggagtcataggttgtt 4993419  T
Q  282 gatg 285  Q
    ||||    
T  4993418 gatg 4993415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 2)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 9369 - 9085
Alignment:
Q  1 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 100  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9369 aggatgttggtaaggtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 9270  T
Q  101 atatgatggttattatggttgttgtctcactgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9269 atatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattgttatatgttgttgttgaattgaatatgattcgctgctgattgttggtttatgcataaatgc 9170  T
Q  201 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9169 attcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaactgagtcataggttgttgatg 9085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 285
Target Start/End: Original strand, 10963 - 11064
Alignment:
Q  183 tggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 282  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10963 tggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 11061  T
Q  283 atg 285  Q
    |||    
T  11062 atg 11064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 10)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 20579663 - 20579377
Alignment:
Q  1 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20579663 aggatgtttgtagtgtttaatgacgtcgacttaggtcgatgaacaaatgaggagatagttatatgttatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 20579564  T
Q  101 atatgatggttattatggttgttgtctcactgcttattattat---atgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaa 197  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20579563 atatgatggttattattgttgt-gtctcgctacttattattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaa 20579465  T
Q  198 tgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20579464 tgcattcaattggattatacaagatgttggttcgggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagccataggttgttgatg 20579377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 157 - 285
Target Start/End: Original strand, 2333034 - 2333162
Alignment:
Q  157 attgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtt 256  Q
    |||||||||| |||| |||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  2333034 attgaatatgttttgttgctgactgctggtttgtgcataactgcattcaattagaatatacaaggtgtgagttcgagttgtaaagttgcaagttgtcgtt 2333133  T
Q  257 ctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2333134 ctaagtaacggagtcataggttgttgatg 2333162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 294257 - 294128
Alignment:
Q  156 aattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgta-aggttgcaagttgtcg 254  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| | |||||||| ||| ||||||| ||| || || ||||| |||  ||||  |||||| | ||||||||||||||    
T  294257 aattgaatatgatt-gttgctgattgctagtttatgcttaactgcattccattagaatacacaaggtgtaagttcgagttgtagaagttgcaagttgtcg 294159  T
Q  255 ttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  294158 ttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 294128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 24087449 - 24087349
Alignment:
Q  183 tggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 282  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||| || |||||||| |||||||  || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24087449 tggtttatgcttaactacattcaattagaatatacaaggtgttggtcgag-ttgtaag-ttgcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 24087352  T
Q  283 atg 285  Q
    |||    
T  24087351 atg 24087349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 20631347 - 20631246
Alignment:
Q  183 tggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 282  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20631347 tggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 20631249  T
Q  283 atg 285  Q
    |||    
T  20631248 atg 20631246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 36181606 - 36181505
Alignment:
Q  183 tggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 282  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36181606 tggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 36181508  T
Q  283 atg 285  Q
    |||    
T  36181507 atg 36181505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 296558 - 296449
Alignment:
Q  176 tgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtt-ctaagtaacggagtcata 274  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  296558 tgatcgttggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgtttctaagtaacggagtcata 296460  T
Q  275 ggttgttgatg 285  Q
    |||||||||||    
T  296459 ggttgttgatg 296449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 37358502 - 37358402
Alignment:
Q  183 tggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 282  Q
    |||||||| | ||| |||||||| || || |||||||  ||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37358502 tggtttatacttaactgcattcagttagaatatacaatgtgttggttc-ggttgtaag-ttgtgagttgtcgttataagtaacggagtcataggttgttg 37358405  T
Q  283 atg 285  Q
    |||    
T  37358404 atg 37358402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 285
Target Start/End: Original strand, 14432505 - 14432543
Alignment:
Q  247 agttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14432505 agttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 14432543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 45307321 - 45307219
Alignment:
Q  183 tggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtt-ctaagtaacggagtcataggttgtt 281  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  45307321 tggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgtttccaagtaacggagtcataggttgtt 45307223  T
Q  282 gatg 285  Q
    ||||    
T  45307222 gatg 45307219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0586
Description:

Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 2052 - 1901
Alignment:
Q  1 aggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgttgt 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  2052 aggatgtatataatgtttaatgacgtcgatttaagttaataaacaaatgaggagatagttaaatattatgaaagatgttgatatgagttatacttgttgt 1953  T
Q  101 atatgatggttattatggttgttgtctcactgcttattattatatgttgttg 152  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||  ||||||||||||| ||| |||||    
T  1952 atatgatgattattattgttgttgacttgctgcttattattagatgatgttg 1901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 145 - 285
Target Start/End: Original strand, 8548 - 8687
Alignment:
Q  145 tgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaag-gtt 243  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| || || ||||| ||| |||||  |||||||  |||    
T  8548 tgttgttgttga-ttgaatatgatt-gttgctgattgctggtttatgcttaactgcattccattagaatacacaaggtgtaggttcgagttgtaaaagtt 8645  T
Q  244 gcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8646 gcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatg 8687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 2545 - 2432
Alignment:
Q  173 tgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaag-gttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtc 271  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| | ||||| ||| || || ||||| ||| |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2545 tgctgattgctggtttatgtttaactacattccattagaatacacaaggtgtaggttcgagttgtaaaagttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtc 2446  T
Q  272 ataggttgttgatg 285  Q
    ||||||||||||||    
T  2445 ataggttgttgatg 2432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 162490 - 162377
Alignment:
Q  173 tgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaag-gttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtc 271  Q
    ||||||||| | |||||||  ||| ||||||| ||| || || ||||| ||| |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  162490 tgctgattgctagtttatgtttaactgcattccattagaatacacaaggtgtaggttcgagttgtaaaagttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtc 162391  T
Q  272 ataggttgttgatg 285  Q
    ||||||||||||||    
T  162390 ataggttgttgatg 162377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 285
Target Start/End: Original strand, 134057 - 134157
Alignment:
Q  183 tggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttg 282  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  134057 tggtttatacttaactgcattcaattagaatatacaatgtgttggttc-ggttgtaag-ttgtgagttgtcgttataagaaacggagtcataggttgttg 134154  T
Q  283 atg 285  Q
    |||    
T  134155 atg 134157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 137981 - 137868
Alignment:
Q  173 tgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggtt-gcaagttgtcgttctaagtaacggagtc 271  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| | ||||| ||| || || ||||| ||| |||||  |||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  137981 tgctgattgctggtttatgtttaacttcattccattagaatacacaaggtgtaggttcgagttgtaaaatttgcaagttgtcgttctaagtaatggagtc 137882  T
Q  272 ataggttgttgatg 285  Q
    ||||||||||||||    
T  137881 ataggttgttgatg 137868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 198 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 1716 - 1638
Alignment:
Q  198 tgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggt 277  Q
    ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1716 tgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcttaggt 1638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1089 times since January 2019
Visitors: 4402