View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0684_low_105 (Length: 251)

Name: NF0684_low_105
Description: NF0684
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0684_low_105
NF0684_low_105
[»] chr3 (74 HSPs)
chr3 (6-243)||(3135454-3135699)
chr3 (8-174)||(43346793-43346959)
chr3 (7-174)||(37990978-37991145)
chr3 (8-162)||(15772856-15773010)
chr3 (6-174)||(37990639-37990807)
chr3 (6-164)||(35946522-35946680)
chr3 (6-162)||(22304571-22304727)
chr3 (6-162)||(29644902-29645058)
chr3 (6-175)||(42342388-42342557)
chr3 (6-162)||(29644581-29644737)
chr3 (6-162)||(54017816-54017972)
chr3 (6-162)||(54018198-54018354)
chr3 (9-174)||(32462903-32463069)
chr3 (8-162)||(42342092-42342246)
chr3 (12-162)||(15773194-15773346)
chr3 (6-162)||(21832345-21832499)
chr3 (14-155)||(39934963-39935104)
chr3 (6-162)||(12114562-12114718)
chr3 (6-162)||(32589706-32589861)
chr3 (6-158)||(33803252-33803404)
chr3 (6-174)||(52634666-52634833)
chr3 (4-174)||(45901703-45901874)
chr3 (6-162)||(25739425-25739581)
chr3 (6-174)||(25755384-25755552)
chr3 (6-162)||(53577366-53577522)
chr3 (6-142)||(41359765-41359901)
chr3 (14-175)||(22303963-22304117)
chr3 (5-175)||(31190006-31190168)
chr3 (27-162)||(4823657-4823792)
chr3 (15-162)||(39389072-39389219)
chr3 (32-157)||(3135099-3135224)
chr3 (4-162)||(8327906-8328068)
chr3 (17-162)||(39914254-39914399)
chr3 (9-162)||(45395656-45395809)
chr3 (6-164)||(33175659-33175822)
chr3 (14-174)||(49336694-49336855)
chr3 (6-162)||(50612447-50612608)
chr3 (6-162)||(53117975-53118130)
chr3 (6-162)||(1634315-1634471)
chr3 (6-174)||(32462558-32462727)
chr3 (4-162)||(51886563-51886715)
chr3 (6-162)||(44160547-44160700)
chr3 (7-161)||(11661954-11662108)
chr3 (9-103)||(22303662-22303756)
chr3 (22-161)||(33362305-33362451)
chr3 (6-162)||(37726506-37726654)
chr3 (6-80)||(41359491-41359565)
chr3 (48-154)||(42584864-42584970)
chr3 (57-162)||(3384317-3384422)
chr3 (13-162)||(9240151-9240300)
chr3 (57-114)||(52634990-52635047)
chr3 (6-94)||(54017548-54017636)
chr3 (98-164)||(11661535-11661601)
chr3 (36-122)||(39336000-39336086)
chr3 (32-162)||(47964544-47964674)
chr3 (72-161)||(7767380-7767469)
chr3 (109-162)||(22304248-22304301)
chr3 (6-55)||(22304302-22304351)
chr3 (6-162)||(39336232-39336385)
chr3 (52-98)||(16871005-16871051)
chr3 (108-162)||(43346652-43346706)
chr3 (7-60)||(8328374-8328427)
chr3 (6-84)||(43978865-43978947)
chr3 (57-161)||(46546376-46546480)
chr3 (6-162)||(47964915-47965071)
chr3 (32-101)||(25317221-25317290)
chr3 (58-98)||(17735043-17735083)
chr3 (58-98)||(19036312-19036352)
chr3 (52-98)||(17731950-17731996)
chr3 (52-98)||(19033181-19033227)
chr3 (46-96)||(53596028-53596078)
chr3 (46-96)||(53596343-53596393)
chr3 (65-162)||(25991405-25991502)
chr3 (52-96)||(16143506-16143550)
[»] chr4 (84 HSPs)
chr4 (7-162)||(36629239-36629394)
chr4 (1-162)||(25483338-25483500)
chr4 (6-155)||(44620362-44620511)
chr4 (6-175)||(50002415-50002584)
chr4 (8-164)||(39792860-39793016)
chr4 (6-162)||(41370359-41370515)
chr4 (7-158)||(1731646-1731797)
chr4 (7-174)||(34646648-34646815)
chr4 (7-174)||(39404388-39404555)
chr4 (6-164)||(39404018-39404176)
chr4 (4-162)||(3340809-3340967)
chr4 (6-180)||(10245904-10246077)
chr4 (8-162)||(50630755-50630909)
chr4 (13-162)||(32941128-32941277)
chr4 (9-162)||(54017596-54017749)
chr4 (6-162)||(55933122-55933278)
chr4 (6-174)||(36572009-36572177)
chr4 (6-162)||(36608659-36608815)
chr4 (6-164)||(20825836-20825994)
chr4 (7-161)||(50459724-50459878)
chr4 (6-155)||(44621011-44621160)
chr4 (6-162)||(44620662-44620817)
chr4 (7-162)||(16889535-16889690)
chr4 (6-141)||(18932747-18932882)
chr4 (16-162)||(52884697-52884844)
chr4 (6-154)||(54343006-54343147)
chr4 (5-162)||(16888813-16888970)
chr4 (6-175)||(22183262-22183431)
chr4 (16-149)||(54108928-54109060)
chr4 (27-162)||(4955336-4955471)
chr4 (7-162)||(22027960-22028115)
chr4 (6-162)||(22028367-22028525)
chr4 (5-161)||(49302907-49303065)
chr4 (46-164)||(41707503-41707620)
chr4 (4-162)||(49076827-49076984)
chr4 (5-162)||(3244448-3244605)
chr4 (6-176)||(54936188-54936353)
chr4 (35-149)||(45496820-45496934)
chr4 (16-162)||(52884889-52885038)
chr4 (6-162)||(3341130-3341286)
chr4 (6-110)||(23817679-23817783)
chr4 (11-158)||(20826223-20826370)
chr4 (7-174)||(45489331-45489497)
chr4 (27-162)||(49880162-49880296)
chr4 (6-112)||(43827492-43827597)
chr4 (6-162)||(54108540-54108694)
chr4 (9-162)||(4390102-4390255)
chr4 (9-158)||(51768061-51768210)
chr4 (6-162)||(2740702-2740856)
chr4 (5-174)||(43174496-43174666)
chr4 (9-162)||(34004586-34004737)
chr4 (46-162)||(54741216-54741332)
chr4 (57-162)||(2741073-2741178)
chr4 (12-113)||(31691203-31691306)
chr4 (6-146)||(3271802-3271947)
chr4 (32-162)||(23556890-23557020)
chr4 (41-158)||(6975489-6975606)
chr4 (6-162)||(49076449-49076602)
chr4 (9-162)||(3700367-3700512)
chr4 (18-174)||(19504695-19504842)
chr4 (6-138)||(48111696-48111828)
chr4 (24-164)||(40067043-40067184)
chr4 (8-116)||(18879854-18879962)
chr4 (46-162)||(28034231-28034347)
chr4 (75-162)||(10246349-10246436)
chr4 (57-151)||(54017751-54017845)
chr4 (46-161)||(34544107-34544225)
chr4 (97-175)||(44620285-44620363)
chr4 (97-162)||(44621428-44621493)
chr4 (3-159)||(760194-760348)
chr4 (27-150)||(15841387-15841510)
chr4 (10-84)||(41370738-41370812)
chr4 (6-72)||(43174233-43174299)
chr4 (118-162)||(45050603-45050647)
chr4 (97-163)||(44620945-44621012)
chr4 (6-164)||(45489712-45489870)
chr4 (46-96)||(11197294-11197344)
chr4 (1-51)||(23817448-23817498)
chr4 (112-162)||(50788087-50788137)
chr4 (15-54)||(19895406-19895445)
chr4 (8-78)||(39698944-39699014)
chr4 (57-98)||(1868117-1868158)
chr4 (6-50)||(11702297-11702341)
chr4 (48-92)||(11706584-11706628)
[»] chr2 (66 HSPs)
chr2 (6-163)||(6421386-6421543)
chr2 (6-162)||(36178605-36178761)
chr2 (12-174)||(15880253-15880415)
chr2 (6-162)||(37105926-37106082)
chr2 (6-162)||(41283475-41283631)
chr2 (8-162)||(37106190-37106344)
chr2 (6-162)||(14745667-14745823)
chr2 (9-162)||(962600-962753)
chr2 (6-157)||(15511495-15511646)
chr2 (6-174)||(6712966-6713135)
chr2 (13-174)||(36005887-36006047)
chr2 (6-162)||(5542625-5542781)
chr2 (10-162)||(5543002-5543154)
chr2 (6-142)||(36178171-36178307)
chr2 (6-162)||(42514651-42514807)
chr2 (8-159)||(33731653-33731804)
chr2 (6-148)||(6422126-6422268)
chr2 (6-162)||(35580724-35580879)
chr2 (6-156)||(29676543-29676687)
chr2 (9-158)||(40679632-40679781)
chr2 (16-162)||(1769894-1770040)
chr2 (4-162)||(7598230-7598388)
chr2 (27-160)||(28254260-28254391)
chr2 (7-162)||(38796619-38796776)
chr2 (6-164)||(40733883-40734040)
chr2 (9-151)||(23346250-23346391)
chr2 (6-164)||(40733517-40733675)
chr2 (7-159)||(29676908-29677065)
chr2 (1-162)||(37632593-37632753)
chr2 (8-162)||(28531316-28531470)
chr2 (4-153)||(40163370-40163520)
chr2 (13-158)||(14745300-14745446)
chr2 (57-162)||(16542451-16542556)
chr2 (20-164)||(5367455-5367599)
chr2 (16-179)||(12529038-12529201)
chr2 (11-162)||(7598611-7598754)
chr2 (6-102)||(6421793-6421889)
chr2 (57-162)||(31468801-31468902)
chr2 (76-161)||(31899496-31899581)
chr2 (57-162)||(36178320-36178425)
chr2 (6-110)||(3673122-3673226)
chr2 (32-162)||(30313180-30313309)
chr2 (48-161)||(31259658-31259774)
chr2 (1-92)||(3672773-3672865)
chr2 (6-161)||(9231252-9231407)
chr2 (57-162)||(33561502-33561607)
chr2 (52-156)||(37895107-37895211)
chr2 (87-162)||(38796299-38796374)
chr2 (10-102)||(6421688-6421780)
chr2 (13-162)||(16590890-16591034)
chr2 (57-164)||(29874074-29874181)
chr2 (107-162)||(36785664-36785719)
chr2 (59-148)||(28254165-28254254)
chr2 (118-174)||(6421294-6421350)
chr2 (6-74)||(31899102-31899170)
chr2 (19-111)||(36784273-36784365)
chr2 (47-162)||(30323466-30323581)
chr2 (33-162)||(31385739-31385868)
chr2 (32-162)||(29873563-29873693)
chr2 (8-161)||(3594180-3594333)
chr2 (10-96)||(35580443-35580530)
chr2 (46-158)||(37894732-37894844)
chr2 (57-162)||(41678419-41678525)
chr2 (58-165)||(34481265-34481372)
chr2 (68-109)||(13091833-13091874)
chr2 (105-149)||(42515031-42515075)
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (6-162)||(29518505-29518661)
chr6 (6-162)||(29518922-29519078)
chr6 (6-162)||(32741181-32741337)
chr6 (1-162)||(35210206-35210367)
chr6 (6-162)||(14748342-14748494)
chr6 (16-162)||(3409261-3409407)
chr6 (6-163)||(2377755-2377912)
chr6 (6-162)||(2378128-2378284)
chr6 (6-174)||(2578443-2578610)
chr6 (15-174)||(16107668-16107827)
chr6 (6-162)||(1846750-1846906)
chr6 (6-162)||(2579872-2580028)
chr6 (6-174)||(16454897-16455065)
chr6 (6-177)||(16454562-16454733)
chr6 (6-163)||(2843555-2843713)
chr6 (6-162)||(2578835-2578990)
chr6 (6-162)||(3058228-3058384)
chr6 (14-162)||(10074371-10074519)
chr6 (14-159)||(2579500-2579645)
chr6 (6-162)||(3409662-3409818)
chr6 (6-160)||(3415462-3415618)
chr6 (5-162)||(10073990-10074147)
chr6 (1-163)||(5832022-5832183)
chr6 (9-178)||(6999799-6999968)
chr6 (6-158)||(1127366-1127518)
chr6 (8-162)||(10073618-10073770)
chr6 (16-162)||(26544051-26544197)
chr6 (12-158)||(5958613-5958755)
chr6 (6-174)||(2579109-2579273)
chr6 (7-174)||(16108053-16108208)
chr6 (21-174)||(1950200-1950353)
chr6 (6-162)||(593707-593865)
chr6 (57-159)||(32460631-32460733)
chr6 (10-162)||(10911567-10911720)
chr6 (39-158)||(9062383-9062501)
chr6 (45-162)||(8481929-8482045)
chr6 (5-162)||(12071690-12071847)
chr6 (32-162)||(6071134-6071264)
chr6 (5-162)||(12092481-12092638)
chr6 (6-160)||(17135069-17135223)
chr6 (9-81)||(12085037-12085109)
chr6 (9-101)||(31714732-31714823)
chr6 (13-60)||(3409405-3409452)
chr6 (64-97)||(22605313-22605346)
[»] chr1 (62 HSPs)
chr1 (6-174)||(26661522-26661690)
chr1 (6-162)||(44290824-44290981)
chr1 (6-162)||(41156993-41157149)
chr1 (6-162)||(41142374-41142531)
chr1 (6-174)||(34649428-34649596)
chr1 (6-162)||(44290458-44290614)
chr1 (7-162)||(41157377-41157532)
chr1 (1-159)||(3537594-3537752)
chr1 (9-164)||(17294577-17294733)
chr1 (6-162)||(41759485-41759641)
chr1 (6-162)||(5319965-5320121)
chr1 (4-162)||(34364927-34365085)
chr1 (9-162)||(48588491-48588644)
chr1 (6-162)||(29798201-29798357)
chr1 (15-174)||(37556101-37556260)
chr1 (21-172)||(38804370-38804521)
chr1 (6-164)||(11977280-11977438)
chr1 (29-175)||(26661921-26662067)
chr1 (4-162)||(34364509-34364667)
chr1 (6-162)||(22077495-22077651)
chr1 (6-162)||(31767161-31767317)
chr1 (14-162)||(40082409-40082556)
chr1 (6-161)||(50052024-50052178)
chr1 (10-162)||(3550722-3550871)
chr1 (13-162)||(24600321-24600470)
chr1 (6-162)||(45084384-45084534)
chr1 (38-162)||(32594748-32594872)
chr1 (8-154)||(3875333-3875479)
chr1 (6-156)||(14318875-14319025)
chr1 (5-162)||(37850599-37850756)
chr1 (14-154)||(5528762-5528902)
chr1 (6-162)||(39066201-39066356)
chr1 (5-160)||(9955911-9956068)
chr1 (10-162)||(66476-66628)
chr1 (12-158)||(24131994-24132137)
chr1 (6-162)||(45493974-45494135)
chr1 (16-162)||(30630648-30630794)
chr1 (70-162)||(41184489-41184581)
chr1 (5-162)||(32168697-32168843)
chr1 (15-161)||(37555733-37555878)
chr1 (6-139)||(22077110-22077243)
chr1 (17-162)||(66100-66245)
chr1 (87-162)||(3537228-3537303)
chr1 (8-162)||(22077831-22077984)
chr1 (14-158)||(5575110-5575252)
chr1 (5-162)||(19283454-19283611)
chr1 (16-174)||(45839617-45839779)
chr1 (70-162)||(44685458-44685551)
chr1 (6-82)||(11977026-11977102)
chr1 (28-162)||(22793280-22793415)
chr1 (44-127)||(44043810-44043893)
chr1 (6-162)||(1188588-1188744)
chr1 (6-94)||(50051689-50051776)
chr1 (5-162)||(1187362-1187520)
chr1 (118-176)||(35154151-35154209)
chr1 (17-137)||(4956218-4956340)
chr1 (87-162)||(21378122-21378197)
chr1 (4-46)||(21378057-21378099)
chr1 (46-122)||(10351202-10351278)
chr1 (103-162)||(50469178-50469237)
chr1 (14-59)||(31767047-31767092)
chr1 (57-93)||(47380218-47380254)
[»] chr5 (64 HSPs)
chr5 (7-174)||(36492218-36492385)
chr5 (6-162)||(40296315-40296471)
chr5 (6-162)||(6500453-6500608)
chr5 (6-162)||(6500825-6500980)
chr5 (10-162)||(18603124-18603276)
chr5 (6-162)||(27502036-27502192)
chr5 (15-164)||(26074612-26074761)
chr5 (6-158)||(41170640-41170792)
chr5 (6-176)||(6224184-6224354)
chr5 (13-174)||(26075168-26075330)
chr5 (6-162)||(3295015-3295170)
chr5 (6-162)||(15370101-15370257)
chr5 (6-162)||(32487396-32487551)
chr5 (6-162)||(41632784-41632940)
chr5 (6-161)||(3295345-3295498)
chr5 (6-161)||(25327938-25328093)
chr5 (5-162)||(35150009-35150165)
chr5 (6-162)||(299491-299647)
chr5 (15-162)||(26074155-26074302)
chr5 (20-162)||(13415774-13415916)
chr5 (6-179)||(42405598-42405769)
chr5 (10-175)||(34753029-34753194)
chr5 (10-162)||(624198-624350)
chr5 (6-158)||(9498655-9498806)
chr5 (6-162)||(12662652-12662808)
chr5 (6-157)||(11416977-11417128)
chr5 (6-164)||(1028517-1028675)
chr5 (6-162)||(36568569-36568723)
chr5 (10-152)||(33747783-33747925)
chr5 (6-162)||(623820-623976)
chr5 (8-138)||(15370428-15370558)
chr5 (6-161)||(2411010-2411165)
chr5 (27-162)||(5723812-5723947)
chr5 (32-174)||(26074807-26074950)
chr5 (7-162)||(24489207-24489360)
chr5 (14-127)||(26590918-26591031)
chr5 (29-162)||(29549278-29549411)
chr5 (6-174)||(35167838-35168006)
chr5 (14-159)||(38427553-38427697)
chr5 (8-164)||(300959-301107)
chr5 (6-175)||(35914838-35915007)
chr5 (27-174)||(41635212-41635359)
chr5 (6-78)||(26900017-26900089)
chr5 (69-164)||(42508612-42508707)
chr5 (69-162)||(31509625-31509718)
chr5 (57-162)||(36521947-36522052)
chr5 (6-77)||(38427306-38427377)
chr5 (98-164)||(39309684-39309750)
chr5 (87-162)||(26074320-26074395)
chr5 (46-161)||(36522277-36522392)
chr5 (69-164)||(42524717-42524811)
chr5 (89-162)||(7768852-7768925)
chr5 (28-80)||(795254-795306)
chr5 (4-80)||(13785630-13785706)
chr5 (39-150)||(31509745-31509857)
chr5 (46-96)||(13042607-13042657)
chr5 (10-63)||(24489582-24489635)
chr5 (105-161)||(6225047-6225103)
chr5 (122-162)||(35150749-35150789)
chr5 (122-162)||(35151040-35151080)
chr5 (27-93)||(9498344-9498410)
chr5 (28-94)||(36527117-36527183)
chr5 (117-174)||(26900081-26900138)
chr5 (68-101)||(34103617-34103650)
[»] chr8 (75 HSPs)
chr8 (6-162)||(3669689-3669845)
chr8 (14-174)||(34834866-34835026)
chr8 (8-174)||(3038292-3038458)
chr8 (16-162)||(45122067-45122213)
chr8 (5-162)||(3670062-3670219)
chr8 (6-164)||(34835209-34835367)
chr8 (5-174)||(25561814-25561984)
chr8 (6-162)||(6876862-6877019)
chr8 (6-164)||(34835474-34835633)
chr8 (6-164)||(34835740-34835899)
chr8 (5-174)||(30359261-30359430)
chr8 (10-175)||(30359598-30359763)
chr8 (7-176)||(33113368-33113537)
chr8 (6-174)||(147441-147609)
chr8 (8-162)||(40518584-40518738)
chr8 (6-140)||(45122648-45122782)
chr8 (6-162)||(9309357-9309512)
chr8 (2-162)||(9608747-9608907)
chr8 (13-162)||(30441083-30441236)
chr8 (6-162)||(5915874-5916025)
chr8 (6-157)||(6651510-6651652)
chr8 (10-139)||(9483191-9483320)
chr8 (9-157)||(70277-70425)
chr8 (14-162)||(1014253-1014401)
chr8 (6-178)||(37544490-37544662)
chr8 (10-157)||(9482608-9482755)
chr8 (6-162)||(40518071-40518229)
chr8 (6-164)||(1513915-1514073)
chr8 (12-162)||(40579512-40579662)
chr8 (8-162)||(20870575-20870731)
chr8 (6-162)||(8918764-8918920)
chr8 (6-162)||(45121910-45122066)
chr8 (5-162)||(6731906-6732054)
chr8 (16-161)||(32640542-32640682)
chr8 (6-162)||(45123008-45123164)
chr8 (14-162)||(1013879-1014027)
chr8 (10-154)||(18371998-18372142)
chr8 (9-162)||(41972160-41972316)
chr8 (13-174)||(45121663-45121823)
chr8 (8-162)||(5420653-5420807)
chr8 (6-162)||(9308979-9309139)
chr8 (6-85)||(41129067-41129146)
chr8 (15-160)||(43398077-43398225)
chr8 (46-174)||(8794101-8794229)
chr8 (51-174)||(43274824-43274947)
chr8 (64-160)||(18372992-18373085)
chr8 (6-82)||(8919144-8919220)
chr8 (6-138)||(32305503-32305635)
chr8 (32-162)||(4154694-4154822)
chr8 (6-85)||(40579269-40579348)
chr8 (16-162)||(147831-147968)
chr8 (27-141)||(9609108-9609222)
chr8 (10-157)||(18371665-18371807)
chr8 (99-161)||(18372349-18372411)
chr8 (7-160)||(18380020-18380171)
chr8 (92-161)||(18372785-18372854)
chr8 (91-154)||(25561729-25561792)
chr8 (13-127)||(9507819-9507933)
chr8 (87-157)||(41416252-41416322)
chr8 (6-162)||(9620678-9620832)
chr8 (15-162)||(12283875-12284021)
chr8 (59-159)||(20130454-20130553)
chr8 (57-164)||(18372657-18372760)
chr8 (46-158)||(4154321-4154432)
chr8 (6-70)||(43274635-43274699)
chr8 (6-53)||(3037969-3038016)
chr8 (74-161)||(3037776-3037865)
chr8 (32-162)||(5274777-5274907)
chr8 (120-161)||(18372485-18372526)
chr8 (32-85)||(20995442-20995495)
chr8 (27-83)||(16524446-16524502)
chr8 (72-127)||(18373236-18373291)
chr8 (107-162)||(20995502-20995557)
chr8 (132-162)||(18645713-18645743)
chr8 (65-101)||(11442916-11442952)
[»] chr7 (60 HSPs)
chr7 (6-162)||(1085616-1085772)
chr7 (6-162)||(37533011-37533166)
chr7 (6-178)||(45433227-45433399)
chr7 (5-176)||(7517568-7517739)
chr7 (6-174)||(30244260-30244428)
chr7 (6-162)||(40094774-40094930)
chr7 (6-176)||(22567039-22567208)
chr7 (6-163)||(6054561-6054718)
chr7 (6-174)||(30245067-30245231)
chr7 (8-174)||(34218036-34218202)
chr7 (6-175)||(23377-23546)
chr7 (6-174)||(45434626-45434794)
chr7 (6-157)||(11845198-11845349)
chr7 (6-161)||(37533364-37533519)
chr7 (6-176)||(30032555-30032725)
chr7 (17-174)||(45754706-45754862)
chr7 (6-163)||(47129096-47129253)
chr7 (9-162)||(29157567-29157720)
chr7 (16-156)||(19122740-19122879)
chr7 (6-162)||(24177437-24177593)
chr7 (35-162)||(7554027-7554154)
chr7 (7-162)||(36622962-36623117)
chr7 (9-174)||(20599304-20599471)
chr7 (14-162)||(36939741-36939889)
chr7 (8-161)||(9901648-9901799)
chr7 (57-162)||(22566713-22566818)
chr7 (44-162)||(16569198-16569316)
chr7 (44-162)||(16596346-16596464)
chr7 (29-174)||(24838724-24838870)
chr7 (1-162)||(118294-118457)
chr7 (9-162)||(14681512-14681663)
chr7 (6-162)||(8128441-8128597)
chr7 (10-162)||(40230295-40230447)
chr7 (6-122)||(30253534-30253646)
chr7 (38-162)||(1085280-1085405)
chr7 (12-161)||(41910592-41910749)
chr7 (8-116)||(28300255-28300364)
chr7 (6-83)||(47129450-47129527)
chr7 (6-162)||(41854637-41854792)
chr7 (8-103)||(37167842-37167937)
chr7 (76-162)||(28301613-28301699)
chr7 (98-162)||(30244703-30244767)
chr7 (98-162)||(36109009-36109073)
chr7 (43-162)||(43241497-43241616)
chr7 (98-162)||(30245496-30245560)
chr7 (98-162)||(30255341-30255405)
chr7 (15-162)||(36534795-36534940)
chr7 (7-81)||(28300569-28300644)
chr7 (101-176)||(36967325-36967399)
chr7 (8-76)||(37532753-37532821)
chr7 (59-159)||(44361517-44361616)
chr7 (7-62)||(30244454-30244509)
chr7 (46-96)||(21416181-21416231)
chr7 (17-98)||(40094424-40094505)
chr7 (46-122)||(4124128-4124204)
chr7 (47-95)||(23569043-23569091)
chr7 (6-62)||(30245257-30245313)
chr7 (6-62)||(30253672-30253728)
chr7 (6-94)||(37393128-37393216)
chr7 (118-162)||(40094506-40094550)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (6-163)||(514-671)
scaffold0702 (6-162)||(147-298)
[»] scaffold0391 (3 HSPs)
scaffold0391 (10-175)||(1110-1275)
scaffold0391 (46-116)||(1731-1801)
scaffold0391 (113-159)||(3092-3138)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (6-162)||(47362-47518)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (13-162)||(4984-5133)
scaffold0078 (44-162)||(5359-5477)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (15-162)||(5398-5546)
scaffold0734 (15-162)||(5779-5931)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (69-162)||(17519-17612)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (87-163)||(10192-10268)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (32-162)||(39459-39588)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 74)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 243
Target Start/End: Original strand, 3135454 - 3135699
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggg--ttctctta 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||    
T  3135454 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttatctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggggtcctctta 3135553  T
Q  104 tttata-----aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacatattttcatataaatttaaaacac 198  Q
     | |||     ||||||| ||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3135554 ctaatataataaggtgttcaacttttactcttttatctgaggtgggacatataactcacacttgtacacaacaacatattttcatataaatttaaaacac 3135653  T
Q  199 ttt-gttttagcattcggttgcacatgtgaactgtgaagtattatc 243  Q
    ||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  3135654 tttggttttagcattcagctgcacatgtgaagtgtgaagtattatc 3135699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Original strand, 43346793 - 43346959
Alignment:
Q  8 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 107  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43346793 ggaccgtccacatagaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttactta 43346892  T
Q  108 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  43346893 taaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 43346959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Original strand, 37990978 - 37991145
Alignment:
Q  7 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||    
T  37990978 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgatgagtttataggtcctcttactt 37991077  T
Q  107 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  37991078 ataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgagacatataactcacacttgtacacaacaaca 37991145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 15773010 - 15772856
Alignment:
Q  8 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  15773010 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaagcaatgagtttatgggtcctcttactta 15772911  T
Q  108 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  15772910 taaggtgttcaacatttactcttttatccgatatgggacatataactcacacttg 15772856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Original strand, 37990639 - 37990807
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  37990639 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttact 37990738  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  37990739 tataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacacttgtacacaacaaca 37990807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 35946680 - 35946522
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |    
T  35946680 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaattgcacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttact 35946581  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 164  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35946580 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgta 35946522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22304727 - 22304571
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  22304727 ggggactgtccacatcgagactagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttact 22304628  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22304627 tataaggtattcaacctttactattttatccgatgtgggacatatagctcacacttg 22304571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 29644902 - 29645058
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |    
T  29644902 ggggaccgtccacatcgaggctaaaacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttact 29645001  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  29645002 tataaggtgtttaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacttacacttg 29645058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 175
Target Start/End: Original strand, 42342388 - 42342557
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| |    
T  42342388 ggggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtcctcttact 42342487  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacat 175  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  42342488 tataaggtgttgaacctttactcttttatcggatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacat 42342557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 29644581 - 29644737
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||| |||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  29644581 ggggaccatccacatcgaagctaaaacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggttctcttact 29644680  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29644681 tataaggtgttcaacctttactctttaatccgatgtgggacatataactcacacttg 29644737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 54017816 - 54017972
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |  ||||||| || |||||| |    
T  54017816 ggggaccgcccacatcgaagctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgagtcctcttact 54017915  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  54017916 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtaggacatataactcacacttg 54017972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 54018198 - 54018354
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |  |||||||||| |||||| |    
T  54018198 ggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcatgagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgggtcctcttact 54018297  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  54018298 tataaggtgttcaatctttactcttttatccgatgcaggacatataactcacacttg 54018354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Original strand, 32462903 - 32463069
Alignment:
Q  9 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 108  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||    
T  32462903 gaccgtacacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcttcttacttat 32463002  T
Q  109 aaggtgttaaacc-tttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  32463003 aaggtattcaaccttttactcttctatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 32463069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 162
Target Start/End: Original strand, 42342092 - 42342246
Alignment:
Q  8 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||    
T  42342092 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttactta 42342191  T
Q  108 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||  || ||| |||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||    
T  42342192 taaggcattgaacatttactcttttatccgatgtggaacatatgaatcacacttg 42342246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 15773346 - 15773194
Alignment:
Q  12 cgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaag--agagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| |||||    
T  15773346 cgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagcaagagacatcacactcttacccaaaactttaaggcaatgagcttatgagtcctcttacttata 15773247  T
Q  110 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    || |||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15773246 agatgttcaacttttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttg 15773194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 21832345 - 21832499
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |    
T  21832345 ggggactgtccacatcgaggctagaacaaccagacaagcaagagagacgc--cactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgagtcctcttact 21832442  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21832443 tataaggtgttcaacctttacttttctatccaatgtgggacatataactcacacttg 21832499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 39934963 - 39935104
Alignment:
Q  14 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||    
T  39934963 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaactttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggt 39935062  T
Q  114 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactc 155  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  39935063 gttcaacctttactcttttatccgatgtaggacatataactc 39935104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 12114562 - 12114718
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |    
T  12114562 ggggaccgaccacatcgtggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttact 12114661  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  12114662 tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggatatataacttacacttg 12114718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 32589861 - 32589706
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  32589861 ggggaccgtccacatcgagcctagaacaaccacacaagcaagagagacatcgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 32589762  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||    
T  32589761 tataaggtgttcaacctttattattttatcttatgtgggacatat-actcacacttg 32589706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 158
Target Start/End: Original strand, 33803252 - 33803404
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||| | |||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |    
T  33803252 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagagagggagacgccacactcttacccaataccttaatgcaatgggtttatgggtcctcttact 33803351  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 158  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33803352 tatatggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 33803404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 52634833 - 52634666
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||| ||| ||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  52634833 ggggacagtctacatcaaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt-ctcttact 52634735  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  52634734 tataaggcgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 52634666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 45901874 - 45901703
Alignment:
Q  4 caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctta 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  45901874 caggggaccgtccacatcgaagttagaacaaccctataagtaagagagacaccacactcttaccaaaaactttaaggccatgagtttatgcgtcctctta 45901775  T
Q  104 tttataaggtgttaaacc-tttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
     |||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  45901774 cttataaggtgttcaacctttttttcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 45901703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 25739425 - 25739581
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||   |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |    
T  25739425 ggggaccgtccacatcgaggctagaactaccgcacaagctagagagacgtcacactcttacccaaaacctaaaagcaatgagtttatgggtcctcttact 25739524  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||| | |||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25739525 tatatgatgttcaacttttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 25739581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 25755552 - 25755384
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||  |||||| ||| ||| | |||||  |||||| || |||||| |    
T  25755552 ggggaccatccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacacttttacccacaactttaggacaatggatttatgagtcctcttact 25755453  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  25755452 tataaggtattcaacctttactcttttatctgatgtgagacatataactcacacttgtacacaacaaca 25755384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 53577522 - 53577366
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||| | | ||||||    
T  53577522 ggggaccatccacaccgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttacccaagaccttaaggcaatatgtttatggatccacttatt 53577423  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    | |||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53577422 tttaagatgttcaacctttactgttttatccgatgtgtgacatataactcacacttg 53577366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 142
Target Start/End: Original strand, 41359765 - 41359901
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  41359765 ggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcgagagagacgccacattcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 41359864  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtg 142  Q
    |||||||| || |||||||||| || |||||||||||    
T  41359865 tataaggtattcaacctttactattgtatccgatgtg 41359901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 175
Target Start/End: Original strand, 22303963 - 22304117
Alignment:
Q  14 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 113  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||      
T  22303963 tccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccgcttacttataag-- 22304060  T
Q  114 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacat 175  Q
         ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22304061 -----acctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacat 22304117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 31190168 - 31190006
Alignment:
Q  5 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 104  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||        ||||||| |||| |     
T  31190168 aggggagcgtccaaatcgaggctagaacaacccgacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc--------tatgggtcctctaac 31190077  T
Q  105 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacat 175  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |  |||||||||    
T  31190076 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatatcactcacacttgcacacaacaacat 31190006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 4823792 - 4823657
Alignment:
Q  27 tagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttac 126  Q
    ||||||| || || |||||| | |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||| |||||    
T  4823792 tagaacatccgcataagcaaaaaagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcctacttataaggtgtttaacttttac 4823693  T
Q  127 tcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4823692 tattttatccgatgtgagacttataactcacacttg 4823657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 39389219 - 39389072
Alignment:
Q  15 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg 114  Q
    ||||||| ||| ||||||||   |||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || |||||||    
T  39389219 ccacatcaaggctagaacaattgcacaggcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttagttttaaggtg 39389120  T
Q  115 ttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    || |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  39389119 ttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttg 39389072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 157
Target Start/End: Original strand, 3135099 - 3135224
Alignment:
Q  32 caaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttt 131  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||    
T  3135099 caaccgcacaagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttatggcagtgggtttatgggttcttttacttataaggtgttcaacatttactattt 3135198  T
