View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0684_low_30 (Length: 395)

Name: NF0684_low_30
Description: NF0684
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0684_low_30
NF0684_low_30
[»] chr3 (47 HSPs)
chr3 (29-386)||(32796857-32797209)
chr3 (75-307)||(50347658-50347891)
chr3 (73-307)||(11180035-11180269)
chr3 (73-307)||(16811291-16811526)
chr3 (101-307)||(39640875-39641082)
chr3 (73-307)||(28561656-28561891)
chr3 (73-307)||(13150100-13150334)
chr3 (69-307)||(39653070-39653309)
chr3 (72-307)||(14813858-14814094)
chr3 (84-300)||(30529608-30529825)
chr3 (100-305)||(20885120-20885325)
chr3 (100-301)||(25230712-25230914)
chr3 (100-301)||(25238299-25238501)
chr3 (86-307)||(32227222-32227444)
chr3 (78-305)||(16810840-16811068)
chr3 (73-307)||(37044944-37045180)
chr3 (100-307)||(25230249-25230457)
chr3 (100-307)||(25237836-25238044)
chr3 (73-302)||(25803010-25803240)
chr3 (115-307)||(32227453-32227645)
chr3 (161-307)||(31284277-31284423)
chr3 (202-307)||(25238685-25238790)
chr3 (73-307)||(2911005-2911240)
chr3 (177-307)||(25239078-25239208)
chr3 (161-304)||(41472300-41472442)
chr3 (205-307)||(13150555-13150657)
chr3 (84-305)||(29224245-29224467)
chr3 (214-307)||(4067361-4067454)
chr3 (161-304)||(25248110-25248253)
chr3 (144-307)||(25802549-25802712)
chr3 (116-307)||(14820107-14820299)
chr3 (198-305)||(7493917-7494024)
chr3 (161-303)||(8067279-8067421)
chr3 (198-307)||(32386735-32386844)
chr3 (198-305)||(7477227-7477334)
chr3 (177-307)||(27187331-27187461)
chr3 (161-307)||(41473996-41474142)
chr3 (198-305)||(31103961-31104070)
chr3 (73-154)||(39653530-39653612)
chr3 (211-307)||(26309990-26310086)
chr3 (72-210)||(13155302-13155438)
chr3 (73-120)||(25238860-25238907)
chr3 (76-123)||(14814318-14814365)
chr3 (72-141)||(970875-970944)
chr3 (230-277)||(3890046-3890093)
chr3 (230-277)||(3899868-3899915)
chr3 (211-269)||(47518358-47518416)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (73-307)||(33174868-33175103)
chr2 (72-307)||(29804591-29804827)
chr2 (76-307)||(1706955-1707186)
chr2 (72-303)||(18098883-18099116)
chr2 (73-307)||(41754199-41754434)
chr2 (73-307)||(33174415-33174648)
chr2 (73-307)||(8256436-8256671)
chr2 (72-307)||(25337998-25338234)
chr2 (72-307)||(25434057-25434293)
chr2 (73-307)||(16379302-16379538)
chr2 (73-307)||(38898913-38899148)
chr2 (73-305)||(27882929-27883162)
chr2 (77-272)||(18447954-18448150)
chr2 (73-307)||(33770920-33771146)
chr2 (100-307)||(1912462-1912669)
chr2 (72-305)||(15619807-15620041)
chr2 (200-307)||(16378975-16379082)
chr2 (159-307)||(11388186-11388332)
chr2 (161-307)||(24818325-24818471)
chr2 (177-303)||(30966249-30966375)
chr2 (177-307)||(30966705-30966835)
chr2 (159-284)||(1953152-1953277)
chr2 (143-307)||(82999-83162)
chr2 (198-303)||(13191010-13191115)
chr2 (72-305)||(15639649-15639877)
chr2 (161-300)||(29259628-29259767)
chr2 (181-307)||(11394554-11394678)
chr2 (227-300)||(5399825-5399898)
chr2 (177-303)||(8073907-8074033)
chr2 (177-307)||(30963721-30963851)
chr2 (195-278)||(16542018-16542101)
chr2 (172-265)||(8181394-8181487)
chr2 (200-305)||(20502061-20502165)
chr2 (211-283)||(30963288-30963360)
chr2 (160-307)||(30961884-30962039)
chr2 (213-278)||(36924452-36924519)
chr2 (168-283)||(9909098-9909213)
chr2 (73-202)||(18098667-18098798)
chr2 (184-307)||(37552590-37552710)
chr2 (231-283)||(26864841-26864893)
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (73-307)||(6330913-6331148)
chr6 (73-304)||(20896692-20896924)
chr6 (73-305)||(20126185-20126418)
chr6 (75-307)||(3652398-3652631)
chr6 (73-307)||(20850231-20850466)
chr6 (74-307)||(23986318-23986552)
chr6 (73-305)||(2681219-2681452)
chr6 (73-307)||(11062196-11062430)
chr6 (72-307)||(14771720-14771956)
chr6 (73-303)||(21311881-21312112)
chr6 (72-307)||(2720564-2720801)
chr6 (74-305)||(23776352-23776584)
chr6 (73-307)||(15929492-15929727)
chr6 (135-296)||(31821704-31821865)
chr6 (161-307)||(16519967-16520113)
chr6 (162-307)||(9352062-9352207)
chr6 (162-307)||(13191514-13191659)
chr6 (75-301)||(15929111-15929338)
chr6 (161-307)||(7911877-7912023)
chr6 (181-307)||(13492808-13492934)
chr6 (71-307)||(21311422-21311660)
chr6 (162-307)||(17027532-17027677)
chr6 (73-307)||(2890840-2891073)
chr6 (72-307)||(17850827-17851063)
chr6 (163-303)||(20735696-20735836)
chr6 (75-305)||(17851286-17851517)
chr6 (73-234)||(3652889-3653051)
chr6 (161-303)||(7912309-7912451)
chr6 (107-302)||(27334105-27334301)
chr6 (107-302)||(27394845-27395041)
chr6 (161-305)||(17731112-17731260)
chr6 (101-307)||(12194268-12194473)
chr6 (72-307)||(33775003-33775241)
chr6 (160-303)||(17205337-17205479)
chr6 (143-307)||(9440310-9440475)
chr6 (227-307)||(13492397-13492477)
chr6 (198-307)||(1991589-1991698)
chr6 (198-303)||(32292921-32293024)
chr6 (198-301)||(20732614-20732717)
chr6 (212-306)||(28583013-28583107)
chr6 (207-307)||(9440858-9440958)
chr6 (144-307)||(33470819-33470982)
chr6 (198-305)||(10964340-10964447)
chr6 (227-305)||(28065838-28065919)
chr6 (200-300)||(30729847-30729947)
chr6 (161-251)||(9440485-9440575)
chr6 (261-307)||(28780209-28780255)
chr6 (201-300)||(3885098-3885194)
chr6 (166-247)||(9441054-9441135)
[»] chr4 (69 HSPs)
chr4 (73-303)||(50398537-50398768)
chr4 (73-307)||(1645744-1645979)
chr4 (73-307)||(4127432-4127668)
chr4 (72-307)||(50398988-50399224)
chr4 (73-307)||(12691994-12692229)
chr4 (73-300)||(4127891-4128120)
chr4 (73-307)||(23942784-23943016)
chr4 (72-307)||(29628663-29628898)
chr4 (75-307)||(51331276-51331509)
chr4 (73-305)||(3169116-3169349)
chr4 (72-307)||(21220326-21220563)
chr4 (73-283)||(8467819-8468029)
chr4 (73-307)||(27029188-27029422)
chr4 (73-305)||(1464057-1464290)
chr4 (73-307)||(14351705-14351940)
chr4 (101-307)||(53996110-53996317)
chr4 (75-307)||(24628972-24629208)
chr4 (161-307)||(44471320-44471466)
chr4 (77-307)||(23943237-23943464)
chr4 (73-307)||(24629428-24629662)
chr4 (162-307)||(49998636-49998781)
chr4 (73-300)||(27026414-27026640)
chr4 (72-300)||(31817854-31818083)
chr4 (161-276)||(14572176-14572291)
chr4 (73-298)||(9423862-9424088)
chr4 (178-307)||(7678617-7678746)
chr4 (84-277)||(31817423-31817617)
chr4 (73-307)||(21067648-21067876)
chr4 (161-307)||(35871627-35871772)
chr4 (161-307)||(14571716-14571862)
chr4 (165-307)||(15306086-15306234)
chr4 (101-305)||(21067220-21067425)
chr4 (73-307)||(4185624-4185860)
chr4 (90-277)||(17028801-17028989)
chr4 (161-300)||(23350285-23350424)
chr4 (228-307)||(50814820-50814899)
chr4 (126-251)||(53854858-53854984)
chr4 (181-300)||(42838642-42838763)
chr4 (164-278)||(23976243-23976357)
chr4 (202-307)||(13613893-13613997)
chr4 (178-305)||(33764876-33765003)
chr4 (212-307)||(44470870-44470964)
chr4 (172-305)||(43928961-43929093)
chr4 (211-307)||(17628560-17628656)
chr4 (198-301)||(24271552-24271654)
chr4 (159-307)||(27578904-27579052)
chr4 (201-277)||(41869957-41870033)
chr4 (200-307)||(4186205-4186312)
chr4 (200-307)||(17029368-17029475)
chr4 (198-307)||(52048662-52048770)
chr4 (100-283)||(26200304-26200491)
chr4 (228-303)||(27578456-27578531)
chr4 (229-307)||(23091506-23091584)
chr4 (227-272)||(20306191-20306236)
chr4 (227-300)||(34554494-34554567)
chr4 (177-249)||(2499647-2499719)
chr4 (143-278)||(17628948-17629084)
chr4 (200-307)||(44831035-44831142)
chr4 (165-278)||(9882612-9882723)
chr4 (161-283)||(13266085-13266207)
chr4 (237-277)||(39902478-39902518)
chr4 (200-284)||(53391925-53392009)
chr4 (166-261)||(17506389-17506484)
chr4 (71-213)||(33987160-33987303)
chr4 (201-280)||(45682242-45682321)
chr4 (258-308)||(33294886-33294936)
chr4 (73-127)||(10165873-10165927)
chr4 (159-221)||(20309599-20309661)
chr4 (147-247)||(17505916-17506016)
[»] chr7 (53 HSPs)
chr7 (73-307)||(6747599-6747834)
chr7 (73-307)||(34405592-34405827)
chr7 (73-307)||(42515455-42515689)
chr7 (73-303)||(2611657-2611888)
chr7 (73-307)||(35474122-35474357)
chr7 (73-307)||(679727-679961)
chr7 (74-307)||(36422163-36422397)
chr7 (135-307)||(46425713-46425886)
chr7 (73-307)||(2189054-2189289)
chr7 (73-283)||(43233323-43233534)
chr7 (99-307)||(28495790-28495999)
chr7 (161-307)||(42515091-42515237)
chr7 (116-307)||(2193209-2193401)
chr7 (161-307)||(2941758-2941904)
chr7 (159-303)||(6719079-6719223)
chr7 (72-262)||(26957603-26957794)
chr7 (187-307)||(2465949-2466069)
chr7 (144-307)||(28495609-28495772)
chr7 (177-307)||(13125137-13125267)
chr7 (73-301)||(29039027-29039248)
chr7 (81-307)||(35527122-35527348)
chr7 (161-307)||(9124958-9125104)
chr7 (206-307)||(2465777-2465878)
chr7 (143-307)||(25182341-25182506)
chr7 (72-307)||(29357457-29357692)
chr7 (161-307)||(11517390-11517535)
chr7 (116-277)||(22529266-22529428)
chr7 (72-246)||(3305374-3305549)
chr7 (164-307)||(26421306-26421449)
chr7 (70-204)||(2463549-2463684)
chr7 (199-307)||(5406589-5406697)
chr7 (160-307)||(31406585-31406732)
chr7 (200-307)||(26421761-26421868)
chr7 (161-307)||(18833285-18833431)
chr7 (202-307)||(9623248-9623352)
chr7 (202-298)||(31743834-31743930)
chr7 (200-307)||(36015412-36015519)
chr7 (73-205)||(10430673-10430806)
chr7 (73-254)||(16811900-16812074)
chr7 (228-300)||(16192385-16192457)
chr7 (187-307)||(20966076-20966196)
chr7 (192-303)||(11372481-11372592)
chr7 (164-283)||(11372901-11373020)
chr7 (73-120)||(2189510-2189557)
chr7 (211-303)||(1628765-1628854)
chr7 (201-283)||(6585647-6585731)
chr7 (234-307)||(7461352-7461424)
chr7 (246-307)||(13122506-13122567)
chr7 (198-266)||(33316764-33316832)
chr7 (177-252)||(13124757-13124832)
chr7 (164-307)||(37672162-37672305)
chr7 (258-307)||(7646479-7646528)
chr7 (72-122)||(16812143-16812193)
[»] chr1 (48 HSPs)
chr1 (72-307)||(16451934-16452170)
chr1 (72-307)||(16461087-16461323)
chr1 (73-307)||(43057524-43057759)
chr1 (73-307)||(20054081-20054316)
chr1 (73-307)||(20054537-20054772)
chr1 (73-307)||(20054993-20055228)
chr1 (73-307)||(20055449-20055684)
chr1 (73-307)||(20055905-20056140)
chr1 (73-307)||(20056361-20056596)
chr1 (73-307)||(20057264-20057499)
chr1 (73-307)||(52250116-52250351)
chr1 (73-307)||(20845662-20845897)
chr1 (73-307)||(20057720-20057955)
chr1 (73-307)||(43057066-43057300)
chr1 (70-305)||(30872953-30873190)
chr1 (73-307)||(38340816-38341051)
chr1 (73-307)||(20056817-20057043)
chr1 (73-307)||(31822664-31822899)
chr1 (108-303)||(50002712-50002908)
chr1 (77-307)||(12883438-12883669)
chr1 (73-305)||(7548003-7548234)
chr1 (159-307)||(50002286-50002434)
chr1 (73-307)||(50003076-50003311)
chr1 (161-307)||(20061192-20061338)
chr1 (159-307)||(12727988-12728137)
chr1 (161-302)||(35760920-35761061)
chr1 (73-307)||(51372875-51373110)
chr1 (198-307)||(2328351-2328460)
chr1 (72-278)||(10820501-10820708)
chr1 (161-300)||(35759616-35759755)
chr1 (103-307)||(2634864-2635069)
chr1 (104-303)||(16907175-16907375)
chr1 (227-307)||(20060341-20060421)
chr1 (212-307)||(46693736-46693831)
chr1 (200-300)||(16440587-16440687)
chr1 (177-305)||(23180745-23180873)
chr1 (197-300)||(2739557-2739660)
chr1 (145-300)||(2634448-2634604)
chr1 (231-295)||(31823097-31823161)
chr1 (172-279)||(842962-843069)
chr1 (73-283)||(16410748-16410960)
chr1 (260-307)||(52250641-52250688)
chr1 (260-307)||(52250978-52251025)
chr1 (72-108)||(9189351-9189387)
chr1 (195-283)||(42066114-42066202)
chr1 (244-303)||(7229948-7230007)
chr1 (214-269)||(46411173-46411228)
chr1 (73-117)||(50002443-50002487)
[»] chr5 (46 HSPs)
chr5 (73-307)||(2193726-2193961)
chr5 (72-307)||(20039476-20039711)
chr5 (73-307)||(39146849-39147084)
chr5 (73-307)||(10926947-10927183)
chr5 (72-307)||(17445456-17445692)
chr5 (73-303)||(34867700-34867931)
chr5 (72-307)||(42788647-42788882)
chr5 (85-307)||(10927404-10927628)
chr5 (73-307)||(34371978-34372213)
chr5 (73-307)||(27646836-27647072)
chr5 (72-307)||(34371521-34371757)
chr5 (73-305)||(15513015-15513249)
chr5 (73-303)||(21886151-21886382)
chr5 (73-307)||(18304341-18304576)
chr5 (84-307)||(4657994-4658217)
chr5 (161-307)||(8642035-8642181)
chr5 (72-305)||(5066894-5067127)
chr5 (198-305)||(1821942-1822049)
chr5 (161-307)||(189067-189213)
chr5 (159-303)||(8391327-8391470)
chr5 (161-307)||(2473958-2474104)
chr5 (201-307)||(2474444-2474550)
chr5 (100-283)||(16370733-16370917)
chr5 (161-307)||(3887058-3887204)
chr5 (161-307)||(22556535-22556681)
chr5 (92-277)||(42429083-42429260)
chr5 (161-307)||(3886602-3886748)
chr5 (161-307)||(22556968-22557114)
chr5 (207-307)||(4673472-4673572)
chr5 (177-307)||(29680108-29680231)
chr5 (159-305)||(30719808-30719954)
chr5 (72-307)||(1879990-1880221)
chr5 (162-276)||(24182277-24182391)
chr5 (159-300)||(2058664-2058805)
chr5 (195-295)||(11160694-11160794)
chr5 (211-303)||(18750201-18750293)
chr5 (216-303)||(20858546-20858633)
chr5 (184-278)||(43356650-43356743)
chr5 (242-307)||(11757282-11757347)
chr5 (227-307)||(30684557-30684637)
chr5 (103-283)||(32574683-32574864)
chr5 (161-242)||(22975076-22975157)
chr5 (200-272)||(39801498-39801571)
chr5 (73-250)||(4102723-4102895)
chr5 (161-283)||(5549343-5549466)
chr5 (72-119)||(8391477-8391524)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (72-307)||(2651-2887)
[»] chr8 (46 HSPs)
chr8 (72-307)||(27022339-27022575)
chr8 (73-307)||(10844793-10845028)
chr8 (73-307)||(22026289-22026524)
chr8 (73-307)||(22548996-22549231)
chr8 (71-307)||(12827255-12827492)
chr8 (72-307)||(8080343-8080579)
chr8 (73-307)||(27925809-27926044)
chr8 (73-305)||(33852261-33852493)
chr8 (73-308)||(22840529-22840765)
chr8 (72-307)||(41659106-41659341)
chr8 (73-307)||(6464911-6465146)
chr8 (73-307)||(32292307-32292542)
chr8 (81-284)||(27021903-27022111)
chr8 (73-307)||(22548550-22548785)
chr8 (73-307)||(2043965-2044203)
chr8 (73-283)||(28375079-28375290)
chr8 (73-307)||(28453249-28453483)
chr8 (162-303)||(25147536-25147677)
chr8 (177-304)||(17103096-17103223)
chr8 (177-307)||(10844616-10844746)
chr8 (159-307)||(27819247-27819395)
chr8 (161-305)||(34308482-34308626)
chr8 (192-307)||(41913000-41913115)
chr8 (195-301)||(3744671-3744777)
chr8 (161-307)||(25144771-25144917)
chr8 (161-307)||(25147966-25148112)
chr8 (162-303)||(1297007-1297148)
chr8 (206-307)||(3745145-3745246)
chr8 (161-307)||(34308936-34309086)
chr8 (161-307)||(12100691-12100836)
chr8 (81-259)||(29971450-29971629)
chr8 (202-301)||(15819022-15819121)
chr8 (100-272)||(6466648-6466820)
chr8 (177-272)||(22705187-22705282)
chr8 (177-307)||(21316110-21316240)
chr8 (160-277)||(30334939-30335056)
chr8 (211-307)||(15567557-15567653)
chr8 (200-307)||(30527483-30527589)
chr8 (240-307)||(31283652-31283719)
chr8 (213-278)||(15568035-15568100)
chr8 (100-303)||(6466194-6466397)
chr8 (201-273)||(17429539-17429611)
chr8 (212-269)||(36968434-36968491)
chr8 (258-305)||(10729689-10729736)
chr8 (196-307)||(28912851-28912962)
chr8 (72-190)||(44041799-44041918)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (73-307)||(1130-1365)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (72-307)||(4470-4706)
scaffold0333 (73-307)||(4926-5166)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (73-307)||(154668-154902)
scaffold0002 (72-210)||(151550-151686)
[»] scaffold0047 (3 HSPs)
scaffold0047 (100-307)||(18136-18343)
scaffold0047 (100-307)||(17599-17807)
scaffold0047 (73-170)||(17817-17916)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (73-274)||(23583-23785)
[»] scaffold0499 (1 HSPs)
scaffold0499 (159-307)||(2052-2200)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (161-276)||(245085-245200)
scaffold0005 (161-307)||(245514-245660)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (177-307)||(162679-162809)
scaffold0022 (156-307)||(69816-69967)
scaffold0022 (261-307)||(163135-163181)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (162-307)||(18966-19111)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (161-301)||(2217-2357)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (161-307)||(107464-107610)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (161-307)||(10299-10445)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (162-307)||(105720-105865)
[»] scaffold0557 (2 HSPs)
scaffold0557 (207-307)||(2150-2250)
scaffold0557 (73-211)||(660-799)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (161-279)||(142303-142421)
[»] scaffold0664 (2 HSPs)
scaffold0664 (161-283)||(4007-4129)
scaffold0664 (75-110)||(4172-4207)
[»] scaffold0391 (1 HSPs)
scaffold0391 (84-307)||(14663-14886)
[»] scaffold0442 (1 HSPs)
scaffold0442 (73-204)||(2414-2547)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (201-273)||(45425-45497)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (248-307)||(13534-13593)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (177-303)||(26085-26211)
scaffold0036 (166-278)||(16038-16152)
[»] scaffold1138 (1 HSPs)
scaffold1138 (197-271)||(734-808)
[»] scaffold0277 (1 HSPs)
scaffold0277 (261-307)||(14703-14749)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (230-307)||(7009-7087)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 47)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 29 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 32797209 - 32796857
Alignment:
Q  29 atagaatatggtgtcaaatttgtgtaagaccttgtttaatttgttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgac 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32797209 atagaatatggtgtcaaatttgtgtaagaccttgttt-----gttgtaacacccaaggctaacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaag-tatgac 32797116  T
Q  129 aatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagac 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32797115 aatgaacggctcccgacagcttctagacaagccgaatcacatcgaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgaaactacatggttgaagcaagac 32797016  T
Q  228 ttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagtatcattaattttatgtatag 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32797015 ttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttttgtagcacattccataagaactccacagtatcattaattttatgtatag 32796916  T
Q  328 gagctatattcaactttcattcacctaaaaatcacttatatatgtgagtcaagtattat 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32796915 gagctatattcaactttcattcacctaaaaatcacttatatatgtgagtcaagtattat 32796857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 75 - 307
Target Start/End: Original strand, 50347658 - 50347891
Alignment:
Q  75 taacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||  | |||||||||  |  |    
T  50347658 taacacccaaggctgacgagggcggggagtgatcgccggtgcacaaggaacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacgccgga 50347757  T
Q  174 ataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttc 273  Q
    || |||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50347758 atgagagggatcctgaggccttgtatgtatgagactacttggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatcttc 50347857  T
Q  274 tttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  50347858 tttttggtagctcattccataagaactccacagt 50347891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 11180269 - 11180035
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||  | ||||||||   |     
T  11180269 tgtaacacccaaggctgaagagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggtacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaaccgaatcagc-cg 11180171  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11180170 gaatgagagggatcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatct 11180071  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  11180070 tcttttcggtagctcatttcataagaactccacagt 11180035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 16811291 - 16811526
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||  |  |||||||||||     
T  16811291 tgtaacacccaaggctgacgagggtggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaatcgaatcacatcg 16811390  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||||||||||| || ||||||| || |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16811391 gaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtttgggactccatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatttcaacaagatgcatct 16811490  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  16811491 tcttttcggtagctcattccataagaattccacagt 16811526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 101 - 307
Target Start/End: Original strand, 39640875 - 39641082
Alignment:
Q  101 gagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtag 199  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||  |  |||||||||||| ||| |||| ||||||||| || |||||    
T  39640875 gagtggtcgtcggtgcacaagacatgacaatgaacggctcccgacagcttttagaagaatcgaatcacatcagaatgagagagatcctgaggccgtgtag 39640974  T
Q  200 gtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaac 299  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  39640975 gtatgagactacatggttgaaggaagacttataagagttgtttggtactacctatatcaataagatgcatcttctttttggtagctcattccataagaac 39641074  T
Q  300 tccacagt 307  Q
    ||||||||    
T  39641075 tccacagt 39641082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 28561656 - 28561891
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| | | || ||||||||  | | |||||||| |     
T  28561656 tgtaacacccaagactgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctactgacaacttctagaggaactgaatcacaccg 28561755  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||| ||||||| || || ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28561756 gaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 28561855  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28561856 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 28561891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 13150334 - 13150100
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||| || |||||||||||  | |||||||||  |     
T  13150334 tgtaacacccaaggctgatgagggcggggagtg-tcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctctcgacagcttctagaggaaccgaatcacgccg 13150236  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13150235 gaatgagagggctcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctgtatcaacaagatgcatct 13150136  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13150135 tcttttcagtagctcattccataagaactccacagt 13150100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 69 - 307
Target Start/End: Original strand, 39653070 - 39653309
Alignment:
Q  69 ttgttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcac 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||  | | |||||||    
T  39653070 ttgttgtaacacccaaggctgacgaggacggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaactgaatcac 39653169  T
Q  168 atcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgc 267  Q
    | |  ||| |||||| ||||||| || || ||||||| |||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  39653170 accggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgttggatactacctatatcaacaagatgc 39653269  T
Q  268 atcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  39653270 atcttcttttcggtagctcattccatgagaactccacagt 39653309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 72 - 307
Target Start/End: Original strand, 14813858 - 14814094
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccgc-agcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||| | |  ||||||||||  | |||||||||| |    
T  14813858 ttgtaacacacaaggctgacgagggcgaggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaattagcggcttctgagagcttctagaggaaccgaatcacacc 14813957  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 270  Q
      ||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14813958 ggaatgagagggttcctgaggccgtgtaggtatgagactgcatggttaaaggaaggcttataataattgtttggtactacctatatcaataagatgcatc 14814057  T
Q  271 ttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||    
T  14814058 ttcttttcggtagctcgttccataagaactccacagt 14814094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 84 - 300
Target Start/End: Original strand, 30529608 - 30529825
Alignment:
Q  84 aggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagaggg 182  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| | |||||| | | ||||||| || ||||||||  | | ||||||||||  ||| ||||||    
T  30529608 aggctgacgagggcgatgagtggtcgtcagtgcacaaggcacgacaataagcagctcccgacaacttctagaggaactgaatcacatcggaatgagaggg 30529707  T
Q  183 atcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggta 282  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30529708 atcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggttgaagtaaggcttataagaattttttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggta 30529807  T
Q  283 gtacattccataagaact 300  Q
    |  |||||||||||||||    
T  30529808 gcccattccataagaact 30529825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 100 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20885325 - 20885120
Alignment:
Q  100 ggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgta 198  Q
    |||||| |||||||||||||||| | | |||||| ||||||||| || ||||||||  | || |||||||||  ||| ||||||||| ||||  | ||||    
T  20885325 ggagtgatcgccggtgcacaaggcacgccaatgagcggctcccgacaacttctagaggaacc-aatcacatcgcaatgagagggatcttgaggtcgtgta 20885227  T
Q  199 ggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaa 298  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20885226 ggtatgtgactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttgatactacctatatcaacaagatgcatcttctttttagtagcacattccataagaa 20885127  T
Q  299 ctccaca 305  Q
    |||||||    
T  20885126 ctccaca 20885120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 100 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 25230914 - 25230712
Alignment:
Q  100 ggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgta 198  Q
    |||||| || ||||||||||||| | |||||||| | ||||||| |||||| ||||  | || ||||||||   ||| |||||||||||||| |||||||    
T  25230914 ggagtgatctccggtgcacaaggcacgacaatgagcagctcccgacagcttatagaggaaccaaatcacattggaatgagagggatcctgaggccatgta 25230815  T
Q  199 ggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  25230814 ggtatgagactacatggttgaaggaaggtttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcattttctttttggtagcccattccataagaa 25230715  T
Q  299 ctc 301  Q
    |||    
T  25230714 ctc 25230712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 100 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 25238501 - 25238299
Alignment:
Q  100 ggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgta 198  Q
    |||||| || ||||||||||||| | |||||||| | ||||||| |||||| ||||  | || ||||||||   ||| |||||||||||||| |||||||    
T  25238501 ggagtgatctccggtgcacaaggcacgacaatgagcagctcccgacagcttatagaggaaccaaatcacattggaatgagagggatcctgaggccatgta 25238402  T
Q  199 ggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  25238401 ggtatgagactacatggttgaaggaaggtttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcattttctttttggtagcccattccataagaa 25238302  T
Q  299 ctc 301  Q
    |||    
T  25238301 ctc 25238299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 32227444 - 32227222
Alignment:
Q  86 gctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggat 184  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |  ||||||| ||||||||  || ||||||||  | |||||||||  |  ||| ||||||||    
T  32227444 gctgacgagggcggggagtggtcgccagtgcacaaggcacaacaatgagcggctcccaacaacttctagaggaaccgaatcacgccggaatgagagggat 32227345  T
Q  185 cctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagt 284  Q
    ||| || || |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  32227344 cctaaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatattaacaagatgcatcttctttttggtagc 32227245  T
Q  285 acattccataagaactccacagt 307  Q
     |||| |||||||||||||||||    
T  32227244 tcatttcataagaactccacagt 32227222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 78 - 305
Target Start/End: Original strand, 16810840 - 16811068
Alignment:
Q  78 cacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaata 176  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||  |  |||||||||||  |||     
T  16810840 caccgaaggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaatcgaatcacatcggaatg 16810939  T
Q  177 agagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttt 276  Q
    ||||||||| |||| || ||||| |||| |||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16810940 agagggatcttgaggccgtgtagatatgggactgcatggttgatggaaggcttataagaattgttgcgtactaactatatctacaagatgcatcttcttt 16811039  T
Q  277 ttggtagtacattccataagaactccaca 305  Q
    | |||||  ||||||||||||||| ||||    
T  16811040 tcggtagctcattccataagaacttcaca 16811068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 37044944 - 37045180
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggc-gtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    |||||||||||  |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| | | |||||| ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  37044944 tgtaacacccacagctgacgagggcaggggagtggtcaccggtgcacaaggcacgccaatgagcggctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacatc 37045043  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 270  Q
      ||| |||||||||||||| || ||||||| || |||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  37045044 tgaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtgtgggactacatgaatgaaggaatgcttataagaattgtttggtaatacctatatcaacaaggtgcatc 37045143  T
Q  271 ttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  37045144 ttctttttggtaccctattccataagaactccacagt 37045180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 25230457 - 25230249
Alignment:
Q  100 ggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgta 198  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||| ||||||||| || ||| ||||  | || |||||||||  ||  ||||||||||||||  | ||||    
T  25230457 ggagtgatagccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacatcttatagaggaaccaaatcacatcggaaggagagggatcctgaggtcgtgta 25230358  T
Q  199 ggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaa 298  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  25230357 ggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattatttggtactacctatatcaacaagatacatcttctttttggtagcccattcaataagaa 25230258  T
Q  299 ctccacagt 307  Q
    |||||||||    
T  25230257 ctccacagt 25230249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 25238044 - 25237836
Alignment:
Q  100 ggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgta 198  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||||| ||||||||| || ||| ||||  | || |||||||||  ||  ||||||||||||||  | ||||    
T  25238044 ggagtgatagccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacatcttatagaggaaccaaatcacatcggaaggagagggatcctgaggtcgtgta 25237945  T
Q  199 ggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaa 298  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  25237944 ggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattatttggtactacctatatcaacaagatacatcttctttttggtagcccattcaataagaa 25237845  T
Q  299 ctccacagt 307  Q
    |||||||||    
T  25237844 ctccacagt 25237836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 73 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 25803240 - 25803010
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||| ||  |||||||||||  | |||||||| |||     
T  25803240 tgtaacacccaaggctgactaggacggggagtggtcgctggtgcacaaggcataacaatgagcggcttccaacagcttctagatgaaccgaatcatatcg 25803141  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     |||||||||| |||| |   | |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  25803140 gaataagagggttcctaatgtcgtgtaggtatgggactgcatggttgaagtaagacttgtaagaattgtttggtactacctataaaaacaagatgtatct 25803041  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactcc 302  Q
    |||||| ||||   |||| ||||||||||||    
T  25803040 tcttttcggtatcccatttcataagaactcc 25803010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 115 - 307
Target Start/End: Original strand, 32227453 - 32227645
Alignment:
Q  115 gcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacat 213  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||  | |||||||||  |  ||| ||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||    
T  32227453 gcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacgccggaatgagagggatc-tgaggccttgtaggtatgggactacat 32227551  T
Q  214 ggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  32227552 ggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatattaacaagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagt 32227645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 161 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 31284423 - 31284277
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||| ||||  | || ||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31284423 gaatcacatcggaatgagagggatcttgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 31284324  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31284323 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 31284277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 202 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 25238790 - 25238685
Alignment:
Q  202 atgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactc 301  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  25238790 atgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactatctttatcaacaagatgcatcttctttttggtagcccattccataagaactc 25238691  T
Q  302 cacagt 307  Q
    ||||||    
T  25238690 cacagt 25238685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 2911005 - 2911240
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||  | || ||| | ||| |||   |||||||||||| | |||||||||| |     
T  2911005 tgtaacacccaagattgacgaggacggggagtggtcgccggtgcacaagacacgataataagcggatcctaacagcttctagacgaaccgaatcacacct 2911104  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||||||| ||| || || ||||||| ||| |||||||||||  ||   |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |    
T  2911105 gaatgagagggatcccgaggccgtgcaggtatgggaccacatggttgaaagaatggttataaaaattgtttgatattacctatatcaacaagatgcatat 2911204  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2911205 tctttttggtagctcattccataagaactccacagt 2911240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 177 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 25239208 - 25239078
Alignment:
Q  177 agagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttt 276  Q
    |||||||| |||||  | |||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25239208 agagggattctgaggtcgtgtaggtatgggactatatggttgaaggaacgcttataagaattttttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttt 25239109  T
Q  277 ttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25239108 ttggtagcccattccataagaactccacagt 25239078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 161 - 304
Target Start/End: Original strand, 41472300 - 41472442
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||  | |  |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41472300 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggtcgtacaggtatgagactgcatggttgaaggaag-cttataagaattgtttggtactacatatatcaac 41472398  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccac 304  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  41472399 aagatgcatcttcttttcggtagatcattccataagaactccac 41472442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 205 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 13150657 - 13150555
Alignment:
Q  205 agactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccac 304  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  13150657 agactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccac 13150558  T
Q  305 agt 307  Q
    |||    
T  13150557 agt 13150555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 84 - 305
Target Start/End: Original strand, 29224245 - 29224467
Alignment:
Q  84 aggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaat-cacatcaaaataagagg 181  Q
    ||||||| |||| || |||||||| ||| || || |||| |||||||||| ||||||| | |||||| |   ||| |||||| ||||||| ||| | |||    
T  29224245 aggctgatgaggacggggagtggttgccagttcagaaggcatgacaatgagcggctcctggcagcttttcagcaa-ccgaattcacatcagaatgaaagg 29224343  T
Q  182 gatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggt 281  Q
    | || |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  29224344 gttcatgaggccatgtagatatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatactaacaagatgcatcttcttttcggt 29224443  T
Q  282 agtacattccataagaactccaca 305  Q
    ||  ||  ||||||||||| ||||    
T  29224444 agcccaaaccataagaacttcaca 29224467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 214 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 4067454 - 4067361
Alignment:
Q  214 ggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  4067454 ggttgaaggaagacttataaaaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcattacataagaactccacagt 4067361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 161 - 304
Target Start/End: Original strand, 25248110 - 25248253
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||  ||| |||||||| || || || || ||||||| |||| ||||||| ||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25248110 gaatcacatcggaatgagagggattctaaggccgtgcaggtatgggactgcatggttaaaggaatgtttataagaattgtttggtactacctatatcaac 25248209  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  25248210 aagatgcatcttctttttggtagcccattccataataactccac 25248253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 25802712 - 25802549
Alignment:
Q  144 cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttg 243  Q
    |||||||||||  |||||| || |||   ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||| | | ||| || |||||||| |||||    
T  25802712 cagcttctagaggagccgagtctcattggaatgagagggatcatgtggccatgtaggtatgagactgcatggttaacggaaggctgataagaatggtttg 25802613  T
Q  244 gtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||| ||||||||    
T  25802612 gtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcgatagcccattccataagaaatccacagt 25802549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 116 - 307
Target Start/End: Original strand, 14820107 - 14820299
Alignment:
Q  116 cacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatg 214  Q
    ||||||| | || ||||| ||||||| | |||||||||||  | |||||||||| |  ||| |||||| ||||||| || |||||||||| | || || |    
T  14820107 cacaaggcacgataatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccgcaatgagagggttcctgagcccgtgtaggtatggggctgcacg 14820206  T
Q  215 gttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    | | ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  | ||||||||||||||||||||    
T  14820207 gctaaaggaaggcttataagaattgtttggtactacttatatcaacaagatgcatcttattttcggtagctcgttccataagaactccacagt 14820299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 198 - 305
Target Start/End: Original strand, 7493917 - 7494024
Alignment:
Q  198 aggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataaga 297  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||  ||||||||    
T  7493917 aggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagcccaaaccataaga 7494016  T
Q  298 actccaca 305  Q
    ||||||||    
T  7494017 actccaca 7494024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 161 - 303
Target Start/End: Original strand, 8067279 - 8067421
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||  ||| ||||||| |||||| || || ||||||| || | |||||||||||   | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8067279 gaatcacatcggaatgagagggaccctgaggccgtgcaggtatgggattgcatggttgaaggccggcttataagaattgtttagtactacctatatcaac 8067378  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactcca 303  Q
    |||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  8067379 aagatgcatctttttttcggtagctcattccataagaactcca 8067421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 198 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 32386844 - 32386735
Alignment:
Q  198 aggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataaga 297  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||    
T  32386844 aggtatgggactgtatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgcatcttcttttcagtagctaattccataaga 32386745  T
Q  298 actccacagt 307  Q
    ||||||||||    
T  32386744 actccacagt 32386735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 198 - 305
Target Start/End: Original strand, 7477227 - 7477334
Alignment:
Q  198 aggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataaga 297  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||  ||||||||    
T  7477227 aggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatcttcttttcggtagcccaaaccataaga 7477326  T
Q  298 actccaca 305  Q
    ||||||||    
T  7477327 actccaca 7477334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 27187461 - 27187331
Alignment:
Q  177 agagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttt 276  Q
    |||||||||||||| |  || | ||||| |||| ||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  27187461 agagggatcctgaggctgtgcatgtatgggactgcatggttaaatgaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcactaagatgcatcttcttt 27187362  T
Q  277 ttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    | |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  27187361 tcggtagctcatttcataagaactccacagt 27187331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 307
Target Start/End: Original strand, 41473996 - 41474142
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||  | |  ||||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  41473996 gaatcacatcgaaatgagagggatcttgaggtcgttcaggtatgtgactggatggttaaaggaagacttataagaattgtttgatacttcctatatcaac 41474095  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||  || ||||||||||| |  ||||| |||| |||||||||||    
T  41474096 aagattgatattctttttggtggatcattctataaaaactccacagt 41474142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 198 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 31104070 - 31103961
Alignment:
Q  198 aggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtag--tacattccataa 295  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||    ||||||||||    
T  31104070 aggtatgagattgcatggttcaaggaagacttataagaattgtttgatactatctataccaactagatgcattttctttttggtagctctcattccataa 31103971  T
Q  296 gaactccaca 305  Q
    ||||| ||||    
T  31103970 gaacttcaca 31103961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 154
Target Start/End: Original strand, 39653530 - 39653612
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctaga 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  39653530 tgtaacacccaaggctgacgagggtggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctaga 39653612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26310086 - 26309990
Alignment:
Q  211 catggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||| |||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||| |||||    
T  26310086 catggttgaaggacgatttataagaattttttgttactacatataccaaaaagatgcatcttctttatggtagctcattccattagaactcgacagt 26309990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13155438 - 13155302
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||| || || |||||||||||  | |||||||||  |    
T  13155438 ttgtaacacccaatgctgacgagggcggggagt-gtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcgg-tctcgacagcttctagaggaaccgaatcacgcc 13155341  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagacta 210  Q
     |||| ||| |||||||||| || |||||||||| |||||    
T  13155340 gaaatgaga-ggatcctgaggccttgtaggtatgggacta 13155302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 25238907 - 25238860
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25238907 tgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaa 25238860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 123
Target Start/End: Original strand, 14814318 - 14814365
Alignment:
Q  76 aacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  14814318 aacacccaaggctgacgagggcggggagtggtcaccggtgcacaaggt 14814365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 141
Target Start/End: Original strand, 970875 - 970944
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcc 141  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| | |||||||||| |||||||| |||||||    
T  970875 ttgtaacacccaaggccggcgagggcggggagtggttgccagggcacaaggtacgacaatgagcggctcc 970944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 277
Target Start/End: Original strand, 3890046 - 3890093
Alignment:
Q  230 ataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttt 277  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3890046 ataagaattgtttgctactacatatatcaacaagatgcatcttttttt 3890093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 277
Target Start/End: Original strand, 3899868 - 3899915
Alignment:
Q  230 ataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttt 277  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  3899868 ataagaattgtttggtactacatataccaacaagatgcatcttttttt 3899915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 47518416 - 47518358
Alignment:
Q  211 catggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 269  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||| || || |||||||||||||    
T  47518416 catggttgaaggaaaacttataagaattgtttgaaactatctctaccaacaagatgcat 47518358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 33174868 - 33175103
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||     
T  33174868 tgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcatgacaatgagtggctcccgacaacttctagacaagccgaatcacatcg 33174967  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33174968 gaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 33175067  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  33175068 tctttttggtagctcatttcataagaactccacagt 33175103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 72 - 307
Target Start/End: Original strand, 29804591 - 29804827
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||  |  |||||||||||    
T  29804591 ttgtaacacccaaggctgacgaggacggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgataatgagcggctcccgacagcttctagaggaatcgaatcacatc 29804690  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 270  Q
      ||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29804691 ggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggcaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatc 29804790  T
Q  271 ttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29804791 ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 29804827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 76 - 307
Target Start/End: Original strand, 1706955 - 1707186
Alignment:
Q  76 aacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaa 174  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||  |||||||  | ||||||||||||  ||    
T  1706955 aacacccaaggctaacgagggcggggagtggtcgtcggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacaatttctagaggaaccgaatcacatcggaa 1707054  T
Q  175 taagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttct 274  Q
    | ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1707055 tgagagg-atcctgagactgtgtaggtatgagactacatgattgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttct 1707153  T
Q  275 ttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||  |||  |||||||||||||||||    
T  1707154 ttttggtagcccatctcataagaactccacagt 1707186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 72 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18099116 - 18098883
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggc-gtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacat 169  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||||||| | ||||||| |||||| ||||  | |||||||||||    
T  18099116 ttgtaacacccacggctgacgagggcaggggagtgatcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcagctcccgacagcttatagaggaaccgaatcacat 18099017  T
Q  170 caaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 269  Q
    |  ||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099016 cggaatgagaggaatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaagggatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 18098917  T
Q  270 cttctttttggtagtacattccataagaactcca 303  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18098916 cttctttttggtagctcattccataagaactcca 18098883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 41754199 - 41754434
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||  | | |||||||| |     
T  41754199 tgtaacacccaaggatgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaactgaatcacaccg 41754298  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||| || |||| || || |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41754299 gaatgagagggttcttgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactatctatatcaacaagatgcatct 41754398  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  41754399 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 41754434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 33174415 - 33174648
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||     
T  33174415 tgtaatacccaaggctaacgaaggcggggagtggtcgccggtgcaaggggcatgacaatgagcggctcccgacagcttctagacgaaccgaatcacatcg 33174514  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||||||||||  || |||||||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33174515 gaatgagagggatcctgatgccgtgtaggtatgggactaca--gttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 33174612  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  33174613 tcttttcggtagcccattccataagaactccgcagt 33174648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 8256436 - 8256671
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||  |  | ||||||  |     
T  8256436 tgtaacacccaaggctgacgagggtggggagtagtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaatcaaatcacgccg 8256535  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| ||||||||| |||  || |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8256536 gaatgagagggatcttgaagccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatct 8256635  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8256636 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 8256671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 72 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 25338234 - 25337998
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||  | | |||||||| |    
T  25338234 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgaggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaactgaatcacacc 25338135  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 270  Q
      ||| |||||| |||||||  | || ||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25338134 ggaatgagagggttcctgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatc 25338035  T
Q  271 ttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||| | |||  |||| |||||||||||||||||    
T  25338034 ttcttttcgatagctcatttcataagaactccacagt 25337998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 72 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 25434293 - 25434057
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | ||||||||| || | |||||||||| |    
T  25434293 ttgtaacacacaaggctgacgagggcggggagtggccgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctaaacgaaccgaatcacacc 25434194  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 270  Q
      ||| |||||||||||||| || ||  |||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  25434193 ggaatgagagggatcctgaggccgtgctggtatgggacttcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgatacaacctttatcaacaagatgcatc 25434094  T
Q  271 ttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    | |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25434093 tcctttctggtagcccattccataagaactccacagt 25434057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 16379302 - 16379538
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtgg-agtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||  ||| || || || | |||||||| ||     
T  16379302 tgtaacacccacggctgacgagagcaagggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcagctcccaacagtttataaacgaaccgaatcaaatt 16379401  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 270  Q
      ||| |||||||||| ||| || || ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16379402 ggaatgagagggatcccgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttatacgaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 16379501  T
Q  271 ttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16379502 ttctttttggtagcacattccataagaactccacagt 16379538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 38899148 - 38898913
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||  |||| |||||  |||||||| || |||||||||||||| |||||||||     
T  38899148 tgtaacactcaagactgacgagggcggggagtggtcgttggtgcataagacatgaaaatgagtggctcccgacaacttctagacaagccaaatcacatcg 38899049  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||  |||| |||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38899048 gaaggagagtgatcttgaggccgtgtaggtatcagactacatggttgaaggagagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcattt 38898949  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  38898948 tctttttggtaacacatttcataagaactccacagt 38898913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 27883162 - 27882929
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||| ||   |||||||||| |     
T  27883162 tgtaacatccaaggctgacgaggacggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgtcagattctacacgtaccgaatcacaccg 27883063  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
    |||| |||||||||||||| || || | |||||||||| ||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  27883062 aaatgagagggatcctgaggccgtgcatgtatgagactgcattgttgaaggaatgcttataagaattgtttggtattatctatatcaataagatgcatct 27882963  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccaca 305  Q
    ||||||| ||||  | ||||||||||||||||||    
T  27882962 tcttttttgtaggccgttccataagaactccaca 27882929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 77 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18448150 - 18447954
Alignment:
Q  77 acacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaat 175  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| |||||| ||||  | ||||||||||||  |||    
T  18448150 acacctaaggctggcgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggttcccgacagcttttagaggaaccgaatcacatcggaat 18448051  T
Q  176 aagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 272  Q
     | |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18448050 gatagggatcctgaggccgtgtaggtatgtgactacatggttgaagtaagacttataagaattgtttggtactacttgtatcaacaagatgcatctt 18447954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 33770920 - 33771146
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||  | | |||||||| |     
T  33770920 tgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaactgaatcacaccg 33771019  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||| |||||||         ||||| |||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33771020 gaatgagagggttcctgag---------gtatgggactgcagggttgaagaaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 33771110  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  33771111 tcttttcggtagctcatttcataagaactccacagt 33771146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 100 - 307
Target Start/End: Original strand, 1912462 - 1912669
Alignment:
Q  100 ggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgta 198  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |  |||||| ||||  | | ||||||||||  ||| ||||||||||||||   |||||    
T  1912462 ggagtgatcgccagtgcacaaggtacgacaatgagcggctctcaacagcttttagaggaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggttatgta 1912561  T
Q  199 ggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  1912562 ggtatgagactacatggttgaaagtagatttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttc-ttttggtagcccattccataagaa 1912660  T
Q  299 ctccacagt 307  Q
    |||||||||    
T  1912661 ctccacagt 1912669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 72 - 305
Target Start/End: Original strand, 15619807 - 15620041
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccgc-agcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||  ||||| ||||| | |||||| |||||    
T  15619807 ttgtaacacccaagactgatgagagcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgatagcttatagacgaaccgaattacatc 15619906  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaag-caagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 269  Q
    | ||| |||||||||| ||  || || | |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15619907 agaatgagagggatcccgatgccgtgcaagtatgagactgcatagttgaaggcaag-cttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatacat 15620005  T
Q  270 cttctttttggtagtacattccataagaactccaca 305  Q
    ||||||||||| |   || |||||||||||||||||    
T  15620006 cttctttttggaaacccaatccataagaactccaca 15620041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 200 - 307
Target Start/End: Original strand, 16378975 - 16379082
Alignment:
Q  200 gtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaac 299  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16378975 gtatgagactgcatggttgaaggaagtcttatacgaattgtttgatactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagcacattccataagaac 16379074  T
Q  300 tccacagt 307  Q
    ||||||||    
T  16379075 tccacagt 16379082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 159 - 307
Target Start/End: Original strand, 11388186 - 11388332
Alignment:
Q  159 ccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatca 258  Q
    ||||||||||||  ||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  11388186 ccgaatcacatcggaatgagagg-atcctgatgccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgcttaaaa-aattgtttggtactacctatatca 11388283  T
Q  259 acaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11388284 acaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 11388332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 161 - 307
Target Start/End: Original strand, 24818325 - 24818471
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| || || | ||||| |||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24818325 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgcatgtatgggactgcatggttcaaggaaggcttataagaattgtttagtactacctatatcaac 24818424  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24818425 aagatgcatctttttttcggtagctcattccataagaactccacagt 24818471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 177 - 303
Target Start/End: Original strand, 30966249 - 30966375
Alignment:
Q  177 agagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttt 276  Q
    |||||||||||||| || |  ||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30966249 agagggatcctgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttt 30966348  T
Q  277 ttggtagtacattccataagaactcca 303  Q
    | ||||   ||||||||||||||||||    
T  30966349 tcggtatctcattccataagaactcca 30966375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 177 - 307
Target Start/End: Original strand, 30966705 - 30966835
Alignment:
Q  177 agagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttt 276  Q
    |||||||||||||| || |  | ||||| |||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30966705 agagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggattataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttt 30966804  T
Q  277 ttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    | |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  30966805 tcggtagctcattccataagaactccacagt 30966835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 159 - 284
Target Start/End: Original strand, 1953152 - 1953277
Alignment:
Q  159 ccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatca 258  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||   | || |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1953152 ccgaatcacatcggaatgagagggatcctgaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaagacctataagaattgtttggtactacctatatca 1953251  T
Q  259 acaagatgcatcttctttttggtagt 284  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  1953252 actagatgcatcttctttttggtagt 1953277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 143 - 307
Target Start/End: Original strand, 82999 - 83162
Alignment:
Q  143 gcagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgttt 242  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||| || |||| |||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| ||||    
T  82999 gcagcttctaggcaa-ctgaatcacgtcgaaatgagagggatcctgagattgtgcaggtatgagactacatggttgaaggtatgcttataagaatcgttt 83097  T
Q  243 ggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  83098 ggtactacctataccaacaagatgaatcttttttttggtagctcattccataagaactctacagt 83162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 198 - 303
Target Start/End: Original strand, 13191010 - 13191115
Alignment:
Q  198 aggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataaga 297  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  13191010 aggtataagactgcatggttcaaggaagacttataagaattgtttggtactacatataccaacaagatgcatcttctttttggtagtccattttataaga 13191109  T
Q  298 actcca 303  Q
    ||||||    
T  13191110 actcca 13191115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 305
Target Start/End: Original strand, 15639649 - 15639877
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||  ||||| ||||| | |||||| |||||    
T  15639649 ttgtaacacccaagactgatgagagcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgatagcttatagacgaaccgaattacatc 15639748  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 270  Q
    | ||| |||||||||| ||| |  || | |||||      ||| |||||||  |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  15639749 agaatgagagggatcccgaggctgtggaagtatg------catagttgaaggcacgcttataggaattgtttggtactacctatatcaacaacatacatc 15639842  T
Q  271 ttctttttggtagtacattccataagaactccaca 305  Q
    |||||||||| |   || |||| ||||||||||||    
T  15639843 ttctttttggaaacccaatccacaagaactccaca 15639877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 29259767 - 29259628
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  29259767 gaatcacatcggaatgagagggatcctgagaccgtacaagtatgggactgcatggttgaaggaaggcttattaaaattgtttggtactacatatatcaac 29259668  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaact 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||    
T  29259667 aagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaact 29259628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 181 - 307
Target Start/End: Original strand, 11394554 - 11394678
Alignment:
Q  181 ggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttgg 280  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11394554 ggatcctgatgccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgcttaaaa-aattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcgg 11394652  T
Q  281 tagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||   |||||||||||||| ||||||    
T  11394653 tag-ctattccataagaacttcacagt 11394678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5399898 - 5399825
Alignment:
Q  227 cttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  5399898 cttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaact 5399825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 177 - 303
Target Start/End: Original strand, 8073907 - 8074033
Alignment:
Q  177 agagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttt 276  Q
    ||||||||| |||||   || ||||||| | ||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8073907 agagggatcatgagattgtgcaggtatgggtctataaggttgaagggagacttataagaattgtttggtactacctataccaacaagatgcatcttcttt 8074006  T
Q  277 ttggtagtacattccataagaactcca 303  Q
     | ||||  |||| |||||||||||||    
T  8074007 cttgtagcccatttcataagaactcca 8074033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 177 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 30963851 - 30963721
Alignment:
Q  177 agagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttt 276  Q
    ||||||||| |||  || || ||||| |||| | ||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30963851 agagggatcatgaagccgtgcaggtaagagaatgcatggttgaaggaaaacttataagaattgtatggttctacctatatcaacaagatgcatcttcttt 30963752  T
Q  277 ttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
     ||||||  ||  |||||| |||||||||||    
T  30963751 ctggtagcccaaaccataataactccacagt 30963721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 195 - 278
Target Start/End: Original strand, 16542018 - 16542101
Alignment:
Q  195 tgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttt 278  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16542018 tgtaggtatgactctacatggttgaaggaagacttataataattgttttgtactacctatatcaacaagatgtatctttttttt 16542101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 172 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 8181487 - 8181394
Alignment:
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagat 265  Q
    |||| |||||||||| |||||| | |||||||| ||||   ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8181487 aaatgagagggatcccgagaccttataggtatgggactttgtggttgaaggaagacttttaagaattgtttggtactacctatatcaacaagat 8181394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 200 - 305
Target Start/End: Original strand, 20502061 - 20502165
Alignment:
Q  200 gtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaac 299  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||| |||||||||    
T  20502061 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactttctatatcaacaagatgcttctt-tttttggtagcccatttcataagaac 20502159  T
Q  300 tccaca 305  Q
    | ||||    
T  20502160 ttcaca 20502165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 211 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 30963360 - 30963288
Alignment:
Q  211 catggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtag 283  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30963360 catgattgaaggaaggcttataagaattgttaggtactacctatatcaacaagatgcatcttatttttggtag 30963288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 30962039 - 30961884
Alignment:
Q  160 cgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagca--------agacttataagaattgtttggtactacc 251  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||  || |||||||||| || | ||||||||||| |        || ||||||||| ||| |||||||||||    
T  30962039 cgaatcacatcagaatgagagagatcctgaagccgtgtaggtatgggattgcatggttgaaggatttaaggaagtcttataagatttgattggtactacc 30961940  T
Q  252 tatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||||   |  ||||||||||||||||||    
T  30961939 tatatcaacaagatgcatatttttttcggtagccgaaaccataagaactccacagt 30961884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 36924519 - 36924452
Alignment:
Q  213 tggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactac--ctatatcaacaagatgcatcttcttttt 278  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  36924519 tggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtattacttatatatcaacaagatgcatcttcttttt 36924452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 283
Target Start/End: Original strand, 9909098 - 9909213
Alignment:
Q  168 atcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgc 267  Q
    |||| ||| ||||||||||||| | | | || ||||||||||| |||||||||| | |  ||||||  |||  ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  9909098 atcagaatgagagggatcctgaaatcgtataagtatgagactatatggttgaaggagggtttataatgattaattggtactacctataccaacaagattc 9909197  T
Q  268 atcttctttttggtag 283  Q
    | ||||||||||||||    
T  9909198 aacttctttttggtag 9909213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18098798 - 18098667
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggc-gtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||| |||||| ||||  |  |||||||||||    
T  18098798 tgtaacacccacggctgacgagggcaggggagtgatcgccggtgcacaaggcacgacattgagcggctcccgacagcttatagaggaatcgaatcacatc 18098699  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggta 202  Q
      ||| ||||| | |||||| || ||||||||    