Q  132 tatccgatgtgagacatataactcac 157  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3135199 tatccgatgtgggacatataactcac 3135224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 8328068 - 8327906
Alignment:
Q  4 caggggaccgtccacatcgaggttagaacaac----cacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttct 99  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||    | |||  |  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  8328068 caggggagcgtccacatcgaggctagaacaactgcactcacttgtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattacgtttatgggttct 8327969  T
Q  100 cttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||| ||||||| | || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8327968 cttacttataagatattcatcctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 8327906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 39914399 - 39914254
Alignment:
Q  17 acatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgtt 116  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||  |||||||||| |||||| || ||||||  |||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39914399 acatcgaggctagaacaaccgcataagtgagagagacaccacactcttatccaaaatattaaggcattaggtttatgggtcctcttatttataaggtgtt 39914300  T
Q  117 aaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
     ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39914299 caacctctactgttttatctgatgtgagacatataactcacacttg 39914254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Original strand, 45395656 - 45395809
Alignment:
Q  9 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 108  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  45395656 gaccctccacatcgaggctagagcaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgggtttatggatcctcttacttat 45395755  T
Q  109 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||    
T  45395756 aacgtgtttaacctttactcttttattcgatgtgggatatataacttacacttg 45395809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Original strand, 33175659 - 33175822
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagac---acgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat---gggttct 99  Q
    |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||||   || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||    
T  33175659 ggggactgcccacaccgaggctagaacaatcacacaagtgagagagacgtcac-acactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttattatgggttct 33175757  T
Q  100 cttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 164  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33175758 cttacttataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgagacatataactcacacttgta 33175822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 174
Target Start/End: Original strand, 49336694 - 49336855
Alignment:
Q  14 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaa-gagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataagg 112  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||  || ||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  49336694 tccacattgaggatagaacaaccgcacaaaaaaagagagacaccacactcttacccagaactttaagactatgggtttatgggtcctcttacttataagg 49336793  T
Q  113 tgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    || | |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  49336794 tggtcaacctttacttttctatccgatgtgagacatgtaactcacacttgtacacaacaaca 49336855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 50612447 - 50612608
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtt-----tatgggttctc 100  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||  |||  |||     |||| || |||    
T  50612447 ggggaccgtccacgtcgaggatggaacaaccactcaagcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagataatatgttagatttatgagtcctc 50612546  T
Q  101 ttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50612547 ttacttataaggtgttcaatctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 50612608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 53117975 - 53118130
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||  |  |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||  | |||| | |    
T  53117975 ggggaccgttcacatcgatgctagaacaaccacacttgtgagagagacactacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggttt-tgaatcctctcact 53118073  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  53118074 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatatggaacatataactcacacttg 53118130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 1634315 - 1634471
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |  ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |    
T  1634315 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccatata-gtgagagagataccgcactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttatgggtcctcttact 1634413  T
Q  106 tataaggtgttaaacc-tttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||| ||||| |||| |||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1634414 tataatgtgtttaaccttttatttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 1634471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Original strand, 32462558 - 32462727
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||| ||||| ||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||| | |||||| || |||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||| |    
T  32462558 gggggccgtctacatcgaggctaaaacaatcccacaaacaagagagaccccacactcttatccaaaaccttaaagcaataggtttatggatcatcttact 32462657  T
Q  106 tataaggtgttaaacc-tttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  32462658 tataaggtgttcaaccttttactctttcattcgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 32462727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 51886715 - 51886563
Alignment:
Q  4 caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctta 103  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||||  |||||| || |||||||      ||||||||||||||||| ||||||    
T  51886715 cagggtaccgttcacatcgagattagaacaatcacacttgcaaaagagacatcacactcttatccaaaac------gcaatgagtttatgggtcctctta 51886622  T
Q  104 tttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
     ||||| | |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51886621 cttatatgatgttcaacctttactattttattcgatgtgagacatataactcacacttg 51886563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 44160547 - 44160700
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | ||  || ||||||||| | ||| || |||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||    
T  44160547 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcgca--agtaagagagacgccacattcttacc-aaaaccttaagacaatgggtttatggatcctcttatt 44160643  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||| || ||| |||||||||| |||||||    
T  44160644 tataaggtgttcaacctttattgttttatccaatatgaaacatataactgacacttg 44160700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 11662108 - 11661954
Alignment:
Q  7 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaa-ccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||| |  |||| | |    
T  11662108 gggactgttcacatcgaggctagaacaaccacacaatga-gagagacacctcactcttacccaaaaaccttaaggcaattggtttatgaggcctctcact 11662010  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 161  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  11662009 tttaaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtggggcatttaactcacactt 11661954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 103
Target Start/End: Original strand, 22303662 - 22303756
Alignment:
Q  9 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctta 103  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22303662 gaccgtctacatcgaggctagaacaatcgcacaagtaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 22303756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 161
Target Start/End: Original strand, 33362305 - 33362451
Alignment:
Q  22 gaggttagaacaaccacacaag----caagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgtta 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||    ||||||||| ||| ||| | ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||     
T  33362305 gaggttagaacaatcacacaagcaagcaagagagagacgccacacttacccaaaatcttaaggaaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattc 33362404  T
Q  118 aacctttactcttttatccgatgtgaga---catataactcacactt 161  Q
    |||||||| | ||||||||||  |||||   ||||||||||||||||    
T  33362405 aacctttattattttatccgacatgagatatcatataactcacactt 33362451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 37726654 - 37726506
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| | ||   |||||| || ||||||||| |||||||||        | | |||||| |    
T  37726654 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaactatacaagtaagataaacgtcacactcttatccaaaacctaaaggcaatg--------gatcctcttact 37726563  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37726562 tataaggtattcaacatttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 37726506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 80
Target Start/End: Original strand, 41359491 - 41359565
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaagg 80  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  41359491 ggggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacgccacactcttacccaaaaccttaagg 41359565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 48 - 154
Target Start/End: Original strand, 42584864 - 42584970
Alignment:
Q  48 agagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagaca 147  Q
    |||||||| |||||| | | ||||| |||||| ||||  |||||||| | |||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  42584864 agagacaccacactctttctcaaaatcttaagacaattggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaatctttactcttctatccgatgtgggaca 42584963  T
Q  148 tataact 154  Q
    |||||||    
T  42584964 tataact 42584970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 162
Target Start/End: Original strand, 3384317 - 3384422
Alignment:
Q  57 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 156  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||  |||||| ||||| ||||| |||| |||||||  ||||| |||||||||||||    
T  3384317 acactcttacccaaaactttaaggcattaagtttatgggtcctcttccttataaagtgtttaacctatactgttttatcatatgtgggacatataactca 3384416  T
Q  157 cacttg 162  Q
    | ||||    
T  3384417 cgcttg 3384422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 9240300 - 9240151
Alignment:
Q  13 gtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataagg 112  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||| |   |||||||||| ||| || || || ||| ||||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||||    
T  9240300 gtccacatcgaggctagaataaccgcactattgagagagacaccacattcttatccgaaatcttaaggtaatggatttatgggtcctcttacttataagg 9240201  T
Q  113 tgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||| | | ||||||  | |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9240200 tgttcagcttttacttctctatccgatgtggaacatataactcacacttg 9240151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 52635047 - 52634990
Alignment:
Q  57 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg 114  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52635047 acactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttatttataaggtg 52634990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 94
Target Start/End: Original strand, 54017548 - 54017636
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgg 94  Q
    |||||||| |||||||||||  | ||||| |||| ||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54017548 ggggaccgaccacatcgaggccaaaacaatcacataagtaatagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 54017636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 11661601 - 11661535
Alignment:
Q  98 ctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 164  Q
    |||||| ||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11661601 ctcttacttataagatgtttaaccgttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgta 11661535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 122
Target Start/End: Original strand, 39336000 - 39336086
Alignment:
Q  36 cacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacct 122  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||  | | |||||||| ||||| |||||    
T  39336000 cacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgattttatgagtcttatcatttataaagtgttcaacct 39336086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 162
Target Start/End: Original strand, 47964544 - 47964674
Alignment:
Q  32 caaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttt 131  Q
    ||||||||||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| | |||||  | ||| |||||  ||  ||     
T  47964544 caaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctctcacttatatagcgttcaacctccacatttc 47964643  T
Q  132 tatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  47964644 tatccgatgcgggacatacaactcacacttg 47964674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 161
Target Start/End: Original strand, 7767380 - 7767469
Alignment:
Q  72 accttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 161  Q
    |||||||| ||||| ||||||| || |||||| |||||| ||||  |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  7767380 accttaagacaatgggtttatgagtcctcttagttataaagtgtccaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcagactt 7767469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22304301 - 22304248
Alignment:
Q  109 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22304301 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 22304248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 22304351 - 22304302
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacac 55  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22304351 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacac 22304302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 39336232 - 39336385
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||| |||||||| |||  ||| ||||||||| ||| |||||| ||  |||||  || |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| | |    
T  39336232 ggggaccatccacatccaggc-agagcaaccacacgagcgagagaggca--acactattatccaaaaccttaaagcaatgagtttatggatcctctcact 39336328  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||| ||||| |||||  |   || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39336329 tataaagtgttcaacctccaactttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 39336385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 98
Target Start/End: Original strand, 16871005 - 16871051
Alignment:
Q  52 acacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttc 98  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16871005 acacgacactcttacctaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttc 16871051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 43346706 - 43346652
Alignment:
Q  108 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  43346706 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatacaactcacacttg 43346652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 8328427 - 8328374
Alignment:
Q  7 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacac 60  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  8328427 gggaccgtccacatcgaggctaaaacaaccccacaagcaagagagacaccacac 8328374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 84
Target Start/End: Original strand, 43978865 - 43978947
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcc----tacccaaaaccttaaggcaat 84  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| | ||||||     |||||||||||||||||||||    
T  43978865 ggggacagtccacatcgaggttagaacaaacacacaagtgagagagacgccacactctagcttacccaaaaccttaaggcaat 43978947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 161
Target Start/End: Original strand, 46546376 - 46546480
Alignment:
Q  57 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 156  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||| ||||| |||||  ||  ||  |||| ||||  |||||||||||||    
T  46546376 acactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggattctctaacttataaagtgttcaacctccacatttcaatccaatgtaggacatataactca 46546475  T
Q  157 cactt 161  Q
    |||||    
T  46546476 cactt 46546480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 47964915 - 47965071
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||| |||||||||| |||  ||||||| || | |||  |||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |  |||| | |    
T  47964915 ggggaacgtccacatctaggccagaacaatcatataagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggcttatgagccctctcact 47965014  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||   |||| |||||  ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  47965015 tatataatgtttaacctccacttttctatccgatgtaaaacatataactcacacttg 47965071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 25317290 - 25317221
Alignment:
Q  32 caaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctct 101  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  25317290 caaccacacaagtgagagacacactacacttttacccaaaaccttaaggcaacaagtttatgggtcctct 25317221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 98
Target Start/End: Original strand, 17735043 - 17735083
Alignment:
Q  58 cactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttc 98  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17735043 cactcttacccaaaaccttaagtcaatgagtttatgggttc 17735083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 98
Target Start/End: Original strand, 19036312 - 19036352
Alignment:
Q  58 cactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttc 98  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19036312 cactcttacccaaaaccttaagtcaatgagtttatgggttc 19036352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 98
Target Start/End: Original strand, 17731950 - 17731996
Alignment:
Q  52 acacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttc 98  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17731950 acaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgggttc 17731996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 98
Target Start/End: Original strand, 19033181 - 19033227
Alignment:
Q  52 acacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttc 98  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19033181 acaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgggttc 19033227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 53596078 - 53596028
Alignment:
Q  46 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 96  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  53596078 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaacgggtttatgggt 53596028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 53596393 - 53596343
Alignment:
Q  46 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 96  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  53596393 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaacgggtttatgggt 53596343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 25991502 - 25991405
Alignment:
Q  65 acccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||| |||||||| | ||||||  |||| ||| || |||  |||||  |||||| ||||||| |||||||||||    
T  25991502 acccaaaaccttaaggcattaggtttataggttctctcacttataaaatgtttaacattaacttgtttatttgatgtgggacatattactcacacttg 25991405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 16143550 - 16143506
Alignment:
Q  52 acacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 96  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16143550 acactacactcttacccaaaactttaaggcaatgagcttatgggt 16143506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 84)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 36629394 - 36629239
Alignment:
Q  7 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  36629394 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttactt 36629295  T
Q  107 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36629294 ataaggtgtttaacttttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 36629239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 25483500 - 25483338
Alignment:
Q  1 agccaggg-gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttct 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  25483500 agccagggagaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcct 25483401  T
Q  100 cttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25483400 cttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 25483338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 44620511 - 44620362
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  44620511 ggggaccgtccacatcaaggttagaacaaccacacaagcaagagaaacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggctctcttatt 44620412  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactc 155  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  44620411 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtggaacatataactc 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 50002584 - 50002415
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| |    
T  50002584 ggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtcctcttact 50002485  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacat 175  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  50002484 taaaaagtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaacaacaacat 50002415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 164
Target Start/End: Original strand, 39792860 - 39793016
Alignment:
Q  8 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||  |||    
T  39792860 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttacggttcctctttctta 39792959  T
Q  108 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 164  Q
    ||||||||| ||| |||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  39792960 taaggtgttcaacatttacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttgta 39793016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 41370515 - 41370359
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  41370515 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacactacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 41370416  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||| || ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  41370415 tataaggttttcaacatttactattttatccgatttgggacatataactcacacttg 41370359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 158
Target Start/End: Original strand, 1731646 - 1731797
Alignment:
Q  7 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 106  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  1731646 gggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctcttattt 1731745  T
Q  107 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 158  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  1731746 ataagatgttcaacctttactgttttatctgatgtgggacatataactcaca 1731797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Original strand, 34646648 - 34646815
Alignment:
Q  7 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 106  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||  | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  34646648 gggaccgtccacaacaaggctagaacaaccacacagaccagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttagtt 34646747  T
Q  107 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  34646748 ataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 34646815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 39404555 - 39404388
Alignment:
Q  7 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 106  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| ||    
T  39404555 gggaccgttcacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacattcttgcccaaaaccttaaggctataggtttatgggtcctcttactt 39404456  T
Q  107 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  39404455 ataaggtgttccacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 39404388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 39404176 - 39404018
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| |    
T  39404176 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaatgctatgagtttatgagtcctcttact 39404077  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 164  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||    
T  39404076 tataaagtgttcaacctttactcttttattcaatgtaggacatataactcacacttgta 39404018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 3340967 - 3340809
Alignment:
Q  4 caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctta 103  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  3340967 caggagaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctctta 3340868  T
Q  104 tttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
     |||||||||| | |||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  3340867 cttataaggtgctcaacctttactctttcatctgatgcgggacatataactcacacttg 3340809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 10246077 - 10245904
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || |||||| ||| |||||| |    
T  10246077 ggggagcgtccacatcgaggctagaacaaccagacaagcaagggagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctttgggtttat-ggtcctcttact 10245979  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacatatttt 180  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||    
T  10245978 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggggcatataactcacacttgcacacaacaacatctttt 10245904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 162
Target Start/End: Original strand, 50630755 - 50630909
Alignment:
Q  8 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 107  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  50630755 ggaccgcccacatcgaggctaaaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 50630854  T
Q  108 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  50630855 taatgtgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacgcttg 50630909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 162
Target Start/End: Original strand, 32941128 - 32941277
Alignment:
Q  13 gtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataagg 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  32941128 gtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagccctcttatttataagg 32941227  T
Q  113 tgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||| |||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32941228 tgttcaacctttactgttctttccgatgtaagacatataactcacacttg 32941277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Original strand, 54017596 - 54017749
Alignment:
Q  9 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  54017596 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacatcacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 54017695  T
Q  109 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  54017696 aagatgttcaacctttactattttatctgacgtgggacatataactcacacttg 54017749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 55933122 - 55933278
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  55933122 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaactgtacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 55933221  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  55933222 tataaggtgttcaacccttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttg 55933278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 36572177 - 36572009
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |    
T  36572177 ggggaccgttcacatcgaggcttgaacaaccgcacaagcgagagagacaccatactctaacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcttcttact 36572078  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  36572077 tataaggtgttcaacatttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 36572009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 36608659 - 36608815
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||| |    
T  36608659 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatggatcctcttact 36608758  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  36608759 tatgaggtgttcaacttttactcttttatccgatgttggacatataactcacacttg 36608815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 20825994 - 20825836
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||| || ||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |   |||||||||| ||||||||    
T  20825994 ggggactgtccacatcaaggctagaacaaccgcataaggaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggctaaaggtttatgggtgctcttatt 20825895  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 164  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  20825894 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcacatttgta 20825836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 50459878 - 50459724
Alignment:
Q  7 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 106  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||  |||| ||||||| || |||||| ||    
T  50459878 gggaccgtgcacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacgctcttacctaaaaccttaagataatgggtttatgagtcctcttactt 50459779  T
Q  107 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 161  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  50459778 ataagatgttcaacctttactcttttaaccgatgtggaacatataactcacactt 50459724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 44621160 - 44621011
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||| |    
T  44621160 ggggaccgtccacatcgaggctagaataaccgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgtgccctcttact 44621061  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactc 155  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||    
T  44621060 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggtcatacaactc 44621011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 44620817 - 44620662
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |    
T  44620817 ggggaccgtccacatcgaggatataacaaccgcacaagcaagagagaaaccacactcttacccaaaaccttaaggttatg-gtttatgggtcctcttact 44620719  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44620718 tataaagtgttcaacctctactatttcatccgatgtgggacatataactcacacttg 44620662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 162
Target Start/End: Original strand, 16889535 - 16889690
Alignment:
Q  7 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||| |  |||||||  | |||||| ||    
T  16889535 gggaccgtccacatcgaggttagaacaatcacacaaggaagagagacaccatactcttacccaaaactttaaggcagtaggtttatgaatcctcttactt 16889634  T
Q  107 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||| || |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16889635 ataaggtattcaacctttacttttctatccgatttgagacatataactcacacttg 16889690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 141
Target Start/End: Original strand, 18932747 - 18932882
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18932747 ggggaccgtacacatcgaggctataacaaccactcaagtaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttatt 18932846  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgt 141  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  18932847 tataaggtattcaacctttactattttatccgatgt 18932882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 52884844 - 52884697
Alignment:
Q  16 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctaccc-aaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg 114  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | |  ||||| ||||||||||    
T  52884844 cacatcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatcgatcatcttacttataaggtg 52884745  T
Q  115 ttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52884744 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 52884697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 154
Target Start/End: Original strand, 54343006 - 54343147
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||       |||| |||||| |    
T  54343006 ggggaccatccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatg-------gggtcctcttact 54343098  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataact 154  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  54343099 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 54343147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 162
Target Start/End: Original strand, 16888813 - 16888970
Alignment:
Q  5 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 104  Q
    ||||||||||| |||||||   |||||||| | ||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||     
T  16888813 aggggaccgtctacatcgaaactagaacaatcgcacaaacaagagagacatcacactcttacccaaaaccgtaagacaatgagtttataggttctcttac 16888912  T
Q  105 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||| || |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16888913 ttataaggtattcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 16888970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 175
Target Start/End: Original strand, 22183262 - 22183431
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |    
T  22183262 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttact 22183361  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacat 175  Q
    |||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |  |||||||||    
T  22183362 tataaattgttcaacatttactcttttatccgatgtgggatatataactcacacttgcacacaacaacat 22183431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 54109060 - 54108928
Alignment:
Q  16 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgt 115  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  54109060 cacatcgaagctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaac-ttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 54108962  T
Q  116 taaacctttactcttttatccgatgtgagacata 149  Q
    | |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  54108961 tcaacctttactattttatccgatgtgggacata 54108928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 162
Target Start/End: Original strand, 4955336 - 4955471
Alignment:
Q  27 tagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttac 126  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  4955336 tagagcaaccgcacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaaccttaac 4955435  T
Q  127 tcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4955436 tattttatccgatatgagacatataactcacacttg 4955471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 162
Target Start/End: Original strand, 22027960 - 22028115