T  18098698 ggaatgagaggaaccctgaggccgtgtaggta 18098667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 307
Target Start/End: Original strand, 37552590 - 37552710
Alignment:
Q  184 tcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtag 283  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||| ||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||| |||||||||||| ||    
T  37552590 tcctgagaccatgcaagtatgggactgcatggtcaaa-cgagacttataagaattgtttggtactacatata-caaaatgatgc-tcttctttttggcag 37552686  T
Q  284 tacattccataagaactccacagt 307  Q
      |||||| |||||| ||||||||    
T  37552687 cgcattccgtaagaattccacagt 37552710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26864893 - 26864841
Alignment:
Q  231 taagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtag 283  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  26864893 taagaactctttggtactacctacatcgacaagatgcatcttccatttggtag 26864841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 6331148 - 6330913
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     
T  6331148 tgtaacacccaaggctgacgagggtggggagtggtcgccggtgcacaaggcatgacaatgagcggctcccgacaacttctagacaagccgaatcacatcg 6331049  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6331048 gaatgagatggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaatatgcatct 6330949  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  6330948 tcttttcggtagctcatttcataagaactccacagt 6330913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 73 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 20896924 - 20896692
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     
T  20896924 tgtaacacccaaggctgacgaggacggagagtggtcgccgttgcacaaggcatgacaatgagcggctcccgacaacttctagacaagccgaatcacatcg 20896825  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20896824 gaatgagagggatccttaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 20896725  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccac 304  Q
    ||||||  ||||  |||||||||||||||||||    
T  20896724 tcttttcagtagctcattccataagaactccac 20896692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 73 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20126418 - 20126185
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||     
T  20126418 tgtaacacccaaggccgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcatgacaatgagcggctcctgacaacttctagacaagctgaatcacatcg 20126319  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| ||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20126318 gaatgagagggatcctaaggctgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaatggtttgatactacctatatcaacaagatgcatct 20126219  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccaca 305  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20126218 tctttttggtagcacattccataagaattccaca 20126185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 75 - 307
Target Start/End: Original strand, 3652398 - 3652631
Alignment:
Q  75 taacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaa 173  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||  |    
T  3652398 taacacccaaggctgatgagggcggggagtggtcgtcggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacatcgga 3652497  T
Q  174 ataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttc 273  Q
    || |||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3652498 atgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtctgatactacctatatcaacaagatgcatcttc 3652597  T
Q  274 tttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3652598 tttttggtagttcattccataagaactccacagt 3652631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 20850231 - 20850466
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||  | |||||||||| |     
T  20850231 tgtaacacccaaggctgacgagggcgaggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccg 20850330  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||| || |||| || || ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20850331 gaatgagagggttcatgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttttgtactacctatatcaacaagatgcatct 20850430  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  20850431 tcttttcggtagctcattccataagaactctacagt 20850466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 74 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 23986552 - 23986318
Alignment:
Q  74 gtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaa 172  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||      
T  23986552 gtaatacctaaggctgacgagggcggggagtggtcgtcggtgcacaaggcatgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacatcgg 23986453  T
Q  173 aataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 272  Q
    ||| |||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23986452 aatgagagggatccggaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggtaggcttataagaattgtttggtactacctatatgaacaagatgcatctt 23986353  T
Q  273 ctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||| |||||  ||  ||||||||||| ||||||    
T  23986352 cttttcggtagctcaaaccataagaacttcacagt 23986318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 73 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 2681452 - 2681219
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||| | ||| |||||||  | |||||||||| |     
T  2681452 tgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtcgccggtacacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagtttctagaggaaccgaatcacaccg 2681353  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||| ||||||| || ||||||| || |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2681352 gaatgagagggttcctgaggccgtgtaggtttgggactgcatggttgaatgaagacttataagaattgtttggtactacccatatcaacaagatgcatct 2681253  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccaca 305  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  2681252 tcttttcggtagctcattccataagaactccaca 2681219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 11062196 - 11062430
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||| |||||||  | ||||||||||||     
T  11062196 tgtaacgcccaaggcttacgaaggcggggagtggtcaccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagtttctagaggaaccgaatcacatcg 11062295  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
    | || ||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11062296 acatgagagg-atcctgaggctgtgtaggtatgaaactacatggttgaaggaaggcttataagaagtgttttgtactacctatatcaacaagatgcatct 11062394  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11062395 tctttttggtagcccattccataagaactccacagt 11062430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 72 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 14771956 - 14771720
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||| | |||||||| || |||||| |||||||| ||  |  ||||||||  |    
T  14771956 ttgtaacacccacggctgacgagggcagggagtgatcgccggtgcgcaaggcacgacaatgagcgactcccgacagcttcttgatgaagcgaatcacgcc 14771857  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 270  Q
      ||| |||||||||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  14771856 ggaatgagagggatcccgaagccgtgtaggtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatccata 14771757  T
Q  271 ttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  14771756 ttctttttggtaatctattccataagaactccacagt 14771720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 303
Target Start/End: Original strand, 21311881 - 21312112
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccgc-agcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |  ||||||| || ||||||  |||||||| |  | | |||||||| ||    
T  21311881 tgtaacacccaaggctgacgagggcgggaagtggtcgccagtgcacaaggcacaacaatgagcgactcccgatagcttctaaaggaactgaatcacacca 21311980  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||| || |||| |  || |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21311981 gaatgagagggttcatgaggctgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttaggtactacctatatcaacaagatgcatct 21312080  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactcca 303  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||| ||||    
T  21312081 tctttttggtagcccatttcataagaaatcca 21312112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 72 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 2720801 - 2720564
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||| || || | | |||||||||||| | || ||||| | |    
T  2720801 ttgtaacacctaaggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaagtcacgacaatgagcgacttcggacagcttctagacgaaccaaatcatacc 2720702  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 270  Q
      ||| ||||||||||  ||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  2720701 ggaatgagagggatcccaaggtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatattaacaagacacatc 2720602  T
Q  271 -ttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
     || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2720601 tttttttttggtagctcattccataagaactccacagt 2720564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 74 - 305
Target Start/End: Original strand, 23776352 - 23776584
Alignment:
Q  74 gtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaa 172  Q
    |||||||| || ||||||||||  |  |||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||  | | |||||||  |      
T  23776352 gtaacaccgaaagctgacgaggatggagagtggtcgccgatgtacaaggtacgacaatgagcggcttccgacagcttctagaggaactgaatcacgccgg 23776451  T
Q  173 aataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 272  Q
    ||| ||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23776452 aatgagaggtatcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataagaatcgtctggtactacctatatcaacaagatgcatctt 23776551  T
Q  273 ctttttggtagtacattccataagaactccaca 305  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||||| ||||    
T  23776552 cttttcggtagctcatttcataagaacttcaca 23776584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 15929492 - 15929727
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||  || |||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||| | || ||||||||  |  ||||||||||||    
T  15929492 tgtaatacccaaggatgacgagggccgggtgtggtcgttggtgcataaggcatgacaatgagcggctccggacaacttctagatgaatcgaatcacatca 15929591  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     |||||||| |||||| |  || |||| ||||  |||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15929592 gaataagagagatcctaatgccttgtatgtattggactacatggttgaatgaaggcttataagaattatttggtactacctatatcaacaaaatgcatct 15929691  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15929692 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 15929727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 135 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 31821865 - 31821704
Alignment:
Q  135 cggctcccgcagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataag 234  Q
    |||||||  ||||||||||| || ||||||||||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  31821865 cggctccgacagcttctagagaaaccgaatcacatcggaatgagagggatcatgaggccatgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgcttataag 31821766  T
Q  235 aattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataag 296  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  31821765 aattatttggtactaactatatcaacaagatgcatcttttttttggtagctcattccataag 31821704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 161 - 307
Target Start/End: Original strand, 16519967 - 16520113
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16519967 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggtcgaaggaaggcttatgagatttgtttggtactacctatatcaac 16520066  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16520067 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 16520113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 162 - 307
Target Start/End: Original strand, 9352062 - 9352207
Alignment:
Q  162 aatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 261  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  9352062 aatcacatcgaaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggtcgaagggagacttataatatttgtttggtactacctatataaaca 9352161  T
Q  262 agatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9352162 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 9352207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 162 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 13191659 - 13191514
Alignment:
Q  162 aatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 261  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13191659 aatcacatcggaatgagagggatcctaagactatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 13191560  T
Q  262 agatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||| ||||||    
T  13191559 agatgcatcttcttttcggtagctcgttccataagaacttcacagt 13191514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 301
Target Start/End: Original strand, 15929111 - 15929338
Alignment:
Q  75 taacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccgc-agcttctagacaagccgaatcacatcaaa 173  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |||||| |||||||||| || || | |  | ||||||||  | |||||||||| || |    
T  15929111 taacacccaaggctgatgagggtggggagtggtcgctgatgtacaaggcatgacaatgagcgacttcagatatcttctagattaaccgaatcacaacata 15929210  T
Q  174 ataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttc 273  Q
    |||||| |||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||    
T  15929211 ataagatggatcctgaggccgtttaggtatgagactacaaggttgaagaaaagcttataagaattgtttggtaatgcctatatcaataagatgcatattc 15929310  T
Q  274 tttttggtagtacattccataagaactc 301  Q
    |||| |||||  ||||||||||||||||    
T  15929311 ttttcggtagctcattccataagaactc 15929338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 161 - 307
Target Start/End: Original strand, 7911877 - 7912023
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||  ||| || || ||||||  |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7911877 gaatcacatcggaatgagagggatctcgaggccgtgcaggtataggactgcatggttgaaggaaaacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 7911976  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  7911977 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 7912023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 181 - 307
Target Start/End: Original strand, 13492808 - 13492934
Alignment:
Q  181 ggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttgg 280  Q
    |||||||||| |  || |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13492808 ggatcctgaggctgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataataattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcgg 13492907  T
Q  281 tagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  13492908 tagctcattccataagaactccacagt 13492934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 71 - 307
Target Start/End: Original strand, 21311422 - 21311660
Alignment:
Q  71 gttgtaacacccaaggctgacgagggcgt-ggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcaca 168  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||  || || ||  |||||||||| ||  |||||||||    
T  21311422 gttgtaacacccacggctgacaagggcataggagtggtcgccggtgcacaaggaacgacaatgagaggttctcgaaagcttctagagaaaacgaatcaca 21311521  T
Q  169 tcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgca 268  Q
    ||  ||| |||||| || |||| || |  | ||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||    
T  21311522 tcggaatgagagggttcatgaggccgtacaagtatgggactgcatggttgaaggaagccttataagaattgtttggtattacctagataaacaagatcca 21311621  T
Q  269 tcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||    
T  21311622 tcttctttttggaagctcattccataagaactccgcagt 21311660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 162 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 17027677 - 17027532
Alignment:
Q  162 aatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 261  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| ||| || || ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17027677 aatcacatcggaatgagagggatccagaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 17027578  T
Q  262 agatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||| ||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  17027577 agattcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagt 17027532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 2891073 - 2890840
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||  | |||||||| ||||||| | ||| |||||||  |  |||||||||| |    
T  2891073 tgtaacacccaaggctgacgagggcagggactggttgccggtgcacaagccacgacaatgagcggctcctgacag-ttctagaggaatcgaatcacatta 2890975  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| ||||| |||| ||| || || ||||||| |||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||    
T  2890974 gaatgagagg-atcccgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggtttataagaattgttagggactacctatatcaaaaagatgcttct 2890876  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2890875 tcttttcagtagcccattccataagaactccacagt 2890840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 307
Target Start/End: Original strand, 17850827 - 17851063
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    |||||| || ||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||| ||| || ||||||||| | |||||||||| |    
T  17850827 ttgtaatactcaaggctaacaagggcgggaagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaattagcggcttccgacaacttctagacgaaccgaatcacacc 17850926  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 270  Q
      ||| ||||||||||||||  | || | ||||| |||| ||||||| ||  ||  || ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17850927 ggaatgagagggatcctgaggtcgtgcaagtatgggactgcatggttaaaagaatgctgataagatatgtttggtactacctttatcaacaagatgcatc 17851026  T
Q  271 ttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  17851027 ttctttctggtagcccattctataagaactccacagt 17851063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 163 - 303
Target Start/End: Original strand, 20735696 - 20735836
Alignment:
Q  163 atcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaa 262  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  20735696 atcacatcataatgagagggatcttgagactgtgtaggtatgtgactacatgattgtaggaaggcttataagaattgtttgatactacttatatcaacaa 20735795  T
Q  263 gatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactcca 303  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||    
T  20735796 gatgcatcttcttttcggtagtccattctataaaaactcca 20735836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 305
Target Start/End: Original strand, 17851286 - 17851517
Alignment:
Q  75 taacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaa 173  Q
    ||||||||||||||  |||||||| | |||| |||||||||||||||| | || ||| | |||||   | || ||||||||| | |||||||||| |  |    
T  17851286 taacacccaaggctaccgagggcgggaagtgttcgccggtgcacaaggcacgataattagcggctttagacaacttctagacgaaccgaatcacaccgga 17851385  T
Q  174 ataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttc 273  Q
    || |||||||||| ||| || || | ||||| |||| ||||||| ||  ||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17851386 atgagagggatcccgaggccgtgcaagtatgggactgcatggttaaaagaaggcttataagatatgtttggtactacctttatcaacaagatgcatcttc 17851485  T
Q  274 tttttggtagtacattccataagaactccaca 305  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  17851486 tttttggtagcccattctataagaactccaca 17851517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 234
Target Start/End: Original strand, 3652889 - 3653051
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||  | |||| |||||||     
T  3652889 tgtaacacccaagactgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagatgaaccgactcacatcg 3652988  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataag 234  Q
     ||| |||||||||||||| |  |||||||||| |||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  3652989 gaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgggactgcatggttgaacgaaggcttataag 3653051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 161 - 303
Target Start/End: Original strand, 7912309 - 7912451
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||  ||| || || ||||||| |||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7912309 gaatcacatcggaatgagagggatctcgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaaacttatatgaattgtttggtactacctatatcaac 7912408  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactcca 303  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  7912409 aagatgcattttcttttcggtagctcattccataagaactcca 7912451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 302
Target Start/End: Original strand, 27334105 - 27334301
Alignment:
Q  107 tcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatga 205  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||  |||||| ||||  | | |||||||| |  ||  |||||| |||||||  | || |||||||     
T  27334105 tcgccggtgcacaaggcacgacaatgaacgactcccaacagcttatagaggaactgaatcacaccggaacgagagggttcctgaggtcgtgcaggtatgg 27334204  T
Q  206 gactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactcc 302  Q
     ||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  27334205 aactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgaatcttcttttcggtagctcattccataagaactcc 27334301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 302
Target Start/End: Original strand, 27394845 - 27395041
Alignment:
Q  107 tcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatga 205  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||  |||||| ||||  | | |||||||| |  ||  |||||| |||||||  | || |||||||     
T  27394845 tcgccggtgcacaaggcacgacaatgaacgactcccaacagcttatagaggaactgaatcacaccggaacgagagggttcctgaggtcgtgcaggtatgg 27394944  T
Q  206 gactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactcc 302  Q
     ||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  27394945 aactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgaatcttcttttcggtagctcattccataagaactcc 27395041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 17731260 - 17731112
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| || |  ||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17731260 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgttcaggtatgggactgcatggttaaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 17731161  T
Q  261 a----agatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccaca 305  Q
    |    |||||||||||||||| |||||  |||||  |||||||||||||    
T  17731160 aagatagatgcatcttcttttcggtagctcattctttaagaactccaca 17731112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 307
Target Start/End: Original strand, 12194268 - 12194473
Alignment:
Q  101 gagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtag 199  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||  |||| | ||||| | || ||||||| ||| |||||||||||   ||| ||||| ||||||||||| || ||    
T  12194268 gagtggtcgctggtgcacaagttaagaggatgagctgctcctgacatcttctagtcaaaccgaatcacattggaatgagaggaatcctgagaccgtgcag 12194367  T
Q  200 gtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaac 299  Q
     ||||| ||| |||| |||||| ||||||||||| | || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||    
T  12194368 atatga-actgcatgattgaagaaagacttataa-atttttttggcactatctatatcaacaagatgcatcttcttttttataattcattccataagaac 12194465  T
Q  300 tccacagt 307  Q
    ||||||||    
T  12194466 tccacagt 12194473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 33775241 - 33775003
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |  | |||||||| |||||||||||| | || ||||| | ||||||  ||| ||||| ||||  |||||||||      
T  33775241 ttgtaacacccaaggttgatgaggacaggtagtggtcgtcggtgcacaaggcacgataatgagcagctcccaacagtttctacacaaaacgaatcacact 33775142  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaaga--tgca 268  Q
      ||| |||| ||||  ||| || || | ||||| |||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  33775141 ggaatgagagtgatcgcgaggccgtgcaagtatgtgaccgcatggttgaaggaaggattataagaattgtctggtgctacctatatcaacaagagatgca 33775042  T
Q  269 tcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  33775041 tcttctttttgatagtccattccataagaactccacagt 33775003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 303
Target Start/End: Original strand, 17205337 - 17205479
Alignment:
Q  160 cgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaa 259  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||  ||||||||||  ||||||| ||| |||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  17205337 cgaatcacatcggaattagagggattttgagaccatggtggtatgaaactgcatgattgaatgaagaattataagaattgtttggtactacctttaccaa 17205436  T
Q  260 caagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactcca 303  Q
    |||||| ||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  17205437 caagattcatctt-gttttggtagcccattccataagaactcca 17205479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 143 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 9440475 - 9440310
Alignment:
Q  143 gcagcttctagacaag-ccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtt 241  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||   | || |||||||  ||| ||||||||||  ||  |||||||||||||||    
T  9440475 gcagcttctagggaagaccgaatcacatcggaatgagagggatcctgaagtcgtgcaggtatggaactgcatggttgaatgaaagcttataagaattgtt 9440376  T
Q  242 tggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||  || |||||||||||| ||||||    
T  9440375 cggtactacttatatcaacaagatgcattttcttttcggtagctcactccataagaacttcacagt 9440310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 307
Target Start/End: Original strand, 13492397 - 13492477
Alignment:
Q  227 cttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||    
T  13492397 cttataagaattgtttgatattacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctaattccataagaactccacagt 13492477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 198 - 307
Target Start/End: Original strand, 1991589 - 1991698
Alignment:
Q  198 aggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataaga 297  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||    
T  1991589 aggtatgagactacatggttggaagaaggcttacaagaattgtttggtattacatatctaaacaagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataaga 1991688  T
Q  298 actccacagt 307  Q
    ||| ||||||    
T  1991689 acttcacagt 1991698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 198 - 303
Target Start/End: Original strand, 32292921 - 32293024
Alignment:
Q  198 aggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataaga 297  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||| |||  |||||  ||||||    
T  32292921 aggtatgagactgcatggttgaatgaaggcttataagaattgtttggtactacctataccaacaaaatacatcttgtttttagtaacacatt--ataaga 32293018  T
Q  298 actcca 303  Q
    ||||||    
T  32293019 actcca 32293024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 198 - 301
Target Start/End: Original strand, 20732614 - 20732717
Alignment:
Q  198 aggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataaga 297  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||  ||||| |||| |    
T  20732614 aggtatgtgactacatggttgtaggaaggcttataagaattatttggtactacctatattaataatatgcatattcttttcggtagcccattcaataaaa 20732713  T
Q  298 actc 301  Q
    ||||    
T  20732714 actc 20732717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 306
Target Start/End: Original strand, 28583013 - 28583107
Alignment:
Q  212 atggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacag 306  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28583013 atggttgaatgaaggcttataagaattatttgatacgatctatatcaacaagatgcatcatctttccggtagttcattccataagaaatccacag 28583107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 9440958 - 9440858
Alignment:
Q  207 actacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacag 306  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||  ||  ||||||||||| |||||    
T  9440958 actacatggttgaaggaatgcttataagaattctttggtactacttttatcaacaagatgcattttcttttcagtagcccaaaccataagaacttcacag 9440859  T
Q  307 t 307  Q
    |    
T  9440858 t 9440858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 307
Target Start/End: Original strand, 33470819 - 33470982
Alignment:
Q  144 cagcttctagacaagccgaat-cacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgttt 242  Q
    |||||||||||| |  ||||| || |||| ||| || |||| ||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| ||  ||    
T  33470819 cagcttctagacgaatcgaattcatatcagaatgagtgggaccctaagatcatgttggtaagagacttcatggttaaaggaagacttattaga-ttactt 33470917  T
Q  243 ggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  33470918 ggtattacctatactaacaagatgcatattcttttttgtagttcattacataagaattccacagt 33470982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 198 - 305
Target Start/End: Original strand, 10964340 - 10964447
Alignment:
Q  198 aggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataaga 297  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||  || |||||||||||||   | ||||||| |    
T  10964340 aggtatgagactgtatggtagaagaaagacttacaagaattgtttggtactacatatatcaataaaataaatattctttttggtagcttaatccataaaa 10964439  T
Q  298 actccaca 305  Q
    ||||||||    
T  10964440 actccaca 10964447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 28065919 - 28065838
Alignment:
Q  227 cttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc---ttctttttggtagtacattccataagaactccaca 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||   || ||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  28065919 cttataagaattgtttggtactatctctatcaacaagatgcatctttttttttttggtagcttattccataagaactccaca 28065838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 30729947 - 30729847
Alignment:
Q  200 gtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaac 299  Q
    |||||||||  ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||  |||||||||| ||||||  |||| ||||||||    
T  30729947 gtatgagacagcatggttgaaggaggactcataaaaattgtttggtactacgtatataaacatgattgatcttcttttgggtagtcaattctataagaac 30729848  T
Q  300 t 300  Q
    |    
T  30729847 t 30729847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 9440575 - 9440485
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacc 251  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||   | || ||||||| |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9440575 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaagtcgtgcaggtatgggacttcatggttgaatgaaggcttataagaattgtttggtactacc 9440485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 307
Target Start/End: Original strand, 28780209 - 28780255
Alignment:
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28780209 aagatgcatcttgttttcggtagctcattccataagaactccacagt 28780255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 3885194 - 3885098
Alignment:
Q  201 tatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaact 300  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| || ||   ||||||||||||   ||||||||||||||    
T  3885194 tatgagactgcatagttgaaggaatgcttaaaagaattgtttggtactacatatactaacaaaataca---tctttttggtagcttattccataagaact 3885098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 247
Target Start/End: Original strand, 9441054 - 9441135
Alignment:
Q  166 acatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtac 247  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |  || || || |||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  9441054 acatcaaaatgagaggaatcctaaagccgtgcagatatgtgactacatgattgaaggaaagcttataagaattgtttggtac 9441135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 69)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 73 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 50398768 - 50398537
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     
T  50398768 tgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcatgacaatgagcggctcccgacaacttctagacaagccgaatcacatcg 50398669  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50398668 gaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtataggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 50398569  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactcca 303  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  50398568 tcttttcggtagctcattccataagaactcca 50398537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 1645979 - 1645744
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||     
T  1645979 tgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacatcg 1645880  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| ||||| ||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1645879 gaatgagaggaatcttgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtattacctatatcaacaagatgcatct 1645780  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1645779 tctttttggtagcccattccataagaactccacagt 1645744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 4127668 - 4127432
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttcta-gacaagccgaatcacatc 170  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| || |||||| ||  | ||||||||||||    
T  4127668 tgtaacacccaagactgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacaacttctaagaggaaccgaatcacatc 4127569  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 270  Q
      ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4127568 ggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgggactacatagttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 4127469  T
Q  271 ttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4127468 ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 4127432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 72 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 50399224 - 50398988
Alignment:
Q  72 ttgtaaca-cccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacat 169  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| | | || |||||||||||||||||||||||    
T  50399224 ttgtaacatcccagggctgacgagggcg-ggagtggtcgccagtgcacaaggcatgacaatgagcggcttctgacaacttctagacaagccgaatcacat 50399126  T
Q  170 caaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 269  Q
    |  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50399125 cggaatgagagggatcctgagaccgtgtaggtatgagattacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacacgatgcat 50399026  T
Q  270 cttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  50399025 cttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 50398988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 12692229 - 12691994
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||  | |||||||||| |     
T  12692229 tgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccg 12692130  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||| ||||||| || || ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12692129 gaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 12692030  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12692029 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 12691994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 73 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4128120 - 4127891
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttcta-gacaagccgaatcacatc 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||| ||  |  |||||||||||    
T  4128120 tgtaacacccaaggctgacgagggcgaggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccaacagcttctaagaggaatcgaatcacatc 4128021  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 270  Q
      ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4128020 ggaatgagagggatcctgaggccatgtaggcatgagactatatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 4127921  T
Q  271 ttctttttggtagtacattccataagaact 300  Q
    ||||||| |||||   ||||||||||||||    
T  4127920 ttcttttcggtagccaattccataagaact 4127891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 23943016 - 23942784
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||   ||||| | |||||||||||  | ||||||||||||     
T  23943016 tgtaacacctaaggatgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatga---gctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacatcg 23942920  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23942919 gaatgagagggatcctggggccgtgtaggtatggaactacatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 23942820  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23942819 tcttttttgtagcacattccataagaactccacagt 23942784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 72 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 29628898 - 29628663
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | ||||||  |||| | | |||||||||||  | ||||||||||||    
T  29628898 ttgtaacatccaaggcggacgaggacggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgccaatgagtggcttctgacagcttctagaggaaccgaatcacatc 29628799  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 270  Q
     |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  29628798 gaaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgtgtc 29628699  T
Q  271 ttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    || | ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29628698 tt-tgtttggtagcccattccataagaactccacagt 29628663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 75 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 51331509 - 51331276
Alignment:
Q  75 taacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccgc-agcttctagacaagccgaatcacatcaaa 173  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| ||||| ||| ||||   | ||||||||||||||||||||||||  |    
T  51331509 taacacccaaggctgatgagggcggggagtggttgtcggtgcacaaggcatgataatgagcggttccctataacttctagacaagccgaatcacatcgga 51331410  T
Q  174 ataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttc 273  Q
    || ||||| ||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  51331409 atgagaggaatcatgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactatctatatcaacaagatacatcttc 51331310  T
Q  274 tttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||| |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  51331309 ttttcggtagctcatttcataagaactccacagt 51331276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 73 - 305
Target Start/End: Original strand, 3169116 - 3169349
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||  | |||||||| || |||| | |||||| ||||  | ||||||||||||     
T  3169116 tgtaacacccaaggttgacgaggacggggagtggtcaccggtgcacaagacacgacaatgagcgactcctgacagcttatagaggaaccgaatcacatcg 3169215  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| ||||| ||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3169216 gaatgagaggaatcatgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataaaaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 3169315  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccaca 305  Q
    |||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  3169316 tctttttggtaacccaatccataagaactccaca 3169349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 72 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 21220563 - 21220326
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtgg-agtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacat 169  Q
    |||||||||||| | || ||||| || ||| ||||||| | ||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||  | |||||||||||    
T  21220563 ttgtaacacccacgactaacgagagcatgggagtggtcactggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccggcagcttctagaggaaccgaatcacat 21220464  T
Q  170 caaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 269  Q
    || ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21220463 cagaatgagagggatcatgaggccatgtaggtatgaaactatatggttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 21220364  T
Q  270 cttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||||||   ||||| ||||||||| ||||||    
T  21220363 cttctttttggtaactcattctataagaactacacagt 21220326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 73 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8468029 - 8467819
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||  ||||||| | |||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  8468029 tgtaacgcccgaggttgacgagggcggggagtggtcgccagtgcacaaggcatgacattgcgcggctcctggcagcttctaggcaa-ccgaaccacatca 8467931  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| | ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8467930 gaatgaaagggatcctgagactgtgcaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctataccaacaagatgcatct 8467831  T
Q  272 tctttttggtag 283  Q
    |||||| |||||    
T  8467830 tcttttcggtag 8467819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 27029188 - 27029422
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccgc-agcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||| | |  ||||| |||  || |||||| ||||||    
T  27029188 tgtaacacccgaggctgacgagggcggggagtggtcgccaatgcacaatgtatgacaatgagcggcttctggtagcttataggaaaaccgaattacatca 27029287  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||||| | | ||||||| ||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27029288 gaatgagagggattcgg-gaccatgcaggaatgagactacacgattgaaggaagacttataagaattatttggtactacttatatcaacaagatgcatct 27029386  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27029387 tcttttcggtagcccattccataagaactccacagt 27029422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 305
Target Start/End: Original strand, 1464057 - 1464290
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    ||||||||||||| || |||| | ||  ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||  || || ||| ||||| | |||||||||||||    
T  1464057 tgtaacacccaagactaacgaagacggagagtggtcgccggtgcataagacatgacaatgaacggctttcgacaccttttagacgaaccgaatcacatca 1464156  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| ||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1464157 gaatgagagggatcatgcgaccgtgtaggtatgagaatacatagttgaaagaaaacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 1464256  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccaca 305  Q
    |||||| |||||  |||| |||||||||| ||||    
T  1464257 tcttttcggtagctcatttcataagaacttcaca 1464290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 14351705 - 14351940
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    ||||||||||||||||||  |||    |||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||    
T  14351705 tgtaacacccaaggctgataaggctagggagtggttgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacaacttctagacaaaccgaatcacacca 14351804  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| ||||||||||||||  | || | ||||||| || ||||||||||| ||| ||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14351805 gaatgagagggatcctgaggtcgtgcatgtatgagtctgcatggttgaaggaaggcttgtaagagttttttggtactatctatatcaacaagatgcatct 14351904  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  14351905 tctttttggtatcctattccataagaactccacagt 14351940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 101 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 53996317 - 53996110
Alignment:
Q  101 gagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtag 199  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  || ||| ||||  | ||||||||||||  ||| ||| |||||||||| | ||||||    
T  53996317 gagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccaacaacttttagaggaaccgaatcacatcggaatgagaaggatcctgaggctatgtag 53996218  T
Q  200 gtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaac 299  Q
     |||| |||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  53996217 atatgggactacatggttgaaggaatgcttataaaaattgtttggtactacctatatcaacaagattcatcttctttttggtatctcattccataagaac 53996118  T
Q  300 tccacagt 307  Q
    ||||||||    
T  53996117 tccacagt 53996110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 75 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 24629208 - 24628972
Alignment:
Q  75 taacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaa 173  Q
    ||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||||| ||  | |||||||||| |  |    
T  24629208 taacacctaaggctaacgagggacaggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttcttgaggaaccgaatcacaccgga 24629109  T
Q  174 ataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaa---gacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 270  Q
    || |||||| ||||||| || |||||||||| |||| ||||||| ||| ||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24629108 atgagagggttcctgaggccgtgtaggtatgggactgcatggttaaaggaattaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 24629009  T
Q  271 ttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||  ||||  | ||||||||||||||||||||    
T  24629008 ttcttttcagtagctcgttccataagaactccacagt 24628972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 161 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 44471466 - 44471320
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||  ||| |||| |||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44471466 gaatcacatcggaatgagagagatcttgaggccgtacaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 44471367  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  44471366 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 44471320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 77 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 23943464 - 23943237
Alignment:
Q  77 acacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaat 175  Q
    ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||||||||| |  ||| | |||||||| ||||||  | |||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  23943464 acacctaaggatgacgaggacggagagtggtcgccggtgtatgaggcacgacaatgagcggctcttgacagcttctagaggaaccgaatcacatcaaaat 23943365  T
Q  176 aagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 275  Q
     | |||||||||||| |  ||||||||||  ||   |||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23943364 gatagggatcctgaggcg-tgtaggtatgtcac---atggttgaaggaagacttataaaaaatatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 23943269  T
Q  276 tttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23943268 tttggtagcacattccataagaactccacagt 23943237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 24629662 - 24629428
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||  | |||||||||||  | |||||||||| |     
T  24629662 tgtaacacccaaggctaacgaggtgg-ggagtggtcgccggttcacaaggcacgacaatgagcggctcttgacagcttctagaggaaccgaatcacaccg 24629564  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||| |||||||  | |||||||||| |||| ||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24629563 gaatgagagggttcctgaggtcgtgtaggtatgggactgcatggttaaaggaatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 24629464  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| ||||   | ||||||||||| ||||||||    
T  24629463 tcttttcggtacctcgttccataagaattccacagt 24629428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 162 - 307
Target Start/End: Original strand, 49998636 - 49998781
Alignment:
Q  162 aatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 261  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||| || |  |||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49998636 aatcacatcggaatgagagggatcctaaggctgtgtaggcatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 49998735  T
Q  262 agatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  49998736 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 49998781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 73 - 300
Target Start/End: Original strand, 27026414 - 27026640
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccgc-agcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||| ||| |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||| |  ||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  27026414 tgtaacgcccgaggctgacgagaacggggagtggtcgtcggtgcacaaggcatgacaatgagcgactcctggtagcttttaggcaaaccgaatcacatca 27026513  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| ||||||||  || |||  || ||||||| ||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27026514 gaatgagagggatattg-gacggtgcaggtatgggactacacgattgaaggaaggcttataagaattgtttgatactacctatatcaacaagatgcatct 27026612  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaact 300  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  27026613 t-tttttggtagcccattccataagaact 27026640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 72 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 31818083 - 31817854
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccgca-gcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    ||||||||||| ||  |||||| || | |||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| | | |  |||||||||||    
T  31818083 ttgtaacacccgagattgacgatggtggggagtgatcgccgatgcacaaggcatgacaataaacggatcccgaaagcttctggtcgaatcgaatcacatc 31817984  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 270  Q
      ||||||||||||  ||||  |||| | ||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31817983 ggaataagagggattatgaggtcatgcatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttcggtactacctataccaacaagatgcatc 31817884  T
Q  271 ttctttttggtagtacattccataagaact 300  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  31817883 ttcttttcggtagtccatttcataagaact 31817854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 161 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 14572291 - 14572176
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572291 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgggactacatggttgaagggaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 14572192  T
Q  261 aagatgcatcttcttt 276  Q
    ||||||||||||||||    
T  14572191 aagatgcatcttcttt 14572176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 73 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 9424088 - 9423862
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||  |  |||||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||| ||  |||||||| |  ||||||||| | |||||||||| |     
T  9424088 tgtaacacccacagaagacgagggcggggagtggtcgtcggtgcacaaggcacgacaaagagtggctcccgacgacttctagacgaaccgaatcacaccg 9423989  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| ||||||||||||||  | || | ||||| |||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9423988 gaatgagagggatcctgaggtcgtgcatgtatgggactgcatggttgaaagaaggcttataataattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 9423889  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaa 298  Q
    ||||| | ||||  |||||||||||||    
T  9423888 tctttctagtagcccattccataagaa 9423862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 178 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 7678746 - 7678617
Alignment:
Q  178 gagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttt 277  Q
    |||||||| |||| || |||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7678746 gagggatcttgaggccttgtaggtatggggctacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttt 7678647  T
Q  278 tggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
     |||||   |||||||||||||||||||||    
T  7678646 cggtagcttattccataagaactccacagt 7678617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 84 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31817617 - 31817423
Alignment:
Q  84 aggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagaggg 182  Q
    |||||||||||| || ||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||  || ||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  31817617 aggctgacgaggccggggagtggtcaccagtgcacaaggcatgacaatgagcggttcccgacaatttttagacaaggagaatcacatcgaaataagaggg 31817518  T
Q  183 atcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttt 277  Q
    ||| ||||  | || | |||||||||| ||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  31817517 atcatgaggtcgtgcatgtatgagacttcatggttgaaggaacgtttataataattgtttggtactacctataccaacaaaatgcatcttctttt 31817423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 21067648 - 21067876
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||| ||  || ||||| | |||||||||| ||    
T  21067648 tgtaacacccaagt-tgatgagggcggggagtggtcgccggtgcagaaggcacgacaatgagcggctcccgacaaattatagacgaaccgaatcacacca 21067746  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     |||   |   |||| ||| || || ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||       
T  21067747 gaatggaa---atcccgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtgctacctatatcaacaagataca--- 21067840  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  21067841 tttttttggtagtccattccataagaacttcacagt 21067876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 161 - 307
Target Start/End: Original strand, 35871627 - 35871772
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| || |  ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  35871627 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgggacttcatggttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtaccacctatatcaac 35871726  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  35871727 aagatgcat-ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 35871772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 161 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 14571862 - 14571716
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||| |||| || |||||||||| |||| |||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14571862 gaatcacatcataatgaaagggatcttgagtccgtgtaggtatgggacttcatggttgaagggatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 14571763  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||||||||||  ||||   |  ||||||||||||||||||    
T  14571762 aagatgcatcttcttttcagtagcctaaaccataagaactccacagt 14571716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 165 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 15306234 - 15306086
Alignment:
Q  165 cacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattg------tttggtactacctatatca 258  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||      ||||||||||||||||| |    
T  15306234 cacatcagaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgggactacatggtcgaaagaagacttataagatttgagcaattttggtactacctatataa 15306135  T
Q  259 acaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15306134 acaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 15306086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 101 - 305
Target Start/End: Original strand, 21067220 - 21067425
Alignment:
Q  101 gagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtag 199  Q
    |||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||| || ||| ||||| |  ||||||||| |  ||| |||||||||| |||  | || |     
T  21067220 gagtggtcgccgatgcacaaggcacgataatgagcggctcccgacaacttatagacgaatcgaatcacaccggaatgagagggatcccgaggtcgtgcat 21067319  T
Q  200 gtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaac 299  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||| | ||| ||    
T  21067320 gtatgagactgcatggttgaaggaagactaataataattatttggtactacatatatcaacaagatgcatcttctttccggtagctcattctaaaagtac 21067419  T
Q  300 tccaca 305  Q
    ||||||    
T  21067420 tccaca 21067425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 4185624 - 4185860
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctccc-gcagcttctagacaagccgaat-cacatc 170  Q
    |||||| ||| |||||||| |||| | |||||| ||| || ||||||||  |||| |||||  |||||   |||||||||||   | |||||| ||||||    
T  4185624 tgtaacgcccgaggctgacaagggaggggagtgatcgtcgttgcacaagacatgaaaatgagtggctcatagcagcttctaggtgaaccgaattcacatc 4185723  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 270  Q
    ||||| |||||| || |||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||| || || ||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||    
T  4185724 aaaatgagagggttcatgaggccatgcaggtatgagacggcatggttaaaggaatacatataagaattgtttgataccacatataccaacaagatgcatc 4185823  T
Q  271 ttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||||| |||||    
T  4185824 ttctttttggtagctcattctacaagaactctacagt 4185860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 90 - 277
Target Start/End: Original strand, 17028801 - 17028989
Alignment:
Q  90 acgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctccc-gcagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggatcctg 188  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||||||||||| ||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  17028801 acgaggacgtgtagtggtcggcggtgcacaaggcatgacaatgagaggctccttgcagcttctaggcaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctg 17028900  T
Q  189 agaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttt 277  Q
    |  || || | ||||| |||| ||| ||||||| | || || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17028901 aagccttgcatgtatgggactgcatagttgaaggaggatttgtaagaattgttaggtgctacctatatcaacaagatgcgtcttatttt 17028989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 161 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23350424 - 23350285
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||  ||| |||| |||| |||| || |  ||||| | |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23350424 gaatcacatcggaatgagagagatcttgaggccgtacaggtaggggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtacttcctatatcaac 23350325  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaact 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||    
T  23350324 aagatgcatcttcttttcggtagctccttccataagaact 23350285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 228 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 50814899 - 50814820
Alignment:
Q  228 ttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  50814899 ttataagaattgtttggtactatctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 50814820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 53854984 - 53854858
Alignment:
Q  126 gacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaa 224  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||  ||| ||||||||| |||  |  |||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  53854984 gacaatgagcggctcccgacagcttatagacgaaccgaatcacatcggaatgagagggatcatgaagcagtgtaggtatgagactatatggttgaaggaa 53854885  T
Q  225 gacttataagaattgtttggtactacc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  53854884 gacttataagaattgtttggtactacc 53854858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 300
Target Start/End: Original strand, 42838642 - 42838763
Alignment:
Q  181 ggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc-ttcttttt- 278  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  42838642 ggatcctgagactgtgtaagtatgagactacatagttcaaggaagacgtataaaaattgtttggtactacctatatcaacaaaatgcatctttctttttc 42838741  T
Q  279 ggtagtacattccataagaact 300  Q
    | |||| |||||||||||||||    
T  42838742 gatagttcattccataagaact 42838763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 164 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23976357 - 23976243
Alignment:
Q  164 tcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaag 263  Q
    ||||||| |||| |||||  ||||| | ||||||||||||| | || |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  23976357 tcacatcgaaatgagaggtttcctggggccatgtaggtatgggtctgcatgattgaaggaagagttataagaattgtttggtactacctatactaacaag 23976258  T
Q  264 atgcatcttcttttt 278  Q
    |||||||||||||||    
T  23976257 atgcatcttcttttt 23976243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 202 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 13613997 - 13613893
Alignment:
Q  202 atgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactc 301  Q
    |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  13613997 atgagactccatggtagaaggagtacttataagaattgtttgataccacctatatcaacaagatgcatcttc-tttcggtagttcattctataagaactc 13613899  T
Q  302 cacagt 307  Q
    ||||||    
T  13613898 cacagt 13613893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 178 - 305
Target Start/End: Original strand, 33764876 - 33765003
Alignment:
Q  178 gagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttt 277  Q
    ||||||||||| |||| ||   |||| |||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33764876 gagggatcctgggaccgtgcgtgtataagactacatggttggatgaagacttttaagaattgtttggtgctacctataccaacaagatgcatcttctttt 33764975  T
Q  278 tggtagtacattccataagaactccaca 305  Q
    | ||||  ||||  ||||||||| ||||    
T  33764976 ttgtagctcattttataagaacttcaca 33765003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 44470964 - 44470870
Alignment:
Q  212 atggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||   ||||||||||||||||||||||    
T  44470964 atggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttc-tgttcgtaactcattccataagaactccacagt 44470870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 172 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 43929093 - 43928961
Alignment:
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
    |||| |||||| ||||||  || || |||||||||||||  |||| |||| ||  |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  43929093 aaatgagagggttcctgaagccgtgcaggtatgagactatttggtcgaaggaaagcttacaagaattgtttggtactacatataccaacaagatgcatct 43928994  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccaca 305  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||| ||||||    
T  43928993 tctttttggtagt-tatttcataagaaatccaca 43928961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 211 - 307
Target Start/End: Original strand, 17628560 - 17628656
Alignment:
Q  211 catggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||  ||  ||||||||| ||||||||    
T  17628560 catggttgaaggtaggcttataagaattgtttggtactacctataccaacaagatgcatcttcttttcgatagcccaacccataagaattccacagt 17628656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 198 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 24271654 - 24271552
Alignment:
Q  198 aggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataaga 297  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||| || |||| |||||  ||||||||||||    
T  24271654 aggtatgagactacatggttaaagtaagacatataagaattatttgatactacctatacgaacaagatgcatatt-ttttgggtagcccattccataaga 24271556  T
Q  298 actc 301  Q
    ||||    
T  24271555 actc 24271552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 27579052 - 27578904
Alignment:
Q  159 ccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatca 258  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | |   | ||||||||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27579052 ccgaatcacatcggaataagagggatcttaaagtcgtgtaggtatgacactacttggttgactgaagacttataagaattgtttggtactacatatatca 27578953  T
Q  259 acaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |  |||  |||||||||||  ||||  |  |||||||||||| ||||||    
T  27578952 attagacacatcttcttttcagtagccctatccataagaactacacagt 27578904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 201 - 277
Target Start/End: Original strand, 41869957 - 41870033
Alignment:
Q  201 tatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttt 277  Q
    |||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41869957 tatgggactgcatgattgaaggaagacttataagaattgtatgatactacctatatcaacaagacgcatcttctttt 41870033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 307
Target Start/End: Original strand, 4186205 - 4186312
Alignment:
Q  200 gtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaac 299  Q
    ||||||||||| ||| || ||| ||  |||||||||||  |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  4186205 gtatgagactaaatgtttaaaggaatgcttataagaatgatttggtactacctacatgaacaagattcatcttctttttggtagcccattgcataagaac 4186304  T
Q  300 tccacagt 307  Q
    | ||||||    
T  4186305 tacacagt 4186312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 307
Target Start/End: Original strand, 17029368 - 17029475
Alignment:
Q  200 gtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaac 299  Q
    ||||| |||| ||| ||||||  ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    |||||||||||||    
T  17029368 gtatgggactgcatagttgaatgaagacttgtaataattgtttagtactacctatatcaacaagatgcatattacttttggtaccttattccataagaac 17029467  T
Q  300 tccacagt 307  Q
    ||||||||    
T  17029468 tccacagt 17029475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 198 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 52048770 - 52048662
Alignment:
Q  198 aggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataaga 297  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||| || | |||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  52048770 aggtatgaaactgcatagctgaaggaaaatttataagaattgtttgatactacgtatactaacaagatgcatcttcattttgtaagt-cattccataaga 52048672  T
Q  298 actccacagt 307  Q
    ||||||||||    
T  52048671 actccacagt 52048662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 100 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26200491 - 26200304
Alignment:
Q  100 ggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaat-cacatcaaaataagagggatcctgagaccatgt 197  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| || ||  |||| |   |||||||||| ||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||||| |   |||    
T  26200491 ggagtggtcgtcggtgcacaaggcatgataaagagtggcttctaacagcttctaggcaaactgaattcacatcagaatgagagggatcctgatattgtgt 26200392  T
Q  198 aggtatgagactacatggttgaagcaaga--cttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtag 283  Q
    ||||||| |||  ||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| ||||| |||||  |||||||||||| |||||| ||||||    
T  26200391 aggtatgggacatcatggttgaaggaagaggcttataacaattgtttgatactaactatacaaacaagatgcatattctttgtggtag 26200304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 228 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27578531 - 27578456
Alignment:
Q  228 ttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactcca 303  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||  ||||||||||||||    
T  27578531 ttataagaattatttggtgctacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtatcccaaaccataagaactcca 27578456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 23091584 - 23091506
Alignment:
Q  229 tataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||   |||| |||| |||||||||||    
T  23091584 tataaaaattgtttggtactacatatattaacaagatgcatcttctttctggtagcttattctataaaaactccacagt 23091506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 20306236 - 20306191
Alignment:
Q  227 cttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20306236 cttataagaattgtttggtactatctatatcaacaagatgcatctt 20306191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 300
Target Start/End: Original strand, 34554494 - 34554567
Alignment:
Q  227 cttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaact 300  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  34554494 cttataagaattgtttgacactacctataccagcaagatgcattttatttttggtagaccattccataagaact 34554567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 177 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 2499719 - 2499647
Alignment:
Q  177 agagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtacta 249  Q
    |||||||| || | ||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  2499719 agagggattctaaaaccgtgcaggtatgagacttcatggttgaagcaacacttataaaaattgtttggtacta 2499647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 17628948 - 17629084
Alignment:
Q  143 gcagcttctagacaagccgaatc-acatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtt 241  Q
    ||||||||||| |||  |||||| |||||| ||| || |||||||| ||  | || ||||||| || |  |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  17628948 gcagcttctaggcaaatcgaatccacatcagaatgagtgggatcctaaggtcgtgcaggtatgtgaatgtatggttgaataaaaacttataagaattgtt 17629047  T
Q  242 tggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttt 278  Q
    ||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||    
T  17629048 tggtactacctatactaataagatgcctcttcttttt 17629084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 307
Target Start/End: Original strand, 44831035 - 44831142
Alignment:
Q  200 gtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaac 299  Q
    |||||||| |||||||||||||  |  ||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||| || ||||||| |||||  |||| |||| ||||    
T  44831035 gtatgagattacatggttgaagggaagcttataaaaattgtttggtactacctaaactaacaagatgtatattcttttcggtagcccatttcatatgaac 44831134  T
Q  300 tccacagt 307  Q
    | ||||||    