Alignment:
Q  7 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 106  Q
    ||||| ||||||||||||  || |||||||||| |||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||    
T  22027960 gggactgtccacatcgagactaaaacaaccacataagcgagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaatatgtttatgggtcctcttactt 22028059  T
Q  107 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||||| |||||||  | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  22028060 ataaggtgttcaacctttcgtattttatccgatgtgggacatataagtcacacttg 22028115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 22028367 - 22028525
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  22028367 ggggaccgtccacattgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgagtttatgggtcctcttact 22028466  T
Q  106 tataaggtgttaaaccttta--ctcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
     |||||||||| ||||||||   | |||||||||||||  ||||||||| | |||||||    
T  22028467 aataaggtgttcaacctttatttttttttatccgatgtaggacatataagtaacacttg 22028525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 49303065 - 49302907
Alignment:
Q  5 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctta- 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| | || ||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||     
T  49303065 aggggatcgtccacatcgaggatagaacaatcgcataagtaagagatacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 49302966  T
Q  104 -tttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 161  Q
     |||||||| |||| |||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  49302965 ttttataagatgttcaacctttacttttttatttgatgtgggacatataactcacactt 49302907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 164
Target Start/End: Original strand, 41707503 - 41707620
Alignment:
Q  46 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgaga 145  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41707503 agagagacaccacactcttacc-aaaaccttaagacaatgagtttatgggttcttttacttatatggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggga 41707601  T
Q  146 catataactcacacttgta 164  Q
    |||||||||||||||||||    
T  41707602 catataactcacacttgta 41707620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Original strand, 49076827 - 49076984
Alignment:
Q  4 caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctta 103  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  49076827 caggggacagtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagaaagacaccacactctaacccaaaaccttaaggttatgggtttatgggttctctta 49076926  T
Q  104 tttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
      ||||||||||| |||||||||| ||||| || || ||  ||||||||||||||||||    
T  49076927 -ctataaggtgttcaacctttactattttagccaatatggaacatataactcacacttg 49076984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 162
Target Start/End: Original strand, 3244448 - 3244605
Alignment:
Q  5 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 104  Q
    ||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||||  ||||||||   ||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||     
T  3244448 aggggactgcccacatcgaggctggaacaaccatacaagtgagagagacgacacattcttacccaaaactttaagacaatgagtttatgggtcctcttac 3244547  T
Q  105 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3244548 ttataagatgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttg 3244605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 54936353 - 54936188
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  54936353 ggggactgtccacatcgaggctagaacaaccacata-gtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 54936255  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacata 176  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |    ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  54936254 tacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtggg----ataactcacacttgtacacaacaacata 54936188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 45496934 - 45496820
Alignment:
Q  35 ccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  45496934 ccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacgattttat 45496835  T
Q  135 ccgatgtgagacata 149  Q
    |||||||| ||||||    
T  45496834 ccgatgtgggacata 45496820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 52885038 - 52884889
Alignment:
Q  16 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagaga--cacgacactcctaccc-aaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataagg 112  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||  ||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||    
T  52885038 cacatcgaggctagatcaaccacacaaataagagagagacaccacattcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataagg 52884939  T
Q  113 tgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52884938 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 52884889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 3341286 - 3341130
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||  |||| |||||  |||||| ||||||||| |||||  ||||||  |||||||| |||||| |    
T  3341286 ggggaccgtctacatcgaggttaaaataaccacataattaagaaagacatcacactcttacccaaaatcttaaaacaatgatgttatgggtcctcttact 3341187  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  3341186 tataaagtgtttaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttg 3341130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 110
Target Start/End: Original strand, 23817679 - 23817783
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |    
T  23817679 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgaatcctcttact 23817778  T
Q  106 tataa 110  Q
    |||||    
T  23817779 tataa 23817783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 20826370 - 20826223
Alignment:
Q  11 ccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataa 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||||  |||||| |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20826370 ccgtccacatcgaggctagaacaatcgcataaggaagagagacatcacactcttacctaaaatgttaaggctatgggtttatgggttctcttacttataa 20826271  T
Q  111 ggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 158  Q
     ||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20826270 cgtgttcaacttttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 20826223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Original strand, 45489331 - 45489497
Alignment:
Q  7 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 106  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||| |||| |||| |||||  || |  ||||| | ||||||||| ||    
T  45489331 gggaccatccacatcgaggctagaacaatcacactagcaaaagagacatcacactcttaccaaaaatcttaaa-cagtaggtttaagagttctcttactt 45489429  T
Q  107 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  45489430 atatggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataattcacacttgtacacaacaaca 45489497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 49880296 - 49880162
Alignment:
Q  27 tagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttac 126  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  49880296 tagaacaac-acataaacaagagagacaccacgctcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac 49880198  T
Q  127 tcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    | |||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  49880197 tattttattcaatgtgggacatataactcacacttg 49880162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 43827597 - 43827492
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  43827597 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatcc-aaaccttaaggcaatgaatttatgggtcctcttatt 43827499  T
Q  106 tataagg 112  Q
    |||||||    
T  43827498 tataagg 43827492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 54108694 - 54108540
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatg-agtttatgggttctcttat 104  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||     
T  54108694 ggggaccg-ccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttagccaaaaccttaaggcaatgaattttatgggtccttttac 54108596  T
Q  105 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| || || |||  ||||||||||||||    
T  54108595 ttataaggtgttcaacctttactattttatcctatatgggac--ataactcacacttg 54108540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Original strand, 4390102 - 4390255
Alignment:
Q  9 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 108  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||| |||||| | | | || | |||||| ||||    
T  4390102 gaccgtccgcatcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaacgcaatgtgctaaaggatcctcttacttat 4390201  T
Q  109 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||    
T  4390202 aaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggatatgtaactcacacttg 4390255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 158
Target Start/End: Original strand, 51768061 - 51768210
Alignment:
Q  9 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||    |||  |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  51768061 gaccgtccacatcgaggttagaacaatcccataagtaagagagacatcgtacttttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgagtcctcttatttat 51768160  T
Q  109 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 158  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||| |||| |  |||||||||||||||    
T  51768161 aaggtgttcaacatttactcttatattcgatataggacatataactcaca 51768210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 2740856 - 2740702
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||  ||  |||||||| | |||||| |||  |||||||||||||  || |||||| ||| |||||| |    
T  2740856 ggggaccatccatatcgaggctagaacaaccaca--agtgagagagacgccacactcttacgtaaaaccttaaggctctgggtttataggtcctcttact 2740759  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2740758 tataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 2740702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 43174666 - 43174496
Alignment:
Q  5 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 104  Q
    |||| |||||||||||| ||| || |||||||| | || |||||||||| | |||||| ||||||| || ||||||  ||  ||||||| || ||||||     
T  43174666 agggaaccgtccacatcaaggctacaacaaccatataaacaagagagacgccacactcttacccaacactttaaggtcataggtttatgtgtcctcttac 43174567  T
Q  105 ttataaggtgttaaacctttactc-ttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  43174566 ttataaggtgttcaacctttactctttttatctgatgtgtggcatataactcacacttgtacacaacaaca 43174496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Original strand, 34004586 - 34004737
Alignment:
Q  9 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 108  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||   |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  34004586 gaccgttcacatcgaggctagaacaaccgcacaagggagagagacggcacactcttatcgaaaaccttaagg-aatgagtttatgggtcctcttacttat 34004684  T
Q  109 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||| |||| |||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  34004685 aagttgttcaacctttagt-ttttatcatatgtgtgacatataactcacacttg 34004737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 162
Target Start/End: Original strand, 54741216 - 54741332
Alignment:
Q  46 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgaga 145  Q
    ||||||| || |||||| || ||||||||||||| ||||  || ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  54741216 agagagagactacactcttatccaaaaccttaagacaatctgtgtatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgaga 54741315  T
Q  146 catataactcacacttg 162  Q
    ||||||| |||||||||    
T  54741316 catataattcacacttg 54741332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 2741178 - 2741073
Alignment:
Q  57 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 156  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||    
T  2741178 acactcttacccaaaaccttaaggcaatggagttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactattctatctgatgtgggacatataactca 2741079  T
Q  157 cacttg 162  Q
    ||||||    
T  2741078 cacttg 2741073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 31691306 - 31691203
Alignment:
Q  12 cgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacg--acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 109  Q
    |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||| | |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  31691306 cgtccacatcgaggctagaacaatcgtacaagcaagagatagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttata 31691207  T
Q  110 aggt 113  Q
    ||||    
T  31691206 aggt 31691203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 3271947 - 3271802
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaa---gagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctt 102  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||   ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  3271947 ggggactgtccacatcgaggctagaacaaccacataataaacgagagagacac-acactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggttctctt 3271849  T
Q  103 attt---ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagac 146  Q
    | ||   |||||||||| ||| |||||| || |||| ||||||||||    
T  3271848 acttataataaggtgtttaacttttacttttctatctgatgtgagac 3271802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 32 - 162
Target Start/End: Original strand, 23556890 - 23557020
Alignment:
Q  32 caaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttt 131  Q
    |||||||||||| |||||||||   |||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||| |||||  ||| ||     
T  23556890 caaccacacaagtaagagagacgtcacactcttatccaaaactttaaggcaatgattttatggattctcttatttataaaatgttcaacctccacttttc 23556989  T
Q  132 tatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  23556990 tatccgatgtaaaacatttaactcacacttg 23557020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 158
Target Start/End: Original strand, 6975489 - 6975606
Alignment:
Q  41 aagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatg 140  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||  ||||  |||||| || |||||| ||||||| | || |||||||||| ||||||| ||||    
T  6975489 aagcaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaagataatggatttatgagtcctcttacttataagatattcaacctttactattttatcggatg 6975588  T
Q  141 tgagacatataactcaca 158  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6975589 tgagacatataactcaca 6975606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 49076449 - 49076602
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| | || |||| ||| ||||||  | ||  |||||||| | ||||| ||||| |||||| ||| |||||| |    
T  49076449 ggggaccgtccacatcgaggctataacaatcgcataagcgagacagacaccgccct--tacccaaa-ctttaagacaatgggtttataggtcctcttact 49076545  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  49076546 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatatggtacatataactcacacttg 49076602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 3700512 - 3700367
Alignment:
Q  9 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 108  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||   |||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||         || ||| ||||    
T  3700512 gaccgtccacatcgaggcttgaataaccacacaaatgagagagacatcatactcttatccaaaaccttaaggcaatgagtc--------cttttacttat 3700421  T
Q  109 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  3700420 aaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtaggacatataactcacacttg 3700367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 19504842 - 19504695
Alignment:
Q  18 catcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgtta 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||| ||||||||||   ||||||||| |||||         |||||     
T  19504842 catcgaggctagaacaaccacacaagcaagatagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaatagatttatgggtcctctt---------gtgttc 19504752  T
Q  118 aacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  19504751 aacttttactattttatccgatatgggacatataactcatacttgtacacaacaaca 19504695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 138
Target Start/End: Original strand, 48111696 - 48111828
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||   |  |||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||  |||||  || || ||| |    
T  48111696 ggggaccgtccacattgaggttagaaaaaccacatttgtgagagagacaccacactcatacctaaaaccttaaggtaatggatttataagtccttttact 48111795  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccga 138  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  48111796 tataatgtgttcaacctttactcttttatccga 48111828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 40067184 - 40067043
Alignment:
Q  24 ggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaac-ct 122  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||| | ||  | |||| || |||||| |||||| ||||| |||  |    
T  40067184 ggttagaacaaccacataagcaagagagacatcacacttttacccaaaatcttaaggtagtggatctatgtgtcctcttacttataatgtgttcaacttt 40067085  T
Q  123 ttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 164  Q
    |||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  40067084 ttacacttttatccgatgtagaacatataactcacacttgta 40067043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 18879962 - 18879854
Alignment:
Q  8 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 107  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| |||  ||||| |||    
T  18879962 ggaccgtccacatcgaagctagaacaaccacacaaccaaaagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggaaataggtttataggtcatcttactta 18879863  T
Q  108 taaggtgtt 116  Q
    |||||||||    
T  18879862 taaggtgtt 18879854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 28034347 - 28034231
Alignment:
Q  46 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgaga 145  Q
    |||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||  ||| || ||||||||| | ||    
T  28034347 agagagacgccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggttctctcacttataaagtgttcaacctccacttttctatccgatgcggga 28034248  T
Q  146 catataactcacacttg 162  Q
    ||||||| |||||||||    
T  28034247 catataattcacacttg 28034231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 10246436 - 10246349
Alignment:
Q  75 ttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  10246436 ttaaggctatgggtttatgggtcctctaacttataagatgttcaacctttactcttttatccgatttgagacatataacagacacttg 10246349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 57 - 151
Target Start/End: Original strand, 54017751 - 54017845
Alignment:
Q  57 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatata 151  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||| |  ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  54017751 acactcttacctaaaaccttaagacaatgggaatatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggatatata 54017845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 34544225 - 34544107
Alignment:
Q  46 agagagacacgacactcctacccaaaa-ccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgag 144  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||  ||| || ||| |||||||||    
T  34544225 agagagataccacactcttacccaaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcatttataaagtgatcaacctccacttttctattcgatgtgag 34544126  T
Q  145 --acatataactcacactt 161  Q
      | |||||||||||||||    
T  34544125 atatatataactcacactt 34544107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 44620363 - 44620285
Alignment:
Q  97 tctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacat 175  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||  |||||||||    
T  44620363 tctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcccatgtgggacatataactcatatttgtacacaacaacat 44620285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 44621493 - 44621428
Alignment:
Q  97 tctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  44621493 tctcttacttataaggtgtttaacctttactgttttatcccatgttggacatataactcacacttg 44621428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 760348 - 760194
Alignment:
Q  3 ccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctt 102  Q
    ||||||||||  ||||||| || | ||| |||||||||||   |||||||||| |||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||     
T  760348 ccaggggaccacccacatccag-taagagcaaccacacaaatgagagagacaccacacttttacc-aaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctctc 760251  T
Q  103 atttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacac 159  Q
    | |||||| ||  | |||||| | | || ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  760250 acttataaagttctcaaccttcatttttctattcgatgtgggacatataactcacac 760194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 27 - 150
Target Start/End: Original strand, 15841387 - 15841510
Alignment:
Q  27 tagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttac 126  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | |||| | ||| || ||||| |||||  ||    
T  15841387 tagagcaaccacacaagtgagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgaatcctctcacttacaaagtgttcaacctccac 15841486  T
Q  127 tcttttatccgatgtgagacatat 150  Q
    | || |||  ||||||||||||||    
T  15841487 ttttctatttgatgtgagacatat 15841510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 41370812 - 41370738
Alignment:
Q  10 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaat 84  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| |  |||| |||| |||||||||||    
T  41370812 accgtccacatcgaggttagaacaaccactcaagtaagagagacatcacatttttacctaaaatcttaaggcaat 41370738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 43174299 - 43174233
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaa 72  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||    
T  43174299 ggggaccgtccacatcaaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaa 43174233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 45050647 - 45050603
Alignment:
Q  118 aacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  45050647 aacctttactcttttatttgatgtgagacatataactcacacttg 45050603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 44621012 - 44620945
Alignment:
Q  97 tctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatg-tgagacatataactcacacttgt 163  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  44621012 tctcttacttataaggtgttcaacctttacagttttatccgatgttgggacatctaactcacacttgt 44620945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Original strand, 45489712 - 45489870
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatga-gtttatgggttctcttat 104  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||  |  | | ||||| || |  |||||     
T  45489712 ggggatcggccacatcgagactagaacaaccatgcaagcgagagagacaccacactattacccaaaaccttaa-actttaaggtttaaggatcatcttac 45489810  T
Q  105 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 164  Q
    ||||| | | || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  45489811 ttatatgatattcaatctttactcttttatccaatgtgatacatataactcacaattgta 45489870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 46 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 11197344 - 11197294
Alignment:
Q  46 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 96  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  11197344 agagagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggt 11197294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 23817448 - 23817498
Alignment:
Q  1 agccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagag 51  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  23817448 agcctgggaaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagag 23817498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 162
Target Start/End: Original strand, 50788087 - 50788137
Alignment:
Q  112 gtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  50788087 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataacttacacttg 50788137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 19895445 - 19895406
Alignment:
Q  15 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagaca 54  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  19895445 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagaca 19895406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 78
Target Start/End: Original strand, 39698944 - 39699014
Alignment:
Q  8 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaa 78  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||    
T  39698944 ggactgtccacatcgagactagaataaccgcacaagcaagagagatgctacactcttactcaaaaccttaa 39699014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 57 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 1868158 - 1868117
Alignment:
Q  57 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttc 98  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  1868158 acactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggttc 1868117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Original strand, 11702297 - 11702341
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagaga 50  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  11702297 ggggactgttcacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagaga 11702341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 92
Target Start/End: Original strand, 11706584 - 11706628
Alignment:
Q  48 agagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 92  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11706584 agagacgccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttat 11706628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 66)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 6421543 - 6421386
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |    
T  6421543 ggggaccgtccacatcgagactagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctcttact 6421444  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgt 163  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6421443 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgt 6421386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 36178605 - 36178761
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  36178605 ggggatcgtccacatagaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 36178704  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36178705 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 36178761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15880415 - 15880253
Alignment:
Q  12 cgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataag 111  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  15880415 cgtccacatcgaggctaaaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 15880316  T
Q  112 gtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15880315 gtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcacacttgtacacaacaaca 15880253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 37106082 - 37105926
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |    
T  37106082 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtccccttact 37105983  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  37105982 tataaggtgttcaacctttactattttattcgatgtgggacatataactcacacttg 37105926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 41283475 - 41283631
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  41283475 ggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacaaacaagagagacgccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttact 41283574  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  41283575 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatatgggacatataactcacacttg 41283631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 37106344 - 37106190
Alignment:
Q  8 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||    
T  37106344 ggaccgtccacatcgaggctagaacaatcgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaatgggtttatgggtcctcttactta 37106245  T
Q  108 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37106244 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 37106190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 14745667 - 14745823
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  14745667 ggggactgtccacatcgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 14745766  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14745767 tataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttg 14745823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 962753 - 962600
Alignment:
Q  9 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| | ||||    
T  962753 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagtgacaacacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctctcacttat 962654  T
Q  109 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  962653 aaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 962600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 157
Target Start/End: Original strand, 15511495 - 15511646
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||| |    
T  15511495 ggggatcgtccacatcgagactagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcctcttact 15511594  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 157  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15511595 tataacgtgttcaacctttactcttttatccgttgtgtgacatataactcac 15511646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6713135 - 6712966
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaa-ccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||     
T  6713135 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaaccttaaagcaataggtttatgggtcctcttac 6713036  T
Q  105 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6713035 ttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtatacaacaaca 6712966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Original strand, 36005887 - 36006047
Alignment:
Q  13 gtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataagg 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  36005887 gtccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacgccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagg 36005986  T
Q  113 tgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    |||| ||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  36005987 tgttcaacttttact-ttctattcgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 36006047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 5542625 - 5542781
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |    
T  5542625 ggggaccgtccacatcgagacttgaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctcttact 5542724  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  5542725 tataaggtgttcaacctttactattttattcgatatgggacatataactcacacttg 5542781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 162
Target Start/End: Original strand, 5543002 - 5543154
Alignment:
Q  10 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 109  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||| | |||||| |||||    
T  5543002 accgtccacatcgaggcttgaacaaccgcacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatggatcctcttacttata 5543101  T
Q  110 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  5543102 aggtgttcaacctttactattttatcggatgtgggacatataactcacacttg 5543154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 142
Target Start/End: Original strand, 36178171 - 36178307
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  36178171 ggggaccgtctacatcgaggctataacaaccacacaagcaagagaggcaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggttcccttact 36178270  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtg 142  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  36178271 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg 36178307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 42514807 - 42514651
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| |    
T  42514807 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcgatgggtttatgggtcctcttact 42514708  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  42514707 tataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtaggacatataactcacacttg 42514651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 33731804 - 33731653
Alignment:
Q  8 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 107  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||| |||    
T  33731804 ggaccgtttacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatggatcctcttactta 33731705  T
Q  108 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacac 159  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33731704 taaggtgctcaacctttactcttttatccgatgtgagatatataactcacac 33731653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 6422268 - 6422126
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |    
T  6422268 ggggacagtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttaat 6422169  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacat 148  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  6422168 tataatgtgttcaacctttacttttttatctgatgtgggacat 6422126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 35580724 - 35580879
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| | |    
T  35580724 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaaacaagagagacgccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat-ggtcctctcact 35580822  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35580823 tataaggtgttcaacatttattgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 35580879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 29676687 - 29676543
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||      ||||||||||||||||||||||| | |    
T  29676687 ggggaccgtccacatcgaggtttgaataaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa------ggcaatgagtttatgggttctctcact 29676594  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 156  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29676593 tataatgtgttcaatctttactcttttatccaatgtgagacatataactca 29676543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 158
Target Start/End: Original strand, 40679632 - 40679781
Alignment:
Q  9 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 108  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  40679632 gaccgtccacatcgagactagaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcgatgggtttatgggttctcttacttat 40679731  T
Q  109 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 158  Q
    |||||||| |||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||    
T  40679732 aaggtgttcaacccttacttttctatccgatatgggacatataactcaca 40679781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 1770040 - 1769894