T  44831135 ttcacagt 44831142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 278
Target Start/End: Original strand, 9882612 - 9882723
Alignment:
Q  165 cacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaaga 264  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||| || | | ||||||| | |||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||   || || |    
T  9882612 cacatcaaaatgagacggatcatgagaccgtgcaagcatgagacaagatggttgaagaaaaacttataagaat--tttggtactacctatcctaataaaa 9882709  T
Q  265 tgcatcttcttttt 278  Q
    ||||||||||||||    
T  9882710 tgcatcttcttttt 9882723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 283
Target Start/End: Original strand, 13266085 - 13266207
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||| | |  || || ||||||| || | ||||||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||     
T  13266085 gaatcacattagaatgagagggatcttaaagccgtgcaggtatgggaatgcatggttgaaggaaggcttataataattttttagtactccctatatcaat 13266184  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtag 283  Q
    |||||||||||| |||| |||||    
T  13266185 aagatgcatcttattttcggtag 13266207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 237 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 39902518 - 39902478
Alignment:
Q  237 ttgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttt 277  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39902518 ttgtttggtactatctatatcaacaagatgcatcttctttt 39902478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 284
Target Start/End: Original strand, 53391925 - 53392009
Alignment:
Q  200 gtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagt 284  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||| || |||| ||||||    
T  53391925 gtatgagactgcatggttgaagaaatgcttataaaaattgtttgataccatctatatcaacaagatacatatttttttcggtagt 53392009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 261
Target Start/End: Original strand, 17506389 - 17506484
Alignment:
Q  166 acatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 261  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||  |||| | |||||||| | |||| || ||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  17506389 acatcagaatgagagggatcatgaggtcatgcatgtatgagagtgcatgattaaaagaagacttataagaattgtatagtactacctatatcaaca 17506484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 33987303 - 33987160
Alignment:
Q  71 gttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacat 169  Q
    ||||||||  || |||||| |||||  | |||||||||| | |||||||||| |||||||||| || |||  | |||||||||| ||| | |||||||||    
T  33987303 gttgtaacgtccgaggctggcgaggatgaggagtggtcgtcagtgcacaaggcatgacaatgagcgactcttggcagcttctaggcaaactgaatcacat 33987204  T
Q  170 caaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacat 213  Q
    |  ||| ||||||||| ||||| | || ||||||| ||||||||    
T  33987203 cggaatgagagggatcatgagatcgtgcaggtatgtgactacat 33987160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 280
Target Start/End: Original strand, 45682242 - 45682321
Alignment:
Q  201 tatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttgg 280  Q
    |||| ||||||||| |||||  |||  ||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  45682242 tatgggactacatgattgaatgaaggtttataagaattatttggtattatctataccaacaagatgcattttctttttgg 45682321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 33294936 - 33294886
Alignment:
Q  258 aacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagta 308  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  33294936 aacaaaatgcatcttcttttttgtagttcactccataagaactccacagta 33294886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 127
Target Start/End: Original strand, 10165873 - 10165927
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatga 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  10165873 tgtaacactcaaggctgacgagggtggggagtggtcgcggatgcacaaggcatga 10165927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20309661 - 20309599
Alignment:
Q  159 ccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaag 221  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||  || ||||||| ||||||||||||||||    
T  20309661 ccgaatcacatcggaatgagagggatcatgagactttgcaggtatgtgactacatggttgaag 20309599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 247
Target Start/End: Original strand, 17505916 - 17506016
Alignment:
Q  147 cttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggta 246  Q
    ||||||||| | || || |||||||||||||||  |||| ||||| |||| | ||||||||||  |||||| ||  ||| ||||||| |||||||| |||    
T  17505916 cttctagacgaaccaaaccacatcaaaataagatagatcatgagatcatgcacgtatgagactgtatggttaaatgaagtcttataaaaattgtttagta 17506015  T
Q  247 c 247  Q
    |    
T  17506016 c 17506016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 53)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 6747834 - 6747599
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||      
T  6747834 tgtaacacccaaggctgacgagggcagggagtggtcgccggtgcacaaggcatgacaatgagcggctcccgacaacttctagacaagctgaatcacattg 6747735  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6747734 gaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgatactacatggttgaaggaaggattataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 6747635  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||   ||||||||| |||||||||||    
T  6747634 tctttttggtagcctattccataaaaactccacagt 6747599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 34405827 - 34405592
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||  | |||||||||| |     
T  34405827 tgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacaccg 34405728  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| ||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34405727 gaatgagagggatcctaaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaggatgcatct 34405628  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  34405627 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 34405592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 42515455 - 42515689
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||   ||  ||||||||| | ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  42515455 tgtaatacccaaggctgacgagggcagggagtg-tcgccggtgcaaggggcgtgacaatgagcagctcccgacagcttctagacgaaccgaatcacatca 42515553  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42515554 gaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaagtgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 42515653  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  42515654 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 42515689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 73 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 2611888 - 2611657
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||  | | ||||||||||     
T  2611888 tgtaacaccaaaggctgacgagggtggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaactgaatcacatcg 2611789  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  2611788 gaatgagaggggtcctgaggtcatgtaggtatgagactatatggtggaaggaaggcttataagaattgtttggtactatctataacaacaagatgcatct 2611689  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactcca 303  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  2611688 tctttttggtagcccattctataagaactcca 2611657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 35474357 - 35474122
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||| || ||||||||  || ||||||||| |     
T  35474357 tgtaacacctaaggctgatgagtgcggggagtggtcgtcggtgcacaaggcacgacaatgagcggttcccgacaacttctagaacagtcgaatcacaccg 35474258  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35474257 gaatgagagggatccttaggtcgtgtaggtatgagactacatggttgaagaaagacttataagaattgtttagtactacttatatcaacaagatgcatct 35474158  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  35474157 tctttttggtagctcattccataagaactccacagt 35474122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 679727 - 679961
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| | | |||||||| | ||||||| |||||||||||  | | |||||||||||    
T  679727 tgtaacacctaaggctgacgaggacggggagtggtcgccgatgcacaaagcacgacaatgagctgctcccgacagcttctagaggaactgaatcacatca 679826  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| ||||||||||||||  | |||||||||| || ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  679827 gaatgagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggagtacatggctgaaggaaggcttataagaattgtt-ggtactacctatatcaacaagatgcatat 679925  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  679926 tctttttggtagcccattccataagaactccacagt 679961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 74 - 307
Target Start/End: Original strand, 36422163 - 36422397
Alignment:
Q  74 gtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaa 172  Q
    |||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||  |  ||||||||  |      
T  36422163 gtaacacccaagaccgacgaggatggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaatcgaatcacgccgg 36422262  T
Q  173 aataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 272  Q
    ||| ||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36422263 aatgagagggatcctaaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatctt 36422362  T
Q  273 ctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||| |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  36422363 cttttcggtagctcatttcataagaactccacagt 36422397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 135 - 307
Target Start/End: Original strand, 46425713 - 46425886
Alignment:
Q  135 cggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataa 233  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||    
T  46425713 cggctcccgacagcttctagacaagccgaatcacatcggaatgagagggatcctgagaccatgtaggtatgggactacatggttgaaataaggcttataa 46425812  T
Q  234 gaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||||    
T  46425813 gaattgtttggtattacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtatcttattccataagaactccacagt 46425886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 2189054 - 2189289
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||  | |||||||||| |     
T  2189054 tgtaacactcaaggatgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccg 2189153  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||| ||||||| |  || |||| || |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2189154 gaatgagagggttcctgaggctgtgcaggtgtgggactgcatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggcactacctatatcaacaagatgcatct 2189253  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| | |||  |||| |||||||||||||||||    
T  2189254 tcttttcgatagctcatttcataagaactccacagt 2189289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 283
Target Start/End: Original strand, 43233323 - 43233534
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||   |||||||||||  | |||||||||| |     
T  43233323 tgtaacacccaaggctgacgagtgcgaggagtggtcgccggtgcataaggcacgacaatgagcggctcctaacagcttctagaggaaccgaatcacaccg 43233422  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
    |||| ||||||||| |||| || |||||||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43233423 aaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgtgactgtatggttaaaggaagacttataagaattgtttggtactatctatatcaacaagatgcatct 43233522  T
Q  272 tctttttggtag 283  Q
    | |||| |||||    
T  43233523 ttttttcggtag 43233534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 99 - 307
Target Start/End: Original strand, 28495790 - 28495999
Alignment:
Q  99 tggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||| | ||||||||  || ||||||||  |  |||||||||||  ||| ||||||||| |||| || |||    
T  28495790 tggagtggtcgccggtgcacaaggcacaacaattagcggctcccaacaacttctagaggaatcgaatcacatcggaatgagagggatcttgaggccgtgt 28495889  T
Q  198 aggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataaga 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  28495890 aggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaactgttgggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataaga 28495989  T
Q  298 actccacagt 307  Q
    ||||||||||    
T  28495990 actccacagt 28495999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 161 - 307
Target Start/End: Original strand, 42515091 - 42515237
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| || || |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42515091 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatgattgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 42515190  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  42515191 aagatgcattttctttttggtagctcattccataagaactccacagt 42515237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 116 - 307
Target Start/End: Original strand, 2193209 - 2193401
Alignment:
Q  116 cacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatg 214  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||  | |||||||||| |  ||| |||||| |||||||||| || ||||||| |||| ||||    
T  2193209 cacaaggcacgacaatgaacggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggttcctgagaccgtgcaggtatgggactgcatg 2193308  T
Q  215 gttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||| |||| ||||||||||||    
T  2193309 gttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctattcggtagctcatttcataggaactccacagt 2193401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 161 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 2941904 - 2941758
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| || |  ||||||| |||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2941904 gaatcacatcagaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggctgataagaattgtttggtactacctatatcaac 2941805  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2941804 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 2941758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 6719223 - 6719079
Alignment:
Q  159 ccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatca 258  Q
    |||||||||||   ||| |||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6719223 ccgaatcacattggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactacctatatca 6719124  T
Q  259 acaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactcca 303  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  6719123 acaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactcca 6719079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 26957794 - 26957603
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||    
T  26957794 ttgtaacaccaaaggccgacgagggcgggaagtggtcgtcggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacaacttctagaggaaccgaatcacatc 26957695  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaa 262  Q
      ||| ||||||||| |||| |  ||||||||||  ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26957694 ggaatgagagggatcttgaggctgtgtaggtatggaactacatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaa 26957603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 187 - 307
Target Start/End: Original strand, 2465949 - 2466069
Alignment:
Q  187 tgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtac 286  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |    
T  2465949 tgaggccatgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagagttgtttggtactacctatatcaacaagttgcatcttcttttcggtagctc 2466048  T
Q  287 attccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2466049 attccataagaactccacagt 2466069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 144 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 28495772 - 28495609
Alignment:
Q  144 cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttg 243  Q
    |||||||||||  |  |||||| ||||  ||| ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  28495772 cagcttctagaggaatcgaatcccatcggaatgagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataagaattgttga 28495673  T
Q  244 gtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28495672 gttttacctatatcaacaagatgcatcttcttttaggtagctcattccataagaactccacagt 28495609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 177 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 13125267 - 13125137
Alignment:
Q  177 agagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttt 276  Q
    ||||||||| |||| || || ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13125267 agagggatcttgaggccctgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgcatcttcttt 13125168  T
Q  277 ttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    | |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13125167 tcggtagctcattccataagaactccacagt 13125137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 73 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 29039248 - 29039027
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggc-gtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccgcagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    ||||||||||| |||||| | |||| | |||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||        | | || ||||||||||||     
T  29039248 tgtaacacccacggctgatgggggcaggggagtgatcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccg--------acagaaaccgaatcacatcg 29039157  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| ||||| |||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29039156 gaatgagaggcatcctgaggccgtgtagatatgtgactacatggttgaatggaggcttacaagaattgtttggtactacctatatcaacaacatgcatct 29039057  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactc 301  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||    
T  29039056 tctttttgataatccattccataagaactc 29039027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 81 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 35527348 - 35527122
Alignment:
Q  81 ccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataaga 179  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  | | |||||| ||||||||  |||||||||||| | |||||||||| | |||| |||    
T  35527348 ccaaggctgacgaggacggggagtggtcgtcggtgcacaagacacg-caatgagcggctcccaacagcttctagacgaaccgaatcacaccgaaatgaga 35527250  T
Q  180 gggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttg 279  Q
    ||||||| |||  | || |  |||| ||||   ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  35527249 gggatcccgaggtcgtgcaaatatgggactggttggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtgctacctatatcaacaagatgcatattcttttca 35527150  T
Q  280 gtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  35527149 gtagtccattccataggaactccacagt 35527122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 161 - 307
Target Start/End: Original strand, 9124958 - 9125104
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||  ||| |||| |||| |||| || || ||||||||||||  |||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9124958 gaatcacatcggaatgagagagatcttgaggccgtgcaggtatgagactgtatggttaaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 9125057  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9125058 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 9125104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 206 - 307
Target Start/End: Original strand, 2465777 - 2465878
Alignment:
Q  206 gactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccaca 305  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  2465777 gactacatggttgaaggaaggcttataagagttgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccaca 2465876  T
Q  306 gt 307  Q
    ||    
T  2465877 gt 2465878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 143 - 307
Target Start/End: Original strand, 25182341 - 25182506
Alignment:
Q  143 gcagcttctagacaa-gccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtt 241  Q
    ||||||||||| ||| | ||| |||||||  ||| |||| |||||||||||  || | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25182341 gcagcttctaggcaaagacgagtcacatcggaatgagagagatcctgagactgtgcaagtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtt 25182440  T
Q  242 tggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||||||||| ||||||    
T  25182441 tggtactacctatatcaacaagatacatcttattttcggtaactcattccataagaacttcacagt 25182506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 29357692 - 29357457
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||| |||| | |||||||| ||||||||| || ||||||||  | | |||||||| |    
T  29357692 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtaaaatggtcgccgatgcataaggcacgacaatgagcggctcccgacaacttctagatgaactgaatcacacc 29357593  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 270  Q
     || | ||||| |||| |||  | || ||||||| |||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29357592 gaa-tgagaggtatcccgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaatgtttataagaattgtttggtactaactatatcaacaagatgcatc 29357494  T
Q  271 ttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||| | |||  | || |||||||||| ||||||    
T  29357493 ttcttttcgatagcccgtttcataagaactacacagt 29357457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 161 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 11517535 - 11517390
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| || |  ||||||| |||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11517535 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgggactgcatggt-gaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 11517437  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  11517436 aagatgcatctacttttcggtagctcattccataagaactccgcagt 11517390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 116 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22529428 - 22529266
Alignment:
Q  116 cacaaggtatgacaatgaacggctcccgca-gcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatg 214  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||||||| | |||||||| |||  ||| ||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||    
T  22529428 cacaaggcgtgacaatgagcggctcccgcctgcttctagacgaaccgaatcatatccgaatgagagggatcctgaggtcatgtaagtatgggcctacatg 22529329  T
Q  215 gttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttt 277  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22529328 gttgaaggaaggcttataagaaatgtttggtactatctatataaacaagatgcatcttctttt 22529266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 3305549 - 3305374
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||| | |||||||| | ||||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  3305549 ttgtaacacataaggctgacgagggcggagagtggtcgccggtggataaggcacgacaatgagcagctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacatc 3305450  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggta 246  Q
     |||| || ||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||    
T  3305449 gaaatgagggggatcctgaggccgtgtaagtatgggactacatggttgaatgaaggcttatgagaattgtttggta 3305374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26421449 - 26421306
Alignment:
Q  164 tcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaag 263  Q
    |||||||| ||| | |||| || |||| ||||||||||||| | |   |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26421449 tcacatcagaatgatagggttcttgaggccatgtaggtatgggtcagtatggttgaaggaagacttataagaattgcttgatactacctatatcaacaag 26421350  T
Q  264 atgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26421349 atgcatatttttttcggtagtccattccataagaactccacagt 26421306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 204
Target Start/End: Original strand, 2463549 - 2463684
Alignment:
Q  70 tgttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcc-cgcagcttctagacaagccgaatcaca 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||  | ||||| ||||    
T  2463549 tgttgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgaacggctcctaacagcttctagaggaaccgaaacaca 2463648  T
Q  169 tcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatg 204  Q
     |  ||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  2463649 ccggaatgagagggttcctgaggccatgtaggtatg 2463684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 199 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 5406697 - 5406589
Alignment:
Q  199 ggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaa 298  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  |||||||||    
T  5406697 ggtatgggactgcatggttgaaggaagatttataagaattgtttggtattacctatatcaacaagatgcatcttatttttggttgcccaaaccataagaa 5406598  T
Q  299 ctccacagt 307  Q
    |||||||||    
T  5406597 ctccacagt 5406589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 31406732 - 31406585
Alignment:
Q  160 cgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaa 259  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  || || || | || ||||  |||||||||  | ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  31406732 cgaatcacatcaaaatgagagggatcctgaagccgtgcagatctgggactgaatggttgaaagatgacttattagaattgtttggtgttacctatatcaa 31406633  T
Q  260 caagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||||||    
T  31406632 caagatgcatcttcttttcggtagcccgtttcataagaactccacagt 31406585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26421868 - 26421761
Alignment:
Q  200 gtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaac 299  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  26421868 gtatgagactgcatggttgaagtaaggctcataagaattgttaggtactccctataccaacaagatgaatcttcttttcggtagcccattccataagaac 26421769  T
Q  300 tccacagt 307  Q
    | ||||||    
T  26421768 tacacagt 26421761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 307
Target Start/End: Original strand, 18833285 - 18833431
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||  ||| |||||| ||||||| || |  |||||||  ||| ||||||||| | ||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18833285 gaatcacatcggaatgagagggttcctgaggccgtacaggtatggaactgcatggttgagggaaagcttatatgaattgtttagtactacctatatcaac 18833384  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||   ||| |||||||||||||||||    
T  18833385 aagatgcatcttcttttcggtagctaattacataagaactccacagt 18833431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 202 - 307
Target Start/End: Original strand, 9623248 - 9623352
Alignment:
Q  202 atgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactc 301  Q
    |||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  9623248 atgagactccatggtagaaggagtacttataagaattgtttgataccacctatatcaacaagatgcatcttc-tttcggtagttcattctataagaactc 9623346  T
Q  302 cacagt 307  Q
    ||||||    
T  9623347 cacagt 9623352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 31743930 - 31743834
Alignment:
Q  202 atgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaa 298  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  31743930 atgagactgcatggttgaaggaatgcttataagaatggtttggtgctatctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagcccattccataagaa 31743834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 200 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 36015519 - 36015412
Alignment:
Q  200 gtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaac 299  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||   |||  ||||||||||||||    
T  36015519 gtatgagactccatggttgaaggaaagcttaaaagaattgtttggtactacatatatcaacaagatgcctcttcttttaaatagcccattccataagaac 36015420  T
Q  300 tccacagt 307  Q
    | ||||||    
T  36015419 ttcacagt 36015412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 205
Target Start/End: Original strand, 10430673 - 10430806
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||  | ||| |||||| |     
T  10430673 tgtaacacccaaggctgatgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgtatcacaccg 10430772  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatga 205  Q
     ||| |||||| ||||||| || || ||||||||    
T  10430773 gaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatga 10430806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16812074 - 16811900
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||  | | |||||| ||||||||| | ||||||| | || |||||||||||||    
T  16812074 tgtaacatccaaggctgactagggcggggagtggttgccggtgcacaagacacgccaatgagcggctcccgacggcttctaaagaaaccgaatcacatca 16811975  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctat 254  Q
     ||| |||        ||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16811974 gaatgaga--------gatgccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgcttataagaattgttttgtactatctat 16811900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 228 - 300
Target Start/End: Original strand, 16192385 - 16192457
Alignment:
Q  228 ttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaact 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  16192385 ttataagaattgtttggtattacctacatcaacaagatgcatcttcgttttggtagcccattccataagaact 16192457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 307
Target Start/End: Original strand, 20966076 - 20966196
Alignment:
Q  187 tgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtac 286  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||| || || |||| |||||  |    
T  20966076 tgaggccatctaggtatgagactgcatgattgaaggatgacttataagaattattttgtaatacctataccaacaagatgtatattattttcggtagctc 20966175  T
Q  287 attccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  20966176 attccataagaacttcacagt 20966196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 192 - 303
Target Start/End: Original strand, 11372481 - 11372592
Alignment:
Q  192 ccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattcc 291  Q
    |||||||||||||| | |  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| || ||||||||||  ||  ||    
T  11372481 ccatgtaggtatgaaattgtatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctgtaccaacatgatgcatgttatttttggtagctcaaacc 11372580  T
Q  292 ataagaactcca 303  Q
    ||||||||||||    
T  11372581 ataagaactcca 11372592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 164 - 283
Target Start/End: Original strand, 11372901 - 11373020
Alignment:
Q  164 tcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaag 263  Q
    |||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||| ||||||||||||  || || ||||| |||||||    
T  11372901 tcacatcaaaatgagagggttcctaaggccatgtaggtatgagattgcatggttgaatgaagacttgtaagaattgtttcatagtatctataccaacaag 11373000  T
Q  264 atgcatcttctttttggtag 283  Q
    |||  |||||||||| ||||    
T  11373001 atgagtcttctttttcgtag 11373020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 120
Target Start/End: Original strand, 2189510 - 2189557
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2189510 tgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaa 2189557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 303
Target Start/End: Original strand, 1628765 - 1628854
Alignment:
Q  211 catggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactcca 303  Q
    ||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||  ||| ||||||||||||||    
T  1628765 catggttgaagaaaggcttataa---ttgtttggtactatcgatatcaacaagatgcatcttcttttttgaagcccataccataagaactcca 1628854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 283
Target Start/End: Original strand, 6585647 - 6585731
Alignment:
Q  201 tatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac--aagatgcatcttctttttggtag 283  Q
    ||||||| | |||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||    
T  6585647 tatgagattgcatgattgaaagaagacttataaaaattgtttggtactacctatatcaacaaaagatacatcttccttttggtag 6585731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 7461424 - 7461352
Alignment:
Q  234 gaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  7461424 gaattgtttgatactaactatataaacaagatacatcttctttttggtagttcatt-cataagaactctacagt 7461352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 13122567 - 13122506
Alignment:
Q  246 actacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13122567 actacatatattaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 13122506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 266
Target Start/End: Original strand, 33316764 - 33316832
Alignment:
Q  198 aggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatg 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||    
T  33316764 aggtatgagactacatggttgaaggaaaaattataagaattgtttgacaatacttatatcaacaagatg 33316832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 13124832 - 13124757
Alignment:
Q  177 agagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacct 252  Q
    ||||||||| |||| || || ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  13124832 agagggatcttgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtgtggtactacct 13124757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 307
Target Start/End: Original strand, 37672162 - 37672305
Alignment:
Q  164 tcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaag 263  Q
    |||||||| ||| |||||| || | | ||| || |||||| ||||| |||||||| |  |||  |||||| |||||||||||||||| | || |||||||    
T  37672162 tcacatcataatgagaggggtcatcacaccgtgcaggtataagactgcatggttgcaaaaaggtttataataattgtttggtactacttgtaccaacaag 37672261  T
Q  264 atgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||| |||||||||| ||||  ||| |||||||| | ||||||    
T  37672262 atgcaacttctttttgttagttgatttcataagaaatacacagt 37672305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 258 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 7646528 - 7646479
Alignment:
Q  258 aacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  7646528 aacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaacttcacagt 7646479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 122
Target Start/End: Original strand, 16812143 - 16812193
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaagg 122  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16812143 ttgtaacatccaaggttgactagggcggggagtggttgccggtgcacaagg 16812193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 48)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 72 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 16452170 - 16451934
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||  |  |||||||||||    
T  16452170 ttgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaatcgaatcacatc 16452071  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 270  Q