Alignment:
Q  16 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgt 115  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||  |||| | | || || ||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  1770040 cacatcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttattcaaagcttcaaagctatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgt 1769941  T
Q  116 taaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1769940 tcaacttttactcttttatccgatgtgtgacatataactcacacttg 1769894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 7598388 - 7598230
Alignment:
Q  4 caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctta 103  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||  |||||||||| | | || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7598388 caggggaccgttcacatcgaggcttgaacaaccgcacaagtgagagagacaccatattcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcctctta 7598289  T
Q  104 tttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||   |||||||| |||||||||    
T  7598288 tttataaggtgttgaacctttacttttctattcgatgtagaacatataattcacacttg 7598230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 160
Target Start/End: Original strand, 28254260 - 28254391
Alignment:
Q  27 tagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttac 126  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  28254260 tagaacaaccccacaag--agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttac 28254357  T
Q  127 tcttttatccgatgtgagacatataactcacact 160  Q
    | || ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  28254358 ttttctatccgatgtgggacatataagtcacact 28254391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 162
Target Start/End: Original strand, 38796619 - 38796776
Alignment:
Q  7 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgaca--ctcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 104  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| | |||  ||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||     
T  38796619 gggaccgtcgacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaatagagacgccacatactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggtcctcttac 38796718  T
Q  105 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  38796719 ttataaggtgttcaacctttattgttttatcagatgtgggacatataactcacacttg 38796776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 40734040 - 40733883
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||  | || ||||| |  |||||| |    
T  40734040 ggggaccgtccacatcgagacttgaacaaccacacaagcgagacagacaccacactcttacccaaaactttaaggctgt-aggttatgagccctcttact 40733942  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40733941 tataaggtgttaaatctttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgta 40733883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 23346391 - 23346250
Alignment:
Q  9 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 108  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||  |||||| ||||    
T  23346391 gaccgtccacatctaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacatcacactcttaccgaaaaccttaaggctatgggtttatgggccctctta-ttat 23346293  T
Q  109 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatata 151  Q
    |||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  23346292 aaggtgtttaacctttacttttctatacgatgtgagacatata 23346250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 40733675 - 40733517
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||| |||||||||||  | |||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||   |  |||||||||| |||||| |    
T  40733675 ggggaccatccacatcgagacttgaactaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggttgtaggtttatgggtcctcttact 40733576  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 164  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  40733575 tataaggtgttcaacatttacttttttatctgatgtgggacatataactcacacttgta 40733517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 29677065 - 29676908
Alignment:
Q  7 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtt-----ctct 101  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||| |||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||||||||      ||||    
T  29677065 gggaccatccacatcgaggttggaacaaccccacaattaagagagacaccacactcttacttaaagccttaaggcaatgggtttatgggtcttctcctct 29676966  T
Q  102 tatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacac 159  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29676965 cacctataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacac 29676908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 37632593 - 37632753
Alignment:
Q  1 agccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||  | |||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||| |||    
T  37632593 agccagggg-ccgtccacatcgaggctagaacaatcacacttgtaagagatacaccacactcttacccaaaaccttaaagttatgggtttatgggtcctc 37632691  T
Q  101 ttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||| ||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  37632692 ttacttataaaatgtcaaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttg 37632753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 162
Target Start/End: Original strand, 28531316 - 28531470
Alignment:
Q  8 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 107  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||  || ||   |||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  28531316 ggaccatccacatcgaggctagagcaactgcataactgagagagtcaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggacctcttactta 28531415  T
Q  108 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||| ||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28531416 taaggtgttcaacctttgcttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 28531470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 153
Target Start/End: Original strand, 40163370 - 40163520
Alignment:
Q  4 caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaacctt-aaggcaatgagtttatgggttctctt 102  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||| || |  ||| ||||||  ||||    
T  40163370 caggagaccatctacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaagacactaggttaatgggtcatctt 40163469  T
Q  103 atttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataac 153  Q
    | |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  40163470 acttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataac 40163520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 158
Target Start/End: Original strand, 14745300 - 14745446
Alignment:
Q  13 gtccacatcgaggttagaacaaccac-acaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataag 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||   |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||| |||    
T  14745300 gtccacatcgaggctagaacaaccaccacttacaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcatacttacaag 14745399  T
Q  112 gtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 158  Q
     |||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14745400 atgttcaaccattactattttattcgatgtgggacatataactcaca 14745446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 57 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 16542556 - 16542451
Alignment:
Q  57 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 156  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16542556 acactcttactcaaaatcttaaggcaatgagtttataagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacttataactca 16542457  T
Q  157 cacttg 162  Q
    ||||||    
T  16542456 cacttg 16542451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 5367599 - 5367455
Alignment:
Q  20 tcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaa 119  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||| |  ||||| |||||||||||| ||    
T  5367599 tcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggttatgtgttcatggatcatcttacttataaggtgttcaa 5367500  T
Q  120 cctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 164  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||    
T  5367499 cctttgctcttttatccgatctgggacatatatatcacacttgta 5367455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 179
Target Start/End: Original strand, 12529038 - 12529201
Alignment:
Q  16 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgt 115  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  || || | ||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||    
T  12529038 cacattgaggttagaacaaccgcacaaacaagagagacactacgttcttatctaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttatacggtgt 12529137  T
Q  116 taaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacatattt 179  Q
    | || ||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||    
T  12529138 tcaatctttactgttttatttgatgtaggacatataactcacacttgcatacaacaacgtattt 12529201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 7598754 - 7598611
Alignment:
Q  11 ccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataa 110  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||        |||||||| |||||| ||||||    
T  7598754 ccgtccacatcgatgcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttaccaaaaacgttaagg--------ttatgggtcctcttacttataa 7598663  T
Q  111 ggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  7598662 ggtgttcaacctttacttttttatctgatgtgggacatataactcacacttg 7598611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 6421889 - 6421793
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctt 102  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  6421889 ggggaccgtccacatcgaggccagaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctctt 6421793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 57 - 162
Target Start/End: Original strand, 31468801 - 31468902
Alignment:
Q  57 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 156  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    ||| | || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  31468801 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttat----aagatattcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 31468896  T
Q  157 cacttg 162  Q
    ||||||    
T  31468897 cacttg 31468902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 161
Target Start/End: Original strand, 31899496 - 31899581
Alignment:
Q  76 taaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 161  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31899496 taaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacactt 31899581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 162
Target Start/End: Original strand, 36178320 - 36178425
Alignment:
Q  57 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 156  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| || | |||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  36178320 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtccccttacttataaggtgttccacctttactattttatccgaagtgggacatataactca 36178419  T
Q  157 cacttg 162  Q
    ||||||    
T  36178420 cacttg 36178425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 3673226 - 3673122
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||  |||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||| |    
T  3673226 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtaagagagacatcacactcttagccaaaatcttaaagcaatgagtttatggatcctcttact 3673127  T
Q  106 tataa 110  Q
    |||||    
T  3673126 tataa 3673122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 32 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 30313309 - 30313180
Alignment:
Q  32 caaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttt 131  Q
    ||||||||||||  |||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||| ||||| |||||  ||| ||     
T  30313309 caaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttttgggtcctctcacttataa-gtgttcaacctccacttttc 30313211  T
Q  132 tatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  30313210 tatccgatgtgagacatataacacacgcttg 30313180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 161
Target Start/End: Original strand, 31259658 - 31259774
Alignment:
Q  48 agagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatcc---gatgtgag 144  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||||  ||  ||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||    
T  31259658 agagataccacactcttacccaaaaccttaaggtgataggtttatgggtcatcttacttataaggtgttgaacctttactcttttatccgatgatgtgag 31259757  T
Q  145 acatataactcacactt 161  Q
    ||||||||||| |||||    
T  31259758 acatataactcgcactt 31259774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 3672865 - 3672773
Alignment:
Q  1 agccagggga-ccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 92  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  3672865 agccaggggaaccgtccacatcgagactagaacaaccacacaattaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttat 3672773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 9231407 - 9231252
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||| || |||  ||||||| || |||||| || ||||||| |||||||  || ||| |||| | ||||||||    
T  9231407 ggggatcgtccacatcaaggttagaataaccgcataagttagagagatactacactcttaaccaaaactttaaggcggtgggttgatggatcctcttatt 9231308  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 161  Q
    |||||  |||| |||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  9231307 tataatatgttcaacctttacttttctatctgatatgagacatataactcatactt 9231252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 162
Target Start/End: Original strand, 33561502 - 33561607
Alignment:
Q  57 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 156  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||| ||||| |||||  ||| || |||| ||||||  ||||||||||||    
T  33561502 acactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccacttttctatctgatgtggaacatataactca 33561601  T
Q  157 cacttg 162  Q
    ||||||    
T  33561602 cacttg 33561607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 156
Target Start/End: Original strand, 37895107 - 37895211
Alignment:
Q  52 acacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatata 151  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| || |||||| || ||| |||| | || ||||||||||| ||||||||    
T  37895107 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgtgttcttttacttttaaggttttcaacttttatttttctatccgatgtgggacatata 37895206  T
Q  152 actca 156  Q
    |||||    
T  37895207 actca 37895211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 162
Target Start/End: Original strand, 38796299 - 38796374
Alignment:
Q  87 gtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38796299 gtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 38796374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 6421780 - 6421688
Alignment:
Q  10 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctt 102  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||  |||||||||| |||||    
T  6421780 accgtccacatcgaggccggaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaacctttagtcaataggtttatgggtcctctt 6421688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 16591034 - 16590890
Alignment:
Q  13 gtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataagg 112  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||  | | || |||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||          
T  16591034 gtccacattgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacattagattcttacttaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttactt------ 16590941  T
Q  113 tgttaaacctttac-tcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||| ||||||||| | ||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  16590940 tgttcaacctttactttttttatttgatgtgggacatataactcacacttg 16590890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 164
Target Start/End: Original strand, 29874074 - 29874181
Alignment:
Q  57 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 156  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  | |||||| ||||| |||||  ||| || |||| |||||| |||||||||| ||    
T  29874074 acactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcccaattataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacatataacaca 29874173  T
Q  157 cacttgta 164  Q
    ||||||||    
T  29874174 cacttgta 29874181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 162
Target Start/End: Original strand, 36785664 - 36785719
Alignment:
Q  107 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36785664 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 36785719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 148
Target Start/End: Original strand, 28254165 - 28254254
Alignment:
Q  59 actcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacat 148  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||| | ||||||| || |||||| |||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  28254165 actcttaccctaaactttaaggcaaagtgtttatgagtcctcttacttataaagtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacat 28254254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6421350 - 6421294
Alignment:
Q  118 aacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  6421350 aacctttactcttttatccgatgtgggacatataacttacacttgtacacaacaaca 6421294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 74
Target Start/End: Original strand, 31899102 - 31899170
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaacc 74  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||    
T  31899102 ggggaccgttcacatcgaggttagaagaaccccacaagcaagagagatacctcactcttacccaaaacc 31899170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 111
Target Start/End: Original strand, 36784273 - 36784365
Alignment:
Q  19 atcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataag 111  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||| |||||||    
T  36784273 atcgaggcttgaataaccacacaagcaagagagacacaacacttttatccaaaaccttaagacaaagggtttatgggtcatcttacttataag 36784365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 47 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 30323581 - 30323466
Alignment:
Q  47 gagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagac 146  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | || ||| ||||| |||||  | | || |||| ||| || |||    
T  30323581 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttataggtcctctcacttctaaagtgttcaacctccaattttctatctgatttgggac 30323482  T
Q  147 atataactcacacttg 162  Q
    ||||||| ||||||||    
T  30323481 atataacacacacttg 30323466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 31385868 - 31385739
Alignment:
Q  33 aaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactctttt 132  Q
    |||||||||||  | |||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||| || | | |||||||||| | |||||  | | || |    
T  31385868 aaccacacaagtgaaagagacaccacacttattcccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctttcacttataaggtgctcaacctccatttttct 31385769  T
Q  133 atccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    | ||||||| |||| | |||||||||||||    
T  31385768 aaccgatgtcagacttctaactcacacttg 31385739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 32 - 162
Target Start/End: Original strand, 29873563 - 29873693
Alignment:
Q  32 caaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttt 131  Q
    ||||||||||||  ||||||||   |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||||  |||| |||||  ||| ||     
T  29873563 caaccacacaagtgagagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcccacttataaaatgttcaacctccacttttc 29873662  T
Q  132 tatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||| |||||| ||||| |||| ||| ||||    
T  29873663 tatctgatgtgggacatgtaacacacccttg 29873693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 161
Target Start/End: Original strand, 3594180 - 3594333
Alignment:
Q  8 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 107  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||| || | |||||| |  |||||| ||| ||||| ||||| |||||| |||||||| | || | | |||    
T  3594180 ggaccgttcacatcgaggttagaataaacacactagtatgagagatatcacactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctatcactta 3594279  T
Q  108 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 161  Q
    ||| |||||  ||||  ||| || ||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  3594280 taaagtgttcgacctccacttttctattcgttgtgaaacatacaactcacactt 3594333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 96
Target Start/End: Original strand, 35580443 - 35580530
Alignment:
Q  10 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcc--tacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 96  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| | | | ||||||| | ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580443 accgtccacatcgaggctaaaacaatcacataggga-gagagacgccacactctcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 35580530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 158
Target Start/End: Original strand, 37894732 - 37894844
Alignment:
Q  46 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgaga 145  Q
    ||||| |||| |||||  || |||||| ||||||||||||  |||||| ||  ||||| ||||||||| || | |||||||| || ||| | ||||| ||    
T  37894732 agagacacaccacacttttaaccaaaatcttaaggcaatggatttatgagtcttcttacttataaggtttttagcctttacttttctattcaatgtggga 37894831  T
Q  146 catataactcaca 158  Q
    |||||||||||||    
T  37894832 catataactcaca 37894844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 162
Target Start/End: Original strand, 41678419 - 41678525
Alignment:
Q  57 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagac--atataact 154  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||| | |||||| ||||| |||||   || || |||| ||||||||||  ||||||||    
T  41678419 acactcttactcaaaaccttaaggcaaag-gtttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccccttttctatctgatgtgagacatatataact 41678517  T
Q  155 cacacttg 162  Q
    ||||||||    
T  41678518 cacacttg 41678525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 34481372 - 34481265
Alignment:
Q  58 cactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 157  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| | |||| | ||||||||  | || |||||  ||| || ||||||| |||||| ||||||||||     
T  34481372 cactcttacccaaaaccttaaagcaataaatttatagattctatcatttataaaatattcaacctccacttttatatccgacgtgagaaatataactcat 34481273  T
Q  158 acttgtaa 165  Q
    ||||||||    
T  34481272 acttgtaa 34481265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 109
Target Start/End: Original strand, 13091833 - 13091874
Alignment:
Q  68 caaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 109  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  13091833 caaaaccttaagacattgagtttatgggttctctcatttata 13091874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 42515075 - 42515031
Alignment:
Q  105 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacata 149  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  42515075 ttataaggtgtttaacctttacttttctatccgatgtgggacata 42515031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 29518661 - 29518505
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |    
T  29518661 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttact 29518562  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29518561 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 29518505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 29519078 - 29518922
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |    
T  29519078 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttact 29518979  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29518978 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 29518922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 32741337 - 32741181
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |    
T  32741337 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttact 32741238  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32741237 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 32741181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 35210367 - 35210206
Alignment:
Q  1 agccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  35210367 agccaggggaccgtccacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaaaagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggttttatgggtcctc 35210268  T
Q  101 ttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35210267 ttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 35210206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 14748342 - 14748494
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14748342 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagaga----ccacactcttacccaaaaccttaacgcaatgagtttatgggtcctcttatt 14748437  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14748438 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 14748494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 3409407 - 3409261
Alignment:
Q  16 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgt 115  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  3409407 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgt 3409308  T
Q  116 taaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    | |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  3409307 tcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 3409261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 2377912 - 2377755
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  2377912 ggggaccttccacatcgaggctagaaaaaccactcaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 2377813  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgt 163  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2377812 tataaggtgttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacatataactcacacttgt 2377755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 2378284 - 2378128
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |    
T  2378284 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttact 2378185  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2378184 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 2378128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Original strand, 2578443 - 2578610
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |    
T  2578443 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttact 2578542  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  2578543 tataaagtgttcaacctttactcttttatccg-tgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 2578610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16107827 - 16107668
Alignment:
Q  15 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg 114  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||    
T  16107827 ccacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtg 16107728  T
Q  115 ttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16107727 tttaacctttacttttttatccgatgtgacacatataactcacacttgtacacaacaaca 16107668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 1846906 - 1846750
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |    
T  1846906 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtgctcttact 1846807  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  1846806 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatagaattcacacttg 1846750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 2579872 - 2580028
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||| |    
T  2579872 ggggaccttccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggctgtgggtttatgggtcctcttact 2579971  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2579972 tataatgtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 2580028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16455065 - 16454897
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||| |    
T  16455065 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctattact 16454966  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||    
T  16454965 tataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggacacataactcacatttgtacacaacaaca 16454897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16454733 - 16454562
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  16454733 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 16454634  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacatat 177  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16454633 tataaggtgttcaacttttattcttttatctgatgtgggacacataactcacacttgtacacaacaacatat 16454562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 2843713 - 2843555
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat-gggttctcttat 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  2843713 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggggtcctcttac 2843614  T
Q  105 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgt 163  Q
    |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  2843613 ttataaggtgttcaacttttattattttatccgatgtgaaacatataactcacaattgt 2843555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 2578835 - 2578990
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  2578835 ggggaccgtccacatcgaggtcagaacaaccacacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgagtttatggatcctcttatt 2578934  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||| || ||| |||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  2578935 tataaggtattcaacatttact-ttttatccgatgagggacatataaatcacacttg 2578990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 3058384 - 3058228
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || |    
T  3058384 ggggacggtccacatcgaggttagaaccaccctacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcatact 3058285  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3058284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactaacacttg 3058228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 162
Target Start/End: Original strand, 10074371 - 10074519
Alignment:
Q  14 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 113  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10074371 tccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggt 10074470  T
Q  114 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||| |||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  10074471 gttcaacctttacttttctatccgatgtgggacctctaactcacacttg 10074519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 159
Target Start/End: Original strand, 2579500 - 2579645
Alignment:
Q  14 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  2579500 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccatacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggccctcttacttataaggt 2579599  T
Q  114 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacac 159  Q
     |   ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2579600 atccgacctttacttttttgtccgatgtgggacatataactcacac 2579645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 3409818 - 3409662
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  3409818 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaaataaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 3409719  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||| |||| ||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  3409718 tataagatgttcaacttttactattttatctgatgtggtacatataactcacacttg 3409662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 3415618 - 3415462
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttaga--acaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctta 103  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3415618 ggggaccttccacatcgaggctagagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 3415519  T
Q  104 tttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacact 160  Q
     ||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  3415518 cttatatggtgttcaacctttactattttatgtgatgtgggacatataactcacact 3415462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 162
Target Start/End: Original strand, 10073990 - 10074147
Alignment:
Q  5 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 104  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||     
T  10073990 aggggaccgtccacgtcgaggctagaacaaccaaataagcgagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 10074089  T
Q  105 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  10074090 ttataaggtgttcaacgtttacttttctatccgatgtgggatatataactcacccttg 10074147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 5832022 - 5832183
Alignment:
Q  1 agccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctc 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||   ||  ||||||||| |||    
T  5832022 agcctggggaccgtctacatcgaggctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacacttttacccaaaatcttaagggg-tggctttatgggtcctc 5832120  T
Q  101 ttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgt 163  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5832121 ttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataacttacacttgt 5832183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 178
Target Start/End: Original strand, 6999799 - 6999968
Alignment:
Q  9 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 108  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||  |||    
T  6999799 gaccgtccacatcgagactagaacaaccacattagcaagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcagtgagtttatggatcctcttacatat 6999898  T
Q  109 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacatatt 178  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||    
T  6999899 aaggtgttcaacttttacttttttatccgatgtaggacatataactcacacttatacacaataacatatt 6999968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 1127518 - 1127366
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||| |    
T  1127518 ggggaccacccacatcgaggttagagcaaccacataagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttact 1127419  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 158  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  1127418 tataaggtgttcaacctttactattttacccgatgtgggatatataactcaca 1127366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 162
Target Start/End: Original strand, 10073618 - 10073770
Alignment:
Q  8 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 107  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||| |||    
T  10073618 ggaccgtccacatcgatgctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagccaatgagtttatggatcctcttactta 10073717  T
Q  108 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10073718 taaggtgttcaaccttta--cttttctccgatgtgggacatataactaacacttg 10073770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 26544197 - 26544051
Alignment:
Q  16 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgt 115  Q
    ||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||  || |||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  26544197 cacattgaggctagaacaatcgcacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaaccttaaggcggtgggtttatgggtcctcttacttataacgtgt 26544098  T
Q  116 taaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26544097 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 26544051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 158
Target Start/End: Original strand, 5958613 - 5958755
Alignment:
Q  12 cgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataag 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||  ||||||   |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5958613 cgtccacatcgaggttagaacaatcacacaag----agagacatcacactctatcccaaaactttaagacaatgagtttatgagttctcttatttataag 5958708  T
Q  112 gtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 158  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  5958709 gtgttcaacctttactgttttatccgatgtaacacatataactcaca 5958755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Original strand, 2579109 - 2579273
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||| |||||| |  ||| |||||||| | |||    |    
T  2579109 ggggaccgtgcacatcgaggctagaacaaccacacgagcaagagagacaccacactcttagccaaagccttaaagttatgggtttatggttcctc----t 2579204  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  2579205 tataaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgggacatataactaacacttgtacacaacaaca 2579273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16108208 - 16108053
Alignment:
Q  7 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||            ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  16108208 gggaccgtccacatcgaggttataacaaccccacaagcaagagagacaccacac------------ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 16108121  T
Q  107 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16108120 ataaggtgttcaacatttactcttttatctgatgtggaacatataactcacacttgtacacaacaaca 16108053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 174
Target Start/End: Original strand, 1950200 - 1950353
Alignment:
Q  21 cgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaac 120  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||   |||||| ||| ||||||||||||||| |   ||||||| | |||||| || ||||||||| |||    
T  1950200 cgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcattagatttatggctcctcttacttgtaaggtgttcaac 1950299  T
Q  121 ctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  1950300 ctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttatacgcaacaaca 1950353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 593707 - 593865
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagaca--cgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctta 103  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||  ||||| |||||||| |  | |||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||    
T  593707 ggggaccgtcaacatcgagcctagaacaaccgtacaagtaagagagagataccacactattacccaaaaccttaaggcagtcggtttatgagtcctctta 593806  T
Q  104 tttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  593807 cttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatacaactcacacttg 593865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 57 - 159
Target Start/End: Original strand, 32460631 - 32460733
Alignment:
Q  57 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 156  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  32460631 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatacgatgtgggacatataactca 32460730  T
Q  157 cac 159  Q
    |||    
T  32460731 cac 32460733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 10911720 - 10911567
Alignment:
Q  10 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 109  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||  || ||||||||||  |||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  10911720 accgtccacatcgaggcttgaacaacaacattagtaagagagacatcacactcttattcaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttata 10911621  T
Q  110 aggtgttaaacctttac-tcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  10911620 aggtgttcaacctttactttttttatctgatgtaggacatataactcacacttg 10911567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 158
Target Start/End: Original strand, 9062383 - 9062501
Alignment:
Q  39 acaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccga 138  Q
    ||||| |||||||| || |||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  9062383 acaagtaagagagataccacacttttacccaaaac-ttaagacaatgagtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccga 9062481  T
Q  139 tgtgagacatataactcaca 158  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  9062482 tgtgggacatataactcaca 9062501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 8482045 - 8481929
Alignment:
Q  45 aagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgag 144  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| ||||| |||||  ||| || |||| |||||| |    
T  8482045 aagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgagtcatctcatttataaagtgttcaacctccacttttatatctgatgtg-g 8481947  T
Q  145 acatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||||||||||    
T  8481946 acatataactcacacttg 8481929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 162
Target Start/End: Original strand, 12071690 - 12071847
Alignment:
Q  5 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 104  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||||  ||  ||||||| || || |       
T  12071690 aggggaccgttcacatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtcataggtttatgagtcctttcta 12071789  T
Q  105 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||| ||||| || ||  | | || |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  12071790 ttataaagtgttcaaactccatttttctatctgatgcgagacatataactcacacttg 12071847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 6071264 - 6071134
Alignment:
Q  32 caaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttt 131  Q
    |||||| |||||| |||||||| | |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |  ||| | |||||| ||||| |||||  ||| ||     
T  6071264 caaccatacaagcgagagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcatctcacttataaagtgttcaacctccacttttc 6071165  T
Q  132 tatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  6071164 tattcaatgtgggacatataactcacacttg 6071134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 162
Target Start/End: Original strand, 12092481 - 12092638
Alignment:
Q  5 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 104  Q
    ||||||||  ||||||| |||  ||| ||||| ||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |     
T  12092481 aggggaccacccacatccaggccagagcaacctcacaagtgagagagacaccacagtcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatggatcctctcac 12092580  T
Q  105 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||| ||| | |||||  ||| || ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||    
T  12092581 ttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgggacatctaacacacccttg 12092638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Original strand, 17135069 - 17135223
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||| | |||| |   |||||| || ||||||| ||    |||||||||||||  | |||||  |    
T  17135069 ggggaccgtccacatcaaggccggaacaaccgcacaagcgaaagagccgtcacactcttatccaaaactttctaacaatgagtttatgaatcctcttgct 17135168  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacact 160  Q
    |||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17135169 tataaggtattaaacatttacttctctatccgatgtgagacatataactcacact 17135223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 81
Target Start/End: Original strand, 12085037 - 12085109
Alignment:
Q  9 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggc 81  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  12085037 gaccgttcgcatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggc 12085109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 31714823 - 31714732
Alignment:
Q  9 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctct 101  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | | || | |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  31714823 gaccgtccacatcgaggctagagcaaccacacaagcgaaaaa-acgccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgagttaatgggtcctct 31714732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 3409452 - 3409405
Alignment:
Q  13 gtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacac 60  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  3409452 gtccacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagagacaccacac 3409405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 97
Target Start/End: Original strand, 22605313 - 22605346
Alignment:
Q  64 tacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtt 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22605313 tacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtt 22605346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 62)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Original strand, 26661522 - 26661690
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |    
T  26661522 ggggaccgtccatatcgaggcttgaacaaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcact 26661621  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26661622 tataaggtgttcaacctttactcttttacccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 26661690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 44290824 - 44290981
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcct-acccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||     
T  44290824 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagatacaccacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 44290923  T
Q  105 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44290924 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 44290981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 41157149 - 41156993
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  41157149 ggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatgggtcctcttact 41157050  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||    
T  41157049 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgttatgggacatataattcacacttg 41156993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 41142531 - 41142374
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcct-acccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||     
T  41142531 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactctttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttac 41142432  T
Q  105 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41142431 ttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 41142374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 34649596 - 34649428
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||   | |    
T  34649596 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacgcctcactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggttcttgcact 34649497  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  34649496 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtatacaacaaca 34649428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 44290458 - 44290614
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  44290458 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagcaagaaagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 44290557  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44290558 tataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 44290614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 41157532 - 41157377
Alignment:
Q  7 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 106  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  41157532 gggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagacagacaccacactcttactcaaaacctaaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 41157433  T
Q  107 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  41157432 ataaggtgttcaacttttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttg 41157377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 3537594 - 3537752
Alignment:
Q  1 agccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||    
T  3537594 agccaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttataggtcctc 3537693  T
Q  101 ttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacac 159  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3537694 ttactcataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactaacac 3537752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 17294733 - 17294577
Alignment:
Q  9 gaccgtccacatcgaggttagaacaacca-cacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 107  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||  || |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  17294733 gaccgtccacatcgaggctagagcaacctgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 17294634  T
Q  108 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 164  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17294633 taaagtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgta 17294577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 41759641 - 41759485
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |  ||||| |    
T  41759641 ggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatggatcatcttact 41759542  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41759541 tataaggtgttcaacttttactattttatccgatgtgtgacatataactcacacttg 41759485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 5319965 - 5320121
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |    
T  5319965 ggggaccgtctacattgaggctagaacaaccacataagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcctctcact 5320064  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  5320065 tataaggtgttcaacttttacttttctatccgatgtggaacatataactcacacttg 5320121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 34365085 - 34364927
Alignment:
Q  4 caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctta 103  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||  || |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  34365085 cagggaaccatccacatcgaggttagagcaactgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctctta 34364986  T
Q  104 tttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
     |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34364985 cttataaggtgttcaacctttattattttatccgatgtgtgacatataactcacacttg 34364927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Original strand, 48588491 - 48588644
Alignment:
Q  9 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||| ||||    
T  48588491 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttacgggtcttcttacttat 48588590  T
Q  109 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  48588591 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtcggacatagaactcacacttg 48588644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 29798357 - 29798201
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||| ||||||| || |||||| |    
T  29798357 ggggaccgtctatatcgaggttagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttatccaagaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttact 29798258  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  29798257 tataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtaggacatataactcacacttg 29798201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 37556260 - 37556101
Alignment:
Q  15 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg 114  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||| ||||||| ||    
T  37556260 ccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttat-ggtcctcttacttataagatg 37556162  T
Q  115 ttaaacctttact-cttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  37556161 ttcaacctttactatttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 37556101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 172
Target Start/End: Original strand, 38804370 - 38804521
Alignment:
Q  21 cgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaac 120  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||| | |||||| |||||| ||||| |||    
T  38804370 cgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggttatgggtttatggatcctcttacttataatgtgttcaac 38804469  T
Q  121 ctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaa 172  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  38804470 ctttactcttttattcgatgtgggacgtataactcacacttgtaaacaacaa 38804521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 11977438 - 11977280
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||||| |    
T  11977438 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacttgcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgagtgctcttact 11977339  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 164  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11977338 tataaggtgttcaacatttactgttttacccgatgtgggacatataactcacacttgta 11977280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 175
Target Start/End: Original strand, 26661921 - 26662067
Alignment:
Q  29 gaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  26661921 gaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatgggtcttctcacttataaggtgttcaacctttactc 26662020  T
Q  129 ttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacat 175  Q
    ||||||| ||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26662021 ttttatctgatatgggatatataactcacacttgtacacaacaacat 26662067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 34364667 - 34364509
Alignment:
Q  4 caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctta 103  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||    
T  34364667 cagggaaccatccacatcgaggctagagcaaccgcataagcgagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttacggatcctctta 34364568  T
Q  104 tttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
     |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34364567 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 34364509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 22077495 - 22077651
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||| ||||| | | |||||||| || |||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |    
T  22077495 ggggaccgtccatatcgatgcttgaacaaccgcataagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggctacgagtttatgggtcctcttact 22077594  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077595 tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttg 22077651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 31767161 - 31767317
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||   |||||| ||||||||||||||||||| |  ||| |||||| |||||| |    
T  31767161 ggggaccgtccacatcgagtctagaacaaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcattaggttaatgggtcctcttact 31767260  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  31767261 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtggaacatataacccacacttg 31767317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 40082556 - 40082409
Alignment:
Q  14 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 113  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||| |||||||||    
T  40082556 tccacatcgaggctagaacaaacgcacaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttat-gatcctcttacttataaggt 40082458  T
Q  114 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  40082457 gttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttg 40082409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 161
Target Start/End: Original strand, 50052024 - 50052178
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  |||  |||||||||| |||||| |    
T  50052024 ggggactgtccacatcgaggttagaacaac-acataaacaagagagacaccacactcttacccaaaactttaagaaaataggtttatgggtcctcttact 50052122  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 161  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50052123 tataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 50052178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 3550871 - 3550722
Alignment:
Q  10 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |   ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||| |||||    
T  3550871 accgtccacatcgaggctagaacaaccgta---gcaagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttata 3550775  T
Q  110 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  3550774 aggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 3550722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 162
Target Start/End: Original strand, 24600321 - 24600470
Alignment:
Q  13 gtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataagg 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||      
T  24600321 gtccacatcgaggctagaacaaccatactagcgagagagacaccacactcttacacaaaaccttaagacaatgagtttatgagttctcttacttataata 24600420  T
Q  113 tgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||| |||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24600421 tgttcaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttg 24600470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 45084534 - 45084384
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||      ||  |||||||| |||||| |    
T  45084534 ggggaccgtccgcatcgaggttagaacaaccgcacaagcaagagagacaccactctcttacccaaaaccttaa------gacgttatgggtcctcttact 45084441  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  45084440 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggagatataactcacacttg 45084384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 162
Target Start/End: Original strand, 32594748 - 32594872
Alignment:
Q  38 cacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccg 137  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  32594748 cacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctg 32594847  T
Q  138 atgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||  |||||||||||||||||||    
T  32594848 atgtaggacatataactcacacttg 32594872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 154
Target Start/End: Original strand, 3875333 - 3875479
Alignment:
Q  8 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| | ||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||    
T  3875333 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagactccacattcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttactta 3875432  T
Q  108 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataact 154  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  3875433 taaggtgtacaacctttacttttttatccgatgtgtgacatataact 3875479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14319025 - 14318875
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| |    
T  14319025 ggggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaaataagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatagatttatgggtcttcttact 14318926  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 156  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||    
T  14318925 tataaggtgttcaacctttactattttatccgacgtggaacatataactca 14318875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 162
Target Start/End: Original strand, 37850599 - 37850756
Alignment:
Q  5 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||  |||||||||| |||||| || || |||||||||  || |  |||||||||||||||||     
T  37850599 aggggaccgtccacatcgaggctagagcaaccgcacaagtgagagagacaccacactcttatccgaaaccttaaaacattaggtttatgggttctcttac 37850698  T
Q  105 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  37850699 ttataaggtgttcaacctctactgttttatgcgatgtgggacatataactcacacttg 37850756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 5528762 - 5528902
Alignment:
Q  14 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 113  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||||| | ||||   ||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  5528762 tccacatcgaggatagaacaaccgcataaagaagagagacgccacacatttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgagtcctcttatttataagat 5528861  T
Q  114 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataact 154  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5528862 gttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataact 5528902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 39066201 - 39066356
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||| |    
T  39066201 ggggaccgtc-acatcaaggctagaacaaccacataagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaagacaatgattttatgggtcatcttagt 39066299  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  39066300 tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtggaatatataactcacacttg 39066356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 9956068 - 9955911
Alignment:
Q  5 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagttt-atgggttctctta 103  Q
    |||||||||  |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||    
T  9956068 aggggaccgctcacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttaatgggtcctctta 9955969  T
Q  104 tttataaggtgttaaacctttac-tcttttatccgatgtgagacatataactcacact 160  Q
     |||||| ||||| ||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  9955968 cttataatgtgttcaacctttactttttttatctgatgtgggacatataactcacact 9955911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 162
Target Start/End: Original strand, 66476 - 66628
Alignment:
Q  10 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 109  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||| | | |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| | |||||| |||||    
T  66476 accgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcgagagagacgctatactcttacccaaaaccttaaggccatatgtttatggatcctcttacttata 66575  T
Q  110 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  66576 aggtgttcaacctttacttttctatccgatatggaacatataactcacacttg 66628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 158
Target Start/End: Original strand, 24131994 - 24132137
Alignment:
Q  12 cgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataag 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  24131994 cgtctacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacact--tacccaaa-ccttaaggcaatgagtttatggatccccttatttataag 24132090  T
Q  112 gtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 158  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||    
T  24132091 gtgttcaacctttacttttctatccgatgagggacatataactcaca 24132137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 45493974 - 45494135
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt--tct--ct 101  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||  ||    
T  45493974 ggggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccacataaggaagagagacaccacactcttatccaaaactttaaggcaatgggtttatggatcatcttact 45494073  T
Q  102 tatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatat-aactcacacttg 162  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  45494074 tatatatatggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataaactcacacttg 45494135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 162
Target Start/End: Original strand, 30630648 - 30630794
Alignment:
Q  16 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgt 115  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||  | || ||| |  ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  30630648 cacatcgaggccagaacaaccacataagtgatagggacgccccactcttacccaaaactttaaggcaatgtgtttatgggttctcttacttataaagtgt 30630747  T
Q  116 taaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
     ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30630748 caaacctttaattttttatccgatgtgagacatataaatcacacttg 30630794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 162
Target Start/End: Original strand, 41184489 - 41184581
Alignment:
Q  70 aaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41184489 aaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 41184581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 162
Target Start/End: Original strand, 32168697 - 32168843
Alignment:
Q  5 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 104  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||       
T  32168697 aggggactgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcctct--- 32168793  T
Q  105 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
       ||||||||| |||||||||| ||||||||     | |||||||||||||||||||    
T  32168794 ---taaggtgttcaacctttactattttatcc-----gggacatataactcacacttg 32168843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 37555878 - 37555733
Alignment:
Q  15 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg 114  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |  ||||  ||| |||||| |||||| ||     
T  37555878 ccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctaaggattta-aggtcctcttacttataatgta 37555780  T
Q  115 ttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 161  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  37555779 ttcaaccttcactattttatccgatgtgggacttataactcacactt 37555733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 139
Target Start/End: Original strand, 22077110 - 22077243
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| || |||  || |||||   |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  22077110 ggggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccgcataagtgagggagacgtcacactcttatccaaaaccttagggcaatgagtttatgggtcctcttact 22077209  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgat 139  Q
    |||||||| || |||||||||| || ||||||||    
T  22077210 tataaggtattcaacctttacttttctatccgat 22077243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Original strand, 66100 - 66245
Alignment:
Q  17 acatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgtt 116  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||   ||||| | | |||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  66100 acatcgaggccagaacaaccatacaagt--gagaggcgccacactcttacccaaaaccttaaggccataggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 66197  T
Q  117 -aaacctttactcttttatccgatgtgagacat-ataactcacacttg 162  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  66198 caaacctttacttttctatccgatgtgagacatgattactcacacttg 66245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 87 - 162
Target Start/End: Original strand, 3537228 - 3537303
Alignment:
Q  87 gtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3537228 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 3537303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 162
Target Start/End: Original strand, 22077831 - 22077984
Alignment:
Q  8 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 107  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||| || |||  | |||||| | |||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  22077831 ggaccgtccacatcgatgcttgaacaaccgcataagtgaaagagacgccacactcttaccccaaacctta-ggctatgagtttatgggtcctcttactta 22077929  T
Q  108 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||| |||| |||||||| | || |||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  22077930 taagatgttcaacctttatttttctatccgatttaaaacatataactcacacttg 22077984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 5575252 - 5575110
Alignment:
Q  14 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 113  Q
    |||||||||||| |||||| ||| || |||  |||||||| | |||||| || |||||||||||| || |||  ||||| ||| |||||| |||||||||    
T  5575252 tccacatcgaggctagaactacctcataag--agagagacgccacactcttatccaaaaccttaaagctatggatttataggtcctcttacttataaggt 5575155  T
Q  114 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 158  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  5575154 gttcaacctttactcttctatccgacgtgggacatataattcaca 5575110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 162
Target Start/End: Original strand, 19283454 - 19283611
Alignment:
Q  5 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 104  Q
    ||||||||  ||||||| ||| |||| ||||| ||||||  |||||||| | |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||    
T  19283454 aggggacctcccacatccaggctagagcaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcgatgagtttatgtgtcctctcat 19283553  T
Q  105 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||| || ||| | |||||  ||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  19283554 ttacaaagtgctcaacctccacttttctatccggtgtgggacatataactcacacttg 19283611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 45839779 - 45839617
Alignment:
Q  16 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg- 114  Q
    ||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |   |||||||||  ||||| ||||||||||     
T  45839779 cacatcgaggccagaacaatcccacaagcaagagagacaccacaatcttacccaaaaccttaaggcattacatttatgggtcttcttacttataaggtgt 45839680  T
Q  115 ----ttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
        || |||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  45839679 tcgattcaaccttta-ttttctatccgatgtgggacatataactcatacttgtacacaacaaca 45839617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 44685551 - 44685458
Alignment:
Q  70 aaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgtt-aaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| || ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  44685551 aaacattaaggcaatgagtttattggtcctcttacttataaggttttcaaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttg 44685458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 11977102 - 11977026
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 82  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  11977102 ggggaccgtccacatcgaggctagaactaccgcacttgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 11977026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22793415 - 22793280
Alignment:
Q  28 agaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaa-tgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttac 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||||   |||||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||| | |||| | |||||| || || ||||| |||    
T  22793415 agaacaaccacacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccgtaaggcaaatgggtttatggatcctctcacttataaagttttcaacctctac 22793316  T
Q  127 tcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    | || ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22793315 ttttctatacgatgtgggacatataactcacacttg 22793280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 127
Target Start/End: Original strand, 44043810 - 44043893
Alignment:
Q  44 caagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttact 127  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  44043810 caagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacatttact 44043893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 1188588 - 1188744
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||||  |||||| |||| ||| |||||||| |||  |||||||| | |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||| | |    
T  1188588 ggggaccgcacacatctaggtcagagcaaccacataagtgagagagacgccacacttttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatgagtcttctcact 1188687  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||  | || |||||  ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  1188688 tataaaatattcaacctccacttttctatccgatatggaacatataactcacacttg 1188744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 94
Target Start/End: Original strand, 50051689 - 50051776
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgg 94  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||| || |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||  |||| ||||||||    
T  50051689 ggggaccgtccacatcgatgctagaacaac-acataaacaagagagacaccacactcttacgcaaaaccttaagataatgggtttatgg 50051776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 162
Target Start/End: Original strand, 1187362 - 1187520
Alignment:
Q  5 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaa-gcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctta 103  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| | | || |  ||||||||   |||||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||| |    
T  1187362 aggggaccgtccacatctaggtcagaacaactataaaaagtgagagagacgtcacacttttactcaaaatcttaaggtaatgagtttatgggtcttctca 1187461  T
Q  104 tttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
     ||||||  |||| |||||  ||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  1187462 cttataaaatgtttaacctccacttttatattcgatgtgagacatataattcacacttg 1187520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 176
Target Start/End: Original strand, 35154151 - 35154209
Alignment:
Q  118 aacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacata 176  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  35154151 aacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacata 35154209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 4956340 - 4956218
Alignment:
Q  17 acatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacg--acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg 114  Q
    |||||||||||| | ||| | ||||||||||||| | |||  |||||  |||| ||||| |||  ||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||    
T  4956340 acatcgaggttaaagcaatcgcacaagcaagagatagacgtcacacttttacctaaaactttagagcaatgagtttatggatcctcttacttataagatg 4956241  T
Q  115 ttaaacctttactcttttatccg 137  Q
    || |||||||||| || ||||||    
T  4956240 ttcaacctttacttttctatccg 4956218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 162
Target Start/End: Original strand, 21378122 - 21378197
Alignment:
Q  87 gtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| | || |||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  21378122 gtttatgggtcctcttacttataagatattcaacctttactgttctatccgatctgggacatataactgacacttg 21378197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 46
Target Start/End: Original strand, 21378057 - 21378099
Alignment:
Q  4 caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaa 46  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  21378057 caggggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaa 21378099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 10351278 - 10351202
Alignment:
Q  46 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacct 122  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||    
T  10351278 agagagacgccacactcttacccaaaatcttaaagtaatgtgtttatgggttctctcacttataaagtgttcaacct 10351202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Original strand, 50469178 - 50469237
Alignment:
Q  103 atttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  50469178 atttataaagtgttcaacctttactttattatctgatgtaggacatataactcacacttg 50469237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 59
Target Start/End: Original strand, 31767047 - 31767092
Alignment:
Q  14 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgaca 59  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  31767047 tccacatcgaagttagaacaaccgcataagtaagagagacacgaca 31767092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 93
Target Start/End: Original strand, 47380218 - 47380254
Alignment:
Q  57 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatg 93  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47380218 acactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatg 47380254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 64)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Original strand, 36492218 - 36492385
Alignment:
Q  7 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| |||| |||||| ||| |||||| ||    
T  36492218 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaacctaaaggtaatgtgtttattggtcctcttactt 36492317  T
Q  107 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  36492318 ataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaacaacaaca 36492385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 40296315 - 40296471
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  40296315 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 40296414  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40296415 tataaggtgttcaaccttttctattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 40296471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 6500608 - 6500453
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| |    
T  6500608 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttaaaggtcctcttact 6500509  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6500508 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg-gacatataactcacacttg 6500453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 6500980 - 6500825
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  6500980 ggggaccgtccacatcgaggctagaataaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtccttttatt 6500881  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6500880 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg-gacatataactcacacttg 6500825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 162
Target Start/End: Original strand, 18603124 - 18603276
Alignment:
Q  10 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 109  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  18603124 accgtccacatcgaggctagaactaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 18603223  T
Q  110 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  18603224 aggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 18603276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 27502036 - 27502192
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||| |||||||||||  |||||||||| |||||| |    
T  27502036 ggggaccgtccacatcgaggatagaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttaccaaaaatcttaaggcaataggtttatgggtcctcttact 27502135  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27502136 tataaggtgtttaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttg 27502192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 26074761 - 26074612
Alignment:
Q  15 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  26074761 ccacatcgaggttagagcaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 26074662  T
Q  115 ttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 164  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  26074661 ttcaacctttactcttttatccgatatggaacatataactcacacttgta 26074612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 41170792 - 41170640
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  41170792 ggggaccgtctacaccgaggctagaacaaccacacaagcaagaaaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 41170693  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 158  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41170692 tataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 41170640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6224354 - 6224184
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||| || |||| |||| ||||| |||||||||  ||| ||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  6224354 ggggaccgtccatattgaggctagaccaaccgcacaagcaactgaggcaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgagtttatgggtcctcttact 6224255  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacata 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6224254 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgaagtgggacatataactcacacttgtacacaacaacata 6224184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Original strand, 26075168 - 26075330
Alignment:
Q  13 gtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcct-acccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataag 111  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||   |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  26075168 gtccacatcgaggctaaaacaaccacacttgcaagagagacgacacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 26075267  T
Q  112 gtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  26075268 gtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataaatcacacttgtacacaacaaca 26075330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 3295015 - 3295170
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| |    
T  3295015 ggggactgtccacatcgaggctacaacaaccacacaaccaagagagacaccacactcatacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcttcttact 3295114  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  3295115 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatat-actcacacttg 3295170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 15370257 - 15370101
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||  ||||||||| |||||| |    
T  15370257 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctgtggatttatgggtcctcttact 15370158  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15370157 tataagatgttcaacctttactattttattcgatgtgggacatataactcacacttg 15370101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 32487551 - 32487396
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||   |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  32487551 ggggaccatccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagatacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 32487452  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32487451 tat-aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 32487396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 41632940 - 41632784
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||| || |||||||||| |||||| |    
T  41632940 ggggaccgtccacatcgagactaaaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaagcattgggtttatgggtcctcttact 41632841  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41632840 tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataacttacacttg 41632784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 6 - 161
Target Start/End: Original strand, 3295345 - 3295498
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |    
T  3295345 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaacacactcttacc-aaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctcttact 3295443  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 161  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  3295444 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatat-actcacactt 3295498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 6 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 25328093 - 25327938
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||| |    
T  25328093 ggggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggtcctcttact 25327994  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 161  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25327993 tataaggtgttcaacttttactgttttatccgatgtaggacatataactcacactt 25327938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 35150165 - 35150009
Alignment:
Q  5 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 104  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||     
T  35150165 aggggacggtccacattgaggttagaacaaccacactagtgagagagacaccacacttttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggt-ctcttac 35150067  T
Q  105 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35150066 ttataaggtgttcaaccttgactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 35150009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 299647 - 299491
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||  |||||||| |||||| | |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |    
T  299647 ggggactgtccacatcgatgctagaacaaccgtacaagcaatagagacgccacactcttacacaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcatcttact 299548  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  299547 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 162
Target Start/End: Original strand, 26074155 - 26074302
Alignment:
Q  15 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||  ||| |||||    
T  26074155 ccacatcgaggttagagcaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttcatgggtcctcttacatatgaggtg 26074254  T
Q  115 ttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26074255 ttcaacctttacttttttatccgatgtgtgacatataactcacacttg 26074302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 162
Target Start/End: Original strand, 13415774 - 13415916
Alignment:
Q  20 tcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaa 119  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  13415774 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 13415873  T
Q  120 cctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13415874 cctttactaatttatccgatgtgggacatataactcacacttg 13415916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 179
Target Start/End: Original strand, 42405598 - 42405769
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| || || ||| |    
T  42405598 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagaga--caccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgagtccttttact 42405695  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacatattt 179  Q
    | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  42405696 tgtaaggtgttcaacctttactattttatccgatgttggacatataactcacacttgtacacaacaacagattt 42405769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Original strand, 34753029 - 34753194
Alignment:
Q  10 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||||    
T  34753029 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatgggtcttcttacttata 34753128  T
Q  110 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacat 175  Q
    ||||||| ||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||  |||||||||    
T  34753129 aggtgttcaacttttacttttctatccaatgtgggacatataacttacatttgtacacaacaacat 34753194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 624350 - 624198
Alignment:
Q  10 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  624350 accgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggctatgggtttatgggtcatcttacttata 624251  T
Q  110 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    | ||||| |||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  624250 acgtgttcaacctttactattttatacaatgtgggacatataactcacacttg 624198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 158
Target Start/End: Original strand, 9498655 - 9498806
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| || | ||| || |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  9498655 ggggaccgtccacattgaggctagaccagc-acataaacaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 9498753  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 158  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  9498754 tataaggtgttcaacctttactattctatctgatgtgagacatataactcaca 9498806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 12662652 - 12662808
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| || ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||  |||||||||| ||||| |    
T  12662652 ggggaccgaccacatcgaggctagaagaaccccacaagcaagaaaggcaccacactcttacccaaaaacttaagacaatggatttatgggttttcttact 12662751  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||  |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12662752 tataaaatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 12662808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 157
Target Start/End: Original strand, 11416977 - 11417128
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||| |  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |    
T  11416977 ggggaccatccacatcgaagctagaacaatcccacaagcaagagagagatcacactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttact 11417076  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 157  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11417077 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatataactcac 11417128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Original strand, 1028517 - 1028675
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| | |||||| |||| ||||||||||||  ||  |||||||||| |||||| |    
T  1028517 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggttataggtttatgggtcctcttact 1028616  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 164  Q
    ||||| ||||| | |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1028617 tataaagtgttcatcctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgta 1028675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 36568569 - 36568723
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| | |    
T  36568569 ggggaccttccacatcgaggatagaacaaccacacaag--agagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttacgggtcatctcact 36568666  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36568667 tataaggtgttcaacttttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 36568723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 33747925 - 33747783
Alignment:
Q  10 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 109  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  33747925 accgtccacatcaaggctagaacaaccgcataaggaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcctcttacttata 33747826  T
Q  110 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataa 152  Q
    | || || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  33747825 aagtatttaacctttactattttatccgatgtgggacatataa 33747783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 623976 - 623820
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| |   |||| |    
T  623976 ggggaccgtctacattgaggctagaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggctataagtttatggctcaacttact 623877  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    | ||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  623876 tgtaaagtgttcaacctttactattatatccgatgtgagacatataactcacacttg 623820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 15370558 - 15370428
Alignment:
Q  8 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||    
T  15370558 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaaacaagagagacgccacactcttacgcaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttactta 15370459  T
Q  108 taaggtgttaaacctttactcttttatccga 138  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||| ||||||    
T  15370458 taaggtgttcaacatttactgtttcatccga 15370428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 2411165 - 2411010
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||| || ||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  2411165 ggggaccgtccatatcgaggttagaacaatcattcaagtaatagagaaactacactcttactcaaaaccttaaggcaataagtttatgggttctcttact 2411066  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 161  Q
    || ||| |||| ||| ||||||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  2411065 tacaagatgttcaacttttacttctctatccaatgtaggacatataactcacactt 2411010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 162
Target Start/End: Original strand, 5723812 - 5723947
Alignment:
Q  27 tagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttac 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||| |||| | || |||||||||||||  ||||| ||||| ||| ||||     
T  5723812 tagaacaaccgcacaagcaagagagacactatactctttcccaaaaccttaagacaataaattaatgggttctcttacatataatgtgttcaacttttat 5723911  T
Q  127 tcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5723912 tattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 5723947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 174
Target Start/End: Original strand, 26074807 - 26074950
Alignment:
Q  32 caaccacacaagcaagagagacacgacactcct-acccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactctt 130  Q
    |||||||||  ||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| || |||||  ||||| |||||||||||||    
T  26074807 caaccacacttgcaagagagacgccacactctttacccaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcctacttatattgtgttcaacctttactctt 26074906  T
Q  131 ttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26074907 ttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 26074950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 162
Target Start/End: Original strand, 24489207 - 24489360
Alignment:
Q  7 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 106  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||| || |||||| | |||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| |     
T  24489207 gggaccgcccacatcgagactagaacaaccgcacaagtaaaagagacgccacactcttacgcaaaatcttaaggcaatgggtttatgggt--tcttacta 24489304  T
Q  107 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||||| ||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  24489305 ataaggtgtttaaccttttcttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 24489360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Original strand, 26590918 - 26591031
Alignment:
Q  14 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||| |||||||||    
T  26590918 tccacatcgaggttagaacaaccacactagtgagagagacgccacactcttactcaaaaccttaaggcattgaatttatggatcctcttacttataaggt 26591017  T
Q  114 gttaaacctttact 127  Q
    ||| ||||||||||    
T  26591018 gttcaacctttact 26591031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 162
Target Start/End: Original strand, 29549278 - 29549411
Alignment:
Q  29 gaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactc 128  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| |||||| | ||||||||     
T  29549278 gaacaaccacataagcaagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggtaatgtgtttatgggtcttcttacttatatggtgttcatcctttacta 29549377  T
Q  129 ttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||    
T  29549378 ttttatctgatatggaacatataactcacacttg 29549411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Original strand, 35167838 - 35168006
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||   ||||||||  |||||| |||| ||||| | ||||||||   |||||||||  || || |    
T  35167838 ggggacagtccacatcgatgctagaacaaccacactagtgtgagagacatcacactcttaccaaaaacatcaaggcaatagatttatgggtcatcctact 35167937  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||  ||||||||    
T  35167938 tataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgagatacataactcatacttgtacacaacaaca 35168006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 38427697 - 38427553
Alignment:
Q  14 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||   |||||| ||| |||||||||||| |||||  || |||||| ||| || ||||||| |    
T  38427697 tccacatcgaggttagaacaaccgcacaagtgagagagacgtcacactcttacacaaaaccttaagacaatggattaatgggtcctc-tacttataagat 38427599  T
Q  114 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacac 159  Q
    ||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  38427598 gttcaacctttacttttctatccaatgtgggacatataactcacac 38427553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 301107 - 300959
Alignment:
Q  8 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 107  Q
    ||||||| ||| |||||  | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||        |||| |||||||| |||    
T  301107 ggaccgttcacgtcgagacttgaacagccacacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaatcttaaggca--------atggattctcttactta 301016  T
Q  108 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 164  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  301015 taaggtattcaacctttactgttttatctgatgtgggacatataacccacacttgta 300959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 35915007 - 35914838
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||| || | |||||||||||| || ||| || || |||| |  ||| |||||||  |||| ||||  ||||| |    
T  35915007 ggggaccgtccacattgaggtttgaccaatcatataagcaagagagataccacattcttatccaataatttagggcaatggatttacgggtcttcttact 35914908  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacat 175  Q
    |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||  |||||||||    
T  35914907 tataaaatgttcaacctttactcttttatccgatgtgtgacatataactcatacttatacacaacaacat 35914838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 174
Target Start/End: Original strand, 41635212 - 41635359
Alignment:
Q  27 tagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttac 126  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||| || |||||| |||| ||||  ||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  41635212 tagagcaaccatacaagtaaaagagatactacactcttacctaaaattttaagacaatggatttatggatcctcttatttataaggtgttcaacatttac 41635311  T
Q  127 tcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||| |||| ||  ||||||||    
T  41635312 tcttttatctgatgggaaacatataactcatacttatacacaacaaca 41635359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 78
Target Start/End: Original strand, 26900017 - 26900089
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaa 78  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  26900017 ggggaccgtccacatcaaggctagaacaaacccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 26900089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 69 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 42508707 - 42508612
Alignment:
Q  69 aaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 164  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||| || |||| |||||||||| || ||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  42508707 aaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttattagatgtttaacctttacttttctatccgatgtgggatatataattcacacttgta 42508612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 31509718 - 31509625
Alignment:
Q  69 aaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||| | |||||| ||| | |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31509718 aaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttg 31509625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 162
Target Start/End: Original strand, 36521947 - 36522052
Alignment:
Q  57 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 156  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||| |  ||||| |||||  ||| || |||| |||||| |||||||||||||    
T  36521947 acactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctctcatttaaagagtgttcaacctcaacttttctatctgatgtgggacatataactca 36522046  T
Q  157 cacttg 162  Q
    ||||||    
T  36522047 cacttg 36522052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 38427377 - 38427306
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaacctta 77  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  38427377 ggggaccgccaacatcgaggttagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaatctta 38427306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 39309750 - 39309684
Alignment:
Q  98 ctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 164  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  39309750 ctcttatttataatgtgttcaacatttacccttttatccgatgtgggacatataactcatacttgta 39309684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 87 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 26074395 - 26074320
Alignment:
Q  87 gtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||| | || |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  26074395 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaatctttagttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 26074320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 46 - 161
Target Start/End: Original strand, 36522277 - 36522392
Alignment:
Q  46 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgaga 145  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||| |||||| ||| |||| | ||||||  |||| ||| |  | | || ||||| ||||||||    
T  36522277 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaagataatgggtttattggtcctctcacttataaaatgttcaacttccatttttctatccaatgtgaga 36522376  T
Q  146 catataactcacactt 161  Q
    ||||||||||||||||    
T  36522377 catataactcacactt 36522392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 69 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 42524811 - 42524717
Alignment:
Q  69 aaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 164  Q
    |||||||| || |||||  |||||| || |||||||| ||||| |||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42524811 aaaaccttcagacaatggatttatgagtcctcttattcataagatgttcaac-tttacttttctatccgatgtgagacatataattcacacttgta 42524717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 7768925 - 7768852
Alignment:
Q  89 ttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  7768925 ttatgggtccttttacttataaggtgttcaacctttattattttatccgatgtaggatatataactcacacttg 7768852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 80
Target Start/End: Original strand, 795254 - 795306
Alignment:
Q  28 agaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaagg 80  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  795254 agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaagg 795306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 80
Target Start/End: Original strand, 13785630 - 13785706
Alignment:
Q  4 caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaagg 80  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||| |||| |||||  |||  ||||||||||||    
T  13785630 caggggaccgtccacatcgaagttagaacaaccatacaaacgagagaaacaccacacttttacttaaaaccttaagg 13785706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 31509857 - 31509745
Alignment:
Q  39 acaagcaagagagacacgacactcctacccaaaa-ccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccg 137  Q
    |||||| |||||||||| ||| || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| || |||| | |||||| ||| | |||||  ||| || ||||||    
T  31509857 acaagcgagagagacaccacattcttaccaaaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccg 31509758  T
Q  138 atgtgagacatat 150  Q
    |||||||||||||    
T  31509757 atgtgagacatat 31509745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 46 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 13042657 - 13042607
Alignment:
Q  46 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 96  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13042657 agagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 13042607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 24489635 - 24489582
Alignment:
Q  10 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcc 63  Q
    ||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  24489635 accgttcatatcgaggttagaacaactgcacaagcaagagagacaccacactcc 24489582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 6225103 - 6225047
Alignment:
Q  105 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 161  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||| ||||    
T  6225103 ttataaggtgttcaacctttattcttttatctgatgtgggatatataactcagactt 6225047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 35150789 - 35150749
Alignment:
Q  122 tttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  35150789 tttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttg 35150749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 35151080 - 35151040
Alignment:
Q  122 tttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  35151080 tttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttg 35151040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 93
Target Start/End: Original strand, 9498344 - 9498410
Alignment:
Q  27 tagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatg 93  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| ||| ||||  |||||||||||| |||||||    
T  9498344 tagaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttactcaaatgcttaaggcaatgggtttatg 9498410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 94
Target Start/End: Original strand, 36527117 - 36527183
Alignment:
Q  28 agaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgg 94  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||  |||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  36527117 agaacagccacacaagtgagagagacagcacactcttatccaaaatcttaaggcaatgcgtttatgg 36527183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 174
Target Start/End: Original strand, 26900081 - 26900138
Alignment:
Q  117 aaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||  ||||||||    
T  26900081 aaaccttaactcttttatctgatgtgggacatataactcaaatttgtacacaacaaca 26900138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 34103650 - 34103617
Alignment:
Q  68 caaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctct 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34103650 caaaaccttaaggcaatgagtttatgagttctct 34103617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 75)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 3669845 - 3669689