      ||| |||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16452070 ggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtaggggactacatggttgaaggaaagcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatc 16451971  T
Q  271 ttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16451970 ttcttttcggtagttcattccataagaactccacagt 16451934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 72 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 16461323 - 16461087
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||  |  |||||||||||    
T  16461323 ttgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaatcgaatcacatc 16461224  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 270  Q
      ||| |||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16461223 ggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtaggggactacatggttgaaggaaagcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatc 16461124  T
Q  271 ttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16461123 ttcttttcggtagttcattccataagaactccacagt 16461087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 43057759 - 43057524
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||  | ||||||||||||     
T  43057759 tgtaacacccaaggctgaagagggcggggaatggtcgccggtgcacaaggcatgccaatgagcggctcccgacagcttttagaggaaccgaatcacatcg 43057660  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43057659 gaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgcatct 43057560  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  43057559 tcttttcggtagcccattccataagaactccacagt 43057524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20054316 - 20054081
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||  | |||||||||| |     
T  20054316 tgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccg 20054217  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||| ||||||| || || ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20054216 gaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 20054117  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20054116 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 20054081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20054772 - 20054537
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||  | |||||||||| |     
T  20054772 tgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccg 20054673  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||| ||||||| || || ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20054672 gaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 20054573  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20054572 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 20054537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20055228 - 20054993
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||  | |||||||||| |     
T  20055228 tgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccg 20055129  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||| ||||||| || || ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20055128 gaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 20055029  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20055028 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 20054993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20055684 - 20055449
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||  | |||||||||| |     
T  20055684 tgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccg 20055585  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||| ||||||| || || ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20055584 gaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 20055485  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20055484 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 20055449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20056140 - 20055905
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||  | |||||||||| |     
T  20056140 tgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccg 20056041  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||| ||||||| || || ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20056040 gaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 20055941  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20055940 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 20055905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20056596 - 20056361
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||  | |||||||||| |     
T  20056596 tgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccg 20056497  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||| ||||||| || || ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20056496 gaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 20056397  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20056396 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 20056361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20057499 - 20057264
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||  | |||||||||| |     
T  20057499 tgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccg 20057400  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||| ||||||| || || ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20057399 gaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 20057300  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20057299 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 20057264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 52250116 - 52250351
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||  | |||||||||| |     
T  52250116 tgtaatacccaaggctgacgagggcggggagcggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacaccg 52250215  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| ||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52250216 gaatgagagggatcatgaggccttgtaggtatgggactacatggtcgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatct 52250315  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  52250316 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 52250351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20845897 - 20845662
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||  | |||||||||| |     
T  20845897 tgtaacacccaaggctgacgaggacggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccg 20845798  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| ||| || ||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20845797 gaatgagacggttcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgttactacctatatcaacaagatgcatct 20845698  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20845697 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 20845662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20057955 - 20057720
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||   |||||||||||  | | |||||||| |     
T  20057955 tgtaacacccaaggttgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctaacagcttctagaggaactgaatcacaccg 20057856  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
    |||| |||||| ||||||| || || ||||||| |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20057855 aaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 20057756  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20057755 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 20057720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 43057300 - 43057066
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||  |||||||  | |||||||||||||    
T  43057300 tgtaacacccaaggctgacgaggacggggagtggttgccggtgcacaaggcatgacaatgagcgactcccgacaatttctagaggaaccgaatcacatca 43057201  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| || |||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43057200 gaatgag-gggatcctaaggccgtgtaggtatgtgactacatggttgaaggaaggcttagaagaattgtttgatactacctatatcaacaagatgcatct 43057102  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  43057101 tcttttcggtagcccattccataagaactccacagt 43057066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 70 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 30873190 - 30872953
Alignment:
Q  70 tgttgtaacacccaaggctgacgagggcg--tggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccgcagcttctagacaagccgaatcac 167  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| |  ||  |||||||| | |||||||||    
T  30873190 tgttgtaacatccaaggctgacgagggcgcgtggagtggtcgtcggtgcacaaggcacgacaatgagcggcttcgacaatttctagacgaaccgaatcac 30873091  T
Q  168 atcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgc 267  Q
    | |  ||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30873090 accggaatgagagggattctgaggccgtgcaggtatgagactgtatggttgaaggaagacttttaagaattgtttgatactacctatatcaacaagatgc 30872991  T
Q  268 atcttctttttggtagtacattccataagaactccaca 305  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30872990 atcttctttttggtagtccattctataagaactccaca 30872953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 38340816 - 38341051
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||| | | |||||||||||  | |||||||||| |     
T  38340816 tgtaacacccaaggctgacgagggtggggagtggtcaccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctactgacagcttctagaggaaccgaatcacaccg 38340915  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| ||| || ||||||| || || ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38340916 gaatgagatggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 38341015  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    || ||| |||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  38341016 tcatttcggtagctcattccataagaacttcacagt 38341051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20057043 - 20056817
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||  | |||||||||| |     
T  20057043 tgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccg 20056944  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||| |||||||         ||||| |||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20056943 gaatgagagggttcctgag---------gtatgggactgcagggttgaaggaaggcttatgagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 20056853  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20056852 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 20056817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 31822899 - 31822664
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| |||||| |||| | || ||||| ||||||||  |||||||||||  | || ||||||||||    
T  31822899 tgtaacacccacggctgacgatggcgaggagcggtcgctggtgcagaaggcacgataatgagcggctcccaacagcttctagagcaaccaaatcacatca 31822800  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31822799 gaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagatttataagaattatttggtactacatatatcaacaatatgcatct 31822700  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  || |||| ||||||||||||||    
T  31822699 tcttttcggtagctcaatccaaaagaactccacagt 31822664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 108 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 50002908 - 50002712
Alignment:
Q  108 cgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgag 206  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||| || |||||| ||| |    
T  50002908 cgccgatgcacaaggcatgacaatgagcggctcccgacatcttctagaggagccgaatcacatcggaatgagagagatcctgaggccgtgtaggcatggg 50002809  T
Q  207 actacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactcca 303  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  |||||||||||    
T  50002808 actgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattctttaagaactcca 50002712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 77 - 307
Target Start/End: Original strand, 12883438 - 12883669
Alignment:
Q  77 acacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaat 175  Q
    |||| ||||||| ||||||| |  ||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| || |||||||||||| | |||||||||| |  |||    
T  12883438 acactcaaggctaacgagggtggtgagtggtcgtcggtgcacaaggcacgacaatgagcggctctcgacagcttctagacgaaccgaatcacaccggaat 12883537  T
Q  176 aagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 275  Q
     ||| |||||| ||| |  || ||||||| |||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12883538 gagatggatcccgaggctgtgcaggtatgggactgcatgattgaaggaatacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcattttctt 12883637  T
Q  276 tttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  12883638 tttggtagctcattccataaaaactccacagt 12883669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 73 - 305
Target Start/End: Original strand, 7548003 - 7548234
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| || ||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||| | || ||||  ||||| | |||||||||      
T  7548003 tgtaacacccaggactgacgagggcggggggtgatcaccggtgcacaaggcacgacaatgaacggctcctgacaacttc--gacaaactgaatcacattg 7548100  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  7548101 caatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgagactacatgattaaaggaagacttataaaaattgtttggtattaactatatcaacaagatgcatat 7548200  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccaca 305  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  7548201 tctttttggtagcccatttgataagaactccaca 7548234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 159 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 50002434 - 50002286
Alignment:
Q  159 ccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatca 258  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||| |||| || |||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50002434 ccgaatcacatcggaatgagagggatcatgaggccgtgtaggcatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctttatca 50002335  T
Q  259 acaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  50002334 acaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 50002286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 50003311 - 50003076
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||| |||| ||||  ||||||||| ||||||||| |  | ||||||||||||     
T  50003311 tgtaatacctaaggctgacgagggcagagagtggtcgtcggtgcaaaaggcatgataatgtgcggctcccgacagcttctaaaggaaccgaatcacatcg 50003212  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||||||||||| ||||| ||||||  |||| ||||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50003211 gaatgagagggatcctgaggccatgcaggtataggactgcatggttaaagggagacttataataattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatct 50003112  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||  ||||  ||||||| ||||||| ||||||    
T  50003111 tcttttcagtagctcattccaaaagaacttcacagt 50003076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 161 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20061338 - 20061192
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||  | || ||||||| |||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20061338 gaatcacatcagaatgagagggatcctgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 20061239  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20061238 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 20061192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 307
Target Start/End: Original strand, 12727988 - 12728137
Alignment:
Q  159 ccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggt-actacctatatc 257  Q
    |||||||||||  |||| | |||||| |||||||  |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  12727988 ccgaatcacattgaaatgaaagggattctgagactgtgtaggtatgggacaacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggttactgcctatatc 12728087  T
Q  258 aacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12728088 aacaagatgcatcttcttttcggtagcacattccataagaactccacagt 12728137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 161 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 35761061 - 35760920
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35761061 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 35760962  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactcc 302  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  35760961 aagatgcatcttctttttggtagctcattccatgagaactcc 35760920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 51373110 - 51372875
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||| ||| ||||| |||| | |||||||| || |||||| || |||||||||   || |||||||  |    
T  51373110 tgtaacacccaagactgacgaggacgaagagtggttgccagtgcataaggcacgacaatgagcgactcccgacatcttctagacgtaccaaatcacacta 51373011  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||||||| ||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  51373010 gaatgagagggatcccgaggccatacaggtatgtgactgtatggttgaaggaaggcttataagaattgtttagtactacctatatcgacaagatgcatct 51372911  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    | |||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  51372910 tattttcggtagctcattccataagaactccacagt 51372875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 198 - 307
Target Start/End: Original strand, 2328351 - 2328460
Alignment:
Q  198 aggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataaga 297  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2328351 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgcatcttctttttggtagcacattccataaga 2328450  T
Q  298 actccacagt 307  Q
    ||||||||||    
T  2328451 actccacagt 2328460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 278
Target Start/End: Original strand, 10820501 - 10820708
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| || ||||||||  | ||||||||||||    
T  10820501 ttgtaccacccaaggctgacgaggatgggaagtggtcgccggtgcacaaagcatgacaatgaacggctaccgacaacttctagatgaaccgaatcacatc 10820600  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 270  Q
      | | ||||||||  |||| |  |||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10820601 ggagtgagagggattatgaggcggtgtatgtattggactacatggttgaaggaagatttataagaattgtttggtactacctatatcaataagatacatc 10820700  T
Q  271 ttcttttt 278  Q
    || |||||    
T  10820701 tttttttt 10820708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 161 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 35759755 - 35759616
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| || || ||||||| |||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35759755 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 35759656  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaact 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  35759655 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaact 35759616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 103 - 307
Target Start/End: Original strand, 2634864 - 2635069
Alignment:
Q  103 gtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctccc-gcagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggt 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||  ||| ||||||| |||  |||||||||||  ||| ||||||||| ||||    || ||||    
T  2634864 gtggtcgccggtgcacaaggcatgacaatgtgtggctcctagcaacttctaggcaaatcgaatcacatcggaatgagagggatcatgaggttgtgcaggt 2634963  T
Q  202 atgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactc 301  Q
    ||| |||| ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||    
T  2634964 atgggactgcatggttgaaggataactcataagaattgtttggtactacctataccaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattcaataagaactc 2635063  T
Q  302 cacagt 307  Q
    ||||||    
T  2635064 cacagt 2635069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 303
Target Start/End: Original strand, 16907175 - 16907375
Alignment:
Q  104 tggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggta 202  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||| | ||||||| | |||||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||  ||||||  || |||||    
T  16907175 tggtcgccagtgcacaagacatgacaatcagcggctcctggcagcttctaggcaaaccaaatcatatcaaaatgagagggattttgagactgtgcaggta 16907274  T
Q  203 tgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactcc 302  Q
    ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || || ||||| | |||||||||    
T  16907275 tgaaactgcatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatacatcttcttttcagtggtccattctacaagaactcc 16907374  T
Q  303 a 303  Q
    |    
T  16907375 a 16907375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 227 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20060421 - 20060341
Alignment:
Q  227 cttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20060421 cttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 20060341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 212 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 46693831 - 46693736
Alignment:
Q  212 atggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||    
T  46693831 atggttgaaggaaggcttataaaaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtatctcatttcataataactccacagt 46693736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16440687 - 16440587
Alignment:
Q  200 gtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaac 299  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| |||    
T  16440687 gtatgggaatacatggttgaagaaagacttataagaactgtttgctactaccgataacaacaagatgcatattctttttggtagctcattctataataac 16440588  T
Q  300 t 300  Q
    |    
T  16440587 t 16440587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 177 - 305
Target Start/End: Original strand, 23180745 - 23180873
Alignment:
Q  177 agagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttt 276  Q
    ||||||||| |||  || |||||| ||| |||||| ||||||||| ||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  23180745 agagggatcttgaagccgtgtaggaatgggactacgtggttgaaggaatgattataagaattgcttggtactacctatatcaacaagatgtatcttctat 23180844  T
Q  277 ttggtagtacattccataagaactccaca 305  Q
    | | |||  ||||||||||||| ||||||    
T  23180845 tcgctagcccattccataagaattccaca 23180873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 197 - 300
Target Start/End: Original strand, 2739557 - 2739660
Alignment:
Q  197 taggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataag 296  Q
    |||||||||||||  |||||| | | |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||  ||||  ||||||||||    
T  2739557 taggtatgagactgtatggttaaggaaagacttataagaattgtttagcactacatatatcaacaatatgtatcttcttttttatagtctattccataag 2739656  T
Q  297 aact 300  Q
    ||||    
T  2739657 aact 2739660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 300
Target Start/End: Original strand, 2634448 - 2634604
Alignment:
Q  145 agcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagaggg-atcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttg 243  Q
    |||||||||  || |||||||||||| |||| |||||| ||||||||    |||| |||||||| | |||| || ||| ||| |||  ||||||||||||    
T  2634448 agcttctaggaaaaccgaatcacatcgaaatgagaggggatcctgaggttgtgtatgtatgagattgcatgattaaaggaaggcttgcaagaattgtttg 2634547  T
Q  244 gtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaact 300  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||    
T  2634548 gtactagctatacaaacaagatgcatcttcttttcgatagtctattcaataagaact 2634604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 31823161 - 31823097
Alignment:
Q  231 taagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataa 295  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31823161 taagaattatttggtactacctatatcaataaaatgcatcttctttttggtagctcattccataa 31823097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 843069 - 842962
Alignment:
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
    |||| ||||||||| ||||| | |||||||||| | || |||| |||||| ||| | | ||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| |    
T  843069 aaatgagagggatcatgagatcgtgtaggtatgtgtctgcatgattgaaggaagtcgtgtaagaattgtttggtactatccattccaacaagatgcatgt 842970  T
Q  272 tctttttg 279  Q
    ||||||||    
T  842969 tctttttg 842962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16410960 - 16410748
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctccc-gcagcttctagacaagccgaatca-catc 170  Q
    |||||||||  || ||||||||| || ||||| |||  |||| ||||||| |||||||| | || ||||  ||| ||||||| ||| || ||| | | ||    
T  16410960 tgtaacacctgagactgacgaggacgaggagtagtcatcggtacacaaggcatgacaataatcgactcctagcaacttctagtcaaaccaaattaacttc 16410861  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 270  Q
    | ||| |||||||| |||||| | |||  ||||| || | ||| ||||||| ||  |||||||||||| |||  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16410860 agaatgagagggattctgagatcgtgtgagtatgggaatgcattgttgaaggaaagcttataagaattatttactactaccaataccaacaagatgcatc 16410761  T
Q  271 ttctttttggtag 283  Q
    || ||||||||||    
T  16410760 ttgtttttggtag 16410748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 307
Target Start/End: Original strand, 52250641 - 52250688
Alignment:
Q  260 caagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  52250641 caagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 52250688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 307
Target Start/End: Original strand, 52250978 - 52251025
Alignment:
Q  260 caagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  52250978 caagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 52251025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 108
Target Start/End: Original strand, 9189351 - 9189387
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9189351 ttgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtc 9189387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 283
Target Start/End: Original strand, 42066114 - 42066202
Alignment:
Q  195 tgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtag 283  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||||||| |  |||||  ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  42066114 tgtatgtatgtgactccatggttgaagaaagacttgaaataattgtttggtattttctatactaacaaaatgtatcttctttttggtag 42066202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 244 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 7230007 - 7229948
Alignment:
Q  244 gtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactcca 303  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  7230007 gtactaactatatcaacacgaagcatcttcatttcggtagttcattacataagaactcca 7229948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 214 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 46411228 - 46411173
Alignment:
Q  214 ggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 269  Q
    |||||||| || | || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46411228 ggttgaagaaaaatttttaagaattatttggtactacctatatcaataagatgcat 46411173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 50002487 - 50002443
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgca 117  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  50002487 tgtaacacccacggatgacgagggcggggagttgtcgccggtgca 50002443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 46)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 2193726 - 2193961
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||  | |||||||||  |     
T  2193726 tgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacgccg 2193825  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| ||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2193826 gaatgagagggatcatgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatct 2193925  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2193926 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 2193961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 72 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20039711 - 20039476
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  20039711 ttgtaacacccaaggctgacgagggcggggaatggtcgccggtgcacaaggcatgacaatgagcagctcccgacagcttctagacaaaccgaatcacatc 20039612  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 270  Q
      ||| ||||||||| |||| || |||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20039611 ggaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtataggactacatagttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatt 20039512  T
Q  271 ttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  20039511 ttc-ttttggtagcccattccataagaactctacagt 20039476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 39146849 - 39147084
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | || ||||||||  | | ||||||||||     
T  39146849 tgtaacacccaaggctgacgagggtggggagtgatcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacaacttctagaggaactgaatcacatcg 39146948  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
    |||| ||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  39146949 aaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggtagacttataagaattgtttgatactacttatattaacaagatgcatct 39147048  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  39147049 tctttttggtagcccattccataagaactccacagt 39147084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 10927183 - 10926947
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggc-gtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    |||||||||||  |||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||| | ||||||||   ||||||| |||||| ||||  | ||||||||||||    
T  10927183 tgtaacacccacagctgacgagggcaggggagtgatcgtcggtgcacaaggcacgacaatgagtagctcccgacagcttatagaggaaccgaatcacatc 10927084  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 270  Q
    | ||| ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10927083 agaatgagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 10926984  T
Q  271 ttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10926983 ttccttttggtagtccattccataagaactccacagt 10926947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 72 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 17445692 - 17445456
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    ||||||||||||||||| || ||| || |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||  || ||||||||  | ||||||||||||    
T  17445692 ttgtaacacccaaggctaacaaggacggggagtggtcgacggtgcacaaggcatggcaatgagcggctcccaacaacttctagaggaaccgaatcacatc 17445593  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 270  Q
     |||| |||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17445592 gaaatgagagggatcctgaggccgtgtaggcatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 17445493  T
Q  271 ttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||| | |||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  17445492 ttcttatcggtagctcattccataagaaatccacagt 17445456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 73 - 303
Target Start/End: Original strand, 34867700 - 34867931
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||  | |||||||||| |     
T  34867700 tgtaacacccaaggctgacgagggcgaggagtagtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaagaaccgaatcacaccg 34867799  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||| ||||||| || || ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867800 gaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 34867899  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactcca 303  Q
    |||||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  34867900 tcttttcggtagctcatttcataagaactcca 34867931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 42788882 - 42788647
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||||| || || ||||||||  | |||||||||| |    
T  42788882 ttgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacaaca-tgagcggctctcgacaacttctagaggaaccgaatcacaac 42788784  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 270  Q
      ||| |||||||||||||| || ||||||  || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42788783 ggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggattgggactacatggttgaaagaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 42788684  T
Q  271 ttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  42788683 ttcttttcggtagctcattccacaagaactccacagt 42788647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 85 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 10927628 - 10927404
Alignment:
Q  85 ggctgacgagggc-gtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagaggg 182  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||| | |||||||| | ||||||  || ||| ||||  | ||||||||||||  ||| ||||||    
T  10927628 ggctgacgagggcaggggagtgatcgtcggtgcacaaggcacgacaatgagcagctcccaacaacttatagaggaaccgaatcacatcggaatgagaggg 10927529  T
Q  183 atcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggta 282  Q
    ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10927528 atcttgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggta 10927429  T
Q  283 gtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |  ||||||||||||||||||||||    
T  10927428 gcccattccataagaactccacagt 10927404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 34371978 - 34372213
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||  | |||||||||| ||    
T  34371978 tgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcaggacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacacca 34372077  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||| |||  || || |  | ||||| |||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34372078 gaatgagagggttcccaaggccgtacaagtatgggactacatggttgaaggaatgcttaaaagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 34372177  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  34372178 tcttttcggtagctcattccataagaacttcacagt 34372213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 27647072 - 27646836
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggc-gtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    |||||| ||||  |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| | | |||||  ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  27647072 tgtaacgcccacagctgacgagggcaggggagtggttgccggtgcacaaggcacgccaatgtgcggctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacatc 27646973  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 270  Q