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  3669845 ggggaccatccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttact 3669746  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  3669745 tataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 3669689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 34835026 - 34834866
Alignment:
Q  14 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||    
T  34835026 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcatcttacttataaggt 34834927  T
Q  114 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  34834926 gtttaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 34834866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Original strand, 3038292 - 3038458
Alignment:
Q  8 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||    
T  3038292 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttactta 3038391  T
Q  108 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  3038392 taaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 3038458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 162
Target Start/End: Original strand, 45122067 - 45122213
Alignment:
Q  16 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgt 115  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45122067 cacatcgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgggttctcttacttataaggtgt 45122166  T
Q  116 taaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45122167 tcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 45122213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 3670219 - 3670062
Alignment:
Q  5 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 104  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||     
T  3670219 agggaaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaataggtttatgggtcctcatac 3670120  T
Q  105 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3670119 ttataaggtgttaaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 3670062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 34835367 - 34835209
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  34835367 ggggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctcttact 34835268  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 164  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  34835267 tataaggtgttcaacctttactattttatcggatgtgggacatataactcacccttgta 34835209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 174
Target Start/End: Original strand, 25561814 - 25561984
Alignment:
Q  5 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctaccc-aaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctta 103  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  25561814 aggggaccttccacatcgaggctagagcaaccacacaagcaagagagatgtcacactcttaccccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctctta 25561913  T
Q  104 tttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
     |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  25561914 cttataaggtgttcaacgtttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtagacaacaaca 25561984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 6876862 - 6877019
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||  |||||||    
T  6876862 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaaacaagagaaacaccacactcttacccaaaaccctaagacaatgagtgtatgggtcatcttatt 6876961  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagac-atataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  6876962 tataaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgggactatataactcacacttg 6877019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 34835633 - 34835474
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  34835633 ggggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctcttact 34835534  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatc-cgatgtgagacatataactcacacttgta 164  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| |||||||||||||| ||||||    
T  34835533 tataaggtgttaaacctttactattttatcgggacgtgggacatataactcacccttgta 34835474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 34835899 - 34835740
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  34835899 ggggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctcttact 34835800  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatc-cgatgtgagacatataactcacacttgta 164  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| |||||||||||||| ||||||    
T  34835799 tataaggtgttaaacctttactattttatcgggacgtgggacatataactcacccttgta 34835740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 30359430 - 30359261
Alignment:
Q  5 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 104  Q
    |||| ||| ||||||| |||| || ||||||  |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||      
T  30359430 agggaaccatccacattgaggctaaaacaacatcacaagaaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttgc 30359331  T
Q  105 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30359330 ttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtacacaacaaca 30359261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 30359763 - 30359598
Alignment:
Q  10 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||| || |||||| |||||    
T  30359763 accgtccacatcgaagttagaacaaccgcataagtaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggttatgggtttatgagtcctcttacttata 30359664  T
Q  110 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacat 175  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  30359663 aggtgttcaacttttactcttttatctgatgtgagacatataactcacacttgtacacaacaacat 30359598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 33113368 - 33113537
Alignment:
Q  7 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 106  Q
    |||||||||| ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  33113368 gggaccgtccgcattgagcctagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttactt 33113467  T
Q  107 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacata 176  Q
    |||||  ||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  33113468 ataagacgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcaaacttgtacacaacaacata 33113537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 147609 - 147441
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||  ||||||| | | |||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  147609 ggggaccacccacatcaatgctagaactaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaataggtttatgggtcctcttatt 147510  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  147509 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttacacgcaacaaca 147441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 40518738 - 40518584
Alignment:
Q  8 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 107  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||   |||||| |||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||    
T  40518738 ggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagagtgacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcattgggtttatgggtcctcttattta 40518639  T
Q  108 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  40518638 taaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 40518584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 45122782 - 45122648
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  45122782 ggggaccttccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttact 45122683  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatg 140  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  45122682 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatg 45122648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 9309512 - 9309357
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |   | ||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  9309512 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacatactga-gagagacaccacactcttacccgacaccttaaggcaatgagtttaagggtcctcttact 9309414  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9309413 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 9309357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 9608907 - 9608747
Alignment:
Q  2 gccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctct 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||  |||    
T  9608907 gccagggggccgtccacatcgaggctagaacaacctcactagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaaggtgatgggtttatgggtcatct 9608808  T
Q  102 tatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    || |||||||||||| |||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9608807 tacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttg 9608747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 30441236 - 30441083
Alignment:
Q  13 gtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta----t 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||    |    
T  30441236 gtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataatt 30441137  T
Q  109 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  30441136 aaggtgttcaacctttactattttagccgatgtgggacatataactcacacttg 30441083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 5916025 - 5915874
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |    
T  5916025 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctc----t 5915930  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||| |||||||| ||||||  |||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  5915929 tataaagtgttaaa-ctttacatttttatccaatgtaggacatataactcacacttg 5915874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 6651652 - 6651510
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6651652 ggggaccatccacatcgaggttagaacaatcgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctcttatt 6651553  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 157  Q
             || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6651552 ---------ttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcac 6651510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 139
Target Start/End: Original strand, 9483191 - 9483320
Alignment:
Q  10 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  9483191 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacgagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttacttata 9483290  T
Q  110 aggtgttaaacctttactcttttatccgat 139  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9483291 aggtgttcaacctttactcttttatccgat 9483320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 157
Target Start/End: Original strand, 70277 - 70425
Alignment:
Q  9 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 108  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||    
T  70277 gaccgtccgcattgaggttagaacaaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacctaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttat 70376  T
Q  109 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 157  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  70377 aagatgttcaacatttactcttttatccgatgtgggacatataactcac 70425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 162
Target Start/End: Original strand, 1014253 - 1014401
Alignment:
Q  14 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 113  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| || ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  1014253 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaggagagacaccacactcttacccaaaactttaaggtaacgagtttacgggtcctcttacttataaggt 1014352  T
Q  114 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||| |||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  1014353 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactcacacttg 1014401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Original strand, 37544490 - 37544662
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||| |||||  |    
T  37544490 ggggatcgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaagtaatggatttatgggtcctctttct 37544589  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacatatt 178  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  37544590 tataatgtgttcaacctttactattttatccgatgtgcgacttataactcacacttgtgcacaacaacatatt 37544662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 157
Target Start/End: Original strand, 9482608 - 9482755
Alignment:
Q  10 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||  ||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  9482608 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagataccacactcttatacaaaatctttaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 9482707  T
Q  110 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 157  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  9482708 aggtgttcaacctttactcttttatcccatgtggaacatataactcac 9482755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 40518229 - 40518071
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |  ||| |    
T  40518229 ggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcattgggtttatgggtccatttact 40518130  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttac--tcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  40518129 tataaggtgttcaacctttacttttttttatccaatgtggaacatataactcacacttg 40518071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Original strand, 1513915 - 1514073
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| | |||||||| || |||||  |||||||||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| |    
T  1513915 ggggaccgtccacatcgaggctagaataaccccacatgtaagagagataccacacttttacccaaaaccttaaggttatgggtttaagggtcctcttact 1514014  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 164  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  1514015 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggatatataactcatacttgta 1514073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 162
Target Start/End: Original strand, 40579512 - 40579662
Alignment:
Q  12 cgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataag 111  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  40579512 cgtccacatcgaggatagaacaaccgtacaagcaatagagacaccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggtcctcttacttataag 40579611  T
Q  112 gtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| || ||| |||||||| |||||||||    
T  40579612 gtgttcaacctttactattttatccaatatgaaacatataattcacacttg 40579662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 162
Target Start/End: Original strand, 20870575 - 20870731
Alignment:
Q  8 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 107  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| |||    
T  20870575 ggaccgtccatatcaaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcagtgggtttatgggtcctcttactta 20870674  T
Q  108 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtg--agacatataactcacacttg 162  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||  | | ||||||||||||||||    
T  20870675 taagatgttcaacctttactattttatctgatgtggaacatatataactcacacttg 20870731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 8918764 - 8918920
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||   |||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||| |    
T  8918764 ggggaccgtccacatcgaggttaaaacaaccacacacgcaagaaagacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcaataggtttatgggtcctcttact 8918863  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  |||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  8918864 tataaagtgttcaacctttactctgctatctgatgtgggacatgtaactcacacttg 8918920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 45121910 - 45122066
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||| | |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  45121910 ggggaccttccacatcgaggcttgaataaccacacgagcaaaagagacgccacactgttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgagtcctcttact 45122009  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  45122010 tataaagtgttcaacctttactattttatgcgatgtgggacatataactcacacttg 45122066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 6732054 - 6731906
Alignment:
Q  5 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 104  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  6732054 aggggatcatccacatcgaggttagaacaaccgcataagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctcttac 6731955  T
Q  105 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |         || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6731954 t---------ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 6731906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 161
Target Start/End: Original strand, 32640542 - 32640682
Alignment:
Q  16 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgt 115  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||     |||    
T  32640542 cacatcgaggctagaacaatcacaaaagcaagagagacgcaacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatcggtcctcttaccta-----tgt 32640636  T
Q  116 taaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 161  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32640637 tcaacctttactcttttatccgatgtgagacagataactcacactt 32640682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 45123164 - 45123008
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcc--tacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctta 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||  |||  ||||||||||  |||||    
T  45123164 ggggaccgtccacatcgagattagaacaaccccacaaataagagagacaccacactctcttacccaaaaccttaagaaaataggtttatgggtcatctta 45123065  T
Q  104 tttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
     |||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45123064 ctta--aggtgtttaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 45123008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 162
Target Start/End: Original strand, 1013879 - 1014027
Alignment:
Q  14 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 113  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||  |||||| ||| ||||||  |||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||    
T  1013879 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaaaagagacaacacactcttactcaaaactctaaggcaatgggtttattggtcctcttacttatagggt 1013978  T
Q  114 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1013979 gttcaacttttactattttatccgatgtggaacatataactcacacttg 1014027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 154
Target Start/End: Original strand, 18371998 - 18372142
Alignment:
Q  10 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 109  Q
    ||||| ||||| |||| |||| ||||| ||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  18371998 accgttcacattgaggctagagcaaccgcacaagcgagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatggatcctcttacttata 18372097  T
Q  110 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataact 154  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||    
T  18372098 aggtgttcaacctttactattttattggatgtggtacatataact 18372142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 41972316 - 41972160
Alignment:
Q  9 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaa---aaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||   ||| ||| ||||||| |||||||||| || | | |    
T  41972316 gaccgtccatattgaggctggaacaaccacacaagcaagagtgacgccacactcttacccaacaaaactttatggcaatgggtttatgggtcctatcact 41972217  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41972216 tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 41972160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Original strand, 45121663 - 45121823
Alignment:
Q  13 gtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataagg 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  |  |||||||| | |||||| ||||||||    
T  45121663 gtccacatcgaggctagaacaaccccataagtaagagagatatcacactcttactcaaaaccttaaggctgtaggtttatggatcctcttacttataagg 45121762  T
Q  113 tgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  45121763 tgatcaacctttactcttttatccgatgtgggaca-acaactcacacttgtacacaacaaca 45121823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 5420807 - 5420653
Alignment:
Q  8 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 107  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||  || |||||   |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||    
T  5420807 ggacggtccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagggagacgtcacactcttacaaaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttactta 5420708  T
Q  108 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||| |||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  5420707 taagatgttcaacctttactattctatccgatgtgggacatataatacacacttg 5420653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 9309139 - 9308979
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactccta---cccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctt 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |  |||||||||| ||||| ||    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  9309139 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacata-gtgagagagacaccacactactcttgcccaaaacctttaggcaatgggtttatgggtcctctt 9309041  T
Q  103 atttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtg--agacatataactcacacttg 162  Q
    | ||||||  |||| ||| |||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  9309040 acttataacatgttcaacttttactcttttatctgatgtgtaggacatataactcacacttg 9308979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 41129146 - 41129067
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatg 85  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  41129146 ggggaccgtccacatcgaggtttgaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcatacccaaaaccttaagacaatg 41129067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 160
Target Start/End: Original strand, 43398077 - 43398225
Alignment:
Q  15 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctc---ttatttataag 111  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| || || ||| || | ||| || || ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||    
T  43398077 ccacatcgaggttagagcaaccgcactagtaaaagaaacgccacattcttatccaaaactttaaggcaatgaatttatgggtcctcctcttatttataag 43398176  T
Q  112 gtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacact 160  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  43398177 gtgttcaacctttacttttctatccgatatgagatatataactcacact 43398225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 8794229 - 8794101
Alignment:
Q  46 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgaga 145  Q
    ||||||||||  |||||  |||||||||||||||  | |  ||||||| || |||||| ||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  8794229 agagagacaccgcactctcacccaaaaccttaagatattaggtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacatttattcttttatccgatgtgaga 8794130  T
Q  146 catataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  8794129 catataactcacacttgtacacaacaaca 8794101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 174
Target Start/End: Original strand, 43274824 - 43274947
Alignment:
Q  51 gacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatat 150  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||| ||||||  | || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  43274824 gacaccacactcttactcaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcttacttataatatattcaacctttactcttttatctgatgtgaaacatat 43274923  T
Q  151 aactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||    
T  43274924 aactcacacttatacacaacaaca 43274947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 160
Target Start/End: Original strand, 18372992 - 18373085
Alignment:
Q  64 tacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacact 160  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  18372992 tacccaaaacct---ggcaatgagtttatgagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgaagtgggacatataaatcacact 18373085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 82
Target Start/End: Original strand, 8919144 - 8919220
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 82  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  8919144 ggggaccgtccacatcgaagctagaacaaccacacaagcaaaagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggca 8919220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 32305635 - 32305503
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  || ||| || | |||| | |||||| || |||||| ||||||| |||| |||||| |||  ||||| |    
T  32305635 ggggaccgtccacatcaaggttagaacaactgcataagtaataaagacgccacactcttatccaaaatcttaaggtaatgggtttataggtcttcttact 32305536  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccga 138  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  32305535 tataaggtgttcaacctttactattttatccga 32305503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 162
Target Start/End: Original strand, 4154694 - 4154822
Alignment:
Q  32 caaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttt 131  Q
    |||||||||||||  ||||||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| || | | |||||| ||||| |||||  ||| ||     
T  4154694 caaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctttcacttataaagtgttcaacctccacttttc 4154791  T
Q  132 tatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  4154792 tatcagatgtgggacatataactcacacttg 4154822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Original strand, 40579269 - 40579348
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatg 85  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  40579269 ggggacagtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcctaaggcaatg 40579348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 147968 - 147831
Alignment:
Q  16 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgt 115  Q
    ||||| |||| |||||||||  |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||         ||||| | |||    
T  147968 cacattgaggctagaacaactgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatggg---------ttatatgttgt 147878  T
Q  116 taaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  147877 tcaacatttacttttttatcagatgtgggacatataactcacacttg 147831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 9609222 - 9609108
Alignment:
Q  27 tagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttac 126  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  9609222 tagaacaaccacactagcaagagagacgccacactcttaccgaaaacattaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataagatgttcaacctttac 9609123  T
Q  127 tcttttatccgatgt 141  Q
    | || |||| |||||    
T  9609122 ttttctatctgatgt 9609108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 157
Target Start/End: Original strand, 18371665 - 18371807
Alignment:
Q  10 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 109  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| |||||   ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| |||      
T  18371665 accgtccacatcgaagctagagcaaccgcacaaatgagagacacaccacactcttacccaaaaccttaaggc-atgggtttatgggtcttcttactta-- 18371761  T
Q  110 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 157  Q
       |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18371762 --atgttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataactcac 18371807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 161
Target Start/End: Original strand, 18372349 - 18372411
Alignment:
Q  99 tcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 161  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372349 tcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacactt 18372411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Original strand, 18380020 - 18380171
Alignment:
Q  7 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 106  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||| || | ||||||||||||   ||| |||||| ||| ||||||||||||| | || |||||| ||  | |||| ||    
T  18380020 gggactgtccacatcgaagctagaagaatcgcacaagcaagagg--caccacactcttactcaaaaccttaaggtagtgggtttataggcccccttactt 18380117  T
Q  107 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacact 160  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  18380118 ataaggtgttcaacctttactattttattcgatgtgggatatataactcacact 18380171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 92 - 161
Target Start/End: Original strand, 18372785 - 18372854
Alignment:
Q  92 tgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 161  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18372785 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataactcacactt 18372854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 154
Target Start/End: Original strand, 25561729 - 25561792
Alignment:
Q  91 atgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataact 154  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25561729 atgggtactcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataact 25561792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 9507933 - 9507819
Alignment:
Q  13 gtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataagg 112  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| | |||  | |||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||| ||||||||    
T  9507933 gtccacatcgaggcttgaacaaccatataagagatagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttacttataagg 9507834  T
Q  113 tgttaaacctttact 127  Q
    | || ||||||||||    
T  9507833 tattcaacctttact 9507819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 157
Target Start/End: Original strand, 41416252 - 41416322
Alignment:
Q  87 gtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 157  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41416252 gtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 41416322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 9620678 - 9620832
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||| |||   || ||||||||||||  |||||||||  | |||| ||   |||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |    
T  9620678 ggggaccgtccacatccaggcctgagcaaccacacaagtgagagagacatcaaactcttat--aaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctctcact 9620775  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||| ||| | ||| | |||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  9620776 tataaagtgatcaacttctacttttctatctgttgtgagacatataactcacacttg 9620832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 12284021 - 12283875
Alignment:
Q  15 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg 114  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||||||||||||| |  |||||||||| ||  | ||| || |||| |     
T  12284021 ccacatagaggctagaacaaccacacaagtgagagagacactacactcttatccaaaaccttaagac-ttgagtttatgtgtcattttacttttaagata 12283923  T
Q  115 ttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    || ||| |||||| ||||||| || ||| ||||||||||| |||||||    
T  12283922 ttcaacatttacttttttatctgacgtgggacatataacttacacttg 12283875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 20130553 - 20130454
Alignment:
Q  59 actcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 158  Q
    |||| |||| |||||| |||||  ||| |||||||| |  ||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20130553 actcttacctaaaaccgtaaggttatgggtttatggatcatcttactta-aaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgagacatatatctcaca 20130455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 164
Target Start/End: Original strand, 18372657 - 18372760
Alignment:
Q  57 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 156  Q
    |||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||| || |||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||  ||  |||||||| |||    
T  18372657 acactcttacccaaaacct---ggcaatgggtttatgagtcctcttacttataag-tgttcaacctttactattttatccgaaatggaacatataaatca 18372752  T
Q  157 cacttgta 164  Q
    ||||||||    
T  18372753 cacttgta 18372760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 158
Target Start/End: Original strand, 4154321 - 4154432
Alignment:
Q  46 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgaga 145  Q
    |||||||||  |||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||||  ||| || |||| |||||  ||    
T  4154321 agagagacatcacacacttacccaaaatattaaggcaatgagtttatggg-tctctcacttataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtagga 4154419  T
Q  146 catataactcaca 158  Q
    |||||||||||||    
T  4154420 catataactcaca 4154432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 6 - 70
Target Start/End: Original strand, 43274635 - 43274699
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaa 70  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| || ||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  43274635 ggggaccgtccacatcgaggctggaacaaccccataagtaagagagacaccacactcatacccaa 43274699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 53
Target Start/End: Original strand, 3037969 - 3038016
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagac 53  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  3037969 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagatagagagac 3038016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 74 - 161
Target Start/End: Original strand, 3037776 - 3037865
Alignment:
Q  74 cttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtg--agacatataactcacactt 161  Q
    |||||| ||||| ||||||| || |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||  | | |||||||||||||||    
T  3037776 cttaagacaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactatttcatccgatgtggaacatatataactcacactt 3037865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 32 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 5274907 - 5274777
Alignment:
Q  32 caaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttt 131  Q
    |||| |||||||| | |||||||  |||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||| ||||| ||||| | || |||    
T  5274907 caacaacacaagcgatagagacatcacactcttactcaaaatcttaaggcaatgattttatgggtcttcccatttataaagtgttcaacctctccttttt 5274808  T
Q  132 tatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||| | ||||   |||||||||||| |||||    
T  5274807 tattcaatgtagaacatataactcatacttg 5274777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 161
Target Start/End: Original strand, 18372485 - 18372526
Alignment:
Q  120 cctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 161  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18372485 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 18372526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 85
Target Start/End: Original strand, 20995442 - 20995495
Alignment:
Q  32 caaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatg 85  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  20995442 caaccacacaagtgagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaatg 20995495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 16524502 - 16524446
Alignment:
Q  27 tagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaa 83  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  16524502 tagagcaaccacacaagtaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaagcaa 16524446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 127
Target Start/End: Original strand, 18373236 - 18373291
Alignment:
Q  72 accttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttact 127  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18373236 accttaagacaatgggttaatggatcctcttatttataaggtgttcaacctttact 18373291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 162
Target Start/End: Original strand, 20995502 - 20995557
Alignment:
Q  107 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||| ||||| |||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20995502 ataaagtgttcaacctccacttttttatctgatgtgagacatataactcacacttg 20995557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 162
Target Start/End: Original strand, 18645713 - 18645743
Alignment:
Q  132 tatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18645713 tatccgatgtgagacatataactcacacttg 18645743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 11442952 - 11442916
Alignment:
Q  65 acccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctct 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  11442952 acccaaaaccttaaggcattgagtttatgggtcctct 11442916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 60)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 1085616 - 1085772
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  1085616 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 1085715  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1085716 tataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 1085772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 37533011 - 37533166
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  37533011 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaagcgcacaagcaagagagacaccacactt-tacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttact 37533109  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  37533110 tataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttg 37533166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 45433399 - 45433227
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| |    
T  45433399 ggggaccgaccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatgagttctcttact 45433300  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacatatt 178  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  45433299 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggatcatataactcacacttgtacacaacaacatatt 45433227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7517739 - 7517568
Alignment:
Q  5 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 104  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||     
T  7517739 aggggaccacccacatcgaggctagaacaaccacacaagtgagacagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 7517640  T
Q  105 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacata 176  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  7517639 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacata 7517568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 30244428 - 30244260
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |    
T  30244428 ggggaccatccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttact 30244329  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30244328 tataaggtcttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 30244260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 40094774 - 40094930
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||| |    
T  40094774 ggggaccgaccacatcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacgatgggtttatgggtcctcttact 40094873  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40094874 tataaggtgttgaacctttactcttttattcgatgtgagacatataactcacacttg 40094930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Original strand, 22567039 - 22567208
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||| ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  22567039 ggggaccatccacatcgaggcccgaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttact 22567138  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacata 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||    
T  22567139 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtg-gacatattactcacacttgcatacaacaacata 22567208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 6054718 - 6054561
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  6054718 ggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccatacaagtaggagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttact 6054619  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgt 163  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6054618 tataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtgagacatataactaacacttgt 6054561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 30245231 - 30245067
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  30245231 ggggaccatccacatcgaggcttgaacaaccacacaag----agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcgtcttact 30245136  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30245135 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcacacttgtacacaacaaca 30245067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Original strand, 34218036 - 34218202
Alignment:
Q  8 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 107  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||| | |||    
T  34218036 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 34218135  T
Q  108 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  34218136 taaggtgttcaacatttacttttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 34218202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 175
Target Start/End: Original strand, 23377 - 23546
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |    
T  23377 ggggaccgtccaaatcgaggctagaacaaccgcacatgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctcttact 23476  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacat 175  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||| ||| |  |||||||||    
T  23477 tataaggtgttcaacctttactattgtatccgatgtggaacatataactcacaattgcacacaacaacat 23546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 6 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 45434794 - 45434626
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |    
T  45434794 ggggaccgatcacatcgaggctagaacaactccacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcagtaagtttatgggtcctcttact 45434695  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  45434694 tataaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgggacatataacttacacttgtacacaacaaca 45434626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 6 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 11845349 - 11845198
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |    
T  11845349 ggggaccgtctacatcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttact 11845250  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 157  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11845249 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatataactcac 11845198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 6 - 161
Target Start/End: Original strand, 37533364 - 37533519
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |    
T  37533364 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttact 37533463  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 161  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||   |||||||||||||||||    
T  37533464 tataaggtgttcaacctttactattttattcaatgtagaacatataactcacactt 37533519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 30032725 - 30032555
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| | |||||| |    
T  30032725 ggggaccgtccacatcgaggatagaacaaccgcacaagcaagagagatgtcacactcttacccaaaaccttaaggctataggtttatggatactcttact 30032626  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacata 176  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  30032625 tataaggtgttcaacacttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacatgtacgcaacaacata 30032555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 45754862 - 45754706
Alignment:
Q  17 acatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgtt 116  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||    
T  45754862 acatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgagtcatcttacttataaggtgtt 45754763  T
Q  117 aaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
     ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  45754762 caacatttactattttatccgatgtg-gacatataactcacacttgtacacaacaaca 45754706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 47129253 - 47129096
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||| |    
T  47129253 ggggaccgtctacattgaggctagaacaaccacacttgtgagagagacaccacactcctacccaaaaccttaaagcgatgggtttatgggtcctcttact 47129154  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgt 163  Q
    ||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47129153 tataagaggttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgt 47129096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 29157720 - 29157567
Alignment:
Q  9 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 108  Q
    ||||||||||||| ||  |||| |||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||    
T  29157720 gaccgtccacatcaagactagagcaactacacgagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcgtcttacttat 29157621  T
Q  109 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  29157620 aaggtgttcaacctttactattttatccggtgtgggacatataactcacacttg 29157567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 19122879 - 19122740
Alignment:
Q  16 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgt 115  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||| |||||||||||    
T  19122879 cacatcgagactagaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgagtcctcttacttataaggtgt 19122780  T
Q  116 taaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 156  Q
    | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19122779 tcaacctttactattttatccgatgtg-gacatataactca 19122740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 24177593 - 24177437
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||||||||| |||||| ||  |||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||| | |||| |    
T  24177593 ggggaccgtccacgtcgaggctaagacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttaccaaaaactttaaggcaatgggtttatgggtccgcttact 24177494  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  24177493 tataaggtgttcagcctttactcttttatccgatgtgggacatataactcatacttg 24177437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 7554154 - 7554027
Alignment:
Q  35 ccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttat 134  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7554154 ccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttat 7554055  T
Q  135 ccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  7554054 ccgatgtgggacatataactcacacttg 7554027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 36623117 - 36622962
Alignment:
Q  7 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||| || ||    
T  36623117 gggaccgtccacatcaaggtcagaacaatcacacaagtaagagaggcaccatactcctacccaaaaccttaaggcaatggatttatggatcctcctactt 36623018  T
Q  107 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||  |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36623017 ataaaatgtttaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 36622962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20599471 - 20599304
Alignment:
Q  9 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcc--tacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 106  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  20599471 gaccgttcacatcaaggttaaaacaaccatacaagcaagagagacaccacactctcttacccaaaacgttaaggcaatgagtttatatgtcctcttattt 20599372  T
Q  107 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    |||| ||||| | |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  20599371 ataaagtgtttatcctttacttttttatccgatatgggacatataactcacacttatagacaacaaca 20599304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 162
Target Start/End: Original strand, 36939741 - 36939889
Alignment:
Q  14 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 113  Q
    |||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||    
T  36939741 tccacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagaaacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttacttataaggt 36939840  T
Q  114 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||| ||| |||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  36939841 gttcaacttttactattttatacgatttgggacatataactcacacttg 36939889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 9901799 - 9901648
Alignment:
Q  8 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 107  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  ||    
T  9901799 ggacagtccacaccgaggctagaacaaccgcactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatggatcctc-tacgta 9901701  T
Q  108 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 161  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9901700 taagatgttcaacctttactgttttatccgatgtg-gacatataactcacactt 9901648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 57 - 162
Target Start/End: Original strand, 22566713 - 22566818
Alignment:
Q  57 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 156  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  22566713 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatattactca 22566812  T
Q  157 cacttg 162  Q
    ||||||    
T  22566813 cacttg 22566818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 16569316 - 16569198
Alignment:
Q  44 caagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtga 143  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||    
T  16569316 caagagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtga 16569217  T
Q  144 gacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16569216 gacatataactcacacttg 16569198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 162
Target Start/End: Original strand, 16596346 - 16596464
Alignment:
Q  44 caagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtga 143  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||    
T  16596346 caagagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtga 16596445  T
Q  144 gacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16596446 gacatataactcacacttg 16596464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 174
Target Start/End: Original strand, 24838724 - 24838870
Alignment:
Q  29 gaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttct-cttatttataaggtgttaaacctttact 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| | || |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24838724 gaacaaccacacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaacgggtttatggatccttcttacttataaggtgttcaacctttact 24838823  T
Q  128 cttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 174  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||    
T  24838824 cttttattcgatgtgagacatataacttacacttatacacaacaaca 24838870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 118294 - 118457
Alignment:
Q  1 agccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacg--acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttc 98  Q
    |||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| | |||  |||||| |||||||||||||| || |||| |||||||| | |    
T  118294 agcctggggaccgtccacatcaaagctagaacaaccacacaagcaagagatagacgccacactcttacccaaaaccttacggtaatgggtttatggatcc 118393  T
Q  99 tcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  118394 tcttacttattaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgggacatataacttacacttg 118457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 14681663 - 14681512
Alignment:
Q  9 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 108  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |   ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||| |||     
T  14681663 gaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacttg--tgagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggccctcttacttac 14681566  T
Q  109 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  14681565 aaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataacttacacttg 14681512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 8128441 - 8128597
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||| || |||||||| | ||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||      
T  8128441 ggggactgttcacatcgatgctagaacaaccacataagcgagagtgacaccacactcttaaccaaaaccttaaggttatgggtttatgggtcctcttaca 8128540  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||| | || |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  8128541 tataaggtgttcaacctttatttttctatccgatatgggacatataactcacacttg 8128597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 162
Target Start/End: Original strand, 40230295 - 40230447
Alignment:
Q  10 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 109  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||  ||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  40230295 accgtccacatagaggttagaataactacacttgcaagagagacaccagacttttacccaaaaccttaagactatgggtttatgggtcctcttacttata 40230394  T
Q  110 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    || |||| ||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  40230395 agatgttcaacttttacttttttattcgatgtgggacatataacttacacttg 40230447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 30253646 - 30253534
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30253646 ggggaccatccacatcgaggcttgaacaaccacacaag----agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttact 30253551  T
Q  106 tataaggtgttaaacct 122  Q
    |||||||| || |||||    
T  30253550 tataaggtcttcaacct 30253534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 162
Target Start/End: Original strand, 1085280 - 1085405
Alignment:
Q  38 cacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccg 137  Q
    |||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||| |||||| |||||||||    
T  1085280 cacaaggaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttatgagttgttcaacttttactattttatccg 1085379  T
Q  138 atgtgagacat-ataactcacacttg 162  Q
    || || ||||| | ||||||||||||    
T  1085380 atatgggacataaaaactcacacttg 1085405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 41910592 - 41910749
Alignment:
Q  12 cgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaacc--------ttaaggcaatgagtttatgggttctctta 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||| |||| |||||| |||| |||| |        ||||| ||||| |||||||||| |||| |    
T  41910592 cgtccacatcgaggttagaacaaccacacttgtgagagaaacaccacactcttaccaaaaatccaaaaatcttaagccaatgggtttatgggtcctctca 41910691  T
Q  104 tttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 161  Q
     ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41910692 gttataaggtattcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 41910749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 116
Target Start/End: Original strand, 28300255 - 28300364
Alignment:
Q  8 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat-gggttctcttattt 106  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  28300255 ggaccgtccacatcgaggcccgaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatggggttctcttactt 28300354  T
Q  107 ataaggtgtt 116  Q
    ||||||||||    
T  28300355 ataaggtgtt 28300364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 47129527 - 47129450
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaa 83  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  47129527 ggggaccgtccacatcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 47129450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 41854792 - 41854637
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||| |||| ||||   |||||| ||||||||||||||||||| |   ||||| |||  ||||  |    
T  41854792 ggggaccgtctacattgaggctagaacaaccgcacaagtaagaaagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcattatatttataggtcatcttgct 41854693  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||    
T  41854692 tataaggtgttcaacctttactctttta-ctgatgtgggacatataactcatacttg 41854637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 37167937 - 37167842
Alignment:
Q  8 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctta 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||  ||||||| | ||||||    
T  37167937 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaactttaagtcaatggatttatggatcctctta 37167842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 76 - 162
Target Start/End: Original strand, 28301613 - 28301699
Alignment:
Q  76 taaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28301613 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcagcttttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttg 28301699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 98 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 30244767 - 30244703
Alignment:
Q  98 ctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30244767 ctcttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttg 30244703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 98 - 162
Target Start/End: Original strand, 36109009 - 36109073
Alignment:
Q  98 ctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36109009 ctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagaaatataactcacacttg 36109073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 43241616 - 43241497
Alignment:
Q  43 gcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtg 142  Q
    ||||||||||||  | |||  |||| ||||||||||| |||| |||||||| || || ||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  43241616 gcaagagagacatcatacttttacctaaaaccttaagtcaataagtttatgagtccttttacttataaggtgttcaacctttatttttttatccgatgtg 43241517  T
Q  143 agacatataactcacacttg 162  Q
      ||||||||||||||||||    
T  43241516 gaacatataactcacacttg 43241497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 30245560 - 30245496
Alignment:
Q  98 ctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  30245560 ctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttg 30245496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 30255405 - 30255341
Alignment:
Q  98 ctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  30255405 ctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacgcacacttg 30255341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 162
Target Start/End: Original strand, 36534795 - 36534940
Alignment:
Q  15 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg 114  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||  |   ||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |  |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  36534795 ccacatcgaggctggaacaaccacacttgt--gagagacgccacactcttacccaaaaccttaagactttaggtttatgggtcctcttacttataaggtg 36534892  T
Q  115 ttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    || ||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  36534893 ttcaacctctactgttttatccgaggtgggacatataagttacacttg 36534940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 81
Target Start/End: Original strand, 28300569 - 28300644
Alignment:
Q  7 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactccta-cccaaaaccttaaggc 81  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  28300569 gggatcgtccacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaaggc 28300644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 176
Target Start/End: Original strand, 36967325 - 36967399
Alignment:
Q  101 ttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacata 176  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  36967325 ttatttataag-tgtttaatctttacttttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtacacaacaacata 36967399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 76
Target Start/End: Original strand, 37532753 - 37532821
Alignment:
Q  8 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaacctt 76  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  37532753 ggaccgtccacatcgaggctagaacaacagcacaagctagagagacaccacactcttacccaaaacctt 37532821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 159
Target Start/End: Original strand, 44361517 - 44361616
Alignment:
Q  59 actcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 158  Q
    |||| |||| |||||| |||||  ||| |||||||| |  ||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44361517 actcttacctaaaaccgtaaggttatgggtttatggatcatcttactta-aaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgagacatatatctcaca 44361615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 30244509 - 30244454
Alignment:
Q  7 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactc 62  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  30244509 gggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactc 30244454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 46 - 96
Target Start/End: Original strand, 21416181 - 21416231
Alignment:
Q  46 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 96  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21416181 agagagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggt 21416231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 98
Target Start/End: Original strand, 40094424 - 40094505
Alignment:
Q  17 acatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttc 98  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||| |||| ||||   |||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  40094424 acatcggggctagaacaaccacataagtaagaaagacgtcacactcttacccaaaactttaaagtaatgagtttatgggttc 40094505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 122
Target Start/End: Original strand, 4124128 - 4124204
Alignment:
Q  46 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacct 122  Q
    |||||||||| |||||  || |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| | |||||| |||| ||||||    
T  4124128 agagagacaccacacttttatccaaaaccttaatgcaatgagtttattggtcctctcacttataaagtgtcaaacct 4124204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 95
Target Start/End: Original strand, 23569043 - 23569091
Alignment:
Q  47 gagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggg 95  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23569043 gagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 23569091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 30245313 - 30245257
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactc 62  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  30245313 ggggaccgtccacattgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactc 30245257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 30253728 - 30253672
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactc 62  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  30253728 ggggacagtccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactc 30253672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 37393216 - 37393128
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgg 94  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||    |||||| | |||||  ||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  37393216 ggggatcgtccacatcgaggttagagcaaccacataagtggaagagacgccacacttttactcaaaacctcaaggcattgagtttatgg 37393128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 162
Target Start/End: Original strand, 40094506 - 40094550
Alignment:
Q  118 aacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  40094506 aacctttactcttttatctgatgttggacatataactcacacttg 40094550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Original strand, 514 - 671
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  514 ggggaccttccacatcgaggctagaaaaaccactcaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 613  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgt 163  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  614 tataaggtgttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacatataactcacacttgt 671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Original strand, 147 - 298
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||| ||| ||| |||   ||| |||||||| | |||||| |    
T  147 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaa-cctaaagt--atg-gtttatgg-tcctcttact 241  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  242 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Original strand, 1110 - 1275
Alignment:
Q  10 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||  |||||    
T  1110 accgtccacatcgaggctagaacaaccacataaacaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctttttcttata 1209  T
Q  110 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacat 175  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  1210 aggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacat 1275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 116
Target Start/End: Original strand, 1731 - 1801
Alignment:
Q  46 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgtt 116  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  1731 agagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctcacttataaggtgtt 1801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 159
Target Start/End: Original strand, 3092 - 3138
Alignment:
Q  113 tgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacac 159  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3092 tgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacac 3138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 6 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 47518 - 47362
Alignment:
Q  6 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  47518 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccgcgcaagcaagagagacaccacatttttacccaaaactttaaggcaatgggtttatggattctcttact 47419  T
Q  106 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  47418 tataaggtgttcaaactttactattttatcggatgtgagacatttaattcacacttg 47362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 5133 - 4984
Alignment:
Q  13 gtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataagg 112  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||| |||||||     
T  5133 gtccacatcgaggctagagcaaccgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccataaggcaatgagtttatgggtctttttacttataaga 5034  T
Q  113 tgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    | ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5033 tattaaacctttactgttctctccgatgtgagacatataattcacacttg 4984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 5477 - 5359
Alignment:
Q  44 caagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtga 143  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||     
T  5477 caagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtgg 5378  T
Q  144 gacatataactcacacttg 162  Q
     ||||||||||||||||||    
T  5377 aacatataactcacacttg 5359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 5546 - 5398
Alignment:
Q  15 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaacctt-aaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 113  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| ||||  |||||||||  |||||| |||||||||    
T  5546 ccacatcgaggcttgaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaactttaagacaatatgtttatgggccctcttacttataaggt 5447  T
Q  114 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5446 gttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttg 5398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 5931 - 5779
Alignment:
Q  15 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaac-----cttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 109  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||| || |||||||| |||||| ||| |||||      |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  5931 ccacatcgaagtttgaacaaccccacaagtaaaagagacaccacactcttactcaaaatttaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 5832  T
Q  110 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5831 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgcgacatataactcacacttg 5779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 69 - 162
Target Start/End: Original strand, 17519 - 17612
Alignment:
Q  69 aaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17519 aaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgtgacatataactcacacttg 17612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 163
Target Start/End: Original strand, 10192 - 10268
Alignment:
Q  87 gtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgt 163  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10192 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttaccattttatccgatgtgagacatataactcacacttgt 10268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 39588 - 39459
Alignment:
Q  32 caaccacacaagcaagagagacacga-cactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactctt 130  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||||  |||||||||| |||||||||   |||||| | | |||| | |||||||| ||| |||||  ||| ||    
T  39588 caaccacacaagcaagagagacgccaacacttttacccaaaac-ttaaggcaacatgtttatagttcctctcacttataaggagttcaacctccactttt 39490  T
Q  131 ttatccgatgtgagacatataactcacacttg 162  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  39489 ctatgcg-tgtgagacatataactcacacttg 39459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 771 times since January 2019
Visitors: 4393