      ||| |||||||||||  | || |||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27646972 ggaatgagagggatcctagggccgtgtaggtatggggctacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctataacaacaagatgcatc 27646873  T
Q  271 ttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  27646872 ttctttttggtagcccatttcataagaactccacagt 27646836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 72 - 307
Target Start/End: Original strand, 34371521 - 34371757
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||  | |||||||||| |    
T  34371521 ttgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacacc 34371620  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 270  Q
      ||| |||||| |||  || || |  |||| || |||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34371621 ggaatgagagggttcccaaggccgtacaggtgtgggactgcatggttgaaggaatgcttaaaagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 34371720  T
Q  271 ttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||    
T  34371721 ttcttttcggtagctcattccataagaacaccacagt 34371757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 73 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15513249 - 15513015
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| ||| || ||||  | ||||||||||||     
T  15513249 tgtaacacccaaggctgacgaggacggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgataatgagcggctcccgacagtttttagaggaaccgaatcacatcg 15513150  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaaga--cttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 269  Q
     ||| ||||||||| | || |  |||||||||| |||||||||||||||| || |  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15513149 gaatgagagggatcattaggctgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaatatgcttataagaattgtt-ggtactaccaatatcaacaagatgcat 15513051  T
Q  270 cttctttttggtagtacattccataagaactccaca 305  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  15513050 cttctttttggtatctcattccataagaactccaca 15513015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 21886382 - 21886151
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccgc-agcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |  ||||||||||  | |||||||||| |     
T  21886382 tgtaacaccgaaggctgatgagggcggagagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctggtagcttctagaggaaccgaatcacaccg 21886283  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||| |||||||    || ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21886282 gaatgagagggttcctgaggttgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacatatatcaacaagatgcatct 21886183  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactcca 303  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  21886182 tcttttcggtagctcattccataagaactcca 21886151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 18304341 - 18304576
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||  | |||||||| ||||||||| |||||||||||| | || ||||||| |     
T  18304341 tgtaacacccaagactgacgaggacggggagtgatcgccggtgcacaagacacgacaatgagcggctcccgacagcttctagacgaaccaaatcacaacg 18304440  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| ||| ||||||||||  | |||||||||| |||||||||| ||| | ||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18304441 gaatgagaaggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggatgatgaaaagcttatataaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatat 18304540  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  18304541 tcttttcggtagctcattccataagaattccacagt 18304576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 84 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 4658217 - 4657994
Alignment:
Q  84 aggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagaggg 182  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||| ||||| || | |||||||||| || |||| | |||| ||||| ||| | |||||||||| |||||||||||    
T  4658217 aggctgacaaggacggggagtggtcgccagtgcataatgcatgacaatgaccgactcctgacagcctctaggcaaactgaatcacatcgaaataagaggg 4658118  T
Q  183 atcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggta 282  Q
    ||| ||| ||| || |||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  4658117 atcttgaaaccgtgcaggtatgagacttcatggttgaacgaaga-ttataagacttgtttgatactacctataacaacaacatgcatcttctttttggta 4658019  T
Q  283 gtacattccataagaactccacagt 307  Q
    || ||||||||||||||| ||||||    
T  4658018 gtccattccataagaacttcacagt 4657994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 161 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 8642181 - 8642035
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || || || ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8642181 gaatcacatcagaatgagagggatcctaaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattatttggtactacctatatcaac 8642082  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8642081 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 8642035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 5067127 - 5066894
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccgcagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||  |  ||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||| ||    
T  5067127 ttgtaacacccatggctgacgaggatggggagtggtcgccggtgcgcaagacacaacaatgagcggctctcgcaacttctagacaaatcgaatcacacca 5067028  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||| ||||| ||| || || | ||||||||||  ||| || ||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  5067027 gaatgagagagatcccgaggccgtgcatgtatgagactgtatgattaaaggaaaacttataagaattgtttggtattatctatatcaacaagatgcattt 5066928  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccaca 305  Q
    |||||||||||||  ||| ||||| |||||||||    
T  5066927 tctttttggtagtctatttcataaaaactccaca 5066894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 198 - 305
Target Start/End: Original strand, 1821942 - 1822049
Alignment:
Q  198 aggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataaga 297  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1821942 aggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagcccattccataaga 1822041  T
Q  298 actccaca 305  Q
    ||||||||    
T  1822042 actccaca 1822049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 161 - 307
Target Start/End: Original strand, 189067 - 189213
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| || |  | ||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189067 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 189166  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  189167 aagatgtatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 189213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 159 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 8391470 - 8391327
Alignment:
Q  159 ccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatca 258  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  8391470 ccgaatcacatcggaatgagagggattctgaggccgtgtaggcatgagactacatgattgaaggaagacttataagaattgtttggtact-cctgtatca 8391372  T
Q  259 acaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactcca 303  Q
    ||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||    
T  8391371 acaagatgcatcttcttttcggtagctaattccataagaactcca 8391327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 161 - 307
Target Start/End: Original strand, 2473958 - 2474104
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||| ||  | |  ||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2473958 gaatcacatcggaatgagagggatcctaaggtcgtacaggcatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaac 2474057  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2474058 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 2474104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 201 - 307
Target Start/End: Original strand, 2474444 - 2474550
Alignment:
Q  201 tatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaact 300  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  2474444 tatgggactgcatggttgaaggaagacttaaaagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaact 2474543  T
Q  301 ccacagt 307  Q
    |||||||    
T  2474544 ccacagt 2474550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16370917 - 16370733
Alignment:
Q  100 ggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgta 198  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||| |   ||| |  | ||||||| |||| |||||| ||||||  |||||||    
T  16370917 ggagtggttgtcggtgcacaaggtatgacaatgaatggcttctgacagcttttcatcaatcgaattcacatcgaaatgagagggttcctgatgccatgta 16370818  T
Q  199 ggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtag 283  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  16370817 ggtataagactgcatggttgaaggaaaacttataagaattgtttggtactacttatatcaacaagacgtatcttctttttggtag 16370733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 161 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 3887204 - 3887058
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||  ||| |||| ||||||||| || |  ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3887204 gaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttatatgaattatttggtactacctatatcaac 3887105  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||| ||||||    
T  3887104 aagatgcatcttcttttcggtaactcattccataagaacttcacagt 3887058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 161 - 307
Target Start/End: Original strand, 22556535 - 22556681
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||  ||| |||||| ||||||| || || ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22556535 gaatcacatcggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtactacctatatcaac 22556634  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||  |||||||| ||||||    
T  22556635 aagatgcatcttcttttcggtagctcattctttaagaacttcacagt 22556681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 92 - 277
Target Start/End: Original strand, 42429083 - 42429260
Alignment:
Q  92 gagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccgcagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggatcctgaga 191  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||  |||       ||||| ||||| | ||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  42429083 gagggcgaggagtggtcgccggtgcacaatgcataacaatgggcgg-------agcttttagacgaaccgaatcacatcggaataagagg-atcctgaga 42429174  T
Q  192 ccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttt 277  Q
    || |||||||||| ||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  42429175 ccgtgtaggtatgtgaacacatggttgaaggaggacttataagaattgtttggtactacctttatcaacaatatgcatattctttt 42429260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 161 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 3886748 - 3886602
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||  | |  | ||||| |||| |||||| |||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3886748 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggtcgtacaagtatgggactgcatggtagaaggaatgcttatatgaattgtttggtactacctatatcaac 3886649  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3886648 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 3886602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 161 - 307
Target Start/End: Original strand, 22556968 - 22557114
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||  ||| |||| | || |||| || || ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  22556968 gaatcacatcggaatgagagagttcatgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtactaccaatatcaac 22557067  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||  |||||||| ||||||    
T  22557068 aagatgcatcttcttttcggtagctcattctttaagaacttcacagt 22557114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 207 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 4673572 - 4673472
Alignment:
Q  207 actacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacag 306  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  4673572 actacatgattgaaggaagtcttataagaattatttggtagcacctgtatcaacaagatgcatattctttttggtatttcattccataagaactccacag 4673473  T
Q  307 t 307  Q
    |    
T  4673472 t 4673472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 177 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 29680231 - 29680108
Alignment:
Q  177 agagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttt 276  Q
    |||| |||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||       ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29680231 agagagatcttgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataag-------tggtaatacctatatcaacaagatgcatcttcttt 29680139  T
Q  277 ttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  29680138 ttggtagcccattacataagaactccacagt 29680108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 30719954 - 30719808
Alignment:
Q  159 ccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatca 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    || | ||||| |||  ||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |    
T  30719954 ccgaatcacatcagaatgagagggatcctgaggttgtgcaagtatgggacatcattgttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtactacctataaaa 30719855  T
Q  259 acaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccaca 305  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||    
T  30719854 acaagatgcatcttcttttcggtaggtcaaaccataagaactccaca 30719808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 307
Target Start/End: Original strand, 1879990 - 1880221
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctccc-gcagcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || | || ||||||||||||| |||| | ||||||||  | |||||  || ||||||||||| || ||||||| |    
T  1879990 ttgtaacaccaaaggctgacgaggacgggaagcggtcgccggtgcataaggcacgacaatgagtgactcccaacaacttctagacaaaccaaatcacacc 1880089  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 270  Q
    | ||| |||||||||  |||||| || || |||| |||| ||||||||||| |||     ||||||||||   ||||| ||||||| ||||| ||||||     
T  1880090 agaatgagagggatctcgagaccgtgcagttatgtgactgcatggttgaaggaag----ttaagaattgtccagtacttcctatattaacaa-atgcata 1880184  T
Q  271 ttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||    
T  1880185 ttctttttggtagtctattccacaagaactctacagt 1880221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 162 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 24182391 - 24182277
Alignment:
Q  162 aatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 261  Q
    |||||||| | ||| ||||||||| ||||| | || | ||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  24182391 aatcacattagaatgagagggatcttgagaacgtgcaagtatgagacgaaatggttgaaggaaggcttataagaattatttggtactatctataccaaca 24182292  T
Q  262 agatgcatcttcttt 276  Q
    |||||||||||||||    
T  24182291 agatgcatcttcttt 24182277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 2058805 - 2058664
Alignment:
Q  159 ccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatca 258  Q
    ||||||||||||  | | |||| ||||||||   |||| || |||||||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2058805 ccgaatcacatcggattgagagagatcctgaagtcatgcagctatgagactggatgattgaaggaagacttatatgaattgtttggtactacctatatca 2058706  T
Q  259 acaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaact 300  Q
    ||||||||||  |||| ||   ||| ||||||||||||||||    
T  2058705 acaagatgcaaattctgttaaatagcacattccataagaact 2058664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 195 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11160794 - 11160694
Alignment:
Q  195 tgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccata 294  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||    
T  11160794 tgtaggtatgacactacatagttgaaggaaggcttataataattgtttggtactatctatgtcaacaagatgcatattctttcacgtagttcattccata 11160695  T
Q  295 a 295  Q
    |    
T  11160694 a 11160694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 211 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18750293 - 18750201
Alignment:
Q  211 catggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactcca 303  Q
    ||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||    
T  18750293 catggttgaaggaaggattataacaattgtttggtactacctataccaaaaagatgcatcttcttttcggtagcttattccataagaactcca 18750201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 20858633 - 20858546
Alignment:
Q  216 ttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactcca 303  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||||||||    
T  20858633 ttgaagaaaggcttataagaattgtttggtattttctatatcaacaagatgcttcttcttttctgtagctcattccataagaactcca 20858546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 43356743 - 43356650
Alignment:
Q  184 tcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttt 278  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| |||| |||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  43356743 tcctgagatcatgcaggtatgagactgcatgattgagg-atgacttataagaattgtttggtacaacctaaaccaacaatatgcatcttcttttt 43356650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 242 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 11757347 - 11757282
Alignment:
Q  242 tggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||    
T  11757347 tggtactacttatatcaacaaaatgcatcttcttttcggtagttcaatccataagaactccacagt 11757282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 30684637 - 30684557
Alignment:
Q  227 cttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  30684637 cttatatgaattgtttggtactatctataaaaacaagatgcatcttcttttcggtaggtcaaaccataagaactccacagt 30684557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 32574864 - 32574683
Alignment:
Q  103 gtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatc-acatcaaaataagagggatcctgagaccatgtagg 200  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||| | || |||| | |||| ||| | |||| | | ||   | ||||||    
T  32574864 gtggtctccgatgcacaaggtataacaatgagcggctcctgacagcttctagacgaaccaaatccaaatcagaatgaaagggtttcagatgtcgtgtagg 32574765  T
Q  201 tatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtag 283  Q
    ||||||||| || |||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||||    
T  32574764 tatgagactgcacggttaaag-aaggcttataggaattgtttggtactacctatacaaacaaaatgcatctttcttttggtag 32574683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22975157 - 22975076
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgttt 242  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| || || ||||||| |||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  22975157 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgtgactgcatggttgaagaaaagcttataagaattgttt 22975076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 39801571 - 39801498
Alignment:
Q  200 gtatgagactacatggttgaagcaagactta-taagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 272  Q
    ||||||||||| |||||| ||  |||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39801571 gtatgagactatatggttaaaagaagactttctaaaaatcgtttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 39801498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 250
Target Start/End: Original strand, 4102723 - 4102895
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcc-cgcagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    ||||||| || ||||||| ||||  | |||||| ||| || ||||||||| |||| |||   ||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||     
T  4102723 tgtaacatccgaggctgatgaggatggggagtgatcgtcgatgcacaaggcatgataatatgcggctcctcgcagcttctaggcaatc-gaatcacatct 4102821  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactac 250  Q
     ||| |||||||| |||| ||| || ||||||||||||     ||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4102822 gaatgagagggattctgataccgtgcaggtatgagact-----gttgaaagaatgcttataagaattgtttggtactac 4102895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 283
Target Start/End: Original strand, 5549343 - 5549466
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaa-ttgtttggtactacctatatcaa 259  Q
    ||||||||||  ||| ||| || || ||| ||||||||||||||||| |  ||  |||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||| |||    
T  5549343 gaatcacatcggaatgagatggttcatgaaaccatgtaggtatgagattgtataattgaaggaaaacttataaaaaattgtttggtactacgtataccaa 5549442  T
Q  260 caagatgcatcttctttttggtag 283  Q
    ||| |||  | |||||||||||||    
T  5549443 caatatgtttattctttttggtag 5549466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 72 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 8391524 - 8391477
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcaca 119  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8391524 ttgtaacacccacagctgaagagggcggggagtggtcgccggtgcaca 8391477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 72 - 307
Target Start/End: Original strand, 2651 - 2887
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||  |||||||| || ||||||||  |  |||||||||||    
T  2651 ttgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtcgccggagcacaaggcacgacaatgagtggctcccgacaacttctagaggaatcgaatcacatc 2750  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 270  Q
     |||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  2751 gaaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcata 2850  T
Q  271 ttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2851 ttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 2887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 46)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 72 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 27022575 - 27022339
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  27022575 ttgtaatacccaaggctgacgaggacggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggagccgaatcacatc 27022476  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 270  Q
      ||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27022475 ggaatgagagggatcttgaggccatgtaggtatgggactacatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaacatgcatc 27022376  T
Q  271 ttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    || |||| || ||  ||||||||||||||||||||||    
T  27022375 ttattttcggcagctcattccataagaactccacagt 27022339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 10844793 - 10845028
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||  | |||||||||| |     
T  10844793 tgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccg 10844892  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||| ||||||| || || ||||||| |||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10844893 gaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 10844992  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10844993 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 10845028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 22026289 - 22026524
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||  | |||||||||| |     
T  22026289 tgtaacacccaaggctgacgagggcgaggagtggtcgccggtgcacaaggcatgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccg 22026388  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||| || |||| || || ||||||| |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22026389 gaatgagagggttcgtgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaatgaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 22026488  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22026489 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 22026524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 22549231 - 22548996
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||  | |||||||||| |     
T  22549231 tgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccg 22549132  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||  ||||||| |  || ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22549131 gaatgagaggcttcctgaggctgtgcaggtatgtgactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 22549032  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  |||||||||| |||||||||||    
T  22549031 tcttttcggtagctcattccataaaaactccacagt 22548996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 71 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 12827492 - 12827255
Alignment:
Q  71 gttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacat 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | | |||||||||  | |||||||||      
T  12827492 gttgtaacacccaaggctgacgagggtggggagtgatcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgactgcttctagaagaaccgaatcacgc 12827393  T
Q  170 caaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 269  Q
    |  ||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12827392 cggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtatgggactacttggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcat 12827293  T
Q  270 cttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12827292 cttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 12827255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 72 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 8080579 - 8080343
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    |||||||||||  | | ||||||||||    
T  8080579 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgaggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcttaacagcttctagaggaactgaatcacatc 8080480  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 270  Q
      ||| |||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8080479 ggaatgagagggatcctgaagccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaagctgataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatt 8080380  T
Q  271 ttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  8080379 ttctttttggtagcccattccataagaacttcacagt 8080343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 27925809 - 27926044
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||  | |||||||||| |     
T  27925809 tgtaacacccaaggctgacgaggacggggagtggtcgctggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccg 27925908  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||| ||||||| || || ||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27925909 gaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggattataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 27926008  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  27926009 tcttttcggtagctcatttcataagaactccacagt 27926044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 73 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 33852493 - 33852261
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccgc-agcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||  | |||| |||  | | |||||||| ||    
T  33852493 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtg-agtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgataacttcaagaggaactgaatcacacca 33852395  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  33852394 gaatgagagggatcccgagaccgtgcaggtatgagactgtatggttgaaggaaaacttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgtatct 33852295  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccaca 305  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  33852294 tctttttggtagcccattccataagaacttcaca 33852261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 73 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22840765 - 22840529
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccgc-agcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||  | || ||||| |||||||||  | ||||||||  | | ||||||||||     
T  22840765 tgtaacacccaaggctgacaagggcggggagtggtcgccggtgcataagacacgataatgagcggctcccgataacttctagagtaactgaatcacatcg 22840666  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22840665 gaatgagagagatcctgaggctttgtaggtatgagactacatggtcgaatgaagacttataagaattgtttggtactatctatatcaacaagatgcatct 22840566  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagta 308  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  22840565 tctttttgttagctcattccataagaactccacagta 22840529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 72 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 41659341 - 41659106
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||| |||||||||||  | |||||||||| |    
T  41659341 ttgtaacacctaaggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaagc-acgacaatgagtggctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacacc 41659243  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 270  Q
      ||| |||||| ||||||   | || ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41659242 ggaatgagagggttcctgatgtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 41659143  T
Q  271 ttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||| | |||  |||| |||||||||||||||||    
T  41659142 ttcttttcgatagctcattacataagaactccacagt 41659106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 6465146 - 6464911
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||  || ||||||||  |  ||||||||||      
T  6465146 tgtaacacccacgtctgacgagggcgaggagtggtcgccggtgcacaaggcacgataatgagcggctcccaacaacttctagagtaatcgaatcacattg 6465047  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| ||||| ||| |||| || ||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6465046 gaatgagaggaatcatgaggccgtgtaggtatggaactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcattt 6464947  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  6464946 tctttttggtagctcattccataacaactccacagt 6464911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 32292307 - 32292542
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccgc-agcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||  || |||||||  | |||||||||| |     
T  32292307 tgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtgatcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgatagtttctagaggaaccgaatcacaccg 32292406  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||| ||||||| || || | ||||| |||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  32292407 gaatgagagggttcctgaggccgtgcaagtatgggactgcatggttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactatctatatcaacaagttgcatct 32292506  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  32292507 tctttttgctagcccattccataagaactccacagt 32292542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 81 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27022111 - 27021903
Alignment:
Q  81 ccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatc--aa--aat 175  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||||| || ||||||||  ||||||||||||||  ||  |||    
T  27022111 ccaaggctgacgagggtggggagtggtcgcgggtgcacaaggcacgacaatgagtggctcccgacaacttctagaggagccgaatcacatcggaatgaat 27022012  T
Q  176 aagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 275  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27022011 gagagggatcctgaggccatgtaggtataagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacttatatcaacaagatgcatcttctt 27021912  T
Q  276 tttggtagt 284  Q
    || ||||||    
T  27021911 ttcggtagt 27021903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 22548785 - 22548550
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| |  ||||||| ||||||| | |||||||||||  | || ||||||| |     
T  22548785 tgtaacacccaaggctgatgagggtggggagtggtcgccagtgcacaaggcactacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaacctaatcacaccg 22548686  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||| ||||||| |  || ||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22548685 gaatgagagggttcctgaggctgtgcaggtatgtgactgcatggttgaaggaagttttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 22548586  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  |||||||||| |||||||||||    
T  22548585 tcttttcggtagctcattccataataactccacagt 22548550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 2043965 - 2044203
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacga---gggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcaca 168  Q
    |||||||||||||||||||||   || || | | |||||||||||||||||   | || ||| ||||||| ||| || ||||||||  | | ||||||||    
T  2043965 tgtaacacccaaggctgacgacgaggacgggaaatggtcgccggtgcacaaaacacgataattaacggcttccgacaacttctagaggaacagaatcaca 2044064  T
Q  169 tcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgca 268  Q
    ||  ||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2044065 tcggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgatactacctatatcaacaagatgca 2044164  T
Q  269 tcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    | |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  2044165 ttttctttttggtagcccattccataataactccacagt 2044203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28375290 - 28375079
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||| | |||||| | ||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||    
T  28375290 tgtaacaaccaaagctaacgagggcagagagtggtcgtcggtgcacaaggcacgacaattagcggctcccgacagcttctagacgaaacgaatcacacca 28375191  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||||||||||| || || |||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28375190 taatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatgattgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctacatcaacaagatgcatct 28375091  T
Q  272 tctttttggtag 283  Q
    |||||| |||||    
T  28375090 tcttttcggtag 28375079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 28453249 - 28453483
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||| || ||| ||||  | | |||||||| |     
T  28453249 tgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggttgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacaacttttagatga-ctgaatcacaccg 28453347  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||||||| |||  | || |||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28453348 gaatgagagggatcccgaggtcgtgcaggtatgagacttcatggttgaaagaaaacttataagaattgttttatactacctatattaacaagatgcatct 28453447  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  28453448 tctttatggtagcccattccataagaactctacagt 28453483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 162 - 303
Target Start/End: Original strand, 25147536 - 25147677
Alignment:
Q  162 aatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 261  Q
    |||||||||  ||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25147536 aatcacatcggaatgagagagatcctaagactgtgtaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtgctacctatatcaaca 25147635  T
Q  262 agatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactcca 303  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  25147636 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactcca 25147677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 177 - 304
Target Start/End: Original strand, 17103096 - 17103223
Alignment:
Q  177 agagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttt 276  Q
    |||| ||||||||| || |  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  17103096 agagagatcctgaggccgtacaggtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagctgcatcttcttt 17103195  T
Q  277 ttggtagtacattccataagaactccac 304  Q
    | |||||  |||||||||||||||||||    
T  17103196 tcggtagctcattccataagaactccac 17103223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 177 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 10844746 - 10844616
Alignment:
Q  177 agagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttt 276  Q
    |||||| ||||||| || || ||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10844746 agagggttcctgaggccttgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagagttgtttggtactacctatattaacaagatgcatcttcttt 10844647  T
Q  277 ttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    | |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10844646 tcggtagctcattccataagaactccacagt 10844616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 159 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 27819395 - 27819247
Alignment:
Q  159 ccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatca 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| |||   |||| | |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27819395 ccgaatcacatcagaatgagagggatcatgaagtcatgcaagtatgagacttcatggttgaaggaaggctaataagaattgtttggtactacctatatca 27819296  T
Q  259 acaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||| ||||||||||||||   |||  |||||||||| |||||||||||    
T  27819295 acaaaatgcatcttcttttcaatagctcattccataaaaactccacagt 27819247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 161 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 34308626 - 34308482
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||  ||| | |||||||||||| || |  | ||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34308626 gaatcacatcggaatgaaagggatcctgaggccgtacaagtatgagactgtatggttgaaggaaggcttataagaactgtttggtactacctatatcaac 34308527  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccaca 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  34308526 aagatgcatcttcttttcggtagcctattccataagaactccaca 34308482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 307
Target Start/End: Original strand, 41913000 - 41913115
Alignment:
Q  192 ccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattcc 291  Q
    ||||| ||||||| |||| |||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||    
T  41913000 ccatgcaggtatgggactgcatgtttgaaagaaggcttataagaattgtttggtgctacctatatcaacaagatgcgtcttctttttggtagcccattcc 41913099  T
Q  292 ataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||| ||||    
T  41913100 ataagaactccgcagt 41913115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 301
Target Start/End: Original strand, 3744671 - 3744777
Alignment:
Q  195 tgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccata 294  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  3744671 tgtaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttgacactacctataccaacaatatgcaccttctttttggtagcacatttcata 3744770  T
Q  295 agaactc 301  Q
    |||||||    
T  3744771 agaactc 3744777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 161 - 307
Target Start/End: Original strand, 25144771 - 25144917
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||  |||  | || ||||||| || | |||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25144771 gaatcacatcagaatgagagagatctcgaggtcgtgcaggtatgggattgcatgattgaaggcaggcttataagaattgtttggtactacctatatcagc 25144870  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25144871 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 25144917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 161 - 307
Target Start/End: Original strand, 25147966 - 25148112
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||| |||  | |||||||||| ||||   | ||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25147966 gaatcacataagaatgagagggatcccgaggtcgtgtaggtatgggactgtgtcgttgaaggaaggcttataagaattgtttggtcttacctatatcaac 25148065  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25148066 aagatgcatattcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 25148112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 162 - 303
Target Start/End: Original strand, 1297007 - 1297148
Alignment:
Q  162 aatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 261  Q
    |||||||||||| | |||||| | |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1297007 aatcacatcaaagtgagaggggttctgagatcatgcaggtatgagactgcatggttgaagtaaaacttataagaattgtttggtactacctataccaaca 1297106  T
Q  262 agatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactcca 303  Q
    ||||  || ||||||| ||||   ||||  ||||||||||||    
T  1297107 agatttatattcttttcggtatcccattatataagaactcca 1297148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 206 - 307
Target Start/End: Original strand, 3745145 - 3745246
Alignment:
Q  206 gactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccaca 305  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  3745145 gactacatggttgaaggaaaacttataagaactgtttagtactacctataccaacaatatgcatcttctttttggtagcccattccataataactccaca 3745244  T
Q  306 gt 307  Q
    ||    
T  3745245 gt 3745246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 161 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 34309086 - 34308936
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacct----atat 256  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| || |  | ||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    ||||    
T  34309086 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacaagtatgagactgtatggttgaaggaaggcttataagaactgtttggtactacctatatatat 34308987  T
Q  257 caacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||    
T  34308986 caacaagatgcatcttcttttcggtagcctattccataagaactccacagt 34308936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 161 - 307
Target Start/End: Original strand, 12100691 - 12100836
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaa-gcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaa 259  Q
    |||||||||| |||| ||| | |||||||| || |  |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12100691 gaatcacatcgaaatgagaag-atcctgaggccgtacaggtatgagactgcatggttgaaggcaag-cttataagatttgtttggtactacctatatcaa 12100788  T
Q  260 caagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
     ||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||| ||||||    
T  12100789 taagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaacttcacagt 12100836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 81 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 29971629 - 29971450
Alignment:
Q  81 ccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataaga 179  Q
    |||||||| || || ||| ||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||||  || ||||| ||| || ||||| | | ||||||||||| |||  ||    
T  29971629 ccaaggctcacaagtgcggggaatggtcaccggtgcataaggcatggcaatgagtggttcccgacagtttttagacgaactgaatcacatcagaattgga 29971530  T
Q  180 gggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaa 259  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  29971529 aggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagatttataagaattgtttgatactatctatatcaa 29971450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 15819121 - 15819022
Alignment:
Q  202 atgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactc 301  Q
    ||||||| |||||||||||| ||  |||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15819121 atgagacaacatggttgaaggaatgcttagaaaaattgtttggtactacatatatcaacatgatgcatcttcttttcggtagcacattccataagaactc 15819022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 272
Target Start/End: Original strand, 6466648 - 6466820
Alignment:
Q  100 ggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgta 198  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||||| | ||||| | ||||||| || ||| || ||||| |||| ||| |||||||| |||||||  ||      
T  6466648 ggagtggttgccagtgcacaaggcatgacaatgagcagctcctgacagcttccaggcaaaccaaatcatatcagaatgagagggattctgagactgtgcg 6466747  T
Q  199 ggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 272  Q
    ||||||  ||| ||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6466748 ggtatggaactgcatggttaaagga-gacttataaaaattgtttggtactacctataccaacaagatgcatctt 6466820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 272
Target Start/End: Original strand, 22705187 - 22705282
Alignment:
Q  177 agagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 272  Q
    |||||||||||||  || |||||||||| ||||  ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22705187 agagggatcctgaagccgtgtaggtatgggactggatgattgaaggaagggttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 22705282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 177 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 21316240 - 21316110
Alignment:
Q  177 agagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttt 276  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||||  |||||| ||  |   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21316240 agagggatcctaaggccgtgcaggtatgagactgtatggttaaatgagcgcttaaaagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcgtcttt 21316141  T
Q  277 ttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |  ||||  |||| |||||||||||||||||    
T  21316140 tcagtagctcatttcataagaactccacagt 21316110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 30335056 - 30334939
Alignment:
Q  160 cgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaa 259  Q
    |||||||||||  ||| ||| ||||||||||||  || ||||||| |||| || |||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  30335056 cgaatcacatcggaattagatggatcctgagactgtgcaggtatgcgactgcaaggttgaaagaagacttataaaaattgtttgatactacctataccaa 30334957  T
Q  260 caagatgcatcttctttt 277  Q
    |||||| |||||||||||    
T  30334956 caagatacatcttctttt 30334939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 211 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 15567653 - 15567557
Alignment:
Q  211 catggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  15567653 catggtggaaggaaggcttataagaattgtttgacactacatataccaacaagatacatcttctttttggtagttcatttcataagaactccgcagt 15567557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 30527589 - 30527483
Alignment:
Q  200 gtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaac 299  Q
    |||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||  |||| |||||||||    
T  30527589 gtatgagactgcatgtttgaacca-gacttataagaattgtttggtaccacttacatcaataagatacatcttcttttgggtagcccatttcataagaac 30527491  T
Q  300 tccacagt 307  Q
    ||||||||    
T  30527490 tccacagt 30527483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 240 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 31283719 - 31283652
Alignment:
Q  240 tttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31283719 tttggtactacctatattaacaagatgcatcttcttttcggtagcccattccataagaactccacagt 31283652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 15568100 - 15568035
Alignment:
Q  213 tggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttt 278  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15568100 tggttgaaggaagacttataacaattgtttggtatgacctatatcaacaagatgcatctttttttt 15568035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 100 - 303
Target Start/End: Original strand, 6466194 - 6466397
Alignment:
Q  100 ggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccgc-agcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgta 198  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||| |  ||  ||||| |||   ||||||||||| ||| ||||| || ||||||   || |    
T  6466194 ggagtggtcgccggtgcacaaagcatgacagtgagcggctcctgatagtgtctaggcaaattgaatcacatcagaatgagaggaattctgagagagtgca 6466293  T
Q  199 ggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaa 298  Q
     ||||| ||||||||| || ||   | ||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  6466294 tgtatgggactacatgtttaaaagtatactaatatgaattgtttggtactacttataccaacaagttgcatcttccttttggtagt-catttcataagaa 6466392  T
Q  299 ctcca 303  Q
     ||||    
T  6466393 atcca 6466397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 273
Target Start/End: Original strand, 17429539 - 17429611
Alignment:
Q  201 tatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttc 273  Q
    |||| |||| ||| ||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17429539 tatgtgactgcattgttgaaggaagacttatgagtattatttggtactacctatatcaacaagatgtatcttc 17429611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 36968491 - 36968434
Alignment:
Q  212 atggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 269  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  36968491 atggttgaaggatgacttataagaattgattggtgctacttatatcaacaagatgcat 36968434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 258 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 10729736 - 10729689
Alignment:
Q  258 aacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccaca 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||    
T  10729736 aacaagatgcatcttctttttggtagcctattccataaggactccaca 10729689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 196 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 28912962 - 28912851
Alignment:
Q  196 gtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataa 295  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||  ||| | |||||||||||| || || || || |||| |||||||||||||| |||||| ||   ||||| ||||    
T  28912962 gtaggtatgacactgcatgattgaaagaagtcatataagaattgtctgatattatctgtatcgacaagatgcatcttatttttgatatcccattctataa 28912863  T
Q  296 gaactccacagt 307  Q
     |||||||||||    
T  28912862 taactccacagt 28912851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 72 - 190
Target Start/End: Original strand, 44041799 - 44041918
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| || | |||||| | ||| ||| |||| |||||||||  ||| ||| | |||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  44041799 ttgtaacgcccgaggctgacgaggacgagaagtggttgtcggggcataaggcatgacaatgtgcggttcctggcagcttataggcaaaccgaatcacatc 44041898  T
Q  171 aaaataagagggatcctgag 190  Q
    | ||| ||||||||| ||||    
T  44041899 agaatgagagggatcatgag 44041918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 1130 - 1365
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | || ||||||||  | |||||||||| |     
T  1130 tgtaacacccaaggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacaacttctagaggaaccgaatcacaccg 1229  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| ||| || ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1230 gaatgagacggttcctgaggccatgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatataaacaagatgcatct 1329  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1330 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 1365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 307
Target Start/End: Original strand, 4470 - 4706
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||    
T  4470 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgaggagtggccgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacatc 4569  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 270  Q
      ||  |||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4570 ggaaggagagggttcctgaggccatgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggtttagaagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 4669  T
Q  271 ttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||||||||||||||||    
T  4670 ttcttttcggtagctcattttataagaactccacagt 4706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 4926 - 5166
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||| | || ||||||||  | |||||||||| |     
T  4926 tgtaacacctaaggctgacgagggcgaggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaattagcggctcctgacaacttctagaggaaccgaatcacaccg 5025  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagactt-----ataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatg 266  Q
     ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||  ||     | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5026 gaatgagagggttcctgaggccatgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggtttaaaagagaagaattgtttggtactacctatattaacaagatg 5125  T
Q  267 catcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  5126 catcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagt 5166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 73 - 307
Target Start/End: Original strand, 154668 - 154902
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||| || |||||||||||  | |||||||||  |     
T  154668 tgtaacacccaaggctgatgagggcggggagtg-tcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctctcgacagcttctagaggaaccgaatcacgccg 154766  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
     ||| |||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  154767 gaatgagagggctcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctgtatcaacaagatgcatct 154866  T
Q  272 tctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  154867 tcttttcagtagctcattccataagaactccacagt 154902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 210
Target Start/End: Original strand, 151550 - 151686
Alignment:
Q  72 ttgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||| || || |||||||||||  | |||||||||  |    
T  151550 ttgtaacacccaatgctgacgagggcggggagt-gtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcgg-tctcgacagcttctagaggaaccgaatcacgcc 151647  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagacta 210  Q
     |||| ||| |||||||||| || |||||||||| |||||    
T  151648 gaaatgaga-ggatcctgaggccttgtaggtatgggacta 151686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 100 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 18343 - 18136
Alignment:
Q  100 ggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgta 198  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||  | | ||||||||||  ||| |||||||||||||| || ||||    
T  18343 ggagtggtcgctggtgcaccaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgta 18244  T
Q  199 ggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaa 298  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||    
T  18243 ggtatgtgactacatagttgaaggaagacttataagaattgtttgatactacctatatcaacaagatgcatctt-tttttggtagctaattccataagaa 18145  T
Q  299 ctccacagt 307  Q
    |||||||||    
T  18144 ctccacagt 18136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 17807 - 17599
Alignment:
Q  100 ggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgta 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||| || ||||| ||  | |||||| |||||| ||| |||||||||||||| || ||||    
T  17807 ggagtggtcgccggtgcaccaggcacgacaatgagcggctcccgacaacttcttgaggaaccgaatgacatcagaatgagagggatcctgaggccgtgta 17708  T
Q  199 ggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaa 298  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  || | ||||||||    
T  17707 ggtatgggactacatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaggatgtatcttctttttggtagctcaattcataagaa 17608  T
Q  299 ctccacagt 307  Q
    |||||||||    
T  17607 ctccacagt 17599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 17916 - 17817
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggc-gtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  17916 tgtaacacccacggctgacgagggaaggggagtggtcgccggtgcacgaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacatc 17817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 274
Target Start/End: Original strand, 23583 - 23785
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccgcag-cttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |  | | ||||||  | |||||||||| |     
T  23583 tgtaacacccaaggctgacgagggcggggaatggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgatggcatctagaggaaccgaatcacaccg 23682  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
    |||| |||||| || |||| || || ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23683 aaatgagagggttcttgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 23782  T
Q  272 tct 274  Q
    |||    
T  23783 tct 23785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0499 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0499
Description:

Target: scaffold0499; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 159 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 2200 - 2052
Alignment:
Q  159 ccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatca 258  Q
    |||||||||| || ||| | |||| ||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2200 ccgaatcacaccagaatgaaagggttcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatca 2101  T
Q  259 acaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2100 acaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 2052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 161 - 276
Target Start/End: Original strand, 245085 - 245200
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  245085 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgggactacatggttgaagggaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 245184  T
Q  261 aagatgcatcttcttt 276  Q
    ||||||||||||||||    
T  245185 aagatgcatcttcttt 245200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 161 - 307
Target Start/End: Original strand, 245514 - 245660
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||| |||| || |||||||||| |||| |||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  245514 gaatcacatcataatgaaagggatcttgagtccgtgtaggtatgggacttcatggttgaagggatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 245613  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||||||||||  ||||   |  ||||||||||||||||||    
T  245614 aagatgcatcttcttttcagtagcctaaaccataagaactccacagt 245660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 177 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 162809 - 162679
Alignment:
Q  177 agagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttt 276  Q
    |||||||||||||| || |  ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  162809 agagggatcctgaggccgtacaggtatgtgactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgcatcttcttt 162710  T
Q  277 ttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    | |||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  162709 tcggtagctcattccataagaactccgcagt 162679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 156 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 69967 - 69816
Alignment:
Q  156 aagccgaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctata 255  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  69967 aagccgattcacatcataatgagagggatcctaagactatgcaggtatgagactgcatcgttgaaggaatgcttataataattgtttggtactacctata 69868  T
Q  256 tcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||| |||||||||| ||||   |||  ||||||||||||||||||||||    
T  69867 tcaacatgatgcatctttttttcattagctcattccataagaactccacagt 69816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 163181 - 163135
Alignment:
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  163181 aagatgcatcttgttttcggtagctcattccataagaactccacagt 163135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 162 - 307
Target Start/End: Original strand, 18966 - 19111
Alignment:
Q  162 aatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 261  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| ||| || || ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18966 aatcacatcggaatgagagggatccagaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 19065  T
Q  262 agatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||| ||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  19066 agattcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagt 19111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 161 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 2357 - 2217
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||||||| || || || ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2357 gaatcacatcggaatgagaaggatcctaaggccgtgcaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 2258  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactc 301  Q
    ||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  2257 aagatgcatcttcttttcggtagcttattccataagaactc 2217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 161 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 107610 - 107464
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||  ||| |||||||| ||||| || |  ||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  107610 gaatcacatcggaatgagagggattctgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgatactaccaatatcaac 107511  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  107510 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 107464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 161 - 307
Target Start/End: Original strand, 10299 - 10445
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| || || | ||||| |||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10299 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgcatgtatgggactgcatggttcaaggaaggcttataagaattgtttagtactacctatatcaac 10398  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10399 aagatgcatctttttttcggtagctcattccataagaactccacagt 10445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 162 - 307
Target Start/End: Original strand, 105720 - 105865
Alignment:
Q  162 aatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 261  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||| || |  |||||||  ||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  105720 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatggaactgcagggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 105819  T
Q  262 agatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    | |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  105820 aaatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 105865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0557 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0557
Description:

Target: scaffold0557; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 207 - 307
Target Start/End: Original strand, 2150 - 2250
Alignment:
Q  207 actacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacag 306  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  2150 actacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactccctatataaacaagatgcatcttctttttggtagcccattccttaagaactccacag 2249  T
Q  307 t 307  Q
    |    
T  2250 t 2250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0557; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 73 - 211
Target Start/End: Original strand, 660 - 799
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccg-cagcttctagacaagccgaatcacatca 171  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||| ||||  | ||||||||||||     
T  660 tgtaacacctaaggctgacgaggcaggggagtgaccgctggtgcacaaggtacgacaatgagcggctcccgacaacttatagaggaaccgaatcacatcg 759  T
Q  172 aaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactac 211  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  760 gaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgggactac 799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 161 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 142421 - 142303
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| || || ||||||| |||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  142421 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgggacttcatggttgaaggaatgtttataagaattgtttggtactacctatatcaac 142322  T
Q  261 aagatgcatcttctttttg 279  Q
    |||||||||||||||||||    
T  142321 aagatgcatcttctttttg 142303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 161 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 4129 - 4007
Alignment:
Q  161 gaatcacatcaaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 260  Q
    |||||||| || ||| |||||||||| ||| || || ||||||| |||| ||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4129 gaatcacaccagaatgagagggatcccgaggccgtgcaggtatgggactgcattgttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactacctgtatcaac 4030  T
Q  261 aagatgcatcttctttttggtag 283  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  4029 aagatgcatcttctttttggtag 4007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 75 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 4207 - 4172
Alignment:
Q  75 taacacccaaggctgacgagggcgtggagtggtcgc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4207 taacacccaaggctgacgagggcggggagtggtcgc 4172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 84 - 307
Target Start/End: Original strand, 14663 - 14886
Alignment:
Q  84 aggctgacgagggcgtggagtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccgca-gcttctagacaagccgaatcacatcaaaataagaggg 182  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| | | |||| |||  |||| ||||||||||  || |||||||    
T  14663 aggctgacgaggacggagagtggtcgccggtgcaaaaggcatgacaatgagcggctcctggaagcttttaggaaagc-gaatcacatcggaacaagaggg 14761  T
Q  183 atcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggta 282  Q
    ||||| | | | || | ||||  |||| ||  ||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  14762 atcctaatatcgtgcatgtataggactgcagtgttgaaggaatgcttataagaattgtttggtaatacctatatcaataagatgcatcgtcttttcggta 14861  T
Q  283 gtacattccataagaactccacagt 307  Q
     | ||||  ||||||||| ||||||    
T  14862 attcattgaataagaacttcacagt 14886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0442 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0442
Description:

Target: scaffold0442; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Original strand, 2414 - 2547
Alignment:
Q  73 tgtaacacccaaggctgacgagggcgtgg-agtggtcgccggtgcacaaggtatgacaatgaacggctcccgcag-cttctagacaagccgaatcacatc 170  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||  || |||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |  ||| ||||  | ||||||||||||    
T  2414 tgtaacacctaaggctgacaagggcaagggagtgatcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgaaaacttatagaggaaccgaatcacatc 2513  T
Q  171 aaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatg 204  Q
    | ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  2514 agaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatg 2547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 201 - 273
Target Start/End: Original strand, 45425 - 45497
Alignment:
Q  201 tatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttc 273  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45425 tatgtgactacattgttgaaggaagacttatgagaattatttggtactacctatatcaacaagatgtatcttc 45497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 248 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 13593 - 13534
Alignment:
Q  248 tacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13593 tacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagt 13534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 177 - 303
Target Start/End: Original strand, 26085 - 26211
Alignment:
Q  177 agagggatcctgagaccatgtaggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttt 276  Q
    ||||||||||| || || || |||| ||||||| |||||||| |  | | ||||||  |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  26085 agagggatcctaaggccgtgcaggtgtgagacttcatggttgcataatggcttatacaaattttttggtactacatatatcaacatgatgcatcttcttt 26184  T
Q  277 ttggtagtacattccataagaactcca 303  Q
    |||||||  ||||  ||||||||||||    
T  26185 ttggtagctcattttataagaactcca 26211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 278
Target Start/End: Original strand, 16038 - 16152
Alignment:
Q  166 acatcaaaataagagggatcctgagaccatg--taggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaag 263  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| | | ||  ||||||||||| | ||| ||||||  | ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  16038 acatcagaatgagagggatcctgatatcgtgcataggtatgagattgcatagttgaatgatgacttgtaagaattgtttggtgctatctatatcaacatg 16137  T
Q  264 atgcatcttcttttt 278  Q
    |||| |||| |||||    
T  16138 atgcctctttttttt 16152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1138 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1138
Description:

Target: scaffold1138; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 808 - 734
Alignment:
Q  197 taggtatgagactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 271  Q
    ||||||||||| || |||||||||| | |||||||| | |||  | |||||||| || |||||||||||||||||    
T  808 taggtatgagattatatggttgaaggaggacttatatggattaatcggtactacatacatcaacaagatgcatct 734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 14749 - 14703
Alignment:
Q  261 aagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    |||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14749 aagatgcatcttgttttcggtagctcattccataagaactccacagt 14703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 307
Target Start/End: Original strand, 7009 - 7087
Alignment:
Q  230 ataagaattgtttggtactaccta-tatcaacaagatgcatcttctttttggtagtacattccataagaactccacagt 307  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||| ||||||  | | ||  ||||||||||||||||||    
T  7009 ataagaattgtttggtactacatattaccaacaagatgcaccttttttttgacaatccaaaccataagaactccacagt 7087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1687 times since January 2019
Visitors: 4429